JP4280786B2 - 同一のn末端を有する塩基性繊維芽細胞増殖因子の高レベル発現 - Google Patents
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Description
本発明は、増殖因子の組み換え生産の分野に関する。特に、本発明は、同一のN末端を有するヒト塩基性繊維芽細胞増殖因子の生産に関する。本発明は、同一のN末端を有するヒト塩基性繊維芽細胞増殖因子の高レベルな発現および回収の手段および方法を提供する。
塩基性繊維芽細胞増殖因子(bFGF)は、毛細管内皮細胞を含む広範囲な細胞型において強力なマイトジェン活性を発現するタンパク質である。ウシの下垂体由来のbFGFの完全なアミノ酸配列が決定されている(Esch,F.ら、Proc Natl Acad Sci(USA)(1985)82:6507)。ヒトbFGFをコードするクローニングされたDNA配列は単離され、そのアミノ酸配列のヒトタンパク質の131−、146−および154−アミノ酸形態は決定されている(1987年3月26日にWO 87/01728として公開されているPCT出願 US86/01879、Abraham,J.ら、Science(1986)233:545、Abraham,J.ら、The EMBO Journal(1986)5:2523)。クローニングされたDNA配列を分析すると、可能な開始メチオニンコドンが、bFGFの154−アミノ酸形態のコーディング配列のすぐ上流側に存在することが示され、このことは、(i)この遺伝子からの一次翻訳産物の長さが155個の残基で、
(ii)154−アミノ酸形態が、開始メチオニンの翻訳後除去によって得られることを示している。次いで、Florkiewicz、R.およびSommer,A.(Proc Natl Acad Sci(USA)(1989)86:3978−3981)およびPrats,H.ら、(Proc Natl Acad Sci(USA)(1989)86:1836−1840)は、155−残基一次翻訳産物のメチオニン開始コドンの上流側に存在するロイシンコドンにおける、代替翻訳開始の結果として生産され得る、より長い形態のbFGFの存在を報告した。
本発明は、実質的に同一のN末端を有するヒトbFGFの高レベルな発現の方法および手段を提供する。「実質的に同一」とは、Edman分解法による配列分析によって、bFGFが、95%、好ましくは98%より多くの、同一N末端を有する物質を含むことが示されることを意味する。本発明は、ヒトbFGFの155−アミノ酸一次翻訳産物のN末端メチオニン残基の直後にある2つのアラニン残基の1つをコードするコドンが欠失すると、N末端が同一のヒトbFGFタンパク質が発現および回収されるという発見に基づいている。特にN末端メチオニンの翻訳後プロセシングに次いで、同一なN末端配列Ala−Gly−Ser−を有する長さが153個のアミノ酸のヒトbFGFが生産される。さらに、以下の実施例3および5におけるE.coli発現ベクターを用いて、Alaが欠失した配列が発現すると、その発現レベルは、Alaを欠失していない対応のタンパク質配列の発現レベルよりもおよそ50%から100%高くなることが発見されている。
本発明は、ヒトbFGFの155−アミノ酸前駆体をコードし、N末端メチオニンのすぐ後ろの2つのアラニン残基のうち1つのアラニン残基のコドンを欠失しているDNA配列を使用する。以下では、ヒトbFGFをコードし改変された形を、一次翻訳産物がN末端配列Met−Ala−Gly−Ser−を有することを示すために「bFGF(MAGS)」と表す。このヒトbFGFおよびウシbFGFの155−残基形態のアミノ酸配列を、図1Aおよび図1Bにそれぞれ示す。図1Aおよび図1Bに示されるDNA配列は、ここに参考として援用されているPCT公報第WO 87/01728号に記載のように
決定された、天然のコーディング配列である。これらの配列のいずれかが、部位特異的変異誘発(Zoller,M.J.,およびSmith,M.,Nucleic Acids Res(1982)10:6487およびAdelman,J.P.ら.,DNA(1983)2:183)によって改変され得、N末端メチオニンのすぐ後のアラニン残基の1つを欠いたヒトbFGFの類似体をコードするDNAを生産する。周知のDNAコードの変性により、他のDNA配列がN末端アラニン残基の1つを欠く所望のヒトbFGF配列をコードする場合は、そのDNA配列が使用し得ることが理解される。好適な実施態様においては、アラニン残基を有しないヒトbFGFをコードするDNA配列が提供される。このような実施態様では、アラニン残基を欠くヒトbFGFをコードしているDNA配列が提供され、そこでは分子のN末端部をコードするDNAの実質的な部分が、天然のDNA配列と比較するとG+C含有量が減少しているように改変される。
Chem Soc(1981)103:3185に記載のホスホルアミダイト法によって調製し得、市販で入手可能な自動オリゴヌクレオチド合成機によっても調製し得る。このアプローチはかなりの長さの遺伝子全体を合成するために効果的に用いられている。
Press(1981)3:1−32に記載されている。一般的に、オリゴヌクレオチドの全体の長さは、変異部位からの5’および3’伸長部がDNAポリメラーゼのエキソヌレアーゼ活性による変異の修正を回避するのに充分な長さであり、変異部位において、安定かつ固有のハイブリダイゼーションを最適に行えるものである。本発明にしたがって変異誘発に用いられるオリゴヌクレオチドは、通常、約18から約45の塩基を有し、好ましくは約23から約27の塩基を有する。それらは変化したまたは欠失したコドンの3’側に少なくとも約9個の塩基を有する。
74のような一本鎖ファージにハイブリダイズされる。ファージが遺伝子のセンス鎖またはアンチセンス鎖のいずれかを有し得ることが好ましい。ファージがアンチセンス鎖を有する場合は、プライマーは、欠失するアラニンを指定するコドンの欠失を除いて、変異する領域のコーディング配列と同一である。ファージがセンス鎖を有する場合は、プライマーは、欠失するアラニン残基をコードするものと相補的であるトリプレットの欠失を除いて、変異する領域のコーディング配列と相補的である。
ミノ酸配列に基づくナンバーリングシステムによる)。このように、ヒトbFGF(MAGS)に対応するウシタンパク質をコードするDNA配列は、図2のDNA配列の変異によって調製し得、120番および136番のアミノ酸残基に対応するコドンを変える。これは、各コドンにおいて1個のヌクレオチドの変異により達成される。
またはManiatisら、Molecular Cloning:A Laboratory Manual(1982)Cold Spring harbor Press,254ページおよびHanahan,D.,J Mol Biol(1983)166:557−580に記載のRbCl2法が、原核細胞または実質的に細胞壁バリアを有する他の細胞に使用し得る。そのような細胞壁を持たない哺乳類の細胞には、Grahamおよびvan der Eb,Virology(1978)52:546のリン酸カルシウム沈澱法が使用し得、任意にWigler,M.ら、Cell(1979)16:777−785によって改変された方法が使用し得る。酵母への形質転換は、Beggs,J.D.,Nature(1978)275:104−109またはHinnen,A.,ら,Proc Natl Acad Sci(USA)(1978)75:1929の方法により実施し得る。
Collectionに寄託されている。従って、下記の実施例において出発物質として使用されるbFGFのDNA配列は、種々の起源のものから入手可能である。
(pTrp−233細菌発現プラスミドの構築)
A.合成トリプトファンオペロンプロモーターおよびオペレーター調節配列の構築
図3Aに示す10個のオリゴデオキシヌクレオチドを、ホスホトリエステル法によって合成し、精製した。1および10以外のオリゴデオキシヌクレオチド各々500ピコモルを、37℃で30分間、60 mM Tris−HCl、pH8、15mM DTT、10mM MgCl2、[γ−32p]−ATP20μCiおよびポリヌクレオチドキナーゼ(P/L Biochemicals)20ユニットを含有する溶液20μl中で別々にリン酸化した。続いて、60 mM Tris−HCl、pH8、15 mM DTT、10 mM MgCl2、1.5mM ATPおよび別のポリヌクレオチドキナーゼ20ユニットを含有する溶液10μlを添加し、その後、37℃で30分間、インキュベートした。インキュベートした後、試料を100℃で5分間、インキュベートした。オリゴデオキシヌクレオチド1および10の500ピコモルを、上記緩衝液からATPを除いた溶液30μl中で希釈した。
プラスミドpKK233−2(図4A;Amann,E.およびBrosius,J.,前出)を、NdeIを用いて完全に消化し、その後、Maniatisら、Molecular Cloning,Cold Spring Harbor Laboratories(1982),p.394の方法により、E.coli DNAポリマラーゼI、クレノウ断片(Boehringer−Mannheim,Inc.)5ユニットを用いて、末端を満たし、50 μMにdATP,dCTP,dGTPおよびTTPを添加した。得られた物質を25℃で20分間インキュベートした。フェノール/クロロホルム抽出およびエタノール沈澱に続いて、NdeIで消化したDNAを再連結させてE.coliに形質転換した(Nakamura,K.ら、J Mol Appl Genet(1982)1:289)。得られた、NdeI部位を欠いたプラスミドをpKK233−2−Nde(図4B)と命名した。
(プラスミドpTsF11の構築)
A.ヒト塩基性繊維芽細胞増殖因子をコードするcDNA配列の構築
参考のため援用されるPCT公報WO 87/01728;Abraham,J.A.ら,Science(1986),前出;およびAbraham,J.A.ら、The EMBO Journal(1986),前出に記載されているように、ハイブリダイゼーションプローブをつくるために、クローンλBB2中に含有されたウシ塩基性FGF cDNAを用いることにより、塩基性FGFクローンを、ヒトcDNAおよびゲノムライブラリーから単離した。
BB2クローン(ATCC NO.40196)を消化し、bFGFタンパク質をコードする配列にわたる1.4kbの領域を、M13mp8のEcoRI部位に連結した。そして、正しい方向に挿入物を有するファージを回収した。3個のオリゴヌクレオチド:「万能」プライマーである17−mer;コドン121においてコーディング配列を変更する変異誘発性の16−mer 5’−GAAATACACCAGTTGG−3’(配列番号11);コドン137において配列を変更する変異誘発性の17−mer 5’−ACTTGGATCCAAAACAG−3’(配列番号12)の存在下で1回目のインビトロ
変異誘発を実行した。その後、得られた、変異誘発されたファージを、プライマーで方向づけられた、2回目のインビトロ変異誘発にかけることにより、変異誘発性25−mer,5’TTTTACATGAAGCTTTATATTTCAG−3’(配列番号13)を用いて翻訳終止コドンから下流にHindIII部位34 bpを作成した。
pJJ15−1中に含有されるコーディング領域の5’末端(最初の125bp)のG+C含有量を低下させるために、連続する配列の上にリストアップされている合成オリゴヌクレオチドを用いて、下に示されている配列を有する合成DNA断片を構築した。オリゴヌクレオチドを対にアニーリングし、その対を順に連結し、HindIIIで切断されたM13mp9に連結した。M13mp9にクローニングした合成135bp挿入物の配列を、ジデオキシ配列分析により確認した。合成断片を有するM13mp9ファージの複製型を、HindIIIを用いて消化し、135bp断片を単離した。この断片を、HindIIIで切断されたpUC9に連結した。その後、得られたプラスミドをNdeIおよびHhaIを用いて消化し、合成挿入物の126bpサブ断片を単離した。この126bpのNdeIからHhaIのサブ断片を、JJ15−1からの377bpのHhaIからHindIIIのDNA断片に結合した。上記377bpのHhaIからHindIIIのDNA断片は塩基性FGFコーディング配列のほぼ4分の3にわたり、この部分は、カルボキシ末端である。その後、得られた物質を、発現ベクターpTrp−233のNdeIおよびHindIII部位に連結することにより、プラスミドpTsF11(図5A,5B)を得た。
(bFGFのためのpTsF−9Δβgal発現ベクターの生成)
trpプロモーター/オペレーターの制御下でbFGFを発現させるためのコピー数の多い発現ベクターを、以下の方法で調製した。この方法を図5に示す。E.coli中で機能する複製起点(ori)、アンピシリン耐性遺伝子、lacプロモーター/オペレーター、およびポリリンカー領域を含有するプラスミドpUC9(図5D;Vieira,J.およびMessing,J.,Gene(1982)19:259)を、PvuI(New England Biolabs)およびEcoRI(New England
Biolabs)を用いて、製造会社の指示に従って、3.25時間消化した。
DNAをインキュベートした。デオキシヌクレオシドトリホスフェートおよびDNAポリメラーゼIのクレノウ断片とともにDNAをインキュベートすることにより、EcoRIの開裂部位における突出部を満たした。T4 DNAリガーゼの存在下での平滑末端の連結により、DNAを再び円形にした。E.coli
Bをアンピシリン耐性に形質転換するために、連結反応を用いた。単一のコロニー形質転換体からのプラスミドDNAを、プラスミドサイズおよび制限分析によって分析することにより、図5FにおいてpTsF−9Δβgalと示されているプラスミドを単離した。満たしたEcoRI部位およびPvuII部位の平滑末端連結の結果、pTsF−9Δβgal中のEcoRI部位を回復させた。プラスミドpTsF−9Δβgalは、trpプロモーター/オペレーターの制御下のbFGFコーディング配列、アンピシリン耐性遺伝子およびE.coli中で機能する複製起点を含有する。
(bFGF(MAGS)をコードするDNA配列の生成)
pTsF11(trpプロモーター/オペレーター領域およびヒトのbFGFの155残基前駆体型をコードするDNAを含有する)の約590 bpのEcoRI−HindIIIDNA断片を、M13mp9のEcoRI−HindIII部位に連結することにより、プラスミドFGFt7910を構築した。FGFt7910の一本鎖DNAが単離されると、ZollerおよびSmith,前出に記載されているように、インビトロ変異誘発を実行した。上記インビトロ変異誘発は、ATG開始コドンによってコードされるメチオニンの直後の2つのアラニンのうちの1つのためのコドンを欠いた、bFGFのN末端の一部位をコーディングする合成オリゴヌクレオチドを用いて行った。この変異誘発の結果、以下に示すアラニン用のコドンのうちの1つが除去された。
hringer Mannheim)のクレノウ断片5ユニット、およびT4 DNAリガーゼ(New England Biolabs)20ユニットを含有する溶液0.01 mlを添加し、15℃で4−6時間インキュベートした。その後、反応液の一部(0.002 ml)を、競合するE.coli JM101細菌に添加し、37℃でL寒天皿上で一晩培養した。得られたM13プラークのDNAを、2つのニトロセルロースフィルターの各々に移し、80℃で減圧下で2時間焼成し、その後、42℃で2時間、プレハイブリダイゼーション溶液中でインキュベートした。プレハイブリダイゼーション溶液は、6×SSC(1×SSCは150
mM NaCl,15 mMクエン酸ナトリウム,pH7.0である),0.1%ドデシル硫酸ナトリウム(SDS)、2×デンハルツ(Denhardt’s)(0.04%フィコール、0.04%ポリビニルピロリドン、0.04%ウシ血清アルブミン)、および変性サケ精子のDNA0.4mg/mlを含有する。その後、[γ−32P]−ATPおよびT4ポリヌクレオチドキナーゼで標識された5’末端であった変異誘発性オリゴヌクレオチドを含有する新に調製したプレハイブリダイゼーション溶液を用いて、42℃で3時間、フィルターをインキュベートした。その後、フィルターを、4×SSCを用いて室温で15分間洗浄し、65℃で15分間一回洗浄し、室温でTMACl溶液(3Mテトラメチルアンモニウムクロライド、50 mM Tris−HCl、pH8.0、2 mM
EDTA、0.1%SDS)中で一回洗浄し、65℃でTMACl溶液中で一回洗浄し、その後、得られたフィルターを、X線フィルムを室温で一晩露光するために用いた。その後、X線フィルム上の暗い複写が陽性であるクローンを元の皿から取り出した。DNAを単離して、その後、ジデオキシ配列分析法によって、変異した配列を検出するために分析した。変異したM13クローンの複製型DNAを調製し、EcoRIおよびHindIIIを用いて消化し、変異した塩基性FGFをコードするDNA断片を、アガローゼゲル電気泳動によって単離した。この断片中の、bFGFコーディング領域の配列を図2に示す。
(bFGF(MAGS)のための発現ベクターの構築)
図6に示す方法に従って、bFGF(MAGS)をコードするDNA断片の挿入に適した発現ベクターを調製した。上記のプラスミドpTrp−233(図5A、図6A)を製造会社の指示に従ってEcoRIおよびPvuIを用いて消化し、trpプロモーター/オペレーターを含有する断片を単離した。同時に、EcoRIおよびPvuIを用いて、pUC9を消化し、複製起点を有する断片を単離した。単離した断片をT4 DNAの存在下で連結することにより、trpプロモーター/オペレーターおよびpTrp−233と複製起点とからのポリリンカー領域、lacプロモーター/オペレーターおよびpUC9からのポリリンカーを含有するプラスミドであるpTrp−9を生成した(図6C)。EcoRIおよびPvuIIを用いてpTrp−9を消化し、上記のように、DNAポリメラーゼI、クレノウ断片およびデオキシヌクレオシドトリホスフフェートを用いてEcoRI末端を満たした。T4 DNAリガーゼの存在下で平滑末端を連結することにより、DNAを再び円形にした。E.coli Bをアンピシリン耐性に形質転換するために、連結反応を用いた。単一コロニー形質転換体からのプラスミドDNAを、プラスミドサイズおよび制限分析によって分析することにより、pTsF−9Δβgal−GM−2(図6D)と示されたプラスミドを単離した。
l−GM−2の、単離した断片に連結した。競合するE.coli W3110細胞を形質転換するために連結を用い、その後、E.coli W3110細胞を、アンピシリン100 μg/mlを添加したL寒天皿上で一晩増殖させた。コロニーを選択して、アンピシリン100 μg/mlを添加したL肉汁中で増殖させ、その後、プラスミドDNAを細菌から単離して制限消化によって分析することにより、所望の構築を確認した。得られたプラスミドはpTsF−9Δβgal(MAGS)と命名されているが、これは、bFGFコーディング配列に代えてbFGF(MAGS)コーディング配列を含有する以外は、pTsF−9Δβgalと同一である。
(bFGFおよびbFGF(MAGS)の発現)
pTsF−9ΔβgalおよびpTsF−9Δβgal(MAGS)のプラスミドを別々にE.coliのB細胞に形質転換した。単コロニーを用いて培養物をL+amp培地に植え付けた後、30℃で5時間増殖させた。次にこれらの培養物を用いて発現培養物(0.5%のカサミノ酸(casamino acid)、0.4%のグルコース、2μg/mlのチアミン、0.1mMのCaCl2、0.8mMのMgSO4、および50μg/mlのアンピシリンを含有するM9塩に1から100倍に希釈したもの)を接種した。50μg/mlの3−β−インドールアクリル酸を添加して、trpプロモーターを誘導して、培養物を一夜30℃で増殖した。14から18時間後に、A550を測定して、1単位吸光度の細胞ペレットを100μlのSDS含有ポリアクリルアミドゲル負荷用緩衝液に再懸濁して、煮沸した。得た10μlの上清を15%のアルクリアミド−SDSゲルに負荷して、電気泳動にかけた。ゲルをクーマシーブルーで染色した。図7は、レーン1に分子量マーカーを伴った染色したゲルの写真である。レーン2および3に、pTsF−9Δβgal形質転換細胞の2つの培養物から抽出したタンパク質を負荷した。レーン4および5に、pTsF−9Δβgal(MAGS)形質転換細胞の2つの培養物から抽出したタンパク質を負荷した。レーン6は、bFGF標準を含有する。レーン4および5のbFGF(MAGS)に対応するバンドは、レーン2および3のbFGFに対応するバンドより視覚的に暗い。
(bFGF(MAGS)のN末端配列の決定)
実施例6と同様の手順により、pTsF−9Δβgal(MAGS)で形質転換されたE.coliB細胞をカサミノ酸および50μg/mlのアンピシリンを含有するM9培地2リットルで増殖した。培養物を光学濃度が0.58(550nmで測定)になるまで増殖し、50μg/mlの3−β−インドールアクリル酸で誘導し、その後振盪させながら一夜30℃でインキュベートした。培養物を遠心分離機にかけ、細胞ペレットを、20mMのTris−HCl、pH7.5、5mMのEDTA、1mMのフェニルメチルスルフォニルフルオライド、および0,5mg/mlのリゾチーム含有溶液30mlに再懸濁した。氷の上に30分置いた後、上清に超音波をあてて細胞を破砕した。RNアーゼおよびDNアーゼを各100μg添加した。氷の上に30分置いた後、混合物を遠心分離機にかけ、上清を精製のため取り除いた。
SP−セファデックスカラムから500mMのNaClをぬいて、20mMのTris−HCL、pH7.5、5mMのEDTA、600mMのNaClで平衡化したヘパリン−セファロースのカラム(2.5cm×2cm)に負荷した。カラムを、280nmでの吸光度が基準レベルに戻るまで同じ緩衝液で洗浄した。タンパク質を20mMのTris−HCl、pH7.5、5mMのEDTA、2MのNaClで溶離させた。
このようにして得られたbFGF(MAGS)を自動ガス相シークエネーターを用いてエドマン分解法によりN末端アミノ酸配列を分析した。多量のタンパク質をシークエネーターに負荷すると、極少量の、すなわち1〜2%の、N末端配列Gly−Ser−を有するタンパク質が検出され、残りは、N末端配列Ala−Gly−Serを有するタンパク質であった。bFGFをpTsF−9Δβgalで形質転換されたE.coliB細胞を用いて、本質的に同様の方法で生産して精製すると、得られたタンパク質は約70%のAla−Ala−Gly−Ser−および30%のAla−Gly−Ser−を含有する混合N末端配列を示した。
(配列表)
Claims (3)
- 配列番号6に示す配列からなるポリペプチド。
- 請求項1に記載のポリペプチドを含む組成物。
- 請求項1に記載のポリペプチドと薬学的に受容可能なキャリアとを含む薬学的組成物。
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