JP2024506022A - 多機能性抗体 - Google Patents
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Abstract
本発明は、構造(1)または(2)の、少なくとも1つの抗体Abと、2つの別個のペイロードD1およびD2と、を含む多機能性抗体構築物に関する。本発明に係る多機能性抗体構築物は、癌、ウイルス感染症、細菌感染症、神経疾患、自己免疫疾患、眼疾患、高コレステロール血症およびアミロイドーシスの治療における使用などの、医薬における使用に適している。(式中、L1、L2、L3、L4およびL5は、リンカーであり;x1およびx2は、それぞれ個別に1~8の範囲の整数であり、x1+x2=2~10であり;BMは、分枝部分であり;mおよびnは、それぞれ独立して、0または1であり;x3は、1~4の範囲の整数であり;D1およびD2は、ポリペプチド、小分子、細胞毒およびオリゴヌクレオチドからなる群から選択される2つの別個のペイロードであり、D1およびD2のうちの少なくとも1つは、ポリペプチドである。)TIFF2024506022000093.tif31149【選択図】なし
Description
[発明の分野]
[0001]本発明は、複数の機能を有する抗体に関する。より具体的には、本発明は、2つ(またはそれ以上)の機能性部分が、結合の前に抗体の遺伝子操作を必要とせずに抗体に結合している構築物および組成物に関し、その機能性部分は、細胞毒、ポリペプチドまたは他のペイロードを含み得る。得られた多機能性抗体構築物は、例えば、治療法において有用であり得る。
[0001]本発明は、複数の機能を有する抗体に関する。より具体的には、本発明は、2つ(またはそれ以上)の機能性部分が、結合の前に抗体の遺伝子操作を必要とせずに抗体に結合している構築物および組成物に関し、その機能性部分は、細胞毒、ポリペプチドまたは他のペイロードを含み得る。得られた多機能性抗体構築物は、例えば、治療法において有用であり得る。
[発明の背景]
[0002]慎重に選択された生物学的受容体に対するタンパク質リガンドとしてのモノクローナル抗体は、疾患領域または特定の病原体に対する選択的インビボ標的化のための理想的な送達プラットフォームを提供する。抗体(リガンドとしても知られる)は、低分子タンパク質フォーマット(scFv、Fabフラグメント、DARPin、アフィボディなど)であり得るが、一般に、所与の抗原に対する高い選択性および親和性、長い循環半減期、ならびに免疫原性がほとんどまたは全くないことに基づいて選択されたモノクローナル抗体(mAb)である。例えば、特定の癌関連抗原と選択的に結合すると知られているモノクローナル抗体は、結合、内部移行、細胞内プロセシング、および最終的には活性な異化産物の放出を介して、化学的にコンジュゲートされた細胞傷害剤を腫瘍に送達するために使用することができる。細胞傷害剤は、小分子毒素、タンパク質毒素、またはオリゴヌクレオチドのような他のフォーマットであり得る。結果として、抗体によって標的化されていない正常細胞を残しながら、腫瘍細胞を選択的に根絶することができる。同様に、抗体への抗菌薬(抗生物質)の化学的コンジュゲーションは、細菌感染症の治療に適用することができ、抗炎症薬のコンジュゲートは、自己免疫疾患の治療のために研究中であり、例えば、抗体へのオリゴヌクレオチドの結合は、神経筋疾患を治療するための有望な潜在的アプローチである。ゆえに、最適な特定の細胞位置への活性な薬学的薬物の標的化送達の概念は、同じ薬物の全身送達と比べて多くの有益な態様を有する、広範囲の疾患の治療のための強力なアプローチである。
[0002]慎重に選択された生物学的受容体に対するタンパク質リガンドとしてのモノクローナル抗体は、疾患領域または特定の病原体に対する選択的インビボ標的化のための理想的な送達プラットフォームを提供する。抗体(リガンドとしても知られる)は、低分子タンパク質フォーマット(scFv、Fabフラグメント、DARPin、アフィボディなど)であり得るが、一般に、所与の抗原に対する高い選択性および親和性、長い循環半減期、ならびに免疫原性がほとんどまたは全くないことに基づいて選択されたモノクローナル抗体(mAb)である。例えば、特定の癌関連抗原と選択的に結合すると知られているモノクローナル抗体は、結合、内部移行、細胞内プロセシング、および最終的には活性な異化産物の放出を介して、化学的にコンジュゲートされた細胞傷害剤を腫瘍に送達するために使用することができる。細胞傷害剤は、小分子毒素、タンパク質毒素、またはオリゴヌクレオチドのような他のフォーマットであり得る。結果として、抗体によって標的化されていない正常細胞を残しながら、腫瘍細胞を選択的に根絶することができる。同様に、抗体への抗菌薬(抗生物質)の化学的コンジュゲーションは、細菌感染症の治療に適用することができ、抗炎症薬のコンジュゲートは、自己免疫疾患の治療のために研究中であり、例えば、抗体へのオリゴヌクレオチドの結合は、神経筋疾患を治療するための有望な潜在的アプローチである。ゆえに、最適な特定の細胞位置への活性な薬学的薬物の標的化送達の概念は、同じ薬物の全身送達と比べて多くの有益な態様を有する、広範囲の疾患の治療のための強力なアプローチである。
[0003]特定のタンパク質作用物質の標的化送達のためにモノクローナル抗体を使用する代替ストラテジーは、組換えDNA技術による抗体への後者のタンパク質の遺伝的融合、例えば、軽鎖もしくは重鎖(またはその両方)のN末端もしくはC末端、または2つの抗体ドメイン間での遺伝的融合によるものである。この場合、目的の生物学的に活性なタンパク質、例えば、シュードモナス外毒素A(PE38)のようなタンパク質毒素または抗CD3一本鎖可変フラグメント(scFv)は、場合によってはペプチドスペーサーを介してであるが必ずしもそうではない、抗体との融合物として遺伝的にコードされるので、その抗体は、融合タンパク質として発現される。ペプチドスペーサーは、プロテアーゼ感受性の切断部位を含んでいてもよいし、含んでいなくてもよい。
[0004]モノクローナル抗体はまた、タンパク質配列自体において遺伝子改変されることにより、その構造が改変され得、それによって特定の特性が導入(または除去)され得る。例えば、Fc-ガンマ受容体への結合を無くす(nihilate)ために抗体Fcフラグメントに変異を作ることができるか、FcRn受容体への結合もしくは特定の癌標的への結合を調節することができるか、またはpIを低下させ、循環からのクリアランス速度を制御するように抗体を操作することができる。
[0005]治療上の処置における新たなストラテジーは、参照により援用されるKontermann and Brinkmann,Drug Discov.Today 2015,20,838-847に要約されているように、複数の抗原またはエピトープに同時に結合することができる抗体、いわゆる二重特異性抗体(2つの異なる抗原またはエピトープに同時に対処する)または三重特異性抗体(エピトープの3つの異なる抗原に対処する)などの使用を含む。「2標的」機能を有する二重特異性抗体は、例えば、癌、増殖または炎症過程に関連する複数の表面受容体またはリガンドを干渉し得る。二重特異性抗体はまた、1つの細胞上でのタンパク質複合体形成を支援するために、または細胞間の接触を引き起こすために、標的を近接して配置することができる。「強制接続」機能の例は、凝固カスケードにおけるタンパク質複合体形成を支持する二重特異性抗体、または腫瘍によって標的化される免疫細胞動員因子および/もしくは活性化因子である。二重特異性抗体は、作製方法および構造に応じて、抗原結合部位の数、幾何形状、血清中の半減期およびエフェクター機能が異なる。この点において、二重特異性は、二価と混同されるべきではなく、二価は、対称的なIgGが2つの同一のCDRのそれぞれを介して同時に2つの同一の標的に結合できることを指す。
[0006]二重特異性抗体または三重特異性抗体はまた、さらなる機能、例えば、細胞傷害剤、ポリペプチドサイトカイン、オリゴヌクレオチド、抗生物質または抗ウイルス剤を含み得る。これにより、二重特異性抗体が三機能性分子に、三重特異性抗体が四機能性分子に効果的に変換されるなどする。多機能性抗体における異なる機能はそれぞれ、結合、シグナル伝達、免疫細胞結合、エフェクター機能の誘導、チェックポイント阻害、細胞活性化、細胞のダウンレギュレーション、細胞殺滅、遺伝子サイレンシング、遺伝子活性化を含むがこれらに限定されない特異的な生物学的機能を有する。異なる機能は、特異的な生物学的応答を誘導するように独立して作用することができるか(相加効果)、またはそれらの活性を相互に増強することができる(相乗効果)。
[0007]参照により援用される、Kontermann and Brinkmann,Drug Discov.Today 2015,20,838-847およびYu and Wang,J.Cancer Res.Clin.Oncol.2019,145,941-956によって要約されるように、多機能性抗体のための広範囲の種々のフォーマットが長年にわたって開発されており、これはIgG様(Fcフラグメントを有する)フォーマットと非IgG様(Fcフラグメントを欠く)フォーマットとに大別することができる。ほとんどの二重特異性抗体は、2つのハイブリドーマ株の体細胞融合(クワドローマ)、遺伝子(タンパク質/細胞)工学、または架橋剤を用いた化学的コンジュゲーションによる3つの方法のうちの1つによって作製され、今日では合計60を超える種々の技術プラットフォームがある。
[0008]完全IgG分子構造に基づくIgG様フォーマットとしては、二重可変ドメイン(DVD-Ig)を有するIgG、Duobody技術、ノブインホール(KIH)技術、一般的な軽鎖技術およびクロスmAb技術が挙げられるがこれらに限定されず、切断型IgGバージョンには、ADAPTIR、XmAbおよびBEAT技術が含まれる。非IgG様アプローチとしては、BITE、DART、TandAbおよびImmTAC技術が挙げられるが、これらに限定されない。二重特異性抗体または三重特異性抗体はまた、異なる抗原結合部分(例えば、scFvまたはFab)を他のタンパク質ドメインに融合することによって作製することもでき、これによりさらなる機能を含めることが可能になる。例えば、2つのscFvフラグメントがアルブミンに融合され、これにより、参照により援用されるMuller et al.,J.Biol.Chem.2007,282,12650-12660によって実証されているように、それらの抗体フラグメントに長い血清アルブミンの循環時間が付与される。別の例は、参照により援用されるRossi et al.,Proc.Nat.Acad.Sci.2006,103,6841-6846によって報告されているように、cAMP依存性プロテインキナーゼAおよびプロテインAキナーゼアンカータンパク質のヘテロ二量体化に基づく「ドックアンドロック」アプローチである。Rossi et al.,Bioconj.Chem.2012,23,309-323によって示されているように、これらのドメインをFabフラグメントおよび抗体全体に連結して、多価の二重特異性抗体を形成することができる。ドックアンドロックストラテジーには、プロテインAキナーゼアンカータンパク質上にドッキングするために標的化抗体とペプチドフラグメントとの間の融合タンパク質の作製が必要である。治療用Abフラグメント(scFv、ダイアボディ)はまた、アルブミンまたはアルブミンに結合するタンパク質と融合され得、これにより、血液中の薬物の半減期が最大5~6倍増加する。そのような分子の構築は、予測不可能な結果をもたらし、それにより、異なるAbフラグメントの融合または他のタンパク質へのAbの結合の結果として作製される二重特異性抗体は、新しい治療分子の研究開発における適用が制限されている。
[0009]この意味で一般的に用いられるわけではないが、対称的なY字型IgG抗体はいずれも、そのFcドメインに複合体N-グリカンを有する場合には、二重特異性抗体と見なすことができるだろう。そのような抗体は、(a)そのポリペプチド補体依存性領域(CDR)を介して特異的抗原に、ならびに(b)そのN-グリカンを介してCD64、CD32およびCD16としても知られる様々なFc-ガンマ受容体I、IIおよびIIIに同時に結合することができる。例えば、トラスツズマブは、癌細胞上のHER2抗原に結合する抗体であって、エフェクター機能、すなわち抗体依存性細胞傷害(ADCC)、抗体依存性細胞食作用(ADCP)および補体依存性細胞傷害(CDC)(これらはすべて、その複合体N-グリカンが特定のタンパク質または受容体に結合することによってプライミングされる)によってその生物学的効果を(少なくとも部分的に)発揮する抗体である。同様に、任意の二重特異性抗体が、(a)2つの異なる特異的抗原(またはエピトープ)および(b)免疫細胞受容体(そのグリカン)に結合することができる場合、それらを三重特異性と見なすことができる。例えば、カツマキソマブは、細胞表面受容体EpCamとCD3とに同時に結合することができ、そのため、二重特異性抗体である公知の抗体である。それにもかかわらず、カツマキソマブは、抗体Fc部分に結合したその複雑なN-グリカンのおかげでNK細胞上のCD16に同時に結合できることに起因して三重特異性抗体と呼ばれることが多い。誤解を避けるために、二重特異性抗体は、抗体がそのFc領域において、Fc-ガンマ受容体へのN-グリカンの結合を無くすように変異されているか、またはN-グリカンの完全な除去などの別の手段によってFcサイレントにされている場合、決して三重特異性とは見なされない。
[0010]真の意味における多機能性抗体、すなわちFc-グリカンの結合のことを指さず、同時に複数の標的に結合するCDRを有することを指す多機能性抗体は、当該分野で公知であり、例えば、参照により援用されるWu et al.Nature Cancer 2020,1,86-98には、CD38、CD3およびCD28に結合する三重特異性三機能性融合IgG抗体が記載されている。同様に、CDR-Life(https://www.cdr-life.com/science/#pipeline)は、BCMA、PD-L1およびCD3を標的とする三重特異性三機能性抗体を開発中である。Numab Therapeutics(www.numab.com)は、PD-L1、HER-2、CD-3およびHSAに結合する四価四機能性抗体を報告した。
[0011]二重特異性三機能性抗体も当該分野で公知であり、例えば、Affimed(www.affimed.com)は、2つの異なる抗原(例えば、CD200およびBCMA)ならびにCD16に結合することができる抗体に基づくaTriFlex技術を開発した。同様に、GT Biopharmaも、参照により援用されるVallera et al.Clin.Cancer Res.2016,22,3440-3451によって記載されているように、サイトカイン(IL-15)に融合した2つの抗体フラグメント(抗CD33および抗CD16)の融合に基づく二重特異性三機能性タンパク質を開発中である。IL-15に融合したB7-H3およびCD16に結合する類似の三機能性構築物は、参照により援用されるVallera et al.Cancers 2020,12,2659-2677に記載されている。例えば、参照により援用されるLi et al.,Cancer Cell 2016,29,117-129によってMEDI4276について報告されているような、二重特異性三機能性抗体-薬物コンジュゲートも当該分野で公知である。二重特異性三機能性抗体-薬物コンジュゲートの別の例は、Zymeworks(www.zymeworks.com)によって開発されたZW49であり、これは、HER-2上の2つの異なるエピトープを標的とし、アウリスタチンペイロードにコンジュゲートされた二パラトープ抗体に基づく。第3の例は、Merck-Seronoによって開発された、MUC-1およびEGFRを標的とし、ヘミアステリン細胞傷害性ペイロードにコンジュゲートされた、二重特異性抗体であるM1231である。
[0012]本明細書では、Fc-ガンマ受容体にも結合できる任意の単一特異性IgG抗体を、単一特異性二機能性と呼び、二重特異性抗体を二重特異性三機能性と呼ぶ。同じ理由で、Fcサイレントである単一特異性または二重特異性IgG抗体を、それぞれ単一特異性単機能性抗体または二重特異性二機能性抗体と呼ぶ。サイトカイン、オリゴヌクレオチドまたは細胞傷害性ペイロードにコンジュゲートされた(任意のタイプの)単一特異性抗体を、二機能性と呼び、サイトカイン、オリゴヌクレオチドまたは細胞傷害性ペイロードにコンジュゲートされた二重特異性IgG抗体を、三機能性と呼ぶ。2つの異なる小分子、2つの異なるオリゴヌクレオチドもしくは2つの異なるペプチドフラグメント、またはこれらの組み合わせが共有結合している単一特異性抗体は、単一特異性三機能性と呼ばれる。
[0013]非IgG型二重特異性抗体を作製するための化学的コンジュゲーションは、参照により援用されるBrennan et al.,Science 1985,229,81-83によって初めて使用された:ウサギIgGのペプシノリシスによって得られた2つのFab2フラグメントを還元し、次いで酸化して、二重特異性Fab2を得た。同様に、システイン残基と相互作用するホモ二機能性試薬およびヘテロ二機能性試薬が、参照により援用されるGlennie et al.1987,139,2367-2375によって報告された。参照により援用されるGall et al.,Exp.Hematol.2005,33,452-459によって示されるように、CD3およびCD20(リツキシマブ)に対するAbの化学的コンジュゲーションを使用して、二重特異性抗体でコーティングされた表面を有するT細胞を得た。二重特異性CD20×CD3の作製は、OKT3(抗CD3)をTraut試薬で処理した後、マレイミド官能化リツキシマブ(リツキシマブをスルホスクシンイミジル4-(N-マレイミドメチル)シクロヘキサン-1-カルボキシレート(スルホ-SMCC)で前処理することによって得られる)と混合することによって確実にした。両方の抗体のランダムな化学的コンジュゲーションの後のランダムなヘテロ二量体化のおかげで、二重特異性抗体は、必然的に、非常に不均一な混合物(多量体も含む)として得られる。これまでに報告された、部位特異的でもある唯一の化学的方法は、参照により援用されるDoppalapudi et al.,Bioorg.Med.Chem.Lett.2007,17,501-506によって報告されたCovX-Body技術であり、これは、アルドラーゼ触媒抗体部位を標的化抗体に設置した後、アゼチジノンモチーフで化学修飾されたペプチドフラグメントで処理して、自発的なライゲーションをもたらすことに基づく技術である。二重特異性抗体は、参照により援用されるDoppalapudi et al.,Proc.Nat.Acad.Sci.2010,107,22611-22616によって報告されているように、VEGFまたはアンジオポエチン2を阻害する2つの短いペプチドを分枝状リンカーに付加し、さらにAbに付加することによって作製された。
[0014]今日の化学的AbまたはAbフラグメントコンジュゲーションに基づく二重特異性抗体作製のフォーマットは、特に(低純度の)生成物の収率が低いこと、および商品原価が高いことに起因して使用されていない。さらに、組換えDNA技術の進歩により、融合タンパク質の効率的な作製が可能になり、それによって肯定的な臨床結果が得られた。それにもかかわらず、非遺伝的化学修飾アプローチは、化学量論の部位特異性の適切な制御を保証できる場合には、臨床までの時間を有意に加速することができるだろう。
[0015]臨床開発されたまたは現在臨床開発中の二重特異性抗体(これらはすべてFcサイレントであり、したがって二機能性でもある)の例は、ブリナツモマブ(CD19×CD3)、GBR1302(Her2×CD3)、MEDI-565(CEA×CD3)、BAY2010112(PSMA×CD3)、RG7221(アンジオポエチン×VEGF)、RG6013(FIX×FX)、RG7597(Her1×Her3)、MCLA128(Her2×Her3)、MM111(Her2×Her3)、MM141(IGF1R×Her3)、ABT122(TNFアルファ×IL17)、ABT981(IL1a×Il1b)、ALX0761(IL17A×IL17F)、SAR156597(IL4×IL13)、AFM13(CD30×CD16)およびLY3164530(Her1×cMET)である。
[0016]癌治療の分野で一般的なストラテジーは、アップレギュレートされた腫瘍関連抗原(TAAまたは単に標的)に結合する1つのCDRと、癌を破壊する免疫細胞(例えば、T細胞またはNK細胞)上に存在する受容体に結合する1つのCDRとを含む二重特異性抗体の使用を使用する。そのような二重特異性抗体は、それぞれT細胞またはNK細胞リダイレクト抗体としても知られている。免疫細胞をリダイレクトするアプローチは、すでに30年以上前のものであるが、新しい技術は、第1世代の免疫細胞リダイレクト抗体の限界を克服しつつあり、特に、間欠投与を可能にする半減期の延長、免疫原性の低減、安全性プロファイルの改善をしつつある。現在、承認された薬物が1つあり(ブリナツモマブまたはBlincyto(登録商標))、30を超える他の二重特異性フォーマットが様々な臨床開発段階にある。
[0017]重篤な疾患のための他の治療方法と同様に、治療用の二重特異性抗体は、種々の副作用を引き起こし、その最も一般的なものは、悪心、嘔吐、腹痛、疲労、白血球減少、好中球減少および血小板減少である。多くの患者において、治療用の二重特異性抗体に対するAbが、治療中に血液中に現れる。ほとんどの有害事象は、治療の初期に起こり、ほとんどの場合、副作用は、継続的な治療下で正常化する。治療用BsAbの有害作用に関するデータの大部分は、ブリナツモマブおよびカツマキソマブで入手可能であるが、これはこれらの薬物が多数の臨床試験を経ているためである。ブリナツモマブおよびカツマキソマブ療法の一般的な副作用は、サイトカインレベルの上昇である「サイトカインストーム」およびいくつかの神経学的事象である。サイトカイン放出に関連する症状は、多くの治療用mAbの一般的な副作用であり、特定の作用機序:エフェクターとしての細胞傷害性T細胞の使用に起因して生じる。サイトカイン放出症候群の最小化は、その後の高用量、ならびにコルチコステロイド(デキサメタゾン)および抗ヒスタミン剤の前投薬と組み合わせて低初回量の薬物を用いることにより可能である。
[0018]免疫細胞関与療法に関連する有害事象、特にサイトカイン放出症候群を軽減する1つの方法、および漸増投薬レジメンの使用を回避する1つの方法が、参照により援用されるBacac et al.,Clin.Cancer Res.2018,24,4785-4797によって報告された。有意により高い効力およびより安全な投与が、2:1の分子フォーマット、すなわち、CD20への二価結合およびCD3への一価結合を有するCD20×CD3 T細胞エンゲージャーを作製することによって達成され得、これは、完全IgG抗CD20抗体のFabアームの1つに抗CD3フラグメントを挿入することによって達成されることが示された。得られる二重特異性抗体は、CD20への高アビディティー二価結合ならびに2:1分子フォーマットのB細胞結合ドメインおよびT細胞結合ドメインのヘッドトゥーテール配向によって可能にされる長い半減期および高い効力に関連する。「PG LALA」変異を有するヘテロ二量体ヒトIgG1 Fc領域を組み込むことにより、新生児型Fc受容体(FcRn)結合を維持しながら、Fcg受容体および補体成分C1qへの結合を消失させて、長い循環半減期が可能になった。二重特異性CD20-T細胞エンゲージャーは、臨床開発において他のCD20-TCB抗体よりもかなり高い効力を示し、低レベルのCD20を発現する腫瘍細胞に対して有効である。CD20-TCBはまた、低いエフェクター:標的比を有する原発腫瘍サンプルにおいて強力な活性を示す。
[0019]T細胞関与の目的でこれまでに最も研究されている受容体には、活性化T細胞上のCD3受容体が含まれる。T細胞リダイレクト二重特異性抗体は、癌治療において最も使用されているアプローチの1つであり、二重特異性抗体が一方ではT細胞上のCD3と特異的に会合し、他方ではT細胞受容体(TCR)とは無関係の癌細胞の抗原と特異的に会合した最初の報告が30年前に発表された。T細胞リダイレクト抗体は、過去10年間に血液悪性腫瘍および固形腫瘍の治療においてかなりの進歩を遂げてきた。カツマキソマブは、上皮細胞接着分子(EpCAM)およびCD3を標的とする同種類の最初の二重特異性抗体であり、これは、そのグリカンを介してCD16にも結合するので、実際には三重特異性である。カツマキソマブは、悪性腹水の治療に対して欧州(2009)で承認された(しかし、商業的理由により2017年に撤退した)。この発見に続いて、別のCD19およびCD3の二重特異性標的化が成功し(ブリナツモマブ)、これは2014年に再発性または難治性の前駆B細胞急性リンパ芽球性白血病(ALL)の治療に対してFDAによって販売許可を与えられた。現在、多くの患者が、ブリナツモマブから恩恵を受けているが、臨床試験において潜在的な抗腫瘍有効性を示す異なるフォーマットおよび特性を有するT細胞リダイレクト抗体がいくつか存在する。
[0020]T細胞に結合すると知られている抗体が、当該分野で知られており、Martin et al.,Clin.Immunol.2013,148,136-147およびRossi et al.,Int.Immunol.2008,20,1247-1258(両方とも参照により援用される)によって強調されており、例えば、OKT3、UCHT3、BMA031およびそれらのヒト化バージョンである。Vγ9Vδ2 T細胞に結合すると知られている抗体も知られている。例えば、参照により援用されるde Bruin et al.,J.Immunol.2017,198,308-317を参照のこと。
[0021]T細胞を腫瘍にリダイレクトするという概念は、現在、同時に共刺激性である他の受容体、例えば、CD28、CD137(4-1BB)、CD134(OX40)、CD27またはICOSにまで拡大されている。
[0022]T細胞の関与と同様に、腫瘍微小環境へのNK細胞の動員が広範に調査されている。NK細胞の関与は、参照により援用されるKonjevic et al.,2017,http://dx.doi.org/10.5772/intechopen.69729に要約されているように、通常、CD16、CD56、NKp46または他のNK細胞特異的受容体への結合に基づく。NK細胞エンゲージャーは、腫瘍関連抗原に結合する完全IgGへのNK結合抗体(フラグメント)の融合または挿入によって作製することができる。あるいは、NK細胞の抗腫瘍活性が数多くの活性化NK細胞受容体および阻害性NK細胞受容体によって制御されることを考えると、特異的なサイトカインを使用することもでき、NK細胞受容体発現およびシグナル伝達の変化が細胞傷害性NK細胞機能の低下の根底にある。このことに基づいて、また、予測的なインビトロでの知見に基づいて、IFNα、IL-2、IL-12、IL-15およびIL-18を含むサイトカインが、全身的に、またはNK細胞のエクスビボでの活性化および拡大のために使用されており、NK細胞活性化受容体の発現を増大させることによって、および細胞傷害性エフェクター分子を誘導することによって、改善されたNK細胞抗腫瘍活性をもたらした。さらに、このサイトカインベースの治療は、NK細胞の増殖および調節機能を増強し、改善されたNK細胞の活性および長寿命を有する新たに定義されたNK細胞サブセットに相当する、サイトカイン誘導性メモリー様特性を示すNK細胞を誘導することが示されている。癌の治療と慢性炎症の治療の両方のために、いくつかのサイトカインペイロードが開発され、前臨床試験において試験されている。IL-2、TNFおよびIL-12などの炎症促進性サイトカインは、腫瘍部位での白血球の局所浸潤を増加させ、活性化することが見出されているので、腫瘍療法について調査されている。例えば、IL-2単独療法は、アルデスロイキン(Proleukin(登録商標))として承認されており、ニボルマブ(NKTR-214)と組み合わせた第III相臨床試験中である。同様に、IL-15の様々な組換えバージョンが、臨床評価段階にある(rhIL-15またはALT-803)。IL-15の具体的な変異体は、例えば、Behar et al.,Prot.Engin.Des.Sel.2011,24,283-290およびSilva et al.,Nature 2019,565,186-191(両方ともが参照により援用される)によって報告されており、Rubinstein et al.,Proc.Nat.Acad.Sci.2006,103,9166-9171(参照により援用される)によって報告されているような、IL-15とIL-15受容体(IL-15R)との複合体、およびIL-15とIL-15R(Sushiドメイン)との融合構築物も、抗腫瘍活性(例えば、参照により援用されるBessard et al.,Mol.Canc.Ther.2009,8,2736-2745を参照のこと)について評価されている。さらに、例えば、Boyman et al.,Science 2006,311,1924-1927、Arenas-Ramirez et al.,Sci.Transl.Med.2016,8,DOI:10.1126/scitranslmed.aag3187、Lee et al,Oncoimmunology 2020,9,e1681869,DOI:10.1080/2162402X.2019.1681869、国際公開第2017070561号、国際公開第2018217058号、国際公開第2016005950号(すべて参照により援用される)によって報告されているように、最も好都合には通常IL-2Rαに結合するIL-2ドメインに結合することによって内因性のIL-2を動員し、それにより、Tregの活性化を伴わずにCD8+T細胞の選択的活性化をもたらす抗体が開発されている。対照的に、IL-10などの免疫抑制性サイトカインは、慢性炎症状態または他の疾患(例えば、子宮内膜症)の治療のためのペイロードと見なされ得る。
[0023]炎症促進性サイトカインの全身投与は、重度のオフターゲット関連有害作用をもたらすことがあり、それにより、用量が制限され、治療的に有効なレジメンへの段階的な拡大が妨げられることがある。ある特定のサイトカイン産物(例えば、IL-2、TNF、IL-12)は、1桁のミリグラム範囲(1人あたり)またはそれ未満の推奨用量を示している。炎症促進性サイトカインの静脈内投与に関連する有害作用には、低血圧、発熱、悪心またはインフルエンザ様症状が含まれ得、時折、重篤な血液学的事象、内分泌事象、自己免疫事象または神経学的事象も引き起こし得る。これらの考慮すべき事柄に照らすと、参照により援用されるMurer and Neri,New Biotechnol.2019,52,42-53に要約されているように、より良好に耐容され、疾患部位で優先的な作用を示し、正常組織を温存するのに役立つ、「次世代」サイトカイン製品の開発に対する明確な生物医学的必要性がある。したがって、腫瘍へのサイトカインの標的化送達は、免疫細胞を活性化および動員し得る局所的な炎症促進性環境を誘導することを目的とする。上記文献に記載されている抗体-サイトカイン融合物のリストは、参照により援用されるHutmacher and Neri,Adv.Drug Deliv.Rev.2018,141,67-91によって報告されている。臨床用のサイトカイン融合物のリストは、参照により援用されるMurer and Neri,New Biotechnol.2019,52,42-53に記載されている。様々なIL-15融合タンパク質が、参照により援用されるLa Merie publishingによって公表された“T-cell&NK-Cell Engaging Bispecific Antibodies 2019:A Business,Stakeholder,Technology and Pipeline Analysis”,2019に要約されているように、前臨床評価中であり、例えば、Trike技術によって調製されたOXS-3550(CD33-IL-15-CD16融合物)は、現在、第I相にある。
[0024]免疫細胞関与の分野における一般的なストラテジーは、Fc-ガンマ受容体に対する抗体の結合能の無効化(nihilation)または除去を使用し、これは複数の薬学的意味を有する。Fc-ガンマ受容体への結合の除去の第1の結果は、例えば、マクロファージまたは巨核球による、抗体のFc-ガンマ受容体媒介性取り込みの減少であり、これは、例えばKadcyla(登録商標)(トラスツズマブ-DM1)およびLOP628について報告されているように用量制限毒性をもたらし得る。インビボでの抗体の選択的な脱グリコシル化は、抗体媒介性自己免疫を有する患者を治療する機会を与える。高マンノースグリコフォームは、例えば、Gorovits and Krinos-Fiorotti,Cancer Immunol.Immunother.2013,62,217-223およびGoetze et al,Glycobiology 2011,21,949-959(いずれも参照により援用される)に記載されているように、内在性のマンノース受容体による非特異的な取り込みおよび迅速なクリアランスに至ることよって治療効果を損なうと知られているので、治療用の組換え糖タンパク質中の高マンノースグリコフォームを除去することは有益であり得る。さらに、Van de Bovenkamp et al,J.Immunol.2016,196,1435-1441(参照により援用される)には、高マンノースグリカンがどの程度免疫に影響を及ぼし得るかが記載されている。Reusch and Tejada,Glycobiology 2015,25,1325-1334(参照により援用される)により、モノクローナル抗体における不適当なグリコシル化が、発現されたIg遺伝子からの無効な産生に寄与し得ることが記載された。
[0025]免疫療法の分野では、免疫細胞上のFc-ガンマ受容体へのグリコシル化抗体の結合は、抗体が腫瘍関連抗原に結合する前に免疫系の全身活性化を誘導することがあり、それにより、サイトカインストーム(サイトカイン放出症候群、CRS)がもたらされ得る。ゆえに、CRSのリスクを低下させるために、臨床における免疫細胞エンゲージャーの大部分は、Fc-ガンマ受容体に結合する能力を欠いている、Fcがサイレンシングされた抗体に基づいている。さらに、二重特異性抗体の分野の様々な企業は、標的結合抗体ドメイン対免疫細胞結合抗体ドメインに関して、定義された比で分子構造を調整している。例えば、Rocheは、両方のCDRによってTAA(例えば、CD20またはCEA)に対する二価結合能を保持するが2つの重鎖の一方のみに操作された追加の抗CD3フラグメントを有する非対称モノクローナル抗体に基づくT細胞エンゲージャーを開発している(2:1の比の標的結合:CD3結合)。同様のストラテジーを、抗CD137(4-1BB)、抗OX40、抗CD27によるT細胞の結合/活性化、または抗CD16、CD56、NKp46もしくは他のNK細胞特異的受容体によるNK細胞の結合/活性化のために使用することができる。
[0026]Fc-ガンマ受容体への結合の回避は、様々な方法で、例えば、抗体(具体的にはFcフラグメント)における特異的変異によって、またはFcフラグメント(CH2ドメイン、N297付近)に天然に存在するグリカンの除去によって、達成することができる。グリカンの除去は、Fcドメインにおける遺伝的改変、例えば、N297Q変異もしくはT299A変異によって、または抗体の組換え発現後のグリカンの酵素的除去によって、例えば、PNGase Fもしくはエンドグリコシダーゼを使用して、達成することができる。例えば、エンドグリコシダーゼHは、高マンノース型およびハイブリッド型のグリコフォームをトリミングすると知られており、エンドグリコシダーゼSは、複合型グリカン、およびある程度、ハイブリッドグリカンをトリミングすることができる。エンドグリコシダーゼS2は、複合型、ハイブリッド型および高マンノース型の両方のグリコフォームをトリミングすることができる。エンドグリコシダーゼF2は、複合型グリカンをトリミングすることができる(が、ハイブリッド型をトリミングすることはできず)、エンドグリコシダーゼF3は、1,6-フコシル化された複合型グリカンのみをトリミングすることができる。別のエンドグリコシダーゼであるエンドグリコシダーゼDは、Man5(M5)グリカンだけを加水分解することができる。種々のエンドグリコシダーゼの比活性の概要は、参照により本明細書中に援用されるFreeze et al.Curr.Prot.Mol.Biol.,2010,89:17.13A.1-17に開示されている。治療で使用するためのタンパク質の脱グリコシル化のさらなる利点は、バッチ間の一貫性の促進および均一性の有意な改善である。
[0027]二重特異性抗体または抗体-サイトカイン融合物を作製するための抗体-タンパク質コンジュゲートを調製するために、ADC技術の分野から着想を得ることがある。
[0028]参照により援用されるG.T.Hermanson,“Bioconjugate Techniques”,Elsevier,3rd Ed.2013に要約されているように、バイオコンジュゲーションのための多くの技術が知られている。リジン側鎖のアシル化またはシステイン側鎖のアルキル化のいずれかに基づくランダムなコンジュゲーションによるADCの調製のための主要な技術を2つ認識することができる。リジン側鎖のε-アミノ基のアシル化は、通常、活性化エステルまたは活性化カーボネート誘導体に基づく試薬に当該タンパク質を供することによって達成され、例えば、SMCCは、Kadcyla(登録商標)の製造に適用されている。システイン側鎖中のチオール基のアルキル化の主な化学は、例えば、Adcetris(登録商標)の製造に適用されているような、マレイミド試薬の使用に基づく。標準的なマレイミド誘導体のほかに、例えば、James Christie et al.,J.Contr.Rel.2015,220,660-670およびLyon et al.,Nat.Biotechnol.2014,32,1059-1062(両方ともが参照により援用される)によって実証されているように、より安定なシステインコンジュゲーションのために一連のマレイミドバリアントも適用されている。システイン側鎖へのコンジュゲーションのための別の重要な技術は、タンパク質毒素、化学療法薬およびプローブを担体分子に可逆的に接続するために利用されている生物活性化可能な接続であるジスルフィド結合によるものである(例えば、Pillow et al.,Chem.Sci.2017,8,366-370を参照のこと)。システインアルキル化の他のアプローチとしては、例えば、ハロアセトアミド(通常、ブロモアセトアミドまたはヨードアセトアミド)の求核置換(例えば、参照により援用されるAlley et al.,Bioconj.Chem.2008,19,759-765を参照のこと)またはアクリレート試薬との反応などの不飽和結合へのマイケル付加に基づく様々なアプローチ(例えば、Bernardim et al.,Nat.Commun.2016,7,DOI:10.1038/ncomms13128およびAriyasu et al.,Bioconj.Chem.2017,28,897-902(両方ともが参照により援用される)を参照のこと)、ホスホンアミデートとの反応(例えば、参照により援用されるKasper et al.,Angew.Chem.Int.Ed.2019,58,11625-11630を参照のこと)、アレンアミドとの反応(例えば、参照により援用されるAbbas et al.,Angew.Chem.Int.Ed.2014,53,7491-7494を参照のこと)、シアノエチニル試薬との反応(例えば、参照により援用されるKolodych et al.,Bioconj.Chem.2015,26,197-200を参照のこと)、ビニルスルホンとの反応(例えば、参照により援用されるGil de Montes et al.,Chem.Sci.2019,10,4515-4522)またはビニルピリジンとの反応(例えば、https://iksuda.com/science/permalink/(2020年1月7日にアクセス))がある。メチルスルホニルフェニルオキサジアゾールとの反応は、参照により援用されるToda et al.,Angew.Chem.Int.Ed.2013,52,12592-12596によって、システインコンジュゲーションについても報告されている。
[0029]抗体中の1つ(またはそれ以上)の所定の部位への部位特異的コンジュゲーションによって、定義された薬物対抗体比(DAR)を有する抗体-薬物コンジュゲートの作製を可能にするいくつかのプロセスが開発されている。部位特異的コンジュゲーションは、典型的には、ペイロード結合のためのアンカーポイントとして働く抗体への特定のアミノ酸(または配列)の操作(例えば、参照により援用されるAggerwal and Bertozzi,Bioconj.Chem.2014,53,176-192を参照のこと)、最も典型的には、システインの操作によって達成される。その上、一連の他の部位特異的コンジュゲーション技術、最も顕著には、非天然のアミノ酸、例えば、オキシムライゲーションに適したp-アセトフェニルアラニン、またはクリックケミストリーコンジュゲーションに適したp-アジドメチルフェニルアラニンの遺伝子コード化が、過去10年間で研究されてきた。抗体の遺伝子再操作に基づくアプローチの大部分は、DARが約2のADCをもたらす。抗体を再操作することなく抗体コンジュゲーションを行う別のアプローチは、鎖間ジスルフィド架橋を還元した後、システイン架橋試薬、例えば、ビス-スルホン試薬(例えば、Balan et al.,Bioconj.Chem.2007,18,61-76およびBryant et al.,Mol.Pharmaceutics 2015,12,1872-1879(両方ともが参照により援用される)を参照のこと)、モノ-またはビス-ブロモマレイミド(例えば、Smith et al.,J.Am.Chem.Soc.2010,132,1960-1965およびSchumacher et al.,Org.Biomol.Chem.2014,37,7261-7269(両方ともが参照により援用される)を参照のこと)、ビス-マレイミド試薬(例えば、国際公開第2014114207号を参照のこと)、ビス(フェニルチオ)マレイミド(例えば、Schumacher et al.,Org.Biomol.Chem.2014,37,7261-7269およびAubrey et al.,Bioconj.Chem.2018,29,3516-3521(両方ともが参照により援用される)を参照のこと)、ビス-ブロモピリダジンジオン(例えば、Robinson et al.,RSC Advances 2017,7,9073-9077(参照により援用される)を参照のこと)、ビス(ハロメチル)ベンゼン(例えば、Ramos-Tomillero et al.,Bioconj.Chem.2018,29,1199-1208(参照により援用される)を参照のこと)または他のビス(ハロメチル)芳香族化合物(例えば、国際公開第2013173391号を参照のこと)に結合したペイロードを加えるものである。典型的には、システインの架橋によって調製されたADCは、約4の薬物対抗体負荷量(DAR4)を有する。
[0030]Ruddle et al.,ChemMedChem 2019,14,1185-1195は、最近、CH1とCL鎖との間ジスルフィド鎖の選択的還元の後、2つのマレイミド単位を含む対称的なPDB二量体での処理によってフラグメントを再架橋することによって、抗体Fabフラグメント(完全抗体のパパイン消化または組換え発現によって調製される)からDAR1コンジュゲートを調製することができることを示した。得られたDAR1型Fabフラグメントは、高度に均一であり、血清中で安定であり、優れた細胞傷害性を示すことが示された。追跡調査の刊行物であるWhite et al.,MAbs 2019,11,500-515およびまた参照により援用される国際公開第2019034764号では、抗体の事前の操作の後、DAR1コンジュゲートを完全IgG抗体から調製することもできることが示された:ヒンジ領域にただ1つの鎖内ジスルフィド架橋を有する抗体を使用するか(参照により援用されるDimasi et al.,J.Mol.Biol.2009,393,672-692に報告されているFlexmab技術)、または天然アミノ酸の変異(例えば、HC-S239C)もしくは配列への挿入(例えば、Dimasi et al.,Mol.Pharmaceut.2017,14,1501-1516によって報告されているHC-i239C)によって得られることがあるさらなる遊離システインを有する抗体を使用する。どちらの操作された抗体も、得られるシステイン操作されたADCとビスマレイミド由来PBD二量体との反応によって、DAR1 ADCの作製を可能にすることが示された。Flexmab由来DAR1 ADCは、血清中のペイロード損失に対して高度に耐性であり、HER2陽性胃癌異種移植モデルにおいて強力な抗腫瘍活性を示すことが示された。さらに、このADCは、単一のマレイミド含有PBD二量体を使用して調製された部位特異的DAR2 ADCと比べて、2倍の用量でラットにおいて耐容性が示された。しかしながら、DAR1 ADC対DAR2 ADCの最小有効用量(MED)が同じ係数2で増加したので、治療濃度域(therapeutic window)の改善は認められなかった。
[0031]国際公開第2014065661号およびvan Geel et al.,Bioconj.Chem.2015,26,2233-2242(両方ともが参照により援用される)において、抗体が、N297での天然抗体グリカンの酵素的リモデリング(エンドグリコシダーゼによるトリミングおよびグリコシルトランスフェラーゼの作用下でのアジド修飾GalNAc誘導体の導入)に続くクリックケミストリーを用いた細胞傷害性ペイロードの結合に基づいて部位特異的にコンジュゲートされ得ることが示された。アシル化スルファミドの導入により、治療指数に関してグリカンリモデリング技術がさらに改善され、得られた抗体-薬物コンジュゲートのDARが、特異的リンカーの選択によってDAR2またはDAR4に合わせることができることが、Verkade et al.,Antibodies 2018,7,12によって実証された。コンジュゲーション前のグリカンのトリミングが、得られた抗体-薬物コンジュゲート(ADC)の、Fc-ガンマ受容体への結合の無効化(Fcサイレンシング)をもたらすことも実証された。この技術によって調製されたADCは、一連の他のコンジュゲーション技術および例えばADCT-601(ADC Therapeutics)において現在臨床応用されているグリカン-リモデリングコンジュゲーションの技術と比べて、有意に拡張された治療指数を示すことが見出された。
[0032]参照により援用されるLhospice et al.,Mol.Pharmaceut.2015,12,1863-1871に報告されている、抗体を、Fcサイレンシングを伴うアジド修飾抗体に変換するための類似の酵素的アプローチは、細菌酵素のトランスグルタミナーゼ(BTGまたはTGase)を使用する。PNGase Fによる天然のグリコシル化部位N297の脱グリコシル化は、TGase媒介性導入のための基質となるように隣接するN295を遊離させ、それにより、TGaseの存在下でアジド担持分子に供すると、脱グリコシル化抗体がビスアジド抗体に変換されることが示された。その後、そのビスアジド抗体をDBCO修飾細胞毒と反応させて、DAR2を有するADCを作製した。C末端TGase媒介性アジド導入の後、金属フリークリックケミストリーを用いたADCにおける変換に基づく遺伝的方法が、参照により援用されるCheng et al.,Mol.Cancer Therap.2018,17,2665-2675によって報告された。
[0033]小分子の結合に加えて、様々なクリックケミストリーがタンパク質-タンパク質コンジュゲートの作製に適していることも十分に実証されている。例えば、参照により援用されるWitte et al.,Proc.Nat.Acad.Sci.2012,109,11993-11998は、2つの相補的なクリックプローブ(アジドおよびDBCO)を2つの異なるタンパク質にソルターゼ媒介性導入の後、金属フリークリックケミストリー(歪み促進型アジド-アルキン付加環化またはSPAAC)に基づくシームレスライゲーションの組み合わせによって、非天然のN対NおよびC対Cタンパク質二量体を得ることができることを示した。参照により援用されるWagner et al.,Proc.Nat.Acad.Sci.2014,111,16820-16825は、このアプローチを適用して、抗インフルエンザscFvによるC末端ソルタギング(sortagging)に基づく二重特異性抗体を調製し、これをさらに、参照により援用されるBartels et al.,Methods 2019,154,93-101によって、テトラジンとの逆電子要請型ディールス-アルダー付加環化に基づく金属フリークリックケミストリーに拡張した。テトラジンライゲーションは、例えば、Devaraj et al.,Angew.Chem.Int.Ed.2009,48,7013-7016およびRobillard et al.,Angew.Chem.Ed.Engl.2010,49,3375-3378(両方ともが参照により援用される)によって、抗体へのtrans-シクロオクテン(TCO)の最初の(ランダムな)化学的な設置による抗体修飾のために以前に適用された。対照的に、抗体へのTCO(またはテトラジンライゲーションのためのテトラジンもしくはシクロプロペンの他のクリック部分)の部位特異的導入は、上に記載されたように、および例えば、Lang et al.,J.Am.Chem.Soc.2012,134,10317-10320、Seitchik et al.,J.Am.Chem.Soc.2012,134,2898-2901およびOller-Salvia,Angew.Chem.Int.Ed.2018,57,2831-2834(すべて参照により援用される)に報告されているように、抗体の事前の遺伝的改変に基づく多数の方法によって達成することができる。
[0034]ソルターゼは、Popp et al.,Nat.Chem.Biol.2007,3,707-708によって最初に報告されたように、ソルターゼ認識配列の事前導入後のタンパク質の部位特異的修飾に適した酵素である。例えば、参照により援用されるMilczek,Chem.Rev.2018,118,119-141によって要約されているように、他の多くの酵素-酵素認識配列の組み合わせも部位特異的タンパク質修飾について知られており、具体的には、Falck and Muller,Antibodies 2018,7,4(doi:10.3390/antib7010004)およびvan Berkel and van Delft,Drug Discov.Today:Technol.2018,30,3-10(両方ともが参照により援用される)によって要約されているように抗体に適用される。その上、参照により援用されるKoniev and Wagner,Chem.Soc.Rev.2015,44,5495-5551によって要約されているように天然タンパク質の非遺伝的改変、ならびにRosen and Francis,Nat.Chem.Biol.2017,13,697-705およびChen et al.,Chem.Sci.2017,8,27172722(両方ともが参照により援用される)によって要約されているようにN末端修飾のために、広範囲の方法が利用可能である。例えば、Chen et al.,Acc.Chem.Res.2011,44,762-773およびJung and Kwon,Polymer Chem.2016,7,4585-4598(両方ともが参照により援用される)によって要約されているように、上記のいずれのアプローチも、適切なクリックプローブをポリペプチド/タンパク質に組み込むために使用することができ、免疫細胞エンゲージャーまたはサイトカインに適用できる。相補的なクリックプローブを、腫瘍関連抗原を標的とする抗体に組み込むと、免疫細胞エンゲージャーを容易に作製することができる一方で、適切な技術の選択によって、免疫細胞結合剤に対する化学量論の腫瘍結合抗体を調整することができる。
[0035]また、参照により援用されるBruins et al.,Bioconjugate Chem.2017,28,1189-1193によって、後に歪みアルキンまたはアルケンとの付加環化に供され得る中間体1,2-キノンを介した、適切に配置されたチロシンのチロシナーゼ媒介性酸化によって、抗体を細胞傷害性ペイロードに部位特異的にコンジュゲートすることができることも示された。この技術は、歪み促進型の、酸化によって制御されるキノン-アルキン付加環化(SPOCQ)と呼ばれる。
[0036]例えば、Yamada and Ito,ChemBioChem.2019,20,2729-2737によって強調されているように、事前の遺伝的改変を伴わない抗体の部位特異的修飾のための化学的アプローチも開発されている。
[0037]部位特異的修飾のための親和性ペプチドによる化学的コンジュゲーション(CCAP)は、ヒトIgG-Fcに高親和性で結合するペプチドを使用することによりFcフラグメント中の単一リジンをビオチン部分または細胞傷害性ペイロードで選択的に修飾することを可能にすることによって、Kishimoto et al.,Bioconj.Chem.2019によって開発された。同様に、Yamada et al.,Angew.Chem.Int.Ed.2019,58,5592-5597およびMatsuda et al.,ACS Omega 2019,4,20564-20570(両方ともが参照により援用される)は、同様のアプローチ(AJICAPTM技術)を抗体重鎖中の単一リジン上へのチオール基の部位特異的導入に適用できることを実証した。CCAPまたはAJICAPTM技術は、アジド基または他の官能基の部位特異的導入にも使用され得る。
[0038]明らかなように、IgGへの免疫細胞エンゲージャーまたはサイトカインの遺伝的融合は、均一な産物をもたらす。抗体への免疫細胞エンゲージャーの化学的コンジュゲーションが適用されているが、これは、不均一な混合物をもたらす。今日まで、完全長IgGの事前の再操作を必要とせず、かつ/または免疫細胞結合ポリペプチドの数ならびにIgGとポリペプチドとの間のスペーサーの長さおよび構造の調整を可能にする、均一な二重特異性抗体または抗体-サイトカイン融合物を調製するための方法は報告されていない。さらに、IgGをFcサイレントである二重特異性抗体に変換する非遺伝的方法も報告されていない。
[0039]さらに、2つの異なる官能基を制御された様式でIgGに化学的にコンジュゲートし、それによって任意の単機能性抗体を三機能性抗体に、または二重特異性二機能性抗体を四機能性抗体に変換する方法も報告されていない。
[発明の要旨]
[0040]本発明者らは、IgGの遺伝的改変を必要とせずに、少なくとも2つの異なる機能(小分子、ポリペプチド、オリゴヌクレオチド、フルオロフォア、放射性標識など)の結合による多機能性抗体構築物を開発した。典型的には、その抗体は、腫瘍細胞に特異的であり、ポリペプチドペイロードは、免疫細胞に特異的である。本発明は、得られた多機能性抗体の分子フォーマットを、定義された比、すなわち、完全なIgG CDR中の補体依存性領域対新たに設置された機能的標識の比に合わせることを可能にする。例えば、単一特異性単機能性完全長IgG抗体は、2つの異なる機能性分子の正確に2つ(それぞれ1つ)を設置することによって2:1:1比の三機能性構築物に変換することができ、または1つの機能性および別の機能性の1つの4つの分子を設置することによって2:4:1比の三機能性構築物に変換することができる。さらに、本発明は、すでに二重特異性であるIgG(すなわち、2つの異なるCDR、例えばDuobody、またはノブインホール技術もしくは制御されたFab交換技術によって得られた二重特異性IgGを用いて)への適用にも適しており、それによって、所与のフォーマット、例えば、完全IgG CDR(1:1)中の2つの補体依存性領域および2つの新たに設置された異なる機能性分子のことを指す1:1:1:1の四機能性抗体を生成する。最後に、IgG抗体の機能化がエンドグリコシダーゼ媒介性の完全脱グリコシル化ステップまたはエンドグリコシダーゼ媒介性のトリミングステップを含む場合、得られる多機能性抗体構築物は、抗体を再操作することなくFc-ガンマ受容体(Fcサイレント)に結合することができなくなる。本発明はさらに、本発明に係る多機能性抗体構築物の医薬的使用に関する。
[0040]本発明者らは、IgGの遺伝的改変を必要とせずに、少なくとも2つの異なる機能(小分子、ポリペプチド、オリゴヌクレオチド、フルオロフォア、放射性標識など)の結合による多機能性抗体構築物を開発した。典型的には、その抗体は、腫瘍細胞に特異的であり、ポリペプチドペイロードは、免疫細胞に特異的である。本発明は、得られた多機能性抗体の分子フォーマットを、定義された比、すなわち、完全なIgG CDR中の補体依存性領域対新たに設置された機能的標識の比に合わせることを可能にする。例えば、単一特異性単機能性完全長IgG抗体は、2つの異なる機能性分子の正確に2つ(それぞれ1つ)を設置することによって2:1:1比の三機能性構築物に変換することができ、または1つの機能性および別の機能性の1つの4つの分子を設置することによって2:4:1比の三機能性構築物に変換することができる。さらに、本発明は、すでに二重特異性であるIgG(すなわち、2つの異なるCDR、例えばDuobody、またはノブインホール技術もしくは制御されたFab交換技術によって得られた二重特異性IgGを用いて)への適用にも適しており、それによって、所与のフォーマット、例えば、完全IgG CDR(1:1)中の2つの補体依存性領域および2つの新たに設置された異なる機能性分子のことを指す1:1:1:1の四機能性抗体を生成する。最後に、IgG抗体の機能化がエンドグリコシダーゼ媒介性の完全脱グリコシル化ステップまたはエンドグリコシダーゼ媒介性のトリミングステップを含む場合、得られる多機能性抗体構築物は、抗体を再操作することなくFc-ガンマ受容体(Fcサイレント)に結合することができなくなる。本発明はさらに、本発明に係る多機能性抗体構築物の医薬的使用に関する。
[発明の詳細な説明]
[0067]定義
本明細書および特許請求の範囲で使用される「含む」という動詞およびその語形変化は、その語の前の項目が含まれ、具体的に言及されていない項目は除外されないことを意味するために非限定的な意味で使用される。さらに、不定冠詞「a」または「an」による要素への言及は、文脈が、要素の1つのみが存在することを明確に要求しない限り、要素が2つ以上存在する可能性を排除しない。したがって、不定冠詞「a」または「an」は、通常、「少なくとも1つ」を意味する。
[0067]定義
本明細書および特許請求の範囲で使用される「含む」という動詞およびその語形変化は、その語の前の項目が含まれ、具体的に言及されていない項目は除外されないことを意味するために非限定的な意味で使用される。さらに、不定冠詞「a」または「an」による要素への言及は、文脈が、要素の1つのみが存在することを明確に要求しない限り、要素が2つ以上存在する可能性を排除しない。したがって、不定冠詞「a」または「an」は、通常、「少なくとも1つ」を意味する。
[0068]本明細書および特許請求の範囲に開示されている化合物は、1つ以上の不斉中心を含むことがあり、それらの化合物の異なるジアステレオマーおよび/またはエナンチオマーが存在してもよい。本明細書および特許請求の範囲における任意の化合物の説明は、別段述べられない限り、すべてのジアステレオマーおよびそれらの混合物を含むことを意味する。さらに、本明細書および特許請求の範囲における任意の化合物の説明は、別段述べられない限り、個々のエナンチオマー、ならびにエナンチオマーのラセミまたはその他の任意の混合物の両方を含むことを意味する。化合物の構造が特定のエナンチオマーとして示されているとき、本願の発明は、その特定のエナンチオマーに限定されないことが理解されるべきである。
[0069]化合物は、異なる互変異性体で存在し得る。本発明に係る化合物は、別段述べられない限り、すべての互変異性体を含むことを意味する。化合物の構造が、特定の互変異性体として示されているとき、本願の発明は、その特定の互変異性体に限定されないことが理解されるべきである。
[0070]本明細書および特許請求の範囲に開示されている化合物は、さらにエキソジアステレオ異性体およびエンドジアステレオ異性体として存在し得る。別段述べられない限り、本明細書および特許請求の範囲における任意の化合物の説明は、化合物の個々のエキソジアステレオ異性体と個々のエンドジアステレオ異性体の両方、ならびにそれらの混合物を含むことを意味する。化合物の構造が、特定のエンドジアステレオマーまたはエキソジアステレオマーとして示されているとき、本願の発明は、その特定のエンドジアステレオマーまたはエキソジアステレオマーに限定されないことが理解されるべきである。
[0071]さらに、本明細書および特許請求の範囲に開示されている化合物は、シス異性体およびトランス異性体として存在し得る。別段述べられない限り、本明細書および特許請求の範囲における任意の化合物の説明は、化合物の個々のシス異性体と個々のトランス異性体の両方、ならびにそれらの混合物を含むことを意味する。一例として、化合物の構造が、シス異性体として示されているとき、対応するトランス異性体またはシス異性体とトランス異性体との混合物は、本願の発明から除外されないことが理解されるべきである。化合物の構造が、特定のシス異性体またはトランス異性体として示されているとき、本願の発明は、その特定のシス異性体またはトランス異性体に限定されないことを理解されるべきである。
[0072]本発明に係る化合物は、塩の形態で存在してもよく、これも本発明によって包含される。塩は、典型的には、薬学的に許容され得るアニオンを含む薬学的に許容され得る塩である。「その塩」という用語は、酸性プロトン、典型的には酸のプロトンが金属カチオンまたは有機カチオンなどのカチオンで置き換えられたとき形成される化合物を意味する。適用可能な場合、塩は、薬学的に許容され得る塩であるが、これは、患者への投与を意図されない塩には必要ではない。例えば、化合物の塩において、その化合物は、無機酸または有機酸の共役塩基を塩のアニオン成分として用いて、無機酸または有機酸によってプロトン化されてカチオンを形成し得る。
[0073]「薬学的に許容され得る」塩という用語は、哺乳動物などの患者への投与に許容され得る塩(所与の投与レジメンに対して許容され得る哺乳動物の安全性を有する対イオンとの塩)を意味する。そのような塩は、薬学的に許容され得る無機塩基または有機塩基および薬学的に許容され得る無機酸または有機酸から誘導され得る。「薬学的に許容され得る塩」は、当該分野で公知の種々の有機対イオンおよび無機対イオンから誘導され、例えば、ナトリウム、カリウム、カルシウム、マグネシウム、アンモニウム、テトラアルキルアンモニウムなどを含む、化合物の薬学的に許容され得る塩のことを指し、その分子が、塩基性官能基を含むとき、有機酸または無機酸の塩、例えば、塩酸塩、臭化水素酸塩、ギ酸塩、酒石酸塩、ベシル酸塩、メシル酸塩、酢酸塩、マレイン酸塩、シュウ酸塩などのことを指す。
[0074]「タンパク質」という用語は、本明細書ではその通常の科学的意味で使用される。本明細書では、約10個以上のアミノ酸を含むポリペプチドをタンパク質と見なす。タンパク質は、天然のアミノ酸を含み得るが、非天然のアミノ酸も含み得る。
[0075]「単糖」という用語は、本明細書ではその通常の科学的意味で使用され、最も一般的には5個の炭素原子(ペントース)、6個の炭素原子(ヘキソース)または9個の炭素原子(シアル酸)を含む5~9個の(ヒドロキシル化された)炭素原子の鎖の環化時の分子内ヘミアセタール形成から生じる酸素含有複素環のことを指す。典型的な単糖は、リボース(Rib)、キシロース(Xyl)、アラビノース(Ara)、グルコース(Glu)、ガラクトース(Gal)、マンノース(Man)、グルクロン酸(GlcA)、N-アセチルグルコサミン(GlcNAc)、N-アセチルガラクトサミン(GalNAc)およびN-アセチルノイラミン酸(NeuAc)である。
[0076]「サイトカイン」という用語は、本明細書ではその通常の科学的意味で使用され、それらの同族受容体に結合し、その後の細胞シグナル伝達を引き起こすことによって免疫細胞の活性を調節する小分子タンパク質(5~20kDa)である。サイトカインには、ケモカイン、インターフェロン(IFN)、インターロイキン、モノカイン、リンフォカイン、コロニー刺激因子(CSF)および腫瘍壊死因子(TNF)が含まれる。サイトカインの例は、IL-1アルファ(IL1a)、IL-1ベータ(IL1b)、IL-2(IL2)、IL-4(IL4)、IL-5(IL5)、IL-6(IL6)、IL8(IL-8)、IL-10(IL10)、IL-12(IL12)、IL-15(IL15)、IFN-アルファ(IFNA)、IFN-ガンマ(IFN-G)およびTNF-アルファ(TNFA)である。
[0077]「抗体」という用語は、本明細書ではその通常の科学的意味で使用される。抗体は、特定の抗原を認識して結合することができる、免疫系によって生成されるタンパク質である。抗体は、糖タンパク質の一例である。本明細書における抗体という用語は、その最も広い意味で使用され、具体的には、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、二量体、多量体、多重特異性抗体(例えば、二重特異性抗体)、抗体フラグメント、ならびに二本鎖抗体および一本鎖抗体を含む。「抗体」という用語は、本明細書では、ヒト抗体、ヒト化抗体、キメラ抗体および癌抗原に特異的に結合する抗体も含むことを意味する。「抗体」という用語は、免疫グロブリン全体を含むことを意味するが、抗体の抗原結合フラグメントも含むことを意味する。さらに、この用語は、遺伝的に操作された抗体および抗体の誘導体を含む。抗体、抗体のフラグメントおよび遺伝的に操作された抗体は、当該分野で公知の方法によって得ることができる。抗体の典型的な例としては、とりわけ、アブシキシマブ、リツキシマブ、バシリキシマブ、パリビズマブ、インフリキシマブ、トラスツズマブ、エファリツマブ、アレムツズマブ、アダリムマブ、セツキシマブ、オマリズマブ、ベバシズマブ、ナタリズマブ、ラニビズマブ、パニツムマブ、エクリズマブ、ゴリムマブ、カナキヌマブ、カツマキソマブ、ウステキヌマブ、トシリズマブ、オファツムマブ、デノスマブ、ベリムマブ、イピリムマブおよびブレンツキシマブが挙げられる。
[0078]「抗体フラグメント」は、本明細書では、その抗原結合領域または可変領域を含むインタクトな抗体の一部と定義される。抗体フラグメントの例としては、Fab、Fab’、F(ab’)2およびFvフラグメント、ダイアボディ、ミニボディ、トリアボディ、テトラボディ、鎖状抗体、一本鎖抗体分子、scFv、scFv-Fc、抗体フラグメントから形成された多機能性抗体フラグメント、Fab発現ライブラリーによって産生されたフラグメント、または標的抗原(例えば、癌細胞抗原、ウイルス抗原または微生物抗原)に免疫特異的に結合する上記のいずれかのエピトープ結合フラグメントが挙げられる。
[0079]「抗体構築物」という用語は、本明細書では、2つ以上の異なるタンパク質の共有結合的に連結された組み合わせと定義され、ここで、1つのタンパク質が、抗体または抗体フラグメントであり、他のタンパク質は、抗体、抗体フラグメントまたはサイトカインなどのポリペプチドである。典型的には、それらのタンパク質の1つは、腫瘍関連受容体または抗原に対して高い親和性を有する抗体または抗体フラグメントであり、他のタンパク質の1つ(またはそれ以上)は、免疫細胞上の受容体または抗原に対して高い親和性を有する抗体、抗体フラグメントまたはポリペプチドである。
[0080]「抗原」は、本明細書では、抗体が特異的に結合する実体と定義される。
[0081]「特異的結合」および「特異的に結合する」という用語は、本明細書では、抗体または抗体が標的抗原の対応するエピトープと結合し、他の多数の抗原とは結合しない高度に選択的な様式と定義される。典型的には、抗体または抗体誘導体は、少なくとも約1×10-7M、好ましくは10-8M~10-9M、10-10M、10-11Mまたは10-12Mの親和性で結合し、所定の抗原または近縁抗原以外の非特異的抗原(例えば、BSA、カゼイン)への結合に対する親和性よりも少なくとも2倍高い親和性で所定の抗原に結合する。
[0082]「二重特異性」という用語は、本明細書では、腫瘍細胞上または免疫細胞上に存在し得る2つの異なる受容体または抗原(または単一抗原上の異なるエピトープ)に対して親和性を有する抗体構築物と定義され、二重特異性は、様々な分子フォーマットであり得、異なる結合価を有し得る。
[0083]「三重特異性」という用語は、本明細書では、腫瘍細胞上または免疫細胞上に存在し得る3つの異なる受容体または腫瘍関連抗原(または単一抗原上の異なるエピトープ)に対して親和性を有する抗体構築物と定義され、三重特異性は、様々な分子フォーマットであり得、異なる結合価を有し得る。
[0084]「多重特異性」という用語は、本明細書では、腫瘍細胞上または免疫細胞上に存在し得る少なくとも2つの異なる受容体または抗原(または1つ以上の単一抗原上の異なるエピトープ)に対して親和性を有する抗体構築物と定義され、多重特異性は、様々な分子フォーマットであり得、異なる結合価を有し得る。
[0085]「二パラトープ」という用語は、本明細書では、2つの明確に異なるエピトープに対して親和性を有する抗体と定義されるが、両方のエピトープが、同じ受容体上または腫瘍関連抗原上に存在する。
[0086]「二機能性」という用語は、本明細書では、2つの明確に異なる特性を有する抗体、例えば、2つの明確に異なるエピトープもしくは腫瘍関連抗原に結合することができる抗体、または特定のエピトープもしくは腫瘍関連抗原に結合することができ、小分子ペイロードも担持する抗体と定義される。
[0087]「三機能性」という用語は、本明細書では、3つの明確に異なる特性を有する抗体、例えば、3つの明確に異なるエピトープまたは腫瘍関連抗原に結合することができる抗体、あるいは2つの明確に異なるエピトープもしくは腫瘍関連抗原に結合することができ、小分子ペイロードも担持する抗体、または特定のエピトープもしくは腫瘍関連抗原に結合することができ、2つの異なる小分子ペイロードも担持する抗体と定義される。
[0088]「多機能性」という用語は、本明細書では、多数の明確に異なる特性を有する抗体、例えば、複数の明確に異なるエピトープもしくは腫瘍関連抗原に結合することができる抗体、または特定のエピトープもしくは腫瘍関連抗原に結合することができ、複数の小分子ペイロードも担持する抗体またはそれらのバリエーションと定義される。
[0089]「Fcサイレント」という用語は、本明細書では、Fc-ガンマ受容体III(CD16)への結合が有意に減少しているかまたは無くなっている抗体と定義される。
[0090]「実質的な」または「実質的に」という用語は、本明細書では、集団、混合物またはサンプルの大部分、すなわち>50%、好ましくは集団の50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%を超えるものと定義される。
[0091]「リンカー」は、本明細書では、化合物の2つ以上の要素を接続する部分と定義される。例えば、抗体コンジュゲートでは、抗体とペイロードとが、リンカーを介して互いに共有結合的に接続されている。リンカーは、リンカー内の様々な部分を接続する1つ以上のリンカーおよびスペーサー部分を含み得る。
[0092]「極性リンカー」は、本明細書では、リンカーの極性を増加させ、それによって水溶解度を改善することを特に目的とした構造要素を含むリンカーと定義される。極性リンカーは、例えば、エチレングリコール、カルボン酸部分、スルホネート部分、スルホン部分、アシル化スルファミド部分、ホスフェート部分、ホスフィネート部分、アミノ基またはアンモニウム基から選択される1つ以上の単位またはそれらの組み合わせを含み得る。
[0093]「スペーサー」またはスペーサー部分(Sp)は、本明細書では、リンカーの2つ(またはそれ以上の)部分の間隔を空け(すなわち、それらの間に距離を提供し)、それらを一緒に共有結合的に連結する部分と定義される。リンカーは、下記で定義されるように、例えば、リンカー構築物、リンカーコンジュゲートまたはバイオコンジュゲートの一部であり得る。スペーサーは、共有結合またはC、N、O、SおよびPから選択される少なくとも1個、好ましくは2~50個の原子の鎖であり得る。本明細書では、原子の鎖は、スペーサーの末端から延びる最短の原子鎖のことを指す。鎖内の原子は、骨格原子と呼ばれることもある。当業者が理解するように、C、NおよびPなどの3以上の結合価を有する原子は、これらの原子の結合価を完了させるように適切に官能化され得る。
[0094]「バイオコンジュゲート」は、本明細書では、生体分子がリンカーを介してペイロードに共有結合的に接続されている化合物と定義される。バイオコンジュゲートは、1つ以上の生体分子および/または1つ以上の標的分子を含む。
[0095]「生体分子」は、本明細書では、天然から単離することができる任意の分子、または天然由来の高分子構造、特に核酸、タンパク質、グリカンおよび脂質の構成要素であるより小さな分子基本単位から構成される任意の分子と定義される。生体分子の例としては、酵素、(非触媒)タンパク質、ポリペプチド、ペプチド、アミノ酸、オリゴヌクレオチド、単糖、オリゴ糖、多糖、グリカン、脂質およびホルモンが挙げられる。
[0096]「ペイロード」という用語は、抗体などの標的化部分に共有結合している部分のことを指す。したがって、ペイロードは、リンカーを介して標的化部分に共有結合している1つの開放末端を有する一価部分のことを指す。ペイロードは、小分子または生体分子であり得る。
[0097]「分子フォーマット」という用語は、抗体上の異なる官能基の数および相対化学量論のことを指し、2:1:1分子フォーマットは、同じ標的に結合する2つのCDRドメインおよび結合した別の機能性分子の1つの存在を有する三機能性抗体を表し、1:1:2:2分子フォーマットは、2つの異なる標的(または同じエピトープ上の2つの標的)に結合する2つの異なるCDRドメインおよび結合した別の機能性分子の1つの存在を有する二重特異性抗体に基づく四機能性抗体を表す。機能性部分自体の一方(または両方)は、抗体骨格の標的とは異なり得る、特定の標的に結合することができるポリペプチドフラグメントでもあり得る。「2:1分子フォーマット」という用語は、単一の機能的ペイロードにコンジュゲートされた二価のモノクローナル抗体からなるタンパク質コンジュゲートのことを指す。
[0098]「補体依存性領域」または「CDR」という用語は、特定の受容体または抗原に結合することができる抗体の可変フラグメントのことを指す。
[0099]本発明
本発明者らは、一方では腫瘍細胞に特異的であり、他方ではT細胞、NK細胞、単球、マクロファージ、顆粒球などの免疫細胞に特異的である、多機能性抗体構築物を開発した。本発明の多機能性抗体構築物はさらに、腫瘍微小環境または腫瘍リソソームにおける特異的放出のための1つ以上の異なる小分子ペイロードを含み得る。初めて、分子フォーマットを完全に制御し、遺伝子操作を必要とせずに、そのような二機能性抗体構築物または多機能性抗体構築物を調製することが可能になった。本発明は、多機能性抗体構築物、ならびに本発明に係る多機能性抗体構築物の(医薬的)使用に関する。
本発明者らは、一方では腫瘍細胞に特異的であり、他方ではT細胞、NK細胞、単球、マクロファージ、顆粒球などの免疫細胞に特異的である、多機能性抗体構築物を開発した。本発明の多機能性抗体構築物はさらに、腫瘍微小環境または腫瘍リソソームにおける特異的放出のための1つ以上の異なる小分子ペイロードを含み得る。初めて、分子フォーマットを完全に制御し、遺伝子操作を必要とせずに、そのような二機能性抗体構築物または多機能性抗体構築物を調製することが可能になった。本発明は、多機能性抗体構築物、ならびに本発明に係る多機能性抗体構築物の(医薬的)使用に関する。
[0100]ここで以下、分子部分は、出発物質、中間体および最終生成物において定義される。当業者は、分子のその部分が変換中に影響を受けない限り、それらのいずれか1つの好ましい実施形態の任意の定義が他の化合物に等しく適用されることを理解する。同様に、本発明に係るプロセスについて構造的に定義されるものはいずれも、本発明に係る化合物に等しく適用される。
[0101]多機能性抗体構築物
第1の態様において、本発明は、少なくとも1つの抗体(Ab)と、2つの別個のペイロード(D1)および(D2)と、を含む多機能性抗体構築物に関する。本明細書において、ペイロードの少なくとも1つはポリペプチドであり、他のペイロードは別のポリペプチド、細胞毒、別の小分子またはオリゴヌクレオチドであり得る。1つの実施形態において、多機能性抗体構築物は、第3の別個のペイロード(D3)を含み得る。
第1の態様において、本発明は、少なくとも1つの抗体(Ab)と、2つの別個のペイロード(D1)および(D2)と、を含む多機能性抗体構築物に関する。本明細書において、ペイロードの少なくとも1つはポリペプチドであり、他のペイロードは別のポリペプチド、細胞毒、別の小分子またはオリゴヌクレオチドであり得る。1つの実施形態において、多機能性抗体構築物は、第3の別個のペイロード(D3)を含み得る。
[0102]本発明に係る多機能性抗体構築物は、構造(1)または(2)を有し得る。
ここで、
Abは、抗体であり;
L1、L2、L3、L4およびL5は、リンカーであり;
x1およびx2は、それぞれ個別に1~8の範囲の整数であり、x1+x2=2~10であり;
BMは、分枝部分であり;
mおよびnは、それぞれ独立して、0または1であり;
x3は、1~4の範囲の整数であり;
D1およびD2は、ポリペプチド、小分子、細胞毒およびオリゴヌクレオチドからなる群から選択される2つの別個のペイロードであり、D1およびD2の少なくとも1つは、ポリペプチドである。
ここで、
Abは、抗体であり;
L1、L2、L3、L4およびL5は、リンカーであり;
x1およびx2は、それぞれ個別に1~8の範囲の整数であり、x1+x2=2~10であり;
BMは、分枝部分であり;
mおよびnは、それぞれ独立して、0または1であり;
x3は、1~4の範囲の整数であり;
D1およびD2は、ポリペプチド、小分子、細胞毒およびオリゴヌクレオチドからなる群から選択される2つの別個のペイロードであり、D1およびD2の少なくとも1つは、ポリペプチドである。
[0103]構造(1)に記載の多機能性抗体構築物は、抗体上の別個の結合点に接続された両方の別個のペイロードを有する。構造(2)に記載の多機能性抗体構築物は、同じ分枝リンカーに接続された両方の別個のペイロードを有し、そのリンカーは、抗体上に単一または複数の結合点を有し得る。下記でより詳細に説明されるように、ペイロードを抗体に結合させるための方法は、当該分野で公知の任意のコンジュゲーション技術であり得る。好ましくは、構造(1)に記載の多機能性抗体構築物の場合、2つの別個のペイロードに対して2つの異なるコンジュゲーション法が使用されるのに対して、構造(2)に記載の多機能性抗体構築物は、2つの別個のペイロードを有するリンカー-ペイロード構築物を接続する単一のコンジュゲーション法によって容易に調製することができる。
[0104]抗体
Abは、抗体である。抗体は、当該分野で公知であり、抗体には、IgA、IgD、IgE、IgG、IgM、Fab、VHH、scFv、ダイアボディ、ミニボディ、アフィボディ、アフィリン(affylin)、アフィマー、アトリマー(atrimers)、ファイノマー(fynomer)、Cys-ノット、DARPin、アドネクチン/セントリイン(centryin)、ノッチン、アンチカリン、FN3、Kunitzドメイン、OBody、二環式ペプチドおよび三環式ペプチドが含まれる。好ましくは、抗体は、モノクローナル抗体であり、より好ましくは、IgA、IgD、IgE、IgGおよびIgM抗体からなる群から選択される。さらにより好ましくは、Abは、IgG抗体である。IgG抗体は、任意のIgGアイソタイプであり得る。抗体は、任意のIgGアイソタイプ、例えば、IgG1、IgG2、IgI3またはIgG4であり得る。好ましくは、Abは、完全長抗体であるが、Abは、Fcフラグメントであってもよい。
Abは、抗体である。抗体は、当該分野で公知であり、抗体には、IgA、IgD、IgE、IgG、IgM、Fab、VHH、scFv、ダイアボディ、ミニボディ、アフィボディ、アフィリン(affylin)、アフィマー、アトリマー(atrimers)、ファイノマー(fynomer)、Cys-ノット、DARPin、アドネクチン/セントリイン(centryin)、ノッチン、アンチカリン、FN3、Kunitzドメイン、OBody、二環式ペプチドおよび三環式ペプチドが含まれる。好ましくは、抗体は、モノクローナル抗体であり、より好ましくは、IgA、IgD、IgE、IgGおよびIgM抗体からなる群から選択される。さらにより好ましくは、Abは、IgG抗体である。IgG抗体は、任意のIgGアイソタイプであり得る。抗体は、任意のIgGアイソタイプ、例えば、IgG1、IgG2、IgI3またはIgG4であり得る。好ましくは、Abは、完全長抗体であるが、Abは、Fcフラグメントであってもよい。
[0105]抗体Abは、典型的には、腫瘍細胞上の細胞外受容体に特異的であり、好ましくは、腫瘍細胞上の細胞外受容体は、5T4、ADAM-9、AMHRII、ASCT2、ASLG659、ASPHD1、av-インテグリン、Axl、B7-H3、B7-H4、BAFF-R、BCMA、BMPR1B、ブレビカン、c-KIT、c-Met、C4.4a、CA-IX、カドヘリン-6、CanAg、CD123、CD13、CD133、CD138/シンデカン-1、CD166、CD19、CD20、CD203c、CD205、CD21、CD22、CD228、CD25、CD30、CD324、CD33、CD37、CD38、CD45、CD46、CD48a、CD56、CD70、CD71、CD72、CD74、CD79a、CD79b、CEACAM5、クローディン-18.2、クローディン-6、CLEC12A、CLL-1、Cripto、CRIPTO、CS1、CXCR5、DLK-1、DLL3、DPEP3、E16、EGFR、ENPP3、EpCAM、EphA2、EphB2R、ETBR、FAP、FcRH1、FcRH2、FcRH5、FGFR2、フィブロネクチン、FLT3、葉酸受容体アルファ、Gal-3BP、GD3、GDNF-Ra1、GEDA、GFRA1、Globo H、gpNMB、GPR172A、GPR19、GPR54、グアニルシクラーゼC、HER2、HER3、HLA-DOB、IGF-1R、IL13R、IL20Rα、Lewis Y、LGR5、LIV-1、LRRC15、LY64、Ly6E、Ly6G6D、LY6K、MDP、MFI2、MICA/B、MOSPD2、MPF、MSG783、MUC1、MUC16、NaPi2b、NCA、ネクチン-4、Notch3、P-カドヘリン、P2X5、PD-L1、PMEL17、PRLR、PSCA、PSCA hlg、PSMA、PTK7、RET、RNF43、RON、ROR1、ROR2、Sema 5b、SLITRK6、SSTR2、STEAP1、STEAP2、TAG72、TENB2、TF、TIM-1、TM4SF、TMEFF、TMEM118、TMEM46、トランスフェリン、TROP-2、TrpM4、TWEAKR、受容体チロシンキナーゼ(RTK)、テネイシンからなる群から選択される。
[0106]構造(1)に記載の多機能性抗体構築物において、抗体は、x1個のペイロードD1の存在およびx2個のペイロードD2の存在で機能化されている。ここで、x1およびx2は、それぞれ個別に、1~8の範囲の整数であり、x1+x2=2~10である。x1およびx2の正確な数は、分子フォーマット比を決定し、使用されるコンジュゲーション法によって決定される。好ましい1つの実施形態において、x1とx2は、同じであり、両方とも1~4の範囲の整数であり、好ましくは両方または1もしくは2であり、最も好ましくは両方とも1である。別の好ましい実施形態において、x1は、1~8の範囲の整数であり、x2は、1~4の範囲の整数であり、好ましくは、x2は、1または2であり、最も好ましくは、x2は、2である。あるいは、x1は、1~4の範囲の整数であり、x2は、1~8の範囲の整数であり、好ましくは、x1は、1または2であり、最も好ましくは、x1は、2である。
[0107]構造(2)に記載の多機能性抗体構築物において、抗体は、ペイロードD1とペイロードD2の両方を有するx3個のリンカー構築物の存在によって機能化される。ここで、x3は、1~4の範囲の整数であり、好ましくは、x3は、1、2または4であり、より好ましくは、x3は、1または2である。
[0108]ペイロード
ペイロードの少なくとも1つ、典型的にはD1は、ポリペプチドである。そのポリペプチドペイロードは、抗体Abとは異なる標的に対して親和性を有する。したがって、本発明に係る抗体構築物は、多機能性であり、少なくとも2つの別個の標的を標的とする。好ましくは、ポリペプチドは、免疫細胞エンゲージャー、チェックポイント阻害剤、および細胞表面受容体の結合剤から選択され、好ましくは、そのポリペプチドは、免疫細胞結合ポリペプチドまたはチェックポイント阻害ポリペプチドである。
ペイロードの少なくとも1つ、典型的にはD1は、ポリペプチドである。そのポリペプチドペイロードは、抗体Abとは異なる標的に対して親和性を有する。したがって、本発明に係る抗体構築物は、多機能性であり、少なくとも2つの別個の標的を標的とする。好ましくは、ポリペプチドは、免疫細胞エンゲージャー、チェックポイント阻害剤、および細胞表面受容体の結合剤から選択され、好ましくは、そのポリペプチドは、免疫細胞結合ポリペプチドまたはチェックポイント阻害ポリペプチドである。
[0109]免疫細胞結合ポリペプチドは、当該分野で公知であり、任意の公知のそのようなポリペプチドが、本発明の文脈で使用され得る。免疫細胞結合ポリペプチドは、好ましくは、T細胞、NK細胞、単球、マクロファージもしくは顆粒球上の細胞受容体に特異的であるか、またはIL2もしくはIL15に特異的である。ここで、T細胞上の細胞受容体は、CD3、CD28、CD137(4-1BB)、CD134、CD27、Vγ9Vδ2およびICOSからなる群から選択されること;NK細胞上の細胞受容体は、CD16、CD56、CD335、CD336、CD337、CD28、NKG2A、NKG2D、NKp46、KIR、DNAM-1およびCD161からなる群から選択されること;単球上またはマクロファージ上の細胞受容体はCD64であること;顆粒球上の細胞受容体はCD89であることが好ましい。
[0110]チェックポイント阻害ポリペプチドは、当該分野で公知であり、任意の公知のそのようなポリペプチドが、本発明の文脈において使用され得る。好ましくは、チェックポイント阻害ポリペプチドは、CTLA-4、PD-1、PD-L1、TIGIT、TIM-3、LAG-3またはVISTAに特異的である。
[0111]細胞表面受容体に結合するポリペプチドは、当該分野で公知であり、任意の公知のそのようなポリペプチドが、本発明の文脈において使用され得る。
[0112]特に好ましい実施形態において、上記ポリペプチドは、OKT3、UCHT1、BMA031、VHH 6H4、IL2、IL15、IL15/IL15R複合体、IL15/IL15R融合物、IL2に特異的な抗体およびIL15に特異的な抗体からなる群から選択される。最も好ましくは、上記ポリペプチドは、OKT3、IL15/IL15R融合物、IL15、mAb602、Nara1またはTCB2である。
[0113]第2のペイロード、典型的にはD2は、ポリペプチドであってもよいし、細胞毒、別の小分子またはオリゴヌクレオチドであってもよい。第2のペイロードもポリペプチドである場合、それは、第1のペイロードとは異なるポリペプチドである。第2のペイロードは、細胞毒または他の小分子などの小分子であってもよい。小分子は、典型的には、低~中分子量の化合物、例えば、約100~約2500Da、好ましくは、約300~約1750Daを有する。これらには、下記で定義されるような活性物質(例えば、細胞毒)およびレポーター分子(例えば、フルオロフォア、放射標識)が含まれ得る。好ましい実施形態において、第2のペイロードは、ポリペプチド、細胞毒またはオリゴヌクレオチド、より好ましくは、ポリペプチドまたは細胞毒である。1つの実施形態において、第2のペイロードは、ポリペプチドである。別の実施形態において、第2のペイロードは、細胞毒である。
[0114]細胞毒は、抗体-コンジュゲートの分野において、特に癌の治療について、周知である。抗体-薬物コンジュゲートは、典型的には、細胞傷害性ペイロードを有し、任意のそのような細胞傷害性ペイロードが、本発明の文脈において使用され得る。本明細書において、「細胞毒」は、「抗癌剤」とも呼ばれ得る。細胞毒は、薬物またはプロドラッグであり得、薬学的に活性な化合物、特に、低~中分子量の化合物(例えば、約200~約2500Da、好ましくは、約300~約1750Da)からなる群から選択される。
[0115]細胞毒の例としては、コルヒチン、ビンカアルカロイド、アントラサイクリン、カンプトテシン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、タキサン、カリチアマイシン、チューブリシン(tubulysins)、イリノテカン、阻害性ペプチド、アマニチン、エリブリン、deBouganin、デュオカルマイシン、メイタンシン、アウリスタチン、エンジイン、ピロロベンゾジアゼピン(PBD)またはインドリノベンゾジアゼピン二量体(IGN)またはPNU159,682が挙げられる。特に好ましい細胞毒には、MMAEなどのアウリスタチン、メイタンシノイド(maytansinoids)、カリチアマイシンおよびカンプトテシンが含まれる。
[0116]ペイロードD1およびD2の好ましい組み合わせは、以下のとおりである:
(i)D1が、CD3標的化ポリペプチドであり、D2が、CD28標的化ポリペプチドであるか;
(ii)D1が、IL15またはIL15標的化ポリペプチドであり、D2が、CD16標的化ポリペプチドであるか;
(iii)D1が、IL2またはIL2標的化ポリペプチドであり、D2が、CD16標的化ポリペプチドであるか;
(iv)D1が、NKp46標的化ポリペプチドであり、D2が、CD16標的化ポリペプチドであるか;
(v)D1が、細胞毒であり、D2が、チェックポイント阻害剤であり、好ましくは、CTLA-4、TIGIT、LAG-3、TIM-3、VISTA、PD-1またはPD-L1を標的とするポリペプチドから選択されるか;
(vi)D1が、OX40標的化ポリペプチドであり、D2が、CD137標的化ポリペプチドであるか;
(vii)D1が、PD-L1標的化ポリペプチドであり、D2が、CD137標的化ポリペプチドであるか;
(viii)D1が、細胞毒であり、D2が、IL15またはIL15標的化ポリペプチドであるか;
(ix)D1が、細胞毒であり、D2が、IL2またはIL2標的化ポリペプチドであるか;
(x)D1が、細胞毒であり、D2が、CD16標的化ポリペプチドであるか;または
(xi)D1が、TLR7アゴニストまたはTRL8アゴニストであり、D2が、CD16標的化ポリペプチドである。
(i)D1が、CD3標的化ポリペプチドであり、D2が、CD28標的化ポリペプチドであるか;
(ii)D1が、IL15またはIL15標的化ポリペプチドであり、D2が、CD16標的化ポリペプチドであるか;
(iii)D1が、IL2またはIL2標的化ポリペプチドであり、D2が、CD16標的化ポリペプチドであるか;
(iv)D1が、NKp46標的化ポリペプチドであり、D2が、CD16標的化ポリペプチドであるか;
(v)D1が、細胞毒であり、D2が、チェックポイント阻害剤であり、好ましくは、CTLA-4、TIGIT、LAG-3、TIM-3、VISTA、PD-1またはPD-L1を標的とするポリペプチドから選択されるか;
(vi)D1が、OX40標的化ポリペプチドであり、D2が、CD137標的化ポリペプチドであるか;
(vii)D1が、PD-L1標的化ポリペプチドであり、D2が、CD137標的化ポリペプチドであるか;
(viii)D1が、細胞毒であり、D2が、IL15またはIL15標的化ポリペプチドであるか;
(ix)D1が、細胞毒であり、D2が、IL2またはIL2標的化ポリペプチドであるか;
(x)D1が、細胞毒であり、D2が、CD16標的化ポリペプチドであるか;または
(xi)D1が、TLR7アゴニストまたはTRL8アゴニストであり、D2が、CD16標的化ポリペプチドである。
[0117]実施形態(v)では、任意のチェックポイント阻害剤が使用され得る。好ましいチェックポイント阻害剤には、PD-1標的化ポリペプチドおよびPD-L1標的化ポリペプチドが含まれる。現在の癌治療では、抗体-薬物コンジュゲートは、チェックポイント阻害剤と同時投与されることが多い。本発明は、抗体-薬物コンジュゲートを単一の多機能性抗体構築物中のチェックポイント阻害剤と組み合わせるための汎用的な方法を提供し、それにより、現在使用されている併用療法が大幅に容易になる。したがって、細胞毒とチェックポイント阻害剤との組み合わせが、本発明の文脈において特に好ましい。
[0118]本発明に係る多機能性抗体構築物は、例えば、リンカーの1つが、典型的にはリンカーを介して、第3の別個のペイロードD3に接続された(追加の)分枝部分を含むとき、第3の別個のペイロードを含み得る。ペイロード分子は、抗体に共有結合した部分であってコンジュゲートの取り込み時および/またはリンカーの切断時に抗体から放出される部分として、当該分野、特に抗体コンジュゲートの分野で周知である。好ましい実施形態において、ペイロードは、活性物質、レポーター分子、ポリマー、固体表面、ヒドロゲル、ナノ粒子、微粒子および生体分子からなる群から選択される。特に好ましいペイロードは、活性物質およびレポーター分子、特に活性物質である。
[0119]本明細書における「活性物質」という用語は、薬理学的および/または生物学的物質、すなわち、生物学的および/または薬学的に活性な物質、例えば、薬物、プロドラッグ、細胞毒、診断薬、タンパク質、ペプチド、ポリペプチド、ペプチドタグ、アミノ酸、グリカン、脂質、ビタミン、ステロイド、ヌクレオチド、ヌクレオシド、ポリヌクレオチド、RNAまたはDNAに関する。ペプチドタグの例としては、ヒトラクトフェリンまたはポリアルギニンのような細胞透過性ペプチドが挙げられる。グリカンの例は、オリゴマンノースである。アミノ酸の例は、リジンである。ペイロードが活性物質であるとき、その活性物質は、好ましくは、薬物およびプロドラッグからなる群から選択される。より好ましくは、活性物質は、薬学的に活性な化合物、特に、低~中分子量の化合物(例えば約200~約2500Da、好ましくは約300~約1750Da)からなる群から選択される。さらに好ましい実施形態において、活性物質は、細胞毒、抗ウイルス剤、抗菌剤、ペプチドおよびオリゴヌクレオチドからなる群から選択される。細胞毒の例としては、コルヒチン、ビンカアルカロイド、アントラサイクリン、カンプトテシン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、タキサン、カリチアマイシン、チューブリシン、イリノテカン、阻害性ペプチド、アマニチン、エリブリン、deBouganin、デュオカルマイシン、メイタンシン、アウリスタチン、エンジイン、ピロロベンゾジアゼピン(PBD)またはインドリノベンゾジアゼピン二量体(IGN)またはPNU159,682およびそれらの誘導体が挙げられる。好ましいペイロードは、MMAE、MMAF、エキサテカン、SN-38、DXd、メイタンシノイド、カリケアマイシン、PNU159,685およびPBD二量体から選択される。特に好ましいペイロードは、PBD、MMAE、エキサテカンまたはDXdである。1つの実施形態において、ペイロードは、メイタンシノイドである。1つの実施形態において、ペイロードは、エキサテカンまたはDXdである。1つの実施形態において、ペイロードは、MMAEである。1つの実施形態において、ペイロードは、PDB二量体である。
[0120]本明細書における「レポーター分子」という用語は、その存在が容易に検出される分子、例えば、診断薬、色素、フルオロフォア、放射性同位体標識、造影剤、磁気共鳴イメージング剤または質量標識のことを指す。蛍光プローブとも呼ばれる多種多様のフルオロフォアが当業者に公知である。いくつかのフルオロフォアは、例えば、参照により援用されるG.T.Hermanson,“Bioconjugate Techniques”,Elsevier,3rd Ed.2013,Chapter 10:“Fluorescent probes”,p.395-463に詳細に説明されている。フルオロフォアの例としては、あらゆる種類のAlexa Fluor(例えば、Alexa Fluor 555)、シアニン色素(例えば、Cy3またはCy5)およびシアニン色素誘導体、クマリン誘導体、フルオレセインおよびフルオレセイン誘導体、ローダミンおよびローダミン誘導体、ボロンジピロメテン誘導体、ピレン誘導体、ナフタルイミド誘導体、フィコビリンタンパク質誘導体(例えば、アロフィコシアニン)、クロモマイシン、ランタニドキレートならびに量子ドットナノ結晶が挙げられる。
[0121]放射性同位体標識の例としては、99mTc、111In、114mIn、115In、18F、14C、64Cu、131I、125I、123I、212Bi、88Y、90Y、67Cu、186Rh、188Rh、66Ga、67Gaおよび10Bが挙げられ、これは必要に応じて、キレート化部分、例えば、DTPA(無水ジエチレントリアミン五酢酸)、DOTA(1,4,7,10-テトラアザシクロドデカン-N,N’,N’’,N’’’-四酢酸)、NOTA(1,4,7-トリアザシクロノナンN,N’,N’’-三酢酸)、TETA(1,4,8,11-テトラアザシクロテトラデカン-N,N’,N’’,N’’’-四酢酸)、DTTA(N1-(p-イソチオシアナトベンジル)-ジエチレントリアミン-N1,N2,N3,N3-四酢酸)、デフェロキサミンまたはDFA(N’-[5-[[4-[[5-(アセチルヒドロキシアミノ)ペンチル]アミノ]-1,4-ジオキソブチル]ヒドロキシアミノ]ペンチル]-N-(5-アミノペンチル)-N-ヒドロキシブタンジアミド)またはHYNIC(ヒドラジノニコチンアミド)を介して接続される。同位体標識法は、当業者に公知であり、例えば、参照により援用されるG.T.Hermanson,“Bioconjugate Techniques”,Elsevier,3rd Ed.2013,Chapter 12:“Isotopic labelling techniques”,p.507-534に詳細に説明されている。
[0122]本発明に係る化合物中のペイロードD3として使用するのに適したポリマーは、当業者に公知であり、いくつかの例が、例えば、参照により援用されるG.T.Hermanson,“Bioconjugate Techniques”,Elsevier,3rd Ed.2013,Chapter 18:“PEGylation and synthetic polymer modification”,p.787-838に詳細に説明されている。ペイロードD3が、ポリマーであるとき、ペイロードD3は、好ましくは、ポリ(エチレングリコール)(PEG)、ポリエチレンオキシド(PEO)、ポリプロピレングリコール(PPG)、ポリプロピレンオキシド(PPO)、1,q-ジアミノアルカンポリマー(ここで、qは、アルカン中の炭素原子の数であり、好ましくは、qは、2~200、好ましくは2~10の範囲の整数である)、(ポリ)エチレングリコールジアミン(例えば、1,8-ジアミノ-3,6-ジオキサオクタン、およびより長いエチレングリコール鎖を含む等価物)、多糖(例えば、デキストラン)、ポリ(アミノ酸)(例えば、ポリ(L-リジン))およびポリ(ビニルアルコール)からなる群から独立して選択される。
[0123]ペイロードD3として使用するのに適した固体表面は、当業者に公知である。固体表面は、例えば、機能性表面(例えば、ナノ材料、カーボンナノチューブ、フラーレンまたはウイルスカプシドの表面)、金属表面(例えば、チタン、金、銀、銅、ニッケル、スズ、ロジウムまたは亜鉛表面)、金属合金表面(合金は、例えば、アルミニウム、ビスマス、クロム、コバルト、銅、ガリウム、金、インジウム、鉄、鉛、マグネシウム、水銀、ニッケル、カリウム、プルトニウム、ロジウム、スカンジウム、銀、ナトリウム、チタン、スズ、ウラン、亜鉛および/またはジルコニウムからのものである)、ポリマー表面(ポリマーは、例えば、ポリスチレン、ポリ塩化ビニル、ポリエチレン、ポリプロピレン、ポリ(ジメチルシロキサン)またはポリメチルメタクリレート、ポリアクリルアミド)、ガラス表面、シリコーン表面、クロマトグラフィー支持表面(クロマトグラフィー支持体は、例えば、シリカ支持体、アガロース支持体、セルロース支持体またはアルミナ支持体である)などである。ペイロードD3が、固体表面であるとき、Dは、機能性表面またはポリマー表面からなる群から独立して選択されることが好ましい。
[0124]ヒドロゲルは、当業者に公知である。ヒドロゲルは、ポリマー構成要素間の架橋によって形成される水膨潤ネットワークである。例えば、参照により援用されるA.S.Hoffman,Adv.Drug Delivery Rev.2012,64,18を参照のこと。ペイロードが、ヒドロゲルであるとき、ヒドロゲルは、ポリマーベースとしてポリ(エチレン)グリコール(PEG)から構成されることが好ましい。
[0125]ペイロードD3として使用するのに適した微粒子およびナノ粒子は、当業者に公知である。種々の好適な微粒子およびナノ粒子が、例えば、参照により援用されるG.T.Hermanson,“Bioconjugate Techniques”,Elsevier,3rd Ed.2013,Chapter 14:“Microparticles and nanoparticles”,p.549-587に記載されている。微粒子またはナノ粒子は、任意の形状、例えば、球、棒、管、立方体、三角形および円錐であってもよい。好ましくは、微粒子またはナノ粒子は、球形である。微粒子およびナノ粒子の化学組成は、変動し得る。ペイロードD3が、微粒子またはナノ粒子であるとき、その微粒子またはナノ粒子は、例えば、ポリマー微粒子もしくはポリマーナノ粒子、シリカ微粒子もしくはシリカナノ粒子、または金微粒子もしくは金ナノ粒子である。粒子が、ポリマー微粒子またはポリマーナノ粒子であるとき、そのポリマーは、好ましくは、ポリスチレンもしくはスチレンのコポリマー(例えば、スチレンと、ジビニルベンゼン、ブタジエン、アクリレートおよび/またはビニルトルエンとのコポリマー)、ポリメチルメタクリレート(PMMA)、ポリビニルトルエン、ポリ(ヒドロキシエチルメタクリレート(pHEMA)またはポリ(エチレングリコールジメタクリレート/2-ヒドロキシエチルメタクリラ)[ポリ(EDGMA/HEMA)]である。必要に応じて、微粒子またはナノ粒子の表面は、例えば、洗浄剤を用いて、2次ポリマーのグラフト重合によって、または別のポリマーもしくはスペーサー部分の共有結合などによって修飾される。
[0126]ペイロードD3は、生体分子であってもよい。生体分子およびその好ましい実施形態は、下記でより詳細に説明される。ペイロードD3が、生体分子であるとき、その生体分子は、タンパク質(抗体などの糖タンパク質を含む)、ポリペプチド、ペプチド、グリカン、脂質、核酸、オリゴヌクレオチド、多糖、オリゴ糖、酵素、ホルモン、アミノ酸および単糖からなる群から選択されることが好ましい。好ましい実施形態において、ペイロードD3は、オリゴヌクレオチドである。
[0127]本発明の文脈において、細胞傷害性ペイロードが特に好ましい。したがって、D2および/またはD3は、好ましくは、細胞毒であり、より好ましくは、コルヒチン、ビンカアルカロイド、アントラサイクリン、カンプトテシン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、タキサン、カリケアマイシン、チューブリシン、イリノテカン、阻害性ペプチド、アマニチン、アマトキシン、エリブリン、deBouganin、デュオカルマイシン、エポチロン、マイトマイシン、コンブレタスタチン、メイタンシン、アウリスタチン、エンジイン、ピロロベンゾジアゼピン(PBD)またはインドリノベンゾジアゼピン二量体(IGN)またはPNU159,682からなる群から選択される。特に好ましい実施形態において、ペイロードは、MMAE、カリケアマイシンまたはエキサテカンである。
[0128]コンジュゲーション法
当該分野で公知の任意のコンジュゲーション法を使用して、本発明に係る多機能性抗体構築物を調製することができる。好適なコンジュゲーション法としては、チオールライゲーション、リジンライゲーション、付加環化(例えば、銅触媒クリック反応、歪み促進型アジド-アルキン付加環化、歪み促進型キノン-アルキン付加環化)が挙げられる。本発明の文脈において使用される好ましいコンジュゲーション法には、求核反応および付加環化が含まれ、好ましくは、付加環化は、[4+2]付加環化または[3+2]付加環化であり、求核反応は、マイケル付加または求核置換である。好適なコンジュゲーション法は、例えば、G.T.Hermanson,“Bioconjugate Techniques”,Elsevier,3rd Ed.2013(ISBN:978-0-12-382239-0)、国際公開第2014/065661号、van Geel et al.,Bioconj.Chem.2015,26,2233-2242、PCT/EP2021/050594、PCT/EP2021/050598およびNL2026947に開示されている。
当該分野で公知の任意のコンジュゲーション法を使用して、本発明に係る多機能性抗体構築物を調製することができる。好適なコンジュゲーション法としては、チオールライゲーション、リジンライゲーション、付加環化(例えば、銅触媒クリック反応、歪み促進型アジド-アルキン付加環化、歪み促進型キノン-アルキン付加環化)が挙げられる。本発明の文脈において使用される好ましいコンジュゲーション法には、求核反応および付加環化が含まれ、好ましくは、付加環化は、[4+2]付加環化または[3+2]付加環化であり、求核反応は、マイケル付加または求核置換である。好適なコンジュゲーション法は、例えば、G.T.Hermanson,“Bioconjugate Techniques”,Elsevier,3rd Ed.2013(ISBN:978-0-12-382239-0)、国際公開第2014/065661号、van Geel et al.,Bioconj.Chem.2015,26,2233-2242、PCT/EP2021/050594、PCT/EP2021/050598およびNL2026947に開示されている。
[0129]したがって、本発明に係るコンジュゲーションプロセスの好ましい実施形態において、コンジュゲーションは、求核置換またはマイケル反応などの求核反応を介して達成される。好ましい求核反応は、活性化エステルを用いた第1級アミノ基のアシル化である。好ましいマイケル反応は、バイオコンジュゲーションに広く用いられているマレイミド-チオール反応である。
[0130]したがって、本発明に係るコンジュゲーションプロセスの好ましい実施形態において、コンジュゲーションは、付加環化を介して達成される。好ましい付加環化は、(4+2)付加環化(例えば、ディールス-アルダー反応)または(3+2)付加環化(例えば、1,3-双極子付加環化)である。好ましくは、コンジュゲーション反応は、ディールス-アルダー反応または1,3-双極子付加環化である。好ましいディールス-アルダー反応は、逆電子要請型ディールス-アルダー付加環化である。別の好ましい実施形態において、1,3-双極子付加環化、より好ましくは、アルキン-アジド付加環化が用いられ、最も好ましくは、Qは、アルキン基であるかまたはアルキン基を含み、Fは、アジド基である。ディールス-アルダー反応および1,3-双極子付加環化などの付加環化は、当該分野で公知であり、当業者は、それらを行う方法を知っている。
[0131]接続基Z
使用されるコンジュゲーション法の正確な性質は、本発明に係る多機能性抗体構築物に存在するリンカーの正確な構造を決定する。典型的には、抗体Abに接続されるリンカーは、コンジュゲーション反応中に形成される接続基Zを含む。「接続基」という用語は、ある化合物の一部分と、同じ化合物の別の部分とを接続する構造要素のことを指す。例えば、Zは、抗体Abを、必要に応じてL8などのリンカーを介して、ペイロードまたは分枝部分BMに、必要に応じてL7などのリンカーを介して、接続し得る。当業者によって理解されるように、接続基の性質は、前記化合物の部分間の接続が得られる反応のタイプに依存する。一例として、R-C(O)-OH(またはその活性化エステル誘導体)のカルボキシル基を、H2N-R’のアミノ基と反応させてR-C(O)-N(H)-R’を形成するとき、Rは、接続基Zを介してR’に接続され、Zは、基-C(O)-N(H)-によって表される。接続基Zは、QとFとの反応に由来するので、任意の形態をとることができる。さらに、本発明の実施にとって、接続基Zの性質は、重要ではない。
使用されるコンジュゲーション法の正確な性質は、本発明に係る多機能性抗体構築物に存在するリンカーの正確な構造を決定する。典型的には、抗体Abに接続されるリンカーは、コンジュゲーション反応中に形成される接続基Zを含む。「接続基」という用語は、ある化合物の一部分と、同じ化合物の別の部分とを接続する構造要素のことを指す。例えば、Zは、抗体Abを、必要に応じてL8などのリンカーを介して、ペイロードまたは分枝部分BMに、必要に応じてL7などのリンカーを介して、接続し得る。当業者によって理解されるように、接続基の性質は、前記化合物の部分間の接続が得られる反応のタイプに依存する。一例として、R-C(O)-OH(またはその活性化エステル誘導体)のカルボキシル基を、H2N-R’のアミノ基と反応させてR-C(O)-N(H)-R’を形成するとき、Rは、接続基Zを介してR’に接続され、Zは、基-C(O)-N(H)-によって表される。接続基Zは、QとFとの反応に由来するので、任意の形態をとることができる。さらに、本発明の実施にとって、接続基Zの性質は、重要ではない。
[0132]リンカーL1、L2およびL3は、典型的には、コンジュゲーション反応によって入手可能な接続基Zを含む。多機能性抗体構築物が構造(1)を有する場合、リンカーL1中の接続基Zの構造が、リンカーL2中のものと異なることが好ましく、それにより、多機能性抗体構築物の合成が単純化される。2つの別個のコンジュゲーション法を用いることにより、2つの別個のペイロードを接続することができる。しかしながら、同じコンジュゲーション法を両方のペイロードに対して使用する合成アプローチであって、Zの構造がリンカーL1とL2の両方において同じである合成アプローチも開発することができる。
[0133]接続基は、典型的には、反応性部分Fを含む抗体を、反応性部分Qを含むペイロードリンカー構築物と反応させることによって得られる。ここで、反応性部分Fと反応性部分Qは、相補的であり、これは、QがFと反応して、接続基Zの形態の共有結合した構築物が形成されることを意味する。反応基Qを反応性部分Fに接続するために多数の有機反応が利用可能である。その結果として、多種多様な接続基Zが利用可能である。例えば、Zは、付加環化または求核反応によって入手可能であり得、好ましくは、付加環化は、[4+2]付加環化または1,3-双極子付加環化であり、求核反応は、マイケル付加または求核置換である。コンジュゲーション反応は、当業者に公知であり、当業者は、適切な反応パートナーFおよびQを選択することができ、得られる接続基Zの性質を理解するだろう。反応基Qのいくつかの例示的な選択肢が、図5に提供されており、QおよびFならびに対応する接続基Zのいくつかの例示的な組み合わせが、図1に提供されている。さらなる指針は、参照により援用されるG.T.Hermanson,“Bioconjugate Techniques”,Elsevier,3rd Ed.2013(ISBN:978-0-12-382239-0)、特にChapter 3の229~258頁に提供されている。
[0134]例えば、Fが、チオール基を含むかまたはチオール基であるとき、相補的な基Qには、N-マレイミジル基およびアルケニル基が含まれ、対応する接続基Zは、図1に示されているとおりである。Fが、チオール基を含むかまたはチオール基であるとき、相補的な基Qには、アレンアミド基およびホスホンアミダイト基も含まれる。
[0135]例えば、Fが、ケトン基を含むかまたはケトン基であるとき、相補的な基Qには、(O-アルキル)ヒドロキシルアミノ基およびヒドラジン基が含まれ、対応する接続基Zは、図1に示されているとおりである。
[0136]例えば、Fが、アルキニル基を含むかまたはアルキニル基であるとき、相補的な基Qには、アジド基が含まれ、対応する接続基Zは、図1に示されているとおりである。
[0137]例えば、Fが、アジド基を含むかまたはアジド基であるとき、相補的な基Qには、アルキニル基が含まれ、対応する接続基Zは、図1に示されているとおりである。
[0138]例えば、Fが、シクロプロペニル基、trans-シクロオクテン基またはシクロアルキン基を含むかまたはそれらであるとき、相補的な基Qには、テトラジニル基が含まれ、対応する接続基Zは、図1に示されているとおりである。特定の場合において、Zは、中間構造にすぎず、N2を放出し、それによってジヒドロピリダジン(アルケンとの反応から)またはピリダジン(アルキンとの反応から)を生成する。
[0139]例えば、Fが、テトラジニル基を含むかまたはテトラジニル基であるとき、相補的な基Qには、シクロプロペニル基、trans-シクロオクテン基またはシクロアルキン基が含まれ、対応する接続基Zは、図1に示されているとおりである。特定の場合において、Zは、中間構造にすぎず、N2を放出し、それによってジヒドロピリダジン(アルケンとの反応から)またはピリダジン(アルキンとの反応から)を生成する。
[0140]FおよびQのさらなる好適な組み合わせ、ならびに得られる接続基Zの性質は、当業者に公知であり、例えば、参照により援用されるG.T.Hermanson,“Bioconjugate Techniques”,Elsevier,3rd Ed.2013(ISBN:978-0-12-382239-0),Chapter 3の229~258頁に記載されている。バイオコンジュゲーションプロセスに適した相補的な反応基のリストは、G.T.Hermanson,“Bioconjugate Techniques”,Elsevier,3rd Ed.2013(ISBN:978-0-12-382239-0)のChapter 3の230~232頁の表3.1に開示されており、この表の内容は、参照により本明細書中に明確に援用される。
[0141]好ましい実施形態において、各Zは、-O-、-S-、-S-S-、-NR2-、-N=N-、-C(O)-、-C(O)-NR2-、-O-C(O)-、-O-C(O)-O-、-O-C(O)-NR2、-NR2-C(O)-、-NR2-C(O)-O-、-NR2-C(O)-NR2-、-S-C(O)-、-S-C(O)-O-、-S-C(O)-NR2-、-S(O)-、-S(O)2-、-O-S(O)2-、-O-S(O)2-O-、-O-S(O)2-NR2-、-O-S(O)-、-O-S(O)-O-、-O-S(O)-NR2-、-O-NR2-C(O)-、-O-NR2-C(O)-O-、-O-NR2-C(O)-NR2-、-NR2-O-C(O)-、-NR2-O-C(O)-O-、-NR2-O-C(O)-NR2-、-O-NR2-C(S)-、-O-NR2-C(S)-O-、-O-NR2-C(S)-NR2-、-NR2-O-C(S)-、-NR2-O-C(S)-O-、-NR2-O-C(S)-NR2-、-O-C(S)-、-O-C(S)-O-、-O-C(S)-NR2-、-NR2-C(S)-、-NR2-C(S)-O-、-NR2-C(S)-NR2-、-S-S(O)2-、-S-S(O)2-O-、-S-S(O)2-NR2-、-NR2-O-S(O)-、-NR2-O-S(O)-O-、-NR2-O-S(O)-NR2-、-NR2-O-S(O)2-、-NR2-O-S(O)2-O-、-NR2-O-S(O)2-NR2-、-O-NR2-S(O)-、-O-NR2-S(O)-O-、-O-NR2-S(O)-NR2-、-O-NR2-S(O)2-O-、-O-NR2-S(O)2-NR2-、-O-NR2-S(O)2-、-O-P(O)(R2)2-、-S-P(O)(R2)2-、-NR2-P(O)(R2)2-、および(Z1)~(Z71)のうちのいずれか1つによって表される部分からなる群から独立して選択される。ここで、R2は、水素、C1-C24アルキル基、C2-C24アルケニル基、C2-C24アルキニル基およびC3-C24シクロアルキル基からなる群から独立して選択され、そのアルキル基、アルケニル基、アルキニル基およびシクロアルキル基は、置換されていてもよい。
[0142]より好ましくは、各Zは、スクシンイミド、トリアゾール、シクロヘキセン、シクロヘキサジエン、イソオキサゾリン、イソオキサゾリジン、ピラゾリン、ピペラジン、チオエーテル、アミドまたはイミド基からなる群から選択される部分を含む。好ましくは、Zは、トリアゾール、シクロヘキセン、シクロヘキサジエン、イソオキサゾリン、イソオキサゾリジン、ピラゾリン、ピペラジン、チオエーテル、アミドまたはイミド基からなる群から選択されるから選択される部分を含む。特に好ましい実施形態において、Zは、トリアゾール部分またはスクシンイミド部分を含む。トリアゾール部分が、Zに存在することが特に好ましい。
[0143]第1の好ましい実施形態において、Zは、付加環化によって形成される。好ましい付加環化は、(4+2)付加環化(例えば、ディールス-アルダー反応)または(3+2)付加環化(例えば、1,3-双極子付加環化)である。好ましくは、コンジュゲーション反応は、ディールス-アルダー反応または1,3-双極子付加環化である。好ましいディールス-アルダー反応は、逆電子要請型ディールス-アルダー付加環化である。別の好ましい実施形態において、1,3-双極子付加環化、より好ましくは、アルキン-アジド付加環化が用いられ、最も好ましくは、Qは、アルキン基であるかまたはアルキン基を含み、Fは、アジド基である。ディールス-アルダー反応および1,3-双極子付加環化などの付加環化は、当該分野で公知であり、当業者は、それらを行う方法を知っている。
[0144]好ましくは、Zは、トリアゾール、シクロヘキセン、シクロヘキサジエン、[2.2.2]-ビシクロオクタジエン、[2.2.2]-ビシクロオクテン、イソオキサゾリン、イソオキサゾリジン、ピラゾリン、ピペラジン、チオエーテル、アミドまたはイミド基からなる群から選択される部分を含む。トリアゾール部分が、Zに存在することが特に好ましい。1つの実施形態において、Zは、(ヘテロ)シクロアルケン部分を含み、すなわち、(ヘテロ)シクロアルキン部分を含むQから形成される。別の実施形態において、Zは、(ヘテロ)シクロアルカン部分を含み、すなわち、(ヘテロ)シクロアルケン部分を含むQから形成される。
[0146]ここで、---として示される結合は、単結合または二重結合である。さらに、
R15は、水素、ハロゲン、-OR16、-NO2、-CN、-S(O)2R16、-S(O)3 (-)、C1-C24アルキル基、C6-C24(ヘテロ)アリール基、C7-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC7-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立して選択され、そのアルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基および(ヘテロ)アリールアルキル基は、置換されていてもよく、2つの置換基R15は、一緒に連結して、置換されていてもよい環化シクロアルキルまたは置換されていてもよい環化(ヘテロ)アレーン置換基を形成してもよく、R16は、水素、ハロゲン、C1-C24アルキル基、C6-C24(ヘテロ)アリール基、C7-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC7-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立して選択され;
Y2は、C(R31)2、O、S、S(+)R31、S(O)R31、S(O)=NR31またはNR31であり、S(+)は、B(-)によって平衡化されたカチオン性硫黄原子であり、B(-)は、アニオンであり、各R31は、個別にR15であるか、またはLを介して接続される、Q2もしくはDとの接続であり;
uは、0、1、2、3、4または5であり;
u’は、0、1、2、3、4または5であり、ここで、u+u’=0、1、2、3、4、5、6、7または8であり;
v=8~16の範囲の整数であり;
環Zは、付加環化によって形成され、好ましくは、下記で定義される(Za)~(Zn)から選択される。
R15は、水素、ハロゲン、-OR16、-NO2、-CN、-S(O)2R16、-S(O)3 (-)、C1-C24アルキル基、C6-C24(ヘテロ)アリール基、C7-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC7-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立して選択され、そのアルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基および(ヘテロ)アリールアルキル基は、置換されていてもよく、2つの置換基R15は、一緒に連結して、置換されていてもよい環化シクロアルキルまたは置換されていてもよい環化(ヘテロ)アレーン置換基を形成してもよく、R16は、水素、ハロゲン、C1-C24アルキル基、C6-C24(ヘテロ)アリール基、C7-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC7-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立して選択され;
Y2は、C(R31)2、O、S、S(+)R31、S(O)R31、S(O)=NR31またはNR31であり、S(+)は、B(-)によって平衡化されたカチオン性硫黄原子であり、B(-)は、アニオンであり、各R31は、個別にR15であるか、またはLを介して接続される、Q2もしくはDとの接続であり;
uは、0、1、2、3、4または5であり;
u’は、0、1、2、3、4または5であり、ここで、u+u’=0、1、2、3、4、5、6、7または8であり;
v=8~16の範囲の整数であり;
環Zは、付加環化によって形成され、好ましくは、下記で定義される(Za)~(Zn)から選択される。
[0147]---として示される結合が二重結合である場合、u+u’=4、5、6、7または8であることが好ましい。好ましくは、*でラベルされた波状結合は、必要に応じてリンカーを介して抗体Abに接続され、**でラベルされた波状結合は、必要に応じてリンカーを介してペイロードに接続される。
[0148]環Zは、付加環化反応によって形成され、好ましくは、トリアゾール、シクロヘキセン、シクロヘキサジエン、[2.2.2]-ビシクロオクタジエン、[2.2.2]-ビシクロオクテン、イソオキサゾリン、イソオキサゾリジン、ピラゾリンまたはピペラジンである。最も好ましくは、環Zは、トリアゾール環である。環Zは、好ましくは、下記に示される(Za)~(Zn)から選択される構造を有し、**でラベルされた炭素原子は、環Zが縮合している(ヘテロ)シクロアルカンまたは(ヘテロ)シクロアルケン環の2つの炭素原子に対応する。環Zが(ヘテロ)シクロアルケン環に縮合している場合、(Z1)において---として上で示された結合は、二重結合であり、環Zは、好ましくは、下記に示される(Za)~(Zj)から選択される。好ましくは、環Zは、(Za)、(Zi)または(Zj)に記載のもの、最も好ましくは、(Za)に記載のものである。
[0149]環Zが(ヘテロ)シクロアルカン環に縮合している場合、(Z1)において---として上で示された結合は、単結合であり、環Zは、好ましくは、下記に示される(Zk)~(Zn)から選択される。好ましくは、環Zは、(Zn)に記載のものである。
[0150]Zが(ヘテロ)シクロアルケン部分を含むこと、すなわち、---として示される結合が二重結合であることが特に好ましい。好ましい実施形態において、Zは、下記に示される構造(Z2)~(Z20)から選択される。
[0151]本明細書において、典型的にはリンカーを介した、ペイロードへの接続は、波状結合で示されている。B(-)は、アニオン、好ましくは、薬学的に許容され得るアニオンである。環Zは、付加環化反応によって形成され、好ましくは、上に示された(Za)~(Zj)から選択される構造を有し、**でラベルされた炭素原子は、環Zが縮合している(Z2)~(Z20)の(ヘテロ)シクロアルケン環の2つの炭素原子に対応する。
[0153]本明細書において、必要に応じてリンカーを介した、ペイロードへの接続は、波状結合で示されている。構造(Z38)において、B(-)は、アニオン、好ましくは、薬学的に許容され得るアニオンである。環Zは、上で定義されたような構造(Za)~(Zj)から選択される。環Zは、付加環化反応によって形成され、好ましくは、上に示された(Za)~(Zj)から選択される構造を有し、**でラベルされた炭素原子は、環Zが縮合している(Z21)~(Z38)の(ヘテロ)シクロアルケン環の2つの炭素原子に対応する。
[0154]好ましい実施形態において、Zは、置換されていてもよい、構造(Z8)、より好ましくは(Z29)に記載の(ヘテロ)シクロオクテン部分を含む。本実施形態の文脈において、Zは、好ましくは、下記に示されるような構造(Z39)に記載の(ヘテロ)シクロオクテン部分を含み、Vは、(CH2)lであり、lは、0~10の範囲、好ましくは、0~6の範囲の整数である。より好ましくは、lは、0、1、2、3または4であり、より好ましくは、lは、0、1または2であり、最も好ましくは、lは、0または1である。基(Z39)の文脈において、lは、最も好ましくは、1である。最も好ましくは、Zは、下記でさらに定義される構造(Z42)に記載のものである。
[0155]別の好ましい実施形態において、Zは、置換されていてもよい、構造(Z26)、(Z27)または(Z28)に記載の(ヘテロ)シクロオクテン部分を含む。本実施形態の文脈において、Zは、好ましくは、下記に示されるような構造(Z40)または(Z41)に記載の(ヘテロ)シクロオクテン部分を含み、Y1は、OまたはNR11であり、R11は、水素、直鎖状もしくは分枝状のC1-C12アルキル基またはC4-C12(ヘテロ)アリール基からなる群から独立して選択される。(Z40)の芳香環は、1つ以上の位置において必要に応じてO-スルホニル化されるのに対し、(Z41)の環は、1つ以上の位置においてハロゲン化されてもよい。最も好ましくは、Zは、下記でさらに定義される構造(Z43)に記載のものである。
[0157]特に好ましい実施形態において、Zは、シクロオクテニル基を含み、構造(Z42):
に記載のものであり、
ここで、
*でラベルされた結合は、必要に応じてリンカーを介して、抗体に接続され、**でラベルされた波状結合は、必要に応じてリンカーを介して、ペイロードに接続され;
R15は、水素、ハロゲン、-OR16、-NO2、
-CN、-S(O)2R16、-S(O)3 (-)、C1-C24アルキル基、C5-C24(ヘテロ)アリール基、C7-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC7-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立して選択され、そのアルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基および(ヘテロ)アリールアルキル基は、必要に応じて置換され、2つの置換基R15が、一緒に連結して、置換されていてもよい環化シクロアルキルまたは置換されていてもよい環化(ヘテロ)アレーン置換基を形成してもよく、R16は、水素、ハロゲン、C1-C24アルキル基、C6-C24(ヘテロ)アリール基、C7-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC7-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立して選択され;
R18は、水素、ハロゲン、C1-C24アルキル基、C6-C24(ヘテロ)アリール基、C7-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC7-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立して選択され;
R19は、水素、ハロゲン、C1-C24アルキル基、C6-C24(ヘテロ)アリール基、C7-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC7-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から選択され、そのアルキル基は、O、NおよびSからなる群から選択されるより多くのヘテロ原子のうちの1つによって中断されていてもよく、そのアルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基および(ヘテロ)アリールアルキル基は、独立して必要に応じて置換されているか、またはR19は、スペーサー部分を介して接続される、D3などのペイロードのさらなる存在であり;
lは、0~10の範囲の整数である。
に記載のものであり、
ここで、
*でラベルされた結合は、必要に応じてリンカーを介して、抗体に接続され、**でラベルされた波状結合は、必要に応じてリンカーを介して、ペイロードに接続され;
R15は、水素、ハロゲン、-OR16、-NO2、
-CN、-S(O)2R16、-S(O)3 (-)、C1-C24アルキル基、C5-C24(ヘテロ)アリール基、C7-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC7-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立して選択され、そのアルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基および(ヘテロ)アリールアルキル基は、必要に応じて置換され、2つの置換基R15が、一緒に連結して、置換されていてもよい環化シクロアルキルまたは置換されていてもよい環化(ヘテロ)アレーン置換基を形成してもよく、R16は、水素、ハロゲン、C1-C24アルキル基、C6-C24(ヘテロ)アリール基、C7-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC7-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立して選択され;
R18は、水素、ハロゲン、C1-C24アルキル基、C6-C24(ヘテロ)アリール基、C7-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC7-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立して選択され;
R19は、水素、ハロゲン、C1-C24アルキル基、C6-C24(ヘテロ)アリール基、C7-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC7-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から選択され、そのアルキル基は、O、NおよびSからなる群から選択されるより多くのヘテロ原子のうちの1つによって中断されていてもよく、そのアルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基および(ヘテロ)アリールアルキル基は、独立して必要に応じて置換されているか、またはR19は、スペーサー部分を介して接続される、D3などのペイロードのさらなる存在であり;
lは、0~10の範囲の整数である。
[0158]構造(Z42)に記載の基の好ましい実施形態において、R15は、水素、ハロゲン、-OR16、C1-C6アルキル基、C5-C6(ヘテロ)アリール基からなる群から独立して選択され、R16は、水素またはC1-C6アルキルであり、より好ましくは、R15は、水素およびC1-C6アルキルからなる群から独立して選択され、最も好ましくは、すべてのR15がHである。構造(Z42)に記載の基の好ましい実施形態において、R18は、水素、C1-C6アルキル基からなる群から独立して選択され、最も好ましくは、両方のR18がHである。構造(Z42)に記載の基の好ましい実施形態において、R19は、Hである。構造(Z42)に記載の基の好ましい実施形態において、Iは、0または1であり、より好ましくは、lは、1である。
[0159]特に好ましい実施形態において、Zは、(ヘテロ)シクロオクテニル基を含み、構造(Z43)に記載のものである:
ここで、
*でラベルされた結合は、必要に応じてリンカーを介して、抗体に接続され、**でラベルされた波状結合は、必要に応じてリンカーを介して、ペイロードに接続され;
R15は、水素、ハロゲン、-OR16、-NO2、-CN、-S(O)2R16、-S(O)3 (-)、C1-C24アルキル基、C5-C24(ヘテロ)アリール基、C7-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC7-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立して選択され、そのアルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基および(ヘテロ)アリールアルキル基は、置換されていてもよく、2つの置換基R15が、一緒に連結して、置換されていてもよい環化シクロアルキルまたは置換されていてもよい環化(ヘテロ)アレーン置換基を形成してもよく、R16は、水素、ハロゲン、C1-C24アルキル基、C6-C24(ヘテロ)アリール基、C7-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC7-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立して選択され;
Yは、NまたはCR15である。
ここで、
*でラベルされた結合は、必要に応じてリンカーを介して、抗体に接続され、**でラベルされた波状結合は、必要に応じてリンカーを介して、ペイロードに接続され;
R15は、水素、ハロゲン、-OR16、-NO2、-CN、-S(O)2R16、-S(O)3 (-)、C1-C24アルキル基、C5-C24(ヘテロ)アリール基、C7-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC7-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立して選択され、そのアルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基および(ヘテロ)アリールアルキル基は、置換されていてもよく、2つの置換基R15が、一緒に連結して、置換されていてもよい環化シクロアルキルまたは置換されていてもよい環化(ヘテロ)アレーン置換基を形成してもよく、R16は、水素、ハロゲン、C1-C24アルキル基、C6-C24(ヘテロ)アリール基、C7-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC7-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立して選択され;
Yは、NまたはCR15である。
[0160]構造(Z43)に記載の基の好ましい実施形態において、R15は、水素、ハロゲン、-OR16、-S(O)3
(-)、C1-C6アルキル基、C5-C6(ヘテロ)アリール基からなる群から独立して選択され、R16は、水素またはC1-C6アルキルであり、より好ましくは、R15は、水素および-S(O)3
(-)からなる群から独立して選択される。構造(Z43)に記載の基の好ましい実施形態において、Yは、NまたはCHであり、より好ましくは、Y=Nである。
[0161]別の好ましい実施形態において、Zは、(ヘテロ)シクロアルカン部分を含み、すなわち、---として示される結合は、単結合である。(ヘテロ)シクロアルカン基は、ヘテロシクロアルカニル基またはシクロアルカニル基、好ましくは、シクロアルカニル基と呼ばれることもあり、(ヘテロ)シクロアルカニル基は、置換されていてもよい。好ましくは、(ヘテロ)シクロアルカニル基は、(ヘテロ)シクロプロパニル基、(ヘテロ)シクロブタニル基、ノルボルナン基、ノルボルネン基、(ヘテロ)シクロヘプタニル基、(ヘテロ)シクロオクタニル基、(ヘテロ)シクロノンニル基または(ヘテロ)シクロデカニル基であり、これらはすべて、必要に応じて置換されてもよい。(ヘテロ)シクロプロパニル基、(ヘテロ)シクロヘプタニル基または(ヘテロ)シクロオクタニル基が特に好ましく、(ヘテロ)シクロプロパニル基、trans-(ヘテロ)シクロヘプタニル基または(ヘテロ)シクロオクタニル基は、置換されていてもよい。
[0162]好ましくは、Zは、構造(Z44)に記載のシクロプロパニル部分、構造(Z45)に記載のヘテレオシクロブタン部分、構造(Z46)に記載のノルボルナンもしくはノルボルネン基、構造(Z47)に記載の(ヘテロ)シクロヘプタニル部分または構造(Z48)に記載の(ヘテロ)シクロオクタニル部分を含む。ここで、Y3は、C(R23)2、NR23またはOから選択され、各R23は、個別に水素、C1-C6アルキルであるか、または必要に応じてスペーサーを介して、Lに接続され、---とラベルされた結合は、単結合または二重結合である。さらに好ましい実施形態において、シクロプロパニル基は、構造(Z49)に記載のものである。別の好ましい実施形態において、(ヘテロ)シクロヘプタン基は、構造(Z50)または(Z51)に記載のものである。別の好ましい実施形態において、(ヘテロ)シクロオクタン基は、構造(Z52)、(Z53)、(Z54)、(Z55)または(Z56)に記載のものである。
[0163]ここで、(Z50)および(Z51)中のSi上のR基は、典型的には、アルキルまたはアリール、好ましくは、C1-C6アルキルである。環Zは、付加環化反応によって形成され、好ましくは、上に示された(Zk)~(Zn)から選択される構造を有し、**でラベルされた炭素原子は、環Zが縮合している(Z44)~(Z56)の(ヘテロ)シクロアルカン環の2つの炭素原子に対応する。
[0164]第2の好ましい実施形態において、Zは、求核反応によって、好ましくは、求核アシル化またはマイケル付加によって、好ましくは、マイケル付加によって形成される。好ましいマイケル反応は、チオール-マレイミドライゲーションであり、最も好ましくは、Qがマレイミドであり、Fがチオール基である。好ましい実施形態において、接続基Zは、スクシンイミジル環またはその開環コハク酸アミド誘導体を含む。接続基Zの好ましい選択肢は、下記に示される(Z57)~(Z71)から選択される部分を含む。
[0165]ここで、*でラベルされた波状結合は、必要に応じてリンカーを介して、抗体Abに接続され、標識なしの波状結合は、必要に応じてリンカーを介して、ペイロードに接続される。さらに、R29は、C1-12アルキル、好ましくは、C1-4アルキル、最も好ましくは、エチルであり、X1は、OまたはS、好ましくは、X1=Oである。(Z67)~(Z71)において**でラベルされた窒素原子は、抗体のリジン残基の側鎖の窒素原子に対応する。(Z69)および(Z70)のフェニル基の炭素原子は、置換されていてもよく、好ましくは、フッ素化されていてもよい。
[0166]好ましい実施形態において、接続基Zは、(Z1)~(Z71)から選択される部分を含む。
[0167]リンカー
本発明に係る多重特異性抗体構築物は、いくつかのリンカーを含む。連結単位とも呼ばれるリンカーは、当該分野で周知であり、任意の好適なリンカーを使用してもよい。構造(1)の多重特異性抗体構築物において、リンカーL1は、抗体AbをペイロードD1と接続し、リンカーL2は、抗体AbをペイロードD2と接続する。構造(2)の多重特異性抗体構築物において、リンカーL3は、抗体Abを分枝部分BMと接続し、リンカーL4は、分枝部分BMをペイロードD1と接続し、リンカーL5は、分枝部分BMをペイロードD2と接続する。リンカーは、切断可能であってもよいし、切断不可能であってもよい。リンカーは、複数のペイロードDを抗体Abに結合させるための1つ以上の分枝点(BMに加えて)を含み得る。
本発明に係る多重特異性抗体構築物は、いくつかのリンカーを含む。連結単位とも呼ばれるリンカーは、当該分野で周知であり、任意の好適なリンカーを使用してもよい。構造(1)の多重特異性抗体構築物において、リンカーL1は、抗体AbをペイロードD1と接続し、リンカーL2は、抗体AbをペイロードD2と接続する。構造(2)の多重特異性抗体構築物において、リンカーL3は、抗体Abを分枝部分BMと接続し、リンカーL4は、分枝部分BMをペイロードD1と接続し、リンカーL5は、分枝部分BMをペイロードD2と接続する。リンカーは、切断可能であってもよいし、切断不可能であってもよい。リンカーは、複数のペイロードDを抗体Abに結合させるための1つ以上の分枝点(BMに加えて)を含み得る。
[0168]本発明に係る多機能性抗体構築物のために定義される各リンカーは、独立して、C、N、O、SおよびPから選択される少なくとも1個、好ましくは5~100個の原子の鎖である。ここで、原子の鎖とは、連結単位の末端から延びる最も短い原子の鎖のことを指す。鎖内の原子は、骨格原子と呼ばれることもある。当業者が理解するように、C、NおよびPなどの3以上の結合価を有する原子は、これらの原子の結合価を完了させるように適切に官能化され得る。換言すれば、骨格原子は、官能化されていてもよい。好ましい実施形態において、L1、L2およびL3、ならびに存在する場合にはL4およびL5の各々は、独立して、C、N、O、SおよびPから選択される少なくとも5~50個、好ましくは6~25個の原子の鎖である。骨格原子は、好ましくは、C、NおよびOから選択される。
[0169]リンカーは、例えば、直鎖状または分枝状のC1-C200アルキレン基、C2-C200アルケニレン基、C2-C200アルキニレン基、C3-C200シクロアルキレン基、C5-C200シクロアルケニレン基、C8-C200シクロアルキニレン基、C7-C200アルキルアリーレン基、C7-C200アリールアルキレン基、C8-C200アリールアルケニレン基、C9-C200アリールアルキニレン基およびそれらの組み合わせからなる群から選択され得る。必要に応じて、そのアルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基およびアリールアルキニレン基は、置換され得、必要に応じて前記基は、1つ以上のヘテロ原子、好ましくは、1~100個のヘテロ原子によって中断され得、前記ヘテロ原子は、好ましくは、O、S(O)yおよびNR12からなる群から選択され、yは、0、1または2、好ましくは、y=2であり、R12は、水素、ハロゲン、C1-C24アルキル基、C6-C24(ヘテロ)アリール基、C7-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC7-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立して選択される。リンカーは、(ポリ)エチレングリコールジアミン(例えば、1,8-ジアミノ-3,6-ジオキサオクタンまたはより長いエチレングリコール鎖を含む等価物)、(ポリ)エチレングリコールまたは(ポリ)エチレンオキシド鎖、(ポリ)プロピレングリコールまたは(ポリ)プロピレンオキシド鎖および1,z-ジアミノアルカンを含み得、ここで、zは、アルカン中の炭素原子の数であり、例えば、2~25の範囲であり得る。
[0170]各リンカーは、切断可能であってもよいし、切断不可能であってもよい。特に、ペイロードに直接結合したリンカー、すなわちL1および/もしくはL2またはL4および/もしくはL5は、切断可能であり得る。切断可能なリンカーは、それらが結合しているペイロードが細胞毒または受動拡散によって腫瘍細胞に入ることができる任意の小分子ペイロードである場合に特に好ましい。ここで、切断可能なリンカーは、好ましくは、腫瘍リソソームまたは腫瘍微小環境において切断可能である。したがって、1つの実施形態において、切断可能なリンカーは、腫瘍微小環境において切断可能である。腫瘍微小環境において切断可能なリンカーは、細胞毒ペイロードが腫瘍細胞の外側表面上の受容体を標的とするポリペプチドと組み合わされるとき、特に有利である。したがって、多機能性抗体構築物は、腫瘍微小環境において腫瘍細胞に結合し、そこで細胞毒に対するリンカーが切断され、細胞毒が腫瘍細胞に近接して放出される。次いで、細胞毒の内部移行が、腫瘍細胞の細胞死をもたらし得る。腫瘍微小環境において切断可能なリンカーは、当業者に公知であり、典型的には、タンパク質分解酵素、例えば、FAP(線維芽細胞活性化タンパク質)、プロタンパク質転換酵素サブチリシン、フューリン、エラスターゼ、レグマイン、線維芽細胞活性化タンパク質、組織型プラスミノーゲン活性化因子、ウロキナーゼ、マトリックスメタロプロテアーゼ(MMP)およびマトリプターゼによる加水分解を受けやすい。腫瘍リソソームにおいて切断可能なリンカーは、当業者に公知であり、典型的には、タンパク質分解酵素、例えば、グランザイム、カテプシン、プロタンパク質転換酵素サブチリシン、フューリン、レグマイン、カスパーゼおよびカリケレインによる加水分解を受けやすい。
[0171]そのような切断可能なリンカーは、当該分野で公知であり、典型的には、ペプチドスペーサーまたはペプチド誘導体(例えば、シクロブタン-1,1-ジカルボキサミド-Cit)を含む。切断可能なリンカーは、構造(26):
のペプチドスペーサーを含むことが好ましく、ここで、R17は、アミノ酸側鎖を表し、nは、1~10の範囲の整数、好ましくは、n=1~8、より好ましくは、n=1~5、最も好ましくは、n=1~4、好ましくは、n=2である。
のペプチドスペーサーを含むことが好ましく、ここで、R17は、アミノ酸側鎖を表し、nは、1~10の範囲の整数、好ましくは、n=1~8、より好ましくは、n=1~5、最も好ましくは、n=1~4、好ましくは、n=2である。
[0172]好ましくは、ペプチドスペーサーは、当該分野で公知であるようなジペプチドスペーサーまたはトリペプチドスペーサー、好ましくは、ジペプチドスペーサーである。好適なペプチドスペーサーは、Val-Cit、Val-Ala、Val-Lys、Val-Arg、Val-Gln、AcLys-Val-Cit、AcLys-Val-Ala、Phe-Cit、Phe-Ala、Phe-Lys、Phe-Arg、Phe-Gln、Ala-Lys、Leu-Cit、Leu-Gln、Ile-Cit、Trp-Cit、Ala-Ala-Asn、Ala-Asn、Pro-Leu-Gly、Asn-Pro-Val、Lys-Ser-Gly-Arg-Ser-Asp-Asn-His、Pro-Val-Gly-Leu-Ile-Gly、Val-Lys-Gly、Gly-Gly-Gly、Gly-Gly-Phe-GlyおよびLys、好ましくは、Val-Cit、Val-Ala、Val-Lys、Val-Arg、AcLys-Val-Cit、AcLys-Val-Ala、Phe-Cit、Phe-Ala、Phe-Lys、Phe-Arg、Ala-Lys、Leu-Cit、Ile-Cit、Trp-Cit、Ala-Ala-Asn、Ala-Asn、より好ましくは、Val-Cit、Val-Ala、Val-Lys、Phe-Cit、Phe-Ala、Phe-Lys、Ala-Ala-Asn、Ala-Asn、Pro-Leu-Gly、Asn-Pro-Val、Lys-Ser-Gly-Arg-Ser-Asp-Asn-His、Gly-Gly-Phe-GlyおよびLysからなる群から選択され、好ましくは、ペプチドスペーサーは、Val-Cit、Val-AlaまたはAla-Ala-Asnである。1つの実施形態において、ペプチドスペーサーは、Val-Citである。1つの実施形態において、ペプチドスペーサーは、Val-Alaである。
[0173]好ましい実施形態において、ペプチドスペーサーは、一般構造(27):
によって表され、ここで、R17は、アミノ酸側鎖を表し、好ましくは、R17=CH3(Val)またはCH2CH2CH2NHC(O)NH2(Cit)である。
によって表され、ここで、R17は、アミノ酸側鎖を表し、好ましくは、R17=CH3(Val)またはCH2CH2CH2NHC(O)NH2(Cit)である。
[0174]構造(26)および(27)における波線は、その分子の残りの部分への接続を示し、好ましくは、ペプチドスペーサーは、NH抗体を介して、典型的にはリンカーを介して、およびC(O)を介して、典型的にはリンカーを介して、ペイロードに接続される。
[0175]抗体Abに直接結合したリンカーは、抗体に対する単一の結合点を有してもよいし、2つ以上の、典型的には2つの、結合点を有してもよい。これは、リンカーL1、L2、L3についても同様である。リンカーL1とリンカーL2の両方が、2つ以上の結合点を有することも可能であるが、リンカーL1およびリンカーL2の一方が1つの結合点のみを有し、他方が1つまたは2つの結合点を有することが好ましい。
[0176]抗体Abに対する2つの結合点を有するリンカーは、好ましくは、構造(L-A):
によって表され、ここで、
L6、L7およびL8は、リンカーであり;
pおよびqは、それぞれ個別に1または0であり;
BM1は、分枝部分であり;
Zは、接続基である。
によって表され、ここで、
L6、L7およびL8は、リンカーであり;
pおよびqは、それぞれ個別に1または0であり;
BM1は、分枝部分であり;
Zは、接続基である。
[0177]好ましい実施形態において、リンカーL1またはリンカーL3は、構造(L-A)を有する。リンカーL1が構造(L-A)を有する場合、x1は、1または2であることが好ましく、好ましくは、x1は、1である。リンカーL3が構造(L-A)を有する場合、x3は、1または2であることが好ましく、好ましくは、x3は、1である。
[0178]分枝部分BM1は、その好ましい実施形態を含めて、分枝部分BMと同じ方法で定義される。本発明に係る多機能性抗体構築物が、分枝部分BMとBM1の両方を含む場合、両方の分枝部分は、同じであっても異なっていてもよい。
[0179]接続基Zは、さらに上で定義されている。好ましくは、Zの両方の存在は、同じである。本実施形態の文脈において、接続基Zは、好ましくは、上で定義されたような付加環化によって得られる。Zが付加環化によって得られる場合、好ましくは、両方のリンカーL8が存在し、q=1である。両方のリンカーL7が、好ましくは存在し、p=1である。最も好ましくは、q=p=1である。
[0180]L6は、好ましくは、構造(L-D):
**-(L21)n-(L22)o-(L23)p-(L24)q-***
(L-D)
を有し、ここで、
**とラベルされた結合は、BM1に接続され、***とラベルされた結合は、BMに接続され;
n、o、pおよびqは、それぞれ独立して、0または1であり;
L21、L22、L23およびL24は、リンカーである。
**-(L21)n-(L22)o-(L23)p-(L24)q-***
(L-D)
を有し、ここで、
**とラベルされた結合は、BM1に接続され、***とラベルされた結合は、BMに接続され;
n、o、pおよびqは、それぞれ独立して、0または1であり;
L21、L22、L23およびL24は、リンカーである。
[0181]リンカーL6は、多機能性抗体構築物の合成中に形成される接続基Zを含み得る。BM、D1およびD2を含むペイロード構築物は、BM1を含むリンカー構築物に接続されてもよく、これはリンカー構築物(特に反応性部分Q)と機能化抗体(特に反応性部分F)との反応の前または後のいずれであってもよい。2つの代表的な合成アプローチを下記のスキーム1および2に示す。リンカーL3内の接続基は、連結単位L21、L22、L23およびL24のいずれかの接合点において形成されてもよいし、リンカーL3内に別々に存在してもよい。したがって、リンカーL3は、-Sp-Z-Sp-(式中、Spは個別にスペーサーである)によって表され得る。これらのスペーサーは、典型的には、構造(L-D)によって定義されるリンカーの一部を含む。例えば、L3は、-Z-(L21)n-(L22)o-(L23)p-(L24)q-または-(L21)n-Z-(L22)o-(L23)p-(L24)q-によって表され得る。ここで、Zは、任意の形態をとってもよく、好ましくは、上で定義されたとおりである。
[0184]次に、リンカー構築物は、以下のようなコンジュゲーション反応によって調製され得る:
ここで、R32=D1もしくはD2((16)および(19)の場合)、またはR32=BM((L4)m-D1)((L5)n-D2)((17)および(20)の場合)である。
ここで、R32=D1もしくはD2((16)および(19)の場合)、またはR32=BM((L4)m-D1)((L5)n-D2)((17)および(20)の場合)である。
[0185]リンカーL7は、BMを接続基Zと接続する。L7が両方とも存在することが好ましく、すなわち、pの両方の存在が1であり、より好ましくは、それらは同じである。各L7は、直鎖状または分枝状のC1-C200アルキレン基、C2-C200アルケニレン基、C2-C200アルキニレン基、C3-C200シクロアルキレン基、C5-C200シクロアルケニレン基、C8-C200シクロアルキニレン基、C7-C200アルキルアリーレン基、C7-C200アリールアルキレン基、C8-C200アリールアルケニレン基およびC9-C200アリールアルキニレン基からなる群より独立して選択され得、そのアルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基およびアリールアルキニレン基は、O、SおよびNR3の群から選択される1つ以上のヘテロ原子によって置換されていてもよく、中断されていてもよく、R3は、水素、C1-C24アルキル基、C2-C24アルケニル基、C2-C24アルキニル基およびC3-C24シクロアルキル基からなる群から独立して選択され、そのアルキル基、アルケニル基、アルキニル基およびシクロアルキル基は、置換されていてもよい。そのアルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基およびアリールアルキニレン基が、上で定義されたような1つ以上のヘテロ原子によって中断されるとき、前記基は、1つ以上のO原子および/または1つ以上のS-S基によって中断されることが好ましい。
[0186]より好ましくは、各L7は、直鎖状または分枝状のC1-C100アルキレン基、C2-C100アルケニレン基、C2-C100アルキニレン基、C3-C100シクロアルキレン基、C5-C100シクロアルケニレン基、C8-C100シクロアルキニレン基、C7-C100アルキルアリーレン基、C7-C100アリールアルキレン基、C8-C100アリールアルケニレン基およびC9-C100アリールアルキニレン基からなる群から独立して選択され、そのアルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基およびアリールアルキニレン基は、O、SおよびNR3の群から選択される1つ以上のヘテロ原子によって置換されていてもよく、中断されていてもよく、R3は、水素、C1-C24アルキル基、C2-C24アルケニル基、C2-C24アルキニル基およびC3-C24シクロアルキル基からなる群から独立して選択され、そのアルキル基、アルケニル基、アルキニル基およびシクロアルキル基は、置換されていてもよい。
[0187]なおもより好ましくは、各L7は、直鎖状または分枝状のC1-C50アルキレン基、C2-C50アルケニレン基、C2-C50アルキニレン基、C3-C50シクロアルキレン基、C5-C50シクロアルケニレン基、C8-C50シクロアルキニレン基、C7-C50アルキルアリーレン基、C7-C50アリールアルキレン基、C8-C50アリールアルケニレン基およびC9-C50アリールアルキニレン基からなる群から独立して選択され、そのアルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基およびアリールアルキニレン基は、O、SおよびNR3の群から選択される1つ以上のヘテロ原子によって置換されていてもよく、中断されていてもよく、R3は、水素、C1-C24アルキル基、C2-C24アルケニル基、C2-C24アルキニル基およびC3-C24シクロアルキル基からなる群から独立して選択され、そのアルキル基、アルケニル基、アルキニル基およびシクロアルキル基は、置換されていてもよい。
[0188]さらになおもより好ましくは、各L7は、直鎖状または分枝状のC1-C20アルキレン基、C2-C20アルケニレン基、C2-C20アルキニレン基、C3-C20シクロアルキレン基、C5-C20シクロアルケニレン基、C8-C20シクロアルキニレン基、C7-C20アルキルアリーレン基、C7-C20アリールアルキレン基、C8-C20アリールアルケニレン基およびC9-C20アリールアルキニレン基からなる群から独立して選択され、そのアルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基およびアリールアルキニレン基は、O、SおよびNR3の群から選択される1つ以上のヘテロ原子によって置換されていてもよく、中断されていてもよく、R3は、水素、C1-C24アルキル基、C2-C24アルケニル基、C2-C24アルキニル基およびC3-C24シクロアルキル基からなる群から独立して選択され、そのアルキル基、アルケニル基、アルキニル基およびシクロアルキル基は、置換されていてもよい。
[0189]これらの好ましい実施形態において、アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基およびアリールアルキニレン基は、非置換であり、O、SおよびNR3の群から選択される1つ以上のヘテロ原子、好ましくはOによって必要に応じて中断されることがさらに好ましく、R3は、水素およびC1-C4アルキル基、好ましくは、水素またはメチルからなる群から独立して選択される。
[0190]最も好ましくは、各L7は、直鎖状または分枝状のC1-C20アルキレン基からなる群から独立して選択され、そのアルキレン基は、O、SおよびNR3の群から選択される1つ以上のヘテロ原子によって置換されていてもよく、中断されていてもよく、R3は、水素、C1-C24アルキル基、C2-C24アルケニル基、C2-C24アルキニル基およびC3-C24シクロアルキル基からなる群から独立して選択され、そのアルキル基、アルケニル基、アルキニル基およびシクロアルキル基は、置換されていてもよい。この実施形態において、アルキレン基は、非置換であり、O、SおよびNR3の群から選択される1つ以上のヘテロ原子、好ましくは、Oおよび/またはまたはS-Sによって必要に応じて中断されることがさらに好ましく、R3は、水素およびC1-C4アルキル基、好ましくは、水素またはメチルからなる群から独立して選択される。
[0191]好ましいリンカーL7としては、-(CH2)n1-、-(CH2CH2)n1-、-(CH2CH2O)n1-、-(OCH2CH2)n1-、-(CH2CH2O)n1CH2CH2-、-CH2CH2(OCH2CH2)n1-、-(CH2CH2CH2O)n1-、-(OCH2CH2CH2)n1-、-(CH2CH2CH2O)n1CH2CH2CH2-および-CH2CH2CH2(OCH2CH2CH2)n1-が挙げられ、ここで、n1は、1~50の範囲、好ましくは、1~40の範囲、より好ましくは、1~30の範囲、さらにより好ましくは、1~20の範囲およびなおもさらにより好ましくは、1~15の範囲の整数である。より好ましくは、n1は、1、2、3、4、5、6、7、8、9または10、より好ましくは、1、2、3、4、5、6、7または8、さらにより好ましくは、1、2、3、4、5または6、なおもさらにより好ましくは、1、2、3または4である。
[0192]好ましくは、構造(L-A)を有するリンカーは、リンカーL8が部分的に抗体の(修飾された)グリカンを形成するように、抗体Abの2つのグリコシル化部位に接続される。リンカーL8は、好ましくは、構造(L-E):
*-GlcNAc(Fuc)d-(G)e-Su-**
(L-E)
を有し、ここで、
*とラベルされた結合は、抗体Abのアミノ酸に接続され、**とラベルされた結合は、Zに接続され;
dは、0または1であり;
eは、0~10の範囲の整数であり;
Suは、単糖であり;
Gは、単糖部分であり;
GlcNAcは、N-アセチルグルコサミン部分であり;
Fucは、フコース部分である。
*-GlcNAc(Fuc)d-(G)e-Su-**
(L-E)
を有し、ここで、
*とラベルされた結合は、抗体Abのアミノ酸に接続され、**とラベルされた結合は、Zに接続され;
dは、0または1であり;
eは、0~10の範囲の整数であり;
Suは、単糖であり;
Gは、単糖部分であり;
GlcNAcは、N-アセチルグルコサミン部分であり;
Fucは、フコース部分である。
[0193]抗体Abに対する1つの結合点を有するリンカーは、好ましくは、構造(L-B)または(L-C):
*-GlcNAc(Fuc)d-(G)e-Su-Z-(L21)n-(L22)o-(L23)p-(L24)q-**
(L-B)
*-Z-(L21)n-(L22)o-(L23)p-(L24)q-**
(L-C)
によって表され、ここで、
*とラベルされた結合は、抗体Abの2つの別個のアミノ酸に接続され、**とラベルされた結合は、必要に応じてリンカーを介して、ペイロードに接続され;
d、n、o、pおよびqは、それぞれ独立して、0または1であり;
eは、0~10の範囲の整数であり;
L21、L22、L23およびL24は、リンカーであり;
Suは、単糖であり;
Gは、単糖部分であり;
GlcNAcは、N-アセチルグルコサミン部分であり;
Fucは、フコース部分であり;
Zは、接続基である。
*-GlcNAc(Fuc)d-(G)e-Su-Z-(L21)n-(L22)o-(L23)p-(L24)q-**
(L-B)
*-Z-(L21)n-(L22)o-(L23)p-(L24)q-**
(L-C)
によって表され、ここで、
*とラベルされた結合は、抗体Abの2つの別個のアミノ酸に接続され、**とラベルされた結合は、必要に応じてリンカーを介して、ペイロードに接続され;
d、n、o、pおよびqは、それぞれ独立して、0または1であり;
eは、0~10の範囲の整数であり;
L21、L22、L23およびL24は、リンカーであり;
Suは、単糖であり;
Gは、単糖部分であり;
GlcNAcは、N-アセチルグルコサミン部分であり;
Fucは、フコース部分であり;
Zは、接続基である。
[0194]好ましい実施形態において、リンカーL1および/またはL2、好ましくは両方が、構造(L-B)または(L-C)を有する。構造(L-B)を有するリンカーは、抗体Abに対する1つの結合点を有する好ましいリンカーである。リンカー(L-B)は、好ましくは、抗体Abのグリコシル化部位、主にアスパラギンアミノ酸に結合しており、部分的に抗体の(修飾された)グリカンを形成する。リンカー(L-C)は、好ましくは、抗体のチロシン、システインまたはリジンアミノ酸、最も好ましくは、システインアミノ酸に結合している。
[0195]接続基Zは、上記でさらに定義されている。リンカーが、構造(L-B)を有する場合、接続基Zは、上で定義されたような付加環化によって得られることが好ましい。リンカーが、構造(L-C)を有し、システインまたはリジンアミノ酸に結合している場合、接続基Zは、上で定義されたような求核反応によって得られることが好ましい。リンカーが、構造(L-C)を有し、チロシンアミノ酸に結合している場合、接続基Zは、上で定義されたような付加環化によって得られることが好ましい。
[0196]抗体に対する1つの結合点を有するリンカーおよび2つの結合点を有するリンカーは、構造Ab((L8)q-F)xの抗体に結合することができ、xの値は、調製される多機能性抗体構築物の正確な構造に依存する。例えば、xは、2または4であり得る。
[0197]構造Ab((L8)q-F)xの抗体は、当該分野で公知の任意の手段によって調製され得る。例えば、抗体の鎖間ジスルフィド結合の還元は、すでにチオール基をFに与えている。このような還元の後に、マレイミド構築物(または他のチオール反応性構築物)を含む規定数の反応性部分Fとの反応が続く場合、任意の反応性部分Fを抗体に接続することができる。抗体コンジュゲーションのより制御された部位特異的プロセスは、例えば、2つの不対システイン(重鎖あたり1つまたは軽鎖あたり1つ)を含むように抗体を遺伝子操作することによって達成することができ、それにより、抗体をF含有マレイミド構築物に供したとき、抗体上に正確に2つの反応性部分Fが提供される。遺伝子コード化は、AMBER終止コドンを適用することによって、予め定義された数の反応性部分Fを特定の部位に含めるように抗体を直接発現することを可能にする。例えば、トランスグルタミナーゼ(TGase)、ソルターゼ、ホルミル-グリシン生成酵素(FGE)などに基づいて、規定数の反応性部分Fを抗体上に設置するための一連の酵素的アプローチも報告されている。別の酵素的アプローチは、チロシナーゼの酸化作用によって、利用可能なチロシン残基オルト-キノン部分Fの側鎖を変換する。形成されたオルト-キノン部分は、付加環化においてアルケンおよびアルキンに対して反応性である。したがって、1つの実施形態において、機能化抗体は、鎖間ジスルフィド結合の還元とそれに続くF含有チオール反応性構築物との反応、不対システイン残基の導入とそれに続くF含有チオール反応性構築物との反応、反応性部分Fの酵素的導入、および遺伝子操作による反応性部分の導入によって調製される。遺伝子操作の使用は、本願の文脈において最も好ましくなく、反応性部分Fの酵素的導入が、最も好ましい。
[0198]好ましい実施形態において、GlycoConnect技術(例えば、参照により援用される、国際公開第2014/065661号およびVan Geel et al.,Bioconj.Chem.2015,26,2233-2242を参照のこと)は、モノクローナル抗体の重鎖に天然に存在するグリカンを利用して、固定数のクリックプローブ、特にアジドを導入する。したがって、好ましい実施形態において、機能化抗体は、(i)必要に応じて、好適なエンドグリコシダーゼを用いて天然グリカンをトリミングし、それにより、典型的にはAsn-297上に存在する、コアGlcNAcを遊離させた後、(ii)好適なグリコシルトランスフェラーゼの作用下で、対応するUDP-糖から非天然アジド担持糖基質を転移させること、例えば、ガラクトシルトランスフェラーゼ変異体Gal-T(Y289L)を用いてGalNAzを転移させること、またはGalNAc-トランスフェラーゼ(GalNAc-T)を用いて6-アジドGalNAcを転移させることによって調製される。あるいは、GalNAc-Tを適用して、Ac基に芳香族部分またはチオール官能基を有するコア-GlcNAcにGalNAc誘導体を設置することもできる。本発明に係る多機能性抗体構築物は、この技術を用いて得ることができ、トリミングステップ(i)を、e=0を有する機能化抗体を得るために用いてもよいし、トリミングステップ(i)は、e=1~10を有する機能化抗体を得るために省略され得る。好ましくは、トリミングステップが行われ、e=0である。
[0199]好ましい実施形態において、抗体のグリカンは、1つ以上のペイロードを結合させるために使用される。本実施形態の文脈において、本発明に係る多機能性抗体構築物は、単糖Suが付加された構造-GlcNAc(Fuc)b-(G)e-のグリカンを有する。Suは、反応基F(コンジュゲーション前)または接続基Z(コンジュゲーション後)を含む官能化単糖である。ゆえに、Suは、単糖誘導体と見なすことができ、下記でさらに定義される。Suの単糖コア構造を考慮すると、それはグリカンの一部として見ることができるだろう。しかしながら、構造
-GlcNAc(Fuc)b-(G)e-のグリカンは、Suが結合している抗体の元のグリカンに由来する。
-GlcNAc(Fuc)b-(G)e-のグリカンは、Suが結合している抗体の元のグリカンに由来する。
[0200]したがって、グリカンの-GlcNAc(Fuc)b-(G)e-は、典型的には元の抗体に由来し、GlcNAcは、N-アセチルグルコサミン部分であり、Fucは、フコース部分である。Fucは、典型的には、α-1,6-グリコシド結合を介してGlcNAcに結合する。通常、抗体は、(b=1)であり得るか、またはフコシル化されていなくてもよい(b=0)。GlcNAc残基は、コア-GlcNAc残基とも呼ばれることがあり、抗体のペプチド部分に直接結合している単糖である。
[0201]2つのGlcNAc部分のそれぞれは、好ましくは、抗体AbのFcフラグメント中の天然のN-グリコシル化部位に存在する。好ましくは、前記GlcNAc部分は、Abの領域290~305のアスパラギンアミノ酸に結合している。さらに好ましい実施形態において、抗体は、IgG型抗体であり、特定のIgG型抗体に応じて、前記GlcNAc部分は、抗体のアミノ酸アスパラギン297(Asn297またはN297)上に存在する。
[0202]Gは、単糖部分であり、eは、0~10の範囲の整数である。Gは、好ましくは、グルコース(Glc)、ガラクトース(Gal)、マンノース(Man)、フコース(Fuc)、N-アセチルグルコサミン(GlcNAc)、N-アセチルガラクトサミン(GalNAc)、N-アセチルノイラミン酸(NeuNAc)およびシアル酸およびキシロース(Xyl)からなる群から選択される。より好ましくは、Gは、グルコース(Glc)、ガラクトース(Gal)、マンノース(Man)、フコース(Fuc)、N-アセチルグルコサミン(GlcNAc)およびN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)からなる群から選択される。
[0203]好ましい実施形態において、eは0であり、Gは存在しない。抗体のグリカンが、トリミングされるとき、Gは、典型的には存在しない。トリミングとは、フコシル化されていてもよい、グリカンのコアGlcNAc部分のみが残るようなエンドグリコシダーゼによる処理のことを指す。
[0204]別の好ましい実施形態において、eは、1~10の範囲の整数である。この実施形態において、Gは、グルコース(Glc)、ガラクトース(Gal)、マンノース(Man)、フコース(Fuc)、N-アセチルグルコサミン(GlcNAc)、N-アセチルガラクトサミン(GalNAc)、N-アセチルノイラミン酸(NeuNAc)またはシアル酸およびキシロース(Xyl)からなる群から選択され、より好ましくは、グルコース(Glc)、ガラクトース(Gal)、マンノース(Man)、フコース(Fuc)、N-アセチルグルコサミン(GlcNAc)およびN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)からなる群から選択されることがさらに好ましい。
[0205]eが3~10であるとき、(G)eは、直鎖状であっても分枝状であってもよい。分枝状オリゴ糖(G)eの好ましい例は、下記に示されるような(a)、(b)、(c)、(d)、(e)、(f)、(h)および(h)である。
[0206]Gが存在する場合、GはGlcNAcで終わることが好ましい。換言すれば、Suに直接接続している単糖残基は、GlcNAcである。単糖誘導体Suは、末端GlcNAc残基へのグリコシル転移によって容易に導入され得るので、GlcNAc部分の存在は、機能化抗体の合成を促進する。構造(a)~(h)を有する(G)eについての上記の好ましい実施形態において、部分Suは、末端GlcNAc残基のいずれか、すなわち抗体上のコアGlcNAc残基に接続されている波状結合を有するものではないものに接続されてもよい。
[0207]Gが存在しないこと、すなわちe=0であることが特に好ましい。e=0である多機能性抗体構築物の利点は、そのようなコンジュゲートが臨床的に使用されるとき、Fcガンマ受容体CD16、CD32およびCD64への結合が、有意に低減されるかまたは完全に抑止されることである。
[0208]Suは、糖誘導体とも呼ばれる単糖誘導体である。好ましくは、糖誘導体は、グリコシル転移によって機能化抗体に組み込むことができる。より好ましくは、Suは、Gal、Glc、GalNAcまたはGlcNAc、より好ましくは、GalまたはGalNAc、最も好ましくは、GalNAcである。導入され得るヌクレオチド-糖誘導体のいくつかの好ましい例については、図7を参照のこと。誘導体という用語は、(G)eおよびFに接続するために適切に官能化されている単糖のことを指す。
[0209]リンカーL4は、BMとペイロードD1とを接続する。リンカーL4は、存在していてもよいし(m=1)、存在しなくてもよく(m=0)、好ましくは、L4は、存在し、すなわちm=1である。リンカーL5は、BMとペイロードD2とを接続する。リンカーL5は、存在してもよいし(n=1)、存在しなくてもよく(n=0)、好ましくは、L5は、存在し、すなわちn=1である。リンカーL4とL5は、同じであってもよいが、2つの別個のペイロードをBMに接続するために使用されるので、同じでないことが好ましい。
[0210]好ましい実施形態において、L4とL5は両方とも、下記でさらに定義される構造(L-D)を個別に有する。
**-(L21)n-(L22)o-(L23)p-(L24)q-***
(L-D)
ここで、
**とラベルされた結合は、BMに接続され、***とラベルされた結合は、D1またはD2に接続され;
n、o、pおよびqは、それぞれ独立して、0または1であり;
L21、L22、L23およびL24は、リンカーである。
(L-D)
ここで、
**とラベルされた結合は、BMに接続され、***とラベルされた結合は、D1またはD2に接続され;
n、o、pおよびqは、それぞれ独立して、0または1であり;
L21、L22、L23およびL24は、リンカーである。
[0211]リンカーL6と同様に、リンカーL4およびL5は、多機能性抗体構築物の合成中に形成される接続基Zを含み得る。ペイロードは、BMを含むリンカー構築物に接続され得、その接続は、BM1を含むリンカー構築物の反応または機能化抗体との反応の前または後のいずれかであり得る。リンカーL4およびL5内の接続基は、連結単位L21、L22、L23およびL24のいずれかの接合点において形成されてもよいし、リンカーL4およびL5内に別々に存在してもよい。したがって、リンカーL4およびL5は、-Sp-Z-Sp-によって表され得、式中、Spは、個別にスペーサーである。これらのスペーサーは、典型的には、構造(L-D)によって定義されるリンカーの一部を含む。例えば、L4およびL5は、-(L21)n-(L22)o-(L23)p-Z-(L24)q-または-(L21)n-(L22)o-(L23)p-(L24)q-Z-によって表され得る。ここで、Zは、任意の形態をとってもよく、好ましくは、上で定義されたとおりである。
[0212]L4、L5およびL6のそれぞれは、L21、L22、L23およびL24のうちの1つ以上を含み得る。L21、L22、L23およびL24は、一緒になって、下記でさらに定義されるようなリンカーL4、L5またはL6を形成するリンカーであり;n、o、pおよびqは、個別に0または1である。好ましい実施形態において、少なくともリンカーL21およびL22が存在し(すなわち、n=1;o=1;p=0または1;q=0または1である)、より好ましくは、リンカーL21、L22およびL23が存在し、L24が存在するかまたは存在しない(すなわち、n=1;o=1;p=1;q=0または1である)。1つの実施形態において、リンカーL21、L22、L23およびL24が存在する(すなわち、n=1;o=1;p=1;q=1である)。1つの実施形態において、リンカーL21、L22およびL23が存在し、L24は存在しない(すなわち、n=1;o=1;p=1;q=0である)。1つの実施形態において、n+o+p+q=1、2、3または4、好ましくは、2、3または4、より好ましくは、3または4である。好ましい実施形態において、L22およびL23は、両方とも存在し、すなわち、o+p=2である。最も好ましくは、n+o+p+q=3または4である。
[0213]リンカーL21は、存在しない(n=0)かまたは存在する(n=1)。好ましくは、リンカーL21は存在し、n=1である。L21は、例えば、直鎖状または分枝状のC1-C200アルキレン基、C2-C200アルケニレン基、C2-C200アルキニレン基、C3-C200シクロアルキレン基、C5-C200シクロアルケニレン基、C8-C200シクロアルキニレン基、C7-C200アルキルアリーレン基、C7-C200アリールアルキレン基、C8-C200アリールアルケニレン基、C9-C200アリールアルキニレン基からなる群から選択され得る。アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基およびアリールアルキニレン基は、置換されてもよく、前記基は、1つ以上のヘテロ原子、好ましくは、1~100個のヘテロ原子によって中断されてもよく、前記ヘテロ原子は、好ましくは、O、S(O)yおよびNR15からなる群から選択され、yは、0、1または2、好ましくは、y=2であり、R15は、水素、ハロゲン、C1-C24アルキル基、C6-C24(ヘテロ)アリール基、C7-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC7-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立して選択される。
[0214]L21は、(ポリ)エチレングリコールジアミン(例えば、1,8-ジアミノ-3,6-ジオキサオクタンまたはより長いエチレングリコール鎖を含む等価物)、ポリエチレングリコールまたはポリエチレンオキシド鎖、ポリプロピレングリコールまたはポリプロピレンオキシド鎖および1,z-ジアミノアルカンを含み得、zは、アルカン中の炭素原子の数である(zは、例えば、1~10の範囲の整数であり得る)。
[0215]好ましい実施形態において、リンカーL21は、エチレングリコール基、カルボン酸部分、スルホネート部分、スルホン部分、ホスフェート部分、ホスフィネート部分、アミノ基、アンモニウム基またはスルファミド基を含む。
[0217]波線は、化合物の残りの部分への接続、L4およびL5の場合、典型的にはBMおよびL22、L23、L24、D1またはD2、好ましくはBMおよびL22への接続を表す。好ましくは、(O)aC(O)部分は、BMに接続され、NR13部分は、L22、L23、L24、D1またはD2、好ましくはL22に接続され;L6の場合、典型的にはBM1およびBMに接続される。好ましくは、(O)aC(O)部分は、BM1に接続され、NR13部分は、BMに接続される。
[0218]構造(23)において、a1=0または1、好ましくは、a1=1であり、R13は、O、SおよびNR14から選択される1つ以上のヘテロ原子によって置換されていてもよく、中断されていてもよく、水素、C1-C24アルキル基、C3-C24シクロアルキル基、C2-C24(ヘテロ)アリール基、C3-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC3-C24(ヘテロ)アリールアルキル基、C1-C24アルキル基、C3-C24シクロアルキル基、C2-C24(ヘテロ)アリール基、C3-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC3-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から選択され、R14は、水素およびC1-C4アルキル基からなる群から独立して選択される。
[0219]あるいは、R13は、おそらくスペーサー部分を介して、ペイロードに接続される。1つの実施形態において、環状構造が形成されるように、R13も、ペイロードD1またはD2に接続される。例えば、Nは、炭素原子または窒素原子を介して、好ましくはピペラジン環の第2の窒素原子を介して、D1またはD2に接続されているピペラジン部分の一部である。好ましくは、環状構造、例えば、ピペラジン環は、下記でさらに定義されるように、-(B)e1-(A)f1-(B)g1-C(O)-または-(B)e1-(A)f1-(B)g1-C(O)-(L22)o-(L23)p-(L24)q-を介して、D1またはD2に接続される。
[0220]好ましい実施形態において、R13は、水素またはC1-C20アルキル基であり、より好ましくは、R13は、水素またはC1-C16アルキル基であり、さらにより好ましくは、R13は、水素またはC1-C10アルキル基であり、そのアルキル基は、O、SおよびNR14から選択される1つ以上のヘテロ原子、好ましくはOによって置換されていてもよく、中断されていてもよく、R14は、水素およびC1-C4アルキル基からなる群から独立して選択される。好ましい実施形態において、R13は、水素である。別の好ましい実施形態において、R13は、C1-C20アルキル基、より好ましくは、C1-C16アルキル基、さらにより好ましくは、C1-C10アルキル基であり、そのアルキル基は、1つ以上のO原子によって中断されていてもよく、そのアルキル基は、-OH基、好ましくは、末端-OH基で置換されていてもよい。この実施形態では、R13が、末端-OH基を含む(ポリ)エチレングリコール鎖であることがさらに好ましい。別の好ましい実施形態において、R13は、水素、メチル、エチル、n-プロピル、i-プロピル、n-ブチル、s-ブチルおよびt-ブチルからなる群から選択され、より好ましくは、水素、メチル、エチル、n-プロピルおよびi-プロピルからなる群、さらにより好ましくは、水素、メチルおよびエチルからなる群から選択される。なおもさらにより好ましくは、R13は、水素またはメチルであり、最も好ましくは、R13は、水素である。
[0222]ここで、aおよびR13は、上で定義されたとおりであり、Sp1およびSp2は、独立してスペーサー部分であり、b1およびc1は、独立して0または1である。好ましくは、b1=0または1かつc1=1であり、より好ましくは、b1=0かつc1=1である。1つの実施形態において、スペーサーSp1およびSp2は、直鎖状または分枝状のC1-C200アルキレン基、C2-C200アルケニレン基、C2-C200アルキニレン基、C3-C200シクロアルキレン基、C5-C200シクロアルケニレン基、C8-C200シクロアルキニレン基、C7-C200アルキルアリーレン基、C7-C200アリールアルキレン基、C8-C200アリールアルケニレン基およびC9-C200アリールアルキニレン基からなる群から独立して選択され、そのアルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基およびアリールアルキニレン基は、O、SおよびNR16の群から選択される1つ以上のヘテロ原子によって置換されていてもよく、中断されていてもよく、R16は、水素、C1-C24アルキル基、C2-C24アルケニル基、C2-C24アルキニル基およびC3-C24シクロアルキル基からなる群から独立して選択され、そのアルキル基、アルケニル基、アルキニル基およびシクロアルキル基は、置換されていてもよい。そのアルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基およびアリールアルキニレン基が、上で定義されたような1つ以上のヘテロ原子によって中断されるとき、前記基は、1つ以上のO原子および/または1つ以上のS-S基によって中断されることが好ましい。
[0223]より好ましくは、スペーサー部分Sp1およびSp2は、存在する場合、直鎖状または分枝状のC1-C100アルキレン基、C2-C100アルケニレン基、C2-C100アルキニレン基、C3-C100シクロアルキレン基、C5-C100シクロアルケニレン基、C8-C100シクロアルキニレン基、C7-C100アルキルアリーレン基、C7-C100アリールアルキレン基、C8-C100アリールアルケニレン基およびC9-C100アリールアルキニレン基からなる群から独立して選択され、そのアルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基およびアリールアルキニレン基は、O、SおよびNR16の群から選択される1つ以上のヘテロ原子によって置換されていてもよく、中断されていてもよく、R16は、水素、C1-C24アルキル基、C2-C24アルケニル基、C2-C24アルキニル基およびC3-C24シクロアルキル基からなる群から独立して選択され、そのアルキル基、アルケニル基、アルキニル基およびシクロアルキル基は、置換されていてもよい。
[0224]さらにより好ましくは、スペーサー部分Sp1およびSp2は、存在する場合、直鎖状または分枝状のC1-C50アルキレン基、C2-C50アルケニレン基、C2-C50アルキニレン基、C3-C50シクロアルキレン基、C5-C50シクロアルケニレン基、C8-C50シクロアルキニレン基、C7-C50アルキルアリーレン基、C7-C50アリールアルキレン基、C8-C50アリールアルケニレン基およびC9-C50アリールアルキニレン基からなる群から独立して選択され、そのアルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基およびアリールアルキニレン基は、O、SおよびNR16の群から選択される1つ以上のヘテロ原子によって置換されていてもよく、中断されていてもよく、R16は、水素、C1-C24アルキル基、C2-C24アルケニル基、C2-C24アルキニル基およびC3-C24シクロアルキル基からなる群から独立して選択され、そのアルキル基、アルケニル基、アルキニル基およびシクロアルキル基は、置換されていてもよい。
[0225]なおもさらにより好ましくは、スペーサー部分Sp1およびSp2は、存在する場合、直鎖状または分枝状のC1-C20アルキレン基、C2-C20アルケニレン基、C2-C20アルキニレン基、C3-C20シクロアルキレン基、C5-C20シクロアルケニレン基、C8-C20シクロアルキニレン基、C7-C20アルキルアリーレン基、C7-C20アリールアルキレン基、C8-C20アリールアルケニレン基およびC9-C20アリールアルキニレン基からなる群から独立して選択され、そのアルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基およびアリールアルキニレン基は、O、SおよびNR16の群から選択される1つ以上のヘテロ原子によって置換されていてもよく、中断されていてもよく、R16は、水素、C1-C24アルキル基、C2-C24アルケニル基、C2-C24アルキニル基およびC3-C24シクロアルキル基からなる群から独立して選択され、そのアルキル基、アルケニル基、アルキニル基およびシクロアルキル基は、置換されていてもよい。
[0226]これらの好ましい実施形態において、アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基およびアリールアルキニレン基は、非置換であり、O、SおよびNR16の群から選択される1つ以上のヘテロ原子、好ましくはOによって必要に応じて中断されることがさらに好ましく、R16は、水素およびC1-C4アルキル基、好ましくは、水素またはメチルからなる群から独立して選択される。
[0227]最も好ましくは、スペーサー部分Sp1およびSp2は、存在する場合、直鎖状または分枝状のC1-C20アルキレン基からなる群から独立して選択され、そのアルキレン基は、O、SおよびNR16の群から選択される1つ以上のヘテロ原子によって置換されていてもよく、中断されていてもよく、R16は、水素、C1-C24アルキル基、C2-C24アルケニル基、C2-C24アルキニル基およびC3-C24シクロアルキル基からなる群から独立して選択され、そのアルキル基、アルケニル基、アルキニル基およびシクロアルキル基は、置換されていてもよい。この実施形態において、アルキレン基は、非置換であり、O、SおよびNR16の群から選択される1つ以上のヘテロ原子、好ましくは、Oおよび/またはまたはS-Sによって必要に応じて中断されることがさらに好ましく、R3は、水素およびC1-C4アルキル基、好ましくは、水素またはメチルからなる群から独立して選択される。
[0228]したがって、好ましいスペーサー部分Sp1およびSp2としては、-(CH2)r-、-(CH2CH2)r-、-(CH2CH2O)r-、-(OCH2CH2)r-、-(CH2CH2O)rCH2CH2-、-CH2CH2(OCH2CH2)r-、-(CH2CH2CH2O)r-、-(OCH2CH2CH2)r-、-(CH2CH2CH2O)rCH2CH2CH2-および-CH2CH2CH2(OCH2CH2CH2)r-が挙げられ、rは、1~50の範囲、好ましくは、1~40の範囲、より好ましくは、1~30の範囲、さらにより好ましくは、1~20の範囲、なおもさらにより好ましくは、1~15の範囲の整数である。より好ましくは、rは、1、2、3、4、5、6、7、8、9または10、より好ましくは、1、2、3、4、5、6、7または8、さらにより好ましくは、1、2、3、4、5または6、なおもさらにより好ましくは、1、2、3または4である。
[0229]あるいは、好ましいリンカーL21は、-(W)k1-(A)d1-(B)e1-(A)f1-(C(O))g1-によって表され得、式中、
d1=0または1、好ましくはd1=1であり;
e1=0~10の範囲の整数、好ましくは、e1=0、1、2、3、4、5または6、好ましくは、1~10の範囲の整数、最も好ましくは、e1=1、2、3または4であり;
f1=0または1、好ましくは、f1=0であり;
ここで、d1+e1+f1は、少なくとも1であり、好ましくは、1~5の範囲であり;好ましくは、d1+f1は、少なくとも1、好ましくは、d1+f1=1である。
d1=0または1、好ましくはd1=1であり;
e1=0~10の範囲の整数、好ましくは、e1=0、1、2、3、4、5または6、好ましくは、1~10の範囲の整数、最も好ましくは、e1=1、2、3または4であり;
f1=0または1、好ましくは、f1=0であり;
ここで、d1+e1+f1は、少なくとも1であり、好ましくは、1~5の範囲であり;好ましくは、d1+f1は、少なくとも1、好ましくは、d1+f1=1である。
g1=0または1、好ましくは、g1=1であり;
k1=0または1、好ましくは、k1=1であり;
Aは、構造(23)に記載のスルファミド基であり;
Bは、-CH2-CH2-O-もしくは-O-CH2-CH2-部分であるか、または(B)e1は、-(CH2-CH2-O)e3-CH2-CH2-部分であり、e3は、e1と同じように定義され;
Wは、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)NH-、-NHC(O)-、-OC(O)NH-、-NHC(O)O-、-C(O)(CH2)mC(O)-、-C(O)(CH2)mC(O)NH-または-(4-Ph)CH2NHC(O)(CH2)mC(O)NH-であり、好ましくは、Wは、-OC(O)NH-、-C(O)(CH2)mC(O)NH-または-C(O)NH-であり、mは、0~10の範囲の整数であり、好ましくは、m=0、1、2、3、4、5または6、最も好ましくは、m=2または3であり;
好ましくは、L21は、(A)d1-(B)e1を介してBMまたはBM1に接続され、(C(O))g1、好ましくはC(O)を介して(L22)oに接続される。
k1=0または1、好ましくは、k1=1であり;
Aは、構造(23)に記載のスルファミド基であり;
Bは、-CH2-CH2-O-もしくは-O-CH2-CH2-部分であるか、または(B)e1は、-(CH2-CH2-O)e3-CH2-CH2-部分であり、e3は、e1と同じように定義され;
Wは、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)NH-、-NHC(O)-、-OC(O)NH-、-NHC(O)O-、-C(O)(CH2)mC(O)-、-C(O)(CH2)mC(O)NH-または-(4-Ph)CH2NHC(O)(CH2)mC(O)NH-であり、好ましくは、Wは、-OC(O)NH-、-C(O)(CH2)mC(O)NH-または-C(O)NH-であり、mは、0~10の範囲の整数であり、好ましくは、m=0、1、2、3、4、5または6、最も好ましくは、m=2または3であり;
好ましくは、L21は、(A)d1-(B)e1を介してBMまたはBM1に接続され、(C(O))g1、好ましくはC(O)を介して(L22)oに接続される。
[0230]本実施形態の文脈において、構造(23)の波線は、(W)k1、(B)e1および(C(O))g1などの隣接する基への接続を表す。Aは、a1=1であり、R13=HまたはC1-C20アルキル基、より好ましくはR13=Hまたはメチル、最も好ましくはR13=Hである構造(23)に記載のものであることが好ましい。
[0231]好ましいリンカーL21は、以下のとおりである。
(a)k1=0;d1=1;g1=1;f1=0;B=-CH2-CH2-O-;e1=1、2、3または4、好ましくは、e1=2。
(b)k1=1;W=-C(O)(CH2)mC(O)NH-;m=2;d1=0;(B)e1=-(CH2-CH2-O)e3-CH2-CH2-;f1=0;g1=1;e3=1、2、3または4、好ましくは、e1=1。
(c)k1=1;W=-OC(O)NH-;d1=0;B=-CH2-CH2-O-;g1=1;f1=0;e1=1、2、3または4、好ましくは、e1=2。
(d)k1=1;W=-C(O)(CH2)mC(O)NH-;m=2;d1=0;(B)e1=-(CH2-CH2-O)e3-CH2-CH2-;f1=0;g1=1;e3=1、2、3または4、好ましくは、e3=4。
(e)k1=1;W=-OC(O)NH-;d1=0;(B)e1=-(CH2-CH2-O)e3-CH2-CH2-;g1=1;f1=0;e3=1、2、3または4、好ましくは、e3=4。
(f)k1=1;W=-(4-Ph)CH2NHC(O)(CH2)mC(O)NH-、m=3;d1=0;(B)e1=-(CH2-CH2-O)e3-CH2-CH2-;g1=1;f1=0;e3=1、2、3または4、好ましくは、e3=4。
(g)k1=0;d1=0;g1=1;f1=0;B=-CH2-CH2-O-;e1=1、2、3または4、好ましくは、e1=2。
(h)k1=1;W=-C(O)NH-;d1=0;g1=1;f1=0;B=-CH2-CH2-O-;e1=1、2、3または4、好ましくは、e1=2。
[0232]1つの実施形態において、リンカーL21は、BMまたはBM1と(L22)oとの間の骨格に配置される分枝窒素原子であって、好ましくはリンカーを介してその分枝窒素原子に連結されたさらなる部分Dを置換基として含む分枝窒素原子を含む。分枝窒素原子の例は、構造(23)中の窒素原子NR13であり、R13は、スペーサー部分を介してDの第2の存在に接続されている。あるいは、分枝窒素原子は、構造-(W)k1-(A)d1-(B)e1-(A)f1-(C(O))g1-に記載のL21内に配置され得る。1つの実施形態において、L21は、-(W)k1-(A)d1-(B)e1-(A)f1-(C(O))g1-N*[-(A)d1-(B)e1-(A)f1-(C(O))g1-]2によって表され、式中、A、B、W、d1、e1、f1、g1およびk1は、上で定義されたとおりであり、各存在について個別に選択され、N*は、分枝窒素原子であり、その原子に-(A)d1-(B)e1-(A)f1-(C(O))g1-の2つの例が接続される。ここで、両方の(C(O))g1部分が、-(L22)o-(L23)p-(L24)q-Dに接続され、式中、L22、L23、L24、o、p、qおよびDは、上で定義されたとおりであり、それぞれ個別に選択される。最も好ましい実施形態において、そのような分枝原子は、存在せず、リンカーL21は、さらなるペイロードへの接続を含まない。
[0233]リンカーL22は、存在しない(o=0)かまたは存在する(o=1)。好ましくは、リンカーL22は存在し、o=1である。リンカーL22は、当該分野で公知であるようなペプチドスペーサーまたはその誘導体(例えば、シクロブタン-1,1-ジカルボキサミド-Cit)であり、好ましくは、2~5個のアミノ酸を含む。ペプチドスペーサーは、好ましくは、構造(26)である:
ここで、R17は、アミノ酸側鎖を表し、nは、1~10の範囲の整数、好ましくは、n=1~8、より好ましくは、n=1~5、最も好ましくは、n=1~4、好ましくは、n=2である。
ここで、R17は、アミノ酸側鎖を表し、nは、1~10の範囲の整数、好ましくは、n=1~8、より好ましくは、n=1~5、最も好ましくは、n=1~4、好ましくは、n=2である。
[0234]好ましくは、ペプチドスペーサーは、当該分野で公知であるようなジペプチドスペーサーまたはトリペプチドスペーサー、好ましくは、ジペプチドスペーサーである。好適なペプチドスペーサーは、Val-Cit、Val-Ala、Val-Lys、Val-Arg、Val-Gln、AcLys-Val-Cit、AcLys-Val-Ala、Phe-Cit、Phe-Ala、Phe-Lys、Phe-Arg、Phe-Gln、Ala-Lys、Leu-Cit、Leu-Gln、Ile-Cit、Trp-Cit、Ala-Ala-Asn、Ala-Asn、Pro-Leu-Gly、Asn-Pro-Val、Lys-Ser-Gly-Arg-Ser-Asp-Asn-His、Pro-Val-Gly-Leu-Ile-Gly、Val-Lys-Gly、Gly-Gly-Gly、Gly-Gly-Phe-GlyおよびLys、好ましくは、Val-Cit、Val-Ala、Val-Lys、Val-Arg、AcLys-Val-Cit、AcLys-Val-Ala、Phe-Cit、Phe-Ala、Phe-Lys、Phe-Arg、Ala-Lys、Leu-Cit、Ile-Cit、Trp-Cit、Ala-Ala-Asn、Ala-Asn、より好ましくは、Val-Cit、Val-Ala、Val-Lys、Phe-Cit、Phe-Ala、Phe-Lys、Ala-Ala-Asn、Ala-Asn、Pro-Leu-Gly、Asn-Pro-Val、Lys-Ser-Gly-Arg-Ser-Asp-Asn-His、Gly-Gly-Phe-GlyおよびLysからなる群から選択され、好ましくは、ペプチドスペーサーは、Val-Cit、Val-AlaまたはAla-Ala-Asnである。1つの実施形態において、ペプチドスペーサーは、Val-Citである。1つの実施形態において、ペプチドスペーサーは、Val-Alaである。
[0235]これらのリンカーは、典型的には、タンパク質分解酵素、好ましくは、カテプシン、グランザイム、カスパーゼ、カリケレイン、プロタンパク質転換酵素サブチリシン、フューリン、エラスターゼ、レグマイン、線維芽細胞活性化タンパク質、組織型プラスミノーゲン活性化因子、ウロキナーゼ、マトリックスメタロプロテアーゼおよびマトリプターゼの群から選択されるタンパク質分解酵素によって切断可能である。
[0236]好ましい実施形態において、ペプチドスペーサーは、一般構造(27):
によって表される。ここで、R17は、アミノ酸側鎖、好ましくは、R17=CH3(Val)またはCH2CH2CH2NHC(O)NH2(Cit)を表す。
によって表される。ここで、R17は、アミノ酸側鎖、好ましくは、R17=CH3(Val)またはCH2CH2CH2NHC(O)NH2(Cit)を表す。
[0237]構造(26)および(27)の波線は、分子の残りの部分への接続を示し、好ましくは、ペプチドスペーサーは、NHを介して、典型的にはリンカーを介して(L21)に接続され、C(O)を介して、典型的にはリンカーを介してペイロードに接続される。
[0238]波線は、(L21)nおよび(L23)pへの接続を示し、好ましくは、構造(26)または(27)に記載のL22は、NHを介して(L21)nに接続され、C(O)を介して(L23)pに接続される。
[0239]リンカーL23は、存在しない(p=0)かまたは存在する(p=1)。好ましくは、リンカーL23は存在し、p=1である。リンカーL23は、自己犠牲スペーサーとも呼ばれる自己切断可能なスペーサーである。好ましくは、L23は、構造(25)に記載のパラ-アミノベンジルオキシ(PAB)誘導体、より好ましくは、PAB誘導体である。
ここで、
Aは、置換されていてもよい5員または6員の芳香環または芳香族複素環であり;
bは、0または1であり;
R3は、H、R4またはC(O)R4であり、R4は、C1-C24(ヘテロ)アルキル基、C3-C10(ヘテロ)シクロアルキル基、C2-C10(ヘテロ)アリール基、C3-C10アルキル(ヘテロ)アリール基およびC3-C10(ヘテロ)アリールアルキル基であり、これらは、O、SおよびNR5から選択される1つ以上のヘテロ原子によって置換されていてもよく、中断されていてもよく、R5は、水素およびC1-C4アルキル基からなる群から独立して選択される。
ここで、
Aは、置換されていてもよい5員または6員の芳香環または芳香族複素環であり;
bは、0または1であり;
R3は、H、R4またはC(O)R4であり、R4は、C1-C24(ヘテロ)アルキル基、C3-C10(ヘテロ)シクロアルキル基、C2-C10(ヘテロ)アリール基、C3-C10アルキル(ヘテロ)アリール基およびC3-C10(ヘテロ)アリールアルキル基であり、これらは、O、SおよびNR5から選択される1つ以上のヘテロ原子によって置換されていてもよく、中断されていてもよく、R5は、水素およびC1-C4アルキル基からなる群から独立して選択される。
[0240]ここで、波線は、(L22)oおよび(L24)qへの接続を示す。典型的には、PAB誘導体は、NHを介して(L22)oに接続され、Oを介して(L24)qに接続される。
[0241]R3は、H、R4またはC(O)R4であり、R4は、C1-C24(ヘテロ)アルキル基、C3-C10(ヘテロ)シクロアルキル基、C2-C10(ヘテロ)アリール基、C3-C10アルキル(ヘテロ)アリール基およびC3-C10(ヘテロ)アリールアルキル基であり、これらは、O、SおよびNR5から選択される1つ以上のヘテロ原子によって置換されていてもよく、中断されていてもよく、R5は、水素およびC1-C4アルキル基からなる群から独立して選択される。好ましくは、R4は、C3-C10(ヘテロ)シクロアルキルまたはポリアルキレングリコールである。そのポリアルキレングリコールは、好ましくは、ポリエチレングリコールまたはポリプロピレングリコール、より好ましくは、-(CH2CH2O)sHまたは-(CH2CH2CH2O)sHである。そのポリアルキレングリコールは、最も好ましくは、ポリエチレングリコール、好ましくは、-(CH2CH2O)sHであり、式中、sは、1~10の範囲の整数であり、好ましくは、1~5、最も好ましくは、s=1、2、3または4である。より好ましくは、R3は、HまたはC(O)R4であり、R4=4-メチル-ピペラジンまたはモルホリンである。最も好ましくは、R3は、Hである。好ましくは、Aはフェニル環であり、b=1である。
[0242]リンカーL24は、存在しない(q=0)かまたは存在する(q=1)。好ましくは、リンカーL24は存在し、q=1である。リンカーL24は、アミノアルカン酸スペーサー、すなわち、-N-(Ch-アルキレン)-C(O)-であり、式中、hは、1~20、好ましくは、1~10、最も好ましくは1~6の範囲の整数である。ここで、アミノアルカン酸スペーサーは、典型的には、窒素原子を介してL23に接続され、カルボニル部分を介してペイロードに接続される。好ましいリンカーL24は、6-アミノヘキサン酸(Ahx,h=6)、β-アラニン(h=2)およびグリシン(Gly,h=1)、さらにより好ましくは6-アミノヘキサン酸またはグリシンから選択される。1つの実施形態において、L24=6-アミノヘキサン酸である。1つの実施形態において、L24=グリシンである。あるいは、リンカーL24は、構造-N-(CH2-CH2-O)e6-(CH2)e7-(C(O)-に記載のエチレングリコールスペーサーであり、式中、e6は、1~10の範囲の整数であり、e7は、1~3の範囲の整数である。
[0243]分枝部分
本発明の文脈における「分枝部分」とは、3つの部分を接続するリンカーに埋め込まれた部分のことを指す。換言すれば、分枝部分は、他の部分に対する少なくとも3つの結合を含む。分枝部分BMは、典型的にはリンカーL4を介したペイロードD1への1つの結合、典型的にはリンカーL5を介したペイロードD2への1つの結合、およびリンカーL3を介した抗体Abへの1つの結合を含む。分枝部分BM1は、リンカーL6を介した分枝部分BMへの1つの結合を含み、(L8)q-Z-(L7)pを介した抗体Abへの2つの結合を含む。下記で定義される分枝部分は、BMおよびBM1に等しく適用される。
本発明の文脈における「分枝部分」とは、3つの部分を接続するリンカーに埋め込まれた部分のことを指す。換言すれば、分枝部分は、他の部分に対する少なくとも3つの結合を含む。分枝部分BMは、典型的にはリンカーL4を介したペイロードD1への1つの結合、典型的にはリンカーL5を介したペイロードD2への1つの結合、およびリンカーL3を介した抗体Abへの1つの結合を含む。分枝部分BM1は、リンカーL6を介した分枝部分BMへの1つの結合を含み、(L8)q-Z-(L7)pを介した抗体Abへの2つの結合を含む。下記で定義される分枝部分は、BMおよびBM1に等しく適用される。
[0244]他の部分に対する少なくとも3つの結合を含む任意の部分が、本発明の文脈において分枝部分として適している。好適な分枝部分としては、炭素原子(BM-1)、窒素原子(BM-3)、リン原子(ホスフィン(BM-5)およびホスフィンオキシド(BM-6))、芳香環、例えば、フェニル環(例えば、BM-7)またはピリジル環(例えば、BM-9)、(ヘテロ)環(例えば、BM-11およびBM-12)および多環式部分(例えば、BM-13、BM-14およびBM-15)が挙げられる。好ましい分枝部分は、炭素原子、窒素原子およびフェニル環から選択され、最も好ましくは、分枝部分は、炭素原子または窒素原子である。構造(BM-1)~(BM-15)を下記に示し、3つの分枝、すなわち上で定義されたような他の部分への結合を*で示す(*でラベルされた結合)。
[0245](BM-1)において、*でラベルされた分枝の1つは、----で示される単結合または二重結合であり得る。(BM-11)~(BM-15)において、以下が該当する。
n、p、qおよびqの各々は、個別に、0~5の範囲の整数、好ましくは、0または1、最も好ましくは、1であり;
W1、W2およびW3の各々は、C(R21)wおよびNから独立して選択され;
W4、W5およびW6の各々は、C(R21)w+1、N(R22)w、OおよびSから独立して選択され;
各----は、単結合または二重結合を表し;
wは、0または1または2であり、好ましくは、0または1であり;
各R21は、水素、OH、C1-C24アルキル基、C1-C24アルコキシ基、C3-C24シクロアルキル基、C2-C24(ヘテロ)アリール基、C3-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC3-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立して選択され、そのC1-C24アルキル基、C1-C24アルコキシ基、C3-C24シクロアルキル基、C2-C24(ヘテロ)アリール基、C3-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC3-C24(ヘテロ)アリールアルキル基は、O、SおよびNR3から選択される1つ以上のヘテロ原子によって置換されていてもよく、中断されていてもよく、R3は、水素およびC1-C4アルキル基からなる群から独立して選択され;
各R22は、水素、C1-C24アルキル基、C3-C24シクロアルキル基、C2-C24(ヘテロ)アリール基、C3-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC3-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立して選択され、そのC1-C24アルキル基、C1-C24アルコキシ基、C3-C24シクロアルキル基、C2-C24(ヘテロ)アリール基、C3-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC3-C24(ヘテロ)アリールアルキル基は、O、SおよびNR3から選択される1つ以上のヘテロ原子によって置換されていてもよく、中断されていてもよく、R3は、水素およびC1-C4アルキル基からなる群から独立して選択される。
n、p、qおよびqの各々は、個別に、0~5の範囲の整数、好ましくは、0または1、最も好ましくは、1であり;
W1、W2およびW3の各々は、C(R21)wおよびNから独立して選択され;
W4、W5およびW6の各々は、C(R21)w+1、N(R22)w、OおよびSから独立して選択され;
各----は、単結合または二重結合を表し;
wは、0または1または2であり、好ましくは、0または1であり;
各R21は、水素、OH、C1-C24アルキル基、C1-C24アルコキシ基、C3-C24シクロアルキル基、C2-C24(ヘテロ)アリール基、C3-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC3-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立して選択され、そのC1-C24アルキル基、C1-C24アルコキシ基、C3-C24シクロアルキル基、C2-C24(ヘテロ)アリール基、C3-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC3-C24(ヘテロ)アリールアルキル基は、O、SおよびNR3から選択される1つ以上のヘテロ原子によって置換されていてもよく、中断されていてもよく、R3は、水素およびC1-C4アルキル基からなる群から独立して選択され;
各R22は、水素、C1-C24アルキル基、C3-C24シクロアルキル基、C2-C24(ヘテロ)アリール基、C3-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC3-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立して選択され、そのC1-C24アルキル基、C1-C24アルコキシ基、C3-C24シクロアルキル基、C2-C24(ヘテロ)アリール基、C3-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC3-C24(ヘテロ)アリールアルキル基は、O、SおよびNR3から選択される1つ以上のヘテロ原子によって置換されていてもよく、中断されていてもよく、R3は、水素およびC1-C4アルキル基からなる群から独立して選択される。
[0246]当業者は、wの値と----によって表される結合の結合次数とが相互依存的であることを認識する。したがって、Wの存在が、環内二重結合に結合されるときはいつでも、Wの存在についてはw=1であり、Wの存在が2つの環内単結合に結合されるときはいつでも、Wの存在についてはw=0である。BM-12の場合、oおよびpの少なくとも一方は、0ではない。
[0247]構造(BM-11)および(BM-12)に記載の分枝部分の代表例としては、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチル、シクロオクチル、シクロプロペニル、シクロブテニル、シクロペンテニル、シクロヘキセニル、シクロヘプテニル、シクロオクテニル、アジリジン、アゼチジン、ジアゼチジン、オキセタン、チエタン、ピロリジン、ジヒドロピロリル、テトラヒドロフラニル、ジヒドロフラニル、チオラニル、イミダゾリニル、ピラゾリジニル、オキサゾリジニル、イソオキサゾリジニル、チアゾリジニル、イソチアゾリジニル、ジオキソラニル、ジチオラニル、ピペリジニル、オキサニル、チアニル、ピペラジニル、モルホリノ、チオモルホリノ、ジオキサニル、トリオキサニル、ジチアニル、トリチアニル、アゼパニル、オキセパニルおよびチエパニルが挙げられる。分枝部分として使用するための好ましい環状部分としては、シクロプロペニル、シクロヘキシル、オキサニル(テトラヒドロピラン)およびジオキサニルが挙げられる。3つの分枝の置換パターンは、分枝部分が構造(BM-11)のものであるかまたは構造(BM-12)のものであるかを決定する。
[0248]構造(BM-13)~(BM-15)に記載の分枝部分の代表例としては、デカリン、テトラリン、ジアリン、ナフタレン、インデン、インダン、イソインデン、インドール、イソインドール、インドリン、イソインドリンなどが挙げられる。
[0249]好ましい実施形態において、分枝部分は、炭素原子である。炭素原子が、構造(BM-1)に記載のものであり、別個の部分への4つすべての結合を有する場合、その炭素原子は、キラルである。炭素原子の立体化学は、本発明にとって重要ではなく、SであってもRであってもよい。同じことがホスフィン(BM-6)にも当てはまる。最も好ましくは、炭素原子は、構造(BM-1)に記載のものである。構造(BM-1)に記載の炭素原子において*で示される分枝の1つは、二重結合であり得、この場合、その炭素原子は、アルケンまたはイミンの一部であり得る。分枝部分が炭素原子である場合、その炭素原子は、アセタール、ケタール、ヘミケタール、オルトエステル、オルト炭酸エステル、アミノ酸などのより大きな官能基の一部であり得る。これは、分枝部分が窒素またはリン原子である場合にも当てはまり、その場合、分枝部分は、アミド、イミド、イミン、ホスフィンオキシド(BM-6におけるように)またはホスホトリエステルの一部であり得る。
[0250]好ましい実施形態において、分枝部分は、フェニル環である。最も好ましくは、そのフェニル環は、構造(BM-7)に記載のものである。フェニル環の置換パターンは、任意の位置化学のもの、例えば、1,2,3置換フェニル環、1,2,4置換フェニル環または1,3,5置換フェニル環であり得る。最適な屈曲性および立体配座の自由を可能にするために、フェニル環は、構造(BM-7)に記載のものであることが好ましく、最も好ましくは、フェニル環は1,3,5置換されている。同じことが(BM-9)のピリジン環にも当てはまる。
[0251]好ましい実施形態において、分枝部分は、炭素原子、窒素原子、リン原子、(ヘテロ)芳香環、(ヘテロ)環または多環式部分から選択される。
[0252]好ましい多機能性抗体構築物
本発明に係る特に好ましい多機能性抗体構築物は、構造(3)、(4)、(5)、(6)または(7)を有する。1つの実施形態において、多機能性抗体構築物は、構造(3)、(4)、(5)または(6)に記載のものである。1つの実施形態において、多機能性抗体構築物は、構造(3)、(4)または(6)に記載のものである。1つの実施形態において、多機能性抗体構築物は、構造(3)または(4)に記載のものである。
本発明に係る特に好ましい多機能性抗体構築物は、構造(3)、(4)、(5)、(6)または(7)を有する。1つの実施形態において、多機能性抗体構築物は、構造(3)、(4)、(5)または(6)に記載のものである。1つの実施形態において、多機能性抗体構築物は、構造(3)、(4)または(6)に記載のものである。1つの実施形態において、多機能性抗体構築物は、構造(3)または(4)に記載のものである。
[0253]1つの実施形態において、多機能性抗体構築物は、構造(3):
を有し、式中、
BMおよびBM1は、分枝部分であり;
d、m、nおよびpは、それぞれ独立して、0または1であり;
D1およびD2は、ポリペプチド、小分子、細胞毒およびオリゴヌクレオチドからなる群から選択される2つの別個のペイロードであり、D1およびD2のうちの少なくとも1つは、ポリペプチドであり;
eは、0~10の範囲の整数であり;
L4、L5、L6およびL7は、リンカーであり;
Suは、単糖であり;
Gは、単糖部分であり;
GlcNAcは、N-アセチルグルコサミン部分であり;
Fucは、フコース部分であり;
Z1は、接続基である。
を有し、式中、
BMおよびBM1は、分枝部分であり;
d、m、nおよびpは、それぞれ独立して、0または1であり;
D1およびD2は、ポリペプチド、小分子、細胞毒およびオリゴヌクレオチドからなる群から選択される2つの別個のペイロードであり、D1およびD2のうちの少なくとも1つは、ポリペプチドであり;
eは、0~10の範囲の整数であり;
L4、L5、L6およびL7は、リンカーであり;
Suは、単糖であり;
Gは、単糖部分であり;
GlcNAcは、N-アセチルグルコサミン部分であり;
Fucは、フコース部分であり;
Z1は、接続基である。
[0254]多機能性抗体構築物が構造(3)を有する場合、n=m=1であることが好ましい。
[0255]1つの実施形態において、多機能性抗体構築物は、構造(4):
を有し、式中、
D1およびD2は、ポリペプチド、小分子、細胞毒およびオリゴヌクレオチドからなる群から選択される2つの別個のペイロードであり、D1およびD2のうちの少なくとも1つは、ポリペプチドであり;
dおよびpは、それぞれ独立して、0または1であり;
eは、0~10の範囲の整数であり;
x2は、1~8の範囲の整数であり;
L6、L7およびL14は、リンカーであり;
Suは、単糖であり;
Gは、単糖部分であり;
GlcNAcは、N-アセチルグルコサミン部分であり;
Fucは、フコース部分であり;
BM1は、分枝部分であり;
Z1およびZ2は、接続基である。
を有し、式中、
D1およびD2は、ポリペプチド、小分子、細胞毒およびオリゴヌクレオチドからなる群から選択される2つの別個のペイロードであり、D1およびD2のうちの少なくとも1つは、ポリペプチドであり;
dおよびpは、それぞれ独立して、0または1であり;
eは、0~10の範囲の整数であり;
x2は、1~8の範囲の整数であり;
L6、L7およびL14は、リンカーであり;
Suは、単糖であり;
Gは、単糖部分であり;
GlcNAcは、N-アセチルグルコサミン部分であり;
Fucは、フコース部分であり;
BM1は、分枝部分であり;
Z1およびZ2は、接続基である。
[0256]多機能性抗体構築物が構造(4)を有する場合、L14は、上で定義されたような構造(L-D)に記載のものであることが好ましい。接続基Z1は、求核反応を介した付加環化および接続基Z2によって得られることがさらに好ましい。
[0257]1つの実施形態において、多機能性抗体構築物は、構造(5):
を有し、式中、
D1およびD2は、ポリペプチド、小分子、細胞毒およびオリゴヌクレオチドからなる群から選択される2つの別個のペイロードであり、D1およびD2のうちの少なくとも1つは、ポリペプチドであり;
x1およびx2は、それぞれ独立して、1、2または3であり;
各dは、独立して0または1であり;
eは、0~10の範囲の整数であり;
L15およびL16は、リンカーであり;
Suは、単糖であり;
Gは、単糖部分であり;
GlcNAcは、N-アセチルグルコサミン部分であり;
Fucは、フコース部分であり;
Z1およびZ2は、接続基である。
を有し、式中、
D1およびD2は、ポリペプチド、小分子、細胞毒およびオリゴヌクレオチドからなる群から選択される2つの別個のペイロードであり、D1およびD2のうちの少なくとも1つは、ポリペプチドであり;
x1およびx2は、それぞれ独立して、1、2または3であり;
各dは、独立して0または1であり;
eは、0~10の範囲の整数であり;
L15およびL16は、リンカーであり;
Suは、単糖であり;
Gは、単糖部分であり;
GlcNAcは、N-アセチルグルコサミン部分であり;
Fucは、フコース部分であり;
Z1およびZ2は、接続基である。
[0258]多機能性抗体構築物が構造(5)を有する場合、L15とL16は両方とも、個別に、上で定義されたような構造(L-D)に記載のものであることが好ましい。接続基Z1とZ2は両方とも、個別に付加環化によって得られることがさらに好ましい。典型的には、x1とx2との合計は、多くとも4、好ましくは、2または4である。より好ましくは、x1とx2は、同じであり、1または2である。
[0259]1つの実施形態において、多機能性抗体構築物は、構造(6):
を有し、式中、
D1およびD2は、ポリペプチド、小分子、細胞毒およびオリゴヌクレオチドからなる群から選択される2つの別個のペイロードであり、D1およびD2のうちの少なくとも1つは、ポリペプチドであり;
x1は、1~8の範囲の整数であり、x2は、1~4の範囲の整数であり、x1+x2=2~10であり、
各dは、独立して0または1であり;
eは、0~10の範囲の整数であり;
L14およびL15は、リンカーであり;
Suは、単糖であり;
Gは、単糖部分であり;
GlcNAcは、N-アセチルグルコサミン部分であり;
Fucは、フコース部分であり;
Z1およびZ2は、接続基である。
を有し、式中、
D1およびD2は、ポリペプチド、小分子、細胞毒およびオリゴヌクレオチドからなる群から選択される2つの別個のペイロードであり、D1およびD2のうちの少なくとも1つは、ポリペプチドであり;
x1は、1~8の範囲の整数であり、x2は、1~4の範囲の整数であり、x1+x2=2~10であり、
各dは、独立して0または1であり;
eは、0~10の範囲の整数であり;
L14およびL15は、リンカーであり;
Suは、単糖であり;
Gは、単糖部分であり;
GlcNAcは、N-アセチルグルコサミン部分であり;
Fucは、フコース部分であり;
Z1およびZ2は、接続基である。
[0260]多機能性抗体構築物が構造(6)を有する場合、L14とL15は両方とも、個別に、上で定義されたような構造(L-D)に記載のものであることが好ましい。接続基Z1は、求核反応を介した付加環化および接続基Z2によって得られることがさらに好ましい。x2は、1~4の範囲の整数であり、好ましくは、x2は、1または2であり、最も好ましくは、x2は、2である。
[0261]1つの実施形態において、多機能性抗体構築物は、構造(7):
を有し、式中、
D1およびD2は、ポリペプチド、小分子、細胞毒およびオリゴヌクレオチドからなる群から選択される2つの別個のペイロードであり、D1およびD2のうちの少なくとも1つは、ポリペプチドであり;
x3は、1~4の範囲の整数であり;
各dは、独立して0または1であり;
eは、0~10の範囲の整数であり;
L4、L5およびL17は、リンカーであり;
BMは、分枝部分であり;
Suは、単糖であり;
Gは、単糖部分であり;
GlcNAcは、N-アセチルグルコサミン部分であり;
Fucは、フコース部分であり;
Z1およびZ2は、接続基である。
を有し、式中、
D1およびD2は、ポリペプチド、小分子、細胞毒およびオリゴヌクレオチドからなる群から選択される2つの別個のペイロードであり、D1およびD2のうちの少なくとも1つは、ポリペプチドであり;
x3は、1~4の範囲の整数であり;
各dは、独立して0または1であり;
eは、0~10の範囲の整数であり;
L4、L5およびL17は、リンカーであり;
BMは、分枝部分であり;
Suは、単糖であり;
Gは、単糖部分であり;
GlcNAcは、N-アセチルグルコサミン部分であり;
Fucは、フコース部分であり;
Z1およびZ2は、接続基である。
[0262]多機能性抗体構築物が構造(7)を有する場合、L17は、上で定義されたような構造(L-D)に記載のものであることが好ましい。接続基Z1は、付加環化によって得られることがさらに好ましい。x2は、1~4の範囲の整数であり、好ましくは、x3は、2または4であり、最も好ましくは、x3は、2である。さらに、m=n=1であることが好ましい。
[0263]用途
本発明に係る多機能性抗体構築物は、癌に対する複数の作用様式を単一分子内で組み合わせることによって、例えば癌の治療に特に適している。したがって、本発明はさらに、医薬における本発明に係る多機能性抗体構築物の使用に関する。さらなる態様において、本発明はまた、本発明に係る多機能性抗体構築物を被験体に投与するステップを含む、それを必要とする被験体を治療する方法に関する。この態様に係る方法はまた、治療において使用するための本発明に係る多機能性抗体構築物としても述べられ得る。この態様に係る方法はまた、薬の製造のための本発明に係る多機能性抗体構築物の使用としても述べられ得る。ここで、投与は、典型的には、治療有効量の本発明に係る多機能性抗体構築物を用いて行われる。
本発明に係る多機能性抗体構築物は、癌に対する複数の作用様式を単一分子内で組み合わせることによって、例えば癌の治療に特に適している。したがって、本発明はさらに、医薬における本発明に係る多機能性抗体構築物の使用に関する。さらなる態様において、本発明はまた、本発明に係る多機能性抗体構築物を被験体に投与するステップを含む、それを必要とする被験体を治療する方法に関する。この態様に係る方法はまた、治療において使用するための本発明に係る多機能性抗体構築物としても述べられ得る。この態様に係る方法はまた、薬の製造のための本発明に係る多機能性抗体構築物の使用としても述べられ得る。ここで、投与は、典型的には、治療有効量の本発明に係る多機能性抗体構築物を用いて行われる。
[0264]本発明に係る抗体構築物の多機能性が理由で、治療は、抗体の標的化の性質のおかげで、ペイロードD1とD2の両方を腫瘍に向かわせる。したがって、抗体-薬物コンジュゲートなどのペイロードD1に基づく1つの薬物と、別個に投与される追加の薬物(例えば、化学療法薬またはチェックポイント阻害剤)との同時投与は、もはや必要ではない。さらに、本発明に係る多機能性抗体構築物は、腫瘍関連抗原への結合、免疫細胞結合ポリペプチドまたはチェックポイント阻害剤の数、および小分子ペイロードなどの他のペイロードの数に関して、慎重に調整された化学量論を可能にする。最後に、本発明に係る多機能性抗体構築物は、腫瘍の多剤耐性に起因して従来の治療法を用いた治療に対して非感受性になった患者の治療に特に適し得る。したがって、特に好ましい1つの実施形態において、被験体は、従来の癌治療に対して多剤耐性を発症した癌患者である。
[0265]本発明はさらに、上で定義されたような本発明に係る多機能性抗体構築物の投与を含む、特定の疾患の治療を必要とする被験体における特定の疾患を治療するための方法に関する。その特定の疾患は、癌、ウイルス感染症、細菌感染症、神経疾患、自己免疫疾患、眼疾患、高コレステロール血症およびアミロイドーシスから選択され得、より好ましくは、癌およびウイルス感染症から選択され得、最も好ましくは、その疾患は、癌である。治療を必要とする被験体は、典型的には癌患者である。抗体-コンジュゲートの使用は、このような治療、特に、癌治療の分野で周知であり、本発明に係る多機能性抗体構築物は、この点において特に適している。この態様に係る方法において、多機能性抗体構築物は、典型的には治療有効量で投与される。本発明の本態様はまた、特定の疾患の治療を必要とする被験体における特定の疾患の治療において使用するため、好ましくは癌の治療のために使用するための本発明に係る多機能性抗体構築物としても述べられ得る。換言すれば、この態様は、特定の疾患の治療を必要とする被験体における特定の疾患の治療において使用するため、好ましくは癌の治療において使用するための薬または医薬組成物を調製するための本発明に係る多機能性抗体構築物の使用に関する。
[0266]本発明に係る多機能性抗体構築物は、Fcサイレントであること、すなわち、臨床で使用されたとき、Fcガンマ受容体CD16に有意に結合しないことが好ましい。これは、Gが存在しない場合、すなわちe=0の場合である。好ましくは、CD32およびCD64に対する結合も有意に減少する。
[0267]本発明はさらに、免疫細胞を腫瘍細胞と会合させる方法に関する。免疫細胞および腫瘍細胞を含むサンプルを、本発明に係る多機能性抗体構築物と接触させる。免疫細胞は、免疫細胞結合ペプチドに結合し、腫瘍細胞は、本抗体に結合するため、腫瘍細胞と免疫細胞と多機能性抗体構築物との複合体会合物が形成される。別の実施形態において、本発明に係る方法は、腫瘍細胞およびチェックポイント阻害剤への同時結合のための方法である。ここで、チェックポイント阻害剤および腫瘍細胞を含むサンプルを、本発明に係る多機能性抗体構築物と接触させる。チェックポイント阻害剤は、チェックポイント阻害剤標的化ポリペプチドに結合し、腫瘍細胞は、本抗体に結合するため、腫瘍細胞とチェックポイント阻害剤と多機能性抗体構築物との複合体会合物が形成される。この接触は、インビトロのサンプル中、例えば被験体から採取したサンプル中で、または被験体内のインビボで(この場合、本発明に係る多機能性抗体構築物は被験体に投与される)行われ得る。
[0268]本発明の文脈における投与とは、全身投与のことを指す。ゆえに、1つの実施形態において、本明細書中で定義される方法は、多機能性抗体構築物の全身投与のための方法である。多機能性抗体構築物の特異性を考慮して、それらは、全身投与され得るが、目的の組織(例えば、腫瘍)内またはその近くでそれらの活性を発揮し得る。全身投与は、薬物が、イメージング技術では検出できない腫瘍転移にも到達することがあり、血液腫瘍に適用可能であり得るので、局所投与よりも大きな利点を有する。
[0269]本発明はさらに、本発明に係る抗体-ペイロードコンジュゲートおよび薬学的に許容され得る担体を含む医薬組成物に関する。
本発明を以下の実施例によって例証する。
一般的な手順
化学物質は、通常使用される供給業者(Sigma-Aldrich、Acros、Alfa Aesar、Fluorochem、Apollo Scientific LtdおよびTCI)から購入し、さらに精製することなく使用した。化学変換、ワークアップおよびクロマトグラフィーのための溶媒(乾燥溶媒を含む)は、Aldrich(Dorset,UK)からHPLCグレードで購入し、さらに蒸留することなく使用した。シリカゲル60F254分析用薄層クロマトグラフィー(TLC)プレートは、Merck(Darmstadt,Germany)製であり、過マンガン酸カリウム染色またはアニスアルデヒド染色を用いてUV光下で可視化した。クロマトグラフィー精製は、Buchi Sepacore C660フラクションコレクター(Flawil、Switzerland)と組み合わせてAcrosシリカゲル(0.06-0.200,60A)または充填済みカラム(Screening Devices)を使用して行った。逆相HPLC精製は、Waters Xbridge C18カラム(5μm OBD,30×100mm,PN186002982)を備えたAgilent1200システムを使用して行った。NMR分光法に使用される重水素化溶媒は、Cambridge Isotope Laboratoriesから入手した。ビス-mal-Lys-PEG4-TFPエステル(177)は、Quanta Biodesignから入手し、O-(2-アミノエチル)-O’-(2-アジドエチル)ジエチレングリコール(XL07)ならびに化合物344および179は、Broadpharmから入手し、2,3-ビス(ブロモメチル)-6-キノキサリンカルボン酸(178)は、ChemSceneから入手し、32-アジド-5-オキソ-3,9,12,15,18,21,24,27,30-ノナオキサ-6-アザドトリアコンタン酸(348)は、Carbosynthから入手した。化合物313m(LD14,マレイミドカプロイル-Val-Cit-PABC-MMAE)は、Levena Biopharmaから入手した。アドセトリスおよびカドサイラは、薬局から入手した。
化学物質は、通常使用される供給業者(Sigma-Aldrich、Acros、Alfa Aesar、Fluorochem、Apollo Scientific LtdおよびTCI)から購入し、さらに精製することなく使用した。化学変換、ワークアップおよびクロマトグラフィーのための溶媒(乾燥溶媒を含む)は、Aldrich(Dorset,UK)からHPLCグレードで購入し、さらに蒸留することなく使用した。シリカゲル60F254分析用薄層クロマトグラフィー(TLC)プレートは、Merck(Darmstadt,Germany)製であり、過マンガン酸カリウム染色またはアニスアルデヒド染色を用いてUV光下で可視化した。クロマトグラフィー精製は、Buchi Sepacore C660フラクションコレクター(Flawil、Switzerland)と組み合わせてAcrosシリカゲル(0.06-0.200,60A)または充填済みカラム(Screening Devices)を使用して行った。逆相HPLC精製は、Waters Xbridge C18カラム(5μm OBD,30×100mm,PN186002982)を備えたAgilent1200システムを使用して行った。NMR分光法に使用される重水素化溶媒は、Cambridge Isotope Laboratoriesから入手した。ビス-mal-Lys-PEG4-TFPエステル(177)は、Quanta Biodesignから入手し、O-(2-アミノエチル)-O’-(2-アジドエチル)ジエチレングリコール(XL07)ならびに化合物344および179は、Broadpharmから入手し、2,3-ビス(ブロモメチル)-6-キノキサリンカルボン酸(178)は、ChemSceneから入手し、32-アジド-5-オキソ-3,9,12,15,18,21,24,27,30-ノナオキサ-6-アザドトリアコンタン酸(348)は、Carbosynthから入手した。化合物313m(LD14,マレイミドカプロイル-Val-Cit-PABC-MMAE)は、Levena Biopharmaから入手した。アドセトリスおよびカドサイラは、薬局から入手した。
モノクローナル抗体およびADCの質量スペクトル分析のための一般的な手順
質量スペクトル分析の前に、Fc/2フラグメントの分析のためにIdeS(FabricatorTM)でIgGを処理した。20μgの(修飾)IgGの溶液を、10μLの総体積において、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)pH6.6中の0.5μLのIdeS(50U/μL)とともに37℃で1時間インキュベートした。サンプルを40μLに希釈した後、JEOL AccuTOFにおいてエレクトロスプレーイオン化飛行時間型(ESI-TOF)分析を行った。デコンボリューションされたスペクトルを、Magtranソフトウェアを使用して得た。
質量スペクトル分析の前に、Fc/2フラグメントの分析のためにIdeS(FabricatorTM)でIgGを処理した。20μgの(修飾)IgGの溶液を、10μLの総体積において、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)pH6.6中の0.5μLのIdeS(50U/μL)とともに37℃で1時間インキュベートした。サンプルを40μLに希釈した後、JEOL AccuTOFにおいてエレクトロスプレーイオン化飛行時間型(ESI-TOF)分析を行った。デコンボリューションされたスペクトルを、Magtranソフトウェアを使用して得た。
分析用RP-HPLCの一般的な手順
RP-HPLC分析の前に、IgGをIdeSで処理し、Fc/2フラグメントの分析を可能にした。(修飾)IgG(100μL,PBS pH7.4中1mg/mL)の溶液を、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)pH6.6中の1.5μLのIdeS/FabricatorTM(50U/μL)とともに37℃で1時間インキュベートした。49%アセトニトリル、49%水、2%ギ酸(100μL)を加えることによって、反応をクエンチした。RP-HPLC分析は、Agilent1100シリーズ(Hewlett Packard)において行った。サンプル(10μL)を、70℃のカラム温度を有するZORBAX Poroshell 300 SB-C8カラム(1×75mm,5μm,Agilent)に0.5mL/分で注入した。0.1%TFA中の30~54%アセトニトリルおよび水という直線勾配を25分で適用した。
RP-HPLC分析の前に、IgGをIdeSで処理し、Fc/2フラグメントの分析を可能にした。(修飾)IgG(100μL,PBS pH7.4中1mg/mL)の溶液を、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)pH6.6中の1.5μLのIdeS/FabricatorTM(50U/μL)とともに37℃で1時間インキュベートした。49%アセトニトリル、49%水、2%ギ酸(100μL)を加えることによって、反応をクエンチした。RP-HPLC分析は、Agilent1100シリーズ(Hewlett Packard)において行った。サンプル(10μL)を、70℃のカラム温度を有するZORBAX Poroshell 300 SB-C8カラム(1×75mm,5μm,Agilent)に0.5mL/分で注入した。0.1%TFA中の30~54%アセトニトリルおよび水という直線勾配を25分で適用した。
分析用HPLC-SECの一般的な手順
HPLC-SEC分析は、Agilent1100シリーズ(Hewlett Packard)において行った。サンプル(4μL,1mg/mL)をXbridge BEH200A(3.5μM,7.8×300mm,PN186007640 Waters)カラムに0.86mL/分で注入した。0.1Mリン酸ナトリウム緩衝液pH6.9(NaH2PO4/Na2HPO4)を用いたアイソクラティック溶出を16分間行った。
HPLC-SEC分析は、Agilent1100シリーズ(Hewlett Packard)において行った。サンプル(4μL,1mg/mL)をXbridge BEH200A(3.5μM,7.8×300mm,PN186007640 Waters)カラムに0.86mL/分で注入した。0.1Mリン酸ナトリウム緩衝液pH6.9(NaH2PO4/Na2HPO4)を用いたアイソクラティック溶出を16分間行った。
実施例1.化合物102の合成
DCM(500mL)中の4-ニトロフェニルクロロホルメート(30.5g,151mmol)の冷却(0℃)溶液に、ピリジン(24.2mL,23.7g,299mmol)を加えた。その反応混合物に、DCM(200mL)中のBCN-OH(101,18.0g,120mmol)の溶液を滴下した。添加が完了した後、NH4Clの飽和水溶液(500mL)および水(200mL)を加えた。分離後、水相をDCM(2×500mL)で抽出した。合わせた有機相を乾燥させ(Na2SO4)、濃縮した。その粗材料をシリカゲルクロマトグラフィーによって精製し、所望の生成物102をオフホワイト色の固体として得た(18.7g,59mmol,39%)。1H NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm)8.32-8.23(m,2H),7.45-7.34(m,2H),4.40(d,J=8.3 Hz,2H),2.40-2.18(m,6H),1.69-1.54(m,2H),1.51(quintet,J=9.0 Hz,1H),1.12-1.00(m,2H)
DCM(500mL)中の4-ニトロフェニルクロロホルメート(30.5g,151mmol)の冷却(0℃)溶液に、ピリジン(24.2mL,23.7g,299mmol)を加えた。その反応混合物に、DCM(200mL)中のBCN-OH(101,18.0g,120mmol)の溶液を滴下した。添加が完了した後、NH4Clの飽和水溶液(500mL)および水(200mL)を加えた。分離後、水相をDCM(2×500mL)で抽出した。合わせた有機相を乾燥させ(Na2SO4)、濃縮した。その粗材料をシリカゲルクロマトグラフィーによって精製し、所望の生成物102をオフホワイト色の固体として得た(18.7g,59mmol,39%)。1H NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm)8.32-8.23(m,2H),7.45-7.34(m,2H),4.40(d,J=8.3 Hz,2H),2.40-2.18(m,6H),1.69-1.54(m,2H),1.51(quintet,J=9.0 Hz,1H),1.12-1.00(m,2H)
実施例2.化合物104の合成
THF(3mL)中のアジド-PEG11-アミン(103)(182mg,0.319mmol)の冷却溶液(-5℃)に、10%NaHCO3水溶液(1.5mL)、およびTHF(2mL)に溶解された9-フルオレニルメトキシカルボニルクロリド(99mg,0.34mmol)を加えた。2時間後、EtOAc(20mL)を加え、混合物をブライン(2×6mL)で洗浄し、MgSO4で乾燥させ、濃縮した。シリカゲルカラムクロマトグラフィーによる精製(DCM中の0→11%MeOH)により、104を透明な油状物として98%収率で得た(251mg,0.316mmol)。C39H60N4O13 +(M+Na+)についてのLCMS(ESI+)計算値815.42、実測値815.53。
THF(3mL)中のアジド-PEG11-アミン(103)(182mg,0.319mmol)の冷却溶液(-5℃)に、10%NaHCO3水溶液(1.5mL)、およびTHF(2mL)に溶解された9-フルオレニルメトキシカルボニルクロリド(99mg,0.34mmol)を加えた。2時間後、EtOAc(20mL)を加え、混合物をブライン(2×6mL)で洗浄し、MgSO4で乾燥させ、濃縮した。シリカゲルカラムクロマトグラフィーによる精製(DCM中の0→11%MeOH)により、104を透明な油状物として98%収率で得た(251mg,0.316mmol)。C39H60N4O13 +(M+Na+)についてのLCMS(ESI+)計算値815.42、実測値815.53。
実施例3.化合物105の合成
THF(3mL)および水(0.2mL)中の104(48mg,0.060mmol)の溶液を調製し、0℃に冷却した。トリメチルホスフィン(トルエン中1M,0.24mL,0.24mmol)を加え、混合物を23時間撹拌したままにした。DCM(6mL)で抽出することによって水を除去した。この溶液に、(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(102)(25mg,0.079mmol)およびトリエチルアミン(10μL,0.070mmol)を加えた。27時間後、混合物を濃縮し、残渣をDMF(3mL)に溶解した後、ピペリジン(400μL)を加えた。1時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→21%MeOH)によって精製することにより、105を無色油状物として得た(8.3mg,0.0092mmol)。C46H76N2O15 +(M+NH4 +)についてのLCMS(ESI+)計算値914.52、実測値914.73。
THF(3mL)および水(0.2mL)中の104(48mg,0.060mmol)の溶液を調製し、0℃に冷却した。トリメチルホスフィン(トルエン中1M,0.24mL,0.24mmol)を加え、混合物を23時間撹拌したままにした。DCM(6mL)で抽出することによって水を除去した。この溶液に、(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(102)(25mg,0.079mmol)およびトリエチルアミン(10μL,0.070mmol)を加えた。27時間後、混合物を濃縮し、残渣をDMF(3mL)に溶解した後、ピペリジン(400μL)を加えた。1時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→21%MeOH)によって精製することにより、105を無色油状物として得た(8.3mg,0.0092mmol)。C46H76N2O15 +(M+NH4 +)についてのLCMS(ESI+)計算値914.52、実測値914.73。
実施例4.化合物107の合成
乾燥DCM(500μL)中の(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(102)(4.1mg,0.013mmol)の溶液を、乾燥DCM(500μL)中のアミノ-PEG23-アミン(106)(12.3mg,0.0114mmol)の溶液にゆっくり加えた。20時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→25%MeOH)によって精製することにより、所望の化合物107を73%収率で得た(12mg,0.0080mmol)。C70H124N2O27 +(M+NH4 +)についてのLCMS(ESI+)計算値1443.73、実測値1444.08。
乾燥DCM(500μL)中の(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(102)(4.1mg,0.013mmol)の溶液を、乾燥DCM(500μL)中のアミノ-PEG23-アミン(106)(12.3mg,0.0114mmol)の溶液にゆっくり加えた。20時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→25%MeOH)によって精製することにより、所望の化合物107を73%収率で得た(12mg,0.0080mmol)。C70H124N2O27 +(M+NH4 +)についてのLCMS(ESI+)計算値1443.73、実測値1444.08。
実施例5.化合物108の合成
MeCN(450mL)中のBCN-OH(101,21.0g,0.14mol)の溶液に、ジスクシンイミジルカーボネート(53.8g,0.21mol)およびトリエチルアミン(58.5mL,0.42mol)を加えた。混合物を140分間撹拌した後、これを真空中で濃縮し、残渣をMeCN(400mL)と1回共蒸発させた。残渣をEtOAc(600mL)に溶解し、H2O(3×200mL)で洗浄した。有機層をNa2SO4で乾燥させ、真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→4%EtOAc)によって精製し、108(11.2g,38.4mmol,27%収率)を白色固体として得た。1H NMR(400 MHz,CDCl3):δ(ppm)4.45(d,2H,J=8.4 Hz),2.85(s,4H),2.38-2.18(m,6H),1.65-1.44(m,3H),1.12-1.00(m,2H).
MeCN(450mL)中のBCN-OH(101,21.0g,0.14mol)の溶液に、ジスクシンイミジルカーボネート(53.8g,0.21mol)およびトリエチルアミン(58.5mL,0.42mol)を加えた。混合物を140分間撹拌した後、これを真空中で濃縮し、残渣をMeCN(400mL)と1回共蒸発させた。残渣をEtOAc(600mL)に溶解し、H2O(3×200mL)で洗浄した。有機層をNa2SO4で乾燥させ、真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→4%EtOAc)によって精製し、108(11.2g,38.4mmol,27%収率)を白色固体として得た。1H NMR(400 MHz,CDCl3):δ(ppm)4.45(d,2H,J=8.4 Hz),2.85(s,4H),2.38-2.18(m,6H),1.65-1.44(m,3H),1.12-1.00(m,2H).
実施例6.化合物110の合成
DCM(15mL)中の(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチルN-スクシンイミジルカーボネート(108)(500mg,1.71mmol)の溶液に、トリエチルアミン(718uL,5.14mmol)およびモノ-Fmocエチレンジアミン塩酸塩(109)(657mg,2.06mmol)を加えた。混合物を45分間撹拌し、EtOAc(150mL)で希釈し、50%飽和NH4Cl水溶液(50mL)で洗浄した。水層をEtOAc(50mL)で抽出し、合わせた有機層をH2O(10mL)で洗浄した。合わせた有機抽出物を真空中で濃縮し、残渣の半分をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→3%MeOH)によって精製することにより、所望の化合物110を42%収率で得た(332mg,0.72mmol)。1H NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm)7.77(d,J=7.5 Hz,2H),7.59(d,J=7.4 Hz,2H),7.44-7.37(m,2H),7.36-7.28(m,2H),5.12(br s,1H),4.97(br s,1H),44.41(d,J=6.8 Hz,2H),4.21(t,J=6.7 Hz,1H),4.13(d,J=8.0 Hz,2H),3.33(br s,4H),2.36-2.09(m,6H),1.67-1.45(m,2H),1.33(quintet,J=8.6 Hz,1H),1.01-0.85(m,2H).C28H31N2O4 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値459.23、実測値459.52。
DCM(15mL)中の(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチルN-スクシンイミジルカーボネート(108)(500mg,1.71mmol)の溶液に、トリエチルアミン(718uL,5.14mmol)およびモノ-Fmocエチレンジアミン塩酸塩(109)(657mg,2.06mmol)を加えた。混合物を45分間撹拌し、EtOAc(150mL)で希釈し、50%飽和NH4Cl水溶液(50mL)で洗浄した。水層をEtOAc(50mL)で抽出し、合わせた有機層をH2O(10mL)で洗浄した。合わせた有機抽出物を真空中で濃縮し、残渣の半分をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→3%MeOH)によって精製することにより、所望の化合物110を42%収率で得た(332mg,0.72mmol)。1H NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm)7.77(d,J=7.5 Hz,2H),7.59(d,J=7.4 Hz,2H),7.44-7.37(m,2H),7.36-7.28(m,2H),5.12(br s,1H),4.97(br s,1H),44.41(d,J=6.8 Hz,2H),4.21(t,J=6.7 Hz,1H),4.13(d,J=8.0 Hz,2H),3.33(br s,4H),2.36-2.09(m,6H),1.67-1.45(m,2H),1.33(quintet,J=8.6 Hz,1H),1.01-0.85(m,2H).C28H31N2O4 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値459.23、実測値459.52。
実施例7.化合物111の合成
化合物110(327mg,0.713mmol)をDMF(6mL)に溶解し、ピペリジン(0.5mL)を加えた。2時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→32%0.7N NH3 MeOH)によって精製することにより、所望の化合物111を黄色油状物として得た(128mg,0.542mmol,76%)。1H-NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm,rotamers)5.2(bs,1H),4.15(d,J=8.0 Hz,2H),3.48-3.40(m,2/3H),3.33-3.27(m,2/3H),3.27-3.19(m,1 1/3H),2.85-2.80(m,1 1/3H),2.36-2.17(m,6H),1.67-1.50(m,2H),1.36(quintet,J=8.5 Hz,1H),1.01-0.89(m,2H).
化合物110(327mg,0.713mmol)をDMF(6mL)に溶解し、ピペリジン(0.5mL)を加えた。2時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→32%0.7N NH3 MeOH)によって精製することにより、所望の化合物111を黄色油状物として得た(128mg,0.542mmol,76%)。1H-NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm,rotamers)5.2(bs,1H),4.15(d,J=8.0 Hz,2H),3.48-3.40(m,2/3H),3.33-3.27(m,2/3H),3.27-3.19(m,1 1/3H),2.85-2.80(m,1 1/3H),2.36-2.17(m,6H),1.67-1.50(m,2H),1.36(quintet,J=8.5 Hz,1H),1.01-0.89(m,2H).
実施例8.化合物114の合成
水(20mL)中のジエタノールアミン(112)(208mg,1.98mmol)の溶液に、MeCN(20mL)、NaHCO3(250mg,2.97mmol)、およびMeCN(20mL)中のFmoc-OSu(113)(601mg,1.78mmol)の溶液を加えた。混合物を2時間撹拌し、DCM(50mL)を加えた。分離後、有機相を水(20mL)で洗浄し、乾燥させ(Na2SO4)、濃縮した。所望の生成物114を無色の濃厚な油状物として得た(573mg,1.75mmol,98%)。1H NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm)7.79-7.74(m,2H),7.60-7.54(m,2H),7.44-7.37(m,2H),7.36-7.30(m,2H),4.58(d,J=5.4 Hz,2H),4.23(t,J=5.3 Hz,1H),3.82-3.72(m,2H),3.48-3.33(m,4H),3.25-3.11(m,2H).
水(20mL)中のジエタノールアミン(112)(208mg,1.98mmol)の溶液に、MeCN(20mL)、NaHCO3(250mg,2.97mmol)、およびMeCN(20mL)中のFmoc-OSu(113)(601mg,1.78mmol)の溶液を加えた。混合物を2時間撹拌し、DCM(50mL)を加えた。分離後、有機相を水(20mL)で洗浄し、乾燥させ(Na2SO4)、濃縮した。所望の生成物114を無色の濃厚な油状物として得た(573mg,1.75mmol,98%)。1H NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm)7.79-7.74(m,2H),7.60-7.54(m,2H),7.44-7.37(m,2H),7.36-7.30(m,2H),4.58(d,J=5.4 Hz,2H),4.23(t,J=5.3 Hz,1H),3.82-3.72(m,2H),3.48-3.33(m,4H),3.25-3.11(m,2H).
実施例9.化合物116の合成
DCM(50mL)中の114(567mg,1.73mmol)の溶液に、4-ニトロフェニルクロロホルメート(115)(768mg,3.81mmol)およびEt3N(1.2mL,875mg)を加えた。混合物を18時間撹拌し、濃縮した。残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(DCM中の0%→10%MeOH、次いでヘプタン中の20%→70%EtOAc)によって精製することにより、32mg(49μmol,2.8%)の所望の生成物116を得た。1H NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm)8.31-8.20(m,4H),7.80-7.74(m,2H),7.59-7.54(m,2H),7.44-7.37(m,2H),7.37-7.29(m,6H),4.61(d,J=5.4 Hz,2H),4.39(t,J=5.1 Hz,2H),4.25(t,J=5.5 Hz,1H),4.02(t,J=5.0 Hz,2H),3.67(t,J=4.8 Hz,2H),3.45(t,J=5.2 Hz,2H).
DCM(50mL)中の114(567mg,1.73mmol)の溶液に、4-ニトロフェニルクロロホルメート(115)(768mg,3.81mmol)およびEt3N(1.2mL,875mg)を加えた。混合物を18時間撹拌し、濃縮した。残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(DCM中の0%→10%MeOH、次いでヘプタン中の20%→70%EtOAc)によって精製することにより、32mg(49μmol,2.8%)の所望の生成物116を得た。1H NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm)8.31-8.20(m,4H),7.80-7.74(m,2H),7.59-7.54(m,2H),7.44-7.37(m,2H),7.37-7.29(m,6H),4.61(d,J=5.4 Hz,2H),4.39(t,J=5.1 Hz,2H),4.25(t,J=5.5 Hz,1H),4.02(t,J=5.0 Hz,2H),3.67(t,J=4.8 Hz,2H),3.45(t,J=5.2 Hz,2H).
実施例10.化合物117の合成
DCM(2mL)中の116(34mg,0.050mmol)の溶液に、111(49mg,0.21mmol)およびトリエチルアミン(20μL,0.14mmol)を加えた。混合物を室温で一晩撹拌したままにした。23時間後、混合物を濃縮した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→40%MeOH)で精製することにより、117を白色固体として61%収率で得た(27mg,0.031mmol)。C47H57N5O10 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値851.41、実測値852.49。
DCM(2mL)中の116(34mg,0.050mmol)の溶液に、111(49mg,0.21mmol)およびトリエチルアミン(20μL,0.14mmol)を加えた。混合物を室温で一晩撹拌したままにした。23時間後、混合物を濃縮した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→40%MeOH)で精製することにより、117を白色固体として61%収率で得た(27mg,0.031mmol)。C47H57N5O10 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値851.41、実測値852.49。
実施例11.化合物118の合成
化合物118を117の調製中に得た(3.8mg,0.0060mmol)。C32H47N5O8 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値629.34、実測値630.54。
化合物118を117の調製中に得た(3.8mg,0.0060mmol)。C32H47N5O8 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値629.34、実測値630.54。
実施例12.化合物121の合成
THF(6mL)中の、ジエチレントリアミン(119)(73μL,0.67mmol)およびトリエチルアミン(283μL,2.03mmol)の溶液を-5℃に冷却し、窒素雰囲気下に置いた。2-(Boc-オキシイミノ)-2-フェニルアセトニトリル(120)(334mg,1.35mmol)をTHF(4mL)に溶解し、冷却した溶液にゆっくり加えた。2.5時間後、氷浴を除去し、混合物を室温でさらに2.5時間撹拌し、真空中で濃縮した。残渣をDCM(15mL)に再溶解し、5%NaOH水溶液(2×5mL)、ブライン(2×5mL)で洗浄し、MgSO4で乾燥させた。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→14%MeOH)で精製することにより、121を無色油状物として91%収率で得た(185mg,0.610mmol)。1H-NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm)5.08(s,2H),3.30-3.12(m,4H),2.74(t,J=5.9 Hz,4H),1.45(s,18H).
THF(6mL)中の、ジエチレントリアミン(119)(73μL,0.67mmol)およびトリエチルアミン(283μL,2.03mmol)の溶液を-5℃に冷却し、窒素雰囲気下に置いた。2-(Boc-オキシイミノ)-2-フェニルアセトニトリル(120)(334mg,1.35mmol)をTHF(4mL)に溶解し、冷却した溶液にゆっくり加えた。2.5時間後、氷浴を除去し、混合物を室温でさらに2.5時間撹拌し、真空中で濃縮した。残渣をDCM(15mL)に再溶解し、5%NaOH水溶液(2×5mL)、ブライン(2×5mL)で洗浄し、MgSO4で乾燥させた。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→14%MeOH)で精製することにより、121を無色油状物として91%収率で得た(185mg,0.610mmol)。1H-NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm)5.08(s,2H),3.30-3.12(m,4H),2.74(t,J=5.9 Hz,4H),1.45(s,18H).
実施例13.化合物123の合成
THF(2mL)中の121(33.5mg,0.110mmol)の冷却溶液(-10℃)に、10%NaHCO3水溶液(500μL)、およびTHF(1mL)に溶解された9-フルオレニルメトキシカルボニルクロリド(122)(34mg,0.13mmol)を加えた。1時間後、混合物を濃縮し、残渣をEtOAc(10mL)に再溶解し、ブライン(2×5mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濃縮した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→50%MeOH)で精製することにより、123を86%収率で得た(50mg,0.090mmol)。1H-NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm)7.77(d,J=7.4 Hz,2H),7.57(d,J=7.4 Hz,2H),7.43-7.38(m,2H),7.36-7.31(m,2H),5.57(d,J=5.2 Hz,2H),4.23(t,J=5.1 Hz,1H),3.40-2.83(m,8H),1.41(s,18H).
THF(2mL)中の121(33.5mg,0.110mmol)の冷却溶液(-10℃)に、10%NaHCO3水溶液(500μL)、およびTHF(1mL)に溶解された9-フルオレニルメトキシカルボニルクロリド(122)(34mg,0.13mmol)を加えた。1時間後、混合物を濃縮し、残渣をEtOAc(10mL)に再溶解し、ブライン(2×5mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濃縮した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→50%MeOH)で精製することにより、123を86%収率で得た(50mg,0.090mmol)。1H-NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm)7.77(d,J=7.4 Hz,2H),7.57(d,J=7.4 Hz,2H),7.43-7.38(m,2H),7.36-7.31(m,2H),5.57(d,J=5.2 Hz,2H),4.23(t,J=5.1 Hz,1H),3.40-2.83(m,8H),1.41(s,18H).
実施例14.化合物124の合成
DCM(3mL)中の123(50mg,0.095mmol)の溶液に、ジオキサン中の4M HCl(200μL)を加えた。混合物を19時間撹拌し、濃縮し、白色固体を精製せずに得て(35mg)、脱保護された中間体および(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(102)(70mg,0.22mmol)をDMF(3mL)に溶解し、トリエチルアミン(34μL,0.24mmol)を加えた。2時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→25%MeOH)によって精製することにより、124を48%で得た(31mg,0.045mmol)。C41H47N3O6 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値677.35、実測値678.57。
DCM(3mL)中の123(50mg,0.095mmol)の溶液に、ジオキサン中の4M HCl(200μL)を加えた。混合物を19時間撹拌し、濃縮し、白色固体を精製せずに得て(35mg)、脱保護された中間体および(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(102)(70mg,0.22mmol)をDMF(3mL)に溶解し、トリエチルアミン(34μL,0.24mmol)を加えた。2時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→25%MeOH)によって精製することにより、124を48%で得た(31mg,0.045mmol)。C41H47N3O6 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値677.35、実測値678.57。
実施例15.化合物125の合成
DMF(500μL)中の124(10mg,0.014mmol)の溶液に、ピペリジン(20μL)を加えた。3.5時間後、混合物を濃縮した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→20%MeOH)で精製することにより、125を58%収率で得た(3.7mg,0.0080mmol)。C26H37N3O4 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値455.28、実測値456.41。
DMF(500μL)中の124(10mg,0.014mmol)の溶液に、ピペリジン(20μL)を加えた。3.5時間後、混合物を濃縮した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→20%MeOH)で精製することにより、125を58%収率で得た(3.7mg,0.0080mmol)。C26H37N3O4 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値455.28、実測値456.41。
実施例16.化合物127および128の合成
DCM(20mL)中のジエチレングリコール(126)(446μL,0.50g,4.71mmol)の溶液に、4-ニトロフェノールクロロホルメート(115)(1.4g,7.07mmol)およびEt3N(3.3.mL,2.4g,23.6mmol)を加えた。混合物を撹拌し、濾過し、真空中で濃縮した(55℃で)。残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(ヘプタン中の15%→75%EtOAc)によって精製し、2つの生成物を単離した。生成物127を白色固体として得た(511mg,1.17mmol,25%)。1H NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm)8.31-8.23(m,4H),7.43-7.34(m,4H),4.54-4.44(m,4H),3.91-3.83(m,4H).生成物128を無色油状物として得た(321mg,1.18mmol,25%)。1H NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm)8.32-8.24(m,2H),7.43-7.36(m,2H),4.50-4.44(m,2H),3.86-3.80(m,2H),3.81-3.74(m,2H),3.69-3.64(m,2H).
DCM(20mL)中のジエチレングリコール(126)(446μL,0.50g,4.71mmol)の溶液に、4-ニトロフェノールクロロホルメート(115)(1.4g,7.07mmol)およびEt3N(3.3.mL,2.4g,23.6mmol)を加えた。混合物を撹拌し、濾過し、真空中で濃縮した(55℃で)。残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(ヘプタン中の15%→75%EtOAc)によって精製し、2つの生成物を単離した。生成物127を白色固体として得た(511mg,1.17mmol,25%)。1H NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm)8.31-8.23(m,4H),7.43-7.34(m,4H),4.54-4.44(m,4H),3.91-3.83(m,4H).生成物128を無色油状物として得た(321mg,1.18mmol,25%)。1H NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm)8.32-8.24(m,2H),7.43-7.36(m,2H),4.50-4.44(m,2H),3.86-3.80(m,2H),3.81-3.74(m,2H),3.69-3.64(m,2H).
実施例17.化合物131の合成
DMF(295μL)中の118(2.3mg,3.7μmol)の溶液に、DMF(65μL)中の127(3.2mg,7.4μmol)の溶液およびEt3N(1.6μL,1.1mg,11.1μmol)を加えた。混合物を17時間静置し、DMF(14μL)中のHOBt(0.5mg,3.7μmol)の溶液を加えた。4時間後、Et3N(5.2μL,3.8mg,37μmol)およびDMF(276μL)中のvc-PABC-MMAE.TFA(130,13.8mg,11μmol)の溶液を加えた。3日後、混合物をRP HPLC(C18,水(1%AcOH)中の30%→90%MeCN(1%AcOH)によって精製した。所望の生成物131を無色のフィルム状物として得た(1.5mg,0.78μmol,21%)。C96H148N15O25 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1911.08、実測値1912.08。
DMF(295μL)中の118(2.3mg,3.7μmol)の溶液に、DMF(65μL)中の127(3.2mg,7.4μmol)の溶液およびEt3N(1.6μL,1.1mg,11.1μmol)を加えた。混合物を17時間静置し、DMF(14μL)中のHOBt(0.5mg,3.7μmol)の溶液を加えた。4時間後、Et3N(5.2μL,3.8mg,37μmol)およびDMF(276μL)中のvc-PABC-MMAE.TFA(130,13.8mg,11μmol)の溶液を加えた。3日後、混合物をRP HPLC(C18,水(1%AcOH)中の30%→90%MeCN(1%AcOH)によって精製した。所望の生成物131を無色のフィルム状物として得た(1.5mg,0.78μmol,21%)。C96H148N15O25 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1911.08、実測値1912.08。
実施例18.化合物132の合成
DCM(2mL)中の121(168mg,0.554mmol)の溶液に、DCM(1mL)中の128(240mg,0.89mmol)の溶液、DCM(1mL)およびEt3N(169mg,233μL)を加えた。混合物を17時間撹拌し、濃縮し、シリカゲルクロマトグラフィー(ヘプタン中のEtOAcのグラジエント)によって精製した。所望の生成物132を、わずかに黄色の油状物として得た(85mg,0.20mmol,35%)。1H NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm)5.24-5.02(m,2H),4.36-4.20(m,3H),3.84-3.67(m,4H),3.65-3.58(m,2H),3.47-3.34(m,4H),3.34-3.18(m,4H),1.44(bs,18H).
DCM(2mL)中の121(168mg,0.554mmol)の溶液に、DCM(1mL)中の128(240mg,0.89mmol)の溶液、DCM(1mL)およびEt3N(169mg,233μL)を加えた。混合物を17時間撹拌し、濃縮し、シリカゲルクロマトグラフィー(ヘプタン中のEtOAcのグラジエント)によって精製した。所望の生成物132を、わずかに黄色の油状物として得た(85mg,0.20mmol,35%)。1H NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm)5.24-5.02(m,2H),4.36-4.20(m,3H),3.84-3.67(m,4H),3.65-3.58(m,2H),3.47-3.34(m,4H),3.34-3.18(m,4H),1.44(bs,18H).
実施例19.化合物134の合成
DCM(3mL)中の132(81mg,0.19mmol)の溶液に、ジオキサン中の4N HCl(700μL)を加えた。混合物を19時間撹拌し、濃縮し、残渣をDMF(0.5mL)に溶解した。Et3N(132μL,96mg,0.95mmol)、DMF(0.5mL)および(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(102)(132mg,0.42mmol)を加え、得られた混合物を2時間撹拌した。混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(DCM中の0%→3%MeOH)によって精製した。所望の生成物134を無色のフィルム状物として得た(64mg,0.11mmol,57%)。1H NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm)4.31-4.23(m,2H),4.22-4.08(m,4H),3.80-3.68(m,4H),3.66-3.58(m,2H),3.50-3.28(m,8H),2.80-2.65(m,1H),2.40-2.10(m,12H),1.68-1.48(m,4H),1.35(quintet,J=8.1 Hz,1H),1.02-0.87(m,2H).C31H46N3O8 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値588.33、実測値588.43。
DCM(3mL)中の132(81mg,0.19mmol)の溶液に、ジオキサン中の4N HCl(700μL)を加えた。混合物を19時間撹拌し、濃縮し、残渣をDMF(0.5mL)に溶解した。Et3N(132μL,96mg,0.95mmol)、DMF(0.5mL)および(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(102)(132mg,0.42mmol)を加え、得られた混合物を2時間撹拌した。混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(DCM中の0%→3%MeOH)によって精製した。所望の生成物134を無色のフィルム状物として得た(64mg,0.11mmol,57%)。1H NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm)4.31-4.23(m,2H),4.22-4.08(m,4H),3.80-3.68(m,4H),3.66-3.58(m,2H),3.50-3.28(m,8H),2.80-2.65(m,1H),2.40-2.10(m,12H),1.68-1.48(m,4H),1.35(quintet,J=8.1 Hz,1H),1.02-0.87(m,2H).C31H46N3O8 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値588.33、実測値588.43。
実施例20.化合物137の合成
DCM(1mL)中の134(63mg,0.11mmol)の溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(35)(32.6mg,0.107mmol)およびEt3N(32.5mg,45μL,0.32mmol)を加えた。2時間後、77μLを主反応混合物から除去し、DMF(200μL)中のvc-PABC-MMAE.TFA(130,10mg,8.1μmol)およびEt3N(3.4μL,2.5mg,24μmol)を加えた。18時間後、2,2’-(エチレンジオキシ)ビス(エチルアミン)(4.9μL,5.0mg,34μmol)を加え、混合物を45分間静置した。混合物をRP HPLC(C18,水(1%AcOH)中の30%→90%MeCN(1%AcOH)によって精製した。所望の生成物137を無色のフィルム状物として得た(8.7mg,5.0μmol,61%)。C90H138N13O21 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1737.01、実測値1738.01。
DCM(1mL)中の134(63mg,0.11mmol)の溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(35)(32.6mg,0.107mmol)およびEt3N(32.5mg,45μL,0.32mmol)を加えた。2時間後、77μLを主反応混合物から除去し、DMF(200μL)中のvc-PABC-MMAE.TFA(130,10mg,8.1μmol)およびEt3N(3.4μL,2.5mg,24μmol)を加えた。18時間後、2,2’-(エチレンジオキシ)ビス(エチルアミン)(4.9μL,5.0mg,34μmol)を加え、混合物を45分間静置した。混合物をRP HPLC(C18,水(1%AcOH)中の30%→90%MeCN(1%AcOH)によって精製した。所望の生成物137を無色のフィルム状物として得た(8.7mg,5.0μmol,61%)。C90H138N13O21 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1737.01、実測値1738.01。
実施例21.化合物139の合成
DCM(1mL)中の134(63mg,0.11mmol)の溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(35)(32.6mg,0.107mmol)およびEt3N(32.5mg,45μL,0.32mmol)を加えた。20時間後、77μLを主反応混合物から除去し、DMF(240μL)中のvc-PABC-MMAF.TFA(138,9.6mg,8.2μmol)の溶液およびEt3N(3.4μL,2.5mg,24μmol)を加えた。3時間後、2,2’-(エチレンジオキシ)ビス(エチルアミン)(20μL,20mg,0.14mmol)を加え、混合物を20分間静置した。混合物をRP HPLC(C18,水(1%AcOH)中の30%→90%MeCN(1%AcOH)によって精製した。所望の生成物139を無色のフィルム状物として得た(5.3mg,3.2μmol,39%)。C87H130N11O21 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1664.94、実測値1665.99。
DCM(1mL)中の134(63mg,0.11mmol)の溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(35)(32.6mg,0.107mmol)およびEt3N(32.5mg,45μL,0.32mmol)を加えた。20時間後、77μLを主反応混合物から除去し、DMF(240μL)中のvc-PABC-MMAF.TFA(138,9.6mg,8.2μmol)の溶液およびEt3N(3.4μL,2.5mg,24μmol)を加えた。3時間後、2,2’-(エチレンジオキシ)ビス(エチルアミン)(20μL,20mg,0.14mmol)を加え、混合物を20分間静置した。混合物をRP HPLC(C18,水(1%AcOH)中の30%→90%MeCN(1%AcOH)によって精製した。所望の生成物139を無色のフィルム状物として得た(5.3mg,3.2μmol,39%)。C87H130N11O21 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1664.94、実測値1665.99。
実施例22.化合物141の合成
DCM(400ml)中の(1R,8S,9S)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチルN-スクシンイミジルカーボネート(108)(16.35g,56.13mmol)の溶液に、2-(2-アミノエトキシ)エタノール(140)(6.76ml,67.35mmol)およびトリエチルアミン(23.47ml,168.39mmol)を加えた。得られた薄黄色溶液を室温で90分間撹拌した。混合物を真空中で濃縮し、残渣をアセトニトリル(400mL)と1回共蒸発させた。得られた油状物をEtOAc(400mL)に溶解し、H2O(3×200mL)で洗浄した。有機層を真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘプタン中の50%→88%EtOAc)によって精製し、141(11.2g,39.81mmol,71%収率)を薄黄色油状物として得た。1H-NMR(400 MHz,CDCl3):δ(ppm)5.01(br s,1H),4.17(d,2H,J=12.0 Hz),3.79-3.68(m,2H),3.64-3.50(m,4H),3.47-3.30(m,2H),2.36-2.14(m,6H),1.93(br s,1H),1.68-1.49(m,2H),1.37(quintet,1H,J=8.0 Hz),1.01-0.89(m,2H).
DCM(400ml)中の(1R,8S,9S)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチルN-スクシンイミジルカーボネート(108)(16.35g,56.13mmol)の溶液に、2-(2-アミノエトキシ)エタノール(140)(6.76ml,67.35mmol)およびトリエチルアミン(23.47ml,168.39mmol)を加えた。得られた薄黄色溶液を室温で90分間撹拌した。混合物を真空中で濃縮し、残渣をアセトニトリル(400mL)と1回共蒸発させた。得られた油状物をEtOAc(400mL)に溶解し、H2O(3×200mL)で洗浄した。有機層を真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘプタン中の50%→88%EtOAc)によって精製し、141(11.2g,39.81mmol,71%収率)を薄黄色油状物として得た。1H-NMR(400 MHz,CDCl3):δ(ppm)5.01(br s,1H),4.17(d,2H,J=12.0 Hz),3.79-3.68(m,2H),3.64-3.50(m,4H),3.47-3.30(m,2H),2.36-2.14(m,6H),1.93(br s,1H),1.68-1.49(m,2H),1.37(quintet,1H,J=8.0 Hz),1.01-0.89(m,2H).
実施例23.化合物142の合成
DCM(15mL)中の141(663mg,2.36mmol)の溶液に、トリエチルアミン(986uL,7.07mmol)および4-ニトロフェニルクロロホルメート(115)(712mg,3.53mmol)を加えた。混合物を4時間撹拌し、真空中で濃縮した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘプタン中の0→20%EtOAc)で精製することにより、142(400mg,0.9mmol,収率38%)を薄黄色油状物として得た。1H-NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm)8.29(d,J=9.4 Hz,2H),7.40(d,J=9.3 Hz,2H),5.05(br s,1H),4.48-4.41(m,2H),4.16(d,J=8.0 Hz,2H),3.81-3.75(m,2H),3.61(t,J=5.0 Hz,2H),3.42(q,J=5.4 Hz,2H),2.35-2.16(m,6H),1.66-1.50(m,2H),1.35(quintet,J=8.6 Hz,1H),1.02-0.88(m,2H).C22H26N2NaO8 +(M+Na+)についてのLCMS(ESI+)計算値469.16、実測値469.36。
DCM(15mL)中の141(663mg,2.36mmol)の溶液に、トリエチルアミン(986uL,7.07mmol)および4-ニトロフェニルクロロホルメート(115)(712mg,3.53mmol)を加えた。混合物を4時間撹拌し、真空中で濃縮した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘプタン中の0→20%EtOAc)で精製することにより、142(400mg,0.9mmol,収率38%)を薄黄色油状物として得た。1H-NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm)8.29(d,J=9.4 Hz,2H),7.40(d,J=9.3 Hz,2H),5.05(br s,1H),4.48-4.41(m,2H),4.16(d,J=8.0 Hz,2H),3.81-3.75(m,2H),3.61(t,J=5.0 Hz,2H),3.42(q,J=5.4 Hz,2H),2.35-2.16(m,6H),1.66-1.50(m,2H),1.35(quintet,J=8.6 Hz,1H),1.02-0.88(m,2H).C22H26N2NaO8 +(M+Na+)についてのLCMS(ESI+)計算値469.16、実測値469.36。
実施例24.化合物143の合成
DMF(48μL)中の142(2.7mg,6.0μmol)の溶液およびEt3N(2.1μL,1.5mg,15μmol)を、DMF(0.32mL)中の125(2.3mg,5.0μmol)の溶液に加えた。混合物を4日間静置し、DMF(100μL)で希釈し、RP HPLC(C18,水(1%AcOH)中の30%→100%のMeCN(1%AcOH)によって精製した。生成物143を無色のフィルム状物として得た(2.8mg,3.7μmol,74%)。C42H59N4O9 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値763.43、実測値763.53。
DMF(48μL)中の142(2.7mg,6.0μmol)の溶液およびEt3N(2.1μL,1.5mg,15μmol)を、DMF(0.32mL)中の125(2.3mg,5.0μmol)の溶液に加えた。混合物を4日間静置し、DMF(100μL)で希釈し、RP HPLC(C18,水(1%AcOH)中の30%→100%のMeCN(1%AcOH)によって精製した。生成物143を無色のフィルム状物として得た(2.8mg,3.7μmol,74%)。C42H59N4O9 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値763.43、実測値763.53。
実施例25.化合物145の合成
DCM(1mL)中の128(200mg,0.45mmol)の溶液に、トリエチルアミン(41.6uL,0.30mmol)およびトリス(2-アミノエチル)アミン144(14.9uL,0.10mmol)を加えた。混合物を150分間撹拌した後、真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の25%→100%EtOAc、次いでDCM中の0%→10%MeOH)によって精製し、145を43%収率(45.4mg,42.5umol)で黄色油状物として得た。1H NMR(400 MHz,CDCl3):δ(ppm)5.68-5.18(m,6H),4.32-4.18(m,6H),4.18-4.11(d,J=7.9 Hz,6H),3.74-3.61(m,6H),3.61-3.51(m,6H),3.43-3.29(m,6H),3.29-3.15(m,6H),2.65-2.47(m,6H),2.37-2.16(m,18H),1.69-1.49(m,6H),1.35(quintet,J=8.9 Hz,3H),1.03-0.87(m,6H).
DCM(1mL)中の128(200mg,0.45mmol)の溶液に、トリエチルアミン(41.6uL,0.30mmol)およびトリス(2-アミノエチル)アミン144(14.9uL,0.10mmol)を加えた。混合物を150分間撹拌した後、真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の25%→100%EtOAc、次いでDCM中の0%→10%MeOH)によって精製し、145を43%収率(45.4mg,42.5umol)で黄色油状物として得た。1H NMR(400 MHz,CDCl3):δ(ppm)5.68-5.18(m,6H),4.32-4.18(m,6H),4.18-4.11(d,J=7.9 Hz,6H),3.74-3.61(m,6H),3.61-3.51(m,6H),3.43-3.29(m,6H),3.29-3.15(m,6H),2.65-2.47(m,6H),2.37-2.16(m,18H),1.69-1.49(m,6H),1.35(quintet,J=8.9 Hz,3H),1.03-0.87(m,6H).
実施例26.化合物148の合成
DCM(300mL)中のBCN-OH(101)(3.0g,20mmol)の溶液に、CSI(146)(1.74mL,2.83g,20mmol)を加えた。混合物を15分間撹拌した後、Et3N(5.6mL,4.0g,40mmol)を加えた。混合物を5分間撹拌し、2-(2-アミノエトキシ)エタノール(147)(2.2mL,2.3g,22mmol)を加えた。得られた混合物を15分間撹拌し、飽和NH4Cl水溶液(300mL)を加えた。層を分離し、水相をDCM(200mL)で抽出した。合わせた有機層を乾燥させ(Na2SO4)、濃縮した。残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(DCM中の0%~10%MeOH)によって精製した。所望の生成物を含む画分を濃縮した。残渣をEtOAc(100mL)に溶解し、濃縮した。所望の生成物148を、わずかに黄色の油状物として得た(4.24g,11.8mmol,59%)。1H NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm)5.99-5.79(bs,1H),4.29(d,J=8.3 Hz,2H),3.78-3.74(m,2H),3.66-3.56(m,4H),3.37-3.30(m,2H),2.36-2.16(m,6H),1.63-1.49(m,2H),1.40(quintet,J=8.7 Hz,1H),1.05-0.94(m,2H).
DCM(300mL)中のBCN-OH(101)(3.0g,20mmol)の溶液に、CSI(146)(1.74mL,2.83g,20mmol)を加えた。混合物を15分間撹拌した後、Et3N(5.6mL,4.0g,40mmol)を加えた。混合物を5分間撹拌し、2-(2-アミノエトキシ)エタノール(147)(2.2mL,2.3g,22mmol)を加えた。得られた混合物を15分間撹拌し、飽和NH4Cl水溶液(300mL)を加えた。層を分離し、水相をDCM(200mL)で抽出した。合わせた有機層を乾燥させ(Na2SO4)、濃縮した。残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(DCM中の0%~10%MeOH)によって精製した。所望の生成物を含む画分を濃縮した。残渣をEtOAc(100mL)に溶解し、濃縮した。所望の生成物148を、わずかに黄色の油状物として得た(4.24g,11.8mmol,59%)。1H NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm)5.99-5.79(bs,1H),4.29(d,J=8.3 Hz,2H),3.78-3.74(m,2H),3.66-3.56(m,4H),3.37-3.30(m,2H),2.36-2.16(m,6H),1.63-1.49(m,2H),1.40(quintet,J=8.7 Hz,1H),1.05-0.94(m,2H).
実施例27.化合物149の合成
DCM(200mL)中の148(3.62g,10.0mmol)の溶液に、4-ニトロフェニルクロロホルメート(15)(2.02g,10.0mmol)およびEt3N(4.2mL,3.04g,30.0mmol)を加えた。混合物を1.5時間撹拌し、濃縮した。残渣を、シリカゲルクロマトグラフィー(ヘプタン(1%AcOH)中の20%→70%EtOAc(1%AcOH))によって精製した。生成物149を白色泡状物として得た(4.07g,7.74mmol,74%)。1H NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm)8.32-8.26(m,2H),7.45-7.40(m,2H),5.62-5.52(m,1H),4.48-4.42(m,2H),4.28(d,J=8.2 Hz,2H),3.81-3.76(m,2H),3.70-3.65(m,2H),3.38-3.30(m,2H),2.35-2.16(m,6H),1.62-1.46(m,2H),1.38(quintet,J=8.7 Hz,1H),1.04-0.93(m,2H).
DCM(200mL)中の148(3.62g,10.0mmol)の溶液に、4-ニトロフェニルクロロホルメート(15)(2.02g,10.0mmol)およびEt3N(4.2mL,3.04g,30.0mmol)を加えた。混合物を1.5時間撹拌し、濃縮した。残渣を、シリカゲルクロマトグラフィー(ヘプタン(1%AcOH)中の20%→70%EtOAc(1%AcOH))によって精製した。生成物149を白色泡状物として得た(4.07g,7.74mmol,74%)。1H NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm)8.32-8.26(m,2H),7.45-7.40(m,2H),5.62-5.52(m,1H),4.48-4.42(m,2H),4.28(d,J=8.2 Hz,2H),3.81-3.76(m,2H),3.70-3.65(m,2H),3.38-3.30(m,2H),2.35-2.16(m,6H),1.62-1.46(m,2H),1.38(quintet,J=8.7 Hz,1H),1.04-0.93(m,2H).
実施例28.化合物150の合成
DCM(1mL)中の149(200mg,0.38mmol)の溶液に、トリエチルアミン(35.4uL,0.24mmol)およびトリス(2-アミノエチル)アミン(144)(12.6uL,84.6umol)を加えた。混合物を120分間撹拌し、真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の25%→100%EtOAc、次いでDCM中の0%→10%MeOH)によって精製し、150を36%収率(40.0mg,30.6umol)で白色泡状物として得た。1H NMR(400 MHz,CDCl3):δ(ppm)6.34-5.72(m,6H),4.34-4.18(m,12H),3.76-3.58(m,12H),3.43-3.30(m,6H),3.30-3.18(m,6H),2.64-2.49(m,6H),2.38-2.14(m,18H),1.65-1.47(m,6H),1.39(quintet,J=9.1 Hz,3H),1.06-0.90(m,6H).
DCM(1mL)中の149(200mg,0.38mmol)の溶液に、トリエチルアミン(35.4uL,0.24mmol)およびトリス(2-アミノエチル)アミン(144)(12.6uL,84.6umol)を加えた。混合物を120分間撹拌し、真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の25%→100%EtOAc、次いでDCM中の0%→10%MeOH)によって精製し、150を36%収率(40.0mg,30.6umol)で白色泡状物として得た。1H NMR(400 MHz,CDCl3):δ(ppm)6.34-5.72(m,6H),4.34-4.18(m,12H),3.76-3.58(m,12H),3.43-3.30(m,6H),3.30-3.18(m,6H),2.64-2.49(m,6H),2.38-2.14(m,18H),1.65-1.47(m,6H),1.39(quintet,J=9.1 Hz,3H),1.06-0.90(m,6H).
実施例29.化合物153の合成
無水DMF(1mL)中のFmoc-Gly-Gly-Gly-OH(151)(31.2mg,75.8μmol)の混合物に、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(40μL,29mg,0.23mmol)およびHATU(30.3mg,79.6μmol)を加えた。10分後、テトラジン-PEG3-エチルアミン(152)(30.3mg,75.8μmol)を加え、混合物をボルテックスした。2時間後、混合物をRP HPLC(C18,水(1%AcOH)中の30%→90%MeCN(1%AcOH)によって精製した。所望の生成物を淡紅色のフィルム状物として得た(24.1mg,31.8μmol,42%)。C38H45N8O9 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値757.33、実測値757.46。
無水DMF(1mL)中のFmoc-Gly-Gly-Gly-OH(151)(31.2mg,75.8μmol)の混合物に、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(40μL,29mg,0.23mmol)およびHATU(30.3mg,79.6μmol)を加えた。10分後、テトラジン-PEG3-エチルアミン(152)(30.3mg,75.8μmol)を加え、混合物をボルテックスした。2時間後、混合物をRP HPLC(C18,水(1%AcOH)中の30%→90%MeCN(1%AcOH)によって精製した。所望の生成物を淡紅色のフィルム状物として得た(24.1mg,31.8μmol,42%)。C38H45N8O9 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値757.33、実測値757.46。
実施例30.化合物154の合成
DMF(500μL)中の153(24.1mg,31.8μmol)の溶液に、ジエチルアミン(20μL,14mg,191μmol)を加えた。混合物を2時間静置し、RP HPLC(C18,水(1%AcOH)中の5%→90%MeCN(1%AcOH)によって精製した。所望の目的物154を淡紅色のフィルム状物として得た(17.5mg,32.7μmol,定量的)。C23H35N8O7 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値535.26、実測値535.37。
DMF(500μL)中の153(24.1mg,31.8μmol)の溶液に、ジエチルアミン(20μL,14mg,191μmol)を加えた。混合物を2時間静置し、RP HPLC(C18,水(1%AcOH)中の5%→90%MeCN(1%AcOH)によって精製した。所望の目的物154を淡紅色のフィルム状物として得た(17.5mg,32.7μmol,定量的)。C23H35N8O7 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値535.26、実測値535.37。
実施例31.化合物156の合成
乾燥DMF(2mL)中のN-[(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチルオキシカルボニル]-1,8-ジアミノ-3,6-ジオキサオクタン(155)(68mg,0.21mmol)の溶液を、乾燥DMF(2mL)中のFmoc-Gly-Gly-Gly-OH(151)(86mg,0.21mmol)の溶液に移した。DIPEA(100μL,0.630mmol)およびHATU(79mg,0.21mmol)を加えた。1.5時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→11%MeOH)によって精製することにより、所望の化合物156を34%収率で得た(52mg,0.072mmol)。C35H47N5O9 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値717.34、実測値718.39。
乾燥DMF(2mL)中のN-[(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチルオキシカルボニル]-1,8-ジアミノ-3,6-ジオキサオクタン(155)(68mg,0.21mmol)の溶液を、乾燥DMF(2mL)中のFmoc-Gly-Gly-Gly-OH(151)(86mg,0.21mmol)の溶液に移した。DIPEA(100μL,0.630mmol)およびHATU(79mg,0.21mmol)を加えた。1.5時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→11%MeOH)によって精製することにより、所望の化合物156を34%収率で得た(52mg,0.072mmol)。C35H47N5O9 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値717.34、実測値718.39。
実施例32.化合物157の合成
化合物156(21mg,0.029mmol)をDMF(2.4mL)に溶解し、ピペリジン(600μL)を加えた。20分後、混合物を濃縮し、残渣を分取HPLCによって精製することにより、所望の化合物157を白色固体として得た(9.3mg,0.018mmol,64%)。C23H37N5O7 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値495.27、実測値496.56。
化合物156(21mg,0.029mmol)をDMF(2.4mL)に溶解し、ピペリジン(600μL)を加えた。20分後、混合物を濃縮し、残渣を分取HPLCによって精製することにより、所望の化合物157を白色固体として得た(9.3mg,0.018mmol,64%)。C23H37N5O7 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値495.27、実測値496.56。
実施例33.化合物159の合成
DCM(5mL)中のアミノ-PEG11-アミン(158)(143mg,0.260mmol)の溶液に、DCM(5mL)に溶解された(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(102)(41mg,0.13mmol)をゆっくり加えた。1.5時間後、混合物を還元し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→20%0.7N NH3 MeOH)によって精製することにより、所望の化合物159を透明な油状物として得た(62mg,0.086mmol,66%)。C35H46N2O13 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値720.44、実測値721.56。
DCM(5mL)中のアミノ-PEG11-アミン(158)(143mg,0.260mmol)の溶液に、DCM(5mL)に溶解された(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(102)(41mg,0.13mmol)をゆっくり加えた。1.5時間後、混合物を還元し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→20%0.7N NH3 MeOH)によって精製することにより、所望の化合物159を透明な油状物として得た(62mg,0.086mmol,66%)。C35H46N2O13 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値720.44、実測値721.56。
実施例34.化合物160の合成
乾燥DMF(2mL)中の159(62mg,0.086mmol)の溶液を、乾燥DMF(2mL)中のFmoc-Gly-Gly-Gly-OH(151)(36mg,0.086mmol)の溶液に移した。DIPEA(43μL,0.25mmol)およびHATU(33mg,0.086mmol)を加えた。18時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→20%MeOH)によって精製することにより、所望の化合物160を62%収率で得た(60mg,0.054mmol)。C56H83N5O18+(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1113.57、実測値1114.93。
乾燥DMF(2mL)中の159(62mg,0.086mmol)の溶液を、乾燥DMF(2mL)中のFmoc-Gly-Gly-Gly-OH(151)(36mg,0.086mmol)の溶液に移した。DIPEA(43μL,0.25mmol)およびHATU(33mg,0.086mmol)を加えた。18時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→20%MeOH)によって精製することにより、所望の化合物160を62%収率で得た(60mg,0.054mmol)。C56H83N5O18+(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1113.57、実測値1114.93。
実施例35.化合物161の合成
化合物160(36mg,0.032mmol)をDMF(2mL)に溶解し、ピペリジン(200μL)を加えた。2時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→40%0.7N NH3 MeOH)によって精製することにより、所望の化合物161を黄色油状物として得た(16.7mg,0.0187mmol,58%)。C41H73N5O16 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値891.51、実測値892.82。
化合物160(36mg,0.032mmol)をDMF(2mL)に溶解し、ピペリジン(200μL)を加えた。2時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→40%0.7N NH3 MeOH)によって精製することにより、所望の化合物161を黄色油状物として得た(16.7mg,0.0187mmol,58%)。C41H73N5O16 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値891.51、実測値892.82。
実施例36.化合物162の合成
DCM(3mL)中のアミノ-PEG23-アミン(106)(60mg,0.056mmol)の溶液に、DCM(5mL)に溶解された(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(102)(12mg,0.037mmol)をゆっくり加えた。4時間後、混合物を濃縮し、DMF(2mL)に再溶解し、その後、Fmoc-Gly-Gly-Gly-OH(51)(23mg,0.056mmol)、HATU(21mg,0.056mmol)およびDIPEA(27μL,0.16mmol)を加えた。20時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→27%MeOH)によって精製することにより、所望の化合物162を93%で得た(57mg,0.043mmol)。C80H131N5O30 +(M+NH4 +)についてのLCMS(ESI+)計算値1641.89、実測値1659.92。
DCM(3mL)中のアミノ-PEG23-アミン(106)(60mg,0.056mmol)の溶液に、DCM(5mL)に溶解された(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(102)(12mg,0.037mmol)をゆっくり加えた。4時間後、混合物を濃縮し、DMF(2mL)に再溶解し、その後、Fmoc-Gly-Gly-Gly-OH(51)(23mg,0.056mmol)、HATU(21mg,0.056mmol)およびDIPEA(27μL,0.16mmol)を加えた。20時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→27%MeOH)によって精製することにより、所望の化合物162を93%で得た(57mg,0.043mmol)。C80H131N5O30 +(M+NH4 +)についてのLCMS(ESI+)計算値1641.89、実測値1659.92。
実施例37.化合物163の合成
化合物162(57mg,0.034mmol)をDMF(1mL)に溶解し、ピペリジン(120μL)を加えた。2時間後、混合物を濃縮し、水に再溶解し、Fmoc-ピペリジン副産物をジエチルエーテル(3×10mL)で抽出して除去した。凍結乾燥後、163を黄色油状物として得た(46.1mg,0.032mmol,95%)。C65H121N5O28 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1419.82、実測値1420.91。
化合物162(57mg,0.034mmol)をDMF(1mL)に溶解し、ピペリジン(120μL)を加えた。2時間後、混合物を濃縮し、水に再溶解し、Fmoc-ピペリジン副産物をジエチルエーテル(3×10mL)で抽出して除去した。凍結乾燥後、163を黄色油状物として得た(46.1mg,0.032mmol,95%)。C65H121N5O28 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1419.82、実測値1420.91。
実施例38.化合物165の合成
(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(102)(204mg,0.650mmol)の溶液に、アミノ-PEG12-アルコール(164)(496mg,0.908mmol)およびトリエチルアミン(350μL,2.27mmol)を加えた。19時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の2→20%MeOH)で精製することにより、165を透明な黄色油状物として得た(410mg,0.560mmol,87%)。C35H63NO14 +(M+Na+)についてのLCMS(ESI+)計算値721.42、実測値744.43。
(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(102)(204mg,0.650mmol)の溶液に、アミノ-PEG12-アルコール(164)(496mg,0.908mmol)およびトリエチルアミン(350μL,2.27mmol)を加えた。19時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の2→20%MeOH)で精製することにより、165を透明な黄色油状物として得た(410mg,0.560mmol,87%)。C35H63NO14 +(M+Na+)についてのLCMS(ESI+)計算値721.42、実測値744.43。
実施例39.化合物166の合成
DCM(6mL)中の165(410mg,0.560mmol)の溶液に、4-ニトロフェニルクロロホルメート(171,0.848mmol)およびトリエチルアミン(260μL,1.89mmol)を加えた。18時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→7%MeOH)によって精製することにより、所望の化合物166を透明な油状物として得た(350mg,0.394mmol,70%)。C42H66N2O18 +(M+Na+)についてのLCMS(ESI+)計算値886.43、実測値909.61。
DCM(6mL)中の165(410mg,0.560mmol)の溶液に、4-ニトロフェニルクロロホルメート(171,0.848mmol)およびトリエチルアミン(260μL,1.89mmol)を加えた。18時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→7%MeOH)によって精製することにより、所望の化合物166を透明な油状物として得た(350mg,0.394mmol,70%)。C42H66N2O18 +(M+Na+)についてのLCMS(ESI+)計算値886.43、実測値909.61。
実施例40.化合物168の合成
DMF(2mL)中の166(15mg,0.017mmol)の溶液に、ペプチドLPETGG(167)(9.7mg,0.017mmol)およびトリエチルアミン(7μL,0.05mmol)を加えた。46時間後、混合物を濃縮し、残渣を分取HPLCによって精製することにより、所望の化合物168を63%で得た(14mg,0.010mmol)。C60H101N7O25+(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1319.68、実測値1320.92。
DMF(2mL)中の166(15mg,0.017mmol)の溶液に、ペプチドLPETGG(167)(9.7mg,0.017mmol)およびトリエチルアミン(7μL,0.05mmol)を加えた。46時間後、混合物を濃縮し、残渣を分取HPLCによって精製することにより、所望の化合物168を63%で得た(14mg,0.010mmol)。C60H101N7O25+(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1319.68、実測値1320.92。
実施例41.XL01の合成
無水DMF(170μL)中の155(9.7mg,0.03mmol)の溶液に、177(ビス-マレイミド-リジン-PEG4-TFP,Broadpharm)(20mg,0.024mmol)およびEt3N(9.9μL,0.071mmol)を加えた。室温で42時間撹拌した後、混合物をDCM(0.4mL)で希釈し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→18%MeOH)によって精製することにより、XL01を透明な油状物として得た(10.2mg,0.010mmol,43%)。C49H72N7O16 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1003.12、実測値1003.62。
無水DMF(170μL)中の155(9.7mg,0.03mmol)の溶液に、177(ビス-マレイミド-リジン-PEG4-TFP,Broadpharm)(20mg,0.024mmol)およびEt3N(9.9μL,0.071mmol)を加えた。室温で42時間撹拌した後、混合物をDCM(0.4mL)で希釈し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→18%MeOH)によって精製することにより、XL01を透明な油状物として得た(10.2mg,0.010mmol,43%)。C49H72N7O16 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1003.12、実測値1003.62。
実施例42.ビス-マレイミドアジドXL02の合成
乾燥DMF(400μL)中の177(32.9mg,39.0μmol,1.0当量)が入ったバイアルに、XL07(9.2mg,42.1μmol,1.08当量)を加え、その溶液を混合し、室温で約50分間放置した。次に、DiPEAを加え、得られた溶液を混合し、室温で約2時間放置した。次いで、反応混合物をシリカゲルクロマトグラフィー(DCM→DCM中の14%MeOH)によって直接精製した。所望の生成物XL02を無色油状物として得た(28.9mg,32.2μmol,83%収率)。C39H62N9O15 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値896.97、実測値896.52。
乾燥DMF(400μL)中の177(32.9mg,39.0μmol,1.0当量)が入ったバイアルに、XL07(9.2mg,42.1μmol,1.08当量)を加え、その溶液を混合し、室温で約50分間放置した。次に、DiPEAを加え、得られた溶液を混合し、室温で約2時間放置した。次いで、反応混合物をシリカゲルクロマトグラフィー(DCM→DCM中の14%MeOH)によって直接精製した。所望の生成物XL02を無色油状物として得た(28.9mg,32.2μmol,83%収率)。C39H62N9O15 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値896.97、実測値896.52。
実施例43.XL03の合成
乾燥DCM(7.5mL)中の2,3-ビス(ブロモメチル)-6-キノキサリンカルボン酸178(51.4mg,142.8μmol,1.00当量)が入ったバイアルに、DIC(9.0mg,71.4μmol,0.5当量)を加えた。得られた混合物を室温で30分間放置した後、乾燥DCM(0.5mL)中のXL07(17.7mg,78.5μmol,0.55当量)の溶液を加えた。反応混合物を室温で約35分間撹拌し、次いで、シリカゲルクロマトグラフィー(DCM→DCM中の10%MeOH)によって直接精製して、不純な生成物(72mg)を白色固体として得た。その不純な生成物を1.0mLのDMFに溶解し、この溶液の50%をトルエンと共蒸発させた(2×)。残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(トルエン中の12→30%アセトン)によって精製した。所望の生成物XL03を無色油状物として得た(20.1mg,35.9μmol)。C19H25Br2N6O4 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値561.03、実測値561.12
乾燥DCM(7.5mL)中の2,3-ビス(ブロモメチル)-6-キノキサリンカルボン酸178(51.4mg,142.8μmol,1.00当量)が入ったバイアルに、DIC(9.0mg,71.4μmol,0.5当量)を加えた。得られた混合物を室温で30分間放置した後、乾燥DCM(0.5mL)中のXL07(17.7mg,78.5μmol,0.55当量)の溶液を加えた。反応混合物を室温で約35分間撹拌し、次いで、シリカゲルクロマトグラフィー(DCM→DCM中の10%MeOH)によって直接精製して、不純な生成物(72mg)を白色固体として得た。その不純な生成物を1.0mLのDMFに溶解し、この溶液の50%をトルエンと共蒸発させた(2×)。残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(トルエン中の12→30%アセトン)によって精製した。所望の生成物XL03を無色油状物として得た(20.1mg,35.9μmol)。C19H25Br2N6O4 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値561.03、実測値561.12
実施例44.XL05の合成
DCM(0.3mL)中の178(30mg,0.09mmol)の溶液に、3-マレイミドプロピオン酸NHSエステル(27mg,0.10mmol)およびEt3N(38μL,0.27mmol)を加えた。室温で28時間撹拌した後、粗混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→15%MeOH)によって精製することにより、XL05を透明な油状物として得た(27mg,0.056mmol,62%)。C24H34N3O7 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値476.54、実測値476.46。
DCM(0.3mL)中の178(30mg,0.09mmol)の溶液に、3-マレイミドプロピオン酸NHSエステル(27mg,0.10mmol)およびEt3N(38μL,0.27mmol)を加えた。室温で28時間撹拌した後、粗混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→15%MeOH)によって精製することにより、XL05を透明な油状物として得た(27mg,0.056mmol,62%)。C24H34N3O7 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値476.54、実測値476.46。
実施例45.XL06の合成
24(17.2mg,1-H-qNMRによる88重量%,18.4μmol,1.00当量)が入ったバイアルに、乾燥DMF中の179の溶液(60μL)を加えた。得られた無色溶液に、トリエチルアミン(40.6μL,15.8当量,291μmol)を加えたところ、直ちに黄色溶液が生成された。反応混合物を室温で約28時間放置し、次いで、Et3Nの大部分が蒸発するまで真空中で濃縮した。次いで、残渣をDCM(1mL)で希釈し、シリカゲルクロマトグラフィー(第1のカラム:DCM→DCM中の20%MeOH、第2のカラム:DCM→DCM中の20%MeOH)によって直接精製した。所望の生成物(XL06)を無色油状物として得た(4.3mg,18.4μmol,26%収率)。C34H62N7O19S+(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値904.38、実測値904.52。
24(17.2mg,1-H-qNMRによる88重量%,18.4μmol,1.00当量)が入ったバイアルに、乾燥DMF中の179の溶液(60μL)を加えた。得られた無色溶液に、トリエチルアミン(40.6μL,15.8当量,291μmol)を加えたところ、直ちに黄色溶液が生成された。反応混合物を室温で約28時間放置し、次いで、Et3Nの大部分が蒸発するまで真空中で濃縮した。次いで、残渣をDCM(1mL)で希釈し、シリカゲルクロマトグラフィー(第1のカラム:DCM→DCM中の20%MeOH、第2のカラム:DCM→DCM中の20%MeOH)によって直接精製した。所望の生成物(XL06)を無色油状物として得た(4.3mg,18.4μmol,26%収率)。C34H62N7O19S+(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値904.38、実測値904.52。
実施例46.186の合成
DCM(10mL)中のオクタ-エチレングリコール185の溶液に、トリエチルアミン(1.0mL,7.24mmol,2.5当量)を加えた後、DCM(5mL)中の4-ニトロフェニルクロロホルメート(0.58g,2.90mmol,1当量)溶液を28分で滴下した。混合物を90分間撹拌した後、真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の75%→0%EtOAcの後、DCM中の0%→7%MeOH)によって精製した。生成物186を無色油状物として38%収率で得た(584.6mg,1.09mmol)。C23H38NO13 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値536.23、実測値536.93。1H-NMR(400 MHz,CDCl3):δ(ppm)8.28(d,J=12.0 Hz,2H),7.40(d,J=12.0 Hz,2H),4.47-4.42(m,2H),3.84-3.79(m,2H),3.75-3.63(m,26H),3.63-3.59(m,2H),2.70-2.55(bs,1H).
DCM(10mL)中のオクタ-エチレングリコール185の溶液に、トリエチルアミン(1.0mL,7.24mmol,2.5当量)を加えた後、DCM(5mL)中の4-ニトロフェニルクロロホルメート(0.58g,2.90mmol,1当量)溶液を28分で滴下した。混合物を90分間撹拌した後、真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の75%→0%EtOAcの後、DCM中の0%→7%MeOH)によって精製した。生成物186を無色油状物として38%収率で得た(584.6mg,1.09mmol)。C23H38NO13 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値536.23、実測値536.93。1H-NMR(400 MHz,CDCl3):δ(ppm)8.28(d,J=12.0 Hz,2H),7.40(d,J=12.0 Hz,2H),4.47-4.42(m,2H),3.84-3.79(m,2H),3.75-3.63(m,26H),3.63-3.59(m,2H),2.70-2.55(bs,1H).
実施例47.188の合成
DCM(1mL)中の187(BocNH-PEG2)2NH,202mg,0.42mmol)の溶液に、調製された186の原液(DCM(1mL)中の584mg)の一部(0.5mL,0.54mmol 1.3当量)を加えた後、トリエチルアミン(176μL,1.26mmol,3当量)およびHOBt(57mg,0.42mmol,1当量)を加えた。混合物を8日間撹拌した後、真空中で濃縮した。残渣を、アセトニトリル(4.2mL)および0.1N NaOH(aq)(4.2mL,1当量)およびさらなる量の固体NaOH(91.5mg)の混合物に溶解した。混合物をさらに21.5時間撹拌した後、混合物をDCM(3×40mL)で抽出した。合わせた有機層を真空中で濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→15%MeOH)によって精製した。生成物188を薄黄色油状物として87%収率で得た(320.4mg,0.37mmol)。C39H78N3O18 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値876.53、実測値876.54。
DCM(1mL)中の187(BocNH-PEG2)2NH,202mg,0.42mmol)の溶液に、調製された186の原液(DCM(1mL)中の584mg)の一部(0.5mL,0.54mmol 1.3当量)を加えた後、トリエチルアミン(176μL,1.26mmol,3当量)およびHOBt(57mg,0.42mmol,1当量)を加えた。混合物を8日間撹拌した後、真空中で濃縮した。残渣を、アセトニトリル(4.2mL)および0.1N NaOH(aq)(4.2mL,1当量)およびさらなる量の固体NaOH(91.5mg)の混合物に溶解した。混合物をさらに21.5時間撹拌した後、混合物をDCM(3×40mL)で抽出した。合わせた有機層を真空中で濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→15%MeOH)によって精製した。生成物188を薄黄色油状物として87%収率で得た(320.4mg,0.37mmol)。C39H78N3O18 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値876.53、実測値876.54。
1H-NMR(400 MHz,CDCl3):δ(ppm)5.15-5.02(bs,2H),4.25-4.19(m,2H),3.76-3.46(m,50H),3.35-3.26(m,4H),2.79-2.69(br.s,1H),1.44(s,18H).
実施例48.189の合成
188(320mg,0.37mmol)をDCM(1mL)に溶解した。次いで、ジオキサン中の4M HCl(456μL,1.83mmol,5当量)を加えた。混合物を3.5時間撹拌した後、ジオキサン中のさらなる4M HCl(450μL,1.80mmol,4.9当量)を加えた。混合物をさらに3.5時間撹拌した後、ジオキサン中のさらなる4M HCl(450μL,1.80mmol,4.9当量)を加えた。混合物を16.5時間撹拌した後、混合物を真空中で濃縮した。生成物189を白色の粘着性固体として定量的収率で得た。これを次のステップで直接使用した。1H-NMR(400 MHz,DMSO-d6):δ(ppm)8.07-7.81(bs,6H),4.15-4.06(m,2H),3.75-3.66(m,2H),3.65-3.48(m,48H),3.03-2.92(m,4H).
188(320mg,0.37mmol)をDCM(1mL)に溶解した。次いで、ジオキサン中の4M HCl(456μL,1.83mmol,5当量)を加えた。混合物を3.5時間撹拌した後、ジオキサン中のさらなる4M HCl(450μL,1.80mmol,4.9当量)を加えた。混合物をさらに3.5時間撹拌した後、ジオキサン中のさらなる4M HCl(450μL,1.80mmol,4.9当量)を加えた。混合物を16.5時間撹拌した後、混合物を真空中で濃縮した。生成物189を白色の粘着性固体として定量的収率で得た。これを次のステップで直接使用した。1H-NMR(400 MHz,DMSO-d6):δ(ppm)8.07-7.81(bs,6H),4.15-4.06(m,2H),3.75-3.66(m,2H),3.65-3.48(m,48H),3.03-2.92(m,4H).
実施例49.190の合成
DCM(3mL)中のBCN-OH(164mg,1.10mmol,3当量)の溶液に、CSI(76μL,0.88mmol,2.4当量)を加えた。15分間撹拌した後、トリエチルアミン(255μL,5.50mmol,5当量)を加えた。189の溶液を、DCM(3mL)およびトリエチルアミン(508μL,11.0mmol,10当量)を加えることによって調製した。この原液を、6分後に元の反応混合物に加えた。その混合物を21.5時間撹拌した後、真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→10%MeOH)によって精製した。生成物190を薄黄色油状物として39%収率で得た(165.0mg,139μmol)。C43H72N5O18S2 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1186.54、実測値1186.65。
DCM(3mL)中のBCN-OH(164mg,1.10mmol,3当量)の溶液に、CSI(76μL,0.88mmol,2.4当量)を加えた。15分間撹拌した後、トリエチルアミン(255μL,5.50mmol,5当量)を加えた。189の溶液を、DCM(3mL)およびトリエチルアミン(508μL,11.0mmol,10当量)を加えることによって調製した。この原液を、6分後に元の反応混合物に加えた。その混合物を21.5時間撹拌した後、真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→10%MeOH)によって精製した。生成物190を薄黄色油状物として39%収率で得た(165.0mg,139μmol)。C43H72N5O18S2 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1186.54、実測値1186.65。
1H-NMR(400 MHz,CDCl3):δ(ppm)6.09-5.87(m,2H),4.31-4.19(m,6H),3.76-3.50(m,50H),3.40-3.29(m,4H),2.38-2.16(m,12H),1.66-1.47(m,4H),1.40(quintet,J=8.0 Hz,2H),1.04-0.94(m,4H).
実施例50.191の合成
DCM(2.0mL)中の190(101mg,0.085mmol)の溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(39mg,0.127mmol)およびEt3N(36uL,0.25mmol)を加えた。室温で42時間撹拌した後、粗混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(A.DCM中の0%→25%EtOAc(p-ニトロフェノールが回避されるまで)の後、グラジエントB.DCM中の0%→12%MeOH)によって精製することにより、191を透明な油状物として得た(49mg,0.036mmol,42%)。C58H91N6O26S2 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1352.50、実測値1352.78。
DCM(2.0mL)中の190(101mg,0.085mmol)の溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(39mg,0.127mmol)およびEt3N(36uL,0.25mmol)を加えた。室温で42時間撹拌した後、粗混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(A.DCM中の0%→25%EtOAc(p-ニトロフェノールが回避されるまで)の後、グラジエントB.DCM中の0%→12%MeOH)によって精製することにより、191を透明な油状物として得た(49mg,0.036mmol,42%)。C58H91N6O26S2 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1352.50、実測値1352.78。
実施例51.XL11の合成
無水DMF(130μL)中の191(7mg,0.0059mmol)の溶液に、Et3N(2.2uL,0.015mmol)およびTCO-アミン塩酸塩(Broadpharm)(1.8mg,0.0068mmol)を加えた。室温で19時間撹拌した後、粗混合物をシリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→15%MeOH)によって精製することにより、XL11を透明な油状物として得た(1.5mg,0.001mmol,17%)。C64H111N8O25S2 +(M+NH4 +)についてのLCMS(ESI+)計算値1456.73、実測値1456.81。
無水DMF(130μL)中の191(7mg,0.0059mmol)の溶液に、Et3N(2.2uL,0.015mmol)およびTCO-アミン塩酸塩(Broadpharm)(1.8mg,0.0068mmol)を加えた。室温で19時間撹拌した後、粗混合物をシリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→15%MeOH)によって精製することにより、XL11を透明な油状物として得た(1.5mg,0.001mmol,17%)。C64H111N8O25S2 +(M+NH4 +)についてのLCMS(ESI+)計算値1456.73、実測値1456.81。
実施例52.194の合成
DCM(8.0mL)中の入手可能な187(638mg,1.33mmol)の溶液に、128(470mg,1.73mmol)、Et3N(556.0μL,4.0mmol)および1-ヒドロキシベンゾトリアゾール(179.0mg,1.33mmol)を加えた。外界温度で41時間撹拌した後、混合物を真空中で濃縮し、MeCN(10mL)に再溶解した後、0.1M NaOH水溶液(10mL)および固体NaOHペレット(100.0mg)を加えた。1.5時間後、DCM(20mL)を加え、所望の化合物を4回抽出した。有機層を真空中で濃縮し、残渣をシリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→12%MeOH)によって精製することにより、194を透明な黄色油状物として得た(733mg,1.19mmol,90%)。1H NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm)4.29-4.23(m,2H),3.77-3.68(m,4H),3.65-3.56(m,14H),3.56-3.49(m,8H),3.37-3.24(m,4H),1.45(s,18H).C27H54N3O12 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値612.73、実測値612.55。
DCM(8.0mL)中の入手可能な187(638mg,1.33mmol)の溶液に、128(470mg,1.73mmol)、Et3N(556.0μL,4.0mmol)および1-ヒドロキシベンゾトリアゾール(179.0mg,1.33mmol)を加えた。外界温度で41時間撹拌した後、混合物を真空中で濃縮し、MeCN(10mL)に再溶解した後、0.1M NaOH水溶液(10mL)および固体NaOHペレット(100.0mg)を加えた。1.5時間後、DCM(20mL)を加え、所望の化合物を4回抽出した。有機層を真空中で濃縮し、残渣をシリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→12%MeOH)によって精製することにより、194を透明な黄色油状物として得た(733mg,1.19mmol,90%)。1H NMR(400 MHz,CDCl3)δ(ppm)4.29-4.23(m,2H),3.77-3.68(m,4H),3.65-3.56(m,14H),3.56-3.49(m,8H),3.37-3.24(m,4H),1.45(s,18H).C27H54N3O12 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値612.73、実測値612.55。
実施例53.195の合成
DCM(1.0mL)中の194(31.8mg,0.052mmol)の溶液に、ジオキサン(0.4mL)中の4.0M HClを加えた。外界温度で2.5時間撹拌した後、反応混合物を真空中で濃縮し、その間にDCM(2mL)に再溶解し、濃縮した。化合物195を透明な油状物として定量的収率で得た。C17H38N3O8 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値412.50、実測値412.45
DCM(1.0mL)中の194(31.8mg,0.052mmol)の溶液に、ジオキサン(0.4mL)中の4.0M HClを加えた。外界温度で2.5時間撹拌した後、反応混合物を真空中で濃縮し、その間にDCM(2mL)に再溶解し、濃縮した。化合物195を透明な油状物として定量的収率で得た。C17H38N3O8 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値412.50、実測値412.45
実施例54.196の合成
DCM(1.0mL)中の195(21.4mg,0.052mmol)の冷溶液(0℃)に、Et3N(36μL,0.26mmol)および2-ブロモアセチルブロミド(10.5μL,0.12mmol)を加えた。氷上で10分間撹拌した後、氷浴を取り外し、0.1M NaOH水溶液(0.8mL)を加えた。室温で20分間撹拌した後、水層をDCM(2×5mL)で抽出した。有機層を合わせ、真空中で濃縮した。粗茶色油状物をシリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→18%MeOH)によって精製することにより、196を透明な油状物として得た(6.9mg,0.011mmol,20%)。C21H40Br2N3O10 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値654.36、実測値654.29。
DCM(1.0mL)中の195(21.4mg,0.052mmol)の冷溶液(0℃)に、Et3N(36μL,0.26mmol)および2-ブロモアセチルブロミド(10.5μL,0.12mmol)を加えた。氷上で10分間撹拌した後、氷浴を取り外し、0.1M NaOH水溶液(0.8mL)を加えた。室温で20分間撹拌した後、水層をDCM(2×5mL)で抽出した。有機層を合わせ、真空中で濃縮した。粗茶色油状物をシリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→18%MeOH)によって精製することにより、196を透明な油状物として得た(6.9mg,0.011mmol,20%)。C21H40Br2N3O10 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値654.36、実測値654.29。
実施例55.XL12の合成
DCM(0.8mL)中の196(6.9mg,0.011mmol)の溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(3.8mg,0.012mmol)およびEt3N(5μL,0.03mmol)を加えた。室温で18時間撹拌した後、DCM(0.5mL)に溶解された155(BCN-PEG2-NH2,3.3mg,0.01mmol)を加えた。さらに2時間撹拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(グラジエント:A.DCM中の0%→30%EtOAc(p-ニトロフェノールが回避されるまで)、その後、グラジエントB.DCM中の0%→20%MeOH)によって精製することにより、XL12を透明な油状物として得た(1.0mg,0.001mmol,9%)。C39H66Br2N5O15 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1004.77、実測値1004.51。
DCM(0.8mL)中の196(6.9mg,0.011mmol)の溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(3.8mg,0.012mmol)およびEt3N(5μL,0.03mmol)を加えた。室温で18時間撹拌した後、DCM(0.5mL)に溶解された155(BCN-PEG2-NH2,3.3mg,0.01mmol)を加えた。さらに2時間撹拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(グラジエント:A.DCM中の0%→30%EtOAc(p-ニトロフェノールが回避されるまで)、その後、グラジエントB.DCM中の0%→20%MeOH)によって精製することにより、XL12を透明な油状物として得た(1.0mg,0.001mmol,9%)。C39H66Br2N5O15 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1004.77、実測値1004.51。
実施例56.XL14の合成
乾燥DMF(80μL)中の152(メチルテトラジン-PEG4-NH2.HCl,7.8mg,0.02mmol)の溶液に、トリエチルアミン(9μL,0.06mmol)の後、338(25mg,0.02mmol)を加えた。室温で6.5時間撹拌した後、反応混合物をDMF(400μL)でさらに希釈し、RP HPLC(Column Xbridge prep C18 5um OBD,30x100mm,H2O中の5%→90%MeCN(両方とも1%酢酸を含む))によって精製した。XL14を淡紅色油状物として得た(12.8mg,0.008mmol,45%)。C69H86N11O21S2 +(M+NH4 +)についてのLCMS(ESI+)計算値1469.61、実測値1469.69。
乾燥DMF(80μL)中の152(メチルテトラジン-PEG4-NH2.HCl,7.8mg,0.02mmol)の溶液に、トリエチルアミン(9μL,0.06mmol)の後、338(25mg,0.02mmol)を加えた。室温で6.5時間撹拌した後、反応混合物をDMF(400μL)でさらに希釈し、RP HPLC(Column Xbridge prep C18 5um OBD,30x100mm,H2O中の5%→90%MeCN(両方とも1%酢酸を含む))によって精製した。XL14を淡紅色油状物として得た(12.8mg,0.008mmol,45%)。C69H86N11O21S2 +(M+NH4 +)についてのLCMS(ESI+)計算値1469.61、実測値1469.69。
実施例57.314の合成
水(6mL)中の3-メルカプトプロパン酸(200mg,1.9mmol)の溶液を0℃に冷却した後、エタノール(3mL)中のメチルメタンチオスルホネート(263mg,2.1mmol)を加えた。反応物を一晩撹拌し、室温に加温した。続いて、飽和NaCl水溶液(10mL)およびEt2O(20mL)によって反応をクエンチした。水層をEt2O(3×20mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4で乾燥させ、濾過し、濃縮することにより、粗ジスルフィド生成物を得た(266mg,1.7mmol,93%)。1H-NMR(400 MHz,CDCl3):δ 7.00(bs,1H),2.96-2.92(m,2H),2.94-2.80(m,2H),2.43(s,3H).
3-メルカプトプロパン酸(266mg,1.7mmol)に由来する粗ジスルフィドをCH2Cl2(20mL)に溶解した後、EDC.HCl(480mg,2.2mmol)およびN-ヒドロキシスクシンイミド(270mg,2.1mmol)を加えた。反応物を90分間撹拌し、水(20mL)でクエンチした。有機層を飽和NaHCO3水溶液(2×20mL)で洗浄した。有機層をNa2SO4で乾燥させ、濾過し、濃縮することにより、粗生成物314(346mg,1.4mmol,81%)を得た。1H-NMR(400 MHz,CDCl3):δ 3.12-3.07(m,2H),3.02-2.99(m,2H),2.87(bs,4H),2.44(s,3H).
水(6mL)中の3-メルカプトプロパン酸(200mg,1.9mmol)の溶液を0℃に冷却した後、エタノール(3mL)中のメチルメタンチオスルホネート(263mg,2.1mmol)を加えた。反応物を一晩撹拌し、室温に加温した。続いて、飽和NaCl水溶液(10mL)およびEt2O(20mL)によって反応をクエンチした。水層をEt2O(3×20mL)で抽出し、合わせた有機層をNa2SO4で乾燥させ、濾過し、濃縮することにより、粗ジスルフィド生成物を得た(266mg,1.7mmol,93%)。1H-NMR(400 MHz,CDCl3):δ 7.00(bs,1H),2.96-2.92(m,2H),2.94-2.80(m,2H),2.43(s,3H).
3-メルカプトプロパン酸(266mg,1.7mmol)に由来する粗ジスルフィドをCH2Cl2(20mL)に溶解した後、EDC.HCl(480mg,2.2mmol)およびN-ヒドロキシスクシンイミド(270mg,2.1mmol)を加えた。反応物を90分間撹拌し、水(20mL)でクエンチした。有機層を飽和NaHCO3水溶液(2×20mL)で洗浄した。有機層をNa2SO4で乾燥させ、濾過し、濃縮することにより、粗生成物314(346mg,1.4mmol,81%)を得た。1H-NMR(400 MHz,CDCl3):δ 3.12-3.07(m,2H),3.02-2.99(m,2H),2.87(bs,4H),2.44(s,3H).
実施例58.316の合成
CH2Cl2/DMF(それぞれ5mL)中の315(参照により援用される国際公開第2015057063号の実施例40に従って調製したもの)(420mg,1.14mmol)の溶液に、粗314(425mg,1.71mmol)およびEt3N(236μL,1.71mmol)を加えた。反応混合物を一晩撹拌した後、減圧下で濃縮した。フラッシュクロマトグラフィー(1:0~6:4 MeCN:MeOH)により、316を得た(358mg,0.7mmol,60%)。1H-NMR(400 MHz,CD3OD):δ 5.46-5.45(m,1H),5.33-5.27(m,1H),5.15-5.11(m,1H),4.43-4.41(m,1H),4.17-4.06(m,2H),3.97-3.88(m,1H),2.89-2.83(m,2H),2.69-2.53(m,2H),2.32(s,3H),2.04(s,3H),1.91(s,3H),1.86(s,3H).
CH2Cl2/DMF(それぞれ5mL)中の315(参照により援用される国際公開第2015057063号の実施例40に従って調製したもの)(420mg,1.14mmol)の溶液に、粗314(425mg,1.71mmol)およびEt3N(236μL,1.71mmol)を加えた。反応混合物を一晩撹拌した後、減圧下で濃縮した。フラッシュクロマトグラフィー(1:0~6:4 MeCN:MeOH)により、316を得た(358mg,0.7mmol,60%)。1H-NMR(400 MHz,CD3OD):δ 5.46-5.45(m,1H),5.33-5.27(m,1H),5.15-5.11(m,1H),4.43-4.41(m,1H),4.17-4.06(m,2H),3.97-3.88(m,1H),2.89-2.83(m,2H),2.69-2.53(m,2H),2.32(s,3H),2.04(s,3H),1.91(s,3H),1.86(s,3H).
実施例59.UDP GalNProSSMe(318)の合成
DMF(5mL)中のUMP.NBu3(632mg,1.12mmol)の溶液に、CDI(234mg,1.4mmol)を加え、30分間撹拌した。メタノール(25μL,0.6mmol)を加え、15分後、反応物を高真空下に15分間置く。その後、316(358mg,0.7mmol)およびNMI.HCl(333mg,2.8mmol)をDMF(2mL)に溶解し、反応混合物に加える。一晩撹拌した後、反応混合物を減圧下で濃縮することにより、粗生成物317を得る。
DMF(5mL)中のUMP.NBu3(632mg,1.12mmol)の溶液に、CDI(234mg,1.4mmol)を加え、30分間撹拌した。メタノール(25μL,0.6mmol)を加え、15分後、反応物を高真空下に15分間置く。その後、316(358mg,0.7mmol)およびNMI.HCl(333mg,2.8mmol)をDMF(2mL)に溶解し、反応混合物に加える。一晩撹拌した後、反応混合物を減圧下で濃縮することにより、粗生成物317を得る。
粗生成物317をMeOH:H2O:Et3N(7:3:3,10mL)に溶解し、一晩撹拌した後、追加のMeOH:H2O:Et3N(7:3:3,5mL)を加える。48時間後、全反応時間、反応混合物を減圧下で濃縮した。粗生成物を陰イオン交換カラム(Q HITRAP,3×5mL,1×20mLカラム)によって2回に分けて精製した。緩衝液A(10mM NaHCO3)とともにロードすることによってカラムへの最初の結合を達成し、カラムを50mL緩衝液Aでリンスした。次に、70%B(250mM NaHCO3)までグラジエントを行い、UDP GalNProSSMe 318(355mg,0.5mmol,72%)を溶出した。1H-NMR(400 MHz,D2O):δ 7.86-7.84(m,1H),5.86-5.85(m,1H),5.44(bs,1H),4.26-4.22(m,2H),4.17-4.08(m,6H),3.92(m,1H),3.84-3.83(m,1H),3.66-3.64(m,2H),2.88(t,J=7.2 Hz,2H),2.68(t,J=7.2 Hz,2H),2.31(s,3H).
実施例60.319の合成
DCM(1mL)およびDMF(200μL)中の化合物121(442mg,1.46mmol)の溶液に、DCM(1mL)およびトリエチルアミン(609μL,4.37mmol)中の化合物128の溶液を加えた。混合物を16時間撹拌した後、真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘプタン中の50%→100%EtOAc)によって精製し、319(316mg)を得た。これをRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30x100mm,水(1%AcOH)中の5%→90%MeCN(1%AcOH)によってさらに精製した。生成物319を無色油状物として17%収率で得た(110mg,0.25mmol)。C19H37N3NaO8 +((M+Na+)についてのLCMS(ESI+)計算値458.25、実測値458.33。1H-NMR(400 MHz,CDCl3):δ(ppm)5.41-4.89(m,2H),4.31-4.24(m,2H),3.78-3.68(m,4H),3.65-3.59(m,2H),3.44-3.34(m,4H),3.34-3.19(m,4H),1.43(s,18H).
DCM(1mL)およびDMF(200μL)中の化合物121(442mg,1.46mmol)の溶液に、DCM(1mL)およびトリエチルアミン(609μL,4.37mmol)中の化合物128の溶液を加えた。混合物を16時間撹拌した後、真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘプタン中の50%→100%EtOAc)によって精製し、319(316mg)を得た。これをRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30x100mm,水(1%AcOH)中の5%→90%MeCN(1%AcOH)によってさらに精製した。生成物319を無色油状物として17%収率で得た(110mg,0.25mmol)。C19H37N3NaO8 +((M+Na+)についてのLCMS(ESI+)計算値458.25、実測値458.33。1H-NMR(400 MHz,CDCl3):δ(ppm)5.41-4.89(m,2H),4.31-4.24(m,2H),3.78-3.68(m,4H),3.65-3.59(m,2H),3.44-3.34(m,4H),3.34-3.19(m,4H),1.43(s,18H).
実施例61.320の合成
化合物319(107mg,0.25mmol)をDCM(1mL)に溶解した。次いで、ジオキサン中の4M HCl(300μL,1.2mmol,4.8当量)を加えた。混合物を15時間撹拌した後、沈殿物からデカントし、沈殿物をDCM(2mL)で1回洗浄した。生成物320を定量的収率で白色の粘着性固体として得た(89.9mg,0.29mmol)。これを次のステップで直接使用した。
化合物319(107mg,0.25mmol)をDCM(1mL)に溶解した。次いで、ジオキサン中の4M HCl(300μL,1.2mmol,4.8当量)を加えた。混合物を15時間撹拌した後、沈殿物からデカントし、沈殿物をDCM(2mL)で1回洗浄した。生成物320を定量的収率で白色の粘着性固体として得た(89.9mg,0.29mmol)。これを次のステップで直接使用した。
実施例62.321の合成
DCM(1mL)中の101(75mg,0.50mmol,2当量)の溶液に、CSI(41μL,0.48mmol,1.9当量)を加えた。6分間撹拌した後、トリエチルアミン(139μL,1.0mmol,4当量)を加えた。DMF(200μL)およびDCM(2mL)を加えた後、トリエチルアミン(139μL,0.75mmol,3当量)を加えることによって、320の原液を調製した。この320の原液の一部(32μL,0.25mmol)を、CSIを含む元の反応混合物に加えた。混合物を16時間撹拌した後、真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→10%MeOH)によって精製した。生成物321を無色油状物として3%収率で得た(11mg,14.2μmol)。C31H48N5O12S2 +((M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値746.27、実測値746.96。1H-NMR(400 MHz,CDCl3):δ(ppm)6.36-5.94(m,2H),4.38-4.17(m,6H),3.84-3.79(m,2H),3.77-3.72(m,2H),3.68-3.63(m,2H),3.54-3.45(m,4H),3.39-3.27(m,4H),2.38-2.16(m,12H),1.67-1.47(m,5H),1.40(quintet,J=8.0 Hz,2H),1.05-0.93(m,4H).
DCM(1mL)中の101(75mg,0.50mmol,2当量)の溶液に、CSI(41μL,0.48mmol,1.9当量)を加えた。6分間撹拌した後、トリエチルアミン(139μL,1.0mmol,4当量)を加えた。DMF(200μL)およびDCM(2mL)を加えた後、トリエチルアミン(139μL,0.75mmol,3当量)を加えることによって、320の原液を調製した。この320の原液の一部(32μL,0.25mmol)を、CSIを含む元の反応混合物に加えた。混合物を16時間撹拌した後、真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→10%MeOH)によって精製した。生成物321を無色油状物として3%収率で得た(11mg,14.2μmol)。C31H48N5O12S2 +((M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値746.27、実測値746.96。1H-NMR(400 MHz,CDCl3):δ(ppm)6.36-5.94(m,2H),4.38-4.17(m,6H),3.84-3.79(m,2H),3.77-3.72(m,2H),3.68-3.63(m,2H),3.54-3.45(m,4H),3.39-3.27(m,4H),2.38-2.16(m,12H),1.67-1.47(m,5H),1.40(quintet,J=8.0 Hz,2H),1.05-0.93(m,4H).
実施例63.301(LD01)の合成
DCM(100μL)中の321(10.6mg,14.2μmol)の溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(4.3mg,14.2μmol,1.0当量)およびトリエチルアミン(5.9μL,42.6μmol,3.0当量)を加えた。66時間撹拌した後、この混合物の一部を、DMF中のvc-PABC-MMAE.TFAの原液(200μL,50mg/mL)およびさらなる量のトリエチルアミン(5.9μL,42.6μmol,3.0当量)で処理した。24時間後、これを真空中で部分的に濃縮した。残渣をRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30x100mm,水(1%AcOH)中の5%→90%MeCN(1%AcOH)によって精製した。化合物301をフィルム状物として28%収率で得た(3.4mg,1.9μmol)。C90H140N15O25S2 +((M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1894.96、実測値1895.00。
DCM(100μL)中の321(10.6mg,14.2μmol)の溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(4.3mg,14.2μmol,1.0当量)およびトリエチルアミン(5.9μL,42.6μmol,3.0当量)を加えた。66時間撹拌した後、この混合物の一部を、DMF中のvc-PABC-MMAE.TFAの原液(200μL,50mg/mL)およびさらなる量のトリエチルアミン(5.9μL,42.6μmol,3.0当量)で処理した。24時間後、これを真空中で部分的に濃縮した。残渣をRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30x100mm,水(1%AcOH)中の5%→90%MeCN(1%AcOH)によって精製した。化合物301をフィルム状物として28%収率で得た(3.4mg,1.9μmol)。C90H140N15O25S2 +((M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1894.96、実測値1895.00。
実施例64.322の合成
DCM(10mL)中の185(オクタエチレングリコール)の溶液に、トリエチルアミン(1.0mL,7.24mmol;2.5当量)を加えた後、DCM(5mL)中の4-ニトロフェニルクロロホルメート(0.58g;2.90mmol;1当量)溶液を28分で滴下した。混合物を90分間撹拌した後、真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の75%→0%EtOAcの後、DCM中の0%→7%MeOH)によって精製した。生成物322を無色油状物として38%収率で得た(584.6mg;1.09mmol)。C23H38NO13 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値536.23、実測値536.93。1H-NMR(400 MHz,CDCl3):δ(ppm)8.28(d,J=12.0 Hz,2H),7.40(d,J=12.0 Hz,2H),4.47-4.42(m,2H),3.84-3.79(m,2H),3.75-3.63(m,26H),3.63-3.59(m,2H),2.70-2.55(br.s,1H).
DCM(10mL)中の185(オクタエチレングリコール)の溶液に、トリエチルアミン(1.0mL,7.24mmol;2.5当量)を加えた後、DCM(5mL)中の4-ニトロフェニルクロロホルメート(0.58g;2.90mmol;1当量)溶液を28分で滴下した。混合物を90分間撹拌した後、真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の75%→0%EtOAcの後、DCM中の0%→7%MeOH)によって精製した。生成物322を無色油状物として38%収率で得た(584.6mg;1.09mmol)。C23H38NO13 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値536.23、実測値536.93。1H-NMR(400 MHz,CDCl3):δ(ppm)8.28(d,J=12.0 Hz,2H),7.40(d,J=12.0 Hz,2H),4.47-4.42(m,2H),3.84-3.79(m,2H),3.75-3.63(m,26H),3.63-3.59(m,2H),2.70-2.55(br.s,1H).
実施例65.323の合成
DCM(1mL)中の化合物121(127mg,0.42mmol)の溶液に、調製された322の原液(DCM(1mL)中の584mg)の一部(0.5mL;0.54mmol;1.3当量)を加えた後、トリエチルアミン(176μL,1.26mmol;3当量)およびHOBt(57mg;0.42mmol;1当量)を加えた。混合物を4.5日間撹拌した後、真空中で濃縮した。残渣をアセトニトリル(4.2mL)および0.1N NaOH(4.2mL,1当量)の混合物に溶解した。混合物を24時間撹拌した後、さらなる固体NaOH(104.5mg)を加えた。混合物をさらに5時間撹拌した後、混合物をDCM(2×10mL)で抽出した。合わせた有機層を真空中で濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→15%MeOH)によって精製した。生成物323を薄黄色油状物として54%収率で得た(164.5mg,0.23mmol)。C26H54N3O12 +(M-BOC+)についてのLCMS(ESI+)計算値600.36、実測値600.49。1H-NMR(400 MHz,CDCl3):δ(ppm)5.27-5.05(m,2H),4.26-4.21(m,2H),3.76-3.59(m,30H),3.43-3.33(m,4H),3.33-3.22(m,4H),1.43(s,18H).
DCM(1mL)中の化合物121(127mg,0.42mmol)の溶液に、調製された322の原液(DCM(1mL)中の584mg)の一部(0.5mL;0.54mmol;1.3当量)を加えた後、トリエチルアミン(176μL,1.26mmol;3当量)およびHOBt(57mg;0.42mmol;1当量)を加えた。混合物を4.5日間撹拌した後、真空中で濃縮した。残渣をアセトニトリル(4.2mL)および0.1N NaOH(4.2mL,1当量)の混合物に溶解した。混合物を24時間撹拌した後、さらなる固体NaOH(104.5mg)を加えた。混合物をさらに5時間撹拌した後、混合物をDCM(2×10mL)で抽出した。合わせた有機層を真空中で濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→15%MeOH)によって精製した。生成物323を薄黄色油状物として54%収率で得た(164.5mg,0.23mmol)。C26H54N3O12 +(M-BOC+)についてのLCMS(ESI+)計算値600.36、実測値600.49。1H-NMR(400 MHz,CDCl3):δ(ppm)5.27-5.05(m,2H),4.26-4.21(m,2H),3.76-3.59(m,30H),3.43-3.33(m,4H),3.33-3.22(m,4H),1.43(s,18H).
実施例66.324の合成
化合物323(164mg,0.23mmol)をDCM(1mL)に溶解した。次いで、ジオキサン中の4M HCl(293μL,1.17mmol,5当量)を加えた。混合物を18時間撹拌した後、ジオキサン中のさらなる4M HCl(293μL,1.17mmol,5当量)を加えた。混合物をさらに5時間撹拌した後、混合物を真空中で濃縮した。生成物324を定量的収率で白色の粘着性固体として得た(132mg,0.23mmol)。これを次のステップで直接使用した。
化合物323(164mg,0.23mmol)をDCM(1mL)に溶解した。次いで、ジオキサン中の4M HCl(293μL,1.17mmol,5当量)を加えた。混合物を18時間撹拌した後、ジオキサン中のさらなる4M HCl(293μL,1.17mmol,5当量)を加えた。混合物をさらに5時間撹拌した後、混合物を真空中で濃縮した。生成物324を定量的収率で白色の粘着性固体として得た(132mg,0.23mmol)。これを次のステップで直接使用した。
実施例67.325の合成
DCM(2mL)中の101(81mg,0.54mmol,2.3当量)の溶液に、CSI(43μL,0.49mmol,2.1当量)を加えた。15分間撹拌した後、トリエチルアミン(164μL,1.17mmol,5当量)を加えた。DCM(2mL)およびトリエチルアミン(164μL,1.17mmol,5当量)を加えることによって、324の溶液を調製した。この原液を、6分後に元の反応混合物に加えた。混合物を23時間撹拌した後、真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→12%MeOH)によって精製した。生成物325を薄黄色油状物として31%収率で得た(73.0mg,72.2μmol)。C43H72N5O18S2 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1010.43、実測値1010.50。
DCM(2mL)中の101(81mg,0.54mmol,2.3当量)の溶液に、CSI(43μL,0.49mmol,2.1当量)を加えた。15分間撹拌した後、トリエチルアミン(164μL,1.17mmol,5当量)を加えた。DCM(2mL)およびトリエチルアミン(164μL,1.17mmol,5当量)を加えることによって、324の溶液を調製した。この原液を、6分後に元の反応混合物に加えた。混合物を23時間撹拌した後、真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→12%MeOH)によって精製した。生成物325を薄黄色油状物として31%収率で得た(73.0mg,72.2μmol)。C43H72N5O18S2 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1010.43、実測値1010.50。
1H-NMR(400 MHz,CDCl3):δ(ppm)6.21-5.85(m,2H),4.38-4.17(m,6H),3.80-3.57(m,30H),3.57-3.44(m,4H),3.44-3.30(m,4H),2.38-2.16(m,12H),1.64-1.48(m,4H),1.40(quintet,J=8.0 Hz,2H),1.05-0.91(m,4H).
実施例68.302(LD02)の合成
DCM(100μL)中の325(19.5mg,19.7μmol)の溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(6.0mg,19.7μmol,1.0当量)およびトリエチルアミン(8.2μL,59.1μmol,3.0当量)を加えた。66時間撹拌した後、この混合物の一部を、DMF中のvc-PABC-MMAE.TFAの原液(200μL,50mg/mL)およびさらなる量のトリエチルアミン(8.2μL,59.1μmol,3.0当量)で処理した。95時間後、これを真空中で部分的に濃縮した。残渣をRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30x100mm,水(1%AcOH)中の5%→90%MeCN(1%AcOH)によって精製した。化合物302をフィルム状物として9%収率で得た(3.7mg,1.71μmol)。C102H165N15O31S2 2+(M+2H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1080.56、実測値1080.74。
DCM(100μL)中の325(19.5mg,19.7μmol)の溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(6.0mg,19.7μmol,1.0当量)およびトリエチルアミン(8.2μL,59.1μmol,3.0当量)を加えた。66時間撹拌した後、この混合物の一部を、DMF中のvc-PABC-MMAE.TFAの原液(200μL,50mg/mL)およびさらなる量のトリエチルアミン(8.2μL,59.1μmol,3.0当量)で処理した。95時間後、これを真空中で部分的に濃縮した。残渣をRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30x100mm,水(1%AcOH)中の5%→90%MeCN(1%AcOH)によって精製した。化合物302をフィルム状物として9%収率で得た(3.7mg,1.71μmol)。C102H165N15O31S2 2+(M+2H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1080.56、実測値1080.74。
実施例69.329の合成
DCM(1mL)中の101(18mg,0.12mmol)の溶液に、クロロスルホニルイソシアネート(CSI)を加えた。30分後、Et3N(37μL,27mg,0.27mmol)を加えた。DCM(1mL)中の195(26mg,0.054mmol)の溶液に、Et3N(37μL,27mg,0.27mmol)を加えた。この混合物を反応混合物に加えた。45分後、反応混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(DCMからDCM中の7%MeOH)によって精製した。生成物329を無色のフィルム状物として得た(27mg,0.029mmol,54%)。C39H64N5O16S2 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値922.38、実測値922.50。
DCM(1mL)中の101(18mg,0.12mmol)の溶液に、クロロスルホニルイソシアネート(CSI)を加えた。30分後、Et3N(37μL,27mg,0.27mmol)を加えた。DCM(1mL)中の195(26mg,0.054mmol)の溶液に、Et3N(37μL,27mg,0.27mmol)を加えた。この混合物を反応混合物に加えた。45分後、反応混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(DCMからDCM中の7%MeOH)によって精製した。生成物329を無色のフィルム状物として得た(27mg,0.029mmol,54%)。C39H64N5O16S2 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値922.38、実測値922.50。
実施例70.330の合成
DCM(1mL)中の329の溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(8.9mg,29.3μmol)およびEt3N(12.2μL,8.9mg,87.9μmol)を加えた。1日後、0.28mLを化合物303の調製に使用した。2日後、追加のビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(7.0mg,23μmol)を主反応混合物に加えた。1日後、反応混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製した。生成物330を無色のフィルム状物として得た(17.5mg,0.016mmol,55%(76%補正))。C46H67N6O20S2 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1087.38、実測値1087.47。
DCM(1mL)中の329の溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(8.9mg,29.3μmol)およびEt3N(12.2μL,8.9mg,87.9μmol)を加えた。1日後、0.28mLを化合物303の調製に使用した。2日後、追加のビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(7.0mg,23μmol)を主反応混合物に加えた。1日後、反応混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製した。生成物330を無色のフィルム状物として得た(17.5mg,0.016mmol,55%(76%補正))。C46H67N6O20S2 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1087.38、実測値1087.47。
実施例71.303(LD03)の合成
330の反応混合物(0.28mL,理論的には8.8mg,8.1μmolを含む)に、Et3N(3.4μL,2.5mg,24.3μmol)、およびDMF(200μL)中のvc-PABC-MMAE.TFA(10mg,8.1μmol)の溶液を加えた。21時間後、2,2’-(エチレンジオキシ)ビス(エチルアミン)(4.7μL,4.8mg,32μmol)を加えた。45分後、反応混合物を窒素ガス流下で濃縮した。残渣をRP-HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm、水(1%AcOH)中の30%~90%MeCN(1%AcOH)によって精製した。生成物303を無色のフィルム状物として得た(5.6mg,2.7μmol)。C98H157N15O29S2 2+((M+2H+)/2)についてのLCMS(ESI+)計算値1036.53、実測値1036.70。
330の反応混合物(0.28mL,理論的には8.8mg,8.1μmolを含む)に、Et3N(3.4μL,2.5mg,24.3μmol)、およびDMF(200μL)中のvc-PABC-MMAE.TFA(10mg,8.1μmol)の溶液を加えた。21時間後、2,2’-(エチレンジオキシ)ビス(エチルアミン)(4.7μL,4.8mg,32μmol)を加えた。45分後、反応混合物を窒素ガス流下で濃縮した。残渣をRP-HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm、水(1%AcOH)中の30%~90%MeCN(1%AcOH)によって精製した。生成物303を無色のフィルム状物として得た(5.6mg,2.7μmol)。C98H157N15O29S2 2+((M+2H+)/2)についてのLCMS(ESI+)計算値1036.53、実測値1036.70。
実施例72.332の合成
脱気したDCM(400μL,DCMにN2を5分間パージすることによって得た)中のAlloc2-va-PABC-PBD 331(10.0mg,0.009mmol)の溶液に、ピロリジン(1.9μL,0.027mmol)およびPd(PPh3)4(1.6mg,0.0014mmol)を加えた。外界温度で15分間撹拌した後、反応混合物をDCM(10mL)で希釈し、飽和NH4Cl水溶液(10mL)を加えた。粗混合物をDCM(3×10mL)で抽出した。有機層を合わせ、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、真空中で濃縮した。黄色残渣をDMF(450μL)およびMeCN(450μL)に再溶解し、RP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,H2O中の5%→90%MeCN(両方とも0.1%ギ酸を含む))によって精製した。純粋な画分をSPEカラム(PL-HCO3 MP,500mg/6mL)で中和し、濃縮し、MeCN(2×5mL)と共蒸発させることにより、332を白色固体として得た(4.8mg,0.005mmol,58%)。C49H60N7O11 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値923.04、実測値923.61。
脱気したDCM(400μL,DCMにN2を5分間パージすることによって得た)中のAlloc2-va-PABC-PBD 331(10.0mg,0.009mmol)の溶液に、ピロリジン(1.9μL,0.027mmol)およびPd(PPh3)4(1.6mg,0.0014mmol)を加えた。外界温度で15分間撹拌した後、反応混合物をDCM(10mL)で希釈し、飽和NH4Cl水溶液(10mL)を加えた。粗混合物をDCM(3×10mL)で抽出した。有機層を合わせ、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、真空中で濃縮した。黄色残渣をDMF(450μL)およびMeCN(450μL)に再溶解し、RP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,H2O中の5%→90%MeCN(両方とも0.1%ギ酸を含む))によって精製した。純粋な画分をSPEカラム(PL-HCO3 MP,500mg/6mL)で中和し、濃縮し、MeCN(2×5mL)と共蒸発させることにより、332を白色固体として得た(4.8mg,0.005mmol,58%)。C49H60N7O11 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値923.04、実測値923.61。
実施例73.304(LD04)の合成
脱気した無水DMF(60μL,DMFにN2を5分間パージすることによって得た)中の332(4.8mg,0.005mmol)の溶液に、330(10mg,0.009mmol,48μLの脱気した無水DMFに溶解したもの)、Et3N(3.6μL,0.026mmol)およびHOBt(脱気した無水DMF中の原液,5.1μL,0.35mg,0.0026mmol,0.5当量)を加えた。暗所において外界温度で41時間撹拌した後、粗反応混合物をDCM(300μL)で希釈し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→12%MeOH)によって精製することにより、304を透明な黄色油状物として得た(4.0mg,0.0021mmol,41%)。C89H121N12O28S2 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1871.11、実測値1871.09。
脱気した無水DMF(60μL,DMFにN2を5分間パージすることによって得た)中の332(4.8mg,0.005mmol)の溶液に、330(10mg,0.009mmol,48μLの脱気した無水DMFに溶解したもの)、Et3N(3.6μL,0.026mmol)およびHOBt(脱気した無水DMF中の原液,5.1μL,0.35mg,0.0026mmol,0.5当量)を加えた。暗所において外界温度で41時間撹拌した後、粗反応混合物をDCM(300μL)で希釈し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→12%MeOH)によって精製することにより、304を透明な黄色油状物として得た(4.0mg,0.0021mmol,41%)。C89H121N12O28S2 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1871.11、実測値1871.09。
実施例74.305(LD05)の合成
無水DMF(60μL)中の、参照により援用される国際公開第2019110725A1号の実施例5-5に従って調製された333(2.9mg,0.0013mmol)の溶液に、330(1.45mg,0.0013mmol)およびEt3N(1.2μL,0.023mmol)を加えた。室温で48時間撹拌した後、反応混合物をDMF(500μL)で希釈し、RP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,H2O中の30%→100%MeCN(両方とも1%酢酸を含む))によって精製した。生成物305を無色のフィルム状物として得た(0.6mg,0.207μmol,16%)。C124H182IN14O46S5 +(M/2+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1447.03、実測値1447.19。
無水DMF(60μL)中の、参照により援用される国際公開第2019110725A1号の実施例5-5に従って調製された333(2.9mg,0.0013mmol)の溶液に、330(1.45mg,0.0013mmol)およびEt3N(1.2μL,0.023mmol)を加えた。室温で48時間撹拌した後、反応混合物をDMF(500μL)で希釈し、RP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,H2O中の30%→100%MeCN(両方とも1%酢酸を含む))によって精製した。生成物305を無色のフィルム状物として得た(0.6mg,0.207μmol,16%)。C124H182IN14O46S5 +(M/2+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1447.03、実測値1447.19。
実施例75.306(LD06)の合成
無水DMF(150μL)中の330(7mg,0.006mmol)の溶液に、無水DMF中のvc-PABC-DMEA-PNU(334)の原液(125μL,5.7mg,0.005mmol)およびEt3N(2μL,0.015mmol)を加えた。室温で25時間撹拌した後、反応混合物をDCM(0.3mL)で希釈し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→20%MeOH)によって精製することにより、306を赤色のフィルム状物として得た(5mg,0.0024mmol,47%)。C96H133N13O36S3 +(M/2+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1055.64、実測値1055.50。
無水DMF(150μL)中の330(7mg,0.006mmol)の溶液に、無水DMF中のvc-PABC-DMEA-PNU(334)の原液(125μL,5.7mg,0.005mmol)およびEt3N(2μL,0.015mmol)を加えた。室温で25時間撹拌した後、反応混合物をDCM(0.3mL)で希釈し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→20%MeOH)によって精製することにより、306を赤色のフィルム状物として得た(5mg,0.0024mmol,47%)。C96H133N13O36S3 +(M/2+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1055.64、実測値1055.50。
実施例76.337の合成
化合物336(DIBO,95mg,0.43mmol)をDCM(1.0mL)に溶解し、クロロスルホニルイソシアネート(33.0μL,0.37mmol)を室温において加えたところ、2分後、不溶性物質が形成された。室温でさらに15分間撹拌した後、Et3N(120.0μL,0.85mmol)を加えると、すべての不溶性物質が消失し、DCM(1.0mL)およびEt3N(120.0μL,0.85mmol)に溶解された195(71mg,0.0171)の混合物の添加を行った。室温で16時間撹拌した後、粗混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→15%MeOH)によって精製し、その後、これをEtOAc(2×)と共蒸発させてMeOHを完全に除去した。生成物337を蝋様の白色固体として得た(136.0mg,0.12mmol,75%)。C51H63N6O16S2 +(M+NH4 +)についてのLCMS(ESI+)計算値1080.21、実測値1080.59。
化合物336(DIBO,95mg,0.43mmol)をDCM(1.0mL)に溶解し、クロロスルホニルイソシアネート(33.0μL,0.37mmol)を室温において加えたところ、2分後、不溶性物質が形成された。室温でさらに15分間撹拌した後、Et3N(120.0μL,0.85mmol)を加えると、すべての不溶性物質が消失し、DCM(1.0mL)およびEt3N(120.0μL,0.85mmol)に溶解された195(71mg,0.0171)の混合物の添加を行った。室温で16時間撹拌した後、粗混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→15%MeOH)によって精製し、その後、これをEtOAc(2×)と共蒸発させてMeOHを完全に除去した。生成物337を蝋様の白色固体として得た(136.0mg,0.12mmol,75%)。C51H63N6O16S2 +(M+NH4 +)についてのLCMS(ESI+)計算値1080.21、実測値1080.59。
実施例77.338の合成
DCM(2.0mL)中の337(136.0mg,0.12mmol)の溶液に、ビス-(4-ニトロフェニル)カーボネート(47.0mg,0.15mmol)およびEt3N(54.0μL,0.38mmol)を加えた。室温で18時間撹拌した後、粗混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(グラジエント:A.DCM中の0%→35%EtOAc(p-ニトロフェノールが回避されるまで)の後、グラジエントB.DCM中の0%→13%MeOH)によって精製することにより、338を淡黄色油状物として得た(89.0mg,0.07mmol,60%)。C48H66N7O20S2 +(M+NH4 +)についてのLCMS(ESI+)計算値1245.31、実測値1245.64。
DCM(2.0mL)中の337(136.0mg,0.12mmol)の溶液に、ビス-(4-ニトロフェニル)カーボネート(47.0mg,0.15mmol)およびEt3N(54.0μL,0.38mmol)を加えた。室温で18時間撹拌した後、粗混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(グラジエント:A.DCM中の0%→35%EtOAc(p-ニトロフェノールが回避されるまで)の後、グラジエントB.DCM中の0%→13%MeOH)によって精製することにより、338を淡黄色油状物として得た(89.0mg,0.07mmol,60%)。C48H66N7O20S2 +(M+NH4 +)についてのLCMS(ESI+)計算値1245.31、実測値1245.64。
実施例78.307(LD07)の合成
無水DMF(93.0μL)中の338(6.95mg,0.005mmol)の溶液に、Et3N(2.4μL,0.017mmol)、および無水DMF中のvc-PABC-MMAE.TFA(Levena Bioscience)の原液(70μL,7.0mg,0.005mmol)を加えた。室温で18時間撹拌した後、DMF(450μL)を加え、粗混合物をRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,H2O中の30%→100%MeCN(両方とも1%酢酸を含む))によって精製した。生成物307を無色のフィルム状物として得た(4.5mg,0.002mmol,36%)。C110H152N15O29S2 +(M/2+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1106.30、実測値1106.79。
無水DMF(93.0μL)中の338(6.95mg,0.005mmol)の溶液に、Et3N(2.4μL,0.017mmol)、および無水DMF中のvc-PABC-MMAE.TFA(Levena Bioscience)の原液(70μL,7.0mg,0.005mmol)を加えた。室温で18時間撹拌した後、DMF(450μL)を加え、粗混合物をRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,H2O中の30%→100%MeCN(両方とも1%酢酸を含む))によって精製した。生成物307を無色のフィルム状物として得た(4.5mg,0.002mmol,36%)。C110H152N15O29S2 +(M/2+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1106.30、実測値1106.79。
実施例79.341の合成
化合物101(16.3mg,0.10mmol)をDCM(0.8mL)に溶解し、クロロスルホニルイソシアネート(8.6μL,0.099mmol)を室温において加えた。室温で15分間撹拌した後、Et3N(69.0μL,0.49mmol)を加え、その後、DCM(1.0mL)およびEt3N(69.0μL,0.49mmol)に溶解された335(40mg,0.099mmol)の混合物を加えた。この混合物を室温で1.5時間撹拌することにより(混合物1)、粗生成物339を得た。別のバイアルでは、340(DBCO-C2-OH,Broadpharm)(34.0mg,0.099mmol)を室温のDCM(0.8mL)に溶解し、クロロスルホニルイソシアネート(7.75μL,0.089mmol)を加えた。室温で15分間撹拌した後、Et3N(69.0μL,0.49mmol)を加え、その後、粗化合物339を加えた。室温でさらに2時間撹拌した後、反応混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→15%MeOH)によって精製し、その後、これをEtOAC(2×)と共蒸発させてMeOHを完全に除去した。生成物341を透明な黄色油状物として得た(20.0mg,0.017mmol,17%)。C50H70N7O18S2 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1121.26、実測値1121.59。
化合物101(16.3mg,0.10mmol)をDCM(0.8mL)に溶解し、クロロスルホニルイソシアネート(8.6μL,0.099mmol)を室温において加えた。室温で15分間撹拌した後、Et3N(69.0μL,0.49mmol)を加え、その後、DCM(1.0mL)およびEt3N(69.0μL,0.49mmol)に溶解された335(40mg,0.099mmol)の混合物を加えた。この混合物を室温で1.5時間撹拌することにより(混合物1)、粗生成物339を得た。別のバイアルでは、340(DBCO-C2-OH,Broadpharm)(34.0mg,0.099mmol)を室温のDCM(0.8mL)に溶解し、クロロスルホニルイソシアネート(7.75μL,0.089mmol)を加えた。室温で15分間撹拌した後、Et3N(69.0μL,0.49mmol)を加え、その後、粗化合物339を加えた。室温でさらに2時間撹拌した後、反応混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→15%MeOH)によって精製し、その後、これをEtOAC(2×)と共蒸発させてMeOHを完全に除去した。生成物341を透明な黄色油状物として得た(20.0mg,0.017mmol,17%)。C50H70N7O18S2 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1121.26、実測値1121.59。
実施例80.342の合成
DCM(1.0mL)中の341(20.0mg,0.17mmol)の溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(5.6mg,0.019mmol)およびEt3N(7.5μL,0.053mmol)を加えた。室温で40時間撹拌した後、粗混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(グラジエント:A.DCM中の0%→30%EtOAc(p-ニトロフェノールが回避されるまで)の後、グラジエントB.DCM中の0%→20%MeOH)によって精製することにより、342を透明な淡黄色油状物として得た(6.9mg,0.005mmol,30%)。C57H73N8O22S2 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1286.36、実測値1286.57。
DCM(1.0mL)中の341(20.0mg,0.17mmol)の溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(5.6mg,0.019mmol)およびEt3N(7.5μL,0.053mmol)を加えた。室温で40時間撹拌した後、粗混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(グラジエント:A.DCM中の0%→30%EtOAc(p-ニトロフェノールが回避されるまで)の後、グラジエントB.DCM中の0%→20%MeOH)によって精製することにより、342を透明な淡黄色油状物として得た(6.9mg,0.005mmol,30%)。C57H73N8O22S2 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1286.36、実測値1286.57。
実施例81.308(LD08)の合成
無水DMF(35.0μL)中の342(3.6mg,0.0028mmol)の溶液に、Et3N(1.2μL,0.008mmol)、および無水DMF中のvc-PABC-MMAE.TFA(Levena Bioscience)の原液(34μL,3.4mg,0.0028mmol)を加えた。室温で27時間撹拌した後、DCM(400μL)を加え、粗混合物をシリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→30%MeOH)によって精製することにより、308を無色のフィルム状物として得た(3.7mg,0.0016mmol,58%)。C109H161N17O31S2 +(M/2+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1135.84、実測値1135.73。
無水DMF(35.0μL)中の342(3.6mg,0.0028mmol)の溶液に、Et3N(1.2μL,0.008mmol)、および無水DMF中のvc-PABC-MMAE.TFA(Levena Bioscience)の原液(34μL,3.4mg,0.0028mmol)を加えた。室温で27時間撹拌した後、DCM(400μL)を加え、粗混合物をシリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→30%MeOH)によって精製することにより、308を無色のフィルム状物として得た(3.7mg,0.0016mmol,58%)。C109H161N17O31S2 +(M/2+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1135.84、実測値1135.73。
実施例82.309(LD09)の合成
無水DMF中のvc-PABC-MMAE.TFA(Levena Bioscience)の原液(91μL,9.1mg,0.0073mmol)に、Et3N(5.1μL,0.037mmol)および343(ビス-マレイミド-リジン-PEG4-TFP,Broadpharm)(6.2mg,0.0073mmol)を加えた。室温で3時間撹拌した後、混合物をDCM(0.4mL)で希釈し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→30%MeOH)によって精製することにより、309を透明な油状物として得た(9.1mg,0.0051mmol,69%)。C89H138N15O24 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1802.13、実測値1802.11。
無水DMF中のvc-PABC-MMAE.TFA(Levena Bioscience)の原液(91μL,9.1mg,0.0073mmol)に、Et3N(5.1μL,0.037mmol)および343(ビス-マレイミド-リジン-PEG4-TFP,Broadpharm)(6.2mg,0.0073mmol)を加えた。室温で3時間撹拌した後、混合物をDCM(0.4mL)で希釈し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0%→30%MeOH)によって精製することにより、309を透明な油状物として得た(9.1mg,0.0051mmol,69%)。C89H138N15O24 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1802.13、実測値1802.11。
実施例83.310(LD10)の合成
344(4.3mg,6.0μmol,1.7当量)が入ったEppendorfバイアルに、DMF中のvc-PABC-MMAF.TFA塩(4.00mg,100μL,34.31ミリモル濃度,3.43μmol,1.0当量)を加え、加えた後、トリエチルアミン(1.43μL,10.3μmol,3.0当量)を加えた。混合物を混合し、得られた無色溶液を室温で約3時間放置した。次いで、反応混合物をRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,水(1%AcOH)中の30%→90%MeCN(1%AcOH)によって直接精製した。所望の生成物310を無色の残渣として得た(4.5mg,2.7μmol,79%収率)。C80H134N15O22 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1656.98、実測値1657.03。
344(4.3mg,6.0μmol,1.7当量)が入ったEppendorfバイアルに、DMF中のvc-PABC-MMAF.TFA塩(4.00mg,100μL,34.31ミリモル濃度,3.43μmol,1.0当量)を加え、加えた後、トリエチルアミン(1.43μL,10.3μmol,3.0当量)を加えた。混合物を混合し、得られた無色溶液を室温で約3時間放置した。次いで、反応混合物をRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,水(1%AcOH)中の30%→90%MeCN(1%AcOH)によって直接精製した。所望の生成物310を無色の残渣として得た(4.5mg,2.7μmol,79%収率)。C80H134N15O22 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1656.98、実測値1657.03。
実施例84.346の合成
102(54.7mg,1.00当量,173μmol)および345(トリグリシン,28.8mg,0.878当量,152μmol)が入ったEppendorfバイアルに、乾燥DMF(250μL)およびトリエチルアミン(52.7mg,72.5μL,3当量,520μmol)を加えた。得られた黄色懸濁液を室温で21時間撹拌した後、50μLのH2OをそのRMに加えた。反応混合物を室温でさらに1日間撹拌し、追加のH2O(200μL)を加え、反応混合物を室温でさらに3日間撹拌した。次に、MeCN(約0.5mL)および追加のEt3N(約10滴)を加え、得られた懸濁液を室温で1時間撹拌した後、真空中で濃縮した。黄色残渣をDMF(600μL)に溶解し、得られた黄色懸濁液をメンブランフィルターで濾過した。そのメンブランフィルターを200μLの追加のDMFで洗浄し、合わせた濾液をRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,水(1%AcOH)中の30%→90%MeCN(1%AcOH)によって直接精製した。所望の生成物346を茶色油状物として得た(41.5mg,114μmol,66%収率)。C17H24N3O6 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値366.17、実測値366.27。
102(54.7mg,1.00当量,173μmol)および345(トリグリシン,28.8mg,0.878当量,152μmol)が入ったEppendorfバイアルに、乾燥DMF(250μL)およびトリエチルアミン(52.7mg,72.5μL,3当量,520μmol)を加えた。得られた黄色懸濁液を室温で21時間撹拌した後、50μLのH2OをそのRMに加えた。反応混合物を室温でさらに1日間撹拌し、追加のH2O(200μL)を加え、反応混合物を室温でさらに3日間撹拌した。次に、MeCN(約0.5mL)および追加のEt3N(約10滴)を加え、得られた懸濁液を室温で1時間撹拌した後、真空中で濃縮した。黄色残渣をDMF(600μL)に溶解し、得られた黄色懸濁液をメンブランフィルターで濾過した。そのメンブランフィルターを200μLの追加のDMFで洗浄し、合わせた濾液をRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,水(1%AcOH)中の30%→90%MeCN(1%AcOH)によって直接精製した。所望の生成物346を茶色油状物として得た(41.5mg,114μmol,66%収率)。C17H24N3O6 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値366.17、実測値366.27。
実施例85.347の合成
無水DMF(0.3mL)中の346(21.6mg,0.056mmol)の溶液に、DIPEA(30μL,0.171mmol)およびHATU(21.6mg,0.056mmol)を加えた。室温で10分間撹拌した後、DCM(310μL)に溶解された320(7.37mg,0.031mmol)を加えた。室温で24時間撹拌した後、混合物をRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,H2O中の30%→100%MeCN(両方とも1%AcOHを含む))によって精製した。生成物347をオフホワイト色油状物として得た(5.2mg,0.005mmol,20%)。C43H64N9O14 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値931.02、実測値931.68。
無水DMF(0.3mL)中の346(21.6mg,0.056mmol)の溶液に、DIPEA(30μL,0.171mmol)およびHATU(21.6mg,0.056mmol)を加えた。室温で10分間撹拌した後、DCM(310μL)に溶解された320(7.37mg,0.031mmol)を加えた。室温で24時間撹拌した後、混合物をRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,H2O中の30%→100%MeCN(両方とも1%AcOHを含む))によって精製した。生成物347をオフホワイト色油状物として得た(5.2mg,0.005mmol,20%)。C43H64N9O14 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値931.02、実測値931.68。
実施例86.311(LD13)の合成
無水DMF(200μL)中の347(5.2mg,0.0056mmol)の溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(1.9mg,0.006mmol)およびEt3N(2.4μL,0.016mmol)を加えた。室温で27時間撹拌した後、vc-PABC-MMAE.TFA(Levena Bioscience)の原液(66μL,6.6mg,0.0053mmol)およびEt3N(2μL,0.014mmol)を加えた。室温でさらに17時間撹拌した後、粗混合物をDMF(250μL)で希釈し、RP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,H2O中の5%→90%のMeCN(両方とも1%AcOHを含む))によって精製した。生成物311を透明な油状物として得た(0.6mg,0.28μmol,5%)。C102H156N19O27 +(M/2+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1040.71、実測値1040.85。
無水DMF(200μL)中の347(5.2mg,0.0056mmol)の溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(1.9mg,0.006mmol)およびEt3N(2.4μL,0.016mmol)を加えた。室温で27時間撹拌した後、vc-PABC-MMAE.TFA(Levena Bioscience)の原液(66μL,6.6mg,0.0053mmol)およびEt3N(2μL,0.014mmol)を加えた。室温でさらに17時間撹拌した後、粗混合物をDMF(250μL)で希釈し、RP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,H2O中の5%→90%のMeCN(両方とも1%AcOHを含む))によって精製した。生成物311を透明な油状物として得た(0.6mg,0.28μmol,5%)。C102H156N19O27 +(M/2+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1040.71、実測値1040.85。
実施例87.化合物312の合成
化合物312(LD11)を、参照により援用されるVerkade et al.,Antibodies 2018,7,doi:10.3390/antib7010012に記載されている手順に従って調製した。
化合物312(LD11)を、参照により援用されるVerkade et al.,Antibodies 2018,7,doi:10.3390/antib7010012に記載されている手順に従って調製した。
実施例88.313(LD311)の合成
348(2.7mg,1.1当量,4.9μmol)が入ったバイアルに、DMF(60μL)およびニートのトリエチルアミントリエチルアミン(1.9μL,3当量,13μmol)を加えた。次に、乾燥DMF溶液中のHBTU(2.0mg,11μL,472ミリモル濃度,1.2当量,5.3μmol)の溶液を加え、混合物を混合した。反応混合物を室温で30分間放置した後、va-PABC-MMAF.TFA塩(5.2mg,0.13mL,34.31ミリモル濃度,1当量,4.4μmol)を加えた。得られた混合物を混合し、室温で110分間放置し、次いで、RP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,水(1%AcOH)中の30%→90%MeCN(1%AcOH)によって直接精製した。所望の生成物313を無色油状物として得た(1.8mg,1.1μmol,26%収率)。C77H127N12O23 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1587.91、実測値1588.05。
実施例89.350の合成
DCM(400μL)中のメチルテトラジン-NHSエステル349(19mg,0.057mmol)の溶液に、DCM(800μL)に溶解されたアミノ-PEG11-アミン(47mg,0.086mmol)を加えた。室温で20分間撹拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→50%MeOH(0.7M NH3))によって精製することにより、所望の化合物350を淡紅色油状物として得た(17mg,0.022mmol,39%)。C35H61N6O12 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値757.89、実測値757.46。
348(2.7mg,1.1当量,4.9μmol)が入ったバイアルに、DMF(60μL)およびニートのトリエチルアミントリエチルアミン(1.9μL,3当量,13μmol)を加えた。次に、乾燥DMF溶液中のHBTU(2.0mg,11μL,472ミリモル濃度,1.2当量,5.3μmol)の溶液を加え、混合物を混合した。反応混合物を室温で30分間放置した後、va-PABC-MMAF.TFA塩(5.2mg,0.13mL,34.31ミリモル濃度,1当量,4.4μmol)を加えた。得られた混合物を混合し、室温で110分間放置し、次いで、RP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,水(1%AcOH)中の30%→90%MeCN(1%AcOH)によって直接精製した。所望の生成物313を無色油状物として得た(1.8mg,1.1μmol,26%収率)。C77H127N12O23 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1587.91、実測値1588.05。
実施例89.350の合成
DCM(400μL)中のメチルテトラジン-NHSエステル349(19mg,0.057mmol)の溶液に、DCM(800μL)に溶解されたアミノ-PEG11-アミン(47mg,0.086mmol)を加えた。室温で20分間撹拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→50%MeOH(0.7M NH3))によって精製することにより、所望の化合物350を淡紅色油状物として得た(17mg,0.022mmol,39%)。C35H61N6O12 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値757.89、実測値757.46。
実施例90.351の合成
無水DMF(500μL)中の151(Fmoc-Gly-Gly-Gly-OH,10mg,0.022mmol)の撹拌溶液に、DIPEA(11μL,0.067mmol)およびHATU(8.5mg,0.022mmol)を加えた。10分後、無水DMF(500μL)に溶解された350(17mg,0.022mmol)を加えた。室温で18.5時間撹拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→17%MeOH)によって精製することにより、所望の化合物351を淡紅色油状物として得た(26mg,0.022mmol,定量的)。C56H83N10O17 +(M+NH4 +)についてのLCMS(ESI+)計算値1168.32、実測値1168.67
無水DMF(500μL)中の151(Fmoc-Gly-Gly-Gly-OH,10mg,0.022mmol)の撹拌溶液に、DIPEA(11μL,0.067mmol)およびHATU(8.5mg,0.022mmol)を加えた。10分後、無水DMF(500μL)に溶解された350(17mg,0.022mmol)を加えた。室温で18.5時間撹拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→17%MeOH)によって精製することにより、所望の化合物351を淡紅色油状物として得た(26mg,0.022mmol,定量的)。C56H83N10O17 +(M+NH4 +)についてのLCMS(ESI+)計算値1168.32、実測値1168.67
実施例91.169の合成
無水DMF(500μL)中の351(26mg,0.022mmol)の溶液に、ジエチルアミン(12μL,0.11mmol)を加えた。室温で1.5時間撹拌した後、粗混合物をRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,H2O中の5%→90%MeCN(両方とも1%酢酸を含む))によって精製した。生成物169を透明な淡紅色油状物として得た(10.9mg,0.011mmol,53%)。C41H70N9O15 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値929.05、実測値929.61。
無水DMF(500μL)中の351(26mg,0.022mmol)の溶液に、ジエチルアミン(12μL,0.11mmol)を加えた。室温で1.5時間撹拌した後、粗混合物をRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,H2O中の5%→90%MeCN(両方とも1%酢酸を含む))によって精製した。生成物169を透明な淡紅色油状物として得た(10.9mg,0.011mmol,53%)。C41H70N9O15 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値929.05、実測値929.61。
実施例92.352の合成
DCM(200μL)中の349(メチルテトラジン-NHSエステル,10.3mg,0.031mmol)の溶液に、DCM(200μL)に溶解されたアミノ-PEG23-アミン(50mg,0.046mmol)を加えた。室温で50分間撹拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→60%MeOH(0.7M NH3))によって精製することにより、所望の化合物352を淡紅色油状物として得た(17.7mg,0.013mmol,44%)。C59H109N6O24 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1286.52、実測値1286.72。
DCM(200μL)中の349(メチルテトラジン-NHSエステル,10.3mg,0.031mmol)の溶液に、DCM(200μL)に溶解されたアミノ-PEG23-アミン(50mg,0.046mmol)を加えた。室温で50分間撹拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→60%MeOH(0.7M NH3))によって精製することにより、所望の化合物352を淡紅色油状物として得た(17.7mg,0.013mmol,44%)。C59H109N6O24 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1286.52、実測値1286.72。
実施例93.353の合成
無水DMF(500μL)中の151(5.7mg,0.013mmol)の撹拌溶液に、DIPEA(7μL,0.04mmol)およびHATU(5.3mg,0.013mmol)を加えた。10分後、無水DMF(500μL)に溶解された352(17.7mg,0.013mmol)を加えた。室温で6時間撹拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→18%MeOH)によって精製することにより、所望の化合物353を淡紅色油状物として得た(21mg,0.012mmol,91%)。C80H131N10O29 +(M/2+NH4 +)についてのLCMS(ESI+)計算値857.45、実測値857.08
実施例94.170の合成
無水DMF(500μL)中の353(21mg,0.012mmol)の溶液に、ジエチルアミン(6.7μL,0.06mmol)を加えた。室温で4時間撹拌した後、粗混合物をRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,H2O中の5%→90%MeCN(両方とも1%酢酸を含む))によって精製した。生成物170を淡紅色油状物として得た(11.6mg,0.008mmol,66%)。C65H118N9O27 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1457.68、実測値1457.92。
実施例95.356の合成
DCM(1mL)中の354(テトラフルオロフェニルアジド-NHSエステル,40mg,0.12mmol)の溶液に、355(Boc-NH-PEG2-NH2,33mg,0.13mmol)およびEt3N(50μL,0.36mmol)を加えた。暗所において室温で30分間撹拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→7%MeOH)によって精製することにより、所望の化合物356を透明な油状物として得た(47mg,0.10mmol,84%)。C18H24F4N5O5 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値466.41、実測値466.23。
無水DMF(500μL)中の151(5.7mg,0.013mmol)の撹拌溶液に、DIPEA(7μL,0.04mmol)およびHATU(5.3mg,0.013mmol)を加えた。10分後、無水DMF(500μL)に溶解された352(17.7mg,0.013mmol)を加えた。室温で6時間撹拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→18%MeOH)によって精製することにより、所望の化合物353を淡紅色油状物として得た(21mg,0.012mmol,91%)。C80H131N10O29 +(M/2+NH4 +)についてのLCMS(ESI+)計算値857.45、実測値857.08
実施例94.170の合成
無水DMF(500μL)中の353(21mg,0.012mmol)の溶液に、ジエチルアミン(6.7μL,0.06mmol)を加えた。室温で4時間撹拌した後、粗混合物をRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,H2O中の5%→90%MeCN(両方とも1%酢酸を含む))によって精製した。生成物170を淡紅色油状物として得た(11.6mg,0.008mmol,66%)。C65H118N9O27 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1457.68、実測値1457.92。
実施例95.356の合成
DCM(1mL)中の354(テトラフルオロフェニルアジド-NHSエステル,40mg,0.12mmol)の溶液に、355(Boc-NH-PEG2-NH2,33mg,0.13mmol)およびEt3N(50μL,0.36mmol)を加えた。暗所において室温で30分間撹拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→7%MeOH)によって精製することにより、所望の化合物356を透明な油状物として得た(47mg,0.10mmol,84%)。C18H24F4N5O5 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値466.41、実測値466.23。
実施例96.357の合成
DCM(2mL)中の356(47mg,0.10mmol)の溶液に、ジオキサン中の4.0M HCl(300μL)を加えた。暗所において室温で17.5時間撹拌した後、混合物を濃縮し、357を定量的収率で白色固体として得た(36mg,0.10mmol)。C13H16F4N5O3 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値366.29、実測値366.20。
DCM(2mL)中の356(47mg,0.10mmol)の溶液に、ジオキサン中の4.0M HCl(300μL)を加えた。暗所において室温で17.5時間撹拌した後、混合物を濃縮し、357を定量的収率で白色固体として得た(36mg,0.10mmol)。C13H16F4N5O3 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値366.29、実測値366.20。
実施例97.358の合成
無水DMF(600μL)中の151(Fmoc-Gly-Gly-Gly-OH,42mg,0.10mmol)の撹拌溶液に、DIPEA(50μL,0.30mmol)およびHATU(39mg,0.10mmol)を加えた。暗所で15分後、無水DMF(500μL)に溶解された357(36mg,0.10mmol)を加えた。暗所において室温で41時間撹拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→20%MeOH)によって精製することにより、所望の化合物358を透明な油状物として得た(36mg,0.047mmol,47%)。C34H35F4N8O8 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値759.68、実測値759.38。
無水DMF(600μL)中の151(Fmoc-Gly-Gly-Gly-OH,42mg,0.10mmol)の撹拌溶液に、DIPEA(50μL,0.30mmol)およびHATU(39mg,0.10mmol)を加えた。暗所で15分後、無水DMF(500μL)に溶解された357(36mg,0.10mmol)を加えた。暗所において室温で41時間撹拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→20%MeOH)によって精製することにより、所望の化合物358を透明な油状物として得た(36mg,0.047mmol,47%)。C34H35F4N8O8 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値759.68、実測値759.38。
実施例98.171の合成
無水DMF(750μL)中の358(36mg,0.047mmol)の溶液に、ジエチルアミン(24μL,0.24mmol)を加えた。暗所において室温で55分間撹拌した後、粗混合物をRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,H2O中の5%→90%MeCN(両方とも1%酢酸を含む))によって精製した。生成物171を透明な油状物として得た(18.7mg,0.034mmol,74%)。C19H25F4N8O6 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値537.45、実測値537.29。
無水DMF(750μL)中の358(36mg,0.047mmol)の溶液に、ジエチルアミン(24μL,0.24mmol)を加えた。暗所において室温で55分間撹拌した後、粗混合物をRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,H2O中の5%→90%MeCN(両方とも1%酢酸を含む))によって精製した。生成物171を透明な油状物として得た(18.7mg,0.034mmol,74%)。C19H25F4N8O6 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値537.45、実測値537.29。
実施例99.BCN-LPETGG(172)の合成
無水DMF(500μL)中の102(10mg,0.031mmol)の溶液に、ペプチド167(H-LPETGG-OH,18mg,0.031mmol)およびEt3N(13μL,0.095mmol)を加えた。室温で93時間撹拌した後、粗混合物をRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,H2O中の5%→90%MeCN(両方とも1%酢酸を含む))によって精製した。生成物172を透明な油状物として得た(16.8mg,0.022mmol,72%)。C35H53N6O12 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値749.83、実測値749.39。
無水DMF(500μL)中の102(10mg,0.031mmol)の溶液に、ペプチド167(H-LPETGG-OH,18mg,0.031mmol)およびEt3N(13μL,0.095mmol)を加えた。室温で93時間撹拌した後、粗混合物をRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,H2O中の5%→90%MeCN(両方とも1%酢酸を含む))によって精製した。生成物172を透明な油状物として得た(16.8mg,0.022mmol,72%)。C35H53N6O12 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値749.83、実測値749.39。
実施例100.359の合成
DCM(8mL)中の102(56mg,0.17mmol)の溶液に、アミノ-PEG24-アルコール(214mg,0.199mmol)およびEt3N(80μL,0.53mmol)を加えた。室温で20時間撹拌した後、溶媒を真空中で減少させ、残渣をフラッシュシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の2→30%MeOH)によって精製することにより、所望の化合物359を95%収率で黄色油状物として得た(210mg,0.168mmol)。C59H111NO26Na+(M+Na+)についてのLCMS(ESI+)計算値1273.50、実測値1273.07。
DCM(8mL)中の102(56mg,0.17mmol)の溶液に、アミノ-PEG24-アルコール(214mg,0.199mmol)およびEt3N(80μL,0.53mmol)を加えた。室温で20時間撹拌した後、溶媒を真空中で減少させ、残渣をフラッシュシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の2→30%MeOH)によって精製することにより、所望の化合物359を95%収率で黄色油状物として得た(210mg,0.168mmol)。C59H111NO26Na+(M+Na+)についてのLCMS(ESI+)計算値1273.50、実測値1273.07。
実施例101.360の合成
DCM(7mL)中の359(170mg,0.136mmol)および4-ニトロフェニルクロロホルメート(44mg,0.22mmol)の溶液に、Et3N(63μL,0.40mmol)を加えた。室温で41時間撹拌した後、溶媒を減少させ、残渣をフラッシュシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→10%MeOH)によって精製することにより、所望の化合物360を67%収率で透明な油状物として得た(129mg,0.091mmol)。C66H114N2O30Na+(M+Na+)についてのLCMS(ESI+)計算値1438.59、実測値1438.13。
DCM(7mL)中の359(170mg,0.136mmol)および4-ニトロフェニルクロロホルメート(44mg,0.22mmol)の溶液に、Et3N(63μL,0.40mmol)を加えた。室温で41時間撹拌した後、溶媒を減少させ、残渣をフラッシュシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→10%MeOH)によって精製することにより、所望の化合物360を67%収率で透明な油状物として得た(129mg,0.091mmol)。C66H114N2O30Na+(M+Na+)についてのLCMS(ESI+)計算値1438.59、実測値1438.13。
実施例102.173の合成
無水DMF(800μL)中の360(16mg,0.011mmol)の溶液に、167(ペプチドH-LPETGG-OH,6.5mg,0.011mmol)およびEt3N(5μL,0.04mmol)を加えた。室温で95時間撹拌した後、粗混合物をRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,H2O中の5%→90%MeCN(両方とも1%酢酸を含む))によって精製した。生成物173を透明な油状物として得た(12.6mg,0.0068mmol,62%)。C84H153N8O37 +(M/2+NH4 +)についてのLCMS(ESI+)計算値942.55、実測値924.26。
無水DMF(800μL)中の360(16mg,0.011mmol)の溶液に、167(ペプチドH-LPETGG-OH,6.5mg,0.011mmol)およびEt3N(5μL,0.04mmol)を加えた。室温で95時間撹拌した後、粗混合物をRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,H2O中の5%→90%MeCN(両方とも1%酢酸を含む))によって精製した。生成物173を透明な油状物として得た(12.6mg,0.0068mmol,62%)。C84H153N8O37 +(M/2+NH4 +)についてのLCMS(ESI+)計算値942.55、実測値924.26。
実施例103.174の合成
無水DMF(230μL)中の361(メチルテトラジン-PEG5-NHSエステル,6.1mg,0.011mmol)の溶液に、ペプチドH-LPETGG-OH(6.5mg,0.011mmol)およびEt3N(4μL,0.028mmol)を加えた。室温で22時間撹拌した後、粗混合物をRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,H2O中の5%→90%MeCN(両方とも1%酢酸を含む))によって精製した。生成物174を透明な淡紅色油状物として得た(9.9mg,0.01mmol,91%)。C44H70N11O16 +(M+NH4 +)についてのLCMS(ESI+)計算値1009.09、実測値1009.61。
無水DMF(230μL)中の361(メチルテトラジン-PEG5-NHSエステル,6.1mg,0.011mmol)の溶液に、ペプチドH-LPETGG-OH(6.5mg,0.011mmol)およびEt3N(4μL,0.028mmol)を加えた。室温で22時間撹拌した後、粗混合物をRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,H2O中の5%→90%MeCN(両方とも1%酢酸を含む))によって精製した。生成物174を透明な淡紅色油状物として得た(9.9mg,0.01mmol,91%)。C44H70N11O16 +(M+NH4 +)についてのLCMS(ESI+)計算値1009.09、実測値1009.61。
実施例104.362の合成
DCM(1mL)中の354(31mg,0.093mmol)の溶液に、181(56mg,0.10mmol)およびEt3N(40μL,0.28mmol)を加えた。暗所において室温で25分間撹拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→15%MeOH)によって精製することにより、所望の化合物362を透明な油状物として得た(55mg,0.072mmol,77%)。C31H51F4N4O13 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値763.75、実測値763.08。
DCM(1mL)中の354(31mg,0.093mmol)の溶液に、181(56mg,0.10mmol)およびEt3N(40μL,0.28mmol)を加えた。暗所において室温で25分間撹拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→15%MeOH)によって精製することにより、所望の化合物362を透明な油状物として得た(55mg,0.072mmol,77%)。C31H51F4N4O13 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値763.75、実測値763.08。
実施例105.363の合成
DCM(2mL)中の362(55mg,0.072mmol)の溶液に、4-ニトロフェニルクロロホルメート(13mg,0.064mmol)およびEt3N(30μL,0.21mmol)を加えた。暗所において室温で21時間撹拌した後、混合物を真空中で濃縮し、RP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,水(1%AcOH)中の5%→90%MeCN(1%AcOH)によって精製した。生成物363を黄色油状物として得た(13.3mg,0.014mmol,20%)。C38H54F4N5O17 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値928.85、実測値928.57。
DCM(2mL)中の362(55mg,0.072mmol)の溶液に、4-ニトロフェニルクロロホルメート(13mg,0.064mmol)およびEt3N(30μL,0.21mmol)を加えた。暗所において室温で21時間撹拌した後、混合物を真空中で濃縮し、RP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,水(1%AcOH)中の5%→90%MeCN(1%AcOH)によって精製した。生成物363を黄色油状物として得た(13.3mg,0.014mmol,20%)。C38H54F4N5O17 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値928.85、実測値928.57。
実施例106.175の合成
無水DMF(300μL)中の363(13.3mg,0.014mmol)の溶液に、167(ペプチドH-LPETGG-OH,8.2mg,0.014mmol)およびEt3N(6μL,0.043mmol)を加えた。暗所で26時間後、粗混合物をRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,H2O中の5%→90%MeCN(両方とも1%酢酸を含む))によって精製した。生成物175を透明な油状物として得た(11.4mg,0.0084mmol,59%)。C56H89F4N10O24 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1362.35、実測値1362.81。
無水DMF(300μL)中の363(13.3mg,0.014mmol)の溶液に、167(ペプチドH-LPETGG-OH,8.2mg,0.014mmol)およびEt3N(6μL,0.043mmol)を加えた。暗所で26時間後、粗混合物をRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,H2O中の5%→90%MeCN(両方とも1%酢酸を含む))によって精製した。生成物175を透明な油状物として得た(11.4mg,0.0084mmol,59%)。C56H89F4N10O24 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1362.35、実測値1362.81。
実施例107.365の合成
無水DMF(350μL)中の151(Fmoc-Gly-Gly-Gly-OH,20mg,0.049mmol)の撹拌溶液に、DIPEA(25μL,0.15mmol)およびHATU(18mg,0.049mmol)を加えた。10分後、無水物に溶解された化合物364(N-Boc-エチレンジアミン,7.8mg,0.049mmol)を加えた。室温で45分間撹拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→30%MeOH)によって精製することにより、所望の化合物365を透明な油状物として得た(12.4mg,0.022mmol,46%)。C28H36N5O7 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値554.61、実測値554.46。
無水DMF(350μL)中の151(Fmoc-Gly-Gly-Gly-OH,20mg,0.049mmol)の撹拌溶液に、DIPEA(25μL,0.15mmol)およびHATU(18mg,0.049mmol)を加えた。10分後、無水物に溶解された化合物364(N-Boc-エチレンジアミン,7.8mg,0.049mmol)を加えた。室温で45分間撹拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルでのフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0→30%MeOH)によって精製することにより、所望の化合物365を透明な油状物として得た(12.4mg,0.022mmol,46%)。C28H36N5O7 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値554.61、実測値554.46。
実施例108.366の合成
DCM(0.7mL)中の365(12.4mg,0.022mmol)の撹拌溶液に、ジオキサン中の4.0M HCl(400μL)を加えた。室温で1時間撹拌した後、混合物を濃縮し、366を白色固体として得た(11mg,0.022mmol,定量的)。C23H28N5O7+(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値545.50、実測値454.33。
DCM(0.7mL)中の365(12.4mg,0.022mmol)の撹拌溶液に、ジオキサン中の4.0M HCl(400μL)を加えた。室温で1時間撹拌した後、混合物を濃縮し、366を白色固体として得た(11mg,0.022mmol,定量的)。C23H28N5O7+(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値545.50、実測値454.33。
実施例109.176の合成
無水DMF(300μL)中の191(8mg,0.0059mmol)の溶液に、Et3N(2.5μL,0.017mmol)、および無水DMF中の366の原液(110μL,3.0mg,0.0059mmol)を加えた。室温で18時間撹拌した後、ジエチルアミン(2uL)を加えた。さらに2時間後、混合物をRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,H2O中の5%→90%MeCN(両方とも1%酢酸を含む))によって精製した。生成物176を透明な油状物として得た(1.3mg,0.0009mmol,15%)。C60H103N10O26S2 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1444.64、実測値1444.75。
無水DMF(300μL)中の191(8mg,0.0059mmol)の溶液に、Et3N(2.5μL,0.017mmol)、および無水DMF中の366の原液(110μL,3.0mg,0.0059mmol)を加えた。室温で18時間撹拌した後、ジエチルアミン(2uL)を加えた。さらに2時間後、混合物をRP HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD,30×100mm,H2O中の5%→90%MeCN(両方とも1%酢酸を含む))によって精製した。生成物176を透明な油状物として得た(1.3mg,0.0009mmol,15%)。C60H103N10O26S2 +(M+H+)についてのLCMS(ESI+)計算値1444.64、実測値1444.75。
サイトカインおよびscFvの発現
実施例110.ヒト化OKT3 200
C末端ソルターゼ(hOKT3)A認識配列(配列番号1によって特定されるC末端タグ)を有するヒト化OKT3を、Absolute Antibody Ltd(Oxford,United Kingdom)から入手した。質量スペクトル分析は、1つの主要生成物(観測質量28836Da)を示した。
実施例110.ヒト化OKT3 200
C末端ソルターゼ(hOKT3)A認識配列(配列番号1によって特定されるC末端タグ)を有するヒト化OKT3を、Absolute Antibody Ltd(Oxford,United Kingdom)から入手した。質量スペクトル分析は、1つの主要生成物(観測質量28836Da)を示した。
実施例111.抗4-1BB PF31
抗4-1BB scFvを、C末端ソルターゼA認識配列とそれに続くHisタグ(配列番号4によって特定されるアミノ酸配列)を用いて設計した。抗4-1BB scFvをHEK293細胞において一過性に発現させた後、Absolute Antibody Ltd(Oxford,United Kingdom)がIMAC精製した。質量スペクトル分析は、1つの主要生成物(観測質量28013Da、予想質量28018Da)を示した。
抗4-1BB scFvを、C末端ソルターゼA認識配列とそれに続くHisタグ(配列番号4によって特定されるアミノ酸配列)を用いて設計した。抗4-1BB scFvをHEK293細胞において一過性に発現させた後、Absolute Antibody Ltd(Oxford,United Kingdom)がIMAC精製した。質量スペクトル分析は、1つの主要生成物(観測質量28013Da、予想質量28018Da)を示した。
実施例112.pET32a発現ベクターへのSYR-(G4S)3-IL15 PF18のクローニング
SYR-(G4S)3-IL15(PF18)(配列番号5によって特定されるアミノ酸配列)を、N末端(M)SYR配列を用いて設計し、メチオニンが、発現後に切断されて、N末端セリン、およびSYR配列とIL15との間に屈曲性の(G4S)3スペーサーが残る。コドン最適化されたDNA配列を、pET32A発現ベクターのNdeIとXhoIとの間に挿入することにより、チオレドキシン融合タンパク質をコードする配列を除去した。そのコドン最適化されたDNA配列は、Genscript,Piscataway,USAから入手した。
SYR-(G4S)3-IL15(PF18)(配列番号5によって特定されるアミノ酸配列)を、N末端(M)SYR配列を用いて設計し、メチオニンが、発現後に切断されて、N末端セリン、およびSYR配列とIL15との間に屈曲性の(G4S)3スペーサーが残る。コドン最適化されたDNA配列を、pET32A発現ベクターのNdeIとXhoIとの間に挿入することにより、チオレドキシン融合タンパク質をコードする配列を除去した。そのコドン最適化されたDNA配列は、Genscript,Piscataway,USAから入手した。
実施例113.SYR-(G4S)3-IL15 PF18のE.coli発現および封入体の単離
SYR-(G4S)3-IL15(PF18)の発現は、BL21細胞(Novagen)へのプラスミド(pET32a-SYR-(G4S)3-IL15)の形質転換から始める。形質転換細胞を、アンピシリンを含むLB寒天上にプレーティングし、37℃で一晩インキュベートした。シングルコロニーを拾い、それを用いて50mLのTB培地+アンピシリンに接種した後、37℃で一晩インキュベートした。次に、一晩培養物を用いて、1000mLのTB培地+アンピシリンに接種した。培養物を160RPMにて37℃でインキュベートし、OD600が1.5に達したら、1mM IPTG(1mLの1M原液)で誘導した。160RPMにて37℃で>16時間誘導した後、培養物を遠心分離(5000×g-5分)によってペレットにした。1000mLの培養物から得られた細胞ペレットを、1500単位のベンゾナーゼを含む60mLのBugBusterTMに溶解し、ローラーバンク上で室温にて30分間インキュベートした。溶解後、不溶性画分を遠心分離(15分,15000×g)によって可溶性画分から分離した。不溶性画分の半分を、リゾチーム(最終濃度:200μg/mL)を含む30mLのBugBusterTMに溶解し、ローラーバンク上で10分間インキュベートした。次に、溶液を6体積の1:10希釈BugBusterTMで希釈し、15分間、15000×gで遠心分離した。ホモジナイザーを用いてペレットを200mLの1:10希釈BugBusterTMに再懸濁し、10分間、12000×gで遠心分離した。最後のステップを3回繰り返した。
SYR-(G4S)3-IL15(PF18)の発現は、BL21細胞(Novagen)へのプラスミド(pET32a-SYR-(G4S)3-IL15)の形質転換から始める。形質転換細胞を、アンピシリンを含むLB寒天上にプレーティングし、37℃で一晩インキュベートした。シングルコロニーを拾い、それを用いて50mLのTB培地+アンピシリンに接種した後、37℃で一晩インキュベートした。次に、一晩培養物を用いて、1000mLのTB培地+アンピシリンに接種した。培養物を160RPMにて37℃でインキュベートし、OD600が1.5に達したら、1mM IPTG(1mLの1M原液)で誘導した。160RPMにて37℃で>16時間誘導した後、培養物を遠心分離(5000×g-5分)によってペレットにした。1000mLの培養物から得られた細胞ペレットを、1500単位のベンゾナーゼを含む60mLのBugBusterTMに溶解し、ローラーバンク上で室温にて30分間インキュベートした。溶解後、不溶性画分を遠心分離(15分,15000×g)によって可溶性画分から分離した。不溶性画分の半分を、リゾチーム(最終濃度:200μg/mL)を含む30mLのBugBusterTMに溶解し、ローラーバンク上で10分間インキュベートした。次に、溶液を6体積の1:10希釈BugBusterTMで希釈し、15分間、15000×gで遠心分離した。ホモジナイザーを用いてペレットを200mLの1:10希釈BugBusterTMに再懸濁し、10分間、12000×gで遠心分離した。最後のステップを3回繰り返した。
実施例114.単離された封入体からのSYR-(G4S)3-IL15 PF18のリフォールディング
SYR-(G4S)3-IL15 PF18を含む精製封入体を、40mMシステアミンおよび20mM Tris pH8.0を含む30mLの5Mグアニジンに溶解し、変性させた。その懸濁液を16.000×gで5分間遠心分離して、残りの細胞残屑をペレットにした。上清を40mMシステアミンおよび20mM Tris pH8.0を含む5Mグアニジンで1mg/mLに希釈し、ローラーバンク上で室温において2時間インキュベートした。その1mg/mLの溶液を、10体積のリフォールディング緩衝液(pH8.0の、50mM Tris、10.53mM NaCl、0.44mM KCl、2.2mM MgCl2、2.2mM CaCl2、0.055%PEG-4000、0.55M L-アルギニン、4mMシステアミン、4mMシスタミン)に4℃の低温室において必要な撹拌をしながら滴下した。溶液を4℃で少なくとも24時間放置する。SpectrumTMSpectra/PorTM3 RC Dialysis Membrane Tubing 3500 Dalton MWCOを使用して、溶液を10mM NaClおよび20mM Tris pH8.0に1×一晩および2×4時間透析する。リフォールディングされたSYR-(G4S)3-IL15(PF18)を、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)において平衡化Qトラップ陰イオン交換カラム(GE health care)にロードした。カラムを最初に緩衝液A(20mM Tris、10mM NaCl,pH8.0)で洗浄した。保持されたタンパク質を、緩衝液Aから緩衝液Bまで30mLのグラジエントで緩衝液B(20mM Tris緩衝液、1M NaCl,pH8.0)で溶出した。質量分析は、PF18に対応する14122Da(予想質量:14122Da)の重量を示した。精製されたSYR-(G4S)3-IL15(PF18)を、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)においてHiPrepTM26/10脱塩カラム(Cytiva)を使用してPBSに緩衝液交換した。
SYR-(G4S)3-IL15 PF18を含む精製封入体を、40mMシステアミンおよび20mM Tris pH8.0を含む30mLの5Mグアニジンに溶解し、変性させた。その懸濁液を16.000×gで5分間遠心分離して、残りの細胞残屑をペレットにした。上清を40mMシステアミンおよび20mM Tris pH8.0を含む5Mグアニジンで1mg/mLに希釈し、ローラーバンク上で室温において2時間インキュベートした。その1mg/mLの溶液を、10体積のリフォールディング緩衝液(pH8.0の、50mM Tris、10.53mM NaCl、0.44mM KCl、2.2mM MgCl2、2.2mM CaCl2、0.055%PEG-4000、0.55M L-アルギニン、4mMシステアミン、4mMシスタミン)に4℃の低温室において必要な撹拌をしながら滴下した。溶液を4℃で少なくとも24時間放置する。SpectrumTMSpectra/PorTM3 RC Dialysis Membrane Tubing 3500 Dalton MWCOを使用して、溶液を10mM NaClおよび20mM Tris pH8.0に1×一晩および2×4時間透析する。リフォールディングされたSYR-(G4S)3-IL15(PF18)を、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)において平衡化Qトラップ陰イオン交換カラム(GE health care)にロードした。カラムを最初に緩衝液A(20mM Tris、10mM NaCl,pH8.0)で洗浄した。保持されたタンパク質を、緩衝液Aから緩衝液Bまで30mLのグラジエントで緩衝液B(20mM Tris緩衝液、1M NaCl,pH8.0)で溶出した。質量分析は、PF18に対応する14122Da(予想質量:14122Da)の重量を示した。精製されたSYR-(G4S)3-IL15(PF18)を、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)においてHiPrepTM26/10脱塩カラム(Cytiva)を使用してPBSに緩衝液交換した。
実施例115.pET32a発現ベクターへのH6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15 207のクローニング
IL15Rα-IL15融合タンパク質207(配列番号3によって特定されるアミノ酸配列)を、N末端Hisタグ(HHHHHH)、TEVプロテアーゼ認識配列(SSGENLYFQ)とそれに続くソルターゼA認識配列(GGG)を用いて設計した。コドン最適化されたDNA配列を、pET32A発現ベクターのNdeIとXhoIとの間に挿入することにより、チオレドキシン融合タンパク質をコードする配列を除去した。そのコドン最適化されたDNA配列は、Genscript,Piscataway,USAから入手した。
IL15Rα-IL15融合タンパク質207(配列番号3によって特定されるアミノ酸配列)を、N末端Hisタグ(HHHHHH)、TEVプロテアーゼ認識配列(SSGENLYFQ)とそれに続くソルターゼA認識配列(GGG)を用いて設計した。コドン最適化されたDNA配列を、pET32A発現ベクターのNdeIとXhoIとの間に挿入することにより、チオレドキシン融合タンパク質をコードする配列を除去した。そのコドン最適化されたDNA配列は、Genscript,Piscataway,USAから入手した。
実施例116.His6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15 207のE.coli発現および封入体の単離
His6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15 207の発現は、BL21細胞(Novagen)へのプラスミド(pET32a-IL15Rα-IL15)の形質転換から始める。次のステップは、BL21細胞への500mL培養物(LB培地+アンピシリン)の接種だった。OD600が0.7に達したら、培養物を1mM IPTG(500μLの1M原液)で誘導した。37℃で4時間誘導した後、培養物を遠心分離によってペレットにした。500mLの培養物から得られた細胞ペレットを、625単位のベンゾナーゼを含む25mLのBugBusterTMに溶解し、ローラーバンク上で室温にて20分間インキュベートした。溶解後、不溶性画分を遠心分離(20分,12000×g,4℃)によって可溶性画分から分離した。不溶性画分を、リゾチーム(最終濃度:200μg/mL)を含む25mLのBugBusterTMに溶解し、ローラーバンク上で5分間インキュベートした。次に、溶液を6体積の1:10希釈BugBusterTMで希釈し、4℃で15分間、9000×gで遠心分離した。ホモジナイザーを用いてペレットを250mLの1:10希釈BugBusterTMに再懸濁し、15分間、9000×gにて4℃で遠心分離した。最後のステップを3回繰り返した。
His6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15 207の発現は、BL21細胞(Novagen)へのプラスミド(pET32a-IL15Rα-IL15)の形質転換から始める。次のステップは、BL21細胞への500mL培養物(LB培地+アンピシリン)の接種だった。OD600が0.7に達したら、培養物を1mM IPTG(500μLの1M原液)で誘導した。37℃で4時間誘導した後、培養物を遠心分離によってペレットにした。500mLの培養物から得られた細胞ペレットを、625単位のベンゾナーゼを含む25mLのBugBusterTMに溶解し、ローラーバンク上で室温にて20分間インキュベートした。溶解後、不溶性画分を遠心分離(20分,12000×g,4℃)によって可溶性画分から分離した。不溶性画分を、リゾチーム(最終濃度:200μg/mL)を含む25mLのBugBusterTMに溶解し、ローラーバンク上で5分間インキュベートした。次に、溶液を6体積の1:10希釈BugBusterTMで希釈し、4℃で15分間、9000×gで遠心分離した。ホモジナイザーを用いてペレットを250mLの1:10希釈BugBusterTMに再懸濁し、15分間、9000×gにて4℃で遠心分離した。最後のステップを3回繰り返した。
実施例117.単離された封入体からのHis6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15 207のリフォールディング
His6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15 207を含む精製封入体を、25mLの変性緩衝液(5Mグアニジン、0.3M亜硫酸ナトリウム)および2.5mLの50mM 2-ニトロ-5-スルホベンゾナート二ナトリウム中、4℃で一晩スルホン化した。その溶液を10体積の冷Milli-Qで希釈し、遠心分離した(8000×gで10分間)。ホモジナイザーを用いてペレットを125mLの冷Milli-Qに溶解し、遠心分離した(8000×gで10分間)。最後のステップを3回繰り返した。精製されたHis6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15 207を5Mグアニジンで変性させ、1mg/mLのタンパク質濃度に希釈した。直径0.8mmのシリンジを用いて、変性タンパク質を氷上の10体積のリフォールディング緩衝液(pH8.0の、50mM Tris、10.53mM NaCl、0.44mM KCl、2.2mM MgCl2、2.2mM CaCl2、0.055%PEG-4000、0.55M L-アルギニン、8mMシステアミン、4mMシスタミン)に滴下し、4℃で48時間インキュベートした(撹拌は不要)。リフォールディングされたHis6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15 207をAKTA Purifier-10(GE Healthcare)上の20mL HisTrapエクセルカラム(GE health care)にロードした。そのカラムを最初に緩衝液A(5mM Tris緩衝液、20mMイミダゾール、500mM NaCl,pH7.5)で洗浄した。保持されたタンパク質を、緩衝液Aから緩衝液Bまで25mLのグラジエントで緩衝液B(20mM Tris緩衝液、500mMイミダゾール、500mM NaCl,pH7.5)で溶出した。画分をポリアクリルアミドゲル(16%)においてSDS-PAGEによって分析した。精製された標的タンパク質を含む画分を合わせ、4℃で一晩実施した透析によって緩衝液をTBS(20mM Tris pH7.5および150mM NaCl2)と交換した。精製されたタンパク質を、Amicon Ultra-0.5,MWCO 3kDa(Merck-Millipore)を用いて少なくとも2mg/mLに濃縮した。質量スペクトル分析は、25044Daの重量を示した(予想:25044Da)。生成物をさらに使用する前に-80℃で保存した。
His6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15 207を含む精製封入体を、25mLの変性緩衝液(5Mグアニジン、0.3M亜硫酸ナトリウム)および2.5mLの50mM 2-ニトロ-5-スルホベンゾナート二ナトリウム中、4℃で一晩スルホン化した。その溶液を10体積の冷Milli-Qで希釈し、遠心分離した(8000×gで10分間)。ホモジナイザーを用いてペレットを125mLの冷Milli-Qに溶解し、遠心分離した(8000×gで10分間)。最後のステップを3回繰り返した。精製されたHis6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15 207を5Mグアニジンで変性させ、1mg/mLのタンパク質濃度に希釈した。直径0.8mmのシリンジを用いて、変性タンパク質を氷上の10体積のリフォールディング緩衝液(pH8.0の、50mM Tris、10.53mM NaCl、0.44mM KCl、2.2mM MgCl2、2.2mM CaCl2、0.055%PEG-4000、0.55M L-アルギニン、8mMシステアミン、4mMシスタミン)に滴下し、4℃で48時間インキュベートした(撹拌は不要)。リフォールディングされたHis6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15 207をAKTA Purifier-10(GE Healthcare)上の20mL HisTrapエクセルカラム(GE health care)にロードした。そのカラムを最初に緩衝液A(5mM Tris緩衝液、20mMイミダゾール、500mM NaCl,pH7.5)で洗浄した。保持されたタンパク質を、緩衝液Aから緩衝液Bまで25mLのグラジエントで緩衝液B(20mM Tris緩衝液、500mMイミダゾール、500mM NaCl,pH7.5)で溶出した。画分をポリアクリルアミドゲル(16%)においてSDS-PAGEによって分析した。精製された標的タンパク質を含む画分を合わせ、4℃で一晩実施した透析によって緩衝液をTBS(20mM Tris pH7.5および150mM NaCl2)と交換した。精製されたタンパク質を、Amicon Ultra-0.5,MWCO 3kDa(Merck-Millipore)を用いて少なくとも2mg/mLに濃縮した。質量スペクトル分析は、25044Daの重量を示した(予想:25044Da)。生成物をさらに使用する前に-80℃で保存した。
実施例118.GGG-IL15Rα-IL15 208を得るためのHis6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15 207のTEV切断
His6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15(207,330μL,TBS pH7.5中の2.3mg/mL)の溶液に、TEVプロテアーゼ(50.5μL,50mM Tris-HCl,250mM NaCl,1mM TCEP,1mM EDTA,50%グリセロール,pH7.5中の10単位/μL,New England Biolabs)を加えた。反応物を30℃で1時間インキュベートした。TEV切断後、溶液を、サイズ排除クロマトグラフィーを用いて精製した。反応混合物を、移動相としてTBS pH7.5を使用し、0.5mL/分の流速で、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)においてSuperdex75 10/300GLカラム(GE Healthcare)にロードした。GGG-IL15Rα-IL15 208を12mLの保持時間で溶出した。精製されたタンパク質を、Amicon Ultra-0.5,MWCO 3kDa(Merck Millipore)を使用して少なくとも2mg/mLに濃縮した。生成物を質量分析で分析したところ(観測質量:22965Da、予想質量:22964Da)、GGG-IL15Rα-IL15 208に対応した。生成物をさらに使用する前に-80℃で保存した。
His6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15(207,330μL,TBS pH7.5中の2.3mg/mL)の溶液に、TEVプロテアーゼ(50.5μL,50mM Tris-HCl,250mM NaCl,1mM TCEP,1mM EDTA,50%グリセロール,pH7.5中の10単位/μL,New England Biolabs)を加えた。反応物を30℃で1時間インキュベートした。TEV切断後、溶液を、サイズ排除クロマトグラフィーを用いて精製した。反応混合物を、移動相としてTBS pH7.5を使用し、0.5mL/分の流速で、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)においてSuperdex75 10/300GLカラム(GE Healthcare)にロードした。GGG-IL15Rα-IL15 208を12mLの保持時間で溶出した。精製されたタンパク質を、Amicon Ultra-0.5,MWCO 3kDa(Merck Millipore)を使用して少なくとも2mg/mLに濃縮した。生成物を質量分析で分析したところ(観測質量:22965Da、予想質量:22964Da)、GGG-IL15Rα-IL15 208に対応した。生成物をさらに使用する前に-80℃で保存した。
実施例119.pET32a発現ベクターへのSYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15 PF26のクローニング
SYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15(PF26)(配列番号6によって特定されるアミノ酸配列)は、N末端(M)SYR配列を有するように設計され、メチオニンは、発現後に切断されて、N末端セリン、およびSYR配列とIL15Ra-リンカー-IL15との間に屈曲性の(G4S)3スペーサーが残る。コドン最適化されたDNA配列を、pET32A発現ベクターのNdeIとXhoIとの間に挿入することにより、チオレドキシン融合タンパク質をコードする配列を除去した。そのコドン最適化されたDNA配列は、Genscript,Piscataway,USAから入手した。
SYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15(PF26)(配列番号6によって特定されるアミノ酸配列)は、N末端(M)SYR配列を有するように設計され、メチオニンは、発現後に切断されて、N末端セリン、およびSYR配列とIL15Ra-リンカー-IL15との間に屈曲性の(G4S)3スペーサーが残る。コドン最適化されたDNA配列を、pET32A発現ベクターのNdeIとXhoIとの間に挿入することにより、チオレドキシン融合タンパク質をコードする配列を除去した。そのコドン最適化されたDNA配列は、Genscript,Piscataway,USAから入手した。
実施例120.SYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15 PF26のE.coli発現および封入体の単離
SYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15 PF26の発現は、BL21細胞(Novagen)へのプラスミド(pET32a-SYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15)の形質転換から始める。次のステップは、BL21細胞への1000mL培養物(TB培地+アンピシリン)の接種だった。OD600が1.5に達したら、培養物を1mM IPTG(1mLの1M原液)で誘導した。160RPMにて37℃で>16時間誘導した後、培養物を遠心分離(5000×g-5分)によってペレットにした。1000mLの培養物から得られた細胞ペレットを、1500単位のベンゾナーゼを含む60mLのBugBusterTMに溶解し、ローラーバンク上で室温にて30分間インキュベートした。溶解後、不溶性画分を遠心分離(15分,15000×g)によって可溶性画分から分離した。不溶性画分の半分を、リゾチーム(最終濃度:200μg/mL)を含む30mLのBugBusterTMに溶解し、ローラーバンク上で10分間インキュベートした。次に、溶液を6体積の1:10希釈BugBusterTMで希釈し、15分間、15000×gで遠心分離した。ホモジナイザーを用いてペレットを200mLの1:10希釈BugBusterTMに再懸濁し、10分間、12000×gで遠心分離した。最後のステップを3回繰り返した。
SYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15 PF26の発現は、BL21細胞(Novagen)へのプラスミド(pET32a-SYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15)の形質転換から始める。次のステップは、BL21細胞への1000mL培養物(TB培地+アンピシリン)の接種だった。OD600が1.5に達したら、培養物を1mM IPTG(1mLの1M原液)で誘導した。160RPMにて37℃で>16時間誘導した後、培養物を遠心分離(5000×g-5分)によってペレットにした。1000mLの培養物から得られた細胞ペレットを、1500単位のベンゾナーゼを含む60mLのBugBusterTMに溶解し、ローラーバンク上で室温にて30分間インキュベートした。溶解後、不溶性画分を遠心分離(15分,15000×g)によって可溶性画分から分離した。不溶性画分の半分を、リゾチーム(最終濃度:200μg/mL)を含む30mLのBugBusterTMに溶解し、ローラーバンク上で10分間インキュベートした。次に、溶液を6体積の1:10希釈BugBusterTMで希釈し、15分間、15000×gで遠心分離した。ホモジナイザーを用いてペレットを200mLの1:10希釈BugBusterTMに再懸濁し、10分間、12000×gで遠心分離した。最後のステップを3回繰り返した。
実施例121.単離された封入体からのSYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15 PF26のリフォールディング
SYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15(PF26)を含む精製封入体を、40mMシステアミンおよび20mM Tris pH8.0を含む30mLの5Mグアニジンに溶解し、変性させた。その懸濁液を16.000×gで5分間遠心分離して、残りの細胞残屑をペレットにした。上清を40mMシステアミンおよび20mM Tris pH8.0を含む5Mグアニジンで1mg/mLに希釈し、ローラーバンク上で室温において2時間インキュベートした。その1mg/mLの溶液を、10体積のリフォールディング緩衝液(pH8.0の、50mM Tris、10.53mM NaCl、0.44mM KCl、2.2mM MgCl2、2.2mM CaCl2、0.055%PEG-4000、0.55M L-アルギニン、4mMシステアミン、4mMシスタミン)に4℃の低温室において必要な撹拌をしながら滴下した。溶液を4℃で少なくとも24時間放置する。SpectrumTMSpectra/PorTM3 RC Dialysis Membrane Tubing 3500 Dalton MWCOを使用して、溶液を10mM NaClおよび20mM Tris pH8.0に1×一晩および2×4時間透析する。リフォールディングされたSYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15(PF26)を、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)において平衡化Qトラップ陰イオン交換カラム(GE health care)にロードした。カラムを最初に緩衝液A(20mM Tris、10mM NaCl,pH8.0)で洗浄した。保持されたタンパク質を、緩衝液Aから緩衝液Bまで30mLのグラジエントで緩衝液B(20mM Tris緩衝液、1M NaCl,pH8.0)で溶出した。質量分析は、PF26に対応する24146Daの重量を示した(予想質量:24146Da)。精製されたSYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15(PF26)を、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)においてcytiva製のHiPrepTM26/10脱塩カラムを使用してPBSに緩衝液交換した。
SYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15(PF26)を含む精製封入体を、40mMシステアミンおよび20mM Tris pH8.0を含む30mLの5Mグアニジンに溶解し、変性させた。その懸濁液を16.000×gで5分間遠心分離して、残りの細胞残屑をペレットにした。上清を40mMシステアミンおよび20mM Tris pH8.0を含む5Mグアニジンで1mg/mLに希釈し、ローラーバンク上で室温において2時間インキュベートした。その1mg/mLの溶液を、10体積のリフォールディング緩衝液(pH8.0の、50mM Tris、10.53mM NaCl、0.44mM KCl、2.2mM MgCl2、2.2mM CaCl2、0.055%PEG-4000、0.55M L-アルギニン、4mMシステアミン、4mMシスタミン)に4℃の低温室において必要な撹拌をしながら滴下した。溶液を4℃で少なくとも24時間放置する。SpectrumTMSpectra/PorTM3 RC Dialysis Membrane Tubing 3500 Dalton MWCOを使用して、溶液を10mM NaClおよび20mM Tris pH8.0に1×一晩および2×4時間透析する。リフォールディングされたSYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15(PF26)を、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)において平衡化Qトラップ陰イオン交換カラム(GE health care)にロードした。カラムを最初に緩衝液A(20mM Tris、10mM NaCl,pH8.0)で洗浄した。保持されたタンパク質を、緩衝液Aから緩衝液Bまで30mLのグラジエントで緩衝液B(20mM Tris緩衝液、1M NaCl,pH8.0)で溶出した。質量分析は、PF26に対応する24146Daの重量を示した(予想質量:24146Da)。精製されたSYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15(PF26)を、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)においてcytiva製のHiPrepTM26/10脱塩カラムを使用してPBSに緩衝液交換した。
サイトカインおよびscFvの改変
実施例122.hOKT3-PEG2-BCN 201を得るための、ソルターゼAを使用したhOKT3 200への化合物GGG-PEG2-BCN(157)のC末端ソルタギング
本発明に係るバイオコンジュゲートを、ソルターゼA(配列番号2によって特定される)を使用したC末端ソルタギングによって調製した。hOKT3 200(500μL,500μg,PBS pH7.4中35μM)の溶液に、ソルターゼA(58μL,384μg,TBS pH7.5+10%グリセロール中302μM)、GGG-PEG2-BCN(157,28μL,DMSO中50mM)、CaCl2(69μL,MQ中100mM)およびTBS pH7.5(39μL)を加えた。反応物を37℃で一晩インキュベートした後、AKTA Explorer-100(GE Healthcare)においてHis-trap excel 1mLカラム(GE Healthcare)で精製した。カラムを緩衝液A(20mM Tris、200mM NaCl、20mMイミダゾール,pH7.5)で平衡化し、そのサンプルを1mL/分でロードした。フロースルーを収集したところ、質量スペクトル分析は、201に対応する1つの主要生成物(観測質量27829Da)を示した。そのサンプルをPBS pH7.4に対して透析し、スピン濾過(Amicon Ultra-0.5,Ultracel-10 Membrane,Millipore)によって濃縮して、hOKT3-PEG2-BCN 201(60μL,169μg,PBS pH7.4中101μM)を得た。
実施例122.hOKT3-PEG2-BCN 201を得るための、ソルターゼAを使用したhOKT3 200への化合物GGG-PEG2-BCN(157)のC末端ソルタギング
本発明に係るバイオコンジュゲートを、ソルターゼA(配列番号2によって特定される)を使用したC末端ソルタギングによって調製した。hOKT3 200(500μL,500μg,PBS pH7.4中35μM)の溶液に、ソルターゼA(58μL,384μg,TBS pH7.5+10%グリセロール中302μM)、GGG-PEG2-BCN(157,28μL,DMSO中50mM)、CaCl2(69μL,MQ中100mM)およびTBS pH7.5(39μL)を加えた。反応物を37℃で一晩インキュベートした後、AKTA Explorer-100(GE Healthcare)においてHis-trap excel 1mLカラム(GE Healthcare)で精製した。カラムを緩衝液A(20mM Tris、200mM NaCl、20mMイミダゾール,pH7.5)で平衡化し、そのサンプルを1mL/分でロードした。フロースルーを収集したところ、質量スペクトル分析は、201に対応する1つの主要生成物(観測質量27829Da)を示した。そのサンプルをPBS pH7.4に対して透析し、スピン濾過(Amicon Ultra-0.5,Ultracel-10 Membrane,Millipore)によって濃縮して、hOKT3-PEG2-BCN 201(60μL,169μg,PBS pH7.4中101μM)を得た。
実施例123.hOKT3-PEG2-BCN 201を得るための、ソルターゼA五変異体を用いたhOKT3 200への化合物GGG-PEG2-BCN(157)のC末端ソルタギング
本発明に係るバイオコンジュゲートを、ソルターゼA五変異体(BPS Bioscience,カタログ番号71046)を使用したC末端ソルタギングによって調製した。hOKT3 200(14.3μL,14μg,PBS pH7.4中35μM)の溶液に、ソルターゼA五変異体(0.5μL,1μg,40mM Tris pH8.0中92μM、110mM NaCl、2.2mM KCl、400mMイミダゾールおよび20%グリセロール)、GGG-PEG2-BCN(157,2μL,DMSO:MQ=2:3中20mM)、CaCl2(2μL,MQ中100mM)およびTBS pH7.5(1.2μL)を加えた。反応物を37℃で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、hOKT3-PEG2-BCN 201に対応する1つの主要生成物(観測質量27829Da)を示した。
本発明に係るバイオコンジュゲートを、ソルターゼA五変異体(BPS Bioscience,カタログ番号71046)を使用したC末端ソルタギングによって調製した。hOKT3 200(14.3μL,14μg,PBS pH7.4中35μM)の溶液に、ソルターゼA五変異体(0.5μL,1μg,40mM Tris pH8.0中92μM、110mM NaCl、2.2mM KCl、400mMイミダゾールおよび20%グリセロール)、GGG-PEG2-BCN(157,2μL,DMSO:MQ=2:3中20mM)、CaCl2(2μL,MQ中100mM)およびTBS pH7.5(1.2μL)を加えた。反応物を37℃で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、hOKT3-PEG2-BCN 201に対応する1つの主要生成物(観測質量27829Da)を示した。
実施例124.hOKT3-PEG11-テトラジンPF01を得るための、ソルターゼAを用いたhOKT3 200へのGGG-PEG11-テトラジン(169)のC末端ソルタギング
本発明に係るバイオコンジュゲートを、ソルターゼA(配列番号2によって特定される)を用いたC末端ソルタギングによって調製した。hOKT3 200(1908μL,5mg,PBS pH7.4中91μM)の溶液に、ソルターゼA(81μL,948μg,TBS pH7.5+10%グリセロール中533μM)、GGG-PEG11-テトラジン(169,347μL,MQ中20mM)、CaCl2(347μL,MQ中100mM)およびTBS pH7.5(789μL)を加えた。反応物を37℃で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、hOKT3-PEG11-テトラジンPF01に対応する1つの主要生成物(観測質量28258Da)を示した。その反応物を、AKTA Explorer-100(GE Healthcare)においてHis-trap excel 1mLカラム(GE Healthcare)で精製した。カラムを緩衝液A(20mM Tris、200mM NaCl、20mMイミダゾール,pH7.5)で平衡化し、そのサンプルを1mL/分でロードした。フロースルーを収集し、HiPrep 26/10脱塩カラム(GE Healthcare)を用いてPBS pH6.5に緩衝液交換した。PBS pH6.5に対して追加の透析を4℃で3日間行い、残渣169を除去した。
本発明に係るバイオコンジュゲートを、ソルターゼA(配列番号2によって特定される)を用いたC末端ソルタギングによって調製した。hOKT3 200(1908μL,5mg,PBS pH7.4中91μM)の溶液に、ソルターゼA(81μL,948μg,TBS pH7.5+10%グリセロール中533μM)、GGG-PEG11-テトラジン(169,347μL,MQ中20mM)、CaCl2(347μL,MQ中100mM)およびTBS pH7.5(789μL)を加えた。反応物を37℃で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、hOKT3-PEG11-テトラジンPF01に対応する1つの主要生成物(観測質量28258Da)を示した。その反応物を、AKTA Explorer-100(GE Healthcare)においてHis-trap excel 1mLカラム(GE Healthcare)で精製した。カラムを緩衝液A(20mM Tris、200mM NaCl、20mMイミダゾール,pH7.5)で平衡化し、そのサンプルを1mL/分でロードした。フロースルーを収集し、HiPrep 26/10脱塩カラム(GE Healthcare)を用いてPBS pH6.5に緩衝液交換した。PBS pH6.5に対して追加の透析を4℃で3日間行い、残渣169を除去した。
実施例125.hOKT3-PEG23-テトラジンPF02を得るための、ソルターゼAを用いたhOKT3 200へのGGG-PEG23-テトラジン(170)のC末端ソルタギング
本発明に係るバイオコンジュゲートを、ソルターゼA(配列番号2によって特定される)を用いたC末端ソルタギングによって調製した。hOKT3 200(1908μL,5mg,PBS pH7.4中91μM)の溶液に、ソルターゼA(81μL,948μg,TBS pH7.5+10%グリセロール中533μM)、GGG-PEG23-テトラジン(170,347μL,MQ中20mM)、CaCl2(347μL,MQ中100mM)およびTBS pH7.5(789μL)を加えた。反応物を37℃で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、hOKT3-PEG23-テトラジンPF02に対応する1つの主要生成物(観測質量28787Da)を示した。その反応物を、AKTA Explorer-100(GE Healthcare)においてHis-trap excel 1mLカラム(GE Healthcare)で精製した。カラムを緩衝液A(20mM Tris、200mM NaCl、20mMイミダゾール,pH7.5)で平衡化し、そのサンプルを1mL/分でロードした。フロースルーをPBS pH6.5に対して透析した後、移動相としてPBS pH6.5を使用してAKTA Purifier-10(GE Healthcare)においてSuperdex75 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。
本発明に係るバイオコンジュゲートを、ソルターゼA(配列番号2によって特定される)を用いたC末端ソルタギングによって調製した。hOKT3 200(1908μL,5mg,PBS pH7.4中91μM)の溶液に、ソルターゼA(81μL,948μg,TBS pH7.5+10%グリセロール中533μM)、GGG-PEG23-テトラジン(170,347μL,MQ中20mM)、CaCl2(347μL,MQ中100mM)およびTBS pH7.5(789μL)を加えた。反応物を37℃で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、hOKT3-PEG23-テトラジンPF02に対応する1つの主要生成物(観測質量28787Da)を示した。その反応物を、AKTA Explorer-100(GE Healthcare)においてHis-trap excel 1mLカラム(GE Healthcare)で精製した。カラムを緩衝液A(20mM Tris、200mM NaCl、20mMイミダゾール,pH7.5)で平衡化し、そのサンプルを1mL/分でロードした。フロースルーをPBS pH6.5に対して透析した後、移動相としてPBS pH6.5を使用してAKTA Purifier-10(GE Healthcare)においてSuperdex75 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。
実施例126.hOKT3-PEG2-アリールアジドPF03を得るための、ソルターゼAを用いたhOKT3 200へのGGG-PEG2-アリールアジド(171)のC末端ソルタギング
本発明に係るバイオコンジュゲートを、ソルターゼA(配列番号2によって特定される)を用いたC末端ソルタギングによって調製した。hOKT3 200(2092μL,5mg,PBS pH7.4中83μM)の溶液に、ソルターゼA(95μL,950μg,TBS pH7.5+10%グリセロール中456μM)、GGG-PEG2-アリールアジド(171,347μL,MQ中20mM)、CaCl2(347μL,MQ中100mM)およびTBS pH7.5(591μL)を加えた。反応物を37℃で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、hOKT3-PEG2-アリールアジドPF03に対応する1つの主要生成物(観測質量27865Da)を示した。反応物を、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)においてHis-trap excel 1mLカラム(GE Healthcare)で精製した。カラムを緩衝液A(20mM Tris、200mM NaCl、20mMイミダゾール,pH7.5)で平衡化し、そのサンプルを1mL/分でロードした。フロースルーを、移動相としてPBS pH7.4を使用してAKTA Purifier-10(GE Healthcare)においてSuperdex75 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。
本発明に係るバイオコンジュゲートを、ソルターゼA(配列番号2によって特定される)を用いたC末端ソルタギングによって調製した。hOKT3 200(2092μL,5mg,PBS pH7.4中83μM)の溶液に、ソルターゼA(95μL,950μg,TBS pH7.5+10%グリセロール中456μM)、GGG-PEG2-アリールアジド(171,347μL,MQ中20mM)、CaCl2(347μL,MQ中100mM)およびTBS pH7.5(591μL)を加えた。反応物を37℃で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、hOKT3-PEG2-アリールアジドPF03に対応する1つの主要生成物(観測質量27865Da)を示した。反応物を、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)においてHis-trap excel 1mLカラム(GE Healthcare)で精製した。カラムを緩衝液A(20mM Tris、200mM NaCl、20mMイミダゾール,pH7.5)で平衡化し、そのサンプルを1mL/分でロードした。フロースルーを、移動相としてPBS pH7.4を使用してAKTA Purifier-10(GE Healthcare)においてSuperdex75 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。
実施例127.抗4-1BB PF07を得るための、ソルターゼAを用いた化合物GGG-PEG23-BCN(163)抗4-1BB PF31のC末端ソルタギング
本発明に係るバイオコンジュゲートを、ソルターゼA(配列番号2によって特定される)を用いたC末端ソルタギングによって調製した。抗4-1BB-PF31(665μL,2mg,PBS pH7.4中107μM)の溶液に、ソルターゼA(100μL,1mg,TBS pH7.5+10%グリセロール中357μM)、GGG-PEG23-BCN(163,140μL,MQ中20mM)、CaCl2(140μL,MQ中100mM)およびTBS pH7.5(355μL)を加えた。反応物を37℃で一晩インキュベートした後、AKTA Explorer-100(GE Healthcare)においてHis-trap excel 1mLカラム(GE Healthcare)で精製した。カラムを緩衝液A(20mM Tris、200mM NaCl、20mMイミダゾール,pH7.5)で平衡化し、そのサンプルを1mL/分でロードした。フロースルーを収集し、濃縮後、Superdex75 10/300カラム(Cytiva)で精製した。質量スペクトル分析は、抗4-1BB-BCN PF07に対応する1つの主要生成物(観測質量28478Da)を示した。
本発明に係るバイオコンジュゲートを、ソルターゼA(配列番号2によって特定される)を用いたC末端ソルタギングによって調製した。抗4-1BB-PF31(665μL,2mg,PBS pH7.4中107μM)の溶液に、ソルターゼA(100μL,1mg,TBS pH7.5+10%グリセロール中357μM)、GGG-PEG23-BCN(163,140μL,MQ中20mM)、CaCl2(140μL,MQ中100mM)およびTBS pH7.5(355μL)を加えた。反応物を37℃で一晩インキュベートした後、AKTA Explorer-100(GE Healthcare)においてHis-trap excel 1mLカラム(GE Healthcare)で精製した。カラムを緩衝液A(20mM Tris、200mM NaCl、20mMイミダゾール,pH7.5)で平衡化し、そのサンプルを1mL/分でロードした。フロースルーを収集し、濃縮後、Superdex75 10/300カラム(Cytiva)で精製した。質量スペクトル分析は、抗4-1BB-BCN PF07に対応する1つの主要生成物(観測質量28478Da)を示した。
実施例128.抗4-1BB PF09を得るための、ソルターゼAを用いた化合物GGG-PEG2-アリールアジド(171)抗4-1BB-PF31のC末端ソルタギング
本発明に係るバイオコンジュゲートを、ソルターゼA(配列番号2によって特定される)を用いたC末端ソルタギングによって調製した。抗4-1BB-PF31(665μL,2mg,PBS pH7.4中107μM)の溶液に、ソルターゼA(100μL,1mg,TBS pH7.5+10%グリセロール中357μM)、GGG-PEG2-アリールアジド(171,140μL,MQ中20mM)、CaCl2(140μL,MQ中100mM)およびTBS pH7.5(355μL)を加えた。反応物を37℃で一晩インキュベートした後、AKTA Explorer-100(GE Healthcare)においてHis-trap excel 1mLカラム(GE Healthcare)で精製した。カラムを緩衝液A(20mM Tris、200mM NaCl、20mMイミダゾール,pH7.5)で平衡化し、そのサンプルを1mL/分でロードした。フロースルーを収集し、質量スペクトル分析は、抗4-1BB-アジドPF09に対応する1つの主要生成物(観測質量27592Da)を示した。
本発明に係るバイオコンジュゲートを、ソルターゼA(配列番号2によって特定される)を用いたC末端ソルタギングによって調製した。抗4-1BB-PF31(665μL,2mg,PBS pH7.4中107μM)の溶液に、ソルターゼA(100μL,1mg,TBS pH7.5+10%グリセロール中357μM)、GGG-PEG2-アリールアジド(171,140μL,MQ中20mM)、CaCl2(140μL,MQ中100mM)およびTBS pH7.5(355μL)を加えた。反応物を37℃で一晩インキュベートした後、AKTA Explorer-100(GE Healthcare)においてHis-trap excel 1mLカラム(GE Healthcare)で精製した。カラムを緩衝液A(20mM Tris、200mM NaCl、20mMイミダゾール,pH7.5)で平衡化し、そのサンプルを1mL/分でロードした。フロースルーを収集し、質量スペクトル分析は、抗4-1BB-アジドPF09に対応する1つの主要生成物(観測質量27592Da)を示した。
実施例129.BCN-IL15Rα-IL15 PF15を得るための、SPANCによるIL15Rα-IL15 PF26のN末端BCN官能化
IL15Rα-IL15 PF26(2.9mg,PBS中50μM)に、2当量のNaIO4(4.8μLの、PBS中の50mM原液)および10当量のL-メチオニン(12.5μLの、PBS中の100mM原液)を加えた。反応物を4℃で5分間インキュベートした。質量スペクトル分析は、対応するアルデヒドおよび水和物へのセリンの酸化を示した(観測質量24114Daおよび24132Da)。Sephadex G-25樹脂(Cytiva)を充填されたPD-10脱塩カラムを使用して反応混合物を精製し、PBSを使用して溶出した。溶出液(2.6mg,PBS中50μM)に、160当量のN-メチルヒドロキシルアミン.HCl(340μLの、PBS中の50mM原液)および160当量のp-アニシジン(340μLの、PBS中の50mM原液)を加えた。反応混合物を25℃で3時間インキュベートした。質量スペクトル分析は、N-メチル-イミン-オキシド-IL15に対応する単一のピーク(観測質量24143Da)を示した。Sephadex G-25樹脂(Cytiva)を充填されたPD-10脱塩カラムを使用して反応混合物を精製し、PBSを使用して溶出した。溶出液(2.47mg,PBS中50μM)に、25当量のビス-BCN-PEG11(105)(51μL,DMSO中50mM)および150μLのDMFを加えた。反応物を室温で一晩インキュベートした。Superdex75 10/300カラム(Cytiva)を用いて反応物を精製した。質量スペクトル分析は、BCN-IL15Rα-IL15 PF15に対応する1つの主要なピークを示した(観測質量25041Da)。
IL15Rα-IL15 PF26(2.9mg,PBS中50μM)に、2当量のNaIO4(4.8μLの、PBS中の50mM原液)および10当量のL-メチオニン(12.5μLの、PBS中の100mM原液)を加えた。反応物を4℃で5分間インキュベートした。質量スペクトル分析は、対応するアルデヒドおよび水和物へのセリンの酸化を示した(観測質量24114Daおよび24132Da)。Sephadex G-25樹脂(Cytiva)を充填されたPD-10脱塩カラムを使用して反応混合物を精製し、PBSを使用して溶出した。溶出液(2.6mg,PBS中50μM)に、160当量のN-メチルヒドロキシルアミン.HCl(340μLの、PBS中の50mM原液)および160当量のp-アニシジン(340μLの、PBS中の50mM原液)を加えた。反応混合物を25℃で3時間インキュベートした。質量スペクトル分析は、N-メチル-イミン-オキシド-IL15に対応する単一のピーク(観測質量24143Da)を示した。Sephadex G-25樹脂(Cytiva)を充填されたPD-10脱塩カラムを使用して反応混合物を精製し、PBSを使用して溶出した。溶出液(2.47mg,PBS中50μM)に、25当量のビス-BCN-PEG11(105)(51μL,DMSO中50mM)および150μLのDMFを加えた。反応物を室温で一晩インキュベートした。Superdex75 10/300カラム(Cytiva)を用いて反応物を精製した。質量スペクトル分析は、BCN-IL15Rα-IL15 PF15に対応する1つの主要なピークを示した(観測質量25041Da)。
実施例130.アジド-IL15 PF19を得るためのIL15 PF18のN末端ジアゾ転移反応
IL15 PF18(5mg,0.1M TEA緩衝液pH8.0中50μM)に、イミダゾール-1-スルホニルアジド塩酸塩(708μL,50mM NaOH中50mM)を加え、37℃で一晩インキュベートした。反応物を、HiPrepTM26/10脱塩カラム(Cytiva)を使用して精製した。質量スペクトル分析は、アジド-IL15 PF19に対応する1つの主要なピーク(観測質量14147Da)を示した。
IL15 PF18(5mg,0.1M TEA緩衝液pH8.0中50μM)に、イミダゾール-1-スルホニルアジド塩酸塩(708μL,50mM NaOH中50mM)を加え、37℃で一晩インキュベートした。反応物を、HiPrepTM26/10脱塩カラム(Cytiva)を使用して精製した。質量スペクトル分析は、アジド-IL15 PF19に対応する1つの主要なピーク(観測質量14147Da)を示した。
実施例131.ビス-BCN-hOKT3 PF22を得るためのhOKT3-PEG2-アリールアジドPF03へのトリ-BCN(150)のコンジュゲーション
hOKT3-PEG2-アリールアジドPF03(87μL,1mg,PBS pH7.4中411μM)の溶液に、PBS pH7.4(559μL)、DMF(49μL)および化合物150(22μL,DMF中40mM溶液,25当量)を加えた。反応物を室温で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、ビス-BCN-hOKT3 PF22に対応する1つの主要生成物(観測質量29171Da)を示した。移動相としてPBS pH7.4を使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)においてSuperdex75 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で反応物を精製した。
hOKT3-PEG2-アリールアジドPF03(87μL,1mg,PBS pH7.4中411μM)の溶液に、PBS pH7.4(559μL)、DMF(49μL)および化合物150(22μL,DMF中40mM溶液,25当量)を加えた。反応物を室温で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、ビス-BCN-hOKT3 PF22に対応する1つの主要生成物(観測質量29171Da)を示した。移動相としてPBS pH7.4を使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)においてSuperdex75 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で反応物を精製した。
実施例132.BCN-PEG11-IL15 PF33を得るためのSPANCによるIL15 PF18のN末端BCN官能化
IL15 PF18(8070μL,PBS中50μM)に、2当量のNaIO4(16.4μLの、PBS中50mM原液)を加えた。反応物を4℃で5分間インキュベートした。質量スペクトル分析は、対応する水和物へのセリンの酸化を示した(観測質量14109Da)。Sephadex G-25樹脂(Cytiva)を充填されたPD-10脱塩カラムを使用して反応混合物を精製し、PBSを使用して溶出した。溶出液(11500μL,PBS中32μM)に、160当量のN-メチルヒドロキシルアミンHCl(558μLの、PBS中100mM原液)および160当量のp-アニシジン(558μLの、PBS中100mM原液)を加えた。反応混合物を25℃で3時間インキュベートした。質量スペクトル分析は、N-メチル-イミン-オキシド-IL15に対応する単一のピーク(観測質量14119Da)を示した。Sephadex G-25樹脂(Cytiva)を充填されたPD-10脱塩カラムを使用して反応混合物を精製し、PBSを使用して溶出した。濃縮溶出液(5370,PBS中66μMμM)に、25当量のBCN-PEG11-BCN(105)(142μL,DMSO中50mM)および1576μLのPBSを加えた。反応物を室温で一晩インキュベートした。移動相としてPBS pH7.4を使用し、0.5mL/分の流速で、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)におけるSuperdex75 10/300 GLカラム(GE Healthcare)に反応混合物をロードした。質量スペクトル分析は、BCN-PEG11-IL15 PF33(観測質量15016Da)に対応する1つの主要なピークを示した。
IL15 PF18(8070μL,PBS中50μM)に、2当量のNaIO4(16.4μLの、PBS中50mM原液)を加えた。反応物を4℃で5分間インキュベートした。質量スペクトル分析は、対応する水和物へのセリンの酸化を示した(観測質量14109Da)。Sephadex G-25樹脂(Cytiva)を充填されたPD-10脱塩カラムを使用して反応混合物を精製し、PBSを使用して溶出した。溶出液(11500μL,PBS中32μM)に、160当量のN-メチルヒドロキシルアミンHCl(558μLの、PBS中100mM原液)および160当量のp-アニシジン(558μLの、PBS中100mM原液)を加えた。反応混合物を25℃で3時間インキュベートした。質量スペクトル分析は、N-メチル-イミン-オキシド-IL15に対応する単一のピーク(観測質量14119Da)を示した。Sephadex G-25樹脂(Cytiva)を充填されたPD-10脱塩カラムを使用して反応混合物を精製し、PBSを使用して溶出した。濃縮溶出液(5370,PBS中66μMμM)に、25当量のBCN-PEG11-BCN(105)(142μL,DMSO中50mM)および1576μLのPBSを加えた。反応物を室温で一晩インキュベートした。移動相としてPBS pH7.4を使用し、0.5mL/分の流速で、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)におけるSuperdex75 10/300 GLカラム(GE Healthcare)に反応混合物をロードした。質量スペクトル分析は、BCN-PEG11-IL15 PF33(観測質量15016Da)に対応する1つの主要なピークを示した。
実施例133.アリールアジド-IL15Rα-IL15 PF13を得るための、ソルターゼAを用いたGGG-IL15Rα-IL15 208へのアリールアジド-PEG11-LPETGG(175)のN末端ソルタギング
タンパク質208を含む溶液(2000μL,TBS pH7.5中140μM)に、TBS pH7.5(2686μL)、CaCl2(559μL,100mM)および175(83μL,DMSO中50mM)およびソルターゼA(260μL,TBS pH7.5中537μM)を加え、37℃で3時間インキュベートした(遮光して)。インキュベーション後、Ni-NTAビーズ(500μLビーズ=1mLスラリー)を使用して、その溶液からソルターゼAを除去した。その溶液をローラーバンク上でNi-NTAビーズとともに4℃で一晩インキュベートし、その後、溶液を遠心分離した(5分、7.000×g)。ペレットから上清を分離することによって、生成物PF13を含む上清を回収した。移動相としてPBS pH7.4を使用し、0.5mL/分の流速で、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)におけるSuperdex75 10/300 GLカラム(GE Healthcare)に反応混合物をロードした。質量分析は、PF13に対応する24193Daの重量を示した(予想質量:24193Da)。
タンパク質208を含む溶液(2000μL,TBS pH7.5中140μM)に、TBS pH7.5(2686μL)、CaCl2(559μL,100mM)および175(83μL,DMSO中50mM)およびソルターゼA(260μL,TBS pH7.5中537μM)を加え、37℃で3時間インキュベートした(遮光して)。インキュベーション後、Ni-NTAビーズ(500μLビーズ=1mLスラリー)を使用して、その溶液からソルターゼAを除去した。その溶液をローラーバンク上でNi-NTAビーズとともに4℃で一晩インキュベートし、その後、溶液を遠心分離した(5分、7.000×g)。ペレットから上清を分離することによって、生成物PF13を含む上清を回収した。移動相としてPBS pH7.4を使用し、0.5mL/分の流速で、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)におけるSuperdex75 10/300 GLカラム(GE Healthcare)に反応混合物をロードした。質量分析は、PF13に対応する24193Daの重量を示した(予想質量:24193Da)。
実施例134.ビス-BCN-IL15Rα-IL15 PF27を得るための、歪み促進型アルキン-ニトロン付加環化を用いたSYR-(G4S)3-IL15Rα-IL15 PF26におけるトリ-BCN(150)のN末端組み込み
IL15Rα-IL15 PF26(3840μL,PBS中50μM)に、2当量のNaIO4(7.7μLのPBS中50mM原液)および10当量のL-メチオニン(19.2μLのPBS中100mM原液)を加えた。反応物を4℃で5分間インキュベートした。質量スペクトル分析は、対応するアルデヒドおよび水和物へのセリンの酸化を示した(観測質量24114Daおよび24132Da)。Sephadex G-25樹脂(Cytiva)を充填されたPD-10脱塩カラムを使用して反応混合物を精製し、PBSを使用して溶出した。濃縮溶出液(1800μL,PBS中50μM)に、160当量のN-メチルヒドロキシルアミン.HCl(320μLのPBS中90mM原液)および160当量のp-アニシジン(288μLのPBS中100mM原液)を加えた。反応混合物を25℃で3時間インキュベートした。質量スペクトル分析は、N-メチル-イミン-オキシド-IL15Rα-IL15に対応する単一のピーク(観測質量24143Da)を示した。Sephadex G-25樹脂(Cytiva)を充填されたPD-10脱塩カラムを使用して反応混合物を精製し、PBSを使用して溶出した。濃縮溶出液(3100μL,PBS中60μM)に、25当量のトリ-BCN(150)(116μL,DMSO中40mM)、256μLのDMFおよびPBS pH7.4(248μL)を加えた。反応物を室温で一晩インキュベートした。移動相としてPBS pH7.4を使用し、0.5mL/分の流速で、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)におけるSuperdex75 10/300 GLカラム(GE Healthcare)に反応混合物をロードした。質量スペクトル分析は、所望のビス-BCN-IL15Rα-IL15 PF27(観測質量25448Da、予想質量25447)を示した。RP-HPLCは、60%の標識効率を示した。
IL15Rα-IL15 PF26(3840μL,PBS中50μM)に、2当量のNaIO4(7.7μLのPBS中50mM原液)および10当量のL-メチオニン(19.2μLのPBS中100mM原液)を加えた。反応物を4℃で5分間インキュベートした。質量スペクトル分析は、対応するアルデヒドおよび水和物へのセリンの酸化を示した(観測質量24114Daおよび24132Da)。Sephadex G-25樹脂(Cytiva)を充填されたPD-10脱塩カラムを使用して反応混合物を精製し、PBSを使用して溶出した。濃縮溶出液(1800μL,PBS中50μM)に、160当量のN-メチルヒドロキシルアミン.HCl(320μLのPBS中90mM原液)および160当量のp-アニシジン(288μLのPBS中100mM原液)を加えた。反応混合物を25℃で3時間インキュベートした。質量スペクトル分析は、N-メチル-イミン-オキシド-IL15Rα-IL15に対応する単一のピーク(観測質量24143Da)を示した。Sephadex G-25樹脂(Cytiva)を充填されたPD-10脱塩カラムを使用して反応混合物を精製し、PBSを使用して溶出した。濃縮溶出液(3100μL,PBS中60μM)に、25当量のトリ-BCN(150)(116μL,DMSO中40mM)、256μLのDMFおよびPBS pH7.4(248μL)を加えた。反応物を室温で一晩インキュベートした。移動相としてPBS pH7.4を使用し、0.5mL/分の流速で、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)におけるSuperdex75 10/300 GLカラム(GE Healthcare)に反応混合物をロードした。質量スペクトル分析は、所望のビス-BCN-IL15Rα-IL15 PF27(観測質量25448Da、予想質量25447)を示した。RP-HPLCは、60%の標識効率を示した。
実施例135.hOKT3-(TCO)1-(BCN)1 PF32を得るための、hOKT3-PEG2-アリールアジドPF03へのビス-BCN-TCO XL11のコンジュゲーション
hOKT3-PEG2-アリールアジドPF03を含む溶液(35μL,PBS pH7.4中411μM)に、PBS pH7.4(224.2μL)およびビス-BCN-TCO XL11(28.8μL,DMF中10mM、20当量)を加えた。反応物を室温で16時間インキュベートした。遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa,Merck Millipore)を用いて過剰なビス-BCN-TCO XL11を除去することにより、PBS pH7.4中3.39mg/mLの濃度の最終サンプルを得た。質量スペクトル分析は、予想生成物hOKT3-(TCO)1-(BCN)1 PF32に対応する1つの主要生成物(観測質量29305Da)を示した。
hOKT3-PEG2-アリールアジドPF03を含む溶液(35μL,PBS pH7.4中411μM)に、PBS pH7.4(224.2μL)およびビス-BCN-TCO XL11(28.8μL,DMF中10mM、20当量)を加えた。反応物を室温で16時間インキュベートした。遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa,Merck Millipore)を用いて過剰なビス-BCN-TCO XL11を除去することにより、PBS pH7.4中3.39mg/mLの濃度の最終サンプルを得た。質量スペクトル分析は、予想生成物hOKT3-(TCO)1-(BCN)1 PF32に対応する1つの主要生成物(観測質量29305Da)を示した。
実施例136.hOKT3-(IL15)1-(TCO)1 PF34を得るための、hOKT3-(TCO)1-(BCN)1 PF32へのアジド-IL15 PF19のコンジュゲーション
hOKT3-(TCO)1-(BCN)1 PF32(50μL,PBS pH7.4中116μM)を含む溶液に、アジド-IL15 PF19(52μL,PBS pH7.4中225μM,2当量)を加えた。反応物を37℃で16時間インキュベートした。質量スペクトル分析は、予想生成物hOKT3-(IL15)1-(TCO)1 PF34に対応する1つの主要生成物(観測質量43453Da)を示した。
hOKT3-(TCO)1-(BCN)1 PF32(50μL,PBS pH7.4中116μM)を含む溶液に、アジド-IL15 PF19(52μL,PBS pH7.4中225μM,2当量)を加えた。反応物を37℃で16時間インキュベートした。質量スペクトル分析は、予想生成物hOKT3-(IL15)1-(TCO)1 PF34に対応する1つの主要生成物(観測質量43453Da)を示した。
実施例137.IL15Rα-IL15-(抗4-1-BB)1-(BCN)1 PF35を得るための、ビス-BCN-IL15Rα-IL15 PF27への抗4-1BB-PEG2-アリールアジドPF09のコンジュゲーション
抗4-1BB-PEG2-アリールアジドPF09(52μL,PBS pH7.4中200μM)を含む溶液に、ビス-BCN-IL15Rα-IL15 PF27(80μL,PBS pH7.4中169μM)を加えた。反応物を室温で16時間インキュベートした。移動相としてPBS pH7.4を使用し、0.5mL/分の流速で、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)におけるSuperdex75 10/300 GLカラム(GE Healthcare)に反応混合物をロードした。質量スペクトル分析は、IL15Rα-IL15-(抗4-1-BB)1-(BCN)1 PF35に対応する53043Daの重量を示した(予想質量:53050Da)。
抗4-1BB-PEG2-アリールアジドPF09(52μL,PBS pH7.4中200μM)を含む溶液に、ビス-BCN-IL15Rα-IL15 PF27(80μL,PBS pH7.4中169μM)を加えた。反応物を室温で16時間インキュベートした。移動相としてPBS pH7.4を使用し、0.5mL/分の流速で、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)におけるSuperdex75 10/300 GLカラム(GE Healthcare)に反応混合物をロードした。質量スペクトル分析は、IL15Rα-IL15-(抗4-1-BB)1-(BCN)1 PF35に対応する53043Daの重量を示した(予想質量:53050Da)。
抗体修飾
実施例138.アドセトリスからアドセトリス(6-N3GalNAc)2アドセトリス-v1aへの酵素的リモデリング
アドセトリス(薬局から調達)を緩衝液交換し、遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa,Merck Millipore)を用いて20mMヒスチジン、150mM NaCl pH7.5中、35.6mg/mLに濃縮した。アドセトリス(84μL,3mg,20mMヒスチジン,150mM NaCl pH7.5中35.6mg/mL)を、国際公開第2017137459A1号に記載されているEndoSH(6μL,31μg,5.2mg/mL)、TnGalNAcT(32μL,106μg,3.3mg/mL)、6-N3GalNAc-UDP(5μL,MQ中100mM)(両方とも国際公開第2016170186号に記載されている)、MnCl2(1μL,MQ中1M)および20mMヒスチジン、150mM NaCl pH7.5(22μL)とインキュベートした。反応物を30℃で一晩インキュベートし、緩衝液交換し、遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa,Merck Millipore)を用いてPBS pH7.4中35.6mg/mLに濃縮した。IdeS処理後のサンプルの質量スペクトル分析は、予想生成物アドセトリス-v1aに対応する1つの主要なFc/2生成物(観測質量24333Da)を示した。さらに、RP-HPLC分析により、MMAEが、抗体にコンジュゲートされたままであることが確認された(3.8という平均DARが、アドセトリスとアドセトリス-v1aの両方で観察された)。
実施例138.アドセトリスからアドセトリス(6-N3GalNAc)2アドセトリス-v1aへの酵素的リモデリング
アドセトリス(薬局から調達)を緩衝液交換し、遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa,Merck Millipore)を用いて20mMヒスチジン、150mM NaCl pH7.5中、35.6mg/mLに濃縮した。アドセトリス(84μL,3mg,20mMヒスチジン,150mM NaCl pH7.5中35.6mg/mL)を、国際公開第2017137459A1号に記載されているEndoSH(6μL,31μg,5.2mg/mL)、TnGalNAcT(32μL,106μg,3.3mg/mL)、6-N3GalNAc-UDP(5μL,MQ中100mM)(両方とも国際公開第2016170186号に記載されている)、MnCl2(1μL,MQ中1M)および20mMヒスチジン、150mM NaCl pH7.5(22μL)とインキュベートした。反応物を30℃で一晩インキュベートし、緩衝液交換し、遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa,Merck Millipore)を用いてPBS pH7.4中35.6mg/mLに濃縮した。IdeS処理後のサンプルの質量スペクトル分析は、予想生成物アドセトリス-v1aに対応する1つの主要なFc/2生成物(観測質量24333Da)を示した。さらに、RP-HPLC分析により、MMAEが、抗体にコンジュゲートされたままであることが確認された(3.8という平均DARが、アドセトリスとアドセトリス-v1aの両方で観察された)。
実施例139.カドサイラからカドサイラ(6-N3GalNAc)2カドサイラ-v1aへの酵素的リモデリング
カドサイラ(薬局から調達)を緩衝液交換し、遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa,Merck Millipore)を用いて20mMヒスチジン、150mM NaCl pH7.5中17.8mg/mLに濃縮した。カドサイラ(224μL,4mg,20mMヒスチジン、150mM NaCl pH7.5中17.8mg/mL)を、国際公開第2017137459A1号に記載されているEndoSH(8μL,42μg,5.2mg/mL)、TnGalNAcT(42μL,139μg,3.3mg/mL)、6-N3GalNAc-UDP(7μL,MQ中100mM)(両方とも国際公開第2016170186号に記載されている)およびMnCl2(2μL,MQ中1M)とインキュベートした。反応物を30℃で一晩インキュベートし、緩衝液交換し、遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa,Merck Millipore)を用いてPBS pH7.4中10mg/mLに濃縮した。IdeS処理後のサンプルの質量スペクトル分析は、アジド修飾Fc/2フラグメントに対応する1つの主要なFc/2生成物(観測質量24363Da、総Fc/2フラグメントのおよそ80%)、およびDM1を含むアジド修飾Fc/2フラグメントに対応する1つのマイナーなFc/2生成物(観測質量25321Da、総Fc/2フラグメントのおよそ20%)を示し、それによってカドサイラ-v1aの形成が確認された。
カドサイラ(薬局から調達)を緩衝液交換し、遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa,Merck Millipore)を用いて20mMヒスチジン、150mM NaCl pH7.5中17.8mg/mLに濃縮した。カドサイラ(224μL,4mg,20mMヒスチジン、150mM NaCl pH7.5中17.8mg/mL)を、国際公開第2017137459A1号に記載されているEndoSH(8μL,42μg,5.2mg/mL)、TnGalNAcT(42μL,139μg,3.3mg/mL)、6-N3GalNAc-UDP(7μL,MQ中100mM)(両方とも国際公開第2016170186号に記載されている)およびMnCl2(2μL,MQ中1M)とインキュベートした。反応物を30℃で一晩インキュベートし、緩衝液交換し、遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa,Merck Millipore)を用いてPBS pH7.4中10mg/mLに濃縮した。IdeS処理後のサンプルの質量スペクトル分析は、アジド修飾Fc/2フラグメントに対応する1つの主要なFc/2生成物(観測質量24363Da、総Fc/2フラグメントのおよそ80%)、およびDM1を含むアジド修飾Fc/2フラグメントに対応する1つのマイナーなFc/2生成物(観測質量25321Da、総Fc/2フラグメントのおよそ20%)を示し、それによってカドサイラ-v1aの形成が確認された。
実施例140.トラスツズマブ-S239Cからトラスツズマブ-S239C(6-N3GalNAc)2trast-v9aへの酵素的リモデリング
トラスツズマブ-S239C変異体(EvitriaによってCHOにおいて一過性に発現、重鎖変異S239C)を緩衝液交換し、遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa,Merck Millipore)を用いて20mMヒスチジン、150mM NaCl pH7.5中27.0mg/mLに濃縮した。トラスツズマブ-S239C(148μL,4mg,20mMヒスチジン,150mM NaCl pH7.5中27.0mg/mL)を、国際公開第2017137459A1号に記載されているEndoSH(8μL,42μg,5.2mg/mL)、TnGalNAcT(42μL,139μg,3.3mg/mL)、6-N3GalNAc-UDP(7μL,MQ中100mM)(両方とも国際公開第2016170186号に記載されている)およびMnCl2(1μL,MQ中1M)とインキュベートした。反応物を30℃で一晩インキュベートし、緩衝液交換し、遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa,Merck Millipore)を用いてPBS pH7.4中10mg/mLに濃縮した。IdeS処理後のサンプルの質量スペクトル分析は、システインとジスルフィドを形成するCys239を含むアジド修飾Fc/2フラグメントに対応する1つの主要なFc/2生成物(観測質量24499Da,総Fc/2フラグメントのおよそ80%)、およびC末端リジンを含むアジド修飾Fc/2フラグメントに対応する2つのマイナーなFc/2生成物(観測質量24625および24685Da、総Fc/2フラグメントのおよそ15%および5%)、およびグルタチオンとジスルフィドを形成するCys239を含むアジド修飾Fc/2-フラグメントを示し、それにより、trast-v9aの形成が確認された。
トラスツズマブ-S239C変異体(EvitriaによってCHOにおいて一過性に発現、重鎖変異S239C)を緩衝液交換し、遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa,Merck Millipore)を用いて20mMヒスチジン、150mM NaCl pH7.5中27.0mg/mLに濃縮した。トラスツズマブ-S239C(148μL,4mg,20mMヒスチジン,150mM NaCl pH7.5中27.0mg/mL)を、国際公開第2017137459A1号に記載されているEndoSH(8μL,42μg,5.2mg/mL)、TnGalNAcT(42μL,139μg,3.3mg/mL)、6-N3GalNAc-UDP(7μL,MQ中100mM)(両方とも国際公開第2016170186号に記載されている)およびMnCl2(1μL,MQ中1M)とインキュベートした。反応物を30℃で一晩インキュベートし、緩衝液交換し、遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa,Merck Millipore)を用いてPBS pH7.4中10mg/mLに濃縮した。IdeS処理後のサンプルの質量スペクトル分析は、システインとジスルフィドを形成するCys239を含むアジド修飾Fc/2フラグメントに対応する1つの主要なFc/2生成物(観測質量24499Da,総Fc/2フラグメントのおよそ80%)、およびC末端リジンを含むアジド修飾Fc/2フラグメントに対応する2つのマイナーなFc/2生成物(観測質量24625および24685Da、総Fc/2フラグメントのおよそ15%および5%)、およびグルタチオンとジスルフィドを形成するCys239を含むアジド修飾Fc/2-フラグメントを示し、それにより、trast-v9aの形成が確認された。
実施例141.トラスツズマブ-テトラジンtrast-v1a-XL14を得るための、ビス-DIBO-テトラジンXL14によるトラスツズマブ(6-N3GalNAc)2trast-v1aの分子内架橋
国際公開第2016170186号に従って調製されたトラスツズマブ(6-N3GalNAc)2(trast-v1a)(149μL,5mg,PBS pH7.4中33.6mg/mL)の溶液に、PBS pH7.4(351μL)プロピレングリコール(497μL)およびビス-DIBO-テトラジンXL14(3.3μL,DMF中40mM溶液,IgGと比較して4.0当量)を加えた。反応物を室温で一晩インキュベートした後、移動相としてPBS pH7.4を使用してAKTA Purifier-10(GE Healthcare)においてSuperdex200 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。IdeS消化サンプルの質量スペクトル分析は、分子内架橋されたFc/2-フラグメントに対応する1つの主要生成物(観測質量50177Da)を示し、それにより、trast-v1a-XL14の形成が確認された。質量スペクトル分析を、精製されたモノマー画分に対して行ったので、分子間架橋を除外することができた。遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa,Merck Millipore)を用いて最終サンプルを11.98mg/mLに濃縮した。
国際公開第2016170186号に従って調製されたトラスツズマブ(6-N3GalNAc)2(trast-v1a)(149μL,5mg,PBS pH7.4中33.6mg/mL)の溶液に、PBS pH7.4(351μL)プロピレングリコール(497μL)およびビス-DIBO-テトラジンXL14(3.3μL,DMF中40mM溶液,IgGと比較して4.0当量)を加えた。反応物を室温で一晩インキュベートした後、移動相としてPBS pH7.4を使用してAKTA Purifier-10(GE Healthcare)においてSuperdex200 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。IdeS消化サンプルの質量スペクトル分析は、分子内架橋されたFc/2-フラグメントに対応する1つの主要生成物(観測質量50177Da)を示し、それにより、trast-v1a-XL14の形成が確認された。質量スペクトル分析を、精製されたモノマー画分に対して行ったので、分子間架橋を除外することができた。遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa,Merck Millipore)を用いて最終サンプルを11.98mg/mLに濃縮した。
実施例142.トラスツズマブ-BCN trast-v1a-145を得るための、トリ-BCN 145によるトラスツズマブ(6-N3GalNAc)2trast-v1aの分子内架橋
国際公開第2016170186号に従って調製されたトラスツズマブ(6-N3GalNAc)2 trast-v1a(320μL,2mg,PBS pH7.4中5.56mg/mL)の溶液に、化合物145(80μL,DMF中1.66mM溶液,IgGと比較して10当量)を加えた。反応物を室温で1日間インキュベートした後、遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa,Merck Millipore)を用いて緩衝液をPBS pH7.4に交換した。IdeS消化サンプルの質量スペクトル分析は、分子内架橋されたトラスツズマブ誘導体trast-v1a-145に対応する1つの主要生成物(計算質量49796Da、観測質量49807Da)を示した。HPLC-SECは、<4%の凝集を示したので、分子間架橋が除外された。
国際公開第2016170186号に従って調製されたトラスツズマブ(6-N3GalNAc)2 trast-v1a(320μL,2mg,PBS pH7.4中5.56mg/mL)の溶液に、化合物145(80μL,DMF中1.66mM溶液,IgGと比較して10当量)を加えた。反応物を室温で1日間インキュベートした後、遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa,Merck Millipore)を用いて緩衝液をPBS pH7.4に交換した。IdeS消化サンプルの質量スペクトル分析は、分子内架橋されたトラスツズマブ誘導体trast-v1a-145に対応する1つの主要生成物(計算質量49796Da、観測質量49807Da)を示した。HPLC-SECは、<4%の凝集を示したので、分子間架橋が除外された。
実施例143.リツキシマブ-BCN rit-v1a-145を得るための、トリ-BCN145によるリツキシマブ(6-N3GalNAc)2 rit-v1aの分子内架橋
国際公開第2016170186号に従って調製されたrit-v1a(494μL,30mg,PBS pH7.4中60.7mg/mL)の溶液に、PBS pH7.4(2506μL)、プロピレングリコール(2980μL)および三価リンカー145(20μL,DMF中40mM溶液,IgGと比較して4.0当量)を加えた。反応物を室温で一晩インキュベートした後、移動相としてPBS pH7.4を使用してAKTA Purifier-10(GE Healthcare)においてSuperdex200 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。還元SDS-PAGEは、架橋重鎖に対応する1つの主要なHC生成物を示した(図24の右のパネルのレーン3を参照のこと)ことから、rit-v1a-145の形成が示された。さらに、非還元SDS-PAGEは、rit-v1aと同じ高さ付近に1つの主要なバンドを示した(図24の左のパネルのレーン3を参照のこと)ことから、分子内架橋のみが起こったことが実証された。
国際公開第2016170186号に従って調製されたrit-v1a(494μL,30mg,PBS pH7.4中60.7mg/mL)の溶液に、PBS pH7.4(2506μL)、プロピレングリコール(2980μL)および三価リンカー145(20μL,DMF中40mM溶液,IgGと比較して4.0当量)を加えた。反応物を室温で一晩インキュベートした後、移動相としてPBS pH7.4を使用してAKTA Purifier-10(GE Healthcare)においてSuperdex200 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。還元SDS-PAGEは、架橋重鎖に対応する1つの主要なHC生成物を示した(図24の右のパネルのレーン3を参照のこと)ことから、rit-v1a-145の形成が示された。さらに、非還元SDS-PAGEは、rit-v1aと同じ高さ付近に1つの主要なバンドを示した(図24の左のパネルのレーン3を参照のこと)ことから、分子内架橋のみが起こったことが実証された。
実施例144.カドサイラ-BCN カドサイラ-v1a-145を得るための、トリ-BCN145によるカドサイラ(6-N3GalNAc)2カドサイラ-v1aの分子内架橋
カドサイラ-v1a(400μL,4mg,PBS pH7.4中10mg/mL)の溶液に、プロピレングリコール(397μL)および三価リンカー145(2.7μL,DMF中40mM溶液,IgGと比較して4.0当量)を加えた。反応物を室温で一晩インキュベートした後、移動相としてPBS pH7.4を使用してAKTA Purifier-10(GE Healthcare)においてSuperdex200 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。IdeS消化サンプルの質量スペクトル分析は、0、1および2個のDM1部分を有する分子内架橋されたFc/2フラグメントに対応する3つの主要生成物(観測質量:49795、50752および51711Da)を示し、それによって、カドサイラ-v1a-145の形成が確認された。質量スペクトル分析を、精製されたモノマー画分に対して行ったので、分子間架橋を除外することができた。遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa,Merck Millipore)を用いて最終サンプルを6.88mg/mLに濃縮した。
カドサイラ-v1a(400μL,4mg,PBS pH7.4中10mg/mL)の溶液に、プロピレングリコール(397μL)および三価リンカー145(2.7μL,DMF中40mM溶液,IgGと比較して4.0当量)を加えた。反応物を室温で一晩インキュベートした後、移動相としてPBS pH7.4を使用してAKTA Purifier-10(GE Healthcare)においてSuperdex200 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。IdeS消化サンプルの質量スペクトル分析は、0、1および2個のDM1部分を有する分子内架橋されたFc/2フラグメントに対応する3つの主要生成物(観測質量:49795、50752および51711Da)を示し、それによって、カドサイラ-v1a-145の形成が確認された。質量スペクトル分析を、精製されたモノマー画分に対して行ったので、分子間架橋を除外することができた。遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa,Merck Millipore)を用いて最終サンプルを6.88mg/mLに濃縮した。
実施例145.トラスツズマブ-S239C-BCN trast-v9a-145を得るための、トリ-BCN145によるトラスツズマブ-S239C(6-N3GalNAc)2 trast-v9aの分子内架橋
trast-v9a(400μL,4mg,PBS pH7.4中10mg/mL)の溶液に、プロピレングリコール(397μL)および三価リンカー145(2.7μL,DMF中40mM溶液,IgGと比較して4.0当量)を加えた。反応物を室温で一晩インキュベートした後、移動相としてPBS pH7.4を使用してAKTA Purifier-10(GE Healthcare)においてSuperdex200 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。IdeS消化サンプルの質量スペクトル分析は、システインとジスルフィドを形成する1つのCys239およびグルタチオンとジスルフィドを形成する1つのCys239を有する分子内架橋されたFc/2フラグメントに対応する1つの主要生成物(観測質量50251Da)を示し、それによってtrast-v9a-145の形成が確認された。質量スペクトル分析を、精製されたモノマー画分に対して行ったので、分子間架橋を除外することができた。遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa,Merck Millipore)を用いて最終サンプルを7.88mg/mLに濃縮した。
trast-v9a(400μL,4mg,PBS pH7.4中10mg/mL)の溶液に、プロピレングリコール(397μL)および三価リンカー145(2.7μL,DMF中40mM溶液,IgGと比較して4.0当量)を加えた。反応物を室温で一晩インキュベートした後、移動相としてPBS pH7.4を使用してAKTA Purifier-10(GE Healthcare)においてSuperdex200 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。IdeS消化サンプルの質量スペクトル分析は、システインとジスルフィドを形成する1つのCys239およびグルタチオンとジスルフィドを形成する1つのCys239を有する分子内架橋されたFc/2フラグメントに対応する1つの主要生成物(観測質量50251Da)を示し、それによってtrast-v9a-145の形成が確認された。質量スペクトル分析を、精製されたモノマー画分に対して行ったので、分子間架橋を除外することができた。遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa,Merck Millipore)を用いて最終サンプルを7.88mg/mLに濃縮した。
二機能性抗体および多機能性抗体の作製
実施例146.2:1分子フォーマット(CDR:抗4-1-BB)を有するtrast-v1a-(PF07)1を得るための、trast-v1aへの抗4-1-BB-PEG23-BCN PF07のコンジュゲーション
国際公開第2016170186号に従って調製されたトラスツズマブ(6-N3GalNAc)2 trast-v1a(1mg,PBS中33.6mg/mL)を、抗4-1-BB-PEG23-BCN PF07(55.8μL,PBS pH7.5中6.8mg/mL)と37℃で一晩インキュベートした後、過剰なPF07を除去し、遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 100kDa,Merck Millipore)を用いて17.5mg/mLの濃度になるようにPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS処理後のサンプルの質量スペクトル分析は、未反応のFc/2およびFc/2-PF07にそれぞれ対応する2つの主要なFc/2生成物(観測質量24362Daおよび52840Da)を示した。これにより、予想生成物trast-v1a-(PF07)1の形成が確認された。SDS-PAGE分析は、この結論を支持した(図25を参照のこと)。
実施例146.2:1分子フォーマット(CDR:抗4-1-BB)を有するtrast-v1a-(PF07)1を得るための、trast-v1aへの抗4-1-BB-PEG23-BCN PF07のコンジュゲーション
国際公開第2016170186号に従って調製されたトラスツズマブ(6-N3GalNAc)2 trast-v1a(1mg,PBS中33.6mg/mL)を、抗4-1-BB-PEG23-BCN PF07(55.8μL,PBS pH7.5中6.8mg/mL)と37℃で一晩インキュベートした後、過剰なPF07を除去し、遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 100kDa,Merck Millipore)を用いて17.5mg/mLの濃度になるようにPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS処理後のサンプルの質量スペクトル分析は、未反応のFc/2およびFc/2-PF07にそれぞれ対応する2つの主要なFc/2生成物(観測質量24362Daおよび52840Da)を示した。これにより、予想生成物trast-v1a-(PF07)1の形成が確認された。SDS-PAGE分析は、この結論を支持した(図25を参照のこと)。
実施例147.2:1:1分子フォーマット(CDR:抗4-1-BB:MMAE)を有するtrast-v1a-(PF07)1-(LD11)1を得るための、trast-v1a-(PF07)1へのBCN-MMAE(LD11)のコンジュゲーション
Trast-v1a-(PF07)1(5.56μL,PBS中17.5mg/mL)を、BCN-MMAE LD11(0.57μL,DMF中10mM)と室温で一晩インキュベートした。IdeS処理後のサンプルの質量スペクトル分析は、Fc/2-LD11およびFc/2-PF07にそれぞれ対応する2つの主要なFc/2生成物(観測質量25872Daおよび52840Da)を示した。これにより、予想生成物trast-v1a-(PF07)1-(LD11)1の形成が確認された。SDS-PAGE分析は、この結論を支持した(図25を参照のこと)。
Trast-v1a-(PF07)1(5.56μL,PBS中17.5mg/mL)を、BCN-MMAE LD11(0.57μL,DMF中10mM)と室温で一晩インキュベートした。IdeS処理後のサンプルの質量スペクトル分析は、Fc/2-LD11およびFc/2-PF07にそれぞれ対応する2つの主要なFc/2生成物(観測質量25872Daおよび52840Da)を示した。これにより、予想生成物trast-v1a-(PF07)1-(LD11)1の形成が確認された。SDS-PAGE分析は、この結論を支持した(図25を参照のこと)。
実施例148.2:1:1分子フォーマット(CDR:抗4-1-BB:IL15)を有するtrast-v1a-(PF07)1-(PF33)1を得るための、trast-v1a-(PF07)1へのBCN-IL15 PF33のコンジュゲーション
Trast-v1a-(PF07)1(5.56μL,PBS中17.5mg/mL)を、BCN-IL15 PF33(4.13μL,PBS pH7.5中8.2mg/mL)と37℃で一晩インキュベートした。IdeS処理後のサンプルの質量スペクトル分析は、Fc/2-PF33およびFc/2-PF07にそれぞれ対応する2つの主要なFc/2生成物(観測質量39376Daおよび52842Da)を示した。これにより、予想生成物trast-v1a-(PF07)1-(PF33)1の形成が確認された。SDS-PAGE分析は、この結論を支持した(図25を参照のこと)。
Trast-v1a-(PF07)1(5.56μL,PBS中17.5mg/mL)を、BCN-IL15 PF33(4.13μL,PBS pH7.5中8.2mg/mL)と37℃で一晩インキュベートした。IdeS処理後のサンプルの質量スペクトル分析は、Fc/2-PF33およびFc/2-PF07にそれぞれ対応する2つの主要なFc/2生成物(観測質量39376Daおよび52842Da)を示した。これにより、予想生成物trast-v1a-(PF07)1-(PF33)1の形成が確認された。SDS-PAGE分析は、この結論を支持した(図25を参照のこと)。
実施例149.2:1:1分子フォーマット(CDR:hOKT3:IL15)を有する免疫細胞エンゲージャーtrast-v1a-XL14-PF34を得るための、trast-v1a-XL14へのhOKT3-(IL15)1-(TCO)1 PF34のコンジュゲーション
trast-v1a-XL14(4.2μL,50μg,PBS pH7.4中11.98mg/mL)の溶液に、hOKT3-(IL15)1-(TCO)1 PF34(17.1μL,29μg,PBS pH6.5中39μM,IgGと比較して2当量)を加えた。反応物を室温で一晩インキュベートした。IdeS消化サンプルの質量スペクトル分析は、PF34にコンジュゲートされた架橋Fc/2フラグメントに対応する1つの主要なFc/2生成物(観測質量93608Da)を示し、それにより、trast-v1a-XL14-PF34の形成が確認された。
trast-v1a-XL14(4.2μL,50μg,PBS pH7.4中11.98mg/mL)の溶液に、hOKT3-(IL15)1-(TCO)1 PF34(17.1μL,29μg,PBS pH6.5中39μM,IgGと比較して2当量)を加えた。反応物を室温で一晩インキュベートした。IdeS消化サンプルの質量スペクトル分析は、PF34にコンジュゲートされた架橋Fc/2フラグメントに対応する1つの主要なFc/2生成物(観測質量93608Da)を示し、それにより、trast-v1a-XL14-PF34の形成が確認された。
実施例150.2:2:2分子フォーマット(CDR:IL15Rα-IL15:抗4-1-BB)を有するtrast-v1a-(PF35)2を得るための、trast-v1aへのIL15Rα-IL15-(抗4-1-BB)1-(BCN)1 PF35のコンジュゲーション
国際公開第2016170186号に従って調製されたトラスツズマブ(6-N3GalNAc)2 trast-v1a(1μL,56μg,PBS pH7.4中56.1mg/mL)の溶液に、IL15Rα-IL15-(抗4-1-BB)1-(BCN)1 PF35(22μL,PBS pH7.4中4mg/mL,IgGと比較して4当量)を加えた。反応物を室温で16時間インキュベートした。IdeS消化サンプルの質量スペクトル分析は、コンジュゲートtrast-v1a-(PF35)2に対応する77413Daのピーク(予想質量77413Da)を示した。
国際公開第2016170186号に従って調製されたトラスツズマブ(6-N3GalNAc)2 trast-v1a(1μL,56μg,PBS pH7.4中56.1mg/mL)の溶液に、IL15Rα-IL15-(抗4-1-BB)1-(BCN)1 PF35(22μL,PBS pH7.4中4mg/mL,IgGと比較して4当量)を加えた。反応物を室温で16時間インキュベートした。IdeS消化サンプルの質量スペクトル分析は、コンジュゲートtrast-v1a-(PF35)2に対応する77413Daのピーク(予想質量77413Da)を示した。
実施例151.2:1:1分子フォーマット(CDR:IL15Rα-IL15:抗4-1-BB)を有するtrast-v1a-XL14-PF35を得るための、トラスツズマブ-テトラジンtrast-v1a-XL14へのIL15Rα-IL15-(抗4-1-BB)1-(BCN)1 PF35のコンジュゲーション
trast-v1a-XL14(3.2μL,38μg,PBS pH7.4中11.98mg/mL)の溶液に、IL15Rα-IL15-(抗4-1-BB)1-(BCN)1(PF35 7μL,4mg/mL,IgGと比較して2当量)を加えた。反応物を室温で4時間インキュベートした。IdeS消化サンプルの質量スペクトル分析は、コンジュゲートtrast-v1a-XL14-PF35に対応する103199のピーク(予想質量103197Da)を示した。
trast-v1a-XL14(3.2μL,38μg,PBS pH7.4中11.98mg/mL)の溶液に、IL15Rα-IL15-(抗4-1-BB)1-(BCN)1(PF35 7μL,4mg/mL,IgGと比較して2当量)を加えた。反応物を室温で4時間インキュベートした。IdeS消化サンプルの質量スペクトル分析は、コンジュゲートtrast-v1a-XL14-PF35に対応する103199のピーク(予想質量103197Da)を示した。
実施例152.2:4:1分子フォーマット(CDR:MMAE:hOKT3)を有する免疫細胞エンゲージャーアドセトリス-v1a-PF22を得るための、アドセトリス-v1aへのビス-BCN-hOKT3 PF22のコンジュゲーション
アドセトリス-v1a(3.6μL,75μg,PBS pH7.4中20.75mg/mL)の溶液に、ビス-BCN-hOKT3 PF22(5.1μL,29μg,PBS pH7.4中194μM,IgGと比較して2当量)を加えた。反応物を37℃で一晩インキュベートした。IdeS消化サンプルの質量スペクトル分析は、アドセトリス-v1a-PF22の架橋Fc/2フラグメントに対応する1つの主要生成物(観測質量77837Da)を示した。
アドセトリス-v1a(3.6μL,75μg,PBS pH7.4中20.75mg/mL)の溶液に、ビス-BCN-hOKT3 PF22(5.1μL,29μg,PBS pH7.4中194μM,IgGと比較して2当量)を加えた。反応物を37℃で一晩インキュベートした。IdeS消化サンプルの質量スペクトル分析は、アドセトリス-v1a-PF22の架橋Fc/2フラグメントに対応する1つの主要生成物(観測質量77837Da)を示した。
実施例153.2:4:1分子フォーマット(CDR:MMAE:IL15Rα-IL15)を有する免疫細胞エンゲージャーアドセトリス-v1a-PF27を得るための、アドセトリス-v1aへのビス-BCN-IL15Rα-IL15 PF27のコンジュゲーション
アドセトリス-v1a(3.6μL,75μg,PBS pH7.4中20.75mg/mL)の溶液に、ビス-BCN-IL15Rα-IL15 PF27(3.5μL,25μg,PBS pH7.4中285μM,IgGと比較して2当量)を加えた。反応物を37℃で一晩インキュベートした。IdeS消化サンプルの質量スペクトル分析は、アドセトリス-v1a-PF27の架橋Fc/2フラグメントに対応する1つの主要生成物(観測質量74126Da)を示した。
アドセトリス-v1a(3.6μL,75μg,PBS pH7.4中20.75mg/mL)の溶液に、ビス-BCN-IL15Rα-IL15 PF27(3.5μL,25μg,PBS pH7.4中285μM,IgGと比較して2当量)を加えた。反応物を37℃で一晩インキュベートした。IdeS消化サンプルの質量スペクトル分析は、アドセトリス-v1a-PF27の架橋Fc/2フラグメントに対応する1つの主要生成物(観測質量74126Da)を示した。
実施例154.2:4:1分子フォーマット(CDR:DM1:hOKT3)を有する免疫細胞エンゲージャーカドサイラ-v1a-145-PF01を得るための、カドサイラ-v1a-145へのhOKT3-PEG11-テトラジンPF01のコンジュゲーション
カドサイラ-v1a-145(22μL,150μg,PBS pH7.4中6.88mg/mL)の溶液に、hOKT3-PEG11-テトラジンPF01(8.8μL,57μg,PBS pH7.4中230μM,IgGと比較して2当量)を加えた。反応物を室温で一晩インキュベートした。IdeS消化サンプルの質量スペクトル分析は、PF01を有する分子内架橋されたFc/2-フラグメント(観測質量78024Da、総Fc/2フラグメントのおよそ40%)ならびにPF01およびDM1を有する分子内架橋されたFc/2-フラグメント(観測質量78985Da、総Fc/2フラグメントのおよそ60%)に対応する2つの主要生成物を示し、それによって、カドサイラ-v1a-145-PF01の形成が確認された。
カドサイラ-v1a-145(22μL,150μg,PBS pH7.4中6.88mg/mL)の溶液に、hOKT3-PEG11-テトラジンPF01(8.8μL,57μg,PBS pH7.4中230μM,IgGと比較して2当量)を加えた。反応物を室温で一晩インキュベートした。IdeS消化サンプルの質量スペクトル分析は、PF01を有する分子内架橋されたFc/2-フラグメント(観測質量78024Da、総Fc/2フラグメントのおよそ40%)ならびにPF01およびDM1を有する分子内架橋されたFc/2-フラグメント(観測質量78985Da、総Fc/2フラグメントのおよそ60%)に対応する2つの主要生成物を示し、それによって、カドサイラ-v1a-145-PF01の形成が確認された。
実施例155.2:1分子フォーマット(CDR:hOKT3)を有するT細胞エンゲージャーrit-v1a-145-PF02を得るための、リツキシマブ-BCN rit-v1a-145へのhOKT3-PEG23-テトラジンPF02のコンジュゲーション
rit-v1a-145(247μL,6.3mg,PBS pH7.4中171μM)の溶液に、hOKT3-PEG23-テトラジンPF02(262μL,2.0mg,PBS pH6.5中267μM,IgGと比較して1.7当量)を加えた。反応物を室温で一晩インキュベートした後、移動相としてPBS pH7.4を使用してAKTA Purifier-10(GE Healthcare)においてSuperdex200 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。非還元SDS-PAGE分析は、単一のhOKT3にコンジュゲートされた抗体からなる1つの主要生成物を示し(図24の左パネルのレーン7を参照のこと)、それにより、rit-v1a-145-PF02の形成が確認された。さらに、還元SDS-PAGEにより、単一のhOKT3にコンジュゲートされた2つの重鎖に対応する1つの主要なHC生成物が確認された(図24の右のパネルのレーン7を参照のこと)。
rit-v1a-145(247μL,6.3mg,PBS pH7.4中171μM)の溶液に、hOKT3-PEG23-テトラジンPF02(262μL,2.0mg,PBS pH6.5中267μM,IgGと比較して1.7当量)を加えた。反応物を室温で一晩インキュベートした後、移動相としてPBS pH7.4を使用してAKTA Purifier-10(GE Healthcare)においてSuperdex200 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。非還元SDS-PAGE分析は、単一のhOKT3にコンジュゲートされた抗体からなる1つの主要生成物を示し(図24の左パネルのレーン7を参照のこと)、それにより、rit-v1a-145-PF02の形成が確認された。さらに、還元SDS-PAGEにより、単一のhOKT3にコンジュゲートされた2つの重鎖に対応する1つの主要なHC生成物が確認された(図24の右のパネルのレーン7を参照のこと)。
実施例156.2:1:1分子フォーマット(CDR:hOKT3:MMAE)を有するrit-v10-[145-PF02]-[LD09]を得るためのrit-v1a-145-PF02へのビス-マレイミド-MMAE(LD09)のマレイミドコンジュゲーション
Rit-v1a-145-PF02(0.7mg,PBS+10mM EDTA中7.34mg/mL)を0.8μLの10mM TCEPと37℃で2時間インキュベートした。反応混合物の一部(13.6μL)に、ビスマレイミド-MMAE(LD09)(1.7μL,DMF中1mM)を加え、室温で3時間インキュベートした。DTT還元後のサンプルの質量スペクトル分析は、予想生成物Rit-v10-[145-PF02]-[LD09]に対応する1つの主要なHC生成物(観測質量130895Da)を示した。
Rit-v1a-145-PF02(0.7mg,PBS+10mM EDTA中7.34mg/mL)を0.8μLの10mM TCEPと37℃で2時間インキュベートした。反応混合物の一部(13.6μL)に、ビスマレイミド-MMAE(LD09)(1.7μL,DMF中1mM)を加え、室温で3時間インキュベートした。DTT還元後のサンプルの質量スペクトル分析は、予想生成物Rit-v10-[145-PF02]-[LD09]に対応する1つの主要なHC生成物(観測質量130895Da)を示した。
実施例157.中間体rit-v10-[145-PF02]-[XL01]を得るための、rit-v1a-145-PF02へのビス-マレイミド-BCN(XL01)のマレイミドコンジュゲーション
Rit-v1a-145-PF02(0.7mg,PBS+10mM EDTA中7.34mg/mL)を0.8μLの10mM TCEPと37℃で2時間インキュベートした。反応混合物の一部(84μL)に、ビス-マレイミド-BCN(XL01)(10.3μL,DMF中1mM)を加え、室温で3時間インキュベートした後、遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 100kDa,Merck Millipore)を用いて9.8mg/mLの濃度になるようにPBS pH7.4に緩衝液交換した。SDS-PAGEにより、予想生成物Rit-v10-[145-PF02]-[XL01]の形成が確認された(図26を参照のこと)。
Rit-v1a-145-PF02(0.7mg,PBS+10mM EDTA中7.34mg/mL)を0.8μLの10mM TCEPと37℃で2時間インキュベートした。反応混合物の一部(84μL)に、ビス-マレイミド-BCN(XL01)(10.3μL,DMF中1mM)を加え、室温で3時間インキュベートした後、遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 100kDa,Merck Millipore)を用いて9.8mg/mLの濃度になるようにPBS pH7.4に緩衝液交換した。SDS-PAGEにより、予想生成物Rit-v10-[145-PF02]-[XL01]の形成が確認された(図26を参照のこと)。
実施例158.2:1:1分子フォーマット(CDR:hOKT3:IL15)を有するrit-v10-[145-PF02]-[XL01-PF19]を得るためのRit-v10-[145-PF02]-[XL01]へのアジド-IL15 PF19のコンジュゲーション
Rit-v10-[145-PF02]-[XL01](9.8μL,PBS中9.8mg/mL)をアジド-IL15 PF19(4.49μL,PBS pH7.5中7.2mg/mL)と室温で一晩インキュベートした。SDS-PAGE分析により、予想生成物Rit-v10-[145-PF02]-[XL01-PF19]の形成が確認された(図26を参照のこと)。
Rit-v10-[145-PF02]-[XL01](9.8μL,PBS中9.8mg/mL)をアジド-IL15 PF19(4.49μL,PBS pH7.5中7.2mg/mL)と室温で一晩インキュベートした。SDS-PAGE分析により、予想生成物Rit-v10-[145-PF02]-[XL01-PF19]の形成が確認された(図26を参照のこと)。
実施例159.2:1:1分子フォーマット(CDR:hOKT3:IL15Rα-IL15)を有するRit-v10-[145-PF02]-[XL01-PF13]を得るための、rit-v10-[145-PF02]-[XL01]へのアリールアジド-IL15Rα-IL15 PF13のコンジュゲーション
Rit-v10-[145-PF02]-[XL01](9.8μL,PBS中9.8mg/mL)をアリールアジド-IL15Rα-IL15 PF13(10.6μL,PBS pH7.5中2.6mg/mL)と室温で一晩インキュベートした。SDS-PAGE分析により、予想生成物Rit-v10-[145-PF02]-[XL01-PF13]の形成が確認された(図26を参照のこと)。
Rit-v10-[145-PF02]-[XL01](9.8μL,PBS中9.8mg/mL)をアリールアジド-IL15Rα-IL15 PF13(10.6μL,PBS pH7.5中2.6mg/mL)と室温で一晩インキュベートした。SDS-PAGE分析により、予想生成物Rit-v10-[145-PF02]-[XL01-PF13]の形成が確認された(図26を参照のこと)。
実施例160.2:1分子フォーマット(CDR:MMAF)および未反応アジドを有する中間体trast-v1a-145-(LD10)1を得るための、trast-v1a-145へのビス-アジド-MMAF LD10のコンジュゲーション
trast-v1a-145(150μL,1mg,PBS pH7.4中6.7mg/mL)の溶液に、ビス-アジド-MMAF(LD10,50μL,DMF中1.33mM溶液,IgGと比較して10当量)を加えた。反応物を室温で16時間インキュベートした後、遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa,Merck Millipore)を用いて20.7mg/mLの濃度になるようにPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS消化サンプルの質量スペクトル分析は、分子内架橋を介して得られたコンジュゲートされたADC trast-v1a-145-(LD10)1に対応する1つの主要生成物(観測質量51455Da)を示した。
trast-v1a-145(150μL,1mg,PBS pH7.4中6.7mg/mL)の溶液に、ビス-アジド-MMAF(LD10,50μL,DMF中1.33mM溶液,IgGと比較して10当量)を加えた。反応物を室温で16時間インキュベートした後、遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa,Merck Millipore)を用いて20.7mg/mLの濃度になるようにPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS消化サンプルの質量スペクトル分析は、分子内架橋を介して得られたコンジュゲートされたADC trast-v1a-145-(LD10)1に対応する1つの主要生成物(観測質量51455Da)を示した。
実施例161.2:1:1分子フォーマット(CDR:MMAF:IL15)を有するtrast-v1a-145-(LD10)1-(PF33)1を得るための、trast-v1a-145-(LD10)1へのBCN-IL15 PF33のコンジュゲーション
Trast-v1a-145-(LD10)1(0.075mg,PBS中20.7mg/mL)をBCN-IL15(PF33)(3.69μL,PBS pH7.5中8.2mg/mL)と室温で一晩インキュベートした。IdeS処理後のサンプルの質量スペクトル分析は、予想生成物trast-v1a-145-(LD10)1-(PF33)1に対応する1つの主要なFc/2生成物(観測質量66472Da)を示した。
Trast-v1a-145-(LD10)1(0.075mg,PBS中20.7mg/mL)をBCN-IL15(PF33)(3.69μL,PBS pH7.5中8.2mg/mL)と室温で一晩インキュベートした。IdeS処理後のサンプルの質量スペクトル分析は、予想生成物trast-v1a-145-(LD10)1-(PF33)1に対応する1つの主要なFc/2生成物(観測質量66472Da)を示した。
実施例162.2:1:1分子フォーマット(CDR:MMAF:IL15Rα-IL15)を有するtrast-v1a-145-(LD10)1-(PF15)1を得るためのtrast-v1a-145-(LD10)1へのBCN-IL15Rα-IL15 PF15のコンジュゲーション
Trast-v1a-145-(LD10)1(0.075mg,PBS中20.7mg/mL)をBCN-IL15Rα-IL15 PF15(7.47μL,PBS pH7.5中6.7mg/mL)と室温で一晩インキュベートした。IdeS処理後のサンプルの質量スペクトル分析は、予想生成物trast-v1a-145-(LD10)1-(PF15)1に対応する1つの主要なFc/2生成物(観測質量76494Da)を示した。
Trast-v1a-145-(LD10)1(0.075mg,PBS中20.7mg/mL)をBCN-IL15Rα-IL15 PF15(7.47μL,PBS pH7.5中6.7mg/mL)と室温で一晩インキュベートした。IdeS処理後のサンプルの質量スペクトル分析は、予想生成物trast-v1a-145-(LD10)1-(PF15)1に対応する1つの主要なFc/2生成物(観測質量76494Da)を示した。
実施例163.2:1:1分子フォーマット(CDR:MMAF:hOKT3)を有するtrast-v1a-145-(LD10)1-(201)1を得るための、trast-v1a-145-(LD10)1へのhOKT3-BCN(201)のコンジュゲーション
Trast-v1a-145-(LD10)1(0.075mg,PBS中20.7mg/mL)をhOKT3-BCN 201(5.25μL,PBS pH5.5中11mg/mL)と室温で一晩インキュベートした。IdeS処理後のサンプルの質量スペクトル分析は、予想生成物trast-v1a-145-(LD10)1-(201)1に対応する1つの主要なFc/2生成物(観測質量79280Da)を示した。
Trast-v1a-145-(LD10)1(0.075mg,PBS中20.7mg/mL)をhOKT3-BCN 201(5.25μL,PBS pH5.5中11mg/mL)と室温で一晩インキュベートした。IdeS処理後のサンプルの質量スペクトル分析は、予想生成物trast-v1a-145-(LD10)1-(201)1に対応する1つの主要なFc/2生成物(観測質量79280Da)を示した。
実施例164.2:1分子フォーマット(CDR:hOKT3)を有する中間体trast-v9a-145-PF01を得るための、trast-v9a-145へのhOKT3-PEG11-テトラジンPF01のコンジュゲーション
trast-v9a-145(127μL,1.2mg,PBS pH7.4中7.88mg/mL)の溶液に、hOKT3-PEG11-テトラジンPF01(59μL,0.4mg,PBS pH6.5中230μM,IgGと比較して2当量)を加えた。反応物を室温で一晩インキュベートした。IdeS消化サンプルの質量スペクトル分析は、両方のCys239残基がシステインとジスルフィドを形成しているtrast-v9a-145-PF01の架橋Fc/2フラグメントに対応する1つの主要Fc/2生成物(観測質量78297Da)を示した。trast-v9a-145-PF01を、遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 100kDa,Merck Millipore)を用いてPBS+10mM EDTAでスピン濾過して、残留hOKT3-PEG11-テトラジンPF01を除去した。
trast-v9a-145(127μL,1.2mg,PBS pH7.4中7.88mg/mL)の溶液に、hOKT3-PEG11-テトラジンPF01(59μL,0.4mg,PBS pH6.5中230μM,IgGと比較して2当量)を加えた。反応物を室温で一晩インキュベートした。IdeS消化サンプルの質量スペクトル分析は、両方のCys239残基がシステインとジスルフィドを形成しているtrast-v9a-145-PF01の架橋Fc/2フラグメントに対応する1つの主要Fc/2生成物(観測質量78297Da)を示した。trast-v9a-145-PF01を、遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 100kDa,Merck Millipore)を用いてPBS+10mM EDTAでスピン濾過して、残留hOKT3-PEG11-テトラジンPF01を除去した。
2:1:1分子フォーマット(CDR:hOKT3;MMAE)を有するtrast-v9b-[145-PF01]-[LD09]を得るための、ビス-mal-MMAE LD09によるtrast-v9a-145-PF01の分子内架橋
Trast-v9a-145-PF01(0.85mg,PBS+10mM EDTA中17mg/mL)をTCEP(4.9μL,MQ中10mM)と37℃で2時間インキュベートした。還元抗体を、遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa,Merck Millipore)を用いてPBS+10mM EDTAでスピン濾過し、50μLに希釈した。その後、DHA(4.9μL,MQ:DMSO(9:1)中10mM)を加え、反応物を室温で3時間インキュベートした。反応混合物の一部(0.17mg,10μL)に、ビス-mal-MMAE LD09(1.5μL,DMF中2mM,3当量)を加えた後、室温で1.5時間インキュベートした。IdeS処理後のサンプルの質量スペクトル分析は、予想生成物trast-v9b-[145-PF01]-[LD09]に対応する1つの主要なFc/2生成物(観測質量79857Da)を示した。
Trast-v9a-145-PF01(0.85mg,PBS+10mM EDTA中17mg/mL)をTCEP(4.9μL,MQ中10mM)と37℃で2時間インキュベートした。還元抗体を、遠心フィルター(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa,Merck Millipore)を用いてPBS+10mM EDTAでスピン濾過し、50μLに希釈した。その後、DHA(4.9μL,MQ:DMSO(9:1)中10mM)を加え、反応物を室温で3時間インキュベートした。反応混合物の一部(0.17mg,10μL)に、ビス-mal-MMAE LD09(1.5μL,DMF中2mM,3当量)を加えた後、室温で1.5時間インキュベートした。IdeS処理後のサンプルの質量スペクトル分析は、予想生成物trast-v9b-[145-PF01]-[LD09]に対応する1つの主要なFc/2生成物(観測質量79857Da)を示した。
配列表
C末端ソルターゼA認識配列(配列番号1)の配列同定:
GGGGSGGGGSLPETGGHHHHHHHHHH
C末端ソルターゼA認識配列(配列番号1)の配列同定:
GGGGSGGGGSLPETGGHHHHHHHHHH
ソルターゼA(配列番号2)の配列同定:
TGSHHHHHHGSKPHIDNYLHDKDKDEKIEQYDKNVKEQASKDKKQQAKPQIPKDKSKVAGYIEIPDADIKEPVYPGPATPEQLNRGVSFAEENESLDDQNISIAGHTFIDRPNYQFTNLKAAKKGSMVYFKVGNETRKYKMTSIRDVKPTDVGVLDEQKGKDKQLTLITCDDYNEKTGVWEKRKIFVATEVK
TGSHHHHHHGSKPHIDNYLHDKDKDEKIEQYDKNVKEQASKDKKQQAKPQIPKDKSKVAGYIEIPDADIKEPVYPGPATPEQLNRGVSFAEENESLDDQNISIAGHTFIDRPNYQFTNLKAAKKGSMVYFKVGNETRKYKMTSIRDVKPTDVGVLDEQKGKDKQLTLITCDDYNEKTGVWEKRKIFVATEVK
His6-TEV部位-GGG-IL15Rα-IL15(配列番号3)の配列同定:
MGSSHHHHHHSSGENLYFQGGGITCPPPMSVEHADIWVKSYSLYSRERYICNSGFKRKAGTSSLTECVLNKATNVAHWTTPSLKCIRDPALVHQRPAPPSGGSGGGGSGGGSGGGGSLQNWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS
MGSSHHHHHHSSGENLYFQGGGITCPPPMSVEHADIWVKSYSLYSRERYICNSGFKRKAGTSSLTECVLNKATNVAHWTTPSLKCIRDPALVHQRPAPPSGGSGGGGSGGGSGGGGSLQNWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS
抗4-1BB PF31(配列番号4)の配列同定:
DIVMTQSPPTLSLSPGERVTLSCRASQSISDYLHWYQQKPGQSPRLLIKYASQSISGIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQDGHSFPPTFGGGTKVEIKGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSQVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFSSYWMHWVRQAPGQRLEWMGEINPGNGHTNYSQKFQGRVTITVDKSASTAYMELSSLRSEDTAVYYCARSFTTARAFAYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSLPETGGHHHHHH
DIVMTQSPPTLSLSPGERVTLSCRASQSISDYLHWYQQKPGQSPRLLIKYASQSISGIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQDGHSFPPTFGGGTKVEIKGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSQVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFSSYWMHWVRQAPGQRLEWMGEINPGNGHTNYSQKFQGRVTITVDKSASTAYMELSSLRSEDTAVYYCARSFTTARAFAYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSLPETGGHHHHHH
SYR-(G4S)3-IL15(PF18)(配列番号5)の配列同定:
SYRGGGGSGGGGSGGGGSNWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS
SYRGGGGSGGGGSGGGGSNWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS
SYR-(G4S)3-IL15Rα-リンカー-IL15(PF26)(配列番号6)の配列同定:
SYRGGGGSGGGGSGGGGSITCPPPMSVEHADIWVKSYSLYSRERYICNSGFKRKAGTSSLTECVLNKATNVAHWTTPSLKCIRDPALVHQRPAPPSGGSGGGGSGGGSGGGGSLQNWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS
SYRGGGGSGGGGSGGGGSITCPPPMSVEHADIWVKSYSLYSRERYICNSGFKRKAGTSSLTECVLNKATNVAHWTTPSLKCIRDPALVHQRPAPPSGGSGGGGSGGGSGGGGSLQNWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS
Claims (23)
- 少なくとも1つの抗体Abと、2つの別個のペイロードD1およびD2と、を含む多機能性抗体構築物であって、前記構築物は、構造(1)または(2):
を有し、式中、
Abは、抗体であり;
L1、L2、L3、L4およびL5は、リンカーであり;
x1およびx2は、それぞれ個別に1~8の範囲の整数であり、x1+x2=2~10であり;
BMは、分枝部分であり;
mおよびnは、それぞれ独立して、0または1であり;
x3は、1~4の範囲の整数であり;
D1およびD2は、ポリペプチド、小分子、細胞毒およびオリゴヌクレオチドからなる群から選択される2つの別個のペイロードであり、D1およびD2の少なくとも1つは、ポリペプチドである、多機能性抗体構築物。 - 前記ポリペプチドが、Fab、VHH、scFv、ダイアボディ、ミニボディ、アフィボディ、アフィリン、アフィマー、アトリマー、ファイノマー、Cys-ノット、DARPin、アドネクチン/セントリイン、ノッチン、アンチカリン、FN3、Kunitzドメイン、OBody、二環式ペプチドおよび三環式ペプチドからなる群から選択される、請求項1に記載の多機能性抗体構築物。
- 前記ポリペプチドが、免疫細胞エンゲージャー、チェックポイント阻害剤、および細胞表面受容体の結合剤から選択され、好ましくは、前記ポリペプチドが、免疫細胞結合ポリペプチドまたはチェックポイント阻害ポリペプチドである、請求項1または2に記載の多機能性抗体構築物。
- 前記ポリペプチドが、免疫細胞結合ポリペプチドまたはチェックポイント阻害ポリペプチドであり、好ましくは、
前記免疫細胞結合ポリペプチドは、T細胞上の細胞受容体に特異的であり、好ましくは、T細胞上の前記細胞受容体は、CD3、CD28、CD137(4-1BB)、CD134、CD27、Vγ9Vδ2およびICOSからなる群から選択されるか;または
前記免疫細胞結合ポリペプチドは、NK細胞上の細胞受容体に特異的であり、好ましくは、NK細胞上の前記細胞受容体は、CD16、CD56、CD335、CD336、CD337、CD28、NKG2A、NKG2D、NKp46、KIR、DNAM-1およびCD161からなる群から選択されるか;または
前記免疫細胞結合ポリペプチドは、単球またはマクロファージ上の細胞受容体に特異的であり、好ましくは、前記単球またはマクロファージ上の前記細胞受容体は、CD64であるか;または
前記免疫細胞結合ポリペプチドは、顆粒球上の細胞受容体に特異的であり、好ましくは、前記顆粒球上の前記細胞受容体は、CD89であり;
前記免疫細胞結合ポリペプチドは、IL2またはIL15に特異的であるか;または
前記チェックポイント阻害ポリペプチドは、CTLA-4、PD-1、PD-L1、TIGIT、TIM-3、LAG-3またはVISTAに特異的である、
請求項3に記載の多機能性抗体構築物。 - 前記ポリペプチドが、OKT3、L2K、UCHT1、BMA031、VHH6H4、IL2、IL15、IL15/IL15R複合体、IL15/IL15R融合物、IL2に特異的な抗体およびIL15に特異的な抗体からなる群から選択され、好ましくは、前記ポリペプチドは、OKT3、L2K、IL15/IL15R融合物、IL15、mAb602、Nara1またはTCB2である、請求項1~4のいずれかに記載の多機能性抗体構築物。
- 各リンカーが、直鎖状または分枝状のC1-C200アルキレン基、C2-C200アルケニレン基、C2-C200アルキニレン基、C3-C200シクロアルキレン基、C5-C200シクロアルケニレン基、C8-C200シクロアルキニレン基、C7-C200アルキルアリーレン基、C7-C200アリールアルキレン基、C8-C200アリールアルケニレン基、C9-C200アリールアルキニレン基およびそれらの組み合わせからなる群から個別に選択され、前記アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基およびアリールアルキニレン基は、置換されていてもよく、1つ以上のヘテロ原子によって中断されていてもよく、好ましくは、前記ヘテロ原子は、O、S(O)yおよびNR12からなる群から選択され、ここで、yは、0、1または2であり、R12は、独立して、水素、ハロゲン、C1-C24アルキル基、C6-C24(ヘテロ)アリール基、C7-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC7-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から選択される、請求項1~6のいずれか一項に記載の多機能性抗体構築物。
- L1および/もしくはL2またはL4および/もしくはL5が、腫瘍リソソームまたは腫瘍微小環境において切断可能であり、前記切断可能リンカーが、好ましくは、構造(26):
のペプチドスペーサーを含み、
式中、R17は、アミノ酸側鎖を表し、nは、1~10の範囲の整数であり、好ましくは、前記リンカーは、FAP、カテプシン、グランザイム、カスパーゼ、カリクレイン、プロタンパク質転換酵素サブチリシン、フューリン、エラスターゼ、レグマイン、線維芽細胞活性化タンパク質、組織型プラスミノーゲン活性化因子、ウロキナーゼ、マトリックスメタロプロテアーゼおよびマトリプターゼの群から選択される存在するタンパク質分解酵素によって切断可能であり、かつ/または前記ペプチドスペーサーは、Val-Cit、Val-Ala、Val-Lys、Val-Arg、Val-Gln、AcLys-Val-Cit、AcLys-Val-Ala、Phe-Cit、Phe-Ala、Phe-Lys、Phe-Arg、Phe-Gln、Ala-Lys、Leu-Cit、Leu-Gln、Ile-Cit、Trp-Cit、Ala-Ala-Asn、Ala-Asn、Pro-Leu-Gly、Asn-Pro-Val、Lys-Ser-Gly-Arg-Ser-Asp-Asn-His、Pro-Val-Gly-Leu-Ile-Gly、Val-Lys-Gly、Gly-Gly-Gly、Gly-Gly-Phe-GlyおよびLysから選択される、請求項1~7のいずれか一項に記載の多機能性抗体構築物。 - L4、L5、L6およびL7のそれぞれが、構造-(L21)n-(L22)o-(L23)p-(L24)q-を有し、L21、L22、L23およびL24は、一体となってリンカーL4、L5、L6およびL7を形成するリンカーであり;n、o、pおよびqは、個別に0または1であり、
(a)リンカーL21は、-(W)k1-(A)d1-(B)e1-(A)f1-(B)g1-C(O)-によって表され、式中、
d1=0または1であり;
e1=1~10の範囲の整数であり;
f1=0または1であり;
g1=0~10の範囲の整数であり;
k1=0または1であるが、但し、k1=1の場合、d1=0であり;
Aは、構造(23)に記載のスルファミド基であり、
式中、a1=0または1であり、R13は、水素、C1-C24アルキル基、C3-C24シクロアルキル基、C2-C24(ヘテロ)アリール基、C3-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC3-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から選択され、前記C1-C24アルキル基、C3-C24シクロアルキル基、C2-C24(ヘテロ)アリール基、C3-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC3-C24(ヘテロ)アリールアルキル基は、O、SおよびNR14から選択される1つ以上のヘテロ原子によって、置換されていてもよく、中断されていてもよく、ここで、R14は、独立して、水素およびC1-C4アルキル基からなる群から選択されるか、またはR13は、場合によってはスペーサー部分を介して、Nに接続されたDであり;
Bは、-CH2-CH2-O-または-O-CH2-CH2-部分であるか、または(B)e1は、-(CH2-CH2-O)e3-CH2-CH2-部分であり、ここで、e3は、e1と同じように定義され;
Wは、-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)NH-、-NHC(O)-、-OC(O)NH-、-NHC(O)O-、-C(O)(CH2)mC(O)-、-C(O)(CH2)mC(O)NH-または-(4-Ph)CH2NHC(O)(CH2)mC(O)NH-であり、ここで、mは、0~10の範囲の整数であり;
(b)リンカーL22は、ペプチドスペーサー、好ましくは、ジペプチドであり、ここで、L22は、一般構造(27):
によって表され、式中、R17=CH3またはCH2CH2CH2NHC(O)NH2であり;
(c)リンカーL23は、自己犠牲スペーサー、好ましくは、構造(25)に記載のパラ-アミノベンジルオキシ(PAB)誘導体であり、
式中、
Aは、置換されていてもよい5員または6員の芳香環または芳香族複素環であり;
bは、0または1であり;
R3は、H、R4またはC(O)R4であり、ここで、R4は、C1-C24(ヘテロ)アルキル基、C3-C10(ヘテロ)シクロアルキル基、C2-C10(ヘテロ)アリール基、C3-C10アルキル(ヘテロ)アリール基およびC3-C10(ヘテロ)アリールアルキル基であり、これらは、O、SおよびNR5から選択される1つ以上のヘテロ原子によって、置換されていてもよく、中断されていてもよく、ここで、R5は、独立して、水素およびC1-C4アルキル基からなる群から選択され、
好ましくは、R3は、HまたはC(O)R4であり、ここで、R4=4-メチル-ピペラジンまたはモルホリンであり、最も好ましくは、R3は、Hであり;
(d)リンカーL24は、構造-N-(Cx-アルキレン)-C(O)-に記載のアミノアルカン酸スペーサーであり、ここで、xは、1~10の範囲の整数であるか;または
リンカーL24は、構造-N-(CH2-CH2-O)e6-(CH2)e7-C(O)-に記載のエチレングリコールスペーサーであり、ここで、e6は、1~10の範囲の整数であり、e7は、1~3の範囲の整数である、
請求項1~8のいずれか一項に記載の多機能性抗体構築物。 - リンカーL1、L2およびL3が、コンジュゲーション反応によって入手可能な接続基Zを含み、好ましくは、コンジュゲーション反応によって個別に入手でき、好ましくは、求核反応および付加環化から選択されるコンジュゲーション反応によって入手可能な接続基Zを含み、好ましくは、前記付加環化は、[4+2]付加環化または1,3-双極子付加環化であるか、または前記求核反応は、マイケル付加または求核置換である、請求項1~9のいずれかに記載の多機能性抗体構築物。
- 各接続基が、トリアゾール、シクロヘキセン、シクロヘキサジエン、[2.2.2]-ビシクロオクタジエン、[2.2.2]-ビシクロオクテン、イソオキサゾリン、イソオキサゾリジン、ピラゾリン、ピペラジン、チオエーテル、スクシンイミジル環もしくは開環コハク酸アミド、アミドまたはイミド基を含む、請求項10に記載の多機能性抗体構築物。
- L1およびL2の少なくとも一方、好ましくは両方が、構造(L-B)または(L-C):
*-GlcNAc(Fuc)d-(G)e-Su-Z-(L21)n-(L22)o-(L23)p-(L24)q-**
(L-B)
*-Z-(L21)n-(L22)o-(L23)p-(L24)q-**
(L-C)
を有し、式中、
*とラベルされた結合は、前記抗体Abの2つの別個のアミノ酸に接続され、**とラベルされた結合は、D1またはD2に接続され;
d、n、o、pおよびqは、それぞれ独立して、0または1であり;
eは、0~10の範囲の整数であり;
L21、L22、L23およびL24は、請求項9において定義されたリンカーであり;
Suは、単糖であり;
Gは、単糖部分であり;
GlcNAcは、N-アセチルグルコサミン部分であり;
Fucは、フコース部分であり;
Zは、接続基である、
請求項1~11のいずれかに記載の多機能性抗体構築物。 - L4およびL5が、構造(L-C)
**-(L21)n-(L22)o-(L23)p-(L24)q-***
(L-D)
を有し、式中、
**とラベルされた結合は、BMに接続され、***とラベルされた結合は、D1またはD2に接続され;
n、o、pおよびqは、それぞれ独立して、0または1であり;
L21、L22、L23およびL24は、請求項9において定義されたリンカーであり;
前記リンカーL4およびL5は、連結単位L21、L22、L23およびL24のいずれかの接合点に接続基Zをさらに含んでいてもよい、
請求項1~12のいずれかに記載の多機能性抗体構築物。 - (i)D1が、CD3標的化ポリペプチドであり、D2が、CD28標的化ポリペプチドであるか;
(ii)D1が、IL15またはIL15標的化ポリペプチドであり、D2が、CD16標的化ポリペプチドであるか;
(iii)D1が、IL2またはIL2標的化ポリペプチドであり、D2が、CD16標的化ポリペプチドであるか;
(iv)D1が、NKp46標的化ポリペプチドであり、D2が、CD16標的化ポリペプチドであるか;
(v)D1が、細胞毒であり、D2が、チェックポイント阻害剤であり、好ましくは、CTLA-4、TIGIT、LAG-3、TIM-3、VISTA、PD-1またはPD-L1を標的とするポリペプチドから選択されるか;
(vi)D1が、OX40標的化ポリペプチドであり、D2が、CD137標的化ポリペプチドであるか;
(vii)D1が、PD-L1標的化ポリペプチドであり、D2が、CD137標的化ポリペプチドであるか;
(viii)D1が、細胞毒であり、D2が、IL15またはIL15標的化ポリペプチドであるか;
(ix)D1が、細胞毒であり、D2が、IL2またはIL2標的化ポリペプチドであるか;
(x)D1が、細胞毒であり、D2が、CD16標的化ポリペプチドであるか;または
(xi)D1が、TLR7-アゴニストまたはTRL8-アゴニストであり、D2が、CD16標的化ポリペプチドである、
請求項1~18のいずれか一項に記載の多機能性抗体構築物。 - 前記抗体Abが、腫瘍細胞上の細胞外受容体に特異的であり、好ましくは、前記腫瘍細胞上の前記細胞外受容体は、5T4、ADAM-9、AMHRII、ASCT2、ASLG659、ASPHD1、av-インテグリン、Axl、B7-H3、B7-H4、BAFF-R、BCMA、BMPR1B、ブレビカン、c-KIT、c-Met、C4.4a、CA-IX、カドヘリン-6、CanAg、CD123、CD13、CD133、CD138/シンデカン-1、CD166、CD19、CD20、CD203c、CD205、CD21、CD22、CD228、CD25、CD30、CD324、CD33、CD37、CD38、CD45、CD46、CD48a、CD56、CD70、CD71、CD72、CD74、CD79a、CD79b、CEACAM5、クローディン-18.2、クローディン-6、CLEC12A、CLL-1、Cripto、CRIPTO、CS1、CXCR5、DLK-1、DLL3、DPEP3、E16、EGFR、ENPP3、EpCAM、EphA2、EphB2R、ETBR、FAP、FcRH1、FcRH2、FcRH5、FGFR2、フィブロネクチン、FLT3、葉酸受容体アルファ、Gal-3BP、GD3、GDNF-Ra1、GEDA、GFRA1、Globo H、gpNMB、GPR172A、GPR19、GPR54、グアニルシクラーゼC、HER2、HER3、HLA-DOB、IGF-1R、IL13R、IL20Rα、Lewis Y、LGR5、LIV-1、LRRC15、LY64、Ly6E、Ly6G6D、LY6K、MDP、MFI2、MICA/B、MOSPD2、MPF、MSG783、MUC1、MUC16、NaPi2b、NCA、ネクチン-4、Notch3、P-カドヘリン、P2X5、PD-L1、PMEL17、PRLR、PSCA、PSCA hlg、PSMA、PTK7、RET、RNF43、RON、ROR1、ROR2、Sema 5b、SLITRK6、SSTR2、STEAP1、STEAP2、TAG72、TENB2、TF、TIM-1、TM4SF、TMEFF、TMEM118、TMEM46、トランスフェリン、TROP-2、TrpM4、TWEAKR、レセプターチロシンキナーゼ(RTK)、テネイシンからなる群から選択される、請求項1~19のいずれか一項に記載の多機能性抗体構築物。
- 医薬において使用するための、請求項1~20のいずれか一項に記載の多機能性抗体構築物。
- 癌、ウイルス感染症、細菌感染症、神経疾患、自己免疫疾患、眼疾患、高コレステロール血症およびアミロイドーシスの治療において、好ましくは癌の治療において使用するための、請求項1~20のいずれか一項に記載の多機能性抗体構築物。
- 請求項1~20のいずれか一項に記載の多機能性抗体構築物と、薬学的に許容され得る担体と、を含む医薬組成物。
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