JP4602318B2 - 微生物細胞壁の透過性を増大させるための組成物および膜上で前記微生物を検出するための方法 - Google Patents
微生物細胞壁の透過性を増大させるための組成物および膜上で前記微生物を検出するための方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP4602318B2 JP4602318B2 JP2006341250A JP2006341250A JP4602318B2 JP 4602318 B2 JP4602318 B2 JP 4602318B2 JP 2006341250 A JP2006341250 A JP 2006341250A JP 2006341250 A JP2006341250 A JP 2006341250A JP 4602318 B2 JP4602318 B2 JP 4602318B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- microorganisms
- membrane
- probe
- pei
- composition
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/02—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms
- C12Q1/04—Determining presence or kind of microorganism; Use of selective media for testing antibiotics or bacteriocides; Compositions containing a chemical indicator therefor
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6806—Preparing nucleic acids for analysis, e.g. for polymerase chain reaction [PCR] assay
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Toxicology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Description
(a)液体または気体の媒質が、この媒質中に存在する微生物を膜の上または中に留めるように膜を通して濾過される。
(b)この膜および微生物が、ポリエチレンイミンと少なくとも1つのアルコールを含む上述されたような透過性付与組成物と接触させられる。
(c)架橋剤によって細胞が膜に固定される。
(d)微生物が、場合によって標識される1つまたは複数の、微生物細胞壁を横切ることが可能な巨大分子と接触させられる。
(e)微生物の内部に透過した巨大分子が検出される。
5’−TCTACCGCGTCACTTACGTGACACC−3’[配列番号1]
5’−CGACCAGCCAGAGCTTACGGAGTA−3’[配列番号2]
5’−CCCGAGGTGCTGGTAACT−3’[配列番号3]
のうちの1つまたは複数を含む。
液体または気体の媒質を濾過するための膜、および
本発明に述べられるような透過性付与組成物、
を含むキットを範囲に入れるように意図される。
実施される方法の複数の工程が図2に具体的に示される。
5’−CGACCAGCCAGAGCTTACGGAGTA−3’[配列番号2]
a)20%エタノール、PEI200μg/ml透過性付与溶液の使用
実施される方法の複数の工程は図5に具体的に示される。
上記で述べられたものと同じ手順がPEIのみを含む透過性付与溶液で、次いで10%エタノールと500μg/mlの濃度のPEIで構成された混合物(EtoH10%−PEI500)を含む透過性付与溶液で実施された。
本発明による透過性付与組成物は生きた微生物によって産生されるATPを、先行技術(Alexander,D.N.,G.M.Ederer,and J.M.Matsen.1976.「Evaluation of an adenosine 5’−triphosphate assay as a screening method to detect significant acteriuria」,J.Clin.Microbiol.3:42〜46)から知られている化学発光反応に従って検出するための方法に使用できる。
水中に存在する出芽酵母(Saccharomyces cerevisiae)をATP生物発光(様々な工程は図8に例示されている)によって検出するための方法が試験された。この試験では、化学発光反応の前に細胞が90%エタノール、または25%エタノール−PEI 500μg/mlで透過処理される。
上述されたのと同じ手順が実施され、ここではエタノールによる処理はPEIのみ(100−250−500μg/ml)、またはエタノール−PEIの混合物(本発明による組成物)、すなわちEtOH10%−PEI 100μg/ml、EtOH10%−PEI 250μg/ml、EtOH10%−PEI 500μg/ml EtOHで置き換えられた。
1つの実験は、10%エタノール−PEI 100μg/ml混合物を含む本発明による組成物の溶液中で大腸菌をインキュベートすることにある。
Claims (22)
- 10重量%から25重量%のエタノールおよび100μg/mlから500μg/mlのポリエチレンイミン(PEI)を少なくとも含む、微生物細胞壁を透過性にするための組成物。
- 以下の工程、すなわち
(a)液体または気体の媒質が、この媒質中に存在する微生物を膜の上または中に留めるように膜を通して濾過される工程、
(b)この膜および微生物が、10重量%から25重量%のエタノールおよび100μg/mlから500μg/mlのポリエチレンイミン(PEI)を少なくとも含む、透過性にするための組成物と接触させられる工程、
(c)架橋剤によって細胞が膜に固定される工程、
(d)微生物が、場合によって標識される1つまたは複数の、微生物細胞壁を横切ることが可能な巨大分子と接触させられる工程、および
(e)微生物の内部に透過した巨大分子が検出される工程
を含むことを特徴とする、液体または気体の媒質中に最初に存在する微生物を膜の上で計数および/または同定するための方法。 - 工程a)と工程b)の間に、微生物を培養することで構成される追加の工程を含むことを特徴とする、請求項2に記載の方法。
- 工程c)で架橋剤として働く作用物質がグルタルアルデヒド、ホルムアルデヒドおよびパラホルムアルデヒドから選択されることを特徴とする、請求項2および3のいずれかに記載の方法。
- 工程d)において、使用される巨大分子がPNAタイプのプローブであることを特徴とする、請求項2から4のいずれか一項に記載の方法。
- 工程d)において、使用される巨大分子がオリゴヌクレオチドタイプのプローブであることを特徴とする、請求項2から4のいずれか一項に記載の方法。
- 工程d)において使用されるプローブが配列番号1、配列番号2または配列番号3と少なくとも80%の同一性を示す配列を含むことを特徴とする、請求項5および6のいずれかに記載の方法。
- 工程d)において、プローブまたはプライマーが光信号の放出を可能にする酵素と結合することによって標識されることを特徴とする、請求項2から7のいずれか一項に記載の方法。
- 工程e)における微生物の検出が、化学発光反応および適切なインターフェースにより放出された光の認識によって実行されることを特徴とする、請求項8に記載の方法。
- 工程d)において、プローブまたはプライマーが蛍光分子で標識されることを特徴とする、請求項2から7のいずれか一項に記載の方法。
- 工程e)における微生物の検出が、プローブまたはプライマーの標識に対応する蛍光放出信号を適切なインターフェースで検出することによって実行されることを特徴とする、請求項10に記載の方法。
- 工程d)と工程e)の間に、前記微生物の核酸とプローブまたはプライマーの特異的なハイブリッド形成で構成される追加の工程を含むことを特徴とする、請求項2から11のいずれか一項に記載の方法。
- 工程d)とe)の間に、微生物中に存在する核酸の特異的な増幅で構成される追加の工程を含むことを特徴とする、請求項2から12のいずれか一項に記載の方法。
- 上で微生物が検出される膜が、主にPVDFまたはNylon(登録商標)から成ることを特徴とする、請求項2から13のいずれか一項に記載の方法。
- 微生物細胞壁の透過性を高めるための、請求項1に記載の組成物の使用。
- 微生物を計数および/または同定する方法における、請求項1に記載の組成物の使用。
- インヴィトロで核酸を細胞の中に透過させるための、請求項1に記載の組成物の使用。
- 液体を濾過するための膜、および
請求項1に記載の組成物
を含むことを特徴とする、微生物を検出および計数するためのキット。 - グルタルアルデヒド、ホルムアルデヒドおよびパラホルムアルデヒドから選択される架橋剤を含む組成物も含むことを特徴とする、請求項18に記載のキット。
- 微生物の特異的検出のための少なくとも1つのプローブも含むことを特徴とする、請求項18または19のいずれかに記載のキット。
- 微生物の特異的検出のためのプローブが配列番号1、配列番号2または配列番号3と少なくとも80%の同一性を示す配列を含むことを特徴とする、請求項20に記載のキット。
- 前記膜が主にPVDFまたはNylon(登録商標)で構成されることを特徴とする、請求項18から21のいずれか一項に記載のキット。
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
FR0512971A FR2894984B1 (fr) | 2005-12-20 | 2005-12-20 | Composition pour augmenter la permeabilite des parois microorganismes et procede de detection sur membrane desdits microorganismes. |
Related Child Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2010130826A Division JP2010213724A (ja) | 2005-12-20 | 2010-06-08 | 微生物細胞壁の透過性を増大させるための組成物および膜上で前記微生物を検出するための方法 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2007202553A JP2007202553A (ja) | 2007-08-16 |
JP4602318B2 true JP4602318B2 (ja) | 2010-12-22 |
Family
ID=36693767
Family Applications (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2006341250A Active JP4602318B2 (ja) | 2005-12-20 | 2006-12-19 | 微生物細胞壁の透過性を増大させるための組成物および膜上で前記微生物を検出するための方法 |
JP2010130826A Pending JP2010213724A (ja) | 2005-12-20 | 2010-06-08 | 微生物細胞壁の透過性を増大させるための組成物および膜上で前記微生物を検出するための方法 |
Family Applications After (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2010130826A Pending JP2010213724A (ja) | 2005-12-20 | 2010-06-08 | 微生物細胞壁の透過性を増大させるための組成物および膜上で前記微生物を検出するための方法 |
Country Status (9)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US20090197247A1 (ja) |
EP (1) | EP1801239B1 (ja) |
JP (2) | JP4602318B2 (ja) |
CN (1) | CN101054554B (ja) |
AT (1) | ATE468410T1 (ja) |
DE (1) | DE602006014354D1 (ja) |
ES (1) | ES2343200T3 (ja) |
FR (1) | FR2894984B1 (ja) |
SG (1) | SG133533A1 (ja) |
Families Citing this family (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
FR2929291B1 (fr) * | 2008-04-01 | 2010-04-23 | Millipore Corp | Composition de permeabilisation cellulaire comprenant nog, hmp, chlorure de rubidium et/ou chlorure de lithium pour la detection sur membrane de cellules vivantes. |
US8486427B2 (en) | 2011-02-11 | 2013-07-16 | Kimberly-Clark Worldwide, Inc. | Wipe for use with a germicidal solution |
Family Cites Families (14)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
NL123810C (ja) * | 1963-12-24 | 1900-01-01 | ||
US4871461A (en) * | 1987-01-22 | 1989-10-03 | The General Director Of The Agency Of Industrial Science And Technology | Polymer composite membrane |
JPS63305904A (ja) * | 1987-06-08 | 1988-12-13 | Asahi Chem Ind Co Ltd | スルホン酸型半透膜の改質方法 |
US4941991A (en) * | 1987-10-22 | 1990-07-17 | Rajamannan A H J | Composition and process for use in neutralizing malodorous gases |
JP2849426B2 (ja) * | 1990-01-23 | 1999-01-20 | 旭化成工業株式会社 | 消臭用高分子及びその製造方法 |
FR2763853B1 (fr) * | 1997-05-28 | 2000-01-07 | Oreal | Association d'un retinoide avec un polymere polyamine |
US6551795B1 (en) * | 1998-02-18 | 2003-04-22 | Genome Therapeutics Corporation | Nucleic acid and amino acid sequences relating to pseudomonas aeruginosa for diagnostics and therapeutics |
US7019113B2 (en) * | 1999-06-07 | 2006-03-28 | Mirus Bio Corporation | Reversible modification of membrane interaction |
DE19941359C2 (de) * | 1999-08-31 | 2002-12-05 | Gsf Forschungszentrum Umwelt | Schneller, hochspezifischer Nachweis von Pseudomonas aeruginosa durch Mehrfachsondendetektion |
WO2001059157A2 (en) * | 2000-02-08 | 2001-08-16 | Millipore Corporation | Process for the enumeration and identification of microorganisms |
IL151289A0 (en) * | 2000-02-18 | 2003-04-10 | Aventis Pharma Sa | Method for preparing functionalised polyalkylenimines, composition containing same and uses thereof |
US20030175709A1 (en) * | 2001-12-20 | 2003-09-18 | Murphy George L. | Method and system for depleting rRNA populations |
FR2847589B1 (fr) * | 2002-11-25 | 2006-02-17 | Hemosystem | Procede de detection universelle de microorganismes et milieu reactionnel permettant la mise en oeuvre du procede |
JP2004313181A (ja) * | 2003-04-02 | 2004-11-11 | Canon Inc | 感染症起炎菌検出用プローブ及びプローブセット、ならびに担体及び遺伝子検査方法 |
-
2005
- 2005-12-20 FR FR0512971A patent/FR2894984B1/fr not_active Expired - Fee Related
-
2006
- 2006-12-14 SG SG200608705-0A patent/SG133533A1/en unknown
- 2006-12-14 US US11/638,745 patent/US20090197247A1/en not_active Abandoned
- 2006-12-18 DE DE602006014354T patent/DE602006014354D1/de active Active
- 2006-12-18 ES ES06291966T patent/ES2343200T3/es active Active
- 2006-12-18 AT AT06291966T patent/ATE468410T1/de not_active IP Right Cessation
- 2006-12-18 EP EP06291966A patent/EP1801239B1/en active Active
- 2006-12-19 JP JP2006341250A patent/JP4602318B2/ja active Active
- 2006-12-20 CN CN2006101686057A patent/CN101054554B/zh active Active
-
2010
- 2010-01-25 US US12/692,741 patent/US8148081B2/en active Active
- 2010-06-08 JP JP2010130826A patent/JP2010213724A/ja active Pending
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
FR2894984B1 (fr) | 2009-01-16 |
DE602006014354D1 (de) | 2010-07-01 |
US8148081B2 (en) | 2012-04-03 |
EP1801239B1 (en) | 2010-05-19 |
US20090197247A1 (en) | 2009-08-06 |
EP1801239A2 (en) | 2007-06-27 |
ATE468410T1 (de) | 2010-06-15 |
CN101054554B (zh) | 2011-07-27 |
ES2343200T3 (es) | 2010-07-26 |
JP2010213724A (ja) | 2010-09-30 |
SG133533A1 (en) | 2007-07-30 |
FR2894984A1 (fr) | 2007-06-22 |
US20100255476A1 (en) | 2010-10-07 |
CN101054554A (zh) | 2007-10-17 |
JP2007202553A (ja) | 2007-08-16 |
EP1801239A3 (en) | 2007-08-15 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP5031732B2 (ja) | フィルター上の微生物の検出及びキャラクタリゼーション方法 | |
Perry‐O’Keefe et al. | Filter‐based PNA in situ hybridization for rapid detection, identification and enumeration of specific micro‐organisms | |
JP4986178B2 (ja) | 膜上で生細胞を検出するための、nog、hmp、塩化ルビジウム及び/又は塩化リチウムを含む細胞透過処理のための組成物 | |
US20060134729A1 (en) | Process for the universal detection of microorganisms and reaction environment permitting the implementation of the process | |
US20100305312A1 (en) | Method For The Extraction And Purification Of Nucleic Acids On A Membrane | |
JP2010046042A (ja) | 特定遺伝子の検出方法 | |
CN112159854A (zh) | 一种大肠杆菌O157:H7的CRISPR/Cas12a检测用引物组合物和检测方法 | |
US20110097702A1 (en) | Methods and compositions for in situ detection of microorganisms on a surface | |
US20110245352A1 (en) | Composition For Permeabilizing The Walls Of Microorganisms Comprising The Combination Of Ethylenediaminetetraacetic Acid (EDTA) And Polyethyleneimine (PEI) | |
US20100075298A1 (en) | Method for rapid identification and quantification of microorganisms | |
CN112410405B (zh) | 一种复杂样品中细菌的快速检测方法 | |
JP4602318B2 (ja) | 微生物細胞壁の透過性を増大させるための組成物および膜上で前記微生物を検出するための方法 | |
KR102082117B1 (ko) | 육안으로 판독 가능한 입자 기반 유전자 측정 방법 및 시스템 | |
AU2003226729A1 (en) | Method for the identification of microorganisms by means of in situ hybridization and flow cytometry | |
JP2009055812A (ja) | 試料からの抗酸菌の分離回収方法 | |
AU2020231725B9 (en) | Method for determining whether organism having cell wall exists and method for identifying organism having cell wall | |
JP2006081506A (ja) | 微生物の高感度迅速検出方法 | |
JP2000333668A (ja) | 有機被膜処理フィルターならびにそれを用いる微生物の識別および計数方法 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20090707 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20090930 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20091005 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20100106 |
|
A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20100209 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20100608 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20100611 |
|
A911 | Transfer to examiner for re-examination before appeal (zenchi) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A911 Effective date: 20100809 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20100907 |
|
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20100929 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20131008 Year of fee payment: 3 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 4602318 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20131008 Year of fee payment: 3 |
|
S533 | Written request for registration of change of name |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R313533 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20131008 Year of fee payment: 3 |
|
R350 | Written notification of registration of transfer |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R350 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
S531 | Written request for registration of change of domicile |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R313531 |
|
R350 | Written notification of registration of transfer |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R350 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |