JP2023511857A - 付加環化を介して両側官能化された抗体 - Google Patents
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Abstract
本発明は、ペイロード抗体比1を有する抗体-ペイロードコンジュゲートを提供する。抗体-ペイロードコンジュゲートは、構造(1):式(1)(式中、a、b及びcはそれぞれ独立に、0又は1であり;L1、L2及びL3はリンカーであり;Dはペイロードであり;BMは分岐部分であり;Zは付加環化反応によって得ることができる接続基である)を有する。本発明は、本発明による抗体-ペイロードコンジュゲートを調製する方法、その調製方法における中間体化合物、及び本発明による抗体-ペイロードコンジュゲートの医学的使用をさらに提供する。
Description
[0001]本発明は、バイオコンジュゲーションの分野、特に単一ペイロードを含有する抗体コンジュゲート(薬物抗体比1)に関する。より詳細には、本発明は、付加環化反応を介したIgG型抗体へのペイロードの付着に適したコンジュゲート、組成物及び方法に関する。化合物、組成物、及び方法としての単官能化抗体コンジュゲートは、例えば、極めて強力な細胞傷害剤又は免疫調節剤などのペイロードの標的化送達用の新規な薬物の提供において有用となり得る。
[0002]治療における魔法の弾丸と考えられている抗体-薬物複合体(ADC)は、医薬品が付着している抗体から構成されている。抗体(リガンドとしても知られる)は、小型タンパク質フォーマット(scFv、Fabフラグメント、DARPin、アフィボディ等)であり得るが、一般的には、所与の抗原に対するその高い選択性及び親和性、その長い循環半減期、並びに免疫原性がほとんど~全くないことに基づいて選択されているモノクローナル抗体(mAb)である。よって、慎重に選択された生物学的受容体のタンパク質リガンドとしてのmAbは、医薬品の選択的標的化のための理想的な送達プラットフォームを提供する。例えば、特定のがん関連抗原と選択的に結合することが知られているモノクローナル抗体を、活性異化産物の結合、内部移行、細胞内プロセシング及び最終的には放出を介した、化学的にコンジュゲートされた細胞傷害剤の腫瘍への送達に使用することができる。細胞傷害剤は低分子毒素、タンパク質毒素又は他のフォーマット、例えばオリゴヌクレオチドであり得る。結果として、抗体によって標的化されなかった正常細胞を温存しながら、腫瘍細胞を選択的に根絶することができる。同様に、抗菌薬(抗生物質)の抗体への化学的コンジュゲーションを細菌感染症の処置に適用することができ、一方、抗炎症薬のコンジュゲートは自己免疫疾患の処置について調査中であり、例えば、オリゴヌクレオチドの抗体への付着は神経筋疾患の処置のための潜在的に有望なアプローチである。よって、活性医薬品の、選択された特定の細胞位置への標的化送達の概念は、同じ薬物の全身送達と比較して多くの有益な側面を有する、広範囲の疾患を処置するための強力なアプローチである。
[0003]特定のタンパク質薬剤の標的化送達のためにモノクローナル抗体を採用する代替戦略は、軽鎖又は重鎖(又は両方)のN末端又はC末端であり得る1つ(又は複数)の抗体の末端への前者のタンパク質の遺伝子融合によるものである。この場合、目的の生物学的に活性なタンパク質、例えばシュードモナス(Pseudomonas)外毒素A(PE38)などのタンパク質毒素又は抗CD3単鎖可変領域フラグメント(scFv)は、必ずしもそうではないがおそらくペプチドスペーサーを介した、抗体との融合体として遺伝的にコードされるので、抗体は融合タンパク質として発現される。ペプチドスペーサーは、プロテアーゼ感受性切断部位を含有してもよいし、しなくてもよい。
[0004]モノクローナル抗体は、タンパク質配列自体を遺伝子改変して、その構造を修飾し、それによって、特定の特性を導入(又は除去)することもできる。例えば、抗体Fcフラグメントに突然変異を導入して、Fcガンマ受容体への結合を無化する(nihilate)ことができ、FcRn受容体への結合、若しくは特定のがん標的への結合を調節することができ、又は抗体を操作してpIを低下させ、循環からのクリアランス速度を制御することができる。がん処置において新たに出現した戦略は、T細胞又はNK細胞再指向性抗体としても知られる、上方制御された腫瘍関連抗原(TAA又は単に標的)並びにがん破壊免疫細胞(例えば、T細胞又はNK細胞)上に存在する受容体に結合することができる抗体の使用を伴う。免疫細胞再指向のアプローチの歴史は既に30年を超えているが、新たな技術が、第一世代免疫細胞再指向性抗体の制限を克服している、特に、半減期を延長して間欠性投薬を可能にし、免疫原性を低下させ、安全性プロファイルを改善している。最も一般的には、T細胞再指向性二重特異性抗体(TRBA)は、FABフラグメントのアームの一方の補体依存性領域(CDR)を、T細胞上のCD3又はCD137(4-1BB)に密接に結合する抗体フラグメントに遺伝子スワッピングすることによって作製される。しかしながら、これらの伝統的なT細胞エンゲージング二重特異性抗体に加えて、多種多様な他の分子構造、典型的にはIgG型も、例えばYu及びWang、J.Cancer Res.Clin.Oncol.2019、145、941~956に開示されるように開発されている。同様に、腫瘍微小環境へのNK細胞動員も広範に調査されている。NK細胞エンゲージメントは、CD16、CD56、NKp46、又は他のNK細胞特異的受容体に選択的に結合する抗体(フラグメント)のIgG足場への挿入に典型的に基づく。
[0005]ADCの分野並びに免疫細胞エンゲージメントの分野で一般的な戦略は、抗体のFcガンマ受容体への結合能の無化(nihilation)又は除去を採用し、これには複数の製薬上の意味がある。Fcガンマ受容体への結合の除去の最初の結果は、例えばカドサイラ(Kadcyla)(登録商標)(トラスツズマブ-DM1)及びLOP628について報告されるように用量制限毒性がもたらし得る、例えばマクロファージ又は巨核球による抗体のFcガンマ受容体媒介取り込みの減少である。インビボでの抗体の選択的脱グリコシル化は、抗体媒介自己免疫を有する患者を処置する機会を与える。例えばGorovits及びKrinos-Fiorotti、Cancer Immunol.Immunother.2013、62、217~223並びにGoetzeら、Glycobiology 2011、21、949~959(共に参照により組み込まれる)によって記載されるように、高マンノースグリコフォームは内因性マンノース受容体による非特異的取り込み及び急速なクリアランスをもたらすことによって治療有効性を損なうことが知られているので、組換え治療用糖タンパク質の高マンノースグリコフォームの除去は有益となり得る。さらに、Van de Bovenkampら、J.Immunol.2016、196、1435~1441(参照により組み込まれる)は、高マンノースグリカンが免疫にどのように影響を及ぼし得るかを記載している。モノクローナル抗体の不適切なグリコシル化は、発現されるIg遺伝子からの無効な産生に寄与し得ることがReusch及びTejada、Glycobiology 2015、25、1325~1334(参照により組み込まれる)によって記載された。免疫療法の分野では、グリコシル化抗体の免疫細胞上のFcガンマ受容体への結合が、抗体の腫瘍関連抗原への結合の前に、免疫系の全身活性化を誘導し、サイトカインストーム(サイトカイン放出症候群、CRS)をもたらし得る。したがって、CRSのリスクを低下させるために、臨床における免疫細胞エンゲージャーの大多数は、Fcガンマ受容体に結合する能力を欠くFcサイレンシング抗体に基づく。さらに、二重特異性抗体の分野における様々な企業が、免疫細胞エンゲージング抗体ドメインに対する標的結合に関して規定の比を有するように分子構造を適合させている。例えば、Rocheは、両CDRによるTAA(例えば、CD20又はCEA)への二価結合能を保持しているが、2本の重鎖のうちの一方のみに改変された追加の抗CD3フラグメントを有する(2:1比の標的結合:CD3結合)、非対称モノクローナル抗体に基づくT細胞エンゲージャーを開発している。同様の戦略は、抗CD137(4-1BBB)によるT細胞のエンゲージメント/活性化又は抗CD16、CD56、NKp46、若しくは他のNK細胞特異的受容体によるNK細胞エンゲージメント/活性化に採用することができる。
[0006]Fcガンマ受容体への結合の抑止は、様々な方法で、例えば抗体(詳細には、Fcフラグメント)の特定の変異によって、又はFcフラグメント(CH2ドメイン、N297の周り)に天然に存在するグリカンの除去によって達成することができる。グリカン除去は、Fcドメインの遺伝子改変、例えばN297Q変異若しくはT299A変異によって、又は例えばPNGase F若しくはエンドグリコシダーゼを使用した、抗体の組換え発現後のグリカンの酵素的除去によって達成することができる。例えば、エンドグリコシダーゼHは高マンノース及びハイブリッドグリコフォームをトリミングするが、複合型グリカンをトリミングしないことが知られているが、エンドグリコシダーゼSは複合型グリカン及びある程度はハイブリッドグリカンをトリミングすることができるが、高マンノース形態をトリミングすることができない。エンドグリコシダーゼF2は複合型グリカンをトリミングすることができ(但し、ハイブリッドをトリミングすることはできない)、エンドグリコシダーゼF3は1,6-フコシル化もされている複合型グリカンをトリミングすることができるだけである。別のエンドグリコシダーゼであるエンドグリコシダーゼDはMan5(M5)グリカンのみを加水分解することができる。様々なエンドグリコシダーゼの詳細な活性の概要は、参照により本明細書に組み込まれる、Freezeら Curr.Prot.Mol.Biol.、2010、89:17.13A.1~17に開示されている。治療用途のためのタンパク質の脱グリコシル化の追加の利点は、促進されたバッチ間一貫性及び有意に改善した均質性である。
[0007]ADCの分野においては、化学的リンカーを典型的に採用して、医薬品を抗体に付着させる。このリンカーは、薬物投与後、長期間にわたって血漿中で安定であるための要件を含む、いくつかの重要な属性を有する必要がある。安定なリンカーは、体内の計画された部位又は細胞へのADCの局在化を可能にし、あらゆる種類の望ましくない生物学的応答を無差別に誘導し、それによってADCの治療指数を低下させるであろう、循環中へのペイロードの早すぎる放出を防止する。内部移行すると、ADCは、ペイロードが有効に放出され、その標的に結合することができるようにプロセシングされるべきである。
[0008]非切断可能と切断可能の2つのファミリーのリンカーが存在する。非切断可能リンカーは、どの器官又は生物学的区画に抗体-薬物コンジュゲートが存在するかにかかわらず生理的条件下で完全に安定である、抗体とペイロードとの間の原子の鎖からなる。結果として、非切断可能リンカーを含むADCからのペイロードの遊離は、ADCの細胞への内部移行後の抗体の完全な(リソソーム)分解に依拠する。この分解の結果として、リンカー、並びにリンカーが元々付着していた抗体由来のペプチドフラグメント及び/又はアミノ酸を依然として保有するペイロードが放出される。切断可能リンカーは、ADCからのペイロードの選択的放出のために細胞又は細胞区画の固有の特性を利用し、代謝プロセシング後にリンカーの痕跡を一般的に残さない。切断可能リンカーについては、以下の3つの一般的に使用される機序が存在する:1)特定の酵素に対する感受性、2)pH感受性、及び3)細胞(又はその微小環境)の酸化還元状態に対する感受性。
[0009]酵素ベースの戦略は、特定のプロテアーゼ、エステラーゼ、グリコシダーゼなどの内因的存在に一般的に基づく。例えば、腫瘍学で使用されるADCの大部分は、リンカーの特定のペプチド配列の認識及び切断に腫瘍細胞リソソームに見られる優勢なプロテアーゼを利用する。参照により組み込まれる、Dubowchikら、Bioconjug Chem.2002、13、855-69は、カテプシンによる細胞内切断機序としての特定のジペプチドの発見を開拓した。腫瘍リゾチーム又は腫瘍微小環境において上方制御されることが知られている他の酵素は、プラスミン、マトリックスメタロプロテアーゼ(MMP)、ウロキナーゼなどであり、これらの全てが、ADCの特定のペプチド配列を認識し、ペプチド結合のうちの1つの加水分解性切断によってリンカーからのペイロードの放出を誘導し得る。エステラーゼもエステル結合の加水分解でのペイロードの細胞内放出に採用され得、例えば、ヒトカルボキシルエステラーゼ2(CES2、hiCE)が、ペイロード自体のインビボ抗腫瘍有効性よりも優れているか、又はこれと同等である、CES2陽性異種移植片に対するドキソルビシンプロドラッグのインビボ抗腫瘍有効性を示したことが、参照により組み込まれる、Barthelら、J.Med.Chem.2012、55、6595~6607によって実証された。第3に、様々なグリコシダーゼ、特に例えば参照により組み込まれる、Torgovら、Bioconj.Chem.2005、16、717~721及びJeffreyら、J.Med.Chem.2006、17、831~840にそれぞれ例示されるガラクトシダーゼ(ガラクトースの除去のため)又はグルクロニダーゼ(グルクロン酸の除去のため)が、特定の単糖の選択的切断に採用され得る。結合の腫瘍特異的加水分解性切断に採用され得る他の内因性酵素は、例えばホスファターゼ又はスルファターゼである。
[0010]内因性酵素の使用に加えて、天然では豊富ではない場合がある、選択されるいずれかの酵素の局所濃度増強を、静脈内注射、腫瘍内注射又はADEPT(抗体による指向性を用いた酵素プロドラッグ療法(antibody-directed enzyme prodrug therapy))などの他の方法による全身投与などの戦略によって達成することができる。
[0011]酸感受性戦略は、ヒト細胞のサイトゾル(pH7.4)と比較して低いエンドソーム(pH5~6)及びリソソーム(pH4.8)区画のpHを利用して、ヒドラゾンなどのリンカー内の酸不安定基の加水分解を誘因する。例えば、参照により組み込まれる、Ritchieら、mAbs 2013、5、13~21を参照されたい。例えば米国特許出願公開第20180200273号に開示されるシリルエーテルに基づく、代替の酸感受性リンカーも採用され得る。
[0012]酸化還元機序に基づく第3の放出戦略は、血漿中よりも高濃度の細胞内グルタチオンを活用する。よって、ジスルフィド架橋を含有するリンカーは、グルタチオンによる還元で遊離チオール基を放出し、ペイロードの一部のままであり得るか、又はさらなる自壊性により遊離ペイロードを放出し得る。遊離ペイロードの放出についての代替の還元機序は、(芳香族)ニトロ基又は(芳香族)アジド基のアニリンへの変換に基づくことができ、アニリンはペイロードの一部又は自壊性組み立て単位(self-immolative assembly unit)の一部であり得る。
[0013]抗体-薬物コンジュゲートの自壊性組み立て単位は、薬物単位をコンジュゲートの残り又はその薬物-リンカー中間体に連結する。自壊性組み立て単位の主な機能は、リガンド単位によって標的化された部位で遊離薬物を条件的に放出することである。活性化可能自壊性部分は、活性化可能基及び自壊性スペーサー単位を含む。例えばアミド基のアミノ基への酵素的変換によって、又はジスルフィドの遊離チオール基への還元によって、活性化可能基が活性化すると、任意選択で二酸化炭素の放出を伴う、及び/又は第2の環化放出機序が続く、p-アミノベンジル基のp-キノンメチドへの(一時的な)1,6-脱離を伴い得る、様々な機序のうちの1つ又は複数によって遊離薬物の放出をもたらす自壊性反応順序が開始される。自壊性組み立て単位は、(官能基を介して)抗体とペイロードを接続する化学的スペーサーの一部であり得る。或いは、自壊性基は、化学的スペーサーの固有の部分ではないが、抗体とペイロードを接続する化学的スペーサーから分岐する。
[0014]販売承認されているか、又は現在後期臨床試験中である抗体-薬物コンジュゲートの大部分は、活性薬物の放出のために上記の機序のうちの1つを採用している。例えば、アドセトリス(Adcetris)(登録商標)は、様々な血液腫瘍の処置に使用されるADCであり、自壊性p-アミノベンジルオキシカルボニル基(PAB)に接続されたカテプシン感受性フラグメントからなるリンカーを介して極めて強力なチューブリン阻害剤MMAE(ペイロード)に接続された、CD30標的化抗体(リガンド)で構成される。MMAEの放出について同じ機序が、ポラツズマブ-ベドチン(ポライビー(Polivy)(登録商標))について有効である。プロテアーゼ/ペプチダーゼ感受性リンカーを採用する主試験中の他のADCは、SYD985、ADCT-402、ASG-22CE及びDS-8201aである。ペイロードのプロテアーゼ媒介放出は、腫瘍学の外側の領域において、詳細には細菌感染症を処置するために開発中のADCであるRG7861(DSTA4637S)の設計の一部でもある。
[0015]酸感受性基、特にヒドラゾン基を介してDNA損傷ペイロード(カリケアミシン)に接続された抗体からなる2種類のADCが承認されている(ベスポンサ(Besponsa)(登録商標)及びマイロターグ(Mylotarg)(登録商標))。同様に、第III相臨床試験中のADCであるサシツズマブゴビテカンは、カーボネート基の酸加水分解を介したペイロードの放出を採用する。グルタチオン感受性ジスルフィド基は、抗体をメイタンシノイドペイロードDM4に接続するためのミルベツキシマブソラブタンシンにおける、及びまたIMGN853におけるリンカーの一部である。現在、75種を超えるADCが様々な臨床試験段階にあり、そのうちの少なくとも70%がある形態の切断可能リンカーを含有している。
[0016]上記のように、自壊性単位は、アミノ基の酵素的放出のためにプロテアーゼ感受性ペプチドフラグメントに接続された(アシル化)パラ-アミノベンジル単位の、ほとんどの場合少なくとも存在する多くのADCのリンカーの一部である。アミノベンジル基に加えて、他の芳香族部分、例えばピリジン又はチアゾールなどの複素芳香族部分も自壊性単位のための部分として採用され得る。例えば、米国特許第7754681号及び米国特許出願公開第2005/0256030号を参照されたい。アミノベンジル基の置換はパラ位又はオルト位であり得、両方の場合で、同じ1,6-脱離機序をもたらし得る。ベンジル位は、例えば参照により組み込まれる、国際公開第2015/038426号に開示されるように、アルキル又はカルボニル誘導体、例えばマンデル酸から誘導されるエステル又はアミドで置換され得る。自壊性単位のベンジル位は、典型的には、それだけに限らないが、酸素又は窒素に基づく、ヘテロ原子脱離基に接続されている。主に、1,6-脱離機序の誘因で二酸化炭素を放出する、カルバメート部分のベンジル官能基、及び第一級又は第二級アミノ基が存在する。第一級又は第二級アミノ基は、毒性ペイロード自体の一部であり得、芳香族アミノ基又は脂肪族アミノ基であり得る。後者の場合、遊離ペイロードのアミノ基が、おそらくより高いpKaを有し、したがって、主に生理的条件(pH7~7.5)、及び詳細には腫瘍の酸性環境(pH<7)でプロトン化状態となる。
[0017]第一級又は第二級アミノ基は、別の自壊性基、例えばN,N-ジアルキルエチレンジアミン部分の一部であってもよい。他方でN,N-ジアルキルエチレンジアミン部分は、例えば参照により組み込まれる、Elgersmaら、Mol.Pharm.2015、12、1813~1835によって実証されるように、別のカルバメート基に接続されており、環化すると、毒性ペイロードの一部としてアルコール基を遊離し得る。カルバメート部分の第一級又は第二級アミノ基はまた、N,O-アセタールの一部を形成してもよく、例えば5-フルオロウラシル(Madec-Lougerstayら、J.Chem.Soc.Perkin Trans I、1999、1369~1375)及びSN-38(Santiら、J.Med.Chem.2014、57、2303~2314)を放出するためのいくつかの薬物送達戦略で使用されている方法である。ごく最近では、脂肪族アルコールを放出するために、ベータ-グルクロニダーゼ促進放出機序と組み合わせて、ADCの長い循環時間のために長期血清曝露を有するリンカーを設計するために、同様の構成が、参照により組み込まれる、Kolakowskiら、Angew.Chem.Int.Ed.2016、55、7948~7951によって採用された。自壊性芳香族部分のベンジル位の官能基はまた、フェノール酸素であってもよい(例えば、参照により組み込まれる、Tokiら、J.Org.Chem.2002、67、1866~1872及び米国特許第7553816号参照)が、脂肪族アルコールは十分な脱離基能力(典型的にはpKa13~15)を有さないので、脂肪族アルコールであることはできない。ベンジル官能基の別の選択肢は、参照により組み込まれる、Burkeら、Mol.Cancer Ther.2016、15、938~945及びStabenら、Nat.Chem.2016、8、1112~1119によって報告されるように、脱離でトリアルキルアミノ基又はヘテロアリールアミンを放出する第四級アンモニウム基である。
[0018]現在、ADCに利用されているペイロードは、微小管破壊剤[例えば、モノメチルアウリスタチンE(MMAE)並びにメイタンシノイド由来DM1及びDM4]、DNA損傷剤[例えば、カリケアミシン、ピロロベンゾジアゼピン(PBD)二量体、インドリノベンゾジアゼピン二量体、デュオカルマイシン、アントラサイクリン]、トポイソメラーゼ阻害剤[例えば、SN-38、エキサテカン及びその誘導体、シミテカン]又はRNAポリメラーゼII阻害剤[例えば、アマニチン]を含む。ADCは臨床及び前臨床活性を示しているが、標的化腫瘍細胞上の抗原発現に加えて、どの因子がこのような効力を決定するかはずっと不明確である。例えば、薬物:抗体比(DAR)、ADC結合親和性、ペイロードの効力、受容体発現レベル、内部移行速度、輸送、多剤耐性(MDR)状態、及び他の因子は全て、インビトロでADC処置の転帰に影響を及ぼすことが暗に示されている。抗原陽性腫瘍細胞の直接的な殺傷に加えて、ADCはまた、Sahinら、Cancer Res.1990、50、6944~6948によって最初に報告され、例えばLiら、Cancer Res.2016、76、2710~2719によって研究されるように、隣接する抗原陰性腫瘍細胞も殺傷する能力:いわゆる「バイスタンダー殺傷」効果を有する。一般的に言うと、中性の細胞傷害性ペイロードはバイスタンダー殺傷を示すが、イオン性(帯電)ペイロードは、イオン性種が受動拡散によって細胞膜を容易に通過しないという事実の結果として、バイスタンダー殺傷を示さない。例えば、参照により組み込まれる、Ogitaniら、Cancer Sci.2016、107、1039~1046によって開示されるように、様々なエキサテカン誘導体の評価は、ヒドロキシ酢酸による第一級アミンのアシル化が、様々なアミノアシル化エキサテカン誘導体と比較して実質的に増強されたバイスタンダー殺傷体を伴う誘導体(DXd)を提供することを示した。
[0019]この分野の臨床試験及び販売されているADCの大部分の欠点は、毒性ペイロードが、参照により組み込まれる、Donaghyら、MAbs 2016、8、659~71によって概説される用量制限オフターゲット毒性を誘導し得ることである。例えば、ADCは分化中の造血幹細胞に取り込まれて、毒性ペイロードの放出、巨核球増殖及び分化の阻害をもたらし、よって、血小板の生成を妨げ、最終的に血小板減少症をもたらし得ることが、参照により組み込まれる、Thonら Blood 2012、120、1975~84によって実証された。同様に、ヒドラゾンリンカーの不安定性が、2010年に市場から撤退した(しかしながら、後に再導入された)マイロターグ(Mylotarg)(登録商標)の安全性の問題に関与していたと考えられている。カテプシンによるタンパク質分解性切断のために設計されたリンカーが、エステラーゼCes1cなどの他の酵素によっても切断され得ることが示されている(参照により組み込まれる、Dorywalskaら、Mol.Cancer Ther.2016、15、958~970によって報告されている)。実際、カテプシンBの非存在下でさえ、ペプチドベースの切断可能リンカーは細胞プロセシングを容易に受けて遊離ペイロードを放出することが、参照によって組み込まれる、Caculitanら、Cancer Res.2017、7027~7037によって実証された。さらに、分化中の好中球によるエラスターゼの排出が、毒性ペイロードの早すぎる放出を引き起こし得、MMAEベースのADCで処置されたがん患者において一般的な有害事象である好中球減少症の原因の1つであることが、Zhaoら(参照により組み込まれる、Mol.Cancer Ther.2017、16、1866~1876)によって実証された。
[0020]当技術分野で公知の抗体コンジュゲートはいくつかの欠点が問題となり得る。抗体-薬物コンジュゲートについては、抗体への毒素の担持の尺度が、薬物抗体比(DAR)によって与えられ、この比は抗体1つ当たりの活性物質分子の平均数を与える。一般に、ADCの作製のために2つの一般的なアプローチを特定することができ、1つは内因性アミノ酸へのランダム(確率的)コンジュゲーションを介するものであり、1つは抗体の天然部位又はこのような目的のために抗体内に設計された部位であり得る抗体中の1つ又は複数の特定の部位へのコンジュゲーションを伴うものである。
[0021]確率的コンジュゲーションによってADCを調製する方法は、2.5~4の間のDARを有する生成物を一般的にもたらすが、実際は、このようなADCは、0~8又はそれ以上で変化する目的の分子の数を有する抗体コンジュゲートの混合物を含む。換言すれば、確率的コンジュゲーションによる抗体コンジュゲートは、高い標準偏差を有するDARで一般的に形成される。例えば、ゲムツズマブオゾガマイシンは、50%のコンジュゲート抗体(抗体の溶媒露出リジン残基にランダムに連結した、平均2又は3のIgG分子1つ当たり0~8個のカリケアミシン部分)と50%の非コンジュゲート抗体の不均一混合物である(共に参照により組み込まれる、Brossら、Clin.Cancer Res.2001、7、1490;Labrijnら、Nat.Biotechnol.2009、27、767)。臨床におけるブレンツキシマブベドチン(アドセトリス(登録商標))、カドサイラ(Kadcyla)(登録商標)(T-DM1)、及び他のADCについては、正確に何個の薬物が任意の所与の抗体に付着しているかは依然として制御不能であり、したがって、大部分がDAR3~4を有するコンジュゲートの統計分布としてADCが得られる。より高いDARを達成するための1つのアプローチは、モノクローナル抗体中の全ての(4つの)鎖間ジスルフィド結合を還元し、それによって、遊離チオールとしての合計8個のシステイン側鎖を遊離し、引き続いてマレイミド官能化ペイロードとの全体的なコンジュゲーションをして、6~8の間の最終的なDARに到達することによるものである。この方法論は、例えばIMMU-132、IMMU-110、DS-8201a、U3-1402、SGN-CD48a及びSGN-CD228Aを含む、様々な臨床段階のADCで適用されており、様々なペイロードに適用することができるが、還元ステップ中のフラグメントスクランブリングのためにIgG1以外の抗体にはあまり適さない。
[0022]参照により組み込まれる、G.T.Hermanson、「Bioconjugate Techniques」、Elsevier、第3版 2013に要約されるように、バイオコンジュゲーションについて多くの技術が知られている。2つの主要な技術が、リジン側鎖のアシル化に基づくか、又はシステイン側鎖のアルキル化に基づく、ランダムコンジュゲーションによるADCの調製について認識され得る。リジン側鎖のε-アミノ基のアシル化は、タンパク質を活性化エステル又は活性化カーボネート誘導体に基づく試薬に供することによって典型的に達成され、例えばカドサイラ(登録商標)の製造にはSMCCが適用される。システイン側鎖のチオール基のアルキル化についての主要な化学は、例えばアドセトリス(Adcetris)(登録商標)の製造に適用されるように、マレイミド試薬の使用に基づく。標準的なマレイミド誘導体に加えて、例えば共に参照により組み込まれる、James Christieら、J.Contr.Rel.2015、220、660~670及びLyonら、Nat.Biotechnol.2014、32、1059~1062によって実証されるように、ある範囲のマレイミドバリアントもより安定なシステインコンジュゲーションに適用される。システイン側鎖へのコンジュゲーションのための別の重要な技術は、タンパク質毒素、化学療法薬、及びプローブを担体分子に可逆的に接続するために利用されている生物活性化可能接続であるジスルフィド結合によるものである(例えば、Pillowら、Chem.Sci.2017、8、366~370参照)。システインアルキル化のための他のアプローチは、例えばハロアセトアミド(典型的にはブロモアセトアミド又はヨードアセトアミド)の求核置換(例えば参照により組み込まれる、Alleyら、Bioconj.Chem.2008、19、759~765参照)、又はアクリレート試薬との反応(例えば、共に参照により組み込まれる、Bernardimら、Nat.Commun.2016、7、DOI:10.1038/ncomms13128及びAriyasuら、Bioconj.Chem.2017、28、897~902参照)、ホスホンアミデート(phosphonamidate)との反応(例えば、参照により組み込まれる、Kasperら、Angew.Chem.Int.Ed.2019、58、11625~11630参照)、アレンアミドとの反応(例えば、参照により組み込まれる、Abbasら、Angew.Chem.Int.Ed.2014、53、7491~7494参照)、シアノエチニル試薬との反応(例えば、参照により組み込まれる、Kolodychら、Bioconj.Chem.2015、26、197~200参照)、ビニルスルホンとの反応(例えば、参照により組み込まれる、Gil de Montesら、Chem.Sci.2019、10、4515~4522参照)、若しくはビニルピリジンとの反応(例えば、https://iksuda.com/science/permalink/(2020年1月7日にアクセス)参照)などの、不飽和結合への求核付加に基づく様々なアプローチを伴う。メチルスルホニルフェニルオキサジアゾールとの反応も、参照により組み込まれる、Todaら、Angew.Chem.Int.Ed.2013、52、12592~12596によってシステインコンジュゲーションについて報告されている。
[0023]臨床的ADCの大部分(約65%)はランダムペイロード付着に基づくが、部位特異的ADCに改善した治療指数がついてくるという知見に基づいて、部位特異的コンジュゲートADCに向かう明らかな傾向がある。このため、抗体の1つ(又は複数)の所定の部位(複数可)への部位特異的コンジュゲーションによって、規定のDARを有する抗体-薬物コンジュゲートの作製を可能にするいくつかの方法が開発されている。部位特異的コンジュゲーションは、ペイロード付着のためのアンカー点として働く、特定のアミノ酸(又は配列)の抗体への設計(例えば、参照により組み込まれる、Aggerwal及びBertozzi、Bioconj.Chem.2014、53、176~192参照)、最も典型的にはシステインの設計によって典型的に達成される。そのうえ、過去10年間で、ある範囲の他の部位特異的コンジュゲーション技術、最も顕著には非天然アミノ酸、例えばオキシムライゲーションに適したp-アセトフェニルアラニン、又はクリックケミストリーコンジュゲーションに適したp-アジドメチルフェニルアラニンの遺伝子コードが調査されている。抗体の遺伝子再設計に基づくアプローチの大部分は、約2のDARを有するADCをもたらす。抗体の再設計を伴わない抗体コンジュゲーションへの代替アプローチは、鎖間ジスルフィド架橋の還元、引き続いてシステイン架橋試薬、例えばビス-スルホン試薬(例えば、共に参照により組み込まれる、Balanら、Bioconj.Chem.2007、18、61~76及びBryantら、Mol.Pharmaceutics 2015、12、1872~1879参照)、モノ-若しくはビス-ブロモマレイミド(例えば、共に参照により組み込まれる、Smithら、J.Am.Chem.Soc.2010、132、1960~1965及びSchumacherら、Org.Biomol.Chem.2014、37、7261~7269参照)、ビス-マレイミド試薬(例えば、国際公開第2014114207号参照)、ビス(フェニルチオ)マレイミド(例えば、共に参照により組み込まれる、Schumacherら、Org.Biomol.Chem.2014、37、7261~7269及びAubreyら、Bioconj.Chem.2018、29、3516~3521参照)、ビス-ブロモピリダジンジオン(例えば、参照により組み込まれる、Robinsonら、RSC Advances 2017、7、9073~9077参照)、ビス(ハロメチル)ベンゼン(例えば、参照により組み込まれる、Ramos-Tomilleroら、Bioconj.Chem.2018、29、1199~1208参照)又は他のビス(ハロメチル)芳香族(例えば、国際公開第2013173391号参照)に付着したペイロードの付加を伴う。典型的には、システインの架橋によって調製されたADCは、約4の薬物抗体担持(DAR4)を有する。
[0024]N297での天然抗体グリカンの酵素的リモデリング(エンドグリコシダーゼによるトリミング及びグリコシルトランスフェラーゼの作用下でのアジド修飾GalNAc誘導体の導入)、引き続いてクリックケミストリーを使用した細胞傷害性ペイロードの付着に基づいて、均質ADCを調製し、DAR2又はDAR4に選択的に適合させることができることが、全て参照により組み込まれる、国際公開第2014065661号、van Geelら、Bioconj.Chem.2015、26、2233~2242及びVerkadeら、Antibodies 2018、7、12によって示されている。この技術によって調製されたADCは、ある範囲の他のコンジュゲーション技術及び例えばADCT-601(ADC Therapeutics)で現在臨床的に適用されているグリカンリモデリングコンジュゲーションの技術と比較して有意に増加した治療指数を示すことが分かった。
[0025]参照により組み込まれる、Lhospiceら、Mol.Pharmaceut.2015、12、1863~1871によって報告された、抗体をアジド修飾抗体に変換する同様の酵素的アプローチは、細菌酵素トランスグルタミナーゼ(BTG又はTGase)を採用する。PNGase Fによる天然グリコシル化部位N297の脱グリコシル化は、TGase媒介導入の基質になるように隣接N295を遊離させ、これは、TGaseの存在下でアジド保有分子に供すると、脱グリコシル化抗体をビス-アジド抗体に変換することが示された。その後、ビス-アジド抗体をDBCO修飾細胞毒と反応させると、DAR2を有するADCが得られた。C末端TGase媒介アジド導入、引き続いてメタルフリークリックケミストリーによるADCの変換に基づく遺伝子法が、参照により組み込まれる、Chengら、Mol.Cancer Therap.2018、17、2665~2675によって報告された。
[0026]例えば参照により組み込まれる、Axupら、Proc.Nat.Acad.Sci.2012、109、16101~16106によって実証されるように、抗体の事前遺伝子改変、引き続いてAMBER抑制コドンに基づく遺伝子コードを使用した非天然アミノ酸の導入に基づく、アジドを抗体に導入する他の方法が報告されている。同様に、参照により組み込まれる、Zimmermanら、Bioconj.Chem.2014、25、351~361は、メタルフリークリックケミストリーによってADCに変換するためにアジドメチルフェニルアラニン(AzPhe)をモノクローナル抗体に導入する無細胞タンパク質合成法を採用している。また、この場合、DAR2、又は2個のAzPheアミノ酸が最初に導入される場合にはDAR4を有するADCが調製される。また、アジドホモアラニン(Aha)などのメチオニン類似体を、栄養要求菌によってタンパク質に導入し、(銅触媒)クリックケミストリーによってタンパク質コンジュゲートにさらに変換することができることも、参照により組み込まれる、Nairnら、Bioconj.Chem.2012、23、2087~2097によって示されている。最後に、ピロリシル-tRNAシンテターゼ/tRNACUAペアを使用した組換えタンパク質への脂肪族アジドの遺伝子コードは、参照により組み込まれる、Nguyenら、J.Am.Chem.Soc.2009、131、8720~8721によって示され、標識はクリックケミストリーによって確保された。後者の方法も、Oller-Salviaら、Angew.Chem.Int.Ed.2018、57、2831~2834によって報告された方法と同様に、DAR2 ADCを作製するために適用可能であるはずである。
[0027]後に歪みアルキン又はアルケンによる付加環化を受けることができる中間体1,2-キノンを介した、適切に配置されたチロシンのチロシナーゼ媒介酸化によって、抗体を細胞傷害性ペイロードに部位特異的にコンジュゲートすることができることも、参照により組み込まれる、Bruinsら、Bioconjugate Chem.2017、28、1189~1193によって示されている。
[0028]例えばYamada及びIto、ChemBioChem.2019、20、2729~2737によって強調されるように、事前遺伝子改変を用いない抗体の部位特異的修飾のための化学的アプローチも開発されている。
[0029]部位特異的修飾のための親和性ペプチドによる化学的コンジュゲーション(CCAP)は、ヒトIgG-Fcに高い親和性で結合し、それによって、ビオチン部分又は細胞傷害性ペイロードによるFcフラグメント中の単一リジンの選択的修飾を可能にするペプチドを使用することによって、Kishimotoら、Bioconj.Chem.2019によって開発されている。同様に、Matsudaら、ACS Omega 2019、4、20564~20570は、同様のアプローチ(アジキャップ(AJICAP)(商標)技術)を抗体重鎖の単一リジンへのチオール基の部位特異的導入に適用することができることを実証している。CCAP又はアジキャップ(商標)技術はまた、アジド基又は他の官能基の導入にも採用され得る。
[0030]市場及び臨床でのADCの主流は、上記のように、およそ2~8の間の薬物担持を有するが、PBD二量体のほとんど、関連IGN型ペイロード、またエンジインベースのペイロード、アマニチンなどの一部の高度細胞傷害性ペイロードについては、より低いDARが好ましいだろう。極めて強力なペイロードについてのヒトにおける最大耐用量は、1mg/kgをはるかに下回る、通常さらには300μg/kg未満又はさらには100μg/kg未満の値まで低下し得ることが分かっている。結果として、投与(典型的には静脈内)後にインビボ受容体飽和に到達せず、最適以下の腫瘍取り込み及び増強したクリアランスにつながる。このような場合については、同様のDAR2バージョンと比較してMTDがおそらく2倍高いので、同じペイロードを有するDAR1フォーマットが好ましくなり得る。Ruddleら、ChemMedChem 2019、14、1185~1195は、DAR1コンジュゲートを、CH1及びCL鎖間ジスルフィド鎖の選択的還元、引き続いて2つのマレイミド単位を含有する対称なPDB二量体による処理によるフラグメントの再架橋によって、(完全抗体のパパイン消化又は組換え発現によって調製される)抗体Fabフラグメントから調製することができることを最近示した。得られたDAR1型Fabフラグメントは、極めて均質であり、血清中で安定であり、優れた細胞傷害性を示すことが示された。参照により組み込まれる、フォローアップ刊行物であるWhiteら、MAbs 2019、11、500~515、及びまた国際公開第2019034764号において、DAR1コンジュゲートを、抗体の事前設計後に、完全IgG抗体から調製することもできることが示された:ヒンジ領域にただ1つの鎖内ジスルフィド架橋を有する抗体が使用される(Flexmab技術、参照により組み込まれる、Dimasiら、J.Mol.Biol.2009、393、672~692に報告される)か、又は天然アミノ酸の変異(例えば、HC-S239C)によって、若しくは配列への挿入(例えば、HC-i239C、Dimasiら、Mol.Pharmaceut.2017、14、1501~1516によって報告される)によって得ることができる、追加の遊離システインを有する抗体が使用される。いずれの設計された抗体も、得られたシステイン設計ADCとビス-マレイミド誘導PBD二量体の反応によりDAR1 ADCの作製を可能にすることが示された。Flexmab誘導DAR1 ADCは、血清中でのペイロード損失に極めて耐性であり、HER2陽性胃癌異種移植モデルで強力な抗腫瘍活性を示すことが示された。さらに、このADCは、単一マレイミド含有PBD二量体を使用して調製された部位特異的DAR2 ADCと比較して2倍の用量でラットにおいて忍容性を示した。しかしながら、DAR2 ADCと比較したDAR1 ADCの最小有効量(MED)は同じ係数2で増加したので、治療濃度域の改善は認められなかった。
[0031]現在まで、DAR2 ADCと比較して治療指数を改善するDAR1技術は報告されていない。また、モノクローナル抗体の再設計を要しない、完全抗体からのDAR1 ADCによる作製のための技術は報告されていない。治療指数の改善及び/又はDAR1 ADCに向けた非遺伝子アプローチの両方が、より速い臨床までの時間を有するより優れたADCの開発への有意な寄与となるだろう。
[0032]抗体の事前再設計を要することなく、完全長抗体を、単一薬物担持(DAR1)を有する安定で部位特異的なADCに変換するための技術が提示される。この技術は、いずれのIgGアイソタイプにも適用可能であり、付加環化コンジュゲーション反応を介して、低分子細胞傷害剤からタンパク質足場(サイトカイン、scFv)、オリゴヌクレオチドなどに及ぶペイロードの、抗体への付着を可能にする。エンドグリコシダーゼによるグリカンの事前トリミングを伴う、好ましい実施形態による手順は、Fcガンマ受容体結合の付随する抑止と共に進行し、よって、エフェクター機能を除去する。
[0033]本発明による抗体-ペイロードコンジュゲートは、構造(1):
(式中、
a、b及びcはそれぞれ独立に、0又は1であり;
L1、L2及びL3はリンカーであり;
Dはペイロードであり;
BMは分岐部分であり;
Zは付加環化反応によって得ることができる接続基である)
によるものである。
(式中、
a、b及びcはそれぞれ独立に、0又は1であり;
L1、L2及びL3はリンカーであり;
Dはペイロードであり;
BMは分岐部分であり;
Zは付加環化反応によって得ることができる接続基である)
によるものである。
[0034]本発明は、本発明による抗体-ペイロードコンジュゲートを調製する方法、その調製方法における中間体化合物、及び本発明による抗体-ペイロードコンジュゲートの医学的使用をさらに提供する。
定義
[0066]動詞「含む(to comprise)」、及びその活用形は、本明細書及び特許請求の範囲で使用される場合、非限定的な意味で使用されて、この単語の後の項目が含まれるが、詳細に言及されていない項目が除外されないことを意味する。さらに、不定冠詞「a」又は「an」による要素への言及は、文脈が1つ及びただ1つの要素が存在することを明確に要求しない限り、2つ以上の要素が存在する可能性を除外しない。よって、不定冠詞「a」又は「an」は「少なくとも1つの」を通常意味する。
[0066]動詞「含む(to comprise)」、及びその活用形は、本明細書及び特許請求の範囲で使用される場合、非限定的な意味で使用されて、この単語の後の項目が含まれるが、詳細に言及されていない項目が除外されないことを意味する。さらに、不定冠詞「a」又は「an」による要素への言及は、文脈が1つ及びただ1つの要素が存在することを明確に要求しない限り、2つ以上の要素が存在する可能性を除外しない。よって、不定冠詞「a」又は「an」は「少なくとも1つの」を通常意味する。
[0067]本明細書及び特許請求の範囲に開示される化合物は、1つ又は複数の不斉中心を含むことがあり、化合物の様々なジアステレオマー及び/又はエナンチオマーが存在し得る。本明細書及び特許請求の範囲におけるいずれの化合物の説明も、特に明記しない限り、全てのジアステレオマー、及びその混合物を含むことを意味する。さらに、本明細書及び特許請求の範囲におけるいずれの化合物の説明も、特に明記しない限り、個々のエナンチオマーとエナンチオマーの任意の混合物、ラセミ体などの両方を含むことを意味する。化合物の構造が特定のエナンチオマーとして描かれている場合、本出願の本発明はその特定のエナンチオマーに限定されないことを理解すべきである。
[0068]化合物は、様々な互変異性型で生じ得る。本発明による化合物は、特に明記しない限り、全ての互変異性型を含むことを意味する。化合物の構造が特定の互変異性体として描かれている場合、本出願の本発明はその特定の互変異性体に限定されないことを理解すべきである。
[0069]本明細書及び特許請求の範囲に開示される化合物は、エキソ及びエンドジアステレオ異性体としてさらに存在し得る。特に明記しない限り、本明細書及び特許請求の範囲におけるいずれの化合物の説明も、化合物の個々のエキソジアステレオ異性体及び個々のエンドジアステレオ異性体とその混合物の両方を含むことを意味する。化合物の構造が特定のエンド又はエキソジアステレオマーとして描かれている場合、本出願の本発明はその特定のエンド又はエキソジアステレオマーに限定されないことを理解すべきである。
[0070]さらに、本明細書及び特許請求の範囲に開示される化合物は、シス及びトランス異性体として存在し得る。特に明記しない限り、本明細書及び特許請求の範囲におけるいずれの化合物の説明も、化合物の個々のシス異性体及び個々のトランス異性体とその混合物の両方を含むことを意味する。例として、化合物の構造がシス異性体として描かれている場合、対応するトランス異性体又はシス異性体とトランス異性体の混合物が本出願の本発明から除外されないことを理解すべきである。化合物の構造が特定のシス又はトランス異性体として描かれている場合、本出願の本発明はその特定のシス又はトランス異性体に限定されないことを理解すべきである。
[0071]本発明による化合物は塩形態で存在してもよく、これも本発明によって網羅される。塩は、典型的には薬学的に許容できるアニオンを含有する、薬学的に許容できる塩である。「その塩」という用語は、酸性プロトン、典型的には酸のプロトンが、金属カチオン又は有機カチオンなどのカチオンによって置き換えられる場合に形成される化合物を意味する。適用可能な場合、塩は薬学的に許容できる塩であるが、これは患者への投与を意図しない塩については要求されない。例えば、化合物の塩においては、化合物は無機又は有機酸によってプロトン化されて、塩のアニオン性成分としての無機又は有機酸の共役塩基を伴うカチオンを形成することができる。
[0072]「薬学的に許容できる」塩という用語は、哺乳動物などの患者への投与に許容される塩(所与の投薬体制について許容される哺乳動物の安全性を有する対イオンを伴う塩)を意味する。このような塩は、薬学的に許容できる無機又は有機塩基及び薬学的に許容できる無機又は有機酸から誘導され得る。「薬学的に許容できる塩」は、その塩が当技術分野で公知の様々な有機及び無機対イオンから誘導され、例えば、ナトリウム、カリウム、カルシウム、マグネシウム、アンモニウム、テトラアルキルアンモニウム等、及び分子が塩基性官能基を含有する場合には、有機又は無機酸の塩、例えば塩酸塩、臭化水素酸塩、ギ酸塩、酒石酸塩、ベシル酸塩、メシル酸塩、酢酸塩、マレイン酸塩、シュウ酸塩等を含む、化合物の薬学的に許容できる塩を指す。
[0073]「タンパク質」という用語は、その通常の科学的意味で本明細書において使用される。本明細書では、約10個以上のアミノ酸を含むポリペプチドがタンパク質と考えられる。タンパク質は天然アミノ酸だけでなく、非天然アミノ酸も含み得る。
[0074]「単糖」という用語は、その通常の科学的意味で本明細書において使用され、最も一般的には5個の炭素原子(ペントース)、6個の炭素原子(ヘキソース)又は9個の炭素原子(シアル酸)を含有する、5~9個の(ヒドロキシル化)炭素原子の鎖の環化で分子内ヘミアセタール形成から生じる酸素含有複素環を指す。典型的な単糖は、リボース(Rib)、キシロース(Xyl)、アラビノース(Ara)、グルコース(Glu)、ガラクトース(Gal)、マンノース(Man)、グルクロン酸(GlcA)、N-アセチルグルコサミン(GlcNAc)、N-アセチルガラクトサミン(GalNAc)及びN-アセチルノイラミン酸(NeuAc)である。
[0075]「抗体」という用語は、その通常の科学的意味で本明細書において使用される。抗体は、特異的抗原を認識し、これに結合することができる、免疫系によって産生されるタンパク質である。抗体は糖タンパク質の一例である。抗体という用語は、本明細書において、広義に使用され、詳細にはモノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、ダイマー、マルチマー、多重特異性抗体(例えば、二重特異性抗体)、抗体フラグメント、並びに二本鎖及び単鎖抗体を含む。「抗体」という用語はまた、本明細書において、ヒト抗体、ヒト化抗体、キメラ抗体及びがん抗原に特異的に結合する抗体を含むことを意味する。「抗体」という用語は、免疫グロブリン全体を含むが、抗体の抗原結合フラグメントも含むことを意味する。さらに、この用語は、遺伝子改変抗体及び抗体の誘導体を含む。抗体、抗体のフラグメント及び遺伝子改変抗体は、当技術分野で公知の方法によって得ることができる。抗体の典型的な例としては、数ある中でも、アブシキシマブ、リツキシマブ、バシリキシマブ、パリビズマブ、インフリキシマブ、トラスツズマブ、エファリズマブ、アレムツズマブ、アダリムマブ、トシツモマブ-I131、セツキシマブ、イブリツキシマブチウキセタン、オマリズマブ、ベバシズマブ、ナタリズマブ、ラニビズマブ、パニツムマブ、エクリズマブ、セルトリズマブペゴル、ゴリムマブ、カナキヌマブ、カツマキソマブ、ウステキヌマブ、トシリズマブ、オファツムマブ、デノスマブ、ベリムマブ、イピリムマブ及びブレンツキシマブが挙げられる。
[0076]「抗体フラグメント」は、その抗原結合領域又は可変領域を含む、インタクト抗体の一部として本明細書において定義される。抗体フラグメントの例としては、Fab、Fab’、F(ab’)2、及びFvフラグメント、ダイアボディ、ミニボディ、トリアボディ、テトラボディ、直鎖抗体、単鎖抗体分子、scFv、scFv-Fc、抗体フラグメント(複数可)から形成される多重特異性抗体フラグメント、Fab発現ライブラリーによって作製されるフラグメント(複数可)、又は標的抗原(例えば、がん細胞抗原、ウイルス抗原若しくは微生物抗原)に免疫特異的に(immunospecifically)結合する上記のいずれかのエピトープ結合フラグメントが挙げられる。
[0077]「抗原」は、抗体が特異的に結合する実体として本明細書において定義される。
[0078]「特異的結合」及び「特異的に結合する」という用語は、抗体が標的抗原の対応するエピトープと結合するが、多数の他の抗原とは結合しない高度に選択的な方法として本明細書において定義される。典型的には、抗体又は抗体誘導体は、少なくとも約1×10-7M、好ましくは10-8M~10-9M、10-10M、10-11M、又は10-12Mの親和性で結合し、所定の抗原又は密接に関連する抗原以外の非特異的抗原(例えば、BSA、カゼイン)への結合についての親和性よりも少なくとも2倍高い親和性で所定の抗原に結合する。
[0079]「実質的な」又は「実質的に」という用語は、集団、混合物又は試料の大部分、すなわち、50%超、好ましくは集団の50%超、55%超、60%超、65%超、70%超、75%超、80%超、85%超、90%超、91%超、92%超、93%超、94%超、95%超、96%超、97%超、98%超、又は99%超として本明細書において定義される。
[0080]「リンカー」は、化合物の2つ以上の要素を接続する部分として本明細書において定義される。例えば、抗体コンジュゲートにおいては、抗体とペイロードがリンカーを介して互いに共有結合的に接続される。リンカーは、1つ又は複数のリンカー、及びリンカー内の様々な部分を接続するスペーサー部分を含み得る。
[0081]「極性リンカー」は、リンカーの極性を増加させ、それによって、水溶解度を改善する特定の目的を有する構造要素を含有するリンカーとして本明細書において定義される。極性リンカーは、例えば、エチレングリコール、カルボン酸部分、スルホネート部分、スルホン部分、アシル化スルファミド部分、ホスフェート部分、ホスフィネート部分、アミノ基又はアンモニウム基から選択される、1つ又は複数の単位、又はその組み合わせを含み得る。
[0082]「スペーサー」又はスペーサー部分は、リンカーの2つ(又はそれ以上)の部分の間隔をあけ(すなわち、間に距離を提供し)、これらの部分を共有結合する部分として本明細書において定義される。リンカーは、例えばリンカー構築物、リンカーコンジュゲート又は以下に定義されるバイオコンジュゲートの一部であり得る。
[0083]「自壊性基」は、リガンド単位によって標的化された部位で遊離薬物を条件的に放出する機能を有する抗体-薬物コンジュゲート中のリンカーの一部として本明細書において定義される。活性化可能自壊性部分は、活性化可能基(AG)及び自壊性スペーサー単位を含む。例えばアミド基のアミノ基への酵素的変換によって、又はジスルフィドの遊離チオール基への還元によって、活性化可能基が活性化すると、任意選択で二酸化炭素の放出を伴う、及び/又は第2の環化放出機序が続く、p-アミノベンジル基のp-キノンメチドへの(一時的な)1,6-脱離を伴い得る、様々な機序のうちの1つ又は複数によって遊離薬物の放出をもたらす自壊性反応順序が開始される。自壊性組み立て単位は、(官能基を介して)抗体とペイロードを接続する化学的スペーサーの一部であり得る。或いは、自壊性基は、化学的スペーサーの固有の部分ではないが、抗体とペイロードを接続する化学的スペーサーから分岐する。
[0084]「活性化可能基」は、アミド結合のタンパク質分解性加水分解又はジスルフィド結合の還元などの生化学的プロセシングステップを受け得る芳香族基に付着した官能基として本明細書において定義され、その生化学的プロセシングステップで、芳香族基の自壊性プロセスが開始される。活性化可能基は、「活性化基」とも呼ばれ得る。
[0085]「バイオコンジュゲート」は、生体分子がリンカーを介してペイロードに共有結合的に接続されている化合物として本明細書において定義される。バイオコンジュゲートは、1つ若しくは複数の生体分子及び/又は1つ若しくは複数のペイロードを含む。抗体-ペイロードコンジュゲート及び抗体-薬物コンジュゲートなどの抗体コンジュゲートは、生体分子が抗体であるバイオコンジュゲートである。
[0086]「生体分子」は、自然から単離することができる任意の分子、又は自然に由来する高分子構造の構成成分である低分子構築ブロックで構成される任意の分子、特に核酸、タンパク質、グリカン及び脂質として本明細書において定義される。生体分子の例としては、酵素、(非触媒)タンパク質、ポリペプチド、ペプチド、アミノ酸、オリゴヌクレオチド、単糖、オリゴ糖、多糖、グリカン、脂質及びホルモンが挙げられる。
[0087]「ペイロード」という用語は、抗体などの標的化部分に共有結合的に付着されている部分を指すが、リンカーの切断でコンジュゲートから放出される分子も指す。よって、ペイロードは、本発明の文脈においてDと呼ばれる、リンカーを介して標的化部分に共有結合的に付着されている1つの開口端を有する一価部分を指し、そこから放出される分子も指す。
[0088]「2:1分子フォーマット」という用語は、単一官能性ペイロードにコンジュゲートした二価モノクローナル抗体(IgG型)からなるタンパク質コンジュゲートを指す。
本発明による抗体-ペイロードコンジュゲート
[0089]本発明は、構造(1):
(式中、
a、b及びcはそれぞれ独立に、0又は1であり;
L1、L2及びL3はリンカーであり;
Dはペイロードであり;
BMは分岐部分であり;
Zは付加環化反応によって得ることができる接続基である)
を有する抗体-ペイロードコンジュゲートに関する。
[0089]本発明は、構造(1):
(式中、
a、b及びcはそれぞれ独立に、0又は1であり;
L1、L2及びL3はリンカーであり;
Dはペイロードであり;
BMは分岐部分であり;
Zは付加環化反応によって得ることができる接続基である)
を有する抗体-ペイロードコンジュゲートに関する。
[0090]抗体-ペイロードコンジュゲート(1)中、ペイロードDは、接続基Z、任意選択のリンカーL1、L2及びL3並びに分岐部分BMを介して、抗体ABに接続されている。(1)中、a、b及びcはそれぞれ0及び1から独立的に選択される。本発明による好ましい抗体-ペイロードコンジュゲートはa=b=1を有する、すなわち、L1とL2の両方が存在し、より好ましくはL1とL2が同じである。特に好ましいのは、出現するZ、a/b及びL1/L2の各々が同じである対称的な抗体-ペイロードコンジュゲートである。
[0091]好ましい実施形態では、抗体がグリカンを介してペイロードDにコンジュゲートされており、その場合、本発明による抗体-ペイロードコンジュゲートが構造(5):
(式中、
eは0~10の範囲の整数であり;
Suは単糖であり;
Gは単糖部分であり;
GlcNAcはN-アセチルグルコサミン部分であり;
Fucはフコース部分であり;
dは0又は1である)
を有する。
(式中、
eは0~10の範囲の整数であり;
Suは単糖であり;
Gは単糖部分であり;
GlcNAcはN-アセチルグルコサミン部分であり;
Fucはフコース部分であり;
dは0又は1である)
を有する。
抗体AB
[0092](1)中、ABは抗体である。好ましくは、ABがモノクローナル抗体であり、より好ましくはIgA、IgD、IgE、IgG及びIgM抗体からなる群から選択される。さらにより好ましくはABがIgG抗体である。IgG抗体は任意のIgGアイソタイプのものであり得る。抗体は任意のIgGアイソタイプ、例えばIgG1、IgG2、IgI3又はIgG4であり得る。好ましくはABが完全長抗体であるが、ABがFcフラグメントであってもよい。
[0092](1)中、ABは抗体である。好ましくは、ABがモノクローナル抗体であり、より好ましくはIgA、IgD、IgE、IgG及びIgM抗体からなる群から選択される。さらにより好ましくはABがIgG抗体である。IgG抗体は任意のIgGアイソタイプのものであり得る。抗体は任意のIgGアイソタイプ、例えばIgG1、IgG2、IgI3又はIgG4であり得る。好ましくはABが完全長抗体であるが、ABがFcフラグメントであってもよい。
[0093](5)中のGlcNAc部分は、好ましくは抗体ABのFcフラグメント中の天然Nグリコシル化部位に存在する。好ましくは前記GlcNAc部分がABの領域290~305中のアスパラギンアミノ酸に付着している。さらなる好ましい実施形態では、抗体がIgG型抗体であり、特定のIgG型抗体に応じて、前記GlcNAc部分がABのアミノ酸アスパラギン297(Asn297又はN297)上に存在する。
接続基Z
[0094]抗体-ペイロードコンジュゲート(1)中、Zは接続基である。上でさらに詳細に記載されるように、「接続基」という用語は、化合物の一方の部分と同化合物の別の部分を接続する構造要素を指す。(1)中、Zは、存在する場合、L1及び/又はL2を介して、抗体を、おそらくスペーサーを介して、分岐部分BMと接続する。L1及び/又はL2が存在するかしないかは、a及びbの値に依存する。好ましい実施形態では、出現する両方のZが同じである。
[0094]抗体-ペイロードコンジュゲート(1)中、Zは接続基である。上でさらに詳細に記載されるように、「接続基」という用語は、化合物の一方の部分と同化合物の別の部分を接続する構造要素を指す。(1)中、Zは、存在する場合、L1及び/又はL2を介して、抗体を、おそらくスペーサーを介して、分岐部分BMと接続する。L1及び/又はL2が存在するかしないかは、a及びbの値に依存する。好ましい実施形態では、出現する両方のZが同じである。
[0095]当業者によって理解されるように、接続基の性質は、前記化合物の部分間の接続が得られた付加環化反応の種類に依存する。例えば、Zは[4+2]付加環化又は1,3-双極子付加環化によって得ることができる。
[0096]反応性基Qを反応性基Fに付着するための付加環化反応は当技術分野で公知である。結果として、多種多様な接続基Zが本発明によるコンジュゲートに存在し得る。一実施形態では、接続基Zが、好ましくは図1に描かれる、上記の選択肢から選択される。
[0097]例えば、Fがアルキニル基を含むか、又はアルキニル基である場合、相補的基Qはアジド基を含み、対応する接続基Zは図1に示される通りである。
[0098]例えば、Fがアジド基を含むか、又はアジド基である場合、相補的基Qはアルキニル基を含み、対応する接続基Zは図1に示される通りである。
[0099]例えば、Fがシクロプロペニル基、トランス-シクロオクテン基若しくはシクロアルキン基を含むか、又はシクロプロペニル基、トランス-シクロオクテン基若しくはシクロアルキン基である場合、相補的基Qはテトラジニル基を含み、対応する接続基Zは図1に示される通りである。特定の場合、Zは単に中間体構造であり、N2を排出し、それによって、ジヒドロピリダジン(アルケンとの反応から)又はピリダジン(アルキンとの反応から)を生成する。
[0100]例えば、Fがテトラジニル基を含むか、又はテトラジニル基である場合、相補的基Qはシクロプロペニル基、トランス-シクロオクテン基又はシクロアルキン基を含み、対応する接続基Zは図1に示される通りである。特定の場合、Zは単に中間体構造であり、N2を排出し、それによって、ジヒドロピリダジン(アルケンとの反応から)又はピリダジン(アルキンとの反応から)を生成する。
[0101]FとQの追加の適切な組み合わせ、及び得られた接続基Zの性質は当業者に公知であり、例えば参照により組み込まれる、G.T.Hermanson、「Bioconjugate Techniques」、Elsevier、第3版 2013(ISBN:978-0-12-382239-0)、特に第3章、229~258頁に記載されている。バイオコンジュゲーション法に適した相補的反応性基のリストは、G.T.Hermanson、「Bioconjugate Techniques」、Elsevier、第3版 2013(ISBN:978-0-12-382239-0)の第3章の230~232頁、表3.1に開示されており、この表の内容は参照により本明細書に明示的に組み込まれる。
[0102]好ましい実施形態では、接続基Zが、以下に定義される構造(Za)、(Ze)~(Zh)、(Zj)及び(Zk)のうちのいずれか1つによるものである。好ましくは、Zが構造(Za)、(Ze)又は(Zj):
によるものである。
によるものである。
本明細書において、
X9はH、C1~12アルキル及びピリジルから選択され、C1~12アルキルは、好ましくはC1~4アルキルであり、最も好ましくはメチルである。
X9はH、C1~12アルキル及びピリジルから選択され、C1~12アルキルは、好ましくはC1~4アルキルであり、最も好ましくはメチルである。
波線はリンカーLとの接続を示す。接続性はQ及びFの詳細な性質に依存する。(Za)~(Zh)による接続基のいずれの部位もLに接続され得るが、描かれるこれらの基の最も左が(L1)a/(L2)bに接続されることが好ましい。
[0103]接続基(Zh)は、典型的にはN2の遊離により(Zg)に再配列する。
[0104]好ましい実施形態では、各Zが独立に、トリアゾール、シクロヘキセン、シクロヘキサジエン、イソオキサゾリン、イソオキサゾリジン、ピラゾリン、ピペラジン、チオエーテル、アミド又はイミド基からなる群から選択される部分を含有する。トリアゾール部分がZ中に存在することが特に好ましい。
本明細書において、R15、X10、u、u’及びvは(Q36)について定義される通りであり、その全ての好ましい実施形態を(Zj)に等しく適用する。波線は、隣接部分(Su及び(L1)a又は(L2)b)との接続を示し、接続性はQ及びFの詳細な性質に依存する。(Zj)による接続基のいずれの部位も(L1)a/(L2)bに接続され得るが、描かれる上の波線結合がSuとの接続性を表すことが好ましい。構造(Zf)及び(Zk)による接続基は(Zj)による接続基の好ましい実施形態である。
[0107]本明細書において、R15、R18、R19、及びlは(Q37)について定義される通りであり、その全ての好ましい実施形態を(Zj)に等しく適用する。波線は、隣接部分(Su及び(L1)a又は(L2)b)との接続を示し、接続性はQ及びFの詳細な性質に依存する。(Zj)による接続基のいずれの部位も(L1)aに接続され得るが、描かれる左の波線結合がSuとの接続性を表すことが好ましい。
[0108]好ましい実施形態では、Qがアルキン部分を含むか、又はアルキン部分であり、Fがアジド部分であり、結果として接続基Zがトリアゾール部分を含む。トリアゾール部分を含む好ましい接続基は構造(Ze)又は(Zj)による接続基であり、構造(Zj)による接続基は、好ましくは構造(Zk)又は(Zf)によるものである。好ましい実施形態では、接続基が構造(Zj)によるものであり、より好ましくは構造(Zk)又は(Zf)によるものである。
分岐部分BM
[0109]本発明の文脈における「分岐部分」は、3つの部分を接続するリンカーに埋め込まれている部分を指す。換言すれば、分岐部分は、他の部分との少なくとも3つの結合、反応性基F、接続基Z又はペイロードDとの1つの結合、反応性基Q又は接続基Zとの1つの結合、及び反応性基Q又は接続基Zとの1つの結合を含む。
[0109]本発明の文脈における「分岐部分」は、3つの部分を接続するリンカーに埋め込まれている部分を指す。換言すれば、分岐部分は、他の部分との少なくとも3つの結合、反応性基F、接続基Z又はペイロードDとの1つの結合、反応性基Q又は接続基Zとの1つの結合、及び反応性基Q又は接続基Zとの1つの結合を含む。
[0110]他の部分との少なくとも3つの結合を含有するいずれの部分も本発明の文脈における分岐部分として適している。適切な分岐部分は、炭素原子(BM-1)、窒素原子(BM-3)、リン原子(ホスフィン(BM-5)及びホスフィンオキシド(BM-6))、フェニル環(例えば、BM-7)又はピリジル環(例えば、BM-9)などの芳香環、(複素)環(例えば、BM-11及びBM-12)及び多環式部分(例えば、BM-13、BM-14及びBM-15)を含む。好ましい分岐部分は炭素原子及びフェニル環から選択され、最も好ましくはBMが炭素原子である。構造(BM-1)~(BM-15)を以下に描くが、ここでは3つの分岐、すなわち、上に定義される他の部分との結合が*によって示される(*で標識される結合)。
[0111](BM-1)においては、*で標識された分岐のうちの1つは単結合又は二重結合であり得、
で示される。(BM-11)~(BM-15)においては、以下を適用する:
n、p、q及びqの各々は個別に0~5の範囲の整数、好ましくは0又は1、最も好ましくは1であり;
W1、W2及びW3の各々は、C(R21)w及びNから独立的に選択され;
W4、W5及びW6の各々は、C(R21)w+1、N(R22)w、O及びSから独立的に選択され;
各
は単結合又は二重結合を表し;
wは0又は1又は2、好ましくは0又は1であり;
各R21は、水素、OH、C1~C24アルキル基、C1~C24アルコキシ基、C3~C24シクロアルキル基、C2~C24(ヘテロ)アリール基、C3~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC3~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、C1~C24アルキル基、C1~C24アルコキシ基、C3~C24シクロアルキル基、C2~C24(ヘテロ)アリール基、C3~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC3~C24(ヘテロ)アリールアルキル基は任意選択で置換されており、O、S及びNR3から選択される1個又は複数のヘテロ原子によって任意選択で中断されており、R3は、水素及びC1~C4アルキル基からなる群から独立的に選択され;
各R22は、水素、C1~C24アルキル基、C3~C24シクロアルキル基、C2~C24(ヘテロ)アリール基、C3~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC3~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、C1~C24アルキル基、C1~C24アルコキシ基、C3~C24シクロアルキル基、C2~C24(ヘテロ)アリール基、C3~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC3~C24(ヘテロ)アリールアルキル基は任意選択で置換されており、O、S及びNR3から選択される1個又は複数のヘテロ原子によって任意選択で中断されており、R3は、水素及びC1~C4アルキル基からなる群から独立的に選択される。
で示される。(BM-11)~(BM-15)においては、以下を適用する:
n、p、q及びqの各々は個別に0~5の範囲の整数、好ましくは0又は1、最も好ましくは1であり;
W1、W2及びW3の各々は、C(R21)w及びNから独立的に選択され;
W4、W5及びW6の各々は、C(R21)w+1、N(R22)w、O及びSから独立的に選択され;
各
は単結合又は二重結合を表し;
wは0又は1又は2、好ましくは0又は1であり;
各R21は、水素、OH、C1~C24アルキル基、C1~C24アルコキシ基、C3~C24シクロアルキル基、C2~C24(ヘテロ)アリール基、C3~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC3~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、C1~C24アルキル基、C1~C24アルコキシ基、C3~C24シクロアルキル基、C2~C24(ヘテロ)アリール基、C3~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC3~C24(ヘテロ)アリールアルキル基は任意選択で置換されており、O、S及びNR3から選択される1個又は複数のヘテロ原子によって任意選択で中断されており、R3は、水素及びC1~C4アルキル基からなる群から独立的に選択され;
各R22は、水素、C1~C24アルキル基、C3~C24シクロアルキル基、C2~C24(ヘテロ)アリール基、C3~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC3~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、C1~C24アルキル基、C1~C24アルコキシ基、C3~C24シクロアルキル基、C2~C24(ヘテロ)アリール基、C3~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC3~C24(ヘテロ)アリールアルキル基は任意選択で置換されており、O、S及びNR3から選択される1個又は複数のヘテロ原子によって任意選択で中断されており、R3は、水素及びC1~C4アルキル基からなる群から独立的に選択される。
[0112]当業者であれば、wの値と
によって表される結合の結合次数が相互依存的であることを認識する。よって、出現するWが環内二重結合に結合している場合はいつでも、その出現するWについてw=1であり、出現するWが2つの環内単結合に結合している場合はいつでも、その出現するWについてw=0である。BM-12については、o及びpのうちの少なくとも1つが0ではない。
によって表される結合の結合次数が相互依存的であることを認識する。よって、出現するWが環内二重結合に結合している場合はいつでも、その出現するWについてw=1であり、出現するWが2つの環内単結合に結合している場合はいつでも、その出現するWについてw=0である。BM-12については、o及びpのうちの少なくとも1つが0ではない。
[0113]構造(BM-11)及び(BM-12)による分岐部分の代表的な例としては、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチル、シクロオクチル、シクロプロペニル、シクロブテニル、シクロペンテニル、シクロヘキセニル、シクロヘプテニル、シクロオクテニル、アジリジン、アゼチジン、ジアゼチジン、オキセタン、チエタン、ピロリジン、ジヒドロピロリル、テトラヒドロフラニル、ジヒドロフラニル、チオラニル、イミダゾリニル、ピラゾリジニル、オキサゾリジニル、イソオキサゾリジニル、チアゾリジニル、イソチアゾリジニル、ジオキソラニル、ジチオラニル、ピペリジニル、オキサニル、チアニル、ピペラジニル、モルホリノ、チオモルホリノ、ジオキサニル、トリオキサニル、ジチアニル、トリチアニル、アゼパニル、オキセパニル及びチエパニルが挙げられる。分岐部分として使用するのに好ましい環式部分には、シクロプロペニル、シクロヘキシル、オキサニル(テトラヒドロピラン)及びジオキサニルが含まれる。3つの分岐の置換パターンが、分岐部分が構造(BM-11)のものか、又は構造(BM-12)のものかを決定する。
[0114]構造(BM-13)~(BM-15)による分岐部分の代表的な例としては、デカリン、テトラリン、ジアリン、ナフタレン、インデン、インダン、イソインデン、インドール、イソインドール、インドリン、イソインドリンなどが挙げられる。
[0115]好ましい実施形態では、BMが炭素原子である。炭素原子が構造(BM-1)によるものであり、別個の部分との全4つの結合を有する場合、炭素原子がキラルである。炭素原子の立体化学は本発明にとって重要ではなく、SであってもRであってもよい。同じことがホスフィン(BM-6)にも当てはまる。最も好ましくは、炭素原子が構造(BM-1)によるものである。構造(BM-1)による炭素原子において*で示される分岐のうちの1つは二重結合であってもよく、その場合、炭素原子はアルケン又はイミンの一部であり得る。BMが炭素原子である場合、炭素原子は、アセタール、ケタール、ヘミケタール、オルトエステル、オルト炭酸エステル、アミノ酸などのより大きな官能基の一部であり得る。このことは、BMが窒素又はリン原子である場合にも当てはまり、その場合、窒素又はリン原子はアミド、イミド、イミン、ホスフィンオキシド(BM-6の場合)又はホスホトリエステルの一部であり得る。
[0116]好ましい実施形態では、BMがフェニル環である。最も好ましくは、フェニル環が構造(BM-7)によるものである。フェニル環の置換パターンは、1,2,3-置換フェニル環、1,2,4-置換フェニル環、又は1,3,5-置換フェニル環などの、任意の位置化学のものであり得る。最適な柔軟性及びコンフォメーションの自由を可能にするために、フェニル環が構造(BM-7)によるものであり、最も好ましくはフェニル環が1,3,5-置換されていることが好ましい。同じことが(BM-9)のピリジン環にも当てはまる。
[0117]好ましい実施形態では、分岐部分BMが、炭素原子、窒素原子、リン原子、(複素)芳香環、(複素)環又は多環式部分から選択される。
リンカー
[0118]L1、L2及びL3の各々は非存在であっても存在していてもよいが、好ましくは3つの連結単位全てが存在する。好ましい実施形態では、L1、L2及びL3の各々が、存在する場合、独立に、C、N、O、S及びPから選択される少なくとも2個、好ましくは5~100個の原子の鎖である。本明細書において、原子の鎖は、連結単位の端から出てくる原子の最短の鎖を指す。鎖内の原子は骨格原子とも呼ばれ得る。当業者が認識するように、C、N及びPなどの、3以上の結合価を有する原子は、これらの原子の結合価を満たすために適切に官能化され得る。換言すれば、骨格原子は任意選択で官能化される。好ましい実施形態では、L1、L2及びL3の各々が、存在する場合、独立に、C、N、O、S及びPから選択される少なくとも5~50個、好ましくは6~25個の原子の鎖である。骨格原子は、好ましくはC、N及びOから選択される。
[0118]L1、L2及びL3の各々は非存在であっても存在していてもよいが、好ましくは3つの連結単位全てが存在する。好ましい実施形態では、L1、L2及びL3の各々が、存在する場合、独立に、C、N、O、S及びPから選択される少なくとも2個、好ましくは5~100個の原子の鎖である。本明細書において、原子の鎖は、連結単位の端から出てくる原子の最短の鎖を指す。鎖内の原子は骨格原子とも呼ばれ得る。当業者が認識するように、C、N及びPなどの、3以上の結合価を有する原子は、これらの原子の結合価を満たすために適切に官能化され得る。換言すれば、骨格原子は任意選択で官能化される。好ましい実施形態では、L1、L2及びL3の各々が、存在する場合、独立に、C、N、O、S及びPから選択される少なくとも5~50個、好ましくは6~25個の原子の鎖である。骨格原子は、好ましくはC、N及びOから選択される。
[0119]リンカーL1及びL2は、BMと反応性部分Q又は接続基Zを接続する。L1とL2が共に存在する、すなわち、a=b=1であることが好ましく、より好ましくはL1とL2が同じである。特に好ましい実施形態では、(L1)a-Zが(L2)b-Zと同一であり、(L1)a-Qが(L2)b-Qと同一である。
[0120]L1、L2及びL3は、直鎖又は分岐C1~C200アルキレン基、C2~C200アルケニレン基、C2~C200アルキニレン基、C3~C200シクロアルキレン基、C5~C200シクロアルケニレン基、C8~C200シクロアルキニレン基、C7~C200アルキルアリーレン基、C7~C200アリールアルキレン基、C8~C200アリールアルケニレン基及びC9~C200アリールアルキニレン基からなる群から独立的に選択され得、アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基及びアリールアルキニレン基は任意選択で置換されており、O、S及びNR3の群から選択される1個又は複数のヘテロ原子によって任意選択で中断されており、R3は水素、C1~C24アルキル基、C2~C24アルケニル基、C2~C24アルキニル基及びC3~C24シクロアルキル基からなる群から独立的に選択され、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基及びシクロアルキル基は任意選択で置換されている。アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基及びアリールアルキニレン基が上に定義される1個又は複数のヘテロ原子によって中断されている場合、前記基が1個若しくは複数のO原子によって、及び/又は1つ若しくは複数のS-S基によって中断されていることが好ましい。
[0121]より好ましくは、L1及びL2が、存在する場合、直鎖又は分岐C1~C100アルキレン基、C2~C100アルケニレン基、C2~C100アルキニレン基、C3~C100シクロアルキレン基、C5~C100シクロアルケニレン基、C8~C100シクロアルキニレン基、C7~C100アルキルアリーレン基、C7~C100アリールアルキレン基、C8~C100アリールアルケニレン基及びC9~C100アリールアルキニレン基からなる群から独立的に選択され、アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基及びアリールアルキニレン基が任意選択で置換されており、O、S及びNR3の群から選択される1個又は複数のヘテロ原子によって任意選択で中断されており、R3が水素、C1~C24アルキル基、C2~C24アルケニル基、C2~C24アルキニル基及びC3~C24シクロアルキル基からなる群から独立的に選択され、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基及びシクロアルキル基が任意選択で置換されている。
[0122]さらにより好ましくは、L1及びL2が、存在する場合、直鎖又は分岐C1~C50アルキレン基、C2~C50アルケニレン基、C2~C50アルキニレン基、C3~C50シクロアルキレン基、C5~C50シクロアルケニレン基、C8~C50シクロアルキニレン基、C7~C50アルキルアリーレン基、C7~C50アリールアルキレン基、C8~C50アリールアルケニレン基及びC9~C50アリールアルキニレン基からなる群から独立的に選択され、アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基及びアリールアルキニレン基が任意選択で置換されており、O、S及びNR3の群から選択される1個又は複数のヘテロ原子によって任意選択で中断されており、R3が水素、C1~C24アルキル基、C2~C24アルケニル基、C2~C24アルキニル基及びC3~C24シクロアルキル基からなる群から独立的に選択され、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基及びシクロアルキル基が任意選択で置換されている。
[0123]なおさらにより好ましくは、L1及びL2が、存在する場合、直鎖又は分岐C1~C20アルキレン基、C2~C20アルケニレン基、C2~C20アルキニレン基、C3~C20シクロアルキレン基、C5~C20シクロアルケニレン基、C8~C20シクロアルキニレン基、C7~C20アルキルアリーレン基、C7~C20アリールアルキレン基、C8~C20アリールアルケニレン基及びC9~C20アリールアルキニレン基からなる群から独立的に選択され、アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基及びアリールアルキニレン基が任意選択で置換されており、O、S及びNR3の群から選択される1個又は複数のヘテロ原子によって任意選択で中断されており、R3が水素、C1~C24アルキル基、C2~C24アルケニル基、C2~C24アルキニル基及びC3~C24シクロアルキル基からなる群から独立的に選択され、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基及びシクロアルキル基が任意選択で置換されている。
[0124]これらの好ましい実施形態では、アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基及びアリールアルキニレン基が非置換であり、O、S及びNR3、好ましくはOの群から選択される1個又は複数のヘテロ原子によって任意選択で中断されており、R3が水素及びC1~C4アルキル基、好ましくは水素又はメチルからなる群から独立的に選択されることがさらに好ましい。
[0125]最も好ましくは、L1及びL2が、存在する場合、直鎖又は分岐C1~C20アルキレン基からなる群から独立的に選択され、アルキレン基が任意選択で置換されており、O、S及びNR3の群から選択される1個又は複数のヘテロ原子によって任意選択で中断されており、R3が水素、C1~C24アルキル基、C2~C24アルケニル基、C2~C24アルキニル基及びC3~C24シクロアルキル基からなる群から独立的に選択され、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基及びシクロアルキル基が任意選択で置換されている。この実施形態では、アルキレン基が非置換であり、O、S及びNR3、好ましくはO及び/又はS-Sの群から選択される1個又は複数のヘテロ原子によって任意選択で中断されており、R3が水素及びC1~C4アルキル基、好ましくは水素又はメチルからなる群から独立的に選択されることがさらに好ましい。
[0126]好ましいリンカーL1及びL2には、-(CH2)n1-、-(CH2CH2)n1-、-(CH2CH2O)n1-、-(OCH2CH2)n1-、-(CH2CH2O)n1CH2CH2-、-CH2CH2(OCH2CH2)n1-、-(CH2CH2CH2O)n1-、-(OCH2CH2CH2)n1-、-(CH2CH2CH2O)n1CH2CH2CH2-及び-CH2CH2CH2(OCH2CH2CH2)n1-(式中、n1は1~50の範囲、好ましくは1~40の範囲、より好ましくは1~30の範囲、さらにより好ましくは1~20の範囲、なおさらにより好ましくは1~15の範囲の整数である)が含まれる。より好ましくは、n1が1、2、3、4、5、6、7、8、9又は10、より好ましくは1、2、3、4、5、6、7又は8、さらにより好ましくは1、2、3、4、5又は6、なおさらにより好ましくは1、2、3又は4である。
[0127]一実施形態では、L3が非存在であり、c=0である。代替のより好ましい実施形態では、L3が存在し、c=1である。L3が存在する場合、L3はL1及びL2と同じであっても異なっていてもよく、好ましくは異なる。
[0128]好ましい実施形態では、L3がL4、L5、L6及びL7のうちの1つ又は複数を含有し得る。よって、一実施形態では、L3が-(L4)n-(L5)o-(L6)p-(L7)q-(式中、L4、L5、L6及びL7は一緒になって以下でさらに定義されるリンカーLを形成するリンカーであり;n、o、p及びqは個別に0又は1である)である。好ましい実施形態では、少なくともリンカーL4及びL5が存在し(すなわち、n=1;o=1;p=0又は1;q=0又は1)、より好ましくはリンカーL4、L5及びL6が存在し、L7が存在するか、又は存在しない(すなわち、n=1;o=1;p=1;q=0又は1)。一実施形態では、リンカーL4、L5、L6及びL7が存在する(すなわち、n=1;o=1;p=1;q=1)。一実施形態では、リンカーL4、L5及びL6が存在し、L7が存在しない(すなわち、n=1;o=1;p=1;q=0)。一実施形態では、n+o+p+q=1、2、3又は4、好ましくは2、3又は4、より好ましくは3又は4である。好ましい実施形態では、L5及びL6が共に存在する、すなわち、o+p=2である。最も好ましくは、n+o+p+q=4である。
[0129]リンカーL3は、リンカー構築物(特に反応性部分Q)と官能化抗体(特に反応性部分F)の反応前又は後のいずれかであり得る、ペイロードDがリンカー構築物に接続されると形成される接続基Z3を含有し得る。リンカーL3内の接続基は、連結単位L4、L5、L6及びL7のいずれかの接合部で形成され得るか、又はリンカーL3内に別々に存在し得る。例えば、L3は-Z3-(L4)n-(L5)o-(L6)p-(L7)q-又は-(L4)n-Z3-(L5)o-(L6)p-(L7)q-によって表され得る。本明細書において、Zは任意の形態をとることができ、好ましくはQとFの反応によって得られる接続基について以下でさらに定義される通りである。
リンカーL4
[0130]リンカーL4は非存在であるか(n=0)、又は存在する(n=1)。好ましくは、リンカーL4が存在し、n=1である。L4は、例えば直鎖又は分岐C1~C200アルキレン基、C2~C200アルケニレン基、C2~C200アルキニレン基、C3~C200シクロアルキレン基、C5~C200シクロアルケニレン基、C8~C200シクロアルキニレン基、C7~C200アルキルアリーレン基、C7~C200アリールアルキレン基、C8~C200アリールアルケニレン基、C9~C200アリールアルキニレン基からなる群から選択され得る。任意選択で、アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基及びアリールアルキニレン基は置換されていてもよく、任意選択で前記基は1個又は複数のヘテロ原子、好ましくは1~100個のヘテロ原子によって中断されていてもよく、前記ヘテロ原子は、好ましくはO、S(O)y及びNR15からなる群から選択され、yは0、1又は2であり、好ましくはy=2であり、R15は水素、ハロゲン、C1~C24アルキル基、C6~C24(ヘテロ)アリール基、C7~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC7~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択される。
[0130]リンカーL4は非存在であるか(n=0)、又は存在する(n=1)。好ましくは、リンカーL4が存在し、n=1である。L4は、例えば直鎖又は分岐C1~C200アルキレン基、C2~C200アルケニレン基、C2~C200アルキニレン基、C3~C200シクロアルキレン基、C5~C200シクロアルケニレン基、C8~C200シクロアルキニレン基、C7~C200アルキルアリーレン基、C7~C200アリールアルキレン基、C8~C200アリールアルケニレン基、C9~C200アリールアルキニレン基からなる群から選択され得る。任意選択で、アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基及びアリールアルキニレン基は置換されていてもよく、任意選択で前記基は1個又は複数のヘテロ原子、好ましくは1~100個のヘテロ原子によって中断されていてもよく、前記ヘテロ原子は、好ましくはO、S(O)y及びNR15からなる群から選択され、yは0、1又は2であり、好ましくはy=2であり、R15は水素、ハロゲン、C1~C24アルキル基、C6~C24(ヘテロ)アリール基、C7~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC7~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択される。
[0131]L4は、(ポリ)エチレングリコールジアミン(例えば、1,8-ジアミノ-3,6-ジオキサオクタン又はより長いエチレングリコール鎖を含む等価物)、ポリエチレングリコール又はポリエチレンオキシド鎖、ポリプロピレングリコール又はポリプロピレンオキシド鎖及び1,z-ジアミノアルカン(式中、zはアルカン中の炭素原子の数である)(zは例えば1~10の範囲の整数であり得る)を含有し得る。
[0132]好ましい実施形態では、リンカーL4がエチレングリコール基、カルボン酸部分、スルホネート部分、スルホン部分、ホスフェート部分、ホスフィネート部分、アミノ基、アンモニウム基又はスルファミド基を含む。
[0134]波線は、化合物の残り、典型的にはBM及びL5、L6、L7又はD、好ましくはBM及びL5への接続を表す。好ましくは、(O)aC(O)部分がBMに接続されており、NR13部分がL5、L6、L7又はD、好ましくはL5に接続されている。
[0135]構造(23)中、a1=0又は1であり、好ましくはa1=1であり、R13は水素、C1~C24アルキル基、C3~C24シクロアルキル基、C2~C24(ヘテロ)アリール基、C3~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC3~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から選択され、C1~C24アルキル基、C3~C24シクロアルキル基、C2~C24(ヘテロ)アリール基、C3~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC3~C24(ヘテロ)アリールアルキル基は任意選択で置換されており、O、S及びNR14から選択される1個又は複数のヘテロ原子によって任意選択で中断されており、R14は水素及びC1~C4アルキル基からなる群から独立的に選択される。
[0136]或いは、R13は、おそらくスペーサー部分を介して、Nに接続されたDである。一実施形態では、この接続が、以下に定義されるスペーサー部分Sp2を介しており、好ましくはDが、以下でさらに定義される、-(B)e1-(A)f1-(B)g1-C(O)-を介して、又は-(B)e1-(A)f1-(B)g1-C(O)-(L5)o-(L6)p-(L7)q-を介してNに接続されている。別の実施形態では、R13がまた、環状構造が形成されるようにペイロードDの第1のインスタンスに接続されている。例えば、Nは、炭素原子又は窒素原子を介して、好ましくはピペラジン環の第2の窒素原子を介してDに接続されている、ピペラジン部分の一部である。好ましくは、環状構造、例えばピペラジン環が、以下でさらに定義される、-(B)e1-(A)f1-(B)g1-C(O)-を介して、又は-(B)e1-(A)f1-(B)g1-C(O)-(L5)o-(L6)p-(L7)q-を介してDに接続されている。
[0137]好ましい実施形態では、R13が水素又はC1~C20アルキル基であり、より好ましくはR13が水素又はC1~C16アルキル基であり、さらにより好ましくはR13が水素又はC1~C10アルキル基であり、アルキル基が任意選択で置換されており、O、S及びNR14、好ましくはOから選択される1個又は複数のヘテロ原子によって任意選択で中断されており、R14が水素及びC1~C4アルキル基からなる群から独立的に選択される。好ましい実施形態では、R13が水素である。別の好ましい実施形態では、R13がC1~C20アルキル基、より好ましくはC1~C16アルキル基、さらにより好ましくはC1~C10アルキル基であり、アルキル基が1個又は複数のO原子によって任意選択で中断されており、アルキル基が-OH基、好ましくは末端-OH基で任意選択で置換されている。この実施形態では、R13が末端-OH基を含む(ポリ)エチレングリコール鎖であることがさらに好ましい。別の好ましい実施形態では、R13が水素、メチル、エチル、n-プロピル、i-プロピル、n-ブチル、s-ブチル及びt-ブチルからなる群、より好ましくは水素、メチル、エチル、n-プロピル及びi-プロピルからなる群、さらにより好ましくは水素、メチル及びエチルからなる群から選択される。なおさらにより好ましくは、R13が水素又はメチルであり、最も好ましくはR13が水素である。
[0139]本明細書において、a及びR13は上に定義される通りであり、Sp1及びSp2は独立にスペーサー部分であり、b1及びc1は独立に0又は1である。好ましくは、b1=0又は1であり、c1=1であり、より好ましくはb1=0であり、c1=1である。一実施形態では、スペーサーSp1及びSp2が直鎖又は分岐C1~C200アルキレン基、C2~C200アルケニレン基、C2~C200アルキニレン基、C3~C200シクロアルキレン基、C5~C200シクロアルケニレン基、C8~C200シクロアルキニレン基、C7~C200アルキルアリーレン基、C7~C200アリールアルキレン基、C8~C200アリールアルケニレン基及びC9~C200アリールアルキニレン基からなる群から独立的に選択され、アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基及びアリールアルキニレン基が任意選択で置換されており、O、S及びNR16の群から選択される1個又は複数のヘテロ原子によって任意選択で中断されており、R16が水素、C1~C24アルキル基、C2~C24アルケニル基、C2~C24アルキニル基及びC3~C24シクロアルキル基からなる群から独立的に選択され、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基及びシクロアルキル基が任意選択で置換されている。アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基及びアリールアルキニレン基が上に定義される1個又は複数のヘテロ原子によって中断されている場合、前記基が1個若しくは複数のO原子によって、及び/又は1個若しくは複数のS-S基によって中断されていることが好ましい。
[0140]より好ましくは、スペーサー部分Sp1及びSp2が、存在する場合、直鎖又は分岐C1~C100アルキレン基、C2~C100アルケニレン基、C2~C100アルキニレン基、C3~C100シクロアルキレン基、C5~C100シクロアルケニレン基、C8~C100シクロアルキニレン基、C7~C100アルキルアリーレン基、C7~C100アリールアルキレン基、C8~C100アリールアルケニレン基及びC9~C100アリールアルキニレン基からなる群から独立的に選択され、アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基及びアリールアルキニレン基が任意選択で置換されており、O、S及びNR16の群から選択される1個又は複数のヘテロ原子によって任意選択で中断されており、R16が水素、C1~C24アルキル基、C2~C24アルケニル基、C2~C24アルキニル基及びC3~C24シクロアルキル基からなる群から独立的に選択され、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基及びシクロアルキル基が任意選択で置換されている。
[0141]さらにより好ましくは、スペーサー部分Sp1及びSp2が、存在する場合、直鎖又は分岐C1~C50アルキレン基、C2~C50アルケニレン基、C2~C50アルキニレン基、C3~C50シクロアルキレン基、C5~C50シクロアルケニレン基、C8~C50シクロアルキニレン基、C7~C50アルキルアリーレン基、C7~C50アリールアルキレン基、C8~C50アリールアルケニレン基及びC9~C50アリールアルキニレン基からなる群から独立的に選択され、アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基及びアリールアルキニレン基が任意選択で置換されており、O、S及びNR16の群から選択される1個又は複数のヘテロ原子によって任意選択で中断されており、R16が水素、C1~C24アルキル基、C2~C24アルケニル基、C2~C24アルキニル基及びC3~C24シクロアルキル基からなる群から独立的に選択され、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基及びシクロアルキル基が任意選択で置換されている。
[0142]なおさらにより好ましくは、スペーサー部分Sp1及びSp2が、存在する場合、直鎖又は分岐C1~C20アルキレン基、C2~C20アルケニレン基、C2~C20アルキニレン基、C3~C20シクロアルキレン基、C5~C20シクロアルケニレン基、C8~C20シクロアルキニレン基、C7~C20アルキルアリーレン基、C7~C20アリールアルキレン基、C8~C20アリールアルケニレン基及びC9~C20アリールアルキニレン基からなる群から独立的に選択され、アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基及びアリールアルキニレン基が任意選択で置換されており、O、S及びNR16の群から選択される1個又は複数のヘテロ原子によって任意選択で中断されており、R16が水素、C1~C24アルキル基、C2~C24アルケニル基、C2~C24アルキニル基及びC3~C24シクロアルキル基からなる群から独立的に選択され、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基及びシクロアルキル基が任意選択で置換されている。
[0143]これらの好ましい実施形態では、アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基及びアリールアルキニレン基が非置換であり、O、S及びNR16、好ましくはOの群から選択される1個又は複数のヘテロ原子によって任意選択で中断されており、R16が水素及びC1~C4アルキル基、好ましくは水素又はメチルからなる群から独立的に選択されることがさらに好ましい。
[0144]最も好ましくは、スペーサー部分Sp1及びSp2が、存在する場合、直鎖又は分岐C1~C20アルキレン基からなる群から独立的に選択され、アルキレン基が任意選択で置換されており、O、S及びNR16の群から選択される1個又は複数のヘテロ原子によって任意選択で中断されており、R16が水素、C1~C24アルキル基、C2~C24アルケニル基、C2~C24アルキニル基及びC3~C24シクロアルキル基からなる群から独立的に選択され、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基及びシクロアルキル基が任意選択で置換されている。この実施形態では、アルキレン基が非置換であり、O、S及びNR16、好ましくはO及び/又はS-Sの群から選択される1個又は複数のヘテロ原子によって任意選択で中断されており、R3が水素及びC1~C4アルキル基、好ましくは水素又はメチルからなる群から独立的に選択されることがさらに好ましい。
[0145]よって、好ましいスペーサー部分Sp1及びSp2は-(CH2)r-、-(CH2CH2)r-、-(CH2CH2O)r-、-(OCH2CH2)r-、-(CH2CH2O)rCH2CH2-、-CH2CH2(OCH2CH2)r-、-(CH2CH2CH2O)r-、-(OCH2CH2CH2)r-、-(CH2CH2CH2O)rCH2CH2CH2-及び-CH2CH2CH2(OCH2CH2CH2)r-(式中、rは1~50の範囲、好ましくは1~40の範囲、より好ましくは1~30の範囲、さらにより好ましくは1~20の範囲、なおさらにより好ましくは1~15の範囲の整数である)を含む。より好ましくは、rが1、2、3、4、5、6、7、8、9又は10、より好ましくは1、2、3、4、5、6、7又は8、さらにより好ましくは1、2、3、4、5又は6、なおさらにより好ましくは1、2、3又は4である。
[0146]或いは、好ましいリンカーL4は、-(W)k1-(A)d1-(B)e1-(A)f1-(C(O))g1-(式中、
d1=0又は1、好ましくはd1=1であり;
e1=0~10の範囲の整数であり、好ましくはe1=0、1、2、3、4、5又は6、好ましくは1~10の範囲の整数であり、最も好ましくはe1=1、2、3又は4であり;
f1=0又は1であり、好ましくはf1=0であり;
d1+e1+f1は少なくとも1、好ましくは1~5の範囲であり;好ましくはd1+f1は少なくとも1であり、好ましくはd1+f1=1であり;
g1=0又は1であり、好ましくはg1=1であり;
k1=0又は1であり、好ましくはk1=1であり;
Aは構造(23)によるスルファミド基であり;
Bは-CH2-CH2-O-若しくは-O-CH2-CH2-部分であるか、又は(B)e1は-(CH2-CH2-O)e3-CH2-CH2-部分(式中、e3はe1と同じ方法で定義される)であり;
Wは-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)NH-、-NHC(O)-、-OC(O)NH-、-NHC(O)O-、-C(O)(CH2)mC(O)-、-C(O)(CH2)mC(O)NH-又は-(4-Ph)CH2NHC(O)(CH2)mC(O)NH-であり、好ましくは、Wは-OC(O)NH-、-C(O)(CH2)mC(O)NH-又は-C(O)NH-であり、mは0~10の範囲の整数であり、好ましくはm=0、1、2、3、4、5又は6であり、最も好ましくはm=2又は3であり;
好ましくは、L4は(A)d1-(B)e1を介してBMに、及び(C(O))g1、好ましくはC(O)を介して(L5)oに接続されている)
によって表され得る。
d1=0又は1、好ましくはd1=1であり;
e1=0~10の範囲の整数であり、好ましくはe1=0、1、2、3、4、5又は6、好ましくは1~10の範囲の整数であり、最も好ましくはe1=1、2、3又は4であり;
f1=0又は1であり、好ましくはf1=0であり;
d1+e1+f1は少なくとも1、好ましくは1~5の範囲であり;好ましくはd1+f1は少なくとも1であり、好ましくはd1+f1=1であり;
g1=0又は1であり、好ましくはg1=1であり;
k1=0又は1であり、好ましくはk1=1であり;
Aは構造(23)によるスルファミド基であり;
Bは-CH2-CH2-O-若しくは-O-CH2-CH2-部分であるか、又は(B)e1は-(CH2-CH2-O)e3-CH2-CH2-部分(式中、e3はe1と同じ方法で定義される)であり;
Wは-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)NH-、-NHC(O)-、-OC(O)NH-、-NHC(O)O-、-C(O)(CH2)mC(O)-、-C(O)(CH2)mC(O)NH-又は-(4-Ph)CH2NHC(O)(CH2)mC(O)NH-であり、好ましくは、Wは-OC(O)NH-、-C(O)(CH2)mC(O)NH-又は-C(O)NH-であり、mは0~10の範囲の整数であり、好ましくはm=0、1、2、3、4、5又は6であり、最も好ましくはm=2又は3であり;
好ましくは、L4は(A)d1-(B)e1を介してBMに、及び(C(O))g1、好ましくはC(O)を介して(L5)oに接続されている)
によって表され得る。
[0147]本実施形態の文脈では、構造(23)中の波線が、(W)k1、(B)e1及び(C(O))g1などの隣接基への接続を表す。Aが構造(23)によるものであり、a1=1であり、R13=H又はC1~C20アルキル基であることが好ましく、より好ましくはR13=H又はメチルであり、最も好ましくはR13=Hである。
[0148]好ましいリンカーL4は以下の通りである:
(a)k1=0;d1=1;g1=1;f1=0;B=-CH2-CH2-O-;e1=1、2、3又は4、好ましくはe1=2。
(a)k1=0;d1=1;g1=1;f1=0;B=-CH2-CH2-O-;e1=1、2、3又は4、好ましくはe1=2。
(b)k1=1;W=-C(O)(CH2)mC(O)NH-;m=2;d1=0;(B)e1=-(CH2-CH2-O)e3-CH2-CH2-;f1=0;g1=1;e3=1、2、3又は4、好ましくはe1=1。
(c)k1=1;W=-OC(O)NH-;d1=0;B=-CH2-CH2-O-;g1=1;f1=0;e1=1、2、3又は4、好ましくはe1=2。
(d)k1=1;W=-C(O)(CH2)mC(O)NH-;m=2;d1=0;(B)e1=-(CH2-CH2-O)e3-CH2-CH2-;f1=0;g1=1;e3=1、2、3又は4、好ましくはe3=4。
(e)k1=1;W=-OC(O)NH-;d1=0;(B)e1=-(CH2-CH2-O)e3-CH2-CH2-;g1=1;f1=0;e3=1、2、3又は4、好ましくはe3=4。
(f)k1=1;W=-(4-Ph)CH2NHC(O)(CH2)mC(O)NH-、m=3;d1=0;(B)e1=-(CH2-CH2-O)e3-CH2-CH2-;g1=1;f1=0;e3=1、2、3又は4、好ましくはe3=4。
(g)k1=0;d1=0;g1=1;f1=0;B=-CH2-CH2-O-;e1=1、2、3又は4、好ましくはe1=2。
(h)k1=1;W=-C(O)NH-;d1=0;g1=1;f1=0;B=-CH2-CH2-O-;e1=1、2、3又は4、好ましくはe1=2。
[0149]一実施形態では、リンカーL4が、BMと(L5)oとの間の骨格に位置し、好ましくはリンカーを介して分岐窒素原子に連結されている、置換基としてのさらなる部分Dを含有する分岐窒素原子を含む。分岐窒素原子の例は、構造(23)中の窒素原子NR13であり、R13はスペーサー部分を介して、出現する第2のDに接続されている。或いは、分岐窒素原子は、構造-(W)k1-(A)d1-(B)e1-(A)f1-(C(O))g1-によるL4内に位置し得る。一実施形態では、L4が-(W)k1-(A)d1-(B)e1-(A)f1-(C(O))g1-N*[-(A)d1-(B)e1-(A)f1-(C(O))g1-]2(式中、A、B、W、d1、e1、f1、g1及びk1は上に定義される通りであり、各出現について個別に選択され、N*は、-(A)d1-(B)e1-(A)f1-(C(O))g1-の2つのインスタンスが接続されている、分岐窒素原子である)によって表される。本明細書において、両(C(O))g1部分は-(L5)o-(L6)p-(L7)q-D(式中、L5、L6、L7、o、p、q及びDは上に定義される通りであり、それぞれ個別に選択される)に接続されている。最も好ましい実施形態では、このような分岐原子が存在せず、リンカーL4がさらなる部分Dへの接続を含有しない。
リンカーL5
[0150]リンカーL5は非存在であるか(o=0)又は存在する(o=1)。好ましくは、リンカーL5が存在し、o=1である。リンカーL5は、好ましくは2~5個のアミノ酸を含む、当技術分野で公知のペプチドスペーサー、より好ましくはジペプチド又はトリペプチドスペーサー、最も好ましくはジペプチドスペーサーである。任意のペプチドスペーサーが使用され得るが、好ましくはリンカーL5がVal-Cit、Val-Ala、Val-Lys、Val-Arg、Phe-Cit、Phe-Ala、Phe-Lys、Phe-Arg、Ala-Lys、Leu-Cit、Ile-Cit、Trp-Cit、Ala-Ala-Asn、Ala-Asn、より好ましくはVal-Cit、Val-Ala、Val-Lys、Phe-Cit、Phe-Ala、Phe-Lys、Ala-Ala-Asn、より好ましくはVal-Cit、Val-Ala、Ala-Ala-Asnから選択される。一実施形態では、L5=Val-Citである。一実施形態では、L5=Val-Alaである。
[0150]リンカーL5は非存在であるか(o=0)又は存在する(o=1)。好ましくは、リンカーL5が存在し、o=1である。リンカーL5は、好ましくは2~5個のアミノ酸を含む、当技術分野で公知のペプチドスペーサー、より好ましくはジペプチド又はトリペプチドスペーサー、最も好ましくはジペプチドスペーサーである。任意のペプチドスペーサーが使用され得るが、好ましくはリンカーL5がVal-Cit、Val-Ala、Val-Lys、Val-Arg、Phe-Cit、Phe-Ala、Phe-Lys、Phe-Arg、Ala-Lys、Leu-Cit、Ile-Cit、Trp-Cit、Ala-Ala-Asn、Ala-Asn、より好ましくはVal-Cit、Val-Ala、Val-Lys、Phe-Cit、Phe-Ala、Phe-Lys、Ala-Ala-Asn、より好ましくはVal-Cit、Val-Ala、Ala-Ala-Asnから選択される。一実施形態では、L5=Val-Citである。一実施形態では、L5=Val-Alaである。
[0152]本明細書において、R17=CH3又はCH2CH2CH2NHC(O)NH2である。波線は(L4)n及び(L6)pへの接続を示し、好ましくは構造(27)によるL5がNHを介して(L4)nに、及びC(O)を介して(L6)pに接続されている。
リンカーL6
[0153]リンカーL6は非存在であるか(p=0)又は存在する(p=1)。好ましくは、リンカーL6が存在し、p=1である。リンカーL6は、自壊性スペーサーとも呼ばれる、自己切断可能スペーサーである。好ましくは、L6がパラ-アミノベンジルオキシカルボニル(PABC)誘導体、より好ましくは構造(25)によるPABC誘導体である。
[0153]リンカーL6は非存在であるか(p=0)又は存在する(p=1)。好ましくは、リンカーL6が存在し、p=1である。リンカーL6は、自壊性スペーサーとも呼ばれる、自己切断可能スペーサーである。好ましくは、L6がパラ-アミノベンジルオキシカルボニル(PABC)誘導体、より好ましくは構造(25)によるPABC誘導体である。
[0154]本明細書において、波線は(L5)n及び(L7)pへの接続を示す。典型的には、PABC誘導体がNHを介して(L5)nに、及びOを介して(L7)pに接続されている。
[0155]R3はH、R4又はC(O)R4であり、R4は、任意選択で置換されており、O、S及びNR5(式中、R5は水素及びC1~C4アルキル基からなる群から独立的に選択される)から選択される1個又は複数のヘテロ原子によって任意選択で中断されているC1~C24(ヘテロ)アルキル基、C3~C10(ヘテロ)シクロアルキル基、C2~C10(ヘテロ)アリール基、C3~C10アルキル(ヘテロ)アリール基及びC3~C10(ヘテロ)アリールアルキル基である。好ましくは、R4がC3~C10(ヘテロ)シクロアルキル又はポリアルキレングリコールである。ポリアルキレングリコールは、好ましくはポリエチレングリコール又はポリプロピレングリコール、より好ましくは-(CH2CH2O)sH又は-(CH2CH2CH2O)sHである。ポリアルキレングリコールは、最も好ましくはポリエチレングリコール、好ましくは-(CH2CH2O)sH(式中、sは1~10、好ましくは1~5の範囲の整数であり、最も好ましくはs=1、2、3又は4である)である。より好ましくは、R3がH又はC(O)R4であり、R4が4-メチル-ピペラジン又はモルホリンである。最も好ましくは、R3がHである。
リンカーL7
[0156]リンカーL7は非存在であるか(q=0)又は存在する(q=1)。好ましくは、リンカーL7が存在し、q=1である。リンカーL7はアミノアルカン酸スペーサー、すなわち、-N-(Ch-アルキレン)-C(O)-(式中、hは1~20、好ましくは1~10、最も好ましくは1~6の範囲の整数である)である。本明細書において、アミノアルカン酸スペーサーは、窒素原子を介してL6に、及びカルボニル部分を介してDに典型的に接続されている。好ましいリンカーL7は6-アミノヘキサン酸(Ahx、h=6)、β-アラニン(h=2)及びグリシン(Gly、h=1)、さらにより好ましくは6-アミノヘキサン酸又はグリシンから選択される。一実施形態では、L7=6-アミノヘキサン酸である。一実施形態では、L7=グリシンである。或いは、リンカーL7が構造-N-(CH2-CH2-O)e6-(CH2)e7-(C(O)-(式中、e6は1~10の範囲の整数であり、e7は1~3の範囲の整数である)によるエチレングリコールスペーサーである。
[0156]リンカーL7は非存在であるか(q=0)又は存在する(q=1)。好ましくは、リンカーL7が存在し、q=1である。リンカーL7はアミノアルカン酸スペーサー、すなわち、-N-(Ch-アルキレン)-C(O)-(式中、hは1~20、好ましくは1~10、最も好ましくは1~6の範囲の整数である)である。本明細書において、アミノアルカン酸スペーサーは、窒素原子を介してL6に、及びカルボニル部分を介してDに典型的に接続されている。好ましいリンカーL7は6-アミノヘキサン酸(Ahx、h=6)、β-アラニン(h=2)及びグリシン(Gly、h=1)、さらにより好ましくは6-アミノヘキサン酸又はグリシンから選択される。一実施形態では、L7=6-アミノヘキサン酸である。一実施形態では、L7=グリシンである。或いは、リンカーL7が構造-N-(CH2-CH2-O)e6-(CH2)e7-(C(O)-(式中、e6は1~10の範囲の整数であり、e7は1~3の範囲の整数である)によるエチレングリコールスペーサーである。
ペイロードD
[0157]本発明によるリンカーコンジュゲートの好ましい実施形態では、ペイロードが活性物質、レポーター分子、ポリマー、固体表面、ヒドロゲル、ナノ粒子、微粒子及び生体分子からなる群から選択される。特に好ましいペイロードは活性物質及びレポーター分子、特に活性物質である。
[0157]本発明によるリンカーコンジュゲートの好ましい実施形態では、ペイロードが活性物質、レポーター分子、ポリマー、固体表面、ヒドロゲル、ナノ粒子、微粒子及び生体分子からなる群から選択される。特に好ましいペイロードは活性物質及びレポーター分子、特に活性物質である。
[0158]「活性物質」という用語は、本明細書において、薬理学的及び/又は生物学的物質、すなわち、生物学的に及び/又は薬学的に活性である物質、例えば薬物、プロドラッグ、診断用薬、タンパク質、ペプチド、ポリペプチド、ペプチドタグ、アミノ酸、グリカン、脂質、ビタミン、ステロイド、ヌクレオチド、ヌクレオシド、ポリヌクレオチド、RNA又はDNAに関する。ペプチドタグの例としては、ヒトラクトフェリン又はポリアルギニンなどの細胞膜透過性ペプチドが挙げられる。グリカンの例はオリゴマンノースである。アミノ酸の例はリジンである。
[0159]ペイロードが活性物質である場合、活性物質は、好ましくは薬物及びプロドラッグからなる群から選択される。より好ましくは、活性物質が、薬学的に活性の化合物、特に低~中分子量化合物(例えば、約200~約2500Da、好ましくは約300~約1750Da)からなる群から選択される。さらなる好ましい実施形態では、活性物質が細胞毒、抗ウイルス薬、抗菌薬、ペプチド及びオリゴヌクレオチドからなる群から選択される。細胞毒の例としては、コルヒチン、ビンカアルカロイド、アントラサイクリン、カンプトテシン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、タキサン、カリケアミシン、チューブリシン、イリノテカン、抑制ペプチド、アマニチン、デボウガニン(deBouganin)、デュオカルマイシン、メイタンシン、オーリスタチン、エンジイン、ピロロベンゾジアゼピン(PBD)又はインドリノベンゾジアゼピン二量体(IGN)又はPNU159,682が挙げられる。
[0160]「レポーター分子」という用語は、本明細書において、その存在が容易に検出される分子、例えば診断用薬、色素、フルオロフォア、放射性同位体標識、造影剤、磁気共鳴イメージング剤又は質量標識を指す。
[0161]蛍光プローブとも呼ばれる、多種多様なフルオロフォアが当業者に公知である。いくつかのフルオロフォアは、例えば参照により組み込まれる、G.T.Hermanson、「Bioconjugate Techniques」、Elsevier、第3版 2013、第10章:「Fluorescent probes」、395~463頁により詳細に記載されている。フルオロフォアの例としては、あらゆる種類のAlexa Fluor(例えば、Alexa Fluor 555)、シアニン色素(例えば、Cy3又はCy5)及びシアニン色素誘導体、クマリン誘導体、フルオレセイン及びフルオレセイン誘導体、ローダミン及びローダミン誘導体、ホウ素ジピロメテン誘導体、ピレン誘導体、ナフタルイミド誘導体、フィコビリンタンパク質誘導体(例えば、アロフィコシアニン)、クロモマイシン、ランタニドキレート及び量子ドットナノ結晶が挙げられる。
[0162]放射性同位体標識の例としては、例えばDTPA(ジエチレントリアミン五酢酸無水物)、DOTA(1,4,7,10-テトラアザシクロドデカン-N,N’,N’’,N’’’-四酢酸)、NOTA(1,4,7-トリアザシクロノナンN,N’,N’’-三酢酸)、TETA(1,4,8,11-テトラアザシクロテトラデカン-N,N’,N’’,N’’’-四酢酸)、DTTA(N1-(p-イソチオシアナトベンジル)-ジエチレントリアミン-N1,N2,N3,N3-四酢酸)、デフェロキサミン又はDFA(N’-[5-[[4-[[5-(アセチルヒドロキシアミノ)ペンチル]アミノ]-1,4-ジオキソブチル]ヒドロキシアミノ]ペンチル]-N-(5-アミノペンチル)-N-ヒドロキシブタンジアミド)又はHYNIC(ヒドラジノニコチンアミド)などのキレート部分を介して任意選択で接続されている99mTc、111In、114mIn、115In、18F、14C、64Cu、131I、125I、123I、212Bi、88Y、90Y、67Cu、186Rh、188Rh、66Ga、67Ga及び10Bが挙げられる。同位体標識技術は当業者に公知であり、例えば参照により組み込まれる、G.T.Hermanson、「Bioconjugate Techniques」、Elsevier、第3版 2013、第12章:「Isotopic labelling techniques」、507~534頁により詳細に記載されている。
[0163]本発明による化合物でペイロードDとして使用するのに適したポリマーは当業者に公知であり、いくつかの例が、例えば参照により組み込まれる、G.T.Hermanson、「Bioconjugate Techniques」、Elsevier、第3版 2013、第18章:「PEGylation and synthetic polymer modification」、787~838頁により詳細に記載されている。ペイロードDがポリマーである場合、ペイロードDは、好ましくはポリ(エチレングリコール)(PEG)、ポリエチレンオキシド(PEO)、ポリプロピレングリコール(PPG)、ポリプロピレンオキシド(PPO)、1,x-ジアミノアルカンポリマー(式中、xはアルカン中の炭素原子の数であり、好ましくは、xは2~200、好ましくは2~10の範囲の整数である)、(ポリ)エチレングリコールジアミン(例えば、1,8-ジアミノ-3,6-ジオキサオクタン及びより長いエチレングリコール鎖を含む等価物)、多糖(例えば、デキストラン)、ポリ(アミノ酸)(例えば、ポリ(L-リジン))及びポリ(ビニルアルコール)からなる群から独立的に選択される。
[0164]ペイロードDとして使用するのに適した固体表面は当業者に公知である。固体表面は、例えば機能表面(例えば、ナノ材料、カーボンナノチューブ、フラーレン又はウイルスカプシドの表面)、金属表面(例えば、チタン、金、銀、銅、ニッケル、スズ、ロジウム又は亜鉛表面)、金属合金表面(合金は、例えばアルミニウム、ビスマス、クロム、コバルト、銅、ガリウム、金、インジウム、鉄、鉛、マグネシウム、水銀、ニッケル、カリウム、プルトニウム、ロジウム、スカンジウム、銀、ナトリウム、チタン、スズ、ウラン、亜鉛及び/又はジルコニウム由来である)、ポリマー表面(ポリマーは、例えばポリスチレン、ポリ塩化ビニル、ポリエチレン、ポリプロピレン、ポリ(ジメチルシロキサン)又はポリメチルメタクリレート、ポリアクリルアミドである)、ガラス表面、シリコーン表面、クロマトグラフィー支持体表面(クロマトグラフィー支持体は、例えばシリカ支持体、アガロース支持体、セルロース支持体又はアルミナ支持体である)等である。ペイロードDが固体表面である場合、Dが機能表面又はポリマー表面からなる群から独立的に選択されることが好ましい。
[0165]ヒドロゲルは当業者に公知である。ヒドロゲルは、ポリマー構成成分間の架橋によって形成される、水膨潤ネットワークである。例えば参照により組み込まれる、A.S.Hoffman、Adv.Drug Delivery Rev.2012、64、18を参照されたい。ペイロードがヒドロゲルである場合、ヒドロゲルがポリマーベースとしてのポリ(エチレン)グリコール(PEG)で構成されることが好ましい。
[0166]ペイロードDとして使用するのに適した微粒子及びナノ粒子は当業者に公知である。様々な適切な微粒子及びナノ粒子が、例えば参照により組み込まれる、G.T.Hermanson、「Bioconjugate Techniques」、Elsevier、第3版 2013、第14章:「Microparticles and nanoparticles」、549~587頁に記載されている。微粒子又はナノ粒子は、任意の形状、例えば球、ロッド、チューブ、キューブ、三角形及び円錐のものであり得る。好ましくは、微粒子又はナノ粒子が球形状のものである。微粒子及びナノ粒子の化学組成は変動し得る。ペイロードDが微粒子又はナノ粒子である場合、微粒子又はナノ粒子は、例えばポリマー微粒子若しくはナノ粒子、シリカ微粒子若しくはナノ粒子、又は金微粒子若しくはナノ粒子である。粒子がポリマー微粒子又はナノ粒子である場合、ポリマーは、好ましくはポリスチレン又はスチレンのコポリマー(例えば、スチレンとジビニルベンゼン、ブタジエン、アクリレート及び/又はビニルトルエンのコポリマー)、ポリメチルメタクリレート(PMMA)、ポリビニルトルエン、ポリ(ヒドロキシエチルメタクリレート(pHEMA)又はポリ(エチレングリコールジメタクリレート/2-ヒドロキシエチルメタクリレート)[ポリ(EDGMA/HEMA)]である。任意選択で、微粒子又はナノ粒子の表面は、二次ポリマーのグラフト重合、又は別のポリマー若しくはスペーサー部分の共有結合的付着等によって、例えば界面活性剤で修飾される。
[0167]ペイロードDは生体分子であってもよい。生体分子、及びその好ましい実施形態は以下でさらに詳細に記載される。ペイロードDが生体分子である場合、生体分子がタンパク質(糖タンパク質及び抗体を含む)、ポリペプチド、ペプチド、グリカン、脂質、核酸、オリゴヌクレオチド、多糖、オリゴ糖、酵素、ホルモン、アミノ酸及び単糖からなる群から選択されることが好ましい。
[0168]本発明によるDAR1抗体-ペイロードコンジュゲートは、PBD二量体、インドリノベンゾジアゼピン二量体(IGN)、エンジイン、PNU159,682、デュオカルマイシン二量体、アマニチン及びオーリスタチン、好ましくはPBD二量体、インドリノベンゾジアゼピン二量体(IGN)、エンジイン又はPNU159,682などの極めて強力な細胞毒で使用するのに特に適している。特に好ましい実施形態では、ペイロードがPBD二量体、インドリノベンゾジアゼピン二量体(IGN)、エンジイン、PNU159,682、デュオカルマイシン二量体、アマニチン及びオーリスタチン、好ましくはPBD二量体、インドリノベンゾジアゼピン二量体(IGN)、エンジイン又はPNU159,682からなる群から選択される。さらなる好ましい実施形態では、ペイロードが対称ペイロードでも二量体ペイロードでもない。
[0169]好ましい実施形態では、本発明による抗体-ペイロードコンジュゲートが構造(5)によるものである。この実施形態によるコンジュゲートは、以下でさらに定義される(G)e及びSuを含む。
[0170](4)中の2つのGlcNAc部分の各々が、好ましくは抗体ABのFcフラグメント中の天然N-グリコシル化部位に存在する。好ましくは、前記GlcNAc部分がABの領域290~305中のアスパラギンアミノ酸に付着している。さらに好ましい実施形態では、抗体がIgG型抗体であり、特定のIgG型抗体に応じて、前記GlcNAc部分が抗体のアミノ酸アスパラギン297(Asn297又はN297)上に存在する。
[0171]Gは単糖部分であり、eは0~10の範囲の整数である。Gが、好ましくはグルコース(Glc)、ガラクトース(Gal)、マンノース(Man)、フコース(Fuc)、N-アセチルグルコサミン(GlcNAc)、N-アセチルガラクトサミン(GalNAc)、N-アセチルノイラミン酸(NeuNAc)及びシアル酸及びキシロース(Xyl)からなる群から選択される。より好ましくは、Gが、グルコース(Glc)、ガラクトース(Gal)、マンノース(Man)、フコース(Fuc)、N-アセチルグルコサミン(GlcNAc)及びN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)からなる群から選択される。
[0172]好ましい実施形態では、eが0であり、Gが非存在である。抗体のグリカンがトリミングされている場合、Gが典型的には非存在である。トリミングは、グリカンのコアGlcNAc部分のみが残るような、エンドグリコシダーゼによる処理を指す。
[0173]別の好ましい実施形態では、eが1~10の範囲の整数である。この実施形態では、Gがグルコース(Glc)、ガラクトース(Gal)、マンノース(Man)、フコース(Fuc)、N-アセチルグルコサミン(GlcNAc)、N-アセチルガラクトサミン(GalNAc)、N-アセチルノイラミン酸(NeuNAc)又はシアル酸及びキシロース(Xyl)からなる群、より好ましくはグルコース(Glc)、ガラクトース(Gal)、マンノース(Man)、フコース(Fuc)、N-アセチルグルコサミン(GlcNAc)及びN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)からなる群から選択されることがさらに好ましい。
[0174]eが3~10である場合、(G)eは直鎖又は分岐であり得る。分岐オリゴ糖(G)eの好ましい例は、以下に示される(a)、(b)、(c)、(d)、(e)、(f)、(h)及び(h)である。
[0175]Gが存在している場合、GがGlcNAcで終わることが好ましい。換言すれば、Suに直接接続している単糖残基がGlcNAcである。単糖誘導体Suは末端GlcNAc残基上にグリコシル転移(glycosyltransfer)によって容易に導入され得るので、GlcNAc部分の存在は官能化抗体の合成を促進する。構造(a)~(h)を有する、(G)eについての上記の好ましい実施形態では、部分Suが末端GlcNAc残基のいずれかに接続され得る、すなわち、抗体上のコアGlcNAc残基に接続されている、波線結合を有するものではない。
[0176]Gが非存在であること、すなわち、e=0であることが特に好ましい。e=0である抗体-ペイロードコンジュゲート(1)の利点は、このようなコンジュゲートが臨床的に使用される場合、Fcガンマ受容体CD16、CD32及びCD64への結合が有意に減少するか、又は完全に抑止されることである。
[0177]Suは単糖誘導体であり、糖誘導体とも呼ばれる。好ましくは、糖誘導体が、グリコシル転移によって官能化抗体に組み込まれ得る。導入することができるヌクレオチド-糖誘導体の一部の好ましい例については図2を参照されたい。より好ましくは、SuがGal、Glc、GalNAc又はGlcNAc、より好ましくはGal又はGalNAc、最も好ましくはGalNAcである。誘導体という用語は、(G)e及びFに接続するために適切に官能化されている単糖を指す。
調製方法
[0178]本発明はまた、仮定のペイロード抗体比1を有する抗体-ペイロードコンジュゲートを調製する方法であって、
(a)少なくとも2つの反応性基Qを含有する構造(2)を有する化合物を、2つの反応性基Fで官能化されている構造(3)を有する抗体と反応させて:
(式中、
Abは抗体であり;
a、b及びcはそれぞれ個別に0又は1であり;
L1、L2及びL3はリンカーであり;
Vは反応性基Q’又はペイロードDであり;
BMは分岐部分であり;
Q及びFは、これらが連結して接続基Zになる付加環化反応を受けることができる反応性基である)
構造(1’)による官能化抗体:
(式中、ZはQとFの反応によって得られる接続基であり;
構造(1’)による官能化抗体は、VがペイロードDである場合、抗体-ペイロードコンジュゲートである;
又は構造(1’)による官能化抗体は、Vが反応性基Q’である場合、VがペイロードDである場合の抗体-ペイロードコンジュゲートを得るために、ステップ(b)によりさらに反応させられる)
を得るステップと;
(b)V=Q’である場合、反応性基Q’を、反応性基F’を含有するペイロードと反応させて、VがペイロードDである抗体-ペイロードコンジュゲートを得るステップと
を含む方法に関する。
[0178]本発明はまた、仮定のペイロード抗体比1を有する抗体-ペイロードコンジュゲートを調製する方法であって、
(a)少なくとも2つの反応性基Qを含有する構造(2)を有する化合物を、2つの反応性基Fで官能化されている構造(3)を有する抗体と反応させて:
(式中、
Abは抗体であり;
a、b及びcはそれぞれ個別に0又は1であり;
L1、L2及びL3はリンカーであり;
Vは反応性基Q’又はペイロードDであり;
BMは分岐部分であり;
Q及びFは、これらが連結して接続基Zになる付加環化反応を受けることができる反応性基である)
構造(1’)による官能化抗体:
(式中、ZはQとFの反応によって得られる接続基であり;
構造(1’)による官能化抗体は、VがペイロードDである場合、抗体-ペイロードコンジュゲートである;
又は構造(1’)による官能化抗体は、Vが反応性基Q’である場合、VがペイロードDである場合の抗体-ペイロードコンジュゲートを得るために、ステップ(b)によりさらに反応させられる)
を得るステップと;
(b)V=Q’である場合、反応性基Q’を、反応性基F’を含有するペイロードと反応させて、VがペイロードDである抗体-ペイロードコンジュゲートを得るステップと
を含む方法に関する。
[0181]本発明による方法は、ステップ(b)が実施されない形態とステップ(b)が実施される形態の2つの主な形態をとることができる。
[0182]一実施形態では、ステップ(b)が実施されず、構造(2)を有する化合物上に存在するVがペイロードDである。その場合、ステップ(a)が最終コンジュゲート(構造(1))を直接与える。この好ましい実施形態による方法はスキーム1によって表され得る。
[0184]本明細書において、LBは構造(9)による三価リンカーを表し、上にさらに定義される。
[0185]よって、好ましい実施形態では、構造(1)による官能化抗体がステップ(a)で得られ、Dがペイロードであり、ステップ(b)が実施されない。
[0186]一実施形態では、ステップ(b)が実施され、構造(2)を有する化合物上に存在するVが反応性基Q’である。その場合、ステップ(a)が構造(1)(式中、V=Q’(以下(1b)として描かれる))を有する中間官能化抗体を与える。この中間官能化抗体は、反応性基Fを有する適切に官能化されたペイロードと反応して、構造(1)(式中、V=D)を有する最終コンジュゲートを与えるさらなる反応性基Q’を含有する。この好ましい実施形態による方法はスキーム2によって表され得る。
[0188]本明細書において、Q1及びF1は、Q及びFと同じように反応性部分であり、Q及びFの定義及び好ましい実施形態はQ1及びF1に等しく適用される。リンカー化合物(2)中のQ’の存在は、反応に干渉すべきではなく、これはQ1とF1との間の反応においてQ’が不活性であることにより達成され得る。本発明者らは、Q1とQ’の両方が同じ反応性部分である三価リンカー化合物で、Ab(F1)2との反応は2つの組み合わせQ1/Q’についてのみ起こり、第3の反応性部分は未反応のままであることを見出した。リンカー化合物で起こる第3の反応のさらなる減少は、希薄濃度で反応を実施することによって達成される。
[0189]よって、好ましい実施形態では、構造(1’)による官能化抗体がステップ(a)で得られ、Vが反応性基Q’である、すなわち、構造(1b)であり、ステップ(b)が実施される。
[0190]薬物抗体比(DAR)としても知られる、「ペイロード抗体比」は、コンジュゲート中のペイロード分子の抗体分子に対する比を指す。本発明は、DAR1を有するコンジュゲート(すなわち、1つのペイロード分子が1つの抗体分子にコンジュゲートされている)に向けた効率的な経路を提供する。全ての官能化抗体が構造(2)のリンカー化合物と反応し得るわけではなく、結果として実際のペイロード抗体比が仮定のペイロード抗体比から幾分逸脱し得る(すなわち、幾分低くなり得る)ので、生成物のペイロード抗体比は仮定のペイロード抗体比よりもわずかに低くなり得る。本発明による方法は、仮定の比1に近いペイロード抗体比を有する生成物混合物を提供する。
[0191]本発明は、従来の方法と比較して、ペイロード抗体比1を有する抗体コンジュゲートを調製する大いに改善された方法を提供する。従来の方法は、抗体への単一付着点のみの導入で苦労している。抗体は、マレイミド-システインコンジュゲーションなどのランダムコンジュゲーションが、最大8個又はさらにより多いペイロードを保有するコンジュゲートに広範な分布を典型的に与えるように、多くのアミノ酸を含有する。他のコンジュゲーション方法は、抗体が対称的であり、よって、少なくとも2つの使用され得る任意の付着点を提供するという事実が問題となる。よって、遺伝子改変に頼ってただ1つの付着点を含有する組換え抗体を設計することができる。
[0192]代替の先行技術のアプローチは、対称的なペイロード(二量体)がリンカーを介して2つの同一の反応性部分で対称的に官能化されている対称的に官能化されたペイロードの使用を伴う。そのため、これらの2つの反応性部分が、抗体に提供される2つの付着点と反応する。
[0193]本発明による方法は、二官能性リンカー化合物を抗体上の2つの付着点にクリッピングすることによって、抗体の2つの付着点を単一付着点に優雅に変換する。例で実証されるように、ペイロード抗体比1を有するコンジュゲートをそのまま優雅に得ることができる。また、分岐部分によって、いかなるペイロードも抗体にコンジュゲートすることができるので、結果として本方法は対称的なペイロードに限定されない。
[0194]V=Dである場合、ステップ(a)の反応がコンジュゲーション反応である。そうでなければ、V=Q’である場合、ステップ(b)の反応がコンジュゲーション反応である。本発明による方法はいずれのコンジュゲーション技術とも適合性であり、いずれのこのような技術も、実施する場合、ステップ(a)とステップ(b)の両方に使用することができる。
[0195]好ましい実施形態では、ステップ(a)の反応が[4+2]付加環化又は1,3-双極子付加環化である。
[0196]構造(3)による抗体は当技術分野で公知の任意の手段によって調製され得る。例えば、抗体の鎖間ジスルフィド結合の還元、引き続いてマレイミド構築物(又は他のチオール反応性構築物)を含有する規定の数の反応性部分Fとの反応によって、化学量論によって適合させることができる基Fの担持がもたらされる。抗体コンジュゲーションのより制御された、部位特異的方法は、例えば2つのペアになっていないシステイン(重鎖1本当たり1つ又は軽鎖1本当たり1つ)を含有する抗体の遺伝子改変によって、抗体をF含有マレイミド構築物に供して正確に2つの反応性部分Fを抗体に提供することによって達成することができる。遺伝子コードは、AMBER終止コドンを適用することによって、特定の部位で予め定義された数の反応性部分Fを含有する抗体の直接発現が可能になる。例えばトランスグルタミナーゼ(TGase)、ソルターゼ、ホルミル-グリシン生成酵素(FGE)などに基づく、規定の数の反応性部分Fを抗体に取り付けるための様々な酵素的アプローチも報告されている。よって、一実施形態では、官能化抗体が、鎖間ジスルフィド結合の還元、引き続いてF含有チオール反応性構築物との反応、ペアになっていないシステイン残基の導入、引き続いてF含有チオール反応性構築物との反応、反応性部分Fの酵素的導入、及び遺伝子改変による反応性部分の導入によって調製される。遺伝子改変の使用が本出願の文脈において最も好ましくなく、反応性部分Fの酵素的導入が最も好ましい。
[0197]好ましい実施形態では、GlycoConnect技術(例えば、参照により組み込まれる、国際公開第2014/065661号及びvan Geelら、Bioconj.Chem.2015、26、2233~2242参照)は、モノクローナル抗体の重鎖に天然に存在するグリカンを利用して、一定数のクリックプローブ、特にアジドを導入する。よって、好ましい実施形態では、官能化抗体が、(i)任意選択で適切なエンドグリコシダーゼにより天然グリカンをトリミングし、それによって、Asn-297上に典型的に存在するコアGlcNAcを遊離させるステップ、引き続いて(ii)適切なグリコシルトランスフェラーゼの作用下で、対応するUDP-糖から非天然のアジド保有糖基質を移動させる、例えば、ガラクトシルトランスフェラーゼ変異体Gal-T(Y289L)によりGalNAz又はGalNAc-トランスフェラーゼ(GalNAc-T)により6-アジドGalNAcを移動させるステップによって調製される。或いは、GalNAc-Tを適用して、Ac基上に芳香族部分又はチオール官能基を保有するGalNAc誘導体をコアGlcNAc上に取り付けることもできる。構造(5)による官能化抗体をこの技術によって得ることができ、ここではトリミングステップ(i)を採用してe=0を有する官能化抗体を得ることができるか、又はトリミングステップ(i)を省略してe=1~10を有する官能化抗体を得ることができる。好ましくは、ステップ(i)が実施され、e=0である。
反応性部分Q及びF
[0198]本発明の文脈において、「反応性部分」という用語は、官能基を含む化学部分を指し得るが、官能基自体も指し得る。例えば、シクロオクチニル基は、官能基、すなわちC-C三重結合を含む反応性基である。しかしながら、官能基、例えばアジド官能基、チオール官能基又はアルキニル官能基も、本明細書において、反応性基と呼ばれ得る。
[0198]本発明の文脈において、「反応性部分」という用語は、官能基を含む化学部分を指し得るが、官能基自体も指し得る。例えば、シクロオクチニル基は、官能基、すなわちC-C三重結合を含む反応性基である。しかしながら、官能基、例えばアジド官能基、チオール官能基又はアルキニル官能基も、本明細書において、反応性基と呼ばれ得る。
[0199]本発明による方法において反応性であるためには、反応性部分Qは、官能化抗体上に存在する反応性部分Fと反応することができるべきである。換言すれば、反応性部分Qは、官能化抗体上に存在する反応性部分Fに対して反応性である。本明細書において、反応性部分は、別の反応性部分に対して、前記第1の反応性部分が、任意選択で他の官能基の存在下で、選択的に前記第2の反応性部分と反応する場合に、「反応性」であると定義される。相補的反応性部分は当業者に公知であり、以下でさらに詳細に記載され、図1に例示される。よって、コンジュゲーション反応は、抗体とペイロードとの間の共有結合的接続を含むコンジュゲートを形成する、QとFとの間の化学反応である。ここで提供される反応性部分Qの定義をF、Q1、F1及びQ’に等しく適用する。
[0200]好ましい実施形態では、反応性部分が、任意選択で置換された、アルケニル基、アルキニル基、テトラジニル基、アジド基、ニトリルオキシド基、ニトロン基、ニトリルイミン基、ジアゾ基、ケトン基、(O-アルキル)ヒドロキシルアミノ基、ヒドラジン基、アレンアミド基、トリアジン基、ホスホンアミダイト(phosphonamidite)基からなる群から選択される。特に好ましい実施形態では、反応性部分Qがアジド基又はアルキニル基であり、最も好ましくは、反応性部分Qがアルキニル基である。Qがアルキニル基である場合、Qが末端アルキン基、(ヘテロ)シクロアルキニル基及びビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イル]基から選択されることが好ましい。
[0201]別の好ましい実施形態では、Qがシクロアルケニル基を含むアルケニル基を含むか、又はシクロアルケニル基を含むアルケニル基であり、好ましくはQがアルケニル基である。アルケニル基は直鎖又は分岐であり得、任意選択で置換されている。アルケニル基は末端又は内部アルケニル基であり得る。アルケニル基は、2つ以上のC-C二重結合を含むことができ、好ましくは、1つ又は2つのC-C二重結合を含む。アルケニル基がジエニル基である場合、2つのC-C二重結合が1つのC-C単結合によって分離されていることがさらに好ましい(すなわち、ジエニル基が共役ジエニル基であることが好ましい)。好ましくは、前記アルケニル基が、C2~C24アルケニル基、より好ましくはC2~C12アルケニル基、さらにより好ましくはC2~C6アルケニル基である。アルケニル基が末端アルケニル基であることがさらに好ましい。より好ましくは、アルケニル基が、以下に示される構造(Q8)によるものであり、lが0~10の範囲、好ましくは0~6の範囲の整数であり、pが0~10の範囲、好ましくは0~6の範囲の整数である。より好ましくは、lが0、1、2、3又は4であり、より好ましくはlが0、1又は2であり、最も好ましくはlが0又は1である。より好ましくは、pが0、1、2、3又は4であり、より好ましくはpが0、1又は2であり、最も好ましくはpが0又は1である。pが0であり、lが0又は1であるか、又はpが1であり、lが0又は1であることが特に好ましい。
[0202]特に好ましいアルケニル基は、ヘテロシクロアルケニル基を含むシクロアルケニル基であり、シクロアルケニル基は任意選択で置換されている。好ましくは、前記シクロアルケニル基が、C3~C24シクロアルケニル基、より好ましくはC3~C12シクロアルケニル基、さらにより好ましくはC3~C8シクロアルケニル基である。好ましい実施形態では、シクロアルケニル基が、トランス-シクロアルケニル基、より好ましくはトランス-シクロオクテニル基(TCO基とも呼ばれる)、最も好ましくは以下に示される構造(Q9)又は(Q10)によるトランス-シクロオクテニル基である。別の好ましい実施形態では、シクロアルケニル基がシクロプロペニル基であり、シクロプロペニル基が任意選択で置換されている。別の好ましい実施形態では、シクロアルケニル基が、ノルボルネニル基、オキサノルボルネニル基、ノルボルナジエニル基又はオキサノルボルナジエニル基であり、ノルボルネニル基、オキサノルボルネニル基、ノルボルナジエニル基又はオキサノルボルナジエニル基が任意選択で置換されている。さらに好ましい実施形態では、シクロアルケニル基が以下に示される構造(Q11)、(Q12)、(Q13)又は(Q14)によるものであり、X4がCH2又はOであり、R27が水素、直鎖若しくは分岐C1~C12アルキル基又はC4~C12(ヘテロ)アリール基からなる群から独立的に選択され、R14が水素及びフッ素化炭化水素からなる群から選択される。好ましくは、R27が独立に、水素又はC1~C6アルキル基であり、より好ましくはR27が独立に、水素又はC1~C4アルキル基である。さらにより好ましくは、R27が独立に、水素又はメチル、エチル、n-プロピル、i-プロピル、n-ブチル、s-ブチル又はt-ブチルである。なおさらにより好ましくは、R27が独立に、水素又はメチルである。さらに好ましい実施形態では、R14が、水素及び-CF3、-C2F5、-C3F7及び-C4F9、より好ましくは水素及び-CF3の群から選択される。さらに好ましい実施形態では、シクロアルケニル基が構造(Q11)によるものであり、一方のR27が水素であり、他方のR27がメチル基である。別のさらに好ましい実施形態では、シクロアルケニル基が構造(Q12)によるものであり、両R27が水素である。これらの実施形態では、lが0又は1であることがさらに好ましい。別のさらに好ましい実施形態では、シクロアルケニル基が、構造(Q13)によるノルボルネニル(X4がCH2である)若しくはオキサノルボルネニル(X4がOである)基、又は構造(Q14)によるノルボルナジエニル(X4がCH2である)若しくはオキサノルボルナジエニル(X4がOである)基であり、R27が水素であり、R14が水素又は-CF3、好ましくは-CF3である。
[0203]別の好ましい実施形態では、Qがシクロアルキニル基を含むアルキニル基を含むか、又はシクロアルキニル基を含むアルキニル基であり、好ましくはQがアルキニル基を含む。アルキニル基は直鎖又は分岐であり得、任意選択で置換されている。アルキニル基は末端又は内部アルキニル基であり得る。好ましくは、前記アルキニル基が、C2~C24アルキニル基、より好ましくはC2~C12アルキニル基、さらにより好ましくはC2~C6アルキニル基である。アルキニル基が末端アルキニル基であることがさらに好ましい。より好ましくは、アルキニル基が以下に示される構造(Q15)によるものであり、lが0~10の範囲、好ましくは0~6の範囲の整数である。より好ましくは、lが0、1、2、3又は4であり、より好ましくはlが0、1又は2であり、最も好ましくはlが0又は1である。
[0204]特に好ましいアルキニル基はヘテロシクロアルキニル基を含むシクロアルキニル基であり、シクロアルケニル基は、任意選択で置換されている。好ましくは、(ヘテロ)シクロアルキニル基が(ヘテロ)シクロオクチニル基、すなわち、ヘテロシクロオクチニル基又はシクロオクチニル基であり、(ヘテロ)シクロオクチニル基が任意選択で置換されている。さらに好ましい実施形態では、(ヘテロ)シクロオクチニル基が構造(Q36)によるものであり、以下でさらに定義される。(ヘテロ)シクロオクチニル基の好ましい例としては、全ての以下に示される、DIBO基とも呼ばれる構造(Q16)、DIBAC基とも呼ばれる(Q17)、又はBARAC基とも呼ばれる(Q18)、COMBO基とも呼ばれる(Q19)、及びBCN基とも呼ばれる(Q20)が挙げられ、X5はO又はNR27であり、R27の好ましい実施形態は上に定義される通りである。(Q16)中の芳香環は、1つ又は複数の位置で、好ましくは2つの位置で、最も好ましくは(Q40)(スルホニル化ジベンゾシクロオクチン(s-DIBO))のように任意選択でO-スルホニル化されているのに対して、(Q17)及び(Q18)の環は、1つ又は複数の位置でハロゲン化され得る。特に好ましいシクロアルキニル基は、任意選択で置換されている、ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イル]基(BCN基)である。好ましくは、ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イル]基が以下に示される構造(Q20)によるものである。
[0205]別の好ましい実施形態では、Qが共役(ヘテロ)ジエン基を含むか、又は共役(ヘテロ)ジエン基であり、好ましくはQがディールス-アルダー反応で反応することができる共役(ヘテロ)ジエン基である。好ましい(ヘテロ)ジエン基には、任意選択で置換されたテトラジニル基、任意選択で置換された1,2-キノン基及び任意選択で置換されたトリアジン基が含まれる。より好ましくは、前記テトラジニル基が以下に示される構造(Q21)によるものであり、R27が水素、直鎖若しくは分岐C1~C12アルキル基又はC4~C12(ヘテロ)アリール基からなる群から選択される。好ましくは、R27が水素、C1~C6アルキル基又はC4~C10(ヘテロ)アリール基であり、より好ましくはR27が水素、C1~C4アルキル基又はC4~C6(ヘテロ)アリール基である。さらにより好ましくは、R27が水素、メチル、エチル、n-プロピル、i-プロピル、n-ブチル、s-ブチル、t-ブチル又はピリジルである。なおさらにより好ましくは、R27が水素、メチル又はピリジルである。より好ましくは、前記1,2-キノン基が構造(Q22)又は(Q23)によるものである。前記トリアジン基は任意の位置異性体であり得る。より好ましくは、前記トリアジン基が、構造(Q24)に示されるように、任意の可能な位置を介して付着され得る1,2,3-トリアジン基又は1,2,4-トリアジン基である。1,2,3-トリアジンがトリアジン基として最も好ましい。
[0206]別の好ましい実施形態では、Qがアジド基を含むか、又はアジド基であり、好ましくはQがアジド基である。好ましくは、アジド基が以下に示される構造(Q25)によるものである。
[0207]別の好ましい実施形態では、Qがニトリルオキシド基を含むか、又はニトリルオキシド基であり、好ましくはQがニトリルオキシド基である。好ましくは、ニトリルオキシド基が以下に示される構造(Q27)によるものである。
[0208]別の好ましい実施形態では、Qがニトロン基を含むか、又はニトロン基であり、好ましくはQがニトロン基である。好ましくは、ニトロン基が以下に示される構造(Q28)によるものであり、R29が直鎖又は分岐C1~C12アルキル基及びC6~C12アリール基からなる群から選択される。好ましくは、R29がC1~C6アルキル基であり、より好ましくはR29がC1~C4アルキル基である。さらにより好ましくはR29がメチル、エチル、n-プロピル、i-プロピル、n-ブチル、s-ブチル又はt-ブチルである。なおさらにより好ましくはR29がメチルである。
[0209]別の好ましい実施形態では、Qがニトリルイミン基を含むか、又はニトリルイミン基であり、好ましくはQがニトリルイミン基である。好ましくは、ニトリルイミン基が以下に示される構造(Q29)又は(Q30)によるものであり、R30が直鎖又は分岐C1~C12アルキル基及びC6~C12アリール基からなる群から選択される。好ましくは、R30がC1~C6アルキル基であり、より好ましくはR30がC1~C4アルキル基である。さらにより好ましくはR30がメチル、エチル、n-プロピル、i-プロピル、n-ブチル、s-ブチル又はt-ブチルである。なおさらにより好ましくはR30がメチルである。
[0210]別の好ましい実施形態では、Qがジアゾ基を含むか、又はジアゾ基であり、好ましくはQがジアゾ基である。好ましくは、ジアゾ基が以下に示される構造(Q31)によるものであり、R33が水素又はカルボニル誘導体からなる群から選択される。より好ましくは、R33が水素である。
[0211]別の好ましい実施形態では、Qがケトン基を含むか、又はケトン基であり、好ましくはQがケトン基である。好ましくは、ケトン基が以下に示される構造(Q32)によるものであり、R34が直鎖又は分岐C1~C12アルキル基及びC6~C12アリール基からなる群から選択される。好ましくは、R34がC1~C6アルキル基であり、より好ましくはR34がC1~C4アルキル基である。さらにより好ましくは、R34がメチル、エチル、n-プロピル、i-プロピル、n-ブチル、s-ブチル又はt-ブチルである。なおさらにより好ましくは、R34がメチルである。
[0212]別の好ましい実施形態では、Qが(O-アルキル)ヒドロキシルアミノ基を含むか、又は(O-アルキル)ヒドロキシルアミノ基であり、好ましくはQが(O-アルキル)ヒドロキシルアミノ基である。好ましくは、(O-アルキル)ヒドロキシルアミノ基が以下に示される構造(Q33)によるものである。
[0213]別の好ましい実施形態では、Qがヒドラジン基を含むか、又はヒドラジン基であり、好ましくはQがヒドラジン基である。好ましくは、ヒドラジン基が以下に示される構造(Q34)によるものである。
[0214]別の好ましい実施形態では、Qがアレンアミド基を含むか、又はアレンアミド基であり、好ましくはQがアレンアミド基である。好ましくは、アレンアミド基が構造(Q35)によるものである。
[0215]別の好ましい実施形態では、Qがホスホンアミダイト基を含むか、又はホスホンアミダイト基であり、好ましくはQがホスホンアミダイト基である。好ましくは、ホスホンアミダイト基が構造(Q36)によるものである。
[0216]本明細書において、(Q16)中の芳香環は、1つ又は複数の位置で、任意選択でO-スルホニル化されているのに対して、(Q17)及び(Q18)の環は、1つ又は複数の位置でハロゲン化され得る。
[0218]本明細書において、波線結合で描かれる、分子の残りとの接続は、Qの任意の利用可能な炭素又は窒素原子であり得る。(Q50)、(Q53)、(Q54)及び(Q55)の窒素原子は接続を保有し得るか、又は水素原子を含有し得るか、又は任意選択で官能化され得る。B(-)はアニオンであり、好ましくは(-)OTf、Cl(-)、Br(-)又はI(-)から選択され、最も好ましくはB(-)が(-)OTfである。コンジュゲーション反応において、B(-)はどのようにしても反応混合物中に存在するアニオンと交換するので、B(-)は薬学的に許容できるアニオンである必要はない。(Q59)がQに使用される場合、抗体コンジュゲートが医薬品として容易に使用可能となるように、負に帯電した対イオンは、好ましくは、本発明による抗体コンジュゲートの単離で薬学的に許容できる。
[0219]FとQとの間の反応及びそれらの対応する生成物(接続基Z)の一部の代表的な例が図1に描かれている。
[0220]コンジュゲーションは付加環化によって達成される。好ましい実施形態では、コンジュゲーションが[4+2]付加環化又は1,3-双極子付加環化によって達成され、求核反応がマイケル付加又は求核置換である。よって、本発明によるコンジュゲーション方法の好ましい実施形態では、コンジュゲーションが、[4+2]付加環化又は1,3-双極子付加環化、好ましくは1,3-双極子付加環化を介して達成される。
[0221]典型的な[4+2]付加環化はディールス-アルダー反応であり、Qはジエン又はジエノフィル(dienophile)である。当業者によって認識されるように、ディールス-アルダー反応の文脈における「ジエン」という用語は、1,3-(ヘテロ)ジエンを指し、共役ジエン(R2C=CR-CR=CR2)、イミン(例えば、R2C=CR-N=CR2又はR2C=CR-CR=NR、R2C=N-N=CR2)及びカルボニル(例えば、R2C=CR-CR=O又はO=CR-CR=O)を含む。N及びO含有ジエンとのヘテロ-ディールス-アルダー反応は当技術分野で公知である。[4+2]付加環化に適していることが当技術分野で知られている任意のジエンを反応性基Qとして使用することができる。好ましいジエンには、上記のテトラジン、上記の1,2-キノン及び上記のトリアジンが含まれる。[4+2]付加環化に適していることが当技術分野で知られている任意のジエノフィルを反応性基Qとして使用することができるが、ジエノフィルは、好ましくは上記のアルケン又はアルキン基、最も好ましくはアルキン基である。[4+2]付加環化を介したコンジュゲーションについては、Qがジエノフィルである(及びFがジエンである)ことが好ましく、より好ましくはQがアルキニル基であるか、又はアルキニル基を含む。
[0222]1,3-双極子付加環化については、Qが1,3-双極子又は親双極子である。1,3-双極子付加環化に適していることが当技術分野で知られている任意の1,3-双極子を反応性基Qとして使用することができる。好ましい1,3-双極子には、アジド基、ニトロン基、ニトリルオキシド基、ニトリルイミン基及びジアゾ基が含まれる。1,3-双極子付加環化に適していることが当技術分野で知られている任意の親双極子を反応性基Qとして使用することができるが、親双極子は、好ましくはアルケン又はアルキン基、最も好ましくはアルキン基である。1,3-双極子付加環化を介したコンジュゲーションについては、Qが親双極子である(及びFが1,3-双極子である)ことが好ましく、より好ましくはQがアルキニル基であるか、又はアルキニル基を含む。
[0223]よって、好ましい実施形態では、Qが親双極子及びジエノフィルから選択される。好ましくは、Qがアルケン又はアルキン基である。特に好ましい実施形態では、Qが、好ましくは上記のアルキニル基、上記のシクロアルケニル基、上記の(ヘテロ)シクロアルキニル基及びビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イル]基から選択される、アルキン基を含む。より好ましくは、Qが、末端アルキン又はシクロオクチン部分、好ましくはビシクロノニン(BCN)、アザジベンゾシクロオクチン(DIBAC/DBCO)又はジベンゾシクロオクチン(DIBO)、より好ましくはBCN又はDIBAC/DBCO、最も好ましくはBCNを含む。代替の好ましい実施形態では、Qが、式(Q5)、(Q6)、(Q7)、(Q8)、(Q20)及び(Q9)から選択され、より好ましくは式(Q6)、(Q7)、(Q8)、(Q20)及び(Q9)から選択される。最も好ましくは、Qが、好ましくは式(Q20)の、ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イル]基である。これらの基は、アジド官能化抗体とのコンジュゲーションにおいて極めて有効であることが知られている。
本明細書において、
R15は、水素、ハロゲン、-OR16、-NO2、-CN、-S(O)2R16、C1~C24アルキル基、C6~C24(ヘテロ)アリール基、C7~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC7~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は任意選択で置換されており、2つの置換基R15は連結して、縮環シクロアルキル又は縮環(ヘテロ)アレーン置換基を形成してもよく、R16は、水素、ハロゲン、C1~C24アルキル基、C6~C24(ヘテロ)アリール基、C7~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC7~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され;
X10はC(R17)2、O、S又はNR17であり、R17はR15であり;
uは0、1、2、3、4又は5であり;
u’は0、1、2、3、4又は5であり;
u+u’=5であり;
v=9又は10である。
R15は、水素、ハロゲン、-OR16、-NO2、-CN、-S(O)2R16、C1~C24アルキル基、C6~C24(ヘテロ)アリール基、C7~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC7~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は任意選択で置換されており、2つの置換基R15は連結して、縮環シクロアルキル又は縮環(ヘテロ)アレーン置換基を形成してもよく、R16は、水素、ハロゲン、C1~C24アルキル基、C6~C24(ヘテロ)アリール基、C7~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC7~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され;
X10はC(R17)2、O、S又はNR17であり、R17はR15であり;
uは0、1、2、3、4又は5であり;
u’は0、1、2、3、4又は5であり;
u+u’=5であり;
v=9又は10である。
[0225]構造(Q36)による反応性基の好ましい実施形態は、構造(Q37)、(Q6)、(Q7)、(Q8)、(Q9)及び(Q20)による反応性基である。
本明細書において、
R15は、水素、ハロゲン、-OR16、-NO2、-CN、-S(O)2R16、C1~C24アルキル基、C5~C24(ヘテロ)アリール基、C7~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC7~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は任意選択で置換されており、2つの置換基R15は連結して、縮環シクロアルキル又は縮環(ヘテロ)アレーン置換基を形成してもよく、R16は、水素、ハロゲン、C1~C24アルキル基、C6~C24(ヘテロ)アリール基、C7~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC7~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され;
R18は、水素、ハロゲン、C1~C24アルキル基、C6~C24(ヘテロ)アリール基、C7~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC7~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され;
R19は、水素、ハロゲン、C1~C24アルキル基、C6~C24(ヘテロ)アリール基、C7~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC7~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から選択され、アルキル基はO、N及びSからなる群から選択される1個又は複数のヘテロ原子によって任意選択で中断されており、アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は独立に、任意選択で置換されており;
lは0~10の範囲の整数である。
R15は、水素、ハロゲン、-OR16、-NO2、-CN、-S(O)2R16、C1~C24アルキル基、C5~C24(ヘテロ)アリール基、C7~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC7~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され、アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は任意選択で置換されており、2つの置換基R15は連結して、縮環シクロアルキル又は縮環(ヘテロ)アレーン置換基を形成してもよく、R16は、水素、ハロゲン、C1~C24アルキル基、C6~C24(ヘテロ)アリール基、C7~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC7~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され;
R18は、水素、ハロゲン、C1~C24アルキル基、C6~C24(ヘテロ)アリール基、C7~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC7~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から独立的に選択され;
R19は、水素、ハロゲン、C1~C24アルキル基、C6~C24(ヘテロ)アリール基、C7~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC7~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から選択され、アルキル基はO、N及びSからなる群から選択される1個又は複数のヘテロ原子によって任意選択で中断されており、アルキル基、(ヘテロ)アリール基、アルキル(ヘテロ)アリール基及び(ヘテロ)アリールアルキル基は独立に、任意選択で置換されており;
lは0~10の範囲の整数である。
[0227]構造(Q37)による反応性基の好ましい実施形態では、R15が、水素、ハロゲン、-OR16、C1~C6アルキル基、C5~C6(ヘテロ)アリール基からなる群から独立的に選択され、R16が水素又はC1~C6アルキルであり、より好ましくはR15が水素及びC1~C6アルキルからなる群から独立的に選択され、最も好ましくは全てのR15がHである。構造(Q37)による反応性基の好ましい実施形態では、R18が、水素、C1~C6アルキル基からなる群から独立的に選択され、最も好ましくは両R18がHである。構造(Q37)による反応性基の好ましい実施形態では、R19がHである。構造(Q37)による反応性基の好ましい実施形態では、lが0又は1であり、より好ましくはlが1である。構造(Q37)による反応性基の特に好ましい実施形態は構造(Q20)による反応性基である。
化合物
[0228]さらなる態様では、本発明は構造(2):
(式中、
a、b及びcはそれぞれ個別に0又は1であり;
L1、L2及びL3はリンカーであり;
Dはペイロードであり;
BMは分岐部分であり;
Qは(ヘテロ)シクロオクチン部分を含む)
の化合物に関する。
[0228]さらなる態様では、本発明は構造(2):
(式中、
a、b及びcはそれぞれ個別に0又は1であり;
L1、L2及びL3はリンカーであり;
Dはペイロードであり;
BMは分岐部分であり;
Qは(ヘテロ)シクロオクチン部分を含む)
の化合物に関する。
[0229]部分a、b、c、L1、L2、L3、D、BM及びQは上にさらに定義され、上に定義される好ましい実施形態を含めて、本態様に等しく適用される。好ましい実施形態では、Dが上にさらに定義される細胞毒である。構造(2)の好ましい化合物は対称的である、すなわち、出現するa/b、L1/L2及びQの各々が同じである。好ましくは、a=b=1であり、より好ましくはc=1でもある。
[0230]本態様の文脈において、Qは、任意選択で置換されており、ヘテロシクロオクチニル基又はシクロオクチニル基、好ましくはシクロオクチニル基であり得る(ヘテロ)シクロオクチン部分を含む。さらなる好ましい実施形態では、(ヘテロ)シクロオクチニル基が構造(Q36)によるものである。(ヘテロ)シクロオクチニル基の好ましい例としては、DIBO基とも呼ばれる構造(Q16)、DIBAC基とも呼ばれる(Q17)、又はBARAC基とも呼ばれる(Q18)、COMBO基とも呼ばれる(Q19)、及びBCN基とも呼ばれる(Q20)が挙げられ、X5はO又はNR27であり、R27の好ましい実施形態は上に定義される通りである。(Q16)の芳香環は、1つ又は複数の位置で、好ましくは2つの位置で、最も好ましくは(Q37)によって、任意選択でO-スルホニル化されており、(Q17)及び(Q18)の環は、1つ又は複数の位置でハロゲン化され得る。特に好ましいシクロオクチニル基は、任意選択で置換されている、ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イル]基(BCN基)である。好ましくは、ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イル]基が以下に示される構造(Q20)によるものである。一実施形態では、Qがビシクロノニン(BCN)、アザジベンゾシクロオクチン(DIBAC/DBCO)、ジベンゾシクロオクチン(DIBO)又はスルホニル化ジベンゾシクロオクチン(s-DIBO)、より好ましくはBCN又はDIBAC/DBCO、最も好ましくはBCNである。
[0231]この態様による化合物は、理想的には、本発明による抗体-ペイロードコンジュゲートの調製における中間体として適している。
用途
[0232]本発明によるコンジュゲートは、がんの処置において特に適している。よって、本発明は、医薬品における本発明によるコンジュゲートの使用にさらに関する。さらなる態様では、本発明はまた、それを必要とする対象を処置する方法であって、本発明によるコンジュゲートを対象に投与するステップを含む方法に関する。この態様による方法は、処置に使用するための本発明によるコンジュゲートと言い表すこともできる。この態様による方法は、医薬品を製造するための本発明によるコンジュゲートの使用と言い表すこともできる。本明細書において、投与は、治療上有効量の本発明によるコンジュゲートを用いて典型的に行われる。
[0232]本発明によるコンジュゲートは、がんの処置において特に適している。よって、本発明は、医薬品における本発明によるコンジュゲートの使用にさらに関する。さらなる態様では、本発明はまた、それを必要とする対象を処置する方法であって、本発明によるコンジュゲートを対象に投与するステップを含む方法に関する。この態様による方法は、処置に使用するための本発明によるコンジュゲートと言い表すこともできる。この態様による方法は、医薬品を製造するための本発明によるコンジュゲートの使用と言い表すこともできる。本明細書において、投与は、治療上有効量の本発明によるコンジュゲートを用いて典型的に行われる。
[0233]本発明は、それを必要とする対象の特定の疾患を処置する方法であって、上に定義される本発明によるコンジュゲートを投与するステップを含む方法にさらに関する。特定の疾患は、がん、ウイルス感染症、細菌感染症、神経学的疾患、自己免疫疾患、眼疾患、高コレステロール血症及びアミロイドーシス、より好ましくはがん及びウイルス感染症から選択され得、最も好ましくは疾患が、がんである。それを必要とする対象は、典型的にはがん患者である。本発明によるコンジュゲートの使用は、このような処置において、特にがん処置の分野において周知であり、本発明によるコンジュゲートはこの点で特に適している。この態様による方法では、コンジュゲートが、治療上有効量で典型的に投与される。本発明の本態様は、それを必要とする対象の特定の疾患の処置に使用するための、好ましくはがんを処置するための、本発明によるコンジュゲートと言い表すこともできる。換言すれば、この態様は、それを必要とする対象の特定の疾患の処置に使用するための、好ましくはがんの処置に使用するための医薬品又は医薬組成物を調製するための、本発明によるコンジュゲートの使用に関する。
[0234]本発明によるコンジュゲートがFcサイレントである、すなわち、臨床的に使用した場合に、Fcガンマ受容体CD16、CD32及びCD64に有意には結合しないことが好ましい。これは、Gが非存在である、すなわち、e=0である場合である。
[0235]本発明の文脈における投与は全身投与を指す。したがって、一実施形態では、本明細書に定義される方法がコンジュゲートの全身投与のためのものである。コンジュゲートの特異性に照らして、コンジュゲートを全身投与することができるが、それでもこれらの抗体は目的の組織(例えば、腫瘍)で又はその近くで活性を及ぼすことができる。全身投与は、薬物が画像化技術で検出可能ではない腫瘍転移にも到達することができ、血液腫瘍に適用可能であり得るので、局所投与と比較して大きな利点を有する。
[0236]本発明は、本発明による抗体-ペイロードコンジュゲートと薬学的に許容できる担体とを含む医薬組成物にさらに関する。
本発明を以下の実施例によって例示する。
一般的手順
化学物質は、一般的に使用される供給業者(Sigma-Aldrich、Acros、Alfa Aesar、Fluorochem、Apollo Scientific Ltd及びTCI)から購入し、さらに精製することなく使用した。化学的変換、後処理及びクロマトグラフィーのための溶媒(脱水溶媒を含む)は、HPLCグレードでAldrich(英国、ドーセット)から購入し、さらに蒸留することなく使用した。シリカゲル60 F254分析用薄層クロマトグラフィー(TLC)プレートは、Merck(ドイツ、ダルムシュタット)製のものとし、UV光下で、過マンガン酸カリウム染色又はアニスアルデヒド染色を用いて可視化した。クロマトグラフィー精製は、Buchi Sepacore C660フラクションコレクター(スイス、フラヴィル)と組み合わせたAcrosシリカゲル(0.06~0.200、60A)又は充填済カラム(Silicycle)を使用して実施した。逆相HPLC精製は、Waters Xbridge C18カラム(5μm OBD、30×100mm、PN186002982)を備えたAgilent 1200システムを使用して実施した。NMR分光法に使用される重水素化溶媒は、Cambridge Isotope Laboratoriesから入手した。H-Val-Ala-PABC-MMAF.TFAはLevena Biopharmから入手し、ビス-mal-Lys-PEG4-TFPエステル(177)はQuanta Biodesignから入手し、O-(2-アミノエチル)-O’-(2-アジドエチル)ジエチレングリコール(XL07)並びに化合物344及び179はBroadpharmから入手し、2,3-ビス(ブロモメチル)-6-キノキサリンカルボン酸(178)はChemSceneから入手し、32-アジド-5-オキソ-3,9,12,15,18,21,24,27,30-ノナオキサ-6-アザドトリアコンタン酸(348)はCarbosynthから入手した。
一般的手順
化学物質は、一般的に使用される供給業者(Sigma-Aldrich、Acros、Alfa Aesar、Fluorochem、Apollo Scientific Ltd及びTCI)から購入し、さらに精製することなく使用した。化学的変換、後処理及びクロマトグラフィーのための溶媒(脱水溶媒を含む)は、HPLCグレードでAldrich(英国、ドーセット)から購入し、さらに蒸留することなく使用した。シリカゲル60 F254分析用薄層クロマトグラフィー(TLC)プレートは、Merck(ドイツ、ダルムシュタット)製のものとし、UV光下で、過マンガン酸カリウム染色又はアニスアルデヒド染色を用いて可視化した。クロマトグラフィー精製は、Buchi Sepacore C660フラクションコレクター(スイス、フラヴィル)と組み合わせたAcrosシリカゲル(0.06~0.200、60A)又は充填済カラム(Silicycle)を使用して実施した。逆相HPLC精製は、Waters Xbridge C18カラム(5μm OBD、30×100mm、PN186002982)を備えたAgilent 1200システムを使用して実施した。NMR分光法に使用される重水素化溶媒は、Cambridge Isotope Laboratoriesから入手した。H-Val-Ala-PABC-MMAF.TFAはLevena Biopharmから入手し、ビス-mal-Lys-PEG4-TFPエステル(177)はQuanta Biodesignから入手し、O-(2-アミノエチル)-O’-(2-アジドエチル)ジエチレングリコール(XL07)並びに化合物344及び179はBroadpharmから入手し、2,3-ビス(ブロモメチル)-6-キノキサリンカルボン酸(178)はChemSceneから入手し、32-アジド-5-オキソ-3,9,12,15,18,21,24,27,30-ノナオキサ-6-アザドトリアコンタン酸(348)はCarbosynthから入手した。
モノクローナル抗体及びADCの質量スペクトル分析の一般的手順
質量スペクトル分析の前に、IgGを、Fc/2フラグメントの分析のためにIdeS(ファブリケーター(Fabricator)(商標))で処理した。20μgの(修飾)IgGの溶液を、総体積10μLでリン酸緩衝生理食塩水(PBS)pH6.6中0.5μLのIdeS(50U/μL)と共に37℃で1時間インキュベートした。試料を40μLに希釈し、引き続いてJEOL AccuTOFでエレクトロスプレーイオン化飛行時間(ESI-TOF)分析をした。Magtranソフトウェアを使用して、デコンボリューションスペクトルを得た。
質量スペクトル分析の前に、IgGを、Fc/2フラグメントの分析のためにIdeS(ファブリケーター(Fabricator)(商標))で処理した。20μgの(修飾)IgGの溶液を、総体積10μLでリン酸緩衝生理食塩水(PBS)pH6.6中0.5μLのIdeS(50U/μL)と共に37℃で1時間インキュベートした。試料を40μLに希釈し、引き続いてJEOL AccuTOFでエレクトロスプレーイオン化飛行時間(ESI-TOF)分析をした。Magtranソフトウェアを使用して、デコンボリューションスペクトルを得た。
分析RP-HPLCの一般的手順
RP-HPLC分析の前に、IgGを、Fc/2フラグメントの分析を可能にするIdeSで処理した。(修飾)IgGの溶液(100μL、PBS pH7.4中1mg/mL)を、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)pH6.6中1.5μLのIdeS/ファブリケーター(商標)(50U/μL)と共に37℃で1時間インキュベートした。49%アセトニトリル、49%水、2%ギ酸(100μL)を添加することによって、反応物をクエンチした。RP-HPLC分析をAgilent 1100シリーズ(Hewlett Packard)で実施した。試料(10μL)を、0.5mL/分で、カラム温度70℃のZORBAX Poroshell 300SB-C8カラム(1×75mm、5μm、Agilent)に注入した。線形勾配を30~54%アセトニトリル及び0.1%TFA中水で25分間適用した。
RP-HPLC分析の前に、IgGを、Fc/2フラグメントの分析を可能にするIdeSで処理した。(修飾)IgGの溶液(100μL、PBS pH7.4中1mg/mL)を、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)pH6.6中1.5μLのIdeS/ファブリケーター(商標)(50U/μL)と共に37℃で1時間インキュベートした。49%アセトニトリル、49%水、2%ギ酸(100μL)を添加することによって、反応物をクエンチした。RP-HPLC分析をAgilent 1100シリーズ(Hewlett Packard)で実施した。試料(10μL)を、0.5mL/分で、カラム温度70℃のZORBAX Poroshell 300SB-C8カラム(1×75mm、5μm、Agilent)に注入した。線形勾配を30~54%アセトニトリル及び0.1%TFA中水で25分間適用した。
分析HPLC-SECの一般的手順
HPLC-SEC分析をAgilent 1100シリーズ(Hewlett Packard)で実施した。試料(4μL、1mg/mL)を、0.86mL/分で、Xbridge BEH200A(3.5μM、7.8×300mm、PN186007640 Waters)カラムに注入した。0.1Mリン酸ナトリウム緩衝液pH6.9(NaH2PO4/Na2HPO4)を使用したアイソクラティック溶出を16分間実施した。
HPLC-SEC分析をAgilent 1100シリーズ(Hewlett Packard)で実施した。試料(4μL、1mg/mL)を、0.86mL/分で、Xbridge BEH200A(3.5μM、7.8×300mm、PN186007640 Waters)カラムに注入した。0.1Mリン酸ナトリウム緩衝液pH6.9(NaH2PO4/Na2HPO4)を使用したアイソクラティック溶出を16分間実施した。
実施例1.化合物102の合成
4-ニトロフェニルクロロホルメート(30.5g、151mmol)のDCM(500mL)中冷却(0℃)溶液に、ピリジン(24.2mL、23.7g、299mmol)を添加した。BCN-OH(101、18.0g、120mmol)のDCM(200mL)中溶液を反応混合物に滴加した。添加が完了した後、NH4Clの飽和水溶液(500mL)及び水(200mL)を添加した。分離後、水相をDCM(2×500mL)で抽出した。合わせた有機相を乾燥させ(Na2SO4)、濃縮した。粗物質をシリカゲルクロマトグラフィーによって精製すると、所望の生成物102が灰白色固体(18.7g、59mmol、39%)として得られた。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 8.32-8.23 (m, 2H), 7.45-7.34 (m, 2H), 4.40 (d, J = 8.3 Hz, 2H), 2.40-2.18 (m, 6H), 1.69- 1.54 (m, 2H), 1.51 (五重線, J = 9.0 Hz, 1H), 1.12-1.00 (m, 2H)
4-ニトロフェニルクロロホルメート(30.5g、151mmol)のDCM(500mL)中冷却(0℃)溶液に、ピリジン(24.2mL、23.7g、299mmol)を添加した。BCN-OH(101、18.0g、120mmol)のDCM(200mL)中溶液を反応混合物に滴加した。添加が完了した後、NH4Clの飽和水溶液(500mL)及び水(200mL)を添加した。分離後、水相をDCM(2×500mL)で抽出した。合わせた有機相を乾燥させ(Na2SO4)、濃縮した。粗物質をシリカゲルクロマトグラフィーによって精製すると、所望の生成物102が灰白色固体(18.7g、59mmol、39%)として得られた。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 8.32-8.23 (m, 2H), 7.45-7.34 (m, 2H), 4.40 (d, J = 8.3 Hz, 2H), 2.40-2.18 (m, 6H), 1.69- 1.54 (m, 2H), 1.51 (五重線, J = 9.0 Hz, 1H), 1.12-1.00 (m, 2H)
実施例2.化合物104の合成
アジド-PEG11-アミン(103)(182mg、0.319mmol)のTHF(3mL)中冷却溶液(-5℃)に、10% NaHCO3水溶液(1.5mL)及びTHF(2mL)に溶解した9-フルオレニルメトキシカルボニルクロリド(99mg、0.34mmol)を添加した。2時間後、EtOAc(20mL)を添加し、混合物をブライン(2×6mL)で洗浄し、MgSO4上で乾燥させ、濃縮した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→11%MeOH)による精製によって、104が透明な油として収率98%(251mg、0.316mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C39H60N4O13 + (M+Na+)の計算値815.42 実測値815.53.
アジド-PEG11-アミン(103)(182mg、0.319mmol)のTHF(3mL)中冷却溶液(-5℃)に、10% NaHCO3水溶液(1.5mL)及びTHF(2mL)に溶解した9-フルオレニルメトキシカルボニルクロリド(99mg、0.34mmol)を添加した。2時間後、EtOAc(20mL)を添加し、混合物をブライン(2×6mL)で洗浄し、MgSO4上で乾燥させ、濃縮した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→11%MeOH)による精製によって、104が透明な油として収率98%(251mg、0.316mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C39H60N4O13 + (M+Na+)の計算値815.42 実測値815.53.
実施例3.化合物105の合成
104(48mg、0.060mmol)のTHF(3mL)及び水(0.2mL)中溶液を調製し、0℃まで冷却した。トリメチルホスフィン(トルエン中1M、0.24mL、0.24mmol)を添加し、混合物を23時間攪拌したままにした。水をDCM(6mL)による抽出を介して除去した。この溶液に、(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(102)(25mg、0.079mmol)及びトリエチルアミン(10μL、0.070mmol)を添加した。27時間後、混合物を濃縮し、残渣をDMF(3mL)に溶解し、引き続いてピペリジン(400μL)を添加した。1時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→21%MeOH)によって精製すると、105が無色油(8.3mg、0.0092mmol)として得られた。LCMS (ESI+) C46H76N2O15 + (M+NH4 +)の計算値914.52 実測値914.73.
104(48mg、0.060mmol)のTHF(3mL)及び水(0.2mL)中溶液を調製し、0℃まで冷却した。トリメチルホスフィン(トルエン中1M、0.24mL、0.24mmol)を添加し、混合物を23時間攪拌したままにした。水をDCM(6mL)による抽出を介して除去した。この溶液に、(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(102)(25mg、0.079mmol)及びトリエチルアミン(10μL、0.070mmol)を添加した。27時間後、混合物を濃縮し、残渣をDMF(3mL)に溶解し、引き続いてピペリジン(400μL)を添加した。1時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→21%MeOH)によって精製すると、105が無色油(8.3mg、0.0092mmol)として得られた。LCMS (ESI+) C46H76N2O15 + (M+NH4 +)の計算値914.52 実測値914.73.
実施例4.化合物107の合成
(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(102)(4.1mg、0.013mmol)の脱水DCM(500μL)中溶液を、アミノ-PEG23-アミン(106)(12.3mg、0.0114mmol)の脱水DCM(500μL)中溶液にゆっくり添加した。20時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→25%MeOH)によって精製すると、所望の化合物107が収率73%(12mg、0.0080mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C70H124N2O27 + (M+ NH4 +)の計算値1443.73 実測値1444.08.
(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(102)(4.1mg、0.013mmol)の脱水DCM(500μL)中溶液を、アミノ-PEG23-アミン(106)(12.3mg、0.0114mmol)の脱水DCM(500μL)中溶液にゆっくり添加した。20時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→25%MeOH)によって精製すると、所望の化合物107が収率73%(12mg、0.0080mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C70H124N2O27 + (M+ NH4 +)の計算値1443.73 実測値1444.08.
実施例5.化合物108の合成
BCN-OH(101、21.0g、0.14mol)のMeCN(450mL)中溶液に、ジスクシンイミジルカーボネート(53.8g、0.21mol)及びトリエチルアミン(58.5mL、0.42mol)を添加した。混合物を140分間攪拌した後、これを真空中で濃縮し、残渣をMeCN(400mL)と1回共蒸発させた。残渣をEtOAc(600mL)に溶解し、H2O(3×200mL)で洗浄した。有機層をNa2SO4上で乾燥させ、真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→4%EtOAc)によって精製すると、108(11.2g、38.4mmol、収率27%)が白色固体として得られた。1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ (ppm) 4.45 (d, 2H, J = 8.4 Hz), 2.85 (s, 4H), 2.38- 2.18 (m, 6H), 1.65- 1.44 (m, 3H), 1.12-1.00 (m, 2H).
BCN-OH(101、21.0g、0.14mol)のMeCN(450mL)中溶液に、ジスクシンイミジルカーボネート(53.8g、0.21mol)及びトリエチルアミン(58.5mL、0.42mol)を添加した。混合物を140分間攪拌した後、これを真空中で濃縮し、残渣をMeCN(400mL)と1回共蒸発させた。残渣をEtOAc(600mL)に溶解し、H2O(3×200mL)で洗浄した。有機層をNa2SO4上で乾燥させ、真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→4%EtOAc)によって精製すると、108(11.2g、38.4mmol、収率27%)が白色固体として得られた。1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ (ppm) 4.45 (d, 2H, J = 8.4 Hz), 2.85 (s, 4H), 2.38- 2.18 (m, 6H), 1.65- 1.44 (m, 3H), 1.12-1.00 (m, 2H).
実施例6.化合物110の合成
(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチルN-スクシンイミジルカーボネート(108)(500mg、1.71mmol)のDCM(15mL)中溶液に、トリエチルアミン(718μL、5.14mmol)及びモノ-Fmocエチレンジアミン塩酸塩(109)(657mg、2.06mmol)を添加した。混合物を45分間攪拌し、EtOAc(150mL)で希釈し、50%飽和NH4Cl水溶液(50mL)で洗浄した。水層をEtOAc(50mL)で抽出し、合わせた有機層をH2O(10mL)で洗浄した。合わせた有機抽出物を真空中で濃縮し、残渣の半分をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→3%MeOH)によって精製すると、所望の化合物110が収率42%(332mg、0.72mmol)で得られた。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 7.77 (d, J = 7.5 Hz, 2H), 7.59 (d, J = 7.4 Hz, 2H), 7.44-7.37 (m, 2H), 7.36-7.28 (m, 2H), 5.12 (br s, 1H), 4.97 (br s, 1H), 44.41 (d, J = 6.8 Hz, 2H), 4.21 (t, J = 6.7 Hz, 1H), 4.13 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 3.33 (br s, 4H), 2.36-2.09 (m, 6H), 1.67-1.45 (m, 2H), 1.33 (五重線, J = 8.6 Hz, 1H), 1.01- 0.85 (m, 2H). LCMS (ESI+) C28H31N2O4 + (M+ H+)の計算値459.23 実測値459.52.
(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチルN-スクシンイミジルカーボネート(108)(500mg、1.71mmol)のDCM(15mL)中溶液に、トリエチルアミン(718μL、5.14mmol)及びモノ-Fmocエチレンジアミン塩酸塩(109)(657mg、2.06mmol)を添加した。混合物を45分間攪拌し、EtOAc(150mL)で希釈し、50%飽和NH4Cl水溶液(50mL)で洗浄した。水層をEtOAc(50mL)で抽出し、合わせた有機層をH2O(10mL)で洗浄した。合わせた有機抽出物を真空中で濃縮し、残渣の半分をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→3%MeOH)によって精製すると、所望の化合物110が収率42%(332mg、0.72mmol)で得られた。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 7.77 (d, J = 7.5 Hz, 2H), 7.59 (d, J = 7.4 Hz, 2H), 7.44-7.37 (m, 2H), 7.36-7.28 (m, 2H), 5.12 (br s, 1H), 4.97 (br s, 1H), 44.41 (d, J = 6.8 Hz, 2H), 4.21 (t, J = 6.7 Hz, 1H), 4.13 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 3.33 (br s, 4H), 2.36-2.09 (m, 6H), 1.67-1.45 (m, 2H), 1.33 (五重線, J = 8.6 Hz, 1H), 1.01- 0.85 (m, 2H). LCMS (ESI+) C28H31N2O4 + (M+ H+)の計算値459.23 実測値459.52.
実施例7.化合物111の合成
化合物110(327mg、0.713mmol)をDMF(6mL)に溶解し、ピペリジン(0.5mL)を添加した。2時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→32% 0.7N NH3 MeOH)によって精製すると、所望の化合物111が黄色油(128mg、0.542mmol、76%)として得られた。1H-NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm, 回転異性体) 5.2 (bs, 1H), 4.15 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 3.48-3.40 (m, 2/3H), 3.33-3.27 (m, 2/3H), 3.27-3.19 (m, 11/3H), 2.85-2.80 (m, 11/3H), 2.36-2.17 (m, 6H), 1.67-1.50 (m, 2H), 1.36 (五重線, J = 8.5 Hz, 1H), 1.01-0.89 (m, 2H)
化合物110(327mg、0.713mmol)をDMF(6mL)に溶解し、ピペリジン(0.5mL)を添加した。2時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→32% 0.7N NH3 MeOH)によって精製すると、所望の化合物111が黄色油(128mg、0.542mmol、76%)として得られた。1H-NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm, 回転異性体) 5.2 (bs, 1H), 4.15 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 3.48-3.40 (m, 2/3H), 3.33-3.27 (m, 2/3H), 3.27-3.19 (m, 11/3H), 2.85-2.80 (m, 11/3H), 2.36-2.17 (m, 6H), 1.67-1.50 (m, 2H), 1.36 (五重線, J = 8.5 Hz, 1H), 1.01-0.89 (m, 2H)
実施例8.化合物114の合成
ジエタノールアミン(112)(208mg、1.98mmol)の水(20mL)中溶液に、MeCN(20mL)、NaHCO3(250mg、2.97mmol)及びFmoc-OSu(113)(601mg、1.78mmol)のMeCN(20mL)中溶液を添加した。混合物を2時間攪拌し、DCM(50mL)を添加した。分離後、有機相を水(20mL)で洗浄し、乾燥させ(Na2SO4)、濃縮した。所望の生成物114が無色の濃厚な油(573mg、1.75mmol、98%)として得られた。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 7.79-7.74 (m, 2H), 7.60-7.54 (m, 2H), 7.44-7.37 (m, 2H), 7.36-7.30 (m, 2H), 4.58 (d, J = 5.4 Hz, 2H), 4.23 (t, J = 5.3 Hz, 1H), 3.82-3.72 (m, 2H), 3.48-3.33 (m, 4H), 3.25-3.11 (m, 2H).
ジエタノールアミン(112)(208mg、1.98mmol)の水(20mL)中溶液に、MeCN(20mL)、NaHCO3(250mg、2.97mmol)及びFmoc-OSu(113)(601mg、1.78mmol)のMeCN(20mL)中溶液を添加した。混合物を2時間攪拌し、DCM(50mL)を添加した。分離後、有機相を水(20mL)で洗浄し、乾燥させ(Na2SO4)、濃縮した。所望の生成物114が無色の濃厚な油(573mg、1.75mmol、98%)として得られた。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 7.79-7.74 (m, 2H), 7.60-7.54 (m, 2H), 7.44-7.37 (m, 2H), 7.36-7.30 (m, 2H), 4.58 (d, J = 5.4 Hz, 2H), 4.23 (t, J = 5.3 Hz, 1H), 3.82-3.72 (m, 2H), 3.48-3.33 (m, 4H), 3.25-3.11 (m, 2H).
実施例9.化合物116の合成
114(567mg、1.73mmol)のDCM(50mL)中溶液に、4-ニトロフェニルクロロホルメート(115)(768mg、3.81mmol)及びEt3N(1.2mL、875mg)を添加した。混合物を18時間攪拌し、濃縮した。残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(DCM中0%→10%MeOH、次いで、ヘプタン中20%→70%EtOAc)によって精製すると、所望の生成物116 32mg(49μmol、2.8%)が得られた。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 8.31-8.20 (m, 4H), 7.80-7.74 (m, 2H), 7.59-7.54 (m, 2H), 7.44-7.37 (m, 2H), 7.37-7.29 (m, 6H), 4.61 (d, J = 5.4 Hz, 2H), 4.39 (t, J = 5.1 Hz, 2H), 4.25 (t, J = 5.5 Hz, 1H), 4.02 (t, J = 5.0 Hz, 2H), 3.67 (t, J = 4.8 Hz, 2H), 3.45 (t, J = 5.2 Hz, 2H).
114(567mg、1.73mmol)のDCM(50mL)中溶液に、4-ニトロフェニルクロロホルメート(115)(768mg、3.81mmol)及びEt3N(1.2mL、875mg)を添加した。混合物を18時間攪拌し、濃縮した。残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(DCM中0%→10%MeOH、次いで、ヘプタン中20%→70%EtOAc)によって精製すると、所望の生成物116 32mg(49μmol、2.8%)が得られた。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 8.31-8.20 (m, 4H), 7.80-7.74 (m, 2H), 7.59-7.54 (m, 2H), 7.44-7.37 (m, 2H), 7.37-7.29 (m, 6H), 4.61 (d, J = 5.4 Hz, 2H), 4.39 (t, J = 5.1 Hz, 2H), 4.25 (t, J = 5.5 Hz, 1H), 4.02 (t, J = 5.0 Hz, 2H), 3.67 (t, J = 4.8 Hz, 2H), 3.45 (t, J = 5.2 Hz, 2H).
実施例10.化合物117の合成
116(34mg、0.050mmol)のDCM(2mL)中溶液に、111(49mg、0.21mmol)及びトリエチルアミン(20μL、0.14mmol)を添加した。混合物を室温で一晩攪拌したままにした。23時間後、混合物を濃縮した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→40%MeOH)による精製によって、117が白色固体として収率61%(27mg、0.031mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C47H57N5O10 + (M+H+)の計算値851.41 実測値852.49.
116(34mg、0.050mmol)のDCM(2mL)中溶液に、111(49mg、0.21mmol)及びトリエチルアミン(20μL、0.14mmol)を添加した。混合物を室温で一晩攪拌したままにした。23時間後、混合物を濃縮した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→40%MeOH)による精製によって、117が白色固体として収率61%(27mg、0.031mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C47H57N5O10 + (M+H+)の計算値851.41 実測値852.49.
実施例11.化合物118の合成
化合物118は117の調製中に得られた(3.8mg、0.0060mmol)。LCMS (ESI+) C32H47N5O8 + (M+H+)の計算値629.34 実測値630.54.
化合物118は117の調製中に得られた(3.8mg、0.0060mmol)。LCMS (ESI+) C32H47N5O8 + (M+H+)の計算値629.34 実測値630.54.
実施例12.化合物121の合成
ジエチレントリアミン(119)(73μL、0.67mmol)及びトリエチルアミン(283μL、2.03mmol)のTHF(6mL)中溶液を-5℃まで冷却し、窒素雰囲気下に置いた。2-(Boc-オキシイミノ)-2-フェニルアセトニトリル(120)(334mg、1.35mmol)をTHF(4mL)に溶解し、冷却した溶液にゆっくり添加した。2.5時間後、氷浴を除去し、混合物を室温でさらに2.5時間攪拌し、真空中で濃縮した。残渣をDCM(15mL)に再溶解し、5% NaOH水溶液(2×5mL)、ブライン(2×5mL)で洗浄し、MgSO4上で乾燥させた。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→14%MeOH)による精製によって、121が無色油として収率91%(185mg、0.610mmol)で得られた。1H-NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 5.08 (s, 2H), 3.30-3.12 (m, 4H), 2.74 (t, J = 5.9 Hz, 4H), 1.45 (s, 18H).
ジエチレントリアミン(119)(73μL、0.67mmol)及びトリエチルアミン(283μL、2.03mmol)のTHF(6mL)中溶液を-5℃まで冷却し、窒素雰囲気下に置いた。2-(Boc-オキシイミノ)-2-フェニルアセトニトリル(120)(334mg、1.35mmol)をTHF(4mL)に溶解し、冷却した溶液にゆっくり添加した。2.5時間後、氷浴を除去し、混合物を室温でさらに2.5時間攪拌し、真空中で濃縮した。残渣をDCM(15mL)に再溶解し、5% NaOH水溶液(2×5mL)、ブライン(2×5mL)で洗浄し、MgSO4上で乾燥させた。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→14%MeOH)による精製によって、121が無色油として収率91%(185mg、0.610mmol)で得られた。1H-NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 5.08 (s, 2H), 3.30-3.12 (m, 4H), 2.74 (t, J = 5.9 Hz, 4H), 1.45 (s, 18H).
実施例13.化合物123の合成
121(33.5mg、0.110mmol)のTHF(2mL)中冷却溶液(-10℃)に、10% NaHCO3水溶液(500μL)及びTHF(1mL)に溶解した9-フルオレニルメトキシカルボニルクロリド(122)(34mg、0.13mmol)を添加した。1時間後、混合物を濃縮し、残渣をEtOAc(10mL)に再溶解し、ブライン(2×5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥させ、濃縮した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→50%MeOH)による精製によって、123が収率86%(50mg、0.090mmol)で得られた。1H-NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 7.77 (d, J = 7.4 Hz, 2H), 7.57 (d, J = 7.4 Hz, 2H), 7.43-7.38 (m, 2H), 7.36-7.31 (m, 2H), 5.57 (d, J = 5.2 Hz, 2H), 4.23 (t, J = 5.1 Hz, 1H), 3.40-2.83 (m, 8H), 1.41 (s, 18H).
121(33.5mg、0.110mmol)のTHF(2mL)中冷却溶液(-10℃)に、10% NaHCO3水溶液(500μL)及びTHF(1mL)に溶解した9-フルオレニルメトキシカルボニルクロリド(122)(34mg、0.13mmol)を添加した。1時間後、混合物を濃縮し、残渣をEtOAc(10mL)に再溶解し、ブライン(2×5mL)で洗浄し、Na2SO4上で乾燥させ、濃縮した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→50%MeOH)による精製によって、123が収率86%(50mg、0.090mmol)で得られた。1H-NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 7.77 (d, J = 7.4 Hz, 2H), 7.57 (d, J = 7.4 Hz, 2H), 7.43-7.38 (m, 2H), 7.36-7.31 (m, 2H), 5.57 (d, J = 5.2 Hz, 2H), 4.23 (t, J = 5.1 Hz, 1H), 3.40-2.83 (m, 8H), 1.41 (s, 18H).
実施例14.化合物124の合成
123(50mg、0.095mmol)のDCM(3mL)中溶液に、ジオキサン中4M HCl(200μL)を添加した。混合物を19時間攪拌し、濃縮すると、白色固体が得られた(35mg)。精製することなく、脱保護中間体及び(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(102)(70mg、0.22mmol)をDMF(3mL)に溶解し、トリエチルアミン(34μL、0.24mmol)を添加した。2時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→25%MeOH)によって精製すると、124が48%(31mg、0.045mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C41H47N3O6 + (M+H+)の計算値677.35 実測値678.57.
123(50mg、0.095mmol)のDCM(3mL)中溶液に、ジオキサン中4M HCl(200μL)を添加した。混合物を19時間攪拌し、濃縮すると、白色固体が得られた(35mg)。精製することなく、脱保護中間体及び(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(102)(70mg、0.22mmol)をDMF(3mL)に溶解し、トリエチルアミン(34μL、0.24mmol)を添加した。2時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→25%MeOH)によって精製すると、124が48%(31mg、0.045mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C41H47N3O6 + (M+H+)の計算値677.35 実測値678.57.
実施例15.化合物125の合成
124(10mg、0.014mmol)のDMF(500μL)中溶液に、ピペリジン(20μL)を添加した。3.5時間後、混合物を濃縮した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→20%MeOH)による精製によって、125が収率58%(3.7mg、0.0080mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C26H37N3O4 + (M+H+)の計算値455.28 実測値456.41.
124(10mg、0.014mmol)のDMF(500μL)中溶液に、ピペリジン(20μL)を添加した。3.5時間後、混合物を濃縮した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→20%MeOH)による精製によって、125が収率58%(3.7mg、0.0080mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C26H37N3O4 + (M+H+)の計算値455.28 実測値456.41.
実施例16.化合物127及び128の合成
ジエチレングリコール(126)(446μL、0.50g、4.71mmol)のDCM(20mL)中溶液に、4-ニトロフェノールクロロホルメート(115)(1.4g、7.07mmol)及びEt3N(3.3mL、2.4g、23.6mmol)を添加した。混合物を攪拌し、濾過し、真空中(55℃で)濃縮した。残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(ヘプタン中15%→75%EtOAc)によって精製し、2種類の生成物を単離した。生成物127が白色固体(511mg、1.17mmol、25%)として得られた。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 8.31- 8.23 (m, 4H), 7.43-7.34 (m, 4H), 4.54-4.44 (m, 4H), 3.91-3.83 (m, 4H).生成物128が無色油(321mg、1.18mmol、25%)として得られた。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 8.32-8.24 (m, 2H), 7.43-7.36 (m, 2H), 4.50-4.44 (m, 2H), 3.86-3.80 (m, 2H), 3.81-3.74 (m, 2H), 3.69-3.64 (m, 2H).
ジエチレングリコール(126)(446μL、0.50g、4.71mmol)のDCM(20mL)中溶液に、4-ニトロフェノールクロロホルメート(115)(1.4g、7.07mmol)及びEt3N(3.3mL、2.4g、23.6mmol)を添加した。混合物を攪拌し、濾過し、真空中(55℃で)濃縮した。残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(ヘプタン中15%→75%EtOAc)によって精製し、2種類の生成物を単離した。生成物127が白色固体(511mg、1.17mmol、25%)として得られた。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 8.31- 8.23 (m, 4H), 7.43-7.34 (m, 4H), 4.54-4.44 (m, 4H), 3.91-3.83 (m, 4H).生成物128が無色油(321mg、1.18mmol、25%)として得られた。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 8.32-8.24 (m, 2H), 7.43-7.36 (m, 2H), 4.50-4.44 (m, 2H), 3.86-3.80 (m, 2H), 3.81-3.74 (m, 2H), 3.69-3.64 (m, 2H).
実施例17.化合物131の合成
118(2.3mg、3.7μmol)のDMF(295μL)中溶液に、127(3.2mg、7.4μmol)のDMF(65μL)中溶液及びEt3N(1.6μL、1.1mg、11.1μmol)を添加した。混合物を17時間静置し、HOBt(0.5mg、3.7μmol)のDMF(14μL)中溶液を添加した。4時間後、Et3N(5.2μL、3.8mg、37μmol)及びvc-PABC-MMAE.TFA(130、13.8mg、11μmol)のDMF(276μL)中溶液を添加した。3日後、混合物をRP HPLC(C18、水(1%AcOH)中30%→90%MeCN(1%AcOH))によって精製した。所望の生成物131が無色フィルム(1.5mg、0.78μmol、21%)として得られた。LCMS (ESI+) C96H148N15O25 + (M+H+)の計算値1911.08 実測値1912.08.
118(2.3mg、3.7μmol)のDMF(295μL)中溶液に、127(3.2mg、7.4μmol)のDMF(65μL)中溶液及びEt3N(1.6μL、1.1mg、11.1μmol)を添加した。混合物を17時間静置し、HOBt(0.5mg、3.7μmol)のDMF(14μL)中溶液を添加した。4時間後、Et3N(5.2μL、3.8mg、37μmol)及びvc-PABC-MMAE.TFA(130、13.8mg、11μmol)のDMF(276μL)中溶液を添加した。3日後、混合物をRP HPLC(C18、水(1%AcOH)中30%→90%MeCN(1%AcOH))によって精製した。所望の生成物131が無色フィルム(1.5mg、0.78μmol、21%)として得られた。LCMS (ESI+) C96H148N15O25 + (M+H+)の計算値1911.08 実測値1912.08.
実施例18.化合物132の合成
121(168mg、0.554mmol)のDCM(2mL)中溶液に、128(240mg、0.89mmol)のDCM(1mL)中溶液、DCM(1mL)及びEt3N(169mg、233μL)を添加した。混合物を17時間攪拌し、濃縮し、シリカゲルクロマトグラフィー(ヘプタン中EtOAcの勾配)によって精製した。所望の生成物132がわずかに黄色の油(85mg、0.20mmol、35%)として得られた。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 5.24-5.02 (m, 2H), 4.36-4.20 (m, 3H), 3.84-3.67 (m, 4H), 3.65-3.58 (m, 2H), 3.47-3.34 (m, 4H), 3.34-3.18 (m, 4H), 1.44 (bs, 18H).
121(168mg、0.554mmol)のDCM(2mL)中溶液に、128(240mg、0.89mmol)のDCM(1mL)中溶液、DCM(1mL)及びEt3N(169mg、233μL)を添加した。混合物を17時間攪拌し、濃縮し、シリカゲルクロマトグラフィー(ヘプタン中EtOAcの勾配)によって精製した。所望の生成物132がわずかに黄色の油(85mg、0.20mmol、35%)として得られた。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 5.24-5.02 (m, 2H), 4.36-4.20 (m, 3H), 3.84-3.67 (m, 4H), 3.65-3.58 (m, 2H), 3.47-3.34 (m, 4H), 3.34-3.18 (m, 4H), 1.44 (bs, 18H).
実施例19.化合物134の合成
132(81mg、0.19mmol)のDCM(3mL)中溶液に、ジオキサン中4N HCl(700μL)を添加した。混合物を19時間攪拌し、濃縮し、残渣をDMF(0.5mL)に溶解した。Et3N(132μL、96mg、0.95mmol)、DMF(0.5mL)及び(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(102)(132mg、0.42mmol)を添加し、得られた混合物を2時間攪拌した。混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(DCM中0%→3%MeOH)によって精製した。所望の生成物134が無色フィルム(64mg、0.11mmol、57%)として得られた。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 4.31-4.23 (m, 2H), 4.22-4.08 (m, 4H), 3.80-3.68 (m, 4H), 3.66-3.58 (m, 2H), 3.50-3.28 (m, 8H), 2.80-2.65 (m, 1H), 2.40-2.10 (m, 12H), 1.68-1.48 (m, 4H), 1.35 (五重線, J = 8.1 Hz, 1H), 1.02-0.87 (m, 2H). LCMS (ESI+) C31H46N3O8 + (M+H+)の計算値588.33 実測値588.43.
132(81mg、0.19mmol)のDCM(3mL)中溶液に、ジオキサン中4N HCl(700μL)を添加した。混合物を19時間攪拌し、濃縮し、残渣をDMF(0.5mL)に溶解した。Et3N(132μL、96mg、0.95mmol)、DMF(0.5mL)及び(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(102)(132mg、0.42mmol)を添加し、得られた混合物を2時間攪拌した。混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(DCM中0%→3%MeOH)によって精製した。所望の生成物134が無色フィルム(64mg、0.11mmol、57%)として得られた。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 4.31-4.23 (m, 2H), 4.22-4.08 (m, 4H), 3.80-3.68 (m, 4H), 3.66-3.58 (m, 2H), 3.50-3.28 (m, 8H), 2.80-2.65 (m, 1H), 2.40-2.10 (m, 12H), 1.68-1.48 (m, 4H), 1.35 (五重線, J = 8.1 Hz, 1H), 1.02-0.87 (m, 2H). LCMS (ESI+) C31H46N3O8 + (M+H+)の計算値588.33 実測値588.43.
実施例20.化合物137の合成
134(63mg、0.11mmol)のDCM(1mL)中溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(35)(32.6mg、0.107mmol)及びEt3N(32.5mg、45μL、0.32mmol)を添加した。2時間後、77μLを主反応混合物から除去し、vc-PABC-MMAE.TFA(130、10mg、8.1μmol)のDMF(200μL)中溶液及びEt3N(3.4μL、2.5mg、24μmol)を添加した。18時間後、2,2’-(エチレンジオキシ)ビス(エチルアミン)(4.9μL、5.0mg、34μmol)を添加し、混合物を45分間静置した。混合物をRP HPLC(C18、水(1%AcOH)中30%→90%MeCN(1%AcOH))によって精製した。所望の生成物137が無色フィルム(8.7mg、5.0μmol、61%)として得られた。LCMS (ESI+) C90H138N13O21 + (M+H+)の計算値1737.01 実測値1738.01.
134(63mg、0.11mmol)のDCM(1mL)中溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(35)(32.6mg、0.107mmol)及びEt3N(32.5mg、45μL、0.32mmol)を添加した。2時間後、77μLを主反応混合物から除去し、vc-PABC-MMAE.TFA(130、10mg、8.1μmol)のDMF(200μL)中溶液及びEt3N(3.4μL、2.5mg、24μmol)を添加した。18時間後、2,2’-(エチレンジオキシ)ビス(エチルアミン)(4.9μL、5.0mg、34μmol)を添加し、混合物を45分間静置した。混合物をRP HPLC(C18、水(1%AcOH)中30%→90%MeCN(1%AcOH))によって精製した。所望の生成物137が無色フィルム(8.7mg、5.0μmol、61%)として得られた。LCMS (ESI+) C90H138N13O21 + (M+H+)の計算値1737.01 実測値1738.01.
実施例21.化合物139の合成
134(63mg、0.11mmol)のDCM(1mL)中溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(35)(32.6mg、0.107mmol)及びEt3N(32.5mg、45μL、0.32mmol)を添加した。20時間後、77μLを主反応混合物から除去し、vc-PABC-MMAF.TFA(138、9.6mg、8.2μmol)のDMF(240μL)中溶液及びEt3N(3.4μL、2.5mg、24μmol)を添加した。3時間後、2,2’-(エチレンジオキシ)ビス(エチルアミン)(20μL、20mg、0.14mmol)を添加し、混合物を20分間静置した。混合物をRP HPLC(C18、水(1%AcOH)中30%→90%MeCN(1%AcOH))によって精製した。所望の生成物139が無色フィルム(5.3mg、3.2μmol、39%)として得られた。LCMS (ESI+) C87H130N11O21 + (M+H+)の計算値1664.94 実測値1665.99.
134(63mg、0.11mmol)のDCM(1mL)中溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(35)(32.6mg、0.107mmol)及びEt3N(32.5mg、45μL、0.32mmol)を添加した。20時間後、77μLを主反応混合物から除去し、vc-PABC-MMAF.TFA(138、9.6mg、8.2μmol)のDMF(240μL)中溶液及びEt3N(3.4μL、2.5mg、24μmol)を添加した。3時間後、2,2’-(エチレンジオキシ)ビス(エチルアミン)(20μL、20mg、0.14mmol)を添加し、混合物を20分間静置した。混合物をRP HPLC(C18、水(1%AcOH)中30%→90%MeCN(1%AcOH))によって精製した。所望の生成物139が無色フィルム(5.3mg、3.2μmol、39%)として得られた。LCMS (ESI+) C87H130N11O21 + (M+H+)の計算値1664.94 実測値1665.99.
実施例22.化合物141の合成
(1R,8S,9S)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチルN-スクシンイミジルカーボネート(108)(16.35g、56.13mmol)のDCM(400ml)中溶液に、2-(2-アミノエトキシ)エタノール(140)(6.76ml、67.35mmol)及びトリエチルアミン(23.47ml、168.39mmol)を添加した。得られた淡黄色溶液を室温で90分間攪拌した。混合物を真空中で濃縮し、残渣をアセトニトリル(400mL)と1回共蒸発させた。得られた油をEtOAc(400mL)に溶解し、H2O(3×200mL)で洗浄した。有機層を真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘプタン中50%→88%EtOAc)によって精製すると、141(11.2g、39.81mmol、収率71%)が淡黄色油として得られた。1H-NMR (400 MHz, CDCl3): δ (ppm) 5.01 (br s, 1H), 4.17 (d, 2H, J = 12.0 Hz), 3.79-3.68 (m, 2H), 3.64-3.50 (m, 4H), 3.47-3.30 (m, 2H), 2.36-2.14 (m, 6H), 1.93 (br s, 1H), 1.68- 1.49 (m, 2H), 1.37 (五重線, 1H, J = 8.0 Hz), 1.01-0.89 (m, 2H).
(1R,8S,9S)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチルN-スクシンイミジルカーボネート(108)(16.35g、56.13mmol)のDCM(400ml)中溶液に、2-(2-アミノエトキシ)エタノール(140)(6.76ml、67.35mmol)及びトリエチルアミン(23.47ml、168.39mmol)を添加した。得られた淡黄色溶液を室温で90分間攪拌した。混合物を真空中で濃縮し、残渣をアセトニトリル(400mL)と1回共蒸発させた。得られた油をEtOAc(400mL)に溶解し、H2O(3×200mL)で洗浄した。有機層を真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘプタン中50%→88%EtOAc)によって精製すると、141(11.2g、39.81mmol、収率71%)が淡黄色油として得られた。1H-NMR (400 MHz, CDCl3): δ (ppm) 5.01 (br s, 1H), 4.17 (d, 2H, J = 12.0 Hz), 3.79-3.68 (m, 2H), 3.64-3.50 (m, 4H), 3.47-3.30 (m, 2H), 2.36-2.14 (m, 6H), 1.93 (br s, 1H), 1.68- 1.49 (m, 2H), 1.37 (五重線, 1H, J = 8.0 Hz), 1.01-0.89 (m, 2H).
実施例23.化合物142の合成
141(663mg、2.36mmol)のDCM(15mL)中溶液に、トリエチルアミン(986μL、7.07mmol)及び4-ニトロフェニルクロロホルメート(115)(712mg、3.53mmol)を添加した。混合物を4時間攪拌し、真空中で濃縮した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘプタン中0→20%EtOAc)による精製によって、142(400mg、0.9mmol、収率38%)が淡黄色油として得られた。1H-NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 8.29 (d, J = 9.4 Hz, 2H), 7.40 (d, J = 9.3 Hz, 2H), 5.05 (br s, 1H), 4.48-4.41 (m, 2H), 4.16 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 3.81-3.75 (m, 2H), 3.61 (t, J = 5.0 Hz, 2H), 3.42 (q, J = 5.4 Hz, 2H), 2.35-2.16 (m, 6H), 1.66-1.50 (m, 2H), 1.35 (五重線, J = 8.6 Hz, 1H), 1.02-0.88 (m, 2H). LCMS (ESI+) C22H26N2NaO8 + (M+Na+)の計算値469.16 実測値469.36.
141(663mg、2.36mmol)のDCM(15mL)中溶液に、トリエチルアミン(986μL、7.07mmol)及び4-ニトロフェニルクロロホルメート(115)(712mg、3.53mmol)を添加した。混合物を4時間攪拌し、真空中で濃縮した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘプタン中0→20%EtOAc)による精製によって、142(400mg、0.9mmol、収率38%)が淡黄色油として得られた。1H-NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 8.29 (d, J = 9.4 Hz, 2H), 7.40 (d, J = 9.3 Hz, 2H), 5.05 (br s, 1H), 4.48-4.41 (m, 2H), 4.16 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 3.81-3.75 (m, 2H), 3.61 (t, J = 5.0 Hz, 2H), 3.42 (q, J = 5.4 Hz, 2H), 2.35-2.16 (m, 6H), 1.66-1.50 (m, 2H), 1.35 (五重線, J = 8.6 Hz, 1H), 1.02-0.88 (m, 2H). LCMS (ESI+) C22H26N2NaO8 + (M+Na+)の計算値469.16 実測値469.36.
実施例24.化合物143の合成
142(2.7mg、6.0μmol)のDMF(48μL)中溶液及びEt3N(2.1μL、1.5mg、15μmol)を125(2.3mg、5.0μmol)のDMF(0.32mL)中溶液に添加した。混合物を4日間静置し、DMF(100μL)で希釈し、RP HPLC(C18、水(1%AcOH)中30%→100%MeCN(1%AcOH))によって精製した。生成物143が無色フィルム(2.8mg、3.7μmol、74%)として得られた。LCMS (ESI+) C42H59N4O9 + (M+H+)の計算値763.43 実測値763.53.
142(2.7mg、6.0μmol)のDMF(48μL)中溶液及びEt3N(2.1μL、1.5mg、15μmol)を125(2.3mg、5.0μmol)のDMF(0.32mL)中溶液に添加した。混合物を4日間静置し、DMF(100μL)で希釈し、RP HPLC(C18、水(1%AcOH)中30%→100%MeCN(1%AcOH))によって精製した。生成物143が無色フィルム(2.8mg、3.7μmol、74%)として得られた。LCMS (ESI+) C42H59N4O9 + (M+H+)の計算値763.43 実測値763.53.
実施例25.化合物145の合成
128(200mg、0.45mmol)のDCM(1mL)中溶液に、トリエチルアミン(41.6μL、0.30mmol)及びトリス(2-アミノエチル)アミン144(14.9μL、0.10mmol)を添加した。混合物を150分間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中25%→100%EtOAc、次いで、DCM中0%→10%MeOH)によって精製すると、145が収率43%(45.4mg、42.5μmol)で黄色油として得られた。1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ (ppm) 5.68-5.18 (m, 6H), 4.32-4.18 (m, 6H), 4.18-4.11 (d, J = 7.9 Hz, 6H), 3.74-3.61 (m, 6H), 3.61-3.51 (m, 6H), 3.43- 3.29 (m, 6H), 3.29-3.15 (m, 6H), 2.65-2.47 (m, 6H), 2.37-2.16 (m, 18H), 1.69-1.49 (m, 6H), 1.35 (五重線, J = 8.9 Hz, 3H), 1.03-0.87 (m, 6H).
128(200mg、0.45mmol)のDCM(1mL)中溶液に、トリエチルアミン(41.6μL、0.30mmol)及びトリス(2-アミノエチル)アミン144(14.9μL、0.10mmol)を添加した。混合物を150分間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中25%→100%EtOAc、次いで、DCM中0%→10%MeOH)によって精製すると、145が収率43%(45.4mg、42.5μmol)で黄色油として得られた。1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ (ppm) 5.68-5.18 (m, 6H), 4.32-4.18 (m, 6H), 4.18-4.11 (d, J = 7.9 Hz, 6H), 3.74-3.61 (m, 6H), 3.61-3.51 (m, 6H), 3.43- 3.29 (m, 6H), 3.29-3.15 (m, 6H), 2.65-2.47 (m, 6H), 2.37-2.16 (m, 18H), 1.69-1.49 (m, 6H), 1.35 (五重線, J = 8.9 Hz, 3H), 1.03-0.87 (m, 6H).
実施例26.化合物148の合成
BCN-OH(101)(3.0g、20mmol)のDCM(300mL)中溶液に、CSI(146)(1.74mL、2.83g、20mmol)を添加した。混合物を15分間攪拌した後、Et3N(5.6mL、4.0g、40mmol)を添加した。混合物を5分間攪拌し、2-(2-アミノエトキシ)エタノール(147)(2.2mL、2.3g、22mmol)を添加した。得られた混合物を15分間攪拌し、飽和NH4Cl水溶液(300mL)を添加した。層を分離し、水相をDCM(200mL)で抽出した。合わせた有機層を乾燥させ(Na2SO4)、濃縮した。残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(DCM中0%~10%MeOH)によって精製した。所望の生成物を含有する画分を濃縮した。残渣をEtOAc(100mL)に溶解し、濃縮した。所望の生成物148がわずかに黄色の油(4.24g、11.8mmol、59%)として得られた。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 5.99-5.79 (bs, 1H), 4.29 (d, J = 8.3 Hz, 2H), 3.78-3.74 (m, 2H), 3.66-3.56 (m, 4H), 3.37-3.30 (m, 2H), 2.36-2.16 (m, 6H), 1.63-1.49 (m, 2H), 1.40 (五重線, J = 8.7 Hz, 1H), 1.05-0.94 (m, 2H).
BCN-OH(101)(3.0g、20mmol)のDCM(300mL)中溶液に、CSI(146)(1.74mL、2.83g、20mmol)を添加した。混合物を15分間攪拌した後、Et3N(5.6mL、4.0g、40mmol)を添加した。混合物を5分間攪拌し、2-(2-アミノエトキシ)エタノール(147)(2.2mL、2.3g、22mmol)を添加した。得られた混合物を15分間攪拌し、飽和NH4Cl水溶液(300mL)を添加した。層を分離し、水相をDCM(200mL)で抽出した。合わせた有機層を乾燥させ(Na2SO4)、濃縮した。残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(DCM中0%~10%MeOH)によって精製した。所望の生成物を含有する画分を濃縮した。残渣をEtOAc(100mL)に溶解し、濃縮した。所望の生成物148がわずかに黄色の油(4.24g、11.8mmol、59%)として得られた。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 5.99-5.79 (bs, 1H), 4.29 (d, J = 8.3 Hz, 2H), 3.78-3.74 (m, 2H), 3.66-3.56 (m, 4H), 3.37-3.30 (m, 2H), 2.36-2.16 (m, 6H), 1.63-1.49 (m, 2H), 1.40 (五重線, J = 8.7 Hz, 1H), 1.05-0.94 (m, 2H).
実施例27.化合物149の合成
148(3.62g、10.0mmol)のDCM(200mL)中溶液に、4-ニトロフェニルクロロホルメート(15)(2.02g、10.0mmol)及びEt3N(4.2mL、3.04g、30.0mmol)を添加した。混合物を1.5時間攪拌し、濃縮した。残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(ヘプタン(1%AcOH)中20%→70%EtOAc(1%AcOH))によって精製した。生成物149が白色泡(4.07g、7.74mmol、74%)として得られた。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 8.32-8.26 (m, 2H), 7.45-7.40 (m, 2H), 5.62-5.52 (m, 1H), 4.48-4.42 (m, 2H), 4.28 (d, J = 8.2 Hz, 2H), 3.81-3.76 (m, 2H), 3.70-3.65 (m, 2H), 3.38-3.30 (m, 2H), 2.35-2.16 (m, 6H), 1.62-1.46 (m, 2H), 1.38 (五重線, J = 8.7 Hz, 1H), 1.04-0.93 (m, 2H).
148(3.62g、10.0mmol)のDCM(200mL)中溶液に、4-ニトロフェニルクロロホルメート(15)(2.02g、10.0mmol)及びEt3N(4.2mL、3.04g、30.0mmol)を添加した。混合物を1.5時間攪拌し、濃縮した。残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(ヘプタン(1%AcOH)中20%→70%EtOAc(1%AcOH))によって精製した。生成物149が白色泡(4.07g、7.74mmol、74%)として得られた。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 8.32-8.26 (m, 2H), 7.45-7.40 (m, 2H), 5.62-5.52 (m, 1H), 4.48-4.42 (m, 2H), 4.28 (d, J = 8.2 Hz, 2H), 3.81-3.76 (m, 2H), 3.70-3.65 (m, 2H), 3.38-3.30 (m, 2H), 2.35-2.16 (m, 6H), 1.62-1.46 (m, 2H), 1.38 (五重線, J = 8.7 Hz, 1H), 1.04-0.93 (m, 2H).
実施例28.化合物150の合成
149(200mg、0.38mmol)のDCM(1mL)中溶液に、トリエチルアミン(35.4μL、0.24mmol)及びトリス(2-アミノエチル)アミン(144)(12.6μL、84.6μmol)を添加した。混合物を120分間攪拌し、真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中25%→100%EtOAc、次いで、DCM中0%→10%MeOH)によって精製すると、150が収率36%(40.0mg、30.6μmol)で白色泡として得られた。1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ (ppm) 6.34-5.72 (m, 6H), 4.34-4.18 (m, 12H), 3.76-3.58 (m, 12H), 3.43-3.30 (m, 6H), 3.30-3.18 (m, 6H), 2.64-2.49 (m, 6H), 2.38-2.14 (m, 18H), 1.65-1.47 (m, 6H), 1.39 (五重線, J = 9.1 Hz, 3H), 1.06-0.90 (m, 6H).
149(200mg、0.38mmol)のDCM(1mL)中溶液に、トリエチルアミン(35.4μL、0.24mmol)及びトリス(2-アミノエチル)アミン(144)(12.6μL、84.6μmol)を添加した。混合物を120分間攪拌し、真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中25%→100%EtOAc、次いで、DCM中0%→10%MeOH)によって精製すると、150が収率36%(40.0mg、30.6μmol)で白色泡として得られた。1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ (ppm) 6.34-5.72 (m, 6H), 4.34-4.18 (m, 12H), 3.76-3.58 (m, 12H), 3.43-3.30 (m, 6H), 3.30-3.18 (m, 6H), 2.64-2.49 (m, 6H), 2.38-2.14 (m, 18H), 1.65-1.47 (m, 6H), 1.39 (五重線, J = 9.1 Hz, 3H), 1.06-0.90 (m, 6H).
実施例29.化合物153の合成
無水DMF(1mL)中のFmoc-Gly-Gly-Gly-OH(151)(31.2mg、75.8μmol)の混合物に、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(40μL、29mg、0.23mmol)及びHATU(30.3mg、79.6μmol)を添加した。10分間後、テトラジン-PEG3-エチルアミン(152)(30.3mg、75.8μmol)を添加し、混合物をボルテックスした。2時間後、混合物をRP HPLC(C18、水(1%AcOH)中30%→90%MeCN(1%AcOH))によって精製した。所望の生成物がピンク色フィルム(24.1mg、31.8μmol、42%)として得られた。LCMS (ESI+) C38H45N8O9 + (M+H+)の計算値757.33 実測値757.46.
無水DMF(1mL)中のFmoc-Gly-Gly-Gly-OH(151)(31.2mg、75.8μmol)の混合物に、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(40μL、29mg、0.23mmol)及びHATU(30.3mg、79.6μmol)を添加した。10分間後、テトラジン-PEG3-エチルアミン(152)(30.3mg、75.8μmol)を添加し、混合物をボルテックスした。2時間後、混合物をRP HPLC(C18、水(1%AcOH)中30%→90%MeCN(1%AcOH))によって精製した。所望の生成物がピンク色フィルム(24.1mg、31.8μmol、42%)として得られた。LCMS (ESI+) C38H45N8O9 + (M+H+)の計算値757.33 実測値757.46.
実施例30.化合物154の合成
153(24.1mg、31.8μmol)のDMF(500μL)中溶液に、ジエチルアミン(20μL、14mg、191μmol)を添加した。混合物を2時間静置し、RP HPLC(C18、水(1%AcOH)中5%→90%MeCN(1%AcOH))によって精製した。所望の生成物154がピンク色フィルム(17.5mg、32.7μmol、定量的)として得られた。LCMS (ESI+) C23H35N8O7 + (M+H+)の計算値535.26 実測値535.37.
153(24.1mg、31.8μmol)のDMF(500μL)中溶液に、ジエチルアミン(20μL、14mg、191μmol)を添加した。混合物を2時間静置し、RP HPLC(C18、水(1%AcOH)中5%→90%MeCN(1%AcOH))によって精製した。所望の生成物154がピンク色フィルム(17.5mg、32.7μmol、定量的)として得られた。LCMS (ESI+) C23H35N8O7 + (M+H+)の計算値535.26 実測値535.37.
実施例31.化合物156の合成
N-[(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチルオキシカルボニル]-1,8-ジアミノ-3,6-ジオキサオクタン(155)(68mg、0.21mmol)の脱水DMF(2mL)中溶液をFmoc-Gly-Gly-Gly-OH(151)(86mg、0.21mmol)の脱水DMF(2mL)中溶液に移した。DIPEA(100μL、0.630mmol)及びHATU(79mg、0.21mmol)を添加した。1.5時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→11%MeOH)によって精製すると、所望の化合物156が収率34%(52mg、0.072mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C35H47N5O9 + (M+ H+)の計算値717.34 実測値718.39.
N-[(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチルオキシカルボニル]-1,8-ジアミノ-3,6-ジオキサオクタン(155)(68mg、0.21mmol)の脱水DMF(2mL)中溶液をFmoc-Gly-Gly-Gly-OH(151)(86mg、0.21mmol)の脱水DMF(2mL)中溶液に移した。DIPEA(100μL、0.630mmol)及びHATU(79mg、0.21mmol)を添加した。1.5時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→11%MeOH)によって精製すると、所望の化合物156が収率34%(52mg、0.072mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C35H47N5O9 + (M+ H+)の計算値717.34 実測値718.39.
実施例32.化合物157の合成
化合物156(21mg、0.029mmol)をDMF(2.4mL)に溶解し、ピペリジン(600μL)を添加した。20分後、混合物を濃縮し、残渣を分取HPLCによって精製すると、所望の化合物157が白色固体(9.3mg、0.018mmol、64%)として得られた。LCMS (ESI+) C23H37N5O7 + (M+ H+)の計算値495.27 実測値496.56.
化合物156(21mg、0.029mmol)をDMF(2.4mL)に溶解し、ピペリジン(600μL)を添加した。20分後、混合物を濃縮し、残渣を分取HPLCによって精製すると、所望の化合物157が白色固体(9.3mg、0.018mmol、64%)として得られた。LCMS (ESI+) C23H37N5O7 + (M+ H+)の計算値495.27 実測値496.56.
実施例33.化合物159の合成
アミノ-PEG11-アミン(158)(143mg、0.260mmol)のDCM(5mL)中溶液に、DCM(5mL)に溶解した(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(102)(41mg、0.13mmol)をゆっくり添加した。1.5時間後、混合物を還元し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→20% 0.7N NH3 MeOH)によって精製すると、所望の化合物159が透明な油(62mg、0.086mmol、66%)として得られた。LCMS (ESI+) C35H46N2O13 + (M+ H+)の計算値720.44 実測値721.56.
アミノ-PEG11-アミン(158)(143mg、0.260mmol)のDCM(5mL)中溶液に、DCM(5mL)に溶解した(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(102)(41mg、0.13mmol)をゆっくり添加した。1.5時間後、混合物を還元し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→20% 0.7N NH3 MeOH)によって精製すると、所望の化合物159が透明な油(62mg、0.086mmol、66%)として得られた。LCMS (ESI+) C35H46N2O13 + (M+ H+)の計算値720.44 実測値721.56.
実施例34.化合物160の合成
159(62mg、0.086mmol)の脱水DMF(2mL)中溶液をFmoc-Gly-Gly-Gly-OH(151)(36mg、0.086mmol)の脱水DMF(2mL)中溶液に移した。DIPEA(43μL、0.25mmol)及びHATU(33mg、0.086mmol)を添加した。18時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→20%MeOH)によって精製すると、所望の化合物160が収率62%(60mg、0.054mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C56H83N5O18 + (M+H+)の計算値1113.57 実測値1114.93.
159(62mg、0.086mmol)の脱水DMF(2mL)中溶液をFmoc-Gly-Gly-Gly-OH(151)(36mg、0.086mmol)の脱水DMF(2mL)中溶液に移した。DIPEA(43μL、0.25mmol)及びHATU(33mg、0.086mmol)を添加した。18時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→20%MeOH)によって精製すると、所望の化合物160が収率62%(60mg、0.054mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C56H83N5O18 + (M+H+)の計算値1113.57 実測値1114.93.
実施例35.化合物161の合成
化合物160(36mg、0.032mmol)をDMF(2mL)に溶解し、ピペリジン(200μL)を添加した。2時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→40%0.7N NH3 MeOH)によって精製すると、所望の化合物161が黄色油(16.7mg、0.0187mmol、58%)として得られた。LCMS (ESI+) C41H73N5O16 + (M+H+)の計算値891.51 実測値892.82.
化合物160(36mg、0.032mmol)をDMF(2mL)に溶解し、ピペリジン(200μL)を添加した。2時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→40%0.7N NH3 MeOH)によって精製すると、所望の化合物161が黄色油(16.7mg、0.0187mmol、58%)として得られた。LCMS (ESI+) C41H73N5O16 + (M+H+)の計算値891.51 実測値892.82.
実施例36.化合物162の合成
アミノ-PEG23-アミン(106)(60mg、0.056mmol)のDCM(3mL)中溶液に、DCM(5mL)に溶解した(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(102)(12mg、0.037mmol)をゆっくり添加した。4時間後、混合物を濃縮し、DMF(2mL)に再溶解し、その後、Fmoc-Gly-Gly-Gly-OH(51)(23mg、0.056mmol)、HATU(21mg、0.056mmol)、及びDIPEA(27μL、0.16mmol)を添加した。20時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→27%MeOH)によって精製すると、所望の化合物162が93%(57mg、0.043mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C80H131N5O30 + (M+NH4 +)の計算値1641.89 実測値1659.92.
アミノ-PEG23-アミン(106)(60mg、0.056mmol)のDCM(3mL)中溶液に、DCM(5mL)に溶解した(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(102)(12mg、0.037mmol)をゆっくり添加した。4時間後、混合物を濃縮し、DMF(2mL)に再溶解し、その後、Fmoc-Gly-Gly-Gly-OH(51)(23mg、0.056mmol)、HATU(21mg、0.056mmol)、及びDIPEA(27μL、0.16mmol)を添加した。20時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→27%MeOH)によって精製すると、所望の化合物162が93%(57mg、0.043mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C80H131N5O30 + (M+NH4 +)の計算値1641.89 実測値1659.92.
実施例37.化合物163の合成
化合物162(57mg、0.034mmol)をDMF(1mL)に溶解し、ピペリジン(120μL)を添加した。2時間後、混合物を濃縮し、水に再溶解し、Fmoc-ピペリジン副産物をジエチルエーテル(3×10mL)による抽出で除去した。凍結乾燥後、163が黄色油(46.1mg、0.032mmol、95%)として得られた。LCMS (ESI+) C65H121N5O28 + (M+H+)の計算値1419.82 実測値1420.91.
化合物162(57mg、0.034mmol)をDMF(1mL)に溶解し、ピペリジン(120μL)を添加した。2時間後、混合物を濃縮し、水に再溶解し、Fmoc-ピペリジン副産物をジエチルエーテル(3×10mL)による抽出で除去した。凍結乾燥後、163が黄色油(46.1mg、0.032mmol、95%)として得られた。LCMS (ESI+) C65H121N5O28 + (M+H+)の計算値1419.82 実測値1420.91.
実施例38.化合物165の合成
(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(102)(204mg、0.650mmol)の溶液に、アミノ-PEG12-アルコール(164)(496mg、0.908mmol)及びトリエチルアミン(350μL、2.27mmol)を添加した。19時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中2→20%MeOH)によって精製すると、165が透明な黄色油(410mg、0.560mmol、87%)として得られた。LCMS (ESI+) C35H63NO14 + (M+ Na+)の計算値721.42 実測値744.43.
(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(102)(204mg、0.650mmol)の溶液に、アミノ-PEG12-アルコール(164)(496mg、0.908mmol)及びトリエチルアミン(350μL、2.27mmol)を添加した。19時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中2→20%MeOH)によって精製すると、165が透明な黄色油(410mg、0.560mmol、87%)として得られた。LCMS (ESI+) C35H63NO14 + (M+ Na+)の計算値721.42 実測値744.43.
実施例39.化合物166の合成
165(410mg、0.560mmol)のDCM(6mL)中溶液に、4-ニトロフェニルクロロホルメート(171、0.848mmol)及びトリエチルアミン(260μL、1.89mmol)を添加した。18時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→7%MeOH)によって精製すると、所望の化合物166が透明な油(350mg、0.394mmol、70%)として得られた。LCMS (ESI+) C42H66N2O18 + (M+ Na+)の計算値886.43 実測値909.61.
165(410mg、0.560mmol)のDCM(6mL)中溶液に、4-ニトロフェニルクロロホルメート(171、0.848mmol)及びトリエチルアミン(260μL、1.89mmol)を添加した。18時間後、混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→7%MeOH)によって精製すると、所望の化合物166が透明な油(350mg、0.394mmol、70%)として得られた。LCMS (ESI+) C42H66N2O18 + (M+ Na+)の計算値886.43 実測値909.61.
実施例40.化合物168の合成
166(15mg、0.017mmol)のDMF(2mL)中溶液に、ペプチドLPETGG(167)(9.7mg、0.017mmol)及びトリエチルアミン(7μL、0.05mmol)を添加した。46時間後、混合物を濃縮し、残渣を分取HPLCによって精製すると、所望の化合物168が63%(14mg、0.010mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C60H101N7O25+ (M+H+)の計算値1319.68 実測値1320.92.
166(15mg、0.017mmol)のDMF(2mL)中溶液に、ペプチドLPETGG(167)(9.7mg、0.017mmol)及びトリエチルアミン(7μL、0.05mmol)を添加した。46時間後、混合物を濃縮し、残渣を分取HPLCによって精製すると、所望の化合物168が63%(14mg、0.010mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C60H101N7O25+ (M+H+)の計算値1319.68 実測値1320.92.
実施例42.182の合成
180(メチルテトラジン-NHSエステル、19mg、0.058mmol)のDCM(0.8mL)中溶液に、181(33.6mg、0.061mmol)及びEt3N(24μL、0.17mmol)を添加した。室温で2.5時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0→15%MeOH)によって精製すると、所望の化合物182が収率93%(41mg、0.054mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C35H60N5O13 + (M+H+)の計算値758.88 実測値758.64.
180(メチルテトラジン-NHSエステル、19mg、0.058mmol)のDCM(0.8mL)中溶液に、181(33.6mg、0.061mmol)及びEt3N(24μL、0.17mmol)を添加した。室温で2.5時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0→15%MeOH)によって精製すると、所望の化合物182が収率93%(41mg、0.054mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C35H60N5O13 + (M+H+)の計算値758.88 実測値758.64.
実施例43.183の合成
182(41mg、0.054mmol)のDCM(3mL)中溶液に、4-ニトロフェニルクロロホルメート(16mg、0.081mmol)及びEt3N(23μL、0.16mmol)を添加した。室温で21時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(勾配:A.DCM中0%→20%EtOAc(p-ニトロフェノールが逃げるまで)、引き続いて勾配B.DCM中0%→13%MeOH)によって精製すると、所望の化合物183が収率76%(37.9mg、0.041mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C42H63N6O17 + (M+H+)の計算値923.98 実測値923.61.
182(41mg、0.054mmol)のDCM(3mL)中溶液に、4-ニトロフェニルクロロホルメート(16mg、0.081mmol)及びEt3N(23μL、0.16mmol)を添加した。室温で21時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(勾配:A.DCM中0%→20%EtOAc(p-ニトロフェノールが逃げるまで)、引き続いて勾配B.DCM中0%→13%MeOH)によって精製すると、所望の化合物183が収率76%(37.9mg、0.041mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C42H63N6O17 + (M+H+)の計算値923.98 実測値923.61.
実施例44.XL10の合成
参照により組み込まれる、MacDonaldら、Nat.Chem.Biol.2015、11、326~334により調製された184(5.6mg、0.023mmol)の無水DMF(0.1mL)中溶液に、無水DMF(0.3ml)に溶解した183(14.3mg、0.015mmol)及びEt3N(7μL、0.046mmol)を添加した。室温で2時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0→15%MeOH)によって精製すると、所望の化合物XL10が収率50%(7.5mg、0.0076mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C47H73N8O15 + (M+H+)の計算値990.13 実測値990.66.
参照により組み込まれる、MacDonaldら、Nat.Chem.Biol.2015、11、326~334により調製された184(5.6mg、0.023mmol)の無水DMF(0.1mL)中溶液に、無水DMF(0.3ml)に溶解した183(14.3mg、0.015mmol)及びEt3N(7μL、0.046mmol)を添加した。室温で2時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0→15%MeOH)によって精製すると、所望の化合物XL10が収率50%(7.5mg、0.0076mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C47H73N8O15 + (M+H+)の計算値990.13 実測値990.66.
実施例45.186の合成
オクタ-エチレングリコール185のDCM(10mL)中溶液に、トリエチルアミン(1.0mL、7.24mmol、2.5当量)を添加し、引き続いてDCM(5mL)中4-ニトロフェニルクロロホルメート(0.58g、2.90mmol、1当量)溶液を28分で滴加した。混合物を90分間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中75%→0%EtOAc、引き続いてDCM中0%→7%MeOH)によって精製した。生成物186が収率38%で無色油(584.6mg、1.09mmol)として得られた。LCMS (ESI+) C23H38NO13 + (M+H+)の計算値536.23, 実測値536.93. 1H-NMR (400 MHz, CDCl3): δ (ppm) 8.28 (d, J = 12.0 Hz, 2H), 7.40 (d, J = 12.0 Hz, 2H), 4.47 - 4.42 (m, 2H), 3.84 - 3.79 (m, 2H), 3.75 - 3.63 (m, 26H), 3.63 - 3.59 (m, 2H), 2.70 - 2.55 (bs, 1H).
実施例46.188の合成
187(BocNH-PEG2)2NH、202mg、0.42mmol)のDCM(1mL)中溶液に、186の調製したストック溶液(DCM(1mL)中584mg)の一部(0.5mL、0.54mmol、1.3当量)、引き続いてトリエチルアミン(176μL、1.26mmol、3当量)及びHOBt(57mg、0.42mmol、1当量)を添加した。混合物を8日間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮した。残渣をアセトニトリル(4.2mL)及び0.1N NaOH(水溶液)(4.2mL、1当量)及びさらなる量の固体NaOH(91.5mg)の混合物に溶解した。混合物をさらに21.5時間攪拌した後、混合物をDCM(3×40mL)で抽出した。合わせた有機層を真空中で濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0%→15%MeOH)によって精製した。生成物188が収率87%で淡黄色油(320.4mg、0.37mmol)として得られた。LCMS (ESI+) C39H78N3O18 + (M+H+)の計算値876.53, 実測値876.54.
1H-NMR (400 MHz, CDCl3): δ (ppm) 5.15 - 5.02 (bs, 2H), 4.25 - 4.19 (m, 2H), 3.76 - 3.46 (m, 50H), 3.35 - 3.26 (m, 4H), 2.79 - 2.69 (br. s, 1H), 1.44 (s, 18H).
187(BocNH-PEG2)2NH、202mg、0.42mmol)のDCM(1mL)中溶液に、186の調製したストック溶液(DCM(1mL)中584mg)の一部(0.5mL、0.54mmol、1.3当量)、引き続いてトリエチルアミン(176μL、1.26mmol、3当量)及びHOBt(57mg、0.42mmol、1当量)を添加した。混合物を8日間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮した。残渣をアセトニトリル(4.2mL)及び0.1N NaOH(水溶液)(4.2mL、1当量)及びさらなる量の固体NaOH(91.5mg)の混合物に溶解した。混合物をさらに21.5時間攪拌した後、混合物をDCM(3×40mL)で抽出した。合わせた有機層を真空中で濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0%→15%MeOH)によって精製した。生成物188が収率87%で淡黄色油(320.4mg、0.37mmol)として得られた。LCMS (ESI+) C39H78N3O18 + (M+H+)の計算値876.53, 実測値876.54.
1H-NMR (400 MHz, CDCl3): δ (ppm) 5.15 - 5.02 (bs, 2H), 4.25 - 4.19 (m, 2H), 3.76 - 3.46 (m, 50H), 3.35 - 3.26 (m, 4H), 2.79 - 2.69 (br. s, 1H), 1.44 (s, 18H).
実施例47.189の合成
188(320mg、0.37mmol)をDCM(1mL)に溶解した。次いで、ジオキサン中4M HCl(456μL、1.83mmol、5当量)を添加した。混合物を3.5時間攪拌した後、さらなるジオキサン中4M HCl(450μL、1.80mmol、4.9当量)を添加した。混合物をさらに3.5時間攪拌した後、さらなるジオキサン中4M HCl(450μL、1.80mmol、4.9当量)を添加した。混合物を16.5時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮した。生成物189が定量的収率で白色粘着性固体として得られた。これを次のステップに直接使用した。1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ (ppm) 8.07 - 7.81 (bs, 6H), 4.15 - 4.06 (m, 2H), 3.75 - 3.66 (m, 2H), 3.65 - 3.48 (m, 48H), 3.03 - 2.92 (m, 4H).
188(320mg、0.37mmol)をDCM(1mL)に溶解した。次いで、ジオキサン中4M HCl(456μL、1.83mmol、5当量)を添加した。混合物を3.5時間攪拌した後、さらなるジオキサン中4M HCl(450μL、1.80mmol、4.9当量)を添加した。混合物をさらに3.5時間攪拌した後、さらなるジオキサン中4M HCl(450μL、1.80mmol、4.9当量)を添加した。混合物を16.5時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮した。生成物189が定量的収率で白色粘着性固体として得られた。これを次のステップに直接使用した。1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ (ppm) 8.07 - 7.81 (bs, 6H), 4.15 - 4.06 (m, 2H), 3.75 - 3.66 (m, 2H), 3.65 - 3.48 (m, 48H), 3.03 - 2.92 (m, 4H).
実施例48.190の合成
BCN-OH(101、164mg、1.10mmol、3当量)のDCM(3mL)中溶液に、CSI(76μL、0.88mmol、2.4当量)を添加した。15分間攪拌した後、トリエチルアミン(255μL、5.50mmol、5当量)を添加した。DCM(3mL)及びトリエチルアミン(508μL、11.0mmol、10当量)を添加することによって、189の溶液を調製した。このストック溶液を6分後に元の反応混合物に添加した。混合物を21.5時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0%→10%MeOH)によって調製した。生成物190が収率39%で淡黄色油(165.0mg、139μmol)として得られた。LCMS (ESI+) C43H72N5O18S2 + (M+H+)の計算値1186.54, 実測値1186.65.
1H-NMR (400 MHz, CDCl3): δ (ppm) 6.09 - 5.87 (m, 2H), 4.31 - 4.19 (m, 6H), 3.76 - 3.50 (m, 50H), 3.40 - 3.29 (m, 4H), 2.38 - 2.16 (m, 12H), 1.66 - 1.47 (m, 4H), 1.40 (五重線, J = 8.0 Hz, 2H), 1.04 - 0.94 (m, 4H).
BCN-OH(101、164mg、1.10mmol、3当量)のDCM(3mL)中溶液に、CSI(76μL、0.88mmol、2.4当量)を添加した。15分間攪拌した後、トリエチルアミン(255μL、5.50mmol、5当量)を添加した。DCM(3mL)及びトリエチルアミン(508μL、11.0mmol、10当量)を添加することによって、189の溶液を調製した。このストック溶液を6分後に元の反応混合物に添加した。混合物を21.5時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0%→10%MeOH)によって調製した。生成物190が収率39%で淡黄色油(165.0mg、139μmol)として得られた。LCMS (ESI+) C43H72N5O18S2 + (M+H+)の計算値1186.54, 実測値1186.65.
1H-NMR (400 MHz, CDCl3): δ (ppm) 6.09 - 5.87 (m, 2H), 4.31 - 4.19 (m, 6H), 3.76 - 3.50 (m, 50H), 3.40 - 3.29 (m, 4H), 2.38 - 2.16 (m, 12H), 1.66 - 1.47 (m, 4H), 1.40 (五重線, J = 8.0 Hz, 2H), 1.04 - 0.94 (m, 4H).
実施例49.191の合成
190(101mg、0.085mmol)のDCM(2.0mL)中溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(39mg、0.127mmol)及びEt3N(36μL、0.25mmol)を添加した。室温で42時間攪拌した後、粗混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(A.DCM中0%→25%EtOAc(p-ニトロフェノールが逃げるまで)、引き続いて勾配B.DCM中0%→12%MeOH)によって精製すると、191が透明な油(49mg、0.036mmol、42%)として得られた。LCMS (ESI+) C58H91N6O26S2 + (M+H+)の計算値1352.50 実測値1352.78.
190(101mg、0.085mmol)のDCM(2.0mL)中溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(39mg、0.127mmol)及びEt3N(36μL、0.25mmol)を添加した。室温で42時間攪拌した後、粗混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(A.DCM中0%→25%EtOAc(p-ニトロフェノールが逃げるまで)、引き続いて勾配B.DCM中0%→12%MeOH)によって精製すると、191が透明な油(49mg、0.036mmol、42%)として得られた。LCMS (ESI+) C58H91N6O26S2 + (M+H+)の計算値1352.50 実測値1352.78.
実施例50.XL11の合成
191(7mg、0.0059mmol)の無水DMF(130μL)中溶液に、Et3N(2.2μL、0.015mmol)及びTCO-アミン塩酸塩(Broadpharm)(1.8mg、0.0068mmol)を添加した。室温で19時間攪拌した後、粗混合物をシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0%→15%MeOH)によって精製すると、XL11が透明な油(1.5mg、0.001mmol、17%)として得られた。LCMS (ESI+) C64H111N8O25S2 + (M+NH4 +)の計算値1456.73 実測値1456.81.
191(7mg、0.0059mmol)の無水DMF(130μL)中溶液に、Et3N(2.2μL、0.015mmol)及びTCO-アミン塩酸塩(Broadpharm)(1.8mg、0.0068mmol)を添加した。室温で19時間攪拌した後、粗混合物をシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0%→15%MeOH)によって精製すると、XL11が透明な油(1.5mg、0.001mmol、17%)として得られた。LCMS (ESI+) C64H111N8O25S2 + (M+NH4 +)の計算値1456.73 実測値1456.81.
実施例51.194の合成
利用可能な187(638mg、1.33mmol)のDCM(8.0mL)中溶液に、128(470mg、1.73mmol)、Et3N(556.0μL、4.0mmol)、及び1-ヒドロキシベンゾトリアゾール(179.0mg、1.33mmol)を添加した。周囲温度で41時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、MeCN(10mL)に再溶解し、引き続いて0.1M NaOH水溶液(10mL)及び固体NaOHペレット(100.0mg)を添加した。1.5時間後、DCM(20mL)を添加し、所望の化合物を4回抽出した。有機層を真空中で濃縮し、残渣をシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0%→12%MeOH)によって精製すると、194が透明な黄色油(733mg、1.19mmol、90%)として得られた。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 4.29 - 4.23 (m, 2H), 3.77 - 3.68 (m, 4H), 3.65 - 3.56 (m, 14H), 3.56 - 3.49 (m, 8H), 3.37 - 3.24 (m, 4H), 1.45 (s, 18H). LCMS (ESI+) C27H54N3O12 + (M+H+)の計算値612.73 実測値612.55.
利用可能な187(638mg、1.33mmol)のDCM(8.0mL)中溶液に、128(470mg、1.73mmol)、Et3N(556.0μL、4.0mmol)、及び1-ヒドロキシベンゾトリアゾール(179.0mg、1.33mmol)を添加した。周囲温度で41時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、MeCN(10mL)に再溶解し、引き続いて0.1M NaOH水溶液(10mL)及び固体NaOHペレット(100.0mg)を添加した。1.5時間後、DCM(20mL)を添加し、所望の化合物を4回抽出した。有機層を真空中で濃縮し、残渣をシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0%→12%MeOH)によって精製すると、194が透明な黄色油(733mg、1.19mmol、90%)として得られた。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 4.29 - 4.23 (m, 2H), 3.77 - 3.68 (m, 4H), 3.65 - 3.56 (m, 14H), 3.56 - 3.49 (m, 8H), 3.37 - 3.24 (m, 4H), 1.45 (s, 18H). LCMS (ESI+) C27H54N3O12 + (M+H+)の計算値612.73 実測値612.55.
実施例52.195の合成
194(31.8mg、0.052mmol)のDCM(1.0mL)中溶液に、ジオキサン中4.0M HCl(0.4mL)を添加した。周囲温度で2.5時間攪拌した後、反応混合物を真空中で濃縮し、その合間にDCM(2mL)に再溶解し、濃縮した。化合物195が透明な油として定量的収率で得られた。LCMS (ESI+) C17H38N3O8 + (M+H+)の計算値412.50 実測値412.45
194(31.8mg、0.052mmol)のDCM(1.0mL)中溶液に、ジオキサン中4.0M HCl(0.4mL)を添加した。周囲温度で2.5時間攪拌した後、反応混合物を真空中で濃縮し、その合間にDCM(2mL)に再溶解し、濃縮した。化合物195が透明な油として定量的収率で得られた。LCMS (ESI+) C17H38N3O8 + (M+H+)の計算値412.50 実測値412.45
実施例53.196の合成
195(21.4mg、0.052mmol)のDCM(1.0mL)中冷溶液(0℃)に、Et3N(36μL、0.26mmol)及び2-ブロモアセチルブロミド(10.5μL、0.12mmol)を添加した。氷上で10分間攪拌した後、氷浴を除去し、0.1M NaOH水溶液(0.8mL)を添加した。室温で20分間攪拌した後、水層をDCM(2×5mL)で抽出した。有機層を合わせ、真空中で濃縮した。粗褐色油をシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0%→18%MeOH)によって精製すると、196が透明な油(6.9mg、0.011mmol、20%)として得られた。LCMS (ESI+) C21H40Br2N3O10 + (M+H+)の計算値654.36 実測値654.29.
195(21.4mg、0.052mmol)のDCM(1.0mL)中冷溶液(0℃)に、Et3N(36μL、0.26mmol)及び2-ブロモアセチルブロミド(10.5μL、0.12mmol)を添加した。氷上で10分間攪拌した後、氷浴を除去し、0.1M NaOH水溶液(0.8mL)を添加した。室温で20分間攪拌した後、水層をDCM(2×5mL)で抽出した。有機層を合わせ、真空中で濃縮した。粗褐色油をシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0%→18%MeOH)によって精製すると、196が透明な油(6.9mg、0.011mmol、20%)として得られた。LCMS (ESI+) C21H40Br2N3O10 + (M+H+)の計算値654.36 実測値654.29.
実施例54.XL12の合成
196(6.9mg、0.011mmol)のDCM(0.8mL)中溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(3.8mg、0.012mmol)及びEt3N(5μL、0.03mmol)を添加した。室温で18時間攪拌した後、DCM(0.5mL)に溶解した155(BCN-PEG2-NH2、3.3mg、0.01mmol)を添加した。さらに2時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(勾配:A.DCM中0%→30%EtOAc(p-ニトロフェノールが逃げるまで)、引き続いて勾配B.DCM中0%→20%MeOH)によって精製すると、XL12が透明な油(1.0mg、0.001mmol、9%)として得られた。LCMS (ESI+) C39H66Br2N5O15 + (M+H+)の計算値1004.77 実測値1004.51.
196(6.9mg、0.011mmol)のDCM(0.8mL)中溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(3.8mg、0.012mmol)及びEt3N(5μL、0.03mmol)を添加した。室温で18時間攪拌した後、DCM(0.5mL)に溶解した155(BCN-PEG2-NH2、3.3mg、0.01mmol)を添加した。さらに2時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(勾配:A.DCM中0%→30%EtOAc(p-ニトロフェノールが逃げるまで)、引き続いて勾配B.DCM中0%→20%MeOH)によって精製すると、XL12が透明な油(1.0mg、0.001mmol、9%)として得られた。LCMS (ESI+) C39H66Br2N5O15 + (M+H+)の計算値1004.77 実測値1004.51.
実施例55.197の合成
102(204mg、0.647mmol)のDCM(20mL)中溶液に、181(496mg、0.909mmol)及びEt3N(350μL、2.27mmol)を添加した。室温で19時間攪拌した後、溶媒を真空中で減少させ、残渣をシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中2→20%MeOH)によって精製すると、所望の化合物197が黄色油として収率87%(410mg、0.567mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C35H63NO14Na+ (M+Na+)の計算値744.86 実測値744.43.
102(204mg、0.647mmol)のDCM(20mL)中溶液に、181(496mg、0.909mmol)及びEt3N(350μL、2.27mmol)を添加した。室温で19時間攪拌した後、溶媒を真空中で減少させ、残渣をシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中2→20%MeOH)によって精製すると、所望の化合物197が黄色油として収率87%(410mg、0.567mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C35H63NO14Na+ (M+Na+)の計算値744.86 実測値744.43.
実施例56.198の合成
197(410mg、0.567mmol)及び4-ニトロフェニルクロロホルメート(172mg、0.853mmol)のDCM(6mL)中溶液に、Et3N(260μL、1.88mmol)を添加した。室温で18時間攪拌した後、溶媒を真空中で減少させ、残渣をシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0→7%MeOH)によって精製すると、所望の化合物198が透明な油として収率70%(350mg、0.394mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C42H66N2O18Na+ (M+Na+)の計算値909.96 実測値909.61.
197(410mg、0.567mmol)及び4-ニトロフェニルクロロホルメート(172mg、0.853mmol)のDCM(6mL)中溶液に、Et3N(260μL、1.88mmol)を添加した。室温で18時間攪拌した後、溶媒を真空中で減少させ、残渣をシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0→7%MeOH)によって精製すると、所望の化合物198が透明な油として収率70%(350mg、0.394mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C42H66N2O18Na+ (M+Na+)の計算値909.96 実測値909.61.
実施例57.XL13の合成
198(44.2mg、0.05mmol)のDCM(5mL)中溶液に、199(ビス-アミノオキシ-PEG2、33.3mg、0.18mmol)及びEt3N(11μL、0.07mmol)を添加した。室温で67時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、RP HPLC(カラムXBridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、H2O中5%→90%MeCN(共に1%酢酸を含有する))によって精製した。生成物XL13が透明な油(8.1mg、0.0087μmol、17%)として得られた。LCMS (ESI+) C42H78N3O19 + (M+H+)の計算値929.08 実測値928.79.
198(44.2mg、0.05mmol)のDCM(5mL)中溶液に、199(ビス-アミノオキシ-PEG2、33.3mg、0.18mmol)及びEt3N(11μL、0.07mmol)を添加した。室温で67時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、RP HPLC(カラムXBridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、H2O中5%→90%MeCN(共に1%酢酸を含有する))によって精製した。生成物XL13が透明な油(8.1mg、0.0087μmol、17%)として得られた。LCMS (ESI+) C42H78N3O19 + (M+H+)の計算値929.08 実測値928.79.
実施例58.319の合成
化合物121(442mg、1.46mmol)のDCM(1mL)及びDMF(200μL)中溶液に、化合物128のDCM(1mL)及びトリエチルアミン(609μL、4.37mmol)中溶液を添加した。混合物を16時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘプタン中50%→100%EtOAc)によって精製すると、319(316mg)が得られた。これをRP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、水(1%AcOH)中5%→90%MeCN(1%AcOH))によってさらに精製した。生成物319が収率17%で無色油(110mg、0.25mmol)として得られた。LCMS (ESI+) C19H37N3NaO8 + (M+Na+)の計算値458.25, 実測値458.33. 1H-NMR (400 MHz, CDCl3): δ (ppm) 5.41 - 4.89 (m, 2H), 4.31 - 4.24 (m, 2H), 3.78 - 3.68 (m, 4H), 3.65 - 3.59 (m, 2H), 3.44 - 3.34 (m, 4H), 3.34 - 3.19 (m, 4H), 1.43 (s, 18H).
化合物121(442mg、1.46mmol)のDCM(1mL)及びDMF(200μL)中溶液に、化合物128のDCM(1mL)及びトリエチルアミン(609μL、4.37mmol)中溶液を添加した。混合物を16時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘプタン中50%→100%EtOAc)によって精製すると、319(316mg)が得られた。これをRP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、水(1%AcOH)中5%→90%MeCN(1%AcOH))によってさらに精製した。生成物319が収率17%で無色油(110mg、0.25mmol)として得られた。LCMS (ESI+) C19H37N3NaO8 + (M+Na+)の計算値458.25, 実測値458.33. 1H-NMR (400 MHz, CDCl3): δ (ppm) 5.41 - 4.89 (m, 2H), 4.31 - 4.24 (m, 2H), 3.78 - 3.68 (m, 4H), 3.65 - 3.59 (m, 2H), 3.44 - 3.34 (m, 4H), 3.34 - 3.19 (m, 4H), 1.43 (s, 18H).
実施例59.320の合成
化合物319(107mg、0.25mmol)をDCM(1mL)に溶解した。次いで、ジオキサン中4M HCl(300μL、1.2mmol、4.8当量)を添加した。混合物を15時間攪拌した後、混合物を沈殿からデカントし、沈殿をDCM(2mL)で1回洗浄した。生成物320が定量的収率で白色粘着性固体(89.9mg、0.29mmol)として得られた。これを次のステップに直接使用した。
化合物319(107mg、0.25mmol)をDCM(1mL)に溶解した。次いで、ジオキサン中4M HCl(300μL、1.2mmol、4.8当量)を添加した。混合物を15時間攪拌した後、混合物を沈殿からデカントし、沈殿をDCM(2mL)で1回洗浄した。生成物320が定量的収率で白色粘着性固体(89.9mg、0.29mmol)として得られた。これを次のステップに直接使用した。
実施例60.321の合成
101(75mg、0.50mmol、2当量)のDCM(1mL)中溶液に、CSI(41μL、0.48mmol、1.9当量)を添加した。6分間攪拌した後、トリエチルアミン(139μL、1.0mmol、4当量)を添加した。DMF(200μL)及びDCM(2mL)、引き続いてトリエチルアミン(139μL、0.75mmol、3当量)を添加することによって、320のストック溶液を調製した。320のこのストック溶液の一部(32μL、0.25mmol)を、CSIを含有する元の反応混合物に添加した。混合物を16時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0%→10%MeOH)によって精製した。生成物321が収率3%で無色油(11mg、14.2μmol)として得られた。LCMS (ESI+) C31H48N5O12S2 + ((M+H+)の計算値746.27, 実測値746.96. 1H-NMR (400 MHz, CDCl3): δ (ppm) 6.36 - 5.94 (m, 2H), 4.38 - 4.17 (m, 6H), 3.84 - 3.79 (m, 2H), 3.77 - 3.72 (m, 2H), 3.68 - 3.63 (m, 2H), 3.54 - 3.45 (m, 4H), 3.39 - 3.27 (m, 4H), 2.38 - 2.16 (m, 12H), 1.67 - 1.47 (m, 5H), 1.40 (五重線, J = 8.0 Hz, 2H), 1.05 - 0.93 (m, 4H).
101(75mg、0.50mmol、2当量)のDCM(1mL)中溶液に、CSI(41μL、0.48mmol、1.9当量)を添加した。6分間攪拌した後、トリエチルアミン(139μL、1.0mmol、4当量)を添加した。DMF(200μL)及びDCM(2mL)、引き続いてトリエチルアミン(139μL、0.75mmol、3当量)を添加することによって、320のストック溶液を調製した。320のこのストック溶液の一部(32μL、0.25mmol)を、CSIを含有する元の反応混合物に添加した。混合物を16時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0%→10%MeOH)によって精製した。生成物321が収率3%で無色油(11mg、14.2μmol)として得られた。LCMS (ESI+) C31H48N5O12S2 + ((M+H+)の計算値746.27, 実測値746.96. 1H-NMR (400 MHz, CDCl3): δ (ppm) 6.36 - 5.94 (m, 2H), 4.38 - 4.17 (m, 6H), 3.84 - 3.79 (m, 2H), 3.77 - 3.72 (m, 2H), 3.68 - 3.63 (m, 2H), 3.54 - 3.45 (m, 4H), 3.39 - 3.27 (m, 4H), 2.38 - 2.16 (m, 12H), 1.67 - 1.47 (m, 5H), 1.40 (五重線, J = 8.0 Hz, 2H), 1.05 - 0.93 (m, 4H).
実施例61.301(LD01)の合成
321(10.6mg、14.2μmol)のDCM(100μL)中溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(4.3mg、14.2μmol、1.0当量)及びトリエチルアミン(5.9μL、42.6μmol、3.0当量)を添加した。66時間攪拌した後、この混合物の一部をvc-PABC-MMAE.TFAのDMF中ストック溶液(200μL、50mg/mL)及びさらなる量のトリエチルアミン(5.9μL、42.6μmol、3.0当量)で処理した。24時間後、これを真空中で部分的に濃縮した。残渣をRP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、水(1%AcOH)中5%→90%MeCN(1%AcOH))によって精製した。化合物301が収率28%でフィルム(3.4mg、1.9μmol)として得られた。LCMS (ESI+) C90H140N15O25S2 + ((M+H+)の計算値1894.96, 実測値1895.00.
321(10.6mg、14.2μmol)のDCM(100μL)中溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(4.3mg、14.2μmol、1.0当量)及びトリエチルアミン(5.9μL、42.6μmol、3.0当量)を添加した。66時間攪拌した後、この混合物の一部をvc-PABC-MMAE.TFAのDMF中ストック溶液(200μL、50mg/mL)及びさらなる量のトリエチルアミン(5.9μL、42.6μmol、3.0当量)で処理した。24時間後、これを真空中で部分的に濃縮した。残渣をRP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、水(1%AcOH)中5%→90%MeCN(1%AcOH))によって精製した。化合物301が収率28%でフィルム(3.4mg、1.9μmol)として得られた。LCMS (ESI+) C90H140N15O25S2 + ((M+H+)の計算値1894.96, 実測値1895.00.
実施例62.322の合成
185(オクタエチレングリコール)のDCM(10mL)中溶液に、トリエチルアミン(1.0mL、7.24mmol;2.5当量)を添加し、引き続いてDCM(5mL)中4-ニトロフェニルクロロホルメート(0.58g;2.90mmol;1当量)溶液を28分で滴加した。混合物を90分間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中75%→0%EtOAc、引き続いてDCM中0%→7%MeOH)によって精製した。生成物322が収率38%で無色油(584.6mg;1.09mmol)として得られた。LCMS (ESI+) C23H38NO13 + (M+H+)の計算値536.23, 実測値536.93. 1H-NMR (400 MHz, CDCl3): δ (ppm) 8.28 (d, J = 12.0 Hz, 2H), 7.40 (d, J = 12.0 Hz, 2H), 4.47 - 4.42 (m, 2H), 3.84 - 3.79 (m, 2H), 3.75 - 3.63 (m, 26H), 3.63 - 3.59 (m, 2H), 2.70 - 2.55 (br. s, 1H).
実施例63.323の合成
化合物121(127mg、0.42mmol)のDCM(1mL)中溶液に、322の調製したストック溶液(DCM(1mL)中584mg)の一部(0.5mL;0.54mmol;1.3当量)、引き続いてトリエチルアミン(176μL、1.26mmol;3当量)及びHOBt(57mg;0.42mmol;1当量)を添加した。混合物を4.5日間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮した。残渣をアセトニトリル(4.2mL)と0.1N NaOH(4.2mL、1当量)の混合物に溶解した。混合物を24時間攪拌した後、さらなる固体NaOH(104.5mg)を添加した。混合物をさらに5時間攪拌した後、混合物をDCM(2×10mL)で抽出した。合わせた有機層を真空中で濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0%→15%MeOH)によって精製した。生成物323が収率54%で淡黄色油(164.5mg、0.23mmol)として得られた。LCMS (ESI+) C26H54N3O12 + (M-BOC+)の計算値600.36, 実測値600.49. 1H-NMR (400 MHz, CDCl3): δ (ppm) 5.27 - 5.05 (m, 2H), 4.26 - 4.21 (m, 2H), 3.76 - 3.59 (m, 30H), 3.43 - 3.33 (m, 4H), 3.33 - 3.22 (m, 4H), 1.43 (s, 18H).
化合物121(127mg、0.42mmol)のDCM(1mL)中溶液に、322の調製したストック溶液(DCM(1mL)中584mg)の一部(0.5mL;0.54mmol;1.3当量)、引き続いてトリエチルアミン(176μL、1.26mmol;3当量)及びHOBt(57mg;0.42mmol;1当量)を添加した。混合物を4.5日間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮した。残渣をアセトニトリル(4.2mL)と0.1N NaOH(4.2mL、1当量)の混合物に溶解した。混合物を24時間攪拌した後、さらなる固体NaOH(104.5mg)を添加した。混合物をさらに5時間攪拌した後、混合物をDCM(2×10mL)で抽出した。合わせた有機層を真空中で濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0%→15%MeOH)によって精製した。生成物323が収率54%で淡黄色油(164.5mg、0.23mmol)として得られた。LCMS (ESI+) C26H54N3O12 + (M-BOC+)の計算値600.36, 実測値600.49. 1H-NMR (400 MHz, CDCl3): δ (ppm) 5.27 - 5.05 (m, 2H), 4.26 - 4.21 (m, 2H), 3.76 - 3.59 (m, 30H), 3.43 - 3.33 (m, 4H), 3.33 - 3.22 (m, 4H), 1.43 (s, 18H).
実施例64.324の合成
化合物323(164mg、0.23mmol)をDCM(1mL)に溶解した。次いで、ジオキサン中4M HCl(293μL、1.17mmol、5当量)を添加した。混合物を18時間攪拌した後、さらなるジオキサン中4M HCl(293μL、1.17mmol、5当量)を添加した。混合物をさらに5時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮した。生成物324が定量的収率で白色粘着性固体(132mg、0.23mmol)として得られた。これを次のステップに直接使用した。
化合物323(164mg、0.23mmol)をDCM(1mL)に溶解した。次いで、ジオキサン中4M HCl(293μL、1.17mmol、5当量)を添加した。混合物を18時間攪拌した後、さらなるジオキサン中4M HCl(293μL、1.17mmol、5当量)を添加した。混合物をさらに5時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮した。生成物324が定量的収率で白色粘着性固体(132mg、0.23mmol)として得られた。これを次のステップに直接使用した。
実施例65.325の合成
101(81mg、0.54mmol、2.3当量)のDCM(2mL)中溶液に、CSI(43μL、0.49mmol、2.1当量)を添加した。15分間攪拌した後、トリエチルアミン(164μL、1.17mmol、5当量)を添加した。DCM(2mL)及びトリエチルアミン(164μL、1.17mmol、5当量)を添加することによって、324の溶液を調製した。このストック溶液を6分後に元の反応混合物に添加した。混合物を23時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0%→12%MeOH)によって精製した。生成物325が収率31%で淡黄色油(73.0mg、72.2μmol)として得られた。LCMS (ESI+) C43H72N5O18S2 + (M+H+)の計算値1010.43, 実測値1010.50.
1H-NMR (400 MHz, CDCl3): δ (ppm) 6.21 - 5.85 (m, 2H), 4.38 - 4.17 (m, 6H), 3.80 - 3.57 (m, 30H), 3.57 - 3.44 (m, 4H), 3.44 - 3.30 (m, 4H), 2.38 - 2.16 (m, 12H), 1.64 - 1.48 (m, 4H), 1.40 (五重線, J = 8.0 Hz, 2H), 1.05 - 0.91 (m, 4H).
101(81mg、0.54mmol、2.3当量)のDCM(2mL)中溶液に、CSI(43μL、0.49mmol、2.1当量)を添加した。15分間攪拌した後、トリエチルアミン(164μL、1.17mmol、5当量)を添加した。DCM(2mL)及びトリエチルアミン(164μL、1.17mmol、5当量)を添加することによって、324の溶液を調製した。このストック溶液を6分後に元の反応混合物に添加した。混合物を23時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0%→12%MeOH)によって精製した。生成物325が収率31%で淡黄色油(73.0mg、72.2μmol)として得られた。LCMS (ESI+) C43H72N5O18S2 + (M+H+)の計算値1010.43, 実測値1010.50.
1H-NMR (400 MHz, CDCl3): δ (ppm) 6.21 - 5.85 (m, 2H), 4.38 - 4.17 (m, 6H), 3.80 - 3.57 (m, 30H), 3.57 - 3.44 (m, 4H), 3.44 - 3.30 (m, 4H), 2.38 - 2.16 (m, 12H), 1.64 - 1.48 (m, 4H), 1.40 (五重線, J = 8.0 Hz, 2H), 1.05 - 0.91 (m, 4H).
実施例66.302(LD02)の合成
325(19.5mg、19.7μmol)のDCM(100μL)中溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(6.0mg、19.7μmol、1.0当量)及びトリエチルアミン(8.2μL、59.1μmol、3.0当量)を添加した。66時間攪拌した後、この混合物の一部をvc-PABC-MMAE.TFAのDMF中ストック溶液(200μL、50mg/mL)及びさらなる量のトリエチルアミン(8.2μL、59.1μmol、3.0当量)で処理した。95時間後、これを真空中で部分的に濃縮した。残渣をRP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、水(1%AcOH)中5%→90%MeCN(1%AcOH))によって精製した。化合物302が収率9%でフィルム(3.7mg、1.71μmol)として得られた。LCMS (ESI+) C102H165N15O31S2 2+ (M+2H+)の計算値1080.56, 実測値1080.74.
325(19.5mg、19.7μmol)のDCM(100μL)中溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(6.0mg、19.7μmol、1.0当量)及びトリエチルアミン(8.2μL、59.1μmol、3.0当量)を添加した。66時間攪拌した後、この混合物の一部をvc-PABC-MMAE.TFAのDMF中ストック溶液(200μL、50mg/mL)及びさらなる量のトリエチルアミン(8.2μL、59.1μmol、3.0当量)で処理した。95時間後、これを真空中で部分的に濃縮した。残渣をRP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、水(1%AcOH)中5%→90%MeCN(1%AcOH))によって精製した。化合物302が収率9%でフィルム(3.7mg、1.71μmol)として得られた。LCMS (ESI+) C102H165N15O31S2 2+ (M+2H+)の計算値1080.56, 実測値1080.74.
実施例67.329の合成
101(18mg、0.12mmol)のDCM(1mL)中溶液に、クロロスルホニルイソシアネート(CSI)を添加した。30分後、Et3N(37μL、27mg、0.27mmol)を添加した。195(26mg、0.054mmol)のDCM(1mL)中溶液に、Et3N(37μL、27mg、0.27mmol)を添加した。この混合物を反応混合物に添加した。45分後、反応混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(DCM→DCM中7%MeOH)によって精製した。生成物329が無色フィルム(27mg、0.029mmol、54%)として得られた。LCMS (ESI+) C39H64N5O16S2 + (M+H+)の計算値922.38, 実測値922.50.
101(18mg、0.12mmol)のDCM(1mL)中溶液に、クロロスルホニルイソシアネート(CSI)を添加した。30分後、Et3N(37μL、27mg、0.27mmol)を添加した。195(26mg、0.054mmol)のDCM(1mL)中溶液に、Et3N(37μL、27mg、0.27mmol)を添加した。この混合物を反応混合物に添加した。45分後、反応混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(DCM→DCM中7%MeOH)によって精製した。生成物329が無色フィルム(27mg、0.029mmol、54%)として得られた。LCMS (ESI+) C39H64N5O16S2 + (M+H+)の計算値922.38, 実測値922.50.
実施例68.330の合成
329のDCM(1mL)中溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(8.9mg、29.3μmol)及びEt3N(12.2μL、8.9mg、87.9μmol)を添加した。1日後、0.28mLを化合物303の調製に使用した。2日後、余分のビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(7.0mg、23μmol)を主反応混合物に添加した。1日後、反応混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製した。生成物330が無色フィルム(17.5mg、0.016mmol、55%(補正76%))として得られた。LCMS (ESI+) C46H67N6O20S2 + (M+H+)の計算値1087.38, 実測値1087.47.
329のDCM(1mL)中溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(8.9mg、29.3μmol)及びEt3N(12.2μL、8.9mg、87.9μmol)を添加した。1日後、0.28mLを化合物303の調製に使用した。2日後、余分のビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(7.0mg、23μmol)を主反応混合物に添加した。1日後、反応混合物を濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製した。生成物330が無色フィルム(17.5mg、0.016mmol、55%(補正76%))として得られた。LCMS (ESI+) C46H67N6O20S2 + (M+H+)の計算値1087.38, 実測値1087.47.
実施例69.303(LD03)の合成
330の反応混合物(0.28mL、8.8mg、8.1μmolを理論上含有する)に、Et3N(3.4μL、2.5mg、24.3μmol)及びvc-PABC-MMAE.TFA(10mg、8.1μmol)のDMF(200μL)中溶液を添加した。21時間後、2,2’-(エチレンジオキシ)ビス(エチルアミン)(4.7μL、4.8mg、32μmol)を添加した。45分後、反応混合物を窒素ガス流下で濃縮した。残渣をRP-HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、水(1%AcOH)中30%~90%MeCN(1%AcOH))によって精製した。生成物303が無色フィルム(5.6mg、2.7μmol)として得られた。LCMS (ESI+) C98H157N15O29S2 2+ ((M+2H+)/2)の計算値1036.53, 実測値1036.70.
330の反応混合物(0.28mL、8.8mg、8.1μmolを理論上含有する)に、Et3N(3.4μL、2.5mg、24.3μmol)及びvc-PABC-MMAE.TFA(10mg、8.1μmol)のDMF(200μL)中溶液を添加した。21時間後、2,2’-(エチレンジオキシ)ビス(エチルアミン)(4.7μL、4.8mg、32μmol)を添加した。45分後、反応混合物を窒素ガス流下で濃縮した。残渣をRP-HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、水(1%AcOH)中30%~90%MeCN(1%AcOH))によって精製した。生成物303が無色フィルム(5.6mg、2.7μmol)として得られた。LCMS (ESI+) C98H157N15O29S2 2+ ((M+2H+)/2)の計算値1036.53, 実測値1036.70.
実施例70.332の合成
Alloc2-va-PABC-PBD 331(10.0mg、0.009mmol)の脱気DCM(400μL、DCMを通してN2を5分間パージすることによって得られる)中溶液に、ピロリジン(1.9μL、0.027mmol)及びPd(PPh3)4(1.6mg、0.0014mmol)を添加した。周囲温度で15分間攪拌した後、反応混合物をDCM(10mL)で希釈し、飽和NH4Cl水溶液(10mL)を添加した。粗混合物をDCM(3×10mL)で抽出した。有機層を合わせ、Na2SO4上で乾燥させ、濾過し、真空中で濃縮した。黄色残渣をDMF(450μL)及びMeCN(450μL)に再溶解し、RP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、H2O中5%→90%MeCN(共に0.1%ギ酸を含有する))によって精製した。純粋な画分をSPEカラム(PL-HCO3 MP、500mg/6mL)上で中和し、濃縮し、MeCN(2×5mL)と共蒸発させると、332が白色固体(4.8mg、0.005mmol、58%)として得られた。LCMS (ESI+) C49H60N7O11 + (M+H+)の計算値923.04 実測値923.61.
Alloc2-va-PABC-PBD 331(10.0mg、0.009mmol)の脱気DCM(400μL、DCMを通してN2を5分間パージすることによって得られる)中溶液に、ピロリジン(1.9μL、0.027mmol)及びPd(PPh3)4(1.6mg、0.0014mmol)を添加した。周囲温度で15分間攪拌した後、反応混合物をDCM(10mL)で希釈し、飽和NH4Cl水溶液(10mL)を添加した。粗混合物をDCM(3×10mL)で抽出した。有機層を合わせ、Na2SO4上で乾燥させ、濾過し、真空中で濃縮した。黄色残渣をDMF(450μL)及びMeCN(450μL)に再溶解し、RP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、H2O中5%→90%MeCN(共に0.1%ギ酸を含有する))によって精製した。純粋な画分をSPEカラム(PL-HCO3 MP、500mg/6mL)上で中和し、濃縮し、MeCN(2×5mL)と共蒸発させると、332が白色固体(4.8mg、0.005mmol、58%)として得られた。LCMS (ESI+) C49H60N7O11 + (M+H+)の計算値923.04 実測値923.61.
実施例71.304(LD04)の合成
332(4.8mg、0.005mmol)の無水脱気DMF(60μL、DMFを通してN2を5分間パージすることによって得られる)中溶液に、330(10mg、0.009mmol、無水脱気DMF 48μLに溶解)、Et3N(3.6μL、0.026mmol)、及びHOBt(無水脱気DMF中ストック、5.1μL、0.35mg、0.0026mmol、0.5当量)を添加した。暗所中周囲温度で41時間攪拌した後、粗反応混合物をDCM(300μL)で希釈し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0%→12%MeOH)によって精製すると、304が透明な黄色油(4.0mg、0.0021mmol、41%)として得られた。LCMS (ESI+) C89H121N12O28S2 + (M+H+)の計算値1871.11 実測値1871.09.
332(4.8mg、0.005mmol)の無水脱気DMF(60μL、DMFを通してN2を5分間パージすることによって得られる)中溶液に、330(10mg、0.009mmol、無水脱気DMF 48μLに溶解)、Et3N(3.6μL、0.026mmol)、及びHOBt(無水脱気DMF中ストック、5.1μL、0.35mg、0.0026mmol、0.5当量)を添加した。暗所中周囲温度で41時間攪拌した後、粗反応混合物をDCM(300μL)で希釈し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0%→12%MeOH)によって精製すると、304が透明な黄色油(4.0mg、0.0021mmol、41%)として得られた。LCMS (ESI+) C89H121N12O28S2 + (M+H+)の計算値1871.11 実測値1871.09.
実施例72.305(LD05)の合成
参照により組み込まれる、国際公開第2019110725号、実施例5-5により調製した、333(2.9mg、0.0013mmol)の無水DMF(60μL)中溶液に、330(1.45mg、0.0013mmol)及びEt3N(1.2μL、0.023mmol)を添加した。室温で48時間攪拌した後、反応混合物をDMF(500μL)で希釈し、RP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、H2O中30%→100%MeCN(共に1%酢酸を含有する))によって精製した。生成物305が無色フィルム(0.6mg、0.207μmol、16%)として得られた。LCMS (ESI+) C124H182IN14O46S5 + (M/2+H+)の計算値1447.03 実測値1447.19.
参照により組み込まれる、国際公開第2019110725号、実施例5-5により調製した、333(2.9mg、0.0013mmol)の無水DMF(60μL)中溶液に、330(1.45mg、0.0013mmol)及びEt3N(1.2μL、0.023mmol)を添加した。室温で48時間攪拌した後、反応混合物をDMF(500μL)で希釈し、RP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、H2O中30%→100%MeCN(共に1%酢酸を含有する))によって精製した。生成物305が無色フィルム(0.6mg、0.207μmol、16%)として得られた。LCMS (ESI+) C124H182IN14O46S5 + (M/2+H+)の計算値1447.03 実測値1447.19.
実施例73.306(LD06)の合成
330(7mg、0.006mmol)の無水DMF(150μL)中溶液に、vc-PABC-DMEA-PNU(334)の無水DMF(125μL、5.7mg、0.005mmol)中ストック及びEt3N(2μL、0.015mmol)を添加した。室温で25時間攪拌した後、反応混合物をDCM(0.3mL)で希釈し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0%→20%MeOH)によって精製すると、306が赤色フィルム(5mg、0.0024mmol、47%)として得られた。LCMS (ESI+) C96H133N13O36S3 + (M/2+H+)の計算値1055.64 実測値1055.50.
330(7mg、0.006mmol)の無水DMF(150μL)中溶液に、vc-PABC-DMEA-PNU(334)の無水DMF(125μL、5.7mg、0.005mmol)中ストック及びEt3N(2μL、0.015mmol)を添加した。室温で25時間攪拌した後、反応混合物をDCM(0.3mL)で希釈し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0%→20%MeOH)によって精製すると、306が赤色フィルム(5mg、0.0024mmol、47%)として得られた。LCMS (ESI+) C96H133N13O36S3 + (M/2+H+)の計算値1055.64 実測値1055.50.
実施例74.337の合成
化合物336(DIBO、95mg、0.43mmol)をDCM(1.0mL)に溶解し、クロロスルホニルイソシアネート(33.0μL、0.37mmol)を室温で添加すると、2分後、不溶性物質が形成された。室温でさらに15分間攪拌した後、Et3N(120.0μL、0.85mmol)を添加すると、全ての不溶性物質が消滅し、DCM(1.0mL)に溶解した195(71mg、0.0171)とEt3N(120.0μL、0.85mmol)の混合物の添加を実施した。室温で16時間攪拌した後、粗混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0%→15%MeOH)によって精製し、その後、これをEtOAc(2×)と共蒸発させてMeOHを完全に除去した。生成物337が蝋様白色固体(136.0mg、0.12mmol、75%)として得られた。LCMS (ESI+) C51H63N6O16S2 + (M+NH4 +)の計算値1080.21 実測値1080.59.
化合物336(DIBO、95mg、0.43mmol)をDCM(1.0mL)に溶解し、クロロスルホニルイソシアネート(33.0μL、0.37mmol)を室温で添加すると、2分後、不溶性物質が形成された。室温でさらに15分間攪拌した後、Et3N(120.0μL、0.85mmol)を添加すると、全ての不溶性物質が消滅し、DCM(1.0mL)に溶解した195(71mg、0.0171)とEt3N(120.0μL、0.85mmol)の混合物の添加を実施した。室温で16時間攪拌した後、粗混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0%→15%MeOH)によって精製し、その後、これをEtOAc(2×)と共蒸発させてMeOHを完全に除去した。生成物337が蝋様白色固体(136.0mg、0.12mmol、75%)として得られた。LCMS (ESI+) C51H63N6O16S2 + (M+NH4 +)の計算値1080.21 実測値1080.59.
実施例75.338の合成
337(136.0mg、0.12mmol)のDCM(2.0mL)中溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(47.0mg、0.15mmol)及びEt3N(54.0μL、0.38mmol)を添加した。室温で18時間攪拌した後、粗混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(勾配:A.DCM中0%→35%EtOAc(p-ニトロフェノールが逃げるまで)、引き続いて勾配、B.DCM中0%→13%MeOH)によって精製すると、338が淡黄色油(89.0mg、0.07mmol、60%)として得られた。LCMS (ESI+) C48H66N7O20S2 + (M+NH4 +)の計算値1245.31 実測値1245.64.
337(136.0mg、0.12mmol)のDCM(2.0mL)中溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(47.0mg、0.15mmol)及びEt3N(54.0μL、0.38mmol)を添加した。室温で18時間攪拌した後、粗混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(勾配:A.DCM中0%→35%EtOAc(p-ニトロフェノールが逃げるまで)、引き続いて勾配、B.DCM中0%→13%MeOH)によって精製すると、338が淡黄色油(89.0mg、0.07mmol、60%)として得られた。LCMS (ESI+) C48H66N7O20S2 + (M+NH4 +)の計算値1245.31 実測値1245.64.
実施例76.307(LD07)の合成
338(6.95mg、0.005mmol)の無水DMF(93.0μL)中溶液に、Et3N(2.4μL、0.017mmol)及びvc-PABC-MMAE.TFA(Levena Bioscience)の無水DMF(70μL、7.0mg、0.005mmol)中ストック溶液を添加した。室温で18時間攪拌した後、DMF(450μL)を添加し、粗混合物をRP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、H2O中30%→100%MeCN(共に1%酢酸を含有する))によって精製した。生成物307が無色フィルム(4.5mg、0.002mmol、36%)として得られた。LCMS (ESI+) C110H152N15O29S2 + (M/2+H+)の計算値1106.30 実測値1106.79.
338(6.95mg、0.005mmol)の無水DMF(93.0μL)中溶液に、Et3N(2.4μL、0.017mmol)及びvc-PABC-MMAE.TFA(Levena Bioscience)の無水DMF(70μL、7.0mg、0.005mmol)中ストック溶液を添加した。室温で18時間攪拌した後、DMF(450μL)を添加し、粗混合物をRP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、H2O中30%→100%MeCN(共に1%酢酸を含有する))によって精製した。生成物307が無色フィルム(4.5mg、0.002mmol、36%)として得られた。LCMS (ESI+) C110H152N15O29S2 + (M/2+H+)の計算値1106.30 実測値1106.79.
実施例77.341の合成
化合物101(16.3mg、0.10mmol)をDCM(0.8mL)に溶解し、クロロスルホニルイソシアネート(8.6μL、0.099mmol)を室温で添加した。室温で15分間攪拌した後、Et3N(69.0μL、0.49mmol)を添加し、引き続いてDCM(1.0mL)に溶解した335(40mg、0.099mmol)とEt3N(69.0μL、0.49mmol)の混合物を添加した。この混合物を室温で1.5時間攪拌すると(混合物1)、粗339が得られた。別のバイアルで、340(DBCO-C2-OH、Broadpharm)(34.0mg、0.099mmol)を室温でDCM(0.8mL)に溶解し、クロロスルホニルイソシアネート(7.75μL、0.089mmol)を添加した。室温で15分間攪拌した後、Et3N(69.0μL、0.49mmol)、引き続いて粗339を添加した。室温でさらに2時間攪拌した後、反応混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0%→15%MeOH)によって精製し、その後、これをEtOAC(2×)と共蒸発させて、MeOHを完全に除去した。生成物341が透明な黄色油(20.0mg、0.017mmol、17%)として得られた。LCMS (ESI+) C50H70N7O18S2 + (M+H+)の計算値1121.26 実測値1121.59.
化合物101(16.3mg、0.10mmol)をDCM(0.8mL)に溶解し、クロロスルホニルイソシアネート(8.6μL、0.099mmol)を室温で添加した。室温で15分間攪拌した後、Et3N(69.0μL、0.49mmol)を添加し、引き続いてDCM(1.0mL)に溶解した335(40mg、0.099mmol)とEt3N(69.0μL、0.49mmol)の混合物を添加した。この混合物を室温で1.5時間攪拌すると(混合物1)、粗339が得られた。別のバイアルで、340(DBCO-C2-OH、Broadpharm)(34.0mg、0.099mmol)を室温でDCM(0.8mL)に溶解し、クロロスルホニルイソシアネート(7.75μL、0.089mmol)を添加した。室温で15分間攪拌した後、Et3N(69.0μL、0.49mmol)、引き続いて粗339を添加した。室温でさらに2時間攪拌した後、反応混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0%→15%MeOH)によって精製し、その後、これをEtOAC(2×)と共蒸発させて、MeOHを完全に除去した。生成物341が透明な黄色油(20.0mg、0.017mmol、17%)として得られた。LCMS (ESI+) C50H70N7O18S2 + (M+H+)の計算値1121.26 実測値1121.59.
実施例78.342の合成
341(20.0mg、0.17mmol)のDCM(1.0mL)中溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(5.6mg、0.019mmol)及びEt3N(7.5μL、0.053mmol)を添加した。室温で40時間攪拌した後、粗混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(勾配:A.DCM中0%→30%EtOAc(p-ニトロフェノールが逃げるまで)、引き続いて勾配B.DCM中0%→20%MeOH)によって精製すると、342が透明な淡黄色油(6.9mg、0.005mmol、30%)として得られた。LCMS (ESI+) C57H73N8O22S2 + (M+H+)の計算値1286.36 実測値1286.57.
341(20.0mg、0.17mmol)のDCM(1.0mL)中溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(5.6mg、0.019mmol)及びEt3N(7.5μL、0.053mmol)を添加した。室温で40時間攪拌した後、粗混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(勾配:A.DCM中0%→30%EtOAc(p-ニトロフェノールが逃げるまで)、引き続いて勾配B.DCM中0%→20%MeOH)によって精製すると、342が透明な淡黄色油(6.9mg、0.005mmol、30%)として得られた。LCMS (ESI+) C57H73N8O22S2 + (M+H+)の計算値1286.36 実測値1286.57.
実施例79.308(LD08)の合成
342(3.6mg、0.0028mmol)の無水DMF(35.0μL)中溶液に、Et3N(1.2μL、0.008mmol)及びvc-PABC-MMAE.TFA(Levena Bioscience)の無水DMF中ストック溶液(34μL、3.4mg、0.0028mmol)を添加した。室温で27時間攪拌した後、DCM(400μL)を添加し、粗混合物をシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0%→30%MeOH)によって精製すると、308が無色フィルム(3.7mg、0.0016mmol、58%)として得られた。LCMS (ESI+) C109H161N17O31S2 + (M/2+H+)の計算値1135.84 実測値1135.73.
342(3.6mg、0.0028mmol)の無水DMF(35.0μL)中溶液に、Et3N(1.2μL、0.008mmol)及びvc-PABC-MMAE.TFA(Levena Bioscience)の無水DMF中ストック溶液(34μL、3.4mg、0.0028mmol)を添加した。室温で27時間攪拌した後、DCM(400μL)を添加し、粗混合物をシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0%→30%MeOH)によって精製すると、308が無色フィルム(3.7mg、0.0016mmol、58%)として得られた。LCMS (ESI+) C109H161N17O31S2 + (M/2+H+)の計算値1135.84 実測値1135.73.
実施例80.310(LD10)の合成
344(4.3mg、6.0μmol、1.7当量)を含有するエッペンドルフバイアルに、DMF中vc-PABC-MMAF.TFA塩(4.00mg、100μL、34.31ミリモル濃度、3.43μmol、1.0当量)、引き続いてトリエチルアミン(1.43μL、10.3μmol、3.0当量)を添加した。混合物を混合し、得られた無色溶液を室温でおよそ3時間放置した。次いで、反応混合物を、RP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、水(1%AcOH)中30%→90%MeCN(1%AcOH))を介して直接精製した。所望の生成物310が無色残渣(4.5mg、2.7μmol、収率79%)として得られた。LCMS (ESI+) C80H134N15O22 + (M+H+)の計算値1656.98. 実測値1657.03.
344(4.3mg、6.0μmol、1.7当量)を含有するエッペンドルフバイアルに、DMF中vc-PABC-MMAF.TFA塩(4.00mg、100μL、34.31ミリモル濃度、3.43μmol、1.0当量)、引き続いてトリエチルアミン(1.43μL、10.3μmol、3.0当量)を添加した。混合物を混合し、得られた無色溶液を室温でおよそ3時間放置した。次いで、反応混合物を、RP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、水(1%AcOH)中30%→90%MeCN(1%AcOH))を介して直接精製した。所望の生成物310が無色残渣(4.5mg、2.7μmol、収率79%)として得られた。LCMS (ESI+) C80H134N15O22 + (M+H+)の計算値1656.98. 実測値1657.03.
実施例81.346の合成
102(54.7mg、1.00当量、173μmol)及び345(トリグリシン、28.8mg、0.878当量、152μmol)を含有するエッペンドルフバイアルに、脱水DMF(250μL)及びトリエチルアミン(52.7mg、72.5μL、3当量、520μmol)を添加した。得られた黄色懸濁液を室温で21時間攪拌し、引き続いてH2O 50μLを反応混合物に添加した。反応混合物を室温でさらに1日攪拌し、さらなるH2O(200μL)を添加し、反応混合物を室温でさらに3日間攪拌した。次に、MeCN(およそ0.5mL)及びさらなるEt3N(およそ10滴)を添加し、得られた懸濁液を室温で1時間攪拌した後、真空中で濃縮した。黄色残渣をDMF(600μL)に溶解し、得られた黄色懸濁液をメンブレンフィルターで濾過した。メンブレンフィルターをさらなるDMF 200μLで洗浄し、合わせた濾液を、RP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、水(1%AcOH)中30%→90%MeCN(1%AcOH))を介して直接精製した。所望の生成物346が褐色油(41.5mg、114μmol、収率66%)として得られた。LCMS (ESI+) C17H24N3O6 + (M+H+)の計算値366.17. 実測値366.27.
102(54.7mg、1.00当量、173μmol)及び345(トリグリシン、28.8mg、0.878当量、152μmol)を含有するエッペンドルフバイアルに、脱水DMF(250μL)及びトリエチルアミン(52.7mg、72.5μL、3当量、520μmol)を添加した。得られた黄色懸濁液を室温で21時間攪拌し、引き続いてH2O 50μLを反応混合物に添加した。反応混合物を室温でさらに1日攪拌し、さらなるH2O(200μL)を添加し、反応混合物を室温でさらに3日間攪拌した。次に、MeCN(およそ0.5mL)及びさらなるEt3N(およそ10滴)を添加し、得られた懸濁液を室温で1時間攪拌した後、真空中で濃縮した。黄色残渣をDMF(600μL)に溶解し、得られた黄色懸濁液をメンブレンフィルターで濾過した。メンブレンフィルターをさらなるDMF 200μLで洗浄し、合わせた濾液を、RP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、水(1%AcOH)中30%→90%MeCN(1%AcOH))を介して直接精製した。所望の生成物346が褐色油(41.5mg、114μmol、収率66%)として得られた。LCMS (ESI+) C17H24N3O6 + (M+H+)の計算値366.17. 実測値366.27.
実施例82.347の合成
346(21.6mg、0.056mmol)の無水DMF(0.3mL)中溶液に、DIPEA(30μL、0.171mmol)及びHATU(21.6mg、0.056mmol)を添加した。室温で10分間攪拌した後、DCM(310μL)に溶解した320(7.37mg、0.031mmol)を添加した。室温で24時間攪拌した後、混合物をRP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、H2O中30%→100%MeCN(共に1%AcOHを含有する))によって精製した。生成物347が灰白色油(5.2mg、0.005mmol、20%)として得られた。LCMS (ESI+) C43H64N9O14 + (M+H+)の計算値931.02 実測値931.68.
346(21.6mg、0.056mmol)の無水DMF(0.3mL)中溶液に、DIPEA(30μL、0.171mmol)及びHATU(21.6mg、0.056mmol)を添加した。室温で10分間攪拌した後、DCM(310μL)に溶解した320(7.37mg、0.031mmol)を添加した。室温で24時間攪拌した後、混合物をRP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、H2O中30%→100%MeCN(共に1%AcOHを含有する))によって精製した。生成物347が灰白色油(5.2mg、0.005mmol、20%)として得られた。LCMS (ESI+) C43H64N9O14 + (M+H+)の計算値931.02 実測値931.68.
実施例83.311(LD13)の合成
347(5.2mg、0.0056mmol)の無水DMF(200μL)中溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(1.9mg、0.006mmol)及びEt3N(2.4μL、0.016mmol)を添加した。室温で27時間攪拌した後、vc-PABC-MMAE.TFAのストック溶液(Levena Bioscience)(66μL、6.6mg、0.0053mmol)及びEt3N(2μL、0.014mmol)を添加した。室温でさらに17時間攪拌した後、粗混合物をDMF(250μL)で希釈し、RP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、H2O中5%→90%MeCN(共に1%AcOHを含有する))によって精製した。生成物311が透明な油(0.6mg、0.28μmol、5%)として得られた。LCMS (ESI+) C102H156N19O27 + (M/2+H+)の計算値1040.71 実測値1040.85.
347(5.2mg、0.0056mmol)の無水DMF(200μL)中溶液に、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(1.9mg、0.006mmol)及びEt3N(2.4μL、0.016mmol)を添加した。室温で27時間攪拌した後、vc-PABC-MMAE.TFAのストック溶液(Levena Bioscience)(66μL、6.6mg、0.0053mmol)及びEt3N(2μL、0.014mmol)を添加した。室温でさらに17時間攪拌した後、粗混合物をDMF(250μL)で希釈し、RP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、H2O中5%→90%MeCN(共に1%AcOHを含有する))によって精製した。生成物311が透明な油(0.6mg、0.28μmol、5%)として得られた。LCMS (ESI+) C102H156N19O27 + (M/2+H+)の計算値1040.71 実測値1040.85.
実施例84.化合物312(LD11)の合成
化合物312(LD11)を、参照により組み込まれる、Verkadeら、Antibodies 2018、7、doi:10.3390/antib7010012によって記載される手順によって調製した。
化合物312(LD11)を、参照により組み込まれる、Verkadeら、Antibodies 2018、7、doi:10.3390/antib7010012によって記載される手順によって調製した。
実施例85.313(LD12)の合成
348(2.7mg、1.1当量、4.9μmol)を含有するバイアルに、DMF(60μL)及びニートなトリエチルアミン(1.9μL、3当量、13μmol)を添加した。次に、HBTUの脱水DMF中溶液(2.0mg、11μL、472ミリモル濃度、1.2当量、5.3μmol)を添加し、混合物を混合した。反応混合物を室温で30分間放置し、引き続いてva-PABC-MMAF.TFA塩(5.2mg、0.13mL、34.31ミリモル濃度、1当量、4.4μmol)を添加した。得られた混合物を混合し、室温で110分間放置し、次いで、RP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、水(1%AcOH)中30%→90%MeCN(1%AcOH))を介して直接精製した。所望の生成物313が無色油(1.8mg、1.1μmol、収率26%)として得られた。LCMS (ESI+) C77H127N12O23 + (M+H+)の計算値1587.91. 実測値1588.05.
348(2.7mg、1.1当量、4.9μmol)を含有するバイアルに、DMF(60μL)及びニートなトリエチルアミン(1.9μL、3当量、13μmol)を添加した。次に、HBTUの脱水DMF中溶液(2.0mg、11μL、472ミリモル濃度、1.2当量、5.3μmol)を添加し、混合物を混合した。反応混合物を室温で30分間放置し、引き続いてva-PABC-MMAF.TFA塩(5.2mg、0.13mL、34.31ミリモル濃度、1当量、4.4μmol)を添加した。得られた混合物を混合し、室温で110分間放置し、次いで、RP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、水(1%AcOH)中30%→90%MeCN(1%AcOH))を介して直接精製した。所望の生成物313が無色油(1.8mg、1.1μmol、収率26%)として得られた。LCMS (ESI+) C77H127N12O23 + (M+H+)の計算値1587.91. 実測値1588.05.
実施例86.350の合成
メチルテトラジン-NHSエステル349(19mg、0.057mmol)のDCM(400μL)中溶液に、DCM(800μL)に溶解したアミノ-PEG11-アミン(47mg、0.086mmol)を添加した。室温で20分間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0→50%MeOH(0.7M NH3))によって精製すると、所望の化合物350がピンク色油(17mg、0.022mmol、39%)として得られた。LCMS (ESI+) C35H61N6O12 + (M+H+)の計算値757.89 実測値757.46.
メチルテトラジン-NHSエステル349(19mg、0.057mmol)のDCM(400μL)中溶液に、DCM(800μL)に溶解したアミノ-PEG11-アミン(47mg、0.086mmol)を添加した。室温で20分間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0→50%MeOH(0.7M NH3))によって精製すると、所望の化合物350がピンク色油(17mg、0.022mmol、39%)として得られた。LCMS (ESI+) C35H61N6O12 + (M+H+)の計算値757.89 実測値757.46.
実施例87.351の合成
151(Fmoc-Gly-Gly-Gly-OH、10mg、0.022mmol)の無水DMF(500μL)中攪拌溶液に、DIPEA(11μL、0.067mmol)及びHATU(8.5mg、0.022mmol)を添加した。10分後、無水DMF(500μL)に溶解した350(17mg、0.022mmol)を添加した。室温で18.5時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0→17%MeOH)によって精製すると、所望の化合物351がピンク色油(26mg、0.022mmol、定量的)として得られた。LCMS (ESI+) C56H83N10O17 +(M+NH4 +)の計算値1168.32 実測値1168.67
151(Fmoc-Gly-Gly-Gly-OH、10mg、0.022mmol)の無水DMF(500μL)中攪拌溶液に、DIPEA(11μL、0.067mmol)及びHATU(8.5mg、0.022mmol)を添加した。10分後、無水DMF(500μL)に溶解した350(17mg、0.022mmol)を添加した。室温で18.5時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0→17%MeOH)によって精製すると、所望の化合物351がピンク色油(26mg、0.022mmol、定量的)として得られた。LCMS (ESI+) C56H83N10O17 +(M+NH4 +)の計算値1168.32 実測値1168.67
実施例88.169の合成
351(26mg、0.022mmol)の無水DMF(500μL)中溶液に、ジエチルアミン(12μL、0.11mmol)を添加した。室温で1.5時間攪拌した後、粗混合物をRP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、H2O中5%→90%MeCN(共に1%酢酸を含有する))によって精製した。生成物169が透明なピンク色油(10.9mg、0.011mmol、53%)として得られた。LCMS (ESI+) C41H70N9O15 + (M+H+)の計算値929.05 実測値929.61.
351(26mg、0.022mmol)の無水DMF(500μL)中溶液に、ジエチルアミン(12μL、0.11mmol)を添加した。室温で1.5時間攪拌した後、粗混合物をRP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、H2O中5%→90%MeCN(共に1%酢酸を含有する))によって精製した。生成物169が透明なピンク色油(10.9mg、0.011mmol、53%)として得られた。LCMS (ESI+) C41H70N9O15 + (M+H+)の計算値929.05 実測値929.61.
実施例89.352の合成
349(メチルテトラジン-NHSエステル、10.3mg、0.031mmol)のDCM(200μL)中溶液に、DCM(200μL)に溶解したアミノ-PEG23-アミン(50mg、0.046mmol)を添加した。室温で50分間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0→60%MeOH(0.7M NH3))によって精製すると、所望の化合物352がピンク色油(17.7mg、0.013mmol、44%)として得られた。LCMS (ESI+) C59H109N6O24 + (M+H+)の計算値1286.52 実測値1286.72.
349(メチルテトラジン-NHSエステル、10.3mg、0.031mmol)のDCM(200μL)中溶液に、DCM(200μL)に溶解したアミノ-PEG23-アミン(50mg、0.046mmol)を添加した。室温で50分間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0→60%MeOH(0.7M NH3))によって精製すると、所望の化合物352がピンク色油(17.7mg、0.013mmol、44%)として得られた。LCMS (ESI+) C59H109N6O24 + (M+H+)の計算値1286.52 実測値1286.72.
実施例90.353の合成
151(5.7mg、0.013mmol)の無水DMF(500μL)中攪拌溶液に、DIPEA(7μL、0.04mmol)及びHATU(5.3mg、0.013mmol)を添加した。10分後、無水DMF(500μL)に溶解した352(17.7mg、0.013mmol)を添加した。室温で6時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0→18%MeOH)によって精製すると、所望の化合物353がピンク色油(21mg、0.012mmol、91%)として得られた。LCMS (ESI+) C80H131N10O29 + (M/2+NH4 +)の計算値857.45 実測値857.08
151(5.7mg、0.013mmol)の無水DMF(500μL)中攪拌溶液に、DIPEA(7μL、0.04mmol)及びHATU(5.3mg、0.013mmol)を添加した。10分後、無水DMF(500μL)に溶解した352(17.7mg、0.013mmol)を添加した。室温で6時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0→18%MeOH)によって精製すると、所望の化合物353がピンク色油(21mg、0.012mmol、91%)として得られた。LCMS (ESI+) C80H131N10O29 + (M/2+NH4 +)の計算値857.45 実測値857.08
実施例91.170の合成
353(21mg、0.012mmol)の無水DMF(500μL)中溶液に、ジエチルアミン(6.7μL、0.06mmol)を添加した。室温で4時間攪拌した後、粗混合物をRP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、H2O中5%→90%MeCN(共に1%酢酸を含有する))によって精製した。生成物170がピンク色油(11.6mg、0.008mmol、66%)として得られた。LCMS (ESI+) C65H118N9O27 + (M+H+)の計算値1457.68 実測値1457.92.
353(21mg、0.012mmol)の無水DMF(500μL)中溶液に、ジエチルアミン(6.7μL、0.06mmol)を添加した。室温で4時間攪拌した後、粗混合物をRP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、H2O中5%→90%MeCN(共に1%酢酸を含有する))によって精製した。生成物170がピンク色油(11.6mg、0.008mmol、66%)として得られた。LCMS (ESI+) C65H118N9O27 + (M+H+)の計算値1457.68 実測値1457.92.
実施例92.356の合成
354(テトラフルオロフェニルアジド-NHSエステル、40mg、0.12mmol)のDCM(1mL)中溶液に、355(Boc-NH-PEG2-NH2、33mg、0.13mmol)及びEt3N(50μL、0.36mmol)を添加した。暗所中室温で30分間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0→7%MeOH)によって精製すると、所望の化合物356が透明な油(47mg、0.10mmol、84%)として得られた。LCMS (ESI+) C18H24F4N5O5 + (M+H+)の計算値466.41 実測値466.23.
354(テトラフルオロフェニルアジド-NHSエステル、40mg、0.12mmol)のDCM(1mL)中溶液に、355(Boc-NH-PEG2-NH2、33mg、0.13mmol)及びEt3N(50μL、0.36mmol)を添加した。暗所中室温で30分間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0→7%MeOH)によって精製すると、所望の化合物356が透明な油(47mg、0.10mmol、84%)として得られた。LCMS (ESI+) C18H24F4N5O5 + (M+H+)の計算値466.41 実測値466.23.
実施例93.357の合成
356(47mg、0.10mmol)のDCM(2mL)中溶液に、ジオキサン中4.0M HCl(300μL)を添加した。暗所中室温で17.5時間攪拌した後、混合物を濃縮すると、357が白色固体として定量的収率(36mg、0.10mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C13H16F4N5O3 + (M+H+)の計算値366.29 実測値366.20.
356(47mg、0.10mmol)のDCM(2mL)中溶液に、ジオキサン中4.0M HCl(300μL)を添加した。暗所中室温で17.5時間攪拌した後、混合物を濃縮すると、357が白色固体として定量的収率(36mg、0.10mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C13H16F4N5O3 + (M+H+)の計算値366.29 実測値366.20.
実施例94.358の合成
151(Fmoc-Gly-Gly-Gly-OH、42mg、0.10mmol)の無水DMF(600μL)中攪拌溶液に、DIPEA(50μL、0.30mmol)及びHATU(39mg、0.10mmol)を添加した。暗所中で15分後、無水DMF(500μL)に溶解した357(36mg、0.10mmol)を添加した。暗所中室温で41時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0→20%MeOH)によって精製すると、所望の化合物358が透明な油(36mg、0.047mmol、47%)として得られた。LCMS (ESI+) C34H35F4N8O8 + (M+H+)の計算値759.68 実測値759.38.
151(Fmoc-Gly-Gly-Gly-OH、42mg、0.10mmol)の無水DMF(600μL)中攪拌溶液に、DIPEA(50μL、0.30mmol)及びHATU(39mg、0.10mmol)を添加した。暗所中で15分後、無水DMF(500μL)に溶解した357(36mg、0.10mmol)を添加した。暗所中室温で41時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0→20%MeOH)によって精製すると、所望の化合物358が透明な油(36mg、0.047mmol、47%)として得られた。LCMS (ESI+) C34H35F4N8O8 + (M+H+)の計算値759.68 実測値759.38.
実施例95.171の合成
358(36mg、0.047mmol)の無水DMF(750μL)中溶液に、ジエチルアミン(24μL、0.24mmol)を添加した。暗所中室温で55分間攪拌した後、粗混合物をRP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、H2O中5%→90%MeCN(共に1%酢酸を含有する))によって精製した。生成物171が透明な油(18.7mg、0.034mmol、74%)として得られた。LCMS (ESI+) C19H25F4N8O6 + (M+H+)の計算値537.45 実測値537.29.
358(36mg、0.047mmol)の無水DMF(750μL)中溶液に、ジエチルアミン(24μL、0.24mmol)を添加した。暗所中室温で55分間攪拌した後、粗混合物をRP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、H2O中5%→90%MeCN(共に1%酢酸を含有する))によって精製した。生成物171が透明な油(18.7mg、0.034mmol、74%)として得られた。LCMS (ESI+) C19H25F4N8O6 + (M+H+)の計算値537.45 実測値537.29.
実施例96.359の合成
102(56mg、0.17mmol)のDCM(8mL)中溶液に、アミノ-PEG24-アルコール(214mg、0.199mmol)及びEt3N(80μL、0.53mmol)を添加した。室温で20時間攪拌した後、溶媒を真空中で減少させ、残渣をフラッシュシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中2→30%MeOH)によって精製すると、所望の化合物359が黄色油として収率95%(210mg、0.168mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C59H111NO26Na+ (M+Na+)の計算値1273.50 実測値1273.07.
102(56mg、0.17mmol)のDCM(8mL)中溶液に、アミノ-PEG24-アルコール(214mg、0.199mmol)及びEt3N(80μL、0.53mmol)を添加した。室温で20時間攪拌した後、溶媒を真空中で減少させ、残渣をフラッシュシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中2→30%MeOH)によって精製すると、所望の化合物359が黄色油として収率95%(210mg、0.168mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C59H111NO26Na+ (M+Na+)の計算値1273.50 実測値1273.07.
実施例97.360の合成
359(170mg、0.136mmol)及び4-ニトロフェニルクロロホルメート(44mg、0.22mmol)のDCM(7mL)中溶液に、Et3N(63μL、0.40mmol)を添加した。室温で41時間攪拌した後、溶媒を減少させ、残渣をフラッシュシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→10%MeOH)によって精製すると、所望の化合物360が透明な油として収率67%(129mg、0.091mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C66H114N2O30Na+ (M+Na+)の計算値1438.59 実測値1438.13.
359(170mg、0.136mmol)及び4-ニトロフェニルクロロホルメート(44mg、0.22mmol)のDCM(7mL)中溶液に、Et3N(63μL、0.40mmol)を添加した。室温で41時間攪拌した後、溶媒を減少させ、残渣をフラッシュシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0→10%MeOH)によって精製すると、所望の化合物360が透明な油として収率67%(129mg、0.091mmol)で得られた。LCMS (ESI+) C66H114N2O30Na+ (M+Na+)の計算値1438.59 実測値1438.13.
実施例98.173の合成
360(16mg、0.011mmol)の無水DMF(800μL)中溶液に、167(ペプチドH-LPETGG-OH、6.5mg、0.011mmol)及びEt3N(5μL、0.04mmol)を添加した。室温で95時間攪拌した後、粗混合物をRP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、H2O中5%→90%MeCN(共に1%酢酸を含有する))によって精製した。生成物173が透明な油(12.6mg、0.0068mmol、62%)として得られた。LCMS (ESI+) C84H153N8O37 + (M/2+NH4 +)の計算値942.55 実測値924.26.
360(16mg、0.011mmol)の無水DMF(800μL)中溶液に、167(ペプチドH-LPETGG-OH、6.5mg、0.011mmol)及びEt3N(5μL、0.04mmol)を添加した。室温で95時間攪拌した後、粗混合物をRP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、H2O中5%→90%MeCN(共に1%酢酸を含有する))によって精製した。生成物173が透明な油(12.6mg、0.0068mmol、62%)として得られた。LCMS (ESI+) C84H153N8O37 + (M/2+NH4 +)の計算値942.55 実測値924.26.
実施例99.174の合成
361(メチルテトラジン-PEG5-NHSエステル、6.1mg、0.011mmol)の無水DMF(230μL)中溶液に、ペプチドH-LPETGG-OH(6.5mg、0.011mmol)及びEt3N(4μL、0.028mmol)を添加した。室温で22時間攪拌した後、粗混合物をRP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、H2O中5%→90%MeCN(共に1%酢酸を含有する))によって精製した。生成物174が透明なピンク色油(9.9mg、0.01mmol、91%)として得られた。LCMS (ESI+) C44H70N11O16 + (M+NH4 +)の計算値1009.09 実測値1009.61.
361(メチルテトラジン-PEG5-NHSエステル、6.1mg、0.011mmol)の無水DMF(230μL)中溶液に、ペプチドH-LPETGG-OH(6.5mg、0.011mmol)及びEt3N(4μL、0.028mmol)を添加した。室温で22時間攪拌した後、粗混合物をRP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、H2O中5%→90%MeCN(共に1%酢酸を含有する))によって精製した。生成物174が透明なピンク色油(9.9mg、0.01mmol、91%)として得られた。LCMS (ESI+) C44H70N11O16 + (M+NH4 +)の計算値1009.09 実測値1009.61.
実施例100.362の合成
354(31mg、0.093mmol)のDCM(1mL)中溶液に、181(56mg、0.10mmol)及びEt3N(40μL、0.28mmol)を添加した。暗所中室温で25分間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0→15%MeOH)によって精製すると、所望の化合物362が透明な油(55mg、0.072mmol、77%)として得られた。LCMS (ESI+) C31H51F4N4O13 + (M+H+)の計算値763.75 実測値763.08.
354(31mg、0.093mmol)のDCM(1mL)中溶液に、181(56mg、0.10mmol)及びEt3N(40μL、0.28mmol)を添加した。暗所中室温で25分間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0→15%MeOH)によって精製すると、所望の化合物362が透明な油(55mg、0.072mmol、77%)として得られた。LCMS (ESI+) C31H51F4N4O13 + (M+H+)の計算値763.75 実測値763.08.
実施例101.363の合成
362(55mg、0.072mmol)のDCM(2mL)中溶液に、4-ニトロフェニルクロロホルメート(13mg、0.064mmol)及びEt3N(30μL、0.21mmol)を添加した。暗所中室温で21時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、RP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、水(1%AcOH)中5%→90%MeCN(1%AcOH))によって精製した。生成物363が黄色油(13.3mg、0.014mmol、20%)として得られた。LCMS (ESI+) C38H54F4N5O17 + (M+H+)の計算値928.85 実測値928.57.
362(55mg、0.072mmol)のDCM(2mL)中溶液に、4-ニトロフェニルクロロホルメート(13mg、0.064mmol)及びEt3N(30μL、0.21mmol)を添加した。暗所中室温で21時間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、RP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、水(1%AcOH)中5%→90%MeCN(1%AcOH))によって精製した。生成物363が黄色油(13.3mg、0.014mmol、20%)として得られた。LCMS (ESI+) C38H54F4N5O17 + (M+H+)の計算値928.85 実測値928.57.
実施例102.175の合成
363(13.3mg、0.014mmol)の無水DMF(300μL)中溶液に、167(ペプチドH-LPETGG-OH、8.2mg、0.014mmol)及びEt3N(6μL、0.043mmol)を添加した。暗所中で26時間後、粗混合物をRP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、H2O中5%→90%MeCN(共に1%酢酸を含有する))によって精製した。生成物175が透明な油(11.4mg、0.0084mmol、59%)として得られた。LCMS (ESI+) C56H89F4N10O24 + (M+H+)の計算値1362.35 実測値1362.81.
363(13.3mg、0.014mmol)の無水DMF(300μL)中溶液に、167(ペプチドH-LPETGG-OH、8.2mg、0.014mmol)及びEt3N(6μL、0.043mmol)を添加した。暗所中で26時間後、粗混合物をRP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、H2O中5%→90%MeCN(共に1%酢酸を含有する))によって精製した。生成物175が透明な油(11.4mg、0.0084mmol、59%)として得られた。LCMS (ESI+) C56H89F4N10O24 + (M+H+)の計算値1362.35 実測値1362.81.
実施例103.365の合成
151(Fmoc-Gly-Gly-Gly-OH、20mg、0.049mmol)の無水DMF(350μL)中攪拌溶液に、DIPEA(25μL、0.15mmol)及びHATU(18mg、0.049mmol)を添加した。10分後、無水に溶解した化合物364(N-Boc-エチレンジアミン、7.8mg、0.049mmol)を添加した。室温で45分間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0→30%MeOH)によって精製すると、所望の化合物365が透明な油(12.4mg、0.022mmol、46%)として得られた。LCMS (ESI+) C28H36N5O7 + (M+H+)の計算値554.61 実測値554.46.
151(Fmoc-Gly-Gly-Gly-OH、20mg、0.049mmol)の無水DMF(350μL)中攪拌溶液に、DIPEA(25μL、0.15mmol)及びHATU(18mg、0.049mmol)を添加した。10分後、無水に溶解した化合物364(N-Boc-エチレンジアミン、7.8mg、0.049mmol)を添加した。室温で45分間攪拌した後、混合物を真空中で濃縮し、シリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0→30%MeOH)によって精製すると、所望の化合物365が透明な油(12.4mg、0.022mmol、46%)として得られた。LCMS (ESI+) C28H36N5O7 + (M+H+)の計算値554.61 実測値554.46.
実施例104.366の合成
365(12.4mg、0.022mmol)のDCM(0.7mL)中攪拌溶液に、ジオキサン中4.0M HCl(400μL)を添加した。室温で1時間攪拌した後、混合物を濃縮すると、366が白色固体(11mg、0.022mmol、定量的)として得られた。LCMS (ESI+) C23H28N5O7+ (M+H+)の計算値545.50 実測値454.33
365(12.4mg、0.022mmol)のDCM(0.7mL)中攪拌溶液に、ジオキサン中4.0M HCl(400μL)を添加した。室温で1時間攪拌した後、混合物を濃縮すると、366が白色固体(11mg、0.022mmol、定量的)として得られた。LCMS (ESI+) C23H28N5O7+ (M+H+)の計算値545.50 実測値454.33
実施例105.176の合成
191(8mg、0.0059mmol)の無水DMF(300μL)中溶液に、Et3N(2.5μL、0.017mmol)及び366の無水DMF中ストック(110μL、3.0mg、0.0059mmol)を添加した。室温で18時間攪拌した後、ジエチルアミン(2μL)を添加した。さらに2時間後、混合物をRP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、H2O中5%→90%MeCN(共に1%酢酸を含有する))によって精製した。生成物176が透明な油(1.3mg、0.0009mmol、15%)として得られた。LCMS (ESI+) C60H103N10O26S2 + (M+H+)の計算値1444.64 実測値1444.75.
191(8mg、0.0059mmol)の無水DMF(300μL)中溶液に、Et3N(2.5μL、0.017mmol)及び366の無水DMF中ストック(110μL、3.0mg、0.0059mmol)を添加した。室温で18時間攪拌した後、ジエチルアミン(2μL)を添加した。さらに2時間後、混合物をRP HPLC(カラムXbridge prep C18 5μm OBD、30×100mm、H2O中5%→90%MeCN(共に1%酢酸を含有する))によって精製した。生成物176が透明な油(1.3mg、0.0009mmol、15%)として得られた。LCMS (ESI+) C60H103N10O26S2 + (M+H+)の計算値1444.64 実測値1444.75.
実施例106.抗4-1BB PF31
抗4-1BB scFvを、C末端ソルターゼA認識配列、引き続いてHisタグ(アミノ酸配列は配列番号4によって識別される)を用いて設計した。抗4-1BB scFvをHEK293細胞で一過的に発現させ、引き続いてAbsolute Antibody Ltd(英国、オックスフォード)によるIMAC精製を行った。質量スペクトル分析は、1つの主生成物(実測質量28013Da、予測質量28018Da)を示した。
抗4-1BB scFvを、C末端ソルターゼA認識配列、引き続いてHisタグ(アミノ酸配列は配列番号4によって識別される)を用いて設計した。抗4-1BB scFvをHEK293細胞で一過的に発現させ、引き続いてAbsolute Antibody Ltd(英国、オックスフォード)によるIMAC精製を行った。質量スペクトル分析は、1つの主生成物(実測質量28013Da、予測質量28018Da)を示した。
実施例107.SYR-(G4S)3-IL15(PF18)のpET32a発現ベクターへのクローニング
SYR-(G4S)3-IL15(PF18)(アミノ酸配列は配列番号5によって識別される)を、N末端(M)SYR配列を用いて設計し、メチオニンを発現後に切断してN末端セリン、及びSYR配列とIL15との間のフレキシブル(G4S)3スペーサーを残す。コドン最適化DNA配列を、pET32A発現ベクターのNdeIとXhoIとの間に挿入し、それによって、チオレドキシン融合タンパク質をコードする配列を除去し、米国ピスカタウェイのGenscriptから入手した。
SYR-(G4S)3-IL15(PF18)(アミノ酸配列は配列番号5によって識別される)を、N末端(M)SYR配列を用いて設計し、メチオニンを発現後に切断してN末端セリン、及びSYR配列とIL15との間のフレキシブル(G4S)3スペーサーを残す。コドン最適化DNA配列を、pET32A発現ベクターのNdeIとXhoIとの間に挿入し、それによって、チオレドキシン融合タンパク質をコードする配列を除去し、米国ピスカタウェイのGenscriptから入手した。
実施例108.SYR-(G4S)3-IL15(PF18)の大腸菌(E.coli)発現及び封入体単離
SYR-(G4S)3-IL15(PF18)の発現は、プラスミド(pET32a-SYR-(G4S)3-IL15)のBL21細胞(Novagen)への形質転換により開始する。形質転換細胞を、アンピシリンを含むLB寒天上に蒔き、37℃で一晩インキュベートした。単一コロニーを摘み取り、これを使用して50mLのTB培地+アンピシリンに接種し、引き続いて37℃で一晩インキュベートした。次に、一晩培養物を使用して1000mLのTB培地+アンピシリンに接種した。培養物を160RPMにおいて37℃でインキュベートし、OD600が1.5に達したら、1mM IPTG(1mLの1Mストック溶液)で誘導した。160RPMにおいて37℃で16時間超の誘導後、培養物を遠心分離(5000×g-5分間)によってペレット化した。1000mL培養物から得た細胞ペレットを、1500ユニットのBenzonaseを含む60mLのバグバスター(BugBuster)(商標)に溶解し、ローラーバンク上室温で30分間インキュベートした。溶解後、不溶性画分を遠心分離(15分間、15000×g)によって可溶性画分から分離した。不溶性画分の半分を、リゾチーム(最終濃度:200μg/mL)を含む30mLのバグバスター(商標)に溶解し、ローラーバンク上で10分間インキュベートした。次に、溶液を6倍体積の1:10希釈バグバスター(商標)で希釈し、15分間、15000×gで遠心分離した。ペレットを200mLの1:10希釈バグバスター(商標)にホモジナイザーを使用することによって再懸濁し、10分間、12000×gで遠心分離した。最後のステップを3回繰り返した。
SYR-(G4S)3-IL15(PF18)の発現は、プラスミド(pET32a-SYR-(G4S)3-IL15)のBL21細胞(Novagen)への形質転換により開始する。形質転換細胞を、アンピシリンを含むLB寒天上に蒔き、37℃で一晩インキュベートした。単一コロニーを摘み取り、これを使用して50mLのTB培地+アンピシリンに接種し、引き続いて37℃で一晩インキュベートした。次に、一晩培養物を使用して1000mLのTB培地+アンピシリンに接種した。培養物を160RPMにおいて37℃でインキュベートし、OD600が1.5に達したら、1mM IPTG(1mLの1Mストック溶液)で誘導した。160RPMにおいて37℃で16時間超の誘導後、培養物を遠心分離(5000×g-5分間)によってペレット化した。1000mL培養物から得た細胞ペレットを、1500ユニットのBenzonaseを含む60mLのバグバスター(BugBuster)(商標)に溶解し、ローラーバンク上室温で30分間インキュベートした。溶解後、不溶性画分を遠心分離(15分間、15000×g)によって可溶性画分から分離した。不溶性画分の半分を、リゾチーム(最終濃度:200μg/mL)を含む30mLのバグバスター(商標)に溶解し、ローラーバンク上で10分間インキュベートした。次に、溶液を6倍体積の1:10希釈バグバスター(商標)で希釈し、15分間、15000×gで遠心分離した。ペレットを200mLの1:10希釈バグバスター(商標)にホモジナイザーを使用することによって再懸濁し、10分間、12000×gで遠心分離した。最後のステップを3回繰り返した。
実施例109.単離した封入体からのSYR-(G4S)3-IL15(PF18)のリフォールディング
SYR-(G4S)3-IL15(PF18)を含有する精製した封入体を、40mMシステアミン及び20mM Tris pH8.0を含む30mLの5Mグアニジンに溶解し、変性させた。懸濁液を16.000×gで5分間遠心分離して、残っている細胞片をペレット化した。上清を、40mMシステアミン及び20mM Tris pH8.0を含む5Mグアニジンで1mg/mLに希釈し、ローラーバンク上室温で2時間インキュベートした。1mg/mL溶液を、4℃の低温室中、10倍体積のリフォールディング緩衝液(50mM Tris、10.53mM NaCl、0.44mM KCl、2.2mM MgCl2、2.2mM CaCl2、0.055%PEG-4000、0.55M L-アルギニン、4mMシステアミン、4mMシスタミン、pH8.0)に滴加する(攪拌を要する)。溶液を4℃で少なくとも24時間放置する。スペクトラム(Spectrum)(商標)スペクトラ/ポア(Spectra/Por)(商標)3 RC Dialysis Membrane Tubing 3500ダルトンMWCOを使用して、溶液を10mM NaCl及び20mM Tris pH8.0に1×一晩及び2×4時間透析する。リフォールディングしたSYR-(G4S)3-IL15(PF18)を、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上で平衡化Qトラップ陰イオン交換カラム(GE health care)に充填した。カラムを最初に緩衝液A(20mM Tris、10mM NaCl、pH8.0)で洗浄した。保持されたタンパク質を緩衝液B(20mM Tris緩衝液、1M NaCl、pH8.0)で、緩衝液Aから緩衝液Bまでの30mLの勾配で溶出した。質量分析は、PF18に対応する14122Daの重量(予測質量:14122Da)を示した。AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上ハイプレップ(HiPrep)(商標)26/10脱塩カラム(Cytiva)を使用して、精製したSYR-(G4S)3-IL15(PF18)をPBSに緩衝液交換した。
SYR-(G4S)3-IL15(PF18)を含有する精製した封入体を、40mMシステアミン及び20mM Tris pH8.0を含む30mLの5Mグアニジンに溶解し、変性させた。懸濁液を16.000×gで5分間遠心分離して、残っている細胞片をペレット化した。上清を、40mMシステアミン及び20mM Tris pH8.0を含む5Mグアニジンで1mg/mLに希釈し、ローラーバンク上室温で2時間インキュベートした。1mg/mL溶液を、4℃の低温室中、10倍体積のリフォールディング緩衝液(50mM Tris、10.53mM NaCl、0.44mM KCl、2.2mM MgCl2、2.2mM CaCl2、0.055%PEG-4000、0.55M L-アルギニン、4mMシステアミン、4mMシスタミン、pH8.0)に滴加する(攪拌を要する)。溶液を4℃で少なくとも24時間放置する。スペクトラム(Spectrum)(商標)スペクトラ/ポア(Spectra/Por)(商標)3 RC Dialysis Membrane Tubing 3500ダルトンMWCOを使用して、溶液を10mM NaCl及び20mM Tris pH8.0に1×一晩及び2×4時間透析する。リフォールディングしたSYR-(G4S)3-IL15(PF18)を、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上で平衡化Qトラップ陰イオン交換カラム(GE health care)に充填した。カラムを最初に緩衝液A(20mM Tris、10mM NaCl、pH8.0)で洗浄した。保持されたタンパク質を緩衝液B(20mM Tris緩衝液、1M NaCl、pH8.0)で、緩衝液Aから緩衝液Bまでの30mLの勾配で溶出した。質量分析は、PF18に対応する14122Daの重量(予測質量:14122Da)を示した。AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上ハイプレップ(HiPrep)(商標)26/10脱塩カラム(Cytiva)を使用して、精製したSYR-(G4S)3-IL15(PF18)をPBSに緩衝液交換した。
実施例110.SYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15(PF26)のpET32a発現ベクターへのクローニング
SYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15(PF26)(アミノ酸配列は配列番号6によって識別される)を、N末端(M)SYR配列を用いて設計し、メチオニンを発現後に切断してN末端セリン、及びSYR配列とIL15Ra-リンカー-IL15との間のフレキシブル(G4S)3スペーサーを残す。コドン最適化DNA配列を、pET32A発現ベクターのNdeIとXhoIとの間に挿入し、それによって、チオレドキシン融合タンパク質をコードする配列を除去し、米国ピスカタウェイのGenscriptから入手した。
SYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15(PF26)(アミノ酸配列は配列番号6によって識別される)を、N末端(M)SYR配列を用いて設計し、メチオニンを発現後に切断してN末端セリン、及びSYR配列とIL15Ra-リンカー-IL15との間のフレキシブル(G4S)3スペーサーを残す。コドン最適化DNA配列を、pET32A発現ベクターのNdeIとXhoIとの間に挿入し、それによって、チオレドキシン融合タンパク質をコードする配列を除去し、米国ピスカタウェイのGenscriptから入手した。
実施例111.SYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15(PF26)の大腸菌発現及び封入体単離
SYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15(PF26)の発現は、プラスミド(pET32a-SYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15)のBL21細胞(Novagen)への形質転換により開始する。次のステップは、BL21細胞での1000mLの培養物(TB培地+アンピシリン)への接種であった。OD600が1.5に達したら、培養物を1mM IPTG(1mLの1Mストック溶液)で誘導した。160RPMにおいて37℃で16時間超の誘導後、培養物を遠心分離(5000×g-5分間)によってペレット化した。1000mL培養物から得た細胞ペレットを、1500ユニットのBenzonaseを含む60mLのバグバスター(商標)に溶解し、ローラーバンク上室温で30分間インキュベートした。溶解後、不溶性画分を遠心分離(15分間、15000×g)によって可溶性画分から分離した。不溶性画分の半分を、リゾチーム(最終濃度:200μg/mL)を含む30mLのバグバスター(商標)に溶解し、ローラーバンク上で10分間インキュベートした。次に、溶液を6倍体積の1:10希釈バグバスター(商標)で希釈し、15分間、15000×gで遠心分離した。ペレットを200mLの1:10希釈バグバスター(商標)にホモジナイザーを使用することによって再懸濁し、10分間、12000×gで遠心分離した。最後のステップを3回繰り返した。
SYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15(PF26)の発現は、プラスミド(pET32a-SYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15)のBL21細胞(Novagen)への形質転換により開始する。次のステップは、BL21細胞での1000mLの培養物(TB培地+アンピシリン)への接種であった。OD600が1.5に達したら、培養物を1mM IPTG(1mLの1Mストック溶液)で誘導した。160RPMにおいて37℃で16時間超の誘導後、培養物を遠心分離(5000×g-5分間)によってペレット化した。1000mL培養物から得た細胞ペレットを、1500ユニットのBenzonaseを含む60mLのバグバスター(商標)に溶解し、ローラーバンク上室温で30分間インキュベートした。溶解後、不溶性画分を遠心分離(15分間、15000×g)によって可溶性画分から分離した。不溶性画分の半分を、リゾチーム(最終濃度:200μg/mL)を含む30mLのバグバスター(商標)に溶解し、ローラーバンク上で10分間インキュベートした。次に、溶液を6倍体積の1:10希釈バグバスター(商標)で希釈し、15分間、15000×gで遠心分離した。ペレットを200mLの1:10希釈バグバスター(商標)にホモジナイザーを使用することによって再懸濁し、10分間、12000×gで遠心分離した。最後のステップを3回繰り返した。
実施例112.単離した封入体からのSYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15(PF26)のリフォールディング
SYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15(PF26)を含有する精製した封入体を、40mMシステアミン及び20mM Tris pH8.0を含む30mLの5Mグアニジンに溶解し、変性させた。懸濁液を16.000×gで5分間遠心分離して、残っている細胞片をペレット化した。上清を、40mMシステアミン及び20mM Tris pH8.0を含む5Mグアニジンで1mg/mLに希釈し、ローラーバンク上室温で2時間インキュベートした。1mg/mL溶液を、4℃の低温室中、10倍体積のリフォールディング緩衝液(50mM Tris、10.53mM NaCl、0.44mM KCl、2.2mM MgCl2、2.2mM CaCl2、0.055%PEG-4000、0.55M L-アルギニン、4mMシステアミン、4mMシスタミン、pH8.0)に滴加する(攪拌を要する)。溶液を4℃で少なくとも24時間放置する。スペクトラム(商標)スペクトラ/ポア(商標)3 RC Dialysis Membrane Tubing 3500ダルトンMWCOを使用して、溶液を10mM NaCl及び20mM Tris pH8.0に1×一晩及び2×4時間透析する。リフォールディングしたSYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15(PF26)を、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上で平衡化Qトラップ陰イオン交換カラム(GE health care)に充填した。カラムを最初に緩衝液A(20mM Tris、10mM NaCl、pH8.0)で洗浄した。保持されたタンパク質を緩衝液B(20mM Tris緩衝液、1M NaCl、pH8.0)で、緩衝液Aから緩衝液Bまでの30mLの勾配で溶出した。質量分析は、PF26に対応する24146Daの重量(予測質量:24146Da)を示した。AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上ハイプレップ(商標)26/10脱塩カラム(cytiva製)を使用して、精製したSYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15(PF26)をPBSに緩衝液交換した。
SYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15(PF26)を含有する精製した封入体を、40mMシステアミン及び20mM Tris pH8.0を含む30mLの5Mグアニジンに溶解し、変性させた。懸濁液を16.000×gで5分間遠心分離して、残っている細胞片をペレット化した。上清を、40mMシステアミン及び20mM Tris pH8.0を含む5Mグアニジンで1mg/mLに希釈し、ローラーバンク上室温で2時間インキュベートした。1mg/mL溶液を、4℃の低温室中、10倍体積のリフォールディング緩衝液(50mM Tris、10.53mM NaCl、0.44mM KCl、2.2mM MgCl2、2.2mM CaCl2、0.055%PEG-4000、0.55M L-アルギニン、4mMシステアミン、4mMシスタミン、pH8.0)に滴加する(攪拌を要する)。溶液を4℃で少なくとも24時間放置する。スペクトラム(商標)スペクトラ/ポア(商標)3 RC Dialysis Membrane Tubing 3500ダルトンMWCOを使用して、溶液を10mM NaCl及び20mM Tris pH8.0に1×一晩及び2×4時間透析する。リフォールディングしたSYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15(PF26)を、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上で平衡化Qトラップ陰イオン交換カラム(GE health care)に充填した。カラムを最初に緩衝液A(20mM Tris、10mM NaCl、pH8.0)で洗浄した。保持されたタンパク質を緩衝液B(20mM Tris緩衝液、1M NaCl、pH8.0)で、緩衝液Aから緩衝液Bまでの30mLの勾配で溶出した。質量分析は、PF26に対応する24146Daの重量(予測質量:24146Da)を示した。AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上ハイプレップ(商標)26/10脱塩カラム(cytiva製)を使用して、精製したSYR-(G4S)3-IL15Ra-リンカー-IL15(PF26)をPBSに緩衝液交換した。
実施例113.ヒト化OKT3 200
C末端ソルターゼA認識配列(C末端タグは配列番号1によって識別される)を有するヒト化OKT3(hOKT3)をAbsolute Antibody Ltd(英国、オックスフォード)から入手した。質量スペクトル分析は、1つの主生成物(実測質量28836Da)を示した。
C末端ソルターゼA認識配列(C末端タグは配列番号1によって識別される)を有するヒト化OKT3(hOKT3)をAbsolute Antibody Ltd(英国、オックスフォード)から入手した。質量スペクトル分析は、1つの主生成物(実測質量28836Da)を示した。
実施例114.hOKT3-PEG2-BCN 201を得るためのソルターゼAを使用した化合物GGG-PEG2-BCN(157)のhOKT3 200へのC末端ソルタギング
ソルターゼA(配列番号2によって識別される)を使用したC末端ソルタギングによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。hOKT3 200の溶液(500μL、500μg、PBS pH7.4中35μM)に、ソルターゼA(58μL、384μg、TBS pH7.5中302μM+10%グリセロール)、GGG-PEG2-BCN(157、28μL、DMSO中50mM)、CaCl2(69μL、MQ中100mM)及びTBS pH7.5(39μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートし、引き続いてAKTA Explorer-100(GE Healthcare)上His-trap excel 1mLカラム(GE Healthcare)で精製した。カラムを緩衝液A(20mM Tris、200mM NaCl、20mMイミダゾール、pH7.5)と平衡化し、試料を1mL/分で充填した。フロースルーを回収すると、質量スペクトル分析は、201に対応する1つの主生成物(実測質量27829Da)を示した。試料をPBS pH7.4に対して透析し、スピンフィルトレーション(spinfiltration)(Amicon Ultra-0.5、Ultracel-10 Membrane、Millipore)によって濃縮すると、hOKT3-PEG2-BCN 201(60μL、169μg、PBS pH7.4中101μM)が得られた。
ソルターゼA(配列番号2によって識別される)を使用したC末端ソルタギングによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。hOKT3 200の溶液(500μL、500μg、PBS pH7.4中35μM)に、ソルターゼA(58μL、384μg、TBS pH7.5中302μM+10%グリセロール)、GGG-PEG2-BCN(157、28μL、DMSO中50mM)、CaCl2(69μL、MQ中100mM)及びTBS pH7.5(39μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートし、引き続いてAKTA Explorer-100(GE Healthcare)上His-trap excel 1mLカラム(GE Healthcare)で精製した。カラムを緩衝液A(20mM Tris、200mM NaCl、20mMイミダゾール、pH7.5)と平衡化し、試料を1mL/分で充填した。フロースルーを回収すると、質量スペクトル分析は、201に対応する1つの主生成物(実測質量27829Da)を示した。試料をPBS pH7.4に対して透析し、スピンフィルトレーション(spinfiltration)(Amicon Ultra-0.5、Ultracel-10 Membrane、Millipore)によって濃縮すると、hOKT3-PEG2-BCN 201(60μL、169μg、PBS pH7.4中101μM)が得られた。
実施例115.hOKT3-PEG2-BCN 201を得るためのソルターゼA ペンタ変異体(pentamutant)を使用した化合物GGG-PEG2-BCN(157)のhOKT3 200へのC末端ソルタギング
ソルターゼAペンタ変異体(BPS Bioscience、カタログ番号71046)を使用したC末端ソルタギングによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。hOKT3 200の溶液(14.3μL、14μg、PBS pH7.4中35μM)に、ソルターゼAペンタ変異体(0.5μL、1μg、40mM Tris pH8.0中92μM、110mM NaCl、2.2mM KCl、400mMイミダゾール及び20%グリセロール)、GGG-PEG2-BCN(157、2μL、DMSO:MQ=2:3中20mM)、CaCl2(2μL、MQ中100mM)及びTBS pH7.5(1.2μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、hOKT3-PEG2-BCN 201に対応する1つの主生成物(実測質量27829Da)を示した。
ソルターゼAペンタ変異体(BPS Bioscience、カタログ番号71046)を使用したC末端ソルタギングによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。hOKT3 200の溶液(14.3μL、14μg、PBS pH7.4中35μM)に、ソルターゼAペンタ変異体(0.5μL、1μg、40mM Tris pH8.0中92μM、110mM NaCl、2.2mM KCl、400mMイミダゾール及び20%グリセロール)、GGG-PEG2-BCN(157、2μL、DMSO:MQ=2:3中20mM)、CaCl2(2μL、MQ中100mM)及びTBS pH7.5(1.2μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、hOKT3-PEG2-BCN 201に対応する1つの主生成物(実測質量27829Da)を示した。
実施例116.hOKT3-PEG11-BCN 202を得るためのソルターゼAを使用した化合物GGG-PEG11-BCN(161)のhOKT3 200へのC末端ソルタギング
ソルターゼA(配列番号2によって識別される)を使用したC末端ソルタギングによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。hOKT3 200の溶液(14.3μL、14μg、PBS pH7.4中35μM)に、ソルターゼA(0.9μL、12μg、TBS pH7.5中582μM+10%グリセロール)、GGG-PEG11-BCN(161、2μL、MQ中20mM)、CaCl2(2μL、MQ中100mM)及びTBS pH7.5(0.9μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、ソルターゼAに対応する1つの主生成物(実測質量21951Da、およそ85%)、hOKT3-PEG11-BCN 202に対応する少量生成物(実測質量28227Da、およそ5%)、及び2つの他の少量生成物(実測質量28051Da及び28325Da、それぞれおよそ5%)を示した。
ソルターゼA(配列番号2によって識別される)を使用したC末端ソルタギングによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。hOKT3 200の溶液(14.3μL、14μg、PBS pH7.4中35μM)に、ソルターゼA(0.9μL、12μg、TBS pH7.5中582μM+10%グリセロール)、GGG-PEG11-BCN(161、2μL、MQ中20mM)、CaCl2(2μL、MQ中100mM)及びTBS pH7.5(0.9μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、ソルターゼAに対応する1つの主生成物(実測質量21951Da、およそ85%)、hOKT3-PEG11-BCN 202に対応する少量生成物(実測質量28227Da、およそ5%)、及び2つの他の少量生成物(実測質量28051Da及び28325Da、それぞれおよそ5%)を示した。
実施例117.hOKT3-PEG11-BCN 202を得るためのソルターゼAペンタ変異体を使用した化合物GGG-PEG11-BCN(161)のhOKT3 200へのC末端ソルタギング
ソルターゼAペンタ変異体(BPS Bioscience、カタログ番号71046)を使用したC末端ソルタギングによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。hOKT3 200の溶液(14.3μL、14μg、PBS pH7.4中35μM)に、ソルターゼAペンタ変異体(0.5μL、1μg、40mM Tris pH8.0中92μM、110mM NaCl、2.2mM KCl、400mMイミダゾール及び20%グリセロール)、GGG-PEG11-BCN(161、2μL、MQ中20mM)、CaCl2(2μL、MQ中100mM)及びTBS pH7.5(1.2μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、hOKT3-PEG11-BCN 202に対応する1つの主生成物(実測質量28225Da、およそ60%)、及び1つの少量生成物(実測質量28326Da、およそ40%)を示した。
ソルターゼAペンタ変異体(BPS Bioscience、カタログ番号71046)を使用したC末端ソルタギングによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。hOKT3 200の溶液(14.3μL、14μg、PBS pH7.4中35μM)に、ソルターゼAペンタ変異体(0.5μL、1μg、40mM Tris pH8.0中92μM、110mM NaCl、2.2mM KCl、400mMイミダゾール及び20%グリセロール)、GGG-PEG11-BCN(161、2μL、MQ中20mM)、CaCl2(2μL、MQ中100mM)及びTBS pH7.5(1.2μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、hOKT3-PEG11-BCN 202に対応する1つの主生成物(実測質量28225Da、およそ60%)、及び1つの少量生成物(実測質量28326Da、およそ40%)を示した。
実施例118.hOKT3-PEG23-BCN 203を得るためのソルターゼAを使用した化合物GGG-PEG23-BCN(163)のhOKT3 200へのC末端ソルタギング
ソルターゼA(配列番号2によって識別される)を使用したC末端ソルタギングによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。hOKT3 200の溶液(14.3μL、14μg、PBS pH7.4中35μM)に、ソルターゼA(0.9μL、12μg、TBS pH7.5中582μM+10%グリセロール)、GGG-PEG23-BCN(163、2μL、MQ中20mM)、CaCl2(2μL、MQ中100mM)及びTBS pH7.5(0.9μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、ソルターゼAに対応する1つの主生成物(実測質量21951Da、およそ70%)、及びhOKT3-PEG23-BCN 203に対応する1つの少量生成物(実測質量28755Da、およそ30%)を示した。
ソルターゼA(配列番号2によって識別される)を使用したC末端ソルタギングによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。hOKT3 200の溶液(14.3μL、14μg、PBS pH7.4中35μM)に、ソルターゼA(0.9μL、12μg、TBS pH7.5中582μM+10%グリセロール)、GGG-PEG23-BCN(163、2μL、MQ中20mM)、CaCl2(2μL、MQ中100mM)及びTBS pH7.5(0.9μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、ソルターゼAに対応する1つの主生成物(実測質量21951Da、およそ70%)、及びhOKT3-PEG23-BCN 203に対応する1つの少量生成物(実測質量28755Da、およそ30%)を示した。
実施例119.hOKT3-PEG23-BCN 203を得るためのソルターゼAペンタ変異体を使用した化合物GGG-PEG23-BCN(163)のhOKT3 200へのC末端ソルタギング
ソルターゼAペンタ変異体(BPS Bioscience、カタログ番号71046)を使用したC末端ソルタギングによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。hOKT3 200の溶液(14.3μL、14μg、PBS pH7.4中35μM)に、ソルターゼAペンタ変異体(0.5μL、1μg、40mM Tris pH8.0中92μM、110mM NaCl、2.2mM KCl、400mMイミダゾール及び20%グリセロール)、GGG-PEG23-BCN(163、2μL、MQ中20mM)、CaCl2(2μL、MQ中100mM)及びTBS pH7.5(1.2μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、hOKT3-PEG23-BCN 203に対応する1つの主生成物(実測質量28754Da)を示した。
ソルターゼAペンタ変異体(BPS Bioscience、カタログ番号71046)を使用したC末端ソルタギングによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。hOKT3 200の溶液(14.3μL、14μg、PBS pH7.4中35μM)に、ソルターゼAペンタ変異体(0.5μL、1μg、40mM Tris pH8.0中92μM、110mM NaCl、2.2mM KCl、400mMイミダゾール及び20%グリセロール)、GGG-PEG23-BCN(163、2μL、MQ中20mM)、CaCl2(2μL、MQ中100mM)及びTBS pH7.5(1.2μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、hOKT3-PEG23-BCN 203に対応する1つの主生成物(実測質量28754Da)を示した。
実施例120.hOKT3-PEG4-テトラジン 204を得るためのソルターゼAを使用した化合物GGG-PEG4-テトラジン(154)のhOKT3 200へのC末端ソルタギング
ソルターゼA(配列番号2によって識別される)を使用したC末端ソルタギングによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。hOKT3 200の溶液(500μL、500μg、PBS pH7.4中35μM)に、ソルターゼA(58μL、384μg、TBS pH7.5中302μM+10%グリセロール)、GGG-PEG4-テトラジン(154、35μL、MQ中40mM)、CaCl2(69μL、MQ中100mM)及びTBS pH7.5(32μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートし、引き続いてAKTA Explorer-100(GE Healthcare)上His-trap excel 1mLカラム(GE Healthcare)で精製した。カラムを緩衝液A(20mM Tris、200mM NaCl、20mMイミダゾール、pH7.5)と平衡化し、試料を1mL/分で充填した。フロースルーを回収すると、質量スペクトル分析は、104に対応する1つの主生成物(実測質量27868Da)を示した。試料をPBS pH7.4に対して透析し、スピンフィルトレーション(Amicon Ultra-0.5、Ultracel-10 Membrane、Millipore)によって濃縮すると、hOKT3-PEG4-テトラジン 204(70μL、277μg、PBS pH7.4中143μM)が得られた。
ソルターゼA(配列番号2によって識別される)を使用したC末端ソルタギングによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。hOKT3 200の溶液(500μL、500μg、PBS pH7.4中35μM)に、ソルターゼA(58μL、384μg、TBS pH7.5中302μM+10%グリセロール)、GGG-PEG4-テトラジン(154、35μL、MQ中40mM)、CaCl2(69μL、MQ中100mM)及びTBS pH7.5(32μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートし、引き続いてAKTA Explorer-100(GE Healthcare)上His-trap excel 1mLカラム(GE Healthcare)で精製した。カラムを緩衝液A(20mM Tris、200mM NaCl、20mMイミダゾール、pH7.5)と平衡化し、試料を1mL/分で充填した。フロースルーを回収すると、質量スペクトル分析は、104に対応する1つの主生成物(実測質量27868Da)を示した。試料をPBS pH7.4に対して透析し、スピンフィルトレーション(Amicon Ultra-0.5、Ultracel-10 Membrane、Millipore)によって濃縮すると、hOKT3-PEG4-テトラジン 204(70μL、277μg、PBS pH7.4中143μM)が得られた。
実施例121.hOKT3-PEG4-テトラジン 204を得るためのソルターゼAペンタ変異体を使用した化合物GGG-PEG4-テトラジン(154)のhOKT3 200へのC末端ソルタギング
ソルターゼAペンタ変異体(BPS Bioscience、カタログ番号71046)を使用したC末端ソルタギングによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。hOKT3 200の溶液(14.3μL、14μg、PBS pH7.4中35μM)に、ソルターゼAペンタ変異体(0.5μL、1μg、40mM Tris pH8.0中92μM、110mM NaCl、2.2mM KCl、400mMイミダゾール及び20%グリセロール)、GGG-PEG4-テトラジン(154、2μL、MQ中20mM)、CaCl2(2μL、MQ中100mM)及びTBS pH7.5(1.2μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、hOKT3-PEG4-テトラジン 204に対応する1つの主生成物(実測質量27868Da)を示した。
ソルターゼAペンタ変異体(BPS Bioscience、カタログ番号71046)を使用したC末端ソルタギングによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。hOKT3 200の溶液(14.3μL、14μg、PBS pH7.4中35μM)に、ソルターゼAペンタ変異体(0.5μL、1μg、40mM Tris pH8.0中92μM、110mM NaCl、2.2mM KCl、400mMイミダゾール及び20%グリセロール)、GGG-PEG4-テトラジン(154、2μL、MQ中20mM)、CaCl2(2μL、MQ中100mM)及びTBS pH7.5(1.2μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、hOKT3-PEG4-テトラジン 204に対応する1つの主生成物(実測質量27868Da)を示した。
実施例122.hOKT3-PEG11-テトラジン PF01を得るためのソルターゼAを使用したGGG-PEG11-テトラジン(169)のhOKT3 200へのC末端ソルタギング
ソルターゼA(配列番号2によって識別される)を使用したC末端ソルタギングによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。hOKT3 200の溶液(1908μL、5mg、PBS pH7.4中91μM)に、ソルターゼA(81μL、948μg、TBS pH7.5中533μM+10%グリセロール)、GGG-PEG11-テトラジン(169、347μL、MQ中20mM)、CaCl2(347μL、MQ中100mM)及びTBS pH7.5(789μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、hOKT3-PEG11-テトラジン PF01に対応する1つの主生成物(実測質量28258Da)を示した。反応物をAKTA Explorer-100(GE Healthcare)上His-trap excel 1mLカラム(GE Healthcare)で精製した。カラムを緩衝液A(20mM Tris、200mM NaCl、20mMイミダゾール、pH7.5)と平衡化し、試料を1mL/分で充填した。フロースルーを回収し、HiPrep 26/10脱塩カラム(GE Healthcare)を使用してPBS pH6.5に緩衝液交換した。PBS pH6.5に対して4℃で3日間さらなる透析を実施して、残留169を除去した。
ソルターゼA(配列番号2によって識別される)を使用したC末端ソルタギングによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。hOKT3 200の溶液(1908μL、5mg、PBS pH7.4中91μM)に、ソルターゼA(81μL、948μg、TBS pH7.5中533μM+10%グリセロール)、GGG-PEG11-テトラジン(169、347μL、MQ中20mM)、CaCl2(347μL、MQ中100mM)及びTBS pH7.5(789μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、hOKT3-PEG11-テトラジン PF01に対応する1つの主生成物(実測質量28258Da)を示した。反応物をAKTA Explorer-100(GE Healthcare)上His-trap excel 1mLカラム(GE Healthcare)で精製した。カラムを緩衝液A(20mM Tris、200mM NaCl、20mMイミダゾール、pH7.5)と平衡化し、試料を1mL/分で充填した。フロースルーを回収し、HiPrep 26/10脱塩カラム(GE Healthcare)を使用してPBS pH6.5に緩衝液交換した。PBS pH6.5に対して4℃で3日間さらなる透析を実施して、残留169を除去した。
実施例123.hOKT3-PEG23-テトラジン PF02を得るためのソルターゼAを使用したGGG-PEG23-テトラジン(170)のhOKT3 200へのC末端ソルタギング
ソルターゼA(配列番号2によって識別される)を使用したC末端ソルタギングによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。hOKT3 200の溶液(1908μL、5mg、PBS pH7.4中91μM)に、ソルターゼA(81μL、948μg、TBS pH7.5中533μM+10%グリセロール)、GGG-PEG23-テトラジン(170、347μL、MQ中20mM)、CaCl2(347μL、MQ中100mM)及びTBS pH7.5(789μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、hOKT3-PEG23-テトラジン PF02に対応する1つの主生成物(実測質量28787Da)を示した。反応物をAKTA Explorer-100(GE Healthcare)上His-trap excel 1mLカラム(GE Healthcare)で精製した。カラムを緩衝液A(20mM Tris、200mM NaCl、20mMイミダゾール、pH7.5)と平衡化し、試料を1mL/分で充填した。フロースルーをPBS pH6.5に透析し、引き続いてPBS pH6.5を移動相として使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上Superdex75 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。
ソルターゼA(配列番号2によって識別される)を使用したC末端ソルタギングによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。hOKT3 200の溶液(1908μL、5mg、PBS pH7.4中91μM)に、ソルターゼA(81μL、948μg、TBS pH7.5中533μM+10%グリセロール)、GGG-PEG23-テトラジン(170、347μL、MQ中20mM)、CaCl2(347μL、MQ中100mM)及びTBS pH7.5(789μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、hOKT3-PEG23-テトラジン PF02に対応する1つの主生成物(実測質量28787Da)を示した。反応物をAKTA Explorer-100(GE Healthcare)上His-trap excel 1mLカラム(GE Healthcare)で精製した。カラムを緩衝液A(20mM Tris、200mM NaCl、20mMイミダゾール、pH7.5)と平衡化し、試料を1mL/分で充填した。フロースルーをPBS pH6.5に透析し、引き続いてPBS pH6.5を移動相として使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上Superdex75 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。
実施例124.hOKT3-PEG2-アリールアジド PF03を得るためのソルターゼAを使用したGGG-PEG2-アリールアジド(171)のhOKT3 200へのC末端ソルタギング
ソルターゼA(配列番号2によって識別される)を使用したC末端ソルタギングによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。hOKT3 200の溶液(2092μL、5mg、PBS pH7.4中83μM)に、ソルターゼA(95μL、950μg、TBS pH7.5中456μM+10%グリセロール)、GGG-PEG2-アリールアジド(171、347μL、MQ中20mM)、CaCl2(347μL、MQ中100mM)及びTBS pH7.5(591μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、hOKT3-PEG2-アリールアジド PF03に対応する1つの主生成物(実測質量27865Da)を示した。反応物をAKTA Purifier-10(GE Healthcare)上His-trap excel 1mLカラム(GE Healthcare)で精製した。カラムを緩衝液A(20mM Tris、200mM NaCl、20mMイミダゾール、pH7.5)と平衡化し、試料を1mL/分で充填した。フロースルーを、PBS pH7.4を移動相として使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上Superdex75 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。
ソルターゼA(配列番号2によって識別される)を使用したC末端ソルタギングによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。hOKT3 200の溶液(2092μL、5mg、PBS pH7.4中83μM)に、ソルターゼA(95μL、950μg、TBS pH7.5中456μM+10%グリセロール)、GGG-PEG2-アリールアジド(171、347μL、MQ中20mM)、CaCl2(347μL、MQ中100mM)及びTBS pH7.5(591μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、hOKT3-PEG2-アリールアジド PF03に対応する1つの主生成物(実測質量27865Da)を示した。反応物をAKTA Purifier-10(GE Healthcare)上His-trap excel 1mLカラム(GE Healthcare)で精製した。カラムを緩衝液A(20mM Tris、200mM NaCl、20mMイミダゾール、pH7.5)と平衡化し、試料を1mL/分で充填した。フロースルーを、PBS pH7.4を移動相として使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上Superdex75 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。
実施例125.抗4-1BB-PEG11-テトラジン PF08を得るためのソルターゼAを使用したGGG-PEG11-テトラジン(169)の抗4-1BB PF31へのC末端ソルタギング
タンパク質PF31(1151μL、TBS pH7.5中93μM)を含有する溶液に、TBS pH7.5(512μL)、CaCl2(214μL、100mM)及びGGG-PEG11-テトラジン(169、220μL、MQ中20mM)及びソルターゼA(50μL、TBS pH7.5中533μM)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートし、引き続いてAKTA Explorer-100(GE Healthcare)上His-trap excel 1mLカラム(GE Healthcare)で精製した。カラムを緩衝液A(20mM Tris、200mM NaCl、20mMイミダゾール、pH7.5)と平衡化し、試料を1mL/分で充填した。フロースルーを回収すると、質量スペクトル分析は、4-1BB-テトラジン PF08に対応する1つの主生成物(実測質量27989Da)を示した。
タンパク質PF31(1151μL、TBS pH7.5中93μM)を含有する溶液に、TBS pH7.5(512μL)、CaCl2(214μL、100mM)及びGGG-PEG11-テトラジン(169、220μL、MQ中20mM)及びソルターゼA(50μL、TBS pH7.5中533μM)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートし、引き続いてAKTA Explorer-100(GE Healthcare)上His-trap excel 1mLカラム(GE Healthcare)で精製した。カラムを緩衝液A(20mM Tris、200mM NaCl、20mMイミダゾール、pH7.5)と平衡化し、試料を1mL/分で充填した。フロースルーを回収すると、質量スペクトル分析は、4-1BB-テトラジン PF08に対応する1つの主生成物(実測質量27989Da)を示した。
実施例126.抗4-1BB PF09を得るためのソルターゼAを使用した化合物GGG-PEG2-アリールアジド(171)の抗4-1BB-PF31へのC末端ソルタギング
ソルターゼA(配列番号2によって識別される)を使用したC末端ソルタギングによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。抗4-1BB-PF31の溶液(665μL、2mg、PBS pH7.4中107μM)に、ソルターゼA(100μL、1mg、TBS pH7.5中357μM+10%グリセロール)、GGG-PEG2-アリールアジド(171、140μL、MQ中20mM)、CaCl2(140μL、MQ中100mM)及びTBS pH7.5(355μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートし、引き続いてAKTA Explorer-100(GE Healthcare)上His-trap excel 1mLカラム(GE Healthcare)で精製した。カラムを緩衝液A(20mM Tris、200mM NaCl、20mMイミダゾール、pH7.5)と平衡化し、試料を1mL/分で充填した。フロースルーを回収すると、質量スペクトル分析は、抗4-1BB-アジド PF09に対応する1つの主生成物(実測質量27592Da)を示した。
ソルターゼA(配列番号2によって識別される)を使用したC末端ソルタギングによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。抗4-1BB-PF31の溶液(665μL、2mg、PBS pH7.4中107μM)に、ソルターゼA(100μL、1mg、TBS pH7.5中357μM+10%グリセロール)、GGG-PEG2-アリールアジド(171、140μL、MQ中20mM)、CaCl2(140μL、MQ中100mM)及びTBS pH7.5(355μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートし、引き続いてAKTA Explorer-100(GE Healthcare)上His-trap excel 1mLカラム(GE Healthcare)で精製した。カラムを緩衝液A(20mM Tris、200mM NaCl、20mMイミダゾール、pH7.5)と平衡化し、試料を1mL/分で充填した。フロースルーを回収すると、質量スペクトル分析は、抗4-1BB-アジド PF09に対応する1つの主生成物(実測質量27592Da)を示した。
実施例127.アリールアジド-PEG11-GGG-IL15Rα-IL15(PF13)を得るためのソルターゼAを使用したアリールアジド-PEG11-LPETGG(175)のGGG-IL15Rα-IL15(208)へのN末端ソルタギング
タンパク質208を含有する溶液(2000μL、TBS pH7.5中140μM)に、TBS pH7.5(2686μL)、CaCl2(559μL、100mM)及び175(83μL、DMSO中50mM)及びソルターゼA(260μL、TBS pH7.5中537μM)を添加し、37℃で3時間インキュベートした(光から遮断して)。インキュベーション後、Ni-NTAビーズ(500μLビーズ=1mLスラリー)を使用して、ソルターゼAを溶液から除去した。溶液をローラーバンク上Ni-NTAビーズと共に4℃で一晩インキュベートし、その後、溶液を遠心分離(5分間、7.000×g)した。生成物PF13を含有する上清を、ペレットから上清を分離することによって回収した。反応混合物を、移動相としてのPBS pH7.4及び流量0.5mL/分を使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上Superdex75 10/300 GLカラム(GE Healthcare)に充填した。質量分析は、PF13に対応する24193Daの重量(予測質量:24193Da)を示した。
タンパク質208を含有する溶液(2000μL、TBS pH7.5中140μM)に、TBS pH7.5(2686μL)、CaCl2(559μL、100mM)及び175(83μL、DMSO中50mM)及びソルターゼA(260μL、TBS pH7.5中537μM)を添加し、37℃で3時間インキュベートした(光から遮断して)。インキュベーション後、Ni-NTAビーズ(500μLビーズ=1mLスラリー)を使用して、ソルターゼAを溶液から除去した。溶液をローラーバンク上Ni-NTAビーズと共に4℃で一晩インキュベートし、その後、溶液を遠心分離(5分間、7.000×g)した。生成物PF13を含有する上清を、ペレットから上清を分離することによって回収した。反応混合物を、移動相としてのPBS pH7.4及び流量0.5mL/分を使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上Superdex75 10/300 GLカラム(GE Healthcare)に充填した。質量分析は、PF13に対応する24193Daの重量(予測質量:24193Da)を示した。
実施例128.BCN-PEG12-SYR-(G4S)3-IL15Rα-IL15(PF14)を得るためのBCN-PEG12-アミノオキシ(XL13)のSYR-(G4S)3-IL15Rα-IL15(PF26)へのN末端オキシムライゲーション
PF26の標識の前に、過ヨウ素酸ナトリウムを使用して、N末端セリンを酸化した。タンパク質PF26を含有する溶液(700μL、PBS pH7.4中70μM)に、PBS pH7.4(286μL)、NaIO4(0.98μL、MQ中100mM)及びL-メチオニン(5μL、MQ中100mM)を添加し、4℃で5分間インキュベートした。質量分析は、24114Da(アルデヒド)及び24132Da(水和物)の予測質量に対応する24114Da及び24130Daの重量を示した。PD-10脱塩カラムを使用して、過剰なNaIO4及びL-メチオニンを除去した。酸化したPF26を、Amiconスピンフィルター0.5、MWCO10kDa(Merck-Millipore)を使用して50μMの濃度まで濃縮した。酸化したPF26を含有する溶液(416μL、PBS pH7.4中50μM)に、XL13(41.6μL、DMSO中50mM)を添加した。37℃で一晩のインキュベーション後、反応混合物を、Sephadex G-25樹脂(Cytiva)を充填したPD-10脱塩カラムを使用して精製し、PBSを使用して溶出した。質量分析は、PF14に対応する25024Daの重量(予測質量:25042Da)を示した。
PF26の標識の前に、過ヨウ素酸ナトリウムを使用して、N末端セリンを酸化した。タンパク質PF26を含有する溶液(700μL、PBS pH7.4中70μM)に、PBS pH7.4(286μL)、NaIO4(0.98μL、MQ中100mM)及びL-メチオニン(5μL、MQ中100mM)を添加し、4℃で5分間インキュベートした。質量分析は、24114Da(アルデヒド)及び24132Da(水和物)の予測質量に対応する24114Da及び24130Daの重量を示した。PD-10脱塩カラムを使用して、過剰なNaIO4及びL-メチオニンを除去した。酸化したPF26を、Amiconスピンフィルター0.5、MWCO10kDa(Merck-Millipore)を使用して50μMの濃度まで濃縮した。酸化したPF26を含有する溶液(416μL、PBS pH7.4中50μM)に、XL13(41.6μL、DMSO中50mM)を添加した。37℃で一晩のインキュベーション後、反応混合物を、Sephadex G-25樹脂(Cytiva)を充填したPD-10脱塩カラムを使用して精製し、PBSを使用して溶出した。質量分析は、PF14に対応する25024Daの重量(予測質量:25042Da)を示した。
実施例129.BCN-IL15Rα-IL15 PF15を得るためのIL15Rα-IL15 PF26のN末端BCN官能化
IL15Rα-IL15 PF26(2.9mg、PBS中50μM)に、2当量のNaIO4(4.8μLのPBS中50mMストック)及び10当量のL-メチオニン(12.5μLのPBS中100mMストック)を添加した。反応物を4℃で5分間インキュベートした。質量スペクトル分析は、セリンの対応するアルデヒド及び水和物(実測質量24114Da及び24132Da)への酸化を示した。反応混合物を、Sephadex G-25樹脂(Cytiva)を充填したPD-10脱塩カラムを使用して精製し、PBSを使用して溶出した。溶離液(2.6mg、PBS中50μM)に、160当量のN-メチルヒドロキシルアミン.HCl(340μLのPBS中50mMストック)及び160当量のp-アニシジン(340μLのPBS中50mMストック)を添加した。反応混合物を25℃で3時間インキュベートした。質量スペクトル分析は、N-メチル-イミン-オキシド-IL15に対応する単一ピーク(実測質量24143Da)を示した。反応混合物を、Sephadex G-25樹脂(Cytiva)を充填したPD-10脱塩カラムを使用して精製し、PBSを使用して溶出した。溶離液(2.47mg、PBS中50μM)に、25当量のビス-BCN-PEG11(105)(51μL、DMSO中50mM)及び150μLのDMFを添加した。反応物を室温で一晩インキュベートした。反応物を、Superdex75 10/300カラム(Cytiva)を使用して精製した。質量スペクトル分析は、BCN-IL15Rα-IL15 PF15に対応する1つの主ピークを示した(実測質量25041Da)。
IL15Rα-IL15 PF26(2.9mg、PBS中50μM)に、2当量のNaIO4(4.8μLのPBS中50mMストック)及び10当量のL-メチオニン(12.5μLのPBS中100mMストック)を添加した。反応物を4℃で5分間インキュベートした。質量スペクトル分析は、セリンの対応するアルデヒド及び水和物(実測質量24114Da及び24132Da)への酸化を示した。反応混合物を、Sephadex G-25樹脂(Cytiva)を充填したPD-10脱塩カラムを使用して精製し、PBSを使用して溶出した。溶離液(2.6mg、PBS中50μM)に、160当量のN-メチルヒドロキシルアミン.HCl(340μLのPBS中50mMストック)及び160当量のp-アニシジン(340μLのPBS中50mMストック)を添加した。反応混合物を25℃で3時間インキュベートした。質量スペクトル分析は、N-メチル-イミン-オキシド-IL15に対応する単一ピーク(実測質量24143Da)を示した。反応混合物を、Sephadex G-25樹脂(Cytiva)を充填したPD-10脱塩カラムを使用して精製し、PBSを使用して溶出した。溶離液(2.47mg、PBS中50μM)に、25当量のビス-BCN-PEG11(105)(51μL、DMSO中50mM)及び150μLのDMFを添加した。反応物を室温で一晩インキュベートした。反応物を、Superdex75 10/300カラム(Cytiva)を使用して精製した。質量スペクトル分析は、BCN-IL15Rα-IL15 PF15に対応する1つの主ピークを示した(実測質量25041Da)。
実施例130.アジド-IL15 PF19を得るためのIL15 PF18のN末端ジアゾ転移反応
IL15 PF18(5mg、0.1M TEA緩衝液pH8.0中50μM)に、イミダゾール-1-スルホニルアジド塩酸塩(708μL、50mM NaOH中50mM)を添加し、37℃で一晩インキュベートした。反応物を、ハイプレップ(商標)26/10脱塩カラム(Cytiva)を使用して精製した。質量スペクトル分析は、アジド-IL15 PF19に対応する1つの主ピーク(実測質量14147Da)を示した。
IL15 PF18(5mg、0.1M TEA緩衝液pH8.0中50μM)に、イミダゾール-1-スルホニルアジド塩酸塩(708μL、50mM NaOH中50mM)を添加し、37℃で一晩インキュベートした。反応物を、ハイプレップ(商標)26/10脱塩カラム(Cytiva)を使用して精製した。質量スペクトル分析は、アジド-IL15 PF19に対応する1つの主ピーク(実測質量14147Da)を示した。
実施例131.テトラジン-PEG12-SYR-(G4S)3-IL15(PF21)を得るための2PCAを使用したテトラジン-PEG12-2PCA(XL10)のSYR-(G4S)3-IL15(PF18)へのN末端組み込み
SYR-(G4S)3-IL15(PF18)(1052μL、PBS中50μM)に、20当量のテトラジン-PEG12-2PCA(XL10)(112μLのDMSO中50mMストック)及び4359μLのPBSを添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。スピンフィルトレーション(Amicon Ultra-0.5、Ultracel-10 Membrane、Millipore)を使用して、試料を1mL未満に濃縮し、移動相としてのPBS pH7.4及び流量0.5mL/分を使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上Superdex75 10/300 GLカラム(GE Healthcare)に充填した。質量スペクトル分析は、出発物質SYR-(G4S)3-IL15(PF18)(予測質量:14121Da)に対応する24121Daの重量及び生成物PF21(予測質量:15094Da)に対応する15093Daの質量を示した。
SYR-(G4S)3-IL15(PF18)(1052μL、PBS中50μM)に、20当量のテトラジン-PEG12-2PCA(XL10)(112μLのDMSO中50mMストック)及び4359μLのPBSを添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。スピンフィルトレーション(Amicon Ultra-0.5、Ultracel-10 Membrane、Millipore)を使用して、試料を1mL未満に濃縮し、移動相としてのPBS pH7.4及び流量0.5mL/分を使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上Superdex75 10/300 GLカラム(GE Healthcare)に充填した。質量スペクトル分析は、出発物質SYR-(G4S)3-IL15(PF18)(予測質量:14121Da)に対応する24121Daの重量及び生成物PF21(予測質量:15094Da)に対応する15093Daの質量を示した。
実施例132.ビス-BCN-hOKT3 PF22を得るための、トリ-BCN(150)のhOKT3-PEG2-アリールアジド PF03へのコンジュゲーション
hOKT3-PEG2-アリールアジド PF03の溶液(87μL、1mg、PBS pH7.4中411μM)に、PBS pH7.4(559μL)、DMF(49μL)及び化合物150(22μL、DMF中40mM溶液、25当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、ビス-BCN-hOKT3 PF22に対応する1つの主生成物(実測質量29171Da)を示した。反応物を、PBS pH7.4を移動相として使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上Superdex75 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。
hOKT3-PEG2-アリールアジド PF03の溶液(87μL、1mg、PBS pH7.4中411μM)に、PBS pH7.4(559μL)、DMF(49μL)及び化合物150(22μL、DMF中40mM溶液、25当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、ビス-BCN-hOKT3 PF22に対応する1つの主生成物(実測質量29171Da)を示した。反応物を、PBS pH7.4を移動相として使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上Superdex75 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。
実施例133.ビス-BCN-hOKT3 PF23を得るためのソルターゼAを使用したGGG-ビス-BCN 176のhOKT3 200へのC末端ソルタギング
ソルターゼA(配列番号2によって識別される)を使用したC末端ソルタギングによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。hOKT3 200の溶液(272μL、0.7mg、PBS pH7.4中83μM)に、ソルターゼA(25μL、250μg、TBS pH7.5中456μM+10%グリセロール)、GGG-ビス-BCN(176、45μL、DMSO中20mM)、CaCl2(45μL、MQ中100mM)及びTBS pH7.5(64μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、ビス-BCN-hOKT3 PF23に対応する1つの主生成物(実測質量28772Da)を示した。反応物を、PBS pH7.4を移動相として使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上Superdex75 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。
ソルターゼA(配列番号2によって識別される)を使用したC末端ソルタギングによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。hOKT3 200の溶液(272μL、0.7mg、PBS pH7.4中83μM)に、ソルターゼA(25μL、250μg、TBS pH7.5中456μM+10%グリセロール)、GGG-ビス-BCN(176、45μL、DMSO中20mM)、CaCl2(45μL、MQ中100mM)及びTBS pH7.5(64μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、ビス-BCN-hOKT3 PF23に対応する1つの主生成物(実測質量28772Da)を示した。反応物を、PBS pH7.4を移動相として使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上Superdex75 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。
実施例134.ビス-BCN-SYR-(G4S)3-IL15(PF29)を得るための歪み促進型アルキン-アジド付加環化を使用したトリ-BCN(150)のN3-SYR-(G4S)3-IL15(PF19)へのN末端組み込み
N3-IL15 PF19(706μL、PBS中50μM)に、4当量のトリ-BCN(150)(3.5μLのDMF中40mMストック)及び67μLのDMFを添加した。反応物を室温で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、ビス-BCN-SYR-(G4S)3-IL15 PF29(実測質量15453Da、予測質量15453Da)の形成を確認した。反応混合物を、Sephadex G-25樹脂(Cytiva)を充填したPD-10脱塩カラムを使用して精製し、PBSを使用して溶出した。さらなる洗浄を、スピンフィルトレーション(Amicon Ultra-0.5、Ultracel-10 Membrane、Millipore)を使用して400μLのPBSで6回実施して、残っているトリ-BCN(150)を除去した。
N3-IL15 PF19(706μL、PBS中50μM)に、4当量のトリ-BCN(150)(3.5μLのDMF中40mMストック)及び67μLのDMFを添加した。反応物を室温で一晩インキュベートした。質量スペクトル分析は、ビス-BCN-SYR-(G4S)3-IL15 PF29(実測質量15453Da、予測質量15453Da)の形成を確認した。反応混合物を、Sephadex G-25樹脂(Cytiva)を充填したPD-10脱塩カラムを使用して精製し、PBSを使用して溶出した。さらなる洗浄を、スピンフィルトレーション(Amicon Ultra-0.5、Ultracel-10 Membrane、Millipore)を使用して400μLのPBSで6回実施して、残っているトリ-BCN(150)を除去した。
実施例135.PNGase Fによるトラスツズマブの酵素的脱グリコシル化
トラスツズマブ(Herzuma)(20mg、PBS pH7.4中12.5mg/mL)をPNGase F(16μL、8000ユニット)と37℃でインキュベートした。IdeS処理後の試料の質量スペクトル分析は、予測生成物に対応する1つの主Fc/2生成物(実測質量23787Da)を示した。
トラスツズマブ(Herzuma)(20mg、PBS pH7.4中12.5mg/mL)をPNGase F(16μL、8000ユニット)と37℃でインキュベートした。IdeS処理後の試料の質量スペクトル分析は、予測生成物に対応する1つの主Fc/2生成物(実測質量23787Da)を示した。
実施例136.PNGase Fによるリツキシマブの酵素的脱グリコシル化
リツキシマブ(6mg、PBS pH7.4中10mg/mL)をPNGase F(6μL、3000ユニット)と37℃でインキュベートした。IdeS処理後の試料の質量スペクトル分析は、予測生成物に対応する1つの主Fc/2生成物(実測質量23754Da)を示した。
リツキシマブ(6mg、PBS pH7.4中10mg/mL)をPNGase F(6μL、3000ユニット)と37℃でインキュベートした。IdeS処理後の試料の質量スペクトル分析は、予測生成物に対応する1つの主Fc/2生成物(実測質量23754Da)を示した。
実施例137.ビス-アジド-トラスツズマブ trast-v3を得るためのアジド-PEG3-アミンの脱グリコシル化トラスツズマブへのMTGase触媒組み込み
脱グリコシル化トラスツズマブの溶液(806μL、10mg、PBS pH7.4中12.4mg/mL)に、PBS pH7.4(3544μL)、アジド-PEG3-アミン(BroadPharmから商業的に入手可能、500μL、MQ中10mM溶液、IgGに対して75当量)及び組換え微生物トランスグルタミナーゼ(Zediraから商業的に入手可能、150μL、15U、0.1U/μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、ビス-アジド-トラスツズマブ trast-v3に対応する1つの主生成物(実測質量23988Da)を示した。反応物を、AKTA Explorer-100(GE Healthcare)上protAカラム(5mL、MabSelect Sure、GE Healthcare)を使用して精製し、引き続いてPBS pH7.4に透析した。
脱グリコシル化トラスツズマブの溶液(806μL、10mg、PBS pH7.4中12.4mg/mL)に、PBS pH7.4(3544μL)、アジド-PEG3-アミン(BroadPharmから商業的に入手可能、500μL、MQ中10mM溶液、IgGに対して75当量)及び組換え微生物トランスグルタミナーゼ(Zediraから商業的に入手可能、150μL、15U、0.1U/μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、ビス-アジド-トラスツズマブ trast-v3に対応する1つの主生成物(実測質量23988Da)を示した。反応物を、AKTA Explorer-100(GE Healthcare)上protAカラム(5mL、MabSelect Sure、GE Healthcare)を使用して精製し、引き続いてPBS pH7.4に透析した。
実施例138.ビス-アジド-リツキシマブ rit-v3を得るためのアジド-PEG3-アミンの脱グリコシル化リツキシマブへのMTGase触媒組み込み
脱グリコシル化リツキシマブの溶液(90μL、1.8mg、PBS pH7.4中20.2mg/mL)に、PBS pH7.4(693μL)、アジド-PEG3-アミン(BroadPharmから商業的に入手可能、90μL、MQ中10mM溶液、IgGに対して75当量)及び組換え微生物トランスグルタミナーゼ(Zediraから商業的に入手可能、27μL、2.7U、0.1U/μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、ビス-アジド-リツキシマブ rit-v3に対応する1つの主生成物(実測質量23956Da)を示した。遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore)を使用して、反応物をPBS pH7.4に緩衝液交換した。
脱グリコシル化リツキシマブの溶液(90μL、1.8mg、PBS pH7.4中20.2mg/mL)に、PBS pH7.4(693μL)、アジド-PEG3-アミン(BroadPharmから商業的に入手可能、90μL、MQ中10mM溶液、IgGに対して75当量)及び組換え微生物トランスグルタミナーゼ(Zediraから商業的に入手可能、27μL、2.7U、0.1U/μL)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、ビス-アジド-リツキシマブ rit-v3に対応する1つの主生成物(実測質量23956Da)を示した。遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore)を使用して、反応物をPBS pH7.4に緩衝液交換した。
実施例139.コンジュゲート206を得るためのトラスツズマブ(6-N3-GalNAc)2 205と201のコンジュゲーション
BCN修飾hOKT3 201のアジド修飾トラスツズマブ205へのコンジュゲーションによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。国際公開第2016170186号により調製したトラスツズマブ-(6-N3-GalNAc)2の溶液(205、2μL、75μg、PBS pH7.4中250μM)に、hOKT3-PEG2-BCN 201(9.9μL、28μg、PBS pH7.4中101μM)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートした。ファブリケーター(商標)消化試料の質量スペクトル分析は、それぞれアジド修飾Fc/2フラグメント及びコンジュゲート206に対応する2つの主生成物(実測質量24368Da及び52196Da、それぞれおよそ50%)を示した。
BCN修飾hOKT3 201のアジド修飾トラスツズマブ205へのコンジュゲーションによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。国際公開第2016170186号により調製したトラスツズマブ-(6-N3-GalNAc)2の溶液(205、2μL、75μg、PBS pH7.4中250μM)に、hOKT3-PEG2-BCN 201(9.9μL、28μg、PBS pH7.4中101μM)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートした。ファブリケーター(商標)消化試料の質量スペクトル分析は、それぞれアジド修飾Fc/2フラグメント及びコンジュゲート206に対応する2つの主生成物(実測質量24368Da及び52196Da、それぞれおよそ50%)を示した。
実施例140.His6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15のpET32a発現ベクターへのクローニング
IL15Rα-IL15融合タンパク質207を、N末端Hisタグ(HHHHHH)、TEVプロテアーゼ認識配列(SSGENLYFQ)及びN末端ソルターゼA認識配列(GGG)を用いて設計した。塩基対158と692との間にHis6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15(配列番号3)をコードし、それによってチオレドキシンコード配列を除去するDNA配列を含有するpET32AベクターをGenscriptから入手した。
IL15Rα-IL15融合タンパク質207を、N末端Hisタグ(HHHHHH)、TEVプロテアーゼ認識配列(SSGENLYFQ)及びN末端ソルターゼA認識配列(GGG)を用いて設計した。塩基対158と692との間にHis6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15(配列番号3)をコードし、それによってチオレドキシンコード配列を除去するDNA配列を含有するpET32AベクターをGenscriptから入手した。
実施例141.His6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15(207)の大腸菌発現及び封入体単離
His6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15 207の発現は、プラスミド(pET32a-IL15Rα-IL15)のBL21細胞(Novagen)への形質転換により開始する。次のステップは、BL21細胞での500mLの培養物(LB培地+アンピシリン)への接種であった。OD600が0.7に達したら、培養物を1mM IPTG(500μLの1Mストック溶液)で誘導した。37℃で4時間の誘導後、培養物を遠心分離によってペレット化した。500mL培養物から得た細胞ペレットを、625ユニットのbenzonaseを含む25mLのバグバスター(商標)に溶解し、ローラーバンク上室温で20分間インキュベートした。溶解後、不溶性画分を遠心分離(20分間、12000×g、4℃)によって可溶性画分から分離した。不溶性画分を、リゾチーム(最終濃度:200μg/mL)を含む25mLのバグバスター(商標)に溶解し、ローラーバンク上で5分間インキュベートした。次に、溶液を6倍体積の1:10希釈バグバスター(商標)で希釈し、4℃で15分間、9000×gで遠心分離した。ペレットを250mLの1:10希釈バグバスター(商標)にホモジナイザーを使用することによって再懸濁し、4℃で15分間、9000×gで遠心分離した。最後のステップを3回繰り返した。
His6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15 207の発現は、プラスミド(pET32a-IL15Rα-IL15)のBL21細胞(Novagen)への形質転換により開始する。次のステップは、BL21細胞での500mLの培養物(LB培地+アンピシリン)への接種であった。OD600が0.7に達したら、培養物を1mM IPTG(500μLの1Mストック溶液)で誘導した。37℃で4時間の誘導後、培養物を遠心分離によってペレット化した。500mL培養物から得た細胞ペレットを、625ユニットのbenzonaseを含む25mLのバグバスター(商標)に溶解し、ローラーバンク上室温で20分間インキュベートした。溶解後、不溶性画分を遠心分離(20分間、12000×g、4℃)によって可溶性画分から分離した。不溶性画分を、リゾチーム(最終濃度:200μg/mL)を含む25mLのバグバスター(商標)に溶解し、ローラーバンク上で5分間インキュベートした。次に、溶液を6倍体積の1:10希釈バグバスター(商標)で希釈し、4℃で15分間、9000×gで遠心分離した。ペレットを250mLの1:10希釈バグバスター(商標)にホモジナイザーを使用することによって再懸濁し、4℃で15分間、9000×gで遠心分離した。最後のステップを3回繰り返した。
実施例142.単離した封入体からのHis6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15 207のリフォールディング
His6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15 207を含有する精製した封入体を、25mLの変性緩衝液(5Mグアニジン、0.3M亜硫酸ナトリウム)及び2.5mLの50mM 2-ニトロ-5-スルホ安息香酸二ナトリウム中、4℃で一晩スルホン化した。溶液を10倍体積の冷Milli-Qで希釈し、遠心分離した(8000×gで10分間)。ペレットを、125mLの冷Milli-Qにホモジナイザーを使用して溶解し、遠心分離した(80000×gで10分間)。最後のステップを3回繰り返した。精製したHis6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15 207を5Mグアニジン中で変性させ、1mg/mLのタンパク質濃度に希釈した。直径0.8mmのシリンジを使用して、変性したタンパク質を、氷上で10倍体積のリフォールディング緩衝液(50mM Tris、10.53mM NaCl、0.44mM KCl、2.2mM MgCl2、2.2mM CaCl2、0.055% PEG-4000、0.55M L-アルギニン、8mMシステアミン、4mMシスタミン、pH8.0)に滴加し、4℃で48時間インキュベートした(攪拌を要しない)。リフォールディングしたHis6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15 207を、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上で20mL HisTrap excelカラム(GE health care)に充填した。カラムを最初に緩衝液A(5mM Tris緩衝液、20mM イミダゾール、500mM NaCl、pH7.5)で洗浄した。保持されたタンパク質を緩衝液B(20mM Tris緩衝液、500mMイミダゾール、500mM NaCl、pH7.5)で、緩衝液Aから緩衝液Bまでの25mLの勾配で溶出した。画分をポリアクリルアミドゲル(16%)上SDS-PAGEによって分析した。精製した標的タンパク質を含有する画分を合わせ、緩衝液を、4℃で一晩実施する透析によってTBS(20mM Tris pH7.5及び150mM NaCl2)に対して交換した。精製したタンパク質を、Amicon Ultra-0.5、MWCO 3kDa(Merck-Millipore)を使用して少なくとも2mg/mLに濃縮した。質量スペクトル分析は25044Daの重量(予測:25044Da)を示した。生成物を、さらに使用する前に-80℃で保管した。
His6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15 207を含有する精製した封入体を、25mLの変性緩衝液(5Mグアニジン、0.3M亜硫酸ナトリウム)及び2.5mLの50mM 2-ニトロ-5-スルホ安息香酸二ナトリウム中、4℃で一晩スルホン化した。溶液を10倍体積の冷Milli-Qで希釈し、遠心分離した(8000×gで10分間)。ペレットを、125mLの冷Milli-Qにホモジナイザーを使用して溶解し、遠心分離した(80000×gで10分間)。最後のステップを3回繰り返した。精製したHis6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15 207を5Mグアニジン中で変性させ、1mg/mLのタンパク質濃度に希釈した。直径0.8mmのシリンジを使用して、変性したタンパク質を、氷上で10倍体積のリフォールディング緩衝液(50mM Tris、10.53mM NaCl、0.44mM KCl、2.2mM MgCl2、2.2mM CaCl2、0.055% PEG-4000、0.55M L-アルギニン、8mMシステアミン、4mMシスタミン、pH8.0)に滴加し、4℃で48時間インキュベートした(攪拌を要しない)。リフォールディングしたHis6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15 207を、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上で20mL HisTrap excelカラム(GE health care)に充填した。カラムを最初に緩衝液A(5mM Tris緩衝液、20mM イミダゾール、500mM NaCl、pH7.5)で洗浄した。保持されたタンパク質を緩衝液B(20mM Tris緩衝液、500mMイミダゾール、500mM NaCl、pH7.5)で、緩衝液Aから緩衝液Bまでの25mLの勾配で溶出した。画分をポリアクリルアミドゲル(16%)上SDS-PAGEによって分析した。精製した標的タンパク質を含有する画分を合わせ、緩衝液を、4℃で一晩実施する透析によってTBS(20mM Tris pH7.5及び150mM NaCl2)に対して交換した。精製したタンパク質を、Amicon Ultra-0.5、MWCO 3kDa(Merck-Millipore)を使用して少なくとも2mg/mLに濃縮した。質量スペクトル分析は25044Daの重量(予測:25044Da)を示した。生成物を、さらに使用する前に-80℃で保管した。
実施例143.GGG-IL15Rα-IL15 208を得るためのHis6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15 207のTEV切断
His6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15の溶液(207、330μL、TBS pH7.5中2.3mg/mL)に、TEVプロテアーゼ(50.5μL、50mM Tris-HCl、250mM NaCl、1mM TCEP、1mM EDTA、50%グリセロール、pH7.5中10ユニット/μL、New England Biolabs)を添加した。反応物を30℃で1時間インキュベートした。TEV切断後、サイズ排除クロマトグラフィーを使用して溶液を精製した。反応混合物を、移動相としてのTBS pH7.5及び流量0.5mL/分を使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上Superdex75 10/300 GLカラム(GE Healthcare)に充填した。GGG-IL15Rα-IL15 208は12mLの保持時間で溶出した。精製したタンパク質を、Amicon Ultra-0.5、MWCO 3kDa(Merck Millipore)を使用して少なくとも2mg/mLに濃縮した。生成物を質量分析(実測質量:22965Da、予測質量:22964Da)で分析すると、GGG-IL15Rα-IL15 208に対応していた。生成物を、さらに使用する前に-80℃で保管した。
His6-SSGENLYFQ-GGG-IL15Rα-IL15の溶液(207、330μL、TBS pH7.5中2.3mg/mL)に、TEVプロテアーゼ(50.5μL、50mM Tris-HCl、250mM NaCl、1mM TCEP、1mM EDTA、50%グリセロール、pH7.5中10ユニット/μL、New England Biolabs)を添加した。反応物を30℃で1時間インキュベートした。TEV切断後、サイズ排除クロマトグラフィーを使用して溶液を精製した。反応混合物を、移動相としてのTBS pH7.5及び流量0.5mL/分を使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上Superdex75 10/300 GLカラム(GE Healthcare)に充填した。GGG-IL15Rα-IL15 208は12mLの保持時間で溶出した。精製したタンパク質を、Amicon Ultra-0.5、MWCO 3kDa(Merck Millipore)を使用して少なくとも2mg/mLに濃縮した。生成物を質量分析(実測質量:22965Da、予測質量:22964Da)で分析すると、GGG-IL15Rα-IL15 208に対応していた。生成物を、さらに使用する前に-80℃で保管した。
実施例144.BCN-PEG12-IL15Rα-IL15(209)を得るためのソルターゼAを使用したBCN-PEG12-LPETGG(168)のGGG-IL15Rα-IL15 208への組み込み
GGG-IL15Rα-IL15の溶液(208、219μL、TBS pH7.5中91.4μM)に、TBS pH7.5(321μL)、CaCl2(40.0μL、100mM)及びBCN-PEG12-LPETGG(168、120μL、DMSO中5mM)を添加し、37℃で1時間インキュベートした。168の組み込みが完了した後、反応体積(800μL)と同じ体積のNi-NTAビーズを使用して、ソルターゼAを溶液から除去した。溶液を回転ホイール/又はテーブルシェーカーで1時間インキュベートし、その後、溶液を遠心分離(2分間、13000rpm)し、上清を捨てた。800rpmのテーブルシェーカーにおいてビーズを5分間800μLの洗浄緩衝液(40mMイミダゾール、20mM Tris、0.5M NaCl)とインキュベートすることによって、BCN-PEG12-IL15Rα-IL15(209)をビーズから回収した。ビーズを遠心分離(2分間、13000×rpm)し、209を含有する上清を分離し、緩衝液を4℃で一晩の透析によってTBSに交換した。最後に、溶液を、Amiconスピンフィルター0.5、MWCO 3kDa(Merck-Millipore)を使用して0.5~1mg/mLに濃縮した。質量分析は、BCN-PEG12-IL15Rα-IL15(209)に対応する24155Daの重量(予測質量:24152)を示した。
GGG-IL15Rα-IL15の溶液(208、219μL、TBS pH7.5中91.4μM)に、TBS pH7.5(321μL)、CaCl2(40.0μL、100mM)及びBCN-PEG12-LPETGG(168、120μL、DMSO中5mM)を添加し、37℃で1時間インキュベートした。168の組み込みが完了した後、反応体積(800μL)と同じ体積のNi-NTAビーズを使用して、ソルターゼAを溶液から除去した。溶液を回転ホイール/又はテーブルシェーカーで1時間インキュベートし、その後、溶液を遠心分離(2分間、13000rpm)し、上清を捨てた。800rpmのテーブルシェーカーにおいてビーズを5分間800μLの洗浄緩衝液(40mMイミダゾール、20mM Tris、0.5M NaCl)とインキュベートすることによって、BCN-PEG12-IL15Rα-IL15(209)をビーズから回収した。ビーズを遠心分離(2分間、13000×rpm)し、209を含有する上清を分離し、緩衝液を4℃で一晩の透析によってTBSに交換した。最後に、溶液を、Amiconスピンフィルター0.5、MWCO 3kDa(Merck-Millipore)を使用して0.5~1mg/mLに濃縮した。質量分析は、BCN-PEG12-IL15Rα-IL15(209)に対応する24155Daの重量(予測質量:24152)を示した。
実施例145.コンジュゲート210を得るためのBCN-PEG12-IL15Rα-IL15(209)のトラスツズマブ(6-N3-GalNAc)2 205へのコンジュゲーション
2:1モル比での209のアジド修飾トラスツズマブ(205、トラスツズマブ(6-N3-GalNAc)2、国際公開第2016170186号により調製)へのコンジュゲーションによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。よって、BCN-PEG12-IL15Rα-IL15の溶液(209、20μL、TBS pH7.4中20μM)に、トラスツズマブ(6-N3-GalNAc)2(205、1.2μL、PBS pH7.4中82μM)を添加し、37℃で一晩インキュベートした。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、コンジュゲート210のFc/2フラグメントに対応する48526Daの質量(予測質量:48518Da)を示した。
2:1モル比での209のアジド修飾トラスツズマブ(205、トラスツズマブ(6-N3-GalNAc)2、国際公開第2016170186号により調製)へのコンジュゲーションによって、本発明によるバイオコンジュゲートを調製した。よって、BCN-PEG12-IL15Rα-IL15の溶液(209、20μL、TBS pH7.4中20μM)に、トラスツズマブ(6-N3-GalNAc)2(205、1.2μL、PBS pH7.4中82μM)を添加し、37℃で一晩インキュベートした。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、コンジュゲート210のFc/2フラグメントに対応する48526Daの質量(予測質量:48518Da)を示した。
実施例146.211を得るためのトラスツズマブ-(アジド)2と二価リンカー105の分子内架橋
国際公開第2016170186号により調製した、トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)2の溶液(7.5μL、150μg、PBS pH7.4中17.56mg/mL;trast-v1aとも呼ばれる)に、化合物105(2.5μL、DMF中0.8mM溶液、IgGに対して2当量)を添加した。反応物を室温で1日間インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck-Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、分子内架橋トラスツズマブ誘導体211に対応する1つの主生成物(計算質量49625Da、実測質量49626Da)を示した。HPLC-SECは4%未満の凝集を示し、よって、分子間架橋を除外した。
国際公開第2016170186号により調製した、トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)2の溶液(7.5μL、150μg、PBS pH7.4中17.56mg/mL;trast-v1aとも呼ばれる)に、化合物105(2.5μL、DMF中0.8mM溶液、IgGに対して2当量)を添加した。反応物を室温で1日間インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck-Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、分子内架橋トラスツズマブ誘導体211に対応する1つの主生成物(計算質量49625Da、実測質量49626Da)を示した。HPLC-SECは4%未満の凝集を示し、よって、分子間架橋を除外した。
実施例147.212を得るためのトラスツズマブ-(アジド)2と二価リンカー107の分子内架橋
トラスツズマブ-(6-アジド-GalNAc)2の溶液(7.5μL、150μg、PBS pH7.4中17.56mg/mL)に、化合物107(2.5μL、DMF中4mM溶液、IgGに対して10当量)を添加した。反応物を室温で1日間インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck-Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、分子内架橋トラスツズマブ誘導体212に対応する生成物(計算質量50153Da、実測質量50158Da)を示した。HPLC-SECは4%未満の凝集を示し、よって、分子間架橋を除外した。
トラスツズマブ-(6-アジド-GalNAc)2の溶液(7.5μL、150μg、PBS pH7.4中17.56mg/mL)に、化合物107(2.5μL、DMF中4mM溶液、IgGに対して10当量)を添加した。反応物を室温で1日間インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck-Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、分子内架橋トラスツズマブ誘導体212に対応する生成物(計算質量50153Da、実測質量50158Da)を示した。HPLC-SECは4%未満の凝集を示し、よって、分子間架橋を除外した。
実施例148.213を得るためのトラスツズマブ-(アジド)2と二価リンカー117の分子内架橋
トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)2の溶液(7.5μL、150μg、PBS pH7.4中17.56mg/mL)に、化合物117(2.5μL、DMF中0.8mM溶液、IgGに対して2当量)を添加した。反応物を室温で1日間インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、分子内架橋トラスツズマブ誘導体213に対応する1つの主生成物(計算質量49580Da、実測質量49626Da)を示した。HPLC-SECは4%未満の凝集を示し、よって、分子間架橋を除外した。
トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)2の溶液(7.5μL、150μg、PBS pH7.4中17.56mg/mL)に、化合物117(2.5μL、DMF中0.8mM溶液、IgGに対して2当量)を添加した。反応物を室温で1日間インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、分子内架橋トラスツズマブ誘導体213に対応する1つの主生成物(計算質量49580Da、実測質量49626Da)を示した。HPLC-SECは4%未満の凝集を示し、よって、分子間架橋を除外した。
実施例149.214を得るためのトラスツズマブ-(アジド)2と二価リンカー118の分子内架橋
トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)2の溶液(7.5μL、150μg、PBS pH7.4中17.56mg/mL)に、化合物118(2.5μL、DMF中4mM溶液、IgGに対して10当量)を添加した。反応物を室温で1日間インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、分子内架橋トラスツズマブ誘導体214に対応する生成物(計算質量49358Da、実測質量49361Da)を示した。HPLC-SECは4%未満の凝集を示し、よって、分子間架橋を除外した。
トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)2の溶液(7.5μL、150μg、PBS pH7.4中17.56mg/mL)に、化合物118(2.5μL、DMF中4mM溶液、IgGに対して10当量)を添加した。反応物を室温で1日間インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、分子内架橋トラスツズマブ誘導体214に対応する生成物(計算質量49358Da、実測質量49361Da)を示した。HPLC-SECは4%未満の凝集を示し、よって、分子間架橋を除外した。
実施例150.215を得るためのトラスツズマブ-(アジド)2と二価リンカー124の分子内架橋
トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)2の溶液(7.5μL、150μg、PBS pH7.4中17.56mg/mL)に、化合物124(2.5μL、DMF中4mM溶液、IgGに対して10当量)を添加した。反応物を室温で1日間インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、分子内架橋トラスツズマブ誘導体215に対応する生成物(計算質量49406Da、実測質量49409Da)を示した。HPLC-SECは4%未満の凝集を示し、よって、分子間架橋を除外した。
トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)2の溶液(7.5μL、150μg、PBS pH7.4中17.56mg/mL)に、化合物124(2.5μL、DMF中4mM溶液、IgGに対して10当量)を添加した。反応物を室温で1日間インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、分子内架橋トラスツズマブ誘導体215に対応する生成物(計算質量49406Da、実測質量49409Da)を示した。HPLC-SECは4%未満の凝集を示し、よって、分子間架橋を除外した。
実施例151.216を得るためのトラスツズマブ-(アジド)2と二価リンカー125の分子内架橋
トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)2の溶液(7.5μL、150μg、PBS pH7.4中17.56mg/mL)に、化合物125(2.5μL、DMF中0.8mM溶液、IgGに対して2当量)を添加した。反応物を室温で1日間インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、分子内架橋トラスツズマブ誘導体216に対応する1つの主生成物(計算質量49184Da、実測質量49184Da)を示した。HPLC-SECは4%未満の凝集を示し、よって、分子間架橋を除外した。
トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)2の溶液(7.5μL、150μg、PBS pH7.4中17.56mg/mL)に、化合物125(2.5μL、DMF中0.8mM溶液、IgGに対して2当量)を添加した。反応物を室温で1日間インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、分子内架橋トラスツズマブ誘導体216に対応する1つの主生成物(計算質量49184Da、実測質量49184Da)を示した。HPLC-SECは4%未満の凝集を示し、よって、分子間架橋を除外した。
実施例152.217を得るためのトラスツズマブ-(アジド)2と二価リンカー145の分子内架橋
トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)2の溶液(320μL、2mg、PBS pH7.4中5.56mg/mL)に、化合物145(80μL、DMF中1.66mM溶液、IgGに対して10当量)を添加した。反応物を室温で1日間インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、分子内架橋トラスツズマブ誘導体217に対応する1つの主生成物(計算質量49796Da、実測質量49807Da)を示した。HPLC-SECは4%未満の凝集を示し、よって、分子間架橋を除外した。
トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)2の溶液(320μL、2mg、PBS pH7.4中5.56mg/mL)に、化合物145(80μL、DMF中1.66mM溶液、IgGに対して10当量)を添加した。反応物を室温で1日間インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、分子内架橋トラスツズマブ誘導体217に対応する1つの主生成物(計算質量49796Da、実測質量49807Da)を示した。HPLC-SECは4%未満の凝集を示し、よって、分子間架橋を除外した。
実施例153.DAR1 ADC 218を得るためのトラスツズマブ-(アジド)2と二価リンカー-ペイロード構築物137の分子内架橋
トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)2の溶液(37.5μL、250μg、PBS pH7.4中6.67mg/mL)に、化合物137(12.5μL、DMF中0.67mM溶液、IgGに対して5当量)を添加した。反応物を室温で1日インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、分子内架橋を介して得られたコンジュゲートADC 218に対応する1つの主生成物(計算質量50464Da、実測質量50474Da)を示した。HPLC-SECは4%未満の凝集を示し、よって、分子間架橋を除外した。RP-HPLCは、Fc/2(tr6.099)、Fc-毒素(tr8.275、全Fc/2フラグメントの82.4%に対応する)及びFab(tr9.320)フラグメントを示した。
トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)2の溶液(37.5μL、250μg、PBS pH7.4中6.67mg/mL)に、化合物137(12.5μL、DMF中0.67mM溶液、IgGに対して5当量)を添加した。反応物を室温で1日インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、分子内架橋を介して得られたコンジュゲートADC 218に対応する1つの主生成物(計算質量50464Da、実測質量50474Da)を示した。HPLC-SECは4%未満の凝集を示し、よって、分子間架橋を除外した。RP-HPLCは、Fc/2(tr6.099)、Fc-毒素(tr8.275、全Fc/2フラグメントの82.4%に対応する)及びFab(tr9.320)フラグメントを示した。
実施例154.DAR1 ADC 219を得るためのトラスツズマブ-(アジド)2と二価リンカー-ペイロード構築物131の分子内架橋
トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)2の溶液(37.5μL、250μg、PBS pH7.4中6.67mg/mL)に、化合物131(12.5μL、DMF中0.67mM溶液、IgGに対して5当量)を添加した。反応物を室温で1日インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、分子内架橋を介して得られたADC 219に対応する1つの主生成物(計算質量50638Da、実測質量50649Da)を示した。HPLC-SECは4%未満の凝集を示し、よって、分子間架橋を除外した。RP-HPLCは、Fc/2(tr6.082)、Fc-毒素(tr9.327、全Fc/2フラグメントの76.7%に対応する)及びFab(tr9.347)フラグメントを示した。
トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)2の溶液(37.5μL、250μg、PBS pH7.4中6.67mg/mL)に、化合物131(12.5μL、DMF中0.67mM溶液、IgGに対して5当量)を添加した。反応物を室温で1日インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、分子内架橋を介して得られたADC 219に対応する1つの主生成物(計算質量50638Da、実測質量50649Da)を示した。HPLC-SECは4%未満の凝集を示し、よって、分子間架橋を除外した。RP-HPLCは、Fc/2(tr6.082)、Fc-毒素(tr9.327、全Fc/2フラグメントの76.7%に対応する)及びFab(tr9.347)フラグメントを示した。
実施例155.DAR1 ADC 220を得るためのトラスツズマブ-(アジド)2と二価リンカー-ペイロード構築物139の分子内架橋
トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)2の溶液(37.5μL、250μg、PBS pH7.4中6.67mg/mL)に、化合物139(12.5μL、DMF中0.67mM溶液、IgGに対して5当量)を添加した。反応物を室温で1日インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、分子内架橋を介して得られたADC 220に対応する1つの主生成物(計算質量50392Da、実測質量50402Da)を示した。HPLC-SECは4%未満の凝集を示し、よって、分子間架橋を除外した。RP-HPLCは、Fc/2(tr6.062)、Fc-毒素(tr8.548、全Fc/2フラグメントの89.5%に対応する)及びFab(tr9.295)フラグメントを示した。
トラスツズマブ-(6-アジドGalNAc)2の溶液(37.5μL、250μg、PBS pH7.4中6.67mg/mL)に、化合物139(12.5μL、DMF中0.67mM溶液、IgGに対して5当量)を添加した。反応物を室温で1日インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、分子内架橋を介して得られたADC 220に対応する1つの主生成物(計算質量50392Da、実測質量50402Da)を示した。HPLC-SECは4%未満の凝集を示し、よって、分子間架橋を除外した。RP-HPLCは、Fc/2(tr6.062)、Fc-毒素(tr8.548、全Fc/2フラグメントの89.5%に対応する)及びFab(tr9.295)フラグメントを示した。
実施例156.2:1分子フォーマットを有するT細胞エンゲージャー221を得るためのトラスツズマブ誘導体217(単一BCNを含有する)とテトラジン修飾抗CD3免疫細胞エンゲージャー204の分子内架橋
217の溶液(8μL、141μg、PBS pH7.4中17.7mg/mL)に、hOKT-PEG4-テトラジン(204、13.15μL、280μg、PBS pH7.4中21.45mg/mL、IgGに対して2当量)を添加した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、コンジュゲートFc-PEG4-hOKT3(221)に対応する1つの主生成物(計算質量77664Da、実測質量77647Da)を示した。
217の溶液(8μL、141μg、PBS pH7.4中17.7mg/mL)に、hOKT-PEG4-テトラジン(204、13.15μL、280μg、PBS pH7.4中21.45mg/mL、IgGに対して2当量)を添加した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、コンジュゲートFc-PEG4-hOKT3(221)に対応する1つの主生成物(計算質量77664Da、実測質量77647Da)を示した。
実施例157.BCN-リツキシマブ rit-v1a-145を得るためのビス-アジド-リツキシマブ rit-v1aと三価リンカー145の分子内架橋
国際公開第2016170186号により調製したビス-アジド-リツキシマブ rit-v1aの溶液(494μL、30mg、PBS pH7.4中60.7mg/mL)に、PBS pH7.4(2506μL)、プロピレングリコール(2980μL)及び三価リンカー145(20μL、DMF中40mM溶液、IgGに対して4.0当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートし、引き続いてPBS pH7.4を移動相として使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上Superdex200 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。還元SDS-PAGEは、rit-v1a-145の形成を示す、架橋重鎖に対応する1つの主HC生成物(図16、右のパネル、3レーン参照)を示した。さらに、非還元SDS-PAGEは、rit-v1aとほぼ同じ高さの1つの主バンド(図16、左のパネル、3レーン参照)を示し、分子内架橋のみが起こったことを実証した。
国際公開第2016170186号により調製したビス-アジド-リツキシマブ rit-v1aの溶液(494μL、30mg、PBS pH7.4中60.7mg/mL)に、PBS pH7.4(2506μL)、プロピレングリコール(2980μL)及び三価リンカー145(20μL、DMF中40mM溶液、IgGに対して4.0当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートし、引き続いてPBS pH7.4を移動相として使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上Superdex200 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。還元SDS-PAGEは、rit-v1a-145の形成を示す、架橋重鎖に対応する1つの主HC生成物(図16、右のパネル、3レーン参照)を示した。さらに、非還元SDS-PAGEは、rit-v1aとほぼ同じ高さの1つの主バンド(図16、左のパネル、3レーン参照)を示し、分子内架橋のみが起こったことを実証した。
実施例158.BCN-B12 B12-v1a-145を得るためのビス-アジド-B12 B12-v1aと三価リンカー145の分子内架橋
国際公開第2016170186号により調製したビス-アジド-B12 B12-v1aの溶液(415μL、4mg、PBS pH7.4中9.6mg/mL)に、プロピレングリコール(412μL)及び三価リンカー145(2.7μL、DMF中40mM溶液、IgGに対して4.0当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートし、引き続いてPBS pH7.4を移動相として使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上Superdex200 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。IdeS消化試料のRP-HPLC分析はB12-v1a-145の形成を示している(図17参照)。
国際公開第2016170186号により調製したビス-アジド-B12 B12-v1aの溶液(415μL、4mg、PBS pH7.4中9.6mg/mL)に、プロピレングリコール(412μL)及び三価リンカー145(2.7μL、DMF中40mM溶液、IgGに対して4.0当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートし、引き続いてPBS pH7.4を移動相として使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上Superdex200 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。IdeS消化試料のRP-HPLC分析はB12-v1a-145の形成を示している(図17参照)。
実施例159.TCO-トラスツズマブ trast-v1a-XL11を得るためのビス-アジド-トラスツズマブ trast-v1aとビス-BCN-TCO XL11の分子内架橋
国際公開第2016170186号により調製したビス-アジド-トラスツズマブ trast-v1aの溶液(36μL、2mg、PBS pH7.4中56.1mg/mL)に、PBS pH7.4(164μL)、プロピレングリコール(195μL)及びビス-BCN-TCO XL11(5.3μL、DMF中10mM溶液、IgGに対して4.0当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。還元SDS-PAGEは、非コンジュゲート重鎖及び架橋重鎖に対応する2つの主HC生成物を示し(図18、右のパネル、2レーン参照)、trast-v1a-XL11への部分的変換を示した。さらに、非還元SDS-PAGEはtrast-v1aの高さに1つの主バンドを示し(図18、左のパネル、2レーン参照)、分子内架橋のみが起こったことを示した。
国際公開第2016170186号により調製したビス-アジド-トラスツズマブ trast-v1aの溶液(36μL、2mg、PBS pH7.4中56.1mg/mL)に、PBS pH7.4(164μL)、プロピレングリコール(195μL)及びビス-BCN-TCO XL11(5.3μL、DMF中10mM溶液、IgGに対して4.0当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。還元SDS-PAGEは、非コンジュゲート重鎖及び架橋重鎖に対応する2つの主HC生成物を示し(図18、右のパネル、2レーン参照)、trast-v1a-XL11への部分的変換を示した。さらに、非還元SDS-PAGEはtrast-v1aの高さに1つの主バンドを示し(図18、左のパネル、2レーン参照)、分子内架橋のみが起こったことを示した。
実施例160.TCO-リツキシマブ rit-v1a-XL11を得るためのビス-アジド-リツキシマブ rit-v1aとビス-BCN-TCO XL11の分子内架橋
ビス-アジド-リツキシマブ rit-v1aの溶液(37μL、2mg、PBS pH7.4中54.5mg/mL)に、PBS pH7.4(163μL)、プロピレングリコール(195μL)及びビス-BCN-TCO XL11(5.3μL、DMF中10mM溶液、IgGに対して4.0当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。還元SDS-PAGEは、非コンジュゲート重鎖及び架橋重鎖に対応する2つの主HC生成物を示し(図18、右のパネル、6レーン参照)、rit-v1a-XL11への部分的変換を示した。さらに、非還元SDS-PAGEは、rit-v1aの高さの1つの主バンドを示し(図18、左のパネル、2レーン参照)、分子内架橋のみが起こったことを示した。
ビス-アジド-リツキシマブ rit-v1aの溶液(37μL、2mg、PBS pH7.4中54.5mg/mL)に、PBS pH7.4(163μL)、プロピレングリコール(195μL)及びビス-BCN-TCO XL11(5.3μL、DMF中10mM溶液、IgGに対して4.0当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。還元SDS-PAGEは、非コンジュゲート重鎖及び架橋重鎖に対応する2つの主HC生成物を示し(図18、右のパネル、6レーン参照)、rit-v1a-XL11への部分的変換を示した。さらに、非還元SDS-PAGEは、rit-v1aの高さの1つの主バンドを示し(図18、左のパネル、2レーン参照)、分子内架橋のみが起こったことを示した。
実施例161.DAR1 ADC trast-v3-137を得るためのビス-アジド-トラスツズマブ trast-v3とビス-BCN-MMAE 137の分子内架橋
trast-v3の溶液(15μL、150μg、PBS pH7.4中10mg/mL)に、ビス-BCN-MMAE(137、15μL、PG中0.27mM溶液、IgGに対して4当量)を添加した。反応物を室温で16時間インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、分子内架橋を介して得られたtrast-v3-137に対応する1つの主生成物(実測質量48719Da)を示した。
trast-v3の溶液(15μL、150μg、PBS pH7.4中10mg/mL)に、ビス-BCN-MMAE(137、15μL、PG中0.27mM溶液、IgGに対して4当量)を添加した。反応物を室温で16時間インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、分子内架橋を介して得られたtrast-v3-137に対応する1つの主生成物(実測質量48719Da)を示した。
実施例162.脱グリコシル化トラスツズマブとビス-BCN-MMAE LD03の分子内架橋
脱グリコシル化トラスツズマブ(8.3μL、0.15mg、PBS 5.5中18.1mg/mL)をビス-BCN-MMAE(LD03、8.3μL、PG中1.2mM)及びマッシュルームチロシナーゼ(3μL、リン酸緩衝液pH6.0中10mg/mL、Sigma Aldrich T3824)と室温で16時間インキュベートした。参照により本明細書に組み込まれる、オランダ特許出願第2026947号も参照されたい。DTT処理ADCのRP-HPLC分析は、trast-v4-LD03への35%変換を示した(図19参照)。
脱グリコシル化トラスツズマブ(8.3μL、0.15mg、PBS 5.5中18.1mg/mL)をビス-BCN-MMAE(LD03、8.3μL、PG中1.2mM)及びマッシュルームチロシナーゼ(3μL、リン酸緩衝液pH6.0中10mg/mL、Sigma Aldrich T3824)と室温で16時間インキュベートした。参照により本明細書に組み込まれる、オランダ特許出願第2026947号も参照されたい。DTT処理ADCのRP-HPLC分析は、trast-v4-LD03への35%変換を示した(図19参照)。
実施例163.DAR1 ADC trast-v3-LD03を得るためのビス-アジド-トラスツズマブ trast-v3とビス-BCN-MMAE LD03の分子内架橋
trast-v3の溶液(22.5μL、5mg、PBS pH7.4中6.7mg/mL)に、ビス-BCN-MMAE(LD03、7.5μL、DMF中0.53mM溶液、IgGに対して4当量)を添加した。反応物を室温で16時間インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、分子内架橋を介して得られたtrast-v3-LD03に対応する1つの主生成物(実測質量50052Da)を示した。
trast-v3の溶液(22.5μL、5mg、PBS pH7.4中6.7mg/mL)に、ビス-BCN-MMAE(LD03、7.5μL、DMF中0.53mM溶液、IgGに対して4当量)を添加した。反応物を室温で16時間インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、分子内架橋を介して得られたtrast-v3-LD03に対応する1つの主生成物(実測質量50052Da)を示した。
実施例164.DAR1 ADC rit-v3-LD03を得るためのビス-アジド-リツキシマブ rit-v3とビス-BCN-MMAE LD03の分子内架橋
rit-v3の溶液(22.5μL、5mg、PBS pH7.4中6.7mg/mL)に、ビス-BCN-MMAE(LD03、7.5μL、DMF中0.53mM溶液、IgGに対して4当量)を添加した。反応物を室温で16時間インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、分子内架橋を介して得られたrit-v3-LD03に対応する1つの主生成物(質量49989Da)を示した。
rit-v3の溶液(22.5μL、5mg、PBS pH7.4中6.7mg/mL)に、ビス-BCN-MMAE(LD03、7.5μL、DMF中0.53mM溶液、IgGに対して4当量)を添加した。反応物を室温で16時間インキュベートし、引き続いて遠心濾過機(Amicon Ultra-0.5mL MWCO 10kDa、Merck Millipore)を使用してPBS pH7.4に緩衝液交換した。IdeS消化試料の質量スペクトル分析は、分子内架橋を介して得られたrit-v3-LD03に対応する1つの主生成物(質量49989Da)を示した。
実施例165.歪み促進型アルキン-アジド付加環化(SPAAC)を介したビス-BCN-IL15Rα-IL15 PF27のtrast-v3への分子内架橋(P:A比1:1)
trast-v3(2.57μL、0.05mg、PBS中19.5mg/mL)をビス-BCN-IL15Rα-IL15(PF27、5.6μL、3当量のビス-BCN標識IL15Rα-IL15、PBS中7.6mg/mL)と室温で16時間インキュベートした。IdeS処理後の試料の質量スペクトル分析は、予測生成物trast-v3-PF27に対応する1つの主Fc/2生成物(実測質量73432Da)を示した。
trast-v3(2.57μL、0.05mg、PBS中19.5mg/mL)をビス-BCN-IL15Rα-IL15(PF27、5.6μL、3当量のビス-BCN標識IL15Rα-IL15、PBS中7.6mg/mL)と室温で16時間インキュベートした。IdeS処理後の試料の質量スペクトル分析は、予測生成物trast-v3-PF27に対応する1つの主Fc/2生成物(実測質量73432Da)を示した。
実施例166.SPAACを介したhOKT3-ビス-BCN PF22のtrast-v3への分子内架橋(P:A比1:1)
trast-v3(2.57μL、0.05mg、PBS中19.5mg/mL)をhOKT3-ビス-BCN PF22(5.15μL、3当量、PBS中5.7mg/mL)と室温で16時間インキュベートした。IdeS処理後の試料の質量スペクトル分析は、予測生成物trast-v3-PF22に対応する1つの主Fc/2生成物(実測質量77150Da)を示した。
trast-v3(2.57μL、0.05mg、PBS中19.5mg/mL)をhOKT3-ビス-BCN PF22(5.15μL、3当量、PBS中5.7mg/mL)と室温で16時間インキュベートした。IdeS処理後の試料の質量スペクトル分析は、予測生成物trast-v3-PF22に対応する1つの主Fc/2生成物(実測質量77150Da)を示した。
実施例167.2:1分子フォーマットを有するT細胞エンゲージャー rit-v1a-145-204を得るためのhOKT3-PEG4-テトラジン 204のBCN-リツキシマブ rit-v1a-145へのコンジュゲーション
rit-v1a-145の溶液(287μL、6.6mg、PBS pH7.4中154μM)に、hOKT3-PEG4-テトラジン 204(247μL、1.9mg、PBS pH6.5中269μM、IgGに対して1.5当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートし、引き続いてPBS pH7.4を移動相として使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上Superdex200 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。非還元SDS-PAGE分析は、単一hOKT3にコンジュゲートした抗体からなる1つの主生成物を示し(図16、左のパネル、5レーン参照)、それによって、rit-v1a-145-204の形成を確認した。さらに、還元SDS-PAGEは、単一hOKT3にコンジュゲートした2本の重鎖に対応する1つの主HC生成物を確認している(図16、右のパネル、5レーン参照)。
rit-v1a-145の溶液(287μL、6.6mg、PBS pH7.4中154μM)に、hOKT3-PEG4-テトラジン 204(247μL、1.9mg、PBS pH6.5中269μM、IgGに対して1.5当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートし、引き続いてPBS pH7.4を移動相として使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上Superdex200 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。非還元SDS-PAGE分析は、単一hOKT3にコンジュゲートした抗体からなる1つの主生成物を示し(図16、左のパネル、5レーン参照)、それによって、rit-v1a-145-204の形成を確認した。さらに、還元SDS-PAGEは、単一hOKT3にコンジュゲートした2本の重鎖に対応する1つの主HC生成物を確認している(図16、右のパネル、5レーン参照)。
実施例168.2:1分子フォーマットを有するT細胞エンゲージャー rit-v1a-145-PF01を得るためのhOKT3-PEG11-テトラジン PF01のBCN-リツキシマブ rit-v1a-145へのコンジュゲーション
rit-v1a-145の溶液(247μL、6.3mg、PBS pH7.4中171μM)に、hOKT3-PEG11-テトラジン PF01(304μL、2.0mg、PBS pH6.5中230μM、IgGに対して1.7当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートし、引き続いてPBS pH7.4を移動相として使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上Superdex200 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。非還元SDS-PAGE分析は、単一hOKT3にコンジュゲートした抗体からなる1つの主生成物を示し(図16、左のパネル、6レーン参照)、それによって、rit-v1a-145-PF01の形成を確認した。さらに、還元SDS-PAGEは、単一hOKT3にコンジュゲートした2本の重鎖に対応する1つの主HC生成物を確認している(図16、右のパネル、6レーン参照)。
rit-v1a-145の溶液(247μL、6.3mg、PBS pH7.4中171μM)に、hOKT3-PEG11-テトラジン PF01(304μL、2.0mg、PBS pH6.5中230μM、IgGに対して1.7当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートし、引き続いてPBS pH7.4を移動相として使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上Superdex200 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。非還元SDS-PAGE分析は、単一hOKT3にコンジュゲートした抗体からなる1つの主生成物を示し(図16、左のパネル、6レーン参照)、それによって、rit-v1a-145-PF01の形成を確認した。さらに、還元SDS-PAGEは、単一hOKT3にコンジュゲートした2本の重鎖に対応する1つの主HC生成物を確認している(図16、右のパネル、6レーン参照)。
実施例169.2:1分子フォーマットを有するT細胞エンゲージャー B12-v1a-145-PF01を得るためのhOKT3-PEG11-テトラジン PF01のBCN-B12 B12-v1a-145へのコンジュゲーション
B12-v1a-145の溶液(38μL、1.0mg、PBS pH7.4中178μM)に、hOKT3-PEG11-テトラジン PF01(44μL、0.3mg、PBS pH6.5中230μM、IgGに対して1.5当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートし、引き続いてPBS pH7.4を移動相として使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上Superdex200 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。非還元SDS-PAGE分析は、単一hOKT3にコンジュゲートした抗体からなる1つの主生成物を示し(図20、4レーン参照)、それによって、B12-v1a-145-PF01の形成を確認した。
B12-v1a-145の溶液(38μL、1.0mg、PBS pH7.4中178μM)に、hOKT3-PEG11-テトラジン PF01(44μL、0.3mg、PBS pH6.5中230μM、IgGに対して1.5当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートし、引き続いてPBS pH7.4を移動相として使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上Superdex200 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。非還元SDS-PAGE分析は、単一hOKT3にコンジュゲートした抗体からなる1つの主生成物を示し(図20、4レーン参照)、それによって、B12-v1a-145-PF01の形成を確認した。
実施例170.2:1分子フォーマットを有するT細胞エンゲージャー trast-v1a-XL11-204を得るためのhOKT3-PEG4-テトラジン 204のTCO-トラスツズマブ trast-v1a-XL11へのコンジュゲーション
TCO-トラスツズマブ trast-v1a-XL11の溶液(5.7μL、100μg、PBS pH7.4中117μM)に、hOKT3-PEG4-テトラジン 204(5μL、38μg、PBS pH6.5中269μM、IgGに対して2.0当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートした。非還元SDS-PAGE分析は、非コンジュゲート抗体及び単一hOKT3にコンジュゲートした抗体に対応する2つの主生成物を示し(図22、左のパネル、3レーン参照)、それによって、trast-v1a-XL11-204の形成を確認した。さらに、還元SDS-PAGEは、OKT3がTCO反応性ハンドルを含有する架橋重鎖にコンジュゲートしていることを確認している(図22、右のパネル、3レーン参照)。
TCO-トラスツズマブ trast-v1a-XL11の溶液(5.7μL、100μg、PBS pH7.4中117μM)に、hOKT3-PEG4-テトラジン 204(5μL、38μg、PBS pH6.5中269μM、IgGに対して2.0当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートした。非還元SDS-PAGE分析は、非コンジュゲート抗体及び単一hOKT3にコンジュゲートした抗体に対応する2つの主生成物を示し(図22、左のパネル、3レーン参照)、それによって、trast-v1a-XL11-204の形成を確認した。さらに、還元SDS-PAGEは、OKT3がTCO反応性ハンドルを含有する架橋重鎖にコンジュゲートしていることを確認している(図22、右のパネル、3レーン参照)。
実施例171.2:1分子フォーマットを有するT細胞エンゲージャー rit-v1a-XL11-204を得るためのhOKT3-PEG4-テトラジン 204のTCO-リツキシマブ rit-v1a-XL11へのコンジュゲーション
TCO-リツキシマブ rit-v1a-XL11の溶液(56.3μL、100μg、PBS pH7.4中106μM)に、hOKT3-PEG4-テトラジン 204(5μL、38μg、PBS pH6.5中269μM、IgGに対して2.0当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートした。非還元SDS-PAGE分析は、非コンジュゲート抗体及び単一hOKT3にコンジュゲートした抗体に対応する2つの主生成物を示し(図22、左のパネル、7レーン参照)、それによって、rit-v1a-XL11-204の形成を確認した。さらに、還元SDS-PAGEは、OKT3がTCO反応性ハンドルを含有する架橋重鎖にコンジュゲートしていることを確認している(図22、右のパネル、7レーン参照)。
TCO-リツキシマブ rit-v1a-XL11の溶液(56.3μL、100μg、PBS pH7.4中106μM)に、hOKT3-PEG4-テトラジン 204(5μL、38μg、PBS pH6.5中269μM、IgGに対して2.0当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートした。非還元SDS-PAGE分析は、非コンジュゲート抗体及び単一hOKT3にコンジュゲートした抗体に対応する2つの主生成物を示し(図22、左のパネル、7レーン参照)、それによって、rit-v1a-XL11-204の形成を確認した。さらに、還元SDS-PAGEは、OKT3がTCO反応性ハンドルを含有する架橋重鎖にコンジュゲートしていることを確認している(図22、右のパネル、7レーン参照)。
実施例172.2:1分子フォーマットを有するT細胞エンゲージャー rit-v1a-145-PF02を得るためのhOKT3-PEG23-テトラジン PF02のBCN-リツキシマブ rit-v1a-145へのコンジュゲーション
rit-v1a-145の溶液(247μL、6.3mg、PBS pH7.4中171μM)に、hOKT3-PEG23-テトラジン PF02(262μL、2.0mg、PBS pH6.5中267μM、IgGに対して1.7当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートし、引き続いてPBS pH7.4を移動相として使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上Superdex200 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。非還元SDS-PAGE分析は、単一hOKT3にコンジュゲートした抗体からなる1つの主生成物を示し(図18、左のパネル、7レーン参照)、それによって、rit-v1a-145-PF02の形成を確認した。さらに、還元SDS-PAGEは、単一hOKT3にコンジュゲートした2本の重鎖に対応する1つの主HC生成物を確認している(図18、右のパネル、7レーン参照)。
rit-v1a-145の溶液(247μL、6.3mg、PBS pH7.4中171μM)に、hOKT3-PEG23-テトラジン PF02(262μL、2.0mg、PBS pH6.5中267μM、IgGに対して1.7当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートし、引き続いてPBS pH7.4を移動相として使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上Superdex200 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。非還元SDS-PAGE分析は、単一hOKT3にコンジュゲートした抗体からなる1つの主生成物を示し(図18、左のパネル、7レーン参照)、それによって、rit-v1a-145-PF02の形成を確認した。さらに、還元SDS-PAGEは、単一hOKT3にコンジュゲートした2本の重鎖に対応する1つの主HC生成物を確認している(図18、右のパネル、7レーン参照)。
実施例173.2:1分子フォーマットを有するT細胞エンゲージャー trast-v1a-145-PF03を得るためのhOKT3-PEG2-アリールアジド PF03のBCN-トラスツズマブ trast-v1a-145へのコンジュゲーション
trast-v1a-145の溶液(2.9μL、150μg、PBS pH7.4中347μM)に、hOKT3-PEG2-アリールアジド PF03(4.9μL、56μg、PBS pH7.4中411μM、IgGに対して2.0当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートした。還元試料の質量スペクトル分析は、trast-v1a-145-PF03に対応する1つの主重鎖生成物(実測質量128388Da)を示した。
trast-v1a-145の溶液(2.9μL、150μg、PBS pH7.4中347μM)に、hOKT3-PEG2-アリールアジド PF03(4.9μL、56μg、PBS pH7.4中411μM、IgGに対して2.0当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートした。還元試料の質量スペクトル分析は、trast-v1a-145-PF03に対応する1つの主重鎖生成物(実測質量128388Da)を示した。
実施例174.2:1分子フォーマットを有するT細胞エンゲージャーrit-v1a-145-PF03を得るためのhOKT3-PEG2-アリールアジド PF03のBCN-リツキシマブ rit-v1a-145へのコンジュゲーション
rit-v1a-145の溶液(30μL、1.5mg、PBS pH7.4中337μM)に、hOKT3-PEG2-アリールアジド PF03(49μL、0.6mg、PBS pH7.4中411μM、IgGに対して2.0当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートし、引き続いてPBS pH7.4を移動相として使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上Superdex200 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。還元試料の質量スペクトル分析は、rit-v1a-145-PF03に対応する1つの主重鎖生成物(実測質量128211Da)を示した。
rit-v1a-145の溶液(30μL、1.5mg、PBS pH7.4中337μM)に、hOKT3-PEG2-アリールアジド PF03(49μL、0.6mg、PBS pH7.4中411μM、IgGに対して2.0当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートし、引き続いてPBS pH7.4を移動相として使用して、AKTA Purifier-10(GE Healthcare)上Superdex200 10/300 GLカラム(GE Healthcare)で精製した。還元試料の質量スペクトル分析は、rit-v1a-145-PF03に対応する1つの主重鎖生成物(実測質量128211Da)を示した。
実施例175.2:1分子フォーマットを有するT細胞エンゲージャー trast-v1a-PF22を得るためのビス-BCN-hOKT3 PF22のビス-アジド-トラスツズマブ trast-v1aへのコンジュゲーション
trast-v1aの溶液(1.8μL、100μg、PBS pH7.4中374μM)に、PBS pH7.4(4.5μL)及びビス-BCN-hOKT3 PF22(13.7μL、78μg、PBS pH7.4中194μM、IgGに対して4.0当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートした。非還元SDS-PAGE分析は、単一hOKT3にコンジュゲートした抗体からなる1つの主生成物を示し(図21、5レーン参照)、それによって、trast-v1a-PF22の形成を確認した。
trast-v1aの溶液(1.8μL、100μg、PBS pH7.4中374μM)に、PBS pH7.4(4.5μL)及びビス-BCN-hOKT3 PF22(13.7μL、78μg、PBS pH7.4中194μM、IgGに対して4.0当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートした。非還元SDS-PAGE分析は、単一hOKT3にコンジュゲートした抗体からなる1つの主生成物を示し(図21、5レーン参照)、それによって、trast-v1a-PF22の形成を確認した。
実施例176.2:1分子フォーマットを有するT細胞エンゲージャー rit-v1a-145-PF22を得るためのビス-BCN-hOKT3 PF22のビス-アジド-リツキシマブ rit-v1aへのコンジュゲーション
rit-v1aの溶液(1.8μL、100μg、PBS pH7.4中363μM)に、PBS pH7.4(7.9μL)及びビス-BCN-hOKT3 PF22(10.3μL、58μg、PBS pH7.4中194μM、IgGに対して3.0当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートした。非還元SDS-PAGE分析は、単一hOKT3にコンジュゲートした抗体からなる1つの主生成物を示し(図21、4レーン参照)、それによって、rit-v1a-PF22の形成を確認した。
rit-v1aの溶液(1.8μL、100μg、PBS pH7.4中363μM)に、PBS pH7.4(7.9μL)及びビス-BCN-hOKT3 PF22(10.3μL、58μg、PBS pH7.4中194μM、IgGに対して3.0当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートした。非還元SDS-PAGE分析は、単一hOKT3にコンジュゲートした抗体からなる1つの主生成物を示し(図21、4レーン参照)、それによって、rit-v1a-PF22の形成を確認した。
実施例177.2:1分子フォーマットを有するT細胞エンゲージャー trast-v1a-PF23を得るためのビス-BCN-hOKT3 PF23のビス-アジド-トラスツズマブ trast-v1aへのコンジュゲーション
trast-v1aの溶液(1.8μL、100μg、PBS pH7.4中374μM)に、PBS pH7.4(9.9μL)及びビス-BCN-hOKT3 PF23(8.4μL、58μg、PBS pH7.4中239μM、IgGに対して3.0当量)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。非還元SDS-PAGE分析は、非コンジュゲートトラスツズマブ及びビス-BCN-hOKT3 PF23にコンジュゲートしたトラスツズマブからなる2つの主生成物を示し(図22、2レーン参照)、それによって、trast-v1a-PF23の部分的形成を確認した。
trast-v1aの溶液(1.8μL、100μg、PBS pH7.4中374μM)に、PBS pH7.4(9.9μL)及びビス-BCN-hOKT3 PF23(8.4μL、58μg、PBS pH7.4中239μM、IgGに対して3.0当量)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。非還元SDS-PAGE分析は、非コンジュゲートトラスツズマブ及びビス-BCN-hOKT3 PF23にコンジュゲートしたトラスツズマブからなる2つの主生成物を示し(図22、2レーン参照)、それによって、trast-v1a-PF23の部分的形成を確認した。
実施例178.2:1分子フォーマットを有するT細胞エンゲージャー rit-v1a-PF23を得るためのビス-BCN-hOKT3 PF23のビス-アジド-リツキシマブ rit-v1aへのコンジュゲーション
rit-v1aの溶液(1.8μL、100μg、PBS pH7.4中363μM)に、PBS pH7.4(13.6μL)及びビス-BCN-hOKT3 PF23(4.3μL、30μg、PBS pH7.4中239μM、IgGに対して1.5当量)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。非還元SDS-PAGE分析は、非コンジュゲートリツキシマブ及びビス-BCN-hOKT3 PF23に1回コンジュゲートしたリツキシマブからなる2つの主生成物を示し(図23、5レーン参照)、それによって、rit-v1a-PF23の部分的形成を確認した。
rit-v1aの溶液(1.8μL、100μg、PBS pH7.4中363μM)に、PBS pH7.4(13.6μL)及びビス-BCN-hOKT3 PF23(4.3μL、30μg、PBS pH7.4中239μM、IgGに対して1.5当量)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。非還元SDS-PAGE分析は、非コンジュゲートリツキシマブ及びビス-BCN-hOKT3 PF23に1回コンジュゲートしたリツキシマブからなる2つの主生成物を示し(図23、5レーン参照)、それによって、rit-v1a-PF23の部分的形成を確認した。
実施例179.2:1分子フォーマットを有するT細胞エンゲージャー rit-v1a-145-PF08を得るための4-1BB-PEG11-テトラジン PF08のBCN-リツキシマブ rit-v1a-145へのコンジュゲーション
rit-v1a-145の溶液(35μL、0.9mg、PBS pH7.4中170μM)に、4-1BB-PEG11-テトラジン PF08(40μL、248μg、PBS pH7.4中222μM、IgGに対して1.5当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートした。非還元SDS-PAGE分析は、4-1BB-PEG23-BCN PF08にコンジュゲートしたリツキシマブからなる1つの主生成物を示し(図20、3レーン参照)、それによって、rit-v1a-145-PF08の部分的形成を確認した。
rit-v1a-145の溶液(35μL、0.9mg、PBS pH7.4中170μM)に、4-1BB-PEG11-テトラジン PF08(40μL、248μg、PBS pH7.4中222μM、IgGに対して1.5当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートした。非還元SDS-PAGE分析は、4-1BB-PEG23-BCN PF08にコンジュゲートしたリツキシマブからなる1つの主生成物を示し(図20、3レーン参照)、それによって、rit-v1a-145-PF08の部分的形成を確認した。
実施例180.2:1分子フォーマットを有するT細胞エンゲージャー B12-v1a-145-PF08を得るための4-1BB-PEG11-テトラジン PF08のBCN-B12 B12-v1a-145へのコンジュゲーション
B12-v1a-145の溶液(34μL、0.9mg、PBS pH7.4中178μM)に、4-1BB-PEG11-テトラジン PF08(40μL、248μg、PBS pH7.4中222μM、IgGに対して1.5当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートした。非還元SDS-PAGE分析は、4-1BB-PEG23-BCN PF08にコンジュゲートしたB12からなる1つの主生成物を示し(図20、5レーン参照)、それによって、B12-v1a-145-PF08の部分的形成を確認した。
B12-v1a-145の溶液(34μL、0.9mg、PBS pH7.4中178μM)に、4-1BB-PEG11-テトラジン PF08(40μL、248μg、PBS pH7.4中222μM、IgGに対して1.5当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートした。非還元SDS-PAGE分析は、4-1BB-PEG23-BCN PF08にコンジュゲートしたB12からなる1つの主生成物を示し(図20、5レーン参照)、それによって、B12-v1a-145-PF08の部分的形成を確認した。
実施例181.2:1分子フォーマットを有するT細胞エンゲージャー trast-v1a-145-PF09を得るための4-1BB-PEG2-アリールアジド PF09のBCN-トラスツズマブ trast-v1a-145へのコンジュゲーション
trast-v1a-145の溶液(1.9μL、100μg、PBS pH7.4中347μM)に、4-1BB-PEG2-アリールアジド PF09(5.9μL、37μg、PBS pH7.4中225μM、IgGに対して2.0当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートした。非還元SDS-PAGE分析は、単一4-1BB-PEG2-アリールアジド PF09にコンジュゲートしたトラスツズマブからなる1つの主生成物を示し(図24、4レーン参照)、それによって、trast-v1a-145-PF09の形成を確認した。
trast-v1a-145の溶液(1.9μL、100μg、PBS pH7.4中347μM)に、4-1BB-PEG2-アリールアジド PF09(5.9μL、37μg、PBS pH7.4中225μM、IgGに対して2.0当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートした。非還元SDS-PAGE分析は、単一4-1BB-PEG2-アリールアジド PF09にコンジュゲートしたトラスツズマブからなる1つの主生成物を示し(図24、4レーン参照)、それによって、trast-v1a-145-PF09の形成を確認した。
実施例182.2:1分子フォーマットを有するT細胞エンゲージャー rit-v1a-145-PF09を得るための4-1BB-PEG2-アリールアジド PF09のBCN-リツキシマブ rit-v1a-145へのコンジュゲーション
rit-v1a-145の溶液(2.0μL、100μg、PBS pH7.4中337μM)に、4-1BB-PEG2-アリールアジド PF09(5.9μL、37μg、PBS pH7.4中225μM、IgGに対して2.0当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートした。非還元SDS-PAGE分析は、単一4-1BB-PEG2-アリールアジド PF09にコンジュゲートしたリツキシマブからなる1つの主生成物を示し(図24、2レーン参照)、それによって、rit-v1a-145-PF09の形成を確認した。
rit-v1a-145の溶液(2.0μL、100μg、PBS pH7.4中337μM)に、4-1BB-PEG2-アリールアジド PF09(5.9μL、37μg、PBS pH7.4中225μM、IgGに対して2.0当量)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートした。非還元SDS-PAGE分析は、単一4-1BB-PEG2-アリールアジド PF09にコンジュゲートしたリツキシマブからなる1つの主生成物を示し(図24、2レーン参照)、それによって、rit-v1a-145-PF09の形成を確認した。
実施例183.2:1分子フォーマットを有するT細胞エンゲージャー trast-v1a-145-PF12を得るためのテトラジン-PEG3-GGG-IL15Rα-IL15(PF12)のBCN-トラスツズマブ trast-v1a-145へのコンジュゲーション
trast-v1a-145(75μL、1.575mg、PBS中21mg/mL)をPF12(80μL、2当量、PBS中6.5mg/mL)と37℃で16時間インキュベートした。非還元SDS-PAGEでの分析は、Trast-v1a-145-PF12の形成を確認した(図25、5レーン参照)。
trast-v1a-145(75μL、1.575mg、PBS中21mg/mL)をPF12(80μL、2当量、PBS中6.5mg/mL)と37℃で16時間インキュベートした。非還元SDS-PAGEでの分析は、Trast-v1a-145-PF12の形成を確認した(図25、5レーン参照)。
実施例184.2:1分子フォーマットを有するT細胞エンゲージャー trast-v1a-145-PF13を得るためのアリールアジド-PEG11-GGG-IL15Rα-IL15(PF13)のBCN-トラスツズマブ trast-v1a-145へのコンジュゲーション
trast-v1a-145(280μL、5.2mg、PBS中18.6mg/mL)をPF13(477μL、1.5当量、PBS中2.6mg/mL)と37℃で16時間インキュベートした。IdeS処理後の試料の質量スペクトル分析は、PF13にコンジュゲートした架橋Fcフラグメントに対応する、73991Daの1つの主生成物(予測質量:73989Da)を示し、それによって、trast-v1a-145-PF13の形成を確認した。
trast-v1a-145(280μL、5.2mg、PBS中18.6mg/mL)をPF13(477μL、1.5当量、PBS中2.6mg/mL)と37℃で16時間インキュベートした。IdeS処理後の試料の質量スペクトル分析は、PF13にコンジュゲートした架橋Fcフラグメントに対応する、73991Daの1つの主生成物(予測質量:73989Da)を示し、それによって、trast-v1a-145-PF13の形成を確認した。
実施例185.2:1分子フォーマットを有するT細胞エンゲージャー Rit-v1a-145-PF13を得るためのアリールアジド-PEG11-GGG-IL15Rα-IL15(PF13)のBCN-リツキシマブ Rit-v1a-145へのコンジュゲーション
Rit-v1a-145(0.5μL、0.025mg、PBS中50.6mg/mL)をPF13(6.6μL、4当量、PBS中2.6mg/mL)と室温で16時間インキュベートした。IdeS処理後の試料の質量スペクトル分析は、PF13にコンジュゲートした架橋Fcフラグメントに対応する、73927Daの1つの主生成物(予測質量:73925Da)を示し、それによって、rit-v1a-145-PF13の形成を確認した。
Rit-v1a-145(0.5μL、0.025mg、PBS中50.6mg/mL)をPF13(6.6μL、4当量、PBS中2.6mg/mL)と室温で16時間インキュベートした。IdeS処理後の試料の質量スペクトル分析は、PF13にコンジュゲートした架橋Fcフラグメントに対応する、73927Daの1つの主生成物(予測質量:73925Da)を示し、それによって、rit-v1a-145-PF13の形成を確認した。
実施例186.2:1分子フォーマットを有するT細胞エンゲージャー trast-v1a-145-PF27を得るためのビス-BCN-SYR-(G4S)3-IL15Rα-IL15(PF27)のビス-アジド-トラスツズマブ trast-v1aへのコンジュゲーション
trast-v1a(1.78μL、0.099mg、PBS中56.1mg/mL)をPF27(18.4μL、4当量、PBS中7.62mg/mL)及び2.87μLのPBSと37℃で16時間インキュベートした。IdeS処理後の試料の質量スペクトル分析は、PF27にコンジュゲートした架橋Fcフラグメントに対応する、74193Daの1つの主生成物(予測質量:74178Da)を示し、それによって、trast-v1a-145-PF27の形成を確認した。
trast-v1a(1.78μL、0.099mg、PBS中56.1mg/mL)をPF27(18.4μL、4当量、PBS中7.62mg/mL)及び2.87μLのPBSと37℃で16時間インキュベートした。IdeS処理後の試料の質量スペクトル分析は、PF27にコンジュゲートした架橋Fcフラグメントに対応する、74193Daの1つの主生成物(予測質量:74178Da)を示し、それによって、trast-v1a-145-PF27の形成を確認した。
実施例187.2:1分子フォーマットを有するT細胞エンゲージャーRit-v1a-145-PF27を得るためのビス-BCN-SYR-(G4S)3-IL15Rα-IL15(PF27)のビス-アジド-リツキシマブ Rit-v1aへのコンジュゲーション
Rit-v1a(1μL、0.055mg、PBS中54.6mg/mL)をPF27(8.9μL、4当量、PBS中6.2mg/mL)及び1.6μLのPBSと37℃で16時間インキュベートした。IdeS処理後の試料の質量スペクトル分析は、PF27にコンジュゲートした架橋Fcフラグメントに対応する、74118Daの1つの主生成物(予測質量:74114Da)を示し、それによって、rit-v1a-145-PF27の形成を確認した。
Rit-v1a(1μL、0.055mg、PBS中54.6mg/mL)をPF27(8.9μL、4当量、PBS中6.2mg/mL)及び1.6μLのPBSと37℃で16時間インキュベートした。IdeS処理後の試料の質量スペクトル分析は、PF27にコンジュゲートした架橋Fcフラグメントに対応する、74118Daの1つの主生成物(予測質量:74114Da)を示し、それによって、rit-v1a-145-PF27の形成を確認した。
実施例188.2:1分子フォーマットを有するT細胞エンゲージャー trast-v1a-145-PF17を得るためのアジド-IL15Rα-IL15 PF17のBCN-トラスツズマブ trast-v1a-145へのコンジュゲーション
trast-v1a-145の溶液(29μL、1.5mg、PBS pH7.4中347μM)に、アジド-IL15Rα-IL15 PF17(97μL、1.1mg、PBS pH7.4中411μM、IgGに対して4.0当量)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。非還元SDS-PAGE分析は、単一アジド-IL15Rα-IL15 PF17にコンジュゲートしたトラスツズマブからなる1つの主生成物を示し(図26、4レーン参照)、それによって、trast-v1a-145-PF17の形成を確認した。
trast-v1a-145の溶液(29μL、1.5mg、PBS pH7.4中347μM)に、アジド-IL15Rα-IL15 PF17(97μL、1.1mg、PBS pH7.4中411μM、IgGに対して4.0当量)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。非還元SDS-PAGE分析は、単一アジド-IL15Rα-IL15 PF17にコンジュゲートしたトラスツズマブからなる1つの主生成物を示し(図26、4レーン参照)、それによって、trast-v1a-145-PF17の形成を確認した。
実施例189.2:1分子フォーマットを有するT細胞エンゲージャー rit-v1a-145-PF17を得るためのアジド-IL15Rα-IL15 PF17のBCN-リツキシマブ rit-v1a-145へのコンジュゲーション
rit-v1a-145の溶液(3μL、150μg、PBS pH7.4中337μM)に、アジド-IL15Rα-IL15 PF17(9.7μL、111μg、PBS pH7.4中411μM、IgGに対して4.0当量)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。非還元SDS-PAGE分析は、単一アジド-IL15Rα-IL15 PF17にコンジュゲートしたリツキシマブからなる1つの主生成物を示し(図26、2レーン参照)、それによって、rit-v1a-145-PF17の形成を確認した。
rit-v1a-145の溶液(3μL、150μg、PBS pH7.4中337μM)に、アジド-IL15Rα-IL15 PF17(9.7μL、111μg、PBS pH7.4中411μM、IgGに対して4.0当量)を添加した。反応物を37℃で一晩インキュベートした。非還元SDS-PAGE分析は、単一アジド-IL15Rα-IL15 PF17にコンジュゲートしたリツキシマブからなる1つの主生成物を示し(図26、2レーン参照)、それによって、rit-v1a-145-PF17の形成を確認した。
実施例190.2:1分子フォーマットを有するT細胞エンゲージャー tras-v1a-145-PF19を得るためのアジド-IL15 PF19のBCN-トラスツズマブ tras-v1a-145へのコンジュゲーション
trast-v1a-145(4.0μL、0.075mg、PBS中18.6mg/mL)をPF19(4.6μL、5当量、PBS中7.7mg/mL)と室温で16時間インキュベートした。IdeS処理後の試料の質量スペクトル分析は、PF19にコンジュゲートした架橋Fcフラグメントに対応する、63941Daの1つの主生成物(予測質量:63936Da)を示し、それによって、trast-v1a-145-PF19の形成を確認した。
trast-v1a-145(4.0μL、0.075mg、PBS中18.6mg/mL)をPF19(4.6μL、5当量、PBS中7.7mg/mL)と室温で16時間インキュベートした。IdeS処理後の試料の質量スペクトル分析は、PF19にコンジュゲートした架橋Fcフラグメントに対応する、63941Daの1つの主生成物(予測質量:63936Da)を示し、それによって、trast-v1a-145-PF19の形成を確認した。
実施例191.2:1分子フォーマットを有するT細胞エンゲージャー rit-v1a-145-PF19を得るためのアジド-IL15 PF19のBCN-リツキシマブ rit-v1a-145へのコンジュゲーション
rit-v1a-145(2.0μL、0.112mg、PBS中50.6mg/mL)をPF19(5.1μL、4当量、PBS中7.7mg/mL)と室温で16時間インキュベートした。IdeS処理後の試料の質量スペクトル分析は、PF19にコンジュゲートした架橋Fcフラグメントに対応する、63882Daの1つの主生成物を示し(予測質量:63879Da)、それによって、rit-v1a-145-PF19の形成を確認した。
rit-v1a-145(2.0μL、0.112mg、PBS中50.6mg/mL)をPF19(5.1μL、4当量、PBS中7.7mg/mL)と室温で16時間インキュベートした。IdeS処理後の試料の質量スペクトル分析は、PF19にコンジュゲートした架橋Fcフラグメントに対応する、63882Daの1つの主生成物を示し(予測質量:63879Da)、それによって、rit-v1a-145-PF19の形成を確認した。
実施例192.2:1分子フォーマットを有するT細胞エンゲージャー Tras-v1a-PF29を得るためのビス-BCN-SYR-(G4S)3-IL15(PF29)のビス-アジド-トラスツズマブ tras-v1aへのコンジュゲーション
trast-v1a(1μL、0.056mg、PBS中56.1mg/mL)をPF29(11μL、4当量、PBS中3.6mg/mL)と37℃で16時間インキュベートした。非還元SDS-PAGE分析は、非コンジュゲートトラスツズマブ及び単一ビス-BCN-SYR-(G4S)3-IL15 PF29にコンジュゲートしたトラスツズマブに対応する2つの主生成物を示し(図27、2レーン参照)、それによって、Tras-v1a-PF29への部分的変換を確認した。
trast-v1a(1μL、0.056mg、PBS中56.1mg/mL)をPF29(11μL、4当量、PBS中3.6mg/mL)と37℃で16時間インキュベートした。非還元SDS-PAGE分析は、非コンジュゲートトラスツズマブ及び単一ビス-BCN-SYR-(G4S)3-IL15 PF29にコンジュゲートしたトラスツズマブに対応する2つの主生成物を示し(図27、2レーン参照)、それによって、Tras-v1a-PF29への部分的変換を確認した。
実施例193.2:1分子フォーマットを有するT細胞エンゲージャー Rit-v1a-PF29を得るためのビス-BCN-SYR-(G4S)3-IL15(PF29)のビス-アジド-リツキシマブ Rit-v1aへのコンジュゲーション
Rit-v1a(1μL、0.055mg、PBS中54.6mg/mL)をPF29(11μL、4当量、PBS中3.6mg/mL)と37℃で16時間インキュベートした。非還元SDS-PAGE分析は、非コンジュゲートリツキシマブ及び単一ビス-BCN-SYR-(G4S)3-IL15 PF29にコンジュゲートしたリツキシマブに対応する2つの主生成物を示し(図27、4レーン参照)、それによって、rit-v1a-PF29への部分的変換を確認した。
Rit-v1a(1μL、0.055mg、PBS中54.6mg/mL)をPF29(11μL、4当量、PBS中3.6mg/mL)と37℃で16時間インキュベートした。非還元SDS-PAGE分析は、非コンジュゲートリツキシマブ及び単一ビス-BCN-SYR-(G4S)3-IL15 PF29にコンジュゲートしたリツキシマブに対応する2つの主生成物を示し(図27、4レーン参照)、それによって、rit-v1a-PF29への部分的変換を確認した。
実施例194.2:1分子フォーマットを有するT細胞エンゲージャー trast-v1a-145-PF21を得るためのテトラジン-PEG12-SYR-(G4S)3-IL15(PF21)のBCN-トラスツズマブ trast-v1a-145へのコンジュゲーション
trast-v1a(2μL、0.042mg、PBS中21mg/mL)をPF21(10μL、6.7当量、PBS中2.9mg/mL)と37℃で16時間インキュベートした。IdeS処理後の試料の質量スペクトル分析は、PF21にコンジュゲートした架橋Fcフラグメントに対応する、64865Daの1つの主生成物を示し(予測質量:64863Da)、それによって、trast-v1a-145-PF21の形成を確認した。
trast-v1a(2μL、0.042mg、PBS中21mg/mL)をPF21(10μL、6.7当量、PBS中2.9mg/mL)と37℃で16時間インキュベートした。IdeS処理後の試料の質量スペクトル分析は、PF21にコンジュゲートした架橋Fcフラグメントに対応する、64865Daの1つの主生成物を示し(予測質量:64863Da)、それによって、trast-v1a-145-PF21の形成を確認した。
実施例195.CD3結合分析
細胞表面でCD3を発現するJurkat E6.1細胞及び細胞表面でCD3を発現しないMOLT-4細胞を使用して、CD3への特異的結合を評価した。両細胞株を、2×105~1×106細胞/mlの濃度で、1%ペニシリン/ストレプトマイシン及び10%ウシ胎児血清を補充したRPMI 1640中で培養した。細胞を実験前に新鮮な培地で洗浄し、1ウェル当たり100,000個の細胞を96ウェルプレート(2連ウェル)に播種した。6つの抗体の希釈系列をリン酸緩衝生理食塩水(PBS)で作製した。抗体を細胞懸濁液に10倍希釈し、暗所中4℃で30分間インキュベートした。インキュベーション後、細胞を冷PBS/0.5%BSAで2回洗浄し、暗所中4℃で30分間、抗HIS-PE(200についてのみ)又は抗IgG1-PE(他の全ての化合物)とインキュベートした。第2のインキュベーションステップ後、細胞を2回洗浄した。7AADをlive-dead染色として添加した。Yellow-Bチャネル(抗IgG1-PE及び抗HIS-PE)及びRed-Bチャネル(7AAD)での蛍光の検出をGuava 5HTフローサイトメーターで行った。生細胞におけるYellow-Bチャネル(抗IgG1-PE及び抗HIS-PE)の蛍光強度中央値をKaluzaソフトウェアで決定した。全ての二重特異性抗体(但し、陰性対照リツキシマブは除く)が、CD3陽性Jurkat E6.1細胞株への濃度依存的結合を示す(表1)。対照的に、CD3陰性MOLT-4細胞株への結合は観察されなかった(表2)。
細胞表面でCD3を発現するJurkat E6.1細胞及び細胞表面でCD3を発現しないMOLT-4細胞を使用して、CD3への特異的結合を評価した。両細胞株を、2×105~1×106細胞/mlの濃度で、1%ペニシリン/ストレプトマイシン及び10%ウシ胎児血清を補充したRPMI 1640中で培養した。細胞を実験前に新鮮な培地で洗浄し、1ウェル当たり100,000個の細胞を96ウェルプレート(2連ウェル)に播種した。6つの抗体の希釈系列をリン酸緩衝生理食塩水(PBS)で作製した。抗体を細胞懸濁液に10倍希釈し、暗所中4℃で30分間インキュベートした。インキュベーション後、細胞を冷PBS/0.5%BSAで2回洗浄し、暗所中4℃で30分間、抗HIS-PE(200についてのみ)又は抗IgG1-PE(他の全ての化合物)とインキュベートした。第2のインキュベーションステップ後、細胞を2回洗浄した。7AADをlive-dead染色として添加した。Yellow-Bチャネル(抗IgG1-PE及び抗HIS-PE)及びRed-Bチャネル(7AAD)での蛍光の検出をGuava 5HTフローサイトメーターで行った。生細胞におけるYellow-Bチャネル(抗IgG1-PE及び抗HIS-PE)の蛍光強度中央値をKaluzaソフトウェアで決定した。全ての二重特異性抗体(但し、陰性対照リツキシマブは除く)が、CD3陽性Jurkat E6.1細胞株への濃度依存的結合を示す(表1)。対照的に、CD3陰性MOLT-4細胞株への結合は観察されなかった(表2)。
実施例196.FcRn結合分析
単一サイクル速度論を使用したBiacore T200(シリアル番号1909913)を使用し、Biacore T200 Evaluation Software V2.0.1を実行して、FcRn受容体への結合をpH7.4及びpH6.0で決定した。標準的なアミン化学を使用して、酢酸ナトリウムpH5.5中でCM5チップをFcRnとカップリングした。二重特異性抗体の段階希釈及び対照を、0.05% tween-20を用いてPBS pH7.4中で(9点;2倍希釈系列;最高濃度8000nM)、及び0.05% tween-20を用いてPBS pH6.0中で(3点;2倍希釈系列;最高濃度4000nM)測定した。流量30μl/分、及び会合時間40秒及び解離時間75秒を使用した。定常状態分析を使用して試料を分析した。FcRn結合はpH6.0で全ての二重特異性抗体について観察されたが、pH7.4では結合が観察されなかった(表3)。
単一サイクル速度論を使用したBiacore T200(シリアル番号1909913)を使用し、Biacore T200 Evaluation Software V2.0.1を実行して、FcRn受容体への結合をpH7.4及びpH6.0で決定した。標準的なアミン化学を使用して、酢酸ナトリウムpH5.5中でCM5チップをFcRnとカップリングした。二重特異性抗体の段階希釈及び対照を、0.05% tween-20を用いてPBS pH7.4中で(9点;2倍希釈系列;最高濃度8000nM)、及び0.05% tween-20を用いてPBS pH6.0中で(3点;2倍希釈系列;最高濃度4000nM)測定した。流量30μl/分、及び会合時間40秒及び解離時間75秒を使用した。定常状態分析を使用して試料を分析した。FcRn結合はpH6.0で全ての二重特異性抗体について観察されたが、pH7.4では結合が観察されなかった(表3)。
実施例197.ヒトPBMCを用いたRaji-B腫瘍細胞殺傷に対する二重特異性抗体の効果
2連ウェルに、96ウェルプレートでRaji-B細胞(5e4細胞)及びヒトPBMC(5e5)(1:10細胞比)を蒔いた。二重特異性抗体の段階希釈(1:10希釈;8点;最高濃度10nM)をウェルに添加し、組織培養インキュベーター中37℃で24時間インキュベートした。試料をCD19、CD20抗体で染色し、BD Fortessa Cell Analyzerの取得前にヨウ化プロピジウムを添加した。生RajiB細胞を、フローサイトメトリー分析を介したPI-/CD19+/CD20+染色に基づいて定量化した。未処理細胞に対する、生RajiB細胞のパーセンテージを計算した。hOKT3 200に基づく二重特異性抗体(図28)と抗4-1BB PF31に基づく二重特異性抗体(図29)の両方について、標的依存性細胞殺傷が実証された。
2連ウェルに、96ウェルプレートでRaji-B細胞(5e4細胞)及びヒトPBMC(5e5)(1:10細胞比)を蒔いた。二重特異性抗体の段階希釈(1:10希釈;8点;最高濃度10nM)をウェルに添加し、組織培養インキュベーター中37℃で24時間インキュベートした。試料をCD19、CD20抗体で染色し、BD Fortessa Cell Analyzerの取得前にヨウ化プロピジウムを添加した。生RajiB細胞を、フローサイトメトリー分析を介したPI-/CD19+/CD20+染色に基づいて定量化した。未処理細胞に対する、生RajiB細胞のパーセンテージを計算した。hOKT3 200に基づく二重特異性抗体(図28)と抗4-1BB PF31に基づく二重特異性抗体(図29)の両方について、標的依存性細胞殺傷が実証された。
実施例198.Raji-B腫瘍細胞及びヒトPBMCの共培養におけるサイトカイン分泌に対する二重特異性抗体の効果
2連ウェルに、96ウェルプレートでRaji-B細胞(5e4細胞)及びヒトPBMC(5e5)(1:10細胞比)を蒔いた。二重特異性抗体の段階希釈(1:10希釈;8点;最高濃度10nM)をウェルに添加し、組織培養インキュベーター中37℃で24時間インキュベートした。TNF-α、IFN-γ及びIL-10についてのサイトカイン分析を上清で行った(キット:HCYTOMAG-60K-05、Merck Millipore)。図30はhOKT3 200に基づく二重特異性抗体についてのサイトカインレベルを示し、図31は抗4-1BB PF31に基づく二重特異性抗体についてのサイトカインレベルを示す。
2連ウェルに、96ウェルプレートでRaji-B細胞(5e4細胞)及びヒトPBMC(5e5)(1:10細胞比)を蒔いた。二重特異性抗体の段階希釈(1:10希釈;8点;最高濃度10nM)をウェルに添加し、組織培養インキュベーター中37℃で24時間インキュベートした。TNF-α、IFN-γ及びIL-10についてのサイトカイン分析を上清で行った(キット:HCYTOMAG-60K-05、Merck Millipore)。図30はhOKT3 200に基づく二重特異性抗体についてのサイトカインレベルを示し、図31は抗4-1BB PF31に基づく二重特異性抗体についてのサイトカインレベルを示す。
配列表
C末端ソルターゼA認識配列の配列識別(配列番号1):
GGGGSGGGGSLPETGGHHHHHHHHHH
ソルターゼAの配列識別(配列番号2):
TGSHHHHHHGSKPHIDNYLHDKDKDEKIEQYDKNVKEQASKDKKQQAKPQIPKDKSKVAGYIEIPDADIKEPVYPGPATPEQLNRGVSFAEENESLDDQNISIAGHTFIDRPNYQFTNLKAAKKGSMVYFKVGNETRKYKMTSIRDVKPTDVGVLDEQKGKDKQLTLITCDDYNEKTGVWEKRKIFVATEVK
His6-TEV部位-GGG-IL15Rα-IL15の配列識別(配列番号3):
MGSSHHHHHHSSGENLYFQGGGITCPPPMSVEHADIWVKSYSLYSRERYICNSGFKRKAGTSSLTECVLNKATNVAHWTTPSLKCIRDPALVHQRPAPPSGGSGGGGSGGGSGGGGSLQNWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS
抗4-1BB PF31の配列識別(配列番号4):
DIVMTQSPPTLSLSPGERVTLSCRASQSISDYLHWYQQKPGQSPRLLIKYASQSISGIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQDGHSFPPTFGGGTKVEIKGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSQVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFSSYWMHWVRQAPGQRLEWMGEINPGNGHTNYSQKFQGRVTITVDKSASTAYMELSSLRSEDTAVYYCARSFTTARAFAYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSLPETGGHHHHHH
SYR-(G4S)3-IL15(PF18)の配列識別(配列番号5):
SYRGGGGSGGGGSGGGGSNWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS
SYR-(G4S)3-IL15Rα-リンカー-IL15(PF26)の配列識別(配列番号6):
SYRGGGGSGGGGSGGGGSITCPPPMSVEHADIWVKSYSLYSRERYICNSGFKRKAGTSSLTECVLNKATNVAHWTTPSLKCIRDPALVHQRPAPPSGGSGGGGSGGGSGGGGSLQNWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS
C末端ソルターゼA認識配列の配列識別(配列番号1):
GGGGSGGGGSLPETGGHHHHHHHHHH
ソルターゼAの配列識別(配列番号2):
TGSHHHHHHGSKPHIDNYLHDKDKDEKIEQYDKNVKEQASKDKKQQAKPQIPKDKSKVAGYIEIPDADIKEPVYPGPATPEQLNRGVSFAEENESLDDQNISIAGHTFIDRPNYQFTNLKAAKKGSMVYFKVGNETRKYKMTSIRDVKPTDVGVLDEQKGKDKQLTLITCDDYNEKTGVWEKRKIFVATEVK
His6-TEV部位-GGG-IL15Rα-IL15の配列識別(配列番号3):
MGSSHHHHHHSSGENLYFQGGGITCPPPMSVEHADIWVKSYSLYSRERYICNSGFKRKAGTSSLTECVLNKATNVAHWTTPSLKCIRDPALVHQRPAPPSGGSGGGGSGGGSGGGGSLQNWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS
抗4-1BB PF31の配列識別(配列番号4):
DIVMTQSPPTLSLSPGERVTLSCRASQSISDYLHWYQQKPGQSPRLLIKYASQSISGIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQDGHSFPPTFGGGTKVEIKGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSQVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFSSYWMHWVRQAPGQRLEWMGEINPGNGHTNYSQKFQGRVTITVDKSASTAYMELSSLRSEDTAVYYCARSFTTARAFAYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSLPETGGHHHHHH
SYR-(G4S)3-IL15(PF18)の配列識別(配列番号5):
SYRGGGGSGGGGSGGGGSNWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS
SYR-(G4S)3-IL15Rα-リンカー-IL15(PF26)の配列識別(配列番号6):
SYRGGGGSGGGGSGGGGSITCPPPMSVEHADIWVKSYSLYSRERYICNSGFKRKAGTSSLTECVLNKATNVAHWTTPSLKCIRDPALVHQRPAPPSGGSGGGGSGGGSGGGGSLQNWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS
Claims (23)
- Zが[4+2]付加環化又は1,3-双極子付加環化によって得ることができる、請求項1に記載の抗体-ペイロードコンジュゲート。
- Zがトリアゾール、シクロヘキセン、シクロヘキサジエン、イソオキサゾリン、イソオキサゾリジン、ピラゾリン、ピペラジンを含有する、請求項1又は2に記載の抗体-ペイロードコンジュゲート。
- L1、L2及びL3の各々が、存在する場合、C、N、O、S及びPから選択される少なくとも2個、好ましくは5~100個の原子の鎖である、請求項1~3のいずれか一項に記載の抗体-ペイロードコンジュゲート。
- a及びbが1であり、好ましくはL1とL2が同じであり、より好ましくは前記抗体-ペイロードコンジュゲートが請求項5に記載のものであり、出現するSu、Z、G及びeの各々も同じである、請求項1~5のいずれか一項に記載の抗体-ペイロードコンジュゲート。
- 分岐部分BMが炭素原子、窒素原子、リン原子、(複素)芳香環、(複素)環又は多環式部分から選択される、請求項1~6のいずれか一項に記載の抗体-ペイロードコンジュゲート。
- L3が-(L4)n-(L5)o-(L6)p-(L7)q-(式中、L4、L5、L6及びL7は一緒になってリンカーL3を形成するリンカーであり;n、o、p及びqは個別に0又は1であり、好ましくは
(a)リンカーL4は-(W)k1-(A)d1-(B)e1-(A)f1-(B)g1-C(O)-(式中、
d1=0又は1であり;
e1=1~10の範囲の整数であり;
f1=0又は1であり;
g1=0~10の範囲の整数であり;
k1=0又は1であり、但し、k1=1である場合、d1=0であり;
Aは構造(23)
(式中、a1=0又は1であり、R13は水素、C1~C24アルキル基、C3~C24シクロアルキル基、C2~C24(ヘテロ)アリール基、C3~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC3~C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群から選択され、前記C1~C24アルキル基、C3~C24シクロアルキル基、C2~C24(ヘテロ)アリール基、C3~C24アルキル(ヘテロ)アリール基及びC3~C24(ヘテロ)アリールアルキル基は任意選択で置換されており、O、S及びNR14から選択される1個又は複数のヘテロ原子によって任意選択で中断されており、R14は水素及びC1~C4アルキル基からなる群から独立的に選択される、又はR13は、おそらくスペーサー部分を介して、Nに接続されたDである)
によるスルファミド基であり;
Bは-CH2-CH2-O-若しくは-O-CH2-CH2-部分であるか、又は(B)e1は-(CH2-CH2-O)e3-CH2-CH2-部分(式中、e3はe1と同じ方法で定義される)であり;
Wは-OC(O)-、-C(O)O-、-C(O)NH-、-NHC(O)-、-OC(O)NH-、-NHC(O)O-、-C(O)(CH2)mC(O)-、-C(O)(CH2)mC(O)NH-又は-(4-Ph)CH2NHC(O)(CH2)mC(O)NH-(式中、mは0~10の範囲の整数である)である)
によって表される;
及び/又は
(b)リンカーL5はペプチドスペーサー、好ましくはL5が一般構造(27):
(式中、R17=CH3又はCH2CH2CH2NHC(O)NH2である)
によって表されるジペプチドである;
及び/又は
(c)リンカーL6は自壊性スペーサー、好ましくは構造(25)
(式中、R3はH、R4又はC(O)R4であり、R4は、任意選択で置換されており、O、S及びNR5から選択される1個又は複数のヘテロ原子によって任意選択で中断されているC1~C24(ヘテロ)アルキル基、C3~C10(ヘテロ)シクロアルキル基、C2~C10(ヘテロ)アリール基、C3~C10アルキル(ヘテロ)アリール基及びC3~C10(ヘテロ)アリールアルキル基であり、R5は水素及びC1~C4アルキル基からなる群から独立的に選択され、好ましくはR3はH又はC(O)R4であり、R4=4-メチル-ピペラジン又はモルホリンであり、最も好ましくはR3はHである)
によるパラ-アミノベンジルオキシカルボニル(PABC)誘導体である;
及び/又は
(d)リンカーL7は構造-N-(Cx-アルキレン)-C(O)-(式中、xは1~10の範囲の整数である)によるアミノアルカン酸スペーサーであるか;若しくは
リンカーL7は構造-N-(CH2-CH2-O)e6-(CH2)e7-C(O)-(式中、e6は1~10の範囲の整数であり、e7は1~3の範囲の整数である)によるエチレングリコールスペーサーである)
である、請求項1~7のいずれか一項に記載の抗体-ペイロードコンジュゲート。 - DがPBD二量体、インドリノベンゾジアゼピン二量体(IGN)、エンジイン、PNU159,682、デュオカルマイシン二量体、アマニチン及びオーリスタチン、好ましくはPBD二量体、インドリノベンゾジアゼピン二量体(IGN)、エンジイン又はPNU159,682から選択される細胞毒である、請求項1~8のいずれか一項に記載の抗体-ペイロードコンジュゲート。
- 仮定のペイロード抗体比1を有する抗体-ペイロードコンジュゲートを調製する方法であって、
(a)少なくとも2つの反応性基Qを含有する構造(2)を有する化合物を、2つの反応性基Fで対称的に官能化されている構造(3)を有する抗体と反応させて:
(式中、
Abは抗体であり;
a、b及びcはそれぞれ個別に0又は1であり;
L1、L2及びL3はリンカーであり;
Vは反応性基Q’又はペイロードDであり;
BMは分岐部分であり;
Q及びFは、これらが連結して接続基Zになる付加環化反応を受けることができる反応性基である)
構造(1):
(式中、Zは、QとFの付加環化反応によって得られる接続基であり:
構造(1’)による官能化抗体は、VがペイロードDである場合、抗体-ペイロードコンジュゲートであるか;又は構造(1’)による官能化抗体は、Vが反応性基Q’である場合、ステップ(b)によりさらに反応させられる)
による官能化抗体を得るステップと;
(b)V=Q’である場合、反応性基Q’を、反応性基F’を含有するペイロードと反応させて、VがペイロードDである抗体-ペイロードコンジュゲートを得るステップと
を含む方法。 - 前記付加環化反応が[4+2]付加環化又は1,3-双極子付加環化である、請求項10に記載の方法。
- Qが末端アルキン又はシクロオクチン部分、好ましくはQがビシクロノニン(BCN)、アザジベンゾシクロオクチン(DIBAC/DBCO)、ジベンゾシクロオクチン(DIBO)又はスルホニル化ジベンゾシクロオクチン(s-DIBO)、より好ましくはBCN又はDIBAC/DBCO、最も好ましくはBCNを含む、請求項10又は11に記載の方法。
- ステップ(a)で、構造(1)による官能化抗体が得られ、Dが前記ペイロードであり、ステップ(b)が実施されない、請求項10~12のいずれか一項に記載の方法。
- ステップ(a)で、構造(1)による官能化抗体が得られ、Dが反応性基Qであり、ステップ(b)が実施される、請求項10~13のいずれか一項に記載の方法。
- Qがビシクロノニン(BCN)、アザジベンゾシクロオクチン(DIBAC/DBCO)、ジベンゾシクロオクチン(DIBO)又はスルホニル化ジベンゾシクロオクチン(s-DIBO)、より好ましくはBCN又はDIBAC/DBCO、最も好ましくはBCNである、請求項15に記載の化合物。
- Dが細胞毒である、請求項15又は16に記載の化合物。
- L1とL2が共に存在し、同一である、請求項15~17のいずれか一項に記載の化合物。
- a=b=c=1である、請求項15~18のいずれか一項に記載の化合物。
- 請求項1~9のいずれか一項に記載の抗体-ペイロードコンジュゲートと、薬学的に許容できる担体とを含む医薬組成物。
- それを必要とする対象の処置に使用するための請求項1~9のいずれか一項に記載の抗体-ペイロードコンジュゲート。
- がんの処置に使用するための請求項1~9のいずれか一項に記載の抗体-ペイロードコンジュゲート。
- e=0であり、前記コンジュゲートがFcガンマ受容体CD16に結合しない、請求項21又は22に記載の抗体-ペイロードコンジュゲート。
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