JP2023544200A - 全身性エリテマトーデス(sle)を含む自己免疫疾患を治療するためのバイオマーカー、方法、及び組成物 - Google Patents
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Abstract
本開示は、一つ又は複数のバイオマーカーを検出する、ならびに/あるいは、そのようなバイオマーカーの存在に基づいて、自己免疫疾患、例えば全身性エリテマトーデス(SLE)などを抗CD19抗体で治療する方法に関する。バイオマーカーは、別々で、又は組み合わせであり得、それらの検出は、複数の異なる方法において使用することができる。
Description
関連出願への相互参照
本出願は、米国仮特許出願第63/088,444号(2020年10月6日出願)、及び米国仮特許出願第63/108,138号(2020年10月30日出願)に対する優先権を主張し、各々の全内容が参照により本明細書中に組み入れられる。
本出願は、米国仮特許出願第63/088,444号(2020年10月6日出願)、及び米国仮特許出願第63/108,138号(2020年10月30日出願)に対する優先権を主張し、各々の全内容が参照により本明細書中に組み入れられる。
配列リスト
即時出願は、ASCII形式で電子的に出願された配列リストを含み、その全体において参照により本明細書中に組み入れられる。当該ASCIIコピーは、2021年9月27日に作成されており、P295266_WO_01_SL.txtと名付けられ、23,152バイトのサイズである。
即時出願は、ASCII形式で電子的に出願された配列リストを含み、その全体において参照により本明細書中に組み入れられる。当該ASCIIコピーは、2021年9月27日に作成されており、P295266_WO_01_SL.txtと名付けられ、23,152バイトのサイズである。
本開示は、全身性エリテマトーデス(SLE)治療効果のバイオマーカー、抗CD19抗体を用いたSLEを治療する方法、及びそのような方法のために有用であり得る組成物に関する。
SLEは、複数の器官に影響を及ぼし得る慢性全身性自己免疫疾患である。SLEについてのACR分類基準(Tan et al.,1982)は、蝶形紅斑、円板状発疹、光過敏性、関節炎、漿膜炎、腎臓障害、神経障害、血液障害、免疫障害(自己抗体)、及び抗核抗体(ANA)を含み、それらのうち、11のいずれか4つが、SLEを有するとしてヒト対象を分類するために存在することができる。SLEは、典型的には、15~45歳の若い女性の疾患であり、女性における発生率は男性よりも10倍高い。いくつかの民族差があり、アフリカ、ヒスパニック、アジア、及びネイティブアメリカン系統の人々においてより高い疾患の有病率及び重症度を伴う。死亡のリスクは10年で5~10%まで減少した一方で、ヒト対象は、依然として、活性疾患、感染症、心血管系の原因、及び治療関連効果で死亡する。改善した生存率にもかかわらず、ヒト対象の15%だけが、1年間にわたり持続した良好な又は優れた疾患管理を有すると推定される。
SLEは現在、治癒不能である。治療の目的は、炎症及び器官への損傷を低下させ、疾患の悪化を防止又は逆転させることである。治療は、関与する器官系及び炎症の量に対して調整されるが、しかし、使用される薬剤の大半が、組み合わせにおいて頻繁に使用される非特異的免疫抑制剤である。皮膚及び/又は関節を含む軽度形態のSLEについては、局所又は低用量の経口ステロイド、ヒドロキシクロロキン、NSAID、及び/又はメトトレキサートが、しばしば、治療の頼みの綱である。他の器官系の関与によって、しばしば、薬剤、例えばアザチオプリン、ミコフェノール酸モフェチル、又はベリムマブなどと一緒に、より高用量の経口ステロイドが正当化される。侵襲性治療が、重要な器官が関与する場合には、器官の損傷又は不全を予防するために正当化される。シクロホスファミド、アザチオプリン、又はミコフェノール酸モフェチルを伴う高用量の経口又はIVコルチコステロイドが、腎臓、CVS、及び造血系における器官の脅威となる疾患について使用され得る。治療薬の多くが、特に若い女性にとって、それらの長期の安全性プロファイルのため、最適な治療には満たない。例えば、コルチコステロイドの長期使用は、高血圧、糖尿病、骨粗しょう症、及び感染リスクに導き得るのに対し、シクロホスファミドは、不妊及び膀胱癌に導き得る。SLEについてのわずかに一つの新たな治療であるベリムマブが、50年以上にわたり承認されている。従って、疾患を長期管理するために、より標的化された薬剤についての必要性がある。
B細胞活性化を抑制する、増加したFcγRIIb結合を伴う抗CD19抗体であるオベキセリマブ(本明細書中で「XmAb5871」及び「HuAMAG7」として互換的に使用される)についての以前の第2相SLE治験の結果では、ステロイドに対するベースライン応答の喪失を測定した主要評価項目は満たされなかった。
一態様では、本開示は、自己免疫疾患の治療のための治療有効性を改善する方法に関する。SLEを有する対象におけるCD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現が決定される。あるいは、SLEを有する対象におけるCD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、USP21、及びIL7R(CD127)から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現が決定される。一つ又は複数のバイオマーカーの発現の増加は、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗CD19抗体の有効性を示し、ナンバリングは、対象において、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
別の態様では、本開示は、それを必要とするヒト対象において、自己免疫疾患のための治療に対する感受性を決定する方法に関する。対象におけるCD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現が決定される。一つ又は複数のバイオマーカーの発現の増加は、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗CD19抗体の有効性を示し、ナンバリングは、対象において、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
別の態様では、本開示は、自己免疫疾患を治療する又はその症状を低下させるために、一人又は複数のヒト対象を選択する方法に関する。一人又は複数の対象におけるCD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現を決定する発現を決定する。一つ又は複数のバイオマーカーの発現における増加は、抗体治療が対象において有効であることを示す。
別の態様では、対象におけるCD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現の増加は、ヒト抗CD19抗体が対象において効果的であることを示す。
別の態様では、対象におけるCD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現の増加の非存在は、ヒト抗CD19抗体が対象において効果的ではないことを示す。
別の態様では、対象におけるCD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現の増加の非存在は、ヒト抗CD19抗体が対象に有害であることを示す。
別の態様では、本開示は、SLEの治療のための治療有効性を改善する方法に関する。SLEを有する対象におけるCD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現が決定される。一つ又は複数のバイオマーカーの発現の増加は、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗CD19抗体の有効性を示し、ナンバリングは、対象において、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
別の態様では、本開示は、それを必要とするヒト対象におけるSLEについての治療に対する感受性を決定する方法に関する。対象におけるCD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現。一つ又は複数のバイオマーカーの発現の増加は、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗CD19抗体の有効性を示し、ナンバリングは、対象において、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
別の態様では、対象におけるCD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現の増加は、ヒト抗CD19抗体が対象において効果的であることを示す。
別の態様では、対象におけるCD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現の増加の非存在は、ヒト抗CD19抗体が対象において効果的ではないことを示す。
別の態様では、対象におけるCD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現の増加の非存在は、ヒト抗CD19抗体が対象に有害であることを示す。
別の態様では、本開示は、それを必要とするヒト対象において、SLEを治療する、又はその症状を低下させる方法に関する。この方法は、ヒト対象の血液サンプル中のCD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加した発現レベルを決定することを含む。一つ又は複数のバイオマーカーの発現が増加する場合、ヒト抗CD19抗体が投与される。特定の実施形態では、抗体は、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含み、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
別の態様では、本開示は、SLEの症状を治療する又は低下させる方法に関する。それを必要とするヒト対象が、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択されたバイオマーカーの増加発現を決定することにより選択される。一つ又は複数のバイオマーカーの発現が増加する場合、ヒト抗CD19抗体が投与される。特定の実施形態では、抗体は、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含み、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
別の態様では、本開示は、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの上昇レベルを発現する血液組織を有するとして対象を特定することにより、その中のヒト対象におけるSLEを治療するための方法に関する。対象が、一つ又は複数のバイオマーカーの発現を有するとして特定される場合、ヒト抗CD19抗体が投与される。特定の実施形態では、抗体は、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含み、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
別の態様では、一つ又は複数のバイオマーカーは、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1Aから選択される。さらなる態様では、一つ又は複数のバイオマーカーは、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28から選択される。さらに、さらなる態様では、一つ又は複数のバイオマーカーは、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される。
別の態様では、一つ又は複数のバイオマーカーは、CD27、APP、及びそれらの組み合わせから選択される。一部のバリエーションでは、バイオマーカーはCD27である。一部のバリエーションでは、バイオマーカーはAPPである。一部のバリエーションでは、バイオマーカーはCD27及びAPPの組み合わせである。
別の態様では、一つ又は複数のバイオマーカーの発現が増加していない場合、次に抗体は対象から控えられる。
別の態様では、決定又は特定工程は、対象の血液サンプルに遺伝子型判定テストを施すことを含む。
別の態様では、決定又は特定する工程は、対象の血液サンプルにプロテオミクステストを施すことを含む。
別の態様では、血液サンプルは全血液である。あるいは、血液サンプルは、T細胞、形質芽球、及びそれらの組み合わせから選択される。別のバリエーションでは、血液サンプルは、形質細胞様樹状細胞であり得る。
別の態様では、開示されるのは、治療有効量の抗CD19抗体を用いて、それを必要とするヒト対象において全身性エリテマトーデス(SLE)を治療する方法である。一実施形態では、抗CD19抗体は、配列番号10を含むCDR1、配列番号11を含むCDR2、及び配列番号12を含むCDR3を有する可変領域を含む軽鎖;ならびに配列番号13を含むCDR1、配列番号14を含むCDR2、及び配列番号15を含むCDR3を有する可変領域を含む重鎖を含み、それにおいて、重鎖は、配列番号4と比較して、Fc領域中にアミノ酸置換S267E及びL328Fを含み、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
別の態様では、開示されるのは、治療有効量の抗CD19抗体を用いて、それを必要とするヒト対象において全身性エリテマトーデス(SLE)を治療する方法であって、それにおいて、抗CD19抗体は、軽鎖;及び配列番号2のアミノ酸配列、ならびに配列番号4と比較してFc領域中にアミノ酸置換S267E及びL328Fを含む重鎖を含み、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
別の態様では、開示されるのは、治療有効量の抗CD19抗体を用いてそれを必要とするヒト対象において全身性エリテマトーデス(SLE)を治療する方法であって、それにおいて、抗CD19抗体が、配列番号7のアミノ酸配列を含む軽鎖;及び配列番号9のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。
別の態様では、開示される方法の抗CD19抗体の治療有効量は、少なくとも10用量について、14日毎に約5.0mg/kgである。一実施形態では、抗CD19抗体の治療有効量は、少なくとも15用量について、14日毎に約5.0mg/kgである。別の実施形態では、抗CD19抗体の治療有効量は、少なくとも16用量について、14日毎に約5.0mg/kgである。
別の態様では、抗CD19抗体の治療有効量は、7日毎に約125mgである。一実施形態では、抗CD19抗体の治療有効量は、少なくとも20用量について、7日毎に約125mgである。さらなる実施形態では、抗CD19抗体の治療有効量は、少なくとも30用量について、7日毎に約125mgである。別の実施形態では、抗CD19抗体の治療有効量は、少なくとも32用量について、7日毎に約125mgである。
別の態様では、開示される方法の抗CD19抗体の治療有効量は、14日毎に約250mgである。一実施形態では、抗CD19抗体の治療有効量は、少なくとも10用量について、14日毎に約250mgである。別の実施形態では、抗CD19抗体の治療有効量は、少なくとも15用量について、14日毎に約250mgである。さらなる実施形態では、抗CD19抗体の治療有効量は、少なくとも16用量について、14日毎に約250mgである。
別の態様では、抗CD19抗体が静脈内に提供される。
別の態様では、抗CD19抗体が皮下に提供される。
さらに別の態様では、開示されるのは、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択されるバイオマーカーの増加発現を有する、それを必要とするヒト対象において全身性エリテマトーデス(SLE)を治療するための治療有効量の抗CD19抗体の使用である。さらに別の態様では、開示されるのは、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択されるバイオマーカーの増加発現を有する、それを必要とするヒト対象において全身性エリテマトーデス(SLE)を治療するための医薬の製造における治療有効量の抗CD19抗体の使用である。一実施形態では、抗CD19抗体は、配列番号10を含むCDR1、配列番号11を含むCDR2、及び配列番号12を含むCDR3を有する可変領域を含む軽鎖;ならびに配列番号13を含むCDR1、配列番号14を含むCDR2、及び配列番号15を含むCDR3を有する可変領域を含む重鎖を含み、それにおいて、重鎖は、配列番号4と比較して、Fc領域中にアミノ酸置換S267E及びL328Fを含み、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。別の実施形態では、抗CD19抗体は、配列番号7のアミノ酸配列を含む軽鎖;及び配列番号9のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。
本明細書中に記載される方法は、任意の組み合わせにおいて、再発している、又はリツキシマブに対して再発性もしくは難治性である対象を選択することを含み得る。
適用ファイルは、カラーで、実行された少なくとも一つの図面を含む。カラー図面を伴う本特許出願公開の写しは、要請及び必要な料金の支払い時に、事務局により提供される。
前述の要約、ならびに本発明の以下の詳細な説明は、添付の図と併せて読まれた場合に、より良く理解されるであろう。本発明を例証する目的のために、図は、本発明の実施形態を示す。しかし、本発明は、示される正確な配置、実施例、及び手段に限定されないことが理解すべきである。
本開示は、全身性エリテマトーデス(SLE)治療の有効性のバイオマーカー、抗CD19抗体でSLEを治療する方法、及びそのような方法のために有用であり得る組成物を提供する。
定義
本明細書中に記載するのは、いくつかの定義である。そのような定義は、文法的な等価物を包含することを意味する。
本明細書中に記載するのは、いくつかの定義である。そのような定義は、文法的な等価物を包含することを意味する。
文脈により他に要求されない限り、本明細書中で及び特許請求の範囲中で使用される単数形用語は、複数形を含むものとし、複数形用語は単数形を含むものとする。
「又は」の使用は、他に記述されない場合、「及び/又は」を意味する。さらに、用語「含む(comprising)」、「有する(having)」、「含む(including)」、ならびに他の形態、例えば「含む(includes)」及び「含まれる(included)」などの使用は、包括的であることを意図しており、列挙された要素以外の追加の要素があり得ることを意味する。また、用語、例えば「要素」又は「成分」などは、他に具体的に記述されない場合、一つのユニットを含む要素及び成分ならびに1を上回るサブユニットを含む要素及び成分の両方を包含する。
様々な変化が、本開示の範囲から逸脱することなく、上に記載する組成物、方法、及びキットにおいて作製することができるため、上の記載において及び以下に与えられる実施例において含まれる全ての事項が、限定する意味でではなく、例証として解釈されるべきであることが意図される。
値の範囲が提供される場合、各介在値は、文脈が他を明確に指示しない場合、その範囲の上限と下限の間の下限の単位の10分の1まで、及びその記述される範囲中の任意の他の記述される値又は介在値が、本発明内に包含されることが理解される。これらのより小さな範囲の上限及び下限は、独立してより小さな範囲中に含まれてもよく、また、本発明内に包含され、記述される範囲中の任意の具体的に除外される限度の対象となる。記述される範囲が、限度の一つ又は両方を含む場合、それらに含まれる限度のいずれか又は両方を除外する範囲がまた、本発明中に含まれる。
「投与される」又は「投与」は、限定されないが、注射可能な形態、例えば、静脈内、筋肉内、皮内もしくは皮下経路、又は粘膜経路などによる、例えば、吸入用の経鼻スプレーもしくはエアロゾルとして、又は摂取可能な溶液、カプセルもしくは錠剤としての送達を含む。
「抗体」は、認識されたイムノグロブリン遺伝子の全部又は一部により実質的にコードされる一つ又は複数のポリペプチドからなるタンパク質を意味する。認識されるイムノグロブリン遺伝子は、例えば、ヒトにおいて、カッパ(κ)、ラムダ(λ)、及び重鎖遺伝子座を含み、それらは一緒に、無数の可変領域遺伝子、ならびに、それぞれIgM、IgD、IgG(IgG1、IgG2、IgG3、及びIgG4)、IgE、ならびにIgA(IgA1及びIgA2)アイソタイプをコードする定常領域遺伝子ミュー(μ)、デルタ(δ)、ガンマ(γ)、シグマ(σ)、及びアルファ(α)を含む。本明細書中の抗体は、全長抗体及び抗体断片を含むことを意味し、任意の生物からの天然抗体、操作された抗体、又は実験的な、治療的な、もしくは他の目的のために組換え的に生成された抗体を指し得る。
本明細書中の「自己免疫疾患」は、同種膵島移植拒絶反応、円形脱毛症、強直性脊椎炎、抗リン脂質症候群、自己免疫性アジソン病、抗好中球細胞質自己抗体(ANCA)、副腎の自己免疫疾患、自己免疫性溶血性貧血、自己免疫性肝炎、自己免疫性心筋炎、自己免疫性好中球減少症、自己免疫性卵巣炎及び精巣炎、自己免疫性血小板減少症、自己免疫性蕁麻疹、ベーチェット病、水疱性類天疱瘡、心筋症、キャッスルマン症候群、セリアックスプルース皮膚炎、慢性疲労免疫不全症候群、慢性炎症性脱髄性多発神経障害、チャーグ・ストラウス症候群、瘢痕性類天疱瘡、CREST症候群、寒冷凝集素症、クローン病、皮膚筋炎、円盤状狼瘡、本態性混合型クリオグロブリン血症、第VIII因子欠乏症、線維筋痛症-線維筋炎、糸球体腎炎、バセドウ病、ギランバレー、グッドパスチャー症候群、移植片対宿主病(GVHD)、橋本甲状腺炎、血友病A、特発性肺線維症、特発性血小板減少性紫斑病(ITP)、IgAニューロパシー、IgG4-RD、IgMポリニューロパシー、免疫介在性血小板減少症、若年性関節炎、川崎病、足底苔癬、エリテマトーデス、メニエール病、混合性結合組織病、多発性硬化症、1型糖尿病、重症筋無力症、尋常性天疱瘡、悪性貧血、結節性多発動脈炎、多発性軟骨炎、多腺性症候群、リウマチ性多発筋痛症、多発性筋炎及び皮膚筋炎、原発性無ガンマグロブリン血症(agammaglobinulinemia)、原発性胆汁性肝硬変、乾癬、乾癬性関節炎、レイノルズ現象、ライター症候群、関節リウマチ、サルコイドーシス、強皮症、シェーグレン(Sjorgen’s )症候群、固形臓器移植拒絶反応、スティッフマン症候群、全身性エリテマトーデス、高安動脈炎、側頭動脈炎/巨細胞性動脈炎、血栓性血小板減少性紫斑病、潰瘍性大腸炎、ブドウ膜炎、脈管炎、例えば疱疹状皮膚炎、血管炎、白斑、ウェグナー肉芽腫症などを含む。
「CD19」は、CD19として公知のタンパク質を指し、以下の同義語を有する:B4、B-リンパ球抗原CD19、Bリンパ球表面抗原B4、CVID3、分化抗原CD19、MGC12802、及びT細胞表面抗原Leu-12。CD19について特異的な一つの抗体は、開示される抗体であり、以下にさらに記載されている。CD19について特異的な一部の追加の抗体が、WO2005012493(US7109304)、WO2010053716(US12/266,999)(Immunomedics);WO2007002223(USUS8097703)(Medarex);WO2008022152(12/377,251)及びWO2008150494(Xencor)、WO2008031056(US11/852,106)(Medimmune);WO2007076950(US11/648,505)(Merck Patent GmbH);WO 2009/052431(US12/253,895)(Seattle Genetics);ならびにWO2010095031(12/710,442)(Glenmark Pharmaceuticals)、WO2012010562及びWO2012010561(International Drug Development)、WO2011147834(Roche Glycart)、及びWO2012/156455(Sanofi)において記載されており、それらは、それらの全体において参照により組み入れられる。特定の実施形態では、これらの追加の抗体は、本開示において使用され得る。
「CDR」又は「相補性決定領域」は、抗原結合部位を形成する、重鎖及び軽鎖の可変ドメイン中のループである。一般的に、合計で六つのCDRがあり、重鎖及び軽鎖毎に各三つ、VH CDR1、VH CDR2、VH CDR3、VL CDR1、VL CDR2、及びVL CDR3が指定される。
抗体の「定常領域」は、軽鎖又は重鎖イムノグロブリン定常領域遺伝子の一つによりコードされる、抗体の領域を意味する。本明細書中で使用される「定常軽鎖」又は「軽鎖定常領域」により、カッパ(Cκ)又はラムダ(Cλ)軽鎖によりコードされる、抗体の領域を意味する。定常軽鎖は、典型的には、単一ドメインを含み、本明細書中に定義されるように、Cκ又はCλの位置108~214を指し、ここで、ナンバリングはEUインデックスに従う。本明細書中で使用される「定常重鎖」又は「重鎖定常領域」により、それぞれIgM、IgD、IgG、IgA、又はIgEとして抗体のアイソタイプを定義するための、ミュー、デルタ、ガンマ、アルファ、又はイプシロン遺伝子によりコードされる、抗体の領域を意味する。全長IgG抗体については、定常重鎖は、本明細書中で定義されるように、CH1ドメインのN末端からCH3ドメインのC末端を指し、このように、位置118-447を含み、それにおいて、ナンバリングはEUインデックスに従う。
「Fc」又は「Fc領域」は、第一の定常領域イムノグロブリンドメイン、及び、一部の場合では、ヒンジの一部を除く、抗体の定常領域を含むポリペプチドを意味する。このように、Fcは、IgA、IgD、及びIgGの最後の二つの定常領域イムノグロブリンドメイン、ならびにIgE及びIgMの最後の三つの定常領域イムノグロブリンドメイン、ならびにこれらのドメインに対する可動性ヒンジN末端を指す。IgA及びIgMについては、FcはJ鎖を含んでもよい。IgGについて、Fcは、イムノグロブリンドメインCgamma2及びCgamma3(Cγ2及びCγ3)ならびにCgamma1(Cγ1)とCgamma2(Cγ2)の間のヒンジを含む。Fc領域の境界は変動し得るが、ヒトIgG重鎖Fc領域は、通常、そのカルボキシル末端に残基C226又はP230を含むと定義され、それにおいて、ナンバリングは、KabatにあるようにEUインデックスに従う。Fcは、以下に記載されるように、単離におけるこの領域、又はFcポリペプチドの状況におけるこの領域を指し得る。
「Fcガンマ受容体」又は「FcγR」は、IgG抗体Fc領域に結合し、FcγR遺伝子により実質的にコードされるタンパク質のファミリーの任意のメンバーを意味する。ヒトにおいて、このファミリーは、限定されないが、FcγRI(CD64)、アイソフォームFcγRIa、FcγRib、及びFcγRIcを含み;FcγRII(CD32)、アイソフォームFcγRIIa(アロタイプH131及びR131を含む)、FcγRIIb(FcγRIIb-1及びFcγRIIb-2を含む)、及びFcγRIIcを含み;ならびにFcγRIII(CD16)、アイソフォームFcγRIIIa(アロタイプV158及びF158を含む)及びFcγRIIIb(アロタイプFcγRIIIb-NA1及びFcγRIIIb-NA2を含む)(Jefferis et al.,2002,Immunol Lett 82:57-65、参照により完全的に組み入れられる)を含み、ならびに任意の未発見のヒトFcγR又はFcγRアイソフォーム又はアロタイプを含む。FcγRは、限定されないが、ヒト、マウス、ラット、ウサギ、及びサルを含む、任意の生物からであってもよい。マウスFcγRは、限定されないが、FcγRI(CD64)、FcγRII(CD32)、FcγRIII(CD16)、及びFcγRIII-2(CD16-2)、ならびに任意の未発見のマウスFcγR又はFcγRアイソフォーム又はアロタイプを含む。
「修飾」は、タンパク質、ポリペプチド、抗体、又はイムノグロブリンの物理的、化学的、又は配列特性における変化を意味する。本明細書中に記載される修飾は、アミノ酸修飾及びグリコフォーム修飾を含む。
「アミノ酸修飾」は、ポリペプチド配列中でのアミノ酸の置換、挿入、及び/又は欠失を意味する。本明細書中の「アミノ酸置換」又は「置換」により、親ポリペプチド配列中の特定位置でのアミノ酸の、別のアミノ酸での置換を意味する。例えば、置換S267Eは、バリアントポリペプチド、この場合では、定常重鎖バリアントを指し、それにおいて、位置267のセリンがグルタミン酸で置換されている。本明細書中で使用される「アミノ酸挿入」又は「挿入」により、親ポリペプチド配列中の特定の位置でのアミノ酸の付加を意味する。本明細書中で使用される「アミノ酸欠失」又は「欠失」により、親ポリペプチド配列中の特定の位置でのアミノ酸の除去を意味する。
「親ポリペプチド」、「親タンパク質」、「親イムノグロブリン」、「前駆体ポリペプチド」、「前駆体タンパク質」、又は「前駆体イムノグロブリン」は、未改変のポリペプチド、タンパク質、又はイムノグロブリンを意味し、それは、その後、バリアント、例えば、本明細書中に記載される少なくとも一つのアミノ酸改変のためのテンプレート及び/又は基礎としての役割を果たす任意のポリペプチド、タンパク質、又はイムノグロブリンを生成するように改変される。親ポリペプチドは、天然ポリペプチド、又は天然型ポリペプチドのバリアントもしくは操作バージョンであってもよい。親ポリペプチドは、ポリペプチド自体、親ポリペプチドを含む組成物、又はそれをコードするアミノ酸配列を指し得る。したがって、本明細書中で使用される「親Fcポリペプチド」により、バリアントFcポリペプチドを生成するように改変されたFcポリペプチドを意味し、本明細書中で使用される「親抗体」により、バリアント抗体を生成するように改変された抗体を意味する(例、親抗体は、限定されないが、天然Igの定常領域を含むタンパク質を含み得る)。
「ポリペプチド」又は「タンパク質」は、タンパク質、ポリペプチド、オリゴペプチド、及びペプチドを含む、少なくとも二つの共有結合的に付着されたアミノ酸を意味する。
タンパク質配列に関する「パーセント(%)アミノ酸配列同一性」は、配列を整列させ、必要な場合にギャップを導入した後、配列同一性の最大パーセントを達成し、配列同一性の一部として任意の保存的置換を考慮しない、特定の(親)配列中のアミノ酸残基と同一である、候補配列中のアミノ酸残基のパーセンテージとして定義される。アミノ酸配列同一性パーセントを決定する目的のためのアライメントは、例えば、公的に入手可能なコンピュータソフトウェア、例えばBLAST、BLAST-2、ALIGN、又はMegalign(DNASTAR)ソフトウェアなどを使用して、当技術分野におけるスキル内にある様々な方法で達成することができる。当業者は、比較されている配列の全長にわたって最大アライメントを達成するために必要とされる任意のアルゴリズムを含む、アライメントを測定するための適したパラメータを決定することができる。一つの特定のプログラムは、米国公開第20160244525号のパラグラフ[0279]~[0280]に概説されているALIGN-2プログラムであり、参照により本明細書により組み入れられる。
二つの類似した配列(例、抗体可変ドメイン)間の配列同一性は、アルゴリズム、例えばSmith,T.F.& Waterman,M.S.(1981)“Comparison Of Biosequences,”Adv.Appl.Math.2:482[局所相同性アルゴリズム];Needleman,S.B.& Wunsch,C D.(1970)“A General Method Applicable To The Search For Similarities In The Amino Acid Sequence Of Two Proteins,”J.Mol.Biol.48:443[相同性アライメントアルゴリズム],Pearson,W.R.& Lipman,D.J.(1988)“Improved Tools For Biological Sequence Comparison,”Proc.Natl.Acad.Sci.(U.S.A.)85:2444[類似性方法についての検索];又はAltschul、S.F.et al、(1990)“Basic Local Alignment Search Tool,”J.Mol.Biol.215:403-10のアルゴリズム、「BLAST」アルゴリズムなどにより測定することができ、https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi.を参照のこと。前述のアルゴリズムのいずれかを使用する場合、デフォルトパラメータ(ウィンドウ長、ギャップペナルティ等)が使用される。一実施形態では、配列同一性は、BLASTアルゴリズムを使用して、デフォルトパラメータを使用して行われる。
本開示のアミノ酸配列(「開示配列」)と親アミノ酸配列の間での同一性の程度は、二つの配列のアラインメントにおける正確な一致の数として算出され、「開示配列」の長さ、又は親配列の長さのいずれか最も短い方により除される。結果は、同一性パーセントで表される。一部の実施形態では、二つ以上のアミノ酸配列は、少なくとも50%、60%、70%、80%、又は90%同一である。一部の実施形態では、二つ以上のアミノ酸配列は、少なくとも95%、97%、98%、99%、又はさらには100%同一である。
「位置」は、タンパク質の配列中の位置を意味する。位置は、順次、又は確立された形式、例えば、KabatにおけるようにEUインデックスに従ってナンバリングされてもよい。例えば、位置267は、ヒト抗体IgG1中の位置である。
「残基」は、タンパク質中の位置及びその関連するアミノ酸同一性を意味する。例えば、セリン267(また、Ser267として言及される、また、S267として言及される)は、ヒト抗体IgG1中の残基である。
「相乗作用(synergy)」、「相乗作用(synergism)」、又は「相乗作用的(synergistic)」は、組み合わせの予想される相加効果よりも多いことを意味する。組み合わせの「相乗作用(synergy)」、「相乗作用(synergism)」、又は「相乗作用的(synergistic)」効果。
化合物又は組み合わせの「治療有効量」は、それが投与されるための効果を産生させる用量である。当該用量は、所与の疾患又は障害及びその合併症の臨床症状を治癒、軽減、又は部分的に停止させ得る。正確な用量は、処置の目的ならびにヒト対象の体重及び一般状態に依存し、公知の技術を使用して当業者により確認可能である。適した投与量の決定は、値のマトリクスを構築して、マトリクス中の異なる点をテストすることにより、ルーチン実験を使用して達成されてもよく、それら全てが、訓練を受けた医師又は臨床科学者の通常のスキル内であることが理解されるであろう。
「可変領域」は、カッパ、ラムダ、及び重鎖イムノグロブリン遺伝子座をそれぞれ構成するV遺伝子κ、V遺伝子λ、及び/又はVH遺伝子のいずれかにより実質的にコードされる一つ又は複数のIgドメインを含むイムノグロブリンの領域を意味する。
「開示される抗体」は抗CD19抗体である。抗CD19ヒト抗体は、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含み、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。開示される抗体は、本明細書中に記載されるCDR配列、軽鎖配列、及び重鎖配列を有することができる。可変ドメインのアミノ酸配列の例が、図5中に提供されている。開示される抗体の重鎖及び軽鎖Fc領域のアミノ酸配列が、図5中に提供されている。開示される抗体が、米国特許第8,063,187号において記載されており、それは、その全体において参照により組み入れられる。開示される抗体は、全身性エリテマトーデス(SLE)におけるヒト臨床治験において試験されている。
他に定義されない限り、本明細書中で使用される全ての技術用語及び科学用語は、本発明が属する技術分野における当業者により一般的に理解されるものと同じ意味を有する。本明細書中に記載されるものと類似の又は等価の任意の方法及び材料がまた、本発明の実行又はテストにおいて使用することができるが、代表的な例示的方法、及び材料がここに記載されている。
本開示は、SLEの治療のための治療有効性を改善する方法に関する。SLEを有する対象における、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aから選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現が決定される。増加発現は、開示される抗体を用いた効果的な治療を予測するものである。開示される抗体は、対象に投与することができる。
バイオマーカー及びその特定
本開示は、SLEと診断されたヒト対象が、FcγIIbへの増加したFc結合を伴う抗CD19治療抗体の投与時に、改善の消失(LOI)までのより大きな日数を有するか否かを評価するために使用することができる、一つ又は複数のバイオマーカーに関する。LOIは、患者において生じる再燃に関する。LOIは、≧4ポイントのSLEDAI増加、又は新たなBILAG AもしくはBスコア及びレスキュー医薬で処置する医師の意図であり得る。LOIの喪失は、改善の維持を指さない。
本開示は、SLEと診断されたヒト対象が、FcγIIbへの増加したFc結合を伴う抗CD19治療抗体の投与時に、改善の消失(LOI)までのより大きな日数を有するか否かを評価するために使用することができる、一つ又は複数のバイオマーカーに関する。LOIは、患者において生じる再燃に関する。LOIは、≧4ポイントのSLEDAI増加、又は新たなBILAG AもしくはBスコア及びレスキュー医薬で処置する医師の意図であり得る。LOIの喪失は、改善の維持を指さない。
さらに、本開示は、SLEと診断されたヒト対象が、FcγIIbへの増加したFc結合を伴い、抗CD19治療抗体に対してより低いものを有し、この抗体を投与すべきではないか否かを評価するために使用することができる一つ又は複数のバイオマーカーに関する。
バイオマーカーの増加発現レベルは、改善の喪失までの増加時間と相関する、薬物投与前のベースラインでの統計的に有意なより高い発現を指す。0.05未満のp値は、統計的に有意であると考えられる。統計的に有意な増加は、テストされた対象の数又は検出もしくは測定の特定の方法を含む変数に基づくことができる。複数のバイオマーカーが検出される状況では、バイオマーカーの組み合わせについての0.05未満のp値を、統計的に有意であると考えることができる。増加発現は、対照群、例えば試験におけるプラセボ群などの発現と比較することができる。
LOIまでのより長い時間が、ベースラインでのバイオマーカーのより高い発現に対応する例では、バイオマーカーは、単独で、あるいは一つ又は複数の他のバイオマーカーとの組み合わせにおいて、本明細書中に記載される任意の方法の一部として検出又は測定することができる。
表1は、LOIイベントまでの時間の評価項目に基づく、ベースラインでより高い発現レベルを有するバイオマーカーを描写する。Cox回帰を使用して、ハザード比(HR)を推定した-任意の所与の時間点での、オベキセリマブ処置対象 vs.プラセボ処置対象の間での改善の喪失の相対的可能性。RNAhigh(cDx+)vs.RNAlow(cDx-)におけるより小さなHRに関連付けられるP値を使用して、候補遺伝子の予測性を順位付けした。五倍交差検証及びサブサンプリングを使用して、予測手順の一般化可能性及びモデルの頑健性を評価した。
一部のバリエーションでは、対象への抗体投与後、LOIまでのより長い時間は、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、LOIまでのより長い時間は、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される二つ以上、あるいは三つ以上、あるいは四つ以上、あるいは五つ以上、あるいは六つ以上、あるいは七つ以上、あるいは八つ以上、あるいは九つ以上、あるいは十以上、又は各々のバイオマーカーの増加発現に対応する。
一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、改善の喪失(LOI)までのより長い時間は、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aから選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、LOIまでのより長い時間は、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aから選択される二つ以上、あるいは三つ以上、あるいは四つ以上、あるいは五つ以上、あるいは六つ以上、あるいは七つ以上、あるいは八つ以上のバイオマーカーの増加発現に対応する。
一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、改善の喪失(LOI)までのより長い時間は、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、及びCD28から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、改善の喪失(LOI)までのより長い時間は、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、及びCD28から選択される二つ以上、あるいは三つ以上、あるいは四つ以上の一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、改善の喪失(LOI)までのより長い時間は、バイオマーカーCD27の増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、改善の喪失(LOI)までのより長い時間は、バイオマーカーTCF7の増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、改善の喪失(LOI)までのより長い時間は、バイオマーカーCD40LGの増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、改善の喪失(LOI)までのより長い時間は、バイオマーカーFOXP3の増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、改善の喪失(LOI)までのより長い時間は、バイオマーカーCD28の増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、改善の喪失(LOI)までのより長い時間は、バイオマーカーCD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、及びCD28の増加発現に対応する。
一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、USP21、及びIL7R(CD127)から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、LOIまでのより長い時間は、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、USP21、及びIL7R(CD127)から選択される二つ以上、あるいは三つ以上、あるいは四つ以上、あるいは五つ以上、あるいは六つ以上、あるいは七つ以上、あるいは八つ以上、あるいは九つ以上、あるいは十以上、又は各々のバイオマーカーの増加発現に対応する。
一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、改善の喪失(LOI)までのより長い時間は、APP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aから選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、改善の喪失(LOI)までのより長い時間は、バイオマーカーAPPの増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、改善の喪失(LOI)までのより長い時間は、バイオマーカーIL-3RAの増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、改善の喪失(LOI)までのより長い時間は、バイオマーカーIL-3RA(CD123)の増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、改善の喪失(LOI)までのより長い時間は、バイオマーカーMAP1Aの増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、改善の喪失(LOI)までのより長い時間は、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、及びCD28から選択される一つ又は複数のバイオマーカーならびにAPP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aから選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、改善の喪失(LOI)までのより長い時間は、バイオマーカーCD27及びAPPの組み合わせの増加発現に対応する。
一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aから選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、及びCD28から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、バイオマーカーCD27の増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、バイオマーカーTCF7の増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、バイオマーカーCD40LGの増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、バイオマーカーFOXP3の増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、バイオマーカーCD28の増加発現に対応する。
一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、APP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aから選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、バイオマーカーAPPの増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、バイオマーカーIL-3RAの増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、バイオマーカーMAP1Aの増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、バイオマーカーAPP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aの各々の増加発現に対応する。
一部のバリエーションでは、バイオマーカーは、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21の一つ又は複数から選択される。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、バイオマーカーTRABD2Aの増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、バイオマーカーST6GAL1の増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、バイオマーカーATAD5の増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、バイオマーカーATP13A2の増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、バイオマーカーSLC17A9の増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、バイオマーカーTBC1D4の増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、バイオマーカーMALの増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、バイオマーカーACY3の増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、バイオマーカーDNPH1の増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、バイオマーカーCNDP2、CLCN5の増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、バイオマーカーCALRの増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、バイオマーカーST3GAL5の増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、バイオマーカーUSP21の増加発現に対応する。
一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、及びCD28から選択される一つ又は複数のバイオマーカーならびにAPP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aから選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現に対応する。一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、バイオマーカーCD27及びAPPの組み合わせの増加発現に対応する。
一部のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、CD27、TCF7、CCR7、IL7R、及びCD28の一つ又は複数の増加発現に対応する。
代替的なバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、CD27及びTCF7の増加発現に対応する。他のバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、CD27、TCF7、CCR7、及びIL7Rの増加発現に対応する。代替的なバリエーションでは、対象への抗体の投与後、LOIまでのより長い時間は、CD27、TCF7、CCR7、IL7R、及びCD28の増加発現に対応する。
一部のバリエーションでは、複数のバイオマーカーの発現レベルを決定することは、単一のバイオマーカーの発現レベルを決定するよりも頑健であり得る。これは、バイオマーカーに関連付けられる遺伝子が異なる細胞経路にある場合に特に該当する。例えば、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、及びCD28から選択される一つ又は複数のバイオマーカーならびにAPP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aバイオマーカーから選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現レベルによって、頑健な予測が提供される。一部のバリエーションでは、三つ以上、四つ以上、五つ以上、六つ以上、七つ以上、八つ以上、九つ以上、又は十以上のバイオマーカーの発現レベルを決定することができる。
本明細書中で投与される抗体によって、処置されるSLE対象においてB細胞数が低下する。抗体によって、循環総B細胞及び活性化B細胞ならびに形質細胞のRNAマーカーがさらに低下する。遺伝子発現解析によって、オベキセリマブ応答へのpDC及びT細胞の両方の追加的な関与が指摘される。APPはpDC中で高度に発現される。CDCD27発現は、SLE対象において、他の基準静止T及びTscmシグネチャー遺伝子(TCF7、CD28、CCR7、IL-7R)と高度に相関していた。
本明細書中で言及されるバイオマーカーは、例えば、NCBI登録番号、GI番号、及び同様のものにおいて見出すことができる。
バイオマーカー発現レベルは、全血液から決定することができる。あるいは、発現は、サンプル中で分離される、単離される、及び/又は濃度において増加している異なる細胞型から測定することができる。一部のバリエーションでは、バイオマーカーの発現は、全血液のサンプルから決定することができる。一部の追加的なバリエーションでは、サンプルは、先行技術の方法において用いられるように、単離された末梢血単核細胞(PBMC)、又は単離されたT細胞、例えば単離されたCD8+細胞もしくは単離されたCD4+T細胞などを含み得る。サンプルは、サンプル収集後の処理、例えば細胞溶解ならびに/あるいは全血液サンプル中のRNA分解を阻害する一つ又は複数の酵素阻害剤の添加などに供され得る。一部のバリエーションでは、バイオマーカーの発現は、T細胞、形質芽球、及びそれらの組み合わせから決定することができる。一部のバリエーションでは、バイオマーカーの発現は、樹状細胞、例えば形質細胞様樹状細胞などから決定することができる。
本開示の別の態様は、CD19について特異的な抗体の治療有効量を投与することにより、それを必要とする個体においてSLEを治療する方法である。特定の実施形態では、個体は、本明細書中で開示されるバイオマーカーの一つ又は複数を発現する。
本開示のさらに別の態様は、本明細書中で開示されるバイオマーカーのいずれかの増加発現を有するヒト対象において全身性エリテマトーデス(SLE)を治療するための治療有効量の抗CD19抗体の使用である。本開示のさらに別の態様では、本明細書中で開示されるバイオマーカーのいずれかの増加発現を有するヒト対象において全身性エリテマトーデス(SLE)を治療するための医薬品の製造における、治療有効量の抗CD19抗体の使用である。
以下の実施例においてさらに記載されるように、本明細書中で開示される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現レベルを決定することによって、SLEを治療する際での、開示される抗体の一つの増加した有効性が提供されることが驚くべきことに見出されている。一部のバリエーションでは、一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現を伴うヒト対象は、改善の喪失(LOI)までの延長した時間を有した。一部のバリエーションでは、一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現を伴うヒト対象は、一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現を伴わないヒト対象ほど頻繁には改善の喪失を経験しなかった。一部の追加的なバリエーションでは、一つ又は複数のバイオマーカーの発現の増加を示さなかったヒト対象は、LOIまでの低下した時間を示した。
バイオマーカー発現レベルを決定するために使用され得る多くの適切な方法がある。
例えば、一つ又は複数のバイオマーカーの発現のレベルは、群から得られたデータのコレクションと比較してもよい。比較は、線形回帰モデルを使用してもよい。別の例では、バイオマーカー発現のレベルは、問題の各遺伝子についての閾値レベルと比較することができる。遺伝子についての適切な閾値レベルは、例えば、qPCR発現データ及び機械学習方法(例えばロジスティック回帰、サポートベクターマシン、又は決定ツリーベースの方法など)を使用して決定されて、対象の最大分離を可能にする最適な発現閾値を確立することができる。
あるいは、一つ又は複数のバイオマーカーの発現レベルの中央値を、対照値として使用してもよく、それにおいて、群は、対象、好ましくは少なくとも100人、少なくとも50人、又は少なくとも10人の対象から成った。この場合では、バイオマーカーの発現レベルの上の中央値は、本明細書中に記載される抗体が、対象に投与されるべきであることを示し得る。一つ又は複数のバイオマーカーの発現レベルが、バイオマーカーの発現レベルの中央値を下回る場合、それによって、本明細書中に記載される抗体が、対象に投与されるべきではないことを示すことができる。さらなる代替法として、対象の群、例えば少なくとも100人、少なくとも50人、又は少なくとも10人の対象などから得られたサンプル中での、問題の遺伝子の各発現レベルの中央値を対照として使用してもよく、それにおいて、群は対象から成った。
バイオマーカーの発現のレベルは、任意の便利な手段により決定されてもよく、多くの適切な技術が当技術分野において公知である。例えば、適切な技術は、リアルタイム定量的PCR(RT-qPCR)、デジタルPCR、マイクロアレイ解析、全トランスクリプトームショットガンシーケンシング(RNA-SEQ)、期待値最大化によるRNA-Seq(RSEM)、及び直接マルチプレックス遺伝子発現解析を含む。本発明の方法は、従って、対象から得られた全血液サンプルを、バイオマーカー発現レベルを決定するために適切な試薬、例えば、RT-qPCR、デジタルPCR、マイクロアレイ解析、全トランスクリプトームショットガンシーケンシング、直接マルチプレックス遺伝子発現解析、ELISA、タンパク質チップ、フローサイトメトリー、質量分析、又はウェスタンブロッティングを使用して、二つ以上の当該遺伝子の発現レベルを決定するのために適切な試薬又は試薬と接触させることを含み得る。例えば、試薬は、RT-qPCR、デジタルPCR、又は全トランスクリプトームショットガンシーケンシングを使用して、当該遺伝子の一つ又は複数の発現レベルを決定するために適切な、核酸プライマーの対又は対であってもよい。あるいは、試薬は、ELISA又はウェスタンブロッティングを使用して、当該一つ又は複数の遺伝子の発現レベルを決定するために適切な抗体であってもよい。好ましくは、当該遺伝子の発現レベルは、RT-qPCR、デジタルPCR、マイクロアレイ解析、全トランスクリプトームショットガンシーケンシング、又は直接マルチプレックス遺伝子発現解析を使用して決定される。最も好ましくは、当該遺伝子の発現のレベルは、RT-qPCRを使用して決定される。
RT-qPCRによって、標的DNA分子の増幅及び同時定量が可能になる。RT-qPCRを使用して遺伝子発現レベルを解析するために、全血液サンプルの全mRNAを最初に単離し、逆転写酵素を使用してcDNA中に逆転写してもよい。例えば、mRNAレベルは、例えば、製造元の説明書に従って、ABI PRISM 7900HT機器でTaqman Gene Expression Assays(Applied Biosystems)を使用して決定することができる。転写物の存在量を次に、標準曲線との比較により算出することができる。
デジタルPCRはまた、バイオマーカーを検出するために使用することができる。デジタルPCRは、DNA又はcDNAのサンプルを多くの対象、平行PCR反応中に分割することにより機能する;これらの反応の一部が標的分子を含む(陽性)一方で、他は含まない(陰性)。単一分子は、100万倍以上増幅することができる。増幅の間に、色素標識プローブを用いたTaqMan(登録商標)ケミストリーを使用して、配列特異的標的を検出する。標的配列が存在しない場合、シグナルは蓄積しない。PCR解析後、陰性反応の分画を使用して、標準又は内因性対照を必要とすることなく、サンプル中の標的分子の数の絶対数を生成する。ナノ流体チップの使用によって、数千のPCR反応を並行して実行するための便利で直接的な機構が提供される。各ウェルに、サンプル、マスターミックス、及びTaqMan(登録商標)アッセイ試薬の混合物が充填され、エンドポイントシグナルの存在(陽性)又は非存在(陰性)を検出するために解析する。標的配列の1を上回る分子を受けたであろうウェルを説明するために、補正係数を、ポアソンモデルを使用して適用する。
RNA-SEQは、所与の時点で生物学的サンプル中のRNAの検出及び定量のために、次世代シーケンシング(NGS)を使用する。RNAライブラリーは、調製され、転写され、断片化され、配列決定され、再構成され、目的の配列又は配列が定量化される。
NanoString技術では、多くの異なる型の標的核酸分子に直接的にハイブリダイズすることができる固有のカラーコードされた分子バーコードが使用され、800までの遺伝子の発現レベルを同時に解析するコスト効率の良い方法を提供し、qPCRと同等の感度を伴う。
RNA用のFlow-FISHは、フローサイトメトリーを用いて、蛍光タグ付きRNAオリゴを使用してサンプル内の標的mRNAの存在量を決定する。この技術は、例えば、Porichis et al.、NatComm(2014)5:5641において記載されている。この技術の利点は、サンプル中に存在する細胞を分離する必要なく使用することができることである。
マイクロアレイによって、二つのサンプル中の遺伝子発現を比較することが可能になる。全RNAは、例えば、トリゾール又はRNeasyミニキット(Qiagen)を使用して、例えば、PBMC又は全血液から最初に単離される。単離された全RNAを次に、逆転写酵素及びポリTプライマーを使用して二本鎖cDNA中に逆転写し、例えば、Cy3-又はCy5-dCTPを使用して標識する。適したCy3及びCy5標識サンプルを次にプールし、適切な遺伝子及び対照特色を表すプローブで構成されるカスタムスポットオリゴヌクレオチドマイクロアレイ、例えば(Willcocks et al.,J Exp Med 205,1573-82,2008)において記載されているマイクロアレイなどにハイブリダイズする。サンプルは、プールされたPBMC又は全血液サンプルから由来する共通参照RNAに対して、染料スワップ戦略を使用して、二重にハイブリダイズされてもよい。ハイブリダイゼーション後、アレイを洗浄し、例えば、Agilent G2565Bスキャナ上でスキャンする。上に記載する工程に対する適切な代替法は、当技術分野において周知であり、当業者には明らかであろう。得られたマイクロアレイの生データは、適切な方法を使用して解析され、遺伝子CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、CCR7、IL7R 、及びUSP21のいずれかの相対発現を決定する。
酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)によって、サンプル中に存在するタンパク質の相対量を検出することが可能になる。サンプルを最初に、固体支持体、例えばポリスチレンマイクロタイタープレートなどの上で、直接的に又は目的のタンパク質について特異的な抗体を介して固定化する。固定化後、抗原を、標的タンパク質について特異的な抗体を使用して検出する。標的タンパク質を検出するために使用される一次抗体は、検出を可能にするように標識してもよく、又は一次抗体は、適切に標識された二次抗体を使用して検出することができる。例えば、抗体は、抗体をレポーター酵素に共役することにより標識してもよい。この場合では、プレートは、適切な酵素基質を加えて、可視シグナルを産生することにより視覚化された。シグナルの強度は、サンプル中に存在する標的タンパク質の量に依存的である。
タンパク質チップは、また、タンパク質アレイ又はタンパク質マイクロアレイとして言及され、サンプル中に存在するタンパク質の相対量を検出することを可能にする。異なる捕捉分子をチップに取り付けてもよい。例は、抗体、抗原、酵素基質、ヌクレオチド、及び他のタンパク質を含む。タンパク質チップはまた、広範なタンパク質に結合する分子を含むことができる。タンパク質チップは当技術分野において周知であり、多くの異なるタンパク質チップが商業的に入手可能である。
ウェスタンブロッティングによって、また、サンプル中に存在するタンパク質の相対量を決定することが可能になる。サンプル中に存在するタンパク質は、最初に、ゲル電気泳動を使用して分離される。タンパク質は次に、膜、例えば、ニトロセルロース又はPVDF膜に移され、標的タンパク質に特異的なモノクローナル抗体又はポリクローナル抗体を使用して検出される。多くの異なる抗体が商業的に入手可能であり、所与の標的タンパク質に対する抗体を作製する方法がまた、当技術分野において十分に確立されている。検出を可能にするために、対象のタンパク質について特異的な抗体、又は適切な二次抗体を、例えば、レポーター酵素に連結してもよく、それによって、比色反応が駆動され、適した基質に曝露された場合に色を産生する。他のレポーター酵素は、西洋ワサビペルオキシダーゼを含み、それは、適した基質が提供された場合に化学発光を産生する。抗体はまた、適切な放射性標識又は蛍光標識で標識してもよい。使用される標識に依存して、タンパク質レベルは、デンシトメトリー、分光光度法、写真フィルム、X線フィルム、又はフォトセンサーを使用して決定され得る。
フローサイトメトリーによって、例えば、対象から得られたPBMC又は全血液サンプル中に存在するタンパク質の相対量を決定することが可能になる。 フローサイトメトリーは、また、細胞の表面上の目的のタンパク質の発現のレベルを検出又は測定するためにも使用することができる。フローサイトメトリーを使用したタンパク質及び細胞の検出は、通常、最初に蛍光標識を目的のタンパク質又は細胞に付着させることを含む。蛍光標識は、例えば、目的のタンパク質又は細胞について特異的な蛍光標識抗体であり得る。多くの異なる抗体が商業的に入手可能であり、目的のタンパク質について特異的な抗体を作製するための方法がまた、当技術分野において十分に確立されている。
質量分析、例えば、マトリクス支援レーザー脱離/イオン化(MALDI)質量分析によって、例えば、ペプチドマスフィンガープリントを使用して、対象から得られたサンプル中に存在するタンパク質の特定が可能になる。 質量分析の前に、サンプル中に存在するタンパク質を、ゲル電気泳動、例えば、SDS-PAGE、サイズ排除クロマトグラフィー、又は二次元ゲル電気泳動を使用して単離してもよい。
キット
また、開示されるのは、一つ又は複数のバイオマーカーを決定する際での使用のためのキットである。キットは、バイオマーカー発現レベルを確立するための試薬を含み得る。キットは、三つ以上の、四つ以上の、五つ以上の、六つ以上の、七つ以上の、八つ以上の、九つ以上の、又は十以上のバイオマーカーの発現レベルを確立するための試薬を含み得る。例えば、試薬は、本明細書中に記載される任意の技術、例えばRT-qPCR、デジタルPCR、マイクロアレイ解析、全トランスクリプトームショットガン配列決定、又は直接マルチプレックス遺伝子発現解析などを使用して、問題の遺伝子の発現を確立するために適切な試薬であり得る。例えば、キットは、例えば、RT-qPCR、デジタルPCR、全トランスクリプトームショットガン配列決定、又は直接マルチプレックス遺伝子発現解析を使用して、問題の遺伝子の発現レベルを確立するために適切なプライマーを含み得る。適切なプライマーの設計はルーチンであり、当業者の能力の十分に範囲内である。直接マルチプレックス遺伝子発現解析用のキットは、追加的に、又は代替的に、問題の遺伝子の発現のレベルを確立するための蛍光プローブを含んでもよい。検出試薬に加えて、キットはまた、RNA抽出試薬及び/又はcDNA中へのRNAの逆転写用の試薬を含んでもよい。
また、開示されるのは、一つ又は複数のバイオマーカーを決定する際での使用のためのキットである。キットは、バイオマーカー発現レベルを確立するための試薬を含み得る。キットは、三つ以上の、四つ以上の、五つ以上の、六つ以上の、七つ以上の、八つ以上の、九つ以上の、又は十以上のバイオマーカーの発現レベルを確立するための試薬を含み得る。例えば、試薬は、本明細書中に記載される任意の技術、例えばRT-qPCR、デジタルPCR、マイクロアレイ解析、全トランスクリプトームショットガン配列決定、又は直接マルチプレックス遺伝子発現解析などを使用して、問題の遺伝子の発現を確立するために適切な試薬であり得る。例えば、キットは、例えば、RT-qPCR、デジタルPCR、全トランスクリプトームショットガン配列決定、又は直接マルチプレックス遺伝子発現解析を使用して、問題の遺伝子の発現レベルを確立するために適切なプライマーを含み得る。適切なプライマーの設計はルーチンであり、当業者の能力の十分に範囲内である。直接マルチプレックス遺伝子発現解析用のキットは、追加的に、又は代替的に、問題の遺伝子の発現のレベルを確立するための蛍光プローブを含んでもよい。検出試薬に加えて、キットはまた、RNA抽出試薬及び/又はcDNA中へのRNAの逆転写用の試薬を含んでもよい。
キットはまた、本方法の実行のための一つ又は複数の物品ならびに/あるいは試薬、例えば緩衝溶液など、ならびに/あるいはサンプル自体を得るための手段、例えば、サンプルを得る及び/又は単離するための手段ならびにサンプル取り扱い容器(一般的に無菌であるそのような成分)を含み得る。キットは、本明細書中に記載される抗体を対象に投与するか否かを評価するための方法におけるキットの使用のための説明書を含み得る。
抗CD19抗体の例
様々な態様では、抗CD19抗体は、Fc領域中にアミノ改変S267Eを有し、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。様々な態様では、抗CD19抗体は、Fc領域中にアミノ改変L328Fを有する。様々な態様では、抗CD19抗体は、Fc領域中にアミノ改変S267E及びL328Fを有し、ここで、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
様々な態様では、抗CD19抗体は、Fc領域中にアミノ改変S267Eを有し、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。様々な態様では、抗CD19抗体は、Fc領域中にアミノ改変L328Fを有する。様々な態様では、抗CD19抗体は、Fc領域中にアミノ改変S267E及びL328Fを有し、ここで、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
一実施形態では、抗CD19抗体は、配列番号10を含むCDR1、配列番号11を含むCDR2、及び配列番号12を含むCDR3を有する可変領域を含む軽鎖;ならびに配列番号13を含むCDR1、配列番号14を含むCDR2、及び配列番号15を含むCDR3を有する可変領域を含む重鎖を含む抗体と同じエピトープに結合する抗体を含み、それにおいて、重鎖は、配列番号4と比較して、Fc領域中にアミノ酸置換S267E及びL328Fを含み、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
一実施形態では、抗CD19抗体は、配列番号10を含むCDR1、配列番号11を含むCDR2、及び配列番号12を含むCDR3を有する可変領域を含む軽鎖;ならびに配列番号13を含むCDR1、配列番号14を含むCDR2、及び配列番号15を含むCDR3を有する可変領域を含む重鎖を含み、それにおいて、重鎖は、配列番号4と比較して、Fc領域中にアミノ酸置換S267E及びL328Fを含み、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
一実施形態では、抗CD19抗体は、軽鎖;ならびに配列番号2のアミノ酸配列及び、配列番号4と比較して、Fc領域中にアミノ酸置換S267E及びL328Fを含む重鎖を含み、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
一実施形態では、抗CD19抗体は、配列番号7のアミノ酸配列を含む軽鎖;及び配列番号9のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。
一実施形態では、抗CD19抗体は、配列番号7のアミノ酸配列と少なくとも90%、あるいは少なくとも95%、あるいは少なくとも96%、あるいは少なくとも97%、あるいは少なくとも98%、あるいは少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖;及び配列番号9のアミノ酸配列と少なくとも90%、あるいは少なくとも95%、あるいは少なくとも96%、あるいは少なくとも97%、あるいは少なくとも98%、あるいは少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖を含む。
組み合わせ、医薬品、及び医薬組成物
本開示はまた、記載されている組み合わせを含む組み合わせ、医薬品、及び医薬組成物に関する。
本開示はまた、記載されている組み合わせを含む組み合わせ、医薬品、及び医薬組成物に関する。
用語「組み合わせにおいて」及び「同時投与」は、正確に同じ時間での薬剤の投与に限定されない。代わりに、本明細書中に開示される抗CD19抗体、及び別の分子は、それらが一緒に作用して、抗CD19抗体のみを用いた処置に対して増加する利益を提供し得るように、連続的に及び時間間隔内で投与されることを意味する。一部の実施形態では、二つの成分が、両方の成分(薬物)がヒト対象において同時に活性である時に投与される。そのような分子は、意図される目的のために効果的である量で、組み合わせにおいて適切に存在する。当業者は、経験的に、又は薬剤の薬物動態及び作用様式、各治療薬剤の適した用量、もしくは用量、ならびに投与の適したタイミング及び方法を考慮することにより決定することができる。
一部の実施形態では、医薬組成物が提供される。医薬組成物が企図され、それにおいて、CD19について特異的な抗体である。本明細書中に開示される抗CD19抗体の製剤は、所望の純度を有する当該抗CD19抗体を、任意の医薬的に許容可能な担体、賦形剤、又は安定剤(Remington’s Pharmaceutical Sciences 16th edition,Osol,A.Ed.,1980、参照により全体的に組み入れられる)と、凍結乾燥製剤又は水溶液の形態において混合することにより、保存のために調製される。インビボ投与のために使用される製剤は、滅菌であり得る。これは、滅菌濾過膜又は他の方法を通じた濾過により容易に達成される。
本明細書中で開示されるCD19に特異的な抗体はまた、イムノリポソームとして製剤化され得る。リポソームは、哺乳動物への治療薬剤の送達のために有用な様々な種類の脂質、リン脂質、及び/又は界面活性剤を含む小さなベジクルである。抗CD19抗体を含むリポソームは、当技術分野において公知である、例えばEpstein et al.,1985,Proc Natl Acad Sci USA,82:3688;Hwang et al.,1980,Proc Natl Acad Sci USA,77:4030;US4,485,045;US4,544,545;及びPCT WO97/38731において記載されている方法により調製され、全てが参照により全体的に組み入れられる。増強された循環時間を伴うリポソームが、US 5,013,556において開示されており、参照により全体的に組み入れられる。リポソームの成分は、生物学的な膜の脂質配置と類似する二層形成中で一般的に配置される。特に有用なリポソームは、ホスファチジルコリン、コレステロール、及びPEG-誘導体化ホスファチジルエタノールアミン(PEG-PE)を含む脂質組成物を用いた逆相蒸発方法により生成することができる。リポソームは、定義された細孔サイズのフィルターを通じて押出され、所望の直径を伴うリポソームをもたらす。化学療法薬剤又は他の治療活性薬剤は、場合により、リポソーム内に含まれる(Gabizon et al.、1989、JNational Cancer Inst 81:1484、参照により全体的に組み入れられる)。
抗CD19抗体及び他の治療活性薬剤はまた、限定されないが、コアセルベーション技術、界面重合(例えば、ヒドロキシメチルセルロースもしくはゼラチンマイクロカプセル、又はポリ(メチルメタクリレート)マイクロカプセルを使用する)、コロイド薬物送達系(例えば、リポソーム、アルブミンマイクロスフェア、マイクロエマルジョン、ナノ粒子及びナノカプセル)、及びマクロエマルジョンを含む方法により調製されたマイクロカプセル中に封入してもよい。そのような技術は、Remington’s Pharmaceutical Sciences 16th edition,Osol,A.Ed.,1980において開示されており、参照により全体的に組み入れられる。持続放出調製物が調製され得る。持続放出調製物の適切な例は、固体疎水性ポリマーの半透過性マトリックスを含み、そのマトリックスは、成型された物品、例えば、フィルム、又はマイクロカプセルの形態である。持続放出マトリックスの例は、ポリエステル、ヒドロゲル(例えば、ポリ(2-ヒドロキシエチルメタクリレート)、又はポリ(ビニルアルコール))、ポリラクチド(US3,773,919、参照により全体的に組み入れられる)、L-グルタミン酸及びガンマエチル-L-グルタメートの共重合体、非分解性エチレン酢酸ビニル、分解性乳酸-グリコール酸共重合体、例えばLupron Depot(登録商標)(それは、乳酸-グリコール酸共重合体及び酢酸ロイプロリドで構成される注射用マイクロスフェア)など、ポリ-D-(-)-3-ヒドロキシ酪酸、及びProLease(登録商標)(Alkermesから商業的に入手可能)、それは、ポリ-DL-ラクチド-コ-グリコリド(PLG)のマトリックスに組み入れられた所望の生物活性分子で構成されるマイクロスフェアベースの送達系である、を含む。
一実施形態では、本明細書中に開示されるCD19に特異的な抗体は、静脈内(IV)投与又は皮下(SC)投与のために製剤化される。一般的に、IV投与又はSC投与のための製剤は、抗CD19抗体、一つ又は複数の緩衝剤、一つ又は複数の等張化剤、一つ又は複数の溶媒、及び一つ又は複数の界面活性剤を含む。
実施形態では、IV製剤は、約1mg~約50mg/mLの量で抗CD19抗体を含む。抗CD19抗体の量は、約1mg~約500mg/mL又は約1mg~約100mg/mL又は約1mg~約50mg/mLであることができる。
一実施形態では、SC製剤は、抗CD19抗体を、約100mg~約250mg/mLの量で含む。抗CD19抗体の量は、約1mg~約500mg/mL又は約50mg~約250mg/mL又は約100mg~約250mg/mLであることができる。一部の実施形態では、抗CD19抗体の量は、約125mg/mLである。一部のバリエーションでは、抗CD19抗体は、14日毎に200mg~300mgの間の量で投与することができる。一部のバリエーションでは、抗CD19抗体は、14日毎に250mgでSC投与することができる。一部のバリエーションでは、抗CD19抗体は、14日毎に100mg~150mgの間の量でSC投与することができる。一部のバリエーションでは、抗CD19抗体は、14日毎に120mgでSC投与することができる。
ヒト対象を処置するために、本明細書中に開示される抗CD19抗体の治療有効用量を投与してもよい。正確な用量は、処置の目的に依存し、公知の技術を使用して当業者により確認可能である。投与量は、0.0001~100mg/kgの体重又はそれ以上、例えば、0.1、1、5、10、又は50mg/kgの体重の範囲であり得る。一実施形態では、投与量は約1~約10mg/kgの範囲である。別の実施形態では、投与量は約5mg/kgである。
一部の実施形態では、SLEを治療するために使用される抗体は、0.2mg/kgを上回る又はそれと等しい用量で投与することができる。例えば、SLEを治療するために使用される抗体は、0.1mg/kgを上回る又はそれと等しい、0.5mg/kgを上回る又はそれと等しい、1mg/kgを上回る又はそれと等しい、2mg/kgを上回る又はそれと等しい、5mg/kgを上回る又はそれと等しい、10mg/kgを上回る又はそれと等しい、15mg/kgを上回る又はそれと等しい、20mg/kgを上回る又はそれと等しい、あるいは25mg/kgを上回る又はそれと等しい用量で投与することができる。あるいは、SLEを治療するために使用される抗体は、25mg/kgを上回る又はそれと等しい、50mg/kgを上回る又はそれと等しい、75mg/kgを上回る又はそれと等しい、100mg/kgを上回る又はそれと等しい、125mg/kgを上回る又はそれと等しい、150mg/kgを上回る又はそれと等しい、175mg/kgを上回る又はそれと等しい、あるいは200mg/kgを上回る又はそれと等しい用量で投与することができる。他の実施形態では、SLEを治療するために使用される抗体は、約0.2mg/kgの用量で投与することができる。例えば、SLEを治療するために使用される抗体は、約0.1mg/kg、約0.5mg/kg、約1mg/kg、約2mg/kg、約5mg/kg、約10mg/kg、約15mg/kg、約20mg/kg、又は約25mg/kgの用量で投与することができる。あるいは、SLEを治療するために使用される抗体は、約25mg/kg、約50mg/kg、約75mg/kg、約100mg/kg、約125mg/kg、約150mg/kg、約175mg/kg、又は約200mg/kgの用量で投与することができる。
一部の実施形態では、抗CD19抗体は、約125mgの用量で投与される。他の実施形態では、抗CD19抗体は、約250mgの用量で投与される。
一部の実施形態では、抗CD19抗体の単一用量だけが使用される。他の実施形態では、抗CD19抗体の複数用量が投与される。投与間の経過時間は、1時間未満、約1時間、約1~2時間、約2~3時間、約3~4時間、約6時間、約12時間、約24時間、約48時間、約2~4日、約4~6日、約7日、約14日、又は14日超であり得る。特定の実施形態では、抗CD19抗体は14日毎に投与される。一部の実施形態では、抗CD19抗体は7日毎に投与される。
特定の実施形態では、125mgの抗CD19抗体が7日毎に投与される。他の実施形態では、250mgの抗CD19抗体が14日毎に投与される。
一部の実施形態において、抗CD19抗体は少なくとも1用量投与される。他の実施形態では、抗CD19抗体は少なくとも2用量投与される。他の実施形態では、抗CD19抗体は少なくとも3用量投与される。他の実施形態では、抗CD19抗体は少なくとも4用量投与される。他の実施形態では、抗CD19抗体は少なくとも5用量投与される。他の実施形態では、抗CD19抗体は少なくとも6用量投与される。他の実施形態では、抗CD19抗体は少なくとも7用量投与される。他の実施形態では、抗CD19抗体は少なくとも8用量投与される。他の実施形態では、抗CD19抗体は少なくとも9用量投与される。他の実施形態では、抗CD19抗体は少なくとも10用量投与される。他の実施形態では、抗CD19抗体は少なくとも11用量投与される。他の実施形態では、抗CD19抗体は少なくとも12用量投与される。他の実施形態では、抗CD19抗体は少なくとも13用量投与される。他の実施形態では、抗CD19抗体は少なくとも15用量投与される。他の実施形態では、抗CD19抗体は少なくとも16用量投与される。他の実施形態では、抗CD19抗体は少なくとも17用量投与される。他の実施形態では、抗CD19抗体は少なくとも18用量投与される。他の実施形態では、抗CD19抗体は少なくとも19用量投与される。他の実施形態では、抗CD19抗体は少なくとも20用量投与される。他の実施形態では、抗CD19抗体は少なくとも25用量投与される。他の実施形態では、抗CD19抗体は少なくとも30用量投与される。他の実施形態では、抗CD19抗体は少なくとも35用量投与される。他の実施形態では、抗CD19抗体は少なくとも40用量投与される。他の実施形態では、抗CD19抗体は少なくとも45用量投与される。他の実施形態では、抗CD19抗体は少なくとも50用量投与される。他の実施形態では、抗CD19抗体は少なくとも55用量投与される。他の実施形態では、抗CD19抗体は少なくとも60用量投与される。他の実施形態では、抗CD19抗体は2用量を上回って投与される。特定の一実施形態では、抗CD19抗体は、14日毎に合計16用量で投与される。特定の別の実施形態では、抗CD19抗体は、14日毎に合計32用量で投与される。
一部の例では、本明細書中に記載されている方法のいずれかを、免疫抑制性生物学的治療(例、リツキシマブ、ボルテゾミブ)に難治性である対象に対して実施することができる。投与された免疫抑制性生物学的治療に難治性である対象は、所与の免疫抑制性生物製剤、例えばリツキシマブもしくはボルテゾミブなどに応答しない、又は治療応答を示し、次に疾患の症状を再発生する。一部の例では、自己免疫疾患(例、SLE、関節リウマチ)は、リツキシマブに難治性である対象に、本明細書中に記載される抗体を投与することにより治療することができる。
一部の例では、本明細書中に記載される方法のいずれかを、免疫抑制性生物製剤を用いた処置後に再発した対象に対して実施することができる。再発した対象は、免疫抑制性生物製剤での処置に応答したが、しかし、疾患の症状を再発生した。一部の例では、免疫抑制的な生物製剤はリツキシマブであり得る。一部の例では、免疫抑制的な生物製剤はボルテゾミブであり得る。
以下の実施例が、本開示の実施形態を示すために含まれる。続く実施例において開示されている技術は、本開示の実践において十分に機能するために本発明者により発見された技術を表し、このように、その実践のための好ましい様式を構成すると考えることができることが、当業者により理解されるはずである。しかし、当業者は、本開示に照らして、本開示の精神及び範囲から逸脱することなく、多くの変化を、開示される特定の実施形態において作製して、依然として同様の又は類似の結果を得ることができることを理解するはずである。
実施例1
全身性エリテマトーデス(SLE)におけるオベキセリマブの効果を、第2相二重盲検無作為化プラセボ対照試験において試験した。B細胞表面上での阻害的Fcγ受容体FcγRIIbとの免疫複合体の会合による抗原活性化B細胞の下方制御を図1B中に示す。図1Bは、オベキセリマブの作用の機構、具体的には、オベキセリマブによるB細胞受容体関連膜タンパク質CD19及びFcγRIIbの共ライゲーションの図を示し、B細胞における多くの活性化経路の阻害をもたらす。臨床治験についての事象のタイムラインを図2中に示す。図3及び図4はそれぞれ臨床治験の結果を示す。図3は、225日目の計画来院までの改善の喪失(LOI)までの時間を描写する。図4は、疾患NADIRから試験終了時までのSLEDAIにおける変化を描写する(平均値の差、95% CI、最終来院時1.404 p=0.0456)。
全身性エリテマトーデス(SLE)におけるオベキセリマブの効果を、第2相二重盲検無作為化プラセボ対照試験において試験した。B細胞表面上での阻害的Fcγ受容体FcγRIIbとの免疫複合体の会合による抗原活性化B細胞の下方制御を図1B中に示す。図1Bは、オベキセリマブの作用の機構、具体的には、オベキセリマブによるB細胞受容体関連膜タンパク質CD19及びFcγRIIbの共ライゲーションの図を示し、B細胞における多くの活性化経路の阻害をもたらす。臨床治験についての事象のタイムラインを図2中に示す。図3及び図4はそれぞれ臨床治験の結果を示す。図3は、225日目の計画来院までの改善の喪失(LOI)までの時間を描写する。図4は、疾患NADIRから試験終了時までのSLEDAIにおける変化を描写する(平均値の差、95% CI、最終来院時1.404 p=0.0456)。
オベキセリマブの投与後、個々の遺伝子の発現及び遺伝子経路スコアを、試験を完了した、又は五倍交差検証フレームワークを使用して応答の消失のために早期に終了した68人の患者(「患者」は「対象」と互換的に使用される)について評価した。遺伝子の発現を、ベースライン(即ち、オベキセリマブの投与前)及び処置後の両方について評価した。予測解析が、ベースライン/処置前の発現に基づいている一方で、薬力学的変化は、処置サンプルで使用することであった。潜在的なバイオマーカー予測モデルに対する各遺伝子の関連性を、高又は低発現によって、cDX-患者におけるよりも、オベキセリマブによる再燃のリスクにおけるより大きな低下を伴う患者サブグループ(cDx+)が特定された程度により測定した。
68のRNAseq全血液ベースラインサンプルを予測バイオマーカー検出のために使用した。候補遺伝子を、AMPの第1相ループスscRNAseqデータからの22の免疫モジュールに基づいて事前にスクリーニングした。(Arazi A,et al.The immune cell landscape in kidneys of patients with lupus nephritis[公開された訂正が、Nat Immunol.Nat Immunol.2019;20(7):902-914.において見られる])予測モデルは、(LOI)のイベントまでの時間の評価項目に基づいていた。Cox回帰を使用して、ハザード比(HR)を推定した-任意の所与の時間点での、オベキセリマブ処置対象 vs.プラセボ処置対象の間での改善の喪失の相対的可能性。RNAhigh(cDx+)vs.RNAlow(cDx-)におけるより小さなHRに関連付けられるP値を使用して、候補遺伝子の予測性を順位付けした。五倍交差検証及びサブサンプリングを使用して、予測手順の一般化可能性及びモデルの頑健性を評価した。
オベキセリマブ処置は、活性化B細胞及び形質細胞/形質芽球を反映するB細胞遺伝子及び遺伝子セットの低下と関連付けられた(図13)。図13Aは、経時的なB細胞マーカー遺伝子CD19遺伝子発現を描写する。図13Bは、経時的なB細胞マーカー遺伝子CD20(転写物MS4A1)遺伝子発現を描写する。図13Cは、経時的な活性化B細胞シグネチャースコアを描写する。図13Dは、経時的な血漿/形質芽球シグネチャースコアを描写する。
図13A~13Dは、評価可能なベースライン全血液トランスクリプトーム(RNA-seq)データを有し、再燃なしで試験を完了した、又は試験中に再燃を経験したSLEを伴う対象におけるプラセボ(上曲線)と比較した、オベキセリマブ(下曲線)の薬力学的効果を示す。図13Aは、経時的な標準化されたCD19発現を示す。図13Bは、225日間までの標準化されたCD20発現を示す。図13Cは、225日間までの活性化B細胞シグネチャースコアを示す。RNA発現及びシグネチャースコアは、ベースラインと比べた倍率変化である。シグネチャースコアは、免疫細胞シグネチャー(Arazi,A.et al.Nat.Immunol.2019.20;902-914、その全体において参照により組み入れられる)に基づき、シグネチャー方法(Foroutan M,et al.,BMC Bioinformatics,2018 19; 404、その全体において参照により組み入れられる)により生成される。
データは、全血液RNAseqによって、全B細胞及び活性化B細胞ならびに形質芽球における処置関連の低下が確認されることを示す。
実施例2
図6は、CD27が、オベキセリマブ 活性の強い単一遺伝子予測因子であることを示す。
図6は、CD27が、オベキセリマブ 活性の強い単一遺伝子予測因子であることを示す。
図6は交差検証解析である。解析によって、CD27予測モデルを使用して、オベキセリマブでの大幅に低下した再燃リスクを伴うcDx+群(全患者の50%)が特定された。五倍交差検証フレームワークを開発して、結果の一般化可能性及びcDx+としてどの割合の患者が割り当てるかを確認した。プラセボ群では、cDx+対象はより高い再燃リスクを有したが、このように、cDx+によって、また、オベキセリマブから利益を得る予後不良患者が特定される。
cDx+群は、広範な臨床評価項目にわたって、cDx-患者と比較して、増加したオベキセリマブ効果を示した。さらに、BM-であった対象は、BM-プラセボ対象よりも悪い応答を示した。BM+患者へのオベキセリマブの投与によって、LOIまでの実質的に増加した時間が示された。cDx+群におけるプラセボを上回るオベキセリマブの利益は、CD27について、cDx-群における利益よりも有意に大きかった。cDx-患者におけるプラセボ群の転帰は、CD27について、cDx+群よりも良好であった。
CD27は、従って、オベキセリマブの有効性及び/又はオベキセリマブを投与しないことの強力な単一遺伝子予測因子である。
実施例3
図7A-Cは、他のT細胞遺伝子とのCD27レベルの関連性及びpDCとのAPPレベルの関連を示す。
図7A-Cは、他のT細胞遺伝子とのCD27レベルの関連性及びpDCとのAPPレベルの関連を示す。
図7Aは、CD27が、いくつかのT細胞遺伝子と高度に相関することを示す。図7Bは、バイオマーカーCD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、及びCD28が、LOIまでの時間が、カプランマイヤー予測性解析における統計的有意性と相関するため(P<0.05)、抗体有効性の予測であることを示している。TCF7、CD40LG、FOXP3、及びCD28の各々が、CD27の増加発現と相関しており、それ自体が、オベキセリマブ投与後のSLE対象についてのLOIにおける低下を予測している。
図7Cは、APPが、scRNAseqデータセットに従って、PBMC中でのpDCにおいてその最も高い発現を有することを示す。(Y.Kotliarov,et al.Broad immune activation underlies shared set point signatures for vaccine responsiveness in healthy individuals and disease activity in patients with lupus.Nat Med.2020; 26(4):618-629.)
実施例4
図8は、改善されたオベキセリマブ処置のバイオマーカーとしての複数の追加の遺伝子を描写する。
図8は、改善されたオベキセリマブ処置のバイオマーカーとしての複数の追加の遺伝子を描写する。
図8は、抗体及びプラセボ対象についての処置有効性の予測因子としてのCD27、TCF7、FOXP3、及びCD28発現の交差検証解析を示す。解析では、予測モデルとしてCD27、TCF7、FOXP3、又はCD28から選択される単一のバイオマーカーを使用して、オベキセリマブでの再燃の大幅に低下したリスクを伴うcDx+群(全患者の50%)が特定された。五倍交差検証フレームワークを開発して、結果の一般化可能性及びcDx+としてどの割合の患者が割り当てるかを確認した。プラセボ群では、CDx+対象はより高い再燃リスクを有したが、このように、cDX+によって、また、オベキセリマブから利益を得る予後不良患者が特定される。
cDx+群におけるプラセボを上回るオベキセリマブの利益は、CD27、TCF7、FOXP3、及びCD28の各々について、cDx-群における利益よりも有意に大きかった。さらに、cDx-患者におけるプラセボ群の転帰は、特にCD27について、ならびに、また、TCF7、FOXP3、及びCD28の各々について、cDx+群よりも良好であった。バイオマーカーの非存在は、このように、オベキセリマブを提供しないために使用することができる。
実施例5
盲検化プラセボ対照試験では、48名の健康な男性ボランティアに、オベキセリマブの単回漸増用量が提供された。対象を3:オベキセリマブ:プラセボに無作為化した。オベキセリマブが投与された対象は、七つのコホート中に分けられた。コホート1~7には、それぞれ0.03、0.1、0.2、0.6、0.03~10mg/kgのオベキセリマブがIV注入により提供された。
盲検化プラセボ対照試験では、48名の健康な男性ボランティアに、オベキセリマブの単回漸増用量が提供された。対象を3:オベキセリマブ:プラセボに無作為化した。オベキセリマブが投与された対象は、七つのコホート中に分けられた。コホート1~7には、それぞれ0.03、0.1、0.2、0.6、0.03~10mg/kgのオベキセリマブがIV注入により提供された。
図9Aは、プラセボと比較して、ベースラインCD86発現のパーセントにおける実質的な初期の低下を、オベキセリマブ投与後の時間の関数として描写する。100日間の時間経過にわたり、CD86発現は100日目までにプラセボレベルに戻った。CD86上方調節の可逆的な抑制及び抗体応答の強力な抑制が観察された。
図9Bの抗破傷風IgG(u/ml)は、21日目の別々のコホートの各々についての抗破傷風応答の阻害を示す。0.1mg/kgを超える用量が、抗破傷風IgGにおける統計的に有意な低下を示す各コホートであって、0.1mg/kg~5.0mg/kgの間で最も用量依存的な有意性を伴う。
実施例6
図10A-10Cは、バイオマーカーAPP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aの増加発現を伴うSLE対象が、別々に、各々が、オベキセリマブでの投与の場合、統計的に有意なLOIまでの増加時間を有することを示す。
図10A-10Cは、バイオマーカーAPP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aの増加発現を伴うSLE対象が、別々に、各々が、オベキセリマブでの投与の場合、統計的に有意なLOIまでの増加時間を有することを示す。
図10は、それぞれAPP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aのベースライン発現レベルの交差検証解析を示す。解析によって、予測モデルにおいて単一のAPP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aバイオマーカーを使用して、オベキセリマブでの再燃の大幅に低下したリスクを伴うcDx+群(全患者の50%)が特定された。五倍交差検証フレームワークを開発して、結果の一般化可能性及びcDx+としてどの割合の患者が割り当てるかを確認した。プラセボ群では、CDx+対象はより高い再燃リスクを有したが、このように、cDX+によって、また、オベキセリマブから利益を得る予後不良患者が特定される。
cDx+群は、広範な臨床評価項目にわたって、APP、IL-3RA(CD123)、又はMAP1Aの各々について、cDx-患者と比較して、増加したオベキセリマブの有効性を示した。
cDx+群におけるプラセボを上回るオベキセリマブの利益は、単一のバイオマーカーAPP、IL3RA、及びMAP1Aの各々について、cDx-群における利益よりも有意に大きかった。加えて、cDx-患者におけるプラセボ群の転帰は、特にAPPについて、また、IL3RA及びMAP1Aの各々について、cDx+を上回る改善を示した。バイオマーカーの非存在は、このように、オベキセリマブを提供しないように、診断において使用することができる。
実施例7
図11A~11Dは、応答率が、二つのバイオマーカーCD27及びAPP予測モデルで陽性の患者について、32週時点でのcDX+(50%)患者の四つの目印の評価項目において有意に強化されることを示す。さらに、BM-対象はプラセボよりも悪い転帰を有した。目印の評価項目は、(A)SRI-4、(B)SRI-6、(C)LLDAS、及び(D)BICLAについてであった。
図11A~11Dは、応答率が、二つのバイオマーカーCD27及びAPP予測モデルで陽性の患者について、32週時点でのcDX+(50%)患者の四つの目印の評価項目において有意に強化されることを示す。さらに、BM-対象はプラセボよりも悪い転帰を有した。目印の評価項目は、(A)SRI-4、(B)SRI-6、(C)LLDAS、及び(D)BICLAについてであった。
実施例8
組み合わされたCD27とAPP RNAのレベルは、有効性の強い予測であった。交差検証解析によって、2つの予測バイオマーカー遺伝子CD27及びAPPのベースライン発現レベルにより、オベキセリマブでの大幅に低下した再燃のリスクを伴うcDx+群(全患者の50%)が特定されることが決定された(交差検証されたHR=0.262、全データセットHR=0.166)(図12)。五倍交差検証フレームワークが、結果の一般化可能性を確実にし、必要な遺伝子数及びcDx+として割り当てる患者の割合を決定するために開発された。分類は、訓練サンプルの平均値及び標準偏差により標準化された遺伝子発現レベルの合計についての単純な閾値に基づいている。逆に、プラセボ群では、CDx+対象はより高い再燃リスクを有したが、このように、cDX+によって、また、オベキセリマブから利益を得る予後不良患者が特定される。cDx+群は、広範な臨床評価項目にわたり、cDx-患者と比較して、増加したオベキセリマブ効果を示した(SRI-4:56% cDx+ vs.14% cDx-、SRI-6:33% vs.6.2%、LLDAS:50% vs.6.2%、BICLA:33% vs.12.5%)。
組み合わされたCD27とAPP RNAのレベルは、有効性の強い予測であった。交差検証解析によって、2つの予測バイオマーカー遺伝子CD27及びAPPのベースライン発現レベルにより、オベキセリマブでの大幅に低下した再燃のリスクを伴うcDx+群(全患者の50%)が特定されることが決定された(交差検証されたHR=0.262、全データセットHR=0.166)(図12)。五倍交差検証フレームワークが、結果の一般化可能性を確実にし、必要な遺伝子数及びcDx+として割り当てる患者の割合を決定するために開発された。分類は、訓練サンプルの平均値及び標準偏差により標準化された遺伝子発現レベルの合計についての単純な閾値に基づいている。逆に、プラセボ群では、CDx+対象はより高い再燃リスクを有したが、このように、cDX+によって、また、オベキセリマブから利益を得る予後不良患者が特定される。cDx+群は、広範な臨床評価項目にわたり、cDx-患者と比較して、増加したオベキセリマブ効果を示した(SRI-4:56% cDx+ vs.14% cDx-、SRI-6:33% vs.6.2%、LLDAS:50% vs.6.2%、BICLA:33% vs.12.5%)。
図12Aは、CD27及びAPPの二つのバイオマーカー分類の標準化された発現レベルを示す。対象はcDX+又はcDx-として分類され、推定50%の患者が各群に割り当てられる。cDx+群におけるプラセボ(下の実線の曲線)を上回るオベキセリマブ(上の実線の曲線)からの利益は、cDx-群(青及び黒の破線の曲線)における利益よりも有意に大きかった(p=0.00149、HR cDx+=0.166 対 HR cDx-=1.5)。図12Aはさらに、組み合わされたCD27及びAPPバイオマーカーについての、cDx-である対象についての陰性結果の臨床結果を示す。
cDx+群におけるプラセボを上回るオベキセリマブの利益は、CD27及びAPPを組み合わせたバイオマーカーにおけるcDx-群での利益よりも有意に大きかった。プラセボ群では、cDx+対象はより高い再燃リスクを有した。cDX+によって、オベキセリマブから利益を得る予後不良患者を特定することができる。加えて、cDx-患者におけるプラセボ群の転帰は、cDx+群よりも良好であった。一部のバリエーションでは、cDx-CD27+APPバイオマーカーは、オベキセリマブを提供しない予測因子として使用することができる。
図12B~12Dは、データセットの80%のサブサンプリングに基づく相互作用p値の分布により示されるように、(B)CD27単一バイオマーカー(C)APP単一バイオマーカー、及び(D)CD27+APP2バイオマーカー予測モデルの頑健性を示す(1000倍)。
CD27は、上位の予測バイオマーカーであり、Tナイーブ及びメモリー細胞により高度に発現される。CD27発現がT細胞系統内で重要であるという考え方と一致して、他のT細胞遺伝子の増加発現がまた、CD28(p=0.04)、TCF7(p=0.03)、及びFOXP3(p=0.05)を含む、低下した再燃リスクに関連付けられた。処置時に見られるB細胞シグネチャーの低下と一緒に、潜在的なT細胞関連予測バイオマーカーとしてのCD27のこの新たな特定は、B細胞及びT細胞の相互作用の抑制におけるオベキセリマブの重要な治療的役割を示唆する。
RNA配列決定により全血液トランスクリプトームデータから開発された二つのバイオマーカーによって、高いベースライン静止及び幹様T細胞(CD27+、CD28+、及びTCF7+)シグネチャーを伴う患者のバイオマーカー陽性群が特定される。これらのcDx+患者は、複数の臨床評価項目にわたってプラセボと比較して優れた応答率を有し、適応免疫応答、例えばB細胞抗原提示及び/又はT細胞共刺激などが、オベキセリマブ効果の成分であり得ることを示唆する。
五倍交差検証フレームワークが、2遺伝子バイオマーカー(全血液からのCD27及びAPP)の結果の一般化可能性を確実にするために開発された。クラスタリング解析によって、バイオマーカー陽性及び陰性クラスについておよそ均等な分割が示唆された:最終的な分類子では、標準化されたCD27及びAPP発現の合計の50%分割の中央値を使用して、患者をcDx+又はcDx-として割り当てた。
一つの非限定的な例では、組み合わせスコアを使用して、抗体を投与するか否かを決定することができる。以下の等式は、二つのバイオマーカースコアリングモデルを描写する。測定された組み合わせが0.14以上であった場合、次に抗体を投与すべきである。
図14A及び14Bは、40%バイオマーカー陽性群(図14A)及び60%バイオマーカー陽性群(図14B)の予測可能性を示す。具体的には、図14A及び14Bは、40%バイオマーカー陽性群及び60%バイオマーカー陽性群が、両方とも予測可能性を示すことを立証する。
RNA配列発現の範囲を、以下の表2及び3中に要約する。具体的には、表2及び表3は、スクリーニング、1日目(D1)、127日目(D127)、211日目(D211)、及び225日目(D225)を含む、RNAseqサンプルが入手可能な時点でのバイオマーカーコホートについてのCD27及びAPP遺伝子発現を要約する。CDCD27又はAPPのいずれかにおける経時的な明らかな傾向は観察されなかった。
実施例9
図15A-Qは、改善されたオベキセリマブ処置のバイオマーカーとして、複数の追加の遺伝子を描写する。具体的には、図15A-Qは、抗体対象及びプラセボ対象についての治療効果の予測因子としてA)TRABD2A、B)ST6GAL1、C)ATAD5、D)ATP13A2、E)SLC17A9、F)TBC1D4、G)MAL、H)ACY3、I)DNPH1、J)CNDP2、K)CLCN5、L)CALR、M)ST3GAL5、N)USP21、O)CD40LG、P)FOXP3、及びQ)TCF7発現の交差検証解析を示す。解析によって、予測モデルとして単一のバイオマーカーA)TRABD2A、B)ST6GAL1、C)ATAD5、D)ATP13A2、E)SLC17A9、F)TBC1D4、G)MAL、H)ACY3、I)DNPH1、J)CNDP2、K)CLCN5、L)CALR、M)ST3GAL5、N)USP21、O)CD40LG、P)FOXP3、及びQ)TCF7を使用して、オベキセリマブでの大幅に低下した再燃のリスクを伴うcDx+群(全患者の50%)が特定された。
図15A-Qは、改善されたオベキセリマブ処置のバイオマーカーとして、複数の追加の遺伝子を描写する。具体的には、図15A-Qは、抗体対象及びプラセボ対象についての治療効果の予測因子としてA)TRABD2A、B)ST6GAL1、C)ATAD5、D)ATP13A2、E)SLC17A9、F)TBC1D4、G)MAL、H)ACY3、I)DNPH1、J)CNDP2、K)CLCN5、L)CALR、M)ST3GAL5、N)USP21、O)CD40LG、P)FOXP3、及びQ)TCF7発現の交差検証解析を示す。解析によって、予測モデルとして単一のバイオマーカーA)TRABD2A、B)ST6GAL1、C)ATAD5、D)ATP13A2、E)SLC17A9、F)TBC1D4、G)MAL、H)ACY3、I)DNPH1、J)CNDP2、K)CLCN5、L)CALR、M)ST3GAL5、N)USP21、O)CD40LG、P)FOXP3、及びQ)TCF7を使用して、オベキセリマブでの大幅に低下した再燃のリスクを伴うcDx+群(全患者の50%)が特定された。
cDx+群におけるプラセボを上回るオベキセリマブの利益は、A)TRABD2A、B)ST6GAL1、C)ATAD5、D)ATP13A2、E)SLC17A9、F)TBC1D4、G)MAL、H)ACY3、I)DNPH1、J)CNDP2、K)CLCN5、L)CALR、M)ST3GAL5、N)USP21、O)CD40LG、P)FOXP3、及びQ)TCF7の各々について、cDx-群における利益よりも有意に大きかった。さらに、cDx-患者におけるプラセボ群の転帰は、cDx+群よりも良好であった。バイオマーカーの非存在は、このように、オベキセリマブを提供しないために使用することができる。
実施例10
図16A~Cは、オベキセリマブ活性についての適切な予測因子である、追加の2遺伝子、4遺伝子、及び5遺伝子のバイオマーカーの組み合わせを示す。具体的には、図16A-Cは、CD27及びTCF-7との組み合わせにおいて使用され得るTim/ナイーブ/幹細胞遺伝子シグネチャーを、オベキセリマブ活性についての予測因子として示す。これらの遺伝子の組み合わせは、以下である:CD27、TCF7、CCR7、及びIL7R(CD127)の4遺伝子シグネチャー(図16A);CD27及びTCF7の2遺伝子シグネチャー(図16B)、ならびにCD27、TCF7、CCR7、IL7R、及びCD28の5遺伝子シグネチャー(図16C)。
図16A~Cは、オベキセリマブ活性についての適切な予測因子である、追加の2遺伝子、4遺伝子、及び5遺伝子のバイオマーカーの組み合わせを示す。具体的には、図16A-Cは、CD27及びTCF-7との組み合わせにおいて使用され得るTim/ナイーブ/幹細胞遺伝子シグネチャーを、オベキセリマブ活性についての予測因子として示す。これらの遺伝子の組み合わせは、以下である:CD27、TCF7、CCR7、及びIL7R(CD127)の4遺伝子シグネチャー(図16A);CD27及びTCF7の2遺伝子シグネチャー(図16B)、ならびにCD27、TCF7、CCR7、IL7R、及びCD28の5遺伝子シグネチャー(図16C)。
全ての引用されている参考文献が、それらの全体において、参照により本明細書中に明示的に組み入れられる。任意の刊行物の引用は、出願日前のその開示についてであり、本発明が、先行発明により、そのような刊行物に先行する資格を有しないことの承認として解釈されるべきではない。さらに、提供される公開の日付は、実際の公開日とは異なり得るが、それは、独立して確認される必要があり得る。
番号付けされた実施形態
ここで提供されるのは、開示される技術の番号付けされた実施形態である。これらの実施形態は、例証的だけであり、本開示の又は添付の特許請求の範囲を限定しない。
ここで提供されるのは、開示される技術の番号付けされた実施形態である。これらの実施形態は、例証的だけであり、本開示の又は添付の特許請求の範囲を限定しない。
実施形態1。それを必要とするヒト対象において全身性エリテマトーデス(SLE)を治療する又はその症状を低下させる方法であって、以下を含む:ヒト対象の血液サンプル中のCD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aから選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現レベルを決定すること;一つ又は複数のバイオマーカーの発現が増加した場合、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗IgG1抗体を投与すること、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
実施形態2。それを必要とするヒト対象において全身性エリテマトーデス(SLE)を治療する方法であって、以下を含む:CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aから選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現を決定することにより、そのような治療を必要とするSLEを伴うヒト対象を選択すること;親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗IgG1抗体を投与すること、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
実施形態3。その中でヒト対象において全身性エリテマトーデス(SLE)を治療するための方法であって、それにおいて、当該方法は以下を含む:CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aから選択される一つ又は複数のバイオマーカーの上昇レベルを発現する血液組織を有するとして当該対象を特定すること;ならびに親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗IgG1抗体を投与すること、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
実施形態4。一つ又は複数のバイオマーカーが、CD27、APP、及びそれらの組み合わせから選択される、実施形態1~3のいずれか一つの方法。
実施形態5。バイオマーカーがCD27である、実施形態1~4のいずれか一つの方法。
実施形態6。バイオマーカーがAPPである、実施形態1~4のいずれか一つの方法。
実施形態7。バイオマーカーがCD27及びAPPの組み合わせである、実施形態1~4のいずれか一つの方法。
実施形態8。決定又は特定工程が、対象の血液サンプルに遺伝子型判定テストを施すことを含む、実施形態1~7のいずれか一つの方法。
実施形態9。決定又は特定工程が、対象の血液サンプルにプロテオミクステストを施すことを含む、実施形態1~8のいずれか一つの方法。
実施形態10。一つ又は複数のバイオマーカーの発現が増加しない場合、次に抗体は対象から控えられる、実施形態1~9のいずれか一つの方法。
実施形態11。血液サンプルが全血液である、実施形態1~10のいずれか一つの方法。
実施形態12。血液サンプルが、T細胞、形質芽球、及びそれらの組み合わせから選択される、実施形態1~11のいずれか一つの方法。
実施形態13.血液サンプルが形質細胞様樹状細胞を含む、実施形態1~12のいずれか一つの方法。
実施形態14.実施形態1~13のいずれか一つの方法であって、それにおいて、抗体は、配列番号10を含むCDR1、配列番号11を含むCDR2、及び配列番号12を含むCDR3を有する可変領域を含む軽鎖;配列番号13を含むCDR1、配列番号14を含むCDR2、及び配列番号15を含むCDR3を有する可変領域を含む重鎖を含み、配列番号4と比較して;Fc改変は、配列番号4と比較したものであり、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
実施形態15.実施形態1~14のいずれか一つ方法であって、それにおいて、抗体は、軽鎖;及び配列番号2のアミノ酸配列、ならびに配列番号4と比較して、Fc領域中にアミノ酸置換S267E及びL328Fを含む重鎖を含み、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
実施形態16.抗体が、配列番号7のアミノ酸配列を含む軽鎖;及び配列番号9のアミノ酸配列を含む重鎖を含む、実施形態1~15のいずれか一つの方法。
実施形態17。当該対象内の疾患の重症度が低下し、及び/又は改善の消失(LOI)までの日数が増加する、実施形態1~16のいずれか一つの方法。
実施形態18。ヒト抗IgG1抗体が皮下投与される、実施形態1~17のいずれか一つの方法。
実施形態19。対象から血液サンプルを得ることをさらに含む、実施形態1~18のいずれか一つの方法。
実施形態20。それを必要とするヒト対象において自己免疫疾患を治療する又はその症状を低下させる方法であって、以下を含む:ヒト対象の血液サンプル中のCD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aから選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現レベルを決定すること;一つ又は複数のバイオマーカーの発現が増加している場合、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗IgG1抗体を投与すること、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
実施形態21。それを必要とするヒト対象において自己免疫疾患を治療する方法であって、以下を含む:CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aから選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現を決定することにより、そのような治療を必要とするSLEを伴うヒト対象を選択すること;親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗IgG1抗体を投与すること、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
実施形態22。その中でヒト対象における自己免疫疾患を治療する方法であって、それにおいて、当該方法は以下を含む:CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aから選択される一つ又は複数のバイオマーカーの上昇レベルを発現する血液組織を有するとして当該対象を特定すること;ならびに親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗IgG1抗体を投与すること、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
実施形態23。自己免疫疾患がSLE及び関節リウマチから選択される、実施形態20~22のいずれか一つの方法。
実施形態24。全身性エリテマトーデス(SLE)の治療についての治療有効性を改善する方法であって、以下を含む:SLEを有する対象において、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aから選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現を決定すること;それにおいて、一つ又は複数のバイオマーカーの発現の増加は、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗IgG1抗体の有効性を示し、それにおいて、ナンバリングは、対象において、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
実施形態25。それを必要とするヒト対象において全身性エリテマトーデス(SLE)についての治療に対する感受性を決定する方法であって、以下を含む:対象において、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aから選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現を決定すること;それにおいて、一つ又は複数のバイオマーカーの発現の増加は、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗IgG1抗体の有効性を示し、それにおいて、ナンバリングは、対象において、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
実施形態26。対象におけるCD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aから選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現の増加が、ヒト抗IgG1抗体が対象において有効であることを示す、実施形態24又は25のいずれか一つの方法。
実施形態27。一つ又は複数のバイオマーカーが、CD27、APP、及びそれらの組み合わせから選択される、実施形態20~26のいずれか一つに記載の方法。
実施形態28。バイオマーカーがCD27である、実施形態20~27のいずれか一つに記載の方法。
実施形態29。バイオマーカーがAPPである、実施形態20~27のいずれか一つに記載の方法。
実施形態30。バイオマーカーがCD27及びAPPの組み合わせである、実施形態20~27のいずれか一つに記載の方法。
実施形態31。決定又は特定工程が、対象の血液サンプルに遺伝子型判定テストを施すことを含む、実施形態20~30のいずれか一つの方法。
実施形態32。決定又は特定工程が、対象の血液サンプルにプロテオミクステストを施すことを含む、実施形態20~30のいずれか一つの方法。
実施形態33。一つ又は複数のバイオマーカーの発現が増加しない場合、次に抗体は対象から控えられる、実施形態20~32のいずれか一つの方法。
実施形態34。血液サンプルが全血液である、実施形態20~33のいずれか一つに記載の方法。
実施形態35。血液サンプルが、T細胞、形質芽球、及びそれらの組み合わせから選択される、実施形態20~33のいずれか一つの方法。
実施形態36。血液サンプルが形質細胞様樹状細胞を含む、実施形態20~33のいずれか一つに記載の方法。
下に提供されるのは、開示される技術のさらなる番号付けされた実施形態である。
さらなる実施形態1。それを必要とするヒト対象において自己免疫疾患を治療する又はその症状を低下させる方法であって、以下を含む:ヒト対象の血液サンプル中でのCD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現レベルを決定すること ;ならびに一つ又は複数のバイオマーカーの発現が増加する場合、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗CD19抗体を投与すること、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
さらなる実施形態2。自己免疫疾患を治療する又はその症状を低下させる方法であって、以下を含む:CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現を決定することにより、そのような治療を必要とする自己免疫疾患を伴うヒト対象を選択すること;ならびに親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗CD19抗体を投与すること、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
さらなる実施形態3。自己免疫疾患を治療する又はその症状を低下させる方法であって、それにおいて、当該方法は以下を含む:CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現レベルを有するとして当該対象を特定すること;ならびに、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗CD19抗体を投与すること、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
さらなる実施形態4。自己免疫疾患を治療する又はその症状を低下させるために、一人又は複数のヒト対象を選択する方法であって、以下を含む:一人又は複数の対象において、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現を決定すること;ならびに、増加発現を有する対象に、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗CD19抗体を投与すること、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
さらなる実施形態5。それを必要とするヒト対象においてSLEを治療する又はその症状を低下させる方法であって、以下を含む:ヒト対象の血液サンプル中でのCD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現レベルを決定すること;一つ又は複数のバイオマーカーの発現が増加している場合、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗CD19抗体を投与すること、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
さらなる実施形態6。それを必要とするヒト対象においてSLEを治療する方法であって、以下を含む:CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現を決定することにより、そのような治療を必要とするSLEを伴うヒト対象を選択すること;親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗CD19抗体を投与すること、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
さらなる実施形態7。その中のヒト対象においてSLEを治療するための方法であって、それにおいて、当該方法は以下を含む:CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現レベルを有するとして当該対象を特定すること;ならびに、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗CD19抗体を投与すること、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
さらなる実施形態8。SLEを治療するために一人又は複数のヒト対象を選択する方法であって、以下を含む:一人又は複数の対象において、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現を決定すること;ならびに、増加発現を有する対象に、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗CD19抗体を投与すること、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
あるいは、さらなる実施形態1~8におけるバイオマーカーは、以下であり得る:(a)CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、USP21、及びIL7R(CD127)から選択される一つ又は複数のバイオマーカー;(b)CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、及びCD28 から選択される一つ又は複数のバイオマーカー、ならびに/あるいはAPP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aから選択される1 つ又は複数のバイオマーカー;(c)CD27及びTCF;(d)CD27、TCF7、CCR7、及びIL7R;(e)CD27、TCF7、CCR7、IL7R、及びCD28;(f)CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28;ならびに(g)APP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1A。
さらなる実施形態9。一つ又は複数のバイオマーカーが、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1Aから選択される、さらなる実施形態1~8のいずれか一つの方法。
さらなる実施形態10。一つ又は複数のバイオマーカーが、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28から選択される、さらなる実施形態1~8のいずれか一つの方法。
さらなる実施形態11。一つ又は複数のバイオマーカーが、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される、さらなる実施形態1~8のいずれか一つの方法。
さらなる実施形態12。一つ又は複数のバイオマーカーがCD27及びAPPから選択される、さらなる実施形態1~8のいずれか一つの方法。
さらなる実施形態13。バイオマーカーがCD27である、さらなる実施形態1~8のいずれか一つの方法。
さらなる実施形態14。バイオマーカーがAPPである、さらなる実施形態1~8のいずれか一つの方法。
さらなる実施形態15。バイオマーカーがCD27及びAPPの組み合わせである、さらなる実施形態1~8のいずれか一つの方法。
さらなる実施形態16。決定又は特定工程が、対象の血液サンプルに遺伝子型判定テストを施すことを含む、さらなる実施形態1~15のいずれか一つの方法。
さらなる実施形態17。決定又は特定工程が、対象の血液サンプルにプロテオミクステストを施すことを含む、さらなる実施形態1~16のいずれか一つの方法。
さらなる実施形態18。一つ又は複数のバイオマーカーの発現が増加しない場合、次に抗体は対象から控えられる、さらなる実施形態1~17のいずれか一つの方法。
さらなる実施形態19。血液サンプルが全血液である、さらなる実施形態1~18のいずれか一つの方法。
さらなる実施形態20。血液サンプルが、T細胞、形質芽球、及びそれらの組み合わせから選択される、さらなる実施形態1~19のいずれか一つの方法。
さらなる実施形態21。血液サンプルが形質細胞様樹状細胞を含む、さらなる実施形態1~20のいずれか一つの方法。
さらなる実施形態22。さらなる実施形態1~21のいずれか一つの方法であって、それにおいて、抗体は、配列番号10を含むCDR1、配列番号11を含むCDR2、及び配列番号12を含むCDR3を有する可変領域を含む軽鎖を含み;配列番号13を含むCDR1、配列番号14を含むCDR2、及び配列番号15を含むCDR3を有する可変領域を含む重鎖を含み、ならびに、配列番号4と比較して;Fc改変は、配列番号4と比較したものであり、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
さらなる実施形態23。さらなる実施形態1~22のいずれか一つの方法であって、それにおいて、抗体は、軽鎖;及び配列番号2のアミノ酸配列、ならびに配列番号4と比較してFc領域中にアミノ酸置換S267E及びL328Fを含む重鎖を含み、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
さらなる実施形態24。抗体が、配列番号7のアミノ酸配列を含む軽鎖;及び配列番号9のアミノ酸配列を含む重鎖を含む、さらなる実施形態1~23のいずれか一つに記載の方法。
さらなる実施形態25。当該対象内の疾患の重症度が低下し、及び/又は改善の消失(LOI)までの日数が増加する、さらなる実施形態1~24のいずれか一つの方法。
さらなる実施形態26。ヒト抗CD19抗体が皮下投与される、さらなる実施形態1~25のいずれか一つの方法。
さらなる実施形態27。対象から血液サンプルを得ることをさらに含む、さらなる実施形態1~26のいずれか一つの方法。
さらなる実施形態28。自己免疫疾患がSLE及び関節リウマチから選択される、さらなる実施形態1~4又は9~27の一つの方法。
さらなる実施形態29 自己免疫疾患の治療についての治療有効性を改善する方法であって、以下を含む:自己免疫疾患を有する対象において、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現を決定すること;それにおいて、一つ又は複数のバイオマーカーの発現の増加は、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗CD19抗体の有効性を示し、それにおいて、ナンバリングは、対象において、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
さらなる実施形態30。それを必要とするヒト対象において自己免疫疾患のための治療に対する感受性を決定する方法であって、以下を含む:対象において、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現を決定すること;それにおいて、一つ又は複数のバイオマーカーの発現の増加は、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗CD19抗体の有効性を示し、それにおいて、ナンバリングは、対象において、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
さらなる実施形態31 自己免疫疾患の治療に対して増加した応答性を伴う一人又は複数のヒト対象を選択する方法であって、以下を含む:一人又は複数の対象において、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現を決定すること;それにおいて、一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現は、対象における応答性における増加に対応する。
さらなる実施形態32。SLEの治療についての治療有効性を改善させる方法であって、以下を含む:SLEを有する対象において、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現を決定すること;それにおいて、一つ又は複数のバイオマーカーの発現の増加は、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗CD19抗体の有効性を示し、それにおいて、ナンバリングは、対象において、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
さらなる実施形態33。それを必要とするヒト対象においてSLEのための治療に対する感受性を決定する方法であって、以下を含む:対象において、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現を決定すること;それにおいて、一つ又は複数のバイオマーカーの発現の増加は、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗CD19抗体の有効性を示し、それにおいて、ナンバリングは、対象において、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
さらなる実施形態34。SLE治療に対して増加した応答性を伴う一人又は複数のヒト対象を選択する方法であって、以下を含む:一人又は複数の対象において、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現を決定すること;それにおいて、集団、それにおいて、一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現は、対象における応答性における増加に対応する。
あるいは、さらなる実施形態29~34におけるバイオマーカーは、以下であり得る:(a)CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、USP21、及びIL7R(CD127)から選択される一つ又は複数のバイオマーカー;(b)CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、及びCD28から選択される一つ又は複数のバイオマーカー、ならびに/あるいはAPP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aから選択される一つ又は複数のバイオマーカー;(c)CD27及びTCF;(d)CD27、TCF7、CCR7、及びIL7R;(e)CD27、TCF7、CCR7、IL7R、及びCD28;(f)CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28;ならびに(g)APP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1A。
さらなる実施形態35。対象におけるCD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aから選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現の増加が、ヒト抗CD19抗体が対象において有効であることを示す、さらなる実施形態29~34のいずれか一つの方法。
さらなる実施形態36。一つ又は複数のバイオマーカーが、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28から選択される、さらなる実施形態29~34のいずれか一つの方法。
さらなる実施形態37。一つ又は複数のバイオマーカーが、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される、さらなる実施形態29~34のいずれか一つの方法。
さらなる実施形態38。一つ又は複数のバイオマーカーがCD27及びAPPから選択される、さらなる実施形態29~34のいずれか一つの方法。
さらなる実施形態39。バイオマーカーがCD27である、さらなる実施形態29~34のいずれか一つの方法。
さらなる実施形態40。バイオマーカーがAPPである、さらなる実施形態29~34のいずれか一つの方法。
さらなる実施形態41。バイオマーカーがCD27及びAPPの組み合わせである、さらなる実施形態29~34のいずれか一つの方法。
さらなる実施形態42。決定又は特定工程が、対象の血液サンプルに遺伝子型判定テストを施すことを含む、さらなる実施形態29~41のいずれか一つの方法。
さらなる実施形態43。決定又は特定工程が、対象の血液サンプルにプロテオミクステストを施すことを含む、さらなる実施形態29~41のいずれか一つの方法。
さらなる実施形態44。一つ又は複数のバイオマーカーの発現が増加しない場合、次に抗体は対象から控えられる、さらなる実施形態29~43のいずれか一つの方法。
さらなる実施形態45。血液サンプルが全血液である、さらなる実施形態29~44のいずれか一つの方法。
さらなる実施形態46。血液サンプルが、T細胞、形質芽球、及びそれらの組み合わせから選択される、さらなる実施形態29~44のいずれか一つの方法。
さらなる実施形態47。血液サンプルが形質細胞様樹状細胞を含む、さらなる実施形態29~44のいずれか一つに記載の方法。
さらなる実施形態48。自己免疫疾患の治療についての治療有効性を改善するインビトロ方法であって、以下を含む:自己免疫疾患を有する対象からのサンプル中で、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現を決定すること、それにおいて、一つ又は複数のバイオマーカーの発現の増加は、対象におけるヒト抗CD19抗体の有効性を示す。
さらなる実施形態49。それを必要とするヒト対象において自己免疫疾患のための治療に対する感受性を決定するインビトロ方法であって、以下を含む:対象からのサンプル中で、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現を決定すること、それにおいて、対象はヒト抗CD19抗体で治療されており、それにおいて、一つ又は複数のバイオマーカーの発現の増加は、対象におけるヒト抗CD19抗体の有効性を示す。
さらなる実施形態50。自己免疫疾患の治療に対して増加した応答性を伴う一人又は複数のヒト対象を特定するインビトロ方法であって、以下を含む:ヒト抗CD19抗体で治療された一人又は複数の対象からのサンプル中で、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現を決定すること、それにおいて、一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現は、対象における応答性における増加に対応する。
さらなる実施形態51。さらなる実施形態48~50のいずれか一つのインビトロ方法であって、以下を含む:抗体での治療前の対象からのサンプル中で、又は自己免疫疾患を有する対象からのサンプル中で、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現を決定すること;及び、一つ又は複数のバイオマーカーの発現を比較して、増加発現を決定すること。
さらなる実施形態52。それを必要とするヒト対象においてSLEのための治療に対する感受性を決定するインビトロ方法であって、以下を含む:ヒト抗CD19抗体で治療されたSLE患者からのサンプル中で、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現を決定すること;それにおいて、一つ又は複数のバイオマーカーの発現の増加は、対象におけるヒト抗CD19抗体の有効性を示す。
さらなる実施形態53。SLE治療に対して増加した応答性を伴う一人又は複数のヒト対象を特定するインビトロ方法であって、以下を含む:ヒト抗CD19抗体で治療された一人又は複数のSLE対象において、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現を決定すること;それにおいて、集団、それにおいて、一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現は、対象における応答性における増加に対応する。
さらなる実施形態54。さらなる実施形態52又は53のインビトロ方法であって、以下を含む:抗体での治療前の対象からのサンプル中で、又はSLEを有する対象からのサンプル中で、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現を決定すること;ならびに、一つ又は複数のバイオマーカーの発現を比較して、増加発現を決定すること。
あるいは、さらなる実施形態48~54におけるバイオマーカーは、以下であり得る:(a)CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、USP21、及びIL7R(CD127)から選択される一つ又は複数のバイオマーカー;(b)CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、及びCD28から選択される一つ又は複数のバイオマーカー、ならびに/あるいはAPP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aから選択される一つ又は複数のバイオマーカー;(c)CD27及びTCF;(d)CD27、TCF7、CCR7、及びIL7R;(e)CD27、TCF7、CCR7、IL7R、及びCD28;(f)CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28;ならびに(g)APP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1A。
さらなる実施形態55。さらなる実施形態48~54のいずれか一つのインビトロ方法であって、それにおいて、抗CD19抗体は、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含み、それにおいて、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う。
さらなる実施形態56。対象においてCD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aから選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現の増加が、ヒト抗CD19抗体が対象において有効であることを示す、さらなる実施形態48~55のいずれか一つのインビトロ方法。
さらなる実施形態57。一つ又は複数のバイオマーカーが、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28から選択される、さらなる実施形態48~55のいずれか一つのインビトロ方法。
さらなる実施形態58。一つ又は複数のバイオマーカーが、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される、さらなる実施形態48~55のいずれか一つのインビトロ方法。
さらなる実施形態59。一つ又は複数のバイオマーカーがCD27及びAPPから選択される、さらなる実施形態48~55のいずれか一つのインビトロ方法。
さらなる実施形態60。バイオマーカーがCD27である、さらなる実施形態48~55のいずれか一つのインビトロ方法。
さらなる実施形態61。バイオマーカーがAPPである、さらなる実施形態48~55のいずれか一つのインビトロ方法。
さらなる実施形態62。バイオマーカーがCD27及びAPPの組み合わせである、さらなる実施形態48~55のいずれか一つのインビトロ方法。
さらなる実施形態63。サンプルが血液サンプルである、さらなる実施形態48~62のいずれか一つのインビトロ方法。
さらなる実施形態64。血液が、T細胞、形質芽球、及びそれらの組み合わせを含む、さらなる実施形態63のインビトロ方法。
さらなる実施形態65。血液サンプルが形質細胞様樹状細胞を含む、さらなる実施形態63のインビトロ方法。
さらなる実施形態66。CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現を有するヒト対象において全身性エリテマトーデス(SLE)を治療するための治療有効量の抗CD19抗体の使用であって、抗CD19抗体は、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含み、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う、使用。
さらなる実施形態67。CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現を有するヒト対象において全身性エリテマトーデス(SLE)を治療するための医薬の製造における治療有効量の抗CD19抗体の使用であって、抗CD19抗体は、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含み、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う、使用。
あるいは、さらなる実施形態66又は67におけるバイオマーカーは、以下であり得る:(a)CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、USP21、及びIL7R(CD127)から選択される一つ又は複数のバイオマーカー;(b)CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、及びCD28から選択される一つ又は複数のバイオマーカー、ならびに/あるいはAPP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aから選択される一つ又は複数のバイオマーカー;(c)CD27及びTCF;(d)CD27、TCF7、CCR7、及びIL7R;(e)CD27、TCF7、CCR7、IL7R、及びCD28;(f)CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28;ならびに(g)APP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1A。
さらなる実施形態68。一つ又は複数のバイオマーカーが、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、及びCD28から選択される、さらなる実施形態66又は67の使用。
さらなる実施形態69。一つ又は複数のバイオマーカーが、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される、さらなる実施形態66又は67の使用。
さらなる実施形態70。一つ又は複数のバイオマーカーがCD27及びAPPから選択される、さらなる実施形態66又は67の使用。
さらなる実施形態71。バイオマーカーがCDCD27である、さらなる実施形態66又は67の使用。
さらなる実施形態72。バイオマーカーがAPPである、さらなる実施形態66又は67の使用。
さらなる実施形態73。バイオマーカーがCD27及びAPPの組み合わせである、さらなる実施形態66又は67の使用。
特定の実施形態が、例証の目的のために上に記載されてきたのに対し、多数の詳細のバリエーションが、添付の特許請求の範囲において記載されているように、本発明から逸脱することなく作られ得ることが当業者により理解されるであろう。
Claims (73)
- それを必要とするヒト対象において自己免疫疾患を治療する又はその症状を低下させる方法であって:
前記ヒト対象の血液サンプル中で、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現レベルを決定すること;ならびに
前記一つ又は複数のバイオマーカーの前記発現が増加している場合、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗CD19抗体を投与することを含み、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う、方法。 - 自己免疫疾患を治療する又はその症状を低下させる方法であって:
CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現を決定することにより、そのような治療を必要とする前記自己免疫疾患を伴う前記ヒト対象を選択すること;ならびに
親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗CD19抗体を投与することを含み、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う、方法。 - 自己免疫疾患を治療する又はその症状を低下させる方法であって、前記方法が:
CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現レベルを有するとして前記対象を特定すること;ならびに
親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗CD19抗体を投与することを含み、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う、方法。 - 自己免疫疾患を治療する又はその症状を低下させるために、一人又は複数のヒト対象を選択する方法であって:
前記一人又は複数の対象において、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現を決定すること;ならびに
増加発現を有する前記対象に、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗CD19抗体を投与することを含み、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う、方法。 - それを必要とするヒト対象においてSLEを治療する又はその症状を低下させる方法であって:
前記ヒト対象の血液サンプル中で、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現レベルを決定すること;ならびに
前記一つ又は複数のバイオマーカーの前記発現が増加している場合、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗CD19抗体を投与することを含み、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う、方法。 - それを必要とするヒト対象においてSLEを治療する方法であって:
CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現を決定することにより、そのような治療を必要とするSLEを伴う前記ヒト対象を選択すること;ならびに
親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗CD19抗体を投与することを含み、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う、方法。 - それを必要とするヒト対象においてSLEを治療するための方法であって、前記方法は:
CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現レベルを有するとして前記対象を特定すること;ならびに
親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗CD19抗体を投与することを含み、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う、方法。 - SLEを治療するために、一人又は複数のヒト対象を選択する方法であって:
前記一人又は複数の対象において、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現を決定すること;ならびに
増加発現を有する前記対象に、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗CD19抗体を投与することを含み、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う、方法。 - 前記一つ又は複数のバイオマーカーが、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1Aから選択される、請求項1~8のいずれか一項に記載の方法。
- 前記一つ又は複数のバイオマーカーが、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28から選択される、請求項1~8のいずれか一項に記載の方法。
- 前記一つ又は複数のバイオマーカーが、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される、請求項1~8のいずれか一項に記載の方法。
- 前記一つ又は複数のバイオマーカーが、CD27及びAPPから選択される、請求項1~8のいずれか一項に記載の方法。
- 前記バイオマーカーがCD27である、請求項1~8のいずれか一項に記載の方法。
- 前記バイオマーカーがAPPである、請求項1~8のいずれか一項に記載の方法。
- 前記バイオマーカーが、CD27及びAPPの組み合わせである、請求項1~8のいずれか一項に記載の方法。
- 前記決定又は特定工程が、前記対象の前記血液サンプルに遺伝子型判定テストを施すことを含む、請求項1~15のいずれか一項に記載の方法。
- 前記決定又は特定工程が、前記対象の前記血液サンプルにプロテオミクステストを施すことを含む、請求項1~16のいずれか一項に記載の方法。
- 一つ又は複数のバイオマーカーの前記発現が増加しない場合、次に前記抗体が前記対象から控えられる、請求項1~17のいずれか一項に記載の方法。
- 前記血液サンプルが全血液である、請求項1~18のいずれか一項に記載の方法。
- 前記血液サンプルが、T細胞、形質芽球、及びそれらの組み合わせから選択される、請求項1~19のいずれか一項に記載の方法。
- 前記血液サンプルが、形質細胞様樹状細胞を含む、請求項1~20のいずれか一項に記載の方法。
- 前記抗体が:
配列番号10を含むCDR1、配列番号11を含むCDR2、及び配列番号12を含むCDR3を有する可変領域を含む軽鎖;
配列番号13を含むCDR1、配列番号14を含むCDR2、及び配列番号15を含むCDR3を有する可変領域を含む重鎖を含み、配列番号4と比較して;ならびに
前記Fc改変は、配列番号4と比較したものであり、
ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う、請求項1~21のいずれか一項に記載の方法。 - 前記抗体が、
軽鎖;及び
配列番号2のアミノ酸配列、ならびに配列番号4と比較して、Fc領域中にアミノ酸置換S267E及びL328Fを含む重鎖を含み、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う、請求項1~22のいずれか一項に記載の方法。 - 前記抗体が、
配列番号7のアミノ酸配列を含む軽鎖;及び
配列番号9のアミノ酸配列を含む重鎖を含む、請求項1~23のいずれか一項に記載の方法。 - 前記対象内の前記疾患の重症度が低下し、及び/又は改善の喪失(LOI)までの日数が増加する、請求項1~24のいずれか一項に記載の方法。
- 前記ヒト抗CD19抗体が皮下に投与される、請求項1~25のいずれか一項に記載の方法。
- 前記対象から前記血液サンプルを得ることをさらに含む、請求項1~26のいずれか一項に記載の方法。
- 前記自己免疫疾患がSLE及び関節リウマチから選択される、請求項1~4又は9~27のいずれか一項に記載の方法。
- 自己免疫疾患の治療のための治療有効性を改善する方法であって:
前記自己免疫疾患を有する対象においてCD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現を決定することを含み、
前記一つ又は複数のバイオマーカーの前記発現の増加は、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗CD19抗体の有効性を示し、ナンバリングは、前記対象において、KabatにおけるようにEUインデックスに従う、方法。 - それを必要とするヒト対象において自己免疫疾患のための治療に対する感受性を決定する方法であって:
前記対象において、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現を決定することを含み、
前記一つ又は複数のバイオマーカーの前記発現の増加は、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗CD19抗体の有効性を示し、ナンバリングは、前記対象において、KabatにおけるようにEUインデックスに従う、方法。 - 自己免疫疾患の治療に対して増加した応答性を伴う一人又は複数のヒト対象を選択する方法であって:
前記一人又は複数の対象において、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現を決定することを含み、
前記一つ又は複数のバイオマーカーの前記増加発現が、前記対象における応答性の増加に対応する、方法。 - SLEの治療のための治療有効性を改善する方法であって、
SLEを有する対象において、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現を決定することを含み、
前記一つ又は複数のバイオマーカーの前記発現の増加は、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗CD19抗体の有効性を示し、ナンバリングは、前記対象において、KabatにおけるようにEUインデックスに従う、方法。 - それを必要とするヒト対象においてSLEのための治療に対する感受性を決定する方法であって:
前記対象において、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現を決定することを含み、
前記一つ又は複数のバイオマーカーの前記発現の増加は、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含むヒト抗CD19抗体の有効性を示し、ナンバリングは、前記対象において、KabatにおけるようにEUインデックスに従う、方法。 - SLE治療に対して増加した応答性を伴う一人又は複数のヒト対象を選択する方法であって:
前記一人又は複数の対象において、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現を決定することを含み、それにおいて、集団、それにおいて、前記一つ又は複数のバイオマーカーの前記増加発現は、前記対象における応答性の増加に対応する、方法。 - 前記対象におけるCD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aから選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現の増加が、前記ヒト抗CD19抗体が前記対象において有効であることを示す、請求項29~34のいずれか一項に記載の方法。
- 前記一つ又は複数のバイオマーカーが、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28から選択される、請求項29~34のいずれか一項に記載の方法。
- 前記一つ又は複数のバイオマーカーが、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される、請求項29~34のいずれか一項に記載の方法。
- 前記一つ又は複数のバイオマーカーがCD27及びAPPから選択される、請求項29~34のいずれか一項に記載の方法。
- 前記バイオマーカーがCD27である、請求項29~34のいずれか一項に記載の方法。
- 前記バイオマーカーがAPPである、請求項29~34のいずれか一項に記載の方法。
- 前記バイオマーカーがCD27及びAPPの組み合わせである、請求項29~34のいずれか一項に記載の方法。
- 前記決定又は特定工程が、前記対象の前記血液サンプルに遺伝子型判定テストを施すことを含む、請求項29~41のいずれか一項に記載の方法。
- 前記決定又は特定工程が、前記対象の前記血液サンプルにプロテオミクステストを施すことを含む、請求項29~41のいずれか一項に記載の方法。
- 一つ又は複数のバイオマーカーの前記発現が増加しない場合、次に前記抗体は前記対象から控えられる、請求項29~43のいずれか一項に記載の方法。
- 前記血液サンプルが全血液である、請求項29~44のいずれか一項に記載の方法。
- 前記血液サンプルが、T細胞、形質芽球、及びそれらの組み合わせから選択される、請求項29~44のいずれか一項に記載の方法。
- 前記血液サンプルが形質細胞様樹状細胞を含む、請求項29~44のいずれか一項に記載の方法。
- 自己免疫疾患の治療のための治療有効性を改善するインビトロ方法であって:
前記自己免疫疾患を有する対象からのサンプル中で、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現を決定することを含み、
前記一つ又は複数のバイオマーカーの前記発現の増加が、前記対象におけるヒト抗CD19抗体の有効性を示す、方法。 - それを必要とするヒト対象において自己免疫疾患のための治療に対する感受性を決定するインビトロ方法であって:
前記対象からのサンプル中で、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現を決定することを含み、前記対象はヒト抗CD19抗体で治療されており、
前記一つ又は複数のバイオマーカーの前記発現の増加が、前記対象におけるヒト抗CD19抗体の有効性を示す、方法。 - 自己免疫疾患の治療に対して増加した応答性を伴う一人又は複数のヒト対象を特定するインビトロ方法であって:
ヒト抗CD19抗体で治療された前記一人又は複数の対象からのサンプル中で、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現を決定することを含み、
前記一つ又は複数のバイオマーカーの前記増加発現が、前記対象における応答性の増加に対応する、方法。 - 前記抗体での治療前の前記対象からのサンプル中で、又は前記自己免疫疾患を有する対象からのサンプル中で、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現を決定すること;ならびに
前記一つ又は複数のバイオマーカーの前記発現を比較して、増加発現を決定することを含む、請求項48~50のいずれか一項に記載のインビトロ方法。 - それを必要とするヒト対象においてSLEのための治療に対する感受性を決定するインビトロ方法であって:
ヒト抗CD19抗体で治療された前記SLE患者からのサンプル中で、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現を決定することを含み;
前記一つ又は複数のバイオマーカーの前記発現の増加が、前記対象におけるヒト抗CD19抗体の有効性を示す、方法。 - SLE治療に対して増加した応答性を伴う一人又は複数のヒト対象を特定するインビトロ方法であって:
ヒト抗CD19抗体で治療された前記一人又は複数のSLE対象において、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現を決定することを含み、
それにおいて、集団、それにおいて、前記一つ又は複数のバイオマーカーの前記増加発現は、前記対象における応答性の増加に対応する、方法。 - 前記抗体での治療前の前記対象からのサンプル中で、又はSLEを有する対象からのサンプル中で、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現を決定すること;ならびに
前記一つ又は複数のバイオマーカーの前記発現を比較して、増加発現を決定することを含む、請求項52又は53に記載のインビトロ方法。 - 前記抗CD19抗体が、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含み、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う、請求項48~54のいずれか一項に記載のインビトロ方法。
- 前記対象におけるCD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、及びMAP1Aから選択される一つ又は複数のバイオマーカーの発現の増加が、前記ヒト抗CD19抗体が前記対象において有効であることを示す、請求項48~55のいずれか一項に記載のインビトロ方法。
- 前記一つ又は複数のバイオマーカーが、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28から選択される、請求項48~55のいずれか一項に記載のインビトロ方法。
- 前記一つ又は複数のバイオマーカーが、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される、請求項48~55のいずれか一項に記載のインビトロ方法。
- 前記一つ又は複数のバイオマーカーがCD27及びAPPから選択される、請求項48~55のいずれか一項に記載のインビトロ方法。
- 前記バイオマーカーがCD27である、請求項48~55のいずれか一項に記載のインビトロ方法。
- 前記バイオマーカーがAPPである、請求項48~55のいずれか一項に記載のインビトロ方法。
- 前記バイオマーカーがCD27及びAPPの組み合わせである、請求項48~55のいずれか一項に記載のインビトロ方法。
- 前記サンプルが血液サンプルである、請求項48~62のいずれか一項に記載のインビトロ方法。
- 前記血液が、T細胞、形質芽球、及びそれらの組み合わせを含む、請求項63に記載のインビトロ方法。
- 前記血液サンプルが形質細胞様樹状細胞を含む、請求項63に記載のインビトロ方法。
- CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現を有するヒト対象において全身性エリテマトーデス(SLE)を治療するための治療有効量の抗CD19抗体の使用であって、前記抗CD19抗体は、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含み、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う、使用。
- CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、CD28、APP、IL-3RA(CD123)、MAP1A、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される一つ又は複数のバイオマーカーの増加発現を有するヒト対象において全身性エリテマトーデス(SLE)を治療するための医薬の製造における治療有効量の抗CD19抗体の使用であって、前記抗CD19抗体は、親IgG Fc領域と比較して、S267E、L328F、及びそれらの組み合わせから選択されるFc改変を含み、ナンバリングは、KabatにおけるようにEUインデックスに従う、使用。
- 前記一つ又は複数のバイオマーカーが、CD27、TCF7、CD40LG、FOXP3、及びCD28から選択される、請求項66又は67に記載の使用。
- 前記一つ又は複数のバイオマーカーが、TRABD2A、ST6GAL1、ATAD5、ATP13A2、SLC17A9、TBC1D4、MAL、ACY3、DNPH1、CNDP2、CLCN5、CALR、ST3GAL5、及びUSP21から選択される、請求項66又は67に記載の使用。
- 前記一つ又は複数のバイオマーカーがCD27及びAPPから選択される、請求項66又は67に記載の使用。
- 前記バイオマーカーがCD27である、請求項66又は67に記載の使用。
- 前記バイオマーカーがAPPである、請求項66又は67に記載の使用。
- 前記バイオマーカーがCD27及びAPPの組み合わせである、請求項66又は67に記載の使用。
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