JP2023541637A - 抗体-エクサテカンコンジュゲート - Google Patents

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マリア アントニア ヴァイデベン,
ゲール, レモン ファン
インゲ カタリーナ ジョゼフィーナ ハークマンズ,
デ サンデ, ピーター ファン
バーケル, サンダー セバスティアーン ファン
デルフト, フロリス ルイス ファン
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Abstract

本発明は、構造(1)を有する抗体-薬物コンジュゲートに関するTIFF2023541637000112.tif64149[構造中、ABは抗体であり、L1及びL2はリンカーであり、wは、0又は1であり、Zは、無金属クリック反応又はチオールライゲーションによって得られた接続基であり、R17はそれぞれ個別にアミノ酸側鎖であり、nは、1~5の範囲の整数であり、Aは、5員又は6員の芳香族又はヘテロ芳香族環であり、xは、1~8の範囲の整数であり、R21は、H、R22、C(O)OH及びC(O)R22から選択され、R22は、C1~C24(ヘテロ)アルキル基、C3~C10(ヘテロ)シクロアルキル基、C2~C10(ヘテロ)アリール基、C3~C10アルキル(ヘテロ)アリール基及びC3~C10(ヘテロ)アリールアルキル基であり、それらは、任意選択で置換されており、O、S及びNR23から選択される1個又は複数のヘテロ原子で任意選択で中断されており、R23は、水素及びC1~C4アルキル基からなる群から独立的に選択される]。【選択図】 なし

Description

[0001]本発明は、抗体-薬物コンジュゲートの分野、特にがんの処置に適している、エクサテカン細胞傷害性ペイロードを含む抗体-薬物コンジュゲートに関する。
[0002]治療における特効薬と考えられる抗体薬物コンジュゲート(ADC)は、薬剤に結合している抗体からなる。抗体(リガンドとも呼ばれる)は、小タンパク質フォーマット(scFv、Fabフラグメント、DARPin、アフィボディなど)とすることができるが、一般に所与の抗原に対する高選択性及び親和性、長い循環半減期、並びにほとんどない~全くない免疫原性に基づいて選択されたモノクローナル抗体(mAb)である。したがって、慎重に選択された生物学的受容体のタンパク質リガンドとしてのmAbは、医薬品の選択的標的化にとって理想的な送達プラットホームを提供する。例えば、特異的がん関連抗原と選択的に結合することが知られているモノクローナル抗体は、化学的にコンジュゲートされた細胞傷害性物質の腫瘍への送達のために結合、内部移行、細胞内プロセシング、最後に活性カタボライトの遊離を介して使用されうる。細胞傷害性物質は、低分子毒素、タンパク質毒素又はオリゴヌクレオチドのような他のフォーマットとすることができる。その結果、抗体によって標的にされなかった正常細胞を温存しながら、腫瘍細胞が選択的に根絶されうる。同様に、抗細菌薬(抗生物質)の抗体への化学的コンジュゲーションを細菌感染症の処置に適用することができるが、抗炎症薬のコンジュゲートが、自己免疫疾患の処置について研究中であり、例えばオリゴヌクレオチドの抗体への付着は、神経筋疾患の処置のための潜在的な有望手法である。したがって、活性医薬品の選択された特定細胞部位への標的化送達の概念は、同じ薬物の全身送達に優る多くの有利な面をもつ、広範囲の疾患の処置のための強力な手法である。
[0003]モノクローナル抗体を採用して、特定タンパク質物質を標的化送達するための代替戦略は、軽鎖又は重鎖(又は両方)のN末端又はC末端でありうる抗体の末端の1つ(又は複数)への後者のタンパク質の遺伝子融合によるものである。この場合、興味の対象となる生物活性タンパク質、例えばシュードモナス外毒素A(PE38)のようなタンパク質毒素又は抗CD3単鎖可変フラグメント(scFv)は、必ずしもそうではないがおそらくペプチドスペーサーを介して抗体への融合物として遺伝子にコードされ、抗体が融合タンパク質として発現される。ペプチドスペーサーは、プロテアーゼ感受性切断部位を含むこともあれば、含まないこともある。
[0004]ADCの分野において、化学的リンカーが、典型的に医薬品を抗体に付着させるために採用される。このリンカーは、長期間の薬物投与後に血漿が安定である必要性を含めて、いくつかの重要な属性を有する必要がある。安定なリンカーは、身体の計画された部位又は細胞へのADCの局在化を可能にし、循環におけるペイロードの早期遊離を予防する。その早期放出は、あらゆる種類の望ましくない生物学的応答を無差別に誘導し、それによってADCの治療指数が下がる。内部移行すると、ADCは、ペイロードが効果的に遊離されるようにプロセシングされるべきであり、したがってその標的に結合することができる。
[0005]リンカーには、切断不可能なリンカーと切断可能なリンカーの2つのファミリーがある。切断不可能なリンカーは、抗体とペイロードの間の原子の鎖からなり、抗体薬物コンジュゲートが存在する器官又は生体コンパートメントにかかわりなく、生理的条件下で十分に安定である。結果として、切断不可能なリンカーを含むADCからのペイロードの遊離は、ADCの細胞への内部移行後における抗体の完全な(リソソーム)分解に依存する。この分解の結果として、ペイロード(リンカーを依然として有する)、並びにペプチドフラグメント及び/又はアミノ酸は、リンカーが元々付着していた抗体から遊離される。切断可能なリンカーは、細胞又は細胞コンパートメントの固有の特性をADCからのペイロードの選択的遊離のために利用し、これによって、一般に代謝プロセシング後に微量のリンカーも残らない。切断可能なリンカーには、1)特定酵素に対する感受性、2)pH感受性、及び3)細胞の酸化還元状態(又はその微小環境)に対する感受性という3つのよく使用される機構がある。切断可能なリンカーは、例えばパラ-アミノベンジルアルコール基及びその誘導体をベースにした自己破壊性ユニットも含んでもよい。リンカーは、抗体との反応のための反応性基とリンカーを接続するための、スペーサー又はストレッチャーユニットと呼ばれることが多い追加の非機能的要素も含んでもよい。
[0006]ADCは、臨床及び前臨床活性を明らかにしてきたが、標的にされた腫瘍細胞での抗原発現に加えてどの因子がそのような効力を決定するか不明であった。例えば、薬物:抗体比(DAR)、ADC結合親和性、ペイロードの効力、受容体発現レベル、内部移行率、輸送、多剤耐性(MDR)状態、及び他の因子はすべてインビトロでのADC処置の転帰に影響するように関与した。抗原陽性腫瘍細胞の直接死滅に加えて、ADCは、参照により組み込まれるSahinら、Cancer Res.、1990、50、6944~6948によって報告され、例えば参照により組み込まれるLiら、Cancer Res.、2016、76、2710~2719によって研究されたように、隣接している抗原陰性腫瘍細胞を死滅させる能力、いわゆる「バイスタンダー死滅」効果も有する。概して、中性である細胞傷害性ペイロードは、バイスタンダー死滅を示すが、イオン性(荷電)ペイロードは、イオン種が受動拡散では細胞性膜を容易に透過しないという事実の結果としてバイスタンダー死滅を示さない。確立されたバイスタンダー効果を有するペイロードは、例えばMMAE及びDXdである。バイスタンダー死滅を示さないペイロードの例には、MMAF又はカドサイラ(Kadcyla)の活性カタボライト(リシン-MCC-DM1)がある。
[0007]ADCは、バイオコンジュゲーションと呼ばれるプロセスである、リンカー-薬物とタンパク質のコンジュゲーションによって調製される。参照により組み込まれるG.T.Hermanson、「Bioconjugate Techniques」、Elsevier、第3版、2013に要約されているように、バイオコンジュゲーションについては多くの技術が公知である。リシン側鎖のアシル化に基づく又はシステイン側鎖のアルキル化に基づく、主要な2つの技術をランダムコンジュゲーションによるADCの調製に関して認めることができる。リシン側鎖におけるε-アミノ基のアシル化は、典型的にはタンパク質を、活性化エステル又は活性化カーボネート誘導体をベースにした試薬にさらすことによって達成され、例えばSMCCが、カドサイラ(Kadcyla)(登録商標)の製造に適用されている。システイン側鎖におけるチオール基のアルキル化のための主要な化学は、例えばアドセトリス(Adcetris)(登録商標)の製造において適用されるようにマレイミド試薬の使用に基づいている。標準のマレイミド誘導体の他に、例えば共に参照により組み込まれるJames Christieら、J.Contr.Rel.、2015、220、660~670及びLyonら、Nat.Biotechnol.、2014、32、1059~1062によって明らかなように、さまざまなマレイミドバリアントもより安定なシステインコンジュゲーションに適用される。システインアルキル化のための他の手法は、例えば、ハロアセトアミド(典型的にブロモアセトアミド又はヨードアセトアミド)の求核置換(例えば参照により組み込まれるAlleyら、Bioconj.Chem.、2008、19、759~765を参照のこと)、若しくはアクリレート試薬との反応など不飽和結合に対する求核付加に基づくさまざまな手法(例えば共に参照により組み込まれるBernardimら、Nat.Commun.、2016、7、DOI:10.1038/ncomms13128及びAriyasuら、Bioconj.Chem.、2017、28、897~902を参照のこと)、ホスホンアミデートとの反応(例えば参照により組み込まれるKasperら、Angew.Chem.Int.Ed.、2019、58、11625~11630を参照のこと)、アレンアミドとの反応(例えば参照により組み込まれるAbbasら、Angew.Chem.Int.Ed.、2014、53、7491~7494を参照のこと)、シアノエチニル試薬との反応(例えば参照により組み込まれるKolodychら、Bioconj.Chem.、2015、26、197~200を参照のこと)、ビニルスルホンとの反応(例えば参照により組み込まれるGil de Montesら、Chem.Sci.、2019、10、4515~4522を参照のこと)、又はビニルピリジンとの反応(例えばhttps://iksuda.com/science/permalink/(2020年1月7日にアクセス)を参照のこと)を含む。抗体のリエンジニアリングを含まない抗体コンジュゲーションへの代替手法は、鎖間ジスルフィド架橋の低減、及びそれに続く、ビス-スルホン試薬(例えば共に参照により組み込まれるBalanら、Bioconj.Chem.、2007、18、61~76及びBryantら、Mol.Pharmaceutics、2015、12、1872~1879を参照のこと)、モノ-若しくはビス-ブロモマレイミド(例えば共に参照により組み込まれるSmithら、J.Am.Chem.Soc.、2010、132、1960~1965及びSchumacherら、Org.Biomol.Chem.、2014、37、7261~7269を参照のこと)、ビス-マレイミド試薬(例えば国際公開第2014114207号を参照のこと)、ビス(フェニルチオ)マレイミド(例えば共に参照により組み込まれるSchumacherら、Org.Biomol.Chem.、2014、37、7261~7269及びAubreyら、Bioconj.Chem.、2018、29、3516~3521を参照のこと)、ビス-ブロモピリダジンジオン(例えば参照により組み込まれるRobinsonら、RSC Advances、2017、7、9073~9077)、ビス(ハロメチル)ベンゼン(例えば参照により組み込まれるRamos-Tomilleroら、Bioconj.Chem.、2018、29、1199~1208を参照のこと)、又は他のビス(ハロメチル)芳香族化合物(例えば国際公開第2013173391号を参照のこと)などのシステイン架橋試薬に付着しているペイロードの付加を伴う。典型的に、システインの架橋によって調製されるADCは、約4の薬物抗体負荷(DAR4)を有する。システイン側鎖へのコンジュゲーションに有用な別の技術は、タンパク質毒素、化学療法薬、及びプローブを担体分子に可逆的に接続するために利用されてきたバイオ活性化可能な接続であるジスルフィド結合による技術である(例えば参照により組み込まれるPillowら、Chem.Sci.、2017、8、366~370を参照のこと)。
[0008]リシン又はシステインへのコンジュゲーションの他に、さまざまな他のコンジュゲーション技術がこの10年間探索されてきた。ある方法は、例えば参照により組み込まれるAxupら、Proc.Nat.Acad.Sci.、2012、109、16101~16106によって明らかなように、非天然アミノ酸、例えばオキシムライゲーションに適したp-アセトフェニルアラニン、又はクリックケミストリーコンジュゲーションに適したp-アジドメチルフェニルアラニン若しくはp-アジドフェニルアラニンの遺伝子コード化に基づく。同様に、参照により組み込まれるZimmermanら、Bioconj.Chem.、2014、25、351~361は、無細胞タンパク質合成方法を採用して、無金属クリックケミストリーによるADCへの変換のためにアジドメチルフェニルアラニン(AzPhe)をモノクローナル抗体に導入した。また、参照により組み込まれるNairnら、Bioconj.Chem.、2012、23、2087~2097によって、アジドホモアラニン(Aha)のようなメチオニン類似体を、栄養素要求性細菌によってタンパク質に導入することができ、さらに(銅触媒)クリックケミストリーによってタンパク質コンジュゲートに変換できることも示された。最後に、ピロリシル-tRNAシンテターゼ/tRNACUA対を使用する組換えタンパク質における脂肪族アジドの遺伝子コード化が、参照により組み込まれるNguyenら、J.Am.Chem.Soc.、2009、131、8720~8721によって示され、標識が、クリックケミストリーによって確保された。
[0009]別の方法は、非天然官能性の酵素的導入に基づく。例えば、参照により組み込まれるLhospiceら、Mol.Pharmaceut.、2015、12、1863~1871は、アジド部分の抗体への導入のために細菌酵素トランスグルタミナーゼ(BTG又はTGase)を採用する。C末端TGase媒介アジド導入に続いて、無金属クリックケミストリーを用いたADCにおける変換に基づく遺伝学的方法が、参照により組み込まれるChengら、Mol.Cancer Therap.、2018、17、2665~2675によって報告された。
[0010]すべて参照により組み込まれる国際公開第2014065661号において、van Geelら、Bioconj.Chem.、2015、26、2233~2242及びVerkadeら、Antibodies、2018、7、12によって、自然抗体グリカンのN297における酵素的リモデリングは、クリックケミストリーを使用する細胞傷害性ペイロードの付着に適したアジド修飾糖の導入を可能にすることが示された(図5Aを参照のこと)。代替として、修飾糖が、ジスルフィド結合を有するかたちで酵素的に組み込まれ、続いて還元後に、遊離されて、アルキル化によるコンジュゲーションのための遊離チオール基を与える(図5Bを参照のこと)。例えばYamada及びIto、ChemBioChem.、2019、20、2729~2737によって強調されているように、事前の遺伝子改変を行わない、抗体の部位特異的修飾のための化学的手法も開発された。
[0011]よく行われるリンカー-薬物のアジド修飾タンパク質へのバイオコンジュゲーション方法は、歪み促進型アルキン-アジド環化付加(SPAAC)である。SPAAC反応において、リンカー-薬物は環式アルキンで官能化され、アジド修飾抗体との環化付加は、環歪みの解放によって駆動される。反対に、リンカー-薬物はアジドで官能化され、抗体は環式アルキンで官能化される。無金属クリックケミストリーに適したさまざまな歪んだアルキンを図1Aに示す。
[0012]その上、歪んだアルキンの場合、リンカー-薬物の抗体(及びグリカン、核酸などの他の生体分子)へのバイオコンジュゲーションは、さまざまな他の無金属クリックケミストリーによって達成することができる。例えば、参照により組み込まれるNguyen及びPrescher、Nature rev. 2020, doi: 10.1038/s41570-020-0205-0を参照のこと。例えば、タンパク質における特定チロシンの酸化によって、オルトキノンを得ることができ、それは、歪んだアルケン(例えば、TCO)又は歪んだアルキンと容易に環化付加を起こす。例えば、参照により組み込まれるBruinsら、Chem.Eur.J.、2017、24、4749~4756を参照のこと。シクロオクチンの他に、いくつかのシクロヘプチンも、参照により組み込まれるWeteringら、Chem.Sci.、2020、doi: 10.1039/d0sc03477kによって報告されたように無金属クリックケミストリーに適している。テトラジン部分は、さまざまな手段、例えば遺伝子コード化又は化学的アシル化によってタンパク質又はグリカンに導入することもでき、環式アルケン及びアルキンと環化付加を起こすこともある。無金属クリックケミストリーのための官能基FとQの対の一覧を図2に記載する。
[0013]上記に基づいて、図3におけるモノクローナル抗体に対して例証されているタンパク質コンジュゲートを調製する一般的方法は、x個の反応性部分Fを含むタンパク質と単一分子Qを含むリンカー-薬物構築物との反応を必要とする。反応性分子Fを如何にモノクローナル抗体に導入することができるかを示す概略図を図4に記載する。
[0014]上記の方法のうちのいずれかによる細胞傷害性ペイロードの抗体へのコンジュゲーションは、ペイロードの疎水性、場合によってはリンカーと組み合わせたペイロードの疎水性が、水性又は緩衝系(抗体にとって好ましい媒体)に対する溶解度を妨げるため、難題であることが多い。結果として、細胞傷害性ペイロードのコンジュゲーションは、典型的に水/緩衝液に加えて有機共溶媒からなる媒体中で行われる。コンジュゲーションのために典型的な共溶媒は、DMSO、プロピレングリコール(PG)、エタノール、DMF、DMA及びNMPであり、リンカー-薬物の可溶化を促進するが、水ともよく混合することができる。共溶媒の典型的な量は、水性媒体に対して10~25%であるが、共溶媒は、場合によっては50%まで添加されてもよい。高量の共溶媒を添加することは、ペイロードが著しく疎水性(親油性)であるコンジュゲーションプロセスにとって、大過剰のリンカー-薬物が所望の生成物への十分な変換を達成するために必要とされるプロセスにおいて特に有利である。
[0015]明らかな利益の他に、相当量の有機共溶媒を添加することの不利な面は、抗体が、溶媒混合物において安定でない可能性があり、結果としてコンジュゲーションプロセスの間に凝集する可能性があることである。典型的に、凝集レベルは共溶媒の量と相互関係があるが、これは抗体依存性でもある。特に不安定な抗体では、凝集レベルは著しいことがあり、10%か、さらにはそれ以上のレベルに達し、その結果プロセス収率を損なう。さらに、凝集塊のこれらのレベルは、凝集塊を許容されるレベルに除去するのに追加のプロセシングステップ(例えば、SEC又はCHT)を必要とする。コンジュゲーション時において共溶媒レベルが高いことの追加の不利な点は、サイズ排除精製(SEC)を行うことができるようになるには、その前に、例えば透析、スピン濾過又はTFFによって過剰の共溶媒を除去するための追加のプロセスステップを導入する必要があることである。
[0016]現在、細胞傷害性ペイロードとしては、例えば微小管破壊剤[例えば、モノメチルアウリスタチンE(MMAE)やモノメチルアウリスタチンF(MMAF)などのアウリスタチン、DM1やDM4などのメイタンシノイド、ツブリシン]、DNA損傷剤[例えば、カリケアマイシン、ピロロベンゾジアゼピン(PBD)二量体、インドリノベンゾジアゼピン(indolinobenzodiapine)二量体、デュオカルマイシン、アントラサイクリン]、トポイソメラーゼ阻害剤[例えば、DXd、SN-38]又はRNAポリメラーゼII阻害剤[例えば、アマニチン]が挙げられる。市販承認に到達したADCは、例えばペイロードMMAE、MMAF、DM1、カリケアマイシン、SN-38及びDXdを含んでおり、さまざまな主試験が、デュオカルマイシン、DM4及びPBD二量体をベースにしたADCに対して実行されている。より多岐にわたるペイロード、例えばエリブリン、インドリノベンゾジアゼピン二量体、PNU-159,682、ヘミアステルリン、ドキソルビシン、ビンカアルカロイドなどが、やはり臨床評価の段階であり、又はこれまでに臨床試験が行われている。最後に、後期前臨床ステージのさまざまなADCが、新規ペイロード、例えばアマニチン、KSP阻害剤、MMADなどにコンジュゲートされている。
[0017]サシツズマブゴビテカン(sacituzumabgovetican)(トロデルヴィ(Trodelvy)(登録商標))を除いて、臨床及び市販ADCのすべてが、独立型薬として適していない細胞傷害性薬を含む。トロデルヴィ(登録商標)は、細胞傷害性ペイロードとしてイリノテカンの活性カタボライト(SN-38プロドラッグ)でもあるSN-38を特徴とするので例外である。臨床ADCにおいて今や使用されるいくつかの他のペイロードは、最初に遊離薬物、例えばカリケアマイシン、PBD二量体及びエリブリンとして化学療法について評価されたが、パクリタキセルやドキソルビシンなど標準化学療法薬の典型的に低いマイクロモル濃度の効力に比べた、細胞毒の極度に高い効力(ピコモル濃度~低ナノモル濃度IC50値)が理由で失敗に終わった。
[0018]現在、市販のADCが1種及びさまざまな臨床ステージのADCが5種あり、すべてエクサテカンの合成誘導体であるペイロードDXd(図6に示す構造)をベースにし、リンカー-薬物デルクステカン(図8)をベースにしたADCである。DXd及びエクサテカンは、両方ともカンプトテシンのファミリーメンバーである(トポイソメラーゼ1阻害剤)。これまでに、エクサテカンは、前臨床試験が、CPT-11耐性腫瘍を含めてさまざまな腫瘍異種移植片モデルに対してSN-38ベースのイリノテカン(CPT-11)より強力であることを示したので、独立型化学療法薬(エクサテカンメシレート、DX-8951f)として臨床的に評価された。さらに、エクサテカンは、多剤耐性を与えるPgpトランスポーターの基質ではないことがわかったが、SN-38はPgpの弱い基質である。しかし、臨床研究において、エクサテカンメシレートのさまざまながんタイプに対するわずかな効果のみ観察され、参照により組み込まれるVenditto及びSimanek、Mol. Pharmaceut.、2010、7、307~349にまとめられており、最もよく見られた薬物関連毒性は好中球減少であった。エクサテカンとゲムシタビンを比較する第III相試験は、ゲムシタビン単独療法に対して生存期間の延長を示さなかった。結果として、遊離薬物としてのエクサテカンメシレートの開発は中止された。
[0019]その後のエクサテカンベースの研究は、DX-8951fがGly-Gly-Phe-Gly(GGFG)テトラペプチドスペーサーを介してカルボキシメチルデキストランポリアルコール(CM-Dex-PA)に共有結合している高分子担体系であるDE-310の開発に焦点を絞った。DE-310のGGFGペプチドスペーサーは、腫瘍微小環境において実際に前臨床試験でアップレギュレートされる特異的システインプロテアーゼによって切断されるように設計され、実際にマウスにおいてDE-310の11.4mg/kgの単回投与が、DX-8951f単独の反復投与(1日10mg/kg、5日間)より強い抗腫瘍活性を示すことが明らかになっていた。しかし、透過性貯蔵性の亢進(EPR)によって起こりうる徐放の利点は、参照により組み込まれるWenteら、Invest New Drugs.、2005、23、339によって報告されたように、ヒトがんの処置の第I相試験において確認されなかった。
[0020]ごく最近、エクサテカンは、例えば、参照により組み込まれるNakadaら、Bioorg. Med. Chem. Lett.、2016、26、1542~1545によって報告されたように、抗体-薬物コンジュゲートのペイロードとして検討され、さまざまなリンカーフォーマットがスクリーニングされた。しかし、エクサテカンベースのADCは最大で26%という甚だしい凝集を示すことが観察された。さらに、GGFGリンカーのエクサテカンアミノ基への直接付着によって、GGFGペプチドスペーサーのタンパク質分解除去が不完全になり、遊離DX-8951とG-DX-8951、すなわちN-グリシル-エクサテカンの両方の混合物を遊離することが見出された(図6を参照のこと)。実際、参照により組み込まれるWenteら、Invest New Drugs.、2005、23、339によって報告されたように、DE-310の以前の臨床試験から、腫瘍組織中のG-DX-8951濃度は、DX-8951自体の約10倍であることが明らかになり、G-DX-8951が、DE-310の細胞傷害活性を引き起こす要因の一端を担っている可能性があることを示唆された。同時に、前臨床データは、参照により組み込まれるShioseら、Biol. Pharm. Bull.、2007、30、2365~2370によって報告されたように、DX-8951及びG-DX-8951のトポイソメラーゼ-I活性に対する阻害活性は同程度であるが、DX-8951のインビトロ細胞傷害性は、G-DX-8951の約20~190倍強いことを示していた。最後に、さまざまなN-アミノアシル化誘導体は、エクサテカン/DX-8951自体と比べて有意に低減した膜透過性を示すことがPAMPAアッセイにより決定してわかった。
[0021]DX-8951に比べたG-DX-8951の効力の低減、アミノアシル化エクサテカン誘導体全般の不十分な細胞膜透過性及びエクサテカンベースのADCの著しい凝集可能性の結果として、GGFG-アミナールベースのリンカーと組み合わせたN-ヒドロキシアシル化DX-8951誘導体(DXd)をベースにしたデルクステカン(図8に示す)と呼ばれる、新しいエクサテカンベースのリンカー技術がDaiichi-Sankyoによって開発された。リンカー-ペイロードは、鎖間ジスルフィド結合が還元剤で還元された後、システイン残基を介して抗体とコンジュゲートされ、それによってDAR4又はDAR8のADC(それぞれ図10Aに示すADC4a又はADC4b)が還元剤の化学量論に応じて産生される。代替として、システインエンジニアリング抗体を使用して、DAR2のADCを産生することができる(図10Bに示すADC5)。テトラペプチドは、腫瘍細胞において高発現されるカテプシンB及びLなどのリソソーム酵素によって分解されるので、次にDXdが(ホルムアルデヒドの遊離を伴って)遊離アミナール部分の自壊を介して遊離されると思われる。予想通りに、DXdは、参照により組み込まれるOgitaniら、Cancer Sci.、2016、107、1039~1046によって報告されたように、高細胞透過性であることがわかり、結果として著しいバイスタンダー効果を示した。したがって、デルクステカンをベースにしたADCは、標的不均一性で腫瘍を処置する際に有益でありうる。さらに、デルクステカンとのシステインコンジュゲーションによって誘導されたADCは、3つのADCプログラム、すなわちDS-8201a(HER2を標的にするADC、現在Enhertuとして市販)、U3-1402a(HER3を標的にするADC)及びDS-6157a(GRP20を標的にするADC)において適用されたように、高安定性を示し、最大でDAR8の高薬物負荷を可能にすることが見出された。さらに、2種のデルクステカンベースのDAR4のADC、すなわちDS-1062a(TROP-2を標的にするADC)及びDS-7300a(B7-H3を標的にするADC)が、臨床開発のさまざまなステージにある。
[0022]デルクステカンベースのプログラムの他に、カンプトテシンペイロードを有する他の3種のADCが臨床に到達し、これらのうちの2種がSN-38をベースにしたADC、すなわち両方ともSN-38をベースにした(TROP-2を標的にする)サシツズマブゴビテカン(sacetizumab govetican)と(CEACAM5を標的にする)ラベツズマブゴビテカン(labetuzumab govetican)である。実際、参照により組み込まれるWalkerら、Bioorg. Med. Chem. Lett.、2002、12、217~219によるカンプトテシンペイロードをベースにしたADCに関する第一報は、(抗BR96標的化抗体にコンジュゲートされた)SN-38を含むものであった。参照により組み込まれるSharkeyら、Clin. Cancer Res.、2015、21、5131~5138によって記載されたサシツズマブゴビテカン(sacetizumab govetican)は、トリプルネガティブ乳がんの処置のためのトロデルヴィ(登録商標)として承認された。最近臨床に入った、カンプトテシンペイロード(ベロテカン)を有する第3のADCは、SKB264である。
[0023]ADCの文脈の中でカンプトテシン型ペイロードの他のバリアントを用いたいくつかの前臨床試験も、最近開示された。例えば、参照により組み込まれるBurkeら、Bioconj. Chem.、2009、20、1242~1250には、カンプトテシン自体の10~1000倍強力な新規カンプトテシン類似体を有する抗体-薬物コンジュゲート(ADC)の調製が記載されている。強力なカンプトテシン類似体の7-ブチル-9-アミノ-10,11-メチレンジオキシ-カンプトテシンを有するADCは、インビトロでがん細胞株の一団に対して高度に強力で、免疫学的に特異的であり、腎細胞癌異種移植モデルにおいて忍容性が良好な用量で効果的である。しかし、これらのADCは、それ以上開発されなかった。最後に、2019年にLiら、ACS Med. Chem. Lett.、2019、10、1386~1392によって、エクサテカンによって喚起されたがペイロードの(図6を参照のこと、カンプトテシン環番号付けの)F環を欠いているカンプトテシンを有するADCに関する報告が発表された。F環のキラル中心がその合成及び誘導体化を複雑にすると推論されたので、ペイロードにおいてF環を欠くものの、それでもインビトロ及びインビボでDXdを有するコンジュゲートと同様に挙動する新しいカンプトテシンが合成された。特に、ペプチドリンカー切断に続いてヒドロキシル又はチオールを有する代謝物を遊離する能力を有する、バイスタンダー死滅がさまざまな程度のADCは、デルクステカンベースのADCに対してベンチマークテストされ、共培養中の標的陽性細胞に対して少なくとも同じ効力及び標的陰性細胞に対する増強した効力(バイスタンダー死滅)を有することが見出された。しかし、エクサテカン自体をベースにしたADCは、スクリーニングされなかった。
[0024]多種多様なカンプトテシンベースのADCが記載され、これらのうち複数は、DXd、SN-38又はベロテカンをベースにしたすべてが臨床評価中であるか、又は市販承認に到達した。しかし、現在まで、活性カタボライトとしてエクサテカンを遊離するように設計されたリンカーフォーマットをベースにしたADCは、もしかすると参照により組み込まれるNakadaら、Bioorg. Med. Chem. Lett.、2016、26、1542~1545によって報告された高凝集傾向が理由で、報告されていない。解決策として、DXdの著しいバイスタンダー効果がデルクステカンリンカー技術の価値に実質的に寄与する、DXdが開発された。
[0025]本発明者らは驚いたことに、切断可能なペプチド-PABC系を有するリンカーが、凝集傾向を全く示さないか、又は無視できるほどの凝集傾向を示す抗体-エクサテカンコンジュゲートを生じる、エクサテカンの抗体への無金属クリック又はチオールコンジュゲーションに大いに適していることを見出した。得られたADCは、著しいインビボ有効性効能を示すことがわかった。したがって、本発明者らは初めて、凝集を全く示すことなく、現在までに知られている最も効果的な抗体-カンプトテシンコンジュゲートと同じ大きさの有効性を示す、エクサテカンペイロードを有するADCを調製することができた。
[0026]本発明は、まず第一に構造(1)を有する抗体-薬物コンジュゲートに関する
Figure 2023541637000002

[構造中、
ABは抗体であり、
及びLはリンカーであり、
wは、0又は1であり、
Zは、無金属クリック反応又はチオールライゲーションによって得られた接続基であり、
17はそれぞれ個別にアミノ酸側鎖であり、
nは、1~5の範囲の整数であり、
Aは、5員又は6員の芳香族又はヘテロ芳香族環であり、
xは、1~8の範囲の整数であり、
21は、H、R22、C(O)OH及びC(O)R22から選択され、R22は、C~C24(ヘテロ)アルキル基、C~C10(ヘテロ)シクロアルキル基、C~C10(ヘテロ)アリール基、C~C10アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C10(ヘテロ)アリールアルキル基であり、それらは、任意選択で置換されており、O、S及びNR23から選択される1個又は複数のヘテロ原子で任意選択で中断されており、R23は、水素及びC~Cアルキル基からなる群から独立的に選択される]。
[0027]本発明はさらに、本発明に係る抗体薬物コンジュゲートの合成方法、本発明に係る方法において使用されることが適したリンカー-薬物構築物、本発明に係る抗体薬物コンジュゲートの医学的使用及び本発明に係る抗体薬物コンジュゲートを含む医薬組成物に関する。
無金属クリックケミストリーに適した環式アルキン、及び反応性部分Qの好ましい実施形態を示す図である。この一覧は包括的なものではなく、例えばアルキンは、フッ素化、芳香族環の置換又は芳香族環におけるヘテロ原子の導入によってさらに活性化されうる。 システイン側鎖との反応に適したさまざまな試薬を示す図である。試薬は、モノアルキル化型(A)とすることができるか、又は2個のシステイン側鎖との反応のための架橋剤(B)とすることができる。 相補的反応性基Qとの無金属クリック反応後に、接続基Zを生じる、エンジニアリング、化学修飾、又は酵素的手段によって抗体に導入することができる官能基(F)の代表的(ではあるが包括的でない)一群を示す図である。官能基Fは、抗体に選択されたいずれの位置でも人工的に導入(エンジニアリング)されうる。いくつかの官能基F(例えば、ニトリルオキシド、キノン)は、歪んだアルキンの他に、歪んだアルケンとも反応することができ、例として、トリアジン又はテトラジンが描かれる(最下行)。ピリジン又はピリダジン接続基は、それぞれトリアジン又はテトラジンとアルキン(アルケンではない)の反応後にNを失って形成される、テトラアザビシクロ[2.2.2]オクタン接続基の転位生成物である。接続基Zは、本発明において使用されるのに好ましい接続基である。 x個の官能基Fを含むモノクローナル抗体(たいていの場合、対称的二量体)の反応による抗体薬物コンジュゲート調製の一般スキームを示す図である。抗体-(F)xと過剰のリンカー-薬物構築物(Q-スペーサー-リンカー-ペイロード)のインキュベーションにより、FとQが反応し、結合Zを形成することによってコンジュゲートが得られる。 クリックコンジュゲーション又はチオールライゲーションのためのプローブ(F)を含む抗体へのモノクローナル抗体の非遺伝子変換の一般プロセスを示す図である。クリックプローブは、採用される技術に応じて、抗体のさまざまな位置に存在することができる。例えば、抗体は、クリックコンジュゲーションのための、2つのクリックプローブ(左側の構造)又は4つのクリックプローブ(下側の構造)又は8つのプローブ(右側の構造)を含む抗体に変換されうる。 全長IgGのグリカンリモデリングに続いて、アジド-シクロオクチンクリックケミストリーに基づく、ペイロードの部位特異的コンジュゲーションの具体例を示す図である。最初に、IgGは、異なるすべてのグリコフォームのエンドグリコシダーゼ媒介トリミングに続いて、エンドグリコシダーゼによって遊離されたコアGlcNAcへのアジド-糖のグリコシルトランスフェラーゼ媒介移動によって、酵素的にリモデリングされる。次のステップで、アジド-リモデリングIgGを免疫細胞エンゲージングポリペプチドにさらし、無金属クリックケミストリーのために単一のシクロオクチンで修飾され(SPAAC)、2:2の分子フォーマットの二重特異性抗体を生じる。シクロオクチン-ポリペプチド構築物が、シクロオクチンとポリペプチドの間にIgG-ポリペプチドの距離の調整を可能にする特定のスペーサーを有するか、又は得られた二重特異性抗体に他の特性を付与することも示されている。 全長IgGのグリカンリモデリングとそれに続くチオールアルキル化ケミストリーに基づく、ペイロードの部位特異的コンジュゲーションの具体例を示す図である。最初に、IgGは、異なるすべてのグリコフォームのエンドグリコシダーゼ媒介トリミングとそれに続くエンドグリコシダーゼによって遊離されたコアGlcNAcへのチオール修飾(及びジスルフィド保護)糖誘導体のグリコシルトランスフェラーゼ媒介転移によって、酵素的にリモデリングされる。次のステップで、リモデリングIgGの還元(ジスルフィドのチオールへの変換)と、もしかするとそれに続く酸化、次いで好適なチオール反応性試薬で修飾されたペイロードとの反応を行う。 トポイソメラーゼ阻害剤DXd及びエクサテカン、並びにN-グリシル-エクサテカン(G-DX-8951)の構造を示す図である。エクサテカンについて、環番号付けを示す。 アジド修飾抗体へのコンジュゲーションによるADCにおける適用に適したBCN-リンカー-薬物1~3の構造を示す図である。構造1~3は、ペプチド-PABC切断可能なリンカーを含み、Val-Ala(1a及び2a)又はVal-Cit(1b又は2b)のペプチドが存在する。構造1及び2は、ペイロードの直接遊離に合わせて設計され、構造3については、追加部分(N,N’-ジメチルエチレンジアミノカルボニル)が、環化を通したペイロードの遊離のために含まれている。構造1及び2は、細胞傷害性ペイロードエクサテカンを含み、構造3は、細胞傷害性ペイロードSN-38を含む。 遊離システイン側鎖へのコンジュゲーションによるADCにおける適用に適したDXdベースのマレイミド-リンカー-薬物4(デルクステカンとも呼ばれる)の構造を示す図である。 (アジド-糖の導入のための)N-グリカンの酵素リモデリングとそれに続くリンカー-薬物1又は2との無金属クリックコンジュゲーションによって得られたADCの構造を示す図である。リモデリング及びネイティブのN297グリカンのみにおける1又は2とのコンジュゲーションが、それぞれDAR4のADC1a又はDAR4のADC2をもたらす。リモデリング及びネイティブのN297グリカン+追加のエンジニアリングN-グリコシル化部位(例えば、HC-L201N)における1とのコンジュゲーションが、DAR8のADC1bをもたらす。 ネイティブのジスルフィド結合の還元とそれに続くデルクステカン4とのコンジュゲーションを行い、採用された具体的な条件(還元剤、例えばTCEP又はDTTの化学量論、及びデルクステカン)に応じてADC4a(平均DAR4)又はADC4b(平均DAR8)をもたらすことによって得られたADCの構造を示す図である。 天然アミノ酸の変異体、システイン挿入又は抗体のN末端若しくはC末端に縮合しているペプチドにおけるシステインとすることがあるエンジニアリングシステイン、及びそれに続く、ADC5(平均DAR2)をもたらすデルクステカン4とのコンジュゲーションを有する抗体から得られたADCの構造を示す図である。 アジド基又はチオール基が次に起こる抗体コンジュゲートへの変換の出発物質として利用できるさまざまな抗体バリアントを示す図である。 アジド-トラスツズマブ(酵素リモデリング後)、ADC1a(DAR4)及びADC4a(DAR4)のHICプロファイルを示す図である。アジド-トラスツズマブは、保持時間9.2分を示し、本発明に係るADC1aは、保持時間9.8分の単一ピークを示し、したがって相対保持時間は1.06である。対照的に、対照のADC ADC4aは、HICカラムから溶離する多数のピーク(10.2分から>12.3分まで)を示し、アジド-トラスツズマブに対する相対保持時間は、1.11から>1.33までである。 トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)の25aとのコンジュゲーションのRP-HPLCトレースを示す図である。 トラスツズマブS239C変異体trast-v3のマレイミド-エクサテカンバリアント54a、57b、59a又は60aとのコンジュゲーションの還元条件下におけるRP-UPLCトレースを示す図である。 トラスツズマブGalProSH trast-v2のマレイミド-エクサテカンバリアント57b又は60aとのコンジュゲーションの還元条件下におけるRP-UPLCトレースを示す図である。 一般手順Aに従ったトラスツズマブtrast-v4のマレイミド-エクサテカンバリアント60a又は57bとのコンジュゲーションの還元条件下におけるRP-UPLCトレースを示す図である。 一般手順Aに従ったリツキシマブrit-v4のマレイミド-エクサテカンバリアント60a又は57bとのコンジュゲーションの還元条件下におけるRP-UPLCトレースを示す図である。 一般手順Bに従ったトラスツズマブtrast-v4のマレイミド-エクサテカンバリアント60a又は57bとのコンジュゲーションの還元条件下におけるRP-UPLCトレースを示す図である。 BT-474細胞株を移植し、ビヒクル、カドサイラ(Kadcyla)(T-DM1)並びにエクサテカン(ADC1a)及びSN-38(ADC3)をベースにしたDAR4 ADCを投与(すべて単回投与)したマウスにおける腫瘍容積のインビボ有効性研究モニタリングの結果を示す図である。本発明に係るADC1aは、1回12mg/kgで完全な腫瘍消失を示し、対照ADC3と比べて有意な改善である。 BT-474細胞株を移植し、ビヒクル並びにエクサテカン(ADC1a)及びDXd(ADC4a)をベースにしたDAR4 ADCを投与(すべて単回投与)したマウスにおける腫瘍容積のインビボ有効性研究モニタリングの結果を示す図である。 図20Aのズームを示す図である。本発明に係るADC1a及び対照ADC4aは、有効性における有意差を示さず、4mg/kgで部分応答を、両ADCについて1回12mg/kgで完全な腫瘍退縮を示す。 BT-474細胞株を移植し、ビヒクル、並びにエクサテカン(ADC1a(DAR4)及びADC1b(DAR8))及びDXd(ADC4a(DAR4)及びADC4b(DAR4))をベースにしたDAR4+DAR8 ADCを投与(すべて単回投与)したマウスにおける腫瘍容積のインビボ有効性研究モニタリングの結果を示す図である。 BT-474細胞株を移植し、ビヒクル、及び短いスペーサー(ADC1a(DAR4))又は長いスペーサー(ADC2(DAR4))を有するエクサテカンをベースにしたDAR4 ADCを投与したマウスにおける腫瘍容積のインビボ有効性研究モニタリングの結果を示す図である。本発明に係るADC1a及びADC2は、有効性における有意差を示さない。
定義
[0052]本明細書及び特許請求の範囲において使用される「含むこと(to comprise)」という動詞及びその活用形は、その単語に続く事項を含むが、具体的に述べられていない事項を除外しないことを意味するためにその非限定的な意味で使用される。さらに、不定冠詞「a」又は「an」による「要素」への言及は、文脈上から要素は唯一つ存在していることが明確に求められていない限り、1つより多くの要素が存在する可能性を排除しない、したがって、不定冠詞「a」又は「an」は、通常「少なくとも1つ」を意味する。
[0053]本明細書及び特許請求の範囲に開示された化合物は、1個又は複数の不斉中心を含むことができ、化合物のさまざまなジアステレオマー及び/又はエナンチオマーが存在する可能性がある。本明細書及び特許請求の範囲におけるいずれの化合物の説明も、別段の記載がない限り、すべてのジアステレオマー及びその混合物を含むことになっている。さらに、本明細書及び特許請求の範囲におけるいずれの化合物の説明も、別段の記載がない限り、個々のエナンチオマーも、エナンチオマーのいずれの混合物、ラセミかそうでないものも含むことになっている。化合物の構造が特定のエナンチオマーとして示されているとき、本出願の発明はその特定のエナンチオマーに限定されないことを理解すべきである。
[0054]化合物は、さまざまな互変異性形で出現する可能性がある。本発明に係る化合物は、別段の記載がない限り、すべての互変異性形を含むことになっている。化合物の構造が特定の互変異性体として示されているとき、本出願の発明は、その特定の互変異性体に限定されないことを理解すべきである。
[0055]本明細書及び特許請求の範囲に開示された化合物は、R及びSの立体異性体としてさらに存在する可能性がある。別段の記載がない限り、本明細書及び特許請求の範囲におけるいずれの化合物の説明も、化合物の個々のRと個々のSの立体異性体の両方、並びにそれらの混合物を含むことになっている。化合物の構造が特定のS又はRの立体異性体として示されているとき、本出願の発明は、その特定のS又はRの立体異性体に限定されないことを理解すべきである。
[0056]本明細書及び特許請求の範囲に開示された化合物は、R及びSの立体異性体としてさらに存在する可能性がある。別段の記載がない限り、本明細書及び特許請求の範囲におけるいずれの化合物の説明も、化合物の個々のRと個々のSの立体異性体の両方、並びにそれらの混合物を含むことになっている。化合物の構造が特定のS又はRの立体異性体として示されているとき、本出願の発明は、その特定のS又はRの立体異性体に限定されないことを理解すべきである。
[0057]本明細書及び特許請求の範囲に開示された化合物は、エキソ及びエンドジアステレオマーとしてさらに存在する可能性がある。別段の記載がない限り、本明細書及び特許請求の範囲におけるいずれの化合物の説明も、化合物の個々のエキソジアステレオマーと個々のエンドジアステレオマーの両方、並びにそれらの混合物を含むことになっている。化合物の構造がエンド又はエキソジアステレオマーとして示されているとき、本出願の発明はその特定のエンド又はエキソジアステレオマーに限定されないことを理解すべきである。
[0058]本発明に係る化合物は、本発明によってやはり包含される塩の形で存在する可能性がある。塩は、典型的に薬学的に許容されるアニオンを含む薬学的に許容される塩である。用語「その塩」は、酸性プロトン、典型的に酸のプロトンが金属カチオン又は有機カチオンなどカチオンによって置き換えられるとき形成された化合物を意味する。適用可能な場合、塩は、薬学的に許容される塩であるが、これは、患者への投与が意図されていない塩には必要でない。例えば、化合物の塩では、化合物は、無機酸又は有機酸によってプロトン化されて、カチオンを形成することができ、無機酸又は有機酸の共役塩基が塩のアニオン成分である。
[0059]用語「薬学的に許容される」塩は、哺乳類など患者への投与のために許容される塩(所与の投与計画に対して許容される哺乳類の安全性を有する対イオンを含む塩)を意味する。そのような塩は、薬学的に許容される無機塩基又は有機塩基及び薬学的に許容される無機酸又は有機酸から誘導することができる。「薬学的に許容される塩」は、化合物の薬学的に許容される塩を指す。その塩は、当技術分野において公知であるさまざまな有機及び無機の対イオンから誘導されるものであり、例えばナトリウム塩、カリウム塩、カルシウム塩、マグネシウム塩、アンモニウム塩、テトラアルキルアンモニウム塩など、分子が塩基性官能基を含むとき、塩酸塩、臭化水素酸塩、ギ酸塩、酒石酸塩、ベシル酸塩、メシル酸塩、酢酸塩、マレイン酸塩、シュウ酸塩などの有機酸又は無機酸の塩が含まれる。
[0060]本明細書では用語「タンパク質」は、その通常の科学的意味で使用される。本明細書では、約10個以上のアミノ酸を含むポリペプチドは、タンパク質と考えられる。タンパク質は、天然アミノ酸を含むことができるが、非天然アミノ酸も含むことができる。
[0061]本明細書では用語「抗体」は、その通常の科学的意味で使用される。抗体は、免疫系によって産生されたタンパク質であり、特異的抗原を認識し、それに結合することができる。抗体は、糖タンパク質の例である。本明細書では抗体という用語は、その最も広義の意味で使用され、具体的にはモノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、二量体、多量体、多特異性抗体(例えば、二重特異性抗体)、抗体フラグメント、並びに二重鎖及び単鎖抗体が含まれる。本明細書では用語「抗体」は、ヒト抗体、ヒト化抗体、キメラ抗体及びがん抗原を特異的に結合する抗体も含むように意図されている。用語「抗体」は、全免疫グロブリンを含むが、抗体の抗原結合性フラグメントも含むように意図されている。さらに、用語は、遺伝子エンジニアリング抗体及び抗体の誘導体を含む。抗体、抗体のフラグメント及び遺伝子エンジニアリング抗体は、当技術分野において公知である方法によって得ることができる。
[0062]本明細書では「抗体フラグメント」は、その抗原結合性又は可変領域を含むインタクト抗体の一部分と定義される。抗体フラグメントの例としては、Fab、Fab’、F(ab’)、及びFvフラグメント、ダイアボディ、ミニボディ、トリアボディ、テトラボディ、線状抗体、単鎖抗体分子、scFv、scFv-Fc、抗体フラグメント(複数可)から形成された多重特異性抗体フラグメント、Fab発現ライブラリーによって産生されたフラグメント(複数可)、又は標的抗原(例えば、がん細胞抗原、ウイルス抗原又は微生物抗原)に免疫特異的に結合する上記のいずれかのエピトープ結合性フラグメントが挙げられる。
[0063]本明細書では「抗原」は、抗体が特異的に結合する単位と定義される。
[0064]本明細書では用語「特異的結合」及び「特異的に結合する」は、抗体又は抗体がその対応する標的抗原エピトープと結合し、多数の他の抗原とは結合しない高度に選択的な様式と定義される。典型的に、抗体又は抗体誘導体は、少なくとも約1×10-7M、好ましくは10-8M~10-9M、10-10M、10-11M、又は10-12Mの親和性で結合し、所定の抗原に、所定の抗原又は密接に関連した抗原以外の非特異的抗原(例えば、BSA、カゼイン)に結合するためのその親和性より少なくとも2倍高い親和性で結合する。
[0065]本明細書では用語「実質的な」又は「実質的に」は、混合物又は試料の集団の大多数、すなわち>50%、好ましくは集団の50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、又は99%超と定義される。
[0066]本明細書では「リンカー」は、化合物の2個以上の元素を接続する部分と定義される。例えば、抗体コンジュゲートにおいて、抗体及びペイロードは互いにリンカーを介して共有結合される。リンカーは、1つ又は複数のリンカー及びさまざまな部分をリンカー内で接続するスペーサー部分を含むことができる。
[0067]本明細書では「スペーサー」又はスペーサー部分は、リンカーの2つ(以上)のパートに一定の間隔を置き(それらのパートの間に距離を与え)、それらのパートを共有結合する部分と定義される。リンカーは、以下に定義されるように、例えばリンカー-構築物の一部分、リンカーコンジュゲート又はバイオコンジュゲートとすることができる。
[0068]本明細書では「自己破壊性基」は、リガンドユニットによって標的にされる部位において遊離薬物を条件付きで遊離する機能を有する抗体薬物コンジュゲートにおけるリンカーの一部分と定義される。活性化可能な自己破壊性部分は、活性化可能な基(AG)及び自己破壊性スペーサーユニットを含む。活性化可能な基を例えばアミド基のアミノ基への酵素的変換又はジスルフィドの遊離チオール基への還元によって活性化すると、任意選択で二酸化炭素の遊離を伴う、p-アミノベンジル基のp-キノンメチドへの(一時的)1,6-脱離反応、及び/又はその後に続く第2の環化遊離機構を含むことができるさまざまな機構のうちの1つ又は複数によって、自己破壊性反応順序が開始され、遊離薬物の遊離を引き起こす。自己破壊性アセンブリユニットは、抗体とペイロードを(官能基を介して)接続する化学的スペーサーの一部分とすることができる。代替として、自己破壊性基は、化学的スペーサーの固有の一部分ではなく、抗体とペイロードを接続する化学的スペーサーから分岐する。
[0069]本明細書では「コンジュゲート」は、抗体がリンカーを介してペイロードに共有結合される化合物と定義される。コンジュゲートは、1個若しくは複数の抗体及び/又は1個若しくは複数のペイロードを含む。
[0070]用語「ペイロード」は、抗体などのターゲティング部分に共有結合しているが、タンパク質コンジュゲートの取り込み及び/又はリンカーの切断後にコンジュゲートから遊離される分子にも共有結合している部分を指す。したがって、ペイロードは、リンカーを介してターゲティング部分に共有結合している1つの開放端部を有する1価の部分、及びそれから遊離される分子も指す。本発明の文脈において、ペイロードはエクサテカンである。
本発明
[0071]本発明者らは、凝集傾向を全く示さないか、又は無視できるほどの凝集傾向を示す、細胞傷害性ペイロードとしてエクサテカン及び切断可能なペプチド-PABC系を含む抗体-薬物コンジュゲートを開発した。得られたADCは、著しいインビボ有効性を示すことがわかった。
[0072]本発明は、まず第一に抗体-薬物コンジュゲートに関する。第2の態様において、本発明は、本発明に係る抗体-薬物コンジュゲートの合成方法に関する。第3の態様において、本発明は、本発明に係る方法において使用されるのに適したリンカー-薬物構築物に関する。第4の態様において、本発明は、本発明に係る抗体-薬物コンジュゲートの医学的使用、及び本発明に係る抗体-薬物コンジュゲートを含む医薬組成物に関する。当業者は、すべての態様が関連づけられていること、並びに本発明に係る抗体-薬物コンジュゲートについて述べられているあらゆることが、本発明に係る方法、本発明に係るリンカー-薬物構築物、本発明に係る使用、及び本発明に係る組成物に同様に適用され、逆も同様であることを理解する。
[0073]本発明は、以下の好ましい実施形態の一覧に従って定義されうる。
1. 構造(1)を有する抗体-薬物コンジュゲート
Figure 2023541637000003

[構造中、
ABは抗体であり、
及びLはリンカーであり、
wは、0又は1であり、
Zは、無金属クリック反応又はチオールライゲーションによって得られた接続基であり、
17はそれぞれ個別にアミノ酸側鎖であり、
nは、1~5の範囲の整数であり、
Aは、5員又は6員の芳香族又はヘテロ芳香族環であり、
xは、1~8の範囲の整数であり、
21は、H、R22、C(O)OH及びC(O)R22から選択され、R22は、C~C24(ヘテロ)アルキル基、C~C10(ヘテロ)シクロアルキル基、C~C10(ヘテロ)アリール基、C~C10アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C10(ヘテロ)アリールアルキル基であり、それらは、任意選択で置換されており、O、S及びNR23から選択される1個又は複数のヘテロ原子で任意選択で中断されており、R23は、水素及びC~Cアルキル基からなる群から独立的に選択される]。
2. Lが、構造(2)を有する
Figure 2023541637000004

[構造中、
*で標識された波形の結合は、Zに接続されており、**で標識された波形の結合は、NHに接続されており、
Sp及びSpはそれぞれ個別にスペーサー部分であり、
n、A、R17及びR21は、実施形態1に記載の通りである]、
実施形態1に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
3. 出現する各Spが同じであり、出現する各(NH-CR17-CO)が同じであり、出現する各Aが同じであり、出現する各R21が同じである、実施形態2に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
4. L、好ましくはSpが、構造(3)で表されるスルファミド基を含む
Figure 2023541637000005

[構造中、
a=0又は1であり、
13は、水素、C~C24アルキル基、C~C24シクロアルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から選択され、C~C24アルキル基、C~C24シクロアルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意選択で置換されており、O、S及びNR14[ここで、R14は、水素及びC~Cアルキル基からなる群から独立的に選択される]から選択される1個若しくは複数のヘテロ原子で任意選択で中断されているか、又はR13は、スペーサー部分を介してNに接続されているC(O)Xの第2の出現である]、
実施形態1~3のいずれか一形態に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
5. L、好ましくはSpが、式(3)の基を2個含む、実施形態4に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
6. 出現する各nが2である、実施形態1~5のいずれか一形態に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
7. 出現する各(NH-CR17-CO)が、Val-Cit、Val-Ala、Val-Lys、Val-Arg、AcLys-Val-Cit、AcLys-Val-Ala、Phe-Cit、Phe-Ala、Phe-Lys、Phe-Arg、Ala-Lys、Leu-Cit、Ile-Cit、Trp-Cit、Ala-Ala-Asn、Ala-Asn及びLys、好ましくはVal-Cit、Val-Ala、Val-Lys、Phe-Cit、Phe-Ala、Phe-Lys、Ala-Ala-Asnから、最も好ましくはVal-Cit又はVal-Alaから選択される、実施形態1~6のいずれか一形態に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
8. Zが、(Z1)~(Z8)及び(Z11)~(Z23)から選択される構造を有する

[構造中、
*で標識された波形の結合は、Lを任意選択で介してABに接続されており、他の波形の結合は、Lに接続されており、
(Z3)、(Z7)及び(Z8)における官能基Rは、水素、C~C24アルキル基、C~C24アシル基、C~C24シクロアルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基、C~C24(ヘテロ)アリールアルキル基及びC~C24スルホニル基から選択され、これらのそれぞれが、任意選択で置換されていてもよく、O、S及びNR32[ここで、R32は、水素及びC~Cアルキル基からなる群から独立的に選択される]から選択される1個又は複数のヘテロ原子で任意選択で中断されていてもよく、
24は、H又はC1~12アルキル、好ましくはH又はC1~6アルキルであり、
29は、C1~12アルキル、好ましくはC1~4アルキル、最も好ましくはエチルである]、
実施形態1~7のいずれか一形態に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
9. 構造(1a)を有する

[構造中、
AB、L、w、Z、A、R21及びxは、実施形態1に記載の通りであり、
17は、CH又はCHCHCHNHC(O)NHであり、
mは、1~10の範囲の整数であり、
qは、0~10の範囲の整数であり、
pは、0又は1である]、
実施形態1~8のいずれか一形態に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
10. w=0であり、コンジュゲーション部位が、システイン残基であり、好ましくはシステイン残基が、任意選択でジスルフィド結合の還元後に、抗体中に天然に存在するか、或いはシステイン残基が、エンジニアリングされ、好ましくはアミノ酸のシステインによる置換、システイン挿入或いは単一システイン残基又はN末端若しくはC末端にシステイン残基を含むペプチドフラグメントの導入によってエンジニアリングされている、実施形態1~9のいずれか一形態に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
11. 構造(1b)を有する

[構造中、
Z、L、R17、A、R21、n及びxは、実施形態1に記載の通りであり、
eは、0~20の範囲の整数であり、
Suは単糖であり、
Gは単糖部分であり、
GlcNAcは、N-アセチルグルコサミン部分であり、
Fucは、フコース部分であり、
dは、0又は1である]、
実施形態1~9のいずれか一形態に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
12. 抗体ABが、HER2を標的にする、実施形態1~11のいずれか一形態に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
13. 実施形態1~12のいずれか一形態に記載の抗体-薬物コンジュゲートの合成方法であって、
(i) 構造AB-((L-F)の修飾抗体[構造中、
ABは抗体であり、
はリンカーであり、
wは、0又は1であり、
Fは、無金属クリック反応においてQと反応することができるクリックプローブ、又はチオール若しくはその前駆体であり、
xは、1~8の範囲の整数である]を
(ii) 構造(5)で表されるリンカー-薬物構築物
Figure 2023541637000009

[構造中、
はリンカーであり、
Qは、無金属クリック反応を行うことができるクリックプローブ又はチオール反応性プローブであり、
17はそれぞれ個別にアミノ酸側鎖であり、
nは、1~5の範囲の整数であり、
Aは、5員又は6員の芳香族又はヘテロ芳香族環であり、
xは、1~8の範囲の整数であり、
21は、H、R22、C(O)OH及びC(O)R22から選択され、R22は、C~C24(ヘテロ)アルキル基、C~C10(ヘテロ)シクロアルキル基、C~C10(ヘテロ)アリール基、C~C10アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C10(ヘテロ)アリールアルキル基であり、それらは、任意選択で置換されており、O、S及びNR23から選択される1個又は複数のヘテロ原子で任意選択で中断されており、R23は、水素及びC~Cアルキル基からなる群から独立的に選択される]と
反応させて、QとFの間の無金属クリック反応又はQとFの間のチオールライゲーションによって形成された接続基Zを介して薬物が抗体に共有結合している抗体-薬物コンジュゲートを形成するステップを含む方法。
14. クリックプローブQが、環式アルキン部分若しくは環式アルケン部分を含み、又はチオール反応性プローブQが、マレイミド部分を含む、実施形態13に記載の方法。
15. クリックプローブQが、(Q22)~(Q36)からなる群から選択されるか
Figure 2023541637000010

[構造中、B(-)はアニオンである]、
又は(ヘテロ)シクロアルキニル部分Qが、構造(Q37)に一致し、
Figure 2023541637000011

[構造中、
15は、水素、ハロゲン、-OR16、-NO、-CN、-S(O)16、-S(O) (-)、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意選択で置換されており、2個の置換基R15は連結されて、任意選択で置換されている縮合環化シクロアルキル又は任意選択で置換されている縮合環化(ヘテロ)アレーン置換基を形成することがあり、R16は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、
は、C(R31、O、S又はNR31であり、R31はそれぞれ個別に、R15又はスペーサー部分を介して接続されているエクサテカンペイロードの第2の出現であり、
uは、0、1、2、3、4又は5であり、
u’は、0、1、2、3、4又は5であり、u+u’=4、5、6、7又は8であり、
v=8~16の範囲の整数である]、
好ましくはシクロオクチニル部分Qが、構造(Q38)で表されるか
Figure 2023541637000012

[構造中、
15は、水素、ハロゲン、-OR16、-NO、-CN、-S(O)16、-S(O) (-)、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意選択で置換されており、2個の置換基R15は連結されて、任意選択で置換されている縮合環化シクロアルキル又は任意選択で置換されている縮合環化(ヘテロ)アレーン置換基を形成することがあり、R16は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、
18は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、
19は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から選択され、アルキル基は、O、N及びSからなる群から選択される1個若しくは複数(one of more)のヘテロ原子で任意選択で中断されており、アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は、独立的に任意選択で置換されており、又はR19は、スペーサー部分を介して接続されているエクサテカンペイロードの第2の出現であり、
lは、0~10の範囲の整数である]、
又は(ヘテロ)シクロオクチニル部分Qが、構造(Q39)で表されるか
Figure 2023541637000013

[構造中、
15は、水素、ハロゲン、-OR16、-NO、-CN、-S(O)16、-S(O) (-)、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意選択で置換されており、2個の置換基R15は連結されて、任意選択で置換されている縮合環化シクロアルキル又は任意選択で置換されている縮合環化(ヘテロ)アレーン置換基を形成することがあり、R16は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、
Yは、N又はCR15である]、
又はヘテロシクロヘプチニル部分Qが、構造(Q36a)で表される、
Figure 2023541637000014

実施形態14に記載の方法。
17. クリックプローブQが、任意選択で置換されている(ヘテロ)シクロプロペニル基、(ヘテロ)シクロブテニル基、トランス-(ヘテロ)シクロヘプテニル基、トランス-(ヘテロ)シクロオクテニル基、トランス-(ヘテロ)シクロノネニル基又はトランス-(ヘテロ)シクロデシニル基からなる群から選択され、好ましくはクリックプローブQが、(Q40)~(Q50)からなる群から選択され、
Figure 2023541637000015

(Q44)及び(Q45)においてSiのR基(複数可)が、アルキル又はアリールである、実施形態14に記載の方法。
18. チオール反応性プローブQが、(Q51)~(Q65)からなる群から選択され
Figure 2023541637000016

[構造中、
は、H、ハロゲン、PhS、MeSであり、
は、ハロゲン、PhS、MeSであり、
24は、H又はC1~12アルキル、好ましくはH又はC1~6アルキルであり、
25は、H、C1~12アルキル、C1~12アリール、C1~12アルカリール又はC1~12アラルキル、好ましくはH又はパラ-メチルフェニルであり、
(Q55)及び(Q57)の芳香族環が、任意選択でフェニル又はピリジン環などヘテロ芳香族環とすることができる]、
実施形態13又は14に記載の方法。
19. クリックプローブFが、アジド、テトラジン、トリアジン、ニトロン、ニトリルオキシド、ニトリルイミン、ジアゾ化合物、オルト-キノン、ジオキソチオフェン及びシドノンからなる群から選択され、好ましくはクリックプローブFが、アジド部分である、実施形態13~18のいずれか一形態に記載の方法。
20. クリック反応が、1,3双極付加環化又は(4+2)環化付加である、実施形態13~19のいずれか一形態に記載の方法。
21. Fが、チオールである、実施形態13~18のいずれか一形態に記載の方法。
22. チオールライゲーションが、求核性反応、好ましくはマイケル付加又は求核置換である、実施形態13~18又は21のいずれか一形態に記載の方法。
23. w=0であり、コンジュゲーション部位が、システイン残基であり、好ましくはシステイン残基が、任意選択でジスルフィド結合の還元後に、抗体中に天然に存在するか、或いはシステイン残基が、エンジニアリングされ、好ましくはアミノ酸のシステインによる置換、システイン挿入又は単一システイン残基又はN末端若しくはC末端にシステイン残基を含むペプチドフラグメントの導入によってエンジニアリングされている、実施形態13~18又は21若しくは22のいずれか一形態に記載の方法。
24. w=1であり、AB-((L-F)が、構造(6)で表される
Figure 2023541637000017

[構造中、
eは、0~10の範囲の整数であり、
Suは単糖であり、
Gは単糖部分であり、
GlcNAcは、N-アセチルグルコサミン部分であり、
Fucは、フコース部分であり、
dは、0又は1である]、
実施形態13~23のいずれか一形態に記載の方法。
25. 構造(5)で表されるリンカー-薬物構築物
Figure 2023541637000018

[構造中、
はリンカーであり、
Qは、無金属クリック反応を行うことができるクリックプローブ又はチオール反応性プローブであり、
17はそれぞれ個別にアミノ酸側鎖であり、
nは、1~5の範囲の整数であり、
Aは、5員又は6員の芳香族又はヘテロ芳香族環であり、
xは、1~8の範囲の整数であり、
21は、H、R22、C(O)OH及びC(O)R22から選択され、R22は、C~C24(ヘテロ)アルキル基、C~C10(ヘテロ)シクロアルキル基、C~C10(ヘテロ)アリール基、C~C10アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C10(ヘテロ)アリールアルキル基であり、それらは、任意選択で置換されており、O、S及びNR23から選択される1個又は複数のヘテロ原子で任意選択で中断されており、R23は、水素及びC~Cアルキル基からなる群から独立的に選択される]。
26. クリックプローブQが、環式アルキン部分若しくは環式アルケン部分を含み、又はチオール反応性プローブQが、マレイミド部分を含む、実施形態25に記載のリンカー-薬物構築物。
27. クリックプローブQが、(Q22)~(Q36)からなる群から選択されるか

[構造中、B(-)はアニオンである]、
又は(ヘテロ)シクロアルキニル部分Qが、構造(Q37)に一致し
Figure 2023541637000020

[構造中、
15は、水素、ハロゲン、-OR16、-NO、-CN、-S(O)16、-S(O) (-)、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意選択で置換されており、2個の置換基R15は連結されて、任意選択で置換されている縮合環化シクロアルキル又は任意選択で置換されている縮合環化(ヘテロ)アレーン置換基を形成することがあり、R16は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、
は、C(R31、O、S又はNR31であり、R31はそれぞれ個別に、R15又はスペーサー部分を介して接続されているエクサテカンペイロードの第2の出現であり、
uは、0、1、2、3、4又は5であり、
u’は、0、1、2、3、4又は5であり、u+u’=4、5、6、7又は8であり、
v=8~16の範囲の整数である]、
好ましくはシクロオクチニル部分Qが、構造(Q38)で表されるか
Figure 2023541637000021

[構造中、
15は、水素、ハロゲン、-OR16、-NO、-CN、-S(O)16、-S(O) (-)、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意選択で置換されており、2個の置換基R15は連結されて、任意選択で置換されている縮合環化シクロアルキル又は任意選択で置換されている縮合環化(ヘテロ)アレーン置換基を形成することがあり、R16は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、
18は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、
19は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から選択され、アルキル基は、O、N及びSからなる群から選択される1個若しくは複数(one of more)のヘテロ原子で任意選択で中断されており、アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は、独立的に任意選択で置換されており、又はR19は、スペーサー部分を介して接続されているエクサテカンペイロードの第2の出現であり、
lは、0~10の範囲の整数である]、
又は(ヘテロ)シクロオクチニル部分Qが、構造(Q39)で表されるか
Figure 2023541637000022

[構造中、
15は、水素、ハロゲン、-OR16、-NO、-CN、-S(O)16、-S(O) (-)、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意選択で置換されており、2個の置換基R15は連結されて、任意選択で置換されている縮合環化シクロアルキル又は任意選択で置換されている縮合環化(ヘテロ)アレーン置換基を形成することがあり、R16は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、
Yは、N又はCR15である]、
又はヘテロシクロヘプチニル部分Qが、構造(Q36a)で表される、
Figure 2023541637000023

実施形態25に記載のリンカー-薬物構築物。
28. クリックプローブQが、任意選択で置換されている(ヘテロ)シクロプロペニル基、(ヘテロ)シクロブテニル基、トランス-(ヘテロ)シクロヘプテニル基、トランス-(ヘテロ)シクロオクテニル基、トランス-(ヘテロ)シクロノネニル基又はトランス-(ヘテロ)シクロデシニル基からなる群から選択され、好ましくはクリックプローブQが、(Q40)~(Q50)からなる群から選択され、
Figure 2023541637000024

(Q44)及び(Q45)においてSiのR基(複数可)が、アルキル又はアリールである、
実施形態26に記載のリンカー-薬物構築物。
29. チオール反応性プローブQが、(Q51)~(Q65)からなる群から選択される
Figure 2023541637000025

[構造中、
は、H、ハロゲン、PhS、MeSであり、
は、ハロゲン、PhS、MeSであり、
24は、H又はC1~12アルキル、好ましくはH又はC1~6アルキルであり、
25は、H、C1~12アルキル、C1~12アリール、C1~12アルカリール又はC1~12アラルキル、好ましくはH又はパラ-メチルフェニルであり、
29は、C1~12アルキル、好ましくはC1~4アルキル、最も好ましくはエチルであり、
(Q55)及び(Q57)の芳香族環は、任意選択でフェニル又はピリジン環などヘテロ芳香族環とすることができる]、
実施形態25又は26に記載のリンカー-薬物構築物。
30. 実施形態1~12のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲートと薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物。
31. 治療を必要とする対象の治療における使用のための、実施形態1~12のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
32. がんの処置における使用のための、実施形態1~12のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
33. がんが、HER2陽性がん、好ましくは乳がん、胃がん、結腸がん、肺がん、膵がん、尿路上皮がん、脳がん又は卵巣がんである、実施形態32に記載の使用のための抗体-薬物コンジュゲート。
抗体-薬物コンジュゲート
[0074]本発明に係る抗体-薬物コンジュゲートは、構造(1)を有する
Figure 2023541637000026

[構造中、
ABは抗体であり、
及びLはリンカーであり、
wは、0又は1であり、
Zは、無金属クリック反応又はチオールライゲーションによって得られた接続基であり、
17はそれぞれ個別にアミノ酸側鎖であり、
nは、1~5の範囲の整数であり、
Aは、6員の芳香族環又はヘテロ芳香族環であり、
xは、1~8の範囲の整数であり、
21は、H、R22、C(O)OH及びC(O)R22から選択され、R22は、C~C24(ヘテロ)アルキル基、C~C10(ヘテロ)シクロアルキル基、C~C10(ヘテロ)アリール基、C~C10アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C10(ヘテロ)アリールアルキル基であり、それらは、任意選択で置換されており、O、S及びNR23から選択される1個又は複数のヘテロ原子で任意選択で中断されており、R23は、水素及びC~Cアルキル基からなる群から独立的に選択される]。
[0075]本発明に係るコンジュゲートは、ペプチドスペーサー及びパラ-アミノベンシルオキシカルボニル(PABC)部分又はその誘導体を含む自己破壊性基又は切断可能なリンカーを含む。
[0076]ペプチドスペーサーは、(NH-CR17-CO)によって定義され、ここで、R17は、当技術分野において公知のアミノ酸側鎖を表す。本明細書では、アミノ酸は、天然アミノ酸でも、合成アミノ酸でもよい。好ましくは、アミノ酸(複数可)はすべて、そのL型配置である。nは、1~5の範囲の整数、好ましくは2~5の範囲である。したがって、ペプチドスペーサーは、1~5個のアミノ酸を含む。好ましくは、ペプチドは、ジペプチド(n=2)又はトリペプチド(n=3)であり、最も好ましくはペプチドスペーサーはジペプチドである。いずれのペプチドスペーサーも使用することができるが、好ましくはペプチドスペーサーは、Val-Cit、Val-Ala、Val-Lys、Val-Arg、AcLys-Val-Cit、AcLys-Val-Ala、Glu-Val-Ala、Asp-Val-Ala、Phe-Cit、Phe-Ala、Phe-Lys、Phe-Arg、Ala-Lys、Leu-Cit、Ile-Cit、Trp-Cit、Ala-Ala-Asn、Ala-Asn及びLys、より好ましくはVal-Cit、Val-Ala、Glu-Val-Ala、Val-Lys、Phe-Cit、Phe-Ala、Phe-Lys、Ala-Ala-Asn、より好ましくはVal-Cit、Val-Ala、Ala-Ala-Asn、最も好ましくはVal-Cit又はVal-Alaから選択される。一実施形態において、ペプチドスペーサーは、Val-Citである。一実施形態において、ペプチドスペーサーは、Val-Alaである。
[0077]R17は、アミノ酸側鎖を表し、好ましくはアラニン、システイン、アスパラギン酸、グルタミン酸、フェニルアラニン、グリシン、ヒスチジン、イソロイシン、リシン、アセチルリシン、ロイシン、メチオニン、アスパラギン、ピロリシン、プロリン、グルタミン、アルギニン、セリン、トレオニン、セレノシステイン、バリン、トリプトファン、チロシン及びシトルリンの側鎖から選択される。好ましいアミノ酸側鎖は、Val、Cit、Ala、Lys、Arg、AcLys、Phe、Leu、Ile、Trp、Glu、Asp及びAsnの側鎖であり、より好ましくはVal、Cit、Ala、GLu及びLysの側鎖に由来する。言葉を換えれば、R17は、好ましくはCH(Ala)、CHCH(CH(Leu)、CHCHCHNHC(O)NH(Cit)、CHCHCHCHNH(Lys)、CHCHCHNHC(O)CH(AcLys)、CHCHCHNHC(=NH)NH(Arg)、CHPh(Phe)、CH(CH(Val)、CH(CH)CHCH(Ile)、CHC(O)NH(Asn)、CHCHC(O)OH(Glu)、CHC(O)OH(Asp)及びCH(1H-インドール-3-イル)(Trp)から選択される。R17の特に好ましい実施形態は、CH(Ala)、CHCHCHNHC(O)NH(Cit)、CHCHCHCHNH(Lys)、CHCHC(O)OH(Glu)及びCH(CH(Val)である。最も好ましくは、R17は、CH(Ala)、CHCHCHNHC(O)NH(Cit)、CHCHCHCHNH(Lys)、又はCH(CH(Val)である。
[0078]特に好ましい実施形態において、ペプチドスペーサーは、一般構造(L3)によって表すことができる。
Figure 2023541637000027
[0079]本明細書では、R17は以上に記載の通りであり、好ましくはR17は、CH(Val)又はCHCHCHNHC(O)NH(Cit)である。
[0080]パラ-アミノベンシルオキシカルボニル(PABC)誘導体は、一般構造(L4)によって表すことができる。
Figure 2023541637000028
[0081]Aは、5員又は6員芳香族又はヘテロ芳香族環、好ましくは6員の芳香族又はヘテロ芳香族環である。好適な5員環は、オキサゾール、チアゾール及びフランである。好適な6員環は、フェニル及びピリジルである。好ましい実施形態において、Aは、1,4-フェニル、2,5-ピリジル又は3,6-ピリジルである。最も好ましくは、Aは、1,4-フェニルである。
[0082]R21は、H、R22、C(O)OH及びC(O)R22から選択され、R22は、C~C24(ヘテロ)アルキル基、C~C10(ヘテロ)シクロアルキル基、C~C10(ヘテロ)アリール基、C~C10アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C10(ヘテロ)アリールアルキル基であり、それらは、任意選択で置換されており、O、S及びNR23から選択される1個又は複数のヘテロ原子で任意選択で中断されており、R23は、水素及びC~Cアルキル基からなる群から独立的に選択される。好ましくは、R22は、C~C10(ヘテロ)シクロアルキル又はポリアルキレングリコールである。ポリアルキレングリコールは、好ましくはポリエチレングリコール又はポリプロピレングリコール、より好ましくは-(CHCHO)H又は-(CHCHCHO)Hである。ポリアルキレングリコールは、最も好ましくはポリエチレングリコール、好ましくは-(CHCHO)Hであり、sは、1~10、好ましくは1~5の範囲の整数であり、最も好ましくはs=1、2、3又は4である。より好ましくは、R21は、H又はC(O)R22であり、R22=4-メチル-ピペラジン又はモルホリンである。最も好ましくは、R21はHである。
リンカー(L、L及びL
[0083]リンキングユニットとも呼ばれるリンカーは、当技術分野において周知であり、いずれの好適なリンカーも使用することができる。本発明の文脈において、エクサテカンペイロードは、リンカーLを介して無金属クリック反応又はチオールライゲーションによって得られた接続基Zに化学的に接続され、接続基Zは、リンカーLを介して抗体に化学的に接続される。接続基Zは、リンカーLを介して(O)に化学的に接続される。リンカー、特にリンカーLは、複数のペイロードが単一の接続基に付着するための1個又は複数の分枝点を含むことができる。リンカーLは、存在しても(w=1)、存在しなくても(w=0)よい。リンカーLが存在する場合、Fは、抗体に直接付着する。好ましくは、コンジュゲーションの場合w=0は、チオールライゲーションを介している。好ましくは、コンジュゲーションの場合w=1は、クリック反応を介している。リンカーLは、存在しても(r=1)、存在しなくても(r=0)よい。
[0084]リンカーは、例えば直鎖状又は分枝状C~C200アルキレン基、C~C200アルケニレン基、C~C200アルキニレン基、C~C200シクロアルキレン基、C~C200シクロアルケニレン基、C~C200シクロアルキニレン基、C~C200アルキルアリーレーン基、C~C200アリールアルキレン基、C~C200アリールアルケニレン基、C~C200アリールアルキニレン基からなる群から選択することができる。任意選択でアルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレーン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基及びアリールアルキニレン基は置換されていてもよく、任意選択で前記基は、1個又は複数のヘテロ原子、好ましくは1~100個のヘテロ原子で中断されていてもよく、前記ヘテロ原子は、好ましくはO、S(O)及びNR12からなる群から選択され、yは、0、1又は2であり、好ましくはy=2であり、R12は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択される。リンカーは、(ポリ)エチレングリコールジアミン(例えば、1,8-ジアミノ-3,6-ジオキサオクタン又はより長いエチレングリコール鎖を含む等価物)、(ポリ)エチレングリコール又は(ポリ)エチレンオキシド鎖、(ポリ)プロピレングリコール又は(ポリ)プロピレンオキシド鎖及び1,z-ジアミノアルカンを含むことができ、zは、アルカンにおける炭素原子の数であり、例えば2~25の範囲とすることができる。
[0085]好ましい実施形態において、リンカーL(特にSpが存在する場合それ)は、極性基を含む。そのような極性基は、-(O)-C(O)-NH-S(O)-NR13-(以下にさらに定義される)、-C(S(O) (-))-、-C(C(O) (-))-、-S(O)-、-P(O) (-)-、-O(CHCHO)-、-NR30(CHCHNR30-、及び以下の2つの構造から選択することができる。
Figure 2023541637000029

極性基は、アミノ酸、好ましくはArg、Glu、Asp、Ser及びThrから選択されるアミノ酸を含むこともできる。本明細書では、a及びR13は、以下に構造(3)でさらに定義される。tは、0~15、好ましくは1~10、より好ましくは2~5の範囲の整数であり、最も好ましくはt=2又は4である。R30はそれぞれ個別にH、C1~12アルキル、C1~12アリール、C1~12アルカリール又はC1~12アラルキルである。リンカーLは、少なくとも2個の極性基など1個より多いそのような極性基を含むことができる。極性基は、他で定義された分枝部分から分枝するリンカーL(特にSpが存在する場合それ)の分枝中に存在することもできる。好ましくは、窒素又は炭素原子は、分枝部分として使用される。分枝中に存在する-O(CHCHO)-極性基を有することが特に好ましい。
[0086]好ましい実施形態において、リンカーLは、スルファミド基、好ましくは構造(3)で表されるスルファミド基を含む。
Figure 2023541637000030
[0087]波線は、コンジュゲートの残部、典型的にZ及び(NH-CR17-CO)への、スペーサーを任意選択で介した接続を表す。好ましくは、(O)C(O)部分はZに接続され、NR13部分は(NH-CR17-CO)に接続される。リンカーLがスペーサー部分Spを含む場合、構造(3)で表されるスルファミド基がスペーサー部分Spに含まれることが好ましい。
[0088]構造(3)では、a=0又は1、好ましくはa=1であり、R13は、水素、C~C24アルキル基、C~C24シクロアルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から選択され、C~C24アルキル基、C~C24シクロアルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意選択で置換されており、O、S及びNR14[ここで、R14は、水素及びC~Cアルキル基からなる群から独立的に選択される]から選択される1個若しくは複数のヘテロ原子で任意選択で中断されているか、又はR13は、スペーサー部分を介してNに接続されているエクサテカンペイロードの第2の出現である(すなわち、窒素原子が分枝部分でありうる)。
[0089]好ましい実施形態において、R13は、水素、C~C20アルキル基であるか、又はR13は、スペーサー部分を介してNに接続されているエクサテカンペイロードの第2の出現である。より好ましくは、R13は、水素、C~C10アルキル基、又はスペーサー部分を介してNに接続されているエクサテカンペイロードの第2の出現である。本明細書では、アルキル基は、任意選択で置換されており、O、S及びNR14[ここで、R14は、水素及びC~Cアルキル基からなる群から独立的に選択される]から選択される1個又は複数のヘテロ原子、好ましくはOによって任意選択で中断されている。好ましい実施形態において、R13は水素である。別の好ましい実施形態において、R13は、C~C20アルキル基、より好ましくはC~C16アルキル基、さらにより好ましくはC~C10アルキル基であり、アルキル基は、1個又は複数のO原子で任意選択で中断されており、アルキル基は、-OH基、好ましくは末端-OH基で任意選択で置換されている。この実施形態において、R13は、末端-OH基を含む(ポリ)エチレングリコール鎖であることがさらに好ましい。別の好ましい実施形態において、R13は、スペーサー部分を介してNに接続されているエクサテカンペイロードの第2の出現である。別の好ましい実施形態において、R13は、水素、メチル、エチル、n-プロピル、i-プロピル、n-ブチル、s-ブチル及びt-ブチルからなる群から、より好ましくは水素、メチル、エチル、n-プロピル及びi-プロピルからなる群から、さらにより好ましくは水素、メチル及びエチルからなる群から選択される。さらにより好ましくは、R13は、水素、又はスペーサー部分を介してNに接続されているエクサテカンペイロードの第2の出現であり、最も好ましくはR13は水素である。
[0090]本発明に係る抗体-薬物コンジュゲートは、式(3)の基を2個含むことがあり、好ましくは両方ともL、より好ましくは両方ともSpに含まれている。典型的に、本明細書に定義されるリンカーなど、出現する両方の式(3)の基を接続するスペーサーが存在する。好ましくは、これは、(CHCHO)と定義されるPEGスペーサーであり、ここで、mは、1~10の範囲、好ましくは2~6の範囲の整数であり、最も好ましくはmは、2又は4である。
[0091]一実施形態において、リンカーL、好ましくはスペーサーSpは、構造(L3)を含む。
(O)aC(O)NHS(O)2NH-(CH2CH2O)m-C(O)-(NHS(O)2)pN*
(L3)
[0092]本明細書では、a及びmは以上に記載の通りであり、pは、0又は1である。N*は、ペプチドスペーサーの窒素原子、又は分枝部分を表すことができる。
分枝部分
[0093]好ましい実施形態において、本発明に係るコンジュゲートのリンカーは、分枝部分を含む。本発明の文脈において「分枝部分」は、3つの部分を接続するリンカーに埋め込まれた部分を指す。言い換えれば、分枝部分は、他の部分への結合を少なくとも3つ含み、典型的に1つはZに接続する抗体ABへの結合、1つはエクサテカンペイロードへの結合、及び1つは第2のエクサテカンペイロードへの結合である。分枝部分は、好ましくはリンカーLに埋め込まれている。他の部分への結合を少なくとも3つ含むいずれの部分も、本発明の文脈における分枝部分として適している。好ましい実施形態において、分枝部分BMは、炭素原子、窒素原子、リン原子、(ヘテロ)芳香族環、(ヘテロ)環又は多環式部分から選択される。最も好ましくは、分枝部分は窒素原子である。
[0094]したがって、リンカーLは、2個のエクサテカンペイロードが単一部分Zに接続されるように、分枝部分を好ましくは窒素原子を介して含むことが好ましい。特に好ましい実施形態において、Lは、構造(2)を有する。
Figure 2023541637000031
[0095]本明細書では、*で標識された波形の結合は、Zに接続されており、**で標識された波形の結合は、NHに接続されている。Sp及びSpはそれぞれ個別にスペーサー部分である。可変要素n、A、R17及びR21は、他で定義されており、この実施形態に同様に適用される。分枝窒素原子に接続されている2個のリンカー-エクサテカン部分は、同じでも異なってもよい。好ましくは、それらは同じであり、すなわち出現する各Spは同じであり、出現する各(NH-CR17-CO)は同じであり、出現する各Aは同じであり、出現する各R21は同じである。
接続基Z
[0096]Zは接続基である。用語「接続基」は、コンジュゲートのある部分と同じバイオコンジュゲートの別の部分を接続する構造要素を指す。(1)では、Zは、リンカーを介して抗体ABをエクサテカンペイロードと接続する。接続基Zは、無金属クリック反応又はチオールライゲーションによって得られうる部分である。当業者が理解するように、Zの正確な性質は、F及びQの性質に依存する。Q及びFについて好ましい実施形態は、以下にさらに定義される。
[0097]第1の好ましい実施形態において、接続基Zは、無金属クリック反応によって得られうる。本明細書では、接続基Zは、好ましくはトリアゾール部分、イソオキサゾール部分、ジヒドロイソオキサゾール部分、ビシクロ[2.2.2]オクタ-5,7-ジエン-2,3-ジオン部分、ビシクロ[2.2.2]オクタ-5-エン-2,3-ジオン部分、7-チアビシクロ[2.2.1]ヘプタ-2,5-ジエン-7,7-ジオキシド部分、7-チアビシクロ[2.2.1]ヘプタ-2-エン-7,7-ジオキシド部分、ピラゾール部分、ピリジン部分、ジヒドロピリジン部分、ピリダジン部分又はジヒドロピリダジン部分を含むことができる。接続基Zについて好ましい構造は、ここで以下に示す部分(Z1)~(Z8)である。
Figure 2023541637000032
[0098]本明細書では、(Z3)、(Z7)及び(Z8)における官能基Rは、水素、C~C24アルキル基、C~C24アシル基、C~C24シクロアルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基、C~C24(ヘテロ)アリールアルキル基及びC~C24スルホニル基から選択することができ、これらのそれぞれ(水素を除く)が、任意選択で置換されていてもよく、O、S及びNR32[ここで、R32は、水素及びC~Cアルキル基からなる群から独立的に選択される]から選択される1個又は複数のヘテロ原子で任意選択で中断されていてもよい。*で標識された波形の結合は、Lに接続されており、他の波形の結合は、Lに接続されている。当業者は、どのR基を接続基Zのそれぞれに適用することができるかを理解する。例えば、(Z3)の窒素原子に接続されているR基は、以上に定義されたアルキル又はアリールから選択することができ、(Z3)の炭素原子に接続されているR基は、以上に定義された水素、アルキル、アリール、アシル及びスルホニルから選択することができる。
[0099]特に好ましい実施形態において、Qは、環式アルキン部分を含み、Fはアジドであり、Zは、アルキン部分とアジド部分の1,3-双極付加環化によって形成されたトリアゾール部分を含む。別の特に好ましい実施形態において、Zは、ここで以下に定義された構造(Z36)~(Z40)[構造中、*で標識された波形の結合は、Lに接続されており、他の波形の結合は、Lに接続されている]のいずれか1つで表される。
[0100]特に好ましい実施形態において、接続基Zは、構造(Z37)で表される。
Figure 2023541637000033

本明細書では、
15は、水素、ハロゲン、-OR16、-NO、-CN、-S(O)16、-S(O) (-)、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意選択で置換されており、2個の置換基R15は連結されて、任意選択で置換されている縮合環化シクロアルキル又は任意選択で置換されている縮合環化(ヘテロ)アレーン置換基を形成することがあり、R16は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、
は、C(R31、O、S又はNR31であり、R31はそれぞれ個別に、R15又はスペーサー部分を介して接続されているエクサテカンペイロードの第2の出現であり、
uは、0、1、2、3、4又は5であり、
u’は、0、1、2、3、4又は5であり、u+u’=4、5、6、7又は8であり、
v=8~16の範囲の整数である。
[0101]好ましい実施形態において、u+u’=4、5又は6であり、より好ましくはu+u’=5である。典型的に、v=(u+u’)×2又は[(u+u’)×2]-1である。好ましい実施形態において、v=8、9又は10であり、より好ましくはv=9又は10であり、最も好ましくはv=10である。
[0102]特に好ましい実施形態において、接続基Zは、構造(Z38)で表される。
Figure 2023541637000034

本明細書では、
15は、水素、ハロゲン、-OR16、-NO、-CN、-S(O)16、-S(O) (-),C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意選択で置換されており、2個の置換基R15は連結されて、任意選択で置換されている縮合環化シクロアルキル又は任意選択で置換されている縮合環化(ヘテロ)アレーン置換基を形成することがあり、R16は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、
18は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、
19は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から選択され、アルキル基は、O、N及びSからなる群から選択される1個若しくは複数(one of more)のヘテロ原子で任意選択で中断されており、アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は、独立的に任意選択で置換されており、又はR19は、スペーサー部分を介して接続されているエクサテカンペイロードの第2の出現であり、
lは、0~10の範囲の整数である。
[0103]構造(Z38)で表される反応性基の好ましい実施形態において、R15は、水素、ハロゲン、-OR16[ここで、R16は、水素又はC~Cアルキルである]、C~Cアルキル基、C~C(ヘテロ)アリール基からなる群から独立的に選択され、より好ましくはR15は、水素及びC~Cアルキルからなる群から独立的に選択され、最も好ましくはR15はすべてHである。構造(Z38)で表される反応性基の好ましい実施形態において、R18は、水素、C~Cアルキル基からなる群から独立的に選択され、最も好ましくはR18は両方ともHである。構造(Z38)で表される反応性基の好ましい実施形態において、R19はHである。構造(Z38)で表される反応性基の好ましい実施形態において、lは、0又は1であり、より好ましくはlは1である。
[0104]特に好ましい実施形態において、接続基Zは、構造(Z39)で表される。
Figure 2023541637000035

本明細書では、
15は、水素、ハロゲン、-OR16、-NO、-CN、-S(O)16、-S(O) (-)、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意選択で置換されており、2個の置換基R15は連結されて、任意選択で置換されている縮合環化シクロアルキル又は任意選択で置換されている縮合環化(ヘテロ)アレーン置換基を形成することがあり、R16は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、
Yは、N又はCR15である。
[0105]構造(Z39)で表される反応性基の好ましい実施形態において、R15は、水素、ハロゲン、-OR16[ここで、R16は、水素又はC~Cアルキルである]、-S(O) (-)、C~Cアルキル基、C~C(ヘテロ)アリール基からなる群から独立的に選択され、より好ましくはR15は、水素及び-S(O) (-)からなる群から独立的に選択される。構造(Z39)で表される反応性基の好ましい実施形態において、Yは、N又はCHであり、より好ましくはY=Nである。
[0106]特に好ましい実施形態において、接続基Zは、構造(Z36)で表される。
Figure 2023541637000036
[0107]最も好ましくは、接続基Zは、構造(Z38)[構造中、R15、R18及びR19はすべてHであり、lは1である]で表される。
[0108]第2の好ましい実施形態において、接続基Zは、チオールライゲーションによって得られうる。本明細書では、接続基Zは、多分Lを介した、Lへの接続を1つ及びABへの接続を少なくとも1つ有する。1個の接続基Zは、架橋チオール反応性プローブQが使用される場合、ABへの接続を2つ有することもできる(図1Bを参照のこと)。好ましくは、Lは存在せず(w=0)、Zは、ABに直接接続されている。好ましい実施形態において、接続基Zは、スクシンイミジル環又はその開環コハク酸アミド誘導体を含む。ABへの接続を1つ含む、接続基Zの好ましい選択肢は、ここで以下に示す(Z10)~(Z20)から選択される部分を含む。ABへの接続を2つ含む、接続基Zの好ましい選択肢は、ここで以下に示す(Z11)~(Z23)から選択される部分を含む。
[0109]本明細書では、*で標識された波形の結合(複数可)は、Lを任意選択で介してABに接続されており、他の波形の結合は、Lに接続されている。さらに、以下のことが適用される。
24は、H又はC1~12アルキル、好ましくはH又はC1~6アルキルであり、
29は、C1~12アルキル、好ましくはC1~4アルキル、最も好ましくはエチルである。
コンジュゲーションの様式
[0110]本発明に係るコンジュゲートは、コンジュゲーションのいずれの様式でも調製することができる。コンジュゲーション反応は、チオールライゲーション又は無金属クリック反応である。修飾抗体AB-((L-F)の性質、特にL、w及びxの性質は、採用されたコンジュゲーションの様式に依存する。xは、抗体上における(Lの付着点(コンジュゲーション部位)の数を指し、1~8の範囲の整数である。(コンジュゲートにおける)Z又は(修飾抗体における)Fが抗体に直接付着している場合、Lは存在せず、w=0である。この実施形態において、修飾抗体は、AB-(F)と呼ばれることもある。
[0111]xは、リンカーLを任意選択で介して抗体上に存在するプローブFの量を表し、1~8の範囲の整数である。好ましくは、xは、1~6の範囲の整数であり、より好ましくはx=1、2、3又は4であり、さらにより好ましくはx=1又は2であり、最も好ましくはx=2である。典型的に、xは、抗体に接続されている部分Zの平均数を指す。好ましい実施形態において、特にコンジュゲーションがクリック反応によって行われる場合、本発明に係るコンジュゲートは、普通同じ量の、抗体に接続されている部分Zを有するが、コンジュゲーション反応は、時には若干不完全なことがある。注目すべきことに、リンカーLはそれぞれ、リンカーLごとに1個又は2個のペイロード分子など1個より多いエクサテカンペイロードを含むことができる。
[0113]好ましい実施形態において、w=1であり、コンジュゲーションの様式には、抗体のグリカンを介した、好ましくはN-グリコシル化部位を介したコンジュゲーションが関わっている。好ましくは、修飾抗体は、構造-GlcNAc(Fuc)-(G)-Su-F[構造中、eは、0~20の範囲の整数であり、Suは単糖であり、Gは単糖部分であり、GlcNAcは、N-アセチルグルコサミン部分であり、Fucは、フコース部分であり、dは、0又は1である]を有する1種又は複数のグリカンを含む。言い換えれば、Lは、好ましくは-GlcNAc(Fuc)-(G)-Su-[ここで、GlcNAc(Fuc)d-は、抗体のペプチド部分に付着しており、Suは、Z又はFに付着している]によって表される。本明細書では、GlcNAcは、典型的に抗体のグリカン構造中に存在するコアN-アセチルグルコサミン部分である。本明細書では、コアN-アセチルグルコサミン部分は、抗体のペプチド鎖に直接付着しているN-アセチルグルコサミン部分を指す。このコアN-アセチルグルコサミン部分は、任意選択でフコシル化されており(dは、0又は1である)、それは、抗体のよく見られる特徴である。
[0114](G)は、抗体のグリコフォームを表す。本発明は、いずれのグリコフォームの抗体にも適用されうる。グリカン中に存在し、それらのうちからGが選択されうる典型的な単糖としては、グルコース、ガラクトース、マンノース、フコース、N-アセチルグルコサミン、N-アセチルガラクトサミン、N-アセチルノイラミン酸及びキシロースが挙げられる。したがって、(G)は、e単糖部分を含む直鎖状又は分枝状オリゴ糖とすることができる。典型的なグリカンは、4~16、好ましくは6~10の範囲のeを有する。好ましい実施形態において、抗体は刈り込まれ、e=0である。そのような刈り込みは、EndoSなどのエンドグリコシダーゼ酵素によって行うことができる。グリカンを介したコンジュゲーションは、好ましくはN-グリコシル化部位、より好ましくは抗体のアスパラギンアミノ酸、最も好ましくは抗体のアミノ酸N297における保存グリコシル化部位に接続されているN-グリコシル化部位を採用する。
[0115]Suは、Fを含む単糖である。Suは、好ましくはガラクトース(Gal)、マンノース(Man)、グルコース(Glc)、N-アセチルグルコサミン(GlcNAc)、N-アセチルガラクトサミン(GalNAc)、N-アセチルノイラミン酸又はシアル酸(Sial)及びフコース(Fuc)からなる群から選択される。Suは、好ましくはグルコース又はガラクトース誘導体、より好ましくはガラクトース誘導体、最も好ましくはN-アセチルガラクトサミンである。
[0116]代替の好ましい実施形態において、w=0であり、抗体におけるコンジュゲーション部位は、システイン残基であり、好ましくはシステイン残基は、当技術分野において公知のように、任意選択でジスルフィド結合の還元後に、抗体中に天然に存在するか、或いはシステイン残基は、エンジニアリングされ、好ましくはアミノ酸のシステインによる置換、システイン挿入又は単一システイン残基又はN末端若しくはC末端にシステイン残基を含むペプチドフラグメントの導入によってエンジニアリングされている。
[0117]ABは、抗体を表す。当業者は、本発明がいずれの抗体にも適用されうることを理解する。好ましくは、抗体はHER2を標的にする。
好ましいコンジュゲート
[0118]本発明に係る好ましいコンジュゲートは、構造(1f)を有する。
Figure 2023541637000038
[0119]本明細書では、Lの正確な性質がさらに明記され、分枝部分Nを含む。AB、L、Z、A、a、R13、R21、x、n、R17、m及びpは、本明細書において他で定義され、Lはリンカーであり、rは、0又は1であり、qは、0~10の範囲の整数である。好ましくは、リンカーLは存在しないか、又はCHである。好ましくは、mは、1~10の範囲の整数であり、qは、1~4の範囲の整数であり、pは1である。好ましくは、nは、1、2又は3である。さらにより好ましくは、
ABは抗体であり、
はリンカーであり、
Zは、構造(Z38)で表される接続基であり、好ましくは構造中、R15、R18及びR19はすべてHであり、lは1であり、
a=1であり、
13は水素であり、
r=0であり、Lは存在せず、
(NH-CH(R17)-C(O))はそれぞれ、Val-Ala又はVal-Citであり、
mは、2又は4であり、好ましくはm=2であり、
pは、0又は1であり、好ましくはp=1であり、
qはそれぞれ、2又は4であり、好ましくはそれぞれq=2であり、
Aはそれぞれ、1,4-フェニルであり、
xは、2~4の範囲の整数であり、好ましくはx=2であり、
21はそれぞれHである。
[0120]本発明に係る好ましいコンジュゲートは、構造(1a)を有する。
Figure 2023541637000039
[0121]本明細書では、Lの正確な性質がさらに明記され、分枝部分Nを含む。AB、L、Z、A、R21、x、R17、m及びpは、本明細書において他で定義され、qは、0~10の範囲の整数である。好ましくは、R17は、CH又はCHCHCHNHC(O)NHであり、mは、1~10の範囲の整数であり、qは、1~4の範囲の整数であり、pは1である。さらにより好ましくは、
ABは抗体であり、
はリンカーであり、
Zは、構造(Z38)で表される接続基であり、好ましくは構造中、R15、R18及びR19はすべてHであり、lは1であり、
17はそれぞれ個別にCH又はCHCHCHNHC(O)NHであり、好ましくはR17はそれぞれCHであり、
mは、2又は4であり、好ましくはm=2であり、
pは、0又は1であり、好ましくはp=1であり、
qはそれぞれ、2又は4であり、好ましくはそれぞれq=2であり、
Aはそれぞれ、1,4-フェニルであり、
xは、2~4の範囲の整数であり、好ましくはx=2であり、
21はそれぞれHである。
[0122]本発明に係る好ましいコンジュゲートは、構造(1b)を有する。
[0123]本明細書では、Lの正確な性質がさらに明記され、分枝部分Nを含む。AB、L、w、Z、A、R21、x、R17、m及びpは、本明細書において他で定義され、qは、0~10の範囲の整数である。好ましくは、R17は、CH又はCHCHCHNHC(O)NHであり、mは、1~10の範囲の整数であり、qは、1~4の範囲の整数であり、pは1である。さらにより好ましくは、
ABは抗体であり、
はリンカーであり、
wは、0又は1であり、
Zは、構造(Z1)で表される接続基であり、
17はそれぞれ個別にCH又はCHCHCHNHC(O)NHであり、好ましくはR17はそれぞれCHであり、
mは、2又は4であり、好ましくはm=2であり、
pは、0又は1であり、好ましくはp=1であり、
qは、2又は4であり、好ましくはq=2であり、
Aはそれぞれ、1,4-フェニルであり、
xは、2~4の範囲の整数であり、好ましくはx=2であり、
21はそれぞれHである。
[0124]本発明に係る別の好ましいコンジュゲートは、構造(1c)を有する。
Figure 2023541637000041
[0125]本明細書では、Lの正確な性質及び抗体へのコンジュゲーションの様式がさらに明記される。Z、L、A、R21、x及びR17は、本明細書において他で定義される。追加的に、eは、0~20の範囲の整数であり、Suは単糖であり、Gは単糖部分であり、GlcNAcは、N-アセチルグルコサミン部分であり、Fucは、フコース部分であり、dは、0又は1である。
[0126]本発明に係る特に好ましいコンジュゲートは、コンジュゲーションの様式及び構造(1c)のL定義と構造(1f)のLの定義を組み合わせ、したがって構造(1g)を有する。
[0127]本明細書では、e、Su、G、GlcNAc、Fuc、d、Z、L、r、m、p、q、A、a、R13、R21、n、R17、及びxのすべては、それらの好ましい実施形態を含めて、以上に記載の通りである。
[0128]特に好ましい実施形態において、本発明に係るコンジュゲートは、構造(1d)を有する[構造中、
dは、0又は1であり、
eは0であり、Gは存在せず、
SuはGalNAcであり、
Zは、構造(Z38)で表される接続基であり、好ましくは構造中、R15、R18及びR19はすべてHであり、lは1であり、
a=1であり、
13は水素であり、
r=0であり、Lは存在せず、
(NH-CH(R17)-C(O))はそれぞれ、Val-Ala又はVal-Citであり、
mは、2又は4であり、好ましくはm=2であり、
pは、0又は1であり、好ましくはp=1であり、
qはそれぞれ、2又は4であり、好ましくはそれぞれq=2であり、
Aはそれぞれ、1,4-フェニルであり、
xは、2~4の範囲の整数であり、好ましくはx=2であり、
21はそれぞれHである]。
[0129]本発明に係る特に好ましいコンジュゲートは、コンジュゲーションの様式及び構造(1c)のL定義と構造(1a)のLの定義を組み合わせ、したがって構造(1d)を有する。
[0130]本明細書では、e、Su、G、GlcNAc、Fuc、d、Z、m、p、q、R17、A、R21及びxのすべては、それらの好ましい実施形態を含めて、以上に記載の通りである。
[0131]特に好ましい実施形態において、本発明に係るコンジュゲートは、構造(1d)を有する[構造中、
dは、0又は1であり、
eは0であり、Gは存在せず、
SuはGalNAcであり、
Zは、構造(Z38)で表される接続基であり、好ましくは構造中、R15、R18及びR19はすべてHであり、lは1であり、
17はそれぞれ個別にCH又はCHCHCHNHC(O)NHであり、好ましくはR17はそれぞれCHであり、
mは、2又は4であり、好ましくはm=2であり、
pは、0又は1であり、好ましくはp=1であり、
qはそれぞれ、2又は4であり、好ましくはそれぞれq=2であり、
Aはそれぞれ、1,4-フェニルであり;
xは、2~4の範囲の整数であり、好ましくはx=2であり、
21はそれぞれHである]。
[0132]本発明に係る特に好ましいコンジュゲートは、コンジュゲーションの様式及び構造(1c)のL定義と構造(1b)のLの定義を組み合わせ、したがって構造(1e)を有する。
Figure 2023541637000044
[0133]本明細書では、e、Su、G、GlcNAc、Fuc、d、Z、m、p、q、R17、A、R21及びxのすべては、それらの好ましい実施形態を含めて、以上に記載の通りである。
[0134]特に好ましい実施形態において、本発明に係るコンジュゲートは、構造(1e)を有する[構造中、
dは、0又は1であり、
eは0であり、Gは存在せず、
SuはGalNAcであり、
Zは、構造(Z1)で表される接続基であり、
17はそれぞれ個別にCH又はCHCHCHNHC(O)NHであり、好ましくはR17はそれぞれCHであり、
mは、2又は4であり、好ましくはm=2であり、
pは、0又は1であり、好ましくはp=1であり、
qは、2又は4であり、好ましくはq=2であり、
Aはそれぞれ、1,4-フェニルであり、
xは、2~4の範囲の整数であり、好ましくはx=2であり、
21はそれぞれHである]。
[0135]特に好ましい実施形態において、本発明に係るコンジュゲートは、構造(1h)を有する。
[0136]本明細書では、e、Su、G、GlcNAc、Fuc及びdは、それらの好ましい実施形態を含めて、以上に記載の通りであり、n=0又は1である。構造(1h)は、実施例においてn=0の化合物(31a)及びn=1の化合物(32a)のコンジュゲートに相当する。最も好ましくは、e=0であり、Suは、N-アセチルガラクトサミンである。
抗体-薬物コンジュゲートの合成方法
[0137]第2の態様において、本発明は、本発明に係る抗体-薬物コンジュゲートを調製する方法に関する。本発明に係る方法は、(i)構造AB-((L-F)の修飾抗体を(ii)構造(5)で表されるリンカー-薬物構築物と反応させるステップを含む。反応は、エクサテカンペイロードと抗体の間に共有結合を形成するコンジュゲーション反応である。反応は、無金属クリック反応又はチオールライゲーションであり、QとFの間の無金属クリック反応又はQとFの間のチオールライゲーションによって形成された接続基Zを介して薬物が抗体に共有結合している抗体-薬物コンジュゲートを形成する。
[0138]本発明に係る方法では、構造AB-((L-F)の修飾抗体[構造中、ABは抗体であり、Lはリンカーであり、wは、0又は1であり、Fは、無金属クリック反応においてQと反応することができるクリックプローブ又はチオールライゲーションにおいてQと反応することができるチオール若しくはその前駆体であり、xは、1~8の範囲の整数である]。無金属クリック反応又はチオールライゲーションを介して、Fを構造(5)で表されるリンカー-薬物構築物のQと反応させると、接続基Zが形成される。一実施形態において、修飾抗体は、AB-(F)と呼ばれることもある。修飾抗体を調製する方法は、参照により本明細書に組み込まれる、例えば国際公開第2014/065661号、同第2016/170186号及び同第2016/053107号から当技術分野において公知である。同じ文献から、修飾糖タンパク質と細胞毒及びクリックプローブを含むリンカー-薬物構築物との間のコンジュゲーション反応は、当業者に公知である。
[0139]本発明に係る方法では、リンカー-薬物構築物は、構造(5)を有する
Figure 2023541637000046

[構造中、
はリンカーであり、
Qは、無金属クリック反応を行うことができるクリックプローブ又はチオール反応性プローブであり、
17はそれぞれ個別にアミノ酸側鎖であり、
nは、1~5の範囲の整数であり、
Aは、5員又は6員の芳香族又はヘテロ芳香族環であり、
xは、1~8の範囲の整数であり、
21は、H、R22、C(O)OH及びC(O)R22から選択され、R22は、C~C24(ヘテロ)アルキル基、C~C10(ヘテロ)シクロアルキル基、C~C10(ヘテロ)アリール基、C~C10アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C10(ヘテロ)アリールアルキル基であり、それらは、任意選択で置換されており、O、S及びNR23から選択される1個又は複数のヘテロ原子で任意選択で中断されており、R23は、水素及びC~Cアルキル基からなる群から独立的に選択される]。
無金属クリック反応
[0140]無金属クリック反応は、当技術分野において周知であり(例えば、共に参照により組み込まれる国際公開第2014/065661号、並びにNguyen及びPrescher、Nature rev.、2020、doi:10.1038/s41570-020-0205-0を参照のこと)、典型的に1,3双極付加環化又は(4+2)環化付加の形をとることができる。アルキン-アジド環化付加は、歪み促進型(例えば、歪み促進型アルキン-アジド環化付加、SPAAC)とすることができる。好ましい実施形態において、バイオコンジュゲーション反応は、無金属歪み促進型環化付加、最も好ましくは無金属歪み促進型アルキン-アジド環化付加である。好ましい実施形態において、コンジュゲーションは、(4+2)環化付加又は1,3双極付加環化、好ましくは1,3双極付加環化など環化付加を介して達成される。
[0141]典型的な(4+2)環化付加は、ディールス-アルダー反応であり、ここで、Qは、ジエン又はジエノフィルである。当業者によって理解されるように、ディールス-アルダー反応の文脈の中で用語「ジエン」は、1,3-(ヘテロ)ジエンを指し、共役ジエン(RC=CR-CR=CR)、イミン(例えば、RC=CR-N=CR又はRC=CR-CR=NR、RC=N-N=CR)及びカルボニル(例えば、RC=CR-CR=O又はO=CR-CR=O)を包含する。N含有及びO含有ジエンとのヘテロ-ディールス-アルダー反応は、当技術分野において公知である。当技術分野において(4+2)環化付加に適していると公知であるいずれのジエンも、反応性基Qとして使用することができる。好ましいジエンとしては、テトラジン、1,2-キノン及びトリアジンが挙げられる。当技術分野において(4+2)環化付加に適していると公知であるいずれのジエノフィルも、反応性基Qとして使用することができるが、ジエノフィルは、好ましくは上記のアルケン基又はアルキン基、最も好ましくはアルキン基である。(4+2)環化付加を介したコンジュゲーションでは、Qはジエノフィルである(Fはジエンである)ことが好ましく、より好ましくはQはアルキニル基であるか、又はアルキニル基を含む。
[0142]1,3双極付加環化では、Qは、1,3-双極子又は親双極子である。当技術分野において1,3双極付加環化に適していると公知であるいずれの1,3-双極子も、反応性基Qとして使用することができる。好ましい1,3-双極子としては、アジド基、ニトロン基、ニトリルオキシド基、ニトリルイミン基及びジアゾ基が挙げられる。当技術分野において1,3双極付加環化に適していると公知であるいずれの親双極子も、反応性基Qとして使用することができるが、親双極子は、好ましくはアルケン基又はアルキン基、最も好ましくはアルキン基である。1,3双極付加環化を介したコンジュゲーションでは、Qは親双極子である(Fは1,3-双極子である)ことが好ましく、より好ましくはQはアルキニル基であるか、又はアルキニル基を含む。
[0143]したがって、好ましい実施形態において、Qは、親双極子及びジエノフィルから選択される。
クリックプローブQ
[0144]クリックプローブQは、コンジュゲーション反応において使用されて、リンカー-薬物構築物を構造AB-(F)の抗体に接続する。Qは、無金属クリック反応においてクリックプローブFに対して反応性を示す。そのようなクリックプローブは、当技術分野において公知であり、環式アルケン、環式アルキン、アジド、テトラジン、トリアジン、ニトロン、ニトリルオキシド、ニトリルイミン、ジアゾ化合物、オルト-キノン、ジオキソチオフェン及びシドノンが挙げられる。好ましくは、Qは、環式アルケン又は環式アルキン部分であり、最も好ましくは、Qは環式アルキン部分である。
[0145]特に好ましい実施形態において、クリックプローブQは、環式アルキン部分を含む。アルキニル基は、(ヘテロ)シクロアルキニル基、すなわちヘテロシクロアルキニル基又はシクロアルキニル基とも呼ばれることがあり、(ヘテロ)シクロアルキニル基は任意選択で置換されている。好ましくは、(ヘテロ)シクロアルキニル基は、(ヘテロ)シクロヘプチニル基、(ヘテロ)シクロオクチニル基、(ヘテロ)シクロノニニル基又は(ヘテロ)シクロデシニル基である。本明細書では、(ヘテロ)シクロアルキンは、任意選択で置換されていてもよい。好ましくは、(ヘテロ)シクロアルキニル基は、任意選択で置換されている(ヘテロ)シクロヘプチニル基又は任意選択で置換されている(ヘテロ)シクロオクチニル基である。最も好ましくは、(ヘテロ)シクロアルキニル基は、(ヘテロ)シクロオクチニル基であり、(ヘテロ)シクロオクチニル基は任意選択で置換されている。好ましくは、Qは、以下の構造(Q1)で表される(ヘテロ)シクロオクチン部分を含む。別の好ましい実施形態において、(ヘテロ)シクロオクチニル基は、以下にさらに定義される構造(Q37)、(Q38)又は(Q39)で表される。(ヘテロ)シクロオクチニル基の好ましい例としては、DIBO基とも呼ばれる構造(Q2)、DIBAC基とも呼ばれる構造(Q3)、又はBARAC基とも呼ばれる構造(Q4)、COMBO基とも呼ばれる構造(Q5)、及びBCN基とも呼ばれる構造(Q6)が挙げられ、すべて以下に示され、構造中、Yは、O又はNR11であり、R11は、水素、直鎖状若しくは分枝状C~C12アルキル基又はC~C12(ヘテロ)アリール基からなる群から独立的に選択される。(Q2)における芳香族環は、1個又は複数の位置で任意選択でO-スルホニル化されており、(Q3)及び(Q4)の環は、1個又は複数の位置でハロゲン化されていてもよい。特に好ましいシクロアルキニル基は、任意選択で置換されているビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イル]基(BCN基)である。好ましくは、ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イル]基は、以下に示す式(Q6)[式中、Vは(CHであり、lは、0~10の範囲、好ましくは0~6の範囲の整数である]で表される。より好ましくは、lは、0、1、2、3又は4であり、より好ましくはlは、0、1又は2であり、最も好ましくはlは、0又は1である。(Q6)基の文脈の中で、lは、最も好ましくは1である。
Figure 2023541637000047
[0146]別の好ましい実施形態において、クリックプローブQは、ここで以下に示す(Q7)~(Q21)からなる群から選択される。
Figure 2023541637000048
[0147]本明細書では、波形の結合で示されたLへの接続は、Qのいずれか利用可能な炭素又は窒素原子への接続とすることができる。B(-)はアニオンであり、好ましくはOTf、Cl、Br又はIから選択され、最も好ましくはB(-)は、(-)OTfである。コンジュゲーション反応において、B(-)は、反応混合物中に存在するアニオンといずれにしても交換できるので、薬学的に許容されるアニオンである必要はない。(Q21b)がQとして使用される場合、負電荷対イオンは、好ましいことに、本発明に係るコンジュゲートが医薬品として容易に使用可能であるように、コンジュゲートの単離時に薬学的に許容されるものである。
[0148]別の好ましい実施形態において、クリックプローブQは、ここで以下に示す(Q22)~(Q36)からなる群から選択される。
Figure 2023541637000049
[0149]構造(Q36b)では、B(-)はアニオンであり、好ましくはOTf、Cl、Br又はIから選択され、最も好ましくはBはOTfである。
[0150]特に好ましい実施形態において、クリックプローブQは、(ヘテロ)シクロアルキニル基を含み、構造(Q37)で表される。
Figure 2023541637000050

本明細書では、
15は、水素、ハロゲン、-OR16、-NO、-CN、-S(O)16、-S(O) (-)、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意選択で置換されており、2つの置換基R15は連結されて、任意選択で置換されている縮合環化シクロアルキル又は任意選択で置換されている縮合環化(ヘテロ)アレーン置換基を形成することがあり、R16は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、
は、C(R31、O、S又はNR31であり、R31はそれぞれ個別に、R15又はスペーサー部分を介して接続されているエクサテカンペイロードの第2の出現であり、
uは、0、1、2、3、4又は5であり、
u’は、0、1、2、3、4又は5であり、u+u’=4、5、6、7又は8であり、
v=8~16の範囲の整数である。
[0151]好ましい実施形態において、u+u’=4、5又は6であり、より好ましくはu+u’=5である。典型的に、v=(u+u’)×2又は[(u+u’)×2]-1である。好ましい実施形態において、v=8、9又は10であり、より好ましくはv=9又は10であり、最も好ましくはv=10である。
[0152]特に好ましい実施形態において、クリックプローブQは、シクロオクチニル基を含み、構造(Q38)で表される。
Figure 2023541637000051

本明細書では、
15は、水素、ハロゲン、-OR16、-NO、-CN、-S(O)16、-S(O) (-),C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意選択で置換されており、2つの置換基R15は連結されて、任意選択で置換されている縮合環化シクロアルキル又は任意選択で置換されている縮合環化(ヘテロ)アレーン置換基を形成することがあり、R16は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、
18は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、
19は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から選択され、アルキル基は、O、N及びSからなる群から選択される1個若しくは複数(one of more)のヘテロ原子で任意選択で中断されており、アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は、独立的に任意選択で置換されており、又はR19は、スペーサー部分を介して接続されているエクサテカンペイロードの第2の出現であり、
lは、0~10の範囲の整数である。
[0153]構造(Q38)で表される反応性基の好ましい実施形態において、R15は、水素、ハロゲン、-OR16、C~Cアルキル基、C~C(ヘテロ)アリール基からなる群から独立的に選択され、R16は、水素又はC~Cアルキルであり、より好ましくはR15は、水素及びC~Cアルキルからなる群から独立的に選択され、最も好ましくはR15はすべてHである。構造(Q38)で表される反応性基の好ましい実施形態において、R18は、水素、C~Cアルキル基からなる群から独立的に選択され、最も好ましくはR18は両方ともHである。構造(Q38)で表される反応性基の好ましい実施形態において、R19はHである。構造(Q38)で表される反応性基の好ましい実施形態において、lは、0又は1であり、より好ましくはlは1である。構造(Q38)で表される反応性基の特に好ましい実施形態は、構造(Q30)で表される反応性基である。
[0154]特に好ましい実施形態において、クリックプローブQは、シクロオクチニル基を含み、構造(Q39)で表される。
Figure 2023541637000052

本明細書では、
15は、水素、ハロゲン、-OR16、-NO、-CN、-S(O)16、-S(O) (-)、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意選択で置換されており、2つの置換基R15は連結されて、任意選択で置換されている縮合環化シクロアルキル又は任意選択で置換されている縮合環化(ヘテロ)アレーン置換基を形成することがあり、R16は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、
Yは、N又はCR15である。
[0155]構造(Q39)で表される反応性基の好ましい実施形態において、R15は、水素、ハロゲン、-OR16、-S(O) (-)、C~Cアルキル基、C~C(ヘテロ)アリール基からなる群から独立的に選択され、R16は、水素又はC~Cアルキルであり、より好ましくはR15は、水素及び-S(O) (-)からなる群から独立的に選択される。構造(Q39)で表される反応性基の好ましい実施形態において、Yは、N又はCHであり、より好ましくはY=Nである。
[0156]特に好ましい実施形態において、クリックプローブQは、ヘテロシクロヘプチニル基を含み、構造(Q36a)で表される。
Figure 2023541637000053
[0157]代替の好ましい実施形態において、クリックプローブQは、環式アルケン部分を含む。アルケニル基Qは、(ヘテロ)シクロアルケニル基、すなわちヘテロシクロアルケニル基又はシクロアルケニル基、好ましくはシクロアルケニル基とも呼ばれることがあり、(ヘテロ)シクロアルケニル基は、任意選択で置換されている。好ましくは、(ヘテロ)シクロアルケニル基は、(ヘテロ)シクロプロペニル基、(ヘテロ)シクロブテニル基、トランス-(ヘテロ)シクロヘプテニル基、トランス-(ヘテロ)シクロオクテニル基、トランス-(ヘテロ)シクロノネニル基又はトランス-(ヘテロ)シクロデシニル基であり、それらはすべて任意選択で置換されていてもよい。特に好ましいのは、(ヘテロ)シクロプロペニル基、トランス-(ヘテロ)シクロヘプテニル基又はトランス-(ヘテロ)シクロオクテニル基であり、(ヘテロ)シクロプロペニル基、トランス-(ヘテロ)シクロヘプテニル基又はトランス-(ヘテロ)シクロオクチニル基は、任意選択で置換されている。好ましくは、Qは、構造(Q40)で表されるシクロプロペニル部分、構造(Q41)で表されるトランス-(ヘテロ)シクロヘプテニル部分又は構造(Q42)で表されるトランス-(ヘテロ)シクロオクテニル部分を含む。別の好ましい実施形態において、シクロプロペニル基は、構造(Q43)で表される。別の好ましい実施形態において、トランス-(ヘテロ)シクロヘプテン基は、構造(Q44)又は(Q45)で表される。別の好ましい実施形態において、トランス-(ヘテロ)シクロオクテン基は、構造(Q46)、(Q47)、(Q48)、(Q49)又は(Q50)で表される。
Figure 2023541637000054
[0158]本明細書では、(Q44)及び(Q45)におけるSiのR基(複数可)は、典型的にアルキル又はアリール、好ましくはC~Cアルキルである。
チオールライゲーション
[0159]抗体-薬物コンジュゲート調製のためのチオールライゲーションは、当技術分野において周知であり、チオール基のアルキル化と呼ばれることもある。それは、典型的に求核置換又はマイケル反応など求核性反応の形をとる。好ましいマイケル反応は、マレイミド-チオール反応であり、バイオコンジュゲーションにおいて広く用いられている。したがって、好ましい実施形態において、Qは、求核性反応、好ましくは求核置換又はマイケル反応において反応性を示す。本明細書では、Qは、マレイミド部分、ハロアセトアミド部分、アレンアミド部分、ホスホンアミダイト部分、シアノエチニル部分、ビニルスルホン、ビニルピリジン部分又はメチルスルホニルフェニルオキサジアゾール部分、最も好ましくはマレイミド部分を含むことが好ましい。Qの特に好ましい選択肢を図1Bに示す。
チオール反応性プローブQ
[0160]チオール反応性プローブQは、コンジュゲーション反応において使用されて、リンカー-薬物構築物を構造AB-((L-F)の抗体に接続する。Qは、チオールライゲーションにおいてチオール又はその前駆体Fに対して反応性を示す。そのようなプローブは、当技術分野において公知であり、マレイミド部分、ハロアセトアミド部分、アレンアミド部分、ホスホンアミダイト部分、シアノエチニル部分、ビニルスルホン、ビニルピリジン部分又はメチルスルホニルフェニルオキサジアゾール部分からなる群から選択することができる。最も好ましくは、Qは、マレイミド部分を含むか、又はマレイミド部分である。
[0161]別の好ましい実施形態において、プローブQは、ここで以下に示す(Q51)~(Q65)からなる群から選択される
Figure 2023541637000055

[構造中、
は、H、ハロゲン、PhS、MeS、好ましくはCl、Br、Iなどハロゲンであり、
は、ハロゲン、PhS、MeS、好ましくはCl、Br、Iなどハロゲンであり、
24は、H又はC1~12アルキル、好ましくはH又はC1~6アルキルであり、
25は、H、C1~12アルキル、C1~12アリール、C1~12アルカリール又はC1~12アラルキル、好ましくはH又はパラ-メチルフェニルであり、
(Q55)及び(Q57)の芳香族環は、任意選択でフェニル又はピリジン環などヘテロ芳香族環とすることができる]。
[0162]チオール反応性プローブ(Q51)の好ましい実施形態において、プローブQは、ここで以下に示す(Q66)~(Q68)からなる群から選択される
Figure 2023541637000056

[構造中、
27は、C1~12アルキル、C1~12アリール、C1~12アルカリール又はC1~12アラルキルであり、
tは、0~15、好ましくは1~10の範囲の整数である]。
好ましいリンカー-薬物構築物
[0163]特に好ましい実施形態において、本発明に係るリンカー-薬物構築物は、構造(5c)を有する
Figure 2023541637000057

[構造中、Q、m、p、q、R17、A及びR21のそれぞれは、以上に記載の通りである]。
[0164]最も好ましくは、本発明に係るリンカー-薬物構築物は、構造(5a)を有する[構造中、
Qは、構造(Q38)で表される接続基であり、好ましくは構造中、R15、R18及びR19はすべてHであり、lは1であり、
17はそれぞれ個別にCH又はCHCHCHNHC(O)NHであり、好ましくはR17はそれぞれCHであり、
mは、2又は4であり、好ましくはm=2であり、
pは、0又は1であり、好ましくはp=1であり、
qはそれぞれ、2又は4であり、好ましくはそれぞれq=2であり、
Aはそれぞれ、1,4-フェニルであり、
21はそれぞれHである]。
[0165]特に好ましい実施形態において、本発明に係るリンカー-薬物構築物は、構造(5a)を有する
Figure 2023541637000058

[構造中、Q、m、p、q、R17、A及びR21のそれぞれは、以上に記載の通りである]。
[0166]最も好ましくは、本発明に係るリンカー-薬物構築物は、構造(5a)を有する[構造中、
Qは、構造(Q38)で表される接続基であり、好ましくは構造中、R15、R18及びR19はすべてHであり、lは1であり、
17はそれぞれ個別にCH又はCHCHCHNHC(O)NHであり、好ましくはR17はそれぞれCHであり、
mは、2又は4であり、好ましくはm=2であり、
pは、0又は1であり、好ましくはp=1であり、
qはそれぞれ、2又は4であり、好ましくはそれぞれq=2であり、
Aはそれぞれ、1,4-フェニルであり、
21はそれぞれHである]。
[0167]特に好ましい実施形態において、本発明に係るリンカー-薬物構築物は、構造(5b)を有する

[構造中、Q、m、p、q、R17、A及びR21のそれぞれは、以上に記載の通りである]。
[0168]最も好ましくは、本発明に係るリンカー-薬物構築物は、構造(5a)を有する[構造中、
Qは、構造(Q1)で表される接続基であり、
17はそれぞれ個別にCH又はCHCHCHNHC(O)NHであり、好ましくはR17はそれぞれCHであり、
mは、2又は4であり、好ましくはm=2であり、
pは、0又は1であり、好ましくはp=1であり、
qはそれぞれ、2又は4であり、好ましくはそれぞれq=2であり、
Aはそれぞれ、1,4-フェニルであり、
21はそれぞれHである]。
[0169]特に好ましい実施形態において、本発明に係るリンカー-薬物構築物は、構造(5d)を有する
Figure 2023541637000060

[構造中、n=0又は1である]。
[0170]構造(5d)は、実施例においてn=0の化合物(31a)及びn=1の化合物(32a)に相当する。
反応性基F
[0171]反応性基Fは、クリックプローブ又はチオール若しくはその前駆体である。したがって、第1の好ましい実施形態において、Fは、クリックプローブである。クリックプローブFは、コンジュゲーション反応において使用されて、リンカー-薬物構築物を修飾抗体に接続する。Fは、無金属クリック反応においてクリックプローブQに対して反応性を示す。そのようなクリックプローブは、当技術分野において公知であり、環式アルケン、環式アルキン、アジド、テトラジン、トリアジン、ニトロン、ニトリルオキシド、ニトリルイミン、ジアゾ化合物、オルト-キノン、ジオキソチオフェン及びシドノンが挙げられる。
[0172]好ましくは、Fは、環式アルケン、環式アルキンに対して反応性を示し、典型的にアジド、テトラジン、トリアジン、ニトロン、ニトリルオキシド、ニトリルイミン、ジアゾ化合物、オルト-キノン、ジオキソチオフェン及びシドノンからなる群から選択される。反応性基について好ましい構造は、ここで以下に示す構造(F1)~(F10)である。
Figure 2023541637000061
[0173]本明細書では、波形の結合は、抗体への接続を表す。(F3)、(F4)、(F8)及び(F9)については、抗体を波形の結合のうちのいずれか1つに接続させることができる。次いで、他の波形の結合を、水素、C~C24アルキル基、C~C24アシル基、C~C24シクロアルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基、C~C24(ヘテロ)アリールアルキル基及びC~C24スルホニル基から選択されるR基に接続させることができ、これらのそれぞれ(水素を除く)が、任意選択で置換されていてもよく、O、S及びNR32[ここで、R32は、水素及びC~Cアルキル基からなる群から独立的に選択される]から選択される1個又は複数のヘテロ原子で任意選択で中断されていてもよい。当業者は、どのR基をクリックプローブFのそれぞれに適用することができるかを理解する。例えば、(F3)の窒素原子に接続されているR基は、アルキル及びアリールから選択することができ、(F3)の炭素原子に接続されているR基は、水素、アルキル、アリール、アシル及びスルホニルから選択することができる。好ましくは、クリックプローブFは、アジド又はテトラジンから選択される。最も好ましくは、クリックプローブFはアジドである。
[0174]第2の好ましい実施形態において、Fは、チオール又はその前駆体である。チオール又はその前駆体Fは、コンジュゲーション反応において使用されて、リンカー-薬物構築物を修飾抗体に接続する。Fは、チオールライゲーションにおいてチオール反応性プローブQに対して反応性を示す。バイオコンジュゲーションの文脈の中でチオール前駆体は、当技術分野において公知であり、ジスルフィドが挙げられる。それは、抗体中に存在する天然の架橋ジスルフィドでも、合成で導入されたジスルフィドでもよく、当技術分野において公知のように還元される。好ましくは、Fはチオール基である。
リンカー-薬物構築物
[0175]第3の態様において、本発明は、構造(5)で表されるリンカー-薬物構築物に関する
Figure 2023541637000062

[構造中、
はリンカーであり、
Qは、無金属クリック反応を行うことができるクリックプローブ又はチオール反応性プローブであり、
17はそれぞれ個別にアミノ酸側鎖であり、
nは、1~5の範囲の整数であり、
Aは、5員又は6員の芳香族又はヘテロ芳香族環であり、
xは、1~8の範囲の整数であり、
21は、H、R22、C(O)OH及びC(O)R22から選択され、R22は、C~C24(ヘテロ)アルキル基、C~C10(ヘテロ)シクロアルキル基、C~C10(ヘテロ)アリール基、C~C10アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C10(ヘテロ)アリールアルキル基であり、それらは、任意選択で置換されており、O、S及びNR23から選択される1個又は複数のヘテロ原子で任意選択で中断されており、R23は、水素及びC~Cアルキル基からなる群から独立的に選択される]。
[0176]本発明の第1及び第2の態様の文脈の中で記載されているリンカー-薬物構築物の定義及び好ましい実施形態並びにL、Q、R17、n、A、x及びR21は、本発明の第3の態様に同様に適用される。この態様によるリンカー-薬物構築物は、本発明に係る抗体-薬物コンジュゲートの調製における中間体として理想的に適している。したがって、本発明は、構造AB-((L-F)の修飾抗体との無金属クリックコンジュゲーション反応又はチオールライゲーションコンジュゲーション反応における本発明に係るリンカー-薬物構築物の使用にも関する。
応用
[0177]本発明に係るコンジュゲートは、がんの治療において特に適している。したがって、本発明はさらに、医薬における本発明に係るコンジュゲートの使用に関する。別の態様において、本発明は、それを必要とする対象を治療する方法であって、本発明に係るコンジュゲートを対象に投与するステップを含む方法にも関する。この態様による方法は、治療における使用のため、特にそれを必要とする対象の治療における使用のための本発明に係るコンジュゲートと称することもできる。この態様による方法は、医薬品の製造のための、本発明に係るコンジュゲートの使用と称することもできる。本明細書では、投与は、典型的に治療有効量の本発明に係るコンジュゲートを用いて行われる。
[0178]本発明はさらに、それを必要とする対象における特定の疾患の治療方法であって、以上に定義した本発明に係るコンジュゲートの投与を含む方法に関する。特定の疾患は、がん及び自己免疫疾患から選択することができ、好ましくは疾患はがんである。それを必要とする対象は、典型的にがん患者である。抗体-薬物コンジュゲートの使用は、そのような治療、特にがん治療の分野において周知であり、本発明に係るコンジュゲートは、この点に関して特に適している。この態様による方法では、コンジュゲートは、典型的に治療有効量で投与される。本発明のこの態様は、それを必要とする対象における特定の疾患の治療における使用のため、好ましくはがんの治療のための本発明に係るコンジュゲートと称することもできる。言い換えれば、この態様は、それを必要とする対象における特定の疾患の治療における使用のため、好ましくはがんの治療における使用のための医薬品又は医薬組成物の調製のための、本発明に係るコンジュゲートの使用に関する。一実施形態において、がんは、HER2陽性乳がん、HER2陽性胃がん、HER2陽性結腸がん、HER2陽性肺がん、HER2陽性膵がん、HER2陽性尿路上皮がん、HER2陽性脳がん、HER2陽性卵巣がんなどHER2陽性がんである。したがって、一実施形態において、患者は、HER2陽性である。
[0179]本発明の文脈における投与は、全身投与を指す。したがって、一実施形態において、本明細書において定義された方法は、コンジュゲートの全身投与のための方法である。コンジュゲートの特異性を考えると、それらは、全身投与することができるが、それでも、それらの活性を目的の組織(例えば、腫瘍)又はその付近において発揮する。全身投与は、薬物が、画像処理技法で検出不可能な腫瘍転移に到達することもでき、血液腫瘍に適用可能でありうるので、局所投与に対して大きな利点を有する。
[0180]本発明はさらに、本発明に係る抗体-ペイロードコンジュゲートと薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物に関する。
[0181]本発明を、以下の実施例によって説明する。
分析用RP-HPLCの一般手順(DTT還元)
[0182]RP-HPLC分析の前に、IgG(10μL、PBS中1mg/mL、pH 7.4)を12.5mM DTT、100mM TrisHCl pH 8.0(40μL)に添加し、37℃で15分間インキュベートした。49%アセトニトリル、49%水、2%ギ酸(50μL)を添加することによって、反応をクエンチした。RP-HPLC分析を、Agilent 1100シリーズ(Hewlett Packard社)で行った。試料(10μL)を0.5mL/分で、カラム温度70℃のBioresolve RP mAb 2.1×150mm 2.7μm(Waters社)に注入した。16.8分で0.1%TFA及び水中アセトニトリル30→54%の直線グラジエントを適用した。
分析用RP-UPLCの一般手順
[0183]RP-UPLC分析の前に、IgG(10μL、PBS pH 7.4中の1mg/mL)を、12.5mM DTT、100mM Tris HCl pH 8.0(40μL)に添加し、37℃で15分間インキュベートした。49%アセトニトリル、49%水、2%ギ酸(50μL)を添加することによって、反応をクエンチした。Waters Acquity UPLC-SQDで、RP-UPLC分析を行った。試料(5μL)を0.4mL/分で、カラム温度70℃のBioresolve RP mAb 2.1×150mm 2.7μm(Waters社)に注入した。9分で0.1%TFA及び水中アセトニトリル30→54%の直線グラジエントを適用した。
分析SECの一般手順
[0184]HPLC-SEC分析は、Agilent 1100シリーズ(Hewlett Packard社)でXbridge BEH200A(3.5μM、7.8×300mM、PN 186007640 Waters社)カラムを使用して行った。試料をPBS中1mg/mLに希釈し、0.86mL/分のアイソクラティック法(10%イソプロパノールを含有する0.1Mリン酸ナトリウム緩衝液 pH 6.9(NaHPO/NaPO))で16分間測定した。
分析HPLC-MSの一般手順(IdeS消化)
[0185]質量スペクトル分析の前に、IgGをIdeSで処理した。それによって、Fc/2フラグメントの分析が可能になる。Fc/2フラグメントの分析では、20μgの(修飾)IgGの溶液を、総容積10μLでPBS中IdeS/Fabricator(商標)(1.25U/μL) pH 6.6と共に37℃で1時間インキュベートした。試料を80μLに希釈し、次にJEOL AccuTOFでエレクトロスプレーイオン化飛行時間(ESI-TOF)型分析を行った。Magtranソフトウェアを使用して、デコンボリューション後のスペクトルが得られた。
[0186]化合物3(図7を参照のこと)を国際公開第2020/094670号に従って(リンカー-薬物化合物42)調製した。化合物4(デルクステカン、図8を参照のこと)をMedChemExpress社から得た。無金属クリックコンジュゲーション(v1及びv5)又はチオールライゲーション(v2、v3、v4)のためのさまざまな抗体フォーマットの構造を図11に示す。
実施例1. 化合物6の調製
Figure 2023541637000063
[0187]BCN-OH(5、1.5g、10mmol)のDCM(150mL)溶液に、N雰囲気下、CSI(0.87mL、1.4g、10mmol)、EtN(2.8mL、2.0g、20mmol)及び2-(2-アミノエトキシ)エタノール(1.2mL、1.26g、12mmol)を添加した。混合物を10分間撹拌し、NHCl水溶液(飽和、150mL)の添加によりクエンチした。分離後、水性層をDCM(150mL)で抽出した。合わせた有機層を乾燥し(NaSO)、濃縮した。残渣をカラムクロマトグラフィーで精製した。生成物6が若干黄色の濃厚な油(2.06g、5.72mmol、57%)として得られた。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm)6.0 (bs, 1H), 4.28 (d, J = 8.2 Hz, 2H), 3.78-3.73 (m, 2H), 3.66-3.61 (m, 2H),3.61-3.55 (m, 2H), 3.34 (t, J = 4.9 Hz, 2H), 2.37-2.15 (m, 6H), 1.64-1.48 (m,2H), 1.40 (五重線, J = 8.7 Hz, 1H), 1.05-0.92 (m, 2H).
実施例2. 化合物7の調製
Figure 2023541637000064
[0188]撹拌した6(47mg、0.13mmol)のDCM(10mL)溶液に、CSI(11μL、18mg、0.13mmol)を添加した。30分後、EtN(91μL、66mg、0.65mmol)、及びジエタノールアミン(16mg、0.16mmol)のDMF(0.5mL)溶液を添加した。30分後、クロロギ酸p-ニトロフェニル(52mg、0.26mmol)及びEtN(54μL、39mg、0.39mmol)を添加した。さらに4.5時間後、反応混合物を濃縮し、残渣をグラジエントカラムクロマトグラフィー(33→66% EtOAc/ヘプタン(1%AcOH))によって精製して、7を無色油(88mg、0.098mmol、75%)として得た。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 8.28-8.23 (m, 4H), 7.42-7.35 (m, 4H), 4.52 (t, J = 5.4 Hz,4H), 4.30 (d, J = 8.3 Hz, 2H), 4.27-4.22 (m, 2H), 3.86 (t, J = 5.3 Hz, 4H),3.69-3.65 (m, 2H), 3.64-3.59 (m, 2H), 3.30-3.22 (m, 2H), 2.34-2.14 (m, 6H),1.62-1.46 (m, 2H), 1.38 (五重線, J = 8.7 Hz, 1H), 1.04-0.92(m, 2H).
実施例3. 化合物9a及び9bの調製
Figure 2023541637000065
[0189]化合物8a(163mg、240μmol)を、乾燥DMF(0.9mL)中エクサテカンメシレート(125mg、235μmol)とDIPEA(61mg、82μL、0.47mmol)の混合物に添加した。20時間後、反応混合物を9mLのDCMに希釈し、グラジエントカラムクロマトグラフィー(0→40% MeOH/DCM)によって精製して、9a(155mg、159μmol、68%)を得た。LCMS (ESI+) C55H54FN6O10 +(M+H)+の計算値977.39, 実測値977.72. 9a以外に、エクサテカン(82.4mg、189μmol、20%)の遊離塩基を回収した。LCMS (ESI+) C24H23FN3O4 +(M+H)+の計算値436.46, 実測値436.54.
[0190]化合物8b(29.1mg、38μmol)を、乾燥DMF(150μL)中エクサテカンメシレート(19.8mg、37.2μmol)とDIPEA(9.6mg、13μL、74.5μmol)の混合物に添加した。5時間後、反応混合物を3mLのDCMに希釈し、自動グラジエントシリカゲルカラムクロマトグラフィー(0→10% MeOH/DCM)によって精製して、9b(28.2mg、26.5μmol、74%)を淡黄色固体として得た。LCMS (ESI+) C58H60FN8O11 +(M+H)+の計算値1063.44, 実測値1063.72.
実施例4. 化合物1a及び1bの調製(構造について、図7を参照のこと)
[0191]化合物9a(155mg、159μmol)のDMF(1.6mL)溶液に、EtN(73mg、101μL、0.72mmol)、及び化合物7(65mg、72μmol)のDMF(1.4mL)溶液を添加した。反応混合物を18時間撹拌し、DCM(20mL)で希釈し、グラジエントカラムクロマトグラフィー(0→40% MeOH/DCM)によって精製して、1aを淡黄色固体(94mg、44μmol、28%)として得た。LCMS (ESI+) C102H118F2N16O29S2 2+(M/2+H)+の計算値1066.88, 実測値1067.12.
[0192]化合物7(3.5mg、3.9μmol)のDMF(78μL)溶液に、化合物9b(8.2mg、9.7μmol)のDMF(97μL)溶液及びEtN(2.4mg、3.3μL、23.4μmol)を添加した。反応混合物を20時間放置した。反応混合物をDCM(2mL)で希釈し、自動グラジエントシリカゲルカラムクロマトグラフィー(0→30% MeOH/DCM)によって精製した。得られた材料の一部を分取RP-HPLC(XBridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、30→90% MeCN/HO+1%AcOH)によって再精製して、1bを白色固体(1.0mg、0.43μmol、11%)として得た。LCMS (ESI+) C108H130F2N20O31S2 2+(M/2+H)+の計算値1152.93, 実測値1152.58.
実施例5. 化合物10a及び10bの調製
Figure 2023541637000066
[0193]化合物9a(32mg、33μmol)をDMF(1mL)に溶解し、ピペリジン(28mg、33μL、0.33mmol)を添加した。混合物を5.5時間撹拌し、濃縮し、DCM(2mL)に溶解し、グラジエントカラムクロマトグラフィー(0→30% MeOH/DCM(1%AcOH))によって精製して、10a(14.8mg、19.6μmol、59%)を得た。LCMS (ESI+) C40H44FN6O8 +(M+H)+の計算値755.32, 実測値755.46.
[0194]化合物9b(28.2mg、26.5μmol)のDMF(200μL)溶液に、ピペリジン(22.6mg、26.2μL、265μmol)を添加した。反応混合物を5.5時間放置した。反応混合物をDCM(2mL)で希釈し、グラジエントカラムクロマトグラフィー(0→30% MeOH/DCM)によって精製して、10bを淡黄色固体(16.3mg、19.4μmol、73%)として得た。LCMS (ESI+) C43H50FN8O9 +(M+H)+の計算値841.37, 実測値841.53.
実施例6. 化合物2aの調製
Figure 2023541637000067
[0195]撹拌した6(172mg、0.48mmol)のDCM(20mL)溶液に、CSI(42μL、67mg、0.48mmol)を添加した。20分後、EtN(331μL、240mg、2.38mmol)、及び11(250mg、0.55mmol)のDMF(1mL)溶液を添加した。60分後、クロロギ酸p-ニトロフェニル(242mg、1.20mmol)及びEtN(643μL、467mg、1.43mmol)を添加した。16時間後、追加のクロロギ酸p-ニトロフェニル(50mg、0.25mmol)を添加し、撹拌を4時間続けた。反応混合物を濃縮し、残渣をグラジエントカラムクロマトグラフィー(20→100% EtOAc/ヘプタン(1%AcOH))によって精製して、12を無色油(318mg、0.25mmol、53%)として得た。LCMS (ESI+) C50H73N6O27S2 +(M+H+)の計算値1253.40, 実測値1253.49.
[0196]化合物12(10.0mg、8.0μmol)のDMF(200μL)溶液に、化合物10(14.8mg、19.6μmol)のDMF(200μL)溶液及びEtN(4.0mg、5.6μL、40μmol)を添加した。反応混合物を64時間放置した。反応混合物を、分取HPLC(XBridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、30→100% CHCN/HO(1%AcOH含有))によって精製して、2aを淡黄色フィルム(4.3mg、1.73μmol、22%)として得た。LCMS (ESI+) C118H150F2N16O37S2 2+(M/2+H)+の計算値1242.99, 実測値1243.13.
実施例7. 化合物14の調製
Figure 2023541637000068
[0197]13の調製:6(3.62g、10mmol)のDCM(200mL)溶液に、クロロギ酸4-ニトロフェニル(2.02g、10mmol)及びEtN(4.2mL、3.04g、30mmol)を添加した。周囲温度で1.5時間撹拌した後、反応混合物を濃縮し、自動グラジエントシリカゲルカラムクロマトグラフィー(20%→70% EtOAc/ヘプタン+1%AcOH)によって精製して、13を白色フォーム(4.07g、11.7mmol、77%)として得た。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 8.32 - 8.27 (m, 2H), 7.46 - 7.40 (m, 2H), 5.56 (t, J = 5.4Hz, 1H), 4.49 - 4.42 (m, 2H), 4.28 (d, J = 8.2 Hz, 2H), 3.80 - 3.76 (m, 2H),3.70 - 3.65 (m, 2H), 3.39-3.30 (m, 2H), 2.36 - 2.16 (m, 6H), 1.62-1.46 (m, 2H),1.38 (五重線, J = 8.7 Hz, 1H), 1.05-0.92 (m, 2H).
[0198]14の調製:DCM(80.0mL)中13(2.61g、1H-NMRによる純度86.8%、4.62mmol、1.0当量)の混合物に、クロロギ酸4-ニトロフェニル(2.14g、10.6mmol、2.30当量)を添加した後、続いてEtN(3.70mL、2.68g、26.5mmol、5.75当量)を添加した。反応混合物を室温で4.5時間撹拌し、次いで真空中で濃縮し、黄色油を得た。残渣をグラジエントカラムクロマトグラフィー(50→100%EtOAc/ヘプタン+1%AcOH)によって精製した後、続いて第2のグラジエントカラムクロマトグラフィー(50→100%EtOAc/ヘプタン+1%AcOH)によって精製して、14を白色固体(2.1g、1H-NMRによる純度88%、2.25μmol、49%)として得た。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ (ppm) 8.33-8.20 (m, 4H), 7.40 (d, J = 8.4 Hz, 4H), 5.74 (t, J = 5.8Hz, 1H), 4.56-4.42 (m, 4H), 4.40-4.31 (m, 2H), 4.26 (d, J = 8.3 Hz, 2H),3.83-3.72 (m, 4H), 3.71-3.64 (m, 2H), 3.60 (t, J = 4.9 Hz, 2H), 3.34-3.23 (m,2H), 2.36-2.14 (m. 6H), 1.82-1.44 (m, 4H), 1.44-1.31 (m, 1H), 0.98-0.92 (m,2H).
実施例8:化合物17bの調製
Figure 2023541637000069
[0199]16bの調製:撹拌した14(62mg、75μmol)のDMF(500μL)溶液に、15b(60mg、158μmol)及びEtN(63μL、46mg、450μmol)を添加した。3.5時間後、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(137mg、450μmol)及びEtN(63μL、46mg、450μmol)を添加した。反応混合物をDMF(500μL)で希釈し、撹拌を1.5時間続けた。反応混合物を濃縮し、残渣を自動グラジエントシリカゲルカラムクロマトグラフィー(0→15% MeOH/DCM)によって精製して、16bを白色固体(86mg、52.7μmol、70%)として得た。LCMS (ESI+) C72H94N15O27S+(M+H)+の計算値1632.62, 実測値1632.70.
[0200]17bの調製:DMF(40μL)中エクサテカンメシレート(2.0mg、3.7μmol)の混合物に、EtN(0.9mg、1.2μL、8.9μmol)、及び化合物16b(2.9mg、1.78μmol)のDMF(25μL)溶液を添加した。反応混合物を19時間放置した。反応混合物をDMF(100μL)で希釈し、分取HPLC(XBridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、30→100% MeCN/HO(1%AcOH含有))によって精製して、17bを白色固体(2.5mg、1.1μmol、62%)として得た。LCMS (ESI+) C108H129F2N19O29S2 2+(M/2+H)+の計算値1113.45, 実測値1113.80.
実施例9:化合物21bの調製
[0201]19の調製:N雰囲気下で、BCN-OH(5、1.0g、6.7mmol)のDCM(50mL)冷却溶液(0℃)に、CSI(597μL、0.94g、6.7mmol)を添加した。7分後、撹拌を周囲温度で続け、追加のCSI(58μL、0.1g、0.67mmol)を添加した。6分撹拌した後、EtN(1.86mL、1.35g、13.3mmol)を添加し、続いて3分撹拌した後、2-[2-(1-ピペラジニル)エトキシ]エタノール(18、1.42mL、1.51g、8.65mmol)を添加した。混合物を17時間撹拌した。反応混合物を真空中で濃縮し、残渣を自動グラジエントシリカゲルカラムクロマトグラフィー(0→10% MeOH/DCM)によって精製して、19を明黄色フォーム(2.05g、3.91mmol、58%)を得た。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 4.21 (d, J = 8.2 Hz, 2H), 3.72-3.63 (m, 4H), 3.62-3.56 (m,2H), 3.47-3.36 (m, 4H), 2.70-2.55 (m, 6H), 2.37-2.15 (m, 6H), 1.66-1.48 (m,2H), 1.39 (五重線, J = 8.7 Hz, 1H), 1.03-0.89 (m, 2H).LCMS (ESI+) C19H32N8O6S+(M+H+)の計算値430.20, 実測値430.43.
[0202]20の調製:撹拌した19(750mg、1.75mmol)のDCM(18mL)冷却懸濁液(0℃)に、CSI(167μL、272mg、1.92mmol)を添加した。0℃で2分撹拌した後、撹拌を周囲温度で28分間続けた。次いで、EtN(1.22mL、886mg、8.75mmol)を添加し、3分撹拌した後、ジエタノールアミン(229mg、209μL、2.18mmol)のDMF(0.5mL)溶液を添加した。40分後、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(1.33g、4.38mmol)及びEtN(725μL、526mg、5.20mmol)を添加した。18時間後、追加のビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(266mg)を添加し、撹拌を25時間続けた。反応混合物を濃縮し、残渣を自動グラジエントシリカゲルカラムクロマトグラフィー(0→20% MeOH/EtOAc、続いて50%MeOH/DCM)によって精製した。生成物を含む画分の貯蔵及び濃縮を行った後、残渣を分取RP-HPLC(XBridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、30→90% CHCN/HO+1%AcOH)によって2回再精製して、20をフィルム(10.5mg、10.8μmol、0.6%)として得た。LCMS (ESI+) C38H48N7O19S2 +(M+H+)の計算値970.24, 実測値970.39.
[0203]21bの調製:化合物20(10.5mg、10.8μmol)のDMF(270μL)溶液に、化合物10b(20.4mg、27.1μmol)のDMF(175μL)溶液及びEtN(6.6mg、9.1μL、65μmol)を添加した。反応混合物を17.5時間放置した。反応混合物をDCM(2mL)で希釈し、自動グラジエントシリカゲルカラムクロマトグラフィー(0→20% MeOH/DCM)によって精製して、21bを淡黄色固体(13.5mg、6.13μmol、57%)として得た。LCMS (ESI+) C106H125F2N7O19S2 2+(M/2+2H)+の計算値1101.41, 実測値1101.61.
実施例10:化合物25aの調製
Figure 2023541637000071
[0204]23aの調製:乾燥DMF中の10a(21.7mg、28.7μmol、1.0当量)及びFmoc-Gly-Gly-OH(12.6mg、36.6μmol、1.24当量)の溶液に、HBTU(18.5mg、48.9μmol、1.7当量)を添加した後、続いてDiPEA(12.3mg、16.5μL、94.9μmol、3.3当量)を添加した。得られた混合物を混合し、室温で110分間放置し、次いでDCMで希釈し、得られた混合物をグラジエントカラムクロマトグラフィー(0→12% MeOH/DCM)によって精製して、23aを明黄色固体(36mg、HPLC純度48%、16μmol、55,0%)として得た。LCMS (ESI+) C59H60FN8O12 +(M+H+)の計算値1091.43, 実測値1091.61.
[0205]24aの調製:化合物23a(36mg、48重量%、16μmol、1.0当量)を、DMF(250μL)とHO(1.25μL)の混合物に溶解した。得られた混合物に、EtN(8.0mg、11μL、79μmol、5.0当量)を添加し、得られた溶液を室温で約5時間放置した。次に、追加のEtN(8.0mg、11μL、79μmol、5.0当量)を反応混合物に添加し、混合物を室温で18時間放置し、次いで冷凍庫にもう1日貯蔵した。反応混合物を冷凍庫から取り出し、真空中で濃縮した後、続いて乾燥DMFと(3回)共蒸発させて、24aを褐色油として得た。それをさらに精製することなく使用した。LCMS (ESI+) C44H50FN8O10 +(M+H+)の計算値869.36, 実測値869.53.
[0206]25aの調製:24a(14mg、16μmol、3.2当量)が入っているバイアルに、100mM 化合物7(4.5mg、50μL、5.0μmol、1.0当量)のDMF溶液を添加し、続いてEtN(2.5mg、3.5μL、25μmol、5.0当量)を添加した。得られた混合物に、追加の乾燥DMF(50μL)を添加し、次いで反応混合物を室温で4.5時間放置した。次に、反応混合物を乾燥DMFで希釈し、次いでRP-HPLC(C18、30%→90% MeCN(1%AcOH含有)/水(1%AcOH含有))によって精製して、25a(3.6mg、1.5μmol、収率31%)を得た。LCMS (ESI+) C110H130F2N20O33S2+(M+2H+)の計算値1180.93. 実測値1180.94.
実施例11:化合物26aの調製
Figure 2023541637000072
[0207]10a(18.9mg、0.025mmol)の無水DMF(500μL)溶液に、13(16mg、0.03mmol)及びEtN(11μL、0.075mmol)を添加した。周囲温度で23時間撹拌した後、反応混合物をDMFで総容積が700μLに到達するまで希釈し、分取RP-HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、30%→100% MeCN/HO+1%AcOH)によって精製した。生成物26aが灰白色固体(5.3mg、4.6μmol、18.6%)として得られた。LCMS (ESI+) C56H66FN8O15S+(M+H)+の計算値1142.23, 実測値1142.54.
実施例12:化合物31a及び32aの調製
Figure 2023541637000073
[0208]27aの調製:Boc-Glu(OtBu)-OH(11.1mg、36.6μmol、1.32当量)が入っているバイアルに、148.4mM 10a(21.0mg、187.5μL、27.83μmol、1.0当量)の乾燥DMF溶液を添加した後、続いてHBTU(18.6mg、49.0μmol、1.76当量)及び追加の乾燥DMF(75μL)を添加した。最後に、DiPEA(12.2mg、16.5μL、94.7μmol、3.40当量)を添加し、反応混合物を、褐色溶液が得られるまで混合した。反応混合物を室温で約35分間放置し、次いでDCM(2.8mL)で希釈し、次いで得られた溶液をグラジエントカラムクロマトグラフィー(0→12% MeOH/DCM)によって精製して、27aを白色残渣(30.8mg、29.6μmol、定量的収率)として得た。LCMS (ESI+) C54H67FN7O13 +(M+H+)の計算値1040.48, 実測値1040.70.
[0209]28aの調製:10a(619.9mg、1当量、821.3μmol)の乾燥DMF(2.5ml)溶液が入っている10mLの容器に、Fmoc-Glu(OFm)-OH(418.3mg、0.93当量、763.8μmol)を添加した。得られた白色懸濁液に、追加の乾燥DMF(1.0mL)を添加した後、続いてDIPEA(318.5mg、429μL、3当量、2.464mmol)を添加した。この懸濁液に、HBTU(289.7mg、0.93当量、763.8μmol)を追加の乾燥DMF(0.5mL)と一緒に添加した。反応混合物を5分間混合し、溶液を生成し、それを室温でもう40分間放置した。反応混合物をDCM(40mL)で希釈し、得られた混合物をグラジエントカラムクロマトグラフィー(0→10% MeOH/DCM)によって精製して、28aを白色固体(617.5mg、481μmol、63,0%)として得た。LCMS (ESI+) C74H71FN7O13 +(M+H+)の計算値1284.51, 実測値1284.91.
[0210]29aの調製:28a(617.5mg、481μmol、1.0当量)が入っているバイアルに、DMF(7.5mL)及びEtN(670μL、486.5mg、4.81mmol、10当量)を添加した。得られた混合物を水浴中で40℃に5分間加熱し、褐色溶液を生成し、それを室温で18時間放置した。次いで、反応混合物を冷凍庫中で3日間維持した。次に、反応混合物を冷凍庫から取り出し、真空中で濃縮し、29aを褐色油として得た。それをさらに精製することなく使用した。LCMS (ESI+) C45H51FN7O11 +(M+H+)の計算値884.36, 実測値884.70.
[0211]30aの調製:27a(10.8mg、10.4μmol、1.0当量)が入っているバイアルを氷浴に入れた後、続いて氷冷TFA(1.04g、700μL、9.15mmol、881当量)を添加した。得られた溶液を混合し、次いで氷浴に70分間放置した。次いで、反応混合物を真空中で濃縮し(34℃の水浴)、残渣をMeCNとDMSOの1:1混合物に溶解し、次いでRP-HPLC(C18、5%→90% MeCN(+1%AcOH)/水(+1%AcOH))によって精製して、30aを酢酸アンモニウム塩(4.5mg、5.1μmol、収率49%)として得た。LCMS (ESI+) C45H51FN7O11 +(M+H+)の計算値884.36, 実測値884.55.
[0212]31aの調製:粗製29a(386mg、437μmol、3.86当量)を乾燥DMF(300μL)に溶解した後、14(105.6mg、1H-qNMRによって88重量%、113.1μmol、1.0当量)、追加の乾燥DMF(200μL)及びEtN(78.8μL、57.2mg、565μmol、5.0当量)を添加した。得られた混合物を混合し、褐色溶液を生成した。それを室温で85分間放置した。次に、反応混合物を冷凍庫に18.5時間貯蔵し、次いで冷凍庫から取り出し、室温で追加の6時間放置した後、反応混合物を冷凍庫にもう18時間貯蔵した。最後に、反応混合物を冷凍庫から取り出し、RP-HPLC(C18、50%→100% MeCN(1%AcOH)/水(1%AcOH))によって精製した。純粋な画分を、乾燥DMF(53μL)中で29a(38.9mg、44.0μmol、3.88当量)、14(10.6mg、1H-qNMRによって88重量%、11.4μmol、1.0当量)及びEtN(7.91μL、5.74mg、56.8μmol、5.0当量)を利用した、室温で反応時間5時間のより小スケール反応から得られた純粋な画分と組み合わせた。純粋な画分を真空中で濃縮し、31aを灰白色残渣(86.6mg、37.5μmol、33.1%)として得た。LCMS (ESI+) C112H131F2N17O33S2+(M+2H+)の計算値1156.44, 実測値1157.03.
[0213]32aの調製:30a(4.50mg、5.09μmol、3.28当量)が入っているバイアルに、100mM 化合物7の乾燥DMA溶液(1.40mg、15.5μL、1.55μmol、1.0当量)を添加した後、続いてEtN(1.26mg、1.73μL、12.4μmol、8.00当量)を添加した。得られた混合物をボルテックスし、43℃に約10分間加熱して、橙色溶液を得た。次いで、反応混合物を暗所に室温で2時間45分放置し、次いで冷蔵庫に16時間貯蔵した。次に、反応混合物を冷凍庫から取り出し、室温で40分間放置した後、反応混合物をDMFで希釈した。得られた溶液をRP-HPLC(C18、30%→90% MeCN(+1%AcOH)/水(+1%AcOH))によって精製して、32aを白色固体(1.0mg、0.42μmol、27%)として得た。LCMS (ESI+) C112H132F2N18O35S2 +(M+2H+)の計算値1195.93, 実測値1196.33.
実施例13:化合物35aの調製
Figure 2023541637000074
[0214]33の調製:化合物5(101mg、0.67mmol)をDCM(800μL)に溶解し、クロロスルホニルイソシアネート(CSI、64.0μL、0.74mmol)を添加すると、褐色溶液が生じた。周囲温度で17分間撹拌した後、EtN(187.0μL、1.34mmol)を添加した(混合物が黄色に変色)後、続いてN,N,-(2-ヒドロキシエチル)エチレンジアミン(110.9mg、0.748mmol)をDCM(1.0mL)に溶解した。周囲温度でさらに18時間撹拌した後、粗製混合物を真空中で濃縮し、自動グラジエントシリカゲルカラムクロマトグラフィー(0%→30% MeOH/DCM)によって精製して、33を白色蝋様固体(33.5mg、0.083mmol、12%)として得た。LCMS (ESI+) C17H30N3O6S+(M+H)+の計算値404.50, 実測値404.42.
[0215]34の調製:33(16.5mg、0.041mmol)のDCM(900μL)溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(29.9mg、0.098mmol)及びEtN(17.0μL、0.012mmol)を添加した。周囲温度で96時間撹拌した後、粗製混合物を真空中で濃縮し、自動グラジエントシリカゲルカラムクロマトグラフィー(10%→100% EtOAc/ヘプタン)によって精製して、34を透明な油(2.5mg、0.003mmol、8%)として得た。LCMS (ESI+) C31H36N5O14S+(M+H)+の計算値734.71, 実測値734.48.
[0216]35aの調製:34(2.5mg、0.003mmol)のDMF(110μL)溶液に、200mM 10a(41.0μL、6.2mg、0.008mmol)のストック及びEtN(3.0μL、0.02mmol)を添加した。周囲温度で4.5時間後に、反応混合物を分取RP-HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、5%→90% MeCN/HO+1%AcOH)によって精製した。生成物35aが無色フィルム(1.0mg、0.5μmol、10%)として得られた。LCMS (ESI+) C99H112F2N15O24S+(M+H)+の計算値1966.10, 実測値1966.85.
実施例14:化合物39aの調製
Figure 2023541637000075
[0217]37aの調製:DBCO-PEG-OSu(36、63.0mg、0.097mmol)のDMF(2.0mL)溶液に、Val-Ala-PAB(15a、26.0mg、0.108mmol)を添加した後、続いてEtN(41.0μL、0.28mmol)を添加した。周囲温度で2時間撹拌した後、DMF(150μL)に溶解したVal-Ala-PAB(15a、7.8mg、0.03mmol)をさらに添加した。さらに45分後、反応混合物を0.5mLの容積に濃縮し、自動グラジエントシリカゲルカラムクロマトグラフィー(0%→15% MeOH/DCM)によって精製して、37aを透明な油(94mg、0.113mmol)として得た。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 7.72 - 7.61 (m, 3H), 7.44 - 7.21 (m, 9H), 5.12 (d, J = 14.0Hz, 1H), 4.74 - 4.56 (m, 3H), 4.24 - 4.14 (m, 1H), 3.83 - 3.73 (m, 1H), 3.70(dd, J = 14.0 Hz; J = 1.8 Hz, 1H), 3.66 - 3.36 (m, 16H), 3.35 - 3.14 (m, 2H),2.70 - 1.80 (m, 6H), 1.49 - 1.36 (m, 3H), 1.05 - 0.90 (m, 6H).
[0218]38aの調製:37a(94.0mg、0.113mmol)のDMF(1.5mL)溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(38.0mg、0.12mmol)及びEtN(46.0μL、0.33mmol)を添加した。2時間撹拌した後、余分のビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(10.0mg、0.03mmol)を添加した。さらに1時間後、反応混合物を、1mLの溶媒が残るまで濃縮し、自動グラジエントシリカゲルカラムクロマトグラフィー(100% DCM、続いて0%→10% MeOH/DCM)によって精製して、38aを透明な油(79mg、0.095mmol)として得た。LCMS (ESI+) C52H60N6O14 +(M+H)+の計算値994.07, 実測値994.74.
[0219]39aの調製:エクサテカン遊離塩基(7.28mg、0.0167mmol、9aの調製において回収、実施例3を参照のこと)のDMF(214μL)溶液に、38a(15.1mg、0.015mmol)及びEtN(6.0μL、0.04mmol)を添加した。周囲温度で16.5時間後、反応混合物をDMFで600μLになるまで希釈し、分取RP-HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、30%→100% MeCN/HO+1%AcOH)によって精製した。生成物39aが無色フィルム(8.3mg、15.2μmol、42%)として得られた。LCMS (ESI+) C70H78FN8O15 +(M+H)+の計算値1290.41, 実測値1290.02.
実施例15:化合物43aの調製
Figure 2023541637000076
[0220]41の調製:DIBO(40、220mg、1.0mmol)の無水DCM(15mL)溶液に、クロロスルホニルイソシアネート(CSI、88.1μL、1.0mmol)を添加すると、白色懸濁液が形成された。周囲温度で20分間撹拌した後、EtN(282μL、2.0mmol)を添加した後、続いて2-アミノ-エトキシエタノール(117mg、1.11mmol)を添加した。さらに20分間撹拌した後、反応混合物をNHCl水溶液(飽和、30mL)添加によりクエンチした。分離後、水性層をDCM(20mL)で抽出した。合わせた有機層を乾燥し(MgSO)、濃縮した。残渣を自動グラジエントシリカゲルカラムクロマトグラフィー(0%→7% MeOH/DCM)によって精製して、41を明黄色油(498mg、1.15mmol)として得た。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 7.52 - 7.42 (m, 1H), 7.35 - 7.29 (m, 2H), 7.28 - 7.19 (m,5H), 5.42 - 5.39 (bs, 1H), 3.48 - 3.43 (m, 4H), 3.36 - 3.32 (m, 2H), 3.23 -3.18 (m, 2H), 3.17 - 3.12 (m, 2H).
[0221]42の調製:41(192mg、0.44mmol)のDCM(30mL)溶液に、N雰囲気下、クロロスルホニルイソシアネート(CSI、38.8μL、0.44mmol)を滴下して加えた。周囲温度で20分間撹拌した後、EtN(311μL、2.23mmol)を添加し、この混合物を10分間撹拌した。その後、ジエタノールアミン(51.6μL、0.53mmol)のDMF(1.5mL)溶液を添加した。反応を1時間撹拌した後、続いてクロロギ酸4-ニトロフェニル(180mg、0.89mmol)及びEtN(187μL、1.34mmol)を添加した。周囲温度で18時間撹拌した後、反応混合物を自動グラジエントシリカゲルカラムクロマトグラフィー(0%→6% MeOH/DCM)によって精製して、42を白色固体(187mg、0.19mmol)として得た。LCMS (ESI+) C40H39N6O19S2 +(M+H)+の計算値971.90, 実測値971.26.
[0222]43aの調製:10a(15mg、0.02mmol)の無水DMF(110μL)溶液に、42(7.9mg、0.008mmol)及びEtN(5.0μL、0.04mmol)を添加した。周囲温度で6時間後、反応混合物を自動グラジエントシリカゲルカラムクロマトグラフィー(0%→15% MeOH/DCM)によって精製して、43aを灰白色固体(10.1mg、0.0046mmol、55%)として得た。LCMS (ESI+) C108H115F2N16O29S2 +(M/2+H)+の計算値1101.64, 実測値1101.97.
実施例16:化合物49aの調製
[0223]45の調製:(9H-フルオレン-9-イル)メチル(5-ヒドロキシペンチル)カルバメート(397mg、1.22mmol、1.0当量)のDCM(55mL)溶液に、CSI(106μL、1.22mmol、1.0当量)を室温で滴下して加えた。反応混合物を室温で20分間撹拌した後、続いてEtN(850μL、6.10mmol、5.0当量)を添加した。得られた混合物を室温で10分間撹拌し、次いでジエタノールアミン(144mg、1.37mmol、1.11当量)のDMF(1.7mL)溶液を添加した。反応混合物を2時間撹拌し、次いでクロロギ酸4-ニトロフェニル(492mg、2.44mmol、2.0当量)を追加のEtN(340μL、2.44mmol、2.0当量)と一緒に添加した。反応混合物を18時間撹拌し、次いで真空中で濃縮し、得られた残渣をDCM(100mL)に溶解し、飽和NHCl水溶液(50mL)で洗浄した。水層をDCM(50mL)で抽出し、合わせた有機層をMgSOで脱水し、真空中で濃縮した。次いで、残渣をグラジエントカラムクロマトグラフィー(0→5% MeOH/DCM)によって精製した後、続いて第2のカラムクロマトグラフィー(65% EtOAc/ヘプタン)によって精製して、45を白色粉末(342mg、395μmol、収率32.3%)として得た。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 8.24 (d, J = 9.2 Hz, 4H), 7.76 (d, J = 7.5 Hz, 2H), 7.59 (d,J = 7.5 Hz, 2H), 7.42-7.33 (m, 6H), 7.33-7.27 (m, 2H), 4.86 (t, J = 5.5 Hz,1H), 4.51 (t, J = 5.4 Hz, 4H), 4.43 (d, J = 6.9 Hz, 2H), 4.21 (t, J = 6.8 Hz,1H), 4.17-4.09 (m, 2H), 3.84 (t, J = 4.4 Hz, 4H), 3.24-3.14 (m, 2H), 1.72-1.62(m, 2H), 1.62-1.48 (m, 3H), 1.48-1.36 (m, 2H).
[0224]46aの調製:EtN(37.7μL、27.3mg、270μmol、10当量)を含む25mM 粗製29aの乾燥DMF溶液(25mg、1.1mL、28μmol、4.0当量)を真空中で濃縮した。得られた残渣に、45(6.1mg、7.1μmol、1.0当量)の乾燥DMF(150μL)溶液を添加した後、続いてEtN(6.0μL、4.2mg、42μmol、6.0当量)を添加した。得られた混合物を45℃に5分間加熱し、次いで室温で2.5時間放置し、次いで冷蔵庫に17時間貯蔵した。次に、反応混合物を冷凍庫から取り出し、乾燥DMFで希釈し、メンブランフィルターで濾過し、次いでRP-HPLC(C18、50%→100% MeCN(+1%AcOH)/水(+1%AcOH))によって精製して、46aを(7.4mg、3.1μmol、収率44%)として得た。LCMS (ESI+) C117H131F2N17O32S2+(M+2H+)の計算値1178.44, 実測値1178.79.
[0225]49aの調製:46a(7.4mg、3.1μmol、1.0当量)が入っているバイアルに、DMF(200μL)を添加した後、続いてEtN(4.4μL、3.2mg、31.6μmol、10当量)を添加した。得られた混合物を室温で2時間放置した後、続いて追加のEtN(10μL、7.3mg、71.7μmol、23当量)を添加した。反応混合物を混合し、室温で21時間放置した。次に、DMF(5μL)中のDBCO-NHSエステル48(2.1mg、5.2μmol、1.7当量)を添加した。得られた褐色溶液を室温で1時間放置し、次いで冷蔵庫に18時間貯蔵した。翌日、反応混合物を冷凍庫から取り出し、次いでRP-HPLC(C18、50%→100%MeCN(+1%AcOH)/水(+1%AcOH)によって精製して、不純な生成物を得た。それをさらにグラジエントカラムクロマトグラフィー(0→30% MeOH/DCM)によって精製して、49aを白色固体(2.5mg、1.0μmol、収率33%)として得た。LCMS (ESI+) C121H134F2N18O32S2+(M+2H+)の計算値1210.96, 実測値1211.20.
実施例17:化合物52aの調製
Figure 2023541637000078
[0226]50aの調製:化合物10a(87.3μmol、1.71当量)が入っているバイアルに、45(16.2mg、18.7μmol、1.0当量)を添加した後、続いて乾燥DMF(200μL)及びEtN(9.5mg、13μL、94μmol、5.0当量)を添加した。得られた褐色溶液を室温で50分間放置し、次いで追加の中間体10a(55.3μmol、3.0当量)が入っているバイアルに移した。得られた反応混合物を室温で40分間放置した後、続いて追加の乾燥DMF(150μL)を添加した。反応混合物を室温で20時間放置し、次いで冷蔵庫に3日間貯蔵した。次に、反応混合物を冷凍庫から取り出し、2,2’-(エタン-1,2-ジイルビス(オキシ))ビス(エタン-1-アミン)(5.0μL)を添加した。反応混合物を室温で20分間放置し、次いで乾燥DMFで希釈し、0.2μmのナイロンシリンジフィルターで濾過し、次いでRP-HPLC(C18、50%→100% MeCN(+1%AcOH)/水(+1%AcOH))によって精製して、不純な生成物を得た。それをさらにグラジエントカラムクロマトグラフィー(0→30% MeOH/DCM)によって精製して、50aを白色残渣(6.5mg、3.06μmol、収率16%)として得た。LCMS (ESI+) C107H117F2N15O26S2+(M+2H+)の計算値1049.40, 実測値1049.28.
[0227]52aの調製:50a(1.6mg、0.76μmol、1.0当量)が入っているバイアルに、DMF(150μL)を添加した後、続いてEtN(1.5mg、2.1μL、15μmol、20当量)を添加した。得られた淡褐色溶液を室温で50分間放置した後、続いて追加のEtN(3.5μL)を添加した。反応混合物を室温でもう18時間放置し、次いで真空中で濃縮した。この粗製残渣に、((1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イル)メチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(BCN-OPNP、1.2mg、3.8μmol、5.0当量)の乾燥DMF(10μL)溶液を添加した後、続いてEtN(0.35mg、0.48μL、3.4μmol、4.5当量)を添加した。得られた褐色溶液をボルテックスし、室温で140分間放置した。次いで、反応混合物をDCMで希釈し、得られた混合物をグラジエントカラムクロマトグラフィー(0→10% MeOH/DCM)によって精製して、52aを白色固体(1.7mg、HPLCによる純度86%、0.71μmol、94%)として得た。LCMS (ESI+) C103H119F2N15O26S2+(M+2H+)の計算値1026.41, 実測値1026.11.
実施例18:化合物54aの調製
[0228]10a(15mg、0.020mmol)の無水DMF(150μL)溶液に、2,5-ジオキシピロリジン-1-イル6-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)ヘキサノエート(53、5.5mg、0.018mmol)及びDIPEA(10μL、0.060mmol)を添加した。周囲温度で35分後、反応混合物を分取RP-HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、30%→100% MeCN/HO+1%AcOH)によって精製した。生成物54aが透明な油(2.4mg、2.1μmol、11%)として得られた。LCMS (ESI+) C50H55FN7O11 +(M+H)+の計算値949.01, 実測値949.82.
実施例19:化合物57bの調製
Figure 2023541637000080
[0229]55bの調製:乾燥DMF(2mL)中の化合物53(684μmol)が入っているバイアルに、H-Val-Cit-PAB-OH(15b、259mg、684μmol、1.0当量)を添加し、得られた溶液を室温で17時間撹拌した。次に、反応混合物を追加のDMF(2.0mL)で希釈し、次いでEtO(80mL)に注ぎ、濾過した。濾過した固体をEtO(25mL、2回)で洗浄し、次いで真空中で濃縮して、55bを白色固体(378mg、1H-NMR純度95.3%、629μmol、収率91.9%)として得た。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ (ppm) 9.91 (s, 1H), 8.08 (d, J = 7.6 Hz, 1H), 7.82 (d, J = 8.4 Hz,1H), 7.56 (d, J = 8.3 Hz, 2H), 7.24 (d, J = 8.2 Hz, 2H), 7.02 (s, 2H),6.06-5.90 (m, 1H), 5.42 (s, 2H), 5.11 (t, J = 5.6 Hz, 1H), 4.52-4.33 (m, 3H),4.20 (t, J = 7.6 Hz, 1H), 3.09-2.93 (m, 2H), 2.26-2.06 (m, 2H), 2.05-1.91 (m,1H), 1.77-1.65 (m, 1H), 1.65-1.56 (m, 1H), 1.56-1.30 (m, 6H), 1.28-1.15 (m,2H), 0.93-0.76 (m, 6H).
[0230]56bの調製:DMF(2.0mL)中の55b(214mg、1H-NMR純度95.3%、0.357mmol)及びビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(217mg、0.714mmol)の溶液に、DIPEA(88μL、0.535mmol)を添加した。周囲温度で2時間撹拌した後、反応混合物をジエチルエーテル(80mL)に注ぎ、濾過した。残渣をジエチルエーテル(2回×50mL)に懸濁し、再び濾過した。真空中で濃縮した後、56bが明黄色固体(251.0mg、0.34mmol、95%)として得られた。LCMS (ESI+) C35H44N7O11 +(M+H)+の計算値738.76, 実測値738.25. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ (ppm) 10.08 (s, 1H), 8.40-8.28 (m, 2H), 8.12 (d, J = 7.6 Hz, 1H),7.82 (d, J = 8.7 Hz, 1H), 7.67 (d, J = 8.5, 2H), 7.62-7.53 (m, 2H), 7.42 (d, J= 8.4 Hz, 2H), 7.02 (s, 2H), 5.99 (t, J = 5.4 Hz, 1H), 5.43 (s, 2H), 5.26 (s,2H), 4.46-4.34 (m, 1H), 4.21 (t, J = 7.4 Hz, 1H), 3.12-2.88 (m, 2H), 2.26-2.04(m, 2H), 2.04-1.89 (m, 1H), 1.77-1.67 (m, 1H), 1.67-1.56 (m, 1H), 1.56 (m, 6H),1.27-1.14 (m, 2H), 0.94-0.78 (m, 6H).
[0231]57bの調製:エクサテカンメシル酸塩(20mg、0.038mmol)の無水DMF(220μL)溶液に、DIPEA(33.0μL、0.19mmol)及び56b(25mg、0.034mmol)を添加した。周囲温度で2時間後、粗製反応混合物を分取RP-HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、30%→90% MeCN/HO+1%AcOH)によって直接精製した。生成物57bが透明な油(8.1mg、7.8μmol、21%)として得られた。LCMS (ESI+) C53H61FN9O12 +(M+H)+の計算値1035.10, 実測値1035.82.
実施例20:化合物59bの調製
[0232]10a(15mg、0.020mmol)の無水DMF(150μL)溶液に、マレイミド-PEG1-OPNP(58、7.7mg、0.022mmol)及びDIPEA(10μL、0.060mmol)を添加した。周囲温度で2.5時間後、粗製反応混合物を分取RP-HPLC(Column Xbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、30%→100% MeCN/HO+1%AcOH)によって直接精製した。生成物59aが透明な油(3.6mg、3.4μmol、17%)として得られた。LCMS (ESI+) C49H53FN7O13 +(M+H)+の計算値966.98, 実測値966.77.
実施例21:化合物60aの調製
Figure 2023541637000082
[0233]マレイミドカプロン酸NHSエステル(53、5.2mg、17μmol、1.0当量)が入っているバイアルに、EtN(23.3μL、16.9mg、167μmol、10当量)を含有する25mM 粗製29aの乾燥DMF溶液(15mg、0.68mL、17μmol、1.0当量)を添加した。得られた褐色溶液を室温で40分間放置し、次いでDMF(20μL)中の追加のマレイミドカプロン酸NHSエステル(2.1mg、6.8μmol、0.4当量)を添加した。RMを室温でもう24分間放置し、次いでRP-HPLC(C18、40%→100% MeCN(1%AcOH)/水(1%AcOH))によって精製して、60aを白色残渣(3.3mg、2.5μmol、HPLC純度80%、収率14%)として得た。LCMS (ESI+) C55H62FN8O14 +(M+H+)の計算値1077.44, 実測値1077.78.
実施例22. ADC1a-DAR4の調製(構造について、図9を参照のこと)
[0234]リンカーコンジュゲートである化合物1aの生体分子であるアジド修飾トラスツズマブへのコンジュゲーションによって、本発明に係るバイオコンジュゲートを調製した。したがって、国際公開第2016170186号に従って調製されたトラスツズマブ-(6-N-GalNAc)(604μL、20.6mg、PBS pH 7.4中の34.1mg/ml、trast-v1)の溶液に、PBS pH 7.4(63μL)、1,2-プロピレングリコール(587μL)及び化合物1a(80μL、DMF中の10mM溶液)を添加した。反応を室温で終夜インキュベートした後、続いてPBS pH 7.4に透析した。残留遊離ペイロードを、チャコール(ADC 1mg当たりチャコール1.2mg)の添加後、続いて室温で終夜回転させることによって除去した。チャコールを遠心及び濾過によって除去し、Superdex200 Increase 10/300 GL(GE Healthcare社)カラムを用いてAKTA Purifier-10(GE Healthcare社)でADCを精製した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、コンジュゲートされたFc/2フラグメント(ペイロードの2つの閉環ラクトン形)に対応する1つの主生成物(観測質量26494Da、全Fc/2フラグメントの約60%、計算質量26495Da)、及びコンジュゲートされたFc/2フラグメント(ペイロードの1つの閉環ラクトン形及び1つの開環カルボキシレート形)に対応する1つの少量生成物(観測質量26510Da、全Fc/2フラグメントの約30%、計算質量26513Da)を示した。
[0235]ADC1a-DAR8(構造について、図9を参照のこと)を、化合物1aのトラスツズマブ-(HC-L196N変異体)-(6-N-GalNAc)(trast-v5)へのコンジュゲーションによって同様に調製した。
実施例23. ADC2(DAR4)の調製
[0236]リンカーコンジュゲートである化合物2の生体分子であるアジド修飾トラスツズマブへのコンジュゲーションによって、本発明に係るバイオコンジュゲートを調製した。したがって、国際公開第2016170186号に従って調製されたトラスツズマブ-(6-N-GalNAc)(363μL、12.0mg、PBS pH 7.4中の33.1mg/ml、trast-v1)の溶液に、PBS pH 7.4(37μL)、1,2-プロピレングリコール(336μL)及び化合物2(64μL、DMF中の10mM溶液)を添加した。反応を室温で終夜インキュベートした後、続いて追加の2(16μL、DMF中の10mM溶液)を添加し、室温で終夜インキュベートした。反応をPBS pH 7.4に透析し、残留遊離ペイロードを、チャコール(ADC 1mg当たりチャコール4.8mg)の添加後、続いて室温で4時間回転させることによって除去した。チャコールを遠心及び濾過によって除去し、Superdex200 Increase 10/300 GL(GE Healthcare社)カラムを用いてAKTA Purifier-10(GE Healthcare社)でADCを精製した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、コンジュゲートされたFc/2フラグメント(ペイロードの2つの閉環ラクトン形)に対応する1つの主生成物(観測質量26847Da、全Fc/2フラグメントの約60%、計算質量26847Da)、及びコンジュゲートされたFc/2フラグメント(ペイロードの1つの閉環ラクトン形及び1つの開環カルボキシレート形)に対応する1つの少量生成物(観測質量26865Da、全Fc/2フラグメントの約30%、計算質量26865Da)を示した。
実施例24. ADC3(DAR4)の調製
[0237]トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)(333μL、11mg、PBS pH 7.4中の33mg/mL、trast-v1)の溶液に、3(350μL、PG中の2mM溶液、IgGと比べて10当量)を添加した。反応を室温で18時間インキュベートした後、続いてSuperdex200 Increase 10/300 GL(GE Healthcare社)カラムを用いてAKTA Purifier-10(GE Healthcare社)で精製した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、コンジュゲートされたADC trast-v1-3(ADC-3)に対応する1つの主生成物(計算質量26732Da、観測質量26733Da)を示した。
実施例25. ADC4a及びADC4b(DAR4及びDAR8)の調製
[0238]トラスツズマブ(290mg、製剤緩衝液+25mM EDTA+25mM トリス pH 8.5中の18mg/mL、trast-v4)をTCEP(386μL、2.05当量μL、MQ中の10mM)と共に90分間インキュベートした。反応に、デルクステカン(4、1.6mL、6当量、DMA中の7.1mM)を添加した後、続いて室温で90分間インキュベートした。続いて、反応を過剰量のN-アセチルシステインでクエンチし、TFFで精製した。RP-HPLCによる分析は、3.94の平均DARを有する生成物trast-v4-4a(ADC4a)の形成を示した。
[0239]trast-v4を5~6当量のTCEPで還元した後、化合物4のコンジュゲーションによって、ADC4bを同様に調製した。RP-HPLCによる分析は、7.0の平均DARを有する生成物trast-v4-4b(ADC4b)の形成を示した。
実施例26. トラスツズマブ-(HC-L196N変異体)-(6-N -GalNAc) trast-v5の17bへのコンジュゲーション
[0240]トラスツズマブ-(HC-L196N変異体)-(6-N-GalNAc)(6.8μL、151μg、PBS pH 7.4中の22.2mg/ml、trast-v5)の溶液に、PBS pH 7.4(0.7μL)及び17b(2.5μL、DMF中の8mM溶液、IgGと比べて20当量)を添加した。反応を室温で18時間インキュベートした。還元試料の質量スペクトル分析は、非コンジュゲート重鎖(観測質量50317Da、全重鎖生成物の約70%)、単一コンジュゲート重鎖(観測質量52544Da、全重鎖生成物の約25%)、及び二重コンジュゲート重鎖(観測質量54768Da、全重鎖生成物の約5%)に対応する3つの重鎖生成物を示した。
実施例27. 1aとのトラスツズマブ-(6-azidoGalNAc) trast-v1コンジュゲーション
[0241]トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)(167μL、5mg、PBS pH 7.4中の30mg/mL、trast-v1)の溶液に、1a(167μL、PG中の1.2mM溶液、IgGと比べて6当量)を添加した。反応を室温で18時間インキュベートした後、続いてSuperdex200 Increase 10/300 GL(GE Healthcare社)カラムを用いてAKTA Purifier-10(GE Healthcare社)で精製した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、コンジュゲートされたADC trast-v1-1aに対応する1つの主生成物(計算質量26496Da、観測質量26498Da)を示した。
実施例28. 2aとのトラスツズマブ-(6-アジドGalNAc) trast-v1コンジュゲーション
[0242]トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)(400μL、12mg、PBS pH 7.4中の30mg/mL、trast-v1)の溶液に、2a(400μL、PG中の1.6mM溶液、IgGと比べて8当量)を添加した。反応を室温で18時間インキュベートした後、続いてSuperdex200 Increase 10/300 GL(GE Healthcare社)カラムを用いてAKTA Purifier-10(GE Healthcare社)で精製した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、コンジュゲートされたADC trast-v1-2aに対応する1つの主生成物(計算質量26847Da、観測質量26847Da)を示した。
実施例29. 21bとのトラスツズマブ-(6-アジドGalNAc) trast-v1コンジュゲーション
[0243]トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)(167μL、5mg、PBS pH 7.4中の30mg/mL)の溶液に、21b(167μL、PG中の1.2mM溶液、IgGと比べて6当量)を添加した。反応を室温で18時間インキュベートした後、続いてSuperdex200 Increase 10/300 GL(GE Healthcare社)カラムを用いてAKTA Purifier-10(GE Healthcare社)で精製した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、コンジュゲートされたADC trast-v1-21bに対応する1つの主生成物(計算質量26565Da、観測質量26567Da)を示した。
実施例30. 1bとのトラスツズマブ-(6-アジドGalNAc) trast-v1コンジュゲーション
[0244]トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)(167μL、5mg、PBS pH 7.4中の30mg/mL、trast-v1)の溶液に、1b(167μL、PG中の1.2mM溶液、IgGと比べて6当量)を添加した。反応を室温で18時間インキュベートした後、続いてSuperdex200 Increase 10/300 GL(GE Healthcare社)カラムを用いてAKTA Purifier-10(GE Healthcare社)で精製した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、コンジュゲートされたADC trast-v1-1bに対応する1つの主生成物(計算質量26668Da、観測質量26671Da)を示した。
実施例31. 25aとのトラスツズマブ-(6-アジドGalNAc) trast-v1コンジュゲーション
[0245]トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)(300μL、5mg、PBS pH 7.4中の16.7mg/mL、trast-v1)の溶液に、50μLのデオキシコール酸ナトリウム(MQ中の110mM)及び25a(150μL、PG中の1.33mM溶液、IgGと比べて6当量)を添加した。反応を室温で18時間インキュベートした後、続いてSuperdex200 Increase 10/300 GL(GE Healthcare社)カラムを用いてAKTA Purifier-10(GE Healthcare社)で精製した。DTT還元試料のRP-HPLC分析(図13を参照のこと)は、コンジュゲーション後にHCのはっきりとしたシフト(RTHC-0=8.7分、RTHC-25a=10.5分)を示した。これは、3.66の平均薬物抗体比(DAR)に対応し、trast-v1-25aの形成を示唆する。
実施例32. 26aとのトラスツズマブ-(6-アジドGalNAc) trast-v1コンジュゲーション
[0246]トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)(20.9μL、0.5mg、PBS pH 7.4中の23.92mg/mL、trast-v1)の溶液に、PBS pH 7.4(9.1μL)、デオキシコール酸ナトリウム(5μL、110mM)及び化合物26a(15μL、PG中の1.3mM溶液、IgGと比べて6当量)を添加した。反応を室温で18時間インキュベートした後、続いて遠心濾過器(Amicon Ultra 0.5ml MWCO 10kDa、Merck Millipore社)を使用してPBS pH 7.4に緩衝液交換を行った。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、コンジュゲートされたADC trast-v1-26aに対応する1つの主生成物(計算質量25504Da、観測質量25505Da)を示した。
実施例33. 32aとのトラスツズマブ-(6-アジドGalNAc) trast-v1コンジュゲーション
[0247]トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)(12.54μL、0.3mg、PBS pH 7.4中の23.92mg/mL、trast-v1)の溶液に、PBS pH 7.4(5.46μL)、デオキシコール酸ナトリウム(3μL、110mM)及び化合物32a(9μL、PG中の0.8mM溶液、IgGと比べて7当量)を添加した。反応を室温で18時間インキュベートした後、続いて遠心濾過器(Amicon Ultra 0.5ml MWCO 10kDa、Merck Millipore社)を使用してPBS pH 7.4に緩衝液交換を行った。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、コンジュゲートされたADC trast-v1-32aに対応する1つの主生成物(計算質量26753Da、観測質量26752Da)を示した。
実施例34. 35aとのトラスツズマブ-(6-アジドGalNAc) trast-v1コンジュゲーション
[0248]トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)(12.54μL、0.3mg、PBS pH 7.4中の23.92mg/mL、trast-v1)の溶液に、デオキシコール酸ナトリウム(3μL、110mM)及び化合物35a(15μL、PG中の1.2mM溶液、IgGと比べて9当量)を添加した。反応を室温で18時間インキュベートした後、続いて遠心濾過器(Amicon Ultra 0.5ml MWCO 10kDa、Merck Millipore社)を使用してPBS pH 7.4に緩衝液交換を行った。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、コンジュゲートされたADC trast-v1-35aに対応する1つの主生成物(計算質量26328Da、観測質量26329Da)を示した。
実施例35. 31aとのトラスツズマブ-(6-アジドGalNAc) trast-v1コンジュゲーション
[0249]トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)(15mL、250mg、TBS pH 7.4中の16.67mg/mL、trast-v1)の溶液に、2.5mLのデオキシコール酸ナトリウム(MQ中の110mM)及び化合物31a(7.5mL、PG中の0.88mM溶液、IgGと比べて4当量)を添加した。反応を室温で18時間インキュベートした後、続いてSuperdex200 Increase 10/300 GL(GE Healthcare社)カラムを用いてAKTA Purifier-10(GE Healthcare社)で精製した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、コンジュゲートされたADC trast-v1-31aに対応する1つの主生成物(計算質量26675Da、観測質量26672Da)を示した。
実施例36. 39aとのリツキシマブ-(6-アジドGalNAc) rit-v1コンジュゲーション
[0250]リツキシマブのリツキシマブ-(6-N-GalNAc)への酵素リモデリングを、リツキシマブ(15mg/mL)と国際出願PCT/EP2017/052792号に記載されたEndoSH(1重量/重量%)、国際出願PCT/EP2016/059194号(5重量/重量%)に記載されたHis-TnGalNAcT、及び国際出願PCT/EP2016/059194号に従って調製されたUDP 6-N-GalNAc(IgGと比べて25当量)を、10mM MnClを含有するTBS中、30℃で16時間インキュベートすることによって行った。次に、官能化IgGを、HiTrap MabSelect Sure 5mLカラムを使用して精製した。反応混合物を負荷した後、カラムをTBS+0.2%Triton及びTBSで洗浄した。IgGを0.1M グリシン-HCl pH 2.7で溶離し、1M トリス-HCl pH 8.8で中和した。PBSに3回透析した後、Vivaspin Turbo 15限外濾過ユニット(Sartorius社)を使用して、IgGを15~20mg/mLに濃縮した。
[0251]コンジュゲーション:化合物39a(15μl;PG中の0.53mM溶液、IgGと比べて4当量)を、リツキシマブ-(6-アジドGalNAc)(15μl;PBS pH 7.4中の20mg/ml、rit-v1)の溶液に添加した。反応を室温で終夜インキュベートした後、続いて遠心濾過器(Amicon Ultra 0.5ml MWCO 10kDa、Merck Millipore社)を使用してPBS pH 7.4に緩衝液交換を行った。IdeS消化試料の質量分析は、コンジュゲートされたADC rit-v1-39aに対応する1つの主生成物(計算質量25619.6Da、観測質量25618.1Da)を示した。
実施例37. 39aとのトラスツズマブ-(6-アジドGalNAc) trast-v1コンジュゲーション
[0252]化合物39a(15μl;PG中の0.53mM溶液、IgGと比べて4当量)を、トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)(15μl;TBS pH 7.4中の20mg/ml、trast-v1)の溶液に添加した。反応を室温で終夜インキュベートした後、続いて遠心濾過器(Amicon Ultra 0.5ml MWCO 10kDa、Merck Millipore社)を使用してPBS pH 7.4に緩衝液交換を行った。IdeS消化試料の質量分析は、コンジュゲートされたADC rit-v1-39aに対応する1つの主生成物(計算質量25619.6Da、観測質量25618.1Da)を示した。
実施例38. 43aとのリツキシマブ-(6-アジドGalNAc) rit-v1コンジュゲーション
[0253]化合物43a(15μl;PG中の0.53mM溶液、IgGと比べて4当量)を、リツキシマブ-(6-アジドGalNAc)(15μl;PBS pH 7.4中の20mg/ml、rit-v1)の溶液に添加した。反応を室温で終夜インキュベートした後、続いて遠心濾過器(Amicon Ultra 0.5ml MWCO 10kDa、Merck Millipore社)を使用してPBS pH 7.4に緩衝液交換を行った。IdeS消化試料の質量分析は、コンジュゲートされたADC rit-v1-43aに対応する1つの主生成物(計算質量26532.5Da、観測質量26531.0Da)を示した。
実施例39. 43aとのトラスツズマブ-(6-アジドGalNAc) trast-v1コンジュゲーション
[0254]化合物43a(15μl;PG中の0.53mM溶液、IgGと比べて4当量)を、トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)(15μl;TBS pH 7.4中の20mg/ml、trast-v1)の溶液に添加した。反応を室温で終夜インキュベートした後、続いて遠心濾過器(Amicon Ultra 0.5ml MWCO 10kDa、Merck Millipore社)を使用してPBS pH 7.4に緩衝液交換を行った。IdeS消化試料の質量分析は、コンジュゲートされたADC trast-v1-43aに対応する1つの主生成物(計算質量26566.7Da、観測質量26564.5Da)を示した。
実施例40. 49aとのリツキシマブ-(6-アジドGalNAc) rit-v1コンジュゲーション
[0255]化合物49a(15μl;PG中の0.53mM溶液、IgGと比べて4当量)を、リツキシマブ-(6-アジドGalNAc)(15μl;PBS pH 7.4中の20mg/ml、rit-v1)の溶液に添加した。反応を室温で終夜インキュベートした後、続いて遠心濾過器(Amicon Ultra 0.5ml MWCO 10kDa、Merck Millipore社)を使用してPBS pH 7.4に緩衝液交換を行った。IdeS消化試料の質量分析は、コンジュゲートされたADC rit-v1-49aに対応する1つの主生成物(計算質量26750.7Da、観測質量26751.1Da)を示した。
実施例41. 49aとのトラスツズマブ-(6-アジドGalNAc) trast-v1コンジュゲーション
[0256]化合物49a(15μl;PG中の0.53mM溶液、IgGと比べて4当量)を、トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)(15μl;TBS pH 7.4中の20mg/ml、trast-v1)の溶液に添加した。反応を室温で終夜インキュベートした後、続いて遠心濾過器(Amicon Ultra 0.5ml MWCO 10kDa、Merck Millipore社)を使用してPBS pH 7.4に緩衝液交換を行った。IdeS消化試料の質量分析は、コンジュゲートされたADC trast-v1-49aに対応する1つの主生成物(計算質量26784.9Da、観測質量26783.8Da)を示した。
実施例42. 52aとのリツキシマブ-(6-アジドGalNAc) rit-v1コンジュゲーション
[0257]化合物52a(15μl;PG中の0.53mM溶液、IgGと比べて4当量)を、リツキシマブ-(6-アジドGalNAc)(15μl;PBS pH 7.4中の20mg/ml、rit-v1)の溶液に添加した。反応を室温で終夜インキュベートした後、続いて遠心濾過器(Amicon Ultra 0.5ml MWCO 10kDa、Merck Millipore社)を使用してPBS pH 7.4に緩衝液交換を行った。IdeS消化試料の質量分析は、コンジュゲートされたADC rit-v1-52aに対応する1つの主生成物(計算質量26381.4Da、観測質量26381.9Da)を示した。
実施例43. 52aとのトラスツズマブ-(6-アジドGalNAc) trast-v1コンジュゲーション
[0258]化合物52a(15μl;PG中の0.53mM溶液、IgGと比べて4当量)を、トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)(15μl;TBS pH 7.4中の20mg/ml、trast-v1)の溶液に添加した。反応を室温で終夜インキュベートした後、続いて遠心濾過器(Amicon Ultra 0.5ml MWCO 10kDa、Merck Millipore社)を使用してPBS pH 7.4に緩衝液交換を行った。IdeS消化試料の質量分析は、コンジュゲートされたADC trast-v1-52aに対応する1つの主生成物(計算質量26415.6、観測質量26414.2Da)を示した。
実施例44. 1aとのリツキシマブ-(6-アジドGalNAc) rit-v1コンジュゲーション
[0259]リツキシマブ-(6-アジドGalNAc)(12.24μL、0.3mg、PBS pH 7.4中の24.5mg/ml、rit-v1)の溶液に、デオキシコール酸ナトリウム(3μL、110mM)及び化合物1a(9μl、PG中の1.33mM溶液、IgGと比べて6当量)を添加した。反応を室温で18時間インキュベートした後、続いて遠心濾過器(Amicon Ultra 0.5ml MWCO 10kDa、Merck Millipore社)を使用してPBS pH 7.4に緩衝液交換を行った。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、コンジュゲートされたADC rit-v1-1aに対応する生成物(計算質量26463Da、観測質量26461Da)の形成を示した。
実施例45. 32aとのリツキシマブ-(6-アジドGalNAc) rit-v1コンジュゲーション
[0260]リツキシマブ-(6-アジドGalNAc)(12.24μL、0.3mg、PBS pH 7.4中の24.5mg/ml、rit-v1)の溶液に、デオキシコール酸ナトリウム(3μL、110mM)及び化合物32a(9μl、PG中の0.89mM溶液、IgGと比べて4当量)を添加した。反応を室温で18時間インキュベートした後、続いて遠心濾過器(Amicon Ultra 0.5ml MWCO 10kDa、Merck Millipore社)を使用してPBS pH 7.4に緩衝液交換を行った。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、コンジュゲートされたADC rit-v1-32aに対応する生成物(計算質量26721Da、観測質量26720Da)の形成を示した。
実施例46. 31aとのリツキシマブ-(6-アジドGalNAc) rit-v1コンジュゲーション
[0261]リツキシマブ-(6-アジドGalNAc)(12.24μL、0.3mg、PBS pH 7.4中の24.5mg/ml、rit-v1)の溶液に、デオキシコール酸ナトリウム(3μL、110mM)及び化合物31a(9μL、PG中の0.89mM溶液、IgGと比べて4当量)を添加した。反応を室温で18時間インキュベートした後、続いて遠心濾過器(Amicon Ultra 0.5ml MWCO 10kDa、Merck Millipore社)を使用してPBS pH 7.4に緩衝液交換を行った。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、コンジュゲートされたADC rit-v1-31aに対応する生成物(計算質量26642Da、観測質量26640Da)の形成を示した。
実施例47. トラスツズマブのトラスツズマブ-(GalNProSSMe) (trast-v2b)への酵素リモデリング
[0262]トラスツズマブ(5mg、22.7mg/ml)を、国際出願PCT/EP2017/052792号に記載されたEndoSH(1重量/重量%)と共に1時間インキュベートした後、続いてTnGalNAcT(CHOにおいて発現)(10重量/重量%)及びUDP-GalNProSSMe(IgGと比べて40当量)を添加し、10mM MnCl及びTBS中、30℃で16時間おいた。成分を添加した後、トラスツズマブの最終濃度は12.5mg/mlである。官能化IgGを、protAカラム(5mL、MabSelect Sure、Cytiva社)を使用して精製した。反応混合物を負荷した後、カラムをTBSで洗浄した。IgGを0.1M NaOAc pH 3.5で溶離し、2.5M トリス-HCl pH 7.2で中和した。PBSに3回透析した後、Vivaspin Turbo 4限外濾過ユニット(Sartorius社)を使用して、官能化トラスツズマブを17.4mg/mlに濃縮した。IdeS処理後の試料の質量スペクトル分析は、予想生成物(trast-v2b)に対応する1つの主Fc/2生成物(観測質量24430Da)を示した。
実施例48. トラスツズマブS239C変異体trast-v3とマレイミド-エクサテカンバリアント54a、57b、59a又は60aとのコンジュゲーション
[0263]トラスツズマブS239C変異体(EvitriaによりCHOにおいて一過性発現、重鎖変異S239C)(1mg、PBS+10mM EDTA中の10mg/ml、trast-v3)を、TCEP(6.5μL、MQ中の10mM)と共に37℃で2時間インキュベートした。遠心濾過器(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore社)を使用して、還元抗体をPBS+10mM EDTAとスピン濾過し、続いて100μLに希釈した。続いて、DHA(6.5μL、MQ中の10mM)を添加し、反応を室温で3時間インキュベートした。反応を4つの部分(それぞれ20μL、0.2mgの抗体)に分け、各部分にマレイミド-エクサテカンバリアント(54a、57b、59a又は60a)(2.3μL、DMF中の5mM)を添加した後、続いて室温で1時間インキュベートした。遠心濾過器(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore社)を使用して、コンジュゲートをPBSにスピン濾過し、続いてRP-UPLCにより分析した(図14を参照のこと)。
Figure 2023541637000083

実施例49. トラスツズマブGalProSH trast-v2とマレイミド-エクサテカンバリアント60aとのコンジュゲーション
[0264]トラスツズマブGalProSSMe(0.5mg、PBS+10mM EDTA中の10mg/ml、trast-v2b)を、TCEP(3.3μL、MQ中の10mM)と共に37℃で2時間インキュベートした。遠心濾過器(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore社)を使用して、還元抗体をPBS+10mM EDTAとスピン濾過した。続いて、デヒドロアスコルビン酸(DHA 3.3μL、MQ中の10mM)を添加し、反応を室温で3時間インキュベートした。反応の一部分(10μL、0.1mgの抗体)に、マレイミド-エクサテカン60a(1.3μL、DMF中の5mM)を添加した後、続いて室温で1時間インキュベートした。遠心濾過器(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore社)を使用して、コンジュゲートをPBSにスピン濾過し、続いてRP-UPLCで分析した。DTT処理コンジュゲートのRP-UPLC分析は、1.15のDARを有するコンジュゲートtrast-v2-60aへの変換を示した(図15を参照のこと)。
実施例50. トラスツズマブGalProSH trast-v2とマレイミド-エクサテカンバリアント57bとのコンジュゲーション
[0265]トラスツズマブGalProSSMe(0.5mg、PBS+10mM EDTA中の10mg/ml、trast-v2b)を、TCEP(3.3μL、MQ中の10mM)と共に37℃で2時間インキュベートした。遠心濾過器(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore社)を使用して、還元抗体をPBS+10mM EDTAとスピン濾過した。続いて、DHA(3.3μL、MQ中の10mM)を添加し、反応を室温で3時間インキュベートした。反応の一部分(10μL、0.1mgの抗体)に、マレイミド-エクサテカン57b(1.3μL、DMF中の5mM)を添加した後、続いて室温で1時間インキュベートした。遠心濾過器(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore社)を使用して、コンジュゲートをPBSにスピン濾過し、続いてRP-UPLCにより分析した。DTT処理コンジュゲートのRP-UPLC分析は、1.37のDARを有するコンジュゲートtrast-v2-57bへの変換を示した(図15を参照のこと)。
一般実験:TCEP還元ステップ後の鎖間マレイミドコンジュゲーション
[0266]一般実験A-3.5当量TCEPを用いたコンジュゲーション:mAb-v4(PBS+10mM EDTA中の10mg/ml)をTCEP(3.5当量、MQ中の10mM)と共に37℃で1時間インキュベートした。反応の一部分(20μL、0.2mgの抗体)に、マレイミド-エクサテカン(2.3μL、DMF中の5mM)を添加した後、続いて室温で1時間インキュベートした。遠心濾過器(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore社)を使用して、コンジュゲートをPBSにスピン濾過し、続いてRP-UPLCで分析した。DARは、以下の式に従って計算した。
[0267]一般実験B-7当量のTCEPを用いたコンジュゲーション:mAb-v4(PBS+10mM EDTA中の10mg/ml)をTCEP(7当量、MQ中の10mM)と共に37℃で1時間インキュベートした。反応の一部分(20μL、0.2mgの抗体)に、マレイミド-エクサテカン(DMF中10~35当量)を添加した後、続いて室温で1時間インキュベートした。遠心濾過器(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore社)を使用して、コンジュゲートをPBSにスピン濾過し、続いてRP-UPLCで分析した。DARは、以下の式に従って計算した。
[0268]平均DAR計算式:
Figure 2023541637000084

実施例51. トラスツズマブtrast-v4とマレイミド-エクサテカン60aとのコンジュゲーション
[0269]一般実験Aに従って、トラスツズマブをマレイミド-エクサテカン60aにコンジュゲートした。DTT処理コンジュゲートのRP-UPLC分析は、4.6のDARを有するコンジュゲートtrast-v4-60aへの変換を示した(図16を参照のこと)。
実施例52. トラスツズマブtrast-v4とマレイミド-エクサテカン57bとのコンジュゲーション
[0270]一般実験Aに従って、トラスツズマブをマレイミド-エクサテカン57bにコンジュゲートした。DTT処理コンジュゲートのRP-UPLC分析は、5.6のDARを有するコンジュゲートtrast-v4-57bへの変換を示した(図16を参照のこと)。
実施例53. リツキシマブrit-v4とマレイミド-エクサテカン60aとのコンジュゲーション
[0271]一般実験Aに従って、リツキシマブをマレイミド-エクサテカン60aにコンジュゲートした。DTT処理コンジュゲートのRP-UPLC分析は、2.5のDARを有するコンジュゲートrit-v4-60aへの変換を示した(図17を参照のこと)。
実施例54. リツキシマブrit-v4とマレイミド-エクサテカン57bとのコンジュゲーション
[0272]一般実験Aに従って、リツキシマブをマレイミド-エクサテカン57bにコンジュゲートした。DTT処理コンジュゲートのRP-UPLC分析は、3.4のDARを有するコンジュゲートrit-v4-57bへの変換を示した(図17を参照のこと)。
実施例55. トラスツズマブtrast-v4とマレイミド-エクサテカン59aとのコンジュゲーション
[0273]一般実験Aに従って、トラスツズマブをマレイミド-エクサテカン59aにコンジュゲートした。DTT処理コンジュゲートのRP-UPLC分析は、2.2のDARを有するコンジュゲートtrast-v4-59aへの変換を示した。
実施例56. リツキシマブrit-v4とマレイミド-エクサテカン59aとのコンジュゲーション
[0274]一般実験Aに従って、リツキシマブをマレイミド-エクサテカン59aにコンジュゲートした。DTT処理コンジュゲートのRP-UPLC分析は、3.6のDARを有するコンジュゲートrit-v4-59aへの変換を示した。
実施例57. トラスツズマブtrast-v4とマレイミド-エクサテカン60aとのコンジュゲーション
[0275]一般実験Bに従って、トラスツズマブをマレイミド-エクサテカン60aにコンジュゲートした。DTT処理コンジュゲートのRP-UPLC分析は、5.7のDARを有するコンジュゲートtrast-v4-60aへの変換を示した(図18を参照のこと)。
実施例58. トラスツズマブtrast-v4とマレイミド-エクサテカン57bとのコンジュゲーション
[0276]一般実験Bに従って、トラスツズマブをマレイミド-エクサテカン57bにコンジュゲートした。DTT処理コンジュゲートのRP-UPLC分析は、6.2のDARを有するコンジュゲートtrast-v4-57bへの変換を示した(図18を参照のこと)。
実施例59. リツキシマブrit-v4とマレイミド-エクサテカン60aとのコンジュゲーション
[0277]一般実験Bに従って、リツキシマブをマレイミド-エクサテカン60aにコンジュゲートした。DTT処理コンジュゲートのRP-UPLC分析は、5.8のDARを有するコンジュゲートrit-v4-60aへの変換を示した。
実施例60. トラスツズマブtrast-v4とマレイミド-エクサテカン59aとのコンジュゲーション
[0278]一般実験Bに従って、トラスツズマブをマレイミド-エクサテカン59aにコンジュゲートした。DTT処理コンジュゲートのRP-UPLC分析は、2.6のDARを有するコンジュゲートtrast-v4-59aへの変換を示した。
実施例61. リツキシマブrit-v4とマレイミド-エクサテカン59aとのコンジュゲーション
[0279]一般実験Bに従って、リツキシマブをマレイミド-エクサテカン59aにコンジュゲートした。DTT処理コンジュゲートのRP-UPLC分析は、4.4のDARを有するコンジュゲートrit-v4-59aへの変換を示した。
実施例62. 凝集研究
[0280]ADC(PBS pH 7.4中の1mg/mL)を37℃でインキュベートした。Agilent 1100シリーズHPLC(Hewlett Packard社)を使用して、凝集レベルを0、1、4、7、14及び21日後に測定した。試料(3μL、1mg/mL)を0.86mL/分で、Xbridge BEH200Åカラム(3.5μM、7.8×300mm、Waters社)に注入した。0.1Mリン酸ナトリウム緩衝液pH 6.9(NaHPO/NaHPO)を使用する定組成溶離を16分間行った。凝集レベルに表1に示す。

実施例63:分析HIC
HIC分析をAgilent 1100シリーズHPLC(Hewlett Packard社)で行った。試料(3μL、PBS中の1mg/ml)を、0.8mL/分でTSKgel(登録商標)ブチル-NPR HPLCカラム(3.5cm×4.6mm、2.5μm、Tosoh Bioscience社)に注入した。13分で2M硫酸アンモニウム/50mMリン酸カリウムpH 6.0から20%イソプロパノール/50mMリン酸カリウム pH 6.0への直線グラジエントを適用した。HIC分析の結果を図12に示す。
実施例64:BT-474有効性研究
[0281]実験段階の初めに8週齢~12週齢のCR雌性CB.17 SCIDマウス(Charles River Laboratories社、USAから得られた)に、50% Matrigel中1×10個のBT-474腫瘍細胞を側腹部皮下に注射した(BT-474細胞異種移植モデル)。腫瘍容積が100~150mmの範囲であるとき、マウス7匹/群に、1日目に単一用量を静脈内注射した。試験品目及び用量レベルを以下に示す。腫瘍を1週間に2回、43日間測定した。腫瘍容積(平均)の結果を図19~22に示す。
Figure 2023541637000086

Claims (18)

  1. 構造(1)を有する抗体-薬物コンジュゲート
    Figure 2023541637000087

    [構造中、
    ABは抗体であり、
    及びLはリンカーであり、
    wは、0又は1であり、
    Zは、無金属クリック反応又はチオールライゲーションによって得られた接続基であり
    17はそれぞれ個別にアミノ酸側鎖であり、
    nは、1~5の範囲の整数であり、
    Aは、5員又は6員の芳香族又はヘテロ芳香族環であり、
    xは、1~8の範囲の整数であり、
    21は、H、R22、C(O)OH及びC(O)R22から選択され、R22は、C~C24(ヘテロ)アルキル基、C~C10(ヘテロ)シクロアルキル基、C~C10(ヘテロ)アリール基、C~C10アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C10(ヘテロ)アリールアルキル基であり、それらは、任意選択で置換されており、O、S及びNR23から選択される1個又は複数のヘテロ原子で任意選択で中断されており、R23は、水素及びC~Cアルキル基からなる群から独立的に選択される]。
  2. が、構造(2)を有し
    Figure 2023541637000088

    [構造中、
    *で標識された波形の結合は、Zに接続されており、**で標識された波形の結合は、NHに接続されており、
    Sp及びSpはそれぞれ個別にスペーサー部分であり、
    n、A、R17及びR21は、請求項1に記載の通りである]、
    好ましくはL、好ましくは出現する各Spが同じであり、出現する各(NH-CR17-CO)が同じであり、出現する各Aが同じであり、出現する各R21が同じである、請求項1に記載の抗体薬物コンジュゲート。
  3. 、好ましくはSpが、構造(3)で表されるスルファミド基を含み、
    Figure 2023541637000089

    [構造中、
    a=0又は1であり、
    13は、水素、C~C24アルキル基、C~C24シクロアルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から選択され、前記C~C24アルキル基、C~C24シクロアルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意選択で置換されており、O、S及びNR14[ここで、R14は、水素及びC~Cアルキル基からなる群から独立的に選択される]から選択される1個若しくは複数のヘテロ原子で任意選択で中断されているか、又はR13は、スペーサー部分を介してNに接続されているC(O)Xの第2の出現である]、
    好ましくはL、好ましくはSpが、式(3)の基を2個含む、請求項1に記載の抗体薬物コンジュゲート。
  4. 出現する各ペプチド(NH-CR17-CO)が、Val-Cit、Val-Ala、Val-Lys、Val-Arg、AcLys-Val-Cit、AcLys-Val-Ala、Glu-Val-Ala、Asp-Val-Ala、Phe-Cit、Phe-Ala、Phe-Lys、Phe-Arg、Ala-Lys、Leu-Cit、Ile-Cit、Trp-Cit、Ala-Ala-Asn、Ala-Asn及びLysから、好ましくはVal-Cit、Val-Ala、Glu-Val-Ala、Val-Lys、Phe-Cit、Phe-Ala、Phe-Lys、Ala-Ala-Asnから、最も好ましくはVal-Cit又はVal-Alaから選択される、請求項1~3のいずれか一項に記載の抗体薬物コンジュゲート。
  5. Zが、(Z1)~(Z8)及び(Z11)~(Z23)から選択される構造を有する
    Figure 2023541637000090

    [構造中、
    *で標識された波形の結合は、Lを任意選択で介してABに接続されており、他の波形の結合は、Lに接続されており、
    (Z3)、(Z7)及び(Z8)における官能基Rは、水素、C~C24アルキル基、C~C24アシル基、C~C24シクロアルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基、C~C24(ヘテロ)アリールアルキル基及びC~C24スルホニル基から選択され、これらのそれぞれが、任意選択で置換されていてもよく、O、S及びNR32[ここで、R32は、水素及びC~Cアルキル基からなる群から独立的に選択される]から選択される1個又は複数のヘテロ原子で任意選択で中断されていてもよく、
    24は、H又はC1~12アルキル、好ましくはH又はC1~6アルキルであり、
    29は、C1~12アルキル、好ましくはC1-4アルキル、最も好ましくはエチルである]
    請求項1~4のいずれか一項に記載の抗体薬物コンジュゲート。
  6. 構造(1f)又は(1b)を有し
    Figure 2023541637000091

    [構造中、
    AB、L、Z、A、R21、n、R17及びxは、請求項1に記載の通りであり、
    a及びR13は、請求項3に記載の通りであり、
    はリンカーであり、
    rは、0又は1であり、
    mは、1~10の範囲の整数であり、
    qは、0~10の範囲の整数であり、
    pは、0又は1である]、

    [構造中、
    Z、L、R17、A、R21、n及びxは、請求項1に記載の通りであり、
    eは、0~20の範囲の整数であり、
    Suは単糖であり、
    Gは単糖部分であり、
    GlcNAcは、N-アセチルグルコサミン部分であり、
    Fucは、フコース部分であり、
    dは、0又は1である]、
    好ましくは構造(1h)を有する

    [構造中、
    e、Su、G、GlcNAc、Fuc及びdは以上に記載の通りであり、
    nは、0又は1である]、
    請求項1~5のいずれか一項に記載の抗体薬物コンジュゲート。
  7. 請求項1~6のいずれか一項に記載の抗体薬物コンジュゲートの合成方法であって、
    (i) 構造AB-((L-F)の修飾抗体[構造中、
    ABは抗体であり、
    はリンカーであり、
    wは、0又は1であり、
    Fは、無金属クリック反応においてQと反応することができるクリックプローブ、又はチオール若しくはその前駆体であり、
    xは、1~8の範囲の整数である]を
    (ii) 構造(5)で表されるリンカー-薬物構築物
    Figure 2023541637000094

    [構造中、
    はリンカーであり、
    Qは、無金属クリック反応を行うことができるクリックプローブ又はチオール反応性プローブであり、
    17はそれぞれ個別にアミノ酸側鎖であり、
    nは、1~5の範囲の整数であり、
    Aは、5員又は6員の芳香族又はヘテロ芳香族環であり、
    xは、1~8の範囲の整数であり、
    21は、H、R22、C(O)OH及びC(O)R22から選択され、R22は、C~C24(ヘテロ)アルキル基、C~C10(ヘテロ)シクロアルキル基、C~C10(ヘテロ)アリール基、C~C10アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C10(ヘテロ)アリールアルキル基であり、それらは、任意選択で置換されており、O、S及びNR23から選択される1個又は複数のヘテロ原子で任意選択で中断されており、R23は、水素及びC~Cアルキル基からなる群から独立的に選択される]と反応させて、
    QとFの間の無金属クリック反応又はQとFの間のチオールライゲーションによって形成された接続基Zを介して薬物が前記抗体に共有結合している抗体薬物コンジュゲートを形成するステップを含む方法。
  8. クリックプローブQが、環式アルキン部分又は環式アルケン部分を含み、好ましくは
    (a)前記クリックプローブQが、(Q22)~(Q36)からなる群から選択されるか

    [構造中、Bは、薬学的に許容されるアニオンである]、
    又は(ヘテロ)シクロアルキニル部分Qが、構造(Q37)で表されるか
    Figure 2023541637000096

    [構造中、
    15は、水素、ハロゲン、-OR16、-NO、-CN、-S(O)16、-S(O) (-)、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、前記アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意選択で置換されており、2個の置換基R15は連結されて、任意選択で置換されている縮合環化シクロアルキル又は任意選択で置換されている縮合環化(ヘテロ)アレーン置換基を形成することがあり、R16は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、
    は、C(R31、O、S又はNR31であり、R31はそれぞれ個別に、R15又はスペーサー部分を介して接続されているエクサテカンペイロードの第2の出現であり、
    uは、0、1、2、3、4又は5であり、
    u’は、0、1、2、3、4又は5であり、u+u’=4、5、6、7又は8であり、
    v=8~16の範囲の整数である]、
    好ましくは、シクロオクチニル部分Qが、構造(Q38)で表されるか
    Figure 2023541637000097

    [構造中、
    15は、水素、ハロゲン、-OR16、-NO、-CN、-S(O)16、-S(O) (-)、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、前記アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意選択で置換されており、2個の置換基R15は連結されて、任意選択で置換されている縮合環化シクロアルキル又は任意選択で置換されている縮合環化(ヘテロ)アレーン置換基を形成することがあり、R16は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、
    18は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、
    19は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から選択され、前記アルキル基は、O、N及びSからなる群から選択される1個若しくは複数(one of more)のヘテロ原子で任意選択で中断されており、前記アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は、独立的に任意選択で置換されており、又はR19は、スペーサー部分を介して接続されている前記エクサテカンペイロードの第2の出現であり、
    lは、0~10の範囲の整数である]、
    又は(ヘテロ)シクロオクチニル部分Qが、構造(Q39)で表されるか
    Figure 2023541637000098

    [構造中、
    15は、水素、ハロゲン、-OR16、-NO、-CN、-S(O)16、-S(O) (-)、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、前記アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意選択で置換されており、2個の置換基R15は連結されて、任意選択で置換されている縮合環化シクロアルキル又は任意選択で置換されている縮合環化(ヘテロ)アレーン置換基を形成することがあり、R16は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、
    Yは、N又はCR15である]、
    又はヘテロシクロヘプチニル部分Qが、構造(Q36a)で表されるか、
    Figure 2023541637000099

    或いは(b)前記クリックプローブQが、任意選択で置換されている(ヘテロ)シクロプロペニル基、(ヘテロ)シクロブテニル基、トランス-(ヘテロ)シクロヘプテニル基、トランス-(ヘテロ)シクロオクテニル基、トランス-(ヘテロ)シクロノネニル基又はトランス-(ヘテロ)シクロデシニル基からなる群から選択され、好ましくはクリックプローブQが、(Q40)~(Q50)からなる群から選択され、
    Figure 2023541637000100

    (Q44)及び(Q45)においてSiのR基(複数可)が、アルキル又はアリールである、請求項7に記載の方法。
  9. チオール反応性プローブQが、(Q51)~(Q65)からなる群から選択される
    Figure 2023541637000101

    [構造中、
    は、H、ハロゲン、PhS、MeSであり、
    は、ハロゲン、PhS、MeSであり、
    24は、H又はC1~12アルキル、好ましくはH又はC1~6アルキルであり、
    25は、H、C1~12アルキル、C1~12アリール、C1~12アルカリール又はC1~12アラルキル、好ましくはH又はパラ-メチルフェニルであり、
    (Q55)及び(Q57)の芳香族環は、任意選択でフェニル又はピリジン環などヘテロ芳香族環とすることができる]、請求項7に記載の方法。
  10. クリックプローブFが、アジド、テトラジン、トリアジン、ニトロン、ニトリルオキシド、ニトリルイミン、ジアゾ化合物、オルト-キノン、ジオキソチオフェン及びシドノンからなる群から選択され、好ましくはクリックプローブFが、アジド部分であり、並びに/又はクリック反応が、1,3双極付加環化若しくは(4+2)環化付加であるか、或いは
    Fがチオールであり、並びに/又はチオールライゲーションが、マイケル付加若しくは求核置換である、
    請求項7~9のいずれか一項に記載の方法。
  11. AB-((L-F)が、構造(6)で表される
    Figure 2023541637000102

    [構造中、
    eは、0~10の範囲の整数であり、
    Suは単糖であり、
    Gは単糖部分であり、
    GlcNAcは、N-アセチルグルコサミン部分であり、
    Fucは、フコース部分であり、
    dは、0又は1である]、
    請求項7~10のいずれか一項に記載の方法。
  12. 構造(5)で表されるリンカー-薬物構築物
    Figure 2023541637000103

    [構造中、
    はリンカーであり、
    Qは、無金属クリック反応を行うことができるクリックプローブ又はチオール反応性プローブであり、
    17はそれぞれ個別にアミノ酸側鎖であり、
    nは、1~5の範囲の整数であり、
    Aは、5員又は6員の芳香族又はヘテロ芳香族環であり、
    xは、1~8の範囲の整数であり、
    21は、H、R22、C(O)OH及びC(O)R22から選択され、R22は、C~C24(ヘテロ)アルキル基、C~C10(ヘテロ)シクロアルキル基、C~C10(ヘテロ)アリール基、C~C10アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C10(ヘテロ)アリールアルキル基であり、それらは、任意選択で置換されており、O、S及びNR23から選択される1個又は複数のヘテロ原子で任意選択で中断されており、R23は、水素及びC~Cアルキル基からなる群から独立的に選択される]。
  13. クリックプローブQが、環式アルキン部分又は環式アルケン部分を含み、好ましくは
    (a)前記クリックプローブQが、(Q22)~(Q36)からなる群から選択されるか

    [構造中、Bは、薬学的に許容されるアニオンである]、
    又は(ヘテロ)シクロアルキニル部分Qが、構造(Q37)で表されるか
    Figure 2023541637000105

    [構造中、
    15は、水素、ハロゲン、-OR16、-NO、-CN、-S(O)16、-S(O) (-)、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、前記アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意選択で置換されており、2個の置換基R15は連結されて、任意選択で置換されている縮合環化シクロアルキル又は任意選択で置換されている縮合環化(ヘテロ)アレーン置換基を形成することがあり、R16は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、
    は、C(R31、O、S又はNR31であり、R31はそれぞれ個別に、R15又はスペーサー部分を介して接続されているエクサテカンペイロードの第2の出現であり、
    uは、0、1、2、3、4又は5であり、
    u’は、0、1、2、3、4又は5であり、u+u’=4、5、6、7又は8であり、
    v=8~16の範囲の整数である]、
    好ましくはシクロオクチニル部分Qが、構造(Q38)で表されるか
    Figure 2023541637000106

    [構造中、
    15は、水素、ハロゲン、-OR16、-NO、-CN、-S(O)16、-S(O) (-)、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、前記アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意選択で置換されており、2個の置換基R15は連結されて、任意選択で置換されている縮合環化シクロアルキル又は任意選択で置換されている縮合環化(ヘテロ)アレーン置換基を形成することがあり、R16は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、
    18は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、
    19は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から選択され、前記アルキル基は、O、N及びSからなる群から選択される1個若しくは複数(one of more)のヘテロ原子で任意選択で中断されており、前記アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は、独立的に任意選択で置換されており、又はR19は、スペーサー部分を介して接続されているエクサテカンペイロードの第2の出現であり、
    lは、0~10の範囲の整数である]、
    又は(ヘテロ)シクロオクチニル部分Qが、構造(Q39)で表されるか
    Figure 2023541637000107

    [構造中、
    15は、水素、ハロゲン、-OR16、-NO、-CN、-S(O)16、-S(O) (-)、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、前記アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意選択で置換されており、2個の置換基R15は連結されて、任意選択で置換されている縮合環化シクロアルキル又は任意選択で置換されている縮合環化(ヘテロ)アレーン置換基を形成することがあり、R16は、水素、ハロゲン、C~C24アルキル基、C~C24(ヘテロ)アリール基、C~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、
    Yは、N又はCR15である]、
    又はヘテロシクロヘプチニル部分Qが、構造(Q36a)で表されるか、
    Figure 2023541637000108

    或いは(b)前記クリックプローブQが、任意選択で置換されている(ヘテロ)シクロプロペニル基、(ヘテロ)シクロブテニル基、トランス-(ヘテロ)シクロヘプテニル基、トランス-(ヘテロ)シクロオクテニル基、トランス-(ヘテロ)シクロノネニル基又はトランス-(ヘテロ)シクロデシニル基からなる群から選択され、好ましくはクリックプローブQが、(Q40)~(Q50)からなる群から選択され、
    Figure 2023541637000109

    (Q44)及び(Q45)においてSiのR基(複数可)が、アルキル又はアリールである、請求項12に記載のリンカー-薬物構築物。
  14. チオール反応性プローブQが、(Q51)~(Q65)からなる群から選択される
    Figure 2023541637000110

    [構造中、
    は、H、ハロゲン、PhS、MeSであり、
    は、ハロゲン、PhS、MeSであり、
    24は、H又はC1~12アルキル、好ましくはH又はC1~6アルキルであり、
    25は、H、C1~12アルキル、C1~12アリール、C1~12アルカリール又はC1~12アラルキル、好ましくはH又はパラ-メチルフェニルであり、
    (Q55)及び(Q57)の芳香族環は、任意選択でフェニル又はピリジン環などヘテロ芳香族環とすることができる]、
    請求項12に記載のリンカー-薬物構築物。
  15. 構造(5d)を有する

    [構造中、n=0又は1である]、
    請求項12に記載のリンカー-薬物構築物。
  16. 請求項1~6のいずれか一項に記載の抗体薬物コンジュゲートと薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物。
  17. 治療を必要とする対象の治療における使用のための、請求項1~6のいずれか一項に記載の抗体薬物コンジュゲート。
  18. がん、好ましくはHER2陽性がんの処置における使用のための、請求項1~6のいずれか一項に記載の抗体薬物コンジュゲート。
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