JP2022126826A - ヘテロアリールスルホンをベースとするコンジュゲーションハンドル、これらの調製のための方法、および抗体薬物コンジュゲートの合成におけるこれらの使用 - Google Patents
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Abstract
Description
Hetは、1~4個のヘテロ原子を有する単環式、二環式または多環式のヘテロアリール環系であり、-SO2-に結合している前記環系上の炭素原子は、前記環系上の少なくとも1個のヘテロ原子に隣接しており、前記ヘテロ原子は、N、OおよびSからなる群から選択され、
各Eは、-C(R1)2-、-O-C(R1)2-C(R1)2-(式中、rは、少なくとも2である)、および-C(R1)2-C(R1)2-O-(式中、sは、少なくとも1である)からなる群から独立に選択され、
各R1は、H、C1~C6直鎖状もしくは分岐状アルキル、C2~C6直鎖状もしくは分岐状アルケニル、およびC2~C6直鎖状もしくは分岐状アルキニルからなる群から独立に選択され、
R2は、ハロゲンもしくはハロアルキルで置換されていてもよいC1~C10アルキル、またはハロゲンもしくはハロアルキルで置換されていてもよいC5~C12アリールであり、
各Xは、独立に、アミノ酸であり、各アミノ酸Xは、同じであるか、または異なり、
各Yは、独立に、アミノ酸であり、各アミノ酸Yは、同じであるか、または異なり、
各Zは、独立に、スペーサー要素であり、各スペーサー要素は、同じであるか、または異なり、
mは、0~5であり、nは、0~5であり、pは、0~2であり、qは、0~10であり、rは、0~2であり、sは、0~2であり、tは、0~1であり、wは、1~2であり、
Dは、細胞毒性剤である。
Pは、少なくとも1個の天然もしくは操作されたシステイン残基を含むペプチド配列であるか、またはPは、少なくとも1個の遊離の硫黄原子を含む部分であり、
Sは、P内の硫黄原子であり、
Hetは、1~4個のヘテロ原子を有する単環式、二環式または多環式のヘテロアリール環系であり、-S(O2)-に結合している前記環系上の炭素原子は、前記環系上の少なくとも1個のヘテロ原子に隣接しており、前記ヘテロ原子は、N、OおよびSからなる群から選択され、
各Eは、-C(R1)2-、-O-C(R1)2-C(R1)2-(式中、rは、少なくとも2である)、および-C(R1)2-C(R1)2-O-(式中、sは、少なくとも1である)からなる群から独立に選択され、
各R1は、H、C1~C6直鎖状もしくは分岐状アルキル、C2~C6直鎖状もしくは分岐状アルケニル、およびC2~C6直鎖状もしくは分岐状アルキニルからなる群から独立に選択され、
各Xは、独立に、アミノ酸であり、各アミノ酸Xは、同じであるか、または異なり、
各Yは、独立に、アミノ酸であり、各アミノ酸Yは、同じであるか、または異なり、
各Zは、独立に、スペーサー要素であり、各スペーサー要素は、同じであるか、または異なり、
mは、0~5であり、nは、0~5であり、pは、0~2であり、qは、0~10であり、rは、0~2であり、sは、0~2であり、tは、0~1であり、wは、1~2であり、
Dは、細胞毒性剤である。
Dは、置換もしくは非置換アルキル、置換もしくは非置換アリール、-(OCH2CH2)p-、-CO2H、-NH2、OH、-N3、
Zは、ZA-(ZB)1~3または(ZB)1~3-ZAであり、
ZAは、ZA1-ZA2またはZA2-ZA1であり、
ZA1は、存在しないか、または-C(O)-、-C(S)-、-C(O)NR-、-C(O)C1~C6アルキル-、-C(O)NRC1~C6アルキル-、-C1~C6アルキル(OCH2CH2)1~6-、-C(O)C1~C6アルキルNRC(O)-、-C(O)C1~C6アルキル(OCH2CH2)1~6-、-C1~C6アルキル(OCH2CH2)1~6-C(O)-、-C1~C6アルキル-S-S-C1~C6アルキルNRC(O)CH2-、-C1~C6アルキル(OCH2CH2)1~6NRC(O)CH2-、-C(O)C1~C6アルキル-NRC(O)C1~6アルキル-、-N=CR-フェニル-O-C1~C6アルキル-、-N=CR-フェニル-O-C1~C6アルキル-C(O)-、-C(O)-C1~C6アルキル(OCH2CH2)1~6NRC(O)-、-C(O)C1~C6アルキル-フェニル(NR-C(O)C1~C6アルキル)1~4-、-C(O)C1~C6アルキル(OCH2CH2)1~6-NRC(O)C1~C6アルキル-、-C1~C6アルキル-、-S-、-C(O)-CH(NR-C(O)C1~C6アルキル)-C1~C6アルキル-および(-CH2-CH2-O-)1~20からなる群から選択される1つもしくは複数の構成要素であり、
ZA2は、-PABA-、-PABC-、-C(O)(CH2)nC(O)-であるか、または存在せず、
ZBは、存在しないか、または-C1~C6アルキレン-、-NRC3~C8-ヘテロシクリルNR-、-NRC3~C8-カルボシクリルNR-、-NRC1~C6アルキルNR-、-NRC1~C6アルキレン-、-S-、-NR-、-NRNR-、-O(CR2)1~4S-S(CR2)1~4N(R)-、-NRC1~C6-アルキレンフェニレンNR-、-NRC1~C6アルキレンフェニレンSO2NR-、-OC1~C6アルキルS-SC1~C6アルキルC(COOR)NR-、-NRC(COOR)C1~C6アルキルS-SC1~C6アルキルO-からなる群から独立に選択される。
Zは、
特に断りのない限り、下記の用語および語句は、本明細書において使用する場合、下記の意味を有することが意図される。本明細書において商品名が使用されるとき、商品名は、文脈によって他の指示がない限り、生成物製剤、ジェネリック薬物、および商品名の製品の活性医薬成分(複数可)を含む。
上で述べたように、「抗体」(または「Ab」もしくは「AB」)という用語は、本明細書において最も広い意味で使用され、具体的には、無傷のモノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、単一特異性抗体、多特異性抗体(例えば、二重特異性抗体)、および所望の生物活性を示す抗体フラグメントを包含する。さらに、本明細書に記載されている本発明の特定の態様は、抗体薬物コンジュゲートを指す一方で、コンジュゲートの抗体部分は、所与の標的細胞集団と関連する受容体、抗原または他の受容性部分と特異的に結合または反応的に会合もしくは複合体化するものと置き換え得ることがさらに想定される。例えば、抗体を含有する代わりに、本発明のコンジュゲートは、治療的にまたはその他の点で生物学的に修飾されることを求められる細胞集団の受容体、抗原または他の受容性部分に結合、複合体化、または反応するターゲティング分子を含有することができる。このような分子の例は、より小さな分子量のタンパク質、ポリペプチドまたはペプチド、レクチン、糖タンパク質、非ペプチド、ビタミン、栄養素輸送分子(これらに限定されないが、トランスフェリンなど)、または任意の他の細胞結合分子もしくは物質を含む。特定の態様において、抗体または他のこのようなターゲティング分子は、それと共に抗体または他のターゲティング分子が相互作用する特定の標的細胞集団に対して薬物を送達するように作用する。
リンカーは、薬物および抗体を連結して、抗体薬物コンジュゲート(ADC)を形成するために使用することができる二官能性化合物である。このようなコンジュゲートは、例えば、腫瘍に関連する抗原に対するイムノコンジュゲートの形成において有用である。このようなコンジュゲートは、腫瘍細胞への細胞毒性薬の選択的送達を可能とする。ADCにおいて、リンカーは、ペイロードを抗体に付着させる役割を果たす。
本発明の化合物およびコンジュゲートは、例示において下記で概要を述べた合成手順を使用して作製することができるものを含む。下でより詳細に記載するように、本発明の化合物およびコンジュゲートは、反応部位を有するリンカー単位のセクションを使用して調製することができる。一態様では、システイン残基のチオール基(またはセレノシステイン残基のセレノール基)に対して選択的に反応性である第2の反応部位を有する、リンカー単位の第2のセクションが導入される。下でより詳細に記載するように、コンジュゲートは、薬物、プローブ、または造影剤への結合のための反応部位を有するリンカーのセクションを使用し、抗体に対する反応部位を有するリンカー単位の別のセクションを導入して調製することができる。一態様では、リンカー単位は、抗体単位、例えば、抗体上に存在するチオール求核基と選択的に反応性である求電子基を有する反応部位を有する。求電子基は、抗体付着のための好都合な部位を提供する。抗体の求核基のヘテロ原子は、リンカー単位上の求電子基に対して反応性であり、リンカー単位への共有結合を形成する。
他の実施形態において、本発明の別の態様は、有効量の本発明の化合物および/またはその抗体薬物コンジュゲート、ならびに薬学的に許容できる担体またはビヒクルを含む医薬組成物に関する。特定の実施形態において、組成物は、動物またはヒトへの投与に適している。
本発明の別の態様は、がんを処置するための、本発明の化合物およびその抗体薬物コンジュゲートを使用する方法に関する。
実験を一般に、酸素感受性もしくは水分感受性試薬または中間体を用いた場合は特に、不活性雰囲気(窒素またはアルゴン)下で行った。適切な場合、無水溶媒を含めて市販の溶媒および試薬は一般に、それ以上精製することなく使用した(一般に、Aldrich Chemical Company、Milwaukee、WisconsinからのSure-Seal(商標)製品)。生成物は、さらなる反応を受けるか、または動物実験を受ける前に、全体的に真空下で乾燥させた。質量分析データは、液体クロマトグラフィー質量分析(LCMS)、大気圧化学イオン化(APCI)またはガスクロマトグラフィー質量分析(GCMS)の計測手段から報告する。核磁気共鳴(NMR)データについての化学シフトは、用いた重水素化溶媒からの残留ピークを参照した百万分率(ppm、δ)で表す。
プロトコルA:カラム:Waters Acquity UPLC BEH、2.1mm×50mm、C18、1.7μm;移動相A:水中の0.1%ギ酸(v/v);移動相B:アセトニトリル中の0.1%ギ酸(v/v);勾配:0.1分に亘り5%B、0.7分に亘り5%~95%B、0.1分に亘り95%B;流量:1.25mL/分、温度:60℃;検出:200~450nm;MS(+)範囲100~1200ダルトン;注入量:5μL;機器:Waters Acquity。
方法A:カラム:Phenomenex Luna C18、100×30mm、10μm;移動相A:水中の0.02%トリフルオロ酢酸(v/v);移動相B:メタノール中の0.02%トリフルオロ酢酸(v/v);勾配:20分に亘り10%~90%B;流量:20mL/分、温度:制御せず、検出:DAD210nm、254nm;注入量:不定;機器:Gilson。
一般手順A:ジエチルアミンを使用したFmoc除去
Fmoc含有化合物のジクロロメタン中溶液に、ジエチルアミンを加え、1:1~1:10のジエチルアミン:ジクロロメタンの比を得た。反応進行をLCMS(またはHPLCもしくはTLC)によってモニターした。反応は通常、3時間以内に完了した。溶媒を真空中で除去するか、または場合によって、窒素流下で濃縮し、残渣を逆相クロマトグラフィーによって精製した。
撹拌したアミン(1.0当量)および酸(1.0~2.0当量)のN,N-ジメチルホルムアミド(DMF)またはN,N-ジメチルアセトアミド(DMA)中溶液に、HATU(1.0~2.0当量)、それに続いてN,N-ジイソプロピルエチルアミン(2.0~4.0当量)を加えた。反応進行を、LCMS(またはHPLCもしくはTLC)によってモニターした。反応は通常、3時間以内に完了した。溶媒を真空中で除去した。残渣をシリカゲルまたは逆相クロマトグラフィーによって精製した。
注意:全てのLCMSデータは、特に断りのない限り、プロトコルA(1.5分の方法)に基づく。
2-(メチルスルホニル)ベンゾ[d]チアゾール-6-カルボン酸(#2)の調製
(m, 1H), 3.62 (s, 3H).
6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサン酸(1g、3mmol)のN,N-ジメチルホルムアミド(5mL、0.15M)中溶液に、HATU(1.108g、2.8mmol)、それに続いてN,N-ジイソプロピルエチルアミン(1mL、5mmol)を加えた。この反応混合物を、2-メチル-2-(メチルアミノ)プロパン酸(332mg、2.83mmol)およびN,N-ジイソプロピルエチルアミン(1mL、5mmol)のN,N-ジメチルホルムアミド(5mL)中溶液に滴下添加した。このように得られた茶色溶液を室温にて撹拌した。90分後、LCMS分析は、反応が完了したことを示した。反応混合物をジクロロメタンで希釈し、塩酸の1N水溶液(×3)で洗浄し、有機層を無水硫酸ナトリウムで脱水し、濃縮乾固し、このように得られた残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(0.1%酢酸を有するヘプタン中の50%~100%酢酸エチル)によって精製した。プールした生成物含有画分を蒸発させ、表題化合物#3(415mg、30%)をピンク色がかったゴム状物として得た。LCMS: m/z 453.20 [M+H]+, 保持時間 =
0.89分; 1H NMR (500 MHz, クロロホルム-d) δ ppm 7.76 (d, J=7.6 Hz, 2 H) 7.60 (d,
J=7.3 Hz, 2 H) 7.39 (t, J=7.5 Hz, 2 H) 7.28 - 7.34 (m, 2 H) 4.33 - 4.45 (m, 2
H) 4.17 - 4.28 (m, 1 H) 3.12 - 3.22 (m, 2 H) 2.97 (s, 3 H) 2.30 - 2.39 (m, 2 H)
1.58 - 1.68 (m, 2 H) 1.47 - 1.56 (m, 2 H) 1.43 (s, 6 H) 1.31 - 1.39 (m, 2 H).
氷で冷やした水浴中の#3(194mg、0.429mmol)のテトラヒドロフラン(2mL)中溶液に、N-メチルモルホリン(140μL)を加え、それに続いてイソプロプレニルクロロホルメート(47.8μL、1.3mmol)を滴下添加した。1時間後、この反応混合物を、N-{(2R,3R)-3-メトキシ-3-[(2S)-1-{(3R,4S,5S)-3-メトキシ-5-メチル-4-[メチル(L-バリル)アミノ]ヘプタノイル}ピロリジン-2-イル]-2-メチルプロパノイル}-L-フェニルアラニン(US2013/0129753A1における実施例#114)(211mg、0.311mmol)のイソプロパノール(1mL)およびテトラヒドロフラン(1mL)中溶液に滴下添加した。2時間後、LCMS分析は、反応が完了したことを示した。反応混合物を減圧下で濃縮し、次いで、残渣を、精製方法Aの修正したバージョン(20分に亘る0.02%酢酸を含有する水中の20~100%アセトニトリルの勾配溶離を利用した)によって逆相クロマトグラフィーによって精製した。プールした生成物含有画分を凍結乾燥し、表題化合物#4(82mg、25%)を白色固体として得た。LCMS:m/z1053.6[M+H]+、保持時間=2.10分;HPLC(プロトコルB):保持時間=8.034分。
上記の一般手順Aによれば、精製方法Aの修正したバージョン(20分に亘る0.02%酢酸を含有する水中の20~70%アセトニトリルの勾配溶離を利用した)による逆相クロマトグラフィーによる精製の後に、#4(81mg、0.077mmol)、ジクロロメタン(1mL、0.08M)およびジエチルアミン(0.3mL、3mmol)から、#5(59mg)を非結晶質ガラス状物として合成した。LCMS:m/z831.5[M+H]+、保持時間=0.69分;HPLC(プロトコルB):保持時間=5.240分。
5-(メチルスルホニル)ピラジン-2-カルボン酸、#1(5.5mg、0.027mmol)、およびN,N-ジイソプロピルエチルアミン(3mL、0.017mmol)のN,N-ジメチルホルムアミド(0.1mL)中溶液に、HATU(7.9mg、0.020mmol)を加えた。約15分後、#5(13.5mg、0.016mmol)およびN,N-ジイソプロピルエチルアミン(6mL、0.033mmol)のN,N-ジメチルホルムアミド(0.2mL)中溶液を、反応混合物に加えた。45分後、LC-MS分析は、反応が完了したことを示し、精製方法Aの修正したバージョン(20分に亘る0.02%酢酸を含有する水中の20~95%アセトニトリル勾配溶離を利用した)によって混合物を逆相クロマトグラフィーによって直接精製し、表題化合物A(1.9mg、12%)を得た。LC-MS:m/z1013.5[M-H+],1039.5[M+Na+]保持時間=1.61分;HPLC(プロトコルH):保持時間=10.090分。
上記の一般手順Bによれば、シリカゲルクロマトグラフィー(勾配:ヘプタン中の10~100%アセトン)の後で、2-メチル-L-プロリル-N-[(3R,4S,5S)-1-{(2S)-2-[(1R,2R)-3-{[(2S)-1-tert-ブトキシ-1-オキソ-3-フェニルプロパン-2-イル]アミノ}-1-メトキシ-2-メチル-3-オキソプロピル]ピロリジン-1-イル}-3-メトキシ-5-メチル-1-オキソヘプタン-4-イル]-N-メチル-L-バリンアミド(US2013/0129753A1における実施例#239)(237mg、0.302mmol)、1-(9H-フルオレン-9-イル)-3-オキソ-2,7,10,13,16,19,22-ヘプタオキサ-4-アザペンタコサン-25-酸(201mg、0.332mmol)、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(210μL、1.21mmol)、N,N-ジメチルホルムアミド(3mL)およびHATU(133mg、0.332mmol)から、#8(238mg、59%)を白色の泡として合成した。LCMS: m/z 1344.1 [M+H]+, 保持時間 =
2.33分; HPLC (プロトコルF): 保持時間 = 10.301分; 1H NMR (400 MHz,
CDCl3): δ 7.76 (d, 2H), 7.59 (d, 2H), 7.39 (m, 2H),
7.33 (m, 2H), 7.26-6.83 (m, 5H), 5.44 (br, 1H), 4.72-4.62 (m, 2H), 4.41 (d,
2H), 4.16 (m, 2H), 3.76-3.31 (m, 39H), 3.08-2.99 (m, 5H), 2.60-2.25 (m, 6H),
1.93-1.46 (m, 13H), 1.46 (m, 1H), 1.38 (s, 9H), 1.19 (m, 4H), 0.99-0.84 (m,
13H).
上記の一般手順Aによれば、精製方法Aの修正したバージョン(20分に亘る0.02%トリフルオロ酢酸を含有する水中の20~75%アセトニトリルの勾配溶離を利用した)による逆相クロマトグラフィーによる精製の後で、#8(800mg、0.595mmol)、ジクロロメタン(20mL)およびジエチルアミン(2mL、20mmol)から、#9(400mg、54%)を非結晶質固体として合成した。LCMS:m/z1122.1[M+H]+、保持時間=0.81分;HPLC(プロトコルB):保持時間=6.282分。
白色の2-(メチルスルホニル)ピリミジン-5-カルボン酸(25.0mg、0.124mmol)のテトラヒドロフラン(0.5mL)中懸濁液に室温にて、2-クロロ-4,6-ジメトキシ-1,3,5-トリアジン(22mg、0.12mmol)、それに続いてN-メチルモルホリン(18μL、0.165mmol)を加えた。懸濁液は濃厚で僅かに黄色となった。N,N-ジメチルアセトアミド(0.2mL)を加え、反応混合物を室温にて撹拌した。2時間後、LCMSは、完全な活性化を示した。無色の#9(44mg、0.033mmol)のテトラヒドロフラン(0.5mL)中溶液を、従前の反応混合物に加えた。40分後、LCMS分析は、反応が完了したことを示した。反応混合物を窒素の強力な流れ下で濃縮し、ジクロロメタン(0.5mL)で希釈し、トリフルオロ酢酸を加えた(1.5mL)。2時間後、LCMS分析は、Boc-脱保護反応が完了したことを示した。混合物をDMSOで希釈し、精製方法Aの修正したバージョン(20分に亘る0.02%トリフルオロ酢酸を含有する水中の20~80%アセトニトリルの勾配溶離を利用した)によって逆相クロマトグラフィーによって精製し、表題化合物#10(18.2mg、44%)を固体として得た。LCMS(プロトコルC):m/z1250.6[M+H]+、保持時間=8.252分。
一般手順Bによれば、シリカゲルクロマトグラフィー(勾配:ヘプタン中の10~100%アセトン)の後で、2-メチル-L-プロリル-N-[(3R,4S,5S)-3-メトキシ-1-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-メトキシ-3-{[(2S)-1-メトキシ-1-オキソ-3-フェニルプロパン-2-イル]アミノ}-2-メチル-3-オキソプロピル]ピロリジン-1-イル}-5-メチル-1-オキソヘプタン-4-イル]-N-メチル-L-バリンアミド(US2013/0129753A1における実施例#117)(115mg、0.146mmol)、1-(9H-フルオレン-9-イル)-3-オキソ-2,7,10,13,16,19,22-ヘプタオキサ-4-アザペンタコサン-25-酸(97.6mg、0.161mmol)、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(102μL、0.584mmol)、N,N-ジメチルホルムアミドおよびHATU(64.4mg、0.161mmol)から、#12(164mg、86%)を白色の泡として合成した。LCMS: m/z 1302.1 [M+H]+, 保持時間 =
2.17分; HPLC (プロトコルG): 保持時間 = 4.158分; 1H NMR (400 MHz,
CDCl3): δ 7.77 (d, 2H), 7.61 (d, 2H), 7.39 (m, 2H),
7.33 (m, 2H), 7.22-6.95 (m, 7H), 5.44 (br, 1H), 4.86-4.70 (m, 3H), 4.42 (d,
2H), 4.24 (m, 3H), 3.87-3.55 (m, 29H), 3.38-3.32 (m, 9H), 3.10 (m, 4H), 2.61
(m, 2H), 2.41-2.39 (m, 3H), 1.91-1.62 (m, 13H), 1.30 (br 1H), 1.20 (d, 3H),
1.00-0.84 (m, 12H).
氷で冷やした水浴中の#12(88mg、0.068mmol、1当量)のN,N-ジメチルホルムアミド(1mL)中溶液に、水酸化リチウム(36mg、1.5mmol)の水(0.4mL)溶液を加えた。20分後、LCMS分析は、反応が完了したことを示し、窒素の強力な流れ下で濃縮し、残渣を方法Bによって逆相クロマトグラフィーによって精製し、化合物#13(189mg、71%)を白色固体として得た。LCMS(プロトコルC):m/z1065.7[M+H]+、保持時間=6.959分。
白色の2-(メチルスルホニル)-1,3-ベンゾチアゾール-6-カルボン酸、#2(5mg、0.02mmol)のテトラヒドロフラン(0.1mL)中懸濁液に、室温にて4-(4,6-ジメトキシ-1,3,5-トリアジン-2-イル)-4-メチルモルホリニウムクロリド(DMT-MM)(5mg、0.018mmol)、それに続いて1滴のN-メチルモルホリンを加えた。反応混合物を室温にて撹拌した。2時間後、LCMSは、完全な活性化を示した。N,N-ジメチルアセトアミド(0.1mL)中の#13の無色溶液(10mg、0.009mmol)を、従前の反応混合物に加えた。室温にて一晩撹拌した後、LCMS分析は、反応が完了したことを示し、次いで、DMSOで希釈し、方法A(調節剤:トリフルオロ酢酸;勾配:水中の20~90%アセトニトリル)によって逆相クロマトグラフィーによって精製し、表題化合物#14(0.9mg、8%)を無色ガラス状物として得た。LCMS:m/z1304.4[M+H]+、保持時間=1.70分;HPLC(プロトコルB):保持時間=6.412分。
2-メチルアラニル-N-[(3R,4S,5S)-3-メトキシ-1-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-メトキシ-2-メチル-3-オキソ-3-{[(1S)-2-フェニル-1-(1,3-チアゾール-2-イル)エチル]アミノ}プロピル]ピロリジン-1-イル}-5-メチル-1-オキソヘプタン-4-イル]-N-メチル-L-バリンアミド(US2013/0129753A1における実施例#54)(105mg、0.141mmol)、FmocAmCapValCitPABC-PNP、#16(138mg、0.157mmol)、HOAt(6.40mg、0.047mmol)、および2,6-ルチジン(91uL、84mg、0.783mmol)のN,N-ジメチルホルムアミド(1.4mL)中溶液を、45℃にて21時間加熱した。さらなるFmocAmCapValCitPABC-PNP、#16(31mg、0.035mmol)、HOAt(3.83mg、0.028mmol)、および2,6-ルチジン(16uL、15mg、0.141mmol)を次いで加え、反応物を40℃にてさらに6時間加熱し、次いで、室温にて一晩保持した。LCMS分析は、反応物が化合物#17および#18の混合物を含有したことを示した。ピペリジン(0.5mL)を加え、反応物を室温にて1時間撹拌した。LCMS分析は、Fmoc-脱保護反応が完了したことを示し、反応物を濃縮し、残渣を精製方法Aの修正したバージョン(20分に亘る0.02%トリフルオロ酢酸を含有する水中の10~85%アセトニトリルの勾配溶離を利用した)によって逆相クロマトグラフィーによって精製し、97mg(54%)の所望の生成物(#18)を白色固体として得た。LCMS(プロトコルI):m/z1062.3[M+H]+、保持時間=2.36分。
N-(6-アミノヘキサノイル)-L-バリル-N-{4-[(8S,11S,12R)-11-[(2S)-ブタン-2-イル]-12-(2-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-メトキシ-2-メチル-3-オキソ-3-{[(1S)-2-フェニル-1-(1,3-チアゾール-2-イル)エチル]アミノ}プロピル]ピロリジン-1-イル}-2-オキソエチル)-5,5,10-トリメチル-3,6,9-トリオキソ-8-(プロパン-2-イル)-2,13-ジオキサ-4,7,10-トリアザテトラデカ-1-イル]フェニル}-N5-カルバモイル-L-オルニチンアミド、#18(100mg、0.061mmol)のテトラヒドロフラン(1mL)中溶液に、2-(メチルスルホニル)ピリミジン-5-カルボン酸(41mg、0.2mmol)、それに続いて2-クロロ-4,6-ジメトキシ-1,3,5-トリアジン(35mg、0.20mmol)およびN-メチルモルホリン(50μL、0.46mmol)を加えた。反応混合物を室温にて2日間撹拌し、次いで、DMSOで希釈し、精製方法Aの修正したバージョン(20分に亘る0.02%トリフルオロ酢酸を含有する水中の20~90%アセトニトリルの勾配溶離を利用した)によって逆相クロマトグラフィーによって精製し、表題化合物#19(52mg、59%)を白色固体として得た。LCMS(プロトコルC):m/z1445.6[M+H]+、723.5[M+2H]/2+、保持時間=8.721分。
5-クロロピラジン-2-カルボン酸(500mg、3.1mmol)およびメチル-6-アミノヘキサノエート塩酸塩(688mg、3.71mmol)のジクロロメタン(15mL)中溶液に、1-エチル-3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド(711mg、3.71mmol、1.2当量)を加えた。反応物を室温にて18時間撹拌し、次いで、ジクロロメタン(75mL)で希釈し、1Nの塩酸(15mL)で洗浄した。層を分離し、有機層をブラインで洗浄し、無水硫酸ナトリウムで脱水し、濾過し、真空中で濃縮し、残渣をシリカゲル(ヘプタン中の20%~70%酢酸エチルによる勾配溶離)上のフラッシュカラムクロマトグラフィーによって精製し、メチル6-{[(5-クロロピラジン-2-イル)カルボニル]-アミノ}ヘキサノエート、#20(378mg、43%)を白色固体として得た。LCMS (プロトコルE): m/z 308.2 [M+Na+], 保持時間 = 1.25分; 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6):
δ ppm 9.00 (d, J=1.22 Hz, 1 H), 8.96 (t, J=5.99 Hz, 1
H), 8.87 (d, J=1.47 Hz, 1 H), 3.58 (s, 3 H), 3.29 (q, J=6.85 Hz, 2 H), 2.30 (t,
J=7.46 Hz, 2 H), 1.50 - 1.59 (m, 4 H), 1.25 - 1.33 (m, 2 H).
メチル6-{[(5-クロロピラジン-2-イル)カルボニル]アミノ}ヘキサノエート、#20(374mg、1.31mmol)のジメチルスルホキシド(8mL)中溶液に、ナトリウムチオメトキシド(184mg、2.62mmol)を加えた。反応物を室温にて18時間撹拌し、次いで、ジクロロメタン(50mL)で希釈し、飽和塩化アンモニウム(10mL)で洗浄した。有機相をブラインで洗浄し、無水硫酸ナトリウムで脱水し、濾過し、真空中で濃縮し、メチル6-({[5-(メチルスルファニル)ピラジン-2-イル]カルボニル}アミノ)ヘキサノエート(262mg、67%)、#21を白色固体として得た。LCMS (プロトコルE): m/z 298.2 [M+H]+, 保持時間 = 1.35分; 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6):
δ 8.96 (d, J=1.47 Hz, 1 H), 8.77 (t, J=5.87 Hz, 1 H),
8.64 (d, J=1.71 Hz, 1 H), 3.58 (s, 3 H), 3.27 (q, J=6.77 Hz, 2 H), 2.62 (s, 3
H), 2.30 (t, J=7.34 Hz, 2 H), 1.49 - 1.59 (m, 4 H), 1.23 - 1.33 (m, 2 H).
メチル6-({[5-(メチルスルファニル)ピラジン-2-イル]カルボニル}アミノ)ヘキサノエート、#21(50mg、0.17mmol)のテトラヒドロフラン(1mL)中溶液に、水酸化リチウム(8mg、0.3mmol)の水(0.3mL)溶液を加えた。反応物を室温にて3時間撹拌した。反応物をジクロロメタン(25mL)で希釈し、1Nの塩酸(6mL)を加えた。層を分離し、有機層をブライン(5mL)で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで脱水し、濾過し、真空中で濃縮し、6-({[5-(メチルスルファニル)ピラジン-2-イル]カルボニル}アミノ)ヘキサン酸、#22(43mg、90%)を白色固体として得た。LCMS (プロトコルE): m/z 284.2 [M+H]+, 保持時間 = 1.07分; 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6):
δ 11.98 (br. s., 1 H), 8.97 (d, J=1.47 Hz, 1 H), 8.77
(t, J=5.87 Hz, 1 H), 8.64 (d, J=1.47 Hz, 1 H), 3.28 (q, J=6.85 Hz, 2 H), 2.62
(s, 3 H), 2.20 (t, J=7.34 Hz, 2 H), 1.48 - 1.57 (m, 4 H), 1.25 - 1.33 (m, 2 H).
6-({[5-(メチルスルファニル)ピラジン-2-イル]カルボニル}アミノ)ヘキサン酸、#22(40mg、0.14mmol)のジクロロメタン(2mL)中懸濁液に、m-クロロ過安息香酸(126mg、0.56mmol)を加えた。反応物を室温にて18時間撹拌した。反応物を濾過し、固体を集め、6-({[5-(メチルスルホニル)ピラジン-2-イル]カルボニル}アミノ)ヘキサン酸、#23(33mg、74%)を白色固体として得た。LCMS (プロトコルA): m/z 316.2 [M+H]+, 保持時間 = 0.54分; 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6):
δ 11.97 (br. s., 1 H), 9.34 (d, J=1.47 Hz, 1 H), 9.25
(d, J=1.22 Hz, 1 H), 9.18 (t, J=5.99 Hz, 1 H), 3.40 (s, 3 H), 3.29 - 3.36 (m, 2
H), 2.21 (t, J=7.34 Hz, 2 H), 1.49 - 1.60 (m, 4 H), 1.31 (五重線, J=7.58 Hz, 2 H).
2-メチルアラニル-N-[(3R,4S,5S)-3-メトキシ-1-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-メトキシ-2-メチル-3-オキソ-3-{[(1S)-2-フェニル-1-(1,3-チアゾール-2-イル)エチル]アミノ}プロピル]ピロリジン-1-イル}-5-メチル-1-オキソヘプタン-4-イル]-N-メチル-L-バリンアミド(US2013/0129753A1における実施例#54)(50mg、0.067mmol)のN,N-ジメチルアセトアミド(1mL)中溶液に、N-(tert-ブトキシカルボニル)-L-バリル-N5-カルバモイル-N-[4-({[(4-ニトロフェノキシ)カルボニル]オキシ}メチル)フェニル]-L-オルニチンアミド(US8399403B2における化合物10)(52mg、0.081mmol)、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(0.05mL、0.3mmol)、2,6-ルチジン(0.03mL、0.3mmol)、および1-ヒドロキシ-7-アザベンゾトリアゾール(11mg、0.081mmol)を加えた。反応物を45℃にて24時間撹拌し、次いで、室温に冷却し、2日間撹拌した。粗反応物を濾過し、濾液を方法Cによって逆相HPLCによって精製し、#24(46mg、55%)を白色固体として得た。LCMS(プロトコルE):m/z1248.8[M+H]+、保持時間=1.83分。
トリフルオロ酢酸(0.1mL、1mmol)を、#24(45mg、0.036mmol)のジクロロメタン(1mL)中溶液に加え、反応物を室温にて20分間撹拌した。反応物を減圧下で濃縮し、L-バリル-N-{4-[(8S,11S,12R)-11-[(2S)-ブタン-2-イル]-12-(2-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-メトキシ-2-メチル-3-オキソ-3-{[(1S)-2-フェニル-1-(1,3-チアゾール-2-イル)エチル]アミノ}プロピル]ピロリジン-1-イル}-2-オキソエチル)-5,5,10-トリメチル-3,6,9-トリオキソ-8-(プロパン-2-イル)-2,13-ジオキサ-4,7,10-トリアザテトラデカ-1-イル]フェニル}-N5-カルバモイル-L-オルニチンアミド、#25(50mg)を白色固体として得て、これを更には精製せずに直接使用した。LCMS(プロトコルE):m/z1149.2[M+H]+、保持時間=1.50分。
6-({[5-(メチルスルホニル)ピラジン-2-イル]カルボニル}アミノ)ヘキサン酸、#23(5mg、0.02mmol)、およびL-バリル-N-{4-[(8S,11S,12R)-11-[(2S)-ブタン-2-イル]-12-(2-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-メトキシ-2-メチル-3-オキソ-3-{[(1S)-2-フェニル-1-(1,3-チアゾール-2-イル)エチル]アミノ}プロピル]ピロリジン-1-イル}-2-オキソエチル)-5,5,10-トリメチル-3,6,9-トリオキソ-8-(プロパン-2-イル)-2,13-ジオキサ-4,7,10-トリアザテトラデカ-1-イル]フェニル}-N5-カルバモイル-L-オルニチンアミド、#25(10mg、0.007mmol)のN,N-ジメチルホルムアミド(0.2mL、0.04mmol)中溶液に、(1-[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]-1H-1,2,3-トリアゾロ[4,5-b]ピリジニウム3-オキシドヘキサフルオロホスフェート)(3mg、0.008mmol)およびN,N-ジイソプロピルエチルアミン(0.002mL、0.014mmol)を加えた。反応物を室温にて24時間撹拌した。粗反応物を濾過し、濾液を方法Cによって逆相HPLCによって直接精製し、表題化合物、#26(3.7mg、37%)を白色固体として得た。LCMS(プロトコルE):m/z1491.8[M+HCO2 -]、保持時間=1.74分。
2-(メチルスルファニル)-1,3-ベンゾチアゾール-6-カルボン酸4(500mg、2.22mmol)およびメチル6-アミノヘキサノエート塩酸塩(494mg、2.66mmol)のジクロロメタン(10mL)中溶液に、1-エチル-3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド(510mg、2.66mmol)を加えた。反応物を室温にて18時間撹拌した。反応物を水(15mL)およびジクロロメタン(75mL)で希釈した。水層をジクロロメタン(50mL)で逆抽出した。合わせた有機層をブライン(15mL)で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで脱水し、濾過し、真空中で濃縮し、シリカゲルクロマトグラフィー(勾配:ヘプタン中の50%~100%酢酸エチル)によって精製し、メチル6-({[2-(メチルスルファニル)-1,3-ベンゾチアゾール-6-イル]カルボニル}アミノ)-ヘキサノエート、#27(189mg、24%)を黄固体として得た。LCMS (プロトコルE): m/z 353.2 [M+H]+, 保持時間 = 1.45分; 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6):
δ 8.53 (t, J=5.62 Hz, 1 H), 8.48 (d, J=1.22 Hz, 1 H), 7.87
- 7.94 (m, 2 H), 3.58 (s, 3 H), 3.24 - 3.31 (m, 2 H), 2.82 (s, 3 H), 2.32 (t,
J=7.34 Hz, 2 H), 1.56 (tt, J=14.58, 7.31 Hz, 4 H), 1.29 - 1.38 (m, 2 H).
メチル6-({[2-(メチルスルファニル)-1,3-ベンゾチアゾール-6-イル]カルボニル}アミノ)-ヘキサノエート、#27(50mg、0.14mmol)のテトラヒドロフラン(1mL)中溶液に、水酸化リチウム(15mg、0.61mmol)の水(0.3mL)溶液を加えた。2時間後、反応物をジクロロメタン(30mL)で希釈し、1Nの塩酸でpH=3に酸性化した。水層をジクロロメタン(15mL)で逆抽出した。合わせた有機層を無水硫酸ナトリウムで脱水し、濾過し、真空中で濃縮し、6-({[2-(メチルスルファニル)-1,3-ベンゾチアゾール-6-イル]カルボニル}アミノ)ヘキサン酸、#28(40mg、83%)を黄色固体として得て、これを更には精製せずに次のステップで使用した。LCMS (プロトコルA): m/z 339.2 [M+H]+, 保持時間 = 0.71分; 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6):
δ 8.65 (d, J=1.5 Hz, 1H), 8.53 (t, J=5.5 Hz, 1H), 8.48
(d, J=1.2 Hz, 1H), 8.02 (dd, J=8.3, 1.7 Hz, 1H), 7.87-7.95 (m, 2H), 3.27 (q,
J=6.7 Hz, 2H), 2.82 (s, 3H), 2.22 (t, J=7.3 Hz, 2H), 1.54 (五重線, J=7.5 Hz, 4H), 1.29-1.38 (m, 2H).
6-({[2-(メチルスルファニル)-1,3-ベンゾチアゾール-6-イル]カルボニル}アミノ)ヘキサン酸、#28(39mg、0.12mmol、1当量)のジクロロエタン(2mL)中懸濁液に、m-クロロ過安息香酸(103mg、0.46mmol、4当量)を加えた。反応物を室温にて24時間撹拌した。反応物を濾過し、固体を集め、6-({[2-(メチルスルホニル)-1,3-ベンゾチアゾール-6-イル]カルボニル}アミノ)ヘキサン酸、#29(27mg、63%)を黄色固体として得て、これを更には精製せずに次のステップで使用した。LCMS (プロトコルE): m/z 371.2 [M+H]+, 保持時間 = 0.98分; 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6)
δ: 11.96 (br. s., 1 H), 8.80 (s, 1 H), 8.70 - 8.76 (m,
1 H), 8.33 (d, J=8.80 Hz, 1 H), 8.11 - 8.15 (m, 1 H), 3.62 (s, 3 H), 3.27 -
3.32 (m, 2 H), 2.23 (t, J=7.34 Hz, 2 H), 1.56 (dq, J=14.82, 7.45 Hz, 4 H), 1.31
- 1.39 (m, 2 H).
6-({[2-(メチルスルホニル)-1,3-ベンゾチアゾール-6-イル]カルボニル}アミノ)ヘキサン酸、#29(6mg、0.02mmol)、およびL-バリル-N-{4-[(8S,11S,12R)-11-[(2S)-ブタン-2-イル]-12-(2-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-メトキシ-2-メチル-3-オキソ-3-{[(1S)-2-フェニル-1-(1,3-チアゾール-2-イル)エチル]アミノ}プロピル]ピロリジン-1-イル}-2-オキソエチル)-5,5,10-トリメチル-3,6,9-トリオキソ-8-(プロパン-2-イル)-2,13-ジオキサ-4,7,10-トリアザテトラデカ-1-イル]フェニル}-N5-カルバモイル-L-オルニチンアミド、#25(9.6mg、0.007mmol)のN,N-ジメチルホルムアミド(0.2mL、0.04mmol)中溶液に、(1-[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]-1H-1,2,3-トリアゾロ[4,5-b]ピリジニウム3-オキシドヘキサフルオロホスフェート)(3mg、0.008mmol)、およびN,N-ジイソプロピルエチルアミン(0.002mL、0.014mmol)を加えた。反応物を室温にて24時間撹拌した。粗反応混合物を濾過し、濾液を方法Cによって逆相HPLCによって精製し、表題化合物、#30(2.3mg、22%)を白色固体として得た。LCMS(プロトコルE):m/z1502.3[M+2H+]、保持時間=1.79分。
一般手順Bによれば、氷冷の撹拌したL-バリル-N5-カルバモイル-N-[4-(ヒドロキシメチル)フェニル]-L-オルニチンアミド[ValCitPABA](化合物64、Dubowchik, G.M.ら、Bioconjug Chem、13、855~69(2002)5(1800mg、4.744mmol)、1-(9H-フルオレン-9-イル)-3-オキソ-2,7,10,13,16,19,22-ヘプタオキサ-4-アザペンタコサン-25-酸(2.73g、4.74mmol)、およびN,N-ジイソプロピルエチルアミン(736mg、5.69mmol)のN,N-ジメチルホルムアミド(12mL)中溶液に、HATU(2160mg、5.69mmol)を加えた。反応物を、LCMSによって完了するまで室温にて撹拌した。次いで、混合物を酢酸エチル中で希釈し、このように得られた固体を濾過によって集め、表題化合物、#31(1.9g、43%)を黄色固体として得た。LCMS (プロトコルD): m/z 937.2 [M+H]+, 保持時間 = 0.785分; 1H NMR (400 MHz,
DMSO): δ 9.89 (m, 1H), 8.10-8.08 (d, 1H), 7.89-7.86 (m,
2H), 7.70-7.68 (d, 2H), 7.55-7.53 (d, 2H), 7.43-7.41 (m, 2H), 7.34-7.31 (m,
2H), 7.24-7.22 (d, 1H), 5.97 (br, 1H), 5.41 (s, 2H), 5.11-5.08 (m, 1H),
4.43-4.20 (m, 5H), 3.59-3.58 (d, 2H), 3.49-3.48 (m, 18H), 3.41-3.38 (m, 4H),
2.40-2.33 (m, 2H), 1.99-1.94 (m, 1H), 1.69-1.17 (m, 6H), 0.86-0.82 (m, 6H).
氷で冷やした水浴中の撹拌した黄色のN-[1-(9H-フルオレン-9-イル)-3,25-ジオキソ-2,7,10,13,16,19,22-ヘプタオキサ-4-アザペンタコサン-25-イル]-L-バリル-N5-カルバモイル-N-[4-(ヒドロキシメチル)フェニル]-L-オルニチンアミド、#31(9.35g、9.978mmol)の無水N,N-ジメチルホルムアミド(56mL)中溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(9.11g、29.9mmol)およびN,N-ジイソプロピルエチルアミン(1550mg、12.0mmol)を加えた。室温にて1.5時間撹拌した後、TLC(ジクロロメタン:メタノール:水酸化アンモニウム10:1:0.1)は、反応の完了を示した。反応混合物をtert-ブチルメチルエーテル(2L)に滴下添加し、30分間撹拌した。白色の沈殿物が形成され、濾過し、表題化合物#32(7.2g、65.5%)を白色固体として得た。LCMS (プロトコルD): m/z 1102.2 [M+H]+,
1124.2 [M+Na+] 保持時間 = 0.882分; 1H NMR (400 MHz, DMSO): δ 10.07
(s, 1H), 8.32-8.30 (d, 2H), 8.15-8.14 (d, 1H), 7.89-7.87 (d, 3H), 7.70-7.64 (m,
4H), 7.58-7.55 (d, 2H), 7.42-7.40 (m, 4H), 7.34-7.30 (m, 3H), 5.98 (br, 1H),
5.42 (s, 2H), 5.24 (s, 2H), 4.39-4.20 (m, 5H), 3.61-3.59 (d, 2H), 3.49-3.47 (m,
18H), 3.15-2.93 (m, 6H), 2.40-2.33 (m, 2H), 1.99-1.94 (m, 1H), 1.69-1.25 (m,
5H), 0.87-0.82 (m, 6H).
2-メチルアラニル-N-[(3R,4S,5S)-3-メトキシ-1-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-メトキシ-2-メチル-3-オキソ-3-{[(1S)-2-フェニル-1-(1,3-チアゾール-2-イル)エチル]アミノ}プロピル]ピロリジン-1-イル}-5-メチル-1-オキソヘプタン-4-イル]-N-メチル-L-バリンアミド(US2013/0129753A1における実施例#54)(189mg、0.254mmol)のN,N-ジメチルアセトアミド(1mL)中溶液に、N-[1-(9H-フルオレン-9-イル)-3,25-ジオキソ-2,7,10,13,16,19,22-ヘプタオキサ-4-アザペンタコサン-25-イル]-L-バリル-N5-カルバモイル-N-[4-({[(4-ニトロフェノキシ)カルボニル]オキシ}メチル)フェニル]-L-オルニチンアミド、#32[PF-06452175](336mg、0.305)、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(0.2mL、1mmol)、2,6-ルチジン(0.1mL、1mmol)および1-ヒドロキシ-7-アザベンゾトリアゾール(42mg、0.31mmol)を加えた。反応物を45℃にて一晩撹拌し、それに引き続いてLCMS分析は、反応が完了したことを示した。反応混合物を、20分に亘り0.02%トリフルオロ酢酸を含有する水中の30~100%アセトニトリルの勾配溶離を使用して50g C18カラム上の逆相クロマトグラフィーによって直接精製し、表題化合物、#33(156mg、36%)をゴム状物として得た。LCMS:m/z1705.8[M+H]+、保持時間=1.01分;HPLC(プロトコルB):保持時間=6.225分。
N-(21-アミノ-4,7,10,13,16,19-ヘキサオキサヘンイコサン-1-オイル)-L-バリル-N-{4-[(8S,11S,12R)-11-[(2S)-ブタン-2-イル]-12-(2-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-メトキシ-2-メチル-3-オキソ-3-{[(1S)-2-フェニル-1-(1,3-チアゾール-2-イル)エチル]アミノ}プロピル]ピロリジン-1-イル}-2-オキソエチル)-5,5,10-トリメチル-3,6,9-トリオキソ-8-(プロパン-2-イル)-2,13-ジオキサ-4,7,10-トリアザテトラデカ-1-イル]フェニル}-N5-カルバモイル-L-オルニチンアミド、#33(150mg、0.088mmol)のN,N-ジメチルホルムアミド(1mL)中溶液に、ジエチルアミン(1mL、10mmol)を加えた。反応物を室温にて一晩撹拌し、次いで、20分に亘る0.02%トリフルオロ酢酸を含有する水中の20~100%アセトニトリルの勾配溶離を使用して50g C18カラム上の逆相クロマトグラフィーによって直接精製し、表題化合物#34(60mg、46%、純度>99%)を白色固体として得た。LCMS:m/z1483.9[M+H]+、保持時間=1.39分;HPLC(プロトコルB):保持時間=5.282分。
N-(21-アミノ-4,7,10,13,16,19-ヘキサオキサヘンイコサン-1-オイル)-L-バリル-N-{4-[(8S,11S,12R)-11-[(2S)-ブタン-2-イル]-12-(2-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-メトキシ-2-メチル-3-オキソ-3-{[(1S)-2-フェニル-1-(1,3-チアゾール-2-イル)エチル]アミノ}プロピル]ピロリジン-1-イル}-2-オキソエチル)-5,5,10-トリメチル-3,6,9-トリオキソ-8-(プロパン-2-イル)-2,13-ジオキサ-4,7,10-トリアザテトラデカ-1-イル]フェニル}-N5-カルバモイル-L-オルニチンアミド、トリフルオロ酢酸塩、#34(24.3mg、0.015mmol)および5-(メチルスルホニル)ピラジン-2-カルボン酸、#1(8.3mg、0.041mmol)のテトラヒドロフラン(0.5mL)中溶液に、室温にてN-メチルモルホリン(1滴、約20uL)および4-(4,6-ジメトキシ-1,3,5-トリアジン-2-イル)-4-メチルモルホリニウムクロリド(DMT-MM、12.5mg、0.045mmol)を加えた。このように得られたオレンジ色の懸濁液は、時間と共により濁った。30分後、LCMS分析は、反応が完了したことを示し、反応混合物をDMSOで希釈し、精製方法Aの修正したバージョン(20分に亘る0.02%酢酸を含有する水中の20~90%アセトニトリルの勾配溶離を利用した)によって逆相クロマトグラフィーによって直接精製し、表題化合物#35(19.7mg、79%)をガラス状物として得た。LCMS:m/z1668.7[M+H]+、保持時間=1.70分;HPLCMS(プロトコルC):m/z1669.9[M+H]+、835.5[M/2+H+]保持時間=8.627分。
N-[1-(9H-フルオレン-9-イル)-3,25-ジオキソ-2,7,10,13,16,19,22-ヘプタオキサ-4-アザペンタコサン-25-イル]-L-バリル-N5-カルバモイル-N-[4-({[(4-ニトロフェノキシ)カルボニル]オキシ}メチル)フェニル]-L-オルニチンアミド、#32(308.0mg、0.279mmol)のN,N-ジメチルアセトアミド(2mL)中溶液に、tert-ブチルメチル[2-(メチルアミノ)エチル]カルバメート6(56.0mg、0.30mmol)、1-ヒドロキシ-7-アザベンゾトリアゾール(49mg、0.36mmol)、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(0.2mL、1mmol)および2,6-ルチジン(0.1mL、0.8mmol)を加えた。反応物を45℃にて一晩撹拌し、それに引き続いてLCMS分析は、反応が完了したことを示した。混合物を室温に冷却し、ピペリジン(1mL、10mmol)を加えた。15分後、LCMSは、アミンへの変換を伴って、Fmoc保護の完全な喪失を示した。混合物を窒素の強力な流れ下で濃縮し、このように得られた残渣を、20分に亘る0.02%酢酸を含有する水中の10~70%アセトニトリルの勾配溶離を使用して50g C18カラム上の逆相クロマトグラフィーによって精製し、表題化合物#36(290mg、定量的)をゴム状物として得た。LCMS:m/z1014.8[M+H]+、保持時間=0.61分;HPLC(プロトコルB):保持時間=5.179分。
酸2-(メチルスルホニル)ピリミジン-5-カルボン酸(281.0mg、1.39mmol)、およびN-(21-アミノ-4,7,10,13,16,19-ヘキサオキサヘンイコサン-1-オイル)-L-バリル-N5-カルバモイル-N-[4-(4,7,10,10-テトラメチル-3,8-ジオキソ-2,9-ジオキサ-4,7-ジアザウンデカ-1-イル)フェニル]-L-オルニチンアミドの酢酸塩、#36(290.0mg、0.312mmol)のN,N-ジメチルアセトアミド(2mL)中溶液に、2-クロロ-4,6-ジメトキシ-1,3,5-トリアジン(241mg、1.37mmol)、それに続いてN-メチルモルホリン(200μL、1.8mmol)を加えた。反応混合物を室温にて一晩撹拌し、それに引き続いてLCMS分析は、反応が完了したことを示した。混合物を、20分に亘る0.02%酢酸を含有する水中の10~90%アセトニトリルの勾配溶離を使用した50g C18カラム上の逆相クロマトグラフィーによって直接精製し、表題化合物#37(138.6mg、40%)を白色固体として得た。LCMS: m/z 1113.5 [M+H]+, 保持時間 =
0.81分; HPLC (プロトコルB): 保持時間 = 5.774分; 1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) d ppm 9.39 (s, 2 H) 7.65 (d, J=4.7 Hz, 2 H) 7.36 (d, J=8.2 Hz,
2 H) 5.10 (s, 2 H) 4.55 (dd, J=8.8, 4.9 Hz, 1 H) 4.17 - 4.28 (m, 1 H) 3.76 -
3.83 (m, 2 H) 3.70 - 3.76 (m, 2 H) 3.58 - 3.70 (m, 22 H) 3.30 - 3.37 (m, 8 H)
3.09 - 3.28 (m, 2 H) 2.95 - 3.03 (m, 3 H) 2.90 (s, 1 H) 2.80 (s, 2 H) 2.59 (t,
J=6.0 Hz, 2 H) 2.36 (s, 3 H) 2.20 (s, 1 H) 2.09 - 2.19 (m, 1 H) 1.89 - 2.01 (m,
1 H) 1.72 - 1.86 (m, 1 H) 1.54 - 1.71 (m, 2 H) 1.47 (s, 9 H) 1.02 (t, J=6.2 Hz,
6 H).
N-{23-[2-(メチルスルホニル)ピリミジン-5-イル]-23-オキソ-4,7,10,13,16,19-ヘキサオキサ-22-アザトリコサン-1-オイル}-L-バリル-N5-カルバモイル-N-[4-(4,7,10,10-テトラメチル-3,8-ジオキソ-2,9-ジオキサ-4,7-ジアザウンデカ-1-イル)フェニル]-L-オルニチンアミド、#37(136.0mg、0.122mmol)のジクロロメタン(1mL)中溶液に、トリフルオロ酢酸(0.5mL、7mmol)を加えた。20分後、LCMS分析は、反応が完了したことを示し、反応混合物を窒素流下で濃縮し、DMSOで希釈し、精製方法Aの修正したバージョン(20分に亘る0.02%トリフルオロ酢酸を含有する水中の5~60%アセトニトリルの勾配溶離を利用した)によって逆相クロマトグラフィーによって精製し、表題化合物#38(126mg、91.5%)をゴム状物として得た。LCMS:m/z1014.8[M+H]+、保持時間=0.61分;HPLC(プロトコルB):保持時間=4.280分。
N-{23-[2-(メチルスルホニル)ピリミジン-5-イル]-23-オキソ-4,7,10,13,16,19-ヘキサオキサ-22-アザトリコサン-1-オイル}-L-バリル-N5-カルバモイル-N-{4-[({メチル[2-(メチルアミノ)エチル]カルバモイル}オキシ)メチル]フェニル}-L-オルニチンアミドのトリフルオロ酢酸塩、#38(37.9mg、0.0336mmol)のN,N-ジメチルアセトアミド(1mL)中溶液、および(1S)-1-(クロロメチル)-3-[(3-{[(1S)-1-(クロロメチル)-5-(ホスホノオキシ)-1,2-ジヒドロ-3H-ベンゾ[e]インドール-3-イル]カルボニル}ビシクロ[1.1.1]ペンタ-1-イル)カルボニル]-2,3-ジヒドロ-1H-ベンゾ[e]インドール-5-イル4-ニトロフェニルカーボネート(28mg、0.034mmol)の溶液を合わせた。1-ヒドロキシ-7-アザベンゾトリアゾール(4.58mg、0.0336mmol)、それに続いて2,6-ルチジン(15.7mL、0.135mmol)およびN,N-ジイソプロピルエチルアミン(23.7mL、0.135mmol)を加えた。反応混合物は直ちに黄色となり、反応物を室温にて一晩放置した。粗反応混合物を、精製方法Aの修正したバージョン(20分に亘る0.02%トリフルオロ酢酸を含有する水中の0~100%アセトニトリルの勾配溶離を利用した)によって直接精製し、表題化合物#39(21.3mg、37%)をガラス状物として得た。LCMS:m/z1707.7[M+H]+、保持時間0.82分。
Boc-N-β-Fmoc-L-ジアミノプロピオン酸(346mg、0.811mmol)のジクロロメタン(2mL)中懸濁液に、トリフルオロ酢酸(2mL)を加え、無色溶液がもたらされた。30分後、濃厚な白色の反応混合物を減圧下で濃縮した。残渣をピリジンで希釈し、氷で冷やした水浴で冷却し、次いで、無水酢酸(250uL、2.68mmol)を滴下添加した。20分後、反応混合物を減圧下で濃縮し、ジメチルスルホキシドで希釈し、精製方法Aの修正したバージョン(20分に亘る0.02%トリフルオロ酢酸を含有する水中の10~80%アセトニトリルの勾配溶離を利用した)によって逆相クロマトグラフィーによって直接精製し、表題化合物#40(169mg、56%)をガラス状物として得た。LCMS (プロトコルA): m/z 369.3 [M+H]+, 保持時間 = 0.92分; HPLC (プロトコルB): 保持時間 = 6.065分.1H
NMR (400 MHz, メタノール-d4) d ppm 7.79 (d, J=7.8 Hz, 2 H)
7.64 (d, J=7.4 Hz, 2 H) 7.38 (t, J=7.4 Hz, 2 H) 7.31 (t, J=7.4 Hz, 2 H) 4.55
(t, J=5.9 Hz, 1 H) 4.33 (d, J=6.6 Hz, 2 H) 4.20 (t, J=6.8 Hz, 1 H) 3.60 (dd,
J=14.2, 4.5 Hz, 1 H) 3.45 (dd, J=14.0, 7.4 Hz, 1 H) 1.97 (s, 3 H)
氷で冷やした水浴中で、L-バリル-N-{4-[(8S,11S,12R)-11-[(2S)-ブタン-2-イル]-12-(2-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-メトキシ-2-メチル-3-オキソ-3-{[(1S)-2-フェニル-1-(1,3-チアゾール-2-イル)エチル]アミノ}プロピル]ピロリジン-1-イル}-2-オキソエチル)-5,5,10-トリメチル-3,6,9-トリオキソ-8-(プロパン-2-イル)-2,13-ジオキサ-4,7,10-トリアザテトラデカ-1-イル]フェニル}-N5-カルバモイル-L-オルニチンアミド、トリフルオロ酢酸塩、#25(40.0mg、0.032mmol)のN,N-ジメチルアセトアミド(400μL)中溶液に、N-アセチル-3-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}-L-アラニン、#40(11.7mg、0.0317mmol)、HATU(25.0mg、0.066mmol)およびN,N-ジイソプロピルエチルアミン(81.9μL、0.475mmol)を加えた。反応物を15分間撹拌し、次いで、ジメチルスルホキシドで希釈し、精製方法Aの修正したバージョン(20分に亘る0.02%トリフルオロ酢酸を含有する水中の20~100%アセトニトリルの勾配溶離を利用した)によって逆相クロマトグラフィーによって直接精製し、表題化合物#41(9.7mg、20%)を白色固体として得た。LCMS(プロトコルA):m/z1500.0[M+H]+、保持時間=1.11分;HPLC(プロトコルB):保持時間=7.449分。
氷で冷やした水浴中の#41(9.0mg、0.006mmol)のアセトニトリル(1mL)中溶液に、水酸化リチウム(10mg、0.2mmol)の水(0.1mL)溶液を加えた。45分後、LCMS分析は、反応が完了したことを示し、次いで、酢酸で中和し、ジメチルスルホキシドで希釈し、精製方法Aの修正したバージョン(20分に亘る0.02%トリフルオロ酢酸を含有する水中の15~90%アセトニトリルの勾配溶離を利用した)によって逆相クロマトグラフィーによって直接精製し、表題化合物#42(2.8mg、30%)を白色固体として得た。LCMS(プロトコルA):m/z1298.8[M+H]+、保持時間=0.80分;HPLC(プロトコルB):保持時間=5.717分。
酸2-(メチルスルホニル)ピリミジン-5-カルボン酸(20.0mg、0.099mmol)およびN-アセチル-3-アミノ-L-アラニル-L-バリル-N-{4-[(8S,11S,12R)-11-[(2S)-ブタン-2-イル]-12-(2-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-メトキシ-2-メチル-3-オキソ-3-{[(1S)-2-フェニル-1-(1,3-チアゾール-2-イル)エチル]アミノ}プロピル]ピロリジン-1-イル}-2-オキソエチル)-5,5,10-トリメチル-3,6,9-トリオキソ-8-(プロパン-2-イル)-2,13-ジオキサ-4,7,10-トリアザテトラデカ-1-イル]フェニル}-N5-カルバモイル-L-オルニチンアミドのトリフルオロ酢酸塩、#43(2.8mg、0.0022mmol)の混合物を、メタノールおよびトルエンで希釈し、濃縮乾固した。これをさらに2回繰り返した。N,N-ジメチルアセトアミド(0.5mL)中のこのように得られた混合物に、2-クロロ-4,6-ジメトキシ-1,3,5-トリアジン(5mg、0.03mmol)、それに続いてN-メチルモルホリン(50μL、0.45mmol)を加えた。反応混合物を室温にて1時間撹拌し、それに引き続いてLCMS分析は、反応が完了したことを示した。混合物をジメチルスルホキシドで希釈し、精製方法Aの修正したバージョン(20分に亘る0.02%トリフルオロ酢酸を含有する水中の10~80%アセトニトリルの勾配溶離を利用した)によって逆相クロマトグラフィーによって直接精製し、表題化合物#43(1.0mg、31%)を白色固体として得た。LCMS(プロトコルA):m/z1461.8[M+H]+、保持時間=0.93分;HPLC(プロトコルB):保持時間=6.362分。
氷で冷やした水浴中で、L-バリル-N-{4-[(8S,11S,12R)-11-[(2S)-ブタン-2-イル]-12-(2-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-メトキシ-2-メチル-3-オキソ-3-{[(1S)-2-フェニル-1-(1,3-チアゾール-2-イル)エチル]アミノ}プロピル]ピロリジン-1-イル}-2-オキソエチル)-5,5,10-トリメチル-3,6,9-トリオキソ-8-(プロパン-2-イル)-2,13-ジオキサ-4,7,10-トリアザテトラデカ-1-イル]フェニル}-N5-カルバモイル-L-オルニチンアミド、トリフルオロ酢酸塩、#25(60.0mg、0.048mmol)のN,N-ジメチルアセトアミド(600μL)中溶液に、Ac-Dab(Boc)-OH(23.2mg、0.0891mmol)、HATU(33.4mg、0.0878mmol)およびN,N-ジイソプロピルエチルアミン(23.0μL、0.13mmol)を加えた。反応物を室温にて一晩撹拌した。次いで、反応混合物をジメチルスルホキシドで希釈し、精製方法Aの修正したバージョン(20分に亘る0.02%トリフルオロ酢酸を含有する水中の20~100%アセトニトリルの勾配溶離を利用した)によって逆相クロマトグラフィーによって直接精製し、表題化合物#44(18.7mg、29%)を白色固体として得た。LCMS(プロトコルA):m/z1391.9[M+H]+、保持時間=0.98分;HPLC(プロトコルB):保持時間=6.643分。
トリフルオロ酢酸(1mL、10mmol)を#44(13.6mg、0.0098mmol)のアセトニトリル(2mL)中溶液に加え、反応物を室温にて20分間撹拌した。反応物を減圧下で濃縮し、表題化合物#45(13.7mg)を白色固体として得て、これを更には精製せずに直接使用した。LCMS(プロトコルE):m/z1290.9[M+H]+、保持時間=0.84分。
N-[(2S)-2-(アセチルアミノ)-4-アミノブタノイル]-L-バリル-N-{4-[(8S,11S,12R)-11-[(2S)-ブタン-2-イル]-12-(2-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-メトキシ-2-メチル-3-オキソ-3-{[(1S)-2-フェニル-1-(1,3-チアゾール-2-イル)エチル]アミノ}プロピル]ピロリジン-1-イル}-2-オキソエチル)-5,5,10-トリメチル-3,6,9-トリオキソ-8-(プロパン-2-イル)-2,13-ジオキサ-4,7,10-トリアザテトラデカ-1-イル]フェニル}-N5-カルバモイル-L-オルニチンアミドのトリフルオロ酢酸塩、#45(13.7mg、0.00975mmol)のN,N-ジメチルアセトアミド(1mL)中溶液に、2-(メチルスルホニル)ピリミジン-5-カルボン酸(27.9mg、0.138mmol)および2-クロロ-4,6-ジメトキシ-1,3,5-トリアジン(24.0mg、0.137mmol)、それに続いてN-メチルモルホリン(200μL、1.8mmol)を加えた。反応混合物を室温にて10分間撹拌し、それに引き続いてLCMS分析は、反応が完了したことを示した。混合物をジメチルスルホキシドで希釈し、精製方法Aの修正したバージョン(20分に亘る0.02%トリフルオロ酢酸を含有する水中の10~100%アセトニトリルの勾配溶離を利用した)によって逆相クロマトグラフィーによって直接精製し、表題化合物#46(8.0mg、56%)を白色固体として得た。LCMS(プロトコルA):m/z1475.0[M+H]+、保持時間=0.94分;HPLC(プロトコルB):保持時間=6.344分。
N5-(tert-ブトキシカルボニル)-L-オルニチン、[H-Orn(Boc)-OH](5.0g、21.5mmol)のTHF:水(80:20mL)溶液に、炭酸カリウムの水溶液(11.9g、50mLの水中86.1mmol)をゆっくりと加えた。混合物を5分間撹拌し、次いで、氷で冷やした水浴で冷却し、その後、塩化アセチル(3.38g、43.1mmol)を滴下添加した。混合物を室温にて2.5時間撹拌し、それによってTLC(ジクロロメタン:メタノール:酢酸=100:10:)は、反応が完了したことを示した。混合物を減圧下で濃縮し、このように得られた水性混合物を、塩酸の3M水溶液によってpH=2.0に酸性化し、次いで、酢酸エチル(200mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブラインで洗浄し、硫酸ナトリウムで脱水し、濾過し、濃縮し、表題化合物#47(5.8g、98%)を白色固体として得た。HPLC (プロトコルJ): 保持時間
= 2.94分. 1H NMR (400MHz, DMSO-d6) δ = 12.51 (br. s., 1H), 8.10 (d, J=7.5 Hz, 1H), 6.82 (br. s., 1H),
4.13 (d, J=5.0 Hz, 1H), 2.90 (d, J=6.0 Hz, 2H), 1.84 (s, 3H), 1.65 (br. s.,
1H), 1.51 (d, J=9.0 Hz, 1H), 1.43-1.35 (m, 11H).
N2-アセチル-N5-(tert-ブトキシカルボニル)-L-オルニチン#47[Ac-Orn(Boc)-OH](875mg、3.19mmol)の無水N,N-ジメチルホルムアミド(30mL)中溶液を、HATU(1210mg、3.19mmol)で処理した。30分後、混合物を氷で冷やした水浴で冷却し、L-バリル-N5-カルバモイル-N-[4-(ヒドロキシメチル)フェニル]-L-オルニチンアミド2[ValCitPABA](化合物64、Dubowchik, G.M.ら、Bioconjug Chem、13、855~69(2002)5(1100mg、2.899mmol)、それに続いてN,N-ジイソプロピルエチルアミン(1.5mL、1113mg、8.61mmol)を加えた。混合物を撹拌し、室温に到達させた。2時間後、MTBEを加え、生成物を沈殿させ、これを濾過し、ジクロロメタン(150mL)に20分間分散させた。混合物を濾過し、ジクロロメタン:メタノール(10:1)で洗浄し、次いで、空気乾燥させ、表題化合物#48(1400mg、76%)を灰色固体として得た。この材料を、更には精製せずにそれに続く反応において直接使用した。HPLC (プロトコルJ): 保持時間
= 3.16分. 1H NMR (400MHz, DMSO-d6)
δ = 9.96 (s, 1H), 8.12 (d, J=1.0 Hz, 1H), 8.05 (d,
J=8.0 Hz, 1H), 7.73 (d, J=8.5 Hz, 1H), 7.55 (d, J=8.5 Hz, 2H), 7.25 (d, J=8.0
Hz, 2H), 6.80 (t, J=5.3 Hz, 1H), 6.00 (t, J=5.3 Hz, 1H), 5.78 (s, 1H), 5.44 (s,
2H), 5.11 (t, J=5.8 Hz, 1H), 4.45 (d, J=1.0 Hz, 1H), 4.42 - 4.34 (m, J=1.0,
1.0, 1.0 Hz, 1H), 4.32 - 4.23 (m, 1H), 4.21 (t, J=8.5 Hz, 1H), 3.09 - 2.85 (m,
4H), 1.99 (qd, J=6.4, 13.4 Hz, 1H), 1.86 (s, 3H), 1.76 - 1.65 (m, J=9.5 Hz,
1H), 1.64 - 1.53 (m, J=9.0 Hz, 2H), 1.51 - 1.43 (m, 2H), 1.43 - 1.35 (m, 11H),
0.87 (d, J=7.0 Hz, 3H), 0.84 (d, J=6.5 Hz, 3H).
氷で冷やした水浴中で、N2-アセチル-N5-(tert-ブトキシカルボニル)-L-オルニチル-L-バリル-N5-カルバモイル-N-[4-(ヒドロキシメチル)フェニル]-L-オルニチンアミド、#48(1400mg、2.202mmol)の無水N,N-ジメチルホルムアミド(25mL)中溶液を、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(767μL、569mg、4.40mmol)を有するビス-(4-ニトロフェニル)カーボネート(1.34g、4.40mmol)で処理し、反応物を室温にて6時間撹拌した。反応混合物をMTBE中に注ぎ、20分後、固体を濾過によって単離し、ジクロロメタン(150mL)で洗浄し、次いで、空気乾燥させ、表題化合物#49(1.3g、74%)を白色固体として得た。この材料を、更には精製せずにそれに続く反応において直接使用した。LCMS (プロトコルK): m/z 801.3 [M+H]+,
m/z 823.3 [M+Na]+ 保持時間 = 4.066分; HPLC (プロトコルJ): 保持時間 = 2.63分. 1H NMR (400MHz,
DMSO-d6) d = 10.21 - 10.02 (m, 1H), 8.39 - 8.27 (m, 2H), 8.20 - 7.95 (m, 2H), 7.76
- 7.53 (m, 5H), 7.42 (d, J=8.0 Hz, 2H), 6.84 - 6.72 (m, 1H), 6.07 - 5.92 (m,
1H), 5.48 - 5.39 (m, 2H), 5.29 - 5.20 (m, 2H), 4.47 - 4.10 (m, 3H), 3.06 - 2.81
(m, 4H), 2.10 - 1.92 (m, 1H), 1.91 - 1.79 (m, 3H), 1.76 - 1.53 (m, 3H), 1.37
(br. s., 14H), 0.94 - 0.74 (m, 6H)
2-メチルアラニル-N-[(3R,4S,5S)-3-メトキシ-1-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-メトキシ-2-メチル-3-オキソ-3-{[(1S)-2-フェニル-1-(1,3-チアゾール-2-イル)エチル]アミノ}プロピル]ピロリジン-1-イル}-5-メチル-1-オキソヘプタン-4-イル]-N-メチル-L-バリンアミド(US2013/0129753A1における実施例#54)[Aur-0101](113mg、0.152mmol)のN,N-ジメチルアセトアミド(4mL)中溶液に、N2-アセチル-N5-(tert-ブトキシカルボニル)-L-オルニチル-L-バリル-N5-カルバモイル-N-[4-({[(4-ニトロフェノキシ)カルボニル]オキシ}メチル)フェニル]-L-オルニチンアミド、#49(124.5mg、0.155mmol)、HOAt(24mg、0.18mmol)、2,6-ルチジン(44.3μL、41mg、0.38mmol)、およびN,N-ジイソプロピルエチルアミン(66.9μL、50mg、0.38mmol)を加えた。オレンジ色の反応混合物を45℃にて一晩加熱した。LCMS分析は、反応が完了したことを示した。混合物をジメチルスルホキシドで希釈し、精製方法Aの修正したバージョン(20分に亘る0.02%トリフルオロ酢酸を含有する水中の20~100%アセトニトリルの勾配溶離を利用した)によって逆相クロマトグラフィーによって精製し、所望の生成物#50(82.2mg、38%)を白色固体として得た。LCMS(プロトコルC):m/z1405.9[M+H]+、保持時間=0.95分。HPLC(プロトコルB):保持時間=6.735分。
トリフルオロ酢酸(1mL、10mmol)を、N2-アセチル-N5-(tert-ブトキシカルボニル)-L-オルニチル-N5-カルバモイル-L-オルニチル-N-{4-[(8S,11S,12R)-11-[(2S)-ブタン-2-イル]-12-(2-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-メトキシ-2-メチル-3-オキソ-3-{[(1S)-2-フェニル-1-(1,3-チアゾール-2-イル)エチル]アミノ}プロピル]ピロリジン-1-イル}-2-オキソエチル)-5,5,10-トリメチル-3,6,9-トリオキソ-8-(プロパン-2-イル)-2,13-ジオキサ-4,7,10-トリアザテトラデカ-1-イル]フェニル}-N5-カルバモイル-L-オルニチンアミド、#50(82.2mg、0.0585mmol)のアセトニトリル(2mL)中溶液に加え、反応物を室温にて15分間撹拌した。反応物を減圧下で濃縮し、表題化合物#51(90mg)を白色固体として得て、これを更には精製せずに直接使用した。LCMS(プロトコルE):m/z1304.9[M+H]+、保持時間=0.81分;HPLC(プロトコルB):保持時間=5.804分。
N2-アセチル-L-オルニチル-N5-カルバモイル-L-オルニチル-N-{4-[(8S,11S,12R)-11-[(2S)-ブタン-2-イル]-12-(2-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-メトキシ-2-メチル-3-オキソ-3-{[(1S)-2-フェニル-1-(1,3-チアゾール-2-イル)エチル]アミノ}プロピル]ピロリジン-1-イル}-2-オキソエチル)-5,5,10-トリメチル-3,6,9-トリオキソ-8-(プロパン-2-イル)-2,13-ジオキサ-4,7,10-トリアザテトラデカ-1-イル]フェニル}-N5-カルバモイル-L-オルニチンアミドのトリフルオロ酢酸塩、#51(88.0mg、0.067mmol)のN,N-ジメチルアセトアミド(0.5mL)中溶液に、2-(メチルスルホニル)ピリミジン-5-カルボン酸(68.2mg、0.337mmol)および2-クロロ-4,6-ジメトキシ-1,3,5-トリアジン(59.2mg、0.337mmol)、それに続いてN-メチルモルホリン(74μL、68.2mg、0.675mmol)を加えた。オレンジ色の反応混合物を室温にて90分間撹拌し、それに引き続いてLCMS分析は、反応が完了したことを示した。混合物をジメチルスルホキシドで希釈し、精製方法Aの修正したバージョン(20分に亘る0.02%トリフルオロ酢酸を含有する水中の10~80%アセトニトリルの勾配溶離を利用した)によって逆相クロマトグラフィーによって直接精製し、表題化合物#52(98.4mg、98%)を白色固体として得た。LCMS(プロトコルA):m/z1489.8[M+H]+、保持時間=0.92分;HPLC(プロトコルB):保持時間=6.342分。
氷で冷やした水浴中で、Ac-Lys(Boc)-OH(15.2g、52.7mmol)の無水N,N-ジメチルホルムアミド(250mL)中溶液を、HATU(20.0g、52.7mmol)で処理した。30分後、L-バリル-N5-カルバモイル-N-[4-(ヒドロキシメチル)フェニル]-L-オルニチンアミド2(Dubowchik, G.M.ら、Bioconjug Chem、13、855~69(2002)5における化合物64)(20g、52.7mmol)、それに続いてN,N-ジイソプロピルエチルアミン(12.8mL、9.54g、73.8mmol)を加えた。混合物を室温に到達させた。2時間後、反応混合物をMTBE中に注ぎ、生成物を沈殿させ、これを濾過し、ジクロロメタン:メタノール(10:1、800mL)に20分間分散させた。混合物を濾過し、空気乾燥させ、方法Dによって分取-HPLCによって精製した。減圧下で濃縮した後、残渣をクロロホルム:イソプロピルアルコール4:1中に注いだ。固体を濾過によって集め、空気乾燥させ、表題化合物#53(15.0g、44%)を白色固体として得た。HPLC (プロトコルJ): 保持時間
= 3.63分. 1H NMR (400MHz, DMSO-d6)
δ = 9.95 (s, 1H), 8.32 (s, 1H), 8.09 (d, J=7.5 Hz, 1H),
8.03 (d, J=8.0 Hz, 1H), 7.72 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.57 - 7.51 (m, J=8.5 Hz, 2H),
7.27 - 7.20 (m, J=8.5 Hz, 2H), 6.77 (t, J=5.5 Hz, 1H), 5.98 (t, J=5.8 Hz, 1H),
5.43 (s, 2H), 5.11 (t, J=5.5 Hz, 1H), 4.43 (d, J=5.5 Hz, 2H), 4.41 - 4.35 (m,
1H), 4.29 - 4.21 (m, 1H), 4.19 (dd, J=7.0, 8.5 Hz, 1H), 3.07 - 2.92 (m, 2H),
2.91 - 2.84 (m, 2H), 2.34 (s, 1H), 1.98 (qd, J=6.7, 13.6 Hz, 1H), 1.84 (s, 3H),
1.72 - 1.50 (m, 3H), 1.43 - 1.33 (m, 12H), 1.25 (dd, J=10.3, 15.8 Hz, 3H), 0.86
(d, J=6.5 Hz, 3H), 0.83 (d, J=6.5 Hz, 3H).
保持時間 = 4.101分; HPLC (プロトコルJ): 保持時間 = 4.58分. 1H
NMR (400MHz, DMSO-d6) δ = 10.12 (s, 1H),
8.35 - 8.29 (m, J=9.0 Hz, 2H), 8.13 (d, J=7.0 Hz, 1H), 8.03 (d, J=7.5 Hz, 1H),
7.74 - 7.62 (m, 3H), 7.60 - 7.55 (m, J=9.0 Hz, 2H), 7.42 (d, J=8.5 Hz, 2H),
6.77 (br. s., 1H), 6.03 - 5.96 (m, 1H), 5.44 (s, 2H), 5.25 (s, 2H), 4.44 - 4.35
(m, 1H), 4.29 - 4.16 (m, 2H), 3.09 - 2.84 (m, 5H), 2.74 (s, 1H), 2.04 - 1.91
(m, 1H), 1.85 (s, 3H), 1.69 (br. s., 1H), 1.60 (d, J=9.0 Hz, 2H), 1.46 (br. s.,
2H), 1.37 (s, 12H), 1.24 (br. s., 2H), 1.11 (s, 2H), 0.86 (d, J=7.0 Hz, 3H),
0.83 (d, J=6.5 Hz, 3H).
2-メチルアラニル-N-[(3R,4S,5S)-3-メトキシ-1-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-メトキシ-2-メチル-3-オキソ-3-{[(1S)-2-フェニル-1-(1,3-チアゾール-2-イル)エチル]アミノ}プロピル]ピロリジン-1-イル}-5-メチル-1-オキソヘプタン-4-イル]-N-メチル-L-バリンアミド(US2013/0129753A1における実施例#54)(88mg、0.12mmol)のN,N-ジメチルアセトアミド(1mL)中溶液に、AcLys(Boc)ValCitPABC-PNP、#55(100mg、0.123mmol)、HOAt(17.2mg、0.126mmol)、2,6-ルチジン(34.8μL、32mg、0.30mmol)、およびN,N-ジイソプロピルエチルアミン(52.6μL、39mg、0.30mmol)を加えた。オレンジ色の反応混合物を45℃にて一晩加熱した。LCMS分析は、反応が完了したことを示した。混合物をジメチルスルホキシドで希釈し、精製方法Aの修正したバージョン(20分に亘る0.02%トリフルオロ酢酸を含有する水中の20~100%アセトニトリルの勾配溶離を利用した)によって逆相クロマトグラフィーによって精製し、所望の生成物#56(85.2mg、51%)を白色固体として得た。LCMS(プロトコルC):m/z1419.9[M+H]+、1442.9[M+Na]+保持時間=0.97分。HPLC(プロトコルB):保持時間=6.836分。
トリフルオロ酢酸(1mL、10mmol)を、N2-アセチル-N6-(tert-ブトキシカルボニル)-L-リジル-N5-カルバモイル-L-オルニチル-N-{4-[(8S,11S,12R)-11-[(2S)-ブタン-2-イル]-12-(2-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-メトキシ-2-メチル-3-オキソ-3-{[(1i)-2-フェニル-1-(1,3-チアゾール-2-イル)エチル]アミノ}プロピル]ピロリジン-1-イル}-2-オキソエチル)-5,5,10-トリメチル-3,6,9-トリオキソ-8-(プロパン-2-イル)-2,13-ジオキサ-4,7,10-トリアザテトラデカ-1-イル]フェニル}-N5-カルバモイル-L-オルニチンアミド、#56(85.2mg、0.0601mmol)のアセトニトリル(2mL)中溶液に加え、反応物を室温にて15分間撹拌した。反応物を減圧下で濃縮し、表題化合物#57(90mg)を白色固体として得て、これを更には精製せずに直接使用した。LCMS(プロトコルE):m/z1318.9[M+H]+、保持時間=0.81分;HPLC(プロトコルB):保持時間=5.813分。
N2-アセチル-L-リジル-N5-カルバモイル-L-オルニチル-N-{4-[(8S,11S,12R)-11-[(2S)-ブタン-2-イル]-12-(2-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-メトキシ-2-メチル-3-オキソ-3-{[(1S)-2-フェニル-1-(1,3-チアゾール-2-イル)エチル]アミノ}プロピル]ピロリジン-1-イル}-2-オキソエチル)-5,5,10-トリメチル-3,6,9-トリオキソ-8-(プロパン-2-イル)-2,13-ジオキサ-4,7,10-トリアザテトラデカ-1-イル]フェニル}-N5-カルバモイル-L-オルニチンアミドのトリフルオロ酢酸塩、#57(90.0mg、0.068mmol)のN,N-ジメチルアセトアミド(0.5mL)中溶液に、2-(メチルスルホニル)ピリミジン-5-カルボン酸(69.0mg、0.341mmol)および2-クロロ-4,6-ジメトキシ-1,3,5-トリアジン(59.9mg、0.341mmol)、それに続いてN-メチルモルホリン(200μL、180mg、1.8mmol)を加えた。オレンジ色の反応混合物を室温にて90分間撹拌し、それに引き続いてLCMS分析は、反応が完了したことを示した。混合物をジメチルスルホキシドで希釈し、精製方法Aの修正したバージョン(20分に亘り0.02%トリフルオロ酢酸を含有する水中の10~80%アセトニトリルの修正した勾配溶離を利用した)によって逆相クロマトグラフィーによって直接精製し、表題化合物#58(91.7mg、89%)を白色固体として得た。LCMS(プロトコルA):m/z1503.8[M+H]+、保持時間=0.92分;HPLC(プロトコルB):保持時間=6.360分。
2-(メチルスルファニル)ピリミジン-5-カルボン酸(US2010/210593A1における実施例29;Yu-Xiu, Liu; Ming-Bo, Cui;Qi-Qi, Zhao;Qing-Min, Wang;Ying, Liu;Run-Qiu, Huang、Reduction of pyrimidine derivatives by LiAlH4、Journal of Chemical Research、2007、#8、p.490~493)(228mg、1.34mmol)およびメチル6-アミノヘキサノエート塩酸塩(497mg、2.68mmol)のジクロロメタン(6mL)中溶液に、1-エチル-3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド(68mg、0.36mmol)およびN,N-ジイソプロピルエチルアミン(0.5mL、3mmol)を加えた。反応物を室温にて18時間撹拌した。反応物を減圧下で濃縮し、シリカゲルクロマトグラフィー(勾配:ヘプタン中の20%~100%酢酸エチル)によって精製し、メチル6-({[2-(メチルスルファニル)ピリミジン-5-イル]カルボニル}アミノ)ヘキサノエート、#59(131mg、33%)を白色固体として得た。LCMS (プロトコルE): m/z 298.4 [M+H]+, 保持時間 = 1.21分; 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6):
δ 1H NMR (500MHz,
DMSO-d6) δ = 8.97 (s, 2H), 8.67 (t, J=5.4
Hz, 1H), 3.58 (s, 3H), 3.33 (s, 2H), 3.29 - 3.23 (m, 2H), 2.57 (s, 3H), 2.32
(t, J=7.5 Hz, 2H), 1.54 (d五重線, 4H), 1.36 - 1.28 (m,
2H).
メチルメチル6-({[2-(メチルスルファニル)ピリミジン-5-イル]カルボニル}アミノ)ヘキサノエート、#59(63mg、0.21mmol)のテトラヒドロフラン(1mL)中溶液に、水酸化リチウム(21mg、0.86mmol)の水(0.3mL)溶液を加えた。3時間後、反応物をジクロロメタンで希釈し、1Nの塩酸でpH=2へと酸性化した。水層をジクロロメタンで逆抽出した。有機層を無水硫酸ナトリウムで脱水し、濾過し、真空中で濃縮し、6-({[2-(メチルスルファニル)ピリミジン-5-イル]カルボニル}アミノ)ヘキサン酸、#60(53mg、88%)を白色固体として得て、これを更には精製せずに次のステップで使用した。LCMS (プロトコルA): m/z 284.19 [M+H]+,
保持時間 = 0.93分; 1H NMR
(500 MHz, DMSO-d6): δ 11.99 (s, 1H), 8.97
(s, 2H), 8.67 (t, J=5.5 Hz, 1H), 3.29 - 3.17 (m, 2H), 2.57 (s, 3H), 2.22 (t,
J=7.3 Hz, 2H), 1.53 (五重線, J=7.4 Hz, 4H), 1.39 - 1.24
(m, 2H).
6-({[2-(メチルスルファニル)ピリミジン-5-イル]カルボニル}アミノ)ヘキサン酸、#60(146mg、0.515mmol)のジクロロメタン(2mL)中懸濁液に、m-クロロ過安息香酸(272mg、1.55mmol)を加えた。反応物を室温にて3時間撹拌した。反応物を濾過し、固体を集め、6-({[2-(メチルスルホニル)ピリミジン-5-イル]カルボニル}アミノ)ヘキサン酸、#61(58mg、36%)を黄色固体として得て、これを更には精製せずに次のステップで使用した。LCMS (プロトコルE): m/z 338.3 [M+Na]+,
314.4 [M-H]+, 保持時間 = 0.57分; 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 9.36 (d, J=1.6 Hz, 1 H) 9.25 (d, J=1.6 Hz, 1 H) 9.13 (br. s., 1 H)
3.43 - 3.50 (m, 2 H) 3.33 (s, 3 H) 2.31 (t, J=7.4 Hz, 2 H) 1.62 - 1.73 (m, 4 H)
1.38 - 1.49 (m, 2 H).
6-({[2-(メチルスルホニル)ピリミジン-5-イル]カルボニル}アミノ)ヘキサン酸、#61(14.2mg、0.045mmol)およびN-ヒドロキシスクシンイミド(5.6mg、0.049mmol)のジクロロメタン(1mL)中溶液に、1-エチル-3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド(8.6mg、0.045mmol)およびN,N-ジイソプロピルエチルアミン(0.5mL、3mmol)を加えた。反応物を室温にて72時間撹拌した。混合物をジメチルスルホキシドで希釈し、精製方法Aの修正したバージョン(20分に亘る0.02%酢酸を含有する水中の10~90%アセトニトリルの勾配溶離を利用した)によって逆相クロマトグラフィーによって直接精製し、表題化合物(9.2mg、50%)を白色固体として得た。LCMS(プロトコルE):m/z413.3[M+H]+、保持時間=0.65分。
N,N-ジメチルアセトアミド(5mL)中の2-({N-[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]-ベータ-アラニル}アミノ)-4-({[(4-ニトロフェノキシ)カルボニル]オキシ}メチル)フェニルメチル-2,3,4-トリ-O-アセチル-ベータ-D-グルコピラノシドウロン酸、#63(WO2007/11968A2における化合物7)(585mg、0.54mmol)および2-メチルアラニル-N-[(3R,4S,5S)-3-メトキシ-1-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-メトキシ-2-メチル-3-オキソ-3-{[(1S)-2-フェニル-1-(1,3-チアゾール-2-イル)エチル]アミノ}プロピル]ピロリジン-1-イル}-5-メチル-1-オキソヘプタン-4-イル]-N-メチル-L-バリンアミド(US2013/0129753A1における実施例#54)(105mg、0.141mmol)(412.0mg、0.554mmol)の混合物に、HOAt(85mg、0.62mmol)、2,6-ルチジン(216μL、200mg、0.1.9mmol)、およびN,N-ジイソプロピルエチルアミン(327μL、250mg、1.9mmol)を加えた。オレンジ色の反応混合物を45℃にて1.5時間加熱し、次いで、室温にて一晩撹拌した。LCMS分析は、反応が完了したことを示した。混合物をジメチルスルホキシドで希釈し、精製方法Aの修正したバージョン(20分に亘る0.02%トリフルオロ酢酸を含有する水中の30~100%アセトニトリルの勾配溶離を利用した)によって逆相クロマトグラフィーによって精製し、所望の生成物#64(307.9mg、37%)を白色固体として得た。LCMS(プロトコルC):m/z1519.0[M+H]+、保持時間=1.09分。HPLC(プロトコルB):保持時間=8.559分。
氷で冷やした水浴中で、N-[({3-({N-[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]-ベータ-アラニル}アミノ)-4-[(2,3,4-トリ-O-アセチル-6-メチル-ベータ-D-グルコピラヌロノシル)オキシ]ベンジル}オキシ)カルボニル]-2-メチルアラニル-N-[(3R,4S,5S)-3-メトキシ-1-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-メトキシ-2-メチル-3-オキソ-3-{[(1S)-2-フェニル-1-(1,3-チアゾール-2-イル)エチル]アミノ}プロピル]ピロリジン-1-イル}-5-メチル-1-オキソヘプタン-4-イル]-N-メチル-L-バリンアミド、#64(119.0mg、0.0784mmol)のN,N-ジメチルアセトアミド(2mL)中溶液に、水酸化リチウムの水溶液(461μL、46.1mg、1.10mmol)を加えた。10分後、LCMS分析は、反応が完了したことを示し、次いで、酢酸で中和し、ジメチルスルホキシドおよびメタノールで希釈し、精製方法Aの修正したバージョン(20分に亘る0.02%酢酸を含有する水中の15~70%アセトニトリルの勾配溶離を利用した)によって逆相クロマトグラフィーによって直接精製し、表題化合物#65(34.8mg、36.5%)を白色固体として得た。LCMS(プロトコルA):m/z1155.9[M+H]+、保持時間=0.73分;HPLC(プロトコルB):保持時間=5.532分。
N-({[3-(ベータ-アラニルアミノ)-4-(ベータ-D-グルコピラヌロノシルオキシ)ベンジル]オキシ}カルボニル)-2-メチルアラニル-N-[(3R,4S,5S)-3-メトキシ-1-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-メトキシ-2-メチル-3-オキソ-3-{[(1S)-2-フェニル-1-(1,3-チアゾール-2-イル)エチル]アミノ}プロピル]ピロリジン-1-イル}-5-メチル-1-オキソヘプタン-4-イル]-N-メチル-L-バリンアミド、酢酸塩、#65(26.0mg、0.019mmol)およびN-{6-[(2,5-ジオキソピロリジン-1-イル)オキシ]-6-オキソヘキシル}-2-(メチルスルホニル)ピリミジン-5-カルボキサミド、#62(9.2mg、0.022mmol)のN,N-ジメチルホルムアミド(1mL)中溶液に、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(30μL、22mg、0.17mmol)を加えた。反応物を室温にて1.5時間撹拌した。粗反応混合物をジメチルスルホキシドで希釈し、精製方法Aの修正したバージョン(20分に亘る0.02%トリフルオロ酢酸を含有する水中の15~90%アセトニトリルの勾配溶離を利用した)によって逆相HPLCによって直接精製し、表題化合物#66(3.7mg、13.5%)を白色固体として得た。LCMS(プロトコルE):m/z1453.4[M+H+]、保持時間=0.84分;HPLC(プロトコルB):保持時間=6.225分。
1-{[4-(11,12-ジデヒドロジベンゾ[b,f]アゾシン-5(6H)-イル)-4-オキソブタノイル]オキシ}ピロリジン-2,5-ジオン(0.10g、0.25mmol)およびtert-ブチル(2-{2-[2-(2-アミノエトキシ)エトキシ]エトキシ}エチル)カルバメート(0.073g、0.25mmol)のジクロロメタン(5mL)中溶液を、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(0.05mL、0.3mmol)で処理し、溶液を室温にて撹拌した。約1時間後、反応物を濃縮し、12gのシリカゲル上で精製し、25分に亘りジクロロメタン中の0~20%メタノールで溶出させた。生成物含有画分を合わせ、濃縮し、所望の化合物、#67、(0.12g、83%)を無色油状物として得た。LCMS(プロトコルP):m/z580.5[M+H]+、保持時間=1.75分
tert-ブチル[16-(11,12-ジデヒドロジベンゾ[b,f]アゾシン-5(6H)-イル)-13,16-ジオキソ-3,6,9-トリオキサ-12-アザヘキサデカ-1-イル]カルバメート(0.119g、0.205mmol)のジクロロメタン(5mL)中溶液を、4MのHCl/ジオキサン溶液(1mL、4mmol)で処理し、反応物を室温にて撹拌した。約30分後、反応物を濃縮し、残渣を4gのシリカゲル上で精製し、25分に亘りジクロロメタン中の0~100%メタノールで溶出させた。生成物含有画分を合わせ、濃縮し、所望の化合物、#68、(0.084g、79%)を粘性油状物として得た。LCMS(プロトコルO):m/z480.4[M+H]+、保持時間=0.63分
2-(メチルスルホニル)ピリミジン-5-カルボン酸(0.032g、0.16mmol)のジクロロメタン(3mL)中溶液を、HATU(0.060g、0.16mmol)およびN,N-ジイソプロピルエチルアミンDIEA(0.05mL、0.31mmol)で処理した。約3分後、N-(2-{2-[2-(2-アミノエトキシ)エトキシ]エトキシ}エチル)-4-(11,12-ジデヒドロジベンゾ[b,f]アゾシン-5(6H)-イル)-4-オキソブタンアミド(0.080g、0.16mmol)のジクロロメタン(2mL)中溶液を加え、反応物を室温にて撹拌した。約1.5~2時間後、反応物を濃縮し、残渣を12gのシリカゲル上で精製し、25分に亘りジクロロメタン中の0~20%メタノールで溶出させた。生成物含有画分を合わせ、濃縮し、所望の化合物、#69(0.070g、68%)を油状物として得た。LCMS(プロトコルP):m/z664.5[M+H]+、保持時間=1.46分。
6-アジド-N-(tert-ブトキシカルボニル)-L-ノルロイシン(4.9g、18mmol)の無水ジクロロメタン(80mL)中溶液に、0℃にてトリエチルアミン(17.2mL、126mmol)、それに続いてT3P(16.6mL、27.9mmol、EtOAc中50%)を加え、混合物を0℃にて30分間撹拌した。N,N-ジメチルエタン-1,2-ジアミン(2.38g、27.0mmol)の無水ジクロロメタン(20mL)中溶液を加え、混合物を0℃にて撹拌し、15℃に一晩温めた。次いで、混合物を飽和水性NaHCO3でクエンチし、ジクロロメタン(3×100mL)で抽出した。合わせた有機抽出物を飽和水性NaHCO3(100mL)、水(100mL)で洗浄し、次いで、濃縮した。このように得られた残渣を40gのシリカゲル上で精製し、1:1のEtOAc:ジクロロメタンから10:1のEtOAc:メタノールの混合勾配で溶出させた。生成物含有画分をプールし、濃縮し、所望の化合物、#70(3.15g、51%収率)を黄色油状物として得た。LCMS(プロトコルO):m/z342.9[M+H]+、保持時間=0.536分。
6-アジド-N2-(tert-ブトキシカルボニル)-N-[2-(ジメチルアミノ)エチル]-L-ノルロイシンアミド(3.98g、11.6mmol)および1,3-プロパンスルトン(2.24g、18.4mmol)の無水EtOAc(70mL)中溶液、および反応混合物を窒素の雰囲気下で90℃にて16時間撹拌した。この期間に続いて、いくらかの白色の沈殿物が現れ、混合物を室温に冷却させ、一晩撹拌した。次いで、白色の沈殿物を濾過し、無水EtOAc(3×10mL)で洗浄し、乾燥させ、所望の生成物、#71(4.31g、79.8%)を白色固体として得た。LCMS(プロトコルQ):m/z466.3[M+H]+、保持時間=2.354分
3-[(2-{[6-アジド-N-(tert-ブトキシカルボニル)-L-ノルロイシル]アミノ}エチル)(ジメチル)アンモニオ]プロパン-1-スルホネート(0.2g、0.4mmol)のメタノール(10.8mL)およびジクロロメタン(2mL)中溶液を、4MのHCl/ジオキサン溶液(1mL、4mmol)で処理し、溶液を窒素雰囲気下で室温にて一晩撹拌した。反応物を濃縮し、次のステップにおいて精製をせずに直接使用した。LCMS(プロトコルO):m/z365.2[M+H]+、保持時間=0.61分
3-[{2-[(6-アジド-L-ノルロイシル)アミノ]エチル}(ジメチル)アンモニオ]-プロパン-1-スルホネート塩酸塩(0.2g、0.5mmol)の無水ジメチルスルホキシド(1.66mL)中溶液を、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(0.193g、1.50mmol、0.3mL)、2-(メチルスルホニル)ピリミジン-5-カルボン酸(0.111g、0.55mmol)、およびHATU(0.190g、0.50mmol)で逐次的に処理し、混合物を室温にて約1時間撹拌した。次いで、混合物を加熱せずに真空下で濃縮し、このように得られた残渣を12gのシリカゲル上で精製し、ジクロロメタン、それに続いてジクロロメタン中の0~100%メタノールの勾配で20分に亘り溶出させた。生成物含有画分をプールし、窒素流(加熱を伴わない)下で濃縮し、所望の生成物、#73を黄色の泡として得た。LCMS(プロトコルO):m/z549.3[M+H]+、保持時間=0.49分
コンジュゲーション手順A:抗体の内部ジスルフィド(天然システイン残基)へのリンカーペイロードのコンジュゲーションのための代表的な手順。H-(C)-#10の合成。
ダルベッコリン酸緩衝溶液(DPBS、Lonza、pH7.4)中の市販のHerceptin抗体(Genentech)溶液を、2.6当量のトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩(TCEP、DPBS中の5mM溶液)を添加することによって還元した。反応物を37℃にて1時間インキュベートし、次いで、周囲温度に冷却した。7当量のリンカーペイロード[化合物#10、N,N-ジメチルアセトアミド(DMA)中の10mM溶液]を加えることによってコンジュゲーションを行った。さらなるDMAを反応混合物に加えて、最終反応混合物中の15%(v/v)の総有機溶媒構成要素を達成した。反応物を周囲温度にて1時間インキュベートした。次に、反応混合物をGE Sephadexゲル脱塩カラムおよびDPBS(pH7.4)溶離液によって脱塩した。粗コンジュゲートを、GE Superdex200(10/300GL)カラムおよびDPBS(pH7.4)溶離液を有するGE AKTA Explorerシステムを使用してサイズ排除クロマトグラフィー(SEC)によって精製した。
20mMのトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン(TCEP)溶液(133μL、100当量)を、最終抗体濃度が5mMのEDTA(507μLのPBS/EDTA)を含有するPBS緩衝液中の5mg/mL(0.84mLの最終容量)であるように、抗体(4.2mg)に加えた。反応物を37℃にて1.5時間静置した後、50kDMWカットオフスピン濃縮装置(サイクル毎に3×2mLの洗浄、10×濃度)を使用して、抗体を5mMのEDTAを含有するPBSに緩衝液交換した。このように得られた抗体を、5mMのEDTAを含有するPBSを使用して824μLまで希釈し、新たに調製した1:1PBS/エタノール中のデヒドロアスコルビン酸(DHA)の50mM溶液(最終DHA濃度、約1mM)で処理し、4℃にて一晩放置した。50kDMWカットオフスピン濃縮装置(サイクル毎に3×2mLの洗浄、10×濃度)を使用して、抗体/DHA混合物を5mMのEDTAを含有するPBSに緩衝液交換した。このように得られた抗体(90μL、1.5mgのAb)を、PBS(204.3μL)およびN,N-ジメチルアセトアミド(30μL)に再懸濁させ、DMA中の5.7μL(Abに対して5×リンカーペイロード)の10mMのベンゾチアゾールペイロード(化合物30)で処理した。37℃にて24時間静置させた後、材料を、0.4mLの最終容量、DAR=1.6および濃度2.02mg/mLまで、(上記のように)PBS(サイクル毎に3×2mLの洗浄、10×濃度)に緩衝液交換した。
下記の表(表1および表2)において概要を述べるように、上記のコンジュゲーション手順Aおよび本明細書において開示されているリンカーペイロードを使用して、抗CD33mAb、CD33-11A1-v1417-hG1、および抗Her2mAb、Her2-PTを使用して、ならびに上記のコンジュゲーション手順Bを使用して、本明細書に記載されているリンカーペイロードを使用して、114位(H-(A114C))および183位(H-(kK183C))における操作されたシステイン残基を担持する種々の抗Her2mAb、ならびに290位および334位(CD33-11A1-v1417-(K290C)-(K334C))ならびに334位および392位(CD33-11A1-v1417-(K334C)-(K392C))における操作されたシステイン残基を担持する種々の抗CD33mAbについて上記の手順をまた行った。
H-(E380C)-#30の溶液(50mM中2.02mg/ml、pH7.4のPBS緩衝液、99μL、0.2mgのAb)に、さらなる50mMのpH7.4のPBS緩衝液(31.3μL)、それに続いて25mMの水性グルタチオン(GSH)溶液(2.7μL)を加え、10μMの最終タンパク質濃度を生じさせた。対照試料(GSHを有さない)を、PBSで10μMまで希釈した99μLのADCから同様に調製した。GSH-処理したADC試料および対照ADC試料を、37℃にてインキュベートし、0日目、4日目、および6日目において試料採取した。一定分量を過剰なTCEPで還元し、LC/MSによる添加量について分析した。比較物質として部位特異的にコンジュゲートされたmc-MMAD(H-(E380C)-mcMMAD)およびvc-0101(H-(E380C-mcValCitPABC-Aur0101)と共に、この研究、および本明細書に記載されている他のADCについてのさらなる研究の結果を、下記の表(表3)において示す。
Her2-標的を発現している(BT474(乳がん)、N87(胃がん)、MDA-MB-361-DYT2(乳がん))、またはHer2を発現していない(MDA-MB-468、HT29)細胞、またはCD33-標的を発現しているHL60、HEL92.1.7、NB4、またはCD33を発現していない(ラージ)細胞を、処理の前に96ウェル細胞培養プレートに24時間添加した。細胞を、3倍段階希釈した抗体薬物コンジュゲートまたは遊離化合物(すなわち、抗体は、薬物にコンジュゲートしていない)によって10の濃度にて2連で処置した。細胞生存率を、処置の96時間後にCellTiter96(登録商標)AQueous One Solution細胞増殖MTSアッセイ(Promega、Madison WI)によって決定した。相対的細胞生存率を、未処置対照の百分率として決定した。IC50値を、4パラメーターロジスティックモデル#203を使用してXLfit v4.2(IDBS、Guildford、Surry、UK)で計算した。結果を表4(Herceptinコンジュゲートについて)または表5(CD33コンジュゲートについて)において下記で示す。
Claims (12)
- 式(I)の化合物
[式中、
Hetは、
各Eは、-C(R1)2-、-O-C(R1)2-C(R1)2-(式中、rは、少なくとも2である)、および-C(R1)2-C(R1)2-O-(式中、sは、少なくとも1である)からなる群から独立に選択され、
各R1は、H、C1~C6直鎖状もしくは分岐状アルキル、C2~C6直鎖状もしくは分岐状アルケニル、およびC2~C6直鎖状もしくは分岐状アルキニルからなる群から独立に選択され、
R2は、ハロゲンもしくはハロアルキルで置換されていてもよいC1~C10アルキル、またはハロゲンもしくはハロアルキルで置換されていてもよいC5~C12アリールであり、
各Xは、独立に、アミノ酸であり、各アミノ酸Xは、同じであるか、または異なり、
各Yは、独立に、アミノ酸であり、各アミノ酸Yは、同じであるか、または異なり、
各Zは、独立に、スペーサー要素であり、各スペーサー要素は、同じであるか、または異なり、
mは、0~5であり、nは、0~5であり、pは、0~2であり、qは、0~10であり、rは、0~2であり、sは、0~2であり、tは、0~1であり、wは、1であり、
Dは、活性剤、または活性剤に結合することができる部分である]。 - 式(II)の化合物:
[式中、
Pは、少なくとも1個の天然もしくは操作されたシステイン残基を含むペプチド配列であるか、またはPは、少なくとも1個の遊離の硫黄原子を含む部分であり、
Sは、P内の硫黄原子であり、
Hetは、
各Eは、-C(R1)2-、-O-C(R1)2-C(R1)2-(式中、rは、少なくとも2である)、および-C(R1)2-C(R1)2-O-(式中、sは、少なくとも1である)からなる群から独立に選択され、
各R1は、H、C1~C6直鎖状もしくは分岐状アルキル、C2~C6直鎖状もしくは分岐状アルケニル、およびC2~C6直鎖状もしくは分岐状アルキニルからなる群から独立に選択され、
各Xは、独立に、アミノ酸であり、各アミノ酸Xは、同じであるか、または異なり、
各Yは、独立に、アミノ酸であり、各アミノ酸Yは、同じであるか、または異なり、
各Zは、独立に、スペーサー要素であり、各スペーサー要素は、同じであるか、または異なり、
mは、0~5であり、nは、0~5であり、pは、0~2であり、qは、0~10であり、rは、0~2であり、sは、0~2であり、tは、0~1であり、wは、2であり、
Dは、活性剤、または活性剤に結合することができる部分である]。 - Dが、細胞毒性部分である、請求項1または2に記載の化合物、またはその薬学的に許容できる塩もしくは溶媒和物。
- Dが、アントラサイクリン、アウリスタチン、スプライソスタチン、CBIダイマー、CPIダイマー、CTIダイマー;CBI、CPIおよびCTIから選択される2つの異なるモノマーを含むダイマー;カリケアマイシン、エスペラミシンおよびネオカルチノスタチンから選択されてもよいエンジイン;デュオカルマイシン、ゲルダナマイシン、メイタンシン、ピューロマイシン、タキサン、ビンカアルカロイド、SN38、ツブリシン、ヘミアステリン、カンプトテシン、コンブレタスタチン、ドラスタチン、インドリノベンゾジアゼピンダイマー、ピロロベンゾジアゼピンダイマーおよびプラジエノライド、ならびにその立体異性体、もしくはアイソスターからなる群から選択されるか;または
Dが、治療剤、抗ウイルス剤、免疫学的薬剤、フルオロフォア、非フルオロフォア造影剤である、請求項4に記載の化合物、またはその薬学的に許容できる塩もしくは溶媒和物。 - Dが、ドラスタチン、MMAD、MMAE、MMAF、PF-06380101、PF-06463377、PF-06456780、PF-06843982、PF-06874082、PF-06852321、PF-06757725、PF-06859944およびPF-06698970から選択される、請求項4に記載の化合物、またはその薬学的に許容できる塩もしくは溶媒和物。
- Zが、ZA-(ZB)1~3または(ZB)1~3-ZAであり、
ZAが、ZA1-ZA2またはZA2-ZA1であり、
ZA1が、存在しないか、または-C(O)-、-C(S)-、-C(O)NR-、-C(O)C1~C6アルキル-、-C(O)NRC1~C6アルキル-、-C1~C6アルキル(OCH2CH2)1~6-、-C(O)C1~C6アルキルNRC(O)-、-C(O)C1~C6アルキル(OCH2CH2)1~6-、-C1~C6アルキル(OCH2CH2)1~6-C(O)-、-C1~C6アルキル-S-S-C1~C6アルキルNRC(O)CH2-、-C1~C6アルキル(OCH2CH2)1~6NRC(O)CH2-、-C(O)C1~C6アルキル-NRC(O)C1~6アルキル-、-N=CR-フェニル-O-C1~C6アルキル-、-N=CR-フェニル-O-C1~C6アルキル-C(O)-、-C(O)-C1~C6アルキル(OCH2CH2)1~6NRC(O)-、-C(O)C1~C6アルキル-フェニル(NR-C(O)C1~C6アルキル)1~4-、-C(O)C1~C6アルキル(OCH2CH2)1~6-NRC(O)C1~C6アルキル-、-C1~C6アルキル-、-S-、-C(O)-CH(NR-C(O)C1~C6アルキル)-C1~C6アルキル-および(-CH2-CH2-O-)1~20からなる群から選択される1つもしくは複数の構成要素であり、
ZA2が、-PABA-、-PABC-、-C(O)(CH2)nC(O)-であるか、または存在せず、
ZBが、存在しないか、または-C1~C6アルキレン-、-NRC3~C8-ヘテロシクリルNR-、-NRC3~C8-カルボシクリルNR-、-NRC1~C6アルキルNR-、-NRC1~C6アルキレン-、-S-、-NR-、-NRNR-、-O(CR2)1~4S-S(CR2)1~4N(R)-、-NRC1~C6-アルキレンフェニレンNR-、-NRC1~C6アルキレンフェニレンSO2NR-、-OC1~C6アルキルS-SC1~C6アルキルC(COOR)NR-、-NRC(COOR)C1~C6アルキルS-SC1~C6アルキルO-からなる群から独立に選択される、請求項1または2に記載の化合物、またはその薬学的に許容できる塩もしくは溶媒和物。 - 請求項1から9のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容できる塩もしくは溶媒和物、および薬学的に許容できる添加剤を含む医薬組成物。
- がんを処置するために用いるための、請求項10に記載の医薬組成物。
- 前記がんが、膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、結腸がん、子宮内膜がん、腎臓がん、肺がん、食道がん、卵巣がん、前立腺がん、膵臓がん、皮膚がん、胃(胃の)がん、睾丸がん、白血病およびリンパ腫である、請求項11に記載の医薬組成物。
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