JP2023542295A - Glp1ペプチド模倣薬を含む抗体薬物複合体及びその使用 - Google Patents
Glp1ペプチド模倣薬を含む抗体薬物複合体及びその使用 Download PDFInfo
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Abstract
【解決手段】例えば、グルカゴン様ペプチド1受容体(GLP1R)を標的化するために有用であるタンパク質薬物複合体及びその組成物が本明細書に記載される。ある特定の実施形態では、ペプチド模倣ペイロード及びリンカーペイロード、並びにこれらを作製する方法が提供される。より詳細には、抗GLP1R抗体及びGLP1ペプチド模倣ペイロードを含むGLP1ペプチド模倣薬、抗体薬物複合体及び組成物並びにGLP1R関連症状を治療する方法が提供される。【選択図】なし
Description
関連出願の相互参照
本願は、2020年9月14日に出願された米国仮特許出願第63/077,983号の優先権を主張するものであり、ここに本明細書の一部を構成するものとしてその開示内容全体を援用する。
本願は、2020年9月14日に出願された米国仮特許出願第63/077,983号の優先権を主張するものであり、ここに本明細書の一部を構成するものとしてその開示内容全体を援用する。
配列表
本願は、ASCIIフォーマットで電子的に提出された配列表を含有しており、これは参照としてその全体が本明細書に組み込まれている。2021年9月8日に作成された当該ASCIIコピーの名称は250298_000250_SL.txtであり、サイズは6,072バイトである。
本願は、ASCIIフォーマットで電子的に提出された配列表を含有しており、これは参照としてその全体が本明細書に組み込まれている。2021年9月8日に作成された当該ASCIIコピーの名称は250298_000250_SL.txtであり、サイズは6,072バイトである。
本開示は、タンパク質薬物複合体(例えば、抗体薬物複合体)、医薬組成物及びそれを用いて疾患を治療する方法に関する。ペプチド模倣ペイロード及びリンカーペイロード、並びにこれらを作製する方法もまた提供される。より詳細には、本開示は、GLP1ペプチド模倣薬を含むタンパク質薬物複合体(例えば、抗体薬物複合体)及びそれを用いてGLP1R関連症状を治療する方法に関する。
糖尿病は、異常なグルコース代謝の慢性疾患である。世界で4億2500万人の人々が糖尿病に罹患していると推定されている。世界的な糖尿病薬としては、インスリン、DPP-4阻害剤、グルカゴン様ペプチド1受容体(glucagon-like peptide 1 receptor、GLP1R)アゴニストが挙げられるが、大部分の患者は高血糖症及び心血管危険因子を管理するという併用治療の目的を達成していない。
グルカゴン様ペプチド1受容体(GLP1R)は、グルカゴン様ペプチド1(GLP1)の受容体であり、膵臓β細胞で発現される。GLP1Rは脳でも発現し、食欲、記憶及び学習の制御で機能する。GLP1Rは、Gタンパク質共役型受容体(G protein-coupled receptor、GPCR)のセクレチンファミリー(クラスB)のメンバーである。そのリガンドであるGLP1への結合時、GLP1Rは細胞内サイクリックAMP(cyclic AMP、cAMP)レベルを上昇させるGas Gタンパク質を介して下流のシグナル伝達カスケードを開始させ、遺伝子の転写調節を引き起こす(Donnelly 2011年)。GLP1Rの活性化によってインスリン合成とインスリン放出の増加がもたらされる。
GLP1R及びGLP1は、肥満及び2型糖尿病の高度に検証された標的である。市販のGLP1Rアゴニストはインスリンの分泌を増加させ、それによって血糖値を低下させるが、これには毎週の又はさらに頻繁な投与が必要となる。
したがって、当該技術分野では、持続時間がより長く安全性がさらに良好であるGLP1Rアゴニストが必要とされている。ある特定の実施形態では、本開示はこのニーズに合致しており、他の利点を提供する。
前述の説明は、当該技術分野が直面している課題の性質のより良好な理解を単に提供するために提示されており、いかなる方法であっても先行技術に対する承認として解釈されるべきではなく、かつ本明細書における援用は、かかる援用が本願に対して「先行技術」を構成するという承認として解釈されるべきではない。
本開示の種々の非限定的な態様及び実施形態が以下に記載される。
一態様では、式(A)
BA-(L-P)m (A)、
の構造を有する化合物又は薬学的に許容されるその塩であって、式中、
BAは、抗体又はその抗原結合断片であり、
Lは、非切断型リンカーであり、
Pは、
BA-(L-P)m (A)、
の構造を有する化合物又は薬学的に許容されるその塩であって、式中、
BAは、抗体又はその抗原結合断片であり、
Lは、非切断型リンカーであり、
Pは、
式中、
X1は、H、
X2は、
X3は、結合、-(CH2)2-6-NH-、-(CH2)2-6-Tr-及び-(CH2)2-6-Tr-(CH2)1-6-NHであって、式中、Trはトリアゾール部分である、結合、-(CH2)2-6-NH-、-(CH2)2-6-Tr-及び-(CH2)2-6-Tr-(CH2)1-6-NHから選択され、
nは、0又は1であり、
X4は、-NH2、-OH及び-N(H)(フェニル)から選択され、
X5は、-OH、-NH2、-NH-OH及び
X6は、各発生時に独立してH、-OH、-CH3及び-CH2OHから選択され、
X7は、H、
X8は、H、-OH、-NH2及び
Arは、
X9は、-NH2、
mは、1~4の整数である、ペイロードである、化合物又は薬学的に許容されるその塩。
別の態様では、式(I)
BA-L-P (I)、
の構造を有する化合物又は薬学的に許容されるその塩であって、式中、
BAは、抗体又はその抗原結合断片であり、
Lは、非切断型リンカーであり、
Pは、
BA-L-P (I)、
の構造を有する化合物又は薬学的に許容されるその塩であって、式中、
BAは、抗体又はその抗原結合断片であり、
Lは、非切断型リンカーであり、
Pは、
式中、
X1は、H、
X2は、
X3は、-(CH2)2-6-NH-及び-(CH2)2-6-Tr-であって、式中、Trはトリアゾール部分である、-(CH2)2-6-NH-及び-(CH2)2-6-Tr-から選択され、
nは、0又は1であり、
X4は、H及びフェニルから選択され、
X5は、-OH、-NH2、-NH-OH及び
X6は、各発生時に独立してH、-OH、-CH3及び-CH2OHから選択され、
X7は、H、
X8は、H、-OH、-NH2及び
本明細書に記載の化合物のいくつかの実施形態では、BAはグルカゴン様ペプチド1受容体(GLP1R)標的抗体又はその抗原結合断片である。いくつかの実施形態では、GLP1R標的抗体は、GLP1Rアゴニスト抗体である。いくつかの実施形態では、GLP1R標的抗体は、5A10、9A10、AB9433-I、h38C2、PA5-111834、NLS1205、MAB2814、EPR21819又はグルタズマブである。
いくつかの実施形態では、リンカーLは、BAの一方又は両方の重鎖に結合している。いくつかの実施形態では、リンカーLは、BAの一方又は両方の重鎖可変ドメインに結合している。いくつかの実施形態では、リンカーLは、BAの一方又は両方の軽鎖に結合している。いくつかの実施形態では、リンカーLは、BAの一方又は両方の軽鎖可変ドメインに結合している。
いくつかの実施形態では、リンカーLは、グルタミン残基を介してBAに結合する。いくつかの実施形態では、グルタミン残基は、BAの一方又は両方の重鎖のN末端に導入される。いくつかの実施形態では、グルタミン残基は、BAの一方又は両方の軽鎖のN末端に導入される。いくつかの実施形態では、グルタミン残基は、BAのCH2又はCH3ドメイン中に天然に存在する。いくつかの実施形態では、グルタミン残基は、1つ以上のアミノ酸を修飾することでBAに導入される。いくつかの実施形態では、グルタミン残基はQ295又はN297Qである。
いくつかの実施形態では、リンカーLは、リジン残基を介してBAに結合する。
いくつかの実施形態では、抗体又はその抗原結合断片はグリコシル化(aglycosylated)されている。いくつかの実施形態では、抗体又はその抗原結合断片は脱グリコシル化されている。いくつかの実施形態では、抗原結合断片はFab断片である。
一実施形態では、mは1である。一実施形態では、mは2~4の整数である。一実施形態では、mは2である。
いくつかの実施形態では、2つ以上のL-PはBAに結合されている。いくつかの実施形態では、2つのL-PがBAに結合されている。
いくつかの実施形態では、リンカーLは式(L’)
-La-Y-Lp- (L’)、
の構造であって、式中、Laは、BAに共有結合された第1のリンカーであり、
Yは、トリアゾールを含む基であり、
Lpは、存在しない、又はPに共有結合された第2のリンカーであり、Lpが存在しないときにはYもまた存在しない、構造を有する。
-La-Y-Lp- (L’)、
の構造であって、式中、Laは、BAに共有結合された第1のリンカーであり、
Yは、トリアゾールを含む基であり、
Lpは、存在しない、又はPに共有結合された第2のリンカーであり、Lpが存在しないときにはYもまた存在しない、構造を有する。
いくつかの実施形態では、Yは、
いくつかの実施形態では、Lpは、1~36個の-CH2CH2O-(EG)単位を有するポリエチレングリコール(polyethylene glycol、PEG)セグメントを含む。いくつかの実施形態では、PEGセグメントは2~30個のEG単位を含む。いくつかの実施形態では、PEGセグメントは4~24個のEG単位を含む。いくつかの実施形態では、PEGセグメントは4個のEG単位、又は8個のEG単位、又は12個のEG単位、又は24個のEG単位を含む。いくつかの実施形態では、PEGセグメントは4個のEG単位を含む。いくつかの実施形態では、PEGセグメントは8個のEG単位を含む。
いくつかの実施形態では、Y-Lpは、
式中、pは1~36の整数である、構造を有する。
いくつかの実施形態では、Lpは、グリシン、セリン、グルタミン酸、アラニン、バリン及びプロリン、並びにそれらの組合せから選択される1つ以上のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、Lpは1~10個のグリシンを含む。いくつかの実施形態では、Lpは1~6個のセリンを含む。いくつかの実施形態では、Lpは1~10個のグリシンと、1~6個のセリンと、を含む。いくつかの実施形態では、Lpは4個のグリシンと、1個のセリンと、を含む。いくつかの実施形態では、Lpは、Gly-Gly-Gly-Gly-Ser(G4S)(配列番号1)、Ser-Gly-Gly-Gly-Gly(SG4)(配列番号2)及びGly-Gly-Gly-Gly-Ser-Gly-Gly-Gly-Gly-Ser(G4S-G4S)(配列番号3)からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、Lpは、1~36個のEG単位を有するPEGセグメントと、グリシン、セリン、グルタミン酸、アラニン、バリン及びプロリン、並びにそれらの組合せから選択される1つ以上のアミノ酸との組合せを含む。いくつかの実施形態では、セリン残基は炭水化物基を含む。いくつかの実施形態では、セリン残基はグルコース基を含む。
いくつかの実施形態では、Lpは、
式中、Yはトリアゾールを含む基であり、Pはペイロードであり、式中、RcはH及びグルコースから選択され、gは1~10の整数であり、sは0~4の整数である、構造を有する。
いくつかの実施形態では、Y-Lpは、
いくつかの実施形態では、Laは、1~36個の-CH2CH2O-(EG)単位を有するポリエチレングリコール(PEG)セグメントを含む。いくつかの実施形態では、PEGセグメントは4個のEG単位、又は8個のEG単位、又は12個のEG単位、又は24個のEG単位を含む。いくつかの実施形態では、PEGセグメントは8個のEG単位を含む。いくつかの実施形態では、Laは、
いくつかの実施形態では、Laは、グリシン、スレオニン、セリン、グルタミン、グルタミン酸、アラニン、バリン、ロイシン及びプロリン、並びにそれらの組合せから選択される1つ以上のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、Laは1~10個のグリシンと、1~6個のセリンと、を含む。いくつかの実施形態では、Laは4個のグリシンと、1個のセリンと、を含む。いくつかの実施形態では、Laは、Gly-Gly-Gly-Gly-Ser(G4S)、Ser-Gly-Gly-Gly-Gly(SG4)、Gly-Gly-Ser-Gly-Gly-Ser-Gly-Gly(G2S-G2S-G2)及びGly-Gly-Gly-Gly-Ser-Gly-Gly-Gly-Gly(G4S-G4)からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、Laは、1~36個のEG単位を有するPEGセグメントと、グリシン、スレオニン、セリン、グルタミン、グルタミン酸、アラニン、バリン、ロイシン及びプロリン、並びにそれらの組合せから選択される1つ以上のアミノ酸との組合せを含む。いくつかの実施形態では、Laは、
いくつかの実施形態では、Laは-(CH2)2-24-鎖を含む。いくつかの実施形態では、いくつかの実施形態では、Laは、-(CH2)2-24-鎖と、1~36個のEG単位を有するPEGセグメントと、グリシン、スレオニン、セリン、グルタミン、グルタミン酸、アラニン、バリン、ロイシン及びプロリン、並びにそれらの組合せから選択される1つ以上のアミノ酸との組合せを含む。Laは、
本明細書に記載の化合物の種々の実施形態では、Pは構造
いくつかの実施形態では、X1はHであり、X2は
いくつかの実施形態では、X1は
いくつかの実施形態では、X1は
いくつかの実施形態では、X1は
いくつかの実施形態では、X1は
いくつかの実施形態では、X1は
いくつかの実施形態では、X1は
いくつかの実施形態では、X1は
いくつかの実施形態では、X1は
いくつかの実施形態では、X1は
いくつかの実施形態では、X1は
いくつかの実施形態では、X1は
いくつかの実施形態では、X1はHであり、X2は
いくつかの実施形態では、X1は
いくつかの実施形態では、X1は
いくつかの実施形態では、X1は
本明細書に記載の化合物の種々の実施形態では、Pは構造
いくつかの実施形態では、X1は
本明細書に記載の化合物の種々の実施形態では、Pは、
本明細書に記載の化合物の種々の実施形態では、化合物の半減期は血漿中では7日間よりも長い。
本明細書に記載の化合物の種々の実施形態では、化合物はGLP1R以外のGタンパク質共役型受容体(GPCR)に結合しない。
別の態様では、本明細書に記載の実施形態のうちのいずれかの化合物を含む医薬組成物が本明細書に提供される。
別の態様では、本明細書に記載の実施形態のうちのいずれかの化合物を含む医薬剤形が本明細書に提供される。
別の態様では、本明細書に記載の実施形態のうちのいずれかの化合物を用いて細胞の表面上のGLP1Rを選択的に標的化する方法が本明細書に提供される。いくつかの実施形態では、細胞は哺乳類細胞である。いくつかの実施形態では、細胞はヒト細胞である。いくつかの実施形態では、細胞は膵臓細胞、脳細胞、心臓細胞、血管組織細胞、腎細胞、脂肪組織細胞、肝臓細胞又は筋細胞である。
別の態様では、本明細書に記載の実施形態のうちのいずれかの化合物の有効量、本明細書に記載の組成物の有効量又は本明細書に記載の剤形の有効量をその必要がある個体に投与することを含む、個体でGLP1R活性を増強する方法が本明細書に提供される。
別の態様では、本明細書に記載の実施形態のうちのいずれかの化合物の有効量、本明細書に記載の組成物の有効量又は本明細書に記載の剤形の有効量をその必要がある個体に投与することを含む、個体で血糖値を低下させる方法が本明細書に提供される。
別の態様では、本明細書に記載の実施形態のうちのいずれかの化合物の有効量、本明細書に記載の組成物の有効量又は本明細書に記載の剤形の有効量をその必要がある個体に投与することを含む、個体で体重を低下させる方法が本明細書に提供される。
別の態様では、本明細書に記載の実施形態のうちのいずれかの化合物の有効量、本明細書に記載の組成物の有効量又は本明細書に記載の剤形の有効量をその必要がある個体に投与することを含む、個体でGLP1R関連症状を治療する方法が本明細書に提供される。いくつかの実施形態では、GLP1R関連症状は2型糖尿病、肥満、肝疾患、冠動脈疾患又は腎疾患である。いくつかの実施形態では、GLP1R関連症状は2型糖尿病及び/又は肥満である。いくつかの実施形態では、
本明細書に記載の方法のうちのいずれかの種々の実施形態では、本開示の化合物、組成物又は剤形は、皮下に、静脈内に、皮内に、腹腔内に、又は筋肉内に投与される。別の態様では、式(A)
BA-(L-P)m (A)、
の構造を有する、本明細書に記載の化合物を作製する方法であって、方法は、
a)トランスグルタミナーゼの存在下で、少なくともm個のグルタミン残基Glnを含むBAと、少なくともm当量の化合物L-Pとを接触させる工程と、
b)作製された式(A)の化合物を単離する工程と、を含む、方法が本明細書に提供される。
BA-(L-P)m (A)、
の構造を有する、本明細書に記載の化合物を作製する方法であって、方法は、
a)トランスグルタミナーゼの存在下で、少なくともm個のグルタミン残基Glnを含むBAと、少なくともm当量の化合物L-Pとを接触させる工程と、
b)作製された式(A)の化合物を単離する工程と、を含む、方法が本明細書に提供される。
別の態様では、式(I)
BA-L-P (I)、
の構造を有する、本明細書に記載の化合物を作製する方法であって、方法は、
a)トランスグルタミナーゼの存在下で、少なくとも1個のグルタミン残基Glnを含むBAと、化合物L-Pとを接触させる工程と、
b)作製された式(I)の化合物を単離する工程と、を含む、方法が本明細書に提供される。
BA-L-P (I)、
の構造を有する、本明細書に記載の化合物を作製する方法であって、方法は、
a)トランスグルタミナーゼの存在下で、少なくとも1個のグルタミン残基Glnを含むBAと、化合物L-Pとを接触させる工程と、
b)作製された式(I)の化合物を単離する工程と、を含む、方法が本明細書に提供される。
別の態様では、式(A)
BA-(L-P)m (A)、
の構造を有する請求項1に記載の化合物であって、式中、リンカーLは、式(L’)
-La-Y-Lp- (L’)、の構造であって、
式中、Laは、BAに共有結合された第1のリンカーであり、
Yは、トリアゾールを含む基であり、
Lpは、Pに共有結合された第2のリンカーである、構造を有する、化合物を作製する方法であって、
方法が、
a)トランスグルタミナーゼの存在下で、少なくともm個のグルタミン残基Glnを含むBAと、アジド又はアルキン部分を含む第1のリンカーLaとを接触させる工程と、
b)工程a)の生成物と、少なくともm当量の化合物Lp-Pとを接触させる工程であって、第2のリンカーLpはアジド又はアルキン部分を含み、La及びLpは反応してトリアゾールを作製することが可能である、工程と、
c)作製された式(A)の化合物を単離する工程と、を含む、方法が本明細書に提供される。
BA-(L-P)m (A)、
の構造を有する請求項1に記載の化合物であって、式中、リンカーLは、式(L’)
-La-Y-Lp- (L’)、の構造であって、
式中、Laは、BAに共有結合された第1のリンカーであり、
Yは、トリアゾールを含む基であり、
Lpは、Pに共有結合された第2のリンカーである、構造を有する、化合物を作製する方法であって、
方法が、
a)トランスグルタミナーゼの存在下で、少なくともm個のグルタミン残基Glnを含むBAと、アジド又はアルキン部分を含む第1のリンカーLaとを接触させる工程と、
b)工程a)の生成物と、少なくともm当量の化合物Lp-Pとを接触させる工程であって、第2のリンカーLpはアジド又はアルキン部分を含み、La及びLpは反応してトリアゾールを作製することが可能である、工程と、
c)作製された式(A)の化合物を単離する工程と、を含む、方法が本明細書に提供される。
別の態様では、式(I)
BA-L-P (I)、
の構造を有する本明細書に記載の化合物であって、式中、リンカーLは、式(L’)
-La-Y-Lp- (L’)、の構造であって、
式中、Laは、BAに共有結合された第1のリンカーであり、
Yは、トリアゾールを含む基であり、
Lpは、Pに共有結合された第2のリンカーである、構造を有する、化合物を作製する方法であって、
方法が、
a)トランスグルタミナーゼの存在下で、少なくとも1個のグルタミン残基Glnを含むBAと、アジド又はアルキン部分を含む第1のリンカーLaとを接触させる工程と、
b)工程a)の生成物と、化合物Lp-Pとを接触させる工程であって、第2のリンカーLpはアジド又はアルキン部分を含み、La及びLpは反応してトリアゾールを作製することが可能である、工程と、
c)作製された式(I)の化合物を単離する工程と、を含む、方法が本明細書に提供される。
BA-L-P (I)、
の構造を有する本明細書に記載の化合物であって、式中、リンカーLは、式(L’)
-La-Y-Lp- (L’)、の構造であって、
式中、Laは、BAに共有結合された第1のリンカーであり、
Yは、トリアゾールを含む基であり、
Lpは、Pに共有結合された第2のリンカーである、構造を有する、化合物を作製する方法であって、
方法が、
a)トランスグルタミナーゼの存在下で、少なくとも1個のグルタミン残基Glnを含むBAと、アジド又はアルキン部分を含む第1のリンカーLaとを接触させる工程と、
b)工程a)の生成物と、化合物Lp-Pとを接触させる工程であって、第2のリンカーLpはアジド又はアルキン部分を含み、La及びLpは反応してトリアゾールを作製することが可能である、工程と、
c)作製された式(I)の化合物を単離する工程と、を含む、方法が本明細書に提供される。
別の態様では、式(P-IB)、式(P-IIB)及び式(P-IIIB)
X1は、H、
X2は、
X3は、-CH3、-(CH2)2-6-NH2-、-(CH2)2-6-N3及び-(CH2)2-6-Tr-(CH2)1-6-NH2であって、式中、Trはトリアゾール部分である、-CH3、-(CH2)2-6-NH2-、-(CH2)2-6-N3及び-(CH2)2-6-Tr-(CH2)1-6-NH2から選択され、
nは、0又は1であり、
X4は、-NH2、-OH及び-N(H)(フェニル)から選択され、
X5は、-OH、-NH2、-NH-OH及び
X6は、各発生時に独立してH、-OH、-CH3及び-CH2OHから選択され、
X7は、H、
X8は、H、-OH、-NH2及び
Arは、
X9は、-NH2、
mは、1~4の整数である、化合物
又は薬学的に許容されるその塩が本明細書に提供される。
別の態様では、式(II)
式中、
X1は、H、
X2は、
X3は、-(CH2)2-6-NH2-、-(CH2)2-6-N3及び-CH3から選択されるが、X3が-CH3といった条件では、nは1であり、少なくとも1個の発生においてRaが-(CH2)2-6-NH2-、-(CH2)2-6-N3から選択され、
nは、0又は1であり、
mは、0~3の整数であり、
Raは、各発生時に独立して-CH3、-(CH2)2-6-NH2及び-(CH2)2-6-N3から選択され、
X4は、H及びフェニルから選択され、
X5は、-OH、-NH2、-NH-OH及び
X6は、各発生時に独立してH、-OH、-CH3及び-CH2OHから選択され、
X7は、H、
X8は、H、-OH、-NH2及び
薬学的に許容されるその塩が本明細書に提供される。
いくつかの実施形態では、Pは、
別の態様では、式(C)
Lpは、存在しない、又は
Qは、-NH2、-N3、
X1は、H、
X2は、
X3は、-CH3、-(CH2)2-6-NH2-、-(CH2)2-6-N3及び-(CH2)2-6-Tr-(CH2)1-6-NH2であって、式中、Trはトリアゾール部分である、-CH3、-(CH2)2-6-NH2-、-(CH2)2-6-N3及び-(CH2)2-6-Tr-(CH2)1-6-NH2から選択され、
nは、0又は1であり、
X4は、-NH2、-OH及び-N(H)(フェニル)から選択され、
X5は、-OH、-NH2、-NH-OH及び
X6は、各発生時に独立してH、-OH、-CH3及び-CH2OHから選択され、
X7は、H、
X8は、H、-OH、-NH2及び
Arは、
X9は、-NH2、
mは、1~4の整数である、化合物又は薬学的に許容されるその塩が本明細書に提供される。
別の態様では、式(III)
Lpは、存在しない、又は
Qは、-N3、
X1は、H、
X2は、
X3は、-(CH2)2-6-NH2-、-(CH2)2-6-N3及び-CH3から選択されるが、X3が-CH3といった条件では、nは1であり、少なくとも1個の発生においてRaが-(CH2)2-6-NH2-、-(CH2)2-6-N3から選択され、
nは、0又は1であり、
Raは、各発生時に独立してH、-CH3、-(CH2)2-6-NH2及び-(CH2)2-6-N3から選択され、
X4は、H及びフェニルから選択され、
X5は、-OH、-NH2、-NH-OH及び
X6は、各発生時に独立してH、-OH、-CH3及び-CH2OHから選択され、
X7は、H、
X8は、H、-OH、-NH2及び
薬学的に許容されるその塩が本明細書に提供される。
いくつかの実施形態では、上記の化合物は、
別の態様では、抗体薬物複合体であって、
さらに別の態様では、グルカゴン様ペプチド1受容体(GLP1R)標的抗体又はその抗原結合断片と、構造:
式中、
一実施形態では、ペイロードは、構造:
さらに別の態様では、グルカゴン様ペプチド1受容体(GLP1R)標的抗体又はその抗原結合断片と、構造:
式中、
一実施形態では、リンカーペイロードは、構造:
本開示のこれらの態様及びその他の態様は、添付の特許請求の範囲を含む本開示の以下の詳細な説明を読んだ後には当業者には明らかとなるであろう。
本特許又は本願のファイルは、カラーで作成された少なくとも1つの図面を含む。1つ以上のカラー図面を含む本特許又は本特許出願公開の写しは、請求及び必要な費用の支払いに応じて特許庁により提供される。
例示的な抗体結合薬物複合体(antibody-tethered drug conjugate、ATDC)のデザイン及びその作用機序の概略図を示す。
従来の抗体薬物複合体(ADC)のデザイン及びその作用機序の概略図を示す。
細胞外ドメイン(extracellular domain、ECD)に結合した抗体及び膜貫通ドメイン(transmembrane domain、TMD)に結合したペイロードを有する抗体結合薬物複合体のモデルを示す。
GLP1(7~36)アミド(配列番号4)の概略図を示す。配列上部の数字は、プログルカゴンプロペプチドのアミノ酸位置に対応している。青色の矢印は、ジペプチジルペプチダーゼ-4(dipeptidyl peptidase-4、DPP-IV)切断部位を示す。赤色の矢印は、中性エンドペプチダーゼ(neutral endopeptidase、NEP)切断部位を指す。破線の矢印は、1つ以上の未知のエンドプロテアーゼによる切断部位を指す。オレンジ色の残基は、置換されるとGLP1Rの結合とcAMP産生を減少させるアミノ酸である。緑色の残基は、置換されるとGLP1Rの結合を減少させるアミノ酸である。
GLP1に結合したGLP1Rの構造を示す(タンパク質データバンクID:3IOL)。この構造への言及は、Zhang et al.Nature 2017、Chepurny et al.JBC 2019、De Graaf et al.Pharmacological reviews 2016及びManandhar and Ahn Journal of Medical Chemistry 2014に見出すことができ、これらそれぞれは、本明細書の一部を構成するものとしてその内容全体が援用されている。
GLP1ペプチド模倣薬であるペプチド5(配列番号5)の配列及び構造を示す。配列上部の数字は、プログルカゴンプロペプチドのアミノ酸位置に対応している。
テンプレートとしてペプチド5に結合したGLP1R(タンパク質データバンクID:5NX2)中にGLP1に結合したGLP1R(タンパク質データバンクID:3IOL)を使用した、GLP1Rと5NX2との構造との重ね合わせを示す。5NX2構造への言及は、Jazayeri A,et al.Nature volume 546,pages 254-258(2017)に見出すことができ、これは本明細書の一部を構成するものとしてその内容全体が援用されている。
本開示のGLP1ペプチド模倣ペイロードを作製するための合成スキームを示す。樹脂上での固相ペプチド合成が確立されており、これは良好な収率で本開示のペイロードを効果的に産生した。体系的なR1/R2/R3修飾により、さらなるGLP1Rペプチド模倣ペイロードを産生した。
本開示のGLP1Rペプチド模倣ペイロードが、関連するGPCRバイオアッセイで活性化を示さなかったことを実証している。
本開示のGLP1Rペプチド模倣ペイロードが、関連するGPCRバイオアッセイで活性化を示さなかったことを実証している。
本開示のGLP1Rペプチド模倣ペイロードが、関連するGPCRバイオアッセイで活性化を示さなかったことを実証している。
本開示のGLP1Rペプチド模倣ペイロードが、関連するGPCRバイオアッセイで活性化を示さなかったことを実証している。
より短いリンカーのGLP1R ATDCが、コントロールATDC以上に大きな力価を示したことを示す。
より短いリンカーのGLP1R ATDCが、コントロールATDC以上に大きな力価を示したことを示す。
主要なリンカーペイロードが、インビトロでの心毒性及び潜在的変異原性のない最適なインビトロADMEプロファイルを示し、そのATDCが血漿中で非常に安定した状態であることを示す。
リンカーペイロードを本開示の抗体に結合させるための2つの方法を示す。
抗GLP1R ATDC薬物負荷プロファイルの代表的な疎水性相互作用クロマトグラフィー(hydrophobic interaction chromatography、HIC)グラフを示す。HICは、ATDCを選別するために結合能力のスクリーニングに使用された。このスクリーニングは、低い結合収率、低いDAR、高い凝集及び不十分なBiacore結合を示している。
抗GLP1R ATDCによるCRE依存性ルシフェラーゼレポーター活性を示す。抗GLP1R ATDCは、アイソタイプコントロールATDCよりも良好なインビトロ力価を示した。非結合mAbは、hGLP1R細胞を活性化しなかった(図示せず)。ATDCは、グルカゴン様ペプチド2受容体(Glucagon-like peptide-2 receptor、GLP2R)、グルカゴン受容体(glucagon receptor、GCGR)又は胃抑制ポリペプチド受容体(gastric inhibitory polypeptide receptor、GIPR)を活性化しなかった(図示せず)。
非結合抗GLP1R抗体の存在下での抗GLP1R ATDCによる、サイクリックAMP応答配列(cyclic AMP response element、CRE)依存性ルシフェラーゼレポーター活性を示す。これは、10nM未満の非結合抗GLP1R mAb濃度が、抗GLP1R ATDC活性に何ら影響を及ぼさなかったことを示す。100nMの非結合抗GLP1R mAbは、抗GLP1R ATDCの力価を3.8倍減少させた。このアッセイは、最初に非結合抗GLP1R mAbを加え、続いて直ちに抗GLP1R ATDCを加え、4時間のインキュベートさせることで実施された。
図11Aのグラフに対応するデータを示す。
本開示の例示的なGLP1R QタグmAb-GLP1Rアゴニスト複合体の概略図を示す。
本開示に従ってGLP1ペプチド模倣薬を調製するための一般的な合成スキームを示す。
本開示に従ったGLP1ペプチド模倣ペイロードP1及びP8の固相合成のためのシーケンスを示す。
本開示に従ったGLP1ペプチド模倣ペイロードP2及びP9の固相合成のためのシーケンスを示す。
本開示に従ったGLP1ペプチド模倣ペイロードP3、P4、P5、P6、P7、P11、P13、P14、P15、P16及びP17の固相合成のためのシーケンスを示す。
本開示に従ったGLP1ペプチド模倣ペイロードP10、P12、P18、P19、P25、P26、P27、P28、P29、P30、P31、P36、P37及びP38の固相合成のためのシーケンスを示す。
本開示に従ったGLP1ペプチド模倣ペイロードP10、P12、P18、P19、P25、P26、P27、P28、P29、P30、P31、P36、P37及びP38の固相合成のためのシーケンスを示す。
本開示に従ったGLP1ペプチド模倣ペイロードP20及びP21の固相合成のためのシーケンスを示す。
本開示に従ったGLP1ペプチド模倣ペイロードP22及びP23の固相合成のためのシーケンスを示す。
本開示に従ったGLP1ペプチド模倣ペイロードP24の固相合成のためのシーケンスを示す。
本開示に従ったGLP1ペプチド模倣ペイロードP32、P33、P34及びP35の固相合成のためのシーケンスを示す。
本開示に従ったGLP1ペプチド模倣ペイロードP39の固相合成のためのシーケンスを示す。
本開示に従ったGLP1ペプチド模倣ペイロードP40の固相合成のためのシーケンスを示す。
本開示に従ったGLP1ペプチド模倣ペイロードP41の固相合成のためのシーケンスを示す。
本開示に従ったGLP1ペプチド模倣ペイロードP42の固相合成のためのシーケンスを示す。
本開示に従ったリンカーペイロードLP1、LP2、LP3、LP4及びLP5の調製のための合成経路を示す。
本開示に従ったリンカーペイロードLP6及びLP7の調製のための合成経路を示す。
本開示に従ったリンカーペイロードLP8、LP9、LP10及びLP11の調製のための合成経路を示す。
本開示に従ったリンカーペイロードLP12の調製のための合成経路を示す。
本開示に従ったリンカーペイロードLP13及びLP14の調製のための合成経路を示す。
本開示に従ったリンカーペイロードLP15及びLP18の調製のための合成経路を示す。
本開示に従ったリンカーペイロードLP17の調製のための合成経路を示す。
本開示に従ったリンカーペイロードLP18及びLP20の調製のための合成経路を示す。
本開示に従ったリンカーペイロードLP19の調製のための合成経路を示す。
本開示に従ったリンカーペイロードLP21の調製のための合成経路を示す。
本開示に従ったリンカーペイロードLP22の調製のための合成経路を示す。
本開示に従ったリンカーペイロードLP23の調製のための合成経路を示す。
本開示に従ったリンカーペイロードLP24の調製のための合成経路を示す。
本開示に従ったリンカーペイロードLP25の調製のための合成経路を示す。
本開示に従ったリンカーペイロードLP26の調製のための合成経路を示す。
本開示に従ったリンカーペイロードLP27及びLP28の調製のための合成経路を示す。
本開示に従ったリンカーペイロードLP29の調製のための合成経路を示す。
本開示に従ったリンカーペイロードLP30の調製のための合成経路を示す。
本開示に従ったリンカーペイロードLP31の調製のための合成経路を示す。
本開示に従ったリンカーペイロードLP32の調製のための合成経路を示す。
本開示に従ったリンカーペイロードLP33の調製のための合成経路を示す。
本開示に従ったリンカーペイロードLP34の調製のための合成経路を示す。
本開示に従ったリンカーペイロードLP35の調製のための合成経路を示す。
本開示に従ったリンカーペイロードLP36、LP37、LP38、LP39、LP40及びLP41の調製のための合成経路を示す。
本開示に従ったリンカーペイロードLP42の調製のための合成経路を示す。
本開示に従ったリンカーペイロードLP43の調製のための合成経路を示す。
本開示に従ったリンカーペイロードLP44の調製のための合成経路を示す。
本開示に従ったリンカーペイロードLP45の調製のための合成経路を示す。
部位特異的抗体薬物複合体の調製のための一般的な二段階結合手順の概略図を示す。
部位特異的抗体薬物複合体の調製のための一般的な一段階結合手順の概略図を示す。
電気生理学的試験のためのコマンダ電圧プロトコールを示す。最初に、電圧を、リーク電流を差し引くために80msにわたって-80mVの保持電位から-50mVへとステップし、続いて4800msにわたって+20mVへとステップしてhERGチャネルを開いた。その後、電圧を5000msにわたって-50mVへと戻し、「リバウンド」又はテール電流を引き起こした。これをデータ解析のために測定し、収集した。最終的に、電圧を保持電圧(-80mV、1000ms)に戻した。電圧コマンドプロトコールを20秒ごとに繰り返し、試験中連続してこれを実施した(ビヒクルコントロール及び試験化合物)。
マウス、サル及びヒト血漿中で7日間、37℃のインキュベーションでの抗GLP1R mAB2-LP11のインビトロ安定性を示す。
肥満GLP1Rヒト化マウスでの体重変化パーセントでのGLP1R ATDCの効果を示す。
肥満GLP1Rヒト化マウスでの血糖値でのGLP1R ATDCの効果を示す。
本開示の例示的な実施形態に従ったGLP1R ATDCの概略図である。
本開示は、いくつかの態様では、グルカゴン様ペプチド1受容体(GLP1R)タンパク質に特異的に結合する抗体薬物複合体を提供する。上記背景技術の節に記載されるように、GLP1R及びそのリガンドであるGLP1は、肥満及び2型糖尿病にとって高度に検証された標的である。しかしながら、2型糖尿病の治療にとって直接的なアゴニスト抗体は同定されていない。GLP1R上でアゴニスト活性を有する単一ペプチドは、グルコース制御及び体重減少のための有効な治療薬であるが、一列に並んだペプチド抗体融合物はタンパク質分解に感受性がある。本開示のある特定の実施形態では、GLP1Rの細胞外ドメインを特異的に標的とし、抗体又はその抗原結合断片と、GLP1Rを機能的に活性化させるGLP1ペプチド模倣薬と、を組み合わせた抗体薬物複合体を産生した。ある特定の実施形態では、本開示の抗体薬物複合体は、同等又はより良好な体重減少及びグルコース減少力価並びにオフターゲットの副作用が最小限でありながら、より長い薬物持続時間を有する。
本開示の詳細な実施形態が本明細書に開示されているが、開示された実施形態は、種々の形態で具体化され得る本開示を単に例示したのみであるということを理解されたい。加えて、本開示の種々の実施形態に関連して与えられているそれぞれの実施例は例示ではあるが限定的ではないことを意図している。したがって、本明細書に開示される特定の構造的及び機能的詳細は、限定として解釈されるべきではなく、本開示を様々に利用することを当業者に教示するための代表的な基本原理としてのみ解釈されるべきである。
定義
特段規定しない限り、本明細書で使用される全ての技術用語及び化学用語は、本開示が属する当業者によって一般的に理解される意味と同じ意味を有する。
特段規定しない限り、本明細書で使用される全ての技術用語及び化学用語は、本開示が属する当業者によって一般的に理解される意味と同じ意味を有する。
本明細書及び添付の特許請求の範囲で使用される場合、単数形「a」、「an」及び「the」は、特段文脈で明確に規定しない限り、複数形の指示対象を含む。したがって、例えば、「方法」に対する言及は、本明細書に記載される及び/又は本開示を読めば当業者に明らかとなるであろう種類の1つ以上の方法及び/又は工程を含む。
状態、障害又は症状を「治療する」又は「治療」といった用語は、(1)状態、障害若しくは症状に苦しんでいる、若しくはこれらに罹患しやすくなる可能性があるが、状態、障害若しくは症状の臨床症候若しくは無症候を未だ経験していない対象内で発生した状態、障害若しくは症状のうちの少なくとも1つの臨床症候若しくは無症候の発生及び/若しくは出現の見込みを予防、遅延若しくは減少させること、又は(2)状態、障害若しくは症状を阻害すること、すなわち疾患、若しくはその再発若しくは少なくとも1つのその臨床症候若しくは無症候の発生を抑止、減少若しくは遅延すること、又は(3)疾患の軽減、すなわち状態、障害若しくは症状、若しくは少なくとも1つの書の臨床症候若しくは無症候を退行させること、を含む。治療される対象への利益は、患者又は医師に対し、統計学的に有意であることか、少なくとも知覚できることのいずれかである。いくつかの実施形態では、治療は、疾患が間接的に影響を受けるような方法で細胞を切除する方法を含む。ある特定の実施形態では、治療は、治療(therapy)前の造血幹細胞移植前処置レジメンとして免疫細胞を枯渇させることを含む。
本明細書で使用される場合、「対象」又は「患者」又は「個体」又は「動物」は、ヒト、獣医学的動物(例えば、ネコ、イヌ、ウシ、ウマ、ヒツジ、ブタなど)及び疾患の実験動物モデル(例えば、マウス、ラットなど)を指す。好ましい実施形態では、対象はヒトである。
本明細書で使用される場合、投与量又は量に適用される「有効な」といった用語は、その必要がある対象への投与時に所望の活性をもたらすのに十分な化合物又は医薬組成物の量を指す。活性成分の組合せが投与される場合、有効量の組合せは、個々に投与される場合には有効であった各成分の量を含んでも含まなくてもよいことに留意されたい。必要とされる正確な量は、対象の種、年齢及び全身状態、治療されている症状の重症度、利用される特定の薬物、投与様式などに応じて対象によって異なる。
本開示の組成物に関連して使用される「薬学的に許容される塩」といった語句は、患者への投与に好適な任意の塩を指す。好適な塩としては、本明細書の一部を構成するものとしてその内容全体が援用されている、Berge et al.,「Pharmaceutical Salts」,J.Pharm.Sci.,1977,66:1に開示されているものが挙げられるが、これらに限定されない。塩の例としては、カルシウム塩、マグネシウム塩、カリウム塩、ナトリウム塩、塩酸塩、臭化水素酸塩、硫酸塩、硝酸塩、リン酸塩、酢酸塩、プロピオン酸塩、グリコール酸塩、ピルビン酸塩、シュウ酸塩、マレイン酸塩、マロン酸塩、コハク酸塩、フマル酸塩、酒石酸塩、クエン酸塩、安息香酸塩、ケイ皮酸塩、マンデル酸塩、メタンスルホン酸塩、エタンスルホン酸塩、pトルエンスルホン酸塩、サリチル酸塩などが含まれるが、これらに限定されない、酸由来、塩基由来、有機、無機、アミン及びアルカリ金属又はアルカリ土類金属の塩が挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの例では、本明細書に記載のペイロードは第3級アミンを含み、第3級アミン中の窒素原子は、ペイロードがリンカー又はリンカースペーサーに結合されている原子である。かかる例では、ペイロードの第3級アミンへの結合によって、リンカーペイロード分子中に第4級アミンが得られる。第4級アミンの正電荷は、対イオン(例えば、本明細書に記載のものなどのクロロ、ブロモ、ヨード又は任意の他の好適な荷電部分)によって均衡状態となる。
範囲は、「約」又は「およそ」1つの特定の値から、かつ/又は「約」又は「およそ」別の特定の値までとして本明細書に表すことができる。かかる範囲が表されるときには、別の実施形態は1つの特定の値から、かつ/又は他の特定の値までを含む。
「を含む(comprising)」又は「を含有する(containing)」又は「を含む(including)」は、少なくとも指定された化合物、要素、粒子又は方法の工程が組成物又は物質又は方法の中に存在しているが、他のこうした化合物、材料、粒子又は方法の工程が指定されたものと同一の機能を有する場合であったとしても、他の化合物、材料、粒子又は方法の工程の存在を排除するものではないことを意味している。
本開示の化合物は、本明細書に一般に記載されているものを含み、本明細書に開示されるクラス、サブクラス及び種によってさらに例示されている。本明細書で使用される場合、特段明記しない限り、以下の定義が適用されるものとする。本開示の目的のために、化学元素は、Periodic Table of the Elements,CAS version,Handbook of Chemistry and Physics,75th Edに従って識別される。加えて、有機化学の一般原理は、本明細書の一部を構成するものとしてその内容全体が援用されている「Organic Chemistry」,Thomas Sorrell,University Science Books,Sausalito:1999,及び「March’s Advanced Organic Chemistry」,5th Ed.,Ed.:Smith,M.B.and March,J.,John Wiley&Sons,New York:2001に記載されている。
本明細書で使用される場合、「アルキル」といった用語は、当該技術分野においてはその通常の意味が与えられており、直鎖アルキル基、分岐鎖アルキル基、シクロアルキル(脂環式)基、アルキル置換シクロアルキル基及びシクロアルキル置換アルキル基を含む飽和脂肪族基を含んでもよい。ある特定の実施形態では、直鎖又は分岐鎖アルキルは、主鎖中に約1~20個の炭素原子(例えば、直鎖に関してはC1-C20、分岐鎖に関してはC2-C20)、あるいは約1~10個の炭素原子、又は約1~6個の炭素原子を有する。いくつかの実施形態では、シクロアルキル環は、その環構造中に約3~10個の炭素原子を有し、かかる環が単環式又は二環式の環である。あるいは、環構造中に約5個、約6個又は約7個の炭素を有する。いくつかの実施形態では、アルキル基は低級アルキル基であってもよく、低級アルキル基は1~4個の炭素原子を含む(例えば、直鎖低級アルキルに関してはC1-C4)。
本明細書で使用される場合、「アルケニル」といった用語は、1つ以上の二重結合を有する、本明細書で使用されるアルキル基を指す。
本明細書で使用される場合、「アルキニル」といった用語は、1つ以上の三重結合を有する、本明細書で使用されるアルキル基を指す。
「ヘテロ原子」といった用語は、酸素、硫黄、窒素、リン又はケイ素(窒素、硫黄、リン又はケイ素の任意の酸化形態、任意の塩基性窒素の四級化形態、又は複素環の置換可能な窒素を含む)のうちの1つ以上を含む。
「ハロゲン」といった用語はF、Cl、Br又はIを意味し、「ハロゲン化物」といった用語は、ハロゲン基又は置換基、すなわち-F、-Cl、-Br又は-Iを指す。
本開示の「付加物」、例えば「ディールス・アルダー付加物」は、部分を作製するために採用された合成工程とは無関係である、例えばディールス・アルダー反応といった付加反応の生成物を含む任意の部分を包含する。
「共有結合」といった用語は、共有結合(covalent bond)、すなわち2原子間の1つ以上の電子対の共有に関与する化学結合を意味する。共有結合は、σ結合、π結合、金属間結合、アゴスティック相互活用、曲がった結合及び三中心二電子結合を含むがこれらに限定されない、異なる相互作用を含んでもよい。第1の基が第2の基に「共有結合可能」であると言われる場合、これは、例えば触媒の使用によって、又は特定の反応条件下にて、直接的に又は間接的に、第1の基が第2の基と共有結合を形成可能であることを意味している。互いに共有結合可能である基の非限定的な例としては、例えばアミン及びカルボン酸(アミド結合を形成する)、ジエン及び求ジエン体(ディールス・アルダー反応による)、マレイミド及びチオール(チオマレイミドを形成する)並びにアジド及びアルキン(1,3-環化付加反応を介してトリアゾールを形成する)が挙げられる。
本明細書に記載されるように、本開示の化合物は、「必要に応じて置換された」部分を含有してもよい。一般には、「置換された」といった用語は、「必要に応じて」という用語が先行するしないにかかわらず、指定の部分のうちの1個以上の水素を好適な置換基で置き換えることを意味する。特段明記しない限り、「必要に応じて置換された」基は、基のそれぞれの置換可能位置に好適な置換基を有してもよく、任意の所与の構造内の2つ以上の位置が、特定の基から選択される2個以上の置換基で置換され得る場合には、置換基は全ての位置で同一又は異なっていてもよい。本開示によって想定される置換基の組合せは、安定した又は化学的に実現可能な化合物の形成をもたらすものが好ましい。
本明細書で使用される場合、「安定した」といった用語は、製造、検出、並びにある特定の実施形態ではその回収、精製及び本明細書に開示される目的のうちの1つ以上のための使用を可能にする状態に供された場合に、実質的に変性されない化合物を指す。
特段明記しない限り、本明細書に示されている構造は、構造の全ての異性体(例えば、鏡像異性体、ジアステレオ異性体及び幾何異性体(又は配座異性体))形態であって、例えば各不斉中心のR配置及びS配置、(Z)及び(E)二重結合異性体並びに(Z)及び(E)配座異性体を含むこともまた意味している。したがって、本発明の化合物の単一の立体化学異性体並びに鏡像異性体、ジアステレオ異性体及び幾何(又は配座)異性体の混合物は本開示の範囲内である。
特段明記しない限り、本明細書に示されている例えば環化付加反応、例えばアジド-アセチレン環化付加反応又はディールス・アルダー反応の生成物といった環状付加物は、全ての位置異性体、すなわち官能基又は置換基の位置のみが異なっている構造異性体を含む。一例として、以下の構造は、トリアゾ-ル環上の置換基の位置のみが異なっているトリアゾール位置異性体:
特段明記しない限り、本開示の化合物の全ての互変異性体形態は本開示の範囲内である。
加えて、特段明記しない限り、本明細書に示されている構造は、1つ以上の同位体濃縮原子の存在下でのみ異なる化合物を含むこともまた意味している。例えば、重水素又は三重水素による水素の置換又は11C又は13C又は14C濃縮炭素による炭素の置換を除いた本発明の構造を有する化合物は、本開示の範囲内である。
1つ以上の方法の工程への言及は、明示的に識別されている追加工程又はこうした工程の間に存在する方法の工程の存在を排除するものではないこともまた理解されたい。同様に、デバイス又はシステム中の1つ以上の構成要素への言及は、明示的に識別されている追加の構成要素又はこうした構成要素の間に存在する構成要素の存在を排除するものではないこともまた理解されたい。
特段明記しない限り、本開示の化合物の全ての結晶形態及びその塩もまた、本開示の範囲内である。本開示の化合物は、限定するわけではないが、無水、水和、非溶媒和又は溶媒和状態の形態を含む、種々の非晶質形態及び結晶形態で単離されてもよい。例示的な水和物としては、半水和物、一水和物、二水和物などが挙げられる。いくつかの実施形態では、本開示の化合物は無水状態又は非溶媒和状態である。「無水」は、化合物の結晶形態が結晶格子構造中に結合水を本質的に含有しない、すなわち化合物が結晶水和物を形成しないことを意味している。
本明細書で使用される場合、「結晶形態」は、結晶物質のある特定の格子構成を指すということを意味している。同一の物質の異なる結晶形態は、典型的には異なる結晶格子(例えば単位格子)を有するが、これが結晶形態のそれぞれの特性である異なる物理特性に寄与している。いくつかの例では、異なる格子構成は水又は溶媒の含有量が異なる。異なる結晶格子は、粉末X線回折(X-ray powder diffraction、PXRD)などの固体状態特性評価法によって識別され得る。例えば、示差走査熱量測定(differential scanning calorimetry、DSC)、熱重量分析(thermogravimetric analysis、TGA)、動的水蒸気吸着測定(dynamic vapor sorption、DVS)、固体NMRなどの他の特性評価法は、結晶形態の識別かつ安定性及び溶媒含有量/含水量の決定にさらに役立つ。
物質の結晶形態としては、溶媒和(例えば、水和)形態と非溶媒和(例えば、無水)形態の両方が挙げられる。水和形態は、結晶格子内に水を含む結晶形態である。水和形態は、化学量論的な水和物であり得る。この場合、水はある特定の(例えば、半水和物、一水和物、二水和物などに関する)水/分子比で格子内に存在している。水和形態はまた、非化学量論的である可能性もある。この場合、含水量は可変であり、湿度などの外部条件に依存する。
いくつかの実施形態では、本開示の化合物は実質的に単離されている。「実質的に単離される」とは、特定の化合物が少なくとも部分的に不純物から単離されていることを意味する。例えば、いくつかの実施形態では、本開示の化合物は、約50%未満、約40%未満、約30%未満、約20%未満、約15%未満、約10%未満、約5%未満、約2.5%未満、約1%未満又は約0.5%未満の不純物を含む。不純物は、例えば他の結晶形態及び他の物質を含む、実質的には単離された化合物ではないものを一般には含む。
ある特定の基、部分、置換基及び原子は、波線で示されている。波線は、1つ以上の結合と交差又はこれをキャップすることができる。波線は、基、部分、置換基又は原子が結合されている原子を示す。例えば、
「GLP1R」といった用語は、グルカゴン様ペプチド1受容体を指しており、組換えGLP1Rタンパク質又はその断片を含む。GLP1Rは、463残基の配列である。Donnelly,Br J Pharmacol,166(1):27-41(2011)。グルカゴン様ペプチド1(GLP1)は、栄養素の摂取後に腸管内分泌L細胞から放出された31アミノ酸ペプチドホルモンである。GLP1RへのGLP1の結合は、膵臓β細胞からのグルコース誘発性インスリン分泌を増強し、インスリン発現を増加し、β細胞のアポトーシスを阻害し、β細胞の新生を促進し、グルカゴン分泌を減少し、胃内容排出を遅延し、満腹を推進し、末梢グルコース消失を増加させる。
「GLP1Rに結合する抗体」又は「抗GLP1R抗体」といった語句は、GLP1Rを特異的に認識する抗体及びその抗原結合断片を含む。
本明細書で使用される場合、「アゴニスト抗体」(又は「GLP1R活性を増加若しくは増強する抗体」)は、GLP1Rへの結合によって少なくとも1つのGLP1Rの生物学的活性の活性化をもたらす抗体を指すことを意図している。例えば、GLP1Rのアゴニスト抗体は、細胞が哺乳動物の膵臓β細胞である場合、サイクリックAMPの合成の増加をもたらすアデニル酸シクラーゼ経路の刺激を誘発し、インスリンを放出することができる。GLP1Rのアゴニスト抗体はまた、その必要がある対象への投与時にグルコースレベルを減少させることができる。
本開示で使用される全てのアミノ酸の略語は、米国特許規則連邦規則法典第37巻§1.822(B)(J)に規定されるように、米国特許商標庁によって承認されているものである。
「タンパク質」といった用語は、アミド結合を介して共有結合された約20個を超えるアミノ酸を有する任意のアミノ酸重合体を意味する。本明細書で使用される場合、「タンパク質」としては、生物学的薬物タンパク質、研究又は治療で使用される組換えタンパク質、trapタンパク質及び他のFc融合タンパク質、キメラタンパク質、抗体、モノクローナル抗体、ヒト抗体、二重特異性抗体、抗体断片、ナノボディ、組換え抗体キメラ、scFv融合タンパク質、サイトカイン、ケモカイン、ペプチドホルモンなどが挙げられる。タンパク質は、昆虫バキュロウイルス系、酵母系(例えば、ピキア株)、哺乳動物系(例えば、CHO細胞及びCHO-K1細胞などのCHO誘導体)といった組換え細胞ベースの産生系を使用して産生され得る。
本明細書のタンパク質、ポリペプチド及びタンパク質断片に対する全ての言及は、非ヒト種であると特段明示的に指定しない限りはそれぞれのタンパク質、ポリペプチド又はタンパク質断片のヒトバージョンを指すことを意図している。したがって、「GLP1R」という表現は、例えば「マウスGLP1R」、「サルGLP1R」など、特段非ヒト種であると指定しない限りはヒトGLP1Rを意味する。
抗体のアミノ酸配列は、Kabat et al.,(「Kabat」番号付与スキーム);Al-Lazikani et al.,1997,J.Mol.Biol.,273:927-948(「Chothia」番号付与スキーム);MacCallum et al.,1996,J.Mol.Biol.262:732-745(「Contact」番号付与スキーム);Lefranc et al.,Dev.Comp.Immunol.,2003,27:55-77(「IMGT」番号付与スキーム);及びHonegge and Pluckthun,J.Mol.Biol.,2001,309:657-70(「AHo」番号付与スキーム)に記載されているものを含む、任意の公知の番号付与スキームを使用して番号付与され得る。特段指定しない限り、本明細書で使用される番号付与スキームは、Kabat番号付与スキームである。ただし、番号付与スキームの選択は、差異が存在しない配列においてそれらを暗示しようとするものではなく、当業者は1つ以上の抗体のアミノ酸配列を調べることで配列位置を容易に確認することができる。特段記載しない限り、「EU番号付与スキーム」は、抗体重鎖定常領域内の残基を指す場合に一般には使用される(例えば、前出のKabat et al.に報告されているものなど)。
「グルタミニル修飾抗体」といった用語は、グルタミン側鎖から本開示の第1級アミン化合物まで少なくとも1つの共有結合を有する抗体を指す。特定の実施形態では、第1級アミン化合物は、グルタミン側鎖上のアミド結合を介して結合される。ある特定の実施形態では、グルタミンは内因性グルタミンである。他の実施形態では、グルタミンはポリペプチド改変(例えば、ポリペプチド上でのアミノ酸の欠失、挿入、置換又は変異)によって反応性となった内因性グルタミンである。さらなる実施形態では、グルタミンは、アシル供与体グルタミン含有タグ(例えば、グルタミン含有ペプチドタグ、Qタグ又はTGase認識タグ)で改変されたポリペプチドである。
「TGase認識タグ」といった用語は、受容体であるグルタミン残基を含むアミノ酸の配列であって、好適な条件下でポリペプチド配列へと導入(例えば、付加)される場合に、TGaseによって認識され、そのアミノ酸の配列内部のアミノ酸側鎖と反応パートナーとの間の反応によってTGaseによる架橋を引き起こすアミノ酸の配列を指す。認識タグは、TGase認識タグを含むポリペプチド中に天然に存在しないペプチド配列であってもよい。いくつかの実施形態では、TGase認識タグは少なくとも1個のGlnを含む。いくつかの実施形態では、TGase認識タグはアミノ酸配列XXQXを含み、式中、Xは任意のアミノ酸(例えば、従来のアミノ酸であるLeu、Ala、Gly、Ser、Val、Phe、Tyr、His、Arg、Asn、Glu、Asp、Cys、Gin、He、Met、Pro、Thr、Lys若しくはTrp又は従来のものではないアミノ酸)である。いくつかの実施形態では、アシル供与体グルタミン含有タグは、LLQGG(配列番号6)、LLQG(配列番号7)、LSLSQG(配列番号8)、GGGLLQGG(配列番号9)、GLLQG(配列番号10)、LLQ、GSPLAQSHGG(配列番号11)、GLLQGGG(配列番号12)、GLLQGG(配列番号13)、GLLQ(配列番号14)、LLQLLQGA(配列番号15)、LLQGA(配列番号16)、LLQYQGA(配列番号17)、LLQGSG(配列番号18)、LLQYQG(配列番号19)、LLQLLQG(配列番号20)、SLLQG(配列番号21)、LLQLQ(配列番号22)、LLQLLQ(配列番号23)及びLLQGR(配列番号24)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。例えば、本明細書の一部を構成するものとしてその内容全体が援用される、国際公開第2012059882号を参照されたい。
「抗体」といった用語は、本明細書で使用される場合、特定の抗原に特異的に結合する、又はこれと相互作用する、少なくとも1つの相補性決定領域(complementarity determining region、CDR)を含む任意の抗原結合分子又は分子複合体を意味する。「抗体」といった用語は、ジスルフィド結合によって相互接続された2つの重鎖(H)及び2つの軽鎖(L)4つのポリペプチド鎖を含む免疫グロブリン分子、並びにその多量体(例えば、IgM)を含む。各重鎖は、重鎖可変領域(本明細書ではHCVR又はVHと略記する)と重鎖定常領域を含む。重鎖定常領域は、3つのドメイン(CH1、CH2及びCH3)を含む。各重鎖は、軽鎖可変領域(本明細書ではLCVR又はVLと略記する)と軽鎖定常領域を含む。軽鎖定常領域は、1つのドメイン(CL1)を含む。VH領域及びVL領域は、フレームワーク領域(framework region、FR)と称される多くの保存領域が散在されている、相補性決定領域(CDR)と称される超可変領域へとさらに細分化されることができる。各VH及びVLは、アミノ末端からカルボキシ末端へとFR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4といった順序で配置されている3つのCDRと4つのFRから構成されている。異なる実施形態では、抗体のFR(又はその抗原結合部分)は、ヒト生殖系列配列と同一であるか、又は天然に若しくは人工的に修飾され得る。アミノ酸コンセンサス配列は、2つ以上のCDRの対照解析に基づいて定義され得る。
「抗体」といった用語は、本明細書で使用される場合、完全抗体分子の抗原結合断片もまた含む。抗体の「抗原結合部分」、抗体の「抗原結合断片」などといった用語は、本明細書で使用される場合、抗原に特異的に結合して複合体を形成する、天然に存在する、酵素的に取得可能である、合成の、又は遺伝子操作された任意のポリペプチド又は糖タンパク質を含む。抗体の抗原結合断片は、抗体の可変ドメイン及び必要に応じて抗体の定常ドメインをコードするDNAの操作及び発現に関与する、タンパク質消化又は組換え遺伝子操作技術などの任意の好適な標準技術を使用し、例えば完全抗体分子から誘導されることができる。かかるDNAは公知であり、かつ/又は例えば商業的供給源、DNAライブラリー(例えば、ファージ抗体ライブラリーを含む)から容易に入手可能であり、又は合成することができる。DNAは、化学的に又は分子生物学技術を使用することで配列決定及び操作し、例えば1つ以上の可変ドメイン及び/若しくは定常ドメインを好適な構成に配置するか、コドンを導入し、システイン残基を生成してアミノ酸を修飾、付加又は欠失させることができる。
抗原結合断片の非限定的な例としては、(i)Fab断片、(ii)F(ab’)2断片、(iii)Fd断片、(iv)Fv断片、(v)単鎖Fv(scFv)分子、(vi)dAb断片、及び(vii)抗体の超可変領域(例えば、CDR3ペプチドなどの単離された相補性決定領域(CDR))又は制限されたFR3-CDR3-FR4ペプチドを模倣するアミノ酸残基からなる最小認識単位が挙げられる。例えばドメイン特異抗体、シングルドメイン抗体、ドメイン欠失抗体、キメラ抗体、CDRグラフト化抗体、ダイアボディ、トリアボディ、テトラボディ、ミニボディ、ナノボディ(例えば、一価ナノボディ、二価ナノボディなど)、小モジュラー免疫薬(small modular immunopharmaceuticals、SMIP)及びサメ可変IgNARドメインなどの他の改変された分子もまた、本明細書で使用される場合、「抗原結合断片」といった表現に包含される。
抗体の抗原結合断片は、典型的には少なくとも1つの可変ドメインを含む。可変ドメインは、任意のサイズ又はアミノ酸組成のものであり得、一般には、1つ以上のフレームワーク配列に隣接している、又はインフレームである少なくとも1つのCDRを含む。VLドメインに関連するVHドメインを有する抗原結合断片では、VHドメイン及びVLドメインは、任意の好適な配置で互いに対して位置づけられ得る。例えば、可変領域は二量体であり、VH-VH、VH-VL又はVL-VL二量体を含有することができる。
あるいは、抗体の抗原結合断片は、単量体VHドメイン又はVLドメインを含有することができる。
ある特定の実施形態では、抗体の抗原結合断片は、少なくとも1つの定常ドメインに共有結合された少なくとも1つの可変ドメインを含有することができる。本明細書の抗体の抗原結合断片内で見出すことができる可変ドメイン及び定常ドメインの非限定的で例示的な構成としては、(i)VH-CH1、(ii)VH-CH2、(iii)VH-CH3、(iv)VH-CH1-CH2、(V)VH-CH1-CH2-CH3、(vi)VH-CH2-CH3、(vii)VH-CL、(viii)VL-CH1、(ix)VL-CH2、(x)VL-CH3、(xi)VL-CH1-CH2、(xii)VL-CH1-CH2-CH3、(xiii)VL-CH2-CH3、及び(xiv)VL-CLが挙げられる。本明細書に列挙された例示的な構成のいずれかを含む、可変ドメイン及び定常ドメインのいずれかの構成では、可変ドメイン及び定常ドメインは、互いに直接結合され得るか、完全若しくは部分的ヒンジ又はリンカー領域によって結合され得る。ヒンジ領域は、単一のポリペプチド分子中の隣接する可変ドメイン及び/又は定常ドメイン間の可動性結合又は半可動性結合をもたらす少なくとも2個(例えば、5個、10個、15個、20個、40個、60個以上)のアミノ酸からなり得る。
さらには、本明細書の抗体の抗原結合断片は、互いに非共有結合で会合した状態で、及び/又は1つ以上の単量体のVH若しくはVLドメインを有する(例えば、ジスルフィド結合による)、本明細書に列挙されている可変及び定常ドメイン構成のうちのいずれかのホモ二量体若しくはヘテロ二量体(又は他の多量体)を含み得る。
完全抗体分子と同様に、抗原結合断片は単一特異性又は多特異性(例えば、二重特異性)であり得る。抗体の多特異性抗原結合断片は、典型的には少なくとも2つの異なる可変ドメインを含み、各可変ドメインは、別個の抗原又は同一の抗原上の異なるエピトープに特異的に結合することが可能である。本明細書に開示される例示的な二重特異性抗体フォーマットを含む、任意の多特異性抗体フォーマットは、当該技術分野で利用可能である日常的な技術を使用して、本明細書の抗体の抗原結合断片に関連する使用に適合され得る。
ある特定の実施形態では、例えば抗GLP1R抗体といった本明細書の抗体はヒト抗体である。本明細書で使用される場合、「ヒト抗体」といった用語は、ヒト生殖系列免疫グロブリン配列に由来する可変領域及び定常領域を有する抗体を含むことを意図している。本明細書のヒト抗体は、例えばCDR、特にCDR3にヒト生殖系列免疫グロブリン配列によってコードされていないアミノ酸残基を含むことができる(例えば、インビトロでのランダム若しくは部位特異的変異原性によって、又はインビボでの体細胞突然変異によって導入される突然変異)。ただし、本明細書で使用される場合、「ヒト抗体」といった用語は、マウスなどの別の哺乳動物種の生殖系列に由来するCDR配列がヒトフレームワーク配列上へとグラフト化された抗体を含むことを意図していない。
抗体は、いくつかの実施形態では、組換えヒト抗体であり得る。本明細書で使用される場合、「組換えヒト抗体」といった用語は、宿主細胞へとトランスフェクトされた組換え発現ベクター(以下でさらに説明される)を使用して発現された抗体、組換えコンビナトリアルヒト抗体ライブラリー(以下でさらに説明される)、ヒト免疫グロブリン遺伝子に遺伝子導入される動物(例えば、マウス)から単離された抗体(例えば、Taylor et al.(1992)Nucl.Acids Res.20:6287-6295)などの組換え手段によって調製、発現、生成若しくは単離される全てのヒト抗体、又はヒト免疫グロブリン遺伝子配列の他のDNA配列へのスプライシングを含む任意の他の手段によって調製、発現、生成若しくは単離された抗体を含むことを意図している。かかる組換えヒト抗体は、ヒト生殖系列免疫グロブリン配列に由来する可変領域及び定常領域を有する。ただしある特定の実施形態では、かかる組換えヒト抗体は、インビトロでの変異原性(又は、ヒトIg配列を遺伝子導入した動物を使用した場合には、インビボ体細胞性変異厳正)に供され、それによって組換え抗体のVH領域及びVL領域のアミノ酸配列は、ヒト生殖系列VH配列及びVL配列に由来し、かつこれに関連していても、インビボでヒト抗体生殖系列レパートリー内に天然に存在しない場合がある。
ヒト抗体は、ヒンジの不均一性に関連する2つの形態で存在し得る。一形態では、免疫グロブリン分子は、二量体が鎖間重鎖ジスルフィド結合によって共に保持されている、およそ150~160kDaの安定した4本鎖構築物を含む。第2の形態では、二量体は鎖間ジスルフィド結合を介して結合されておらず、共有結合された軽鎖及び重鎖から構成された約75~80kDaの分子(半抗体)が形成される。これらの形態は、アフィニティー精製後であったとしても分離するのが極めて困難であった。種々の無処置のIgGアイソタイプでの第2の形態の出現頻度は、抗体のヒンジ領域のアイソタイプに関連する構造的差異に起因するが、これに限定されない。ヒトIgG4ヒンジのヒンジ領域における単一アミノ酸置換は、第2の形態の出現を、ヒトIgG1ヒンジを使用することで典型的には観察されるレベルまで大幅に減少させることができる(Angal et al.(1993)Molecular Immunology30:105)。本明細書は、例えば製造に望ましい可能性があり、所望の抗体形態の収率を向上させることができる、ヒンジであるCH2領域又はCH3領域に1つ以上の変異を有する抗体を包含する。
本明細書の抗体は、単離抗体又は精製抗体であり得る。本明細書で使用される場合、「単離抗体」又は「精製抗体」は、その天然環境の少なくとも1つの成分から同定かつ分離かつ/又は回収される抗体を意味する。例えば、生物のうちの少なくとも1つの成分から、又は抗体が天然に存在する、若しくは天然に産生される組織若しくは細胞から分離又は除去される抗体は、本明細書の目的のための「単離抗体」である。例えば、反応又は反応配列のうちの少なくとも1つの成分から精製された抗体は「精製抗体」であるか、又は抗体を精製することで生じる。単離抗体はまた、組換え細胞内のインサイチュでの抗体も含む。単離抗体は、少なくとも1つの精製工程又は単離工程に供された抗体である。ある特定の実施形態によれば、単離抗体又は精製抗体は、他の細胞物質及び/又は化学物質を実質的には含まないものであり得る。
本明細書に開示される抗体は、抗体が誘導された対応する生殖系列配列と比較すると、重鎖可変ドメイン及び軽鎖可変ドメインのフレームワーク領域及び/又はCDR領域での1つ以上のアミノ酸置換、挿入及び/又は欠失を含み得る。かかる変異は、本明細書に開示されるアミノ酸配列と、例えば公開されている抗体配列データベースから入手された生殖系列配列とを比較することで容易に確認することができる。本明細書は、本明細書に開示されたアミノ酸配列のうちのいずれかから誘導される抗体及びその抗原結合断片を含み、1つ以上のフレームワーク領域及び/又はCDR領域内の1つ以上のアミノ酸は、抗体が誘導された生殖系列配列の対応する1つ以上の残基、又は別のヒト生殖系列配列の対応する1つ以上の残基、又は対応する1つ以上の生殖系列残基のアミノ酸の同義置換へと変異される(かかる配列変化は、本明細書では集合的に「生殖系列変異」と称される)。当業者は、所与の重鎖可変領域配列及び軽鎖可変領域配列から出発して、1つ以上の個体の生殖系列変異又はそれらの組合せを含む多数の抗体及び抗原結合断片を容易に産生させることができる。ある特定の実施形態では、VHドメイン及び/又はVLドメイン内のフレームワーク残基及び/又はCDR残基の全ては、抗体が誘導された元々の生殖系列配列に見出された残基に復帰突然変異する。他の実施形態では、例えば、FR1の最初の8アミノ酸内若しくはFR4の最後の8アミノ酸内に見出される変異残基のみ、又はCDR1、CDR2若しくはCDR3内に見出される変異残基のみといったある特定の残基のみが、元々の生殖系列配列に復帰突然変異する。他の実施形態では、1つ以上のフレームワーク残基及び/又はCDR残基のうちの1つ以上は、異なる生殖系列配列(すなわち、抗体が元々誘導された生殖系列配列とは異なる生殖系列配列)の1つ以上の対応する残基に変異する。
さらには、本明細書の抗体は、フレームワーク領域及び/又はCDR領域内に2つ以上の生殖系列変異の任意の組合せを含有することができる。例えば、ある特定の個々の残基は、特定の生殖系列配列の対応する残基に変異するが、一方で元々の生殖系列配列とは異なるある特定の他の残基は維持されるか、異なる生殖系列配列の対応する残基に変異する。取得されると、1つ以上の生殖系列変異を含有する抗体及び抗原結合断片は、例えば結合特異性の改善、結合親和性の増大、拮抗性又は刺激性生物学的特性の改善又は増強(場合による)、免疫原性の減少、抗体薬物複合体の薬物抗体比(drug-to-antibody ratio、DAR)の改善などの1つ以上の所望の特性について容易に試験することができる。この一般的な様式で取得される抗体及び抗原結合断片は、本明細書の範囲内に包含される。
「グリコシル化(aglycosylated)抗体」といった用語は、トランスグルタミネーション反応を阻害することがあるグリコシル化配列を含まない、例えば1つ以上の重鎖上のN297に糖基を有さない抗体などの抗体を指す。特定の実施形態では、抗体重鎖はN297変異を有する。換言すると、抗体は、Kabat et al.により開示されるEU番号付与スキームに従い、297位にアスパラギン残基をもはや有さないように変異される。特定の実施形態では、抗体重鎖はN297Q変異又はN297D変異を有する。かかる抗体は、グリコシル化配列を除去若しくは無効にするための部位特異的突然変異誘発、又はいずれかのグリコシル化干渉部位若しくは他の干渉構造から離れた部位にグルタミン残基を挿入するための部位特異的突然変異誘発により調製され得る。かかる抗体はまた、天然源又は人工源から単離され得る。グリコシル化(aglycosylated)抗体はまた、T299若しくはS298P若しくは他の変異、又はグリコシル化の欠如によりもたらされた変異の組合せを含む抗体も含む。
「脱グリコシル化抗体」といった用語は、トランスグルタミナーゼ媒介性結合が促進するように糖基が除去された抗体を指す。糖としては、N結合型オリゴ糖が挙げられるがこれに限定されない。いくつかの実施形態では、脱グリコシル化はN297残基で行われる。いくつかの実施形態では、糖基の除去はPNGaseを介して酵素的に達成されるものを含むがこれに限定されない。
「エピトープ」といった用語は、パラトープとして公知である抗体分子の可変領域における特異的抗原結合部位と相互作用する抗原決定因子を指す。単一抗原は2つ以上のエピトープを有し得る。したがって、異なる抗体は抗原上の異なる領域に結合することができ、異なる生物学的効果を有することができる。エピトープは構造的又は線状であり得る。構造的エピトープは、線状ポリペプチド鎖の異なるセグメントから空間的に並置されているアミノ酸により産生される。線状エピトープは、ポリペプチド鎖の隣接するアミノ酸残基により産生される。ある特定の状況では、エピトープは抗原上に糖基、ホスホリル基又はスルホニル基の部分を含むことができる。
「結合タンパク質」又は「結合抗体」といった用語は、本明細書で使用される場合、1つ以上の化学部分に共有結合されているタンパク質又は抗体を指す。化学部分は、本開示のアミン化合物を含むことができる。本開示での使用に好適なリンカー(L)及びペイロード(P)が本明細書に詳細に説明される。特定の実施形態では、治療部分を含む結合抗体は抗体薬物複合体(ADC)であり、抗体ペイロード複合体又は抗体リンカーペイロード複合体とも称される。
「薬物抗体比」又は(DAR)といった用語は、例えば本開示の結合剤に結合する薬物といった治療部分の平均数である。
「リンカー抗体比」又は(LAR)(小文字でも記載される)といった用語は、いくつかの実施形態では、本開示の結合剤に結合される反応性第1級アミン化合物の平均数である。例えば抗体といったかかる結合剤は、例えば好適なアジド又はアルキンを含む第1級アミン化合物と結合され得る。得られた結合剤は、アジド又はアルキンで官能化されるが、これは1,3-環化付加反応を介し、対応するアジド又はアルキンを含む治療部分と後に反応することができる。
「薬学的に許容される量」といった語句は、その必要がある対象における少なくとも1つの健康問題による効果又は症候を治療、低減、緩和又は調節する上で有効又は十分な量を指す。例えば、抗体又は抗体薬物複合体の薬学的に許容される量は、本明細書に提供される抗体又は抗体薬物複合体を使用して生物学的標的を調節するために有効な量である。好適な薬学的に許容される量としては、本明細書に提供される抗体又は抗原薬物複合体の約0.001%~最大約10%、及び約0.01%、約0.02%、約0.03%、約0.04%、約0.05%、約0.06%、約0.07%、約0.08%、約0.09%、約0.1%、約0.2%、約0.3%、約0.4%、約0.5%、約0.6%、約0.7%、約0.8%、約0.9%、約1%、約2%、約3%、約4%、約5%、約6%、約7%、約8%、約9%又は約10%などの間のいずれかの量が挙げられるが、これらに限定されない。
「反応pH」といった語句は、全ての反応成分又は反応物が添加された後の反応のpHを指す。
「実質的な同一性」又は「実質的に同一」といった用語は、核酸又はその断片について言及する際には、別の核酸(又はその相補的ストランド)を用いての適切なヌクレオチド挿入又は欠失と適切にアラインメントした場合、以下で説明されるFASTA、BLAST又はGapなど、任意の周知の配列同一性のアルゴリズムにより測定した際にヌクレオチド塩基の少なくとも約95%、より好ましくは少なくとも約96%、約97%、約98%又は約99%のヌクレオチド配列同一性があることを示す。参照核酸分子に対して実質的な同一性を有する核酸分子は、ある特定の例では、参照核酸分子によりコードされたポリペプチドと同一又は実質的に類似するアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードすることができる。
ポリペプチドに適用する場合、「実質的な類似性」又は「実質的に類似」といった用語は、デフォルトのギャップ重みを使用するGAP又はBESTFITといったプログラムにより最適にアラインメントした場合に、2つのペプチド配列が少なくとも95%の配列同一性、よりさらに好ましくは少なくとも98%又は99%の配列同一性を共有していることを意味している。好ましくは、同一ではない残基位置は、アミノ酸の同義置換によって異なるものとなる。「アミノ酸の同義置換」は、アミノ酸残基が、類似の化学特性(例えば、電荷又は疎水性)を有する側鎖を有する別のアミノ酸残基で置換されることである。一般には、アミノ酸の同義置換はタンパク質の機能的特性を実質的に変化させることがない。2つ以上のアミノ酸配列が同義置換により互いに異なる場合では、配列同一性パーセント又は類似性の程度は、置換の保存的性質を補正するために上方調節することができる。こうした調節を行うための手段は当業者に周知である。例えば、Pearson(1994)Methods Mol.Biol.24:307-331を参照されたい。類似の化学特性を有する側鎖を有するアミノ酸の群の例としては、(1)脂肪族側鎖:グリシン、アラニン、バリン、ロイシン及びイソロイシン、(2)脂肪族ヒドロキシル側鎖:セリン及びスレオニン、(3)アミド含有側鎖:アスパラギン及びグルタミン、(4)芳香族側鎖:フェニルアラニン、チロシン及びトリプトファン、(5)塩基性側鎖:リジン、アルギニン及びヒスチジン、(6)酸性側鎖:アスパルタート及びグルタマート並びに(7)硫黄含有側鎖:システイン及びメチオニン、が挙げられる。いくつかの実施形態では、アミノ酸の同義置換基は、バリン-ロイシン-イソロイシン、フェニルアラニン-チロシン、リジン-アルギニン、アラニン-バリン、グルタマート-アスパルタート及びアスパラギン-グルタミンである。
あるいは、同義置換は、Gonnet et al.(1992)Science 256:1443-1445に開示されているPAM250 log-尤度行列で正の値を有する任意の変化である。「適度な同義」置換は、PAM250 log-尤度行列で負以外の値を有する任意の変化である。
ポリペプチドの配列類似性は、配列同一性とも称されるが、典型的には配列解析ソフトウェアを使用して測定される。タンパク質解析ソフトウェアは、アミノ酸の同義置換を含む種々の置換、欠失及び他の修飾に割り当てられた類似性の基準を使用して類似する配列をマッチさせる。例えば、GCGソフトウェアは、例えば生物のうちの異なる種からの相同ポリペプチドといった関連性が高いポリペプチド間の、又は野生型タンパク質とその変異タンパク質間の配列相同性又は配列同一性を決定するデフォルトパラメータとして使用され得るGap及びBestfitなどのプログラムを含有する。例えば、GCGバージョン6.1を参照されたい。ポリペプチド配列はまた、GCGバージョン6.1のプログラムであるデフォルトの又は推奨パラメータを使用するFASTAを使用して比較され得る。FASTA(例えば、FASTA2及びFASTA3)は、クエリと検索配列との間で最良に重複する領域のアラインメント及び配列同一性パーセントを提供する(前出のPearson(2000))。異なる生物に由来する膨大な数の配列を含有するデータベースと本明細書の配列を比較する場合の別の特定のアルゴリズムは、デフォルトパラメータを使用するコンピュータプログラムであるBLAST、特にBLASTP又はTBLASTNである。例えば、Altschul et al.(1990)J.Mol.Biol.215:403-410及びAltschul et al.(1997)Nucleic Acids Res.25:3389-402を参照されたい。
タンパク質薬物複合体化合物
前述の目的又は他の目的によれば、本開示は、例えば抗体薬物複合体化合物といったタンパク質薬物複合体化合物並びにその前駆体及びその中間体、医薬組成物と、かかる治療の必要がある対象のある特定の疾患を治療するための方法と、を提供する。本開示によれば、本明細書に提供されるタンパク質薬物複合体化合物は、本明細書に記載の例えばGLP1ペプチド模倣薬といった治療部分と結合されている結合剤を含む。
前述の目的又は他の目的によれば、本開示は、例えば抗体薬物複合体化合物といったタンパク質薬物複合体化合物並びにその前駆体及びその中間体、医薬組成物と、かかる治療の必要がある対象のある特定の疾患を治療するための方法と、を提供する。本開示によれば、本明細書に提供されるタンパク質薬物複合体化合物は、本明細書に記載の例えばGLP1ペプチド模倣薬といった治療部分と結合されている結合剤を含む。
一態様では、本開示は、非切断型リンカーを介して1つ以上のGLP1ペプチド模倣薬に結合される、本開示による結合剤を含む化合物(例えば、抗体又はその断片)を提供する。例示的な非限定的例としては、本明細書に記載の式(I)が挙げられる。本開示によるタンパク質薬物複合体の特定の実施形態では、結合剤は抗体(例えば、モノクローナル抗体)であり、「抗体薬物複合体」又はADCといった用語が必要に応じて使用される。
種々の実施形態では、本開示の抗体薬物複合体又はADCは、抗体結合薬物複合体又はATDCである。ATDCは抗体薬物複合体であり、薬物は非切断型リンカーによって抗体に結合されている。いくつかの実施形態では、本開示のATDCの非切断型リンカーは、ATDCが体内(例えば、ヒトの体)に投与された後に安定している。例えば、非切断型リンカーは、血漿(例えば、ヒト血漿)内で安定することができ、細胞表面への結合時に安定することができ、抗体がその標的抗原に結合する際及び/若しくはGLP1ペプチド模倣薬がGLP1Rに結合する際に安定することができる。いくつかの実施形態では、非切断型リンカーは、同一の生理学的条件下ではペイロード又は抗体のいずれかよりもインビボでは安定している。いくつかの実施形態では、本開示のATDCはリソソームで分解されてペイロード、リンカーペイロード、及び/又はそのATDC代謝物/異化生成物を放出してもよく、これらはある特定の実施形態では、局所的又は全身的にGLP1R活性化にとって有効である。
いくつかの実施形態では、ATDCは血漿中で安定し、リソソームで分解する。いくつかの実施形態では、ATDCは血漿中で安定し、リソソームで分解しない。
一態様では、式(A)
BA-(L-P)m (A)、
の構造を有する化合物又は薬学的に許容されるその塩であって、式中、
BAは、抗体又はその抗原結合断片であり、
Lは、非切断型リンカーであり、
Pは、
BA-(L-P)m (A)、
の構造を有する化合物又は薬学的に許容されるその塩であって、式中、
BAは、抗体又はその抗原結合断片であり、
Lは、非切断型リンカーであり、
Pは、
式中、
X1は、H、
X2は、
X3は、結合、-(CH2)2-6-NH-、-(CH2)2-6-Tr-及び-(CH2)2-6-Tr-(CH2)1-6-NHであって、式中、Trはトリアゾール部分である、結合、-(CH2)2-6-NH-、-(CH2)2-6-Tr-及び-(CH2)2-6-Tr-(CH2)1-6-NHから選択され、
nは、0又は1であり、
X4は、-NH2、-OH及び-N(H)(フェニル)から選択され、
X5は、-OH、-NH2、-NH-OH及び
X6は、各発生時に独立してH、-OH、-CH3及び-CH2OHから選択され、
X7は、H、
X8は、H、-OH、-NH2及び
Arは、
X9は、-NH2、
mは、1~4の整数である、ペイロードである、化合物又は薬学的に許容されるその塩が本明細書に提供される。
一実施形態では、mは1である。一実施形態では、mは2~4の整数である。一実施形態では、mは2である。
一態様では、本開示は、式(I)
BA-L-P (I)、
の構造を有する化合物又は薬学的に許容されるその塩であって、式中、
BAは、抗体又はその抗原結合断片であり、
Lは、非切断型リンカーであり、
Pは、
BA-L-P (I)、
の構造を有する化合物又は薬学的に許容されるその塩であって、式中、
BAは、抗体又はその抗原結合断片であり、
Lは、非切断型リンカーであり、
Pは、
式中、
X1は、H、
X2は、
X3は、-(CH2)2-6-NH-及び-(CH2)2-6-Tr-であって、式中、Trはトリアゾール部分である、-(CH2)2-6-NH-及び-(CH2)2-6-Tr-から選択され、
nは、0又は1であり、
X4は、H及びフェニルから選択され、
X5は、-OH、-NH2、-NH-OH及び
X6は、各発生時に独立してH、-OH、-CH3及び-CH2OHから選択され、
X7は、H、
X8は、H、-OH、-NH2及び
リンカーL
一実施形態では、本開示によるリンカーLは、非切断型リンカー、すなわち安定しており、抗体と薬物の間、例えばGLP1R標的抗体とGLP1ペプチド模倣ペイロードPとの間に共有結合を提供するリンカーである。いくつかの実施形態では、本開示の非切断型リンカーLは、ATDCが体内(例えば、ヒトの体)に投与された後に安定している。例えば、リンカーLは、血漿(例えば、ヒト血漿)内で安定することができ、細胞表面への結合時に安定することができ、抗体がその標的抗原に結合する際及び/若しくはGLP1ペプチド模倣薬がGLP1Rに結合する際に安定することができる。いくつかの実施形態では、リンカーLは、同一の生理学的条件下ではペイロード又は抗体のいずれかよりもインビボでは安定している。
一実施形態では、本開示によるリンカーLは、非切断型リンカー、すなわち安定しており、抗体と薬物の間、例えばGLP1R標的抗体とGLP1ペプチド模倣ペイロードPとの間に共有結合を提供するリンカーである。いくつかの実施形態では、本開示の非切断型リンカーLは、ATDCが体内(例えば、ヒトの体)に投与された後に安定している。例えば、リンカーLは、血漿(例えば、ヒト血漿)内で安定することができ、細胞表面への結合時に安定することができ、抗体がその標的抗原に結合する際及び/若しくはGLP1ペプチド模倣薬がGLP1Rに結合する際に安定することができる。いくつかの実施形態では、リンカーLは、同一の生理学的条件下ではペイロード又は抗体のいずれかよりもインビボでは安定している。
一実施形態では、リンカーLは式(L’)
-La-Y-Lp (L’)、
の構造であって、式中、Laは、抗体又はこその抗原結合断片に共有結合された第1のリンカーであり、
Yは、トリアゾール、ディールス・アルダー付加物、又はチオール-マレイミド付加物を含む基であり、
Lpは、存在しない、又は本開示によるペイロードPに共有結合された第2のリンカーであり、Lpが存在しないときにはYもまた存在しない、構造を有する。
-La-Y-Lp (L’)、
の構造であって、式中、Laは、抗体又はこその抗原結合断片に共有結合された第1のリンカーであり、
Yは、トリアゾール、ディールス・アルダー付加物、又はチオール-マレイミド付加物を含む基であり、
Lpは、存在しない、又は本開示によるペイロードPに共有結合された第2のリンカーであり、Lpが存在しないときにはYもまた存在しない、構造を有する。
一実施形態では、Yはトリアゾールを含む基である。
別の実施形態では、Yはディールス・アルダー付加物を含む基である。
一実施形態では、リンカーLは式(L’)
-La-Y-Lp (L’)、
の構造であって、式中、Laは、抗体又はその抗原結合断片に共有結合された第1のリンカーであり、
Yは、トリアゾールを含む基であり、
Lpは、存在しない、又は本開示によるペイロードPに共有結合された第2のリンカーである、構造を有する。
-La-Y-Lp (L’)、
の構造であって、式中、Laは、抗体又はその抗原結合断片に共有結合された第1のリンカーであり、
Yは、トリアゾールを含む基であり、
Lpは、存在しない、又は本開示によるペイロードPに共有結合された第2のリンカーである、構造を有する。
一実施形態では、Laは、C1-6アルキル、フェニル、-NH-、-C(O)-、-(CH2)u-NH-C(O)-、-(CH2)u-C(O)-NH-、-(CH2-CH2-O)v-、-(CH2)u-(O-CH2-CH2)v-C(O)-NH-、2個~4個のアミノ酸を含むペプチド単位、又はそれらの組合せを含み、これらのそれぞれが、-S-、-S(O2)-、-C(O)-、-C(O2)-及びCO2Hのうちの1つ以上で必要に応じて置換されてもよく、式中、下に付いているu及びvが独立して1~8の整数である。
一実施形態では、Laは、
一実施形態では、-La-は、
式中、
一実施形態では、-La-は、
別の実施形態では、-La-は、
式中、
いくつかの実施形態では、Laは、1~36個の-CH2CH2O-(EG)単位を有するポリエチレングリコール(PEG)セグメントを含む。いくつかの実施形態では、PEGセグメントは4個のEG単位、又は8個のEG単位、又は12個のEG単位、又は24個のEG単位を含む。いくつかの実施形態では、PEGセグメントは8個のEG単位を含む。いくつかの実施形態では、Laは、
いくつかの実施形態では、Laは、グリシン、スレオニン、セリン、グルタミン、グルタミン酸、アラニン、バリン、ロイシン及びプロリン、並びにそれらの組合せから選択される1つ以上のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、Laは1~10個のグリシンと、1~6個のセリンと、を含む。いくつかの実施形態では、Laは4個のグリシンと、1個のセリンと、を含む。いくつかの実施形態では、Laは、Gly-Gly-Gly-Gly-Ser(G4S)(配列番号1)、Ser-Gly-Gly-Gly-Gly(SG4)(配列番号2)、Gly-Gly-Ser-Gly-Gly-Ser-Gly-Gly(G2S-G2S-G2)及びGly-Gly-Gly-Gly-Ser-Gly-Gly-Gly-Gly(G4S-G4)(配列番号3)からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、Laは、1~36個のEG単位を有するPEGセグメントと、グリシン、スレオニン、セリン、グルタミン、グルタミン酸、アラニン、バリン、ロイシン及びプロリン、並びにそれらの組合せから選択される1つ以上のアミノ酸との組合せを含む。いくつかの実施形態では、Laは、
いくつかの実施形態では、Laは-(CH2)2-24-鎖を含む。いくつかの実施形態では、いくつかの実施形態では、Laは、-(CH2)2-24-鎖と、1~36個のEG単位を有するPEGセグメントと、グリシン、スレオニン、セリン、グルタミン、グルタミン酸、アラニン、バリン、ロイシン及びプロリン、並びにそれらの組合せから選択される1つ以上のアミノ酸との組合せを含む。Laは、
一実施形態では、Yは、
一実施形態では、リンカーL又は第1のリンカーLa又は第2のリンカーLpは、1~36個の-CH2CH2O-(EG)単位を有するポリエチレングリコール(PEG)セグメントを含む。
一実施形態では、PEGセグメントは2~30個のEG単位又は4~24個のEG単位を含む。一実施形態では、PEGセグメントは2個のEG単位、又は4個のEG単位、又は6個のEG単位、又は8個のEG単位、又は10個のEG単位、又は12個のEG単位、又は14個のEG単位、又は16個のEG単位、又は18個のEG単位、又は20個のEG単位、又は22個のEG単位、又は24個のEG単位を含む。
一実施形態では、PEGセグメントは4個のEG単位を含む。一実施形態では、PEGセグメントは8個のEG単位を含む。一実施形態では、PEGセグメントは12個のEG単位を含む。一実施形態では、PEGセグメントは24個のEG単位を含む。
一実施形態では、PEGセグメントは4~8個のEG単位を含む。一実施形態では、PEGセグメントは4個のEG単位又は8個のEG単位を含む。
一実施形態では、Laは3個のEG単位を有するPEGセグメントを含む。
一実施形態では、Lpは4個のEG単位を有するPEGセグメントを含む。一実施形態では、Lpは8個のEG単位を有するPEGセグメントを含む。
一実施形態では、Y-Lpは、
式中、pは1~36の整数である、構造を有する。
一実施形態では、Y-Lpは、
式中、pは1~36の整数である、構造を有する。
別の実施形態では、リンカーL又は第1のリンカーLa又は第2のリンカーLpは、グリシン、セリン、グルタミン酸、アラニン、バリン及びプロリン、並びにそれらの組合せから選択される1つ以上のアミノ酸を含む。
一実施形態では、リンカーL又は第1のリンカーLa又は第2のリンカーLpは、1~10個のグリシン、又は2個のグリシン、又は3個のグリシン、又は4個のグリシン、又は5個のグリシン、又は6個のグリシン、又は7個のグリシン、又は8個のグリシン、又は9個のグリシン、又は10個のグリシンを含む。
一実施形態では、リンカーL又は第1のリンカーLa又は第2のリンカーLpは、1~6個のセリン、又は1個のセリン、又は2個のセリン、又は3個のセリン、又は4個のセリン、又は5個のセリン、又は6個のセリンを含む。
一実施形態では、リンカーL又は第1のリンカーLa又は第2のリンカーLpは、1~10個のグリシンと、1~6個のセリンと、を含む。
一実施形態では、リンカーL又は第1のリンカーLa又は第2のリンカーLpは、4個のグリシンと、1個のセリンと、を含む。
一実施形態では、リンカーL又は第1のリンカーLa又は第2のリンカーLpは、Gly-Gly-Gly-Gly-Ser(G4S)(配列番号1)、Ser-Gly-Gly-Gly-Gly(SG4)(配列番号2)及びGly-Gly-Gly-Gly-Ser-Gly-Gly-Gly-Gly-Ser(G4S-G4S)(配列番号3)からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、1個以上のセリン残基は例えばグルコース基などの炭水化物基を含む。
一実施形態では、リンカーL又は第1のリンカーLa又は第2のリンカーLpは、1~10個のグルタミン酸及び1~10個のグリシンを含む。
いくつかの実施形態では、リンカーL又は第1のリンカーLa又は第2のリンカーLpは、1~36個の-CH2CH2O-(EG)単位を有するポリエチレングリコール(PEG)セグメントとグリシン、セリン、グルタミン酸、アラニン、バリン及びプロリン、並びにそれらの組合せから選択される1つ以上のアミノ酸との組合せを含む。
一実施形態では、リンカーL又は第1のリンカーLa又は第2のリンカーLpは、1~36個のEG単位を有するPEGセグメントと、1~10個のグリシンと、の組合せを含む。一実施形態では、リンカーL又は第1のリンカーLa又は第2のリンカーLpは、1~36個のEG単位を有するPEGセグメントと、Gly-Gly-Gly-Gly-Ser(G4S)(配列番号1)、Ser-Gly-Gly-Gly-Gly(SG4)(配列番号2)及びGly-Gly-Gly-Gly-Ser-Gly-Gly-Gly-Gly-Ser(G4S-G4S)(配列番号3)から選択される群との組合せを含む。
一実施形態では、リンカーL又は第1のリンカーLa又は第2のリンカーLpは、
式中、Yは、例えば上に示されるように、トリアゾールを含む基であり、Pはペイロードであり、式中、Rcは水素(H)及びグルコースから選択され、gは1~10の整数であり、sは0~4の整数である、構造を有する。
一実施形態では、Y-Lpは、
一実施形態では、リンカーLはシクロデキストリン部分を含む。
いくつかの実施形態では、リンカーLは、グルタミン残基を介して、抗体又はその抗原結合断片に結合される。いくつかの実施形態では、リンカーLは、リジン残基を介して、抗体又はその抗原結合断片に結合される。いくつかの実施形態では、リンカーLは、システイン残基を介して、抗体又はその抗原結合断片に結合される。
ペイロードP
一態様では、本開示によるペイロードPは、式(P-IB)、式(P-IIB)及び式(P-IIIB)
一態様では、本開示によるペイロードPは、式(P-IB)、式(P-IIB)及び式(P-IIIB)
X1は、H、
X2は、
X3は、-CH3、-(CH2)2-6-NH2-、-(CH2)2-6-N3及び-(CH2)2-6-Tr-(CH2)1-6-NH2であって、式中、Trはトリアゾール部分である、-CH3、-(CH2)2-6-NH2-、-(CH2)2-6-N3及び-(CH2)2-6-Tr-(CH2)1-6-NH2から選択され、
nは、0又は1であり、
X4は、-NH2、-OH及び-N(H)(フェニル)から選択され、
X5は、-OH、-NH2、-NH-OH及び
X6は、各発生時に独立してH、-OH、-CH3及び-CH2OHから選択され、
X7は、H、
X8は、H、-OH、-NH2及び
Arは、
X9は、-NH2、
mは、1~4の整数である、式の構造又は薬学的に許容されるその塩を有する。
一実施形態では、本開示によるペイロードPは、式(II)
式中、
X1は、H、
X2は、
X3は、-(CH2)2-6-NH2-、-(CH2)2-6-N3及び-CH3から選択されるが、X3が-CH3といった条件では、nは1であり、少なくとも1個の発生においてRaが-(CH2)2-6-NH2-、-(CH2)2-6-N3から選択され、
nは、0又は1であり、
mは、0~3の整数であり、
Raは、各発生時に独立して-CH3、-(CH2)2-6-NH2及び-(CH2)2-6-N3から選択され、
X4は、H及びフェニルから選択され、
X5は、-OH、-NH2、-NH-OH及び
X6は、各発生時に独立してH、-OH、-CH3及び-CH2OHから選択され、
X7は、H、
X8は、H、-OH、-NH2及び
一実施形態では、ペイロードPは、
一実施形態では、ペイロードは、上に示す式(P-I)の構造であって、式中、
・X1は、Hであり、X2は、
・X1は、Hであり、X2は、
・X1は、
・X1は、
・X1は、
・X1は、
・X1は、
・X1は、
・X1は、
・X1は
・X1は
・X1は
・X1は
・X1はHであり、X2は
・X1は
・X1は
・X1は
一実施形態では、ペイロードは、上に示す式(P-II)の構造であって、式中、X1は
一実施形態では、本開示によるペイロードPは、
一実施形態では、上記のペイロードは以下の特性:
いくつかの実施形態では、本開示のペイロードは、結合剤(例えば、抗体)との結合に適している。
リンカーペイロード(L-P)
一実施形態では、本開示は、上記のペイロードPと、抗体又はその抗原結合断片に共有結合可能なリンカーと、を含む、反応性リンカーペイロードを提供する。
一実施形態では、本開示は、上記のペイロードPと、抗体又はその抗原結合断片に共有結合可能なリンカーと、を含む、反応性リンカーペイロードを提供する。
一実施形態では、本開示によるリンカーペイロードは、式(C):
Lpは、存在しない、又は
Qは、-NH2、-N3、
X1は、H、
X2は、
X3は、-CH3、-(CH2)2-6-NH2-、-(CH2)2-6-N3及び-(CH2)2-6-Tr-(CH2)1-6-NH2であって、式中、Trはトリアゾール部分である、-CH3、-(CH2)2-6-NH2-、-(CH2)2-6-N3及び-(CH2)2-6-Tr-(CH2)1-6-NH2から選択され、
nは、0又は1であり、
X4は、-NH2、-OH及び-N(H)(フェニル)から選択され、
X5は、-OH、-NH2、-NH-OH及び
X6は、各発生時に独立してH、-OH、-CH3及び-CH2OHから選択され、
X7は、H、
X8は、H、-OH、-NH2及び
Arは、
X9は、-NH2、
mは、1~4の整数である、構造又は薬学的に許容されるその塩を有する。
一実施形態では、本開示によるリンカーペイロードは、式(III)
Lpは、存在しない、又は
Qは、-N3、
X1は、H、
X2は、
X3は、-(CH2)2-6-NH2-、-(CH2)2-6-N3及び-CH3から選択されるが、X3が-CH3といった条件では、nは1であり、少なくとも1個の発生においてRaが-(CH2)2-6-NH2-、-(CH2)2-6-N3から選択され、
nは、0又は1であり、
Raは、各発生時に独立してH、-CH3、-(CH2)2-6-NH2及び-(CH2)2-6-N3から選択され、
X4は、H及びフェニルから選択され、
X5は、-OH、-NH2、-NH-OH及び
X6は、各発生時に独立してH、-OH、-CH3及び-CH2OHから選択され、
X7は、H、
X8は、H、-OH、-NH2及び
構造並びに薬学的に許容されるその塩を有する。
一実施形態では、リンカーペイロードLPはシクロデキストリン部分を含む。いくつかの実施形態では、シクロデキストリン部分を含むリンカーペイロードLPはGLP1Rアゴニズム活性を呈する。
一実施形態では、本開示によるリンカーペイロードLPは、
一実施形態では、上記のリンカーペイロードは、以下の特性:
結合剤
一実施形態では、本明細書に記載のタンパク質薬物複合体実施形態の有効性は、その結合パートナーに結合する結合剤の選択性に依存する。本開示の一実施形態では、結合剤は、いくらかの特異性を有した状態で所与の結合パートナーに結合可能な任意の分子である。一実施形態では、結合剤は哺乳動物内に存在し、相互作用によって治療的使用がもたらされ得る。代替的な実施形態では、結合剤はインビトロであり、その相互作用によって診断用途がもたらされ得る。いくつかの態様では、結合剤は細胞又は細胞集団に結合可能である。
一実施形態では、本明細書に記載のタンパク質薬物複合体実施形態の有効性は、その結合パートナーに結合する結合剤の選択性に依存する。本開示の一実施形態では、結合剤は、いくらかの特異性を有した状態で所与の結合パートナーに結合可能な任意の分子である。一実施形態では、結合剤は哺乳動物内に存在し、相互作用によって治療的使用がもたらされ得る。代替的な実施形態では、結合剤はインビトロであり、その相互作用によって診断用途がもたらされ得る。いくつかの態様では、結合剤は細胞又は細胞集団に結合可能である。
本開示の好適な結合剤としては、結合パートナーに結合するタンパク質が挙げられる。好適な結合剤としては、抗体、リンホカイン、ホルモン、成長因子、ウイルス受容体、インターロイキン又は他の細胞結合若しくはペプチド結合分子若しくは物質が挙げられるが、これらに限定されない。
一実施形態では、結合剤は抗体である。ある特定の実施形態では、抗体は、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、抗体断片(Fab、Fab’及びF(ab)2、ミニボディ、ダイアボディ、トリボディなど)から選択される。本明細書の抗体は、本明細書の一部を構成するものとしてその内容全体が援用されている、米国特許第6,596,541号及び米国特許出願公開第2012/0096572号に記載の方法を使用してヒト化され得る。本開示のタンパク質薬物複合体化合物のある特定の実施形態では、BAはヒト化モノクローナル抗体である。例えば、BAはGLP1Rに結合するモノクローナル抗体であり得る。
本開示では、抗体は、当業者に好適であると考えられる任意の抗体であり得る。いくつかの実施形態では、リンカー又はリンカーペイロードは、抗体又はその抗原結合断片の一方又は両方の重鎖に結合される。いくつかの実施形態では、リンカー又はリンカーペイロードは、抗体又はその抗原結合断片の一方又は両方の重鎖可変ドメインに結合される。
いくつかの実施形態では、リンカー又はリンカーペイロードは、抗体又はその抗原結合断片の一方又は両方の重鎖可変ドメインのN末端に結合される。いくつかの実施形態では、リンカー又はリンカーペイロードは、抗体又はその抗原結合断片の両方の重鎖可変ドメインのN末端に結合される。いくつかの実施形態では、リンカー又はリンカーペイロードは、抗体又はその抗原結合断片の一方又は両方の軽鎖に結合される。いくつかの実施形態では、リンカー又はリンカーペイロードは、抗体又はその抗原結合断片の一方又は両方の軽鎖可変ドメインに結合される。いくつかの実施形態では、リンカー又はリンカーペイロードは、抗体又はその抗原結合断片の一方又は両方の軽鎖可変ドメインのN末端に結合される。いくつかの実施形態では、リンカー又はリンカーペイロードは、抗体又はその抗原結合断片の両方の軽鎖可変ドメインのN末端に結合される。
いくつかの実施形態では、リンカー又はリンカーペイロードは、抗体又はその抗原結合断片の一方又は両方の重鎖可変ドメインのC末端に結合される。いくつかの実施形態では、リンカー又はリンカーペイロードは、抗体又はその抗原結合断片の両方の重鎖可変ドメインのC末端に結合される。いくつかの実施形態では、リンカー又はリンカーペイロードは、抗体又はその抗原結合断片の一方又は両方の軽鎖に結合される。いくつかの実施形態では、リンカー又はリンカーペイロードは、抗体又はその抗原結合断片の一方又は両方の軽鎖可変ドメインに結合される。いくつかの実施形態では、リンカー又はリンカーペイロードは、抗体又はその抗原結合断片の一方又は両方の軽鎖可変ドメインのC末端に結合される。いくつかの実施形態では、リンカー又はリンカーペイロードは、抗体又はその抗原結合断片の両方の軽鎖可変ドメインのC末端に結合される。
いくつかの実施形態では、抗体は少なくとも1つのポリペプチド鎖配列中に少なくとも1つのグルタミン残基を含む。ある特定の実施形態では、抗体は1つ以上のGln295残基を含む。ある特定の実施形態では、抗体はそれぞれが1つのGln295残基を有する2つの重鎖ポリペプチドを含む。さらなる実施形態では、抗体は、重鎖295以外の部位に1つ以上のグルタミン残基を含む。かかる抗体は、1つ以上のグルタミン残基を含むように天然源から単離され得るか、遺伝子改変され得る。グルタミン残基を抗体ポリペプチド鎖に遺伝子操作するための技術は、当業者の技能の範囲内である。ある特定の実施形態では、グルタミン残基は抗体ポリペプチド鎖のN末端に導入される。一実施形態では、グルタミン残基は、抗体の一方又は両方の重鎖のN末端に導入される。一実施形態では、グルタミン残基は、抗体の両方の重鎖のN末端に導入される。別の実施形態では、グルタミン残基は、抗体の一方又は両方の軽鎖のN末端に導入される。一実施形態では、グルタミン残基は、抗体の両方の軽鎖のN末端に導入される。別の実施形態では、グルタミン残基は、抗体の一方又は両方の重鎖及び一方又は両方の軽鎖のN末端に導入される。
ある特定の実施形態では、グルタミン残基は抗体ポリペプチド鎖のC末端に導入される。一実施形態では、グルタミン残基は、抗体の一方又は両方の重鎖のC末端に導入される。一実施形態では、グルタミン残基は、抗体の両方の重鎖のC末端に導入される。別の実施形態では、グルタミン残基は、抗体の一方又は両方の軽鎖のC末端に導入される。一実施形態では、グルタミン残基は、抗体の両方の軽鎖のC末端に導入される。別の実施形態では、グルタミン残基は、抗体の一方又は両方の重鎖及び一方又は両方の軽鎖のC末端に導入される。
ある特定の実施形態では、抗体又はその抗原結合断片は、TGase認識タグを含むように修飾されている。好適なTGase認識タグは、本明細書に記載のものを含む。
ある特定の実施形態では、抗体又はその抗原結合断片は、一方又は両方の抗体軽鎖のN末端にQタグを含むように修飾されている。ある特定の実施形態では、抗体又はその抗原結合断片は、両方の抗体軽鎖のN末端にQタグを含むように修飾されている。
ある特定の実施形態では、抗体又はその抗原結合断片は、一方又は両方の抗体重鎖のN末端にQタグを含むように修飾されている。ある特定の実施形態では、抗体又はその抗原結合断片は、両方の抗体重鎖のN末端にQタグを含むように修飾されている。
ある特定の実施形態では、抗体又はその抗原結合断片は、一方又は両方の抗体軽鎖のC末端にQタグを含むように修飾されている。ある特定の実施形態では、抗体又はその抗原結合断片は、両方の抗体軽鎖のC末端にQタグを含むように修飾されている。
ある特定の実施形態では、抗体又はその抗原結合断片は、一方又は両方の抗体重鎖のC末端にQタグを含むように修飾されている。ある特定の実施形態では、抗体又はその抗原結合断片は、両方の抗体重鎖のC末端にQタグを含むように修飾されている。
ある特定の実施形態では、抗体又はその抗原結合断片はグリコシル化(aglycosylated)されている。ある特定の実施形態では、抗体抗原結合断片は脱グリコシル化されている。ある特定の実施形態では、抗体抗原結合断片はFab断片である。
抗体は、当業者に公知の任意の形態であり得る。ある特定の実施形態では、抗体は軽鎖を含む。ある特定の実施形態では、抗体はκ軽鎖を含む。ある特定の実施形態では、抗体はλ軽鎖を含む。
ある特定の実施形態では、抗体は重鎖を含む。いくつかの態様では、重鎖はIgAである。いくつかの態様では、重鎖はIgDである。いくつかの態様では、重鎖はIgEである。いくつかの態様では、重鎖はIgGである。いくつかの態様では、重鎖はIgMである。いくつかの態様では、重鎖はIgG1である。いくつかの態様では、重鎖はIgG2である。いくつかの態様では、重鎖はIgG3である。いくつかの態様では、重鎖はIgG4である。いくつかの態様では、重鎖はIgA1である。いくつかの態様では、重鎖はIgA2である。
いくつかの実施形態では、抗体は抗体断片である。いくつかの態様では、抗体断片はFv断片である。いくつかの態様では、抗体断片はFab断片である。いくつかの態様では、抗体断片はF(ab’)2断片である。いくつかの態様では、抗体断片はFab’断片である。いくつかの態様では、抗体断片はscFv(sFv)断片である。いくつかの態様では、抗体断片はscFv-Fc断片である。
いくつかの実施形態では、抗体はモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、抗体はポリクローナル抗体である。
いくつかの実施形態では、抗体はキメラ抗体である。いくつかの実施形態では、ヒト化抗体である。いくつかの実施形態では、抗体はヒト抗体である。
抗体は、当業者に好適であると考えられる任意の抗原への結合特異性を有することができる。ある特定の実施形態では、抗原は膜貫通分子(例えば、受容体)又は成長因子である。例示的な抗原としては、GLP1Rなどの分子が挙げられるが、これに限定されない。
本明細書のいくつかの実施形態は、治療用途又は診断用途にとって標的特異的である。
いくつかの実施形態では、結合剤は抗グルカゴン様ペプチド1受容体(GLP1R)、すなわち抗GLP1R抗体又はその抗原結合断片である。いくつかの実施形態では、結合剤は抗GLP1Rアゴニスト抗体又はその抗原結合断片である。
いくつかの実施形態では、好適な抗GLP1R抗体は、本明細書の一部を構成するものとしてその内容全体が援用されている米国特許出願公開番号20060275288号に開示されたものである。本開示による例示的な抗GLP1R抗体は、5A10及び9A10を含む。
いくつかの実施形態では、好適な抗GLP1R抗体としては、AB9433-I、h38C2、PA5-111834、NLS1205、MAB2814、EPR21819及びグルタズマブが挙げられるがこれらに限定されない。
本開示はまた、抗GLP1R抗体又はその一部分をコードする核酸分子も提供する。抗GLP1R抗体の重鎖可変領域又は軽鎖可変領域を含むポリペプチドを発現することが可能である組換え発現ベクターもまた、本開示の範囲内に含まれる。例えば、本開示は上述の核酸分子のうちのいずれかを含む組換え発現ベクターを含む。かかるベクターが導入される宿主細胞、並びに抗体又は抗体断片の産生が可能である条件下で宿主細胞を培養することで抗体又はその一部分を産生し、産生した抗体及び抗体断片を回収する方法が、本開示の範囲内にさらに含まれる。
いくつかの実施形態では、本開示は修飾グリコシル化パターンを有する抗GLP1R抗体を含む。いくつかの実施形態では、望ましくないグリコシル化部位を除去するための修飾が有用であり得る。これはすなわち、例えば抗体依存性細胞傷害作用(antibody dependent cellular cytotoxicity、ADCC)機能を増大させるために、オリゴ糖鎖上に存在するフコース部分を欠いている抗体である(Shield et al.(2002)JBC 277:26733を参照されたい)。他の用途では、ガラクトシル化の修飾は、補体依存性細胞傷害(complement dependent cytotoxicity、CDC)を修飾するために行われ得る。
別の態様では、本開示は、GLP1R及び薬学的に許容される担体に特異的に結合する組換えヒト抗体又はその断片を含む医薬組成物を提供する。関連する態様では、本開示は、抗GLP1R抗体と第2の治療薬との組合せである組成物を含む。一実施形態では、第2の治療薬は、抗GLP1R抗体と有利には組み合わせられる任意の薬剤である。本開示の抗GLP1R抗体を含む、さらなる併用療法及び合剤は本明細書の他の箇所で開示されている。
別の態様では、本開示は、本開示の抗GLP1R抗体を使用してGLP1Rを発現する細胞を標的化する治療方法を提供する。この治療方法は、本開示の抗GLP1R抗体を含む医薬組成物の治療有効量を、その必要がある対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、細胞は哺乳類細胞である。いくつかの実施形態では、細胞はヒト細胞である。いくつかの実施形態では、細胞は膵臓細胞、脳細胞、心臓細胞、血管組織細胞、腎細胞、脂肪組織細胞、肝臓細胞又は筋細胞である。一実施形態では、細胞は膵臓細胞又は脳細胞である。
いくつかの場合では、抗GLP1R抗体(又はその抗原結合断片)は、細胞内でGLP1R活性を増強させるために使用され得る。
本開示は、GLP1R発現細胞に関連する疾患又は障害(例えば、2型糖尿病及び/又は肥満)を治療するための薬物の製造における本開示の抗GLP1R抗体の使用もまた含む。一態様では、本開示は、医薬に使用するための、本明細書に開示される抗GLP1R抗体又は抗原結合断片を含む化合物に関する。一態様では、本開示は、医薬に使用するための、本明細書に開示される抗体薬物複合体(ADC)を含む化合物に関する。
さらに別の態様では、本開示は、例えばイメージング試薬などの診断用途のための単一特異性抗GLP1R抗体を提供する。
本開示は、ヒトGLP1Rへの結合について、本明細書に記載の抗体と競合する抗体又は抗原結合断片をさらに含む。
本開示は、本明細書に記載の抗体と同一のヒトGLP1R上のエピトープに結合する抗体又はその抗原結合断片をさらに含む。
一態様では、本開示は、上記の抗GLP1R抗体又はその抗原結合断片及び治療薬(例えば、GLP1ペプチド模倣薬)を含む抗体薬物複合体を提供する。いくつかの実施形態では、抗体又は抗原結合断片及びペイロードは、上に説明されるように、リンカーを介して共有結合される。種々の実施形態では、抗GLP1R抗体又は抗原結合断片は、本明細書に記載の抗GLP1R抗体又は断片のうちのいずれかであり得る。いくつかの実施形態では、本開示の抗体薬物複合体は血漿中で安定している。血漿安定性は、以下の実施例8.2又は実施例10に記載のものなどのインビトロ又はインビボ血漿安定性アッセイを使用して決定されてもよい。いくつかの実施形態では、本開示の抗体薬物複合体は、血漿中での半減期は、4日間よりも長い、5日間よりも長い、6日間よりも長い、7日間よりも長い、8日間よりも長い、9日間よりも長い、10日間よりも長い、11日間よりも長い、12日間よりも長い、13日間よりも長い、2週間よりも長い、3週間よりも長い、4週間よりも長い、約1週間、約2週間、約3週間、約4週間、約1ヶ月、約2ヶ月、約3ヶ月、約4ヶ月、約5ヶ月、約6ヶ月、5~10日間、8~12日間、10~15日間、12~18日間、15~20日間、20~30日間、1~2週間、2~3週間、3~4週間、4~6週間、5~8週間、6~10週間、1~2ヶ月、1.5~3ヶ月、2~4ヶ月、2.5ヶ月~5ヶ月、3~6ヶ月又は4~6ヶ月間である。
いくつかの実施形態では、本開示の抗体薬物複合体は、他のGタンパク質共役型受容体(GPCR)よりも少なくとも10倍大きい親和性でGLP1Rに結合する。いくつかの実施形態では、本開示の抗体薬物複合体は、他のGタンパク質共役型受容体(GPCR)よりも少なくとも20倍、50倍、100倍、500倍、1000倍、10,000倍大きい親和性でGLP1Rに結合する。いくつかの実施形態では、かかる抗体薬物複合体は、GLP1R以外でGPCRに対して本質的に検出不可能である結合を呈する。標的分子に対する抗体薬物複合体の結合は、ルシフェラーゼレポーターアッセイ、表面プラズモン共鳴法、酵素結合免疫吸着検定法(enzyme-linked immunosorbent assay、ELISA)、放射免疫測定法(radioimmunoassay、RIA)、FACS解析又はウェスタンブロットアッセイなど、当該関連技術分野に利用可能である標準的な結合アッセイを使用して測定され得る。GLP1R以外のGPCRの例としては、GIPR、GLP2R及びGCGRが挙げられるが、これらに限定されない。
ある特定の実施形態では、本開示の抗体薬物複合体は、リンカーペイロードと結合した抗GLP1R抗体又はその抗原結合断片を含み、リンカーペイロードは、軽鎖のN末端で抗体又はその抗原結合断片に結合される。一実施形態では、本開示の抗体薬物複合体は、リンカーペイロードと軽鎖のN末端で結合されている抗GLP1R抗体又はその抗原結合断片を含み、ペイロードは以下の構造:
ある特定の実施形態では、本開示の抗体薬物複合体は、2つのリンカーペイロードと結合した抗GLP1R抗体又はその抗原結合断片を含み、各リンカーペイロードは、軽鎖のN末端で抗体又はその抗原結合断片に結合される。一実施形態では、本開示の抗体薬物複合体は、各抗体ごとに合計2つのリンカーペイロードのリンカーペイロードと軽鎖のN末端で結合されている抗GLP1R抗体又はその抗原結合断片を含み、ペイロードは以下の構造:
さらに別の態様では、グルカゴン様ペプチド1受容体(GLP1R)標的抗体又はその抗原結合断片と、構造:
式中、
一実施形態では、ペイロードは、構造:
さらに別の態様では、グルカゴン様ペプチド1受容体(GLP1R)標的抗体又はその抗原結合断片と、構造:
式中、
一実施形態では、リンカーペイロードは、構造:
抗体結合
抗体又は抗原結合断片の残基に結合するための技術及びリンカーは、当該技術分野で公知である。本開示の状況で使用され得る例示的なアミノ酸結合は、例えば、リジン(例えば、米国特許第5,208,020号;米国特許出願第2010/0129314号;Hollander et al.,Bioconjugate Chem.,2008,19:358-361;国際公開第2005/089808号;米国特許第5,714,586号;米国特許出願第2013/0101546号;及び米国特許出願第2012/0585592号を参照されたい)、システイン(例えば、米国特許出願第2007/0258987号;国際公開第2013/055993号;国際公開第2013/055990号;国際公開第2013/053873号;国際公開第2013/053872号:国際公開第2011/130598号;米国特許出願第2013/0101546号;及び米国特許第7,750,116号を参照されたい)、セレノシステイン(例えば、国際公開第2008/122039号;及びHofer et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.,USA,2008,105:12451-12456を参照されたい)、ホルミルグリシン(例えば、Carrico et al.,Nat.Chem.Biol.,2007,3:321-322;Agarwal et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.,USA,2013,110:46-51,及びRabuka et al.,Nat.Protocols,2012,10:1052-1067を参照されたい)、非天然アミノ酸(例えば、国際公開第2013/068874号及び国際公開第2012/166559号を参照されたい)並びに酸性アミノ酸(例えば、国際公開第2012/05982号を参照されたい)である。リジン結合はまた、NHS(N-ヒドロキシスクシンイミド)を介して行うことができる。リンカーはまた、チオール間に炭素架橋を形成することで、切断型鎖間ジスルフィド結合のシステイン残基を含むシステイン残基に結合され得る(例えば、米国特許第9,951,141号及び米国特許第9,950,076号を参照されたい)。リンカーはまた、炭水化物への結合(例えば、米国特許出願第2008/0305497号、国際公開第2014/065661号及びRyan et al.,Food&Agriculture Immunol.,2001,13:127-130を参照されたい)並びにジスルフィドリンカー(例えば、国際公開第2013/085925号、国際公開第2010/010324号、国際公開第2011/018611号及びShaunak et al.,Nat.Chem.Biol.,2006,2:312-313を参照されたい)を介して抗原結合タンパク質に結合され得る。部位特異的結合技術もまた、抗体又は抗原結合タンパク質の特定の残基への結合を指示するために利用され得る(例えば、Schumacher et al.J Clin Immunol(2016)36(Suppl 1):100を参照されたい)。以下により詳細に説明される特定の実施形態では、部位特異的結合技術は、トランスグルタミナーゼを介したグルタミン結合を含む(例えば、Schibli,Angew Chemie Inter Ed.2010,49,9995を参照されたい)。
抗体又は抗原結合断片の残基に結合するための技術及びリンカーは、当該技術分野で公知である。本開示の状況で使用され得る例示的なアミノ酸結合は、例えば、リジン(例えば、米国特許第5,208,020号;米国特許出願第2010/0129314号;Hollander et al.,Bioconjugate Chem.,2008,19:358-361;国際公開第2005/089808号;米国特許第5,714,586号;米国特許出願第2013/0101546号;及び米国特許出願第2012/0585592号を参照されたい)、システイン(例えば、米国特許出願第2007/0258987号;国際公開第2013/055993号;国際公開第2013/055990号;国際公開第2013/053873号;国際公開第2013/053872号:国際公開第2011/130598号;米国特許出願第2013/0101546号;及び米国特許第7,750,116号を参照されたい)、セレノシステイン(例えば、国際公開第2008/122039号;及びHofer et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.,USA,2008,105:12451-12456を参照されたい)、ホルミルグリシン(例えば、Carrico et al.,Nat.Chem.Biol.,2007,3:321-322;Agarwal et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.,USA,2013,110:46-51,及びRabuka et al.,Nat.Protocols,2012,10:1052-1067を参照されたい)、非天然アミノ酸(例えば、国際公開第2013/068874号及び国際公開第2012/166559号を参照されたい)並びに酸性アミノ酸(例えば、国際公開第2012/05982号を参照されたい)である。リジン結合はまた、NHS(N-ヒドロキシスクシンイミド)を介して行うことができる。リンカーはまた、チオール間に炭素架橋を形成することで、切断型鎖間ジスルフィド結合のシステイン残基を含むシステイン残基に結合され得る(例えば、米国特許第9,951,141号及び米国特許第9,950,076号を参照されたい)。リンカーはまた、炭水化物への結合(例えば、米国特許出願第2008/0305497号、国際公開第2014/065661号及びRyan et al.,Food&Agriculture Immunol.,2001,13:127-130を参照されたい)並びにジスルフィドリンカー(例えば、国際公開第2013/085925号、国際公開第2010/010324号、国際公開第2011/018611号及びShaunak et al.,Nat.Chem.Biol.,2006,2:312-313を参照されたい)を介して抗原結合タンパク質に結合され得る。部位特異的結合技術もまた、抗体又は抗原結合タンパク質の特定の残基への結合を指示するために利用され得る(例えば、Schumacher et al.J Clin Immunol(2016)36(Suppl 1):100を参照されたい)。以下により詳細に説明される特定の実施形態では、部位特異的結合技術は、トランスグルタミナーゼを介したグルタミン結合を含む(例えば、Schibli,Angew Chemie Inter Ed.2010,49,9995を参照されたい)。
リジン及び/又はシステインにより、例えばマレイミド又はアミド結合を介して結合される、本開示によるペイロードは、本開示の範囲内に含まれる。
いくつかの実施形態では、本開示のタンパク質薬物複合体は、二段階プロセスにより産生される。工程1は、例えばNHS-エステルリンカーといったリジンベースのリンカー結合であり、工程2は、ペイロード結合反応(例えば、1,3-環化付加反応)である。
いくつかの実施形態では、本開示のタンパク質薬物複合体は、二段階プロセスにより産生される。工程1は、例えばマレイミドエステルリンカーといったシステインベースのリンカー結合であり、工程2は、ペイロード結合反応(例えば、1,3-環化付加反応)である。
いくつかの実施形態では、本開示のタンパク質薬物複合体は、二段階プロセスにより産生される。工程1は、トランスグルタミナーゼ介在部位特異性結合であり、工程2は、ペイロード結合反応(例えば、1,3-環化付加反応)である。
工程1:トランスグルタミナーゼ媒介性部位特異的結合
いくつかの実施形態では、タンパク質(例えば、抗体)は、公知の方法に従って修飾され、グルタミニル修飾タンパク質を提供する。抗体と第1級アミン化合物とを結合するための技術は、当該技術分野で公知である。部位特異的結合技術は、トランスグルタミナーゼを介したグルタミン結合を使用してグルタミンへの結合を指示するために本明細書で利用される(例えば、Schibli,Angew Chemie Inter Ed.2010,49,9995を参照されたい)。
いくつかの実施形態では、タンパク質(例えば、抗体)は、公知の方法に従って修飾され、グルタミニル修飾タンパク質を提供する。抗体と第1級アミン化合物とを結合するための技術は、当該技術分野で公知である。部位特異的結合技術は、トランスグルタミナーゼを介したグルタミン結合を使用してグルタミンへの結合を指示するために本明細書で利用される(例えば、Schibli,Angew Chemie Inter Ed.2010,49,9995を参照されたい)。
本開示の第1級アミンを含む化合物(例えば、リンカーLa)は、トランスグルタミナーゼベースの化学酵素的結合を介し、結合剤(例えば、タンパク質、例えば、抗体、例えば、抗GLP1R抗体)の1つ以上のグルタミン残基に結合することができる(例えば、Dennler et al.,Protein Conjugate Chem.2014,25,569-578及び国際公開第2017/147542号を参照されたい)。例えば、トランスグルタミナーゼの存在下では、抗体の1個以上のグルタミン残基は、第1級アミンリンカー化合物に結合され得る。簡潔には、いくつかの実施形態では、グルタミン残基(例えば、Gln295、すなわち、Q295残基)を有する結合剤は、酵素であるトランスグルタミナーゼの存在下で第1級アミン含有リンカーLaで処理される。ある特定の実施形態では、結合剤はグリコシル化(aglycosylated)されている。ある特定の実施形態では、結合剤は脱グリコシル化されている。
ある特定の実施形態では、結合剤(例えば、タンパク質、例えば、抗体)は少なくとも1つのポリペプチド鎖配列中に少なくとも1つのグルタミン残基を含む。ある特定の実施形態では、結合剤はそれぞれが1つのGln295残基を有する2つの重鎖ポリペプチドを含む。さらなる実施形態では、結合剤は、重鎖295以外の部位に1つ以上のグルタミン残基を含む。
いくつかの実施形態では、抗体などの結合剤は、無効な抗体機能又は結合を引き起こすことなく部位にグルタミン残基を挿入するために、部位特異的突然変異誘発によって調製され得る。例えば、本明細書に記載の1つ以上のAsn297Gln(N297Q)変異を有する抗体が本明細書に含まれる。いくつかの実施形態では、Gln295残基及び/又はN297Q変異を有する抗体は、それらの可変領域に、1つ以上のさらなる天然に存在するグルタミン残基を含有する。これらは、トランスグルタミナーゼに接近可能であり得、それによってリンカー又はリンカーペイロードへの結合が可能である。例示的な天然に存在するグルタミン残基は、例えば軽鎖のQ55に見ることができる。かかる例では、トランスグルタミナーゼを介して結合される結合剤(例えば、抗体)は、予想されるLAR値よりも高いLAR値を有し得る(例えば、4超のLAR)。かかる任意の抗体は、天然源又は人工源から単離され得る。
工程2:ペイロード結合反応
ある特定の実施形態では、本開示によるリンカーLaは、トランスグルタミネーション後にさらに反応可能である少なくとも1つの第1の反応基を含む。これらの実施形態では、グルタミニル修飾タンパク質(例えば、抗体)は、反応性ペイロード化合物P又は反応性リンカーペイロード化合物(例えば、本明細書に開示されるLp-P)とさらに反応してタンパク質ペイロード複合体を形成可能である。より詳細には、反応性リンカーペイロード化合物Lp-Pは、リンカーLaの第1の反応基と反応することが可能である第2の反応基を含むことができる。ある特定の実施形態では、本開示による第1の反応基又は第2の反応基は、1,3-環化付加反応を受けることが可能な部分を含む。ある特定の実施形態では、反応基はアジドである。ある特定の実施形態では、反応基はアルキン(例えば、末端アルキン又は内部に歪みを有するアルキン)を含む。本開示のある特定の実施形態では、反応基は結合剤及びトランスグルタミネーション反応条件に適合する。
ある特定の実施形態では、本開示によるリンカーLaは、トランスグルタミネーション後にさらに反応可能である少なくとも1つの第1の反応基を含む。これらの実施形態では、グルタミニル修飾タンパク質(例えば、抗体)は、反応性ペイロード化合物P又は反応性リンカーペイロード化合物(例えば、本明細書に開示されるLp-P)とさらに反応してタンパク質ペイロード複合体を形成可能である。より詳細には、反応性リンカーペイロード化合物Lp-Pは、リンカーLaの第1の反応基と反応することが可能である第2の反応基を含むことができる。ある特定の実施形態では、本開示による第1の反応基又は第2の反応基は、1,3-環化付加反応を受けることが可能な部分を含む。ある特定の実施形態では、反応基はアジドである。ある特定の実施形態では、反応基はアルキン(例えば、末端アルキン又は内部に歪みを有するアルキン)を含む。本開示のある特定の実施形態では、反応基は結合剤及びトランスグルタミネーション反応条件に適合する。
本開示のある特定の実施形態では、リンカーLa分子は第1の反応基を含む。本開示のある特定の実施形態では、リンカーLa分子は2つ以上の反応基を含む。
ある特定の実施形態では、反応性リンカーペイロードLp-Pは1つのペイロード分子(n=1)を含む。ある特定の他の実施形態では、反応性リンカーペイロードLp-Pは、2つ以上のペイロード分子(n≧2)を含む。
本開示のある特定の実施形態では、抗体あたり、薬物抗体比又はDARは、約1~約30、又は約1~約24、又は約1~約20、又は約1~約16、約1~約12、約1~約10、又は約1~約8、又は約1、2、3、4、5、6、7若しくは8つのペイロード分子である。いくつかの実施形態では、DARは1~30である。いくつかの実施形態では、DARは1~16である。いくつかの実施形態では、DARは1~8である。いくつかの実施形態では、DARは1~6である。ある特定の実施形態では、DARは2~4である。いくつかの場合では、DARは2~3である。ある特定の場合では、DARは0.5~3.5である。いくつかの実施形態では、DARは約1、又は約1.5、又は約2、又は約2.5、又は約3、又は約3.5である。いくつかの実施形態では、DARは2である。いくつかの実施形態では、DARは4である。いくつかの実施形態では、DARは8である。
一態様では、本開示は、式(A)
BA-(L-P)m (A)、
の構造を有する化合物を作製する方法であって、方法は、
a)トランスグルタミナーゼの存在下で、少なくともm個のグルタミン残基Glnを含むBAと、少なくともm当量の化合物L-Pとを接触させる工程と、
b)作製された式(A)の化合物を単離する工程と、を含む、方法を提供する。
BA-(L-P)m (A)、
の構造を有する化合物を作製する方法であって、方法は、
a)トランスグルタミナーゼの存在下で、少なくともm個のグルタミン残基Glnを含むBAと、少なくともm当量の化合物L-Pとを接触させる工程と、
b)作製された式(A)の化合物を単離する工程と、を含む、方法を提供する。
一態様では、本開示は、式(A)
BA-(L-P)m (A)、
の構造を有する化合物であって、式中、リンカーLは、式(L’)
-La-Y-Lp- (L’)、の構造であって、
式中、Laは、BAに共有結合された第1のリンカーであり、
Yは、トリアゾールを含む基であり、
Lpは、Pに共有結合された第2のリンカーである、構造を有する、化合物を作製する方法であって、
方法が、
a)トランスグルタミナーゼの存在下で、少なくともm個のグルタミン残基Glnを含むBAと、アジド又はアルキン部分を含む第1のリンカーLaとを接触させる工程と、
b)工程a)の生成物と、少なくともm当量の化合物Lp-Pとを接触させる工程であって、第2のリンカーLpはアジド又はアルキン部分を含み、La及びLpは反応してトリアゾールを作製することが可能である、工程と、
c)作製された式(A)の化合物を単離する工程と、を含む、方法を提供する。
BA-(L-P)m (A)、
の構造を有する化合物であって、式中、リンカーLは、式(L’)
-La-Y-Lp- (L’)、の構造であって、
式中、Laは、BAに共有結合された第1のリンカーであり、
Yは、トリアゾールを含む基であり、
Lpは、Pに共有結合された第2のリンカーである、構造を有する、化合物を作製する方法であって、
方法が、
a)トランスグルタミナーゼの存在下で、少なくともm個のグルタミン残基Glnを含むBAと、アジド又はアルキン部分を含む第1のリンカーLaとを接触させる工程と、
b)工程a)の生成物と、少なくともm当量の化合物Lp-Pとを接触させる工程であって、第2のリンカーLpはアジド又はアルキン部分を含み、La及びLpは反応してトリアゾールを作製することが可能である、工程と、
c)作製された式(A)の化合物を単離する工程と、を含む、方法を提供する。
一態様では、本開示は、式(I)
BA-L-P (I)、
の構造を有する化合物又は薬学的に許容されるその塩を作製する方法であって、方法が、
a)トランスグルタミナーゼの存在下で、少なくとも1個のグルタミン残基Glnを含むBAと、化合物L-Pとを接触させる工程と、
b)作製された式(I)の化合物を単離する工程と、を含む、方法を提供し、
式中、BAは、抗体又はその抗原結合断片であり、
Lは、非切断型リンカーであり、
Pは、
BA-L-P (I)、
の構造を有する化合物又は薬学的に許容されるその塩を作製する方法であって、方法が、
a)トランスグルタミナーゼの存在下で、少なくとも1個のグルタミン残基Glnを含むBAと、化合物L-Pとを接触させる工程と、
b)作製された式(I)の化合物を単離する工程と、を含む、方法を提供し、
式中、BAは、抗体又はその抗原結合断片であり、
Lは、非切断型リンカーであり、
Pは、
式中、
X1は、H、
X2は、
X3は、-(CH2)2-6-NH-及び-(CH2)2-6-Tr-であって、式中、Trはトリアゾール部分である、-(CH2)2-6-NH-及び-(CH2)2-6-Tr-から選択され、
nは、0又は1であり、
X4は、H及びフェニルから選択され、
X5は、-OH、-NH2、-NH-OH及び
X6は、各発生時に独立してH、-OH、-CH3及び-CH2OHから選択され、
X7は、H、
X8は、H、-OH、-NH2及び
方法を提供する。
別の態様では、本開示は、式(I)
BA-L-P (I)、
による構造を有する化合物であって、式中、リンカーLは、式(L’)
-La-Y-Lp- (L’)、の構造であって、
式中、Laは、BAに共有結合された第1のリンカーであり、
Yは、トリアゾールを含む基、ディールス・アルダー付加物又はチオ-マレイミド付加物であり、
Lpは、Pに共有結合された第2のリンカーである、構造を有する、化合物を作製する方法を提供し、
方法が、
a)トランスグルタミナーゼの存在下で、少なくとも1個のグルタミン残基Glnを含むBAと、アジド又はアルキン部分を含む第1のリンカーLaとを接触させる工程と、
b)工程a)の生成物と、化合物Lp-Pとを接触させる工程であって、第2のリンカーLpはアジド又はアルキン部分を含み、La及びLpは反応してトリアゾールを作製することが可能である、工程と、
c)作製された式(I)の化合物を単離する工程と、を含み、
BA、L’及びPは、上に定義されているとおりである。
BA-L-P (I)、
による構造を有する化合物であって、式中、リンカーLは、式(L’)
-La-Y-Lp- (L’)、の構造であって、
式中、Laは、BAに共有結合された第1のリンカーであり、
Yは、トリアゾールを含む基、ディールス・アルダー付加物又はチオ-マレイミド付加物であり、
Lpは、Pに共有結合された第2のリンカーである、構造を有する、化合物を作製する方法を提供し、
方法が、
a)トランスグルタミナーゼの存在下で、少なくとも1個のグルタミン残基Glnを含むBAと、アジド又はアルキン部分を含む第1のリンカーLaとを接触させる工程と、
b)工程a)の生成物と、化合物Lp-Pとを接触させる工程であって、第2のリンカーLpはアジド又はアルキン部分を含み、La及びLpは反応してトリアゾールを作製することが可能である、工程と、
c)作製された式(I)の化合物を単離する工程と、を含み、
BA、L’及びPは、上に定義されているとおりである。
一実施形態では、Yはトリアゾールを含む基である。
一実施形態では、グルタミン残基Glnは、BAのCH2又はCH3ドメイン中に天然に存在する。別の実施形態では、グルタミン残基Glnは、1つ以上のアミノ酸を修飾することでBAに導入される。一実施形態では、GlnはQ295又はN297Qである。
一実施形態では、トランスグルタミナーゼは、微生物トランスグルタミナーゼ(MTG)である。一実施形態では、トランスグルタミナーゼは、細菌性トランスグルタミナーゼ(BTG)である。
一実施形態では、式(I)の化合物を作製する上記方法のうちのいずれかで使用するための化合物L-Pは、
治療製剤及び投与
本開示は、本開示のタンパク質薬物複合体を含む医薬組成物を提供する。
本開示は、本開示のタンパク質薬物複合体を含む医薬組成物を提供する。
一態様では、本開示は、約0.5~約30.0の薬物抗体比(DAR)を有する、本開示によるタンパク質薬物複合体の集団を含む組成物を提供する。
一実施形態では、組成物は、約1.0~約2.5のDARを有する。
一実施形態では、組成物は、約2のDARを有する。
一実施形態では、組成物は、約3.0~約4.5のDARを有する。
一実施形態では、組成物は、約4のDARを有する。
一実施形態では、組成物は、約6.5~約8.5のDARを有する。
一実施形態では、組成物は、約8のDARを有する。
本開示の組成物は、好適な担体、賦形剤及び輸送、送達、耐性などを改善させる他の薬剤とともに製剤化される。多数の適切な製剤は、全ての創薬化学者に公知の処方集:Remington’s Pharmaceutical Sciences,Mack Publishing Company,Easton,PAに見出すことができる。これらの製剤としては、例えば、粉末、ペースト、軟膏、ゼリー、ワックス、オイル、脂質、脂質(カチオン性又はアニオン性)含有ベシクル(LIPOFECTIN(商標)、Life Technologies,Carlsbad,CA)、DNA複合体、無水吸収ペースト、水中油型エマルション及び油中水型エマルション、エマルションカーボワックス(種々の分子量のポリエチレングリコール)、半固体ゲル及びカーボワックスを含油する半固体混合物が挙げられる。Powell et al.「Compendium of excipients for parenteral formulations」 PDA(1998)J Pharm Sci Technol 52:238-311もまた参照されたい。
患者に投与されるタンパク質薬物複合体の投与量は、患者の年齢及びサイズ、標的となる疾患、症状、投与経路などによって変化し得る。好適な投与量は、体重又は体表面積に従って典型的には計算される。本開示のタンパク質薬物複合体が成人患者の治療目的のために使用される場合、約0.01~約20mg/kg体重、より好ましくは約0.02~約7mg/kg、約0.03~約5mg/kg、又は約0.05~約3mg/kg体重の単回投与量で本開示のタンパク質薬物複合体を標準的には静脈内投与することが有利であり得る。症状の重症度に応じて、治療頻度及び持続時間を調節することができる。タンパク質薬物複合体を投与するための有効な用量及びスケジュールは、経験的に決定されてもよく、例えば患者の進行は定期的な評価によってモニタリングされ、それに従って投与量は調節され得る。さらには、用量の種間スケーリングは、当該技術分野で周知の方法を使用して行われ得る(例えば、Mordenti et al.,1991,Pharmaceut.Res.8:1351)。
種々の送達系が公知であり、本開示の医薬組成物を投与するために使用され得る。例えば、リポソーム、微粒子、マイクロカプセル中でのカプセル封入、変異ウイルスを発現可能な組換え細胞、受容体媒介性エンドサイトーシス(例えば、Wu et al.,1987,J.Biol.Chem.262:4429-4432)などである。導入方法としては、皮内、筋肉内、腹腔内、静脈内、皮下、鼻腔内、硬膜外及び経口経路が挙げられるが、これらに限定されない。組成物は、例えば注入又はボーラス注射といった任意の従来の経路によって、上皮又は皮膚粘膜の裏打ちを通した吸収(例えば、経口粘膜、直腸及び腸管粘膜など)によって投与されてもよく、他の生物学的に活性な薬剤とともに投与されてもよい。投与は全身又は局所であり得る。
本開示の医薬組成物は、標準的な針及びシリンジを用いて、皮下で又は静脈内で送達され得る。加えて、皮下送達に関しては、ペン型送達装置は、本開示の医薬組成物の送達に関する用途を容易に有する。かかるペン型送達装置は、再利用可能又は使い捨て可能であり得る。再利用可能なペン型送達装置は、医薬組成物を含有する交換可能なカートリッジを一般には利用する。カートリッジ内の医薬組成物のうちの全てが投与され、カートリッジが空になると、空のカートリッジは容易に廃棄することができ、医薬組成物を含有する新しいカートリッジと交換することができる。ペン型送達装置は再利用することができる。使い捨て可能なペン型送達装置には、交換可能なカートリッジがない。逆に、使い捨て可能なペン型送達装置は、装置内の容器に保持されている医薬組成物で予め充填されている。容器の医薬組成物が空になると、装置全体が廃棄される。
多数の再利用可能なペン型及び自己注射送達装置は、本開示の医薬組成物の皮下送達に適用される。例としては、ほんの数例だが、AUTOPEN(商標)(Owen Mumford、Inc.,Woodstock、UK)、DISETRONIC(商標)ペン(Disetronic Medical System,Bergdorf,Switzerland)、HUMALOG MIX 75/25(商標)ペン、HUMALOG(商標)ペン、HUMALIN 70/30(商標)ペン(Eli Lilly and Co.、Indianapolis,IN)、NOVOPEN(商標)I,II及びIII(Novo Nordisk,Copenhagen,Denmark)、NOVOPEN JUNIOR(商標)(Novo Nordisk、Copenhagen,Denmark)、BD(商標)ペン(Becton Dickinson,Franklin Lakes,NJ)、OPTIPEN(商標)、OPTIPEN PRO(商標)、OPTIPEN STARLET(商標)及びOPTICLIK(商標)(sanofi-aventis,Frankfurt,Germany)が挙げられるがこれらに限定されない。本開示の医薬組成物の皮下送達に適用される使い捨て可能なペン型送達装置の例としては、ほんの数例だが、SOLOSTAR(商標)ペン(sanofi-aventis)、FLEXPEN(商標)(Novo Nordisk)及びKWIKPEN(商標)(Eli Lilly)、SURECLICKTM オートインジェクタ(Amgen,Thousand Oaks,CA)、PENLETTM(Haselmeier,Stuttgart,Germany)、EPIPEN(Dey,L.P.)及びHUMIRATMペン(Abbott Labs,Abbott Park IL)が挙げられるが、これらに限定されない。
ある特定の状況では、医薬組成物は放出制御系で送達され得る。一実施形態では、ポンプが使用されてもよい(前出のLanger;Sefton,1987,CRC Crit.Ref.Biomed.Eng.14:201を参照されたい)。別の実施形態では、ポリマー材料が使用され得る(Medical Applications of Controlled Release,Langer and Wise(eds.),1974,CRC Pres.,Boca Raton,Floridaを参照されたい)。さらに別の実施形態では、放出制御系は、組成物の標的に近接して配置されることができ、したがって全身投与量のうちの一部のみを必要とする(例えば、Goodson,1984,in Medical Applications of Controlled Release,前出,vol.2,pp.115-138を参照されたい)。他の放出制御系は、Langer,1990,Science 249:1527-1533による総説に説明されている。
注射用製剤は、静脈内、皮下、皮内及び筋肉内注射、点滴注入などのための剤形を含んでもよい。これらの注射用製剤は、公知の方法によって調製されてもよい。例えば、注射用製剤は、例えば注射に従来使用されている滅菌水性媒体又は油性媒体に、上記の抗体又はその塩を溶解、懸濁又は乳化させることによって調製されてもよい。注射用の水性媒体としては、例えば生理食塩水、グルコースを含有する等張液及び他の助剤などが存在しているが、これらはアルコール(例えば、エタノール)、ポリアルコール(例えば、プロピレングリコール、ポリエチレングリコール)、非イオン性界面活性剤[例えば、ポリソルベート80、HCO-50(硬化ヒマシ油のポリオキシエチレン(50mol)付加物)]などの適切な可溶化剤と組み合わせて使用されてもよい。油性媒体としては例えばゴマ油、ダイズ油などが利用されるが、これらは安息香酸ベンジル、ベンジルアルコールなどの可溶化剤と組み合わせて使用されてもよい。したがって、調製された注射液は、適切なアンプルに充填されることが好ましい。
有利には、上記の経口使用又は非経口使用のための医薬組成物は、活性成分の投与量に適合するように適した単位投与量の剤形に調製される。単位投与量のかかる剤形としては、例えば錠剤、丸剤、カプセル、注射液(アンプル)、坐剤などが挙げられる。含有される上述の抗体の量は、一般には、単位投与量の剤形あたり約5~約500mgであり、特に注射形態では上述の抗体は約5~約100mgで含有され、他の剤形については約10~約250mgで含有されることが好ましい。
タンパク質薬物複合体、リンカーペイロード及びペイロードの治療的使用
別の態様では、本明細書に開示される化合物(例えば、抗体薬物複合体、リンカーペイロード及び/又はペイロード)は、とりわけ、治療の必要がある疾患、障害又は症状の治療、予防及び/又は回復に有用である。
別の態様では、本明細書に開示される化合物(例えば、抗体薬物複合体、リンカーペイロード及び/又はペイロード)は、とりわけ、治療の必要がある疾患、障害又は症状の治療、予防及び/又は回復に有用である。
一態様では、本開示は、本開示による化合物(例えば、抗体薬物複合体、リンカーペイロード及び/若しくはペイロード)又は本開示によるいずれかの化合物を含む組成物の治療有効量を対象に投与することを含む、その必要がある対象の症状を治療する方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される化合物(例えば、抗体薬物複合体、リンカーペイロード及び/又はペイロード)は、GLP1Rの刺激、活性化及び/又は標的が有益である任意の疾患又は障害を治療する上で有用である。特に、本開示の抗GLP1R抗体薬物複合体は、GLP1Rの発現又は活性に関連する、又はこれによって媒介される、任意の疾患又は障害の治療、予防及び/又は回復のために使用され得る。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される化合物(例えば、抗体薬物複合体、リンカーペイロード及び/又はペイロード)は、GLP1R関連症状を治療する上で有用である。いくつかの実施形態では、GLP1R関連症状は1型糖尿病又は2型糖尿病である。投与される化合物(例えば、抗体薬物複合体、リンカーペイロード及び/又はペイロード)によって、インスリン分泌の誘導、グルカゴン放出の抑制、血糖の低下、血糖コントロールの改善、膵島新生の促進及び胃内容排出の遅延又は耐糖能のある膵島の増強といった結果のうちの少なくとも1つを引き起こし得る。
いくつかの実施形態では、GLP1R関連症状は、神経変性障害、認知障害、記憶障害又は学習障害である。神経変性障害は、例えば認知症、老人性認知症、軽度認知障害、アルツハイマー病関連認知症、ハンチントン病、遅発性ジスキネジア、運動過剰症、躁病、パーキンソン病、スティール・リシャール症候群、ダウン症候群、重症筋無力症、神経外傷、脳外傷、血管アミロイドーシス、アミロイドーシスを伴う脳出血I、脳炎症、フリードリヒ運動失調症(Friedrich’s ataxia)、急性錯乱障害、筋萎縮性側索硬化症、緑内障及びアルツハイマー病であり得る。
いくつかの実施形態では、GLP1R関連症状は肝疾患である。肝疾患は、例えば非アルコール性脂肪性肝疾患(non-alcoholic fatty liver disease、NAFLD)、脂肪肝、非アルコール性脂肪性肝炎(non-alcoholic steatohepatitis、NASH)及び肝硬変であり得る。
いくつかの実施形態では、GLP1R関連症状は冠動脈疾患である。冠動脈疾患は、例えば心筋症及び心筋梗塞であり得る。
いくつかの実施形態では、GLP1R関連症状は腎疾患である。腎疾患は、例えば高血圧又は慢性腎不全であり得る。
いくつかの実施形態では、GLP1R関連症状は摂食障害である。摂食障害は例えば、過食であり得る。
理論に拘束されることを望むものではないが、本明細書に開示される化合物(例えば、抗体薬物複合体、リンカーペイロード及び/又はペイロード)は、アルツハイマー病、クロイツフェルト・ヤコブ病及びウシ海綿状脳症、慢性消耗症候群及び他のプリオン媒介性アポトーシス神経疾患など、中枢神経系のアポトーシス媒介性変性疾患の影響を減弱させるために利用されてもよい(例えば、Perry and Grieg(2004)Current Drug Targets 6:565-571を参照されたい)。本明細書に開示される化合物(例えば、抗体薬物複合体、リンカーペイロード及び/又はペイロード)の投与によって、βAPPの発現低下もまた引き起こされ、それによってアルツハイマー病に関連するAβモノ-又はオリゴマー媒介性症状を回復させることができる(例えば、Perry et al.(2003)Journal of Neuroscience Research 72:603-612を参照されたい)。
本明細書に開示される化合物(例えば、抗体薬物複合体、リンカーペイロード及び/又はペイロード)は、例えば神経可塑性の増強及び細胞分化の促進によって、学習及び記憶を改善させるために使用され得ることもまた企図されている(例えば、During et al.(2003)Nature Medicine 9:1173-1179を参照されたい)。さらには、本明細書に開示される化合物(例えば、抗体薬物複合体、リンカーペイロード及び/又はペイロード)は、パーキンソン病においてドーパミン神経及び運動機能を保全するためにも使用され得る(例えば、Greig et al.(2005)Abstract 897.6,Society for Neuroscience,Washington,D.C.を参照されたい)。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される化合物(例えば、抗体薬物複合体、リンカーペイロード及び/又はペイロード)は、代謝障害を治療するためにも使用され得る。代謝障害は例えば、肥満、脂質異常症、内臓脂肪症候群及び膵島機能不全により生じる病状であり得る。
本開示の化合物(例えば、抗体薬物複合体、リンカーペイロード及び/又はペイロード)により治療され得るさらなる疾患としては、自己免疫疾患、特に自己免疫性糖尿病、成人発症型糖尿病、病的肥満、内臓脂肪症候群及び脂質異常症を含むがこれらに限定されない、炎症に関連する自己免疫疾患が挙げられる。例えば、抗GLP1R抗体薬物複合体は、自己免疫性糖尿病に罹患しているヒトの膵島成長を促進させるための成長因子として利用され得る。本明細書に記載の化合物(例えば、抗体薬物複合体、リンカーペイロード及び/又はペイロード)は、うっ血性心不全の治療にも有用であり得る。
一態様では、本開示は、化合物を用いて細胞の表面上の抗原(例えば、GLP1R)を選択的に標的化する方法を提供する。一実施形態では、化合物を用いて細胞の表面上の抗原(例えば、GLP1R)を選択的に標的化する方法は、化合物を標的化した抗体に結合することを含む。一実施形態では、化合物は上記のペイロードである。一実施形態では、細胞は哺乳類細胞である。一実施形態では、細胞はヒト細胞である。一実施形態では、細胞は膵臓細胞又は脳細胞である。ある特定の実施形態では、本開示は、
式中、
X1は、H、
X2は、
X3は、-(CH2)2-6-NH-及び-(CH2)2-6-Tr-であって、式中、Trはトリアゾール部分である、-(CH2)2-6-NH-及び-(CH2)2-6-Tr-から選択され、
nは、0又は1であり、
X4は、H及びフェニルから選択され、
X5は、-OH、-NH2、-NH-OH及び
X6は、各発生時に独立してH、-OH、-CH3及び-CH2OHから選択され、
X7は、H、
X8は、H、-OH、-NH2及び
ある特定の実施形態では、本開示はまた、GLP1R発現細胞に関連する、又はGLP1R発現細胞によって引き起こされる疾患又は障害(例えば、がん)の治療用の薬物を製造する際の本開示の化合物(例えば、抗体薬物複合体、リンカーペイロード及び/又はペイロード)の使用も含む。一態様では、本開示は、医薬に使用するための、本明細書に開示される抗GLP1R抗体又は抗原結合断片を含むタンパク質薬物複合体に関する。一態様では、本開示は、医薬に使用するための、本明細書に開示される抗体薬物複合体(ADC)を含む化合物に関する。
併用療法及び製剤
併用療法及び製剤
本開示は、1つ以上のさらなる治療薬と組み合わせられる、本明細書に記載の例示的なタンパク質薬物複合体(例えば、抗体薬物複合体)、リンカーペイロード及びペイロードのうちのいずれかを含む医薬組成物を投与することを含む方法を提供する。
本開示のタンパク質薬物複合体(例えば、抗体薬物複合体)、リンカーペイロード及びペイロードと組み合わせられ得る、又はこれらと組み合わせて投与され得る例示的なさらなる治療薬は、他のGLP1Rアゴニスト(例えば、抗GLP1R抗体又はGLP1Rの小分子アゴニスト又は抗GLP1R抗体薬物複合体)を含む。GLP1Rアゴニストの非限定的な例としては、エキセナチド(Byetta,Bydureon)、リラグルチド(Victoza,Saxenda)、リキシセナチド(ヨーロッパではLyxumia、米国ではAdlyxin)、アルビグルチド(Tanzeum)、デュラグルチド(Trulicity)、セマグルチド(Ozempic)及びタスポグルチドが挙げられる。
例示的なさらなる治療薬は、GLP1R/GCGRデュアルアゴニスト、GLP1R/GIPR/GCGRトリプルアゴニストなどのGLP1R/GIPRデュアルアゴニストを含む、デュアルアゴニスト又はトリプルアゴニストを含んでもよい。
本開示のタンパク質薬物複合体(例えば、抗体薬物複合体)、リンカーペイロード及びペイロードと組み合わせて有利に投与され得る他の薬剤は、糖尿病(例えば、2型糖尿病)、肥満及び/又は他の関連する代謝疾患の治療に有用であるものを含む。
いくつかの実施形態では、さらなる治療薬は抗糖尿病薬である。任意の好適な抗糖尿病薬が使用され得る。抗糖尿病薬の非限定的な例としては、インスリン、インスリン類似体(インスリンリスプロ、インスリンアスパート、インスリングルリジン、イソフェンインスリン、インスリン亜鉛、インスリングラルギン及びインスリンデテミルを含む)、ビグアナイド(メトホルミン、フェンホルミン及びブホルミンを含む)、チアゾリジンジオン又はTZD(ロシグリタゾン、ピログリタゾン及びトログリタゾンを含む)、スルホニル尿素(トルブタミド、アセトヘキサミド、トラザミド、クロロプロパミド、グリピジド、グリベンクラミド、グリメピリド、グリクラジド、グリクロピラミド及びグリキドンを含む)、メグリチニド(レパグリニド及びナテグリニドを含む)、α-グルコシダーゼ阻害剤(ミグリトール、アカルボース及びボグリボースを含む)、グルカゴン様ペプチド類似体及びアゴニスト(エキセナチド、リラグルチド、セマグルチド、タスポグルチド、リキシセナチド、アルブグルチド及びデュラグルチドを含む)、胃抑制ペプチド類似体、ジペプチジルペプチダーゼ-4(DPP-4)阻害剤(ビルダグリプチン、シタグリプチン、サキサグリプチン、リナグリプチン、アログリプチン、セプタグリプチン、テネリグリプチン及びゲミグリプチンを含む)、アミリンアゴニスト類似体、ナトリウム/グルコースコトランスポータ2(SGLT2)阻害剤、グルコキナーゼ活性化剤、スクアレンシンターゼ阻害剤、他の脂質低下剤及びアスピリンが挙げられる。いくつかのかかる実施形態では、抗糖尿病薬は、メトホルミン、アカルボース又はTZDなどの経口抗糖尿病薬(oral antidiabetic agents、OAA)である。いくつかのかかる実施形態では、抗糖尿病薬はメトホルミンである。
いくつかの実施形態では、GLP1Rアゴニスト及び1つ以上の抗糖尿病薬は、非経口投与のための溶液又は懸濁液など、同一の剤形へと製剤化され得る。
1つ以上の治療的に有効であるさらなる成分は、本開示の化合物の投与直前、投与と同時に、又は投与直後に投与され得る(本開示の目的のために、かかる投与レジメンは、治療的に有効であるさらなる成分と「組み合わせた」抗原結合分子の投与であると考えられている)。
本開示は、本開示のタンパク質薬物複合体(例えば、抗体薬物複合体)、リンカーペイロード及び/又はペイロードが本明細書の他の箇所に記載される1つ以上の治療的に有効であるさらなる成分のうちの1つ以上とともに合剤化される医薬組成物を含む。
投与レジメン
本開示のある特定の実施形態に従い、タンパク質薬物複合体(例えば、抗GLP1R抗体薬物複合体)、リンカーペイロード及び/又はペイロードの複数の投与量は、規定の時間経過にわたって対象に投与されてもよい。本開示の本態様による方法は、本開示のタンパク質薬物複合体(例えば、抗GLP1R抗体薬物複合体)、リンカーペイロード及び/又はペイロードの複数の投与量を対象に順次投与することを含む。本明細書で使用される場合、「順次投与」は、タンパク質薬物複合体(例えば、抗GLP1R抗体薬物複合体)、リンカーペイロード及び/又はペイロードの各投与量が、例えば所定の間隔(例えば、数時間、数日、数週間又は数ヶ月)によって分けられた異なる日数など、異なる時点で対象に投与されることを意味する。本開示は、タンパク質薬物複合体(例えば、抗GLP1R抗体薬物複合体)、リンカーペイロード及び/又はペイロードの単独での初回投与量、続いてタンパク質薬物複合体(例えば、抗GLP1R抗体薬物複合体)、リンカーペイロード及び/又はペイロードの1回以上の維持投与量、続いて必要に応じてタンパク質薬物複合体(例えば、抗GLP1R抗体薬物複合体)、リンカーペイロード及び/又はペイロードの1回以上のさらなる維持投与量を、患者に順次投与する方法を含む。
本開示のある特定の実施形態に従い、タンパク質薬物複合体(例えば、抗GLP1R抗体薬物複合体)、リンカーペイロード及び/又はペイロードの複数の投与量は、規定の時間経過にわたって対象に投与されてもよい。本開示の本態様による方法は、本開示のタンパク質薬物複合体(例えば、抗GLP1R抗体薬物複合体)、リンカーペイロード及び/又はペイロードの複数の投与量を対象に順次投与することを含む。本明細書で使用される場合、「順次投与」は、タンパク質薬物複合体(例えば、抗GLP1R抗体薬物複合体)、リンカーペイロード及び/又はペイロードの各投与量が、例えば所定の間隔(例えば、数時間、数日、数週間又は数ヶ月)によって分けられた異なる日数など、異なる時点で対象に投与されることを意味する。本開示は、タンパク質薬物複合体(例えば、抗GLP1R抗体薬物複合体)、リンカーペイロード及び/又はペイロードの単独での初回投与量、続いてタンパク質薬物複合体(例えば、抗GLP1R抗体薬物複合体)、リンカーペイロード及び/又はペイロードの1回以上の維持投与量、続いて必要に応じてタンパク質薬物複合体(例えば、抗GLP1R抗体薬物複合体)、リンカーペイロード及び/又はペイロードの1回以上のさらなる維持投与量を、患者に順次投与する方法を含む。
「初回投与量」、「維持投与量」及び「さらなる維持投与量」は、本開示のタンパク質薬物複合体(例えば、抗GLP1R抗体薬物複合体)、リンカーペイロード及び/又はペイロードの投与の時間的順序を指す。したがって、「初回投与量」は、治療レジメン開始時に投与される投与量であり(「ベースライン投与量」と称される)。「維持投与量」は、初回投与量後に投与される投与量であり、「さらなる維持投与量」は、維持投与量後に投与される投与量である。初回投与量、維持投与量及びさらなる維持投与量は全て、同一量のタンパク質薬物複合体(例えば、抗GLP1R抗体薬物複合体)、リンカーペイロード及び/又はペイロードを含有することができるが、一般には、投与頻度という点では互いに異なり得る。ただしある特定の実施形態では、初回投与量、維持投与量及び/又はさらなる維持投与量に含有されるタンパク質薬物複合体(例えば、抗GLP1R抗体薬物複合体)、リンカーペイロード及び/又はペイロードの量は、治療経過中に互いに(例えば、適切に上方制御又は下方制御される)異なっている。ある特定の実施形態では、2回以上(例えば、2回、3回、4回又は5回)の投与量は「負荷投与量」として治療レジメンの治療開始時に投与され、続いてより少ない頻度で投与される投与量(例えば、「管理投与」)で投与される。
本開示の例示的な一実施形態では、各維持投与量及び/又はさらなる維持投与量は、直前投与後、1~26(例えば、1、1.5、2、2.5、3、3.5、4、4.5、5、5.5、6、6.5、7、7.5、8、8.5、9、9.5、10、10.5、11、11.5、12、12.5、13、13.5、14、14.5、15、15.5、16、16.5、17、17.5、18、18.5、19、19.5、20、20.5、21、21.5、22、22.5、23、23.5、24、24.5、25、25.5、26、26.5以上)週間投与される。本明細書で使用される場合、「直前投与量」といった語句は、複数投与の順序においては、介入投与がない順序では直近の投与量の投与前に患者に投与されるタンパク質薬物複合体(例えば、抗GLP1R抗体薬物複合体)、リンカーペイロード及び/又はペイロードの投与量を意味する。
本開示の本態様による方法は、タンパク質薬物複合体(例えば、抗GLP1R抗体薬物複合体)、リンカーペイロード及び/又はペイロードの任意の回数の維持投与量及び/又はさらなる維持投与量を患者に投与することを含んでもよい。例えば、ある特定の実施形態では、1回のみの維持投与量が患者に投与される。他の実施形態では、2回以上(例えば、2回、3回、4回、5回、6回、7回、8回以上)の維持投与量が患者に投与される。同様に、ある特定の実施形態では、1回のみさらなる維持投与量が患者に投与される。他の実施形態では、2回以上(例えば、2回、3回、4回、5回、6回、7回、8回以上)のさらなる維持投与量が患者に投与される。
複数回の維持投与量を含む実施形態では、各維持投与量は、他の維持投与量と同一の頻度で投与されてもよい。例えば、各維持投与量は、直前の投与後1~2週間で患者に投与されてもよい。同様に、複数回のさらなる維持投与量を含む実施形態では、さらなる維持投与量のそれぞれは、他のさらなる維持投与量と同一の頻度で投与されてもよい。例えば、さらなる維持投与量のそれぞれは、直前の投与後2~4週間で患者に投与されてもよい。あるいは、維持投与量及び/又はさらなる維持投与量が患者に投与される回数は、治療レジメンの経過中に変化し得る。投与回数はまた、臨床検査後の個々の患者の必要性に応じて医師による治療経過中に調節されてもよい。
以下の実施例は、当該説明の特定の態様を例示する。この実施例は、実施形態及びそれらの種々の態様の具体的な理解及び実践を提供しているにすぎないため、実施例は限定であると解釈されるべきではない。
実施例及び本明細書全体で使用される略語は以下のとおりである:
実施例1.小分子ペイロード及びリンカーペイロードの合成
1.1 ペプチド模倣ペイロードの固相ペプチド合成
SPPSアプローチを使用したペプチド模倣薬(ペイロード)の調製の一般的手順
スキーム1は、本開示によるペプチド模倣ペイロードの樹脂上での構築を示す。ペプチドは、フィルタディスクを備えたポリプロピレンカラムを使用し、Fmoc SPPS(固相ペプチド合成)上へローラミキサによって手動で構築された。十分な量のリンクアミドMBHA樹脂(負荷量:0.5~0.6mmol/g)をDMF又はCH2Cl2中に15分間膨潤させた。
1.1 ペプチド模倣ペイロードの固相ペプチド合成
SPPSアプローチを使用したペプチド模倣薬(ペイロード)の調製の一般的手順
スキーム1は、本開示によるペプチド模倣ペイロードの樹脂上での構築を示す。ペプチドは、フィルタディスクを備えたポリプロピレンカラムを使用し、Fmoc SPPS(固相ペプチド合成)上へローラミキサによって手動で構築された。十分な量のリンクアミドMBHA樹脂(負荷量:0.5~0.6mmol/g)をDMF又はCH2Cl2中に15分間膨潤させた。
工程1:Fmoc-リンクアミドMBHA樹脂からFmocを除去するための一般的手順
DMF中の20%ピペリジン(10~30ml/100mgの樹脂)で5~15分間樹脂をインキュベーションすることで、樹脂上のFmoc基を除去した。脱保護樹脂を濾過し、過剰なDMF及びDCMで洗浄した。3回洗浄した後に、樹脂を新たに蒸留したDMF(1mL/100mgの樹脂)中で、窒素雰囲気下で5分間インキュベートした。
DMF中の20%ピペリジン(10~30ml/100mgの樹脂)で5~15分間樹脂をインキュベーションすることで、樹脂上のFmoc基を除去した。脱保護樹脂を濾過し、過剰なDMF及びDCMで洗浄した。3回洗浄した後に、樹脂を新たに蒸留したDMF(1mL/100mgの樹脂)中で、窒素雰囲気下で5分間インキュベートした。
工程2:リンクアミドMBHA樹脂上でアミドカップリングするための一般的手順
SPPS反応物を用いたアミドカップリング反応については、HATU(1.5~4当量)を含有するDMF溶液、Fmoc保護アミノ酸(0.5M濃度で1.5~5当量)及びDIPEA(5~10当量)を樹脂に加えた。反応物として天然アミノ酸を用いたアミドカップリング反応については、Fmocアミノ酸(5当量)、HATU(4.5当量)及びDIPEA(10当量)を樹脂と混合し、反応物として非天然アミノ酸を用いたアミドカップリング反応については、Fmocアミノ酸(1.5~2当量)、HATU(1.5当量)及びDIPEA(5.0当量)を樹脂と混合した。続いて混合した樹脂混合物を窒素雰囲気下で1~3時間にわたって振盪させ、ニンヒドリン試験定性分析を使用してカップリング反応を監視した。Fmoc保護アミノ酸の結合後、続いて樹脂をDMF及びDCMで洗浄し、対応するペプチド結合樹脂を生成した。
SPPS反応物を用いたアミドカップリング反応については、HATU(1.5~4当量)を含有するDMF溶液、Fmoc保護アミノ酸(0.5M濃度で1.5~5当量)及びDIPEA(5~10当量)を樹脂に加えた。反応物として天然アミノ酸を用いたアミドカップリング反応については、Fmocアミノ酸(5当量)、HATU(4.5当量)及びDIPEA(10当量)を樹脂と混合し、反応物として非天然アミノ酸を用いたアミドカップリング反応については、Fmocアミノ酸(1.5~2当量)、HATU(1.5当量)及びDIPEA(5.0当量)を樹脂と混合した。続いて混合した樹脂混合物を窒素雰囲気下で1~3時間にわたって振盪させ、ニンヒドリン試験定性分析を使用してカップリング反応を監視した。Fmoc保護アミノ酸の結合後、続いて樹脂をDMF及びDCMで洗浄し、対応するペプチド結合樹脂を生成した。
工程3:樹脂からの切断と、それに続く全ての脱保護の一般的手順
TFAカクテルで樹脂結合ペプチド模倣ペイロードを以下のように切断及び脱保護した。TFA/水/トリイソプロピルシラン(95:2.5:2.5)の溶液(ペプチジル樹脂100mgあたり10mL)をペプチジル樹脂に加え、混合物を室温に維持した。2~3時間後、樹脂を濾過し、切断溶液ですすいだ。組み合わせた濾液を冷t-BuOMeで処理し、ペプチドを沈殿させた。懸濁液を10分間遠心分離にかけた(5000R)。粗白色粉末を組み合わせ、分取HPLCで精製した。
TFAカクテルで樹脂結合ペプチド模倣ペイロードを以下のように切断及び脱保護した。TFA/水/トリイソプロピルシラン(95:2.5:2.5)の溶液(ペプチジル樹脂100mgあたり10mL)をペプチジル樹脂に加え、混合物を室温に維持した。2~3時間後、樹脂を濾過し、切断溶液ですすいだ。組み合わせた濾液を冷t-BuOMeで処理し、ペプチドを沈殿させた。懸濁液を10分間遠心分離にかけた(5000R)。粗白色粉末を組み合わせ、分取HPLCで精製した。
スキーム1に表すように、脱保護、洗浄、カップリング及び洗浄手順からなる多数の反復処理(すなわち、樹脂を各回とも1時間反応条件に供し、溶液を排出して、各回とも樹脂を再度新しい試薬に供した)によりペプチド鎖伸長反応を実施した。最後に、上記のように20%のピペリジンにより得られたFmoc保護ペプチジル樹脂を脱保護し、DMF及びDCMでそれぞれ4回洗浄した。樹脂結合ペプチドを窒素流下で10~15分間乾燥させ、切断/脱保護に供した。上記プロトコール及び好適なそれらの変形を使用し、Fmoc-SPPSアプローチを使用して本開示で設計したペプチド模倣薬を調製した。さらには、樹脂結合ペプチド模倣薬を切断及び脱保護し、以下のプロトコールを使用して精製及び特性評価した。
1.2 粗ペプチド模倣薬の分取HPLC精製
分取HPLCを、Shimadzu LC-8a液体クロマトグラフで実施した。DMF又は水に溶解した粗ペプチドの溶液をカラムに注入し、ACN水溶液の直線的勾配で溶出した。異なる方法を使用した(一般的な情報を参照されたい)。溶出した所望の生成物の量はほんの少しであり、それぞれのHPLC画分を凍結乾燥することで、非晶質の粉末で純粋なペプチド模倣薬を得た。一般には、分取HPLC精製後、全体の回収率は収率40~50%の範囲であることが分かった。
分取HPLCを、Shimadzu LC-8a液体クロマトグラフで実施した。DMF又は水に溶解した粗ペプチドの溶液をカラムに注入し、ACN水溶液の直線的勾配で溶出した。異なる方法を使用した(一般的な情報を参照されたい)。溶出した所望の生成物の量はほんの少しであり、それぞれのHPLC画分を凍結乾燥することで、非晶質の粉末で純粋なペプチド模倣薬を得た。一般には、分取HPLC精製後、全体の回収率は収率40~50%の範囲であることが分かった。
分取HPLC方法A:FA条件(カラム;Xtimate C18 150*25mm*5μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:40%~70%,7分)を使用し、純粋な生成物を得る。
分取HPLC方法B:TFA条件(カラム;YMC-Exphere C18 10μm 300*50mm 12nm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%~45%,55分)を使用し、純粋な生成物を得る。
分取HPLC方法C:中性条件(カラム;Phenomenex Gemini-NX 150*30mm*5μm;移動相:[水(10mM NH4HCO3)-ACN];B%:21%~51%,11分)を使用し、純粋な生成物を得る。
分取HPLC方法D:中性条件(カラム;Waters Xbridge 150*255u;移動相:[水(10mM NH4HCO3)-ACN];B%:20%~50%,7分)を使用し、純粋な生成物を得る。
分取HPLC方法E:FA条件(カラム;Phenomenex Luna C18 250*50mm*10μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:55%~86%,21分)を使用し、純粋な生成物を得る。
1.3 精製したペプチド模倣薬のHPLC分析
上記の調製HPLCによる精製後、方法A、B、C、D、E又はFを使用し、各ペプチドを分析HPLCにより分析した。PDA検出器を使用し、クロマトグラムの取得は220nmで実施した。一般には、分取HPLC精製後に得られた純粋なペプチド模倣薬の純度は95%超であることが分かった。
上記の調製HPLCによる精製後、方法A、B、C、D、E又はFを使用し、各ペプチドを分析HPLCにより分析した。PDA検出器を使用し、クロマトグラムの取得は220nmで実施した。一般には、分取HPLC精製後に得られた純粋なペプチド模倣薬の純度は95%超であることが分かった。
HPLC方法A(20分):移動相:4Lの水中の4.0mLのTFA(溶媒A)及び4Lのアセトニトリル中の3.2mLのTFA(溶媒B)、流量1.0mL/分で、20分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で3.5分間保持;カラム:Gemini-NX 5μm 150*4.6mm,C18,110A、波長:UV220nm,254nm;カラム温度:30℃を使用。
HPLC方法B(15分):移動相:2.75mL/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5mL/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5mL/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持;カラム:WELCH Ultimate LP-C18 150*4.6mm 5μm;波長:UV220nm,215nm,254nm;カラム温度:40℃を使用。
HPLC方法C(8分):移動相:2.75mL/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5mL/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5mL/分で7分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.48分間の保持;カラム:Ultimate XB-C18,3μm,3.0*50mm;波長:UV220nm,215nm,254nm;カラム温度:40℃を使用。
HPLC方法D(15分):移動相:0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)及び0.02%TFAを含有するアセトニトリル(溶媒B)、流量1.5mL/分で、15分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で3.5分間保持;カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm;波長:UV220nm,254nm;カラム温度:30℃を使用。
HPLC方法E(8分):移動相:0.2mL/1LのNH3*H2O水溶液(溶媒A)及びアセトニトリル(溶媒B)、流量1.2mL/分で、5分間の0%~60%溶出勾配(溶媒B)及び60%で2分間保持、カラム:Xbridge Shield RP-18,5μm,2.1*50mm。波長:UV220nm,254nm;カラム温度:30℃を使用。
HPLC方法F(7分):移動相:1.5mL/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75mL/4L TFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、10%~80%溶出勾配(溶媒B)を使用。カラム:Xtimate C18 2.1*30mm;波長:UV220nm,254nm;カラム温度:50℃。
1.4 質量分析法による特性評価
エレクトロスプレーイオン化質量分析法(electrospray ionization mass spectrometry、ESI-MS)により、フローインジェクション又はLC/MSモードで各ペプチドを特性評価した。全ての場合では、実験で測定された分子量は、計算されたモノアイソトピック分子量の0.5ダルトンの範囲内であった。上記プロトコールを使用し、質量分析法により全ての粗/純粋なペプチド模倣薬を特性評価した。一般には、ペプチド模倣薬の観察された質量は計算質量/理論質量と一致するが、これは所望のペプチド模倣薬の合成が成功したことを立証している。
エレクトロスプレーイオン化質量分析法(electrospray ionization mass spectrometry、ESI-MS)により、フローインジェクション又はLC/MSモードで各ペプチドを特性評価した。全ての場合では、実験で測定された分子量は、計算されたモノアイソトピック分子量の0.5ダルトンの範囲内であった。上記プロトコールを使用し、質量分析法により全ての粗/純粋なペプチド模倣薬を特性評価した。一般には、ペプチド模倣薬の観察された質量は計算質量/理論質量と一致するが、これは所望のペプチド模倣薬の合成が成功したことを立証している。
LC-MS方法A:MERCK(RP-18e 25-2mm)カラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出。
LC-MS方法B:Xtimate(C18 2.1*30mm,3μm)カラム、流量0.8mL/分で、0.02%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出。
LC-MS方法C:Chromolith(Flash RP-18e 25-3mm)カラム、流量1.5mL/分で、0.04%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.06%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出。
LC-MS方法D:Agilent,Pursuit(5 C18 20*2.0mm)カラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出。
LC-MS方法E:Xbridge C18 30*2.0mm,3.5μmカラム,流量1.0mL/分、5%~95%勾配で溶出。移動相:A)0.05% NH3H2O水溶液;B)ACN。勾配:0%のBから5.8分以内に95%のBに増加;95%のBで1.1分間保持;続いて6.91分で0%のBに戻り、0.09分間保持。
LC-MS方法F:XBridge C18 3.5μm 2.1*30mmカラム、流量1.0mL/分で、移動相:0.8mL/4LのNH3H2O水溶液(溶媒A)及びアセトニトリル(溶媒B)、2分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.48分間保持。
1.5 HRMS分析をAgilent 6200 Series TOF及び6500 Series Q-TOF LC/MSで実施
移動相:0.1%のFA水溶液(溶媒A)及びACN(溶媒B);溶出勾配:1ml/分の流量で3分間の5%~95%(溶媒B)及び95%で1分間保持;カラム:Xbridge Shield RP 18 5μm,2.1*50mm イオン源:AJS ESI源;イオンモード:正;噴霧ガス:窒素;乾燥ガス(N2)流:8L/分;ネブライザ圧力:35psig;気体温度:325℃;シースガス温度:350℃;シースガス流:11L/分;キャピラリ電圧:3.5KV;フラグメンタ圧力:175V。
実施例2.非天然アミノ酸の合成
2.1 非天然アミノ酸(aa1b)の合成
スキーム2は、非天然アミノ酸(aa1b)の合成を概説している:
スキーム2は、非天然アミノ酸(aa1b)の合成を概説している:
試薬及び条件:a)1-(ベンジルオキシ)-4-(ブロモメチル)ベンゼン(aa1b-4)(1.0当量),t-BuOK(1.0当量),THF,0~10℃,1時間,67.93%;b)Pd/C(10%),H2(50Psi),MeOH,40℃,44時間;94.24%;c)1-クロロ-4-ヨードブタン(1.5当量),K2CO3(2.0当量),DMF,50℃,16時間,83.44%;d)NaN3(2.17当量),K2CO3(2.0当量),DMF,65℃,16時間,98.44%;e)LiOH・H2O(2.0当量),THF/H2O,22℃,1時間,100%;f)HCl/EtOAc,22℃,1時間,85.04%;g)NaHCO3水溶液(0.43M),Fmoc-osu,THF,0~22℃,16時間,92.11%;h)(Boc)2O(3.0当量),DIPEA(3.0当量),Pd/C(10%),H2(15Psi),4時間,22.50%。
Wu,X.Y.;Stockdill,J.L.;Park,P.K.;Samuel J.Danishefsky,S.J.Expanding the Limits of Isonitrile-Mediated Amidations:On the Remarkable Stereosubtleties of Macrolactam Formation from Synthetic Seco-Cyclosporins.J.Am.Chem.Soc.2012,134,2378-2384に見られる詳細な合成手順に従い、aa1b-2を調製した。aa1b-1の調製は、Du,J.J.;Gao,X.F.;Xin,L.M.;Lei,Z.;Liu,Z.;and Guo,J.Convergent Synthesis of N-Linked Glycopeptides via Aminolysis of ω-Asp p-Nitrophenyl Thioesters in Solution.Org.Lett.2016,18,4828-4831に言及されている。
工程1:(S,Z)-メチル5-(4-ベンジルオキシ)フェニル)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)ペント-4-エノアート(aa1b-3)の合成
工程1:(S,Z)-メチル5-(4-ベンジルオキシ)フェニル)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)ペント-4-エノアート(aa1b-3)の合成
THF(100mL)中、aa1b-2(17.50g,32.43mmol,1.0当量)懸濁液に、0℃、窒素下でt-BuOK(3.64g,32.43mmol,1.0当量)を加えた。混合物を0℃で30分間撹拌した。THF(50mL)中のaa1b-1(7.5g,32.43mmol,1.0当量)の溶液を混合物に滴下した。反応物を10℃で加温し、1時間撹拌した。淡黄色の懸濁液を観察した。反応物を氷水(300mL)に加え、EtOAc(200mL×2)で抽出した。有機層を組み合わせ、塩水(200mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥させ、濾過し濃縮して黄色油として粗生成物を得た。その残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);80gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~18%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(50mL/分)の溶出)で1.5時間、総体積2.5Lで精製し、淡黄色の油としてaa1b-3(9.7g,23.57mmol,収率67.93%)を得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.45-7.26(m,6H),7.18(br d,J=8.6Hz,1H),6.92(dd,J=8.7,11.4Hz,2H),6.56-6.34(m,1H),5.98-5.83(m,1H),5.55-5.42(m,1H),5.07(d,J=2.2Hz,3H),4.48-4.36(m,1H),3.77-3.68(m,3H),2.94-2.56(m,2H),1.43(s,9H)
工程2:(S)-メチル2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-5-(4-ヒドロキシフェニル)ペンタノアート(aa1b-4)の合成
MeOH(100mL)中のメチルaa1b-3(9.7g,23.57mmol,1.0当量)及びPd/C(10%パラジウム活性炭,1.0g,9.40mmol)の溶液を、40℃、50Psiの水素下で44時間撹拌した。黒色懸濁液を観察した。反応物をセライトパッドに通して濾過し、ケーキをMeOH(50mL×3)で洗浄した。濾液を真空状態で濃縮し、aa1b-4(7.5g,22.22mmol,収率94.24%,純度95.788%)を灰色固体として得た。
MeOH(100mL)中のメチルaa1b-3(9.7g,23.57mmol,1.0当量)及びPd/C(10%パラジウム活性炭,1.0g,9.40mmol)の溶液を、40℃、50Psiの水素下で44時間撹拌した。黒色懸濁液を観察した。反応物をセライトパッドに通して濾過し、ケーキをMeOH(50mL×3)で洗浄した。濾液を真空状態で濃縮し、aa1b-4(7.5g,22.22mmol,収率94.24%,純度95.788%)を灰色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.05-6.92(m,J=8.3Hz,2H),6.79-6.70(m,J=8.3Hz,2H),5.59(br s,1H),5.03(br d,J=7.8Hz,1H),4.37-4.26(m,1H),3.71(s,3H),2.61-2.47(m,2H),1.81(br s,1H),1.68-1.54(m,3H),1.44(s,9H)。LCMS(ESI):RT=0.927分,mass calcd.for C17H25NO5 323.17,m/z found 345.9[M+Na]+。方法Cを使用し、逆相LC-MSを実施した。
工程3:(S)-メチル2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-5-(4-(4-クロロブトキシ)フェニル)ペンタノアート(aa1b-5)の合成
DMF(70mL)中のaa1b-10(7g,21.65mmol,1.0当量)、1-クロロ-4-ヨードブタン(7.09g,32.47mmol,1.5当量)及びK2CO3(5.98g,43.29mmol,2.0当量)の溶液を、50℃で16時間撹拌した。組み合わせた反応物を氷水(200mL)に加え、EtOAc(150mL×3)で抽出した。有機層を組み合わせ、塩水(150mL×2)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥させ、濾過し濃縮して黄色油として粗生成物を得た。その残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);80gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~20%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(50mL/分)の溶出)で1.5時間、総体積2.5Lで精製し、無色の油としてaa1b-5(8g,19.33mmol,収率83.44%)を得た。
DMF(70mL)中のaa1b-10(7g,21.65mmol,1.0当量)、1-クロロ-4-ヨードブタン(7.09g,32.47mmol,1.5当量)及びK2CO3(5.98g,43.29mmol,2.0当量)の溶液を、50℃で16時間撹拌した。組み合わせた反応物を氷水(200mL)に加え、EtOAc(150mL×3)で抽出した。有機層を組み合わせ、塩水(150mL×2)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥させ、濾過し濃縮して黄色油として粗生成物を得た。その残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);80gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~20%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(50mL/分)の溶出)で1.5時間、総体積2.5Lで精製し、無色の油としてaa1b-5(8g,19.33mmol,収率83.44%)を得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.04(d,J=8.6Hz,2H),6.79(d,J=8.6Hz,2H),4.95(br d,J=7.3Hz,1H),4.34-4.22(m,1H),3.98-3.92(m,2H),3.70(s,3H),3.60(t,J=6.2Hz,2H),2.62-2.48(m,2H),2.04-1.84(m,4H),1.83-1.59(m,4H),1.42(s,9H)
工程4:(S)-メチル5-(4-(4-アジドブトキシ)フェニル)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)ペンタノアート(aa1b-6)の合成
DMF(75mL)中、aa1b-5(7.5g,18.12mmol,1.0当量)と、NaN3(2.56g,39.32mmol,2.17当量)と、K2CO3(5.01g,36.24mmol,2.0当量)と、KI(300.78mg,1.81mmol,0.1当量)との混合物を、65℃で16時間撹拌した。反応物を氷水(200mL)に加え、EtOAc(100mL×3)で抽出した。有機層を組み合わせ、塩水(100mL×3)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥させ、濾過し濃縮して黄色油としてaa1b-6(7.5g,17.84mmol,収率98.44%)を得た。
DMF(75mL)中、aa1b-5(7.5g,18.12mmol,1.0当量)と、NaN3(2.56g,39.32mmol,2.17当量)と、K2CO3(5.01g,36.24mmol,2.0当量)と、KI(300.78mg,1.81mmol,0.1当量)との混合物を、65℃で16時間撹拌した。反応物を氷水(200mL)に加え、EtOAc(100mL×3)で抽出した。有機層を組み合わせ、塩水(100mL×3)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥させ、濾過し濃縮して黄色油としてaa1b-6(7.5g,17.84mmol,収率98.44%)を得た。
工程5:(S)-5-(4-(4-アジドブトキシ)フェニル)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)ペンタン酸(aa1b-7)の合成
THF(70mL)中のaa1b-6(7.5g,17.84mmol,1.0当量)及びLiOH・H2O(1M,35.67mL,2.0当量)の溶液を、22℃で1時間撹拌した。変化は何ら観察されなかった。反応物を真空状態で濃縮し、THFを除去した。1N HClを用いて反応物のpHを5に調整し、EtOAc(10mL×2)を用いて抽出した。有機層を組み合わせ、塩水(10mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥させ、濾過し濃縮して無色の油としてaa1b-7(7.25g,17.84mmol,収率100.00%)を得た。
THF(70mL)中のaa1b-6(7.5g,17.84mmol,1.0当量)及びLiOH・H2O(1M,35.67mL,2.0当量)の溶液を、22℃で1時間撹拌した。変化は何ら観察されなかった。反応物を真空状態で濃縮し、THFを除去した。1N HClを用いて反応物のpHを5に調整し、EtOAc(10mL×2)を用いて抽出した。有機層を組み合わせ、塩水(10mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥させ、濾過し濃縮して無色の油としてaa1b-7(7.25g,17.84mmol,収率100.00%)を得た。
工程6:(S)-2-アミノ-5-(4-(4-アジドブトキシ)フェニル)ペンタン酸塩酸塩(aa1b-8)の合成
4M HCl/EtOAc(75mL)中のaa1b-7(7.25g,17.84mmol,1.0当量)の溶液を、22℃で1時間撹拌した。反応物を真空状態で濃縮し、aa1b-8(5.2g,15.17mmol,収率85.04%,HCl)を白色固体として得た。
4M HCl/EtOAc(75mL)中のaa1b-7(7.25g,17.84mmol,1.0当量)の溶液を、22℃で1時間撹拌した。反応物を真空状態で濃縮し、aa1b-8(5.2g,15.17mmol,収率85.04%,HCl)を白色固体として得た。
工程7:(S)-2-((((9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル)アミノ)-5-(4-(4-アジドブトキシ)フェニル)ペンタン酸(aa1b-9)の合成
THF(116mL)中のaa1b-8(5g,14.58mmol,1.0当量,HCl)溶液に、H2O(58mL)中のNaHCO3(2.45g,29.17mmol,2.0当量)を加え、続いてFmoc-OSu(5.41g,16.04mmol,1.1当量)を0℃で加えた。反応混合物を22℃で16時間撹拌した。変化は何ら観察されなかった。1N HClを用いて反応物のpHを6に調整し、EtOAc(50mL×3)を用いて抽出した。有機層を組み合わせ、塩水(50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥させ、濾過し濃縮して黄色油として粗生成物を得た。その残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);80gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~5%のMeOH/DCM勾配(50mL/分)の溶出)で2.5時間、総体積3Lで精製し、黄色油としてaa1b-9(7g,12.20mmol,収率83.64%,純度92.113%)を得た。
THF(116mL)中のaa1b-8(5g,14.58mmol,1.0当量,HCl)溶液に、H2O(58mL)中のNaHCO3(2.45g,29.17mmol,2.0当量)を加え、続いてFmoc-OSu(5.41g,16.04mmol,1.1当量)を0℃で加えた。反応混合物を22℃で16時間撹拌した。変化は何ら観察されなかった。1N HClを用いて反応物のpHを6に調整し、EtOAc(50mL×3)を用いて抽出した。有機層を組み合わせ、塩水(50mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥させ、濾過し濃縮して黄色油として粗生成物を得た。その残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);80gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~5%のMeOH/DCM勾配(50mL/分)の溶出)で2.5時間、総体積3Lで精製し、黄色油としてaa1b-9(7g,12.20mmol,収率83.64%,純度92.113%)を得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.75(br d,J=7.3Hz,2H),7.60-7.49(m,2H),7.41-7.34(m,2H),7.29(br t,J=7.5Hz,2H),7.05(br d,J=8.3Hz,2H),6.78(br d,J=8.3Hz,2H),5.18(br d,J=8.3Hz,1H),4.40(br d,J=6.8Hz,3H),4.21(br t,J=7.0Hz,1H),3.98-3.88(m,2H),3.34(t,J=6.5Hz,2H),2.57(br d,J=6.1Hz,2H),1.98-1.60(m,8H)
工程8:(S)-2-((((9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル)アミノ)-5-(4-(4-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)ブトキシ)フェニル)ペンタン酸(aa1b)の合成
EtOAc(100mL)中、aa1b-15(7g,13.24mmol,1.0当量)、DIPEA(5.13g,39.73mmol,6.92mL,3.0当量)及びBoc2O(8.67g,39.73mmol,9.13mL,3.0当量)及びPd/C(10%パラジウム活性炭,3.5g,32.9mmol)の混合物を、25℃、15PsiのH2下で4時間撹拌した。黒色懸濁液を観察した。反応物をセライトパッドに通して濾過し、ケーキをEtOAc(50mL×3)で洗浄した。濾液を、NH4Cl(100mL×3)、塩水(100mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過して真空状態で濃縮し、無色の油として粗生成物を得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:Phenomenex Luna(2)C18 250*50 10μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:45%~78%,21.5分)で精製し、aa1b(1.8g,2.99mmol,収率22.50%)を黄色油として得た。LCMS(ESI):RT=0.954分,mass calcd.for C35H42N2O7Na 625.29,m/z found 625.1[M+Na]+。方法Aを使用し、逆相LC-MSを実施した。
EtOAc(100mL)中、aa1b-15(7g,13.24mmol,1.0当量)、DIPEA(5.13g,39.73mmol,6.92mL,3.0当量)及びBoc2O(8.67g,39.73mmol,9.13mL,3.0当量)及びPd/C(10%パラジウム活性炭,3.5g,32.9mmol)の混合物を、25℃、15PsiのH2下で4時間撹拌した。黒色懸濁液を観察した。反応物をセライトパッドに通して濾過し、ケーキをEtOAc(50mL×3)で洗浄した。濾液を、NH4Cl(100mL×3)、塩水(100mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濾過して真空状態で濃縮し、無色の油として粗生成物を得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:Phenomenex Luna(2)C18 250*50 10μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:45%~78%,21.5分)で精製し、aa1b(1.8g,2.99mmol,収率22.50%)を黄色油として得た。LCMS(ESI):RT=0.954分,mass calcd.for C35H42N2O7Na 625.29,m/z found 625.1[M+Na]+。方法Aを使用し、逆相LC-MSを実施した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.75(br d,J=7.6Hz,2H),7.60-7.55(m,2H),7.38(br t,J=6.7Hz,2H),7.29(t,J=7.1Hz,2H),7.04(br d,J=8.1Hz,2H),6.78(d,J=7.4Hz,2H),5.24(br s,1H),4.40(br d,J=6.6Hz,2H),4.23-4.18(m,1H),3.92(br s,2H),3.21-3.07(m,2H),2.61-2.51(m,2H),1.97-1.84(m,2H),1.82-1.54(m,8H),1.43(s,9H)
2.2 非天然アミノ酸(aa2)の合成
スキーム3は、非天然アミノ酸(aa2)の合成を概説している:
スキーム3は、非天然アミノ酸(aa2)の合成を概説している:
試薬及び条件:(a)K2CO3,PMB-Cl,DMF,25℃,12時間;(b)Ph3PCH2Br,t-BuOK,THF,0~25℃,4時間,71.91%;(c)Pd(dppf)Cl2,KOAc,4,4,5,5-テトラメチル-2-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1,3,2-ジオキサボロラン,1,4-ジオキサン,80℃,20時間,42.75%;(d)aa2-6,K2CO3,Pd(PPh3)4,1.4-ジオキサン及びH2O,80℃,2.5時間,76.20%;(e)Pd/C,H2(15psi),MeOH,25℃,48時間,85.01%;(f)K2CO3,1-クロロ-4-ヨード-ブタン,DMF,50℃,12時間;(g)K2CO3,Kl,NaN3,DMF,50℃,7時間;
化合物aa2-5は、以下の参考文献:I.Berezowska,N.N.Chung,C.Lemieux,B.C.Wilkes,and P.W.Schiller,Agonist vs Antagonist Behavior of δ Opioid Peptides Containing Novel Phenylalanine Analogues in Place of Tyr.J.Med.Chem.,Vol.52,No.21,2009,6941-6945に従って調製した。
工程1:2-ブロモ-5-((4-メトキシベンジル)オキシ)ベンズアルデヒド(aa2-2)の合成
DMF(100mL)中のaa2-1(10g,49.75mmol,1.0当量)とK2CO3(10.31g,74.62mmol,1.5当量)の溶液に、PMB-Cl(11.69g,74.62mmol,10.16mL,1.5当量)を加えた。混合物を25℃で12時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮した。残渣をH2O(100mL)で希釈し、EtOAc(100mL×2)で抽出した。組み合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過して減圧下で濃縮した。化合物aa2-2(21g,粗)を白色固体として得た。これをさらなる精製なしに次の工程で直接使用した。
DMF(100mL)中のaa2-1(10g,49.75mmol,1.0当量)とK2CO3(10.31g,74.62mmol,1.5当量)の溶液に、PMB-Cl(11.69g,74.62mmol,10.16mL,1.5当量)を加えた。混合物を25℃で12時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮した。残渣をH2O(100mL)で希釈し、EtOAc(100mL×2)で抽出した。組み合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過して減圧下で濃縮した。化合物aa2-2(21g,粗)を白色固体として得た。これをさらなる精製なしに次の工程で直接使用した。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ=10.16(s,1H),7.69(d,J=8.8Hz,1H),7.43-7.34(m,3H),7.28(dd,J=3.3,8.8Hz,1H),6.99-6.90(m,2H),5.10(s,2H),3.75(s,3H)。
工程2:1-ブロモ-4-((4-メトキシベンジル)オキシ)-2-ビニルベンゼン(aa2-3)の合成
THF(25mL)中のPh3PCH3Br(4.56g,12.77mmol,1.0当量)の溶液に、窒素下でt-BuOK(7.16g,63.83mmol,5.0当量)を加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。続いてTHF(25mL)中のaa2-2(4.1g,12.77mmol,1.0当量)を滴下した。混合物を25℃で3時間撹拌した。反応混合物をH2O(100mL)で希釈し、EtOAc(100mL×2)で抽出した。組み合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過して減圧下で濃縮した。その残渣を、フラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);40gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~5%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(30mL/分)の溶出)で24分、総体積0.9Lで精製した。化合物aa2-3(2.93g,9.18mmol,収率71.91%)を白色固体として得た。
THF(25mL)中のPh3PCH3Br(4.56g,12.77mmol,1.0当量)の溶液に、窒素下でt-BuOK(7.16g,63.83mmol,5.0当量)を加えた。混合物を0℃で1時間撹拌した。続いてTHF(25mL)中のaa2-2(4.1g,12.77mmol,1.0当量)を滴下した。混合物を25℃で3時間撹拌した。反応混合物をH2O(100mL)で希釈し、EtOAc(100mL×2)で抽出した。組み合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過して減圧下で濃縮した。その残渣を、フラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);40gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~5%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(30mL/分)の溶出)で24分、総体積0.9Lで精製した。化合物aa2-3(2.93g,9.18mmol,収率71.91%)を白色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.46-7.29(m,3H),7.18-7.09(m,1H),7.06-6.96(m,1H),6.95-6.86(m,2H),6.81-6.70(m,1H),5.72-5.59(m,1H),5.40-5.29(m,1H),5.03-4.90(m,2H),3.86-3.74(m,3H)。
工程3:2-(4-((4-メトキシベンジル)オキシ)-2ービニルフェニル)-4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン(aa2-4)の合成
1,4-ジオキサン(3mL)中のaa2-3(200mg,626.58μmol,1当量)の溶液を、Pd(PPh3)4(72.41mg,62.66μmol,0.1当量)及びKOAc(122.99mg,1.25mmol,2当量)で処理し、続いて4,4,5,5-テトラメチル-2-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1,3,2-ジオキサボロラン(477.34mg,1.88mmol,3当量)を加えた。混合物を、80℃、窒素下で12時間撹拌した。反応混合物を塩水(30mL)で希釈し、EtOAc(30mL×2)で抽出した。組み合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過して減圧下で濃縮した。その残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);4gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~10%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(18mL/分)の溶出)で精製した。化合物aa2-4(190mg,518.76μmol,収率82.79%)を白色固体として得た。
1,4-ジオキサン(3mL)中のaa2-3(200mg,626.58μmol,1当量)の溶液を、Pd(PPh3)4(72.41mg,62.66μmol,0.1当量)及びKOAc(122.99mg,1.25mmol,2当量)で処理し、続いて4,4,5,5-テトラメチル-2-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)-1,3,2-ジオキサボロラン(477.34mg,1.88mmol,3当量)を加えた。混合物を、80℃、窒素下で12時間撹拌した。反応混合物を塩水(30mL)で希釈し、EtOAc(30mL×2)で抽出した。組み合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過して減圧下で濃縮した。その残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);4gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~10%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(18mL/分)の溶出)で精製した。化合物aa2-4(190mg,518.76μmol,収率82.79%)を白色固体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.75(d,J=8.4Hz,1H),7.55(dd,J=10.9,17.5Hz,1H),7.36(d,J=8.6Hz,2H),7.22(d,J=2.4Hz,1H),6.97-6.89(m,2H),6.87(dd,J=2.4,8.4Hz,1H),5.67(d,J=17.4Hz,1H),5.26(d,J=11.0Hz,1H),5.03(s,2H),3.82(s,3H),1.34(s,12H)。
工程4:(S)-メチル2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-(4’-((4-メトキシベンジル)オキシ)-2’-ビニル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)プロパノアート(aa2-6)の合成
1,4-ジオキサン(3mL)及びH2O(1mL)中のaa2-4(100mg,273.03μmol,1当量)の溶液を、K2CO3(56.60mg,409.55μmol,1.5当量)及びPd(PPh3)4(31.55mg,27.30μmol,0.1当量)で処理し、続いてaa2-5(116.69mg,273.03μmol,1当量)を加えた。混合物を、80℃、窒素下で2.5時間撹拌した。反応混合物を塩水(30mL)で希釈し、EtOAc(30mL×2)で抽出した。組み合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過して減圧下で濃縮した。その残渣を、フラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);4gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~10%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(18mL/分)の溶出)で14分、総体積0.3Lで精製した。化合物aa2-6(100mg,193.20μmol,収率70.76%)を黄色油として得た。
1,4-ジオキサン(3mL)及びH2O(1mL)中のaa2-4(100mg,273.03μmol,1当量)の溶液を、K2CO3(56.60mg,409.55μmol,1.5当量)及びPd(PPh3)4(31.55mg,27.30μmol,0.1当量)で処理し、続いてaa2-5(116.69mg,273.03μmol,1当量)を加えた。混合物を、80℃、窒素下で2.5時間撹拌した。反応混合物を塩水(30mL)で希釈し、EtOAc(30mL×2)で抽出した。組み合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過して減圧下で濃縮した。その残渣を、フラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);4gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~10%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(18mL/分)の溶出)で14分、総体積0.3Lで精製した。化合物aa2-6(100mg,193.20μmol,収率70.76%)を黄色油として得た。
LCMS(ESI):RT=0.950分,mass calcd.for C31H35NO6Na 540.24,[M+Na]+,m/z found 540.1[M+Na]+。方法Aを使用し、逆相LC-MSを実施した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.39(d,J=8.6Hz,2H),7.27-7.25(m,2H),7.23(s,2H),7.17(dd,J=8.3,16.2Hz,3H),6.97-6.91(m,3H),6.67(dd,J=11.0,17.4Hz,1H),5.67(dd,J=1.1,17.4Hz,1H),5.22-5.15(m,1H),5.05(s,2H),3.83(s,3H),3.74(s,3H),1.47-1.35(m,1H),1.43(s,8H)。
工程5:(S)-メチル2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-(2’-エチル-4’-ヒドロキシ-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)プロパノアート(aa2-7)の合成
MeOH(25mL)中のaa2-6(2.8g,5.41mmol,1.0当量)の溶液に、Pd/C(300mg,10%パラジウム活性炭)を加え、25℃、水素下(15psi)で48時間撹拌した。反応混合物を濾過して減圧下で濃縮した。その残渣を、フラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);40gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~30%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(35mL/分)の溶出)で22分、総体積0.9Lで精製した。化合物aa2-7(1.85g,4.60mmol,収率85.01%,純度99.3%)を無色の油として得た。
MeOH(25mL)中のaa2-6(2.8g,5.41mmol,1.0当量)の溶液に、Pd/C(300mg,10%パラジウム活性炭)を加え、25℃、水素下(15psi)で48時間撹拌した。反応混合物を濾過して減圧下で濃縮した。その残渣を、フラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);40gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~30%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(35mL/分)の溶出)で22分、総体積0.9Lで精製した。化合物aa2-7(1.85g,4.60mmol,収率85.01%,純度99.3%)を無色の油として得た。
LCMS(ESI):RT=0.935分,mass calcd.for C23H29NO5Na 422.20,[M+Na]+,m/z found 422.1[M+Na]+。方法Aを使用し、逆相LC-MSを実施した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.22-7.11(m,4H),7.04(d,J=8.2Hz,1H),6.78(d,J=2.6Hz,1H),6.69(dd,J=2.6,8.2Hz,1H),5.24(s,1H),5.05(br d,J=8.4Hz,1H),4.70-4.58(m,1H),3.73(s,3H),3.20-3.11(m,1H),3.11-3.02(m,1H),2.53(q,J=7.6Hz,2H),1.42(s,9H),1.08(t,J=7.5Hz,3H)。
工程6:(S)-メチル2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-(4’-(4-クロロブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)プロパノアート(aa2-8)の合成
工程6:(S)-メチル2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-(4’-(4-クロロブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)プロパノアート(aa2-8)の合成
DMF(5mL)中のaa2-7(350mg,876.14μmol,1当量)及びK2CO3(242.18mg,1.75mmol,2.0当量)の溶液に、1-クロロ-4-ヨード-ブタン(287.11mg,1.31mmol,1.5当量)を25℃で加えた。混合物を50℃で12時間撹拌した。残渣を塩水(50mL)で希釈し、EtOAc(50mL×2)で抽出した。組み合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過して減圧下で濃縮した。その残渣を、フラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);12gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~30%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(35mL/分)の溶出)で14分、総体積0.4Lで精製した。化合物aa2-8(340mg,粗)を黄色油として得た。
LCMS(ESI):RT=1.145分,mass calcd.for C27H36ClNO5Na 512.22,[M+Na]+,m/z found 512.2[M+Na]+。方法Aを使用し、逆相LC-MSを実施した。
工程7:(S)-メチル3-(4’-(4-アジドブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)プロパノアート(aa2-9)の合成
DMF(15mL)中のaa2-8(1.6g,3.27mmol,1.0当量)の溶液に、K2CO3(902.51mg,6.53mmol,2.0当量)、KI(54.20mg,326.51μmol,0.1当量)及びNaN3(460mg,7.08mmol,2.1当量)を加えた。混合物を50℃で7時間撹拌した。反応混合物を塩水(50mL)で希釈し、EtOAc(50mL×2)で抽出した。組み合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過して減圧下で濃縮した。NaClO水溶液(1.0M,100mL)を加えることで水層をクエンチした。化合物aa2-9(1.7g,粗)を黄色油として得た。
DMF(15mL)中のaa2-8(1.6g,3.27mmol,1.0当量)の溶液に、K2CO3(902.51mg,6.53mmol,2.0当量)、KI(54.20mg,326.51μmol,0.1当量)及びNaN3(460mg,7.08mmol,2.1当量)を加えた。混合物を50℃で7時間撹拌した。反応混合物を塩水(50mL)で希釈し、EtOAc(50mL×2)で抽出した。組み合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過して減圧下で濃縮した。NaClO水溶液(1.0M,100mL)を加えることで水層をクエンチした。化合物aa2-9(1.7g,粗)を黄色油として得た。
LCMS(ESI):RT=1.140分,mass calcd.for C27H36N4O5Na 519.27,m/z found 519.3[M+Na]+。方法Aを使用し、逆相LC-MSを実施した。
工程8:(S)-3-(4’-(4-アジドブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)プロパン酸(aa2-10)の合成
工程8:(S)-3-(4’-(4-アジドブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)プロパン酸(aa2-10)の合成
THF(12mL)中のaa2-9(1.7g,3.42mmol,1.0当量)の溶液に、H2O(6mL)中のLiOH・H2O(287.31mg,6.85mmol,2.0当量)を0℃で加え、続いて混合物を25℃まで徐々に加温し、2時間撹拌させた。混合物をEtOAc(30mL)で処理し、水(25mL×2)で抽出した。組み合わせた水層を酸性化(1M HCl水溶液)し、EtOAc(50mL×3)で抽出した。組み合わせた有機層を無水Na2SO4によって乾燥させ、濾過して減圧下で濃縮した。化合物aa2-10(2.01g,粗)を黄色油として得た。これをさらなる精製なしに次の工程で直接使用した。
工程9:(S)-2-アミノ-3-(4’-(4-アジドブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)プロパン酸塩酸塩(aa2-11)の合成
化合物aa2-10(2.01g,4.17mmol,1.0当量)を4.0M HCl/EtOAc(20mL)に溶解した。混合物を25℃で1時間撹拌した。反応混合物を濾過した。濾過ケーキをEtOAc(30ml)で洗浄し、真空下で乾燥した。化合物aa2-11(1g,粗)を白色固体として得た。これをさらなる精製なしに次の工程で直接使用した。
化合物aa2-10(2.01g,4.17mmol,1.0当量)を4.0M HCl/EtOAc(20mL)に溶解した。混合物を25℃で1時間撹拌した。反応混合物を濾過した。濾過ケーキをEtOAc(30ml)で洗浄し、真空下で乾燥した。化合物aa2-11(1g,粗)を白色固体として得た。これをさらなる精製なしに次の工程で直接使用した。
LCMS(ESI):RT=1.121分,mass calcd.for C21H27N4O3 383.21[M+H]+,m/z found 383.2[M+H]+。方法Aを使用し、逆相LC-MSを実施した。
工程10:(S)-2-((((9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル)アミノ)-3-(4’-(4-アジドブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)プロパン酸(aa2)の合成
THF(15mL)中のaa2-11(1g,2.39mmol,1.0当量)の溶液に、H2O(8mL)中のNaHCO3(401.07mg,4.77mmol,2.0当量)を加え、続いて(2,5-ジオキソピロリジン-1-イル)9H-フルオレン-9-イルメチルカルボナート(805.23mg,2.39mmol,1.0当量)を0℃で加えた。混合物を25℃で12時間撹拌した。反応混合物を塩水(100mL)で希釈し、pHを2~3に酸性化した(1M HCl水溶液)。反応混合物をEtOAc(30mL×2)で抽出した。組み合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過して減圧下で濃縮した。その残渣を、フラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);40gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~10%のメタノール/ジクロロメタン勾配(30mL/分)の溶出)で16分、総体積0.6Lで精製した。生成物aa2(1.3g,2.14mmol,収率89.52%,純度99.4%)を白色の泡として得た。
THF(15mL)中のaa2-11(1g,2.39mmol,1.0当量)の溶液に、H2O(8mL)中のNaHCO3(401.07mg,4.77mmol,2.0当量)を加え、続いて(2,5-ジオキソピロリジン-1-イル)9H-フルオレン-9-イルメチルカルボナート(805.23mg,2.39mmol,1.0当量)を0℃で加えた。混合物を25℃で12時間撹拌した。反応混合物を塩水(100mL)で希釈し、pHを2~3に酸性化した(1M HCl水溶液)。反応混合物をEtOAc(30mL×2)で抽出した。組み合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過して減圧下で濃縮した。その残渣を、フラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);40gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~10%のメタノール/ジクロロメタン勾配(30mL/分)の溶出)で16分、総体積0.6Lで精製した。生成物aa2(1.3g,2.14mmol,収率89.52%,純度99.4%)を白色の泡として得た。
LCMS(ESI):RT=1.113分,mass calcd.for C36H36N4O5Na 627.26,[M+Na]+,m/z found 627.3[M+Na]+。方法Aを使用し、逆相LC-MSを実施した。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ=7.88(d,J=7.5Hz,2H),7.81(d,J=8.6Hz,1H),7.66(t,J=6.9Hz,2H),7.40(dt,J=2.3,7.3Hz,2H),7.34-7.25(m,4H),7.14(d,J=8.2Hz,2H),6.97(d,J=8.4Hz,1H),6.83(d,J=2.4Hz,1H),6.76(dd,J=2.5,8.5Hz,1H),4.27-4.17(m,3H),4.17-4.13(m,1H),4.03-3.98(m,2H),3.42(t,J=6.7Hz,2H),3.13(br dd,J=3.9,13.8Hz,1H),2.96-2.87(m,1H),2.52(d,J=1.8Hz,2H),2.43(q,J=7.4Hz,2H),1.82-1.74(m,2H),1.73-1.66(m,2H),0.98-0.90(m,3H)。
SFC:ee%=97.95%~2.05%=95.9%;方法へのコメント:カラム:Chiralcel OJ-3 100×4.6mm(内径),3μm;移動相:A:CO2:B:エタノール(0.05%DEA);勾配:4分間でBを5%~40%、40%で2.5分間保持、続いて1.5分間でBを5%;流量:2.8mL/分;カラム温度;35℃;ABPR;1500psi。
2.3 非天然アミノ酸(aa2b)の合成
スキーム4は、非天然アミノ酸(aa1b)の合成を概説している:
スキーム4は、非天然アミノ酸(aa1b)の合成を概説している:
試薬及び条件:(a)H2,Pd/C,(Boc)2O,DIPEA,MeOH,20℃,12時間,47%
工程1:(R)-2-((((9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル)アミノ)-3-(4’-(4-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)ブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)プロパン酸(aa2b)の合成
MeOH(30mL)中のaa2(3.2g,5.29mmol,1.0当量)の溶液に、Pd/C(700mg,10%パラジウム活性炭)、DIPEA(1.37g,10.60mmol,1.84mL,2.0当量)及びBoc2O(2.31g,10.58mmol,2.43mL,2.0当量)を加えた。混合物を、20℃、水素下(15psi)で12時間撹拌した。反応混合物を小さなセライトパッドに通して濾過し、40*5mLのEtOAc(40mL*5)を用いてすすいだ。続いて、塩水(400mL)を加え、EtOAc(300mL*2)で抽出した。組み合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥させ、濾過して減圧下で濃縮し、残渣を得た。残渣を分取HPLC(カラム:Phenomenex Luna C18 250*50mm*10μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:55%~86%,21分間)で精製し、生成物を水(150mL)に懸濁させ、混合物をドライアイス/エタノール浴で凍結させ、生成物aa2b(3.4g,5.01mmol,収率47.32%、純度100%)を白色固体として得た。
MeOH(30mL)中のaa2(3.2g,5.29mmol,1.0当量)の溶液に、Pd/C(700mg,10%パラジウム活性炭)、DIPEA(1.37g,10.60mmol,1.84mL,2.0当量)及びBoc2O(2.31g,10.58mmol,2.43mL,2.0当量)を加えた。混合物を、20℃、水素下(15psi)で12時間撹拌した。反応混合物を小さなセライトパッドに通して濾過し、40*5mLのEtOAc(40mL*5)を用いてすすいだ。続いて、塩水(400mL)を加え、EtOAc(300mL*2)で抽出した。組み合わせた有機層をNa2SO4上で乾燥させ、濾過して減圧下で濃縮し、残渣を得た。残渣を分取HPLC(カラム:Phenomenex Luna C18 250*50mm*10μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:55%~86%,21分間)で精製し、生成物を水(150mL)に懸濁させ、混合物をドライアイス/エタノール浴で凍結させ、生成物aa2b(3.4g,5.01mmol,収率47.32%、純度100%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=0.922分,mass calcd.for C41H46N2O7Na 701.33,[M+Na]+,m/z found 701.3[M+Na]+。方法Cを使用し、逆相LC-MSを実施した。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ=7.87(d,J=7.6Hz,2H),7.69-7.60(m,2H),7.43-7.36(m,2H),7.33-7.20(m,4H),7.15-7.05(m,3H),6.95(br d,J=8.3Hz,1H),6.89-6.70(m,4H),4.28(br dd,J=5.9,9.0Hz,1H),4.17-4.09(m,2H),4.00-3.91(m,3H),3.19-3.09(m,2H),3.02-2.88(m,2H),2.46-2.38(m,2H),1.73-1.62(m,2H),1.56-1.48(m,2H),1.37(s,9H),0.93(br t,J=7.6Hz,3H)。
2.4 非天然アミノ酸(aa13)の合成
スキーム5は、非天然アミノ酸(aa13)の合成を概説している:
スキーム5は、非天然アミノ酸(aa13)の合成を概説している:
本明細書の一部を構成するものとしてその内容全体が援用されている国際公開第2010/052253号に従い、aa13-1を調製した。
工程1:ベンジル 2,2-ジメチル-3-オキソ-3-(((テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)アミノ)プロパノアート(aa13-2)の合成
DCM(10mL)中のaa13-1(200mg,899.94μmol,1当量)、HATU(513.28mg,1.35mmol,1.5当量)及びDIPEA(348.93mg,2.70mmol,470.26μL,3当量)の溶液を、25℃で10分間撹拌した。O-テトラヒドロピラン-2-イルヒドロキシルアミン(105.42mg,899.94μmol,1当量)を混合物に加え、25℃で2時間撹拌した。反応物をDCM(5mL)に加え、NH4Cl水溶液(5mL)で洗浄した。水層を分離し、DCM(5mL)で抽出した。有機層を組み合わせ、塩水(5mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過して真空状態で濃縮し、黄色油として粗生成物を得た。これをフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);20gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~35%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(30mL/分)の溶出)により精製し、無色の油としてaa13-2(230mg,715.69μmol,収率79.53%)を得た。
DCM(10mL)中のaa13-1(200mg,899.94μmol,1当量)、HATU(513.28mg,1.35mmol,1.5当量)及びDIPEA(348.93mg,2.70mmol,470.26μL,3当量)の溶液を、25℃で10分間撹拌した。O-テトラヒドロピラン-2-イルヒドロキシルアミン(105.42mg,899.94μmol,1当量)を混合物に加え、25℃で2時間撹拌した。反応物をDCM(5mL)に加え、NH4Cl水溶液(5mL)で洗浄した。水層を分離し、DCM(5mL)で抽出した。有機層を組み合わせ、塩水(5mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過して真空状態で濃縮し、黄色油として粗生成物を得た。これをフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);20gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~35%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(30mL/分)の溶出)により精製し、無色の油としてaa13-2(230mg,715.69μmol,収率79.53%)を得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=9.28-9.14(m,1H),7.38-7.30(m,5H),5.16(s,2H),4.87(br s,1H),3.93-3.80(m,1H),3.59(br d,J=1.5Hz,1H),1.76(br s,3H),1.65-1.58(m,1H),1.56-1.52(m,2H),1.48(s,6H)
工程2:2,2-ジメチル-3-オキソ-3-(((テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)アミノ)プロパン酸(aa13)の合成
MeOH(5mL)中、aa13-2(230mg,715.69μmol,1当量)及び10%Pd/C(23mg)の黒色懸濁液を、25℃、15PsiのH2で5時間撹拌した。反応物をセライトパッドに通して濾過し、ケーキをMeOH(5mL*3)で洗浄した。濾液を真空状態で濃縮し、aa13(120mg,518.93μmol,収率72.51%)を無色の油として得た。
MeOH(5mL)中、aa13-2(230mg,715.69μmol,1当量)及び10%Pd/C(23mg)の黒色懸濁液を、25℃、15PsiのH2で5時間撹拌した。反応物をセライトパッドに通して濾過し、ケーキをMeOH(5mL*3)で洗浄した。濾液を真空状態で濃縮し、aa13(120mg,518.93μmol,収率72.51%)を無色の油として得た。
1H NMR(400MHz,メタノール-d4)δ=4.90-4.88(m,1H),4.05(br s,1H),3.59-3.53(m,1H),1.85-1.68(m,3H),1.68-1.51(m,3H),1.40(s,6H)。
2.5 非天然アミノ酸(aa14)の合成
スキーム6は、非天然アミノ酸(aa14)の合成を概説している:
スキーム6は、非天然アミノ酸(aa14)の合成を概説している:
試薬及び条件:(a)aa-14-1a(1.0当量),ジオキサン,50℃、15時間;(b)LiOH・H2O(2.0当量),THF/H20=1/1,50℃、16時間;(c)10%Pd/C触媒TFA,EtOH
化合物aa14-1を米国特許出願公開第2015/380666号に従って調製した。
工程1:メチル2-(1-ベンジル-1H-ピラゾール-5-イル)-2ーメチルプロパノアート(aa14-3)の合成
ジオキサン(30mL)中、aa14-1(2.76g,13.85mmol,1当量)とaa14-1a(2.20g,13.85mmol,1当量)との混合物を、50℃で15時間撹拌した。反応物を濾過し、濾液を真空状態で濃縮し、粗生成物を褐色油として得た。その残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);20gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~20%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(25mL/分)の溶出)で精製し、淡黄色の油としてaa14-2(0.9g,3.48mmol,収率25.15%)を得た。
ジオキサン(30mL)中、aa14-1(2.76g,13.85mmol,1当量)とaa14-1a(2.20g,13.85mmol,1当量)との混合物を、50℃で15時間撹拌した。反応物を濾過し、濾液を真空状態で濃縮し、粗生成物を褐色油として得た。その残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);20gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~20%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(25mL/分)の溶出)で精製し、淡黄色の油としてaa14-2(0.9g,3.48mmol,収率25.15%)を得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.53(s,1H),7.29-7.26(m,1H),7.23-7.16(m,1H),6.98(d,J=7.4Hz,2H),6.22(s,1H),5.23(s,2H),3.26(s,3H),1.56(s,6H)
工程2:メチル2-(1-ベンジル-1H-ピラゾール-5-イル)-2ーメチルプロパノアート(aa14-3)の合成
THF(5.4mL)中、aa14-2(700mg,2.71mmol,1当量)とLiOH・H2O(1M,5.42mL,2当量)との混合物を、50℃で16時間撹拌した。反応物を真空状態で濃縮し、THFを除去した。反応物を水(5mL)及びMTBE(5mL)で希釈した。水層を分離し、1N HClを用いてpHを6に調整した。有機層を廃棄した。水層をEtOAc(5mL*3)で抽出した。有機層を組み合わせ、塩水(5mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過して真空状態で濃縮し、白色固体としてaa14-3(600mg,2.46mmol,収率90.64%)を得た。
THF(5.4mL)中、aa14-2(700mg,2.71mmol,1当量)とLiOH・H2O(1M,5.42mL,2当量)との混合物を、50℃で16時間撹拌した。反応物を真空状態で濃縮し、THFを除去した。反応物を水(5mL)及びMTBE(5mL)で希釈した。水層を分離し、1N HClを用いてpHを6に調整した。有機層を廃棄した。水層をEtOAc(5mL*3)で抽出した。有機層を組み合わせ、塩水(5mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過して真空状態で濃縮し、白色固体としてaa14-3(600mg,2.46mmol,収率90.64%)を得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.53(s,1H),7.26-7.17(m,3H),6.97(d,J=7.4Hz,2H),6.24(s,1H),5.23(s,2H),1.54(s,6H)。
工程3:2-メチル-2-(1H-ピラゾール-5-イル)プロパン酸(aa14)の合成
EtOH(5mL)中、aa14-3(500mg,2.05mmol,1当量)と、TFA(23.34mg,204.68μmol,15.15μL,0.1当量)と、10%Pd/C(100mg)との混合物を、80℃、100PsiのH2で16時間撹拌した。反応物をセライトパッドに通して濾過し、ケーキをEtOH(5mL*3)で洗浄した。濾液を真空状態で濃縮し、aa14(300mg,1.52mmol,収率74.27%,純度78.11%)を淡黄色の油として得た。LCMS(ESI):RT=1.036分,m/z calcd.for C7H11N2O2 [M+H]+155.07,found 155.0。方法Aを使用し、逆相LC-MSを実施した。
EtOH(5mL)中、aa14-3(500mg,2.05mmol,1当量)と、TFA(23.34mg,204.68μmol,15.15μL,0.1当量)と、10%Pd/C(100mg)との混合物を、80℃、100PsiのH2で16時間撹拌した。反応物をセライトパッドに通して濾過し、ケーキをEtOH(5mL*3)で洗浄した。濾液を真空状態で濃縮し、aa14(300mg,1.52mmol,収率74.27%,純度78.11%)を淡黄色の油として得た。LCMS(ESI):RT=1.036分,m/z calcd.for C7H11N2O2 [M+H]+155.07,found 155.0。方法Aを使用し、逆相LC-MSを実施した。
1H NMR(400MHz,メタノール-d4)δ=7.57-7.50(m,1H),6.26(d,J=1.8Hz,1H),1.56(s,6H)。
2.6 非天然アミノ酸[aa20:(R)-異性体及びaa21:(S)-異性体]の合成
スキーム7は、非天然アミノ酸(aa20)及び(aa21)の合成を概説している:
スキーム7は、非天然アミノ酸(aa20)及び(aa21)の合成を概説している:
試薬及び条件:(a)NaH(1.2当量),ジブロモエタン(2当量),THF(25ml),0~100°C,16時間;(b)2-(1-トリチル-1H-イミダゾール-5-イル)エタンアミン(0.9当量),DMF(5ml),60°C,16時間;(c)LiOH(4当量),H2O(10ml),THF(10ml),20°C,16時間;(d)SFC分離。
工程1:ジエチル2-(2-ブロモエチル)-2-メチルマロナート(aa20-2)の合成
一定量のTHF(10mL)を、N2雰囲気下でNaH(252.57mg,6.31mmol,純度60%,1.1当量)に加えた。THF溶液を0℃に冷却した。THF(5mL)中、化合物aa20-1(1g,5.74mmol,980.39μL,1当量)を30分間にわたって撹拌させながら加えた。反応混合物を20℃で60分間撹拌した。生成されたエノラートを、THF(10mL)中の1,2-ジブロモエタン(2.16g,11.48mmol,866.23μL,2当量)に窒素雰囲気下で60分間にわたって撹拌させながら滴下した。次いで、反応混合物を溶媒中で14時間、100℃に加熱した。TLCは、反応物が消費され、極性が低い主要な新規スポットが1つ検出されたことを示した。残渣を1N HClに注ぎ、pHを2~4に調整した。続いて水相を酢酸エチル(30mL*3)で抽出した。組み合わせた有機相を塩水(50mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過して真空状態で濃縮した。その残渣を、0.8Lの溶媒を用いたフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);24gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~20%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(20mL/分)の溶出)で40分間精製した。化合物aa20-2(1.2g,4.27mmol,収率74.35%)を淡黄色の液体として得た。
一定量のTHF(10mL)を、N2雰囲気下でNaH(252.57mg,6.31mmol,純度60%,1.1当量)に加えた。THF溶液を0℃に冷却した。THF(5mL)中、化合物aa20-1(1g,5.74mmol,980.39μL,1当量)を30分間にわたって撹拌させながら加えた。反応混合物を20℃で60分間撹拌した。生成されたエノラートを、THF(10mL)中の1,2-ジブロモエタン(2.16g,11.48mmol,866.23μL,2当量)に窒素雰囲気下で60分間にわたって撹拌させながら滴下した。次いで、反応混合物を溶媒中で14時間、100℃に加熱した。TLCは、反応物が消費され、極性が低い主要な新規スポットが1つ検出されたことを示した。残渣を1N HClに注ぎ、pHを2~4に調整した。続いて水相を酢酸エチル(30mL*3)で抽出した。組み合わせた有機相を塩水(50mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過して真空状態で濃縮した。その残渣を、0.8Lの溶媒を用いたフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);24gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~20%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(20mL/分)の溶出)で40分間精製した。化合物aa20-2(1.2g,4.27mmol,収率74.35%)を淡黄色の液体として得た。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ4.18(q,J=7.20Hz,4H),3.33-3.41(m,2H),2.39-2.47(m,2H),1.43(s,3H),1.22(s,6H)
工程2:エチル3-メチル-2-オキソ-1-(2-(1-トリチル-1H-イミダゾール-5-イル)エチル)ピロリドン-3-カルボキシラート(aa20-3)の合成
イミダゾールDMF(10mL)中の2-(1-トリチル-1H--5-イル)エタンアミン(1g,2.83mmol,1当量)の溶液に、aa20-2(874.95mg,3.11mmol,1.1当量)を加えた。混合物を60℃で16時間撹拌した。LCMSは、物質が完全に消費され、主生成物として所望の生成物が観察されたことを示した。残渣を水(100mL)に注いだ(100mL)。水相を酢酸エチル(50mL*3)で抽出した。組み合わせた有機相を塩水(100mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過して真空状態で濃縮した。粗生成物を、C-18逆相クロマトグラフィー(ISCO(登録商標);80g,C-18カラム、0~100%のアセトニトリル/H2O勾配(40mL/分)の溶出、総体積2400mLで60分間)で精製し、黄色固体を得た。化合物aa20-3(650mg,903.47μmol,収率31.93%、純度70.55%)を黄色固体として得た。
イミダゾールDMF(10mL)中の2-(1-トリチル-1H--5-イル)エタンアミン(1g,2.83mmol,1当量)の溶液に、aa20-2(874.95mg,3.11mmol,1.1当量)を加えた。混合物を60℃で16時間撹拌した。LCMSは、物質が完全に消費され、主生成物として所望の生成物が観察されたことを示した。残渣を水(100mL)に注いだ(100mL)。水相を酢酸エチル(50mL*3)で抽出した。組み合わせた有機相を塩水(100mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過して真空状態で濃縮した。粗生成物を、C-18逆相クロマトグラフィー(ISCO(登録商標);80g,C-18カラム、0~100%のアセトニトリル/H2O勾配(40mL/分)の溶出、総体積2400mLで60分間)で精製し、黄色固体を得た。化合物aa20-3(650mg,903.47μmol,収率31.93%、純度70.55%)を黄色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=0.861分,m/z calcd.for C32H34N3O3 508.25[M+H]+,found 508.3。方法Aを使用し、逆相LC-MSを実施した。
工程3:3-メチル-2-オキソ-1-(2-(1-トリチル-1H-イミダゾール-5-イル)エチル)ピロリドン-3-カルボン酸(aa20-4)の合成
aa20-3(650mg,1.28mmol,1当量)の混合物に、H2O(10mL)及びTHF(10mL)中のLiOH・H2O(268.67mg,6.40mmol,5当量)を加えた。混合物を20℃で16時間撹拌した。LCMSは、物質が完全に消費され、主生成物として所望の生成物が観察されたことを示した。残渣をH2O(50mL)に注ぎ、5%のKHSO4を加え、pHを2~3に調整した。水相を酢酸エチル(50mL*3)で抽出した。組み合わせた有機相を塩水(50ml)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させ、濾過して真空状態で濃縮した。粗生成物を、分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi Max-RP 250*50mm*10um;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:30%~60%,60分)で精製し、aa20-4(180mg,375.34μmol,収率29.31%)を白色固体として得た。
aa20-3(650mg,1.28mmol,1当量)の混合物に、H2O(10mL)及びTHF(10mL)中のLiOH・H2O(268.67mg,6.40mmol,5当量)を加えた。混合物を20℃で16時間撹拌した。LCMSは、物質が完全に消費され、主生成物として所望の生成物が観察されたことを示した。残渣をH2O(50mL)に注ぎ、5%のKHSO4を加え、pHを2~3に調整した。水相を酢酸エチル(50mL*3)で抽出した。組み合わせた有機相を塩水(50ml)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させ、濾過して真空状態で濃縮した。粗生成物を、分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi Max-RP 250*50mm*10um;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:30%~60%,60分)で精製し、aa20-4(180mg,375.34μmol,収率29.31%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=2.391分,m/z calcd.for C30H30N3O3 480.6,found 480.3[M+H]+。Merck,RP-18e 25-2mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LC-MSを実施し、0.02%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
1H NMR(ES8586-496-P1B1)1H NMR(400MHz,メタノール-d4)δ7.92(s,1H),7.35-7.42(m,9H),7.12-7.19(m,6H),6.97(s,1H),3.39-3.64(m,3H),3.32(br d,J=3.75Hz,1H),2.84(br t,J=5.95Hz,2H),2.34-2.42(m,1H),1.86(td,J=7.99,12.90Hz,1H),1.25(s,3H)
工程4:(R)-3-メチル-2-オキソ-1-(2-(1-トリチル-1H-イミダゾール-5-イル)エチル)ピロリジン-3-カルボン酸(aa20)及び(S)-3-メチル-2-オキソ-1-(2-(1-トリチル-1H-イミダゾール-5-イル)エチル)ピロリジン-3-カルボン酸(aa21)の合成
aa20(R)及びaa21(S)の絶対配置は確認されなかった。
aa20(R)及びaa21(S)の絶対配置は確認されなかった。
化合物aa20-4(180mg,375.34μmol)を、分取SFC(カラム:DAICEL CHIRALPAK IC(250mm*30mm,10μm;移動相:0.1%NH3H2O MEOH;B%:50%~50%,80分)で精製した。異性体(R)であるaa20(86mg,177.18μmol,収率94.41%,純度98.8%)を白色固体として得て、異性体(S)であるaa21(85mg,175.29μmol,収率93.41%,純度98.9%)もまた白色固体として得た。
SFC-HPLC上での異性体aa20:RT=2.346分。HPLC条件:Chiralpak IC-3 100×4.6mm(内径),3μm,流量2.8mL/分。40%のメタノール(0.05%DEA)(溶媒B)の勾配及びCO2(溶媒A)で溶出。
SFC-HPLC上での異性体aa21:RT=3.607分。HPLC条件:Chiralpak IC-3 100×4.6mm(内径),3μm,流量2.8mL/分。40%のメタノール(0.05%DEA)(溶媒B)の勾配及びCO2(溶媒A)で溶出。
2.7 非天然アミノ酸[aa22:(R)-異性体及びaa23:(S)-異性体]の合成
スキーム8は、非天然アミノ酸(aa22)及び(aa23)の合成を概説している:
スキーム8は、非天然アミノ酸(aa22)及び(aa23)の合成を概説している:
試薬及び条件:(a)TrtCl(1.2当量),Et3N(2当量),DMF,20°C,2時間,31%;(b)TsCl(1.5当量),Et3N(3当量),DMAP(0.5当量),DCM,20°C,2時間,66%;(c)aa22-3(1.0当量),aa22-3a(1.2当量),LiI(1.5当量),DIPEA(4当量),60°C,2当量,収率17%;(d)aa22-3(1.0当量),aa22-3b(1.2当量),LiI(1.5当量),K2CO3(4当量),20°C,3当量,収率58%;(e)NaOH(2当量),MeOH/水,20°C,2時間,収率87%。
工程1:2-(1-トリチル-1H-イミダゾール-4-イル)エタノール(aa22-2)の合成
DMF(40mL)中のaa22-1(2g,17.84mmol,1当量)の溶液に、TEA(3.61g,35.67mmol,4.97mL,2当量)、[クロロ(ジフェニル)メチル]ベンゼン(5.97g,21.40mmol,1.2当量)を20℃で加えた。反応混合物を20℃で2時間撹拌した。反応の進行をTLC(DCM:MeOH=10:1)で監視した。これは、出発物質が消費され、新規スポットが1つ観察されたことを示していた。反応混合物をNaHCO3(飽和水溶液、20mL)で希釈し、EtOAc(50mL*2)で抽出した。組み合わせた有機層を塩水(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥させ、濾過して減圧下で濃縮し、残渣を得た。その残渣を、フラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);20gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~100%の酢酸エチル/石油エーテル、その後0~10%のMeOH(0.5%TEA添加)/DCM勾配(30mL/分)の溶出)で25分、総体積1.6Lで精製した。化合物aa22-2(2.2g,5.59mmol,収率31.32%,純度90%)を白色固体として得た。
DMF(40mL)中のaa22-1(2g,17.84mmol,1当量)の溶液に、TEA(3.61g,35.67mmol,4.97mL,2当量)、[クロロ(ジフェニル)メチル]ベンゼン(5.97g,21.40mmol,1.2当量)を20℃で加えた。反応混合物を20℃で2時間撹拌した。反応の進行をTLC(DCM:MeOH=10:1)で監視した。これは、出発物質が消費され、新規スポットが1つ観察されたことを示していた。反応混合物をNaHCO3(飽和水溶液、20mL)で希釈し、EtOAc(50mL*2)で抽出した。組み合わせた有機層を塩水(20mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥させ、濾過して減圧下で濃縮し、残渣を得た。その残渣を、フラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);20gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~100%の酢酸エチル/石油エーテル、その後0~10%のMeOH(0.5%TEA添加)/DCM勾配(30mL/分)の溶出)で25分、総体積1.6Lで精製した。化合物aa22-2(2.2g,5.59mmol,収率31.32%,純度90%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=1.397分,m/z calcd.for C24H23N2O 355.2,found 355.2[M+H]+;方法Bを使用して逆相LC-MSを実施した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.39-7.31(m,10H),7.17-7.11(m,6H),6.63-6.57(m,1H),3.89(t,J=5.6Hz,2H),3.64(br s,1H),2.76(t,J=5.5Hz,2H)。
工程2:2-(1-トリチル-1H-イミダゾール-4-イル)エチル4-メチルベンゼンスルホナート(aa22-3)の合成
DCM(20mL)中のaa22-2(2.2g,5.59mmol,1当量)の溶液に、TEA(1.70g,16.76mmol,2.33mL,3当量)、4-メチルベンゼンスルホニルクロリド(1.60g,8.38mmol,1.5当量)及びDMAP(341.23mg,2.79mmol,0.5当量)を20℃で加えた。反応混合物を20℃で2時間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視したところ、これは出発物質が残っていないことと所望の生成物の形成を示していた。反応混合物をNaHCO3(飽和水溶液、50mL)で希釈し、EtOAc(50mL*2)で抽出した。組み合わせた有機層を塩水(20mL×2)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥させ、濾過して減圧下で濃縮し、残渣を得た。その残渣を、フラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);24gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~5%のMeOH(4%TEA添加)/DCM勾配(20mL/分)の溶出)で35分、総体積1.2Lで精製した。化合物aa22-3(2.1g,3.72mmol,収率66.52%,純度90%)を褐色固体として得た。LCMS(ESI):RT=0.775分,m/z calcd.for C31H28N2O3SNa 531.2[M+H]+,found 531.1。方法Dを使用し、逆相LC-MSを実施した。
DCM(20mL)中のaa22-2(2.2g,5.59mmol,1当量)の溶液に、TEA(1.70g,16.76mmol,2.33mL,3当量)、4-メチルベンゼンスルホニルクロリド(1.60g,8.38mmol,1.5当量)及びDMAP(341.23mg,2.79mmol,0.5当量)を20℃で加えた。反応混合物を20℃で2時間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視したところ、これは出発物質が残っていないことと所望の生成物の形成を示していた。反応混合物をNaHCO3(飽和水溶液、50mL)で希釈し、EtOAc(50mL*2)で抽出した。組み合わせた有機層を塩水(20mL×2)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥させ、濾過して減圧下で濃縮し、残渣を得た。その残渣を、フラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);24gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~5%のMeOH(4%TEA添加)/DCM勾配(20mL/分)の溶出)で35分、総体積1.2Lで精製した。化合物aa22-3(2.1g,3.72mmol,収率66.52%,純度90%)を褐色固体として得た。LCMS(ESI):RT=0.775分,m/z calcd.for C31H28N2O3SNa 531.2[M+H]+,found 531.1。方法Dを使用し、逆相LC-MSを実施した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.73(d,J=8.3Hz,2H),7.38-7.28(m,12H),7.15-7.08(m,6H),6.61(s,1H),4.27(t,J=7.0Hz,2H),2.91-2.86(m,2H),2.42(s,3H)。
工程3:(R)-1-(2-(1-トリチル-1H-イミダゾール-4-イル)エチル)ピロリドン-3-カルボン酸(aa22)の合成
DMF(2mL)中のaa22-3(500mg,983.03μmol,1当量)の溶液に、aa22-3a(135.81mg,1.18mmol、1.2当量)、LiI(197.36mg,1.47mmol,56.55μL,1.5当量)及びDIPEA(508.20mg,3.93mmol,684.91μL,4.0当量)を加えた。続いて、混合物を60℃に加熱し、60℃で2時間撹拌した。LCMSは、反応物が完全に消費され、所望のMSが検出されたことを示した。水(10mL)を加えて反応混合物をクエンチし、続いてEtOAc(20mL)で希釈し、続いてEtOAc(20mL*2)で抽出した。水層を2M HClでpH6に酸性化した。続いて水相をDCM(20mL*5)で抽出した。組み合わせた有機層を濃縮し、残渣を得た。粗生成物を逆相HPLC(中性条件)で精製した。生成物aa22(80mg,168.31μmol,収率17.12%、純度95%)をオフホワイト色の固体として得た。LCMS(ESI):RT=1.986分,mass calcd.for C29H30N3O2 452.23,m/z found 452.3[M+H]+。方法Aを使用し、逆相LC-MSを実施した。
DMF(2mL)中のaa22-3(500mg,983.03μmol,1当量)の溶液に、aa22-3a(135.81mg,1.18mmol、1.2当量)、LiI(197.36mg,1.47mmol,56.55μL,1.5当量)及びDIPEA(508.20mg,3.93mmol,684.91μL,4.0当量)を加えた。続いて、混合物を60℃に加熱し、60℃で2時間撹拌した。LCMSは、反応物が完全に消費され、所望のMSが検出されたことを示した。水(10mL)を加えて反応混合物をクエンチし、続いてEtOAc(20mL)で希釈し、続いてEtOAc(20mL*2)で抽出した。水層を2M HClでpH6に酸性化した。続いて水相をDCM(20mL*5)で抽出した。組み合わせた有機層を濃縮し、残渣を得た。粗生成物を逆相HPLC(中性条件)で精製した。生成物aa22(80mg,168.31μmol,収率17.12%、純度95%)をオフホワイト色の固体として得た。LCMS(ESI):RT=1.986分,mass calcd.for C29H30N3O2 452.23,m/z found 452.3[M+H]+。方法Aを使用し、逆相LC-MSを実施した。
工程4:(3S)-1-[2-(1-トリチルイミダゾール-4-イル)エチル]ピロリジン-3-カルボキシラート(aa23-1)の合成
DMF(5mL)中のaa22-3(750mg,1.47mmol,1当量)の溶液に、K2CO3(815.17mg,5.90mmol,4当量)、aa22-3b(293.05mg,1.77mmol,1.2当量,HCl)及びLiI(296.04mg,2.21mmol,84.83μL,1.5当量)を20℃で加えた。反応混合物を20℃で3時間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視したところ、これは出発物質が残っていないことと所望の生成物の形成を示していた。混合物を25℃に冷却し、水(30mL)に注ぎ、5分間撹拌した。水相を酢酸エチル(50mL*2)で抽出した。組み合わせた有機相を塩水(15mL*2)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過して真空状態で濃縮した。その残渣を、フラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);20gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~100%の酢酸エチル/石油エーテル、その後0~10%のMeOH(0.5%TEA添加)/DCM勾配(30mL/分)の溶出)で25分、総体積1.6Lで精製した。生成物aa23-1(420mg,856.99μmol,収率58.12%,純度95%)を褐色固体として得た。
DMF(5mL)中のaa22-3(750mg,1.47mmol,1当量)の溶液に、K2CO3(815.17mg,5.90mmol,4当量)、aa22-3b(293.05mg,1.77mmol,1.2当量,HCl)及びLiI(296.04mg,2.21mmol,84.83μL,1.5当量)を20℃で加えた。反応混合物を20℃で3時間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視したところ、これは出発物質が残っていないことと所望の生成物の形成を示していた。混合物を25℃に冷却し、水(30mL)に注ぎ、5分間撹拌した。水相を酢酸エチル(50mL*2)で抽出した。組み合わせた有機相を塩水(15mL*2)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過して真空状態で濃縮した。その残渣を、フラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);20gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~100%の酢酸エチル/石油エーテル、その後0~10%のMeOH(0.5%TEA添加)/DCM勾配(30mL/分)の溶出)で25分、総体積1.6Lで精製した。生成物aa23-1(420mg,856.99μmol,収率58.12%,純度95%)を褐色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=0.717分,m/z calcd.for C30H31N3O2 466.2[M+H]+,found 465.9;LC-MS条件:方法Dを使用して逆相LC-MSを実施した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.40-7.30(m,10H),7.20-7.09(m,6H),6.58(s,1H),3.75-3.64(m,3H),3.10-2.95(m,2H),2.83-2.74(m,5H),2.72-2.64(m,1H),2.55(q,J=8.0Hz,1H),2.14-2.07(m,2H)。
工程5:(3S)-1-[2-(1-トリチルイミダゾール-4-イル)エチル]ピロリジン-3-カルボキシラート(aa23)の合成
MeOH(3mL)と水(3mL)中のaa23-1(390.00mg,837.66μmol,1当量)の溶液に、NaOH(67.01mg,1.68mmol,2当量)を20℃で加えた。反応混合物を20℃で2時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視したところ、これは出発物質が残っていないことと所望の生成物の形成を示していた。完了後、反応混合物を室温に冷却した。反応混合物を減圧下で濃縮し、溶媒を除去した。1M HClを用いて残渣のpHを6に調整し、凍結乾燥で乾燥させた。残渣をDCM/MeOH=10/1(15mL*3)でトリチュレートした。組み合わせた有機相を無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過して真空状態で濃縮した。生成物aa23(350mg,736.34μmol,収率87.90%、純度95%)を褐色固体として得た。
MeOH(3mL)と水(3mL)中のaa23-1(390.00mg,837.66μmol,1当量)の溶液に、NaOH(67.01mg,1.68mmol,2当量)を20℃で加えた。反応混合物を20℃で2時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視したところ、これは出発物質が残っていないことと所望の生成物の形成を示していた。完了後、反応混合物を室温に冷却した。反応混合物を減圧下で濃縮し、溶媒を除去した。1M HClを用いて残渣のpHを6に調整し、凍結乾燥で乾燥させた。残渣をDCM/MeOH=10/1(15mL*3)でトリチュレートした。組み合わせた有機相を無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過して真空状態で濃縮した。生成物aa23(350mg,736.34μmol,収率87.90%、純度95%)を褐色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=0.708分,m/z calcd.for C29H30N3O2 452.2[M+H]+,found 451.9;方法Dを使用して逆相LC-MSを実施した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.38(s,1H),7.36-7.31(m,9H),7.12(dd,J=3.3,6.3Hz,6H),6.64(s,1H),3.83(br s,1H),3.56(br s,1H),3.20(br d,J=18.5Hz,2H),3.05-2.96(m,4H),2.65-2.61(m,1H),2.42-2.30(m,1H),2.18-2.09(m,1H)。
2.8 非天然アミノ酸(aa27)の合成
スキーム9は、非天然アミノ酸(aa27)の合成を概説している:
スキーム9は、非天然アミノ酸(aa27)の合成を概説している:
試薬及び条件:(a)HCl/ジオキサン,0~25°C,2時間,100%;(b)CbzCl(1.2当量),HOSu(1.3当量),DIPEA(2当量),DCM,0~20℃,12時間,96%;(c)3a(2当量),K2CO3(2当量),60°C,12時間,56%;(d)LiOH(2.0当量),THF,H2O,20°C,12時間,94%;(e)H2,Pd(OH)2,AcOH,MeOH,20℃,12時間;(f)FmocOSu(1.2当量),NaHCO3(2.0当量),THF,H2O,0~20℃,12時間,44%;(g)PhNH2(1.1当量),DIC(1.0当量),HOBt(1.0当量),DCM,0~20℃,1時間,76%;(h)ピペリジン(5.0当量),DMF,20℃,1時間,65%。
工程1:メチル(2S)-2-アミノ-3-[4-(2-エチル-4-ヒドロキシ-フェニル)フェニル]プロパノアート(aa27-2)の合成
化合物aa27-1(3.5g,8.76mmol,1当量)を、HCl/ジオキサン(4M,100mL,45.65当量)中に0℃で溶解した。混合物を25℃で2時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視した。反応混合物を減圧下で濃縮し、粗生成物を得た。化合物aa27-2(2.6g,粗)を無色の油として得た。
化合物aa27-1(3.5g,8.76mmol,1当量)を、HCl/ジオキサン(4M,100mL,45.65当量)中に0℃で溶解した。混合物を25℃で2時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視した。反応混合物を減圧下で濃縮し、粗生成物を得た。化合物aa27-2(2.6g,粗)を無色の油として得た。
LCMS(ESI):RT=0.772分,mass calcd.for C18H22NO3 300.16[M+H]+,m/z found 300.00[M+H]+。方法Aを使用し、逆相LC-MSを実施した。
工程2:メチル(2S)-2-(ベンジルオキシカルボニルアミノ)-3-[4-(2-エチル-4-ヒドロキシ-フェニル)フェニル]プロパノアート(aa27-3)の合成
DCM(50mL)中のHOSu(1.25g,10.86mmol,1.3当量)溶液に、DIPEA(3.24g,25.05mmol,4.36mL,3当量)及びCbzCl(1.57g,9.19mmol,1.31mL,1.1当量)を0℃で加えた。25℃で2時間撹拌した後、化合物 aa27-2(2.5g,8.35mmol,1当量)を加え、混合物を20℃で10時間撹拌した。反応の進行をLC-MS及びTLCで監視した。混合物をDCM(30mL)で希釈し、H2O(30mL*2)で洗浄した。有機層をNa2SO4上で乾燥させ、濾過し濃縮して残渣を得た。続いてカラムクロマトグラフィー(SiO2,石油エーテル/酢酸エチル=2/1)で精製した。化合物aa27-3(3.5g,8.07mmol,収率96.68%)を黄色油として得た。
DCM(50mL)中のHOSu(1.25g,10.86mmol,1.3当量)溶液に、DIPEA(3.24g,25.05mmol,4.36mL,3当量)及びCbzCl(1.57g,9.19mmol,1.31mL,1.1当量)を0℃で加えた。25℃で2時間撹拌した後、化合物 aa27-2(2.5g,8.35mmol,1当量)を加え、混合物を20℃で10時間撹拌した。反応の進行をLC-MS及びTLCで監視した。混合物をDCM(30mL)で希釈し、H2O(30mL*2)で洗浄した。有機層をNa2SO4上で乾燥させ、濾過し濃縮して残渣を得た。続いてカラムクロマトグラフィー(SiO2,石油エーテル/酢酸エチル=2/1)で精製した。化合物aa27-3(3.5g,8.07mmol,収率96.68%)を黄色油として得た。
LCMS(ESI):RT=0.992分,mass calcd.for C26H27NNaO5 456.18,[M+Na]+,m/z found 456.2[M+Na]+。方法Aを使用し、逆相LC-MSを実施した。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm9.35(s,1H)7.88(br d,J=8.07Hz,1H)7.21-7.38(m,7H)7.15(br d,J=8.07Hz,2H)6.93(d,J=8.31Hz,1H)6.70(d,J=2.20Hz,1H)6.63(dd,J=8.07,2.45Hz,1H)4.99(br s,2H)4.24-4.36(m,1H)3.60-3.65(m,3H)3.07(br dd,J=13.69,4.89Hz,1H)2.91(br dd,J=13.57,10.39Hz,1H)2.40-2.48(m,2H)0.99(t,J=7.58Hz,3H)。
工程3:(S)-メチル2-(((ベンジルオキシ)カルボニル)アミノ-3-(4’-(4-((tertーブトキシカルボニル)アミノ)ブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)プロパノアート(aa27-4)の合成
DMF(30mL)中のaa27-3(3.3g,7.61mmol,1当量)とaa27-3a(5.23g,15.23mmol,2当量)の溶液に、K2CO3(2.10g,15.23mmol,2当量)を加えた。混合物を60℃で12時間撹拌した。反応の進行をLC-MS及びTLCで監視した。反応混合物をEtOAc(100mL)で希釈し、H2O(80mL×3)で洗浄した。有機層をNa2SO4上で乾燥させ、濾過し濃縮して残渣を得た。続いてカラムクロマトグラフィー(SiO2,石油エーテル/酢酸エチル=10/1~2/1)で精製した。化合物aa27-4(2.9g,4.32mmol,収率56.70%,純度90%)を黄色油として得た。
DMF(30mL)中のaa27-3(3.3g,7.61mmol,1当量)とaa27-3a(5.23g,15.23mmol,2当量)の溶液に、K2CO3(2.10g,15.23mmol,2当量)を加えた。混合物を60℃で12時間撹拌した。反応の進行をLC-MS及びTLCで監視した。反応混合物をEtOAc(100mL)で希釈し、H2O(80mL×3)で洗浄した。有機層をNa2SO4上で乾燥させ、濾過し濃縮して残渣を得た。続いてカラムクロマトグラフィー(SiO2,石油エーテル/酢酸エチル=10/1~2/1)で精製した。化合物aa27-4(2.9g,4.32mmol,収率56.70%,純度90%)を黄色油として得た。
LCMS(ESI):RT=1.140分,mass calcd.for C35H44N2NaO7 627.30[M+Na]+,m/z found 627.2[M+Na]+。方法Aを使用し、逆相LC-MSを実施した。
工程4:(S)-2-(((ベンジルオキシ)カルボニル)アミノ-3-(4’-(4-((tertーブトキシカルボニル)アミノ)ブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)プロパン酸(aa27-5)の合成
THF(30mL)中のaa27-4(2.7g,4.46mmol,1当量)の溶液に、H2O(15mL)中のLiOH・H2O(374.72mg,8.93mmol,2当量)の溶液を加えた。混合物を20℃で2時間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視した。1M HClを用いて混合物のpHを3~4に調整し、EtOAc(20mL*3)を用いて抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥させ、濾過し濃縮して生成物を得た。化合物aa27-5(2.5g,4.23mmol,収率94.79%)を黄色油として得た。
THF(30mL)中のaa27-4(2.7g,4.46mmol,1当量)の溶液に、H2O(15mL)中のLiOH・H2O(374.72mg,8.93mmol,2当量)の溶液を加えた。混合物を20℃で2時間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視した。1M HClを用いて混合物のpHを3~4に調整し、EtOAc(20mL*3)を用いて抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥させ、濾過し濃縮して生成物を得た。化合物aa27-5(2.5g,4.23mmol,収率94.79%)を黄色油として得た。
LCMS(ESI):RT=1.082分,mass calcd.for C34H42N2NaO7 613.29,m/z found 613.2[M+Na]+。方法Aを使用し、逆相LC-MSを実施した。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ ppm7.29-7.36(m,5H)7.14-7.21(m,4H)7.07(br d,J=8.56Hz,1H)6.81(s,1H)6.73(br d,J=7.83Hz,1H)5.27(br d,J=7.58Hz,1H)5.05-5.16(m,2H)4.68-4.75(m,1H)4.50-4.68(m,2H)3.99(br s,2H)3.20-3.28(m,2H)2.53(q,J=7.42Hz,2H)1.62-1.68(m,2H)1.51-1.57(m,2H)1.44(br s,9H)1.07(t,J=7.46Hz,3H)。
工程5:(2S)-2-アミノ-3-[4-[4-[4-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)ブトキシ]-2-エチル-フェニル]フェニル]プロパン酸(aa27-6)の合成
MeOH(30mL)中のaa27-5(1.5g,2.54mmol,1当量)の溶液に、Pd(OH)2/C(300mg,213.62μmol,純度10%)及びAcOH(105.00mg,1.75mmol,0.1mL)を加えた。混合物を20℃、H2下で12時間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視した。混合物を濾過し、濃縮して粗生成物を得た。化合物aa27-6(1.16g,粗)を黄色油として得た。
MeOH(30mL)中のaa27-5(1.5g,2.54mmol,1当量)の溶液に、Pd(OH)2/C(300mg,213.62μmol,純度10%)及びAcOH(105.00mg,1.75mmol,0.1mL)を加えた。混合物を20℃、H2下で12時間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視した。混合物を濾過し、濃縮して粗生成物を得た。化合物aa27-6(1.16g,粗)を黄色油として得た。
LCMS(ESI):RT=0.890分,mass calcd.for C26H36N2NaO5 479.25,m/z found 479.1[M+Na]+。方法Aを使用し、逆相LC-MSを実施した。
工程6:(S)-2-((((9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル)アミノ)-3-(4’-(4-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)ブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)プロパン酸(aa27-7)の合成
THF(15mL)中のaa27-6(1.16g,2.54mmol,1当量)溶液に、H2O(8mL)中のNaHCO3(426.64mg,5.08mmol,197.52μL,2当量)及びFmoc-OSu(1.03g,3.05mmol,1.2当量)を0℃で加えた。混合物を20℃で12時間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視した。混合物のpHを3~4に調整し、EtOAc(20mL*2)を用いて抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥させ、濾過し濃縮して残渣を得た。続いて分取HPLC(AcOH条件;MeCN/H2O,0~100%)で精製した。化合物aa27-7(950mg,1.12mmol,収率44.09%、純度80%)を無色の油として得た。
THF(15mL)中のaa27-6(1.16g,2.54mmol,1当量)溶液に、H2O(8mL)中のNaHCO3(426.64mg,5.08mmol,197.52μL,2当量)及びFmoc-OSu(1.03g,3.05mmol,1.2当量)を0℃で加えた。混合物を20℃で12時間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視した。混合物のpHを3~4に調整し、EtOAc(20mL*2)を用いて抽出した。有機層をNa2SO4上で乾燥させ、濾過し濃縮して残渣を得た。続いて分取HPLC(AcOH条件;MeCN/H2O,0~100%)で精製した。化合物aa27-7(950mg,1.12mmol,収率44.09%、純度80%)を無色の油として得た。
LCMS(ESI):RT=1.142分,mass calcd.for C41H46N2NaO7 701.32,m/z found 701.0[M+Na]+。方法Aを使用し、逆相LC-MSを実施した。
HPLC:RT=4.33分;移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4L TFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.2ml/分で、6分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で2分間保持;カラム:Ultimate C18 3.0*50mm,3μmを使用。
SFC:RT=0.598分,カラム:Chiralpak AD-3 50×4.6mm(内径),3μm;移動相:A:CO2:B:エタノール(0.05%DEA)イソクラティック:40%B;流量:4mL/分。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ ppm7.29-7.36(m,5H)7.14-7.21(m,4H)7.07(br d,J=8.56Hz,1H)6.81(s,1H)6.73(br d,J=7.83Hz,1H)5.27(br d,J=7.58Hz,1H)5.05-5.16(m,2H)4.68-4.75(m,1H)4.50-4.68(m,2H)3.99(br s,2H)3.20-3.28(m,2H)2.53(q,J=7.42Hz,2H)1.62-1.68(m,2H)1.51-1.57(m,2H)1.44(br s,9H)1.07(t,J=7.46Hz,3H)。
工程7:9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)ー2-アニリノ-1-[[4-]4-]4-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)ブトキシ]-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-オキソ-エチル]カルバマート(aa27-8)の合成
DCM(1.5mL)中のaa27-7(250mg,368.29μmol,1当量)及びHOBt(49.76mg,368.29μmol,1当量)の溶液に、アニリン(36.01mg,386.71μmol,35.31μL,1.05当量)及びDCM(0.5mL)中のDIC(46.48mg,368.29μmol,57.03μL,1当量)の溶液を0℃で加えた。混合物を20℃で1時間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視した。混合物をDCM(20mL)で希釈し、H2O(10mL*2)で洗浄した。有機層をNa2SO4上で乾燥させ、濾過し濃縮して残渣を得た。その残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);12gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~50%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(20mL/分)の溶出)で精製した。化合物aa27-8(220mg,283.05μmol,収率76.86%、純度97%)を白色固体として得た。
DCM(1.5mL)中のaa27-7(250mg,368.29μmol,1当量)及びHOBt(49.76mg,368.29μmol,1当量)の溶液に、アニリン(36.01mg,386.71μmol,35.31μL,1.05当量)及びDCM(0.5mL)中のDIC(46.48mg,368.29μmol,57.03μL,1当量)の溶液を0℃で加えた。混合物を20℃で1時間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視した。混合物をDCM(20mL)で希釈し、H2O(10mL*2)で洗浄した。有機層をNa2SO4上で乾燥させ、濾過し濃縮して残渣を得た。その残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);12gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~50%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(20mL/分)の溶出)で精製した。化合物aa27-8(220mg,283.05μmol,収率76.86%、純度97%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=1.198分,mass calcd.for C47H51N3NaO6 776.37,m/z found 777.3[M+Na]+。方法Aを使用し、逆相LC-MSを実施した。
HPLC:RT=8.07分、方法Dを使用して逆相HPLC分析を実施した。SFC:RT=2.186分;カラム:キラルセル OD-3.50×4.6mm(内径),3μm;移動相:A:CO2 B:エタノール(0.05%DEA);イソクラティック:40%B;流量:4mL/分。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ ppm 7.74(br d,J=7.58Hz,2H)7.51-7.58(m,3H)7.30-7.40(m,4H)7.28(br d,J=7.58Hz,4H)7.17-7.24(m,4H)7.07-7.11(m,1H)7.02(d,J=8.31Hz,1H)6.81(d,J=2.45Hz,1H)6.72(dd,J=8.31,2.45Hz,1H)5.57(br s,1H)4.32-4.69(m,4H)4.20(t,J=6.72Hz,1H)3.99(t,J=6.24Hz,2H)3.06-3.29(m,4H)2.49(q,J=7.42Hz,2H)1.77-1.87(m,2H)1.68(dt,J=14.55,7.15Hz,2H)1.44(s,9H)1.03(t,J=7.58Hz,3H)。
工程8:tert-ブチルN-[4-[4-[4-[(2S)-2-アミノ-3-アニリノ-3-オキソ-プロピル]フェニル]-3-エチル-フェノキシ]ブチル]カルバマート(aa27)の合成
DMF(2mL)中のaa27-8(220mg,291.81μmol,1当量)の溶液に、ピペリジン(124.24mg,1.46mmol,5当量)の溶液を加えた。混合物を20℃で1時間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視した。混合物をEtOAc(30mL)で希釈し、H2O(10mL*3)で洗浄した。有機層をNa2SO4上で乾燥させ、濾過し濃縮して残渣を得た。続いてカラムクロマトグラフィー(SiO2,EtOAc:MeOH=1:0~5:1)で精製した。化合物aa27(105mg,191.56μmol,収率65.65%、純度97%)を黄色の泡として得た。
DMF(2mL)中のaa27-8(220mg,291.81μmol,1当量)の溶液に、ピペリジン(124.24mg,1.46mmol,5当量)の溶液を加えた。混合物を20℃で1時間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視した。混合物をEtOAc(30mL)で希釈し、H2O(10mL*3)で洗浄した。有機層をNa2SO4上で乾燥させ、濾過し濃縮して残渣を得た。続いてカラムクロマトグラフィー(SiO2,EtOAc:MeOH=1:0~5:1)で精製した。化合物aa27(105mg,191.56μmol,収率65.65%、純度97%)を黄色の泡として得た。
LCMS(ESI):RT=0.953分,mass calcd.for C32H41N3NaO4 554.30,m/z found 554.1[M+Na]+。方法Aを使用して逆相LC-MSを実施した。HPLC:RT=9.13分、方法Cを使用して逆相HPLC分析を実施した。
SFC:RT=3.185分:カラム:Chiralpak AS-3 100×4.6mm(内径),3μm;移動相:A:CO2:B:エタノール(0.1%エタノールアミン);勾配:4。5分間でBを5%~40%、2.5分間で40%保持、続いて1分間Bを5%;流量:2.8mL/分。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ ppm 9.45(s,1H)7.60(br d,J=7.83Hz,2H)7.33(t,J=7.83Hz,2H)7.20-7.29(m,4H)7.06-7.13(m,2H)6.84(d,J=2.20Hz,1H)6.75(dd,J=8.31,2.45Hz,1H)4.68(br s,1H)4.01(t,J=6.11Hz,2H)3.82(br d,J=5.38Hz,1H)3.41(br dd,J=13.82,3.30Hz,1H)3.13-3.27(m,2H)2.84(br dd,J=13.82,9.90Hz,1H)2.56(q,J=7.50Hz,2H)1.79-1.86(m,2H)1.69(quin,J=7.15Hz,2H)1.45(s,9H)1.09(t,J=7.58Hz,3H)
2.9 非天然アミノ酸(aa28)の合成
スキーム10は、非天然アミノ酸(aa28)の合成を概説している:
スキーム10は、非天然アミノ酸(aa28)の合成を概説している:
試薬及び条件:(a)PhNH2(1.1当量),DIC(1.0当量),HOBT(1.0当量),DCM,0~20℃,1時間;(b)ピペリジン(3.0当量),DMF,20℃,12時間,52%;(c)3a(1当量),DIC(1.0当量),HOBT(1.0当量),DCM,0~20℃,1時間,61%;(d)ピペリジン(15.0当量),DMF,20℃,0.5時間,41%。
工程1:9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-4-(3,5-ジメチルフェニル)-1-(フェニルカルバモイル)ブチル]カルバマート(aa28-1)の合成
DCM(1.5mL)中のaa1(300mg,676.39μmol,1当量)及びHOBt(91.40mg,676.39μmol,1当量)の溶液に、アニリン(66.14mg,710.21μmol,64.84μL,1.05当量)を0℃で加えた。DCM(0.5mL)中のDIC(85.36mg,676.39μmol,1当量)の溶液を、混合物に加えた。反応物を20℃で1時間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視した。混合物をDCM(20mL)で希釈し、H2O(10mL*2)で洗浄した。有機層をNa2SO4上で乾燥させ、濾過し濃縮して粗生成物を得た。化合物aa28-1(400mg,粗)を黄色固体として得た。
DCM(1.5mL)中のaa1(300mg,676.39μmol,1当量)及びHOBt(91.40mg,676.39μmol,1当量)の溶液に、アニリン(66.14mg,710.21μmol,64.84μL,1.05当量)を0℃で加えた。DCM(0.5mL)中のDIC(85.36mg,676.39μmol,1当量)の溶液を、混合物に加えた。反応物を20℃で1時間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視した。混合物をDCM(20mL)で希釈し、H2O(10mL*2)で洗浄した。有機層をNa2SO4上で乾燥させ、濾過し濃縮して粗生成物を得た。化合物aa28-1(400mg,粗)を黄色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=1.178分,mass calcd.for C34H35N2O3
+519.26[M+H]+,m/z found 519.1[M+H]+。方法Aを使用し、逆相LC-MSを実施した。
工程2:(2S)-2-アミノ-5-(3,5-ジメチルフェニル)-N-フェニル-ペンタンアミド(aa28-2)の合成
DMF(2mL)中のaa28-1(400mg,771.24μmol,1当量)の溶液に、ピペリジン(197.01mg,2.31mmol,3当量)を20℃で加えた。反応物を20℃で12時間撹拌した。反応の進行をLC-MS及びTLCで監視した。混合物をEtOAc(30mL)で希釈し、H2O(10mL*3)で洗浄した。有機層をNa2SO4上で乾燥させ、濾過し濃縮して残渣を得た。続いてフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);12gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~100%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(20mL/分)の溶出)で精製した。化合物aa28-2(150mg,399.79μmol,収率51.84%、純度79%)を黄色の泡として得た。LCMS(ESI):RT=0.861分,mass calcd.for C19H25N2O 297.2[M+H]+,m/z found 297.1[M+H]+。方法Aを使用し、逆相LC-MSを実施した。
DMF(2mL)中のaa28-1(400mg,771.24μmol,1当量)の溶液に、ピペリジン(197.01mg,2.31mmol,3当量)を20℃で加えた。反応物を20℃で12時間撹拌した。反応の進行をLC-MS及びTLCで監視した。混合物をEtOAc(30mL)で希釈し、H2O(10mL*3)で洗浄した。有機層をNa2SO4上で乾燥させ、濾過し濃縮して残渣を得た。続いてフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);12gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~100%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(20mL/分)の溶出)で精製した。化合物aa28-2(150mg,399.79μmol,収率51.84%、純度79%)を黄色の泡として得た。LCMS(ESI):RT=0.861分,mass calcd.for C19H25N2O 297.2[M+H]+,m/z found 297.1[M+H]+。方法Aを使用し、逆相LC-MSを実施した。
1H NMR(400MHz,CD3Cl)δ ppm 9.46(br s,1H),7.60(d,J=7.83Hz,2H),7.33(t,J=7.95Hz,2H),7.07-7.14(m,1H),6.78-6.86(m,4H),3.51(dd,J=7.95,4.28Hz,1H),2.57-2.64(m,2H),2.29(s,6H),1.67-1.81(m,4H)。
工程3:9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[4-]4-]4-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)ブトキシ]-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-4-(3,5-ジメチルフェニル)-1-(フェニルカルバモイル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]カルバマート(aa28-3)の合成
DCM(2.5mL)中のaa2b(343.52mg,506.06μmol,1当量)及びHOBt(68.38mg,506.06μmol,1当量)の溶液に、aa28-2(150mg,506.06μmol,1当量)を0℃で加えた。DCM(0.5mL)のDIC(63.86mg,506.06μmol,1当量)の溶液を混合物に加えた。反応物を20℃で1時間撹拌した。反応の進行をTLCで監視した。混合物をDCM(20mL)で希釈し、H2O(10mL*2)で洗浄した。有機層をNa2SO4上で乾燥させ、濾過し濃縮して残渣を得た。その残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);12gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~45%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(20mL/分)の溶出)で精製した。化合物aa28-3(400mg,309.23μmol,収率61.11%、純度74%)を黄色固体として得た。LCMS(ESI):RT=6.617分,mass calcd.for C60H68N4NaO7 979.50,m/z found 979.8[M+Na]+。方法Bを使用し、逆相LC-MSを実施した。
DCM(2.5mL)中のaa2b(343.52mg,506.06μmol,1当量)及びHOBt(68.38mg,506.06μmol,1当量)の溶液に、aa28-2(150mg,506.06μmol,1当量)を0℃で加えた。DCM(0.5mL)のDIC(63.86mg,506.06μmol,1当量)の溶液を混合物に加えた。反応物を20℃で1時間撹拌した。反応の進行をTLCで監視した。混合物をDCM(20mL)で希釈し、H2O(10mL*2)で洗浄した。有機層をNa2SO4上で乾燥させ、濾過し濃縮して残渣を得た。その残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);12gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~45%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(20mL/分)の溶出)で精製した。化合物aa28-3(400mg,309.23μmol,収率61.11%、純度74%)を黄色固体として得た。LCMS(ESI):RT=6.617分,mass calcd.for C60H68N4NaO7 979.50,m/z found 979.8[M+Na]+。方法Bを使用し、逆相LC-MSを実施した。
1H NMR(400MHz,CD3Cl)δ ppm7.72-7.80(m,2H),7.49-7.57(m,3H),7.35-7.41(m,2H),7.20-7.33(m,5H),7.08-7.20(m,4H),6.96-7.08(m,2H),6.76-6.84(m,2H),6.68-6.75(m,3H),5.32-5.47(m,1H),4.64(br s,1H),4.52-4.60(m,1H),4.42-4.51(m,2H),4.37(br s,1H),4.13-4.23(m,1H),4.00(t,J=6.24Hz,2H),3.05-3.27(m,4H),2.44-2.61(m,4H),2.20-2.25(m,6H),1.82-1.89(m,2H),1.62-1.75(m,6H),1.46(s,9H),1.01-1.09(m,3H)。
工程4:tert-ブチルN-[4-[4-[4-[(2S)-2-アミノ-3-[[(1S)-4-(3,5-ジメチルフェニル)-1-(フェニルカルバモイル)ブチル]アミノ]-3-オキソ-プロピル]フェニル]-3-エチル-フェノキシ]ブチル]カルバマート(aa28)の合成
DMF(2.5mL)中のaa28-3(380mg,396.99μmol,1当量)の溶液に、ピペリジン(507.06mg,5.95mmol,15当量)を20℃で加えた。反応物を20℃で0.5時間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視した。混合物をACN(2mL)で希釈し、分取HPLC(HCl条件;カラム:Agela ASB 150*25mm*5μm;移動相:[水(0.05%HCl)-ACN];B%:55%~85%,8分)で精製した。化合物aa28(125mg,164.97μmol,収率41.56%、純度97%)を小さな黄色の泡として得た。
DMF(2.5mL)中のaa28-3(380mg,396.99μmol,1当量)の溶液に、ピペリジン(507.06mg,5.95mmol,15当量)を20℃で加えた。反応物を20℃で0.5時間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視した。混合物をACN(2mL)で希釈し、分取HPLC(HCl条件;カラム:Agela ASB 150*25mm*5μm;移動相:[水(0.05%HCl)-ACN];B%:55%~85%,8分)で精製した。化合物aa28(125mg,164.97μmol,収率41.56%、純度97%)を小さな黄色の泡として得た。
LCMS(ESI):RT=1.061分,mass calcd.for C45H58N4NaO5 757.43,m/z found 757.5[M+Na]+。方法Aを使用して逆相LC-MSを実施した。HPLC:RT=10.66分、方法Cを使用して逆相HPLC分析を実施した。SFC:RT=2.161分、カラム:Chiralpak AD-3 50*4.6mm(内径),3μm;移動相:A:CO2 B:イソプロパノール(0.05%DEA);勾配:Bを5%~40%で2分間、40%で1.2分間保持、続いて5%のBについては0.8分;流量:4mL/分。
1H NMR(400MHz,CD3OD)δ ppm 7.55(br d,J=8.07Hz,2H),7.24-7.31(m,4H),7.14(d,J=8.07Hz,2H),7.05-7.11(m,1H),6.95(d,J=8.31Hz,1H),6.81(d,J=2.45Hz,1H),6.78(s,3H),6.68-6.72(m,1H),4.54(t,J=6.72Hz,1H),4.20(t,J=6.85Hz,1H),4.00(t,J=6.11Hz,2H),3.25-3.30(m,1H),3.12(br t,J=6.85Hz,3H),2.54-2.63(m,2H),2.51(q,J=7.50Hz,2H),2.22(s,6H),1.62-1.95(m,8H),1.44(s,9H),1.03(t,J=7.58Hz,3H)。
2.10 非天然アミノ酸(aa29)の合成
スキーム11は、非天然アミノ酸(aa29)の合成を概説している:
スキーム11は、非天然アミノ酸(aa29)の合成を概説している:
工程1:(E)-3-(1-トリチル-1H-イミダゾール-5-イル)アクリル酸(aa29-2)の合成
DMF(34mL)中の化合物aa29-1(2g,14.48mmol,1.0当量),TEA(4.40g,43.44mmol,6.05mL,3.0当量)及びTrtCl(4.04g,14.48mmol,1.0当量)を20℃で12時間撹拌した。TLC(DCM/MeOH=10/1)は、反応が完了したことを示した。混合物をCH2Cl2で希釈し、H2O(3*50mL)及びクエン酸溶液(3*50mL)で洗浄した。有機相を蒸発させ、カラムクロマトグラフィー(溶出:CH2Cl2/MeOH,9:1)により精製した。化合物aa29-2(1.6g,4.21mmol,収率29.05%)を白色固体として得た。
DMF(34mL)中の化合物aa29-1(2g,14.48mmol,1.0当量),TEA(4.40g,43.44mmol,6.05mL,3.0当量)及びTrtCl(4.04g,14.48mmol,1.0当量)を20℃で12時間撹拌した。TLC(DCM/MeOH=10/1)は、反応が完了したことを示した。混合物をCH2Cl2で希釈し、H2O(3*50mL)及びクエン酸溶液(3*50mL)で洗浄した。有機相を蒸発させ、カラムクロマトグラフィー(溶出:CH2Cl2/MeOH,9:1)により精製した。化合物aa29-2(1.6g,4.21mmol,収率29.05%)を白色固体として得た。
1H NMR(400MHz,CD3OD)δ 7.57(s,1H),7.51(d,J=15.77Hz,1H),7.38-7.45(m,9H),7.32(s,1H),7.15-7.22(m,6H),6.45(d,J=15.65Hz,1H)ppm。
工程2:3-(1-トリチル-1H-イミダゾール-5-イル)プロパン酸(aa29)の合成
EtOH(20mL)中の化合物aa29-2(1.6g,4.21mmol,1当量)の溶液に、Pd/C(1g,純度10%)をN2雰囲気下で加えた。懸濁液を脱気し、H2で3分間パージした。混合物を20℃、H2下(15Psi)で2時間撹拌した。完了後、混合物を濾過し、濾液を濃縮して生成物を得た。化合物aa29(1.2g,3.14mmol,収率74.60%)を白色固体として得た。
EtOH(20mL)中の化合物aa29-2(1.6g,4.21mmol,1当量)の溶液に、Pd/C(1g,純度10%)をN2雰囲気下で加えた。懸濁液を脱気し、H2で3分間パージした。混合物を20℃、H2下(15Psi)で2時間撹拌した。完了後、混合物を濾過し、濾液を濃縮して生成物を得た。化合物aa29(1.2g,3.14mmol,収率74.60%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=0.802分,mass calcd.for C25H21N2O2 381.17[M-H]-,found 381.17[M-H]-;Waters Xbridge C18 30*2.0mm,3.5μmを使用し、流量1.2ml/分で逆相LCMSを実施し、ACNを含有する5%~95%のアセトニトリル(溶媒B)及び水中0.05%のNH3H2Oを含有する水(溶媒A)の勾配で溶出した。
1H NMR(400MHz,CD3OD)δ 7.34-7.39(m,4H),7.22-7.39(m,4H),7.11-7.14(m,3H),7.06-7.20(m,2H),7.08(d,J=7.25Hz,4H),2.90(t,J=7.32Hz,1H),2.80(t,J=7.38Hz,1H),2.51-2.62(m,2H)ppm。
2.11 非天然アミノ酸(aa30)の合成
スキーム12は、非天然アミノ酸(aa30)の合成を概説している:
スキーム12は、非天然アミノ酸(aa30)の合成を概説している:
工程1:(3-ヒドロキシプロピル)トリフェニルホスホニウムブロミド(aa30-2)の合成
トルエン(100mL)中の3-ブロモプロパン-1-オール(10g,71.95mmol,6.49mL,1当量)の溶液に、PPh3(22.65g,86.34mmol,1.2当量)を加えた。混合物を100℃、N2下で12時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視した。完了後、反応物を0℃に冷却して濾過し、濾過ケーキをトルエン(10mL*3)で洗浄し、続いて減圧下で乾燥した。化合物aa30-2(20.7g,粗)を白色固体として得た。
トルエン(100mL)中の3-ブロモプロパン-1-オール(10g,71.95mmol,6.49mL,1当量)の溶液に、PPh3(22.65g,86.34mmol,1.2当量)を加えた。混合物を100℃、N2下で12時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視した。完了後、反応物を0℃に冷却して濾過し、濾過ケーキをトルエン(10mL*3)で洗浄し、続いて減圧下で乾燥した。化合物aa30-2(20.7g,粗)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=0.758分,mass calcd.for C21H22OP+321.14[M]+,found 321.0[M]+。LCMS条件:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5mL/分で、0.7分間の5%~95%溶出勾配(溶媒B)及び95%で0.4分間保持、カラム:Agilent Pursult5 C18 20*2.0mm、波長:UV220nm&254nm;カラム温度:50℃;MSイオン化:ESIを使用。
1H NMR(400MHz,CD3Cl)δ 7.83-7.65(m,15H),4.94(br s,1H),3.87-3.73(m,4H),1.83(m,2H)ppm。
工程2:(E)-4-(1-トリチル-1H-イミダゾール-4-イル)ブト-3-エン-1-オール(aa30-3)の合成
THF(50mL)中のaa30-2(10.67g,26.60mmol,1.5当量)の溶液に、LiHMDS(1M,70.92mL,4当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌し、続いてTHF(60mL)中のaa30-2A(1-トリチルイミダゾール-4-カルバルデヒド 6g,17.73mmol,1.0当量)の溶液を上記混合物に加え、得られた混合物を25℃で12時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視した。完了後、混合物を濾過して減圧下で濃縮して残渣を得、続いて残渣をジオキサン(50mL)中に再度溶解させ、最終溶液を100℃で12時間撹拌した。その後、溶液を減圧下で濃縮し、残渣を得た。その残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);80gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~80%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(60mL/分)の溶出)で精製した。化合物aa30-3(650mg,粗)を黄色固体として得た。
THF(50mL)中のaa30-2(10.67g,26.60mmol,1.5当量)の溶液に、LiHMDS(1M,70.92mL,4当量)を加えた。混合物を0℃で0.5時間撹拌し、続いてTHF(60mL)中のaa30-2A(1-トリチルイミダゾール-4-カルバルデヒド 6g,17.73mmol,1.0当量)の溶液を上記混合物に加え、得られた混合物を25℃で12時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視した。完了後、混合物を濾過して減圧下で濃縮して残渣を得、続いて残渣をジオキサン(50mL)中に再度溶解させ、最終溶液を100℃で12時間撹拌した。その後、溶液を減圧下で濃縮し、残渣を得た。その残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);80gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~80%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(60mL/分)の溶出)で精製した。化合物aa30-3(650mg,粗)を黄色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=0.846分,mass calcd.for C26H24N2ONa 403.19,[M+Na]+,found 403.1[M+Na]+。LCMS条件:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5mL/分で、0.7分間の5%~95%溶出勾配(溶媒B)及び95%で0.4分間保持、カラム:Agilent Pursult5 C18 20*2.0mm、波長:UV220nm&254nm;カラム温度:50℃;MSイオン化:ESIを使用。
1H NMR(400MHz,CD3OD)δ 7.68-7.57(m,1H),7.40-7.37(m,9H),7.18-7.13(m,6H),6.83(d,J=1.0Hz,1H),6.36-6.14(m,2H),3.62(t,J=6.7Hz,2H),2.36(q,J=6.6Hz,2H)ppm。
工程3:4-(1-トリチル-1H-イミダゾール-4-イル)ブタン-1-オール(aa30-4)の合成
MeOH(5mL)中のaa30-3(650mg,1.71mmol,1当量)の溶液に、Pd/C(50mg,489.61mmol,純度10%)を加えた。混合物を25℃、H2下で2時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視した。完了後、混合物を濾過して減圧下で濃縮し、残渣を得た。その残渣の総体積をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);25gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~50%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(40mL/分)の溶出)で8分間精製した。化合物aa30-4(450mg,1.18mmol,収率68.87%、純度100%)を白色固体として得た。
MeOH(5mL)中のaa30-3(650mg,1.71mmol,1当量)の溶液に、Pd/C(50mg,489.61mmol,純度10%)を加えた。混合物を25℃、H2下で2時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視した。完了後、混合物を濾過して減圧下で濃縮し、残渣を得た。その残渣の総体積をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);25gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~50%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(40mL/分)の溶出)で8分間精製した。化合物aa30-4(450mg,1.18mmol,収率68.87%、純度100%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=0.850分,mass calcd.for C26H26N2ONa 405.20,[M+Na]+,found 405.2[M+Na]+。LCMS条件:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5mL/分で、0.7分間の5%~95%溶出勾配(溶媒B)及び95%で0.4分間保持、カラム:Agilent Pursult5 C18 20*2.0mm、波長:UV220nm&254nm;カラム温度:50℃;MSイオン化:ESIを使用。
工程4:4-(1-トリチル-1H-イミダゾール-4-イル)ブタン酸(aa30)の合成
MeCN(5mL)及びH2O(7mL)中のaa30-4(450mg,1.18mmol,1当量)の溶液に、TEMPO(277.51mg,1.76mmol,1.5当量)及びPIDA(ヨードベンゼンジアセタート(3240-34-4),947.35mg,2.94mmol,2.5当量)を加えた。混合物を25℃で12時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視した。完了後、pHを4に調整するために、混合物にクエン酸(水溶液、15mL)を加え、EtOAc(15mL*2)で抽出した。有機層を回収し、Na2SO4上で乾燥させ、濾過し減圧下で濃縮して残渣を得た。続いて、残渣をMTBEでトリチュレートした。化合物aa30(250mg,粗)を白色固体として得た。
MeCN(5mL)及びH2O(7mL)中のaa30-4(450mg,1.18mmol,1当量)の溶液に、TEMPO(277.51mg,1.76mmol,1.5当量)及びPIDA(ヨードベンゼンジアセタート(3240-34-4),947.35mg,2.94mmol,2.5当量)を加えた。混合物を25℃で12時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視した。完了後、pHを4に調整するために、混合物にクエン酸(水溶液、15mL)を加え、EtOAc(15mL*2)で抽出した。有機層を回収し、Na2SO4上で乾燥させ、濾過し減圧下で濃縮して残渣を得た。続いて、残渣をMTBEでトリチュレートした。化合物aa30(250mg,粗)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=2.484分,mass calcd.for C26H25N2O2 397.18[M+H]+,found 397.2[M+H]+。LCMS条件:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4L TFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、6分間の10%~80%の勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持を使用。ESI源、正イオンモード;波長220nm&254nm,オーブン温度50℃。
1H NMR(400MHz,CD3OD)δ 8.69(d,J=1.6Hz,1H),7.53-7.38(m,9H),7.28-7.14(m,7H),2.75(t,J=7.5Hz,2H),2.34(t,J=7.1Hz,2H),2.00-1.87(m,2H)ppm。
2.12 非天然アミノ酸(aa31)の合成
スキーム13は、非天然アミノ酸(aa31)の合成を概説している:
スキーム13は、非天然アミノ酸(aa31)の合成を概説している:
工程1:(3-カルボキシプロピル)トリフェニルホスホニウムブロミド(aa31-2)の合成
トルエン(70mL)中の4-ブロモブタン酸(5g,29.94mmol,6.76mL,1当量)の溶液に、PPh3(8.64g,32.93mmol,1.1当量)を加えた。混合物を110℃、N2下で12時間撹拌した。反応の進行をTLC及びLCMSで監視した。完了時に、反応混合物を0℃に冷却し、続いて濾過してトルエン(10mL*3)で洗浄し、濾過ケーキを回収して減圧下で乾燥した。化合物aa31-2(5.6g,粗)を白色固体として得た。
トルエン(70mL)中の4-ブロモブタン酸(5g,29.94mmol,6.76mL,1当量)の溶液に、PPh3(8.64g,32.93mmol,1.1当量)を加えた。混合物を110℃、N2下で12時間撹拌した。反応の進行をTLC及びLCMSで監視した。完了時に、反応混合物を0℃に冷却し、続いて濾過してトルエン(10mL*3)で洗浄し、濾過ケーキを回収して減圧下で乾燥した。化合物aa31-2(5.6g,粗)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=1.076分,mass calcd.for C22H22O2P+349.14[M]+,found 349.2[M]+。LCMS条件:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で1.35分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.9分間保持、カラム:Xtimate C18 2.1*30mm,3mm、波長:UV220nm&254nm;カラム温度:50℃;MSイオン化:ESIを使用。
1H NMR(400MHz,CD3Cl)δ 7.91-7.66(m,15H),3.31-3.22(m,2H),2.55(t,J=6.3Hz,2H),1.84(m,2H)ppm。
工程2:(E)-5-(1-トリチル-1H-イミダゾール-4-イル)ペンタ-4-エン酸(aa31-3)の合成
THF(20mL)中のaa31-2(3.81g,8.87mmol,1.5当量)の溶液を、0℃、N2下でtBuOK(1.99g,17.73mmol,3当量)で加え、混合物を0℃で30分間撹拌し、続いてTHF(20mL)中のaa31-2A(2g,5.91mmol,1当量)の溶液を上記混合物に0℃で加え、最終混合物を25℃で12時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視した。完了時に、pHを4に調整するために、混合物にクエン酸を加え、EtOAc(50mL*2)で抽出した。有機層を回収し、Na2SO4上で乾燥させ、濾過し減圧下で濃縮して残渣を得た。その残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);80gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、溶出0~10%MeOH/DCM(40mL/分))で精製した。化合物aa31-3(4g,粗)を淡黄色の泡として得た。
THF(20mL)中のaa31-2(3.81g,8.87mmol,1.5当量)の溶液を、0℃、N2下でtBuOK(1.99g,17.73mmol,3当量)で加え、混合物を0℃で30分間撹拌し、続いてTHF(20mL)中のaa31-2A(2g,5.91mmol,1当量)の溶液を上記混合物に0℃で加え、最終混合物を25℃で12時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視した。完了時に、pHを4に調整するために、混合物にクエン酸を加え、EtOAc(50mL*2)で抽出した。有機層を回収し、Na2SO4上で乾燥させ、濾過し減圧下で濃縮して残渣を得た。その残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);80gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、溶出0~10%MeOH/DCM(40mL/分))で精製した。化合物aa31-3(4g,粗)を淡黄色の泡として得た。
LCMS(ESI):RT=1.487分,mass calcd.for C27H25N2O2 409.18[M+H]+,found 409.3[M+H]+。LCMS条件:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及びアセトニトリル(溶媒B)、流量0.8ml/分で1.35分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.9分間保持、カラム:Xtimate C18 2.1*30mm,3mm、波長:UV220nm&254nm;カラム温度:50℃;MSイオン化:ESIを使用。
工程3:5-(1-トリチル-1H-イミダゾール-4-イル)ペンタン酸(aa31)の合成
MeOH(40mL)中のaa31-3(3g,7.34mmol,粗純度,1当量)の溶液に、Pd/C(300mg,489.61mmol,純度10%)を加えた。混合物を25℃、H2下で2時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視した。完了時に、混合物を濾過して減圧下で濃縮し、残渣を得た。その残渣の総体積をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);40gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、溶出0~10%MeOH/DCM(40mL/分))で7分間精製した。その後、生成物をTBMEによってトリチュレートした。化合物aa31(290mg,692.32mmol,収率71.05%、純度98%)を白色固体として得た。
MeOH(40mL)中のaa31-3(3g,7.34mmol,粗純度,1当量)の溶液に、Pd/C(300mg,489.61mmol,純度10%)を加えた。混合物を25℃、H2下で2時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視した。完了時に、混合物を濾過して減圧下で濃縮し、残渣を得た。その残渣の総体積をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);40gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、溶出0~10%MeOH/DCM(40mL/分))で7分間精製した。その後、生成物をTBMEによってトリチュレートした。化合物aa31(290mg,692.32mmol,収率71.05%、純度98%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=1.805分,mass calcd.for C27H27N2O2 411.20[M+H]+,found 411.3[M+H]+。LCMS条件:0.8mL/4LのNH3H2O水溶液(溶媒A)及びアセトニトリル(溶媒B)、流量0.8mL/分で、6分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持、カラム:XBridge C18 3.5mm 2.1*30mm、波長:UV220nm&254nm;カラム温度:50℃;MSイオン化:ESIを使用。
1H NMR(400MHz,CD3Cl)δ 7.65(s,1H),7.44-7.34(m,9H),7.16(dd,J=2.9,6.8Hz,6H),6.77(s,1H),2.58(br t,J=6.8Hz,2H),2.28(t,J=7.1Hz,2H),1.70-1.55(m,4H)ppm。
2.13 非天然アミノ酸(aa32)の合成
スキーム14は、非天然アミノ酸(aa32)の合成を概説している:
スキーム14は、非天然アミノ酸(aa32)の合成を概説している:
工程1:(4-カルボキシブチル)トリフェニルホスホニウムブロミド(aa32-2)の合成
トルエン(100mL)中の5-ブロモペンタン酸(10g,55.24mmol,6.76mL,1当量)の溶液に、PPh3(15.94g,60.76mmol,1.1当量)を加えた。混合物を110℃、N2下で12時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視した。完了時に、反応混合物を0℃に冷却し、続いて濾過してトルエン(10mL*3)で洗浄し、濾過ケーキを回収して減圧下で乾燥した。化合物aa32-2(16.4g,36.99mmol,収率66.97%)を白色固体として得た。
トルエン(100mL)中の5-ブロモペンタン酸(10g,55.24mmol,6.76mL,1当量)の溶液に、PPh3(15.94g,60.76mmol,1.1当量)を加えた。混合物を110℃、N2下で12時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視した。完了時に、反応混合物を0℃に冷却し、続いて濾過してトルエン(10mL*3)で洗浄し、濾過ケーキを回収して減圧下で乾燥した。化合物aa32-2(16.4g,36.99mmol,収率66.97%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=1.076分,mass calcd.for C22H22O2P+349.14[M+H]+,found 349.2[M+H]+。LCMS条件:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で1.35分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.9分間保持、カラム:Xtimate C18 2.1*30mm,3mm、波長:UV220nm&254nm;カラム温度:50℃を使用。
1H NMR(400MHz,CD3Cl)δ 7.91-7.66(m,15H),3.31-3.22(m,2H),2.55(t,J=6.3Hz,2H),1.86-1.82(m,4H)ppm。
工程2:(E)-6-(1-トリチル-1H-イミダゾール-4-イル)ヘキサ-5-エン酸(aa32-3)の合成
THF(60mL)中のaa32-2(7.86g,17.73mmol,1.5当量)の溶液に、t-BuOK(3.98g,35.46mmol,3当量)を0℃、N2下で加えた。混合物を0℃で30分間撹拌した。THF(40mL)中のaa32-2A(4g,11.82mmol,1.0当量)の溶液を上記混合物に0℃で加え、得られた混合物を25℃で12時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視した。完了時に、pHを4に調整するために、混合物にクエン酸を加え、EtOAc(50mL*2)で抽出した。有機層を回収し、Na2SO4上で乾燥させ、濾過し減圧下で濃縮して残渣を得た。その残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);80gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、溶出0~10%MeOH/DCM(40mL/分))で精製した。化合物aa32-3(4g,粗)を淡黄色の泡として得た。
THF(60mL)中のaa32-2(7.86g,17.73mmol,1.5当量)の溶液に、t-BuOK(3.98g,35.46mmol,3当量)を0℃、N2下で加えた。混合物を0℃で30分間撹拌した。THF(40mL)中のaa32-2A(4g,11.82mmol,1.0当量)の溶液を上記混合物に0℃で加え、得られた混合物を25℃で12時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視した。完了時に、pHを4に調整するために、混合物にクエン酸を加え、EtOAc(50mL*2)で抽出した。有機層を回収し、Na2SO4上で乾燥させ、濾過し減圧下で濃縮して残渣を得た。その残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);80gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、溶出0~10%MeOH/DCM(40mL/分))で精製した。化合物aa32-3(4g,粗)を淡黄色の泡として得た。
LCMS(ESI):RT=2.739分,mass calcd.for C28H27N2O2 423.20[M+H]+,found 423.2[M+H]+。LCMS条件:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及びアセトニトリル(溶媒B)、流量0.8ml/分で1.35分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.9分間保持、カラム:Xtimate C18 2.1*30mm,3mm、波長:UV220nm&254nm;カラム温度:50℃;MSイオン化:ESIを使用。
工程3:6-(1-トリチル-1H-イミダゾール-4-イル)ヘキサン酸(aa32)の合成
MeOH(40mL)中のaa32-3(4g,9.47mmol,1当量)の溶液に、Pd/C(300mg,489.61mmol,純度10%)を加えた。混合物を25℃、H2下で2時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視した。完了時に、混合物を濾過して減圧下で濃縮し、残渣を得た。その残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);40gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、溶出0~10%MeOH/DCM(40mL/分))で精製した。その後、生成物をTBMEによってトリチュレートした。化合物aa32(660mg,1.51mmol,収率15.93%、純度97%)を白色固体として得た。
MeOH(40mL)中のaa32-3(4g,9.47mmol,1当量)の溶液に、Pd/C(300mg,489.61mmol,純度10%)を加えた。混合物を25℃、H2下で2時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視した。完了時に、混合物を濾過して減圧下で濃縮し、残渣を得た。その残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);40gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、溶出0~10%MeOH/DCM(40mL/分))で精製した。その後、生成物をTBMEによってトリチュレートした。化合物aa32(660mg,1.51mmol,収率15.93%、純度97%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=2.807分,mass calcd.for C28H29N2O2 425.22[M+H]+,found 425.2[M+H]+。LCMS条件:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、6.0分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持、カラム:Xtimate C18 2.1*30mm,3mm、波長:UV220nm&254nm;カラム温度:50℃;MSイオン化:ESIを使用。
1H NMR(400MHz,CD3OD)δ 7.43(d,J=1.3Hz,1H),7.41-7.34(m,9H),7.19-7.11(m,6H),6.65(s,1H),2.52(t,J=7.4Hz,2H),2.24(t,J=7.4Hz,2H),1.60(m,4H),1.38-1.27(m,2H)ppm。
2.14 非天然アミノ酸(aa33)の合成
スキーム15は、非天然アミノ酸(aa33)の合成を概説している:
スキーム15は、非天然アミノ酸(aa33)の合成を概説している:
工程1:(5-カルボキシペンチル)トリフェニルホスホニウムブロミド(aa33-2)の合成
トルエン(50mL)中の6-ブロモヘキサン酸(5g,25.63mmol,1当量)の溶液に、PPh3(7.06g,26.92mmol,1.05当量)を加えた。得られた溶液を120℃で12時間にわたり撹拌した。完了後、反応混合物を0℃に冷却し、続いて濾過してトルエン(10mL*3)で洗浄し、濾過ケーキを回収して減圧下で乾燥した。化合物aa33-2(6.85g,14.47mmol,収率56.44%、純度96.6%)を白色固体として得た。
トルエン(50mL)中の6-ブロモヘキサン酸(5g,25.63mmol,1当量)の溶液に、PPh3(7.06g,26.92mmol,1.05当量)を加えた。得られた溶液を120℃で12時間にわたり撹拌した。完了後、反応混合物を0℃に冷却し、続いて濾過してトルエン(10mL*3)で洗浄し、濾過ケーキを回収して減圧下で乾燥した。化合物aa33-2(6.85g,14.47mmol,収率56.44%、純度96.6%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=0.916分,m/z calcd.for C24H26PO2
+377.17,found 377.1[M-Br]+。Xtimate C18,2.1*30mm 3mm,SN:3U411301530カラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LCMSを実施し、0.02%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
工程2:(E)-7-(1-トリチル-1H-イミダゾール-4-イル)ヘプタ-6-エン酸(aa33-3)の合成
THF(20mL)中のaa33-2(4.05g,8.87mmol,2当量)の溶液を、0℃、N2下でtBuOK(1M,22.16mL,5当量)で加え、混合物を0℃で30分間撹拌し、続いてTHF(20mL)中のaa33-2A(1.5g,4.43mmol,1当量)の溶液を上記混合物に0℃で加え、最終混合物を25℃で12時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視した。完了後、pHを4に調整するために、混合物にクエン酸を加え、EtOAc(50mL*2)で抽出した。有機層を回収し、Na2SO4上で乾燥させ、濾過して減圧下で濃縮し、残渣を得た。粗生成物をさらなる精製なしで次の工程に使用した。化合物aa33-3(3.8g,粗)を黄色のシロップとして得た。
THF(20mL)中のaa33-2(4.05g,8.87mmol,2当量)の溶液を、0℃、N2下でtBuOK(1M,22.16mL,5当量)で加え、混合物を0℃で30分間撹拌し、続いてTHF(20mL)中のaa33-2A(1.5g,4.43mmol,1当量)の溶液を上記混合物に0℃で加え、最終混合物を25℃で12時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視した。完了後、pHを4に調整するために、混合物にクエン酸を加え、EtOAc(50mL*2)で抽出した。有機層を回収し、Na2SO4上で乾燥させ、濾過して減圧下で濃縮し、残渣を得た。粗生成物をさらなる精製なしで次の工程に使用した。化合物aa33-3(3.8g,粗)を黄色のシロップとして得た。
LCMS:(ESI):RT=2.904分及び3.068分,mass calcd.for C29H29N2O2 437.22,found 437.3[M+H]+;Chromolith Flash RP-C18 25-3mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LCMSを実施し、0.02%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
工程3:7-(1-トリチル-1H-イミダゾール-4-イル)ヘプタン酸(aa33)の合成
MeOH(30mL)中のaa33-3(3g,6.87mmol,1当量)の溶液に、Pd/C(300mg,489.61mmol,純度10%)を加えた。混合物を25℃、H2下で2時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視した。完了後、残渣を分取HPLC(カラム:Boston Prime C18 150*25mm*5mm;移動相:[水(0.05v/v%水酸化アンモニウム];B%:22%~45%,7分間)で精製した。化合物aa33(200mg,456.04mmol,収率6.64%、純度100%)を白色固体として得た。
MeOH(30mL)中のaa33-3(3g,6.87mmol,1当量)の溶液に、Pd/C(300mg,489.61mmol,純度10%)を加えた。混合物を25℃、H2下で2時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視した。完了後、残渣を分取HPLC(カラム:Boston Prime C18 150*25mm*5mm;移動相:[水(0.05v/v%水酸化アンモニウム];B%:22%~45%,7分間)で精製した。化合物aa33(200mg,456.04mmol,収率6.64%、純度100%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=2.231分,mass calcd.for C29H31N2O2 439.23[M+H]+,found 439.3[M+H]+。LCMS条件:移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、6分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持、ESI源、正イオンモード;波長:220nm&254nm、オーブン温度50℃を使用。
1H NMR(400MHz,CD3OD)δ 7.45-7.31(m,10H),7.19-7.11(m,6H),6.64(s,1H),2.52(t,J=7.3Hz,2H),2.24(t,J=7.4Hz,2H),1.65-1.52(m,4H),1.38-1.26(m,4H)ppm。
2.15 非天然アミノ酸(aa34)の合成
スキーム16は、非天然アミノ酸(aa34)の合成を概説している:
スキーム16は、非天然アミノ酸(aa34)の合成を概説している:
工程1:7-[BLAH(トリフェニル)-λ5-ホスファニル]ヘプタン酸(aa34-2)の合成
トルエン(100mL)中のaa34-1(10g,47.83mmol,1当量)の溶液に、PPh3(13.80g,52.61mmol,1.1当量)を加えた。混合物を110℃で12時間撹拌した。完了後、反応物を減圧下で濾過し、残渣を得た。粗生成物をさらなる精製なしで次の工程に使用した。化合物aa34-2(22.8g,43.73mmol,収率91.43%,純度90.410%)を黄色油として得た。
トルエン(100mL)中のaa34-1(10g,47.83mmol,1当量)の溶液に、PPh3(13.80g,52.61mmol,1.1当量)を加えた。混合物を110℃で12時間撹拌した。完了後、反応物を減圧下で濾過し、残渣を得た。粗生成物をさらなる精製なしで次の工程に使用した。化合物aa34-2(22.8g,43.73mmol,収率91.43%,純度90.410%)を黄色油として得た。
LCMS:(ESI):RT=0.792分,m/z calcd.for C25H28O2P+391.18[M]+,found 391.1[M]+;LC-MS条件:移動相:1.5mL/4L TFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4L TFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ML/分で、0.7分間の5%~95%溶出勾配(溶媒B)及び95%で0.4分間保持、カラム;Agilent Pursult5 C18 20*2.0mmを使用。
THF(150mL)中のaa34-2(10.45g,22.16mmol,1.5当量)の溶液を、0℃、N2下でtBuOK(4.97g,44.33mmol,3当量)で加え、混合物を0℃で撹拌し、続いてTHF(20mL)中のaa34-2A(5g,14.78mmol,1当量)の溶液を上記混合物に0℃で加え、最終混合物を25℃で12時間撹拌した。完了後、pHを4に調整するために、混合物にクエン酸を加え、EtOAc(200mL*2)で抽出した。有機層を回収し、Na2SO4上で乾燥させ、濾過して減圧下で濃縮し、白色固体として目的のaa34-3(14.5g,粗)を得た。
工程2:(E)-8-(1-トリチルイミダゾール-4-イル)オクタ-7-エン酸(aa34-3)の合成
工程2:(E)-8-(1-トリチルイミダゾール-4-イル)オクタ-7-エン酸(aa34-3)の合成
LCMS:(ESI):RT=0.870分,m/z calcd.for C30H31N2O2 451.23[M+H]+,C30H30N2O2Na 473.23[M+Na]+,found 473.1[M+Na]+;LC-MS条件:移動相:1.5mL/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ML/分で、0.7分間の5%~95%溶出勾配(溶媒B)及び95%で0.4分間保持、カラム;Agilent Pursult5 C18 20*2.0mmを使用。
MeOH(200mL)中のaa34-3(14g,15.54mmol,純度50%,1当量)の溶液に、Pd/C(4g,純度10%)及びH2を加えた。混合物を25℃で3時間撹拌した。完了後、混合物を濾過して減圧下で濃縮し、残渣を得た。粗生成物を、C-18逆相クロマトグラフィー(ISCO(登録商標);120gのSepaFlash(登録商標)C-18カラム、60~70%のアセトニトリル/H2O勾配(80mL/分)の溶出、総体積2Lで40分間)で精製し、残渣(中性)を得た。化合物aa34(2.1g,4.53mmol,収率29.15%、純度97.6%)を白色固体として得た。
工程3:8-(1-トリチルイミダゾール-4-イル)オクタン酸(aa34)の合成
工程3:8-(1-トリチルイミダゾール-4-イル)オクタン酸(aa34)の合成
LCMS(ESI):RT=2.956分,mass calcd.for C30H33N2O2 453.25[M+H]+,found 453.3[M+H]+。LCMS条件:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、6.0分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持、カラム:Xtimate C18 2.1*30mm,3μm、波長:UV220nm&254nm;カラム温度:50℃;MSイオン化:ESIを使用。
1H NMR(400MHz,CD3OD)δ 7.47-7.33(m,10H),7.22-7.10(m,6H),6.64(s,1H),2.52(t,J=7.4Hz,2H),2.26(t,J=7.4Hz,2H),1.69-1.48(m,4H),1.37-1.26(m,6H)ppm。
2.16 非天然アミノ酸(aa35)の合成
スキーム17は、非天然アミノ酸(aa35)の合成を概説している:
スキーム17は、非天然アミノ酸(aa35)の合成を概説している:
工程1:(7-カルボキシヘプチル)トリフェニルホスホニウムブロミド(aa35-2)の合成
トルエン(150mL)中のaa35-1(15g,71.74mmol,1当量)の溶液に、PPh3(20.70g,78.92mmol,1.1当量)を加えた。混合物を110℃、N2下で20時間撹拌した。完了後、反応混合物を0℃に冷却し、続いて濾過してトルエン(10mL*3)で洗浄し、濾過ケーキを回収して減圧下で乾燥した。残渣をTHF(200mL)でトリチュレートした。続いて、混合物を濾過し、濾過ケーキを乾燥させて生成物aa35-2(20g,40.31mmol,収率56.18%,純度95%)を白色固体として得た。
トルエン(150mL)中のaa35-1(15g,71.74mmol,1当量)の溶液に、PPh3(20.70g,78.92mmol,1.1当量)を加えた。混合物を110℃、N2下で20時間撹拌した。完了後、反応混合物を0℃に冷却し、続いて濾過してトルエン(10mL*3)で洗浄し、濾過ケーキを回収して減圧下で乾燥した。残渣をTHF(200mL)でトリチュレートした。続いて、混合物を濾過し、濾過ケーキを乾燥させて生成物aa35-2(20g,40.31mmol,収率56.18%,純度95%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):Rt=2.175分,mass calcd.for C26H30O2P+[M+H]+405.20,found 405.70;Chromolith Flash RP-C18 25-3mmを使用し、流量0.8ml/分で逆相LCMSを実施し、0.02%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
工程2:(E)-9-(1-トリチル-1H-イミダゾール-4-イル)ノナン-8-エン酸(aa35-3)の合成
THF(150mL)中のaa35-2(10.45g,22.17mmol,1.5当量)の溶液に、t-BuOK(4.97g,44.34mmol,3.0当量)を0℃で加えた。続いて、混合物を0℃で30分間撹拌した。THF(50mL)中のaa35-2A(5g,14.78mmol,1当量)の溶液を加えた。続いて、混合物を20℃で12時間撹拌した。完了後、0℃のH2O(100mL)を加えることで反応混合物をクエンチし、続いてEtOAc(150mL*2)で抽出した。組み合わせた有機層を、飽和NaCl100mL(50mL*2)で洗浄し、無水硫酸ナトリウム上で乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して残渣を得た。その残渣の総体積をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);80gのSpecial Flash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~20%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(60mL/分)の溶出)で精製し、淡黄色油として生成物aa35-3(1.4g,粗)を得た。
THF(150mL)中のaa35-2(10.45g,22.17mmol,1.5当量)の溶液に、t-BuOK(4.97g,44.34mmol,3.0当量)を0℃で加えた。続いて、混合物を0℃で30分間撹拌した。THF(50mL)中のaa35-2A(5g,14.78mmol,1当量)の溶液を加えた。続いて、混合物を20℃で12時間撹拌した。完了後、0℃のH2O(100mL)を加えることで反応混合物をクエンチし、続いてEtOAc(150mL*2)で抽出した。組み合わせた有機層を、飽和NaCl100mL(50mL*2)で洗浄し、無水硫酸ナトリウム上で乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して残渣を得た。その残渣の総体積をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);80gのSpecial Flash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~20%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(60mL/分)の溶出)で精製し、淡黄色油として生成物aa35-3(1.4g,粗)を得た。
LCMS:(ESI):Rt=3.310分,mass calcd.for C31H33N2O2[M+H]+465.25[M+H]+,found 465.20;Chromolith Flash RP-C18 25-3mmを使用し、流量0.8ml/分で逆相LCMSを実施し、0.02%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
工程3:9-(1-トリチルイミダゾール-4-イル)ノナン酸(aa35)の合成
MeOH(40mL)中のaa35-3(1.4g,3.01mmol,1当量)の溶液に、Pd/C(0.2g,純度10%)を加えた。混合物を25℃、H2下で3時間撹拌した。完了後、混合物を濾過して減圧下で濃縮し、残渣を得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:C18,球状,20~35um,100A,12g;移動相:[水-ACN];B%:0%~90%,15分)で精製し、生成物aa35(0.12g,244.31μmol,収率8.11%,純度95%)を得て、白色固体として得た。
MeOH(40mL)中のaa35-3(1.4g,3.01mmol,1当量)の溶液に、Pd/C(0.2g,純度10%)を加えた。混合物を25℃、H2下で3時間撹拌した。完了後、混合物を濾過して減圧下で濃縮し、残渣を得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:C18,球状,20~35um,100A,12g;移動相:[水-ACN];B%:0%~90%,15分)で精製し、生成物aa35(0.12g,244.31μmol,収率8.11%,純度95%)を得て、白色固体として得た。
LCMS:(ESI):Rt=3.257分,mass calcd.for C31H35N2O2[M+H]+467.26[M+H]+,found 467.20;Chromolith Flash RP-C18 25-3mmを使用し、流量0.8ml/分で逆相LCMSを実施し、0.02%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
2.17 非天然アミノ酸(aa36)の合成
スキーム18は、非天然アミノ酸(aa36)の合成を概説している:
スキーム18は、非天然アミノ酸(aa36)の合成を概説している:
工程1:1-(2-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)エチル)ピペリジン-2-オン(aa36-2)の合成
THF(300mL)中のaa36-1(6g,60.53mmol,1当量)の溶液に、NaH(2.66g,66.58mmol,純度60%、1.1当量)を0℃で加えた。混合物を20℃で0.5時間撹拌し、aa36-1A(14.48g,60.53mmol,1当量)を加えた。反応混合物を70℃で12時間加熱した。LCMSは、所望の生成物が観察されたことを示した。混合物を室温に冷却し、水(150mL)でクエンチし、EtOAc(150mL×2)で抽出した。組み合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過して真空状態で濃縮した。残渣をカラムクロマトグラフィー(SiO2,石油エーテル/酢酸エチル=1/1)で精製した。化合物aa36-2(2.7g,10.49mmol,収率17.33%)を無色の油として得た。
THF(300mL)中のaa36-1(6g,60.53mmol,1当量)の溶液に、NaH(2.66g,66.58mmol,純度60%、1.1当量)を0℃で加えた。混合物を20℃で0.5時間撹拌し、aa36-1A(14.48g,60.53mmol,1当量)を加えた。反応混合物を70℃で12時間加熱した。LCMSは、所望の生成物が観察されたことを示した。混合物を室温に冷却し、水(150mL)でクエンチし、EtOAc(150mL×2)で抽出した。組み合わせた有機層を無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過して真空状態で濃縮した。残渣をカラムクロマトグラフィー(SiO2,石油エーテル/酢酸エチル=1/1)で精製した。化合物aa36-2(2.7g,10.49mmol,収率17.33%)を無色の油として得た。
LCMS:(ESI):RT=0.974分,mass calcd.for C13H27NO2 SiH 258.18,found 258.2[M+H]+;Chromolith Flash Agilent Pursult 5 C18 20*2.0mmを使用し、流量1.5mL/分で逆相LCMSを実施し、0.7分間の5%~95%勾配(溶媒B)で溶出及び95%で0.4分間保持した。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)3.64(t,J=6.0Hz,2H),3.32-3.29(m,4H),2.16(t,J=6.0Hz,2H),1.74-1.57(m,4H),0.83(s,9H),0.00(s,6H)ppm。
工程2:1-(2-ヒドロキシエチル)ピペリジン-2-オン(aa36-3)の合成
MeOH(12mL)中のaa36-2(2.7g,10.49mmol,1当量)に、HCl/MeOH(v/v=30%,8mL)の溶液を0℃で加えた。溶液を0℃で0.5時間撹拌した。完了後、溶液を真空状態で濃縮した。残渣をカラムクロマトグラフィー(SiO2,DCM/MeOH=10/1)で精製した。粗生成物aa36-3(1.4g,9.73mmol,収率92.76%,純度99.5%)を黄色固体として得て、これをさらなる精製なしで次の工程に使用した。
MeOH(12mL)中のaa36-2(2.7g,10.49mmol,1当量)に、HCl/MeOH(v/v=30%,8mL)の溶液を0℃で加えた。溶液を0℃で0.5時間撹拌した。完了後、溶液を真空状態で濃縮した。残渣をカラムクロマトグラフィー(SiO2,DCM/MeOH=10/1)で精製した。粗生成物aa36-3(1.4g,9.73mmol,収率92.76%,純度99.5%)を黄色固体として得て、これをさらなる精製なしで次の工程に使用した。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)4.13-4.11(m,1H),3.52-3.44(m,2H),3.34-3.29(m,4H),2.20(t,J=6.0Hz,2H),1.75-1.61(m,4H)ppm。
LCMS(ESI):RT=0.448~0.574分,mass calcd.for C7H13NO2H 144.09,found 144.2[M+H]+;Chromolith Flash Agilent Pursult 5 C18 20*2.0mmを使用し、流量1.5mL/分で逆相LCMSを実施し、0.7分間の5%~95%勾配(溶媒B)で溶出及び95%で0.4分間保持した。
工程3:2-(2-(2-オキソピペリジン-1-イル)エチル)イソインドリン-1,3-ジオン(aa36-4)の合成
THF(40mL)中のaa36-3(1.5g,10.48mmol,1当量)及びaa36-3A(1.85g,12.57mmol,1.2当量)の溶液に、PPh3(4.12g,15.71mmol,1.5当量)及びDIAD(3.18g,15.71mmol,3.06mL,1.5当量)を0℃で加えた。得られた混合物を20℃で2時間撹拌した。LCMSは、所望の生成物が観察されたことを示した。混合物を濾過し、濾液を真空状態で濃縮した。残渣をカラムクロマトグラフィー(SiO2,石油エーテル/酢酸エチル=1/1)で精製した。化合物aa36-4(0.15g,550.87μmol,収率5.26%)を白色固体として得た。
THF(40mL)中のaa36-3(1.5g,10.48mmol,1当量)及びaa36-3A(1.85g,12.57mmol,1.2当量)の溶液に、PPh3(4.12g,15.71mmol,1.5当量)及びDIAD(3.18g,15.71mmol,3.06mL,1.5当量)を0℃で加えた。得られた混合物を20℃で2時間撹拌した。LCMSは、所望の生成物が観察されたことを示した。混合物を濾過し、濾液を真空状態で濃縮した。残渣をカラムクロマトグラフィー(SiO2,石油エーテル/酢酸エチル=1/1)で精製した。化合物aa36-4(0.15g,550.87μmol,収率5.26%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=0.764分,mass calcd.for C15H16N2O3H 273.12,found 273.1[M+H]+;Chromolith Flash Agilent Pursult 5 C18 20*2.0mmを使用し、流量1.5mL/分で逆相LCMSを実施し、0.7分間の5%~95%勾配(溶媒B)で溶出及び95%で0.4分間保持した。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)7.83-7.65(m,4H),3.68-3.58(m,2H),3.45-3.39(m,2H),3.21(t,J=6.0Hz,2H),1.89(t,J=6.4Hz,2H),1.64-1.56(m,2H),1.55-1.47(m,2H)ppm。
工程4:1-(2-アミノエチル)ピペリジン-2-オン(aa36-5)の合成
MeOH(10mL)中のaa36-4(0.15g,550.87μmol,1当量)の溶液に、NH2NH2・H2O(275.76mg,5.51mmol,267.73μL,10当量)を加えた。溶液を45℃で2時間撹拌した。完了後、溶液を室温に冷却し、真空状態で濃縮した。粗生成物aa36-5(0.07g,粗)を無色の油として得た。これをさらなる精製なしに次の工程で使用した。
MeOH(10mL)中のaa36-4(0.15g,550.87μmol,1当量)の溶液に、NH2NH2・H2O(275.76mg,5.51mmol,267.73μL,10当量)を加えた。溶液を45℃で2時間撹拌した。完了後、溶液を室温に冷却し、真空状態で濃縮した。粗生成物aa36-5(0.07g,粗)を無色の油として得た。これをさらなる精製なしに次の工程で使用した。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)3.27-3.22(m,6H),2.62(t,J=6.8Hz,2H),2.17(t,J=6.0Hz,2H),1.76-1.58(m,4H)ppm。
工程5:2,2-ジメチル-4-オキソ-4-((2-(2-オキソピペリジン-1-イル)エチル)アミノ)ブタン酸(aa36)の合成
DMF(2mL)中のaa36-5(0.07g,492.27μmol,1当量)の溶液に、aa36-5A(69.38mg,541.50μmol,60.86μL,1.1当量)を加えた。溶液を20℃で12時間撹拌した。LCMSは、所望の生成物が観察されたことを示した。溶液を真空状態で濃縮した。残渣を分取HPLC(FA条件;カラム:Phenomenex Synergi C18 150*30mm*4um;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:15%~25%,11分)で精製した。化合物aa36(20mg,73.99μmol,収率15.03%)を白色固体として得た。
DMF(2mL)中のaa36-5(0.07g,492.27μmol,1当量)の溶液に、aa36-5A(69.38mg,541.50μmol,60.86μL,1.1当量)を加えた。溶液を20℃で12時間撹拌した。LCMSは、所望の生成物が観察されたことを示した。溶液を真空状態で濃縮した。残渣を分取HPLC(FA条件;カラム:Phenomenex Synergi C18 150*30mm*4um;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:15%~25%,11分)で精製した。化合物aa36(20mg,73.99μmol,収率15.03%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=0.19分,mass calcd.for C13H22N2O4H 271.16,found 271.1[M+H]+;Chromolith Flash Agilent Pursult 5 C18 20*2.0mmを使用し、流量1.5mL/分で逆相LCMSを実施し、0.7分間の5%~95%勾配(溶媒B)で溶出及び95%で0.4分間保持した。
1H NMR(400MHz,メタノール-d4)3.51-3.44(m,2H),3.43-3.35(m,4H),2.47(s,2H),2.35(t,J=6.0Hz,2H),1.91-1.76(m,4H),1.25(s,6H)ppm。
2.18 非天然アミノ酸(aa37)の合成
スキーム19は、非天然アミノ酸(aa37)の合成を概説している:
スキーム19は、非天然アミノ酸(aa37)の合成を概説している:
工程1:tert-ブチルN-[2-(5-メチル-1,3-ジオキソ-イソインドリン-2-イル)エチル]カルバマート(aa37-2)の合成
トルエン(10mL)中のaa37-1(500mg,3.08mmol,1当量)の溶液に、aa37-1A(543.46mg,3.39mmol,532.80μL,1.1当量)を加えた。混合物を120℃で12時間撹拌した。完了後、反応混合物を真空状態で濃縮して粗生成物を得た。これを25℃で1時間、MTBE/PE(1:1)を用いてトリチュレートした。化合物aa37-2(460mg,1.44mmol,収率46.56%、純度95%)を黄色固体として得た。
トルエン(10mL)中のaa37-1(500mg,3.08mmol,1当量)の溶液に、aa37-1A(543.46mg,3.39mmol,532.80μL,1.1当量)を加えた。混合物を120℃で12時間撹拌した。完了後、反応混合物を真空状態で濃縮して粗生成物を得た。これを25℃で1時間、MTBE/PE(1:1)を用いてトリチュレートした。化合物aa37-2(460mg,1.44mmol,収率46.56%、純度95%)を黄色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=0.898分,m/z calcd.for C16H21N2O4 305.14[M+H]+,C16H21N2O4Na 327.14[M+Na]+,found 327.2[M+Na]+。LC-MS方法A:MERCK,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出。
工程2:2-(2-アミノエチル)-5-メチル-イソインドリン-1,3-ジオン(aa37-3)の合成
aa37-2(460mg,1.51mmol,1当量)の溶液に、HCl/MeOH(4M,377.87μL,1当量)を加えた。混合物を25℃で12時間撹拌した。完了後、反応物を真空状態で濃縮して粗生成物aa37-3(300mg,粗,HCl塩)を得て、白色固体として得た。
aa37-2(460mg,1.51mmol,1当量)の溶液に、HCl/MeOH(4M,377.87μL,1当量)を加えた。混合物を25℃で12時間撹拌した。完了後、反応物を真空状態で濃縮して粗生成物aa37-3(300mg,粗,HCl塩)を得て、白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=0.638分,m/z calcd.for C11H13N2O2 205.09[M+H]+,found 205.0[M+H]+。LC-MS方法A:MERCK,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.99(br s,2H),7.26-7.21(m,1H),3.56(br s,2H),2.77(br s,4H),2.08(s,3H)ppm。
工程3:2ー[2-[2ー(5-メチル-1,3-ジオキソ-イソインドリン-2-イル)エチルアミノ]2-オキソ-エチル]スルファニル酢酸(aa37)の合成
DMF(4mL)中のaa37-3(250mg,1.22mmol,1当量)及びaa37-3A(194.11mg,1.47mmol,1.2当量)の溶液に、DIPEA(316.42mg,2.45mmol,426.45μL,2当量)を加えた。混合物を25℃で12時間撹拌した。反応混合物をEtOAc(50mL)と水(60mL)とに分配した。水層を、1N HCl溶液でpH=4に酸性化した。有機相を分離して塩水(30mL×3)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥させた。得られた溶液を減圧下で濃縮した。その残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);12gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~30%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(35mL/分)の溶出)で精製した。化合物aa37(200mg,535.14μmol,収率43.72%、純度90%)を白色固体として得た。
DMF(4mL)中のaa37-3(250mg,1.22mmol,1当量)及びaa37-3A(194.11mg,1.47mmol,1.2当量)の溶液に、DIPEA(316.42mg,2.45mmol,426.45μL,2当量)を加えた。混合物を25℃で12時間撹拌した。反応混合物をEtOAc(50mL)と水(60mL)とに分配した。水層を、1N HCl溶液でpH=4に酸性化した。有機相を分離して塩水(30mL×3)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥させた。得られた溶液を減圧下で濃縮した。その残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);12gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~30%の酢酸エチル/石油エーテル勾配(35mL/分)の溶出)で精製した。化合物aa37(200mg,535.14μmol,収率43.72%、純度90%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=0.757分,m/z calcd.for C15H16N2O5SNa 359.08[M+Na]+,found 358.9[M+Na]+。LC-MS方法A:MERCK,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.69-7.60(m,1H),7.55(s,1H),7.43(br d,J=7.3Hz,1H),3.82-3.70(m,2H),3.52-3.41(m,2H),2.86(s,2H),2.76(s,2H),2.38(s,3H)ppm。
実施例3.GLP1ペプチド模倣薬の合成
図13にあるように本開示によるGLP1ペプチド模倣ペイロードを作製するための一般的な合成スキームを示す。以下に示す表2は、リンクアミドMBHA樹脂結合ペプチドの構造及び中間体1~59を表す。
図13にあるように本開示によるGLP1ペプチド模倣ペイロードを作製するための一般的な合成スキームを示す。以下に示す表2は、リンクアミドMBHA樹脂結合ペプチドの構造及び中間体1~59を表す。
樹脂からの切断後、LC-MSによりリンクアミドMBHA樹脂結合ペプチド及び中間体(1~59)を分析した。以下の表2Bはこれらの中間体をまとめたものである。
図14は、本開示に従ったGLP1ペプチド模倣ペイロードP1及びP8の固相合成のための工程のシーケンスを表す。
3.1(3S,6S,9R,12S,15S,21S)-21-アミノ-3-(((S)-1-(((S)-1-アミノ-5-(3,5-ジメチルフェニル)-1-オキソペンタン-2-イル)アミノ)-3-(4’-(4-アミノブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)-1-オキソプロパン-2-イル)カルバモイル)-12-(2-フルオロベンジル)-9,15-ビス((R)-1-ヒドロキシエチル)-6-(ヒドロキシメチル)-12-メチル-5,8,11,14,17,20-ヘキサオキソ-22-(2H-テトラゾール-5-イル)-4,7,10,13,16,19-ヘキサアザドコサン-1-酸(P1)の調製
対応するFmoc保護されたaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(9,16.59μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。樹脂結合ペプチド9を、一般的手順に従って切断し、白色固体として粗生成物を得た。この粗生成物をDMF(1mL)中に溶解し、ピペリジン(14.13mg,165.94μmol,16.39μL,10.0当量)を20℃、窒素下で一度に加えた。混合物を20℃で2時間撹拌した。混合物を真空状態で濃縮し、残渣を得た。残渣を分取HPLC(カラム:移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:30%~60%,60分)で精製し、純粋な生成物を得た。生成物を水(10mL)中に懸濁し、混合物をドライアイス/エタノール浴で凍結させ、続いて凍結乾燥で乾燥させて所望の生成物P1(1.02mg,7.48e-1μmol,収率4.50%,純度100%)を白色固体として得た。
HRMS(ESI):mass calcd.for C65H87FN17O15 1364.6552,m/z found 1364.4887 [M+H]+。
対応するFmoc保護されたaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(9,16.59μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。樹脂結合ペプチド9を、一般的手順に従って切断し、白色固体として粗生成物を得た。この粗生成物をDMF(1mL)中に溶解し、ピペリジン(14.13mg,165.94μmol,16.39μL,10.0当量)を20℃、窒素下で一度に加えた。混合物を20℃で2時間撹拌した。混合物を真空状態で濃縮し、残渣を得た。残渣を分取HPLC(カラム:移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:30%~60%,60分)で精製し、純粋な生成物を得た。生成物を水(10mL)中に懸濁し、混合物をドライアイス/エタノール浴で凍結させ、続いて凍結乾燥で乾燥させて所望の生成物P1(1.02mg,7.48e-1μmol,収率4.50%,純度100%)を白色固体として得た。
HRMS(ESI):mass calcd.for C65H87FN17O15 1364.6552,m/z found 1364.4887 [M+H]+。
HPLC:RT=10.15分、MERCK,RP-18e 25-2mmカラムを使用し、流量1.2mL/分で逆相HPLCを実施し、0.02%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
3.2(8S,14S,17S,20S,23S,26S)-8-((2H-テトラゾール-5-イル)メチル)-26-(((S)-1-(((S)-1-アミノ-5-(3,5-ジメチルフェニル)-1-オキソペンタン-2-イル)アミノ)-3-(4’-(4-アミノブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)-1-オキソプロパン-2-イル)カルバモイル)-17-(2-フルオロベンジル)-14,20-ビス((R)-1-ヒドロキシエチル)-23-(ヒドロキシメチル)-1-(1H-イミダゾール-5-イル)-5,5,17-トリメチル-4,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキソ-3,7,10,13,16,19,22,25-オクタアザオクタコサン-28-酸(P8)の調製
対応するaa10-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(10,100.99μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように構築した。樹脂結合ペプチド10を、一般的手順に従って切断し、白色固体として粗生成物を得た。粗生成物を、カラム:Luna 200*25mm,C18,10μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:30%~60%,60分を使用して分取HPLCで精製し、純粋な生成物を得た。生成物を水(10mL)中に懸濁し、混合物をドライアイス/アセトン浴で凍結させ、続いて凍結乾燥で乾燥させて所望の生成物P8(25.00mg,17.49μmol,収率17.32%,純度100%)を白色固体として得た。
対応するaa10-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(10,100.99μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように構築した。樹脂結合ペプチド10を、一般的手順に従って切断し、白色固体として粗生成物を得た。粗生成物を、カラム:Luna 200*25mm,C18,10μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:30%~60%,60分を使用して分取HPLCで精製し、純粋な生成物を得た。生成物を水(10mL)中に懸濁し、混合物をドライアイス/アセトン浴で凍結させ、続いて凍結乾燥で乾燥させて所望の生成物P8(25.00mg,17.49μmol,収率17.32%,純度100%)を白色固体として得た。
HRMS(ESI):mass calcd.for C75H100FN20O17 1571.7559,m/z found 1571.7589[M+H]+。
HPLC:RT=10.14分、YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μmのカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相HPLCを実施し、0.062%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.068%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
図15は、本開示に従ったGLP1ペプチド模倣ペイロードP2及びP9の固相合成のための工程のシーケンスを表す。
3.3(8S,14S,17S,20R,23S,26S)-8-((2H-テトラゾール-5-イル)メチル)-26-(((S)-1-(((S)-1-アミノ-5-(3,5-ジメチルフェニル)-1-オキソペンタン-2-イル)アミノ)-3-(4’-(4-アミノブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)-1-オキソプロパン-2-イル)カルバモイル)-17-(2-フルオロベンジル)-14,20-ビス((R)-1-ヒドロキシエチル)-23-(ヒドロキシメチル)-1-(1H-イミダゾール-5-イル)-5,5,17-トリメチル-4,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキソ-3,7,10,13,16,19,22,25-オクタアザオクタコサン-28-酸(P2)の調製
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(18,74.75μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。樹脂結合ペプチド18を、一般的手順に従って切断し、白色固体として粗生成物を得た。粗生成物を分取HPLC(カラム:移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:20%~50%,60分)に送り、純粋な生成物を得た。生成物を水(100mL)中に懸濁し、混合物をドライアイス/アセトン浴で凍結させ、続いて凍結乾燥で乾燥させて所望の生成物P2(11.56mg,8.45μmol,収率11.27%,純度97.84%)を白色固体として得た。
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(18,74.75μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。樹脂結合ペプチド18を、一般的手順に従って切断し、白色固体として粗生成物を得た。粗生成物を分取HPLC(カラム:移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:20%~50%,60分)に送り、純粋な生成物を得た。生成物を水(100mL)中に懸濁し、混合物をドライアイス/アセトン浴で凍結させ、続いて凍結乾燥で乾燥させて所望の生成物P2(11.56mg,8.45μmol,収率11.27%,純度97.84%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=0.830分,mass calcd.for C65H88FN15O15 1337.66[M-4tBu-Boc+6H]+669.83[M-4tBu-Boc+7H]2+,found 670.0[M-4tBu-Boc+7H]2+。Chromolith Flash RP-18e 25-3mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LC-MSを実施し、0.04%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.06%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:RT=7.77分。移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持;カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μm;波長:220nm&215nm&254nm;カラム温度:40℃を使用。
3.4(8S,14S,17S,20S,23S,26S)-8-((2H-テトラゾール-5-イル)メチル)-26-(((S)-1-(((S)-1-アミノ-5-(3,5-ジメチルフェニル)-1-オキソペンタン-2-イル)アミノ)-3-(4’-(4-アミノブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)-1-オキソプロパン-2-イル)カルバモイル)-17-(2-フルオロベンジル)-14,20-ビス((R)-1-ヒドロキシエチル)-23-(ヒドロキシメチル)-1-(1H-イミダゾール-5-イル)-5,5,17-トリメチル-4,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキソ-3,7,10,13,16,19,22,25-オクタアザオクタコサン-28-酸(P9)の調製
対応するaa10-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(19)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。樹脂結合ペプチド19を、一般的手順に従って切断し、白色固体として粗生成物を得た。粗生成物を分取HPLC(TFA:移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:15%~45%,55分)に送り、純粋な生成物を得た。生成物を水(20mL)中に懸濁し、混合物をドライアイス/アセトン浴で凍結させ、続いて凍結乾燥で乾燥させて所望の生成物P9(125mg,79.82μmol,収率7.70%,純度98.7%)を白色固体として得た。
対応するaa10-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(19)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。樹脂結合ペプチド19を、一般的手順に従って切断し、白色固体として粗生成物を得た。粗生成物を分取HPLC(TFA:移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:15%~45%,55分)に送り、純粋な生成物を得た。生成物を水(20mL)中に懸濁し、混合物をドライアイス/アセトン浴で凍結させ、続いて凍結乾燥で乾燥させて所望の生成物P9(125mg,79.82μmol,収率7.70%,純度98.7%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=0.843分,mass calcd.for C75H102FN18O17 1545.77[M-4tBu-Boc+6H]+773.385[M-4tBu-Boc+7H]2+,found 773.9[M-4tBu-Boc+7H]2+。Chromolith Flash RP-18e 25-3mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LC-MSを実施し、0.04%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.06%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
図16は、本開示に従ったGLP1ペプチド模倣ペイロードP3、P4、P5、P6、P7、P11、P13、P14、P15、P16及びP17の固相合成のための工程のシーケンスを表す。
3.5 3-[[(1S)-2-[[2-[[(1S,2R)-1-[[(1S)-2-[[(1S,2R)-1-[[(1S)-2-[[(1S)-2-[[(1S)-1-[[4-[4-(4-アミノブトキシ)-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-1-(カルボキシメチル)-2-オキソ-エチル]アミノ]-1-(ヒドロキシメチル)-2-オキソ-エチル]カルバモイル]-2-ヒドロキシ-プロピル]アミノ]-1-[(2-フルオロフェニル)メチル]-1-メチル-2-オキソ-エチル]カルバモイル]-2-ヒドロキシ-プロピル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-2-オキソ-1-(2H-テトラゾール-5-イルメチル)エチル]アミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパン酸(P3)の調製
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(18,152.96μmol)及びaa11(57.58mg,305.91μmol,2.0当量)から出発して、対応するaa11-aa10-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(20,119μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(18,152.96μmol)及びaa11(57.58mg,305.91μmol,2.0当量)から出発して、対応するaa11-aa10-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(20,119μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応する樹脂結合ペプチド20(119μmol)を、一般的手順に従ってさらに切断し、白色固体として粗生成物を得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:YMC-Exphere C18 10μm 300*50mm,12nm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%~45%,55分)で精製し、P3(8mg,5.47μmol,収率3.58%,純度99.37%)を淡黄色の固体として得た。
HPLC:RT=8.10分。HPLC条件:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μmカラムを使用し、流量1.5mL/分で、0.12%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.1%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
LCMS:(ESI):RT=0.841分,m/z calcd.for C18H21NO2,1452.69[M+H]+,found 727.3[M+2H]2+;逆相LCMS条件:MERCK,RP-18e 25-2mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
3.6(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-(4-アミノブトキシ)-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[2-[[(2S)-2-[(3-アミノ-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル)アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-(2-フルオロフェニル)-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(P4)の調製
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物18(192.73μmol)及びaa12(75.82mg,578.18μmol,3当量)から出発して、対応するaa12-aa10-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(21,192.73μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように取得した。
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物18(192.73μmol)及びaa12(75.82mg,578.18μmol,3当量)から出発して、対応するaa12-aa10-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(21,192.73μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように取得した。
対応する樹脂結合ペプチド21(192.73μmol)を、一般的手順に従ってさらに切断し、白色固体として粗生成物を得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:YMC-Exphere C18 10μm 300*50mm,12nm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%~45%,55分)で精製し、P4(35mg,24.03μmol,収率8.73%,純度99.66%)を淡黄色の固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=0.861分,m/z calcd.for C76H103FN18O17,726.36 m/z [M+2H]2+,found 726.7 m/z[M+2H]2+;LC-MS:MERCK,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
LCMS:(ESI):RT=0.854分,m/z calcd.for C76H103FN18O17,726.36 m/z [M+2H]2+,found 726.7 m/z[M+2H]2+;LC-MS:MERCK,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:RT=7.90分。移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持;カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μm;波長:UV220nm&215nm&254nm;カラム温度:40℃を使用。
3.7(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-(4-アミノブトキシ)-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-(ヒドロキシアミノ)-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシプロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(P5)の調製
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物18(152.96μmol)及びaa13(60mg,259.47μmol,1.7当量)から出発して、対応するaa13-aa10-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(22,152.67μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように取得した。
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物18(152.96μmol)及びaa13(60mg,259.47μmol,1.7当量)から出発して、対応するaa13-aa10-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(22,152.67μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように取得した。
対応する樹脂結合ペプチド22を、一般的手順に従ってさらに切断し、白色固体として粗生成物を得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:YMC-Exphere C18 10μm 300*50mm,12nm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%~45%,55分)で精製し、P5(4mg,2.66μmol,収率42.12%,純度97.7%)を淡黄色の固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=0.705分,mass calcd.for C70H96FN16O18,733.85 m/z [M+2H]2+,found 718.2 m/z[M-2OH+4H]2+;LC-MS:MERCK,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
LCMS:(ESI):RT=0.847分,mass calcd.for C70H96FN16O18,733.85 m/z [M+2H]2+,found 735.2 m/z[M+2H]2+;LC-MS:MERCK,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:RT=8.00分。移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持;カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μm;波長:UV220nm&215nm&254nm;カラム温度:40℃を使用。
3.8(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-(4-アミノブトキシ)-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[2-メチル-2-(1H-pyrazol-5-イル)プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシプロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(P6)の調製
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物18(82.60μmol)及びaa14(25.47mg,165.19μmol,2当量)から出発して、対応するaa14-aa10-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(23,82.60μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように取得した。
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物18(82.60μmol)及びaa14(25.47mg,165.19μmol,2当量)から出発して、対応するaa14-aa10-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(23,82.60μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように取得した。
対応する樹脂結合ペプチド23(82.60μmol)を、一般的手順に従って切断し、白色固体として粗生成物を得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:YMC-Exphere C18 10μm 300*50mm,12nm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%~45%,55分)で精製し、P6(9mg,6.10μmol,収率7.40%,純度97.34%)を淡黄色の固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=0.856分,mass calcd.for C72H98FN17O16,737.87 m/z [M-4tBu-Boc-C17H17NO4+8H]2+,リンクアミド(C17H17NO4,正確な質量=299.12);found 738.2 m/z[M-4tBu-Boc-C17H17NO4+8H]2+、リンクアミド(C17H17NO4,正確な質量=299.12);LC-MS:MERCK,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
LCMS:(ESI):RT=0.856分,mass calcd.for C72H98FN17O16,737.87 m/z [M-4tBu-Boc-C17H17NO4+8H]2+,リンクアミド(C17H17NO4,正確な質量=299.12);found 738.2 m/z[M-4tBu-Boc-C17H17NO4+8H]2+、リンクアミド(C17H17NO4,正確な質量=299.12);LC-MS:MERCK,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:RT=8.16分。移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持;カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μm;波長:UV220nm&215nm&254nm;カラム温度:40℃を使用。
3.9(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-(4-アミノブトキシ)-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-(2-フルオロフェニル)-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(P7)の調製
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(18,76.48μmol)及びaa4(87.98mg,229.44μmol,3当量)から出発した。対応するaa4-aa10-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(24,76.48μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように得た。
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(18,76.48μmol)及びaa4(87.98mg,229.44μmol,3当量)から出発した。対応するaa4-aa10-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(24,76.48μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように得た。
対応する樹脂結合ペプチド24(76.48μmol)を、一般的手順に従って切断し、白色固体として粗生成物を得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:Waters Xbridge Prep OBD C18 150*40mm*10μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:28%~58%,30分)で精製し、P7(17mg,11.16μmol,収率14.59%,純度93.57%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=2.675分,m/z calcd.for C68H95FN16O17 713.35[M+2H]2+,m/z found 713.8[M+2H]2+;移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、6分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持を使用。
LCMS:(ESI):RT=0.757分,m/z calcd.for C68H95FN16O17,713.35[M+2H]2+,m/z found 713.8[M+2H]2+;Merck,RP-18e 25-2mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LCMSを実施し、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC(Rt=7.58分;移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持。
3.10(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-(4-アミノブトキシ)-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[6-(1H-イミダゾール-5-イル)ヘキサノイルアミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(P11)の調製
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(18,74.75μmol)及びaa17(70.13mg,165.19μmol,2当量)から出発して、対応するaa17-aa10-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(27,74.75μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように取得した。
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(18,74.75μmol)及びaa17(70.13mg,165.19μmol,2当量)から出発して、対応するaa17-aa10-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(27,74.75μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように取得した。
対応する樹脂結合ペプチド化合物27(74.75μmol)を、一般的手順に従って切断し、白色固体として粗生成物を得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:YMC-Exphere C18 10μm 300*50mm,12nm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%~45%,55分)で精製し、P7(9mg,5.80μmol,収率7.05%,純度96.92%)を白色固体として得た。
HPLC:RT=7.72分。HPLC条件:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μmカラムを使用し、流量1.5mL/分で、0.12%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.1%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
LCMS:(ESI):RT=0.828分,m/z calcd.for C18H21NO2,1502.75[M+H]+,found 752.3[M+2H]2+;逆相LCMS条件:MERCK,RP-18e 25-2mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
3.11(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-(4-アミノブトキシ)-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2,5-ジアミノ-5-オキソ-ペンタノイル]アミノ]-3-(1H-イミダゾール-4-イル)プロパノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-(2-フルオロフェニル)-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(P13)の調製
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物18(82.60μmol)、aa15(77.14mg,247.79μmol,3当量)、aa16(93.40mg,247.49μmol,3当量)及びaa19(40.63mg,165.00μmol,2当量)から出発して、対応するaa19-aa16-aa15-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(30,82.50μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物18(82.60μmol)、aa15(77.14mg,247.79μmol,3当量)、aa16(93.40mg,247.49μmol,3当量)及びaa19(40.63mg,165.00μmol,2当量)から出発して、対応するaa19-aa16-aa15-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(30,82.50μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応する樹脂結合ペプチド30(82.50μmol)を、一般的手順に従って切断し、白色固体として粗生成物を得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:YMC-Exphere C18 10μm 300*50mm,12nm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%~45%,55分)で精製し、P13(10mg,5.69μmol,収率6.90%,純度95.28%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=0.807分,mass calcd.for C79H110FN21O19 837.9 m/z [M-4tBu-2Boc-C17H17NO4+9H]2+,リンクアミド(C17H17NO4,正確な質量=299.12);found 838.4 m/z[M-4tBu-Boc-C17H17NO4+9H]2+、リンクアミド(C17H17NO4,正確な質量=299.12);LC-MS:MERCK,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
LCMS:(ESI):RT=0.820分,mass calcd.for C79H110FN21O19 837.9 m/z [M-4tBu-2Boc-C17H17NO4+9H]2+,リンクアミド(C17H17NO4,正確な質量=299.12);found 838.3 m/z[M-4tBu-Boc-C17H17NO4+9H]2+、リンクアミド(C17H17NO4,正確な質量=299.12);LC-MS:MERCK,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:RT=7.37分。移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持;カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μm;波長:220nm&215nm&254nm;カラム温度:40℃を使用。
3.12(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-(4-アミノブトキシ)-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[(3R)-1-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチル]-3-メチル-2-オキソ-ピロリドン-3-カルボニル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシプロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(P14)の調製
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(18,82.60μmol)及びaa20(79.22mg,165.19μmol,2当量)から出発して、対応するaa20-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(31,82.60μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(18,82.60μmol)及びaa20(79.22mg,165.19μmol,2当量)から出発して、対応するaa20-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(31,82.60μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応する樹脂結合ペプチド31(82.60μmol)を、一般的手順に従ってさらに切断し、白色固体として粗生成物を得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:YMC-Exphere C18 10μm 300*50mm,12nm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%~45%,55分)で精製し、P14(8mg,3.85μmol,収率6.2%,純度93.37%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=0.840分,m/z calcd.for C76H103FN18O17,779.39 m/z [M+2H]2+,found 779.9 m/z[M+2H]2+;LC-MS:MERCK,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
LCMS:(ESI):RT=0.864分,m/z calcd.for C76H103FN18O17,779.39 m/z [M+2H]2+,found 779.9 m/z[M+2H]2+;LC-MS:MERCK,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:RT=7.60分。移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持;カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μm;波長:220nm&215nm&254nm;カラム温度:40℃を使用。
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(18,82.60μmol)及びaa21(79.22mg,165.19μmol,2当量)から出発して、対応するaa21-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(32,82.60μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
3.13(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-(4-アミノブトキシ)-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[(3R)-1-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチル]-3-メチル-2-オキソ-ピロリドン-3-カルボニル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシプロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(P15)の調製
対応する樹脂結合ペプチド32(82.60μmol)を、一般的手順に従ってさらに切断し、白色固体として粗生成物を得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:YMC-Exphere C18 10μm 300*50mm,12nm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%~45%,55分)で精製し、P15(10.5mg,6.54μmol,収率7.91%,純度96.96%)を白色固体として得た。
対応する樹脂結合ペプチド32(82.60μmol)を、一般的手順に従ってさらに切断し、白色固体として粗生成物を得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:YMC-Exphere C18 10μm 300*50mm,12nm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%~45%,55分)で精製し、P15(10.5mg,6.54μmol,収率7.91%,純度96.96%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=0.828分,mass calcd.for C76H103FN18O17,779.39 m/z [M+2H]2+,found 779.8 m/z[M+2H]2+;LC-MS:MERCK,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
LCMS:(ESI):RT=0.830分,mass calcd.for C76H103FN18O17,779.39 m/z [M+2H]2+,found 779.8 m/z[M+2H]2+;LC-MS:MERCK,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:RT=7.62分。移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持;カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μm;波長:UV220nm&215nm&254nm;カラム温度:40℃を使用。
3.14(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-(4-アミノブトキシ)-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[(3S)-1-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチル]ピロリドン-3-カルボニル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(P16)の調製
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(18,141.13μmol)及びaa22(127.46mg,282.27μmol,2.0当量)から出発して、対応するaa22-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(33,141.13μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(18,141.13μmol)及びaa22(127.46mg,282.27μmol,2.0当量)から出発して、対応するaa22-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(33,141.13μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応する樹脂結合ペプチド33(141.13μmol)を、一般的手順に従ってさらに切断し、白色固体として粗生成物を得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:YMC-Exphere C18 10μm 300*50mm,12nm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%~45%,55分)で精製し、P16(15mg,9.71μmol,収率6.88%,純度99%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=2.361分、m/z calcd.for C75H103FN18O16,1530.76 M-Boc-4tBu+2H]2+,m/z found 765.8,移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、2.5分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持、ESI源、正イオンモード;波長:220nm&254nm、オーブン温度50℃を使用。
LCMS(ESI):RT=0.755分、m/z calcd.for C75H103FN18O16,1530.76 M-Boc-4tBu+2H]2+,m/z found 765.8,移動相:1.5mL/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75mL/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5mL/分で、0.7分間の5%~95%溶出勾配(溶媒B)及び95%で0.4分間保持;カラム:Agilent Pursult 5 C18 20*2.0mm 波長 UV220nm;カラム温度50℃;MSイオン化:ESIを使用。
HPLC:RT=7.18分。移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持;カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm;波長:UV220nm、215nm&254nm;カラム温度:40℃を使用。
3.15(3S,9S,12S,15S,18S,21S)-tert-ブチル1-((R)-1-(2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチル)ピロリジン-3-イル)-3-((2H-テトラゾール-5-イル)メチル)-21-(((S)-1-(((S)-1-アミノ-5-(3,5-ジメチルフェニル)-1-オキソペンタン-2-イル)アミノ)-3-(4’-(4-アミノブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)-1-オキソプロパン-2-イル)カルバモイル)-12-(2-フルオロベンジル)-9,15-ビス((R)-1-ヒドロキシエチル)-18-(ヒドロキシメチル)-12-メチル-1,4,7,10,13,16,19-ヘプタオキソ-2,5,8,11,14,17,20-ヘプタアザトリコサン-23-オアート(P17)の調製
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物18(101.97μmol)及びaa23(80mg,177.16μmol,1.74当量)から出発して、対応するaa23-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(34,101.88μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物18(101.97μmol)及びaa23(80mg,177.16μmol,1.74当量)から出発して、対応するaa23-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(34,101.88μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応する樹脂結合ペプチド34(101.88μmol)を、一般的手順に従ってさらに切断し、白色固体として粗生成物を得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:YMC-Exphere C18 10μm 300*50mm,12nm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%~45%,55分)で精製し、P17(18mg,11.65μmol,収率11.43%,純度99%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=0.828分、m/z calcd.for C75H103FN18O16,1530.76 M-Boc-4tBu+2H]2+,m/z found 765.8,移動相:1.5mL/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5mL/分で、0.7分間の5%~95%溶出勾配(溶媒B)及び95%で0.4分間保持;カラム:Agilent Pursult 5 C18 20*2.0mm 波長 UV220nm;カラム温度50℃;MSイオン化:ESIを使用。
HPLC:RT=7.36分。移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持;カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm;波長:220nm、215nm&254nm;カラム温度:40℃を使用。
図17A及び図17Bは、本開示に従ったGLP1ペプチド模倣ペイロードP10、P12、P18、P19、P25、P26、P27、P28、P29、P30、P31、P36、P37及びP38の固相合成のための工程のシーケンスを表す。
3.16 [[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-(1H-イミダゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-(2-フルオロフェニル)-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(P10)の調製
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(18,137.66μmol)から出発して、対応するaa16-aa15-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(26,137.28μmol)を、aa15(128.58mg,412.99μmol,3当量)、続いてaa16(155.42mg,411.83μmol,3当量)を用いてペプチドを伸長させることでSPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(18,137.66μmol)から出発して、対応するaa16-aa15-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(26,137.28μmol)を、aa15(128.58mg,412.99μmol,3当量)、続いてaa16(155.42mg,411.83μmol,3当量)を用いてペプチドを伸長させることでSPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応する樹脂結合ペプチド26(137.28μmol)を、一般的手順に従ってさらに切断し、白色固体として粗生成物を得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:YMC-Exphere C18 10μm 300*50mm,12nm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%~45%,55分)で精製し、P10(16mg,10.33μmol,収率7.55%,純度99.85%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=0.808分,mass calcd.for C74H100FN19O17 1545.75[M-4tBu-Boc+6H]+773.88[M-4tBu-Boc+7H]2+,found 774.2[M-4tBu-Boc+7H]2+。Chromolith Flash RP-18e 25-3mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LC-MSを実施し、0.04%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.06%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:RT=7.46分。移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持;カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μm;波長:UV220nm&215nm&254nm;カラム温度:40℃を使用。
3.17(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-(4-アミノブトキシ)-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3-ヒドロキシ-5-メチル-フェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[2-[3-(1H-イミダゾール-4-イル)プロパノイルアミノ]アセチル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシプロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(P12)の調製
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(18,82.60μmol)から出発して、対応するaa18-aa8-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(29,82.60μmol)を、aa8(73.67mg,247.79μmol,3当量)、続いてaa18(63.18mg,165.19μmol,2当量)を用いてペプチドを伸長させることでSPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(18,82.60μmol)から出発して、対応するaa18-aa8-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(29,82.60μmol)を、aa8(73.67mg,247.79μmol,3当量)、続いてaa18(63.18mg,165.19μmol,2当量)を用いてペプチドを伸長させることでSPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応する樹脂結合ペプチド29(82.60μmol)を、一般的手順に従ってさらに切断し、白色固体として粗生成物を得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:YMC-Exphere C18 10μm 300*50mm,12nm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%~45%,55分)で精製し、P12(11mg,7.09μmol,収率8.59%,純度97.99%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=0.828分,mass calcd.for C72H96FN18O18,759.86 m/z [M+2H]2+,found 759.7 m/z[M+2H]2+;[M+2H]2+;LC-MS:MERCK,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
LCMS:(ESI):RT=0.828分,mass calcd.for C72H96FN18O18,759.86 m/z [M+2H]2+,found 759.8 m/z[M+2H]2+;[M+2H]2+;LC-MS:MERCK,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:RT=7.65分。移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持;カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μm;波長:UV220nm&215nm&254nm;カラム温度:40℃を使用。
3.18(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-(4-アミノブトキシ)-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-(2-フルオロフェニル)-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(P18)の調製
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物18(76.48μmol)から出発して、対応するaa24-aa15-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物35(76.48μmol)を、aa15(71.43mg,229.44μmol,3当量)、続いてaa24(64.54mg,229.44μmol,3当量)を用いてペプチドを伸長させることでSPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物18(76.48μmol)から出発して、対応するaa24-aa15-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物35(76.48μmol)を、aa15(71.43mg,229.44μmol,3当量)、続いてaa24(64.54mg,229.44μmol,3当量)を用いてペプチドを伸長させることでSPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応する樹脂結合ペプチド35(76.48μmol)を、一般的手順に従ってさらに切断し、白色固体として粗生成物を得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:YMC-Exphere C18 10μm 300*50mm,12nm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%~45%,55分)で精製し、P18(16mg,10.15μmol,収率11.76%,純度99.77%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=0.762分,m/z calcd.for C77H104FN17O18,786.89[M+2H]2+,m/z found 787.3[M+2H]2+;Merck,RP-18e 25-2mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LCMSを実施し、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC(Rt=7.68分;移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5mL/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持を使用。
3.19(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-(4-アミノブトキシ)-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[2-[[(2S)-2-[[2-[[(2S)-2-アミノ-3-(4-ヒドロキシフェニル)プロパノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-(2-フルオロフェニル)-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシプロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(P19)の調製
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物18(81.07μmol)から出発して、対応するaa24-aa25-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物37(81.07μmol)を、aa25(79.13mg,243.20μmol,3当量)、続いてaa24(68.41mg,243.20μmol,3当量)を用いてペプチドを伸長させることでSPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物18(81.07μmol)から出発して、対応するaa24-aa25-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物37(81.07μmol)を、aa25(79.13mg,243.20μmol,3当量)、続いてaa24(68.41mg,243.20μmol,3当量)を用いてペプチドを伸長させることでSPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応する樹脂結合ペプチド37を、一般的手順に従ってさらに切断し、白色固体として粗生成物を得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini-NX 150*30mm*5μm;移動相:[水(0.04%NH3H2O+10mM NH4HCO3)-ACN];B%:10%~50%,15分)で精製し、P19(9mg,5.62μmol,収率7.03%,純度99%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=0.841分,m/z calcd.for C78H106FN17O18,793.90[M+2H]2+,m/z found 794.2[M+2H]2+;Merck,RP-18e 25-2mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LCMSを実施し、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
粗HPLC:(Rt=7.81分;移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5mL/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持。
LCMS:(ESI):RT=0.813分,m/z calcd.for C78H106FN17O18,793.90[M+2H]2+,m/z found 794.4[M+2H]2+;Merck,RP-18e 25-2mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LCMSを実施し、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:Rt=7.81分;移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持。
3.20(3S,6S,9S,12S,15S,21S)-21-((2H-テトラゾール-5-イル)メチル)-3-(((S)-1-(((S)-1-アミノ-5-(3,5-ジメチルフェニル)-1-オキソペンタン-2-イル)アミノ)-3-(4’-(4-アジドブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)-1-オキソプロパン-2-イル)カルバモイル)-12-(2-フルオロベンジル)-9,15-ビス((R)-1-ヒドロキシエチル)-6-(ヒドロキシメチル)-28-(1H-イミダゾール-5-イル)-12,24,24-トリメチル-5,8,11,14,17,20,23,26-オクタオキソ-4,7,10,13,16,19,22,25-オクタアザオクタコサン-1-酸(P25)の調製
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(1.03mmol)、aa25(669mg,206mmol,2.0当量)から出発して、対応するaa25-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物36A(1.03mmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(1.03mmol)、aa25(669mg,206mmol,2.0当量)から出発して、対応するaa25-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物36A(1.03mmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
DMF(20mL)中の化合物36A(0.1g,50.70μmol,1.0当量)の混合物に、DMF(20mL)中の化合物aa29(58.17mg,152.11μmol,3.0当量)、PyBOP(73.88mg,141.96μmol,2.8当量)及びDIPEA(39.32mg,304.21μmol,52.99μL,6.0当量)の溶液を20℃で一度に加えた。混合物を20℃で2時間、N2でバブリングした。混合物を濾過し、回収した樹脂をDMF(50mL*3)、DCM(50mL*3)で洗浄し、固相で粗生成物を得た。これをTFAカクテル(6mLのTFA,0.4mLの水,0.3mLのトリイソプロピルシラン,120mgのフェノール)を使用することで酸性切断に供した。混合物を濾過し、濾液をt-BuOMe(1000mL)で希釈し、沈殿を得た。これを10分間遠心分離にかけた(5000R)。残渣を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini-NX C18 80*3 0mm*5μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:10%~60%、20分間)により精製し、生成物P25(2.3mg,1.33μmol,収率2.63%、純度91%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=4.006分、m/z calcd.for C75H100FN20O17,1571.76[M+H]+,found 786.20[M+2H]2+,移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、2.5分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持、ESI源、正イオンモード;波長:220nm&254nm、オーブン温度50℃を使用。
HPLC:RT=9.54分、純度98.48%。HPLC方法A:カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μm;2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持を使用。
3.21(3S,6S,9S,12S,15S,21S)-21-((2H-テトラゾール-5-イル)メチル)-3-(((S)-1-(((S)-1-アミノ-5-(3,5-ジメチルフェニル)-1-オキソペンタン-2-イル)アミノ)-3-(4’-(4-アジドブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)-1-オキソプロパン-2-イル)カルバモイル)-12-(2-フルオロベンジル)-9,15-ビス((R)-1-ヒドロキシエチル)-6-(ヒドロキシメチル)-29-(1H-イミダゾール-5-イル)-12,24,24-トリメチル-5,8,11,14,17,20,23,26-オクタオキソ-4,7,10,13,16,19,22,25-オクタアザノナコサン-1-酸(P26)の調製
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(1.03mmol)、aa25(669mg,206mmol,2.0当量)から出発して、対応するaa25-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物36A(1.03mmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(1.03mmol)、aa25(669mg,206mmol,2.0当量)から出発して、対応するaa25-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物36A(1.03mmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
樹脂結合化合物36A(50mg,25.35μmol,1当量)を、TFAカクテル(5mL,TFA/TIPS/H2O=95:2.5:2.5)を使用することで酸性切断に供した。混合物を濾過し、濾液をt-BuOMe(50mL)で希釈し、続いて10分間遠心分離(5000R)にかけ、白色固体として粗生成物(aa25-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1(50mg,粗)を得た。
LCMS(ESI):RT=3.968分、m/z calcd.for C69H95FN18O16,1449.70,found 1449.7[M+H]+,移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、2.5分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持、ESI源、正イオンモード;波長:220nm&254nm、オーブン温度50℃を使用。
DMF(4mL)中のaa30(34.19mg,86.23μmol,2.5当量)の溶液に、PyBOP(39.49mg,75.88μmol,2.2当量)及びDIPEA(26.75mg,206.96μmol,36.05μL,6当量)を加え、混合物を25℃で10分間撹拌し、続いてaa25-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1(50mg,34.49μmol,1当量)を加え、最終混合物を25℃で2時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視した。完了後、混合物をTBME(25mL)でトリチュレートして粗生成物を得た。これをH2O(0.1mL)と、トリイソプロピルシラン(77.10mg,486.88μmol,0.1mL,14.83当量)と、TFA(2.77g,24.31mmol,1.8mL,740.69当量)との溶液に加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視した。完了後、混合物を濾過し、続いてTBME(50mL)でトリチュレートして粗生成物を得た。これを、分取HPLC(カラム:Gemini NX C18 5μm*10*150mm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:10%~60%,30分)で精製し、P26(7.72mg,4.77μmol,収率14.54%,純度98%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=3.991分,mass calcd.for C76H103FN20O17 793.38[M+H]+,found 793.7[M+H]+。LCMS条件:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、6.0分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持、カラム:Xtimate C18 2.1*30mm,3μm、波長:UV220nm&254nm;カラム温度:50℃;MSイオン化:ESIを使用。
HPLC:RT=9.55分,HPLC条件:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持、カラム:WELCH Ultimate LP-C18 150*4.6mm 5μm;波長:UV220nm、215nm、254nm;カラム温度:40℃を使用。
3.22(3S,6S,9S,12S,15S,21S)-21-((2H-テトラゾール-5-イル)メチル)-3-(((S)-1-(((S)-1-アミノ-5-(3,5-ジメチルフェニル)-1-オキソペンタン-2-イル)アミノ)-3-(4’-(4-アジドブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)-1-オキソプロパン-2-イル)カルバモイル)-12-(2-フルオロベンジル)-9,15-ビス((R)-1-ヒドロキシエチル)-6-(ヒドロキシメチル)-30-(1H-イミダゾール-5-イル)-12,24,24-トリメチル-5,8,11,14,17,20,23,26-オクタオキソ-4,7,10,13,16,19,22,25-オクタアザトリアコンタン-1-酸(P27)の調製
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(1.03mmol)、aa25(669mg,206mmol,2.0当量)から出発して、対応するaa25-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物36A(1.03mmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(1.03mmol)、aa25(669mg,206mmol,2.0当量)から出発して、対応するaa25-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物36A(1.03mmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
DMF(4mL)中の化合物36A(120mg,60.84μmol,1当量)の混合物に、DMF(10mL)中のaa31(62.44mg,152.11μmol,2.5当量)と、PyBOP(69.66mg,133.85μmol,2.2当量)と、DIPEA(47.18mg,365.05μmol,63.59μL,6当量)との溶液を20℃で一度に加え、最終混合物をN2、20℃で2時間バブリングし、この進行を2回繰り返した。反応の進行をLCMSで監視した。完了後、混合物を濾過し、DMF(10mL*4)及びDCM(10mL*4)で洗浄し、固相で粗生成物を得た。これをTFAカクテル(5mLのTFA/TIPS/H2O=95:2.5:2.5)を使用することで酸性切断に供した。混合物を濾過し、濾液をt-BuOMe(50mL)で希釈し、沈殿を得た。これを10分間遠心分離にかけた(5000R)。残渣を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini-NX C18 150*40mm*5μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:0%~45%、30分間)により精製し、生成物P27(2.4mg,1.47μmol,収率2.48%、純度98%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=4.071分、m/z calcd.for C77H105FN20O17,800.39 [M+2H]2+,found 800.8,移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で2.5分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持、ESI源、正イオンモード;波長:220nm&254nm、オーブン温度50℃を使用。
HPLC:RT=9.58分,HPLC条件:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持、カラム:WELCH Ultimate LP-C18 150*4.6mm 5μm;波長:UV220nm、215nm、254nm;カラム温度:40℃を使用。
3.23(3S,6S,9S,12S,15S,21S)-21-((2H-テトラゾール-5-イル)メチル)-3-(((S)-1-(((S)-1-アミノ-5-(3,5-ジメチルフェニル)-1-オキソペンタン-2-イル)アミノ)-3-(4’-(4-アジドブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)-1-オキソプロパン-2-イル)カルバモイル)-12-(2-フルオロベンジル)-9,15-ビス((R)-1-ヒドロキシエチル)-6-(ヒドロキシメチル)-31-(1H-イミダゾール-4-イル)-12,24,24-トリメチル-5,8,11,14,17,20,23,26-オクタオキソ-4,7,10,13,16,19,22,25-オクタアザヘントリアコンタン-1-酸(P28)の調製
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(1.03mmol)、aa25(669mg,206mmol,2.0当量)から出発して、対応するaa25-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物36A(1.03mmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(1.03mmol)、aa25(669mg,206mmol,2.0当量)から出発して、対応するaa25-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物36A(1.03mmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
DMF(4mL)中の化合物36A(120mg,60.84μmol,1当量)の混合物に、DMF(10mL)中のaa32(64.57mg,152.10μmol,2.5当量)と、PyBOP(69.65mg,133.85μmol,2.2当量)と、DIPEA(39.32mg,304.20μmol,52.99μL,5当量)との溶液を20℃で一度に加え、最終混合物をN2、20℃で2時間バブリングし、この進行を2回繰り返した。反応の進行をLCMSで監視した。完了後、混合物を濾過し、DMF(10mL*4)及びDCM(10mL*4)で洗浄し、固相で粗生成物を得た。これをTFAカクテル(5mLのTFA/TIPS/H2O=95:2.5:2.5)を使用することで酸性切断に供した。混合物を濾過し、濾液をt-BuOMe(50mL)で希釈し、沈殿を得た。これを10分間遠心分離にかけた(5000R)。残渣を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini-NX 150*30mm*5μm;移動相:[水(0.05v/v%水酸化アンモニウム)-ACN];B%:0%~45%、30分間)により精製し、生成物P28(8.5mg,5.21μmol,収率10.34%、純度99%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=4.035分、m/z calcd.for C78H107FN20O17,807.40 [M+2H]2+,found 807.8,移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で2.5分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持、ESI源、正イオンモード;波長:220nm&254nm、オーブン温度50℃を使用。
HPLC:RT=9.60分,HPLC条件:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持、カラム:WELCH Ultimate LP-C18 150*4.6mm 5μm;波長:UV220nm、215nm、254nm;カラム温度:40℃を使用。
3.24(3S,6S,9S,12S,15S,21S)-21-((2H-テトラゾール-5-イル)メチル)-3-(((S)-1-(((S)-1-アミノ-5-(3,5-ジメチルフェニル)-1-オキソペンタン-2-イル)アミノ)-3-(4’-(4-アジドブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)-1-オキソプロパン-2-イル)カルバモイル)-12-(2-フルオロベンジル)-9,15-ビス((R)-1-ヒドロキシエチル)-6-(ヒドロキシメチル)-32-(1H-イミダゾール-4-イル)-12,24,24-トリメチル-5,8,11,14,17,20,23,26-オクタオキソ-4,7,10,13,16,19,22,25-オウタアザドトリアコンタン-1-酸(P29)の調製
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(1.03mmol)、aa25(669mg,206mmol,2.0当量)から出発して、対応するaa25-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物36A(1.03mmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(1.03mmol)、aa25(669mg,206mmol,2.0当量)から出発して、対応するaa25-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物36A(1.03mmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
DMF(4mL)中の化合物36A(120mg,60.84μmol,1当量)の混合物に、DMF(10mL)中のaa33(64.04mg,146.02μmol,2.4当量)と、PyBOP(63.32mg,121.68μmol,2当量)と、DIPEA(39.32mg,304.21μmol,52.99μL,5当量)との溶液を20℃で一度に加え、最終混合物をN2、20℃で2時間バブリングし、この進行を2回繰り返した。反応の進行をLCMSで監視した。完了後、混合物を濾過し、DMF(10mL*4)及びDCM(10mL*4)で洗浄し、固相で粗生成物を得た。これをTFAカクテル(5mLのTFA/TIPS/H2O=95:2.5:2.5)を使用することで酸性切断に供した。混合物を濾過し、濾液をt-BuOMe(50mL)で希釈し、沈殿を得た。これを10分間遠心分離にかけた(5000R)。残渣を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini-NX 150*30mm*5μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%~55%、20分間)により精製し、生成物P29(5mg,3.05μmol,収率5.22%、純度99.4%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=3.997分、m/z calcd.for C77H103FN20O17,814.40 [M+2H]2+,found 814.9,移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で2.5分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持、ESI源、正イオンモード;波長:220nm&254nm、オーブン温度50℃を使用。
HPLC:RT=9.61分,HPLC条件:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持、カラム:WELCH Ultimate LP-C18 150*4.6mm 5μm;波長:UV220nm、215nm、254nm;カラム温度:40℃を使用。
3.25(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-(4-アジドブトキシ)-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[2-[8-(1H-イミダゾール-5-イル)オクタノイルアミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル] アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(P30)の調製
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(1.03mmol)、aa25(669mg,206mmol,2.0当量)から出発して、対応するaa25-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物36A(1.03mmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(1.03mmol)、aa25(669mg,206mmol,2.0当量)から出発して、対応するaa25-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物36A(1.03mmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
DMF(4mL)中の化合物36A(500mg,126.75μmol,純度50%、1当量)の混合物に、DMF(20mL)中のaa34(286.84mg,633.77μmol,5当量)と、HATU(86.75mg,228.16μmol,1.8当量)と、DIPEA(65.53mg,507.02μmol,88.31μL,4当量)との溶液を20℃で一度に加え、最終混合物をN2、20℃で2時間バブリングした。反応の進行をLCMSで監視した。完了後、混合物を濾過し、DMF(10mL*4)及びDCM(10mL*4)で洗浄し、固相で粗生成物を得た。これをTFAカクテル(10mLのTFA/TIPS/H2O=95:2.5:2.5)を使用することで酸性切断に供した。混合物を濾過し、濾液をt-BuOMe(100mL)で希釈し、沈殿を得た。これを10分間遠心分離にかけた(5000R)。残渣を分取HPLC(カラム:Boston Green ODS150*30mm*5μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:22%~62%、9分間)により精製し、生成物P30(7.68mg,4.62μmol,収率4.45%、純度98.82%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=3.998分,m/z calcd.for C80H110FN20O17 1641.83[M+H]+,C80H111FN20O17 821.4[M+2H]2+,found 821.8[M+2H]2+。LC-MS方法A:MERCK,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出。
HPLC:RT=9.63分;HPLC条件:移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ML/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持;カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μmを使用。
3.26(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-(4-アジドブトキシ)-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[2-[9-(1H-イミダゾール-5-イル)ノナノイルアミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(P31)の調製
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(1.03mmol)、aa25(669mg,206mmol,2.0当量)から出発して、対応するaa25-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物36A(1.03mmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応するaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(1.03mmol)、aa25(669mg,206mmol,2.0当量)から出発して、対応するaa25-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物36A(1.03mmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
DMF(4mL)中の化合物36A(125mg,63.38μmol,1当量)の混合物に、DMF(10mL)中のaa35(57.37mg,126.75μmol,2.0当量)と、HATU(43.38mg,114.08μmol,1.8当量)と、DIPEA(32.76mg,253.51μmol,44.16μl,4.0当量)との溶液を20℃で一度に加え、最終混合物をN2、20℃で2時間バブリングした。反応の進行をLCMSで監視した。完了後、混合物を濾過し、DMF(10mL*4)及びDCM(10mL*4)で洗浄し、固相で粗生成物を得た。これをTFAカクテル(5mLのTFA/TIPS/H2O=95:2.5:2.5)を使用することで酸性切断に供した。混合物を濾過し、濾液をt-BuOMe(50mL)で希釈し、沈殿を得た。これを10分間遠心分離にかけた(5000R)。残渣を分取HPLC(カラム:Boston Green ODS150*30mm*5μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:25%~65%、9分間)により精製し、生成物P31(7.0mg,4.23μmol,収率6.69%、純度100%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=4.023分、m/z calcd.for C75H100FN20O17,1571.76[M+H]+,786.38[M+2H]2+,found 786.20[M+2H]2+,移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、2.5分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持、ESI源、正イオンモード;波長:220nm、254nm、オーブン温度50℃を使用。
HPLC:RT=9.80分、純度100%。HPLC方法A:カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μm;2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持を使用。
3.27(9S,15S,18S,21S,24S,27S)-9-((2H-テトラゾール-5-イル)メチル)-27-(((S)-1-(((S)-1-アミノ-5-(3,5-ジメチルフェニル)-1-オキソペンタン-2-イル)アミノ)-3-(4’-(4-アジドブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)-1-オキソプロパン-2-イル)カルバモイル)-18-(2-フルオロベンジル)-15,21-ビス((R)-1-ヒドロキシエチル)-24-(ヒドロキシメチル)-6,6,18-トリメチル-4,7,10,13,16,19,22,25-オクタオキソ-1-(2-オキソピペリジン-1-イル)-3,8,11,14,17,20,23,26-オクタアザノナコサン-29-酸(P36)の調製
DMF(2mL)中のaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(75mg,19.87μmol,純度50%、1当量)の混合物に、DMF(10mL)中のaa36(20mg,73.99μmol,3.72当量)と、HATU(15.11mg,39.74μmol,2当量)と、DIPEA(25.68mg,198.71μmol,34.61μL,10当量)との溶液を20℃で一度に加え、最終混合物をN2、20℃で2時間バブリングした。反応の進行をLCMSで監視した。完了後、混合物を濾過し、DMF(10mL×4)及びDCM(10mL×4)で洗浄し、固相で粗生成物を得た。これをTFAカクテル(5mLのTFA/TIPS/H2O=95:2.5:2.5)を使用することで酸性切断に供した。混合物を濾過し、濾液をt-BuOMe(50mL)で希釈し、沈殿を得た。これを10分間遠心分離にかけた(5000R)。残渣を分取HPLC(カラム:Welch Xtimate C18 100*40mm*3μm;移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:50%~80%、10分間)により精製し、生成物P36(2.4mg,1.48μmol,収率7.47%、純度100%)を白色固体として得た。
DMF(2mL)中のaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(75mg,19.87μmol,純度50%、1当量)の混合物に、DMF(10mL)中のaa36(20mg,73.99μmol,3.72当量)と、HATU(15.11mg,39.74μmol,2当量)と、DIPEA(25.68mg,198.71μmol,34.61μL,10当量)との溶液を20℃で一度に加え、最終混合物をN2、20℃で2時間バブリングした。反応の進行をLCMSで監視した。完了後、混合物を濾過し、DMF(10mL×4)及びDCM(10mL×4)で洗浄し、固相で粗生成物を得た。これをTFAカクテル(5mLのTFA/TIPS/H2O=95:2.5:2.5)を使用することで酸性切断に供した。混合物を濾過し、濾液をt-BuOMe(50mL)で希釈し、沈殿を得た。これを10分間遠心分離にかけた(5000R)。残渣を分取HPLC(カラム:Welch Xtimate C18 100*40mm*3μm;移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:50%~80%、10分間)により精製し、生成物P36(2.4mg,1.48μmol,収率7.47%、純度100%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=4.416分,mass calcd.for C95H122N20O22FH 1917.11[M+H]+,C95H122N20O22F 809.1[M+2H]2+,found 809.3[M+2H]2+;Chromolith Flashカラム、1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)を使用し、流量0.8ml/分で逆相LCMSを実施し、6分間の10%~80%の勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持;カラム:Xtimate 3μm,C18,2.1*30mmを使用した。
HPLC:RT=5.24分;HPLC条件:移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ML/分で、10分間の10%~80%(溶媒B)溶出勾配及び80%で5分間保持;カラム:Ultimate XB-C18,3μm,3.0*50mmを使用。
3.28(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-(4-アジドブトキシ)-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[2-[2-[2-(5-メチル-1,3-ジオキソ-イソインドリン-2-イル)エチルアミノ]-2-オキソ-エチル]スルファニルアセチル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル] アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(P37)の調製
DMF(2mL)中のaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(100mg,26.49μmol,1当量)の混合物に、DMF(10mL)中のaa36(44.56mg,132.47μmol,5当量)と、HATU(18.13mg,47.69μmol,1.8当量)と、DIPEA(13.70mg,105.98μmol,18.46μL,4当量)との溶液を20℃で一度に加え、最終混合物をN2、20℃で2時間バブリングした。反応の進行をLCMSで監視した。完了後、混合物を濾過し、DMF(10mL×4)及びDCM(10mL×4)で洗浄し、固相で粗生成物を得た。これをTFAカクテル(5mLのTFA/TIPS/H2O=95:2.5:2.5)を使用することで酸性切断に供した。混合物を濾過し、濾液をt-BuOMe(50mL)で希釈し、沈殿を得た。これを10分間遠心分離にかけた(5000R)。残渣を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge BEH C18 100*25mm*5μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:20%~80%、15分間)により精製し、生成物P37(4.81mg,2.86μmol,収率10.86%、純度100%)を白色固体として得た。
DMF(2mL)中のaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(100mg,26.49μmol,1当量)の混合物に、DMF(10mL)中のaa36(44.56mg,132.47μmol,5当量)と、HATU(18.13mg,47.69μmol,1.8当量)と、DIPEA(13.70mg,105.98μmol,18.46μL,4当量)との溶液を20℃で一度に加え、最終混合物をN2、20℃で2時間バブリングした。反応の進行をLCMSで監視した。完了後、混合物を濾過し、DMF(10mL×4)及びDCM(10mL×4)で洗浄し、固相で粗生成物を得た。これをTFAカクテル(5mLのTFA/TIPS/H2O=95:2.5:2.5)を使用することで酸性切断に供した。混合物を濾過し、濾液をt-BuOMe(50mL)で希釈し、沈殿を得た。これを10分間遠心分離にかけた(5000R)。残渣を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge BEH C18 100*25mm*5μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:20%~80%、15分間)により精製し、生成物P37(4.81mg,2.86μmol,収率10.86%、純度100%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=4.602分,m/z calcd.for C80H101FN19O19S 1682.71[M+H]+,C80H100FN19O19S 841.85[M+2H]2+,found 842.3[M+2H]2+。LC-MS方法A:MERCK,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出。
HPLC:RT=4.844分;HPLC条件:移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持;カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μmを使用。
3.29(3S,6S,9S,12S,15S,21S)-21-((2H-テトラゾール-5-イル)メチル)-3-(((S)-1-(((S)-1-アミノ-5-(3,5-ジメチルフェニル)-1-オキソペンタン-2-イル)アミノ)-3-(4’-(4-アジドブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)-1-オキソプロパン-2-イル)カルバモイル)-12-(2-フルオロベンジル)-9,15-ビス((R)-1-ヒドロキシエチル)-6-(ヒドロキシメチル)-12-メチル-5,8,11,14,17,20,23,27-オクタオキソ-29-(2-オキソピロリジン-1-イル)-4,7,10,13,16,19,22,26-オクタアザノナコサン-1-酸(P38)の調製
DMF(2mL)中のaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(0.2g,52.99μmol,純度50%,1.0当量)の混合物に、DMF(10mL)中のaa38(82.48mg,264.94μmol,5.0当量)と、HATU(90.66mg,238.45μmol,4.5当量)と、DIPEA(68.48mg,529.88μmol,92.29μL,10.0当量)との溶液を20℃で一度に加え、最終混合物をN2、20℃で2時間バブリングした。反応の進行をLCMSで監視した。完了後、混合物を濾過し、DMF(10mL×4)及びDCM(10mL×4)で洗浄し、固相で粗生成物を得た。これを20%のピペリジン/DMF(20mL)で再度膨潤させ、N2、20℃で2時間バブリングした。完了後、混合物を濾過し、回収した樹脂をDMF(100mL×3)、DCM(100mL×3)で洗浄して固相上で粗生成物aa38-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1(52.99μmol)を得た。
DMF(2mL)中のaa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(0.2g,52.99μmol,純度50%,1.0当量)の混合物に、DMF(10mL)中のaa38(82.48mg,264.94μmol,5.0当量)と、HATU(90.66mg,238.45μmol,4.5当量)と、DIPEA(68.48mg,529.88μmol,92.29μL,10.0当量)との溶液を20℃で一度に加え、最終混合物をN2、20℃で2時間バブリングした。反応の進行をLCMSで監視した。完了後、混合物を濾過し、DMF(10mL×4)及びDCM(10mL×4)で洗浄し、固相で粗生成物を得た。これを20%のピペリジン/DMF(20mL)で再度膨潤させ、N2、20℃で2時間バブリングした。完了後、混合物を濾過し、回収した樹脂をDMF(100mL×3)、DCM(100mL×3)で洗浄して固相上で粗生成物aa38-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1(52.99μmol)を得た。
DMF(2mL)中のaa38-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(52.60μmol,1当量)の混合物に、DMF(10mL)中のaa39(41.33mg,262.98μmol,5.0当量)と、HATU(90.00mg,236.69μmol,4.5当量)と、DIPEA(67.98mg,525.97μmol,91.61μL,10.0当量)との溶液を20℃で一度に加え、最終混合物をN2、20℃で2時間バブリングした。反応の進行をLCMSで監視した。完了後、混合物を濾過し、DMF(10mL×4)及びDCM(10mL×4)で洗浄し、固相で粗生成物を得た。これをTFAカクテル(10mLのTFA/TIPS/H2O=95:2.5:2.5)を使用することで酸性切断に供した。混合物を濾過し、濾液をt-BuOMe(100mL)で希釈し、沈殿を得た。これを10分間遠心分離にかけた(5000R)。残渣を分取HPLC(カラム:Boston Green ODS150*30mm*5μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:36%~76%、9分間)及び分取HPLC(カラム:Waters X-bridge BEH C18 100*25mm*5μm;移動相:[水(0.05%NH3H2O)-ACN];B%:5%~49%,11分間)により精製し、生成物P38(3.0mg,1.71μmol,収率3.26%、純度90%)を白色固体として得た。LCMS(ESI):RT=4.313分,m/z calcd.for C75H102FN19O18 1575.76[M+H]+,788.38[M+2H]2+,found 788.20[M+2H]2+。LCMS条件:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、6分間の10%~80%の勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持;カラム:Xtimate 3μm,C18,2.1*30mm;HPLC:RT=9.93分,純度90%を使用。HPLC方法A:カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μm;2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持を使用。
図18は、本開示に従ったGLP1ペプチド模倣ペイロードP20及びP21の固相合成のための工程のシーケンスを表す。
3.30(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-(4-アミノブトキシ)-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[2-[[(2S)-2,5-ジアミノ-5-オキソペンタノイル]アミノ]アセチル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-(2-フルオロフェニル)-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(P20)の調製
対応するaa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(17,175.17μmol)及びaa26(193.59mg,525.51μmol,3当量)から出発して、対応するaa26-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(38,175.17μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応するaa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(17,175.17μmol)及びaa26(193.59mg,525.51μmol,3当量)から出発して、対応するaa26-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(38,175.17μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応する樹脂結合ペプチド38(175.17μmol)を、一般的手順に従ってさらに切断し、白色固体として粗生成物を得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:Waters Xbridge Prep OBD C18 150*40mm*10μm;移動相:[水(10mM NH4HCO3)-ACN];B%:0%~90%,25分)で精製し、P20(4.65mg,3.35μmol,純度95.77%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=0.789分,mass calcd.for C66H93FN12O16,664.34 m/z [M+2H]2+,found 665.0 m/z[M+2H]2+;LC-MS:MERCK,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
LCMS:(ESI):RT=1.362分,mass calcd.for C66H92FN12O16 1327.67m/z [M+H]+;found 1327.7m/z [M+H]+;LC-MS:移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、2分間の10%~80%勾配(溶媒B)及び80%で0.48分間保持を使用。
HPLC:RT=7.40分。移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持;カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μm;波長:UV220nm&215nm&254nm;カラム温度:40℃を使用。
3.31(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-(4-アミノブトキシ)-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[2-[[(2S)-5-アミノ-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-5-オキソ-ペンタノイル]アミノ]アセチル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-(2-フルオロフェニル)-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(P21)の調製
対応するaa26-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物38(175.17μmol)及びaa10(163.80mg,350.34μmol,2当量)から出発して、対応するaa10-aa26-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(39,175.17μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応するaa26-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂化合物38(175.17μmol)及びaa10(163.80mg,350.34μmol,2当量)から出発して、対応するaa10-aa26-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2b-aa1ペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(39,175.17μmol)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応する樹脂結合ペプチド39(175.17μmol)を、一般的手順に従ってさらに切断し、白色固体として粗生成物を得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:Waters Xbridge Prep OBD C18 150*40mm*10μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%~45%,20分)で精製し、P21(20mg,12.94μmol,収率7.39%,純度99.31%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=0.833分,mass calcd.for C76H106FN15O18,767.89m/z[M+2H]2+,found 768.3m/z[M+2H]2+;LC-MS:MERCK,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:RT=7.44分。移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持;カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μm;波長:220nm&215nm&254nm;カラム温度:40℃を使用。
図19は、本開示に従ったGLP1ペプチド模倣ペイロードP22及びP23の固相合成のための工程のシーケンスを表す。
3.32(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-(4-アミノブトキシ)-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-アニリノ-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(P22)の調製
対応するaa10-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3ペプチジル2-クロロトリチルクロリド樹脂47を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応するaa10-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3ペプチジル2-クロロトリチルクロリド樹脂47を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応する樹脂結合ペプチド(47,553.98μmol)の混合物に、DCM(8mL)中のTFE(2.61g,26.09mmol,1.88mL,47.09当量)及びAcOH(1.97g,32.83mmol,1.88mL,59.26当量)を、25℃、N2下で一度に加えた。混合物を25℃で2時間振盪した。LCMSのトレースは、反応が完了したことを示した。混合物を濾過し、ケーキをDCM(5mL×3)で洗浄した。濾液を真空状態で濃縮して黄色油を得た。これを水(5mL)で希釈した。NaHCO3飽和水溶液を用いて混合物のpHを8に調整し、黄色固体を沈殿させた。混合物を濾過し、ケーキを水(5mL×2)で洗浄し、真空状態で乾燥して粗生成物(550mg,粗)を黄色固体として得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:Xtimate C18 150*25mm*5μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:48%~58%,11分)で精製し、化合物47(220mg,122.65μmol,収率36.10%,純度82.05%)をオフホワイト色の固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=1.073分,mass calcd.for C76H104FN14O15 1471.78,m/z [M-C19H13Cl+2H]+,m/z found 1471.65;[M-C19H13Cl+2H]+リンク2-[クロロ(ジフェニル)メチル]ベンゼン(C19H13Cl,正確な質量=276.1);Chromolith Flash RP-18e 25-3mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LC-MSを実施し、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
LCMS:(ESI):RT=1.079分,mass calcd.for C76H104FN14O15 1471.78 m/z[M-C19H13Cl+2H]+,m/z found 1471.8;[M-C19H13Cl+2H]+,リンク2-[クロロ(ジフェニル)メチル]ベンゼン(C19H13Cl,正確な質量=276.1);Chromolith Flash RP-18e 25-3mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LC-MSを実施し、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:RT=10.96分。HPLC:カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μm;2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ML/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持。
CHCl3(0.225mL)及びDMF(0.025mL)中の化合物47(37.37μmol)とHOBt(5.05mg,37.37μmol,1当量)の溶液に、aa27(19.87mg,37.37μmol,1当量)を20℃で加えた。CHCl3(0.225mL)及びDMF(0.025mL)中のDIC(4.72mg,37.37μmol,5.79μL,1当量)の溶液を混合物に加えた。反応物を20℃で16時間撹拌した。LCMSのトレースは、反応が完了したことを示した。反応物を真空状態で濃縮し、褐色油として粗生成物48(74.2mg,37.37μmol)を得た。これをさらなる精製なしに次の工程に使用した。
LCMS:(ESI):RT=1.215分,mass calcd.for C108H144FN17O18 993.05 m/z[M+2H]2+,m/z found 993.8m/z[M+2H]2+;Chromolith Flash RP-18e 25-3mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LC-MSを実施し、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
化合物48(74.2mg,37.37μmol,1当量)の混合物に、TFA(2mL)及びH2O(0.06mL)中のトリイソプロピルシラン(137.30mg,867.01μmol,178.08μL,23.20当量)を25℃、N2下で一度に加えた。混合物を15℃、2.5時間で静置した。LCMSのトレースは、反応が完了したことを示した。混合物を真空状態で濃縮し、黄色油として粗生成物を得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:Waters Xbridge Prep OBD C18 150*30mm,10μm;移動相:[水(10mM NH4HCO3)-ACN];B%:28%~58%,11分)で精製し、化合物P22(7.5mg,5.18μmol,収率13.86%,純度97.96%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=0.811分,mass calcd.for C68H90FN17O16 709.84 m/z[M+2H]2+,m/z found 710.2[M+2H]2+;Chromolith Flash RP-18e 25-3mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LC-MSを実施し、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:RT=7.06分。HPLC:カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μm;2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ML/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持。
3.33(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-(4-アミノブトキシ)-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-4-(3,5-ジメチルフェニル)-1-(フェニルカルバモイル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ] アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(P23)の調製
CHCl3(0.225mL)及びDMF(0.025mL)中の47(27.18μmol)とHOBt(3.67mg,27.18μmol,1当量)の溶液に、aa28(19.98mg,27.18μmol,1当量)を20℃で加えた。CHCl3(0.225mL)及びDMF(0.025mL)中のDIC(3.43mg,27.18μmol,4.21μL,1当量)の溶液を混合物に加えた。反応物を20℃で16時間撹拌した。LCMSのトレースは、反応が完了したことを示した。反応物を真空状態で濃縮し、褐色油として粗生成物49(59.49mg,27.18μmol)を得た。これをさらなる精製なしに次の工程に使用した。
CHCl3(0.225mL)及びDMF(0.025mL)中の47(27.18μmol)とHOBt(3.67mg,27.18μmol,1当量)の溶液に、aa28(19.98mg,27.18μmol,1当量)を20℃で加えた。CHCl3(0.225mL)及びDMF(0.025mL)中のDIC(3.43mg,27.18μmol,4.21μL,1当量)の溶液を混合物に加えた。反応物を20℃で16時間撹拌した。LCMSのトレースは、反応が完了したことを示した。反応物を真空状態で濃縮し、褐色油として粗生成物49(59.49mg,27.18μmol)を得た。これをさらなる精製なしに次の工程に使用した。
LCMS:(ESI):RT=1.223分,mass calcd.for C116H154FN18O17 1045.09 m/z[M-Boc+3H]2+,m/z found 1044.8[M-Boc+2H]2+;Chromolith Flash RP-18e 25-3mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LC-MSを実施し、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
化合物49(59.49mg,27.18μmol,1当量)の混合物に、TFA(6mL)及びH2O(0.17mL)中のトリイソプロピルシラン(131.07mg,827.67μmol,0.17mL,30.45当量)を15℃、N2下で一度に加えた。混合物を15℃、2.5時間で静置した。LCMSのトレースは、反応が完了したことを示した。混合物を真空状態で濃縮し、黄色油として粗生成物を得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:Xtimate C18 10μm,250mm*50mm;移動相:[水(0.04%NH3H2O+10mM NH4HCO3)-ACN];B%:25%~55%,8分)で精製し、化合物P23(7.5mg,4.60μmol,収率16.91%,純度99.38%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=0.875分,mass calcd.for C81H107FN18O17 811.4 m/z[M+2H]2+,m/z found 811.9[M+2H]2+;Chromolith Flash RP-18e 25-3mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LC-MSを実施し、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
LCMS:(ESI):RT=0.882分,mass calcd.for C81H107FN18O17 811.4 m/z[M+2H]2+,m/z found 811.8[M+2H]2+;Chromolith Flash RP-18e 25-3mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LC-MSを実施し、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:RT=8.30分。HPLC:カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μm;2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持。
図20は、本開示に従ったGLP1ペプチド模倣ペイロードP24の固相合成のための工程のシーケンスを表す。
3.34(3S)-4-[[(1S)-2-[[(1S)-4-[4-(4-アミノブトキシ)フェニル]-1-カルバモイル-ブチル]アミノ]-1-[[4-(2-エチル-4-メトキシ-フェニル)フェニル]メチル]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2R,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(P24)の調製
対応するaa10-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2c-aa1bペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(59)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応するaa10-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2c-aa1bペプチジルリンクアミドMBHA樹脂(59)を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。
対応する樹脂結合ペプチド59を、一般的手順に従ってさらに切断し、白色固体として粗生成物を得た。粗生成物を分取HPLC(カラム:移動相:[水(10mM NH4HCO3)-ACN];B%:15%~45%,55分)で精製し、純粋な生成物を得た。生成物を水(20mL)中に懸濁し、混合物をドライアイス/アセトン浴で凍結させ、続いて凍結乾燥で乾燥させて所望の生成物を得た。化合物P24(50mg,29.69μmol,収率6.76%,純度98.686%,TFA塩)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=0.821分,mass calcd.for C74H99FN18O18 1546.74[M+H]+,773.4[M+H]2+,m/z found 774.8[M+H]2+。Chromolith Flash RP-18e 25-2mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LC-MSを実施し、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
図21は、本開示に従ったGLP1ペプチド模倣ペイロードP32、P33、P34及びP35の固相合成のための工程のシーケンスを表す。
3.35(8S,14S,17S,20S,23S,26S)-8-((2H-テトラゾール-5-イル)メチル)-26-(((S)-1-(((S)-1-アミノ-5-(4-(アミノメチル)フェニル)-1-オキソペンタン-2-イル)アミノ)-3-(4’-(4-アジドブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)-1-オキソプロパン-2-イル)カルバモイル)-17-(2-フルオロベンジル)-14,20-ビス((R)-1-ヒドロキシエチル)-23-(ヒドロキシメチル)-1-(1H-イミダゾール-5-イル)-5,5,17-トリメチル-4,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキソ-3,7,10,13,16,19,22,25-オクタアザオクタコサン-28-酸(P24A)の調製
3.35(8S,14S,17S,20S,23S,26S)-8-((2H-テトラゾール-5-イル)メチル)-26-(((S)-1-(((S)-1-アミノ-5-(4-(アミノメチル)フェニル)-1-オキソペンタン-2-イル)アミノ)-3-(4’-(4-アジドブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)-1-オキソプロパン-2-イル)カルバモイル)-17-(2-フルオロベンジル)-14,20-ビス((R)-1-ヒドロキシエチル)-23-(ヒドロキシメチル)-1-(1H-イミダゾール-5-イル)-5,5,17-トリメチル-4,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキソ-3,7,10,13,16,19,22,25-オクタアザオクタコサン-28-酸(P24A)の調製
Liberty Lite Automated Microwaveペプチド合成装置を使用し、0.5mmolでペプチド伸長反応を実施した。ポリプロピレン固相反応容器に、リンクアミドMBHA樹脂(0.5mmol,1当量)を加えた。樹脂を2回、以下のように洗浄した:容器上部を通しDMF(10mL)を反応容器に加え、混合物を5分間撹拌し、その後溶媒を、フリットを通して排出した。
各アミノ酸の一般的なカップリング反応を、Fmoc基除去の一般的手順の後に実施した。A)Fmoc基を一般的な除去手順:前の工程から樹脂を含有する反応容器に、ピペリジン:DMF(1:4v/v,5mL)を加えた。混合物をマイクロ波で90℃、2分間撹拌し、続いて溶液をフリットを通して排出した。樹脂を5回、以下のように洗浄した:各洗浄では、DMF(5mL)を容器上部を通して加え、得られた混合物を0.5分間にわたって定期的に撹拌し、その後溶液をフリットを通して排出した。B)一般的なカップリング反応手順:
反応容器にアミノ酸(DMF中0.2M,12.5mL,5当量)を加え、続いてDIC(DMF中0.5M,4mL,4当量)及びオキシマ(DMF中0.5M,2mL,2当量)を加えた。混合物を90℃、マイクロ波下で10分間撹拌し、続いてフリットを通して反応溶液を排出した。樹脂を4回、以下のように洗浄した:各洗浄では、DMF(8mL)を容器上部を通して加え、得られた混合物を0.5分間にわたって定期的に撹拌し、その後溶液をフリットを通して排出した。合成の完了後、樹脂をDMF(6×6mL)、続いてCH2Cl2(6×6mL)で完全にすすいだ。TFAカクテル(TFA/TIPS/H2O=95:2.5:2.5)を使用することで得られた樹脂を2時間酸性切断に供し、続いてこれを濾過し、濾液をt-BuOMeで希釈して沈殿を得た。これを10分間遠心分離(5000R)にかけ、デカントして粗生成物を得た。
対応するaa10-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-aa2-aa1bペプチジルリンクアミドMBHA樹脂を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。粗生成物を、分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini-NX C18 80*30mm*5μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:5%~55%,8分)で精製し、純粋な生成物P24A(50mg,31.79μmol,収率41.80%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=2.913分,m/z calcd.C75H101FN20O17 786.37,found 786.9[M+2H]2+。LCMS条件:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、6分間の10%~80%の勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持;カラム:Xtimate 3μm,C18,2.1*30mmを使用。
HPLC:RT=7.44分、純度99.18%。HPLC方法A:カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μm;2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持。
3.36(8S,14S,17S,20S,23S,26S)-8-((2H-テトラゾール-5-イル)メチル)-26-(((S)-1-(((S)-1-アミノ-5-(4-(13-アミノ-3,6,9,12-テトラオキソ-2,5,8,11-テトラアザトリデシル)フェニル)-1-オキソペンタン-2-イル)アミノ)-3-(4’-(4-アジドブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)-1-オキソプロパン-2-イル)カルバモイル)-17-(2-フルオロベンジル)-14,20-ビス((R)-1-ヒドロキシエチル)-23-(ヒドロキシメチル)-1-(1H-イミダゾール-5-イル)-5,5,17-トリメチル-4,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキソ-3,7,10,13,16,19,22,25-オクタアザオクタコサン-28-酸(P32)の調製
3.36(8S,14S,17S,20S,23S,26S)-8-((2H-テトラゾール-5-イル)メチル)-26-(((S)-1-(((S)-1-アミノ-5-(4-(13-アミノ-3,6,9,12-テトラオキソ-2,5,8,11-テトラアザトリデシル)フェニル)-1-オキソペンタン-2-イル)アミノ)-3-(4’-(4-アジドブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)-1-オキソプロパン-2-イル)カルバモイル)-17-(2-フルオロベンジル)-14,20-ビス((R)-1-ヒドロキシエチル)-23-(ヒドロキシメチル)-1-(1H-イミダゾール-5-イル)-5,5,17-トリメチル-4,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキソ-3,7,10,13,16,19,22,25-オクタアザオクタコサン-28-酸(P32)の調製
DMF(2mL)中のP24A(20mg,12.72μmol,1当量)の溶液に、P32-1(7.13mg,15.26μmol,1.2当量)及びDIPEA(3.29mg,25.43μmol,4.43μL,2.0当量)を加えた。溶液を20℃で2時間撹拌した。完了後、水(6mL)を加え、混合物を凍結乾燥して白色固体(25mg,粗)を得た。これをDCM(2.5mL)中に加え、続いてTFA(3.85g,33.77mmol,2.5mL,2567.52当量)を加えた。溶液を20℃で2時間撹拌した。完了後、減圧下で溶液の溶媒を除去し、粗生成物を得た。これを、分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini-NX 80*40mm*3μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:5%~45%,30分)で精製した。P32(7.2mg,3.60μmol,収率27.36%、純度90%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):Rt=2.880分,mass calcd.for C82H112FN25O21901.20,found 900.91[M+2H]2+;Chromolith Flash RP-C18 25-3mmを使用し、流量0.8ml/分で逆相LCMSを実施し、0.02%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:RT=7.23分、純度100%。HPLC方法A:カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μm;2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持。
3.37(8S,14S,17S,20S,23S,26S)-8-((2H-テトラゾール-5-イル)メチル)-26-(((S)-1-(((S)-1-アミノ-5-(4-(17-ヒドロキシ-3-オキソ-6,9,12,15-テトラオキサ-2-アザヘプタデシル)フェニル)-1-オキソペンタン-2-イル)アミノ)-3-(4’-(4-アジドブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)-1-オキソプロパン-2-イル)カルバモイル)-17-(2-フルオロベンジル)-14,20-ビス((R)-1-ヒドロキシエチル)-23-(ヒドロキシメチル)-1-(1H-イミダゾール-5-イル)-5,5,17-トリメチル-4,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキソ-3,7,10,13,16,19,22,25-オクタアザオクタコサン-28-酸(P33)の調製
3.37(8S,14S,17S,20S,23S,26S)-8-((2H-テトラゾール-5-イル)メチル)-26-(((S)-1-(((S)-1-アミノ-5-(4-(17-ヒドロキシ-3-オキソ-6,9,12,15-テトラオキサ-2-アザヘプタデシル)フェニル)-1-オキソペンタン-2-イル)アミノ)-3-(4’-(4-アジドブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)-1-オキソプロパン-2-イル)カルバモイル)-17-(2-フルオロベンジル)-14,20-ビス((R)-1-ヒドロキシエチル)-23-(ヒドロキシメチル)-1-(1H-イミダゾール-5-イル)-5,5,17-トリメチル-4,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキソ-3,7,10,13,16,19,22,25-オクタアザオクタコサン-28-酸(P33)の調製
DMF(0.3mL)中のP24A(10mg,6.36μmol,1当量)の溶液に、P33-1(2.96mg,7.63μmol,1.2当量)及びDIPEA(1.64mg,12.72μmol,2.22μL,2.0当量)を加えた。溶液を20℃で2時間撹拌した。完了後、反応混合物を分取HPLC(TFA条件,カラム:Boston Green ODS 150*30mm*5μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:14%~54%,9分)で精製し、P33(2.0mg,1.13μmol,収率17.69%,純度95%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):Rt=3.383分,mass calcd.for C85H120FN21O23 911.40 found 911.40[M+2H]2+;Chromolith Flash RP-C18 25-3mmを使用し、流量0.8ml/分で逆相LCMSを実施し、0.02%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:RT=7.96分、純度95.47%。HPLC方法A:カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μm;2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持。
3.38(8S,14S,17S,20S,23S,26S)-8-((2H-テトラゾール-5-イル)メチル)-26-(((S)-1-(((S)-1-アミノ-5-(4-(29,29-ジメチル-3,6,9,12,15,18,21,24,27-ノナオキサ-28-oxa-2,5,8,11,14,17,20,23,26-ノナアザトリアコンチル)フェニル)-1-オキソペンタン-2-イル)アミノ)-3-(4’-(4-アジドブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)-1-オキソプロパン-2-イル)カルバモイル)-17-(2-フルオロベンジル)-14,20-ビス((R)-1-ヒドロキシエチル)-23-(ヒドロキシメチル)-1-(1H-イミダゾール-5-イル)-5,5,17-トリメチル-4,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキソ-3,7,10,13,16,19,22,25-オクタアザオクタコサン-28-酸(P34)の調製
3.38(8S,14S,17S,20S,23S,26S)-8-((2H-テトラゾール-5-イル)メチル)-26-(((S)-1-(((S)-1-アミノ-5-(4-(29,29-ジメチル-3,6,9,12,15,18,21,24,27-ノナオキサ-28-oxa-2,5,8,11,14,17,20,23,26-ノナアザトリアコンチル)フェニル)-1-オキソペンタン-2-イル)アミノ)-3-(4’-(4-アジドブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)-1-オキソプロパン-2-イル)カルバモイル)-17-(2-フルオロベンジル)-14,20-ビス((R)-1-ヒドロキシエチル)-23-(ヒドロキシメチル)-1-(1H-イミダゾール-5-イル)-5,5,17-トリメチル-4,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキソ-3,7,10,13,16,19,22,25-オクタアザオクタコサン-28-酸(P34)の調製
DMF(1mL)中のP32(5mg,2.78μmol,1当量)の溶液に、P32-1(1.56mg,3.33μmol,1.2当量)及びDIPEA(717.64ug,5.55μmol,9.67e-1μL,2.0当量)を加えた。溶液を20℃で2時間撹拌した。完了後、水(6mL)を加え、混合物を凍結乾燥して白色固体(25mg,粗)を得た。これをDCM(0.2mL)中に加え、続いてTFA(256.67mg,2.25mmol,166.67μL,958.60当量)を加えた。溶液を20℃で2時間撹拌した。完了後、減圧下で溶液の溶媒を除去し、粗生成物を得た。これを、分取HPLC(カラム:Waters Xbridge BEH C18 100*25mm*5μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:10%)で精製した。P34(1.72mg,7.63e-1μmol,収率32.49%、純度90%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):Rt=2.760分,mass calcd.for C90H124FN29O25 1014.98 found 1015.20[M+2H]2+;Chromolith Flash RP-C18 25-3mmを使用し、流量0.8ml/分で逆相LCMSを実施し、0.02%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:RT=7.15分、純度100%。HPLC方法A:カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μm;2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5 ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持。
3.39(8S,14S,17S,20S,23S,26S)-8-((2H-テトラゾール-5-イル)メチル)-26-(((S)-1-(((S)-1-アミノ-5-(4-(17-ヒドロキシ-3-オキソ-6,9,12,15-テトラオキサ-2-アザヘプタデシル)フェニル)-1-オキソペンタン-2-イル)アミノ)-3-(4’-(4-アジドブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)-1-オキソプロパン-2-イル)カルバモイル)-17-(2-フルオロベンジル)-14,20-ビス((R)-1-ヒドロキシエチル)-23-(ヒドロキシメチル)-1-(1H-イミダゾール-5-イル)-5,5,17-トリメチル-4,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキソ-3,7,10,13,16,19,22,25-オクタアザオクタコサン-28-酸(P35)の調製
3.39(8S,14S,17S,20S,23S,26S)-8-((2H-テトラゾール-5-イル)メチル)-26-(((S)-1-(((S)-1-アミノ-5-(4-(17-ヒドロキシ-3-オキソ-6,9,12,15-テトラオキサ-2-アザヘプタデシル)フェニル)-1-オキソペンタン-2-イル)アミノ)-3-(4’-(4-アジドブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)-1-オキソプロパン-2-イル)カルバモイル)-17-(2-フルオロベンジル)-14,20-ビス((R)-1-ヒドロキシエチル)-23-(ヒドロキシメチル)-1-(1H-イミダゾール-5-イル)-5,5,17-トリメチル-4,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキソ-3,7,10,13,16,19,22,25-オクタアザオクタコサン-28-酸(P35)の調製
DMF(0.3mL)中のP24A(20mg,12.72μmol,1当量)の溶液に、P35-1(10.75mg,19.08μmol,1.5当量)及びDIPEA(3.29mg,25.43μmol,4.43μL,2.0当量)を加えた。溶液を20℃で2時間撹拌した。完了後、反応混合物を分取HPLC(カラム:Boston Green ODS 150*30mm*5μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:14%~54%,9分)で精製し、P33(20mg,10.01μmol,収率78.75%,純度100%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):Rt=3.325分,mass calcd.for C93H136FN21O27 998.98 found 999.40[M+2H]2+;Chromolith Flash RP-C18 25-3mmを使用し、流量0.8ml/分で逆相LCMSを実施し、0.02%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:RT=7.88分、純度100%。HPLC方法A:カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μm;2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持。
図22は、P39の合成のためのシーケンスを表す。
(3S,6S,9S,12S,15S,21S,27S)-21-((2H-テトラゾール-5-イル)メチル)-27-アミノ-3-(((S)-1-(((S)-1-アミノ-5-(4-(アミノメチル)フェニル)-1-オキソペンタン-2-イル)アミノ)-3-(4-ヒドロキシフェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)カルバモイル)-12-(2-フルオロベンジル)-9,15-ビス((R)-1-ヒドロキシエチル)-6-(ヒドロキシメチル)-28-(4-ヒドロキシフェニル)-12,24,24-トリメチル-5,8,11,14,17,20,23,26-オクタオキソ-4,7,10,13,16,19,22,25-オクタアザオクタコサン-1-酸(P39)の調製
(3S,6S,9S,12S,15S,21S,27S)-21-((2H-テトラゾール-5-イル)メチル)-27-アミノ-3-(((S)-1-(((S)-1-アミノ-5-(4-(アミノメチル)フェニル)-1-オキソペンタン-2-イル)アミノ)-3-(4-ヒドロキシフェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)カルバモイル)-12-(2-フルオロベンジル)-9,15-ビス((R)-1-ヒドロキシエチル)-6-(ヒドロキシメチル)-28-(4-ヒドロキシフェニル)-12,24,24-トリメチル-5,8,11,14,17,20,23,26-オクタオキソ-4,7,10,13,16,19,22,25-オクタアザオクタコサン-1-酸(P39)の調製
Liberty Lite Automated Microwaveペプチド合成装置を使用し、0.5mmolでペプチド伸長反応を実施した。ペプチド合成装置での標準操作に従い、a)脱保護:20%ピペリジン/DMF(5mL)の溶液を樹脂容器に加え、90℃、N2で2分間撹拌した。続いて容器からこれを排出し、DMF(3mL×3)を用いて20℃で洗浄した。b)カップリング(各アミノ酸は5.0当量で3つ組で反応した):DMF(5mL)、DIC(2mL)及びオキシマ(1mL)中のアミノ酸(2.5mmol,5当量)の溶液を容器に加え、90℃、N2で10分間撹拌した。全てのアミノ酸についてa)及びb)を繰り返す。TFAカクテル(TFA/TIPS/H2O=95:2.5:2.5)を使用することで樹脂を酸性切断に供し、続いてこれを濾過し、濾液をt-BuOMeで希釈して沈殿を得た。これを10分間遠心分離(5000R)にかけて粗生成物を得た。
対応するaa24-aa25-aa9-aa8-aa7-aa6-aa5-aa4-aa3-Y-aa1bペプチジルリンクアミドMBHA樹脂を、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。粗生成物を、分取HPLC(カラム:Boston Prime C18 150*30mm*5μm;移動相:[水(0.05v/v%水酸化アンモニウム)-ACN];B%:0%~35%,9分)で精製し、純粋な生成物P39(15mg,9.35μmol,収率9.35%,純度88%)を白色固体として得た。生成物を、分取HPLC(カラム:Welch Xtimate C18 100*40mm*3μm;移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:5%~45%,12分)で精製し、生成物(10mg,6.96μmol,収率65.51%,純度98.26%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=1.573分,m/z calcd.for C65H87FN17O18 [M+H]+1412.63,C65H88FN17O18 [M+2H]2+707.81,found C65H87FN17O18 [M+H]+1412.70,C65H88FN17O18 [M+2H]2+707.30 found。LCMS条件:Chromolith Flash RP-C18 25-3mmカラムを使用し、流量0.8ml/分で逆相LCMSを実施し、0.02%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:RT=4.72分,純度98.26% LC方法A:カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μm;2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5mL/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持。
実施例4.リンカーの合成
4.1 PEGリンカーの調製
以下のスキーム20は、PEGnリンカー(n=4、8、12及び24)の合成を表す:
4.1 PEGリンカーの調製
以下のスキーム20は、PEGnリンカー(n=4、8、12及び24)の合成を表す:
例として、n=8のPEGnリンカーの合成を提供する。他の長さのリンカーを同一の様式で調製した。L1((11,12-ジデヒドロジベンゾ[b,f]アゾシン-5(6H)-イル)-4-オキソブタン酸)の合成は、L.S.Campbell-Verduyn,L.Mirfeizi,A.K.Schoonen,R.A.Dierckx,P.H.Elsinga,and B.L.Feringa,Strain-Promoted Copper-Free ”Click” Chemistry for 18F Radiolabeling of Bombesin.Angew.Chem.Int.Ed.,Vol.50,No.47,2011,11117-11120に従って実施した。
工程1:2,5-ジオキソピロリジン-1-イル-4-(ジデヒドロジベンゾ[b,f]アゾシン-5(6H)-イル)-4-オキソブタノアート(L2)の合成
DCM(4mL)中のL1(0.35g,1.15mmol,1当量)の溶液に、HOSu(158.31mg,1.38mmol,1.2当量)及びEDCI(263.70mg,1.38mmol,1.2当量)を加えた。混合物を20℃で1時間撹拌した。TLC(PE:EtOAc=1:1)は、反応物の完全な消費を示した。混合物を濾過し、濃縮して残渣を得た。残渣をカラムクロマトグラフィー(SiO2,石油エーテル/酢酸エチル=3/1~1/1)で精製した。所望の化合物L2(450mg,1.12mmol,収率97.56%)を白色固体として得た。
DCM(4mL)中のL1(0.35g,1.15mmol,1当量)の溶液に、HOSu(158.31mg,1.38mmol,1.2当量)及びEDCI(263.70mg,1.38mmol,1.2当量)を加えた。混合物を20℃で1時間撹拌した。TLC(PE:EtOAc=1:1)は、反応物の完全な消費を示した。混合物を濾過し、濃縮して残渣を得た。残渣をカラムクロマトグラフィー(SiO2,石油エーテル/酢酸エチル=3/1~1/1)で精製した。所望の化合物L2(450mg,1.12mmol,収率97.56%)を白色固体として得た。
工程2:3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[4-(39-アザトリシクロヘキサデカ-(4),1(5),2(6),3(7),31,33-ヘキサエン-9-イン-39-イル)-4-オキソ-ブタノイル]アミノ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパン酸(L4)の合成
DMF(0.5mL)中のL2(54.68mg,135.90μmol,1.5当量)の溶液に、L3(n=8,40mg,90.60μmol,1当量)及びDIPEA(58.54mg,452.99μmol,78.90μL,5当量)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。LCMSのトレースは、反応物の完全な消費及び所望の質量の形成を示した。混合物を濾過し、分取HPLC(AcOH 0.3%,MeCN/H2O,0~43%,25mL/分,15分)で精製した。所望のL4(60mg,74.09μmol,収率81.78%、純度90%)を淡黄色の油として得た。
DMF(0.5mL)中のL2(54.68mg,135.90μmol,1.5当量)の溶液に、L3(n=8,40mg,90.60μmol,1当量)及びDIPEA(58.54mg,452.99μmol,78.90μL,5当量)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。LCMSのトレースは、反応物の完全な消費及び所望の質量の形成を示した。混合物を濾過し、分取HPLC(AcOH 0.3%,MeCN/H2O,0~43%,25mL/分,15分)で精製した。所望のL4(60mg,74.09μmol,収率81.78%、純度90%)を淡黄色の油として得た。
LCMS(ESI):RT=0.900分,mass calcd.for C38H53N2O12 729.36,m/z found 729.3[M+H]+。MERCK,RP-18e 25-2mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LC-MSを実施し、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
工程3:(2,5-ジオキソピロリジン-1-イル)3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[4-(43-アザトリシクロヘキサデカ-(4),1(5),2(6),3(7),33,35-ヘキサエン-11-イン-43-イル)-4-オキソ-ブタノイル]アミノ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパノアート(L5)の合成
DCM(0.5mL)中のL4(20mg,27.44μmol,1当量)の溶液に、HOSu(6.32mg,54.88μmol,2当量)及びDCC(8.49mg,41.16μmol,8.33μL,1.5当量)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。LCMSのトレースは、反応物の完全な消費及び所望の質量の形成を示した。混合物を濾過し、分取HPLC(AcOH 0.3%,MeCN/H2O,0~65%,18mL/分,15分)で精製した。所望の化合物L5(18mg,17.87μmol,収率65.13%、純度82%)を淡黄色の油として得た。
DCM(0.5mL)中のL4(20mg,27.44μmol,1当量)の溶液に、HOSu(6.32mg,54.88μmol,2当量)及びDCC(8.49mg,41.16μmol,8.33μL,1.5当量)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。LCMSのトレースは、反応物の完全な消費及び所望の質量の形成を示した。混合物を濾過し、分取HPLC(AcOH 0.3%,MeCN/H2O,0~65%,18mL/分,15分)で精製した。所望の化合物L5(18mg,17.87μmol,収率65.13%、純度82%)を淡黄色の油として得た。
LCMS(ESI):RT=0.920分,mass calcd.for C42H55N3O14 825.37,m/z found 848.2[M+Na]+。MERCK,RP-18e 25-2mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LC-MSを実施し、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
4.2 ペプチドリンカーL8の調製
以下のスキーム21は、SG4-SHペプチドリンカーL8の合成を表す:
以下のスキーム21は、SG4-SHペプチドリンカーL8の合成を表す:
以下、参考文献として、D.Crich,K.Sana,and S.Guo,Amino Acid and Peptide Synthesis and Functionalization by the Reaction of Thioacids with 2,4-Dinitrobenzenesulfonamides.Org.Lett.,Vol.9,No.22,2007,4423-4426 and X.Y.Wu,J.L.Stockdill,P.K.Park,J.Samuel,and S.J.Danishefsky,Expanding the Limits of Isonitrile-Mediated Amidations:On the Remarkable Stereosubtleties of Macrolactam Formation from Synthetic Seco-Cyclosporins.J.Am.Chem.Soc.,Vol.134,No.4,2012,2378-2384を参照されたい。
工程1:(S)-S-((9H-フルオレン-9-イル)メチル)6-(tert-ブトキシメチル)-2,2-ジメチル-4,7,10,13,16-ペンタオキソ-3-オキサ-5,8,11,14,17-ペンタアザノナデカン-19-チオアート(L8-3)
DMF(7mL)中のL8-1(700mg,1.43mmol,1当量)の溶液に、4Aモレキュラーシーブ(1g)及びL8-2(455.40mg,2.14mmol,1.5当量)を加え、混合物を-20℃で撹拌した。15分後、PyBOP(1.12g,2.14mmol,1.5当量)及びDIPEA(369.63mg,2.86mmol,498.15μL,2当量)を加え、反応混合物を-20℃で1.5時間撹拌した。LCMSのトレースは、反応が完全に変換したことを示した。反応物をEtOAc(30mL)で希釈して濾過し、ケーキをEtOAc(10mL*2)で洗浄した。濾液を、NH4Cl水溶液(20mL)、水(20mL)、塩水(20mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥し、濾過して真空状態で濃縮し、黄色油として粗生成物を得た。その残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);40gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~20%MeOH/DCMの溶出勾配(30mL/分))で精製し、淡黄色油としてL8-3(700mg,814.78μmol,収率56.98%,純度79.594%)を得た。
DMF(7mL)中のL8-1(700mg,1.43mmol,1当量)の溶液に、4Aモレキュラーシーブ(1g)及びL8-2(455.40mg,2.14mmol,1.5当量)を加え、混合物を-20℃で撹拌した。15分後、PyBOP(1.12g,2.14mmol,1.5当量)及びDIPEA(369.63mg,2.86mmol,498.15μL,2当量)を加え、反応混合物を-20℃で1.5時間撹拌した。LCMSのトレースは、反応が完全に変換したことを示した。反応物をEtOAc(30mL)で希釈して濾過し、ケーキをEtOAc(10mL*2)で洗浄した。濾液を、NH4Cl水溶液(20mL)、水(20mL)、塩水(20mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥し、濾過して真空状態で濃縮し、黄色油として粗生成物を得た。その残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);40gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、0~20%MeOH/DCMの溶出勾配(30mL/分))で精製し、淡黄色油としてL8-3(700mg,814.78μmol,収率56.98%,純度79.594%)を得た。
LCMS:(ESI):RT=0.882分,m/z calcd.for C29H38N5O6S,584.25[M-Boc+2H]2+,m/z found 584.3[M-Boc+2H]2+;Merck,RP-18e 25-2mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LCMSを実施し、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
1H NMR(400MHz,メタノール-d4)δ=7.78(d,J=7.3Hz,2H),7.66(d,J=7.2Hz,2H),7.42-7.29(m,4H),4.15(d,J=5.0Hz,2H),4.04(s,2H),3.92(d,J=4.3Hz,6H),3.68-3.57(m,4H),3.38-3.35(m,3H),1.46(s,9H),1.19(s,10H)。
工程2:(S)-6-(tert-ブトキシメチル)-2,2-ジメチル-4,7,10,13,16-ペンタオキソ-3-オキサ-5,8,11,14,17-ペンタアザノナデカン-19-チオS-酸(L8)
THF(7mL)中のL8-3(560mg,818.94μmol,1当量)の溶液に、ピペリジン(139.46mg,1.64mmol,161.75μL,2当量)を20℃で加えた。反応物を20℃で2時間撹拌した。LCMSのトレースは、反応が完全に変換したことを示した。反応物にMTBE(50mL)を加え、白色固体を沈殿させた。混合物を濾過して、オフホワイト色の固体として粗生成物を得た。粗生成物を、分取HPLC(逆相カラム,40g,0%~35% 0.4%AcOH水溶液/ACN,15分)をL8(180mg,252.88μmol,収率30.88%,純度71.028%)をオフホワイト色の固体として得た。
THF(7mL)中のL8-3(560mg,818.94μmol,1当量)の溶液に、ピペリジン(139.46mg,1.64mmol,161.75μL,2当量)を20℃で加えた。反応物を20℃で2時間撹拌した。LCMSのトレースは、反応が完全に変換したことを示した。反応物にMTBE(50mL)を加え、白色固体を沈殿させた。混合物を濾過して、オフホワイト色の固体として粗生成物を得た。粗生成物を、分取HPLC(逆相カラム,40g,0%~35% 0.4%AcOH水溶液/ACN,15分)をL8(180mg,252.88μmol,収率30.88%,純度71.028%)をオフホワイト色の固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=0.709分,m/z calcd.for C15H28N5O6S,406.18[M-Boc+2H]+,m/z found 406.2[M-Boc+2H]+;Merck,RP-18e 25-2mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LCMSを実施し、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
4.3 ペプチドリンカーL9の調製
以下のスキーム22は、SG4-SHペプチドリンカーL8の合成を表す:
以下のスキーム22は、SG4-SHペプチドリンカーL8の合成を表す:
糖ペプチドL13-3aを、J.J.Du,X.F.Gao,L.M.Xin,Z.Lei,Z.Liu,and J.Guo,Convergent Synthesis of N-Linked Glycopeptides via Aminolysis of ω-Asp p-Nitrophenyl Thioesters in Solution.Org.Lett.,Vol.18,No.19,2016,4828-4831に従って合成した、L13-1aの合成は、Y.A.Naumovich,I.S.Golovanov,A.Y.Sukhorukov,and S.L.Loffe,Addition of HO-Acids to N,N-Bis(oxy)enamines:Mechanism,Scope and Application to the Synthesis of Pharmaceuticals.Eur.J.Org.Chem.,Vol.2017,No.4,2017,6209-6227に従って実施した。
工程1:ベンジル2,2-ジメチル-4,7,10,13-テトラオキソー3-オキソ-5,8,11,14-テトラアザヘキサデカン-16-オアート(L13-2)の合成
DMF(60mL)中のL13-1a(10g,34.57mmol,1当量)の溶液に、HOBt(5.61g,41.48mmol,1.2当量)、DIPEA(22.34g,172.84mmol,30.10mL,5当量)及びEDCI(7.95g,41.48mmol,1.2当量)を20℃で加えた。混合物を20℃で15分間撹拌し、L13-1(11.08g,32.84mmol,0.95当量)を加え、反応混合物を20℃で2時間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視したところ、これは出発物質が残っていないことと所望の生成物の形成を示していた。混合物をNaHCO3(20mL)の飽和溶液と塩水(20mL×3)でクエンチし、固体沈殿物を回収してPE(20mL×2)で洗浄し、減圧下で濃縮して、白色固体としてL13-2(13.5g,29.38mmol,収率85.00%,純度95%)を得た。
DMF(60mL)中のL13-1a(10g,34.57mmol,1当量)の溶液に、HOBt(5.61g,41.48mmol,1.2当量)、DIPEA(22.34g,172.84mmol,30.10mL,5当量)及びEDCI(7.95g,41.48mmol,1.2当量)を20℃で加えた。混合物を20℃で15分間撹拌し、L13-1(11.08g,32.84mmol,0.95当量)を加え、反応混合物を20℃で2時間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視したところ、これは出発物質が残っていないことと所望の生成物の形成を示していた。混合物をNaHCO3(20mL)の飽和溶液と塩水(20mL×3)でクエンチし、固体沈殿物を回収してPE(20mL×2)で洗浄し、減圧下で濃縮して、白色固体としてL13-2(13.5g,29.38mmol,収率85.00%,純度95%)を得た。
LCMS:(ESI):RT=0.714分,m/z calcd.for C20H28N4O7Na 459.2[M+Na]+,found 459.1;LC-MS条件:移動相:1.5mL/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル(溶媒B)、流量1.5ML/分で、0.7分間の5%~95%溶出勾配(溶媒B)及び95%で0.4分間保持、カラム;Agilent Pursult5 C18 20*2.0mmを使用。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ=8.31(br t,J=5.7Hz,1H),8.19(br t,J=5.8Hz,1H),8.05(br t,J=5.3Hz,1H),7.43-7.29(m,5H),7.04-6.95(m,1H),5.13(s,2H),3.90(d,J=5.9Hz,2H),3.75(d,J=5.6Hz,4H),3.58(br d,J=6.0Hz,2H),1.38(s,9H)。
工程2:ベンジル2-(2-(2-(2-アミノアセトアミド)アセトアミド)アセトアミド)アセタート塩酸塩(L13-3)の合成
HCl/EtOAc(4M,14.80mL,4当量)の溶液を、L13-2(7g,14.80mmol,1当量、HCl)に20℃で滴下した。混合物を20℃で10分間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視したところ、これは出発物質が残っていないことと所望の生成物の形成を示していた。混合物を真空状態で濃縮し、凍結乾燥させてL13-3(5.5g,10.33mmol,収率69.77%,純度70%,HCl)を白色固体として得た。
HCl/EtOAc(4M,14.80mL,4当量)の溶液を、L13-2(7g,14.80mmol,1当量、HCl)に20℃で滴下した。混合物を20℃で10分間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視したところ、これは出発物質が残っていないことと所望の生成物の形成を示していた。混合物を真空状態で濃縮し、凍結乾燥させてL13-3(5.5g,10.33mmol,収率69.77%,純度70%,HCl)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=0.479分,m/z calcd.for C15H21N4O5 337.1[M+H]+,found 337.1;LC-MS条件:移動相:1.5mL/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5mL/分で、0.7分間の5%~95%溶出勾配(溶媒B)及び95%で0.4分間保持、カラム;Agilent Pursult5 C18 20*2.0mmを使用。
工程3:(2R,3R,4S,5R,6R)-2-(((S)-16-((((9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル)アミノ)-3,6,9,12,15-ペンタオキソ-1-フェニル-2-オキサ-5,8,11,14-テトラアザヘプタデカン-17-イル)オキシ)-6-(アセトキシメチル)テトラヒドロ-2H-ピラン-3,4,5-トリイルトリアセタート(L13-4)の合成
DMF(20mL)中のL13-3a(2.9g,4.41mmol,1当量)の溶液に、HOBt(715.03g,5.29mmol,1.2当量)、DIPEA(3.42g,26.46mmol,4.61mL,6当量)及びDIC(667.82g,5.29mmol,819.42μL,1.2当量)を20℃で加えた。混合物を20℃で15分間撹拌し、L13-3(3.29g,6.61mmol,1.5当量、HCl)を加え、反応混合物を20℃で12時間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視したところ、これは出発物質が残っていないことと所望の生成物の形成を示していた。混合物を水(40mL)でクエンチし、酢酸エチル(40mL×2)で抽出した。有機層を水及び塩水(30mL×3)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過して真空状態で濃縮した。その残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);40gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、溶出0~5%MeOH/DCM)で25分間、総体積1.6Lで精製し、白色固体としてL13-4(2.1g,1.72mmol,収率39.04%,純度80%)を得た。
DMF(20mL)中のL13-3a(2.9g,4.41mmol,1当量)の溶液に、HOBt(715.03g,5.29mmol,1.2当量)、DIPEA(3.42g,26.46mmol,4.61mL,6当量)及びDIC(667.82g,5.29mmol,819.42μL,1.2当量)を20℃で加えた。混合物を20℃で15分間撹拌し、L13-3(3.29g,6.61mmol,1.5当量、HCl)を加え、反応混合物を20℃で12時間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視したところ、これは出発物質が残っていないことと所望の生成物の形成を示していた。混合物を水(40mL)でクエンチし、酢酸エチル(40mL×2)で抽出した。有機層を水及び塩水(30mL×3)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過して真空状態で濃縮した。その残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);40gのSepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、溶出0~5%MeOH/DCM)で25分間、総体積1.6Lで精製し、白色固体としてL13-4(2.1g,1.72mmol,収率39.04%,純度80%)を得た。
LCMS:(ESI):RT=1.937分,m/z calcd.for C47H54N5O18 976.3[M+H]+,found 976.3;LC-MS条件:移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、2.0分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.48分間保持、カラム:Xtimate 3μm,C18,2.1*30mmを使用。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.83-7.73(m,2H),7.59(br d,J=7.5Hz,2H),7.47-7.28(m,10H),7.21-7.03(m,2H),5.87(br d,J=5.5Hz,1H),5.27-4.89(m,5H),4.61-4.38(m,4H),4.29-3.81(m,13H),2.10-1.98(m,12H)。
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ=7.83-7.73(m,2H),7.59(br d,J=7.5Hz,2H),7.47-7.28(m,10H),7.21-7.03(m,2H),5.87(br d,J=5.5Hz,1H),5.27-4.89(m,5H),4.61-4.38(m,4H),4.29-3.81(m,13H),2.10-1.98(m,12H)。
工程4:(S)-1-(9H-フルオレン-9-イル)-3,6,9,12,15-ペンタオキソ-5-((((2R,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-トリアセトキシ-6-(アセトキシメチル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)メチル)-2-オキサ-4,7,10,13,16-ペンタアザオクタデカン-18-酸(L13)の合成
EtOAc(16mL)及びMeOH(2mL)中のL13-4(2.1g,2.15mmol,1当量)の溶液に、Pd/C(300mg,430.35μmol,10.35μL,純度10%,0.20当量)を20℃で加え、混合物を20℃、H2下で4時間撹拌した(4.35mg,2.15mmol,1当量)(15psi)。反応の進行をLC-MSで監視したところ、これは出発物質が残っていないことと所望の生成物の形成を示していた。混合物を濾過し、濾過ケーキをMeOH(10mL×3)で洗浄し、真空状態で濃縮してL13(1.2g,1.29mmol,収率59.81%,純度95%)を白色固体として得た。
EtOAc(16mL)及びMeOH(2mL)中のL13-4(2.1g,2.15mmol,1当量)の溶液に、Pd/C(300mg,430.35μmol,10.35μL,純度10%,0.20当量)を20℃で加え、混合物を20℃、H2下で4時間撹拌した(4.35mg,2.15mmol,1当量)(15psi)。反応の進行をLC-MSで監視したところ、これは出発物質が残っていないことと所望の生成物の形成を示していた。混合物を濾過し、濾過ケーキをMeOH(10mL×3)で洗浄し、真空状態で濃縮してL13(1.2g,1.29mmol,収率59.81%,純度95%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=0.788分,m/z calcd.for C40H48N5O18 886.3[M+H]+,found 886.3;LC-MS条件:移動相:1.5mL/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ML/分で、0.7分間の5%~95%溶出勾配(溶媒B)及び95%で0.4分間保持、カラム;Agilent Pursult5 C18 20*2.0mmを使用。
1H NMR(400MHz,メタノール-d4)δ=7.81(br d,J=7.4Hz,2H),7.73-7.63(m,2H),7.44-7.37(m,2H),7.36-7.29(m,2H),5.31-5.18(m,1H),5.03(t,J=9.8Hz,1H),4.94-4.89(m,2H),4.51-4.20(m,5H),4.16-4.08(m,1H),4.06-3.75(m,11H),2.05-1.98(m,12H)。
実施例5.GLP1ペプチド模倣リンカーペイロードの合成
図26は、本開示に従ったリンカーペイロードLP1、LP2、LP3、LP4及びLP5の合成を表す。
図26は、本開示に従ったリンカーペイロードLP1、LP2、LP3、LP4及びLP5の合成を表す。
5.1(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-[4-[3-[2-[2-[2-[2-[[4-(124-アザトリシクロヘキサデカ-8(14),9(15),10(16),12(18),68,70(73)-ヘキサエン-33-yn-124-イル)-4-オキソ-ブタノイル]アミノ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]ブトキシ]-2-エチル-72-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシプロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP1)の調製
DMF(0.5mL)中のP9(9.46mg,14.56μmol,1.5当量)の溶液に、L5(n=4,15mg,9.70μmol,1当量)及びDIPEA(6.27mg,48.52μmol,8.45μL,5当量)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。LCMSのトレースは、反応物の完全な消費及び所望の質量の形成を示した。混合物を濾過し、これを分取HPLC(TFA条件;カラム:Phenomenex Gemini-NX 150*30mm*5μm;移動相:[水(10mM NH4HCO3)-ACN];B%:30%~60%,11分)で精製し、LP1(4.84mg,2.23μmol,収率23.02%,純度96%)を得て、白色固体として得た。
DMF(0.5mL)中のP9(9.46mg,14.56μmol,1.5当量)の溶液に、L5(n=4,15mg,9.70μmol,1当量)及びDIPEA(6.27mg,48.52μmol,8.45μL,5当量)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。LCMSのトレースは、反応物の完全な消費及び所望の質量の形成を示した。混合物を濾過し、これを分取HPLC(TFA条件;カラム:Phenomenex Gemini-NX 150*30mm*5μm;移動相:[水(10mM NH4HCO3)-ACN];B%:30%~60%,11分)で精製し、LP1(4.84mg,2.23μmol,収率23.02%,純度96%)を得て、白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=0.944分,mass calcd.for C105H135FN20O24 2078.99,m/z found 1041.0[M+2H]2+。Merck,RP-18e 25-2mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LC-MSを実施し、0.04%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.06%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
5.2 3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-[4-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[4-(132-アザトリシクロヘキサデカ-8(14),9(15),10(16),12(18),76,78(81)-ヘキサエン-33-イン-132-イル)-4-オキソ-ブタノイル]アミノ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]ブトキシ]-2-エチル-80-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP2)の調製
P9(18mg,21.79μmol,2.25当量)から出発し、実施例1に記載されているのと同一手順を使用し、所望のLP2(3.41mg,1.41μmol,収率14.63%、純度94%)を白色固体として得た。LP2の水溶性を評価し、60nM以上であると決定した。
P9(18mg,21.79μmol,2.25当量)から出発し、実施例1に記載されているのと同一手順を使用し、所望のLP2(3.41mg,1.41μmol,収率14.63%、純度94%)を白色固体として得た。LP2の水溶性を評価し、60nM以上であると決定した。
LCMS(ESI):RT=0.949分,mass calcd.for C113H151FN20O28 2255.10,m/z found 1128.9[M+2H]2+。MERCK,RP-18e 25-2mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LC-MSを実施し、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:RT=15.273分、Gemini-NX 5μm 150*4.6mm,C18,110Aカラムを使用し、流量1.0mL/分で逆相HPLCを実施し、0.12%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.12%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
5.3(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-[4-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[4-(140-アザトリシクロヘキサデカ-8(14),9(15),10(16),12(18),84,86(89)-ヘキサエン-33-イン-140-イル)-4-オキソ-ブタノイル]アミノ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]ブトキシ]-2-エチル-88-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP3)の調製
P9(14.59mg,14.56μmol,1.5当量)から出発し、実施例1に記載されているのと同一手順を使用し、所望の生成物LP3(4.68mg,1.68μmol,収率17.27%、純度87.1%)を白色固体として得た。
P9(14.59mg,14.56μmol,1.5当量)から出発し、実施例1に記載されているのと同一手順を使用し、所望の生成物LP3(4.68mg,1.68μmol,収率17.27%、純度87.1%)を白色固体として得た。
HPLC条件:RT=15.120分、Gemini-NX 5u C18 110A 150*4.6mmのカラムを使用し、流量1.0mL/分で逆相HPLCを実施し、0.1%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.1%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
5.4(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-[4-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[4-(164-アザトリシクロヘキサデカ-8,10(16),12(18),14(108),15(109),110(113)-ヘキサエン-33-yn-164-イル)-4-オキソ-ブタノイル]アミノ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]ブトキシ]-2-エチル-112-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP4)の調製
P9(20mg,12.94μmol,1.0当量)から出発し、実施例1に記載されているのと同一手順を使用し、所望の生成物LP4(5.58mg,1.76μmol,収率13.59%、純度93.29%)を白色固体として得た。
P9(20mg,12.94μmol,1.0当量)から出発し、実施例1に記載されているのと同一手順を使用し、所望の生成物LP4(5.58mg,1.76μmol,収率13.59%、純度93.29%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=0.912分,mass calcd.for C145H215FN20O44 2961.36[M+H]+,987.514[M+3H]3+,m/z found 988.3[M+3H]3+。MERCK,RP-18e 25-2mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LC-MSを実施し、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HRMS(ESI):mass calcd for C145H216FN20O44 2960.5263 [M+H]+,1480.7632 [M+2H]2+,987.5088 [M+3H]3+,m/z found 2960.53 [M+H]+,1481.26 [M+2H]2+,987.8517 [M+3H]3+。
5.5 8S,14S,17S,20S,23S,26S)-8-((2H-テトラゾール-5-イル)メチル)-26-(((S)-1-(((S)-1-アミノ-5-(3,5-ジメチルフェニル)-1-オキソペンタン-2-イル)アミノ)-3-(4’-((1-((1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノン-4-イン-9-イル)-3,17-ジオキソ-2,7,10,13,16-ペンタオキサ-4,18-ジアザドコサン-22-イル)oxy)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)-1-オキソプロパン-2-イル)カルバモイル)-17-(2-フルオロベンジル)-14,20-ビス((R)-1-ヒドロキシエチル)-23-(ヒドロキシメチル)-1-(1H-イミダゾール-5-イル)-5,5,17-トリメチル-4,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキソ-3,7,10,13,16,19,22,25-オクタアザオクタコサン-28-酸(LP5)の調製
DMF(0.5mL)中のP9(12mg,7.76μmol,1当量)の溶液に、L6(8.30mg,15.53μmol,2.0当量)及びTEA(1.57mg,15.53μmol,2.16μL,2.0当量)を加えた。続いて、混合物を20℃で12時間撹拌した。LCMSのトレースは、反応物の大部分が完全に消費され、所望のMSが検出されたことを示した。これを、分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini-NX 150*30mm*5μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:0%~55%,45分)で精製した。化合物LP5(4mg,2.00μmol,収率25.75%、純度97%)を白色固体として得た。
DMF(0.5mL)中のP9(12mg,7.76μmol,1当量)の溶液に、L6(8.30mg,15.53μmol,2.0当量)及びTEA(1.57mg,15.53μmol,2.16μL,2.0当量)を加えた。続いて、混合物を20℃で12時間撹拌した。LCMSのトレースは、反応物の大部分が完全に消費され、所望のMSが検出されたことを示した。これを、分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini-NX 150*30mm*5μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:0%~55%,45分)で精製した。化合物LP5(4mg,2.00μmol,収率25.75%、純度97%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):Rt=4.087分,mass calcd.for C95H132FN19O24 [M+2H]2+971.5,m/z found 971.5[M+2H]2+;Chromolith Flash RP-C18 25-3mmを使用し、流量0.8ml/分で逆相LCMSを実施し、0.02%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:(ESI)Rt=10.12分、YMC-Pack ODS-A 150*4.6mmのカラムを使用し、流量1.5ml/分で逆相LCMSを実施し、0.02%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
図27は、本開示に従ったリンカーペイロードLP6及びLP7の合成を表す。
5.6(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-[4-[[(2S)-2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[4-(128-アザトリシクロヘキサデカ-8(14),9(15),10(16),12(18),63,65(68)-ヘキサエン-33-yn-128-イル)-4-オキソ-ブタノイル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]ブトキシ]-2-エチル-67-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP6)の調製
オーブンで乾燥させたバイアルに、L7(163.54mg,323.48μmol,2.5当量)及びP9(200mg,129.39μmol,1当量)を入れた。HOBtのストック溶液(69.93mg,517.56μmol,4当量)、DMF(1mL)中のDIPEA(50.17mg,388.17μmol,3当量)及びDMF(1mL)中のI2(39.41mg,155.27μmol,1.2当量)をバイアルに加えた。反応混合物を15℃で12時間撹拌した。反応の進行をLCMSのトレースで監視した。混合物を濾過し、続いてEtOAc(20mL)を加えることで沈殿させた。濾過後、保護された粗生成物G4S-P9(261mg,116.45μmol,収率90.00%,純度90%)を淡黄色の泡として得た。
オーブンで乾燥させたバイアルに、L7(163.54mg,323.48μmol,2.5当量)及びP9(200mg,129.39μmol,1当量)を入れた。HOBtのストック溶液(69.93mg,517.56μmol,4当量)、DMF(1mL)中のDIPEA(50.17mg,388.17μmol,3当量)及びDMF(1mL)中のI2(39.41mg,155.27μmol,1.2当量)をバイアルに加えた。反応混合物を15℃で12時間撹拌した。反応の進行をLCMSのトレースで監視した。混合物を濾過し、続いてEtOAc(20mL)を加えることで沈殿させた。濾過後、保護された粗生成物G4S-P9(261mg,116.45μmol,収率90.00%,純度90%)を淡黄色の泡として得た。
LCMS(ESI):RT=3.283分,mass calcd.for C95H136FN23O25
2+1009.005[M+2H-Boc]2+,m/z found 1009.5[M+2H]2+。LCMS条件:Flash RP-18e 25-2mm、流量0.8mL/分で、0.02%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出。
オーブンで乾燥させたバイアルに、保護されたG4S-P9(261mg,129.39μmol,1当量)及びDCM(5mL)を入れた。TFA(6.70g,58.75mmol,4.35mL,454.08当量)をバイアルに入れた。反応混合物を20℃で2時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視した。反応混合物を濃縮し、分取HPLC(TFA条件;カラム:Waters Xbridge Prep OBD C18 150*40mm*10μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:0%~70%,30分)で精製した。G4S-P9(206mg,98.61μmol,収率76.21%、純度100%,2TFA)を白色の泡として得た。
LCMS(ESI):RT=2.497分,mass calcd.for C95H136FN23O25
2+930.945[M+2H]2+,m/z found 931.0[M+2H]2+。LCMS条件:Chromolith Flash RP-C18 25-3mm、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出。
オーブンで乾燥させたバイアルに、DIBAC-suc-OSu(39.68mg,98.61μmol,1当量)及びG4S-P9(206mg,98.61μmol,1当量,2TFA)を入れた。DMF(2mL)及びDIPEA(38.23mg,295.83μmol,3当量)をバイアルに入れた。反応混合物を20℃で1時間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視した。反応物を濃縮し、分取HPLC(中性条件;カラム:Waters Xbridge Prep OBD C18 150*40mm*10μm;移動相:[水(10mM NH4HCO3)-ACN];B%:0%~50%,30分)で精製した。LP6(112mg,52.13μmol,収率52.87%、純度100%)を白色の泡として得た。
LCMS(ESI):RT=2.419分,mass calcd.for C105H133FN24O25
2+1074.49[M+2H]2+,m/z found 1074.8[M+2H]2+。LCMS条件:Waters Xbridge C18 30*2.0mm,3.5μm 移動相:A)0.05%NH3H2O水溶液;B)ACN,勾配:0%のBから5.8分以内に95%のBに増加;95%のBで1.1分間保持;続いて6.91分で0%のBに戻り、0.09分間保持、流量1.0mL/分。
HPLC:RT=3.58分:HPLC条件:移動相:0.2ML/1LのNH3H2O水溶液(溶媒A)及びアセトニトリル(溶媒B)、流量1.2ml/分で、5分間の0%~60%溶出勾配(溶媒B)及び60%で2分間保持、カラム:Xbridge Shield RP-18,5μm,2.1*50mmを使用。
1H NMR(400MHz,アセトニトリル-d3)δ ppm8.40(s,1H)7.52(br t,J=6.82Hz,2H)7.35-7.46(m,3H)7.27-7.34(m,2H)7.19-7.25(m,1H)7.05-7.15(m,4H)6.95(br d,J=5.75Hz,4H)6.86-6.91(m,1H)6.74-6.82(m,5H)6.70(br d,J=8.13Hz,1H)4.98(br d,J=14.51Hz,1H)4.61(br s,1H)4.38-4.46(m,2H)4.29(br s,2H)4.16-4.21(m,1H)4.09-4.12(m,2H)3.89-4.01(m,6H)3.79-3.88(m,10H)3.57-3.77(m,7H)3.28-3.36(m,3H)3.16(br s,4H)3.09(br s,1H)2.82-2.89(m,1H)2.76(br d,J=3.75Hz,2H)2.61-2.70(m,1H)2.37-2.48(m,6H)2.16(s,6H)1.53-1.81(m,8H)1.28(br d,J=3.38Hz,3H)1.17-1.22(m,6H)1.11(br d,J=6.00Hz,6H)0.92(br t,J=7.44Hz,3H)。
5.7(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-[4-[[2-[[2-[[2-[[2-[[(2S)-2-[[4-(128-アザトリシクロヘキサデカ-8(14),9(15),10(16),12(18),63,65(68)-ヘキサエン-33-yn-128-イル)-4-オキソ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシプロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]ブトキシ]-2-エチル-67-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシプロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP7)の調製
L8(50mg,32.35μmol,1当量)及びP9(32.71mg,64.70μmol,2当量)、LP7(15mg,6.74μmol,収率53.21%、純度96.47%)を、実施例6に記載されているのと同一手順を使用して白色固体としてこれを得た。
L8(50mg,32.35μmol,1当量)及びP9(32.71mg,64.70μmol,2当量)、LP7(15mg,6.74μmol,収率53.21%、純度96.47%)を、実施例6に記載されているのと同一手順を使用して白色固体としてこれを得た。
LCMS:(ESI):RT=0.845分,m/z calcd.for C105H133FN24O25,1075.5[M+2H]2+,m/z found 1074.6[M+2H]2+;Merck,RP-18e 25-2mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LCMSを実施し、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:RT=3.55分;移動相:移動相:0.5ML/1LのNH3H2O水溶液(溶媒A)及びアセトニトリル(溶媒B)、流量1.2ml/分で、5分間の0%~60%溶出勾配(溶媒B)及び60%で2分間保持。
図28は、本開示に従ったリンカーペイロードLP8、LP9、LP10及びLP11の合成を表す。
5.8(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-[4-[4-[2-[2-[2-[2-[[4-(2-アザトリシクロ[10.4.0.04,9]ヘキサデカ-1(12),4(9),5,7,13,15-ヘキサエン-10-イン-2-イル)-4-オキソブタノイル]アミノ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシメチル]トリアゾール-1-イル]ブトキシ]-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシプロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP8)の調製
H2O(0.25mL)及びt-BuOH(0.5mL)中のP8(20mg,12.73μmol,1当量)及びL9(8.83mg,38.18μmol,3.0当量)の溶液に、CuSO4・5H2O(635.45μg,2.55μmol,0.2当量)及びナトリウム(2R)-2-[(1S)-1,2-ジヒドロキシエチル]-4-ヒドロキシ-5-オキソ-2H-フラン-3-オラート(1.01mg,5.09μmol,0.4当量)を加えた。混合物を20℃で1.5時間撹拌した。LCMSのトレースは、物質が消失し、主生成物として所望の生成物が観察されたことを示した。緑色の溶液を濾過し、粗生成物を得た。粗生成物を、逆相HPLC(ISCO(登録商標),20g C18(登録商標)シリカフラッシュカラム,0~60.1%のCH3CN/H2O(0.4%AcOH)勾配(18mL/分)の溶出)で精製した。所望の流体をフリーズドライヤーで凍結乾燥して化合物61(15mg,8.24μmol,収率64.78%,純度99.090%)を白色固体として得た。
H2O(0.25mL)及びt-BuOH(0.5mL)中のP8(20mg,12.73μmol,1当量)及びL9(8.83mg,38.18μmol,3.0当量)の溶液に、CuSO4・5H2O(635.45μg,2.55μmol,0.2当量)及びナトリウム(2R)-2-[(1S)-1,2-ジヒドロキシエチル]-4-ヒドロキシ-5-オキソ-2H-フラン-3-オラート(1.01mg,5.09μmol,0.4当量)を加えた。混合物を20℃で1.5時間撹拌した。LCMSのトレースは、物質が消失し、主生成物として所望の生成物が観察されたことを示した。緑色の溶液を濾過し、粗生成物を得た。粗生成物を、逆相HPLC(ISCO(登録商標),20g C18(登録商標)シリカフラッシュカラム,0~60.1%のCH3CN/H2O(0.4%AcOH)勾配(18mL/分)の溶出)で精製した。所望の流体をフリーズドライヤーで凍結乾燥して化合物61(15mg,8.24μmol,収率64.78%,純度99.090%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=0.764分,mass calcd.for C23H43N11O6 901.95,m/z found 902.3[M+H]+。LC-MS方法A:Xtimate C18 2.1*30mm,3μmカラム、流量1.2mL/分で、0.75ML/4LのTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)で溶出。
DMF(2mL)中の61(17mg,9.43μmol,1当量)とDIBAC-suc-OSu)(5.05mg,12.55μmol,1.33当量)の溶液に、DIPEA(2.44mg,18.86μmol,3.28μL,2.0当量)を加えた。溶液を15℃で1時間撹拌した。LCMSは、反応が完全に変換され、所望の生成物が観察されたことを示した。溶液を濾過し、分取HPLC(中性条件:カラム:Durashell C18(L)100*10mm*5μm,移動相:[水(10mM NH4HCO3)-ACN];B%:12%~52%,12分)で精製した。所望の流体をフリーズドライヤーで凍結乾燥してLP8(7.0mg,3.21μmol,収率30.42%,純度95.745%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=1.337分,m/z calcd.for C105H135FN22O23[M+2H]2+1045.50,found 1046.1。LCMS条件:0.8mL/4LのNH3H2O水溶液(溶媒A)及びアセトニトリル(溶媒B)、流量1mL/分で2分間の10%~80%勾配(溶媒B)及び80%で0.48分間保持、カラム:XBridge C18 3.5μm 2.1*30mm、波長:UV220nm&254nm;カラム温度:50℃を使用。
HPLC:RT=2.868分;移動相:0.2mL/1LのNH3H2O水溶液(溶媒A)及びアセトニトリル(溶媒B)、流量0.8ml/分で、6分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で2分間保持、カラム:Xbridge Shield C18,5μm,2.1*50mmを使用。
5.9(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-[4-[4-[2-[2-[2-[2-[[(1S,8R)-9-ビシクロ[6.1.0]ノン-4-インイル]メトキシカルボニルアミノ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシメチル]トリアゾール-1-イル]ブトキシ]-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP9)の調製
DMF(2.0mL)中の化合物61(14.55mg,8.07μmol,1当量)の溶液に、(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノン-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カルボナート(BCN-CO-PNP)(5.81mg,18.41μmol,2.28当量)及びDIPEA(2.09mg,16.14μmol,2.81μL,2.0当量)を加えた。この溶液を分取HPLC(FA条件)(カラム:Phenomenex Gemini-NX 150*30mm*5μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:0%~55%,45分)で精製し、LP9(3.6mg,1.79μmol,収率22.21%,純度98.54%)を得て、白色固体として得た。
DMF(2.0mL)中の化合物61(14.55mg,8.07μmol,1当量)の溶液に、(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノン-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カルボナート(BCN-CO-PNP)(5.81mg,18.41μmol,2.28当量)及びDIPEA(2.09mg,16.14μmol,2.81μL,2.0当量)を加えた。この溶液を分取HPLC(FA条件)(カラム:Phenomenex Gemini-NX 150*30mm*5μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:0%~55%,45分)で精製し、LP9(3.6mg,1.79μmol,収率22.21%,純度98.54%)を得て、白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=4.040分,mass calcd.for C97H134FN21O23[M+2H]2+989.89,found 990.6。LCMS条件:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、6分間の10%~80%の勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持;カラム:Xtimate 3μm,C18,2.1*30mm;
HPLC:RT=9.89分,移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持;カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μmを使用。
5.10(3S)-4-[[(1S)-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-1-[[4-[4-[4-[4-[2-[2-[2-[2-[(2-シクロオクト-2-yn-1-イルオキシアセチル)アミノ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシメチル]トリアゾール-1-イル]ブトキシ]-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP10)の調製
DMF(0.5mL)中の61(14mg,7.76μmol,1当量)の溶液に、2,5-ジオキソピロリジン-1-イル2-(シクロオクト-2-イル-1-イルオキシ)アセタート(5.18mg,18.53μmol,2.39当量)及びDIPEA(2.01mg,15.53μmol,2.70μL,2.0当量)を加えた。溶液を20℃で1時間撹拌した。LCMSは、反応が完全に変換され、所望の生成物が観察されたことを示した。混合物をCH3CNで希釈し、粗生成物を、分取HPLC(FA条件:カラム:Phenomenex Gemini-NX 150*30mm*5μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:5%~55%,35分)で精製した。所望の流体をフリーズドライヤーで凍結乾燥してLP10(2.6mg,1.26μmol,収率13.08%,純度95.26%)を白色固体として得た。
DMF(0.5mL)中の61(14mg,7.76μmol,1当量)の溶液に、2,5-ジオキソピロリジン-1-イル2-(シクロオクト-2-イル-1-イルオキシ)アセタート(5.18mg,18.53μmol,2.39当量)及びDIPEA(2.01mg,15.53μmol,2.70μL,2.0当量)を加えた。溶液を20℃で1時間撹拌した。LCMSは、反応が完全に変換され、所望の生成物が観察されたことを示した。混合物をCH3CNで希釈し、粗生成物を、分取HPLC(FA条件:カラム:Phenomenex Gemini-NX 150*30mm*5μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:5%~55%,35分)で精製した。所望の流体をフリーズドライヤーで凍結乾燥してLP10(2.6mg,1.26μmol,収率13.08%,純度95.26%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=3.805分,m/z calcd.for C96H134FN21O23[M+2H]2+983.99,found 984.7。LCMS条件:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、6分間の10%~80%の勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持;カラム:Xtimate 3μm,C18,2.1*30mm。
HPLC:RT=9.74分,移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B),流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持;カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μmを使用;HPLC:RT=9.89分,移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B),流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持;カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μmを使用。
5.11(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-[4-[4-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-アミノエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシメチル]トリアゾール-1-イル]ブトキシ]-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシプロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP11)の調製
t-BuOH(0.8mL)及びH2O(0.4mL)中のP8(10mg,6.36μmol,1当量)と、アスコルビン酸ナトリウム(504.18μg,2.54μmol,0.4当量)と、CuSO4・5H2O(317.72μg,1.27μmol,0.2当量)との混合物を20℃で2時間撹拌した。LCMSは、P8が完全に消費されたことを示した。反応物を濾過して残渣を得た。残渣を分取HPLC(カラム:Phenomenex Genimi NX C18 150*40mm*5μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:0%~60%、25分)で精製し、LP11(4.32mg,2.18μmol,収率34.31%)を白色固体として得た。
t-BuOH(0.8mL)及びH2O(0.4mL)中のP8(10mg,6.36μmol,1当量)と、アスコルビン酸ナトリウム(504.18μg,2.54μmol,0.4当量)と、CuSO4・5H2O(317.72μg,1.27μmol,0.2当量)との混合物を20℃で2時間撹拌した。LCMSは、P8が完全に消費されたことを示した。反応物を濾過して残渣を得た。残渣を分取HPLC(カラム:Phenomenex Genimi NX C18 150*40mm*5μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:0%~60%、25分)で精製し、LP11(4.32mg,2.18μmol,収率34.31%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=3.121分,m/z calcd.for C94H138FN21O25 990.01[M+2H]2+,m/z found 990.6[M+2H]2+;移動相:移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、6分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持を使用。
HPLC(ES8584-1120-P1C1)を取り付けた。RT=3.75分,純度99.72%。HPLC方法:カラム:Ultimate XB-C18,3μm,3.0*50mm;2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5 ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、7分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持。
図29は、本開示に従ったリンカーペイロードLP12の合成を表す。
5.12(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-[4-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[4-(162-アザトリシクロヘキサデカ-6(12),7(13),8(14),10(16),109,111(114)-ヘキサエン-31-yn-162-イル)-4-オキソ-ブタノイル]アミノ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]ブトキシ]-2-エチル-113-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[6-(1H-イミダゾール-5-イル)ヘキサノイルアミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP12)の調製
DMF(1.5mL)中のP11(30mg,14.65μmol,1当量,TFA)及びL11(22.43mg,14.65μmol,1当量)の溶液に、DIPEA(9.47mg,73.25μmol,12.76μL,5当量)を15℃で加えた。混合物を15℃で1時間撹拌した。LCMSのトレースは、反応が完了したことを示した。混合物を濾過して粗生成物を黄色油として得た。残渣を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge Prep OBD C18 150*40mm*10μm;移動相:[水(10mM NH4HCO3)-ACN];B%:0%~80%、30分)で精製し、LP12(25mg,8.18μmol,収率47.72%、純度95.49%)を白色固体として得た。
DMF(1.5mL)中のP11(30mg,14.65μmol,1当量,TFA)及びL11(22.43mg,14.65μmol,1当量)の溶液に、DIPEA(9.47mg,73.25μmol,12.76μL,5当量)を15℃で加えた。混合物を15℃で1時間撹拌した。LCMSのトレースは、反応が完了したことを示した。混合物を濾過して粗生成物を黄色油として得た。残渣を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge Prep OBD C18 150*40mm*10μm;移動相:[水(10mM NH4HCO3)-ACN];B%:0%~80%、30分)で精製し、LP12(25mg,8.18μmol,収率47.72%、純度95.49%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=0.970分,m/z calcd.for C144H217FN19O43 973.18 m/z[M+3H]3+,m/z found 974.0[M+3H]3+;Chromolith Flash RP-18e 25-3mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LC-MSを実施し、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:Rt=2.53;移動相:0.2ML/1LのNH3H2O水溶液(溶媒A)及びアセトニトリル(溶媒B)、流量1.2ml/分で、5分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で2分間保持、カラム:Xbridge Shield RP-18,5μm,2.1*50mmを使用。
図30は、本開示に従ったリンカーペイロードLP13及びLP14の合成を表す。
5.13(3S)-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[2-[[(2S)-2-[(3-アミノ-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル)アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-(2-フルオロフェニル)-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-[[(1S)-1-[[4-[4-[4-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[4-(157-アザトリシクロヘキサデカ-8(14),9(15),10(16),12(18),104,106(109)-ヘキサエン-31-yn-157-イル)-4-オキソブタノイル]アミノ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]ブトキシ]-2-エチル-108-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP13)の調製
DMF(0.5mL)中のP4(10mg,6.89μmol,1当量)及びL12(10.55mg,6.89μmol,1当量)の溶液に、DIPEA(4.45mg,34.44μmol,6.00μL,5当量)を15℃で加えた。混合物を15℃で1時間撹拌した。LCMSは、反応が完全に変換されたことを示した。混合物を濾過して粗生成物を黄色油として得た。粗生成物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge Prep OBD C18 150*30mm*10μm;移動相:[水(10mM NH4HCO3)-ACN];B%:10%~50%、55分)で精製し、LP13(11mg,3.84μmol,収率36.67%)を白色固体として得た。
DMF(0.5mL)中のP4(10mg,6.89μmol,1当量)及びL12(10.55mg,6.89μmol,1当量)の溶液に、DIPEA(4.45mg,34.44μmol,6.00μL,5当量)を15℃で加えた。混合物を15℃で1時間撹拌した。LCMSは、反応が完全に変換されたことを示した。混合物を濾過して粗生成物を黄色油として得た。粗生成物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge Prep OBD C18 150*30mm*10μm;移動相:[水(10mM NH4HCO3)-ACN];B%:10%~50%、55分)で精製し、LP13(11mg,3.84μmol,収率36.67%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=0.965分,m/z calcd.for C140H213FN18O44 717.38[M+4H]2+,m/z found 717.8[M+4H]4+;Chromolith Flash RP-18e 25-3mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LC-MSを実施し、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:RT=3.97;移動相:0.2ML/1LのNH3H2O水溶液(溶媒A)及びアセトニトリル(溶媒B)、流量1.2ml/分で、5分間の0%~60%溶出勾配(溶媒B)及び60%で2分間保持、カラム:Xbridge Shield RP-18,5μm,2.1*50mm 波長:220nm&215nm&254nmを使用。
5.14(3S)-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[2-[[(2S)-2-[(3-アミノ-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル)アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-(2-フルオロフェニル)-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-[[(1S)-1-[[4-[4-[4-[[(2S)-2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[4-(121-アザトリシクロヘキサデカ-8(14),9(15),10(16),12(18),59,61(64)-ヘキサエン-31-yn-121-イル)-4-オキソ-ブタノイル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]ブトキシ]-2-エチル-63-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP14)の調製
DMF(0.5mL)中のP4(40mg,27.56μmol,1当量)の溶液に、HOBt(14.89mg,110.22μmol,4当量)、DIPEA(10.68mg,82.67μmol,14.40μL,3当量)及びL7(34.83mg,68.89μmol,2.5当量)を加え、続いてDMF(0.5mL)中のI2(8.39mg,33.07μmol,6.66μL,1.2当量)を加えた。続いて、反応混合物を20℃で16時間撹拌した。反応物にEtOAc(15mL)を加え、白色固体を沈殿させた。混合物を3分間遠心分離にかけ(5000R)、固体を得た。続いて、この固体をH2O(10mL)及びCAN(2mL)中に溶解した。溶液を凍結乾燥して粗保護化合物62(59mg,23.01μmol,収率83.50%,純度75%)を白色固体として得た。
DMF(0.5mL)中のP4(40mg,27.56μmol,1当量)の溶液に、HOBt(14.89mg,110.22μmol,4当量)、DIPEA(10.68mg,82.67μmol,14.40μL,3当量)及びL7(34.83mg,68.89μmol,2.5当量)を加え、続いてDMF(0.5mL)中のI2(8.39mg,33.07μmol,6.66μL,1.2当量)を加えた。続いて、反応混合物を20℃で16時間撹拌した。反応物にEtOAc(15mL)を加え、白色固体を沈殿させた。混合物を3分間遠心分離にかけ(5000R)、固体を得た。続いて、この固体をH2O(10mL)及びCAN(2mL)中に溶解した。溶液を凍結乾燥して粗保護化合物62(59mg,23.01μmol,収率83.50%,純度75%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=3.882分、mass calcd.for C90H130FN21O25,1923.94 961.9[M+2H]2+,m/z found 962.5 [M+2H]2+,移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、3分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持;カラム:Xtimate C18 2.1*30mm,3μm 波長:UV220nm;カラム温度50℃;MSイオン化:ESIを使用。
DCM(0.5mL)中の保護化合物62(59mg,30.68μmol,1当量)の溶液に、TFA(0.5mL)を0℃で加えた。続いて、混合物を20℃に加温し、20℃で2時間撹拌した。LCMSのトレースは、反応物が完全に消費され、所望のMSが検出されたことを示した。溶媒を30℃、減圧下で除去して粗生成物を得た。残渣を、分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini-NX C18 75*30mm*3μm;移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:0%~60%,35分)で精製し、化合物62(11mg,5.91μmol,収率19.28%,純度95%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=2.936分、mass calcd.for C81H114FN21O23,1767.82 884.2[M+2H]2+,m/z found 884.2[M+2H]2+;移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、6分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持、ESI源、正イオンモード;波長:220nm&254nm、オーブン温度50℃を使用。
HPLC:RT=6.05分。移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持;カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μm;波長:UV220nm&215nm&254nm;カラム温度を使用。
DMF(0.5mL)中の化合物62(11mg,6.23μmol,1当量)とDIBAC-suc-OSu)(2.76mg,6.85μmol,1.1当量)の溶液に、DIPEA(4.02mg,31.13μmol,5.42μL,5.0当量)を20℃で加えた。続いて、混合物を20℃で2時間撹拌した。LCMSのトレースは、反応物が完全に消費され、所望のMSが検出されたことを示した。これを、分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini-NX C18 75*30mm*3μm;移動相:[水(10mM NH4HCO3)-ACN];B%:0%~60%,35分)で精製した。LP14(10mg,4.62μmol,収率74.28%、純度95%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=0.939分、mass calcd.for C100H127FN22O25,2054.92,m/z found 1028.0[M+2H]2+移動相:1.5mL/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75mL/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5mL/分で0.7分間の5%~95%溶出勾配(溶媒B)及び95%で0.4分間保持;カラム:Agilent Pursult 5 C18 20*2.0mm 波長:UV220nm;カラム温度50℃を使用。
HPLC:RT=3.75分 移動相:水(溶媒A)及びアセトニトリル(溶媒B)、流量1.2ml/分で、5分間の0%~60%溶出勾配(溶媒B)及び60%で2分間保持、カラム:Xbridge Shield RP-18,5μm,2.1*50mm 波長:UV220nm,215nm&254nm、カラム温度:40℃を使用した。
図31は、本開示に従ったリンカーペイロードLP15及びLP16の合成を表す。
5.15(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-[4-[[(2S)-2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[4-(134-アザトリシクロヘキサデカ-11(19),12(20),13(21),15(23),69,71(74)-ヘキサエン-38-イン-134-イル)-4-オキソブタノイル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]ブトキシ]-2-エチル-73-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-4-(3,5-ジメチルフェニル)-1-(フェニルカルバモイル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチルプロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP15)の調製
オーブンで乾燥させたバイアルに、L7(47.33mg,93.62μmol,2.5当量)及びP23(65mg,37.45μmol,1当量,TFA)を入れた。HOBtのストック溶液(20.24mg,149.78μmol,4当量)、DMF(0.5mL)中のDIPEA(14.52mg,112.34μmol,19.57μL,3当量)及びDMF(2mL)中のI2(11.40mg,44.94μmol,9.05μL,1.2当量)をバイアルに加えた。反応混合物を20℃で16時間撹拌した。LCMSのトレースは、反応が完了したことを示した。反応物をEtOAc(15mL)に加え、白色固体を沈殿させた。混合物を3分間遠心分離にかけ(5000R)、粗生成物63(60mg,27.82μmol,収率74.29%及び純度97.06%)を白色固体として得た。
オーブンで乾燥させたバイアルに、L7(47.33mg,93.62μmol,2.5当量)及びP23(65mg,37.45μmol,1当量,TFA)を入れた。HOBtのストック溶液(20.24mg,149.78μmol,4当量)、DMF(0.5mL)中のDIPEA(14.52mg,112.34μmol,19.57μL,3当量)及びDMF(2mL)中のI2(11.40mg,44.94μmol,9.05μL,1.2当量)をバイアルに加えた。反応混合物を20℃で16時間撹拌した。LCMSのトレースは、反応が完了したことを示した。反応物をEtOAc(15mL)に加え、白色固体を沈殿させた。混合物を3分間遠心分離にかけ(5000R)、粗生成物63(60mg,27.82μmol,収率74.29%及び純度97.06%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=0.940分,mass calcd.for C96H132FN23O23 997m/z[M-Boc+3H]2+,m/z found 997.5m/z[M-Boc+3H]2+;Chromolith Flash RP-18e 25-3mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LC-MSを実施し、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
TFA(1mL)及びDCM(1mL)中の63(60mg,28.66μmol,1当量)の溶液を、20℃で2時間撹拌した。LCMSのトレースは、反応が完了したことを示した。反応物を真空状態で濃縮し、黄色油として粗生成物を得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:Waters Xbridge Prep OBD C18 150*40mm*10μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:0%~60%,30分)で精製し、64(45mg,22.72μmol,収率79.27%,純度97.81%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=0.890分,mass calcd.for C92H124FN23O23 968.96 m/z[M+2H]2+,m/z found 969.5m/z[M+2H]2+;Chromolith Flash RP-18e 25-3mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LC-MSを実施し、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC(ES8584-719-P1C1)を取り付けた。RT=4.18分,純度97.81%。HPLC方法A:移動相:1.0%のACN水溶液(0.1%TFA)~5%のACN水溶液(0.1%TFA)を1分;続いて5%のACN水溶液(0.1%TFA)~100%のACN(0.1%TFA)を5分;100%のACN(0.1%TFA)で2分間保持;8.01分で1.0%のCAN水溶液(0.1%TFA)に戻し、2分間保持。流量:1.2ml/分。
DMF(1.5mL)中の64(40mg,19.50μmol,1当量,TFA)とDIBAC-suc-OSu(7.85mg,19.50μmol,1当量)の溶液に、DIPEA(12.60mg,97.51μmol,16.98μL,5当量)を18℃で加えた。反応物を18℃で2時間撹拌した。LCMSのトレースは、反応が完了したことを示した。粗生成物を、分取HPLC(カラム:Waters Xbridge Prep OBD C18 150*40mm*10μm;移動相:[水(10mM NH4HCO3)-ACN];B%:0%~50%,35分)で精製し、LP15(27mg,12.07μmol,収率55.75%,純度99.42%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=0.948分,mass calcd.for C111H137FN24O25 1112.51 m/z[M+2H]2+,m/z found 1113.1 m/z[M+2H]2+;Chromolith Flash RP-18e 25-3mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LC-MSを実施し、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:逆相0.2ML/1LのNH3H2O水溶液(溶媒A)及びアセトニトリル(溶媒B)、流量1.2ML/分で、5分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で2分間保持、カラム:Xbridge Shield RP-18、5μm、2.1*50mm 波長:220nm&215nm&254nm、カラム温度:40℃を使用した。
5.16(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-[4-[[2-[[2-[[2-[[2-[[(2S)-2-[[4-(134-アザトリシクロヘキサデカ-11(19),12(20),13(21),15(23),69,71(74)-ヘキサエン-38-イン-134-イル)-4-オキソ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシプロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]ブトキシ]-2-エチル-73-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-4-(3,5-ジメチルフェニル)-1-(フェニルカルバモイル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシプロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP16)の調製
P23(70mg,43.16μmol,1当量)、L8(43.64mg,86.32μmol,2当量)及びDIBAC-suc-OSu(3.92mg,9.75μmol,1当量)、LP16(10mg,4.25μmol,収率34.87%、純度94.53%)を、実施例15に記載されているのと同一手順を使用して白色固体として調製した。
P23(70mg,43.16μmol,1当量)、L8(43.64mg,86.32μmol,2当量)及びDIBAC-suc-OSu(3.92mg,9.75μmol,1当量)、LP16(10mg,4.25μmol,収率34.87%、純度94.53%)を、実施例15に記載されているのと同一手順を使用して白色固体として調製した。
LCMS:(ESI):RT=0.845分,mass calcd.for C111H137FN24O25 1112.51[M+2H]2+,m/z found 1112.9[M+2H]2+;移動相:0.8mL/4LのNH3・H2O水溶液(溶媒A)及びアセトニトリル(溶媒B)、流量1ml/分で、2分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.48分間保持を使用。
HPLC:RT=3.73分、純度94.53%。移動相:2.0ML/4LのNH3H2O水溶液(溶媒A)及びアエトニトリル(Aetonitrile)(溶媒B)、流量1.2ml/分で、4分間の0%~60%溶出勾配(溶媒B)及び60%で2分間保持。
図32は、本開示に従ったリンカーペイロードLP17の合成を表す。
5.17(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-[4-[[(2S)-2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[(2S)-2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[4-(144-アザトリシクロヘキサデカ-8(14),9(15),10(16),12(18),68,70(73)-ヘキサエン-33-イン-144-イル)-4-オキソ-ブタノイル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]ブトキシ]-2-エチル-72-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP17)の調製
オーブンで乾燥させたバイアルに、L7(26.17mg,51.76μmol,2当量)、P9(40.00mg,25.88μmol,1当量)及び4A MS(5mg)を入れた。HOBtのストック溶液(6.99mg,51.76μmol,2当量)、DMF(0.1mL)中のDIPEA(5.02mg,38.82μmol,6.76μL,1.5当量)及びDMF(0.1mL)中のI2(3.94mg,15.53μmol,3.13μL,0.6当量)をバイアルに加えた。反応混合物を15℃で48時間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視した。混合物を濾過し、続いてEtOAc(3mL)を加えることで沈殿させた。濾過後、保護されたG4S-P9(50mg,22.31μmol,収率86.20%,純度90%)を白色の泡として得た。
オーブンで乾燥させたバイアルに、L7(26.17mg,51.76μmol,2当量)、P9(40.00mg,25.88μmol,1当量)及び4A MS(5mg)を入れた。HOBtのストック溶液(6.99mg,51.76μmol,2当量)、DMF(0.1mL)中のDIPEA(5.02mg,38.82μmol,6.76μL,1.5当量)及びDMF(0.1mL)中のI2(3.94mg,15.53μmol,3.13μL,0.6当量)をバイアルに加えた。反応混合物を15℃で48時間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視した。混合物を濾過し、続いてEtOAc(3mL)を加えることで沈殿させた。濾過後、保護されたG4S-P9(50mg,22.31μmol,収率86.20%,純度90%)を白色の泡として得た。
LCMS(ESI):RT=0.907分,mass calcd.for C95H136FN23O25
2+1009.005[M+2H]2+,m/z found 1010.4[M+2H]2+。LCMS条件:Merck,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出。
HPLC:RT=8.87分。HPLC条件:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で、0.12%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.1%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
オーブンで乾燥させたバイアルに、G4S-P9(35mg,17.35μmol,1当量)及びDCM(1mL)を入れた。TFA(1.54g,13.51mmol,1mL,778.42当量)をバイアルに入れた。反応混合物を20℃で3時間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視した。LCMS(ESI):RT=0.832分,mass calcd.for C95H136FN23O25
2+930.945[M+2H]2+,m/z found 931.3[M+2H]2+。LCMS条件:Merck,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出。反応混合物を濃縮し、黄色固体として粗生成物67(35mg,粗)を得た。
オーブンで乾燥させたバイアルに、L7(19.02mg,37.61μmol,2当量)及び化合物67(35mg,18.81μmol,1当量)を入れた。HOBtのストック溶液(10.16mg,75.23μmol,4当量)、DMF(0.5mL)中のDIPEA(7.29mg,56.42μmol,9.83μL,3当量)及びDMF(0.5mL)中のI2(5.73mg,22.57μmol,4.55μL,1.2当量)をバイアルに加えた。反応混合物を15℃で24時間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視した。混合物を濾過し、続いてEtOAc(6mL)を加えることで沈殿させた。濾過後、保護された粗生成物G4S-G4S-P9(40mg,13.38μmol,収率71.12%,純度78%)を淡黄色の泡として得た。
LCMS(ESI):RT=3.400分,mass calcd.for C106H153FN28O31
2+1166.56,m/z found 1166.9[M+2H]2+。LCMS条件:Merck,RP-18e 25-2mmカラム、流量0.8mL/分で、0.02%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出。
HPLC:RT=8.10分。HPLC条件:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で、0.12%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.1%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
オーブンで乾燥させたバイアルに、G4S-G4S-P9(40mg,17.15μmol,1当量)及びDCM(2mL)を入れた。TFA(3.08g,27.01mmol,2mL)をバイアルに入れた。反応混合物を20℃で2時間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視した。反応物を濃縮して残渣を得た。続いて、分取HPLC(TFA条件;カラム:Waters Xbridge Prep OBD C18 150*30mm*10μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:0%~60%,16分)で精製した。化合物68(15mg,6.62μmol,収率38.58%、純度96%)を白色の泡として得た。
LCMS(ESI):RT=0.744分,mass calcd.for C97H137FN28O29
2+1088.505[M+2H]2+,m/z found 1089.2[M+2H]2+。LCMS条件:移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5mL/分で、0.7分間の5%~95%溶出勾配(溶媒B)及び95%で0.4分間保持;カラム:Agilent Pursult 5 C18 20*2.0mmを使用。
HPLC RT=3.89分。HPLC条件:移動相:1.0%のACN水溶液(0.1%TFA)~5%のACN水溶液(0.1%TFA)を1分;続いて5%のACN水溶液(0.1%TFA)~100%のACN(0.1%TFA)を5分;100%のACN(0.1%TFA)で2分間保持;8.01分で1.0%のACN水溶液(0.1%TFA)に戻し、2分間保持。流量:1.2ml/分。
DMF(0.3mL)中のDIBAC-suc-OSu(3.37mg,8.36μmol,1.3当量)の溶液に、化合物68(14mg,6.43μmol,1当量)及びDIPEA(4.16mg,32.17μmol,5.60μL,5当量)を加えた。混合物を20℃で2時間撹拌した。反応の進行をLC-MSで監視した。反応混合物をDMSO(2mL)で希釈し、分取HPLC(中性条件;カラム:Waters Xbridge Prep OBD C18 150*40mm*10μm;移動相:[水(10mMBHA NH4HCO3)-ACN];B%:0%~60%,55分)で精製した。LP17(1。73mg,0.65μmol,収率10.15%、純度93%)を白色の泡として得た。
LCMS(ESI):RT=2.531分,mass calcd.for C116H150FN29O31
2+1232.05[M+2H]2+,m/z found 1232.4[M+2H]2+。LCMS条件:移動相:A)0.05% NH3H2O水溶液;B)ACN。勾配:0%のBから5.8分以内に95%のBに増加;1.1分間95%のBで保持;続いて6.91分で0%のBに戻り、0.09分間保持、流量1.0mL/分;カラム:Waters Xbridge C18 30*2.0mm,3.5μm。
HPLC:RT=2.17分:HPLC条件:移動相:0.2ML/1LのNH3H2O水溶液(溶媒A)及びアセトニトリル(溶媒B)、流量1.2ml/分で、5分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で2分間保持、カラム:Xbridge Shield RP-18,5μm,2.1*50mm;
図33は、本開示に従ったリンカーペイロードLP18及びLP20の合成を表す。
5.18(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-[4-[[2-[[2-[[2-[[2-[[(2S)-2-[3-[[(1S,8R)-9-ビシクロ[6.1.0]ノン-4-インイル]メトキシカルボニルアミノ]プロパノイルアミノ]-3-[(2R,4S,5S)-3,4,5-トリヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロピラン-2-イル]オキシプロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]ブトキシ]-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アスミノ]-3-ヒドロキシプロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP18)の調製
DMF(0.1mL)中のL13(22.92mg,25.88μmol,2当量)、PyBOP(13.47mg,25.88μmol,2当量)及びDIPEA(6.69mg,51.76μmol,9.01μL,4当量)の溶液を、25℃で5分間撹拌した。DMF(0.1mL)中のP9(20mg,12.94μmol,1当量)の溶液を混合物に加え、反応物を25℃で5分間撹拌した。混合物をEtOAc(15mL)で希釈して沈殿を得た。これを3分間(5000R)遠心分離にかけ、白色固体として粗生成物を得た。残渣を水(2mL)及びACN(2mL)で希釈した。溶液を凍結乾燥によって乾燥させ、化合物69(25mg,8.53μmol,収率65.95%,純度82.384%)を白色固体として得た。
DMF(0.1mL)中のL13(22.92mg,25.88μmol,2当量)、PyBOP(13.47mg,25.88μmol,2当量)及びDIPEA(6.69mg,51.76μmol,9.01μL,4当量)の溶液を、25℃で5分間撹拌した。DMF(0.1mL)中のP9(20mg,12.94μmol,1当量)の溶液を混合物に加え、反応物を25℃で5分間撹拌した。混合物をEtOAc(15mL)で希釈して沈殿を得た。これを3分間(5000R)遠心分離にかけ、白色固体として粗生成物を得た。残渣を水(2mL)及びACN(2mL)で希釈した。溶液を凍結乾燥によって乾燥させ、化合物69(25mg,8.53μmol,収率65.95%,純度82.384%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=2.376分,m/z calcd.for C115H148FN23O34 1207.03[M+2H]2+,m/z found 1207.4[M+2H]2+;移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、3分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持を使用。
DMF(2mL)中の化合物69(20mg,8.29μmol,1当量)の溶液に、NH2NH2・H2O(488.04μg,8.29μmol,0.2mL,純度85%,1当量)を25℃で加えた。反応物を25℃で1時間撹拌した。LCMSは、反応が完全に変換したことを示した。混合物を濾過して残渣を得た。これを分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini-NX 150*30mm*5μm;移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:0%~60%,30分)で精製し、化合物70(15mg,7.38μmol,収率71.28%,純度99.58%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=0.791分,m/z calcd.for C92H130FN23O28,1011.97[M+2H]2+,m/z found 1012.2[M+2H]2+;Merck,RP-18e 25-2mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LCMSを実施し、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:Rt=3.47分。移動相:1.0%のACN水溶液(0.1%TFA)~5%のACN水溶液(0.1%TFA)を1分;続いて5%のACN水溶液(0.1%TFA)~100%のACN(0.1%TFA)を5分;100%のACN(0.1%TFA)で2分間保持;8.01分で1.0%のACN水溶液(0.1%TFA)に戻し、2分間保持。流量:1.2ml/分。
PBS緩衝液(0.45mL,pH=8.2)及びDMF(0.9mL)中の化合物70(18mg,8.90μmol,1当量)及びL14(6.88mg,17.79μmol,2当量)の溶液を、25℃で6時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。反応物を濾過して残渣を得た。残渣を、分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini-NX 150*30mm*5μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:0%~60%,35分)で精製し、LP18(7.5mg,3.24μmol,収率36.45%,純度98.18%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=1.595分,m/z calcd.for C106H147FN24O31 1135.53[M+2H]2+,m/z found 1136.0[M+2H]2+;移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、2分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.48分間保持;Chromolith Flash RP-C18 2.1-30mmを使用。
HPLC:RT=8.17分、純度98.18%。HPLC方法A:カラム:YMC-Pack ODS-A150*4.6mm,5μm;2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ML/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持。
5.19(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-[4-[[2-[[2-[[2-[[2-[[(2S)-2-[[4-(153-アザトリシクロヘキサデカ-8(18),10(20),12(22),15(25),77(79),81(85)-ヘキサエン-42(44)-yn-153-イル)-4-オキソ-ブタノイル]アミノ]-3-[6-[[4-(153-アザトリシクロヘキサデカ-8(18),10(20),12(22),15(25),77(79),81(85)-ヘキサエン-42(44)-yn-153-イル)-4-オキソ-ブタノイル]オキシメチル]-3,4,5-トリヒドロキシテトラヒドロピラン-2-イル]オキシ-プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]ブトキシ]-2-エチル-84-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソプロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP20)の調製
70(7.90mg,18.54μmol,2.5当量)の溶液に、DMF(0.5mL)中のDIPEA(4.79mg,37.07μmol,6.46μL,5当量)を25℃で加えた。反応物を25℃で16時間撹拌した。続いてH2O(2.5mL)を加え、これを25℃で2時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。反応物を濾過し、黄色溶液として残渣を得た。残渣を、分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini-NX 150*30mm*5μm;移動相:[水(0.04%NH3H2O+10mM NH4HCO3)-ACN];B%:17%~47%,8分)で精製し、LP20(3.7mg,1.52μmol,収率20.82%,純度95.093%)を白色固体として得た。
70(7.90mg,18.54μmol,2.5当量)の溶液に、DMF(0.5mL)中のDIPEA(4.79mg,37.07μmol,6.46μL,5当量)を25℃で加えた。反応物を25℃で16時間撹拌した。続いてH2O(2.5mL)を加え、これを25℃で2時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。反応物を濾過し、黄色溶液として残渣を得た。残渣を、分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini-NX 150*30mm*5μm;移動相:[水(0.04%NH3H2O+10mM NH4HCO3)-ACN];B%:17%~47%,8分)で精製し、LP20(3.7mg,1.52μmol,収率20.82%,純度95.093%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=1.328分,m/z calcd.for C111H143FN24O30 1155.52[M+2H]2+,m/z found 1156.0[M+2H]2+;移動相:0.8mL/4LのNH3H2O水溶液(溶媒A)及びアセトニトリル(溶媒B)、流量1ml/分で、2分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.48分間保持;カラム:XBridge C18 3.5μm 2.1*30mm;波長:UV 220nm&254nm;カラム温度:50℃を使用。
HPLC:RT=1.328分、純度92.31%。HPLC方法A:移動相:0.8mL/4LのNH3H2O水溶液(溶媒A)及びアセトニトリル(溶媒B)、流量1ml/分で、5分間の0%~60%溶出勾配(溶媒B)及び60%で0.48分間保持、カラム:Xbridge Shield RP18 5μm 2.1*50mm 波長:UV220nm&254nmを使用。
図34は、本開示に従ったリンカーペイロードLP19の合成を表す。
5.20(3S)-4-[[(1S)-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-1-[[4-[4-[4-[[(2R)-2-[[2-[[2-[[2-[[2-[(2-シクロオクト-2-イン-1-イルオキシアセチル)アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]-3-ヒドロキシプロパノイル]アミノ]ブトキシ]-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシプロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP19)の調製
DMF(0.3mL)中のP9(25mg,16.17μmol,1当量)と、L15(16.35mg,32.35μmol,2.0当量)と、HOBt(4.37mg,32.35μmol,2.0当量)と、DIPEA(3.14mg,24.26μmol,4.23μL,1.5当量)の無色の溶液に、DMF(0.25mL)中のI2(2.87mg,11.32μmol,2.28μL,0.7当量)の溶液を加えた。溶液を20℃で1時間撹拌した。LCMSのトレースは、反応が完全に変換され、所望の生成物が観察されたことを示した。溶液をEtOAc(25mL)で処理し、形成された沈殿物を5分間遠心分離にかけることで回収した(5000R)。回収された白色固体をフリーズドライヤーで凍結乾燥して化合物71(45mg,21.11μmol,収率93.25%,純度94.65%)を白色固体として得た。
DMF(0.3mL)中のP9(25mg,16.17μmol,1当量)と、L15(16.35mg,32.35μmol,2.0当量)と、HOBt(4.37mg,32.35μmol,2.0当量)と、DIPEA(3.14mg,24.26μmol,4.23μL,1.5当量)の無色の溶液に、DMF(0.25mL)中のI2(2.87mg,11.32μmol,2.28μL,0.7当量)の溶液を加えた。溶液を20℃で1時間撹拌した。LCMSのトレースは、反応が完全に変換され、所望の生成物が観察されたことを示した。溶液をEtOAc(25mL)で処理し、形成された沈殿物を5分間遠心分離にかけることで回収した(5000R)。回収された白色固体をフリーズドライヤーで凍結乾燥して化合物71(45mg,21.11μmol,収率93.25%,純度94.65%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=0.880分,m/z calcd.for C95H126FN23O23 [M-Boc+2H]2+958.97,found 959.0。LC-MS方法A:Xtimate C18 2.1*30mm,3μmカラム、流量1.2mL/分で、0.75ML/4LのTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)で溶出。
HPLC:RT=4.43分。移動相:1.0%のACN水溶液(0.1%TFA)~5%のACN水溶液(0.1%TFA)を1分;続いて5%のACN水溶液(0.1%TFA)~100%のACN(0.1%TFA)を5分;100%のACN(0.1%TFA)で2分間保持;8.01分で1.0%のACN水溶液(0.1%TFA)に戻し、2分間保持。流量:1.2ml/分。
DCM(1mL)中の71(35mg,17.35μmol,1当量)の溶液に、TFA(1.54g,13.51mmol,1mL,778.42当量)を加えた。溶液を20℃で1時間撹拌した。LCMSのトレースは、反応が完全に変換され、所望の生成物が観察されたことを示した。溶液を真空状態で濃縮し、残渣を得た。残渣を逆相HPLC(0.4%AcOH)(20gのカラム、0~44%CH3CN/H2O溶出、勾配(25mL/分))により精製した。所望の流体をフリーズドライヤーで凍結乾燥して72(18mg,8.91μmol,収率51.35%,純度92.108%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=0.815分,m/z calcd.for C86H120FN23O23 [M+2H]2+930.94,found 931.2。LC-MS方法A:Xtimate C18 2.1*30mm,3μmカラム、流量1.2mL/分で、0.75ML/4LのTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)で溶出。
DMF(0.5mL)中の72(17mg,9.13μmol,1当量)とL16(5.10mg,18.27μmol,2.0当量)の溶液に、DIPEA(2.36mg,18.27μmol,3.18μL,2.0当量)を加えた。溶液を20℃で1時間撹拌した。LCMSのトレースは、反応が完全に変換され、所望の生成物が観察されたことを示した。溶液を分取HPLC(FA条件:カラム:Phenomenex Gemini-NX 150*30mm*5μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:0%~50%,35分)で精製した。所望の流体をフリーズドライヤーで凍結乾燥してLP19(8.36mg,4.12μmol,収率36.34%,純度99.72%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=3.379分,m/z calcd.for C96H132FN23O25 [M+2H]2+1012.98,found 1013.7。LCMS条件:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、6分間の10%~80%の勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持;カラム:Xtimate 3μm,C18,2.1*30mm;
HPLC:RT=8.70分,移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持;カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μmを使用。
図35は、本開示に従ったリンカーペイロードLP21の合成を表す。
5.21(3S)-4-[[(1S)-2-[[(1S)-4-[4-[4-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[4-(163-アザトリシクロヘキサデカ-7(13),8(14),9(15),11(17),108,110(113)-ヘキサエン-33-yn-163-イル)-4-オキソ-ブタノイル]アミノ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]ブトキシ]フェニル]-1-カルバモイル-ブチル]アミノ]-1-[[4-(2-エチル-4-メトキシ-フェニル)フェニル]メチル]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2R,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP21)の調製
DMF(1mL)中のP24(15mg,9.69μmol,1当量)及びL17(22.25mg,14.54μmol,1.5当量)の混合物に、DIPEA(6.26mg,48.46μmol,8.44μL,5当量)を25℃、窒素下で一度に加えた。混合物を25℃で2時間撹拌した。LCMSのトレースは、反応が完全に変換されたことを示した。反応混合物を真空状態で濃縮し、残渣を得た。残渣を分取HPLC(カラム:移動相:[水(10mM NH4HCO3)-ACN];B%:20%~50%,55分)で精製し、純粋な生成物を得た。生成物を水(10mL)中に懸濁し、混合物をドライアイス/エタノール浴で凍結させ、続いて凍結乾燥で乾燥させて所望の生成物LP21(8.2mg,2.70μmol,収率27.86%,純度97.5798%)を白色固体として得た。
DMF(1mL)中のP24(15mg,9.69μmol,1当量)及びL17(22.25mg,14.54μmol,1.5当量)の混合物に、DIPEA(6.26mg,48.46μmol,8.44μL,5当量)を25℃、窒素下で一度に加えた。混合物を25℃で2時間撹拌した。LCMSのトレースは、反応が完全に変換されたことを示した。反応混合物を真空状態で濃縮し、残渣を得た。残渣を分取HPLC(カラム:移動相:[水(10mM NH4HCO3)-ACN];B%:20%~50%,55分)で精製し、純粋な生成物を得た。生成物を水(10mL)中に懸濁し、混合物をドライアイス/エタノール浴で凍結させ、続いて凍結乾燥で乾燥させて所望の生成物LP21(8.2mg,2.70μmol,収率27.86%,純度97.5798%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=0.924分,mass calcd.for C144H213FN20O45 2961.50[M+H]+,987.167[M+3H]3+,m/z found 988.8[M+3H]3+。Chromolith Flash RP-18e 25-3mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LCMSを実施し、0.04%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.06%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC条件:RT=14.496分、Gemini-NX 5u C18 110A 150*4.6mmのカラムを使用し、流量1.0mL/分で逆相HPLCを実施し、0.1%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.1%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
図36は、本開示に従ったリンカーペイロードLP22の合成を表す。
5.22(3S)-4-[[(1S)-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-1-[[4-[4-[4-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[4-[202-[[131,132,133,134,135,136,137,138,139,140,141,142-dodecaヒドロキシ-126,127,128,129,130-ペンタキス(ヒドロキシメチル)-240,241,242,243,244,245,246,247,248,249,250,251-ドデカオキサヘプタシクロドテトラコンタン-125-イル]メチル]-187,189,202,203-テトラザテトラシクロノナデカ-8(14),10(16),11(17),12(18),112(114),115(117),123,187(189)-オクタエン-203-イル]-4-オキソ-ブタノイル]アミノ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]ブトキシ]-2-エチル-116-フェニル]フェニル]メチル]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2R,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP22)の調製
DMF(0.3mL)中の化合物LP4(5mg,1.69μmol,1当量)の混合物に、化合物L18(シクロデキストリン-N3,4.38mg,4.39μmol,2.6当量)を25℃、N2下で一度に加えた。混合物を25℃で12時間撹拌した。LCMS及びHPLCのトレースは、反応が完了したことを示した。残渣を、分取HPLC(中性:カラム:Waters Xbridge 150*25 5u;移動相:[水(10mM NH4HCO3)-ACN];B%:20%~50%,7分)で精製し、LP22(1.66mg,4.03e-1μmol,収率23.88%,純度96.149%)を白色固体として得た。
DMF(0.3mL)中の化合物LP4(5mg,1.69μmol,1当量)の混合物に、化合物L18(シクロデキストリン-N3,4.38mg,4.39μmol,2.6当量)を25℃、N2下で一度に加えた。混合物を25℃で12時間撹拌した。LCMS及びHPLCのトレースは、反応が完了したことを示した。残渣を、分取HPLC(中性:カラム:Waters Xbridge 150*25 5u;移動相:[水(10mM NH4HCO3)-ACN];B%:20%~50%,7分)で精製し、LP22(1.66mg,4.03e-1μmol,収率23.88%,純度96.149%)を白色固体として得た。
HPLC:RT=11.976分、Gemini-NX 5u C18 110A 150*4.6mmのカラムを使用し、流量1.0mL/分で逆相HPLCを実施し、0.1%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.1%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
LCMS(ESI):RT=0.877分,mass calcd.for C74H120N3O30 3956.84[M+H]+,1318.95[M+3H]3+,found 1320.2[M+3H]3+。Chromolith Flash RP-18e 25-3mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LC-MSを実施し、0.04%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.06%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
図37は、本開示に従ったリンカーペイロードLP23の合成を表す。
5.23(3S)-4-[[(1S)-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-[4-[4-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[4-[201-[[130,131,132,133,134,135,136,137,138,139,140,141-ドデカヒドロキシ-125,126,127,128,129-ペンタキス(ヒドロキシメチル)-239,240,241,242,243,244,245,246,247,248,249,250-ドデカオキサヘプタシクロドテトラコンタン-124-イル]メチル]-186,188,201,202-テトラザテトラシクロノナデカ-7(13),9(15),10(16),11(17),112(114),115(117),122,186(188)-オクタエン-202-イル]-4-オキソ-ブタノイル]アミノ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]ブトキシ]フェニル]ブチル]アミノ]-1-[[4-(2-エチル-4-メトキシ-フェニル)フェニル]メチル]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP23)の調製
LP21(9.3mg,3.10μmol,1当量)及びL18(シクロデキストリン-N3,3.7mg,3.7μmol,1.2当量)、LP23(3.5mg,8.84e-1μmol,収率50.00%、純度100%)を、実施例22と同一手順に従って、白色固体として得た。
LP21(9.3mg,3.10μmol,1当量)及びL18(シクロデキストリン-N3,3.7mg,3.7μmol,1.2当量)、LP23(3.5mg,8.84e-1μmol,収率50.00%、純度100%)を、実施例22と同一手順に従って、白色固体として得た。
HPLC条件:RT=8.14分、YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μmを使用し、流量1.5mL/分で逆相HPLCを実施し、0.1%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.1%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
LCMS(ESI):RT=0.868分,mass calcd.for C75H102FN18O17 3958.82[M+H]+,1319.61[M+H]3+,found 1321.5[M+H]3+。Chromolith Flash RP-18e 25-3mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で逆相LC-MSを実施し、0.04%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.06%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
図38は、本開示に従ったリンカーペイロードLP24の合成を表す。
5.24(3S)-4-[[(1S)-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-1-[[4-[2-エチル-4-[4-[4-[2-[2-[2-[2-[[(68S,69R,71S)-106,107,108-トリアザトリシクロドデカ-72(107),106(108)-ジエン-71-イル]メトキシカルボニルアミノ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシメチル]トリアゾール-120-イル]ブトキシ]-61-フェニル]フェニル]メチル]-2-オキソエチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP24)の調製
DMSO(0.1mL)中、LP9(1.13mg,0.571μmol,1当量)とNaN3(44.54μg,0.685μmol,1.2当量)との混合物を37℃で16時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。粗生成物LP24(1.15mg,0.569μmol,収率100.00%)をさらなる精製なしにバイオアッセイのために直接送った。
DMSO(0.1mL)中、LP9(1.13mg,0.571μmol,1当量)とNaN3(44.54μg,0.685μmol,1.2当量)との混合物を37℃で16時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。粗生成物LP24(1.15mg,0.569μmol,収率100.00%)をさらなる精製なしにバイオアッセイのために直接送った。
LCMS(ESI):RT=3.561分,m/z calcd.for C97H135FN24O23 1011.51[M+2H]2+,found 1012.0[M+2H]2+;方法Bを使用して逆相LC-MSを実施した。
図39は、GLP-1Rアゴニストリンカーペイロード(LP25)の合成経路を表す。
5.25(3S)-4-[[(1S)-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-1-[[4-[2-エチル-4-[4-[2-[2-[2-[2-[[(65R,66S,68R)-102,103,104-トリアザトリシクロドデカ-69(103),102(104)-ジエン-68-イル]メトキシカルボニルアミノ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシカルボニルアミノ]ブトキシ]-59-フェニル]フェニル]メチル]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチルプロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP25)の調製
DMSO(0.1mL)中、LP5(1.12mg,0.577μmol,1当量)とNaN3(45.01μg,0.692μmol,1.2当量)との混合物を37℃で16時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。粗生成物LP25(1.14mg,4.42e-1μmol,収率76.68%,純度77%)をさらなる精製なしにバイオアッセイのために直接送った。
DMSO(0.1mL)中、LP5(1.12mg,0.577μmol,1当量)とNaN3(45.01μg,0.692μmol,1.2当量)との混合物を37℃で16時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。粗生成物LP25(1.14mg,4.42e-1μmol,収率76.68%,純度77%)をさらなる精製なしにバイオアッセイのために直接送った。
LCMS(ESI):RT=3.571分,m/z calcd.for C105H134FN27O25 992.49 [M+2H]2+,found 993.0 [M+2H]2+;方法Bを使用して逆相LC-MSを実施した。
図40は、GLP-1Rアゴニストリンカーペイロード(LP26)の合成経路を表す。
5.26(3S)-4-[[(1S)-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-1-[[4-[2-エチル-4-[4-[[(2S)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[4-オキソ-4-(112,113,114,131-テトラザテトラシクロノナデカ-8(14),10(16),11(17),12(18),61(64),65,73(113),112(114)-オクタエン-131-イル)ブタノイル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]プロパノイル]アミノ]ブトキシ]-63-フェニル]フェニル]メチル]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP26)の調製
DMSO(0.1mL)中、LP18(1mg,4.65e-1μmol,1当量)とNaN3(36.31μg,0.559μmol,1.2当量)との混合物を37℃で16時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。粗生成物LP26(1.02mg,0.465μmol,収率100.00%)をさらなる精製なしにバイオアッセイのために直接送った。
DMSO(0.1mL)中、LP18(1mg,4.65e-1μmol,1当量)とNaN3(36.31μg,0.559μmol,1.2当量)との混合物を37℃で16時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。粗生成物LP26(1.02mg,0.465μmol,収率100.00%)をさらなる精製なしにバイオアッセイのために直接送った。
LCMS(ESI):RT=3.259分,m/z calcd.for C105H134FN27O25 1096.0,found 1096.7 [M+2H]2+;方法Fを使用して逆相LC-MSを実施した。
図41は、GLP-1Rアゴニストリンカーペイロード(LP27及びLP28)の合成経路を表す。
5.27(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-[4-[4-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[4-(2-アザトリシクロ[10.4.0.04,9]ヘキサデカ-1(12),4(9),5,7,13,15-ヘキサエン-10-イン-2-イル)-4-オキソ-ブタノイル]アミノ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシメチル]トリアゾール-1-イル]ブトキシ]-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP27)の調製
DMF(0.5mL)中のLP11(70mg,35.37μmol,1当量)とDIBAC-suc-OSu(19.92mg,49.51μmol,1.4当量)の溶液に、DIPEA(9.14mg,70.74μmol,12.32μL,2当量)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。LCMSは、反応が完全に変換され、所望の生成物が観察されたことを示した。溶液を濾過し、分取HPLC(中性条件:カラム:Phenomenex Gemini-NX 80*30mm*3μm;移動相:[水(10mM NH4HCO3)-ACN];B%:25%~55%,9分)で精製した。所望の流体をフリーズドライヤーで凍結乾燥してLP27(24.87mg,10.56μmol,収率29.86%,純度96.235%)を白色固体として得た。
DMF(0.5mL)中のLP11(70mg,35.37μmol,1当量)とDIBAC-suc-OSu(19.92mg,49.51μmol,1.4当量)の溶液に、DIPEA(9.14mg,70.74μmol,12.32μL,2当量)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。LCMSは、反応が完全に変換され、所望の生成物が観察されたことを示した。溶液を濾過し、分取HPLC(中性条件:カラム:Phenomenex Gemini-NX 80*30mm*3μm;移動相:[水(10mM NH4HCO3)-ACN];B%:25%~55%,9分)で精製した。所望の流体をフリーズドライヤーで凍結乾燥してLP27(24.87mg,10.56μmol,収率29.86%,純度96.235%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=2.316分,m/z calcd.for C113H150FN22O27 2266.09[M+H]+,756.03[M+3H]3+,found 756.3[M+3H]3+,LC-MS条件:移動相:1.5mL/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ML/分で、0.7分間の5%~95%溶出勾配(溶媒B)及び95%で0.4分間保持、カラム;Agilent Pursult5 C18 20*2.0mmを使用。
HPLC:RT=9.17分;HPLC条件:移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ML/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持;カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μmを使用。
5.28(3S)-4-[[(1S)-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-1-[[4-[2-エチル-4-[4-[4-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[4-オキソ-4-(3,4,5,13-テトラザテトラシクロ[13.4.0.02,6.07,12]ノナデカ-1(15),2(6),3,7(12),8,10,16,18-オクタエン-13-イル)ブタノイル]アミノ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシメチル]トリアゾール-1-イル]ブトキシ]フェニル]フェニル]メチル]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP28)の調製
DMSO(0.5mL)中のLP27(3mg,1.32μmol,1当量)の溶液に、NaN3(258.14ug,3.97μmol,3当量)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。LC-MSは、LP27が完全に消費され、所望の質量を有する1つの主ピークが検出されたことを示した。反応物をNH4Cl溶液(5mL)に加えた。水層を分離し、EtOAc(5mL*2)で抽出した。有機層を組み合わせ、水/塩水=1/1(400mL*2)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過し真空状態で濃縮して褐色の油として生成物を得た。残渣を分取HPLC(TFA条件;カラム:Waters Xbridge BEH C18 100*25mm*5μm;移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:15%~55%,16分)で精製し、LP28(1.02mg,4.23e-1μmol,収率31.99%,純度95.869%)を得て、白色固体として得た。
DMSO(0.5mL)中のLP27(3mg,1.32μmol,1当量)の溶液に、NaN3(258.14ug,3.97μmol,3当量)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。LC-MSは、LP27が完全に消費され、所望の質量を有する1つの主ピークが検出されたことを示した。反応物をNH4Cl溶液(5mL)に加えた。水層を分離し、EtOAc(5mL*2)で抽出した。有機層を組み合わせ、水/塩水=1/1(400mL*2)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥させ、濾過し真空状態で濃縮して褐色の油として生成物を得た。残渣を分取HPLC(TFA条件;カラム:Waters Xbridge BEH C18 100*25mm*5μm;移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:15%~55%,16分)で精製し、LP28(1.02mg,4.23e-1μmol,収率31.99%,純度95.869%)を得て、白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=3.512分,m/z calcd.for C113H151FN25O27 2309.11[M+H]+,C113H152FN25O27 1155.56[M+2H]2+,found 1155.5[M+2H]2+。LC-MS条件:移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5mL/分で、0.7分間の5%~95%溶出勾配(溶媒B)及び95%で0.4分間保持;カラム:Agilent Pursult 5 C18 20*2.0mmを使用。
HPLC:RT=4.024分;HPLC条件:移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ML/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持;カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μmを使用。
図42は、GLP-1Rアゴニストリンカーペイロード(LP29)の合成経路を表す。
工程1:tert-ブチル(3S)-4-[[(1S)-2-[[(1S)-1-[[[4-(2-アミノ-2-オキソ-エトキシ)フェニル]-(2,4-ジメトキシフェニル)メチル]カルバモイル]-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-1-[[4-[4-(4-アジドブトキシ)-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-3-tert-ブトキシ-2-[[(2S,3R)-3-tert-ブトキシ-2-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-3-tert-ブトキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-3-(2-フルオロフェニル)-2-メチル-プロパノイル]アミノ]ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタノアート(LP29-2)の調製
DMF(10mL)中のLP29-1A(86.20g,264.94μmol,1当量)の溶液に、HATU(181.33mg,476.89μmol,1.8当量)及びDIPEA(136.96mg,1.06mmol,184.59μL,4当量)を25℃で10分間にわたって加えた。続いて、溶液をLP29-1(1g,264.94μmol,純度50%,1当量)に加え、混合物をN2、20℃で2時間バブリングした。完了後、混合物を濾過し、回収した樹脂をDMF(30mL*3),DCM(30mL*3)で洗浄し、固相で粗生成物を得た。これを20%のピペリジン/DMF(10mL)で膨潤させ、25℃のN2で2時間バブリングした。完了後、混合物を濾過し、回収した樹脂をDMF(100mL*3)、DCM(100mL*3)で洗浄して樹脂に結合された粗生成物LP29-2(264.94μmol,粗)を白色固体として得た。
DMF(10mL)中のLP29-1A(86.20g,264.94μmol,1当量)の溶液に、HATU(181.33mg,476.89μmol,1.8当量)及びDIPEA(136.96mg,1.06mmol,184.59μL,4当量)を25℃で10分間にわたって加えた。続いて、溶液をLP29-1(1g,264.94μmol,純度50%,1当量)に加え、混合物をN2、20℃で2時間バブリングした。完了後、混合物を濾過し、回収した樹脂をDMF(30mL*3),DCM(30mL*3)で洗浄し、固相で粗生成物を得た。これを20%のピペリジン/DMF(10mL)で膨潤させ、25℃のN2で2時間バブリングした。完了後、混合物を濾過し、回収した樹脂をDMF(100mL*3)、DCM(100mL*3)で洗浄して樹脂に結合された粗生成物LP29-2(264.94μmol,粗)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=3.923分,m/z calcd.for C102H141FN19O20 1448.70,found 1450.40 [M-4*tBu-C17H17NO4+7H]+。LC-MS方法A:MERCK,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出。
工程2:tert-ブチル(3S)-4-[[(1S)-2-[[(1S)-1-[[[4-(2-アミノ-2-オキソ-エトキシ)フェニル]-(2,4-ジメトキシフェニル)メチル]カルバモイル]-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-1-[[4-[4-(4-アジドブトキシ)-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-3-tert-ブトキシ-2-[[(2S,3R)-3-tert-ブトキシ-2-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-3-tert-ブトキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[2-[[(2S)-2-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)-3-(4-tert-ブトキシフェニル)プロパノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-3-(2-フルオロフェニル)-2-メチル-プロパノイル]アミノ]ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタノアート(LP29-3)の合成
DMF(5mL)中のLP29-2A(222.39mg,659.12μmol,5当量)の溶液に、HATU(90.22mg,237.28μmol,1.8当量)及びDIPEA(68.15mg,527.30μmol,91.85μL,4当量)を25℃で10分間にわたって加えた。続いて、溶液をLP29-2(131.82μmol,1当量)に加え、混合物をN2、25℃で1時間バブリングした。完了後、混合物を濾過し、回収した樹脂をDMF(50mL*3)、DCM(50mL*3)で洗浄して樹脂に結合された粗生成物LP29-3(131.82μmol,粗)を黄色固体として得た。
DMF(5mL)中のLP29-2A(222.39mg,659.12μmol,5当量)の溶液に、HATU(90.22mg,237.28μmol,1.8当量)及びDIPEA(68.15mg,527.30μmol,91.85μL,4当量)を25℃で10分間にわたって加えた。続いて、溶液をLP29-2(131.82μmol,1当量)に加え、混合物をN2、25℃で1時間バブリングした。完了後、混合物を濾過し、回収した樹脂をDMF(50mL*3)、DCM(50mL*3)で洗浄して樹脂に結合された粗生成物LP29-3(131.82μmol,粗)を黄色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=3.990分,m/z calcd.for C78H102FN19O18 806.88,found 807.3[M-5tBu-Boc-C17H17NO4]2+。LC-MS方法A:MERCK,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出。
工程3:(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-[4-[4-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-アミノエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシメチル]トリアゾール-1-イル]ブトキシ]-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-[[[4-(2-アミノ-2-オキソ-エトキシ)フェニル]-(2,4-ジメトキシフェニル)メチル]カルバモイル]-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-3-tert-ブトキシ-2-[[(2S,3R)-3-tert-ブトキシ-2-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-3-tert-ブトキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[2-[[(2S)-2-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)-3-(4-tert-ブトキシフェニル)プロパノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-3-(2-フルオロフェニル)-2-メチル-プロパノイル]アミノ]ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタノアート(LP29-4)の合成
DMF(5mL)中のLP29-3(22.23μmol,1当量)及びLP29-3A(17.78mg,43.64μmol,2当量)の溶液に、アスコルビン酸ナトリウム(21.61mg,109.09μmol,5当量)、TBTA(11.58mg,21.82μmol,1当量)及びCuI(20.78mg,109.09μmol,5当量)を加えた。混合物を25℃で2時間撹拌した。完了後、混合物を濾過し、回収した樹脂をDMF(50mL*3)、DCM(50mL*3)で洗浄して樹脂に結合された粗生成物LP29-4(22.23μmol,粗)を緑色固体として得た。
DMF(5mL)中のLP29-3(22.23μmol,1当量)及びLP29-3A(17.78mg,43.64μmol,2当量)の溶液に、アスコルビン酸ナトリウム(21.61mg,109.09μmol,5当量)、TBTA(11.58mg,21.82μmol,1当量)及びCuI(20.78mg,109.09μmol,5当量)を加えた。混合物を25℃で2時間撹拌した。完了後、混合物を濾過し、回収した樹脂をDMF(50mL*3)、DCM(50mL*3)で洗浄して樹脂に結合された粗生成物LP29-4(22.23μmol,粗)を緑色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=3.085分,m/z calcd.for C97H139FN20O26 1010.51,found 1011.0[M+2H]2+;LC-MS条件:移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5mL/分で、0.7分間の5%~95%溶出勾配(溶媒B)及び95%で0.4分間保持、カラム;Agilent Pursult5 C18 20*2.0mmを使用。
工程4:(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-[4-[4-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-アミノエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシメチル]トリアゾール-1-イル]ブトキシ]-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[2-[[(2S)-2-[[2-[[(2S)-2-アミノ-3-(4-ヒドロキシフェニル)プロパノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-(2-フルオロフェニル)-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP29)の合成
樹脂結合化合物LP29-4(22.23μmol,1当量)を、TFAカクテル(TFA/TIPS/H2O=95:2.5:2.5,10mL)を使用して酸性切断に供し、混合物を25℃で2時間振盪した。混合物を濾過し、濾液を0℃のt-BuOMe(100mL)で希釈し、沈殿を得た。これを10分間遠心分離にかけた(5000R)。残渣を分取HPLC(カラム:Boston Green ODS150*30mm*5μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:17%~57%、9分間)により精製し、生成物LP29(7.55mg,3.69μmol,収率16.58%、純度98.63%)を白色固体として得た。
樹脂結合化合物LP29-4(22.23μmol,1当量)を、TFAカクテル(TFA/TIPS/H2O=95:2.5:2.5,10mL)を使用して酸性切断に供し、混合物を25℃で2時間振盪した。混合物を濾過し、濾液を0℃のt-BuOMe(100mL)で希釈し、沈殿を得た。これを10分間遠心分離にかけた(5000R)。残渣を分取HPLC(カラム:Boston Green ODS150*30mm*5μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:17%~57%、9分間)により精製し、生成物LP29(7.55mg,3.69μmol,収率16.58%、純度98.63%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=3.133分,m/z calcd.for C97H139FN20O26 1010.51,found 1011.0[M+2H]2+。LC-MS方法A:MERCK,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出。
HPLC:RT=3.77分;HPLC条件:移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5mL/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持;カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μmを使用。
図43は、GLP-1Rアゴニストリンカーペイロード(LP30)の合成経路を表す。
5.30(8S,14S,17S,20S,23S,26S)-8-((2H-テトラゾール-5-イル)メチル)-26-(((S)-3-(4’-(4-(4-(25-アミノ-2,5,8,11,14,17,20,23-オウタオキサペンタコシル)-1H-1,2,3-トリアゾール-1-イル)ブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)-1-(((S)-1-アミノ-5-(4-(23-ヒドロキシ-3-オキソ-6,9,12,15,18,21-ヘキサオキサ-2-アザトリコシル)フェニル)-1-オキソペンタン-2-イル)アミノ)-1-オキソプロパン-2-イル)カルバモイル)-17-(2-フルオロベンジル)-14,20-ビス((R)-1-ヒドロキシエチル)-23-(ヒドロキシメチル)-1-(1H-イミダゾール-5-イル)-5,5,17-トリメチル-4,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキソ-3,7,10,13,16,19,22,25-オクタアザオクタコサン-28-酸(LP30)の調製
H2O(0.09mL)中のP35(15mg,7.51μmol,1当量)の溶液に、CuSO4・5H2O(1.88mg,7.51μmol,1.0当量)、ナトリウムの溶液;DMSO(0.03mL)中の(2R)-2-[(1S)-1,2-ジヒドロキシエチル]-4-ヒドロキシ-5-オキソ-2H-フラン-3-オラート(1.49mg,7.51μmol,1.0当量)、続いてH2O(0.03mL)中のTBTA(1.99mg,3.76μmol,0.5当量)及びDMSO(0.03mL)中のLP30-1(6.12mg,15.02μmol,2.0当量)の溶液を加えた。混合物を30℃で2.5時間撹拌した。LCMSは、所望のMSが検出されたことを示した。反応混合物を分取HPLC(カラム:Waters X bridge BEH C18 100*25mm*5μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:5%~42.5%,12分)で精製し、LP30(2mg,8.15e-1μmol,収率10.85%,純度98%)を白色固体として得た。
H2O(0.09mL)中のP35(15mg,7.51μmol,1当量)の溶液に、CuSO4・5H2O(1.88mg,7.51μmol,1.0当量)、ナトリウムの溶液;DMSO(0.03mL)中の(2R)-2-[(1S)-1,2-ジヒドロキシエチル]-4-ヒドロキシ-5-オキソ-2H-フラン-3-オラート(1.49mg,7.51μmol,1.0当量)、続いてH2O(0.03mL)中のTBTA(1.99mg,3.76μmol,0.5当量)及びDMSO(0.03mL)中のLP30-1(6.12mg,15.02μmol,2.0当量)の溶液を加えた。混合物を30℃で2.5時間撹拌した。LCMSは、所望のMSが検出されたことを示した。反応混合物を分取HPLC(カラム:Waters X bridge BEH C18 100*25mm*5μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:5%~42.5%,12分)で精製し、LP30(2mg,8.15e-1μmol,収率10.85%,純度98%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=2.628分,mass calcd.for C112H174FN22O35 2406.23[M+H]+,802.74[M+3H]3+,found 802.20[M+3H]3+。LC-MS条件:移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、6.0分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持;カラム:Xtimate 3μm,C18,2.1*30mmを使用。波長:UV220nm&254nm;カラム温度:50℃。
HPLC:RT=6.32分、純度98%。HPLC方法A:カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μm;2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持を使用。
図44は、GLP-1Rアゴニストリンカーペイロード(LP31)の合成経路を表す。
5.31(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-[4-[4-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-アミノエト-キシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシメチル]トリアゾール-1-イル]ブトキシ]-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP31)の調製
DMSO(0.1mL)及びH2O(0.4mL)中のP8(40mg,25.45μmol,1当量)及びLP31-1(29.71mg,50.90μmol,2当量)の溶液に、TBTA(6.75mg,12.72μmol,0.5当量)、CuSO4・5H2O(6.35mg,25.45μmol,1当量)及びアスコルビン酸ナトリウム(5.04mg,25.45μmol,1当量)に加えた。混合物を37℃で4時間撹拌した。LC-MSは、所望の質量が検出されたことを示した。緑色の溶液を濾過し、粗生成物を得た。残渣を分取HPLC(TFA条件,カラム:Welch Xtimate C18 100*40mm*3μm;移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:23%~53%,10分)で精製し、LP31(バッチ1:11.59mg,5.21μmol,収率20.48%,純度96.94%)及び(バッチ2:11.13mg,4.95μmol,収率19.45%,純度95.86%)を黄色ゴムとして得た。
DMSO(0.1mL)及びH2O(0.4mL)中のP8(40mg,25.45μmol,1当量)及びLP31-1(29.71mg,50.90μmol,2当量)の溶液に、TBTA(6.75mg,12.72μmol,0.5当量)、CuSO4・5H2O(6.35mg,25.45μmol,1当量)及びアスコルビン酸ナトリウム(5.04mg,25.45μmol,1当量)に加えた。混合物を37℃で4時間撹拌した。LC-MSは、所望の質量が検出されたことを示した。緑色の溶液を濾過し、粗生成物を得た。残渣を分取HPLC(TFA条件,カラム:Welch Xtimate C18 100*40mm*3μm;移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:23%~53%,10分)で精製し、LP31(バッチ1:11.59mg,5.21μmol,収率20.48%,純度96.94%)及び(バッチ2:11.13mg,4.95μmol,収率19.45%,純度95.86%)を黄色ゴムとして得た。
バッチ1:LCMS:(ESI):RT=3.160分,m/z calcd.for C102H153FN21O29,2155.10[M+H]+,C102H154FN21O29,1078.05[M+2H]2+,found 1078.6[M+2H]2+。LC-MS方法A:MERCK,RP-18e 25-2mmカラムを使用し、流量1.5mL/分、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:RT=7.48分;HPLC条件:移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ML/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持;カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μmを使用。
バッチ2:LCMS(ESI):RT=3.147分,m/z calcd.for C102H153FN21O29 2155.10 [M+H]+,C102H154FN21O29 1078.05[M+2H]2+,found 1078.6[M+2H]2+。LC-MS方法A:MERCK,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出。
HPLC:RT=7.48分;HPLC条件:移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ML/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持;カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μmを使用。
図45は、GLP-1Rアゴニストリンカーペイロード(LP32)の合成経路を表す。
5.32(2S)-2-[[(2S)-3-[4-[4-[4-[4-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-アミノエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシメチル]トリアゾール-1-イル]ブトキシ]-2-エチル-フェニル]フェニル]-2-[[(2S)-3-カルボキシ-2-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-5-(3,5-ジメチルフェニル)ペンタン酸(LP32)の調製
H2O(1mL)中のLP31-1(35mg,22.25μmol,1当量)の溶液に、CuSO4・5H2O(5.56mg,22.25μmol,1当量)及びNaVc(4.41mg,22.25μmol,1当量)の溶液、DMSO(0.25mL)中のTBTA(5.90mg,11.13μmol,0.5当量)の溶液及びDMSO(0.25mL)中のP41(18.14mg,44.51μmol,2当量)の溶液を加えた。混合物を40℃で12時間撹拌した。反応混合物をH2O(3mL)及びACN(2mL)で希釈し、続いて混合物を濾過した。濾液を分取HPLC(カラム:Welch Xtimate C18 100*40mm*3μm;移動相:[水(TFA)-ACN];B%:20%~60%,10分)で精製し、LP31(1mg,0.46μmol,収率10.11%,純度91%)を得た。
H2O(1mL)中のLP31-1(35mg,22.25μmol,1当量)の溶液に、CuSO4・5H2O(5.56mg,22.25μmol,1当量)及びNaVc(4.41mg,22.25μmol,1当量)の溶液、DMSO(0.25mL)中のTBTA(5.90mg,11.13μmol,0.5当量)の溶液及びDMSO(0.25mL)中のP41(18.14mg,44.51μmol,2当量)の溶液を加えた。混合物を40℃で12時間撹拌した。反応混合物をH2O(3mL)及びACN(2mL)で希釈し、続いて混合物を濾過した。濾液を分取HPLC(カラム:Welch Xtimate C18 100*40mm*3μm;移動相:[水(TFA)-ACN];B%:20%~60%,10分)で精製し、LP31(1mg,0.46μmol,収率10.11%,純度91%)を得た。
LCMS:(ESI):RT=2.910分,m/z calcd.for C94H136FN20O26,991.05[M+H]+,found 990.9[M+H]+。LC-MS方法A:MERCK,RP-18e 25-2mmカラムを使用し、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:RT=7.56分,移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び100%で5分間保持;カラム:YMC-Pack ODS-A150*4.6mm,5μmを使用。
図46は、GLP-1Rアゴニストリンカーペイロード(LP33)の合成経路を表す。
工程1:(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-[4-[4-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[(4S)-5-tert-ブトキシ-4-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-5-オキソ-ペンタノイル]アミノ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシメチル]トリアゾール-1-イル]ブトキシ]-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP33-2)の合成
DMF(2mL)中のLP11(10mg,5.05μmol,1当量)とLP33-1(2.9mg,5.5μmol,1当量)の溶液に、DIPEA(1.96mg,15.16μmol,2.64μL,3当量)を加えた。混合物を20℃で12時間撹拌した。LC-MSは、LP11が完全に消費され、所望の質量を有する1つの主ピークが検出されたことを示した。LCMS(ESI):RT=4.030分,m/z calcd.for C118H163O30N22F 796.6[M+3H]3+,found 796.5。移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、6分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持、カラム:Xtimate C18 2.1*30mm,3μm、波長:UV220nm&254nm;カラム温度:50℃;MSイオン化:ESIを使用。反応物を分取HPLC(カラム:O-phenomenex clarity RP 150*10mm*5μm;移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:20%~70%,20分)で精製し、生成物LP33-2(8mg,3.12μmol,収率61.70%,純度93%)を得た。
DMF(2mL)中のLP11(10mg,5.05μmol,1当量)とLP33-1(2.9mg,5.5μmol,1当量)の溶液に、DIPEA(1.96mg,15.16μmol,2.64μL,3当量)を加えた。混合物を20℃で12時間撹拌した。LC-MSは、LP11が完全に消費され、所望の質量を有する1つの主ピークが検出されたことを示した。LCMS(ESI):RT=4.030分,m/z calcd.for C118H163O30N22F 796.6[M+3H]3+,found 796.5。移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、6分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持、カラム:Xtimate C18 2.1*30mm,3μm、波長:UV220nm&254nm;カラム温度:50℃;MSイオン化:ESIを使用。反応物を分取HPLC(カラム:O-phenomenex clarity RP 150*10mm*5μm;移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:20%~70%,20分)で精製し、生成物LP33-2(8mg,3.12μmol,収率61.70%,純度93%)を得た。
LCMS(ESI):RT=4.003分、m/z calcd.for C118H163O30N22F,1194.17[M+2H]+/2,found 1194.3 移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、6分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持;カラム:Xtimate C18 2.1*30mm,3μm 波長:UV220nm,254nm;カラム温度50℃;MSイオン化:ESIを使用。
工程2:(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-[4-[4-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[(4S)-4-アミノ-5-tert-ブトキシ-5-オキソペンタノイル]アミノ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシメチル]トリアゾール-1-イル]ブトキシ]-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP33-3)
THF(0.5mL)中のLP32-2(8mg,3.35μmol,1当量)の溶液に、N-エチルエタンアミン(2.45mg,33.52μmol,3.45μL,10当量)を加えた。混合物を20℃で3時間撹拌した。LC-MSは、LP32-3が完全に消費され、所望の質量を有する1つの主ピークが検出されたことを示した。LCMS(ESI):RT=3.070分,m/z calcd.for C118H153O28N22F 1082.5[M+2H]2+,found 1082.9。移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、6分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持、カラム:Xtimate C18 2.1*30mm,3μm、波長:UV220nm&254nm;カラム温度:50℃;MSイオン化:ESIを使用。反応混合物を減圧下で濃縮し、無色の油としてLP33-3(7mg,粗)を得た。
THF(0.5mL)中のLP32-2(8mg,3.35μmol,1当量)の溶液に、N-エチルエタンアミン(2.45mg,33.52μmol,3.45μL,10当量)を加えた。混合物を20℃で3時間撹拌した。LC-MSは、LP32-3が完全に消費され、所望の質量を有する1つの主ピークが検出されたことを示した。LCMS(ESI):RT=3.070分,m/z calcd.for C118H153O28N22F 1082.5[M+2H]2+,found 1082.9。移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、6分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持、カラム:Xtimate C18 2.1*30mm,3μm、波長:UV220nm&254nm;カラム温度:50℃;MSイオン化:ESIを使用。反応混合物を減圧下で濃縮し、無色の油としてLP33-3(7mg,粗)を得た。
工程3:(2S)-2-アミノ-5-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[1-[4-[4-[4-[(2S)-3-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-[[(2S)-3-カルボキシ-2-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-3-オキソ-プロピル]フェニル]-3-エチル-フェノキシ]ブチル]トリアゾール-4-イル]メトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エチルアミノ]-5-オキソ-ペンタン酸(LP33)
DCM(0.5mL)中のLP33-3(7mg,3.23μmol,1当量)の溶液に、TFA(770.00mg,6.75mmol,500.00μl,2088.06当量)を加えた。混合物を20℃で1時間撹拌した。LC-MSは、LP32-4が完全に消費され、所望の質量を有する1つの主ピークが検出されたことを示した。LCMS(ESI):RT=2.977分,m/z calcd.for C99H145O28N22F 1054.52[M+2H]2+,found 1054.9。移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、6分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持、カラム:Xtimate C18 2.1*30mm,3μm、波長:UV220nm&254nm;カラム温度:50℃;MSイオン化:ESIを使用。反応混合物を濾過して残渣を得た。残渣を分取HPLC(カラム:O-phenomenex clarity RP 150*10mm*5μm;移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:15%~65%,25分)で精製し、生成物LP33(2.1mg,9.66e-1μmol,収率29.87%,純度97%)を白色固体として得た。
DCM(0.5mL)中のLP33-3(7mg,3.23μmol,1当量)の溶液に、TFA(770.00mg,6.75mmol,500.00μl,2088.06当量)を加えた。混合物を20℃で1時間撹拌した。LC-MSは、LP32-4が完全に消費され、所望の質量を有する1つの主ピークが検出されたことを示した。LCMS(ESI):RT=2.977分,m/z calcd.for C99H145O28N22F 1054.52[M+2H]2+,found 1054.9。移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、6分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持、カラム:Xtimate C18 2.1*30mm,3μm、波長:UV220nm&254nm;カラム温度:50℃;MSイオン化:ESIを使用。反応混合物を濾過して残渣を得た。残渣を分取HPLC(カラム:O-phenomenex clarity RP 150*10mm*5μm;移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:15%~65%,25分)で精製し、生成物LP33(2.1mg,9.66e-1μmol,収率29.87%,純度97%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=2.950分、m/z calcd.for C99H145O28N22F,1054.52[M+2H]+/2,found 1054.9 移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、6分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持;カラム:Xtimate C18 2.1*30mm,3μm 波長:UV220nm,254nm;カラム温度50℃;MSイオン化:ESIを使用。
UPLC:RT=3.277分,移動相:0.05%のTFA水溶液(溶媒A)及び0.05%のTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.6ml/分で、5分間の5%~95%溶出勾配(溶媒B)及び95%で3分間保持;カラム:Waters ACQUITY UPLC HSS T3 1.8um,2.1x100mmを使用。
図47は、GLP-1Rアゴニストリンカーペイロード(LP34)の合成経路を表す。
工程1:[(2-クロロフェニル)-ジフェニル-メチル]2-[[2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)アセチル]アミノ]アセタート(LP34-2)の調製
DMF(200mL)中のLP34-1(20g,21.01mmol,純度32.8%,1当量)の混合物を30分間振盪し、DMF(200mL)中の2-[[2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)アセチル]アミノ]酢酸(37.23g,105.06mmol,5当量)と、DIPEA(27.16g,210.11mmol,36.60mL,10当量)との溶液を加えた。得られた混合物を20℃で12時間振盪した。得られた混合物を20℃で12時間振盪した。混合物をMeOH(100mL)に加え、さらに2時間振盪した。粗生成物WUXI-262-2(26.68g,粗)を、黄色固体としてさらなる精製なしに次の工程で使用した。
DMF(200mL)中のLP34-1(20g,21.01mmol,純度32.8%,1当量)の混合物を30分間振盪し、DMF(200mL)中の2-[[2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)アセチル]アミノ]酢酸(37.23g,105.06mmol,5当量)と、DIPEA(27.16g,210.11mmol,36.60mL,10当量)との溶液を加えた。得られた混合物を20℃で12時間振盪した。得られた混合物を20℃で12時間振盪した。混合物をMeOH(100mL)に加え、さらに2時間振盪した。粗生成物WUXI-262-2(26.68g,粗)を、黄色固体としてさらなる精製なしに次の工程で使用した。
工程2:(4S)-4-[[(2S)-1-[(2S)-2-アミノ-4-メチル-ペンタノイル]ピロリジン-2-カルボニル]アミノ]-5-[[(1S,2R)-1-[[2-(カルボキシメチルアミノ)-2-オキソ-エチル]カルバモイル]-2-ヒドロキシ-プロピル]アミノ]-5-オキソ-ペンタン酸(LP34-3)の調製
Liberty Lite-Automated Microwaveペプチド合成装置で固相ペプチド合成を行った。LP34-2樹脂(0.43mmol,1当量)を、標準で300秒、DMF(10mL)で膨潤させた。ペプチド合成装置での標準操作に従い、a)脱保護:20%ピペリジン/DMF(5mL)の溶液を樹脂容器に加え、90℃、N2で2分間撹拌した。続いて容器からこれを排出し、DMF(3mL×3)を用いて20℃で洗浄した。b)カップリング(各アミノ酸は5.0当量で3つ組で反応した):DMF(5mL)、DIC(2mL)及びオキシマ(1mL)中のアミノ酸(2.5mmol,5当量)の溶液を容器に加え、90℃、N2で10分間撹拌した。全てのアミノ酸についてa)及びb)を繰り返す。TFAカクテル(TFA/TIPS/H2O=95:2.5:2.5)を使用することで樹脂を酸性切断に供し、続いてこれを濾過し、濾液をt-BuOMeで希釈して沈殿を得た。これを10分間遠心分離(5000R)にかけて白色固体として生成物P34-3(0.6g,粗,TFA)を得た。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)13.13-11.71(m,2H),8.52-7.97(m,7H),7.85-7.59(m,1H),5.06(br s,1H),4.48-4.28(m,2H),4.26-4.16(m,1H),4.12(br s,1H),4.04-3.94(m,1H),3.90-3.68(m,5H),2.35-1.72(m,9H),1.64-1.44(m,2H),1.03(d,J=6.3Hz,3H),0.96-0.87(m,6H)。
工程3:(4S)-5-[[(1S,2R)-1-[[2-(カルボキシメチルアミノ)-2-オキソ-エチル]カルバモイル]-2-ヒドロキシ-プロピル]アミノ]-4-[[(2S)-1-[(2S)-4-メチル-2-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-プロプ-2-インオキシエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]ペンタノイル]ピロリジン-2-カルボニル]アミノ]-5-オキソ-ペンタン酸(LP34-5)の調製
Liberty Lite-Automated Microwaveペプチド合成装置で固相ペプチド合成を行った。LP34-2樹脂(0.43mmol,1当量)を、標準で300秒、DMF(10mL)で膨潤させた。ペプチド合成装置での標準操作に従い、a)脱保護:20%ピペリジン/DMF(5mL)の溶液を樹脂容器に加え、90℃、N2で2分間撹拌した。続いて容器からこれを排出し、DMF(3mL×3)を用いて20℃で洗浄した。b)カップリング(各アミノ酸は5.0当量で3つ組で反応した):DMF(5mL)、DIC(2mL)及びオキシマ(1mL)中のアミノ酸(2.5mmol,5当量)の溶液を容器に加え、90℃、N2で10分間撹拌した。全てのアミノ酸についてa)及びb)を繰り返す。TFAカクテル(TFA/TIPS/H2O=95:2.5:2.5)を使用することで樹脂を酸性切断に供し、続いてこれを濾過し、濾液をt-BuOMeで希釈して沈殿を得た。これを10分間遠心分離(5000R)にかけて白色固体として生成物P34-3(0.6g,粗,TFA)を得た。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)13.13-11.71(m,2H),8.52-7.97(m,7H),7.85-7.59(m,1H),5.06(br s,1H),4.48-4.28(m,2H),4.26-4.16(m,1H),4.12(br s,1H),4.04-3.94(m,1H),3.90-3.68(m,5H),2.35-1.72(m,9H),1.64-1.44(m,2H),1.03(d,J=6.3Hz,3H),0.96-0.87(m,6H)。
工程3:(4S)-5-[[(1S,2R)-1-[[2-(カルボキシメチルアミノ)-2-オキソ-エチル]カルバモイル]-2-ヒドロキシ-プロピル]アミノ]-4-[[(2S)-1-[(2S)-4-メチル-2-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-プロプ-2-インオキシエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]ペンタノイル]ピロリジン-2-カルボニル]アミノ]-5-オキソ-ペンタン酸(LP34-5)の調製
DMF(2mL)中のLP34-3(45mg,65.54μmol,1当量,TFA)とLP34-4(36.54mg,65.54μmol,1当量)の溶液に、DIPEA(16.94mg,131.07μmol,22.83μl,2当量)を加えた。溶液を20℃で1時間撹拌した。LCMSは、所望の生成物が観察されたことを示した。(ESI):RT=2.455分,mass calcd.for C47H77N19O19N6 992.08[M+H]+,found 991.6[M+H]+。Chromolith Flash、1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)を使用し、流量0.8ml/分で逆相LCMSを実施し、6分間の10%~80%の溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持;カラム:Xtimate 3μm,C18,2.1*30mmを使用した。混合物をCH3CN(2mL)で希釈した。残渣を分取HPLC(TFA条件;カラム:Welch Xtimate C18 100*40mm*3μm;移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:15%~45%,10分)で精製した。LP34-5(50mg,49.54μmol,収率75.59%,純度98.2%)を無色の油として得て、LCMS:ES17478-97-P1D2,HPLC:ES17478-97-p1C1及びHNMR:ES17478-97-P1B1で確認した。
(ESI):RT=3.158分,mass calcd.for C47H77N19O19N6 992.08[M+H]+,found 991.6[M+H]+,Chromolith Flash 1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)を使用し、流量0.8ml/分で逆相LCMSを実施し、6分間の0%~60%の勾配(溶媒B)及び60%で0.5分間保持;カラム:Xtimate 3μm,C18,2.1*30mmを使用した。
HPLC:RT=3.69分;HPLC条件:移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の1%~100%溶出勾配(溶媒B)及び100%で5分間保持;カラム:Ultimate XB-C18,3μm,3.0*50mmを使用。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)8.20-8.06(m,4H),7.61(d,J=8.0Hz,1H),4.62-4.50(m,1H),4.34(br dd,J=4.4,8.0Hz,1H),4.31-4.24(m,1H),4.19(dd,J=4.0,8.0Hz,1H),4.14(d,J=2.4Hz,2H),4.04-3.96(m,1H),3.82-3.73(m,4H),3.60-3.47(m,34H),2.41-2.25(m,4H),1.99-1.82(m,4H),1.80-1.69(m,1H),1.67-1.56(m,1H),1.50-1.35(m,2H),1.32-1.22(m,1H),1.03(d,J=6.4Hz,3H),0.88(t,J=7.2Hz,6H)。
工程4:(4S)-4-[[(2R)-1-[(2S)-2-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[1-[5-[4-[4-[(2S)-3-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-[[(2S)-3-カルボキシ-2-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-3-オキソ-プロピル]フェニル]-3-エチル-フェノキシ]ペンチル]トリアゾール-4-イル]メトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]-4-メチル-ペンタノイル]ピロリジン-2-カルボニル]アミノ]-5-[[(1S,2R)-1-[[2-(カルボキシメチルアミノ)-2-オキソ-エチル]カルバモイル]-2-ヒドロキシ-プロピル]アミノ]-5-オキソ-ペンタン酸(LP34)の調製
DMSO(0.8mL)及びH2O(0.8mL)中のP8(15mg,9.54μmol,1当量)、LP34-5(19.00mg,19.17μmol,2.01当量)の溶液に、CuSO4・5H2O(2.38mg,9.54μmol,1当量)及びアスコルビン酸ナトリウム(1.89mg,9.54μmol,1当量)及び1-(1-ベンジルトリアゾール-4-イル)-N,N-ビス[(1-ベンジルトリアゾール-4-イル)メチル]メタンアミン(2.5mg,4.77μmol,0.5当量)に加えた。得られた混合物を25℃で3時間撹拌した。LCMSは、所望の生成物が観察されたことを示した。(ESI):RT=3.677分,mass calcd.for C120H175N26O36 2562.25[M+H]+,1282.6[M+2H]2+,found 1282.2[M+2H]2+。Chromolith Flash 1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)を使用し、流量0.8ml/分で逆相LCMSを実施し、6分間の10%~80%の勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持;カラム:Xtimate 3μm,C18,2.1*30mmを使用した。MeOH(2mL)で混合物を希釈し、濾過して濾液を分取HPLCに送った。残渣を分取HPLC(TFA条件)で精製した。カラム:Welch Xtimate C18 100*40mm*3μm;移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:28%~58%,8分。LP34(8.9mg,3.33μmol,収率34.85%、純度96.3%)を白色固体として得た。
DMSO(0.8mL)及びH2O(0.8mL)中のP8(15mg,9.54μmol,1当量)、LP34-5(19.00mg,19.17μmol,2.01当量)の溶液に、CuSO4・5H2O(2.38mg,9.54μmol,1当量)及びアスコルビン酸ナトリウム(1.89mg,9.54μmol,1当量)及び1-(1-ベンジルトリアゾール-4-イル)-N,N-ビス[(1-ベンジルトリアゾール-4-イル)メチル]メタンアミン(2.5mg,4.77μmol,0.5当量)に加えた。得られた混合物を25℃で3時間撹拌した。LCMSは、所望の生成物が観察されたことを示した。(ESI):RT=3.677分,mass calcd.for C120H175N26O36 2562.25[M+H]+,1282.6[M+2H]2+,found 1282.2[M+2H]2+。Chromolith Flash 1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)を使用し、流量0.8ml/分で逆相LCMSを実施し、6分間の10%~80%の勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持;カラム:Xtimate 3μm,C18,2.1*30mmを使用した。MeOH(2mL)で混合物を希釈し、濾過して濾液を分取HPLCに送った。残渣を分取HPLC(TFA条件)で精製した。カラム:Welch Xtimate C18 100*40mm*3μm;移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:28%~58%,8分。LP34(8.9mg,3.33μmol,収率34.85%、純度96.3%)を白色固体として得た。
LCMS RT=3.682分,mass calcd.for C120H175N26O36 2562.25[M+H]+,1282.6[M+2H]2+,found 1282.2[M+2H]2+。Chromolith Flash 1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)を使用し、流量0.8ml/分で逆相LCMSを実施し、6分間の10%~80%の勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持;カラム:Xtimate 3μm,C18,2.1*30mmを使用した。
HPLC:RT=4.34分;HPLC条件:移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ML/分で、10分間の1%~100%溶出勾配(溶媒B)及び100%で5分間保持;カラム:Ultimate XB-C18,3μm,3.0*50mmを使用。
図48は、GLP-1Rアゴニストリンカーペイロード(LP35)の合成経路を表す。
(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-[4-[4-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[(4S)-4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(ベンジルオキシカルボニルアミノ)-4-メチル-ペンタノイル]アミノ]-4-メチル-ペンタノイル]アミノ]-5-[[2-[[(1S)-2-(カルボキシメチルアミノ)-1-(ヒドロキシメチル)-2-オキソ-エチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-5-オキソ-ペンタノイル]アミノ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシメチル]トリアゾール-1-イル]ブトキシ]-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP35)の調製
LP11(6.0mg,2.72μmol,1.0当量,2TFA)及びPBS緩衝液(K-フリー,100mM,pH=7.20)(7.2mL)の溶液のpHを7.2と測定した。LP35-1(9.62mg,13.59μmol,5.0当量)及びMTGase(Ajinomoto-TI,51.6mg)を加えた。得られた混合物を37℃で16時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視した。完了時に、反応混合物をAcOH水溶液(1%v/v,7.2mL)でクエンチした。得られた固体をDMF/H2O(3mL,1/1)ですすぎ、続いて濾液を分取HPLC(カラム:O-Xbridge C18 150*10mm*5μm;移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:10%~65%,20分)で精製してLP35(2.62mg,0.926μmol,収率34.1%,純度98.3%,TFA塩)を白色固体として得た。
LP11(6.0mg,2.72μmol,1.0当量,2TFA)及びPBS緩衝液(K-フリー,100mM,pH=7.20)(7.2mL)の溶液のpHを7.2と測定した。LP35-1(9.62mg,13.59μmol,5.0当量)及びMTGase(Ajinomoto-TI,51.6mg)を加えた。得られた混合物を37℃で16時間撹拌した。反応の進行をLCMSで監視した。完了時に、反応混合物をAcOH水溶液(1%v/v,7.2mL)でクエンチした。得られた固体をDMF/H2O(3mL,1/1)ですすぎ、続いて濾液を分取HPLC(カラム:O-Xbridge C18 150*10mm*5μm;移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:10%~65%,20分)で精製してLP35(2.62mg,0.926μmol,収率34.1%,純度98.3%,TFA塩)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):RT=3.62分,m/z calcd.for C126H184FN27O36 1335.17[M+2H]2+,found 1335.6;220nmで純度100%。LCMS条件:Xtimate C18 2.1*30mm,3μm;1.5mL/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75mL/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8mL/分で、6分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持。
UPLC:RT=7.15分、220nmで純度98.38%。UPLC方法:カラム:Waters ACQUITY UPLC BEH C18 1.7um,2.1*100mm;1Lの水中の0.05%のTFA(溶媒A)及び1Lのアセトニトリル中の0.05%のTFA(溶媒B)、流量0.4mL/分で、11分間の3%~100%溶出勾配(溶媒B)及び100%で4分間保持。
図49は、GLP-1Rアゴニストリンカーペイロード(LP36,LP37,LP38,LP39,LP40,LP41)の合成経路を表す。
5.36(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-[4-[4-[[[(2S)-2-[[2-[[2-[[2-[(2-アミノアセチル)アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]メチル]トリアゾール-1-イル]ブトキシ]-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(1H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP36)の調製
Liberty Lite-Automated Microwaveペプチド合成装置で固相ペプチド合成を行った。LP36-1(0.43mmol,1当量)を、標準で300秒、DMF(10mL)で膨潤させた。ペプチド合成装置での標準操作に従い、a)脱保護:20%ピペリジン/DMF(5mL)の溶液を樹脂容器に加え、90℃、N2で2分間撹拌した。続いて容器からこれを排出し、DMF(3mL×3)を用いて20℃で洗浄した。b)カップリング(各アミノ酸は5.0当量で3つ組で反応した):DMF(5mL)、DIC(2mL)及びオキシマ(1mL)中のアミノ酸(2.5mmol,5当量)の溶液を容器に加え、90℃、N2で10分間撹拌した。全てのアミノ酸についてa)及びb)を繰り返す。TFAカクテル(TFA/TIPS/H2O=95:2.5:2.5)を使用することで樹脂を酸性切断に供し、続いてこれを濾過し、濾液をt-BuOMeで希釈して沈殿を得た。これを10分間遠心分離(5000R)にかけて粗生成物を得た。
Liberty Lite-Automated Microwaveペプチド合成装置で固相ペプチド合成を行った。LP36-1(0.43mmol,1当量)を、標準で300秒、DMF(10mL)で膨潤させた。ペプチド合成装置での標準操作に従い、a)脱保護:20%ピペリジン/DMF(5mL)の溶液を樹脂容器に加え、90℃、N2で2分間撹拌した。続いて容器からこれを排出し、DMF(3mL×3)を用いて20℃で洗浄した。b)カップリング(各アミノ酸は5.0当量で3つ組で反応した):DMF(5mL)、DIC(2mL)及びオキシマ(1mL)中のアミノ酸(2.5mmol,5当量)の溶液を容器に加え、90℃、N2で10分間撹拌した。全てのアミノ酸についてa)及びb)を繰り返す。TFAカクテル(TFA/TIPS/H2O=95:2.5:2.5)を使用することで樹脂を酸性切断に供し、続いてこれを濾過し、濾液をt-BuOMeで希釈して沈殿を得た。これを10分間遠心分離(5000R)にかけて粗生成物を得た。
LP36は、SPPSの一般的な手順に記載されるように調製した。粗生成物を、分取HPLC(カラム:Welch Xtimate C18 100*40mm*3μm;移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:0%~40%,15分)で精製し、純粋な生成物LP36(13.9mg,6.25μmol,収率1.44%,純度97.58%,2TFA)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):Rt=2.715分,m/z calcd.For C89H123FN26O23,971.46,[M+2H]2+;found 971.9[M+2H]2+;Chromolith Flash RPC1825-3mmカラムを使用し、流量0.8ml/分で逆相LCMSを実施し、0.02%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC RT=6.62分。HPLC条件:移動相:1.0%のACN水溶液(0.1%TFA)~5%のACN水溶液(0.1%TFA)を1分;続いて5%のACN水溶液(0.1%TFA)~100%のACN(0.1%TFA)を5分;100%のACN(0.1%TFA)で2分間保持;8.01分で1.0%のACN水溶液(0.1%TFA)に戻し、2分間保持;流量:1.2ml/分;カラム:Ultimate XB-C18,3μm,3.0*50mm。
HRMS(ESI):m/z calcd for C89H121FN26O23 1941.91[M+H]+,971.46[M+2H]2+,found 1942.9299[M+H]+,971.9736[M+2H]2+。
UPLC:RT=5.824分,条件:移動相:1Lの水中0.05%のTFA(溶媒A)及び1Lのアセトニトリル中0.05%のTFA(溶媒B)、流量0.4mL/分で、10分間の30%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持;カラム:Waters ACQUITY UPLC HSS T3 1.8um,2.1*100mmを使用。
5.37 LP37をLP36と同様に得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:Welch Xtimate C18 100*40mm*3μm;移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:0%~40%,15分)で精製し、純粋な生成物LP37(5mg,2.50μmol,収率1.25%,純度97%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):Rt=2.800分,mass calcd.for C89H121FN26O23 971.45[M/2+H]+found 971.0;Chromolith Flash RP-C1825-3mmを使用し、流量0.8ml/分で逆相LCMSを実施し、0.02%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:RT=6.61分。移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間の保持;カラム:WELCH Ultimate LP-C18 150*4.6mm 5μm;波長:UV220nm&215nm&254nm;カラム温度:40℃を使用。
HRMS-TOF:C89H122N26O23F[M+H]=1942.9573。移動相:0.1%のFA水溶液(溶媒A)及びACN中0.05%のFA(溶媒B);溶出勾配:1.2ml/分間の流量で1.3分間の5%~95%(溶媒B)及び0.7分間95%で保持;カラム:Agilent Poroshell HPH-C182.7um,2.1*50mm;イオン源:AJS ESI源;イオンモード:正;噴霧ガス:窒素;乾燥ガス(N2)流:8L/分;ネブライザ圧力:35psi;気体温度:325℃;シースガス温度:350℃;シースガス流:11L/分;キャピラリ電圧:3.5KV;フラグメンタ圧力:300V。
UPLC:RT=4.595分,mass calcd.移動相:1Lの水中0.05%のTFA(溶媒A)及び1Lのアセトニトリル中0.05%のTFA(溶媒B)、流量0.6mL/分で、6分間の0%~95%溶出勾配(溶媒B)及び95%で4分間保持;カラム:Waters ACQUITY UPLC HSS T3 2.1*50mm,1.8μm;カラム温度:40℃を使用。
5.38 LP38をLP36と同様に得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:Welch X timate C18 100*40mm*3μm;移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:15%~45%,15分)で精製し、純粋な生成物LP38(52.17mg,8.87μmol,収率2.53%,純度95%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):Rt=2.723分,mass calcd.for C96H134FN29O27 [M+2H]2+1071.99,C96H135FN29O27 [M+3H]3+714.99;found 1072.40[M+2H]2+found 715.30[M+3H]3+;Chromolith Flash RP-C18 25-3mmを使用し、流量0.8ml/分で逆相LCMSを実施し、0.02%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC:RT=9.00分、純度95%。HPLC方法A:カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μm;2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持。
5.39 LP39をLP36と同様に得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:Welch Xtimate C18 100*40mm*3μm;移動相:[カラム:Waters Xbridge BEH C18 100*25mm*5μm;移動相:水(0.05%NH3H2O)-ACN];B%:5%~32%,11分)で精製し、純粋な生成物LP39(20mg,8.75μmol,収率2.50%,純度95%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):Rt=2.711分,mass calcd.for C97H135FN30O27 [M+2H]2+1085.49,C97H136FN30O27 [M+3H]3+724.30;found 1085.90[M+2H]2+found 725.30[M+3H]3+;Chromolith Flash RP-C1825-3mmを使用し、流量0.8ml/分で逆相LCMSを実施し、0.02%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出出した。
HPLC:RT=8.99分、純度95%。HPLC方法A:カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μm;2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持。
5.40 LP40をLP36と同様に得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:Welch X timate C18 100*40mm*3μm;移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:6%~46%,20分)で精製し、純粋な生成物LP40(3.5mg,1.38μmol,収率3.94e-1%,純度97.99%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):Rt=2.740分,mass calcd.for C108H152FN35O33 [M+2H]2+1243.05,C108H153FN35O33 [M+3H]3+829.03;found 829.4[M+2H]2+found 1243.30[M+3H]3+;X Bridge C18 3.5μm 2.1*30mmを使用し、流量0.8ml/分で逆相LCMSを実施し、10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及びNH3・H2O水溶液(溶媒A)で溶出した。
HPLC:RT=6.50分,純度97.99% HPLC方法A:カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μm;2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5mL/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持。
5.41 LP41をLP36と同様に得た。粗生成物を、分取HPLC(カラム:Welch Xtimate C18 100*40mm*3μm;移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:6%~46%,20分)で精製し、純粋な生成物LP41(4.5mg,1.89μmol,収率0.54%,純度98.52%)を白色固体として得た。
LCMS:(ESI):Rt=2.590分,mass calcd.for C103H145FN32O31 [M+2H]2+1173.21,C103H146FN32O31 [M+3H]3+782.47;found 1172.90[M+2H]2+found 782.30[M+3H]3+;X Bridge C18 3.5μm 2.1*30mmを使用し、流量0.8ml/分で逆相LCMSを実施し、10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及びNH3 H2O水溶液(溶媒A)で溶出した。
HPLC:RT=6.54分,純度98.52% HPLC方法A:カラム:YMC-Pack ODS-A 150*4.6mm,5μm;2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ml/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持。
図50は、GLP-1Rアゴニストリンカーペイロード(LP42)の合成経路を表す。
工程1:(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-[4-[4-[[[(2S)-2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[2-[2-[2-[[2-[2-[2-[[(4S)-5-tert-ブトキシ-4-[(18-tert-ブトキシ-18-オキソ-オクタデカノイル)アミノ]-5-オキソ-ペンタノイル]アミノ]エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]メチル]トリアゾール-1-イル]ブトキシ]-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(1H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP42-2)の調製
DMF(2mL)中のLP42-1(45.75mg,54.07μmol,1.5当量)とHATU(16.45mg,43.25μmol,1.2当量)との溶液に、DIPEA(13.98mg,108.13μmol,18.83μL,3当量)を加えた。混合物を20℃で0.1時間撹拌した。LP36(70mg,36.04μmol,1当量)を加え、混合物を20℃で1時間撹拌した。LCMSは、反応が完全に変換したことを示した。反応混合物をMTBE(40mL)に滴下した。沈殿した黄色固体を遠心分離により回収した。LP42-2(110mg,25.49μmol,収率70.71%、純度64.18%)を淡黄色の固体として得た。
DMF(2mL)中のLP42-1(45.75mg,54.07μmol,1.5当量)とHATU(16.45mg,43.25μmol,1.2当量)との溶液に、DIPEA(13.98mg,108.13μmol,18.83μL,3当量)を加えた。混合物を20℃で0.1時間撹拌した。LP36(70mg,36.04μmol,1当量)を加え、混合物を20℃で1時間撹拌した。LCMSは、反応が完全に変換したことを示した。反応混合物をMTBE(40mL)に滴下した。沈殿した黄色固体を遠心分離により回収した。LP42-2(110mg,25.49μmol,収率70.71%、純度64.18%)を淡黄色の固体として得た。
LCMS(ESI):RT=4.670分,m/z calcd.For C132H199FN29O35 1385.23[M+2H]2+;m/z found 1385.8;LCMS条件:移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、6分間の10%~80%の勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持;カラム:Xtimate,C18,2.1*30mm,3μmを使用。
工程2:18-[[(1S)-4-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[(1S)-2-[[1-[4-[4-[4-[(2S)-3-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-[[(2S)-3-カルボキシ-2-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(1H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-3-オキソ-プロピル]フェニル]-3-エチル-フェノキシ]ブチル]トリアゾール-4-イル]メチルアミノ]-1-(ヒドロキシメチル)-2-オキソ-エチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-2-オキソ-エトキシ]エトキシ]エチルアミノ]-2-オキソ-エトキシ]エトキシ]エチルアミノ]-1-カルボキシ-4-オキソ-ブチル]アミノ]-18-オキソ-オクタデカン酸(LP42)の調製
DCM(1mL)中のLP42-2(110mg,25.49μmol,純度64.18%,1当量)の溶液に、TFA(1.54g,13.51mmol,1mL,529.95当量)を加えた。混合物を20℃で1時間撹拌した。LCMSは、反応が完全に変換したことを示した。反応混合物を、分取HPLC(カラム:Welch Xtimate C18 100*40mm*3μm;移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:10%~50%,40分)で精製し、所望の化合物LP42(24mg,8.68μmol,収率17.03%,純度96.11%)を白色固体として得た。
DCM(1mL)中のLP42-2(110mg,25.49μmol,純度64.18%,1当量)の溶液に、TFA(1.54g,13.51mmol,1mL,529.95当量)を加えた。混合物を20℃で1時間撹拌した。LCMSは、反応が完全に変換したことを示した。反応混合物を、分取HPLC(カラム:Welch Xtimate C18 100*40mm*3μm;移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:10%~50%,40分)で精製し、所望の化合物LP42(24mg,8.68μmol,収率17.03%,純度96.11%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):Rt=3.943分,m/z calcd.For C124H184FN29O35,1329.17[M+2H]2+;m/z found 1329.6;Chromolith Flash RPC1825-3mmカラムを使用し、流量0.8ml/分で逆相LCMSを実施し、0.02%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC RT=8.52分。HPLC条件:移動相:1.0%のACN水溶液(0.1%TFA)~5%のACN水溶液(0.1%TFA)を1分;続いて5%のACN水溶液(0.1%TFA)~100%のACN(0.1%TFA)を5分;100%のACN(0.1%TFA)で2分間保持;8.01分で1.0%のACN水溶液(0.1%TFA)に戻し、2分間保持。流量:1.2ml/分。カラム:Ultimate XB-C18,3μm,3.0*50mm。
HRMS(ESI):m/z calcd for C124H183FN29O35 2657.33[M+H]+,1329.665[M+2H]2+,found 2657.33[M+H]+,1329.6703[M+2H]2+。
UPLC:RT=5.411分,条件:移動相:1Lの水中0.05%のTFA(溶媒A)及び1Lのアセトニトリル中0.05%のTFA(溶媒B)、流量0.4mL/分で、6分間の0%~95%溶出勾配(溶媒B)及び95%で4分間保持;カラム:Waters ACQUITY UPLC HSS T3 1.8um,2.1*100mmを使用。
図51は、GLP-1Rアゴニストリンカーペイロード(LP43)の合成経路を表す。
工程1:(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-[4-[4-[[[2-[[2-[[2-[[2-[[(2S)-2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[2-[2-[2-[[2-[2-[2-[[(4S)-5-tert-ブトキシ-4-[(18-tert-ブトキシ-18-オキソ-オクタデカノイル)アミノ]-5-オキソ-ペンタノイル]アミノ]エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]アセチル]アミノ]メチル]トリアゾール-1-イル]ブトキシ]-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(1H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP43-1)の調製
DMF(0.3mL)中のLP42-1(41mg,18.89μmol,1当量)とHATU(8.62mg,22.67μmol,1.2当量)との溶液に、DIPEA(7.32mg,56.67μmol,9.87μL,3当量)を加えた。混合物を20℃で0.1時間撹拌した。LP39(23.98mg,28.34μmol,1.5当量)を加え、混合物を20℃で1時間撹拌した。LCMSは、反応が完全に変換したことを示した。反応混合物をMTBE(40mL)に滴下した。沈殿した黄色固体を遠心分離により回収した。LP43-1(80mg,12.56μmol,収率66.49%、純度47.08%)を淡黄色の固体として得た。
DMF(0.3mL)中のLP42-1(41mg,18.89μmol,1当量)とHATU(8.62mg,22.67μmol,1.2当量)との溶液に、DIPEA(7.32mg,56.67μmol,9.87μL,3当量)を加えた。混合物を20℃で0.1時間撹拌した。LP39(23.98mg,28.34μmol,1.5当量)を加え、混合物を20℃で1時間撹拌した。LCMSは、反応が完全に変換したことを示した。反応混合物をMTBE(40mL)に滴下した。沈殿した黄色固体を遠心分離により回収した。LP43-1(80mg,12.56μmol,収率66.49%、純度47.08%)を淡黄色の固体として得た。
LCMS(ESI):RT=4.603分,m/z calcd.For C140H213FN33O39 999.85[M+3H]3+;m/z found 1000.3;LCMS条件:移動相:1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量0.8ml/分で、6分間の10%~80%の勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持;カラム:Xtimate,C18,2.1*30mm,3μmを使用。
工程3:18-[[(1S)-4-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[(1S)-2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[1-[4-[4-[4-[(2S)-3-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-[[(2S)-3-カルボキシ-2-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(1H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-3-オキソ-プロピル]フェニル]-3-エチル-フェノキシ]ブチル]トリアゾール-4-イル]メチルアミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-1-(ヒドロキシメチル)-2-オキソ-エチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-2-オキソ-エトキシ]エトキシ]エチルアミノ]-2-オキソ-エトキシ]エトキシ]エチルアミノ]-1-カルボキシ-4-オキソ-ブチル]アミノ]-18-オキソ-オクタデカン酸(LP43)の調製
DCM(0.7mL)中のLP43-1(80mg,12.56μmol,純度47.08%,1当量)の溶液に、TFA(2.31g,20.26mmol,1.5mL,1612.83当量)を加えた。混合物を20℃で3時間撹拌した。LCMSは、反応が完全に変換したことを示した。残渣を分取HPLC(カラム:O-phenomenex clarity RP 150*10mm*5μm;移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:30%~52%,20分)で精製し、所望の化合物LP43(1.8mg,0.571μmol,収率4.55%,純度91.60%)を白色固体として得た。
DCM(0.7mL)中のLP43-1(80mg,12.56μmol,純度47.08%,1当量)の溶液に、TFA(2.31g,20.26mmol,1.5mL,1612.83当量)を加えた。混合物を20℃で3時間撹拌した。LCMSは、反応が完全に変換したことを示した。残渣を分取HPLC(カラム:O-phenomenex clarity RP 150*10mm*5μm;移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:30%~52%,20分)で精製し、所望の化合物LP43(1.8mg,0.571μmol,収率4.55%,純度91.60%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=3.883分,m/z calcd.For C132H196FN33O39,1443.21[M+2H]2+;m/z found 1443.8;Chromolith Flash RPC1825-3mmカラムを使用し、流量0.8ml/分で逆相LCMSを実施し、0.02%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出した。
HPLC RT=8.30分。HPLC条件:移動相:1.0%のACN水溶液(0.1%TFA)~5%のACN水溶液(0.1%TFA)を1分;続いて5%のACN水溶液(0.1%TFA)~100%のACN(0.1%TFA)を5分;100%のACN(0.1%TFA)で2分間保持;8.01分で1.0%のACN水溶液(0.1%TFA)に戻し、2分間保持。流量:1.2ml/分。カラム:Ultimate XB-C18,3μm,3.0*50mm。
HRMS(ESI):m/z calcd for C132H195FN33O39 2885.42[M+H]+,1442.21[M+2H]2+,found 1442.21[M+H]+,1443.7161[M+2H]2+。
UPLC:RT=5.316分,条件:移動相:1Lの水中0.05%のTFA(溶媒A)及び1Lのアセトニトリル中0.05%のTFA(溶媒B)、流量0.4mL/分で、10分間の0%~95%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持;カラム:Waters ACQUITY UPLC HSS T3 1.8um,2.1*100mmを使用。
図52は、GLP-1Rアゴニストリンカーペイロード(LP44)の合成経路を表す。
工程1:(8S,14S,17S,20S,23S,26S)-8-((1H-テトラゾール-5-イル)メチル)-26-(((S)-1-(((S)-1-アミノ-5-(3,5-ジメチルフェニル)-1-オキソペンタン-2-イル)アミノ)-3-(4’-(4-(4-((S)-60-(tert-ブトキシカルボニル)-81,81-ジメチル-39,48,57,62,79-ペンタオキソ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,41,44,50,53,80-ヘプタデカオキサ-38,47,56,61-テトラアザドオクタコンチル)-1H-1,2,3-トリアゾール-1-イル)ブトキシ)-2’-エチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)-1-オキソプロパン-2-イル)カルバモイル)-17-(2-フルオロベンジル)-14,20-ビス((R)-1-ヒドロキシエチル)-23-(ヒドロキシメチル)-1-(1H-イミダゾール-5-イル)-5,5,17-トリメチル-4,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキソ-3,7,10,13,16,19,22,25-オクタアザオクタコサン-28-酸(LP44-2)の調製
DMF(1mL)中のLP30(40mg,18.56μmol,1当量)の溶液に、DIPEA(7.2mg,55.68μmol,10μL,3当量)及びLP44-1(22mg,22.27μmol,1.2当量)を加えた。得られた混合物を20℃で0.5時間撹拌した。LCMSは、反応が完了し、所望の生成物が観察されたことを示した。混合物を氷冷したMTBEに注ぎ、続いてこれを濾過し、濾過ケーキを真空状態で乾燥させた。LP44-2(55mg,粗)を無色の油として得た。
DMF(1mL)中のLP30(40mg,18.56μmol,1当量)の溶液に、DIPEA(7.2mg,55.68μmol,10μL,3当量)及びLP44-1(22mg,22.27μmol,1.2当量)を加えた。得られた混合物を20℃で0.5時間撹拌した。LCMSは、反応が完了し、所望の生成物が観察されたことを示した。混合物を氷冷したMTBEに注ぎ、続いてこれを濾過し、濾過ケーキを真空状態で乾燥させた。LP44-2(55mg,粗)を無色の油として得た。
LCMS(ESI):RT=6.396分,mass calcd.for C145H230FN24O41 2982.66[M+H]+,746.44[M+4H]4+,found 747.2[M+4H]4+。Chromolith Flash 1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)を使用し、流量0.8ml/分で逆相LCMSを実施し、6分間の10%~80%の勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持;カラム:Xtimate 3μm,C18,2.1*30mmを使用して実施した。
TFA(0.5mL)及びDCM(0.5mL)中のLP44-2(55mg,18.26μmol,1当量)の溶液を、20℃で1時間撹拌した。LCMSは、反応が完了し、所望の生成物が観察されたことを示した。(ESI):RT=4.219分,mass calcd.for C137H214FN24O41 2870.53[M+H]+,1436.27[M+2H]2+,found 1436.2[M+2H]2+。Chromolith Flash 1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)を使用し、流量0.8ml/分で逆相LCMSを実施し、6分間の10%~80%の勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持;カラム:Xtimate 3μm,C18,2.1*30mmを使用して実施した。反応溶液を真空状態で濃縮した。残渣を分取HPLC(TFA条件;カラム:O-phenomenex clarity RP 150*10mm*5μm;移動相:[水(0.075%TFA)-ACN];B%:40%)で精製した。所望の化合物LP44(12mg,4.05μmol,収率22.19%、純度96.97%)を白色固体として得た。
工程2:18-[[(1S)-4-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[1-[4-[4-[4-[(2S)-3-[[(1S)-1-カルバモイル-4-(3,5-ジメチルフェニル)ブチル]アミノ]-2-[[(2S)-3-カルボキシ-2-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(1H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-3-オキソ-プロピル]フェニル]-3-エチル-フェノキシ]ブチル]トリアゾール-4-イル]メトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エチルアミノ]-2-オキソ-エトキシ]エトキシ]エチルアミノ]-2-オキソ-エトキシ]エトキシ]エチルアミノ]-1-カルボキシ-4-オキソ-ブチル]アミノ]-18-オキソ-オクタデカン酸(LP44-2)の調製
LCMS(ESI):RT=4.243分,mass calcd.for C137H214FN24O41 2870.53[M+H]+,1436.27[M+2H]2+,found 1436.4[M+2H]2+。Chromolith Flash 1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)を使用し、流量0.8ml/分で逆相LCMSを実施し、6分間の10%~80%の勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持;カラム:Xtimate 3μm,C18,2.1*30mmを使用して実施した。
LCMS(ESI):RT=4.243分,mass calcd.for C137H214FN24O41 2870.53[M+H]+,1436.27[M+2H]2+,found 1436.4[M+2H]2+。Chromolith Flash 1.5ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び0.75ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)を使用し、流量0.8ml/分で逆相LCMSを実施し、6分間の10%~80%の勾配(溶媒B)及び80%で0.5分間保持;カラム:Xtimate 3μm,C18,2.1*30mmを使用して実施した。
HPLC:RT=9.13分;HPLC条件:移動相:2.75ML/4LのTFA水溶液(溶媒A)及び2.5ML/4LのTFAアセトニトリル溶液(溶媒B)、流量1.5ML/分で、10分間の10%~80%溶出勾配(溶媒B)及び80%で5分間保持;カラム:Ultimate XB-C18,3μm,3.0*50mmを使用。
図53は、GLP-1Rアゴニストリンカーペイロード(LP45)の合成経路を表す。
工程1:(3S)-4-[[(1S)-1-[[4-[4-[4-[4-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[2-[2-[2-[[2-[2-[2-[[(4S)-5-tert-ブトキシ-4-[(18-tert-ブトキシ-18-オキソ-オクタデカノイル)アミノ]-5-オキソ-ペンタノイル]アミノ]エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシメチル]トリアゾール-1-イル]ブトキシ]-2-エチル-フェニル]フェニル]メチル]-2-[[(1S)-1-カルバモイル-4-[4-[[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-ヒドロキシエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]メチル]フェニル]ブチル]アミノ]-2-オキソ-エチル]アミノ]-3-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]-4-オキソ-ブタン酸(LP45-2)の調製
DMF(0.5mL)中のLP29(210mg,87.33μmol,1当量)の溶液に、DIPEA(22.57mg,174.66μmol,30.42μL,2当量)及びLP45-1(168.93mg,174.66μmol,2当量)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。LCMSは、LP29が完全に消費され、所望の質量を有する1つの主ピークが検出されたことを示した。反応混合物をH2O(20mL)で分配し、EtOAc(10mL×3)で抽出した。有機相を分離して塩水(10mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥させ、濾過して減圧下で濃縮し、残渣を得た。所望の化合物LP45-2(200mg,粗)を黄色油として得た。
DMF(0.5mL)中のLP29(210mg,87.33μmol,1当量)の溶液に、DIPEA(22.57mg,174.66μmol,30.42μL,2当量)及びLP45-1(168.93mg,174.66μmol,2当量)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。LCMSは、LP29が完全に消費され、所望の質量を有する1つの主ピークが検出されたことを示した。反応混合物をH2O(20mL)で分配し、EtOAc(10mL×3)で抽出した。有機相を分離して塩水(10mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥させ、濾過して減圧下で濃縮し、残渣を得た。所望の化合物LP45-2(200mg,粗)を黄色油として得た。
LCMS(ESI):RT=5.154分,mass calcd.for C155H248FN25O47 3231.78[M+H]+,C155H251FN25O47 1077.9[M+3H]3+,found 1078.45[M+3H]3+。LCMS方法A:MERCK,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する5%~95%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出。
工程2:18-[[(1S)-4-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[1-[4-[4-[4-[(2S)-3-[[(1S)-1-カルバモイル-4-[4-[[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-ヒドロキシエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]メチル]フェニル]ブチル]アミノ]-2-[[(2S)-3-カルボキシ-2-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[3-(2-フルオロフェニル)-2-[[(2S,3R)-3-ヒドロキシ-2-[[2-[[(2S)-2-[[3-[2-(1H-イミダゾール-5-イル)エチルアミノ]-2,2-ジメチル-3-オキソ-プロパノイル]アミノ]-3-(2H-テトラゾール-5-イル)プロパノイル]アミノ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-2-メチル-プロパノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-ブタノイル]アミノ]-3-ヒドロキシ-プロパノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-3-オキソ-プロピル]フェニル]-3-エチル-フェノキシ]ブチル]トリアゾール-4-イル]メトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エチルアミノ]-2-オキソ-エトキシ]エトキシ]エチルアミノ]-2-オキソ-エトキシ]エトキシ]エチルアミノ]-1-カルボキシ-4-オキソ-ブチル]アミノ]-18-オキソ-オクタデカン酸(LP45)の調製
1,1,1,3,3,3-ヘキサフルオロ-2-プロパノール(2mL)中のLP45-2(200mg,61.87μmol,1当量)の溶液に。混合物を、90℃、マイクロ波の下で2時間撹拌した。LCMSは、LP45-2が完全に消費され、所望の質量を有する1つの主ピークが検出されたことを示した。LCMS(ESI):RT=3.575分,mass calcd.for C147H233FN25O47 3119.65[M+H]+,C147H235FN25O47 780.7[M+4H]4+,found 781.0[M+4H]4+。LCMS方法A:MERCK,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出。反応混合物を真空下で濃縮し、粗生成物を得た。残渣を、分取HPLC(カラム:YMC-Actus Triart C18 150*30mm*5μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:36%~56%,10.5分)で精製し、LP45(18.03mg,5.75μmol,収率9.29%,純度99.51%)を白色固体として得た。
1,1,1,3,3,3-ヘキサフルオロ-2-プロパノール(2mL)中のLP45-2(200mg,61.87μmol,1当量)の溶液に。混合物を、90℃、マイクロ波の下で2時間撹拌した。LCMSは、LP45-2が完全に消費され、所望の質量を有する1つの主ピークが検出されたことを示した。LCMS(ESI):RT=3.575分,mass calcd.for C147H233FN25O47 3119.65[M+H]+,C147H235FN25O47 780.7[M+4H]4+,found 781.0[M+4H]4+。LCMS方法A:MERCK,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出。反応混合物を真空下で濃縮し、粗生成物を得た。残渣を、分取HPLC(カラム:YMC-Actus Triart C18 150*30mm*5μm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:36%~56%,10.5分)で精製し、LP45(18.03mg,5.75μmol,収率9.29%,純度99.51%)を白色固体として得た。
LCMS(ESI):RT=3.550分,m/z calcd.for C147H233FN25O47 3119.65[M+H]+,C147H235FN25O47 780.7[M+4H]4+,found 781.0[M+4H]4+。LC-MS方法A:MERCK,RP-18e 25-2mmカラム、流量1.5mL/分で、0.02%のTFAを含有する10%~80%のアセトニトリル勾配(溶媒B)及び0.04%のTFAを含有する水(溶媒A)で溶出。
実施例6.粗ペプチド模倣薬の分取HPLC精製
分取HPLCを、Shimadzu LC-8a液体(Liguid)クロマトグラフで実施した。DMF又は水に溶解した粗ペプチドの溶液をカラムに注入し、ACN水溶液の直線的勾配で溶出した。異なる方法を使用した(一般的な情報を参照されたい)。溶出した所望の生成物の量はほんの少しであり、それぞれのHPLC画分を凍結乾燥することで、非晶質の粉末で純粋なペプチド模倣薬を得た。一般には、分取HPLC精製後、全体の回収率は収率40~50%の範囲であることが分かった。
分取HPLCを、Shimadzu LC-8a液体(Liguid)クロマトグラフで実施した。DMF又は水に溶解した粗ペプチドの溶液をカラムに注入し、ACN水溶液の直線的勾配で溶出した。異なる方法を使用した(一般的な情報を参照されたい)。溶出した所望の生成物の量はほんの少しであり、それぞれのHPLC画分を凍結乾燥することで、非晶質の粉末で純粋なペプチド模倣薬を得た。一般には、分取HPLC精製後、全体の回収率は収率40~50%の範囲であることが分かった。
分取HPLC方法A:FA条件(カラム;Xtimate C18 150*25mm*5μm;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:40%~70%,7分)を使用し、純粋な生成物を得る。
分取HPLC方法B:TFA条件(カラム;YMC-Exphere C18 10μm 300*50mm 12nm;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:15%~45%,55分)を使用し、純粋な生成物を得る。
分取HPLC方法C:中性条件(カラム;Phenomenex Gemini-NX 150*30mm*5μm;移動相:[水(10mM NH4HCO3)-ACN];B%:21%~51%,11分)を使用し、純粋な生成物を得る。
分取HPLC方法D:中性条件(カラム;Waters Xbridge 150*255u;移動相:[水(10mM NH4HCO3)-ACN];B%:20%~50%,7分)を使用し、純粋な生成物を得る。
分取HPLC方法E:FA条件(カラム;Phenomenex Luna C18 250*50mm*10um;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:55%~86%,21分)を使用し、純粋な生成物を得る。
実施例7.抗体薬物複合体の調製
7.1 一般的な部位特異的結合
本実施例は、一般には、ペイロードがQタグを含む抗体に部位特異的ATDC結合するための2つの方法を実証している。ATDC1~30を、以下の表3にまとめられるように、LP1~LP11及び抗GLP1R抗体mAb1~mAb13又はコントロール抗体mAb1~mAb6で調製した。ES-MSの結果及び本開示に記載のADCのDAR値を表3にまとめる。
7.1 一般的な部位特異的結合
本実施例は、一般には、ペイロードがQタグを含む抗体に部位特異的ATDC結合するための2つの方法を実証している。ATDC1~30を、以下の表3にまとめられるように、LP1~LP11及び抗GLP1R抗体mAb1~mAb13又はコントロール抗体mAb1~mAb6で調製した。ES-MSの結果及び本開示に記載のADCのDAR値を表3にまとめる。
7.2 一般的な二段階結合プロトコール
この方法は、図54に示されている二段階プロセスを含む。第1の工程は、例えばアジド-PEG3-アミンといった小分子アミンなどの第1のリンカー(La)の抗体への微生物トランスグルタミナーゼ(microbial transglutaminase、MTG)媒介性結合であり、抗体鎖の潜在的な架橋を防止するために過剰なアミン試薬を使用する。第2の工程は、歪み促進型アジド-アルキル付加環化(strain-promoted azide-alkyne cycloaddition、SPAAC)によって、アジドタグ化複合体にアルキン結合ペイロードリンカーペイロード(LP)を結合する。
この方法は、図54に示されている二段階プロセスを含む。第1の工程は、例えばアジド-PEG3-アミンといった小分子アミンなどの第1のリンカー(La)の抗体への微生物トランスグルタミナーゼ(microbial transglutaminase、MTG)媒介性結合であり、抗体鎖の潜在的な架橋を防止するために過剰なアミン試薬を使用する。第2の工程は、歪み促進型アジド-アルキル付加環化(strain-promoted azide-alkyne cycloaddition、SPAAC)によって、アジドタグ化複合体にアルキン結合ペイロードリンカーペイロード(LP)を結合する。
一般的な手順は以下のとおりである。
工程1:2つのアジド基を含有する部位特異的アジド官能化抗体薬物複合体の作製
Qタグを含有する抗GLP1RヒトIgG抗体又はアイソタイプコントロール抗体を、100~200モル当量のアジド-PEG3-アミン(L1,分子量218.26g/mol)と混合した。得られた溶液と、トランスグルタミナーゼ(Zedira,Darmstadt,Germany,1mgの抗体あたり1U MTG)を混合し、抗体の最終濃度を1~10mg/mLにした。ESI-MSで反応を監視しつつ、穏やかに振盪させながら反応混合物を25~37℃で4~72時間インキュベートした。完了時に、過剰なアミンとMTGをサイズ排除クロマトグラフィー(size exclusion chromatography、SEC)又はプロテインAカラムクロマトグラフィーにより除去した。複合体をUV-Vis、SEC及びESI-MSにより特性評価した。アジドリンカー結合抗体(Ab-N3)によって、DAR2複合体については402Daの質量増加がもたらされた。複合体の単量体純度は95%超であった。
Qタグを含有する抗GLP1RヒトIgG抗体又はアイソタイプコントロール抗体を、100~200モル当量のアジド-PEG3-アミン(L1,分子量218.26g/mol)と混合した。得られた溶液と、トランスグルタミナーゼ(Zedira,Darmstadt,Germany,1mgの抗体あたり1U MTG)を混合し、抗体の最終濃度を1~10mg/mLにした。ESI-MSで反応を監視しつつ、穏やかに振盪させながら反応混合物を25~37℃で4~72時間インキュベートした。完了時に、過剰なアミンとMTGをサイズ排除クロマトグラフィー(size exclusion chromatography、SEC)又はプロテインAカラムクロマトグラフィーにより除去した。複合体をUV-Vis、SEC及びESI-MSにより特性評価した。アジドリンカー結合抗体(Ab-N3)によって、DAR2複合体については402Daの質量増加がもたらされた。複合体の単量体純度は95%超であった。
工程2:アジド官能化抗体(Ab-N3)とアルキン含有リンカーペイロードとの間の[2+3]クリック反応による、表1の部位特異的複合体の作製
部位特異的抗体薬物複合体を、DMSO又はDMA(10~20mg/mL)といった有機溶媒中に溶解された3モル当量以上のリンカーペイロードを用いて、5~15%の有機溶媒(v/v)を含有する反応混合物を有するように、25~37℃で1~48時間、穏やかに振盪させながら、PBS(pH7.4)中でアジド官能化抗体(Ab-N3,1~20mg/mL)をインキュベートすることで調製した。ESI-MSで反応を監視した。完了時に、サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)により過剰な量のリンカーペイロード及びタンパク質凝集体を除去した。精製した複合体を濃縮し、滅菌濾過してUV-Vis、SEC、HIC及びESI-MSによって特性評価した。複合体の単量体の純度は95%超であった。
部位特異的抗体薬物複合体を、DMSO又はDMA(10~20mg/mL)といった有機溶媒中に溶解された3モル当量以上のリンカーペイロードを用いて、5~15%の有機溶媒(v/v)を含有する反応混合物を有するように、25~37℃で1~48時間、穏やかに振盪させながら、PBS(pH7.4)中でアジド官能化抗体(Ab-N3,1~20mg/mL)をインキュベートすることで調製した。ESI-MSで反応を監視した。完了時に、サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)により過剰な量のリンカーペイロード及びタンパク質凝集体を除去した。精製した複合体を濃縮し、滅菌濾過してUV-Vis、SEC、HIC及びESI-MSによって特性評価した。複合体の単量体の純度は95%超であった。
特定の実施例では、36mgの重鎖N末端Qタグを含有する抗GLP1RマウスIgG抗体 COMPmAb1を、150モル当量のアジド-PEG3-アミン(L1,分子量218.26g/mol)と混合した。得られた溶液と、微生物トランスグルタミナーゼ(1mgの抗体あたり1U mTG,Zedira,Darmstadt,Germany)を混合し、抗体の最終濃度を4.0mg/mLとした。ESI-MSで反応を監視しつつ、穏やかに振盪させながら反応混合物を37℃で18時間インキュベートした。完了時に、過剰なアミンとmTGをサイズ排除クロマトグラフィー(SEC)により除去した。PBS(pH7.4)中の濃縮された部位特異的抗体であるアジド複合体(2.9mg/mL)を、10mg/mLのDMSO中の5モル当量のリンカーペイロード(LP4)と混合した。追加のDMSOを10%の総DMSO(v/v)に加え、溶液を穏やかに振盪させながら、25℃で22時間静置した。ESI-MSで反応を監視した。完了時に、サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)により過剰な量のリンカーペイロード及びタンパク質凝集体を除去した。精製した複合体を濃縮し、滅菌濾過してUV-Vis、SEC、HIC及びESI-MSによって特性評価した。複合体の単量体純度は99.7であった。薬物結合抗体)によって、DAR2複合体については5931Daの質量増加がもたらされた。
S7.3 一般的な一段階結合プロトコール
本方法は、図55に示される、抗体へのリンカーペイロード(LP)の微生物トランスグルタミナーゼ(MTG)媒介性結合を含む。
本方法は、図55に示される、抗体へのリンカーペイロード(LP)の微生物トランスグルタミナーゼ(MTG)媒介性結合を含む。
一般的な手順は以下のとおりである。
Qタグを含有する抗GLP1RヒトIgG抗体又はアイソタイプコントロール抗体を、10~20モル当量のリンカーペイロード(LP11,分子量1979.24g/mol)と混合した。トリス-HClを加え、pHを約7.4に上昇させた。得られた溶液と、トランスグルタミナーゼ(Zedira,Darmstadt,Germany,1mgの抗体あたり1U MTG)を混合し、抗体の最終濃度を1~10mg/mLにした。ESI-MSで反応を監視しつつ、穏やかに振盪させながら反応混合物を25~37℃で4~72時間インキュベートした。完了時に、サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)により過剰な量のリンカーペイロード及びタンパク質凝集体及びMTGを除去した。精製した複合体を滅菌濾過し、UV-Vis、SEC、HIC及びESI-MSによって特性評価した。複合体の単量体の純度は95%超であった。
特定の実施例では、1.5mgの重鎖N末端Qタグを含有する抗GLP1RヒトIgG抗体 mAb6を、10mg/mLのDMSO中で15モル当量のリンカーペイロード(LP11)と混合した。さらなるDMSOを合計10%のDMSO(v/v)を加え、その後1M トリス-HCl(pH8)により、トリス濃度を25mM(pH=約8)とした。得られた溶液と、トランスグルタミナーゼ(Zedira,Darmstadt,Germany,1mgの抗体あたり1U MTG)を混合し、抗体の最終濃度を3.0mg/mLにした。溶液を穏やかに振盪させながら、37℃で23時間静置した。ESI-MSで反応を監視した。完了時に、サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)により過剰な量のリンカーペイロード及びタンパク質凝集体及びMTGを除去した。精製した複合体を濃縮し、滅菌濾過してUV-Vis、SEC、HIC及びESI-MSによって特性評価した。薬物結合抗体)によって、DAR2複合体については3924Daの質量増加がもたらされた。
実施例8.ペイロード及びリンカーペイロードのインビトロ特性評価
8.1 ヒトGLP1R cAMP累積アッセイ(サイクリックAMP決定)
細胞ベースのアッセイを使用し、GLP1Rを刺激するための試験化合物の官能活性を評価した。このアッセイのため、全長ヒトGL-P1Rを過剰発現するHEK293細胞を利用し、ヒトGLP-1R刺激の尺度として下流のcAMP累積を評価した。このアッセイのため、化合物を、Bravo自動液体分注プラットフォームを使用してPP-384マイクロプレート中の1μMの開始濃度でDMSO中で5倍段階希釈した。希釈した化合物を、Echoリキッドハンドラを使用し、OptiPlates(100nL/ウェル)に映した。HEK293/細胞を、37℃の水浴で解凍し、HBSSで2回洗浄しhGLP1Rてアッセイ緩衝液(HBSS+5mM HEPES+500μM IBMX+0.1%BSA)中で再懸濁させた。化合物を加えた後に、続いてHEK293細胞を、1×105/ウェル(10μL)で希釈した化合物を含有する384 OptiPlateへと播種した。遠心分離後、アッセイプレートを23℃、30分間インキュベートした。サイクリックAMPイムノアッセイキット(Cisbio,カタログ番号62AM4PEJ)からのD2-cAMP及びcAMP抗体を含有する10μLの溶解緩衝液を加えることで、反応を終了させた。1時間のインキュベーション後、アッセイプレートを、665/615nmでEnVisionプレートリーダで読み取った。ウェルあたりのcAMPのレベルを、GraphPad Prismにより生じた標準曲線を使用して計算した。活性パーセントを、式(%活性=100%*(cAMPレベル-LC)/(HC-LC))に従って計算した。10点の応答曲線(GraphPad Prism)上に4パラメータのロジスティック方程式からのEC50値をフィットさせた。
8.1 ヒトGLP1R cAMP累積アッセイ(サイクリックAMP決定)
細胞ベースのアッセイを使用し、GLP1Rを刺激するための試験化合物の官能活性を評価した。このアッセイのため、全長ヒトGL-P1Rを過剰発現するHEK293細胞を利用し、ヒトGLP-1R刺激の尺度として下流のcAMP累積を評価した。このアッセイのため、化合物を、Bravo自動液体分注プラットフォームを使用してPP-384マイクロプレート中の1μMの開始濃度でDMSO中で5倍段階希釈した。希釈した化合物を、Echoリキッドハンドラを使用し、OptiPlates(100nL/ウェル)に映した。HEK293/細胞を、37℃の水浴で解凍し、HBSSで2回洗浄しhGLP1Rてアッセイ緩衝液(HBSS+5mM HEPES+500μM IBMX+0.1%BSA)中で再懸濁させた。化合物を加えた後に、続いてHEK293細胞を、1×105/ウェル(10μL)で希釈した化合物を含有する384 OptiPlateへと播種した。遠心分離後、アッセイプレートを23℃、30分間インキュベートした。サイクリックAMPイムノアッセイキット(Cisbio,カタログ番号62AM4PEJ)からのD2-cAMP及びcAMP抗体を含有する10μLの溶解緩衝液を加えることで、反応を終了させた。1時間のインキュベーション後、アッセイプレートを、665/615nmでEnVisionプレートリーダで読み取った。ウェルあたりのcAMPのレベルを、GraphPad Prismにより生じた標準曲線を使用して計算した。活性パーセントを、式(%活性=100%*(cAMPレベル-LC)/(HC-LC))に従って計算した。10点の応答曲線(GraphPad Prism)上に4パラメータのロジスティック方程式からのEC50値をフィットさせた。
表4に示されるように、試験ペイロード及びリンカーペイロードは、39pM~11nMを超える範囲のEC50値を有するcAMP活性化を実証し、大部分は1nM未満のEC50値を有するGLP1Rを刺激した。参照化合物であるGLP1は、28pMのEC50値を有するcAMP活性化を実証した。
8.2 血漿安定性
本開示のペイロード及びリンカーペイロードの血漿安定性を測定した。このアッセイのため、試験前に、プール凍結血漿(ヒト、マウス及びサル)を冷水又は37℃の浴で解凍した。血餅が観察された場合には、血漿を4000rpmで5分間遠心分離し、後にこれを除去した。必要に応じ、pHを7.4±0.1に調整した。化合物及びポジティブコントロールの調製のため、90μLのDMSOで10μLのストック溶液を希釈することで1mMの中間溶液を調製し、90μLの超純水で10μLのストック溶液を希釈することでポジティブコントロール(プロパンテリン)の1mM 中間溶液を調製した。その後、180μLの45%のMeOH/H2Oで20μLの中間溶液(1mM)を希釈することで、各化合物の100μM投与溶液を調製した。2μLの投与溶液(100μM)で98μLの血漿を添加し、2連で2μMの最終濃度を得た。続いて、試料を水浴中で37℃でインキュベートした。4つの設定時点で回収した:(A)2時間の試験については、0分、10分、30分、60分及び120分で試料を回収し、(B)24時間の試験については、0分、10分、60分、240分及び1440分で試料を回収し、(C)3日間の試験については、0時間、24時間、48時間及び72時間で試料を回収し、(D)7日間の試験については、0時間、24時間、48時間、72時間、96時間、120時間、144時間及び168時間で回収した。各時点では、400μLの停止溶液(50%のACN/MeOH中、200ng/mLのトルブタミド+200ng/mLのラベタロール)を加え、タンパク質を沈殿させて完全に混合した。続いて試料プレートを4,000rpmで10分間遠心分離にかけた。上清のアリコート(50μL)を各ウェルから移し、100μLの超純水と混合した。続いて試料を800rpmでおよそ10分間振盪させ、その後LC-MS/MS分析にかけた。
本開示のペイロード及びリンカーペイロードの血漿安定性を測定した。このアッセイのため、試験前に、プール凍結血漿(ヒト、マウス及びサル)を冷水又は37℃の浴で解凍した。血餅が観察された場合には、血漿を4000rpmで5分間遠心分離し、後にこれを除去した。必要に応じ、pHを7.4±0.1に調整した。化合物及びポジティブコントロールの調製のため、90μLのDMSOで10μLのストック溶液を希釈することで1mMの中間溶液を調製し、90μLの超純水で10μLのストック溶液を希釈することでポジティブコントロール(プロパンテリン)の1mM 中間溶液を調製した。その後、180μLの45%のMeOH/H2Oで20μLの中間溶液(1mM)を希釈することで、各化合物の100μM投与溶液を調製した。2μLの投与溶液(100μM)で98μLの血漿を添加し、2連で2μMの最終濃度を得た。続いて、試料を水浴中で37℃でインキュベートした。4つの設定時点で回収した:(A)2時間の試験については、0分、10分、30分、60分及び120分で試料を回収し、(B)24時間の試験については、0分、10分、60分、240分及び1440分で試料を回収し、(C)3日間の試験については、0時間、24時間、48時間及び72時間で試料を回収し、(D)7日間の試験については、0時間、24時間、48時間、72時間、96時間、120時間、144時間及び168時間で回収した。各時点では、400μLの停止溶液(50%のACN/MeOH中、200ng/mLのトルブタミド+200ng/mLのラベタロール)を加え、タンパク質を沈殿させて完全に混合した。続いて試料プレートを4,000rpmで10分間遠心分離にかけた。上清のアリコート(50μL)を各ウェルから移し、100μLの超純水と混合した。続いて試料を800rpmでおよそ10分間振盪させ、その後LC-MS/MS分析にかけた。
表5Aに示されるように、大部分の試験ペイロード及びリンカーペイロードはヒト血漿では非常に安定した状態であり、1日の血漿アッセイでは48時間超のT1/2値、及び7日間の血漿アッセイでは14日間超のT1/2値を有し、参照化合物であるGLP1は、ヒト血漿中では不安定であり、10分未満のT1/2値を示した。表5Bに示されるように、サル血漿中で試験された本開示の1つのリンカーペイロード(LP11)は、49.4時間超のT1/2値を有した。マウス血漿安定性について試験された本開示の2つのリンカーペイロード(LP11及びLP23)は、3日間のアッセイでは6日超の、又は2時間のアッセイでは4時間超のT1/2値を有した。
以下の表5Cは、以下で示される構造を有するリンカーペイロードLP11についての試験パラメータをまとめた。
8.3 hERGアッセイ
本開示の化合物がhERGカリウムチャネル活性に影響するかどうかを決定するため、細胞ベースのアッセイを実施した。このアッセイのため、hERGカリウムチャネルを安定して発現するCHO細胞を播種し、電気生理学的実験での使用前に、37℃の湿度があり空気制御されている(5%CO2)インキュベータ中で少なくとも2日間培養した。続いて細胞をTrypLEを使用して回収し、生理学的溶液(10mM HEPES,80mM NaCl,4mM KCl,2mM CaCl2,1mM MgCl2,5mMグルコース,60mM NMDG,pH7.4)中に再懸濁させた。試験化合物を水中に溶解し、異なる試験濃度のストック溶液を得た。ストック溶液を外部電気生理学的記録溶液(10mM HEPES,140mM NaCl,4mM KCl,2mM CaCl2,1mM MgCl2,5mM グルコース、pH7.4)へと希釈し、試験用の最終濃度を得た。Nanion SyncroPatch 384PE(384ウェル自動パッチクランププラットフォーム(内部記録溶液:10mM HEPES,10mM NaCl,10mM KCl,110mM KF,10mM EGTA,pH7.2))を使用して室温で記録を行った。電気生理学的記録に使用される電圧コマンドプロトコールの概略図を図56に示す。40μLのビヒクルを1回加え、続いてベースライン記録期間を300秒とった。続いて40μLの投与量の化合物を各濃度で加えたが、この時の曝露時間は300秒以下であった。記録は、記録期間中の品質管理に合格するために必要とされる。又はウェルを廃棄し、化合物を再試験し、全てをPatchControlによって自動的に設定する。5つの濃度(0.3μM,3μM,10.00μM,30.00μM及び100.00μM)を、各化合物及びポジティブコントロール(アミトリプチリン)について試験した。濃度につき、最低でも2回の反復が得られた。DataControl、Excel2013(Microsoft)及びGraphPad Prism5.0を使用し、データ分析を実施した。GraphPad Prism5.0でカーブフィッティング及びIC50値の計算を実施した。試験された最低濃度で得られた阻害が、50%超又は最高濃度では50%未満であった場合、IC50値は、それぞれ最低濃度未満又は最高濃度よりも高いと報告される。全細胞のhERG電流における試験化合物のIC50値を表6にまとめた。
本開示の化合物がhERGカリウムチャネル活性に影響するかどうかを決定するため、細胞ベースのアッセイを実施した。このアッセイのため、hERGカリウムチャネルを安定して発現するCHO細胞を播種し、電気生理学的実験での使用前に、37℃の湿度があり空気制御されている(5%CO2)インキュベータ中で少なくとも2日間培養した。続いて細胞をTrypLEを使用して回収し、生理学的溶液(10mM HEPES,80mM NaCl,4mM KCl,2mM CaCl2,1mM MgCl2,5mMグルコース,60mM NMDG,pH7.4)中に再懸濁させた。試験化合物を水中に溶解し、異なる試験濃度のストック溶液を得た。ストック溶液を外部電気生理学的記録溶液(10mM HEPES,140mM NaCl,4mM KCl,2mM CaCl2,1mM MgCl2,5mM グルコース、pH7.4)へと希釈し、試験用の最終濃度を得た。Nanion SyncroPatch 384PE(384ウェル自動パッチクランププラットフォーム(内部記録溶液:10mM HEPES,10mM NaCl,10mM KCl,110mM KF,10mM EGTA,pH7.2))を使用して室温で記録を行った。電気生理学的記録に使用される電圧コマンドプロトコールの概略図を図56に示す。40μLのビヒクルを1回加え、続いてベースライン記録期間を300秒とった。続いて40μLの投与量の化合物を各濃度で加えたが、この時の曝露時間は300秒以下であった。記録は、記録期間中の品質管理に合格するために必要とされる。又はウェルを廃棄し、化合物を再試験し、全てをPatchControlによって自動的に設定する。5つの濃度(0.3μM,3μM,10.00μM,30.00μM及び100.00μM)を、各化合物及びポジティブコントロール(アミトリプチリン)について試験した。濃度につき、最低でも2回の反復が得られた。DataControl、Excel2013(Microsoft)及びGraphPad Prism5.0を使用し、データ分析を実施した。GraphPad Prism5.0でカーブフィッティング及びIC50値の計算を実施した。試験された最低濃度で得られた阻害が、50%超又は最高濃度では50%未満であった場合、IC50値は、それぞれ最低濃度未満又は最高濃度よりも高いと報告される。全細胞のhERG電流における試験化合物のIC50値を表6にまとめた。
8.4 エームスアッセイ
このミニエームス試験の目的は、代謝活性化の存在下及び不在状態で、サルモネラ・ティフィムリウム(Salmonella typhimurium)TA98及びTA100の株のゲノムに復帰突然変異を誘発する能力について、試験物質LP11を評価することであった(S9混合物)。
このミニエームス試験の目的は、代謝活性化の存在下及び不在状態で、サルモネラ・ティフィムリウム(Salmonella typhimurium)TA98及びTA100の株のゲノムに復帰突然変異を誘発する能力について、試験物質LP11を評価することであった(S9混合物)。
このミニエームスアッセイは、6つのウェルを使用してネガティブ/溶媒コントロール(DMSO)及び3つのウェルを使用してポジティブコントロール(2μg/ウェル TA98単独、0.2μg/ウェル TA100単独又はS9の存在下での0.4μg/ウェル TA98+TA100)とともに、S9混合物の存在下及び不在状態での試験物質について行った。S9ミックスの存在下及び不在状態での試験物質について試験された投与量レベルは、ウェルあたり1000μg、400μg、160μg、64μg、25μg、10μg、4μg及び1.5μgであり、各投与量を三連で試験した。菌株の新しい培養物及び新しい試験物質製剤を使用し、この試験を行った。
試験物質LP11については、試験株中のS9ミックスの有無にかかわらず、いずれの投与量レベルでも明らかな細胞傷害性は観察されなかった。試験株中のS9ミックスの有無にかかわらず、いずれの投与量レベルでも明らかな沈殿(インキュベーション期間後、肉眼による)は観察されなかった。
LP11は、2つの株TA98又はTA100においては、S9ミックスの存在下で、又は不在状態で、同時に行ったネガティブ/溶媒コントロールに関しては、どの投与量レベルでも復帰突然変異体コロニーの平均数の2.0倍を超える増加を誘発しなかった。どの用量反応も観察されなかった。
この試験で使用された両方の試験株については、ネガティブ/溶媒コントロールについて観察された復帰突然変異体コロニーの平均数は、実験室での過去のネガティブコントロールデータに相当する。全てのポジティブコントロールは、同時に行ったネガティブ/溶媒コントロールと比較すると、S9ミックスの存在下及び不在状態では、復帰突然変異体コロニーの平均数の3倍を超えるという予想された増加を誘発し、それによって株の応答性を確認した。
本アッセイで使用された全ての試験株の遺伝子型を確認した。このミニエームス試験は有効であり、LP11は本試験の条件下での変異原性については陰性であったことを結論づけた。
8.5 インビトロADME
LPのインビトロADME特性を評価するため、ミクロソーム安定性アッセイを実施して固有クリアランスを決定した。さらに血漿タンパク質結合アッセイを実施して分布能を理解した。結果を以下の表7及び表8に列挙した。
LPのインビトロADME特性を評価するため、ミクロソーム安定性アッセイを実施して固有クリアランスを決定した。さらに血漿タンパク質結合アッセイを実施して分布能を理解した。結果を以下の表7及び表8に列挙した。
アッセイを実施し、本開示の化合物の血漿タンパク質結合を決定した。このアッセイのため、実験日に血漿を冷水で解凍し、3220rpmで5分間遠心分離にかけて血餅を取り除いた。得られた血漿のpH値を確認した。
96ウェルの平衡透析装置(カタログ番号1006)及び12~14kDaの分画分子量を有するHTD 96a/bセルロース膜ストリップ(カタログ番号1101)をHTDialysis LLC,Gales Ferry,CTから取得し、透析装置を製造業者による以下の説明書に従って組み立てた(<http://www.htdialysis.com/>)。
透析については、試験化合物及びコントロール化合物をDMSOに溶解し、10mM ストック溶液を得た。DMSO希釈標準溶液を400μMで調製した。添加マトリックスを調製するため、化合物希釈標準溶液(5μL)をブランクマトリックス(995μL)に対して1:200で加え、完全に混合した。回収の決定に使用するゼロ時間(T0)試料を調製するため、50μLの添加マトリックスのアリコートを試料回収プレートに三連で移した。試料を反対側のブランク緩衝液と直ちに組み合わせ、各ウェルに最終体積が100μLである1:1のマトリックス/透析緩衝液(v/v)を得た。これらのT0試料に500μLの停止溶液を加えた。続いてこれを他の透析後試料とともに、さらなるプロセスまで2~8℃で保存した。透析装置に投入するため、添加マトリックスの150μLのアリコートを各透析ウェルのドナー側に三連で移し、150μLの透析緩衝液をウェルのレシーバ側に投入した。透析プレートを、4時間にわたりゆっくりと(約100rpm)回転する振盪プラットフォーム上で、37℃、5%のCO2の加湿状態のインキュベータ中に静置した。透析終了時に、試料の50μLのアリコートを、透析装置の緩衝液側とマトリックス側の両方から採取した。これらの試料を新しい96ウェルプレートに移した。各試料を、各ウェル中にて1:1マトリックス/透析緩衝液(v/v)の最終体積が100μLに達するように、等量の反対のブランクマトリックス(緩衝液又はマトリックス)と混合した。全ての試料を、内部標準を含有する500μLの停止溶液を加えることでさらに処理した。混合物をボルテックスにかけ、4000rpmで約20分間遠心分離にかけた。続いて、LC-MS/MS分析のため、全ての試料の上清のアリコート(100μL)を取り出した。50μLのブランクマトリックスを96ウェルプレートに移し、50μLのブランクPBS緩衝液を各ウェルに加えることで単一のブランク試料を調製した。ブランク血漿は、ウェルの血漿側で使用された血漿種と一致していなければならない。続いて、透析試料と同様の試料処理方法に従い、内部標準を含有する500μLのストップ溶液を加えることで、マトリックスと組み合わせた試料をさらに処理した。
非結合パーセント、結合パーセント、回収パーセントの値を以下の式:
式中、[F]は、膜の緩衝液(レシーバ)側での分析物濃度又は分析物/内部標準のピーク領域比であり、[T]は、膜の緩衝液(ドナー)側での分析物濃度又は分析物/内部標準のピーク領域比であり、[T0]は、時間0での添加マトリックス試料における分析物濃度又は分析物/内部標準のピーク領域比である、式を使用して計算した。以下の表8には、血漿タンパク質結合アッセイの結果をまとめている。
実施例9.GPCRファミリーのメンバーに対するGLP1Rペプチド模倣ペイロード及びリンカーペイロードの活性
インビトロでGLP1Rアゴニストペイロード及びGLP1Rアゴニストリンカーペイロード(LP)の活性を試験するため、細胞ベースのcAMP応答性ルシフェラーゼレポーターアッセイを開発した。サイクリックAMP応答配列(CRE)ルシフェラーゼレポーターを発現するヒト胎児腎細胞(HEK293)を産生した。これは、安定した細胞を産生するために標準的な方法を使用し、Mycタグ化全長ヒトGLP1R(HEK293/Myc-hGLP1R/Cre-Luc細胞株と呼ばれる、アクセス番号NP_002053のアミノ酸1~463)、全長ヒト胃抑制ポリペプチド受容体(GIPR)(HEK293/Myc-hGIPR/Cre-Luc細胞株と呼ばれる、アクセス番号NP_000155.1のアミノ酸1~466)、全長ヒトグルカゴン様ペプチド2受容体(GLP2R)(HEK293/Myc-hGLP2R/Cre-Luc細胞株と呼ばれる、アクセス番号NP_004237のアミノ酸1~553)又は全長ヒトグルカゴン受容体(GCGR)(HEK293/Myc-hGCGR/Cre-Luc細胞株と呼ばれる、アクセス番号NP_000151.1のアミノ酸1~477)のいずれかを発現する。Mycタグを認識する抗体を使用するフローサイトメトリーにより、受容体の細胞表面発現を確認した。
インビトロでGLP1Rアゴニストペイロード及びGLP1Rアゴニストリンカーペイロード(LP)の活性を試験するため、細胞ベースのcAMP応答性ルシフェラーゼレポーターアッセイを開発した。サイクリックAMP応答配列(CRE)ルシフェラーゼレポーターを発現するヒト胎児腎細胞(HEK293)を産生した。これは、安定した細胞を産生するために標準的な方法を使用し、Mycタグ化全長ヒトGLP1R(HEK293/Myc-hGLP1R/Cre-Luc細胞株と呼ばれる、アクセス番号NP_002053のアミノ酸1~463)、全長ヒト胃抑制ポリペプチド受容体(GIPR)(HEK293/Myc-hGIPR/Cre-Luc細胞株と呼ばれる、アクセス番号NP_000155.1のアミノ酸1~466)、全長ヒトグルカゴン様ペプチド2受容体(GLP2R)(HEK293/Myc-hGLP2R/Cre-Luc細胞株と呼ばれる、アクセス番号NP_004237のアミノ酸1~553)又は全長ヒトグルカゴン受容体(GCGR)(HEK293/Myc-hGCGR/Cre-Luc細胞株と呼ばれる、アクセス番号NP_000151.1のアミノ酸1~477)のいずれかを発現する。Mycタグを認識する抗体を使用するフローサイトメトリーにより、受容体の細胞表面発現を確認した。
バイオアッセイについては、細胞を、96ウェル クリアボトムホワイトプレート(Corning,#356693)に、0.1%FBSを補充した80μLのOpti-MEM中に20,000個の細胞/ウェルの密度で蒔いた。細胞を、37℃、5%のCO2で一晩インキュベートした。ペイロード、リンカーペイロードを含む試験試薬及びポジティブコントロールリガンド[ヒトGLP1(R&D Systems,#5374)、ヒトGIP(R&D Systems,#2084)、ヒトGCG(R&D Systems,#6927)又はヒトGLP2(R&D Systems,#2258)]を、0.1%FBSを含むOpti-MEM中で段階希釈し、続いて試験される各濃度について、10μL/ウェルで細胞にこれを加えた。プレートを37℃、5%のCO2で5.5時間、インキュベートした。エンドポイント測定のため、100μL/ウェルのOne-Glo試薬(Promega,#E6051)を加え、プレートを室温で5~10分間維持した。ルシフェラーゼ活性を、発光モードのEnvision Multilabel Plate Reader(Perkin Elmer)で測定した。相対発光量(relative light unit、RLU)値を得て、結果をGraphPad Prism software(GraphPad)で非線形回帰を使用して分析した。
表9及び図6A~図6Dに示すように、ペイロード及びリンカーペイロードは、3.32pM~71.5pMの範囲のEC50値により、HEK293/Myc-hGLP1R/Cre-Luc細胞株での活性化を実証した。ペイロード及びリンカーペイロードは、評価した他の細胞株では測定可能な活性を実証しなかった。全てのポジティブコントロール参照リガンド(ヒトGLP1、GIP、GLP2及びGCG)は、予想されたとおり、個々の細胞株を活性化した。
実施例10.インビトロ血漿安定性
GLP1RアゴニストP8を有するATDC抗GLP1R mAB2-LP11の血漿安定性を決定するため、様々な種に由来する血漿とともにATDCをインビトロでインキュベートし、抗体に対する薬物の比(DAR)を評価した。抗GLP1R mAB2は、ビオチン化抗Fc抗体である。
GLP1RアゴニストP8を有するATDC抗GLP1R mAB2-LP11の血漿安定性を決定するため、様々な種に由来する血漿とともにATDCをインビトロでインキュベートし、抗体に対する薬物の比(DAR)を評価した。抗GLP1R mAB2は、ビオチン化抗Fc抗体である。
プールしたC57BL/6マウス、カニクイザル(Cyno)又はIgG除去ヒト血漿(BioIVT)に、最終濃度50μg/mLまでATDC溶液を添加し、その後、37℃でThermoMixer C(Eppendorf,カタログ番号2231000574)でインキュベートした。0日目、1日目、2日目、3日目及び7日目に100μLのアリコートを取り出し、続いて分析まで、これを直ちに-80℃に凍結して保存した。
DAR分析のために、DynaMag-2磁気ラック(Life Technologies,カタログ番号12321D)を使用し、免疫アフィニティー捕捉により血漿試料からATDCを精製した。最初に、ビオチン化抗ヒトFc抗体(Regeneron発生試薬)をDynabeads M280ストレプトアビジンビーズ(Invitrogen,カタログ番号60210)上に固定化した。ATDCを含有する各血漿試料を、穏やかに振盪しながら室温で2時間、0.5mgのビーズとともに950rpmで混合した。続いてビーズを500μLのHBS-EP緩衝液(pH7.4)(GE Healthcare,カタログ番号BR100188)で3回、500μLの水で1回及び500μLの10%アセトニトリル水溶液(VWR Chemicals,カタログ番号BDH83640.100E)で1回洗浄した。洗浄後、室温で15分間、アセトニトリル:水=30:70(v/v)中の70μLの1%ギ酸でビーズをインキュベートすることで、ATDCを溶出した。50μLの10mM TCEP(Sigma,カタログ番号646547-10X1ML)を加えることで50μLの溶出試料を還元し、ThermoMixer Cにて37℃、20分これをインキュベートした。
続いて、分離のために0.3x50mm 1.7μm BEH300 C4カラム(Waters,カタログ番号186009260)上に還元したATDC試料を注入し、Synapt G2-Si Mass Spectrometer(Waters)により検出した。使用された流量は10μL/分であった(移動相A:0.1%のギ酸水溶液;移動相B:0.1%のギ酸アセトニトリル溶液)。HPLC勾配は、移動相Bの25~40%に対応して3.5~6.5分ATDC溶出した。取得されたスペクトルを、以下のパラメータ:質量範囲:20~60kDa;m/z範囲:800~2500Da;分解度:1.0Da/チャネル;半値幅:0.8Da;最小強度比:33%;最大反復回数:15で、MaxEnt1 software(Waters)を使用してデコンボリューションした。DARを、デコンボリューションされたスペクトル中の個々のDAR種に対応するピーク信号強度に基づいて計算した。
マウス、カニクイザル又はIgG除去ヒト血漿での7日間のインキュベーション後、抗GLP1R mAb2-LP11についてDARの有意な変化は観察されなかった。結果を表10及び図57に示す。
実施例11.ルシフェラーゼレポーターアッセイ
本開示のGLP1Rアゴニストペイロード、GLP1Rアゴニストリンカーペイロード(LP)及び抗GLP1R抗体結合薬物複合体(ATDC)の活性を試験するため、細胞ベースのcAMP応答性ルシフェラーゼレポーターアッセイを開発した。アッセイ細胞株を産生するため、最小プロモータの上流に位置するcAMP応答配列(CRE)の制御下にホタルルシフェラーゼ遺伝子を置き、HEK293細胞にトランスフェクトした。これを本明細書ではHEK293/CRE-Luc細胞と称する。続いてHEK293/CRE-Luc細胞を改変して全長ヒトGLP1R(アクセス番号NP_002053のアミノ酸1~463)を発現させ、これを本明細書ではHEK293/CRE-Luc/hGLP1R細胞と称する。
本開示のGLP1Rアゴニストペイロード、GLP1Rアゴニストリンカーペイロード(LP)及び抗GLP1R抗体結合薬物複合体(ATDC)の活性を試験するため、細胞ベースのcAMP応答性ルシフェラーゼレポーターアッセイを開発した。アッセイ細胞株を産生するため、最小プロモータの上流に位置するcAMP応答配列(CRE)の制御下にホタルルシフェラーゼ遺伝子を置き、HEK293細胞にトランスフェクトした。これを本明細書ではHEK293/CRE-Luc細胞と称する。続いてHEK293/CRE-Luc細胞を改変して全長ヒトGLP1R(アクセス番号NP_002053のアミノ酸1~463)を発現させ、これを本明細書ではHEK293/CRE-Luc/hGLP1R細胞と称する。
このアッセイのため、アッセイ培地(Optimem,0.1%BSA,100単位/mLのペニシリン,100ug/mlのストレプトマイシン,292μg/mlのL-グルタミン)中に10,000個又は20,000個の細胞/ウェルで96ウェルプレートに細胞を播種し、一晩インキュベートした。遊離ペイロード又はLPの3倍段階希釈物を100%DMSO中に調製し、新しいアッセイ培地にこれを移し、0.2%のDMSO最終一定濃度で細胞に加えた。プレートの最後のウェルは、アッセイ培地及び0.2%DMSO(未処理のウェル)を含有するブランクコントロールとして機能し、3倍段階希釈物の連続としてこれをプロットした。4~6時間後、各ウェルにOne-Glo(商標)試薬(Promega,カタログ番号E6130)の添加後にルシフェラーゼ活性を決定した。Envision luminometer(PerkinElmer)で相対発光量(RLU)を測定し、12点の用量反応曲線に4パラメータのロジスティック方程式を使用し、EC50値を決定した。未処理のウェルにおけるRLUに対する用量反応曲線上の最大RLUの比を取得することで信号雑音比(S/N)を決定した。EC50及びS/N値を表11にまとめる。ペイロード相対力価[(P8 EC50/ペイロードEC50)*100]及び相対S/N[(ペイロードSN/P8SN)*100]を計算するため、各実験での参照標準として機能するP8を用いて、いくつかの実験(A,B及びD)についてデータを生成した。
表11に示されるように、HEK293/CRE-Luc/hGLP1R細胞においてはペイロード及びリンカーペイロードEC50値は3.97pM~1.95nMの範囲であり、相対力価(%P8)は0.3%~133.8%の範囲であった。大部分の試験ペイロードは類似の最大活性に到達しており、相対S/N値(P8%)の範囲は68.6%~116.27%であった。HEK293/CRE-Luc/hGLP1R細胞における参照CRE依存性ルシフェラーゼ活性及び増加したCRE依存性ルシフェラーゼ活性にはGLP1リガンドもまた含まれ、EC50は14.3pM、相対力価は37.2%及び相対S/Nは96.8%であった。試験した全てのアゴニストは、hGLP1R発現(HEK293/CRE-Luc細胞)が存在しない状態ではルシフェラーゼ活性における影響が最小であり、S/N値は1.7以下、EC50値は200.0nM超であった。
GLP1Rアゴニストリンカーペイロードを、N末端重鎖又は軽鎖Qタグにより抗hGLP1R抗体に結合した。得られた抗GLP1R抗体結合薬物複合体(ATDC)のいくつかを、遊離GLP1Rペイロード及びリンカーペイロードアゴニストについて上記のHEK293/CRE-Luc/hGLP1Rレポーターアッセイにおける活性について試験した。表12に示されるように、抗GLP1R ATDCは、HEK293/CRE-Luc/hGLP1R細胞におけるCRE依存性ルシフェラーゼレポーター活性を増加させた。EC50値は21.7pM~112pMの範囲であり、相対力価値(%P8)は14.5%~126%の範囲であった。大部分の試験ATDCは類似の最大活性に到達しており、相対S/N値(P8%)の範囲は87.4%~158.4%であった。抗GLP1R ATDCは、hGLP1R(HEK293/CRE-Luc)を発現しないレポーター細胞では不活性であった。非結合ATDCは、抗GLP1R ATDCよりも活性が小さい傾向があり、EC50値は1.92nM~74.6nMの範囲であり、相対力価値(%P8)は0.1%~1.4%の範囲であった。結果の選択されたセットを図10に示す。
別の実験では、抗GLP1R ATDC活性に関して競合する非結合抗GLP1R抗体の能力を、HEK293/CRE-Luc/hGLP1Rレポーターアッセイで評価した。この実験では、一定量(0.01nM、0.1nM、1.0nM、10nM又は100nM)の非結合抗GLP1R抗体レポーター活性の不在状態又は存在下で、抗GLP1R ATDCを用量漸増させながらレポーター細胞をインキュベートした。EC50値を表13に報告するが、ATDC単独条件についてのEC50値での倍率変化(EC50倍率変化)を、ATDC+非結合mAbのEC50/ATDC単独でのEC50といったように計算した。表13に示されるように、最大10nMの非結合mAb濃度は、抗GLP1R ATDC活性における影響が最小であり、EC50倍率変化値は1.5以下であった。100nMの試験非結合抗体の最大濃度は、EC50値を4.0倍減少させた。非結合コントロールATDCは、非結合抗GLP1R抗体の存在では影響を受けなかった。
実施例12.食事性肥満GLP1Rヒト化マウスにおける体重及び血糖への抗GLP1R mAb ATDCの効果
肥満動物における3つの抗GLP1R抗体結合薬物複合体(ATDC)の体重及び血糖低下効果を決定するため、マウスGLP1Rの代わりにヒトGLP1Rの発現についてホモ接合性であるマウス(GLP1Rヒト化マウスと称される)を、6ヶ月間、高脂肪飼料(60%kcal%の脂肪)に設定した。44匹の9月齢のオスのGLP1Rヒト化マウスを、0日目の体重に基づいて5~8匹のマウスの6つのグループに層別化した。層別化の後、0日目に、各グループに25mg/kgのCOMP抗GLP1R mAb1-LP4(n=8)、抗GLP1R mAb3-LP11(n=8)、抗GLP1R mAb4-LP11(n=5)、コントロール抗GLP1R mAb(n=7)、アイソタイプコントロール mAb ATDC(n=8)又は参照化合物(n=8)を皮下投与した。
肥満動物における3つの抗GLP1R抗体結合薬物複合体(ATDC)の体重及び血糖低下効果を決定するため、マウスGLP1Rの代わりにヒトGLP1Rの発現についてホモ接合性であるマウス(GLP1Rヒト化マウスと称される)を、6ヶ月間、高脂肪飼料(60%kcal%の脂肪)に設定した。44匹の9月齢のオスのGLP1Rヒト化マウスを、0日目の体重に基づいて5~8匹のマウスの6つのグループに層別化した。層別化の後、0日目に、各グループに25mg/kgのCOMP抗GLP1R mAb1-LP4(n=8)、抗GLP1R mAb3-LP11(n=8)、抗GLP1R mAb4-LP11(n=5)、コントロール抗GLP1R mAb(n=7)、アイソタイプコントロール mAb ATDC(n=8)又は参照化合物(n=8)を皮下投与した。
本試験で使用されるコントロール抗GLP1R mAbは、任意の薬物結合なしにGLP1Rを活性化させない、又はこれを不活化する高アフィニティー抗GLP1R抗体である。コントロール抗GLP1R抗体は、本明細書の一部を構成するものとしてその内容全体が援用されている米国特許出願公開第20060275288号に開示されている抗体5A10である。コントロール抗GLP1R mAbはQタグを有さない。COMP抗GLP1R mAb1-LP4は、N末端の重鎖Qタグを有する同一のコントロール抗GLP1R mAbを含む。アイソタイプコントロール mAb ATDCは、本明細書に記載され、GLP1Rヒト化マウスにおいてタンパク質に一切結合しない抗体に結合したGLP1ペプチド模倣薬である。参照化合物は、GLP1類似体及びリンカーセグメントにおいてデュラグルチドと同一のアミノ酸配列を有するが、3つの変異(P16E;V17A;G19インサート)を有するhFCで作製された。
投与後3日目及び7日目、並びに14日目から56日目の毎週、動物の体重を記録し、その血糖値を小型のグルコメータを用いて測定した。各時点での0日目の体重における変化パーセントの平均±SEMを各グループについて計算し、これを表14に示す。各時点での血糖値の平均±SEMを各グループについて計算し、これを表15に示す。2元配置分散分析、続いてボンフェローニ事後検定により統計分析を実施し、コントロール抗体群と他の5つの群と比較した。結果もまた図39及び図40に示す。
コントロール抗GLP1R mAbを投与した動物では、名目上の取扱い(すなわち、採血、ケージの変更)に関する変動とともに、体重及び血糖値は安定していた。コントロール抗GLP1R mAb群の動物と比較すると、アイソタイプコントロール mAb ATDCを投与した動物は、体重変化パーセント又は血糖値に関しては有意な差はなかった。参照化合物を投与した動物では、3日目及び7日目に体重減少が観察されたが、グルコースは3日目にのみ減少した。抗GLP1R mAb ATDCを投与した動物では、体重減少は、どのGLP1R ATDCが投与されたかに応じて42日間、56日間及び28日間継続したが、グルコースは試験した全てのGLP1R ATDCについて7日間減少した。
結論としては、試験した3つの抗GLP1R mAb ATDCの単回投与によって、肥満動物においては長期間の体重減少がもたらされた。
参考文献:
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本開示の範囲及び趣旨から逸脱することなく、上記の主題において様々な変更を行うことが可能であることから、上記の説明に含まれる、又は添付の特許請求の範囲に定義される全ての主題は、本開示の説明的及び例示的なものとして解釈されることが意図される。上記の教示に照らして、本開示の多くの修正及び変形が可能である。したがって、本明細書は、添付の特許請求の範囲に含まれる全てのそのような代替形態、修正形態及び変形形態を包含することを意図している。
本明細書中に引用される全ての特許、出願、刊行物、試験方法、文献及び他の材料は、あたかも本明細書中に物理的に存在するかのように、本明細書の一部を構成するものとしてその内容全体が援用される。
Claims (106)
- 式(A)
BA-(L-P)m (A)、
の構造を有する化合物又は薬学的に許容されるその塩であって、式中、
BAが、抗体又はその抗原結合断片であり、
Lが、非切断型リンカーであり、
Pが、
からなる群から選択される構造を有するペイロードであって、
式中、
が、前記ペイロードがLに結合する箇所であり、
X1が、H、
から選択され、
X2が、
から選択され、
X3が、結合、-(CH2)2-6-NH-、-(CH2)2-6-Tr-及び-(CH2)2-6-Tr-(CH2)1-6-NHであって、式中、Trはトリアゾール部分である、結合、-(CH2)2-6-NH-、-(CH2)2-6-Tr-及び-(CH2)2-6-Tr-(CH2)1-6-NHから選択され、
nが、0又は1であり、
X4が、-NH2、-OH及び-N(H)(フェニル)から選択され、
X5が、-OH、-NH2、-NH-OH及び
から選択され、
X6が、各発生時に独立してH、-OH、-CH3及び-CH2OHから選択され、
X7が、H、
から選択され、
X8が、H、-OH、-NH2及び
から選択され、
Arが、
から選択され、
X9が、-NH2、
から選択され、
mが、1~4の整数である、ペイロードである、化合物又は薬学的に許容されるその塩。 - 式(I)
BA-L-P (I)
の構造を有する化合物又は薬学的に許容されるその塩であって、式中、
BAが、抗体又はその抗原結合断片であり、
Lが、非切断型リンカーであり、
Pが、
からなる群から選択される構造を有するペイロードであって、
式中、
が、前記ペイロードがLに結合する箇所であり、
X1が、H、
から選択され、
X2が、
から選択され、
X3が、-(CH2)2-6-NH-及び-(CH2)2-6-Tr-であって、式中、Trはトリアゾール部分である、-(CH2)2-6-NH-及び-(CH2)2-6-Tr-から選択され、
nが、0又は1であり、
X4が、H及びフェニルから選択され、
X5が、-OH、-NH2、-NH-OH及び
から選択され、
X6が、各発生時に独立してH、-OH、-CH3及び-CH2OHから選択され、
X7が、H、
から選択され、
X8が、H、-OH、-NH2及び
から選択される、ペイロードである、
化合物又は薬学的に許容されるその塩。 - BAが、グルカゴン様ペプチド1受容体(GLP1R)標的抗体又はその抗原結合断片である、請求項1又は2に記載の化合物。
- 前記GLP1R標的抗体がGLP1Rアゴニスト抗体である、請求項3に記載の化合物。
- 前記GLP1R標的抗体が、5A10、9A10、AB9433-I、h38C2、PA5-111834、NLS1205、MAB2814、EPR21819又はグルタズマブである、請求項4に記載の化合物。
- リンカーLが、前記BAの一方又は両方の重鎖に結合される、請求項1~5のいずれか一項に記載の化合物。
- リンカーLが、前記BAの一方又は両方の重鎖可変ドメインに結合される、請求項6に記載の化合物。
- リンカーLが、前記BAの一方又は両方の軽鎖に結合される、請求項1~7のいずれか一項に記載の化合物。
- リンカーLが、前記BAの一方又は両方の軽鎖可変ドメインに結合される、請求項8に記載の化合物。
- リンカーLが、グルタミン残基を介してBAに結合される、請求項1~9のいずれか一項に記載の化合物。
- 前記グルタミン残基が、前記BAの一方又は両方の重鎖のN末端に導入される、請求項10に記載の化合物。
- 前記グルタミン残基が、前記BAの一方又は両方の軽鎖のN末端に導入される、請求項10又は11に記載の化合物。
- 前記グルタミン残基が、前記BAのCH2又はCH3ドメイン中に天然に存在する、請求項10に記載の化合物。
- 前記グルタミン残基が、1つ以上のアミノ酸を修飾することで前記BAに導入される、請求項10に記載の化合物。
- 前記グルタミン残基がQ295又はN297Qである、請求項14に記載の化合物。
- リンカーLがリジン残基を介してBAに結合される、請求項1~10のいずれか一項に記載の化合物。
- 前記抗体又はその抗原結合断片がグリコシル化(aglycosylated)されている、請求項1~16のいずれか一項に記載の化合物。
- 前記抗体又はその抗原結合断片が脱グリコシル化されている、請求項1~16のいずれか一項に記載の化合物。
- 前記抗原結合断片がFab断片である、請求項1~18のいずれか一項に記載の化合物。
- mが1である、請求項1及び3~19のいずれか一項に記載の化合物。
- mが2~4の整数である、請求項1及び3~19のいずれか一項に記載の化合物。
- mが2である、請求項20に記載の化合物。
- リンカーLが式(L’)
-La-Y-Lp- (L’)
の構造であって、式中、
Laが、前記BAに共有結合された第1のリンカーであり、
Yが、トリアゾールを含む基であり、
Lpが、存在しない、又はPに共有結合された第2のリンカーであり、前記Lpが存在しないときにはYもまた存在しない、構造を有する、請求項1~22のいずれか一項に記載の化合物。 - Y-Lpが存在しない、請求項23に記載の化合物。
- Yが、
からなる群から選択される構造であって、式中、Qは、C又はNである、構造を有する、請求項23に記載の化合物。 - Lpが、1~36個の-CH2CH2O-(EG)単位を有するポリエチレングリコール(PEG)セグメントを含む、請求項23又は24に記載の化合物。
- 前記PEGセグメントが2~30個のEG単位を含む、請求項26に記載の化合物。
- 前記PEGセグメントが4~24個のEG単位を含む、請求項26又は27に記載の化合物。
- 前記PEGセグメントが4個のEG単位、又は8個のEG単位、又は12個のEG単位、又は24個のEG単位を含む、請求項26~28のいずれか一項に記載の化合物。
- 前記PEGセグメントが4個のEG単位を含む、請求項26~29のいずれか一項に記載の化合物。
- 前記PEGセグメントが8個のEG単位を含む、請求項26~29のいずれか一項に記載の化合物。
- Y-Lpが、
又はそのトリアゾール位置異性体からなる群から選択される構造であって、
式中、pは1~36の整数である、構造を有する、請求項23に記載の化合物。 - 前記Lpが、グリシン、セリン、グルタミン酸、アラニン、バリン及びプロリン、並びにそれらの組合せから選択される1つ以上のアミノ酸を含む、請求項23又は24に記載の化合物。
- 前記Lpが1~10個のグリシンを含む、請求項33に記載の化合物。
- 前記Lpが1~6個のセリンを含む、請求項33に記載の化合物。
- 前記Lpが1~10個のグリシンと、1~6個のセリンと、を含む、請求項33に記載の化合物。
- 前記Lpが4個のグリシンと、1個のセリンと、を含む、請求項33~36のいずれか一項に記載の化合物。
- 前記Lpが、Gly-Gly-Gly-Gly-Ser(G4S)(配列番号1)、Ser-Gly-Gly-Gly-Gly(SG4)(配列番号2)及びGly-Gly-Gly-Gly-Ser-Gly-Gly-Gly-Gly-Ser(G4S-G4S)(配列番号3)からなる群から選択される、請求項33~37のいずれか一項に記載の化合物。
- 前記Lpが、1~36個のEG単位を有するPEGセグメントと、グリシン、セリン、グルタミン酸、アラニン、バリン及びプロリン、並びにそれらの組合せから選択される1つ以上のアミノ酸との組合せを含む、請求項33~38のいずれか一項に記載の化合物。
- セリン残基が炭水化物基を含む、請求項35~38のいずれか一項に記載の化合物。
- セリン残基がグルコース基を含む、請求項35~40のいずれか一項に記載の化合物。
- Lpが、
からなる群から選択される構造であって、
式中、Yがトリアゾールを含む基であり、Pがペイロードであり、式中、RcがH及びグルコースから選択され、gが1~10の整数であり、sが0~4の整数である、構造を有する、請求項33~41のいずれか一項に記載の化合物。 - Y-Lpが、
又はそのトリアゾール位置異性体からなる群から選択される構造を有する、請求項33~41のいずれか一項に記載の化合物。 - Laが、1~36個の-CH2CH2O-(EG)単位を有するポリエチレングリコール(PEG)セグメントを含む、請求項23~43のいずれか一項に記載の化合物。
- 前記PEGセグメントが4個のEG単位、又は8個のEG単位、又は12個のEG単位、又は24個のEG単位を含む、請求項44に記載の化合物。
- 前記PEGセグメントが8個のEG単位を含む、請求項45に記載の化合物。
- Laが、
からなる群から選択される構造を有する、請求項23~46のいずれか一項に記載の化合物。 - Laが、グリシン、スレオニン、セリン、グルタミン、グルタミン酸、アラニン、バリン、ロイシン及びプロリン、並びにそれらの組合せから選択される1つ以上のアミノ酸を含む、請求項23~45のいずれか一項に記載の化合物。
- 前記Laが1~10個のグリシンと、1~6個のセリンと、を含む、請求項46に記載の化合物。
- 前記Laが4個のグリシンと、1個のセリンと、を含む、請求項46~49のいずれか一項に記載の化合物。
- 前記Laが、Gly-Gly-Gly-Gly-Ser(G4S)(配列番号1)、Ser-Gly-Gly-Gly-Gly(SG4)(配列番号2)、Gly-Gly-Ser-Gly-Gly-Ser-Gly-Gly(G2S-G2S-G2)及びGly-Gly-Gly-Gly-Ser-Gly-Gly-Gly-Gly(G4S-G4)(配列番号3)からなる群から選択される、請求項46~50のいずれか一項に記載の化合物。
- Laが、1~36個のEG単位を有するPEGセグメントと、グリシン、スレオニン、セリン、グルタミン、グルタミン酸、アラニン、バリン、ロイシン及びプロリン、並びにそれらの組合せから選択される1つ以上のアミノ酸との組合せを含む、請求項46に記載の化合物。
- 前記Laが、
からなる群から選択される、請求項46~52のいずれか一項に記載の化合物。 - Laが-(CH2)2-24-鎖を含む、請求項23~53のいずれか一項に記載の化合物。
- Laが、-(CH2)2-24-鎖と、1~36個のEG単位を有するPEGセグメントと、グリシン、スレオニン、セリン、グルタミン、グルタミン酸、アラニン、バリン、ロイシン及びプロリン、並びにそれらの組合せから選択される1つ以上のアミノ酸との組合せを含む、請求項54に記載の化合物。
- 前記Laが、
からなる群から選択される、請求項55に記載の化合物。 - Pが、構造
を有する、請求項1~43のいずれか一項に記載の化合物。 - X1がHであり、X2が
であり、X3が、-(CH2)2-6-NH-及び-(CH2)2-6-Tr-であって、式中、Trはトリアゾール部分である、-(CH2)2-6-NH-及び-(CH2)2-6-Tr-から選択され、nが1であり、X4がHである、請求項1~44のいずれか一項に記載の化合物。 - X1が
であり、X2が
であり、X3が-(CH2)2-6-NH-であり、nが1であり、X4がHであり、X5が、-OH、-NH2、-NH-OH及び
から選択される、請求項1~44のいずれか一項に記載の化合物。 - X1が
であり、X2が
であり、X3が-(CH2)2-6-NH-であり、nが1であり、X4がHである、請求項1~44のいずれか一項に記載の化合物。 - X1が
であり、X2が
であり、X3が-(CH2)2-6-NH-であり、nが1であり、X4がHであり、X6が各発生時に独立してH及び-CH2OHから選択され、X7がHである、請求項1~44のいずれか一項に記載の化合物。 - X1が
であり、X2が
であり、X3が、-(CH2)2-6-Tr-であって、式中、Trがトリアゾール部分である、-(CH2)2-6-Tr-であり、nが1であり、X4がHであり、X5が
である、請求項1~44のいずれか一項に記載の化合物。 - X1が
であり、X2が
であり、X3が-(CH2)2-6-NH-であり、nが1であり、X4がHであり、X6が各発生時に独立してH及び-CH3から選択され、X7が
であり、X8が-NH2である、請求項1~44のいずれか一項に記載の化合物。 - X1が
であり、X2が
であり、X3が-(CH2)2-6-NH-であり、nが1であり、X4がHであり、X8がHである、請求項1~44のいずれか一項に記載の化合物。 - X1が
であり、X2が
であり、X3が-(CH2)2-6-NH-であり、nが1であり、X4がHであり、X6が各発生時にはHであり、X7が
であり、X8がHである、請求項1~44のいずれか一項に記載の化合物。 - X1が
であり、X2が
であり、X3が-(CH2)2-6-NH-であり、nが1であり、X4がHであり、X6が各発生時に独立してH及び-CH3から選択され、X7が
であり、X8が
である、請求項1~44のいずれか一項に記載の化合物。 - X1が
であり、X2が
であり、X3が-(CH2)2-6-NH-であり、nが1であり、X4がHである、請求項1~44のいずれか一項に記載の化合物。 - X1が
であり、X2が
であり、X3が-(CH2)2-6-NH-であり、nが1であり、X4がHである、請求項1~44のいずれか一項に記載の化合物。 - X1が
であり、X2が
であり、X3が-(CH2)2-6-NH-であり、nが1であり、X4がHであり、X6が各発生時に独立してH及び-CH3から選択され、X7が
である、請求項1~44のいずれか一項に記載の化合物。 - X1がHであり、X2が
であり、X3が-(CH2)2-6-NH-であり、nが1であり、X4がHである、請求項1~44のいずれか一項に記載の化合物。 - X1が
であり、X2が
であり、X3が-(CH2)2-6-NH-であり、nが1であり、X4がHであり、X5が
である、請求項1~44のいずれか一項に記載の化合物。 - X1が
であり、X2が
であり、X3が-(CH2)2-6-NH-であり、nが0であり、X4がフェニルであり、X5が
である、請求項1~44のいずれか一項に記載の化合物。 - X1が
であり、X2が
であり、X3が-(CH2)2-6-NH-であり、nが1であり、X4がフェニルであり、X5が
である、請求項1~44のいずれか一項に記載の化合物。 - Pが、構造
を有する、請求項1~43のいずれか一項に記載の化合物。 - X1が
であり、X2が
であり、X3が-(CH2)2-6-NH-であり、X4がHであり、X5が
である、請求項74に記載の化合物。 - Pが、
からなる群から選択される構造を有する、請求項1~75のいずれか一項に記載の化合物。 - 前記化合物の半減期が血漿中では7日間よりも長い、請求項1~76のいずれか一項に記載の化合物。
- 前記化合物がGLP1R以外のGタンパク質共役型受容体(GPCR)に結合しない、請求項1~77のいずれか一項に記載の化合物。
- 請求項1~78のいずれか一項に記載の化合物を含む医薬組成物。
- 請求項1~78のいずれか一項に記載の化合物を含む医薬剤形。
- 請求項1~78のいずれか一項に記載の化合物を用いて細胞の表面上のGLP1Rを選択的に標的化する方法。
- 前記細胞が哺乳類細胞である、請求項81に記載の方法。
- 前記細胞がヒト細胞である、請求項81又は82に記載の方法。
- 前記細胞が膵臓細胞、脳細胞、心臓細胞、血管組織細胞、腎細胞、脂肪組織細胞、肝臓細胞又は筋細胞である、請求項81~83のいずれか一項に記載の方法。
- 方法であって、請求項1~78のいずれか一項に記載の化合物の有効量、請求項79に記載の組成物の有効量、又は請求項80に記載の剤形の有効量を個体に投与することを含む、前記個体でGLP1R活性を増強する方法。
- 方法であって、請求項1~78のいずれか一項に記載の化合物の有効量、請求項79に記載の組成物の有効量、又は請求項80に記載の剤形の有効量を個体に投与することを含む、前記個体で血糖値を低下させる方法。
- 方法であって、請求項1~78のいずれか一項に記載の化合物の有効量、請求項79に記載の組成物の有効量、又は請求項80に記載の剤形の有効量を個体に投与することを含む、前記個体で体重を低下させる方法。
- 方法であって、請求項1~78のいずれか一項に記載の化合物の有効量、請求項79に記載の組成物の有効量、又は請求項80に記載の剤形の有効量を個体に投与することを含む、前記個体でGLP1R関連症状を治療する方法。
- 前記GLP1R関連症状が2型糖尿病、肥満、肝疾患、冠動脈疾患又は腎疾患である、請求項88に記載の方法。
- 前記GLP1R関連症状が2型糖尿病及び/又は肥満である、請求項88に記載の方法。
- 請求項1~78のいずれか一項に記載の化合物、請求項79に記載の組成物又は請求項80に記載の剤形が、皮下に、静脈内に、皮内に、腹腔内に、又は筋肉内に投与される、請求項81~89のいずれか一項に記載の方法。
- 式(A)
BA-(L-P)m (A)
の構造を有する請求項1に記載の化合物を作製する方法であって、前記方法が、
a)トランスグルタミナーゼの存在下で、少なくともm個のグルタミン残基Glnを含むBAと、少なくともm当量の化合物L-Pとを接触させる工程と、
b)前記作製された式(A)の化合物を単離する工程と、
を含む、方法。 - 式(I)
BA-L-P (I)
の構造を有する請求項2に記載の化合物を作製する方法であって、前記方法が、
a)トランスグルタミナーゼの存在下で、少なくとも1個のグルタミン残基Glnを含むBAと化合物L-Pとを接触させる工程と、
b)作製された式(I)の化合物を単離する工程と、
を含む、方法。 - 式(A)
BA-(L-P)m (A)
の構造を有する請求項1に記載の化合物であって、式中、前記リンカーLが、式(L’)
-La-Y-Lp- (L’)
の構造であって、
式中、Laが、BAに共有結合された第1のリンカーであり、
Yが、トリアゾールを含む基であり、
Lpが、Pに共有結合された第2のリンカーである、構造を有する、化合物を作製する方法であって、
前記方法が、
a)トランスグルタミナーゼの存在下で、少なくともm個のグルタミン残基Glnを含む前記BAと、アジド又はアルキン部分を含む前記第1のリンカーLaとを接触させる工程と、
b)工程a)の生成物と、少なくともm当量の化合物Lp-Pとを接触させる工程であって、前記第2のリンカーLpがアジド又はアルキン部分を含み、La及びLpは反応してトリアゾールを作製することが可能である、工程と、
c)作製された式(A)の化合物を単離する工程と、
を含む、方法。 - 式(I)
BA-L-P (I)
の構造を有する請求項2に記載の化合物であって、式中、前記リンカーLが、式(L’)
-La-Y-Lp- (L’)
の構造であって、
式中、Laが、BAに共有結合された第1のリンカーであり、
Yが、トリアゾールを含む基であり、
Lpが、Pに共有結合された第2のリンカーである、構造を有する、化合物を作製する方法であって、
前記方法が、
a)トランスグルタミナーゼの存在下で、少なくとも1個のグルタミン残基Glnを含む前記BAと、アジド又はアルキン部分を含む前記第1のリンカーLaとを接触させる工程と、
b)工程a)の生成物と、化合物Lp-Pとを接触させる工程であって、前記第2のリンカーLpがアジド又はアルキン部分を含み、La及びLpは反応してトリアゾールを作製することが可能である、工程と、
c)作製された式(I)の化合物を単離する工程と、
を含む、方法。 - 式(P-IB)、式(P-IIB)及び式(P-IIIB)
からなる群から選択される構造を有する化合物又は薬学的に許容されるその塩であって、式中、
X1が、H、
から選択され、
X2が、
から選択され、
X3が、-CH3、-(CH2)2-6-NH2、-(CH2)2-6-N3及び-(CH2)2-6-Tr-(CH2)1-6-NH2であって、式中、Trはトリアゾール部分である、-CH3、-(CH2)2-6-NH2、-(CH2)2-6-N3及び-(CH2)2-6-Tr-(CH2)1-6-NH2から選択され、
nが、0又は1であり、
X4が、-NH2、-OH及び-N(H)(フェニル)から選択され、
X5が、-OH、-NH2、-NH-OH及び
から選択され、
X6が、各発生時に独立してH、-OH、-CH3及び-CH2OHから選択され、
X7が、H、
から選択され、
X8が、H、-OH、-NH2及び
から選択され、
Arが、
から選択され、
X9が、-NH2、
から選択され、
mが、1~4の整数である、化合物又は薬学的に許容されるその塩。 - 式(II)
の構造を有する化合物並びに薬学的に許容されるその塩であって、
式中、
X1が、H、
から選択され、
X2が、
から選択され、
X3が、-(CH2)2-6-NH2、-(CH2)2-6-N3及び-CH3から選択されるが、X3が-CH3といった条件では、nが1であり、少なくとも1個の発生においてRaが-(CH2)2-6-NH2及び-(CH2)2-6-N3から選択され、
nが、0又は1であり、
mが、0~3の整数であり、
Raが、各発生時に独立して-CH3、-(CH2)2-6-NH2及び-(CH2)2-6-N3から選択され、
X4が、H及びフェニルから選択され、
X5が、-OH、-NH2、-NH-OH及び
から選択され、
X6が、各発生時に独立してH、-OH、-CH3及び-CH2OHから選択され、
X7が、H、
から選択され、
X8が、H、-OH、-NH2及び
から選択される、
化合物並びに薬学的に許容されるその塩。 - Pが、
からなる群から選択される構造を有する、請求項96に記載の化合物。 - 式(C)
の構造を有する化合物又は薬学的に許容されるその塩であって、式中、
Lpが、存在しない、又は
カルバマート基、シクロデキストリン、1~36個の-CH2CH2O-(EG)単位を有するポリエチレングリコール(PEG)セグメント、-(CH2)2-24-鎖、トリアゾール、グリシン、セリン、グルタミン酸、アラニン、バリン及びプロリンから選択される1つ以上のアミノ酸並びにそれらの組合せ、のうちの1つ以上を含むリンカーであり、
Qが、-NH2、-N3、
から選択され、式中、AがC又はNである、部分であり、
X1が、H、
から選択され、
X2が、
から選択され、
X3が、-CH3、-(CH2)2-6-NH2、-(CH2)2-6-N3及び-(CH2)2-6-Tr-(CH2)1-6-NH2であって、式中、Trはトリアゾール部分である、-CH3、-(CH2)2-6-NH2、-(CH2)2-6-N3及び-(CH2)2-6-Tr-(CH2)1-6-NH2から選択され、
nが、0又は1であり、
X4が、-NH2、-OH及び-N(H)(フェニル)から選択され、
X5が、-OH、-NH2、-NH-OH及び
から選択され、
X6が、各発生時に独立してH、-OH、-CH3及び-CH2OHから選択され、
X7が、H、
から選択され、
X8が、H、-OH、-NH2及び
から選択され、
Arが、
から選択され、
X9が、-NH2、
から選択され、
mは、1~4の整数である、化合物又は薬学的に許容されるその塩。 - 式(III)
の構造を有する化合物並びに薬学的に許容されるその塩であって、式中、
Lpが、存在しない、又は
カルバマート基、シクロデキストリン、1~36個の-CH2CH2O-(EG)単位を有するポリエチレングリコール(PEG)セグメント、グリシン、セリン、グルタミン酸、アラニン、バリン及びプロリンから選択される1つ以上のアミノ酸並びにそれらの組合せ、のうちの1つ以上を含むリンカーであり、
Qが、-N3、
から選択され、式中、AがC又はNである、部分であり、
X1が、H、
から選択され、
X2が、
から選択され、
X3が、-(CH2)2-6-NH2、-(CH2)2-6-N3及び-CH3から選択されるが、X3が-CH3といった条件では、nが1であり、少なくとも1個の発生においてRaが-(CH2)2-6-NH2及び-(CH2)2-6-N3から選択され、
nが、0又は1であり、
Raが、各発生時に独立してH、-CH3、-(CH2)2-6-NH2及び-(CH2)2-6-N3から選択され、
X4が、H及びフェニルから選択され、
X5が、-OH、-NH2、-NH-OH及び
から選択され、
X6が、各発生時に独立してH、-OH、-CH3及び-CH2OHから選択され、
X7が、H、
から選択され、
X8が、H、-OH、-NH2及び
から選択される、化合物並びに薬学的に許容されるその塩。 -
からなる群から選択される構造を有する、請求項99に記載の化合物又は薬学的に許容されるその塩。 - 抗体薬物複合体であって、
からなる群から選択される構造又は薬学的に許容されるその塩のペイロードに、必要に応じてリンカーを介して結合されたグルカゴン様ペプチド1受容体(GLP1R)標的抗体又はその抗原結合断片を含む、抗体薬物複合体。 - グルカゴン様ペプチド1受容体(GLP1R)標的抗体又はその抗原結合断片と、構造
を有するペイロードであって、
式中、
が、前記GLP1R標的抗体又はその抗原結合断片に直接的に、又はリンカーを介して、前記ペイロードが結合する箇所である、ペイロードとを含む、抗体薬物複合体。 - 前記ペイロードが、構造
を有する、請求項103に記載の抗体薬物複合体。 - グルカゴン様ペプチド1受容体(GLP1R)標的抗体又はその抗原結合断片と、構造
を有するリンカーペイロードであって、
式中、
が、前記GLP1R標的抗体又はその抗原結合断片に前記リンカーペイロードが結合する箇所である、リンカーペイロードとを含む、抗体薬物複合体。 - 前記リンカーペイロードが、構造
を有する、請求項105に記載の抗体薬物複合体。
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