JP2024095792A - 組織メタロプロテイナーゼ阻害物質３型（ｔｉｍｐ－３）の変異体、組成物、及び方法 - Google Patents

組織メタロプロテイナーゼ阻害物質３型（ｔｉｍｐ－３）の変異体、組成物、及び方法 Download PDF

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Jeonghoon Sun
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Abstract

【課題】マトリクスメタロプロテイナーゼ（ＭＭＰ）活性の治療的阻害剤としての組織メタロプロテイナーゼ阻害物質３（ＴＩＭＰ－３）を提供する。【解決手段】ＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質、変異体、及び誘導体と、それらをコードする核酸と、それらの作成方法、並びに炎症性状態、骨関節炎、心筋虚血、再潅流傷害、及び、鬱血性心不全への進行からなる群より選択される状態の治療における使用方法とが開示される。【選択図】なし

Description

関連出願の相互参照
本願は、２０１３年３月１４日出願の米国仮特許出願第６１／７８２，６１３号；２０１３年３月１５日出願の米国仮特許出願第６１／７９８，１６０号；２０１３年３月１８日出願の米国仮特許出願第６１／８０２，９８８号；及び２０１４年２月１７日出願の米国仮特許出願第６１／９４０，６７３号の利益を主張し、これらの文献はその全体が参照により本明細書に援用される。
配列表の参照
本願は、電子フォーマットの配列表と一緒に提出されている。この配列表は、２０１４年３月１１日作成のＡ－１８２７ＷＯＰＣＴ＿ＳＬ３１３１４という表題のファイルとして提供されており、サイズが３０６ＫＢである。その配列表に関する電子フォーマットの情報は、その全体が参照により本明細書に援用される。
本発明は一般に、メタロプロテイナーゼ阻害物質に関する。詳しくは、本発明は、組織メタロプロテイナーゼ阻害物質３（「ＴＩＭＰ－３」）及びその新規で有用な変異体、突然変異タンパク質、及び誘導体に関する。
結合組織と関節軟骨は、細胞外マトリクスの合成と分解という互いに反対の作用によって動的な平衡状態に維持される。マトリクスの分解は、主に、マトリクスメタロプロテイナーゼ（ＭＭＰ）や、トロンボスポンジンモチーフを有するディスインテグリンメタロプロテイナーゼ（ＡＤＡＭＴＳ）を含むメタロプロテイナーゼの酵素作用によって、引き起こされる。これらの酵素は多くの自然な過程（発育、形態形成、骨再形成、創傷治癒、及び血管形成を含む）において重要である一方、これらの酵素が調節不全になるとそのレベルの上昇につながり、関節リウマチ及び骨関節炎を含む結合組織の崩壊性疾患、並びにがん及び心血管病態を起こす有害な働きをすると考えられる。
内因性のメタロプロテイナーゼ阻害物質としては、プラズマα２－マクログロブリンや、組織メタロプロテイナーゼ阻害物質（ＴＩＭＰ）があり、そのうち、ヒトゲノムでコードされると知られているものが４つある。ＴＩＭＰ－３は、全ての主な軟骨退化メタロプロテアーゼを阻害し、複数の方面の検証により、それが軟骨を保護することが示されている。軟骨移植片へのこのタンパク質の付加はサイトカイン誘発性分解を予防し、骨関節炎のラット内側半月板断裂モデルにおける関節内注射では、軟骨損傷が低減される。
ＭＭＰの調節不全はまた、鬱血性心不全で起こり、多くの炎症誘発性過程で一因となっていると考えられる。しかしながら、ＭＭＰ活性の治療的阻害剤としてＴＩＭＰ－３を開発することは、組換えタンパク質の産生における難題や、組換え形式のＴＩＭＰ－３の短い半減期によって妨げられてきた。そのため、当分野には、有利な産生特性、精製特性、薬物動態学的／薬力学的特性を示す形式のＴＩＭＰ－３に対する必要性がある。
天然の全長ヒトＴＩＭＰ－３と突然変異型の全長ヒトＴＩＭＰ－３の配列比較を示し、後者では、配列内の特定のアミノ酸を文字「Ｘ」に置き換えてある。シグナル配列には下線が引いてあり、したがって、それは本明細書に記載のとおりに他のシグナル配列に置換することができる。 天然の全長ヒトＴＩＭＰ－３と変異体のＴＩＭＰ－３の配列比較を示し、後者では、所定のアミノ酸の置換が行われている。シグナル配列が存在し、天然の全長ＴＩＭＰ－３配列のそれに下線を引いて番号付けの一貫性を維持するようにし、したがって、それは本明細書に記載のとおりに他のシグナル配列に置換することができる。 二次元的ポリペプチドマップを示し、ＴＩＭＰ－３のＮ－領域（残基２３～１４３）及びＣ－領域（１４４～２１１）を含むアミノ酸残基と、ジスルフィド結合を形成するシステイン位置とが特定できるようにアミノ酸が配列されている。 天然のヒトＮ末端ＴＩＭＰ３と突然変異型のヒトＮ末端ＴＩＭＰ３の配列比較を示し、後者では、配列内の特定のアミノ酸を文字「Ｘ」に置き換えてある。シグナル配列には下線が引いてあり、したがって、それは本明細書に記載のとおりに他のシグナル配列に置換することができる。所定の置換が成熟型のＮ末端ＴＩＭＰ－３において考えられ、本明細書中に「ｎ＃ｍ」として表されており、そこで、「ｎ」はＴＩＭＰ－３の天然のＮ末端領域に見出されるアミノ酸を表し、「＃」はアミノ酸残基数を表し、「ｍ」は、置換されたアミノ酸（「‐」は、アミノ酸が欠失したことを示す）を表す。このようにして、例えば、「Ｋ４５Ｉ」は、アミノ酸４５にあるリジン（Ｋ）がイソロイシン（Ｉ）で置換されたことを示す。Ｍ６７の欠失は、Ｍ６７－によって示される。一対のグリシンによる残基７１～７７の置換は、Ｙ７０－ＧＧ－Ｈ７８によって示される。本明細書に例示される突然変異型のヒトＴＩＭＰ－３は、次の突然変異を含む（単独または組合せで）：Ｒ４３Ｆ、Ｋ４５Ｉ、Ｋ４５Ｔ、Ｋ５３Ｔ、Ｅ５４Ｙ、Ｋ６５Ｔ、Ｍ６７－、Ｋ６８Ｔ、Ｋ６８Ｉ、Ｙ７０－ＧＧ－Ｈ７８、Ｈ７８Ｗ。突然変異の具体的な組合せとしては、Ｋ４５Ｉ、Ｋ５３Ｔ、Ｅ５４Ｙ、Ｋ６５Ｔ、Ｍ６７－、Ｋ６８Ｔ；Ｋ４５Ｉ、Ｋ５３Ｔ、Ｅ５４Ｙ、Ｍ６７－、Ｋ６８Ｉ；Ｋ４５Ｉ、Ｋ５３Ｔ、Ｋ６５Ｔ、Ｍ６７－、Ｋ６８Ｔ；Ｋ４５Ｉ、Ｋ５３Ｔ、Ｍ６７－、Ｋ６８Ｉ；Ｋ４５Ｉ、Ｋ５３Ｔ、Ｍ６７－、Ｋ６８Ｉ、Ｈ７８Ｗ；Ｋ４５Ｉ、Ｋ６５Ｔ、Ｋ６８Ｉ；Ｋ４５Ｉ、Ｋ６５Ｔ、Ｍ６７－、Ｋ６８Ｔ；Ｋ４５Ｉ、Ｋ６５Ｔ、Ｍ６７－、Ｋ６８Ｔ、Ｈ７８Ｗ；Ｋ４５Ｉ、Ｍ６７－、Ｋ６８Ｉ、Ｈ７８Ｗ；Ｋ４５Ｉ、Ｍ６７－、Ｋ６８Ｔ；Ｋ４５Ｔ、Ｋ６５Ｔ、Ｍ６７－、Ｋ６８Ｉ；Ｋ４５Ｔ、Ｋ６５Ｔ、Ｍ６７－、Ｋ６８Ｔ；Ｋ５３Ｔ、Ｅ５４Ｙ；Ｋ５３Ｔ、Ｈ７８Ｗ；Ｒ４３Ｆ、Ｋ４５Ｉ、Ｋ６５Ｔ、Ｋ６８Ｉが挙げられる。 天然のヒトＮ末端ＴＩＭＰ３と突然変異型のヒトＮ末端ＴＩＭＰ３の配列比較を示し、後者では、配列内の特定のアミノ酸を文字「Ｘ」に置き換えてある。シグナル配列には下線が引いてあり、したがって、それは本明細書に記載のとおりに他のシグナル配列に置換することができる。所定の置換が成熟型のＮ末端ＴＩＭＰ－３において考えられ、本明細書中に「ｎ＃ｍ」として表されており、そこで、「ｎ」はＴＩＭＰ－３の天然のＮ末端領域に見出されるアミノ酸を表し、「＃」はアミノ酸残基数を表し、「ｍ」は、置換されたアミノ酸（「‐」は、アミノ酸が欠失したことを示す）を表す。このようにして、例えば、「Ｋ４５Ｅ」は、アミノ酸４５にあるリジン（Ｋ）がグルタミン（Ｅ）で置換されたことを示す。本明細書に例示される突然変異型のヒトＴＩＭＰ－３は、次の突然変異を含む（単独または組合せで）：Ｔ２５Ｇ；Ｔ２５Ｈ；Ｔ２５Ｋ；Ｔ２５Ｐ；Ｔ２５Ｒ；Ｔ２５Ｓ；Ｔ２５Ｗ；Ｃ２６Ａ；Ｓ２７Ｖ；Ｓ２７Ａ；Ｐ２８Ａ；Ｐ２８Ｄ；Ｐ２８Ｌ；Ｐ２８Ｓ；Ｓ２９Ｉ；Ｈ３０Ａ；Ｐ３１Ａ；Ｑ３２Ａ；Ｆ３５Ａ；Ｃ３６Ａ；Ｎ３７Ａ；Ｄ３９Ａ；Ｖ４１Ａ；Ｉ４２Ａ；Ｒ４３Ａ；Ｒ４３Ｅ；Ｒ４３Ｔ；Ｋ４５Ｅ；Ｖ４６Ａ；Ｇ４８Ａ；Ｇ４８Ｓ；Ｋ４９Ｓ；Ｋ４９Ｅ；Ｌ５１Ｅ；Ｌ５１Ｔ；Ｋ５３Ｄ；Ｅ５４Ｓ；Ｐ５６Ｎ；Ｌ６０Ｉ；Ｖ６１Ｑ；Ｔ６３Ｅ；Ｔ７４Ｅ；Ｈ７８Ｄ；Ｈ７８Ｅ；Ｑ８０Ｅ；Ｇ１１６Ｔ；Ｃ１１８Ａ；Ｎ１１９Ｄ；Ｃ１４３Ａ；及び１４４Ｎ－。突然変異の具体的な組合せとしては、Ｓ２７Ｖ Ｓ２９Ｉ；Ｖ４６Ａ Ｇ４８Ｓ Ｋ４９Ｅ Ｌ５１Ｅ Ｋ５３Ｄ Ｅ５４Ｓ Ｐ５６Ｎ Ｌ６０Ｉ Ｖ６１Ｑ Ｇ１１６Ｔ Ｎ１１９Ｄ；Ｃ２６Ａ Ｃ１１８Ａ；Ｃ３６Ａ Ｃ１４３Ａ；Ｋ４５Ｅ Ｋ４９Ｅ；Ｋ４５Ｅ Ｋ４９Ｓ；Ｋ４５Ｅ Ｑ８０Ｅ；Ｋ４５Ｅ Ｔ６３Ｅ；Ｋ４５Ｅ Ｔ６３Ｅ Ｈ７８Ｅ；Ｋ４５Ｅ Ｔ６３Ｅ Ｈ７８Ｅ Ｑ８０Ｅ；Ｌ５１Ｔ Ｔ７４Ｅ Ｈ７８Ｄ；Ｒ４３Ｅ Ｔ７４Ｅ Ｈ７８Ｄ Ｑ８０Ｅ；Ｒ４３Ｔ Ｔ７４Ｅ Ｈ７８Ｄ Ｑ８０Ｅ；Ｔ６３Ｅ Ｈ７８Ｄ；Ｔ６３Ｅ Ｈ７８Ｅ；Ｔ６３Ｅ Ｈ７８Ｅ Ｑ８０Ｅ；Ｔ６３Ｅ Ｔ７４Ｅ Ｈ７８Ｄ；Ｔ６３Ｅ Ｔ７４Ｅ Ｈ７８Ｅ；Ｔ７４Ｅ Ｈ７８Ｄ Ｑ８０Ｅ；Ｔ７４Ｅ Ｈ７８Ｅ Ｑ８０Ｅ；Ｙ７０－ＧＧ－７８Ｈが挙げられる。 天然のＴＩＭＰ－２と天然のＴＩＭＰ－３の配列比較を表す。対応する残基におけるアミノ酸の同一性は、配列の下のアスタリスクによって示される。
一実施形態では、本発明は、配列番号２に示されるＴＩＭＰ－３の成熟領域に対してアミノ酸配列が少なくとも９５％同一である成熟領域を有し、少なくとも１つの突然変異を有する単離されたＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質を提供し、突然変異は、Ｋ４５Ｅ；Ｋ４５Ｎ；Ｋ４５Ｓ；Ｖ４７Ｔ；Ｋ４９Ｎ；Ｋ４９Ｅ；Ｋ４９Ｓ；Ｋ５０Ｎ；Ｌ５１Ｔ；Ｌ５１Ｎ；Ｖ５２Ｔ；Ｋ５３Ｔ；Ｐ５６Ｎ；Ｆ５７Ｎ；Ｇ５８Ｔ；Ｔ６３Ｅ；Ｔ６３Ｎ；Ｋ６５Ｔ；Ｋ６５Ｎ；Ｍ６７Ｔ；Ｋ６８Ｓ；Ｔ７４Ｅ；Ｋ７５Ｎ；Ｐ７７Ｔ；Ｈ７８Ｄ；Ｈ７８Ｅ；Ｈ７８Ｎ；Ｑ８０Ｅ；Ｑ８０Ｔ；Ｋ９４Ｎ；Ｅ９６Ｔ；Ｅ９６Ｎ；Ｖ９７Ｎ；Ｎ９８Ｔ；Ｋ９９Ｔ；Ｄ１１０Ｎ；Ｋ１１２Ｔ；Ｑ１２６Ｎ；Ｋ１３３Ｓ；Ｒ１３８Ｔ；Ｒ１３８Ｎ；Ｈ１４０Ｔ；Ｔ１５８Ｎ；Ｋ１６０Ｔ；Ｔ１６６Ｎ；Ｍ１６８Ｔ；Ｇ１７３Ｔ；Ｈ１８１Ｎ；Ａ１８３Ｔ；Ｒ１８６Ｎ；Ｒ１８６Ｑ、Ｒ１８６Ｅ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ１８８Ｑ、Ｋ１８８Ｅ、Ｐ２０１Ｎ；Ｋ２０３Ｔ；Ｉ２０５Ｆ、Ｉ２０５Ｙ、Ａ２０８Ｇ、Ａ２０８Ｖ、及びＡ２０８Ｙからなる群より選択される。
本発明の別の実施形態では、配列番号２に示されるＴＩＭＰ－３の成熟領域に対してアミノ酸配列が少なくとも９５％同一の成熟領域を有し、突然変異Ｆ５７Ｎ及び少なくとも１つのさらなる突然変異を有する単離されたＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質が提供され、その突然変異はＴＩＭＰ－３のＫ残基の１つ以上での置換である。本発明のさらなる態様では、上記さらなる突然変異はＮ結合型グリコシル化部位をアミノ酸配列の中に導入する。
また、本発明において具体化されるのは、配列番号２に示されるＴＩＭＰ－３の成熟領域に対してアミノ酸配列が少なくとも９０％同一の成熟領域を有する単離されたＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質であり、この突然変異タンパク質は、少なくとも１つのＮ結合型グリコシル化部位をアミノ酸配列の中に導入する少なくとも１つの突然変異を有する。追加的な実施形態では、ＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質は、２、３、４、５、または６のＮ結合型グリコシル化部位を有し；なおもさらなる実施形態では、導入されるＮ結合型グリコシル化部位の数は、７、８、９、または１０である。
本発明の一実施形態では、Ｎ結合型グリコシル化部位は、次からなる群より選択される、ＴＩＭＰ－３アミノ酸配列の領域で導入される：アミノ酸４８～５４を含む領域；アミノ酸９３～１００を含む領域；アミノ酸１２１～１２５を含む領域；アミノ酸１４３～１５２を含む領域；アミノ酸１５６～１６４を含む領域；アミノ酸１８３～１９１を含む領域；及びその組合せ。追加的な実施形態では、ＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質は２、３、４、または５のＮ結合型グリコシル化部位を有し；なおもさらなる実施形態では、導入されるＮ結合型グリコシル化部位の数は６、７、８、９、または１０である。
さらに提供されるのは、配列番号２に示されるＴＩＭＰ－３の成熟領域に対してアミノ酸配列が少なくとも９５％同一の成熟領域を有する単離されたＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質であり、この突然変異タンパク質は、次からなる群より選択される少なくとも１つの突然変異を有する：（ａ）ＴＩＭＰ－３表面に露出した正電荷パッチにおいてＴＩＭＰ－２電荷表面を模する特性に変化を引き起こす、そのＴＩＭＰ－３電荷パッチにおける１つ以上の突然変異；（ｂ）タンパク質切断の受けやすさを低減する１つ以上の突然変異；（ｃ）ＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質とスカベンジャー受容体ＬＲＰ－１の相互作用の低下を引き起こす１つ以上の突然変異；（ｄ）ＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質ヘパリンまたは細胞外マトリクス成分の相互作用の低下を引き起こす１つ以上の突然変異；（ｅ）天然ＴＩＭＰ－３配列への１つ以上のシステイニル残基の付加；（ｆ）薬物動態学的及び／または薬力学的特性の向上；及び（ｇ）（ａ）～（ｆ）に示される突然変異の組合せ。一実施形態では、１つ以上の突然変異は、次からなる群より選択されるＴＩＭＰ－３アミノ酸配列の領域において導入される：アミノ酸４８～５４を含む領域；アミノ酸９３～１００を含む領域；アミノ酸１２１～１２５を含む領域；アミノ酸１４３～１５２を含む領域；アミノ酸１５６～１６４を含む領域；アミノ酸１８３～１９１を含む領域；及びその組合せ。
本発明の一態様は、上述のＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質のいずれか１つのＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質をコードする単離された核酸である。本発明の他の態様は、かかる単離された核酸を含む発現ベクターと；上記発現ベクターにより形質転換またはトランスフェクトされた単離された宿主細胞と；組換えＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質の産生方法とであり、上記方法は、形質転換またはトランスフェクトされた宿主細胞をＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質の発現を促進する条件下で培養することと、ＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質を回収することとを含む。
さらに提供されるのは、本明細書に記載のＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質を含む組成物と、ＴＩＭＰ－３によって阻害されるか阻害され得るマトリクスメタロプロテアーゼ（ＭＭＰ）及び／または他のプロテイナーゼが原因的または増悪的働きをする状態の治療方法とであり、上記方法は、かかる状態に罹った個人に状態の治療に十分な量のかかる組成物を投与することを含む。
一実施形態では、状態は、炎症性状態、骨関節炎、心筋虚血、再潅流傷害、及び、鬱血性心不全への進行からなる群より選択される。別の実施形態では、状態は、喘息、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）、及び特発性肺線維症（ＩＰＦ）、炎症性腸疾患（例えば、潰瘍性大腸炎、クローン病、及びセリアック病）、乾癬、ウイルス性心筋炎を含む心筋炎、アテローム性動脈硬化症に関連した炎症、並びに、関節リウマチ及び乾癬性関節炎を含む関節炎状態からなる群より選択される。
さらなる実施形態では、状態は、次からなる群より選択される：栄養障害型表皮水疱症、骨関節炎、ライター症候群、偽痛風、若年性関節リウマチを含む関節リウマチ、強直性脊椎炎、強皮症、歯周病、角膜潰瘍、表皮潰瘍、胃潰瘍を含む潰瘍、手術後の創傷治癒、再狭窄、肺気腫、骨パジェット病、骨粗鬆症、強皮症、褥瘡などの骨または組織の圧迫萎縮、真珠腫、創傷治癒異常、関節リウマチ、少関節性リウマチ様関節炎、多関節性リウマチ様関節炎、全身性発症関節リウマチ、強直性脊椎炎、腸疾患性関節炎、反応性関節炎、ライター症候群、ＳＥＡ症候群（血清陰性、腱付着部症、関節症症候群）、皮膚筋炎、乾癬性関節炎、強皮症、全身性エリテマトーデス、脈管炎、マイオリティス（ｍｙｏｌｉｔｉｓ）、ポリマイオリティス（ｐｏｌｙｍｙｏｌｉｔｉｓ）、ダーマトマイオリティス（ｄｅｒｍａｔｏｍｙｏｌｉｔｉｓ）、骨関節炎、結節性多発動脈炎、ウェゲナー肉芽腫症、動脈炎、リウマチ性多発筋痛症、サルコイドーシス、硬化症、原発性胆汁性硬化症、硬化性胆管炎、シェーグレン症候群、乾癬、尋常性乾癬、滴状乾癬、倒置乾癬、膿疱性乾癬、乾癬性紅皮症、皮膚炎、アトピー性皮膚炎、アテローム性動脈硬化症、ループス、スチル病、全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）、重症筋無力症、炎症性腸疾患、潰瘍性大腸炎、クローン病、セリアック病（非熱帯性スプルー）、血清反応陰性関節症に関連した腸疾患、顕微鏡的大腸炎またはコラーゲン形成大腸炎、好酸球性胃腸炎、または直腸結腸切除及び回腸肛門吻合の後に起こる嚢炎、膵炎、インスリン依存性糖尿病、乳腺炎、胆嚢炎、胆管炎、胆管周囲炎、多発性硬化症（ＭＳ）、喘息（外因性喘息及び内因性喘息、並びに、関連する気道の慢性炎症性状態または応答性亢進、を含む）、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ、即ち、慢性気管支炎、肺気腫）、急性呼吸器疾患症候群（ＡＲＤＳ）、呼吸促迫症候群、嚢胞性線維症、肺高血圧症、肺血管収縮、急性肺傷害、アレルギー性気管支肺アスペルギルス症、過敏性肺炎、好酸球性肺炎、気管支炎、アレルギー性気管支炎気管支拡張症、結核、過敏性肺炎、職業性喘息、喘息様障害、サルコイド、反応性気道疾患（または機能不全）症候群、綿肺、間質性肺疾患、好酸球増加症候群、鼻炎、副鼻腔炎、及び肺寄生虫症、ウイルス誘発性状態に関連した気道過敏（例えば、呼吸器多核体ウイルス（ＲＳＶ）、パラインフルエンザウイルス（ＰＩＶ）、ライノウイルス（ＲＶ）、及びアデノウイルス）、ギラン・バレー疾患、グレーブス病、アジソン病、レイノー現象、自己免疫性肝炎、移植片対宿主病（ＧＶＨＤ）、脳虚血、外傷性脳損傷、多発性硬化症、神経障害、ミオパチー、脊髄損傷、及び筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）。
本発明は、ＴＩＭＰ－３ポリペプチド、変異体、誘導体または突然変異タンパク質に関連する組成物、キット、及び方法を提供する。また、提供されるのは、核酸とその誘導体及び断片（これは、かかるＴＩＭＰ－３ポリペプチド、変異体、誘導体、または突然変異タンパク質の全てまたは一部をコードする一連のヌクレオチド、例えば、かかるＴＩＭＰ－３ポリペプチド、変異体、誘導体、または突然変異タンパク質の全てまたは一部をコードする核酸を含む）と；かかる核酸を含むプラスミド及びベクター、並びに、かかる核酸及び／もしくはベクター及びプラスミドを含む細胞または細胞株と、である。例えば、提供される方法は、望ましい特性を示すＴＩＭＰ－３ポリペプチド、変異体、誘導体、または突然変異タンパク質を作製し、同定し、単離する方法を含む。
哺乳動物中に内因性ＴＩＭＰ－３を増大させること、または特定の組織にＴＩＭＰ－３のレベルを増加させることが有益であると考えられる多くの状態が存在する。したがって、また、本明細書で提供されるのは、医薬組成物など、ＴＩＭＰ－３ポリペプチド、変異体、誘導体、または突然変異タンパク質を含む組成物を作製する方法と、ＴＩＭＰ－３ポリペプチド、変異体、誘導体、または突然変異タンパク質を含む組成物を対象、例えば、マトリクスメタロプロテイナーゼ活性の調節不全が過剰または不適切な組織修復を引き起こす状態に罹った対象に投与する方法と、である。
本明細書で他に定義されていなければ、本発明に関連して用いられる科学技術用語は、当業者に共通に理解される意味を有するものとする。さらに、文脈によって他のように要求されていなければ、単数形の用語は複数を包含し、複数形の用語は単数を包含するものとする。一般に、本明細書に記載の、細胞及び組織培養、分子生物学、免疫学、微生物学、遺伝学、並びに、タンパク質及び核酸の化学及びハイブリダイゼーションに関連して用いられる術語やそれらの技術は、当分野で周知な一般に用いられるものである。本発明の方法及び技術は一般に、他に断りがなければ、当分野で周知の従来方法に従って実行され、かつ、本明細書全体を通して引用され考察される種々の一般的な参考文献及びより専門的な参考文献に記載される通りに実行される。例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，２ｄ ｅｄ．，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，Ｎ．Ｙ．（１９８９）、及びＡｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｇｒｅｅｎｅ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ａｓｓｏｃｉａｔｅｓ（１９９２）、及びＨａｒｌｏｗ ａｎｄ Ｌａｎｅ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，Ｎ．Ｙ．（１９９０）を参照されたく、なお、これらの文献は参照により本明細書に援用される。酵素反応及び精製技術は、製造者の仕様に従って、当分野で一般に行われる通りに、あるいは本明細書に記載される通りに実行される。本明細書に記載の、分析化学、有機合成化学、並びに医薬品化学及び製薬化学に関連して用いられる用語法やその実験法及び実験技術は、当分野で周知な一般に用いられるものである。化学合成、化学分析、薬剤調製、製剤化、及び送達、並びに患者の治療に標準的な技術を用いることができる。
他に断りがなければ、次の用語は次の意味を有するように理解されるものとする。
分子（例えば、分子はポリペプチド、ポリヌクレオチド、または抗体である）の特徴を表すために用いられる用語「単離された」は、分子がその発生源または誘導源の点で、（１）天然状態のものではそれに付随している天然会合成分に、会合していないか、（２）同じ種に由来する他の分子が実質的にないか、（３）異なる種に由来する細胞によって発現されるか、または、（４）ヒトの介在がなければ全く発生しない、ということを示す。このようにして、分子は、化学的に合成するか、その分子を天然に発生させる細胞とは異なる細胞系で合成するかする場合、その天然会合成分から「単離された」ことになる。分子はまた、当分野で周知の精製技術を用いて、天然会合成分を単離によって実質的になくしてもよい。分子の純度または均一性は、当分野で周知のいくつかの手段によってアッセイしてもよい。例えば、ポリペプチド試料の純度は、当分野で周知の技術を用い、ポリアクリルアミドゲル電気泳動とゲルの染色法でポリペプチドを視覚化してアッセイしてもよい。所定の目的のために、ＨＰＬＣまたは当分野で周知の他の精製手段を用いることによって、より高い分解能を得てもよい。
用語「ペプチド」、「ポリペプチド」、及び「タンパク質」はそれぞれ、ペプチド結合によって互いに結合された２つ以上のアミノ酸残基を含む分子を指す。これらの用語は、例えば、天然及び人工タンパク質と、タンパク質断片と、タンパク質配列のポリペプチド類似体（突然変異タンパク質、変異体、及び融合タンパク質など）と、翻訳後に修飾されたタンパク質または他のように共有結合的もしくは非共有結合的に修飾されたタンパク質とを包含する。ペプチド、ポリペプチド、またはタンパク質はモノマーであってもポリマーであってもよい。
本明細書で使用される場合、用語「ポリペプチド断片」とは、対応する全長タンパク質と比べた場合に、アミノ末端欠失及び／またはカルボキシ末端欠失を有するポリペプチドを指す。断片は、例えば、長さが少なくとも５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、２０、５０、７０、８０、９０、１００、１５０、または２００アミノ酸であってもよい。断片はまた、例えば、長さが最長で１，０００、７５０、５００、２５０、２００、１７５、１５０、１２５、１００、９０、８０、７０、６０、５０、４０、３０、２０、１５、１４、１３、１２、１１、または１０アミノ酸であってもよい。断片はさらに、その両端またはどちらか一端に、１つ以上の追加的アミノ酸、例えば、異なる天然のタンパク質（例えば、Ｆｃまたはロイシンジッパー領域）または人工アミノ酸配列（例えば、人工リンカー配列またはタグタンパク質（ｔａｇ ｐｒｏｔｅｉｎ））に由来する一連のアミノ酸を含んでもよい。
ポリペプチドの「変異体」または「突然変異タンパク質」（例えば、ＴＩＭＰ－３変異体または突然変異タンパク質）は、別のポリペプチド配列と比較すると、アミノ酸配列に１つ以上のアミノ酸残基の挿入、欠失、及び／または置換のなされているアミノ酸配列を含む。本発明の変異体は融合タンパク質を含む。
「保存的アミノ酸置換」は、親配列の構造的特性を実質的に変えないものである（例えば、置換アミノ酸は、親配列に生じるヘリックスを破壊する傾向、または親配列を特徴づけるかもしくはその機能に必要である他の型の二次構造を破壊する傾向がないものである）。当分野で認められているポリペプチド二次及び三次構造の例が、Ｐｒｏｔｅｉｎｓ，Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅｓ ａｎｄ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ（Ｃｒｅｉｇｈｔｏｎ，Ｅｄ．，Ｗ．Ｈ．Ｆｒｅｅｍａｎ ａｎｄ Ｃｏｍｐａｎｙ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ（１９８４））；Ｉｎｔｒｏｄｕｃｔｉｏｎ ｔｏ Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ （Ｃ．Ｂｒａｎｄｅｎ ａｎｄ Ｊ． Ｔｏｏｚｅ，ｅｄｓ．，Ｇａｒｌａｎｄ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，Ｎ．Ｙ．（１９９１））；及びＴｈｏｒｎｔｏｎ ｅｔ ａｔ．Ｎａｔｕｒｅ ３５４：１０５（１９９１）に記載されており、なお、それらの文献はそれぞれ参照により本明細書に援用される。
天然タンパク質に対する変異体または突然変異タンパク質の類似度を示すひとつの方法は、２つ（またはそれ以上）のポリペプチド配列の間またはコードする核酸配列の間の同一性のパーセントを比較して示すことによる。２つのポリヌクレオチドまたは２つのポリペプチド配列の「同一性パーセント」は、ＧＡＰコンピュータープログラム（ＧＣＧウィスコンシンパッケージ、バージョン１０．３（Ａｃｃｅｌｒｙｓ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡ）の一部）をその初期パラメーターで用いて配列を比較することによって決定する。
ポリペプチドの「誘導体」は、例えば、別の化学的成分（例えば、ポリエチレングリコールまたはアルブミン、例えば、ヒト血清アルブミンなど）への共役、リン酸化、及び／またはグリコシル化によって化学的に修飾されたポリペプチド（例えば、ＴＩＭＰ－３ポリペプチド、変異体、または突然変異タンパク質）である。
ポリヌクレオチド及びポリペプチド配列は、標準的な１字または３字の略語を用いて示される。他に断りがなければ、各ポリペプチド配列は左にアミノ末端を、右にカルボキシ末端を有し；各一本鎖核酸配列と、各二本鎖核酸配列の上側の鎖とは、左に５’末端を、右に３’末端を有する。特定のポリペプチドまたはポリヌクレオチド配列はまた、それが参照配列とどのように異なるかを説明することによって記載することができる。例えば、本明細書でアミノ酸の置換は「ｎ＃ｍ」として表され、この「ｎ」は天然の全長ポリペプチドに見られるアミノ酸を表し、「＃」はアミノ酸残基数を表し、「ｍ」は置換されたアミノ酸を表す。
用語「ポリヌクレオチド」、「オリゴヌクレオチド」、及び「核酸」は本明細書全体を通して互換的に用いられ、ＤＮＡ分子（例えば、ｃＤＮＡまたはゲノムのＤＮＡ）、ＲＮＡ分子（例えば、ｍＲＮＡ）、ヌクレオチド類似体を用いて生成されたＤＮＡまたはＲＮＡの類似体（例えば、ペプチド核酸及び非天然ヌクレオチド類似体）、及びそれらのハイブリッドを含む。核酸分子は一本鎖であっても二本鎖であってもよい。一実施形態では、本発明の核酸分子は、本発明のＴＩＭＰ－３ポリペプチド、断片、変異体、誘導体、または突然変異タンパク質をコードする隣接読み取り枠を含む。
２つの一本鎖ポリヌクレオチドは、その配列が逆平行向きに配列され得る場合に互いに「補完的なもの」であり、１つのポリヌクレオチドの各ヌクレオチドは、もう一方のポリヌクレオチドの相補的ヌクレオチドに相対するようになっており、ギャップの導入もなく、各配列の５’または３’末端に不対ヌクレオチドもない。ポリヌクレオチドは、２つのポリヌクレオチドが中程度にストリンジェントな条件の下でお互いにハイブリダイズし得る場合、別のポリヌクレオチドに「相補的」である。したがって、ポリヌクレオチドは、別のポリヌクレオチドに対して、それが補完する相手でなくても、相補的であり得る。
「ベクター」は、それに結合させた別の核酸を細胞の中へ導入するために用いることのできる核酸である。ベクターの一種が「プラスミド」であり、これは、直鎖状または環状の二本鎖ＤＮＡ分子を指し、この中へ追加的核酸セグメントを連結することができる。別の種類のベクターとしてはウイルス性ベクター（例えば、複製欠損レトロウイルス、アデノウイルス、及びアデノ随伴ウイルス）があり、追加的ＤＮＡセグメントがウイルスゲノムの中に導入できる。所定のべクターは、それを導入した宿主細胞中で自己複製が可能である（例えば、細菌性複製起点を含む細菌性ベクターや、エピソーム性哺乳動物ベクター）。他のベクター（例えば、非エピソーム性哺乳動物ベクター）は、宿主細胞へ導入すると宿主細胞のゲノムに組みこまれ、それにより宿主ゲノムとともに複製される。「発現ベクター」は、選ばれたポリヌクレオチドの発現を司ることのできる一種のベクターである。
ヌクレオチド配列は、調節配列がヌクレオチド配列の発現（例えば、発現のレベル、タイミング、位置）に影響する場合、調節配列に「作用可能に結合されて」いる。「調節配列」は、それが作用可能に結合された核酸の発現（例えば、発現のレベル、タイミング、位置）に影響する核酸である。調節配列は、例えば、その作用を、調節された核酸に直接及ぼすか、１つ以上の他の分子（例えば、調節配列及び／または核酸に結合する、ポリペプチド）の作用を介して及ぼすことができる。調節配列の例としては、プロモーター、エンハンサー、及び他の発現調節要素（例えば、ポリアデニル化信号）が挙げられる。調節配列のさらなる例が、例えば、Ｇｏｅｄｄｅｌ，１９９０，Ｇｅｎｅ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ：Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ １８５，Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡ、及びＢａｒｏｎ ｅｔ ａｌ．，１９９５，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．２３：３６０５－０６に記載される。
天然の細胞外タンパク質は典型的に「シグナル配列」を含み、これは、タンパク質を細胞経路の中に送り込んでタンパク質が分泌されるようにするが、成熟タンパク質には存在しない。シグナル配列はまた、「シグナルペプチド」または「リーダーペプチド」と称してもよく、細胞外タンパク質から酵素的に切断される。そのように処理された（即ち、シグナル配列を除去された）タンパク質はしばしば「成熟」タンパク質と称される。本発明のタンパク質またはポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、当分野で多くが既知である天然のシグナル配列または異種シグナル配列をコードしてもよい。
当業者に理解されるように、本実施形態による組換えタンパク質またはポリペプチドは、哺乳動物細胞株を含む、細胞株で発現することができる。特定のタンパク質をコードする配列を、適切な哺乳動物宿主細胞の形質転換に用いることができる。形質転換は、ポリヌクレオチドを宿主細胞の中に導入するいずれの既知の方法によることもでき、例えば、ポリヌクレオチドをウイルス（または、ウイルス性ベクター）の中に包み込んでウイルス（またはベクター）で宿主細胞に形質導入を行うこと、または、米国特許第４，３９９，２１６号、同第４，９１２，０４０号、同第４，７４０，４６１号、及び同第４，９５９，４５５号（これらの特許は本記載によって参照により本明細書に援用される）に例示されるような当分野で既知のトランスフェクション手順によることも含められる。用いられる形質転換手順は、形質転換される宿主による。異種ポリヌクレオチドを哺乳動物細胞に導入する方法は当分野で周知であり、例えば、デキストラン媒介によるトランスフェクション、リン酸カルシウム沈殿、ポリブレン媒介によるトランスフェクション、原形質融合、電気穿孔法、リポソームの中へのポリヌクレオチドの封入、及び核の中へのＤＮＡの直接微量注入などが挙げられる。
「宿主細胞」は、核酸、例えば、本発明の核酸を発現するように用いることのできる細胞である。宿主細胞は、原核生物、例えば、大腸菌であってもよく、真核生物、例えば、単細胞の真核生物（例えば、酵母菌または他の真菌）、植物細胞（例えば、タバコまたはトマト植物細胞）、動物細胞（例えば、ヒト細胞、サル細胞、ハムスター細胞、ラット細胞、マウス細胞、または昆虫細胞）、またはハイブリドーマであってもよい。宿主細胞の例としては、サル腎臓由来細胞のＣＯＳ－７株（ＡＴＣＣ ＣＲＬ １６５１）（Ｇｌｕｚｍａｎ ｅｔ ａｌ．，１９８１，Ｃｅｌｌ ２３：１７５を参照）、Ｌ細胞、Ｃ１２７細胞、３Ｔ３細胞（ＡＴＣＣ ＣＣＬ １６３）、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞またはベジー（Ｖｅｇｇｉｅ）ＣＨＯなど、その誘導体及び無血清培地で増殖する関連細胞株（Ｒａｓｍｕｓｓｅｎ ｅｔ ａｌ．，１９９８，Ｃｙｔｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ２８：３１を参照）またはＤＨＦＲが欠けるＣＨＯ菌株ＤＸ－Ｂ１１（Ｕｒｌａｕｂ ｅｔ ａｌ．，１９８０，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ７７：４２１６－２０を参照）、ＨｅＬａ細胞、ＢＨＫ（ＡＴＣＣ ＣＲＬ１０）細胞株、アフリカミドリザル腎臓由来細胞株ＣＶ１（ＡＴＣＣ ＣＣＬ ７０）に由来するＣＶ１／ＥＢＮＡ細胞株（ＭｃＭａｈａｎ ｅｔ ａｌ．，１９９１，ＥＭＢＯ Ｊ．１０：２８２１を参照）、２９３、２９３ＥＢＮＡ、またはＭＳＲ２９３などのヒト胎児由来腎臓細胞、ヒト表皮Ａ４３１細胞、ヒトＣｏｌｏ２０５細胞、他の形質転換した霊長類細胞株、正常２倍体細胞、原発性組織の生体外培養に由来する細胞菌株、原発性移植片、ＨＬ－６０、Ｕ９３７、ＨａＫ、またはジャーカット細胞が挙げられる。
典型的には宿主細胞は、ポリペプチドをコードする核酸で形質転換またはトランスフェクトされ得る培養細胞であり、次いでその核酸が宿主細胞で発現され得る。「一過性トランスフェクション」では、核酸は、当分野で既知のいくつかの方法の１つによって宿主細胞の中に導入され、組換えタンパク質は、例えば、宿主細胞が有糸分裂するとき、核酸が消失または分解される前に、有限期間の間、典型的には約４日間までの間、発現される。「安定トランスフェクション」が望まれる場合、ポリペプチドをコードする核酸は、選択可能なマーカーをコードする核酸とともに宿主細胞の中に導入してもよい。選択可能なマーカーの使用により当業者は、ポリペプチドをコードする核酸が有糸分裂の間ずっと維持されて子孫細胞によって発現され得るように、ポリペプチドをコードする核酸が宿主細胞ゲノムの中に組み込まれた、トランスフェクトされた宿主細胞を選択することができる。
語句「組換え宿主細胞」は、発現させる核酸で形質転換またはトランスフェクトされた宿主細胞を表すように用いることができる。宿主細胞はまた、核酸を含むがしかし、調節配列が核酸と作用可能に結合されるようにその調節配列が宿主細胞に導入されない限り、核酸を所望のレベルで発現しないような細胞であってもよい。宿主細胞という用語は、特定の対象細胞だけでなく、かかる細胞の子孫または潜在的子孫をも指すということを理解されたい。例えば、突然変異または環境の影響による何らかの変異が後継世代に起こり得るので、かかる子孫は、実際には親細胞と同一でないことがあるが、本明細書で使用される用語の範囲の内にやはり含まれる。
本明細書で使用される場合、「ＴＩＭＰ－３ＤＮＡ」、「ＴＩＭＰ－３をコードするＤＮＡ」、及び同種の語は、ＴＩＭＰ－３をコードする選択された核酸を指し、それから発現されるＴＩＭＰ－３は、本明細書に記載の天然ＴＩＭＰ－３またはＴＩＭＰ－３変異体もしくは突然変異タンパク質のいずれかであり得る。同様に、「ＴＩＭＰ－３」、「ＴＩＭＰ－３タンパク質」、及び「ＴＩＭＰ－３ポリペプチド」は、天然ＴＩＭＰ－３タンパク質、または、１つもしくは複数の突然変異を含むＴＩＭＰ－３タンパク質（即ち、ＴＩＭＰ－３ポリペプチド、変異体、誘導体、または突然変異タンパク質）のいずれかを表すために用いられる。ＴＩＭＰ－３の特定の突然変異タンパク質は、１つ以上の突然変異によって表してもよく、例えば、「Ｋ４５Ｎ ＴＩＭＰ－３」または「Ｋ４５Ｎ ＴＩＭＰ－３ポリペプチド」とは、天然ＴＩＭＰ－３のアミノ酸４５にあるリジン（Ｋ）がアスパラギン（Ｎ）で置換されたポリペプチドを示す。
用語「天然ＴＩＭＰ－３」は、本明細書で使用される場合、野生型ＴＩＭＰ－３を指す。ＴＩＭＰ－３は哺乳動物の種々の細胞または組織によって発現され、細胞外マトリクスに存在し、そのように発現されたＴＩＭＰ－３はまた本明細書で「内因性」ＴＩＭＰ－３と称される。ＴＩＭＰ－３のアミノ酸配列、及びＴＩＭＰ－３をコードするＤＮＡの核酸配列は、２００３年５月１３日発行の米国特許第６，５６２，５９６号に開示されており、なお、その開示は参照により本明細書に援用される。米国特許第６，５６２，５９６号で用いられるアミノ酸番号方式は、シグナル（またはリーダー）ペプチドのアミノ酸を負数で表しており、成熟タンパク質（即ち、シグナルまたはリーダーペプチドを除去したタンパク質）をアミノ酸１～１８８と称している。本明細書で用いる番号方式は、天然リーダーペプチドの１番目のアミノ酸を＃１と表してＴＩＭＰ－３を指し、したがって、全長ＴＩＭＰ－３は、アミノ酸１～２１１を含み、成熟型はアミノ酸２４～２１１である。当業者は、これらの相異なる番号方式の使用によって起こり得るアミノ酸番号の異同を容易に理解し、したがって、本明細書で使用される番号方式を、例えば、ＴＩＭＰ－３ポリペプチドに容易に適用でき、それにおいては成熟型の１番目のアミノ酸を＃１と称する。このようにして、例えば、本明細書で表されるＫ４５Ｎは、米国特許第６，５６２，５９６号の番号方式を用いればＫ２２Ｎと表される。
ＴＩＭＰ－３は２つの領域、即ち、ＴＩＭＰ－３のアミノ酸２４～１４３（即ち、分子の約３分の２）を含むＮ末端領域と、アミノ酸１４４～２１１を含むＣ末端領域と、から形成される。図３は、ＴＩＭＰ－３の二次元的ポリペプチド配列を示し、二次及び三次構造ＴＩＭＰ－３の形成を促進するジスルフィド結合の複雑な性質を強調する。しばしば「Ｎ－ＴＩＭＰ－３」と称される、ＴＩＭＰ－３のＮ末端領域は、ＴＩＭＰ－３の生物活性の少なくともいくつかを示すことが分かっており、したがって、本明細書に記載のＴＩＭＰ－３変異体、誘導体、及び突然変異タンパク質は、Ｎ末端領域を含むＴＩＭＰ－３断片の変異体、誘導体、及び突然変異タンパク質を包含する。
天然のＴＩＭＰ－３タンパク質は、治療的分子として用いる場合にいくつかの困難を生じさせる。例えば、標準的な哺乳動物発現技術を用いてＴＩＭＰ－３タンパク質を求めた場合の哺乳動物発現力価は低過ぎるために、治療的タンパク質に適切な規模で十分な量のＴＩＭＰ－３を産生させることができない。さらに、ＴＩＭＰ－３は細胞外マトリクスへ結合するので、細胞培養培地にヘパリン（または、細胞外マトリクスへのＴＩＭＰ－３の結合を低減させる類似の剤）を含むことが必要となり、低密度リポタンパク質受容体関連タンパク質１（ＬＲＰ１）スカベンジャータンパク質へ結合させることは、生産規模のプロセスの開発を可能とするようなレベルで組換えＴＩＭＰ－３を培地の中に分泌させるという難題をさらに困難にする。全長ＴＩＭＰ－３の原核生物細胞における微生物産生は、タンパク質の不正確なフォールディングにより困難であることが判明してきた。
これに対応して、これらの難問の１つ以上を克服するために、本発明のＴＩＭＰ－３変異体または突然変異タンパク質は修飾されている。本発明のポリペプチドとしては、何らかの方法で、何らかの理由により、例えば、（１）タンパク質加水分解の受けやすさを低減する、（２）酸化の受けやすさを低減する、（３）細胞培養で細胞外マトリクスへのＴＩＭＰ－３の結合を阻害する剤に対する必要性を低減する、（４）他の成分、例えば、ＬＲＰ－１などのスカベンジャー受容体に対する結合親和性を変化させる、（５）薬物動態学及び／または薬力学を含む、他の物理化学的または官能的特性を与えるか改変する、（６）組換えタンパク質の発現及び／または精製を促進するように修飾されたポリペプチドが挙げられる。類似体としては、ポリペプチドの突然変異タンパク質が挙げられる。例えば、単一または複数のアミノ酸置換（例えば、保存的アミノ酸置換）は、天然の配列において（例えば、ポリペプチドの、分子間接触を形成する領域の外側の部分で）行ってもよい。共通配列を用いて、置換のためのアミノ酸残基を選択することができ、当業者は、さらなるアミノ酸残基の置換もできることを認識している。
本発明の一態様では、ＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質または変異体の発現レベルのほうが天然ＴＩＭＰ－３で観察されるものよりも増加していることを示すＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質または変異体が提供され、本発明の別の態様では、発現の増加は哺乳動物細胞発現系で起こる。発現レベルは、細胞培養上清液、即ち、馴化培地（ＣＭ）において量または組換えＴＩＭＰ－３（天然、変異体、または突然変異タンパク質）の定量的または半定量的分析を可能とするいずれの適切な方法によって決定してもよい。一実施形態では、試料またはＣＭはウエスタンブロットによって評価され、別の実施形態では、ＣＭ試料は標準的なヒトＴＩＭＰ－３ ＥＬＩＳＡによって評価される。
一実施形態では、発現の増加は一過性発現系で観察され、別の実施形態では、発現の増加は安定トランスフェクション系で観察される。一実施形態は、ＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質または変異体を提供し、それに対して観察される発現が天然ＴＩＭＰ－３に対して観察されるものの２倍（２×）に増加し、別の実施形態は、ＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質または変異体を提供し、それに対して観察される発現が天然ＴＩＭＰ－３に対して観察されるものの５倍（５×）に増加する。さらなる実施形態は、発現の増加が３倍（３×）、４倍（４×）、または６倍（６×）であるＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質または変異体を包含する。一実施形態では、ＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質または変異体の発現は、天然ＴＩＭＰ－３で観察されるものの１０倍（１０×）であり、別の実施形態では、観察される発現は天然ＴＩＭＰ－３で観察されるものの１０倍以上、例えば、２０倍（２０×）以上である。
本発明の別の態様では、細胞培養培地へのヘパリン（または、細胞外マトリクスへのＴＩＭＰ－３の結合を阻害する別の剤）の添加に対する必要性の低下を示すＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質（または変異体）が提供される。ヘパリン（または他の剤）の量の低減は、半定量的に記載することができ、即ち、低減は部分的、中程度、実質的、または完全であるとしてもよい。別の実施形態では、低減はパーセントで表現され、例えば、ヘパリン（または類似の剤）の量は、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、またはそれ以上（例えば、６０％、７０％、８０％、９０％、または１００％）低減されるとしてもよい。
一実施形態では、挿入されたグリコシル化部位を含むＴＩＭＰ－３変異体または突然変異タンパク質が提供される。当分野で既知となっている通り、グリコシル化パターンは、タンパク質の配列（例えば、下に考察される、特定のグリコシル化アミノ酸残基の存在もしくは不存在）か、またはタンパク質が産生される宿主細胞もしくは生体かの両方に左右され得る。具体的な発現系は下に考察される。グリコシル化の存在、不存在、または程度は、例えば、ウエスタンブロットによって観察される分子量（ＭＷ）またはクーマシー染色ＳＤＳ－ＰＡＧＥゲルから得られる分子量の変化の半定性的測定方法を含む、当業者に既知のいずれの方法によって決定してもよく、一方、定量的測定方法としては、質量分光光度計技術を利用し、アスパラギン結合グリコシル化の追加に相当するｍｗ変化の観察、または、ペプチド－Ｎ－グリコシダーゼＦ（ＰＮＧａｓｅ－Ｆ；ＳｉｇｍａＡｌｄｒｉｃｈ，Ｓｔ．Ｌｏｕｉｓ，ＭＯ）などの酵素によってアスパラギン結合グリコシル化を除去しての質量変化の観察によることが挙げられる。
ポリペプチドのグリコシル化は典型的にはＮ結合またはＯ結合のいずれかである。Ｎ結合とは、アスパラギン残基の側鎖への炭水化物成分の付加を指す。トリペプチド配列であるアスパラギン－Ｘ－セリン（ＮＸＳ）及びアスパラギン－Ｘ－スレオニン（ＮＸＴ）においてＸがプロリン以外のいずれかのアミノ酸であるものは、アスパラギン側鎖への炭水化物成分の酵素的付加に対する認識配列である。このようにして、ポリペプチドにおけるこれらのトリペプチド配列のいずれかの存在は潜在的グリコシル化部位を作り出す。Ｏ結合グリコシル化とは、ヒドロキシアミノ酸、最も一般的にはセリンまたはスレオニンへの、糖であるＮ－アセチルガラクトサミン、ガラクトース、またはキシロースの１つの付加を指すが、５－ヒドロキシプロリンまたは５－ヒドロキシリジンも使われ得る。
抗原結合タンパク質へのグリコシル化部位の付加は、アミノ酸配列が（Ｎ結合型グリコシル化部位に対する）上述のトリペプチド配列の１つ以上を含有するようにそのアミノ酸配列を変化させることによって、便宜的に達成される。変化はまた、（Ｏ結合グリコシル化部位に対する）開始配列への１つ以上のセリンまたはスレオニン残基の付加またはそれによる置換によって行ってもよい。簡単にするために、タンパク質アミノ酸配列は好ましくは、ＤＮＡレベルでの変化を通して変化され、具体的には、所望のアミノ酸へ翻訳されるコドンが生成されるように、標的ポリペプチドをコードするＤＮＡをあらかじめ選択された塩基で突然変異させることによって変化される。
したがって、Ｎ結合型グリコシル化部位は、単一アミノ酸に対するコドンを変化させることによって付加してもよい。例えば、Ｎ－Ｘ－ｚ（式中、ｚはいずれのアミノ酸であってもよい）は、Ｎ－Ｘ－Ｔ（またはＮ－Ｘ－Ｓ）をコードするように変化させることができ、あるいは、ｙ－Ｘ－Ｔ／Ｓをコードするコドンは、Ｎ－Ｘ－Ｔ／Ｓをコードするように変化させることができる。あるいは、２つのアミノ酸をコードするコドンは、Ｎ結合型グリコシル化部位を導入するように同時に変化させることができる（例えば、ｙ－Ｘ－ｚに対するコドンはＮ－Ｘ－Ｔ／Ｓをコードするように変化させることができる）。このようにして、１～１０のＮ結合型グリコシル化部位を挿入することができる。
Ｎ結合型グリコシル化部位をＴＩＭＰ－３の中に挿入することに加えて、天然ＴＩＭＰ－３に存在するいずれのグリコシル化部位も、例えば、分子の構造を安定化させるために、修飾することができる。このようにして、例えば、残基２０８におけるＡは、Ｙ、Ｖ、またはＧなど、異なる残基で置換してもよい。残基２０６～２０８における「Ｎ－Ｘ－Ｔ」部位での追加的変異としては、残基２０８における上述の置換の１つと組み合わせて、残基２０５でＩをＦに置換すること、または残基２０５でＹをＩに置換すること、が挙げられる。
別の実施形態では、タンパク質切断に感受性であるまたは容易にタンパク質切断が起こりやすい領域が同定され、突然変異される。本発明の別の態様では、スカベンジャー受容体ＬＲＰ－１との相互作用の低下を示すＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質または変異体が提供される。一実施形態では、かかる突然変異タンパク質は、ＴＩＭＰ－３及びＬＲＰ－１の間の相互作用において重要であると仮定されるリジン残基を同定し突然変異させることによって作製される。
その上、ＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質または変異体はこれらの特性の２つ以上を示し得る（例えば、グリコシル化部位が挿入されると、細胞培養培地でのヘパリンの必要性が低下し、ＬＲＰ－１との相互作用が低下し、タンパク質加水分解への抵抗性が向上するということがあり得る）ことが認識される。追加的な実施形態としては、突然変異の組合せが上述の特性または作用の２つ以上を生じさせるように２つ以上の突然変異を有するＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質または変異体が挙げられる。
望ましいＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質はいくつかの方法で同定することができる。第１の方法では、インシリコ分析を用い、ＴＩＭＰ－３と関連メタロプロテイナーゼ阻害物質ＴＩＭＰ－２との間で電荷の再バランスを促進する（後者は良好な哺乳動物の発現プロファイルを示すことが観察されている）。本発明の一実施形態では、ＴＩＭＰ－３表面に露出した正電荷のパッチを、ＴＩＭＰ－２電荷表面を摸するように再分布させる。別の実施形態では、ＴＩＭＰ－２とＴＩＭＰ－３の電荷の差異を、グリコシル化部位の挿入によってマスクする。グリコシル化挿入もまた、発現の向上に有用であり得る（例えば、Ｅｎｈａｎｃｉｎｇ ｔｈｅ Ｓｅｃｒｅｔｉｏｎ ｏｆ Ｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｂｙ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ Ｎ－Ｇｌｙｃｏｓｙｌａｔｉｏｎ Ｓｉｔｅｓ．Ｌｉｕ Ｙ．ｅｔ ａｌ，Ａｍｅｒ Ｉｎｓｔ Ｃｈｅｍ Ｅｎｇ ２００９，ｐｇ．１４６８を参照）。
このようにして、別の実施形態では、コンピューター分析によって明らかにされた溶媒曝露部位のサブセットをふるいにかけて、Ｎ－グリコシル化の見込みを調べる。グリコシル化部位の挿入が関係する方法の場合、潜在的Ｎ結合型グリコシル化を促進するよう突然変異され得る部位を、例えば、基準のＮ－ｘ－Ｔグリコシル化部位（Ｎはアスパラギンであり、ｘはいずれかのアミノ酸であり、Ｔはスレオニンである）を形成するように突然変異され得る残基を同定することによって選定し、これにＮ－グリコシル化予測ツールが有用である。更なる実施形態では、構造に基づく方法を用いて、溶媒に曝露されたアミノ酸（側鎖の曝露が２０Å２より大きいアミノ酸を含む）全てを同定する。追加的な実施形態としては、ＴＩＭＰ－３に対して相互作用ＲＡＰリジンがマップされたＬＲＰ１／ＲＡＰ（受容体付随タンパク質）の結晶構造に基づき、ＴＩＭＰ－３上にＬＲＰ１相互作用リジンを突然変異させることが挙げられる。
本明細書では、追加的組合せが企図される。例えば、Ｆ５７Ｎ突然変異を、リジン残基での突然変異と組み合わせて作製することができ、リジン残基はＴＩＭＰ－３のなかのいずれかのリジンである。一実施形態では、単一のリジンが突然変異され、別の実施形態では、２、３、４、または５のリジン残基が突然変異される。所定の実施形態では、アミノ酸４５及び／または１３３におけるリジン残基は、突然変異させることができる。別の例では、Ｆ５７Ｎ突然変異は、単一Ｎ結合型グリコシル化部位を導入し、この突然変異は、追加的グリコシル化部位を導入する追加的突然変異、または、ＴＩＭＰ－３の上述の特性の１つ以上に影響するように設計された他の突然変異で作製することができる。本明細書では、１つの導入されたＮ結合型グリコシル化部位を含むＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質または変異体、２、３、または４のＮ結合グリコシル化部位を含むＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質または変異体、及び５以上のＮ結合型グリコシル化部位を含むＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質または変異体が企図される。
具体的な突然変異を図１及び２に示す。図１は、天然の全長ヒトＴＩＭＰ－３と突然変異型の全長ヒトＴＩＭＰ－３の配列比較を示し、後者では、配列内の特定のアミノ酸を文字「Ｘ」に置き換えてある。シグナル配列には下線が引いてあり、したがって、それは本明細書に記載のとおりに他のシグナル配列に置換することができる。所定の置換が成熟型のＴＩＭＰ－３において考えられ、本明細書中に「ｎ＃ｍ」として表されており、そこで、「ｎ」は天然の全長ＴＩＭＰ－３に見出されるアミノ酸を表し、「＃」はアミノ酸残基数を表し、「ｍ」は、置換されたアミノ酸を表す。このようにして、例えば、「Ｋ４５Ｎ」は、アミノ酸４５にあるリジン（Ｋ）がアスパラギン（Ｎ）で置換されたことを示す。本明細書に例示される突然変異型のヒトＴＩＭＰ－３は、次の突然変異を含む（単独または組合せで）：Ｋ４５Ｎ；Ｋ４５Ｓ；Ｖ４７Ｔ；Ｋ５０Ｎ；Ｖ５２Ｔ；Ｐ５６Ｎ；Ｆ５７Ｎ；Ｇ５８Ｔ；Ｔ６３Ｅ；Ｔ６３Ｎ；Ｋ６５Ｔ；Ｔ７４Ｅ；Ｈ７８Ｅ；Ｈ７８Ｅ；Ｈ７８Ｎ；Ｑ８０Ｔ；Ｋ９４Ｎ；Ｅ９６Ｔ；Ｄ１１０Ｎ；Ｋ１１２Ｔ；Ｑ１２６Ｎ；Ｒ１３８Ｔ；及びＧ１７３Ｔ。これらの突然変異の組合せも企図され、上述の置換の２～１０（即ち、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０）を含むことができる。
突然変異の具体的な組合せとしては、Ｋ４５Ｅ、Ｋ４９Ｓ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ４９Ｅ；Ｋ４５Ｅ、Ｔ６３Ｅ；Ｋ４５Ｅ、Ｑ８０Ｅ；Ｋ４５Ｅ、Ｔ６３Ｅ、Ｈ７８Ｅ；Ｔ６３Ｅ、Ｈ７８Ｅ、Ｑ８０Ｅ；Ｋ４５Ｅ、Ｔ６３Ｅ、Ｈ７８Ｅ、Ｑ８０Ｅ；Ｌ５１Ｔ、Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｄ；Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｅ、Ｑ８０Ｅ；Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｄ、Ｑ８０Ｅ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ；Ｋ４９Ｎ、Ｌ５１Ｔ；Ｋ７５Ｎ、Ｐ７７Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ４９Ｎ、Ｌ５１Ｔ、Ｔ６３Ｅ；Ｅ９６Ｎ、Ｎ９８Ｔ；Ｖ９７Ｎ、Ｋ９９Ｔ；Ｒ１３８Ｎ、Ｈ１４０Ｔ；Ｔ１５８Ｎ、Ｋ１６０Ｔ；Ｔ１６６Ｎ、Ｍ１６８Ｔ；Ｈ１８１Ｎ、Ａ１８３Ｔ；Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｐ２０１Ｎ、Ｋ２０３Ｔ；Ａ２０８Ｙ；Ａ２０８Ｖ；Ｔ６３Ｅ、Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｅ；Ｔ６３Ｅ、Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｄ；Ｋ６５Ｎ、Ｍ６７Ｔ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｔ６３Ｅ、Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｅ；Ｋ４９Ｎ、Ｌ５１Ｔ、Ｔ６３Ｅ、Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｅ；Ｋ４９Ｎ、Ｌ５１Ｔ、Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｅ；Ｋ４９Ｎ、Ｌ５１Ｔ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ；Ｌ５１Ｎ、Ｋ５３Ｔ；Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ；Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ；Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ；Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ；Ｑ１２６Ｎ；Ｒ１３８Ｔ；Ｇ１７３Ｔ；Ｆ５７Ｎ；Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ；Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ；Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ；Ｋ４９Ｓ、Ｆ５７Ｎ；Ｋ６８Ｓ、Ｆ５７Ｎ；Ｋ１３３Ｓ、Ｆ５７Ｎ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ１３３Ｓ、Ｆ５７Ｎ；及びＫ４９Ｓ、Ｋ６８Ｓ、Ｆ５７Ｎが挙げられる。
追加的な組合せとしては、Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｑ１２６Ｎ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ Ｑ１２６Ｎ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｑ１２６Ｎ、Ｇ１７３Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｇ１７３Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｒ１３８Ｔ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｒ１３８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｑ１２６Ｎ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ；Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｑ１２６Ｎ、Ｇ１７３Ｔ；Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｑ１２６Ｎ、Ｇ１７３Ｔ；及びＫ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｑ１２６Ｎ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔが挙げられる。
更なる突然変異としては、Ｋ４９Ｓ、Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｋ５３Ｅ、Ｖ９７Ｎ／Ｋ９９Ｔ、Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｖ９７Ｎ／Ｋ９９Ｔ、Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４９Ｅ、Ｋ５３Ｅ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｔ６３Ｎ／Ｋ６５Ｔ、Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ４９Ｓ、Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４９Ｓ、Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｖ９７Ｎ／Ｋ９９Ｔ、Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；及びＫ４５Ｓ、Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｖ９７Ｎ／Ｋ９９Ｔ、Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔが挙げられる。
図２は、天然の全長ヒトＴＩＭＰ－３と変異体のＴＩＭＰ－３の配列比較を示し、後者では、配列をＴＩＭＰ－２の配列にさらに類似させる所定のアミノ酸の置換が行われている。シグナル配列が存在し、天然の全長ＴＩＭＰ－３配列のそれに下線を引いて番号付けの一貫性を維持するようにし、したがって、それは本明細書に記載のとおりに他のシグナル配列に、置換することができる。ＴＩＭＰ－３変異体の配列では、特定のアミノ酸を「Ｘ」に置き換え、成熟型のＴＩＭＰ－３において置換が考えられる残基を示している。これらの置換としては、残基２５におけるＨ、Ｋ、Ｐ、Ｒ、Ｓ、またはＷ；残基２７におけるＡ；残基２８におけるＤ、Ｌ、またはＳ；残基３２におけるＮ；残基３９におけるＴ；残基４３におけるＴ、Ｆ、Ａ又、はＮ；残基４５におけるＩ、またはＴ；残基４６におけるＤ；残基４８におけるＳ；残基４９におけるＳ；残基５１におけるＴ；残基６３におけるＮ；残基６７におけるＮ；残基６８におけるＩ；残基７８におけるＤ、またはＷ；残基９６におけるＴ；残基２０２におけるＮ、及び残基２０７におけるＳが挙げられる。置換は単独で行われても、組合せて行われてもよい。このようにして、図１に対して記載される記号化を用いると、図２で例示される１つの変異体はＡ２７Ｔ、Ｉ６８Ｋである。追加的な組合せも企図され、上述の置換の２～１０を含むことができる。さらに、図２に記載される置換を図１に記載される置換、例えば、Ａ２７Ｔ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔと組み合わせることができる。
Ｌｅｅら（Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２８２：６８８７；２００７）は、ＴＩＭＰ－３における細胞外マトリクス結合モチーフを同定すると主張した研究を開示する。彼らは、ＴＩＭＰ－３における既知のヘパリン結合配列の同定に失敗したとき、１１のリジン及びアルギニン残基を同定し、その位置が、これらの塩基性アミノ酸残基の側鎖がかなりの高密度でＴＩＭＰ－３の表面に露出されると考えられることを示唆した。これらの残基は、Ｋ２６、Ｋ２７、Ｋ３０、Ｋ７１、Ｋ７６、Ｒ１００、Ｋ１２３、Ｋ１２５、Ｋ１３７、Ｒ１６３、Ｋ１６５であった（本明細書で使用される番号方式では、これらの残基は、Ｋ４９、Ｋ５０、Ｋ５３、Ｋ９４、Ｋ９９、Ｒ１２３、Ｋ１４６、Ｋ１４８、Ｋ１６０、Ｒ１８６、Ｋ１８８という番号になる）。したがって、追加的なＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質としては、下に示されるものが挙げられる。これらの突然変異タンパク質は、部分的または完全なヘパリンへの非依存性を示すと考えられる。表面露出した塩基性アミノ酸側鎖の変異に追加的である。一定の突然変異はまた、ＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質の中にＮ結合型グリコシル化部位を導入する（即ち、Ｋ９４Ｎ／Ｅ９６Ｔ）。
ヘパリン非依存性を低減するように作製された突然変異タンパク質としては、Ｋ４９Ｅ、Ｋ５０Ｅ、Ｋ５３Ｅ、Ｋ９９Ｅ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４９Ｅ、Ｋ５０Ｅ、Ｋ５３Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９９Ｅ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ５０Ｅ、Ｋ５３Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９９Ｅ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４９Ｓ、Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｋ９９Ｅ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｋ９９Ｅ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ／Ｅ９６Ｔ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ／Ｅ９６Ｔ、Ｇ１７３Ｔ；Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ／Ｅ９６Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ／Ｅ９６Ｔ、Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ／Ｅ９６Ｔ、Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｔ６３Ｎ／Ｋ６５Ｔ、Ｋ９４Ｎ／Ｅ９６Ｔ、Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｔ６３Ｎ／Ｋ６５Ｔ、Ｋ９４Ｎ／Ｅ９６Ｔ、Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔが挙げられる。本発明によれば、これらの突然変異タンパク質のいくつかは、複数の有利な特性を示し得る。例えば、突然変異タンパク質には、挿入されたＮ結合型グリコシル化部位を含有するものもあれば、哺乳動物の細胞系における発現を向上させる突然変異を含むものもある。
ＴＩＭＰ－３変異体、突然変異タンパク質、または誘導体は、天然ＴＩＭＰ－３の配列にかなり類似したアミノ酸配列を有することになる。一実施形態では、ＴＩＭＰ－３変異体、突然変異タンパク質、または誘導体は天然ＴＩＭＰ－３と少なくとも８５％同一であることになり；別の実施形態では、ＴＩＭＰ－３変異体、突然変異タンパク質、または誘導体は天然ＴＩＭＰ－３と少なくとも９０％同一であることになり；別の実施形態では、ＴＩＭＰ－３変異体、突然変異タンパク質、または誘導体は天然ＴＩＭＰ－３と少なくとも９５％同一であることになる。さらなる実施形態では、ＴＩＭＰ－３変異体、突然変異タンパク質、または誘導体は天然ＴＩＭＰ－３と少なくとも９６％同一、９７％同一、９８％同一、または９９％同一である。本明細書で使用される場合、パーセントで表される同一性は、成熟全長型天然ＴＩＭＰ－３、即ち、シグナルペプチド（ＴＩＭＰ－３のアミノ酸２４～２１１）を欠くＴＩＭＰ－３に対する成熟全長型の変異体、突然変異タンパク質、または誘導体の比較を指す。当業者であれば、ＴＩＭＰ－３のＮ末端領域の変異体、突然変異タンパク質、または誘導体と、天然ＴＩＭＰ－３のＮ末端領域との間で類似の比較が行えることを容易に理解するものである。
類似性はまた、突然変異タンパク質または変異体と天然ＴＩＭＰ－３との間で異なるアミノ酸の数によっても表現できる。例えば、ＴＩＭＰ－３変異体または突然変異タンパク質は、１つのアミノ酸、２つのアミノ酸、３つのアミノ酸、４つのアミノ酸、５つのアミノ酸、６つのアミノ酸、７つのアミノ酸、８つのアミノ酸、９つのアミノ酸、または１０のアミノ酸だけ、天然ＴＩＭＰ－３と異なり得る。天然ＴＩＭＰ－３とは１０のアミノ酸で異なる変異体または突然変異タンパク質は、天然ＴＩＭＰ－３と約９５％同一であることになる。さらなる実施形態では、ＴＩＭＰ－３変異体または突然変異タンパク質は、天然成熟ＴＩＭＰ－３とは１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０のアミノ酸で異なる。
ＴＩＭＰ－３ポリペプチド（天然、突然変異タンパク質、変異体、または誘導体のいずれか）をコードする核酸に追加的な変更を行って発現を容易にすることができる。例えば、天然ＴＩＭＰ－３のシグナルペプチドは、異なるシグナルペプチドで置換することができる。
本発明の範囲内に入るＴＩＭＰ－３ポリペプチドの他の誘導体としては、ＴＩＭＰ－３ポリペプチドまたはその断片と他のタンパク質またはポリペプチドとの共有結合性または集合性共役体が挙げられ、例えば、ＴＩＭＰ－３ポリペプチドのＮ末端またはＣ末端に融合された異種ポリペプチドを含む組換え融合タンパク質の発現によるものなどである。例えば、共役ペプチドは、異種シグナル（またはリーダー）ペプチド、例えば、酵母菌α因子リーダーや、エピトープタグなどのペプチドであってもよい。異種シグナルペプチドは、天然ＴＩＭＰ－３シグナルペプチドとは長さが異なるが、異種シグナルペプチドを用いて産生されたＴＩＭＰ－３ポリペプチドのＮ末端システイン残基を整列させることによって、成熟ＴＩＭＰ－３のアミノ酸配列に対する突然変異タンパク質の位置を正しく同定することができる、ということを当業者は理解する。
ＴＩＭＰ－３ポリペプチドを含有する融合タンパク質は、ＴＩＭＰ－３ポリペプチドの精製または同定を容易にするために付加されるペプチド（例えば、ポリＨｉｓ）を含んでもよい。別のタグペプチドとしては、Ｈｏｐｐ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ６：１２０４，１９８８、及び米国特許第５，０１１，９１２号に記載されるＦＬＡＧ（登録商標）ペプチドがある。ＦＬＡＧ（登録商標）ペプチドは抗原性が高く、特定のモノクローナル抗体（ｍＡｂ）によって可逆的に結合されるエピトープを提供し、発現された組換えタンパク質の迅速なアッセイと容易な精製を可能にする。ＦＬＡＧ（登録商標）ペプチドが所与のポリペプチドに融合されている融合タンパク質を調製するのに有用な試薬は市販されている（Ｓｉｇｍａ，Ｓｔ．Ｌｏｕｉｓ，ＭＯ）。
共有結合修飾物もまた、ＴＩＭＰ－３ポリペプチドの誘導体と考えられ、本発明の範囲内に含まれ、必ずという訳ではないが概ね翻訳後に作られる。例えば、選ばれた側鎖またはＮ末端残基もしくはＣ末端残基と反応できる有機誘導体化剤に抗原結合タンパク質の特定のアミノ酸残基を反応させることによって、抗原結合タンパク質の共有結合修飾物のいくつかの型のものが分子の中に導入される。
システイニル残基は最も一般的には、クロロ酢酸またはクロルアセトアミドなどのαハロアセテート（及び対応するアミン）と反応してカルボキシメチルまたはカルボキシアミドメチルの誘導体を生じる。システイニル残基はまた、ブロモトリフルオロアセトン、α－ブロモ－β－（５－イミドゾイル（ｉｍｉｄｏｚｏｙｌ））プロピオン酸、クロロアセチルリン酸塩、Ｎ－アルキルマレイミド、３－ニトロ－２－ピリジルジスルフィド、メチル２－ピリジルジスルフィド、ｐ－クロロ第二水銀安息香酸、２－クロロ水銀－４－ニトロフェノール、またはクロロ－７－ニトロベンゾ－２－オキサ－１，３－ジアゾールとの反応によって誘導体化される。したがって、本発明の一態様では、システイニル残基は、例えば、選ばれたコドンを変化させてＣｙｓをコードするようにすることによって、天然ＴＩＭＰ－３配列に付加される。かかるＣｙｓ置換は、発現、フォールディング、または本明細書に示す他の特性に重要であることが明らかになっている、ＴＩＭＰ－３中の領域でなされ得る。
本発明のタンパク質の炭水化物成分の数は、タンパク質へのグリコシドの化学的カップリングまたは酵素カップリングによって増やすことができる。これらの手順は、Ｎ及びＯ結合グリコシル化のためのグリコシル化能力を有する宿主細胞でタンパク質を産生することを必要としない点で有利である。用いられる結合モードによっては、糖は、（ａ）アルギニン及びヒスチジン、（ｂ）遊離カルボキシル基、（ｃ）システインの遊離スルフヒドリル基など、遊離スルフヒドリル基、（ｄ）セリン、スレオニン、またはヒドロキシプロリンの遊離ヒドロキシル基など、遊離ヒドロキシル基、（ｅ）フェニルアラニン、チロシン、またはトリプトファンの芳香族残基など、芳香族残基、または（ｆ）グルタミンのアミド基、に付加されてもよい。これらの方法は、１９８７年９月１１日公開のＷＯ８７／０５３３０、並びにＡｐｌｉｎ及びＷｒｉｓｔｏｎ，１９８１，ＣＲＣ Ｃｒｉｔ．Ｒｅｖ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．，ｐｐ．２５９－３０６に記載される。
開始組換えタンパク質に存在する炭水化物成分の除去を、化学的または酵素的に行ってもよい。化学的脱グリコシル化は、化合物トリフルオロメタンスルホン酸または同等の化合物へのタンパク質の曝露を必要とする。この処理は、連結糖（Ｎ－アセチルグルコサミンまたはＮ－アセチルガラクトサミン）を除くほとんどまたは全ての糖の切断という結果になり、一方、ポリペプチドを無傷なままとする。化学的脱グリコシル化は、Ｈａｋｉｍｕｄｄｉｎ ｅｔ ａｌ．，１９８７，Ａｒｃｈ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．２５９：５２、及びＥｄｇｅ ｅｔ ａｌ．，１９８１，Ａｎａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．１１８：１３１に記載される。ポリペプチドの炭水化物成分の酵素切断は、Ｔｈｏｔａｋｕｒａ ｅｔ ａｌ．，１９８７，Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．１３８：３５０に記載されるような種々のエンドグリコシダーゼ及びエキソグリコシダーゼの使用によって達成できる。潜在的グリコシル化部位でのグリコシル化を、Ｄｕｓｋｉｎ ｅｔ ａｌ．，１９８２，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２５７：３１０５に記載されるように化合物ツニカマイシンの使用によって防いでもよい。ツニカマイシンは、タンパク質－Ｎ－グリコシド結合の形成を妨げる。
抗原結合タンパク質の共有結合修飾物の別の型は、米国特許第４，６４０，８３５号；同第４，４９６，６８９号；同第４，３０１，１４４号；同第４，６７０，４１７号；同第４，７９１，１９２号、または同第４，１７９，３３７号に示される方法による、蛋白質でない種々のポリマー、例えば、以下に限定されないが、ポリエチレングリコール、ポリプロピレングリコール、またはポリオキシアルキレンなど、種々のポリオールへのタンパク質の結合を含む。加えて、当分野で既知である通り、アミノ酸置換をタンパク質内の種々の位置で行い、ＰＥＧなど、ポリマーの付加を促進してもよい。
ＴＩＭＰ－３ポリペプチドの発現
当分野で既知のいずれの発現系をも用いて本発明の組換えポリペプチドを作製することができる。一般に、宿主細胞は、所望のＴＩＭＰ－３ポリペプチド（ＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質または変異体を含む）をコードするＤＮＡを含む組換え発現ベクターにより形質転換される。用いることのできる宿主細胞としては、原核生物、酵母菌またはより高等な真核生物細胞がある。原核生物としては、グラム陰性菌またはグラム陽性菌、例えば、大腸菌または桿菌が挙げられる。より高等な真核生物細胞としては、昆虫細胞及び哺乳動物起源の樹立細胞株が挙げられる。適切な哺乳動物の宿主細胞株の例としては、サル腎臓由来細胞のＣＯＳ－７株（ＡＴＣＣ ＣＲＬ １６５１）（Ｇｌｕｚｍａｎ ｅｔ ａｌ．，１９８１，Ｃｅｌｌ ２３：１７５）、Ｌ細胞、２９３細胞、Ｃ１２７細胞、３Ｔ３細胞（ＡＴＣＣ ＣＣＬ １６３）、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞、ＨｅＬａ細胞、ＢＨＫ（ＡＴＣＣ ＣＲＬ １０）細胞株、及びＭｃＭａｈａｎ ｅｔ ａｌ．，１９９１，ＥＭＢＯ Ｊ．１０：２８２１に記載されるようなアフリカミドリザル腎臓由来細胞株ＣＶＩ（ＡＴＣＣ ＣＣＬ ７０）に由来するＣＶＩ／ＥＢＮＡ細胞株が挙げられる。細菌、真菌、酵母菌、及び哺乳動物の細胞宿主と使用するのに適切なクローニング及び発現ベクターが、Ｐｏｕｗｅｌｓ ｅｔ ａｌ．（Ｃｌｏｎｉｎｇ Ｖｅｃｔｏｒｓ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，Ｅｌｓｅｖｉｅｒ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，１９８５）に記載される。
哺乳動物の細胞発現は、天然ＴＩＭＰ－３の産生に非常によく似た高次構造のフォールディングと適合を容易にするという点で、ＴＩＭＰ－３ポリペプチドの産生に利点を提供することができる。数多くの哺乳動物細胞発現系が当分野で既知であり、かつ／または市販されており、後者の系としては、例えば、Ｇｉｂｃｏ（登録商標）Ｆｒｅｅｄｏｍ（登録商標）ＣＨＯ－Ｓ（登録商標）（チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）由来懸濁培養液における組換えタンパク質のクローニングと発現の全ての側面で容易に使用できるよう設計された製品；ＰｒｏＢｉｏＧｅｎ，Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ；Ｃａｒｌｓｂａｄ，ＣＡ）、ＧＳ Ｇｅｎｅ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ Ｓｙｓｔｅｍ（商標）（高収率で安定したｃＧＭＰ適合性哺乳動物細胞株の発生を提供するように設計されたトランスフェクション系；Ｌｏｎｚａ Ｂｉｏｌｏｇｉｃｓ，Ｓｌｏｕｇｈ，ＵＫ）、ＰＥＲ．Ｃ６（登録商標）技術（単一の不死化ヒト細胞に由来する連続的に分かれる一式の細胞を利用して、組換えタンパク質の大規模産生を容易にするよう設計されたツールの一揃い；Ｃｒｕｃｅｌｌ Ｌｅｉｄｅｎ，Ｔｈｅ Ｎｅｔｈｅｒｌａｎｄｓ）、または、ＣＡＰ及びＣＡＰ－Ｔ（複合タンパク質の発現と産生のための、ヒト細胞に基づく発現系；Ｃｅｖｅｃ，Ｃｏｌｏｇｎｅ，Ｇｅｒｍａｎｙ）などの不死化羊膜細胞、が挙げられる。
追加的な細胞発現系としては、例えば、Ｓｅｌｅｘｉｓ ＳＵＲＥｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ｐｌａｔｆｏｒｍ（商標）（組換えタンパク質を産生するよう発生細胞株を促すために種々の細胞株に適用できる技術基盤；Ｓｅｌｅｘｉｓ Ｉｎｃ．，Ｓｗｉｔｚｅｒｌａｎｄ）；ＰｒｏＦｅｃｔｉｏｎ（登録商標）Ｍａｍｍａｌｉａｎ Ｔｒａｎｓｆｅｃｔｉｏｎ Ｓｙｓｔｅｍｓ（組換えタンパク質の産生のために細胞の高効率トランスフェクションを提供するトランスフェクション系；Ｐｒｏｍｅｇａ，Ｍａｄｉｓｏｎ ＷＩ）；ｔｈｅ Ｅｘｐｉ２９３（商標）Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ Ｓｙｓｔｅｍ（高密度な、哺乳動物の一過性タンパク質発現系，Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｇｒａｎｄ Ｉｓｌａｎｄ，ＮＹ）；及び、ＭａｘＣｙｔｅ（登録商標）ＶＬＸ（商標）及びＳＴＸ（商標）Ｔｒａｎｓｉｅｎｔ Ｔｒａｎｓｆｅｃｔｉｏｎ Ｓｙｓｔｅｍｓ（抗体も含む組換えタンパク質の産生において用いられる拡大可能なトランスフェクション系；ＭａｘＣｙｔｅ，Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ，ＭＤ）が挙げられる。当業者はさらに、例えば、Ｗｉｇｌｅｒ ｅｔ ａｌ．（Ｃｅｌｌ １９７９：７７７）に最初に記載された技術、及び、例えば、カナダ国立研究機構（ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｃｏｕｎｃｉｌ ｏｆ Ｃａｎａｄａ）のウェブサイトに記載される追加的技術など、他の発現系を知っている。
形質転換された細胞の培養及び組換えタンパク質の産生に適切な種々の容器が当分野で既知である。これらとしては、２４ディープウェルプレート、２５０ｍｌと１Ｌの振とうフラスコ、及び種々のサイズの種々のバイオリアクター、例えば、２Ｌ、５Ｌ、１０Ｌ、３０Ｌ、１００Ｌ、１０００Ｌ、１００００Ｌ、及びそれより大きいバイオリアクターが挙げられる。細胞培養のための他の適切な容器は当分野で既知であり、また、本明細書に記載されるようにも用いることができる。
細胞培地調合物が当分野で周知であり、典型的には、培地は、最低限の増殖及び／または生存のために細胞が必要とする必須アミノ酸及び可欠アミノ酸、ビタミン、エネルギー源、脂質、及び微量元素、並びに緩衝液、及び塩を提供する。培養培地はまた、増殖及び／または生存を最低限の進度以上で向上させる補足成分、例えば、以下に限定されないが、ホルモン及び／または他の増殖因子、特定のイオン（ナトリウム、塩化物、カルシウム、マグネシウム、及びリン酸塩など）、緩衝液、ビタミン、ヌクレオシドまたはヌクレオチド、微量元素（通常非常に低い最終濃度で存在する無機化合物）、アミノ酸、脂質、及び／またはグルコースもしくは他のエネルギー源を含有してもよく；本明細書に記載される通り、培養培地に細胞周期阻害剤を加えてもよい。所定の実施形態では、培地は、細胞の生存及び増殖に最適なｐＨ及び塩濃度に有利に調合される。所定の実施形態では、培地は、細胞培養の初期の後に加えられる流加培地である。所定の実施形態では、細胞培養培地は、出発栄養液と、細胞培養の初期の後に加えられる何らかの流加培地との混合物である。
定義された培地を含め、種々の組織培地が市販されており、例えば、次の細胞培地のいずれか１つまたは組合せをとりわけ用いることができる：ＲＰＭＩ－１６４０培地、ＲＰＭＩ－１６４１培地、ダルベッコ変法イーグル培地（ＤＭＥＭ）、Ｍｉｎｉｍｕｍ Ｅｓｓｅｎｔｉａｌ Ｍｅｄｉｕｍ Ｅａｇｌｅ、Ｆ－１２Ｋ培地、Ｈａｍ’ｓ Ｆ１２培地、イスコフ改変ダルベッコ培地、ＭｃＣｏｙ’ｓ ５Ａ培地、Ｌｅｉｂｏｖｉｔｚ’ｓ Ｌ－１５培地、及びＥＸ－ＣＥＬＬ（商標）３００シリーズ（ＪＲＨ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｌｅｎｅｘａ，Ｋａｎｓａｓ）などの無血清培地。かかる培地の無血清版もまた市販されている。培養する細胞に必要な事柄及び／または所望の細胞培養パラメーターによっては、アミノ酸、塩、糖、ビタミン、ホルモン、増殖因子、緩衝液、抗生物質、脂質、微量元素、及び同種のものなど、追加の成分またはより濃度の高い成分を細胞培地に追加してもよい。
形質転換された細胞はポリペプチドの発現を促進する条件下で培養でき、ポリペプチドは従来のタンパク質精製手法によって回収できる。１つのかかる精製手法としては、親和性クロマトグラフィー並びに当分野で既知の他の方法の使用が挙げられる。哺乳動物の上清から親ＴＩＭＰ－３またはＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質を単離する１つの方法は、カルボキシ末端６ｘ－ヒスチジンタグに融合したＴＩＭＰ－３を６ｘ－ヒスチジン親和性Ｎｉ－セファロース樹脂と組み合わせて利用することである（例えば、固定化金属親和性クロマトグラフィー（ＩＭＡＣ）であり；一般的な手法は当分野で既知であり、かかる手法のための試薬や例がＱＩＡＧＥＮ，Ｇｅｒｍａｎｔｏｗｎ，ＭＤ及びＧＥ Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ，Ｐｉｔｔｓｂｕｒｇ，ＰＡによって概説されている）。陽イオン交換クロマトグラフィー（例えば、ＳＰ－ＨＰ Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ（登録商標），ＧＥ Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）を利用して、ＩＭＡＣ溶出後にＴＩＭＰ－３をさらに単離することができ、あるいは、代替的手段としてＩＭＡＣを用いずに哺乳動物の上清からＴＩＭＰ－３を捉えることができる（塩化ナトリウム勾配を中性ｐＨで用いると、ＴＩＭＰ－３及びその突然変異タンパク質の溶出が起こる）。サイズ排除クロマトグラフィー（例えば、Ｓｕｐｅｒｄｅｘ ２００（登録商標），ＧＥ Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ（移動相の例：１０ｍＭ Ｎａ２ＨＰＯ４、１．８ｍＭ ＫＨ２ＰＯ４、１３７ｍＭ ＮａＣｌ、２．７ｍＭ ＫＣｌ））が、ＴＩＭＰ－３またはその突然変異タンパク質をさらに単離するのに用いることのできる一般的な手段である（ＩＭＡＣ方法またはイオン交換クロマトグラフィーと組み合わせて）。これらの方法及び他の方法は当分野で既知であり、例えば、Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ：Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ：Ｈｉｇｈ Ｒｅｓｏｌｕｔｉｏｎ Ｍｅｔｈｏｄｓ，ａｎｄ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ，Ｔｈｉｒｄ Ｅｄｉｔｉｏｎ （２０１２，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ａｎｄ Ｓｏｎｓ；Ｈｏｂｏｋｅｎ，ＮＪ）を参照されたい。
ポリペプチド（天然ＴＩＭＰ－３またはＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質もしくは変異体）の量は、細胞培養上清液、即ち馴化培地（ＣＭ）における組換えＴＩＭＰ－３（天然、変異体、または突然変異タンパク質）の量の分析ができるいずれの適切な定量的または半定量的方法によっても決定できる。適切な定性的または半定量的方法としては、ウエスタンブロット及びクーマシー染色ＳＤＳ ＰＡＧＥゲルが挙げられる。定量的な測定方法としては、例えば、ヒトＴＩＭＰ－３ ＥＬＩＳＡ（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ Ｉｎｃ．，Ｍｉｎｎｅａｐｏｌｉｓ，ＭＮ）、または、抗体の媒介によってＴＩＭＰ－３を捕捉するＦｏｒｔｅＢｉｏ Ｏｃｔｅｔ（登録商標）（Ｐａｌｌ ＦｏｒｔｅＢｉｏ Ｃｏｒｐ，Ｍｅｎｌｏ Ｐａｒｋ，ＣＡ）、または、精製ＴＩＭＰ－３に対する直接ＵＶ（紫外線）吸光度（２８０ｎｍ）測定などの酵素免疫測定法などの使用が挙げられる。
このようにして、ＴＩＭＰ－３における特定の突然変異の作用を、作製された組換え突然変異タンパク質の量と、類似の培養条件下で作製された天然タンパク質の量とを比較することによって評価することができる。ＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質または変異体は、天然ＴＩＭＰ－３に対して観察されるレベルの１倍、２倍、３倍、４倍、５倍、１０倍、またはそれ以上のレベルで発現させることができる。所望であれば、種々の形式のＴＩＭＰ－３に対する比較または比産生能（ｓｐｅｃｉｆｉｃ ｐｒｏｄｕｃｔｉｖｉｔｙ）を可能とするよう、形質転換またはトランスフェクトされた特定の細胞株の比産生能を決定することができる。比産生能、即ちｑＰは、１日１細胞当りの組換えタンパク質のピコグラム数（ｐｇ／ｃ／ｄ）で表現され、培養液の細胞を定量化する当分野で既知の方法、及び組換えタンパク質を定量化する上述の方法を適用することによって容易に決定できる。
ＴＩＭＰ－３ポリペプチドの用途
ＴＩＭＰ－３ポリペプチド、変異体、突然変異タンパク質、または誘導体は、例えば、アッセイにおいて用いることができ、あるいは、それらはより多いレベルのＴＩＭＰ－３活性が望まれるいずれかの状態（即ち、ＴＩＭＰ－３によって阻害されるか阻害され得るマトリクスメタロプロテアーゼ（ＭＭＰ）及び／または他のプロテイナーゼが原因的または増悪的働きをする状態）の治療でも用いることができ、それとしては、以下に限定されないが、炎症性状態、骨関節炎、及び過剰もしくは不適切なＭＭＰ活性が起こる他の状態（例えば、心筋虚血、再潅流傷害、及び鬱血性心不全への進行途中）が挙げられる。炎症性状態としては、喘息、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）、及び特発性肺線維症（ＩＰＦ）、炎症性腸疾患（例えば、潰瘍性大腸炎、クローン病、及びセリアック病）、乾癬、ウイルス性心筋炎を含む心筋炎、アテローム性動脈硬化症に関連した炎症、並びに、関節リウマチ、乾癬性関節炎及び同種のものを含む関節炎の状態が挙げられる。
本明細書に記載されるＴＩＭＰ－３ポリペプチド、変異体突然変異タンパク質、または誘導体組成物は、病原を改変し、マトリクス分解及び／または炎症、即ちメタロプロテイナーゼが有害な働きをするそれらの状態によって特徴づけられる疾患または状態に対して有益な治療法を提供する。組成物は、単独で用いてもよく、かかる状態の治療で用いられる１つ以上の剤と組み合わせて用いてもよい。したがって、本発明のＴＩＭＰ－３ポリペプチド、変異体突然変異タンパク質、または誘導体組成物は、メタロプロテイナーゼ活性によって過剰なマトリクス損失が引き起こされるいずれの障害の治療においても有用であり得る。本発明のＴＩＭＰ－３変異体突然変異タンパク質、または誘導体組成物は、コラゲナーゼ、アグリカナーゼ、または他のマトリクス分解性または炎症促進性酵素の過剰産生に関連する種々の障害、例えば、栄養障害型表皮水疱症、骨関節炎、ライター症候群、偽痛風、若年性関節リウマチを含む関節リウマチ、強直性脊椎炎、強皮症、歯周病、角膜潰瘍、表皮潰瘍、胃潰瘍を含む潰瘍、手術後の創傷治癒、及び再狭窄の治療において、単独でも有用であり、他の薬物と組み合せられても有用である。過剰なコラーゲン及び／またはプロテオグリカン分解が一因であり得て、したがって、ＴＩＭＰ－３ポリペプチド、変異体突然変異タンパク質、または誘導体組成物の適用が可能な他の病状としては、肺気腫、骨パジェット病、骨粗鬆症、強皮症、褥瘡などの骨もしくは組織の圧迫萎縮、真珠腫、及び創傷治癒異常が挙げられる。直接的または間接的に（例えば、心筋虚血，再潅流傷害における場合及び鬱血性心不全への進行における場合の）ＴＩＭＰ－３の量の低下またはメタロプロテアーゼの量の上昇の結果であるさらなる状態はまた、本明細書に記載の組成物を単独で用いるか、または、かかる状態に罹った個人の治療に一般的に用いられる他の薬物と併せて用いて、治療することができる。ＴＩＭＰ－３ポリペプチド、変異体、突然変異タンパク質、または誘導体組成物は、他の創傷治癒促進剤の補助剤として、例えば、治癒過程中にコラーゲンの代謝回転を調節するために、追加的に適用できる。
多くのメタロプロテイナーゼはまた、炎症誘発性活性を示し、このことに応じた追加的実施形態としては、炎症及び／または自己免疫障害を治療する方法が挙げられ、障害としては、以下に限定されないが、軟骨炎症、及び／または骨分解、関節炎、関節リウマチ、少関節性リウマチ様関節炎、多関節性リウマチ様関節炎、全身性発症関節リウマチ、強直性脊椎炎、腸疾患性関節炎、反応性関節炎、ライター症候群、ＳＥＡ症候群（血清陰性、腱付着部症、関節症症候群）、皮膚筋炎、乾癬性関節炎、強皮症、全身性エリテマトーデス、脈管炎、マイオリティス、ポリマイオリティス、ダーマトマイオリティス、骨関節炎、結節性多発動脈炎、ウェゲナー肉芽腫症、動脈炎、リウマチ性多発筋痛症、サルコイドーシス、硬化症、原発性胆汁性硬化症、硬化性胆管炎、シェーグレン症候群、乾癬、尋常性乾癬、滴状乾癬、倒置乾癬、膿疱性乾癬、乾癬性紅皮症、皮膚炎、アトピー性皮膚炎、アテローム性動脈硬化症、ループス、スチル病、全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）、重症筋無力症、炎症性腸疾患、潰瘍性大腸炎、クローン病、セリアック病（非熱帯性スプルー）、血清反応陰性関節症に関連した腸疾患、顕微鏡的大腸炎またはコラーゲン形成大腸炎、好酸球性胃腸炎、または直腸結腸切除及び回腸肛門吻合の後に起こる嚢炎、膵炎、インスリン依存性糖尿病、乳腺炎、胆嚢炎、胆管炎、胆管周囲炎、多発性硬化症（ＭＳ）、喘息（外因性喘息及び内因性喘息、並びに、関連する気道の慢性炎症性状態または応答性亢進、を含む）、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ、即ち、慢性気管支炎、肺気腫）、急性呼吸器疾患症候群（ＡＲＤＳ）、呼吸促迫症候群、嚢胞性線維症、肺高血圧症、肺血管収縮、急性急性肺傷害、アレルギー性気管支肺アスペルギルス症、過敏性肺炎、好酸球性肺炎、気管支炎、アレルギー性気管支炎気管支拡張症、結核、過敏性肺炎、職業性喘息、喘息様障害、サルコイド、反応性気道疾患（または機能不全）症候群、綿肺、間質性肺疾患、好酸球増加症候群、鼻炎、副鼻腔炎、及び肺寄生虫症、ウイルス性誘発性状態に関連した気道過敏（例えば、呼吸器多核体ウイルス（ＲＳＶ）、パラインフルエンザウイルス（ＰＩＶ）、ライノウイルス（ＲＶ）及びアデノウイルス）、ギラン・バレー疾患、グレーブス病、アジソン病、レイノー現象、自己免疫性肝炎、ＧＶＨＤ、及び同種のものが挙げられる。ＴＩＭＰ－３ポリペプチド、変異体、突然変異タンパク質、または誘導体はまた、ＴＩＭＰ－３の相対的レベルの低下（即ち、ＴＩＭＰ－３の量の低下またはメタロプロテアーゼの量の増加の結果であり得る、メタロプロテアーゼに対する内因性ＴＩＭＰ－３の割合の低下）が、例えば、心筋虚血、再潅流傷害における病理的作用、及び鬱血性心不全への進行中における病理的作用に関連する場合に用途がある。
ＴＩＭＰ－３が結合組織分解を阻害する能力に基づき、ＴＩＭＰ－３ポリペプチド、変異体、突然変異タンパク質、または誘導体は、血管形成の阻害が、例えば、腫瘍成長の予防または抑制、及び、寄生虫の侵入の予防において有用である場合に用途がある。例えば、腫瘍の浸潤と転移に関する分野では、いくつかの特定の腫瘍の転移能は、コラゲナーゼを合成し分泌する能力の向上に相関し、相当量のメタロプロテイナーゼ阻害物質を合成し分泌する能力のなさに相関する。本開示のＴＩＭＰ－３タンパク質はまた、原発性腫瘍の除去の間、化学療法及び放射線療法の間、汚染された骨髄の採取の間、及びがん性腹水のシャンティングの間、腫瘍細胞転移を阻害する場合に治療用途がある。診断的には、腫瘍試料におけるＴＩＭＰ－３産生の不在とその転移能の相関関係は、予後指標として、また、可能な予防治療のための指標として、有用である。
ＭＭＰはまた、血液脳関門（ＢＢＢ）を開けるための経路の一部として、脳の基底層及び密着結合タンパク質に作用し、炎症の細胞及び可溶性メディエーターが脳に入ることを促進する。したがって、本発明の組成物及び方法は、ＢＢＢの過剰な透過化または不適切な透過化によって特徴づけられる神経系の障害の治療において有用であり得る。加えて、ニューロンの回りのマトリクスタンパク質が分解すると、接触の損失及び細胞死が起こり得、したがって、開示されるＴＩＭＰ－３組成物は、神経細胞を取り囲む基底膜を保存することによって、神経細胞を損傷から保護することができる。本発明のＴＩＭＰ－３組成物は、傷害、例えば、脳虚血、または外傷性脳損傷に対する神経炎症性応答の治療または改善に有用である。本明細書に開示される組成物はまた、炎症が疾患、例えば、多発性硬化症の根本原因である神経変性疾患の治療において有用であり、同様に、種々の形式の神経障害及び／またはミオパチー、脊髄損傷、並びに筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）の治療において有用であろう。したがって、本発明の組成物の使用は、ＢＤＮＦ、ＮＴ－３、ＮＧＦ、ＣＮＴＦ、ＮＤＦ、ＳＣＦ、または他の神経細胞の成長もしくは増殖調節因子との併用があり得る。加えて、本発明の組成物及び方法は、結合組織破壊の局所性阻害が組織の外観を変化させ得るという点で美容目的にも適用可能であり得る。
ＴＩＭＰ－３ポリペプチド、変異体、突然変異タンパク質、または誘導体は、生体外処置での使用または生体内での投与を行って、内因性ＴＩＭＰ－３活性の増大及び／またはＴＩＭＰ－３誘発性生物活性の向上が可能である。本発明のＴＩＭＰ－３ポリペプチド、変異体、突然変異タンパク質、または誘導体は、内因性ＴＩＭＰ－３が下方制御されるか低レベルで存在する状況の下、生体内で用いてもよい。そうして、ＴＩＭＰ－３阻害可能プロテイナーゼが（直接的または間接的に）発生または悪化させる障害が治療でき、その例が本発明に提供される。一実施形態では、本発明は、ＴＩＭＰ－３誘発性生物活性を増加させるのに有効な量でＴＩＭＰ－３ポリペプチド、変異体、突然変異タンパク質、または誘導体をそれを必要とする哺乳動物に生体内投与することを含む治療的方法を提供する。別の実施形態では、本発明は、ＴＩＭＰ－３の内在レベルを上昇させるのに有効な量でＴＩＭＰ－３ポリペプチド、変異体、突然変異タンパク質、または誘導体をそれを必要とする哺乳動物に生体内投与することを含む治療的方法を提供する。
別の態様では、本発明は、改善された半減期を生体内に有するＴＩＭＰ－３ポリペプチド、変異体、突然変異タンパク質、または誘導体を提供する。一実施形態では、ＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質の半減期は、天然ＴＩＭＰ－３のそれの少なくとも２倍であり；別の実施形態では、半減期は、天然ＴＩＭＰ－３のそれより少なくとも３倍、４倍、５倍、６倍、８倍、または１０倍大きい。一実施形態では、半減期は、非ヒト哺乳動物において決定され、別の実施形態では、半減期はヒト対象において決定される。さらなる実施形態は、（例えば、ヒト対象に投与された場合に）少なくとも１日の半減期を生体内に有するＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質または変異体を提供する。一実施形態では、ＴＩＭＰ－３ポリペプチド、変異体、突然変異タンパク質、または誘導体は少なくとも３日の半減期を有する。他の実施形態では、ＴＩＭＰ－３ポリペプチド、変異体、突然変異タンパク質、または誘導体は、４日以上の半減期を有する。別の実施形態では、ＴＩＭＰ－３ポリペプチド、変異体、突然変異タンパク質、または誘導体は、８日以上の半減期を有する。
別の実施形態では、ＴＩＭＰ－３ポリペプチド、変異体、または突然変異タンパク質は、それが非誘導体化または未修飾のＴＩＭＰ－３結合タンパク質と比較して、より長い半減期を有するように誘導体化または修飾される。誘導体化ポリペプチドは、特定の使用において半減期を伸ばすなど、所望の特性をポリペプチドに付与するいずれの分子または物質をも含むことができる。誘導体化ポリペプチドは、例えば、検出可能（または標識）成分（例えば、放射性、比色性、抗原性、もしくは酵素性の分子、検出可能なビーズ（電磁ビーズまたは高電子密度（例えば、金）ビーズなど）、または別の分子に結合する分子（例えば、ビオチンまたはストレプトアビジン））、治療用または診断用成分（例えば、放射性、細胞毒性、もしくは薬剤的活性の成分）、または特定の使用に対するポリペプチドの適性を向上させる分子（例えば、ヒト対象などの対象への投与、または他の生体内または生体外使用）を含むことができる。
一つのかかる例として、ポリペプチドは、例えば、ＷＯ２００８０６３２９１及び／またはＲｏｔｈｅｎｆｌｕｈ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ Ｍａｔｅｒｉａｌｓ ７：２４８（２００８）に開示される通り、関節軟骨組織に特異的に結合するリガンドで誘導体化される。ポリペプチドを誘導体化するために用いることのできる分子の例として、アルブミン（例えば、ヒト血清アルブミン）及びポリエチレングリコール（ＰＥＧ）が挙げられる。ポリペプチドのアルブミン結合誘導体及びペグ化誘導体は、当分野に周知の技術を用いて調製できる。一実施形態では、ポリペプチドは、トランスサイレチン（ＴＴＲ）またはＴＴＲ変異体と共役するかまたは別の方法で結合される。ＴＴＲまたはＴＴＲ変異体は、例えば、デキストラン、ポリ（ｎ－ビニルピロリドン（ｖｉｎｙｌ ｐｙｕｒｒｏｌｉｄｏｎｅ））、ポリエチレングリコール、プロプロピレングリコールホモポリマー、ポリプロピレンオキシド／エチレンオキシドコポリマー、ポリオキシエチル化ポリオール、及びポリビニルアルコール（米国特許出願第２００３０１９５１５４号）からなる群より選択される化学薬品で化学的に修飾することができる。
組成物
また、本発明に包含されるのは、有効量の本発明のポリペプチド産生物（即ち、ＴＩＭＰ－３ポリペプチド、変異体、突然変異タンパク質、または誘導体）を、ＴＩＭＰ－３治療法（即ち、ＴＩＭＰ－３の内在レベルを増やすことまたは内因性ＴＩＭＰ－３の活性を増大することが有用である状態）に有用な薬剤的に許容できる希釈剤、保存剤、可溶化剤、乳化剤、アジュバント、及び／または担体とともに含む医薬組成物である。かかる組成物としては、様々な緩衝液含有量（例えば、トリスＨＣｌ、酢酸塩、リン酸塩）、ｐＨ、及びイオン強度の希釈剤；洗浄剤及び可溶化剤などの添加剤（例えば、トウィーン８０、ポリソルベート８０）、抗酸化剤（例えば、アスコルビン酸、メタ重亜硫酸ナトリウム）、保存剤（例えば、チメルソル（Ｔｈｉｍｅｒｓｏｌ）、ベンジルアルコール）及び充填物質（例えば、ラクトース、マンニトール）；タンパク質へポリエチレングリコールなどのポリマーを共有結合的に付加したもの（上に考察の通りであり、例えば、米国特許第４，１７９，３３７号を参照されたく、なお、この文献は参照により本明細書に援用される）；ポリ乳酸、ポリグリコール酸などのポリマー化合物の粒子状調製物またはリポソームに材料を組み込んだもの、が挙げられる。かかる組成物は、ＴＩＭＰ－３結合タンパク質の物理的状態、安定性、生体内放出速度、及び生体内排除速度に影響を与えることができる。例えば、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，１８ｔｈ Ｅｄ．（１９９０，Ｍａｃｋ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏ．，Ｅａｓｔｏｎ，ＰＡ １８０４２）１４３５－１７１２ページを参照されたく、なお、この文献は参照により本明細書に援用される。
一般に、本発明のポリペプチドの有効量は、受容者の年齢、体重、状態、または疾患の重症度によって決めることになる。前掲のＲｅｍｉｎｇｔｏｎｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，６９７～７７３ページを参照されたく、なお、この文献は参照により本明細書に援用される。典型的には、約０．００１ｇ／体重１ｋｇ～約１ｇ／体重１ｋｇの用量を用いてもよく、しかし、当分野の医師が認めるものであればそれより多い量も少ない量も用いることができる。局所適用または関節内適用など、局所的（即ち、非全身的）適用には、投薬は約０．００１ｇ／ｃｍ２～約１ｇ／ｃｍ２であってもよい。投薬は、１日に１回または複数回でも、それより少なくてもよく、本明細書に記載の他の組成物と併用してもよい。本発明は本明細書に記載される用量に限定されないことに留意されたい。
当分野で理解される通り、本発明の分子を含む医薬組成物は適応症に合った方法で対象に投与される。医薬組成物は、以下に限定されないが、非経口的投与、局在的投与、局所的投与、または吸入を含む、いずれの適切な手段によって投与してもよい。注射する場合、この医薬組成物は、例えば、静脈内、筋肉内、病巣内、腹腔内、または皮下の経路で、ボーラス注入または持続注入によって投与してもよい、
例えば、疾患または傷害の部位における、経皮性送達及び移植片からの徐放であるような局在的投与が企図される。他の代替的方法としては、点眼剤が挙げられ、経口剤としては、丸剤、シロップ剤、菓子錠剤、またはチューインガムが挙げられ、局所用調製物としてはローション、ゲル、スプレー、及び軟膏が挙げられる。例えば、関節または筋骨格系への局在的投与としては、関節周囲、関節内、嚢内（ｉｎｔｒａｂｕｒｓａｌ）、軟骨内、滑液包内、及び腱内（ｉｎｔｒａｔｅｎｄｉｎｏｕｓ）の投与が挙げられる。呼吸器系への投与としては、肺内、胸膜内（ｉｎｔｒａｐｌｕｒａｌ）、肺内、気管内、副鼻腔内、及び気管支内送達が挙げられ、例えば、吸入器または噴霧器によって促進することができる。脳及び／または神経系に組成物を導入するのに有用な髄腔内送達及び他の方法もまた本明細書で企図され、例えば、硬膜外、硬膜内、または硬膜外の投与、並びに神経周囲、仙骨内（ｉｎｔｒａｃａｕｄａｌ）、脳内、嚢内、及び脊髄内の投与がある。
局所的投与のさらなる例としては、手術または別の医療処置との併用による組織への送達が挙げられる。例えば、医薬組成物は、心臓症状の治療または改善のために行われる手術の間、または、心臓カテーテルなどの処置（例えば、経皮的冠動脈形成術）の間、心臓組織に投与してもよい。送達は、例えば、冠内、心臓内、心筋内、及び／または経心内膜の経路によってでもよく、心臓の注射対象領域の心内膜性または電気機械的マップまたは他の技術、例えば、磁気共鳴画像法（ＭＲＩ）の使用によって導いてもよい。組成物はまた、心臓パッチへの封入によるか、ステントや心臓状態に有用な他の装置のコーティングとして送達することができる。
点眼剤に加えて、本発明の組成物を目に投与するために軟膏、クリーム、またはゲルを用いることもまた企図される。目の内部への直接投与を、眼窩周囲、結膜、角膜内、結膜下、テノン嚢下（ｓｕｂｔｅｎｏｎｓ）、眼球後、眼内、及び／または硝子体内への注射または投与によって実施してもよい。これら及び他の技術は、例えば、Ｇｉｂａｌｄｉ’ｓ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ Ｓｙｓｔｅｍｓ ｉｎ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｃａｒｅ （２００７，Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｓｏｃｉｅｔｙ ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ－Ｓｙｓｔｅｍ Ｐｈａｒｍａｃｉｓｔｓ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，ＭＤ）に考察される。
複数の剤が、細胞外のマトリクスと組織の動的平衡を維持するために協力して作用する。平衡が崩れている状態の治療においては、他の剤の１つ以上を、本発明のポリペプチドと組み合わせて用いてもよい。これらの他の剤は、同時投与してもよく、順次投与してよく、それらを組み合せて投与してもよい。一般的に、これらの他の剤は、メタロプロテイナーゼ、セリンプロテアーゼ、マトリクス分解酵素の阻害剤、細胞内酵素、細胞接着調節剤、並びに、細胞外マトリクス分解プロテイナーゼの発現を調節する因子及びその阻害剤からなるリストより選択してもよい。具体的な例は下に列記されるが、当業者であれば、追加的な剤または他の形式のその列記された剤（合成的に産生されたものや、組換えＤＮＡ技術によるもの、並びに類似体及び誘導体など）を含む、同等の機能を果たす他の剤を認識するものである。
細胞外マトリクス分解の予防の向上またはより具体的な予防が望まれる場合に、他の分解阻害剤もまた用いてもよい。阻害剤は、α２マクログロブリン、妊娠領域タンパク質、オボスタチン、α１－プロテイナーゼ阻害剤、α２－抗プラスミン、アプロチニン、プロテアーゼネキシン－１、プラスミノーゲン活性化因子阻害剤（ＰＡＩ）－１、ＰＡＩ－２、ＴＩＭＰ－１、及びＴＩＭＰ－２からなる群より選択してもよい。当業者が認める場合は、他のものを用いてもよい。
細胞内酵素もまた、本発明のポリペプチドと併用してもよい。細胞内酵素はまた、細胞外マトリクス分解に影響することがあり、例えば、リソゾーマル（ｌｙｓｏｚｏｍａｌ）酵素、グリコシダーゼ、及びカテプシンが挙げられる。
細胞接着調節剤もまた、本発明のポリペプチドと組み合わせて用いてもよい。例えば、本発明のポリペプチドを用いた、細胞外マトリクスの分解阻害の前、間、または後に細胞外マトリクスへの細胞接着を調節することが望まれることがある。細胞外マトリクスへの細胞接着を示した細胞としては、破骨細胞、マクロファージ、好中球、好酸球、キラーＴ細胞、及びマスト細胞が挙げられる。細胞接着調節剤としては、「ＲＧＤ」モチーフもしくは類似体を含有するペプチドまたは模倣性アンタゴニストもしくはアゴニストが挙げられる。
細胞外マトリクス分解プロテイナーゼの発現を調節する因子及びその阻害剤としては、サイトカイン、例えば、ＩＬ－１及びＴＮＦ－α、ＴＧＦ－β、グルココルチコイド、及びレチノイドが挙げられる。細胞増殖及び／または分化を起こす他の増殖因子を用いてもよい場合があり、それは、所望の作用が、かかる細胞作用の関与の下、本発明のポリペプチドを用いて細胞外マトリクスの分解を阻害することである場合である。例えば、炎症の際、（酵素活性の阻害によって）細胞外マトリクスの維持が望まれる可能性があるが、さらに好中球の産生が望まれる可能性があり、したがって、Ｇ－ＣＳＦが投与されてもよい。他の因子としては、エリスロポエチン、インターロイキンファミリーメンバー、ＳＣＦ、Ｍ－ＣＳＦ、ＩＧＦ－Ｉ、ＩＧＦ－ＩＩ、ＥＧＦ、ＦＧＦファミリーメンバー、例えばＫＧＦなど、ＰＤＧＦ、及びその他が挙げられる。インターフェロンα，β，γ，またはコンセンサスインターフェロンなど、インターフェロンの活性がさらに望まれることがある。細胞内の剤としては、Ｇタンパク質、タンパク質キナーゼＣ、及びイノシトールホスファターゼが挙げられる。本発明のポリペプチドの使用は、炎症治療法に関係する１つ以上の剤とともに治療的利益を提供することができる。
細胞輸送剤を使用してもよい、例えば、炎症は、細胞外マトリクスの分解と、細胞の傷害部位への動きまたは輸送とが関与する。細胞外マトリクスの分解の予防はかかる細胞輸送を予防することができる。本発明のポリペプチドを、細胞輸送調節剤のアゴニストまたはアンタゴニストと併用することは、したがって、炎症の治療において望ましいことがある。細胞輸送調節剤は、内皮細胞表面受容体（Ｅ－セレクチン及びインテグリンなど）；白血球細胞表面受容体（Ｌ－セレクチン）；ケモカイン及び化学誘引物質からなるリストより選択される。炎症に関与する組成物の総説については、Ｃａｒｌｏｓ ｅｔ ａｌ．，Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｒｅｖ．１１４：５－２８（１９９０）を参照されたく、なお、この文献は参照により本明細書に援用される。
さらに、組成物としてはｎｅｕ分化因子「ＮＤＦ」が挙げられ、治療方法としては、ＴＩＭＰ－３の投与前、投与時、投与後にＮＤＦを投与することが挙げられる。ＮＤＦは、ＴＩＭＰ－２の産生を刺激することが分かっており、ＮＤＦ、ＴＩＭＰ－１、－２、及び／または－３の組合せは腫瘍の治療において利益を提供できる。
本発明のポリペプチド産生物は、検出可能なマーカー物質（例えば、１２５Ｉによる放射標識をしたもの、または、ＡｌｅｘａＦｌｕｏｒ（登録商標）［Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｇｒａｎｄ Ｉｓｌａｎｄ ＮＹ］などの蛍光体による標識をしたもの）との会合によって「標識」して、固体組織及び血液または尿などの流体の試料におけるＴＩＭＰ－３の検出及び定量化に有用である試薬を提供してもよい。本発明の核酸産生物はまた、例えば、関連する遺伝子を同定するために、検出可能マーカー（例えば、放射標識、及び非同位体標識、例えば、ビオチン）で標識し、ハイブリダイゼーション処理で用いてもよい。
上に記載の通り、本発明のＴＩＭＰ－３ポリペプチド、変異体突然変異タンパク質、または誘導体組成物は、種々の障害に幅広い用途を有する。このようにして、本明細書で企図される別の実施形態は、本発明の組成物と、任意で、細胞外マトリクスの分解が関与する障害の治療を対象とした上述の追加的組成物の１つ以上とを含むキットである。追加的な実施形態は、包装材料と、その包装材料内の医薬品とを含む製品であり、その医薬品は本発明のポリペプチド、変異体、突然変異タンパク質、または誘導体を含有し、その包装材料は、ＴＩＭＰ－３に対する治療的使用を示す表示を含む。一実施形態では、医薬剤は、がん、炎症、関節炎（骨関節炎及び同種のものを含む）、栄養障害型表皮水疱症、歯周病、潰瘍、肺気腫、骨障害、強皮症、創傷治癒、赤血球欠乏、美容組織再構築、受精または胚着床調節、及び神経細胞障害からなる群より選択される適応症に用いてもよい。この製品は、任意で、他の組成物または他の組成物の表示説明を含んでもよい。
以下の実施例は、本発明の具体的な実施形態または特徴を例示する目的で提供され、その範囲を限定しない。
実施例１
この実施例は、哺乳動物の発現系での発現に対してＴＩＭＰ－３の１つ以上の突然変異の作用があればそれを決定するために用いられる方法を説明する。この実施例は、一般的なベクター及び宿主細胞系について記載しており、多くのベクター及び宿主細胞系は当分野で既知であり、本明細書に記載されており、組換えタンパク質の発現に対してＴＩＭＰ－３配列中の特定の突然変異の作用がもしあればその決定に適切である。
概略的に言えば、ＴＩＭＰ－３をコードするＤＮＡを通常の条件下で発現ベクターに連結させ（即ち、ＴＩＭＰ－３をコードするＤＮＡを、発現できるようにベクターの他の配列に作用可能に連結させ）、適切な哺乳動物の細胞をベクターにより形質転換またはトランスフェクトする。形質転換またはトランスフェクトされた細胞を適切な条件下で培養し、組換えタンパク質を発現させ、その量を、例えば、ウエスタンブロットまたはＳＤＳ＝ＰＡＧＥによって定性的もしくは半定量的に評価するか、または、ＥＬＳＡ（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ，Ｍｉｎｎｅａｐｏｌｉｓ ＭＮ）もしくはＦｏｒｔｅＢｉｏ Ｏｃｔｅｔ（登録商標）（Ｐａｌｌ ＦｏｒｔｅＢｉｏ Ｃｏｒｐ，Ｍｅｎｌｏ Ｐａｒｋ，ＣＡ）などのアッセイを用いてより定量的に評価する。このようにして、哺乳動物細胞によるＴＩＭＰ－３タンパク質、突然変異タンパク質、または変異体を発現する能力に対する種々の突然変異の作用を決定することができる。
１つ以上の突然変異を、ＴＩＭＰ－３ポリペプチドにＮ結合型グリコシル化部位を導入するよう作製する場合、または天然グリコシル化部位を増強するよう作製する場合、グリコシル化の存在及び／または程度を評価することが望ましいことがある。細胞は、先に記載された通り形質転換またはトランスフェクトし、半定量的計測方法（例えば、ウエスタンブロット）を用い、Ｎ結合型グリコシル化がうまく組み込まれなかったか、部分的に組み込まれたか、または十分に組み込まれたかを決定することができる。
実施例２
この実施例は、ＴＩＭＰ－３の１つ以上の突然変異がヘパリン非依存性の増加を引き起こしたかどうかを決定するのに用いられる方法を記載する。細胞は、先に記載された通り形質転換またはトランスフェクトし、ヘパリンの存在または不存在下で培養する。ヘパリンを種々の量で加えて、ヘパリン依存性の程度が半定量的に分かるようにすることができる。次いで、種々の条件下で発現されるＴＩＭＰ－３タンパク質、突然変異タンパク質、または変異体の量を決定し、ヘパリンが細胞外マトリクスからのＴＩＭＰ－３タンパク質、突然変異タンパク質、もしくは変異体の放出に必要とされるか否か、または、必要とされる量もしくはヘパリンが低減されるか否かに特定の突然変異がいくらかでも作用を及ぼすかどうかを決定する比較を行う。
実施例３
この実施例は、蛍光分析を用いてＭＭＰ活性を測定するＭＭＰ阻害アッセイについて記載し、他の方法は当分野で既知である。例えば、消光されたＭＭＰサブタイプ５－ＦＡＭ／ＱＸＬ５２０蛍光共鳴エネルギー転移（ＦＲＥＴ）ペプチド基質を活性化ＭＭＰサブタイプまたはサブタイプ特異的触媒領域によって切断すると、蛍光シグナルが増加する。いくつかの種々のＭＭＰに対するＦＲＥＴペプチドが、例えば、Ａｎａｓｐｅｃ，Ｆｒｅｍｏｎｔ，ＣＡから市販される。本明細書で使用される場合、ＴＩＭＰ－３タンパク質とは、天然ＴＩＭＰ－３またはＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質、変異体、もしくは誘導体であってもよく、試験されるタンパク質は試験分子と称される。
ＭＭＰ２活性アッセイについては、ヒト潜在型ＭＭＰ２（ｈｕｍａｎ ｐｒｏ－ＭＭＰ２）（Ａｎａｓｐｅｃ，Ｆｒｅｍｏｎｔ，ＣＡ）を１ｍＭ 酢酸４－アミノフェニル水銀（ＡＰＭＡ，Ａｎａｓｐｅｃ，Ｆｒｅｍｏｎｔ，ＣＡ）で３７℃で１時間活性化し、その後、黒色３８４ウェルＯｐｔｉｐｌａｔｅ（ＰｅｒｋｉｎＥｌｍｅｒ，Ｗａｌｔｈａｍ，ＭＡ）中種々の濃度の試験分子に対して、納入業者によって供給されたアッセイ緩衝液に入れたＭＭＰ２感応性５－ＦＡＭ／ＱＸＬ ５２０ ＦＲＥＴペプチドで３７℃でインキュベーションを行う。２時間のインキュベーションの後、反応プレートからの蛍光シグナルをＥｎＶｉｓｉｏｎマルチラベル（ｍｕｌｔｉｌａｂｅｌ）マイクロプレートリーダー（ＰｅｒｋｉｎＥｌｍｅｒ，Ｗａｌｔｈａｍ，ＭＡ）にて励起（４９０ｎｍ）及び発光（５２０ｎｍ）で測定する。相対蛍光単位（ＲＦＵ）のデータを、ＧｒａｐｈＰａｄ Ｐｒｉｓｍ ５．０（ＧｒａｐｈＰａｄ，ＳａｎＤｉｅｇｏ，ＣＡ）で試験される試験分子濃度に対してプロットして半最大阻害定数（ＩＣ５０）を推定する。
ＭＭＰ９活性測定については、ヒトＭＭＰ９（Ａｎａｓｐｅｃ，Ｆｒｅｍｏｎｔ，ＣＡ）の触媒領域を黒色３８４ウェルＯｐｔｉｐｌａｔｅ（ＰｅｒｋｉｎＥｌｍｅｒ，Ｗａｌｔｈａｍ，ＭＡ）中ＭＭＰ９感応性５－ＦＡＭ／ＱＸＬ ５２０ ＦＲＥＴペプチド及び種々の濃度の試験分子で３７℃でインキュベートする。２時間のインキュベーションの後、蛍光シグナルをＥｎＶｉｓｉｏｎマルチラベル（ｍｕｌｔｉｌａｂｅｌ）マイクロプレートリーダー（ＰｅｒｋｉｎＥｌｍｅｒ，Ｗａｌｔｈａｍ，ＭＡ）にて励起（４９０ｎｍ）及び発光（５２０ｎｍ）で測定する。相対蛍光単位（ＲＦＵ）のデータを、ＧｒａｐｈＰａｄ Ｐｒｉｓｍ ５．０（ＧｒａｐｈＰａｄ，ＳａｎＤｉｅｇｏ，ＣＡ）で試験される試験分子濃度に対してプロットして半最大阻害定数（ＩＣ５０）を推定する。
ＭＭＰ１３活性については、試験分子をアッセイ緩衝液（２０ｍＭトリス、１０ｍＭ ＣａＣｌ２、１０ｕＭ ＺｎＣｌ２、０．０１％ブリッジ３５（Ｃａｌｂｉｏｃｈｅｍ／ＥＭＤ，ＳａｎＤｉｅｇｏ，ＣＡ）、ｐＨ７．５）中滴定し、黒色ポリスチレン９６または３８４ウェルアッセイプレート（Ｇｒｉｅｎｅｒ Ｂｉｏ－Ｏｎｅ，Ｇｅｒｍａｎｙ）に添加する。活性ＭＭＰ１３（Ｃａｌｂｉｏｃｈｅｍ／ＥＭＤ）をアッセイ緩衝液中に希釈し、試験分子滴定に加え、最終濃度５０マイクロＬにて室温で１０分間インキュベートする。あるいは、潜在型ＭＭＰ－１３（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ，Ｍｉｎｎｅａｐｏｌｉｓ，ＭＮ）をＡＰＭＡで３７℃で２時間活性化し、アッセイで用いる。Ｍｃａ－ＰＬＧＬ－Ｄｐａ－ＡＲ－ＮＨ２蛍光発生ＭＭＰ基質またはＭｃａ－ＫＰＬＧＬ－Ｄｐａ－ＡＲ－ＮＨ２蛍光発生ペプチド基質（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ）などの蛍光発生基質を調製し、ＭＭＰ－１３酵素／ｈｕＴＩＭＰ－３／試験分子溶液に添加する。ＭＭＰ－１３活性を、例えば２０分間、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｄｅｖｉｃｅｓ蛍光プレートリーダー（または同等物）を用いて動力学的に測定する。
試験されている分子の作用は、ＭＭＰ酵素活性に対して予想される最大ＴＩＭＰ－３阻害のパーセントで表現することができる。あるいは、ＭＭＰ阻害活性の定量的な評価は必要でないことがあり、むしろ、個々の試験分子をそれがＭＭＰを阻害するかどうかについて評価することができる。当業者は、本明細書に概説されるパラメーターを日常的実験の応用によって変えることができることを認識する。例えば、先に試験されたＴＩＭＰ－３と他の材料を用いて予備実験を行い、ＭＭＰまたは潜在型ＭＰＰの適切な濃度を決定する。同様に、基質の種類と適切な濃度も決定することができる。こうして、例えば、ＭＭＰを滴定し、先に試験されたＭＭＰのバッチと比較し、アッセイパラメーターを最適化することができる。加えて、当業者は類似のアッセイを利用し、ＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質または変異体の他のＭＭＰを阻害する能力に対する作用があればその作用、または種々のＴＩＭＰ－３突然変異を評価することができる。
実施例４
分子生物学の標準的な技術を用いて、ＴＩＭＰ－３の多くの突然変異タンパク質をコードする核酸を調製し、実質的に先に記載した通りに哺乳動物の細胞中に発現させた。コードされたＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質の発現に対する突然変異の作用を評価した。作製された突然変異のリストは次のものを含む：
Ｇ１１５Ｔ、Ｎ１１８Ｄ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ４９Ｓ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ４９Ｅ；Ｋ４５Ｅ、Ｔ６３Ｅ；Ｋ４５Ｅ、Ｑ８０Ｅ；Ｔ６３Ｅ、Ｈ７８Ｅ；Ｋ４５Ｅ、Ｔ６３Ｅ、Ｈ７８Ｅ；Ｔ６３Ｅ、Ｈ７８Ｅ、Ｑ８０Ｅ；Ｋ４５Ｅ、Ｔ６３Ｅ、Ｈ７８Ｅ、Ｑ８０Ｅ；Ｔ６３Ｅ、Ｈ７８Ｄ；Ｔ６３Ｅ、Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｅ；Ｔ６３Ｅ、Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｄ；Ｌ５１Ｔ、Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｄ；Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｅ、Ｑ８０Ｅ；Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｄ、Ｑ８０Ｅ；Ｒ４３Ｔ、Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｄ、Ｑ８０Ｅ；Ｒ４３Ｅ、Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｄ、Ｑ８０Ｅ；Ｒ４３Ｎ、Ｋ４５Ｔ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ；Ｋ４９Ｎ、Ｌ５１Ｔ；Ｋ６５Ｎ、Ｍ６７Ｔ；Ｋ７５Ｎ、Ｐ７７Ｔ；Ｒ４３Ｎ、Ｋ４５Ｔ、Ｋ４９Ｎ、Ｌ５１Ｔ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｋ４９Ｎ、Ｌ５１Ｔ；Ｒ４３Ｎ、Ｋ４５Ｔ、Ｔ６３Ｅ、Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｅ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｔ６３Ｅ、Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｅ；Ｋ４９Ｎ、Ｌ５１Ｔ、Ｔ６３Ｅ、Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｅ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ４９Ｎ、Ｌ５１Ｔ、Ｔ６３Ｅ；Ｒ４３Ｔ、Ｋ４９Ｎ、Ｌ５１Ｔ、Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｄ；Ｒ４３Ｎ、Ｋ４５Ｔ、Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｅ；Ｋ４９Ｎ、Ｌ５１Ｔ、Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｅ；Ｒ４３Ｎ、Ｋ４５Ｔ、Ｋ４９Ｎ、Ｌ５１Ｔ、Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｅ；Ｑ３２Ｎ、Ａ３４Ｔ；Ｓ３８Ｄ、Ｄ３９Ｔ；Ｒ４３Ｎ、Ｋ４５Ｔ；Ｖ４７Ｎ、Ｋ４９Ｔ；Ｋ４９Ｎ、Ｌ５１Ｔ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ；Ｌ５１Ｎ、Ｋ５３Ｔ；Ｆ５７Ｎ；Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ；Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ；Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ；Ｍ６７Ｎ、Ｍ６９Ｔ；Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ；Ｔ８４Ｎ、Ａ８６Ｔ；Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ；Ｅ９６Ｎ、Ｎ９８Ｔ；Ｖ９７Ｎ、Ｋ９９Ｔ；Ｋ９９Ｎ、Ｑ１０１Ｔ；Ｔ１０５Ｎ、Ｒ１０７Ｔ；Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ；Ｅ１２２Ｎ、Ｗ１２４Ｔ；Ｒ１２３Ｎ、Ｄ１２５Ｔ；Ｑ１２６Ｎ；Ｔ１２８Ｎ；Ｑ１３１Ｎ、Ｋ１３３Ｔ；Ｒ１３２Ｎ Ｇ１３４Ｔ；Ｒ１３８Ｎ、Ｈ１４０Ｔ；Ｒ１３８Ｔ；Ｈ１４０Ｎ、Ｇ１４２Ｔ；Ｋ１４２Ｔ；Ｋ１４６Ｎ、Ｋ１４８Ｔ；Ｔ１５８Ｎ、Ｋ１６０Ｔ；Ｔ１６６Ｎ、Ｍ１６８Ｔ；Ｍ１６８Ｎ；Ｇ１７３Ｔ；ＨＳ１７９Ｎ、Ｈ１８１Ｔ；Ｈ１８１Ｎ、Ａ１８３Ｔ；Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｒ１９６Ｎ、Ｗ１９８Ｔ；Ｐ２００Ｎ、Ｄ２０２Ｔ；Ｐ２０１Ｎ、Ｋ２０３Ｔ；Ｄ２０２Ｎ；Ａ２０８Ｙ；Ａ２０８Ｖ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ；Ｋ４９Ｓ、Ｆ５７Ｎ；Ｋ６８Ｓ、Ｆ５７Ｎ；Ｋ１３３Ｓ、Ｆ５７Ｎ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ１３３Ｓ、Ｆ５７Ｎ；及びＫ４９Ｓ、Ｋ６８Ｓ、Ｆ５７Ｎ。
発現した突然変異タンパク質のさらなる評価を実施したので、下に記載する。追加的突然変異タンパク質が企図され、以下を含む：Ｋ４９Ｅ、Ｋ５０Ｅ、Ｋ５３Ｅ、Ｋ９９Ｅ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４９Ｓ、Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｋ５３Ｅ、Ｖ９７Ｎ／Ｋ９９Ｔ、Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｖ９７Ｎ／Ｋ９９Ｔ、Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４９Ｅ、Ｋ５３Ｅ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｔ６３Ｎ／Ｋ６５Ｔ、Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ４９Ｓ、Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４９Ｓ、Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｖ９７Ｎ／Ｋ９９Ｔ、Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｖ９７Ｎ／Ｋ９９Ｔ、Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ。これらの突然変異タンパク質を作製し、本明細書に記載の通りに試験することができる。
実施例５
この表は、哺乳動物の細胞中に実際に発現した多くのＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質で得られた、発現とＭＭＰ阻害の結果をまとめている。「哺乳動物での発現対ＷＴ」について、データは、発現が野生型（即ち、天然）ＴＩＭＰ－３のそれと実質的に同じであったことを示す「＋」；発現が野生型ＴＩＭＰ－３で観察されたそれの２～４倍に増加したことを示す「＋＋」；発現が野生型ＴＩＭＰ－３の４倍より多くに増加したことを示す「＋＋＋」、として記録されている。酵素阻害を示す列の記号「－－－」は、かかる試験がなされなかったことを示す。野生型ＴＩＭＰ－３に対して観察した発現との比較で発現の倍数的増加を例証する発現レベルの増加を、ウエスタンブロットもしくはＳＤＳ－ＰＡＧＥ Ｃｏｏｍａｓｓｉｅ染色ゲルを用いて定性的に決定するか、抗ＴＩＭＰ－３抗体（かかる抗体は、例えば、ＥＭＤ Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ，Ｂｉｌｌｅｒｉｃａ，ＭＡ：ＡｂＣａｍ（登録商標），Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ，ＭＡ、もしくはＲ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ，Ｍｉｎｎｅａｐｏｌｉｓ，ＭＮから市販される）を用いてＴＩＭＰ－３を捉えるＦｏｒｔｅＢｉｏ Ｏｃｔｅｔ（登録商標）の読み取りで測定される発現力価の測定を通して定性的に決定する。
Figure 2024095792000001
Figure 2024095792000002
一定のこれらの突然変異は哺乳動物細胞において、野生型ＴＩＭＰ－３に比較して発現の増加を示した：Ｔ６３Ｅ、Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｅ；Ｔ６３Ｅ、Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｄ；Ｋ６５Ｎ、Ｍ６７Ｔ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｔ６３Ｅ、Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｅ；Ｋ４９Ｎ、Ｌ５１Ｔ、Ｔ６３Ｅ、Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｅ；Ｋ４９Ｎ、Ｌ５１Ｔ、Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｅ；Ｋ４９Ｎ、Ｌ５１Ｔ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ；Ｌ５１Ｎ、Ｋ５３Ｔ；Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ；Ｋ７５Ｎ、Ｐ７７Ｔ；Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ；Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ；Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ；Ｑ１２６Ｎ；Ｒ１３８Ｔ；Ｇ１７３Ｔ；Ｆ５７Ｎ；Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ；Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ；Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ；Ｋ４９Ｓ、Ｆ５７Ｎ；Ｋ６８Ｓ、Ｆ５７Ｎ；Ｋ１３３Ｓ、Ｆ５７Ｎ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ１３３Ｓ、Ｆ５７Ｎ；及びＫ４９Ｓ、Ｋ６８Ｓ、Ｆ５７Ｎ。これらのうち、サブセット（Ｆ５７Ｎ；Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ；Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ；Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ；Ｋ４９Ｓ、Ｆ５７Ｎ；Ｋ６８Ｓ、Ｆ５７Ｎ；Ｋ１３３Ｓ、Ｆ５７Ｎ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ１３３Ｓ、Ｆ５７Ｎ；及びＫ４９Ｓ、Ｋ６８Ｓ、Ｆ５７Ｎ）は、野生型ＴＩＭＰ－３で観察されたレベルの４倍以上のレベルで発現した。
突然変異タンパク質のいくつかと野生型ＴＩＭＰ－３（ＷＴ）に対するＭＭＰ活性の結果について詳細な比較を実施し、これらの結果を下に示す。
Figure 2024095792000003
実施例６
この実施例は、蛍光活性化細胞選別器（ＦＡＣＳ）分析によって、ＴＩＭＰ－３タンパク質のＨＴＢ－９４（商標）細胞（米国菌培養収集所（ｔｈｅ Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｔｙｐｅ Ｃｕｌｔｕｒｅ Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ），Ｍａｎａｓｓａｓ，ＶＡより市販される軟骨細胞株）に結合する能力を評価するアッセイについて記載する。ＨＴＢ－９４細胞を、ＨＴＢ－９４培地（１０％ウシ胎児血清［ＦＢＳ］及び２ｍＭ Ｌグルタミンを含有する高グルコースＤＭＥＭ）中、５％ＣＯ２下３７℃で培養する。細胞は、染色６～１２週間前に、標準細胞培養フラスコ中２．５×１０４細胞／ｍｌの細胞密度で播種しておき、トリプシン処理によってフラスコから除去した後３～４日ごとに継代培養する。ＦＡＣＳ染色約１６時間前に、ＨＴＢ－９４細胞をウェルあたり１００，０００細胞にて標準組織培養１２ウェルプレートで２ｍｌ体積ＨＴＢ９４培地に播種し、５％ＣＯ２下３７℃でインキュベートする。細胞は染色前に８０～９０％コンフルエントである。
約１６時間後、ＨＴＢ９４培地を吸引によって１２ウェルプレートから除去し、４Ｃ染色緩衝液（リン酸緩衝食塩水［ＰＢＳ］２％ＦＢＳ ０．１５％ＮａＮ３）をウェル当り１ｍｌ適用する。細胞プレートを氷上１時間インキュベートする。染色緩衝液を吸引し、染色緩衝液中８０マイクログラム／ｍｌに希釈したＴＩＭＰ－３ ＨＩＳ－Ｍｙｃ標識タンパク質（天然ＴＩＭＰ－３またはＴＩＭＰ－３変異体のいずれか）を０．９ｍｌ／ウェルにて加え、同じ体積の緩衝液のみを負の対照のウェルに加える。細胞プレートを氷上３０分間インキュベートし、吸引し、染色緩衝液１ｍｌ／ウェルで２回洗浄する。２回目の洗浄の後、緩衝液を吸引し、染色緩衝液中２０μｇ／ｍｌに希釈したマウス抗ペンタＨＩＳ ＡｌｅｘａＦｌｕｏｒ ４８８結合抗体（Ｑｉａｇｅｎ、Ｖａｌｅｎｃｉａ、ＣＡ）を０．９ｍＬ／ウェルにて加えた。並行して、染色緩衝液中２０マイクログラム／ｍｌに希釈した関連性のないｍＩｇＧ１ ＡｌｅｘａＦｌｕｏｒ４８８結合抗体（ｅＢｉｏｓｃｉｅｎｃｅ，ＳａｎＤｉｅｇｏ，ＣＡ）負の対照染色試薬を、既知のバインダーＴＩＭＰ３ ＨＩＳ－Ｍｙｃ（例えば、Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、配列番号２３）で染色した複製ウェルに並行して加える。
細胞プレートを光から保護しながら氷上３０分間インキュベートし、吸引し、ウェル染色緩衝液１ｍｌ／ウェルで２回洗浄する。２回目の洗浄の後、緩衝液を吸引し、ウェルあたり１ｍＬの細胞解離緩衝液（酵素なし、ＰＢＳ、カタログ番号１３１５１－０１４；Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｇｒａｎｄ Ｉｓｌａｎｄ ＮＹ）を加える。細胞プレートを３７℃で５分間インキュベートし、細胞を４ｍｌのＦＡＣＳチューブに移す。プレートウェルを２５ＣＰＢＳ １ｍｌ／ウェルですすぎ、すすぎ落としたものを、細胞解離緩衝液中に細胞を含有した対応するＦＡＣＳチューブに加える。チューブを１０００ＲＰＭで５分間遠心分離し、細胞ペレットを形成し、吸引する。細胞をＰＢＳ（ＰＦＡ）中４％パラホルムアルデヒド３００マイクロＬで再懸濁し、ＦＡＣＳにかけるまでは光から保護して４℃で保存してもよい。
ＴＩＭＰ３染色後２日以内に、例えば、ＡｌｅｘａＦｌｕｏｒ４８８蛍光を検出するためにＢｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳ ＣａｌｉｂｕｒでＦＬ１を用いて８０００固定（Ｆｉｘｅｄ）ＨＴＢ９４細胞イベントを獲得する。前方散乱（ＦＳＣ）検出器電圧をＥ００で設定し、側方散乱（ＳＳＣ）検出器電圧を３１６で設定する。これらの検出器を組み合わせて用い、細胞から反射される光を「前方散乱」及び「側方散乱」として測定し、これにより、ＨＴＢ－９４細胞ゲート（ｇａｔｅ）を定義することができ、なお、これは「ゲート設定される（ｇａｔｅｄ）」とも呼ばれるが、そして、細胞の大きさと粒度に基づいてチューブ中の非細胞材料から分離することができる。ＦＬ１検出器電圧は３７０で設定する。分析を、例えば、ＦｌｏｗＪｏ ｖＸ．０．６を用いて行う。
いくつかのＴＩＭＰ－３変異体を分析し、ＨＴＢ－９４細胞への結合をこのような方法で調べたので、２つの異なる実験に関する結果を下の表３に示す（ｎ．ａ．＝該当せず；ｎ．ｄ．＝実施せず）。９つのＴＩＭＰ３ ＨＩＳ－Ｍｙｃ標識糖変異体（ｇｌｙｃｏｖａｒｉａｎｔ）は、既述の方法でのバックグラウンドに対してＦＬ１シグナルが検出されなかったという点で、ＨＴＢ－９４細胞への結合を示さなかった。結果を下の表３に示す。
実施例７
この表は、哺乳動物細胞中に実際に発現した多くのＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質で得られた、発現とＭＭＰ阻害の結果をまとめている。
Figure 2024095792000004
Figure 2024095792000005
Figure 2024095792000006
Figure 2024095792000007
この表は、哺乳動物の細胞中に発現した多くのＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質のグリコシル化部位と他の特性をまとめている。
Figure 2024095792000008
Figure 2024095792000009
Figure 2024095792000010
追加的な突然変異タンパク質が企図され、Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｑ１２６Ｎ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ Ｑ１２６Ｎ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｑ１２６Ｎ、Ｇ１７３Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｒ１３８Ｔ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｒ１３８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｑ１２６Ｎ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ；Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｑ１２６Ｎ、Ｇ１７３Ｔ；Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｑ１２６Ｎ、Ｇ１７３Ｔ；Ｋ４９Ｓ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ５３Ｅ、Ｖ９７Ｎ、Ｋ９９Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｖ９７Ｎ、Ｋ９９Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４９Ｅ、Ｋ５３Ｅ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ４９Ｓ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４９Ｓ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｖ９７Ｎ、Ｋ９９Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｖ９７Ｎ、Ｋ９９Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｑ１２６Ｎ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｑ１２６Ｎ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｑ１２６Ｎ、；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｑ１２６Ｎ、Ｒ１３８Ｔ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｒ１３８Ｔ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｑ１２６Ｎ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｑ１２６Ｎ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｑ１２６Ｎ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｒ１３８Ｔ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１８６Ｑ；及びＫ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｋ１８８Ｑが挙げられる。さらなる突然変異タンパク質としては、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ４９Ｓ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４９Ｓ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｖ９７Ｎ、Ｋ９９Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｖ９７Ｎ、Ｋ９９Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｅ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｅ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｅ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｅ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｅ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｅ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｓ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｓ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｓ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２
Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｓ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｓ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｓ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｓ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｓ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｅ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｑ１２６Ｎ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｑ１２６Ｎ、；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｑ１２６Ｎ、Ｒ１３８Ｔ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｅ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｑ１２６Ｎ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｑ１２６Ｎ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｓ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｑ１２６Ｎ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｓ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｓ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｒ１３８Ｔ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１８６Ｑ；及びＫ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｋ１８８Ｑが挙げられる。これらの突然変異タンパク質は、本明細書に記載の通りに作製し試験することができる。

Claims (19)

  1. 配列番号２に示されるＴＩＭＰ－３の成熟領域に対してアミノ酸配列が少なくとも９５％同一である成熟領域を有し、少なくとも１つの突然変異を有し、前記突然変異がＫ４５Ｅ；Ｋ４５Ｎ；Ｋ４５Ｓ；Ｖ４７Ｔ；Ｋ４９Ｎ；Ｋ４９Ｅ；Ｋ４９Ｓ；Ｋ５０Ｎ；Ｌ５１Ｔ；Ｌ５１Ｎ；Ｖ５２Ｔ；Ｋ５３Ｔ；Ｐ５６Ｎ；Ｆ５７Ｎ；Ｇ５８Ｔ；Ｔ６３Ｅ；Ｔ６３Ｎ；Ｋ６５Ｔ；Ｋ６５Ｎ；Ｍ６７Ｔ；Ｋ６８Ｓ；Ｔ７４Ｅ；Ｋ７５Ｎ；Ｐ７７Ｔ；Ｈ７８Ｄ；Ｈ７８Ｅ；Ｈ７８Ｎ；Ｑ８０Ｅ；Ｑ８０Ｔ；Ｋ９４Ｎ；Ｅ９６Ｔ；Ｅ９６Ｎ；Ｖ９７Ｎ；Ｎ９８Ｔ；Ｋ９９Ｔ；Ｄ１１０Ｎ；Ｋ１１２Ｔ；Ｑ１２６Ｎ；Ｋ１３３Ｓ；Ｒ１３８Ｔ；Ｒ１３８Ｎ；Ｈ１４０Ｔ；Ｔ１５８Ｎ；Ｋ１６０Ｔ；Ｔ１６６Ｎ；Ｍ１６８Ｔ；Ｇ１７３Ｔ；Ｈ１８１Ｎ；Ａ１８３Ｔ；Ｒ１８６Ｎ；Ｒ１８６Ｑ、Ｒ１８６Ｅ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ１８８Ｑ、Ｋ１８８Ｅ、Ｐ２０１Ｎ；Ｋ２０３Ｔ；Ｉ２０５Ｆ、Ｉ２０５Ｙ、Ａ２０８Ｇ、Ａ２０８Ｖ、及びＡ２０８Ｙからなる群より選択される、単離されたＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質。
  2. 配列番号２に示されるＴＩＭＰ－３の成熟領域に対してアミノ酸配列が少なくとも９５％同一の成熟領域を有し、突然変異Ｆ５７Ｎ及び少なくとも１つのさらなる突然変異を有し、前記突然変異はＴＩＭＰ－３の１つ以上のＫ残基での置換である、単離されたＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質。
  3. 前記さらなる突然変異が前記アミノ酸配列中にＮ結合型グリコシル化部位を導入する、請求項２に記載のＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質。
  4. 配列番号２に示されるＴＩＭＰ－３の成熟領域に対してアミノ酸配列が少なくとも９０％同一の成熟領域を有し、前記突然変異タンパク質が、少なくとも１つのＮ結合型グリコシル化部位を前記アミノ酸配列の中に導入する少なくとも１つの突然変異を有する、単離されたＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質。
  5. ２、３、４、５、または６のＮ結合型グリコシル化部位が導入された、請求項４に記載のＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質。
  6. 前記Ｎ結合型グリコシル化部位が、アミノ酸４８～５４を含む領域；アミノ酸９３～１００を含む領域；アミノ酸１２１～１２５を含む領域；アミノ酸１４３～１５２を含む領域；アミノ酸１５６～１６４を含む領域；アミノ酸１８３～１９１を含む領域；及びその組合せからなる群より選択される前記ＴＩＭＰ－３アミノ酸配列の領域で導入される、請求項３に記載のＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質。
  7. ２、３、４、５または６（以上）のＮ結合型グリコシル化部位が導入される、請求項６に記載のＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質。
  8. 配列番号２に示されるＴＩＭＰ－３の成熟領域に対してアミノ酸配列が少なくとも９５％同一の成熟領域を有する単離されたＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質であって、前記突然変異タンパク質が
    （ａ）ＴＩＭＰ－１、ＴＩＭＰ－２またはＴＩＭＰ－４の電荷表面を模する、ＴＩＭＰ－３表面に露出した正電荷パッチの特性に変化を引き起こす、前記ＴＩＭＰ－３電荷パッチにおける１つ以上の突然変異；
    （ｂ）タンパク質切断の受けやすさを低減する１つ以上の突然変異；
    （ｃ）前記ＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質とスカベンジャー受容体ＬＲＰ－１の相互作用の低下を引き起こす１つ以上の突然変異；
    （ｄ）前記ＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質のヘパリンまたは細胞外マトリクス成分の相互作用の低下を引き起こす１つ以上の突然変異；
    （ｅ）前記天然ＴＩＭＰ－３配列への１つ以上のシステイニル残基の追加；
    （ｆ）薬物動態学的及び／または薬力学的特性の向上；
    （ｇ）少なくとも１つのＮ結合型グリコシル化部位を導入する１つ以上の突然変異；及び
    （ｈ）（ａ）～（ｇ）に示される前記突然変異の組合せ、
    からなる群より選択される少なくとも１つの突然変異を有する、前記単離されたＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質。
  9. ｉ． Ｋ４５Ｅ、Ｋ４９Ｓ；（配列番号５）
    ｉｉ． Ｋ４５Ｅ、Ｋ４９Ｅ；（配列番号６）
    ｉｉｉ． Ｋ４５Ｅ、Ｔ６３Ｅ；（配列番号７）
    ｉｖ． Ｋ４５Ｅ、Ｑ８０Ｅ；（配列番号８）
    ｖ． Ｋ４５Ｅ、Ｔ６３Ｅ、Ｈ７８Ｅ；（配列番号１０）
    ｖｉ． Ｔ６３Ｅ、Ｈ７８Ｅ、Ｑ８０Ｅ；（配列番号１１）
    ｖｉｉ． Ｋ４５Ｅ、Ｔ６３Ｅ、Ｈ７８Ｅ、Ｑ８０Ｅ；（配列番号１２）
    ｖｉｉｉ． Ｔ６３Ｅ、Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｅ；（配列番号１３）
    ｉｘ． Ｔ６３Ｅ、Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｄ；（配列番号１４）
    ｘ． Ｌ５１Ｔ、Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｄ；（配列番号５３）
    ｘｉ． Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｅ、Ｑ８０Ｅ；（配列番号１６）
    ｘｉｉ． Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｄ、Ｑ８０Ｅ；（配列番号１７）
    ｘｉｉｉ． Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ；（配列番号２６）
    ｘｉｖ． Ｋ６５Ｎ、Ｍ６７Ｔ；（配列番号３７）
    ｘｖ． Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｔ６３Ｅ、Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｅ；（配列番号１８）
    ｘｖｉ． Ｋ４９Ｎ、Ｌ５１Ｔ、Ｔ６３Ｅ、Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｅ；（配列番号１９）
    ｘｖｉｉ． Ｋ４５Ｅ、Ｋ４９Ｎ、Ｌ５１Ｔ、Ｔ６３Ｅ；（配列番号２０）
    ｘｖｉｉｉ． Ｋ４９Ｎ、Ｌ５１Ｔ、Ｔ７４Ｅ、Ｈ７８Ｅ；（配列番号２１）
    ｘｉｘ． Ｋ４９Ｎ、Ｌ５１Ｔ；（配列番号２７）
    ｘｘ． Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ；（配列番号３０）
    ｘｘｉ． Ｌ５１Ｎ、Ｋ５３Ｔ；（配列番号５４）
    ｘｘｉｉ． Ｆ５７Ｎ；（配列番号３３）
    ｘｘｉｉｉ． Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ；（配列番号３１）
    ｘｘｉｖ． Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ；（配列番号３６）
    ｘｘｖ． Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ；（配列番号３２）
    ｘｘｖｉ． Ｋ７５Ｎ、Ｐ７７Ｔ；（配列番号３８）
    ｘｘｖｉｉ． Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ；（配列番号３９）
    ｘｘｖｉｉｉ． Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ；（配列番号４０）
    ｘｘｉｘ． Ｅ９６Ｎ、Ｎ９８Ｔ；（配列番号４１）
    ｘｘｘ． Ｖ９７Ｎ、Ｋ９９Ｔ；（配列番号４２）
    ｘｘｘｉ． Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ；（配列番号４３）
    ｘｘｘｉｉ． Ｑ１２６Ｎ；（配列番号４４）
    ｘｘｘｉｉｉ． Ｒ１３８Ｎ、Ｈ１４０Ｔ；（配列番号４６）
    ｘｘｘｉｖ． Ｒ１３８Ｔ；（配列番号４５）
    ｘｘｘｖ． Ｔ１５８Ｎ、Ｋ１６０Ｔ；（配列番号４７）
    ｘｘｘｖｉ． Ｔ１６６Ｎ、Ｍ１６８Ｔ；（配列番号４８）
    ｘｘｘｖｉｉ． Ｇ１７３Ｔ；（配列番号４９）
    ｘｘｘｖｉｉｉ． Ｈ１８１Ｎ、Ａ１８３Ｔ；（配列番号５０）
    ｘｘｘｉｘ． Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；（配列番号５１）
    ｘｌ． Ｐ２０１Ｎ、Ｋ２０３Ｔ；（配列番号５２）
    ｘｌｉ． Ａ２０８Ｙ；（配列番号５５）
    ｘｌｉｉ． Ａ２０８Ｖ；（配列番号５６）
    ｘｌｉｉｉ． Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ；（配列番号２３）
    ｘｌｉｖ． Ｋ４９Ｓ、Ｆ５７Ｎ；（配列番号２８）
    ｘｌｖ． Ｋ６８Ｓ、Ｆ５７Ｎ；（配列番号３４）
    ｘｌｖｉ． Ｋ１３３Ｓ、Ｆ５７Ｎ；（配列番号３５）
    ｘｌｖｉｉ． Ｋ４５Ｓ、Ｋ１３３Ｓ、Ｆ５７Ｎ；（配列番号２４）
    ｘｌｖｉｉｉ． Ｋ４９Ｓ、Ｋ６８Ｓ、Ｆ５７Ｎ（配列番号２９）
    ｘｌｉｘ． Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｉ２０５Ｆ、Ａ２０８Ｇ（配列番号５７）
    ｌ． Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ａ２０８Ｇ（配列番号５８）
    ｌｉ． Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｉ２０５Ｙ（配列番号５９）
    ｌｉｉ． Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｉ２０５Ｙ、Ａ２０８Ｇ（配列番号６０）
    ｌｉｉｉ． Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ７５Ｎ、Ｐ７７Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ（配列番号６１）
    ｌｉｖ． Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ（配列番号６２）：
    ｌｖ． Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｖ９７Ｎ、Ｋ９９Ｔ（配列番号６３）
    ｌｖｉ． Ｋ４５Ｓ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｖ９７Ｎ、Ｋ９９Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ（配列番号６４）
    ｌｖｉｉ． Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ（配列番号６５）
    ｌｖｉｉｉ． Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｇ１７３Ｔ（配列番号６６）
    ｌｉｘ． Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｖ９７Ｎ、Ｋ９９Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ（配列番号６７）
    ｌｘ． Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｑ１２６Ｎ、Ｒ１３８Ｔ（配列番号６８）
    ｌｘｉ． Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｖ９７Ｎ、Ｋ９９Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ（配列番号６９）
    ｌｘｉｉ． Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｖ９７Ｎ、Ｋ９９Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ（配列番号７０）
    ｌｘｉｉｉ． Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ（配列番号７１）
    ｌｘｉｖ． Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ７５Ｎ、Ｐ７７Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ（配列番号７２）
    ｌｘｖ． Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｖ９７Ｎ、Ｋ９９Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ（配列番号７３）
    ｌｘｖｉ． Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｑ１２６Ｎ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ（配列番号７４）
    ｌｘｖｉｉ． Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ（配列番号７５）
    ｌｘｖｉｉｉ． Ｋ４５Ｓ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｖ９７Ｎ、Ｋ９９Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ（配列番号７６）
    ｌｘｉｘ． Ｋ４５Ｓ． Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｖ９７Ｎ、Ｋ９９Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ（配列番号７７）
    ｌｘｘ． Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ（配列番号７８）
    ｌｘｘｉ． Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ（配列番号７９）
    ｌｘｘｉｉ． Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｖ９７Ｎ、Ｋ９９Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ（配列番号８０）
    ｌｘｘｉｉｉ． Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９９Ｅ Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ（配列番号８１）
    ｌｘｘｉｖ． Ｋ４５Ｅ、Ｋ４９Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ（配列番号８２）
    ｌｘｘｖ． Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ（配列番号８３）
    ｌｘｘｖｉ． Ｋ４５Ｅ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ（配列番号８４）
    ｌｘｘｖｉｉ． Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ（配列番号８５）
    ｌｘｘｖｉｉｉ． Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ（配列番号８６）
    ｌｘｘｉｘ． Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ（配列番号８７）
    ｌｘｘｘ． Ｋ４５Ｓ Ｆ５７Ｎ Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ Ｒ１３８Ｔ Ｇ１７３Ｔ（配列番号８８）
    ｌｘｘｘｉ． Ｋ４５Ｅ Ｆ５７Ｎ Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ Ｒ１３８Ｔ Ｇ１７３Ｔ（配列番号８９）
    ｌｘｘｘｉｉ． Ｋ４５Ｅ Ｆ５７Ｎ Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ Ｒ１３８Ｔ Ｇ１７３Ｔ（配列番号９０）
    ｌｘｘｘｉｉｉ． Ｋ４５Ｅ Ｆ５７Ｎ Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ Ｒ１３８Ｔ Ｇ１７３Ｔ Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ（配列番号９１）
    ｌｘｘｘｉｖ． Ｋ４５Ｅ Ｆ５７Ｎ Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ Ｒ１３８Ｔ Ｇ１７３Ｔ Ｒ１８６Ｅ（配列番号９２）
    ｌｘｘｘｖ． Ｋ４５Ｅ Ｆ５７Ｎ Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ Ｒ１３８Ｔ Ｇ１７３Ｔ Ｋ１８８Ｅ（配列番号９３）
    ｌｘｘｘｖｉ． Ｋ４５Ｅ Ｆ５７Ｎ Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ Ｒ１３８Ｔ Ｇ１７３Ｔ Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ（配列番号９４）
    ｌｘｘｘｖｉｉ． Ｋ４５Ｅ Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ Ｒ１３８Ｔ Ｇ１７３Ｔ（配列番号９５）
    ｌｘｘｘｖｉｉｉ． Ｋ４５Ｅ Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ Ｒ１３８Ｔ Ｇ１７３Ｔ Ｋ１８８Ｅ（配列番号９６）
    ｌｘｘｘｉｘ． Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ Ｆ５７Ｎ Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ Ｒ１３８Ｔ Ｇ１７３Ｔ（配列番号９７）
    ｘｃ． Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ Ｆ５７Ｎ Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ Ｒ１３８Ｔ（配列番号９８）、及び
    ｘｃｉ． Ｋ４５Ｅ Ｆ５７Ｎ Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ Ｒ１３８Ｔ（配列番号９９）
    からなる群より選択される、請求項８に記載のＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質。
  10. Ｋ４９Ｅ、Ｋ５０Ｅ、Ｋ５３Ｅ、Ｋ９９Ｅ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４９Ｓ、Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｋ５３Ｅ、Ｖ９７Ｎ／Ｋ９９Ｔ、Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｖ９７Ｎ／Ｋ９９Ｔ、Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４９Ｅ、Ｋ５３Ｅ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｔ６３Ｎ／Ｋ６５Ｔ、Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ４９Ｓ、Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４９Ｓ、Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｖ９７Ｎ／Ｋ９９Ｔ、Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ５０Ｎ／Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｖ９７Ｎ／Ｋ９９Ｔ、Ｒ１８６Ｎ／Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｑ１２６Ｎ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ Ｑ１２６Ｎ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｑ１２６Ｎ、Ｇ１７３Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｒ１３８Ｔ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｒ１３８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｑ１２６Ｎ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ；Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｑ１２６Ｎ、Ｇ１７３Ｔ；Ｐ５６Ｎ、Ｇ５８Ｔ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｑ１２６Ｎ、Ｇ１７３Ｔ；Ｋ４９Ｓ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ５３Ｅ、Ｖ９７Ｎ、Ｋ９９Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｖ９７Ｎ、Ｋ９９Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４９Ｅ、Ｋ５３Ｅ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｔ６３Ｎ、Ｋ６５Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ４９Ｓ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４９Ｓ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｖ９７Ｎ、Ｋ９９Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｖ９７Ｎ、Ｋ９９Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｅ、Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｇ１７３Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｋ１８８Ｅ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１８６Ｎ、Ｋ１８８Ｔ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｇ１７３Ｔ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｑ１２６Ｎ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｑ１２６Ｎ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｑ１２６Ｎ、；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｑ１２６Ｎ、Ｒ１３８Ｔ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｒ１３８Ｔ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｅ、Ｆ５７Ｎ、Ｑ１２６Ｎ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｑ１２６Ｎ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｑ１２６Ｎ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；Ｋ５０Ｎ、Ｖ５２Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｒ１３８Ｔ、；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｄ１１０Ｎ、Ｋ１１２Ｔ、Ｒ１８６Ｑ、Ｋ１８８Ｑ；及びＫ４５Ｓ、Ｆ５７Ｎ、Ｈ７８Ｎ、Ｑ８０Ｔ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ、Ｒ１３８Ｔ；Ｋ４５Ｎ、Ｖ４７Ｔ、Ｆ５７Ｎ、Ｋ９４Ｎ、Ｅ９６Ｔ
    からなる群より選択される、請求項８に記載のＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質。
  11. 請求項１～１０のいずれか一項に記載のＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質をコードする、単離された核酸。
  12. 請求項１１に記載の単離された核酸を含む発現ベクター。
  13. 請求項１２に記載の発現ベクターにより形質転換またはトランスフェクトされた、単離された宿主細胞。
  14. 組換えＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質の産生方法であって、請求項１３に記載の形質転換またはトランスフェクトされた宿主細胞を前記ＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質の発現を促進する条件下で培養することと、前記ＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質を回収することとを含む、前記方法。
  15. 請求項１～１０のいずれか一項に記載のＴＩＭＰ－３突然変異タンパク質と、生理学的に許容できる希釈剤、賦形剤、または担体とを含む組成物。
  16. ＴＩＭＰ－３によって阻害されるか阻害され得るマトリクスメタロプロテアーゼ（ＭＭＰ）及び／または他のプロテイナーゼが原因的または増悪的働きをする状態の治療方法であって、前記状態を治療するのに十分な量の請求項１５の組成物をかかる状態に罹った個人に投与することを含む、前記方法。
  17. 前記状態が、炎症性状態、骨関節炎、心筋虚血、再潅流傷害、及び、鬱血性心不全への進行からなる群より選択される、請求項１６に記載の方法。
  18. 前記状態が、喘息、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）、及び特発性肺線維症（ＩＰＦ）、炎症性腸疾患（例えば、潰瘍性大腸炎、クローン病、及びセリアック病）、乾癬、ウイルス性心筋炎を含む心筋炎、アテローム性動脈硬化症に関連した炎症、並びに、関節リウマチ及び乾癬性関節炎を含む関節炎状態からなる群より選択される、請求項１６に記載の方法。
  19. 前記状態が、栄養障害型表皮水疱症、骨関節炎、偽痛風、若年性関節リウマチを含む関節リウマチ、強直性脊椎炎、歯周病、角膜潰瘍、表皮潰瘍、胃潰瘍を含む潰瘍、手術後の創傷治癒、再狭窄、肺気腫、骨パジェット病、骨粗鬆症、強皮症、褥瘡などの骨または組織の圧迫萎縮、真珠腫、創傷治癒異常、少関節性リウマチ様関節炎、多関節性リウマチ様関節炎、全身性発症関節リウマチ、強直性脊椎炎、腸疾患性関節炎、反応性関節炎、ライター症候群、ＳＥＡ症候群（血清陰性、腱付着部症、関節症症候群）、皮膚筋炎、乾癬性関節炎、強皮症、全身性エリテマトーデス、脈管炎、マイオリティス（ｍｙｏｌｉｔｉｓ）、ポリマイオリティス（ｐｏｌｙｍｙｏｌｉｔｉｓ）、ダーマトマイオリティス（ｄｅｒｍａｔｏｍｙｏｌｉｔｉｓ）、骨関節炎、結節性多発動脈炎、ウェゲナー肉芽腫症、動脈炎、リウマチ性多発筋痛症、サルコイドーシス、硬化症、原発性胆汁性硬化症、硬化性胆管炎、シェーグレン症候群、乾癬、尋常性乾癬、滴状乾癬、倒置乾癬、膿疱性乾癬、乾癬性紅皮症、皮膚炎、アトピー性皮膚炎、アテローム性動脈硬化症、ループス、スチル病、全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）、重症筋無力症、炎症性腸疾患、潰瘍性大腸炎、クローン病、セリアック病（非熱帯性スプルー）、血清反応陰性関節症に関連した腸疾患、顕微鏡的大腸炎またはコラーゲン形成大腸炎、好酸球性胃腸炎、または直腸結腸切除及び回腸肛門吻合の後に起こる嚢炎、膵炎、インスリン依存性糖尿病、乳腺炎、胆嚢炎、胆管炎、胆管周囲炎、多発性硬化症（ＭＳ）、喘息（外因性喘息及び内因性喘息、並びに、関連する気道の慢性炎症性状態または応答性亢進、を含む）、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ、即ち、慢性気管支炎、肺気腫）、急性呼吸器疾患症候群（ＡＲＤＳ）、呼吸促迫症候群、嚢胞性線維症、肺高血圧症、肺血管収縮、急性肺傷害、アレルギー性気管支肺アスペルギルス症、過敏性肺炎、好酸球性肺炎、気管支炎、アレルギー性気管支炎気管支拡張症、結核、過敏性肺炎、職業性喘息、喘息様障害、サルコイド、反応性気道疾患（または機能不全）症候群、綿肺、間質性肺疾患、好酸球増加症候群、鼻炎、副鼻腔炎、及び肺寄生虫症、ウイルス誘発性状態に関連した気道過敏（例えば、呼吸器多核体ウイルス（ＲＳＶ）、パラインフルエンザウイルス（ＰＩＶ）、ライノウイルス（ＲＶ）、及びアデノウイルス）、ギラン・バレー疾患、グレーブス病、アジソン病、レイノー現象、自己免疫性肝炎、移植片対宿主病（ＧＶＨＤ）、脳虚血、外傷性脳損傷、多発性硬化症、神経障害、ミオパチー、脊髄損傷、及び筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）からなる群より選択される、請求項１６に記載の方法。
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