JP2023523401A - タウ結合化合物 - Google Patents

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Abstract

本開示は、抗タウ抗体及びその(例えば、AAV粒子への)ベクター化を提供する。また、神経学的適応症の防止、処置、及び/または診断のために抗タウ抗体及び/またはAAV粒子を使用する方法も提供される。

Description

関連出願の参照
本願は、2020年4月15日に出願された米国仮特許出願第63/010261号、及び2021年3月18日に出願された同第63/162976号の出願日の利益を主張するものであり、上記で参照した出願の内容全体が、表及び図面中のあらゆる配列を含め、参照により本明細書に組み込まれる。
配列表
本願には、ASCIIフォーマットで電子提出され、全体が参照により本明細書に組み込まれる配列表が含まれる。
本開示は、タウ結合化合物、及びそれを含むアデノ随伴ウイルス(AAV)粒子を提示する。
タウオパチーは、微小管関連タンパク質タウの機能不全及び/または凝集を特徴とする神経変性疾患群である。タウは、そのリン酸化の程度に基づいて微小管と会合することが知られている、正常には可溶性がきわめて高いタンパク質である。タウは、その独特で拡張された構造を所与として、特に神経細胞における細胞内輸送プロセスの重要な構成要素と考えられている。タウの過リン酸化は、その微小管への結合及び微小管アセンブリ活性を抑制する。さらに、タウが過リン酸化すると、ミスフォールド及び凝集を起こしやすくなる。タウオパチーでは、タウが過リン酸化され、ミスフォールドし、対らせん状細線維(PHF)、ねじれたリボン、または直線フィラメントの神経原線維変化(NFT)として凝集する。これらのNFTは、神経細胞の死が近いことを示すと広く考えられており、広範な神経細胞の喪失の一因となって種々の行動障害及び認知障害につながると考えられている。
遺伝学的に定義されるタウオパチーが報告されたのは、タウ遺伝子の変異が、17番染色体に連鎖する前頭側頭型認知症及びパーキンソニズム(FTDP-17)として知られる常染色体優性遺伝性タウオパチーにつながることが示されたときであった。これにより、タウの変化が脳内の神経変性変化につながり得るという証拠が得られた。これらの分子は、よりアミロイド形成性が高く、つまり、より過リン酸化されやすく、よりNFTへと凝集しやすいと考えられている(非特許文献1)。
タウ病変の進行に治療的に干渉し、後の分子的帰結及び細胞的帰結を防止するために、幾つかの手法が提案されている。過リン酸化され、ミスフォールドし、凝集した形態のタウからNFTが構成されていることを所与として、これらの段階の各々における干渉は、追求可能な標的をもたらす。リン酸化を制限する、ミスフォールドをブロックする、または凝集を防止する薬剤の導入は、有望な戦略である。また、抗タウ抗体の導入により、タウ病変の経ニューロン性拡散を防止できることも示唆されている。
依然として、タウオパチーの処置、診断、及び他の用途に使用するための抗タウ抗体が必要とされている。本開示は、本明細書に記載される関連化合物及び方法により、この必要性に対処する。
Hutton,M.et al.,1998,Nature 393(6686):702-5
本開示は、少なくとも部分的に、タウのレベル、例えば、タウの凝集及びまたは分布を調整するための組成物及び方法、及び/または、タウに結合する抗体、例えば、抗タウ抗体、例えば、本明細書に記載される抗タウ抗体の送達、例えば、ベクター化送達に関する。いくつかの実施形態では、タウのレベル、例えば、凝集または分布は、本明細書に記載される抗タウ抗体、または、本明細書に記載される抗タウ抗体などの抗タウ抗体をコードするウイルスゲノムを含む、単離された、例えば組換え型のAAV粒子を使用することで低減または阻害される。いくつかの実施形態では、タウの分解が、本明細書に記載される抗タウ抗体、または、本明細書に記載される抗タウ抗体などの抗タウ抗体をコードするウイルスゲノムを含む、単離された、例えば組換え型のAAV粒子を使用することで増加する。このような阻害及び/または分解は、タウオパチーのような、タウの発現に関連する障害及び/または神経障害を処置するのに有用であり得る。
したがって、一態様において、本開示は、タウに結合する、単離された、例えば組換え型の抗体であって、表1、6、2A~2C、4、もしくは5のHC CDR配列のいずれかの重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)、及び/もしくは重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)のうちの1、2、もしくは3つを含む重鎖可変領域(VH)、ならびに/または、表1、6、2A~2B、4、もしくは5のLC CDR配列のいずれかの軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)、及び/もしくは軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)のうちの1、2、もしくは3つを含む軽鎖可変領域(VL)を含む抗体を提供する。
別の態様において、本開示は、ヒトタウに結合する、単離された、例えば組換え型の抗体を提供し、この抗体は、参照抗体と同じかまたは実質的に同じエピトープと結合し、参照抗体は、HC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3を含むVHと、軽鎖LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含むVLとを含み、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3は、それぞれ配列番号315、341、410、474、529、及び571のアミノ酸配列を含むか、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3は、それぞれ配列番号314、341、410、1154、529、及び571のアミノ酸配列を含むか、またはHC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3は、それぞれ配列番号316、341、410、475、530、及び571のアミノ酸配列を含む。
別の態様において、本開示は、ヒトタウに結合する、単離された、例えば組換え型の抗体を提供し、この抗体は、結合を参照抗体と競合し、参照抗体は、HC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3を含むVHと、軽鎖LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含むVLとを含み、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3は、それぞれ配列番号315、341、410、474、529、及び571のアミノ酸配列を含むか、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3は、それぞれ配列番号314、341、410、1154、529、及び571のアミノ酸配列を含むか、またはHC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3は、それぞれ配列番号316、341、410、475、530、及び571のアミノ酸配列を含む。
さらに別の態様では、本開示は、配列番号920に従って番号付けされた残基409~436を含むヒトタウタンパク質の領域に結合する、単離された、例えば組換え型の抗体を提供する。いくつかの実施形態では、抗体は、HC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3を含むVHを含み、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3は、それぞれ配列番号1180、341、及び410のアミノ酸配列を含むか、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3は、それぞれ配列番号1183、1184、及び410のアミノ酸配列を含むか、またはHC CDR1、HC CDR2、HC CDR3は、それぞれ配列番号1186、1187、及び1167のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、抗体は、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含むVLを含み、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3は、それぞれ配列番号1181、1182、及び571のアミノ酸配列を含むか、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3は、それぞれ配列番号1185、1182、及び571のアミノ酸配列を含むか、またはLC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3は、それぞれ配列番号1188、528、及び571のアミノ酸配列を含む。
さらに別の態様では、本開示は、配列番号920に従って番号付けされた残基32~49、55~76、159~194、185~200、219~247、381~426、及び/または409~436を含むヒトタウタンパク質の領域に、例えば直接的にまたは間接的に結合する抗体を提供する。
さらに別の態様では、本開示は、本明細書に記載される抗体、例えば、表1、6、2A~2C、4、もしくは5のHC CDR配列のいずれかのHC CDR1、HC CDR2、及び/またはHC CDR3のうちの1、2、もしくは3つを含むVH、及び/または表1、6、2A~2C、4、もしくは5のLC CDR配列のいずれかのLC CDR1、LC CDR2、及び/またはLC CDR3のうちの1、2、もしくは3つを含むVLを含む抗体をコードする、単離された、例えば組換え型の核酸を提供する。
さらに別の態様では、本開示は、タウに結合する抗体(例えば、本明細書に記載される抗タウ抗体)をコードする核酸に作動可能に連結されたプロモーターを含むウイルスゲノムを提供する。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、内部末端反復(ITR)配列(例えば、本明細書に記載されるITR領域)、エンハンサー(例えば、本明細書に記載されるエンハンサー)、イントロン領域(例えば、本明細書に記載されるイントロン領域)及び/もしくはエクソン領域(例えば、本明細書に記載されるエクソン領域)、polyAシグナル領域(例えば、本明細書に記載されるpolyAシグナル配列)、ならびに/またはコードされたmiR結合部位をさらに含む。
さらに別の態様では、本開示は、カプシドタンパク質と、タウに結合する抗体(例えば、本明細書に記載される抗タウ抗体)をコードする核酸を含むウイルスゲノムとを含む、単離された、例えば組換え型のAAV粒子を提供する。いくつかの実施形態では、カプシドタンパク質は、AAVカプシドタンパク質、例えば、野生型AAVカプシドタンパク質またはその機能的バリアントを含む。いくつかの実施形態では、カプシドタンパク質は、AAV9カプシドタンパク質(例えば、野生型AAV9カプシドタンパク質)、VOY101カプシドタンパク質、PHP.Nカプシドタンパク質、もしくはPHP.Bカプシドタンパク質、もしくはそれらの機能的バリアントを含むか、またはそれらから選択される。
さらに別の態様では、本開示は、タウに結合する外因性抗体分子(例えば、本明細書に記載される抗タウ抗体分子)を対象に送達する方法を提供する。この方法は、本明細書に記載されるAAV粒子または複数のAAV粒子を有効量で投与することを含み、前記AAV粒子は、本明細書に記載されるウイルスゲノムを含む。
さらに別の態様では、本開示は、神経障害、タウオパチー、及び/またはタウの発現に関連する疾患を有するか、または有すると診断されている対象を処置する方法を提供する。この方法は、本明細書に記載されるウイルスゲノムを含む、本明細書に記載されるAAV粒子または複数のAAV粒子を有効量で対象に投与することを含む。
いくつかの実施形態では、本開示は、(1)重鎖可変ドメイン(VH)であって、配列番号296~339からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む相補性決定領域(CDR)H1、またはそのフラグメント、配列番号340~391からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDRH2、またはそのフラグメント、及び配列番号392~456からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDRH3、またはそのフラグメントを含むVH、ならびに(2)軽鎖可変ドメイン(VL)であって、配列番号457~514からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDRL1、またはそのフラグメント、配列番号515~553からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDRL2、またはそのフラグメント、及び配列番号554~600からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCDRL3、またはそのフラグメントを含むVLを含む、抗体を提供する。抗体は、可変ドメインCDRアミノ酸配列のセットを含んでもよく、可変ドメインCDRアミノ酸配列セットは、表6から選択される。
VHは、配列番号601~643からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むフレームワーク領域(FR)H1、またはそのフラグメント、配列番号644~696からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むFRH2、またはそのフラグメント、配列番号697~766からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むFRH3、またはそのフラグメント、及び配列番号767~775からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むFRH4、またはそのフラグメントを含み得る。
VLは、配列番号776~822からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むFRL1、またはそのフラグメント、配列番号823~857からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むFRL2、またはそのフラグメント、配列番号858~904からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むFRL3、またはそのフラグメント、及び配列番号905~919からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むFRL4、またはそのフラグメントを含み得る。
VHは、配列番号1~74からなる群から選択されるアミノ酸配列、及び/または配列番号147~220からなる群から選択される核酸配列によってコードされるアミノ酸配列を含み得る。
VLは、配列番号75~146からなる群から選択されるアミノ酸配列、及び/または配列番号221~295からなる群から選択される核酸配列によってコードされるアミノ酸配列を含み得る。
抗体は、表3から選択される可変ドメインペアを含み得る。
CDRH1は、GFTFTRY(配列番号314)、GYTFTIF(配列番号315)、及びGYTFTRF(配列番号316)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み得る。CDRH2は、NPNNGG(配列番号341)のアミノ酸配列を含み得る。CDRH3は、GTGTGAMDY(配列番号410)のアミノ酸配列を含み得る。
CDRL1は、RSSQSLVHNNGITYLY(配列番号1154)、RSSQSLVHSNGITHLY(配列番号474)、及びRSSQSLVHSNGNTHLY(配列番号475)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み得る。CDRL2は、RVSNRFS(配列番号529)、及びRVSSRFS(配列番号530)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み得る。CDRL3は、FQGTHVPRT(配列番号571)のアミノ酸配列を含み得る。
CDRH1は、GFSLSTSAM(配列番号325)、GFSLNTSGM(配列番号326)、GFSLSTSGM(配列番号321)、及びGFSLSTFGM(配列番号327)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み得る。CDRH2は、YWDDD(配列番号362)のアミノ酸配列を含み得る。CDRH3は、RRRGYGMDY(配列番号435)、RVRGYGMDY(配列番号437)、RVRYYAMDY(配列番号438)、RKRSYGMDY(配列番号440)、RSRRGNYDY(配列番号421)、及びRGYYSNGNYFDY(配列番号432)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み得る。
CDRL1は、KASQSVSNDVA(配列番号495)、KSSQSLLNSGNQKNYLA(配列番号496)、KSSQSLLSSGNQKNYLA(配列番号497)、KSSQSLLDSDGKTYLN(配列番号484)、及びSASSSISSTYLH(配列番号493)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み得る。CDRL2は、YASNRCT(配列番号540)、GTSTRES(配列番号542)、GASTRES(配列番号543)、LVSKLDS(配列番号532)、及びRTSNLAS(配列番号538)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み得る。CDRL3は、QQDYRSPLT(配列番号587)、QNDHSHPYT(配列番号588)、WQGTHFPQT(配列番号576)、及びQQGSSIPRYT(配列番号585)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み得る。
本開示の抗体は、モノクローナル抗体、多特異性抗体、キメラ抗体、抗体模倣物、単鎖Fv(scFv)フォーマット、及び抗体フラグメントからなる群から選択されるフォーマットを含み得る。抗体は、IgA、IgD、IgE、IgG、及びIgMからなる群から選択される抗体クラスを含み得る。抗体は、マウスIgGを含んでもよく、マウスIgGは、IgG1、IgG2a、IgG2b、IgG2c、及びIgG3からなる群から選択されるアイソタイプを含む。抗体は、ヒトIgGを含んでもよく、ヒトIgGは、IgG1、IgG2、IgG3、及びIgG4からなる群から選択されるアイソタイプを含む。抗体は、1または複数のヒト定常ドメインを含み得る。1または複数のヒト定常ドメインは、ヒトIgG定常ドメインを含み得る。抗体は、ヒト化抗体を含み得る。
本開示の抗体は、タウタンパク質エピトープに結合し得る。タウタンパク質エピトープは、配列番号920~926からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み得るか、またはその中に含まれ得る。抗体は、タウタンパク質エピトープへの結合を、AT100、AT120、PT3、C10.2、PT76、IPN002、6C5、及びUCB Dのうちの1または複数から選択される抗体と競合し得る。タウタンパク質エピトープは、ヒトタウ(配列番号920)の残基409~436を含み得る。タウタンパク質エピトープは、ヒトタウ(配列番号920)の残基413~430を含み得る。タウタンパク質エピトープに結合する抗体は、約0.1nM~約0.5nMのKを呈し得る。タウタンパク質エピトープは、ヒトタウ(配列番号920)の残基55~76、159~194、219~247、及び/または381~426を含み得る。タウタンパク質エピトープは、ヒトタウ(配列番号920)の残基57~72、175~191、223~238、及び/または383~400を含み得る。タウタンパク質エピトープは、ヒトタウ(配列番号920)の残基223~238を含み得る。タウタンパク質エピトープに結合する抗体は、約0.5nM~約5nMのKを呈し得る。タウタンパク質エピトープは、少なくとも2つのタウタンパク質の複合体によって形成される領域を含み得る。抗体は、濃縮対らせん状細線維タウタンパク質(ePHF)に、約0.01nM~約100nMの最大半量有効濃度(EC50)で結合し得る。抗体は、病的でないタウには結合しなくてもよい。抗体は、病的なタウに結合し得る。抗体は、免疫枯渇アッセイによって決定した場合に約1nM~約30nMの最大半量阻害濃度(IC50)でタウ凝集を阻害し得る。免疫枯渇アッセイは、タウRDバイオセンサ細胞を用いて行うことができる。
いくつかの実施形態では、本開示は、タウタンパク質エピトープへの結合を第2の抗体と競合する抗体を提供し、タウタンパク質エピトープは、ヒトタウ(配列番号920)の残基32~49、55~76、57~72、159~194、175~191、185~200、219~247、223~238、381~426、383~400、409~436、及び413~430のうちの1または複数を含む。タウタンパク質エピトープは、ヒトタウ(配列番号920)の残基409~436及び413~430のうちの1または複数を含んでもよい。第2の抗体は、配列番号21のアミノ酸配列を有するVH及び配列番号93のアミノ酸配列を有するVL、配列番号22のアミノ酸配列を有するVH及び配列番号94のアミノ酸配列を有するVL、ならびに配列番号23のアミノ酸配列を有するVH及び配列番号95のアミノ酸配列を有するVLからなる群から選択される可変ドメインペアを含み得る。
本開示の抗体はコンジュゲートを含み得る。コンジュゲートは、治療剤を含み得る。コンジュゲートは、検出可能な標識を含み得る。
いくつかの実施形態では、本開示は、本明細書で開示される抗体をコードする構築物を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示は、本明細書で開示される抗体を対象に投与することによって、対象における治療適応症を処置する方法を提供する。治療適応症は、神経学的適応症であり得る。神経学的適応症は、神経変性疾患、アルツハイマー病(AD)、17番染色体に連鎖する前頭側頭型認知症及びパーキンソニズム(FTDP-17)、前頭側頭葉変性症(FTLD)、前頭側頭型認知症(FTD)、慢性外傷性脳症(CTE)、進行性核上性麻痺(PSP)、ダウン症候群、ピック病、大脳皮質基底核変性症(CBD)、皮質基底核症候群、筋萎縮性側索硬化症(ALS)、プリオン病、クロイツフェルトヤコブ病(CJD)、多系統萎縮症、神経原線維型老年認知症(tangle-only dementia)、卒中、または進行性皮質下グリオーシスであり得る。
いくつかの実施形態では、本開示は、本明細書で開示される抗体の使用を通じて対象における治療適応症を診断する方法を提供する。治療適応症は、神経学的適応症を含み得る。神経学的適応症は、神経変性疾患、AD、FTDP-17、FTLD、FTD、CTE、PSP、ダウン症候群、ピック病、CBD、皮質基底核症候群、ALS、プリオン病、CJD、多系統萎縮症、神経原線維型老年認知症、卒中、または進行性皮質下グリオーシスであり得る。抗体は、対象組織における病的なタウを検出するために使用され得る。対象組織は、CNS組織を含み得る。対象組織は、組織薄片でもよい。組織薄片は、凍結保存された組織片でもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のタウ結合化合物または抗体は、アデノ随伴ウイルス(AAV)のウイルスゲノムにコードされていてもよい。いくつかの実施形態では、AAVウイルスゲノムは、本明細書に記載される抗体をコードする1または複数の核酸配列、またはそのフラグメントを含み得る。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、配列番号1035及び1036から選択される5’逆方向末端反復(ITR)配列領域、1039~1050から選択されるプロモーター配列領域、1134~1136から選択されるポリアデニル化(polyA)配列領域、ならびに配列番号1037及び1038から選択される3’ITRを含み得る。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、配列番号1051~1055から選択される1または複数のエクソン配列領域、配列番号1056~1070から選択される1または複数のイントロン配列領域、配列番号1071~1089から選択される1または複数のシグナル配列領域、配列番号1127~1133から選択される1または複数のタグ配列領域、及び/または配列番号1137及び1138から選択される1または複数のフィラー配列領域を含み得る。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、第1の核酸配列及び第2の核酸配列を有してもよく、ここで、第1の核酸配列はVHをコードし、第2の核酸配列はVLをコードする。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、配列番号1~74から選択されるアミノ酸配列を有するVHをコードする。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、配列番号75~146から選択されるアミノ酸配列を有するVLをコードする。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、表3に示されるペアリングから選択されるVH及びVLのペアをコードする。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムの第1及び第2の核酸配列は、1または複数のリンカー配列によって分離されており、リンカー配列(複数可)は、配列番号1090~1126から選択され得る。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、配列番号147~220から選択されるVH核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、配列番号221~295から選択されるVL核酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、配列番号296~600から選択されるアミノ酸配列を有する1または複数のCDR配列をコードし得る。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、表6に概説されているCDRセットから選択されるCDRのセットをコードし得る。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、表6に概説されているものから選択されるCDRセットペアをコードし得る。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、配列番号601~919から選択される1または複数のFRアミノ酸配列をコードし得る。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、5’から3’へ、抗体重鎖、1または複数のリンカー配列、及び抗体軽鎖をコードする。他の実施形態では、ウイルスゲノムは、5’から3’へ、抗体軽鎖、1または複数のリンカー配列、及び抗体重鎖をコードする。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるAAVウイルスゲノムは、AAV粒子に組み込まれ得る。
いくつかの実施形態では、AAV粒子は、VOY101、VOY201、AAVPHP.B(PHP.B)、AAVPHP.A(PHP.A)、AAVG2B-26、AAVG2B-13、AAVTH1.1-32、AAVTH1.1-35、AAVPHP.B2(PHP.B2)、AAVPHP.B3(PHP.B3)、AAVPHP.N/PHP.B-DGT、AAVPHP.B-EST、AAVPHP.B-GGT、AAVPHP.B-ATP、AAVPHP.B-ATT-T、AAVPHP.B-DGT-T、AAVPHP.B-GGT-T、AAVPHP.B-SGS、AAVPHP.B-AQP、AAVPHP.B-QQP、AAVPHP.B-SNP(3)、AAVPHP.B-SNP、AAVPHP.B-QGT、AAVPHP.B-NQT、AAVPHP.B-EGS、AAVPHP.B-SGN、AAVPHP.B-EGT、AAVPHP.B-DST、AAVPHP.B-DST、AAVPHP.B-STP、AAVPHP.B-PQP、AAVPHP.B-SQP、AAVPHP.B-QLP、AAVPHP.B-TMP、AAVPHP.B-TTP、AAVPHP.S/G2A12、AAVG2A15/G2A3(G2A3)、AAVG2B4(G2B4)、AAVG2B5(G2B5)、AAVPHP.N(PHP.N)、PHP.S、AAV1、AAV2、AAV2バリアント、AAV2/3バリアント、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9.47、AAV9(hu14)、AAV9、AAV9 K449R、AAV10、AAV11、AAV12、AAVrh8、AAVrh10、AAVDJ、AAVDJ8、AAV2.BR1、もしくはAAV2G9カプシドタンパク質から選択されるAAVカプシドタンパク質、またはその機能的バリアントを含む。
ある特定の実施形態では、AAV粒子は、VOY101カプシドを含む。いくつかの実施形態では、VOY101カプシドのアミノ酸配列は、配列番号1023により示される。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるAAV粒子のウイルスゲノムは、対応するmiRNAが発現される細胞または組織においてウイルスゲノムによってコードされるペイロードの発現を調整する、例えば低減するmiR結合部位などのmiR結合部位をコードする、ヌクレオチド配列をさらに含み得る。
いくつかの実施形態では、AAV粒子のウイルスゲノムはさらに、コードされたmiR結合部位を少なくとも1~5コピー、例えば、少なくとも1、2、3、4、または5コピー含み得る。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、コードされたmiR結合部位を少なくとも3コピー含んでもよく、場合により、3コピーすべてが同じmiR結合部位に対するものであるか、または少なくとも1、2、もしくはすべてのコピーが異なるmiR結合部位に対するものである。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、miR122結合部位、miR183結合部位、miR-142-3p、またはそれらの組み合わせをコードするヌクレオチド配列をさらに含み得る。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、配列番号1029のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)ヌクレオチド配列、または配列番号1029の修飾を少なくとも1、2、3、4、5、6、もしくは7個有するが、修飾が10個以下である核酸配列を有する、コードされたmiR122結合部位を含む。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、配列番号1032のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)ヌクレオチド配列、または配列番号1032の修飾を少なくとも1、2、3、4、5、6、もしくは7個有するが、修飾が10個以下である核酸配列を有する、コードされたmiR183結合部位を含む。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、配列番号1031のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)ヌクレオチド配列、または配列番号1031の修飾を少なくとも1、2、3、4、5、6、もしくは7個有するが、修飾が10個以下である核酸配列を有する、コードされたmiR-142-3p結合部位を含む。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、コードされたmiR結合部位を少なくとも4コピー含み、場合により、4コピーすべてが同じmiR結合部位を含むか、または少なくとも1、2、3、もしくはすべてのコピーが異なるmiR結合部位を含む。
いくつかの実施形態では、本明細書で開示されるAAV粒子は、医薬組成物へと製剤され得る。
本開示は、医薬組成物を対象に投与することによって、対象において抗体を産生する方法を提供する。
本開示は、本明細書に記載される医薬組成物を治療有効量で対象に投与することによって、対象におけるタウオパチーを防止または処置する方法も提供する。医薬組成物は、静脈内、筋肉内、実質内、脳室内、大槽内(ICM)、鞘内、またはそれらの組み合わせを含むがこれらに限定されない任意の投与経路によって投与され得る。
本開示の方法及び/または組成物によって処置され得るタウオパチーは、AD、FTDP-17、FTLD、FTD、CTE、PSP、ダウン症候群、ピック病、CBD、皮質基底核症候群、ALS、プリオン病、CJD、多系統萎縮症、神経原線維型老年認知症、及び進行性皮質下グリオーシスを含むが、これらに限定されない。
当業者であれば、定型的な実験を使用するだけで、本明細書に記載される本発明の特定の実施形態に対する多くの均等物を認識するか、または確認することができよう。このような均等物は、以下の列挙される実施形態に包含されることが意図される。
実施形態の列挙
E1.
ヒトタウに結合する、単離された、例えば組換え型の抗体であって、前記抗体は、参照抗体と同じまたは実質的に同じエピトープと結合し、前記参照抗体は、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)、及び重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)を含む重鎖可変領域(VH)と、軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)、及び軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)を含む軽鎖可変領域(VL)とを含み、
(i)前記HC CDR1、前記HC CDR2、前記HC CDR3、前記LC CDR1、前記LC CDR2、及び前記LC CDR3は、それぞれ配列番号315、341、410、474、529、及び571のアミノ酸配列を含むか、
(ii)前記HC CDR1、前記HC CDR2、前記HC CDR3、前記LC CDR1、前記LC CDR2、及び前記LC CDR3は、それぞれ配列番号314、341、410、1154、529、及び571のアミノ酸配列を含むか、または
(iii)前記HC CDR1、前記HC CDR2、前記HC CDR3、前記LC CDR1、前記LC CDR2、及び前記LC CDR3は、それぞれ配列番号316、341、410、475、530、及び571のアミノ酸配列を含む、
前記抗体。
E2.
ヒトタウに結合する、単離された、例えば組換え型の抗体であって、前記抗体は、結合を参照抗体と競合し、前記参照抗体は、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)、及び重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)を含む重鎖可変領域(VH)と、軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)、及び軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)を含む軽鎖可変領域(VL)とを含み、
(i)前記HC CDR1、前記HC CDR2、前記HC CDR3、前記LC CDR1、前記LC CDR2、及び前記LC CDR3は、それぞれ配列番号315、341、410、474、529、及び571のアミノ酸配列を含むか、
(ii)前記HC CDR1、前記HC CDR2、前記HC CDR3、前記LC CDR1、前記LC CDR2、及び前記LC CDR3は、それぞれ配列番号314、341、410、1154、529、及び571のアミノ酸配列を含むか、または
(iii)前記HC CDR1、前記HC CDR2、前記HC CDR3、前記LC CDR1、前記LC CDR2、及び前記LC CDR3は、それぞれ配列番号316、341、410、475、530、及び571のアミノ酸配列を含む、
前記抗体。
E3.
前記参照抗体は、
(i)配列番号22のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号94のアミノ酸配列を含むVL、
(ii)配列番号21のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号93のアミノ酸配列を含むVL、または、
(iii)配列番号23のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号95のアミノ酸配列を含むVL
を含む、実施形態E1またはE2に記載の抗体。
E4.
前記参照抗体によって認識されるエピトープと重複するエピトープと結合する、実施形態E1~E3のいずれか1つに記載の抗体。
E5.
配列番号920に従って番号付けされた残基409~436を含むヒトタウタンパク質の領域に結合する、実施形態E1~E4のいずれか1つに記載の抗体。
E6.
配列番号920に従って番号付けされた残基413~430を含むヒトタウタンパク質の領域に結合する、実施形態E1~E5のいずれか1つに記載の抗体。
E7.
約0.1~約10nM、または約0.2~5nMの解離定数(K)でタウタンパク質に結合する、実施形態E1~E6のいずれか1つに記載の抗体。
E8.
(i)それぞれ配列番号1180、341、及び410、
(ii)それぞれ配列番号1183、1184、及び410、または
(iii)それぞれ配列番号1186、1187、及び1167
のアミノ酸配列を含むHC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3のうちの少なくとも1、2、または3つを含む重鎖可変領域を含む、実施形態E1~E7のいずれか1つに記載の抗体。
E9.
(i)それぞれ配列番号1181、1182、及び571、
(ii)それぞれ配列番号1185、1182、及び571、または、
(iii)それぞれ配列番号1188、528、及び571
のLC CDR1、LC CDR2、及び/またはLC CDR3のうちの1、2、または3つを含む軽鎖可変領域(VL)を含む、実施形態E1~E8のいずれか1つに記載の抗体。
E10.
(i)前記HC CDR1、前記HC CDR2、前記HC CDR3、前記LC CDR1、前記LC CDR2、及び前記LC CDR3は、それぞれ配列番号315、341、410、474、529、及び571のアミノ酸配列を含むか、
(ii)前記HC CDR1、前記HC CDR2、前記HC CDR3、前記LC CDR1、前記LC CDR2、及び前記LC CDR3は、それぞれ配列番号1147、1148、410、474、529、及び571のアミノ酸配列を含むか、または
(iii)前記HC CDR1、前記HC CDR2、前記HC CDR3、前記LC CDR1、前記LC CDR2、及び前記LC CDR3は、それぞれ配列番号1168、1169、1167、1170、528、及び571のアミノ酸配列を含む、
実施形態E1~E9のいずれか1つに記載の抗体。
E11.
(i)前記HC CDR1、前記HC CDR2、前記HC CDR3、前記LC CDR1、前記LC CDR2、及び前記LC CDR3は、それぞれ配列番号314、341、410、1154、529、及び571のアミノ酸配列を含むか、
(ii)前記HC CDR1、前記HC CDR2、前記HC CDR3、前記LC CDR1、前記LC CDR2、及び前記LC CDR3は、それぞれ配列番号1144、1145、410、1146、529、及び571のアミノ酸配列を含むか、または
(iii)前記HC CDR1、前記HC CDR2、前記HC CDR3、前記LC CDR1、前記LC CDR2、及び前記LC CDR3は、それぞれ配列番号1165、1166、1167、473、528、及び571のアミノ酸配列を含む、
実施形態E1~E9のいずれか1つに記載の抗体。
E12.
(i)前記HC CDR1、前記HC CDR2、前記HC CDR3、前記LC CDR1、前記LC CDR2、及び前記LC CDR3は、それぞれ配列番号316、341、410、475、530、及び571のアミノ酸配列を含むか、
(ii)前記HC CDR1、前記HC CDR2、前記HC CDR3、前記LC CDR1、前記LC CDR2、及び前記LC CDR3は、それぞれ配列番号1149、1150、410、475、530、及び571のアミノ酸配列を含むか、または
(iii)前記HC CDR1、前記HC CDR2、前記HC CDR3、前記LC CDR1、前記LC CDR2、及び前記LC CDR3は、それぞれ配列番号1171、1166、1167、1172、528、及び571のアミノ酸配列を含む、
実施形態E1~E9のいずれか1つに記載の抗体。
E13.
(i)配列番号21~23のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び/または
(ii)配列番号93~95のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL
を含む、実施形態E1~E12のいずれか1つに記載の抗体。
E14.
配列番号920に従って番号付けされた残基409~436を含むヒトタウタンパク質の領域に結合する、単離された、例えば組換え型の抗体であって、
(i)HC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3を含むVHであって、
(a)前記HC CDR1、前記HC CDR2、前記HC CDR3は、それぞれ配列番号1180、341、及び410のアミノ酸配列を含むか、
(b)前記HC CDR1、前記HC CDR2、前記HC CDR3は、それぞれ配列番号1183、1184、及び410のアミノ酸配列を含むか、または
(c)前記HC CDR1、前記HC CDR2、前記HC CDR3は、それぞれ配列番号1186、1187、及び1167のアミノ酸配列を含む、前記VHと、
(ii)LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含むVLであって、
(a)前記LC CDR1、前記LC CDR2、前記LC CDR3は、それぞれ配列番号1181、1182、及び571のアミノ酸配列を含むか、
(b)前記LC CDR1、前記LC CDR2、前記LC CDR3は、それぞれ配列番号1185、1182、及び571のアミノ酸配列を含むか、または、
(c)前記LC CDR1、前記LC CDR2、前記LC CDR3は、それぞれ配列番号1188、528、及び571のアミノ酸配列を含む、前記VLと
を含む前記抗体。
E15.
配列番号920に従って番号付けされた残基32~49、55~76、159~194、185~200、219~247、381~426、及び/または409~436を含むヒトタウタンパク質の領域に、例えば直接的にまたは間接的に結合する抗体。
E16.
配列番号920に従って番号付けされた残基55~76、159~194、219~247、及び/または381~426を含むヒトタウタンパク質の領域と結合する、実施形態E14またはE15に記載の抗体。
E17.
配列番号920に従って番号付けされた残基57~72、175~191、223~238、及び/または383~400を含むヒトタウタンパク質の領域と結合する、実施形態E14またはE15に記載の抗体。
E18.
配列番号920に従って番号付けされた残基223~238を含むヒトタウタンパク質の領域と結合する、実施形態E14またはE15に記載の抗体。
E19.
配列番号920に従って番号付けされた残基55~76、159~194、219~247、及び381~426を含む立体構造エピトープと結合する、実施形態E14~E17のいずれか1つに記載の抗体。
E20.
(i)それぞれ配列番号325、362、及び435のアミノ酸配列を含むHC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3を含むVH、及び/または、それぞれ配列番号495、540、及び587のアミノ酸配列を含むLC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含むVL、
(ii)それぞれ配列番号1152、1153、及び435のアミノ酸配列を含むHC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3を含むVH、及び/または、それぞれ配列番号495、540、及び587のアミノ酸配列を含むLC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含むVL、
(iii)それぞれ配列番号1173、1174、及び1175のアミノ酸配列を含むHC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3を含むVH、及び/または、それぞれ配列番号1176、1177、及び587のアミノ酸配列を含むLC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含むVLを含む、
実施形態E15~E19のいずれか1つに記載の抗体。
E21.
約0.1~約1nMの解離定数(K)でタウタンパク質に結合する、実施形態E14~E20のいずれか1つに記載の抗体。
E22.
(i)表1、6、2A~2C、4、もしくは5のHC CDR配列のいずれかのHC CDR1、HC CDR2、及び/またはHC CDR3のうちの1、2、もしくは3つを含む重鎖可変領域(VH)、及び/または
(ii)表1、6、2A~2C、4、もしくは5のLC CDR配列のいずれかのLC CDR1、LC CDR2、及び/またはLC CDR3のうちの1、2、もしくは3つを含む軽鎖可変領域(VL)
を含む、タウに結合する、単離された、例えば組換え型の抗体。
E23.
表1、6、2A~2C、4、もしくは5の抗体のいずれか1つのHC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3を含むVHを含む、実施形態E22に記載の抗体。
E24.
表1、6、2A~2C、4、もしくは5の抗体のいずれか1つのLC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含むVLを含む、実施形態E22またはE23に記載の抗体。
E25.
表1、6、2A~2C、4、もしくは5の抗体のいずれか1つのHC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3を含むVHと、表1、6、2A~2C、4、もしくは5の抗体の前記いずれか1つのLC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含むVLとを含む、実施形態E22~E24のいずれか1つに記載の抗体。
E26.
(i)それぞれ配列番号931もしくは932、341、及び410のアミノ酸配列を含むHC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3、ならびに/または
(ii)それぞれ配列番号933もしくは934、935もしくは936、及び571のアミノ酸配列を含むLC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3
を含む、実施形態E22~E25のいずれか1つに記載の抗体。
E27.
(i)それぞれ配列番号1180、341、及び410のアミノ酸配列を含むHC DR1、HC CDR2、及びHC CDR3、ならびに/もしくは、それぞれ配列番号1181、1182、及び571のアミノ酸配列を含むLC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3、
(ii)それぞれ配列番号1183、1184、及び410のアミノ酸配列を含むHC DR1、HC CDR2、及びHC CDR3、ならびに/もしくは、それぞれ配列番号1185、1182、及び571のアミノ酸配列を含むLC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3、または
(iii)それぞれ配列番号1186、1187、及び1167のアミノ酸配列を含むHC DR1、HC CDR2、及びHC CDR3、ならびに/もしくは、それぞれ配列番号1188、528、及び571のアミノ酸配列を含むLC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3
を含む、実施形態E22~E26のいずれか1つに記載の抗体。
E28.
(i)それぞれ配列番号315、341、及び410のアミノ酸配列を含むHC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3、ならびに/もしくは、それぞれ配列番号474、529、及び571のアミノ酸配列を含むLC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3、
(ii)それぞれ配列番号1147、1148、及び410のアミノ酸配列を含むHC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3、ならびに/もしくは、それぞれ配列番号474、529、及び571のアミノ酸配列を含むLC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3、または
(iii)それぞれ配列番号1168、1169、及び1167のアミノ酸配列を含むHC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3、ならびに/もしくは、それぞれ配列番号1170、528、及び571のアミノ酸配列を含むLC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3
を含む、実施形態E22~E27のいずれか1つに記載の抗体。
E29.
(i)それぞれ配列番号314、341、及び410のアミノ酸配列を含むHC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3、ならびに/もしくは、それぞれ配列番号1154、529、及び571のアミノ酸配列を含むLC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3、
(ii)それぞれ配列番号1144、1145、及び410のアミノ酸配列を含むHC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3、ならびに/もしくは、それぞれ配列番号1146、529、及び571のアミノ酸配列を含むLC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3、または
(iii)それぞれ配列番号1165、1166、及び1167のアミノ酸配列を含むHC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3、ならびに/もしくは、それぞれ配列番号473、528、及び571のアミノ酸配列を含むLC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3
を含む、実施形態E22~E27のいずれか1つに記載の抗体。
E30.
(i)それぞれ配列番号316、341、及び410のアミノ酸配列を含むHC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3、ならびに/もしくは、それぞれ配列番号475、530、及び571のアミノ酸配列を含むLC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3、
(ii)それぞれ配列番号1149、1150、及び410のアミノ酸配列を含むHC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3、ならびに/もしくは、それぞれ配列番号475、1151、及び571のアミノ酸配列を含むLC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3、または
(iii)それぞれ配列番号1171、1166、及び1167のアミノ酸配列を含むHC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3、ならびに/もしくは、それぞれ配列番号1172、528、及び571のアミノ酸配列を含むLC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3
を含む、実施形態E22~E27のいずれか1つに記載の抗体。
E31.
(i)それぞれ配列番号325、362、及び435のアミノ酸配列を含むHC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3、ならびに/もしくは、それぞれ配列番号495、540、及び587のアミノ酸配列を含むLC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3、
(ii)それぞれ配列番号1152、1153、及び435のアミノ酸配列を含むHC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3、ならびに/もしくは、それぞれ配列番号495、540、及び587のアミノ酸配列を含むLC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3、または
(iii)それぞれ配列番号1173、1174、及び1175のアミノ酸配列を含むHC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3、ならびに/もしくは、それぞれ配列番号1176、1177、及び587のアミノ酸配列を含むLC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3
を含む、実施形態E22~E27のいずれか1つに記載の抗体。
E32.
(i)それぞれ配列番号304、347、及び400のアミノ酸配列を含むHC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3、ならびに/もしくは、それぞれ配列番号464、523、及び562のアミノ酸配列を含むLC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3、
(ii)それぞれ配列番号1142、1143、及び400のアミノ酸配列を含むHC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3、ならびに/もしくは、それぞれ配列番号464、523、及び562のアミノ酸配列を含むLC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3、または
(iii)それぞれ配列番号1160、1161、及び1162のアミノ酸配列を含むHC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3、ならびに/もしくは、それぞれ配列番号1163、1164、及び562のアミノ酸配列を含むLC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3
を含む、実施形態E22~E27のいずれか1つに記載の抗体。
E33.
(i)それぞれ配列番号299、343、及び395のアミノ酸配列を含むHC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3、ならびに/もしくは、それぞれ配列番号460、518、及び557のアミノ酸配列を含むLC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3、
(ii)それぞれ配列番号1140、1141、及び395のアミノ酸配列を含むHC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3、ならびに/もしくは、それぞれ配列番号460、518、及び557のアミノ酸配列を含むLC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3、または
(iii)それぞれ配列番号1155、1156、及び1157のアミノ酸配列を含むHC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3、ならびに/もしくは、それぞれ配列番号1158、1159、及び557のアミノ酸配列を含むLC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3
を含む、実施形態E22~E27のいずれか1つに記載の抗体。
E34.
(i)表7もしくは4に提示された抗体の重鎖フレームワーク領域のいずれかのアミノ配列を含む重鎖フレームワーク領域1(FRH1)、重鎖フレームワーク領域2(FRH2)、重鎖フレームワーク領域3(FRH3)、及び/または重鎖フレームワーク領域4(FRH4)のうちの1つ、2つ、3つ、もしくはすべて、または
(ii)表7もしくは4に提示された抗体の重鎖フレームワーク領域のいずれかのアミノ酸配列に対して、少なくとも1、2、もしくは3個だが4個以下の修飾、例えば、置換を有するアミノ酸配列を含む、重鎖フレームワーク領域1(FRH1)、重鎖フレームワーク領域2(FRH2)、重鎖フレームワーク領域3(FRH3)、及び/または重鎖フレームワーク領域4(FRH4)のうちの1つ、2つ、3つ、もしくはすべて
を含む、先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体。
E35.
(i)配列番号603のアミノ酸配列を含むFRH1、配列番号664のアミノ酸配列を含むFRH2、配列番号718のアミノ酸配列を含むFRH3、及び/または配列番号771のアミノ酸配列を含むFRH4のうちの1つ、2つ、3つ、もしくはすべて、または配列番号603、664、718、及び/または771のアミノ酸配列の各々に対して少なくとも1、2、もしくは3個だが4個以下の修飾、例えば、置換を有するアミノ酸配列、
(ii)配列番号619のアミノ酸配列を含むFRH1、配列番号663のアミノ酸配列を含むFRH2、配列番号717のアミノ酸配列を含むFRH3、及び/または配列番号771のアミノ酸配列を含むFRH4のうちの1つ、2つ、3つ、もしくはすべて、または配列番号619、663、717、及び/または771のアミノ酸配列の各々に対して少なくとも1、2、もしくは3個だが4個以下の修飾、例えば、置換を有するアミノ酸配列、
(iii)配列番号603のアミノ酸配列を含むFRH1、配列番号665のアミノ酸配列を含むFRH2、配列番号719のアミノ酸配列を含むFRH3、及び/または配列番号771のアミノ酸配列を含むFRH4のうちの1つ、2つ、3つ、もしくはすべて、または配列番号603、665、719、及び/または771のアミノ酸配列の各々に対して少なくとも1、2、もしくは3個だが4個以下の修飾、例えば、置換を有するアミノ酸配列、
(iv)配列番号633のアミノ酸配列を含むFRH1、配列番号682のアミノ酸配列を含むFRH2、配列番号745のアミノ酸配列を含むFRH3、及び/または配列番号771のアミノ酸配列を含むFRH4のうちの1つ、2つ、3つ、もしくはすべて、または配列番号663、682、745、及び/または771のアミノ酸配列の各々に対して少なくとも1、2、もしくは3個だが4個以下の修飾、例えば、置換を有するアミノ酸配列、
(v)配列番号608のアミノ酸配列を含むFRH1、配列番号652のアミノ酸配列を含むFRH2、配列番号705のアミノ酸配列を含むFRH3、及び/または配列番号767のアミノ酸配列を含むFRH4のうちの1つ、2つ、3つ、もしくはすべて、または配列番号608、652、705、及び/または767のアミノ酸配列の各々に対して少なくとも1、2、もしくは3個だが4個以下の修飾、例えば、置換を有するアミノ酸配列、または、
(vi)配列番号604のアミノ酸配列を含むFRH1、配列番号647のアミノ酸配列を含むFRH2、配列番号700のアミノ酸配列を含むFRH3、及び/または配列番号770のアミノ酸配列を含むFRH4のうちの1つ、2つ、3つ、もしくはすべて、または配列番号604、647、700、及び/または770のアミノ酸配列の各々に対して少なくとも1、2、もしくは3個だが4個以下の修飾、例えば、置換を有するアミノ酸配列
を含む、先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体。
E36.
(i)表7もしくは4に提示された抗体の軽鎖フレームワーク領域のいずれかのアミノ配列を含む軽鎖フレームワーク領域1(FRL1)、軽鎖フレームワーク領域2(FRL2)、軽鎖フレームワーク領域3(FRL3)、及び/または軽鎖フレームワーク領域4(FRL4)のうちの1つ、2つ、3つ、もしくはすべて、または
(ii)表7もしくは4に提示された抗体の軽鎖フレームワーク領域のいずれかのアミノ酸配列に対して、少なくとも1、2、もしくは3個だが4個以下の修飾、例えば、置換を有するアミノ酸配列を含む、軽鎖フレームワーク領域1(FRL1)、軽鎖フレームワーク領域2(FRL2)、軽鎖フレームワーク領域3(FRL3)、及び/または軽鎖フレームワーク領域4(FRL4)のうちの1つ、2つ、3つ、もしくはすべて
を含む、先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体。
E37.
(i)配列番号793のアミノ酸配列を含むFRL1、配列番号836のアミノ酸配列を含むFRL2、配列番号874のアミノ酸配列を含むFRL3、及び/または配列番号910のアミノ酸配列を含むFRL4のうちの1つ、2つ、3つ、もしくはすべて、または配列番号793、836、874、及び/または910のアミノ酸配列の各々に対して少なくとも1、2、もしくは3個だが4個以下の修飾、例えば、置換を有するアミノ酸配列、
(ii)配列番号1178のアミノ酸配列を含むFRL1、配列番号831のアミノ酸配列を含むFRL2、配列番号1179のアミノ酸配列を含むFRL3、及び/または配列番号906のアミノ酸配列を含むFRL4のうちの1つ、2つ、3つ、もしくはすべて、または配列番号1178、831、1179、及び/または906のアミノ酸配列の各々に対して少なくとも1、2、もしくは3個だが4個以下の修飾、例えば、置換を有するアミノ酸配列、
(iii)配列番号787のアミノ酸配列を含むFRL1、配列番号831のアミノ酸配列を含むFRL2、配列番号870のアミノ酸配列を含むFRL3、及び/または配列番号906のアミノ酸配列を含むFRL4のうちの1つ、2つ、3つ、もしくはすべて、または配列番号787、831、870、及び/または906のアミノ酸配列の各々に対して少なくとも1、2、もしくは3個だが4個以下の修飾、例えば、置換を有するアミノ酸配列、または
(iv)配列番号807のアミノ酸配列を含むFRL1、配列番号830のアミノ酸配列を含むFRL2、配列番号888のアミノ酸配列を含むFRL3、及び/または配列番号908のアミノ酸配列を含むFRL4のうちの1つ、2つ、3つ、もしくはすべて、または配列番号807、830、888、及び/または908のアミノ酸配列の各々に対して少なくとも1、2、もしくは3個だが4個以下の修飾、例えば、置換を有するアミノ酸配列、
(v)配列番号783のアミノ酸配列を含むFRL1、配列番号830のアミノ酸配列を含むFRL2、配列番号866のアミノ酸配列を含むFRL3、及び/または配列番号906のアミノ酸配列を含むFRL4のうちの1つ、2つ、3つ、もしくはすべて、または配列番号783、830、866、及び/または906のアミノ酸配列の各々に対して少なくとも1、2、もしくは3個だが4個以下の修飾、例えば、置換を有するアミノ酸配列、または、
(vi)配列番号779のアミノ酸配列を含むFRL1、配列番号825のアミノ酸配列を含むFRL2、配列番号861のアミノ酸配列を含むFRL3、及び/または配列番号908のアミノ酸配列を含むFRL4のうちの1つ、2つ、3つ、もしくはすべて、または配列番号779、825、861、及び/または908のアミノ酸配列の各々に対して少なくとも1、2、もしくは3個だが4個以下の修飾、例えば、置換を有するアミノ酸配列
を含む、先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体。
E38.
(i)表3もしくは4に提示された任意のVHのアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列、
(ii)表3もしくは4に提示された任意のVHのアミノ酸配列の修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が30個以下、20個以下、もしくは10個以下であるアミノ酸配列、または
(iii)表3もしくは4に提示された任意のVHのヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列
を含むVHを含む、実施形態E22~E37のいずれか1つに記載の抗体。
E39.
(i)配列番号4、9、21~23、もしくは51のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列、
(ii)配列番号4、9、21~23、もしくは51のアミノ酸配列の修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が30個以下、20個以下、もしくは10個以下であるアミノ酸配列、または、
(iii)配列番号150、155、167~169、もしくは197のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列
を含むVHを含む、実施形態E22~E38のいずれか1つに記載の抗体。
E40.
N末端からC末端へ、
(i)表7の抗体のいずれかのFRH1のアミノ酸配列を含むFRH1、
(ii)表6または5の抗体のHC CDR1のアミノ酸配列を含むHC CDR1、
(iii)表7または4の抗体のFRH2のアミノ酸配列を含むFRH2、
(iv)表6または5の抗体のHC CDR2のアミノ酸配列を含むHC CDR2、
(v)表7または4の抗体のFRH3のアミノ酸配列を含むFRH3、
(vi)表6または5の抗体のHC CDR3のアミノ酸配列を含むHC CDR3、及び
(vii)表7または4の抗体のFRH4のアミノ酸配列を含むFRH4
を含むVHを含む、先行実施形態のいずれかに記載の単離された抗体。
E41.
N末端からC末端へ、FRH1、HC CDR1、FRH2、HC CDR2、FRH3、HC CDR3、及びFRH4を含むVHを含み、
(i)前記FRH1、前記HC CDR1、前記FRH2、前記HC CDR2、前記FRH3、前記HC CDR3、前記FRH4は、それぞれ配列番号603、315、664、341、718、410、及び771のアミノ酸配列を含むか、
(ii)前記FRH1、前記HC CDR1、前記FRH2、前記HC CDR2、前記FRH3、前記HC CDR3、前記FRH4は、それぞれ配列番号619、314、663、341、717、410、及び771のアミノ酸配列を含むか、
(iii)前記FRH1、前記HC CDR1、前記FRH2、前記HC CDR2、前記FRH3、前記HC CDR3、前記FRH4は、それぞれ配列番号603、316、665、341、719、410、及び771のアミノ酸配列を含むか、
(vi)前記FRH1、前記HC CDR1、前記FRH2、前記HC CDR2、前記FRH3、前記HC CDR3、前記FRH4は、それぞれ配列番号663、325、682、362、745、435、及び771のアミノ酸配列を含むか、
(v)前記FRH1、前記HC CDR1、前記FRH2、前記HC CDR2、前記FRH3、前記HCDR3、前記FRH4は、それぞれ配列番号608、304、652、347、705、400、及び767のアミノ酸配列を含むか、または、
(vi)前記FRH1、前記HC CDR1、前記FRH2、前記HC CDR2、前記FRH3、前記HC CDR3、前記FRH4は、それぞれ配列番号604、299、647、343、700、395、及び770のアミノ酸配列を含む、
先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体。
E42.
前記VHをコードする前記ヌクレオチド配列は、表3もしくは4に提示された任意のVHのヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む、実施形態E22~E41のいずれか1つに記載の抗体。
E43.
前記VHをコードする前記ヌクレオチド配列は、配列番号150、155、167~169、もしくは197のヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む、実施形態E22~E42のいずれか1つに記載の抗体。
E44.
(i)表3もしくは4に提示された任意のVLのアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列、
(ii)表3もしくは4に提示された任意のVLのアミノ酸配列の修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が30個以下、20個以下、もしくは10個以下であるアミノ酸配列、または
(iii)表3もしくは4に提示された任意のVLのヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列
を含むVLを含む、実施形態E22~E43のいずれか1つに記載の抗体。
E45.
(i)配列番号78、83、93~95、もしくは122のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列、
(ii)配列番号78、83、93~95、もしくは122のアミノ酸配列の修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が30個以下、20個以下、もしくは10個以下であるアミノ酸配列、または、
(iii)配列番号224、229、241~243、もしくは270のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列
を含むVLを含む、実施形態E22~E44のいずれか1つに記載の抗体。
E46.
N末端からC末端へ、
(i)表7または4の抗体のいずれかのFRL1のアミノ酸配列を含むFRL1、
(ii)表6または5の抗体のLC CDR1のアミノ酸配列を含むLC CDR1、
(iii)表7または4の抗体のFRL2のアミノ酸配列を含むFRL2、
(iv)表6または5の抗体のLC CDR2のアミノ酸配列を含むLC CDR2、
(v)表7または4の抗体のFRL3のアミノ酸配列を含むFRL3、
(vi)表6または5の抗体のLC CDR3のアミノ酸配列を含むLC CDR3、及び
(vii)表7または4の抗体のFRL4のアミノ酸配列を含むFRL4
を含むVLを含む、先行実施形態のいずれかに記載の抗体。
E47.
N末端からC末端へ、FRL1、LC CDR1、FRL2、LC CDR2、FRL3、LC CDR3、及びFRL4を含むVLを含み、
(i)前記FRL1、前記LC CDR1、前記FRL2、前記LC CDR2、前記FRL3、前記LC CDR3、前記FRL4は、それぞれ配列番号793、474、836、529、874、571、及び910のアミノ酸配列を含むか、
(ii)前記FRL1、前記LC CDR1、前記FRL2、前記LC CDR2、前記FRL3、前記LC CDR3、前記FRL4は、それぞれ配列番号1178、1154、831、529、1179、571、及び906のアミノ酸配列を含むか、
(iii)前記FRL1、前記LC CDR1、前記FRL2、前記LC CDR2、前記FRL3、前記LC CDR3、前記FRL4は、それぞれ配列番号787、475、831、530、870、571、及び906のアミノ酸配列を含むか、
(iv)前記FRL1、前記LC CDR1、前記FRL2、前記LC CDR2、前記FRL3、前記LC CDR3、前記FRL4は、それぞれ配列番号807、495、830、540、888、587、及び908のアミノ酸配列を含むか、
(v)前記FRL1、前記LC CDR1、前記FRL2、前記LC CDR2、前記FRL3、前記LC CDR3、前記FRL4は、それぞれ配列番号配列番号783、464、830、523、866、562、及び906のアミノ酸配列を含むか、または、
(vi)前記FRL1、前記LC CDR1、前記FRL2、前記LC CDR2、前記FRL3、前記LC CDR3、前記FRL4は、それぞれ配列番号779、460、825、518、861、557、及び908のアミノ酸配列を含む、
先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体。
E48.
前記VLをコードする前記ヌクレオチド配列は、表3もしくは4に提示された任意のVLのヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む、実施形態E22~E47のいずれか1つに記載の抗体。
E49.
前記VLをコードする前記ヌクレオチド配列は、配列番号224、229、241~243、もしくは270のヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む、実施形態E22~E48のいずれか1つに記載の抗体。
E50.
(i)VHであって、
(a)表3もしくは4に提示された任意のVHのアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列、
(b)表3もしくは4に提示された任意のVHのアミノ酸配列の修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が30個以下、20個以下、もしくは10個以下であるアミノ酸配列、または
(c)表3もしくは4に提示された任意のVHのヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む前記VH、及び
(ii)VLであって、
(a)表3もしくは4に提示された任意のVLのアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列、
(b)表3もしくは4に提示された任意のVLのアミノ酸配列の修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が30個以下、20個以下、もしくは10個以下であるアミノ酸配列、または
(c)表3もしくは4に提示された任意のVLのヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む前記VL
を含む、先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体。
E51.
表3及び4に提示された抗体の任意のVHのアミノ酸配列と、表3または4に提示された抗体のVLのアミノ酸配列とを含む、先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体。
E52.
(i)配列番号22のアミノ酸配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVHと、
(ii)配列番号94のアミノ酸配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVLと
を含む、実施形態E22~E28及びE34~E51のいずれか1つに記載の抗体。
E53.
(i)配列番号21のアミノ酸配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVHと、
(ii)配列番号93のアミノ酸配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVLと
を含む、実施形態E22~E27、E29、及びE34~E51のいずれか1つに記載の抗体。
E54.
(i)配列番号23のアミノ酸配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVHと、
(ii)配列番号95のアミノ酸配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVLと
を含む、実施形態E22~E27、E30、及びE34~E51のいずれか1つに記載の抗体。
E55.
(i)配列番号51のアミノ酸配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVHと、
(ii)配列番号122のアミノ酸配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVLと
を含む、実施形態E22~E27、E31、及びE44~E51のいずれか1つに記載の抗体。
E56.
(i)配列番号9のアミノ酸配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVHと、
(ii)配列番号83のアミノ酸配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVLと
を含む、実施形態E22~E27、E32、及びE44~E51のいずれか1つに記載の抗体。
E57.
(i)配列番号4のアミノ酸配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVHと、
(ii)配列番号78のアミノ酸配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVLと
を含む、実施形態E22~E27、及びE33~E51のいずれか1つに記載の抗体。
E58.
前記抗体をコードする前記ヌクレオチド配列は、
(i)配列番号150のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列、及び/または配列番号224のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列、
(ii)配列番号155のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列、及び/または配列番号229のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列、
(iii)配列番号167のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列、及び/または配列番号241のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列、
(iv)配列番号168のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列、及び/または配列番号242のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列、
(v)配列番号169のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列、及び/または配列番号243のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列、または
(vi)配列番号197のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列、及び/または配列番号270のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列
を含む、先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体。
E59.
完全長抗体、二重特異性抗体、Fab、F(ab’)、Fv、または単鎖Fvフラグメント(scFv)である、先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体。
E60.
ヒトIgG1、ヒトIgG2、ヒトIgG3、ヒトIgG4、マウスIgG1、マウスIgG2a、マウスIgG2b、マウスIgG2c、及びマウスIgG3から選択される重鎖定常領域、ならびに/またはカッパもしくはラムダの軽鎖定常領域から選択される軽鎖定常領域を含む、先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体。
E61.
表Xに提示された重鎖定常領域のアミノ酸、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖定常領域、及び/または表Xに提示された軽鎖定常領域のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖定常領域を含む、先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体。
E62.
前記重鎖定常領域をコードする前記ヌクレオチド配列は、表Xに提示された重鎖定常領域のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む、及び/または、前記軽鎖定常領域をコードする前記ヌクレオチド配列は、表Xに提示された軽鎖定常領域のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む、先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体。
E63.
(i)表3もしくは4に提示された任意のVHのアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び表Xに提示された重鎖定常領域のアミノ酸のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖定常領域、及び/または
(ii)表3もしくは4に提示された任意のVLのアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL、及び表Xに提示された軽鎖定常領域のアミノ酸のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖定常領域
を含む、先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体。
E64.
(i)配列番号4、9、21~23、もしくは51のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び表Xに提示された重鎖定常領域のアミノ酸のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖定常領域、及び/または、
(ii)配列番号78、83、93~95、もしくは122のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL、及び表Xに提示された軽鎖定常領域のアミノ酸のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖定常領域
を含む、先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体。
E65.
タウタンパク質のC末端、例えば、配列番号920に従って番号付けされた残基409~436と結合する、先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体。
E66.
タウタンパク質の微小管結合ドメインと結合する、先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体。
E67.
タウタンパク質のプロリンリッチドメインと結合する、先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体。
E68.
例えば実施例8に記載のように、例えばOctetによって測定した場合、約120nM未満の解離定数(K)でタウタンパク質に結合する、先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体。
E69.
約0.1nM~約0.5nMのKでタウタンパク質に結合する、先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体。
E70.
約0.5nM~約5nMのKでタウタンパク質に結合することができる、先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体。
E71.
約5nM~約30nMのKでタウタンパク質に結合することができる、先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体。
E72.
少なくとも1つ、2つ、3つ、またはそれ以上のリン酸化残基、例えば、配列番号920に従って番号付けされた残基T212、T217、S396、S404、S409、またはそれらの組み合わせを含むタウタンパク質と結合する、先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体。
E73.
濃縮対らせん状細線維タウタンパク質(ePHF)と、例えば、約0.01nM~約100nMの最大半量有効濃度(EC50)で結合する、先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体。
E74.
タウの凝集を低減する、例えば阻害する、先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体。
E75.
例えば実施例6に記載のように、例えば免疫枯渇アッセイによって(例えば、タウRDバイオセンサ細胞を用いて)測定した場合、約1nM~約30nMの最大半量阻害濃度(IC50)でタウの凝集を阻害する、先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体。
E76.
少なくとも2つのタウタンパク質の複合体、例えば、タウ二量体によって形成される領域を含むエピトープと結合する、先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体。
E77.
タウへの結合を先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体と競合する抗体。
E78.
先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体のエピトープと同じエピトープ、それと実質的に同じエピトープ、またはそれと重複するエピトープに結合する抗体。
E79.
先行実施形態のいずれか1つに記載の抗体をコードする、単離された、例えば組換え型の核酸。
E80.
タウに結合する抗体をコードする、単離された、例えば組換え型の核酸であって、前記抗体は、
(i)表1、6、2A~2C、4、もしくは5の抗体のHC CDR1、HC CDR2、及び/またはHC CDR3のうちの少なくとも1、2、もしくは3つを含む重鎖可変領域(VH)、及び/または
(ii)表1、6、2A~2C、4、もしくは5の抗体のLC CDR1、LC CDR2、及び/またはLC CDR3のうちの少なくとも1、2、もしくは3つを含む軽鎖可変領域(VL)
を含む、前記核酸。
E81.
(i)前記HC CDR1、前記HC CDR2、前記HC CDR3、前記LC CDR1、前記LC CDR2、及び前記LC CDR3は、それぞれ配列番号315、341、410、474、529、及び571のアミノ酸配列を含むか、
(ii)前記HC CDR1、前記HC CDR2、前記HC CDR3、前記LC CDR1、前記LC CDR2、及び前記LC CDR3は、それぞれ配列番号314、341、410、1154、529、及び571のアミノ酸配列を含むか、
(iii)前記HC CDR1、前記HC CDR2、前記HC CDR3、前記LC CDR1、前記LC CDR2、及び前記LC CDR3は、それぞれ配列番号316、341、410、475、530、及び571のアミノ酸配列を含むか、
(iv)前記HC CDR1、前記HC CDR2、前記HC CDR3、前記LC CDR1、前記LC CDR2、及び前記LC CDR3は、それぞれ配列番号325、362、435、495、540、及び587のアミノ酸配列を含むか、
(v)前記HC CDR1、前記HC CDR2、前記HC CDR3、前記LC CDR1、前記LC CDR2、及び前記LC CDR3は、それぞれ配列番号304、347、400、464、523、及び562のアミノ酸配列を含むか、または
(vi)前記HC CDR1、前記HC CDR2、前記HC CDR3、前記LC CDR1、前記LC CDR2、及び前記LC CDR3は、それぞれ配列番号299、343、395、460、518、及び557のアミノ酸配列を含む、
実施形態E80に記載の核酸。
E82.
前記抗体は、
(i)表3もしくは4に提示された任意のVHのアミノ酸配列、表3もしくは4に提示された任意のVHに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列、もしくは表3もしくは4に提示された任意のVHのアミノ酸配列の修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が30個以下、20個以下、もしくは10個以下であるアミノ酸配列を含むVH、及び/または
(ii)表3もしくは4に提示された任意のVLのアミノ酸配列、表3もしくは4に提示された任意のVLに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列、もしくは表3もしくは4に提示された任意のVLのアミノ酸配列の修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が30個以下、20個以下、もしくは10個以下であるアミノ酸配列を含むVL
を含む、実施形態E80に記載の核酸。
E83.
前記抗体は、
(i)配列番号4、9、21~23、もしくは51のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列、または配列番号4、9、21~23、もしくは51のアミノ酸配列の修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が30個以下、20個以下、もしくは10個以下であるアミノ酸配列を含むVH、及び/または
(ii)配列番号78、83、93~95、もしくは122のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列、または配列番号78、83、93~95、もしくは122のアミノ酸配列の修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が30個以下、20個以下、もしくは10個以下であるアミノ酸配列を含むVL
を含む、実施形態E80~E82のいずれか1つに記載の核酸。
E84.
前記抗体は、
(i)表Xに提示された重鎖定常領域のアミノ酸、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖定常領域、及び/または
(ii)表Xに提示された軽鎖定常領域のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖定常領域
を含む、実施形態E80~E83のいずれか1つに記載の核酸。
E85.
(i)表3もしくは4に提示された任意のVHのヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列、及び/または
(ii)表3もしくは4に提示された任意のVLのヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列
を含む、実施形態E80~E84のいずれか1つに記載の核酸。
E86.
(i)配列番号150、155、167~169、もしくは197のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列、及び/または
(ii)配列番号224、229、241~243、もしくは270のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列
を含む、実施形態E80~E85のいずれか1つに記載の核酸。
E87.
前記重鎖可変領域及び/または前記軽鎖可変領域をコードする核酸配列はコドン最適化されている、実施形態E79~E86のいずれか1つに記載の単離された核酸配列。
E88.
実施形態E79~E87のいずれか1つに記載の核酸によってコードされる、単離された、例えば組換え型の抗体。
E89.
実施形態E79~E87のいずれか1つに記載の核酸、または実施形態E1~E78及びE88のいずれか1つに記載の抗体をコードする核酸を含むベクター。
E90.
実施形態E79~E87のいずれか1つに記載の核酸、実施形態E1~E78及びE88のいずれか1つに記載の抗体をコードする核酸、または実施形態E89に記載のベクター(例えば、発現ベクター)を含む宿主細胞。
E91.
昆虫細胞、細菌細胞、または哺乳動物細胞である、実施形態E90に記載の宿主細胞。
E92.
抗体を産生する方法であって、実施形態E90またはE91に記載の宿主細胞を遺伝子発現に好適な条件下で培養することを含む前記方法。
E93.
ペイロードをコードする単離された核酸であって、前記コードされたペイロードは、実施形態E1~E78及びE88のいずれか1つに記載の抗体を含む、前記核酸。
E94.
シグナル配列をさらにコードし、場合により、前記シグナル配列をコードするヌクレオチド配列は、表14に列挙されたシグナル配列のいずれかのヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも95%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含む、実施形態E93に記載の核酸。
E95.
第2のシグナル配列をさらにコードし、場合により、前記シグナル配列をコードするヌクレオチド配列は、表14に列挙されたシグナル配列のいずれかのヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも95%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含む、実施形態E93~E94のいずれか1つに記載の核酸。
E96.
(i)前記シグナル配列をコードする前記ヌクレオチド配列は、前記VHをコードする前記ヌクレオチド配列に対して5’に位置している、及び/または
(ii)前記シグナル配列をコードする前記ヌクレオチド配列は、前記VLをコードする前記ヌクレオチド配列に対して5’に位置している、
実施形態E93~E95のいずれか1つに記載の核酸。
E97.
前記コードされたVH及びVLの配列は、直接、例えば、リンカーなしで接続されている、実施形態E93~E96のいずれか1つに記載の核酸。
E98.
前記コードされたVH及びVLの配列は、リンカーを介して接続されている、実施形態E93~E97のいずれか1つに記載の核酸。
E99.
前記リンカーは、表15に提示されたリンカー配列のいずれかのヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも95%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含む、実施形態E98に記載の核酸。
E100.
前記コードされたペイロードは、完全長抗体、二重特異性抗体、Fab、F(ab’)、Fv、単鎖Fvフラグメント(scFv)、単一ドメイン抗体、またはラクダ科抗体である、実施形態E93~E99のいずれか1つに記載の核酸。
E101.
実施形態E1~E78及びE88のいずれか1つに記載の抗体を含むペイロードをコードする前記核酸に作動可能に連結されたプロモーターを含むウイルスゲノム。
E102.
前記プロモーターは、
(i)ヒト伸長因子1α-サブユニット(EF1α)、サイトメガロウイルス(CMV)前初期エンハンサー及び/もしくはプロモーター、ニワトリβ-アクチン(CBA)及びその誘導体CAG、βグルクロニダーゼ(GUSB)、もしくはユビキチンC(UBC)、ニューロン特異的エノラーゼ(NSE)、血小板由来成長因子(PDGF)、血小板由来成長因子B鎖(PDGF-β)、細胞間接着分子2(ICAM-2)、シナプシン(Syn)、メチルCpG結合タンパク質2(MeCP2)、Ca2+/カルモジュリン依存性タンパク質キナーゼII(CaMKII)、代謝調節型グルタミン酸受容体2(mGluR2)、神経フィラメント軽鎖(NFL)もしくは神経フィラメント重鎖(NFH)、β-グロビンミニ遺伝子nβ2、プレプロエンケファリン(PPE)、エンケファリン(Enk)及び興奮性アミノ酸輸送体2(EAAT2)、グリア線維酸性タンパク質(GFAP)、ミエリン塩基性タンパク質(MBP)、もしくはそれらのフラグメント、例えば、トランケーション、もしくは機能的バリアントから選択される、及び/または
(ii)表11に提示されたプロモーター配列のいずれかのヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも95%同一であるヌクレオチド配列を含む、
実施形態E101に記載のウイルスゲノム。
E103.
エンハンサーをさらに含み、場合により、前記エンハンサーはCMV前初期(CMVie)エンハンサーである、実施形態E101~E102のいずれか1つに記載のウイルスゲノム。
E104.
ポリアデニル化(polyA)シグナル領域をさらに含む、実施形態E101~E103のいずれか1つに記載のウイルスゲノム。
E105.
前記polyAシグナル領域は、配列番号1134~1136のいずれかのヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも95%の同一性をもつヌクレオチド配列を含む、実施形態E104に記載のウイルスゲノム。
E106.
逆方向末端反復(ITR)配列をさらに含む、実施形態E101~E105のいずれか1つに記載のウイルスゲノム。
E107.
(i)前記ITR配列は、前記コードされたペイロードに対して5’に位置付けられる、及び/または
(ii)前記ITR配列は、前記コードされたペイロードに対して3’に位置付けられる、
実施形態E106に記載のウイルスゲノム。
E108.
前記コードされたペイロードに対して5’に位置付けられたITR配列と、前記コードされたペイロードに対して3’に位置付けられたITR配列とを含む、実施形態E101~E107のいずれか1つに記載のウイルスゲノム。
E109.
前記ITR配列は、配列番号1035~1038のいずれか1つのヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、もしくは95%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含む、実施形態E101~E108のいずれか1つに記載のウイルスゲノム。
E110.
イントロン領域をさらに含む、実施形態E101~E109のいずれか1つに記載のウイルスゲノム。
E111.
前記イントロン領域は、表13に列挙されたイントロン領域のいずれかのヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも95%の同一性をもつヌクレオチド配列を含む、実施形態E110に記載のウイルスゲノム。
E112.
少なくとも1、2、または3つのイントロン領域を含む、実施形態E101~E111のいずれか1つに記載のウイルスゲノム。
E113.
エクソン領域をさらに含む、実施形態E101~E112のいずれか1つに記載のウイルスゲノム。
E114.
前記エクソン領域は、表12のエクソン配列のいずれかのヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも95%の同一性をもつヌクレオチド配列を含む、実施形態E113に記載のウイルスゲノム。
E115.
少なくとも1、2、または3つのエクソン領域を含む、実施形態E101~E114のいずれか1つに記載のウイルスゲノム。
E116.
Kozak配列をさらに含み、場合により、前記Kozak配列は、GCCGCCACCATG(配列番号1079)またはGAGGAGCCACC(配列番号1089)のヌクレオチド配列を含む、実施形態E101~E115のいずれか1つに記載のウイルスゲノム。
E117.
対応するmiRNAが発現される細胞または組織において前記ウイルスゲノムによってコードされる前記ペイロードの発現を調整する、例えば低減するmiR結合部位などのmiR結合部位をコードする、ヌクレオチド配列をさらに含む、実施形態E101~E116のいずれか1つに記載のウイルスゲノム。
E118.
コードされたmiR結合部位を少なくとも1~5コピー、例えば、少なくとも1、2、3、4、または5コピー含む、実施形態E117に記載のウイルスゲノム。
E119.
コードされたmiR結合部位を少なくとも3コピー含み、場合により、3コピーすべてが同じmiR結合部位を含むか、または少なくとも1、2、もしくはすべてのコピーが異なるmiR結合部位を含む、実施形態E117~E118のいずれか1つに記載のウイルスゲノム。
E120.
コードされたmiR結合部位を少なくとも4コピー含み、場合により、4コピーすべてが同じmiR結合部位を含むか、または少なくとも1、2、3、もしくはすべてのコピーが異なるmiR結合部位を含む、実施形態E117~E119のいずれか1つに記載のウイルスゲノム。
E121.
前記コードされたmiR結合部位は、miR122結合部位、miR183結合部位、miR-142-3p、またはそれらの組み合わせを含み、場合により、
(i)前記コードされたmiR122結合部位は、配列番号1029のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)ヌクレオチド配列、もしくは配列番号1029の修飾を少なくとも1、2、3、4、5、6、もしくは7個有するが、修飾が10個以下であるヌクレオチド配列を含む、
(ii)前記コードされたmiR183結合部位は、配列番号1032のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)ヌクレオチド配列、もしくは配列番号1032の修飾を少なくとも1、2、3、4、5、6、もしくは7個有するが、修飾が10個以下であるヌクレオチド配列を含む、及び/または
(iii)前記コードされたmiR-142-3p結合部位は、配列番号1031のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)ヌクレオチド配列、もしくは配列番号1031の修飾を少なくとも1、2、3、4、5、6、もしくは7個有するが、修飾が10個以下であるヌクレオチド配列を含む、
実施形態E117~E120のいずれか1つに記載のウイルスゲノム。
E122.
一本鎖である、実施形態E101~E121のいずれか1つに記載のウイルスゲノム。
E123.
非構造タンパク質などのRepタンパク質をコードするヌクレオチド配列をさらに含み、前記Repタンパク質は、Rep78タンパク質、Rep68、Rep52タンパク質、及び/またはRep40タンパク質を含む、実施形態E101~E122のいずれか1つに記載のウイルスゲノム。
E124.
前記Rep78タンパク質、前記Rep68タンパク質、前記Rep52タンパク質、及び/または前記Rep40タンパク質は、少なくとも1つのRep遺伝子によってコードされる、実施形態E123に記載のウイルスゲノム。
E125.
構造タンパク質などのカプシドタンパク質をコードする核酸配列をさらに含み、前記カプシドタンパク質は、VP1ポリペプチド、VP2ポリペプチド、及び/またはVP3ポリペプチドを含む、実施形態E101~E124のいずれか1つに記載のウイルスゲノム。
E126.
前記VP1ポリペプチド、前記VP2ポリペプチド、及び/または前記VP3ポリペプチドは、少なくとも1つのCap遺伝子によってコードされる、実施形態E125に記載のウイルスゲノム。
E127.
実施形態E101~E126のいずれか1つに記載のウイルスゲノムを含むベクター。
E128.
(i)カプシドタンパク質、ならびに、
(ii)実施形態E79~E87及びE93~E100のいずれか1つに記載の核酸、または実施形態E101~E126のいずれか1つに記載のウイルスゲノム
を含む、単離された、例えば組換え型のAAV粒子。
E129.
(i)前記カプシドタンパク質は、配列番号1003のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも80%(例えば、少なくとも約85、90、95、96、97、98、もしくは99%)の配列同一性をもつアミノ酸配列を含む、
(ii)前記カプシドタンパク質は、配列番号1003のアミノ酸配列の修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が30個以下、20個以下、もしくは10個以下であるアミノ酸配列を含む、
(iii)前記カプシドタンパク質は、配列番号1011のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも80%(例えば、少なくとも約85、90、95、96、97、98、もしくは99%)の配列同一性をもつアミノ酸配列を含む、
(iv)前記カプシドタンパク質は、配列番号1011のアミノ酸配列の修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が30個以下、20個以下、もしくは10個以下であるアミノ酸配列を含む、
(v)前記カプシドタンパク質は、配列番号1002のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも80%(例えば、少なくとも約85、90、95、96、97、98、もしくは99%)の配列同一性をもつ配列によってコードされるアミノ酸配列を含む、及び/または
(vi)前記カプシドタンパク質をコードする前記ヌクレオチド配列は、配列番号1002のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも80%(例えば、少なくとも約85、90、95、96、97、98、もしくは99%)の配列同一性をもつ配列を含む、
実施形態E128に記載の単離されたAAV粒子。
E130.
前記カプシドタンパク質は、
(i)配列番号1003に従って番号付けされたK449位のアミノ酸置換、例えば、K449R置換、
(ii)TLAVPFK(配列番号1151)のアミノ酸配列を含むインサートであって、場合により、配列番号1003に従って番号付けされた参照配列に対して、588位の直後に存在する前記インサート、
(iii)配列番号1003に従って番号付けされた587位の「A」以外のアミノ酸及び/もしくは588位の「Q」以外のアミノ酸、ならびに/または
(iv)配列番号1003に従って番号付けされたA587D及び/もしくはQ588Gのアミノ酸置換
を含む、実施形態E128またはE129に記載の単離されたAAV粒子。
E131.
前記カプシドタンパク質は、(i)配列番号1003に従って番号付けされたK449Rのアミノ酸置換、及び(ii)TLAVPFK(配列番号1151)のアミノ酸配列を含むインサートであって、場合により、配列番号1003の588位の直後に存在する前記インサートを含む、実施形態E128~E130のいずれか1つに記載のAAV粒子。
E132.
前記カプシドタンパク質は、(i)配列番号1003に従って番号付けされたK449Rのアミノ酸置換、(ii)TLAVPFK(配列番号1151)のアミノ酸配列を含むインサートであって、場合により、配列番号1003に従って番号付けされた参照配列に対して、588位の直後に存在する前記インサート、ならびに(iii)配列番号1003に従って番号付けされたA587D及びQ588Gのアミノ酸置換を含む、実施形態E128~E130のいずれか1つに記載のAAV粒子。
E133.
前記カプシドタンパク質は、(i)TLAVPFK(配列番号1151)のアミノ酸配列を含むインサートであって、場合により、配列番号1003に従って番号付けされた参照配列に対して、588位の直後に存在する前記インサート、ならびに(ii)配列番号1003に従って番号付けされたA587D及びQ588Gのアミノ酸置換を含む、実施形態E128~E130のいずれか1つに記載のAAV粒子。
E134.
前記カプシドタンパク質は、表9に列挙されたカプシドタンパク質のいずれか、またはその機能的バリアントを含む、実施形態E128~E133のいずれか1つに記載のAAV粒子。
E135.
前記カプシドタンパク質は、VOY101、VOY201、AAVPHP.B(PHP.B)、AAVPHP.A(PHP.A)、AAVG2B-26、AAVG2B-13、AAVTH1.1-32、AAVTH1.1-35、AAVPHP.B2(PHP.B2)、AAVPHP.B3(PHP.B3)、AAVPHP.N/PHP.B-DGT、AAVPHP.B-EST、AAVPHP.B-GGT、AAVPHP.B-ATP、AAVPHP.B-ATT-T、AAVPHP.B-DGT-T、AAVPHP.B-GGT-T、AAVPHP.B-SGS、AAVPHP.B-AQP、AAVPHP.B-QQP、AAVPHP.B-SNP(3)、AAVPHP.B-SNP、AAVPHP.B-QGT、AAVPHP.B-NQT、AAVPHP.B-EGS、AAVPHP.B-SGN、AAVPHP.B-EGT、AAVPHP.B-DST、AAVPHP.B-DST、AAVPHP.B-STP、AAVPHP.B-PQP、AAVPHP.B-SQP、AAVPHP.B-QLP、AAVPHP.B-TMP、AAVPHP.B-TTP、AAVPHP.S/G2A12、AAVG2A15/G2A3(G2A3)、AAVG2B4(G2B4)、AAVG2B5(G2B5)、AAVPHP.N(PHP.N)、PHP.S、AAV1、AAV2、AAV2バリアント、AAV2/3バリアント、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9.47、AAV9(hu14)、AAV9、AAV9 K449R、AAV10、AAV11、AAV12、AAVrh8、AAVrh10、AAVDJ、AAVDJ8、もしくはAAV2G9カプシドタンパク質、またはその機能的バリアントを含む、実施形態E128~E134のいずれか1つに記載のAAV粒子。
E136.
前記カプシドタンパク質は、VOY101カプシドタンパク質を含む、実施形態E128~E135のいずれかに記載のAAV粒子。
E137.
前記カプシドタンパク質は、
(i)配列番号1023のアミノ酸配列、もしくはそれに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)アミノ酸配列、
(ii)配列番号1023のアミノ酸配列に対して、少なくとも1、2、もしくは3個の修飾だが30個以下、20個以下、もしくは10個以下の修飾、例えば、置換を含むアミノ酸配列、または
(iii)配列番号1022のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)ヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列
を含む、実施形態E136に記載のAAV粒子。
E138.
前記カプシドタンパク質をコードする前記ヌクレオチド配列は、配列番号1022のヌクレオチド配列、またはそれに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)ヌクレオチド配列を含む、実施形態E136またはE137に記載のAAV粒子。
E139.
前記カプシドタンパク質は、
(i)VP1ポリペプチド、VP2ポリペプチド、VP3ポリペプチド、もしくはそれらの組み合わせ、
(ii)配列番号1023の138~743位、例えば、VP2に対応するアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも80%(例えば、少なくとも約85、90、92、95、96、97、98、もしくは99%)の配列同一性をもつ配列、
(iii)配列番号1023の203~743位、例えば、VP3に対応するアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも80%(例えば、少なくとも約85、90、92、95、96、97、98、もしくは99%)の配列同一性をもつ配列、及び/または
(iv)配列番号1023の1~743位、例えば、VP1に対応するアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも80%(例えば、少なくとも約85、90、92、95、96、97、98、もしくは99%)の配列同一性をもつ配列
を含む、実施形態E128~E138のいずれか1つに記載のAAV粒子。
E140.
実施形態E79~E87及びE93~E100のいずれか1つに記載の核酸、実施形態E101~E126のいずれか1つに記載のウイルスゲノム、または実施形態E128~E139のいずれか1つに記載のAAV粒子を含む宿主細胞であって、場合により、昆虫細胞、細菌細胞、または哺乳動物細胞である前記宿主細胞。
E141.
実施形態E101~E126のいずれか1つに記載のウイルスゲノム、及び細菌細胞などの細胞におけるウイルスゲノムの複製に好適な骨格領域(例えば、前記骨格領域は、細菌の複製起点及び選択マーカーの一方または両方を含む)をコードする核酸。
E142.
ウイルスゲノムを作製する方法であって、
(i)実施形態E101~E126のいずれか1つに記載のウイルスゲノムを含む核酸分子を用意することと、
(ii)例えば、前記ウイルスゲノムの上流及び下流で前記核酸分子を切断することにより、前記ウイルスゲノムを骨格領域から切除することと
を含む前記方法。
E143.
単離された、例えば組換え型のAAV粒子を作製する方法であって、
(i)実施形態E140に記載のウイルスゲノムを含む宿主細胞を用意することと、
(ii)VOY101カプシドタンパク質などのカプシドタンパク質に前記ウイルスゲノムを封じ込むのに好適な条件下で前記宿主細胞をインキュベートすることとを含み、
これにより、前記単離されたAAV粒子を作製する前記方法。
E144.
ステップ(i)の前に、前記ウイルスゲノムを含む第1の核酸分子を前記宿主細胞に導入することをさらに含む、実施形態E143に記載の方法。
E145.
前記宿主細胞は、VOY101カプシドタンパク質などのカプシドタンパク質をコードする第2の核酸を含む、実施形態E143またはE144に記載の方法。
E146.
前記第2の核酸分子は、前記第1の核酸分子の前に、それと同時に、またはその後に前記宿主細胞に導入される、実施形態E143~E144のいずれか1つに記載の方法。
E147.
実施形態E1~E78及びE88のいずれか1つに記載の抗体、実施形態E128~E139のいずれか1つに記載のAAV粒子、または実施形態E101~E126のいずれか1つに記載のウイルスゲノムを含むAAV粒子、または実施形態E79~E87及びE93~E100のいずれか1つに記載の単離された核酸、及び薬学的に許容される賦形剤を含む医薬組成物。
E148.
タウに結合する外因性抗体を対象に送達する方法であって、有効量の、実施形態S1に記載の医薬組成物、実施形態E1~E78及びE88のいずれか1つに記載の抗体、実施形態E128~E139のいずれか1つに記載のAAV粒子、例えば、複数のAAV粒子、または実施形態E101~E126のいずれか1つに記載のウイルスゲノムを含むAAV粒子、例えば、複数のAAV粒子、または実施形態E79~E87及びE93~E100のいずれか1つに記載の単離された核酸を投与することを含む前記方法。
E149.
前記対象は、タウの発現に関連する疾患を有する、有すると診断されている、または有するリスクがある、実施形態E148に記載の方法。
E150.
前記対象は、神経障害、例えば、神経変性障害を有する、有すると診断されている、または有するリスクがある、実施形態E148またはE149に記載の方法。
E151.
前記対象は、タウオパチーを有する、有すると診断されている、または有するリスクがある、実施形態E148、E149、またはE150に記載の方法。
E152.
タウの発現に関連する疾患を有するかまたは有すると診断された対象を処置する方法であって、有効量の、実施形態E147に記載の医薬組成物、実施形態E1~E78及びE88のいずれか1つに記載の抗体、実施形態E128~E139のいずれか1つに記載のAAV粒子、例えば、複数のAAV粒子、または実施形態E101~E126のいずれか1つに記載のウイルスゲノムを含むAAV粒子、例えば、複数のAAV粒子、または実施形態E79~E87及びE93~E100のいずれか1つに記載の単離された核酸を前記対象に投与することを含む前記方法。
E153.
神経障害、例えば神経変性障害を有するかまたは有すると診断された対象を処置する方法であって、有効量の、実施形態E147に記載の医薬組成物、実施形態E1~E78及びE88のいずれか1つに記載の抗体、実施形態E128~E139のいずれか1つに記載のAAV粒子、例えば、複数のAAV粒子、または実施形態E101~E126のいずれか1つに記載のウイルスゲノムを含むAAV粒子、例えば、複数のAAV粒子、または実施形態E79~E87及びE93~E100のいずれか1つに記載の単離された核酸を前記対象に投与することを含む前記方法。
E154.
タウオパチーを有するかまたは有すると診断された対象を処置する方法であって、有効量の、実施形態E147に記載の医薬組成物、実施形態E1~E78及びE88のいずれか1つに記載の抗体、実施形態E128~E139のいずれか1つに記載のAAV粒子、例えば、複数のAAV粒子、または実施形態E101~E126のいずれか1つに記載のウイルスゲノムを含むAAV粒子、例えば、複数のAAV粒子、または実施形態E79~E87及びE93~E100のいずれか1つに記載の単離された核酸を前記対象に投与することを含む前記方法。
E155.
タウ発現に関連する前記疾患、前記神経障害、または前記タウオパチーは、AD、FTDP-17、FTLD、FTD、CTE、PSP、ダウン症候群、ピック病、CBD、皮質基底核症候群、ALS、プリオン病、CJD、多系統萎縮症、神経原線維型老年認知症、または進行性皮質下グリオーシスを含む、実施形態E152~E154のいずれか1つに記載の方法。
E156.
処置は、前記対象における前記疾患の進行の防止を含む、実施形態E152~E155のいずれか1つに記載の方法。
E157.
前記対象はヒトである、実施形態E152~E156のいずれか1つに記載の方法。
E158.
前記AAV粒子は、前記対象に静脈内投与されるか、筋肉内投与されるか、実質内投与を介して投与されるか、脳室内投与されるか、大槽内(ICM)注射を介して投与されるか、鞘内投与されるか、集束超音波(FUS)、例えば、微小気泡の静脈内投与と併用されるもの(FUS-MB)、または静脈内投与と併用されるMRIガイド下FUSを介して投与される、実施形態E152~E157のいずれか1つに記載の方法。
E159.
前記AAV粒子は、前記対象に静脈内投与される、実施形態E152~E158のいずれか1つに記載の方法。
E160.
前記AAV粒子は、前記対象に大槽内注射(ICM)を介して投与される、実施形態E152~E158のいずれか1つに記載の方法。
E161.
対象において、例えば前記対象の細胞または組織において、生成された抗体のレベルを評価すること、例えば測定することをさらに含む、実施形態E152~E160のいずれか1つに記載の方法。
E162.
前記投与は、前記対象において、例えば前記対象の細胞または組織において、0.001ug/mL~100mg/mLの抗体の生成をもたらす、実施形態E152~E161のいずれか1つに記載の方法。
E163.
前記細胞は神経細胞である、実施形態E162に記載の方法。
E164.
前記組織は、中枢神経系組織、例えば、脳組織である、実施形態E162に記載の方法。
E165.
血液検査、画像検査、CNS生検サンプル、または水性脳脊髄液生検を行うことをさらに含む、実施形態E152~E164のいずれか1つに記載の方法。
E166.
抗体のレベルの測定は、前記AAV粒子、例えば、複数のAAV粒子での処置の前に、その間に、またはその後に行われる、実施形態E161~E165のいずれか1つに記載の方法。
E167.
前記対象は、参照レベル、例えば、処置を受けていない対象、例えば、前記AAV粒子または複数のAAV粒子を投与されていない対象よりも高いレベルの抗体を有する、実施形態E152~E166のいずれか1つに記載の方法。
E168.
前記複数のAAV粒子は、約1×10VG/mL~約1×1016VG/mLまたは約0.0001mg/kg~約100mg/kgの用量で投与される、実施形態E152~E167のいずれか1つに記載の方法。
E169.
タウ発現に関連する障害、神経障害、例えば、神経変性障害の処置または防止に好適な更なる治療剤及び/または療法の投与をさらに含む、実施形態E152~E168のいずれか1つに記載の方法。
E170.
前記更なる治療剤及び/または療法は、コリンエステラーゼ阻害剤(例えば、ドネペジル、リバスチグミン、及び/またはガランタミン)、N-メチルD-アスパラギン酸(NMDA)アンタゴニスト(例えば、メマンチン)、抗精神病薬、抗不安薬、抗けいれん薬、ドパミンアゴニスト(例えば、プラミペキソール、ロピニロール、ロチゴチン、及び/またはアポモルヒネ)、MAO B阻害剤(例えば、セレギリン、ラサギリン、及び/またはサフィナミド)、カテコールO-メチルトランスフェラーゼ(COMT)阻害剤(エンタカポン、オピカポン、及び/またはトルカポン)、抗コリン作用薬(例えば、ベンズトロピン及び/またはトリヘキシフェニジル)、アマンタジン、カルビドパ-レボドパ、深部脳刺激(DBS)、またはそれらの組み合わせを含む、実施形態E169に記載の方法。
E171.
医薬の製造において使用するための、実施形態E1~E78及びE88のいずれか1つに記載の抗体、実施形態E79~E87及びE93~E100のいずれか1つに記載の核酸、実施形態E101~E126のいずれか1つに記載のウイルスゲノム、実施形態E147に記載の医薬組成物、または実施形態E128~E139のいずれか1つに記載のAAV粒子。
E172.
タウ発現に関連する疾患の処置において使用するための、実施形態E1~E78及びE88のいずれか1つに記載の抗体、実施形態E79~E87及びE93~E100のいずれか1つに記載の核酸、実施形態E101~E126のいずれか1つに記載のウイルスゲノム、実施形態E147に記載の医薬組成物、または実施形態E128~E139のいずれか1つに記載のAAV粒子。
E173.
神経障害、例えば、神経変性障害の処置において使用するための、実施形態E1~E78及びE88のいずれか1つに記載の抗体、実施形態E79~E87及びE93~E100のいずれか1つに記載の核酸、実施形態E101~E126のいずれか1つに記載のウイルスゲノム、実施形態E147に記載の医薬組成物、または実施形態E128~E139のいずれか1つに記載のAAV粒子。
E174.
タウオパチーの処置において使用するための、実施形態E1~E78及びE88のいずれか1つに記載の抗体、実施形態E79~E87及びE93~E100のいずれか1つに記載の核酸、実施形態E101~E126のいずれか1つに記載のウイルスゲノム、実施形態E147に記載の医薬組成物、または実施形態E128~E139のいずれか1つに記載のAAV粒子。
E175.
対象におけるタウ発現に関連する疾患、神経障害、例えば、神経変性障害、またはタウオパチーを処置するための医薬の製造における、有効量の、実施形態E1~E78及びE88のいずれか1つに記載の抗体、実施形態E79~E87及びE93~E100のいずれか1つに記載の核酸、実施形態E101~E126のいずれか1つに記載のウイルスゲノム、実施形態E147に記載の医薬組成物、または実施形態E128~E139のいずれか1つに記載のAAV粒子の使用。
A及びBは、Kabat番号付けシステムに従う、CDR配列が強調されている、選択された抗体V0004、V0009、V0022、V0023、V0024及びV0052の可変軽鎖すなわちVL領域(A)及び可変重鎖すなわちVH領域(B)のアラインメントを示す。Kabat番号付けシステムにおける、FRH1~FRH4及びFRL1~FRL4を含む、対応するフレームワーク領域配列は、CDR領域の境界によって定義される。 A及びBは、Chothia番号付けシステムに従う、CDR配列が強調されている、選択された抗体V0004、V0009、V0022、V0023、V0024及びV0052の可変軽鎖領域(A)及び可変重鎖領域(B)のアラインメントを示す。Chothia番号付けシステムにおける、FRH1~FRH4及びFRL1~FRL4を含む、対応するフレームワーク領域配列は、CDR領域の境界によって定義される。 A及びBは、IMGT番号付けシステムに従う、CDR配列が強調されている、選択された抗体V0004、V0009、V0022、V0023、V0024及びV0052の可変軽鎖領域(A)及び可変重鎖領域(B)のアラインメントを示す。IMGT番号付けシステムにおける、FRH1~FRH4及びFRL1~FRL4を含む、対応するフレームワーク領域配列は、CDR領域の境界によって定義される。
I.組成物
いくつかの実施形態では、本開示は、ヒト微小管関連タンパク質タウと相互作用する組成物を提供する。このような組成物は、本明細書では「抗タウ抗体」と呼ばれる、タウタンパク質エピトープと結合する抗体であり得る。タウの機能不全及び/または凝集は、タウオパチーと呼ばれる神経変性疾患のクラスに見られる。タウの過リン酸化は、凝集、及びタウに依存する微小管アセンブリの抑制をもたらす。タウオパチーでは、タウ凝集体が、神経原線維変化(NFT)に見られる対らせん状細線維(PHF)を形成する。これらの凝集体は、ニューロン喪失及び認知機能低下をもたらす。本開示の抗タウ抗体は、タウオパチーの処置及び/または診断、ならびに本明細書に記載される他の用途に有用であり得る。
抗体
いくつかの実施形態では、本開示の化合物(例えば、抗タウ抗体)及び組成物は、抗体またはそのフラグメントを含む。いくつかの実施形態では、本明細書に記載される抗体は、タウと結合する。例えば、抗体は、例えば本明細書に記載されるような、タウ上のエピトープ、例えば、立体構造エピトープ、リン酸化エピトープ、または線状エピトープに結合する。
本明細書で使用される場合、「抗体」という用語は、最も広い意味で使用され、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、多特異性抗体(例えば少なくとも2つのインタクト抗体から形成された二重特異性抗体)、単鎖Fv(scFv)フォーマット、及び抗体フラグメント(例えばFab、F(ab’)、F(ab’)、Fvなど)を含むがこれらに限定されない様々な実施形態を具体的に包含するが、これは、それらが所望の機能的活性または生物学的活性を呈する場合に限る。抗体は、主としてアミノ酸ベースの分子であるが、1または複数の修飾(糖部分、蛍光部分、化学タグなどの付加を含むがこれらに限定されない)を含んでもよい。
本開示の抗体(その抗原結合性フラグメントを含む)は、ポリクローナル、モノクローナル抗体、多特異性抗体、二重特異性抗体、三重特異性抗体、ヒト抗体、ヒト化抗体、キメラ抗体、単鎖抗体、ダイアボディ、線状抗体、Fabフラグメント、F(ab’)フラグメント、F(ab’)フラグメント、Fvフラグメント、Fab発現ライブラリにより産生されるフラグメント、可変ドメイン、抗イディオタイプ(抗Id)抗体(例えば、本発明の抗体に対する抗Id抗体を含む)、細胞内で作られる抗体(すなわち、イントラボディ)、コドン最適化抗体、scFvフラグメント、タンデムscFv抗体、二重特異性T細胞エンゲージャー、mAb2抗体、キメラ抗原受容体(CAR)、四価二重特異性抗体、生合成抗体、天然抗体、小型化抗体、ユニボディ、マキシボディ、及び上記のいずれかのエピトープ結合性フラグメントを含み得るが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、抗体は、少なくとも1つの免疫グロブリン可変ドメイン配列を含む。抗体は、例えば、完全長の成熟抗体、及び抗体の抗原結合性フラグメントを含み得る。例えば、抗体は、重(H)鎖可変ドメイン配列(本明細書ではVHと略す)と、軽(L)鎖可変ドメイン配列(本明細書ではVLと略す)とを含むことができる。別の例では、抗体は、2つの重(H)鎖可変ドメイン配列及び2つの軽(L)鎖可変ドメイン配列を含み、これにより2つの抗原結合部位を形成する、例えばFab、Fab’、F(ab’)、Fc、Fd、Fd’、Fv、単鎖抗体(例えばscFv)、単一可変ドメイン抗体、ダイアボディ(Dab)(二価かつ二重特異性)、及びキメラ(例えば、ヒト化)抗体であり、これらは、全抗体または組換えDNA技術を使用してde novo合成されたものの修飾によって産生され得る。これらの機能的抗体フラグメントは、それらのそれぞれの抗原または受容体と選択的に結合する能力を保持している。抗体及び抗体フラグメントは、IgG、IgA、IgM、IgD、及びIgEを含むがこれらに限定されない抗体の任意のクラスに由来してもよく、抗体の任意のサブクラス(例えば、ヒトのIgG1、IgG2、IgG3、及びIgG4、ならびにマウスのIgG1、IgG2a、IgG2b、IgG2c、及びIgG3)に由来してもよい。本開示の抗体は、モノクローナルでもポリクローナルでもよい。抗体はまた、ヒト抗体、ヒト化抗体、CDR移植抗体、またはin vitro生成抗体でもよい。抗体は、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4から選択される重鎖定常領域を有し得る。抗体は、例えば、カッパまたはラムダから選択される軽鎖を有してもよい。
いくつかの実施形態では、本開示の抗体は、その機能的フラグメントまたはバリアントを含む。抗体の定常領域は、抗体の性質を修飾するように(例えば、Fc受容体結合性、抗体グリコシル化、システイン残基の数、エフェクター細胞機能、または補体機能のうちの1または複数を増加または減少させるように)、変化させる、例えば、変異させることができる。
本明細書で使用される場合、「抗体フラグメント」という用語は、インタクト抗体またはその融合タンパク質の一部を指し、場合によっては、少なくとも1つの抗原結合領域を含む。抗原結合性フラグメントの例としては、(i)Fabフラグメント、すなわち、VL、VH、CL及びCH1ドメインからなる一価フラグメント、(ii)F(ab’)フラグメント、すなわち、ヒンジ領域でジスルフィド架橋によって連結された2つのFabフラグメントを含む二価フラグメント、(iii)VH及びCH1ドメインからなるFdフラグメント、(iv)抗体の1本のアームのVL及びVHドメインからなるFvフラグメント、(v)VHドメインからなるダイアボディ(dAb)フラグメント、(vi)ラクダ科のまたはラクダ化された可変ドメイン、(vii)単鎖Fv(scFv)(例えば、Bird et al.(1988)Science 242:423-426、及びHuston et al.(1988)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85:5879-5883を参照のこと)、ならびに(viii)単一ドメイン抗体が挙げられる。これらの抗体フラグメントは、当業者に公知の従来技法を使用して得られ、これらのフラグメントは、インタクト抗体と同じ様式で有用性についてスクリーニングされる。抗体フラグメントは、単一ドメイン抗体、マキシボディ、ミニボディ、ナノボディ、イントラボディ、ダイアボディ、トリアボディ、テトラボディ、v-NAR及びbis-scFvに組み込むこともできる(例えば、Hollinger and Hudson,Nature Biotechnology 23:1126-1136,2005を参照のこと)。いくつかの実施形態では、抗体のパパイン消化により、「Fab」フラグメントと呼ばれる2つの同一の抗原結合性フラグメントが産生され、これらは各々が単一の抗原結合部位を有する。また、残留する「Fc」フラグメントも産生され、その名称は、容易に結晶化するその能力を反映している。ペプシン処理により、2つの抗原結合部位を有し、依然として抗原に架橋することができるF(ab’)フラグメントが得られる。本開示の抗体は、これらのフラグメントのうちの1または複数を含んでもよく、例えば、全抗体の酵素消化によって、または組換え発現によって生成され得る。
いくつかの実施形態では、抗体は単一ドメイン抗体であり得る。単一ドメイン抗体には、相補性決定領域が単一ドメインポリペプチドの一部である抗体が含まれ得る。例としては、重鎖抗体、軽鎖を天然に欠いている抗体、従来の4本鎖抗体に由来する単一ドメイン抗体、工学操作された抗体、及び抗体に由来するもの以外の単一ドメイン足場が挙げられるが、これらに限定されない。単一ドメイン抗体は、当技術分野におけるいずれかでも、任意の将来的な単一ドメイン抗体でもよい。単一ドメイン抗体は、マウス、ヒト、ラクダ、ラマ、魚、サメ、ヤギ、ウサギ、及びウシを含むがこれらに限定されない任意の種に由来し得る。本発明の別の態様によれば、単一ドメイン抗体は、軽鎖を欠いている重鎖抗体として知られる、天然起源の単一ドメイン抗体である。このような単一ドメイン抗体は、例えばWO9404678で開示されている。明確さのために、軽鎖を天然に欠いている重鎖抗体に由来するこの可変ドメインは、4本鎖免疫グロブリンの従来のVHから区別するために、本明細書ではVHHまたはナノボディと記載される。このようなVHH分子は、ラクダ科の種、例えばラクダ、ラマ、ヒトコブラクダ、アルパカ、及びグアナコにおいて産生される抗体に由来し得る。ラクダ科以外の種が、軽鎖を天然に欠いている重鎖抗体を産生することもあり、このようなVHHは、本発明の範囲内にある。
「天然抗体」は、通常、2つの同一の軽(L)鎖及び2つの同一の重(H)鎖から構成される約150,000ダルトンのヘテロ四量体糖タンパク質である。抗体の重鎖及び軽鎖をコードする遺伝子は公知であり、各々を構成するセグメントは十分に特徴決定され説明されている(Matsuda,F.et al.,1998.The Journal of Experimental Medicine.188(11);2151-62及びLi,A.et al.,2004.Blood.103(12:4602-9、各文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。各軽鎖は1つのジスルフィド共有結合により重鎖に連結しているが、ジスルフィド結合の数は、異なる免疫グロブリンアイソタイプの重鎖間で異なる。また、各重鎖及び軽鎖は、規則的な間隔をあけた鎖内ジスルフィド架橋を有する。各重鎖は、一端に可変ドメイン(V)を有し、続いていくつかの定常ドメインを有する。各軽鎖は、一端に可変ドメイン(V)を有し、他端に定常ドメインを有する。軽鎖の定常ドメインは重鎖の第1の定常ドメインと並んでおり、軽鎖可変ドメインは重鎖の可変ドメインと並んでいる。
本明細書で使用される場合、「可変ドメイン」という用語は、抗体の重鎖と軽鎖との両方に見られ、抗体の中で配列が大きく異なり、特定の各抗体の特定の抗原に対する結合及び特異性に使用される、特定の抗体ドメインを指す。いくつかの実施形態では、本明細書に記載される抗体のVH及びVL領域は、フレームワーク領域(FR)と呼ばれる高度に保存されている領域が散在する、相補性決定領域(CDR)と呼ばれる超可変性領域に細分され得る。
本明細書で使用される場合、「超可変領域」という用語は、抗原結合に関与するアミノ酸残基を含む可変ドメイン内の領域を指す。超可変領域内に存在するアミノ酸は、抗体の抗原結合部位の一部となる相補性決定領域(CDR)の構造を決定する。
本明細書で使用される場合、「CDR」という用語は、抗体のうち、その標的抗原またはエピトープに相補的な構造を含む領域を指す。CDR領域は、一般に、抗原特異性及び結合親和性を付与する。抗原と相互作用しない可変ドメインの他の部分は、各々「フレームワーク領域」(FR)と呼ばれる。抗原結合部位(antigen-binding site)(抗原結合部位(antigen combining site)またはパラトープとしても知られる)は、特定の抗原と相互作用するために必要なアミノ酸残基を含む。抗原結合部位を構成する正確な残基は、CDR分析によって決定され得る。
本明細書で使用される場合、「CDR分析」という用語は、どの抗体可変ドメイン残基がCDRを構成するかを決定するために使用される任意のプロセスを指す。フレームワーク領域及びCDRの範囲は、いくつかの方法によって正確に定義されている(Kabat,E.A.,et al.(1991)Sequences of Proteins of Immunological Interest,Fifth Edition,U.S.Department of Health and Human Services,NIH Publication No.91-3242、Chothia,C.et al.(1987) J.Mol.Biol.196:901-917、及びOxford MolecularのAbM抗体モデリングソフトウェアが使用するAbMの定義を参照のこと。一般的には、例えば、Protein Sequence and Structure Analysis of Antibody Variable Domains.In:Antibody Engineering Lab Manual(Ed.:Duebel,S.and Kontermann,R.,Springer-Verlag,Heidelbergを参照のこと)。CDR分析は、結合した抗原との共結晶構造解析により行うことができる。いくつかの実施形態では、CDR分析には、他の抗体との比較に基づくコンピュータによる評価(Strohl,W.R.Therapeutic Antibody Engineering.Woodhead Publishing,Philadelphia PA.2012.Ch.3,p47-54、同文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)が含まれ得る。CDR分析及び/または正確なアミノ酸配列の境界には、Kabat[Wu,T.T.et al.,1970,JEM,132(2):211-50及びJohnson,G.et al.,2000,Nucleic Acids Res.28(1):214-8、各文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる]、Chothia[Chothia and Lesk,J.Mol.Biol.196,901(1987)、Chothia et al.,Nature 342,877(1989)、及びAl-Lazikani,B.et al.,1997,J.Mol.Biol.273(4):927-48、各文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる]、Lefranc(Lefranc,M.P.et al.,2005,Immunome Res.1:3)、及びHonegger(Honegger,A.and Pluckthun,A.2001.J.Mol.Biol.309(3):657-70、同文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)によって教示されたものを含むがこれらに限定されない、番号付けスキームの使用が含まれ得る。いくつかの実施形態では、Chothia番号スキームに従って定義されるCDRは、超可変ループと呼ばれることもある。
例えば、Kabatでは、重鎖可変ドメイン(VH)のCDRアミノ酸残基は、31~35(HCDR1)、50~65(HCDR2)、及び95~102(HCDR3)と番号付けされ、軽鎖可変ドメイン(VL)のCDRアミノ酸残基は、24~34(LCDR1)、50~56(LCDR2)、及び89~97(LCDR3)と番号付けされる。
Chothiaでは、VHのCDRアミノ酸は、26~32(HCDR1)、52~56(HCDR2)、及び95~102(HCDR3)と番号付けされ、VLのアミノ酸残基は、26~32(LCDR1)、50~52(LCDR2)、及び91~96(LCDR3)と番号付けされる。
KabatとChothiaとの両方のCDR定義を組み合わせると、CDRは、ヒトVHではアミノ酸残基26~35(HCDR1)、50~65(HCDR2)、及び95~102(HCDR3)、ヒトVLではアミノ酸残基24~34(LCDR1)、50~56(LCDR2)、及び89~97(LCDR3)からなる。
本発明のある特定の抗体について、Kabat、Chothia、及びIMGTの番号付けシステムに基づく同等のCDR配列及びフレームワーク領域配列は、少なくとも、それぞれKabat、Chothia、及びIMGTの番号付けシステムに基づく同等のCDR領域の配列番号を提示する本明細書に記載の表及び配列に基づいて、容易に取得することができる。図1A~3Bも参照のこと。
一般に、VH及びVLドメインは、各々3つのCDRを有する。VL CDRは、本明細書では、可変ドメインポリペプチドに沿ってN末端からC末端へ移動する際の出現順に、CDRL1、CDRL2、及びCDRL3と呼ばれる。VH CDRは、本明細書では、可変ドメインポリペプチドに沿ってN末端からC末端へ移動する際の出現順に、CDRH1、CDRH2、及びCDRH3と呼ばれる。CDRの各々には、抗体間で配列及び長さが高度に可変であり、抗原結合ドメインの種々の三次元構造をもたらし得るアミノ酸配列を含むCDRH3を例外として、優先される正準構造がある(Nikoloudis,D.et al.,2014.PeerJ.2:e456)。場合によっては、関連する抗体の一群においてCDRH3を分析して、抗体の多様性を評価することがある。CDR配列を決定する様々な方法が当技術分野で公知であり、既知の抗体配列に適用され得る(Strohl,W.R.Therapeutic Antibody Engineering.Woodhead Publishing,Philadelphia PA.2012.Ch.3,p47-54、同文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。
いくつかの実施形態では、VH及びVLドメインは各々、CDR領域の前、後、及び間に位置している4つのフレームワーク領域(FR)を有する。VHフレームワーク領域は、本明細書ではFRH1、FRH2、FRH3、及びFRH4と呼ばれ、VLフレームワーク領域は、本明細書ではFRL1、FRL2、FRL3、及びFRL4と呼ばれる。いくつかの実施形態では、VHドメインにおいて、FR及びCDRは、N末端からC末端へ、FRH1-CDRH1-FRH2-CDRH2-FRH3-CDRH3-FRH4の順である。いくつかの実施形態では、VLドメインにおいて、FR及びCDRは、N末端からC末端へ、FRL1-CDRL1-FRL2-CDRL2-FRL3-CDRL3-FRL4の順である。
いくつかの実施形態では、本開示の抗体の抗原結合ドメインは、抗体のうち、タウポリペプチドまたはそのエピトープに結合する界面を形成する決定基を含む部分である。タンパク質(またはタンパク質模倣物)に関して、抗原結合部位は典型的に、タウポリペプチドに結合する界面を形成する1または複数のループ(少なくとも4つのアミノ酸またはアミノ酸模倣体からなる)を含む。典型的には、抗体の抗原結合部位は、少なくとも1つまたは2つのCDR及び/または超可変ループを含み、より典型的には、少なくとも3、4、5、または6つのCDR及び/または超可変ループを含む。
さらに他の実施形態では、抗体は、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA1、IgA2、IgD、及びIgEの重鎖定常領域から選択される、特に、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、及びIgG4のヒト重鎖定常領域、またはIgG1、IgG2a、IgG2b、IgG2c、及びIgG3のマウス重鎖定常領域から選択される、重鎖定常領域を有する。別の実施形態では、抗体は、例えば、カッパまたはラムダの(例えば、マウスまたはヒト)軽鎖定常領域から選択される軽鎖定常領域を有する。
定常領域は、抗体の性質を修飾するように(例えば、Fc受容体結合性、抗体グリコシル化、システイン残基の数、エフェクター細胞機能、及び/または補体機能のうちの1または複数を増加または減少させるように)、変化させる、例えば、変異させることができる。いくつかの実施形態では、抗体は、エフェクター機能を有し、補体を固定することができる。他の実施形態では、抗体は、エフェクター細胞を動員することも補体を固定することもない。他の実施形態では、抗体のFc受容体に結合する能力は、低減しているか、または存在しない。例えば、抗体は、Fc受容体への結合を支持しないアイソタイプまたはサブタイプ、フラグメントまたは他の変異体であり、例えば、そのFc受容体結合領域は、突然変異を起こしているか、または欠失している。
抗体定常領域を変化させる方法は当技術分野で公知である。機能が変化している、例えば、細胞上のFcRなどのエフェクターリガンドまたは補体のC1成分に対する親和性が変化している抗体は、抗体の定常部分における少なくとも1つのアミノ酸残基を異なる残基で置換することによって産生することができる(例えば、EP388,151A1、米国特許第5,624,821号、及び米国特許第5,648,260号を参照のこと。これらの内容はいずれも、参照により本明細書に組み込まれる)。マウスまたは他の種の免疫グロブリンに適用されるとこれらの機能を低減または消失させる、同様のタイプの変化が記述されることもある。
本明細書で使用される場合、「Fv」という用語は、完全な抗原結合部位を形成するのに必要な抗体の最小のフラグメントを含む抗体フラグメントを指す。これらの領域は、密接な非共有結合性会合状態にある、1つの重鎖可変ドメインと1つの軽鎖可変ドメインとの二量体からなる。Fvフラグメントは、タンパク分解的切断によって生成され得るが、大部分が不安定である。安定なFvフラグメントを生成するための組換え法が当技術分野で公知であり、これらは典型的に、軽鎖可変ドメインと重鎖可変ドメインとの間に可動性リンカーを挿入すること[これによって単鎖Fv(scFv)を形成する]、または重鎖可変ドメインと軽鎖可変ドメインとの間にジスルフィド架橋を導入することによるものである(Strohl,W.R.Therapeutic Antibody Engineering.Woodhead Publishing,Philadelphia PA.2012.Ch.3,p46-47、同文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。
いずれの脊椎動物種に由来する抗体「軽鎖」にも、その定常ドメインのアミノ酸配列に基づいて、カッパ及びラムダと呼ばれる2つの明確に異なるタイプの一方が割り当てられ得る。抗体には、その重鎖の定常ドメインのアミノ酸配列に応じて、異なるクラスが割り当てられ得る。
本明細書で使用される場合、「単鎖Fv」または「scFv」という用語は、VH抗体ドメイン及びVL抗体ドメインの融合タンパク質で、これらのドメインが可動性ペプチドリンカーによってひとつに連結されて単一のポリペプチド鎖になっているものを指す。いくつかの実施形態では、Fvポリペプチドリンカーは、scFvが抗原結合に望ましい構造を形成することを可能にする。いくつかの実施形態では、scFvは、ファージディスプレイ、酵母ディスプレイ、または他のディスプレイ法と併せて利用され、ここで、scFvは、表面メンバー(例えばファージコートタンパク質)と会合して発現され、所与の抗原に対する高親和性ペプチドの同定に使用され得る。いくつかの実施形態では、本開示の抗体は、scFvFc抗体として調製される。「scFvFc」という用語は、1または複数のscFvと抗体Fcドメインの融合を含む抗体フォーマットを指す。
「キメラ抗体」という用語は、2つ以上の供給源に由来する部分を有する抗体を指す。キメラ抗体は、異なる種に由来する部分を含み得る。例えば、キメラ抗体は、マウス可変ドメイン及びヒト定常ドメインを有する抗体を含み得る。キメラ抗体及びそれらを産生する方法のさらなる例としては、Morrison,S.L.,Transfectomas provide novel chimeric antibodies.Science.1985 Sep 20;229(4719):1202-7、Gillies,S.D.et al.,High-level expression of chimeric antibodies using adapted cDNA variable region cassettes.J Immunol Methods.1989 Dec 20;125(1-2):191-202.、ならびに米国特許第5,807,715号、同第4,816,567号、及び同第4,816,397号に記載のものすべてが挙げられ、各文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
「ダイアボディ」という用語は、2つの抗原結合部位を有する小さな抗体フラグメントで、同じポリペプチド鎖内の軽鎖可変ドメインVに接続された重鎖可変ドメインVを含むフラグメントを指す。同じ鎖上の2つのドメイン間でのペアリングを可能にするには短すぎるリンカーを使用することにより、これらのドメインを別の鎖の相補的ドメインとペアリングさせ、2つの抗原結合部位を作り出す。ダイアボディは、例えば、EP404,097、WO93/11161、及びHollinger et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,90:6444-6448(1993)にさらに詳細に記載されており、各文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
「イントラボディ」という用語は、抗体が産生される細胞から分泌されるのではなく、代わりに1または複数の細胞内タンパク質(複数可)を標的とする抗体の形態を指す。イントラボディは、細胞内輸送、転写、翻訳、代謝プロセス、増殖性シグナル伝達、及び細胞分裂を含むがこれらに限定されない、多数の細胞プロセスに影響を与えるために使用され得る。いくつかの実施形態では、本発明の方法は、イントラボディに基づく療法を含み得る。このようないくつかの実施形態では、本明細書で開示される可変ドメイン配列及び/またはCDR配列が、イントラボディに基づく療法のための1または複数の構築物に組み込まれ得る。場合によっては、本発明のイントラボディは、1または複数の糖化細胞内タンパク質を標的とすることもあれば、1または複数の糖化細胞内タンパク質と代替タンパク質との相互作用を調整することもある。
本明細書で使用される「キメラ抗原受容体」または「CAR」という用語は、免疫エフェクター細胞の表面で発現されて、かかる免疫エフェクター細胞が、高親和性で人工受容体に結合する実体を発現する細胞を特異的に標的とするように工学操作されている人工受容体を指す。CARは、かかるCARが免疫エフェクター細胞上で発現されると、免疫エフェクター細胞が、CARの抗体部分によって認識される細胞と結合してそれらを排除するように、抗体、抗体可変ドメイン及び/または抗体CDRの1または複数のセグメントを含むように設計され得る。場合によっては、CARは、がん細胞と特異的に結合して、がん細胞の免疫調節によるクリアランスをもたらすように設計される。
本発明の抗体は、モノクローナル抗体でもポリクローナル抗体でもよい。本明細書で使用される「モノクローナル抗体」という用語は、実質的に同種の細胞(またはクローン)の集団から得られる抗体を指し、すなわち、その集団を構成する個々の抗体は同一である、及び/または同じエピトープと結合するが、ただし、モノクローナル抗体の産生中に生じ得る可能性のあるバリアントは除外され、かかるバリアントは、概して微量で存在する。異なる決定基(エピトープ)に対する異なる抗体を含むのが一般的であるポリクローナル抗体調製物とは異なり、各モノクローナル抗体は、抗原上の単一の決定基に対するものである。
「モノクローナル」という修飾語は、実質的に同種の抗体集団から得られるという抗体の特質を示すものであり、いずれかの特定の方法による抗体の産生を必要とするものと解釈されてはならない。
いくつかの実施形態では、抗体は、可変領域またはその一部、例えばCDRが、ヒト以外の生物、例えばラットまたはマウスにおいて生成される抗体のアミノ酸配列を含む。キメラ抗体、CDR移植抗体、及びヒト化抗体を含む抗体は、本発明の範囲内にある。ヒト以外の生物、例えばラットまたはマウスにおいて生成され、次いで、ヒトにおける抗原性を減少させるように、例えば可変フレームワークまたは定常領域において修飾された抗体の配列を含む抗体は、本発明の範囲内にある。
本明細書におけるモノクローナル抗体には、重鎖及び/または軽鎖の一部が、特定の種に由来するまたは特定の抗体クラスもしくはサブクラスに属する抗体における対応する配列と同一または同種であるが、鎖(複数可)の残部は、別の種に由来するまたは別の抗体クラスもしくはサブクラスに属する抗体における対応する配列と同一または同種である「キメラ」抗体(免疫グロブリン)、ならびにかかる抗体のフラグメントが含まれる。
本開示の抗体は、哺乳動物、鳥類、爬虫類、及び昆虫を含む任意の動物起源に由来し得る。哺乳動物抗体は、例えば、ヒト、ネズミ科(例えば、マウスまたはラット)、ロバ、ヒツジ、ウサギ、ヤギ、モルモット、ラクダ、ウシ、またはウマ起源のものであり得る。
いくつかの実施形態では、本開示の抗体は、抗体模倣物であり得る。「抗体模倣物」という用語は、抗体の機能または効果を模倣し、その分子標的に特異的かつ高親和性で結合する任意の分子を指す。いくつかの実施形態では、抗体模倣物は、フィブロネクチンIII型ドメイン(Fn3)をタンパク質足場として組み込むように設計されたモノボディであり得る(US6,673,901、US6,348,584)。いくつかの実施形態では、抗体模倣物は、アフィボディ分子、アフィリン、アフィチン、アンチカリン、アビマー、DARPin、Fynomer及びKunitzならびにドメインペプチドを含むがこれらに限定されない、当技術分野で公知のものであり得る。他の実施形態では、抗体模倣物は、1または複数の非ペプチド領域を含み得る。
本明細書で使用される場合、「抗体バリアント」という用語は、ある抗体と構造、配列及び/または機能が類似するが、別の抗体または天然抗体と比較するとそのアミノ酸配列、組成または構造にいくつかの相違点を含む生体分子を指す。
多特異性抗体
いくつかの実施形態では、抗体は多特異性抗体であり、例えば、複数の免疫グロブリン可変ドメイン配列を含み、複数のうち第1の免疫グロブリン可変ドメイン配列は、第1のエピトープに対する結合特異性を有し、複数のうち第2の免疫グロブリン可変ドメイン配列は、第2のエピトープに対する結合特異性を有する。いくつかの実施形態では、第1及び第2のエピトープは、同じ抗原、例えば、同じタンパク質(または多量体タンパク質のサブユニット)上にある。いくつかの実施形態では、第1及び第2のエピトープは重複する。いくつかの実施形態では、第1及び第2のエピトープは重複しない。いくつかの実施形態では、第1及び第2のエピトープは、異なる抗原、例えば、異なるタンパク質(または多量体タンパク質の異なるサブユニット)上にある。いくつかの実施形態では、多特異性抗体は、第3、第4、または第5の免疫グロブリン可変ドメインを含む。いくつかの実施形態では、多特異性抗体は、二重特異性抗体、三重特異性抗体、または四重特異性抗体である。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は多特異性抗体である。
いくつかの実施形態では、多特異性抗体は二重特異性抗体である。二重特異性抗体は、2つより多くの抗原に対する特異性を有しない。二重特異性抗体は、第1のエピトープに対する結合特異性を有する第1の免疫グロブリン可変ドメイン配列と、第2のエピトープに対する結合特異性を有する第2の免疫グロブリン可変ドメイン配列とを特徴とする。いくつかの実施形態では、第1及び第2のエピトープは、同じ抗原、例えば、同じタンパク質(または多量体タンパク質のサブユニット)上にある。いくつかの実施形態では、第1及び第2のエピトープは重複する。いくつかの実施形態では、第1及び第2のエピトープは重複しない。いくつかの実施形態では、第1及び第2のエピトープは、異なる抗原、例えば、異なるタンパク質(または多量体タンパク質の異なるサブユニット)上にある。いくつかの実施形態では、二重特異性抗体は、第1のエピトープに対する結合特異性を有する重鎖可変ドメイン配列及び軽鎖可変ドメイン配列、ならびに第2のエピトープに対する結合特異性を有する重鎖可変ドメイン配列及び軽鎖可変ドメイン配列を含む。いくつかの実施形態では、二重特異性抗体は、第1のエピトープに対する結合特異性を有する半抗体と、第2のエピトープに対する結合特異性を有する半抗体とを含む。いくつかの実施形態では、二重特異性抗体は、第1のエピトープに対する結合特異性を有する半抗体またはそのフラグメントと、第2のエピトープに対する結合特異性を有する半抗体またはそのフラグメントとを含む。いくつかの実施形態では、二重特異性抗体は、第1のエピトープに対する結合特異性を有するscFvまたはそのフラグメントと、第2のエピトープに対する結合特異性を有するscFvまたはそのフラグメントとを含む。ある実施形態において、抗タウ抗体は二重特異性抗体である。
いくつかの実施形態では、本開示の抗体の配列は、当技術分野で公知のプロトコールを使用して産生された二重特異性抗体またはヘテロ二量体抗体から生成することができ、このプロトコールは、例えば、US5731168などに記載されている「ノブインホール」手法;WO09/089004、WO06/106905、及びWO2010/129304などに記載されている静電ステアリングFcペアリング;WO07/110205などに記載されているSEED(Strand Exchange Engineered Domain)ヘテロ二量体形成;WO08/119353、WO2011/131746、及びWO2013/060867などに記載されているFabアーム交換;US4433059などに記載されている、例えば、アミン反応性基及びスルフヒドリル反応性基を有するヘテロ二官能性試薬を使用した抗体の架橋によって二重特異性構造を生成することによる、二重抗体コンジュゲート;US4444878などに記載されている、2つの重鎖間のジスルフィド結合の還元及び酸化のサイクルを介して異なる抗体から半抗体(重鎖-軽鎖ペアまたはFab)を再結合することにより生成される二重特異性抗体決定基;US5273743などに記載されている、三官能性抗体、例えば、スルフヒドリル反応性基を介して架橋された3つのFab’フラグメント;US5534254などに記載されている、生合成結合タンパク質、例えば、好ましくはジスルフィドまたはアミン反応性の化学的架橋を介してC末端テールを通じて架橋されたscFvのペア;US5582996などに記載されている、二官能性抗体、例えば、定常ドメインを置換したロイシンジッパー(例えば、c-fos及びc-jun)を介して二量体化された異なる結合特異性を有するFabフラグメント;US5591828などに記載されている、二重特異性及びオリゴ特異性の一価及びオリゴバレントの受容体、例えば、一方の抗体のCH1領域と、典型的には会合した軽鎖を有する他方の抗体のVH領域との間のポリペプチドスペーサーを介して連結されている、2つの抗体(2つのFabフラグメント)のVH-CH1領域;US5635602などに記載されている、二重特異性DNA-抗体コンジュゲート、例えば、DNAの二本鎖部分を介した抗体またはFabフラグメントの架橋;US5637481などに記載されている、二重特異性融合タンパク質、例えば、間に親水性のらせん状ペプチドリンカーを有する2つのscFvと完全な定常領域とを含む発現構築物;US5837242などに記載されている、多価かつ多特異性の結合タンパク質、例えば、一般にダイアボディと称される、Ig重鎖可変領域の結合領域をもつ第1のドメインと、Ig軽鎖可変領域の結合領域をもつ第2のドメインとを有するポリペプチドの二量体(二重特異性、三重特異性、または四重特異性の分子を作り出す、より高次の構造も開示されている);US5837821などに記載されている、連結されたVL鎖及びVH鎖を有し、ペプチドスペーサーによって抗体ヒンジ領域及びCH3領域とさらに接続されており、二量体化されて二重特異性/多価分子を形成し得る、ミニボディ構築物;短いペプチドリンカー(例えば、5または10アミノ酸)で連結された、またはいずれの向きにもリンカーが全くなく、二量体を形成して二重特異性ダイアボディを形成し得る、VH及びVLドメイン;US5844094などに記載されている三量体及び四量体;US5864019などに記載されている、C末端でペプチド結合によって架橋性基と接続され、VLドメインとさらに会合して一連のFV(またはscFv)を形成する、ひと続きのVHドメイン(またはファミリーメンバーのVLドメイン);ならびに、US5869620などに記載されている、ペプチドリンカーを介して連結されたVHドメインとVLドメインとの両方が非共有結合性架橋または化学的架橋を介して多価構造へと統合されて、例えば、scFVまたはダイアボディタイプの両方のフォーマットを使用したホモ二価、ヘテロ二価、三価、及び四価の構造を形成している、単鎖結合ポリペプチドを含むが、これらに限定されない。
抗体の開発
本開示による抗体は、当技術分野で標準的な方法を使用して開発することができる。一次抗体調製技術には、免疫化及び抗体ディスプレイ技術の2つがある。いずれの場合も、所望の抗体は、特定の標的またはエピトープに対する親和性に基づいて、より大きな候補プールから同定される。免疫応答は、異物の存在に対する生物の細胞、組織、及び/または器官の反応によって特徴付けられる。このような免疫応答は、通常、抗原または抗原の一部などの異物に対して生物が1または複数の抗体を産生することにつながる。
抗原
抗体は、例えば、任意の天然起源または合成の抗原を使用して、開発する(例えば、免疫化を介して)、または選択する(例えば、候補のプールから)ことができる。本明細書で使用される場合、「抗原」は、生物において免疫応答を誘導または誘起する実体であり、抗体結合パートナーを指すこともある。免疫応答は、異物の存在に対する生物の細胞、組織、及び/または器官の反応によって特徴付けられる。このような免疫応答は、通常、異物に対して生物が1または複数の抗体を産生することにつながる。いくつかの実施形態では、抗原はタウタンパク質を含む。
本明細書で使用される場合、「タウタンパク質」という用語は、微小管関連タンパク質タウまたはそのペプチドフラグメントを含むタンパク質またはタンパク質複合体を指す。タウタンパク質には、「サルコシル不溶性タウ」とも呼ばれる、濃縮対らせん状細線維タウタンパク質(ePHF)、またはそのフラグメントが含まれ得る。タウタンパク質は、1または複数のリン酸化残基を含み得る。このようなリン酸化残基は、疾患に関連するタウタンパク質(本明細書では「病的なタウ]とも呼ばれる)に対応し得る。
免疫化
いくつかの実施形態では、抗体は、目的の抗原で宿主を免疫化することによって調製され得る。宿主動物(例えば、マウス、ウサギ、ヤギ、またはラマ)を抗原性タンパク質で免疫化すると、抗原に特異的に結合するリンパ球を誘発することができる。リンパ球を収集し、不死化細胞株と融合させてハイブリドーマを生成してもよく、これを成長の促進のために好適な培養培地中で培養してもよい(例えば、Kohler,G.et al.,Continuous cultures of fused cells secreting antibody of predefined specificity.Nature.1975 Aug 7;256(5517):495-7を参照のこと。同文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。あるいは、リンパ球をin vitroで免疫化してもよい。
好適な融剤(例えば、ポリエチレングリコール)を使用し、リンパ球を不死化細胞株と融合させて、ハイブリドーマ細胞を形成してもよい(例えば、Goding,J.W.,Monoclonal Antibodies:Principles and Practice.Academic Press.1986;59-1031を参照のこと。同文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。不死化細胞株は、形質転換された哺乳動物細胞、特に、齧歯類動物、ウサギ、ウシ、またはヒト起源の骨髄腫細胞であり得る。いくつかの実施形態では、ラットまたはマウスの骨髄腫細胞株が用いられる。ハイブリドーマ細胞は、典型的には未融合細胞の成長または生存を阻害する1または複数の物質を含む、好適な培養培地中で培養され得る。例えば、酵素ヒポキサンチングアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ(HGPRTまたはHPRT)を欠いている親細胞を使用してもよく、結果として得られるハイブリドーマ細胞のための培養培地にヒポキサンチン、アミノプテリン、及びチミジンを補って(「HAT培地」)、HGPRT欠損(未融合)細胞の成長を防止してもよい。
不死化細胞株の望ましい性質は、効率的な融合、選択された抗体産生細胞による高レベルの抗体発現の支持、及び未融合細胞阻害培地(例えば、HAT培地)に対する感受性を含み得るが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、不死化細胞株は、マウス骨髄腫株である。かかる細胞株は、例えば、Salk Institute Cell Distribution Center(San Diego,CA)またはAmerican Type Culture Collection(Manassas,VA)から得ることができる。ヒト骨髄腫及びマウス-ヒトヘテロ骨髄腫細胞株も、ヒトモノクローナル抗体の産生に使用され得る(例えば、Kozbor,D.et al.,A human hybrid myeloma for production of human monoclonal antibodies.J Immunol.1984 Dec;133(6):3001-5及びBrodeur,B.et al.,Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications.Marcel Dekker,Inc.,New York.1987;33:51-63を参照のこと。各文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。
ハイブリドーマ細胞培養培地は、所望の結合特異性を有するモノクローナル抗体の存在についてアッセイされ得る。アッセイは、免疫沈降アッセイ、in vitro結合アッセイ、ラジオイムノアッセイ(RIA)、表面プラズモン共鳴(SPR)アッセイ、及び/または酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)を含み得るが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、モノクローナル抗体の結合特異性は、Scatchard分析によって決定され得る(Munson,P.J.et al.,Ligand:a versatile computerized approach for characterization of ligand-binding systems.Anal Biochem.1980 Sep 1;107(1):220-39、同文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。
培養されたハイブリドーマにより産生された抗体を分析して、標的抗原に対する結合特異性を決定してもよい。望ましい特徴を有する抗体が同定されたら、対応するハイブリドーマを限界希釈手順によってサブクローニングし、標準的な方法によって成長させることができる。ハイブリドーマによって産生された抗体は、例えば、プロテインA-セファロース、ヒドロキシアパタイトクロマトグラフィ、ゲル電気泳動、透析、またはアフィニティクロマトグラフィなどの標準的な免疫グロブリン精製手順を使用して単離及び精製することができる。あるいは、ハイブリドーマ細胞は、哺乳動物において腹水としてin vivoで成長させてもよい。いくつかの実施形態では、抗体は、免疫化された宿主の血清から直接単離してもよい。
いくつかの実施形態では、免疫化によって生成された抗体の組換えバージョンを調製してもよい。かかる抗体は、選択されたハイブリドーマから、ゲノム抗体配列を使用して調製され得る。ハイブリドーマのゲノム抗体配列は、RNA分子を抗体産生ハイブリドーマ細胞から抽出し、逆転写酵素ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によりcDNAを産生することによって得ることができる。PCRは、抗体の重鎖及び軽鎖に特異的なプライマーを使用してcDNAを増幅するために使用され得る。PCR産物は、次いで、配列分析のためにプラスミドにサブクローニングされ得る。抗体は、得られた抗体配列を発現ベクターに挿入することにより産生され得る。いくつかの組換え抗体は、単離されたハイブリドーマ抗体から得られるアミノ酸配列に対応するアミノ酸配列をコードする合成核酸構築物を使用して調製され得る。
抗体ディスプレイ
いくつかの実施形態では、抗体は、抗体ディスプレイ技術を使用して開発され得る。「ディスプレイ技術」は、アミノ酸ベースの候補化合物をコードする核酸と該化合物が連結しており、標的またはリガンドにアクセス可能なフォーマットで該化合物を発現させるための系及び方法を指す。候補化合物は、ほとんどの系において宿主カプシドまたは細胞の表面で発現されるが、いくつかの無宿主系(例えば、リボソームディスプレイ)が存在する。ディスプレイ技術を使用すると、候補化合物ライブラリメンバーのセットを含むディスプレイ「ライブラリ」を生成することができる。抗体(またはそのバリアントもしくはフラグメント)をライブラリメンバーとして含むディスプレイライブラリを、本明細書では「抗体ディスプレイライブラリ」と呼ぶ。抗体は、抗体ディスプレイライブラリを使用して標的抗原をスクリーニングすることにより、設計、選択、または最適化することができる。抗体ディスプレイライブラリは、各々が固有の抗体ドメインを発現する数百万から数十億のメンバーを含み得る。提示される抗体フラグメントは、V及びVの抗体ドメインが可動性リンカーによって結合された融合タンパク質であるscFv抗体フラグメントであり得る。ディスプレイライブラリは、可変ドメインフレームワーク領域とCDRとの間で多様性のレベルが異なる抗体フラグメントを含み得る。ディスプレイライブラリ抗体フラグメントのCDRは、固有の可変ループ長及び/または配列を含み得る。ディスプレイライブラリ選択から得られた抗体可変ドメインまたはCDRは、組換え抗体の産生のために抗体配列に直接組み込んでもよく、変異させてin vitro親和性成熟を介したさらなる最適化のために利用してもよい。
抗体ディスプレイライブラリは、抗体ファージディスプレイライブラリを含み得る。抗体ファージディスプレイライブラリは、各々が固有の抗体ドメインを発現する数百万から数十億のメンバーと共に、ファージウイルス粒子を宿主として利用する。このようなライブラリは、1または複数の目的の抗原に対して多様なレベルの親和性をもつ、場合によっては数百もの抗体フラグメントを選択するために使用できる、多様性に富む供給源を提供し得る(McCafferty,et al.,1990.Nature.348:552-4、Edwards,B.M.et al.,2003.JMB.334:103-18、Schofield,D.et al.,2007.Genome Biol.8,R254、及びPershad,K.et al.,2010.Protein Engineering Design and Selection.23:279-88;各文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。提示される抗体フラグメントは、scFv抗体フラグメントであり得る。ファージディスプレイライブラリメンバーは、ウイルスコートタンパク質(例えばウイルスpIIIコートタンパク質のN末端)に連結された融合タンパク質として発現され得る。V鎖を別々に発現させて、ペリプラズム内でV鎖とアセンブルした後、ウイルスコートに複合体を組み込んでもよい。沈殿したライブラリメンバーを、結合したファージからシーケンシングして、所望の抗体ドメインをコードするcDNAを取得してもよい。
いくつかの実施形態では、抗体ディスプレイライブラリは、酵母表面ディスプレイ技術を使用して生成され得る。抗体酵母ディスプレイライブラリは、表面提示された抗体または抗体フラグメントを有する酵母細胞から構成されている。抗体酵母ディスプレイライブラリは、Saccharomyces cerevisiae細胞の表面で発現された抗体可変ドメインを含み得る。酵母ディスプレイライブラリは、酵母表面タンパク質(例えばAga2pタンパク質)との融合タンパク質として目的の抗体フラグメントを提示することによって展開され得る。特定の標的に対する親和性を有する抗体または抗体フラグメントを提示する酵母細胞は、標準的な方法に従って単離することができる。このような方法は、磁気分離及びフローサイトメトリを含み得るが、これらに限定されない。
組換え合成
本開示の抗体は、組換えDNA技術及び関連プロセスを使用して調製され得る。抗体をコードする構築物(例えば、DNA発現プラスミド)を調製し、完全な抗体またはその一部を合成するために使用してもよい。いくつかの実施形態では、本開示の抗体可変ドメインをコードするDNA配列を、他の抗体ドメインをコードする発現ベクター(例えば、哺乳動物発現ベクター)に挿入し、これを使用して、挿入された可変ドメインを有する抗体を調製してもよい。抗体可変ドメインをコードするDNA配列は、プロモーター/エンハンサーエレメントを有する及び/または免疫グロブリンシグナル配列をコードする上流発現ベクター領域の下流に挿入され得る。抗体可変ドメインをコードするDNA配列は、免疫グロブリン定常ドメインをコードする下流発現ベクター領域の上流に挿入され得る。コードされる定常ドメインは、任意のクラス(例えば、IgG、IgA、IgD、IgE、及びIgM)または種(例えば、ヒト、マウス、ウサギ、ラット、及び非ヒト霊長類)に由来し得る。いくつかの実施形態では、コードされる定常ドメインは、ヒトIgG(例えば、IgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4)の定常ドメインをコードする。いくつかの実施形態では、コードされる定常ドメインは、マウスIgG(例えば、IgG1、IgG2a、IgG2b、IgG2c、またはIgG3)の定常ドメインをコードする。
本開示の抗体をコードする発現ベクターは、抗体産生のために細胞をトランスフェクトするために使用され得る。かかる細胞は哺乳動物細胞であり得る。抗体発現ベクターが安定にトランスフェクトされた細胞株を調製し、安定な細胞株を確立するために使用してもよい。抗体を産生する細胞株を拡大して抗体を発現させてもよく、これを細胞培養培地から単離または精製してもよい。
抗体の特徴決定
いくつかの実施形態では、本開示の抗体は、異なる特徴に基づいて同定、選択、または除外され得る。このような特徴は、物理的特徴及び機能的特徴を含み得るが、これらに限定されない。物理的特徴は、抗体構造の特性[例えば、アミノ酸配列または残基;二次、三次、または四次のタンパク質構造;翻訳後修飾(例えば、グリコシル化);化学結合、及び安定性]を含み得る。機能的特徴は、抗体親和性(すなわち、特定のエピトープ及び/または抗原に対するもの)及び抗体活性(例えば、標的、プロセス、または経路を活性化または阻害する抗体の能力)を含み得るが、これらに限定されない。
抗体の結合及び親和性
いくつかの実施形態では、本開示の抗体は、特定のエピトープ及び/または抗原に対する結合及び/または親和性のレベルに基づいて同定、選択、または除外され得る。抗体結合及び/または親和性のレベルは、異なる抗原フォーマットを用いて評価され得る。いくつかの実施形態では、異なる抗原フォーマットに対する抗体親和性は、in vitroで(例えば、ELISAによって)試験され得る。抗タウ抗体のin vitro試験は、脳のサンプルまたは断片を使用して行われ得る。このようなサンプルまたは断片は、ADを有する対象(例えば、ヒトAD患者)から得ることができる。いくつかの実施形態では、脳のサンプルまたは断片は、非ヒト対象から得られてもよい。このような非ヒト対象には、AD疾患モデル研究において使用される非ヒト動物(例えば、マウス、ラット、及び霊長類)が含まれ得る。いくつかの実施形態では、抗体親和性試験に使用される脳のサンプルまたは断片は、TG4510/P301Sマウス系統に由来し得る。抗体親和性は、親和性を分析しようとする特定の抗原を欠いている対照サンプルに対して比較され得る。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体試験に使用される対照サンプルは、非罹患ヒト対象由来の脳のサンプルまたは断片を含み得る。いくつかの実施形態では、野生型及び/またはタウノックアウトマウス系統由来の脳のサンプルまたは断片を対照サンプルとして使用してもよい。
in vitro親和性試験は、組換えまたは単離されたタンパク質抗原を使用して(例えば、ELISAによって)行ってもよい。例えば、組換えまたは単離されたePHFを抗タウ抗体親和性試験のために使用してもよい。いくつかの実施形態では、本開示の抗タウ抗体は、ELISAによって評価した場合、ePHFへの結合について、約0.01nM~約100nMの最大半量有効濃度(EC50)を呈し得る。いくつかの実施形態では、呈されるEC50は、約50nM未満、約20nM未満、約10nM未満、または約1nM未満であり得る。いくつかの実施形態では、本開示の抗タウ抗体は、ELISAによって評価した場合、表8に列挙された抗原のいずれか、または抗原のいずれかを含むもしくはそれに含まれるエピトープ(立体構造エピトープを含むがこれに限定されない)への結合について、約0.01nM~約100nMのEC50を呈し得る。いくつかの実施形態では、呈されるEC50は、約50nM未満、約20nM未満、約10nM未満、または約1nM未満であり得る。
いくつかの実施形態では、本開示の抗タウ抗体は、病的なタウには結合するが、病的でないタウには結合しない。このような抗体について、本明細書では、病的形態のタウに対して「選択的」であるという場合がある。いくつかの実施形態では、本開示の抗タウ抗体は、タウ濃縮体に結合する。
いくつかの実施形態では、抗体親和性分析が、多重特異性抗体を同定、選択、または除外するために使用され得る。本明細書で使用される場合、「多重特異性抗体」という用語は、複数のエピトープまたは抗原に対する親和性を有する抗体を指す。いくつかの実施形態では、多重特異性抗体は、認識される各エピトープまたは抗原に対する相対的な親和性に基づいて同定、選択、または除外され得る。例えば、多重特異性抗体は、多重特異性抗体が親和性を示す、あるエピトープまたは抗原に対する親和性が、第2のエピトープまたは抗原と比べて高いことに基づいて、使用またはさらなる開発のために選択され得る。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、他の抗タウ抗体との競合について試験され得る。このような試験は、抗体により認識される特定のエピトープに関する情報を提供するために行うことができ、競合する抗体と比較したエピトープ親和性のレベルに関連する情報をもたらすことができる。いくつかの実施形態では、抗体結合及び/または親和性の分析に使用される抗タウ抗体は、米国特許第9,371,376号に記載されている抗タウ抗体PT3、米国特許第10,196,439号に記載されている抗タウ抗体C10.2(同文献では抗体「C10-2」と称される)、米国特許第10,040,847号に記載されている抗タウ抗体IPN002、抗タウ抗体AT8(ThermoFisher,Waltham,MA)、抗タウ抗体AT100(ThermoFisher,Waltham,MA)、米国特許第5,843,779号に記載されている抗タウ抗体AT120、またはVandermeeren,M.et al.,J Alzheimers Dis.2018;65(1):265-281に記載されている抗タウ抗体PT76を含み得る。
抗体活性
いくつかの実施形態では、本開示の抗体は、ある特定の活性を促進または低減する能力に基づいて同定、選択、または除外され得る。抗体活性は、分析アッセイを使用して評価することができる。このようなアッセイは、かかる抗体活性に基づいて抗体を検出、スクリーニング、測定、及び/またはランク付けするように選択または設計され得る。
抗タウ抗体は、タウ凝集を阻害する能力によって特徴決定され得る。阻害は、タウ凝集の物理的破壊に基づくものでもよいし、タウタンパク質の抗タウ抗体依存性枯渇(免疫枯渇)に基づくものでもよい。タウ凝集阻害に基づく特徴決定は、タウ凝集の1または複数のアッセイを使用して評価することができる。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、タウ播種アッセイによって特徴決定され得る。タウ播種アッセイは、典型的には、in vitroでのタウ凝集の開始と、試験される候補化合物による凝集阻害の評価とを含む。タウ播種アッセイは、タウ凝集バイオセンサ細胞を使用して行われ得る。タウ凝集バイオセンサ細胞は、タウ凝集に応答して検出可能なシグナル(例えば、蛍光シグナル)を生じる。タウ凝集バイオセンサ細胞は、組換えもしくは単離されたタウと共に、または高タウ脳組織もしくは流体由来のサンプルと共に(タウ凝集を促進するために)培養され、タウ凝集阻害を評価するために候補化合物ありまたはなしで処理され得る。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、バイオセンサ細胞とのインキュベーションの前に、タウを培地から枯渇させるために使用され得る。枯渇培地による凝集レベルを、非枯渇培地による凝集レベルと比較することで、抗タウ抗体阻害機能を評価することができる。タウ凝集バイオセンサ細胞は、タウRDバイオセンサ細胞を含み得るが、これに限定されない。いくつかの実施形態では、ヒトタウを発現するニューロンが使用され得る。
いくつかの実施形態では、本開示の抗タウ抗体は、免疫枯渇アッセイによって(例えば、タウRDバイオセンサ細胞を使用して)決定した場合、約1nM~約30nMの最大半量阻害濃度(IC50)でタウ凝集を阻害し得る。
抗体の構造及びバリエーション
本開示の抗体は、ポリペプチド全体、複数のポリペプチド、またはポリペプチドのフラグメントとして存在してもよく、これらは独立して、1または複数の核酸、複数の核酸、核酸のフラグメント、または前述のもののいずれかのバリアントによってコードされ得る。
本明細書で使用される場合、「ポリペプチド」は、ほとんどの場合ペプチド結合によってひとつに連結されているアミノ酸残基(天然または非天然)のポリマーを意味する。この用語は、本明細書で使用される場合、任意のサイズ、構造、または機能のタンパク質、ポリペプチド、及びペプチドを指す。約50アミノ酸より小さいポリペプチドは、「ペプチド」という用語を使用して言及される場合がある。ペプチドは、少なくとも約2、3、4、または少なくとも5アミノ酸残基長であり得る。本開示のポリペプチドは、遺伝子産物、天然起源のポリペプチド、合成ポリペプチド、ホモログ、オルソログ、パラログ、フラグメント、または前述のものの他の均等物、バリアント、及び類似体を含み得る。ポリペプチドは、単一分子でもよいし、二量体、三量体、または四量体などの多分子複合体でもよい。ポリペプチドは、単鎖または多連鎖のポリペプチドを含んでもよく、これらは会合または連結されていてもよい。ポリペプチドには、1または複数のアミノ酸残基が、対応する天然起源のアミノ酸の人工化学的類似体である、アミノ酸ポリマーが含まれ得る。
「ポリペプチドバリアント」という用語は、アミノ酸配列が天然配列または参照配列とは異なる分子を指す。アミノ酸配列バリアントは、天然配列または参照配列と比較した場合、アミノ酸配列内のある特定の位置に置換、欠失、及び/または挿入を有し得る。通常、バリアントは、天然配列または参照配列に対して少なくとも約50%の同一性(相同性)を有し、好ましくは、天然配列または参照配列に対して少なくとも約80%、より好ましくは少なくとも約90%同一(相同)である。
いくつかの実施形態では、「バリアント模倣体」が提供される。本明細書で使用される場合、「バリアント模倣体」という用語は、活性化された配列を模倣する1または複数のアミノ酸を含むものである。例えば、グルタミン酸は、リン酸化スレオニン及び/またはリン酸化セリンの模倣体として機能し得る。あるいは、バリアント模倣体は、非活性化、または模倣体を含む不活性化産物をもたらし得、例えば、フェニルアラニンは、チロシンの不活性化置換として作用し得るか、またはアラニンは、セリンの不活性化置換として作用し得る。
「アミノ酸配列バリアント」という用語は、天然または出発配列と比較してアミノ酸配列にいくつかの相違点を有する分子を指す。アミノ酸配列バリアントは、アミノ酸配列内のある特定の位置に置換、欠失、及び/または挿入を有し得る。「天然」または「出発」配列は、野生型配列と混同されてはならない。本明細書で使用される場合、天然または出発配列は、比較がなされ得る元の分子を指す相対的な用語である。「天然」または「出発」配列または分子は、野生型(天然に見出される配列)を表し得るが、野生型配列である必要はない。
通常、バリアントは、天然配列と比較して、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、少なくとも99.5%、少なくとも99.8%、または少なくとも99.9%の配列同一性を有する。
アミノ酸配列に適用される「ホモログ」とは、第2の種の第2の配列に対して実質的な同一性を有する、他の種の対応する配列を意味する。
「類似体」は、1または複数のアミノ酸変化、例えば、アミノ酸残基の置換、付加、または欠失によって異なるが、親ポリペプチドの性質を依然として維持するポリペプチドバリアントを含むことが意図される。
本開示は、本明細書で提示される抗体のバリアント及び誘導体を企図する。これらには、置換、挿入、欠失、及び共有結合性のバリアント及び誘導体が含まれる。例えば、配列タグまたは1もしくは複数のリシンなどのアミノ酸が、抗体ペプチド配列に(例えば、N末端またはC末端で)付加され得る。配列タグは、ペプチドの精製または局在化のために使用され得る。リシンは、ペプチドの溶解度を増加させる、またはビオチン化を可能にするために使用され得る。あるいは、ペプチドまたはポリペプチドのアミノ酸配列のカルボキシ末端領域及びアミノ末端領域に位置しているアミノ酸残基を、場合により欠失させて、トランケート型配列をもたらしてもよい。あるいは、例えば、可溶性であるより大きな配列の一部としての、または固体支持体に連結された配列の発現のような、配列の使用に応じて、ある特定のアミノ酸(例えば、C末端またはN末端の残基)を欠失させてもよい。
ポリペプチドに言及している場合の「置換バリアント」とは、天然または出発配列において少なくとも1つのアミノ酸残基が除去され、その代わりに異なるアミノ酸が同じ位置で挿入されているものである。置換は、分子中の1つのアミノ酸のみが置換されている単一置換でもよいし、同じ分子中で2つ以上のアミノ酸が置換されている多重置換でもよい。
本明細書で使用される場合、「保存的アミノ酸置換」という用語は、配列内に通常存在するアミノ酸を、サイズ、電荷、または極性が同様である異なるアミノ酸で置換することを指す。保存的置換の例としては、イソロイシン、バリン、及びロイシンなどの非極性(疎水性)残基を別の非極性残基に置換することが挙げられる。同様に、保存的置換の例としては、アルギニンとリシン、グルタミンとアスパラギン、及びグリシンとセリンのように、ある極性(親水性)残基を別のものに置換することが挙げられる。更に、リシン、アルギニン、もしくはヒスチジンのような塩基性残基を別のものに置換すること、またはアスパラギン酸もしくはグルタミン酸のようなある酸性残基を別の酸性残基に置換することは、保存的置換の更なる例である。非保存的置換の例としては、イソロイシン、バリン、ロイシン、アラニン、メチオニンなどの非極性(疎水性)アミノ酸残基を、システイン、グルタミン、グルタミン酸もしくはリシンなどの極性(親水性)残基に置換すること、及び/または極性残基を非極性残基に置換することが挙げられる。
ポリペプチドに言及している場合の「挿入バリアント」とは、天然または出発配列内の特定の位置にあるアミノ酸のすぐ隣に挿入された1または複数のアミノ酸を有するものである。アミノ酸の「すぐ隣」とは、アミノ酸のアルファ-カルボキシまたはアルファ-アミノのいずれかの官能基に接続していることを意味する。
ポリペプチドに言及している場合の「欠失バリアント」とは、天然または出発アミノ酸配列内の1または複数のアミノ酸が除去されたものである。通常、欠失バリアントは、分子の特定の領域内で1または複数のアミノ酸が欠失している。
本明細書で使用される場合、「誘導体」という用語は、「バリアント」という用語と同義に使用され、参照分子または出発分子に対して何らかのかたちで修飾または変更されている分子を指す。いくつかの実施形態では、誘導体には、タンパク質性または非タンパク質性の有機誘導体化剤及び翻訳後修飾で修飾されている天然または出発ポリペプチドが含まれる。共有結合性修飾は、従来、ポリペプチドのうち標的となるアミノ酸残基を、選択された側鎖もしくは末端残基と反応することができる有機誘導体化剤と反応させること、または選択された組換え宿主細胞において機能する翻訳後修飾のメカニズムを利用することによって導入される。得られる共有結合誘導体は、生物学的活性、イムノアッセイ、または免疫親和性精製用の抗体の調製のために重要な残基を同定することを目的とするプログラムにおいて有用である。
ある特定の翻訳後修飾は、発現されたポリペプチドに対する組換え宿主細胞の作用の結果である。グルタミニル残基及びアスパラギニル残基は、高頻度で翻訳後に脱アミド化されて対応するグルタミル残基及びアスパルチル残基になる。あるいは、これらの残基は、弱酸性条件下で脱アミド化される。これらの残基のいずれの形態も、本開示に従って使用されるポリペプチドに存在し得る。
他の翻訳後修飾としては、プロリン及びリシンのヒドロキシル化、セリル残基またはスレオニル残基のヒドロキシル基のリン酸化、リシン、アルギニン、及びヒスチジン側鎖のアルファ-アミノ基のメチル化が挙げられる(T.E.Creighton,Proteins:Structure and Molecular Properties,W.H.Freeman&Co.,San Francisco,pp.79-86(1983))。
共有結合誘導体は、ポリペプチドが非タンパク質性ポリマーに共有結合している融合分子を具体的に含む。非タンパク質性ポリマーは、親水性合成ポリマー、すなわち、さもなければ天然には見出されないポリマーを含み得る。しかし、天然に存在し、組換え法またはin vitro法によって生成されるポリマーは、自然界から単離されるポリマーと同じく有用である。親水性ポリビニルポリマーは、ポリビニルアルコール及び/またはポリビニルピロリドンを含み得る。特に有用であるのは、ポリエチレングリコール及びポリプロピレングリコールなどのポリビニルアルキレンエーテルである。ポリペプチドは、米国特許第4,640,835号、同第4,496,689号、同第4,301,144号、同第4,670,417号、同第4,791,192号、または同第4,179,337号に記載の様式で、ポリエチレングリコール、ポリプロピレングリコール、またはポリオキシアルキレンなどの様々な非タンパク質性ポリマーに連結されてよく、各文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
ポリペプチドに言及する際に本明細書で使用される場合、「ループ」という用語は、ペプチドまたはポリペプチドの骨格の方向を逆転させ、4つ以上のアミノ酸残基を含む、ペプチドまたはポリペプチドの構造的特性を指す。Olivaらは、少なくとも5つのクラスのポリペプチドループを同定している(J.Mol Biol 266(4):814-830;1997、同文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。
ポリペプチドに言及する際に本明細書で使用される場合、「半ループ」という用語は、由来元のループとして存在するアミノ酸残基の少なくとも半数を有する同定されたループの一部を指す。ループは必ずしも偶数のアミノ酸残基を含むとは限らないと理解される。したがって、ループが奇数のアミノ酸を含む、または含むと同定される場合、奇数ループの半ループは、ループの整数部分または次の整数部分(ループ/2±0.5アミノ酸の数のアミノ酸)を含む。例えば、7アミノ酸ループと同定されるループは、3アミノ酸または4アミノ酸の半ループを生成し得る(7/2=3.5±0.5は3または4である)。
ポリペプチドに言及する際に本明細書で使用される場合、「ドメイン」という用語は、1または複数の同定可能な構造的及び/または機能的特徴または性質(例えば、結合能力)を有する、例えば、タンパク質-タンパク質相互作用の部位として機能する、ポリペプチドのモチーフを指す。
ポリペプチドに言及する際に本明細書で使用される場合、「部位」という用語は、「アミノ酸残基」及び「アミノ酸側鎖」と同義である。部位は、ポリペプチド内で修飾、操作、変更、誘導体化、または変化することができるポリペプチド上の位置を表す。
本明細書で使用される場合、「末端(terminiまたはterminus)」という用語は、ポリペプチドに言及する際、ペプチドまたはポリペプチドの端部を指す。このような端部は、ペプチドまたはポリペプチドの最初または最後の部位のみに限定されず、末端領域内の更なるアミノ酸を含んでもよい。本開示のポリペプチドベースの分子は、N末端(遊離アミノ基を有するアミノ酸で終結する)とC末端(遊離カルボキシル基を有するアミノ酸で終結する)との両方を有するものと特徴付けられ得る。本開示のタンパク質は、場合によっては、ジスルフィド結合または非共有結合力によってまとめられた複数のポリペプチド鎖から構成されている(多量体、オリゴマー)。これらの類のタンパク質は、複数のN末端及びC末端を有する。あるいは、ポリペプチドの末端は、場合によっては有機コンジュゲートなどの非ポリペプチドベースの部分で開始または終了するように修飾されてもよい。
抗体の修飾
抗体を修飾して、1または複数の変更された性質を有するバリアントを得ることができる。このような性質は、抗体の構造、機能、親和性、特異性、タンパク質フォールディング、安定性、製造、発現、及び/または免疫原性(すなわち、かかる抗体で処置される対象における免疫反応)を含むか、またはそれに関連し得る。いくつかの実施形態では、抗体フラグメントまたはバリアントを、別の抗体の修飾のために使用してもよいし、合成抗体に組み込んでもよい。
抗体の修飾は、アミノ酸配列修飾を含み得る。このような修飾は、アミノ酸の欠失、付加、及び/または置換を含み得るが、これらに限定されない。修飾の情報は、アミノ酸配列分析によって得られることがある。このような分析は、異なる抗体または抗体バリアント間のアミノ酸配列のアラインメントを含み得る。2つ以上の抗体を比較して、修飾に好適な残基または領域を同定することができる。比較される抗体は、同じエピトープに結合するものを含み得る。比較される抗体は、同じタンパク質または標的の異なる(別個のまたは重複する)エピトープに結合してもよい(例えば、これにより、特定のエピトープに対する特異性を与える残基または領域が同定される)。比較には、軽鎖及び/または重鎖の配列変動の分析、CDR配列変動の分析、生殖細胞系配列の分析、及び/またはフレームワーク配列の分析が含まれ得る。このような分析から得られた情報を使用して、同じまたは異なるエピトープに結合する抗体間で保存されているまたは可変である、アミノ酸残基、アミノ酸のセグメント、アミノ酸の側鎖、CDRの長さ、及び/または他の特性もしくは性質を同定することができる。
いくつかの実施形態では、1または複数のCDRアミノ酸残基を付加する、欠失させる、または置換することにより、上述の抗タウ抗体の修飾バージョンが調製され得る。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、同様の標的に結合する抗体のアミノ酸配列アラインメントと、アラインされた配列の分析に基づいて、1または複数のアミノ酸欠失、置換、または挿入を有する修飾抗体を調製することとによって修飾され得る。
本開示は、CDR領域配列のアミノ酸コンセンサス配列を含み、例えば表1AまたはZに記載されるような抗体アミノ酸配列において、修飾され得る特定のアミノ酸(角括弧内に示されている)、またはより一般的に欠失もしくは置換され得るアミノ酸残基位置(変数「X」を使用して示されている)を示す。
抗体の同じVH配列及び/またはVL配列に出現し得る関連するCDR配列は、同じ横列にグループ化されている。例えば、本発明の抗体は、CDRH1~CDRH3及びCDRL1~CDRL3の各々1つを含んでもよく、ここで、前記CDRH1~CDRH3及びCDRL1~CDRL3は、それぞれ配列番号928、930、409、472、525、及び570によって表される。
さらに、表5において、例えば、表見出しの下の奇数の各横列、及びその直下の偶数の横列は、関連する(同一でない場合)コンセンサス配列である(例えば、配列番号927及び928は関連しており、配列番号933及び934は関連している)。本発明の抗体は、CDRH1~CDRH3及びCDRL1~CDRL3の各々1つを含んでもよいことが企図され、ここで、前記CDRH1~CDRH3及びCDRL1~CDRL3の各々は、独立して、2つの関連するコンセンサス配列のうちの1つによって表され得る。例えば、本発明の抗体は、CDRH1~CDRH3及びCDRL1~CDRL3の各々1つを含んでもよく、ここで、前記CDRH1~CDRH3及びCDRL1~CDRL3は、それぞれ配列番号931、341、410、934、935、及び571によって表される。
さらに、各X位またはXi位(ここで、iは1、2、3…である)のアミノ酸は、任意の天然起源アミノ酸でもよいし、各コンセンサス配列X/Xi位において指定されるアミノ酸の選択されたサブセットでもよい。各X位またはXi位における列挙された特定のアミノ酸のうちのいずれか1または複数は、X位またはXi位の許容値として除外され得ることが企図される。例えば、配列番号947において、X4は、T、S、A、V、I、またはLなどの任意の残基であり得る。いくつかの実施形態では、X4は、T、L、もしくはV、またはS、A、もしくはVなどである。
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Figure 2023523401000002
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Figure 2023523401000004
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Figure 2023523401000009
Figure 2023523401000010
いくつかの実施形態では、本開示の抗タウ抗体は、アミノ酸配列GYTFTS[Y/N](配列番号927)を含むCDRH1、もしくはアミノ酸配列GYTFTSX(配列番号928)を含むCDRH1(ここで、Xは、任意のアミノ酸であってよく、例えば、XはY/F/N/Qである);アミノ酸配列NPNNS[D/E](配列番号929)を含むCDRH2、もしくはアミノ酸配列NPNNSX(配列番号930)を含むCDRH2(ここで、Xは、任意のアミノ酸、例えば、負に帯電した側鎖を有するアミノ酸であってよい);及びアミノ酸配列ANYYGGSQFAY(配列番号409)を含むCDRH3;アミノ酸配列RSSQSLVHSNGKTYLH(配列番号472)を含むCDRL1;アミノ酸配列KVSNRFS(配列番号525)を含むCDRL2;及び/またはアミノ酸配列SQSTHVPFT(配列番号570)を含むCDRL3を含み得る。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、アミノ酸配列G[F/Y]TFT[R/I][Y/F](配列番号931)を含むCDRH1、もしくはアミノ酸配列G-X1-TFT-X2-X3(配列番号932)を含むCDRH1(ここで、X1、X2、及びX3の各々は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1及び/またはX3は、FまたはYなどの疎水性及び/もしくは芳香族側鎖を有するアミノ酸であってよく、ならびに/または、X2は、正に帯電した残基(例えばR、K、H)もしくは脂肪族側鎖を有する残基(例えばA、V、I、またはL)であってよい);アミノ酸配列NPNNGG(配列番号341)を含むCDRH2;アミノ酸配列GTGTGAMDY(配列番号410)を含むCDRH3;アミノ酸配列RSSQSLVH[N/S]NG[I/N]T[H/Y]LY(配列番号933)を含むCDRL1、もしくはアミノ酸配列RSSQSLVH-X1-NG-X2-T-X3-LY(配列番号934)を含むCDRL1(ここで、X1、X2、及びX3は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はQ/N/S/Tであり、及び/またはX2はA/V/I/L/Q/Nであり、及び/またはX3はH/R/K/Y/Fである);アミノ酸配列RVS[N/S]RFS(配列番号935)を含むCDRL2、もしくはアミノ酸配列RVSXRFS(配列番号936)を含むCDRL2(ここで、Xは、任意のアミノ酸であってよく、例えば、XはQ/N/S/Tである);及び/またはアミノ酸配列FQGTHVPRT(配列番号571)を含むCDRL3を含む。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、アミノ酸配列G[F/Y]TFT[R/I/D][Y/F](配列番号937)を含むCDRH1、もしくはアミノ酸配列G-X1-TFT-X2-X3(配列番号938)を含むCDRH1(ここで、X1、X2及びX3は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1及びX3は各々独立してF/Yであり、及び/またはX2は任意の残基(例えばR/K/H/D/E/G/A/I/L/V)である);アミノ酸配列NPNNG[G/E](配列番号939)を含むCDRH2、もしくはアミノ酸配列NPNNGX(配列番号940)を含むCDRH2(ここで、Xは、任意のアミノ酸、例えば、E/D/G/A/V/I/Lであってよい);G[T/R]G[T/M]G[不在/Y][不在/Y]A[M/L]DY(配列番号941)のアミノ酸配列を含むCDRH3、もしくはアミノ酸配列G-X1-G-X2-G-X3-X4-A-X5-DY(配列番号942)を含むCDRH3(ここで、X1~X5の各々は、任意のアミノ酸であってよく、ならびに/あるいは、X3及び/またはX4は不在であってよく、例えば、X1はS/T/R/K/Hであり、及び/またはX2はS/T/V/L/A/I/Mであり、及び/またはX3及びX4は各々独立してY/F/不在であり、及び/またはX5はA/V/I/L/Mである);アミノ酸配列[R/G][S/A]S[Q/E][S/N][L/V][V/Y][H/G][S/A/N][N/T/L][G/N][I/N/不在][T/不在][H/Y/不在][L/不在][Y/不在](配列番号943)を含むCDRL1、もしくはアミノ酸配列X1-X2-S-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9-X10-X11-X12-X13-X14-X15(配列番号944)を含むCDRL1(ここで、X1~X15は、任意のアミノ酸であってよく、及び/または、X11、X12、X13、X14、及び/またはX15は不在であってよく、例えば、X1はR/K/H/G/A/V/I/Lであり、及び/またはX2はS/T/A/V/I/Lであり、及び/またはX3はQ/N/E/Dであり、及び/またはX4はS/T/N/Qであり、及び/またはX5はL/V/A/Iであり、及び/またはX6はA/V/I/L/Y/Fであり、及び/またはX7はH/R/K/G/Aであり、及び/またはX8はS/T/A/V/I/L/N/Qであり、及び/またはX9はN/Q/A/I/L/V/M/S/Tであり、及び/またはX10はG/A/N/Qであり、及び/またはX11はQ/N/A/V/I/L/不在であり、及び/またはX12はT/S/不在であり、及び/またはX13はH/R/K/Y/F/不在であり、及び/またはX14はA/V/I/L/不在であり、及び/またはX15はY/F/不在である);[R/G][V/A][S/T][N/T/S][R/L][F/A][S/D](配列番号945)のアミノ酸配列の約3~約7アミノ酸を有するCDRL2コンセンサス配列、もしくはアミノ酸配列X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7(配列番号946)を含むCDRL2(ここで、X1、X2、X3、X4、X5、X6、及びX7は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はR/K/H/G/Aであり、及び/またはX2はV/A/I/Lであり、及び/またはX3はS/Tであり、及び/またはX4はN/Q/T/Sであり、及び/またはX5はR/K/H/A/V/I/Lであり、及び/またはX6はF/Y/A/V/I/L/Gであり、及び/またはX7はS/T/D/Eである);及び/またはアミノ酸配列[F/Q][G/N][G/V][T/L][H/T][V/I]P[R/W]T(配列番号947)を含むCDRL3、もしくはアミノ酸配列X1-X2-X3-X4-X5-X6-P-X7-T(配列番号948)を含むCDRL3(ここで、X1、X2、X3、X4、X5、X6、及びX7は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はF/Y/Q/Nであり、及び/またはX2はG/A/Q/Nであり、及び/またはX3はG/A/V/I/Lであり、及び/またはX4はT/S/A/V/I/Lであり、及び/またはX5はH/R/K/T/Sであり、及び/またはX6はV/I/A/Lであり、及び/またはX7はR/K/H/W/F/Yである)を含む。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、アミノ酸配列GY[S/T]FT[D/E]Y(配列番号949)を含むCDRH1、もしくはアミノ酸配列GY-X1-FT-X2-Y(配列番号950)を含むCDRH1(ここで、X1及びX2は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はS/Tであり、及び/またはX2はD/E/S/Tである);アミノ酸配列[F/Y]PG[S/R][D/G][S/N](配列番号951)を含むCDRH2、もしくはアミノ酸配列X1-PG-X2-X3-X4(配列番号952)を含むCDRH2(ここで、X1~X4は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はF/Yであり、及び/またはX2はS/T/R/K/Hであり、及び/またはX3はD/E/G/Aであり、及び/またはX4はS/T/N/Qである);アミノ酸配列P[T/A][V/I/Y][V/Y][A/S][R/K]DYAM[D/E]Y(配列番号953)を含むCDRH3、もしくはアミノ酸配列P-X1-X2-X3-X4-X5-DYAM-X6-Y(配列番号954)を含むCDRH3(ここで、X1~X6は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はT/S/A/V/I/Lであり、及び/またはX2はV/I/A/L/Y/Fであり、及び/またはX3はV/I/A/L/Y/Fであり、及び/またはX4はA/V/I/L/S/Tであり、及び/またはX5はR/K/Hであり、及び/またはX6はD/Eである);アミノ酸配列RSSQSIV[Y/H][S/R/T]NGNTYLE(配列番号955)を含むCDRL1、もしくはアミノ酸配列RSSQSIV-X1-X2-NGNTYLE(配列番号956)を含むCDRL1(ここで、X1及びX2は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はY/F/H/R/Kであり、及び/またはX2はS/T/R/K/Hである);アミノ酸配列KVSNRFS(配列番号525)を含むCDRL2;及び/またはアミノ酸配列FQGSHVP[Y/F]T(配列番号957)を含むCDRL3、もしくはアミノ酸配列FQGSHVPXT(配列番号958)を含むCDRL3(ここで、Xは、任意のアミノ酸であってよく、例えば、XはY/Fである)を含む。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、アミノ酸配列GY[S/T]FT[D/E/S]Y(配列番号959)を含むCDRH1、もしくはアミノ酸配列GY-X1-FT-X2-Y(配列番号950)を含むCDRH1(ここで、X1及びX2は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はS/Tであり、及び/またはX2はE/D/S/Tである);アミノ酸配列[F/Y]P[G/S][S/R/N][D/G][S/G/N](配列番号960)を含むCDRH2、もしくはアミノ酸配列X1-P-X2-X3-X4-X5(配列番号961)を含むCDRH2(ここで、X1~X5は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はF/Yであり、及び/またはX2はS/T/G/A/V/I/Lであり、及び/またはX3はS/T/R/K/H/N/Qであり、及び/またはX4はD/E/G/Aであり、及び/またはX5はS/T/N/Q/G/Aである);アミノ酸配列[P/S][T/A/S][V/I/Y][V/Y][A/S/G][R/K]DYAM[D/E]Y(配列番号962)を含むCDRH3、もしくはアミノ酸配列X1-X2-X3-X4-X5-X6-DYAM-X7-Y(配列番号963)を含むCDRH3(ここで、X1~X7は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はS/T/P/A/I/L/Vであり、及び/またはX2はT/S/A/V/I/Lであり、及び/またはX3はA/V/I/L/Y/Fであり、及び/またはX4はA/V/I/L/Y/Fであり、及び/またはX5はA/V/I/L/G/S/Tであり、及び/またはX6はR/K/Hであり、及び/またはX7はE/Dである);アミノ酸配列RSSQSIV[Y/H][S/R/T]NGNTYLE(配列番号955)を含むCDRL1、もしくはアミノ酸配列RSSQSIV-X1-X2-NGNTYLE(配列番号956)を含むCDRL1(ここで、X1及びX2は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はY/F/H/R/Kであり、及び/またはX2はS/T/R/K/Hである);アミノ酸配列KVSNRFS(配列番号525)を含むCDRL2;及び/またはアミノ酸配列FQGSHVP[Y/F]T(配列番号957)を含むCDRL3、もしくはアミノ酸配列FQGSHVPXT(配列番号958)を含むCDRL3(ここで、Xは、任意のアミノ酸であってよく、例えば、XはF/Yである)を含む。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、アミノ酸配列GFSL[S/N]T[S/F][A/G]M(配列番号964)を含むCDRH1、もしくはアミノ酸配列GFSL-X1-T-X2-X3-M(配列番号965)を含むCDRH1(ここで、X1~X3は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はS/T/N/Qであり、及び/またはX2はS/T/F/Yであり、及び/またはX3はA/V/I/L/Gである);アミノ酸配列YWDDD(配列番号362)を含むCDRH2;アミノ酸配列R[R/V/K]R[G/Y/S]Y[G/A]MDY(配列番号966)を含むCDRH3、もしくはアミノ酸配列R-X1-R-X2-Y-X3-MDY(配列番号967)を含むCDRH3(ここで、X1~X3は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はR/K/H/A/V/I/Lであり、及び/またはX2はG/A/V/I/L/S/T/Y/Fであり、及び/またはX3はA/V/I/L/Gである);アミノ酸配列K[A/S]SQS[V/L][S/L][N/S][不在/S][不在/G][不在/N][不在/Q][不在/K][不在/N][D/Y][V/L]A(配列番号968)を含むCDRL1、もしくはアミノ酸配列K-X1-SQS-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9-X10-X11-X12-A(配列番号969)を含むCDRL1(ここで、X1~X12は、任意のアミノ酸であってよく、及び/または、X5~X10のうちの1もしくは複数は不在であってよく、例えば、X1はS/T/A/V/I/Lであり、及び/またはX2はA/V/I/Lであり、及び/またはX3はS/T/A/V/I/Lであり、及び/またはX4はN/Q/S/Tであり、及び/またはX5はS/T/不在であり、及び/またはX6はG/A/V/I/L/不在であり、及び/またはX7はN/Q/不在であり、及び/またはX8はN/Q/不在であり、及び/またはX9はK/R/H/不在であり、及び/またはX10はN/Q/不在であり、及び/またはX11はE/D/Y/Fであり、及び/またはX12はA/V/I/Lである);アミノ酸配列[Y/G][A/T]S[N/T]R[C/E][T/S](配列番号970)を含むCDRL2、もしくはアミノ酸配列X1-X2-S-X3-R-X4-X5(配列番号971)を含むCDRL2(ここで、X1~X5は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はY/F/G/A/V/I/Lであり、及び/またはX2はA/V/I/L/T/Sであり、及び/またはX3はN/Q/T/Sであり、及び/またはX4はC/S/E/Dであり、及び/またはX5はT/Sである);及び/またはアミノ酸配列Q[Q/N]D[Y/H][R/S][S/H]P[L/Y]T(配列番号972)を含むCDRL3、もしくはアミノ酸配列Q-X1-D-X3-X4-X5-P-X6-T(配列番号973)を含むCDRL3(ここで、X1~X6は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はQ/Nであり、及び/またはX2はY/F/H/R/Kであり、及び/またはX3はR/K/H/S/Tであり、及び/またはX4はS/T/H/K/R及び/またはA/V/I/L/Y/Fである)を含む。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、アミノ酸配列GFSL[S/N]T[S/F][A/G]M(配列番号964)を含むCDRH1、もしくはアミノ酸配列GFSL-X1-T-X2-X3-M(配列番号965)を含むCDRH1(ここで、X1~X3は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はS/T/N/Qであり、及び/またはX2はS/T/F/Yであり、及び/またはX3はG/A/I/L/Vである);アミノ酸配列YWDDD(配列番号362)を含むCDRH2;アミノ酸配列R[R/V/K/S/G][Y/R][Y/不在][S/不在][不在/N][G/S/Y/R][Y/N/G][G/A/Y/N][M/F/Y]DY(配列番号974)を含むCDRH3、もしくはアミノ酸配列R-X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9-DY(配列番号975)を含むCDRH3(ここで、X1~X9の各々は、任意のアミノ酸であってよく、及び/または、X3~X5のうちの1もしくは複数は不在であってよく、例えば、X1はR/K/H/A/V/I/L/G/S/Tであり、及び/またはX2はY/F/R/K/Hであり、及び/またはX3はY/F/不在であり、及び/またはX4はS/T/不在であり、及び/またはX5はN/Q/不在であり、及び/またはX6はG/A/V/I/L/S/T/Y/F/R/K/Hであり、及び/またはX7はY/F/N/Q/G/A/V/I/Lであり、及び/またはX8はG/A/V/I/L/Y/F/N/Qであり、及び/またはX9はM/F/Yである);アミノ酸配列[K/S][S/A]S[Q/S]S[L/I/V][L/S][N/S/D][D/S/T][V/G/D/Y][N/G/不在][Q/不在][K/不在][N/T/不在][Y/不在][L/不在][A/H/N](配列番号976)を含むCDRL1、もしくはアミノ酸配列X1-X2-S-X3-S-X4-X5-X6-X7-X8-X9-X10-X11-X12-X13-X14-X15(配列番号977)を含むCDRL1(ここで、X1~X15の各々は、任意のアミノ酸であってよく、及び/または、X9~X14のうちの1もしくは複数は不在であってよく、例えば、X1はK/R/H/S/Tであり、及び/またはX2はS/T/A/V/I/Lであり、及び/またはX3はQ/N/S/Tであり、及び/またはX4はL/I/V/Aであり、及び/またはX5はA/V/I/L/S/Tであり、及び/またはX6はN/Q/S/T/D/Eであり、及び/またはX7はD/E/S/Tであり、及び/またはX8はG/A/V/I/L/D/E/Y/Fであり、及び/またはX9はN/Q/G/A/不在であり、及び/またはX10はQ/N/不在であり、及び/またはX11はK/R/H/不在であり、及び/またはX12はN/Q/T/S/不在であり、及び/またはX13はY/F/不在であり、及び/またはX14はA/V/I/L/不在であり、及び/またはX15はA/V/I/L/H/K/R/N/Qである);アミノ酸配列[Y/G/L/R][A/T/V]S[N/T/K][R/L][C/E/D/A][T/S](配列番号978)を含むCDRL2、もしくはアミノ酸配列X1-X2-S-X3-X4-X5-X6(配列番号979)を含むCDRL2(ここで、X1~X6は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はY/F/G/A/V/I/L/R/K/Hであり、及び/またはX2はA/V/I/L/T/Sであり、及び/またはX3はN/Q/T/S/K/R/Hであり、及び/またはX4はR/K/H/A/V/I/Lであり、及び/またはX5はC/S/E/D/A/V/I/Lであり、及び/またはX6はT/Sである);及び/またはアミノ酸配列[W/Q][Q/N][G/D][T/S/Y/H][H/S/R][F/I/S/H]P[Q/R/L/Y][不在/Y]T(配列番号980)を含むCDRL3、もしくはアミノ酸配列X1-X2-X3-X4-X5-X6-P-X7-X8-T(配列番号981)を含むCDRL3(ここで、X1~X8の各々は、任意のアミノ酸であってよく、及び/または、X8は不在であってよく、例えば、X1はQ/N/W/F/Yであり、及び/またはX2はQ/Nであり、及び/またはX3はG/A/V/I/L/D/Eであり、及び/またはX4はT/S/Y/F/H/K/Rであり、及び/またはX5はH/K/R/S/Tであり、及び/またはX6はF/Y/A/V/I/L/S/T/H/K/Rであり、及び/またはX7はQ/N/R/K/H/A/V/I/L/Y/Fであり、及び/またはX8はY/F/不在である)を含む。
機能修飾
いくつかの実施形態では、本開示の抗体は、1または複数の機能的性質(例えば、抗体の親和性または活性)を最適化するように修飾され得る。抗体の機能的性質の非限定的な例としては、エピトープまたは抗原の親和性、標的を動員または固定化する能力、及び標的、プロセス、または経路を活性化または阻害する能力が挙げられる。いくつかの実施形態では、機能的性質は、タンパク質-タンパク質相互作用、タンパク質凝集、酵素活性、受容体-リガンド相互作用、細胞シグナル伝達経路、タンパク分解カスケード、及び/または生物学的応答もしくは生理学的応答を調整する能力を含むか、またはそれに関連する。
抗体の修飾は、エピトープ親和性を調整することにより抗体を最適化し得る。このような修飾は、親和性成熟によって行われ得る。親和性成熟技術は、標的抗原に対して親和性が最も高いCDRをコードする配列を同定するために使用される。いくつかの実施形態では、抗体ディスプレイ技術(例えば、ファージまたは酵母)が使用され得る。このような方法は、最適化される親抗体をコードするヌクレオチド配列を変異させることを含み得る。ヌクレオチド配列は、全体としてランダムに、または特定のアミノ酸残基で発現を変化させて、数百万から数十億のバリアントを作り出すように変異させることができる。部位または残基は、天然のヒト抗体レパートリーにおいて観察される配列またはアミノ酸の頻度に基づいて、変異のために選択され得る。バリアントは、標的抗原結合性について、親和性スクリーニングの複数回の繰り返し[例えば、ディスプレイライブラリスクリーニング技術、表面プラズモン共鳴技術、蛍光関連細胞選別(FACS)分析、酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)などの使用]にかけられ得る。選択、変異、及び発現の複数回の繰り返しは、標的抗原に対する親和性が最も高い抗体フラグメント配列を同定するために行われ得る。このような配列は、産生のために抗体配列に直接組み込んでもよい。場合によっては、親和性成熟の目標は、抗体親和性を、元の抗体または出発抗体の親和性と比較して、少なくとも2倍、少なくとも3倍、少なくとも4倍、少なくとも5倍、少なくとも6倍、少なくとも7倍、少なくとも8倍、少なくとも9倍、少なくとも10倍、少なくとも20倍、少なくとも30倍、少なくとも40倍、少なくとも50倍、少なくとも100倍、少なくとも500倍、少なくとも1,000倍、または1,000倍超増加させることである。親和性が所望よりも低い場合には、このプロセスを繰り返してもよい。
いくつかの実施形態では、抗体親和性は、異なる抗原フォーマットを用いて評価され得る。いくつかの実施形態では、異なる抗原フォーマットに対する抗体親和性は、in vitroで(例えば、ELISAによって)試験され得る。in vitro試験は、脳のサンプルまたは断片を使用して行われ得る。このようなサンプルまたは断片は、ADを有する対象(例えば、ヒトAD患者)から得ることができる。いくつかの実施形態では、脳のサンプルまたは断片は、非ヒト対象から得られてもよい。このような非ヒト対象には、AD疾患モデル研究において使用される非ヒト動物(例えば、マウス、ラット、及び霊長類)が含まれ得る。いくつかの実施形態では、抗体親和性試験に使用される脳のサンプルまたは断片は、TG4510/P301Sマウス系統に由来し得る。抗体親和性は、親和性を分析しようとする特定の抗原を欠いている対照サンプルに対して比較され得る。いくつかの実施形態では、対照サンプルは、非罹患ヒト対象由来の脳のサンプルまたは断片を含み得る。いくつかの実施形態では、野生型及び/またはタウノックアウトマウス系統由来の脳のサンプルまたは断片を対照サンプルとして使用してもよい。in vitro親和性試験は、組換えまたは単離されたタンパク質抗原を使用して(例えば、ELISAによって)行ってもよい。いくつかの実施形態では、組換えまたは単離されたePHFが、抗体親和性試験のために使用される。いくつかの実施形態では、表8に列挙された抗原が使用され得る。
いくつかの実施形態では、抗体親和性分析は、抗体の多重特異性を調整するために(例えば、抗体の多重特異性を低減または増強するために)使用され得る。このような調整は、2つ以上のエピトープまたは抗原に対する相対的な親和性を調整することを含み得る。例えば、抗体は、あるエピトープまたは抗原に対する親和性が第2のエピトープまたは抗原と比べて高いように最適化され得る。
抗体は、抗体の機能的性質を最適化するように修飾され得る。このような機能的性質は、抗体の1または複数の機能的性質に関連する分析アッセイ結果に基づいて評価または工学操作され得る。アッセイを使用して、複数の抗体をスクリーニングし、機能的基準に基づいて抗体を同定またはランク付けしてもよい。抗タウ抗体は、タウ凝集阻害を最適化するように修飾され得る。このような阻害は、タウ凝集の物理的破壊に基づくものでもよいし、アッセイサンプルからタウタンパク質を枯渇させる抗タウ抗体の能力に基づくものでもよい。タウ凝集阻害に基づく最適化は、タウ凝集の1または複数のアッセイを使用して(例えば、タウ播種アッセイによって)評価することができる。
産生の修飾
いくつかの実施形態では、抗体産生を最適化するように修飾を行ってもよい。このような修飾は、タンパク質フォールディング、安定性、発現、及び/または免疫原性のうちの1または複数を含むか、またはそれに関連し得る。修飾は、産生に悪影響を与える1または複数の抗体特性に対処するために行われ得る。このような特性は、不対システインまたは不規則なジスルフィド;グリコシル化部位(例えば、N結合型NXS/T部位);酸切断部位、アミノ酸酸化部位、マウス生殖細胞系配列との適合性;アスパラギン脱アミド化部位;アスパラギン酸異性化部位;N末端ピログルタミン酸形成部位;及び易凝集性アミノ酸配列領域(例えば、CDR配列内)を含み得るが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、本開示の抗体は、組換えDNA技術(例えば、全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許第4,816,567号を参照されたい)を使用して調製され得る。抗体をコードするDNAは、従来の手順を使用して(例えば、マウス抗体の重鎖及び軽鎖をコードする遺伝子に特異的に結合することができるオリゴヌクレオチドプローブを使用することにより)単離及びシーケンシングすることができる。いくつかの実施形態では、ハイブリドーマ細胞が好ましいDNA源として使用され得る。DNAは、単離されたら発現ベクターに入れることができ、次いでこれが宿主細胞にトランスフェクトされる。宿主細胞は、組換え宿主細胞におけるモノクローナル抗体の合成を行うための、さもなければ免疫グロブリンタンパク質を産生しない、HEK293細胞、HEK293T細胞、サルCOS細胞、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞、及び骨髄腫細胞を含み得るが、これらに限定されない。DNAは、例えば、相同的なマウス配列の代わりにヒト重鎖及び軽鎖定常ドメインのコード配列を置換することによって(米国特許第4,816,567号)、または非免疫グロブリンポリペプチドのコード配列の全部もしくは一部を免疫グロブリンコード配列に共有結合することによって修飾することもできる。
抗体のヒト化
いくつかの実施形態では、本開示の抗タウ抗体は、ヒト化抗体として調製され得る。「ヒト化」抗体は、非ヒト免疫グロブリン(例えば、マウス免疫グロブリン)に由来する最小配列(例えば、可変ドメインまたはCDR)を含むキメラ抗体である。ヒト化抗体は、超可変領域の残基が、1または複数の非ヒト「ドナー」抗体(例えば、マウス、ラット、ウサギ、または非ヒト霊長類)由来の超可変領域残基によって置換されている、ヒト(レシピエント)免疫グロブリンから調製され得る。ドナー抗体は、所望の特異性、親和性、及び/または能力に基づいて選択され得る。ヒト化抗体は、ドナー抗体に見出されるアミノ酸への1または複数のアミノ酸の復帰を含む、1または複数の復帰変異を含み得る。逆に、ヒト化抗体に含まれるドナー抗体由来の残基を変異させて、ヒトレシピエント抗体に存在する残基に一致させてもよい。復帰変異は、ヒト化抗体に対するヒト免疫応答を低減するために導入され得る。いくつかの実施形態では、復帰変異は、抗体の製造に関する問題(例えば、タンパク質凝集または翻訳後修飾)を回避するために導入される。
ヒト定常領域を有する完全ヒト化抗体をコードする発現プラスミドを構築するには、抗体可変領域をコードするDNA配列を、発現ベクター(例えば、哺乳動物発現ベクター)内の、上流のプロモーター/エンハンサー及び免疫グロブリンシグナル配列と、下流の免疫グロブリン定常領域遺伝子との間に挿入してもよい。次いで、DNAサンプルを抗体産生のために哺乳動物細胞にトランスフェクトしてもよい。任意のクラスのヒト抗体由来の定常ドメインを使用することができる。インタクトヒト抗体には、IgA、IgD、IgE、IgG、及びIgMの5つの主要なクラスがあり、これらのうち幾つかは、サブクラス(アイソタイプ)、例えば、IgG1(ヒト及びマウス)、IgG2(ヒト)、IgG2a(マウス)、IgG2b(マウス)、IgG2c(マウス)、IgG3(ヒト及びマウス)、IgG4(ヒト)、IgA(マウス)、IgA1(ヒト)、及びIgA2(ヒト)にさらに分類され得る。
ヒト化抗体をコードするDNAが安定にトランスフェクトされた細胞株を調製し、安定な細胞株を確立するために使用してもよい。ヒト化抗体を産生する細胞株を拡大してヒト化抗体を発現させてもよく、これを細胞培養培地から採取して精製してもよい。
いくつかの実施形態では、本開示のヒト化抗体は、非ヒト種との交差反応性を有し得る。種の交差反応性により、抗体を様々な目的で異なる動物において使用することが可能になり得る。例えば、交差反応性抗体を前臨床動物実験で使用して、抗体の有効性及び/または毒性に関する情報を提供することができる。非ヒト種は、マウス、ラット、ウサギ、イヌ、ブタ、ヤギ、ヒツジ、及び非ヒト霊長類(例えばカニクイザル)を含み得るが、これらに限定されない。
抗体コンジュゲート
いくつかの実施形態では、本開示の抗体は、抗体コンジュゲートであり得るか、または抗体コンジュゲートとして調製され得る。本明細書で使用される場合、「コンジュゲート」という用語は、受容実体に付着している任意の薬剤、カーゴ、もしくは化学部分、またはかかる薬剤、カーゴ、もしくは化学部分を付着させるプロセスを指す。本明細書で使用される場合、「抗体コンジュゲート」という用語は、付着した薬剤、カーゴ、または化学部分を有する任意の抗体を指す。抗体コンジュゲートを調製するのに利用されるコンジュゲートは、治療剤を含み得る。このような治療剤は、薬物を含み得る。コンジュゲート薬物を含む抗体コンジュゲートは、本明細書では「抗体薬物コンジュゲート」と呼ばれる。抗体薬物コンジュゲートは、特定の標的に関連するタンパク質またはエピトープに対する関連抗体の親和性に基づいて、コンジュゲート薬物をかかる標的に向けるために使用され得る。このような抗体薬物コンジュゲートは、このようなコンジュゲート薬物に関連する生物学的活性を、標的となる細胞、組織、器官、または他の標的となる実体に局在化させるために使用され得る。いくつかの実施形態では、抗体コンジュゲートを調製するために利用されるコンジュゲートは、検出可能な標識を含む。抗体は、検出の目的で検出可能な標識とコンジュゲートされ得る。このような検出可能な標識は、放射性同位体、フルオロフォア、発色団、化学発光化合物、酵素、酵素補因子、色素、金属イオン、リガンド、ビオチン、アビジン、ストレプトアビジン、ハプテン、量子ドット、または当技術分野で公知もしくは本明細書に記載の任意の他の検出可能な標識を含み得るが、これらに限定されない。
コンジュゲートは、直接、またはリンカーを介して抗体に付着させてもよい。直接的な付着は、共有結合によるものでも、非共有結合性会合(例えば、イオン結合、静力学結合、疎水性結合、水素結合、ハイブリダイゼーションなど)によるものでもよい。コンジュゲートの付着に使用されるリンカーは、抗体をコンジュゲートに接続することができる任意の化学構造を含み得る。いくつかの実施形態では、リンカーは、高分子(例えば、核酸、ポリペプチド、ポリエチレングリコール、炭水化物、脂質、またはそれらの組み合わせ)を含む。抗体コンジュゲートリンカーは、切断可能であり得る(例えば、酵素との接触、pHの変化、または温度の変化を介して)。
例示的な抗タウ抗体
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、本明細書に記載される抗体、例えば、表1、3、6、2A~2C、4、もしくは5に記載されるような、例えば、V0001~V0065、V1001~V1005、もしくはV2001~V2005から選択される抗体由来の少なくとも1つの抗原結合ドメイン、例えば、可変領域もしくはその抗原結合性フラグメント、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列を含む。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、本明細書に記載される、例えば、表3、6、もしくは4に記載されるような、例えば、V0001~V0065、V1001~V1005、もしくはV2001~V2005から選択される抗体由来の重鎖可変領域、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列を含む。いくつかの実施形態では、重鎖可変領域は、表3、6、または4に提示された重鎖可変領域のアミノ酸配列の修飾(例えば、置換、例えば、保存的置換)を少なくとも1、2、または3個有するが、修飾(例えば、置換、例えば、保存的置換)が30個以下、20個以下、または10個以下であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体をコードするヌクレオチド配列は、本明細書に記載される、例えば、表3もしくは4に記載されるような、例えば、V0001~V0065、V1001~V1005、もしくはV2001~V2005から選択される抗体由来の重鎖可変領域のヌクレオチド配列、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)ヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、本明細書に記載される、例えば、表3、6、もしくは4に記載されるような、例えば、V0001~V0065、V1001~V1005、もしくはV2001~V2005から選択される抗体由来の軽鎖可変領域、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列を含む。いくつかの実施形態では、軽鎖可変領域は、表3、6、または4に提示された軽鎖可変領域のアミノ酸配列の修飾(例えば、置換、例えば、保存的置換)を少なくとも1、2、または3個有するが、修飾(例えば、置換、例えば、保存的置換)が30個以下、20個以下、または10個以下であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体をコードするヌクレオチド配列は、本明細書に記載される、例えば、表3もしくは4に記載されるような、例えば、V0001~V0065、V1001~V1005、もしくはV2001~V2005から選択される抗体由来の軽鎖可変領域のヌクレオチド配列、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)ヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、本明細書に記載される、例えば、表3、6、もしくは4に記載されるような、例えば、V0001~V0065、V1001~V1005、もしくはV2001~V2005から選択される抗体由来の重鎖可変領域及び軽鎖可変領域、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、表3、6、または4に提示された重鎖可変領域のアミノ酸配列の修飾(例えば、置換、例えば、保存的置換)を少なくとも1、2、または3個有するが、修飾(例えば、置換、例えば、保存的置換)が30個以下、20個以下、または10個以下であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、表3、6、または4に提示された軽鎖可変領域のアミノ酸配列の修飾(例えば、置換、例えば、保存的置換)を少なくとも1、2、または3個有するが、修飾(例えば、置換、例えば、保存的置換)が30個以下、20個以下、または10個以下であるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、重鎖定常領域、例えば、ヒトIgG1、IgG2、IgG3、もしくはIgG4定常領域、またはマウスIgG1、IgG2A、IgG2B、IgG2C、もしくはIgG3定常領域を含む。いくつかの実施形態では、重鎖定常は、表Xに記載のアミノ酸配列、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列を含む。いくつかの実施形態では、重鎖定常領域をコードする核酸は、表Xに記載のヌクレオチド配列、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)ヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、軽鎖定常領域、例えば、カッパ軽鎖定常領域、例えば、ヒトカッパもしくはラムダ軽鎖定常領域、またはマウスカッパもしくはラムダ軽鎖定常領域を含む。いくつかの実施形態では、軽鎖定常は、表Xに記載のアミノ酸配列、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列を含む。いくつかの実施形態では、軽鎖定常領域をコードする核酸は、表Xに記載のヌクレオチド配列、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)ヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、重鎖定常領域及び軽鎖定常領域を含む。いくつかの実施形態では、重鎖定常領域及び軽鎖定常領域は、表Xに記載のアミノ酸配列、またはそれに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体をコードするヌクレオチド配列は、重鎖定常領域のヌクレオチド配列と、カッパまたはラムダ軽鎖定常領域のヌクレオチド配列とを含む。いくつかの実施形態では、重鎖定常領域及び軽鎖定常領域をコードするヌクレオチド配列は、表Xに記載のヌクレオチド配列、またはそれに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)ヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、可変領域については表3、6、もしくは4のアミノ酸配列を含み、定常領域については表Xのアミノ酸配列を含む、または、表3、6、もしくは4、及びXの核酸配列、もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列によってコードされる、重鎖可変領域及び定常領域、軽鎖可変領域及び定常領域、もしくはこれらの両方を含む。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、本明細書に記載される、例えば、表7もしくは4に記載されるような、例えば、V0001~V0065、V1001~V1005、もしくはV2001~V2005から選択される抗体の重鎖可変領域由来の少なくとも1、2、3、もしくは4つのフレームワーク領域、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列を含む。いくつかの実施形態では、フレームワーク領域のうちの1または複数(または集合的にすべてのフレームワーク領域)は、表7または4に示されるアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換、挿入、または欠失を有する。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、重鎖フレームワーク領域における置換、例えば、重鎖のFRH1、FRH2、FRH3、及び/またはFRH4における1または複数の置換を含む。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、本明細書に記載される、例えば、表7もしくは4に記載されるような、例えば、V0001~V0065、V1001~V1005、もしくはV2001~V2005から選択される抗体の軽鎖可変領域由来の少なくとも1、2、3、もしくは4つのフレームワーク領域、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列を含む。いくつかの実施形態では、フレームワーク領域のうちの1または複数(または集合的にすべてのフレームワーク領域)は、表7または4に示されるアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換、挿入、または欠失を有する。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、軽鎖フレームワーク領域における置換、例えば、軽鎖のFRL1、FRL2、FRL3、及び/またはFRL4における1または複数の置換を含む。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、表2A~2C、3、6、4、もしくは5のアミノ酸配列を含む、または、表4の核酸配列、もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列によってコードされる、重鎖可変領域由来の少なくとも1、2、または3つの相補性決定領域(CDR)を含む。いくつかの実施形態では、CDRのうちの1または複数(または集合的にすべてのCDR)は、表2A~2C、6、4、もしくは5に示される、または表4に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換、挿入、または欠失を有する。いくつかの実施形態では、コードされる抗タウ抗体は、重鎖CDRにおける置換、例えば、重鎖のCDR1、CDR2及び/またはCDR3における1または複数の置換を含む。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、表2A~2C、6、4、もしくは5のアミノ酸配列を含む、または、表4の核酸配列、もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列によってコードされる、軽鎖可変領域由来の少なくとも1、2、もしくは3つの相補性決定領域(CDR)を含む。いくつかの実施形態では、CDRのうちの1または複数(または集合的にすべてのCDR)は、表2A~2C、6、4、もしくは5に示される、または表4に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換、挿入、または欠失を有する。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、軽鎖CDRにおける置換、例えば、軽鎖のCDR1、CDR2及び/またはCDR3における1または複数の置換を含む。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、表2A~2C、6、4、もしくは5に示される、または表4に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖可変領域由来の少なくとも1、2、3、4、5、もしくは6つのCDR(または集合的にすべてのCDR)を含む。いくつかの実施形態では、CDRのうちの1または複数(または集合的にすべてのCDR)は、表2A~2C、6、4、もしくは5に示される、または表4に示されるヌクレオチド配列によってコードされるCDRに対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換、挿入、または欠失を有する。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、表2A~2C、6、4、もしくは5に示される、または表4に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む、重鎖可変領域由来の3つすべてのCDR、軽鎖可変領域由来の3つすべてのCDR、またはその両方(例えば、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域由来の6つすべてのCDR)を含む。
いくつかの実施形態では、本開示の抗タウ抗体は、先述のように、結合した抗原との共結晶構造解析を介した本明細書で提示される可変ドメイン配列のCDR分析によって、他の抗体との比較に基づくコンピュータによる評価によって(例えば、Strohl,W.R.Therapeutic Antibody Engineering.Woodhead Publishing,Philadelphia PA.2012.Ch.3,p47-54を参照のこと)、またはKabat、Chothia、Al-Lazikani、Lefranc、もしくはHoneggerの番号付けスキームによって同定される、CDRを含み得る。
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いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、HC CDR2、及び/またはHC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、HC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3配列は、それぞれ配列番号299、343、及び395の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、LC CDR1、LC CDR2、及び/またはLC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号460、518、及び557の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含み、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号299、343、395、460、518、及び557の配列を含む。いくつかの実施形態では、CDRのうちの1または複数(または集合的にすべてのCDR)は、配列番号299、343、395、460、518、または557のいずれかのアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換、挿入、または欠失を有する。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、HC CDR2、及び/またはHC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、HC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3配列は、それぞれ配列番号1140、1141、及び395の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、LC CDR1、LC CDR2、及び/またはLC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号460、518、及び557の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含み、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号1140、1141、395、460、518、及び557の配列を含む。いくつかの実施形態では、CDRのうちの1または複数(または集合的にすべてのCDR)は、配列番号1140、1141、395、460、518、及び557のいずれかのアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換、挿入、または欠失を有する。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、HC CDR2、及び/またはHC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、HC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3配列は、それぞれ配列番号1155、1156、及び1157の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、LC CDR1、LC CDR2、及び/またはLC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号1158、1159、及び557の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含み、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号1155、1156、1157、1158、1159、及び557の配列を含む。いくつかの実施形態では、CDRのうちの1または複数(または集合的にすべてのCDR)は、配列番号1155、1156、1157、1158、1159、及び557のいずれかのアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換、挿入、または欠失を有する。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、HC CDR2、及び/またはHC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、HC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3配列は、それぞれ配列番号304、347、及び400の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、LC CDR1、LC CDR2、及び/またはLC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号464、523、及び562の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含み、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号304、347、400、464、523、及び562の配列を含む。いくつかの実施形態では、CDRのうちの1または複数(または集合的にすべてのCDR)は、配列番号304、347、400、464、523、及び562のいずれかのアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換、挿入、または欠失を有する。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、HC CDR2、及び/またはHC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、HC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3配列は、それぞれ配列番号1142、1143、及び400の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、LC CDR1、LC CDR2、及び/またはLC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号464、523、及び562の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含み、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号1142、1143、400、464、523、及び562の配列を含む。いくつかの実施形態では、CDRのうちの1または複数(または集合的にすべてのCDR)は、配列番号1142、1143、400、464、523、及び562のいずれかのアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換、挿入、または欠失を有する。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、HC CDR2、及び/またはHC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、HC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3配列は、それぞれ配列番号1160、1161、及び1162の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、LC CDR1、LC CDR2、及び/またはLC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号1163、1164、及び562の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含み、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号1160、1161、1162、1163、1164、及び562の配列を含む。いくつかの実施形態では、CDRのうちの1または複数(または集合的にすべてのCDR)は、配列番号1160、1161、1162、1163、1164、及び562のいずれかのアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換、挿入、または欠失を有する。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、HC CDR2、及び/またはHC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、HC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3配列は、それぞれ配列番号314、341、及び410の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、LC CDR1、LC CDR2、及び/またはLC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号1154、529、及び571の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含み、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号314、341、410、1154、529、及び571の配列を含む。いくつかの実施形態では、CDRのうちの1または複数(または集合的にすべてのCDR)は、配列番号314、341、410、1154、529、及び571のいずれかのアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換、挿入、または欠失を有する。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、HC CDR2、及び/またはHC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、HC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3配列は、それぞれ配列番号1144、1145、及び410の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、LC CDR1、LC CDR2、及び/またはLC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号1146、529、及び571の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含み、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号1144、1145、410、1146、529、及び571の配列を含む。いくつかの実施形態では、CDRのうちの1または複数(または集合的にすべてのCDR)は、配列番号1144、1145、410、1146、529、及び571のいずれかのアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換、挿入、または欠失を有する。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、HC CDR2、及び/またはHC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、HC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3配列は、それぞれ配列番号1165、1166、及び1167の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、LC CDR1、LC CDR2、及び/またはLC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号473、528、及び571の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含み、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号1165、1166、1167、473、528、及び571の配列を含む。いくつかの実施形態では、CDRのうちの1または複数(または集合的にすべてのCDR)は、配列番号1165、1166、1167、473、528、及び571のいずれかのアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換、挿入、または欠失を有する。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、HC CDR2、及び/またはHC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、HC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3配列は、それぞれ配列番号315、341、及び410の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、LC CDR1、LC CDR2、及び/またはLC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号474、529、及び571の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含み、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号315、341、410、474、529、及び571の配列を含む。いくつかの実施形態では、CDRのうちの1または複数(または集合的にすべてのCDR)は、配列番号315、341、410、474、529、及び571のいずれかのアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換、挿入、または欠失を有する。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、HC CDR2、及び/またはHC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、HC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3配列は、それぞれ配列番号1147、1148、及び410の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、LC CDR1、LC CDR2、及び/またはLC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号474、529、及び571の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含み、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号1147、1148、410、474、529、及び571の配列を含む。いくつかの実施形態では、CDRのうちの1または複数(または集合的にすべてのCDR)は、配列番号1147、1148、410、474、529、及び571のいずれかのアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換、挿入、または欠失を有する。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、HC CDR2、及び/またはHC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、HC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3配列は、それぞれ配列番号1168、1169、及び1167の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、LC CDR1、LC CDR2、及び/またはLC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号1170、528、及び571の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含み、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号1168、1169、1167、1170、528、及び571の配列を含む。いくつかの実施形態では、CDRのうちの1または複数(または集合的にすべてのCDR)は、配列番号1168、1169、1167、1170、528、及び571のいずれかのアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換、挿入、または欠失を有する。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、HC CDR2、及び/またはHC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、HC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3配列は、それぞれ配列番号316、341、及び410の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、LC CDR1、LC CDR2、及び/またはLC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号475、530、及び571の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含み、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号316、341、410、475、530、及び571の配列を含む。いくつかの実施形態では、CDRのうちの1または複数(または集合的にすべてのCDR)は、配列番号316、341、410、475、530、及び571のいずれかのアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換、挿入、または欠失を有する。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、HC CDR2、及び/またはHC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、HC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3配列は、それぞれ配列番号1149、1150、及び410の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、LC CDR1、LC CDR2、及び/またはLC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号475、530、及び571の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含み、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号1149、1150、410、475、530、及び571の配列を含む。いくつかの実施形態では、CDRのうちの1または複数(または集合的にすべてのCDR)は、配列番号1149、1150、410、475、530、及び571のいずれかのアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換、挿入、または欠失を有する。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、HC CDR2、及び/またはHC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、HC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3配列は、それぞれ配列番号1171、1166、及び1167の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、LC CDR1、LC CDR2、及び/またはLC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号1172、528、及び571の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含み、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号1171、1166、1167、1172、528、及び571の配列を含む。いくつかの実施形態では、CDRのうちの1または複数(または集合的にすべてのCDR)は、配列番号1171、1166、1167、1172、528、及び571のいずれかのアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換、挿入、または欠失を有する。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、HC CDR2、及び/またはHC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、HC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3配列は、それぞれ配列番号325、362、及び435の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、LC CDR1、LC CDR2、及び/またはLC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号495、540、及び587の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含み、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号325、362、435、495、540、及び587の配列を含む。いくつかの実施形態では、CDRのうちの1または複数(または集合的にすべてのCDR)は、配列番号325、362、435、495、540、及び587のいずれかのアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換、挿入、または欠失を有する。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、HC CDR2、及び/またはHC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、HC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3配列は、それぞれ配列番号1152、1153、及び435の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、LC CDR1、LC CDR2、及び/またはLC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号495、540、及び587の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含み、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号1152、1153、435、495、540、及び587の配列を含む。いくつかの実施形態では、CDRのうちの1または複数(または集合的にすべてのCDR)は、配列番号1152、1153、435、495、540、及び587のいずれかのアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換、挿入、または欠失を有する。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、HC CDR2、及び/またはHC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、HC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3配列は、それぞれ配列番号1173、1174、及び1175の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、LC CDR1、LC CDR2、及び/またはLC CDR3のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、またはすべてを含み、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号1176、1177、及び587の配列を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含み、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3配列は、それぞれ配列番号1173、1174、1175、1176、1177、及び587の配列を含む。いくつかの実施形態では、CDRのうちの1または複数(または集合的にすべてのCDR)は、配列番号1173、1174、1175、1176、1177、及び587のいずれかのアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換、挿入、または欠失を有する。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、配列番号4のアミノ酸配列を含む、または配列番号150のヌクレオチド配列もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列によってコードされる、重鎖可変領域を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、配列番号78のアミノ酸配列を含む、または配列番号224のヌクレオチド配列もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列によってコードされる、軽鎖可変領域を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、それぞれ配列番号4及び78のアミノ酸配列を含む、またはそれぞれ配列番号150及び224のヌクレオチド配列もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列によってコードされる、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体の重鎖可変領域をコードするヌクレオチド配列は、配列番号150のヌクレオチド配列、もしくは実質的に同一の(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列を含む、及び/または、軽鎖可変領域をコードするヌクレオチド配列は、配列番号224のヌクレオチド配列、もしくは実質的に同一の(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列を含む。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、配列番号9のアミノ酸配列を含む、または配列番号155のヌクレオチド配列もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列によってコードされる、重鎖可変領域を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、配列番号83のアミノ酸配列を含む、または配列番号229のヌクレオチド配列もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列によってコードされる、軽鎖可変領域を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、それぞれ配列番号9及び83のアミノ酸配列を含む、またはそれぞれ配列番号155及び229のヌクレオチド配列もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列によってコードされる、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体の重鎖可変領域をコードするヌクレオチド配列は、配列番号155のヌクレオチド配列、もしくは実質的に同一の(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列を含む、及び/または、軽鎖可変領域をコードするヌクレオチド配列は、配列番号229のヌクレオチド配列、もしくは実質的に同一の(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列を含む。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、配列番号21のアミノ酸配列を含む、または配列番号167のヌクレオチド配列もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列によってコードされる、重鎖可変領域を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、配列番号93のアミノ酸配列を含む、または配列番号241のヌクレオチド配列もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列によってコードされる、軽鎖可変領域を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、それぞれ配列番号21及び93のアミノ酸配列を含む、またはそれぞれ配列番号167及び241のヌクレオチド配列もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列によってコードされる、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体の重鎖可変領域をコードするヌクレオチド配列は、配列番号167のヌクレオチド配列、もしくは実質的に同一の(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列を含む、及び/または、軽鎖可変領域をコードするヌクレオチド配列は、配列番号241のヌクレオチド配列、もしくは実質的に同一の(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列を含む。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、配列番号22のアミノ酸配列を含む、または配列番号168のヌクレオチド配列もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列によってコードされる、重鎖可変領域を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、配列番号94のアミノ酸配列を含む、または配列番号242のヌクレオチド配列もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列によってコードされる、軽鎖可変領域を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、それぞれ配列番号22及び94のアミノ酸配列を含む、またはそれぞれ配列番号168及び242のヌクレオチド配列もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列によってコードされる、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体の重鎖可変領域をコードするヌクレオチド配列は、配列番号168のヌクレオチド配列、もしくは実質的に同一の(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列を含む、及び/または、軽鎖可変領域をコードするヌクレオチド配列は、配列番号242のヌクレオチド配列、もしくは実質的に同一の(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列を含む。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、配列番号23のアミノ酸配列を含む、または配列番号169のヌクレオチド配列もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列によってコードされる、重鎖可変領域を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、配列番号95のアミノ酸配列を含む、または配列番号243のヌクレオチド配列もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列によってコードされる、軽鎖可変領域を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、それぞれ配列番号23及び95のアミノ酸配列を含む、またはそれぞれ配列番号169及び243のヌクレオチド配列もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列によってコードされる、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体の重鎖可変領域をコードするヌクレオチド配列は、配列番号169のヌクレオチド配列、もしくは実質的に同一の(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列を含む、及び/または、軽鎖可変領域をコードするヌクレオチド配列は、配列番号243のヌクレオチド配列、もしくは実質的に同一の(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列を含む。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、配列番号51のアミノ酸配列を含む、または配列番号197のヌクレオチド配列もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列によってコードされる、重鎖可変領域を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、配列番号122のアミノ酸配列を含む、または配列番号270のヌクレオチド配列もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列によってコードされる、軽鎖可変領域を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、それぞれ配列番号51及び122のアミノ酸配列を含む、またはそれぞれ配列番号197及び270のヌクレオチド配列もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列によってコードされる、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含む。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体の重鎖可変領域をコードするヌクレオチド配列は、配列番号197のヌクレオチド配列、もしくは実質的に同一の(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列を含む、及び/または、軽鎖可変領域をコードするヌクレオチド配列は、配列番号270のヌクレオチド配列、もしくは実質的に同一の(例えば、少なくとも約80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)配列を含む。
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、コドン最適化された核酸配列によってコードされるVH及び/またはVLを含む。コドン最適化は、Genescript、EMBOSS、Bioinformatics、NUS、NUS2、Geneinfinity、IDT、NUS3、GregThatcher、Insilico、Molbio、N2P、Snapgene、及び/またはVectorNTIによる方法などだがこれらに限定されない、当業者に公知の任意の方法によって達成され得る。
本開示による抗タウ抗体は、本明細書で提示される抗体配列(例えば、可変ドメインアミノ酸配列、可変ドメインアミノ酸配列ペア、CDRアミノ酸配列、可変ドメインCDRアミノ酸配列セット、可変ドメインCDRアミノ酸配列セットペア、及び/またはフレームワーク領域アミノ酸配列)のいずれかを使用して調製することができ、いずれも、例えばモノクローナル抗体、多特異性抗体、キメラ抗体、抗体模倣物、scFv、または抗体フラグメントとして調製することができる。
いくつかの実施形態では、本明細書で提示される抗体配列のいずれかを使用した抗タウ抗体は、IgA、IgD、IgE、IgG、またはIgM抗体として調製され得る。マウスIgG抗体として調製される場合、抗タウ抗体は、IgG1、IgG2a、IgG2b、IgG2c、またはIgG3アイソタイプとして調製され得る。ヒトIgG抗体として調製される場合、抗タウ抗体は、IgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4アイソタイプとして調製され得る。ヒト抗体またはヒト化抗体として調製される抗タウ抗体は、1または複数のヒト定常ドメインを含み得る。
本開示は、いくつかの実施形態において、上述の抗体のいずれかをコードする核酸(例えば、単離された核酸)、ならびにそれを含むウイルスゲノム、ベクター、AAV粒子、及び細胞を提供する。
タウタンパク質抗原
いくつかの実施形態では、抗タウ抗体は、タウタンパク質抗原、例えば、タウタンパク質上のエピトープに結合する。タウタンパク質抗原は、ヒト微小管関連タンパク質タウ、アイソフォーム2(配列番号920)またはそのフラグメントを含み得る。タウタンパク質抗原は、ePHFまたはそのフラグメントを含んでもよい。タウタンパク質抗原は、1または複数のリン酸化残基を含んでもよい。このようなリン酸化残基は、病的なタウに見られるものに対応し得る。いくつかの実施形態では、タウタンパク質抗原は、表8に列挙されたもののいずれかを含む。表中、各抗原に関連するリン酸化残基には二重下線が引かれている。いくつかの実施形態では、タウタンパク質は、列挙された配列のバリアント(例えば、リン酸化型または非リン酸化型のバリアント)またはフラグメントを含み得る。
Figure 2023523401000042
いくつかの実施形態では、本開示の抗タウ抗体は、本明細書に記載されるタウタンパク質抗原上のタウタンパク質エピトープに結合する。このようなタウタンパク質エピトープは、表8に列挙されたタウタンパク質抗原アミノ酸配列を含み得るか、またはその中に含まれ得る。いくつかの実施形態では、本開示の抗タウ抗体は、少なくとも2つのタウタンパク質の複合体によって形成される領域を含むタウタンパク質エピトープに結合する。
いくつかの実施形態では、本明細書で開示されるのは、タウへの結合を前述の抗体と競合するコードされた抗体である。いくつかの実施形態では、本明細書で開示されるのは、前述の抗タウ抗体のエピトープと同じエピトープ、それと実質的に同じエピトープ、それと重複するエピトープ、またはそれと実質的に重複するエピトープに結合する、抗体である。
ある実施形態では、競合または交差競合は、タウタンパク質などの標的に対する、本明細書で提供される抗タウ抗体などの抗タウ抗体の結合と干渉する抗体の能力を指す。結合との干渉は、直接的でも間接的(例えば、抗体または標的のアロステリック調整を介する)でもよい。ある抗体が標的に対する別の抗体の結合と干渉することができる程度、したがってそれが競合すると言えるかどうかは、競合結合アッセイ、例えばFACSアッセイ、ELISAまたはBIACOREアッセイを使用して決定することができる。いくつかの実施形態では、競合結合アッセイは、定量的競合アッセイである。いくつかの実施形態では、第1の抗タウ抗体が標的との結合を第2の抗タウ抗体と競合すると言われるのは、競合結合アッセイ(例えば、本明細書に記載される競合アッセイ)において、第1の抗体の標的への結合が10%以上、例えば20%以上、30%以上、40%以上、50%以上、55%以上、60%以上、65%以上、70%以上、75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上、98%以上、99%以上低減するときである。
いくつかの実施形態では、エピトープは、抗原(例えば、タウタンパク質抗原)のうち、抗体と特異的に相互作用する部分を含む。このような部分は、本明細書ではエピトープ決定基と呼ばれ、典型的には、アミノ酸側鎖または糖側鎖などの要素を含むか、またはその一部である。エピトープ決定基は、当技術分野で公知の、または本明細書で開示される方法によって、例えば、結晶構造解析または水素-重水素交換によって定義することができる。エピトープ決定基と特異的に相互作用する抗体上の部分のうちの少なくとも1つまたはいくつかは、典型的には、CDR(複数可)内に位置している。典型的には、エピトープは、特定の三次元構造特徴を有する。典型的には、エピトープは、特定の電荷特徴を有する。いくつかのエピトープは線状エピトープであり、その他は立体構造エピトープである。
一実施形態において、エピトープ決定基は、抗原上の部分、例えばアミノ酸側鎖もしくは糖側鎖またはその一部などであり、抗原と抗体とが共結晶化されると、抗体上の部分から所定の距離以内、例えば5オングストローム以内にあり、これは本明細書では結晶学的エピトープ決定基と呼ばれる。いくつかの実施形態では、エピトープの結晶学的エピトープ決定基は、集合的に結晶学的エピトープと呼ばれる。
第1の抗体が、第2の抗体(例えば、参照抗体、例えば、本明細書で開示される抗体)と同じエピトープと結合するのは、例えば、該抗体と第2の抗体または参照抗体との両方について同じ方法で相互作用を測定したとき、第2の抗体または参照抗体が特異的に相互作用するのと同じ抗原上のエピトープ決定基と第1の抗体が特異的に相互作用する場合である。重複するエピトープは、少なくとも1つのエピトープ決定基を共有する。第1の抗体が、第2の抗体(例えば、参照抗体、例えば、本明細書で開示される抗体)と重複するエピトープと結合するのは、両方の抗体が共通のエピトープ決定基と特異的に相互作用するときである。第1の抗体及び第2の抗体(例えば、参照抗体、例えば、本明細書で開示される抗体)が、実質的に重複するエピトープと結合するのは、第2の抗体または参照抗体のエピトープ決定基の少なくとも半分が、第1の抗体のエピトープ内にエピトープ決定基として見出される場合である。第1の抗体及び第2の抗体(例えば、参照抗体、例えば、本明細書で開示される抗体)が、実質的に同じエピトープと結合するのは、第1の抗体が、第2の抗体または参照抗体のエピトープのコアエピトープ決定基の少なくとも半分と結合する場合であり、ここで、コアエピトープ決定基は、結晶構造解析によって定義される。
エピトープ特異性
本開示の抗体は、配列番号920~926の残基を含み得るか、またはその中に含まれ得る、タウタンパク質エピトープに結合し得る。抗体は、タウタンパク質エピトープへの結合を、AT100、AT120、PT3、C10.2、PT76、IPN002、6C5、及びUCB Dを含むがこれらに限定されない他の抗タウ抗体と競合し得る。タウタンパク質エピトープは、ヒトタウ(配列番号920)のC末端残基409~436を含み得る。このようなエピトープは、ヒトタウ(配列番号920)の残基413~430を含み得る。このような残基に結合する抗体は、約0.1nM~約0.5nMのKを呈し得る。いくつかの実施形態では、タウタンパク質エピトープは、ヒトタウ(配列番号920)の残基55~76、159~194、219~247、及び/または381~426を含み得る。このようなエピトープは、ヒトタウ(配列番号920)の残基57~72、175~191、223~238、及び/または383~400を含み得る。このような残基に結合する抗体は、約0.5nM~約5nMのKを呈し得る。
いくつかの実施形態では、本開示は、タウタンパク質エピトープへの結合を第2の抗体と競合する抗体を提供する。このようなエピトープは、ヒトタウ(配列番号920)の残基32~49、55~76、57~72、159~194、175~191、185~200、219~247、223~238、381~426、383~400、409~436、及び413~430のうちの1または複数を含み得る。
タウタンパク質エピトープは、ヒトタウ(配列番号920)の残基409~436及び413~430のうちの1または複数を含み得る。このようなエピトープへの結合を競合する第2の抗体は、配列番号21のアミノ酸配列を有するVH及び配列番号93のアミノ酸配列を有するVL、配列番号22のアミノ酸配列を有するVH及び配列番号94のアミノ酸配列を有するVL、ならびに配列番号23のアミノ酸配列を有するVH及び配列番号95のアミノ酸配列を有するVLからなる群から選択される可変ドメインペアを含み得る。
このような第2の抗体とタウエピトープ結合を競合する抗体は、G[F/Y]TFT[R/I][Y/F](配列番号931)、もしくはより一般的にはG-X1-TFT-X2-X3(配列番号932)のアミノ酸配列を含むCDRH1(ここで、X1、X2、及びX3は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1及び/もしくはX3は、FまたはYなどの疎水性及び/または芳香族側鎖を有するアミノ酸であってよく、ならびに/または、X2は、正に帯電した残基(例えばR、K、H)もしくは脂肪族側鎖を有する残基(例えばA、V、I、またはL)であってよい);アミノ酸配列NPNNGG(配列番号341)を含むCDRH2;アミノ酸配列GTGTGAMDY(配列番号410)を含むCDRH3;アミノ酸配列RSSQSLVH[N/S]NG[I/N]T[H/Y]LY(配列番号933)、もしくはより一般的にはRSSQSLVH-X1-NG-X2-T-X3-LY(配列番号934)を含むCDRL1(ここで、X1、X2、及びX3は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はQ/N/S/Tであり、及び/またはX2はA/V/I/L/Q/Nであり、及び/またはX3はH/R/K/Y/Fである);アミノ酸配列RVS[N/S]RFS(配列番号935)、もしくはより一般的にはRVSXRFS(配列番号936)を含むCDRL2(ここで、Xは、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はQ/N/S/Tである);及び/またはアミノ酸配列FQGTHVPRT(配列番号571)を含むCDRL3を含み得る。
いくつかの実施形態では、CDRH1は、アミノ酸配列G[F/Y]TFT[R/I][Y/F](配列番号931)を含み得る。CDRH2は、アミノ酸配列NPNNGG(配列番号341)を含み得る。CDRH3は、アミノ酸配列GTGTGAMDY(配列番号410)を含み得る。CDRL1は、アミノ酸配列RSSQSLVH[N/S]NG[I/N]T[H/Y]LY(配列番号933)を含み得る。CDRL2は、アミノ酸配列RVS[N/S]RFS(配列番号935)を含み得る。CDRL3は、アミノ酸配列FQGTHVPRT(配列番号571)を含み得る。
いくつかの実施形態では、タウタンパク質エピトープは、ヒトタウ(配列番号920)の残基57~72、175~191、223~238、及び383~400のうちの1または複数を含み得る。このようなエピトープへの結合を競合する第2の抗体は、配列番号51のアミノ酸配列を有するVH及び配列番号122のアミノ酸配列を有するVL、配列番号53のアミノ酸配列を有するVH及び配列番号124のアミノ酸配列を有するVL、配列番号54のアミノ酸配列を有するVH及び配列番号125のアミノ酸配列を有するVL、配列番号56のアミノ酸配列を有するVH及び配列番号125のアミノ酸配列を有するVL、配列番号57のアミノ酸配列を有するVH及び配列番号126のアミノ酸配列を有するVL、配列番号35のアミノ酸配列を有するVH及び配列番号107のアミノ酸配列を有するVL、ならびに配列番号48のアミノ酸配列を有するVH及び配列番号120のアミノ酸配列を有するVLからなる群から選択される可変ドメインペアを含み得る。
このような第2の抗体とタウエピトープ結合を競合する抗体は、GFSL[S/N]T[S/F][A/G]M(配列番号964)、もしくはより一般的にはGFSL-X1-T-X2-X3-M(配列番号965)のアミノ酸配列を含むCDRH1(ここで、X1~X3は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はS/T/N/Qであり、及び/またはX2はS/T/F/Yであり、及び/またはX3はG/A/I/L/Vである);アミノ酸配列YWDDD(配列番号362)を含むCDRH2;アミノ酸配列R[R/V/K/S/G][Y/R][Y/不在][S/不在][不在/N][G/S/Y/R][Y/N/G][G/A/Y/N][M/F/Y]DY(配列番号974)、もしくはより一般的にはR-X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9-DY(配列番号975)を含むCDRH3(ここで、X1~X9の各々は、任意のアミノ酸であってよく、及び/または、X3~X5のうちの1もしくは複数は不在であってよく、例えば、X1はR/K/H/A/V/I/L/G/S/Tであり、及び/またはX2はY/F/R/K/Hであり、及び/またはX3はY/F/不在であり、及び/またはX4はS/T/不在であり、及び/またはX5はN/Q/不在であり、及び/またはX6はG/A/V/I/L/S/T/Y/F/R/K/Hであり、及び/またはX7はY/F/N/Q/G/A/V/I/Lであり、及び/またはX8はG/A/V/I/L/Y/F/N/Qであり、及び/またはX9はM/F/Yである);アミノ酸配列[K/S][S/A]S[Q/S]S[L/I/V][L/S][N/S/D][D/S/T][V/G/D/Y][N/G/不在][Q/不在][K/不在][N/T/不在][Y/不在][L/不在][A/H/N](配列番号976)、もしくはより一般的にはX1-X2-S-X3-S-X4-X5-X6-X7-X8-X9-X10-X11-X12-X13-X14-X15(配列番号977)を含むCDRL1(ここで、X1~X15の各々は、任意のアミノ酸であってよく、及び/または、X9~X14のうちの1もしくは複数は不在であってよく、例えば、X1はK/R/H/S/Tであり、及び/またはX2はS/T/A/V/I/Lであり、及び/またはX3はQ/N/S/Tであり、及び/またはX4はL/I/V/Aであり、及び/またはX5はA/V/I/L/S/Tであり、及び/またはX6はN/Q/S/T/D/Eであり、及び/またはX7はD/E/S/Tであり、及び/またはX8はG/A/V/I/L/D/E/Y/Fであり、及び/またはX9はN/Q/G/A/不在であり、及び/またはX10はQ/N/不在であり、及び/またはX11はK/R/H/不在であり、及び/またはX12はN/Q/T/S/不在であり、及び/またはX13はY/F/不在であり、及び/またはX14はA/V/I/L/不在であり、及び/またはX15はA/V/I/L/H/K/R/N/Qである);アミノ酸配列[Y/G/L/R][A/T/V]S[N/T/K][R/L][C/E/D/A][T/S](配列番号978)、もしくはより一般的にはX1-X2-S-X3-X4-X5-X6(配列番号979)を含むCDRL2(ここで、X1~X6は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はY/F/G/A/V/I/L/R/K/Hであり、及び/またはX2はA/V/I/L/T/Sであり、及び/またはX3はN/Q/T/S/K/R/Hであり、及び/またはX4はR/K/H/A/V/I/Lであり、及び/またはX5はC/S/E/D/A/V/I/Lであり、及び/またはX6はT/Sである);及び/またはアミノ酸配列[W/Q][Q/N][G/D][T/S/Y/H][H/S/R][F/I/S/H]P[Q/R/L/Y][不在/Y]T(配列番号980)、もしくはより一般的にはX1-X2-X3-X4-X5-X6-P-X7-X8-T(配列番号981)を含むCDRL3(ここで、X1~X8の各々は、任意のアミノ酸であってよく、及び/または、X8は不在であってよく、例えば、X1はQ/N/W/F/Yであり、及び/またはX2はQ/Nであり、及び/またはX3はG/A/V/I/L/D/Eであり、及び/またはX4はT/S/Y/F/H/K/Rであり、及び/またはX5はH/K/R/S/Tであり、及び/またはX6はF/Y/A/V/I/L/S/T/H/K/Rであり、及び/またはX7はQ/N/R/K/H/A/V/I/L/Y/Fであり、及び/またはX8はY/F/不在である)を含み得る。
CDRH1は、アミノ酸配列GFSL[S/N]T[S/F][A/G]M(配列番号964)を含み得る。CDRH2は、アミノ酸配列YWDDD(配列番号362)を含み得る。CDRH3は、アミノ酸配列R[R/V/K/S/G][Y/R][Y/不在][S/不在][不在/N][G/S/Y/R][Y/N/G][G/A/Y/N][M/F/Y]DY(配列番号974)を含み得る。CDRL1は、アミノ酸配列[K/S][S/A]S[Q/S]S[L/I/V][L/S][N/S/D][D/S/T][V/G/D/Y][N/G/不在][Q/不在][K/不在][N/T/不在][Y/不在][L/不在][A/H/N](配列番号976)を含み得る。CDRL2は、アミノ酸配列[Y/G/L/R][A/T/V]S[N/T/K][R/L][C/E/D/A][T/S](配列番号978)を含み得る。CDRL3は、アミノ酸配列[W/Q][Q/N][G/D][T/S/Y/H][H/S/R][F/I/S/H]P[Q/R/L/Y][不在/Y]T(配列番号980)を含み得る。
II.ベクター化
本開示によれば、抗タウ抗体またはその機能的バリアントをアデノ随伴ウイルス粒子(AAV)によって送達するための組成物が提供される。いくつかの実施形態では、1つのAAV粒子、例えば、本明細書に記載されるAAV粒子、または複数の粒子が、幾つかの投与経路のいずれかを介して、細胞、組織、器官、または生物に、in vivo、ex vivo、またはin vitroで提供され得る、例えば送達され得る。
本明細書で使用される場合、「AAV粒子」は、カプシドならびに少なくとも1つのペイロード領域及び少なくとも1つの逆方向末端反復(ITR)領域を有するウイルスゲノムを含むウイルスである。
本明細書で使用される場合、「ウイルスゲノム」または「ベクターゲノム」は、AAV粒子に封入された核酸配列(複数可)を指す。ウイルスゲノムは、ポリペプチド、例えば、抗体、抗体ベースの組成物、またはそのフラグメントをコードする、少なくとも1つのペイロード領域を含む。
本明細書で使用される場合、「ペイロード」または「ペイロード領域」は、1または複数のポリペプチドをコードする任意の核酸分子である。少なくとも、ペイロード領域は、抗体、抗体ベースの組成物、またはそのフラグメントをコードする核酸配列を含むが、場合により、転写発現及び/またはポリペプチド翻訳を促進する1または複数の機能的エレメントまたは調節エレメントを含んでもよい。
いくつかの実施形態では、AAV粒子、ウイルスゲノム、及び/またはペイロード、ならびにそれらの使用方法は、WO2017189963またはWO2020223276に記載されるとおりであってよく、各文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
本明細書で開示される核酸配列、ウイルスゲノム、及びポリペプチドは、抗体またはその機能的バリアント、例えば、本明細書に記載される抗体の発現を可能にするようにアセンブルされたモジュラーエレメント及び/または配列モチーフを含むように工学操作されてもよい。いくつかの実施形態では、核酸配列は、抗体のCDR(例えば、重鎖及び/もしくは軽鎖CDR)、可変重(VH)鎖領域及び/もしくは可変軽(VL)鎖領域、重鎖及び/もしくは軽鎖定常領域、またはそれらの組み合わせのうちの1または複数を含む抗体をコードする。いくつかの実施形態では、抗体をコードする核酸配列は、例えば、抗体のVH/重鎖及びVL/軽鎖がリンカーを介して接続されるように、リンカーをコードしてもよい。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、プロモーター領域、イントロン、Kozak配列、エンハンサー、またはポリアデニル化配列をさらに含み得る。発現の順序、構造上の位置、またはコンカテマー数(例えば、VH、VL、重鎖、軽鎖、及び/またはリンカー)は、異なるペイロード領域の中またはその間で異なっていてもよい。ペイロード領域によって発現されるリンカーの同一性、位置、及び数も異なり得る。いくつかの実施形態では、ペイロードは、ヒト化抗体VL、軽鎖ドメイン、及び/またはヒト化抗体VH、重鎖ドメイン、またはそれらのフラグメントなどだがこれらに限定されない、1または複数のヒト化抗体配列を含む領域である。
いくつかの実施形態では、本開示は、抗体(例えば、本明細書に記載される抗タウ抗体)、及び/または組換えAAV粒子(例えば、本明細書に記載されるAAV粒子)内に含まれるウイルスゲノム内に含まれる抗体(例えば、本明細書に記載される抗タウ抗体)をコードする核酸配列を、細胞、組織、器官、または対象に送達する方法を提供する。
アデノ随伴ウイルス(AAV)及びAAV粒子
いくつかの実施形態では、アデノ随伴ウイルス(AAV)は、一本鎖DNAウイルスゲノムによって特徴付けられるパルボウイルス科の小さな非エンベロープ正二十面体カプシドウイルスである。パルボウイルス科ウイルスは、脊椎動物に感染するパルボウイルス亜科と、無脊椎動物に感染するデンソウイルス亜科との2つのサブファミリーからなる。パルボウイルス科には、AAVを含むディペンドウイルス属が含まれる。いくつかの実施形態では、AAVは、ヒト、霊長類、ウシ、イヌ、ウマ、及びヒツジ種を含むがこれらに限定されない脊椎動物宿主において複製することができる。
パルボウイルス及びパルボウイルス科の他のメンバーについては、Kenneth I.Berns,“Parvoviridae:The Viruses and Their Replication,”Chapter 69 in FIELDS VIROLOGY(3d Ed.1996)に概説されており、同文献の内容は、その全体が参照により組み込まれる。
AAVは、その比較的単純な構造、宿主ゲノムに組み込まれることも複製することもなく広範な細胞(休止細胞及び分裂細胞を含む)に感染する能力、及び比較的穏和な免疫原性プロファイルのために、生物学的ツールとして有用であることが証明されている。ウイルスのゲノムは、所望のペイロードが搭載された、または特定の組織を標的として所望のペイロードを発現もしくは送達するように工学操作された、機能的な組換えウイルスまたはウイルス粒子のアセンブリのための最小限の構成要素を含むように操作され得る。
野生型AAVベクターゲノムは、およそ5,000ヌクレオチド(nt)長で線状の一本鎖DNA(ssDNA)分子である。逆方向末端反復(ITR)は、従来的に、5’末端と3’末端との両方でウイルスゲノムをキャップし、ウイルスゲノムの複製起点をもたらす。理論に束縛されることを望むものではないが、AAVウイルスゲノムは、典型的には2つのITR配列を含む。これらのITRは、エネルギー的に安定な二本鎖領域を形成する、ssDNAの5’末端及び3’末端にある自己相補領域(野生型AAVでは145nt)によって定義される特徴的なT字型のヘアピン構造を有する。二本鎖ヘアピン構造は、宿主ウイルス複製細胞の内因性DNAポリメラーゼ複合体のプライマーとして機能することによってDNA複製の起点として作用することを含むがこれに限定されない複数の機能を含む。
野生型AAVウイルスゲノムは、2つのオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列をさらに含み、その1つは4つの非構造Repタンパク質(Rep遺伝子によってコードされるRep78、Rep68、Rep52、Rep40)のためのものであり、1つは3つのカプシドまたは構造タンパク質(カプシド遺伝子またはCap遺伝子によってコードされるVP1、VP2、VP3)のためのものである。Repタンパク質は、複製及びパッケージングに重要であり、カプシドタンパク質は、AAVのタンパク質殻、すなわちAAVカプシドを作り出すようにアセンブルされる。選択的スプライシングならびに代替的な開始コドン及びプロモーターは、単一のオープンリーディングフレームからの4つの異なるRepタンパク質の生成と、単一のオープンリーディングフレームからの3つのカプシドタンパク質の生成とをもたらす。AAV血清型によって異なるが、非限定的な例として、AAV9/hu.14(内容の全体が参照により本明細書に組み込まれるUS7,906,111の配列番号123)については、VP1はアミノ酸1~736を指し、VP2はアミノ酸138~736を指し、VP3はアミノ酸203~736を指す。言い換えれば、VP1は完全長のカプシド配列であり、VP2及びVP3は全体より短い構成要素である。結果として、VP3領域内の配列の変化はVP1及びVP2への変化でもあるが、VP3が3つのうち最も短い配列であるので、親配列と比較したパーセント差はVP3で最大となる。ここではアミノ酸配列との関連で説明しているが、これらのタンパク質をコードする核酸配列についても同様に説明できる。3つのカプシドタンパク質は、ひとつにアセンブルしてAAVカプシドタンパク質を作り出す。理論に束縛されることを望むものではないが、AAVカプシドタンパク質は、典型的には、1:1:10のモル比のVP1:VP2:VP3を含む。本明細書で使用される場合、「AAV血清型」は、主にAAVカプシドによって定義される。場合によっては、ITRもAAV血清型(例えば、AAV2/9)によって具体的に説明される。
生物学的ツールとして使用するために、野生型AAVウイルスゲノムを修飾して、少なくとも1つのITR領域を有するペイロード領域を含む核酸配列でrep/cap配列を置換することができる。典型的には、組換えAAVウイルスゲノムには2つのITR領域が存在する。rep/cap配列は、AAV粒子を生成するために産生中にトランスで提供され得る。
コードされた異種ペイロードに加えて、AAVベクターは、任意の天然起源及び/または組換え型のAAV血清型ヌクレオチド配列またはバリアントのウイルスゲノムの全体または一部を含み得る。AAVバリアントは、概して物理的均等物及び機能的機能的である構築物を産生し、同様のメカニズムによって複製し、同様のメカニズムによってアセンブルするように、核酸レベル(ゲノムまたはカプシド)及びアミノ酸レベル(カプシド)で著しい相同性をもつ配列を有し得る。Chiorini et al.,J.Vir.71:6823-33(1997)、Srivastava et al.,J.Vir.45:555-64(1983)、Chiorini et al.,J.Vir.73:1309-1319(1999)、Rutledge et al.,J.Vir.72:309-319(1998)、及びWu et al.,J.Vir.74:8635-47(2000)、各文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、本開示のAAV粒子は、複製欠損であり、そのウイルスゲノム内の機能的なRep及びCapタンパク質をコードする配列が欠如している、組換えAAVウイルスベクターである。これらの欠損AAVベクターは、ほとんどまたはすべての親コード配列を欠き、1つまたは2つのみのAAV ITR配列、及び細胞、組織、器官、または生物に送達するための目的の核酸を本質的に保有し得る。
いくつかの実施形態では、本開示のAAV粒子のウイルスゲノムは、その中にコードされているコード配列の複製、転写、及び翻訳をもたらす少なくとも1つの制御エレメントを含む。コード配列が適切な宿主細胞において複製可能、転写可能、及び/または翻訳可能である限り、制御エレメントのすべてが常に存在する必要があるわけではない。発現制御エレメントの非限定的な例としては、転写開始及び/もしくは終結のための配列、プロモーター及び/もしくはエンハンサー配列、スプライシングシグナル及びポリアデニル化シグナルなどの効率的なRNAプロセシングシグナル、細胞質mRNAを安定させる配列、翻訳有効性を増強する配列(例えば、Kozakコンセンサス配列)、タンパク質の安定性を増強する配列、ならびに/またはタンパク質のプロセシング及び/もしくは分泌を増強する配列が挙げられる。
本開示によれば、治療薬及び/または診断薬に使用するためのAAV粒子は、目的の核酸ペイロードまたはカーゴの形質導入に必要な最小限の構成要素まで蒸留または還元されたウイルスを含む。このようにして、AAV粒子は、野生型ウイルスに見られる有害な複製及び/または組込み特性のない、特異的送達のためのビヒクルとして工学操作される。
本開示のAAVベクターは、組換えにより産生することができ、アデノ随伴ウイルス(AAV)の親配列または参照配列に基づいてもよい。本明細書で使用される場合、「ベクター」は、本明細書に記載される核酸などの異種分子を輸送する、形質導入する、またはその担体として別様に作用する任意の分子または部分である。
一本鎖AAVウイルスゲノム(例えば、ssAAV)に加えて、本開示は、自己相補的AAV(scAAV)ウイルスゲノムも提供する。scAAVベクターゲノムは、ひとつにアニーリングして二本鎖DNAを形成するDNA鎖を含む。scAAVは、第2鎖合成を省略することにより、形質導入細胞での迅速な発現を可能にする。
いくつかの実施形態では、本開示のAAV粒子はscAAVである。
いくつかの実施形態では、本開示のAAV粒子はssAAVである。
AAV粒子を産生及び/または修飾する方法は、シュードタイプ化AAVベクター(PCT特許公開第WO200028004号、同第WO200123001号、同第WO2004112727号、同第WO2005005610号、及び同第WO2005072364号、各文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)のように、当技術分野で開示されている。
AAV粒子は、送達の効率を増強するように修飾され得る。このような修飾されたAAV粒子は、効率的にパッケージングすることができ、高頻度及び極めて低い毒性で標的細胞に首尾よく感染するために使用することができる。いくつかの実施形態では、AAV粒子のカプシドは、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる米国公開第US20130195801号に記載される方法に従って工学操作される。
いくつかの実施形態では、ポリペプチドをコードするペイロード領域を含むAAV粒子は、哺乳動物細胞に導入され得る。
AAV血清型
いくつかの実施形態では、AAV粒子、例えば、本明細書に記載される抗体(例えば、抗タウ抗体)のベクター化送達のためのAAV粒子は、任意の天然または組換え型のAAV血清型を含むか、またはそれに由来し得る。本開示のAAV粒子は、任意の天然または組換え型のAAV血清型を含むか、またはそれに由来し得る。本開示によれば、AAV粒子は、VOY101、VOY201、AAVPHP.B(PHP.B)、AAVPHP.A(PHP.A)、AAVG2B-26、AAVG2B-13、AAVTH1.1-32、AAVTH1.1-35、AAVPHP.B2(PHP.B2)、AAVPHP.B3(PHP.B3)、AAVPHP.N/PHP.B-DGT、AAVPHP.B-EST、AAVPHP.B-GGT、AAVPHP.B-ATP、AAVPHP.B-ATT-T、AAVPHP.B-DGT-T、AAVPHP.B-GGT-T、AAVPHP.B-SGS、AAVPHP.B-AQP、AAVPHP.B-QQP、AAVPHP.B-SNP(3)、AAVPHP.B-SNP、AAVPHP.B-QGT、AAVPHP.B-NQT、AAVPHP.B-EGS、AAVPHP.B-SGN、AAVPHP.B-EGT、AAVPHP.B-DST、AAVPHP.B-DST、AAVPHP.B-STP、AAVPHP.B-PQP、AAVPHP.B-SQP、AAVPHP.B-QLP、AAVPHP.B-TMP、AAVPHP.B-TTP、AAVPHP.S/G2A12、AAVG2A15/G2A3(G2A3)、AAVG2B4(G2B4)、AAVG2B5(G2B5)、PHP.S、AAV1、AAV2、AAV2G9、AAV3、AAV3a、AAV3b、AAV3-3、AAV4、AAV4-4、AAV5、AAV6、AAV6.1、AAV6.2、AAV6.1.2、AAV7、AAV7.2、AAV8、AAV9、AAV9 K449R、AAV9.11、AAV9.13、AAV9.16、AAV9.24、AAV9.45、AAV9.47、AAV9.61、AAV9.68、AAV9.84、AAV9.9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV16.3、AAV24.1、AAV27.3、AAV42.12、AAV42-1b、AAV42-2、AAV42-3a、AAV42-3b、AAV42-4、AAV42-5a、AAV42-5b、AAV42-6b、AAV42-8、AAV42-10、AAV42-11、AAV42-12、AAV42-13、AAV42-15、AAV42-aa、AAV43-1、AAV43-12、AAV43-20、AAV43-21、AAV43-23、AAV43-25、AAV43-5、AAV44.1、AAV44.2、AAV44.5、AAV223.1、AAV223.2、AAV223.4、AAV223.5、AAV223.6、AAV223.7、AAV1-7/rh.48、AAV1-8/rh.49、AAV2-15/rh.62、AAV2-3/rh.61、AAV2-4/rh.50、AAV2-5/rh.51、AAV3.1/hu.6、AAV3.1/hu.9、AAV3-9/rh.52、AAV3-11/rh.53、AAV4-8/r11.64、AAV4-9/rh.54、AAV4-19/rh.55、AAV5-3/rh.57、AAV5-22/rh.58、AAV7.3/hu.7、AAV16.8/hu.10、AAV16.12/hu.11、AAV29.3/bb.1、AAV29.5/bb.2、AAV106.1/hu.37、AAV114.3/hu.40、AAV127.2/hu.41、AAV127.5/hu.42、AAV128.3/hu.44、AAV130.4/hu.48、AAV145.1/hu.53、AAV145.5/hu.54、AAV145.6/hu.55、AAV161.10/hu.60、AAV161.6/hu.61、AAV33.12/hu.17、AAV33.4/hu.15、AAV33.8/hu.16、AAV52/hu.19、AAV52.1/hu.20、AAV58.2/hu.25、AAVA3.3、AAVA3.4、AAVA3.5、AAVA3.7、AAVC1、AAVC2、AAVC5、AAV-DJ、AAV-DJ8、AAVF3、AAVF5、AAVH2、AAVrh.72、AAVhu.8、AAVrh.68、AAVrh.70、AAVpi.1、AAVpi.3、AAVpi.2、AAVrh.60、AAVrh.44、AAVrh.65、AAVrh.55、AAVrh.47、AAVrh.69、AAVrh.45、AAVrh.59、AAVhu.12、AAVH6、AAVLK03、AAVH-1/hu.1、AAVH-5/hu.3、AAVLG-10/rh.40、AAVLG-4/rh.38、AAVLG-9/hu.39、AAVN721-8/rh.43、AAVCh.5、AAVCh.5R1、AAVcy.2、AAVcy.3、AAVcy.4、AAVcy.5、AAVCy.5R1、AAVCy.5R2、AAVCy.5R3、AAVCy.5R4、AAVcy.6、AAVhu.1、AAVhu.2、AAVhu.3、AAVhu.4、AAVhu.5、AAVhu.6、AAVhu.7、AAVhu.9、AAVhu.10、AAVhu.11、AAVhu.13、AAVhu.15、AAVhu.16、AAVhu.17、AAVhu.18、AAVhu.20、AAVhu.21、AAVhu.22、AAVhu.23.2、AAVhu.24、AAVhu.25、AAVhu.27、AAVhu.28、AAVhu.29、AAVhu.29R、AAVhu.31、AAVhu.32、AAVhu.34、AAVhu.35、AAVhu.37、AAVhu.39、AAVhu.40、AAVhu.41、AAVhu.42、AAVhu.43、AAVhu.44、AAVhu.44R1、AAVhu.44R2、AAVhu.44R3、AAVhu.45、AAVhu.46、AAVhu.47、AAVhu.48、AAVhu.48R1、AAVhu.48R2、AAVhu.48R3、AAVhu.49、AAVhu.51、AAVhu.52、AAVhu.54、AAVhu.55、AAVhu.56、AAVhu.57、AAVhu.58、AAVhu.60、AAVhu.61、AAVhu.63、AAVhu.64、AAVhu.66、AAVhu.67、AAVhu.14/9、AAVhu.t 19、AAVrh.2、AAVrh.2R、AAVrh.8、AAVrh.8R、AAVrh.10、AAVrh.12、AAVrh.13、AAVrh.13R、AAVrh.14、AAVrh.17、AAVrh.18、AAVrh.19、AAVrh.20、AAVrh.21、AAVrh.22、AAVrh.23、AAVrh.24、AAVrh.25、AAVrh.31、AAVrh.32、AAVrh.33、AAVrh.34、AAVrh.35、AAVrh.36、AAVrh.37、AAVrh.37R2、AAVrh.38、AAVrh.39、AAVrh.40、AAVrh.46、AAVrh.48、AAVrh.48.1、AAVrh.48.1.2、AAVrh.48.2、AAVrh.49、AAVrh.51、AAVrh.52、AAVrh.53、AAVrh.54、AAVrh.56、AAVrh.57、AAVrh.58、AAVrh.61、AAVrh.64、AAVrh.64R1、AAVrh.64R2、AAVrh.67、AAVrh.73、AAVrh.74、AAVrh8R、AAVrh8R A586R変異体、AAVrh8R R533A変異体、AAAV、BAAV、ヤギAAV、ウシAAV、AAVhE1.1、AAVhEr1.5、AAVhER1.14、AAVhEr1.8、AAVhEr1.16、AAVhEr1.18、AAVhEr1.35、AAVhEr1.7、AAVhEr1.36、AAVhEr2.29、AAVhEr2.4、AAVhEr2.16、AAVhEr2.30、AAVhEr2.31、AAVhEr2.36、AAVhER1.23、AAVhEr3.1、AAV2.5T、AAV-PAEC、AAV-LK01、AAV-LK02、AAV-LK03、AAV-LK04、AAV-LK05、AAV-LK06、AAV-LK07、AAV-LK08、AAV-LK09、AAV-LK10、AAV-LK11、AAV-LK12、AAV-LK13、AAV-LK14、AAV-LK15、AAV-LK16、AAV-LK17、AAV-LK18、AAV-LK19、AAV-PAEC2、AAV-PAEC4、AAV-PAEC6、AAV-PAEC7、AAV-PAEC8、AAV-PAEC11、AAV-PAEC12、AAV-2-pre-miRNA-101、AAV-8h、AAV-8b、AAV-h、AAV-b、AAV SM 10-2、AAVシャッフル100-1、AAVシャッフル100-3、AAVシャッフル100-7、AAVシャッフル10-2、AAVシャッフル10-6、AAVシャッフル10-8、AAVシャッフル100-2、AAV SM 10-1、AAV SM 10-8、AAV SM 100-3、AAV SM 100-10、BNP61 AAV、BNP62 AAV、BNP63 AAV、AAVrh.50、AAVrh.43、AAVrh.62、AAVrh.48、AAVhu.19、AAVhu.11、AAVhu.53、AAV4-8/rh.64、AAVLG-9/hu.39、AAV54.5/hu.23、AAV54.2/hu.22、AAV54.7/hu.24、AAV54.1/hu.21、AAV54.4R/hu.27、AAV46.2/hu.28、AAV46.6/hu.29、AAV128.1/hu.43、真型AAV(ttAAV)、UPENN AAV 10、日本AAV 10血清型、AAV CBr-7.1、AAV CBr-7.10、AAV CBr-7.2、AAV CBr-7.3、AAV CBr-7.4、AAV CBr-7.5、AAV CBr-7.7、AAV CBr-7.8、AAV CBr-B7.3、AAV CBr-B7.4、AAV CBr-E1、AAV CBr-E2、AAV CBr-E3、AAV CBr-E4、AAV CBr-E5、AAV CBr-e5、AAV CBr-E6、AAV CBr-E7、AAV CBr-E8、AAV CHt-1、AAV CHt-2、AAV CHt-3、AAV CHt-6.1、AAV CHt-6.10、AAV CHt-6.5、AAV CHt-6.6、AAV CHt-6.7、AAV CHt-6.8、AAV CHt-P1、AAV CHt-P2、AAV CHt-P5、AAV CHt-P6、AAV CHt-P8、AAV CHt-P9、AAV CKd-1、AAV CKd-10、AAV CKd-2、AAV CKd-3、AAV CKd-4、AAV CKd-6、AAV CKd-7、AAV CKd-8、AAV CKd-B1、AAV CKd-B2、AAV CKd-B3、AAV CKd-B4、AAV CKd-B5、AAV CKd-B6、AAV CKd-B7、AAV CKd-B8、AAV CKd-H1、AAV CKd-H2、AAV CKd-H3、AAV CKd-H4、AAV CKd-H5、AAV CKd-H6、AAV CKd-N3、AAV CKd-N4、AAV CKd-N9、AAV CLg-F1、AAV CLg-F2、AAV CLg-F3、AAV CLg-F4、AAV CLg-F5、AAV CLg-F6、AAV CLg-F7、AAV CLg-F8、AAV CLv-1、AAV CLv1-1、AAV Clv1-10、AAV CLv1-2、AAV CLv-12、AAV CLv1-3、AAV CLv-13、AAV CLv1-4、AAV Clv1-7、AAV Clv1-8、AAV Clv1-9、AAV CLv-2、AAV CLv-3、AAV CLv-4、AAV CLv-6、AAV CLv-8、AAV CLv-D1、AAV CLv-D2、AAV CLv-D3、AAV CLv-D4、AAV CL
v-D5、AAV CLv-D6、AAV CLv-D7、AAV CLv-D8、AAV CLv-E1、AAV CLv-K1、AAV CLv-K3、AAV CLv-K6、AAV CLv-L4、AAV CLv-L5、AAV CLv-L6、AAV CLv-M1、AAV CLv-M11、AAV CLv-M2、AAV CLv-M5、AAV CLv-M6、AAV CLv-M7、AAV CLv-M8、AAV CLv-M9、AAV CLv-R1、AAV CLv-R2、AAV CLv-R3、AAV CLv-R4、AAV CLv-R5、AAV CLv-R6、AAV CLv-R7、AAV CLv-R8、AAV CLv-R9、AAV CSp-1、AAV CSp-10、AAV CSp-11、AAV CSp-2、AAV CSp-3、AAV CSp-4、AAV CSp-6、AAV CSp-7、AAV CSp-8、AAV CSp-8.10、AAV CSp-8.2、AAV CSp-8.4、AAV CSp-8.5、AAV CSp-8.6、AAV CSp-8.7、AAV CSp-8.8、AAV CSp-8.9、AAV CSp-9、AAV.hu.48R3、AAV.VR-355、AAV3B、AAV4、AAV5、AAVF1/HSC1、AAVF11/HSC11、AAVF12/HSC12、AAVF13/HSC13、AAVF14/HSC14、AAVF15/HSC15、AAVF16/HSC16、AAVF17/HSC17、AAVF2/HSC2、AAVF3/HSC3、AAVF4/HSC4、AAVF5/HSC5、AAVF6/HSC6、AAVF7/HSC7、AAVF8/HSC8、及び/またはAAVF9/HSC9、ならびにそれらのバリアントのいずれかから選択される血清型を利用する、もしくはそれに基づく、またはこれらのいずれかから選択されるペプチドを含むことができる。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる米国公開第US20030138772号に記載された配列、例えば、限定されるものではないが、AAV1(US20030138772の配列番号6及び64)、AAV2(US20030138772の配列番号7及び70)、AAV3(US20030138772の配列番号8及び71)、AAV4(US20030138772の配列番号63)、AAV5(US20030138772の配列番号114)、AAV6(US20030138772の配列番号65)、AAV7(US20030138772の配列番号1~3)、AAV8(US20030138772の配列番号4及び95)、AAV9(US20030138772の配列番号5及び100)、AAV10(US20030138772の配列番号117)、AAV11(US20030138772の配列番号118)、AAV12(US20030138772の配列番号119)、AAVrh10(US20030138772の配列番号81のアミノ酸1~738)、AAV16.3(US20030138772配列番号10)、AAV29.3/bb.1(US20030138772配列番号11)、AAV29.4(US20030138772配列番号12)、AAV29.5/bb.2(US20030138772配列番号13)、AAV1.3(US20030138772配列番号14)、AAV13.3(US20030138772配列番号15)、AAV24.1(US20030138772配列番号16)、AAV27.3(US20030138772配列番号17)、AAV7.2(US20030138772配列番号18)、AAVC1(US20030138772配列番号19)、AAVC3(US20030138772配列番号20)、AAVC5(US20030138772配列番号21)、AAVF1(US20030138772配列番号22)、AAVF3(US20030138772配列番号23)、AAVF5(US20030138772配列番号24)、AAVH6(US20030138772配列番号25)、AAVH2(US20030138772配列番号26)、AAV42-8(US20030138772配列番号27)、AAV42-15(US20030138772配列番号28)、AAV42-5b(US20030138772配列番号29)、AAV42-1b(US20030138772配列番号30)、AAV42-13(US20030138772配列番号31)、AAV42-3a(US20030138772配列番号32)、AAV42-4(US20030138772配列番号33)、AAV42-5a(US20030138772配列番号34)、AAV42-10(US20030138772配列番号35)、AAV42-3b(US20030138772配列番号36)、AAV42-11(US20030138772配列番号37)、AAV42-6b(US20030138772配列番号38)、AAV43-1(US20030138772配列番号39)、AAV43-5(US20030138772配列番号40)、AAV43-12(US20030138772配列番号41)、AAV43-20(US20030138772配列番号42)、AAV43-21(US20030138772配列番号43)、AAV43-23(US20030138772配列番号44)、AAV43-25(US20030138772配列番号45)、AAV44.1(US20030138772配列番号46)、AAV44.5(US20030138772配列番号47)、AAV223.1(US20030138772配列番号48)、AAV223.2(US20030138772配列番号49)、AAV223.4(US20030138772配列番号50)、AAV223.5(US20030138772配列番号51)、AAV223.6(US20030138772配列番号52)、AAV223.7(US20030138772配列番号53)、AAVA3.4(US20030138772配列番号54)、AAVA3.5(US20030138772配列番号55)、AAVA3.7(US20030138772配列番号56)、AAVA3.3(US20030138772配列番号57)、AAV42.12(US20030138772配列番号58)、AAV44.2(US20030138772配列番号59)、AAV42-2(US20030138772配列番号9)、もしくはそれらのバリアントであるか、またはそれを有し得る。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる米国公開第US20150159173号に記載された配列、例えば、限定されるものではないが、AAV2(US20150159173の配列番号7及び23)、rh20(US20150159173の配列番号1)、rh32/33(US20150159173の配列番号2)、rh39(US20150159173の配列番号3、20及び36)、rh46(US20150159173の配列番号4及び22)、rh73(US20150159173の配列番号5)、rh74(US20150159173の配列番号6)、AAV6.1(US20150159173の配列番号29)、rh.8(US20150159173の配列番号41)、rh.48.1(US20150159173の配列番号44)、hu.44(US20150159173の配列番号45)、hu.29(US20150159173の配列番号42)、hu.48(US20150159173の配列番号38)、rh54(US20150159173の配列番号49)、AAV2(US20150159173の配列番号7)、cy.5(US20150159173の配列番号8及び24)、rh.10(US20150159173の配列番号9及び25)、rh.13(US20150159173の配列番号10及び26)、AAV1(US20150159173の配列番号11及び27)、AAV3(US20150159173の配列番号12及び28)、AAV6(US20150159173の配列番号13及び29)、AAV7(US20150159173の配列番号14及び30)、AAV8(US20150159173の配列番号15及び31)、hu.13(US20150159173の配列番号16及び32)、hu.26(US20150159173の配列番号17及び33)、hu.37(US20150159173の配列番号18及び34)、hu.53(US20150159173の配列番号19及び35)、rh.43(US20150159173の配列番号21及び37)、rh2(US20150159173の配列番号39)、rh.37(US20150159173の配列番号40)、rh.64(US20150159173の配列番号43)、rh.48(US20150159173の配列番号44)、ch.5(US20150159173の配列番号46)、rh.67(US20150159173の配列番号47)、rh.58(US20150159173の配列番号48)、もしくはCy5R1、Cy5R2、Cy5R3、Cy5R4、rh.13R、rh.37R2、rh.2R、rh.8R、rh.48.1、rh.48.2、rh.48.1.2、hu.44R1、hu.44R2、hu.44R3、hu.29R、ch.5R1、rh64R1、rh64R2、AAV6.2、AAV6.1、AAV6.12、hu.48R1、hu.48R2、及びhu.48R3を含むがこれらに限定されないそれらのバリアントであるか、またはそれを有し得る。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許第US7198951号に記載された配列、例えば、限定されるものではないが、AAV9(US7198951の配列番号1~3)、AAV2(US7198951の配列番号4)、AAV1(US7198951の配列番号5)、AAV3(US7198951の配列番号6)、及びAAV8(US7198951の配列番号7)であるか、またはそれを有し得る。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、AAV9.9、AAV9.11、AAV9.13、AAV9.16、AAV9.24、AAV9.45、AAV9.47、AAV9.61、AAV9.68、AAV9.84などだがこれらに限定されない、N Pulicherlaら(Molecular Therapy 19(6):1070-1078(2011)、これは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)によって説明されたAAV9配列であるか、またはその変異を有し得る。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許第US6156303号に記載された配列、例えば、限定されるものではないが、AAV3B(US6156303の配列番号1及び10)、AAV6(US6156303の配列番号2、7及び11)、AAV2(US6156303の配列番号3及び8)、AAV3A(US6156303の配列番号4及び9)、もしくはそれらの誘導体であるか、またはそれを有し得る。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる米国公開第US20140359799号に記載された配列、例えば、限定されるものではないが、AAV8(US20140359799の配列番号1)、AAVDJ(US20140359799の配列番号2及び3)、もしくはそれらのバリアントであるか、またはそれを有し得る。
いくつかの実施形態では、血清型は、Grimmら(Journal of Virology 82(12):5887-5911(2008)、これは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)によって説明されたAAVDJ8(またはAAV-DJ8)のような、AAVDJまたはそのバリアントであり得る。AAVDJ8のアミノ酸配列は、ヘパリン結合ドメイン(HBD)を除去するために2つ以上の変異を含み得る。非限定的な例として、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許第7,588,772号に配列番号1として記載されたAAV-DJ配列は、(1)アミノ酸587のアルギニン(R;Arg)がグルタミン(Q;Gln)に変化するR587Q、及び(2)アミノ酸590のアルギニン(R;Arg)がスレオニン(T;Thr)に変化するR590Tという2つの変異を含み得る。別の非限定的な例として、(1)アミノ酸406のリシン(K;Lys)がアルギニン(R;Arg)に変化するK406R、(2)アミノ酸587のアルギニン(R;Arg)がグルタミン(Q;Gln)に変化するR587Q、及び(3)アミノ酸590のアルギニン(R;Arg)がスレオニン(T;Thr)に変化するR590Tという3つの変異を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる国際公開第WO1998011244号に記載された、AAV4(WO1998011244の配列番号1~20)などだがこれに限定されないAAV4の配列であるか、またはそれを有し得る。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、国際公開第WO2014144229号に記載され、その全体が参照により本明細書に組み込まれるものであるか、またはAAV2G9を生成するAAV2配列の変異を有し得る。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる国際公開第WO2005033321号に記載された配列、例えば、限定されるものではないが、AAV3-3(WO2005033321の配列番号217)、AAV1(WO2005033321の配列番号219及び202)、AAV106.1/hu.37(WO2005033321の配列番号10)、AAV114.3/hu.40(WO2005033321の配列番号11)、AAV127.2/hu.41(WO2005033321の配列番号6及び8)、AAV128.3/hu.44(WO2005033321の配列番号81)、AAV130.4/hu.48(WO2005033321の配列番号78)、AAV145.1/hu.53(WO2005033321の配列番号176及び177)、AAV145.6/hu.56(WO2005033321の配列番号168及び192)、AAV16.12/hu.11(WO2005033321の配列番号153及び57)、AAV16.8/hu.10(WO2005033321の配列番号156及び56)、AAV161.10/hu.60(WO2005033321の配列番号170)、AAV161.6/hu.61(WO2005033321の配列番号174)、AAV1-7/rh.48(WO2005033321の配列番号32)、AAV1-8/rh.49(WO2005033321の配列番号103及び25)、AAV2(WO2005033321の配列番号211及び221)、AAV2-15/rh.62(WO2005033321の配列番号33及び114)、AAV2-3/rh.61(WO2005033321の配列番号21)、AAV2-4/rh.50(WO2005033321の配列番号23及び108)、AAV2-5/rh.51(WO2005033321の配列番号104及び22)、AAV3.1/hu.6(WO2005033321の配列番号5及び84)、AAV3.1/hu.9(WO2005033321の配列番号155及び58)、AAV3-11/rh.53(WO2005033321の配列番号186及び176)、AAV3-3(WO2005033321の配列番号200)、AAV33.12/hu.17(WO2005033321の配列番号4)、AAV33.4/hu.15(WO2005033321の配列番号50)、AAV33.8/hu.16(WO2005033321の配列番号51)、AAV3-9/rh.52(WO2005033321の配列番号96及び18)、AAV4-19/rh.55(WO2005033321の配列番号117)、AAV4-4(WO2005033321の配列番号201及び218)、AAV4-9/rh.54(WO2005033321の配列番号116)、AAV5(WO2005033321の配列番号199及び216)、AAV52.1/hu.20(WO2005033321の配列番号63)、AAV52/hu.19(WO2005033321の配列番号133)、AAV5-22/rh.58(WO2005033321の配列番号27)、AAV5-3/rh.57(WO2005033321の配列番号105)、AAV5-3/rh.57(WO2005033321の配列番号26)、AAV58.2/hu.25(WO2005033321の配列番号49)、AAV6(WO2005033321の配列番号203及び220)、AAV7(WO2005033321の配列番号222及び213)、AAV7.3/hu.7(WO2005033321の配列番号55)、AAV8(WO2005033321の配列番号223及び214)、AAVH-1/hu.1(WO2005033321の配列番号46)、AAVH-5/hu.3(WO2005033321の配列番号44)、AAVhu.1(WO2005033321の配列番号144)、AAVhu.10(WO2005033321の配列番号156)、AAVhu.11(WO2005033321の配列番号153)、AAVhu.12(WO2005033321配列番号59)、AAVhu.13(WO2005033321の配列番号129)、AAVhu.14/AAV9(WO2005033321の配列番号123及び3)、AAVhu.15(WO2005033321の配列番号147)、AAVhu.16(WO2005033321の配列番号148)、AAVhu.17(WO2005033321の配列番号83)、AAVhu.18(WO2005033321の配列番号149)、AAVhu.19(WO2005033321の配列番号133)、AAVhu.2(WO2005033321の配列番号143)、AAVhu.20(WO2005033321の配列番号134)、AAVhu.21(WO2005033321の配列番号135)、AAVhu.22(WO2005033321の配列番号138)、AAVhu.23.2(WO2005033321の配列番号137)、AAVhu.24(WO2005033321の配列番号136)、AAVhu.25(WO2005033321の配列番号146)、AAVhu.27(WO2005033321の配列番号140)、AAVhu.29(WO2005033321の配列番号132)、AAVhu.3(WO2005033321の配列番号145)、AAVhu.31(WO2005033321の配列番号121)、AAVhu.32(WO2005033321の配列番号122)、AAVhu.34(WO2005033321の配列番号125)、AAVhu.35(WO2005033321の配列番号164)、AAVhu.37(WO2005033321の配列番号88)、AAVhu.39(WO2005033321の配列番号102)、AAVhu.4(WO2005033321の配列番号141)、AAVhu.40(WO2005033321の配列番号87)、AAVhu.41(WO2005033321の配列番号91)、AAVhu.42(WO2005033321の配列番号85)、AAVhu.43(WO2005033321の配列番号160)、AAVhu.44(WO2005033321の配列番号144)、AAVhu.45(WO2005033321の配列番号127)、AAVhu.46(WO2005033321の配列番号159)、AAVhu.47(WO2005033321の配列番号128)、AAVhu.48(WO2005033321の配列番号157)、AAVhu.49(WO2005033321の配列番号189)、AAVhu.51(WO2005033321の配列番号190)、AAVhu.52(WO2005033321の配列番号191)、AAVhu.53(WO2005033321の配列番号186)、AAVhu.54(WO2005033321の配列番号188)、AAVhu.55(WO2005033321の配列番号187)、AAVhu.56(WO2005033321の配列番号192)、AAVhu.57(WO2005033321の配列番号193)、AAVhu.58(WO2005033321の配列番号194)、AAVhu.6(WO2005033321の配列番号84)、AAVhu.60(WO2005033321の配列番号184)、AAVhu.61(WO2005033321の配列番号185)、AAVhu.63(WO2005033321の配列番号195)、AAVhu.64(WO2005033321の配列番号196)、AAVhu.66(WO2005033321の配列番号197)、AAVhu.67(WO2005033321の配列番号198)、AAVhu.7(WO2005033321の配列番号150)、AAVhu.8(WO2005033321配列番号12)、AAVhu.9(WO2005033321の配列番号155)、AAVLG-10/rh.40(WO2005033321の配列番号14)、AAVLG-4/rh.38(WO2005033321の配列番号86)、AAVLG-4/rh.38(WO2005033321の配列番号7)、AAVN721-8/rh.43(WO2005033321の配列番号163)、AAVN721-8/rh.43(WO2005033321の配列番号43)、AAVpi.1(WO2005033321配列番号28)、AAVpi.2(WO2005033321配列番号30)、AAVpi.3(WO2005033321配列番号29)、AAVrh.38(WO2005033321の配列番号86)、AAVrh.40(WO2005033321の配列番号92)、AAVrh.43(WO2005033321の配列番号163)、AAVrh.44(WO2005033321配列番号34)、AAVrh.45(WO2005033321配列番号41)、AAVrh.47(WO2005033321配列番号38)、AAVrh.48(WO2005033321の配列番号115)、AAVrh.49(WO2005033321の配列番号103)、AAVrh.50(WO2005033321の配列番号108)、AAVrh.51(WO2005033321の配列番号104)、AAVrh.52(WO2005033321の配列番号96)、AAVrh.53(WO2005033321の配列番号97)、AAVrh.55(WO2005033321配列番号37)、AAVrh.56(WO2005033321の配列番号152)、AAVrh.57(WO2005033321の配列番号105)、AAVrh.58(WO2005033321の配列番号106)、AAVrh.59(WO2005033321配列番号42)、AAVrh.60(WO2005033321配列番号31)、AAVrh.61(WO2005033321の配列番号107)、AAVrh.62(WO2005033321の配列番号114)、AAVrh.64(WO2005033321の配列番号99)、AAVrh.65(WO2005033321配列番号35)、AAVrh.68(WO2005033321配列番号16)、AAVrh.69(WO2005033321配列番号39)、AAVrh.70(WO2005033321配列番号20)、AAVrh.72(WO2005033321配列番号9)、もしくはAAVcy.2、AAVcy.3、AAVcy.4、AAVcy.5、AAVcy.6、AAVrh.12、AAVrh.17、AAVrh.18、AAVrh.19、AAVrh.21、AAVrh.22、AAVrh.23、AAVrh.24、AAVrh.25、AAVrh.25/42 15、AAVrh.31、AAVrh.32、AAVrh.33、AAVrh.34、AAVrh.35、AAVrh.36、AAVrh.37、AAVrh14を含むがこれらに限定されないそれらのバリアントであるか、またはそれを有し得る。バリアントの非限定的な例としては、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれるWO2005033321の配列番号13、15、17、19、24、36、40、45、47、48、51~54、60~62、64~77、79、80、82、89、90、93~95、98、100、101、109~113、118~120、124、126、131、139、142、151,154、158、161、162、165~183、202、204~212、215、219、224~236が挙げられる。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる国際公開第WO2015168666号に記載された配列、例えば、限定されるものではないが、AAVrh8R(WO2015168666の配列番号9)、AAVrh8R A586R変異体(WO2015168666の配列番号10)、AAVrh8R R533A変異体(WO2015168666の配列番号11)、もしくはそれらのバリアントであるか、またはそれを有し得る。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許第US9233131号に記載された配列、例えば、限定されるものではないが、AAVhE1.1(US9233131の配列番号44)、AAVhEr1.5(US9233131の配列番号45)、AAVhER1.14(US9233131の配列番号46)、AAVhEr1.8(US9233131の配列番号47)、AAVhEr1.16(US9233131の配列番号48)、AAVhEr1.18(US9233131の配列番号49)、AAVhEr1.35(US9233131の配列番号50)、AAVhEr1.7(US9233131の配列番号51)、AAVhEr1.36(US9233131の配列番号52)、AAVhEr2.29(US9233131の配列番号53)、AAVhEr2.4(US9233131の配列番号54)、AAVhEr2.16(US9233131の配列番号55)、AAVhEr2.30(US9233131の配列番号56)、AAVhEr2.31(US9233131の配列番号58)、AAVhEr2.36(US9233131の配列番号57)、AAVhER1.23(US9233131の配列番号53)、AAVhEr3.1(US9233131の配列番号59)、AAV2.5T(US9233131の配列番号42)、もしくはそれらのバリアントであるか、またはそれを有し得る。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許公開第US20150376607号に記載された配列、例えば、限定されるものではないが、AAV-PAEC(US20150376607の配列番号1)、AAV-LK01(US20150376607の配列番号2)、AAV-LK02(US20150376607の配列番号3)、AAV-LK03(US20150376607の配列番号4)、AAV-LK04(US20150376607の配列番号5)、AAV-LK05(US20150376607の配列番号6)、AAV-LK06(US20150376607の配列番号7)、AAV-LK07(US20150376607の配列番号8)、AAV-LK08(US20150376607の配列番号9)、AAV-LK09(US20150376607の配列番号10)、AAV-LK10(US20150376607の配列番号11)、AAV-LK11(US20150376607の配列番号12)、AAV-LK12(US20150376607の配列番号13)、AAV-LK13(US20150376607の配列番号14)、AAV-LK14(US20150376607の配列番号15)、AAV-LK15(US20150376607の配列番号16)、AAV-LK16(US20150376607の配列番号17)、AAV-LK17(US20150376607の配列番号18)、AAV-LK18(US20150376607の配列番号19)、AAV-LK19(US20150376607の配列番号20)、AAV-PAEC2(US20150376607の配列番号21)、AAV-PAEC4(US20150376607の配列番号22)、AAV-PAEC6(US20150376607の配列番号23)、AAV-PAEC7(US20150376607の配列番号24)、AAV-PAEC8(US20150376607の配列番号25)、AAV-PAEC11(US20150376607の配列番号26)、AAV-PAEC12(US20150376607の配列番号27)、もしくはそれらのバリアントであるか、またはそれを有し得る。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許第US9163261号に記載された配列、例えば、限定されるものではないが、AAV-2-pre-miRNA-101(配列番号1 US9163261)、もしくはそのバリアントであるか、またはそれを有し得る。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許公開第US20150376240号に記載された配列、例えば、限定されるものではないが、AAV-8h(US20150376240の配列番号6)、AAV-8b(US20150376240の配列番号5)、AAV-h(US20150376240の配列番号2)、AAV-b(US20150376240の配列番号1)、もしくはそれらのバリアントであるか、またはそれを有し得る。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許公開第US20160017295号に記載された配列、例えば、限定されるものではないが、AAV SM 10-2(US20160017295の配列番号22)、AAVシャッフル100-1(US20160017295の配列番号23)、AAVシャッフル100-3(US20160017295の配列番号24)、AAVシャッフル100-7(US20160017295の配列番号25)、AAVシャッフル10-2(US20160017295の配列番号34)、AAVシャッフル10-6(US20160017295の配列番号35)、AAVシャッフル10-8(US20160017295の配列番号36)、AAVシャッフル100-2(US20160017295の配列番号37)、AAV SM 10-1(US20160017295の配列番号38)、AAV SM 10-8(US20160017295の配列番号39)、AAV SM 100-3(US20160017295の配列番号40)、AAV SM 100-10(US20160017295の配列番号41)、もしくはそれらのバリアントであるか、またはそれを有し得る。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許公開第US20150238550号に記載された配列、例えば、限定されるものではないが、BNP61 AAV(US20150238550の配列番号1)、BNP62 AAV(US20150238550の配列番号3)、BNP63 AAV(US20150238550の配列番号4)、もしくはそれらのバリアントであるか、またはそれを有し得る。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許公開第US20150315612号に記載された配列、例えば、限定されるものではないが、AAVrh.50(US20150315612の配列番号108)、AAVrh.43(US20150315612の配列番号163)、AAVrh.62(US20150315612の配列番号114)、AAVrh.48(US20150315612の配列番号115)、AAVhu.19(US20150315612の配列番号133)、AAVhu.11(US20150315612の配列番号153)、AAVhu.53(US20150315612の配列番号186)、AAV4-8/rh.64(US20150315612の配列番号15)、AAVLG-9/hu.39(US20150315612の配列番号24)、AAV54.5/hu.23(US20150315612の配列番号60)、AAV54.2/hu.22(US20150315612の配列番号67)、AAV54.7/hu.24(US20150315612の配列番号66)、AAV54.1/hu.21(US20150315612の配列番号65)、AAV54.4R/hu.27(US20150315612の配列番号64)、AAV46.2/hu.28(US20150315612の配列番号68)、AAV46.6/hu.29(US20150315612の配列番号69)、AAV128.1/hu.43(US20150315612の配列番号80)、もしくはそれらのバリアントであり得るか、またはそれを有し得る。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる国際公開第WO2015121501号に記載された配列、例えば、限定されるものではないが、真型AAV(ttAAV)(WO2015121501の配列番号2)、「UPenn AAV10」(WO2015121501の配列番号8)、「日本AAV10」(WO2015121501の配列番号9)、もしくはそれらのバリアントであるか、またはそれを有し得る。
本開示によれば、AAVカプシド血清型の選択または使用は、種々の種に由来し得る。いくつかの実施形態では、AAVは、トリAAV(AAAV)であり得る。AAAV血清型は、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許第US9238800号に記載された配列、例えば、限定されるものではないが、AAAV(US9,238,800の配列番号1、2、4、6、8、10、12、及び14)、もしくはそれらのバリアントであるか、またはそれを有し得る。
いくつかの実施形態では、AAVは、ウシAAV(BAAV)でもよい。BAAV血清型は、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許第US9,193,769号に記載された配列、例えば、限定されるものではないが、BAAV(US9193769の配列番号1及び6)、もしくはそれらのバリアントであるか、またはそれを有し得る。BAAV血清型は、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許第US7427396号に記載された配列、例えば、限定されるものではないが、BAAV(US7427396の配列番号5及び6)、もしくはそれらのバリアントであるか、またはそれを有し得る。
いくつかの実施形態では、AAVは、ヤギAAVでもよい。ヤギAAV血清型は、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許第US7427396号に記載された配列、例えば、限定されるものではないが、ヤギAAV(US7427396の配列番号3)、もしくはそのバリアントであるか、またはそれを有し得る。
他の実施形態では、AAVは、2つ以上の親血清型由来のハイブリッドAAVとして工学操作され得る。いくつかの実施形態では、AAVは、AAV2及びAAV9由来の配列を含むAAV2G9であり得る。AAV2G9 AAV血清型は、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許公開第US20160017005号に記載された配列であるか、またはそれを有し得る。
いくつかの実施形態では、AAVは、Pulicherlaら(Molecular Therapy 19(6):1070-1078(2011)、同文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)によって説明されたように、アミノ酸390~627(VP1番号付け)に変異を有するAAV9カプシドライブラリによって生成される血清型であり得る。血清型ならびに対応するヌクレオチド及びアミノ酸置換は、AAV9.1(G1594C;D532H)、AAV6.2(T1418A及びT1436X;V473D及びI479K)、AAV9.3(T1238A;F413Y)、AAV9.4(T1250C及びA1617T;F417S)、AAV9.5(A1235G、A1314T、A1642G、C1760T;Q412R、T548A、A587V)、AAV9.6(T1231A;F411I)、AAV9.9(G1203A、G1785T;W595C)、AAV9.10(A1500G、T1676C;M559T)、AAV9.11(A1425T、A1702C、A1769T;T568P、Q590L)、AAV9.13(A1369C、A1720T;N457H、T574S)、AAV9.14(T1340A、T1362C、T1560C、G1713A;L447H)、AAV9.16(A1775T;Q592L)、AAV9.24(T1507C、T1521G;W503R)、AAV9.26(A1337G、A1769C;Y446C、Q590P)、AAV9.33(A1667C;D556A)、AAV9.34(A1534G、C1794T;N512D)、AAV9.35(A1289T、T1450A、C1494T、A1515T、C1794A、G1816A;Q430L、Y484N、N98K、V606I)、AAV9.40(A1694T、E565V)、AAV9.41(A1348T、T1362C;T450S)、AAV9.44(A1684C、A1701T、A1737G;N562H、K567N)、AAV9.45(A1492T、C1804T;N498Y、L602F)、AAV9.46(G1441C、T1525C、T1549G;G481R、W509R、L517V)、9.47(G1241A、G1358A、A1669G、C1745T;S414N、G453D、K557E、T582I)、AAV9.48(C1445T、A1736T;P482L、Q579L)、AAV9.50(A1638T、C1683T、T1805A;Q546H、L602H)、AAV9.53(G1301A、A1405C、C1664T、G1811T;R134Q、S469R、A555V、G604V)、AAV9.54(C1531A、T1609A;L511I、L537M)、AAV9.55(T1605A;F535L)、AAV9.58(C1475T、C1579A;T492I、H527N)、AAV.59(T1336C;Y446H)、AAV9.61(A1493T;N498I)、AAV9.64(C1531A、A1617T;L511I)、AAV9.65(C1335T、T1530C、C1568A;A523D)、AAV9.68(C1510A;P504T)、AAV9.80(G1441A,;G481R)、AAV9.83(C1402A、A1500T;P468T、E500D)、AAV9.87(T1464C、T1468C;S490P)、AAV9.90(A1196T;Y399F)、AAV9.91(T1316G、A1583T、C1782G、T1806C;L439R、K528I)、AAV9.93(A1273G、A1421G、A1638C、C1712T、G1732A、A1744T、A1832T;S425G、Q474R、Q546H、P571L、G578R、T582S、D611V)、AAV9.94(A1675T;M559L)、及びAAV9.95(T1605A;F535L)であり得るが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる国際公開第WO2016049230号に記載された配列、例えば、限定されるものではないが、AAVF1/HSC1(WO2016049230の配列番号2及び20)、AAVF2/HSC2(WO2016049230の配列番号3及び21)、AAVF3/HSC3(WO2016049230の配列番号5及び22)、AAVF4/HSC4(WO2016049230の配列番号6及び23)、AAVF5/HSC5(WO2016049230の配列番号11及び25)、AAVF6/HSC6(WO2016049230の配列番号7及び24)、AAVF7/HSC7(WO2016049230の配列番号8及び27)、AAVF8/HSC8(WO2016049230の配列番号9及び28)、AAVF9/HSC9(WO2016049230の配列番号10及び29)、AAVF11/HSC11(WO2016049230の配列番号4及び26)、AAVF12/HSC12(WO2016049230の配列番号12及び30)、AAVF13/HSC13(WO2016049230の配列番号14及び31)、AAVF14/HSC14(WO2016049230の配列番号15及び32)、AAVF15/HSC15(WO2016049230の配列番号16及び33)、AAVF16/HSC16(WO2016049230の配列番号17及び34)、AAVF17/HSC17(WO2016049230の配列番号13及び35)、もしくはそれらのバリアントもしくは誘導体であるか、またはそれを有し得る。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許第US8734809号に記載された配列、例えば、限定されるものではないが、AAV CBr-E1(US8734809の配列番号13及び87)、AAV CBr-E2(US8734809の配列番号14及び88)、AAV CBr-E3(US8734809の配列番号15及び89)、AAV CBr-E4(US8734809の配列番号16及び90)、AAV CBr-E5(US8734809の配列番号17及び91)、AAV CBr-e5(US8734809の配列番号18及び92)、AAV CBr-E6(US8734809の配列番号19及び93)、AAV CBr-E7(US8734809の配列番号20及び94)、AAV CBr-E8(US8734809の配列番号21及び95)、AAV CLv-D1(US8734809の配列番号22及び96)、AAV CLv-D2(US8734809の配列番号23及び97)、AAV CLv-D3(US8734809の配列番号24及び98)、AAV CLv-D4(US8734809の配列番号25及び99)、AAV CLv-D5(US8734809の配列番号26及び100)、AAV CLv-D6(US8734809の配列番号27及び101)、AAV CLv-D7(US8734809の配列番号28及び102)、AAV CLv-D8(US8734809の配列番号29及び103)、AAV CLv-E1(US8734809の配列番号13及び87)、AAV CLv-R1(US8734809の配列番号30及び104)、AAV CLv-R2(US8734809の配列番号31及び105)、AAV CLv-R3(US8734809の配列番号32及び106)、AAV CLv-R4(US8734809の配列番号33及び107)、AAV CLv-R5(US8734809の配列番号34及び108)、AAV CLv-R6(US8734809の配列番号35及び109)、AAV CLv-R7(US8734809の配列番号36及び110)、AAV CLv-R8(US8734809の配列番号X及びX)、AAV CLv-R9(US8734809の配列番号X及びX)、AAV CLg-F1(US8734809の配列番号39及び113)、AAV CLg-F2(US8734809の配列番号40及び114)、AAV CLg-F3(US8734809の配列番号41及び115)、AAV CLg-F4(US8734809の配列番号42及び116)、AAV CLg-F5(US8734809の配列番号43及び117)、AAV CLg-F6(US8734809の配列番号43及び117)、AAV CLg-F7(US8734809の配列番号44及び118)、AAV CLg-F8(US8734809の配列番号43及び117)、AAV CSp-1(US8734809の配列番号45及び119)、AAV CSp-10(US8734809の配列番号46及び120)、AAV CSp-11(US8734809の配列番号47及び121)、AAV CSp-2(US8734809の配列番号48及び122)、AAV CSp-3(US8734809の配列番号49及び123)、AAV CSp-4(US8734809の配列番号50及び124)、AAV CSp-6(US8734809の配列番号51及び125)、AAV CSp-7(US8734809の配列番号52及び126)、AAV CSp-8(US8734809の配列番号53及び127)、AAV CSp-9(US8734809の配列番号54及び128)、AAV CHt-2(US8734809の配列番号55及び129)、AAV CHt-3(US8734809の配列番号56及び130)、AAV CKd-1(US8734809の配列番号57及び131)、AAV CKd-10(US8734809の配列番号58及び132)、AAV CKd-2(US8734809の配列番号59及び133)、AAV CKd-3(US8734809の配列番号60及び134)、AAV CKd-4(US8734809の配列番号61及び135)、AAV CKd-6(US8734809の配列番号62及び136)、AAV CKd-7(US8734809の配列番号63及び137)、AAV CKd-8(US8734809の配列番号64及び138)、AAV CLv-1(US8734809の配列番号35及び139)、AAV CLv-12(US8734809の配列番号66及び140)、AAV CLv-13(US8734809の配列番号67及び141)、AAV CLv-2(US8734809の配列番号68及び142)、AAV CLv-3(US8734809の配列番号69及び143)、AAV CLv-4(US8734809の配列番号70及び144)、AAV CLv-6(US8734809の配列番号71及び145)、AAV CLv-8(US8734809の配列番号72及び146)、AAV CKd-B1(US8734809の配列番号73及び147)、AAV CKd-B2(US8734809の配列番号74及び148)、AAV CKd-B3(US8734809の配列番号75及び149)、AAV CKd-B4(US8734809の配列番号76及び150)、AAV CKd-B5(US8734809の配列番号77及び151)、AAV CKd-B6(US8734809の配列番号78及び152)、AAV CKd-B7(US8734809の配列番号79及び153)、AAV CKd-B8(US8734809の配列番号80及び154)、AAV CKd-H1(US8734809の配列番号81及び155)、AAV CKd-H2(US8734809の配列番号82及び156)、AAV CKd-H3(US8734809の配列番号83及び157)、AAV CKd-H4(US8734809の配列番号84及び158)、AAV CKd-H5(US8734809の配列番号85及び159)、AAV CKd-H6(US8734809の配列番号77及び151)、AAV CHt-1(US8734809の配列番号86及び160)、AAV CLv1-1(US8734809の配列番号171)、AAV CLv1-2(US8734809の配列番号172)、AAV CLv1-3(US8734809の配列番号173)、AAV CLv1-4(US8734809の配列番号174)、AAV Clv1-7(US8734809の配列番号175)、AAV Clv1-8(US8734809の配列番号176)、AAV Clv1-9(US8734809の配列番号177)、AAV Clv1-10(US8734809の配列番号178)、AAV.VR-355(US8734809の配列番号181)、AAV.hu.48R3(US8734809の配列番号183)、もしくはそれらのバリアントもしくは誘導体であるか、またはそれを有し得る。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる国際公開第WO2016065001号に記載された配列、例えば、限定されるものではないが、AAV CHt-P2(WO2016065001の配列番号1及び51)、AAV CHt-P5(WO2016065001の配列番号2及び52)、AAV CHt-P9(WO2016065001の配列番号3及び53)、AAV CBr-7.1(WO2016065001の配列番号4及び54)、AAV CBr-7.2(WO2016065001の配列番号5及び55)、AAV CBr-7.3(WO2016065001の配列番号6及び56)、AAV CBr-7.4(WO2016065001の配列番号7及び57)、AAV CBr-7.5(WO2016065001の配列番号8及び58)、AAV CBr-7.7(WO2016065001の配列番号9及び59)、AAV CBr-7.8(WO2016065001の配列番号10及び60)、AAV CBr-7.10(WO2016065001の配列番号11及び61)、AAV CKd-N3(WO2016065001の配列番号12及び62)、AAV CKd-N4(WO2016065001の配列番号13及び63)、AAV CKd-N9(WO2016065001の配列番号14及び64)、AAV CLv-L4(WO2016065001の配列番号15及び65)、AAV CLv-L5(WO2016065001の配列番号16及び66)、AAV CLv-L6(WO2016065001の配列番号17及び67)、AAV CLv-K1(WO2016065001の配列番号18及び68)、AAV CLv-K3(WO2016065001の配列番号19及び69)、AAV CLv-K6(WO2016065001の配列番号20及び70)、AAV CLv-M1(WO2016065001の配列番号21及び71)、AAV CLv-M11(WO2016065001の配列番号22及び72)、AAV CLv-M2(WO2016065001の配列番号23及び73)、AAV CLv-M5(WO2016065001の配列番号24及び74)、AAV CLv-M6(WO2016065001の配列番号25及び75)、AAV CLv-M7(WO2016065001の配列番号26及び76)、AAV CLv-M8(WO2016065001の配列番号27及び77)、AAV CLv-M9(WO2016065001の配列番号28及び78)、AAV CHt-P1(WO2016065001の配列番号29及び79)、AAV CHt-P6(WO2016065001の配列番号30及び80)、AAV CHt-P8(WO2016065001の配列番号31及び81)、AAV CHt-6.1(WO2016065001の配列番号32及び82)、AAV CHt-6.10(WO2016065001の配列番号33及び83)、AAV CHt-6.5(WO2016065001の配列番号34及び84)、AAV CHt-6.6(WO2016065001の配列番号35及び85)、AAV CHt-6.7(WO2016065001の配列番号36及び86)、AAV CHt-6.8(WO2016065001の配列番号37及び87)、AAV CSp-8.10(WO2016065001の配列番号38及び88)、AAV CSp-8.2(WO2016065001の配列番号39及び89)、AAV CSp-8.4(WO2016065001の配列番号40及び90)、AAV CSp-8.5(WO2016065001の配列番号41及び91)、AAV CSp-8.6(WO2016065001の配列番号42及び92)、AAV CSp-8.7(WO2016065001の配列番号43及び93)、AAV CSp-8.8(WO2016065001の配列番号44及び94)、AAV CSp-8.9(WO2016065001の配列番号45及び95)、AAV CBr-B7.3(WO2016065001の配列番号46及び96)、AAV CBr-B7.4(WO2016065001の配列番号47及び97)、AAV3B(WO2016065001の配列番号48及び98)、AAV4(WO2016065001の配列番号49及び99)、AAV5(WO2016065001の配列番号50及び100)、もしくはそれらのバリアントもしくは誘導体であるか、またはそれを有し得る。
いくつかの実施形態では、AAV粒子は、表9に見出されるもののいずれかから選択される血清型を含み得るか、またはその血清型であり得る。
いくつかの実施形態では、AAVカプシドは、表9の配列のいずれかの配列、そのフラグメントまたはバリアントを含み得る。
いくつかの実施形態では、AAVカプシドは、表9に記載の配列、そのフラグメントまたはバリアントによってコードされ得る。
本明細書で参照及び/または記載されるDNA及びRNA配列のいずれにおいても、一文字記号は次のように説明される:Aはアデニンであり、Cはシトシンであり、Gはグアニンであり、Tはチミンであり、Uはウラシルであり、Wはアデニンまたはチミンなどの弱塩基であり、Sはシトシン及びグアニンなどの強ヌクレオチドであり、Mはアデニン及びシトシンなどのアミノヌクレオチドであり、Kはグアニン及びチミンなどのケトヌクレオチドであり、Rはプリンのアデニン及びグアニンであり、Yはピリミジンのシトシン及びチミンであり、BはAではない任意の塩基(例えば、シトシン、グアニン、及びチミン)であり、DはCではない任意の塩基(例えば、アデニン、グアニン、及びチミン)であり、HはGではない任意の塩基(例えば、アデニン、シトシン、及びチミン)であり、VはTではない任意の塩基(例えば、アデニン、シトシン、及びグアニン)であり、Nは任意のヌクレオチド(ギャップではない)であり、Zはゼロである。
本明細書で参照及び/または記載されるアミノ酸配列のいずれにおいても、一文字記号は次のように説明される:G(Gly)はグリシンであり、A(Ala)はアラニンであり、L(Leu)はロイシンであり、M(Met)はメチオニンであり、F(Phe)はフェニルアラニンであり、W(Trp)はトリプトファンであり、K(Lys)はリシンであり、Q(Gln)はグルタミンであり、E(Glu)はグルタミン酸であり、S(Ser)はセリンであり、P(Pro)はプロリンであり、V(Val)はバリンであり、I(Ile)はイソロイシンであり、C(Cys)はシステインであり、Y(Tyr)はチロシンであり、H(His)はヒスチジンであり、R(Arg)はアルギニンであり、N(Asn)はアスパラギンであり、D(Asp)はアスパラギン酸であり、T(Thr)はスレオニンであり、B(Asx)はアスパラギン酸またはアスパラギンであり、J(Xle)はロイシンまたはイソロイシンであり、O(Pyl)はピロリシンであり、U(Sec)はセレノシステインであり、X(Xaa)は任意のアミノ酸であり、Z(Glx)はグルタミンまたはグルタミン酸である。
Figure 2023523401000043
Figure 2023523401000044
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、VOY101、またはそのバリアントである。いくつかの実施形態では、VOY101カプシドは、アミノ酸配列配列番号1023を含む。いくつかの実施形態では、VOY101アミノ酸配列は、配列番号1022を含むヌクレオチド配列によってコードされる。いくつかの実施形態では、VOY101カプシドは、配列番号1023に対して、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または99%超など、少なくとも70%同一のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、VOY101カプシドは、配列番号1022に対して、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または99%超など、少なくとも70%同一のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、VOY201、またはそのバリアントである。いくつかの実施形態では、VOY201カプシドは、アミノ酸配列配列番号1025を含む。いくつかの実施形態では、VOY201アミノ酸配列は、配列番号1024を含むヌクレオチド配列によってコードされる。いくつかの実施形態では、VOY201カプシドは、配列番号1025に対して、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または99%超など、少なくとも70%同一のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、VOY201カプシドは、配列番号1024に対して、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または99%超など、少なくとも70%同一のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、PHP.B、またはそのバリアントである。いくつかの実施形態では、PHP.Bカプシドは、アミノ酸配列配列番号1005を含む。いくつかの実施形態では、PHP.Bアミノ酸配列は、配列番号1004を含むヌクレオチド配列によってコードされる。いくつかの実施形態では、PHP.Bカプシドは、配列番号1005に対して、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または99%超など、少なくとも70%同一のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、PHP.Bカプシドは、配列番号1004に対して、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または99%超など、少なくとも70%同一のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、PHP.N、またはそのバリアントである。いくつかの実施形態では、PHP.Nカプシドは、アミノ酸配列配列番号1009を含む。いくつかの実施形態では、PHP.Nカプシドは、配列番号1009に対して、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または99%超など、少なくとも70%同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、AAV9、またはそのバリアントである。いくつかの実施形態では、AAV9カプシドは、アミノ酸配列配列番号1003を含む。いくつかの実施形態では、AAV9アミノ酸配列は、配列番号1002を含むヌクレオチド配列によってコードされる。いくつかの実施形態では、AAV9カプシドは、配列番号1003に対して、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または99%超など、少なくとも70%同一のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、AAV9カプシドは、配列番号1002に対して、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または99%超など、少なくとも70%同一のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、カプシドタンパク質は、TLAVPFK(配列番号1151)のアミノ酸配列を含むインサートを含む。いくつかの実施形態では、インサートは、配列番号1003に従って番号付けされた参照配列に対して、588位の直後に存在する。いくつかの実施形態では、カプシドタンパク質は、配列番号1003に従って番号付けされた、A587D及びQ588Gのアミノ酸置換を含む。
いくつかの実施形態では、カプシドタンパク質は、配列番号1003に従って番号付けされたK449Rのアミノ酸置換、及び、TLAVPFK(配列番号1151)のアミノ酸配列を含むインサートであって、配列番号1003に従って番号付けされた参照配列に対して、588位の直後に存在するインサートを含む。
いくつかの実施形態では、カプシドタンパク質は、配列番号1003に従って番号付けされたK449Rのアミノ酸置換、TLAVPFK(配列番号1151)のアミノ酸配列を含むインサートであって、配列番号1003に従って番号付けされた参照配列に対して、588位の直後に存在するインサート、ならびに配列番号1003に従って番号付けされたA587D及びQ588Gのアミノ酸置換を含む。
いくつかの実施形態では、カプシドタンパク質は、TLAVPFK(配列番号1151)のアミノ酸配列を含むインサートであって、配列番号1003に従って番号付けされた参照配列に対して、588位の直後に存在するインサート、ならびに配列番号1003に従って番号付けされたA587D及びQ588Gのアミノ酸置換を含む。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、AAV9 K449R、またはそのバリアントである。いくつかの実施形態では、AAV9 K449Rカプシドは、アミノ酸配列配列番号1011を含む。いくつかの実施形態では、AAV9 K449Rカプシドは、配列番号1011に対して、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または99%超など、少なくとも70%同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、AAVカプシドは、静脈内投与後に血液脳関門の透過を可能にする。このようなAAVカプシドの非限定的な例としては、AAVPHP.N(PHP.N)、AAVPHP.B(PHP.B)、PHP.S、G2A3、G2B4、G2B5、G2A12、G2A15、PHP.B2、PHP.B3、またはAAVPHP.A(PHP.A)などだがこれらに限定されないペプチドインサートを含む、AAV9、AAV9 K449R、VOY101、VOY201、またはAAVカプシドが挙げられる。
いくつかの実施形態では、AAVカプシドは、筋肉内投与及び/または筋線維の形質導入に好適である。このようなAAVカプシドの非限定的な例としては、AAV2、AAV3、AAV8、ならびにAAV2バリアント、AAV2/3バリアント、AAV8バリアント、及び/またはAAV2/3/8バリアントなどだがこれらに限定されないそれらのバリアントが挙げられる。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、AAV2バリアントである。非限定的な例として、AAV血清型は、配列番号1026またはそのフラグメントもしくはバリアントを含むAAV2バリアントである。非限定的な例として、AAV血清型は、配列番号1026に対して、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または99%超など、少なくとも70%同一である。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、AAV2/3バリアントである。非限定的な例として、AAV血清型は、配列番号1027またはそのフラグメントもしくはバリアントを含むAAV2/3バリアントである。非限定的な例として、AAV血清型は、配列番号1027に対して、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または99%超など、少なくとも70%同一のAAV2/3バリアントである。非限定的な例として、AAV血清型は、配列番号1028またはそのフラグメントもしくはバリアントを含むAAV2/3バリアントである。非限定的な例として、AAV血清型は、配列番号1028に対して、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または99%超など、少なくとも70%同一のAAV2/3バリアントである。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、本明細書に記載されるもののいずれかに対して50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性をもつカプシドアミノ酸配列を含み得る。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、本明細書に記載されるもののいずれかに対して50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性をもつカプシド核酸配列によってコードされ得る。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、中枢神経系の細胞に対する向性という理由から、使用のために選択される。いくつかの実施形態では、中枢神経系の細胞はニューロンである。別の実施形態では、中枢神経系の細胞はアストロサイトである。
いくつかの実施形態では、AAV血清型は、筋肉(複数可)の細胞に対する向性という理由から、使用のために選択される。
いくつかの実施形態では、AAV VP1カプシドタンパク質の翻訳のための開始コドンは、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許第US8163543号に記載されているように、CTG、TTG、またはGTGであり得る。
本開示は、カプシド(Cap)遺伝子によってコードされる構造カプシドタンパク質(VP1、VP2、及びVP3を含む)に言及する。これらのカプシドタンパク質は、AAVなどのウイルスベクターのタンパク質構造の外殻(すなわちカプシド)を形成する。Capポリヌクレオチドから合成されるVPカプシドタンパク質は、概して、ペプチド配列内の最初のアミノ酸としてメチオニン(Met1)を含み、これは、対応するCapヌクレオチド配列における開始コドン(AUGまたはATG)と会合している。しかし、最初のメチオニン(Met1)残基または一般に任意の最初のアミノ酸(AA1)は、Met-アミノペプチダーゼなどのタンパク質プロセシング酵素によってポリペプチド合成の後またはその間に切断されるのが一般的である。この「Met/AAクリッピング」プロセスは、多くの場合、ポリペプチド配列内の第2のアミノ酸(例えば、アラニン、バリン、セリン、スレオニンなど)の対応するアセチル化と相関する。Metクリッピングは、VP1及びVP3カプシドタンパク質で発生するのが一般的だが、VP2カプシドタンパク質で発生することもある。
Met/AAクリッピングが不完全な場合、ウイルスカプシドを構成する1または複数(1、2、または3つ)のVPカプシドタンパク質の混合物が産生されることがあり、そのうちのいくつかはMet1/AA1アミノ酸を含むことがあり(Met+/AA+)、そのうちのいくつかはMet/AAクリッピングの結果としてMet1/AA1アミノ酸を欠いていることがある(Met-/AA-)。カプシドタンパク質におけるMet/AAクリッピングに関するさらなる記述については、Jin,et al.Direct Liquid Chromatography/Mass Spectrometry Analysis for Complete Characterization of Recombinant Adeno-Associated Virus Capsid Proteins.Hum Gene Ther Methods.2017 Oct.28(5):255-267、Hwang,et al.N-Terminal Acetylation of Cellular Proteins Creates Specific Degradation Signals.Science.2010 February 19.327(5968):973-977を参照されたい。各文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
本開示によれば、カプシドタンパク質への言及は、クリップされたもの(Met-/AA-)またはクリップされていないもの(Met+/AA+)のいずれかに限定されるものではなく、文脈上、独立したカプシドタンパク質、カプシドタンパク質の混合物から成るウイルスカプシド、及び/または本開示のカプシドタンパク質をコードする、表す、産生する、もしくはもたらすポリヌクレオチド配列(またはそのフラグメント)を指し得る。「カプシドタンパク質」または「カプシドポリペプチド」(VP1、VP2、またはVP2など)への直接的な言及には、Met1/AA1アミノ酸を含む(Met+/AA+)VPカプシドタンパク質、ならびにMet/AAクリッピングの結果としてMet1/AA1アミノ酸を欠いている(Met-/AA-)対応するVPカプシドタンパク質も含まれ得る。
さらに本開示によれば、配列を確認すれば、最初に記載されたアミノ酸(Met1/AA1か否かにかかわらない)を欠いているだけの配列は容易に明らかであるため、Met1/AA1アミノ酸を含む(Met+/AA+)1または複数のカプシドタンパク質をそれぞれ含むまたはコードする特定の配列番号(タンパク質または核酸のいずれか)への言及は、Met1/AA1アミノ酸を欠いているVPカプシドタンパク質を教示するものと理解されるべきである。
非限定的な例として、736アミノ酸長であり、AUG/ATG開始コドンによってコードされる「Met1」アミノ酸を含む(Met+)VP1ポリペプチド配列への言及は、735アミノ酸長であり、736アミノ酸Met+配列の「Met1」アミノ酸を含まない(Met-)VP1ポリペプチド配列を教示するものと理解されてもよい。第2の非限定的な例として、736アミノ酸長であり、任意のNNN開始コドンによってコードされる「AA1」アミノ酸を含む(AA1+)VP1ポリペプチド配列への言及は、735アミノ酸長であり、736アミノ酸AA1+配列の「AA1」アミノ酸を含まない(AA1-)VP1ポリペプチド配列を教示するものと理解されてもよい。
VPカプシドタンパク質から形成されたウイルスカプシドへの言及(例えば特定のAAVカプシド血清型への言及)には、Met1/AA1アミノ酸を含む(Met+/AA1+)VPカプシドタンパク質、Met/AA1クリッピングの結果としてMet1/AA1アミノ酸を欠いている(Met-/AA1-)対応するVPカプシドタンパク質、及びそれらの組み合わせ(Met+/AA1+及びMet-/AA1-)が組み込まれ得る。
非限定的な例として、AAVカプシド血清型は、VP1(Met+/AA1+)、VP1(Met-/AA1-)、またはVP1(Met+/AA1+)とVP1(Met-/AA1-)との組み合わせを含むことができる。AAVカプシド血清型は、VP3(Met+/AA1+)、VP3(Met-/AA1-)、またはVP3(Met+/AA1+)とVP3(Met-/AA1-)との組み合わせを含むこともでき、VP2(Met+/AA1)とVP2(Met-/AA1-)との同様の任意選択の組み合わせを含むこともできる。
抗タウ抗体ペイロードを含むAAV粒子
本明細書に記載されるAAV粒子は、抗体ペイロード(例えば、抗タウ抗体)を標的組織(例えば、CNS)に送達するために使用され得る。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体ポリペプチドをコードするウイルスゲノムは、ウイルス粒子、例えば、AAV粒子にパッケージングされ得る。1または複数の抗タウ抗体ポリヌクレオチドを含むウイルス粒子が形質導入された標的細胞は、コードされた単数または複数の抗体を単一細胞において発現し得る。
いくつかの実施形態では、少なくとも1つの抗体重鎖及び/または軽鎖をコードする核酸配列を含む抗タウ抗体ポリヌクレオチド配列を含むAAV粒子が哺乳動物細胞に導入され得る。
本明細書に記載される抗タウ抗体ポリペプチドをコードするAAVウイルスゲノムは、ヒト疾患、ウイルス、感染症獣医学的用途ならびに種々のin vivo及びin vitro設定の分野で有用であり得る。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体ポリペプチドをコードするAAVウイルスゲノムは、タウオパチーの防止及び/または処置のために使用される。
本明細書に記載されるAAV粒子のウイルスゲノムは、ペイロードをコードする核酸配列と、少なくとも1つのITRとを含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、2つのITR配列を、5’及び3’の各末端に1つずつ含む。さらに、本明細書に記載されるAAV粒子のウイルスゲノムは、発現増強のために、調節エレメント(例えば、プロモーター)、非翻訳領域(UTR)、ポリアデニル化配列(polyA)、フィラー配列、イントロン、及び/またはリンカー配列などだがこれらに限定されない、更なる構成要素の核酸配列を含み得る。これらのウイルスゲノム構成要素は、標的組織における所与のペイロードの発現の特異性及び効率をさらに適合させるように選択及び/または工学操作することができる。
本開示のAAV粒子のウイルスゲノムは、表9に列挙されるまたは本明細書に記載されるカプシドのいずれかに封入された、表10~18に記載される配列領域の任意の組み合わせを含み得る。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、表10~18に記載される少なくとも1つの配列領域を含み得る。この領域は、本明細書に記載される他の配列領域のいずれかの前または後に位置し得る。ウイルスゲノムは、表10~18に記載される1または複数の配列領域の複数コピーをさらに含み得る。
ウイルスゲノム構成要素:逆方向末端反復(ITR)
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、少なくとも1つの逆方向末端反復(ITR)領域を含み得る。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのITR領域と、ペイロード、例えば、抗体分子(例えば、抗タウ抗体分子)をコードする核酸とを含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、2つのITRを含む。いくつかの実施形態では、2つのITRは、導入遺伝子をコードする核酸に5’末端及び3’末端でフランキングする。いくつかの実施形態では、ITRは、複製のための認識部位を含む複製起点として機能する。いくつかの実施形態では、ITRは、相補的かつ対称的に配置され得る配列領域を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムに組み込まれたITRは、天然起源の核酸配列または組換え由来の核酸配列から成り得る。
いくつかの実施形態では、ITRは、カプシド、例えば、表9に列挙されたAAV血清型のいずれかから選択されるカプシドタンパク質、またはその機能的バリアントと同じAAV血清型のものであり得る。いくつかの実施形態では、ITRは、カプシドタンパク質とは異なるAAV血清型のものであり得る。いくつかの実施形態では、AAV粒子は、2つのITRを含むウイルスゲノムを含み、ウイルスゲノムの2つのITRは、同じAAV血清型のものである。他の実施形態では、ウイルスゲノムの2つのITRは、異なるAAV血清型のものである。いくつかの実施形態では、AAV粒子のウイルスゲノムの両方のITRが、AAV2 ITRまたはその機能的バリアントである。
ITR領域(複数可)は、独立して、約100~約150ヌクレオチド長などだがこれに限定されない長さを有し得る。ITRは、約100~180ヌクレオチド長、例えば、約100~115、約100~120、約100~130、約100~140、約100~150、約100~160、約100~170、約100~180、約110~120、約110~130、約110~140、約110~150、約110~160、約110~170、約110~180、約120~130、約120~140、約120~150、約120~160、約120~170、約120~180、約130~140、約130~150、約130~160、約130~170、約130~180、約140~150、約140~160、約140~170、約140~180、約150~160、約150~170、約150~180、約160~170、約160~180、または約170~180ヌクレオチド長であり得る。いくつかの実施形態では、ITRは、約120~140ヌクレオチド長、例えば、約130ヌクレオチド長を含む。いくつかの実施形態では、ITRは、約140~150ヌクレオチド長、約141ヌクレオチド長を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、表10に提示された配列のいずれかのヌクレオチド配列もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含むITR領域を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、表10に提示された配列のいずれかのヌクレオチド配列もしくはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含む2つのITR領域を含み、第1及び第2のITRは同じ配列を含むか、または第1及び第2のITRは異なる配列を含む。
非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約141ヌクレオチド長である5’ITRを含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約130ヌクレオチド長である5’ITRを含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約141ヌクレオチド長である3’ITRを含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約130ヌクレオチド長である3’ITRを含む。いくつかの実施形態では、AAV粒子は2つのITRを含み、一方のITRは141ヌクレオチド長であり、他方のITRは130ヌクレオチド長である。
いくつかの実施形態では、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’逆方向末端反復(5’ITR)配列領域を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、3’逆方向末端反復(3’ITR)配列領域を含む。5’ITR及び3’ITR配列領域の非限定的な例を表10に記載する。
Figure 2023523401000045
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、表10に提示されたITRを含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、ITR1~ITR4またはそれらの機能的バリアントのいずれか1つから選択されるITRを含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、ITR1を含むITRを有し得る。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、ITR2を含むITRを有し得る。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、ITR3を含むITRを有し得る。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、ITR4を含むITRを有し得る。
いくつかの実施形態では、ITRは、配列番号1035~1038のいずれか1つのヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつ配列を含む。いくつかの実施形態では、ITRは、配列番号1035のヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、ITRは、配列番号1036のヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、ITRは、配列番号1037のヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、ITRは、配列番号1038のヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、2つのITRを有し得る。非限定的な例として、2つのITRは、ITR1及びITR3である。非限定的な例として、2つのITRは、ITR1及びITR4である。非限定的な例として、2つのITRは、ITR2及びITR3である。非限定的な例として、2つのITRは、ITR2及びITR4である。
ウイルスゲノム構成要素:プロモーター
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、導入遺伝子標的特異性及び/または発現を増強するエレメントを含み得る(例えば、Powell et al.Viral Expression Cassette Elements to Enhance Transgene Target Specificity and Expression in Gene Therapy,2015を参照のこと;同文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。いくつかの実施形態では、AAV粒子ウイルスゲノムは、導入遺伝子標的特異性及び/または発現を増強するエレメントを含み得、プロモーター、CMVエンハンサーなどのエンハンサー、またはそれらの両方を含み得る。いくつかの実施形態では、AAV粒子ウイルスゲノムは、ペイロード、例えば、抗体分子(例えば、抗タウ抗体分子)をコードする核酸分子によってコードされる導入遺伝子に作動可能に連結されたプロモーターを含む。いくつかの実施形態では、AAV粒子ウイルスゲノムは、CMVエンハンサーなどのエンハンサーを含む。いくつかの実施形態では、AAV粒子ウイルスゲノムは、少なくとも2つのプロモーターを含む。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、種特異的、誘導性、組織特異的、及び/または細胞周期特異的である(例えば、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれるParr et al.,Nat.Med.3:1145-9(1997)に記載されているような)プロモーターを含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、例えば、標的細胞における、導入遺伝子によってコードされるペイロード(例えば、抗体分子、例えば、抗タウ抗体)の発現に十分なプロモーターを含む。
いくつかの実施形態では、プロモーターは、細胞、組織、及び/または器官において十分な期間にわたる、ペイロード、例えば、抗体分子(例えば、抗タウ抗体)の発現をもたらす。いくつかの実施形態では、プロモーターは、少なくとも1時間~24時間、例えば、1~5時間、1~10時間、1~15時間、1~20時間、2~5時間、2~10時間、2~15時間、2~20時間、または2~24時間、3~5時間、3~15時間、3~20時間、3~24時間、4~5時間、4~15時間、4~20時間、4~24時間、5~15時間、5~20時間、5~23時間、6~15時間、6~20時間6~24時間、7~15時間、7~20時間、7~24時間、8~10時間、8~15時間、8~20時間、8~24時間、9~10時間、9~15時間、9~20時間、9~24時間、10~15時間、10~20時間、10~23時間、11~15時間、11~20時間11~24時間、12~15時間、12~20時間、12~24時間、13~15時間、13~20時間、13~24時間、14~15時間、14~20時間、14~23時間、15~20時間、15~24時間、16~20時間、16~24時間、17~20時間、17~24時間、18~20時間、18~24時間、19~20時間、19~24時間、20~24時間、21~24時間、22~24時間、または23~24時間、例えば、1時間、5時間、10時間、12時間、14時間、18時間、20時間、または24時間にわたるペイロードの発現をもたらす。いくつかの実施形態では、プロモーターは、少なくとも1~7日間、例えば、1~6日間、1~5日間、1~4日間、1~3日間、1~2日間、2~7日間、2~6日間、2~5日間、2~4日間、2~3日間、3~7日間、3~6日間、3~5日間、3~4日間、4~7日間、4~6日間、4~5日間、5~7日間、5~6日間、または6~7日間、例えば、1日間、5日間、または7日間にわたるペイロードの発現をもたらす。いくつかの実施形態では、プロモーターは、1週間~4週間、例えば、1~3週間、1~2週間、2~4週間、2~3週間、または3~4週間にわたるペイロードの発現をもたらす。いくつかの実施形態では、プロモーターは、少なくとも1~12ヶ月間、少なくとも10~24ヶ月間、または少なくとも1~10年間、例えば、少なくとも1年間、少なくとも5年間、少なくとも10年間、または10年超にわたるペイロードの発現をもたらす。
いくつかの実施形態では、プロモーターは、天然起源のプロモーターでも非天然起源のプロモーターでもよい。いくつかの実施形態では、プロモーターは、天然に発現されるタンパク質に由来する。いくつかの実施形態では、プロモーターは、工学操作されたプロモーターである。いくつかの実施形態では、プロモーターは、ウイルスプロモーター、植物プロモーター、及び/または哺乳動物プロモーターを含む。いくつかの実施形態では、プロモーターはヒトプロモーターでもよい。いくつかの実施形態では、プロモーターはトランケート型でもよい。いくつかの実施形態では、プロモーターは細胞特異的プロモーターではない。
いくつかの実施形態では、プロモーター、例えば、ユビキタスプロモーターは、1つ以上の、例えば、複数の細胞及び/または組織における発現をもたらす。いくつかの実施形態では、1または複数の組織における発現をもたらすプロモーターは、ヒト伸長因子1α-サブユニット(EF1α)プロモーター、サイトメガロウイルス(CMV)前初期エンハンサー及び/もしくはプロモーター、ニワトリβ-アクチン(CBA)プロモーター及びその誘導体CAG、βグルクロニダーゼ(GUSB)プロモーター、またはユビキチンC(UBC)プロモーターを含むが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、組織特異的発現エレメントを使用して、ある特定の細胞型に発現を制限することができ、これは例えば、筋肉特異的プロモーター、B細胞プロモーター、単球プロモーター、白血球プロモーター、マクロファージプロモーター、膵腺房細胞プロモーター、内皮細胞プロモーター、肺組織プロモーター、アストロサイトプロモーター、または発現をニューロン、アストロサイト、もしくは希突起神経膠細胞に制限するために使用され得る神経系プロモーターなどだが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、プロモーターは、Yu et al.(Molecular Pain 2011,7:63)、Soderblom et al.(E.Neuro 2015)、Gill et al.,(Gene Therapy 2001,Vol.8,1539-1546)、及びHusain et al.(Gene Therapy 2009)に記載されているユビキタスプロモーターであり、各文献は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、プロモーターは、CMV、CBA(誘導体CAG、CB6、CBhなどを含む)、EF-1α、PGK、UBC、GUSB(hGBp)、またはUCOE(HNRPA2B1-CBX3のプロモーター)から選択されるユビキタスプロモーターである。
いくつかの実施形態では、プロモーターは、筋肉特異的プロモーター、例えば、筋細胞における発現をもたらすプロモーターである。いくつかの実施形態では、筋肉特異的プロモーターは、哺乳動物筋肉クレアチンキナーゼ(MCK)プロモーター、哺乳動物デスミン(DES)プロモーター、哺乳動物トロポニンI(TNNI2)プロモーター、合成C5-12プロモーター、及び哺乳動物骨格アルファ-アクチン(ASKA)プロモーターを含むが、これらに限定されない(例えば、米国特許公開第US20110212529号を参照のこと。同文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。
いくつかの実施形態では、プロモーターは、神経系特異的プロモーター、例えば、ニューロン、アストロサイト、及び/または希突起神経膠細胞におけるペイロードの発現をもたらすプロモーターである。いくつかの実施形態では、ニューロンにおける発現をもたらす神経系特異的プロモーターは、ニューロン特異的エノラーゼ(NSE)プロモーター、血小板由来成長因子(PDGF)プロモーター、血小板由来成長因子B鎖(PDGF-β)プロモーター、シナプシン(Syn)プロモーター、メチルCpG結合タンパク質2(MeCP2)プロモーター、Ca2+/カルモジュリン依存性タンパク質キナーゼII(CaMKII)プロモーター、代謝調節型グルタミン酸受容体2(mGluR2)プロモーター、神経フィラメント軽鎖(NFL)または神経フィラメント重鎖(NFH)プロモーター、β-グロビンミニ遺伝子nβ2プロモーター、プレプロエンケファリン(PPE)プロモーター、エンケファリン(Enk)プロモーター、及び興奮性アミノ酸輸送体2(EAAT2)プロモーターを含むが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、アストロサイトにおける発現をもたらす神経系特異的プロモーターは、グリア線維酸性タンパク質(GFAP)プロモーター及びEAAT2プロモーターを含むが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、希突起神経膠細胞における発現をもたらす神経系特異的プロモーターは、ミエリン塩基性タンパク質(MBP)プロモーターを含むが、これに限定されない。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、Husain et al.(Gene Therapy 2009)、Passini and Wolfe(J.Virol.2001,12382-12392)、Xu et al.(Gene Therapy 2001,8,1323-1332)、Drews et al.(Mamm Genome(2007)18:723-731)、及びRaymond et al.(Journal of Biological Chemistry(2004)279(44)46234-46241)に記載されているような神経系特異的プロモーターを含み、各文献は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、プロモーターは、肝臓プロモーター、例えば肝細胞における発現をもたらすプロモーターである。いくつかの実施形態では、肝臓プロモーターは、ヒトα-1-アンチトリプシン(hAAT)またはチロキシン結合グロブリン(TBG)から選択される。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、RNA pol IIIプロモーターを含む。いくつかの実施形態では、RNA pol IIIプロモーターは、U6またはH1から選択される。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、2つのプロモーターを含む。非限定的な例として、プロモーターは、EF1αプロモーター及びCMVプロモーターである。
いくつかの実施形態では、プロモーターは、ユビキチンc(UBC)プロモーターである。UBCプロモーターは、300~350ヌクレオチドのサイズを有し得る。非限定的な例として、UBCプロモーターは、332ヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、プロモーターは、β-グルクロニダーゼ(GUSB)プロモーターである。GUSBプロモーターは、350~400ヌクレオチドのサイズを有し得る。非限定的な例として、GUSBプロモーターは、378ヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、プロモーターは、神経フィラメント軽鎖(NFL)プロモーターである。NFLプロモーターは、600~700ヌクレオチドのサイズを有し得る。非限定的な例として、NFLプロモーターは、650ヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、プロモーターは、神経フィラメント重鎖(NFH)プロモーターである。NFHプロモーターは、900~950ヌクレオチドのサイズを有し得る。非限定的な例として、NFHプロモーターは、920ヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、プロモーターは、scn8aプロモーターである。scn8aプロモーターは、450~500ヌクレオチドのサイズを有し得る。非限定的な例として、scn8aプロモーターは、470ヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、プロモーターは、ホスホグリセリン酸キナーゼ1(PGK)プロモーターである。
いくつかの実施形態では、プロモーターは、CAGプロモーター、CBAプロモーター(例えば、最小CBAプロモーター)、CBプロモーター、CMV(IE)プロモーター及び/またはエンハンサー、GFAPプロモーター、シナプシンプロモーター、またはそれらの機能的バリアントから選択される。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、エンハンサーエレメント、プロモーター及び/または5’UTRイントロンを含む。本明細書では「エンハンサー」とも呼ばれるエンハンサーエレメントは、CMVエンハンサーであり得るが、これに限定されず、プロモーターは、CMV、CBA、UBC、GUSB、NSE、シナプシン、MeCP2、及びGFAPプロモーターであり得るが、これらに限定されず、5’UTR/イントロンは、SV40及びCBA-MVMであり得るが、これらに限定されない。非限定的な例として、組み合わせて使用されるエンハンサー、プロモーター及び/またはイントロンは、(1)CMVエンハンサー、CMVプロモーター、SV40 5’UTRイントロン;(2)CMVエンハンサー、CBAプロモーター、SV40 5’UTRイントロン;(3)CMVエンハンサー、CBAプロモーター、CBA-MVM 5’UTRイントロン;(4)UBCプロモーター;(5)GUSBプロモーター;(6)NSEプロモーター;(7)シナプシンプロモーター;(8)MeCP2プロモーター;及び(9)GFAPプロモーターであり得る。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、約100~2000ヌクレオチドの長さを有するプロモーターを含む。いくつかの実施形態では、プロモーターは、約100~700ヌクレオチド、例えば、約100~600ヌクレオチド、100~500ヌクレオチド、100~400ヌクレオチド、100~300ヌクレオチド、100~200ヌクレオチド、200~700ヌクレオチド、200~600ヌクレオチド、200~500ヌクレオチド、200~400ヌクレオチド、200~300ヌクレオチド、300~700ヌクレオチド、300~600ヌクレオチド、300~500ヌクレオチド、300~400ヌクレオチド、400~700ヌクレオチド、400~600ヌクレオチド、400~500ヌクレオチド、500~700ヌクレオチド、500~600ヌクレオチド、または600~700ヌクレオチドの長さを有する。いくつかの実施形態では、プロモーターは、約900~2000ヌクレオチド、例えば、約900~1000ヌクレオチド、9000~1500ヌクレオチド、1000~1500ヌクレオチド、1000~2000ヌクレオチド、または1500~2000ヌクレオチドの長さを有する。いくつかの実施形態では、プロモーターは、約1500~約1800ヌクレオチド、例えば、約1715ヌクレオチドの長さを有する。いくつかの実施形態では、プロモーターは、約500~約750ヌクレオチド、例えば、約557ヌクレオチドまたは約699ヌクレオチドの長さを有する。いくつかの実施形態では、プロモーターは、約200~約450ヌクレオチド、例えば、約260ヌクレオチド、約283ヌクレオチド、約299ヌクレオチド、約380ヌクレオチド、または約399ヌクレオチドの長さを有する。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、表11に提示されたプロモーターを含む。いくつかの実施形態では、プロモーターは、プロモーター1~プロモーター12、またはそれらの機能的バリアントのいずれか1つから選択される。
Figure 2023523401000046
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、表11に提示されたプロモーターを含む。いくつかの実施形態では、プロモーターは、プロモーター1~プロモーター12、またはそれらの機能的バリアントのいずれか1つから選択される。いくつかの実施形態では、プロモーターは、配列番号1039~1050のいずれか1つのヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつ配列を含む。いくつかの実施形態では、プロモーターは、配列番号1039のヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつ配列を含む。いくつかの実施形態では、プロモーターは、配列番号1040のヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつ配列を含む。いくつかの実施形態では、プロモーターは、配列番号1041のヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつ配列を含む。いくつかの実施形態では、プロモーターは、配列番号1042のヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつ配列を含む。いくつかの実施形態では、プロモーターは、配列番号1043のヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつ配列を含む。いくつかの実施形態では、プロモーターは、配列番号1044のヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつ配列を含む。いくつかの実施形態では、プロモーターは、配列番号1050のヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつ配列を含む。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、1つのプロモーター配列領域を含む。いくつかの実施形態では、プロモーター配列領域はプロモーター1である。いくつかの実施形態では、プロモーター配列領域はプロモーター2である。いくつかの実施形態では、プロモーター配列領域はプロモーター3である。いくつかの実施形態では、プロモーター配列領域はプロモーター4である。いくつかの実施形態では、プロモーター配列領域はプロモーター5である。いくつかの実施形態では、プロモーター配列領域はプロモーター6である。いくつかの実施形態では、プロモーター配列領域はプロモーター7である。いくつかの実施形態では、プロモーター配列領域はプロモーター8である。いくつかの実施形態では、プロモーター配列領域はプロモーター9である。いくつかの実施形態では、プロモーター配列領域はプロモーター10である。いくつかの実施形態では、プロモーター配列領域はプロモーター11である。いくつかの実施形態では、プロモーター配列領域はプロモーター12である。
いくつかの実施形態では、プロモーター配列領域は、少なくとも1つのプロモーターサブ領域をさらに含む。非限定的な例として、プロモーター配列はプロモーター1であり、プロモーター2及びプロモーター3のサブ領域をさらに含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、少なくとも2つ以上のプロモーターを含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、プロモーター12及びプロモーター4を含む。
いくつかの実施形態では、CAGプロモーターは、配列番号1039のヌクレオチド配列またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、CBAプロモーター(例えば、最小CBAプロモーター)は、配列番号1041のヌクレオチド配列またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、CBプロモーターは、配列番号1042のヌクレオチド配列またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、GFAPプロモーターは、配列番号1044のヌクレオチド配列またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、シナプシンプロモーターは、配列番号1045のヌクレオチド配列またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、CMV(IE)プロモーターは、配列番号1050のヌクレオチド配列またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、CMV(ie)エンハンサーは、配列番号1040のヌクレオチド配列またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、複数のプロモーター配列領域を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、2つのプロモーター配列領域を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、3つのプロモーター配列領域を含む。
ウイルスゲノム構成要素:非翻訳領域(UTR)
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、非翻訳領域(UTR)を含む。いくつかの実施形態では、遺伝子の野生型UTRは、転写されるが翻訳されない。いくつかの実施形態では、5’UTRは転写開始部位で始まって開始コドンで終わり、3’UTRは停止コドンの直後に始まって転写終結シグナルまで続く。
いくつかの実施形態では、UTRは、安定性及びタンパク質産生を増強する、特定の標的器官の豊富に発現された遺伝子に見出される特性を含む。非限定的な例として、肝臓で通常発現されるmRNA(例えば、アルブミン、血清アミロイドA、アポリポタンパク質A/B/E、トランスフェリン、アルファフェトプロテイン、エリスロポエチン、または第VIII因子)の5’UTRを、本明細書に記載されるAAV粒子のウイルスゲノムに使用して、肝細胞株または肝臓における発現を増強することができる。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、5’UTR、例えば、野生型(例えば、天然起源の)5’UTRまたは組換え(例えば、非天然起源の)5’UTRを含む。いくつかの実施形態では、5’UTRは、翻訳開始に関与する特性を含む。いくつかの実施形態では、UTR、例えば、5’UTRは、Kozak配列を含む。いくつかの実施形態では、Kozak配列は、リボソームが多くの遺伝子の翻訳を開始するプロセスに関与する。いくつかの実施形態では、Kozak配列は、CCR(A/G)CCAUGGのコンセンサス配列を有し、ここで、Rは、開始コドン(ATG)の3塩基上流のプリン(アデニンまたはグアニン)であり、その後に別の「G」が続く。いくつかの実施形態では、Kozak配列は、GAGGAGCCACC(配列番号1089)のヌクレオチド配列またはそれに対して少なくとも95~99%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、Kozak配列は、GCCGCCACCATG(配列番号1079)のヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも95~99%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、Kozak配列を含む5’UTRを含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、Kozak配列を含まない5’UTRを含む。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、3’UTR、例えば、野生型(例えば、天然起源の)3’UTRまたは組換え(例えば、非天然起源の)3’UTRを含む。いくつかの実施形態では、3’UTRは、核酸の安定性を調整する、例えば、増加または減少させるエレメントを含む。いくつかの実施形態では、3’UTRは、中に埋め込まれたアデノシン及びウリジンの区間、例えば、AUリッチシグネチャーを含む。これらのAUリッチシグネチャーは、一般に、ターンオーバー率の高い遺伝子に広く見られ、例えば、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれるChen et al,1995に記載されている。いくつかの実施形態では、ARリッチシグネチャーは、AUリッチエレメント(ARE)を含む。いくつかの実施形態では、3’UTRは、クラスI ARE(例えば、c-Myc及びMyoD)、クラスII ARE(例えば、GM-CSF及びTNF-a)、クラスIII ARE(例えば、c-Jun及びミオゲニン)、またはそれらに対する組み合わせから選択されるAREを含む。いくつかの実施形態では、クラスI AREは、Uリッチ領域内のAUUUAモチーフの幾つかの分散したコピーを含む。いくつかの実施形態では、クラスII AREは、2つ以上の重複するUUAUUUA(U/A)(U/A)ノナマーを含む。いくつかの実施形態では、クラスIII AREは、Uリッチ領域を含む、及び/またはAUUUAモチーフを含まない。いくつかの実施形態では、AREは、メッセンジャーを不安定化する。
いくつかの実施形態では、3’UTRは、ELAVファミリーのタンパク質メンバーのための結合部位を含む。いくつかの実施形態では、3’UTRは、HuRタンパク質のための結合部位を含む。いくつかの実施形態では、HuRタンパク質は、クラスI~IIIのいずれか1つのAREに結合する、及び/またはmRNAの安定性を増加させる。理論に束縛されることを望むものではないが、いくつかの実施形態では、HuR特異的結合部位を含む3’UTRがHuR結合及びin vivoでのメッセージの安定化につながると考えられる。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムの3’UTRは、poly-Aテールの鋳型付加のためのオリゴ(dT)配列を含む。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、miRNAシード、結合部位、及び/または完全な配列を含む。一般に、マイクロRNA(またはmiRNAもしくはmiR)は、核酸標的の部位に結合し、核酸分子安定性を低減することまたは翻訳を阻害することのいずれかによって遺伝子発現を下方調節する、19~25ヌクレオチドの非コードRNAである。いくつかの実施形態では、マイクロRNA配列は、シード領域、例えば、成熟マイクロRNAの2~8位の領域内の配列を含み、この配列は、核酸のmiRNA標的配列に対して完全なワトソン-クリック相補性を有する。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのmiRNA結合部位、配列、またはシード領域を含む、変化させる、または除去するように工学操作され得る。
いくつかの実施形態では、当技術分野で公知の任意の遺伝子由来のUTRが、本明細書に記載されるAAV粒子ウイルスゲノムに組み込まれ得る。これらのUTRまたはその一部は、それらが選択された遺伝子におけるものと同じ向きに配置されてもよく、または向きもしくは位置が変更されてもよい。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムにおいて使用されるUTRは、反転されたり、短縮されたり、延長されたり、当技術分野で公知の1または複数の他の5’UTRまたは3’UTRと共に作製されたりしてもよい。いくつかの実施形態では、変更されたUTRは、参照配列との関連で何らかのかたちで変化しているUTRを含む。例えば、3’または5’UTRは、上記で教示したように向きもしくは位置の変化によって野生型もしくは天然のUTRに対して変更されてもよく、または更なるヌクレオチドの包含、ヌクレオチドの欠失、ヌクレオチドのスワッピングもしくは転位によって変更されてもよい。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、人工UTR、例えば、天然起源のUTRなどの野生型のバリアントではないUTRを含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、タンパク質が共通の機能、構造、特性または性質を有する転写物のファミリーから選択されるUTRを含む。
ウイルスゲノム構成要素:miR結合部位
本発明のAAVウイルス粒子の組織特異的または細胞特異的な発現は、組織特異的または細胞特異的な調節配列、例えば、プロモーター、エンハンサー、マイクロRNA結合部位、例えば、脱標的化(detargeting)部位を導入することによって増強され得る。理論に束縛されることを望むものではないが、コードされたmiR結合部位は、非標的化細胞または組織などの組織または細胞における対応する内因性マイクロRNA(miRNA)または対応する制御された外因性miRNAの発現に基づいて、本発明のウイルスゲノムにおける目的の遺伝子の発現を調整する、例えば、防止する、抑制する、または別様に阻害することができると考えられる。いくつかの実施形態では、miR結合部位は、対応するmRNAが発現される細胞または組織における、本明細書に記載されるAAV粒子のウイルスゲノムによってコードされるペイロードの発現を調整する、例えば、低減する。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるAAV粒子のウイルスゲノムは、マイクロRNA結合部位、例えば、脱標的化部位をコードするヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるAAV粒子のウイルスゲノムは、miR結合部位、マイクロRNA結合部位シリーズ(miR BSs)、またはそれらの逆相補体をコードするヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、miR結合部位シリーズまたはmiR結合部位をコードするヌクレオチド配列は、ウイルスゲノムの3’-UTR領域(例えば、ペイロードをコードする核酸配列に対して3’)、例えば、polyA配列の前、ウイルスゲノムの5’-UTR領域(例えば、ペイロードをコードする核酸配列に対して5’)、またはその両方に位置している。
いくつかの実施形態では、コードされたmiR結合部位シリーズは、miR結合部位(miR BS)を少なくとも1~5コピー、例えば、少なくとも1~3、2~4、3~5、1、2、3、4、5、またはそれ以上のコピーを含む。いくつかの実施形態では、すべてのコピーが同一であり、例えば、同じmiR結合部位を含む。いくつかの実施形態では、コードされたmiR結合部位シリーズ内のmiR結合部位は連続的であり、スペーサーによって分離されていない。いくつかの実施形態では、コードされたmiR結合部位シリーズ内のmiR結合部位は、スペーサー、例えば、非コード配列によって分離されている。いくつかの実施形態では、スペーサーは、少なくとも約5~10ヌクレオチド、例えば、約7~8ヌクレオチドのヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、スペーサーコード配列またはその逆相補体は、(i)GGAT、(ii)CACGTG、(iii)GCATGCのうちの1もしくは複数、または(i)~(iii)のうちの1もしくは複数の繰り返しを含む。
いくつかの実施形態では、コードされたmiR結合部位シリーズは、miR結合部位(miR BS)を少なくとも1~5コピー、例えば、少なくとも1~3、2~4、3~5、1、2、3、4、5、またはそれ以上のコピーを含む。いくつかの実施形態では、少なくとも1、2、3、4、5、またはすべてのコピーが異なっており、例えば、異なるmiR結合部位を含む。いくつかの実施形態では、コードされたmiR結合部位シリーズ内のmiR結合部位は連続的であり、スペーサーによって分離されていない。いくつかの実施形態では、コードされたmiR結合部位シリーズ内のmiR結合部位は、スペーサー、例えば、非コード配列によって分離されている。いくつかの実施形態では、スペーサーは、少なくとも約5~10ヌクレオチド長、例えば、約7~8ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、スペーサーコード配列またはその逆相補体は、(i)GGAT、(ii)CACGTG、(iii)GCATGCのうちの1もしくは複数、または(i)~(iii)のうちの1もしくは複数の繰り返しを含む。
いくつかの実施形態では、コードされたmiR結合部位は、宿主細胞内のmiRに対して実質的に同一(例えば、少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、99%、または100%同一)である。いくつかの実施形態では、コードされたmiR結合部位は、宿主細胞内のmiRに対して少なくとも1、2、3、4、もしくは5個のミスマッチ、または6個以下、7個以下、8個以下、9個以下、もしくは10個以下のミスマッチを含む。いくつかの実施形態では、ミスマッチヌクレオチドは連続的である。いくつかの実施形態では、ミスマッチヌクレオチドは非連続的である。いくつかの実施形態では、ミスマッチヌクレオチドは、miR結合部位のシード領域結合配列の外側、例えばmiR結合部位の一端または両端で生じる。いくつかの実施形態では、コードされたmiR結合部位は、宿主細胞内のmiRと100%同一である。
いくつかの実施形態では、miR結合部位をコードするヌクレオチド配列は、宿主細胞内のmiRに対して実質的に相補的(例えば、少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、99%、または100%同一)である。いくつかの実施形態では、miR結合部位をコードするヌクレオチド配列の相補配列は、宿主細胞内のmiRに対して少なくとも1、2、3、4、もしくは5個のミスマッチ、または6個以下、7個以下、8個以下、9個以下、もしくは10個以下のミスマッチを含む。いくつかの実施形態では、ミスマッチヌクレオチドは連続的である。いくつかの実施形態では、ミスマッチヌクレオチドは非連続的である。いくつかの実施形態では、ミスマッチヌクレオチドは、miR結合部位のシード領域結合配列の外側、例えばmiR結合部位の一端または両端で生じる。いくつかの実施形態では、コードされたmiR結合部位は、宿主細胞内のmiRと100%同一である。
いくつかの実施形態では、コードされたmiR結合部位または配列領域は、少なくとも約10~約125ヌクレオチド長、例えば、少なくとも約10~50ヌクレオチド長、10~100ヌクレオチド長、50~100ヌクレオチド長、50~125ヌクレオチド長、または100~125ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、コードされたmiR結合部位または配列領域は、少なくとも約7~約28ヌクレオチド長、例えば、少なくとも約8~28ヌクレオチド長、7~28ヌクレオチド長、8~18ヌクレオチド長、12~28ヌクレオチド長、20~26ヌクレオチド長、22ヌクレオチド長、24ヌクレオチド長、または26ヌクレオチド長であり、場合により、miRNA(例えば、miR122、miR142、miR183)のシード配列に相補的な少なくとも1つの連続領域(例えば、7または8ヌクレオチド)を含む。
いくつかの実施形態では、コードされたmiR結合部位は、miR122など、肝臓または肝細胞で発現されるmiRに相補的である。いくつかの実施形態では、コードされたmiR結合部位またはコードされたmiR結合部位シリーズは、miR122結合部位配列を含む。いくつかの実施形態では、コードされたmiR122結合部位は、ACAAACACCATTGTCACACTCCA(配列番号1029)のヌクレオチド配列、または、配列番号1029に対して、少なくとも50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、少なくとも95%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有する、または、修飾を少なくとも1、2、3、4、5、6、もしくは7個有するが、修飾が10個以下であるヌクレオチド配列を含み、例えば、修飾は、コードされたmiR結合部位と対応するmiRNAとの間のミスマッチをもたらし得る。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、コードされたmiR122結合部位、例えば、コードされたmiR122結合部位シリーズを少なくとも3、4、または5コピー含み、場合により、コードされたmiR122結合部位シリーズは、ACAAACACCATTGTCACACTCCACACAAACACCATTGTCACACTCCACACAAACACCATTGTCACACTCCA(配列番号1030)のヌクレオチド配列、または、配列番号1030に対して、少なくとも50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、少なくとも95%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有する、または、修飾を少なくとも1、2、3、4、5、6、もしくは7個有するが、修飾が10個以下であるヌクレオチド配列を含み、例えば、修飾は、コードされたmiR結合部位と対応するmiRNAとの間のミスマッチをもたらし得る。いくつかの実施形態では、コードされたmiR122結合部位のうちの少なくとも2つは、直接、例えば、スペーサーなしで接続されている。他の実施形態では、コードされたmiR122結合部位のうちの少なくとも2つは、2つ以上の連続するコードされたmiR122結合部位配列の間に位置している、例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10ヌクレオチド長のスペーサーによって分離されている。諸実施形態において、スペーサーは、少なくとも約5~10ヌクレオチド長、例えば、約7~8ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、スペーサーコード配列またはその逆相補体は、(i)GGAT、(ii)CACGTG、(iii)GCATGCのうちの1もしくは複数、または(i)~(iii)のうちの1もしくは複数の繰り返しを含む。いくつかの実施形態では、コードされたmiR結合部位シリーズは、スペーサーの有無にかかわらず、miR122結合部位を少なくとも3~5コピー(例えば、4コピー)含み、スペーサーは、少なくとも約5~10ヌクレオチド長、例えば、約7~8ヌクレオチド長である。
いくつかの実施形態では、コードされたmiR結合部位は、免疫細胞(例えば、樹状細胞(DC)、マクロファージ、及びBリンパ球を含む抗原提示細胞すなわちAPC)を含む造血系で発現されるmiRに相補的である。いくつかの実施形態では、造血系で発現されるmiRに相補的なコードされたmiR結合部位は、例えば、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれるUS2018/0066279において開示されているヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、コードされたmiR結合部位またはコードされたmiR結合部位シリーズは、miR-142-3p結合部位配列を含む。いくつかの実施形態では、コードされたmiR-142-3p結合部位は、TCCATAAAGTAGGAAACACTACA(配列番号1031)のヌクレオチド配列か、配列番号1031に対して、少なくとも50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、少なくとも95%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有する、または、修飾を少なくとも1、2、3、4、5、6、もしくは7個有するが、修飾が10個以下であるヌクレオチド配列を含み、例えば、修飾は、コードされたmiR結合部位と対応するmiRNAとの間のミスマッチをもたらし得る。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、コードされたmiR-142-3p結合部位、例えば、コードされたmiR-142-3p結合部位シリーズを少なくとも3、4、または5コピー含む。いくつかの実施形態では、コードされたmiR結合部位シリーズは、スペーサーの有無にかかわらず、miR-142-3p結合部位を少なくとも3~5コピー(例えば、4コピー)含み、スペーサーは、少なくとも約5~10ヌクレオチド長、例えば、約7~8ヌクレオチド長である。
いくつかの実施形態では、コードされたmiR結合部位は、DRG(後根神経節)ニューロンで発現されるmiR、例えば、miR183、miR182、及び/またはmiR96結合部位に相補的である。いくつかの実施形態では、DRGニューロンで発現されるmiRに相補的なコードされたmiR結合部位は、例えば、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれるWO2020/132455において開示されているヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、コードされたmiR結合部位またはコードされたmiR結合部位シリーズは、miR183結合部位配列を含む。いくつかの実施形態では、コードされたmiR183結合部位は、
Figure 2023523401000047
のヌクレオチド配列、または、配列番号1032に対して、少なくとも50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、少なくとも95%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有する、または、修飾を少なくとも1、2、3、4、5、6、もしくは7個有するが、修飾が10個以下であるヌクレオチド配列を含み、例えば、修飾は、コードされたmiR結合部位と対応するmiRNAとの間のミスマッチをもたらし得る。いくつかの実施形態では、シード配列に相補的な配列は、コードされたmiR-183結合部位配列の二重下線部に対応する。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、コードされたmiR183結合部位、例えばコードされたmiR183結合部位を少なくとも3、4、または5コピー含む。いくつかの実施形態では、コードされたmiR結合部位シリーズは、スペーサーの有無にかかわらず、miR183結合部位を少なくとも3~5コピー(例えば、4コピー)含み、スペーサーは、少なくとも約5~10ヌクレオチド長、例えば、約7~8ヌクレオチド長である。
いくつかの実施形態では、コードされたmiR結合部位またはコードされたmiR結合部位シリーズは、miR182結合部位配列を含む。いくつかの実施形態では、コードされたmiR182結合部位は、AGTGTGAGTTCTACCATTGCCAAA(配列番号1033)のヌクレオチド配列か、配列番号1033に対して、少なくとも50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、少なくとも95%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有する、または、修飾を少なくとも1、2、3、4、5、6、もしくは7個有するが、修飾が10個以下であるヌクレオチド配列を含み、例えば、修飾は、コードされたmiR結合部位と対応するmiRNAとの間のミスマッチをもたらし得る。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、コードされたmiR182結合部位、例えば、コードされたmiR182結合部位シリーズを少なくとも3、4、または5コピー含む。いくつかの実施形態では、コードされたmiR結合部位シリーズは、スペーサーの有無にかかわらず、miR182結合部位を少なくとも3~5コピー(例えば、4コピー)含み、スペーサーは、少なくとも約5~10ヌクレオチド長、例えば、約7~8ヌクレオチド長である。
いくつかの実施形態では、コードされたmiR結合部位またはコードされたmiR結合部位シリーズは、miR96結合部位配列を含む。いくつかの実施形態では、コードされたmiR96結合部位は、AGCAAAAATGTGCTAGTGCCAAA(配列番号1034)のヌクレオチド配列か、配列番号1034に対して、少なくとも50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、少なくとも95%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有する、または、修飾を少なくとも1、2、3、4、5、6、もしくは7個有するが、修飾が10個以下である配列を含み、例えば、修飾は、コードされたmiR結合部位と対応するmiRNAとの間のミスマッチをもたらし得る。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、コードされたmiR96結合部位、例えば、コードされたmiR96結合部位シリーズを少なくとも3、4、または5コピー含む。いくつかの実施形態では、コードされたmiR結合部位シリーズは、スペーサーの有無にかかわらず、miR96結合部位を少なくとも3~5コピー(例えば、4コピー)含み、スペーサーは、少なくとも約5~10ヌクレオチド長、例えば、約7~8ヌクレオチド長である。
いくつかの実施形態では、コードされたmiR結合部位シリーズは、miR122結合部位、miR142結合部位、miR183結合部位、miR182結合部位、miR96結合部位、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態では、コードされたmiR結合部位シリーズは、miR122結合部位、miR142結合部位、miR183結合部位、miR182結合部位、miR96結合部位、またはそれらの組み合わせを少なくとも3、4、または5コピー含む。いくつかの実施形態では、コードされたmiR結合部位のうちの少なくとも2つは、直接、例えば、スペーサーなしで接続されている。他の実施形態では、コードされたmiR結合部位のうちの少なくとも2つは、2つ以上の連続するコードされたmiR結合部位配列の間に位置している、例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10ヌクレオチド長のスペーサーによって分離されている。諸実施形態では、スペーサーは、少なくとも約5~10ヌクレオチド長、例えば、約7~8ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、スペーサーコード配列またはその逆相補体は、(i)GGAT、(ii)CACGTG、(iii)GCATGCのうちの1もしくは複数、または(i)~(iii)のうちの1もしくは複数の繰り返しを含む。いくつかの実施形態では、コードされたmiR結合部位シリーズは、スペーサーの有無にかかわらず、miR122結合部位、miR142結合部位、miR183結合部位、miR182結合部位、miR96結合部位のうちの少なくとも2つ、3つ、4つ、5つ、またはすべての組み合わせを少なくとも3~5コピー(例えば、4コピー)含み、スペーサーは、少なくとも約5~10ヌクレオチド長、例えば、約7~8ヌクレオチド長である。
ウイルスゲノム構成要素:エクソン配列領域
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのエクソン配列領域を含み得る。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、少なくとも2つ、少なくとも3つ、少なくとも4つ、または少なくとも5つのエクソン領域を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、2つのエクソン配列領域を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、3つのエクソン配列領域を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、4つのエクソン配列領域を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、4つを超えるエクソン配列領域を含む。
いくつかの実施形態では、エクソン領域(複数可)は、独立して、約50~150ヌクレオチド長、例えば、約50~140ヌクレオチド、約50~130ヌクレオチド、約50~120ヌクレオチド、約50~110ヌクレオチド、約50~100ヌクレオチド、約50~90ヌクレオチド、約50~80ヌクレオチド、約50~80ヌクレオチド、約50~70ヌクレオチド、約50~60ヌクレオチド、約60~150ヌクレオチド、約60~140ヌクレオチド、約60~130ヌクレオチド、約60~120ヌクレオチド、約60~110ヌクレオチド、約60~100ヌクレオチド、約60~90ヌクレオチド、約60~80ヌクレオチド、約60~80ヌクレオチド、約60~70ヌクレオチド、約70~150ヌクレオチド、約70~140ヌクレオチド、約70~130ヌクレオチド、約70~120ヌクレオチド、約70~110ヌクレオチド、約70~100ヌクレオチド、約70~90ヌクレオチド、約70~80ヌクレオチド、約80~150ヌクレオチド、約80~140ヌクレオチド、約80~130ヌクレオチド、約80~120ヌクレオチド、約80~110ヌクレオチド、約80~100ヌクレオチド、約80~90ヌクレオチド、約90~150ヌクレオチド、約90~140ヌクレオチド、約90~130ヌクレオチド、約90~120ヌクレオチド、約90~110ヌクレオチド、約90~100ヌクレオチド、約100~150ヌクレオチド、約100~140ヌクレオチド、約100~130ヌクレオチド、約100~120ヌクレオチド、約100~110ヌクレオチド、約110~150ヌクレオチド、約110~140ヌクレオチド、約110~130ヌクレオチド、約110~120ヌクレオチド、約120~150ヌクレオチド、約120~140ヌクレオチド、約120~130ヌクレオチド、約130~150ヌクレオチド、約130~140ヌクレオチド、または約140~150ヌクレオチドなどだがこれらに限定されない長さを有し得る。いくつかの実施形態では、エクソン領域は、約120ヌクレオチド~約140ヌクレオチド長、例えば、約134ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、エクソン領域は、約40ヌクレオチド~約60ヌクレオチド長、例えば、約53ヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、エクソン領域は表12に提示されている。
Figure 2023523401000048
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、エクソン1、エクソン2、エクソン3、エクソン4、またはそれらの機能バリアントから選択されるエクソン領域を含む。いくつかの実施形態では、エクソン領域は、配列番号1051~1055のいずれか1つのヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、1つのエクソン配列領域を含む。いくつかの実施形態では、エクソン配列領域はエクソン1配列領域である。いくつかの実施形態では、エクソン配列領域はエクソン2配列領域である。いくつかの実施形態では、エクソン配列領域はエクソン3配列領域である。いくつかの実施形態では、エクソン配列領域はエクソン4配列領域である。いくつかの実施形態では、エクソン配列領域はエクソン5配列領域である。
ウイルスゲノム構成要素:イントロン配列領域
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、ペイロードをコードする導入遺伝子の発現を増強する少なくとも1つのエレメントを含む。いくつかの実施形態では、導入遺伝子の発現を増強するエレメントは、イントロンまたはその機能的バリアントを含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、イントロンまたはその機能的バリアントを含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、少なくとも2つのイントロン領域、例えば、少なくとも2つのイントロン領域、少なくとも3つのイントロン領域、少なくとも4つのイントロン領域、または5つ以上のイントロン領域を含む。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、MVMイントロン(67~97bp)、F.IXトランケート型イントロン1(300bp)、β-グロビンSD/免疫グロブリン重鎖スプライスアクセプターイントロン(250bp)、アデノウイルススプライスドナー/イムノグロビンスプライスアクセプターイントロン(500bp)、SV40後期スプライスドナー/スプライスアクセプターイントロン(19S/16S)(180bp)、またはハイブリッドアデノウイルススプライスドナー/IgGスプライスアクセプターイントロン(230bp)から選択されるイントロンを含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、ヒトベータグロビンイントロン領域を含む。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、約10ヌクレオチド~約1200ヌクレオチド長を含むイントロン領域を含む。いくつかの実施形態では、イントロン領域は、約10~100ヌクレオチド長、例えば、約10~90ヌクレオチド長、約10~80ヌクレオチド長、約10~70ヌクレオチド長、約10~60ヌクレオチド長、約10~50ヌクレオチド長、約10~40ヌクレオチド長、約10~30ヌクレオチド長、約10~20ヌクレオチド長、約20~100ヌクレオチド長、約20~90ヌクレオチド長、約20~80ヌクレオチド長、約20~70ヌクレオチド長、約20~60ヌクレオチド長、約20~50ヌクレオチド長、約20~40ヌクレオチド長、約20~30ヌクレオチド長、約30~100ヌクレオチド長、約30~90ヌクレオチド長、約30~80ヌクレオチド長、約30~70ヌクレオチド長、約30~60ヌクレオチド長、約30~50ヌクレオチド長、約30~40ヌクレオチド長、約40~100ヌクレオチド長、約40~90ヌクレオチド長、約40~80ヌクレオチド長、約40~70ヌクレオチド長、約40~60ヌクレオチド長、約40~50ヌクレオチド長、約50~100、約50~90ヌクレオチド長、約50~80ヌクレオチド長、約50~70ヌクレオチド長、約50~60ヌクレオチド長、約60~100ヌクレオチド長、約60~90ヌクレオチド長、約60~80ヌクレオチド長、約60~70ヌクレオチド長、約70~100ヌクレオチド長、約70~90ヌクレオチド長、約70~80ヌクレオチド長、約80~100ヌクレオチド長、約80~90ヌクレオチド長、または約90~100ヌクレオチド長を含む。いくつかの実施形態では、イントロン領域は、約100~600ヌクレオチド長、例えば、約100~500ヌクレオチド長、約100~400ヌクレオチド長、約100~300ヌクレオチド長、約100~200ヌクレオチド長、約200~600ヌクレオチド長、約200~500ヌクレオチド長、約200~400ヌクレオチド長、約200~300ヌクレオチド長、約300~600ヌクレオチド長、約300~500ヌクレオチド長、約300~400ヌクレオチド長、約400~600ヌクレオチド長、約400~500ヌクレオチド長、または約500~600ヌクレオチド長を含む。いくつかの実施形態では、イントロン領域は、約900~1200ヌクレオチド長、例えば、約900~1100ヌクレオチド、約900~1000ヌクレオチド、約1000~1200ヌクレオチド、約1000~1100ヌクレオチド、または約1100~1200ヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、イントロン領域は、約20~約40ヌクレオチド長、例えば、約32ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、イントロン領域は、約340~約360ヌクレオチド長、例えば、約347ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、イントロン領域は、約550~約570ヌクレオチド長、例えば、約566ヌクレオチドを含む。
非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約15ヌクレオチド長であるイントロン領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約32ヌクレオチド長であるイントロン領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約41ヌクレオチド長であるイントロン領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約53ヌクレオチド長であるイントロン領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約73ヌクレオチド長であるイントロン領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約168ヌクレオチド長であるイントロン領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約172ヌクレオチド長であるイントロン領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約292ヌクレオチド長であるイントロン領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約347ヌクレオチド長であるイントロン領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約387ヌクレオチド長であるイントロン領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約491ヌクレオチド長であるイントロン領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約566ヌクレオチド長であるイントロン領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約1074ヌクレオチド長であるイントロン領域を含む。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、表13に提示されたイントロン領域を含む。
Figure 2023523401000049
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、イントロン1~イントロン15、またはそれらの機能的バリアントのいずれか1つから選択されるイントロン領域を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムはイントロン1を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムはイントロン3を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムはイントロン12を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムはイントロン12及びイントロン3を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムはイントロン1及びイントロン12を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、配列番号1056~1070のいずれか1つ、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつ配列のイントロン領域を含む。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、1つのイントロン配列領域を含む。いくつかの実施形態では、イントロン配列領域はイントロン1配列領域である。いくつかの実施形態では、イントロン配列領域はイントロン2配列領域である。いくつかの実施形態では、イントロン配列領域はイントロン3配列領域である。いくつかの実施形態では、イントロン配列領域はイントロン4配列領域である。いくつかの実施形態では、イントロン配列領域はイントロン5配列領域である。いくつかの実施形態では、イントロン配列領域はイントロン6配列領域である。いくつかの実施形態では、イントロン配列領域はイントロン7配列領域である。いくつかの実施形態では、イントロン配列領域はイントロン8配列領域である。いくつかの実施形態では、イントロン配列領域はイントロン9配列領域である。いくつかの実施形態では、イントロン配列領域はイントロン10配列領域である。いくつかの実施形態では、イントロン配列領域はイントロン11配列領域である。いくつかの実施形態では、イントロン配列領域はイントロン12配列領域である。いくつかの実施形態では、イントロン配列領域はイントロン13配列領域である。いくつかの実施形態では、イントロン配列領域はイントロン14配列領域である。いくつかの実施形態では、イントロン配列領域はイントロン15配列領域である。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、2つのイントロン配列領域を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、3つのイントロン配列領域を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、3つを超えるイントロン配列領域を含む。
ウイルスゲノム構成要素:シグナル配列領域
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、シグナル配列領域(例えば、1、2、または3つのシグナル配列領域(複数可))をコードするヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、シグナル配列をコードする核酸配列は、VH及び/または重鎖をコードする核酸配列に対して5’に位置している。いくつかの実施形態では、シグナル配列をコードするヌクレオチド配列は、VL及び/または軽鎖をコードする核酸配列に対して5’に位置している。いくつかの実施形態では、コードされた抗体分子のコードされたVH、VL、重鎖、及び/または軽鎖は、N末端にシグナル配列を含み、シグナル配列は、場合により、抗体分子の細胞プロセシング及び/または局在化中に切断される。
いくつかの実施形態では、シグナル配列は、抗体、そのバリアントまたはフラグメントに由来する。別の実施形態では、シグナル配列領域は、抗体に由来しなくてもよい。いくつかの実施形態では、シグナル配列は、重鎖及び軽鎖と同じ抗体に由来する。いくつかの実施形態では、シグナル配列は、重鎖配列または軽鎖配列のうちの1つと同じ抗体に由来する。いくつかの実施形態では、シグナル配列は、重鎖配列または軽鎖配列のいずれとも異なる抗体に由来する。
非限定的な例として、シグナル配列またはシグナル配列をコードするヌクレオチド配列は、IPN002、PHF1及び/またはMC1などだがこれらに限定されない、抗タウ抗体の重鎖または軽鎖に由来し得る。理論に束縛されることを望むものではないが、抗体重鎖または軽鎖配列の最初のおよそ57ヌクレオチドがシグナル配列とみなされ得る。抗体由来シグナル配列の非限定的な例としては、シグナル13~シグナル18(それぞれ配列番号1083~1088)が挙げられる。
いくつかの実施形態では、シグナル配列領域は、転写のためのシグナルとなり得る。いくつかの実施形態では、シグナル配列領域は、翻訳のためのシグナルとなり得る。いくつかの実施形態では、シグナル配列領域は、ペイロードを核の外または細胞の外に向ける。いくつかの実施形態では、シグナル配列領域は、ペイロードを特定の標的に向け、標的は、器官、組織、細胞、細胞区画、細胞小器官、または上記のいずれかの構成要素であり得る。
シグナル配列領域(複数可)は、独立して、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、または150ヌクレオチド超などだがこれらに限定されない長さを有し得る。ウイルスゲノム内のシグナル領域の長さは、10~15、15~25、25~35、25~50、35~45、45~55、50~75、55~65、65~75、75~85、75~100、85~95、95~105、100~125、105~115、115~125、125~135、125~150、135~145、145~155、150~175、155~165、165~175、175~185、175~200、185~195、195~205、200~225、205~215、215~225、225~235、225~250、235~245、245~255、250~275、255~265、265~275、275~285、275~300、285~295、295~305、300~325、305~315、315~325、325~335、325~350、335~345、及び345~500ヌクレオチドであり得る。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのシグナル配列領域を含む。シグナル配列領域の非限定的な例を表14に列挙する。
Figure 2023523401000050
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、1つのシグナル配列領域を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、2つのシグナル配列領域を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、3つのシグナル配列領域を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、3つを超えるシグナル配列領域を含む。いくつかの実施形態では、複数のシグナル配列を含むウイルスゲノムのシグナル配列は、同じである。別の実施形態では、複数のシグナル配列を含むウイルスゲノムのシグナル配列は、同じではない。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、1つのシグナル配列領域を含む。いくつかの実施形態では、シグナル配列領域はシグナル1配列領域である。いくつかの実施形態では、シグナル配列領域はシグナル2配列領域である。いくつかの実施形態では、シグナル配列領域はシグナル3配列領域である。いくつかの実施形態では、シグナル配列領域はシグナル4配列領域である。いくつかの実施形態では、シグナル配列領域はシグナル5配列領域である。いくつかの実施形態では、シグナル配列領域はシグナル6配列領域である。いくつかの実施形態では、シグナル配列領域はシグナル7配列領域である。いくつかの実施形態では、シグナル配列領域はシグナル8配列領域である。いくつかの実施形態では、シグナル配列領域はシグナル9配列領域である。いくつかの実施形態では、シグナル配列領域はシグナル10配列領域である。いくつかの実施形態では、シグナル配列領域はシグナル11配列領域である。いくつかの実施形態では、シグナル配列領域はシグナル12配列領域である。いくつかの実施形態では、シグナル配列領域はシグナル13配列領域である。いくつかの実施形態では、シグナル配列領域はシグナル14配列領域である。いくつかの実施形態では、シグナル配列領域はシグナル15配列領域である。いくつかの実施形態では、シグナル配列領域はシグナル16配列領域である。いくつかの実施形態では、シグナル配列領域はシグナル17配列領域である。いくつかの実施形態では、シグナル配列領域はシグナル18配列領域である。いくつかの実施形態では、シグナル配列領域はシグナル19配列領域である。
いくつかの実施形態では、シグナル配列は、表14に提示されたシグナル配列のいずれか1つまたはその機能的バリアントを含む。いくつかの実施形態では、コードされたシグナル配列は、表14に提示されたヌクレオチド配列のいずれか1つによってコードされるアミノ酸配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、シグナル配列をコードする核酸配列は、表14に提示されたヌクレオチド配列のいずれか1つ、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含む。
ウイルスゲノム構成要素:リンカー
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、リンカー領域もしくはリンカーを含むか、またはそれをコードする。いくつかの実施形態では、リンカーは、ウイルスゲノムの2つの抗体配列領域を接続する(例えば、VH・リンカー・VL、VL・リンカー・VH重鎖・リンカー・軽鎖、または軽鎖・リンカー・重鎖)。
場合によっては、リンカーは、ペイロード領域によってコードされるポリペプチド(例えば、発現中の抗体の軽鎖及び重鎖)を接続するために使用され得るペプチドリンカーであり得る。いくつかのペプチドリンカーは、発現後に切断されて重鎖ドメイン及び軽鎖ドメインを分離させ、成熟抗体または抗体フラグメントのアセンブリを可能にし得る。リンカー切断は酵素的であり得る。場合によっては、リンカーは、細胞内または細胞外の切断を容易にする酵素切断部位を含む。いくつかのペイロード領域は、mRNA転写物からのリンカー配列の翻訳中にポリペプチド合成を中断するリンカーをコードする。このようなリンカーは、単一の転写物からの別個のタンパク質ドメイン(例えば、重鎖及び軽鎖抗体ドメイン)の翻訳を容易にし得る。場合によっては、2つ以上のリンカーがウイルスゲノムのペイロード領域によってコードされる。
いくつかの実施形態では、コードされたリンカーは、表15に提示されたリンカーを含む。アミノ酸組成によって記述される配列(例えば、G4S;配列番号1106)については、括弧内に提示された配列番号がアミノ酸配列を表し、配列番号の縦列がDNA配列番号を列挙する。
Figure 2023523401000051
いくつかの実施形態では、コードされたリンカーは、表15に提示されたヌクレオチド配列のいずれか1つによってコードされるアミノ酸配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、リンカーをコードする核酸配列は、表15に提示されたヌクレオチド配列のいずれか1つ、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、コードされたリンカーは、例えば、細胞内及び/または細胞外の切断のための、酵素切断部位を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、抗原結合ドメインのVH及びVL及び/または抗体分子(例えば、抗タウ抗体)の重鎖及び軽鎖を分離するように切断される。
いくつかの実施形態では、コードされたリンカーは、フューリンリンカー(フューリン切断部位)または機能的バリアントを含む。いくつかの実施形態では、フューリンは、塩基性アミノ酸標的配列(Arg-X-(Arg/Lys)-Arg)のすぐ下流でタンパク質を切断する。いくつかの実施形態では、フューリンリンカーをコードするヌクレオチド配列は、配列番号1090もしくは1091のヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、フューリンは、塩基性アミノ酸標的配列(例えば、Arg-X-(Arg/Lys)-Arg)の下流でタンパク質を切断する(例えば、Thomas,G.,2002.Nature Reviews Molecular Cell Biology 3(10):753-66に記載されているとおり;同文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。
いくつかの実施形態では、コードされたリンカーは、2A自己切断ペプチド(例えば、口蹄疫ウイルス(F2A)、ブタテッショウウイルス-1(P2A)、Thoseaasignaウイルス(T2A)、またはウマ鼻炎Aウイルス(E2A)に由来する2Aペプチド)を含む。2Aの表記は、2AペプチドのC末端におけるグリシル-プロリル結合でのリボソームスキップをもたらすピコルナウイルスポリタンパク質の領域を具体的に指す(Kim,J.H.et al.,2011.PLoS One 6(4):e18556;同文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。このスキップは、2Aペプチドと、そのすぐ下流のペプチドとの間の切断をもたらす。理論に束縛されることを望むものではないが、いくつかの実施形態では、2Aペプチドが、2Aペプチドにフランキングするタンパク質の化学量論的発現をもたらし、それらの長さがより短いことは、ウイルス発現ベクターの生成において有利であり得ると考えられる。
いくつかの実施形態では、コードされたリンカーは、T2A自己切断ペプチドリンカーを含む。いくつかの実施形態では、T2Aリンカーをコードするヌクレオチド配列は、配列番号1092のヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、ペイロードをコードする核酸は、フューリンリンカー及びT2Aリンカーをコードする。
いくつかの実施形態では、コードされたリンカーは、ヌクレオチド配列、例えばmRNA配列の中央に、翻訳開始のためのヌクレオチド配列(500ヌクレオチド超)である内部リボソーム侵入部位(IRES)を含み(Kim,J.H.et al.,2011.PLoS One 6(4):e18556;同文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)、これは、例えば、1または複数の導入遺伝子の発現を調整するために使用され得る。IRES配列を使用すると、IRESの前後の遺伝子の共発現が確実になるが、IRESに続く配列は、IRES配列に先行する配列よりも低いレベルで転写及び翻訳され得る。
いくつかの実施形態では、コードされたリンカーは、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許第US5525491号においてHustonらによって説明されたもののような、小さく非分岐のセリンリッチペプチドリンカーを含む。いくつかの実施形態では、セリンリッチリンカーを含むポリペプチドは、増加した溶解性を有する。いくつかの実施形態では、コードされたリンカーは、米国特許第US5856456号のWhitlow及びFilpula、ならびに米国特許第US4946778号のLadnerらによって説明されたもののような人工リンカーを含み、各文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、カテプシン、マトリックスメタロプロテイナーゼ、またはレグマイン切断部位などだがこれらに限定されない、1または複数のリンカーを含む。このようなリンカーは、例えば、国際公開第WO2008052322号においてCizeau及びMacdonaldによって説明されており、同文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、切断されないリンカーをコードし得る。いくつかの実施形態では、本明細書に記載される抗体分子のいずれかは、抗体分子の抗原結合ドメインの可変ドメイン(例えば、VH及びVL)を接続する様々な長さの可動性ポリペプチドリンカーを有し得る。例えば、(Gly4-Ser)nリンカー(ここで、nは0、1、2、3、4、5、6、7、または8である)を使用することができる(例えば、配列番号1098、1100、1102、1104~1105、1107~1108、1110~1112、1114~1115、1117~1119のいずれか1つ)。いくつかの実施形態では、このようなリンカーは、グリシンリッチ配列などの単純なアミノ酸配列を含み得る。場合によっては、リンカーはグリシン及びセリン残基を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、異なる長さの可動性ペプチドリンカー、例えばnxG4S(ここで、n=1~10である)(配列番号1119)を含んでもよく、コードされたリンカーの長さは、5~50アミノ酸の間で変化する。非限定的な例では、リンカーは5xG4S(配列番号1109)であり得る。理論に束縛されることを望むものではないが、いくつかの実施形態では、これらの可動性リンカーは小さく側鎖を有しないため、抗体セグメント間の可動性リンカーを提供しながらも二次タンパク質構造に影響しない傾向にあると考えられる(George,R.A.,et al.,2002.Protein Engineering 15(11):871-9、Huston,J.S.et al.,1988.PNAS 85:5879-83、及びShan,D.et al.,1999.Journal of Immunology.162(11):6589-95;各文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。さらに、セリン残基の極性は、溶解性を向上させ、凝集の問題を防止する。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのG4S3リンカー(配列番号1103として開示される「G4S3」)をコードする。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのG4Sリンカー(配列番号1097として開示される「G4S」)をコードする。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのフューリン部位をコードする。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのG4S5リンカー(配列番号1109として開示される「G4S5」)をコードする。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのT2Aリンカーをコードする。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのF2Aリンカーをコードする。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのP2Aリンカーをコードする。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのフューリン及び1つの2Aリンカーをコードする。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、フューリン及びT2Aリンカーまたはフューリン及びF2Aリンカーを含み得る。
いくつかの実施形態では、AAV粒子ウイルスゲノムは、少なくとも1つのIRES配列をコードする。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのヒンジ領域をコードする。非限定的な例として、ヒンジはIgGヒンジである。
いくつかの実施形態では、リンカーをコードする核酸配列は、約10~約700ヌクレオチド長、例えば、約10~約700ヌクレオチド、例えば約10~約100、例えば、約50~200ヌクレオチド、約150~300ヌクレオチド、約250~400ヌクレオチド、約350~500ヌクレオチド、約450~600ヌクレオチド、約550~700ヌクレオチド、約650~700ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、リンカーをコードする核酸配列は、約5~約20ヌクレオチド長、例えば、約12ヌクレオチド長を含む。いくつかの実施形態では、リンカーをコードする核酸配列は、約40~約60ヌクレオチド長、例えば、約54ヌクレオチド長を含む。
いくつかの実施形態では、リンカー領域は、1~50、1~100、50~100、50~150、100~150、100~200、150~200、150~250、200~250、200~300、250~300、250~350、300~350、300~400、350~400、350~450、400~450、400~500、450~500、450~550、500~550、500~600、550~600、550~650、または600~650ヌクレオチド長であり得る。リンカー領域は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、115、120、125、130、135、140、145、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、165、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、185、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600、601、602、603、604、605、606、607、608、609、610、611、612、613、614、615、616、617、618、619、620、621、622、623、624、625、626、627、628、629、630、631、632、633、634、635、640、650、または650超の長さを有し得る。いくつかの実施形態では、リンカー領域は、12ヌクレオチド長であり得る。いくつかの実施形態では、リンカー領域は、15ヌクレオチド長でもよく、いくつかの実施形態では、リンカー領域は、18ヌクレオチド長でもよい。いくつかの実施形態では、リンカー領域は、30ヌクレオチド長でもよい。いくつかの実施形態では、リンカー領域は、45ヌクレオチド長でもよい。いくつかの実施形態では、リンカー領域は、54ヌクレオチド長でもよい。いくつかの実施形態では、リンカー領域は、60ヌクレオチド長でもよい。いくつかの実施形態では、リンカー領域は、66ヌクレオチド長でもよい。いくつかの実施形態では、リンカー領域は、75ヌクレオチド長でもよい。いくつかの実施形態では、リンカー領域は、78ヌクレオチド長でもよい。いくつかの実施形態では、リンカー領域は、87ヌクレオチド長でもよい。いくつかの実施形態では、リンカー領域は、108ヌクレオチド長でもよい。いくつかの実施形態では、リンカー領域は、120ヌクレオチド長でもよい。いくつかの実施形態では、リンカー領域は、153ヌクレオチド長でもよい。いくつかの実施形態では、リンカー領域は、198ヌクレオチド長でもよい。いくつかの実施形態では、リンカー領域は、609ヌクレオチド長でもよい。いくつかの実施形態では、リンカー領域は、623ヌクレオチド長でもよい。
ウイルスゲノム構成要素:タグ
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、タグポリペプチド(例えば、本明細書におけるタグ配列またはタグ配列領域)を含み得る。本明細書で使用される場合、「タグ」という用語は、ペイロードに付加されたポリヌクレオチド配列であって、発現すると、発現されたペイロードを同定するために使用され得るポリヌクレオチド配列を示す。あるいは、「タグ」という用語は、細胞の特定の領域(例えば、小胞体)における発現されたペイロードの保持についてのシグナルとなる、ペイロードに付加されたポリヌクレオチド配列を示し得る。
いくつかの実施形態では、タグポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、約10~50ヌクレオチド長、例えば、約10~40ヌクレオチド、約10~30ヌクレオチド、約10~20ヌクレオチド、約20~50ヌクレオチド、約20~40ヌクレオチド、約20~30ヌクレオチド、約30~50ヌクレオチド、約30~40ヌクレオチド、または約40~50ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、タグポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、約10ヌクレオチド~約30ヌクレオチド、例えば、約18ヌクレオチドまたは約21ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、タグポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、約20ヌクレオチド~約40ヌクレオチド、例えば、約27ヌクレオチドを含む。
Figure 2023523401000052
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、表16に提示されたタグ配列を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、タグ1~タグ7のいずれか1つまたはその機能的バリアントを含む。いくつかの実施形態では、タグ配列は、配列番号1127~1133のいずれか1つのヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、コードされたタグポリペプチドは、配列番号1127~1133のいずれか1つによってコードされるアミノ酸配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、1つのタグ配列領域を含む。いくつかの実施形態では、タグ配列領域はタグ1配列領域である。いくつかの実施形態では、タグ配列領域はタグ2配列領域である。いくつかの実施形態では、タグ配列領域はタグ3配列領域である。いくつかの実施形態では、タグ配列領域はタグ4配列領域である。いくつかの実施形態では、タグ配列領域はタグ5配列領域である。いくつかの実施形態では、コードされたタグ配列領域はタグ6配列領域である。いくつかの実施形態では、コードされたタグ配列領域はタグ7配列領域である。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、複数のタグ配列領域を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、2つのタグ配列領域を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、3つのタグ配列領域を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、3つを超えるタグ配列領域を含む。
ウイルスゲノム構成要素:ポリアデニル化配列領域
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのポリアデニル化配列領域を含み得る。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、ペイロードをコードする導入遺伝子の3’末端と3’ITRの5’末端との間にポリアデニル化配列(本明細書ではpoly A、polyA、またはpoly-Aと呼ばれる)を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、2つ以上のpolyA配列を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、polyA配列を含まない。
いくつかの実施形態では、polyAシグナル領域は、約100~600ヌクレオチド、例えば、約100~500ヌクレオチド、約100~400ヌクレオチド、約100~300ヌクレオチド、約100~200ヌクレオチド、約200~600ヌクレオチド、約200~500ヌクレオチド、約200~400ヌクレオチド、約200~300ヌクレオチド、約300~600ヌクレオチド、約300~500ヌクレオチド、約300~400ヌクレオチド、約400~600ヌクレオチド、約400~500ヌクレオチド、または約500~600ヌクレオチドの長さを含む。いくつかの実施形態では、polyAシグナル領域は、約100~150ヌクレオチド、例えば、約127ヌクレオチドの長さを含む。
Figure 2023523401000053
いくつかの実施形態では、polyAシグナル領域は表17に提示されている。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、polyA1、polyA2、polyA3、またはそれらの機能的バリアントから選択されるpolyA配列領域を含む。いくつかの実施形態では、polyAシグナル領域は、配列番号1134~1136のいずれか1つのヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性をもつ配列を含む。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、1つのpolyA配列領域を含む。いくつかの実施形態では、polyA配列領域はPolyA1配列である。いくつかの実施形態では、polyA配列領域はPolyA2配列である。いくつかの実施形態では、polyA配列領域はPolyA3配列である。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、複数のpolyA配列領域を含む。
ウイルスゲノム構成要素:フィラー配列領域
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、少なくとも1つまたは複数のフィラー配列領域を含み得る。
いくつかの実施形態では、フィラー配列は、約100~2000、約200~1900、約300~1800、約400~1700、約500~1600、約600~1500、約700~1500、約800~1500、約900~1500、約1000~1500ヌクレオチド長、例えば、約1000~1400ヌクレオチド、約1000~1300ヌクレオチド、約1000~1200ヌクレオチド、約1200~1500ヌクレオチド、約1200~1400ヌクレオチド、約1200~1300ヌクレオチド、約1300~1500ヌクレオチド、約1300~1400ヌクレオチド、または約1400~1500ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、フィラー配列は、約1140ヌクレオチド~約1160ヌクレオチド長、例えば、約1153ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、フィラー配列は、約1230ヌクレオチド~約1250ヌクレオチド長、例えば、約1240ヌクレオチドを含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約1153ヌクレオチド長であるフィラー領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約1240ヌクレオチド長であるフィラー領域を含む。
いくつかの実施形態では、Aウイルスゲノムは、少なくとも1つのフィラー配列領域を含む。フィラー配列領域の非限定的な例を表18に記載する。
Figure 2023523401000054
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、2つ以上のフィラー配列を含む。フィラー配列は表18に提示されている。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、フィラー1、フィラー2、またはそれらの機能的バリアントを含む。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、フィラー1及びフィラー2を含む。いくつかの実施形態では、フィラー配列は、配列番号1137のヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、99%、もしくは100%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、フィラー配列は、配列番号1138のヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、99%、もしくは100%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、フィラー配列領域を含まない。
ウイルスゲノム構成要素:ペイロード
本開示のウイルスゲノムは、少なくとも1つのペイロード領域を含む。本明細書で使用される場合、「ペイロード」または「ペイロード領域」は、ウイルスゲノムにより、もしくはウイルスゲノム内でコードされる、1もしくは複数のポリヌクレオチドもしくはポリヌクレオチド領域、またはこのようなポリヌクレオチドもしくはポリヌクレオチド領域の発現産物、例えば、導入遺伝子、ポリペプチドもしくはマルチポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、または調整性核酸もしくは調節性核酸を指す。本開示のペイロードは、典型的には、ポリペプチド(例えば、抗体または抗体ベースの組成物)またはそのフラグメントもしくはバリアントをコードする。
ペイロード領域は、mRNAの天然の構成に類似または酷似する領域を反映するようなかたちで構築され得る。
ペイロード領域は、コード核酸配列と非コード核酸配列との組み合わせを含み得る。
いくつかの実施形態では、AAVペイロード領域は、コードRNAまたは非コードRNAをコードしてもよい。
いくつかの実施形態では、AAV粒子は、複数の目的のポリペプチド(例えば、抗体の重鎖及び軽鎖)をコードする核酸配列を含むペイロード領域を有するウイルスゲノムを含む。このような実施形態では、複数のポリペプチドをコードするウイルスゲノムを複製し、ウイルス粒子にパッケージングすることができる。複数のポリペプチドを含むウイルス粒子が形質導入された標的細胞は、ポリペプチドの各々を単一の細胞で発現し得る。
いくつかの実施形態では、AAV粒子は、抗体の重鎖及び軽鎖をコードする核酸配列またはそのフラグメントを含むペイロード領域を有するウイルスゲノムを含む。重鎖及び軽鎖は、発現され、アセンブルされて機能的抗体を形成し、次いでこれが分泌され得る。
いくつかの実施形態では、ペイロード領域は、少なくとも1つの逆方向末端反復(ITR)、プロモーター領域、イントロン領域、及びコード領域を含み得る。いくつかの実施形態では、コード領域は、抗体の重鎖領域及び/または軽鎖領域、またはそのフラグメントを含み、任意の2つの構成要素は、リンカー領域によって分離されていてもよい。
いくつかの実施形態では、コード領域は、リンカー及び/または切断部位によって分離された重鎖及び軽鎖配列を有するペイロード領域を含み得る。いくつかの実施形態では、重鎖及び軽鎖配列は、IRES配列によって分離されている。いくつかの実施形態では、重鎖及び軽鎖配列は、口蹄疫ウイルス配列によって分離されている。いくつかの実施形態では、重鎖及び軽鎖配列は、口蹄疫ウイルス配列及びフューリン切断部位によって分離されている。いくつかの実施形態では、重鎖及び軽鎖配列は、ブタテッショウウイルス-1ウイルス配列によって分離されている。いくつかの実施形態では、重鎖及び軽鎖配列は、ブタテッショウウイルス-1ウイルス及びフューリン切断部位によって分離されている。いくつかの実施形態では、重鎖及び軽鎖配列は、5xG4S配列(配列番号1109として開示される「5xG4S」)によって分離されている。
いくつかの実施形態では、ペイロード領域は、抗タウ抗体、またはそのバリアントもしくはフラグメントをコードする、1または複数の核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、バリアントは、表1、6、2A~2C、4及び5のいずれか1つにおける、いずれか1つの抗体のCDR領域のいずれか1または複数(例えば、6つすべて)を含むヒト化バリアントのような、ヒト化バリアントである。
いくつかの実施形態では、AAV粒子のペイロード領域は、表3もしくは4のいずれかに各々列挙されている重鎖可変領域(VH)及び/または軽鎖可変領域(VL)配列を含む1つのポリペプチドもしくは複数のポリペプチド、またはそのバリアントもしくはフラグメントをコードする核酸配列を含み、場合により、ポリペプチド(複数可)は、表Xに列挙されたもののような重鎖定常領域及び/または軽鎖定常領域をさらに含む。ポリペプチドは、完全長抗体(例えば、表Xに列挙されたもののようなVH及び重鎖定常領域、ならびに表Xに列挙されたもののようなVL及び軽鎖定常領域を含む)、またはその抗体フラグメント、例えばFab、F(ab’)、scFvなどを構成し得る。ペイロード領域は、重鎖配列と軽鎖配列との間にリンカーを含んでもよい。ある特定の実施形態では、重鎖またはVHのコード配列は、軽鎖またはVLのコード配列に対して5’にあり、その逆も同様である。
いくつかの実施形態では、AAV粒子のペイロード領域は、表3もしくは4に列挙された重鎖可変領域及び軽鎖可変領域配列を含むポリペプチド、またはそのバリアントもしくはフラグメントをコードする核酸配列を含み、重鎖可変領域配列は、軽鎖可変領域配列とは異なる抗体に由来する。ある特定の実施形態では、AAV粒子のペイロード領域は、表3もしくは4に列挙された重鎖可変領域及び軽鎖可変領域配列を含むポリペプチド、またはそのバリアントもしくはフラグメントをコードする核酸配列を含み、VH及びVL配列は同じ抗体に由来する。ペイロード領域は、重鎖可変領域配列と軽鎖可変領域配列との間にリンカーを含んでもよい。
いくつかの実施形態では、ペイロード領域は、5’から3’の方向に、抗体軽鎖配列、リンカー、及び重鎖配列を含む(例えば、軽鎖・リンカー・重鎖またはL.リンカー.HまたはLH)。別の実施形態では、リンカーは使用されないか、または不在である。
いくつかの実施形態では、ペイロード領域は、5’から3’の方向に、表3または4(VL配列の場合)及びX(定常領域配列の場合)の抗体軽鎖配列、リンカー、ならびに表3または4(VH配列の場合)及びX(定常領域配列の場合)の重鎖配列をコードする核酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、ペイロード領域は、5’から3’の方向に、抗体重鎖配列、リンカー領域(1または複数のリンカーを含み得る)、及び軽鎖配列を含む(すなわち、重鎖・リンカー・軽鎖またはH.リンカー.LまたはHL)。別の実施形態では、リンカーは使用されないか、または不在である。
いくつかの実施形態では、ペイロード領域は、5’から3’の方向に、表3または4(VH配列の場合)及びX(定常領域配列の場合)の抗体重鎖配列、1または複数のリンカー、ならびに表3または4(VL配列の場合)及びX(定常領域配列の場合)の軽鎖配列をコードする核酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、ペイロード領域は、単一の重鎖をコードする核酸配列を含む。非限定的な例として、重鎖は、表3(VHの場合)、2A~2C及び6(CDRH1~CDRH3の場合)、7(FRH1~FRH4の場合)、4(CDRH1~CDRH3またはVHの場合)、5(CDRH1~CDRH3の場合)、及び/またはX(重鎖定常領域の場合)に記載される1または複数のアミノ酸配列またはそれらのフラグメントを含む。
いくつかの実施形態では、ペイロード領域は、軽鎖をコードする核酸配列をさらに含み得る。非限定的な例として、軽鎖は、表3(VLの場合)、2A~2C及び6(CDRL1~CDRL3の場合)、7(FRL1~FRL4の場合)、4(CDRL1~CDRL3またはVLの場合)、5(CDRL1~CDRL3の場合)、及び/またはX(軽鎖定常領域の場合)に記載される1または複数のアミノ酸配列またはそれらのフラグメントを含む。
表1、3、6、7、X、2A~2C、4、及び5には、抗体の構成要素ならびにそれらのポリヌクレオチド配列及び/またはポリペプチド配列のリストが示されている。これらの配列は、本開示のウイルスゲノムによってコードされるか、またはそれに含まれ得る。表1、3、6、7、X、2A~2C、4、及び5に記載される抗体配列のバリアントまたはフラグメントが、本開示のウイルスゲノムにおいて利用されてもよい。
いくつかの実施形態では、AAV粒子のペイロード領域は、表1、3、6、7、2A~2C、4、及び5に列挙されたペイロード抗体ポリペプチド、またはそのバリアントもしくはフラグメントのうちの1または複数をコードする、1または複数の核酸配列を含む。本明細書で使用される場合、「抗体ポリヌクレオチド」は、抗体ポリペプチドをコードする核酸配列を指す。
いくつかの実施形態では、AAV粒子のペイロード領域は、表3、X、もしくは4に列挙された1または複数の核酸配列、またはそれらのバリアントもしくはフラグメントを含む。
いくつかの実施形態では、AAV粒子のペイロード領域は、表1、3、6、7、X、2A~2C、4、及び5のいずれかに列挙された、1または複数のペイロード抗体ポリペプチド、またはそれらのフレームワーク領域、定常領域、及び抗原結合性フラグメント(VH/VL、及びCDRなど)を含むそれらのフラグメントに対して、少なくとも50%の同一性をもつペイロード抗体をコードする核酸配列を含む。コードされた抗体ポリペプチドは、表1、3、6、7、X、2A~2C、4、及び5に列挙されたペイロード抗体ポリペプチドもしくはそれらのフラグメント、またはそれらのバリアントもしくはフラグメントのうちの1または複数に対して、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有し得る。
いくつかの実施形態では、コードされた抗体ポリペプチドの可変領域配列(複数可)(例えば、重鎖または軽鎖)は、表3もしくは4に列挙されたペイロード抗体ポリペプチド、またはそれらのバリアントもしくはフラグメントのうちの1または複数に対して、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有し得る。
いくつかの実施形態では、コードされた抗体ポリペプチドのCDR領域のうちのいずれか1または複数は、表1、2A~2C、6、4、及び5のいずれかに列挙されたペイロード抗体ポリペプチド、またはそれらのバリアントもしくはフラグメントのうちの1または複数のCDRと比較して、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、もしくは100%の同一性を有し得るか、または少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、もしくは16個、もしくはそれ以下の変化(例えば、保存的置換を含む置換、欠失、及び/または挿入)を含む。
いくつかの実施形態では、コードされた抗体ポリペプチドのフレームワーク領域は、表7もしくは4に列挙されたペイロード抗体ポリペプチド、またはそれらのバリアントもしくはフラグメントのうちの1または複数のフレームワーク配列と比較して、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、もしくは100%の同一性を有し得るか、または少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、もしくは20個、もしくはそれ以下の変化(例えば、保存的置換を含む置換、欠失、及び/または挿入)を含む。
いくつかの実施形態では、ペイロード抗体(例えば、完全長重鎖もしくは完全長軽鎖、またはHC CDR1~3もしくはLC CDR1~3を含むそれらのVHもしくはVL)は、表1、2A~2C、3、6、7、X、4、及び/または5に列挙された抗体ポリペプチド(例えば、VH/VL領域及びCH/CL領域を含む完全長抗体)、またはそれらのバリアントもしくはフラグメントのうちの1または複数に対して90%の同一性を有する。
いくつかの実施形態では、ペイロード抗体(例えば、完全長重鎖もしくは完全長軽鎖、またはHC CDR1~3もしくはLC CDR1~3を含むそれらのVHもしくはVL)は、表1、2A~2C、3~7、及び/またはXに列挙された抗体ポリペプチド(例えば、VH/VL領域及びCH/CL領域を含む完全長抗体)、またはそれらのバリアントもしくはフラグメントのうちの1または複数に対して91%の同一性を有する。
いくつかの実施形態では、ペイロード抗体(例えば、完全長重鎖もしくは完全長軽鎖、またはHC CDR1~3もしくはLC CDR1~3を含むそれらのVHもしくはVL)は、表1、2A~2C、3~7、及び/またはXに列挙された抗体ポリペプチド(例えば、VH/VL領域及びCH/CL領域を含む完全長抗体)、またはそれらのバリアントもしくはフラグメントのうちの1または複数に対して92%の同一性を有する。
いくつかの実施形態では、ペイロード抗体(例えば、完全長重鎖もしくは完全長軽鎖、またはHC CDR1~3もしくはLC CDR1~3を含むそれらのVHもしくはVL)は、表1、2A~2C、3~7、及び/またはXに列挙された抗体ポリペプチド(例えば、VH/VL領域及びCH/CL領域を含む完全長抗体)、またはそれらのバリアントもしくはフラグメントのうちの1または複数に対して93%の同一性を有する。
いくつかの実施形態では、ペイロード抗体(例えば、完全長重鎖もしくは完全長軽鎖、またはHC CDR1~3もしくはLC CDR1~3を含むそれらのVHもしくはVL)は、表1、2A~2C、3~7、及び/またはXに列挙された抗体ポリペプチド(例えば、VH/VL領域及びCH/CL領域を含む完全長抗体)、またはそれらのバリアントもしくはフラグメントのうちの1または複数に対して94%の同一性を有する。
いくつかの実施形態では、ペイロード抗体(例えば、完全長重鎖もしくは完全長軽鎖、またはHC CDR1~3もしくはLC CDR1~3を含むそれらのVHもしくはVL)は、表1、2A~2C、3~7、及び/またはXに列挙された抗体ポリペプチド(例えば、VH/VL領域及びCH/CL領域を含む完全長抗体)、またはそれらのバリアントもしくはフラグメントのうちの1または複数に対して95%の同一性を有する。
いくつかの実施形態では、ペイロード抗体(例えば、完全長重鎖もしくは完全長軽鎖、またはHC CDR1~3もしくはLC CDR1~3を含むそれらのVHもしくはVL)は、表1、2A~2C、3~7、及び/またはXに列挙された抗体ポリペプチド(例えば、VH/VL領域及びCH/CL領域を含む完全長抗体)、またはそれらのバリアントもしくはフラグメントのうちの1または複数に対して96%の同一性を有する。
いくつかの実施形態では、ペイロード抗体(例えば、完全長重鎖もしくは完全長軽鎖、またはHC CDR1~3もしくはLC CDR1~3を含むそれらのVHもしくはVL)は、表1、2A~2C、3~7、及び/またはXに列挙された抗体ポリペプチド(例えば、VH/VL領域及びCH/CL領域を含む完全長抗体)、またはそれらのバリアントもしくはフラグメントのうちの1または複数に対して97%の同一性を有する。
いくつかの実施形態では、ペイロード抗体(例えば、完全長重鎖もしくは完全長軽鎖、またはHC CDR1~3もしくはLC CDR1~3を含むそれらのVHもしくはVL)は、表1、2A~2C、3~7、及び/またはXに列挙された抗体ポリペプチド(例えば、VH/VL領域及びCH/CL領域を含む完全長抗体)、またはそれらのバリアントもしくはフラグメントのうちの1または複数に対して98%の同一性を有する。
いくつかの実施形態では、ペイロード抗体(例えば、完全長重鎖もしくは完全長軽鎖、またはHC CDR1~3もしくはLC CDR1~3を含むそれらのVHもしくはVL)は、表1、2A~2C、3~7、及び/またはXに列挙された抗体ポリペプチド(例えば、VH/VL領域及びCH/CL領域を含む完全長抗体)、またはそれらのバリアントもしくはフラグメントのうちの1または複数に対して99%の同一性を有する。
いくつかの実施形態では、ペイロード抗体(例えば、完全長重鎖もしくは完全長軽鎖、またはHC CDR1~3もしくはLC CDR1~3を含むそれらのVHもしくはVL)は、表1、2A~2C、3~7、及び/またはXに列挙された抗体ポリペプチド(例えば、VH/VL領域及びCH/CL領域を含む完全長抗体)、またはそれらのバリアントもしくはフラグメントのうちの1または複数に対して100%の同一性を有する。
いくつかの実施形態では、AAV粒子のペイロード領域は、表3もしくは4に列挙された1または複数の核酸配列またはそれらのバリアントもしくはフラグメントに対して少なくとも50%の同一性をもつ核酸配列を含む。ペイロード核酸配列は、表3もしくは4に列挙された1または複数の核酸配列またはそれらのバリアントもしくはフラグメントに対して、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を有し得る。
いくつかの実施形態では、ペイロード核酸配列は、表3もしくは4に列挙された核酸配列またはそれらのバリアントもしくはフラグメントのうちの1または複数に対して90%の同一性を有する。
いくつかの実施形態では、ペイロード核酸配列は、表3もしくは4に列挙された核酸配列またはそれらのバリアントもしくはフラグメントのうちの1または複数に対して91%の同一性を有する。
いくつかの実施形態では、ペイロード核酸配列は、表3もしくは4に列挙された核酸配列またはそれらのバリアントもしくはフラグメントのうちの1または複数に対して92%の同一性を有する。
いくつかの実施形態では、ペイロード核酸配列は、表3もしくは4に列挙された核酸配列またはそれらのバリアントもしくはフラグメントのうちの1または複数に対して93%の同一性を有する。
いくつかの実施形態では、ペイロード核酸配列は、表3もしくは4に列挙された核酸配列またはそれらのバリアントもしくはフラグメントのうちの1または複数に対して94%の同一性を有する。
いくつかの実施形態では、ペイロード核酸配列は、表3もしくは4に列挙された核酸配列またはそれらのバリアントもしくはフラグメントのうちの1または複数に対して95%の同一性を有する。
いくつかの実施形態では、ペイロード核酸配列は、表3もしくは4に列挙された核酸配列またはそれらのバリアントもしくはフラグメントのうちの1または複数に対して96%の同一性を有する。
いくつかの実施形態では、ペイロード核酸配列は、表3もしくは4に列挙された核酸配列またはそれらのバリアントもしくはフラグメントのうちの1または複数に対して97%の同一性を有する。
いくつかの実施形態では、ペイロード核酸配列は、表3もしくは4に列挙された核酸配列またはそれらのバリアントもしくはフラグメントのうちの1または複数に対して98%の同一性を有する。
いくつかの実施形態では、ペイロード核酸配列は、表3もしくは4に列挙された核酸配列またはそれらのバリアントもしくはフラグメントのうちの1または複数に対して99%の同一性を有する。
いくつかの実施形態では、ペイロード核酸配列は、表3もしくは4に列挙された核酸配列またはそれらのバリアントもしくはフラグメントのうちの1または複数に対して100%の同一性を有する。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、コドン最適化されている1または複数の構成要素を含み得る。コドン最適化は、Genscript、EMBOSS、Bioinformatics、NUS、NUS2、Geneinfinity、IDT、NUS3、GregThatcher、Insilico、Molbio、N2P、Snapgene、及び/またはVectorNTIによる方法などだがこれらに限定されない、当業者に公知の任意の方法によって達成され得る。同じウイルスゲノム内の抗体の重鎖配列及び/または軽鎖配列は、同じ方法に従って、または異なる方法に従ってコドン最適化されてもよい。
いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、本明細書に記載されるまたは当技術分野で一般的に知られている構成要素の任意の組み合わせを含み得る。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、5’ITR、プロモーター領域(1または複数の構成要素部分を含み得る)、エクソン領域、イントロン領域、Kozak配列、1もしくは複数のシグナル配列(抗体のシグナル配列または別のタンパク質に由来するシグナル配列)、1もしくは複数のフューリン切断部位、1もしくは複数のリンカー配列、1もしくは複数の抗体軽鎖可変領域、1もしくは複数の抗体軽鎖定常領域、1もしくは複数の抗体重鎖可変領域、1もしくは複数の抗体重鎖定常領域、ポリアデニル化配列、及び/またはフィラー配列を含むがこれらに限定されない構成要素の任意の組み合わせを含み得る。
いくつかの実施形態では、AAVウイルスゲノムは、5’から3’の方向に読んだ場合、5’ITR、プロモーター領域、任意選択のイントロン領域、シグナル配列、抗体軽鎖領域、リンカー領域、シグナル配列、抗体重鎖領域、ポリアデニル化配列、任意選択のフィラー配列、及び3’ITRを含む。いくつかの実施形態では、AAVウイルスゲノムは、5’から3’の方向に読んだ場合、軽鎖・リンカー・重鎖フォーマットの抗体構築物を含む。
いくつかの実施形態では、AAVウイルスゲノムは、5’から3’の方向に読んだ場合、5’ITR、プロモーター領域、任意選択のイントロン領域、シグナル配列、抗体重鎖領域、リンカー領域、シグナル配列、抗体軽鎖領域、ポリアデニル化配列、任意選択のフィラー配列、及び3’ITRを含む。いくつかの実施形態では、AAVウイルスゲノムは、5’から3’の方向に読んだ場合、重鎖・リンカー・軽鎖フォーマットの抗体構築物を含む。
ウイルスゲノムは、Fab、F(ab’)、またはscFvフラグメントなどだがこれらに限定されない抗体フラグメントをコードし得る。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、Fab抗体フラグメントをコードする。別の実施形態では、ウイルスゲノムは、F(ab’)抗体フラグメントをコードする。いくつかの実施形態では、ウイルスゲノムは、scFvをコードする。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるウイルスゲノム、またはそのフラグメントは、AAV粒子を生成するために、表9から選択されるまたは本明細書に記載される血清型を有するカプシドにパッケージングされる。例えば、カプシド血清型は、VOY101、VOY201、AAVPHP.B、AAVPHP.N、AAV1、AAV2、AAV2バリアント、AAV3、AAV2/3バリアント、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV9.47、AAV9(hu14)、AAV9 K449R、AAV10、AAV11、AAV12、AAVrh8、AAVrh10、AAVDJ、もしくはAAVDJ8、またはそれらの任意のバリアントであり得る。いくつかの実施形態では、カプシド血清型は、AAVPHP.B、AAV9、AAV6、AAVrh10、及び/またはAAVDJである。
本開示はまた、いくつかの実施形態において、上記のウイルスゲノムを含む核酸、細胞、AAVベクター、及びAAV粒子を提供する。
AAVの産生
本開示は、ウイルス複製細胞におけるウイルスゲノム複製による、パルボウイルス粒子、例えばAAV粒子の生成のための方法を提供する。
本開示によれば、抗体、抗体ベースの組成物またはそのフラグメントをコードするペイロード領域を含むウイルスゲノムが、ウイルス複製細胞で産生されるAAV粒子に組み込まれる。AAV粒子を作製する方法は当技術分野において周知であり、例えば、米国特許第US6204059号、同第US5756283号、同第US6258595号、同第US6261551号、同第US6270996号、同第US6281010号、同第US6365394号、同第US6475769号、同第US6482634号、同第US6485966号、同第US6943019号、同第US6953690号、同第US7022519号、同第US7238526号、同第US7291498号及び同第US7491508号、同第US5064764号、同第US6194191号、同第US6566118号、同第US8137948号、または国際公開第WO1996039530号、同第WO1998010088号、同第WO1999014354号、同第WO1999015685号、同第WO1999047691号、同第WO2000055342号、同第WO2000075353号、及び同第WO2001023597号、Methods In Molecular Biology,ed.Richard,Humana Press,NJ(1995)、O’Reilly et al.,Baculovirus Expression Vectors,A Laboratory Manual,Oxford Univ.Press(1994)、Samulski et al.,J.Vir.63:3822-8(1989)、Kajigaya et al.,Proc.Nat’l.Acad.Sci.USA88:4646-50(1991)、Ruffing et al.,J.Vir.66:6922-30(1992)、Kimbauer et al.,Vir.,219:37-44(1996)、Zhao et al.,Vir.272:382-93(2000)に記載されており、各文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、AAV粒子は、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれるWO2015191508に記載の方法を使用して作製される。
組換えAAVウイルスベクターの産生に一般的に使用されるウイルス複製細胞は、293細胞、COS細胞、HeLa細胞、KB細胞、ならびに米国特許第US6156303号、同第US5387484号、同第US5741683号、同第US5691176号、及び同第US5688676号、米国特許公開第2002/0081721号、及び国際特許公開第WO00/47757号、同第WO00/24916号、及び同第WO96/17947号に記載の他の哺乳動物細胞株を含むが、これらに限定されず、各文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、本開示のAAV粒子は、昆虫細胞(例えば、Sf9細胞)で産生され得る。
いくつかの実施形態では、本開示のAAV粒子は、トリプルトランスフェクションを使用して産生され得る。
いくつかの実施形態では、本開示のAAV粒子は、哺乳動物細胞で産生され得る。
いくつかの実施形態では、本開示のAAV粒子は、哺乳動物細胞におけるトリプルトランスフェクションによって産生され得る。
いくつかの実施形態では、本開示のAAV粒子は、HEK293細胞におけるトリプルトランスフェクションによって産生され得る。
本開示は、1)バクミドベクターならびにウイルス構築物ベクター及び/またはAAVペイロード構築物ベクターのいずれかをコンピテント細菌細胞にコトランスフェクトするステップ、2)得られたウイルス構築物発現ベクター及びAAVペイロード構築物発現ベクターを単離し、ウイルス複製細胞に別々にトランスフェクトするステップ、3)得られたペイロードと、ウイルス構築物発現ベクターまたはAAVペイロード構築物発現ベクターを含むウイルス構築物粒子とを単離及び精製するステップ、4)AAVペイロードと、ウイルス構築物発現ベクターまたはAAVペイロード構築物発現ベクターを含むウイルス構築物粒子との両方をウイルス複製細胞に同時感染させるステップ、5)パルボウイルスゲノムを含むウイルス粒子を採取及び精製するステップを含む、AAV粒子を産生する方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示は、1)HEK293細胞などだがこれに限定されない哺乳動物細胞に、ペイロード領域、rep遺伝子及びcap遺伝子を発現する構築物、ならびにヘルパー構築物を同時にコトランスフェクトするステップ、2)ウイルスゲノムを含むAAV粒子を採取及び精製するステップを含む、AAV粒子を産生する方法を提供する。
いくつかの実施形態では、AAV産生に使用されるウイルス構築物ベクター(複数可)は、AAVカプシドタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含んでもよく、ここで、AAV VP1カプシドタンパク質の開始コドンは非ATG、すなわち、準最適開始コドンであり、産生系において改変された比率のウイルスカプシドタンパク質の発現を可能にして、宿主細胞の感染力の向上をもたらす。非限定的な例において、ウイルス構築物ベクターは、AAV VP1、VP2、及びVP3カプシドタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む核酸構築物を含んでもよく、ここで、AAV VP1カプシドタンパク質の翻訳のための開始コドンは、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許第US8163543号に記載されているように、CTG、TTG、またはGTGである。
いくつかの実施形態では、AAV産生に使用されるウイルス構築物ベクター(複数可)は、AAV repタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含んでもよく、ここで、AAV repタンパク質(複数可)の開始コドンは非ATGである。いくつかの実施形態では、単一のコード配列がRep78及びRep52タンパク質のために使用され、ここで、Rep78タンパク質の翻訳のための開始コドンは、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許第8,512,981号に記載されているように、昆虫細胞において発現すると部分的なエクソンスキッピングをもたらす、ACG、TTG、CTG及びGTGからなる群から選択される準最適開始コドンであり、これにより、例えば、Rep52と比較して発生量の低いRep78の発現が促進され、これは高いベクター収量を促進するという点で有利であり得る。
いくつかの実施形態では、AAV粒子のウイルスゲノムは、場合により、選択マーカーをコードする。選択マーカーは、受容体、CDマーカー、レクチン、インテグリン、またはそれらのトランケート型を含むがこれらに限定されない、細胞の表面で発現される任意のタンパク質などの細胞表面マーカーを含み得る。
いくつかの実施形態では、選択マーカーレポーター遺伝子は、国際出願第WO96/23810号、Heim et al.,Current Biology 2:178-182(1996)、Heim et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA(1995)、またはHeim et al.,Science 373:663-664(1995)、WO96/30540に記載されているものから選択され、各文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
本明細書に記載される抗タウ抗体ペイロードをコードするAAVウイルスゲノムは、ヒト疾患、獣医学的用途ならびに種々のin vivo及びin vitro設定の分野で有用であり得る。本開示のAAV粒子は、医学分野において、神経疾患及び/または神経障害の処置、予防、緩和、または改善のために有用であり得る。いくつかの実施形態では、AAV粒子は、タウオパチーの防止及び/または処置のために使用される。
本明細書における様々な実施形態は、本明細書に記載されるAAV粒子と薬学的に許容される賦形剤とを含む医薬組成物を提供する。
本明細書における様々な実施形態は、治療有効量の本明細書に記載される医薬組成物を対象に投与することを含む、それを必要とする対象を処置する方法を提供する。
本方法のある特定の実施形態は、静脈内、脳室内、実質内、鞘内、軟膜下、及び筋肉内、またはそれらの組み合わせからなる群から選択される医薬組成物の投与経路によって対象が処置されることを定める。本方法のある特定の実施形態は、対象がタウオパチー及び/または他の神経障害のために処置されることを定める。本方法の一態様では、タウオパチーもしくは他の神経障害の病理学的特性が軽減され、及び/またはタウオパチーもしくは他の神経障害の進行が停止、緩徐化、改善もしくは逆転する。
本明細書における様々な実施形態は、有効量の本明細書に記載される医薬組成物を対象に投与することを含む、それを必要とする前記対象の中枢神経系における可溶性タウのレベルを低下させる方法を説明する。
また本明細書には、AAV粒子の設計、調製、製造、及び/または製剤のための組成物、方法、プロセス、キット、及びデバイスも記載される。いくつかの実施形態では、抗タウ抗体などだがこれに限定されないペイロードが、ペイロード構築物によってコードされるか、またはプラスミドもしくはベクターもしくは組換えアデノ随伴ウイルス(AAV)に含まれてもよい。
本開示はまた、タウオパチーなどだがこれに限定されない神経疾患の処置または改善のための、ベクター及びウイルス粒子、例えばAAV粒子の投与方法及び/または送達方法を提供する。
III.製剤及び送達
医薬組成物
本明細書で開示される化合物及びAAV粒子は、医薬組成物として調製されてもよい。本明細書で使用される場合、「医薬組成物」という用語は、少なくとも1つの活性成分と、ほとんどの場合、薬学的に許容される賦形剤とを含む、組成物を指す。
本開示による医薬組成物における活性成分(例えば抗体)、薬学的に許容される賦形剤、及び/または任意の更なる成分の相対量は、処置される対象の個性、サイズ、及び/または状態に応じて、またさらに組成物が投与される経路に応じて変わり得る。例えば、組成物は、0.1%~99%(w/w)の活性成分を含み得る。例として、組成物は、0.1%~100%、例えば、.5~50%、1~30%、5~80%、少なくとも80%(w/w)の活性成分を含んでもよい。
本明細書で提供される医薬組成物の説明はヒトへの投与に好適な医薬組成物を主に対象としているが、当業者には、このような組成物が、任意の他の動物、例えば、非ヒト動物、例えば非ヒト哺乳動物への投与に概して好適であることは理解されよう。ヒトへの投与に好適な医薬組成物を、様々な動物への投与に好適な組成物にするために修飾することは十分に理解されており、通常の技能を有する獣医薬理学者であれば、実験を行うにしても通常の実験を行うだけで、このような修飾を設計及び/または実行することができる。医薬組成物の投与が企図される対象は、ヒト及び/または他の霊長類、畜牛、ブタ、ウマ、ヒツジ、ネコ、イヌ、マウス、ラットなどの商業的に有意義な哺乳動物を含む哺乳動物、家禽、ニワトリ、アヒル、ガチョウ、及び/または七面鳥などの商業的に有意義な鳥類を含む鳥類を含むが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、組成物は、ヒト、ヒト患者、または対象に投与される。
製剤
本開示の化合物及びAAV粒子は、(1)安定性を増加させる、(2)細胞透過性を増加させる、(3)徐放もしくは遅延放出(例えば、徐放製剤からの)を可能にする、及び/または(4)生体内分布を変化させる(例えば、抗体の標的を特定の組織または細胞型に定める)ための1または複数の賦形剤を使用して製剤することができる。ありとあらゆる溶媒、分散媒、希釈剤、または他の液体ビヒクル、分散助剤もしくは懸濁助剤、表面活性剤、等張化剤、増粘剤もしくは乳化剤、防腐剤などの従来の賦形剤に加えて、本開示の製剤は、限定するものではないが、リポソーム、脂質ナノ粒子、ポリマー、リポプレックス、コア-シェルナノ粒子、ペプチド、タンパク質、トランスフェクト細胞(例えば、対象への移植用)、及びそれらの組み合わせを含み得る。
本明細書に記載される医薬組成物は、薬理学の分野において既知の、または今後開発される方法によって調製され得る。このような調製方法は、活性成分を賦形剤及び/または1もしくは複数の他の補助成分と会合させるステップを含み得る。
本開示による医薬組成物は、バルクで、単回単位用量として、及び/または複数の単回単位用量として、調製、パッケージング、及び/または販売され得る。本明細書で使用される場合、「単位用量」は、既定量の活性成分を含む医薬組成物の個別量を指す。活性成分の量は、概して、対象に投与される活性成分の投与量、及び/またはこのような投与量の簡便な一部、例えば、このような投与量の半分もしくは1/3などに等しい。
いくつかの実施形態では、AAV粒子は、エチレンオキシド/プロピレンオキシドコポリマー(プルロニック(登録商標)またはポロクサマーとしても知られる)と組み合わせて、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)中で製剤され得る。
いくつかの実施形態では、AAV粒子は、約7.0のpHで0.001%のプルロニック酸(F-68)(ポロクサマー188)と共にPBS中で製剤され得る。
いくつかの実施形態では、AAV粒子は、約7.3のpHで0.001%のプルロニック酸(F-68)(ポロクサマー188)と共にPBS中で製剤され得る。
いくつかの実施形態では、AAV粒子は、約7.4のpHで0.001%のプルロニック酸(F-68)(ポロクサマー188)を含むPBS中で製剤され得る。
いくつかの実施形態では、AAV粒子は、塩化ナトリウム、リン酸ナトリウム、及びエチレンオキシド/プロピレンオキシドコポリマーを含む溶液中で製剤され得る。
いくつかの実施形態では、AAV粒子は、塩化ナトリウム、二塩基性リン酸ナトリウム、一塩基性リン酸ナトリウム、及びポロクサマー188/プルロニック酸(F-68)を含む溶液中で製剤され得る。
いくつかの実施形態では、AAV粒子は、約180mMの塩化ナトリウム、約10mMのリン酸ナトリウム、及び約0.001%のポロクサマー188を含む溶液中で製剤され得る。いくつかの実施形態では、この製剤は約7.3のpHであり得る。最終溶液中の塩化ナトリウムの濃度は150mM~200mMであり得る。非限定的な例として、最終溶液中の塩化ナトリウムの濃度は、150mM、160mM、170mM、180mM、190mM、または200mMでもよい。最終溶液中のリン酸ナトリウムの濃度は1mM~50mMであり得る。非限定的な例として、最終溶液中のリン酸ナトリウムの濃度は、1mM、2mM、3mM、4mM、5mM、6mM、7mM、8mM、9mM、10mM、15mM、20mM、25mM、30mM、40mM、または50mMでもよい。ポロクサマー188(プルロニック酸(F-68))の濃度は0.0001%~1%でもよい。非限定的な例として、ポロクサマー188(プルロニック酸(F-68))の濃度は、0.0001%、0.0005%、0.001%、0.005%、0.01%、0.05%、0.1%、0.5%、または1%でもよい。最終溶液は6.8~7.7のpHを有し得る。最終溶液のpHの非限定的な例としては、6.8、6.9、7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、または7.7のpHが挙げられる。
いくつかの実施形態では、本発明のAAV粒子は、約7.4のpHで、約1.05%の塩化ナトリウム、約0.212%の二塩基性リン酸ナトリウム七水和物、約0.025%の一塩基性リン酸ナトリウム一水和物、及び0.001%のポロクサマー188を含む溶液中で製剤され得る。非限定的な例として、この製剤溶液中のAAV粒子の濃度は、約0.001%であり得る。最終溶液中の塩化ナトリウムの濃度は0.1~2.0%でもよく、非限定的な例は0.1%、0.25%、0.5%、0.75%、0.95%、0.96%、0.97%、0.98%、0.99%、1.00%、1.01%、1.02%、1.03%、1.04%、1.05%、1.06%、1.07%、1.08%、1.09%、1.10%、1.25%、1.5%、1.75%、または2%である。最終溶液中の二塩基性リン酸ナトリウムの濃度は0.100~0.300%でもよく、非限定的な例は0.100%、0.125%、0.150%、0.175%、0.200%、0.210%、0.211%、0.212%、0.213%、0.214%、0.215%、0.225%、0.250%、0.275%、0.300%を含む。最終溶液中の一塩基性リン酸ナトリウムの濃度は0.010~0.050%でもよく、非限定的な例は0.010%、0.015%、0.020%、0.021%、0.022%、0.023%、0.024%、0.025%、0.026%、0.027%、0.028%、0.029%、0.030%、0.035%、0.040%、0.045%、または0.050%である。ポロクサマー188(プルロニック酸(F-68))の濃度は0.0001%~1%でもよい。非限定的な例として、ポロクサマー188(プルロニック酸(F-68))の濃度は、0.0001%、0.0005%、0.001%、0.005%、0.01%、0.05%、0.1%、0.5%、または1%でもよい。最終溶液は6.8~7.7のpHを有し得る。最終溶液のpHの非限定的な例としては、6.8、6.9、7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、または7.7のpHが挙げられる。
本開示による医薬組成物中の活性成分(例えば抗体)、薬学的に許容される賦形剤、及び/または任意の更なる成分の相対量は、処置される対象の個性、サイズ、及び/または状態に応じて、またさらに投与経路に応じて変わり得る。例えば、組成物は、0.1%~99%(w/w)の活性成分を含んでもよい。例として、組成物は、0.1%~100%、例えば、0.5~50%、1~30%、5~80%、または少なくとも80%(w/w)の活性成分を含んでもよい。
本開示によれば、化合物は、CNS送達のために製剤され得る。脳血液関門を通過する薬剤を使用してもよい。例えば、分子の標的を脳血液関門内皮に定めることのできるいくつかの細胞透過性ペプチドを製剤に使用してもよい(例えば、Mathupala,Expert Opin Ther Pat.,2009,19,137-140;同文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。
賦形剤及び希釈剤
いくつかの実施形態では、薬学的に許容される賦形剤は、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、または100%純粋であり得る。いくつかの実施形態では、賦形剤は、ヒトへの使用及び獣医学的使用のために認可されている。いくつかの実施形態では、賦形剤は、米国食品医薬品局によって認可されていてもよい。いくつかの実施形態では、賦形剤は、医薬グレードのものであり得る。いくつかの実施形態では、賦形剤は、米国薬局方(USP)、欧州薬局方(EP)、英国薬局方、及び/または国際薬局方の基準を満たし得る。
賦形剤は、本明細書で使用される場合、所望される特定の剤形に適した、ありとあらゆる溶媒、分散媒、希釈剤、または他の液体ビヒクル、分散助剤もしくは懸濁助剤、表面活性剤、等張化剤、増粘剤もしくは乳化剤、防腐剤などを含むが、これらに限定されない。医薬組成物を製剤するための様々な賦形剤及び調製技法が当技術分野で知られている(全体が参照により本明細書に組み込まれるRemington:The Science and Practice of Pharmacy,21st Edition,A.R.Gennaro,Lippincott,Williams&Wilkins,Baltimore,MD,2006を参照のこと)。いずれかの従来の賦形剤媒体が、何らかの望ましくない生物学的作用をもたらすか、さもなければ本開示の医薬組成物のいずれかの他の成分(複数可)と有害な様式で相互作用することなどにより、ある特定の物質またはそれらの誘導体と適合しない可能性がある場合を除き、従来の賦形剤媒体の使用は、本開示の範囲内であると企図され得る。
例示的な希釈剤は、炭酸カルシウム、炭酸ナトリウム、リン酸カルシウム、リン酸二カルシウム、硫酸カルシウム、リン酸水素カルシウム、リン酸ナトリウムラクトース、スクロース、セルロース、微結晶セルロース、カオリン、マンニトール、ソルビトール、イノシトール、塩化ナトリウム、乾燥デンプン、トウモロコシデンプン、粉末糖など、及び/またはそれらの組み合わせを含むが、これらに限定されない。
不活性成分
いくつかの実施形態では、本開示の製剤は、少なくとも1つの不活性成分を含み得る。本明細書で使用される場合、「不活性成分」という用語は、医薬組成物の活性に寄与しない薬剤を指す。いくつかの実施形態では、本開示の製剤において使用され得る不活性成分のうちのすべてまたは一部は、米国食品医薬品局(FDA)によって認可されていても、認可されていなくてもよい。
本明細書で開示される製剤は、カチオンまたはアニオンを含み得る。製剤は、Zn2+、Ca2+、Cu2+、Mn2+、Mg、またはそれらの組み合わせを含み得る。非限定的な例として、製剤は、金属カチオンを含むポリマー及び錯体を含み得る(例えば、米国特許第6265389号及び同第6555525号を参照のこと。各文献は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。
IV.投与及び投薬
投与
本開示の化合物及び組成物(例えば、AAV粒子)は、治療上有効な転帰をもたらす任意の送達経路によって投与され得る。送達経路は、腸内(腸の中に)、胃腸、硬膜外(硬膜の中に)、経口(口を介して)、経皮、脳内(大脳の中に)、脳室内(脳室の中に)、皮膚上(皮膚への適用)、皮内(皮膚自体の中に)、皮下(皮膚の下に)、経鼻投与(鼻を通して)、静脈内(静脈の中に)、静脈内ボーラス、静脈内点滴、動脈内(動脈の中に)、筋肉内(筋肉の中に)、心臓内(心臓の中に)、骨内注入(骨髄の中に)、鞘内(脊柱管の中に)、実質内(組織、例えば、脳組織の実質の中に)、腹腔内(腹膜への注入または注射)、膀胱内注入、硝子体内(眼を通して)、空洞内注射(病的腔の中に)腔内(陰茎基部の中に)、膣内投与、子宮内、羊膜外投与、経皮(全身分布のためのインタクトな皮膚を通した拡散)、経粘膜(粘膜を通した拡散)、経膣、吹送(吸引)、舌下、唇下、浣腸、点眼(結膜上に)、点鼻薬、経耳(耳の中または耳を介して)、頬側(頬に向けられた)、経結膜、皮膚性、経歯(単数または複数の歯に)、電気浸透、子宮頸管内、洞内(endosinusial)、気管内、体外、血液透析、浸潤、間質内、腹内、羊膜内、関節内、胆管内、気管支内、嚢内、軟骨内(軟骨の中)、尾内(馬尾内)、大槽内(小脳延髄大槽の中)、角膜内(角膜の中)、歯冠内、冠動脈内(冠動脈の中)、海綿体内(陰茎の海綿体の膨張性空間内)、椎間板内(椎間板の中)、腺管内(腺管の中)、十二指腸内(十二指腸の中)、硬膜内(硬膜の中または下)、表皮内(表皮へ)、食道内(食道へ)、胃内(胃の中)、歯肉内(歯肉の中)、回腸内(小腸遠位部の中)、病巣内(局所病巣の中または局所病巣に直接導入される)、管腔内(管腔の中)、リンパ管内(リンパ内)、髄内(骨の髄腔の中)、髄膜内(髄膜の中)、心筋内(心筋の中)、眼内(眼の中)、卵巣内(卵巣の中)、心膜内(心膜の中)、胸膜内(胸膜の中)、前立腺内(前立腺の中)、肺内(肺またはその気管支の中)、洞内(intrasinal)(鼻洞または眼窩周囲洞の中)、脊髄内(脊柱の中)、滑膜内(関節の滑液腔の中)、腱内(腱の中)、精巣内(精巣の中)、鞘内(脳脊髄軸のいずれかのレベルにおける脳脊髄液の中)、胸腔内(胸腔の中)、管内(器官の細管の中)、腫瘍内(腫瘍の中)、鼓室内(中耳の中)、血管内(単数または複数の血管の中)、心室内(心室の中)、イオン泳動(可溶性塩のイオンを体組織に移動させる電流による)、灌注(開放創または体腔を浸すまたは洗い流すため)、喉頭(喉頭に直接)、経鼻胃(鼻を通って胃の中に)、閉鎖包帯技法(局所経路投与の後にその箇所を包帯で覆って塞ぐ)、眼部(外眼部に)、口咽頭(口及び咽喉に直接)、非経口、経皮的、関節周囲、硬膜上、神経周囲、歯周、直腸、呼吸器(局所的または全身的な効果のために経口的または経鼻的に吸入することによって気道の中に)、眼球後(脳橋の後ろまたは眼球の後ろ)、軟部組織、くも膜下、結膜下、粘膜下、局所、経胎盤(胎盤を通過または横断して)、経気管(気管壁を通して)、経鼓室(鼓室を横断または通過して)、尿管(尿管へ)、尿道(尿道へ)、膣、仙骨ブロック、診断、神経ブロック、胆道灌流、心臓灌流、フォトフェレーシス、及び脊髄を含むが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、組成物は、組成物が血液脳関門、血管関門、または他の上皮性関門を通過することを可能にするかたちで投与され得る。本開示の化合物及び組成物は、溶液として、懸濁液として、または溶液もしくは溶液中の懸濁液に好適な固体形態としての形態を含むがこれらに限定されない任意の好適な形態で投与され得る。
いくつかの実施形態では、対象への送達は、単一経路の投与によるものであり得る。いくつかの実施形態では、対象への送達は、複数部位の投与経路によるものであり得る。投与は、ボーラス注入を含んでもよい。投与は、分単位、時間単位、または日単位の期間にわたる持続的な送達を含み得る。注入による投与は、対象、分布、製剤、または他の送達パラメータに応じて変化し得る注入速度を含み得る。投与は、複数の投与経路によるものであり得る。非限定的な例として、併用投与は、鞘内投与及び脳室内投与、または静脈内投与及び実質内投与を含み得る。
静脈内投与
本開示の化合物及び組成物は、全身投与によって対象に投与され得る。いくつかの実施形態では、全身投与は静脈内投与を含み得る。全身投与は動脈内投与を含み得る。
本開示の化合物及び組成物は、静脈内投与によって対象に投与されてもよい。いくつかの実施形態では、静脈内投与は、皮下送達によって達成され得る。いくつかの実施形態では、AAV粒子は、例えば、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれるTerstappen et al.(Nat Rev Drug Discovery,https://doi.org/10.1038/s41573-021-00139-y(2021))、Burgess et al.(Expert Rev Neurother.15(5):477-491(2015))、及び/またはHsu et al.(PLOS One 8(2):1-8)に記載されているように、集束超音波(FUS)、例えば、微小気泡の静脈内投与と併用されるもの(FUS-MB)、または静脈内投与と併用されるMRIガイド下FUSを介して対象に投与される。いくつかの実施形態では、AAV粒子は、対象に静脈内投与される。静脈内投与は、尾静脈注射によって達成され得る(例えば、マウスモデルにおいて)。静脈内投与は、眼窩後注射によって達成されてもよい。
CNSへの投与
本開示の化合物及び組成物は、脳内への直接注射によって対象に投与されてもよい。非限定的な例として、脳への送達は、海馬内投与によるものであり得る。投与は、実質内投与によるものでもよい。いくつかの実施形態では、実質内投与は、中枢神経系の組織に対するものである。投与は、頭蓋内送達によるものでもよい(例えば、米国特許第8119611号を参照のこと;同文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。投与は、CSF経路への注射によるものでもよい。CSF経路への送達の非限定的な例としては、鞘内投与及び脳室内(例えば、大槽内-ICM)投与が挙げられる。脳への投与は、全身送達によるものでもよい。非限定的な例として、全身送達は、血管内投与によるものでもよい。非限定的な例として、全身投与または血管内投与は、静脈内でもよい。投与は、眼内送達経路によるものでもよい。眼内投与の非限定的な例としては、硝子体内注射が挙げられる。
筋肉内投与
いくつかの実施形態では、AAV粒子は、筋肉内投与によって送達され得る。理論に束縛されることを望むものではないが、筋細胞の多核性は、AAV送達後の遺伝子導入に利点をもたらす。筋肉の細胞は、適切な翻訳後修飾を有する組換えタンパク質を発現することができる。血管構造を有する筋組織の強化は、血流への伝達及び全身送達を可能にする。筋肉内投与の例としては、全身(例えば、静脈内)投与、皮下投与、または筋肉内への直接投与が挙げられる。いくつかの実施形態では、複数の注射が投与される。
いくつかの実施形態では、本開示のAAV粒子は、筋肉内送達経路によって送達され得る。(例えば、米国特許第6506379号を参照のこと;同文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。筋肉内投与の非限定的な例としては、静脈内注射または皮下注射が挙げられる。
いくつかの実施形態では、本開示のAAV粒子は、対象に投与され、対象の筋肉に形質導入される。非限定的な例として、AAV粒子は、筋肉内投与によって投与される。
いくつかの実施形態では、本開示のAAV粒子は、皮下投与によって対象に投与され得る。
いくつかの実施形態では、筋肉内投与は、全身送達による。
いくつかの実施形態では、筋肉内投与は、静脈内送達による。
いくつかの実施形態では、筋肉内投与は、筋肉への直接注射による。
いくつかの実施形態では、筋肉は投与によって形質導入され、これは筋肉内投与と呼ばれる。
いくつかの実施形態では、筋肉内送達は、1つの部位での投与を含む。
いくつかの実施形態では、筋肉内送達は、複数の部位での投与を含む。いくつかの実施形態では、筋肉内送達は、2つの部位での投与を含む。いくつかの実施形態では、筋肉内送達は、3つの部位での投与を含む。いくつかの実施形態では、筋肉内送達は、4つの部位での投与を含む。いくつかの実施形態では、筋肉内送達は、4つを超える部位での投与を含む。
いくつかの実施形態では、筋肉内送達は、少なくとも1つの他の投与方法と組み合わされる。
いくつかの実施形態では、AAV粒子は、末梢注射によって対象に投与され得る。末梢注射の非限定的な例としては、腹腔内注射、筋肉内注射、静脈内注射、結膜注射、または関節注射が挙げられる。当技術分野では、AAVベクターの末梢投与が、中枢神経系に、例えば運動ニューロンに輸送され得ることが開示された(例えば、米国特許公開第US20100240739号及び同第US20100130594号;各文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。
いくつかの実施形態では、本開示のAAV粒子は、実質内投与によって対象に投与されてもよい。いくつかの実施形態では、実質内投与は、筋組織に対するものである。
いくつかの実施形態では、本開示のAAV粒子は、内容の全体が参照により本明細書に組み込まれるBright et al 2015(Neurobiol Aging.36(2):693-709)に記載されているように送達される。
いくつかの実施形態では、本開示のAAV粒子は、対象の腓腹筋に投与される。
いくつかの実施形態では、本開示のAAV粒子は、対象の大腿二頭筋に投与される。
いくつかの実施形態では、本開示のAAV粒子は、前脛骨筋に投与される。
いくつかの実施形態では、本開示のAAV粒子は、ヒラメ筋に投与される。
デポー投与
本明細書に記載されるように、いくつかの実施形態では、医薬組成物、本開示のAAV粒子は、長期放出のためのデポーにおいて製剤される。概して、特定の器官または組織(「標的組織」)が投与の標的となる。
いくつかの態様では、医薬組成物、本開示のAAV粒子は、標的組織内またはその近位に空間的に保持される。標的組織(1または複数の標的細胞を含む)を、医薬組成物、AAV粒子と、それらが標的組織内で実質的に保持されるような、つまり組成物の少なくとも10、20、30、40、50、60、70、80、85、90、95、96、97、98、99、99.9、99.99、または99.99%超が標的組織内で保持されるような条件下で接触させることにより、医薬組成物、AAV粒子を、哺乳動物対象の標的組織に提供する方法が提供される。有利なことに、保持は、1または複数の標的細胞に入る医薬組成物、AAV粒子の量を測定することによって決定される。例えば、対象に投与された医薬組成物、AAV粒子の少なくとも1%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、99.9%、99.99%、または99.99%超が、投与後の一定期間において細胞内に存在する。例えば、哺乳動物対象への筋肉内注射は、医薬組成物、本開示のAAV粒子、及び1または複数のトランスフェクション試薬を含む水性組成物を使用して行われてもよく、保持は、筋細胞に存在する医薬組成物、AAV粒子の量を測定することによって決定される。
ある特定の態様は、標的組織(1または複数の標的細胞を含む)を、医薬組成物、AAV粒子と、それらがかかる標的組織内で実質的に保持されるような条件下で接触させることにより、医薬組成物、本開示のAAV粒子を、哺乳動物対象の標的組織に提供する方法を対象とする。医薬組成物、AAV粒子は、目的の効果が少なくとも1つの標的細胞においてもたらされるように十分な活性成分を含む。いくつかの実施形態では、医薬組成物、AAV粒子は、概して、1または複数の細胞透過剤を含むが、薬学的に許容される担体の有無にかかわらず、「裸の」製剤(例えば細胞透過剤または他の薬剤を含まないもの)も企図される。
用量及びレジメン
本開示は、本開示による化合物及び組成物を、それを必要とする対象に投与する方法を提供する。投与は、疾患、障害、及び/または状態の防止、処置、管理、または診断に有効な任意の量で、任意の投与経路によって行われ得る。必要とされる正確な量は、対象の種、年齢、全身状態、疾患の重篤度、特定の組成物、投与様式、活性様式などに応じて、対象ごとに異なり得る。対象は、ヒト、哺乳動物、または動物であり得るが、これらに限定されない。組成物は、投与の容易さ及び投与量の均一性のために単位剤形で製剤されてもよい。しかし、本開示の組成物の合計一日使用量は、妥当な医学的判断の範囲内で担当医師により決定され得ることが理解されよう。任意の特定の個体に対する具体的な治療上有効な用量レベル、予防上有効な用量レベル、または適切な診断上の用量レベルは、処置される障害及び障害の重篤度、用いられる特定のペイロードの活性、用いられる特定の組成物、患者の年齢、体重、全体的健康状態、性別、及び食事、用いられる化合物及び組成物の投与時間、投与経路、及び排泄速度、処置期間、用いられる化合物及び組成物と組み合わせてまたは同時に使用される薬物、ならびに医学分野で周知の同様の要因を含む種々の要因に応じて変わり得る。
いくつかの実施形態では、本開示による化合物及び組成物は、所望の治療的効果、診断的効果、または予防的効果が得られるように、1日に1回または複数回、対象の体重を基準にして1日当たり約0.0001mg/kg~約100mg/kg、約0.001mg/kg~約0.05mg/kg、約0.005mg/kg~約0.05mg/kg、約0.001mg/kg~約0.005mg/kg、約0.05mg/kg~約0.5mg/kg、約0.01mg/kg~約50mg/kg、約0.1mg/kg~約40mg/kg、約0.5mg/kg~約30mg/kg、約0.01mg/kg~約10mg/kg、約0.1mg/kg~約10mg/kg、または約1mg/kg~約25mg/kgを送達するのに十分な投与量レベルで投与され得る。
いくつかの実施形態では、所望の投与量は、複数回の投与(例えば、2回、3回、4回、または4回を超える投与)を使用して送達されてもよい。複数回の投与を用いる場合、本明細書に記載されるものなどの分割投薬レジメンを使用してもよい。本明細書で使用される場合、「分割用量」は、「単回単位用量」または合計一日用量を2回以上の用量に分割すること、例えば、「単回単位用量」の2回以上の投与である。本明細書で使用される場合、「単回単位用量」は、1用量で/1回で/単一経路で/単一の接触点で投与される、すなわち、単一の投与事象における任意の治療薬の用量である。
本開示の化合物及び組成物は、「パルス用量」として、または「連続流」として投与されてもよい。本明細書で使用される場合、「パルス用量」は、一定の頻度で一定期間にわたって投与される任意の治療剤の一連の単回単位用量である。本明細書で使用される場合、「連続流」は、単一経路/単一の接触点で一定期間連続的に投与される、すなわち、連続投与事象における治療剤の用量である。24時間の間に投与または処方される量である合計一日用量は、これらの方法のいずれかによって、またはこれらの方法の組み合わせとして、または医薬投与に好適な任意の他の方法によって投与され得る。
いくつかの実施形態では、AAV粒子の送達は、約1×10VG~約1×1016VGの総用量を含み得る。いくつかの実施形態では、送達は、約1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×1010、1.9×1010、2×1010、3×1010、3.73×1010、4×1010、5×1010、6×1010、7×1010、8×1010、9×1010、1×1011、2×1011、2.5×1011、3×1011、4×1011、5×1011、6×1011、7×1011、8×1011、9×1011、1×1012、2×1012、3×1012、4×1012、5×1012、6×1012、7×1012、8×1012、9×1012、1×1013、2×1013、3×1013、4×1013、5×1013、6×1013、7×1013、8×1013、9×1013、1×1014、2×1014、3×1014、4×1014、5×1014、6×1014、7×1014、8×1014、9×1014、1×1015、2×1015、3×1015、4×1015、5×1015、6×1015、7×1015、8×1015、9×1015、または1×1016VGの総用量を含み得る。非限定的な例として、総用量は1×1013VGである。別の非限定的な例として、総用量は2.1×1012VGである。
いくつかの実施形態では、AAV粒子の送達は、約1×10VG/mL~約1×1016VG/mLの組成物濃度を含み得る。いくつかの実施形態では、送達は、約1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×1010、2×1010、3×1010、4×1010、5×1010、6×1010、7×1010、8×1010、9×1010、1×1011、2×1011、3×1011、4×1011、5×1011、6×1011、7×1011、8×1011、9×1011、1×1012、2×1012、3×1012、4×1012、5×1012、6×1012、7×1012、8×1012、9×1012、1×1013、2×1013、3×1013、4×1013、5×1013、6×1013、7×1013、8×1013、9×1013、1×1014、2×1014、3×1014、4×1014、5×1014、6×1014、7×1014、8×1014、9×1014、1×1015、2×1015、3×1015、4×1015、5×1015、6×1015、7×1015、8×1015、9×1015、または1×1016VG/mLの組成物濃度を含み得る。いくつかの実施形態では、送達は、1×1013VG/mLの組成物濃度を含む。いくつかの実施形態では、送達は、2.1×1012VG/mLの組成物濃度を含む。
組み合わせ
本開示の化合物及び組成物は、1または複数の他の治療的、予防的、研究的、または診断的な薬剤と組み合わせて使用され得る。「と組み合わせて」には、薬剤が同時に投与されなければならない及び/または送達のために一緒に製剤されなければならないことを暗示する意図はないが、これらの送達方法は本開示の範囲内にある。組成物は、1または複数の他の所望の治療薬または医学的手順と同時に、その前に、またはその後に投与され得る。一般に、各薬剤は、その薬剤について決定された用量及び/またはタイムスケジュールで投与される。いくつかの実施形態では、本開示は、医薬組成物、予防的組成物、研究的組成物、または診断的組成物を、それらのバイオアベイラビリティを向上させる、それらの代謝を低減及び/または改変する、それらの排泄を阻害する、及び/またはそれらの体内分布を改変することのできる薬剤と組み合わせて送達することを包含する。
V.組成物の方法及び使用
いくつかの実施形態では、本開示は、治療的適用及び診断的適用のために化合物及び組成物を使用し評価することに関連する方法を提供する。
治療的適用
いくつかの実施形態では、本開示の方法は、本明細書で開示される化合物及び/または組成物を使用して治療適応症を処置する方法を含む。本明細書で使用される場合、「治療適応症」という用語は、何らかの形態の処置もしくは他の治療介入によって軽減、安定化、向上、治癒、または別様に対処され得る任意の症状、状態、障害、または疾患を指す。いくつかの実施形態では、本開示の方法は、本明細書で開示される抗体を投与することによって治療適応症を処置することを含む。
本明細書で使用される場合、「処置する」、「処置」などの用語は、病的過程の緩和または軽減を指す。本開示の文脈において、「処置する」、「処置」などの用語は、本明細書で下記に挙げる他の状態のいずれかに関する限り、かかる状態に関連する少なくとも1つの症状を緩和もしくは軽減すること、またはかかる状態の進行もしくは予期される進行を緩徐化もしくは逆転させることを意味する。
疾患マーカーまたは症状の文脈における「低下」または「低減」とは、かかるレベルにおける、有意な、多くの場合で統計的に有意な減少を意味する。この減少は、例えば、少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%以上でもよく、好ましくは、かかる障害を有しない個体について正常の範囲内として許容されるレベルまでの低下である。
疾患マーカーまたは症状の文脈における「増加」または「上昇」とは、かかるレベルにおける、有意な、多くの場合で統計的に有意な上昇を意味する。この増加は、例えば、少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%以上でもよく、好ましくは、かかる障害を有しない個体について正常の範囲内として許容されるレベルまでの上昇である。
処置の有効性または疾患の改善は、例えば、疾患進行、疾患寛解、症状の重篤度、疼痛の低減、生活の質、処置の効果を維持するために必要な薬物の用量、疾患マーカーのレベル、または処置されるもしくは防止の標的となる所与の疾患に適切な任意の他の測定可能なパラメータを測定することによって評価することができる。このようなパラメータのいずれか1つまたはパラメータの任意の組み合わせを測定することによって処置または防止の有効性をモニタリングすることは、十分に当業者の能力の範囲内である。本明細書に記載される化合物または組成物の投与との関連における、疾患または障害「に対して有効」は、臨床的に適切な様式での投与が、少なくとも一部の患者に対して、症状の向上、治癒、疾患負荷の低減、タンパク質凝集の低減、神経原線維変化の低減、神経変性の低減、寿命の延長、生活の質の向上、または特定のタイプの疾患もしくは障害の処置に精通した医師によって肯定的であると一般的に認識される他の効果などの有益な効果をもたらすことを示す。
処置または防止の効果が明らかであるのは、病状の1または複数のパラメータにおける、有意な、多くの場合で統計的に有意な向上があるとき、または症状の悪化もしくは発達がさもなければ予期される場合に症状が悪化も発達もしないときである。一例として、疾患の測定可能なパラメータにおける、少なくとも10%、好ましくは少なくとも20%、30%、40%、50%以上の好ましい変化は、有効な処置を示し得る。所与の化合物または組成物についての有効性は、当技術分野で公知の所与の疾患のための実験動物モデルを使用して判断してもよい。実験動物モデルを使用する場合、処置の有効性が証明されるのは、マーカーまたは症状における統計的に有意な調整が観察されるときである。
本開示の化合物と更なる治療剤とは、組み合わせて投与することができる。このような組み合わせは、同じ組成物中でもよいし、または更なる治療剤を別個の組成物の一部として、もしくは本明細書に記載される別の方法によって投与してもよい。
いくつかの実施形態では、本開示の方法によって対処され得る治療適応症は、神経学的適応症を含む。本明細書で使用される場合、「神経学的適応症」は、中枢神経系(CNS)に関する任意の治療適応症を指す。本開示による神経学的適応症を処置する方法は、本明細書に記載される化合物(例えば、抗体)及び/または組成物を投与することを含み得る。神経学的適応症は、タウの不規則な発現または凝集を伴う神経疾患及び/または神経障害を含み得る。このような適応症は、神経変性疾患、アルツハイマー病(AD)、17番染色体に連鎖する前頭側頭型認知症及びパーキンソニズム(FTDP-17)、前頭側頭葉変性症(FTLD)、前頭側頭型認知症(FTD)、慢性外傷性脳症(CTE)、進行性核上性麻痺(PSP)、ダウン症候群、ピック病、大脳皮質基底核変性症(CBD)、皮質基底核症候群、筋萎縮性側索硬化症(ALS)、プリオン病、クロイツフェルトヤコブ病(CJD)、多系統萎縮症、神経原線維型老年認知症、卒中、及び進行性皮質下グリオーシスを含み得るが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、神経疾患及び/または神経障害の処置を、それを必要とする対象において行う方法は、(1)抗タウ抗体またはそのフラグメントもしくは組成物を導出、生成、及び/または選択するステップ、ならびに(2)抗タウ抗体またはそのフラグメントもしくは組成物を対象に投与するステップのうちの1または複数を含み得る。対象への投与は、疾患進行を緩徐化、停止、または逆転させ得る。非限定的な例として、疾患進行は、当業者に公知のミニメンタルステート検査(MMSE)または他の同様の診断ツール(複数可)などだがこれらに限定されない認知テストによって測定され得る。別の非限定的な例として、疾患進行は、対象の脳、CSF、または他の組織の病理学的特性における、タウ(可溶性または不溶性のいずれか)のレベルの低下などだがこれに限定されない変化によって測定されてもよい。いくつかの実施形態では、不溶性過リン酸化タウのレベルが低下する。いくつかの実施形態では、可溶性タウのレベルが低下する。いくつかの実施形態では、可溶性タウと不溶性タウとの両方が減少する。いくつかの実施形態では、不溶性過リン酸化タウのレベルが上昇する。いくつかの実施形態では、可溶性タウのレベルが上昇する。いくつかの実施形態では、不溶性タウと可溶性タウとの両方のレベルが上昇する。いくつかの実施形態では、神経原線維変化が、サイズ、数、密度、またはそれらの組み合わせにおいて減少する。別の実施形態では、神経原線維変化が、サイズ、数、密度、またはそれらの組み合わせにおいて増加する。
神経変性
神経変性疾患は、最終的には神経細胞死に至る、ニューロンの構造及び機能の進行性喪失を特徴とする状態の一群を指す。ニューロンは神経系(複数可)の構成要素であり、一般に再生及び/または置換することができず、したがってニューロンの損傷及び/または死は特に壊滅的である。神経細胞喪失につながる卒中などの他の非変性疾患も、同様に消耗性の転帰をもたらす。細胞の構造または機能の悪化の一因となる分子を標的とすることは、神経変性疾患及び卒中を含む神経学的適応症の処置に概して有益であると証明される可能性がある。
ある特定の分子は、神経突起伸長に対する阻害性効果を有すると考えられており、これは損傷を修復する中枢神経系の能力が限られる一因となる。このような分子は、RGM(反発ガイダンス分子)、NOGO(神経突起伸長阻害剤)、NOGO受容体、MAG(ミエリン関連糖タンパク質)、及びMAI(ミエリン関連阻害剤)などだがこれらに限定されない、ミエリン関連タンパク質を含むが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、本開示の抗タウ抗体を利用して、前述の抗原(例えば、神経突起伸長阻害剤)を標的とすることができる。
多くの神経変性疾患は、アルファシヌクレイン、タウ(タウオパチーなどの場合)、アミロイドβ、プリオンタンパク質、TDP-43、及びハンチンチンを含むがこれらに限定されない、ミスフォールドタンパク質の凝集に関連している(例えば、De Genst et al.,2014,Biochim Biophys Acta;1844(11):1907-1919、及びYu et al.,2013,Neurotherapeutics.;10(3):459-472、同文献中の参考文献を参照のこと。これらはすべて、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。凝集は、可溶性タンパク質から不溶性で高秩序の線維性沈着物への疾患特異的な変換から生じる。この変換は、ミスフォールドタンパク質の適切な廃棄または分解を妨げ、それによってさらなる凝集をもたらすと考えられている。アルファシヌクレインのミスフォールド及び凝集に関連する状態は、「シヌクレイン病」と呼ばれる。いくつかの実施形態では、本開示の抗タウ抗体を利用して、ミスフォールドまたは凝集したタンパク質を標的とすることができる。
アルツハイマー病
アルツハイマー病(AD)は消耗性神経変性疾患で、現在世界中で3500万人超が罹患しており、その数は今後数十年で倍増すると予想されている。対症処置は長年にわたって利用されているが、これらの処置は根底にある病態生理に対処しない。これらの処置及び他の処置を使用した最近の臨床試験は大部分が失敗しており、既知の治療法は現在まで特定されていない。
AD脳は、βアミロイド(Aβ)から構成された細胞外プラークと、過リン酸化微小管関連タンパク質タウから成る細胞内神経原線維変化(NFT)という、2つの形態の病的凝集体の存在を特徴とする。初期の遺伝子学的所見に基づいて、βアミロイドの変化が疾患を開始すると考えられ、タウの変化は下流とみなされていた。したがって、ほとんどの臨床試験はAβを中心にしていた。タウ遺伝子の変異はADと関連付けられていないが、その変化はタウオパチーとして知られる認知症群をもたらすことが示されており、タウの変化が神経変性プロセスの一因となり得ることを示している。タウは、そのリン酸化の程度に基づいて微小管と会合することが知られている、正常には可溶性がきわめて高いタンパク質である。タウの過リン酸化は、その微小管への結合及び微小管アセンブリ活性を抑制する。タウオパチーでは、タウが過リン酸化され、ミスフォールドし、対らせん状細線維(PHF)、ねじれたリボン、または直線フィラメントのNFTとして凝集する。ADでは、プラークの病理よりもNFTの病理が、ニューロン喪失、シナプス欠損、疾患の重篤度及び認知機能低下などの神経病理学的マーカーとより密接に相関する。NFTの病理は脳内を類型的に進み、動物実験ではニューロン結合に沿った経細胞伝播メカニズムが示唆されている。
タウ病変の進行に治療的に干渉し、後の分子的帰結及び細胞的帰結を防止するために、幾つかの手法が提案されている。過リン酸化され、ミスフォールドし、凝集した形態のタウからNFTが構成されていることを所与として、これらの段階の各々における干渉は、最も熱心に追求されている一組の標的をもたらしている。リン酸化を制限する、ミスフォールドをブロックする、または凝集を防止する薬剤の導入は、いずれも有望な結果をもたらしている。マウスモデルにおける後期抗ホスホタウ抗体による受動免疫化及び能動免疫化は、タウ凝集の劇的な減少及び認知パラメータの向上につながっている。また、抗タウ抗体の導入により、タウ病変の経ニューロン性拡散を防止できることも示唆されている。
いくつかの実施形態では、本開示の抗タウ抗体は、AD及び他のタウオパチーを患う対象を処置するために、本明細書で提示される方法に従って使用され得る。場合によっては、本開示の方法は、ADまたは他のタウオパチーを発症する疑いのある対象を処置するために使用され得る。
17番染色体に連鎖する前頭側頭型認知症及びパーキンソニズム(FTDP-17)
アルツハイマー病は部分的にはタウ病変の存在を特徴とするが、タウ遺伝子の既知の変異でこの疾患に原因として関連付けられているものはない。タウ遺伝子の変異は、17番染色体に連鎖する前頭側頭型認知症及びパーキンソニズム(FTDP-17)として知られる常染色体優性遺伝性タウオパチーにつながることが示されており、タウの変化が脳内の神経変性変化につながり得ることを示している。FTDP-17につながるタウ遺伝子の変異は、スプライシングパターンに影響を与え、それによって4つの微小管結合ドメイン(3つではなく)をもつタウの割合の上昇をもたらすと考えられている。これらの分子は、よりアミロイド形成性が高く、つまり、より過リン酸化されやすく、よりNFTへと凝集しやすいと考えられている(Hutton,M.et al.,1998,Nature 393(6686):702-5、同文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。FTDP-17患者は身体的にも行動的にもアルツハイマー病患者とよく似ているように見えることがあるが、剖検においてFTDP-17脳にはAD脳に顕著なAβプラーク病理が存在しない(Gotz,J.et al.,2012,British Journal of Pharmacology 165(5):1246-59、同文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。タウタンパク質の凝集体を治療的に標的とすると、脳の変性変化を改善及び防止することができ、認知能力の向上につながる可能性がある。
現在のところ、FTDP-17を防止する、進行を緩徐化する、または治癒する処置は存在しない。攻撃的、激越的または危険な行動を低減するために、薬物が処方されることはある。タウタンパク質を標的とする抗体療法など、根底にある病態生理に影響を与える療法が依然として必要とされている。
いくつかの実施形態では、本開示の抗タウ抗体は、FTDP-17を患う対象を処置するために使用され得る。場合によっては、本開示の方法は、FTDP-17を発症する疑いのある対象を処置するために使用され得る。
慢性外傷性脳症
遺伝的に連鎖するタウオパチーとは異なり、慢性外傷性脳症は、繰り返された頭部傷害に関連付けられる変性性タウオパチーである。この疾患は、「パンチドランク」の挙動を示したボクサーで初めて報告され、それ以来、アメリカンフットボール、アイスホッケー、レスリング、及び他のコンタクトスポーツを行うアスリートで主に確認されている。CTEを患うものの脳は、NFTにおける凝集タウの過リン酸化種の蓄積を伴う脳萎縮の特有のパターンを特徴とする。CTEにおいて、タウの病理学的変化は、炎症のようないくつかの他の病理生物学的プロセスを伴う(Daneshvar,D.H.et al.,2015 Mol Cell Neurosci 66(Pt B):81-90、同文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。タウ凝集体を標的とすると、疾患の進行が一時軽減される可能性があり、認知機能向上が可能になり得る。
現在のところ、CTEを処置または治癒する医学的療法は存在しない。この状態は、CTE特異的バイオマーカーを同定するin vivo技法が存在しないため、死後に初めて診断される。タウタンパク質を標的とする抗体療法など、根底にある病態生理に影響を与える療法が依然として必要とされている。
いくつかの実施形態では、本開示の抗タウ抗体は、CTEを患う対象を処置するために使用され得る。場合によっては、本開示の方法は、CTEを発症する疑いのある対象を処置するために使用され得る。
プリオン病
プリオン病は、伝播性海綿状脳症(TSE)としても知られ、神経系に影響を及ぼす稀な進行性状態の一群である。関連する状態は稀であり、典型的には、プリオンタンパク質の産生を可能にするPRNP遺伝子の変異によって引き起こされる。遺伝子変異は、異常な構造のプリオンタンパク質をもたらす。あるいは、異常なプリオンは、外部源からの曝露によって、例えば、異常なプリオンタンパク質を含む牛肉製品の消費によって獲得される場合がある。異常なプリオンはミスフォールドし、脳組織を急速に変性させる。プリオン病は、クロイツフェルトヤコブ病(CJD)、ゲルストマン・シュトロイスラー・シャインカー症候群(GSS)、致死性不眠症(FFI)、可変プロテアーゼ感受性プリオノパチー(VPSPr)、及びクールーを含むが、これらに限定されない。プリオン病は稀である。米国では毎年およそ350例のプリオン病が診断されている。
CJDは、筋肉の協調の問題、精神的機能障害を含む人格の変化、視覚障害、不随意の筋痙攣、脱力感、そして最終的には昏睡を特徴とする変性脳障害である。CJDの最も一般的なカテゴリは、孤発性、遺伝子変異による遺伝性、及び獲得性である。孤発性CJDは、この疾患の既知のリスク因子をもたない人々を侵す最も一般的な形態である。獲得型のCJDは、脳及び神経系組織がプリオンに曝露されることによって伝播する。一例として、バリアントCJD(vCDJ)は、「狂牛病」としても知られるウシ海綿状脳症(BSE)に関連付けられている。CJDは致死性であり、患者は通常、診断から1年以内に死亡する。
プリオン病は、プリオンタンパク質の代替的立体構造アイソフォームであるPrPScからなる感染因子に関連している。PrPScの複製は、正常プリオンタンパク質(PrPC)における感染性プリオンの誘導を通じて起こると考えられている。複製は核酸なしで起こる。
現在のところ、CJDまたは他のプリオン病を管理または治癒する療法は存在しない。通常、処置は、例えば鎮痛剤を用いて、症状を軽減し、患者の快適さを高めることを目的とする。根底にある病態生理に影響を与える療法が依然として必要とされている。
いくつかの実施形態では、本開示の抗タウ抗体は、プリオン病を患う対象を処置するために使用され得る。場合によっては、本開示の方法は、プリオン病を発症する疑いのある対象を処置するために使用され得る。
診断的適用
いくつかの実施形態では、本開示の化合物(例えば、抗体)及び組成物は、診断薬として使用され得る。抗タウ抗体は、タウタンパク質を発現する細胞、組織、器官などを同定、標識、または染色するために使用され得る。抗タウ抗体は、タウタンパク質凝集体を有することが分かっているまたは疑われる組織を含む組織切片(例えば、組織学的組織切片)に存在するタウタンパク質を同定するために使用されてもよい。このような抗体は、場合によっては、神経疾患及び/または神経障害を有する対象を同定するために使用されてもよい。組織切片はCNS組織由来であり得る。
いくつかの実施形態では、本開示の診断方法は、免疫組織化学的技法を使用した1または複数の細胞または組織の分析を含み得る。このような方法は、本明細書に記載されるいずれかの抗タウ抗体の1または複数の使用を含み得る。免疫組織化学的方法は、組織切片を染色して、1または複数のタウタンパク質または他のマーカーの存在及び/またはレベルを決定することを含み得る。組織切片は、対象のCNS組織(例えば、患者のCNS、動物のCNS、及び疾患の動物モデル由来のCNS)に由来し得る。組織切片は、ホルマリン固定組織、または未固定の新鮮凍結組織に由来してもよい。場合によっては、組織切片は、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織に由来する。本明細書に記載される抗タウ抗体は、一次抗体として使用され得る。一次抗体は、組織切片に直接接触し、標的エピトープに結合するために使用される。一次抗体は、検出可能な標識に直接コンジュゲートしてもよいし、または二次抗体などの検出剤の使用によって検出してもよい。いくつかの実施形態では、一次抗体または検出剤は、基質と反応して視認可能な生成物(例えば、沈殿物)を生成するために使用できる酵素を含む。このような酵素は、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、ベータガラクトシダーゼ、及びカタラーゼを含み得るが、これらに限定されない。
本明細書に記載される抗タウ抗体は、組織または細胞におけるタウタンパク質を検出するために、本開示の免疫組織化学的方法に従って使用され得る。場合によっては、これらの抗体は、組織内のタウタンパク質を検出する及び/またはそのレベルを決定するために使用される。免疫組織化学的染色技法で使用される抗タウ抗体のレベルは、視認可能な染色を増加させるため、または染色のバックグラウンドレベルを低下させるために変化させてもよい。いくつかの実施形態では、約0.01μg/ml~約50μg/mlの抗体濃度が使用される。例えば、約0.01μg/ml~約1μg/ml、約0.05μg/ml~約5μg/ml、約0.1μg/ml~約3μg/ml、約1μg/ml~約10μg/ml、約2μg/ml~約20μg/ml、約3μg/ml~約25μg/ml、約4μg/ml~約30μg/ml、または約5μg/ml~約50μg/mlの抗体濃度を使用してもよい。
タウタンパク質のレベル及び/または同一性は、タンパク質の同定及び/またはタンパク質レベルの定量化のための当技術分野で公知の任意の方法に従って決定され得る。いくつかの実施形態では、このような方法は、質量分析、アレイ分析(例えば、抗体アレイまたはタンパク質アレイ)、ウエスタンブロッティング、フローサイトメトリ、免疫沈降、表面プラズモン共鳴分析、及びELISAを含み得るが、これらに限定されない。タウタンパク質は、場合によっては、分析前にサンプルから免疫沈降されてもよい。このような免疫沈降は、本明細書で開示される抗タウ抗体を使用して行われ得る。いくつかの実施形態では、タウタンパク質は、抗タウ抗体を使用して生物学的サンプルから免疫沈降され、次いで質量分析を使用して同定及び/または定量化される。
いくつかの実施形態では、処置の情報は、抗タウ抗体を使用して生成された診断情報によって得られる。したがって、本開示は、対象からサンプルを得ることと、抗タウ抗体を使用して1または複数の神経疾患及び/または神経障害を診断することと、診断に基づいて選択された処置を投与することとを含む、神経疾患及び/または神経障害を処置する方法を提供する。このような処置は、抗タウ抗体による処置を含み得る。このような方法に従って投与される抗タウ抗体は、本明細書に記載されるもののいずれを含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示は、捕捉抗体及び検出抗体の使用を通じてサンプル中のタウタンパク質を検出及び/または数量化する方法を提供する。本明細書で使用される場合、「捕捉抗体」は、分析物を単離または検出できるように分析物と結合する抗体である。捕捉抗体は、表面または他の担体(例えばビーズ)と会合していてもよい。検出抗体は、分析物の存在または非存在の観察を容易にする抗体である。タウタンパク質を検出及び/または数量化するいくつかの方法によれば、捕捉抗体と検出抗体との両方がタウタンパク質に結合する。捕捉抗体及び検出抗体は、結合の競合を避けるために、タウタンパク質の異なるエピトープまたは領域に結合してもよい。いくつかの実施形態では、検出抗体は、直接検出のために検出可能な標識とコンジュゲートされ得る。いくつかの実施形態では、検出抗体の結合は、検出抗体の定常ドメインまたは検出抗体の検出可能な標識に結合する二次抗体を使用して評価され得る。捕捉抗体、検出抗体、及び/または二次抗体は、異なる種に由来し得る。これにより、二次抗体が捕捉抗体と検出抗体との両方に結合するのを防ぐことができる。
VI.キット及びデバイス
キット
いくつかの実施形態では、本開示の化合物及び組成物は、キットに含まれていてもよい。このような化合物及び組成物は、本明細書で開示される抗タウ抗体を含み得る。非限定的な例において、キットは、タウタンパク質抗原を含む、抗タウ抗体を生成するための試薬を含み得る。キットは、例えば抗タウ抗体を作出または合成するための、更なる試薬及び/または使用説明書を含んでもよい。キットは、1または複数のバッファーを含んでもよい。キットは、更なる構成要素、例えば、抗体または抗原を付着させるための固体支持体または基質を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、本開示は、1または複数の抗タウ抗体を含む、対象のスクリーニング、モニタリング、及び/または診断のためのキットを含む。このようなキットは、単独で使用されてもよいし、1または複数の他のスクリーニング方法、モニタリング方法、及び/または診断方法と組み合わせて使用されてもよい。キットは、バッファー、生物学的標準物質、二次抗体、検出試薬、及びサンプル前処理用(例えば、抗原回収用、ブロッキング用など)の組成物のうちの1または複数を含んでもよい。
キット構成要素はパッケージングされていてもよい。いくつかの実施形態では、キット構成要素は、水性媒体中または凍結乾燥形態でパッケージングされる。パッケージングには、1または複数のバイアル、試験管、フラスコ、ボトル、シリンジ、または成分を入れる及び/または好適に分注することのできる他の容器が含まれ得る。複数のキット構成要素がある場合(標識試薬及び標識は一緒にパッケージングされてもよい)、キットは、更なる構成要素を別々に入れることのできる第2、第3、または他の更なる容器を含み得る。
キット構成要素が1つ及び/または複数の溶液で用意される場合、溶液は水溶液であり得る。溶液は無菌で用意されてもよい。キット構成要素は乾燥粉末(複数可)として用意されてもよい。乾燥粉末成分は、キット使用者により、例えば、好適な溶媒の添加によって再構成されるように用意されてもよい。溶媒は、キットにおいて、1または複数の別個の容器内に用意されてもよい。いくつかの実施形態では、標識色素は、乾燥粉末フォーマットで用意される。
キットは、キット構成要素ならびにキットに含まれていない他の試薬を用いるための説明書を含んでもよい。説明書は、実行可能なバリエーションを含んでもよい。
デバイス
本明細書に記載される化合物及び組成物のいずれも、デバイスと組み合わせるか、デバイス上にコーティングするか、またはデバイスに包埋するか、またはデバイスによって送達することができる。デバイスは、インプラント、ステント、置換骨、人工関節、弁、ペースメーカー、または他の植え込み可能な治療デバイスを含み得るが、これらに限定されない。
VII.定義
本明細書の様々な箇所において、本開示の化合物の置換基が、複数の群または範囲において開示されている。本開示は、このような群及び範囲のメンバーの個々の部分的組み合わせのすべてを含むことが具体的に意図される。
約:本明細書で使用される場合、「約」という用語は、記載された値の±10%を意味する。
活性:本明細書で使用される場合、「活性」という用語は、物事が起こっているまたは行われている状態を指す。組成物は活性を有することがあり、この活性は1または複数の生物学的事象を伴い得る。
アデノ随伴ウイルス:本明細書で使用される「アデノ随伴ウイルス」または「AAV」という用語は、ディペンドウイルス属に由来する任意の粒子、配列、遺伝子、タンパク質、または構成要素を含むディペンドウイルス属のメンバーを指す。
AAV粒子:本明細書で使用される場合、「AAV粒子」は、少なくとも1つのペイロード領域及び少なくとも1つのITR領域を有するウイルスゲノムを含むウイルスである。本開示のAAVベクターは、組換えにより産生することができ、アデノ随伴ウイルス(AAV)の親配列または参照配列に基づいてもよい。AAV粒子は、血清型の組み合わせ(すなわち、「シュードタイプ化」AAV)または様々なゲノムに由来するもの(例えば、一本鎖または自己相補的)を含め、本明細書に記載される、または当技術分野で公知の、任意の血清型に由来し得る。さらに、AAV粒子は、複製欠損性である及び/または標的となることもある。
組み合わせて投与される:本明細書で使用される場合、「組み合わせて投与される」または「併用投与」という用語は、2つ以上の薬剤が同時に、または患者に対する各薬剤の効果に重複があり得るような間隔で対象に投与されることを意味する。いくつかの実施形態では、これらは互いの約60、30、15、10、5、または1分以内に投与される。いくつかの実施形態では、薬剤の投与は、コンビナトリアル効果(例えば、相乗効果)を達成するのに十分に近い間隔で行われる。
改善:本明細書で使用される場合、「改善」または「改善する」という用語は、状態または疾患の少なくとも1つの指標の重篤度の軽減を指す。例えば、神経変性障害の文脈において、改善にはニューロン喪失の低減が含まれる。
動物:本明細書で使用される場合、「動物」という用語は、動物界の任意のメンバーを指す。いくつかの実施形態では、「動物」は、任意の発達段階におけるヒトを指す。いくつかの実施形態では、「動物」は、任意の発達段階における非ヒト動物を指す。ある特定の実施形態では、非ヒト動物は、哺乳動物(例えば、齧歯類動物、マウス、ラット、ウサギ、サル、イヌ、ネコ、ヒツジ、畜牛、霊長類、またはブタ)である。いくつかの実施形態では、動物は、哺乳動物、鳥類、爬虫類、両生類、魚類、及び虫を含むが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、動物は、トランスジェニック動物、遺伝子工学操作動物、またはクローンである。
およそ:本明細書で使用される場合、1または複数の目的の値に適用される「およそ」または「約」という用語は、記載された参照値と類似する値を指す。ある特定の実施形態では、「およそ」または「約」という用語は、記載された参照値からいずれかの(それを上回るまたは下回る)方向に25%、20%、19%、18%、17%、16%、15%、14%、13%、12%、11%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%、またはそれ以下に含まれる値の範囲を指すが、別段の記載がある場合、または文脈から別の意味が明らかである場合はこの限りではない(このような数が可能な値の100%を超える場合を除く)。
会合:本明細書で使用される場合、2つ以上の実体に関して使用される「会合」、「コンジュゲート」、「連結」、「付着」、及び「係留」という用語は、複数の実体が、直接またはリンカーを介して、互いと物理的に会合または接続して、複数の実体が、例えば、作業条件下で、例えば、生理学的条件下で、物理的に会合した状態を保つように、十分に安定した構造を形成していることを意味する。「会合」は共有結合性の化学結合によるものである必要はなく、「会合した」実体が物理的に会合した状態を保つように十分に安定した他の形態の会合または結合、例えば、イオン結合、静力学結合、疎水性結合、水素結合、またはハイブリダイゼーションに基づく接続を含み得る。
二官能性:本明細書で使用される場合、「二官能性」という用語は、少なくとも2つの機能が可能であるまたは少なくとも2つの機能を維持する任意の物質、分子または部分を指す。これらの機能は、同じ結果または異なる結果をもたらしてもよい。機能をもたらす構造は同じでも異なっていてもよい。
生体適合性:本明細書で使用される場合、「生体適合性」という用語は、生きている細胞、組織、器官、または系と適合し、免疫系による傷害、毒性、または拒絶反応のリスクをほとんどまたは全く呈さないことを意味する。
生分解性:本明細書で使用される場合、「生分解性」という用語は、生物の作用によって無害な生成物に分解できることを意味する。
生物学的に活性がある:本明細書で使用される場合、「生物学的に活性がある」という語句は、生物系及び/または生物において活性を有する任意の物質の特徴を指す。例えば、生物に投与された場合にその生物に生物学的効果を及ぼす物質は、生物学的に活性があるとみなされる。
カプシド:本明細書で使用される場合、「カプシド」という用語は、ウイルス粒子のタンパク質殻を指す。いくつかの実施形態では、カプシドという用語は、ウイルス粒子のタンパク質殻をコードする核酸を指すことがある。
キメラ抗原受容体(CAR):本明細書で使用される場合、「キメラ抗原受容体」または「CAR」という用語は、少なくとも1つの抗原特異的標的化領域(ASTR)、膜貫通ドメイン、及び細胞内シグナル伝達ドメインを含む人工キメラタンパク質を指し、この抗原特異的標的化領域は、完全長抗体、またはそのフラグメントを含む。非限定的な例として、CARのASTRは、本明細書で提示される抗体またはそのフラグメントのいずれでもよい。高い親和性で標的抗原と結合できる任意の分子を、CARのASTRに使用することができる。CARは、場合により、細胞外スペーサードメイン及び/または共刺激ドメインを有し得る。CARは、CARを担持する細胞傷害性細胞を生成するために使用することもできる。
化合物:本開示の化合物は、中間体または最終化合物において生じる原子の同位体のすべてを含む。「同位体」は、同じ原子番号を有するが、核内の中性子の数が異なるために質量数が異なる原子を指す。例えば、水素の同位体としてはトリチウム及び重水素が挙げられる。
本開示の化合物及び塩は、定型的な方法によって溶媒和物及び水和物を形成するように溶媒または水分子と組み合わせて調製することができる。
Comprehensive Positional Evolution(CPE(商標)):本明細書で使用される場合、「comprehensive positional evolution」という用語は、抗体可変ドメインの配列に沿ったあらゆる位置におけるアミノ酸変化の効果のマッピングを可能にする抗体進化技術を指す。この包括的な変異誘発技術は、抗体の1または複数の性質または特徴を増強するために使用することができる。
Comprehensive Protein Synthesis(CPS(商標)):本明細書で使用される場合、「comprehensive protein synthesis」という用語は、最良の性質を組み合わせて新たな高性能抗体にすることによって抗体の性質または特徴を最適化するために使用され得るコンビナトリアルタンパク質合成技術を指す。
条件付きで活性がある:本明細書で使用される場合、「条件付きで活性がある」という用語は、野生型ポリペプチドの変異体またはバリアントであって、生理学的条件において親ポリペプチドよりも活性が高いまたは低い変異体またはバリアントを指す。さらに、条件付きで活性があるポリペプチドは、親ポリペプチドと比較して異常な条件において増加または減少した活性を有し得る。条件付きで活性があるポリペプチドは、正常な生理学的条件または異常な条件において可逆的または不可逆的に不活性化され得る。
保存されている:本明細書で使用される場合、「保存されている」という用語は、ポリヌクレオチド配列またはポリペプチド配列のそれぞれヌクレオチドまたはアミノ酸残基で、比較される2つ以上の配列の同じ位置で変化せずに生じるものを指す。比較的保存されているヌクレオチドまたはアミノ酸は、配列において他の箇所で出現するヌクレオチドまたはアミノ酸よりも関連性の高い配列の間で保存されているものである。
いくつかの実施形態では、2つ以上の配列は、互いと100%同一であれば、「完全に保存されている」と言われる。いくつかの実施形態では、2つ以上の配列は、互いと少なくとも70%同一、少なくとも80%同一、少なくとも90%同一、または少なくとも95%同一であれば、「高度に保存されている」と言われる。いくつかの実施形態では、2つ以上の配列は、互いと約70%同一、約80%同一、約90%同一、約95%、約98%、または約99%同一であれば、「高度に保存されている」と言われる。いくつかの実施形態では、2つ以上の配列は、互いと少なくとも30%同一、少なくとも40%同一、少なくとも50%同一、少なくとも60%同一、少なくとも70%同一、少なくとも80%同一、少なくとも90%同一、または少なくとも95%同一であれば、「保存されている」と言われる。いくつかの実施形態では、2つ以上の配列は、互いと約30%同一、約40%同一、約50%同一、約60%同一、約70%同一、約80%同一、約90%同一、約95%同一、約98%同一、または約99%同一であれば、「保存されている」と言われる。配列の保存は、ポリヌクレオチドまたはポリペプチドの全長に適用されることもあれば、その一部、領域、または特性に適用されることもある。
制御エレメント:本明細書で使用される場合、「制御エレメント」、「調節制御エレメント」、または「調節配列」は、レシピエント細胞におけるコード配列の複製、転写、及び翻訳をもたらす、プロモーター領域、ポリアデニル化シグナル、転写終結配列、上流調節ドメイン、複製起点、内部リボソーム侵入部位(「IRES」)、エンハンサーなどを指す。選択されたコード配列が適切な宿主細胞において複製可能、転写可能、及び/または翻訳可能である限り、これらの制御エレメントのすべてが常に存在する必要があるわけではない。
細胞傷害性:本明細書で使用される場合、「細胞傷害性」は、細胞(例えば、哺乳動物細胞(例えば、ヒト細胞))、細菌、ウイルス、真菌、原生動物、寄生虫、プリオン、もしくはそれらの組み合わせを殺傷すること、またはそれらに対して傷害性、有毒、もしくは致命的な効果をもたらすことを指す。
送達:本明細書で使用される場合、「送達」は、化合物、物質、実体、部分、カーゴ、またはペイロードを対象または目的地に提供する行為または様式を指す。
検出可能な標識:本明細書で使用される場合、「検出可能な標識」は、別の実体に付着する、組み込まれる、または会合する、1または複数のマーカー、シグナル、または部分であって、X線撮影、蛍光、化学発光、酵素活性、吸光度などを含む当技術分野で公知の方法によって容易に検出されるマーカー、シグナル、または部分を指す。検出可能な標識は、放射性同位体、フルオロフォア、化学発光化合物、発色団、酵素、酵素補因子、色素、金属イオン、リガンド、ビオチン、アビジン、ストレプトアビジン、ハプテン、量子ドットなどを含むが、これらに限定されない。検出可能な標識は、それらがコンジュゲートされる、または別様に付着する、組み込まれる、もしくは会合する実体の中または上の任意の位置にあってよい。例えば、ペプチドまたはタンパク質にコンジュゲートされる、または別様に付着する、組み込まれる、もしくは会合する場合、検出可能な標識は、アミノ酸の上、中、もしくは間にあってもよいし、またはN末端もしくはC末端に付着もしくは会合してもよい。
消化:本明細書で使用される場合、「消化」という用語は、より小さな断片または構成要素に分解することを意味する。ポリペプチドまたはタンパク質について言及している場合、消化は、ペプチドの産生をもたらす。
遠位:本明細書で使用される場合、「遠位」という用語は、中心から離れた、または目的の点もしくは領域から離れた場所にあることを意味する。
投薬レジメン:本明細書で使用される場合、「投薬レジメン」は、投与のスケジュール、または医師が決定した処置、予防、もしくは緩和ケアのレジメンである。
封入:本明細書で使用される場合、「封入」という用語は、封じ込む、包囲する、または包み込むことを意味する。
工学操作:本明細書で使用される場合、実施形態が「工学操作」されているのは、特性または性質が、構造的にせよ化学的にせよ、出発化合物、出発物質または出発分子(例えば、野生型または天然分子)から異なるように設計されている場合である。
有効量:本明細書で使用される場合、薬剤の「有効量」という用語は、有益なまたは所望の結果、例えば臨床結果をもたらすのに十分な量であり、したがって「有効量」は、それが適用されている文脈に依存する。例えば、がんを処置する薬剤を投与する文脈において、薬剤の有効量は、例えば、薬剤の投与なしで得られる応答と比較して治療適応症の処置を達成するのに十分な量である。
エピトープ:本明細書で使用される場合、「エピトープ」は、1または複数の実体において、抗体または他の結合生体分子と相互作用することができる表面または領域を指す。例えば、タンパク質エピトープは、抗体と相互作用する1または複数のアミノ酸及び/または翻訳後修飾(例えば、リン酸化残基)を含み得る。いくつかの実施形態では、エピトープは「立体構造エピトープ」でもよく、これは、エピトープを有するまたはエピトープを形成する実体(複数可)の特定の三次元配置を有するエピトープを指す。例えば、タンパク質の立体構造エピトープは、アミノ酸鎖の折り畳まれた非線形区間からのアミノ酸及び/または翻訳後修飾の組み合わせを含み得る。
EvoMap(商標):本明細書で使用される場合、EvoMap(商標)は、ポリペプチドの全長における単一アミノ酸変異の効果ならびに該ポリペプチドの性質及び特徴に対するその影響に関して詳細なインフォマティクスを提示する、ポリペプチドのマップを指す。
発現:本明細書で使用される場合、遺伝子、核酸、またはタンパク質の「発現」は、次の事象のうちの1または複数を指す:(1)DNA配列からの(例えば、転写による)RNA鋳型の産生、(2)RNA転写物の(例えば、スプライシング、編集、5’キャップ形成、及び/または3’末端プロセシングによる)プロセシング、(3)RNAからポリペプチドまたはタンパク質への翻訳、及び(4)ポリペプチドまたはタンパク質の翻訳後修飾。
特性:本明細書で使用される場合、「特性」は、特徴、性質、または特有の要素を指す。
製剤:本明細書で使用される場合、「製剤」は、製法に従って調製された物質または混合物を指す。製剤は、担体または賦形剤と組み合わせた化合物(例えば、抗体)または物質を含み得る。
フラグメント:本明細書で使用される「フラグメント」は、一部分を指す。例えば、タンパク質のフラグメントは、培養細胞から単離された完全長タンパク質を消化することによって得られるポリペプチドを含み得る。
機能的:本明細書で使用される場合、「機能的」な生物学的分子は、それを特徴付ける性質及び/または活性を呈する形態の生物学的分子である。例えば、「機能的」抗体は、特定の標的と結合する抗体、または特定の生物学的プロセスを活性化もしくは阻害する抗体を含み得る。
最大半量有効濃度:本明細書で使用される場合、「最大半量有効濃度」または「EC50」という用語は、所与の反応、活性、またはプロセスを2分の1増加させるのに必要な物質の濃度を指す。例えば、結合アッセイ(例えば、ELISAアッセイ)を使用してサンプル中の標的に対する抗体の結合を測定する場合、EC50は、そのアッセイで観察され得る最大結合の50%をもたらすのに必要なサンプル中の抗体の濃度である。同様に、「最大半量阻害濃度」または「IC50」という用語は、所与の反応またはプロセスを2分の1低減するのに必要な濃度を指す。例えば、生物学的プロセスを阻害することができる抗体についてのIC50は、サンプル中で生物学的プロセスを50%低減するのに必要な抗体の濃度である。EC50及びIC50の値は、特定の時間制約及び/または条件下で異なり得る。
相同性:本明細書で使用される場合、「相同性」という用語は、高分子間、例えばポリヌクレオチド分子(例えばDNA分子及び/またはRNA分子)間及び/またはポリペプチド分子間の全体的関連性を指す。いくつかの実施形態では、高分子は、それらの配列が少なくとも25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または99%同一または同様であれば、互いに「相同」であるとみなされる。「相同」という用語は、少なくとも2つの配列(ポリヌクレオチド配列またはポリペプチド配列)間の比較を必然的に指す。本開示によれば、2つのポリヌクレオチド配列は、それらがコードするポリペプチドが、少なくとも約20アミノ酸からなる少なくとも1つの区間について少なくとも約50%、60%、70%、80%、90%、95%、またはさらには99%であれば、相同であるとみなされる。いくつかの実施形態では、相同なポリヌクレオチド配列は、少なくとも4~5個の一意に指定されるアミノ酸の区間をコードする能力によって特徴付けられる。60ヌクレオチド長未満のポリヌクレオチド配列については、相同性は、少なくとも4~5個の一意に指定されるアミノ酸の区間をコードする能力によって決定される。本開示によれば、2つのタンパク質配列は、これらのタンパク質が、少なくとも約20アミノ酸からなる少なくとも1つの区間について少なくとも約50%、60%、70%、80%、または90%同一であれば、相同であるとみなされる。
異種領域:本明細書で使用される場合、「異種領域」という用語は、相同領域とはみなされない領域を指す。
相同領域:本明細書で使用される場合、「相同領域」という用語は、位置、構造、進化起源、特質、形態または機能において類似している領域を指す。
同一性:本明細書で使用される場合、「同一性」という用語は、高分子間、例えば、ポリヌクレオチド分子(例えばDNA分子及び/またはRNA分子)間及び/またはポリペプチド分子間の全体的関連性を指す。例えば、2つのポリヌクレオチド配列の同一性パーセントの計算は、2つの配列を最適に比較する目的でアラインすることによって行うことができる(例えば、最適なアラインメントのために第1及び第2の核酸配列の一方または両方にギャップを導入してもよく、非同一配列は比較目的で無視してもよい)。ある特定の実施形態では、比較目的でアラインされる配列の長さは、参照配列の長さの少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%、または100%である。次いで、対応するヌクレオチド位置にあるヌクレオチドを比較する。第1の配列における位置が、第2の配列における対応する位置と同じヌクレオチドによって占有されている場合、これらの分子はその位置において同一である。2つの配列間の同一性パーセントは、2つの配列の最適なアラインメントのために導入される必要のあるギャップの数及び各ギャップの長さを考慮した、配列に共通する同一の位置の数の関数である。配列の比較及び2つの配列間の同一性パーセントの決定は、数学的アルゴリズムを使用して達成することができる。例えば、2つのヌクレオチド配列間の同一性パーセントは、Computational Molecular Biology,Lesk,A.M.,ed.,Oxford University Press,New York,1988、Biocomputing:Informatics and Genome Projects,Smith,D.W.,ed.,Academic Press,New York,1993、Sequence Analysis in Molecular Biology,von Heinje,G.,Academic Press,1987、Computer Analysis of Sequence Data,Part I,Griffin,A.M.,and Griffin,H.G.,eds.,Humana Press,New Jersey,1994、及びSequence Analysis Primer,Gribskov,M.and Devereux,J.,eds.,M Stockton Press,New York,1991に記載されているものなどの方法を使用して決定することができ、各文献は、参照により本明細書に組み込まれる。例えば、2つのヌクレオチド配列間の同一性パーセントは、ALIGNプログラム(バージョン2.0)に組み込まれているMeyers及びMiller(CABIOS,1989,4:11-17)のアルゴリズムを使用し、PAM120重み残基表、ギャップ長ペナルティ12、及びギャップペナルティ4を使用して決定することができる。2つのヌクレオチド配列間の同一性パーセントは、代替的に、GCGソフトウェアパッケージ内のGAPプログラムを使用し、NWSgapdna.CMP行列を使用して決定してもよい。配列間の同一性パーセントを決定するために一般的に用いられる方法は、参照により本明細書に組み込まれる、Carillo,H.and Lipman,D.,SIAM J Applied Math.,48:1073(1988)において開示されているものを含むが、これに限定されない。同一性を決定するための技法は、公的に利用可能なコンピュータプログラムにおいて体系化されている。2つの配列間の相同性を決定するための例示的なコンピュータソフトウェアは、GCGプログラムパッケージ(Devereux,J.,et al.,Nucleic Acids Research,12(1),387(1984))、BLASTP、BLASTN、及びFASTA(Altschul,S.F.et al.,J.Molec.Biol.,215,403(1990))を含むが、これらに限定されない。in vitro:本明細書で使用される場合、「in vitro」という用語は、生物(例えば、動物、植物、または微生物)においてではなく、人工環境において、例えば、試験管または反応容器、細胞培養、ペトリ皿などにおいて起こる事象を指す。
in vivo:本明細書で使用される場合、「in vivo」という用語は、生物(例えば、動物、植物、もしくは微生物、またはそれらの細胞もしくは組織)において起こる事象を指す。
単離:本明細書で使用される場合、「単離」という用語は、天然の状態から変更または除去されている物質または実体、例えば、天然の状態ではそれと会合している成分の少なくとも一部から変更または除去されている物質または実体を指す。例えば、生きている動物に天然に存在する核酸またはペプチドは「単離」されていないが、その天然の状態の共存物質から部分的または完全に分離されている同じ核酸またはペプチドは「単離」されている。単離された核酸またはタンパク質は、実質的に精製された形態で存在することができ、または例えば宿主細胞などの非天然環境に存在することもできる。このようなポリヌクレオチドは、ベクターの一部でありながら、及び/またはこのようなポリヌクレオチドもしくはポリペプチドは、組成物の一部でありながら、このようなベクターもしくは組成物が、それが天然に見出される環境の一部ではないという点で、単離されているといえる。いくつかの実施形態では、単離された核酸は組換え型であり、例えば、ベクターに組み込まれている。
リンカー:本明細書で使用される場合、「リンカー」は、2つの分子を接続する分子または分子群を指す。いくつかの実施形態では、リンカーは、切断可能であり得る(例えば、酵素との接触、pHの変化、または温度の変化を介して)。
マイクロRNA(miRNAまたはmiR)結合部位:本明細書で使用される場合、「miR結合部位」は、完全または部分的なハイブリダイゼーションを介してマイクロRNA(miR)に全体的または部分的に結合することができる、または結合する、核酸配列(RNAまたはDNAのいずれか、例えば、RNAの「U」またはDNAの「T」によって異なる)を含む。典型的には、このような結合は、miRと、逆相補体の向きのmiR結合部位との間で起こる。いくつかの実施形態では、miR結合部位は、miR結合部位をコードするAAVベクターゲノムから転写される。
いくつかの実施形態では、miR結合部位は、シリーズでコードまたは転写され得る。このような「miR結合部位シリーズ」または「miRBSs」は、同じまたは異なる核酸配列を有する2つ以上のmiR結合部位を含み得る。
修飾:本明細書で使用される場合、「修飾」は、分子の状態または構造の変化を指す。分子は、化学的、構造的、及び機能的を含め、多くのかたちで修飾され得る。
天然起源:本明細書で使用される場合、「天然起源」または「野生型」は、人工的な援助または人間の手の関与なしに天然に存在することを意味する。
非ヒト脊椎動物:本明細書で使用される場合、「非ヒト脊椎動物」は、野生種及び家畜種を含む、Homo sapiensを除くあらゆる脊椎動物を含む。非ヒト脊椎動物の例は、アルパカ、バンテン、バイソン、ラクダ、ネコ、畜牛、シカ、イヌ、ロバ、ガヤル、ヤギ、モルモット、ウマ、ラマ、ラバ、ブタ、霊長類、ウサギ、トナカイ、ヒツジ、水牛、及びヤクなどの哺乳動物を含むが、これらに限定されない。
オフターゲット:本明細書で使用される場合、「オフターゲット」は、予想される標的以外の実体に対する意図されない活性または結合を指す。
作動可能に連結:本明細書で使用される場合、「作動可能に連結」という語句は、2つ以上の分子、構築物、転写物、実体、部分などの間の機能的接続を指す。
粒子:本明細書で使用される場合、「粒子」は、タンパク質カプシドと、カプシド内に封じ込められたポリヌクレオチド配列(例えば、ウイルスゲノム)との、少なくとも2つの構成要素から成るウイルスである。
患者:本明細書で使用される場合、「患者」は、特定の疾患もしくは状態について、処置を求めるもしくは必要とする可能性がある対象、処置を要する対象、処置を受けている対象、処置を受けることになる対象、または訓練を受けた専門家によるケアを受けている対象を指す。
ペイロード:本明細書で使用される場合、「ペイロード」は、薬剤によって送達される任意の物質を指す。例えば、ペイロードは、抗体のエピトープを有する細胞、組織、または領域に送達するために抗体にコンジュゲートされた治療剤を含み得る。
ペプチド:本明細書で使用される場合、「ペプチド」は、50アミノ酸長より短いかまたはそれに等しい、例えば、約5、10、15、20、25、30、35、40、45、または50アミノ酸長である。
薬学的に許容される:「薬学的に許容される」という語句は、本明細書では、妥当な医学的判断の範囲内で、過度の毒性、刺激、アレルギー反応、または他の問題もしくは合併症を生じずに、ヒト及び動物の組織と接触させて使用するのに好適であり、合理的なベネフィット/リスク比に見合う化合物、物質、組成物、及び/または剤形を指すように用いられる。
薬学的に許容される賦形剤:本明細書で使用される「薬学的に許容される賦形剤」という語句は、患者において実質的に無毒かつ非炎症性であるという性質を有する、本明細書に記載される化合物以外の任意の成分(例えば、活性化合物を懸濁または溶解させることが可能なビヒクル)を指す。賦形剤としては、例えば、付着防止剤、抗酸化剤、結合剤、コーティング、圧縮助剤、崩壊剤、色素(着色料)、エモリエント、乳化剤、フィラー(希釈剤)、成膜剤またはコーティング、風味剤、香料、流動促進剤(フローエンハンサー)、滑沢剤、防腐剤、印刷用インク、吸着剤、懸濁剤または分散剤、甘味料、及び水和水を挙げることができる。例示的な賦形剤は、ブチル化ヒドロキシトルエン(BHT)、炭酸カルシウム、リン酸カルシウム(二塩基性)、ステアリン酸カルシウム、クロスカルメロース、架橋ポリビニルピロリドン、クエン酸、クロスポビドン、システイン、エチルセルロース、ゼラチン、ヒドロキシプロピルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、ラクトース、ステアリン酸マグネシウム、マルチトール、マンニトール、メチオニン、メチルセルロース、メチルパラベン、微結晶セルロース、ポリエチレングリコール、ポリビニルピロリドン、ポビドン、アルファ化デンプン、プロピルパラベン、パルミチン酸レチニル、シェラック、二酸化ケイ素、カルボキシメチルセルロースナトリウム、クエン酸ナトリウム、デンプングリコール酸ナトリウム、ソルビトール、デンプン(トウモロコシ)、ステアリン酸、スクロース、タルク、二酸化チタン、ビタミンA、ビタミンE、ビタミンC、及びキシリトールを含むが、これらに限定されない。
薬学的に許容される塩:本開示には、本明細書に記載される化合物の薬学的に許容される塩も含まれる。本明細書で使用される場合、「薬学的に許容される塩」は、既存の酸または塩基部分をその塩形態に変換することによって(例えば、遊離塩基を好適な有機酸と反応させることによって)親化合物が修飾されている、開示される化合物の誘導体を指す。薬学的に許容される塩の例は、アミンなどの塩基性残基の無機酸塩または有機酸塩、カルボン酸などの酸性残基のアルカリ塩または有機塩などを含むが、これらに限定されない。代表的な酸付加塩としては、酢酸塩、酢酸、アジピン酸塩、アルギン酸塩、アスコルビン酸塩、アスパラギン酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、ベンゼンスルホン酸、安息香酸塩、重硫酸塩、ホウ酸塩、酪酸塩、樟脳塩、カンファースルホン酸塩、クエン酸塩、シクロペンタンプロピオン酸塩、ジグルコン酸塩、ドデシル硫酸塩、エタンスルホン酸塩、フマル酸塩、グルコヘプトン酸塩、グリセロリン酸塩、ヘミ硫酸塩、ヘプトン酸塩、ヘキサン酸塩、臭化水素酸塩、塩酸塩、ヨウ化水素酸塩、2-ヒドロキシ-エタンスルホン酸塩、ラクトビオン酸塩、乳酸塩、ラウリン酸塩、ラウリル硫酸塩、リンゴ酸塩、マレイン酸塩、マロン酸塩、メタンスルホン酸塩、2-ナフタレンスルホン酸塩、ニコチン酸塩、硝酸塩、オレイン酸塩、シュウ酸塩、パルミチン酸塩、パモ酸塩、ペクチン酸塩、過硫酸塩、3-フェニルプロピオン酸塩、リン酸塩、ピクリン酸塩、ピバル酸塩、プロピオン酸塩、ステアリン酸塩、コハク酸塩、硫酸塩、酒石酸塩、チオシアン酸塩、トルエンスルホン酸塩、ウンデカン酸塩、吉草酸塩などが挙げられる。代表的なアルカリ塩またはアルカリ土類金属塩としては、ナトリウム、リチウム、カリウム、カルシウム、マグネシウムなど、ならびに、アンモニウム、テトラメチルアンモニウム、テトラエチルアンモニウム、メチルアミン、ジメチルアミン、トリメチルアミン、トリエチルアミン、エチルアミンなどを含むがこれらに限定されない、非毒性のアンモニウム、第四級アンモニウム、及びアミンカチオンが挙げられる。本開示の薬学的に許容される塩は、例えば非毒性の無機酸または有機酸から形成された、親化合物の従来の非毒性塩を含む。本開示の薬学的に許容される塩は、従来の化学的方法によって、塩基性部分または酸性部分を含む親化合物から合成することができる。一般に、このような塩は、これらの化合物の遊離酸または塩基形態を、水中もしくは有機溶媒中または2つの混合物中で、化学量論量の適切な塩基または酸と反応させることによって調製することができ、一般に、エーテル、酢酸エチル、エタノール、イソプロパノール、またはアセトニトリルなどの非水性媒体が好ましい。好適な塩のリストは、Remington’s Pharmaceutical Sciences,17th ed.,Mack Publishing Company,Easton,Pa.,1985,p.1418、Pharmaceutical Salts:Properties,Selection,and Use,P.H.Stahl and C.G.Wermuth(eds.),Wiley-VCH,2008、及びBerge et al.,Journal of Pharmaceutical Science,66,1-19(1977)に記載されており、各文献は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
薬学的に許容される溶媒和物:本明細書で使用される「薬学的に許容される溶媒和物」という用語は、好適な溶媒の分子が結晶格子に組み込まれている化合物を意味する。好適な溶媒は、投与される投与量で生理学的に耐容可能である。例えば、溶媒和物は、有機溶媒、水、またはそれらの混合物を含む溶液から結晶化、再結晶、または沈殿によって調製され得る。好適な溶媒の例は、エタノール、水(例えば、一水和物、二水和物、及び三水和物)、N-メチルピロリジノン(NMP)、ジメチルスルホキシド(DMSO)、N,N’-ジメチルホルムアミド(DMF)、N,N’-ジメチルアセトアミド(DMAC)、1,3-ジメチル-2-イミダゾリジノン(DMEU)、1,3-ジメチル-3,4,5,6-テトラヒドロ-2-(1H)-ピリミジノン(DMPU)、アセトニトリル(ACN)、プロピレングリコール、酢酸エチル、ベンジルアルコール、2-ピロリドン、安息香酸ベンジルなどである。水が溶媒である場合、溶媒和物は「水和物」と呼ばれる。
薬物動態:本明細書で使用される場合、「薬物動態」は、生体に投与される物質の運命の決定に関連する、分子または化合物のいずれか1または複数の性質を指す。薬物動態は、吸収、分布、代謝及び排泄の程度及び速度を含む幾つかのエリアに分けられる。これは一般的にADMEと呼ばれ、(A)吸収は、物質が血液循環に入るプロセスであり、(D)分布は、身体の体液及び組織全体にわたる物質の分散または拡散であり、(M)代謝(または生体内変換)は、親化合物から娘代謝産物への不可逆的変換であり、(E)排泄(または排除)は、身体からの物質の排除を指す。稀に、いくつかの薬物は体組織に不可逆的に蓄積する。
物理化学的:本明細書で使用される場合、「物理化学的」は、物理的性質及び/または化学的性質に関わるまたは関連することを意味する。
防止:本明細書で使用される場合、「防止」という用語は、感染症、疾患、障害、及び/もしくは状態の発生を部分的もしくは完全に遅延させること;特定の感染症、疾患、障害、及び/もしくは状態の1もしくは複数の症状、特性、もしくは臨床兆候の発生を部分的もしくは完全に遅延させること;特定の感染症、疾患、障害、及び/もしくは状態の1もしくは複数の症状、特性、もしくは兆候の発生を部分的もしくは完全に遅延させること;感染症、特定の疾患、障害、及び/もしくは状態からの進行を部分的もしくは完全に遅延させること;ならびに/または感染症、疾患、障害、及び/もしくは状態に関連する病態を発症するリスクを減少させることを指す。
増殖:本明細書で使用される場合、「増殖」という用語は、成長する、拡大する、もしくは増加すること、または成長させる、拡大させる、もしくは急速に増加させることを意味する。「増殖性」は、増殖する能力を有することを意味する。「抗増殖性」は、増殖性の性質に対して反対または不適当な性質を有することを意味する。
予防的:本明細書で使用される場合、「予防的」は、疾患の蔓延を防止するために使用される治療薬または作用の過程を指す。
予防:本明細書で使用される場合、「予防」は、健康を維持するとともに疾患の蔓延を防止するためにとられる措置を指す。
目的のタンパク質:本明細書で使用される場合、「目的のタンパク質」または「所望のタンパク質」という用語は、本明細書で提供されるもの、ならびにそのフラグメント、変異体、バリアント、及び変化形を含む。
近位:本明細書で使用される場合、「近位」という用語は、中心に近い、または目的の点もしくは領域に近い場所にあることを意味する。
精製された:本明細書で使用される場合、「精製する」、「精製された」、「精製」は、実質的に純粋にすること、または不要な成分、物質汚染、夾雑物、もしくは不純物をなくすことを意味する。「精製された」は、純粋である状態を指す。「精製」は、純粋にするプロセスを指す。
領域:本明細書で使用される場合、「領域」という用語は、ゾーンまたは全般的なエリアを指す。いくつかの実施形態では、ポリペプチドまたはタンパク質に言及している場合、領域は、ポリペプチドもしくはタンパク質に沿ったアミノ酸の線形配列を含んでもよく、または三次元エリア、エピトープ、もしくはエピトープのクラスターを含んでもよい。ポリヌクレオチドに言及している場合、領域は、ポリヌクレオチドに沿った核酸の線形配列を含んでもよく、または三次元エリア、二次構造、もしくは三次構造を含んでもよい。領域は末端領域を含み得る。本明細書で使用される場合、「末端領域」という用語は、所与の実体の端部または「末端」に位置している領域を指す。ポリペプチドに言及している場合、末端領域はN末端及び/またはC末端を含み得る。N末端は、遊離アミノ酸アミノ基を有するポリペプチドの端部を指す。C末端は、遊離アミノ酸カルボキシル基を有するポリペプチドの端部を指す。N末端領域及び/またはC末端領域は、いずれかの末端に位置している単一の末端官能基、単一のアミノ酸、または複数のアミノ酸を指すことがある。ポリヌクレオチドに言及している場合、末端領域は5’末端及び3’末端を含み得る。5’末端は、遊離核酸リン酸基を含むポリヌクレオチドの端部を指す。3’末端は、遊離核酸ヒドロキシル基を含むポリヌクレオチドの端部を指す。ポリヌクレオチド末端領域は、末端に位置している、単一の末端官能基、単一のヌクレオチド、または複数のヌクレオチドを指すことがある。
RNA及びDNA:本明細書で使用される場合、「RNA」または「RNA分子」または「リボ核酸分子」という用語は、リボヌクレオチドのポリマーを指し、「DNA」または「DNA分子」または「デオキシリボ核酸分子」という用語は、デオキシリボヌクレオチドのポリマーを指す。DNA及びRNAは、例えば、それぞれDNA複製及びDNAの転写によって天然に合成することもでき、または化学的に合成することもできる。RNA及びDNAは、一本鎖(すなわち、それぞれssRNAまたはssDNA)でもよく、または多重鎖(例えば、二本鎖、すなわち、それぞれdsRNA及びdsDNA)でもよい。本明細書で使用される「メッセンジャーRNA」または「mRNA」という用語は、1または複数のポリペプチド鎖のアミノ酸配列をコードする一本鎖RNAを指す。
サンプル:本明細書で使用される場合、「サンプル」という用語は、より大きな実体の一部またはサブセットを指す。生物学的な生物または物質からのサンプルは、本明細書では「生物学的サンプル」と呼ばれ、組織、細胞、及び体液(例えば、血液、粘液、リンパ液、滑液、脳脊髄液、唾液、羊水、羊膜帯血液、尿、膣液、及び精液)を含み得るが、これらに限定されない。サンプルは、生物全体、または、例えば、血漿、血清、髄液、リンパ液、皮膚の外切片、気管、腸管、及び泌尿生殖器、涙、唾液、乳汁、血液細胞、腫瘍、及び器官を含むがこれらに限定されない、その組織、細胞、もしくは構成要素のサブセット、またはそれらの画分もしくは部分から調製された、ホモジネート、ライセート、もしくは抽出物をさらに含み得る。サンプルは、タンパク質または核酸分子などの細胞成分を含み得る栄養ブロスまたはゲルなどの培地をさらに含み得る。
シグナル配列:本明細書で使用される場合、「シグナル配列」という語句は、タンパク質の輸送または局在化を指示することができる配列を指す。
単回単位用量:本明細書で使用される場合、「単回単位用量」は、1用量で/1回で/単一経路で/単一の接触点で投与される、すなわち、単一の投与事象における任意の治療薬の用量である。いくつかの実施形態では、単回単位用量は、個別の剤形(例えば、錠剤、カプセル、パッチ、充填済みシリンジ、バイアルなど)として用意される。
スペーサー:本書で使用される場合、「スペーサー」は、概して、2つ以上の連続するmiR結合部位配列の間に位置している、例えば1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10ヌクレオチド長の、任意の選択された核酸配列である。スペーサーは、10ヌクレオチド長より長くてもよく、例えば、20、30、40、または50、または50超のヌクレオチドでもよい。
分割用量:本明細書で使用される場合、「分割用量」は、単回単位用量または合計一日用量を2回以上の用量に分割することである。
安定:本明細書で使用される場合、「安定」は、ある程度の攪乱に耐えられるほど十分に堅牢な実体の状態を指す。例えば、安定な化合物またはタンパク質は、反応混合物から有用な純度まで単離される間にインタクトな状態を保ち得る。
安定化:本明細書で使用される場合、「安定化する」または「安定化された」という用語は、安定にすることまたは安定になることを意味する。
対象:本明細書で使用される場合、「対象」という用語は、本開示による化合物、組成物、方法、キット、またはデバイスが、例えば、実験的、診断的、予防的、及び/または治療的な目的で投与または適用され得る、任意の生物を指す。対象は、動物(例えば、マウス、ラット、ウサギ、非ヒト霊長類、及びヒトなどの哺乳動物)及び植物を含み得る。医学的処置を受けている、それを必要とする、それに適格である、またはそれを求めている対象は、本明細書では「患者」と呼ばれる。
実質的に:本明細書で使用される場合、「実質的に」という用語は、目的の特徴または性質を完全またはほぼ完全な程度または度合いで呈する定性的条件を指す。生物学分野の当業者には、生物学的現象及び化学的現象が完了に至ること、及び/または完了まで進行すること、または絶対的結果を達成もしくは回避することは、あるとしても稀であることが理解されよう。したがって、「実質的に」という用語は、本明細書では、多くの生物学的現象及び化学的現象に内在する完全性の潜在的欠如を捉えるために使用される。
患う:疾患、障害、及び/または状態を「患う」個体は、疾患、障害、及び/または状態の診断を受けているか、またはその1もしくは複数の症状を示す。
易罹患性:疾患、障害、及び/または状態に「易罹患性」のある個体は、疾患、障害、及び/または状態の診断を受けていない及び/またはその症状を呈さない場合があるが、疾患またはその症状を発症する傾向を有する。いくつかの実施形態では、疾患、障害、及び/または状態(例えば、神経変性疾患)に易罹患性のある個体は、次のうちの1または複数によって特徴付けられ得る:(1)疾患、障害、及び/または状態の発症に関連する遺伝子変異、(2)疾患、障害、及び/または状態の発症に関連する遺伝子多型、(3)疾患、障害、及び/または状態に関連するタンパク質及び/または核酸の発現及び/または活性の増加及び/または減少または機能不全、(4)疾患、障害、及び/または状態の発症に関連する習慣及び/または生活様式、(5)疾患、障害、及び/または状態の家族歴、ならびに(6)疾患、障害、及び/または状態の発症に関連する微生物への曝露及び/または感染。いくつかの実施形態では、疾患、障害、及び/または状態に易罹患性のある個体は、疾患、障害、及び/または状態を発症する。いくつかの実施形態では、疾患、障害、及び/または状態に易罹患性のある個体は、疾患、障害、及び/または状態を発症しない。
徐放:本明細書で使用される場合、「徐放」という用語は、特定の期間にわたる、典型的には比較的制御されたまたは一貫した速度での、化合物または薬剤の放出を指す。
合成:「合成」という用語は、人間の手によって生成される、調製される、及び/または製造されることを意味する。本開示の合成ポリヌクレオチド、ポリペプチド、または他の分子は、化学的プロセスまたは酵素的プロセスを使用して調製され得る。
標的:本明細書で使用される場合、「標的」という用語は、対象、器官、組織、細胞、タンパク質、核酸、生体分子、または前述のもののいずれかの群、複合体、もしくは一部を含み得る、目的または関心対象の実体を指す。いくつかの実施形態では、標的は、抗体が親和性を有する、または抗体が親和性を有するように所望される、設計される、もしくは開発される、タンパク質またはそのエピトープであり得る。本明細書で使用される場合、「標的」という用語は、特定の目的物に向けられた薬剤の活性を指すように使用されることもある。例えば、特定のタンパク質「X」への親和性を有する抗体は、タンパク質Xを標的とすると言われることがあり、またはタンパク質Xを標的とする抗体と呼ばれることもあれば、タンパク質X標的化抗体と呼ばれることもある。同様に、薬剤の活性の対象である目的物は、「標的となる」目的物と呼ばれることもある。例えば、抗体が特定のタンパク質「X」に対して親和性を有する場合、タンパク質Xは、抗体の標的となるものと呼ばれることがある。
治療剤:「治療剤」という用語は、対象に投与されると、治療的、診断的、及び/または予防的な効果を有する、及び/または所望の生物学的効果及び/または薬理学的効果を誘発する、任意の薬剤を指す。生体において生物学的効果をもたらすことができる治療剤は、本明細書では「薬物」と呼ばれる。
治療有効量:本明細書で使用される場合、「治療有効量」という用語は、感染症、疾患、障害、及び/または状態を患う、またはそれに易罹患性のある対象に送達される薬剤(例えば、抗体または他の治療剤)の量であって、その量で送達または投与されると、感染症、疾患、障害、及び/または状態を処置する、その症状を向上させる、それを診断する、それを防止する、及び/またはその発生を遅延させるのに十分である量を意味する。いくつかの実施形態では、治療有効量は、単回用量で提供される。いくつかの実施形態では、治療有効量は、複数の用量を含む投与量レジメンで投与される。当業者には、いくつかの実施形態では、単位剤形が、このような投与量レジメンの一部として投与された際に有効である量を含む場合、治療有効量の特定の薬剤または実体を含むとみなされ得ることが理解されよう。
治療上有効な転帰:本明細書で使用される場合、「治療上有効な転帰」という用語は、感染症、疾患、障害、及び/または状態を患う、またはそれに易罹患性のある対象において、感染症、疾患、障害、及び/または状態を処置する、その症状を向上させる、それを診断する、それを防止する、及び/またはその発生を遅延させるのに十分である転帰を意味する。
合計一日用量:本明細書で使用される場合、「合計一日用量」は、24時間の間に投与または処方される量である。これは単回単位用量として投与されてもよい。
処置する:本明細書で使用される場合、「処置する」という用語は、特定の感染症、疾患、障害、及び/または状態の1または複数の症状または特性を、部分的または完全に軽減すること、改善すること、向上させること、緩和すること、その発生を遅延させること、その進行を阻害すること、その重篤度を低減すること、及び/またはその発生率を低減することを指す。例えば、対象の神経変性疾患を「処置する」ことは、対象の神経変性を阻害すること、神経細胞の健康を促進すること、脳内のプラークもしくは濃縮体の形成を逆転させる、防止する、もしくは低減すること、及び/または記憶喪失もしくは他の神経学的機能もしくは活性の喪失を逆転させる、防止する、もしくは低減することを指す場合がある。処置は、疾患、障害、及び/もしくは状態の徴候を呈さない対象、ならびに/または疾患、障害、及び/もしくは状態の初期徴候のみを呈する対象に、疾患、障害、及び/または状態に関連する病態を発症するリスクを減少させる目的で投与され得る。
無修飾:本明細書で使用される場合、「無修飾」は、何らかのかたちで変更される前のあらゆる物質、化合物または分子を指す。無修飾は、生体分子の野生型または天然型を指すことがある。分子は一連の修飾を受けることがあり、それによって修飾された各分子は、後の修飾のための「無修飾」出発分子として機能し得る。
ベクター:本明細書で使用される場合、「ベクター」は、異種分子を輸送する、形質導入する、またはその担体として別様に作用する任意の分子または部分である。本開示のベクターは、組換えにより産生されてもよい。
ウイルスゲノム:本明細書で使用される場合、「ウイルスゲノム」または「ベクターゲノム」は、少なくとも1つの逆方向末端反復(ITR)及び少なくとも1つのコードされたペイロードを含むポリヌクレオチドである。ウイルスゲノムは、ペイロードの少なくとも1コピーをコードする。
VIII.均等物及び範囲
当業者であれば、定型的な実験を使用するだけで、本明細書に記載される本発明に従う特定の実施形態に対する多くの均等物を認識するか、または確認することができよう。本発明の範囲は、上記の説明に限定されるよう意図されるものではなく、むしろ添付の特許請求の範囲に記載されるとおりである。
特許請求の範囲において、「a」、「an」、及び「the」などの冠詞は、別段の記載がある場合または文脈から別の意味が明らかである場合を除き、1または複数を意味し得る。群の1または複数の構成要素の間に「または」を含む請求項または説明は、別段の記載がある場合または文脈から別の意味が明らかである場合を除き、群構成要素のうちの1つ、複数、またはすべてが所与の生成物またはプロセスに存在する、用いられる、または別様に関連していれば満たされるとみなされる。本発明は、群構成要素のうち1つだけが所与の生成物またはプロセスに存在する、用いられる、または別様に関連している実施形態を含む。本発明は、群構成要素のうち複数または全体が所与の生成物またはプロセスに存在する、用いられる、または別様に関連している実施形態を含む。
「含む(comprising)」という用語はオープンであることが意図され、更なる要素またはステップの包含を許容するが必要とはしないことにも留意されたい。したがって、「含む(comprising)」という用語が本明細書で使用される場合、「からなる(consisting of)」という用語も包含され、開示される。
範囲が与えられている場合、両端点が含まれる。さらに、別段の記載がある場合または文脈及び当業者の理解から別の意味が明らかである場合を除き、範囲として表される値は、文脈上明らかに別の意味が示されない限り、その範囲の下限の単位の10分の1まで、本発明の様々な実施形態において指定された範囲内の任意の特定の値または部分的範囲をとり得ることを理解されたい。
さらに、本発明の特定の実施形態で先行技術の範囲に入るものは、請求項のうちのいずれか1または複数から明確に除外され得ることを理解されたい。このような実施形態は当業者に既知であるとみなされるため、除外されることが本明細書に明確に記載されていなくとも除外されてよい。本発明の組成物の任意の特定の実施形態(例えば、任意の核酸またはそれによってコードされるタンパク質、任意の産生方法、任意の使用方法など)は、先行技術の存在に関連するか否かにかかわらず、理由を問わず任意の1または複数の請求項から除外され得る。
すべての引用元、例えば、本明細書で引用される参考文献、刊行物、データベース、データベースエントリ、及び技術は、引用に明確に記載されていなくとも、参照により本願に組み込まれる。引用元と本願とに矛盾する記載がある場合、本願の記載が優先するものとする。
セクション及び表の見出しは限定を意図するものではない。
実施例1。抗原調製
マウスの免疫化ならびに抗ヒトタウ抗体の生成及び特徴決定を支持するために、抗原調製を行った。ヒト微小管関連タンパク質タウ、アイソフォーム2(配列番号920)を含む濃縮対らせん状細線維(ePHF;サルコシル不溶性タウ)を、病的なタウに対応する異なるリン酸化残基を有する幾つかのタウタンパク質抗原と共に調製した。関連する配列を表19に提示する。表中、リン酸化残基には二重下線が引かれている。
Figure 2023523401000055
タウタンパク質抗原を免疫化のためにキーホールリンペットヘモシアニン(KLH)とコンジュゲートした。ePHF抗原調製のために、ePHFをADまたは非ADの前頭皮質組織の画分から単離した。皮質組織画分は、Greenberg及びDavies(1990)により説明された方法をわずかに改変した方法に従って調製した(Liu et al.,J Neuroscience,2016、同文献の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。簡潔に述べると、脳組織を、Teflonガラスホモジナイザーにおいて、プロテアーゼ阻害剤(Roche Molecular Systems,Inc.、ニュージャージー州ブランチバーグ)及びホスファターゼ阻害剤カクテル(ThermoFisher、マサチューセッツ州ウォルサム、カタログ番号78437)または1mM NaF/1mM NaVOを含む冷たいホモジナイゼーションバッファー(10mM Tris/1mM EDTA/0.8M NaCl/10%スクロース、pH7.4)でホモジナイズした。次いで、脳ホモジネートを27,000×gで30分間、4℃で遠心分離した。得られた上清を、37℃で2.5時間にわたり、1%(v/v)の2-メルカプトエタノールの存在下で1%(w/v)のN-ラウロイルサルコシンを用いた抽出にかけ、その後、室温で30分間、108,000×gでの遠心分離を行った。この遠心分離から回収したペレットを、0.5mLのPBS/チューブで1回手早くすすいだ。すすいだPBSは廃棄した。更に0.5mLのPBSを各チューブに加えてPHFを溶解させた。6本のチューブからPHFをプールし、プールしたPHF溶液を超音波処理した。得られた溶液を約5倍に濃縮し、さらに超音波処理した。次いで、PHFサンプルを、定性的評価のためにHT7ウエスタンによって、また定量的評価のためにPT3 ELISAによって分析した。次いでPHFサンプルを-80℃で保存した。
実施例2。免疫化
野生型マウス及びタウノックアウトマウスのコホートを、ePHF、または実施例1に記載したKLHコンジュゲートタウタンパク質抗原で免疫化した。免疫化マウスの血清を、酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)により、アルブミンコンジュゲート抗原に結合する抗体の存在についてスクリーニングした。血清の検査結果が抗原特異的抗体陽性の免疫化マウスを使用して、ハイブリドーマ細胞を調製した。ハイブリドーマ細胞培養培地の上清を直接ELISAによりスクリーニングして、抗原特異的抗体を産生する細胞を同定した。抗原結合が陽性の抗体を産生するハイブリドーマクローンを選択して、サブクローニング及び抗体配列分析を行った。
選択されたクローンの可変ドメインアミノ酸及び核酸配列は表3に提示してあり、各ID番号は、選択されたハイブリドーマクローンによって発現された抗体に対応している。相補性決定領域(CDR)分析を行って、重鎖CDRH1、CDRH2、及びCDRH3配列、ならびに軽鎖CDRL1、CDRL2、及びCDRL3配列を同定した。同定されたCDRアミノ酸配列は、表6に提示したものを含む。
実施例3。タウ結合
上述の免疫化から得られた抗体の可変ドメイン核酸配列を使用して、組換えマウスIgG抗体を調製した。これらの候補抗体を、野生型タウと比べたePHFへの結合及びePHFに対する特異性について、直接ELISAによって分析した。
ePHF及び野生型タウについての直接ELISAでは、まずプレートをePHFまたは野生型タウでコーティングした。抗原のPBS溶液を調製し、50μLを各ウェルにピペットで入れた。プレートを覆い、37℃で1時間、または4℃で一晩インキュベートした。次いで、プレートを洗浄し、150μlのブロッキングバッファーを各ウェルに加えてブロッキングし、室温で1時間インキュベートした。次いで、プレートを洗浄した後、ブロッキングバッファーで調製した段階希釈候補抗体サンプルを加えた。プレートを洗浄し、酵素標識二次抗体のブロッキングバッファー溶液を各ウェルに加えることにより、候補抗体結合の検出を行った。基質を加え、得られた反応生成物の分光光度分析により、二次抗体結合を検出した。ePHF及び野生型タウに結合する抗体の最大半量有効濃度(EC50)を表20に提示する。
Figure 2023523401000056
Figure 2023523401000057
抗体V0004、V0009、V0022、V0023、V0024、及びV0052のフォローアップ分析は、野生型タウと比べて100倍を超えるePHFへの選択性を示した。さらに、これらの抗体は、1mg/mLで低い多重特異性及び良好な溶液中安定性を示した。
実施例4。抗体競合によるエピトープビニング
上述の免疫化から得られた抗体の可変ドメイン核酸配列を使用して、組換えマウスIgG抗体を調製し、iPHF親和性測定及びエピトープ結合競合分析を行った。検査はOctet(ForteBio、カリフォルニア州メンローパーク)分析によって行った。
iPHF親和性分析では、候補抗体を、キネティックバッファー(ForteBio、カタログ番号18-1105)中で抗マウスIgG Fc捕捉(AMC)バイオセンサチップ(ForteBio、カタログ番号18-5088)に固定化した。次いで、バイオセンサチップを洗浄した後、iPHFのキネティックバッファー溶液を導入して、候補抗体とのiPHFの会合及び解離の分析を行った。Data Analysis HTバージョン11.1を使用して親和性測定値を取得し、バックグラウンド及び高周波ノイズを補正した。
「エピトープビニング」とも呼ばれるプロセスであるエピトープ結合競合分析では、サンドイッチアッセイフォーマットを使用して候補抗体を分析した。このアッセイフォーマットでは、第1の「捕捉」抗体をOctetバイオセンサに付着させた後、抗原及び第2の抗体を順次導入し、バイオセンサの読み取り値を使用して、一方または両方の抗体が各抗原に結合するかどうかを決定する。競合するエピトープ結合を示す抗体は、同じまたは同様の特徴決定カテゴリ、すなわち「ビン」に入れた。同時結合を示す抗体は、別々のカテゴリに入れた。PT3、IPN002、またはC10.2抗体を捕捉抗体として使用し、上述のようにAMCバイオセンサチップに固定化した。次いで、バイオセンサチップを洗浄し、10μg/ml MOPCでブロッキングした。さらなる洗浄の後、バイオセンサ捕捉抗体をiPHFと会合させた。次いで、候補抗体をiPHFへの結合について分析した。MOPC(非抗原特異的対照)及びPT3、IPN002、またはC10.2抗体(いずれの場合もバイオセンサ抗体とマッチする)を、直接競合する対照として使用した。結果を表21に示す。
Figure 2023523401000058
Figure 2023523401000059
PT3、C10.2、またはPT3とC10.2との両方とのクロスブロッキングを示した候補抗体を同定した。試験した抗体のいずれともクロスブロッキングを示さなかった、またはiPHFへの結合を示さなかった、さらなる候補抗体を同定した。
実施例5。ペプチド抗原によるエピトープビニング
上述の免疫化から得られた抗体の可変ドメイン核酸配列を使用して、組換えマウスIgG抗体を調製し、サンドイッチELISAによるPHFタウエピトープビニング分析を行った。このアッセイでは、抗タウ抗体AT120(ペプチド1を対象とする)、PT3(ペプチド5を対象とする)、C10.2(ペプチド12を対象とする)、PT76、6C5、及びUCB Dを捕捉抗体として使用した。捕捉抗体をPBSで1μg/mlの濃度に希釈し、溶液50μlを使用して各アッセイプレートウェルをコーティングした。プレートを覆い、4℃で一晩インキュベートした。次いで、プレートを洗浄し、150μlのブロッキングバッファーを各ウェルに加えてブロッキングし、室温で1時間インキュベートした。プレートを再度洗浄した後、ブロッキングバッファー中のePHFまたは野生型タウでコーティングし、その後、室温で1時間インキュベートした。次いで、プレートを洗浄した後、ブロッキングバッファーで調製した段階希釈候補抗体サンプルを加えた。プレートを洗浄し、酵素標識二次抗体のブロッキングバッファー溶液を各ウェルに加えることにより、候補抗体結合の検出を行った。基質を加え、得られた反応生成物の分光光度分析により、二次抗体結合を検出した。試験した各候補抗体についてのエピトープ「ビン」を、試験した各抗タウ捕捉抗体による観察された競合(エピトープブロッキング)に基づいて決定した。結果を表22に示す。
Figure 2023523401000060
Figure 2023523401000061
複数の抗体がC10.2またはPT3のいずれかとエピトープ結合を競合し、1つの抗体は、C10.2及びPT3の両方とエピトープ結合を競合した。また、複数の抗体がPT176及びUCB Dとエピトープ結合を競合し、1つの抗体は、PT176、UCB D、及びC10.2とエピトープ結合を競合した。
実施例6。免疫枯渇スクリーニング
上述の免疫化から得られた抗体の可変ドメイン核酸配列を使用して、組換えマウスIgG抗体を調製し、免疫枯渇アッセイスクリーニングを行った。免疫枯渇アッセイは、枯渇後の溶液に関連する性質の変化を評価することにより、溶液から標的抗原を枯渇させる抗体候補の能力を分析する。ここでは、タウRDバイオセンサ細胞を使用して、候補抗体による免疫枯渇にかけた溶液から得られた上清中のePHFによって誘導されたタウ凝集を分析した。RDバイオセンサ細胞は、タウ凝集に応答して蛍光シグナルを生じる。このアッセイでは、500nM~0.8nMの抗体溶液(合計5つの希釈物を試験した)をProtein G Dynabeadsの10mg/ml溶液と共に室温で30分間インキュベートして、抗体被覆ビーズを得た。10nM ePHFをリン酸緩衝生理食塩水で希釈し、超音波処理した後、抗体被覆ビーズ調製物と共に室温で90分間インキュベートした。次いで上清を収集し、1:5に希釈した後、Opti-MEM(Thermo Fisher Scientific)において、1:1リポフェクタミン2000(Thermo Fisher Scientific、マサチューセッツ州ウォルサム)と共に室温で20分間インキュベートした。得られた溶液20μlをバイオセンサ細胞培養物に加えた(最終培地容量150μl)。細胞を2日間培養した後、蛍光分析のために固定した。核をDraq5染色剤で染色し、ウェル(条件毎に3連のウェル)当たり9枚の10倍画像をCytation5によって取得した。タウ凝集体を有する細胞の割合を各ウェルについて決定し、播種対照として並行して使用したMOPC-21 IgG対照ビーズで処理した細胞に対して正規化した。初期分析においてタウ凝集阻害を示した抗体を選択して用量応答曲線分析を行い、タウ凝集の阻害についての最大半量阻害濃度(IC50)を決定した。試験した各候補抗体についての平均IC50値(幾何平均に基づく)を表23に示す。
Figure 2023523401000062
複数の抗体が30nM未満のタウ凝集阻害IC50値を示し、14種の抗体は10nM未満であった。
実施例7。組織染色
上述の免疫化から得られた抗体の可変ドメイン核酸配列を使用して、組換えマウスIgG抗体を調製し、ヒト脳組織切片における病的なタウと結合する能力について試験した。アルツハイマー病(AD)患者またはアルツハイマー病ではない患者の凍結保存されたヒト脳組織切片をスライドガラスにマウントし、PBSで洗浄した。0.9%過酸化水素及び0.02% Triton-X 100の1×PBS溶液を使用して、組織切片における内因性ペルオキシダーゼ活性を室温で30分間クエンチした。次いで組織切片をPBSで洗浄し、0.02% Triton-X 100を含むPBS中の10%正常ヤギ血清のブロッキング溶液と共に室温で1時間インキュベートした。タンパク質希釈剤を含むPBSでの1:500希釈により候補抗体溶液を調製した。候補抗体溶液中で組織切片を室温で1時間インキュベートした後、PBSで洗浄して未結合抗体を除去した。次いで、タンパク質希釈剤を含むPBS中のビオチン化ヤギ抗マウスIgGの溶液で組織切片を処理し、室温で1時間インキュベートした。組織切片を再度PBSで洗浄し、アビジン-ペルオキシダーゼコンジュゲートの溶液で処理した後、室温で30分間インキュベートした。組織切片を再度PBSで洗浄した後、3,3’ジアミノベンジジン四塩酸塩(DAB)基質溶液で処理すると、候補抗体結合及びペルオキシダーゼ免疫複合体形成の部位で褐色の酵素沈殿物が得られた。酵素反応を約1分間進行させた後、PBS洗浄液ですすぐことによって停止させた。次いで組織切片をマウントして、免疫染色(候補抗体結合を示す)の顕微鏡的評価を行った。観察された染色の程度に基づいて、免疫染色後の組織切片をランク付けした。結果を表24に示す。表中、「-」は、染色なしを示し、「+」、「+/++」、「++」、「++/+++」、及び「+++」は、陽性染色のレベルを低度から高度へと示す。「+/-」は、非疾患組織で観察されたいくらかの染色を除いて、染色なしを示す。細胞核の染色をもたらした抗体が示されている。
Figure 2023523401000063
Figure 2023523401000064
AD脳組織切片では複数の抗体が陽性の染色をもたらし、非AD脳組織の脳組織切片では陽性染色はほとんどまたはまったく観察されなかった。
固定したヒト脳組織を使用して、抗体V0004、V0009、V0022、V0023、V0024、及びV0052を評価した際、同様の結果が得られた。野生型マウスと、P301Sタウ変異を有するFTD変異体タウトランスジェニックマウスとで脳組織染色を比較した際にも、これらの抗体について同様の結果が得られた。
実施例8。iPHF親和性分析
抗ヒトタウ抗体のiPHFに対する親和性について、Octet(ForteBio、カリフォルニア州メンローパーク)分析によって評価した。表3に提示したものから選択されたクローン特異的可変ドメインペア、及びマウスIgG1定常ドメインを用い、組換えマウスIgG抗体を調製した。候補抗体をキネティックバッファー(ForteBio)中でバイオセンサチップ(ForteBio)に固定化した。次いで、バイオセンサチップを洗浄した後、iPHFのキネティックバッファー溶液を導入して、候補抗体との会合及び解離の分析を行った。Data Analysis HTバージョン11.1を使用して親和性測定値(K)を取得し、バックグラウンド及び高周波ノイズを補正した。表25に結果を提示する。
Figure 2023523401000065
表25に示した抗体はすべて、150nM未満のK値を示し、抗体V0009、V0022、V0050、V0052、V0026、V0058、V0055、V0024、V0023、及びV00016は、10nM未満のK値を示した。試験した抗体のうち、野生型タウに対してほぼ均等の親和性を示したV00016を除いては、すべてが野生型タウに対して弱い親和性を示したか、または親和性を示さなかった(200nM超のK)。
実施例9。Pepscanエピトープ分析
表3に提示したものから選択されたクローン特異的可変ドメインペア、及びマウスIgG1定常ドメインを用い、組換えマウスIgG抗体を調製した。エピトープ分析は、ペプチドスキャニング手法(例えば、Verelst,J.et al.Front Mol Biosci.2020 Mar 31;7:48を参照のこと)を使用し、様々な抗タウ抗体を用いて行った。リン酸化ヒトタウに対応する、重複する合成ビオチン化ペプチドのライブラリ(Pepscan、オランダ、レリスタット)を取得し、アッセイプレートウェルの各々を個々のライブラリメンバーでコーティングするために使用した。表3に提示したものから選択されたクローン特異的可変ドメインペア、及びマウスIgG1定常ドメインを用い、組換えマウスIgG抗体を調製した。標識二次抗体を用いたペプチド抗体複合体の比色検出を使用すること、またはアッセイウェルにおいてストレプトアビジンでコーティングされたバイオセンサとビオチン化ペプチドを会合させ、バイオレイヤー干渉法(BLI)ベースの検出によって抗体結合を評価することにより、各ウェルのペプチドに対する抗体結合を分析した。
結果は、ヒトタウ(配列番号920)の残基409~436と対応するペプチドへの親和性を有するタウC末端に近いV0022、V0023、及びV0024抗体の結合を示した。これらの抗体は、ヒトタウ(配列番号920)の残基413~430と対応するペプチドに対して最も高い親和性(V0022 K=3.06×10-10M、V0023 K=2.07×10-10M、V0024 K=2.25×10-10M)を示した。
抗体V0052はヒトタウの複数の領域との会合を示し、これは、完全長タウ上のエピトープが立体構造的であり得る(タンパク質フォールディングによって一緒にグループ化された複数の領域を含む)ことを示している。V0052は、ヒトタウ(配列番号920)の残基55~76、159~194、219~247、及び381~426と対応するペプチドへの親和性を示した。これらの領域のうち、V0052の親和性は、ヒトタウ(配列番号920)の残基57~72(K=1.40×10-8M)、175~191(K=7.24×10-9M)、223~238(K=2.08×10-9M)、及び383~400(K=1.26×10-8M)に対してより高く、ヒトタウ(配列番号920)の残基223~238に対する親和性が最も高かった(K=2.08×10-9M)。
V0009は、ヒトタウ(配列番号920)の残基32~49及び185~200あたりで最も高い親和性を示した。
実施例10。CDR配列分析
上述の抗体に関連するCDRアミノ酸配列をアラインし、配列構造間の関係を評価した。対応するCDR領域における多重配列アラインメントは、EMBL-EBIウェブサイトでウェブベースのT-coffeeプログラム(比較的小さな配列の多重配列アラインメントに好適)を使用して行われる。いくつかの抗体群が、分析したCDR配列の中で高レベルの配列同一性で、場合によっては特定のエピトープ及び/または結合親和性と相関して同定された。
抗体V0020とV0021との間のアラインメント
抗体V0020とV0021との間のアラインメントを以下に示す。
Figure 2023523401000066
VH CDR配列アラインメントは、GYTFTS[Y/N](配列番号927)、またはより一般的にはGYTFTSX(配列番号928)のCDRH1コンセンサス配列(ここで、Xは、任意のアミノ酸であってよく、例えば、XはY/F/N/Qである)、NPNNS[D/E](配列番号929)、またはより一般的にはNPNNSX(配列番号930)のCDRH2コンセンサス配列(ここで、Xは、任意のアミノ酸、例えば、負に帯電した側鎖を有するアミノ酸であってよい)、及びこの群の抗体間で保存されていたANYYGGSQFAY(配列番号409)のCDRH3コンセンサス配列をもたらした。
VL CDR配列アラインメントは、軽鎖CDR配列がこの群の抗体間で完全に保存されていることを示した。
抗体V0022~V0024の間のアラインメント
上述のように、抗体V0022~V0024は、ヒトタウのC末端付近で結合を示し、ヒトタウ(配列番号920)の残基413~430に対応するペプチドへの親和性が最も高かった。この重複を考慮して、抗体V0022~V0024の間のCDR配列アラインメントを行い、コンセンサス配列を同定するために使用した。
抗体V0022~V0024の間のアラインメントを以下に示す。
Figure 2023523401000067
上述のように、抗体V0022~V0024は、ヒトタウのC末端付近で結合を示し、ヒトタウ(配列番号920)の残基413~430に対応するペプチドへの親和性が最も高かった。
VH CDR配列アラインメントは、G[F/Y]TFT[R/I][Y/F](配列番号931)、またはより一般的にはG-X1-TFT-X2-X3(配列番号932)のCDRH1コンセンサス配列(ここで、X1、X2、及びX3は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1及び/またはX3は、FもしくはYなどの疎水性及び/または芳香族側鎖を有するアミノ酸であってよく、及び/または、X2は、正に帯電した残基(R、K、Hなど)もしくは脂肪族側鎖を有する残基(A、V、I、またはLなど)であってよい)、この群の抗体間で保存されていたNPNNGG(配列番号341)のCDRH2コンセンサス配列、及びこの群の抗体間で保存されていたGTGTGAMDY(配列番号410)のCDRH3コンセンサス配列をもたらした。
VL CDR配列アラインメントは、RSSQSLVH[N/S]NG[I/N]T[H/Y]LY(配列番号933)、またはより一般的にはRSSQSLVH-X1-NG-X2-T-X3-LY(配列番号934)のCDRL1コンセンサス配列(ここで、X1、X2、及びX3は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はQ/N/S/Tであり、及び/またはX2はA/V/I/L/Q/Nであり、及び/またはX3はH/R/K/Y/Fである)、RVS[N/S]RFS(配列番号935)、またはより一般的にはRVSXRFS(配列番号936)のCDRL2コンセンサス配列(ここで、Xは、任意のアミノ酸であってよく、例えば、XはQ/N/S/Tである)、及びこの群の抗体間で保存されていたFQGTHVPRT(配列番号571)のCDRL3コンセンサス配列をもたらした。
抗体V0022~V0025の間のアラインメント
抗体V0022~V0025、及びV0050の間のアラインメントを以下に示す。
Figure 2023523401000068
VH CDR配列アラインメントは、G[F/Y]TFT[R/I/D][Y/F](配列番号937)、またはより一般的にはG-X1-TFT-X2-X3(配列番号938)のCDRH1コンセンサス配列(ここで、X1、X2及びX3は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1及びX3は各々独立してF/Yであり、及び/またはX2は任意の残基(R/K/H/D/E/G/A/I/L/Vなど)である)、NPNNG[G/E](配列番号939)、またはより一般的にはNPNNGX(配列番号940)のCDRH2コンセンサス配列(ここで、Xは、任意のアミノ酸、例えば、E/D/G/A/V/I/Lであってよい)、及びG[T/R]G[T/M]G[不在/Y][不在/Y]A[M/L]DY(配列番号941)、またはより一般的にはG-X1-G-X2-G-X3-X4-A-X5-DY(配列番号942)のCDRH3コンセンサス配列(ここで、X1~X5の各々は、任意のアミノ酸であってよく、ならびに/あるいは、X3及び/またはX4は不在であってよく、例えば、X1はS/T/R/K/Hであり、及び/またはX2はS/T/V/L/A/I/Mであり、及び/またはX3及びX4は各々独立してY/F/不在であり、及び/またはX5はA/V/I/L/Mである)をもたらした。
VL CDR配列アラインメントは、[R/G][S/A]S[Q/E][S/N][L/V][V/Y][H/G][S/A/N][N/T/L][G/N][I/N/不在][T/不在][H/Y/不在][L/不在][Y/不在](配列番号943)、またはより一般的にはX1-X2-S-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9-X10-X11-X12-X13-X14-X15(配列番号944)のアミノ酸配列を有する、約11~約17アミノ酸を有するCDRL1コンセンサス配列(ここで、X1~X15は、任意のアミノ酸であってよく、及び/または、X11、X12、X13、X14、及び/またはX15は不在であってよく、例えば、X1はR/K/H/G/A/V/I/Lであり、及び/またはX2はS/T/A/V/I/Lであり、及び/またはX3はQ/N/E/Dであり、及び/またはX4はS/T/N/Qであり、及び/またはX5はL/V/A/Iであり、及び/またはX6はA/V/I/L/Y/Fであり、及び/またはX7はH/R/K/G/Aであり、及び/またはX8はS/T/A/V/I/L/N/Qであり、及び/またはX9はN/Q/A/I/L/V/M/S/Tであり、及び/またはX10はG/A/N/Qであり、及び/またはX11はQ/N/A/V/I/L/不在であり、及び/またはX12はT/S/不在であり、及び/またはX13はH/R/K/Y/F/不在であり、及び/またはX14はA/V/I/L/不在であり、及び/またはX15はY/F/不在である)、[R/G][V/A][S/T][N/T/S][R/L][F/A][S/D](配列番号945)、またはより一般的にはX1-X2-X3-X4-X5-X6-X7(配列番号946)のアミノ酸配列を有する、約3~約7アミノ酸を有するCDRL2コンセンサス配列(ここで、X1、X2、X3、X4、X5、X6、及びX7は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はR/K/H/G/Aであり、及び/またはX2はV/A/I/Lであり、及び/またはX3はS/Tであり、及び/またはX4はN/Q/T/Sであり、及び/またはX5はR/K/H/A/V/I/Lであり、及び/またはX6はF/Y/A/V/I/L/Gであり、及び/またはX7はS/T/D/Eである)、及び[F/Q][G/N][G/V][T/L][H/T][V/I]P[R/W]T(配列番号947)、またはより一般的にはX1-X2-X3-X4-X5-X6-P-X7-T(配列番号948)のアミノ酸配列を有する、約9アミノ酸を有するCDRL3コンセンサス配列(ここで、X1、X2、X3、X4、X5、X6、及びX7は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はF/Y/Q/Nであり、及び/またはX2はG/A/Q/Nであり、及び/またはX3はG/A/V/I/Lであり、及び/またはX4はT/S/A/V/I/Lであり、及び/またはX5はH/R/K/T/Sであり、及び/またはX6はV/I/A/Lであり、及び/またはX7はR/K/H/W/F/Yである)をもたらした。
抗体V0026、V0027、及びV0032の間のアラインメント
抗体V0026、V0027、及びV0032の間のアラインメントを以下に示す。
Figure 2023523401000069
VH CDR配列アラインメントは、GY[S/T]FT[D/E]Y(配列番号949)、またはより一般的にはGY-X1-FT-X2-Y(配列番号950)のCDRH1コンセンサス配列(ここで、X1及びX2は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はS/Tであり、及び/またはX2はD/E/S/Tである)、[F/Y]PG[S/R][D/G][S/N](配列番号951)、またはより一般的にはX1-PG-X2-X3-X4(配列番号952)のCDRH2コンセンサス配列(ここで、X1~X4は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はF/Yであり、及び/またはX2はS/T/R/K/Hであり、及び/またはX3はD/E/G/Aであり、及び/またはX4はS/T/N/Qである)、及びP[T/A][V/I/Y][V/Y][A/S][R/K]DYAM[D/E]Y(配列番号953)、またはより一般的にはP-X1-X2-X3-X4-X5-DYAM-X6-Y(配列番号954)のCDRH3コンセンサス配列(ここで、X1~X6は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はT/S/A/V/I/Lであり、及び/またはX2はV/I/A/L/Y/Fであり、及び/またはX3はV/I/A/L/Y/Fであり、及び/またはX4はA/V/I/L/S/Tであり、及び/またはX5はR/K/Hであり、及び/またはX6はD/Eである)をもたらした。
VL CDR配列アラインメントは、RSSQSIV[Y/H][S/R/T]NGNTYLE(配列番号955)、またはより一般的にはRSSQSIV-X1-X2-NGNTYLE(配列番号956)のCDRL1コンセンサス配列(ここで、X1及びX2は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はY/F/H/R/Kであり、及び/またはX2はS/T/R/K/Hである)、この群の抗体間で保存されていたKVSNRFS(配列番号525)のCDRL2コンセンサス配列、及びFQGSHVP[Y/F]T(配列番号957)、またはより一般的にはFQGSHVPXT(配列番号958)のCDRL3コンセンサス配列(ここで、Xは、任意のアミノ酸、例えば、Y、Fであってよい)をもたらした。
抗体V0026、V0027、V0031、及びV0032の間のアラインメント
抗体V0026、V0027、V0031、及びV0032の間のアラインメントを以下に示す。
Figure 2023523401000070
VH CDR配列アラインメントは、GY[S/T]FT[D/E/S]Y(配列番号959)、またはより一般的にはGY-X1-FT-X2-Y(配列番号950)のCDRH1コンセンサス配列(ここで、X1及びX2は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はS/Tであり、及び/またはX2はE/D/S/Tである)、[F/Y]P[G/S][S/R/N][D/G][S/G/N](配列番号960)、またはより一般的にはX1-P-X2-X3-X4-X5(配列番号961)のCDRH2コンセンサス配列(ここで、X1~X5は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はF/Yであり、及び/またはX2はS/T/G/A/V/I/Lであり、及び/またはX3はS/T/R/K/H/N/Qであり、及び/またはX4はD/E/G/Aであり、及び/またはX5はS/T/N/Q/G/Aである)、及び[P/S][T/A/S][V/I/Y][V/Y][A/S/G][R/K]DYAM[D/E]Y(配列番号962)、またはより一般的にはX1-X2-X3-X4-X5-X6-DYAM-X7-Y(配列番号963)のCDRH3コンセンサス配列(ここで、X1~X7は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はS/T/P/A/I/L/Vであり、及び/またはX2はT/S/A/V/I/Lであり、及び/またはX3はA/V/I/L/Y/Fであり、及び/またはX4はA/V/I/L/Y/Fであり、及び/またはX5はA/V/I/L/G/S/Tであり、及び/またはX6はR/K/Hであり、及び/またはX7はE/Dである)をもたらした。
VL CDR配列アラインメントは、RSSQSIV[Y/H][S/R/T]NGNTYLE(配列番号955)、またはより一般的にはRSSQSIV-X1-X2-NGNTYLE(配列番号956)のCDRL1コンセンサス配列(ここで、X1及びX2は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はY/F/H/R/Kであり、及び/またはX2はS/T/R/K/Hである)、この群の抗体間で保存されていたKVSNRFS(配列番号525)のCDRL2コンセンサス配列、及びFQGSHVP[Y/F]T(配列番号957)、またはより一般的にはFQGSHVPXT(配列番号958)のCDRL3コンセンサス配列(ここで、Xは、任意のアミノ酸、例えば、Y及びFであってよい)をもたらした。
抗体V0052、V0054、V0055、V0057、及びV0058の間のアラインメント
上記で提示したPepscanエピトープ分析において説明したように、V0052は、ヒトタウ(配列番号920)の残基55~76、159~194、219~247、及び381~426と対応するペプチドへの親和性を示した。これらの領域のうち、V0052の親和性は、ヒトタウ(配列番号920)の残基57~72、175~191、223~238、及び383~400に対してより高かった。ePHFに対する抗体V0054、V0055、V0057、及びV0058の結合は、C10.2捕捉抗体でコーティングされたプレートにePHFを結合させたときにブロックされることがELISA分析によって示された。C10.2抗体は、V0052タウ結合に関与する残基と重複するヒトタウ(配列番号920)のアミノ酸残基379~415に対応するペプチド12(配列番号923)と結合することが知られている。この重複を考慮して、抗体V0052、V0054、V0055、V0057、及びV0058の間のCDR配列アラインメントを行い、コンセンサス配列を同定するために使用した。
抗体V0052、V0054、V0055、V0057、及びV0058の間のアラインメントを以下に示す。
Figure 2023523401000071
VH CDR配列アラインメントは、GFSL[S/N]T[S/F][A/G]M(配列番号964)、またはより一般的にはGFSL-X1-T-X2-X3-M(配列番号965)のCDRH1コンセンサス配列(ここで、X1~X3は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はS/T/N/Qであり、及び/またはX2はS/T/F/Yであり、及び/またはX3はA/V/I/L/Gである)、この群の抗体間で保存されていたYWDDD(配列番号362)のCDRH2コンセンサス配列、及びR[R/V/K]R[G/Y/S]Y[G/A]MDY(配列番号966)、またはより一般的にはR-X1-R-X2-Y-X3-MDY(配列番号967)のCDRH3コンセンサス配列(ここで、X1~X3は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はR/K/H/A/V/I/Lであり、及び/またはX2はG/A/V/I/L/S/T/Y/Fであり、及び/またはX3はA/V/I/L/Gである)をもたらした。
VL CDR配列アラインメントは、K[A/S]SQS[V/L][S/L][N/S][不在/S][不在/G][不在/N][不在/Q][不在/K][不在/N][D/Y][V/L]A(配列番号968)、またはより一般的にはK-X1-SQS-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9-X10-X11-X12-A(配列番号969)のCDRL1コンセンサス配列(ここで、X1~X12は、任意のアミノ酸であってよく、及び/または、X5~X10のうちの1もしくは複数は不在であってよく、例えば、X1はS/T/A/V/I/Lであり、及び/またはX2はA/V/I/Lであり、及び/またはX3はS/T/A/V/I/Lであり、及び/またはX4はN/Q/S/Tであり、及び/またはX5はS/T/不在であり、及び/またはX6はG/A/V/I/L/不在であり、及び/またはX7はN/Q/不在であり、及び/またはX8はN/Q/不在であり、及び/またはX9はK/R/H/不在であり、及び/またはX10はN/Q/不在であり、及び/またはX11はE/D/Y/Fであり、及び/またはX12はA/V/I/Lである)、[Y/G][A/T]S[N/T]R[C/E][T/S](配列番号970)、またはより一般的にはX1-X2-S-X3-R-X4-X5(配列番号971)のCDRL2コンセンサス配列(ここで、X1~X5は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はY/F/G/A/V/I/Lであり、及び/またはX2はA/V/I/L/T/Sであり、及び/またはX3はN/Q/T/Sであり、及び/またはX4はC/S/E/Dであり、及び/またはX5はT/Sである)、及びQ[Q/N]D[Y/H][R/S][S/H]P[L/Y]T(配列番号972)、またはより一般的にはQ-X1-D-X3-X4-X5-P-X6-T(配列番号973)のCDRL3コンセンサス配列(ここで、X1~X6は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はQ/Nであり、及び/またはX2はY/F/H/R/Kであり、及び/またはX3はR/K/H/S/Tであり、及び/またはX4はS/T/H/K/R及び/またはA/V/I/L/Y/Fである)をもたらした。
抗体V0052、V0054、V0055、V0057、V0058、V0036、及びV0049の間のアラインメント
上記で提示したPepscanエピトープ分析において説明したように、V0052は、ヒトタウ(配列番号920)の残基55~76、159~194、219~247、及び381~426と対応するペプチドへの親和性を示した。これらの領域のうち、V0052の親和性は、ヒトタウ(配列番号920)の残基57~72、175~191、223~238、及び383~400に対してより高かった。ePHFに対する抗体V0036、V0049、V0054、V0055、V0057、及びV0058の結合は、C10.2捕捉抗体でコーティングされたプレートにePHFを結合させたときにブロックされることがELISA分析によって示された。C10.2抗体は、V0052タウ結合に関与する残基と重複するヒトタウ(配列番号920)のアミノ酸残基379~415に対応するペプチド12(配列番号923)と結合することが知られている。この重複を考慮して、抗体V0036、V0049、V0052、V0054、V0055、V0057、及びV0058の間のCDR配列アラインメントを行い、コンセンサス配列を同定するために使用した。
抗体V0052、V0054、V0055、V0057、V0058、V0036、及びV0049の間のアラインメントを以下に示す。
Figure 2023523401000072
VH CDR配列アラインメントは、GFSL[S/N]T[S/F][A/G]M(配列番号964)、またはより一般的にはGFSL-X1-T-X2-X3-M(配列番号965)のCDRH1コンセンサス配列(ここで、X1~X3は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はS/T/N/Qであり、及び/またはX2はS/T/F/Yであり、及び/またはX3はG/A/I/L/Vである)、この群の抗体間で保存されていたYWDDD(配列番号362)のCDRH2コンセンサス配列、及びR[R/V/K/S/G][Y/R][Y/不在][S/不在][不在/N][G/S/Y/R][Y/N/G][G/A/Y/N][M/F/Y]DY(配列番号974)、またはより一般的にはR-X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9-DY(配列番号975)のCDRH3コンセンサス配列(ここで、X1~X9の各々は、任意のアミノ酸であってよく、及び/または、X3~X5のうちの1もしくは複数は不在であってよく、例えば、X1はR/K/H/A/V/I/L/G/S/Tであり、及び/またはX2はY/F/R/K/Hであり、及び/またはX3はY/F/不在であり、及び/またはX4はS/T/不在であり、及び/またはX5はN/Q/不在であり、及び/またはX6はG/A/V/I/L/S/T/Y/F/R/K/Hであり、及び/またはX7はY/F/N/Q/G/A/V/I/Lであり、及び/またはX8はG/A/V/I/L/Y/F/N/Qであり、及び/またはX9はM/F/Yである)をもたらした。
VL CDR配列アラインメントは、[K/S][S/A]S[Q/S]S[L/I/V][L/S][N/S/D][D/S/T][V/G/D/Y][N/G/不在][Q/不在][K/不在][N/T/不在][Y/不在][L/不在][A/H/N](配列番号976)、またはより一般的にはX1-X2-S-X3-S-X4-X5-X6-X7-X8-X9-X10-X11-X12-X13-X14-X15(配列番号977)のCDRL1コンセンサス配列(ここで、X1~X15の各々は、任意のアミノ酸であってよく、及び/または、X9~X14のうちの1もしくは複数は不在であってよく、例えば、X1はK/R/H/S/Tであり、及び/またはX2はS/T/A/V/I/Lであり、及び/またはX3はQ/N/S/Tであり、及び/またはX4はL/I/V/Aであり、及び/またはX5はA/V/I/L/S/Tであり、及び/またはX6はN/Q/S/T/D/Eであり、及び/またはX7はD/E/S/Tであり、及び/またはX8はG/A/V/I/L/D/E/Y/Fであり、及び/またはX9はN/Q/G/A/不在であり、及び/またはX10はQ/N/不在であり、及び/またはX11はK/R/H/不在であり、及び/またはX12はN/Q/T/S/不在であり、及び/またはX13はY/F/不在であり、及び/またはX14はA/V/I/L/不在であり、及び/またはX15はA/V/I/L/H/K/R/N/Qである)、[Y/G/L/R][A/T/V]S[N/T/K][R/L][C/E/D/A][T/S](配列番号978)、またはより一般的にはX1-X2-S-X3-X4-X5-X6(配列番号979)のCDRL2コンセンサス配列(ここで、X1~X6は、任意のアミノ酸であってよく、例えば、X1はY/F/G/A/V/I/L/R/K/Hであり、及び/またはX2はA/V/I/L/T/Sであり、及び/またはX3はN/Q/T/S/K/R/Hであり、及び/またはX4はR/K/H/A/V/I/Lであり、及び/またはX5はC/S/E/D/A/V/I/Lであり、及び/またはX6はT/Sである)、及び[W/Q][Q/N][G/D][T/S/Y/H][H/S/R][F/I/S/H]P[Q/R/L/Y][不在/Y]T(配列番号980)、またはより一般的にはX1-X2-X3-X4-X5-X6-P-X7-X8-T(配列番号981)のCDRL3コンセンサス配列(ここで、X1~X8の各々は、任意のアミノ酸であってよく、及び/または、X8は不在であってよく、例えば、X1はQ/N/W/F/Yであり、及び/またはX2はQ/Nであり、及び/またはX3はG/A/V/I/L/D/Eであり、及び/またはX4はT/S/Y/F/H/K/Rであり、及び/またはX5はH/K/R/S/Tであり、及び/またはX6はF/Y/A/V/I/L/S/T/H/K/Rであり、及び/またはX7はQ/N/R/K/H/A/V/I/L/Y/Fであり、及び/またはX8はY/F/不在である)をもたらした。
実施例11。受動免疫療法播種モデル分析
受動免疫療法播種モデルを使用して、様々な抗タウ抗体を評価した。評価のために、表3に提示したものから選択されたクローン特異的可変ドメインペア、及びマウスIgG1定常ドメインを用い、組換えマウスIgG抗体を調製した。このモデルでは、P301Sタウ変異を有するFTD変異体タウトランスジェニックマウスを使用した。播種は、研究用マウスのCA1海馬領域への毎週75ngのePHFの実質内注入を8週齢で開始して6週間継続することによって行った。抗体は、40mg/kgの用量で腹腔内注射によってマウスに投与した。投与は、播種の7日前及び3日前、ならびに播種開始後4日目、11日目、18日目、25日目、及び32日目に行った。病原性タウレベルに対する抗体処置の効果は、各事例において、病原性タウに特異的であるAT8抗体との同側海馬サンプルの免疫反応性のELISA分析によって決定した。ビヒクル(対照)処置マウス由来のサンプルと、様々な抗体で処置したマウス由来のサンプルとの間での、AT8反応性の減少率を表26に提示する。
Figure 2023523401000073
試験した抗体の各々が、低減したAT8反応性を有するサンプルをもたらし、V0023及びPHF1は、対照マウス由来のサンプルと比べて最も大きい低減をもたらし、V0023は、最も高い有効性を示した。
実施例12。抗タウ抗体の発現のためのウイルスゲノムの工学操作
抗タウ抗体またはそのバリアントのAAV送達のために、ウイルスゲノムを設計する。表1~7のいずれかに提示された抗体配列を含むまたはコードするペイロード領域を、ウイルスゲノムにクローニングする。ウイルスゲノムは、抗体コード領域の他に、5’ITR、プロモーター(幾つかの構成要素を有し得る)、1または複数のイントロンまたはエクソン配列、1または複数のシグナル配列、1または複数のリンカー配列、タグ配列、ポリアデニル化配列、フィラー配列、及び3’ITRの各々のいずれか1または複数を含み得る。配列構成要素は、表10~18に提示された配列から選択され得る。
重鎖及び軽鎖の順序が5’から3’への方向に関して交互になっている一連のウイルスゲノムを生成する。5’から3’に読んだ場合、重鎖抗体配列、リンカー領域、及び軽鎖抗体配列(重鎖・リンカー・軽鎖)をコードするウイルスゲノムを調製する。軽鎖抗体配列、リンカー領域、及び重鎖抗体配列(軽鎖・リンカー・重鎖)をコードするウイルスゲノムも調製する。
抗タウ抗体の発現のためのウイルスゲノムを、AAV粒子に組み込む(例えば、AAV1、AAV2、AAV2バリアント、AAV2/3バリアント、またはVOY101カプシドを使用する)。
実施例13。AAV粒子の産生及び精製
本明細書で企図されるウイルスゲノムのいずれも、AAV粒子を生成するためにAAVカプシドに封入され得る。AAV粒子は、例えば、トリプルトランスフェクションまたはバキュロウイルス媒介性ウイルス産生など、当技術分野で公知の方法を使用して産生され得る。粒子を産生するためには、当技術分野で公知の好適な許容細胞またはパッケージング細胞のいずれを用いてもよい。多くの場合、哺乳動物細胞が好ましい。同じく好ましいのは、複製欠損ヘルパーウイルスから欠失した機能を提供するトランス補完パッケージング細胞株、例えば、293細胞または他のE1aトランス補完細胞である。
遺伝子カセットは、パルボウイルス(例えば、AAV)のcap及びrep遺伝子の一部または全部を含み得る。しかし、カプシド及び/またはRepタンパク質をコードするパッケージングベクター(複数可)を細胞に導入することにより、cap及びrep機能の一部または全部がトランスで提供されることが好ましい。最も好ましくは、遺伝子カセットは、カプシドまたはRepタンパク質をコードしない。あるいは、cap及び/またはrep遺伝子を発現するように安定に形質転換されているパッケージング細胞株が使用される。
組換えAAVウイルス粒子は、場合によっては、内容が参照により組み込まれているUS20160032254に記載されている手順に従って培養上清から産生され、精製される。産生には、293T細胞、sf9昆虫細胞、トリプルトランスフェクションまたは任意の好適な産生方法を使用するものを含め、当技術分野で公知の方法を用いてもよい。
場合によっては、293T細胞(接着/懸濁)に、AAVの産生に必要なプラスミド、すなわちAAV2 rep、アデノウイルスヘルパー構築物、及びITRフランキング導入遺伝子カセットと共にポリエチレンイミン(PEI)をトランスフェクトする。AAV2 repプラスミドはまた、研究対象の特定のウイルスのcap配列を含む。血清あり/なしのDMEM/F17中で行われるトランスフェクションの24時間後(懸濁液の培地交換はしない)、培地を血清ありまたはなしの新鮮な培地と交換する。トランスフェクションの3日後、293接着細胞の培養培地からサンプルを採取する。その後、細胞を掻き取るか、または浮遊細胞をペレット化し、レセプタクルに移す。接着細胞については、細胞ペレットを除去するための遠心分離の後、掻き取った後の上清から第2のサンプルを採取する。次に、3回連続の凍結-融解サイクル(-80Cから37C)または界面活性剤トリトンの添加により、細胞溶解を達成する。遠心分離または深層濾過によって細胞破片を除去し、サンプル3を培地から採取する。DNA qPCRによるDNase耐性ゲノム力価決定によってサンプルのAAV粒子を数量化する。このようなトランスフェクションからの総産生収量は、上述のサンプル3からの粒子濃度に等しい。
AAV粒子力価は、ゲノムコピー数(1ミリリットル当たりのゲノム粒子)に従って測定される。ゲノム粒子濃度は、既報のように(Clark et al.(1999)Hum.Gene Ther.,10:1031-1039、Veldwijk et al.(2002)Mol.Ther.,6:272-278)、ベクターDNAのDNA qPCRに基づく。

Claims (54)

  1. HC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3を含む重鎖可変領域(VH)と、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含む軽鎖可変領域(VL)とを含む、タウに結合する、単離された、例えば組換え型の抗体であって、
    (i)前記HC CDR1、前記HC CDR2、及び前記HC CDR3は、それぞれ配列番号315、341、及び410のアミノ酸配列を含み、前記LC CDR1、前記LC CDR2、前記LC CDR3は、それぞれ配列番号474、529、及び571のアミノ酸配列を含むか、
    (ii)前記HC CDR1、前記HC CDR2、及び前記HC CDR3は、それぞれ配列番号314、341、及び410のアミノ酸配列を含み、前記LC CDR1、前記LC CDR2、前記LC CDR3は、それぞれ配列番号1154、529、及び571のアミノ酸配列を含むか、
    (iii)前記HC CDR1、前記HC CDR2、及び前記HC CDR3は、それぞれ配列番号316、341、及び410のアミノ酸配列を含み、前記LC CDR1、前記LC CDR2、前記LC CDR3は、それぞれ配列番号475、530、及び571のアミノ酸配列を含むか、
    (iv)前記HC CDR1、前記HC CDR2、及び前記HC CDR3は、それぞれ配列番号325、362、及び435のアミノ酸配列を含み、前記LC CDR1、前記LC CDR2、前記LC CDR3は、それぞれ配列番号495、540、及び587のアミノ酸配列を含むか、
    (v)前記HC CDR1、前記HC CDR2、及び前記HC CDR3は、それぞれ配列番号304、347、及び400のアミノ酸配列を含み、前記LC CDR1、前記LC CDR2、前記LC CDR3は、それぞれ配列番号464、523、及び562のアミノ酸配列を含むか、
    (vi)前記HC CDR1、前記HC CDR2、及び前記HC CDR3は、それぞれ配列番号299、343、及び395のアミノ酸配列を含み、前記LC CDR1、前記LC CDR2、前記LC CDR3は、それぞれ配列番号460、518、及び557のアミノ酸配列を含むか、または
    (vii)前記HC CDR1、前記HC CDR2、及び前記HC CDR3は、表1、6、2A~2C、4、もしくは5のHC CDR配列のいずれかのアミノ酸配列を含み、前記LC CDR1、前記LC CDR2、前記LC CDR3は、表1、6、2A~2C、4、もしくは5のLC CDR配列のいずれかのアミノ酸配列を含む、
    前記抗体。
  2. HC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3を含む重鎖可変領域(VH)と、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含む軽鎖可変領域(VL)とを含む、タウに結合する、単離された、例えば組換え型の抗体であって、
    (i)前記HC CDR1、前記HC CDR2、前記HC CDR3、前記LC CDR1、前記LC CDR2、及び前記LC CDR3は、それぞれ配列番号1180、341、410、1181、1182、及び571のアミノ酸配列を含むか、
    (ii)前記HC CDR1、前記HC CDR2、前記HC CDR3、前記LC CDR1、前記LC CDR2、及び前記LC CDR3は、それぞれ配列番号1183、1184、410、1185、1182、及び571のアミノ酸配列を含むか、または
    (iii)前記HC CDR1、前記HC CDR2、前記HC CDR3、前記LC CDR1、前記LC CDR2、及び前記LC CDR3は、それぞれ配列番号1186、1187、1167、1188、528、及び571のアミノ酸配列を含み、
    場合により、前記抗体は、配列番号920に従って番号付けされた残基409~436を含むヒトタウタンパク質の領域に結合する、
    前記抗体。
  3. 前記抗体は、配列番号920に従って番号付けされた残基409~436を含む前記ヒトタウタンパク質の前記領域に結合し、
    (i)前記HC CDR1、前記HC CDR2、及び前記HC CDR3は、それぞれ配列番号1180、341、及び410のアミノ酸配列を含み、
    (ii)前記LC CDR1、前記LC CDR2、及び前記LC CDR3は、それぞれ配列番号1181、1182及び571のアミノ酸配列を含む、
    請求項2に記載の抗体。
  4. (i)前記VHは、配列番号22、21、23、51、9、もしくは4のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、
    (ii)前記VHは、配列番号22、21、23、51、9、もしくは4のアミノ酸配列の修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が30個以下、20個以下、もしくは10個以下であるアミノ酸配列を含むか、
    (iii)前記VHは、配列番号168、167、169、197、155、もしくは150のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含むか、または
    (iv)前記VHは、表3もしくは4に提示された任意のVHのアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列、もしくは表3もしくは4に提示された任意のVHのアミノ酸配列の修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が30個以下、20個以下、もしくは10個以下であるアミノ酸配列を含む、
    請求項1~3のいずれか1項に記載の抗体。
  5. (i)前記VLは、配列番号94、93、95、122、83、もしくは78のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、
    (ii)前記VLは、配列番号94、93、95、122、83、もしくは78のアミノ酸配列の修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が30個以下、20個以下、もしくは10個以下であるアミノ酸配列を含むか、
    (iii)前記VLは、配列番号242、241、243、270、229、もしくは224のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含むか、または
    (iv)前記VLは、表3もしくは4に提示された任意のVLのアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列、もしくは表3もしくは4に提示された任意のVLのアミノ酸配列の修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が30個以下、20個以下、もしくは10個以下であるアミノ酸配列を含む、
    請求項1~4のいずれか1項に記載の抗体。
  6. (i)前記VHは、配列番号22のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する、もしくはその修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が10個以下であるアミノ酸配列を含み、前記VLは、配列番号94のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する、もしくはその修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が10個以下であるアミノ酸配列を含むか、
    (ii)前記VHは、配列番号21のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する、もしくはその修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が10個以下であるアミノ酸配列を含み、前記VLは、配列番号93のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する、もしくはその修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が10個以下であるアミノ酸配列を含むか、
    (iii)前記VHは、配列番号23のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する、もしくはその修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が10個以下であるアミノ酸配列を含み、前記VLは、配列番号95のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する、もしくはその修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が10個以下であるアミノ酸配列を含むか、
    (iv)前記VHは、配列番号51のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する、もしくはその修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が10個以下であるアミノ酸配列を含み、前記VLは、配列番号122のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する、もしくはその修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が10個以下であるアミノ酸配列を含むか、
    (v)前記VHは、配列番号9のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する、もしくはその修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が10個以下であるアミノ酸配列を含み、前記VLは、配列番号83のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する、もしくはその修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が10個以下であるアミノ酸配列を含むか、または、
    (vi)前記VHは、配列番号4のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する、もしくはその修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が10個以下であるアミノ酸配列を含み、前記VLは、配列番号78のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する、もしくはその修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が10個以下であるアミノ酸配列を含む、
    請求項1~5のいずれか1項に記載の抗体。
  7. (i)前記VHをコードする前記ヌクレオチド配列は、配列番号168、167、169、197、155、もしくは150のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む、及び/または
    (ii)前記VLをコードする前記ヌクレオチド配列は、配列番号242、241、243、270、229、もしくは224のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む、
    請求項1~6のいずれか1項に記載の抗体。
  8. 完全長抗体、二重特異性抗体、Fab、F(ab’)、Fv、または単鎖Fvフラグメント(scFv)である、請求項1~7のいずれか1項に記載の抗体。
  9. ヒトIgG1、ヒトIgG2、ヒトIgG3、及びヒトIgG4、マウスIgG1、マウスIgG2a、マウスIgG2b、マウスIgG2c、及びマウスIgG3から選択される重鎖定常領域、ならびに/または、ヒトもしくはマウスのカッパ、もしくはヒトもしくはマウスのラムダなどの、カッパもしくはラムダの軽鎖定常領域から選択される軽鎖定常領域を含む、請求項1~8のいずれか1項に記載の抗体。
  10. 表Xに提示された重鎖定常領域のアミノ酸、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖定常領域、及び/または表Xに提示された軽鎖定常領域のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖定常領域を含む、請求項1~9のいずれか1項に記載の抗体。
  11. (1)タウタンパク質のC末端、例えば、配列番号920に従って番号付けされた残基409~436、
    (2)タウタンパク質の微小管結合ドメイン、
    (3)タウタンパク質のプロリンリッチドメイン、
    (4)少なくとも1つ、2つ、3つ、もしくはそれ以上のリン酸化残基、例えば、配列番号920に従って番号付けされた残基T212、T217、S396、S404、S409、もしくはそれらの組み合わせを含むタウタンパク質、
    (5)濃縮対らせん状細線維タウタンパク質(ePHF)、及び/または、
    (6)少なくとも2つのタウタンパク質の複合体、例えば、タウ二量体によって形成される領域を含むエピトープ
    と結合する、請求項1~10のいずれか1項に記載の抗体。
  12. 約120nM未満(例えば実施例8に記載のように、例えばOctetによって測定した場合)の解離定数(K)でタウタンパク質に結合する、請求項1~11のいずれか1項に記載の抗体。
  13. タウの凝集を低減または阻害する、例えば、約1nM~約30nM(例えば実施例6に記載のように、例えば免疫枯渇アッセイによって(例えば、タウRDバイオセンサ細胞を用いて)測定した場合)の最大半量阻害濃度(IC50)でタウの凝集を阻害する、請求項1~12のいずれか1項に記載の抗体。
  14. タウへの結合を請求項1~13のいずれか1項に記載の抗体と競合する、単離された、例えば組換え型の抗体。
  15. 請求項1~14のいずれか1項に記載の抗体のエピトープと同じエピトープ、それと実質的に同じエピトープ、またはそれと重複するエピトープに結合する、単離された、例えば組換え型の抗体。
  16. 請求項1~15のいずれか1項に記載の抗体をコードする、単離された、例えば組換え型の核酸。
  17. HC CDR1、HC CDR2、及びHC CDR3を含むVHと、LC CDR1、LC CDR2、及びLC CDR3を含むVLとを含む抗体をコードする、単離された、例えば組換え型の核酸であって、
    (i)前記HC CDR1、前記HC CDR2、及び前記HC CDR3は、それぞれ配列番号315、341、及び410のアミノ酸配列を含み、前記LC CDR1、前記LC CDR2、前記LC CDR3は、それぞれ配列番号474、529、及び571のアミノ酸配列を含むか、
    (ii)前記HC CDR1、前記HC CDR2、及び前記HC CDR3は、それぞれ配列番号314、341、及び410のアミノ酸配列を含み、前記LC CDR1、前記LC CDR2、前記LC CDR3は、それぞれ配列番号1154、529、及び571のアミノ酸配列を含むか、
    (iii)前記HC CDR1、前記HC CDR2、及び前記HC CDR3は、それぞれ配列番号316、341、及び410のアミノ酸配列を含み、前記LC CDR1、前記LC CDR2、前記LC CDR3は、それぞれ配列番号475、530、及び571のアミノ酸配列を含むか、
    (iv)前記HC CDR1、前記HC CDR2、及び前記HC CDR3は、それぞれ配列番号325、362、及び435のアミノ酸配列を含み、前記LC CDR1、前記LC CDR2、前記LC CDR3は、それぞれ配列番号495、540、及び587のアミノ酸配列を含むか、
    (v)前記HC CDR1、前記HC CDR2、及び前記HC CDR3は、それぞれ配列番号304、347、及び400のアミノ酸配列を含み、前記LC CDR1、前記LC CDR2、前記LC CDR3は、それぞれ配列番号464、523、及び562のアミノ酸配列を含むか、
    (vi)前記HC CDR1、前記HC CDR2、及び前記HC CDR3は、それぞれ配列番号299、343、及び395のアミノ酸配列を含み、前記LC CDR1、前記LC CDR2、前記LC CDR3は、それぞれ配列番号460、518、及び557のアミノ酸配列を含むか、または
    (vii)前記HC CDR1、前記HC CDR2、及び前記HC CDR3は、表1、6、2A~2C、4、もしくは5のHC CDR配列のいずれかのアミノ酸配列を含み、前記LC CDR1、前記LC CDR2、前記LC CDR3は、表1、6、2A~2C、4、もしくは5のいずれかのLC CDR配列のアミノ酸配列を含む、
    前記核酸。
  18. (i)前記VHは、配列番号22、21、23、51、9、もしくは4のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する、もしくはそのアミノ酸配列の修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が10個以下であるアミノ酸配列を含む、及び/または
    (ii)前記VLは、配列番号94、93、95、122、83、もしくは78のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する、もしくはそのアミノ酸配列の修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が10個以下であるアミノ酸配列を含む、
    請求項17に記載の核酸。
  19. (i)表3もしくは4に提示された任意のVHのヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列、及び/または
    (ii)表3もしくは4に提示された任意のVLのヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列
    を含む、請求項17または18に記載の核酸。
  20. (i)配列番号168、167、169、197、155、もしくは150のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列、及び/または
    (ii)配列番号242、241、243、270、229、もしくは224のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列
    を含む、請求項17~19のいずれか1項に記載の核酸。
  21. 前記抗体は、
    (i)表Xに提示された重鎖定常領域のアミノ酸、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖定常領域、及び/または
    (ii)表Xに提示された軽鎖定常領域のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも90%、92%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖定常領域
    を含む、請求項17~20のいずれか1項に記載の核酸。
  22. 前記重鎖可変領域及び/または前記軽鎖可変領域をコードする核酸配列はコドン最適化されている、請求項17~21のいずれか1項に記載の単離された核酸配列。
  23. 請求項17~22のいずれか1項に記載の核酸によってコードされる、単離された、例えば組換え型の抗体。
  24. ペイロードをコードする単離された核酸であって、前記コードされたペイロードは、請求項1~15もしくは23のいずれか1項に記載の抗体、または請求項17~22のいずれか1項に記載の核酸によってコードされる抗体を含む、前記核酸。
  25. シグナル配列と、場合により第2のシグナル配列とをさらにコードし、場合により、前記シグナル配列及び/または前記第2のシグナル配列(存在する場合)をコードするヌクレオチド配列は、表14に列挙されたシグナル配列のいずれかのヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも95%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含む、請求項24に記載の核酸。
  26. (i)前記シグナル配列をコードする前記ヌクレオチド配列は、前記VHをコードする前記ヌクレオチド配列に対して5’に位置している、及び/または
    (ii)前記シグナル配列をコードする前記ヌクレオチド配列は、前記VLをコードする前記ヌクレオチド配列に対して5’に位置している、
    請求項24または25に記載の核酸。
  27. (i)前記コードされたVH及びVLの配列は、直接(例えば、リンカーなしで)接続されているか、あるいは
    (ii)前記コードされたVH及びVLの配列は、リンカーを介して接続されており、場合により、前記リンカーは、表15に提示されたリンカー配列のいずれかのヌクレオチド配列、またはそれに対して少なくとも95%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含む、
    請求項24~26のいずれか1項に記載の核酸。
  28. 前記コードされたペイロードは、完全長抗体、二重特異性抗体、Fab、F(ab’)、Fv、単鎖Fvフラグメント(scFv)、単一ドメイン抗体、またはラクダ科抗体である、請求項24~27のいずれか1項に記載の核酸。
  29. 請求項1~15及び23のいずれか1項に記載の抗体を含むペイロードをコードする前記核酸に作動可能に連結されたプロモーターを含むウイルスゲノムであって、場合により、前記プロモーターは、
    (i)ヒト伸長因子1α-サブユニット(EF1α)、サイトメガロウイルス(CMV)前初期エンハンサー及び/もしくはプロモーター、ニワトリβ-アクチン(CBA)及びその誘導体CAG、βグルクロニダーゼ(GUSB)、もしくはユビキチンC(UBC)、ニューロン特異的エノラーゼ(NSE)、血小板由来成長因子(PDGF)、血小板由来成長因子B鎖(PDGF-β)、細胞間接着分子2(ICAM-2)、シナプシン(Syn)、メチルCpG結合タンパク質2(MeCP2)、Ca2+/カルモジュリン依存性タンパク質キナーゼII(CaMKII)、代謝調節型グルタミン酸受容体2(mGluR2)、神経フィラメント軽鎖(NFL)もしくは神経フィラメント重鎖(NFH)、β-グロビンミニ遺伝子nβ2、プレプロエンケファリン(PPE)、エンケファリン(Enk)及び興奮性アミノ酸輸送体2(EAAT2)、グリア線維酸性タンパク質(GFAP)、ミエリン塩基性タンパク質(MBP)、もしくはそれらのフラグメント、例えば、トランケーション、もしくは機能的バリアントから選択される、及び/または
    (ii)表11に提示されたプロモーター配列のいずれかのヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも95%同一であるヌクレオチド配列を含む、
    前記ウイルスゲノム。
  30. エンハンサーをさらに含み、場合により、前記エンハンサーはCMV前初期(CMVie)エンハンサーである、請求項29に記載のウイルスゲノム。
  31. (i)ポリアデニル化(polyA)シグナル領域であって、場合により、配列番号1134~1136のいずれかのヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも95%の同一性をもつヌクレオチド配列を含む、前記polyAシグナル領域、
    (ii)ITR配列であって、場合により、
    (a)前記ITR配列は、前記コードされたペイロードに対して5’に位置付けられる、及び/もしくは、前記ITR配列は、前記コードされたものに対して3’に位置付けられる、ならびに/もしくは
    (b)前記ITR配列は、配列番号1035~1038のいずれか1つのヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、もしくは95%の配列同一性をもつヌクレオチド配列を含む、前記ITR配列、
    (iii)少なくとも1、2、もしくは3つのイントロン領域であって、場合により、各イントロン領域は独立して、表13に列挙されたイントロン領域のいずれかのヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも95%の同一性をもつヌクレオチド配列を含む、前記イントロン領域、
    (iv)少なくとも1、2、もしくは3つのエクソン領域であって、場合により、各エクソン領域は独立して、表12のエクソン配列のいずれかのヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも95%の同一性をもつヌクレオチド配列を含む、前記エクソン領域、ならびに/または
    (v)Kozak配列であって、場合により、GCCGCCACCATG(配列番号1079)もしくはGAGGAGCCACC(配列番号1089)のヌクレオチド配列を含む、前記Kozak配列
    をさらに含む、請求項29または30に記載のウイルスゲノム。
  32. 対応するmiRNAが発現される細胞または組織において前記ウイルスゲノムによってコードされる前記ペイロードの発現を調整する、例えば低減するmiR結合部位などのmiR結合部位をコードする、ヌクレオチド配列をさらに含む、請求項29~31のいずれか1項に記載のウイルスゲノム。
  33. コードされたmiR結合部位を少なくとも1~5コピー、例えば、少なくとも1、2、3、4、または5コピー含む、請求項32に記載のウイルスゲノム。
  34. 前記コードされたmiR結合部位を少なくとも3または4コピー含み、場合により、すべてのコピーが同じmiR結合部位を含むか、または少なくとも1、2、3、もしくはすべてのコピーが異なるmiR結合部位を含む、請求項32または33に記載のウイルスゲノム。
  35. 前記コードされたmiR結合部位は、miR122結合部位、miR183結合部位、miR-142-3p、またはそれらの組み合わせを含み、場合により、
    (i)前記コードされたmiR122結合部位は、配列番号1029のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)ヌクレオチド配列、もしくは配列番号1029の修飾を少なくとも1、2、3、4、5、6、もしくは7個有するが、修飾が10個以下であるヌクレオチド配列を含む、
    (ii)前記コードされたmiR183結合部位は、配列番号1032のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)ヌクレオチド配列、もしくは配列番号1032の修飾を少なくとも1、2、3、4、5、6、もしくは7個有するが、修飾が10個以下であるヌクレオチド配列を含む、及び/または
    (iii)前記コードされたmiR-142-3p結合部位は、配列番号1031のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して実質的に同一の(例えば、少なくとも90%、92%、95%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有する)ヌクレオチド配列、もしくは配列番号1031の修飾を少なくとも1、2、3、4、5、6、もしくは7個有するが、修飾が10個以下であるヌクレオチド配列を含む、
    請求項32~34のいずれか1項に記載のウイルスゲノム。
  36. 一本鎖である、請求項29~35のいずれか1項に記載のウイルスゲノム。
  37. 請求項29~36のいずれか1項に記載のウイルスゲノムを含むベクターであって、場合により、
    (i)非構造タンパク質などのRepタンパク質をコードするヌクレオチド配列であって、前記Repタンパク質は、Rep78タンパク質、Rep68、Rep52タンパク質、及び/もしくはRep40タンパク質を含み、場合により、前記Rep78タンパク質、前記Rep68タンパク質、前記Rep52タンパク質、及び/もしくは前記Rep40タンパク質は、少なくとも1つのRep遺伝子によってコードされる、前記ヌクレオチド配列、ならびに/または
    (ii)構造タンパク質などのカプシドタンパク質をコードするヌクレオチド配列であって、前記カプシドタンパク質は、VP1ポリペプチド、VP2ポリペプチド、及び/もしくはVP3ポリペプチドを含み、場合により、前記VP1ポリペプチド、前記VP2ポリペプチド、及び/もしくは前記VP3ポリペプチドは、少なくとも1つのCap遺伝子によってコードされる、前記ヌクレオチド配列
    をさらに含む前記ベクター。
  38. (i)カプシドタンパク質、ならびに、
    (ii)請求項16及び17~28のいずれか1項に記載の核酸、請求項29~36のいずれか1項に記載のウイルスゲノム、または請求項37に記載のベクター
    を含む、単離された、例えば組換え型のAAV粒子。
  39. (i)前記カプシドタンパク質は、配列番号1003のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも80%(例えば、少なくとも約85、90、95、96、97、98、もしくは99%)の配列同一性をもつアミノ酸配列を含む、
    (ii)前記カプシドタンパク質は、配列番号1003のアミノ酸配列の修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が30個以下、20個以下、もしくは10個以下であるアミノ酸配列を含む、
    (iii)前記カプシドタンパク質は、配列番号1011のアミノ酸配列、もしくはそれに対して少なくとも80%(例えば、少なくとも約85、90、95、96、97、98、もしくは99%)の配列同一性をもつアミノ酸配列を含む、
    (iv)前記カプシドタンパク質は、配列番号1011のアミノ酸配列の修飾を少なくとも1、2、もしくは3個有するが、修飾が30個以下、20個以下、もしくは10個以下であるアミノ酸配列を含む、
    (v)前記カプシドタンパク質は、配列番号1002のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも80%(例えば、少なくとも約85、90、95、96、97、98、もしくは99%)の配列同一性をもつ配列によってコードされるアミノ酸配列を含む、及び/または
    (vi)前記カプシドタンパク質をコードする前記ヌクレオチド配列は、配列番号1002のヌクレオチド配列、もしくはそれに対して少なくとも80%(例えば、少なくとも約85、90、95、96、97、98、もしくは99%)の配列同一性をもつ配列を含む、
    請求項38に記載の単離されたAAV粒子。
  40. 前記カプシドタンパク質は、
    (i)配列番号1003に従って番号付けされたK449位のアミノ酸置換、例えば、K449R置換、
    (ii)TLAVPFK(配列番号1151)のアミノ酸配列を含むインサートであって、場合により、配列番号1003に従って番号付けされた参照配列に対して、588位の直後に存在する前記インサート、
    (iii)配列番号1003に従って番号付けされた587位の「A」以外のアミノ酸及び/もしくは588位の「Q」以外のアミノ酸、ならびに/または
    (iv)配列番号1003に従って番号付けされたA587D及び/もしくはQ588Gのアミノ酸置換
    を含む、請求項38または39に記載の単離されたAAV粒子。
  41. 前記カプシドタンパク質は、
    (i)(a)配列番号1003に従って番号付けされたK449Rのアミノ酸置換、及び(b)TLAVPFK(配列番号1151)のアミノ酸配列を含むインサートであって、場合により、配列番号1003の588位の直後に存在する前記インサート、
    (ii)(a)配列番号1003に従って番号付けされたK449Rのアミノ酸置換、(b)TLAVPFK(配列番号1151)のアミノ酸配列を含むインサートであって、場合により、配列番号1003に従って番号付けされた参照配列に対して、588位の直後に存在する前記インサート、ならびに(c)配列番号1003に従って番号付けされたA587D及びQ588Gのアミノ酸置換、または
    (iii)(a)TLAVPFK(配列番号1151)のアミノ酸配列を含むインサートであって、場合により、配列番号1003に従って番号付けされた参照配列に対して、588位の直後に存在する前記インサート、ならびに(b)配列番号1003に従って番号付けされたA587D及びQ588Gのアミノ酸置換
    を含む、請求項38~40のいずれか1項に記載の単離されたAAV粒子。
  42. 前記カプシドタンパク質は、
    (i)VOY101、VOY201、AAVPHP.B(PHP.B)、AAVPHP.A(PHP.A)、AAVG2B-26、AAVG2B-13、AAVTH1.1-32、AAVTH1.1-35、AAVPHP.B2(PHP.B2)、AAVPHP.B3(PHP.B3)、AAVPHP.N/PHP.B-DGT、AAVPHP.B-EST、AAVPHP.B-GGT、AAVPHP.B-ATP、AAVPHP.B-ATT-T、AAVPHP.B-DGT-T、AAVPHP.B-GGT-T、AAVPHP.B-SGS、AAVPHP.B-AQP、AAVPHP.B-QQP、AAVPHP.B-SNP(3)、AAVPHP.B-SNP、AAVPHP.B-QGT、AAVPHP.B-NQT、AAVPHP.B-EGS、AAVPHP.B-SGN、AAVPHP.B-EGT、AAVPHP.B-DST、AAVPHP.B-DST、AAVPHP.B-STP、AAVPHP.B-PQP、AAVPHP.B-SQP、AAVPHP.B-QLP、AAVPHP.B-TMP、AAVPHP.B-TTP、AAVPHP.S/G2A12、AAVG2A15/G2A3(G2A3)、AAVG2B4(G2B4)、AAVG2B5(G2B5)、AAVPHP.N(PHP.N)、PHP.S、AAV1、AAV2、AAV2バリアント、AAV2/3バリアント、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9.47、AAV9(hu14)、AAV9、AAV9 K449R、AAV10、AAV11、AAV12、AAVrh8、AAVrh10、AAVDJ、AAVDJ8、もしくはAAV2G9カプシドタンパク質、もしくはその機能的バリアント(場合により、前記カプシドタンパク質は、VOY101カプシドタンパク質を含む)、及び/または
    (ii)表1に列挙されたカプシドタンパク質のいずれか、もしくはその機能的バリアント
    を含む、請求項38~41のいずれか1項に記載のAAV粒子。
  43. 請求項16~22及び24~28のいずれか1項に記載の核酸、請求項29~36のいずれか1項に記載のウイルスゲノム、または請求項38~42のいずれか1項に記載のAAV粒子を含む宿主細胞であって、場合により昆虫細胞、細菌細胞、または哺乳動物細胞である前記宿主細胞。
  44. 抗体を産生する方法であって、請求項43に記載の宿主細胞を遺伝子発現に好適な条件下で培養することを含む前記方法。
  45. 請求項1~15及び23のいずれか1項に記載の抗体、請求項16~22及び24~28のいずれか1項に記載の単離された核酸、請求項29~36のいずれか1項に記載のウイルスゲノムを含むAAV粒子、または請求項38~42のいずれか1項に記載のAAV粒子、ならびに薬学的に許容される賦形剤を含む、医薬組成物。
  46. タウに結合する外因性抗体を対象に送達する方法であって、有効量の、請求項1~15及び23のいずれか1項に記載の抗体、請求項16~22及び24~28のいずれか1項に記載の単離された核酸、請求項29~36のいずれか1項に記載のウイルスゲノムを含むAAV粒子(例えば、複数のAAV粒子)、請求項38~42のいずれか1項に記載のAAV粒子(例えば、複数のAAV粒子)、または請求項44に記載の医薬組成物を投与することを含み、場合により、
    (i)前記対象は、タウの発現に関連する疾患を有する、有すると診断されている、もしくは有するリスクがある、
    (ii)前記対象は、神経障害、例えば、神経変性障害を有する、有すると診断されている、もしくは有するリスクがある、及び/または、
    (iii)前記対象は、タウオパチーを有する、有すると診断されている、もしくは有するリスクがある、
    前記方法。
  47. タウオパチーなどの神経障害または神経変性障害を有するかまたは有すると診断された対象を処置する方法であって、有効量の、請求項1~15及び23のいずれか1項に記載の抗体、請求項16~22及び24~28のいずれか1項に記載の単離された核酸、請求項29~36のいずれか1項に記載のウイルスゲノムを含むAAV粒子(例えば、複数のAAV粒子)、請求項38~42のいずれか1項に記載のAAV粒子(例えば、複数のAAV粒子)、または請求項45に記載の医薬組成物を前記対象に投与することを含む前記方法。
  48. 前記神経障害は、
    (i)タウオパチー、及び/または
    (ii)AD、FTDP-17、FTLD、FTD、CTE、PSP、ダウン症候群、ピック病、CBD、皮質基底核症候群、ALS、プリオン病、CJD、多系統萎縮症、神経原線維型老年認知症、もしくは進行性皮質下グリオーシス
    を含む、請求項47に記載の方法。
  49. 前記対象はヒトである、請求項46~48のいずれか1項に記載の方法。
  50. 前記AAV粒子は、前記対象に静脈内投与されるか、筋肉内投与されるか、実質内投与を介して投与されるか、脳室内投与されるか、大槽内(ICM)注射を介して投与されるか、鞘内投与されるか、集束超音波(FUS)、例えば、微小気泡の静脈内投与と併用されるもの(FUS-MB)、または静脈内投与と併用されるMRIガイド下FUSを介して投与され、場合により、前記AAV粒子は、前記対象に静脈内投与されるか、または大槽内注射(ICM)を介して投与される、請求項46~49のいずれか1項に記載の方法。
  51. タウオパチーなどの神経障害または神経変性障害の処置または防止に好適な更なる治療剤及び/または療法の投与をさらに含み、場合により、前記更なる治療剤及び/または療法は、コリンエステラーゼ阻害剤(例えば、ドネペジル、リバスチグミン、及び/またはガランタミン)、N-メチルD-アスパラギン酸(NMDA)アンタゴニスト(例えば、メマンチン)、抗精神病薬、抗不安薬、抗けいれん薬、ドパミンアゴニスト(例えば、プラミペキソール、ロピニロール、ロチゴチン、及び/またはアポモルヒネ)、MAO B阻害剤(例えば、セレギリン、ラサギリン、及び/またはサフィナミド)、カテコールO-メチルトランスフェラーゼ(COMT)阻害剤(エンタカポン、オピカポン、及び/またはトルカポン)、抗コリン作用薬(例えば、ベンズトロピン及び/またはトリヘキシフェニジル)、アマンタジン、カルビドパ-レボドパ、深部脳刺激(DBS)、またはそれらの組み合わせを含む、請求項46~50のいずれか1項に記載の方法。
  52. 医薬の製造において使用するための、請求項1~15及び23のいずれか1項に記載の抗体、請求項16~22及び24~28のいずれか1項に記載の単離された核酸、請求項29~36のいずれか1項に記載のウイルスゲノムを含むAAV粒子、請求項38~42のいずれか1項に記載のAAV粒子、または請求項45に記載の医薬組成物。
  53. タウオパチーなどの神経障害または神経変性障害を処置するのに使用するための、請求項1~15及び23のいずれか1項に記載の抗体、請求項16~22及び24~28のいずれか1項に記載の単離された核酸、請求項29~36のいずれか1項に記載のウイルスゲノムを含むAAV粒子、請求項38~42のいずれか1項に記載のAAV粒子、または請求項45に記載の医薬組成物。
  54. 対象のタウオパチーなどの神経障害または神経変性障害を処置するための医薬の製造における、有効量の、請求項1~15及び23のいずれか1項に記載の抗体、請求項16~22及び24~28のいずれか1項に記載の単離された核酸、請求項29~36のいずれか1項に記載のウイルスゲノムを含むAAV粒子、請求項38~42のいずれか1項に記載のAAV粒子、または請求項45に記載の医薬組成物の使用。
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