JP2024502157A - 樹状細胞活性化キメラ抗原受容体及びその使用 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、2021年1月8日に出願された中国特許出願第202110022268.5号に対する優先権を主張し、この中国特許出願の全開示は、引用することにより本明細書の一部をなす。
本開示は、一般的に、細胞療法の分野に関する。特に、本開示は、免疫抑制性腫瘍微小環境において、樹状細胞(DC)を活性化するための組成物及び方法に関する。
(a)免疫抑制性腫瘍微小環境を含む非ヒト動物を準備することと、
(b)非ヒト動物に、候補CARを発現する樹状細胞を投与することと、
(c)参照樹状細胞と比較した際の、免疫抑制性腫瘍微小環境への浸潤の改善、生存率の改善、及び免疫細胞の活性化を誘導する際の機能の増進から選択される樹状細胞活性化に関するマーカーを検出することと、
(d)樹状細胞を活性化可能なCARとして候補CARを選択することと、
を含む、方法を提供する。
読者を補助するため、以下の定義を提供する。別に定義されない限り、本明細書に用いられる、当該技術分野の全ての用語、表記法及び他の科学的又は医学的用語又は命名法は、当業者によって一般的に理解される意味を有すると意図される。いくつかの場合、一般的に理解される意味を持つ用語は、明確さのため及び/又は容易な参照のため、本明細書に定義され、本明細書におけるこうした定義の包含は、当該技術分野に一般的に理解されるような用語の定義を越える実質的な相違を示すとは必ずしも見なされないものとする。
本開示は、免疫抑制性腫瘍微小環境又は腫瘍免疫抑制性微小環境(TIME)において、樹状細胞(DC)を活性化可能なキメラ抗原受容体(CAR)をコードするポリヌクレオチド(例えばDNA又はRNA)を提供する。用語「免疫抑制性腫瘍微小環境」及び用語「TIME」は交換可能に使用可能であり、高密度細胞外マトリックスとともに、腫瘍免疫監視及び免疫療法を抑制する可能性がある、例えば腫瘍細胞、腫瘍浸潤性免疫細胞、腫瘍関連線維芽細胞、内皮細胞、並びに多様な走化性及び炎症性又は免疫刺激性サイトカインを有する微小環境を指す(F. R. Balkwill et al., The tumor microenvironment at a glance. J. Cell Sci. 125, 5591-5596 (2012)、M. Binnewies et al., Understanding the tumor immune microenvironment (TIME) for effective therapy. Nat Med. 24, 541-550 (2018)、M. A.-M. Alireza Labani-Motlagh et al., The Tumor Microenvironment: A Milieu Hindering and Obstructing Antitumor Immune Responses. Front. Immunol. 11, 940 (2020)及びL. Hui et al., Tumor microenvironment: Sanctuary of the devil. Cancer Lett. 368, 7-13 (2015))。
いくつかの実施形態において、抗原結合ドメインは、ヒト若しくはヒト化抗体又はその抗体断片を含む。用語「ヒト抗体」は、分子全体がヒト起源であるか、又は抗体若しくは免疫グロブリンのヒト型に同一のアミノ酸配列からなる抗体を指す。用語「ヒト化抗体」は、非ヒト免疫グロブリン由来の配列(例えばCDR配列)を含有する抗体を指す。ヒト若しくはヒト化抗体又はその断片は、多様な方法で、例えば組換え方法論を通じて、又はヒト重鎖及び/又は軽鎖コード遺伝子由来の抗体を発現するように遺伝子修飾されているマウスの関心対象の抗原での免疫を通じて、調製され得る。
本明細書に記載のCARの膜貫通ドメインは、限定されるわけではないが、BAFFR、BLAME(SLAMF8)、CD2、CD3ε、CD4、CD5、CD8、CD9、CD11a(CD18、ITGAL、LFA-l)、CD11b、CD11c、CD11d、CD16、CD19、CD22、CD27、CD28、CD29、CD33、CD37、CD40、CD45、CD49a、CD49d、CD49f、CD64、CD80、CD84、CD86、CD96(Tactile)、CD100(SEMA4D)、CD103、CD134、CD137(4-1BB)、CD150(IPO-3、SLAMF1、SLAM)、CD154、CD160(BY55)、CD162(SELPLG)、CD226(DNAM1)、CD229(Ly9)、CD244(2B4、SLAMF4)、CD278(ICOS)、CEACAM1、CRT AM、GITR、HYEM(LIGHTR)、IA4、IL2Rβ、IL2Rγ、IL7Rα、ITGA1、ITGA4、ITGA6、ITGAD、ITGAE、ITGAM、ITGAX、ITGB1、ITGB2、ITGB7、KIR、LTBR、OX40、NKG2C、NKG2D、NKp30、NKp44、NKp46、NKp80(KLRF1)、PAG/Cbp、PSGL1、SLAMF6(NTB-A、Ly108)、SLAMF7、T細胞受容体のα、β又はζ鎖、TNFR2、VLA1、及びVLA-6を含む任意の膜結合型又は膜貫通タンパク質に由来してもよい。
本明細書に記載のCARの細胞内シグナル伝達ドメインは、CARが置かれている免疫細胞(例えば樹状細胞)の正常エフェクター機能の少なくとも1つの活性化に関与する。免疫細胞の文脈で用いられる用語「エフェクター機能」は、細胞の特殊化機能、例えば食作用活性、細胞溶解活性又はヘルパー活性を指す。或る特定の実施形態において、本明細書に記載のCARの細胞内シグナル伝達ドメインは、免疫抑制性腫瘍微小環境において樹状細胞を活性化する(成熟を含む)ことが可能である。DCの活性化は、多様な刺激に反応して、多くの細胞表面受容体、例えばTLR4(A. Iwasaki et al., Toll-like receptor control of the adaptive immune responses. Nat. Immunol. 5, 987-995 (2004).)、TNFR(L. M. Sedger et al., From mediators of cell death and inflammation to therapeutic giants - past, present and future. Cytokine Growth Factor Rev. 25, 453-472 (2014).)、IFNγR(M. Z. Jianping Pan et al., Interferon-γ is an autocrine mediator for dendritic cell maturation. Immunol. Lett. 94, 141-151 (2004).)、デクチン-1(T. S. Helen S. et al., Differential utilization of CARD9 by Dectin-1 in macrophages and dendritic cells. J Immunol. 182, 1146-1154 (2009))及びFcγR(M. Guilliams et al., The function of Fcγ receptors in dendritic cells and macrophages. Nat. Rev. Immunol. 14, 94-108 (2014).、T. H. Flinsenberg, Fc receptor antigen targeting potentiates cross-presentation by human blood and lymphoid tissue BDCA-3 dendritic cells. Blood 120, 26 (2012).)によって誘導されてもよい。これらのDC活性化受容体は、細胞質ドメイン中に1つ以上の免疫受容体チロシンに基づく活性化モチーフ(ITAM)を有し、これは、活性化シグナルカスケードを誘発して、DCを活性化する。本明細書において使用される場合、用語「細胞質ドメイン」は、細胞質内部にあるタンパク質の全長ドメイン、又はその任意の断片、例えば全長ドメインの少なくとも1%、少なくとも2%、少なくとも3%、少なくとも4%、少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、又は少なくとも95%の長さを有する断片を指す。
いくつかの実施形態において、細胞内シグナル伝達ドメインは、共刺激シグナル伝達ドメインを更に含む。
いくつかの実施形態において、CARは、シグナルペプチドを更に含む。いくつかの実施形態において、シグナルペプチドは、CD8αのシグナルペプチドを含む。いくつかの実施形態において、CD8αのシグナルペプチドは、配列番号5の配列、又は配列番号5の実質的な生物学的活性を保持しながら、配列番号5に対して少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、若しくは99%の同一性を有する配列、又はこれに対する1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、9つ若しくは10の保存的置換を有する配列、又はその任意の機能型を含む。
別の態様において、本開示は、本明細書に記載されるようなCARをコードするポリヌクレオチドを含むベクターを提供する。CARをコードするポリヌクレオチドを、当該技術分野に知られる異なるタイプのベクター、例えばプラスミド、ファージミド、ファージ誘導体、動物ウイルス由来のウイルスベクター、コスミド、トランスポゾン、部位特異的挿入ベクター(例えばCRISPR、ジンクフィンガーヌクレアーゼ、TALEN)、in vitro転写RNA、又は自殺発現ベクター内に挿入してもよい。いくつかの実施形態において、ベクターはDNA又はRNAである。
1つの態様において、本開示は、本明細書に記載されるようなCARを含むか又は発現する操作細胞を提供する。いくつかの実施形態において、操作細胞は、CARをコードするポリヌクレオチド、又はCARポリヌクレオチドを含むベクターを含む。本明細書に提供される操作細胞は、1つ以上(例えば1つ、2つ、3つ、又はそれより多い)CARを含むか又は発現してもよい。1つ以上のCARは同じであっても又は異なってもよい。或る特定の実施形態において、操作細胞は、樹状細胞又はその前駆体若しくは前駆細胞である。用語「樹状細胞又はその前駆体若しくは前駆細胞」は、本明細書において使用される場合、天然又は改変樹状細胞又はその前駆体若しくは前駆細胞を指す。
本明細書に提供される操作細胞(例えばCAR-DC)は、任意の供給源から得られ得る。或る特定の実施形態において、本明細書に提供される操作細胞(例えばCAR-DC)は、被験体、例えばヒト被験体から単離される免疫細胞由来である。いくつかの実施形態において、免疫細胞は、関心対象の被験体、例えば特定の疾患若しくは病態を有すると推測される被験体、特定の疾患若しくは病態に対する素因を有すると推測される被験体、特定の疾患若しくは病態のための治療を受ける予定である、受けている、若しくは受けたことがある被験体、健康な志願者若しくは健康なドナーである被験体から、又は血液バンクから得られる。いくつかの実施形態において、免疫細胞は、免疫療法、例えばCAR-T療法に対して劣った反応性を有する癌被験体から得られる。
別の態様において、本開示は、本明細書に記載されるようなCARを発現する操作細胞を作製する方法を提供する。当該技術分野に知られるCAR-T細胞を生成する多くの手段を、CAR-DCにも適用してもよい。CAR-T細胞を生成する方法は、例えば、Zhang et al., Engineering CAR-T cells, Biomarker Research (2017) 5:22に記載されている。いくつかの実施形態において、方法は、本明細書に提供されるCARをコードするポリヌクレオチドを含むベクターを、このポリヌクレオチドの発現に適した条件下で、出発細胞に導入することを含む。本明細書に提供される方法は、出発細胞(すなわち供給源由来の細胞)を得る工程と、この出発細胞を培養する工程(拡大することを含み、任意選択で成熟させることを含む)と、この細胞を遺伝子修飾する工程とから選択される1つ以上の工程を含んでもよい。出発細胞は、上述のような、樹状細胞又はその前駆体若しくは前駆細胞であってもよい。
別の態様において、本開示はまた、DCを活性化可能なCARを選択する方法も提供する。本明細書に提供される方法は、免疫抑制性腫瘍微小環境を含む非ヒト動物を準備することを含む。或る特定の実施形態において、免疫抑制性腫瘍微小環境は、臨床的に適切である。本明細書において使用される場合、免疫抑制性腫瘍微小環境又はTIMEに関する用語「臨床的に適切」は、以下の特徴の1つ以上で特徴づけられる免疫抑制性腫瘍微小環境を指す。1)低酸素及び酸性、2)負の免疫制御細胞、例えば制御性T細胞、免疫抑制性DC細胞、腫瘍関連マクロファージ及び腫瘍関連線維芽細胞の濃縮、3)免疫抑制性分子、例えばPD-1、TIM3、TIGIT、LAG3、A2AR、BTLA(CD272)、CTLA-4(CD152)、IDO1、IDO2、TDO、NOX2、VISTA、SIGLEC7(CD328)、PVR(CD155)及びSIGLEC9(CD329)、PD-L1、PD-L2、B7-H3(CD276)、B7-H4(VTCN1)、PVR(CD155)、HLAクラスI、シアロ糖タンパク質、CD112、CD113、ガレクチン9、CD24、及びCD47の過剰発現、並びに4)腫瘍浸潤性免疫細胞(例えば免疫エフェクター細胞)の活性抑制可能。
別の態様において、本開示はまた、本明細書に提供されるCARをコードするポリヌクレオチドと医薬的に許容され得る媒体とを含む医薬組成物も提供する。別の態様において、本開示はまた、本明細書に提供されるCARポリペプチドと医薬的に許容され得る媒体とを含む医薬組成物も提供する。別の態様において、本開示はまた、本明細書に提供されるCARをコードするポリヌクレオチドを送達するベクターと医薬的に許容され得る媒体とを含む医薬組成物も提供する。別の態様において、本開示はまた、本明細書に提供される操作細胞(例えばCAR-DC)集団と医薬的に許容され得る媒体とを含む医薬組成物も提供する。本明細書において使用される場合、用語「医薬組成物」は、医薬使用のために配合された組成物を指す。
別の態様において、本開示はまた、本明細書に提供される操作細胞(例えばCAR-DC)を含むキットも提供する。別の態様において、本開示はまた、本明細書に提供されるCAR-DCを生成する際に使用される、本明細書に提供されるポリペプチド、本明細書に提供されるポリヌクレオチド又は発現ベクターを含むキットも提供する。
本開示はまた、本明細書に提供される操作細胞(例えばCAR-DC)の多様な使用も提供する。
1つの態様において、本開示は、患者において疾患又は病的状態を治療する方法であって、患者に本明細書に提供される操作細胞を療法的有効量、投与することを含む、方法を提供する。いくつかの実施形態において、疾患又は病的状態を治療する方法は、被験体から単離された細胞(例えば末梢血細胞、骨髄細胞、胚性幹細胞)から単離されたか若しくはこうした細胞に由来する、又はiPSCに由来する、DCを準備することと、DCを操作して本明細書に提供されるようなCARを発現させることと、操作細胞(例えばCAR-DC)を被験体に戻して注入することとを含む。いくつかの実施形態において、疾患又は病的状態を治療する方法は、DCの前駆体又は前駆細胞(例えば末梢血細胞、骨髄細胞、胚性幹細胞、又はiPSC)を準備することと、この前駆体又は前駆細胞を分化させ、操作して、本明細書に提供されるようなCARを発現させることと、分化し操作された細胞(例えばCAR-DC)を被験体に戻して注入することとを含む。いくつかの実施形態において、疾患又は病的状態を治療する方法は、DCの前駆体又は前駆細胞(例えば末梢血細胞、骨髄細胞、胚性幹細胞、又はiPSC)を準備することと、この前駆体又は前駆細胞を操作して、本明細書に提供されるようなCARを発現させることと、操作された前駆体又は前駆細胞を、本明細書に提供されるようなCARを発現するDCに分化させることと、本明細書に提供されるようなCARを発現するDC(例えばCAR-DC)を被験体に戻して注入することとを含む。
1つの態様において、本開示は、本明細書で提供されるCAR-DC又はその集団を用いて、TIMEを破壊する(例えばTIMEを炎症状態に変換する)方法を提供する。
別の態様において、本開示は、治療が必要な被験体において、癌を治療する際の養子細胞療法の有効性を改善する方法を提供する。方法は、本明細書に提供される医薬組成物を療法的有効量、投与することを含む。或る特定の実施形態において、本明細書に提供される方法は、改変免疫細胞集団を含む医薬組成物を投与することを更に含む。
別の態様において、本開示は、本明細書に提供される操作細胞(例えばCAR-DC)と第二の作用物質とを用いた併用療法を提供する。
DCを特異的に活性化するCARの生成
T細胞及びDCを活性化する際に関与する経路が別個であるため、本発明者らは、CAR-T細胞の典型的なCAR分子は、DCを活性化することができないと推測した(図1A、図8A及び図8B)。したがって、本発明者らは、TLR4、TNFR2、デクチン-1及びFcγR等のDC活性化経路を取り込む新規CARを評価した。本発明者らはまず、サイトカインカクテルで機能性DCに分化可能であるヒト単球性白血病細胞株であるTHP-1細胞由来のDC(C. Berges et al., A cell line model for the differentiation of human dendritic cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 333, 896-907 (2005))において、抗ヒトCD19 scFv並びにTLR4、TNFR2、デクチン-1、及びFcγRの細胞内活性化ドメインからなるCAR構造を試験した。TLR4又はTNFR2テールを持つCARはDCを効率的に活性化することができず、TLR4又はTNFRテールのみによって与えられる刺激シグナルは、DC活性化には十分でないことが示された(図8A及び図8B)。THP-1細胞における、デクチン1及びFcRγの細胞質テールのタンデム融合を含む抗ヒトCD19 scFvからなるCARの発現は、CARDF-DCと示される、DCへの分化に影響を及ぼさなかった(図1B及び図1C)。CARDF-DC及び対照THP-1由来DCをH460-CD19に曝露すると(図1F)、CARDF-DCは、対照DCと比較して、より高いレベルの共刺激分子(CD80及びCD86)を発現した(図1D)。さらに、CARDF-DCは、対照DCよりも、同種T細胞のよりロバストな増殖を誘導可能であった(図1E)。CARDF-DCが、CAR-T細胞の機能を活性化可能であるかどうかを調べるため、第二世代抗CD19 CAR-T細胞を、CARDF-DC又は対照DCの存在下で、H460-CD19腫瘍細胞と培養した(図1A及び図1G)。CAR-T細胞は、対照DCよりもCARDF-DCの存在下で、CD19+ H460腫瘍細胞に対するより高い細胞傷害性を与えた(図1H)。さらに、CARDF-DCは、対照DCと比較した際、CAR-T細胞におけるより高い発現レベルのIFN-γ、及び腫瘍細胞による乳酸デヒドロゲナーゼ(LDH)の放出を誘導した(図1I及び図1J)。これらのデータは、CARDFがDCの活性を増進させて、CAR-T細胞を活性化し得ることを示す。
CARDFは、正常末梢単球由来のDCを活性化し得る
THP-1細胞由来のDCにおけるCARDFの知見を確認するため、本発明者らは、臨床適用のためのDCの一般的な供給源である末梢単球由来の正常DC(Mo-DC)に対するCARDF発現の影響を調べた(J. Constantino et al., Antitumor dendritic cell-based vaccines: lessons from 20 years of clinical trials and future perspectives. Transl. Res. 168, 74-95 (2016))。健康なドナーのPBMCから精製した単球を、CARDFを発現するレンチウイルスで形質導入し、DCに分化するよう誘導した(図2A)。CARDFの発現は、Mo-DCの分化及び成熟に影響を及ぼさず、DCマーカーであるCD11C、CD80、CD86、HLA-ABC、及びHLA-DRは対照DCと匹敵する表面発現レベルであった(図2B)。非操作固形腫瘍に特異的でない抗CD19 scFv CARを用いる代わりに、本発明者らは、固形腫瘍の多くのタイプによって高発現されるEphA2に関する抗体scFvを用いた(図9A)(J. Wykosky et al., The EphA2 receptor and ephrinA1 ligand in solid tumors: function and therapeutic targeting. Mol. Cancer Res. 6, 1795-1806 (2008)、J. M. Brannan et al., EphA2 in the early pathogenesis and progression of non-small cell lung cancer. Cancer Prev. Res. 2, 1039-1049 (2009)、V. M. Youngblood et al., The Ephrin-A1/EPHA2 Signaling Axis Regulates Glutamine Metabolism in HER2-Positive Breast Cancer. Cancer Res. 76, 1825-1836 (2016)、M. Tandon et al., Emerging strategies for EphA2 receptor targeting for cancer therapeutics. Expert Opin Ther Targets. 15, 31-51 (2011))。抗EphA2 CARDF-DCがCD3+ T細胞の拡大を増進し得るかどうかを評価するため、本発明者らは、CFSF標識T細胞を、EphA2を発現するヒト肺癌A549細胞に48時間あらかじめ曝露されているCARDF Mo-DC又は対照Mo-DCと培養した。CARDF-DCは、対照Mo-DCよりもよりロバストにT細胞増殖を誘導可能であった(図2C)。要約すると、本発明者らの知見は、CARDFが、腫瘍抗原の刺激に反応して、Mo-DCを活性化可能であることを示す。
CARDF-DCは、in vitroで、CAR-T細胞の細胞傷害性を活性化する
本発明者らのCARDF-DCが、腫瘍細胞に対するCAR-T細胞の細胞傷害性を増加させるかどうかを調べるため、本発明者らは、Mo-DCと同じドナー由来のT細胞を用いて、抗EphA2 CAR-T細胞を産生した。CAR-T細胞表面上のCAR、並びにA549及びA549-CP腫瘍細胞表面上のEphA2の発現を確認した(図3A及び図3B、図9B)。対照Mo-DC又はCARDF-DCによって活性化されるCAR-T細胞の細胞傷害活性を調べるため、A549及びA549-CP細胞をCAR-T細胞及びDCと共培養した。対照Mo-DCと比較した際、CARDF-DCは、A549細胞に対するCAR-T細胞の細胞傷害活性を有意に増加させた(図3C)。A549-CP細胞に向かうCAR-T細胞の細胞溶解活性は、A549細胞のものと比較した際、減少しており、CPの発現がCAR-T細胞の細胞溶解活性を抑制したことが示された。対照的に、腫瘍細胞におけるCPの発現による、CAR-T細胞の細胞溶解活性の阻害は、CARDF-DCによって逆転された(図3C)。この知見と一致して、対照Mo-DCと比較した際、CARDF-DC及びCAR-T細胞の共培養は、CAR-T細胞によるIL-2、IFN-γ及びTNF-αの発現を増加させ(図3D)、IFN-γ+CAR-T細胞の割合並びに上清中のIFN-γ及びLDHのレベルを増加させた(図3E~図3G)。したがって、CARDF-DCは、CP媒介性免疫抑制に抵抗して、CAR-T細胞の細胞溶解活性を活性化し得る。
CARDF-DCは、in vivoで、TIMEに抵抗し、CAR-T細胞の抗腫瘍活性を活性化する
in vivoでのCAR-T細胞に対するCARDF-DCの影響を調べるため、本発明者らは、それぞれ、A549-WT及びA549-CP腫瘍細胞を、免疫不全NOD/SCID/IL-2γ-/-(NSG)マウスに皮下注射した。腫瘍が触診可能なサイズに到達したら、1×107のCAR-T細胞及び5×106の対照Mo-DC又はCARDF-DCを、それぞれ、静脈内注入した(図4A)。A549腫瘍とは対照的に、A549-CP腫瘍は、臨床的に適切なTIMEを発展させた(図4B)。CAR-T細胞は、TIMEを伴う固形腫瘍において、迅速に疲弊するという以前の知見(J. L.-M. Chen et al., NR4A transcription factors limit CAR T cell function in solid tumours. Nature 567, 530-534 (2019)、J. Li et al., Chimeric antigen receptor T cell (CAR-T) immunotherapy for solid tumors: lessons learned and strategies for moving forward. J Hematol Oncol. 11, 22 (2018))と一致して、CAR-T細胞は、A549-WT腫瘍を有効に除去したが、A549-CP腫瘍を除去しなかった(図4C)。CARDF-DCと組み合わされたCAR-T細胞は、CAR-T細胞治療のみと比較して、A549-CP腫瘍負荷を効率的に減少させた(図4C及び図4D)。さらに、CARDF-DCは、in vivoで、CD8+ T細胞を含むT細胞の生存を有意に延長させ、DC自体の生存及び活性化を促進した(図4E及び図4F)。さらに、本発明者らはまた、CARDF-DC治療群の腫瘍において、CD11C及びCD80のより高い発現レベルを検出し(図4E)、CARDF-DCが、対照Mo-DCよりも、CP過剰発現腫瘍においてよりよく浸潤するか又はより長く生存し得ることが示唆された。要約すると、これらのデータは、CARDF-DCがTIMEに抵抗して、CAR-T細胞の生存及び活性を促進し、固形腫瘍を抑制することを示唆する。
CARDF-DCは、TIMEを逆転させて、CAR-T細胞を活性化し、Hu-マウスにおいて固形腫瘍を除去する
免疫系と腫瘍との間の相互作用は、TIMEの形成において重要な役割を果たす(M. Binnewies et al., Understanding the tumor immune microenvironment (TIME) for effective therapy. Nat Med. 24, 541-550 (2018))。したがって、本発明者らは、以前に記載されるような、免疫系ヒト化マウスにおいて、ヒト固形腫瘍が臨床的に適切なTIMEを発展させるHuSモデルを使用して(Q. Li, et al., Developing Covalent Protein Drugs via Proximity-Enabled Reactive Therapeutics. Cell 182, 85-97.e16 (2020))、固形腫瘍のTIMEを逆転させる際のCARDF-DCの活性を更に評価した(図5A)。CARDF-DC及びCAR-T細胞は、HuSモデルを確立するため、ヒト肺腫瘍を接種するためにも用いた同じドナーの組織で確立されたHu-マウスの骨髄細胞及びT細胞由来であった。したがって、HuSマウスにおけるCARDF-DC、CAR-T細胞及び免疫系は、全て同じドナー由来であった。予期されるように、対照Mo-DCを伴う又は伴わないCAR-T細胞は、HuSマウスにおいて形成される臨床的に適切なTIMEを発展させたヒト肺腫瘍を抑制することができなかった(図5B~図5E)。対照的に、CAR-T細胞をCARDF-DCと組み合わせると、Hu-マウスの同じバッチにおいて形成されるヒト肺腫瘍の成長が効率的に抑制された(図5C~図5E)。したがって、CARDF-DCは、臨床的に適切なTIMEに抵抗して、CAR-T細胞の抗腫瘍活性を活性化可能であった。
CARDF-DCは、異なるTIMEにおいて、均一なT細胞活性化活性を有する
固形腫瘍は、TIMEの背景において不均一性である(V. Thorsson et al., The Immune Landscape of Cancer. Immunity 48, 812-830 e814 (2018))。CARDF-DCが、異なる固形腫瘍のTIMEを炎症促進状態に向けて逆転し得るという仮説を試験するため、本発明者らは、PD-L1をより高いレベルで発現し、同様にHu-マウスにおいて臨床的に適切なTIMEを形成する別のヒト肺癌細胞株H460を使用した(図7A及び図7B)。この腫瘍細胞は、EphA2を発現することが確認された(図7C)。Hu-マウスにおいて、A549によって形成される肺腫瘍における知見と一致して、CARDF-DCは、CAR-T細胞の抗腫瘍活性を効率的にレスキューし、HuS-マウスにおいてH460細胞によって形成される固形腫瘍を抑制した(図7D~図7F)。CARDF-DCは、対照DCよりも、H460腫瘍により効率的に浸潤するか又は距離長く生存可能であった(図7G)。したがって、これらのデータは、CARDF-DCの、固形腫瘍の不均一なTIMEにおいて免疫抑制を逆転させる、均一なT細胞活性化能を明らかにした。
考察
血液悪性疾患を治療するCAR-T細胞療法の傑出した有効性にもかかわらず、固形腫瘍の免疫療法は、免疫抑制性微小環境(TIME)が存在するため、困難なままである。したがって、固形腫瘍の免疫療法の有効性を改善するため、TIMEを破壊する戦略を発展させることが非常に重要である。免疫抑制性TIDCが、細胞傷害性T細胞機能を抑制し、免疫抑制性制御T細胞を促進することによって、TIME確立に重要な役割を果たすことは十分に確立されている(非特許文献4)。この目的を達成するため、本発明者らは、DCが腫瘍細胞を特異的に標的化し、TIMEと遭遇した後も活性化されたままであることを可能にする、CAR-DC戦略を発展させた。この背景において、本発明者らは、T細胞の標準CARが、DCがTIMEと遭遇した後、DCを活性化することができないことを示す。DCを特異的に活性化するため、本発明者らは、多様なDC活性化ドメインで構成される細胞内ドメインを持つDC活性化CAR分子を設計した。多様な組み合わせのDC活性化ドメインを持つCARを試験した後、本発明者らは、デクチン1及びFcRγの細胞質テールのタンデム連結が、TIMEと遭遇した後のDCを有効に活性化し得ることを発見した。
材料及び方法
研究設計
示される結果は、標準偏差を伴う平均値である。独立実験反復の数を、図の凡例に示す。腫瘍増殖のin vivo実験に関しては、治療、並びに測定、例えば腫瘍重量及び体積測定、RT-qPCRアッセイ、フローサイトメトリー分析、又はELISA測定前に、動物を盲検的に治療群に分けた。一次データをデータファイルS1に含める。
NOD/SCID/IL-2γ-/-(NSG)マウスを、Nanjing Model biology Companyより購入した。この研究で使用されるNSGマウス及びHu-マウスを、病原体不含隔離動物施設中で維持した。全ての動物研究は、施設動物飼育及び使用委員会(IACUC)によって認可された。
第二世代CAR抗CD19及び抗EphA2の構造は、CD8リーダー配列及びscFv、CD8膜貫通ドメイン、並びに4-1BB及びCD3ζ細胞内ドメインで構成される。DC CARを生成するため、TLR4(NM_138554.5)、TNFR2(NM_001066.3)並びにデクチン1(NM_197947)、FcRγ(NM_004106)の細胞質内配列を増幅して、第二世代CAR内の4-1BB及びCD3ζ細胞内ドメインの領域を置換した。全ての配列を最適化し、IGene company(広州)によって合成した。次いで、Cas9領域を置換することによって、発現カセットをレンチ-Cas9ベクター(Addgene)内にクローニングした。
PBMC(LDEBIOカタログ番号1501)から単離した単球より、DCを生成した。簡潔には、単球を、抗CD14マイクロビーズ(Miltenyi Biotechカタログ番号130-050-201)及びautoMACS Pro分離装置によって単離した。次いで、単球を、10%FBS(Gibco)、100単位/mlペニシリン及び100μg/mlストレプトマイシン(Thermo Fisher Scientific)を補充したRPMI1640(Corning)中、GM-CSF(100ng/ml、PeproTechカタログ番号300-03)及びIL-4(100ng/ml、PeproTechカタログ番号200-04)と5日間~6日間培養して、未成熟DCを生成した。サイトカインを2日~3日ごとに補充した。DCの成熟をTNF-α(10ng/ml、PeproTechカタログ番号300-01A)及びLPS(3μg/ml、Sigma-Aldrichカタログ番号L4391)で24時間行った。
ヒト単球を、形質導入前に、24ウェル超低付着組織培養プレートに、1ウェル当たり2~5×105細胞/400μL分化培地(100ng/ml GM-CSF及び100ng/ml IL-4を補充したRPMI1640完全培地)の密度で移した。レンチウイルス量をqPCRレンチウイルス力価決定(力価)キット(ABMカタログ番号LV900-iC)によって計算した。力価決定されたレンチウイルスストックを37℃で融解することによって、MOI 100を用いて、形質導入を行った。異なる培地中、適切な体積のウイルス濃縮物と、6μg/ml硫酸プロタミン(Sigma-Aldrichカタログ番号1578612-2)を混合して、1ウェル当たり500μlの総体積を達成した。37℃で12時間のインキュベーション後、更に500μlの分化培地を各ウェルに添加した。形質導入24時間後、培地の大部分を吸引し、細胞をPBSで2回洗浄し、分化培地中で更に培養した。5日目に、Mo-DCを将来の共培養実験のために収集するか、又はTNF-α(10ng/ml、PeproTech)及びLPS(3μg/ml、Sigma-Aldrich)によって24時間~48時間直接成熟させた。
本開示の操作細胞(例えばCAR-DC)はまた、ヒト人工多能性幹細胞(hiPSC)に本明細書に提供されるウイルスベクター(例えばレンチウイルスベクター)をトランスフェクトして、安定なCAR発現細胞株(例えばCARDF-hiPSC)を調製することによって調製してもよい。hiPSCは、不死性に増殖して、多様な組織細胞に分化する能力を有し、疾患の細胞療法において大きな潜在能力を有する。本開示において好ましくは、OP9間質細胞栄養法(Nat Protoc. 2011 March; 6(3): 296-313. doi: 10.1038/nprot. 2010.184)が用いられて、hiPSCのDCへの分化が誘導される。本開示において、hiPSC由来の分化細胞の最初の数は、好ましくは1×106~1.5×106であり、最初の培地は、好ましくは、20%ウシ胎児血清及び1%ペニシリン-ストレプトマイシンを補充したMEM-αの完全培地である。DC細胞分化の全プロセスは、好ましくは、約31日~38日を要する。本開示のCARDF-hiPSCを大規模に分化に誘導して、均一なCARDF-DCを産生し得る。hiPSC由来のCARDF-DCは、上述のように、TIMEを破壊し、TIMEを炎症状態に変換し、DCを免疫抑制性腫瘍微小環境において活性化することを可能にする等の機能を有すると予期される。
初代CD3+ T細胞をPBMCから単離し、製造者の指示に従って、ヒトT細胞活性化キットで活性化した。簡潔には、12ウェルプレートを3μg/mL PBS希釈抗CD3抗体(BDカタログ番号555329、RRID:AB_395736)で4℃にて一晩コーティングし、翌日、プレートをPBSで2回洗浄し、次いで、T細胞を融解し、T細胞培地中、1μg/mL抗CD28抗体(BDカタログ番号555725、RRID:AB_396068)とともにプレート内に移した。活性化は2日間続き、3日目、活性化T細胞を採取し、示すT-CAR構築物を発現するレンチウイルスに感染させた。簡潔には、形質導入前に、T細胞を1ウェル当たり5×105細胞/400μL T細胞培地の密度で24ウェル組織培養プレートに移した。力価決定されたウイルスストックを37℃で融解することによって、MOI 10を用いて、形質導入を行った。適切な体積のウイルス濃縮物を10μg/mlポリブレン(Sigma-Aldrichカタログ番号TR-1003-G)と培地中で混合して、1ウェル当たり500μlの総体積を達成した。37℃で12時間のインキュベーション後、更に500μlの培地を各ウェルに添加した。形質導入24時間後、細胞を収集し、PBSで2回洗浄し、T細胞培地中に再懸濁し、増殖のため、培養を続けた。殺細胞アッセイ日(活性化のほぼ10日後)、細胞を収集し、フローサイトメトリーによって分析し、血球計数器を用いて、細胞カウントを得た。
初代CD3+ T細胞を、製造者の指示に従って、CellTrace-CFSE(Life Technologiesカタログ番号65-0850-84)で染色した。実験において、DCを癌標的(H460-CD19細胞、A549細胞又はA549-CP細胞)と、1:1比、48ウェルプレート中で、48時間プレインキュベートし、次いで、初代T細胞(DC:T細胞=1:5)を共培養に添加した。他の実験において、DC及びT細胞を同時に癌標的とインキュベートした(第0日)。特に示さない限り、標的:DC:T細胞=1:1:5の比を各細胞共培養条件で行った。生存CD3+ T細胞をゲート処理することによって、フローサイトメトリーを用いて増殖を分析した。
1×106のH460-CD19細胞、A549細胞又はA549-CP細胞を、THP-1又は単球由来の1×106の偽DC又はCAR-DCと、6ウェルプレート中、共培養し、共培養の48時間後、細胞を0.25%トリプシン-EDTAで37℃にて5分間処理し、PBSで洗浄し、次いで細胞を直接、蛍光色素コンジュゲート化抗体CD11C、CD80、CD86、HLA-ABC、HLA-DRで染色し、フローサイトメトリーによって分析した。
CD19標的
およそ1×104のH460細胞及び1×104のH460-CD19細胞(標的細胞)を、48ウェルプレートの各ウェル中、200μl RPMI1640完全培地中でプレーティングし、100μl RPMI1640培地中の2×104のWT-DC又はCARDF-DC(刺激細胞)を対応するウェルに添加し、100μl RPMI1640培地中の105のCAR-T細胞(エフェクター細胞)を対応するウェルに添加した。続けて、足りないウェルには、400μlまで培地を補った。24時間インキュベートした後、残った細胞をフローサイトメトリーのために収集し、培養上清を続くアッセイのために収集した。各ウェルに関して、特異的細胞溶解パーセントを以下のように計算した。特異的溶解%=(%CD19(腫瘍細胞のみ)-%CD19(殺細胞群))/CD19%(腫瘍細胞のみ)×100%。
およそ2×104のA549細胞又は2×104のA549-CP細胞(標的細胞)を、48ウェルプレートの各ウェル中、200μl RPMI1640完全培地中でプレーティングし、100μl RPMI1640培地中の2×104の偽DC又はCAR-DC(刺激細胞)を対応するウェルに添加し、100μl RPMI1640培地中の1×105のCAR-T細胞(エフェクター細胞)を対応するウェルに添加した。続けて、足りないウェルには、400μlまで培地を補った。12時間、24時間、インキュベートした後、残った細胞をフローサイトメトリーのために収集し、培養上清を続くアッセイのために収集した。
A549-CP腫瘍細胞のin vitro殺細胞アッセイ後、残った細胞を収集し、製造者の指示に従って、細胞内染色キット(BD Biosciences)を用いて染色した。簡潔には、200μl固定/透過処理緩衝液で、氷上で20分間、細胞を固定及び透過処理し、次いで1×洗浄緩衝液で2回洗浄した。細胞をIFN-γ-BV650、CD3-V450、CD8-PEで、洗浄緩衝液中、4℃で30分間染色し、次いで、1×洗浄緩衝液で2回洗浄した後、フローサイトメトリー分析した。
in vitro殺細胞アッセイからの培養上清を収集し、製造者の指示に従って、ELISAキット(Invitrogenカタログ番号88-7316-76)によってサイトカインIFN-γレベルに関して試験し、CytoTox96(商標)非放射性細胞傷害性アッセイ(Promegaカタログ番号G1780)によってLDHレベルに関して試験した。上清を、予備実験に従って、1:50又は1:100に希釈した。
100μlのPBS中の1.5×106細胞を、6週齢NSGマウスの両脇腹内に皮下注射することによって、A549WT腫瘍モデル及びA549-CP腫瘍モデルを生成した。実験において、T細胞及びDCを、500μlのPBS中、5×106のDC及び1×107のCAR-T細胞の静脈内注射によって、腫瘍曝露5日後及び14日後に注入した。ノギス測定によって腫瘍体積を決定し、以下の式を用いて計算した。体積(mm3)=1/2×D×d2、式中、Dはより長く、dはより短い腫瘍軸である。マウスを安楽死させ、全ての腫瘍を収集し、重量測定し、写真撮影した。加えて、マウス脾臓及び血液を収集し、分離し、単一細胞にプロセシングし、示す蛍光色素コンジュゲート化抗体で染色し、フローサイトメトリーによって分析した。
Hu-マウス生成の詳細な説明は、例えば、Rong Z et al., An Effective Approach to Prevent Immune Rejection of Human ESC-Derived Allografts. Cell Stem Cell 14, 121-130 (2014)に見られ得る。Hu-マウス由来DCの生成は、公表されたプロトコルに従って、骨髄細胞から分化させた。簡潔には、Hu-マウスの大腿骨及び脛骨を、滅菌したハサミで取り除き、70%アルコールに3分間浸し、氷冷PBSで2回洗浄した。次いで、無菌シリンジ(26ゲージ針)を用いて、骨髄細胞をフラッシングした。骨髄細胞を再懸濁し、70μmナイロンメッシュを通過させ、次いで赤血球をLyse緩衝液(BD Bioscience)で溶解した。残った細胞をPBSで2回洗浄し、計数し、20ng/mlヒトGM-CSF及び5ng/mlヒトIL-4を補充した完全RPMI-1640培地で、1×106細胞/mlに調整した。3mlの細胞懸濁物を6ウェルプレートの各ウェル内に移した。プレートを穏やかに回旋させ、培地の半分を吸引し、GM-CSF及びIL-4を含有する新鮮な培地を添加することによって、培地を2日ごとに交換した。培養9日後、細胞を収集し、洗浄し、抗ヒトCD11C抗体で染色し、フローサイトメトリーによって分析した。CARDF形質導入のため、形質導入前に、未成熟BM-DCを、1ウェル当たり50×105~10×105細胞/ml分化培地(20ng/ml GM-CSF及び5ng/ml IL-4を補充したRPMI1640完全培地)の密度で、6ウェル組織培養プレートに移した。力価決定されたレンチウイルスストックを37℃で融解することによって、MOI 100を用いて、形質導入を行った。分化培地中、ウイルス濃縮物を6μg/ml硫酸プロタミンと混合した。37℃で12時間のインキュベーション後、更に1mlの分化培地を各ウェルに添加した。形質導入24時間後、培地の大部分を吸引し、細胞をPBSで2回洗浄し、使用するまで分化培地中で更に培養した。
1匹のHu-マウスに移植した、採取した対の腫瘍を混合し、パッチに切断し、組織消化酵素溶液(20μM HEPES(GIBCO)を含む培地199(GIBCO)中、DNアーゼI(STEM CELLカタログ番号07900)100クニッツ単位、リベラーゼTM TM(Sigmaカタログ番号LIBTM-RO)8ウンシュ単位(8U/mL)及びリベラーゼTM TH(Sigmaカタログ番号LIBTH-RO)(8U/mL))を用いて解離させた。37℃、150rpmで1.5時間振盪した後、10%FBSを含有する5mL RPMI-1640を添加することによって、消化を停止した。続いて、40μm細胞ストレーナー(Corning)を通じて懸濁物を濾過し、得た細胞をフローサイトメトリー分析のため、抗体染色に供した。
全てのフローサイトメトリー分析を、LSR Fortessa(BD Biosciences)によって行った。FlowJoソフトウェア(Tree Star、オハイオ州アシュランド)を用いて、フローデータを分析した。適切なサンプルゲート処理が詳細なデータ図に提供されている。蛍光色素コンジュゲート化抗体APC-CD45、PE-CD11C、FITC-CD80、BV605-CD86、PE-cy7-CD83、APC-HLA-ABC、BV510-HLA-DR、V450-CD3、PE-cy7-CD3、BV421-TIM-3、PE-PD-1、PE-CD8、BV650-IFNγ、BV421-IFNγ、FITC-PDL1、Percp-cy5.5-CD19、PE-cy5-ストレプトアビジン、APC-ストレプトアビジンをBD Sciencesから購入し、FITC-TIM-3をMiltenyi Biotechから購入し、ビオチン-プロテインLをGenScriptから購入し、PE-EphA2をBioLegendから購入した。樹状細胞染色アッセイのため、製造者の指示に従って、FcRブロッキング試薬(Miltenyi Biotech)を用いた。表面マーカー染色のため、細胞を遠沈し、製造者の指示に従って、FACS緩衝液(PBS+1%FBS+2mM EDTA)中、希釈した抗体で、4℃で30分間染色し、次いでPBSで2回洗浄し、フローサイトメトリーによって直ちに分析した。プロテインL染色は、製造者の指示に従って、二次抗体染色を必要とした。抗体の詳細に関しては図10Aを参照されたい。
Prism7(GraphPad Software)によって必要とされるように、ウェルチ補正を伴う独立両側t検定、チューキーの多重比較検定を伴う一元配置ANOVA、二元配置ANOVA後のチューキーの多重比較検定を含む、適切な統計比較を用いて統計分析を行った。データを平均±SDとして示した。P≦0.05を統計的に有意と見なした。
補足材料
材料及び方法:
THP-1細胞形質導入及びDCへの分化
THP-1細胞を、形質導入前に、1ウェル当たり5×105細胞/400μL RPMI1640完全培地の密度で24ウェル組織培養プレートに移した。力価決定されたレンチウイルスストックを37℃で融解することによって、MOI 10を用いて、形質導入を行った。RPMI1640完全培地中、適切な体積のウイルス濃縮物を6μg/ml硫酸プロタミンと混合して、1ウェル当たり500μlの総体積を達成した。37℃で12時間のインキュベーション後、更に500μlの培地を各ウェルに添加した。形質導入24時間後、培養培地の大部分を吸引し、細胞をPBSで2回洗浄し、更に培養した。3日目に、細胞を収集し、フローサイトメトリーによって、形質導入効率を分析した。
レンチウイルスパッケージングのためのプラスミドDNAを、製造者の指示に従って、NucleoBond Xtra Midi EFキット(Takara Bioカタログ番号740420.50)で精製した。僅かに修飾を加えて、Addgeneのレンチウイルス産生プロトコルに従って、PEIパッケージング法を行った。簡潔には、293FTパッケージング細胞を15cmディッシュに1:3の希釈比でプレーティングし、翌日、集密度が90%に到達した際、トランスフェクションの1時間前に培地を交換し、2つのパッケージングプラスミドpsPAX2(Addgeneカタログ番号12260)及びpMD2.G(Addgeneカタログ番号12259)を標的プラスミドとともに、1mg/ml PEIを含むOpti-MEM(Gibco)中、1:3~1:4のDNA:PEI比で希釈した。室温で20分間のインキュベーション後、プラスミド混合物を細胞に穏やかに添加し、トランスフェクション8時間後、培地を完全DMEM培地で置き換えた。製造者の指示に従って、Lenti-X concentrator(Takara Bioカタログ番号631232)を用いて、レンチウイルス粒子をトランスフェクションの48時間~72時間後に採取した。簡潔には、収集した培地を1500gで15分間遠心分離し、上清を1/3体積のLenti-X Concentratorと4℃で一晩インキュベートした。3000rpm、4℃で45分間遠心分離した後、ウイルスペレットを0.6ml~0.8mlの冷PBSに再懸濁し、アリコートし、-80℃で保存した。
先に記載されるように、Trizol試薬(TaKaRa)を用いて、細胞又は腫瘍組織から総RNAを抽出した。製造者の指示に従って、PrimeScript RT試薬キット(TaKaRaカタログ番号RR047A)を用いて、1μg総RNAからcDNAを合成した。製造者の指示に従って、TB Green試薬(TaKaRaカタログ番号RR820A)とともにStepOnePlusリアルタイムPCRシステム(Applied Biosystems)及びRocheシステム(Lifescience)を用いて、リアルタイムPCR分析を行った。プライマー配列を図10Bに示す。
Claims (78)
- キメラ抗原受容体(CAR)をコードするポリヌクレオチドであって、前記CARが(1)細胞外抗原結合ドメイン、(2)膜貫通ドメイン及び(3)細胞内シグナル伝達ドメインを含み、前記CARが免疫抑制性腫瘍微小環境において、樹状細胞を活性化可能である、ポリヌクレオチド。
- 前記免疫抑制性腫瘍微小環境が、1)免疫阻害分子を発現し、及び/又は2)免疫刺激性サイトカインが不十分である、腫瘍及び/又は腫瘍浸潤性免疫細胞を含む、請求項1に記載のポリヌクレオチド。
- 前記免疫阻害分子が、PD-1、TIM-3、TIGIT、LAG-3、A2AR、BTLA(CD272)、CTLA-4(CD152)、IDO1、IDO2、TDO、NOX2、VISTA、SIGLEC7(CD328)、PVR(CD155)及びSIGLEC9(CD329)、PD-L1、PD-L2、B7-H3(CD276)、B7-H4(VTCN1)、PVR(CD155)、HLAクラスI、シアロ糖タンパク質、CD112、CD113、ガレクチン9、CD24、並びにCD47からなる群から選択される、請求項2に記載のポリヌクレオチド。
- 前記免疫阻害分子がCTLA-4及び/又はPD-L1である、請求項3に記載のポリヌクレオチド。
- 前記免疫刺激性サイトカインが、TNF-α、IFN-β、IFN-γ、IL-1、IL-2、IL-4、IL-6、IL-8、IL-10、IL-12、IL-18、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子及びそれらの組み合わせから選択される、請求項2に記載のポリヌクレオチド。
- 前記腫瘍が、CTLA4-Ig及び/又はPD-L1を発現する細胞を含む、請求項2に記載のポリヌクレオチド。
- 前記免疫抑制性腫瘍微小環境が、養子細胞療法の単独療法(例えばCAR-T単独療法)に対して劣った反応性を有する腫瘍を含む、請求項1に記載のポリヌクレオチド。
- 前記細胞内シグナル伝達ドメインが、RIG-1、NLRP10、DEC-205、BDCA-2、CD86、4-1BBL、OX40L、CD40、IFNAR、TLR4、TNFR(例えばTNFR2)、CD80、CD40L、CD367(DCIR)、CD207(Langerin)、CD371(DCAL-2、CLEC12a)、CD204、CD36、IFNγR、デクチン-1及びFcγR、又はその組み合わせからなる群から選択される樹状細胞活性化受容体の細胞質ドメインを含む、請求項1に記載のポリヌクレオチド。
- 前記細胞内シグナル伝達ドメインが、デクチン-1の細胞質ドメイン及びFcγRの細胞質ドメインを含む、請求項1に記載のポリヌクレオチド。
- デクチン-1の前記細胞質ドメイン及びFcγRの前記細胞質ドメインがタンデムに連結されている、請求項9に記載のポリヌクレオチド。
- デクチン-1の前記細胞質ドメインが、配列番号1に示されるアミノ酸配列、又はその任意の機能型を含む、請求項10に記載のポリヌクレオチド。
- FcγRの前記細胞質ドメインが、配列番号2に示されるアミノ酸配列、又はその任意の機能型を含む、請求項10又は11に記載のポリヌクレオチド。
- 前記細胞内シグナル伝達ドメインが、配列番号3に示されるアミノ酸配列、又はその任意の機能型を含む、請求項1~12のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- 前記細胞内シグナル伝達ドメインが、配列番号4に示される核酸配列によってコードされるアミノ酸配列、又はその任意の機能型を含む、請求項1~13のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- 前記細胞外抗原結合ドメインが、一本鎖可変断片(scFv)を含む、請求項1~14のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- 前記scFvが、腫瘍表面マーカー(例えば固形腫瘍表面マーカー)に特異的である、請求項15に記載のポリヌクレオチド。
- 前記腫瘍表面マーカーが、EphA2、CD19、CD70、CD133、CD147、CD171、DLL3、EGFRvIII、メソテリン、ガングリオシドGD2、FAP(線維芽細胞活性化タンパク質)、FBP(葉酸結合タンパク質)、ルイスY、クローディン18.2、IL13Rα2、HER2、MDC1、PMSA(前立腺膜特異的抗原)、ROR1、B7-H3、CAIX、CD133、CD171、CEA、GPC3、MUC1、NKG2Dからなる群から選択される、請求項16に記載のポリヌクレオチド。
- 前記CARがシグナルペプチドを更に含む、請求項1~17のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- 前記シグナルペプチドがCD8αのシグナルペプチドを含む、請求項18に記載のポリヌクレオチド。
- CD8αの前記シグナルペプチドが、配列番号5に示される配列、又はその任意の機能型を含む、請求項19に記載のポリヌクレオチド。
- 前記膜貫通ドメインがCD8αの膜貫通ドメインを含む、請求項1~20のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- CD8αの前記膜貫通ドメインが、配列番号6に示される配列、又はその任意の機能型を含む、請求項21に記載のポリヌクレオチド。
- 前記細胞外抗原結合ドメインが、ヒンジ領域によって、膜貫通ドメインに連結される、請求項1~22のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- 前記ヒンジ領域がCD8αのヒンジ領域を含む、請求項23に記載のポリヌクレオチド。
- CD8αの前記ヒンジ領域が、配列番号7に示される配列、又はその任意の機能型を含む、請求項24に記載のポリヌクレオチド。
- DNA又はRNAである、請求項1~25のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- 請求項1~26のいずれか一項に記載のポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチド。
- 前記CARをコードする前記ポリヌクレオチドが、前記CARの発現のための少なくとも1つの制御ポリヌクレオチド要素に動作可能に連結される、請求項1~26のいずれか一項に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
- 前記ベクターが、プラスミドベクター、ウイルスベクター、トランスポゾン、部位特異的挿入ベクター、又は自殺発現ベクターである、請求項28に記載のベクター。
- 前記ウイルスベクターが、レンチウイルスベクター、レトロウイルスベクター、又はAAVベクターである、請求項29に記載のベクター。
- 前記ウイルスベクターがレンチウイルスベクターである、請求項30に記載のベクター。
- 請求項27に記載のポリペプチドを含む操作細胞。
- 前記操作細胞が、樹状細胞又はその前駆体若しくは前駆細胞である、請求項32に記載の操作細胞。
- 前記樹状細胞又はその前駆体若しくは前駆細胞が、末梢血細胞、骨髄細胞、胚性幹細胞、又は人工多能性幹細胞に由来する、請求項32又は33に記載の操作細胞。
- 請求項32~34のいずれか一項に記載の操作細胞を産生する方法であって、請求項28~31のいずれか一項に記載のベクターを、請求項1~26のいずれか一項に記載のポリヌクレオチドの発現に適した条件下で、出発細胞に導入することを含む、方法。
- 前記出発細胞が樹状細胞又はその前駆体若しくは前駆細胞である、請求項35に記載の方法。
- 前記樹状細胞又はその前駆体若しくは前駆細胞が、末梢血細胞、骨髄細胞、胚性幹細胞、又は人工多能性幹細胞に由来する、請求項36に記載の方法。
- 請求項35~37のいずれか一項に記載の方法によって、ex vivoで産生される細胞の集団。
- 細胞の前記集団の少なくとも70%が、請求項27に記載のポリペプチドを検出可能なレベルで発現する、請求項38に記載の細胞の集団。
- (i)請求項1~26のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド、又は請求項27に記載のポリペプチド、又は請求項28~31のいずれか一項に記載のベクター、又は請求項32~34のいずれか一項に記載の操作細胞の集団、又は請求項38若しくは39に記載の細胞の集団と、(ii)医薬的に許容され得る媒体とを含む医薬組成物。
- 治療の必要がある被験体において、癌を治療する際の養子細胞療法の有効性を改善する方法であって、請求項40に記載の医薬組成物を療法的有効量、投与することを含む、方法。
- 前記養子細胞療法が、改変免疫細胞の養子移入を含む、請求項41に記載の方法。
- 前記医薬組成物が、改変免疫細胞の集団を更に含む、請求項41又は42に記載の方法。
- 前記方法が、改変免疫細胞の集団を含む医薬組成物を投与することを更に含む、請求項41又は42に記載の方法。
- 前記改変免疫細胞が、細胞表面上で合成受容体(例えばCAR又はTCR)の発現を有する、請求項42~44のいずれか一項に記載の方法。
- 前記免疫細胞が、T細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、NKT細胞、B細胞、マクロファージ細胞、好酸球又は好中球である、請求項42~45のいずれか一項に記載の方法。
- 前記免疫細胞が、CD4+ T細胞、CD8+ T細胞、細胞傷害性T細胞、ターミナルエフェクターT細胞、メモリーT細胞、ナイーブT細胞、ナチュラルキラーT細胞、γδ T細胞、サイトカイン誘導型キラー(CIK)T細胞、及び腫瘍浸潤性リンパ球からなる群から選択されるT細胞である、請求項46に記載の方法。
- 前記免疫細胞が自己又は同種である、請求項42~47のいずれか一項に記載の方法。
- 前記癌が、副腎癌、骨癌、脳癌、乳癌、結腸直腸癌、食道癌、眼癌、胃癌、頭頸部癌、腎臓癌、肝臓癌、肺癌、非小細胞肺癌、細気管支肺胞細胞肺癌、中皮腫、頭頸部癌、扁平上皮癌、黒色腫、口腔癌、卵巣癌、子宮頸癌、陰茎癌、前立腺癌、膵臓癌、皮膚癌、肉腫、精巣癌、甲状腺癌、子宮癌、膣癌からなる群から選択される固形癌である、請求項41~48のいずれか一項に記載の方法。
- 前記癌が、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、節外性NK/T細胞リンパ腫、HHV8関連原発性滲出性リンパ腫、形質芽球性リンパ腫、原発性CNSリンパ腫、原発性縦隔大細胞型B細胞リンパ腫、T細胞/組織球リッチB細胞リンパ腫、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、多発性骨髄腫(MM)からなる群から選択される血液学的悪性疾患である、請求項41~48のいずれか一項に記載の方法。
- 免疫抑制性微小環境において、免疫細胞の増殖を誘導し、免疫細胞の生存を延長させ、及び/又は免疫細胞からの免疫刺激性サイトカインの発現及び/又は分泌を増加させる方法であって、前記免疫抑制性微小環境を、請求項32~34のいずれか一項に記載の操作細胞と接触させることを含む、方法。
- 前記免疫細胞が、T細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、NKT細胞、B細胞、マクロファージ細胞、好酸球又は好中球である、請求項51に記載の方法。
- 前記免疫細胞が、CD4+ T細胞、CD8+ T細胞、細胞傷害性T細胞、ターミナルエフェクターT細胞、メモリーT細胞、ナイーブT細胞、ナチュラルキラーT細胞、γδ T細胞、サイトカイン誘導型キラー(CIK)T細胞、及び腫瘍浸潤性リンパ球からなる群から選択されるT細胞である、請求項52に記載の方法。
- 前記免疫細胞が自己又は同種である、請求項51~53のいずれか一項に記載の方法。
- 前記免疫抑制性微小環境が、免疫抑制性腫瘍微小環境である、請求項51~54のいずれか一項に記載の方法。
- 前記免疫抑制性腫瘍微小環境が、免疫阻害分子を発現する腫瘍及び/又は腫瘍浸潤性免疫細胞を含む、請求項55に記載の方法。
- 前記免疫阻害分子が、PD-1、TIM-3、TIGIT、LAG-3、A2AR、BTLA(CD272)、CTLA-4(CD152)、IDO1、IDO2、TDO、NOX2、VISTA、SIGLEC7(CD328)、PVR(CD155)及びSIGLEC9(CD329)、PD-L1、PD-L2、B7-H3(CD276)、B7-H4(VTCN1)、PVR(CD155)、シアロ糖タンパク質、CD112、CD113、ガレクチン9、CD24、並びにCD47からなる群から選択される、請求項56に記載の方法。
- 前記免疫阻害分子がCTLA-4及び/又はPD-L1である、請求項57に記載の方法。
- 前記腫瘍が、CTLA4-Ig及び/又はPD-L1を発現する細胞を含む、請求項56に記載の方法。
- 前記免疫刺激性サイトカインが、TNF-α、IFN-β、IFN-γ、IL-1、IL-2、IL-4、IL-6、IL-8、IL-10、IL-12、IL-18及び顆粒球マクロファージコロニー刺激因子の1つ以上である、請求項51~59のいずれか一項に記載の方法。
- 治療が必要な被験体において、疾患又は病的状態を治療する方法であって、請求項40に記載の医薬組成物を療法的有効量、投与することを含む、方法。
- 第二の作用物質を投与することを更に含む、請求項61に記載の方法。
- 前記第二の療法が、改変免疫細胞の集団である、請求項62に記載の方法。
- 前記第二の療法がCAR-T療法である、請求項63に記載の方法。
- 前記疾患が癌を含む、請求項61に記載の方法。
- 樹状細胞を活性化可能なCARを選択する方法であって、
(a)免疫抑制性腫瘍微小環境を含む非ヒト動物を準備することと、
(b)前記非ヒト動物に、候補CARを発現する樹状細胞を投与することと、
(c)参照樹状細胞と比較した際の、前記免疫抑制性腫瘍微小環境への浸潤の改善、生存率の改善、及び免疫細胞の活性化を誘導する際の機能の増進から選択される樹状細胞活性化に関するマーカーを検出することと、
(d)樹状細胞を活性化可能なCARとして前記候補CARを選択することと、
を含む、方法。 - 前記免疫抑制性腫瘍微小環境が臨床的に適切(clinically relevant)である、請求項66に記載の方法。
- 前記非ヒト動物が、ヒト胎性脾臓及び自己ヒト造血幹細胞(例えばヒトCD34+造血幹細胞)を含む、請求項66又は67に記載の方法。
- 前記免疫抑制性腫瘍微小環境が、免疫阻害分子を発現する腫瘍及び/又は腫瘍浸潤性免疫細胞を含む、請求項66に記載の方法。
- 前記免疫阻害分子が、PD-1、TIM-3、TIGIT、LAG-3、A2AR、BTLA(CD272)、CTLA-4(CD152)、IDO1、IDO2、TDO、NOX2、VISTA、SIGLEC7(CD328)、PVR(CD155)及びSIGLEC9(CD329)、PD-L1、PD-L2、B7-H3(CD276)、B7-H4(VTCN1)、PVR(CD155)、HLAクラスI、シアロ糖タンパク質、CD112、CD113、ガレクチン9、CD24、並びにCD47からなる群から選択される、請求項69に記載の方法。
- 前記免疫阻害分子がCTLA-4及び/又はPD-L1である、請求項70に記載の方法。
- 前記腫瘍が、CTLA4-Ig及び/又はPD-L1を発現する細胞を含む、請求項69に記載の方法。
- 前記免疫細胞が、T細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、NKT細胞、B細胞、マクロファージ細胞、好酸球又は好中球である、請求項66~72のいずれか一項に記載の方法。
- 前記免疫細胞が、CD4+ T細胞、CD8+ T細胞、細胞傷害性T細胞、ターミナルエフェクターT細胞、メモリーT細胞、ナイーブT細胞、ナチュラルキラーT細胞、γδ T細胞、サイトカイン誘導型キラー(CIK)T細胞、及び腫瘍浸潤性リンパ球からなる群から選択されるT細胞である、請求項73に記載の方法。
- 前記免疫細胞が自己又は同種である、請求項66~74のいずれか一項に記載の方法。
- 前記免疫細胞が、改変免疫細胞(例えばCAR-T細胞)又は天然免疫細胞である、請求項66~75のいずれか一項に記載の方法。
- 前記改変免疫細胞(例えばCAR-T細胞)が、前記候補CARを発現する前記樹状細胞と組み合わせて投与される、請求項76に記載の方法。
- 前記非ヒト動物が齧歯類、例えばラット又はマウスである、請求項66又は77に記載の方法。
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