JP2022545466A - 養子細胞療法用の免疫細胞 - Google Patents

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Abstract

BCL6および細胞生存促進遺伝子を発現するように操作することによって、高寿命および高増殖速度を有する無限免疫細胞を作製するための方法が提供される。その無限免疫細胞を作製するための方法および癌などの疾患を処置するためにその無限免疫細胞を使用する方法がさらに本明細書中に提供される。【選択図】図1A

Description

関連出願の相互参照
本願は、2019年8月21日出願の米国仮特許出願第62/889,662号に対する優先権を主張する。この仮出願は、その全体が参照により本明細書中に援用される。
本開示は概して、少なくとも分子生物学、細胞生物学、免疫学および医学の分野に関する。より詳細には、本開示は、無限免疫細胞を作製する方法およびその使用方法に関する。
NK細胞およびT細胞は、養子細胞療法の研究においてよく使用される細胞傷害性リンパ球の2つのタイプである。NK細胞およびT細胞に由来するCAR-NK細胞、CAR T細胞、TCRを形質導入されたT細胞、ならびに微生物抗原または腫瘍抗原に特異的な内因性T細胞レセプターを有するT細胞は、血液悪性腫瘍と固形腫瘍の両方の処置にとって非常に有望なアプローチである。CD19を標的化する3つのCAR-T細胞製品が、最近、B細胞悪性腫瘍用としてFDAから承認され、さらに多くの製品が開発中である。現在のところ、TCR-T細胞療法製品とCAR-T細胞療法製品の両方の作製は、まず健康ドナーまたは患者からT細胞を単離した後、ウイルスベクターまたは非ウイルスベクターを用いてそれらのT細胞にTCRまたはCARを導入し、患者に注入する前にその遺伝的に改変されたT細胞をインビトロで拡大することが必要な多段階プロセスである。微生物抗原および腫瘍抗原に特異的なT細胞の作製も同様に、多段階プロセスであり、まず健康ドナーまたは患者からT細胞を回収した後、インビトロにおいて微生物抗原ペプチドもしくは腫瘍抗原ペプチドまたは微生物抗原タンパク質もしくは腫瘍抗原タンパク質を用いて単離および/または刺激し、患者に注入する前にそのT細胞をインビトロで拡大することが必要である。
そのため、各患者用の製品の作製は、コストが多大であり、煩雑であり、時間がかかる。さらに、このように作製されたT細胞は、老化するまでの数週間しかインビトロで拡大できないので、各患者または各健康ドナーから作製できる微生物抗原特異的T細胞および腫瘍抗原特異的T細胞、TCR-T細胞またはCAR-T細胞の数には限界がある。
最近の報告から、遺伝子操作によってCAR-T細胞の生存を促進する因子が、より良好な治療効果と正の関連を示すことが示唆された(Hurton et al.,2016)。ゆえに、正常なT細胞および/または遺伝的に変更されたT細胞の寿命を延長するストラテジー、ならびにそれらの増殖性、サイトカイン産生および細胞傷害性の機能を保存するストラテジーが、それらの細胞の有効性を高める可能性があるのと同時に、養子T細胞療法アプローチを行う時間を大幅に短縮し得、そのアプローチのコストを大幅に削減し得る。細胞傷害性T細胞株であるTALL-104(米国特許第5272082号)およびNK細胞株であるNK-92(米国特許出願公開第20020068044号)は、無限に増殖でき、細胞傷害活性を有するが、それぞれT細胞白血病およびNK細胞白血病から樹立されたものである。したがって、これらの細胞株は、変異および他の遺伝子変化を含んでおり、ヒトの治療で使用するには安全でない。したがって、正常なT細胞の寿命を延長するこれらの目標を達成するストラテジーには満たされていないニーズが存在する。
1つの実施形態において、本開示は、操作されていない免疫細胞と比べて長寿命を有するように操作された免疫細胞(少なくともT細胞またはNK細胞を含む)を含む組成物を提供する。そのような細胞は、本明細書中で無限細胞と称されることがある。特定の実施形態において、方法および組成物は、B細胞リンパ腫6(BCL6)および生存促進性遺伝子または抗アポトーシス遺伝子または細胞生存促進遺伝子の発現(異種発現を含む)を有する免疫細胞に関する。本明細書中で使用されるとき、生存促進性遺伝子とは、抗アポトーシス機能を発揮できるかまたは任意の機構によって生存を促進できる核酸ポリマーのことを指す。抗アポトーシス機能を発揮できる核酸ポリマーは、1つ以上のBcl2ファミリー遺伝子(例えば、BCL-xL(BCL2L1遺伝子としても知られる)、BCL-2、MCL1、BCL2L2(Bcl-w)、BCL2A1(Bfl-1)、BCL2L10(BCL-B)など)であり得る。抗アポトーシス機能を発揮できる核酸ポリマーは、1つ以上のアポトーシス阻害(IAP)ファミリー遺伝子(例えば、XIAP、BIRC2(C-IAPl)、BIRC3(C-IAP2)、NAIP、BIRC5(サバイビン)など)であり得る。抗アポトーシス機能を発揮できる核酸は、アポトーシスにおいて役割を果たす1つ以上のカスパーゼ(例えば、カスパーゼ-1、カスパーゼ-2、カスパーゼ-3、カスパーゼ-4、カスパーゼ-5、カスパーゼ-6、カスパーゼ-7、カスパーゼ-8、カスパーゼ-9、カスパーゼ-10、カスパーゼ-11、カスパーゼ-12、カスパーゼ-13、カスパーゼ-14)の発現を阻害またはノックアウトすることができる場合がある。ノックダウンまたはノックアウトのための核酸ポリマーは、shRNA発現カセットであり得るか、またはこれらのカスパーゼ遺伝子は、遺伝子編集法(CRISPR、TALEN、ジンクフィンガー法など)によってもノックアウトされ得る。抗アポトーシス機能を発揮できる核酸ポリマーは、1つ以上のアポトーシス促進性遺伝子(例えば、BCL2L11(BIM)、BBC3(PUMA)、PMAIP1(NOXA)、BIK、BMF、BAD、HRK、BID、BAX、BAK1、BOKなど)の発現を阻害またはノックアウトすることができる場合がある。抗アポトーシス機能を発揮できる核酸ポリマーは、抗アポトーシス効果を有し得る(例えば、IGF1、HSPA4(Hsp70)、HSPB1(Hsp27)、CLAR(cFLIP)、BNIP3、FADD、AKTおよびNF-κB、RAF1、MAP2K1(MEK1)、RPS6KA1(p90Rsk)、JUN、C-Jun、BNIP2、BAG1、HSPA9、HSP90B1、miRNA21、miR-106b-25、miR-206、miR-221/222、miR-17-92、miR-133、miR-143、miR-145、miR-155、miR-330など)。
特定の実施形態において、本明細書中に包含される細胞は、外部刺激の非存在下において大量のIL-4(例えば、10,000細胞/mLの細胞濃度でインキュベートされたとき、インビトロ培養物において1000pg/mL超)を恒常的に産生でき、そのような細胞は、IL-4がT細胞、マクロファージおよび他の免疫細胞によって誘導される炎症を抑制できるので、臨床用途(例えば、自己免疫疾患、移植片対宿主病、サイトカイン放出症候群に関連するある特定のタイプの感染症、CAR T細胞療法および他の養子T細胞療法に関連する毒性、炎症性腸障害、様々な免疫療法に関連する免疫関連有害事象、血球貪食性リンパ組織球症、周期性発熱症候群などをはじめとした様々な炎症性障害を処置するため)に使用され得る。
いくつかの態様において、上記細胞生存促進遺伝子は、抗アポトーシスB細胞リンパ腫2(BCL-2)ファミリー遺伝子である。ある特定の態様において、抗アポトーシスBCL-2ファミリー遺伝子は、BCL2L1(Bcl-xL)、BCL-2、MCL1、BCL2L2(Bcl-w)、BCL2A1(Bfl-1)、BCL2L10(BCL-B)またはそれらの組み合わせである。特定の態様において、抗アポトーシスBCL-2ファミリー遺伝子は、Bcl-xLである。
さらなる態様において、上記T細胞またはNK細胞は、IL-2および/またはIL-15を発現するようにさらに操作されている。
ある特定の態様において、上記T細胞またはNK細胞は、健康ドナー(例えば、癌と診断されたことがないドナー)に由来する。他の態様において、上記T細胞またはNK細胞は、患者に由来する。特定の態様において、ドナーは、ヒトである。
具体的な態様において、上記T細胞には、CD4+T細胞、CD8+T細胞、iNKT細胞、NKT細胞、γδT細胞、制御性T細胞、自然リンパ球系細胞またはそれらの組み合わせが含まれる。いくつかの態様において、上記T細胞には、CD8および/またはγδT細胞が含まれる。上記T細胞は、ナイーブT細胞、エフェクターT細胞、メモリーT細胞、幹細胞メモリーT細胞、最終分化T細胞またはそれらの組み合わせである。ある特定の態様において、上記T細胞は、TCRαβ細胞またはTCRγδT細胞である。いくつかの態様において、上記組成物は、濾胞性ヘルパー(Tfh)T細胞を含まないかまたは本質的に含まない。いくつかの態様において、上記免疫細胞の組成物は、Th1/Tc1、Th2/Tc2、Th9/Tc9、Th17/Tc17、Tfh、Th22、Tc22またはそれらの組み合わせであるT細胞である。特定の態様において、上記T細胞は、IFNγ、グランザイムB、パーフォリンまたはそれらの組み合わせを発現する。
ある特定の態様において、上記T細胞またはNK細胞は、ウイルス特異的であるか、または腫瘍抗原特異的である。いくつかの態様において、上記T細胞またはNK細胞は、1つ以上のCARおよび/または1つ以上のTCRを発現するようにさらに操作されている。いくつかの態様において、上記CARまたはTCRは、CD4、CD5、CD7、CD10、CD19、CD20、CD22、CD30、CD79a、CD79b、、SLAM-F7、CD123、CD70、CD72、CD33、CD38、CD80、CD86、CD138、CLL-1、FLT3、ROR-1、TACI、TRBC1、MUC1、PD-L1、CD117、FR□、LeY、HER2、IL13Rα2、DLL3、DR5、FAP、LMP1、MAGE-A1、MAGE-A4、MG7、MUC16、PMEL、ROR2、VEGFR2、AFP、EphA2、PSCA、EPCAM、EGFR、PSMA、EGFRvIII、GPC3、CEA、GD2、NY-ESO-1、TCL1、メソテリンまたはBAFF-R抗原結合領域を含む。特定の態様において、上記CARは、CD19抗原結合領域を含む。
ある特定の態様において、上記組成物は、少なくとも5000万、1億、2億、5億、7億5000万、10億、20億、30億、40億、50億、60億、70億、80億、90億または100億個の免疫細胞(T細胞、自然リンパ球系細胞、NK細胞またはそれらの混合物を含む)を含む。
追加の態様において、上記免疫細胞は、少なくとも1つの安全スイッチを含む。いくつかの態様において、安全スイッチは、切断型EGFR(例えば、ドメイン1および2を欠くEGFR)である。いくつかの態様において、上記免疫細胞(T細胞、自然リンパ球系細胞および/またはNK細胞)は、IL-2、IL-15、他の成長因子もしくは分化因子またはそれらの組み合わせを発現する。
いくつかの態様において、上記細胞は、少なくとも3ヶ月間、4ヶ月間、5ヶ月間、6ヶ月間、7ヶ月間、8ヶ月間、9ヶ月間、10ヶ月間、11ヶ月間、12ヶ月間またはそれらの間の任意の範囲にわたって、増殖速度を維持する。ある特定の態様において、上記免疫細胞は、強化された抗腫瘍細胞傷害性、インビボ増殖、インビボ持続性および/または改善された機能を有する。
別の実施形態では、本実施形態のT細胞、自然リンパ球系細胞またはNK細胞を作製するための方法が提供され、その方法は、BCL6および細胞生存促進遺伝子をコードするベクターを前記細胞に導入する工程を含む。いくつかの態様において、その細胞生存促進遺伝子は、抗アポトーシスB細胞リンパ腫2(BCL-2)ファミリー遺伝子である。いくつかの態様において、その抗アポトーシスBCL-2ファミリー遺伝子は、BCL2L1(Bcl-xL)、BCL-2、MCL1、BCL2L2(Bcl-w)、BCL2A1(Bfl-1)、BCL2L10(BCL-B)である。特定の態様において、その抗アポトーシスBCL-2ファミリー遺伝子は、Bcl-xLである。ある特定の態様において、上記ベクターは、BCL6およびBcl-xLを2A配列と連結する。具体的な態様において、2A配列は、T2A配列である。
いくつかの態様において、上記ベクターは、レンチウイルスベクターである。ある特定の態様において、導入する工程は、IL-2および/または他の成長因子の存在下において上記細胞にそのレンチウイルスベクターを形質導入することを含む。ある特定の態様において、IL-2は、10IU/mL~1000IU/mL、例えば、10~50IU/mL、50~75IU/mL、75~100IU/mL、100~250IU/mL、250~500IU/mL、500~750IU/mLまたは750~1000IU/mLの濃度で存在する。特定の態様において、IL-2は、100、200、300、400または500IU/mLの濃度で存在する。
追加の態様において、上記方法は、上記T細胞をCD3およびCD28で活性化する工程をさらに含む。いくつかの態様において、上記方法は、IL-2および/またはIL-15の存在下において上記細胞を培養する工程をさらに含む。ある特定の態様において、IL-2および/またはIL-15は、10ng/mL、25ng/mL、50ng/mL、75ng/mL、100ng/mL、150ng/mLまたは200ng/mLの濃度で存在する。いくつかの態様において、上記細胞は、少なくとも3、4、5、6、7、8、9、10、11、12ヶ月間(またはそれらの間の任意の範囲)にわたって増殖速度が本質的に低下することなく培養される。
さらなる態様において、上記方法は、T細胞サブセットについてソーティングする工程をさらに含む。特定の態様において、そのT細胞サブセットは、CD4+T細胞、CD8+T細胞および/またはγδT細胞を含む。
実施形態は、免疫関連障害、感染症および/または癌を処置するための、本実施形態の細胞集団(例えば、B細胞リンパ腫6(BCL6)および細胞生存促進遺伝子を発現するように操作された免疫細胞)を含む組成物を含む。
実施形態は、被験体における疾患または障害を処置する方法に関し、その方法は、有効量の本実施形態の免疫細胞(例えば、B細胞リンパ腫6(BCL6)および細胞生存促進遺伝子を発現するように操作された免疫細胞)をその被験体に投与する工程を含む。
いくつかの態様において、上記疾患または障害は、感染症、癌および/または免疫関連障害である。ある特定の態様において、上記免疫関連障害は、自己免疫障害、移植片対宿主病、同種移植片拒絶または他の炎症状態である。いくつかの態様において、上記免疫細胞は、同種異系である。特定の態様において、免疫関連障害は、癌である。例えば、癌は、固形癌または血液悪性腫瘍である。
追加の態様において、上記方法は、少なくとも第2の治療薬を投与する工程をさらに含む。いくつかの態様において、上記少なくとも第2の治療薬は、化学療法、免疫療法、手術、放射線療法、薬物療法、ホルモン療法、生物療法またはそれらの組み合わせを含む。
本発明の他の目的、特徴および利点は、以下の詳細な説明から明らかになるだろう。しかしながら、この詳細な説明から当業者には本発明の趣旨および範囲内での様々な変更および改変が明らかになるので、その詳細な説明および具体例は、本発明の好ましい実施形態を示すが、単に例証として与えられることを理解するべきである。
以下の図面は、本明細書の一部を成し、本発明のある特定の態様をさらに実証するために含められる。本発明は、本明細書中に提示される具体的な実施形態の詳細な説明と併せてこれらの図面の1つ以上を参照することによって、より理解される可能性がある。
ヒトPGKプロモーターによって駆動されるBCL6-T2A-BCL-xL遺伝子を含むレンチウイルスベクターのマップ。 無限T細胞株の増殖速度を示しているグラフ。左上のパネルは、2ヶ月目における400IU/mLのIL-2の存在下でのIn1-L4a(無限CD3 T細胞)およびIe1-L4aJ3(無限CD8 CAR-T)の成長曲線を示している。右上のパネルは、100ng/mLのIL-15、IL-7およびIL-21の存在下またはサイトカインの非存在下における無限CD8 CAR T細胞(Ie1-L4aJ3)の成長曲線を示している。このデータは、無限T細胞がIL-15の存在下で成長するが、IL-7、IL-21の存在下またはサイトカインの非存在下では成長しないことを示している。左下および右下のパネルは、CD4無限αβT細胞、CD8無限αβT細胞(Ie1-L4a)、CD8無限αβCAR-T細胞(Ie1-L4aJ3)、無限γδT細胞(Igd1-L4a)および無限γδCAR-T細胞(Igd1-L4aJ3)を含む無限T細胞が、5ヶ月目にIL-2の存在下のインビトロで増殖し続けることを示している。 CD3、CD4、CD8、CD16、CD56、TCRαβおよびTCRγδの発現によって測定された無限T細胞株In1-L4aの表現型を示しているグラフ。 抗TCRγδ抗体を用いてソーティングされたγδT細胞の表現型を示しているグラフ。これらの細胞上のTCRγδ、TCRαβおよびCD16の発現が示されている。 抗TCRγ9抗体および抗TCRδ2抗体を用いてソーティングされたγδT細胞の主要サブセットを示しているグラフ。無限γδT細胞の大部分が、TCRγ9δ2陽性である。 4ヶ月目の無限T細胞の表現型を示しているグラフ。それらの大部分は、主にIFNγ、グランザイムBおよびパーフォリンを発現するエフェクターT細胞およびセントラルメモリーT細胞である。 無限CAR-T細胞上の様々な共阻害性レセプターの発現を示しているグラフ。
抗CD19 CARおよび切断型ヒトEGFR発現カセットを含むレンチウイルスベクターpJ3のマップ。 レンチウイルスベクターpJ3によって形質導入された、Ie1-L4aJ3(無限CD8 CART)およびIn1-L4aJ3(無限CD3 CART)のCAR陽性パーセンテージを示しているグラフ。CAR陽性パーセンテージは、形質導入の10日後に、FITC標識ヒトCD19タンパク質または抗EGFR抗体を用いるフローサイトメトリーによって測定された。 In1-L4aJ3(無限CD3 CART)のCAR陽性細胞パーセンテージを示しているグラフ。tEGFRをAF647標識セツキシマブで染色し、抗CD19 CARをFITC標識組換えヒトCD19タンパク質で染色した。 ソーティング前およびソーティング後のIn1-L4aJ3(無限CD3 CART)のCAR陽性細胞のパーセンテージを示しているグラフ。tEGFRをAF647-セツキシマブで染色し、抗CD19 CARをFITC標識組換えヒトCD19タンパク質で染色した。
12ウェルプレートにおける0.2:1および1:1比というエフェクター:ターゲット(E:T)比でのRajiおよびNalm6細胞に対するIe1-L4aJ3(無限CD8 CART)のインビトロ細胞傷害性を示しているグラフ。Ie1-L4aJ3(無限CD8 CART)細胞またはコントロールIe1-L4a(CARを有しない無限CD8 T細胞)細胞を、RajiまたはNalm6細胞と5日間共培養した。0、1、3および5日目の共培養物中の腫瘍細胞のパーセンテージが示されている。
4ヶ月間拡大した後の無限T細胞のインビトロ細胞傷害性を示しているグラフ。Ie1-L4a(無限CD8 T細胞)、Ie1-L4aJ3(無限CD8 CART)、Igd1-L4a(無限ガンマ/デルタT細胞)またはIgd1-L4aJ3(無限γδCAR-T細胞、CAR-Tパーセンテージが>90%である)細胞を、IL-15の存在下の12ウェルプレートにおいて、DaudiまたはNalm6細胞と7日間、3:1というエフェクター:ターゲット(E:T)比で共培養した。0、1、2、4および7日目の共培養物中の腫瘍細胞のパーセンテージが示されている。これらの結果から、1)CD8無限CAR-Tおよびγδ無限CAR-T細胞は、長期のインビトロでの培養および拡大の後でさえ、特異的な細胞傷害性を維持したこと、および2)CARを有しないが内在性γ9δ2TCRまたは他のTCRを有するγδ無限T細胞は、おそらくそのγδTCRによって媒介される、ある特定のタイプの腫瘍細胞の溶解を誘導できることが示唆される。例えば、Daudi細胞は、CARを有しないγδ無限T細胞によって殺滅され得るのに対して、Nalm-6は、CARを形質導入されたγδ無限T細胞によってのみ殺滅され得る。一部のリンパ腫細胞に加えて、いくつかのミエローマ細胞株および他の癌細胞株もγδT細胞によって殺滅されると知られている。
IL-2の存在下における、抗CD19 CARを有するまたは有しない無限T細胞(CD4+CD8またはCD8)の成長速度。 無限T細胞は、CD4 T細胞とCD8 T細胞との両方の混合物を有し(左のパネル)、CD8無限T細胞について示されているように高純度にソーティングされ得る(右のパネル)。 次いで、6ヶ月間培養中の無限T細胞をIL-2(示されている)またはIL-15(図示せず)なしでインキュベートした。細胞数が6日以内に急速に減少したことから、長期のインビトロ培養後であっても無限T細胞の自律的増殖または悪性形質転換のエビデンスがなかったことが示唆される。
TRAPezeテロメラーゼ活性検出キットを製造者の指示書に従って使用して、無限T細胞または末梢血単核球(PBMC)におけるテロメラーゼ活性を測定した。 RNAseq解析によって測定された、無限T細胞または対応するPBMCサンプルにおける、ヒートマップとして示されているテロメラーゼ活性に関係する遺伝子。これらの結果は、無限T細胞が非常に高いテロメラーゼ活性を有することを示唆している。
抗CD19 CARを有するもしくは有しない無限T細胞、または末梢血T細胞から従来の方法によって作製されたCAR T細胞をCellTrace FarRedで標識し、Daudi腫瘍細胞をCellTrace Violetで標識し、1:1というエフェクター:ターゲット比で共培養した。3、5および7日後に生細胞の腫瘍細胞パーセント(右下のゲート)を測定した。フローサイトメトリーによってCountBright Absolute計数用ビーズ(ThermoFisher Scientific)を用いて生細胞の腫瘍細胞の絶対数も計算したところ、それらの結果は、示された生細胞の腫瘍細胞のパーセンテージと一致した。 抗CD19 CARを有するまたは有しない無限T細胞をNALM-6 B細胞白血病細胞と1:1で共培養した。6時間後にCD107a染色によって脱顆粒を測定した。これらの結果から、CARを発現している無限T細胞が高度に細胞傷害性であり、B細胞腫瘍に応答して脱顆粒することが示唆される。 抗CD19無限CAR T細胞の表現型を、フローサイトメトリーによって示されるマーカーについて測定した。抗CD19 CARの発現を、蛍光標識された組換えヒトCD19-Fcタンパク質による染色によって測定した。これらの結果は、無限T細胞が、従来の疲弊マーカー(例えば、CTLA-4、PD-1、TIM-3、CD160または2B4(CD244))を高レベルで発現しないことを示している。 抗CD19無限CAR T細胞の表現型を、フローサイトメトリーによって示されるマーカーについて測定した。抗CD19 CARの発現を、蛍光標識された組換えヒトCD19-Fcタンパク質による染色によって測定した。これらの結果は、無限T細胞が、従来の疲弊マーカー(例えば、CTLA-4、PD-1、TIM-3、CD160または2B4(CD244))を高レベルで発現しないことを示している。
RNAseq解析によって測定された、無限T細胞または対応するPBMCサンプルにおける、ヒートマップとして示されているT細胞サブセットに関係する遺伝子または遺伝子シグネチャ。 RNAseq解析によって測定された、無限T細胞または対応するPBMCサンプルにおける、ヒートマップとして示されている疲弊マーカーに関係する遺伝子または遺伝子シグネチャ。 RNAseq解析によって測定された、無限T細胞または対応するPBMCサンプルにおける、ヒートマップとして示されているケモカインレセプターに関係する遺伝子または遺伝子シグネチャ。 RNAseq解析によって測定された、無限T細胞または対応するPBMCサンプルにおける、ヒートマップとして示されている老化マーカーに関係する遺伝子または遺伝子シグネチャ。
RNAseq解析によって測定された、無限T細胞または対応するPBMCサンプルにおける、ヒートマップとして示されているケモカイン発現に関係する遺伝子。 RNAseq解析によって測定された、無限T細胞または対応するPBMCサンプルにおける、ヒートマップとして示されているサイトカイン発現に関係する遺伝子。 RNAseq解析によって測定された、無限T細胞または対応するPBMCサンプルにおける、ヒートマップとして示されているサイトカインレセプターに関係する遺伝子。
無限T細胞またはCARを形質導入されたT細胞を解凍し、抗CD19 CARの発現を抗EGFR抗体染色によって測定した。 解凍し、インビトロでIL-2とともに培養した後の抗CD19無限CAR T細胞の成長速度。種々の日における培養液中の細胞数が示されている。 Aにおいて解凍された細胞の細胞傷害活性を、無限T細胞とNALM-6腫瘍細胞との1:1での共培養の4日後に、図7Aのもとで説明されたように測定した。ゲートは、生細胞の腫瘍細胞パーセントを示している。
無限γδT細胞の表現型(下)を、フローサイトメトリーによって示されるマーカーについて測定し、健康ドナーPBMC由来の対応するγδT細胞(上)と比較した。これらの結果は、無限γδT細胞が従来の疲弊マーカーを高レベルで発現しないことを示している。
ルシフェラーゼで標識された無限T細胞を、1および3日目に、IL-15の注射ありまたはなしで腹腔内(i.p.)注射した。T細胞数を生物発光イメージング(BLI)によって画像化した。これらの結果は、IL-15が、インビボで無限T細胞の成長および拡大を促進することを示している。
ルシフェラーゼで標識されたNALM-6細胞を、抗CD19 CARを有するまたは有しない無限T細胞とともに、+/-IL-15でNSGマウスに注射した。抗腫瘍有効性をBLI(左)および生存(右)によって測定した。これらの結果は、抗CD19無限CAR T細胞がインビボにおいて抗腫瘍有効性を有することを示している。
抗原特異的無限T細胞。HLA-A2ドナー由来の無限T細胞を、公知のCD8 T細胞エピトープを有するHLA-A2四量体を用いて感染症および腫瘍関連抗原に対する特異性について試験した。データは、無限T細胞の中に、内在性のTCRを介して微生物抗原および腫瘍関連抗原を認識した抗原特異的T細胞が存在することを示している。
EBV特異的無限T細胞の作製。HLA-A2+ドナー由来の健康ドナー末梢血単核球を、0日目に、HLA-A2に結合するEBVペプチドのプールで刺激し、24時間後にCD137陽性T細胞をフローサイトメトリーによってソーティングし、それを、BCL6およびBcl-xLを形質導入することによる先に記載されたような無限T細胞の作製に使用した。7週間の培養の後、四量体陽性細胞を磁気ビーズによって濃縮し、次いで、濃縮された細胞をさらにもう6週間培養し、CD8、およびEBV-BMLF1タンパク質に由来するHLA-A2結合ペプチド(GLCTLVAML)に対して特異的なBMLF1-HLA-A2四量体について染色した。これらの結果は、微生物抗原特異的または腫瘍抗原特異的な無限CD4またはCD8 T細胞の濃縮集団が、記載した方法を用いて作製され得ることを示唆している。
Tet-off安全スイッチの制御下のBCL6およびBCL2L1遺伝子を用いて無限αβまたはγδT細胞を作製した。1μg/mLのドキシサイクリン(Dox)の存在下(右)または非存在下(左)における、IL-2を用いたときの無限T細胞の成長速度が示されている。これらの結果は、無限T細胞が、ドキシサイクリンの非存在下において成長速度を維持しているが、ドキシサイクリンの存在下では増殖を停止し、徐々に細胞死を起こしたことを示唆している。無限T細胞に組み込まれたIL-2またはIL-15サイトカイン遺伝子をコントロールするために、類似のtet-off安全スイッチも使用できる。
tet-off安全スイッチを有する無限T細胞を、漸増濃度のドキシサイクリン(Dox)の存在下または非存在下においてIL-2とともに培養し、培養液中の細胞を光学顕微鏡によって画像化した。2週間後に、細胞を染色して、フローサイトメトリーによってCD25発現を評価した。光学顕微鏡のイメージングによって、その無限T細胞は、ドキシサイクリンの濃度上昇に伴って増殖クラスターが減少するのとともに、サイズが徐々に小さくなったことが分かった。さらに、CD25の発現が、ドキシサイクリンの存在下において顕著に減少した。
tet-off安全スイッチを有する無限T細胞を、1μg/mLのドキシサイクリン(Dox)の存在下または非存在下においてIL-2とともに培養し、2週間後に、細胞を染色して、記載の表面マーカーについてフローサイトメトリーによって評価した。PD-1の発現は、ドキシサイクリンの存在下において顕著に増加した。
無限T細胞によるサイトカイン産生。抗CD19 CAR発現ありまたはなしの無限T細胞(CD8+)を、NALM-6腫瘍細胞と5:1というエフェクター:ターゲット比で共培養した。3日後、上清中のサイトカインレベルを計測した。データは、異なる3人の健康ドナーに由来する無限T細胞の結果の代表である。これらの結果は、抗CD19 CARを有する無限T細胞が、NALM-6腫瘍細胞に応答して、かなりの量のIL-2、GM-CSF、IFNγ、IL-5およびIL-17を多分に産生したが、抗CD19 CARを有しない無限T細胞は産生しなかったことを示している。腫瘍細胞に応答した抗CD19無限CAR T細胞によるTNFα、IL-4、IL-6、IL-10またはIL-13の産生は、最小であったか、またはCAR発現なしの無限T細胞と有意に異ならなかった。しかしながら、本発明者らは、CAR発現ありまたはなしの無限T細胞は、腫瘍細胞の存在下または非存在下において10,000pg/mLを超える大量のIL-4を産生したことを観察した(図19およびデータ示さず)。
抗体依存性細胞媒介性細胞傷害(ADCC)を介したセツキシマブによる無限CAR T細胞の溶解。抗CD19 CARおよびtEGFRを発現する無限T細胞を、CFSEで標識し、5μg/mLのセツキシマブまたはリツキシマブの存在下において、記載のエフェクター:ターゲット比で、健康ドナーに由来するNK細胞ありまたはなしで2つ組にて共培養した。5時間後、各ウェル内の無限T細胞の絶対数を、計数用ビーズを用いたフローサイトメトリーによって測定し、T細胞のみと比べた無限T細胞数の減少パーセントを計算し、グラフに示した。NK細胞の非存在下においてセツキシマブまたはリツキシマブを用いたときのT細胞の減少パーセントは、<5%だった。
BCL6遺伝子とBCL2L1遺伝子またはBCL6遺伝子とBIRC5(サバイビン)遺伝子、およびTet-off安全スイッチおよびIL-15を用いた無限T細胞の作製。BCL6遺伝子とBCL2L1遺伝子またはBCL6遺伝子とBIRC5遺伝子、Tet-off安全スイッチ、およびIL-15遺伝子を含むレンチウイルス構築物のデザイン。 BCL6遺伝子とBCL2L1遺伝子またはBCL6遺伝子とBIRC5(サバイビン)遺伝子、およびTet-off安全スイッチおよびIL-15を用いた無限T細胞の作製。ヒトT細胞に、パネルAに示された構築物をレンチウイルスによって形質導入し、IL-2の存在下において培養した。12週間後に、この2つのアプローチによって作製されたT細胞の、類似の条件下でのインビトロ培養中の成長速度を測定した。 BCL6遺伝子とBCL2L1遺伝子またはBCL6遺伝子とBIRC5(サバイビン)遺伝子、およびTet-off安全スイッチおよびIL-15を用いた無限T細胞の作製。パネルAに示されたBCL6遺伝子およびBCL2L1遺伝子を含むレンチウイルス構築物を用いて、2人のドナーから無限T細胞を作製し、1μg/mLのドキシサイクリンの存在下または非存在下においてIL-2とともに培養した。それらの細胞は、ドキシサイクリンの非存在下では指数関数的速度で成長したが、ドキシサイクリンの存在下では増殖を停止し、徐々に細胞死を起こした。
Bcl-xlとともにBCL6を含む構築物(L5x(MSCV-BCL6-P2A-BCL-xl-T2A-rtTA))の一例。この構造では少なくとも、野生型BCL-6とBCL-xLとの間にP2Aエレメントが含まれており、BCL-xLとrtTA(Tet onトランス活性化因子)との間にT2Aエレメントが含まれている。
少なくともBCL6発現用を含む構築物の具体的な実施形態の例の図示。いくつかの実施形態は、例としてカスパーゼ9またはBAKに対するものを含む、任意の種類のshRNAを含む。
発明の詳細な説明
例証的な実施形態の説明
ヒトテロメラーゼ逆転写酵素(hTERT)遺伝子の異所性発現は、正常なT細胞を不死化すると以前に報告された(Hooijberg et al.,2000)。しかしながら、hTERTのみの過剰発現では、Tリンパ球の不死化には不十分であることが観察されている。実際に、このアプローチによって作製されたT細胞は、しばらくすると増殖を止める(Migliaccio et al.,2000)。本研究は、正常なNKまたはT細胞におけるBCL6の発現が、それらの分化を停止させる可能性があること、およびBcl-xLタンパク質をコードするBCL2L1のような抗アポトーシスBCL-2ファミリー遺伝子などの細胞生存促進遺伝子の発現が、それらの寿命を大幅に延長する可能性があり、それらの細胞の基本的な機能を維持しながら不死化するとみられることを検討した。
本開示の実施形態は、本明細書中に包含される改変を欠く細胞と比べて大幅に延長された寿命を有する細胞の組成物、作製および使用に関する。具体的な実施形態において、それらの細胞は、遺伝子産物が抗アポトーシス機能を有する任意の遺伝子を含む、異種BCL6および1つ以上の生存促進性遺伝子(または抗アポトーシス遺伝子または細胞生存促進遺伝子)をコードする。例として、生存促進性遺伝子は、任意のBCL-2ファミリー遺伝子であってよく、それらとしては、BCL-xL、BCL-2、MCL-1またはサバイビンが単なる例として挙げられる。追加的にまたは代替的に、それらの細胞は、1つ以上のカスパーゼ(例えば、カスパーゼ-1、カスパーゼ-2、カスパーゼ-3、カスパーゼ-4、カスパーゼ-5、カスパーゼ-6、カスパーゼ-7、カスパーゼ-8、カスパーゼ-9、カスパーゼ-10、カスパーゼ-11、カスパーゼ-12、カスパーゼ-13、カスパーゼ-14またはそれらの組み合わせ)の発現の阻害または発現がノックアウトされている。そのような例において、1つ以上のカスパーゼ遺伝子のノックダウンまたはノックアウトのためのDNAフラグメントは、shRNA発現カセットであり得る。これらのカスパーゼ遺伝子は、遺伝子編集法(CRISPR、TALEN、ジンクフィンガー法など)によってもノックアウトされ得る。ゆえに、具体的な実施形態において、上記免疫細胞は、無限免疫細胞を作製するために、BCL6の過剰発現または異種BCL6に加えてカスパーゼノックアウトを含む。それらの細胞は、1つ以上の生存促進性遺伝子(または抗アポトーシス遺伝子または細胞生存促進遺伝子)を有し得、具体的な場合においては、1つ以上のカスパーゼ遺伝子のノックダウンまたはノックアウトも有し得る。
本開示は、ある特定の実施形態において、大幅に延長された寿命を有し、かつ養子免疫療法などのために迅速に多数に増殖され得る、無限数の無限免疫細胞を作製するための方法を提供する。本方法は、少なくともいくつかの場合において、1回の形質導入によって無限に拡大する能力を有する無限免疫細胞を提供する。本方法は、非常に安価であり、短期間(例えば、1ヶ月またはそれ以上)で無限数の免疫細胞を作製できる。
本明細書中に包含されるこのプラットフォームおよび系は、TCRαβT細胞とTCRγδT細胞の両方を含む無限T細胞などの無限免疫細胞を作製するために使用され得る。このアプローチは、そのまま使用され得るかまたは汎用のキメラ抗原レセプター(CAR)T細胞もしくはT細胞レセプター(TCR)が形質導入されたT細胞をはじめとした所望の細胞を作製するようにさらに遺伝的に操作され得る、無限のヒトT細胞起源を提供する。具体的な実施形態において、それらの細胞は、癌ならびに感染性および炎症性障害を含む他の疾患を処置または予防するために使用される。例として、その系は、癌、感染症および/または炎症性疾患を処置するために使用され得る。具体例としては、B細胞リンパ腫、CMV感染症、EBV感染症、自己免疫障害、移植片対宿主病またはそれらの組み合わせが挙げられる。
一例として、本明細書中に包含される研究は、無限T細胞への抗CD19 CARの形質導入によって、「抗CD19無限CAR T細胞」(CD19 inCART)が作製され、ヒトB細胞腫瘍に対する特異性が再指示されたことを示した。CD19無限CAR T細胞は、たった1回の形質導入の後に無限数の抗原レセプター改変T細胞(例えば、CAR T細胞)を作製するための起源として働くことができ、ヒトB細胞リンパ腫細胞株に対して有意な細胞傷害性を示した。本開示は、無限数の免疫細胞を生成でき、製造プロセスを合理化することによって養子免疫細胞療法のコストを劇的に削減でき、その細胞の作製時間を劇的に短縮できる、汎用の免疫細胞療法プラットフォームおよびシステムを提供する。特定の実施形態では、BCL6および1つ以上の生存促進性遺伝子(または抗アポトーシス遺伝子または細胞生存促進遺伝子)を発現させることによって無限細胞の作製が可能になり、その無限細胞は、養子細胞療法に向けたさらなる操作(例えば、操作された目的の抗原レセプターを組み込むことによるさらなる操作(例えば、ある具体的な癌に適応させるために))のための汎用細胞となる。その汎用細胞は、1つ以上の安全スイッチ(例えば、誘導システム、ならびに排除遺伝子、例えば、切断型EGFR(一例として、ドメイン1および/またはドメイン2を欠く)および/または1つ以上の自殺遺伝子および/または1つ以上のサイトカインを含む)もすでに含んでいてもよいし、後にこれらのうちのいずれかを、所望の特性を有するようにそれらの細胞を適応させる工程において付加してもよい。
I.定義
本明細書中で使用されるとき、特定の構成要素に関する「本質的に含まない」は、その特定の構成要素が、意図的に組成物に製剤化されていないことおよび/または夾雑物としてでさえもしくは微量でさえ存在しないことを意味するために本明細書中で使用される。ゆえに、ある組成物の任意の意図されない混入に起因する、その特定の構成要素の総量は、0.05%未満、好ましくは、0.01%未満である。標準的な分析方法ではその特定の構成要素の量を検出できない組成物が最も好ましい。
本明細書中で使用されるとき、「a」または「an」は、1つ以上を意味し得る。請求項で使用されるとき、語「a」または「an」は、語「~を含む」とともに使用されるとき、1つまたは1つより多いことを意味し得る。本開示のいくつかの実施形態は、本開示の1つ以上のエレメント、方法工程および/または方法からなり得るか、またはそれらから本質的になり得る。本明細書中に記載される任意の方法または組成物は、本明細書中に記載される他の任意の方法または組成物に対して実行され得ること、および異なる実施形態が組み合わされ得ることが企図される。
請求項での用語「または」の使用は、選択肢だけを指すと明示的に示されない限り、またはそれらの選択肢が相互排他的でない限り、「および/または」を意味するために使用されるが、本開示は、選択肢だけおよび「および/または」を指すという定義を支持する。例えば、「x、yおよび/またはz」とは、「x」のみ、「y」のみ、「z」のみ、「x、yおよびz」、「(xおよびy)またはz」、「xまたは(yおよびz)」または「xまたはyまたはz」のことを指し得る。x、yまたはzが、ある実施形態から明確に排除され得ることが明確に企図される。本明細書中で使用されるとき、「別の」は、少なくとも第2のものまたはそれ以上のものを意味し得る。用語「約」、「実質的に」および「およそ」は、一般に、述べられている値プラスまたはマイナス5%を意味する。
本明細書全体にわたって、文脈が他のことを要求しない限り、語「~を含む(comprise)」、「~を含む(comprises)」および「~を含む(comprising)」は、記載の工程もしくはエレメントまたは工程群もしくはエレメント群を包含するが、他の任意の工程もしくはエレメントまたは工程群もしくはエレメント群を排除しないことを暗に示すと理解される。「~からなる」は、句「~からなる」の前に何が置かれたとしても、「~を含み、それらに限定される」ことを意味する。したがって、句「~からなる」は、列挙されたエレメントが、不可欠または必須であること、および他のエレメントが存在しない可能性があることを示す。「~から本質的になる」は、この句の前に列挙される任意のエレメント、および列挙されたエレメントについて本開示に明示される活性または作用を干渉しないまたはそれらに寄与しない他のエレメントに限定されるエレメントを含むことを意味する。したがって、句「~から本質的になる」は、列挙されたエレメントが、不可欠または必須であるが、他のエレメントは自由選択ではなく、それらが列挙されたエレメントの活性または作用に影響するか否かに応じて、存在してもよいか、または存在してはならないことを示す。
本明細書全体にわたる「1つの実施形態」、「ある実施形態」、「特定の実施形態」、「関連する実施形態」、「ある特定の実施形態」、「追加の実施形態」もしくは「さらなる実施形態」またはそれらの組み合わせに対する言及は、その実施形態に関連して記載される特定の特徴、構造または特性が、本発明の少なくとも1つの実施形態に含められることを意味する。したがって、本明細書全体にわたる様々な箇所における前述の句の出現は、必ずしもすべてが同じ実施形態について言及しているわけではない。さらに、特定の特徴、構造または特性が、1つ以上の実施形態において任意の好適な様式で組み合わされ得る。
「免疫障害」、「免疫関連障害」または「免疫媒介性障害」とは、免疫応答が、その疾患の発症または進行において重要な役割を果たす障害のことを指す。免疫媒介性障害としては、自己免疫障害、同種移植片拒絶、移植片対宿主病ならびに炎症状態およびアレルギー状態が挙げられる。
「免疫応答」は、刺激に対する、B細胞またはT細胞または自然免疫細胞などの免疫系細胞の応答である。1つの実施形態において、応答は、特定の抗原に特異的である(「抗原特異的応答」)。
「自己免疫疾患」とは、免疫系が、正常な宿主の一部である抗原(すなわち、自己抗原)に対して免疫応答(例えば、B細胞応答またはT細胞応答)を起こし、その結果、組織が傷害される疾患のことを指す。自己抗原は、宿主細胞に由来し得るか、または共生生物(例えば、通常、粘膜表面にコロニー形成する微生物(共生生物として知られる))に由来し得る。
疾患または状態を「処置する」またはそれらの処置とは、その疾患の徴候または症状を軽減する目的で、1つ以上の薬物を患者に投与することを含み得るプロトコルを実行することを指す。処置の望ましい効果としては、疾患の進行速度の低下、疾患状態の回復または緩和、および予後の緩解または改善が挙げられる。軽減は、現れる疾患または状態の徴候または症状が現れる前ならびに現れた後において生じ得る。したがって、「処置する」または「処置」は、疾患または望ましくない状態を「予防する」またはそれらの「予防」を含み得る。さらに、「処置する」または「処置」は、徴候または症状の完全な軽減を必要とせず、治癒を必要とせず、詳細には、患者に対して周辺効果しか及ぼさないプロトコルを含む。
本願全体にわたって使用される用語「治療効果」または「治療的に有効な」とは、この状態の医学的処置に関して被験体の福祉を増進または向上させる何らかのことを指す。これには、ある疾患の徴候または症状の頻度または重症度の低下が含まれるが、これらに限定されない。例えば、癌の処置は、例えば、腫瘍サイズの減少、腫瘍の侵襲性の低下、癌の成長速度の低下、または転移の予防を含み得る。癌の処置とは、癌を有する被験体の生存時間の延長のことも指し得る。
「被験体」および「患者」および「個体」は、相互交換可能であり得、ヒトまたは非ヒト、例えば、霊長類、哺乳動物および脊椎動物のことを指し得る。特定の実施形態において、被験体は、ヒトである。被験体は、方法または材料の対象である任意の生物または動物被験体であり得、それらとしては、哺乳動物、例えば、ヒト、実験動物(例えば、霊長類、ラット、マウス、ウサギ)、家畜(例えば、ウシ、ヒツジ、ヤギ、ブタ、シチメンチョウおよびニワトリ)、家庭のペット(例えば、イヌ、ネコおよびげっ歯類)、ウマおよびトランスジェニック非ヒト動物が挙げられる。被験体は、患者であり得、例えば、1つ以上の感染症、1つ以上の遺伝性障害、1つ以上の癌またはそれらの任意の組み合わせなどの疾患(病状と称され得る)を有し得るか、または有していると疑われ得る。「被験体」または「個体」は、本明細書中で使用されるとき、医療施設に収容されていてもよいし収容されていなくてもよく、医療施設の外来患者として処置されてもよい。個体は、インターネットを介して1つ以上の医学的組成物を受け取っていてもよい。個体には、任意の齢のヒトまたは非ヒト動物が含まれ得るので、個体は、成体および若年者(すなわち、小児)および乳児を含み、子宮内の個体も含む。被験体は、医学的処置の必要性を有することもあるし、有しないこともあり;個体は、臨床的であるか基礎科学研究の支援であるかを問わず、自発的または非自発的に実験の一部となる場合がある。
句「薬学的にまたは薬理学的に許容され得る」とは、ヒトなどの動物に適宜投与されたとき、有害反応、アレルギー反応または他の不都合な反応をもたらさない分子実体および組成物のことを指す。抗体またはさらなる活性成分を含む薬学的組成物の調製は、本開示に照らせば当業者に公知である。さらに、動物(例えば、ヒト)への投与の場合、調製物は、FDA Office of Biological Standardsが要求する無菌性、発熱性、一般的な安全性および純度の規格を満たすべきであることが理解される。
本明細書中で使用されるとき、「薬学的に許容され得るキャリア」は、当業者に公知であるように、任意のおよびすべての水性溶媒(例えば、水、アルコール溶液/水溶液、食塩水、非経口ビヒクル、例えば、塩化ナトリウム、リンゲルデキストロースなど)、非水溶媒(例えば、プロピレングリコール、ポリエチレングリコール、植物油および注射可能な有機エステル、例えば、オレイン酸エチル)、分散媒、コーティング、界面活性剤、酸化防止剤、保存剤(例えば、抗菌剤または抗真菌剤、抗酸化剤、キレート剤および不活性ガス)、等張剤、吸収遅延剤、塩、薬物、薬物安定剤、ゲル、結合剤、賦形剤、崩壊剤、潤滑剤、甘味剤、香味剤、色素、流動性および栄養補給剤、そのような同様の材料ならびにそれらの組み合わせを含む。薬学的組成物のpHおよび薬学的組成物中の様々な構成要素の正確な濃度は、周知のパラメータに従って調整される。
II.無限免疫細胞
本開示のある特定の実施形態は、1つ以上の遺伝子を発現するように操作された免疫細胞に関する。その1つ以上の遺伝子の発現は、その1つ以上の遺伝子の発現を欠く細胞と比べて、当該細胞の寿命の延長を直接または間接的にもたらす。特定の実施形態において、それらの細胞は、1つ以上の異種遺伝子を含む1つ以上の遺伝子を発現するように操作されている。他の場合において、それらの細胞は、それらの細胞にとって内在性の1つ以上の遺伝子の1つ以上の調節エレメントの操作などによって、それらの細胞にとって内在性の1つ以上の遺伝子の発現がアップレギュレーションするように操作されている。
特定の実施形態では、免疫細胞が、BCL6遺伝子および1つ以上の生存促進性遺伝子または抗アポトーシス遺伝子または細胞生存促進遺伝子を発現するように操作される(かつ、生存促進性または抗アポトーシスまたは細胞生存促進と分類される遺伝子において重複があるかもしれないし、ないかもしれない)。本明細書中で使用されるとき、生存促進性遺伝子とは、抗アポトーシス機能を発揮できるかまたは任意の機構によって生存を促進できる核酸ポリマーのことを指す。抗アポトーシス機能を発揮できる核酸ポリマーは、1つ以上のBcl2ファミリー遺伝子(例えば、BCL-xL、BCL-2、MCL-1、Bcl-w、Bfl-1、BCL-Bなど)であり得る。抗アポトーシス機能を発揮できる核酸ポリマーは、1つ以上のアポトーシス阻害(IAP)ファミリー遺伝子(例えば、XIAP、c-IAPl、C-IAP2、NAIPおよびサバイビンなど)であり得る。抗アポトーシス機能を発揮できる核酸ポリマーは、アポトーシスにおいて役割を果たす1つ以上のカスパーゼ(例えば、カスパーゼ-1、カスパーゼ-2、カスパーゼ-3、カスパーゼ-4、カスパーゼ-5、カスパーゼ-6、カスパーゼ-7、カスパーゼ-8、カスパーゼ-9、カスパーゼ-10、カスパーゼ-11、カスパーゼ-12、カスパーゼ-13、カスパーゼ-14)の発現を阻害またはノックアウトすることができる場合がある。ノックダウンまたはノックアウトのための核酸ポリマーは、shRNA発現カセットであり得るか、またはこれらのカスパーゼ遺伝子は、遺伝子編集法(CRISPR、TALEN、ジンクフィンガー法など)によってもノックアウトされ得る。抗アポトーシス機能を発揮できる核酸ポリマーは、1つ以上のアポトーシス促進性遺伝子(例えば、BIM、Puma、Noxa、Bik、Bmf、Bad、Hrk、Bid、BAX、BAK、BOKなど)の発現を阻害またはノックアウトすることができる場合がある。抗アポトーシス機能を発揮できる核酸ポリマーは、抗アポトーシス効果を有し得る(例えば、インスリン様成長因子(IGF-1)、Hsp70、Hsp27、cFLIP、BNIP3、FADD、AktおよびNF-κB、Raf-1およびMEK1、p90Rsk、C-Jun、BNIP2、BAG1、HSPA9、HSP90B1、miRNA21、miR-106b-25、miR-206、miR-221/222、miR-17-92、miR-133、miR-143、miR-145、miR-155、miR-330など)。
無限T細胞は、野生型BCL6または変異BCL6を用いて作製され得る。本発明者らは、特定の1つのヌクレオチドが異なる野生型BCL6または変異BCL6(つまり、野生型BCL6の395位のアミノ酸のコドンがCCT(プロリン/Pをコードする)であり、変異BCL6の395位のアミノ酸のコドンは、CTT(ロイシン/Lをコードする)である)のいずれかを用いて無限T細胞を作製できることを明らかにした。それらの2つのBCL6遺伝子のヌクレオチド配列およびアミノ酸配列を下記に示す(野生型配列における変異点に下線を引いている)。
野生型BCL6のaa配列:
MASPADSCIQFTRHASDVLLNLNRLRSRDILTDVVIVVSREQFRAHKTVLMACSGLFYSIFTDQLKCNLSVINLDPEINPEGFCILLDFMYTSRLNLREGNIMAVMATAMYLQMEHVVDTCRKFIKASEAEMVSAIKPPREEFLNSRMLMPQDIMAYRGREVVENNLPLRSAPGCESRAFAPSLYSGLSTPPASYSMYSHLPVSSLLFSDEEFRDVRMPVANPFPKERALPCDSARPVPGEYSRPTLEVSPNVCHSNIYSPKETIPEEARSDMHYSVAEGLKPAAPSARNAPYFPCDKASKEEERPSSEDEIALHFEPPNAPLNRKGLVSPQSPQKSDCQPNSPTESCSSKNACILQASGSPPAKSPTDPKACNWKKYKFIVLNSLNQNAKPEGEQAELGRLSPRAYTAPPACQPPMEPENLDLQSPTKLSASGEDSTIPQASRLNNIVNRSMTGSPRSSSESHSPLYMHPPKCTSCGSQSPQHAEMCLHTAGPTFPEEMGETQSEYSDSSCENGAFFCNECDCRFSEEASLKRHTLQTHSDKPYKCDRCQASFRYKGNLASHKTVHTGEKPYRCNICGAQFNRPANLKTHTRIHSGEKPYKCETCGARFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCEICGTRFRHLQTLKSHLRIHTGEKPYHCEKCNLHFRHKSQLRLHLRQKHGAITNTKVQYRVSATDLPPELPKAC (配列番号1)
野生型BCL6のヌクレオチド配列(野生型配列における変異点のコドンに下線を引いている):
ATGgcctcgccggctgacagctgtatccagttcacccgccatgccagtgatgttcttctcaaccttaatcgtctccggagtcgagacatcttgactgatgttgtcattgttgtgagccgtgagcagtttagagcccataaaacggtcctcatggcctgcagtggcctgttctatagcatctttacagaccagttgaaatgcaaccttagtgtgatcaatctagatcctgagatcaaccctgagggattctgcatcctcctggacttcatgtacacatctcggctcaatttgcgggagggcaacatcatggctgtgatggccacggctatgtacctgcagatggagcatgttgtggacacttgccggaagtttattaaggccagtgaagcagagatggtttctgccatcaagcctcctcgtgaagagttcctcaacagccggatgctgatgccccaagacatcatggcctatcggggtcgtgaggtggtggagaacaacctgccactgaggagcgcccctgggtgtgagagcagagcctttgcccccagcctgtacagtggcctgtccacaccgccagcctcttattccatgtacagccacctccctgtcagcagcctcctcttctccgatgaggagtttcgggatgtccggatgcctgtggccaaccccttccccaaggagcgggcactcccatgtgatagtgccaggccagtccctggtgagtacagccggccgactttggaggtgtcccccaatgtgtgccacagcaatatctattcacccaaggaaacaatcccagaagaggcacgaagtgatatgcactacagtgtggctgagggcctcaaacctgctgccccctcagcccgaaatgccccctacttcccttgtgacaaggccagcaaagaagaagagagaccctcctcggaagatgagattgccctgcatttcgagccccccaatgcacccctgaaccggaagggtctggttagtccacagagcccccagaaatctgactgccagcccaactcgcccacagagtcctgcagcagtaagaatgcctgcatcctccaggcttctggctcccctccagccaagagccccactgaccccaaagcctgcaactggaagaaatacaagttcatcgtgctcaacagcctcaaccagaatgccaaaccagaggggcCtgagcaggctgagctgggccgcctttccccacgagcctacacggccccacctgcctgccagccacccatggagcctgagaaccttgacctccagtccccaaccaagctgagtgccagcggggaggactccaccatcccacaagccagccggctcaataacatcgttaacaggtccatgacgggctctccccgcagcagcagcgagagccactcaccactctacatgcaccccccgaagtgcacgtcctgcggctctcagtccccacagcatgcagagatgtgcctccacaccgctggccccacgttccctgaggagatgggagagacccagtctgagtactcagattctagctgtgagaacggggccttcttctgcaatgagtgtgactgccgcttctctgaggaggcctcactcaagaggcacacgctgcagacccacagtgacaaaccctacaagtgtgaccgctgccaggcctccttccgctacaagggcaacctcgccagccacaagaccgtccataccggtgagaaaccctatcgttgcaacatctgtggggcccagttcaaccggccagccaacctgaaaacccacactcgaattcactctggagagaagccctacaaatgcgaaacctgcggagccagatttgtacaggtggcccacctccgtgcccatgtgcttatccacactggtgagaagccctatccctgtgaaatctgtggcacccgtttccggcaccttcagactctgaagagccacctgcgaatccacacaggagagaaaccttaccattgtgagaagtgtaacctgcatttccgtcacaaaagccagctgcgacttcacttgcgccagaagcatggcgccatcaccaacaccaaggtgcaataccgcgtgtcagccactgacctgcctccggagctccccaaagcctgc (配列番号2)
変異BCL6のaa配列(ロイシン変異に下線を引いている):
MASPADSCIQFTRHASDVLLNLNRLRSRDILTDVVIVVSREQFRAHKTVLMACSGLFYSIFTDQLKCNLSVINLDPEINPEGFCILLDFMYTSRLNLREGNIMAVMATAMYLQMEHVVDTCRKFIKASEAEMVSAIKPPREEFLNSRMLMPQDIMAYRGREVVENNLPLRSAPGCESRAFAPSLYSGLSTPPASYSMYSHLPVSSLLFSDEEFRDVRMPVANPFPKERALPCDSARPVPGEYSRPTLEVSPNVCHSNIYSPKETIPEEARSDMHYSVAEGLKPAAPSARNAPYFPCDKASKEEERPSSEDEIALHFEPPNAPLNRKGLVSPQSPQKSDCQPNSPTESCSSKNACILQASGSPPAKSPTDPKACNWKKYKFIVLNSLNQNAKPEGEQAELGRLSPRAYTAPPACQPPMEPENLDLQSPTKLSASGEDSTIPQASRLNNIVNRSMTGSPRSSSESHSPLYMHPPKCTSCGSQSPQHAEMCLHTAGPTFPEEMGETQSEYSDSSCENGAFFCNECDCRFSEEASLKRHTLQTHSDKPYKCDRCQASFRYKGNLASHKTVHTGEKPYRCNICGAQFNRPANLKTHTRIHSGEKPYKCETCGARFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCEICGTRFRHLQTLKSHLRIHTGEKPYHCEKCNLHFRHKSQLRLHLRQKHGAITNTKVQYRVSATDLPPELPKAC (配列番号3)
変異BCL6のヌクレオチド配列(ロイシンに対するコドンに下線を引いている):
ATGgcctcgccggctgacagctgtatccagttcacccgccatgccagtgatgttcttctcaaccttaatcgtctccggagtcgagacatcttgactgatgttgtcattgttgtgagccgtgagcagtttagagcccataaaacggtcctcatggcctgcagtggcctgttctatagcatctttacagaccagttgaaatgcaaccttagtgtgatcaatctagatcctgagatcaaccctgagggattctgcatcctcctggacttcatgtacacatctcggctcaatttgcgggagggcaacatcatggctgtgatggccacggctatgtacctgcagatggagcatgttgtggacacttgccggaagtttattaaggccagtgaagcagagatggtttctgccatcaagcctcctcgtgaagagttcctcaacagccggatgctgatgccccaagacatcatggcctatcggggtcgtgaggtggtggagaacaacctgccactgaggagcgcccctgggtgtgagagcagagcctttgcccccagcctgtacagtggcctgtccacaccgccagcctcttattccatgtacagccacctccctgtcagcagcctcctcttctccgatgaggagtttcgggatgtccggatgcctgtggccaaccccttccccaaggagcgggcactcccatgtgatagtgccaggccagtccctggtgagtacagccggccgactttggaggtgtcccccaatgtgtgccacagcaatatctattcacccaaggaaacaatcccagaagaggcacgaagtgatatgcactacagtgtggctgagggcctcaaacctgctgccccctcagcccgaaatgccccctacttcccttgtgacaaggccagcaaagaagaagagagaccctcctcggaagatgagattgccctgcatttcgagccccccaatgcacccctgaaccggaagggtctggttagtccacagagcccccagaaatctgactgccagcccaactcgcccacagagtcctgcagcagtaagaatgcctgcatcctccaggcttctggctcccctccagccaagagccccactgaccccaaagcctgcaactggaagaaatacaagttcatcgtgctcaacagcctcaaccagaatgccaaaccagaggggcTtgagcaggctgagctgggccgcctttccccacgagcctacacggccccacctgcctgccagccacccatggagcctgagaaccttgacctccagtccccaaccaagctgagtgccagcggggaggactccaccatcccacaagccagccggctcaataacatcgttaacaggtccatgacgggctctccccgcagcagcagcgagagccactcaccactctacatgcaccccccgaagtgcacgtcctgcggctctcagtccccacagcatgcagagatgtgcctccacaccgctggccccacgttccctgaggagatgggagagacccagtctgagtactcagattctagctgtgagaacggggccttcttctgcaatgagtgtgactgccgcttctctgaggaggcctcactcaagaggcacacgctgcagacccacagtgacaaaccctacaagtgtgaccgctgccaggcctccttccgctacaagggcaacctcgccagccacaagaccgtccataccggtgagaaaccctatcgttgcaacatctgtggggcccagttcaaccggccagccaacctgaaaacccacactcgaattcactctggagagaagccctacaaatgcgaaacctgcggagccagatttgtacaggtggcccacctccgtgcccatgtgcttatccacactggtgagaagccctatccctgtgaaatctgtggcacccgtttccggcaccttcagactctgaagagccacctgcgaatccacacaggagagaaaccttaccattgtgagaagtgtaacctgcatttccgtcacaaaagccagctgcgacttcacttgcgccagaagcatggcgccatcaccaacaccaaggtgcaataccgcgtgtcagccactgacctgcctccggagctccccaaagcctgc (配列番号4)
上記免疫細胞は、T細胞(例えば、制御性T細胞、CD4T細胞、CD8T細胞、アルファベータT細胞、ガンマ-デルタT細胞またはそれらの混合物)、NK細胞、インバリアントNKT細胞、NKT細胞、自然リンパ球系細胞またはそれらの混合物を含む任意の種類の免疫細胞であってよい。それらの免疫細胞は、ウイルス特異的であり得、CARを発現し得、かつ/またはTCRを発現し得る。いくつかの実施形態において、それらの細胞は、単球または顆粒球、例えば、骨髄性細胞、マクロファージ、好中球、樹状細胞(DC)、マスト細胞、好酸球および/または好塩基球である。それらの免疫細胞を作製および操作する方法、ならびに養子細胞療法のためにそれらの細胞を使用および投与する方法(この場合、それらの細胞は自己または同種異系であり得る)も本明細書中に提供される。したがって、それらの免疫細胞は、癌細胞を標的化するためなどの免疫療法として使用され得る。これらの免疫細胞は、単一の細胞型として、または複数の免疫細胞型の組み合わせとして、治療に使用され得る。具体的な実施形態において、それらの免疫細胞は、CD3+、CD4+、CD8+、CD16+またはそれらの混合物である。
上記免疫細胞は、被験体、特にヒト被験体から単離され得る。それらの免疫細胞は、目的の被験体(例えば、特定の疾患もしくは状態を有すると疑われる被験体、特定の疾患もしくは状態の素因を有すると疑われる被験体、または特定の疾患もしくは状態に対する治療を受けている被験体)から得ることができる。免疫細胞は、それらが被験体内に存在する任意の位置から回収することができ、それらの位置としては、血液、臍帯血、脾臓、胸腺、リンパ節および骨髄が挙げられるが、これらに限定されない。単離された免疫細胞は、直接使用され得るか、または凍結などによって、ある時間にわたって保存され得る。
上記免疫細胞は、それらが存在する任意の組織から濃縮/精製されてもよく、それらの組織としては、血液(血液バンクまたは臍帯血バンクによって回収された血液を含む)、脾臓、骨髄、外科手技中に除去および/または露出された組織、ならびに生検手技を介して得られた組織が挙げられるが、これらに限定されない。免疫細胞を濃縮、単離および/または精製してくるされる組織/器官は、生存している被験体と生存していない被験体の両方から単離され得る。ここで、生存していない被験体は、臓器ドナーである。特定の実施形態において、免疫細胞は、末梢血または臍帯血などの血液から単離される。いくつかの態様において、臍帯血から単離された免疫細胞は、CD4陽性またはCD8陽性T細胞の抑制によって測定されるような、高い免疫調節能を有する。具体的な態様において、免疫細胞は、高い免疫調節能を求めて、プールされた血液、特に、プールされた臍帯血から単離される。プールされた血液は、2つ以上の起源(例えば、3、4、5、6、7、8、9、10個以上の起源(例えば、ドナー被験体))からの血液であり得る。
免疫細胞の集団は、治療を必要とする被験体または低い免疫細胞活性に関連する疾患に罹患している被験体から得ることができる。したがって、それらの細胞は、治療を必要とする被験体にとって自己であり得る。あるいは、免疫細胞の集団は、ドナー(例えば、部分的にもしくは完全に組織適合性適合ドナーまたは完全に組織適合性不適合ドナー)から得ることができる。その免疫細胞集団は、末梢血、臍帯血、骨髄、脾臓、または免疫細胞が前記被験体もしくはドナーに存在する他の任意の器官/組織から収集され得る。それらの免疫細胞は、被験体および/またはドナーのプール、例えば、プールされた臍帯血から単離され得る。
免疫細胞集団が、被験体とは異なるドナーから得られるとき、そのドナーは、同種異系であり得るが、但し、得られる細胞は、それらの細胞が被験体に導入可能であるという点で、被験体と適合している。同種異系ドナー細胞は、ヒト白血球抗原(HLA)が適合していてもよいし、そうでなくてもよい。
A.T細胞
いくつかの実施形態において、上記免疫細胞は、T細胞である。機能的な抗腫瘍エフェクター細胞の誘導、活性化および拡大のためのいくつかの基本的なアプローチが、過去20年で報告されてきた。これらとしては、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)などの自己細胞;自己DCもしくはPBMC、リンパ球、人工抗原提示細胞(APC)、またはT細胞リガンドおよび活性化抗体でコーティングされたビーズ、または標的細胞膜の捕捉によって単離された細胞を用いてエキソビボで活性化されたT細胞;抗宿主腫瘍T細胞レセプター(TCR)を天然に発現している同種異系細胞;および「T-ボディ」として知られる抗体様腫瘍認識能を示す腫瘍反応性TCR分子またはキメラTCR分子を発現するように遺伝的に再プログラムされたまたは「再指示された」非腫瘍特異的な自己細胞または同種異系細胞が挙げられる。これらのアプローチは、本明細書中に記載される方法において使用され得る、T細胞を調製および免疫化するための数多くのプロトコルの元となった。
いくつかの実施形態において、上記T細胞は、血液、骨髄、リンパ液、臍帯またはリンパ系器官に由来する。いくつかの態様において、それらの細胞は、ヒト細胞である。それらの細胞は、通常、初代細胞であり、例えば、被験体から直接単離された細胞、および/または被験体から単離され、凍結された細胞である。いくつかの実施形態において、それらの細胞には、T細胞または他の細胞型の1つ以上のサブセット(例えば、T細胞集団全体、CD4細胞、CD8細胞、およびそれらの部分集団、例えば、機能、活性化状態、成熟度、分化の可能性、拡大、再循環、局在化および/もしくは残存能、抗原特異性、抗原レセプターのタイプ、特定の器官もしくはコンパートメントに存在すること、マーカーもしくはサイトカイン分泌のプロファイル、ならびに/または分化の程度によって定義される部分集団)が含まれる。処置される被験体に関して、それらの細胞は、同種異系細胞および/または自己細胞であり得る。いくつかの態様において、既存技術などの場合、それらの細胞は、多能性および/または複能性である(例えば、人工多能性幹細胞(iPSC)などの幹細胞)。いくつかの実施形態において、上記方法は、被験体から細胞を単離する工程、それらを本明細書中に記載されるように調製、処理、培養および/または操作する工程、ならびに凍結保存の前または後にそれらを同じ患者に再導入する工程を含む。
T細胞(例えば、CD4および/またはCD8T細胞)のサブタイプおよび部分集団に含まれるのは、ナイーブT(T)細胞、エフェクターT細胞(TEFF)、メモリーT細胞およびそのサブタイプ(例えば、幹細胞メモリーT(TSC)、セントラルメモリーT(TC)、エフェクターメモリーT(TEM)または最終分化型エフェクターメモリーT細胞、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)、未熟T細胞、成熟T細胞、ヘルパーT細胞、細胞傷害性T細胞、粘膜関連インバリアントT(MAIT)細胞、内在性および獲得型(adaptive)の制御性T(Treg)細胞、ヘルパーT細胞(例えば、TH1細胞、TH2細胞、TH3細胞、TH17細胞、TH9細胞、TH22細胞、濾胞性ヘルパーT細胞)、アルファ/ベータT細胞およびガンマ/デルタT細胞である。
いくつかの実施形態において、T細胞集団の1つ以上は、表面マーカーなどの特異的マーカーが陽性であるかまたは特異的マーカーが陰性である細胞が濃縮されているか、または枯渇している。いくつかの場合において、そのようなマーカーは、ある特定のT細胞集団(例えば、非メモリー細胞)上に存在しないかまたは比較的低レベルでしか発現されないが、ある特定の他のT細胞集団(例えば、メモリー細胞)上には存在するかまたは比較的高レベルで発現されるマーカーである。
いくつかの実施形態において、T細胞は、非T細胞(例えば、B細胞、単球または他の白血球)上に発現されているマーカー(例えば、CD14)のネガティブ選択によってPBMCサンプルから分離される。いくつかの態様では、CD4またはCD8選択工程を用いることにより、CD4ヘルパーT細胞およびCD8細胞傷害性T細胞が分離される。そのようなCD4およびCD8集団は、1つ以上のナイーブ、メモリーおよび/またはエフェクターT細胞の部分集団上に発現されているまたは比較的高い程度に発現されているマーカーのポジティブまたはネガティブ選択によって、さらに部分集団にソーティングされ得る。
いくつかの実施形態において、CD8T細胞は、それぞれの部分集団に関連する表面抗原に基づくポジティブ選択またはネガティブ選択などによって、ナイーブ、セントラルメモリー、エフェクターメモリーおよび/またはセントラルメモリー幹細胞がさらに濃縮されるかまたは枯渇される。いくつかの実施形態において、セントラルメモリーT(TCM)細胞または幹細胞メモリー細胞の濃縮は、投与後の長期生存率、拡大および/または生着を改善するなどの有効性を高めるために行われ、これは、いくつかの態様において、そのような部分集団において特に頑健である。
いくつかの実施形態において、上記T細胞は、自己T細胞である。この方法では、腫瘍サンプルを患者から入手し、単一細胞の懸濁液を得る。その単一細胞の懸濁液は、任意の好適な様式で、例えば、機械的に(例えば、gentleMACSTMDissociator,Miltenyi Biotec,Auburn,Calif.を用いて腫瘍を脱凝集させて)または酵素的に(例えば、コラゲナーゼまたはDNase)得ることができる。腫瘍の酵素消化物の単一細胞の懸濁液を、インターロイキン-2(IL-2)中または他の成長因子中で培養する。
培養されたT細胞は、プールされ、急速に拡大され得る。約10~約14日間にわたる急速な拡大によって、抗原特異的T細胞の数が少なくとも約50倍(例えば、50、60、70、80、90もしくは100倍またはそれ以上)増加する。より好ましくは、約10~約14日間にわたる急速な拡大によって、少なくとも約200倍(例えば、200、300、400、500、600、700、800、900またはそれ以上)増加する。
当該分野で公知であるようないくつかの方法のうちのいずれかによって、拡大が達成され得る。例えば、T細胞は、フィーダーリンパ球と、インターロイキン-2(IL-2)またはインターロイキン-15(IL-15)のいずれか(IL-2が好ましい)との存在下において非特異的T細胞レセプター刺激を用いて容易に拡大され得る。その非特異的T細胞レセプター刺激は、およそ30ng/mlの、マウスモノクローナル抗CD3抗体であるOKT3(Ortho-McNeil(登録商標),Raritan,N.J.から入手可能)を含み得る。あるいは、T細胞は、T細胞成長因子(例えば、300IU/mlのIL-2またはIL-15(IL-2が好ましい))の存在下において1つ以上の癌抗原(エピトープなどのその抗原性部分、または細胞を含む)で末梢血単核球(PBMC)をインビトロにおいて刺激することによって容易に拡大され得、その癌抗原は、必要に応じてベクターから発現され得、例えば、ヒト白血球抗原A2(HLA-A2)結合ペプチドまたは他のMHCクラスIもしくはクラスII分子に結合するペプチドである。そのインビトロで誘導されたT細胞は、HLA-A2を発現している抗原提示細胞または他のHLA分子を発現している抗原提示細胞に対してパルスされた同じ癌抗原による再刺激によって急速に拡大される。そのインビトロで誘導されたT細胞は、抗原提示細胞の非存在下においても拡大され得る。
上記自己T細胞は、それらの自己T細胞の成長、分化および活性化を促進するT細胞成長因子またはT細胞分化因子を発現するように改変され得る。好適なT細胞成長因子としては、例えば、インターロイキン(IL)-2、IL-7、IL-15、IL-18、IL-21およびIL-12が挙げられる。好適な改変方法は、当該分野で公知である。例えば、Sambrook et al.,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,3rd ed.,Cold Spring Harbor Press,Cold Spring Harbor,N.Y.2001;およびAusubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology,Greene Publishing Associates and John Wiley & Sons,NY,1994を参照のこと。特定の態様において、改変された自己T細胞は、T細胞成長因子を高レベルで発現する。T細胞成長因子コード配列(例えば、IL-12のコード配列)は、T細胞成長因子コード配列への作動可能な連結が高レベル発現を促進するプロモーターと同様に、当該分野において容易に入手可能である。
B.NK細胞
いくつかの実施形態において、上記免疫細胞は、ナチュラルキラー(NK)細胞である。NK細胞は、種々の腫瘍細胞、ウイルスに感染した細胞、ならびに骨髄および胸腺における一部の正常細胞に対して自発的な細胞傷害性を有するリンパ球の部分集団である。NK細胞は、骨髄、リンパ節、脾臓、扁桃および胸腺において分化し、成熟する。NK細胞は、ヒトにおいては、CD16、CD56および/またはCD8などの特定の表面マーカーによって検出され得る。NK細胞は、T細胞抗原レセプター、汎TマーカーCD3、または表面免疫グロブリンB細胞レセプターを発現しない。
ある特定の実施形態において、NK細胞は、当該分野で周知の方法によってヒト末梢血単核球(PBMC)、未刺激の白血球搬出法生成物(PBSC)、ヒト胚性幹細胞(hESC)、人工多能性幹細胞(iPSC)、骨髄、組織または臍帯血から得られる。
C.NKT細胞
ナチュラルキラーT(NKT)細胞は、T細胞とナチュラルキラー細胞の両方の特性を共有する不均一なT細胞群である。これらの細胞の多くは、自己および外来性の脂質および糖脂質に結合する抗原提示分子である非多形性CD1d分子を認識する。それらは、全末梢血T細胞のおよそ0.1%しか占めない。NKT細胞は、αβT細胞レセプターを共発現するが、典型的にはNK1.1などのNK細胞と関連する種々の分子マーカーも発現する、T細胞のサブセットである。インバリアントナチュラルキラーT(iNKT)細胞は、転写制御因子である前骨髄球性白血病ジンクフィンガーを高レベルで発現し、それらの細胞の発達は、その転写制御因子に左右される。現在、5つの主要な異なるiNKT細胞サブセットが存在する。これらのサブセット細胞は、活性化されると、異なるサイトカインセットを産生する。サブタイプiNKT1、iNKT2およびiNKT17は、サイトカイン産生がTh細胞サブセットに酷似している。さらに、T濾胞性ヘルパー様機能およびIL-10依存性制御機能に特化したサブタイプも存在する。
D.自然リンパ球系細胞
自然リンパ球系細胞(ILC)は、リンパ球系共通前駆細胞(CLP)に由来し、リンパ系に属する、自然免疫細胞の一群である。これらの細胞は、組換え活性化遺伝子(RAG)を欠くので、抗原特異的BまたはT細胞レセプターが存在しないことによって定義される。ILCは、骨髄マーカーまたは樹状細胞マーカーを発現しない。それらは、防御免疫ならびにホメオスタシスおよび炎症の制御において役割を果たすので、それらの調節不全は、アレルギー、気管支喘息および自己免疫疾患などの免疫病理につながり得る。ILCは、それらが産生し得るサイトカインならびにそれらの発達および機能を制御する転写因子に基づいて分けられ得る。
III.無限免疫細胞の作製
いくつかの態様において、本開示は、BCL6および1つ以上の生存促進性遺伝子または抗アポトーシス遺伝子または細胞生存促進遺伝子(Bxl-xLなどの1つ以上の抗アポトーシスBCL-2ファミリー遺伝子を含む)の過剰発現によって免疫細胞の寿命を延長する方法を提供する。その遺伝子発現は、従来の分子生物学の方法(例えば、1つ以上のウイルスベクターまたは非ウイルスベクターにおいて構成的プロモーターまたは誘導性プロモーターの下流にBCL6および抗アポトーシスBCL-2ファミリー遺伝子のコード配列をクローニングすること、ならびにそれらのベクターを上記免疫細胞に送達すること)によって達成され得る。あるいは、その遺伝子発現は、CRISPRまたは他のトランスポザーゼを使用して、BCL6および抗アポトーシスBCL-2ファミリー遺伝子(一例として)のmRNAを上記免疫細胞において特異的に転写することによって達成され得る。BCL6および/または抗アポトーシスBCL-2ファミリーメンバー(例えば、Bcl-xL)の発現は、構成的なまたは誘導性の手段であり得ることを含めて、制御可能であり得る。いくつかの場合において、BCL6および/または抗アポトーシスBCL-2ファミリーメンバーの発現は、第1のタイプの発現制御(例えば、構成的)を有することがあり、その系における1つ以上の他の遺伝子(例えば、同じまたは別のベクター上にある遺伝子)の発現は、同じ様式(例えば、構成的な様式)で、または異なって(例えば、誘導性の様式で)制御され得る。具体的な場合において、BCL6-BCL-xLは、tet-off制御機構またはtet-on制御機構によって制御される。
1つの例示的な方法では、BCL6遺伝子のコード配列とBcl-xL遺伝子(単なる例)のコード配列とをつなげることができるが、それらは、最終的にBCL6分子とBcl-xL分子とが別個に生成されるのを可能にするエレメントによって隔てられ得る。例えば、BCL6遺伝子のコード配列とBcl-xL遺伝子のコード配列とをつなげることができるが、それらは、BCL6遺伝子とBcl-xL遺伝子とを同時に発現できる1つのオープンリーディングフレームをもたらすようにT2A配列によって隔てられ得る。このBCL6-T2A-Bcl-xLオープンリーディングフレームは、レンチウイルスベクターなどのベクターにクローニングされ得る。次いで、そのウイルスベクターによって、例えば、IL-2および/またはIL-15の存在下において、T細胞などの上記免疫細胞に形質導入され得る。この方法により、組換えヒトIL-2および/またはIL-15の存在下において増殖できる「無限T細胞」と称されるT細胞株が健康ドナーのT細胞から作製され得る。いくつかの場合において、これらの細胞は、IL-2および/またはIL-15の存在下において作製され、それらの細胞自身も異種IL-2および/またはIL-15を発現するが、他の場合では、これらのパラメータのうちの1つだけが使用される。
自己切断配列の例は、以下のとおりである:
T2A (GSG)EGRGSLLTCGDVEENPGP(配列番号5)
P2A (GSG)ATNFSLLKQAGDVEENPGP(配列番号6)
E2A (GSG)QCTNYALLKLAGDVESNPGP(配列番号7)
F2A (GSG)VKQTLNFDLLKLAGDVESNPGP(配列番号8)
他の場合では、2A配列の代わりにIRESエレメントが使用される。
いくつかの実施形態において、上記細胞は、ヒトBCL6、2A自己切断ペプチドおよびBCL-xlコード配列を含むBCL6-2A-BCLxL配列(配列番号9)を発現するように操作されている。
ATGgcctcgccggctgacagctgtatccagttcacccgccatgccagtgatgttcttctcaaccttaatcgtctccggagtcgagacatcttgactgatgttgtcattgttgtgagccgtgagcagtttagagcccataaaacggtcctcatggcctgcagtggcctgttctatagcatctttacagaccagttgaaatgcaaccttagtgtgatcaatctagatcctgagatcaaccctgagggattctgcatcctcctggacttcatgtacacatctcggctcaatttgcgggagggcaacatcatggctgtgatggccacggctatgtacctgcagatggagcatgttgtggacacttgccggaagtttattaaggccagtgaagcagagatggtttctgccatcaagcctcctcgtgaagagttcctcaacagccggatgctgatgccccaagacatcatggcctatcggggtcgtgaggtggtggagaacaacctgccactgaggagcgcccctgggtgtgagagcagagcctttgcccccagcctgtacagtggcctgtccacaccgccagcctcttattccatgtacagccacctccctgtcagcagcctcctcttctccgatgaggagtttcgggatgtccggatgcctgtggccaaccccttccccaaggagcgggcactcccatgtgatagtgccaggccagtccctggtgagtacagccggccgactttggaggtgtcccccaatgtgtgccacagcaatatctattcacccaaggaaacaatcccagaagaggcacgaagtgatatgcactacagtgtggctgagggcctcaaacctgctgccccctcagcccgaaatgccccctacttcccttgtgacaaggccagcaaagaagaagagagaccctcctcggaagatgagattgccctgcatttcgagccccccaatgcacccctgaaccggaagggtctggttagtccacagagcccccagaaatctgactgccagcccaactcgcccacagagtcctgcagcagtaagaatgcctgcatcctccaggcttctggctcccctccagccaagagccccactgaccccaaagcctgcaactggaagaaatacaagttcatcgtgctcaacagcctcaaccagaatgccaaaccagaggggcctgagcaggctgagctgggccgcctttccccacgagcctacacggccccacctgcctgccagccacccatggagcctgagaaccttgacctccagtccccaaccaagctgagtgccagcggggaggactccaccatcccacaagccagccggctcaataacatcgttaacaggtccatgacgggctctccccgcagcagcagcgagagccactcaccactctacatgcaccccccgaagtgcacgtcctgcggctctcagtccccacagcatgcagagatgtgcctccacaccgctggccccacgttccctgaggagatgggagagacccagtctgagtactcagattctagctgtgagaacggggccttcttctgcaatgagtgtgactgccgcttctctgaggaggcctcactcaagaggcacacgctgcagacccacagtgacaaaccctacaagtgtgaccgctgccaggcctccttccgctacaagggcaacctcgccagccacaagaccgtccataccggtgagaaaccctatcgttgcaacatctgtggggcccagttcaaccggccagccaacctgaaaacccacactcgaattcactctggagagaagccctacaaatgcgaaacctgcggagccagatttgtacaggtggcccacctccgtgcccatgtgcttatccacactggtgagaagccctatccctgtgaaatctgtggcacccgtttccggcaccttcagactctgaagagccacctgcgaatccacacaggagagaaaccttaccattgtgagaagtgtaacctgcatttccgtcacaaaagccagctgcgacttcacttgcgccagaagcatggcgccatcaccaacaccaaggtgcaataccgcgtgtcagccactgacctgcctccggagctccccaaagcctgcGGAAGCGGAGCTACTAACTTCAGCCTGCTGAAGCAGGCTGGAGACGTGGAGGAGAACCCTGGACCTAGATCTGGAATGTCTCAGAGCAACCGGGAGCTGGTGGTTGACTTTCTCTCCTACAAGCTTTCCCAGAAAGGATACAGCTGGAGTCAGTTTAGTGATGTGGAAGAGAACAGGACTGAGGCCCCAGAAGGGACTGAATCGGAGATGGAGACCCCCAGTGCCATCAATGGCAACCCATCCTGGCACCTGGCAGACAGCCCCGCGGTGAATGGAGCCACTGGCCACAGCAGCAGTTTGGATGCCCGGGAGGTGATCCCCATGGCAGCAGTAAAGCAAGCGCTGAGGGAGGCAGGCGACGAGTTTGAACTGCGGTACCGGCGGGCATTCAGTGACCTGACATCCCAGCTCCACATCACCCCAGGGACAGCATATCAGAGCTTTGAACAGGTAGTGAATGAACTCTTCCGGGATGGGGTAAACTGGGGTCGCATTGTGGCCTTTTTCTCCTTCGGCGGGGCACTGTGCGTGGAAAGCGTAGACAAGGAGATGCAGGTATTGGTGAGTCGGATCGCAGCTTGGATGGCCACTTACCTGAATGACCACCTAGAGCCTTGGATCCAGGAGAACGGCGGCTGGGATACTTTTGTGGAACTCTATGGGAACAATGCAGCAGCCGAGAGCCGAAAGGGCCAGGAACGCTTCAACCGCTGGTTCCTGACGGGCATGACTGTGGCCGGCGTGGTTCTGCTGGGCTCACTCTTCAGTCGGAAAtgA-3 (SEQ ID NO:9)
BCL6およびBcl-xLを含む発現構築物の別の例が下記である。一重下線部がBCL6であり、下線のない部分がP2Aであり、二重下線部がBcL-xLである:
Figure 2022545466000002
Bcl-xlとともにBCL6を含む構築物(L5x(MSCV-BCL6-P2A-BCL-xl-T2A-rtTA);図21を参照のこと)の例が下記である。一般構造は、以下のとおりである:
NNNN-CMVプロモーターNN-HIV-LTR-HIV1_プシーパック-スペーサー-RRE-スペーサー-cPPT-MSCVプロモーター-BCL-6 WT-P2A-BCL-xL-T2A-rtTA-WPRE-U3PPT-HIV-LTR-bGH pA-SV40複製開始点-プラスミド複製開始点-Ampicin耐性遺伝子-AmpR_プロモーター-NNNN。下記(および図21)の構築物の特定のドメインの具体的な配列は、下記の配列番号11のすぐ後に示す:
GTCGACGGATCGGGAGATCTCCCGATCCCCTATGGTGCACTCTCAGTACAATCTGCTCTGATGCCGCATAGTTAAGCCAGTATCTGCTCCCTGCTTGTGTGTTGGAGGTCGCTGAGTAGTGCGCGAGCAAAATTTAAGCTACAACAAGGCAAGGCTTGACCGACAATTGCATGAAGAATCTGCTTAGGGTTAGGCGTTTTGCGCTGCTTCGCGATGTACGGGCCAGATATtCGCGTTGACATTGATTATTGACTAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGAGTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGTGATGCGGTTTTGGCAGTACATCAATGGGCGTGGATAGCGGTTTGACTCACGGGGATTTCCAAGTCTCCACCCCATTGACGTCAATGGGAGTTTGTTTTGGCACCAAAATCAACGGGACTTTCCAAAATGTCGTAACAACTCCGCCCCATTGACGCAAATGGGCGGTAGGCGTGTACGGTGGGAGGTCTATATAAGCAGCGCGTTTTGCCTGTACTGGGTCTCTCTGGTTAGACCAGATCTGAGCCTGGGAGCTCTCTGGCTAACTAGGGAACCCACTGCTTAAGCCTCAATAAAGCTTGCCTTGAGTGCTTCAAGTAGTGTGTGCCCGTCTGTTGTGTGACTCTGGTAACTAGAGATCCCTCAGACCCTTTTAGTCAGTGTGGAAAATCTCTAGCAGTGGCGCCCGAACAGGGACTTGAAAGCGAAAGGGAAACCAGAGGAGCTCTCTCGACGCAGGACTCGGCTTGCTGAAGCGCGCACGGCAAGAGGCGAGGGGCGGCGACTGGTGAGTACGCCAAAAATTTTGACTAGCGGAGGCTAGAAGGAGAGAGATGGGTGCGAGAGCGTCAGTATTAAGCGGGGGAGAATTAGATCGCGATGGGAAAAAATTCGGTTAAGGCCAGGGGGAAAGAAAAAATATAAATTAAAACATATAGTATGGGCAAGCAGGGAGCTAGAACGATTCGCAGTTAATCCTGGCCTGTTAGAAACATCAGAAGGCTGTAGACAAATACTGGGACAGCTACAACCATCCCTTCAGACAGGATCAGAAGAACTTAGATCATTATATAATACAGTAGCAACCCTCTATTGTGTGCATCAAAGGATAGAGATAAAAGACACCAAGGAAGCTTTAGACAAGATAGAGGAAGAGCAAAACAAAAGTAAGACCACCGCACAGCAAGCGGCCGCTGATCTTCAGACCTGGAGGAGGAGATATGAGGGACAATTGGAGAAGTGAATTATATAAATATAAAGTAGTAAAAATTGAACCATTAGGAGTAGCACCCACCAAGGCAAAGAGAAGAGTGGTGCAGAGAGAAAAAAGAGCAGTGGGAATAGGAGCTTTGTTCCTTGGGTTCTTGGGAGCAGCAGGAAGCACTATGGGCGCAGCGTCAATGACGCTGACGGTACAGGCCAGACAATTATTGTCTGGTATAGTGCAGCAGCAGAACAATTTGCTGAGGGCTATTGAGGCGCAACAGCATCTGTTGCAACTCACAGTCTGGGGCATCAAGCAGCTCCAGGCAAGAATCCTGGCTGTGGAAAGATACCTAAAGGATCAACAGCTCCTGGGGATTTGGGGTTGCTCTGGAAAACTCATTTGCACCACTGCTGTGCCTTGGAATGCTAGTTGGAGTAATAAATCTCTGGAACAGATTTGGAATCACACGACCTGGATGGAGTGGGACAGAGAAATTAACAATTACACAAGCTTAATACACTCCTTAATTGAAGAATCGCAAAACCAGCAAGAAAAGAATGAACAAGAATTATTGGAATTAGATAAATGGGCAAGTTTGTGGAATTGGTTTAACATAACAAATTGGCTGTGGTATATAAAATTATTCATAATGATAGTAGGAGGCTTGGTAGGTTTAAGAATAGTTTTTGCTGTACTTTCTATAGTGAATAGAGTTAGGCAGGGATATTCACCATTATCGTTTCAGACCCACCTCCCAACCCCGAGGGGACCCGACAGGCCCGAAGGAATAGAAGAAGAAGGTGGAGAGAGAGACAGAGACAGATCCATTCGATTAGTGAACGGATCGGCACTGCGTGCGCCAATTCTGCAGACAAATGGCAGTATTCATCCACAATTTTAAAAGAAAAGGGGGGATTGGGGGGTACAGTGCAGGGGAAAGAATAGTAGACATAATAGCAACAGACATACAAACTAAAGAATTACAAAAACAAATTACAAAAATTCAAAATTTTCGGGTTTATTACAGGGACAGCAGAGATCCAGTTTGGTTAATtaatgaaagaccccacctgtaggtttggcaagctagcttaagtaacgccattttgcaaggcatggaaaatacataactgagaatagagaagttcagatcaaggttaggaacagagagacagcagaatatgggccaaacaggatatctgtggtaagcagttcctgccccggctcagggccaagaacagatggtccccagatgcggtcccgccctcagcagtttctagagaaccatcagatgtttccagggtgccccaaggacctgaaatgaccctgtgccttatttgaactaaccaatcagttcgcttctcgcttctgttcgcgcgcttctgctccccgagctcaataaaagagcccacaacccctcactcggcgcgccagtcctccgatagactgcgtcgcccgggtacccgtattcccaataaagcctcttgctgtttgcatccgaatcgtggactcgctgatccttgggagggtctcctcagattgattgactgcccacctcgggggtctttcatcctaGGCTAGCcaccATGgcctcgccggctgacagctgtatccagttcacccgccatgccagtgatgttcttctcaaccttaatcgtctccggagtcgagacatcttgactgatgttgtcattgttgtgagccgtgagcagtttagagcccataaaacggtcctcatggcctgcagtggcctgttctatagcatctttacagaccagttgaaatgcaaccttagtgtgatcaatctagatcctgagatcaaccctgagggattctgcatcctcctggacttcatgtacacatctcggctcaatttgcgggagggcaacatcatggctgtgatggccacggctatgtacctgcagatggagcatgttgtggacacttgccggaagtttattaaggccagtgaagcagagatggtttctgccatcaagcctcctcgtgaagagttcctcaacagccggatgctgatgccccaagacatcatggcctatcggggtcgtgaggtggtggagaacaacctgccactgaggagcgcccctgggtgtgagagcagagcctttgcccccagcctgtacagtggcctgtccacaccgccagcctcttattccatgtacagccacctccctgtcagcagcctcctcttctccgatgaggagtttcgggatgtccggatgcctgtggccaaccccttccccaaggagcgggcactcccatgtgatagtgccaggccagtccctggtgagtacagccggccgactttggaggtgtcccccaatgtgtgccacagcaatatctattcacccaaggaaacaatcccagaagaggcacgaagtgatatgcactacagtgtggctgagggcctcaaacctgctgccccctcagcccgaaatgccccctacttcccttgtgacaaggccagcaaagaagaagagagaccctcctcggaagatgagattgccctgcatttcgagccccccaatgcacccctgaaccggaagggtctggttagtccacagagcccccagaaatctgactgccagcccaactcgcccacagagtcctgcagcagtaagaatgcctgcatcctccaggcttctggctcccctccagccaagagccccactgaccccaaagcctgcaactggaagaaatacaagttcatcgtgctcaacagcctcaaccagaatgccaaaccagaggggcctgagcaggctgagctgggccgcctttccccacgagcctacacggccccacctgcctgccagccacccatggagcctgagaaccttgacctccagtccccaaccaagctgagtgccagcggggaggactccaccatcccacaagccagccggctcaataacatcgttaacaggtccatgacgggctctccccgcagcagcagcgagagccactcaccactctacatgcaccccccgaagtgcacgtcctgcggctctcagtccccacagcatgcagagatgtgcctccacaccgctggccccacgttccctgaggagatgggagagacccagtctgagtactcagattctagctgtgagaacggggccttcttctgcaatgagtgtgactgccgcttctctgaggaggcctcactcaagaggcacacgctgcagacccacagtgacaaaccctacaagtgtgaccgctgccaggcctccttccgctacaagggcaacctcgccagccacaagaccgtccataccggtgagaaaccctatcgttgcaacatctgtggggcccagttcaaccggccagccaacctgaaaacccacactcgaattcactctggagagaagccctacaaatgcgaaacctgcggagccagatttgtacaggtggcccacctccgtgcccatgtgcttatcc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acctgcatttccgtcacaaaagccagctgcgacttcacttgcgccagaagcatggcgccatcaccaacaccaaggtgcaataccgcgtgtcagccactgacctgcctccggagctccccaaagcctgcGGAAGCGGAGCTACTAACTTCAGCCTGCTGAAGCAGGCTGGAGACGTGGAGGAGAACCCTGGACCTAGATCTGGAATGTCTCAGAGCAACCGGGAGCTGGTGGTTGACTTTCTCTCCTACAAGCTTTCCCAGAAAGGATACAGCTGGAGTCAGTTTAGTGATGTGGAAGAGAACAGGACTGAGGCCCCAGAAGGGACTGAATCGGAGATGGAGACCCCCAGTGCCATCAATGGCAACCCATCCTGGCACCTGGCAGACAGCCCCGCGGTGAATGGAGCCACTGGCCACAGCAGCAGTTTGGATGCCCGGGAGGTGATCCCCATGGCAGCAGTAAAGCAAGCGCTGAGGGAGGCAGGCGACGAGTTTGAACTGCGGTACCGGCGGGCATTCAGTGACCTGACATCCCAGCTCCACATCACCCCAGGGACAGCATATCAGAGCTTTGAACAGGTAGTGAATGAACTCTTCCGGGATGGGGTAAACTGGGGTCGCATTGTGGCCTTTTTCTCCTTCGGCGGGGCACTGTGCGTGGAAAGCGTAGACAAGGAGATGCAGGTATTGGTGAGTCGGATCGCAGCTTGGATGGCCACTTACCTGAATGACCACCTAGAGCCTTGGATCCAGGAGAACGGCGGCTGGGATACTTTTGTGGAACTCTATGGGAACAATGCAGCAGCCGAGAGCCGAAAGGGCCAGGAACGCTTCAACCGCTGGTTCCTGACGGGCATGACTGTGGCCGGCGTGGTTCTGCTGGGCTCACTCTTCAGTCGGAAAACGCGTGGCAGTggcgagggtagaggttctctcctcacttgtggtgatgttgaagaaaaccctggtccaatgtctagactggacaagagcaaagtcataaacggagctctggaattactcaatggtgtcggtatcgaaggcctgacgacaaggaaactcgctcaaaagctgggagttgagcagcctaccctgtactggcacgtgaagaacaagcgggccctgctcgatgccctgccaatcgagatgctggacaggcatcatacccacttctgccccctggaaggcgagtcatggcaagactttctgcggaacaacgccaagtcataccgctgtgctctcctctcacatcgcgacggggctaaagtgcatctcggcacccgcccaacagagaaacagtacgaaaccctggaaaatcagctcgcgttcctgtgtcagcaaggcttctccctggagaacgcactgtacgctctgtccgccgtgggccactttacactgggctgcgtattggaggaacaggagcatcaagtagcaaaagaggaaagagagacacctaccaccgattctatgcccccacttctgagacaagcaattgagctgttcgaccggcagggagccgaacctgccttccttttcggcctggaactaatcatatgtggcctggagaaacagctaaagtgcgaaagcggcgggccgaccgacgcccttgacgattttgacttagacatgctcccagccgatgcccttgacgactttgaccttgatatgctgcctgctgacgctcttgacgattttgaccttgacatgctccccgggtaaGGTgACCGATATCAAGCTTATCGATAATCAACCTCTGGATTACAAAATTTGTGAAAGATTGACTGGTATTCTTAACTATGTTGCTCCTTTTACGCTATGTGGATACGCTGCTTTAATGCCTTTGTATCATGCTATTGCTTCCCGTATGGCTTTCATTTTCTCCTCCTTGTATAAATCCTGGTTGCTGTCTCTTTATGAGGAGTTGTGGCCCGTTGTCAGGCAACGTGGCGTGGTGTGCACTGTGTTTGCTGACGCAACCCCCACTGGTTGGGGCATTGCCACCACCTGTCAGCTCCTTTCCGGGACTTTCGCTTTCCCCCTCCCTATTGCCACGGCGGAACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGGACAGGGGCTCGGCTGTTGGGCACTGACAATTCCGTGGTGTTGTCGGGGAAATCATCGTCCTTTCCTTGGCTGCTCGCCTGTGTTGCCACCTGGATTCTGCGCGGGACGTCCTTCTGCTACGTCCCTTCGGCCCTCAATCCAGCGGACCTTCCTTCCCGCGGCCTGCTGCCGGCTCTGCGGCCTCTTCCGCGTCTTCGCCTTCGCCCTCAGACGAGTCGGATCTCCCTTTGGGCCGCCTCCCCGCACTCGAGACCTAGAAAAACATGGAGCAATCACAAGTAGCAATACAGCAGCTACCAATGCTGATTGTGCCTGGCTAGAAGCACAAGAGGAGGAGGAGGTGGGTTTTCCAGTCACACCTCAGGTACCTTTAAGACCAATGACTTACAAGGCAGCTGTAGATCTTAGCCACTTTTTAAAAGAAAAGGGGGGACTGGAAGGGCTAATTCACTCCCAACGAAGACAAGATATCCTTGATCTGTGGATCTACCACACACAAGGCTACTTCCCTGATTGGCAGAACTACACACCAGGGCCAGGGATCAGATATCCACTGACCTTTGGATGGTGCTACAAGCTAGTACCAGTTGAGCAAGAGAAGGTAGAAGAAGCCAATGAAGGAGAGAACACCCGCTTGTTACACCCTGTGAGCCTGCATGGGATGGATGACCCGGAGAGAGAAGTATTAGAGTGGAGGTTTGACAGCCGCCTAGCATTTCATCACATGGCCCGAGAGCTGCATCCGGACTGTACTGGGTCTCTCTGGTTAGACCAGATCTGAGCCTGGGAGCTCTCTGGCTAACTAGGGAACCCACTGCTTAAGCCTCAATAAAGCTTGCCTTGAGTGCTTCAAGTAGTGTGTGCCCGTCTGTTGTGTGACTCTGGTAACTAGAGATCCCTCAGACCCTTTTAGTCAGTGTGGAAAATCTCTAGCAGGGCCCGTTTAAACCCGCTGATCAGCCTCGACTGTGCCTTCTAGTTGCCAGCCATCTGTTGTTTGCCCCTCCCCCGTGCCTTCCTTGACCCTGGAAGGTGCCACTCCCACTGTCCTTTCCTAATAAAATGAGGAAATTGCATCGCATTGTCTGAGTAGGTGTCATTCTATTCTGGGGGGTGGGGTGGGGCAGGACAGCAAGGGGGAGGATTGGGAAGACAATAGCAGGCATGCTGGGGATGCGGTGGGCTCTATGGCATGTCTatcccgcccctaactccgcccagttccgcccattctccgccccatggctgactaattttttttatttatgcagaggccgaggccgcctcggcctctgagctattccagaagtagtgaggaggcttttttggaggccGTATACCGTCGACCTCTAGCTAGAGCTTGGCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCTAACTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCGTATTGGGCGCTCTTCCGCTTCCTCGCTCACTGACTCGCTGCGCTCGGTCGTTCGGCTGCGGCGAGCGGTATCAGCTCACTCAAAGGCGGTAATACGGTTATCCACAGAATCAGGGGATAACGCAGGAAAGAACATGTGAGCAAAAGGCCAGCAAAAGGCCAGGAACCGTAAAAAGGCCGCGTTGCTGGCGTTTTTCCATAGGCTCCGCCCCCCTGACGAGCATCACAAAAATCGACGCTCAAGTCAGAGGTGGCGAAACCCGACAGGACTATAAAGATACCAGGCGTTTCCCCCTGGAAGCTCCCTCGTGCGCTCTCCTGTTCCGACCCTGCCGCTTACCGGATACCTGTCCGCCTTTCTCCCTTCGGGAAGCGTGGCGCTTTCTCATAGCTCACGCTGTAGGTATCTCAGTTCGGTGTAGGTCGTTCGCTCCAAGCTGGGCTGTGTGCACGAACCCCCCGTTCAGCCCGACCGCTGCGCCTTATCCGGTAACTATCGTCTTGAGTCCAACCCGGTAAGACACGACTTATCGCCACTGGCAGCAGCCACTGGTAACAGGATTAGCAGAGCGAGGTATGTAGGCGGTGCTACAGAGTTCTTGAAGTGGTGGCCTAACTACGGCTACACTAGAAGAACAGTATTTGGTATCTGCGCTCTGCTGAAGCCAGTTACCTTCGGAAAAAGAGTTGGTAGCTCTTGATCCGGCAAACAAACCACCGCTGGTAGCGGTGGTTTTTTTGTTTGCAAGCAGCAGATTACGCGCAGAAAAAAAGGATCTCAAGAAGATCCTTTGATCTTTTCTACGGGGTCTGACGCTCAGTGGAACGAAAACTCACGTTAAGGGATTTTGGTCATGAGATTATCAAAAAGGATCTTCACCTAGATCCTTTTAAATTAAAAATGAAGTTTTAAATCAATCTAAAGTATATATGAGTAAACTTGGTCTGACAGTTACCAATGCTTAATCAGTGAGGCACCTATCTCAGCGATCTGTCTATTTCGTTCATCCATAGTTGCCTGACTCCCCGTCGTGTAGATAACTACGATACGGGAGGGCTTACCATCTGGCCCCAGTGCTGCAATGATACCGCGAGACCCACGCTCACCGGCTCCAGATTTATCAGCAATAAACCAGCCAGCCGGAAGGGCCGAGCGCAGAAGTGGTCCTGCAACTTTATCCGCCTCCATCCAGTCTATTAATTGTTGCCGGGAAGCTAGAGTAAGTAGTTCGCCAGTTAATAGTTTGCGCAACGTTGTTGCCATTGCTACAGGCATCGTGGTGTCACGCTCGTCGTTTGGTATGGCTTCATTCAGCTCCGGTTCCCAACGATCAAGGCGAGTTACATGATCCCCCATGTTGTGCAAAAAAGCGGTTAGCTCCTTCGGTCCTCCGATCGTTGTCAGAAGTAAGTTGGCCGCAGTGTTATCACTCATGGTTATGGCAGCACT
GCATAATTCTCTTACTGTCATGCCATCCGTAAGATGCTTTTCTGTGACTGGTGAGTACTCAACCAAGTCATTCTGAGAATAGTGTATGCGGCGACCGAGTTGCTCTTGCCCGGCGTCAATACGGGATAATACCGCGCCACATAGCAGAACTTTAAAAGTGCTCATCATTGGAAAACGTTCTTCGGGGCGAAAACTCTCAAGGATCTTACCGCTGTTGAGATCCAGTTCGATGTAACCCACTCGTGCACCCAACTGATCTTCAGCATCTTTTACTTTCACCAGCGTTTCTGGGTGAGCAAAAACAGGAAGGCAAAATGCCGCAAAAAAGGGAATAAGGGCGACACGGAAATGTTGAATACTCATACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATGTATTTAGAAAAATAAACAAATAGGGGTTCCGCGCACATTTCCCCGAAAAGTGCCACCTGAC (配列番号11)
CMVプロモーター
ACATTGATTATTGACTAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGAGTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGTGATGCGGTTTTGGCAGTACATCAATGGGCGTGGATAGCGGTTTGACTCACGGGGATTTCCAAGTCTCCACCCCATTGACGTCAATGGGAGTTTGTTTTGGCACCAAAATCAACGGGACTTTCCAAAATGTCGTAACAACTCCGCCCCATTGACGCAAATGGGCGGTAGGCGTGTACGGTGGGAGGTCTATATAAGC (配列番号61)
HIV LTR
GGGTCTCTCTGGTTAGACCAGATCTGAGCCTGGGAGCTCTCTGGCTAACTAGGGAACCCACTGCTTAAGCCTCAATAAAGCTTGCCTTGAGTGCTTCAAGTAGTGTGTGCCCGTCTGTTGTGTGACTCTGGTAACTAGAGATCCCTCAGACCCTTTTAGTCAGTGTGGAAAATCTCTAGCA (配列番号62)
HIV1プシーパック
TGAGTACGCCAAAAATTTTGACTAGCGGAGGCTAGAAGGAGAGAG (配列番号63)
RRE
AGGAGCTTTGTTCCTTGGGTTCTTGGGAGCAGCAGGAAGCACTATGGGCGCAGCGTCAATGACGCTGACGGTACAGGCCAGACAATTATTGTCTGGTATAGTGCAGCAGCAGAACAATTTGCTGAGGGCTATTGAGGCGCAACAGCATCTGTTGCAACTCACAGTCTGGGGCATCAAGCAGCTCCAGGCAAGAATCCTGGCTGTGGAAAGATACCTAAAGGATCAACAGCTCCT (配列番号64)
cPPT
AAAAGAAAAGGGGGGA(配列番号65)
MSCVプロモーター
aatgaaagaccccacctgtaggtttggcaagctagcttaagtaacgccattttgcaaggcatggaaaatacataactgagaatagagaagttcagatcaaggttaggaacagagagacagcagaatatgggccaaacaggatatctgtggtaagcagttcctgccccggctcagggccaagaacagatggtccccagatgcggtcccgccctcagcagtttctagagaaccatcagatgtttccagggtgccccaaggacctgaaatgaccctgtgccttatttgaactaaccaatcagttcgcttctcgcttctgttcgcgcgcttctgctccccgagctcaataaaagagcccacaacccctcactcggcgcgccagtcctccgatagactgcgtcgcccgggtacccgtattcccaataaagcctcttgctgtttgcatccgaatcgtggactcgctgatccttgggagggtctcctcagattgattgactgcccacctcgggggtctttcat(配列番号66)
BCL-6 WT
ATGgcctcgccggctgacagctgtatccagttcacccgccatgccagtgatgttcttctcaaccttaatcgtctccggagtcgagacatcttgactgatgttgtcattgttgtgagccgtgagcagtttagagcccataaaacggtcctcatggcctgcagtggcctgttctatagcatctttacagaccagttgaaatgcaaccttagtgtgatcaatctagatcctgagatcaaccctgagggattctgcatcctcctggacttcatgtacacatctcggctcaatttgcgggagggcaacatcatggctgtgatggccacggctatgtacctgcagatggagcatgttgtggacacttgccggaagtttattaaggccagtgaagcagagatggtttctgccatcaagcctcctcgtgaagagttcctcaacagccggatgctgatgccccaagacatcatggcctatcggggtcgtgaggtggtggagaacaacctgccactgaggagcgcccctgggtgtgagagcagagcctttgcccccagcctgtacagtggcctgtccacaccgccagcctcttattccatgtacagccacctccctgtcagcagcctcctcttctccgatgaggagtttcgggatgtccggatgcctgtggccaaccccttccccaaggagcgggcactcccatgtgatagtgccaggccagtccctggtgagtacagccggccgactttggaggtgtcccccaatgtgtgccacagcaatatctattcacccaaggaaacaatcccagaagaggcacgaagtgatatgcactacagtgtggctgagggcctcaaacctgctgccccctcagcccgaaatgccccctacttcccttgtgacaaggccagcaaagaagaagagagaccctcctcggaagatgagattgccctgcatttcgagccccccaatgcacccctgaaccggaagggtctggttagtccacagagcccccagaaatctgactgccagcccaactcgcccacagagtcctgcagcagtaagaatgcctgcatcctccaggcttctggctcccctccagccaagagccccactgaccccaaagcctgcaactggaagaaatacaagttcatcgtgctcaacagcctcaaccagaatgccaaaccagaggggcctgagcaggctgagctgggccgcctttccccacgagcctacacggccccacctgcctgccagccacccatggagcctgagaaccttgacctccagtccccaaccaagctgagtgccagcggggaggactccaccatcccacaagccagccggctcaataacatcgttaacaggtccatgacgggctctccccgcagcagcagcgagagccactcaccactctacatgcaccccccgaagtgcacgtcctgcggctctcagtccccacagcatgcagagatgtgcctccacaccgctggccccacgttccctgaggagatgggagagacccagtctgagtactcagattctagctgtgagaacggggccttcttctgcaatgagtgtgactgccgcttctctgaggaggcctcactcaagaggcacacgctgcagacccacagtgacaaaccctacaagtgtgaccgctgccaggcctccttccgctacaagggcaacctcgccagccacaagaccgtccataccggtgagaaaccctatcgttgcaacatctgtggggcccagttcaaccggccagccaacctgaaaacccacactcgaattcactctggagagaagccctacaaatgcgaaacctgcggagccagatttgtacaggtggcccacctccgtgcccatgtgcttatccacactggtgagaagccctatccctgtgaaatctgtggcacccgtttccggcaccttcagactctgaagagccacctgcgaatccacacaggagagaaaccttaccattgtgagaagtgtaacctgcatttccgtcacaaaagccagctgcgacttcacttgcgccagaagcatggcgccatcaccaacaccaaggtgcaataccgcgtgtcagccactgacctgcctccggagctccccaaagcctgc(配列番号:67)
P2A
GGAAGCGGAGCTACTAACTTCAGCCTGCTGAAGCAGGCTGGAGACGTGGAGGAGAACCCTGGACCT(配列番号68)
BCL-xL
AGATCTGGAATGTCTCAGAGCAACCGGGAGCTGGTGGTTGACTTTCTCTCCTACAAGCTTTCCCAGAAAGGATACAGCTGGAGTCAGTTTAGTGATGTGGAAGAGAACAGGACTGAGGCCCCAGAAGGGACTGAATCGGAGATGGAGACCCCCAGTGCCATCAATGGCAACCCATCCTGGCACCTGGCAGACAGCCCCGCGGTGAATGGAGCCACTGGCCACAGCAGCAGTTTGGATGCCCGGGAGGTGATCCCCATGGCAGCAGTAAAGCAAGCGCTGAGGGAGGCAGGCGACGAGTTTGAACTGCGGTACCGGCGGGCATTCAGTGACCTGACATCCCAGCTCCACATCACCCCAGGGACAGCATATCAGAGCTTTGAACAGGTAGTGAATGAACTCTTCCGGGATGGGGTAAACTGGGGTCGCATTGTGGCCTTTTTCTCCTTCGGCGGGGCACTGTGCGTGGAAAGCGTAGACAAGGAGATGCAGGTATTGGTGAGTCGGATCGCAGCTTGGATGGCCACTTACCTGAATGACCACCTAGAGCCTTGGATCCAGGAGAACGGCGGCTGGGATACTTTTGTGGAACTCTATGGGAACAATGCAGCAGCCGAGAGCCGAAAGGGCCAGGAACGCTTCAACCGCTGGTTCCTGACGGGCATGACTGTGGCCGGCGTGGTTCTGCTGGGCTCACTCTTCAGTCGGAAA (配列番号69)
T2A
GGCAGTggcgagggtagaggttctctcctcacttgtggtgatgttgaagaaaaccctggtcca(配列番号70)
rtTA
atgtctagactggacaagagcaaagtcataaacggagctctggaattactcaatggtgtcggtatcgaaggcctgacgacaaggaaactcgctcaaaagctgggagttgagcagcctaccctgtactggcacgtgaagaacaagcgggccctgctcgatgccctgccaatcgagatgctggacaggcatcatacccacttctgccccctggaaggcgagtcatggcaagactttctgcggaacaacgccaagtcataccgctgtgctctcctctcacatcgcgacggggctaaagtgcatctcggcacccgcccaacagagaaacagtacgaaaccctggaaaatcagctcgcgttcctgtgtcagcaaggcttctccctggagaacgcactgtacgctctgtccgccgtgggccactttacactgggctgcgtattggaggaacaggagcatcaagtagcaaaagaggaaagagagacacctaccaccgattctatgcccccacttctgagacaagcaattgagctgttcgaccggcagggagccgaacctgccttccttttcggcctggaactaatcatatgtggcctggagaaacagctaaagtgcgaaagcggcgggccgaccgacgcccttgacgattttgacttagacatgctcccagccgatgcccttgacgactttgaccttgatatgctgcctgctgacgctcttgacgattttgaccttgacatgctccccgggtaaGGTgA (配列番号71)
WPRE
TCAACCTCTGGATTACAAAATTTGTGAAAGATTGACTGGTATTCTTAACTATGTTGCTCCTTTTACGCTATGTGGATACGCTGCTTTAATGCCTTTGTATCATGCTATTGCTTCCCGTATGGCTTTCATTTTCTCCTCCTTGTATAAATCCTGGTTGCTGTCTCTTTATGAGGAGTTGTGGCCCGTTGTCAGGCAACGTGGCGTGGTGTGCACTGTGTTTGCTGACGCAACCCCCACTGGTTGGGGCATTGCCACCACCTGTCAGCTCCTTTCCGGGACTTTCGCTTTCCCCCTCCCTATTGCCACGGCGGAACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGGACAGGGGCTCGGCTGTTGGGCACTGACAATTCCGTGGTGTTGTCGGGGAAATCATCGTCCTTTCCTTGGCTGCTCGCCTGTGTTGCCACCTGGATTCTGCGCGGGACGTCCTTCTGCTACGTCCCTTCGGCCCTCAATCCAGCGGACCTTCCTTCCCGCGGCCTGCTGCCGGCTCTGCGGCCTCTTCCGCGTCTTCGCCTTCGCCCTCAGACGAGTCGGATCTCCCTTTGGGCCGCCTCCCCGCA (配列番号72)
U3PPT
AAAAGAAAAGGGGGGA(配列番号73)
-HIV-LTR
GGGTCTCTCTGGTTAGACCAGATCTGAGCCTGGGAGCTCTCTGGCTAACTAGGGAACCCACTGCTTAAGCCTCAATAAAGCTTGCCTTGAGTGCTTCAAGTAGTGTGTGCCCGTCTGTTGTGTGACTCTGGTAACTAGAGATCCCTCAGACCCTTTTAGTCAGTGTGGAAAATCTCTAGCA (配列番号74)
bGH pA
CGACTGTGCCTTCTAGTTGCCAGCCATCTGTTGTTTGCCCCTCCCCCGTGCCTTCCTTGACCCTGGAAGGTGCCACTCCCACTGTCCTTTCCTAATAAAATGAGGAAATTGCATCGCATTGTCTGAGTAGGTGTCATTCTATTCTGGGGGGTGGGGTGGGGCAGGACAGCAAGGGGGAGGATTGGGAAGACAATAGCAGGCATG (配列番号75)
SV40複製開始点
Atcccgcccctaactccgcccagttccgcccattctccgccccatggctgactaattttttttatttatgcagaggccgaggccgcctcggcctctgagctattccagaagtagtgaggaggcttttttggaggcc (配列番号76)
プラスミド複製開始点
TTTCCATAGGCTCCGCCCCCCTGACGAGCATCACAAAAATCGACGCTCAAGTCAGAGGTGGCGAAACCCGACAGGACTATAAAGATACCAGGCGTTTCCCCCTGGAAGCTCCCTCGTGCGCTCTCCTGTTCCGACCCTGCCGCTTACCGGATACCTGTCCGCCTTTCTCCCTTCGGGAAGCGTGGCGCTTTCTCATAGCTCACGCTGTAGGTATCTCAGTTCGGTGTAGGTCGTTCGCTCCAAGCTGGGCTGTGTGCACGAACCCCCCGTTCAGCCCGACCGCTGCGCCTTATCCGGTAACTATCGTCTTGAGTCCAACCCGGTAAGACACGACTTATCGCCACTGGCAGCAGCCACTGGTAACAGGATTAGCAGAGCGAGGTATGTAGGCGGTGCTACAGAGTTCTTGAAGTGGTGGCCTAACTACGGCTACACTAGAAGAACAGTATTTGGTATCTGCGCTCTGCTGAAGCCAGTTACCTTCGGAAAAAGAGTTGGTAGCTCTTGATCCGGCAAACAAACCACCGCTGGTAGCGGTGGTTTTTTTGTTTGCAAGCAGCAGATTACGCGCAGAAAAAAAGGATCTCAA (配列番号77)
アンピシリン耐性遺伝子
TTACCAATGCTTAATCAGTGAGGCACCTATCTCAGCGATCTGTCTATTTCGTTCATCCATAGTTGCCTGACTCCCCGTCGTGTAGATAACTACGATACGGGAGGGCTTACCATCTGGCCCCAGTGCTGCAATGATACCGCGAGACCCACGCTCACCGGCTCCAGATTTATCAGCAATAAACCAGCCAGCCGGAAGGGCCGAGCGCAGAAGTGGTCCTGCAACTTTATCCGCCTCCATCCAGTCTATTAATTGTTGCCGGGAAGCTAGAGTAAGTAGTTCGCCAGTTAATAGTTTGCGCAACGTTGTTGCCATTGCTACAGGCATCGTGGTGTCACGCTCGTCGTTTGGTATGGCTTCATTCAGCTCCGGTTCCCAACGATCAAGGCGAGTTACATGATCCCCCATGTTGTGCAAAAAAGCGGTTAGCTCCTTCGGTCCTCCGATCGTTGTCAGAAGTAAGTTGGCCGCAGTGTTATCACTCATGGTTATGGCAGCACTGCATAATTCTCTTACTGTCATGCCATCCGTAAGATGCTTTTCTGTGACTGGTGAGTACTCAACCAAGTCATTCTGAGAATAGTGTATGCGGCGACCGAGTTGCTCTTGCCCGGCGTCAATACGGGATAATACCGCGCCACATAGCAGAACTTTAAAAGTGCTCATCATTGGAAAACGTTCTTCGGGGCGAAAACTCTCAAGGATCTTACCGCTGTTGAGATCCAGTTCGATGTAACCCACTCGTGCACCCAACTGATCTTCAGCATCTTTTACTTTCACCAGCGTTTCTGGGTGAGCAAAAACAGGAAGGCAAAATGCCGCAAAAAAGGGAATAAGGGCGACACGGAAATGTTGAATACTCAT (配列番号78)
AmpR_プロモーター
ATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAA (配列番号79)
さらなる態様において、本開示は、特定の器官部位または腫瘍マーカーへの標的化に好都合な性質を付与するように遺伝的に改変され得る無限免疫細胞を提供する。その無限免疫細胞は、重篤な有害事象が起きた場合に患者から無限免疫細胞を排除するために使用され得る1つ以上の自殺遺伝子または排除遺伝子を発現し得る。その無限免疫細胞は、インビボで適用するために無限T細胞の増殖を維持または強化し得るIL-2および/またはIL-15をコードする遺伝子を含む1つ以上の遺伝子を発現し得る。IL-2および/またはIL-15の発現は、構成的発現であり得るか、または制御可能(例えば、ドキシサイクリンで制御可能(Tet-onまたはTet-off))であり得る。その細胞は、他の1つ以上の他のサイトカイン(例えば、IL-7、IL-12、IL-18、IL-21など);1つ以上のケモカインレセプター(例えば、CCR1、CCR4、CCR5、CCR6、CCR7、CCR9、CCR10、CXCR1、CXCR2、CXCR3、CXCR4、CXCR5、CXCR7(ACKR3)、CX3CR1、CCRL2(ACKR5)など)および/または1つ以上の他のケモカイン(例えば、CCL1、CCL2、CCL3、CCL4、CCL5、CCL7、CCL8、CCL11、CCL13、CCL14、CCL15、CCL16、CCL17、CCL18、CCL19、CCL20、CCL21、CCL22、CCL23、CCL24、CCL25、CCL26、CCL27、CCL28、CXCL1、CXCL2、CXCL3、CXCL4、CXCL5、CXCL6、CXCL7、CXCL8、CXCL9、CXCL10、CXCL11、CXCL12、CXCL13、CXCL14、CX3CL1、CXCL4L1など)を発現するように操作され得る。
無限免疫細胞は、腫瘍または感染症を標的化する抗原特異的CARまたはTCRを発現するように改変され得る。腫瘍を標的化する別のストラテジーは、細胞外ドメイン上にFcレセプターを有するCARを発現するように無限T細胞を改変することであり得、それらはその後、腫瘍マーカーに対するモノクローナル抗体とともに使用できるようになる。さらに、無限免疫細胞は、目的の器官部位へのこれらの細胞の輸送を優先的に指示するために、インテグリン、セレクチン、免疫グロブリンスーパーファミリーに属する接着分子、カドヘリンおよびCD44ファミリーを含む特異的なケモカインレセプターおよび/または接着分子を発現するように改変され得る。
さらなる実施形態は、任意の種類の自殺遺伝子または排除遺伝子などの1つ以上の安全スイッチを有する無限免疫細胞を提供する。いくつかの実施形態において、その系は、切断型ヒト上皮成長因子レセプター(hEGFRt)、HSV-TK、SR39変異HSV-TK、酵母CD遺伝子またはその変異CD20を使用し得る。hEGFRtが使用される場合、この遺伝子は、無限T細胞が必要とされなくなったときに、セツキシマブなどのFDAが承認したモノクローナル抗体によって認識され、排除される特性を無限T細胞に与えることができる。例えば、この遺伝子は、治療用の無限免疫細胞を注射した後に重篤な有害事象が起きたとき、安全スイッチとして働くことができる。hEGFRtは、安全スイッチとして働くことに加えて、CAR陽性細胞を濃縮するためのマーカーおよび患者に注入した後にこれらの細胞を追跡するためのマーカーとしても働くこともできる。
切断型EGFRの一例が下記であり、この場合、EGFRのドメイン1および2が欠失している:
DNA配列:5-ATGCTGCTGCTGGTGACCAGCCTGCTGCTGTGCGAGCTGCCACACCCTGCCTTCCTGAGGAAAGTGTGTAATGGCATCGGCATCGGCGAGTTTAAGGACAGCCTGTCCATCAACGCCACAAATATCAAGCACTTCAAGAACTGTACCTCTATCAGCGGCGACCTGCACATCCTGCCAGTGGCCTTCAGAGGCGATTCCTTTACACACACCCCACCACTGGACCCACAGGAGCTGGATATCCTGAAGACAGTGAAGGAGATCACCGGCTTCCTGCTGATCCAGGCATGGCCAGAGAACAGGACAGATCTGCACGCCTTTGAGAATCTGGAGATCATCAGAGGCAGGACCAAGCAGCACGGCCAGTTCTCTCTGGCCGTGGTGAGCCTGAACATCACATCCCTGGGCCTGCGCTCTCTGAAGGAGATCAGCGACGGCGATGTGATCATCTCCGGCAACAAGAATCTGTGCTATGCCAACACCATCAATTGGAAGAAGCTGTTTGGCACATCTGGCCAGAAGACCAAGATCATCAGCAACCGCGGCGAGAATTCCTGCAAGGCAACCGGACAGGTGTGCCACGCACTGTGTAGCCCTGAGGGATGTTGGGGACCAGAGCCACGCGACTGCGTGTCCTGTAGGAACGTGTCTAGGGGAAGGGAGTGCGTGGATAAGTGTAATCTGCTGGAGGGAGAGCCAAGGGAGTTCGTGGAGAACTCCGAGTGCATCCAGTGTCACCCCGAGTGCCTGCCTCAGGCCATGAACATCACATGTACCGGCCGGGGCCCTGACAATTGCATCCAGTGTGCCCACTACATCGATGGCCCTCACTGCGTGAAGACATGTCCAGCCGGCGTGATGGGCGAGAACAATACCCTGGTGTGGAAGTATGCAGACGCAGGACACGTGTGCCACCTGTGTCACCCCAATTGCACATACGGATGTACCGGACCAGGACTGGAGGGATGTCCTACAAACGGCCCTAAGATCCCAAGCATCGCAACCGGAATGGTGGGAGCACTGCTGCTGCTGCTGGTGGTGGCACTGGGAATCGGACTGTTCATGAGGCGGTGA-3 (配列番号12)
ドメイン1および2を欠く切断型EGFRのアミノ酸配列:
MLLLVTSLLLCELPHPAFLRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFKNCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAFENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKLFGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDKCNLLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVMGENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGCPTNGPKIPSIATGMVGALLLLLVVALGIGLFMRR (配列番号13)
ある特定の実施形態において、安全スイッチとしての融合タンパク質は、EGFR(ドメイン3)とHER2(ドメインIV)融合タンパク質との融合物である。そのような場合、EGFRドメイン3が、抗体結合ドメインであり、HER2ドメイン4が、細胞外スペーサーおよび膜貫通ドメインを含む。具体的な実施形態において、この融合タンパク質は、CARとは別個の分子である。
上記無限細胞におけるいずれか1つ以上の遺伝子または発現構築物は、例えばTet-onまたはTet-offシステムによって、ドキシサイクリンによって制御可能な様式で制御可能であってもよいし、そうでなくてもよい。Tet応答性プロモーターの配列の例としては、Tet応答性エレメントの7つのリピートを含む以下のTet応答性プロモーターが挙げられる:
gagtttactccctatcagtgatagagaacgtatgtcgagtttactccctatcagtgatagagaacgatgtcgagtttactccctatcagtgatagagaacgtatgtcgagtttactccctatcagtgatagagaacgtatgtcgagtttactccctatcagtgatagagaacgtatgtcgagtttatccctatcagtgatagagaacgtatgtcgagtttactccctatcagtgatagagaacgtatgtcgaggtaggcgtgtacggtgggaggcctatataagcagagctcgtttagtgaaccgtcagatcgcc(配列番号14)
tetシステムについて、tTA(Tet off)に対するDNA配列の例は、以下のとおりである:
ATGAGCCGCCTGGATAAGTCCAAAGTGATCAACTCTGCCCTGGAGCTGCTGAATGAAGTGGGCATCGAGGGCCTGACCACACGGAAGCTGGCCCAGAAGCTGGGAGTGGAGCAGCCAACCCTGTACTGGCACGTGAAGAACAAGCGCGCCCTGCTGGACGCCCTGGCCATCGAGATGCTGGATCGGCACCACACACACTTCTGCCCCCTGGAGGGAGAGTCCTGGCAGGATTTCCTGCGGAACAATGCCAAGAGCTTTAGATGTGCACTGCTGTCCCACAGGGACGGAGCAAAGGTGCACCTGGGCACCAGGCCTACAGAGAAGCAGTACGAGACCCTGGAGAACCAGCTGGCCTTCCTGTGCCAGCAGGGCTTTTCTCTGGAGAATGCACTGTATGCACTGAGCGCCGTGGGACACTTCACCCTGGGATGCGTGCTGGAGGACCAGGAGCACCAGGTGGCCAAGGAGGAGAGAGAGACACCCACCACAGATTCCATGCCCCCTCTGCTGAGGCAGGCCATCGAGCTGTTTGACCACCAGGGAGCAGAGCCTGCCTTCCTGTTTGGCCTGGAGCTGATCATCTGCGGCCTGGAGAAGCAGCTGAAGTGTGAGTCTGGAGGACCAGCAGACGCCCTGGACGATTTCGACCTGGATATGCTGCCCGCCGATGCCCTGGACGATTTTGACCTGGATATGCTGCCTGCCGACGCCCTGGACGATCTGGACCTGGATATGCTGCCAGGCacc (配列番号15)
tTA(Tet off)のアミノ酸配列の例は、以下のとおりである:
MSRLDKSKVINSALELLNEVGIEGLTTRKLAQKLGVEQPTLYWHVKNKRALLDALAIEMLDRHHTHFCPLEGESWQDFLRNNAKSFRCALLSHRDGAKVHLGTRPTEKQYETLENQLAFLCQQGFSLENALYALSAVGHFTLGCVLEDQEHQVAKEERETPTTDSMPPLLRQAIELFDHQGAEPAFLFGLELIICGLEKQLKCESGGPADALDDFDLDMLPADALDDFDLDMLPADALDDLDLDMLPG (SEQ ID NO:16)
rtTA(Tet on)のDNA配列の例は、以下のとおりである:
atgtctagactggacaagagcaaagtcataaacggagctctggaattactcaatggtgtcggtatcgaaggcctgacgacaaggaaactcgctcaaaagctgggagttgagcagcctaccctgtactggcacgtgaagaacaagcgggccctgctcgatgccctgccaatcgagatgctggacaggcatcatacccacttctgccccctggaaggcgagtcatggcaagactttctgcggaacaacgccaagtcataccgctgtgctctcctctcacatcgcgacggggctaaagtgcatctcggcacccgcccaacagagaaacagtacgaaaccctggaaaatcagctcgcgttcctgtgtcagcaaggcttctccctggagaacgcactgtacgctctgtccgccgtgggccactttacactgggctgcgtattggaggaacaggagcatcaagtagcaaaagaggaaagagagacacctaccaccgattctatgcccccacttctgagacaagcaattgagctgttcgaccggcagggagccgaacctgccttccttttcggcctggaactaatcatatgtggcctggagaaacagctaaagtgcgaaagcggcgggccgaccgacgcccttgacgattttgacttagacatgctcccagccgatgcccttgacgactttgaccttgatatgctgcctgctgacgctcttgacgattttgaccttgacatgctccccgggtaa (配列番号17)
rtTA(Tet on)のアミノ酸配列の例は、以下のとおりである:
MSRLDKSKVINGALELLNGVGIEGLTTRKLAQKLGVEQPTLYWHVKNKRALLDALPIEMLDRHHTHFCPLEGESWQDFLRNNAKSYRCALLSHRDGAKVHLGTRPTEKQYETLENQLAFLCQQGFSLENALYALSAVGHFTLGCVLEEQEHQVAKEERETPTTDSMPPLLRQAIELFDRQGAEPAFLFGLELIICGLEKQLKCESGGPTDALDDFDLDMLPADALDDFDLDMLPADALDDFDLDMLPG (配列番号18)
いくつかの態様において、無限免疫細胞は、増殖の維持または強化などのために、IL-2および/またはIL-15(例えば、誘導性IL-2および/またはIL-15)を含む1つ以上のサイトカインを発現するように操作されてもよい。しかしながら、具体的な場合においては、そのシステムにおけるいずれのサイトカインも、恒常的に制御され得る。例えば、無限免疫細胞は、自身の増殖を補助するために、ドキシサイクリンなどの誘導剤の存在下においてIL-15および/またはIL-2を産生し得る。ドキシサイクリンの投与量を調整することによって、無限免疫細胞の生存および増殖を、インビボにおいて維持または制御できる。
特定のIL-2配列が使用され得る。少なくともいくつかの場合において、IL-2には、DNA配列の例が2つあり、その両方が、同じIL-2アミノ酸配列をコードする。
IL-2のDNA配列1:
ATGTATCGGATGCAACTCCTCAGCTGCATTGCGTTGTCACTCGCACTCGTCACGAACTCTGCACCGACATCTAGTAGTACTAAGAAAACACAGTTGCAACTGGAGCACCTGCTGTTGGATTTGCAAATGATCCTTAACGGGATCAACAACTACAAAAACCCTAAGCTCACACGAATGCTTACTTTCAAGTTTTACATGCCGAAAAAAGCCACAGAGCTGAAGCATCTTCAGTGCCTTGAAGAGGAGCTTAAACCCCTCGAGGAGGTACTGAATCTCGCGCAAAGCAAGAATTTTCATTTGCGGCCCCGGGACCTTATATCAAACATTAACGTGATCGTGTTGGAACTCAAGGGATCAGAGACGACATTTATGTGCGAGTACGCTGACGAGACCGCTACAATCGTAGAGTTTCTCAATAGGTGGATCACGTTTTGCCAAAGCATCATCTCAACGCTC (配列番号19)
IL-2のDNA配列2:
ATGTATAGGATGCAGCTGCTGTCCTGCATCGCCTTGTCCCTGGCCCTTGTGACCAACAGCGCCCCAACCTCCTCCTCTACCAAAAAAACCCAACTTCAGCTTGAGCATCTCCTCTTGGACCTGCAGATGATCCTGAATGGTATAAACAACTACAAGAACCCCAAGCTGACCCGGATGCTTACATTCAAATTCTATATGCCTAAAAAGGCTACAGAGCTGAAGCACCTGCAGTGCCTGGAAGAGGAGCTGAAGCCACTGGAAGAGGTCCTGAACTTGGCCCAGAGCAAGAACTTTCACCTCAGGCCCAGGGACTTGATAAGCAACATAAATGTAATCGTCCTGGAGCTGAAGGGGTCTGAAACAACCTTCATGTGTGAGTATGCAGATGAGACCGCTACCATCGTGGAGTTCCTCAACAGATGGATTACATTTTGTCAATCCATCATCAGCACCCTGACATCT (配列番号20)
ある特定の実施形態において、ある具体的なIL-2アミノ酸配列が、上記細胞において使用される:
MYRMQLLSCIALSLALVTNSAPTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTFKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTL (配列番号21)
ある特定の実施形態において、ある具体的なIL-15核酸ポリマー配列が、上記細胞において使用される:
ATGGGCCTGACCTCTCAGCTGCTGCCACCCCTGTTCTTTCTGCTGGCCTGTGCCGGCAATTTCGTGCACGGCGCCAACTGGGTGAATGTGATCTCTGACCTGAAGAAGATCGAGGATCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACCCTGTATACAGAGTCCGATGTGCACCCTTCTTGCAAGGTGACAGCCATGAAGTGTTTTCTGCTGGAGCTGCAGGTCATCTCTCTGGAGAGCGGCGACGCCAGCATCCACGATACCGTGGAGAATCTGATCATCCTGGCCAACAATAGCCTGAGCTCCAACGGCAATGTGACAGAGTCCGGCTGCAAGGAGTGTGAGGAGCTGGAGGAGAAGAACATCAAGGAGTTCCTGCAGTCCTTTGTGCACATCGTGCAGATGTTTATCAATACCTCTTGA (配列番号22)
ある特定の実施形態において、ある具体的なIL-15アミノ酸配列が、上記細胞において使用される:
MGLTSQLLPPLFFLLACAGNFVHGANWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS (配列番号23)
特定の場合において、上記免疫細胞は、IL-15レセプターの一部または全部と融合したIL-15を含む。具体的な場合において、上記免疫細胞は、IL-15レセプターアルファ単位のsushiドメインと融合したIL-15を含み、その配列の例は、以下のとおりである:
MAPRRARGCRTLGLPALLLLLLLRPPATRGITCPPPMSVEHADIWVKSYSLYSRERYICNSGFKRKAGTSSLTECVLNKATNVAHWTTPSLKCIRDGGGGSGGGGSGGGGSNWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS (配列番号24)
IL-15レセプターアルファ単位のsushiドメインと融合したIL-15のDNA配列:
ATGGCACCTAGAAGAGCCAGAGGATGTAGAACACTGGGACTGCCAGCGCTCCTTCTTTTGTTGCTGCTGAGACCACCTGCAACTCGCGGAATCACTTGTCCTCCTCCTATGAGTGTGGAACACGCTGACATTTGGGTCAAGTCCTACTCTCTGTATTCCCGGGAGAGATATATATGTAACTCTGGTTTCAAACGCAAGGCAGGCACCAGCAGCCTTACCGAGTGTGTGCTTAACAAGGCAACAAATGTGGCTCACTGGACAACACCTTCTCTGAAGTGCATTAGAGATGGAGGCGGAGGATCAGGTGGAGGAGGTTCTGGTGGGGGTGGATCAAATTGGGTGAACGTAATTTCCGACCTGAAAAAGATCGAAGATCTCATTCAAAGCATGCATATCGATGCCACCCTCTATACCGAGAGCGATGTCCACCCATCCTGCAAAGTTACGGCGATGAAATGCTTCCTGCTCGAGCTCCAGGTTATTTCTCTGGAGAGCGGGGATGCCTCCATCCACGATACTGTCGAGAACCTCATTATTCTGGCCAATAACTCCCTGTCTAGCAATGGCAATGTGACTGAATCAGGTTGCAAGGAGTGCGAGGAGCTCGAAGAGAAAAACATAAAAGAATTCCTGCAATCCTTTGTCCATATCGTACAGATGTTTATCAACACCAGC (配列番号25)
無限免疫細胞は、CD19、CD20、CD22および/もしくはメソテリンなどの特異的な腫瘍マーカーを認識できる1つ以上のキメラ抗原レセプター(CAR);ならびに/またはEBV、CMVもしくはNY-ESO-1に対するT細胞レセプター(TCR)などのTCRを導入することによって、無限細胞に標的選択性を与えるように遺伝的に操作され得る。一例は、本明細書中の他の箇所で言及される「抗CD19無限CAR T細胞」(CD19 inCART)である。CD19は、ほとんどすべての種類のB細胞リンパ腫またはB細胞白血病および正常なB細胞において発現される。CD19 in CARTは、抗CD19 CARを発現するレンチウイルスベクターまたは非ウイルスベクターを、選択された無限細胞に送達することによって作製される。
また、無限免疫細胞は、さらなる特性を付与するように遺伝的に操作され得、そのさらなる特性は、i)阻害性レセプターまたは阻害性リガンドであるPD-1、LAG-3、TIM-3、PD-L1などをノックアウトまたはノックダウンすることによる、T細胞疲弊に対する抵抗性、ii)TGF-βレセプターをノックアウトまたはノックダウンすることなどによる、免疫抑制機構に対する抵抗性、iii)TCRをノックアウトすることによる、移植片対宿主病の予防、iv)サイトカインまたは細胞傷害性分子などの表面分子または細胞内分子を発現することによる、有効性の改善、ならびにv)T細胞およびNK細胞をはじめとした宿主免疫細胞による排除に対して抵抗性にすることによる、インビボにおける持続性の改善、などである。これは、宿主免疫細胞の機能を抑制または低減するために、MHC分子をノックアウトもしくはノックダウンすること、または無限免疫細胞において表面リガンドまたは他の表面分子もしくは細胞内分子を発現することによって達成され得る。
無限免疫細胞は、特定の方法によってまたは特定の条件下において作製され得る。例えば、具体的な実施形態において、作製中の無限免疫細胞は、その作製の間に、1つ以上の特定の作用物質に供されてもよく、その1つ以上の特定の作用物質は、少なくともそれへの曝露がない場合の有効性と比べて、作製時にその細胞の有効性を高める作用物質である。例えば、いくつかの場合において、無限T細胞を作製および拡大するために、IL-2が使用される。具体的な実施形態において、サイトカイン(IL-2、IL-7、IL-21、IL-15、IL-12、IL-18、IL-23、IFN-ガンマ、TNF-アルファなど)および/またはケモカインの1つ以上の異なる組み合わせが、特定の表現型および特定の機能を有する無限T細胞を調製するために使用され得る。
IV.遺伝的に操作された抗原レセプター
本開示の免疫細胞は、1つ以上の抗原レセプター(例えば、1つ以上の操作されたTCRおよび/または1つ以上のCAR)を発現するように遺伝的に操作されてもよいし、されなくてもよい。例えば、それらの免疫細胞は、癌抗原または微生物抗原(病原性抗原を含む)に対する抗原特異性を有するCARおよび/またはTCRを発現するように改変され得る。複数のCARおよび/またはTCR(例えば、種々の抗原に対するもの)が、それらの免疫細胞に付加され得る。いくつかの態様において、免疫細胞は、CRISPR/Cas9などの遺伝子編集方法を用いて阻害性遺伝子の遺伝子座にCARまたはTCRをノックインすることによって、CARまたはTCRを発現するように操作される。
好適な改変方法は、当該分野で公知である。例えば、Sambrook and Ausubel,前出を参照のこと。例えば、上記細胞は、Heemskerk et al.,2008およびJohnson et al.,2009に記載されている形質導入法を用いて、癌抗原に対する抗原特異性を有するTCRを発現するように形質導入され得る。
レトロウイルスによって形質導入されたTCR鎖と内在性のTCR鎖との対形成によって引き起こされる自己反応性に関する長期的な問題を克服する選択肢として、完全長TCRαおよびβ(またはγおよびδ)鎖をコードするRNAのエレクトロポレーションを使用することができる。そのような代替の対形成が、一過性のトランスフェクションストラテジーにおいて起きたとしても、導入されたTCRαおよびβ鎖は、一過性に発現されるだけなので、生成される可能性がある自己反応性T細胞は、しばらくするとこの自己反応性を失う。導入されたTCRαおよびβ鎖の発現が減少すると、正常な自己のT細胞だけが残る。これは、完全長TCR鎖が、安定したレトロウイルス形質導入によって導入されたときは当てはまらず、導入されたTCR鎖は失われることはなく、患者に絶えず自己反応性が存在するようになる。
いくつかの実施形態において、上記細胞は、1つ以上の抗原レセプターをコードする、遺伝子操作を介して導入された1つ以上の核酸ポリマー、およびそのような核酸ポリマーの遺伝的に操作された産物を含む。いくつかの実施形態において、それらの核酸ポリマーは、異種であり、すなわち、正常には、細胞または細胞から得られるサンプルに存在しない(例えば、別の生物または細胞から得られ、それは、例えば、操作されている細胞および/またはそのような細胞が由来する生物において通常見られない)。いくつかの実施形態において、それらの核酸ポリマーは、自然界に見られない核酸ポリマー(例えばキメラ)など、天然に存在しない。
いくつかの実施形態において、上記CARは、1つ以上の抗原に特異的に結合する細胞外の抗原認識ドメインを含む。いくつかの実施形態において、その抗原は、特定の癌細胞を含む細胞表面上に発現されるタンパク質、脂質または炭水化物である。いくつかの実施形態において、上記CARは、TCR様CARであり、抗原は、TCRと同様に主要組織適合遺伝子複合体(MHC)分子の状況において細胞表面上で認識される、プロセシングを受けたペプチド抗原(例えば、細胞内タンパク質のペプチド抗原)である。
CARおよび組換えTCRをはじめとした例示的な抗原レセプター、ならびにそれらのレセプターを操作するための方法およびそれらのレセプターを細胞に導入するための方法としては、例えば、国際特許出願公開番号WO200014257、WO2013126726、WO2012/129514、WO2014031687、WO2013/166321、WO2013/071154、WO2013/123061、米国特許出願公開第2002131960号、同第2013287748号、同第20130149337号、米国特許第6,451,995号、同第7,446,190号、同第8,252,592号、同第8,339,645号、同第8,398,282号、同第7,446,179号、同第6,410,319号、同第7,070,995号、同第7,265,209号、同第7,354,762号、同第7,446,191号、同第8,324,353号および同第8,479,118号、ならびに欧州特許出願番号EP2537416に記載されているもの、および/またはSadelain et al.,2013;Davila et al.,2013;Turtle et al.,2012;Wu et al.,2012によって記載されたものが挙げられる。いくつかの態様において、遺伝的に操作された抗原レセプターには、米国特許第7,446,190号に記載されているようなCAR、および国際特許出願公開番号WO/2014055668Alに記載されているものが含まれる。
A.キメラ抗原レセプター
いくつかの実施形態において、上記CARは、a)細胞内のシグナル伝達ドメイン、b)膜貫通ドメイン、c)抗原結合領域を含む細胞外のドメイン、および必要に応じてd)1つ以上の共刺激ドメインを含む。
いくつかの実施形態において、操作された抗原レセプターには、活性化型または刺激型のCAR、共刺激型のCAR(WO2014/055668を参照のこと)および/または阻害型のCAR(iCAR、Fedorov et al.,2013を参照のこと)をはじめとしたCARが含まれる。それらのCARは、一般に、1つ以上の細胞内のシグナル伝達構成要素に、いくつかの態様ではリンカーおよび/または膜貫通ドメインを介して連結された、細胞外の抗原(またはリガンド)結合ドメインを含む。そのような分子は、通常、天然の抗原レセプターを介するシグナル、共刺激レセプターとともにそのようなレセプターを介するシグナル、および/または共刺激レセプターのみを介するシグナルを模倣するかまたはまねる。
本開示のある特定の実施形態は、細胞内のシグナル伝達ドメイン、膜貫通ドメイン、および1つ以上のシグナル伝達モチーフを含む細胞外のドメインを含む、抗原特異的CARポリペプチド(免疫原性を低減するためにヒト化されたCAR(hCAR)を含む)をコードする核酸ポリマーを含む核酸ポリマーの使用に関する。ある特定の実施形態において、そのCARは、1つ以上の抗原の間で共有される空間を含むエピトープを認識し得る。ある特定の実施形態において、結合領域は、モノクローナル抗体の相補性決定領域、モノクローナル抗体の可変領域、および/またはそれらの抗原結合フラグメントを含み得る。別の実施形態において、その特異性は、レセプターに結合するペプチド(例えば、サイトカイン)に由来する。
ヒトCAR核酸ポリマーは、ヒト患者に対する細胞免疫療法を増強するために使用されるヒト遺伝子であり得ると企図される。具体的な実施形態において、本発明は、CARの完全長cDNAまたはコード領域を含む。その抗原結合領域またはドメインは、特定のヒトモノクローナル抗体に由来する一本鎖可変フラグメント(scFv)のV鎖およびV鎖のフラグメント(例えば、参照により本明細書中に援用される米国特許第7,109,304号に記載されているもの)を含み得る。そのフラグメントは、ヒト抗原特異的抗体の任意の数の異なる抗原結合ドメインでもあり得る。より具体的な実施形態において、そのフラグメントは、ヒト細胞における発現のためにヒトのコドン使用頻度に最適化された配列によってコードされる抗原特異的scFvである。
配置は、多量体であり得る(例えば、ダイアボディまたは多量体)。その多量体は、軽鎖および重鎖の可変部分がダイアボディに交差対形成することによって形成される可能性が最も高い。その構築物のヒンジ部分には、完全欠失から、1つ目のシステインが維持されること、セリン置換ではなくプロリン置換であること、1つ目のシステインまで切断されることにまで及ぶ複数の選択肢があり得る。Fc部分を欠失させることができる。安定したかつ/または二量体化する任意のタンパク質が、この目的にかない得る。Fcドメインのうちの1つだけ、例えば、ヒト免疫グロブリンのCH2ドメインまたはCH3ドメインを使用することができる。二量体化を改善するように改変されたヒト免疫グロブリンのヒンジ、CH2およびCH3領域を使用することもできる。免疫グロブリンのヒンジ部分だけを使用することもできる。CD8アルファの部分または合成分子を使用することもできる。
いくつかの実施形態において、上記CAR核酸は、他の共刺激レセプター(例えば、特定の分子(例えばCD28など)の天然のまたは改変された、細胞外ドメイン、膜貫通ドメインおよび細胞内シグナル伝達ドメイン)をコードする部分的または完全な配列を単独でまたは組み合わせて含む。他の共刺激ドメインとしては、CD28、CD27、OX-40(CD134)、ICOS、HVEM、GITR、LIGHT、CD40L、DR3、CD30、SLAM、CD2、CD226(DNAM-1)、MyD88、CD244、TMIGD2、BTNL3、NKG2D、DAP10、DAP12、4-1BB(CD137)または合成分子のうちの1つ以上が挙げられるが、これらに限定されない。CD3ζによって惹起される1次シグナルに加えて、CARに挿入された共刺激レセプターによって提供されるさらなるシグナルが、NK細胞の完全な活性化にとって重要であり、インビボでの持続性および養子免疫療法の治療の成功の改善を助け得る。
いくつかの実施形態において、CARは、特定の抗原(またはマーカーまたはリガンド)(例えば、養子療法によって標的化される特定の細胞型において発現される抗原(例えば、癌マーカー)および/または減衰応答を誘導することを目的とした抗原(例えば、正常細胞型上または非罹患細胞型上に発現される抗原))に対する特異性を有するように構築される。したがって、上記CARは通常、その細胞外の部分に、1つ以上の抗原結合分子(例えば、1つ以上の抗原結合フラグメント、抗原結合ドメインもしくは抗原結合部分)または1つ以上の抗体可変ドメイン、および/または抗体分子を含む。いくつかの実施形態において、上記CARは、抗体分子の抗原結合部分(例えば、モノクローナル抗体(mAb)の可変重鎖(VH)および可変軽鎖(VL)に由来する一本鎖抗体フラグメント(scFv))を含む。
キメラ抗原レセプターのある特定の実施形態において、そのレセプターの抗原特異的部分(抗原結合領域を含む細胞外ドメインと称され得る)は、腫瘍関連抗原または病原体特異的抗原結合ドメインを含む。抗原には、デクチン-1などのパターン認識レセプターによって認識される糖鎖抗原が含まれる。腫瘍関連抗原は、腫瘍細胞の細胞表面上に発現される限り、任意の種類であってよい。腫瘍関連抗原の例示的な実施形態としては、CD19、CD20、癌胎児抗原、アルファフェトプロテイン、CA-125、MUC-1、CD56、EGFR、c-Met、AKT、Her2、Her3、上皮性腫瘍抗原、黒色腫関連抗原、変異型p53、変異型rasなどが挙げられる。ある特定の実施形態において、CARは、腫瘍関連抗原の量が少ないとき、持続性を改善するためにサイトカインと同時発現され得る。例えば、CARは、IL-15と同時発現され得る。
キメラレセプターをコードするオープンリーディングフレームの配列は、ゲノムDNA起源、cDNA起源から得ることができるか、または合成することができるか(例えば、PCRを介して)、またはそれらの組み合わせであり得る。イントロンはmRNAを安定化すると見出されているので、ゲノムDNAのサイズおよびイントロンの数に応じて、cDNAまたはそれらの組み合わせを使用することが望ましい場合がある。また、mRNAを安定化するために内在性または外来性の非コード領域を使用することもさらに有益であり得る。
上記キメラ構築物は、裸のDNAとしてまたは好適なベクターに入った状態で免疫細胞に導入され得ることが企図される。裸のDNAを用いたエレクトロポレーションによって細胞を安定的にトランスフェクトする方法は、当該分野で公知である。例えば、米国特許第6,410,319号を参照のこと。裸のDNAとは、一般に、発現にとって適切な向きでプラスミド発現ベクターに含められたキメラレセプターをコードするDNAのことを指す。
あるいは、キメラ構築物を免疫細胞に導入するために、ウイルスベクター(例えば、レトロウイルスベクター、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクターまたはレンチウイルスベクター)を用いることができる。本開示の方法に従って使用するのに適したベクターは、免疫細胞において非複製性のベクターである。ウイルスに基づくベクターが多数知られており(例えば、HIV、SV40、EBV、HSVまたはBPVに基づくベクター)、細胞内に維持されるそのウイルスのコピー数は、その細胞の生存能を維持するほど十分低い。
いくつかの態様において、抗原に特異的に結合する構成要素または抗原特異的認識構成要素は、1つ以上の膜貫通ドメインおよび細胞内のシグナル伝達ドメインに連結される。いくつかの実施形態において、上記CARは、CARの細胞外ドメインに融合された膜貫通ドメインを含む。1つの実施形態において、そのCARにおけるドメインの1つと天然に会合する膜貫通ドメインが使用される。いくつかの場合において、その膜貫通ドメインは、レセプター複合体の他のメンバーとの相互作用を最小限に抑えるためにそのようなドメインが同じまたは異なる表面膜タンパク質の膜貫通ドメインに結合するのを回避するように、選択されるかまたはアミノ酸置換によって改変される。
膜貫通ドメインは、いくつかの実施形態において、天然起源または合成起源に由来する。起源が天然である場合、そのドメインは、いくつかの態様において、任意の膜結合型タンパク質または膜貫通タンパク質に由来する。膜貫通領域は、T細胞レセプターのアルファ鎖、ベータ鎖またはゼータ鎖、CD28、CD2、CD3ゼータ、CD3イプシロン、CD3ガンマ、CD3デルタ、CD45、CD4、CD5、CD8(CD8アルファを含む)、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137、CD154、ICOS/CD278、GITR/CD357、NKG2D、PD-1、CTLA4およびDAP分子に由来する(すなわち、それらの分子の膜貫通領域を少なくとも含む)膜貫通領域を含む。あるいは、膜貫通ドメインは、いくつかの実施形態において、合成の膜貫通ドメインである。いくつかの態様において、合成の膜貫通ドメインは、ロイシンおよびバリンなどの疎水性残基を主に含む。いくつかの態様では、フェニルアラニン、トリプトファンおよびバリンのトリプレットが、合成の膜貫通ドメインの各末端に見られることがある。
上記CARのヒンジ領域は、膜貫通ドメインに対してN末端に位置することがあり、いくつかの実施形態では、天然または合成の起源に由来する。ヒンジ配列は、スペーサーまたは細胞外スペーサーとも称されることがあり、一般に、膜貫通ドメインから結合単位を隔てるCARの細胞外の構造領域である。特定の実施形態において、CARは、免疫グロブリン(Ig)様ドメインヒンジを含む。そのヒンジは、一般に、効率的なCARの発現および活性に対して安定性をもたらす。ヒンジは、任意の好適な起源に由来してよいが、具体的な実施形態において、ヒンジは、CD8a、CD28、PD-1、CTLA4、T細胞レセプターのアルファ、ベータもしくはゼータ鎖、CD2、CD3ゼータ、CD3イプシロン、CD3ガンマ、CD3デルタ、CD45、CD4、CD5、CD8b、CD9、CD16、CD22、CD27、CD32、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137、CD154、CD160、BTLA、LAIR1、TIGIT、TIM4、ICOS/CD278、GITR/CD357、NKG2D、LAG-3、PD-L1、PD-1、TIM-3、HVEM、LIGHT、DR3、CD30、CD224、CD244、SLAM、CD226、DAPまたはそれらの組み合わせなどに由来する。
ある特定の実施形態において、T細胞またはNK細胞などの免疫細胞を遺伝的に改変するための本明細書中に開示されるプラットフォーム技術としては、(i)エレクトロポレーションデバイス(例えば、ヌクレオフェクター)を用いた非ウイルス遺伝子導入、(ii)エンドドメイン(例えば、CD28/CD3-ζ、CD137/CD3-ζまたは他の組み合わせ)を介してシグナル伝達するCAR、(iii)長さが不定の細胞外ドメインであって抗原認識ドメインを細胞表面に接続する細胞外ドメインを有するCAR、およびいくつかの場合では、(iv)CAR免疫細胞を頑強かつ数値的に拡大することができる、K562に由来する人工抗原提示細胞(aAPC)(Singh et al.,2008;Singh et al.,2011)が挙げられる。
ある特定の実施形態において、上記細胞は、抗CD19抗体のVHおよびVL、CD8ヒンジ(任意のヒンジがスペーサーまたは細胞外スペーサーと称され得る)と膜貫通領域との融合配列、ならびにCD3およびCD28のシグナル伝達領域を含むCD19-CAR配列(配列番号26)を発現するように操作されている。
ATGGCCCTGCCTGTGACAGCCCTGCTGCTGCCTCTGGCTCTGCTGCTGCATGCCGCTAGACCCGATATACAGATGACGCAGACAACGTCAAGTCTTTCCGCCAGCTTGGGAGACCGAGTGACTATATCTTGTAGAGCAAGCCAGGATATTTCTAAGTATCTTAACTGGTACCAACAAAAGCCCGATGGAACGGTTAAGCTGCTTATATACCATACCAGTAGACTCCACTCCGGCGTACCATCACGGTTTTCTGGCAGTGGCTCCGGGACCGACTATTCTTTGACGATCTCTAATCTCGAACAAGAGGATATTGCAACATACTTTTGTCAGCAAGGCAATACCTTGCCATATACGTTTGGGGGCGGGACAAAACTTGAGATAACCGGCGGCGGTGGTTCAGGCGGTGGCGGTTCCGGTGGTGGGGGATCAGAGGTTAAGCTTCAGGAATCCGGACCAGGTTTGGTTGCCCCCAGCCAATCTCTCAGCGTTACATGCACGGTTTCAGGCGTCAGTCTCCCCGATTACGGTGTAAGTTGGATTCGGCAACCTCCGCGAAAGGGTCTGGAATGGCTGGGGGTTATTTGGGGGAGTGAGACAACTTATTACAACTCTGCACTTAAGAGTCGGCTTACCATCATCAAGGATAATTCAAAATCACAAGTATTCCTGAAGATGAACTCATTGCAAACAGATGATACAGCTATATACTATTGTGCCAAGCATTACTATTATGGTGGTTCTTATGCAATGGATTACTGGGGGCAAGGCACGTCAGTGACAGTGAGTTCAACAACTACTCCAGCACCACGACCACCAACACCTGCTCCAACTATCGCATCTCAACCACTTTCTCTACGTCCAGAAGCATGCCGACCAGCTGCAGGAGGTGCAGTTCATACGAGAGGTCTAGATTTCGCATGTGATATCTACATCTGGGCACCATTGGCTGGGACTTGTGGTGTCCTTCTCCTATCACTGGTTATCACCCTTTACTGCTGGGTTAGAAGTAAAAGAAGTAGGCTACTTCATAGTGATTACATGAATATGACTCCTCGACGACCTGGTCCCACCCGTAAGCATTATCAGCCCTATGCACCACCACGAGATTTCGCAGCCTATCGCTCCAGAGTTAAATTTAGCAGAAGTGCAGATGCTCCTGCGTATAAACAGGGTCAAAACCAACTATATAATGAACTAAATCTAGGACGAAGAGAAGAATATGATGTTTTAGATAAAAGACGTGGTCGAGATCCTGAAATGGGAGGAAAACCTAGAAGAAAAAATCCTCAAGAAGGCCTATATAATGAACTACAAAAAGATAAGATGGCAGAAGCTTATAGTGAAATTGGAATGAAAGGAGAACGTCGTAGAGGTAAAGGTCATGATGGTCTTTATCAAGGTCTTAGTACAGCAACAAAAGATACATATGATGCACTTCATATGCAAGCACTTCCACCTCGTTTCGAAGAGCAAAAACTTATC (配列番号26)
使用され得るCAR(FMC63-CD8aヒンジ/TM-CD28-CD3z)の具体例は、以下のとおりである:
MALPVTALLLPLALLLHAARPDIQMTQTTSSLSASLGDRVTISCRASQDISKYLNWYQQKPDGTVKLLIYHTSRLHSGVPSRFSGSGSGTDYSLTISNLEQEDIATYFCQQGNTLPYTFGGGTKLEITGGGGSGGGGSGGGGSEVKLQESGPGLVAPSQSLSVTCTVSGVSLPDYGVSWIRQPPRKGLEWLGVIWGSETTYYNSALKSRLTIIKDNSKSQVFLKMNSLQTDDTAIYYCAKHYYYGGSYAMDYWGQGTSVTVSSTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCWVRSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQPYAPPRDFAAYRSRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR (配列番号27)
FMC63-CD8aヒンジ/TM-CD28-CD3z
抗CD19 scFv FMC63、CD8aのヒンジおよび膜貫通ドメイン、CD28共刺激ドメイン、ならびにCD3ゼータ(FMC63-CD8aヒンジ/TM-CD28-CD3z)を含む抗CD19 CARの一例は、以下のとおりである:
ATGGCCCTGCCAGTGACCGCCCTGCTGCTGCCACTGGCACTGCTGCTGCACGCAGCAAGGCCAGACATCCAGATGACACAGACCACAAGCTCCCTGTCCGCCTCTCTGGGCGACAGAGTGACCATCTCTTGCAGGGCCAGCCAGGATATCTCCAAGTATCTGAATTGGTACCAGCAGAAGCCTGATGGCACAGTGAAGCTGCTGATCTATCACACCTCTAGACTGCACAGCGGCGTGCCATCCAGGTTTAGCGGCTCCGGCTCTGGCACAGACTACTCTCTGACCATCAGCAATCTGGAGCAGGAGGATATCGCCACCTATTTCTGCCAGCAGGGCAACACACTGCCTTACACCTTTGGCGGCGGCACAAAGCTGGAGATCACCGGCGGCGGCGGCTCTGGAGGAGGAGGAAGCGGAGGAGGAGGATCCGAGGTGAAGCTGCAGGAGAGCGGACCAGGACTGGTGGCACCCAGCCAGTCCCTGTCTGTGACATGTACCGTGTCCGGCGTGTCTCTGCCAGACTACGGCGTGAGCTGGATCAGACAGCCACCTAGGAAGGGACTGGAGTGGCTGGGCGTGATCTGGGGCTCCGAGACCACATACTATAACTCCGCCCTGAAGTCTCGGCTGACCATCATCAAGGACAACAGCAAGTCCCAGGTGTTTCTGAAGATGAATTCCCTGCAGACAGACGATACCGCCATCTACTATTGCGCCAAGCACTACTATTACGGCGGCTCTTATGCCATGGATTACTGGGGCCAGGGCACAAGCGTGACCGTGTCTAGCACCACAACCCCTGCACCAAGACCACCAACACCAGCACCTACCATCGCAAGCCAGCCTCTGTCCCTGAGGCCAGAGGCATGCAGGCCAGCAGCAGGAGGAGCAGTGCACACCAGGGGCCTGGACTTCGCCTGCGATATCTACATCTGGGCACCACTGGCAGGAACATGTGGAGTGCTGCTGCTGTCTCTGGTCATCACCCTGTATTGTTGGGTGAGAAGCAAGAGATCCAGGCTGCTGCACAGCGACTACATGAATATGACACCAAGGAGACCAGGACCAACCAGGAAGCACTATCAGCCTTACGCACCTCCAAGGGACTTCGCAGCATATAGGAGCAGGGTGAAGTTTTCTCGCAGCGCCGATGCCCCAGCCTATcAGCAGGGCCAGAACCAGCTGTACAACGAGCTGAATCTGGGCAGGCGCGAGGAGTACGACGTGCTGGATAAGAGGAGAGGAAGGGATCCAGAGATGGGAGGCAAGCCTAGGCGCAAGAACCCACAGGAGGGCCTGTATAATGAGCTGCAGAAGGACAAGATGGCCGAGGCCTACAGCGAGATCGGCATGAAGGGAGAGAGGAGAAGGGGCAAGGGACACGATGGCCTGTATCAGGGCCTGTCCACAGCCACCAAGGACACCTACGATGCACTGCACATGCAGGCACTGCCACCTAGA (配列番号28)
配列番号28の例において、当該CARの以下の構成要素は、以下のように区切られる:
CD8シグナルペプチド
ATGGCCCTGCCAGTGACCGCCCTGCTGCTGCCACTGGCACTGCTGCTGCACGCAGCAAGGCCA (配列番号29)

FMC63軽鎖
GACATCCAGATGACACAGACCACAAGCTCCCTGTCCGCCTCTCTGGGCGACAGAGTGACCATCTCTTGCAGGGCCAGCCAGGATATCTCCAAGTATCTGAATTGGTACCAGCAGAAGCCTGATGGCACAGTGAAGCTGCTGATCTATCACACCTCTAGACTGCACAGCGGCGTGCCATCCAGGTTTAGCGGCTCCGGCTCTGGCACAGACTACTCTCTGACCATCAGCAATCTGGAGCAGGAGGATATCGCCACCTATTTCTGCCAGCAGGGCAACACACTGCCTTACACCTTTGGCGGCGGCACAAAGCTGGAGATCACC (配列番号30)

リンカー
GGCGGCGGCGGCTCTGGAGGAGGAGGAAGCGGAGGAGGAGGATCC (配列番号31)

重鎖
GAGGTGAAGCTGCAGGAGAGCGGACCAGGACTGGTGGCACCCAGCCAGTCCCTGTCTGTGACATGTACCGTGTCCGGCGTGTCTCTGCCAGACTACGGCGTGAGCTGGATCAGACAGCCACCTAGGAAGGGACTGGAGTGGCTGGGCGTGATCTGGGGCTCCGAGACCACATACTATAACTCCGCCCTGAAGTCTCGGCTGACCATCATCAAGGACAACAGCAAGTCCCAGGTGTTTCTGAAGATGAATTCCCTGCAGACAGACGATACCGCCATCTACTATTGCGCCAAGCACTACTATTACGGCGGCTCTTATGCCATGGATTACTGGGGCCAGGGCACAAGCGTGACCGTGTCTAGC (配列番号32)

CD8aヒンジ
ACCACAACCCCTGCACCAAGACCACCAACACCAGCACCTACCATCGCAAGCCAGCCTCTGTCCCTGAGGCCAGAGGCATGCAGGCCAGCAGCAGGAGGAGCAGTGCACACCAGGGGCCTGGACTTCGCCTGCGAT (配列番号33)

CD8TM
ATCTACATCTGGGCACCACTGGCAGGAACATGTGGAGTGCTGCTGCTGTCTCTGGTCATCACCCTGTATTGTTGGGTG (配列番号34)

CD28共刺激ドメイン
AGAAGCAAGAGATCCAGGCTGCTGCACAGCGACTACATGAATATGACACCAAGGAGACCAGGACCAACCAGGAAGCACTATCAGCCTTACGCACCTCCAAGGGACTTCGCAGCATATAGGAGC (配列番号35)

CD3ゼータ
AGGGTGAAGTTTTCTCGCAGCGCCGATGCCCCAGCCTATcAGCAGGGCCAGAACCAGCTGTACAACGAGCTGAATCTGGGCAGGCGCGAGGAGTACGACGTGCTGGATAAGAGGAGAGGAAGGGATCCAGAGATGGGAGGCAAGCCTAGGCGCAAGAACCCACAGGAGGGCCTGTATAATGAGCTGCAGAAGGACAAGATGGCCGAGGCCTACAGCGAGATCGGCATGAAGGGAGAGAGGAGAAGGGGCAAGGGACACGATGGCCTGTATCAGGGCCTGTCCACAGCCACCAAGGACACCTACGATGCACTGCACATGCAGGCACTGCCACCTAGA (配列番号36)
FMC63-CD8aヒンジ/TM-CD28-CD3zの対応するアミノ酸配列は、以下のとおりである:
MALPVTALLLPLALLLHAARPDIQMTQTTSSLSASLGDRVTISCRASQDISKYLNWYQQKPDGTVKLLIYHTSRLHSGVPSRFSGSGSGTDYSLTISNLEQEDIATYFCQQGNTLPYTFGGGTKLEITGGGGSGGGGSGGGGSEVKLQESGPGLVAPSQSLSVTCTVSGVSLPDYGVSWIRQPPRKGLEWLGVIWGSETTYYNSALKSRLTIIKDNSKSQVFLKMNSLQTDDTAIYYCAKHYYYGGSYAMDYWGQGTSVTVSSTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCWVRSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQPYAPPRDFAAYRSRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR (配列番号37)
配列番号37の例において、当該CARの以下の構成要素は、以下のように区切られる:
CD8シグナルペプチド MALPVTALLLPLALLLHAARP(配列番号38)

FMC63軽鎖
Figure 2022545466000003
(太字がCDRである)(配列番号39)

リンカー GGGGSGGGGSGGGGS(配列番号40)

重鎖
Figure 2022545466000004
(太字の文字がCDRである)(配列番号41)

CD8aヒンジ TTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACD(配列番号42)

CD8TM IYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCWV(配列番号43)

CD28共刺激ドメイン RSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQPYAPPRDFAAYRS(配列番号44)

CD3ゼータ
RVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR (配列番号45)
FMC63-CD28ヒンジ/TM-CD28-CD3z
抗CD19 scFv FMC63、CD28のヒンジおよび膜貫通ドメイン、CD28共刺激ドメイン、ならびにCD3ゼータ(FMC63-CD28ヒンジ/TM-CD28-CD3z)を含む抗CD19 CARの一例は、以下のとおりである:
ATGCTGCTGCTCGTGACCTCCCTGCTGCTGTGCGAGCTGCCACACCCTGCCTTCCTGCTGATCCCTGACATCCAGATGACCCAGACCACAAGCTCCCTGTCCGCCTCTCTGGGCGACAGAGTGACAATCTCTTGTAGGGCCAGCCAGGATATCTCCAAGTATCTGAACTGGTACCAGCAGAAGCCAGATGGCACCGTGAAGCTGCTGATCTATCACACATCTAGGCTGCACAGCGGAGTGCCATCCCGGTTTAGCGGATCCGGATCTGGAACCGACTACTCTCTGACAATCAGCAACCTGGAGCAGGAGGATATCGCCACCTATTTCTGCCAGCAGGGCAATACCCTGCCTTACACATTTGGCGGCGGCACAAAGCTGGAGATCACCGGCAGCACATCCGGATCTGGCAAGCCAGGATCCGGAGAGGGATCTACCAAGGGAGAGGTGAAGCTGCAGGAGAGCGGACCAGGACTGGTGGCACCCAGCCAGTCCCTGTCTGTGACCTGTACAGTGTCCGGCGTGTCTCTGCCAGACTACGGCGTGAGCTGGATCAGGCAGCCACCTAGGAAGGGACTGGAGTGGCTGGGCGTGATCTGGGGCTCCGAGACCACATACTATAATAGCGCCCTGAAGTCCAGACTGACCATCATCAAGGATAACAGCAAGTCCCAGGTGTTCCTGAAGATGAATTCCCTGCAGACCGACGATACAGCCATCTACTATTGCGCCAAGCACTACTATTACGGCGGCTCCTATGCCATGGACTACTGGGGCCAGGGCACCTCTGTGACAGTGTCTAGCGCCGCCGCCATCGAAGTGATGTATCCACCCCCTTACCTGGATAACGAGAAGAGCAATGGCACCATCATCCACGTGAAGGGCAAGCACCTGTGCCCATCTCCCCTGTTCCCTGGCCCAAGCAAGCCCTTTTGGGTGCTGGTGGTGGTGGGAGGCGTGCTGGCCTGTTATTCTCTGCTGGTGACAGTGGCCTTCATCATCTTTTGGGTGAGGAGCAAGCGGAGCAGGCTGCTGCACAGCGACTACATGAACATGACCCCCCGGAGACCCGGCCCTACAAGAAAGCACTATCAGCCTTACGCACCACCAAGGGACTTCGCAGCCTATAGAAGCAGGGTGAAGTTTTCTCGCAGCGCCGATGCACCAGCATATCAGCAGGGACAGAATCAGCTGTACAACGAGCTGAATCTGGGCAGGCGCGAGGAGTACGACGTGCTGGATAAGAGGAGAGGAAGGGATCCTGAGATGGGAGGCAAGCCTAGGCGCAAGAACCCACAGGAGGGCCTGTATAATGAGCTGCAGAAGGACAAGATGGCCGAGGCCTACTCCGAGATCGGCATGAAGGGAGAGCGGAGAAGGGGCAAGGGACACGATGGCCTGTATCAGGGCCTGTCTACCGCCACAAAGGACACCTACGATGCCCTGCACATGCAGGCCCTGCCTCCACGG (配列番号46)

FMC63-CD28ヒンジ/TM-CD28-CD3zのアミノ酸配列は、以下のとおりである:
MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIPDIQMTQTTSSLSASLGDRVTISCRASQDISKYLNWYQQKPDGTVKLLIYHTSRLHSGVPSRFSGSGSGTDYSLTISNLEQEDIATYFCQQGNTLPYTFGGGTKLEITGSTSGSGKPGSGEGSTKGEVKLQESGPGLVAPSQSLSVTCTVSGVSLPDYGVSWIRQPPRKGLEWLGVIWGSETTYYNSALKSRLTIIKDNSKSQVFLKMNSLQTDDTAIYYCAKHYYYGGSYAMDYWGQGTSVTVSSAAAIEVMYPPPYLDNEKSNGTIIHVKGKHLCPSPLFPGPSKPFWVLVVVGGVLACYSLLVTVAFIIFWVRSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQPYAPPRDFAAYRSRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR (配列番号47)

FMC63-CD28ヒンジ-TM CARの核酸配列の別の例は、以下のとおりである:
ATGCTGCTGCTCGTGACCTCCCTGCTGCTGTGCGAGCTGCCACACCCTGCCTTCCTGCTGATCCCTGACATCCAGATGACCCAGACCACAAGCTCCCTGTCCGCCTCTCTGGGCGACAGAGTGACAATCTCTTGTAGGGCCAGCCAGGATATCTCCAAGTATCTGAACTGGTACCAGCAGAAGCCAGATGGCACCGTGAAGCTGCTGATCTATCACACATCTAGGCTGCACAGCGGAGTGCCATCCCGGTTTAGCGGATCCGGATCTGGAACCGACTACTCTCTGACAATCAGCAACCTGGAGCAGGAGGATATCGCCACCTATTTCTGCCAGCAGGGCAATACCCTGCCTTACACATTTGGCGGCGGCACAAAGCTGGAGATCACCGGCAGCACATCCGGATCTGGCAAGCCAGGATCCGGAGAGGGATCTACCAAGGGAGAGGTGAAGCTGCAGGAGAGCGGACCAGGACTGGTGGCACCCAGCCAGTCCCTGTCTGTGACCTGTACAGTGTCCGGCGTGTCTCTGCCAGACTACGGCGTGAGCTGGATCAGGCAGCCACCTAGGAAGGGACTGGAGTGGCTGGGCGTGATCTGGGGCTCCGAGACCACATACTATAATAGCGCCCTGAAGTCCAGACTGACCATCATCAAGGATAACAGCAAGTCCCAGGTGTTCCTGAAGATGAATTCCCTGCAGACCGACGATACAGCCATCTACTATTGCGCCAAGCACTACTATTACGGCGGCTCCTATGCCATGGACTACTGGGGCCAGGGCACCTCTGTGACAGTGTCTAGCATCGAAGTGATGTATCCACCCCCTTACCTGGATAACGAGAAGAGCAATGGCACCATCATCCACGTGAAGGGCAAGCACCTGTGCCCATCTCCCCTGTTCCCTGGCCCAAGCAAGCCCTTTTGGGTGCTGGTGGTGGTGGGAGGCGTGCTGGCCTGTTATTCTCTGCTGGTGACAGTGGCCTTCATCATCTTTTGGGTGAGGAGCAAGCGGAGCAGGCTGCTGCACAGCGACTACATGAACATGACCCCCCGGAGACCCGGCCCTACAAGAAAGCACTATCAGCCTTACGCACCACCAAGGGACTTCGCAGCCTATAGAAGCAGGGTGAAGTTTTCTCGCAGCGCCGATGCACCAGCATATCAGCAGGGACAGAATCAGCTGTACAACGAGCTGAATCTGGGCAGGCGCGAGGAGTACGACGTGCTGGATAAGAGGAGAGGAAGGGATCCTGAGATGGGAGGCAAGCCTAGGCGCAAGAACCCACAGGAGGGCCTGTATAATGAGCTGCAGAAGGACAAGATGGCCGAGGCCTACTCCGAGATCGGCATGAAGGGAGAGCGGAGAAGGGGCAAGGGACACGATGGCCTGTATCAGGGCCTGTCTACCGCCACAAAGGACACCTACGATGCCCTGCACATGCAGGCCCTGCCTCCACGG (配列番号48)

CD28ヒンジ:IEVMYPPPYLDNEKSNGTIIHVKGKHLCPSPLFPGPSKP(配列番号49)

CD28ヒンジ核酸配列 ATCGAAGTGATGTATCCACCCCCTTACCTGGATAACGAGAAGAGCAATGGCACCATCATCCACGTGAAGGGCAAGCACCTGTGCCCATCTCCCCTGTTCCCTGGCCCAAGCAAGCCC(配列番号50)

CD28TMドメイン FWVLVVVGGVLACYSLLVTVAFIIFWV(配列番号51)
FMC63-PD-1ヒンジ-TM CAR
以下の構成要素を有するCARの例は、CSF2RAシグナルペプチド-FMC63軽鎖-リンカー-重鎖-PD1ヒンジ-PD-1TM-CD28共刺激-CD3ゼータは、以下のとおりである:
MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIPDIQMTQTTSSLSASLGDRVTISCRASQDISKYLNWYQQKPDGTVKLLIYHTSRLHSGVPSRFSGSGSGTDYSLTISNLEQEDIATYFCQQGNTLPYTFGGGTKLEITGSTSGSGKPGSGEGSTKGEVKLQESGPGLVAPSQSLSVTCTVSGVSLPDYGVSWIRQPPRKGLEWLGVIWGSETTYYNSALKSRLTIIKDNSKSQVFLKMNSLQTDDTAIYYCAKHYYYGGSYAMDYWGQGTSVTVSSQVPTAHPSPSPRPAGQFQTLVVGVVGGLLGSLVLLVWVLAVIERSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQPYAPPRDFAAYRSRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR (配列番号52)

FMC63-PD-1ヒンジ-TM CARの核酸配列は、以下のとおりである:
ATGCTACTGCTGGTGACCAGCCTCCTGCTGTGCGAGCTGCCCCACCCCGCGTTCCTGCTCATCCCCGACATCCAGATGACCCAGACGACCTCCTCGCTGAGTGCATCACTGGGAGACCGCGTCACCATCTCATGCCGAGCTTCCCAGGACATTTCCAAGTACCTGAACTGGTACCAGCAGAAGCCTGACGGCACCGTCAAGCTGCTTATCTACCACACTAGTCGCCTCCACTCTGGCGTGCCCTCTAGATTTAGTGGCTCCGGCTCGGGCACCGACTACAGCCTGACCATCAGCAACCTGGAACAGGAGGACATAGCCACTTACTTCTGCCAGCAGGGCAACACCCTGCCCTATACCTTCGGCGGCGGCACCAAGCTGGAGATCACGGGTTCGACCTCCGGATCTGGGAAGCCGGGGTCCGGAGAGGGCTCCACTAAGGGTGAGGTGAAGCTCCAGGAGAGCGGGCCTGGGCTGGTAGCGCCCAGCCAGAGCTTATCCGTGACCTGTACCGTGTCGGGAGTCTCGCTGCCTGATTACGGCGTGAGCTGGATTCGCCAGCCGCCCCGCAAAGGCTTGGAATGGCTAGGTGTGATCTGGGGCTCCGAGACCACCTATTACAACTCCGCCCTGAAGTCCCGGCTTACGATCATCAAGGACAACTCCAAGTCTCAGGTGTTCTTGAAGATGAACTCTCTTCAAACAGATGACACCGCCATCTATTACTGTGCCAAGCACTACTACTACGGCGGCAGCTACGCCATGGATTATTGGGGCCAAGGAACTTCTGTTACAGTTTCCTCTCAGGTCCCAACAGCGCATCCCTCTCCAAGCCCGCGTCCCGCTGGACAGTTCCAGACTCTGGTGGTGGGCGTGGTGGGCGGGCTGCTGGGTTCTTTGGTGCTGCTGGTGTGGGTCCTCGCTGTCATTGAGCGCAGCAAGCGCAGCCGCCTGTTGCACAGCGATTACATGAATATGACTCCGCGCCGGCCTGGCCCAACGCGTAAGCACTACCAGCCGTACGCGCCCCCGAGAGACTTCGCTGCATACAGGTCCCGCGTAAAATTTTCGCGCTCTGCGGACGCTCCTGCCTATCAGCAGGGTCAGAACCAGCTGTACAATGAGCTCAACCTGGGCCGTAGGGAGGAGTACGATGTGCTCGACAAACGCCGTGGTCGGGACCCGGAGATGGGCGGTAAACCTCGGCGCAAGAATCCTCAGGAGGGCCTTTACAACGAGCTGCAGAAGGACAAAATGGCCGAGGCCTACTCCGAGATCGGTATGAAGGGGGAACGCCGTCGCGGCAAGGGCCACGATGGATTGTATCAGGGCCTGTCCACCGCCACCAAGGACACCTACGACGCCCTGCATATGCAGGCCTTGCCGCCCCGC (配列番号53)

PD-1ヒンジ QVPTAHPSPSPRPAGQFQTLV(配列番号54)

PD-1 TMドメイン VGVVGGLLGSLVLLVWVLAVI(配列番号55)
FMC63-CTLA4ヒンジ-TM CAR:
CSF2RAシグナルペプチド-FMC63軽鎖-リンカー-重鎖-CTLA4ヒンジ-CTLA-4 TM-CD28共刺激-CD3ゼータ
MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIPDIQMTQTTSSLSASLGDRVTISCRASQDISKYLNWYQQKPDGTVKLLIYHTSRLHSGVPSRFSGSGSGTDYSLTISNLEQEDIATYFCQQGNTLPYTFGGGTKLEITGSTSGSGKPGSGEGSTKGEVKLQESGPGLVAPSQSLSVTCTVSGVSLPDYGVSWIRQPPRKGLEWLGVIWGSETTYYNSALKSRLTIIKDNSKSQVFLKMNSLQTDDTAIYYCAKHYYYGGSYAMDYWGQGTSVTVSSvidpepcpdsdfllwilaavssglffysflltaRSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQPYAPPRDFAAYRSRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR (配列番号56)

ATGTTACTGCTCGTTACTTCGCTGCTGCTGTGCGAGCTGCCACACCCCGCGTTCTTGCTGATTCCGGATATCCAGATGACCCAGACGACCTCCTCCCTCTCCGCTAGTCTGGGGGACCGCGTGACCATCTCATGCCGAGCTTCCCAGGACATCTCTAAGTACCTGAACTGGTACCAACAGAAGCCCGATGGGACCGTGAAGTTGCTCATTTACCACACCTCTCGTCTACACAGTGGTGTCCCTTCTCGCTTCTCGGGATCCGGTTCTGGTACAGATTACTCCTTGACCATCTCAAATCTTGAACAGGAGGACATCGCCACTTATTTCTGTCAGCAGGGCAACACGCTTCCGTACACCTTCGGCGGCGGTACTAAGCTGGAGATCACCGGCTCGACCAGCGGCTCGGGCAAGCCCGGCTCCGGCGAAGGCAGCACCAAGGGCGAGGTGAAGCTCCAGGAGAGCGGACCCGGACTGGTGGCGCCAAGCCAGAGCCTGTCTGTGACCTGCACCGTGTCCGGCGTATCTCTGCCCGACTACGGCGTTAGTTGGATCCGCCAGCCGCCCCGCAAAGGCCTGGAGTGGCTAGGGGTCATATGGGGCTCCGAGACCACATACTACAACAGCGCACTGAAATCCCGCTTGACCATCATCAAGGACAACAGCAAGAGCCAGGTGTTCCTGAAGATGAATTCCTTGCAGACTGATGACACCGCCATCTATTACTGTGCTAAGCACTATTACTACGGTGGCAGCTACGCGATGGATTATTGGGGCCAGGGAACTTCTGTGACGGTGTCCTCCGTGATTGACCCGGAGCCATGTCCTGACAGTGACTTCCTGCTTTGGATCCTGGCCGCTGTCTCTTCTGGCCTTTTCTTTTACTCCTTCCTGCTGACAGCCAGGAGCAAGCGCAGCCGCCTGTTGCACTCCGACTACATGAACATGACTCCTCGCCGCCCCGGGCCAACCCGCAAGCACTACCAACCCTATGCTCCCCCGCGCGACTTTGCGGCCTACAGATCACGAGTCAAATTTAGCCGCTCGGCGGACGCTCCTGCCTACCAGCAGGGACAGAACCAGCTTTACAACGAGCTCAACCTGGGCAGAAGGGAGGAGTACGATGTGCTGGACAAGCGTCGCGGCCGGGACCCCGAGATGGGCGGTAAGCCTCGGCGCAAGAACCCTCAGGAGGGCCTGTACAACGAGCTGCAGAAGGACAAAATGGCCGAGGCTTATTCGGAAATCGGTATGAAGGGGGAGCGGCGTCGTGGCAAAGGTCATGACGGCCTCTACCAGGGGCTGTCCACCGCCACCAAAGATACCTACGACGCATTACATATGCAGGCCCTGCCGCCGAGG (配列番号57)

CSF2RAシグナルペプチド MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIP(配列番号58)

CTLA4ヒンジ VIDPEPCPDSD(配列番号59)

CTLA4 TMドメイン FLLWILAAVSSGLFFYSFLLT(配列番号60)
B.T細胞レセプター(TCR)
いくつかの実施形態において、遺伝的に操作された抗原レセプターには、組換えTCR、および/または天然に存在するT細胞からクローニングされたTCRが含まれる。「T細胞レセプター」または「TCR」とは、可変α鎖および可変β鎖(それぞれTCRαおよびTCRβとしても知られる)または可変γ鎖および可変δ鎖(それぞれTCRγおよびTCRδとしても知られる)を含む分子であって、MHCレセプターに結合した抗原ペプチドに特異的に結合することができる分子のことを指す。いくつかの実施形態において、TCRは、αβ型である。代替の実施形態において、上記細胞は、操作されたTCRを欠き;例えば、その細胞内の内在性のTCRが、癌または感染症を標的化し得る(例えば、内在性TCRを有するCMVまたはEBV特異的T細胞)。
通常、αβ型およびγδ型として存在するTCRは、一般に構造が似ているが、それらを発現しているT細胞は、解剖学的位置または機能が異なり得る。TCRは、細胞表面上にまたは可溶型として見られ得る。一般に、TCRは、T細胞(またはTリンパ球)の表面上に見られ、通常、その表面上で、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)分子に結合した抗原の認識に関与する。いくつかの実施形態において、TCRは、定常ドメイン、膜貫通ドメイン、および/または短い細胞質テイルも含み得る(例えば、Janeway et al,1997を参照のこと)。例えば、いくつかの態様において、TCRの各鎖は、1つのN末端免疫グロブリン可変ドメイン、1つの免疫グロブリン定常ドメイン、膜貫通領域、およびC末端に短い細胞質テイルを有し得る。いくつかの実施形態において、TCRは、シグナル伝達の媒介に関わるCD3複合体のインバリアントタンパク質と会合される。別段述べられない限り、用語「TCR」は、その機能的TCRフラグメントを包含すると理解されるべきである。この用語は、αβ型またはγδ型のTCRをはじめとしたインタクトなまたは完全長のTCRも包含する。
したがって、本明細書中の目的では、TCRへの言及には、任意のTCRまたは機能的フラグメント(例えば、MHC分子において結合した特異的な抗原ペプチド、すなわち、MHC-ペプチド複合体に結合するTCRの抗原結合部分)が含まれる。交換可能に使用され得る、TCRの「抗原結合部分」または抗原結合フラグメントとは、TCRの構造ドメインの一部しか含まないが、完全なTCRが結合する抗原(例えば、MHC-ペプチド複合体)に結合する分子のことを指す。いくつかの場合において、抗原結合部分は、特異的なMHC-ペプチド複合体に結合するための結合部位を形成するのに十分なTCRの可変ドメイン(例えば、TCRの可変a鎖および可変β鎖)を含み、例えば一般に、各鎖が3つの相補性決定領域を含む。
いくつかの実施形態において、TCR鎖の可変ドメインは、会合してループ、または免疫グロブリンに類似の相補性決定領域(CDR)を形成し、それにより、抗原認識がもたらされ、TCR分子の結合部位を形成することによってペプチド特異性が決定され、ペプチド特異性が決定される。通常、免疫グロブリンと同様に、CDRは、フレームワーク領域(FR)によって隔てられる(例えば、Jores et al.,1990;Chothia et al.,1988;Lefranc et al.,2003を参照のこと)。いくつかの実施形態において、CDR3は、プロセシングされた抗原の認識に関与する主要なCDRであるが、アルファ鎖のCDR1は、抗原ペプチドのN末端部と相互作用するとも示されているのに対して、ベータ鎖のCDR1は、そのペプチドのC末端部と相互作用する。CDR2は、MHC分子を認識すると考えられている。いくつかの実施形態において、β鎖の可変領域は、さらなる超可変性(HV4)領域を含み得る。
いくつかの実施形態において、TCR鎖は、定常ドメインを含む。例えば、免疫グロブリンと同様に、TCR鎖の細胞外の部分(例えば、a鎖、β鎖)は、2つの免疫グロブリンドメインである、N末端における可変ドメイン(例えば、VまたはVp;通常、KabatナンバリングであるKabat et al.,“Sequences of Proteins of Immunological Interest,US Dept.Health and Human Services,Public Health Service National Institutes of Health,1991,5th ed.に基づくアミノ酸1~116)、および細胞膜に隣接した1つの定常ドメイン(例えば、a鎖定常ドメインまたはC、通常、Kabatに基づくアミノ酸117~259、β鎖定常ドメインまたはCp、通常、Kabatに基づくアミノ酸117~295)を含み得る。例えば、いくつかの場合、それらの2本の鎖によって形成されるTCRの細胞外の部分は、2つの膜近位定常ドメイン、およびCDRを含む2つの膜遠位可変ドメインを含む。TCRドメインの定常ドメインは、システイン残基がジスルフィド結合を形成する短い接続配列を含み、それにより、それらの2本の鎖の間に連結が形成される。いくつかの実施形態では、TCRが、定常ドメインに2つのジスルフィド結合を含むように、そのTCRは、α鎖およびβ鎖の各々に追加のシステイン残基を有してもよい。
いくつかの実施形態において、TCR鎖は、膜貫通ドメインを含み得る。いくつかの実施形態において、膜貫通ドメインは、正に帯電している。いくつかの場合において、TCR鎖は、細胞質テイルを含む。いくつかの場合において、その構造のおかげで、TCRはCD3のような他の分子と会合することができる。例えば、膜貫通領域とともに定常ドメインを含むTCRは、そのタンパク質を細胞膜に固定し得、CD3シグナル伝達装置または複合体のインバリアントサブユニットと会合し得る。
一般に、CD3は、哺乳動物においては3つの異なる鎖(γ、δおよびε)およびζ鎖を有し得る多タンパク質複合体である。例えば、哺乳動物では、この複合体は、CD3γ鎖、CD3δ鎖、2つのCD3ε鎖、およびホモ二量体のCD3ζ鎖を含み得る。CD3γ鎖、CD3δ鎖およびCD3ε鎖は、単一の免疫グロブリンドメインを含む免疫グロブリンスーパーファミリーの高度に関連した細胞表面タンパク質である。CD3γ鎖、CD3δ鎖およびCD3ε鎖の膜貫通領域は、負に帯電しており、これは、これらの鎖が、正に帯電したT細胞レセプター鎖と会合できるようにする特性である。CD3γ鎖、CD3δ鎖およびCD3ε鎖の各細胞内テイルは、免疫受容活性化チロシンモチーフまたはITAMとして知られる保存された単一のモチーフを含むのに対して、各CD3ζ鎖は、3つ含む。一般に、ITAMは、TCR複合体のシグナル伝達能に関わる。これらのアクセサリー分子は、負に帯電した膜貫通領域を有し、TCRから細胞へのシグナルの伝播において役割を果たす。CD3鎖およびζ鎖は、TCRと一体となって、T細胞レセプター複合体として知られる複合体を形成する。
いくつかの実施形態において、TCRは、2本の鎖αおよびβ(または必要に応じてγおよびδ)のヘテロ二量体であり得るか、または一本鎖TCR構築物であり得る。いくつかの実施形態において、TCRは、ジスルフィド結合などによって連結された2本の別個の鎖(α鎖とβ鎖またはγ鎖とδ鎖)を含むヘテロ二量体である。いくつかの実施形態において、標的抗原(例えば、癌抗原)に対するTCRが特定され、細胞に導入される。いくつかの実施形態において、TCRをコードする核酸ポリマーは、公的に入手可能なTCR DNA配列のポリメラーゼ連鎖反応(PCR)増幅などによって、種々の起源から得ることができる。いくつかの実施形態において、TCRは、生物学的起源、例えば、細胞、例えば、T細胞(例えば、細胞傷害性T細胞)、T細胞ハイブリドーマまたは他の公的に入手可能な起源から得られる。いくつかの実施形態において、T細胞は、インビボで単離された細胞から得ることができる。いくつかの実施形態において、高親和性T細胞クローンが、患者から単離され得、TCRが単離され得る。いくつかの実施形態において、T細胞は、培養されたT細胞ハイブリドーマまたはクローンであり得る。いくつかの実施形態において、標的抗原に対するTCRクローンは、ヒト免疫系遺伝子(例えば、ヒト白血球抗原系すなわちHLA)で操作されたトランスジェニックマウスにおいて産生されたクローンである。例えば、腫瘍抗原(例えば、Parkhurst et al.,2009およびCohen et al.,2005)を参照のこと。いくつかの実施形態では、ファージディスプレイを用いて、標的抗原に対するTCRが単離される(例えば、Varela-Rohena et al.,2008およびLi,2005を参照のこと)。いくつかの実施形態において、TCRまたはその抗原結合部分は、TCRの配列の知識によって合成的に作製され得る。
C.抗原提示細胞
マクロファージ、Bリンパ球および樹状細胞を含む抗原提示細胞は、特定のMHC分子の発現によって識別される。APCは、抗原を内部移行し、その抗原の一部をMHC分子とともにその細胞膜の外膜上に再発現する。MHCは、複数の遺伝子座を含む大きな遺伝子複合体である。MHC遺伝子座は、クラスIおよびクラスII MHCと称されるMHC膜分子の主要な2クラスをコードする。Tヘルパーリンパ球は、一般に、MHCクラスII分子と会合した抗原を認識し、T細胞傷害性リンパ球は、MHCクラスI分子と会合した抗原を認識する。MHCは、ヒトではHLA複合体と称され、マウスではH-2複合体と称される。
いくつかの場合において、上記実施形態の治療的組成物および細胞療法用の生成物を調製する際には、aAPCが有用である。抗原提示システムの調製および使用に関する一般的ガイダンスについては、例えば、米国特許第6,225,042号、同第6,355,479号、同第6,362,001号および同第6,790,662号;米国特許出願公開第2009/0017000号および同第2009/0004142号;ならびに国際公開番号WO2007/103009を参照のこと。
aAPCシステムは、少なくとも1つの外来性の補助分子を含み得る。任意の好適な数および組み合わせの補助分子が使用され得る。補助分子は、共刺激分子および接着分子などの補助分子から選択され得る。例示的な共刺激分子としては、CD86、CD64(FcγRI)、41BBリガンドおよびIL-21が挙げられる。接着分子としては、例えば細胞間の接触または細胞とマトリックスとの接触を促進する、セレクチンなどの糖結合糖タンパク質、インテグリンなどの膜貫通結合糖タンパク質、カドヘリンなどのカルシウム依存性タンパク質、および細胞間接着分子(ICAM)などの1回膜貫通型免疫グロブリン(Ig)スーパーファミリータンパク質が挙げられ得る。例示的な接着分子としては、LFA-3、およびICAM-1などのICAMが挙げられる。共刺激分子および接着分子をはじめとした例示的な補助分子の選択、クローニング、調製および発現に有用な手法、方法および試薬は、例えば、米国特許第6,225,042号、同第6,355,479号および同第6,362,001号に例証されている。
D.抗原
遺伝的に操作された抗原レセプターまたは無限免疫細胞上の天然に発現される抗原レセプター(例えば、TCR)によって標的化される抗原には、養子細胞療法を介して標的化される疾患、状態または細胞型の状況において発現される抗原が含まれる。それらの疾患および状態には、血液癌、免疫系の癌(例えば、リンパ腫、白血病および/またはミエローマ、例えば、B、Tおよび骨髄性白血病、リンパ腫ならびに多発性骨髄腫)をはじめとした癌および腫瘍を含む、増殖性、腫瘍性および悪性の疾患および障害が含まれる。いくつかの実施形態において、抗原は、正常細胞もしくは正常組織または非標的化細胞もしくは非標的化組織と比べて、その疾患または状態の細胞上、例えば、腫瘍細胞上または病原性細胞上に、選択的に発現されるかまたは過剰発現される。他の実施形態において、抗原は、正常細胞上に発現され、かつ/または操作された細胞上に発現される。
任意の好適な抗原が、本方法において使用され得る。例示的な抗原としては、感染性物質、自己(auto)抗原/自己(self)抗原、腫瘍関連抗原/癌関連抗原、および腫瘍新抗原に由来する抗原性分子(Linnemann et al.,2015)が挙げられるが、これらに限定されない。特定の態様において、それらの抗原には、CD19、CD20、CD22、CD30、CD70、CD79a、CD79b、SLAM-F7NY-ESO、EGFRvIII、Muc-1、Her2、CA-125、WT-1、Mage-A3、Mage-A4、Mage-A10、TRAIL/DR4、CEAが含まれる。特定の態様において、1つまたは2つ以上の抗原レセプターに対する抗原としては、CD19、EBNA、WT1、CD123、NY-ESO、EGFRvIII、MUC1、HER2、CA-125、WT1、Mage-A3、Mage-A4、Mage-A10、TRAIL/DR4および/またはCEAが挙げられるが、これらに限定されない。これらの抗原に対する配列は、当該分野で公知であり、例えば、以下のものである:CD19(アクセッション番号NG_007275.1)、EBNA(アクセッション番号NG_002392.2)、WT1(アクセッション番号NG_009272.1)、CD123(アクセッション番号NC_000023.11)、NY-ESO(アクセッション番号NC_000023.11)、EGFRvIII(アクセッション番号NG_007726.3)、MUC1(アクセッション番号NG_029383.1)、HER2(アクセッション番号NG_007503.1)、CA-125(アクセッション番号NG_055257.1)、WT1(アクセッション番号NG_009272.1)、Mage-A3(アクセッション番号NG_013244.1)、Mage-A4(アクセッション番号NG_013245.1)、Mage-A10(アクセッション番号NC_000023.11)、TRAIL/DR4(アクセッション番号NC_000003.12)、および/またはCEA(アクセッション番号NC_000019.10)。
腫瘍関連抗原は、前立腺癌、乳癌、直腸結腸癌、肺癌、膵臓癌、腎癌、中皮腫、卵巣癌または黒色腫に由来し得る。例示的な腫瘍関連抗原または腫瘍細胞由来抗原としては、MAGE1、3およびMAGE4(または他のMAGE抗原、例えば、国際特許公開番号WO99/40188に開示されているもの);PRAME;BAGE;RAGE、Lage(NY ESO1としても知られる);SAGE;およびHAGEまたはGAGEが挙げられる。腫瘍抗原のこれらの非限定的な例は、黒色腫、肺癌、肉腫および膀胱癌などの広範囲の腫瘍タイプにおいて発現される。例えば、米国特許第6,544,518号を参照のこと。前立腺癌の腫瘍関連抗原としては、例えば、前立腺特異的膜抗原(PSMA)、前立腺特異的抗原(PSA)、前立腺酸性リン酸塩、NKX3.1および前立腺の6回膜貫通上皮抗原(STEAP)が挙げられる。
他の腫瘍関連抗原としては、Plu-1、HASH-1、HasH-2、CriptoおよびCriptinが挙げられる。さらに、腫瘍抗原は、多くの癌の処置において有用な自己ペプチドホルモン、例えば、短い10アミノ酸長のペプチドである完全長の性腺刺激ホルモン放出ホルモン(GnRH)であり得る。
腫瘍抗原には、HER-2/neuの発現などの腫瘍関連抗原の発現を特徴とする癌に由来する腫瘍抗原が含まれる。目的の腫瘍関連抗原には、系列特異的腫瘍抗原、例えば、メラノサイト-黒色腫系列抗原MART-1/Melan-A、gp100、gp75、mda-7、チロシナーゼおよびチロシナーゼ関連タンパク質が含まれる。例証的な腫瘍関連抗原としては、p53、Ras、c-Myc、細胞質セリン/トレオニンキナーゼ(例えば、A-Raf、B-RafおよびC-Raf、サイクリン依存性キナーゼ)、MAGE-A1、MAGE-A2、MAGE-A3、MAGE-A4、MAGE-A6、MAGE-A10、MAGE-A12、MART-1、BAGE、DAM-6、-10、GAGE-1、-2、-8、GAGE-3、-4、-5、-6、-7B、NA88-A、MART-1、MC1R、Gp100、PSA、PSM、チロシナーゼ、TRP-1、TRP-2、ART-4、CAMEL、CEA、Cyp-B、hTERT、hTRT、iCE、MUC1、MUC2、ホスホイノシチド3-キナーゼ(PI3K)、TRKレセプター、PRAME、P15、RU1、RU2、SART-1、SART-3、ウィルムス腫瘍抗原(WT1)、AFP、-カテニン/m、カスパーゼ-8/m、CEA、CDK-4/m、ELF2M、GnT-V、G250、HSP70-2M、HST-2、KIAA0205、MUM-1、MUM-2、MUM-3、ミオシン/m、RAGE、SART-2、TRP-2/INT2、707-AP、アネキシンII、CDC27/m、TPI/mbcr-abl、BCR-ABL、インターフェロン制御因子4(IRF4)、ETV6/AML、LDLR/FUT、Pml/RAR、腫瘍関連カルシウムシグナル伝達物質1(TACSTD1)TACSTD2、レセプターチロシンキナーゼ(例えば、上皮成長因子レセプター(EGFR)(特に、EGFRvIII)、血小板由来成長因子レセプター(PDGFR)、血管内皮成長因子レセプター(VEGFR))、細胞質チロシンキナーゼ(例えば、srcファミリー、syk-ZAP70ファミリー)、インテグリン結合キナーゼ(ILK)、シグナル伝達性転写因子STAT3、STATSおよびSTATE、低酸素誘導因子(例えば、HIF-1およびHIF-2)、核因子-カッパーB(NF-B)、Notchレセプター(例えば、Notch1~4)、c-Met、ラパマイシンの哺乳動物標的(mTOR)、WNT、細胞外シグナル制御キナーゼ(ERK)およびそれらの調節サブユニット、PMSA、PR-3、MDM2、メソテリン、腎細胞癌-5T4、SM22-アルファ、炭酸脱水酵素I(CAI)およびIX(CAIX)(G250としても知られる)、STEAD、TEL/AML1、GD2、プロテイナーゼ3、hTERT、肉腫転座切断点(sarcoma translocation breakpoints)、EphA2、ML-IAP、EpCAM、ERG(TMPRSS2 ETS融合遺伝子)、NA17、PAX3、ALK、アンドロゲンレセプター、サイクリンB1、ポリシアル酸、MYCN、RhoC、GD3、フコシルGM1、メソテリアン(mesothelian)、PSCA、sLe、PLAC1、GM3、BORIS、Tn、GLoboH、NY-BR-1、RGsS、SART3、STn、PAX5、OY-TES1、精子タンパク質17、LCK、HMWMAA、AKAP-4、SSX2、XAGE1、B7H3、レグマイン(legumain)、TIE2、Page4、MAD-CT-1、FAP、MAD-CT-2、fos関連抗原1、CBX2、CLDN6、SPANX、TPTE、ACTL8、ANKRD30A、CDKN2A、MAD2L1、CTAG1B、SUNC1、LRRN1ならびにイディオタイプのうちのいずれか1つ以上に由来するかまたはいずれか1つ以上を含む腫瘍抗原が挙げられるが、これらに限定されない。
抗原は、腫瘍細胞において変異した遺伝子由来の、または正常細胞と比べて腫瘍細胞において異なるレベルで転写される遺伝子由来の、エピトープ領域またはエピトープペプチド(例えば、テロメラーゼ酵素、サバイビン、メソテリン、変異型ras、bcr/abl再配列、Her2/neu、変異型または野生型p53、シトクロムP450 1B1、およびN-アセチルグルコサミン転移酵素-Vなどの異常に発現されるイントロン配列);ミエローマおよびB細胞リンパ腫においてユニークなイディオタイプを生成する免疫グロブリン遺伝子のクローン性再配列;オンコウイルスのプロセスに由来するエピトープ領域またはエピトープペプチドを含む腫瘍抗原(例えば、ヒトパピローマウイルスタンパク質E6およびE7);エプスタイン・バーウイルスタンパク質LMP2;腫瘍選択的に発現する変異していない腫瘍胎児性タンパク質(例えば、癌胎児抗原およびアルファ-フェトプロテイン)を含み得る。
ある特定の実施形態において、抗原は、微生物の抗原であり得る。いくつかの実施形態において、抗原は、病原性微生物または日和見病原性微生物(本明細書中で感染症微生物とも呼ばれる)(例えば、ウイルス、真菌、寄生生物および細菌)から得られるかまたはそれらに由来する。ある特定の実施形態において、そのような微生物に由来する抗原には、完全長タンパク質が含まれる。
本明細書中に記載される方法において使用が企図される抗原を有する例証的な病原性生物としては、ヒト免疫不全ウイルス(HIV)、単純ヘルペスウイルス(HSV)、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)、サイトメガロウイルス(CMV)、エプスタイン・バーウイルス(EBV)、インフルエンザA、BおよびC、水疱性口内炎ウイルス(VSV)、水疱性口内炎ウイルス(VSV)、ポリオーマウイルス(例えば、BKウイルスおよびJCウイルス)、アデノウイルス、SARS-CoV、SARS-CoV-2またはMERSなどのコロナウイルス、メチシリン耐性Staphylococcus aureus(MRSA)を含むブドウ球菌属の種、ならびにStreptococcus pneumoniaeを含む連鎖球菌属の種が挙げられる。当業者が理解するように、本明細書中に記載されるような抗原として使用するためのこれらおよび他の病原性微生物に由来するタンパク質、ならびにそれらのタンパク質をコードするヌクレオチド配列は、刊行物ならびにGENBANK(登録商標)、SWISS-PROT(登録商標)およびTREMBL(登録商標)などの公的データベースにおいて特定され得る。
ヒト免疫不全ウイルス(HIV)に由来する抗原には、HIVビリオン構造タンパク質(例えば、gp120、gp41、p17、p24)、プロテアーゼ、逆転写酵素、またはtat、rev、nef、vif、vprおよびvpuによってコードされるHIVタンパク質のうちのいずれかが含まれる。
単純ヘルペスウイルス(例えば、HSV1およびHSV2)に由来する抗原としては、HSV後期遺伝子から発現されるタンパク質が挙げられるが、これらに限定されない。後期群の遺伝子は、ビリオン粒子を形成するタンパク質を主にコードする。そのようなタンパク質としては、ウイルスキャプシドを形成する(UL)の5つのタンパク質:UL6、UL18、UL35、UL38ならびに主要キャプシドタンパク質UL19、UL45およびUL27が挙げられ、これらの各々が、本明細書中に記載されるような抗原として使用され得る。本明細書中で抗原としての使用が企図される他の例証的なHSVタンパク質としては、ICP27(H1、H2)、糖タンパク質B(gB)および糖タンパク質D(gD)タンパク質が挙げられる。HSVゲノムは、少なくとも74個の遺伝子を含み、その各々が、抗原として使用され得る可能性があるタンパク質をコードする。
サイトメガロウイルス(CMV)に由来する抗原としては、CMV構造タンパク質、ウイルス複製の前初期および初期に発現されるウイルス抗原、糖タンパク質IおよびIII、キャプシドタンパク質、コートタンパク質、低分子マトリックスタンパク質(lower matrix protein)pp65(ppUL83)、p52(ppUL44)、IE1および1E2(UL123およびUL122)、UL128~UL150の遺伝子クラスターのタンパク質産物(Rykman,et al.,2006)、エンベロープ糖タンパク質B(gB)、gH、gN、ならびにpp150が挙げられる。当業者が理解するように、本明細書中に記載される抗原として使用するためのCMVタンパク質は、GENBANK(登録商標)、SWISS-PROT(登録商標)およびTREMBL(登録商標)などの公的データベースにおいて特定され得る(例えば、Bennekov et al.,2004;Loewendorf et al.,2010;Marschall et al.,2009を参照のこと)。
ある特定の実施形態において使用が企図されるエプスタイン・バンウイルス(EBV)に由来する抗原としては、EBV溶解性タンパク質gp350およびgp110、エプスタイン・バン核抗原(EBNA)-1、EBNA-2、EBNA-3A、EBNA-3B、EBNA-3C、EBNA-リーダータンパク質(EBNA-LP)、ならびに潜伏感染膜タンパク質(LMP)-1、LMP-2AおよびLMP-2Bを含む、潜伏感染サイクル中に生成されるEBVタンパク質が挙げられる(例えば、Lockey et al.,2008を参照のこと)。
本明細書中で使用が企図される呼吸器合胞体ウイルス(RSV)に由来する抗原には、RSVゲノムによってコードされる11個のタンパク質またはそれらの抗原性フラグメント:NS1、NS2、N(ヌクレオキャプシドタンパク質)、M(マトリックスタンパク質)SH、GおよびF(ウイルスコートタンパク質)、M2(第2のマトリックスタンパク質)、M2-1(伸長因子)、M2-2(転写制御)、RNAポリメラーゼ、ならびにリンタンパク質Pのうちのいずれかが含まれる。
使用が企図される水疱性口内炎ウイルス(VSV)に由来する抗原には、VSVゲノムによってコードされる主要な5つのタンパク質およびそれらの抗原性フラグメント:巨大タンパク質(L)、糖タンパク質(G)、核タンパク質(N)、リンタンパク質(P)およびマトリックスタンパク質(M)のうちのいずれか1つが含まれる(例えば、Rieder et al.,1999を参照のこと)。
ある特定の実施形態において使用が企図されるインフルエンザウイルスに由来する抗原としては、赤血球凝集素(HA)、ノイラミニダーゼ(NA)、核タンパク質(NP)、マトリックスタンパク質M1およびM2、NS1、NS2(NEP)、PA、PB1、PB1-F2、ならびにPB2が挙げられる。
例示的なウイルス抗原としては、アデノウイルスのポリペプチド、アルファウイルスのポリペプチド、カリシウイルスのポリペプチド(例えば、カリシウイルスのキャプシド抗原)、コロナウイルスのポリペプチド、ジステンパーウイルスのポリペプチド、エボラウイルスのポリペプチド、エンテロウイルスのポリペプチド、フラビウイルスのポリペプチド、肝炎ウイルス(AE)のポリペプチド(B型肝炎コアまたは表面抗原、C型肝炎ウイルスのE1もしくはE2糖タンパク質、コアまたは非構造タンパク質)、ヘルペスウイルスのポリペプチド(単純ヘルペスウイルスまたは水痘帯状疱疹ウイルスの糖タンパク質を含む)、感染性腹膜炎ウイルスのポリペプチド、白血病ウイルスのポリペプチド、マールブルグウイルスのポリペプチド、オルトミクソウイルスのポリペプチド、パピローマウイルスのポリペプチド、パラインフルエンザウイルスのポリペプチド(例えば、赤血球凝集素ポリペプチドおよびノイラミニダーゼポリペプチド)、パラミクソウイルスのポリペプチド、パルボウイルスのポリペプチド、ペスチウイルスのポリペプチド、ピコルナウイルスのポリペプチド(例えば、ポリオウイルスのキャプシドポリペプチド)、ポックスウイルスのポリペプチド(例えば、ワクシニアウイルスのポリペプチド)、狂犬病ウイルスのポリペプチド(例えば、狂犬病ウイルスの糖タンパク質G)、レオウイルスのポリペプチド、レトロウイルスのポリペプチド、およびロタウイルスのポリペプチドも挙げられるが、これらに限定されない。
ある特定の実施形態において、抗原は、細菌抗原であり得る。ある特定の実施形態において、目的の細菌抗原は、分泌型ポリペプチドであり得る。他のある特定の実施形態において、細菌抗原には、細菌の細胞外面上に露出したポリペプチドの一部を有する抗原が含まれる。
使用が企図される、メチシリン耐性Staphylococcus aureus(MRSA)を含むブドウ球菌属の種に由来する抗原としては、ビルレンス制御因子、例えば、Agrシステム、SarおよびSae、Arlシステム、Sarホモログ(Rot、MgrA、SarS、SarR、SarT、SarU、SarV、SarX、SarZおよびTcaR)、SrrシステムならびにTRAPが挙げられる。抗原として役立ち得る他のブドウ球菌属のタンパク質としては、Clpタンパク質、HtrA、MsrR、アコニターゼ、CcpA、SvrA、Msa、CfvAおよびCfvBが挙げられる(例えば、Staphylococcus:Molecular Genetics,2008 Caister Academic Press,Ed.Jodi Lindsayを参照のこと)。Staphylococcus aureusの2種(N315およびMu50)のゲノムが、配列決定済みであり、例えば、PATRIC(PATRIC:The VBI PathoSystems Resource Integration Center,Snyder et al.,2007)において公的に入手可能である。当業者が理解するように、抗原として使用するためのブドウ球菌属のタンパク質は、GenBank(登録商標)、Swiss-Prot(登録商標)およびTrEMBL(登録商標)などの他の公的データベースにおいても特定され得る。
本明細書中に記載されるある特定の実施形態において使用が企図されるStreptococcus pneumoniaeに由来する抗原としては、ニューモリシン、PspA、コリン結合タンパク質A(CbpA)、NanA、NanB、SpnHL、PavA、LytA、Phtおよびピリンタンパク質(RrgA;RrgB;RrgC)が挙げられる。Streptococcus pneumoniaeの抗原性タンパク質も、当該分野で公知であり、いくつかの実施形態において抗原として使用され得る(例えば、Zysk et al.,2000を参照のこと)。Streptococcus pneumoniaeの毒性株の全ゲノム配列は、配列決定済みであり、当業者が理解するように、本明細書中で使用するためのS.pneumoniaeタンパク質は、GENBANK(登録商標)、SWISS-PROT(登録商標)およびTREMBL(登録商標)などの他の公的データベースにおいても特定され得る。本開示に係る抗原として特に興味深いタンパク質としては、肺炎球菌の表面に露出すると予測される病原性因子およびタンパク質が挙げられる(例えば、Frolet et al.,2010を参照のこと)。
抗原として使用され得る細菌抗原の例としては、アクチノマイセス属のポリペプチド、バチルス属のポリペプチド、バクテロイデス属のポリペプチド、ボルデテラ属のポリペプチド、バルトネラ属のポリペプチド、ボレリア属のポリペプチド(例えば、B.burgdorferi OspA)、ブルセラ属のポリペプチド、カンピロバクター属のポリペプチド、キャプノサイトファーガ属のポリペプチド、クラミジア属のポリペプチド、コリネバクテリウム属のポリペプチド、コクシエラ属のポリペプチド、デルマトフィルス属のポリペプチド、エンテロコッカス属のポリペプチド、エーリキア属のポリペプチド、エシェリキア属のポリペプチド、フランシセラ属のポリペプチド、フソバクテリウム属のポリペプチド、ヘモバルトネラ属のポリペプチド、ヘモフィルス属のポリペプチド(例えば、H.influenzae b型外膜タンパク質)、ヘリコバクター属のポリペプチド、クレブシエラ属のポリペプチド、L型細菌のポリペプチド、レプトスピラ属のポリペプチド、リステリア属のポリペプチド、マイコバクテリウム属のポリペプチド、マイコプラズマ属のポリペプチド、ナイセリア属のポリペプチド、ネオリケッチア属のポリペプチド、ノカルジア属のポリペプチド、パスツレラ属のポリペプチド、ペプトコッカス属のポリペプチド、ペプトストレプトコッカス属のポリペプチド、肺炎球菌のポリペプチド(すなわち、S.pneumoniaeのポリペプチド)(本明細書中の説明を参照のこと)、プロテウス属のポリペプチド、シュードモナス属のポリペプチド、リケッチア属のポリペプチド、ロシャリメア属のポリペプチド、サルモネラ属のポリペプチド、シゲラ属のポリペプチド、ブドウ球菌属のポリペプチド、A群連鎖球菌のポリペプチド(例えば、S.pyogenesのMタンパク質)、B群連鎖球菌(S.agalactiae)のポリペプチド、トレポネーマ属のポリペプチド、およびエルシニア属のポリペプチド(例えば、Y pestisのF1およびV抗原)が挙げられるが、これらに限定されない。
真菌抗原の例としては、アブシディア属のポリペプチド、アクレモニウム属のポリペプチド、アルテルナリア属のポリペプチド、アスペルギルス属のポリペプチド、バシジオボラス属のポリペプチド、ビポラーリス属のポリペプチド、ブラストミセス属のポリペプチド、カンジダ属のポリペプチド、コクシジオイデス属のポリペプチド、コニディオボラス属のポリペプチド、クリプトコッカス属のポリペプチド、カーバラリア属のポリペプチド、エピデルモフィトン属のポリペプチド、エクソフィアラ属のポリペプチド、ゲオトリクム属のポリペプチド、ヒストプラズマ属のポリペプチド、マヅレラ属のポリペプチド、マラセチア属のポリペプチド、ミクロスポルム属のポリペプチド、モニリエラ属のポリペプチド、モルチエレラ属のポリペプチド、ケカビ属のポリペプチド、ペシロマイセス属のポリペプチド、ペニシリウム属のポリペプチド、フィアレモニウム属(Phialemonium)のポリペプチド、フィアロフォラ属のポリペプチド、プロトテカ属のポリペプチド、シュードアレシェリア属のポリペプチド、シュードミクロドキウム属(Pseudomicrodochium)のポリペプチド、フィチウム属のポリペプチド、リノスポリジウム属のポリペプチド、クモノスカビ属のポリペプチド、スコレコバシジウム属(Scolecobasidium)のポリペプチド、スポロトリクス属のポリペプチド、ステンフィリウム属(Stemphylium)のポリペプチド、白癬菌属のポリペプチド、トリコスポロン属のポリペプチドおよびキシロヒファ属(Xylohypha)のポリペプチドが挙げられるが、これらに限定されない。
原生動物の寄生生物抗原の例としては、バベシア属のポリペプチド、バランチジウム属のポリペプチド、ベスノイチア属(Besnoitia)のポリペプチド、クリプトスポリジウム属のポリペプチド、エイメリア属のポリペプチド、エンセファリトゾーン属のポリペプチド、エントアメーバ属のポリペプチド、ジアルジア属のポリペプチド、ハモンディア属(Hammondia)のポリペプチド、ヘパトゾーン属のポリペプチド、イソスポラ属のポリペプチド、リーシュマニア属のポリペプチド、微胞子虫門のポリペプチド、ネオスポラ属のポリペプチド、ノゼマ属のポリペプチド、ペンタトリコモナス属のポリペプチド、プラスモディウム属のポリペプチドが挙げられるが、これらに限定されない。蠕虫寄生生物抗原の例としては、アカントケイロネマ属のポリペプチド、アエルロストロンギルウス属(Aelurostrongylus)のポリペプチド、鉤虫属のポリペプチド、住血線虫属のポリペプチド、回虫属のポリペプチド、ブルギア属のポリペプチド、ブノストムム属のポリペプチド、キャピラリア属のポリペプチド、カベルチア属(Chabertia)のポリペプチド、クーペリア属のポリペプチド、クレノソマ属(Crenosoma)のポリペプチド、ディクチオカウルス属のポリペプチド、ジオクトフィーメ属のポリペプチド、ディペタロネマ属のポリペプチド、裂頭条虫属のポリペプチド、ジプリジウム属のポリペプチド、イヌ糸状虫属のポリペプチド、ドラクンクルス属のポリペプチド、エンテロビウス属のポリペプチド、フィラロイデス属(Filaroides)のポリペプチド、ヘモンクス属のポリペプチド、ラゴキラスカリス属(Lagochilascaris)のポリペプチド、ロア糸状虫属(Loa)のポリペプチド、マンソネラ属のポリペプチド、ムエレリウス属(Muellerius)のポリペプチド、ナノフィエツス属(Nanophyetus)のポリペプチド、アメリカ鉤虫属のポリペプチド、ネマトジルス属のポリペプチド、腸結節虫属のポリペプチド、オンコセルカ属のポリペプチド、オピストルキス属のポリペプチド、オステルタギア属のポリペプチド、パラフィラリア属(Parafilaria)のポリペプチド、肺吸虫属のポリペプチド、パラスカリス属(Parascaris)のポリペプチド、フィサロプテラ属のポリペプチド、プロトストロンギルス属(Protostrongylus)のポリペプチド、セタリア属のポリペプチド、スピロセルカ属(Spirocerca)のポリペプチド スピロメトラ属のポリペプチド、ステファノフィラリア属のポリペプチド、ストロンギロイデス属のポリペプチド、ストロンギルス属のポリペプチド、テラジア属のポリペプチド、トキサスカリス属のポリペプチド、トキソカラ属のポリペプチド、旋毛虫属のポリペプチド、毛様線虫属のポリペプチド、鞭虫属のポリペプチド、ウンシナリア属のポリペプチドおよびウケレリア属のポリペプチド(例えば、P.falciparumのスポロゾイト周囲ポリペプチド(PfCSP))、スポロゾイト表面タンパク質2(PfSSP2)、肝臓状態抗原(liver state antigen)1のカルボキシル末端(PfLSA1 c末端)、ならびに搬出タンパク質1(PfExp-1)、ニューモシスチス属のポリペプチド、サルコシスティス属のポリペプチド、住血吸虫属のポリペプチド、タイレリア属のポリペプチド、トキソプラズマ属のポリペプチド、ならびにトリパノソーマ属のポリペプチドが挙げられるが、これらに限定されない。
外寄生生物抗原の例としては、ノミ;カタダニおよびヒメダニを含むマダニ;ハエ、例えば、小虫、蚊、スナバエ、ブユ、ウマバエ、ノサシバエ、メクラアブ、ツェツェバエ、サシバエ、ハエ幼虫症の原因となるハエおよび刺して血を吸う小さな羽虫(biting gnats);アリ;クモ、シラミ;ダニ;ならびに半翅類の昆虫、例えば、トコジラミおよびサシガメのポリペプチド(抗原ならびにアレルゲンを含む)が挙げられるが、これらに限定されない。
E.自殺遺伝子
本開示の無限免疫細胞(1つ以上のCARおよび/または1つ以上の操作されたTCRを発現し得る免疫細胞を含む)は、1つ以上の自殺遺伝子を含み得る。本明細書中で使用される用語「自殺遺伝子」は、プロドラッグが投与された際に、遺伝子産物が、宿主細胞を殺滅する化合物に変化する遺伝子と定義される。使用され得る自殺遺伝子/プロドラッグの組み合わせの例は、切断型EGFRとセツキシマブ;単純ヘルペスウイルス-チミジンキナーゼ(HSV-tk)と、ガンシクロビル、アシクロビルまたはFIAU;オキシドレダクターゼとシクロヘキシミド;シトシンデアミナーゼと5-フルオロシトシン;チミジンキナーゼチミジル酸キナーゼ(Tdk::Tmk)とAZT;およびデオキシシチジンキナーゼとシトシンアラビノシドである。
V.上記細胞への送達方法
当業者であれば、本開示の抗原レセプターを発現させるために標準的な組換え手法(例えば、Sambrook et al.,2001およびAusubel et al.,1996(両方が参照により本明細書中に援用される)を参照のこと)によってベクターを構築する能力を充分に備えているだろう。ベクターとしては、プラスミド、コスミド、ウイルス(バクテリオファージ、動物ウイルスおよび植物ウイルス)および人工染色体(例えば、YAC)、例えば、レトロウイルスベクター(例えば、モロニーマウス白血病ウイルスベクター(MoMLV)、MSCV、SFFV、MPSV、SNVなどに由来するもの)、レンチウイルスベクター(例えば、HIV-1、HIV-2、SIV、BIV、FIVなどに由来するもの)、アデノウイルス(Ad)ベクター(その複製可能型、複製欠損型およびガットレス型(gutless forms)を含む)、アデノ随伴ウイルス(AAV)ベクター、サルウイルス40(SV-40)ベクター、ウシパピローマウイルスベクター、エプスタイン・バーウイルスベクター、ヘルペスウイルスベクター、ワクシニアウイルスベクター、ハーベイマウス肉腫ウイルスベクター、マウス乳癌ウイルスベクター、ラウス肉腫ウイルスベクター、パルボウイルスベクター、ポリオウイルスベクター、水疱性口内炎ウイルスベクター、マラバウイルス(maraba virus)ベクターおよびB群アデノウイルスenadenotucirevベクターが挙げられるがこれらに限定されない。
A.ウイルスベクター
BCL6ならびに細胞生存促進遺伝子および/または抗原レセプターをコードするウイルスベクターが、本開示のある特定の態様において提供され得る。組換えウイルスベクターを作製する際、必須ではない遺伝子は、通常、異種(または非天然)タンパク質の遺伝子またはコード配列で置き換えられる。ウイルスベクターは、ウイルス配列を利用して、核酸ポリマーおよび場合によってはタンパク質を細胞に導入する一種の発現構築物である。ある特定のウイルスが細胞に感染する能力またはレセプター媒介性のエンドサイトーシスを介して細胞に侵入する能力、および宿主細胞のゲノムにインテグレートし、ウイルス遺伝子を安定かつ効率的に発現する能力によって、それらのウイルスが、外来核酸ポリマーを細胞(例えば、哺乳動物細胞)に移行させるための魅力的な候補になった。本開示のある特定の態様の核酸ポリマーを送達するために使用され得るウイルスベクターの非限定的な例を下記に記載する。
レンチウイルスは、複雑なレトロウイルスであり、一般的なレトロウイルス遺伝子であるgag、polおよびenvに加えて、調節機能または構造機能を有する他の遺伝子も含む。レンチウイルスベクターは、当該分野で周知である(例えば、米国特許第6,013,516号および同第5,994,136号を参照のこと)。
組換えレンチウイルスベクターは、非分裂細胞に感染することができ、インビボとエキソビボの両方において遺伝子導入および核酸ポリマー配列発現のために使用され得る。例えば、非分裂細胞に感染することができる組換えレンチウイルス(ここで、好適な宿主細胞が、パッケージング機能を有する2つ以上のベクター、すなわちgag、polおよびenv、ならびにrevおよびtatでトランスフェクトされる)は、参照により本明細書中に援用される米国特許第5,994,136号に記載されている。
B.調節エレメント
本開示において有用なベクターに含められる発現カセットは、特に、タンパク質コード配列に作動可能に連結された真核生物転写プロモーター、介在配列を含むスプライスシグナル、および転写終結/ポリアデニル化配列を(5’から3’の方向で)含む。タンパク質をコードする遺伝子の転写を真核細胞において制御するプロモーターおよびエンハンサーは、複数の遺伝的エレメントから構成される。細胞機構は、各エレメントによって運ばれる調節情報を集め、統合することができ、それにより、異なる遺伝子が、多くの場合は複雑なパターンである異なるパターンの転写制御を展開することが可能になる。本開示の状況において使用されるプロモーターとしては、構成的プロモーター、誘導性プロモーターおよび組織特異的プロモーターが挙げられる。
C.プロモーター/エンハンサー
本明細書中に提供される発現構築物は、抗原レセプターの発現を駆動するプロモーターを含む。プロモーターは、一般に、RNA合成のための開始部位の位置を特定するように機能する配列を含む。これの最もよく知られている例は、TATAボックスであるが、哺乳動物のターミナルデオキシヌクレオチジルトランスフェラーゼ遺伝子のプロモーターおよびSV40後期遺伝子のプロモーターなど、一部のプロモーターでは、TATAボックスを欠き、開始部位自体と重なっている不連続なエレメントが、開始の場所を固定するのを助ける。さらなるプロモーターエレメントが、転写開始の頻度を制御する。通常、これらは、開始部位の30110bp上流の領域に位置するが、いくつかのプロモーターは、開始部位の下流にも機能的エレメントを含むと示されている。コード配列をプロモーター「の支配下に」するためには、転写読み枠の転写開始部位の5’末端を、選択されたプロモーターの「下流」(すなわち、3’)に置く。「上流」のプロモーターは、DNAの転写を刺激し、コードされるRNAの発現を促進する。
プロモーターエレメント間の間隔は、変更がきくことが多く、エレメントが、反転されるかまたは互いに対して移動された場合でも、プロモーターの機能は保存される。tkプロモーターでは、プロモーターエレメント間の間隔は、活性が低下し始めるまで最大50bp広げられ得る。プロモーターに応じて、個々のエレメントは、協同的にまたは独自に機能して転写を活性化し得るとみられる。プロモーターは、核酸配列の転写性の活性化に関わるシス作用性制御配列のことを指す「エンハンサー」と併せて使用されてもよいし、使用されなくてもよい。
プロモーターは、コードセグメントおよび/またはエキソンの上流に位置する5’非コード配列を単離することによって得られることがあるような、ある核酸配列と天然に会合したプロモーターであり得る。そのようなプロモーターは、「内在性」プロモーターと呼ぶことができる。同様に、エンハンサーは、ある核酸配列の下流または上流に位置する、その配列と天然に会合したエンハンサーであり得る。あるいは、ある核酸配列とその天然の環境では天然には会合していないプロモーターのことを指す、組換えプロモーターまたは異種プロモーターの支配下にコード核酸セグメントを置くことによって、一定の利点が得られる。また、組換えエンハンサーまたは異種エンハンサーは、その天然の環境では核酸配列と天然には会合していないエンハンサーのことを指す。そのようなプロモーターまたはエンハンサーには、他の遺伝子のプロモーターまたはエンハンサー、ならびに他の任意のウイルスまたは原核細胞もしくは真核細胞から単離されたプロモーターまたはエンハンサー、ならびに「天然に存在」しない、すなわち、種々の転写制御領域の種々のエレメントおよび/または発現を変化させる変異を含む、プロモーターまたはエンハンサーが含まれ得る。例えば、組換えDNAの構築において最もよく使用されるプロモーターとしては、βラクタマーゼ(ペニシリナーゼ)、ラクトースおよびトリプトファン(trp-)プロモーターシステムが挙げられる。プロモーターおよびエンハンサーの核酸配列を合成的に作製することに加えて、組換えクローニング、および/またはPCRTMをはじめとした核酸増幅技術を用いて、ある配列が、本明細書中に開示される組成物に関連して作製され得る。さらに、核以外のオルガネラ(例えば、ミトコンドリア、葉緑体など)内での配列の転写および/または発現を指示する調節配列も同様に使用できることが企図される。
当然、発現のために選択されたオルガネラ、細胞型、組織、器官または生物におけるDNAセグメントの発現を効果的に指示するプロモーターおよび/またはエンハンサーを使用することが重要になる。分子生物学の当業者は、一般に、タンパク質発現のために、プロモーター、エンハンサーおよび細胞型の組み合わせを使用することを承知している(例えば、参照により本明細書中に援用されるSambrook et al.1989を参照のこと)。使用されるプロモーターは、構成的プロモーター、組織特異的プロモーター、誘導性プロモーター、および/または導入されたDNAセグメントの高レベル発現を指示する、適切な条件下において有用なプロモーター(例えば、組換えタンパク質および/または組換えペプチドの大規模生成において有益なプロモーター)であり得る。そのプロモーターは、異種であっても、内在性であってもよい。
さらに、任意のプロモーター/エンハンサーの組み合わせ(例えば、epd.isb-sib.ch/のワールドワイドウェブを介したEukaryotic Promoter Data Base EPDBに従って)も、発現を駆動するために使用され得る。T3、T7またはSP6細胞質発現系の使用が、別の実行可能な実施形態である。適切な細菌ポリメラーゼが、送達複合体の一部としてまたはさらなる遺伝的発現構築物として提供される場合、真核細胞は、ある特定の細菌プロモーターからの細胞質での転写を支持し得る。
プロモーターの非限定的な例としては、初期ウイルスプロモーターまたは後期ウイルスプロモーター(例えば、SV40初期または後期プロモーター、サイトメガロウイルス(CMV)最初期プロモーター、ラウス肉腫ウイルス(RSV)初期プロモーター);真核細胞プロモーター(例えば、ベータアクチンプロモーター、GADPHプロモーター、メタロチオネインプロモーター);および連鎖状応答エレメントプロモーター(例えば、サイクリックAMP応答エレメントプロモーター(cre)、血清応答エレメントプロモーター(sre)、ホルボールエステルプロモーター(TPA)およびミニマルTATAボックス近傍の応答エレメントプロモーター(tre))が挙げられる。ヒト成長ホルモンプロモーター配列(例えば、Genbankに記載されているヒト成長ホルモンミニマルプロモーター、アクセッション番号X05244、ヌクレオチド283~341)またはマウス乳腺腫瘍プロモーター(ATCCから入手可能,Cat.No.ATCC45007)を使用することも可能である。ある特定の実施形態において、プロモーターは、CMV IE、デクチン-1、デクチン-2、ヒトCD11c、F4/80、SM22、RSV、SV40、Ad MLP、ベータ-アクチン、MHCクラスIまたはMHCクラスIIプロモーターであるが、しかしながら、治療用の遺伝子の発現を駆動するために有用な他の任意のプロモーターも本開示の実施に適用できる。
ある特定の態様において、本開示の方法は、エンハンサー配列、すなわち、プロモーターの活性を増加させる核酸配列であって、シスで、かつその向きを問わず、比較的長い距離(標的プロモーターから最大数キロベース離れた距離)にわたって作用する能力を有する核酸配列にも関する。しかしながら、エンハンサーは、所与のプロモーターに対して近位でも機能し得るので、エンハンサーの機能は必ずしもそのような長い距離に限定されない。
D.開始シグナルおよび連結発現
コード配列の効率的な翻訳のために、本開示に提供される発現構築物において、特異的な開始シグナルも使用され得る。これらのシグナルは、ATG開始コドンまたは隣接配列を含む。外来性の翻訳制御シグナル(ATG開始コドンを含む)が提供される必要がある場合がある。当業者であれば、これを判断することおよび必要なシグナルを提供することが容易にできるだろう。インサート全体の翻訳を確保するためには、開始コドンが、所望のコード配列の読み枠と「インフレーム」でなければならないことは周知である。その外来性の翻訳制御シグナルおよび開始コドンは、天然のものまたは合成のものであり得る。適切な転写エンハンサーエレメントを含めることによって、発現効率が高められ得る。
ある特定の実施形態において、配列内リボソーム進入部位(IRES)エレメントの使用は、多重遺伝子のメッセージ、すなわちポリシストロニックなメッセージを生成するために使用される。IRESエレメントは、5’メチル化キャップ依存的翻訳のリボソームスキャニングモデルを迂回し、内部の部位において翻訳を開始することができる。ピコルナウイルス科の2つのメンバー(ポリオおよび脳心筋炎)由来のIRESエレメント、ならびに哺乳動物のメッセージ由来のIRESが、報告されている。IRESエレメントは、異種のオープンリーディングフレームに連結できる。各々がIRESによって隔てられた複数のオープンリーディングフレームを一緒に転写することができ、ポリシストロニックなメッセージを生成できる。IRESエレメントのおかげで、各オープンリーディングフレームが、効率的な翻訳のためにリボソームに接近できるようになる。単一のプロモーター/エンハンサーを用いて複数の遺伝子を効率的に発現して、単一のメッセージを転写することもできる。
さらに、本開示に提供される構築物内の遺伝子の連結発現または同時発現をもたらすために、ある特定の2A配列エレメントが使用され得る。例えば、オープンリーディングフレームを連結して単一のシストロンを形成することによって遺伝子を同時発現するために、切断配列が使用され得る。例示的な切断配列は、F2A(口蹄疫ウイルス2A)または「2A様」配列(例えば、Thosea asignaウイルス2A;T2A)である。
E.複製開始点
宿主細胞においてベクターを増殖させるために、そのベクターは、1つ以上の複製開始部位(「ori」と呼ばれることが多い)、例えば、複製が開始される特異的な核酸配列である、上に記載されたようなEBVのoriPまたはプログラミングにおける機能が似ているかもしくは高められた遺伝的に操作されたoriPに対応する核酸配列を含み得る。あるいは、上に記載されたような染色体外で複製する他のウイルスの複製開始点、または自律複製配列(ARS)を使用することができる。
F.選択マーカーおよびスクリーニング可能なマーカー
いくつかの実施形態において、本開示の構築物を含む細胞は、マーカーを発現ベクターに含めることによって、インビトロまたはインビボにおいて特定され得る。そのようなマーカーは、発現ベクターを含む細胞を容易に特定できるようにする特定可能な変化を細胞にもたらす。一般に、選択マーカーは、選択を可能にする特性を付与するマーカーである。ポジティブ選択マーカーは、そのマーカーが存在することによってその選択が可能になるマーカーであり、ネガティブ選択マーカーは、その存在が選択を妨げるマーカーである。ポジティブ選択マーカーの例は、薬物耐性マーカーである。
通常、薬物選択マーカーを含めることにより、形質転換体のクローニングおよび特定が助けられ、例えば、ネオマイシン、ピューロマイシン、ハイグロマイシン、DHFR、GPT、ゼオシンおよびヒスチジノールに対して耐性にする遺伝子が、有用な選択マーカーである。条件の実行に基づいて形質転換体の判別を可能にする表現型を付与するマーカーに加えて、比色解析を基礎とする、GFPなどのスクリーニング可能なマーカーをはじめとした他のタイプのマーカーも企図される。あるいは、単純ヘルペスウイルスチミジンキナーゼ(tk)またはクロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ(CAT)などの、ネガティブ選択マーカーとしてスクリーニング可能な酵素が利用され得る。当業者であれば、免疫学的マーカーをおそらくはFACS解析と併せて使用する方法も承知しているだろう。使用されるマーカーは、遺伝子産物をコードする核酸と同時に発現されることが可能である限り、重要ではないと考えられている。選択マーカーおよびスクリーニング可能なマーカーのさらなる例は、当業者に周知である。
G.核酸ポリマーの送達方法
操作された免疫細胞は、当業者に公知の多くの確立された遺伝子導入方法のうちのいずれかを用いて構築され得る。ある特定の実施形態において、操作された細胞は、核酸ポリマーを導入するためにウイルスベクターベースの遺伝子導入方法を用いて構築される。ウイルスベクターベースの遺伝子導入方法には、レンチウイルスベクター、レトロウイルスベクター、アデノウイルスベクターまたはアデノ随伴ウイルスベクターが含まれ得る。ある特定の実施形態において、操作された細胞は、核酸ポリマーを導入するために非ウイルスベクターベースの遺伝子導入方法を用いて構築される。ある特定の実施形態において、非ウイルスベクターベースの遺伝子導入方法には、ジンクフィンガーヌクレアーゼ(ZFN)、転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ(TALEN)およびクラスター化して規則的な配置の短い回文配列リピート(CRISPR)/CRISPR関連タンパク質9(Cas9)ヌクレアーゼからなる群より選択される遺伝子編集方法が含まれる。ある特定の実施形態において、非ウイルスベクターベースの遺伝子編集方法には、リポフェクション、ヌクレオフェクション、ビロソーム、リポソーム、ポリカチオンまたは脂質:核酸コンジュゲート、裸のDNA、人工ビリオン、および作用物質によって強化されるDNAの取り込みからなる群より選択されるトランスフェクションまたは形質転換方法が含まれる。
上記細胞は、ランダム挿入または部位特異的挿入(例えば、メガヌクレアーゼ、ジンクフィンガーヌクレアーゼ(ZFN)、転写活性化因子様エフェクターベースのヌクレアーゼ(TALEN)およびCRISPR-Casシステムを含むがこれらに限定されない遺伝子編集方法などによる)によって、目的の遺伝子および/または抗原レセプターを発現するように操作され得る。
目的の遺伝子および/または抗原レセプターをコードする核酸ポリマーのウイルス送達に加えて、以下の方法が、所与の宿主細胞への組換え遺伝子送達のさらなる方法であるので、本開示において考慮される。本開示の免疫細胞へのDNAまたはRNAなどの核酸ポリマーの導入は、本明細書中に記載されるようにまたは当業者に公知であるように、細胞を形質転換するための核酸ポリマー送達に適した任意の方法を使用し得る。そのような方法としては、DNAの直接送達(例えば、エキソビボトランスフェクション、注射(マイクロインジェクションを含む));エレクトロポレーション;リン酸カルシウム沈殿;DEAE-デキストランに続くポリエチレングリコールの使用;直接的な音波負荷;リポソーム媒介性のトランスフェクションおよびレセプター媒介性のトランスフェクション;微粒子銃(microprojectile bombardment);炭化ケイ素繊維を伴った撹拌;アグロバクテリウム媒介性の形質転換;乾燥/阻害媒介性のDNA取り込み、およびそのような方法の任意の組み合わせが挙げられるが、これらに限定されない。これらの手法などの手法の適用により、オルガネラ、細胞、組織または生物が安定にまたは一過性に形質転換され得る。
VI.処置方法
本無限免疫細胞は、治療と研究の両方において使用され得る。CARおよび/または操作されたTCRを発現するT細胞またはNK細胞を含む本無限免疫細胞は、癌、感染症、免疫障害または炎症性障害を処置するために使用され得る。
1つの方法において、CD19、CD20、CD22、CD79a、CD79bまたはBAFF-Rなどの抗原を標的化する同種異系の汎用のCAR T細胞が、単独でまたは組み合わせて、B細胞白血病およびリンパ腫を処置するために使用され得る。同種異系の汎用の抗メソテリンCAR T細胞は、一例として、中皮腫、膵臓腺癌または卵巣癌を処置するために使用され得る。NY-ESO標的化TCR-T細胞は、一例として、メラノーマまたは多発性骨髄腫を処置するために使用され得る。EBV、CMV、BKウイルスなどのようなウイルスに対するウイルス特異的T細胞は、それぞれのウイルス感染症を処置するために使用され得る。同種異系の阻害性または制御性T細胞が、自己免疫障害、GVHDおよび他の炎症性障害を処置するために使用され得る。
ガンマ/デルタT細胞およびウイルス特異的T細胞は、GvHDを引き起こす可能性は低く、具体的な実施形態において、さらなる抗腫瘍および/または抗ウイルス機能を提供する。具体的な実施形態において、ウイルス特異的無限T細胞は、少なくとも2つの目的で使用され得る。第1に、ウイルス特異的無限T細胞は、特定のウイルス感染症(例えば、CMVまたはEBV感染症)またはある特定の癌を処置するために使用され得る。第2の実施形態は、1つ以上のCARおよび/または操作されたTCRをウイルス特異的T細胞に形質導入することである。内因性のウイルス特異的TCRを有するそのような無限CAR T細胞は、GVHDを引き起こす可能性が低いなどの潜在的な利点を有し得る。そのような内因性のウイルス特異的TCRを有する細胞は、そのT細胞においてTCRをノックアウトするために遺伝子編集方法を必要としない。CRISPR/Cas9などの遺伝子編集技術を組み合わせる場合、CAR-T細胞を作製するために必ずしもウイルス特異的T細胞は必要でない。あるいは、GvHDを引き起こさず、TCRノックアウトを必要とすると予想されない、ガンマ/デルタ無限CAR T細胞またはCAR-NKまたはCAR-NKTまたはCAR-自然リンパ球系細胞が使用され得る。
本発明の改変された細胞株は、ヒトにおいて使用することが意図されるとき、まず、癌の研究において通常使用されるNSGマウスモデルなどの動物モデルにおいて殺腫瘍活性および治療効果について試験される。そのようなマウスでの研究は、患者において治療的な使用を試みる前に行われ得る前臨床試験である。
無限免疫細胞は、有効量の、種々の腫瘍標的に対する種々のCARまたはTCRを発現する改変された細胞傷害性無限T細胞を単独でまたは組み合わせて患者に投与することなどによって、血液悪性腫瘍および非血液悪性腫瘍を含む癌を処置するために使用され得る。例えば、B細胞白血病またはリンパ腫を有する患者を処置するために、CD19inCART(そのうちの1つが、Ie1-L4aJ3細胞(切断型ヒトEFGRマーカーを有するヒトCD19に対するCARを形質導入された、健康ドナー1由来のCD8陽性細胞)である)が、IL-2またはIL-15とともに投与され得る。そのIe1-L4aJ3細胞は、水または緩衝食塩水などの従来の薬学的賦形剤中に存在し得る。その改変された細胞は、患者に投与されたとき、CD19特異的殺滅によって腫瘍の成長を停止できる。ヒト患者の場合、それらの免疫細胞は、静脈内注入(i.v.)によって投与され得る。しかしながら、皮下(s.c.)注射などの他の投与方法も使用され得る。新生物細胞の根絶に成功したら、それらの免疫細胞は、IL-2もしくはIL-15の投与中止または抗EGFR抗体の注入によって除去され得る。
無限免疫細胞(ならびに使用されるとき、1つ以上のサイトカイン、例えば、IL-2および/またはIL-15)の適切な投与量は、レシピエントの年齢、健康状態、性別および体重、ならびに関連するまたは関連しない状態に対してそのレシピエントが受けている他の任意の同時処置に応じて、変動する。当業者は、上述の因子に応じて、患者に投与するべき改変された細胞および薬物の適切な用量を容易に決定できる。殺腫瘍性の有効量を構成する細胞数は、動物モデルを用いて決定され得る。これらのパラメータは、当業者が容易に決定できる。
腫瘍に対する本治療の有効性は、患者の末梢血もしくは骨髄のサンプル中の任意の生存腫瘍細胞を検出すること、またはCT、MRIもしくはPETスキャンなどの他の画像診断によって、判定され得る。同様に、残留している任意の望まれない改変された無限T細胞は、フローサイトメトリーおよびポリメラーゼ連鎖反応などの方法を用いてモニターされ得る。
TALL-104およびNK-92細胞などの従前の細胞傷害性細胞株と比べて、無限免疫細胞は、正常な免疫細胞から作製される。ゆえに、無限免疫細胞は他の任意の未知の腫瘍原性遺伝子変異を有すると予想されないので、TALL-104およびNK-92と比べて、無限免疫細胞に伴う白血病誘発性のリスクは低い。さらに、無限細胞の増殖は、IL-2またはIL-15の投与中止によって止めることができる。これは、白血病由来の細胞株であるTALL-104およびNK-92にまさる、この上ない安全性の利点である。
いくつかの実施形態において、本開示は、有効量の本開示の免疫細胞を投与する工程を含む、免疫療法のための方法を提供する。本開示のある特定の実施形態において、免疫応答を誘発する免疫細胞集団の移入によって、癌または感染症が処置される。個体の癌を処置するためまたは癌の進行を遅延させるための方法が本明細書中に提供され、その方法は、有効量の抗原特異的細胞療法を個体に投与する工程を含む。本方法は、免疫障害、固形癌、血液癌およびウイルス感染症の処置に適用され得る。
本処置方法が有用な腫瘍には、任意の悪性細胞タイプ、例えば、固形腫瘍または血液腫瘍に見られる細胞タイプが含まれる。例示的な固形腫瘍としては、膵臓、結腸、盲腸、胃、脳、頭部、頸部、卵巣、腎臓、喉頭、肉腫、肺、膀胱、黒色腫、前立腺および乳房からなる群より選択される器官の腫瘍が挙げられ得るが、これらに限定されない。例示的な血液腫瘍としては、骨髄の腫瘍、TまたはB細胞悪性腫瘍、白血病、リンパ腫、芽腫、ミエローマなどが挙げられる。本明細書中に提供される方法を用いて処置され得る癌のさらなる例としては、肺癌(小細胞肺癌、非小細胞肺癌、肺腺癌および肺扁平上皮癌を含む)、腹膜癌、胃(gastric)癌または胃(stomach)癌(消化器癌および消化管間質癌を含む)、膵癌、子宮頸癌、卵巣癌、肝臓癌、膀胱癌、乳癌、結腸癌、直腸結腸癌、子宮内膜癌または子宮癌、唾液腺癌、腎臓癌または腎癌、前立腺癌、外陰癌、甲状腺癌、様々なタイプの頭頸部癌、および黒色腫が挙げられるが、これらに限定されない。
癌は、具体的には以下の組織タイプの癌であり得るが、これらに限定されない:新生物、悪性;癌腫;癌腫、未分化;巨細胞および紡錘形細胞癌;小細胞癌;乳頭状癌;扁平上皮癌;リンパ上皮癌;基底細胞癌;毛母癌;移行上皮癌;乳頭状移行上皮癌;腺癌;ガストリノーマ、悪性;胆管癌;肝細胞癌;肝細胞癌・胆管癌の混合型;索状腺癌;腺様嚢胞癌;腺腫性ポリープ内腺癌;腺癌、家族性大腸ポリポーシス;固形癌;カルチノイド腫瘍、悪性;細気管支肺胞腺癌;乳頭状腺癌;嫌色素性癌;好酸性癌;好酸性腺癌;好塩基性癌;明細胞腺癌;顆粒細胞癌;濾胞腺癌;乳頭状・濾胞腺癌;非被包性硬化癌;副腎皮質癌;類内膜癌;皮膚付属器癌;アポクリン腺癌;皮脂腺癌;耳垢腺癌;粘表皮癌;嚢胞腺癌;乳頭状嚢腺癌;乳頭状漿液性嚢胞腺癌;粘液性嚢胞腺癌;粘液性腺癌;印環細胞癌;浸潤性導管癌;髄様癌;小葉癌;炎症性癌;パジェット病、乳房;腺房細胞癌;腺扁平上皮癌;扁平上皮化生を伴う腺癌;胸腺腫、悪性;卵巣間質腫瘍、悪性;莢膜細胞腫、悪性;顆粒膜細胞腫、悪性;アンドロブラストーマ、悪性;セルトリ細胞癌;ライディッヒ細胞腫瘍、悪性;脂質細胞腫瘍、悪性;傍神経節腫、悪性;乳房外傍神経節腫、悪性;褐色細胞腫;グロムス血管肉腫;悪性黒色腫;無色素性黒色腫;表在拡大型黒色腫;悪性黒子黒色腫;末端黒子型黒色腫;結節性黒色腫;巨大色素性母斑内悪性黒色腫;類上皮細胞黒色腫;青色母斑、悪性;肉腫;線維肉腫;線維性組織球腫、悪性;粘液肉腫;脂肪肉腫;平滑筋肉腫;横紋筋肉腫;胎児性横紋筋肉腫;胞巣状横紋筋肉腫;間質肉腫;混合腫瘍、悪性;ミュラー管混合腫瘍;腎芽腫;肝芽腫;癌肉腫;間葉腫、悪性;ブレンナー腫瘍、悪性;葉状腫瘍、悪性;滑膜肉腫;中皮腫、悪性;未分化胚腫;胎児性癌;奇形腫、悪性;卵巣甲状腺腫、悪性;絨毛癌;中腎腫、悪性;血管肉腫;血管内皮腫、悪性;カポジ肉腫;血管外皮腫、悪性;リンパ管肉腫;骨肉腫;傍皮質骨肉腫;軟骨肉腫;軟骨芽細胞腫、悪性;間葉性軟骨肉腫;骨巨細胞腫瘍;ユーイング肉腫;歯原性腫瘍、悪性;エナメル上皮歯牙肉腫;エナメル上皮腫、悪性;エナメル上皮線維肉腫;松果体腫、悪性;脊索腫;グリオーマ、悪性;上衣腫;アストロサイトーマ;原形質性アストロサイトーマ;細線維性アストロサイトーマ;星芽腫;膠芽腫;乏突起膠腫;希突起芽腫;原始神経外胚葉性;小脳肉腫;神経節神経芽腫;神経芽腫;網膜芽腫;嗅神経原腫瘍;髄膜腫、悪性;神経線維肉腫;神経鞘腫、悪性;顆粒細胞腫、悪性;悪性リンパ腫;ホジキン病;ホジキン;側肉芽腫;悪性リンパ腫、小リンパ球性;悪性リンパ腫、大細胞型、びまん性;悪性リンパ腫、濾胞性;菌状息肉腫;他の特定の非ホジキンリンパ腫;B細胞リンパ腫;低悪性度/濾胞性非ホジキンリンパ腫(NHL);小リンパ球性(SL)NHL;中悪性度/濾胞性NHL;中悪性度びまん性NHL;高悪性度免疫芽球性NHL;高悪性度リンパ芽球性NHL;高悪性度小非切れ込み型細胞NHL;巨大病変(bulky disease)NHL;マントル細胞リンパ腫;AIDS関連リンパ腫;ワルデンシュトレームマクログロブリン血症;悪性組織球増殖症;多発性骨髄腫;肥満細胞肉腫;免疫増殖性小腸疾患;白血病;リンパ性白血病;形質細胞性白血病;赤白血病;リンパ肉腫細胞白血病;骨髄性白血病;好塩基球性白血病;好酸球性白血病;単球性白血病;肥満細胞白血病;巨核芽球性白血病;骨髄性肉腫;ヘアリー細胞白血病;慢性リンパ性白血病(CLL);急性リンパ芽球性白血病(ALL);急性骨髄性白血病(AML);および慢性骨髄芽球性白血病。
本開示のある特定の実施形態において、免疫細胞は、それを必要とする個体(例えば、癌または感染症を有する個体)に送達される。次いで、それらの細胞は、その個体の免疫系を強化して、それぞれの癌細胞または病原性細胞を攻撃する。いくつかの場合では、その個体に免疫細胞が1回以上提供される。個体に免疫細胞が2回以上提供される場合、投与間の時間は、その個体において伝播するのに十分な時間であるべきであり、具体的な実施形態では、投与間の時間は、l、2、3、4、5、6、7日間またはそれ以上である。
本開示のある特定の実施形態は、免疫媒介性障害を処置または予防するための方法を提供する。1つの実施形態において、被験体は、自己免疫疾患を有する。自己免疫疾患の非限定的な例としては、円形脱毛症、強直性脊椎炎、抗リン脂質抗体症候群、自己免疫性アジソン病、副腎の自己免疫疾患、自己免疫性溶血性貧血、自己免疫性肝炎、自己免疫性卵巣炎および自己免疫性睾丸炎、自己免疫性血小板減少症、ベーチェット病、水疱性類天疱瘡、心筋症、セリアック多発性皮膚炎(celiac spate-dermatitis)、慢性疲労免疫不全症候群(CFIDS)、慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー、チャーグ・ストラウス症候群、瘢痕性類天疱瘡、CREST症候群、寒冷凝集素病、クローン病、円板状狼瘡、本態性混合型クリオグロブリン血症、線維筋痛症-線維筋炎、糸球体腎炎、グレーヴズ病、ギランバレー、橋本甲状腺炎、特発性肺線維症、特発性血小板減少紫斑病(ITP)、IgAニューロパシー、若年性関節炎、扁平苔癬、エリテマトーデス、メニエール病、混合結合組織病、多発性硬化症、1型糖尿病または免疫媒介性糖尿病、重症筋無力症、ネフローゼ症候群(例えば、微小変化群、巣状糸球体硬化症または膜性腎症)、尋常性天疱瘡、悪性貧血、結節性多発性動脈炎、多発性軟骨炎、多腺症候群、リウマチ性多発筋痛症、多発性筋炎および皮膚筋炎、原発性無ガンマグロブリン血症、原発性胆汁性肝硬変、乾癬、乾癬性関節炎、レイノー現象、ライター症候群、関節リウマチ、サルコイドーシス、強皮症、シェーグレン症候群、スティフ・マン症候群、全身性エリテマトーデス、エリテマトーデス、潰瘍性大腸炎、ブドウ膜炎、脈管炎(例えば、結節性多発性動脈炎、高安動脈炎、側頭動脈炎/巨細胞性動脈炎または疱疹状皮膚炎脈管炎)、白斑ならびにウェゲナー肉芽腫症が挙げられる。したがって、本明細書中に開示される方法を用いて処置され得る自己免疫疾患のいくつかの例としては、多発性硬化症、関節リウマチ、全身性エリテマトーデス、I型糖尿病、クローン病;潰瘍性大腸炎、重症筋無力症、糸球体腎炎、強直性脊椎炎、脈管炎または乾癬が挙げられるが、これらに限定されない。被験体は、喘息などのアレルギー性障害も有し得る。
さらに別の実施形態では、被験体は、移植される器官または幹細胞のレシピエントであり、拒絶反応を予防および/または処置するために免疫細胞が使用される。特定の実施形態において、被験体は、移植片対宿主病を有するか、または移植片対宿主病を発症するリスクがある。GVHDは、血縁ドナーまたは非血縁ドナーからの幹細胞を使用するまたは含む任意の移植に関して起こり得る合併症である。GVHDには、急性と慢性の2種類がある。急性GVHDは、移植後の最初の3ヶ月以内に現れる。急性GVHDの徴候としては、手および足における赤みがかった発疹が挙げられ、それは、剥皮または皮膚の水疱形成を伴って広がることがあり、より重篤になることがある。急性GVHDは、胃および腸にも影響することがあり、その場合、筋痙攣、悪心および下痢が認められる。皮膚および目の黄変(黄疸)は、急性GVHDが肝臓に影響していることを示す。慢性GVHDは、その重症度に基づいて等級付けされる:ステージ/グレード1が軽度であり;ステージ/グレード4が重度である。慢性GVHDは、移植の3ヶ月後またはそれ以降に発症する。慢性GVHDの症状は、急性GVHDの症状と似ているが、さらに、慢性GVHDは、眼の粘液腺、口の唾液腺ならびに胃壁および腸を滑らかにする腺にも影響し得る。本明細書中に開示される任意の免疫細胞集団を使用することができる。移植される器官の例としては、臓器移植片、例えば、腎臓、肝臓、皮膚、膵臓、肺および/または心臓、あるいは細胞移植片、例えば、小島、肝細胞、筋芽細胞、骨髄または造血性幹細胞もしくは他の幹細胞が挙げられる。移植片は、複合性の移植片、例えば、顔面の組織であり得る。免疫細胞は、移植の前、移植と同時、または移植の後に、投与され得る。いくつかの実施形態において、免疫細胞は、移植の前に、例えば、移植の少なくとも1時間前、少なくとも12時間前、少なくとも1日前、少なくとも2日前、少なくとも3日前、少なくとも4日前、少なくとも5日前、少なくとも6日前、少なくとも1週間前、少なくとも2週間前、少なくとも3週間前、少なくとも4週間前または少なくとも1ヶ月前に投与される。1つの非限定的な具体例では、治療有効量の免疫細胞の投与は、移植の3~5日前に行われる。
いくつかの実施形態において、被験体には、免疫細胞療法の前に骨髄非破壊的なリンパ球除去化学療法が施され得る。その骨髄非破壊的なリンパ球除去化学療法は、任意の好適な経路によって投与され得る任意の好適なそのような治療であり得る。その骨髄非破壊的なリンパ球除去化学療法は、特に、癌が転移性であり得る黒色腫である場合、例えば、シクロホスファミドおよびフルダラビンの投与を含み得る。シクロホスファミドおよびフルダラビンの例示的な投与経路は、静脈内である。同様に、任意の好適な用量のシクロホスファミドおよびフルダラビンが投与され得る。特定の態様では、およそ60mg/kgのシクロホスファミドが2日間投与され、その後、およそ25mg/mのフルダラビンが5日間投与される。
ある特定の実施形態では、免疫細胞の増殖、分化および活性化を促進する成長因子または分化因子が、免疫細胞と同時にまたは免疫細胞に続いて被験体に投与される。免疫細胞成長因子は、免疫細胞の増殖および活性化を促進する任意の好適な成長因子であり得る。好適な免疫細胞成長因子または分化因子の例としては、インターロイキン(IL)-2、IL-7、IL-15およびIL-12が挙げられ、これらは、単独でまたは様々な組み合わせ(例えば、IL-2とIL-7、IL-2とIL-15、IL-7とIL-15、IL-2とIL-7とIL-15、IL-12とIL-7、IL-12とIL-15またはIL-12とIL2)で使用され得る。
治療有効量の免疫細胞が、非経口投与をはじめとしたいくつかの経路、例えば、静脈内、腹腔内、筋肉内、胸骨内、心室内、髄腔内もしくは関節内の注射または注入によって投与され得る。
養子細胞療法において使用するための免疫細胞の治療有効量は、処置される被験体において所望の効果を達成する量である。例えば、これは、進行を阻害するために必要な免疫細胞の量、または自己免疫疾患もしくは同種免疫疾患を後退させるために必要な免疫細胞の量、または自己免疫疾患によって引き起こされる症状、例えば、疼痛および炎症を和らげることができる量であり得る。これは、炎症に伴う症状、例えば、疼痛、浮腫および体温上昇を和らげるために必要な量であり得る。これは、移植された器官の拒絶反応を減少させるまたは予防するために必要な量でもあり得る。
上記免疫細胞集団は、疾患状態を回復させるために、上記疾患と一致した処置レジメンで、例えば、1日から数日間にわたって1回または数回で、投与され得るか、または疾患の進行を阻害するためおよび疾患の再発を予防するために、長期間にわたる定期的な投与で投与され得る。製剤において用いられる正確な用量は、投与経路および疾患または障害の重篤度にも依存し、医師の判断および各患者の状況に従って決定されるべきである。免疫細胞の治療有効量は、処置される被験体、苦痛の重症度およびタイプならびに投与様式に依存する。いくつかの実施形態において、ヒト被験体の処置において使用され得る用量は、少なくとも3.8×10、少なくとも3.8×10、少なくとも3.8×10、少なくとも3.8×10、少なくとも3.8×10、少なくとも3.8×10または少なくとも3.8×1010免疫細胞/mで変動する。ある特定の実施形態において、ヒト被験体の処置において使用される用量は、約3.8×10~約3.8×1010免疫細胞/mの範囲である。さらなる実施形態において、免疫細胞の治療有効量は、約5×10細胞/kg体重~約7.5×10細胞/kg体重、例えば、約2×10細胞~約5×10細胞/kg体重または約5×10細胞~約2×10細胞/kg体重で変動し得る。免疫細胞の正確な量は、被験体の年齢、体重、性別および生理学的状態に基づいて当業者によってすぐに決定される。有効量は、インビトロモデルまたは動物モデルの試験系から導かれた用量反応曲線から外挿され得る。
上記免疫細胞は、免疫媒介性障害を処置するための1つ以上の他の治療薬と併用して投与され得る。併用療法としては、1つ以上の抗菌剤(例えば、抗生物質、抗ウイルス剤および抗真菌剤)、抗腫瘍剤(例えば、リツキシマブ、トラスツズマブなどのようなモノクローナル抗体、フルオロウラシル、メトトレキサート、パクリタキセル、フルダラビン、エトポシド、ドキソルビシンまたはビンクリスチン)、免疫枯渇剤(例えば、フルダラビン、エトポシド、ドキソルビシンまたはビンクリスチン)、免疫抑制剤(例えば、アザチオプリンまたは糖質コルチコイド、例えば、デキサメタゾンまたはプレドニゾン)、抗炎症剤(例えば、糖質コルチコイド(例えば、ヒドロコルチゾン、デキサメタゾンまたはプレドニゾン)または非ステロイド性抗炎症剤(例えば、アセチルサリチル酸、イブプロフェンまたはナプロキセンナトリウム))、サイトカイン(例えば、インターロイキン-10またはトランスフォーミング成長因子-ベータ)、ホルモン(例えば、エストロゲン)またはワクチンが挙げられ得るが、これらに限定されない。さらに、カルシニューリン阻害剤(例えば、シクロスポリンおよびタクロリムス);mTOR阻害剤(例えば、ラパマイシン);ミコフェノール酸モフェチル、抗体(例えば、CD3、CD4、CD40、CD154、CD45、IVIGまたはB細胞を認識する抗体);化学療法剤(例えば、メトトレキサート、トレオスルファン、ブスルファン);照射;またはケモカイン、インターロイキンもしくはそれらの阻害剤(例えば、BAFF、IL-2、抗IL-2R、IL-4、JAKキナーゼ阻害剤)を含むがこれらに限定されない免疫抑制剤または免疫寛容誘発剤が投与され得る。そのようなさらなる医薬品は、所望の効果に応じて免疫細胞の投与前、投与中または投与後に投与され得る。上記細胞および作用物質のこの投与は、同じ経路または異なる経路による投与、および同じ部位または異なる部位における投与であり得る。
A.薬学的組成物
無限免疫細胞(例えば、T細胞またはNK細胞)および薬学的に許容され得るキャリアを含む薬学的組成物および製剤も本明細書中に提供される。
本明細書中に記載されるような薬学的組成物および製剤は、所望の程度の純度を有する活性成分(例えば、抗体またはポリペプチド)を1つ以上の自由選択の薬学的に許容され得るキャリア(Remington’s Pharmaceutical Sciences 22nd edition,2012)と混合することによって、凍結乾燥された製剤または水溶液の形態で調製され得る。薬学的に許容され得るキャリアは、一般に、使用される投与量および濃度においてレシピエントにとって無毒性であり、それらのキャリアとしては、緩衝剤(例えば、リン酸、クエン酸および他の有機酸);酸化防止剤(アスコルビン酸およびメチオニンを含む);保存剤(例えば、塩化オクタデシルジメチルベンジルアンモニウム;塩化ヘキサメトニウム;塩化ベンザルコニウム;塩化ベンゼトニウム;フェノールアルコール、ブチルアルコールまたはベンジルアルコール;アルキルパラベン(例えば、メチルパラベンまたはプロピルパラベン);カテコール;レゾルシノール;シクロヘキサノール;3-ペンタノール;およびm-クレゾール);低分子量(約10残基未満)のポリペプチド;タンパク質(例えば、血清アルブミン、ゼラチンまたは免疫グロブリン);親水性ポリマー(例えば、ポリビニルピロリドン);アミノ酸(例えば、グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニンまたはリジン);単糖類、二糖類および他の炭水化物(グルコース、マンノースまたはデキストリンを含む);キレート剤(例えば、EDTA);糖類(例えば、スクロース、マンニトール、トレハロースまたはソルビトール);塩形成対イオン(例えば、ナトリウム);金属錯体(例えば、Zn-タンパク質複合体);および/または非イオン性界面活性剤(例えば、ポリエチレングリコール(PEG))が挙げられるが、これらに限定されない。例示的な本明細書中の薬学的に許容され得るキャリアとしては、間質薬物分散剤、例えば、中性で活性な可溶性ヒアルロニダーゼ糖タンパク質(sHASEGP)、例えば、ヒト可溶性PH-20ヒアルロニダーゼ糖タンパク質、例えば、rHuPH20(HYLENEX(登録商標),Baxter International,Inc.)がさらに挙げられる。rHuPH20を含むある特定の例示的なsHASEGPおよび使用方法は、米国特許公開第2005/0260186号および同第2006/0104968号に記載されている。1つの態様において、sHASEGPは、1つ以上のさらなるグリコサミノグリカナーゼ、例えば、コンドロイチナーゼと併用される。
B.併用療法
ある特定の実施形態において、本実施形態の組成物および方法は、少なくとも1つのさらなる治療と併用される免疫細胞集団を含む。そのさらなる治療は、放射線療法、手術(例えば、ランペクトミーおよび乳房切除術)、化学療法、標的化療法、遺伝子治療、DNA治療、ウイルス治療、RNA治療、免疫療法、骨髄移植、ナノ治療、モノクローナル抗体治療または前述の組み合わせであり得る。そのさらなる治療は、アジュバント療法またはネオアジュバント療法の形態であり得る。
いくつかの実施形態において、さらなる治療は、小分子酵素阻害剤または抗転移剤の投与である。いくつかの実施形態において、さらなる治療は、副作用制限剤(例えば、処置の副作用の発生率および/または重症度を下げることを目的とする作用物質、例えば、抗悪心剤など)の投与である。いくつかの実施形態において、さらなる治療は、放射線療法である。いくつかの実施形態において、さらなる治療は、手術である。いくつかの実施形態において、さらなる治療は、放射線療法と手術の併用である。いくつかの実施形態において、さらなる治療は、ガンマ線照射である。いくつかの実施形態において、さらなる治療は、PBK/AKT/mTOR経路を標的化する治療、HSP90阻害剤、チューブリン阻害剤、アポトーシス阻害剤および/または化学予防剤である。さらなる治療は、当該分野で公知の化学療法剤の1つ以上であり得る。
免疫細胞療法は、免疫チェックポイント療法などのさらなる癌治療の前、最中、後または様々な組み合わせで投与され得る。それらの投与は、同時から数分、数日、数週間までの範囲の間隔で行われ得る。免疫細胞療法がさらなる治療薬とは別に患者に提供される実施形態では、それら2つの化合物が、なおも患者に対して有益な併用効果を発揮できるように、各送達時点の間にかなりの期間が経過しないことを保証するのが一般的である。そのような場合、抗体療法と抗癌療法とが、互いの約12~24または72時間以内に、より詳細には、互いの約6~12時間以内に患者に提供され得ることが企図される。いくつかの状況において、それぞれの投与間に数日(2、3、4、5、6または7)から数週間(1、2、3、4、5、6、7または8)が経過した場合、処置期間をかなり延長することが望ましいことがある。
様々な組み合わせが使用され得る。下記の例の場合、免疫細胞療法が、「A」であり、抗癌療法が、「B」である:
A/B/A B/A/B B/B/A A/A/B A/B/B B/A/A A/B/B/B B/A/B/B
B/B/B/A B/B/A/B A/A/B/B A/B/A/B A/B/B/A B/B/A/A
B/A/B/A B/A/A/B A/A/A/B B/A/A/A A/B/A/A A/A/B/A
本実施形態の任意の化合物または治療の患者への投与は、それらの作用物質に毒性がある場合はそれを考慮して、そのような化合物を投与するための一般的なプロトコルに従う。ゆえに、いくつかの実施形態では、併用療法に起因し得る毒性をモニタリングする工程が存在する。
1.化学療法
多種多様の化学療法剤が、本実施形態に従って使用され得る。用語「化学療法」とは、薬物を使用して癌を処置することを指す。「化学療法剤」は、癌の処置において投与される化合物または組成物を意味するために使用される。これらの作用物質または薬物は、細胞内でのそれらの活性様式によって、例えば、それらが細胞周期に影響するか否かおよびどのステージにおいて細胞周期に影響するかによって、分類される。あるいは、作用物質は、DNAを直接架橋する能力、DNAにインターカレートする能力、または核酸合成に影響することによって染色体異常および有糸分裂異常を誘導する能力に基づいて特徴付けられ得る。
化学療法剤の例としては、アルキル化剤(例えば、チオテパおよびシクロスホスファミド);スルホン酸アルキル(例えば、ブスルファン、インプロスルファンおよびピポスルファン);アジリジン(例えば、ベンゾドパ(benzodopa)、カルボコン、メツレドパ(meturedopa)およびウレドパ(uredopa));エチレンイミンおよびメチルアメラミン(methylamelamines)(アルトレタミン、トリエチレンメラミン、トリエチレンホスホルアミド、トリエチレンチオホスホルアミドおよびトリメチローロメラミン(trimethylolomelamine)を含む);アセトゲニン(特に、ブラタシンおよびブラタシノン);カンプトテシン(合成アナログであるトポテカンを含む);ブリオスタチン;カリスタチン;CC-1065(そのアドゼレシン、カルゼレシン(carzelesin)およびビゼレシン(bizelesin)合成アナログを含む);クリプトフィシン(特に、クリプトフィシン1およびクリプトフィシン8);ドラスタチン;デュオカルマイシン(合成アナログであるKW-2189およびCB1-TM1を含む);エレウセロビン(eleutherobin);パンクラチスタチン(pancratistatin);サルコジクチイン(sarcodictyin);スポンギスタチン(spongistatin);ナイトロジェンマスタード(例えば、クロラムブシル、クロルナファジン(chlornaphazine)、コロホスファミド(cholophosphamide)、エストラムスチン、イホスファミド、メクロレタミン、塩酸メクロレタミンオキシド、メルファラン、ノベンビキン(novembichin)、フェネステリン(phenesterine)、プレドニムスチン、トロフォスファミド(trofosfamide)およびウラシルマスタード);ニトロソ尿素(例えば、カルムスチン、クロロゾトシン、フォテムスチン、ロムスチン、ニムスチンおよびラニムヌスチン(ranimnustine));抗生物質(例えば、エンジイン抗生物質(例えば、カリケアマイシン、特に、カリケアマイシンガンマlIおよびカリケアマイシンオメガI1));ジネマイシン(dynemicin)(ジネマイシンAを含む);ビスホスホネート(例えば、クロドロネート);エスペラミシン;ならびにネオカルチノスタチンクロモフォアおよび関連色素タンパク質であるエンジイン抗生物質クロモフォア、アクラシノマイシン、アクチノマイシン、アウトラルニシン、アザセリン、ブレオマイシン、カクチノマイシン、カラビシン(carabicin)、カルミノマイシン(carminomycin)、カルジノフィリン(carzinophilin)、クロモミシニス、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、デトルビシン(detorubicin)、6-ジアゾ-5-オキソ-L-ノルロイシン、ドキソルビシン(モルホリノ-ドキソルビシン、シアノモルホリノ-ドキソルビシン、2-ピロリノ-ドキソルビシンおよびデオキシドキソルビシンを含む)、エピルビシン、エソルビシン(esorubicin)、イダルビシン、マルセロマイシン(marcellomycin)、マイトマイシン(例えば、マイトマイシンC)、ミコフェノール酸、ノガラルニシン、オリボマイシン、ペプロマイシン、ポトフィロマイシン(potfiromycin)、ピューロマイシン、クエラマイシン(quelamycin)、ロドルビシン(rodorubicin)、ストレプトニグリン、ストレプトゾシン、ツベルシジン、ウベニメクス、ジノスタチンおよびゾルビシン;抗代謝産物(例えば、メトトレキサートおよび5-フルオロウラシル(5-FU));葉酸アナログ(例えば、デノプテリン(denopterin)、プテロプテリンおよびトリメトレキサート);プリンアナログ(例えば、フルダラビン、6-メルカプトプリン、チアミプリン(thiamiprine)およびチオグアニン);ピリミジンアナログ(例えば、アンシタビン、アザシチジン、6-アザウリジン、カルモフール、シタラビン、ジデオキシウリジン、ドキシフルリジン、エノシタビンおよびフロクスウリジン);アンドロゲン(例えば、カルステロン、プロピオン酸ドロモスタノロン、エピチオスタノール、メピチオスタンおよびテストラクトン);抗副腎(anti-adrenals)(例えば、ミトタンおよびトリロスタン);葉酸補給剤(例えば、フロリン酸(frolinic acid));アセグラトン;アルドホスファミドグリコシド(aldophosphamide glycoside);アミノレブリン酸;エニルウラシル;アムサクリン;ベストラブシル(bestrabucil);ビサントレン(bisantrene);エダトラキセート(edatraxate);デホファミン(defofamine);デメコルチン;ジアジコン;エルフォルミチン(elformithine);酢酸エリプチニウム(elliptinium acetate);エポチロン;エトグルシド;硝酸ガリウム;ヒドロキシ尿素;レンチナン;ロニダイニン(lonidainine);メイタンシノイド(maytansinoids)(例えば、メイタンシンおよびアンサミトシン(ansamitocins));ミトグアゾン;ミトキサントロン;モピダンモール(mopidanmol);ニトラエリン;ペントスタチン;フェナメット(phenamet);ピラルビシン;ロソキサントロン(losoxantrone);ポドフィリン酸(podophyllinic acid);2-エチルヒドラジド;プロカルバジン;PSK多糖複合体;ラゾキサン;リゾキシン;シゾフィラン;スピロゲルマニウム;テヌアゾン酸;トリアジクォン(triaziquone);2,2’,2”-トリクロロトリエチルアミン;トリコテシン(特に、T-2トキシン、ベラクリンA、ロリジン(roridin)Aおよびアングイジン(anguidine));ウレタン;ビンデシン;ダカルバジン;マンノムスチン;ミトブロニトール;ミトラクトール;ピポブロマン;ガシトシン(gacytosine);アラビノシド(「Ara-C」);シクロホスファミド;タキソイド、例えば、パクリタキセルおよびドセタキセルゲムシタビン;6-チオグアニン;メルカプトプリン;白金配位錯体(例えば、シスプラチン、オキサリプラチンおよびカルボプラチン);ビンブラスチン;白金;エトポシド(VP-16);イホスファミド;ミトキサントロン;ビンクリスチン;ビノレルビン;ノバントロン;テニポシド;エダトレキセート;ダウノマイシン;アミノプテリン;キセロダ(xeloda);イバンドロネート;イリノテカン(例えば、CPT-11);トポイソメラーゼ阻害剤RFS2000;ジフルオロメチルオルニチン(DMFO);レチノイド(例えば、レチノイン酸);カペシタビン;カルボプラチン、プロカルバジン、プリコマイシン、ゲムシタビエン、ナベルビン、ファルネシル-タンパク質タンスフェラーゼ阻害剤、トランスプラチナ(transplatinum)、ならびに上記のいずれかの薬学的に許容され得る塩、酸または誘導体が挙げられる。
2.放射線療法
DNA損傷を引き起こす、広く使用されてきた他の因子としては、γ線、X線および/または腫瘍細胞への放射性同位体の定方向送達として一般的に知られているものが挙げられる。マイクロ波、陽子ビーム照射およびUV照射などの他の形態のDNA損傷因子も企図される。これらの因子のすべてが、DNA、DNAの前駆体、DNAの複製および修復ならびに染色体のアセンブリおよび維持に対して広範囲のダメージをもたらす可能性が最も高い。X線の線量の範囲は、長期間(3~4週間)にわたる50~200レントゲンという1日線量から、2000~6000レントゲンという単回線量までの範囲である。放射性同位体の線量の範囲は、大きく異なり、同位体の半減期、放射される放射線の強度およびタイプ、ならびに腫瘍性細胞による取り込みに依存する。
3.免疫療法
当業者は、さらなる免疫療法が本開示の方法および組成物と併用してまたは併せて使用され得ることを理解する。癌の処置の状況において、免疫治療薬は、通常、癌細胞を標的化し、破壊するために免疫エフェクター細胞および免疫エフェクター分子を使用することに頼る。リツキシマブ(RITUXAN(登録商標))が、そのような例である。免疫エフェクターは、例えば、腫瘍細胞の表面上の何らかのマーカーに特異的な抗体であり得る。その抗体は、単独で治療のエフェクターとして機能し得るか、または他の細胞をリクルートして、実際に細胞殺滅に影響し得る。その抗体はまた、薬物またはトキシン(化学療法剤、放射性核種、リシンA鎖、コレラ毒素、百日咳毒素など)に結合体化され得、標的化剤として役立ち得る。あるいは、そのエフェクターは、腫瘍細胞標的と直接または間接的に相互作用する表面分子を有するリンパ球であり得る。様々なエフェクター細胞には、細胞傷害性T細胞、NKT細胞、自然リンパ球系細胞およびNK細胞が含まれる。
抗体-薬物結合体(ADC)は、殺細胞薬に共有結合的に連結されたモノクローナル抗体(MAb)を含み、併用療法において使用され得る。このアプローチは、抗原標的に対するMAbの高い特異性を非常に強力な細胞傷害性薬物と組み合わせることから、豊富なレベルの抗原を有する腫瘍細胞にペイロード(薬物)を送達する「武装した」MAbをもたらす。また、薬物の標的化送達は、正常組織への曝露を最小限に抑えることから、毒性の低減および治療指数の改善をもたらす。例示的なADC薬物としては、ADCETRIS(登録商標)(ブレンツキシマブベドチン)およびKADCYLA(登録商標)(トラスツズマブエムタンシンまたはT-DM1)が挙げられる。
免疫療法の1つの態様において、腫瘍細胞は、標的化の影響を受けやすい何らかのマーカー、すなわち、他の大部分の細胞上に存在しない何らかのマーカーを有さなければならない。多くの腫瘍マーカーが存在し、これらのいずれかが、本実施形態の状況において標的化に好適であり得る。一般的な腫瘍マーカーとしては、CD20、癌胎児抗原、チロシナーゼ(p97)、gp68、TAG-72、HMFG、Sialyl Lewis抗原、MucA、MucB、PLAP、ラミニンレセプター、erb Bおよびp155が挙げられる。免疫療法の代替の態様は、抗癌効果と免疫刺激効果とを組み合わせることである。IL-2、IL-4、IL-12、GM-CSF、ガンマ-IFNなどのサイトカイン、MIP-1、MCP-1、IL-8などのケモカイン、およびFLT3リガンドなどの成長因子をはじめとした免疫刺激分子も存在する。
免疫療法の例としては、免疫アジュバント、例えば、Mycobacterium bovis、Plasmodium falciparum、ジニトロクロロベンゼンおよび芳香族化合物);サイトカイン療法、例えば、インターフェロンα、βおよびγ、IL-1、GM-CSFならびにTNF;遺伝子治療、例えば、TNF、IL-1、IL-2およびp53;ならびにモノクローナル抗体、例えば、抗CD20、抗ガングリオシドGM2および抗p185が挙げられる。1つ以上の抗癌療法が、本明細書中に記載される抗体療法とともに使用され得ることが企図される。
いくつかの実施形態において、免疫療法は、免疫チェックポイント阻害剤であり得る。免疫チェックポイントは、シグナル(例えば、共刺激分子)を強めるかまたはシグナルを弱めるかのいずれかである。免疫チェックポイントの遮断によって標的化され得る阻害性免疫チェックポイントとしては、アデノシンA2Aレセプター(A2AR)、B7-H3(CD276としても知られる)、BおよびTリンパ球アテニュエーター(BTLA)、細胞傷害性Tリンパ球関連タンパク質4(CD152としても知られるCTLA-4)、インドールアミン2,3-ジオキシゲナーゼ(IDO)、キラー細胞免疫グロブリン(KIR)、リンパ球活性化遺伝子-3(LAG3)、プログラム死1(PD-1)、T細胞免疫グロブリンドメインおよびムチンドメイン3(TIM-3)、ならびにT細胞活性化のV-ドメインIgサプレッサー(VISTA)が挙げられる。特に、免疫チェックポイント阻害剤は、PD-1軸および/またはCTLA-4を標的化する。
免疫チェックポイント阻害剤は、小分子、組換え型のリガンドまたはレセプターなどの薬物であり得るか、または特に、ヒト抗体などの抗体である。免疫チェックポイントタンパク質またはそのアナログの公知の阻害剤が、使用され得、特に、キメラ化型、ヒト化型またはヒト型の抗体が使用され得る。当業者が承知しているように、代替のおよび/または等価な名称が、本開示において述べられるある特定の抗体に対して使用され得る。そのような代替のおよび/または等価な名称は、本開示の文脈において相互交換可能である。例えば、ランブロリズマブが、代替のおよび等価な名称であるMK-3475およびペンブロリズマブとしても知られていることは公知である。
いくつかの実施形態において、PD-1結合アンタゴニストは、PD-1がそのリガンド結合パートナーに結合するのを阻害する分子である。具体的な態様において、PD-1リガンド結合パートナーは、PDL1および/またはPDL2である。別の実施形態において、PDL1結合アンタゴニストは、PDL1がその結合パートナーに結合するのを阻害する分子である。具体的な態様において、PDL1結合パートナーは、PD-1および/またはB7-1である。別の実施形態において、PDL2結合アンタゴニストは、PDL2がその結合パートナーに結合するのを阻害する分子である。具体的な態様において、PDL2結合パートナーは、PD-1である。アンタゴニストは、抗体、その抗原結合フラグメント、イムノアドヘシン、融合タンパク質またはオリゴペプチドであり得る。
いくつかの実施形態において、PD-1結合アンタゴニストは、抗PD-1抗体(例えば、ヒト抗体、ヒト化抗体またはキメラ抗体)である。いくつかの実施形態において、抗PD-1抗体は、ニボルマブ、ペンブロリズマブおよびCT-011からなる群より選択される。いくつかの実施形態において、PD-1結合アンタゴニストは、イムノアドヘシン(例えば、定常領域(例えば、免疫グロブリン配列のFc領域)に融合されたPDL1またはPDL2の細胞外の部分またはPD-1結合部分を含むイムノアドヘシン)である。いくつかの実施形態において、PD-1結合アンタゴニストは、AMP-224である。MDX-1106-04、MDX-1106、ONO-4538、BMS-936558およびOPDIVO(登録商標)としても知られるニボルマブは、使用され得る抗PD-1抗体である。MK-3475、Merck3475、ランブロリズマブ、KEYTRUDA(登録商標)およびSCH-900475としても知られるペンブロリズマブは、例示的な抗PD-1抗体である。hBATまたはhBAT-1としても知られるCT-011も、抗PD-1抗体である。B7-DCIgとしても知られるAMP-224は、PDL2-Fc融合可溶性レセプターである。
本明細書中に提供される方法において標的化され得る別の免疫チェックポイントは、CD152としても知られる細胞傷害性Tリンパ球関連タンパク質4(CTLA-4)である。ヒトCTLA-4の完全cDNA配列は、Genbankアクセッション番号L15006を有する。CTLA-4は、T細胞の表面上に見られ、抗原提示細胞の表面上のCD80またはCD86に結合したとき「切」スイッチとして作用する。CTLA4は、ヘルパーT細胞の表面上に発現される免疫グロブリンスーパーファミリーのメンバーであり、T細胞に阻害シグナルを伝達する。CTLA4は、T細胞共刺激タンパク質であるCD28に似ており、両分子は、抗原提示細胞上のCD80およびCD86(それぞれB7-1およびB7-2とも呼ばれる)に結合する。CTLA4は、T細胞に阻害シグナルを伝達するのに対して、CD28は、刺激シグナルを伝達する。細胞内CTLA4は、制御性T細胞にも見られ、それらの細胞の機能にとって重要であり得る。T細胞レセプターおよびCD28を介したT細胞の活性化により、B7分子に対する阻害性レセプターであるCTLA-4が高発現される。
いくつかの実施形態において、免疫チェックポイント阻害剤は、抗CTLA-4抗体(例えば、ヒト抗体、ヒト化抗体またはキメラ抗体)、それらの抗原結合フラグメント、イムノアドヘシン、融合タンパク質またはオリゴペプチドである。
本方法における使用に適した抗ヒトCTLA-4抗体(またはそれ由来のVHおよび/もしくはVLドメイン)は、当該分野で周知の方法を用いて作製され得る。あるいは、当該分野で認められている抗CTLA-4抗体を使用することができる。例示的な抗CTLA-4抗体は、イピリムマブ(10D1、MDX-010、MDX-101およびYervoy(登録商標)としても知られる)またはその抗原結合フラグメントおよびバリアントである。他の実施形態において、その抗体は、イピリムマブの重鎖CDRおよび軽鎖CDRまたは重鎖VRおよび軽鎖VRを含む。したがって、1つの実施形態において、その抗体は、イピリムマブのVH領域のCDR1、CDR2およびCDR3ドメインならびにイピリムマブのVL領域のCDR1、CDR2およびCDR3ドメインを含む。別の実施形態において、その抗体は、CTLA-4上の、上述の抗体と同じエピトープへの結合について競合し、かつ/またはCTLA-4上の、上述の抗体と同じエピトープに結合する。別の実施形態において、その抗体は、上述の抗体に対して少なくとも約90%の可変領域アミノ酸配列同一性(例えば、イピリムマブと少なくとも約90%、95%または99%の可変領域同一性)を有する。
4.手術
癌を有する人のおよそ60%が、予防的手術、診断的手術または進行度診断手術、根治的手術および緩和手術をはじめとした何らかのタイプの手術を受ける。根治的手術には、癌性組織の全部または一部を物理的に除去、切除および/または破壊する摘出術が含まれ、他の治療(例えば、本実施形態の処置、化学療法、放射線療法、ホルモン療法、遺伝子治療、免疫療法および/または代替療法)と併せて使用され得る。腫瘍摘出術とは、腫瘍の少なくとも一部を物理的に除去することを指す。手術による処置には、腫瘍摘出術に加えて、レーザー手術、凍結手術、電気手術および顕微鏡下手術(モース術)が含まれる。
癌性細胞、組織または腫瘍の一部または全部を切除する際、身体に空洞が形成され得る。処置は、さらなる抗癌療法によるその領域の灌流、直接注射または局所適用によって達成され得る。そのような処置は、例えば、1、2、3、4、5、6もしくは7日ごとに、または1、2、3、4および5週間ごとに、または1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11もしくは12ヶ月ごとに、反復され得る。これらの処置は、様々な投与量の処置でもあり得る。
5.他の作用物質
処置の治療効果を改善するために、本実施形態のある特定の態様と組み合わせて他の作用物質が使用され得ることが企図される。これらのさらなる作用物質としては、細胞表面レセプターおよびギャップ結合のアップレギュレーションに影響する作用物質、細胞分裂抑制剤および分化剤、細胞接着の阻害剤、アポトーシス誘導物質に対する過剰増殖細胞の感度を高める作用物質、または他の生物学的作用物質が挙げられる。ギャップ結合数を増加させることによる細胞間のシグナル伝達の増加は、隣接する過剰増殖細胞集団に対する抗過剰増殖効果を高め得る。他の実施形態では、処置の抗過剰増殖の有効性を改善するために、本実施形態のある特定の態様と組み合わせて細胞分裂抑制剤または分化剤が使用され得る。本実施形態の有効性を改善するために、細胞接着の阻害剤が企図される。細胞接着阻害剤の例は、接着斑キナーゼ(FAK)阻害剤およびロバスタチンである。アポトーシスに対する過剰増殖細胞の感度を高める他の作用物質(例えば、抗体c225)が、処置の有効性を改善するために本実施形態のある特定の態様と組み合わせて使用され得ることがさらに企図される。
VII.製品またはキット
無限免疫細胞を含む製品またはキットも本明細書中に提供される。その製品またはキットは、個体の癌を処置するためもしくは癌の進行を遅延させるためにまたは癌を有する個体の免疫機能を高めるために免疫細胞を使用するための指示を含む添付文書をさらに含み得る。本明細書中に記載される抗原特異的免疫細胞のいずれかが、その製品またはキットに含められ得る。好適な容器としては、例えば、ボトル、バイアル、バッグおよびシリンジが挙げられる。その容器は、ガラス、プラスチック(例えば、ポリ塩化ビニルまたはポリオレフィン)または金属合金(例えば、ステンレス鋼またはハステロイ)などの種々の材料から形成され得る。いくつかの実施形態において、その容器は、製剤およびラベルを保持し、そのラベルは、容器に付着しているかまたは関連付けられており、その容器には、使用法が示されている場合がある。その製品またはキットは、商業的な観点およびユーザーの観点から望ましい他の材料をさらに含むことがあり、それらの材料としては、他の緩衝液、希釈剤、フィルター、針、シリンジ、および使用するための指示を含む添付文書が挙げられる。いくつかの実施形態において、その製品は、1つ以上の別の作用物質(例えば、化学療法剤および抗悪性腫瘍剤)をさらに含む。その1つ以上の作用物質に適した容器としては、例えば、ボトル、バイアル、バッグおよびシリンジが挙げられる。
IV.実施例
以下の実施例は、本発明の好ましい実施形態を実証するために含められる。以下の実施例に開示される手法は、本発明の実施において十分に機能すると本発明者が発見した手法であり、ゆえにその実施に対する好ましい形式であると考えることができることが当業者によって認識されるべきである。しかしながら、当業者は、本開示に鑑みて、開示される具体的な実施形態において多くの変更を行うことができ、それらの変更は、本発明の趣旨および範囲から逸脱することなく、なおも同様または類似の結果をもたらすと認識するはずである。
実施例1-養子療法用の無限免疫細胞
293T細胞を、10%FBSおよび1%Pen/Strepを含む10mLの高グルコースDMEM培地中においてT75フラスコ内で培養し、継代した。293T細胞が90%の培養密度に達したら、翌日、それらをレンチウイルスベクターの作製およびプラスミドのパッケージングのためのトランスフェクションに使用した。BCL6およびBcl-xL遺伝子のコード配列をT2A配列とつなげることにより、BCL6遺伝子とBcl-xL遺伝子とを同時に発現できる1つのオープンリーディングフレームを作製することができる。このBCL6-T2A-Bcl-xLオープンリーディングフレームは、NEBが提供するプロトコルに従ってGibsonアセンブリを用いてレンチウイルスベクターにクローニングされ得る。最終的なベクターは、pLV4aプラスミドと命名された(図1A)。このpLV4aプラスミドを、abm社のレンチウイルスベクターパッケージング混合物とともに293T細胞にコトランスフェクトした。ウイルス上清を、Clontech製のLenti-Xコンセントレーターを用いて濃縮した。
健康ドナー由来の無限細胞株を開発するために、正常なT細胞を、STEMCELL Technologies製のRosetteSepTMHuman T Cell Enrichment CocktailおよびSepMateTM-50チューブを用いて健康ドナーから単離した。次いで、単離されたT細胞を、10%FBS、2%HEPES、1%ピルビン酸ナトリウムおよび0.01%2-メルカプトエタノール、ならびに50~1000IU/mL IL-2(Genscript)および25μL/mL ImmunoCultTMヒトCD3/CD28/CD2 T細胞アクチベーター(STEMCELL Technologies)が補充されたRPMI-1640培地(Gibco)を用いて培養した。36~48時間培養した後、培養された100万個のT細胞に、濃縮pLV4aレンチウイルスベクター(図1A)をレトロネクチン(Clontech)の存在下において形質導入し、次いで、そのT細胞をRPMI1640培地中、50~1000IU/mLのIL-2の存在下で培養し、必要に応じて、継代培養し、分割した。形質導入された一部のT細胞は、無限に増殖し続けた。この方法により、組換えヒトIL-2またはIL-15の存在下において増殖する「無限T細胞」と称されるT細胞株が健康ドナーT細胞から作製された。
次に、上記方法によって、いくつかの新規の無限T細胞株を作製した。それらは、複数のT細胞サブセットからなるIn1-L4aT細胞と命名された。一連のT細胞を単離し、Ie1-L4a、If1-L4a、In1-L4aJ3、Ie1-L4aJ3、Igd1-L4a、Igd1-L4aJ3などを含むIn1-L4aT細胞を用いて細胞選別または遺伝子工学によって作製した。これらのIL-2またはIL-15依存性無限T細胞株の詳細な説明を表1に要約する。
Figure 2022545466000005
In1-L4a細胞および派生細胞は、GlutaMAXTM補給物、ピルビン酸ナトリウムおよび10%ウシ胎児血清(FBS)を含むRPMI1640培地などの通常の培養液中で容易に維持される。さらに、50~1000IU/mLの組換えヒトIL-2を、長期間の成長のために加える(図1B)。IL-15も、増殖を助けたが、IL7またはIL-21は、増殖を助けなかった(図1B)。懸濁培養物を週2回の培地交換で維持したとき、それらの細胞は、指数関数的なパターンで非常に急速に増殖および拡大でき、倍加時間は約24時間だった。これらの無限T細胞を培養液中で維持したところ、IL-2の存在下では増殖速度が変化することなく3ヶ月超にわたって増殖し続けた(図1B)。
上記細胞は、その生存および増殖をIL-2に強く依存しており、培養液からIL-2を取り除いた後は、増殖を止め、速やかに死んだ(図1B)。無限T細胞は、CD3陽性であり、インビトロで長期間培養し、拡大した後であっても、他の表面マーカー(例えば、CD4またはCD8、TCRαβまたはTCRgδまたはCD16)が、いくつかの無限T細胞サブセット上に発現された(図1C)。それらのマーカーは、無限T細胞が、異なるT細胞サブセットの混合集団であることを示し(図1C)、ゆえに、特異的なT細胞マーカーを用いた細胞選別によって特定のT細胞集団が単離され得る。例えば、CD8+無限T細胞を、抗CD8抗体を用いた細胞選別によって単離した。別の特定のT細胞集団であるγδT細胞集団も、抗TCRgδ抗体を用いた細胞選別によって単離した。選別の後、比較的純粋なγδT細胞株が作製された(図1D)。
成熟T細胞は、リンパ系組織において、Th1、Th2、Th17、TregおよびTfhなどの異なる機能的サブセットにさらに分化し得る。これらの機能的サブセットへの分化は、ユニークなマスター転写因子によって駆動される。例えば、Th1分化は、Tbetによって駆動され、Th2分化は、GATA-3によって駆動され、Th17分化は、RORgtによって駆動され、Treg分化は、Foxp3によって駆動され、Tfh分化は、BCL6によって駆動される。したがって、既存の文献に基づくと、成熟T細胞における高レベルのBCL6の発現は、Tfh様表現型に至ると予想され得る。しかしながら、無限T細胞ではこのタイプの分化が見られず、これは予想外のことだった。
上記細胞を、抗CD19 CARを発現するようにさらに改変して、一連の「抗CD19無限CAR T細胞」(CD19 inCART)を作製した。CD3無限T細胞およびCD8無限T細胞であるIn1-L4aおよびIe1-L4aを、pJ3プラスミド(図2A)と命名されたベクターを用いて、ヒトCD19を標的化するキメラ抗原レセプター(CAR)をそれらの表面上に発現するように改変したところ、In1-L4aJ3およびIe1-L4aJ3無限T細胞株が得られた。In1-L4aJ3 T細胞とIe1-L4aJ3 T細胞の両方が、抗CD19 CARを発現し、組換えヒトCD19タンパク質に結合できた(図2Bおよび2C)。In1-L4aJ3およびIe1-L4aJ3無限T細胞の作製は成功し、それらの細胞は、それらの親細胞と類似の増殖速度でインビトロにおいて拡大した。Ie1-L4aJ3は、IL-2の存在下においてCD19陽性Rajiリンパ腫細胞株およびNalm6白血病細胞株を0.2:1および1:1というエフェクター:ターゲット比で溶解する能力を示した(図3)。
実施例2-CD19 in CART細胞を作製するためのIn1-L4a由来T細胞株の改変
以下の例では、CD19 in CAR T細胞を作製するためのIn1-L4a由来無限T細胞株の改変を説明する。これらの手順は、他の無限T細胞に対しても同様に使用できる。しかしながら、簡潔さのために、これらの手順を、In1-L4aおよびIe1-L4a細胞株についてのみ詳細に説明する。当業者であれば、上記方法を、抗CD19 CAR遺伝子を他の無限細胞株に挿入するように、または種々の異なる腫瘍に対する種々の腫瘍マーカーを標的化する他のCARもしくはTCRを治療目的で挿入するように適合させることができるだろう。
MSCVプロモーターによって駆動される抗CD19 CARおよびhEGFRtを発現する組換えレンチウイルスベクターを、Gibsonアセンブリ法(NEB)によって作製した。そのベクターは、pJ3(LV-MSCV-最適化C19-CD28z-T2A-tEGFR)と命名された(図2A)。感染性のpJ3ウイルスを生成するために、293T細胞にpJ3プラスミドとレンチウイルスベクターパッケージングミックス(ABM)とをコトランスフェクトした。実施例1に記載された100万個のIn1-L4aおよびIe1-L4a細胞にpJ3レンチウイルスベクターを形質導入した。形質導入の10日後、AF647標識抗EGFR抗体(R&D)およびFITC標識組換えヒトCD19タンパク質(ACROBiosystems)を用いるフローサイトメトリーによって、CAR陽性細胞を試験した。pJ3を形質導入されたIe1-L4aおよびIn1-L4a群におけるCAR陽性細胞のパーセンテージは、約20%および46.5%だった(図2B)。
上記のCAR陽性のパーセンテージは、FITC標識組換えヒトCD19タンパク質およびAF647標識セツキシマブでの二重染色によってさらに確認された(図2C)。そのCAR陽性細胞を、セルソーター(BD)を用いて細胞選別によって濃縮した。選別の後、比較的純粋な抗CD19 CAR細胞を回収し、インビトロで拡大した(図2D)。ヒトCD19に対するCARを発現しているIn1-L4aおよびIe1-L4a細胞を、In1-L4aJ3およびIe1-L4aJ3と命名した。それらは、それらの親In1-L4aおよびIe1-L4a無限T細胞と類似の指数関数的な増殖速度を示した(図1B)。
CD19陽性のリンパ腫細胞および白血病細胞に対するCD19 in CAR T細胞のインビトロ細胞傷害性:Raji細胞は、リンパ腫の前臨床研究において広く使用されている、バーキットリンパ腫患者に由来するCD19+B細胞リンパ腫細胞株であり、Nalm6は、急性リンパ芽球性白血病患者に由来するCD19+B細胞白血病細胞株である。ゆえに、それらの両方を使用して、エフェクターと標的細胞とを0.2:1および1:1の比でIL-2の存在下において共培養することによって、無限抗CD19 CART細胞株の細胞傷害活性を試験した。この試験は、12ウェルプレートにおいて行われた。簡潔には、10万個のRajiまたはNalm6細胞を、2mLの上述の培地中、1ウェルあたり2万個または10万個のIe1-L4aJ3細胞(抗CD19 CART)またはIe1-L4a細胞(抗CD19 CARを有しない)とともに培養した。共培養の5日後に、各ウェル内の細胞を、APC結合体化抗CD8抗体(BD)で染色し、BD Fotessa Analyser(BD)を用いて細胞を取得して、生細胞のT細胞および腫瘍細胞のパーセンテージを測定した。フローサイトメトリーデータを、FlowJoソフトウェアを用いて解析した。データから、両方のIe1-L4aJ3無限T細胞が、Raji腫瘍細胞とNalm6腫瘍細胞の両方をインビトロで効率的に溶解できることが実証された(図3)。対照的に、Ie1-L4a細胞は、抗CD19 CARを欠くので、それらを用いたとき、RajiまたはNalm6腫瘍細胞の有意な溶解は観察されなかった。
実施例3-汎用の養子T細胞療法用の無限T細胞
無限T細胞は、長期間、急速に増殖する能力を有する。現在までに、本発明者らは、8人の健康ドナーから、BCL6およびBCL2L1のレンチウイルス形質導入によって無限T細胞を作製し、それらが、IL-2またはIL-15の存在下において>12ヶ月にわたって継続的に急速に成長できることを観察した。レンチウイルスによってこれらの細胞に抗CD19 CARを組み込んでも成長速度に影響しなかった。これらのT細胞の増加倍率は、10日間で約100倍、30日間で約100万倍であり、増殖能力は、12ヶ月間という継続的なインビトロ培養にわたって変化しない(図5A)。表現型的には、無限T細胞は、CD4T細胞とCD8T細胞との混合物からなり、これは、磁気ビーズによって高純度にソーティングできた(図5B)。CD4T細胞内のFoxp3細胞は、<5%だった(データ示さず)。任意の時点におけるサイトカインの投与中止によって、1週間以内に急速に細胞死が生じたことから、これらのT細胞が、悪性の表現型に形質転換しておらず、自律的増殖の能力を獲得していないことが示唆される(図5C)。
無限T細胞は、高いテロメラーゼ活性を示す。30~40回の集団倍化の後のT細胞の増殖は、テロメアの漸進的な短縮および複製老化を招くので(Barsov et al.,2011)、本発明者らは、TRAPezeテロメラーゼ活性検出キット(Sigma)を用いてこれらの細胞におけるテロメラーゼ活性を測定した。無限T細胞におけるhTERT活性は、末梢血単核球(PBMC)由来の対応するT細胞と比べて非常に高かった(図6A)。これらの細胞のRNAseq解析は、無限CD4+T細胞、無限CD8+T細胞および無限CD8+CAR+T細胞におけるこの観察結果と一致した(図6B)。これらの結果から、形質導入された遺伝子がおそらく、無限T細胞において高いテロメラーゼ活性を誘導し、その結果、テロメアの長さが安定化し、複製老化が防がれ、長期の増殖能力という特性が付与されることが示唆された。
抗CD19 CARの組み込みは、B細胞悪性腫瘍に対する無限T細胞の特異性を再指示する。抗CD19 CAR(CD8αヒンジ/膜貫通ドメイン、CD3ζおよびCD28シグナル伝達ドメインならびに形質導入マーカーおよび安全スイッチとしてtEGFRを有するクローンFMC63抗CD19 scFvに基づく(Wang et al.,2011))を無限T細胞にレンチウイルスで形質導入すると、それらの細胞は、Daudiバーキットリンパ腫細胞株およびNALM-6急性B細胞リンパ芽球性白血病細胞株を効率的かつ特異的に脱顆粒し、殺滅することが可能になった(図7A~7B)。CARを有しない無限T細胞は、有意な細胞傷害性または脱顆粒を示さなかった。健康ドナーから単離されたばかりのT細胞から作製された従来のCAR T細胞と比べて、無限T細胞は、腫瘍細胞の殺滅は遅かったが、7日目までにほぼ完全に排除した(図7A)。この遅い殺滅は、サイトカイン放出症候群および神経性の毒性などの毒性の発生がより少なくなり得るので、臨床では有望な利点であり得る。これらの抗CD19無限CAR T細胞は、セントラルメモリーおよびエフェクターメモリー表現型を有し(図7C)、T細胞疲弊に関連するマーカーの発現が非常に少なかったかまたは無かった(図7D)。
無限T細胞の転写プロファイル。PBMCサンプルから単離された対応するCD4またはCD8T細胞と比べた、抗CD19 CARを有するまたは有しない無限CD4および/またはCD8T細胞のRNAseq解析は、これらが、メモリー表現型および細胞傷害性表現型を有し、古典的なT細胞疲弊に関連するマーカーを発現しないというフローサイトメトリーデータおよび機能データと一致した(図8A~8B)。それらは、ナイーブT細胞から濾胞性ヘルパーT細胞(TFH)への分化に対するマスター転写因子であるBCL6を過剰発現することによって作製されたが、これらの細胞は、TFHシグネチャを示さず(図8A)、TFH細胞の特徴である(Nurieva et al.,2009;Rawal et al.,2013)高レベルのCXCR5を発現しない(図8C)。しかしながら、それらは、リンパ節へのT細胞の輸送にとって重要なケモカインレセプターCCR4およびCCR7、ならびに骨髄への輸送にとって重要なCXCR4の発現を保持する(図8C)(Viola et al.,2006)。両方の部位が、通常、リンパ腫に関わる。無限T細胞は、B3GAT1(CD57)、CD160またはKLRG1などの老化マーカーを発現しない(図8D)(Xu et al.,2017)。ケモカイン(図9A)およびサイトカイン(図9B)遺伝子の発現プロファイルは、無限T細胞と末梢血に由来する対応するCD4またはCD8 T細胞との間でおおむね似ていた。サイトカインレセプターの遺伝子発現は、末梢血由来の対応するCD4またはCD8 T細胞と比べて無限T細胞において、いくらかの差を示し、以下に限定されないが、IL2RA、IL15RAおよびIL21Rレベルの上昇、ならびにIL4R、IL7R、IL10RA、IL17RA、IL18R1およびIFNGR1レベルの低下を含んだ(図9C)。
無限CAR T細胞は、凍結融解後に増殖性および細胞傷害性の機能を保持する。CARを有するおよび有しない無限T細胞を凍結保存し、6ヶ月後に解凍した。解凍後、それらは、抗EGFR抗体を用いたとき、CARの強い発現を示した(図10A)。これらの細胞をIL-2中で培養すると、細胞数が10日間で約100倍増加し、無限CD8 CAR T細胞の増殖能力は凍結融解後に維持されることが確認された(図10B)。さらに、これらの細胞は、悪性B細胞に対して非常に有意かつ特異的な細胞傷害活性を示すと示された(図10C)。
無限γδT細胞は、疲弊マーカーを発現しない。無限γδT細胞は、古典的なT細胞疲弊マーカーを有意に発現しなかった(図11)。
抗CD19無限CAR T細胞は、インビボモデルにおいて抗腫瘍有効性を示す。ルシフェラーゼで標識された無限CAR T細胞を用いて、本発明者らは、NSGマウスに腹腔内(i.p.)注射した後、生物発光イメージング(BLI)によってモニターしたところ、それらのT細胞がサイトカインの補助なしでは72時間以内に急速に消失したことを観察した(図12、中央のカラム)。これは、おそらくマウスサイトカイン(IL-2とIL-15の両方)がヒトT細胞の成長を補助しないからである。対照的に、1および3日目に組換えヒトIL-15を注射すると、IL-15停止後の1週間にわたって細胞が残存するのとともに、強力なT細胞増殖が誘導された(図12、右のカラム)。これらの結果から、IL-15は、インビボでの増殖および持続性を促進し、低用量で十分であり得ることが示唆された。類似の効果は、IL-2でも観察された。
次に、本発明者らは、ルシフェラーゼで標識されたNALM-6腫瘍細胞を、CARを有するまたは有しない3×10無限T細胞/マウスとともにNSGマウスに静脈内(IV)注射し、IL-15を0、4、7および11日目に注射した。CARなしの無限T細胞と対比して、無限CAR T細胞で処置されたマウスでは、有意に腫瘍がコントロールされ、生存時間が延長した(図13)。まとめると、これらの結果は、インビボでの拡大および持続性を強化するためにIL-2またはIL-15を分泌するように無限T細胞を操作する根拠を提供した。
微生物関連および腫瘍関連の抗原特異的無限T細胞。HLA-A2+ドナーから作製された無限T細胞を、四量体を用いて試験したところ、微生物関連および腫瘍関連の抗原特異的T細胞の混合物の存在が明らかになった(図14)。これらのT細胞の濃縮集団を作製するために、本発明者らは、HLA-A2+ドナー由来の健康ドナー末梢血単核球を、EBVタンパク質に由来するペプチドのプールで刺激した。24時間後、CD137陽性T細胞をソーティングし、それらにBCL6およびBCL2L1を発現するレンチウイルスベクターL5x(図22)を形質導入することによって無限T細胞の作製のために使用した。ウイルス作製および形質導入のプロトコルは、実施例1に記載した。形質導入の2週間後、形質導入されたT細胞をCD3/CD28/CD2 T細胞アクチベーターで再度刺激した後、実施例1に記載されているように培養し続けた。IL-2の存在下における7週間のインビトロでの培養および拡大の後、APCで標識された3つの四量体(BMLF1-HLA-A2四量体を含む)を使用して、拡大された細胞を染色し、APC濃縮磁気ビーズによって濃縮し、濃縮された無限T細胞を、他のすべての無限T細胞のように継続的に培養した。13週目に、濃縮された無限T細胞を、APC標識BMLF1-HLA-A2四量体で染色したところ、それらのT細胞の約70%が、CD8陽性かつBMLF1-HLA-A2四量体陽性であることが見出されたことから、それらがEBV-BMLF1タンパク質に由来するHLA-A2結合ペプチド(GLCTLVAML)に対して特異的であることが示唆された(図15)。微生物関連抗原および腫瘍関連抗原に対する他の抗原特異的T細胞を作製するために、類似のアプローチを使用することができる。そして次に、そのような抗原特異的T細胞は、二重抗原特異的T細胞を作製するために、目的のCARまたはTCRの形質導入に使用することができる。
安全スイッチとしてのTet-offシステム。本発明者らは、8人のドナーに由来する無限T細胞の6~>12ヶ月の培養においても、インビトロでの無限T細胞の悪性形質転換またはサイトカイン非依存性増殖を観察しなかった(図4)。しかしながら、臨床へのトランスレーションに向けて安全性を確保するために、ドキシサイクリンを使用することによって、形質導入されたBCL6およびBCL2L1遺伝子をオフにすることができるTet-off安全スイッチを組み込んだ。このTet-off安全スイッチを組み込んだ後でも、無限T細胞は、ドキシサイクリンの非存在下でその成長速度を維持したが、1μg/mLのドキシサイクリンの存在下では増殖を停止し、徐々に細胞死を起こした(図16)。このドキシサイクリンの濃度は、ヒトにおいて標準的なドキシサイクリンの治療用量で達成可能な濃度である(Agwuh et al.,2006)。光学顕微鏡のイメージングによって、その無限T細胞は、ドキシサイクリンの濃度上昇に伴って増殖クラスターが減少するのとともに、サイズが徐々に小さくなったことが分かった(図17)。さらに、CD25の発現は、ドキシサイクリンの存在下において顕著に減少し(図17)、PD-1の発現は増加したことから、おそらくBCL6および/またはBCL2L1遺伝子がこれらの分子の発現を制御したと示唆される。他のT細胞共阻害性レセプターの発現は、ドキシサイクリンの存在下において有意に変化しなかった(図18)。無限T細胞に組み込まれたIL-2またはIL-15サイトカイン遺伝子を制御するために、類似のtet-off安全スイッチを使用することもできる。
抗CD19無限CAR T細胞は、B細胞腫瘍細胞に応答してエフェクターサイトカインを産生する。腫瘍細胞に応答して産生される無限T細胞のサイトカインプロファイルを明らかにするために、本発明者らは、5:1というエフェクター:ターゲット比で、抗CD19 CARを形質導入されたまたはされてないCD8無限T細胞とNALM-6腫瘍細胞を共培養した。3日後、上清中のサイトカインレベルを計測した。結果から、抗CD19 CARを有する無限T細胞は、大部分がNALM-6腫瘍細胞に応答してかなりの量のIL-2、GM-CSF、IFN-γ、IL-5およびIL-17を産生したが、抗CD19 CARを有しない無限T細胞は産生しなかったことが示された(図19)。腫瘍細胞に応答した抗CD19無限CAR T細胞によるTNF-α、IL-4、IL-6、IL-10またはIL-13の産生は、最小だったか、またはCAR発現なしの無限T細胞と有意に異ならなかった。しかしながら、CAR発現ありまたはなしの無限T細胞は、腫瘍細胞の存在下または非存在下において10,000pg/mLを超える大量のIL-4を産生した(図19およびデータ示さず)。IL-4は、T細胞、マクロファージおよび他の免疫細胞によって誘導される炎症を抑制できるので、外部刺激の非存在下において大量のIL-4を恒常的に産生するこの無限T細胞の特性は、様々な炎症性障害(例えば、自己免疫疾患、移植片対宿主病、サイトカイン放出症候群に関連するある特定のタイプの感染症、CAR T細胞療法および他の養子T細胞療法に関連する毒性、炎症性腸障害、様々な免疫療法に関連する免疫関連有害事象、血球貪食性リンパ組織球症、周期性発熱症候群など)を処置するための臨床用途を潜在的に有し得る。
抗CD19無限CAR T細胞用のtEFGR安全スイッチ。切断型EGFR(tEGFR)が、無限T細胞用の安全スイッチとして働くことができるかを判定するために、本発明者らは、5μg/mLの濃度のセツキシマブの存在下において抗CD19 CARおよびtEGFRを発現する無限T細胞を、健康ドナーの末梢血単核球から単離されたナチュラルキラー(NK)細胞とともにまたはその細胞なしで共培養した。セツキシマブは、抗体依存性細胞傷害(ADCC)によって、コントロールとして使用されたリツキシマブと比べて有意な抗CD19無限CAR T細胞の溶解を誘導した(図20)。これらの結果は、tEGFRが、有害事象が起きた場合にインビボにおいて無限T細胞を排除するための安全スイッチとして働き得ることを示唆している。
BCL6およびBIRC5遺伝子の形質導入による無限T細胞の作製。本発明者らは、無限T細胞が、ヒトT細胞へのBCL6およびBCL2L1遺伝子の形質導入またはBCL6およびBIRC5遺伝子の形質導入によって作製され得ることを観察した(図21A)。BCL2L1は、抗アポトーシスタンパク質であるBcl-xLをコードし、BIRC5は、増殖を促進し、細胞のアポトーシスを阻止する、アポトーシス阻害(IAP)ファミリータンパク質であるサバイビンをコードする。どちらの遺伝子の組み合わせを形質導入しても、IL-2の存在下において指数関数的な成長速度で同等の長期増殖能力を有する無限T細胞が作製された(図21B)。さらに、これらの無限T細胞を、ドキシサイクリンを使用することによって、形質導入されたBCL6およびBCL2L1またはBCL6およびBIRC5遺伝子をオフにすることができるTet-off安全スイッチを用いて作製した。そのベクターには、これらの細胞に形質導入されるIL-15遺伝子も組み込まれた。Th細胞は、ドキシサイクリンの非存在下では指数関数的な速度で成長したが、1μg/mLのドキシサイクリンの存在下では、IL-15の形質導入および培養液へのIL-2の添加にもかかわらず増殖を止め、徐々に細胞死を起こした(図21C)。
BCL6およびBcl-xlを含む構築物L5x(MSCV-BCL6-P2A-BCL-xl-T2A-rtTA))の一例。この構造では少なくとも、野生型BCL-6とBCL-xLとの間にP2Aエレメントが含まれており、BCL-xLとrtTA(Tet onトランス活性化因子)との間にT2Aエレメントが含まれている(図22)。
図23は、少なくともBCL6を含む構築物の実施形態の複数の例を提供しており;そのような例は、BCL-xLを使用していてもよいし、使用していなくてもよい。単なる一例として、例1では、BCL6およびrtTAの過剰発現を制御するためにMSCVプロモーターを使用しており、H1プロモーターは、カスパーゼ9の発現をノックダウンするためのカスパーゼ9標的化shRNAを制御する。例2では、BAKの発現をノックダウンするためのBAK遺伝子標的化shRNAを制御するためのヒトU6プロモーターに加えて、BCL6およびrtTAの過剰発現を制御するためにMSCVプロモーターを使用している。例3では、MSCVプロモーターが、BCL6およびHSP27およびrtTAの過剰発現を制御する。例4では、MSCVプロモーターが、BCL6およびrtTAの発現を制御しており、U6プロモーターが、miRNA21の発現を制御している。
本明細書中に開示および特許請求される方法のすべてが、本開示に鑑みて、過度の実験を行うことなく実施および実行され得る。本発明の組成物および方法を好ましい実施形態の点から説明してきたが、本発明の概念、趣旨および範囲から逸脱することなく、本明細書中に記載された方法および方法の工程または工程の順序に変更が適用されてもよいことが当業者には明らかだろう。より詳細には、同じまたは類似の結果が達成される限り、化学的かつ生理的に関係するある特定の作用物質を本明細書中に記載される作用物質の代わりに用いてもよいことが明らかだろう。当業者に明らかなそのような類似の代替物および改変のすべてが、添付の請求項によって定義される本発明の趣旨、範囲および概念の範囲内であるとみなされる。
参考文献
以下の参考文献は、本明細書中に示されたものを補足する例示的な手順の詳細またはその他の詳細を提供する限りにおいて、参照により本明細書中に明確に援用される。

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米国特許出願公開第2002131960号
米国特許出願公開第2013287748号
米国特許出願公開第20130149337号
米国特許第6,410,319号
米国特許第6,451,995号
米国特許第7,070,995号
米国特許第7,265,209号
米国特許第7,354,762号
米国特許第7,446,179号
米国特許第7,446,190号
米国特許第7,446,191号
米国特許第8,252,592号
米国特許第8,324,353号
米国特許第8,339,645号
米国特許第8,398,282号
米国特許第8,479,118号
欧州特許出願第2537416号

Claims (71)

  1. B細胞リンパ腫6(BCL6)および1つ以上の細胞生存促進遺伝子を発現するように操作された免疫細胞を含む、組成物。
  2. 前記細胞生存促進遺伝子が、生存促進性遺伝子または抗アポトーシス遺伝子である、請求項1に記載の組成物。
  3. 免疫細胞が、T細胞、NK細胞、自然リンパ球系細胞またはそれらの混合物である、請求項1に記載の組成物。
  4. 前記細胞生存促進遺伝子が、抗アポトーシスB細胞リンパ腫2(BCL-2)ファミリー遺伝子である、請求項1~3のいずれか1項に記載の組成物。
  5. 前記抗アポトーシスBCL-2ファミリー遺伝子が、BCL2L1(Bcl-xL)、BCL-2、MCL1、BCL2L2(Bcl-w)、BCL2A1(Bfl-1)、BCL2L10(BCL-B)またはそれらの組み合わせである、請求項4に記載の組成物。
  6. 前記抗アポトーシスBCL-2ファミリー遺伝子が、BCL2L1(Bcl-xL)である、請求項5に記載の組成物。
  7. 前記細胞生存促進遺伝子が、アポトーシス阻害ファミリー遺伝子である、請求項1~6のいずれか1項に記載の組成物。
  8. 前記アポトーシス阻害(IAP)ファミリー遺伝子が、XIAP、BIRC2(C-IAPl)、BIRC3(C-IAP2)、NAIP、BIRC5(サバイビン)またはそれらの組み合わせである、請求項7に記載の組成物。
  9. 前記細胞生存促進遺伝子が、1つ以上のカスパーゼの発現を阻害するかまたはノックアウトする核酸ポリマーである、請求項1~8のいずれか1項に記載の組成物。
  10. 前記カスパーゼが、カスパーゼ-1、カスパーゼ-2、カスパーゼ-3、カスパーゼ-4、カスパーゼ-5、カスパーゼ-6、カスパーゼ-7、カスパーゼ-8、カスパーゼ-9、カスパーゼ-10、カスパーゼ-11、カスパーゼ-12、カスパーゼ-13、カスパーゼ-14またはそれらの組み合わせである、請求項9に記載の組成物。
  11. 前記細胞生存促進遺伝子が、1つ以上のアポトーシス促進性遺伝子の発現を阻害するかまたはノックアウトする核酸ポリマーである、請求項1~10のいずれか1項に記載の組成物。
  12. 前記アポトーシス促進性遺伝子が、BCL2L11(BIM)、BBC3(PUMA)、PMAIP1(NOXA)、BIK、BMF、BAD、HRK、BID、BAX、BAK1、BOKまたはそれらの組み合わせである、請求項11に記載の組成物。
  13. 前記細胞生存促進遺伝子が、抗アポトーシス効果を有する遺伝子である、請求項1~12のいずれか1項に記載の組成物。
  14. 抗アポトーシス効果を有する前記遺伝子が、IGF1、HSPA4(Hsp70)、HSPB1(Hsp27)、CLAR(cFLIP)、BNIP3、FADD、AKTおよびNF-κB、RAF1、MAP2K1(MEK1)、RPS6KA1(p90Rsk)、JUN(C-Jun)、BNIP2、BAG1、HSPA9、HSP90B1、miRNA21、miR-106b-25、miR-206、miR-221/222、miR-17-92、miR-133、miR-143、miR-145、miR-155、miR-330またはそれらの組み合わせである、請求項13に記載の組成物。
  15. 前記免疫細胞が、外部刺激の非存在下においてIL-4を産生する、請求項1~14のいずれか1項に記載の組成物。
  16. 前記免疫細胞が、1つ以上のサイトカインを発現するように操作されている、請求項1~15のいずれか1項に記載の組成物。
  17. 前記サイトカインが、IL-2および/またはIL-15である、請求項16に記載の組成物。
  18. 前記免疫細胞が、癌と診断されたことがないドナーに由来する、請求項1~17のいずれかに記載の組成物。
  19. 前記免疫細胞が、処置を必要とする個体に由来する、請求項1~18のいずれかに記載の組成物。
  20. 前記ドナーが、ヒトである、請求項18または19に記載の組成物。
  21. 前記免疫細胞が、CD4+T細胞、CD8+T細胞、iNKT細胞、NKT細胞、γδT細胞、制御性T細胞、自然リンパ球系細胞またはそれらの組み合わせであるT細胞である、請求項1~20のいずれかに記載の組成物。
  22. 前記免疫細胞が、CD4陽性細胞、CD8陽性細胞および/またはγδT細胞を含むT細胞である、請求項1~21のいずれかに記載の組成物。
  23. 前記免疫細胞が、ナイーブT細胞、エフェクターT細胞、メモリーT細胞、幹細胞メモリーT細胞、最終分化T細胞またはそれらの組み合わせであるT細胞である、請求項1~22のいずれかに記載の組成物。
  24. 前記免疫細胞が、TCRαβ細胞、TCRγδT細胞またはそれらの組み合わせであるT細胞である、請求項1~23のいずれかに記載の組成物。
  25. 前記免疫細胞が、Th1/Tc2、Th2/Tc2、Th9/Tc9、Th17/Tc17、Tfh、Th22、Tc22またはそれらの組み合わせであるT細胞である、請求項1~24のいずれかに記載の組成物。
  26. 前記免疫細胞が、IFNγ、GM-CSF、TNFα、IL-2、IL-4、IL-5、IL-6、IL-9、IL-10、IL-13、IL-16、IL-17、IL-23、IL-32、グランザイムB、パーフォリンまたはそれらの組み合わせであるサイトカインおよび細胞傷害性分子を発現する、請求項1~25のいずれかに記載の組成物。
  27. 前記免疫細胞が、1つ以上の微生物抗原、1つ以上の自己抗原または1つ以上の腫瘍抗原に特異的である、請求項1~26のいずれかに記載の組成物。
  28. 前記ウイルスが、ヒト免疫不全ウイルス(HIV)、単純ヘルペスウイルス(HSV)、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)、サイトメガロウイルス(CMV)、エプスタイン・バーウイルス(EBV)、インフルエンザA、インフルエンザB、インフルエンザC、水疱性口内炎ウイルス(VSV)、B型肝炎ウイルス(HBV)、C型肝炎ウイルス(HCV)、ヒトパピローマウイルス(HPV)、水痘帯状疱疹ウイルス(VZV)、水疱性口内炎ウイルス(VSV)、ポリオーマウイルス、BKウイルス、JCウイルス、アデノウイルス、コロナウイルスまたはそれらの組み合わせである、請求項27に記載の組成物。
  29. 前記免疫細胞が、1つ以上のキメラ抗原レセプター(CAR)および/または1つ以上のT細胞レセプター(TCR)を発現するように操作されている、請求項1~28のいずれかに記載の組成物。
  30. 前記CARおよび/またはTCRが、CD19、CD20、CD22、CD79a、CD79b、メソテリン、MAGE-A1、MAGE-A4、TCL1、NY-ESO、WT1および/またはBAFF-R抗原結合領域を標的化する、請求項29に記載の組成物。
  31. 前記CARが、CD8a、CD28、PD-1、CTLA4、前記T細胞レセプターのアルファ、ベータもしくはゼータ鎖、CD2、CD3ゼータ、CD3イプシロン、CD3ガンマ、CD3デルタ、CD45、CD4、CD5、CD8b、CD9、CD16、CD22、CD27、CD32、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137、CD154、CD160、BTLA、LAIR1、TIGIT、TIM4、ICOS/CD278、GITR/CD357、NKG2D、LAG-3、PD-L1、PD-1、TIM-3、HVEM、LIGHT、DR3、CD30、CD224、CD244、SLAM、CD226、DAPのヒンジ、またはそれらの組み合わせもしくは合成分子の部分配列または完全配列を含む、請求項29または30に記載の組成物。
  32. 前記CARが、前記T細胞レセプターのアルファ鎖、前記T細胞レセプターのベータ鎖、前記T細胞レセプターのゼータ鎖、CD28、CD2、CD3ゼータ、CD3イプシロン、CD3ガンマ、CD3デルタ、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137、CD154、ICOS/CD278、GITR/CD357、NKG2D、PD-1、CTLA4、DAP、合成分子またはそれらの組み合わせの部分的または完全な膜貫通ドメインを含む、請求項29~31のいずれか1項に記載の組成物。
  33. 前記CARが、CD28、CD27、OX-40(CD134)、DAP10、DAP12、4-1BBまたはそれらの組み合わせの1つ以上の共刺激ドメインを含む、請求項29~32のいずれか1項に記載の組成物。
  34. 前記組成物が、100,000~100億個の免疫細胞を含む、請求項1~33のいずれかに記載の組成物。
  35. 前記免疫細胞が、1つ以上の安全スイッチを含む、請求項1~34のいずれかに記載の組成物。
  36. 前記安全スイッチが、切断型EGFRまたはその融合タンパク質である、請求項27に記載の組成物。
  37. 前記免疫細胞が、IL-2、IL-15、1つ以上の成長因子、1つ以上の分化因子またはそれらの組み合わせを発現する、請求項1~36のいずれかに記載の組成物。
  38. 前記細胞が、少なくとも3ヶ月間、4ヶ月間、5ヶ月間、6ヶ月間、7ヶ月間、8ヶ月間、9ヶ月間、10ヶ月間、11ヶ月間もしくは12ヶ月間またはそれ以上にわたって増殖速度を維持する、請求項1~37のいずれかに記載の組成物。
  39. 前記免疫細胞が、強化された抗腫瘍細胞傷害性、サイトカイン産生、インビボ増殖、インビボ持続性および/または改善された機能を有する、請求項1~38のいずれかに記載の組成物。
  40. BCL6および細胞生存促進遺伝子をコードする1つ以上のベクターを前記細胞に導入する工程を含む、請求項1~39のいずれかに記載の免疫細胞を作製するための方法。
  41. 前記細胞生存促進遺伝子が、抗アポトーシスB細胞リンパ腫2(BCL-2)ファミリー遺伝子である、請求項40に記載の方法。
  42. 前記抗アポトーシスBCL-2ファミリー遺伝子が、BCL2L1(Bcl-xL)、BCL-2、MCL1、BCL2L2(Bcl-w)、BCL2A1(Bfl-1)、BCL2L10(BCL-B)またはそれらの組み合わせである、請求項41に記載の方法。
  43. 前記抗アポトーシスBCL-2ファミリー遺伝子が、BCL2L1(Bcl-xL)である、請求項42に記載の方法。
  44. 前記ベクターが、BCL6およびBcl-xLを2A配列と連結する、請求項40~43のいずれかに記載の方法。
  45. 前記ベクターが、レンチウイルスベクターである、請求項40~44のいずれかに記載の方法。
  46. 導入する工程が、IL-2、IL-15および/または1つ以上の他の成長因子の存在下において前記細胞に前記レンチウイルスベクターを形質導入することを含む、請求項40~45のいずれか1項に記載の方法。
  47. IL-2が、10IU/mL~1000IU/mLの濃度で存在する、請求項46に記載の方法。
  48. IL-2が、400IU/mLの濃度で存在する、請求項46または47に記載の方法。
  49. 前記T細胞をCD3およびCD28で活性化する工程をさらに含む、請求項40~48のいずれかに記載の方法。
  50. 前記細胞をIL-2および/またはIL-15の存在下において培養する工程をさらに含む、請求項40~49のいずれかに記載の方法。
  51. 前記IL-2またはIL-15が、10~200ng/mLの濃度で存在する、請求項50に記載の方法。
  52. 前記細胞が、少なくとも3、4、5、6、7、8、9、10、11、12ヶ月間またはそれ以上にわたって増殖速度が本質的に低下することなく培養される、請求項40~51のいずれかに記載の方法。
  53. T細胞サブセットについてソーティングする工程をさらに含む、請求項40~52のいずれかに記載の方法。
  54. 前記T細胞サブセットが、CD4+T細胞、CD8+T細胞またはγδT細胞を含む、請求項53に記載の方法。
  55. 1つ以上のサイトカインおよび/または1つ以上の安全スイッチを前記免疫細胞に導入する工程をさらに含む、請求項40~54のいずれか1項に記載の方法。
  56. 前記1つ以上のサイトカインおよび/または1つ以上の安全スイッチが、前記BCL6および細胞生存促進遺伝子と同じベクター上に存在する、請求項55に記載の方法。
  57. 前記1つ以上のサイトカインおよび/または1つ以上の安全スイッチが、前記BCL6および細胞生存促進遺伝子と異なるベクター上に存在する、請求項55に記載の方法。
  58. 免疫関連障害、感染症および/または癌を処置するための、請求項1~39のいずれか1項に記載の細胞の集団を含む組成物であって、ここで、前記免疫細胞は、1つ以上の分子に対して標的化されている、組成物。
  59. 被験体における疾患または障害を処置する方法であって、有効量の請求項1~39のいずれか1項に記載の免疫細胞を前記被験体に投与する工程を含む、方法。
  60. 前記疾患または障害が、感染症、癌または免疫関連障害である、請求項59に記載の方法。
  61. 前記免疫関連障害が、自己免疫障害、移植片対宿主病、同種移植片拒絶または炎症状態である、請求項60に記載の方法。
  62. 前記免疫細胞が、前記被験体に対して同種異系の免疫細胞である、請求項59~61のいずれか1項に記載の方法。
  63. 前記免疫細胞が、前記被験体に対して自己の免疫細胞である、請求項59~61のいずれか1項に記載の方法。
  64. 前記疾患が、癌である、請求項60に記載の方法。
  65. 前記癌が、固形癌または血液悪性腫瘍である、請求項64に記載の方法。
  66. 前記疾患または障害が、自己免疫疾患、移植片対宿主病、サイトカイン放出症候群に関連する感染症、免疫療法に関連する毒性、炎症性腸障害、免疫療法に関連する免疫関連有害事象、血球貪食性リンパ組織球症、周期性発熱症候群またはそれらの組み合わせである、請求項59に記載の方法。
  67. サイトカイン放出症候群に関連する前記感染症が、コロナウイルスによるものである、請求項66に記載の方法。
  68. 前記コロナウイルスが、SARS-CoV、SARS-CoV-2またはMERSである、請求項67に記載の方法。
  69. 前記免疫細胞が、T細胞、マクロファージおよび/または他の免疫細胞によって誘導される炎症を抑制するべき条件下でIL-4を産生する、請求項59~68のいずれか1項に記載の方法。
  70. 少なくとも第2の治療薬を前記被験体に投与する工程をさらに含む、請求項59~69のいずれか1項に記載の方法。
  71. 前記少なくとも第2の治療薬が、化学療法、免疫療法、手術、放射線療法、薬物療法、標的化療法、ホルモン療法、生物療法またはそれらの組み合わせを含む、請求項70に記載の方法。
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