JP2023538160A - Bacillus xiaoxiensis及びその使用 - Google Patents
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Abstract
Description
(1)本発明が提供するBacillus xiaoxiensis STB08は、純度が高いβ-シクロデキストリングリコシルトランスフェラーゼを分泌することができ、当該酵素は、熱安定性がよく、50℃以下で2時間保温した場合、その酵素活性が80%以上に維持され、60℃及び65℃下での半減期がそれぞれ42分間及び9分間である。そのため、産業上の応用において潜在価値を有し、シクロデキストリンの調製に有利である。また、マルトデキストリンを分解して得られるβ-シクロデキストリンが11.6g/Lに達し、総シクロデキストリンの74.3%を占め、比較的に高いβ-シクロデキストリン生成特異性を有する。
(2)本発明は、平板培養の条件及び種子培養の条件の最適化により、Bacillus xiaoxiensis STB08の迅速かつ正常な増殖を実現し、菌の保存とその後の利用に有利である。
(3)本発明は、発酵培養の条件の最適化により、β-シクロデキストリングリコシルトランスフェラーゼの高分泌性及び高純度の発現性を実現する。
Bacillus xiaoxiensis STB08は、分類されてBacillus xiaoxiensisと命名され、2021年5月28日に中国微生物株保存管理委員会総合微生物センターに保存された。その受託番号がCGMCC NO.22625であり、保存所の住所は北京市朝陽区北辰西路1号院3番である。
適切に希釈した酵素溶液0.1mLを取り、予め10mMのリン酸緩衝液(pH6.5)を用いて調製した1%(w/v)のマルトデキストリン(DE=4)溶液を0.9mL入れた試験管に加え、50℃下で10分間反応させた後、30mMのNaOHを3.5mL加えて反応を停止させ、5mMのNa2CO3溶液を用いて調製した0.02%(w/v)のフェノールフタレイン溶液をさらに0.5mL加え、室温下で20分間発色させ、550nmにおける吸光度を測定する。失活した酵素をブランクとする。酵素活性単位は、上記の条件下で1分間当たり1μmolのβ-シクロデキストリンを生成するのに必要な酵素量を酵素活性単位と定義する。
シクロデキストリングリコシルトランスフェラーゼの純度は、SDS-PAGEゲル電気泳動により測定する。Beyotime Biotechnology製のSDS-PAGE Gel Rapid Preparation Kitの説明書を参考してSDS-PAGEゲルを調製し、電気泳動に供する。ここで、用いられる濃縮ゲルの濃度は5%であり、用いられる分離ゲルの濃度は10%であり、また、0.125%のCoomassie Brilliant Blue G-250を用いて染色を行う。最後に、ゲルイメージングアナライザーを用いて電気泳動解析を行う。
1.分離:澱粉工場の周辺の土壌を採取して無菌瓶に入れ、常法により平皿から菌株を15株分離した。
(1)物理化学的性質の解析
プレート上の菌株を種子培地に接種して活性化させた後、活性化液を発酵培地に添加して発酵させた。当該発酵液を遠心分離により収集して酵素活性を測定し、酵素活性が最も高い菌株を選別して菌株の同定を行った。
(2)菌株の同定方法
PCRにより16S rRNAの遺伝子配列を増幅し、菌株の同定を行った。菌株16S rRNAのPCR増幅プライマーは、27F(5’-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3’、配列番号3で示される);1492R(5-AAGTCGTAACAAGGTAACC-3’、配列番号3で示される)である。
Blast(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)を用いて、測定された菌株の16S rRNA配列をデータベース中の既知菌株の16S rRNAと比較して解析した。配列決定の結果によると、当該菌株の16S rRNA配列は、合計で1413bpであった。なお、Bacillus xiaoxiensis STB08の16S rRNA配列は、配列番号5で示されるとおりである。また、最も相同性の高い5つの菌種を表1に列挙している。表1からわかるように、Blastを用いて比較・同定を行った結果、これは、Bacillus xiaoxiensisの16S rRNA配列と最も相同性が高く、6個の塩基という差しかないと、確認された。同時に、何らかの基準株又は非基準株との配列相同性が99%以上であることを満たし、且つ他の菌種よりも0.8%高かった。そのため、同定の結果に基づき、当該菌株は、Bacillus xiaoxiensisに由来するものと断定し、Bacillus xiaoxiensis STB08と命名した。
Bacillus xiaoxiensis STB08は、以下の方法で培養した。
Bacillus xiaoxiensis STB08の菌液を接種用ループで着けて取り、用意しておいたプレート培地(酵母粉末 6g/L、魚のペプトン 6g/L、K2HPO4・3H2O 1g/L、タピオカでん粉 12g/L、MgSO4・7H2O 0.2g/L、寒天 15g/Lからなり、NaOHでpH10.0に調整した)上でスクライビングし、30℃のインキュベーターに入れて12時間培養した。
プレート上からシングルコロニーをピックアップして種子培地に接種し、30℃、200rpmで培養した。
Bacillus xiaoxiensis STB08は、以下の方法で培養する。
Bacillus xiaoxiensis STB08の菌液を接種用ループで着けて取り、用意しておいたプレート培地(酵母粉末 6g/L、魚のペプトン 6g/L、K2HPO4・3H2O 1g/L、タピオカでん粉 12g/L、MgSO4・7H2O 0.2g/L、寒天 15g/Lからなり、NaOHでpH10.0に調整した)上でスクライビングし、30℃のインキュベーターに入れて12時間培養した。
プレート上からシングルコロニーをピックアップして種子培地(酵母粉末 6g/L、魚のペプトン 6g/L、K2HPO4・3H2O 1g/L、タピオカでん粉 12g/L、MgSO4・7H2O 0.2g/Lからなり、NaOHでpH10.0に調整した)に接種し、30℃下、200rpmで12時間培養した。
種子培養液を4%(v/v)の接種量で、50mLの発酵培地を入れた250mLの三角フラスコに接種し、25℃下、200rpmで72時間培養した。
(3)で得られた培養済の菌液を4℃、10000×gで15分間遠心分離し、β-シクロデキストリングリコシルトランスフェラーゼである上清を得た。前記発酵培地の配合のとしては、コーンシロップパウダー26.6g/L、Na2CO3 4.14g/L、MgSO4・7H2O 0.21g/L、KH2PO4 1.63g/L、タピオカでん粉 12g/Lであり、pHは9であった。
遠心分離して得られたシクロデキストリングリコシルトランスフェラーゼについて、純度測定及び性質の解析を行った。その結果は図1、2に示した。図1から分かるように、Bacillus xiaoxiensis STB08から調製したβ-シクロデキストリングリコシルトランスフェラーゼは、SDS-PAGEにより解析した結果、単一バンドを示し、純度が高いと分かった。また、当該酵素の熱安定性は比較的に良い。50℃以下で2時間保温したとき、図2に示されているように、酵素活性は80%以上に維持され、60℃及び65℃下での半減期は、それぞれ42分間及び9分間であった。本発明のシクロデキストリングリコシルトランスフェラーゼでは、1つのバンドにつき、1つの酵素タンパク質がそれと対応している。バンドが単一であることは、この酵素だけが存在し、純度が高いことを意味する。
実施例1で選別したBacillus xiaoxiensisについて、全ゲノム配列決定を行って解析することで、β-シクロデキストリングリコシルトランスフェラーゼをコードする配列番号2で示される遺伝子の配列を得た。解析した結果、当該遺伝子により転写、翻訳されたβ-シクロデキストリングリコシルトランスフェラーゼのアミノ酸配列は、配列番号1で示されているとおりであった。
5%(ドライベース、w/vで、5g/100mL)のマルトデキストリン(DE=4)を基質とし、実施例2で得られたβ-シクロデキストリングリコシルトランスフェラーゼを2U/g(マルトデキストリンドライベース)の量で添加し、45℃下で静置して反応させた。それぞれの時点(0、1、2、3、6、9、12、24時間目)でサンプルをそれぞれ取り、10分間煮沸して酵素を消滅させた後、2U/g(マルトデキストリンドライベース)のグルコアミラーゼを加えて30℃下で1時間糖化させた。続いて10分間煮沸して酵素を消滅させ、10000r/minで20分間遠心分離した後、上清を取ってそれを0.45μmの限外ろ過膜でろ過し、生成物を高速液体クロマトグラフィー(HPLC)により分析した。
Bacillus xiaoxiensis STB08を、以下の方法で培養した。
Bacillus xiaoxiensis STB08の菌液を接種用ループで着けて取り、用意しておいたプレート培地(酵母粉末 6g/L、魚のペプトン 6g/L、K2HPO4・3H2O 1g/L、タピオカでん粉 12g/L、MgSO4・7H2O 0.2g/L、寒天 15g/Lからなり、NaOHでpH10.0に調整した)上でスクライビングし、30℃のインキュベーターに入れて12時間培養した。
プレート上からシングルコロニーをピックアップして種子培地に接種し、30℃下、200rpmで12時間培養した。
Bacillus xiaoxiensis STB08を、以下の方法で培養した。
Bacillus xiaoxiensis STB08の菌液を接種用ループで着けて取り、用意しておいたプレート培地(酵母粉末 6g/L、魚のペプトン 6g/L、K2HPO4・3H2O 1g/L、タピオカでん粉 12g/L、MgSO4・7H2O 0.2g/L、寒天 15g/Lからなり、NaOHでpH10.0に調整した)上でスクライビングし、30℃のインキュベーターに入れて12時間培養した。
プレート上からシングルコロニーをピックアップして種子培地に接種し、30℃下、200rpmで12時間培養する。
Claims (12)
- 2021年5月28日に中国微生物菌種寄託管理委員会普通微生物センターに寄託された、受託番号がCGMCC NO.22625である、Bacillus xiaoxiensis。
- 請求項1に記載のBacillus xiaoxiensisを含む微生物製剤。
- β-シクロデキストリングリコシルトランスフェラーゼの調製における、請求項1に記載のBacillus xiaoxiensis又は請求項2に記載の微生物製剤の使用。
- 請求項1に記載のBacillus xiaoxiensisを、25~30℃下で少なくとも72時間発酵させることを特徴とする、β-シクロデキストリングリコシルトランスフェラーゼを調製する方法。
- 発酵のための培地は、酵母粉末を炭素源とすることを特徴とする、請求項4に記載の方法。
- 発酵のための培地は、魚のペプトンを窒素源とすることを特徴とする、請求項4に記載の方法。
- 発酵のための発酵培地は、コーンシロップパウダー、Na2CO3、MgSO4・7H2O、KH2PO4及びタピオカデンプンを含むことを特徴とする、請求項4に記載の方法。
- 配列番号1で示されるアミノ酸配列を有することを特徴とする、Bacillus xiaoxiensisに由来するβ-シクロデキストリングリコシルトランスフェラーゼ。
- 配列番号2で示されるヌクレオチド配列を有することを特徴とする、請求項8に記載のβ-シクロデキストリングリコシルトランスフェラーゼをコードする遺伝子。
- シクロデキストリンの調製における、請求項1に記載のBacillus xiaoxiensis又は請求項8に記載のβ-シクロデキストリングリコシルトランスフェラーゼの使用。
- 請求項1に記載のBacillus xiaoxiensisを用いてβ-シクロデキストリングリコシルトランスフェラーゼを調製し、さらに、前記β-シクロデキストリングリコシルトランスフェラーゼを2U/g(マルトデキストリンドライベース)の量でマルトデキストリン含有系に加え、45℃下で24時間反応させ、10分間煮沸して酵素を消滅させた後、2U/g(マルトデキストリンドライベース)のグルコアミラーゼを加え、30℃下で1時間糖化させることを特徴とする、シクロデキストリンを調製する方法。
- 食品分野でのマルトデキストリン分解における、請求項1に記載のBacillus xiaoxiensis又は請求項8に記載のβ-シクロデキストリングリコシルトランスフェラーゼの使用。
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