JP2024096805A - a-syn/IGF1Rに対する二重特異抗体およびその用途 - Google Patents
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- C07K2317/56—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
- C07K2317/565—Complementarity determining region [CDR]
-
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- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
- C07K2317/56—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
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- C07K2317/62—Immunoglobulins specific features characterized by non-natural combinations of immunoglobulin fragments comprising only variable region components
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Abstract
Description
本発明の一例は、アルファ-シヌクレイン(a-Syn)に対する抗原結合部位およびIGF1Rに対する抗原結合部位を含むタンパク質複合体および前記タンパク質複合体から得られるアルファ-シヌクレイン(a-Syn)およびIGF1Rに対する二重特異抗体(以下、抗a-Syn/抗IGF1R二重特異抗体)に関するものである。よって、本発明による二重特異抗体は、アルファ-シヌクレインとIGF1Rを全て抗原として認識および結合することができる。
本発明による抗-IGF1R抗体または抗原結合断片は、IGF1R(Insulin-like Growth Factor 1 Receptor)を特異的に認識する抗体またはその抗原結合断片である。
本発明による抗IGF1R抗体または抗原結合断片は、解離定数(dissociation constant、KD)が≦10-6Mの親和度で結合する時、抗原のようなその標的に“特異的に結合する”と言われる。抗体は、KDが≦1x10-8Mである時、あるいはEC50(effective concentration 50)が2nM以下である時、高い親和性で標的に特異的に結合する。一実施形態で、抗体またはその抗原結合断片はKD≦1×10-8であって、IGF1RまたはヒトIGF1Rに結合することができる。本発明に開示された抗体は、IGF1R、特に、ヒトIGF1R、マウスIGF1R、ラットIGF1R、およびサルIGF1Rに結合することが確認された。
本明細書に記載された“抗原結合断片”は、抗原に対する特異的結合能を有する抗体の一部またはこれを含むポリペプチドを意味する。例えば、抗原結合断片は、抗原(例えば、エピトープ)と相互作用して、抗体に抗原に対する特異性および/または親和性を付与するアミノ酸残基を含む抗体の一部またはこれを含むポリペプチドであってもよい。このような抗原結合断片は、典型的に、一つ以上の“相補性決定部位”(Complementary Determining Region、or CDR)を含むことができ、ここに加えて、一つ以上の“フレームワーク”領域を含むことができる。CDRは抗体の抗原結合の特異性と親和性に寄与するアミノ酸配列であり、フレームワーク領域はこれらCDRの適切な形態(conformation)を維持するのに寄与するアミノ酸配列部位であって、抗原結合領域と抗原の間に結合を促進することができる。
本発明において、ポリペプチドの“誘導体”は、挿入、欠失、付加または置換変異体とは異なる、他の化学的モイエティとのコンジュゲーションを通じて化学的に変形されたポリペプチドを意味する。
本発明による抗-IGF1R抗体または抗原結合断片は、IGF1R(Insulin-like Growth Factor 1 Receptor)を特異的に認識し、IGF1R、特に、ヒトIGF1R、マウスIGF1R、ラットIGF1R、およびサルIGF1Rに認識および結合し、IGF1RのリガンドであるIGF-1、IGF-2、および/またはインスリンがIGF1Rに結合することを妨害せず、IGF1Rを通じた信号伝達を阻害せず、トランスサイトーシスに使用できて、血液脳関門通過能を有し、ADCC(Antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity)を有しないので、動物に反復投与した場合にも脳のIGF1R水準を減少させなくて、毒性を有しない。
(i)H-CDR1、H-CDR2およびH-CDR3からなる群より選択された一つ以上の重鎖相補性決定領域、または前記一つ以上の重鎖相補性決定領域を含む重鎖可変領域;
(ii)L-CDR1、L-CDR2およびL-CDR3からなる群より選択された一つ以上の軽鎖相補性決定領域、または前記一つ以上の軽鎖相補性決定領域を含む軽鎖可変領域;
前記一つ以上の重鎖相補性決定領域および前記一つ以上の軽鎖相補性決定領域の組み合わせ;または
前記重鎖可変領域および前記軽鎖可変領域の組み合わせ
を含むものであってもよい。
配列番号10~配列番号49のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖CDR2(H-CDR2)、
配列番号50~配列番号80のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖CDR3(H-CDR3);
配列番号96~配列番号113のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖CDR1(L-CDR1)、
配列番号114~配列番号132のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖CDR2(L-CDR2)、および
配列番号133~配列番号161のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖CDR3(L-CDR3)からなる群より選択された少なくとも一つを含む、抗IGF1R抗体またはその抗原結合断片に関するものである。
配列番号96~配列番号113のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖CDR1(L-CDR1)、配列番号114~配列番号132のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖CDR2(L-CDR2)、および配列番号133~配列番号161のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖CDR3(L-CDR3)を含む軽鎖可変領域を含むことができる。
配列番号81~84のアミノ酸配列のうちの一つを含む、H-CDR1のN-末端側に位置する重鎖可変領域フレームワーク1(H-FR1)、
配列番号85~86のアミノ酸配列のうちの一つを含む、H-CDR1とH-CDR2の間に位置する重鎖可変領域フレームワーク(H-FR2)、
配列番号87~91のアミノ酸配列のうちの一つを含む、H-CDR2とH-CDR3の間に位置する重鎖可変領域フレームワーク(H-FR3)、および
配列番号92~95のアミノ酸配列のうちの一つを含む、H-CDR3のC末端に位置する重鎖可変領域フレームワーク(H-FR4)を含むものであってもよい。
本発明による抗体またはその抗原結合断片の軽鎖可変領域は、
配列番号162~164のアミノ酸配列のうちの一つを含む、L-CDR1のN-末端側に位置する軽鎖可変領域フレームワーク1(L-FR1)、
配列番号165のアミノ酸配列を含む、L-CDR1とL-CDR2の間に位置する軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR2)、
配列番号166~168のアミノ酸配列のうちの一つを含む、L-CDR2とL-CDR3の間に位置する軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR3)、および
配列番号169~171のアミノ酸配列のうちの一つを含む、L-CDR3のC末端に位置する軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR4)を含むものであってもよい。
配列番号172:GGGGSGGGGSGGGGSGGGGS
配列番号173:GGGGSGGGGSGGGGS
このような単鎖Fv(scFv)は、2個の可変ドメインポリペプチド(VLおよびVH)をコーディングするDNAの間にペプチドリンカーをコーディングするDNAを融合することによって製造できる。製造されたポリペプチドは、折りたたみによって抗原-結合単量体を形成するか、または2個の可変ドメインの間に柔軟性リンカーの長さによって、多量体(例えば、二量体、三量体または四量体)を形成することができる。異なるVLとVHを含むポリペプチドを組み合せることによって、異なるエピトープに結合する多量体性scFvを形成することができる。
本明細書で提供される抗体が抗原として認識するアルファ-シヌクレインは、ヒトアルファ-シヌクレイン、サルアルファ-シヌクレイン(例えば、Rhesusアルファ-シヌクレイン)、マウスアルファ-シヌクレイン、ラットアルファ-シヌクレインなどの哺乳動物アルファ-シヌクレインから選択されたものであってもよく、例えば、ヒトアルファ-シヌクレインはアルファ-シヌクレイン(NCBI ID:NP_000336)であってもよいが、これに制限されるわけではない。本明細書に異なって言及されない限り、アルファ-シヌクレインはヒトアルファ-シヌクレインを指して称するものであり、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合断片はヒトアルファ-シヌクレインだけでなく、サル(例えば、Rhesus)、ラット、および/またはマウスアルファ-シヌクレインにも特異的な結合能を有するものであってもよい。
配列番号1および配列番号6のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖CDR1(H-CDR1)、
配列番号2~4および配列番号7~8のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖CDR2(H-CDR2)、
配列番号5および配列番号9のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖CDR3(H-CDR3)、
配列番号10および配列番号13のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖CDR1(L-CDR1)、
配列番号11および配列番号14のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖CDR2(L-CDR2)、および
配列番号12および配列番号15のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖CDR3(L-CDR3)。
[表1]重鎖CDR1~CDR3のアミノ酸配列
[表2]軽鎖CDR1~CDR3のアミノ酸配列
一具体例において、前記抗-アルファ-シヌクレイン抗体またはその抗原結合断片は、配列番号1のアミノ酸配列を含む重鎖CDR1(H-CDR1)、配列番号2~4のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖CDR2(H-CDR2)、および配列番号5のアミノ酸配列を含む重鎖CDR3(H-CDR3)を含む重鎖可変領域;および配列番号10のアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1(L-CDR1)、配列番号11のアミノ酸配列を含む軽鎖CDR2(L-CDR2)、および配列番号12のアミノ酸配列を含む軽鎖CDR3(L-CDR3)を含む軽鎖可変領域を含むことができる。
H-CDR1のN-末端側に位置する重鎖可変領域フレームワーク(H-FR1)であって、配列番号16~17および配列番号35~40のアミノ酸配列のうちの一つを含むポリペプチド断片を含み、
H-CDR1とH-CDR2の間に位置する重鎖可変領域フレームワーク(H-FR2)であって、配列番号18~19および配列番号41~44のアミノ酸配列のうちの一つを含むポリペプチド断片を含み、
H-CDR2とH-CDR3の間に位置する重鎖可変領域フレームワーク(H-FR3)であって、配列番号20~31および配列番号45~50のアミノ酸配列のうちの一つを含むポリペプチド断片を含み、
H-CDR3のC末端に位置する重鎖可変領域フレームワーク(H-FR4)であって、配列番号32~34および配列番号51~52のアミノ酸配列のうちの一つを含むポリペプチド断片を含み、
L-CDR1のN-末端側に位置する軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR1)であって、配列番号53~58および配列番号71~77のアミノ酸配列のうちの一つを含むポリペプチド断片を含み、
L-CDR1とL-CDR2の間に位置する軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR2)であって、配列番号59~61および配列番号78~81のアミノ酸配列のうちの一つを含むポリペプチド断片を含み、
L-CDR2とL-CDR3の間に位置する軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR3)であって、配列番号62~67および配列番号82~88のアミノ酸配列のうちの一つを含むポリペプチド断片を含み、および/または
L-CDR3のC末端に位置する軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR4)であって、配列番号68~70および配列番号89のアミノ酸配列のうちの一つを含むポリペプチド断片を含むものであってもよい。
[表4]重鎖フレームワーク3~4のアミノ酸配列
[表5]軽鎖フレームワーク1~2のアミノ酸配列
[表6]軽鎖フレームワーク3~4のアミノ酸配列
他の具体例において、前記抗-アルファ-シヌクレイン抗体またはその抗原結合断片は、配列番号1および配列番号6のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖CDR1(H-CDR1)、配列番号2~4および配列番号7~8のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖CDR2(H-CDR2)、配列番号5および配列番号9のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖CDR3(H-CDR3)を含む重鎖可変領域を含むことができ、
前記重鎖可変領域は、配列番号16~17および配列番号35~40のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖可変領域フレームワーク(H-FR1)、配列番号20~31および配列番号45~50のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖可変領域フレームワーク(H-FR2)、配列番号20~31および配列番号45~50のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖可変領域フレームワーク(H-FR3)、および配列番号32~34および配列番号51~52のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖可変領域フレームワーク(H-FR4)を含むことができる。さらに詳しくは、前記重鎖可変領域は、配列番号17のアミノ酸配列を含むH-FR1、配列番号18のアミノ酸配列を含むH-FR2、配列番号29~31のアミノ酸配列のうちの一つを含むH-FR3、および配列番号34のアミノ酸配列を含むH-FR4を含むことができる。
前記軽鎖可変領域は、追加的に、配列番号53~58および配列番号71~77のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR1)、配列番号59~61および配列番号78~81のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR2)、配列番号62~67および配列番号82~88のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR3)、および配列番号68~70および配列番号89のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR4)を含むことができる。さらに詳しくは、前記軽鎖可変領域は、配列番号58のアミノ酸配列を含むL-FR1、配列番号59のアミノ酸配列を含むL-FR2、配列番号67のアミノ酸配列を含むL-FR3、および配列番号34のアミノ酸を含むL-FR4を含むことができる。
前記重鎖可変領域は、配列番号16~17のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖可変領域フレームワーク(H-FR1)、配列番号18~19のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖可変領域フレームワーク(H-FR2)、配列番号20~31のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖可変領域フレームワーク(H-FR3)、および配列番号32~34のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖可変領域フレームワーク(H-FR4)を含み、
前記軽鎖可変領域は、配列番号53~58のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR1)、配列番号59~61のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR2)、配列番号62~67のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR3)、および配列番号68~70のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR4)を含むことができる。
前記重鎖可変領域は、配列番号35~40のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖可変領域フレームワーク(H-FR1)、配列番号41~44のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖可変領域フレームワーク(H-FR2)、配列番号45~50のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖可変領域フレームワーク(H-FR3)、および配列番号51~53のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖可変領域フレームワーク(H-FR4)を含み、
前記軽鎖可変領域は、配列番号71~77のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR1)、配列番号78~81のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR2)、配列番号82~88のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR3)、および配列番号89のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR4)を含むことができる。
本明細書に開示された重鎖可変領域および軽鎖可変領域は、完全な抗体の重鎖および軽鎖を形成するために、それぞれ重鎖不変領域および軽鎖不変領域に結合できる。このように生成されたそれぞれの重鎖および軽鎖は適切に組み合わせられて重鎖-軽鎖組み合わせを成すことができ、前記重鎖-軽鎖組み合わせは多量体を形成(例えば、IgGタイプ抗体の場合、二量体を形成)して完全な抗体構造を成すことができる。
1-1:免疫化およびハイブリドーマ生産
抗原としては全長(140残基)またはC-末端21個の残基が切断されたアルファ-シヌクレイン単量体を37度のthermomixer Cに入れて、14日間1050rpmで振って凝集化させ、ソニケーションして使用した。前記製造された1mg/ml濃度の140個および119個残基のアルファ-シヌクレインフィブリルそれぞれをアジュバントと1:1(vol:vol)で混合してよく混合した。
MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAGKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVATVAEKTKEQVTNVGGAVVTGVTAVAQKTVEGAGSIAAATGFVKKDQLGKNEEGAPQEGILEDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA
その次に、前記準備した混合物200μLを5~7週齢BALB/c雌マウスの皮下に注射し、2週後に、同様な方法で製造した混合物200μLを追加的に皮下注射してブースティングさせた。ブースティング1週後に血液を採取して、投与抗原を付けたELISA方法を使用して免疫化滴定(immunization titeration)を行った。その次に、3次ブースティングは、抗原のみを皮下注射した。
融合2週後に、細胞培養培地を用いてマウスに投与した抗原を付けたELISA方法を使用して抗体を生産するマウスB細胞との融合を確認した。その次に、ハイブリドーマを用いて単細胞クローニングを行って単クローン抗体を生産するハイブリドーマを総16個選別した。全長(140残基)アルファ-シヌクレイン凝集体を抗原として用いて9B11(それぞれ、IgG1 kappa)クローンを得て、C-末端21個残基が切断されたアルファ-シヌクレイン凝集体を抗原として用いて3A9および11F11(それぞれ、IgG2b kappa、IgG2b kappa)のクローンを得た。
可変領域およびCDR配列は、Ahn et al、Mol.Cells 2004、18(2):237-241論文を参照して決定した。ハイブリドーマを培養した後、遠心分離して細胞のみを分離した。分離されたハイブリドーマにトリゾールを入れてRNAを分離し、これを鋳型にしてcDNAを合成した後、塩基配列分析によって可変領域およびCDR配列を確認した。したがって、抗体3A9、9B11、11F11を得た。
2-1:抗体クローニングおよび発現
ヒト化を進行後に確保した重鎖可変領域および軽鎖可変領域の抗体nucleotide配列を用いて、短い断片のnucleotideであるgblock(m.biotech)を合成し、これを用いて動物細胞培養用ベクター(pcDNA3.4)にクローニングした。可変領域前後に重畳したnucleotideを約20bp程度含んでgblockを合成し、pcDNA3.4vectorの可変領域を除外した部分をPCRで増幅後に準備して、Gibson assembly方法でクローニングした。
HiTrap MabSelectSure(GE Healthcare、11-0034-94)を使用して培養液を精製した。平衡化バッファー(50mM Tris-HCl pH7.2、100mM NaCl)を使用して平衡化させた後、回収された培養液をカラムにローディングした。ローディングが完了すれば、50mM Sodium Citrate pH5.0で中間洗浄後、50mM Sodium Citrate pH3.4を用いて溶出を行った。溶出液に1M Tris-HCl pH9.0を添加してpH6.0になるように中和した。その後、溶出液をPBS(phosphate buffered saline、pH7.4)でバッファー交換および濃縮して、使用時まで4℃に保管した。
3-1:ライブラリーファージ(Libraryphage)準備
キメラ抗体のCDR1、CDR2、CDR3 residueにhuman frameworkを結合させながら各CDR residueにmouseあるいはヒト由来sequenceが導入されたminiライブラリーを製作した。当該ライブラリーのcompetent cellをクロラムフェニコール(Sigma、C0857)34μg/ml、2%グルコース(Sigma、G5400)および5mM MgCl2(Sigma、M2393)が含まれている2X YT[Tryptone(CONDA、1612.00)17g、イースト抽出物(CONDA、1702.00)10g、NaCl(Sigma、S7653)5g]培地に接種後、37℃で3時間程度培養してOD600値が0.5から0.7になるようにした後、ヘルパーファージ(helper phage)を感染させた後、クロラムフェニコール34μg/ml、5mM MgCl2、カナマイシン(Sigma、K1876)70μg/ml、1mM IPTG(ELPISBIO、IPTG025)を添加した2X YT培地で30℃、16時間培養してファージパッキングを誘導した。その次に、培養液を4500rpm、4℃条件で15分間遠心分離した後、上澄み液に4% PEG6000(Fluka、81253)と3% NaCl(Sigma、S7653)を添加してよく溶かした後、氷で1時間反応させた。これを再び4℃条件で8000rpm、20分間遠心分離した後、ペレットをPBSで懸濁した後、再び4℃条件で12000rpm、10分間遠心分離してライブラリーファージを含む上澄み液を得て、新しいチューブに入れて使用時まで4℃で保管した。
具体的に、免疫試験管(immunotube、maxisorp 444202)に10μg/ml濃度の組換えアルファ-シヌクレイン凝集体をPBSに添加して4℃で一晩試験管表面にタンパク質を吸着させた後、牛血清アルブミン(BSA、Bovine serum albumin)3%溶液を試験管に添加して、アルファ-シヌクレイン凝集体が吸着していない表面を保護した。試験管を空けた後、BSA 3%溶液に分散した1012CFUの抗体ファージライブラリーをアルファ-シヌクレイン単量体タンパク質の吸着している免疫試験管に入れて、常温で1時間反応させた(ネガティブ選別)。アルファ-シヌクレイン単量体に非結合したファージを回収してアルファ-シヌクレイン凝集体が付着された免疫試験管に常温で2時間結合させた。その次に、非特異的に結合したファージをPBS-T(0.05% Tween20)溶液で5回~30回洗い落とした後、残っている抗原特異的ファージ抗体を100mMトリエチルアミン溶液を用いて回収した。回収されたファージを1Mトリスバッファー(pH7.4)で中和させた後、ER2537大腸菌に37℃で1時間感染させ、感染した大腸菌をカルベニシリンを含有する2X YT寒天培地に塗抹して37℃で一晩培養した。翌日、培養された大腸菌を4mlの2X YTカルベニシリン培養液に懸濁し、15%グリセロールを添加して、一部は-80℃に保管し、残りは次のラウンドのパニングのためにファージを製造した。このような過程を総3ラウンド繰り返して抗原特異的な抗体を増幅させた。パニングラウンドが進行するほど、PBS-Tを用いた洗浄回数を増加させて抗原特異的ファージを増幅および濃縮した。
前記パニングによって得られたファージプール(phage pool)からアルファ-シヌクレイン凝集体に特異的に結合する単クローン抗体を選別するために、次のような実験を行った。
4-1:抗-アルファ-シヌクレイン抗体を用いたドットブロット分析
本願による抗体がネイティブ状態での単量体または凝集体に結合するかを分析するために、ドットブロット実験を行った。このために、抗原として50ngあるいは100ngのアルファ-シヌクレインモノマーまたはフィブリルタンパク質(ソウル大学校のイ・スンジェ教授labで製造する;Bae et al.、J.Neurosci 32:13454、2012)をDot blot apparatus(BioRad)を用いてニトロセルロースメンブレンにスポットローディングした。2倍ずつ希釈したモノマーまたはフィブリルタンパク質は、メンブレンの右から左へ順次にローディングした(12.5、25、50、100ng)。メンブレンをTBST組成の5%non-fat dry milkで1時間常温でブロッキングした後、実施例1で製造したアルファ-シヌクレイン抗体を1mg/mlの濃度で1%bovine serum albumin含有TBSTに入れて、メンブレンと当該抗体を1時間常温でインキュベーションした。その次に、TBSTで洗浄した後、HRP(horse radish peroxidase)が結合された2次抗体および基質としてchemiluminscence substrate(NEN)を製造者の方法通りに使用して信号を分析した。結果は、LAS-3000 Luminescent Image Analysis System(FUJIFILM Life Science)を用いてイメージングした。結果は、図1に記載されている。
本願による抗体の抗原に対する結合力を定量的に分析するために、ELISAを行った。このために、実施例1で得られたマウス抗-アルファ-シヌクレイン抗体を1μg/mlの濃度で96ウェルプレートにコーティングした後、ここに10、100、1000、10,000ng/ml濃度のアルファ-シヌクレインフィブリル凝集体を処理した後、PBSで洗浄し、その次に、ビオチンが結合された2次抗体およびHRPが結合されたストレプトアビジンを処理した後、基質としてTMBと反応した後に吸光度を測定し、その測定結果を図2に示した。
実施例1で製造されたアルファ-シヌクレイン抗体の単量体および凝集体抗原結合に対する定量的分析をBIAcoreを使用して行った。
実施例1で製造されたマウスアルファ-シヌクレイン抗体(3A9、9B11、11F11)の単量体および凝集体抗原結合に対する定量的分析をOctetを使用して行った。
10マイクロメートルの厚さのパラフィン包埋されたパーキンソン疾患で死亡した患者の脳組織切片を実施例2で得られたキメラ抗-アルファ-シヌクレイン抗体を用いて組織切片内レビー小体とレビー神経突起(neurite)を次のように染色した。90%ギ酸で組織切片を3分間処理してantigen retrievalを進行させた後、1% H2O2(50% ethanol base)を用いて組織自体のperoxidase活性を抑制した。組織のnon-specific bindingを防止するために、10% normal horse serumを処理した。その次に、リン酸緩衝液で洗浄した後、本願による3A9、11F11および11F11抗体をadjacent sectionに4℃で一晩処理した。リン酸緩衝液で洗浄後、ビオチンが結合されたanti-ヒトIgG抗体を37℃で30分間処理した後、avidin-biotin complexを常温で30分間反応させた(Vectastatin Elite kit;Vector Laboratories)。
実施例2で得られたキメラ抗-アルファ-シヌクレイン抗体である3A9および11F11抗体に対するエピトープマッピングは、PEPSCAN(The Netherlands)にペプチドアレイ分析を依頼して行われた。結果は、図6に開示されている。図6図は、本発明の一例による抗体のエピトープマッピング結果を図式的に示したものである。
実施例4-2と実質的に同様な方法で、実施例2で得られたキメラ抗体(Ch11F11)および実施例3で得られたヒト化抗体(Hu11F11)の結合力を定量的に分析するためにsandwich ELISAを行った。
実施例4-3と実質的に同様な方法で、実施例2で得られたキメラ抗体および実施例3で得られたヒト化抗体の結合力をBIAcoreを使用して定量的に分析した。前記分析結果を図図8および下記表に示す。
その結果、本願に記載されたヒト化抗体、特に11F11のvariant、即ち、hu11F11(ver.2)(Hu11F11-VH-v2とHu11F11-VLv3 4cの組み合わせ)、hu11F11(ver.3)(Hu11F11-VH-v3とHu11F11-VLv3 4cの組み合わせ)、hu11F11(ver.4)(Hu11F11-VH-v4とHu11F11-VLv3 4c)はキメラ11F11クローンと類似なKD値を示すことが確認され、その結合程度としてはヒト化クローンが0.02~0.06×10-9MのKD、キメラ11F11クローンが0.02×10-9Mの低いKD値、即ち、凝集体に対する高い結合力を示した。
9-1:ベータ-シヌクレインおよびガンマ-シヌクレインとのELISA分析
実施例2によるキメラ抗体3A9、9B11、11F11の3種を生産後、当該抗体のアルファ-シヌクレインの結合特異性をそのホモログであるベータ-シヌクレインおよびガンマ-シヌクレインとのELISAと比較した。
実施例2によるキメラ抗体3A9、9B11、11F11の3種をアミロイドベータ1-42(Uniprot:P05067;CAS number:107761-42-2)およびタウ(Uniport:P10636-8)タンパク質から形成された凝集体とドットブロットで反応させて、当該抗体のアルファ-シヌクレイン凝集体に対する特異的結合力を分析した。その理由は次の通りである。
10-1:Bivalent二重抗体クローニング
Bivalent二重抗体発現ベクターを製作するために、pcDNA3.4(in vitrogen)ベクターのMCS(Multi cloning site)内にsignal sequenceを含む抗体nucleotide配列を挿入した。二重抗体発現ベクターはモノシストロン性ベクターであって、重鎖発現ベクターおよび軽鎖発現ベクターをそれぞれ製作した。
Monovalent二重抗体は、抗IGF1R scFvがC terminalにリンカーで接合されている抗a-Syn免疫グロブリン重鎖(hole)とscFvが連結されていない抗a-Syn免疫グロブリン重鎖(knob)が結合した異種二量体に抗体軽鎖が接合された形態である。
前記製造されたベクターをmaxi-prep(Qiagen)して、多量のplasmid DNAを確保後、次のように細胞に導入した。BsAbを生産するために、重鎖発現ベクターDNAおよび軽鎖発現ベクターDNAを1:1の比率で形質導入した。monovalent BsAbを生産するためには、hole type重鎖発現ベクターDNA、knob type重鎖発現ベクターDNAおよび軽鎖発現ベクターDNAを0.5:0.5:1の比率で形質導入した。
生産が完了した培養液の収得のために遠心分離用瓶に培養液を移して4℃、6500rpmで30分間遠心分離後、0.2μmの大きさのフィルターでフィルタリングを行って、浮遊物を除いた培養液を確保して、その後、精製過程を行った。
11-1:IGF1R抗体(scFV)の製造
ファージディスプレイ/パニング技術を用いて単一クローン抗体を製造した。
具体的に、抗-IGF1R抗体製造のためのファージディスプレイパニング遂行およびその他の分析に使用される抗原を次のようなタンパク質を使用した。ヒトIGF1Rの細胞外ドメイン(ECD)で信号配列が除去された配列番号99アミノ酸残基の31番から932番のアミノ酸配列のC-末端にヒスチジン-タグ(His tag)が結合されたものを使用した(R&D Systems、USA、391-GR)。また、種間交差反応性を確認するために、C末端にHis tagが融合されたサルIGF1R(National Research Council Canada)、マウスIGF1R(R&D systems、6630-GR/CF)、およびラットIGF1R(National Research Council Canada)のタンパク質を抗原として使用した。
ヒトIGF1R抗体をスクリーニングするために、次のような方法で総3回パニングを行った。本発明に使用されたファージライブラリーは合成ヒトscFvライブラリーであり、ファージディスプレイパニング過程および結果は次の表11の通りである。
ヒトIGF1RのECD(extracellular domain)に対する結合力(protein binding)だけでなく、IGF1R発現細胞株であるMCF-7に対する結合力を示す(cell binding)クローンを選別した。
リガンド結合力およびBBB通過能を評価して選別されたクローンに対してaffinity variationを行って抗体を最適化した。1次試みでは1564 scFvを基にしてheavy chainのCDR2とlight chainのCDR3をrandomizationするためのNNS hand-mix primerを製作し、PCR技法を用いてrandomization配列が含まれている1564 scFv遺伝子を増幅させた。増幅された遺伝子はpComb3x vectorに挿入することによってphage displayに適したライブラリー形態に作り、library panningおよびELISA screeningによってIGF1Rに結合する複数のscFvクローンを選別することができた。選別されたクローンは遺伝子シークエンシングによって可変部位のアミノ酸配列を確認した。
13-1:Deamidation residue確認
CDRにdeamidationが発生すれば、抗体が分解されながら抗原への結合が弱くなって効能低下およびsample heterogenityが誘発されることがあり、Sample heterogeneityは向後の臨床承認などでそのidentificationのため複雑性を誘発する。したがって、in silico分析およびpeptide mappingによってdeamidationが発生する位置を確認しようとした。
Parental cloneである1564クローンは、in silico分析でnet chargeが-0.7である。通常、net chargeが<0あるいは>5.5である場合、体内でfast clearanceにぜい弱であると考えられる。したがって、deamidation residueをpositive chargeであるH、R、Kなどで置換すれば、deamidationもなくし全体chargeを上げてfast clearanceを防止することができると考えた。したがって、deamidationが発生する位置を図18bのように置換したmutantを生産した。
1)アミノ酸配列で、AsnをAsnと類似したDあるいはQに変えた。結合力に変化がないことが確認されれば、当該residueは全てQで置換する。
2)使用されたparentalクローンのnet chargeは-0.7。fast clearanceが誘発されるnet chargeは<0あるいは>5.5であるので、Chargeがpositiveに変わるほど有利である。したがって、LCDR3のdeamidation発生residueであるN95aはpositive chargeを帯びるH、R、Kで置換した。
14-1:抗-IGF1R minibody形態の抗体製造
実施例11~13で確保したIGF1R特異的単一クローンファージ抗体のscFv全体をFcのC-末端に連結してミニボディを製造した。このために、表12に開示されたscFVのアミノ酸配列を暗号化する核酸配列を製造し、この配列を制限酵素で切断して、Fcをコーディングする核酸を含むpcDNA基盤の発現ベクターにクローニングした。
実施例11~13で確保したIGF1R特異的単一クローンファージ抗体のscFv全体を、治療抗体IgG形態のC-末端それぞれに二つを連結したbivalent形態を製作した。このために、表12に開示されたscFVのアミノ酸配列を暗号化する核酸配列を製造し、この配列を制限酵素で切断して、治療抗体をコーディングする核酸を含むpcDNA基盤の発現ベクターにクローニングした。
実施例11および12で確保したIGF1R特異的単一クローンファージ抗体のうち、564抗体およびF06抗体の配列を全体IgG1(Full IgG)形態に変換するために、重鎖と軽鎖領域の遺伝子配列を合成した(ゼノテック(genotech))。合成した重鎖および軽鎖遺伝子は、発現ベクターにクローニングした。抗-IGF1R scFv一つが連結された重鎖一つ、そうでない重鎖一つ、そして共通した軽鎖から構成された構造を有するmonovalent形態が入っていてmonovalent形態の抗体を製造した。
実施例14-1が重鎖二つのFcのC-末端それぞれに抗-IGF1R抗体がscFv形態に結合したminibody形態であれば、本実施例では重鎖中の一箇所のFc C-末端にのみscFv一つが結合したmonovalent形態で抗体を実施例11~13で確保したIGF1R特異的単一クローンファージ抗体のうちの1564、F06、C04、VH5、VH16、VH35、VH9、VH2、VH7、VH32をFc C-末端中一箇所にのみ結合させたベクター、C-末端に抗-IGF1R抗体が結合されていないベクターを製作した。当該Fc内にはknob-into-hole mutationを導入して、細胞で抗体生産時、heteromeric形態が製作されるようにした。
実施例14-1~14-3で製造されたベクターを次のように細胞に導入した。
具体的に、CHO-S細胞をCD-CHO(Gibco、10743)培地に1.5×106cells/mlで濃度を合わせた後、8% CO2、37℃で1日間培養した。DNA形質注入当日、2.5~3×106cells/mlに育った細胞を1% DMSOが含まれているCD-CHO培地を用いて2.1×106cells/mlの濃度で準備した後、8% CO2、37℃で3hr培養した。3000rpmで15min遠心分離後、上澄み液を除去した後、2.5% FBSが含まれているRPMI 1640培地に再懸濁した。
本発明による抗IGF1R抗体をリンカー(配列番号172)を使用して重鎖可変領域と軽鎖可変領域を連結してscFVに製造し、下記表に記載された抗a-Syn抗体の完全な形態のIGG抗体の重鎖不変領域のC末端にリンカー(配列番号173)によって連結して二重抗体を製造した。本実施例では、抗a-Syn抗体の完全な形態のIGG抗体1分子当り、抗IGF1R抗体のscFv形態一つ分子を連結して製造したmonovalent抗体と、抗IGF1R抗体のscFv形態二つ分子を連結して製造したbivalent抗体をそれぞれ製造した。本実施例で二重抗体製造のために使用した抗a-Syn抗体の例示的配列を下記表に示し、本件発明によって製造した二重抗体の組換え重鎖の組み合わせおよび軽鎖を下記表に記載した。その後、実施例で下記例示された二重抗体に対する実験を行った。
15-1:Minibody形態抗-IGF1R抗体のIGF1Rに対する結合力分析(ELISA)
実施例14-1で製作した996、1226、1564、MKJP2クローンのminibody形態が組換えIGF1Rに対する結合力および濃度依存的に結合するか否かを確認するためにELISA分析を行った。
実施例14-2の方法によって製作した1564抗-IGF1R抗体と、実施例11-3で確保した抗-IGF1R抗体の種間交差結合有無をELISA技法によって分析した。このために、まず、ヒト、サル、マウスおよびラットIGF1R抗原を1ug/mlで希釈して各ウェルに100ulずつ入れ、4℃で15時間反応してプレートの底にコーティングされるようにした。上澄み液を除去した後、3% BSAが含まれているPBSバッファー200ulを各ウェルに処理して非特異的な結合を遮断した。抗-IGF1R抗体を最高濃度400nMにして、PBSB(BSA3% in PBS)に5倍ずつ希釈して前記各ウェルに処理した後、37℃で1時間反応した。その次に、PBSバッファーを用いて5回洗浄した後、結合された抗体のFab部分を認知する抗-ヒトFab HRPを1:20000で希釈して各ウェルに100ul処理した後、37℃で1時間反応させた、その次にPBSバッファーで5回洗浄し、TMB(Tetramethyl benzidine、Sigma、T0440)を使用して製造者の方法通りに発色させた。酵素反応を0.5mol/Lの硫酸によって中止させ、マイクロプレートリーダー機(Molecular device)を用いて450nmで吸光度を測定した。ELISA遂行時、サンプルが多い場合はプレートを2つに分けて行い、実験結果は次の表12に示した。
実施例12で製作されたaffinity variantの結合力をIGF1R ECDタンパク質に対するELISA遂行およびMCF-7に対する結合力をFACSで分析した。
本発明による抗体とヒトIGF1R間の結合力を分析しようとした。
1564クローンのIgG形態に対してSPR分析でヒトIGF1Rに対する結合程度を分析した。抗原であるヒトIGF1R ECDに結合されたHis tagに対する抗-his抗体をacetate pH4.0 bufferに20μg/mlで希釈した後、CM4 chipにamine coupling方法でreference/analytic channelにtarget RUを10,000RUにimmobilizeした。Captureの間、running bufferとしてはPBSを使用した。Flow rateは30μL/minを維持した。Association/dissociationの間、flow rateは40μL/min、running bufferとしてはPBSを使用した。association/disssociationはそれぞれ5分、20分であった。分析は、baseline 1、activation(EDC+NHS)、ヒトIGF1R loading、quenching(1M Ethanolamine)、baseline 2、association、dissociation順に行われた。Evaluationはbivalentモデルを使用し、Biacore T200 Evaluation software(version 1.0、S/N:04Y15X11-0149)を使用して分析した。
16-1:MCF-7に対するFACS分析
実施例14-1で製造した996、1226、および1564クローンのminibody形態が、細胞表面のendogenous IGF1Rに結合するか確認するために、ヒトIGF1Rを発現する細胞株および脳内皮細胞(brain endothelial cell)に対する結合力分析をFACSで行った。Periplasmic extractとIGF1Rが過発現すると知られたMCF-7、乳癌細胞株との結合程度をFACSで確認した。
実施例16-1で使用したMCF-7細胞株の代わりに、JIMT-1およびBT474乳癌細胞株を使用したことを除いては実質的に同様な方法で実施例14-1で製造した996、1226、および1564クローンのminibody形態が、細胞表面のendogenousのIGF1Rに結合するか確認した。前記実験結果を図12aに示した。
実施例14-2方法で製作した1564クローンの二重特異抗体形態と実施例14-3方法で製作した1564クローンのIgG形態がマウスの脳内皮細胞であるbEND.3に結合するかを分析した。この時、secondary抗体のみ処理グループおよび治療抗体単独IgG(CH11F11)処理グループを陰性対照群として使用した。FACS分析法は実施例16-1および16-2と同様に行った。分析結果は図12bに示した。
17-1:MCF-7 internalization assay-1564、996、1226、MKJP2(minibody)
実施例14-1で製造した996、1226、1564およびMKJP2クローンのminibody形態が、IGF1Rを発現する細胞株でintracellular internalizationされ、細胞内に導入された抗体は分解されずRMT Pathwayを経るかを確認しようとした。抗-IGF1R抗体がBBB通過能を向上させるシャトルとして使用されるためには、当該抗体がBBBを構成するbrain endothelial cell内にinternalizeされることが先行されなければならない。
IGF1Rに対する結合力を変化させた1564 variantの細胞表面IGF1R結合を分析するために、IGF1Rを発現するMCF-7細胞株を用いてFACS分析を行った。scFv形態の二重抗体から製作されたIGF1R抗体を10ug/mL濃度で2×10E5のMCF7細胞に30分間処理した。1% BSAが添加されたPBSバッファーで洗浄した後、ヒト抗体をdetectionするFITCが結合された2次抗体を1時間処理した。PBSバッファーで洗浄した後、FACS分析によって結合力が変化多様なvariantの細胞外結合およびinternalizationを確認した。
実施例14-2および14-4で製作した1564クローンのbivalentおよびmonovalent形態がヒト由来brain endothelial細胞(primary human microvascular brain endothelial cell(HMBEC))にinternalizeされるか分析した。治療抗体IgG(11F11)を陰性対照群として使用した。
万一、当該抗体がinternalizeされた後、細胞内のリソソーム関連マーカとcolocalizeすれば、当該抗体はbrain endothelial cell内で分解されてしまうためBBBを通過できない。これとは反対に、exocytosisに関連するearly endosomeあるいはBBB通過に関連すると知られたマーカとcolocalizeすれば、当該抗体はbrain endothelial cellにinternalizeされた後、脳側に抜け出るreceptor-mediated transcytosisによってBBBを通過すると予想される。
-Anti-Caveolin-1:caveolin-mediated transcytosisマーカ(BBB通過の主要メカニズムと思われる)
-Anti-EEA1:early endosomeマーカ
残り方法は実施例17-2と同様であるが、前記のマーカに対するsecondary抗体をそれぞれ処理した。
18-1:MCF-7細胞株のIGF1Rによるproliferation assay
本発明による抗-IGF1R抗体がIGF1R(IGF1受容体)とそのリガンドであるIGF1間の結合を妨害するか否かを、IGF1による細胞増殖効能を用いて確認した。
前記実験結果から、本発明による抗体は、IGF1のIGF1Rに対するsignalingによるMCF-7の細胞増殖を阻害しないことが確認された。対照群として使用したImclone社の抗-IGF1R抗体は、IGF1によるMCF-7の細胞増殖を処理濃度に比例して阻害した。したがって、本発明の抗体はBBBを構成するendothelial cellに発現するIGF1Rに結合してBBB通過能を有するが、同時に体内IGF1によるsignalingを阻害しない抗体であるので、本発明による抗体はBBBシャトルとして使用できるのを確認した。
本発明による抗-IGF1R抗体が、IGF1R発現細胞と結合するIGF1がsignalingを細胞内に伝達する時、そのsignalingのreceptorおよびdownstream signaling componentに関与するかどうかを確認するために実験した。即ち、IGF1Rを発現するMCF-7細胞株に抗-IGF1R抗体を投与し、これによる細胞内の全体IGF1R、リン酸化されたIGF1R、IGF1Rのdownstream factorである全体Akt、リン酸化されたAkt量を分析した。
本発明による抗-IGF1R抗体が、マウス由来brain endothelial細胞にIGF1がsignalingを細胞内に伝達する時、そのsignalingのreceptorおよびdownstream signaling componentに関与するかどうかを確認するために実験した。即ち、IGF1Rを発現することが確認されたbEND3細胞株に実施例14-2の方法で製作された11F11-1564、3A9-1564(CH11F11とch3A9、a-syn単独抗体として大韓民国公開特許2018-0081465に記載されたもの)および実施例14-3の方法で製作された1564クローンのIgG形態を投与し、これによる細胞内の全体IGF1R、リン酸化されたIGF1R、IGF1Rのdownstream factorである全体Akt、リン酸化されたAkt量を分析した。
前記実験結果から、本発明による抗体は、細胞内の全体IGF1R、リン酸化されたIGF1R、IGF1Rのdownstream factorである全体Akt、リン酸化されたAkt量に影響を与えないことを確認した。
19-1:IgG形態IGF1R抗体のADCC分析
実施例14-3による抗-IGF1R抗体がIgG形態として、IGF1R発現細胞の表面に結合してIGF1R依存的な結合によって細胞死滅に影響を与えるか確認するために実験した。即ち、IGF1R発現細胞株に抗-IGF1R抗体である1564クローンが結合した時、ナチュラルキラー細胞(Natural killer cell、NK cell)を活性化させてIGF1R発現細胞に悪影響を与えるかをADCC reporter bioassay kitを使用して分析した。
BBBシャトルとして使用される抗体はbrain endothelial cellのターゲットreceptorに結合して治療抗体の通過能を高める役割を果たすが、当該receptorレベルに変化を与えてはいけない。ターゲットreceptorのdown regulationは当該ターゲットの脳での役割に影響を与えて副作用を引き起こすことがある。
BBBシャトルはbrain endothelial cell表面のreceptorに結合して治療抗体を脳内に伝達するが、脳内の正常細胞表面のreceptorへの結合は少なくなければならない。万一、BBBシャトルが脳内で抗原を発現する正常細胞に多量結合すれば、それだけ当該シャトルに結合された治療抗体は疾患ターゲットに少なく到達するようになる。
20-1.sv-ARBEC由来BBBモデルでbivalent抗体のBBB通過能分析
実施例11および12由来抗体を実施例14-2で製作した二重特異抗体のin vitro BBB通過能をSv-ARBECから構成されたBBBモデルで評価した。Sv-ARBECをpermeable membraneの上に単一層でプレーティングし、当該BBBシステムの抵抗値(TEER)およびsucrose通過程度を基にして当該システムのintegrityを予め評価した。この時、sv-ARBECは当該システムのintegrityに役立つことが確認されたラットastrocyte培養medium(RAS-CM)を処理した。テスト抗体である1564、48G5、54H4、60H6、B11のbivalent二重特異抗体をmembraneの上に処理した後、90分後にbottom chamberでの抗体量を質量分析で分析した。質量分析のために、各抗体FcおよびscFvでのsignature peptideが分析された後、使用された。この時、パーキンソン病治療抗体単独(11F11)および当該抗体にHerceptinTMのバイオシミラーのscFv形態を結合させた二重特異抗体を陰性対照群として使用した。当該システムにはBBBを通過しないと知られたA20.1抗体(national research council製作)を通過させて当該システムの検量限界線を決めた。質量分析で導出された結果値を先行文献で知られた公式に代入してPapp値を決定し、この値はin vitroでのBBB通過能程度を示す。
20-1と同一のモデルで、実施例14-4を基にして製作したmonovalent抗体とbivalent抗体のin vitro BBB通過能を分析した。1564クローンから製作したbivalent、monovalent抗体および陰性対照群であるパーキンソン病治療抗体(3A9)をsv-ARBEC BBBシステムに通過させた後、通過量を分析した。分析結果は、図16bに示した。
ヒトstem cell由来BBBモデルは、ラットあるいはマウス細胞由来BBBシステムに比べて高い抵抗値(TEER)を示し、BBBで確認された多様なマーカを全て発現する。したがって、ヒトstem cell由来モデルのBBB tightnessは動物細胞由来BBBに比べて高く、当該モデルはヒトBBBをよく再現している。
21-1.minibodyのbrain vesselとのcolocalization
本発明の抗-IGF1R抗体がin vivoでbrain vasculatureに沿って分布するかどうかを確認するために次のような実験を行った。
前記実験結果から、本発明によるリガンド結合非阻害クローン(non-blocking antibodies)は優れたBBB通過能を有するのを確認し、抗体が脳血管とcolocalizationする程度を免疫染色で分析する方法(Neuron(2016)Yu-Zuchero et al.)によって、脳組織を血管マーカ(anti-CD31、緑色)とヒト抗体(anti-human Fc、赤色)で染色した結果、本願の一例によるリガンド結合非阻害クローンはIgG対照群に比べて高いcolocalization程度を示した。
本願抗-IGF1R抗体のin vivo BBB通過能をnormal ratで確認しようとした。SD ratに10mg/kgあるいは30mg/kgのパーキンソン病治療単独抗体(11F11)あるいは1564クローンがbivalent形態に結合された二重特異抗体(11F11-1564)を尾静脈に単回投与後、24時間目にそのCSFおよびbrainでの抗体量を質量分析で分析した。質量分析方法は実施例20-1での方法と同一であった。
脱アミド化反応は例えば、アスパラギンの側鎖ペプチド結合を攻撃して対称構造のスクシンイミド中間産物を作ることを意味し、この中間産物は加水分解によってアスパラギン酸あるいはイソアスパラギン酸のうちの一つに変わるようになる。このような脱アミン化反応はタンパク質の持続的な活性に影響を与えることがあるため、軽鎖および重鎖アミノ酸を他のアミノ酸で置換して脱アミン化を防止すると同時に、長期間の安定性を確保しようとした。
23-1.抗-IGF1R抗体とboiled、native IGF1Rタンパク質のELISA
抗-IGF1R抗体が線状あるいはconformational epitopeを認識するか確認しようとした。1564、48G5、54H4、60H6、B11のbivalent二重特異抗体とnative ヒトIGF1R ECDタンパク質あるいは当該タンパク質に熱を加えたタンパク質(boiled IGF1R)に対するELISAを行った。ELISA方法は、実施例15に示された方法と同一であった。分析結果は表20に示した。
1564クローンのConformational epitopeを分析するために、次のようにalanine scanningを行った。IGF1R発現度が低いと確認された卵巣ガン細胞株であるOVCAR3細胞にN-末端にはeGFP tagが融合されC-末端kinase domainは除去されたIGF1Rライブラリーを発現させた。IGF1Rライブラリーは、IGF1R表面の残基がalanineで置換された突然変異を含む。準備されたライブラリーをOVCAR3細胞にtransfectionした。IGF1Rの発現が確認された細胞に対して1564抗体を処理し、その後、DyLight650が標識された二次抗体を処理して蛍光標識した。標識された細胞をIGF1R発現有無とIGF1Rの発現と1564結合有無によって分類した後、これらに対してイルミナHiSeq技法でRNA deep sequencingを行って、当該細胞群での各alanine突然変異の頻度を分析した。当該頻度数はwilde type IGF1Rを発現した細胞に対する結果として正規化した後、相対頻度を計算して、1564が標識された細胞群でその数字が減少した突然変異を選別した。このような観察に基づいて、1564のエピトープはFN2ドメインに位置することが分かり、これに属する残基はY775、P776、F778、R650、S791、L798であることが分かった。当該結果および1564クローンが認識するシークエンスは、図9に示した。この残基は先行文献によればIGF1の結合に関与しないので、当該結果は実施例23-1で1564が示す性質を忠実に説明している。
24-1:a-syn抗原に対する単独抗体および二重抗体の結合力
IGF1R抗体がscFv形態でIgG形態のa-syn抗体と連結させた時、a-syn抗体の結合力に対する影響を分析した。
IGF1R抗原に対するa-syn単独抗体と二重抗体の結合程度を比較するために実施例22と同様な方法で実験を行った。
実施例24-1と同様な方法で実験を行って、キメラ二重抗体とヒト化二重抗体間の結合力差を分析した。
食細胞作用は、大食細胞の多様な受容体が関与して細胞外不必要な物質を除去する作用を意味する。多様なタンパク質凝集体は免疫反応や炎症反応を誘導して人体に悪影響を与えるようになり、特に、a-syn凝集体の除去のために抗体を投与した時、抗体のFc部位と細胞表面のFcrRとの相互作用によって促進されると知られている。このような理由で、単独抗体とIGF1R scFvが連結された二重抗体の食細胞作用に対する活性を比較した。
実施例XXによってキメラ11F11抗体と1564クローンscFvのbivalent二重特異抗体を製作し、ヒトアルファ-シヌクレインを過発現する形質転換マウス(mThy-1 human α-synuclein、UC San Diego)で二重特異抗体とアルファ-シヌクレイン抗体のインビボで効果を比較、分析した。2.5mg/kgの単独抗体またはヒトIgGまたは同一モル数のbivalent二重特異抗体を3ヶ月間毎週腹腔投与した。グループ当り5匹のマウスを使用し、非形質転換マウス(non-transgenic littermate)を対照群として使用した。その次に、灌流を次のように行った。
図11aは、キメラ11F11抗体および当該キメラ抗体と1564クローンのbivalent二重特異抗体がヒトα-Synを過発現するマウス動物モデル(TG)でアルファ-シヌクレイン凝集体を除去することができるかを、マウスに抗体投与後、p-129 α-Syn抗体を用いてマウス脳組織中のcortex、hippomcapusを染色して測定した結果である。p-129 α-synは129番目残基がリン酸化された形態の凝集体のマーカであって、染色された組織で濃い茶色点あるいは凝集体形態に示される。
グリオーシス(gliosis)は、BBBの損傷、TGF-ベータまたはインターロイキンのような物質によって触発される、中枢神経系に損傷がある場合、これに対する反応として膠細胞(glial cell)で起こる非特異的反応である。代表的なものとして、Astrogliosisを含み、GFAPタンパク質がマーカーとして使用される。よって、キメラ11F11抗体およびキメラ抗体と1564クローンの二重特異抗体をマウスに投与してAstrogliosis減少およびこれを触発する炎症性サイトカイン放出減少に及ぼす影響を分析した。分析結果は、図11cおよび11dに開示されている。
アルファシヌクレインの神経毒性および炎症反応によって脳細胞の死滅が発生するのを先行文献で確認されてきた。本願の単独抗体および二重特異抗体がアルファ-シヌクレインによるin vivoでの脳細胞死滅を抑制できるか分析した。
FcRnは、血管内で抗体が循環する時、溶解されないように細胞内に抗体を引き込んで循環させることによって半減期を増加させる細胞膜の重要な受容体である。BBB通過能はトランスサイトーシス抗体の活性も重要であるが、血管内での濃度に依存してBBBを通過するということはよく知られた事実である。このような理由で、二重抗体の半減期を増加させるためにFc部位の428番目アミノ酸をメチオニン(Met)をロイシン(Leu)に変化させてFcRnとの結合力を増大させた二重抗体を製作した。Human FcRnを発現するtg mouseに10mg/kg濃度でWT二重抗体とM428L二重抗体を投与して比較した結果、図12のように、約50%程度の半減期増大効果を確認した。半減期増加を再確認するために、サルにWT二重抗体、Bivalent M428L二重抗体、monovalent M428L二重抗体を投与してPK profileを分析した。図22aのように、WT二重抗体の場合、168時間以後から急激に血液内濃度が低まる反面、FcRnとの結合力が高いM428L二重抗体はWTに比べて向上した血液内濃度を維持した。半減期は、WT二重抗体に比べてM428L二重抗体で1.5日程度増加する結果を確認した。特に、clearance側面からは、monovalent M428L二重抗体が最も優れており、WT二重抗体が最も速いclearanceを示した(図22b)。
本発明の一例は、アルファ-シヌクレイン(a-Syn)に対する抗原結合部位およびIGF1Rに対する抗原結合部位を含むタンパク質複合体および前記タンパク質複合体から得られるアルファ-シヌクレイン(a-Syn)およびIGF1Rに対する二重特異抗体(以下、抗a-Syn/抗IGF1R二重特異抗体)に関するものである。よって、本発明による二重特異抗体は、アルファ-シヌクレインとIGF1Rを全て抗原として認識および結合することができる。
(i)表1に開示されたH-CDR1、H-CDR2およびH-CDR3からなる群より選択された一つ以上の重鎖相補性決定領域、または前記一つ以上の重鎖相補性決定領域を含む重鎖可変領域;
(ii)表2に開示されたL-CDR1、L-CDR2およびL-CDR3からなる群より選択された一つ以上の軽鎖相補性決定領域、または前記一つ以上の軽鎖相補性決定領域を含む軽鎖可変領域;
前記一つ以上の重鎖相補性決定領域および前記一つ以上の軽鎖相補性決定領域の組み合わせ;または
前記重鎖可変領域および前記軽鎖可変領域の組み合わせ
を含むものであってもよい。
配列番号10~配列番号49のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖CDR2(H-CDR2)、
配列番号50~配列番号80のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖CDR3(H-CDR3);
配列番号96~配列番号113のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖CDR1(L-CDR1)、
配列番号114~配列番号132のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖CDR2(L-CDR2)、および
配列番号133~配列番号161のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖CDR3(L-CDR3)からなる群より選択された少なくとも一つを含む、抗IGF1R抗体またはその抗原結合断片に関するものである。
配列番号96~配列番号113のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖CDR1(L-CDR1)、配列番号114~配列番号132のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖CDR2(L-CDR2)、および配列番号133~配列番号161のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖CDR3(L-CDR3)を含む軽鎖可変領域を含むことができる。
配列番号81~84のアミノ酸配列のうちの一つを含む、H-CDR1のN-末端側に位置する重鎖可変領域フレームワーク1(H-FR1)、
配列番号85~86のアミノ酸配列のうちの一つを含む、H-CDR1とH-CDR2の間に位置する重鎖可変領域フレームワーク(H-FR2)、
配列番号87~91のアミノ酸配列のうちの一つを含む、H-CDR2とH-CDR3の間に位置する重鎖可変領域フレームワーク(H-FR3)、および
配列番号92~95のアミノ酸配列のうちの一つを含む、H-CDR3のC末端に位置する重鎖可変領域フレームワーク(H-FR4)を含むものであってもよい。
配列番号162~164のアミノ酸配列のうちの一つを含む、L-CDR1のN-末端側に位置する軽鎖可変領域フレームワーク1(L-FR1)、
配列番号165のアミノ酸配列を含む、L-CDR1とL-CDR2の間に位置する軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR2)、
配列番号166~168のアミノ酸配列のうちの一つを含む、L-CDR2とL-CDR3の間に位置する軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR3)、および
配列番号169~171のアミノ酸配列のうちの一つを含む、L-CDR3のC末端に位置する軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR4)を含むものであってもよい。
配列番号411:GGGGSGGGGSGGGGSGGGGS
配列番号412:GGGGSGGGGSGGGGS
本明細書で提供される抗体が抗原として認識するアルファ-シヌクレインは、ヒトアルファ-シヌクレイン、サルアルファ-シヌクレイン(例えば、Rhesusアルファ-シヌクレイン)、マウスアルファ-シヌクレイン、ラットアルファ-シヌクレインなどの哺乳動物アルファ-シヌクレインから選択されたものであってもよく、例えば、ヒトアルファ-シヌクレインはアルファ-シヌクレイン(NCBI ID:NP_000336)であってもよいが、これに制限されるわけではない。本明細書に異なって言及されない限り、アルファ-シヌクレインはヒトアルファ-シヌクレインを指して称するものであり、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合断片はヒトアルファ-シヌクレインだけでなく、サル(例えば、Rhesus)、ラット、および/またはマウスアルファ-シヌクレインにも特異的な結合能を有するものであってもよい。
配列番号434および配列番号439のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖CDR1(H-CDR1)、
配列番号435~437および配列番号440~441のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖CDR2(H-CDR2)、
配列番号438および配列番号442のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖CDR3(H-CDR3)、
配列番号443および配列番号446のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖CDR1(L-CDR1)、
配列番号444および配列番号447のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖CDR2(L-CDR2)、および
配列番号445および配列番号448のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖CDR3(L-CDR3)。
H-CDR1のN-末端側に位置する重鎖可変領域フレームワーク(H-FR1)であって、配列番号449~450および配列番号468~473のアミノ酸配列のうちの一つを含むポリペプチド断片を含む。
H-CDR2とH-CDR3の間に位置する重鎖可変領域フレームワーク(H-FR3)であって、配列番号453~464および配列番号478~483のアミノ酸配列のうちの一つを含むポリペプチド断片を含み、
H-CDR3のC末端に位置する重鎖可変領域フレームワーク(H-FR4)であって、配列番号465~467および配列番号484~485のアミノ酸配列のうちの一つを含むポリペプチド断片を含み、
L-CDR1のN-末端側に位置する軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR1)であって、配列番号486~491および配列番号504~510のアミノ酸配列のうちの一つを含むポリペプチド断片を含み、
L-CDR1とL-CDR2の間に位置する軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR2)であって、配列番号492~494および配列番号511~514のアミノ酸配列のうちの一つを含むポリペプチド断片を含み、
L-CDR2とL-CDR3の間に位置する軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR3)であって、配列番号495~500および配列番号515~521のアミノ酸配列のうちの一つを含むポリペプチド断片を含み、および/または
L-CDR3のC末端に位置する軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR4)であって、配列番号501~503および配列番号522のアミノ酸配列のうちの一つを含むポリペプチド断片を含むものであってもよい。
前記重鎖可変領域は、配列番号449~450および配列番号468~473のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖可変領域フレームワーク(H-FR1)、配列番号451~452および配列番号474~477のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖可変領域フレームワーク(H-FR2)、配列番号453~464および配列番号478~483のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖可変領域フレームワーク(H-FR3)、および配列番号465~467および配列番号484~485のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖可変領域フレームワーク(H-FR4)を含むことができる。さらに詳しくは、前記重鎖可変領域は、配列番号450のアミノ酸配列を含むH-FR1、配列番号451のアミノ酸配列を含むH-FR2、配列番号462~464のアミノ酸配列のうちの一つを含むH-FR3、および配列番号467のアミノ酸配列を含むH-FR4を含むことができる。
前記軽鎖可変領域は、追加的に、配列番号486~491および配列番号504~510のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR1)、配列番号492~494および配列番号511~514のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR2)、配列番号495~500および配列番号515~521のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR3)、および配列番号501~503および配列番号522のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR4)を含むことができる。さらに詳しくは、前記軽鎖可変領域は、配列番号491のアミノ酸配列を含むL-FR1、配列番号492のアミノ酸配列を含むL-FR2、配列番号500のアミノ酸配列を含むL-FR3、および配列番号501のアミノ酸を含むL-FR4を含むことができる。
前記重鎖可変領域は、配列番号449~450のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖可変領域フレームワーク(H-FR1)、配列番号451~452のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖可変領域フレームワーク(H-FR2)、配列番号453~464のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖可変領域フレームワーク(H-FR3)、および配列番号465~467のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖可変領域フレームワーク(H-FR4)を含み、
前記軽鎖可変領域は、配列番号486~491のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR1)、配列番号492~494のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR2)、配列番号495~500のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR3)、および配列番号501~503のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR4)を含むことができる。
前記重鎖可変領域は、配列番号468~473のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖可変領域フレームワーク(H-FR1)、配列番号474~477のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖可変領域フレームワーク(H-FR2)、配列番号478~483のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖可変領域フレームワーク(H-FR3)、および配列番号484~485のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖可変領域フレームワーク(H-FR4)を含み、
前記軽鎖可変領域は、配列番号504~510のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR1)、配列番号511~514のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR2)、配列番号515~521のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR3)、および配列番号522のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR4)を含むことができる。
1-1:免疫化およびハイブリドーマ生産
抗原としては全長(140残基)またはC-末端21個の残基が切断されたアルファ-シヌクレイン単量体を37度のthermomixer Cに入れて、14日間1050rpmで振って凝集化させ、ソニケーションして使用した。前記製造された1mg/ml濃度の140個および119個残基のアルファ-シヌクレインフィブリルそれぞれをアジュバント(adjuvant)と1:1(vol:vol)で混合してよく混合した。
MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAGKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVATVAEKTKEQVTNVGGAVVTGVTAVAQKTVEGAGSIAAATGFVKKDQLGKNEEGAPQEGILEDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA
その次に、前記準備した混合物200μLを5~7週齢BALB/c雌マウスの皮下に注射し、2週後に、同様な方法で製造した混合物200μLを追加的に皮下注射してブースティングさせた。ブースティング1週後に血液を採取して、投与抗原を付けたELISA方法を使用して免疫化滴定(immunization titeration)を行った。その次に、3次ブースティングは、抗原のみを皮下注射した。
融合2週後に、細胞培養培地を用いてマウスに投与した抗原を付けたELISA方法を使用して抗体を生産するマウスB細胞との融合を確認した。その次に、ハイブリドーマを用いて単細胞クローニングを行って単クローン抗体を生産するハイブリドーマを総16個選別した。全長(140残基)アルファ-シヌクレイン凝集体を抗原として用いて9B11(それぞれ、IgG1 kappa)クローンを得て、C-末端21個残基が切断されたアルファ-シヌクレイン凝集体を抗原として用いて3A9および11F11(それぞれ、IgG2b kappa、IgG2b kappa)のクローンを得た。
可変領域およびCDR配列は、Ahn et al、Mol.Cells 2004、18(2):237-241論文を参照して決定した。ハイブリドーマを培養した後、遠心分離して細胞のみを分離した。分離されたハイブリドーマにトリゾールを入れてRNAを分離し、これを鋳型にしてcDNAを合成した後、塩基配列分析によって可変領域およびCDR配列を確認した。したがって、抗体3A9、9B11、11F11を得た。
2-1:抗体クローニングおよび発現
ヒト化を進行後に確保した重鎖可変領域および軽鎖可変領域の抗体nucleotide配列を用いて、短い断片のnucleotideであるgblock(m.biotech)を合成し、これを用いて動物細胞培養用ベクター(pcDNA3.4)にクローニングした。可変領域前後に重畳したnucleotideを約20bp程度含んでgblockを合成し、pcDNA3.4vectorの可変領域を除外した部分をPCRで増幅後に準備して、Gibson assembly方法でクローニングした。
HiTrap MabSelectSure(GE Healthcare、11-0034-94)を使用して培養液を精製した。平衡化バッファー(50mM Tris-HCl pH7.2、100mM NaCl)を使用して平衡化させた後、回収された培養液をカラムにローディングした。ローディングが完了すれば、50mM Sodium Citrate pH5.0で中間洗浄後、50mM Sodium Citrate pH3.4を用いて溶出を行った。溶出液に1M Tris-HCl pH9.0を添加してpH6.0になるように中和した。その後、溶出液をPBS(phosphate buffered saline、pH7.4)でバッファー交換および濃縮して、使用時まで4℃に保管した。
3-1:ライブラリーファージ(Libraryphage)準備
キメラ抗体のCDR1、CDR2、CDR3 residueにhuman frameworkを結合させながら各CDR residueにmouseあるいはヒト由来sequenceが導入されたminiライブラリーを製作した。当該ライブラリーのcompetent cellをクロラムフェニコール(Sigma、C0857)34μg/ml、2%グルコース(Sigma、G5400)および5mM MgCl2(Sigma、M2393)が含まれている2X YT[Tryptone(CONDA、1612.00)17g、イースト抽出物(CONDA、1702.00)10g、NaCl(Sigma、S7653)5g]培地に接種後、37℃で3時間程度培養してOD600値が0.5から0.7になるようにした後、ヘルパーファージ(helper phage)を感染させた後、クロラムフェニコール34μg/ml、5mM MgCl2、カナマイシン(Sigma、K1876)70μg/ml、1mM IPTG(ELPISBIO、IPTG025)を添加した2X YT培地で30℃、16時間培養してファージパッキングを誘導した。その次に、培養液を4500rpm、4℃条件で15分間遠心分離した後、上澄み液に4% PEG6000(Fluka、81253)と3% NaCl(Sigma、S7653)を添加してよく溶かした後、氷で1時間反応させた。これを再び4℃条件で8000rpm、20分間遠心分離した後、ペレットをPBSで懸濁した後、再び4℃条件で12000rpm、10分間遠心分離してライブラリーファージを含む上澄み液を得て、新しいチューブに入れて使用時まで4℃で保管した。
具体的に、免疫試験管(immunotube、maxisorp 444202)に10μg/ml濃度の組換えアルファ-シヌクレイン凝集体をPBSに添加して4℃で一晩試験管表面にタンパク質を吸着させた後、牛血清アルブミン(BSA、Bovine serum albumin)3%溶液を試験管に添加して、アルファ-シヌクレイン凝集体が吸着していない表面を保護した。試験管を空けた後、BSA 3%溶液に分散した1012CFUの抗体ファージライブラリーをアルファ-シヌクレイン単量体タンパク質の吸着している免疫試験管に入れて、常温で1時間反応させた(ネガティブ選別)。アルファ-シヌクレイン単量体に非結合したファージを回収してアルファ-シヌクレイン凝集体が付着された免疫試験管に常温で2時間結合させた。その次に、非特異的に結合したファージをPBS-T(0.05% Tween20)溶液で5回~30回洗い落とした後、残っている抗原特異的ファージ抗体を100mMトリエチルアミン溶液を用いて回収した。回収されたファージを1Mトリスバッファー(pH7.4)で中和させた後、ER2537大腸菌に37℃で1時間感染させ、感染した大腸菌をカルベニシリンを含有する2X YT寒天培地に塗抹して37℃で一晩培養した。翌日、培養された大腸菌を4mlの2X YTカルベニシリン培養液に懸濁し、15%グリセロールを添加して、一部は-80℃に保管し、残りは次のラウンドのパニングのためにファージを製造した。このような過程を総3ラウンド繰り返して抗原特異的な抗体を増幅させた。パニングラウンドが進行するほど、PBS-Tを用いた洗浄回数を増加させて抗原特異的ファージを増幅および濃縮した。
前記パニングによって得られたファージプール(phage pool)からアルファ-シヌクレイン凝集体に特異的に結合する単クローン抗体を選別するために、次のような実験を行った。
4-1:抗-アルファ-シヌクレイン抗体を用いたドットブロット分析
本願による抗体がネイティブ状態での単量体または凝集体に結合するかを分析するために、ドットブロット実験を行った。このために、抗原として50ngあるいは100ngのアルファ-シヌクレインモノマーまたはフィブリルタンパク質(ソウル大学校のイ・スンジェ教授labで製造する;Bae et al.、J.Neurosci 32:13454、2012)をDot blot apparatus(BioRad)を用いてニトロセルロースメンブレンにスポットローディングした。2倍ずつ希釈したモノマーまたはフィブリルタンパク質は、メンブレンの右から左へ順次にローディングした(12.5、25、50、100ng)。メンブレンをTBST組成の5%non-fat dry milkで1時間常温でブロッキングした後、実施例1で製造したアルファ-シヌクレイン抗体を1mg/mlの濃度で1%bovine serum albumin含有TBSTに入れて、メンブレンと当該抗体を1時間常温でインキュベーションした。その次に、TBSTで洗浄した後、HRP(horse radish peroxidase)が結合された2次抗体および基質としてchemiluminscence substrate(NEN)を製造者の方法通りに使用して信号を分析した。結果は、LAS-3000 Luminescent Image Analysis System(FUJIFILM Life Science)を用いてイメージングした。結果は、図1に記載されている。
本願による抗体の抗原に対する結合力を定量的に分析するために、ELISAを行った。このために、実施例1で得られたマウス抗-アルファ-シヌクレイン抗体を1μg/mlの濃度で96ウェルプレートにコーティングした後、ここに10、100、1000、10,000ng/ml濃度のアルファ-シヌクレインフィブリル凝集体を処理した後、PBSで洗浄し、その次に、ビオチンが結合された2次抗体およびHRPが結合されたストレプトアビジンを処理した後、基質としてTMBと反応した後に吸光度を測定し、その測定結果を図2に示した。
実施例1で製造されたアルファ-シヌクレイン抗体の単量体および凝集体抗原結合に対する定量的分析をBIAcoreを使用して行った。
実施例1で製造されたマウスアルファ-シヌクレイン抗体(3A9、9B11、11F11)の単量体および凝集体抗原結合に対する定量的分析をOctetを使用して行った。
10マイクロメートルの厚さのパラフィン包埋されたパーキンソン疾患で死亡した患者の脳組織切片を実施例2で得られたキメラ抗-アルファ-シヌクレイン抗体を用いて組織切片内レビー小体とレビー神経突起(neurite)を次のように染色した。90%ギ酸で組織切片を3分間処理してantigen retrievalを進行させた後、1% H2O2(50% ethanol base)を用いて組織自体のperoxidase活性を抑制した。組織のnon-specific bindingを防止するために、10% normal horse serumを処理した。その次に、リン酸緩衝液で洗浄した後、本願による3A9、11F11および11F11抗体をadjacent sectionに4℃で一晩処理した。リン酸緩衝液で洗浄後、ビオチンが結合されたanti-ヒトIgG抗体を37℃で30分間処理した後、avidin-biotin complexを常温で30分間反応させた(Vectastatin Elite kit;Vector Laboratories)。
実施例2で得られたキメラ抗-アルファ-シヌクレイン抗体である3A9および11F11抗体に対するエピトープマッピングは、PEPSCAN(The Netherlands)にペプチドアレイ分析を依頼して行われた。結果は、図6に開示されている。図6は、本発明の一例による抗体のエピトープマッピング結果を図式的に示したものである。
実施例4-2と実質的に同様な方法で、実施例2で得られたキメラ抗体(Ch11F11)および実施例3で得られたヒト化抗体(Hu11F11)の結合力を定量的に分析するためにsandwich ELISAを行った。
実施例4-3と実質的に同様な方法で、実施例2で得られたキメラ抗体および実施例3で得られたヒト化抗体の結合力をBIAcoreを使用して定量的に分析した。前記分析結果を図8および下記表に示す。
9-1:ベータ-シヌクレインおよびガンマ-シヌクレインとのELISA分析
実施例2によるキメラ抗体3A9、9B11、11F11の3種を生産後、当該抗体のアルファ-シヌクレインの結合特異性をそのホモログであるベータ-シヌクレインおよびガンマ-シヌクレインとのELISAと比較した。
実施例2によるキメラ抗体3A9、9B11、11F11の3種をアミロイドベータ1-42(Uniprot:P05067;CAS number:107761-42-2)およびタウ(Uniport:P10636-8)タンパク質から形成された凝集体とドットブロットで反応させて、当該抗体のアルファ-シヌクレイン凝集体に対する特異的結合力を分析した。その理由は次の通りである。
10-1:Bivalent二重抗体クローニング
Bivalent二重抗体発現ベクターを製作するために、pcDNA3.4(in vitrogen)ベクターのMCS(Multi cloning site)内にsignal sequenceを含む抗体nucleotide配列を挿入した。二重抗体発現ベクターはモノシストロン性ベクターであって、重鎖発現ベクターおよび軽鎖発現ベクターをそれぞれ製作した。
Monovalent二重抗体は、抗IGF1R scFvがC terminalにリンカーで接合されている抗a-Syn免疫グロブリン重鎖(hole)とscFvが連結されていない抗a-Syn免疫グロブリン重鎖(knob)が結合した異種二量体に抗体軽鎖が接合された形態である。
前記製造されたベクターをmaxi-prep(Qiagen)して、多量のplasmid DNAを確保後、次のように細胞に導入した。BsAbを生産するために、重鎖発現ベクターDNAおよび軽鎖発現ベクターDNAを1:1の比率で形質導入した。monovalent BsAbを生産するためには、hole type重鎖発現ベクターDNA、knob type重鎖発現ベクターDNAおよび軽鎖発現ベクターDNAを0.5:0.5:1の比率で形質導入した。
生産が完了した培養液の収得のために遠心分離用瓶に培養液を移して4℃、6500rpmで30分間遠心分離後、0.2μmの大きさのフィルターでフィルタリングを行って、浮遊物を除いた培養液を確保して、その後、精製過程を行った。
11-1:IGF1R抗体(scFV)の製造
ファージディスプレイ/パニング技術を用いて単一クローン抗体を製造した。
ヒトIGF1R抗体をスクリーニングするために、次のような方法で総3回パニングを行った。本発明に使用されたファージライブラリーは合成ヒトscFvライブラリーであり、ファージディスプレイパニング過程および結果は次の表19の通りである。
ヒトIGF1RのECD(extracellular domain)に対する結合力(protein binding)だけでなく、IGF1R発現細胞株であるMCF-7に対する結合力を示す(cell binding)クローンを選別した。
リガンド結合力およびBBB通過能を評価して選別されたクローンに対してaffinity variationを行って抗体を最適化した。1次試みでは1564 scFvを基にしてheavy chainのCDR2とlight chainのCDR3をrandomizationするためのNNS hand-mix primerを製作し、PCR技法を用いてrandomization配列が含まれている1564 scFv遺伝子を増幅させた。増幅された遺伝子はpComb3x vectorに挿入することによってphage displayに適したライブラリー形態に作り、library panningおよびELISA screeningによってIGF1Rに結合する複数のscFvクローンを選別することができた。選別されたクローンは遺伝子シークエンシングによって可変部位のアミノ酸配列を確認した。
13-1:Deamidation residue確認
CDRにdeamidationが発生すれば、抗体が分解されながら抗原への結合が弱くなって効能低下およびsample heterogenityが誘発されることがあり、Sample heterogeneityは向後の臨床承認などでそのidentificationのため複雑性を誘発する。したがって、in silico分析およびpeptide mappingによってdeamidationが発生する位置を確認しようとした。
Parental cloneである1564クローンは、in silico分析でnet chargeが-0.7である。通常、net chargeが<0あるいは>5.5である場合、体内でfast clearanceにぜい弱であると考えられる。したがって、deamidation residueをpositive chargeであるH、R、Kなどで置換すれば、deamidationもなくし全体chargeを上げてfast clearanceを防止することができると考えた。したがって、deamidationが発生する位置を図18bのように置換したmutantを生産した。
14-1:抗-IGF1R minibody形態の抗体製造
実施例11~13で確保したIGF1R特異的単一クローンファージ抗体のscFv全体をFcのC-末端に連結してミニボディを製造した。このために、本願に開示されたscFVのアミノ酸配列を暗号化する核酸配列を製造し、この配列を制限酵素で切断して、Fcをコーディングする核酸を含むpcDNA基盤の発現ベクターにクローニングした。
実施例11~13で確保したIGF1R特異的単一クローンファージ抗体のscFv全体を、治療抗体IgG形態のC-末端それぞれに二つを連結したbivalent形態を製作した。このために、本願に開示されたscFVのアミノ酸配列を暗号化する核酸配列を製造し、この配列を制限酵素で切断して、治療抗体をコーディングする核酸を含むpcDNA基盤の発現ベクターにクローニングした。
実施例11および12で確保したIGF1R特異的単一クローンファージ抗体のうち、564抗体およびF06抗体の配列を全体IgG1(Full IgG)形態に変換するために、重鎖と軽鎖領域の遺伝子配列を合成した(ゼノテック(genotech))。合成した重鎖および軽鎖遺伝子は、発現ベクターにクローニングした。
実施例14-1が重鎖二つのFcのC-末端それぞれに抗-IGF1R抗体がscFv形態に結合したminibody形態であれば、本実施例では重鎖中の一箇所のFc C-末端にのみscFv一つが結合したmonovalent形態で抗体を製造した。このために実施例11~13で確保したIGF1R特異的単一クローンファージ抗体のうちの1564、F06、C04、VH5、VH16、VH35、VH9、VH2、VH7、VH32をFc C-末端中一箇所にのみ結合させたベクター、C-末端に抗-IGF1R抗体が結合されていないベクターを製作した。当該Fc内にはknob-into-hole mutationを導入して、細胞で抗体生産時、heteromeric形態が製作されるようにした。抗体生産のためにCHO-S細胞にtransfection時には、治療抗体のFc C-末端に抗-IGF1R抗体が結合された重鎖に対するベクター、治療抗体のC-末端に抗-IGF1R抗体が結合されていない重鎖に対するベクター、治療抗体の軽鎖に対するベクター、総3個のベクターを注入した。
実施例14-1~14-4で製造されたベクターを次のように細胞に導入した。
本発明による抗IGF1R抗体をリンカー(配列番号172)を使用して重鎖可変領域と軽鎖可変領域を連結してscFVに製造し、下記表に記載された抗a-Syn抗体の完全な形態のIGG抗体の重鎖不変領域のC末端にリンカー(配列番号173)によって連結して二重抗体を製造した。本実施例では、抗a-Syn抗体の完全な形態のIGG抗体1分子当り、抗IGF1R抗体のscFv形態一つ分子を連結して製造したmonovalent抗体と、抗IGF1R抗体のscFv形態二つ分子を連結して製造したbivalent抗体をそれぞれ製造した。本実施例で二重抗体製造のために使用した抗a-Syn抗体の配列及び本件発明によって製造した二重抗体の配列は表17に記載された通りである。その後、実施例で表17に例示された二重抗体に対する実験を行った。
15-1:Minibody形態抗-IGF1R抗体のIGF1Rに対する結合力分析(ELISA)
実施例14-1で製作した996、1226、1564、MKJP2クローンのminibody形態が組換えIGF1Rに対する結合力および濃度依存的に結合するか否かを確認するためにELISA分析を行った。
実施例14-2の方法によって製作した1564抗-IGF1R抗体と、実施例11-3で確保した抗-IGF1R抗体の種間交差結合有無をELISA技法によって分析した。このために、まず、ヒト、サル、マウスおよびラットIGF1R抗原を1ug/mlで希釈して各ウェルに100ulずつ入れ、4℃で15時間反応してプレートの底にコーティングされるようにした。上澄み液を除去した後、3% BSAが含まれているPBSバッファー200ulを各ウェルに処理して非特異的な結合を遮断した。抗-IGF1R抗体を最高濃度400nMにして、PBSB(BSA3% in PBS)に5倍ずつ希釈して前記各ウェルに処理した後、37℃で1時間反応した。その次に、PBSバッファーを用いて5回洗浄した後、結合された抗体のFab部分を認知する抗-ヒトFab HRPを1:20000で希釈して各ウェルに100ul処理した後、37℃で1時間反応させた、その次にPBSバッファーで5回洗浄し、TMB(Tetramethyl benzidine、Sigma、T0440)を使用して製造者の方法通りに発色させた。酵素反応を0.5mol/Lの硫酸によって中止させ、マイクロプレートリーダー機(Molecular device)を用いて450nmで吸光度を測定した。ELISA遂行時、サンプルが多い場合はプレートを2つに分けて行い、実験結果は次の表12に示した。
実施例12で製作されたaffinity variantの結合力をIGF1R ECDタンパク質に対するELISA遂行およびMCF-7に対する結合力をFACSで分析した。
本発明による抗体とヒトIGF1R間の結合力を分析しようとした。
16-1:MCF-7に対するFACS分析
実施例14-1で製造した996、1226、および1564クローンのminibody形態が、細胞表面のendogenous IGF1Rに結合するか確認するために、ヒトIGF1Rを発現する細胞株および脳内皮細胞(brain endothelial cell)に対する結合力分析をFACSで行った。Periplasmic extractとIGF1Rが過発現すると知られたMCF-7、乳癌細胞株との結合程度をFACSで確認した。
実施例16-1で使用したMCF-7細胞株の代わりに、JIMT-1およびBT474乳癌細胞株を使用したことを除いては実質的に同様な方法で実施例14-1で製造した996、1226、および1564クローンのminibody形態が、細胞表面のendogenousのIGF1Rに結合するか確認した。前記実験結果を図12aに示した。
実施例14-2方法で製作した1564クローンの二重特異抗体形態と実施例14-3方法で製作した1564クローンのIgG形態がマウスの脳内皮細胞であるbEND.3に結合するかを分析した。この時、secondary抗体のみ処理グループおよび治療抗体単独IgG(CH11F11)処理グループを陰性対照群として使用した。FACS分析法は実施例16-1および16-2と同様に行った。分析結果は図12bに示した。
17-1:MCF-7 internalization assay-1564、996、1226、MKJP2(minibody)
実施例14-1で製造した996、1226、1564およびMKJP2クローンのminibody形態が、IGF1Rを発現する細胞株でintracellular internalizationされ、細胞内に導入された抗体は分解されずRMT Pathwayを経るかを確認しようとした。抗-IGF1R抗体がBBB通過能を向上させるシャトルとして使用されるためには、当該抗体がBBBを構成するbrain endothelial cell内にinternalizeされることが先行されなければならない。
IGF1Rに対する結合力を変化させた1564 variantの細胞表面IGF1R結合を分析するために、IGF1Rを発現するMCF-7細胞株を用いてFACS分析を行った。scFv形態の二重抗体から製作されたIGF1R抗体を10ug/mL濃度で2×10E5のMCF7細胞に30分間処理した。1% BSAが添加されたPBSバッファーで洗浄した後、ヒト抗体をdetectionするFITCが結合された2次抗体を1時間処理した。PBSバッファーで洗浄した後、FACS分析によって結合力が変化多様なvariantの細胞外結合およびinternalizationを確認した。
実施例14-2および14-4で製作した1564クローンのbivalentおよびmonovalent形態がヒト由来brain endothelial細胞(primary human microvascular brain endothelial cell(HMBEC))にinternalizeされるか分析した。治療抗体IgG(11F11)を陰性対照群として使用した。
万一、当該抗体がinternalizeされた後、細胞内のリソソーム関連マーカとcolocalizeすれば、当該抗体はbrain endothelial cell内で分解されてしまうためBBBを通過できない。これとは反対に、exocytosisに関連するearly endosomeあるいはBBB通過に関連すると知られたマーカとcolocalizeすれば、当該抗体はbrain endothelial cellにinternalizeされた後、脳側に抜け出るreceptor-mediated transcytosisによってBBBを通過すると予想される。
-Anti-Caveolin-1:caveolin-mediated transcytosisマーカ(BBB通過の主要メカニズムと思われる)
-Anti-EEA1:early endosomeマーカ
残り方法は実施例17-2と同様であるが、前記のマーカに対するsecondary抗体をそれぞれ処理した。
18-1:MCF-7細胞株のIGF1Rによるproliferation assay
本発明による抗-IGF1R抗体がIGF1R(IGF1受容体)とそのリガンドであるIGF1間の結合を妨害するか否かを、IGF1による細胞増殖効能を用いて確認した。
前記実験結果から、本発明による抗体は、IGF1のIGF1Rに対するsignalingによるMCF-7の細胞増殖を阻害しないことが確認された。対照群として使用したImclone社の抗-IGF1R抗体は、IGF1によるMCF-7の細胞増殖を処理濃度に比例して阻害した。したがって、本発明の抗体はBBBを構成するendothelial cellに発現するIGF1Rに結合してBBB通過能を有するが、同時に体内IGF1によるsignalingを阻害しない抗体であるので、本発明による抗体はBBBシャトルとして使用できるのを確認した。
本発明による抗-IGF1R抗体が、IGF1R発現細胞と結合するIGF1がsignalingを細胞内に伝達する時、そのsignalingのreceptorおよびdownstream signaling componentに関与するかどうかを確認するために実験した。即ち、IGF1Rを発現するMCF-7細胞株に抗-IGF1R抗体を投与し、これによる細胞内の全体IGF1R、リン酸化されたIGF1R、IGF1Rのdownstream factorである全体Akt、リン酸化されたAkt量を分析した。
本発明による抗-IGF1R抗体が、マウス由来brain endothelial細胞にIGF1がsignalingを細胞内に伝達する時、そのsignalingのreceptorおよびdownstream signaling componentに関与するかどうかを確認するために実験した。即ち、IGF1Rを発現することが確認されたbEND3細胞株に実施例14-2の方法で製作された11F11-1564、3A9-1564(CH11F11とch3A9、抗a-syn単独抗体として大韓民国公開特許2018-0081465に記載されたもの)および実施例14-3の方法で製作された1564クローンのIgG形態を投与し、これによる細胞内の全体IGF1R、リン酸化されたIGF1R、IGF1Rのdownstream factorである全体Akt、リン酸化されたAkt量を分析した。
前記実験結果から、本発明による抗体は、細胞内の全体IGF1R、リン酸化されたIGF1R、IGF1Rのdownstream factorである全体Akt、リン酸化されたAkt量に影響を与えないことを確認した。
19-1:IgG形態IGF1R抗体のADCC分析
実施例14-3による抗-IGF1R抗体がIgG形態として、IGF1R発現細胞の表面に結合してIGF1R依存的な結合によって細胞死滅に影響を与えるか確認するために実験した。即ち、IGF1R発現細胞株に抗-IGF1R抗体である1564クローンが結合した時、ナチュラルキラー細胞(Natural killer cell、NK cell)を活性化させてIGF1R発現細胞に悪影響を与えるかをADCC reporter bioassay kitを使用して分析した。
BBBシャトルとして使用される抗体はbrain endothelial cellのターゲットreceptorに結合して治療抗体の通過能を高める役割を果たすが、当該receptorレベルに変化を与えてはいけない。ターゲットreceptorのdown regulationは当該ターゲットの脳での役割に影響を与えて副作用を引き起こすことがある。
BBBシャトルはbrain endothelial cell表面のreceptorに結合して治療抗体を脳内に伝達するが、脳内の正常細胞表面のreceptorへの結合は少なくなければならない。万一、BBBシャトルが脳内で抗原を発現する正常細胞に多量結合すれば、それだけ当該シャトルに結合された治療抗体は疾患ターゲットに少なく到達するようになる。
20-1.sv-ARBEC由来BBBモデルでbivalent抗体のBBB通過能分析
実施例11および12由来抗体を実施例14-2で製作した二重特異抗体のin vitro BBB通過能をSv-ARBECから構成されたBBBモデルで評価した。Sv-ARBECをpermeable membraneの上に単一層でプレーティングし、当該BBBシステムの抵抗値(TEER)およびsucrose通過程度を基にして当該システムのintegrityを予め評価した。この時、sv-ARBECは当該システムのintegrityに役立つことが確認されたラットastrocyte培養medium(RAS-CM)を処理した。テスト抗体である1564、48G5、54H4、60H6、B11のbivalent二重特異抗体をmembraneの上に処理した後、90分後にbottom chamberでの抗体量を質量分析で分析した。質量分析のために、各抗体FcおよびscFvでのsignature peptideが分析された後、使用された。この時、パーキンソン病治療抗体単独(11F11)および当該抗体にHerceptinTMのバイオシミラーのscFv形態を結合させた二重特異抗体を陰性対照群として使用した。当該システムにはBBBを通過しないと知られたA20.1抗体(national research council製作)を通過させて当該システムの検量限界線を決めた。質量分析で導出された結果値を先行文献で知られた公式に代入してPapp値を決定し、この値はin vitroでのBBB通過能程度を示す。
20-1と同一のモデルで、実施例14-4を基にして製作したmonovalent抗体と実施例14-2を基にして制作したbivalent抗体のin vitro BBB通過能を分析した。1564クローンから製作したbivalent、monovalent抗体および陰性対照群であるパーキンソン病治療抗体(3A9)をsv-ARBEC BBBシステムに通過させた後、通過量を分析した。分析結果は、図16bに示した。
ヒトstem cell由来BBBモデルは、ラットあるいはマウス細胞由来BBBシステムに比べて高い抵抗値(TEER)を示し、BBBで確認された多様なマーカを全て発現する。したがって、ヒトstem cell由来モデルのBBB tightnessは動物細胞由来BBBに比べて高く、当該モデルはヒトBBBをよく再現している。
21-1.minibodyのbrain vesselとのcolocalization
本発明の抗-IGF1R抗体がin vivoでbrain vasculatureに沿って分布するかどうかを確認するために次のような実験を行った。
前記実験結果から、本発明によるリガンド結合非阻害クローン(non-blocking antibodies)は優れたBBB通過能を有するのを確認し、抗体が脳血管とcolocalizationする程度を免疫染色で分析する方法(Neuron(2016)Yu-Zuchero et al.)によって、脳組織を血管マーカ(anti-CD31、緑色)とヒト抗体(anti-human Fc、赤色)で染色した結果、本願の一例によるリガンド結合非阻害クローンはIgG対照群に比べて高いcolocalization程度を示した。
本願抗-IGF1R抗体のin vivo BBB通過能をnormal ratで確認しようとした。SD ratに10mg/kgあるいは30mg/kgのパーキンソン病治療単独抗体(11F11)あるいは1564クローンがbivalent形態に結合された二重特異抗体(11F11-1564)を尾静脈に単回投与後、24時間目にそのCSFおよびbrainでの抗体量を質量分析で分析した。質量分析方法は実施例20-1での方法と同一であった。
その結果、1次試験群では、1564のmonovalent、F06のmonovalent、C04のmonovalentがparental 1564クローンのbivalentに比べて長くなったserum PKを示した。2次試験群では、VH35 bivalent群を除いてVH2、VH5、VH7、VH9、VH16、VH32のbivalent形態がparental 1564 bivalentに比べて増大されたserum PKを示した。
脱アミド化反応は例えば、アスパラギンの側鎖ペプチド結合を攻撃して対称構造のスクシンイミド中間産物を作ることを意味し、この中間産物は加水分解によってアスパラギン酸あるいはイソアスパラギン酸のうちの一つに変わるようになる。このような脱アミン化反応はタンパク質の持続的な活性に影響を与えることがあるため、軽鎖および重鎖アミノ酸を他のアミノ酸で置換して脱アミン化を防止すると同時に、長期間の安定性を確保しようとした。
23-1.抗-IGF1R抗体とboiled、native IGF1Rタンパク質のELISA
抗-IGF1R抗体が線状あるいはconformational epitopeを認識するか確認しようとした。1564、48G5、54H4、60H6、B11のbivalent二重特異抗体とnative ヒトIGF1R ECDタンパク質あるいは当該タンパク質に熱を加えたタンパク質(boiled IGF1R)に対するELISAを行った。ELISA方法は、実施例15に示された方法と同一であった。分析結果は表28に示した。
1564クローンのConformational epitopeを分析するために、次のようにalanine scanningを行った。IGF1R発現度が低いと確認された卵巣ガン細胞株であるOVCAR3細胞にN-末端にはeGFP tagが融合されC-末端kinase domainは除去されたIGF1Rライブラリーを発現させた。IGF1Rライブラリーは、IGF1R表面の残基がalanineで置換された突然変異を含む。準備されたライブラリーをOVCAR3細胞にtransfectionした。IGF1Rの発現が確認された細胞に対して1564抗体を処理し、その後、DyLight650が標識された二次抗体を処理して蛍光標識した。標識された細胞をIGF1R発現有無とIGF1Rの発現と1564結合有無によって分類した後、これらに対してイルミナHiSeq技法でRNA deep sequencingを行って、当該細胞群での各alanine突然変異の頻度を分析した。当該頻度数はwilde type IGF1Rを発現した細胞に対する結果として正規化した後、相対頻度を計算して、1564が標識された細胞群でその数字が減少した突然変異を選別した。このような観察に基づいて、1564のエピトープはFN2ドメインに位置することが分かり、これに属する残基はY775、P776、F778、R650、S791、L798であることが分かった。当該結果および1564クローンが認識するシークエンスは、図19に示した。この残基は先行文献によればIGF1の結合に関与しないので、当該結果は実施例23-1で1564が示す性質を忠実に説明している。
24-1:a-syn抗原に対する単独抗体および二重抗体の結合力
IGF1R抗体がscFv形態でIgG形態のa-syn抗体と連結させた時、a-syn抗体の結合力に対する影響を分析した。
IGF1R抗原に対するa-syn単独抗体と二重抗体の結合程度を比較するために実施例22と同様な方法で実験を行った。
実施例24-1と同様な方法で実験を行って、キメラ二重抗体とヒト化二重抗体間の結合力差を分析した。
食細胞作用は、大食細胞の多様な受容体が関与して細胞外不必要な物質を除去する作用を意味する。多様なタンパク質凝集体は免疫反応や炎症反応を誘導して人体に悪影響を与えるようになり、特に、a-syn凝集体の除去のために抗体を投与した時、抗体のFc部位と細胞表面のFcrRとの相互作用によって促進されると知られている。このような理由で、単独抗体とIGF1R scFvが連結された二重抗体の食細胞作用に対する活性を比較した。
実施例14-6によってキメラ11F11抗体と1564クローンscFvのbivalent二重特異抗体を製作し、ヒトアルファ-シヌクレインを過発現する形質転換マウス(mThy-1 human α-synuclein、UC San Diego)で二重特異抗体とアルファ-シヌクレイン抗体のインビボで効果を比較、分析した。2.5mg/kgの単独抗体またはヒトIgGまたは同一モル数のbivalent二重特異抗体を3ヶ月間毎週腹腔投与した。グループ当り5匹のマウスを使用し、非形質転換マウス(non-transgenic littermate)を対照群として使用した。その次に、灌流を次のように行った。
図21aは、キメラ11F11抗体および当該キメラ抗体と1564クローンのbivalent二重特異抗体がヒトα-Synを過発現するマウス動物モデル(TG)でアルファ-シヌクレイン凝集体を除去することができるかを、マウスに抗体投与後、p-129 α-Syn抗体を用いてマウス脳組織中のcortex、hippomcapusを染色して測定した結果である。p-129 α-synは129番目残基がリン酸化された形態の凝集体のマーカであって、染色された組織で濃い茶色点あるいは凝集体形態に示される。
グリオーシス(gliosis)は、BBBの損傷、TGF-ベータまたはインターロイキンのような物質によって触発される、中枢神経系に損傷がある場合、これに対する反応として膠細胞(glial cell)で起こる非特異的反応である。代表的なものとして、Astrogliosisを含み、GFAPタンパク質がマーカーとして使用される。よって、キメラ11F11抗体およびキメラ抗体と1564クローンの二重特異抗体をマウスに投与してAstrogliosis減少およびこれを触発する炎症性サイトカイン放出減少に及ぼす影響を分析した。分析結果は、図21cおよび21dに開示されている。
アルファシヌクレインの神経毒性および炎症反応によって脳細胞の死滅が発生するのを先行文献で確認されてきた。本願の単独抗体および二重特異抗体がアルファ-シヌクレインによるin vivoでの脳細胞死滅を抑制できるか分析した。
FcRnは、血管内で抗体が循環する時、溶解されないように細胞内に抗体を引き込んで循環させることによって半減期を増加させる細胞膜の重要な受容体である。BBB通過能はトランスサイトーシス抗体の活性も重要であるが、血管内での濃度に依存してBBBを通過するということはよく知られた事実である。このような理由で、二重抗体の半減期を増加させるためにFc部位の428番目アミノ酸をメチオニン(Met)をロイシン(Leu)に変化させてFcRnとの結合力を増大させた二重抗体を製作した。Human FcRnを発現するtg mouseに10mg/kg濃度でWT二重抗体とM428L二重抗体を投与して比較した結果、図22のように、約50%程度の半減期増大効果を確認した。半減期増加を再確認するために、サルにWT二重抗体、Bivalent M428L二重抗体、monovalent M428L二重抗体を投与してPK profileを分析した。図22aのように、WT二重抗体の場合、168時間以後から急激に血液内濃度が低まる反面、FcRnとの結合力が高いM428L二重抗体はWTに比べて向上した血液内濃度を維持した。半減期は、WT二重抗体に比べてM428L二重抗体で1.5日程度増加する結果を確認した。特に、clearance側面からは、monovalent M428L二重抗体が最も優れており、WT二重抗体が最も速いclearanceを示した(図22b)。
Claims (29)
- 抗a-Syn抗体またはその抗原結合断片;および抗IGF1R抗体またはその抗原結合断片を含む、抗a-Syn/抗IGF1Rの二重特異抗体であって、
前記抗IGF1R抗体は、重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含み、
前記重鎖可変領域は、配列番号1~配列番号9のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖CDR1(H-CDR1)、配列番号10~配列番号49のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖CDR2(H-CDR2)、および配列番号50~配列番号80のアミノ酸配列のうちの一つを重鎖CDR3(H-CDR3)を含み、
前記軽鎖可変領域は、配列番号96~配列番号113のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖CDR1(L-CDR1)、配列番号114~配列番号132のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖CDR2(L-CDR2)、および配列番号133~配列番号161のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖CDR3(L-CDR3)を含むものである、二重特異抗体。 - 前記抗a-Syn抗体またはその抗原結合断片は、ヒトアルファ-シヌクレインタンパク質のC-末端領域に特異的に結合するものである、請求項1に記載の二重特異抗体。
- 前記抗a-Syn抗体またはその抗原結合断片は、配列番号126のアミノ酸配列で、N-末端から110番残基~120番残基を含む連続する少なくとも11個のアミノ酸を含むペプチド、または111番残基~122番残基を含む連続する少なくとも12個のアミノ酸を含むペプチドに特異的に結合するものである、請求項1に記載の二重特異抗体。
- 前記抗a-Syn抗体またはその抗原結合断片は、
配列番号1および配列番号6のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖CDR1(H-CDR1)、配列番号2~4および配列番号7~8のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖CDR2(H-CDR2)、配列番号5および配列番号9のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖CDR3(H-CDR3)、配列番号10および配列番号13のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖CDR1(L-CDR1)、配列番号11および配列番号14のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖CDR2(L-CDR2)、および
配列番号12および配列番号15のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖CDR3(L-CDR3)を含むものである、請求項1に記載の二重特異抗体。 - 前記抗a-Syn抗体またはその抗原結合断片は、
配列番号1のアミノ酸配列を含む重鎖CDR1(H-CDR1)、配列番号2~4のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖CDR2(H-CDR2)、および配列番号5のアミノ酸配列を含む重鎖CDR3(H-CDR3)を含む重鎖可変領域;および
配列番号10のアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1(L-CDR1)、配列番号11のアミノ酸配列を含む軽鎖CDR2(L-CDR2)、および配列番号12のアミノ酸配列を含む軽鎖CDR3(L-CDR3)を含む軽鎖可変領域を含むものである、請求項4に記載の二重特異抗体。 - 前記抗a-Syn抗体またはその抗原結合断片は、
配列番号6のアミノ酸配列を含む重鎖CDR1(H-CDR1)、配列番号7~8のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖CDR2(H-CDR2)、および配列番号9のアミノ酸配列を含む重鎖CDR3(H-CDR3)を含む重鎖可変領域;および
配列番号13のアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1(L-CDR1)、配列番号14のアミノ酸配列を含む軽鎖CDR2(L-CDR2)、および配列番号15のアミノ酸配列を含む軽鎖CDR3(L-CDR3)を含む軽鎖可変領域を含むものである、請求項4に記載の二重特異抗体。 - 前記抗a-Syn抗体の重鎖可変領域は、
配列番号16~17および配列番号35~40のアミノ酸配列のうちの一つを含む、H-CDR1のN-末端側に位置する重鎖可変領域フレームワーク1(H-FR1)、
配列番号18~19および配列番号41~44のアミノ酸配列のうちの一つを含む、H-CDR1とH-CDR2の間に位置する重鎖可変領域フレームワーク(H-FR2)、
配列番号20~31および配列番号45~50のアミノ酸配列のうちの一つを含む、H-CDR2とH-CDR3の間に位置する重鎖可変領域フレームワーク(H-FR3)、および
配列番号32~34および配列番号51~52のアミノ酸配列のうちの一つを含むH-CDR3のC末端に位置する重鎖可変領域フレームワーク(H-FR4)を含むものである、請求項1に記載の二重特異抗体。 - 前記抗a-Syn抗体の軽鎖可変領域は、
配列番号53~58および配列番号71~77のアミノ酸配列のうちの一つを含む、L-CDR1のN-末端側に位置する軽鎖可変領域フレームワーク1(L-FR1)、
配列番号59~61および配列番号78~81のアミノ酸配列のうちの一つを含む、L-CDR1とL-CDR2の間に位置する軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR2)、
配列番号62~67および配列番号82~88のアミノ酸配列のうちの一つを含む、L-CDR2とL-CDR3の間に位置する軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR3)、および
配列番号68~70および配列番号89のアミノ酸配列のうちの一つを含む、L-CDR3のC末端に位置する軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR4)を含むものである、請求項4に記載の二重特異抗体。 - 前記抗a-Syn抗体の重鎖可変領域は、
配列番号16~のアミノ酸配列のうちの一つを含む、H-CDR1のN-末端側に位置する重鎖可変領域フレームワーク1(H-FR1)、
配列番号18~19のアミノ酸配列のうちの一つを含む、H-CDR1とH-CDR2の間に位置する重鎖可変領域フレームワーク(H-FR2)、
配列番号20~31のアミノ酸配列のうちの一つを含む、H-CDR2とH-CDR3の間に位置する重鎖可変領域フレームワーク(H-FR3)、および
配列番号32~34のアミノ酸配列のうちの一つを含む、H-CDR3のC末端に位置する重鎖可変領域フレームワーク(H-FR4)を含むものであり、
前記抗a-Syn抗体の軽鎖可変領域は、
配列番号53~58のアミノ酸配列のうちの一つを含む、L-CDR1のN-末端側に位置する軽鎖可変領域フレームワーク1(L-FR1)、
配列番号59~61のアミノ酸配列のうちの一つを含む、L-CDR1とL-CDR2の間に位置する軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR2)、
配列番号62~67のアミノ酸配列のうちの一つを含む、L-CDR2とL-CDR3の間に位置する軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR3)、および
配列番号68~70のアミノ酸配列のうちの一つを含む、L-CDR3のC末端に位置する軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR4)を含むものである、請求項5に記載の二重特異抗体。 - 前記抗a-Syn抗体の重鎖可変領域は、
配列番号35~40のアミノ酸配列のうちの一つを含む、H-CDR1のN-末端側に位置する重鎖可変領域フレームワーク1(H-FR1)、
配列番号41~44のアミノ酸配列のうちの一つを含む、H-CDR1とH-CDR2の間に位置する重鎖可変領域フレームワーク(H-FR2)、
配列番号45~50のアミノ酸配列のうちの一つを含む、H-CDR2とH-CDR3の間に位置する重鎖可変領域フレームワーク(H-FR3)、および
配列番号51~52のアミノ酸配列のうちの一つを含む、H-CDR3のC末端に位置する重鎖可変領域フレームワーク(H-FR4)を含むものであり、
前記抗a-Syn抗体の軽鎖可変領域は、
配列番号71~77のアミノ酸配列のうちの一つを含む、L-CDR1のN-末端側に位置する軽鎖可変領域フレームワーク1(L-FR1)、
配列番号78~81のアミノ酸配列のうちの一つを含む、L-CDR1とL-CDR2の間に位置する軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR2)、
配列番号82~88のアミノ酸配列のうちの一つを含む、L-CDR2とL-CDR3の間に位置する軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR3)、および
配列番号89のアミノ酸配列のうちの一つを含む、L-CDR3のC末端に位置する軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR4)を含むものである、請求項6に記載の二重特異抗体。 - 前記抗a-Syn抗体の重鎖可変領域は、
配列番号90~101または配列番号102~108から選択されるアミノ酸配列;
配列番号90~101または配列番号102~108から選択されるアミノ酸配列と少なくとも90%以上の相同性を有する配列;または
配列番号90~101または配列番号102~108から選択されるアミノ酸配列と少なくとも95%以上の相同性を有する配列を含むものである、請求項4に記載の二重特異抗体。 - 前記抗a-Syn抗体の軽鎖可変領域は、
配列番号109~115または配列番号116~123から選択されるアミノ酸配列;
配列番号109~115または配列番号116~123から選択されるアミノ酸配列と少なくとも90%以上;または
配列番号109~115または配列番号116~123から選択されるアミノ酸配列と少なくとも95%以上の相同性を有する配列を含むものである、請求項4に記載の二重特異抗体。 - 前記抗a-Syn抗体またはその抗原結合断片は、配列番号90~101のアミノ酸配列のうちの一つの重鎖可変領域と配列番号109~115のアミノ酸配列のうちの一つの軽鎖可変領域を含むものである、請求項4に記載の二重特異抗体。
- 前記抗a-Syn抗体またはその抗原結合断片は、配列番号102~108のアミノ酸配列のうちの一つの重鎖可変領域と配列番号116~123のアミノ酸配列のうちの一つの軽鎖可変領域を含むものである、請求項4に記載の二重特異抗体。
- 前記抗a-Syn抗体またはその抗原結合断片は、
配列番号127重鎖可変領域と配列番号128の軽鎖可変領域を含み、配列番号129の重鎖可変領域と配列番号130の軽鎖可変領域を含み、配列番号131の重鎖可変領域と配列番号132の軽鎖可変領域を含み、配列番号133の重鎖可変領域と配列番号134の軽鎖可変領域を含み、配列番号135の重鎖可変領域と配列番号136の軽鎖可変領域を含み、または配列番号137の重鎖可変領域と配列番号138の軽鎖可変領域を含むものである、請求項4に記載の二重特異抗体。 - 前記抗IGF1R抗体またはその抗原結合断片は、配列番号1~配列番号9のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖CDR1(H-CDR1)、配列番号10~配列番号49のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖CDR2(H-CDR2)、および配列番号50~配列番号80のアミノ酸配列のうちの一つを含む重鎖CDR3(H-CDR3)を含む重鎖可変領域と、
配列番号96~配列番号113のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖CDR1(L-CDR1)、配列番号114~配列番号132のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖CDR2(L-CDR2)、および配列番号133~配列番号161のアミノ酸配列のうちの一つを含む軽鎖CDR3(L-CDR3)を含む軽鎖可変領域を含む、請求項1に記載の二重特異抗体。 - 前記抗IGF1R抗体またはその抗原結合断片は、配列番号174のアミノ酸配列を含むタンパク質でY775、P776、F778、R650、S791、L798、Glu779、L641、H808、E809、L813、V397、D435、W434、Y460、およびC488からなる群より選択された少なくとも一つ以上のアミノ酸を特異的に認識して結合するものである、請求項16に記載の二重特異抗体
- 前記抗IGF1R抗体またはその抗原結合断片は、配列番号174のアミノ酸配列を含むタンパク質で結合部位1~結合部位3からなる群より選択された少なくとも一つ以上の結合部位に結合するものであり、前記結合部位1はY775、P776、F778、R650、S791、L798、およびGlu779からなる群より選択された一つ以上のアミノ酸を含み、結合部位2はL641、H808、E809、およびL813からなる群より選択された一つ以上のアミノ酸を含み、結合部位3はV397、D435、W434、Y460、およびC488からなる群より選択された一つ以上のアミノ酸を含むものである、請求項17に記載の二重特異抗体。
- 前記重鎖可変領域は、
配列番号81~84のアミノ酸配列のうちの一つを含む、H-CDR1のN-末端側に位置する重鎖可変領域フレームワーク1(H-FR1)、
配列番号85~86のアミノ酸配列のうちの一つを含む、H-CDR1とH-CDR2の間に位置する重鎖可変領域フレームワーク(H-FR2)、
配列番号87~91のアミノ酸配列のうちの一つを含む、H-CDR2とH-CDR3の間に位置する重鎖可変領域フレームワーク(H-FR3)、および
配列番号92~95のアミノ酸配列のうちの一つを含む、H-CDR3のC末端に位置する重鎖可変領域フレームワーク(H-FR4)を含むものである、請求項17に記載の二重特異抗体。 - 前記軽鎖可変領域は、
配列番号162~164のアミノ酸配列のうちの一つを含む、L-CDR1のN-末端側に位置する軽鎖可変領域フレームワーク1(L-FR1)、
配列番号165のアミノ酸配列を含む、L-CDR1とL-CDR2の間に位置する軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR2)、
配列番号166~168のアミノ酸配列のうちの一つを含む、L-CDR2とL-CDR3の間に位置する軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR3)、および
配列番号169~171のアミノ酸配列のうちの一つを含む、L-CDR3のC末端に位置する軽鎖可変領域フレームワーク(L-FR4)を含むものである、請求項17に記載の二重特異抗体。 - 前記抗IGF1R抗体の抗原結合断片は、scFv、(scFv)2、scFv-Fc、Fab、Fab’、およびF(ab’)2からなる群より選択されるものである、請求項16に記載の二重特異抗体。
- 前記抗a-Syn抗体は完全な抗体であり、抗IGFR抗体は抗体のFv-断片である、請求項1に記載の二重特異抗体。
- 前記抗a-Syn抗体は、完全な抗体はIgG1、IgG2、IgG3またはIgG4形態である、請求項1に記載の二重特異抗体
- 抗IGFR抗体の抗原結合断片は、scFv、(scFv)2、scFv-Fc、Fab、Fab’およびF(ab’)2からなる群より選択されるものである、請求項1に記載の二重特異抗体。
- 請求項1~24のうちのいずれか一項による二重特異抗体を含む、α-synucleinopathyの予防または治療用薬学組成物。
- 前記α-synucleinopathyは、パーキンソン疾患(Parkinson’s disease、PD)、パーキンソン疾患性認知症(Parkinson’s disease dementia、PDD)、レビー小体認知症(dementia with Lewy bodies、DLB)、アルツハイマーレビー小体疾患(Lewy body variant of Alzheimer’s disease(LBV))、複合性アルツハイマーおよびパーキンソン病(Combined Alzheimer’s and Parkinson disease)、または多系統萎縮症(multiple system atrophy、MSA)を含むものである、請求項25に記載の組成物。
- 請求項1~24のうちのいずれか一項による二重特異抗体を提供する段階、および前記二重抗体を含む、α-synucleinopathyの予防または治療用薬学組成物。
- 請求項1~24のうちのいずれか一項による二重特異抗体を薬学的に有効な量でα-synucleinopathyの治療および/またはα-syn凝集体の濃度調節が必要な対象体に投与する段階を含む、α-synucleinopathyの治療方法。
- 請求項1~24のうちのいずれか一項による二重特異抗体を薬学的に有効な量でα-synucleinopathyの治療および/またはα-syn凝集体の濃度調節が必要な対象体に投与する段階を含む、α-syn凝集体の形成阻害またはα-syn凝集体の濃度を減少させる方法。
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