JP2022526826A - Hiv感染症の処置のためのクロスオーバー二重可変ドメイン(codv)フォーマットを使用した三重特異性および/または三価結合性タンパク質 - Google Patents

Hiv感染症の処置のためのクロスオーバー二重可変ドメイン(codv)フォーマットを使用した三重特異性および/または三価結合性タンパク質 Download PDF

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Abstract

クロスオーバー二重可変ドメイン(CODv)フォーマットを使用して、本開示は、組成物であって、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含む三重特異性および/または三価結合性タンパク質を含み、結合性タンパク質を形成するポリペプチドの第1のペアは、クロスオーバー配向性を有する二重可変ドメインを持ち、ポリペプチドの第2のペアは単一の可変ドメインを持つ、前記組成物に関する。三重特異性および/または三価結合性タンパク質を作製する方法ならびにHIV/AIDSの処置および/または予防のためのそのような結合性タンパク質の使用もまた本明細書において提供される。【選択図】図1

Description

関連出願の相互参照
本出願は、2019年4月9日に出願された米国仮出願第62/831,415号、および2019年10月8日に出願されたEP出願第EP19306312.0号に対する優先権を主張し、これらのそれぞれの開示を参照によって全体として本明細書に組み入れる。
ASCIIテキストファイルでの配列表の提出
ASCIIテキストファイルでの以下の提出の内容を参照によって全体として本明細書に組み入れる:コンピュータ読取り可能な形態(CRF)の配列表(ファイル名:183952031940SEQLIST.TXT、記録日:2020年3月25日、サイズ:580KB)。
分野
本開示は、三重特異性および/または三価結合性タンパク質であって、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、結合性タンパク質を形成するポリペプチドの第1のペアは、クロスオーバー配向性を有する二重可変ドメインを持つ、前記結合性タンパク質に関する。本開示はまた、三重特異性および/または三価結合性タンパク質を作製する方法ならびにHIV/AIDSを処置および/または予防するためのそのような結合性タンパク質の使用に関する。
抗レトロウイルス療法(ART)は、過去数十年においてHIV/AIDS患者のための標準治療である。ART薬物は、HIV-1ゲノムの逆転写、HIV-1ゲノムの組込み、および感染性ウイルス粒子の産生のために必要なタンパク質前駆体のタンパク質分解性切断を阻害することにより内部タンパク質、例えば逆転写酵素(RT)、インテグラーゼ(IN)、およびウイルスプロテアーゼ(PI)を標的化する。ARTまたは異なるクラスのARTの組合せを使用する処置は、HIV-1複製の阻害、および多くの場合に検出不可能なレベル(非ウイルス血症状態)までの、ウイルス血症のその後の低減を結果としてもたらす。ARTは、疾患進行の制御、および大域的なHIVの蔓延の封じ込めにおいてHIV患者を大いに助けるが、多くの場合に厳格なレジメンに従って薬を1日毎に摂取することを患者に要求する。各年で約10%の患者は、薬物毒性、最適以下のアドヒアランスおよび新興の薬物耐性に起因して療法に失敗する。より多くのHIV患者が通常の寿命(80歳を上回る)を生きることができるにつれて、慢性合併症、例えば加齢および薬物-薬物相互作用、ならびに心臓血管/腎臓/骨毒性が特に問題となっている。HIV/AIDSを処置する経済的負担はこれまでおさまっていない。
HIVは、宿主ゲノムに組み込まれたプロウイルスDNAの形態として長命の休止メモリーCD4+ T細胞およびその他に潜伏感染する。潜伏感染した細胞は数十年間生存し、ホメオスタシス増殖を介して幹細胞のように自己複製し、HIV-1リザーバーとしてみなされる。HIV-1リザーバーはウイルスタンパク質を発現しないので、ARTにも宿主免疫系にも影響されない。しかし、リザーバー中の低い割合の細胞は未知の機序により無作為に再活性化され、これはARTが中止された際のウイルス血症の再発の原因となる。
したがって、HIV-1リザーバーを標的化し、最終的にそれらを完全に排除して、いかなるさらなる処置もなしにHIVの治癒、または長期間の軽快を達成するためのHIV/AIDS処置を開発する必要性が存在する。HIV-1リザーバーを排除するためのいかなる治療戦略も、最初にリザーバーを活性化させ、続いて活性化されたHIV-1リザーバー細胞を排除することを必要とする。
特許出願、特許公報、およびUniProtKB/Swiss-Protアクセッション番号を含めて、本明細書において参照される全ての参考文献を、各個々の参考文献が参照によって組み入れることを特におよび個々に指し示されたのと同様に、参照によって全体として本明細書に組み入れる。
これらおよび他の必要性を満たすために、3つの抗原結合性部位を形成する多重特異性結合性タンパク質(例えば、抗体)が本明細書において提供される。一部の実施形態において、結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質およびCD3ポリペプチドに結合する。一部の実施形態において、結合性タンパク質は、HIV標的タンパク質、CD28ポリペプチド、およびCD3ポリペプチドに結合する。本明細書に開示される三重特異性抗HIV/CD28×CD3 T細胞エンゲージャー(TCE)の概念は、抗CD3による活性化、抗CD28による共活性化、および活性化されたCD8 T細胞との係合による抗HIV/抗CD28を通じた活性化されたHIV-1リザーバー細胞のその後の殺滅を通じたHIV-1リザーバーの有効なエリミネーターであり、HIV-1リザーバーを攻撃するための潜在的な戦略を提供すると考えられる。追加的に、抗CD3結合性部位は、ヒトCD3ポリペプチドに対する高親和性結合および除去された潜在的な製造的不都合(例えば、脱アミド部位)と共に記載される。
一部の実施形態において、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含む結合性タンパク質であって、第1のポリペプチド鎖は、式:
L2-L-VL1-L-C [I]
により表される構造を含み、
第2のポリペプチド鎖は、式:
H1-L-VH2-L-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [II]
により表される構造を含み、
第3のポリペプチド鎖は、式:
H3-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [III]
により表される構造を含み、
第4のポリペプチド鎖は、式:
L3-C [IV]
により表される構造を含み、
ここで、
L1は第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L2は第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L3は第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
H1は第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H2は第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H3は第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
は免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
H1は免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
H2は免疫グロブリンCH2重鎖定常ドメインであり;
H3は免疫グロブリンCH3重鎖定常ドメインであり;
ヒンジは、CH1およびCH2ドメインを接続する免疫グロブリンヒンジ領域であり;
、L、LおよびLはアミノ酸リンカーであり;
式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドはクロスオーバー軽鎖-重鎖ペアを形成し;
H1およびVL1は第1の抗原結合性部位を形成し;
H2およびVL2は、CD3ポリペプチドに結合する第2の抗原結合性部位を形成し、VH2ドメインは、GFTFTKAW(配列番号20)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、IKDKSNSYAT(配列番号21)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列、およびRGVYYALSPFDY(配列番号22)のアミノ酸配列を含むCDR-H3配列を含み、VL2ドメインは、QSLVHXNXTYであって、ここでXはEまたはQであり、XはAまたはLであり、XはQ、R、またはFである、QSLVHXNXTY(配列番号293)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、KVS(配列番号29)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびGQGTQYPFT(配列番号30)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含み;
H3およびVL3は、HIV標的タンパク質に結合する第3の抗原結合性部位を形成する、
前記結合性タンパク質が本明細書において提供される。
一部の実施形態において、第1の結合性部位はCD28ポリペプチド(例えば、ヒトCD28ポリペプチド)に結合する。一部の実施形態において、VH1ドメインは、GYTFTSYY(配列番号31)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、IYPGNVNT(配列番号32)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列、およびTRSHYGLDWNFDV(配列番号33)のアミノ酸配列を含むCDR-H3配列を含み、VL1ドメインは、QNIYVW(配列番号34)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、KAS(配列番号35)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびQQGQTYPY(配列番号36)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む。一部の実施形態において、VH1ドメインは
QVQLVQSGAEVVKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGSIYPGNVNTNYAQKFQGRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYYCTRSHYGLDWNFDVWGKGTTVTVSS(配列番号59)のアミノ酸配列を含み、かつ/またはVL1ドメインは
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCQASQNIYVWLNWYQQKPGKAPKLLIYKASNLHTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDIATYYCQQGQTYPYTFGQGTKLEIK(配列番号60)のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、VL2ドメインのCDR-L1配列は、QSLVHQNAQTY(配列番号24)、QSLVHENLQTY(配列番号25)、QSLVHENLFTY(配列番号26)、およびQSLVHENLRTY(配列番号27)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、VH2ドメインは、GFTFTKAW(配列番号20)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、IKDKSNSYAT(配列番号21)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列、およびRGVYYALSPFDY(配列番号22)のアミノ酸配列を含むCDR-H3配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメインを含み;VL2ドメインは、QSLVHQNAQTY(配列番号24)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、KVS(配列番号29)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびGQGTQYPFT(配列番号30)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む。一部の実施形態において、VH2ドメインは、GFTFTKAW(配列番号20)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、IKDKSNSYAT(配列番号21)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列、およびRGVYYALSPFDY(配列番号22)のアミノ酸配列を含むCDR-H3配列を含み;VL2ドメインは、QSLVHENLQTY(配列番号25)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、KVS(配列番号29)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびGQGTQYPFT(配列番号30)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む。一部の実施形態において、VH2ドメインは、GFTFTKAW(配列番号20)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、IKDKSNSYAT(配列番号21)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列、およびRGVYYALSPFDY(配列番号22)のアミノ酸配列を含むCDR-H3配列を含み;ならびにVL2ドメインは、QSLVHENLFTY(配列番号26)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、KVS(配列番号29)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびGQGTQYPFT(配列番号30)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む。一部の実施形態において、VH2ドメインは、GFTFTKAW(配列番号20)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、IKDKSNSYAT(配列番号21)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列、およびRGVYYALSPFDY(配列番号22)のアミノ酸配列を含み、;ならびにVL2ドメインは、QSLVHENLRTY(配列番号27)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、KVS(配列番号29)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびGQGTQYPFT(配列番号30)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、VH2ドメインは
QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFTKAWMHWVRQAPGKQLEWVAQIKDKSNSYATYYADSVKGRFTISRDDSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCRGVYYALSPFDYWGQGTLVTVSS(配列番号52)のアミノ酸配列を含み、かつ/またはVL2ドメインは、
DIVMTQTPLSLSVTPGQPASISCKSSQSLVHQNAQTYLSWYLQKPGQSPQSLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCGQGTQYPFTFGSGTKVEIK(配列番号54)、DIVMTQTPLSLSVTPGQPASISCKSSQSLVHENLQTYLSWYLQKPGQSPQSLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCGQGTQYPFTFGSGTKVEIK(配列番号55)、DIVMTQTPLSLSVTPGQPASISCKSSQSLVHENLFTYLSWYLQKPGQSPQSLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCGQGTQYPFTFGSGTKVEIK(配列番号56)、およびDIVMTQTPLSLSVTPGQPASISCKSSQSLVHENLRTYLSWYLQKPGQSPQSLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCGQGTQYPFTFGSGTKVEIK(配列番号57)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、配列番号52のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および/または配列番号54のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、配列番号52のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および/または配列番号55のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、配列番号52のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および/または配列番号56のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、配列番号52のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および/または配列番号57のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。
一部の実施形態において、第3の抗原結合性部位は、糖タンパク質120、糖タンパク質41および糖タンパク質160からなる群から選択されるHIV標的タンパク質に結合する。一部の実施形態において、VH3ドメインは、NCPIN(配列番号1)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、WMKPRHGAVSYARQLQG(配列番号2)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列、およびGKYCTARDYYNWDFEH(配列番号3)のアミノ酸配列を含むCDR-H3配列を含み、VL3ドメインは、RTSQYGSLA(配列番号4)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、SGSTRAA(配列番号5)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびQQYEF(配列番号6)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む。一部の実施形態において、VH3ドメインは、GYTFTAHI(配列番号7)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、IKPQYGAV(配列番号8)またはIKPQYGAT(配列番号9)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列、およびDRSYGDSSWALDA(配列番号10)のアミノ酸配列を含むCDR-H3配列を含み、VL3ドメインは、QGVGSD(配列番号11)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、HTS(配列番号12)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびCQVLQF(配列番号13)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む。一部の実施形態において、VH3ドメインは、DCTLN(配列番号14)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、WLKPRWGAVNYARPLQG(配列番号15)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列、およびGKNCDYNWDFEH(配列番号16)のアミノ酸配列を含むCDR-H3配列を含み、VL3ドメインは、RTSQYGSLA(配列番号17)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、SGSTRAA(配列番号18)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびQQYEF(配列番号19)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む。一部の実施形態において、VH3ドメインは
QVRLSQSGGQMKKPGDSMRISCRASGYEFINCPINWIRLAPGKRPEWMGWMKPRHGAVSYARQLQGRVTMTRDMYSETAFLELRSLTSDDTAVYFCTRGKYCTARDYYNWDFEHWGQGTPVTVSS(配列番号43)のアミノ酸配列を含み、かつ/またはVL3ドメインは、SLTQSPGTLSLSPGETAIISCRTSQYGSLAWYQQRPGQAPRLVIYSGSTRAAGIPDRFSGSRWGPDYNLTISNLESGDFGVYYCQQYEFFGQGTKVQVDIK(配列番号45)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、VH3ドメインは
QVRLSQSGGQMKKPGDSMRISCRASGYEFINCPINWIRLAPGKRPEWMGWMKPRHGAVSYARQLQGRVTMTRQLSQDPDDPDWGTAFLELRSLTSDDTAVYFCTRGKYCTARDYYNWDFEHWGQGTPVTVSS(配列番号44)のアミノ酸配列を含み、かつ/またはVL3ドメインはSLTQSPGTLSLSPGETAIISCRTSQYGSLAWYQQRPGQAPRLVIYSGSTRAAGIPDRFSGSRWGPDYNLTISNLESGDFGVYYCQQYEFFGQGTKVQVDIK(配列番号45)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、VH3ドメインは
RAHLVQSGTAMKKPGASVRVSCQTSGYTFTAHILFWFRQAPGRGLEWVGWIKPQYGAVNFGGGFRDRVTLTRDVYREIAYMDIRGLKPDDTAVYYCARDRSYGDSSWALDAWGQGTTVVVSA(配列番号46)のアミノ酸配列を含み、かつ/またはVL3ドメインはYIHVTQSPSSLSVSIGDRVTINCQTSQGVGSDLHWYQHKPGRAPKLLIHHTSSVEDGVPSRFSGSGFHTSFNLTISDLQADDIATYYCQVLQFFGRGSRLHIK(配列番号49)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、VH3ドメインは
RAHLVQSGTAMKKPGASVRVSCQTSGYTFTAHILFWFRQAPGRGLEWVGWIKPQYGATNFGGGFRDRVTLTRDVYREIAYMDIRGLKPDDTAVYYCARDRSYGDSSWALDAWGQGTTVVVSA(配列番号47)のアミノ酸配列を含み、かつ/またはVL3ドメインはYIHVTQSPSSLSVSIGDRVTINCQTSQGVGSDLHWYQHKPGRAPKLLIHHTSSVEDGVPSRFSGSGFHTSFNLTISDLQADDIATYYCQVLQFFGRGSRLHIK(配列番号49)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、VH3ドメインは
RAHLVQSGTAMKKPGASVRVSCQTSGYTFTAHILFWFRQAPGRGLEWVGWIKPQYGAVNFGGGFRDRVTLTRQLSQDPDDPDWGIAYMDIRGLKPDDTAVYYCARDRSYGDSSWALDAWGQGTTVVVSA(配列番号48)のアミノ酸配列を含み、かつ/またはVL3ドメインはYIHVTQSPSSLSVSIGDRVTINCQTSQGVGSDLHWYQHKPGRAPKLLIHHTSSVEDGVPSRFSGSGFHTSFNLTISDLQADDIATYYCQVLQFFGRGSRLHIK(配列番号49)のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、VH3ドメインは
QVQLVQSGGQMKKPGESMRISCRASGYEFIDCTLNWIRLAPGKRPEWMGWLKPRWGAVNYARPLQGRVTMTRQLSQDPDDPDWGTAFLELRSLTVDDTAVYFCTRGKNCDYNWDFEHWGRGTPVIVSS(配列番号50)のアミノ酸配列を含み、かつ/またはVL3ドメインはLTQSPGTLSLSPGETAIISCRTSQYGSLAWYQQRPGQAPRLVIYSGSTRAAGIPDRFSGSRWGPDYNLTISNLESGDFGVYYCQQYEFFGQGTKVQVDIK(配列番号51)のアミノ酸配列を含む。
本明細書に記載の任意の他の実施形態と組み合わせることができる一部の実施形態において、L、L、LまたはLの少なくとも1つは独立して0アミノ酸の長さである。一部の実施形態において、L、L、LおよびLはそれぞれ独立して、0アミノ酸の長さであり、またはGGGGSGGGGS(配列番号40)、GGGGSGGGGSGGGGS(配列番号41)、S、RT、TKGPS配列番号39)、GQPKAAP(配列番号38)、およびGGSGSSGSGG(配列番号42)からなる群から選択される配列を含む。一部の実施形態において、L、L、LおよびLはそれぞれ独立して、GGGGSGGGGS(配列番号40)、GGGGSGGGGSGGGGS(配列番号41)、S、RT、TKGPS配列番号39)、GQPKAAP(配列番号38)、およびGGSGSSGSGG(配列番号42)からなる群から選択される配列を含む。一部の実施形態において、Lは配列GQPKAAP(配列番号38)を含み、Lは配列TKGPS(配列番号39)を含み、Lは配列Sを含み、Lは配列RTを含む。一部の実施形態において、L、L、LまたはLの少なくとも1つは配列DKTHT(配列番号37)を含む。一部の実施形態において、L、L、LおよびLは配列DKTHT(配列番号37)を含む。
本明細書に記載の任意の他の実施形態と組み合わせることができる一部の実施形態において、第2および第3のポリペプチド鎖のヒンジ-CH2-CH3ドメインはヒトIgG4ヒンジ-CH2-CH3ドメインであり、ヒンジ-CH2-CH3ドメインはそれぞれ、EUインデックスに従ってヒトIgG4の234および235位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換はF234AおよびL235Aである。一部の実施形態において、第2および第3のポリペプチド鎖のヒンジ-CH2-CH3ドメインはヒトIgG4ヒンジ-CH2-CH3ドメインであり、ヒンジ-CH2-CH3ドメインはそれぞれ、EUインデックスに従ってヒトIgG4の233~236位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、E233P、F234V、L235A、および236における欠失である。一部の実施形態において、第2および第3のポリペプチド鎖のヒンジ-CH2-CH3ドメインはヒトIgG4ヒンジ-CH2-CH3ドメインであり、ヒンジ-CH2-CH3ドメインはそれぞれ、EUインデックスに従ってヒトIgG4の228および409位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換はS228PおよびR409Kである。一部の実施形態において、第2および第3のポリペプチド鎖のヒンジ-CH2-CH3ドメインはヒトIgG1ヒンジ-CH2-CH3ドメインであり、ヒンジ-CH2-CH3ドメインはそれぞれ、EUインデックスに従ってヒトIgG1の234、235、および329位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、L234A、L235A、およびP329Aである。一部の実施形態において、第2および第3のポリペプチド鎖のヒンジ-CH2-CH3ドメインはヒトIgG1ヒンジ-CH2-CH3ドメインであり、ヒンジ-CH2-CH3ドメインはそれぞれ、EUインデックスに従ってヒトIgG1の298、299、および300位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、S298N、T299A、およびY300Sである。一部の実施形態において、第2のポリペプチド鎖のヒンジ-CH2-CH3ドメインは、EUインデックスに従ってヒトIgG1またはIgG4の349、366、368、および407位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vであり;第3のポリペプチド鎖のヒンジ-CH2-CH3ドメインは、EUインデックスに従ってヒトIgG1またはIgG4の354および366位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換はS354CおよびT366Wである。一部の実施形態において、第2のポリペプチド鎖のヒンジ-CH2-CH3ドメインは、EUインデックスに従ってヒトIgG1またはIgG4の354および366位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換はS354CおよびT366Wであり;第3のポリペプチド鎖のヒンジ-CH2-CH3ドメインは、EUインデックスに従ってヒトIgG1またはIgG4の349、366、368、および407位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vである。
一部の実施形態において、第1のポリペプチド鎖は、配列番号61のアミノ酸配列または配列番号61のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号62のアミノ酸配列または配列番号62のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号63のアミノ酸配列または配列番号63のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号64のアミノ酸配列または配列番号64のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、第1のポリペプチド鎖は、配列番号65のアミノ酸配列または配列番号65のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号66のアミノ酸配列または配列番号66のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号67のアミノ酸配列または配列番号67のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号68のアミノ酸配列または配列番号68のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、第1のポリペプチド鎖は、配列番号69のアミノ酸配列または配列番号69のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号70のアミノ酸配列または配列番号70のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号71のアミノ酸配列または配列番号71のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号72のアミノ酸配列または配列番号72のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、第1のポリペプチド鎖は、配列番号73のアミノ酸配列または配列番号73のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号74のアミノ酸配列または配列番号74のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号75のアミノ酸配列または配列番号75のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号76のアミノ酸配列または配列番号76のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、第1のポリペプチド鎖は、配列番号77のアミノ酸配列または配列番号77のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号78のアミノ酸配列または配列番号78のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号79のアミノ酸配列または配列番号79のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号80のアミノ酸配列または配列番号80のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、第1のポリペプチド鎖は、配列番号81のアミノ酸配列または配列番号81のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号82のアミノ酸配列または配列番号82のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号83のアミノ酸配列または配列番号83のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号84のアミノ酸配列または配列番号84のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、第1のポリペプチド鎖は、配列番号85のアミノ酸配列または配列番号85のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号86のアミノ酸配列または配列番号86のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号87のアミノ酸配列または配列番号87のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号88のアミノ酸配列または配列番号88のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、第1のポリペプチド鎖は、配列番号89のアミノ酸配列または配列番号89のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号90のアミノ酸配列または配列番号90のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号91のアミノ酸配列または配列番号91のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号92のアミノ酸配列または配列番号92のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、第1のポリペプチド鎖は、配列番号93のアミノ酸配列または配列番号93のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号94のアミノ酸配列または配列番号94のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号95のアミノ酸配列または配列番号95のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号96のアミノ酸配列または配列番号96のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、第1のポリペプチド鎖は、配列番号97のアミノ酸配列または配列番号97のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号98のアミノ酸配列または配列番号98のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号99のアミノ酸配列または配列番号99のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号100のアミノ酸配列または配列番号100のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、第1のポリペプチド鎖は、配列番号101のアミノ酸配列または配列番号101のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号102のアミノ酸配列または配列番号102のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号103のアミノ酸配列または配列番号103のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号104のアミノ酸配列または配列番号104のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、第1のポリペプチド鎖は、配列番号105のアミノ酸配列または配列番号105のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号106のアミノ酸配列または配列番号106のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号107のアミノ酸配列または配列番号107のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号108のアミノ酸配列または配列番号108のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、第1のポリペプチド鎖は、配列番号109のアミノ酸配列または配列番号109のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号110のアミノ酸配列または配列番号110のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号111のアミノ酸配列または配列番号111のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号112のアミノ酸配列または配列番号112のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、第1のポリペプチド鎖は、配列番号113のアミノ酸配列または配列番号113のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号114のアミノ酸配列または配列番号114のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号115のアミノ酸配列または配列番号115のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号116のアミノ酸配列または配列番号116のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、第1のポリペプチド鎖は、配列番号117のアミノ酸配列または配列番号117のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号118のアミノ酸配列または配列番号118のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号119のアミノ酸配列または配列番号119のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号120のアミノ酸配列または配列番号120のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、第1のポリペプチド鎖は、配列番号121のアミノ酸配列または配列番号121のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号122のアミノ酸配列または配列番号122のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号123のアミノ酸配列または配列番号123のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号124のアミノ酸配列または配列番号124のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、第1のポリペプチド鎖は、配列番号129のアミノ酸配列または配列番号129のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号130のアミノ酸配列または配列番号130のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号131のアミノ酸配列または配列番号131のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号132のアミノ酸配列または配列番号132のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、第1のポリペプチド鎖は、配列番号133のアミノ酸配列または配列番号133のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号134のアミノ酸配列または配列番号134のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号135のアミノ酸配列または配列番号135のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号136のアミノ酸配列または配列番号136のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、第1のポリペプチド鎖は、配列番号137のアミノ酸配列または配列番号137のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号138のアミノ酸配列または配列番号138のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号139のアミノ酸配列または配列番号139のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号140のアミノ酸配列または配列番号140のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、第1のポリペプチド鎖は、配列番号141のアミノ酸配列または配列番号141のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号142のアミノ酸配列または配列番号142のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号143のアミノ酸配列または配列番号143のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号144のアミノ酸配列または配列番号144のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、第1のポリペプチド鎖は、配列番号145のアミノ酸配列または配列番号145のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号146のアミノ酸配列または配列番号146のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号147のアミノ酸配列または配列番号147のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号148のアミノ酸配列または配列番号148のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、第1のポリペプチド鎖は、配列番号149のアミノ酸配列または配列番号149のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号150のアミノ酸配列または配列番号150のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号151のアミノ酸配列または配列番号151のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号152のアミノ酸配列または配列番号152のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、第1のポリペプチド鎖は、配列番号153のアミノ酸配列または配列番号153のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号154のアミノ酸配列または配列番号154のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号155のアミノ酸配列または配列番号155のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号156のアミノ酸配列または配列番号156のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、第1のポリペプチド鎖は、配列番号157のアミノ酸配列または配列番号157のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号158のアミノ酸配列または配列番号158のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号159のアミノ酸配列または配列番号159のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号160のアミノ酸配列または配列番号160のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、第1のポリペプチド鎖は、配列番号161のアミノ酸配列または配列番号161のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号162のアミノ酸配列または配列番号162のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号163のアミノ酸配列または配列番号163のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号164のアミノ酸配列または配列番号164のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、第1のポリペプチド鎖は、配列番号165のアミノ酸配列または配列番号165のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号166のアミノ酸配列または配列番号166のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号167のアミノ酸配列または配列番号167のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号168のアミノ酸配列または配列番号168のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、第1のポリペプチド鎖は、配列番号169のアミノ酸配列または配列番号169のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号170のアミノ酸配列または配列番号170のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号171のアミノ酸配列または配列番号171のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号172のアミノ酸配列または配列番号172のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態において、第1のポリペプチド鎖は、配列番号173のアミノ酸配列または配列番号173のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号174のアミノ酸配列または配列番号174のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号175のアミノ酸配列または配列番号175のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号176のアミノ酸配列または配列番号176のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、上記の実施形態のいずれか1つの結合性タンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子が本明細書において提供される。一部の実施形態において、上記の実施形態のいずれか1つの核酸分子を含む発現ベクターが本明細書において提供される。一部の実施形態において、上記の実施形態のいずれか1つの核酸分子または上記の実施形態のいずれか1つの発現ベクターを含む単離された宿主細胞が本明細書において提供される。一部の実施形態において、宿主細胞は哺乳動物または昆虫細胞である。
一部の実施形態において、上記の実施形態のいずれか1つの結合性タンパク質および薬学的に許容される担体を含む医薬組成物が本明細書において提供される。
一部の実施形態において、患者においてHIV感染症を予防および/または処置する方法であって、患者に治療有効量の少なくとも1つの上記の実施形態のいずれか1つの結合性タンパク質または上記の実施形態のいずれか1つの医薬組成物を投与することを含む、前記方法が本明細書において提供される。一部の実施形態において、結合性タンパク質は標準的な抗レトロウイルス療法と併用投与される。一部の実施形態において、少なくとも1つの結合性タンパク質の投与は、患者において1つまたはそれ以上の潜伏および/または慢性的HIV感染細胞の排除を結果としてもたらす。一部の実施形態において、患者はヒトである。
一部の実施形態において、上記の実施形態のいずれか1つの結合性タンパク質または医薬組成物は、患者におけるHIV感染症の予防および/または処置のために提供される。一部の実施形態において、結合性タンパク質は標準的な抗レトロウイルス療法と併用投与される。一部の実施形態において、結合性タンパク質は、患者において1つまたはそれ以上の潜伏および/または慢性的HIV感染細胞の排除を引き起こす。一部の実施形態において、患者はヒトである。
一部の実施形態において、上記の実施形態のいずれか1つの結合性タンパク質または医薬組成物は、患者におけるHIV感染症の予防および/または処置のための医薬の製造における使用のために提供される。一部の実施形態において、結合性タンパク質は標準的な抗レトロウイルス療法と併用投与される。一部の実施形態において、結合性タンパク質は、患者において1つまたはそれ以上の潜伏および/または慢性的HIV感染細胞の排除を引き起こす。一部の実施形態において、患者はヒトである。
一部の実施形態において、上記の実施形態のいずれか1つの結合性タンパク質の第1、第2、第3、および第4のポリペプチド鎖をコードする1つまたはそれ以上のベクターを含む、ベクターシステムが本明細書において提供される。一部の実施形態において、ベクターシステムは、結合性タンパク質の第1のポリペプチド鎖をコードする第1のベクター、結合性タンパク質の第2のポリペプチド鎖をコードする第2のベクター、結合性タンパク質の第3のポリペプチド鎖をコードする第3のベクター、および結合性タンパク質の第4のポリペプチド鎖をコードする第4のベクターを含む。
一部の実施形態において、キットであって、上記の実施形態のいずれか1つによる結合性タンパク質の1、2、3、または4つのポリペプチド鎖を含む、前記キットが本明細書において提供される。一部の実施形態において、キットは、本明細書に記載の、例えば、上記の方法または使用のいずれかに従ってポリペプチド鎖または結合性タンパク質を使用するための使用説明書をさらに含む。
一部の実施形態において、キットであって、上記の実施形態のいずれか1つによる1、2、3、または4つのポリヌクレオチドを含む、前記キットが本明細書において提供される。一部の実施形態において、ポリヌクレオチドのキットであって、(a)配列番号177のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号178のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号179のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号180のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(b)配列番号181のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号182のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号183のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号184のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(c)配列番号185のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号186のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号187のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号188のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(d)配列番号189のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号190のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号191のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号192のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(e)配列番号193のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号194のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号195のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号196のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(f)配列番号197のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号198のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号199のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号200のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(g)配列番号201のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号202のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号203のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号204のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(h)配列番号205のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号206のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号207のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号208のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(i)配列番号209のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号210のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号211のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号212のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(j)配列番号213のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号214のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号215のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号216のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(k)配列番号217のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号218のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号219のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号220のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(l)配列番号221のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号222のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号223のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号224のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(m)配列番号225のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号226のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号227のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号228のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(n)配列番号229のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号230のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号231のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号232のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(o)配列番号233のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号234のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号235のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号236のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(p)配列番号237のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号238のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号239のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号240のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(q)配列番号241のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号242のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号243のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号244のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(r)配列番号245のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号246のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号247のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号248のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(s)配列番号249のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号250のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号251のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号252のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(t)配列番号253のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号254のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号255のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号256のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(u)配列番号257のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号258のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号259のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号260のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(v)配列番号261のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号262のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号263のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号264のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(w)配列番号265のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号266のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号267のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号268のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(x)配列番号269のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号270のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号271のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号272のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(y)配列番号273のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号274のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号275のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号276のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(z)配列番号277のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号278のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号279のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号280のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(aa)配列番号281のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号282のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号283のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号284のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(bb)配列番号285のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号286のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号287のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号288のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;または(cc)配列番号289のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号290のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号291のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号292のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチドを含むポリヌクレオチドのキットの1、2、3、または4つのポリヌクレオチドを含む、前記キットが本明細書において提供される。一部の実施形態において、第1、第2、第3、および第4のポリヌクレオチドは、1つまたはそれ以上の発現ベクター、例えば、1、2、3、または4つの発現ベクター上に存在する。
本明細書に記載の様々な実施形態の特性の1つ、一部、または全てを組み合わせて本発明の他の実施形態を形成させることができることが理解されるべきである。本発明のこれらおよび他の態様は当業者に明らかとなる。
3つの標的タンパク質:CD28、CD3、およびHIV Envに結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含む三重特異性結合性タンパク質の概略図を提供する。ポリペプチドの第1のペアは、それぞれCD28およびCD3を認識する2つの抗原結合性部位(VH1およびVL1;VH2およびVL2)を形成するクロスオーバー配向性を有する二重可変ドメイン(VH1-VH2およびVL2-VL1)を持ち、ポリペプチドの第2のペアは、HIV Envを認識する単一の抗原結合性部位を形成する単一の可変ドメイン(VH3およびVL3)を持つ。図1に示される三重特異性結合性タンパク質は、「ノブ-イントゥー-ホール」突然変異を有する定常領域を使用し、ノブは単一の可変ドメインを有するポリペプチドの第2のペア上にある。 図2は、図1に示される抗HIV三重特異性結合性タンパク質を使用してHIVリザーバーを標的化および排除するための三重特異性T細胞エンゲージャー(TCE)戦略の図式的な表現を示す。
本開示は、三重特異性および/または三価結合性タンパク質であって、1つもしくはそれ以上のヒト免疫不全ウイルス(HIV)標的タンパク質および/または1つもしくはそれ以上のT細胞受容体標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、該結合性タンパク質を形成するポリペプチドの第1のペアは、クロスオーバー配向性を有する二重可変ドメインを持ち、ポリペプチドの第2のペアは単一の可変ドメインを持つ、前記結合性タンパク質を提供する。
以下の記載は、例示的な方法およびパラメーターなどを記載する。しかしながら、そのような記載は、本開示の範囲に対する限定として意図されるのではなく、例示的な実施形態の記載として提供されることが認識されるべきである。
一般的定義
本開示に従って利用される場合、以下の用語は、他に指し示されなければ、以下の意味を有するものと理解される。文脈により他に要求されなければ、単数の用語は複数を含み、複数の用語は単数を含む。
本明細書に記載の開示の態様および実施形態は、「含む」、「からなる」、および「から本質的になる」態様および実施形態を含むことが理解される。
「ポリヌクレオチド」という用語は、本明細書において使用される場合、少なくとも10ヌクレオチドの長さの一本鎖または二本鎖核酸ポリマーを指す。ある特定の実施形態において、ポリヌクレオチドを構成するヌクレオチドは、リボヌクレオチドもしくはデオキシリボヌクレオチドまたはいずれかの種類のヌクレオチドの修飾形態であり得る。そのような修飾としては、塩基修飾、例えばブロモウリジン、リボース修飾、例えばアラビノシドおよび2’,3’-ジデオキシリボース、ならびにヌクレオチド間連結修飾、例えばホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホロセレノエート、ホスホロジセレノエート、ホスホロアニロチオエート、ホスホロアニラデートおよびホスホロアミデートを挙げることができる。「ポリヌクレオチド」という用語は、DNAの一本鎖および二本鎖形態を特に含む。
「単離されたポリヌクレオチド」は、ゲノム、cDNA、もしくは合成起源またはこれらの何らかの組合せのポリヌクレオチドであって、(1)単離されたポリヌクレオチドが天然において見出されるポリヌクレオチドの全てもしくは部分と会合しておらず、(2)天然において連結していないポリヌクレオチドに連結しており、または(3)より大きい配列の部分として天然において存在しないものである。
「単離されたポリペプチド」は、(1)通常それと共に見出される少なくとも一部の他のポリペプチドから遊離しており、(2)同じ供給源、例えば、同じ種からの他のポリペプチドから本質的に遊離しており、(3)異なる種からの細胞により発現され、(4)天然においてそれに会合しているポリヌクレオチド、脂質、炭水化物、もしくは他の材料の少なくとも約50パーセントから分離されており、(5)「単離されたポリペプチド」が天然において会合しているポリペプチドの部分と(共有もしくは非共有相互作用により)会合しておらず、(6)天然において会合していないポリペプチドと(共有もしくは非共有相互作用により)作動可能に会合しており、または(7)天然において存在しない、ポリペプチドである。そのような単離されたポリペプチドを、合成起源の、ゲノムDNA、cDNA、mRNAもしくは他のRNA、またはこれらの任意の組合せはコードすることができる。好ましくは、単離されたポリペプチドは、その使用(治療的、診断的、予防的、研究またはその他)に干渉するその天然の環境において見出されるポリペプチドまたは他の夾雑物から実質的に遊離している。
天然に存在する抗体は典型的には四量体を含む。各そのような四量体は、典型的には、各ペアが1つの全長「軽」鎖(典型的には約25kDaの分子量を有する)および1つの全長「重」鎖(典型的には約50~70kDaの分子量を有する)を有する、ポリペプチド鎖の2つの同一のペアから構成される。「重鎖」および「軽鎖」という用語は、本明細書において使用される場合、標的抗原に対する特異性を付与するために十分な可変ドメイン配列を有する任意の免疫グロブリンポリペプチドを指す。各軽鎖および重鎖のアミノ末端部分は、典型的には、典型的には抗原認識の原因となる約100~110またはそれより多くのアミノ酸の可変ドメインを含む。各鎖のカルボキシ末端部分は、典型的には、エフェクター機能の原因となる定常ドメインを定義する。そのため、天然に存在する抗体において、全長重鎖免疫グロブリンポリペプチドは可変ドメイン(V)ならびに3つの定常ドメイン(CH1、CH2、およびCH3)を含み、Vドメインはポリペプチドのアミノ末端にあり、CH3ドメインはカルボキシル末端にあり、全長軽鎖免疫グロブリンポリペプチドは可変ドメイン(V)および定常ドメイン(C)を含み、Vドメインはポリペプチドのアミノ末端にあり、Cドメインはカルボキシル末端にある。
ヒト軽鎖は典型的にはカッパおよびラムダ軽鎖として分類され、ヒト重鎖は、典型的には、ミュー、デルタ、ガンマ、アルファ、またはイプシロンとして分類され、それぞれIgM、IgD、IgG、IgA、およびIgEとして抗体のアイソタイプを定義する。IgGは、IgG1、IgG2、IgG3、およびIgG4が挙げられるがこれらに限定されない、いくつかのサブクラスを有する。IgMは、IgM1およびIgM2が挙げられるがこれらに限定されない、サブクラスを有する。IgAは同様に、IgA1およびIgA2が挙げられるがこれらに限定されない、サブクラスにさらに分けられる。全長軽鎖および重鎖内で、可変および定常ドメインは、典型的には、約12またはそれより多くのアミノ酸の「J」領域により接合されており、重鎖はまた、約10個のさらなるアミノ酸の「D」領域を含む。例えば、FUNDAMENTAL IMMUNOLOGY(Paul, W., ed.、Raven Press、2nd ed.、1989)(参照によって全ての目的のために全体として組み入れる)を参照。各軽鎖/重鎖ペアの可変領域は典型的には抗原結合性部位を形成する。天然に存在する抗体の可変ドメインは、典型的には、相補性決定領域またはCDRとも呼ばれる3つの超可変領域により接合された相対的に保存されたフレームワーク領域(FR)という同じ全体構造を呈する。各ペアの2つの鎖からのCDRは典型的にはフレームワーク領域によりアライメントされ、これは特異的なエピトープへの結合を可能にし得る。アミノ末端からカルボキシル末端へ、軽鎖および重鎖の両方の可変ドメインは、典型的には、ドメインFR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、およびFR4を含む。
「CDRセット」という用語は、抗原に結合することができる単一の可変領域中に存在する3つのCDRの群を指す。これらのCDRの正確な境界は、異なるシステムに従って異なって定義されている。Kabat(Kabat et al.、SEQUENCES OF PROTEINS OF IMMUNOLOGICAL INTEREST(National Institutes of Health、Bethesda、Md. (1987)および(1991))により記載されるシステムは、抗体の任意の可変領域に適用可能な明瞭な残基ナンバリングシステムを提供するだけではなく、3つのCDRを定義する精密な残基境界も提供する。これらのCDRをKabat CDRと称することができる。Chothiaおよび共同研究者ら(ChothiaおよびLesk、1987、J. Mol. Biol. 196:901~17頁;Chothia et al.、1989、Nature 342:877~83頁)は、Kabat CDR内のある特定の下位部分は、アミノ酸配列のレベルで大きな多様性を有するにもかかわらず、同一に近いペプチド骨格コンホメーションをとっていることを見出した。これらの下位部分は、L1、L2、およびL3またはH1、H2、およびH3と呼称され、「L」および「H」はそれぞれ軽鎖および重鎖領域を指す。これらの領域をChothia CDRと称することができ、Kabat CDRとオーバーラップする境界を有する。Kabat CDRとオーバーラップするCDRを定義する他の境界は、Padlan、1995、FASEB J. 9:133~39頁;MacCallum、1996、J. Mol. Biol. 262(5):732~45頁;およびLefranc、2003、Dev. Comp. Immunol. 27:55~77頁により記載されている。さらに他のCDR境界定義は、本明細書におけるシステムの1つに厳密には従っていないことがあるが、それにもかかわらずKabat CDRとオーバーラップし、但し、特定の残基または残基の群またはさらにはCDR全体は抗原結合に有意に影響しないという予測または実験的発見に照らして短鎖化または長鎖化されていることがある。本明細書において使用される方法は、これらのシステムのいずれかに従って定義されるCDRを利用することができるが、ある特定の実施形態はKabatまたはChothia定義のCDRを使用する。アミノ酸配列を使用する予測されるCDRの同定は、Martin, A.C.、「Protein sequence and structure analysis of antibody variable domains」、Antibody Engineering、Vol. 2. Kontermann R.、Dubel S.編、Springer-Verlag、Berlin、33~51頁(2010)などにおけるように、当該分野において周知である。他の従来の方法により、例えば、他の重鎖および軽鎖可変領域の既知のアミノ酸配列と比較して配列超可変性の領域を決定することにより、重鎖および/または軽鎖可変ドメインのアミノ酸配列を精査して、CDRの配列を同定することができる。ナンバリングされた配列は、目視により、またはアライメントプログラム、例えば、Thompson、1994、Nucleic Acids Res. 22:4673~80頁に記載されるようなCLUSTALスイートのプログラムの1つを用いることにより、アライメントすることができる。フレームワークおよびCDR領域、ならびにそのため正確な配列ベースの割り当てを正確に描写するために分子モデルが従来使用されている。
「Fc」という用語は、本明細書において使用される場合、単量体または多量体のいずれの形態であれ、抗体の消化の結果としてもたらされるまたは他の手段により産生される非抗原結合性断片の配列を含む分子を指し、ヒンジ領域を含有することができる。ネイティブなFcの元々の免疫グロブリン供給源は好ましくはヒト起源であり、免疫グロブリンのいずれかであり得るが、IgG1およびIgG2が好ましい。Fc分子は、共有性(すなわち、ジスルフィド結合)および非共有性の会合により連結されて二量体または多量体形態となることができる単量体ポリペプチドから構成される。ネイティブなFc分子の単量体サブユニットの間の分子間ジスルフィド結合の数は、クラス(例えば、IgG、IgA、およびIgE)またはサブクラス(例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgA1、およびIgGA2)に依存して、1~4の範囲内である。Fcの1つの例は、IgGのパパイン消化の結果としてもたらされるジスルフィド結合した二量体である。「Fc」という用語は、本明細書において使用される場合、単量体、二量体、および多量体形態に対して包括的である。
F(ab)断片は、典型的には、1つの軽鎖ならびに1つの重鎖のVおよびCH1ドメインを含み、F(ab)断片のV-CH1重鎖部分は別の重鎖ポリペプチドとジスルフィド結合を形成することができない。本明細書において使用される場合、F(ab)断片はまた、アミノ酸リンカーにより分離された2つの可変ドメインを含有する1つの軽鎖ならびにアミノ酸リンカーにより分離された2つの可変ドメインおよびCH1ドメインを含有する1つの重鎖を含むことができる。
F(ab’)断片は、典型的には、1つの軽鎖ならびに(CH1およびCH2ドメインの間に)さらなる定常領域を含有する1つの重鎖の部分を含み、その結果、鎖間ジスルフィド結合が2つの重鎖の間に形成されてF(ab’)分子を形成することができる。
「結合性タンパク質」という用語は、本明細書において使用される場合、少なくとも1つの標的抗原に特異的に結合する天然に存在しない(または組換えもしくは工学的に操作された)分子を指す。本開示の三重特異性結合性タンパク質は、他に指定されなければ、典型的には、少なくとも3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、式:
L2-L-VL1-L-C [I]
により表される構造を有し、
第2のポリペプチド鎖は、式:
H1-L-VH2-L-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [II]
により表される構造を有し、
第3のポリペプチド鎖は、式:
H3-CH1 [III]
により表される構造を有し、
第4のポリペプチド鎖は、式:
L3-C [IV]
により表される構造を有し、
ここで、
L1は第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L2は第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L3は第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
H1は第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H2は第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H3は第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
は免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
H1は免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
ヒンジは、CH1およびCH2ドメインを接続する免疫グロブリンヒンジ領域であり;
、L、LおよびLはアミノ酸リンカーであり;
式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドはクロスオーバー軽鎖-重鎖ペアを形成する。
「組換え」分子は、組換え手段により製造、発現、作出、または単離された分子である。
本開示の1つの実施形態は、1~3個の標的抗原に対して生物学的および免疫学的特異性を有する結合性タンパク質を提供する。本開示の別の実施形態は、そのような結合性タンパク質を形成するポリペプチド鎖をコードするヌクレオチド配列を含む核酸分子を提供する。本開示の別の実施形態は、そのような結合性タンパク質を形成するポリペプチド鎖をコードするヌクレオチド配列を含む核酸分子を含む発現ベクターを提供する。本開示のさらに別の実施形態は、そのような結合性タンパク質を発現する(すなわち、そのような結合性タンパク質を形成するポリペプチド鎖をコードする核酸分子またはベクターを含む)宿主細胞を提供する。
「スワップ可能性」という用語は、本明細書において使用される場合、結合性タンパク質フォーマット内の、ならびにフォールディングおよび究極的な結合親和性の保持を伴う、可変ドメインの互換性を指す。「全スワップ可能性」は、結合親和性の保持により立証されるような結合性タンパク質の全機能性を維持しながら式Iのポリペプチド鎖または式IIのポリペプチド鎖におけるVH1およびVH2の両方のドメインの順序、ならびにしたがってVL1およびVL2ドメインの順序をスワップする(すなわち、順序を逆転させる)能力を指す。さらには、VおよびVという呼称は、最終のフォーマットにおける特定のタンパク質鎖上のドメインの位置を指すに過ぎないことを留意すべきである。例えば、VH1およびVH2は、親抗体中のVL1およびVL2ドメインに由来することができ、結合性タンパク質中のVH1およびVH2位置に置くことができる。同様に、VL1およびVL2は、親抗体中のVH1およびVH2ドメインに由来することができ、結合性タンパク質中のVH1およびVH2位置に置くことができる。そのため、VおよびVという呼称は現在の位置を指し、親抗体中の元々の位置を指すものではない。VおよびVドメインはしたがって「スワップ可能」である。
「抗原」または「標的抗原」または「抗原標的」という用語は、本明細書において使用される場合、結合性タンパク質が結合することができ、追加的に動物において使用されてその抗原のエピトープに結合することができる抗体を産生することができる、分子または分子の部分を指す。標的抗原は1つまたはそれ以上のエピトープを有してもよい。結合性タンパク質により認識される各標的抗原に関して、結合性タンパク質は、標的抗原を認識するインタクトな抗体と競合することができる。
「HIV」という用語は、本明細書において使用される場合、ヒト免疫不全ウイルスを意味する。本明細書において使用される場合、「HIV感染症」という用語は、HIV I、HIV II、HIV III(HTLV-II、LAV-1、LAV-2としても公知)が挙げられるがこれらに限定されないヒト免疫不全ウイルス(HIV)ファミリーのレトロウイルスによる宿主、特にはヒト宿主の感染症を一般に包含する。HIVは、HIVファミリー中の任意の株、形態、サブタイプ、クレードおよびバリエーションを指すために本明細書において使用することができる。そのため、HIV感染症の処置は、HIVファミリーの任意のレトロウイルスのキャリアである人または活性AIDSを有すると診断された人の処置の他に、そのような人におけるAIDS関連状態の処置または予防を包含する。
「AIDS」という用語は、本明細書において使用される場合、獲得免疫不全症候群を意味する。AIDSはHIVにより引き起こされる。
「CD4bs」または「CD4結合性部位」という用語は、免疫細胞、例えばTヘルパー細胞、単球、マクロファージ、および樹状細胞の表面上に見出される糖タンパク質であるCD4(分化抗原群4)に対する結合性部位を指す。
「CD3」という用語は分化抗原群因子3ポリペプチドであり、典型的にはT細胞受容体(TCR)複合体の部分であるT細胞表面タンパク質である。
「CD28」は分化抗原群28ポリペプチドであり、T細胞の活性化および生存のための共刺激シグナルを提供するT細胞表面タンパク質である。
「糖タンパク質160」または「gp160タンパク質」という用語は、HIVのエンベロープ糖タンパク質複合体であって、gp120およびgp41サブユニットに切断されるホモ三量体であるものを指す。
「MPER」という用語は、糖タンパク質41(gp41)の膜近位外部領域であって、HIVを含めてレトロウイルスのエンベロープタンパク質複合体のサブユニットであるものを指す。
「グリカン」という用語は、複合糖質、例えば糖タンパク質、糖脂質、またはプロテオグリカンの炭水化物部分を指す。開示される結合性タンパク質において、グリカンはHIV-1エンベロープ糖タンパク質gp120を指す。
「T細胞エンゲージャー」という用語は、宿主の免疫系、より特にはT細胞の細胞傷害活性に方向付けられている他に、HIV標的タンパク質に方向付けられた結合性タンパク質を指す。
「三量体apex」という用語はHIV-1エンベロープ糖タンパク質gp120のapexを指す。
「単一特異性結合性タンパク質」という用語は、1つの抗原標的に特異的に結合する結合性タンパク質を指す。
「一価結合性タンパク質」という用語は、1つの抗原結合性部位を有する結合性タンパク質を指す。
「二重特異性結合性タンパク質」という用語は、2つの異なる抗原標的に特異的に結合する結合性タンパク質を指す。
「二価結合性タンパク質」という用語は、2つの結合性部位を有する結合性タンパク質を指す。
「三重特異性結合性タンパク質」という用語は、3つの異なる抗原標的に特異的に結合する結合性タンパク質を指す。
「三価結合性タンパク質」という用語は、3つの結合性部位を有する結合性タンパク質を指す。特定の実施形態において、三価結合性タンパク質は1つの抗原標的に結合することができる。他の実施形態において、三価結合性タンパク質は2つの抗原標的に結合することができる。他の実施形態において、三価結合性タンパク質は3つの抗原標的に結合することができる。
「単離された」結合性タンパク質は、同定ならびにその天然の環境の成分から分離および/または回収された結合性タンパク質である。その天然の環境の夾雑物成分は、結合性タンパク質の診断的または治療的使用に干渉する材料であり、酵素、ホルモン、および他のタンパク質性または非タンパク質性溶質を挙げることができる。一部の実施形態において、結合性タンパク質は、(1)ローリー法による決定で95重量%より高い、最も好ましくは99重量%より高い抗体まで、(2)スピニングカップシークエネーターの使用によりN末端もしくは内部アミノ酸配列の少なくとも15個の残基を得るために十分な程度まで、または(3)クマシーブルーもしくは好ましくは銀染色剤を使用する還元もしくは非還元条件下でのSDS-PAGEにより均質状態まで、精製される。結合性タンパク質の天然の環境の少なくとも1つの成分が存在しないので、単離された結合性タンパク質としては、組換え細胞内のin situの結合性タンパク質が挙げられる。
「実質的に純粋な」または「実質的に精製された」という用語は、本明細書において使用される場合、存在する優勢な種である化合物または種を指す(すなわち、それは、モル濃度を基準にして組成物中の任意の他の個々の種よりも豊富に存在する)。一部の実施形態において、実質的に精製された画分は、種が、存在する全ての高分子種の少なくとも約50%(モル濃度を基準にして)を構成する組成物である。他の実施形態において、実質的に純粋な組成物は、組成物中に存在する全ての高分子種が約80%、85%、90%、95%、または99%より多くを構成する組成物である。さらに他の実施形態において、種は、組成物が単一の高分子種から本質的になる本質的な均質状態まで精製される(夾雑物種は従来の検出方法により組成物中に検出することができない)。
「中和」結合性タンパク質は、本明細書において使用される場合、それが結合した標的抗原のエフェクター機能を遮断することまたは実質的に低減させることができる分子を指す。本明細書において使用される場合、「実質的に低減させる」は、標的抗原のエフェクター機能の少なくとも約60%、好ましくは少なくとも約70%、より好ましくは少なくとも約75%、よりいっそう好ましくは少なくとも約80%、さらにより好ましくは少なくとも約85%、最も好ましくは少なくとも約90%の低減を意味する。
「エピトープ」という用語は、免疫グロブリンまたはT細胞受容体に特異的に結合することができる任意の決定因子、好ましくはポリペプチド決定因子を含む。ある特定の実施形態において、エピトープ決定因子は、分子の化学的活性表面グループ分け、例えばアミノ酸、糖側鎖、ホスホリル基、またはスルホニル基を含み、ある特定の実施形態において、特有の三次元構造的特徴および/または特有の電荷的特徴を有してもよい。エピトープは、抗体または結合性タンパク質により結合される抗原の領域である。ある特定の実施形態において、結合性タンパク質は、タンパク質および/または高分子の複雑な混合物中でその標的抗原を優先的に認識する場合に、抗原に特異的に結合するといわれる。一部の実施形態において、平衡解離定数が≦10-8Mである場合に、より好ましくは平衡解離定数が≦10-9Mである場合に、最も好ましくは解離定数が≦10-10Mである場合に、結合性タンパク質は抗原に特異的に結合するといわれる。
結合性タンパク質の解離定数(K)は、例えば、表面プラズモン共鳴により決定することができる。一般に、表面プラズモン共鳴分析は、BIAcoreシステム(Pharmacia Biosensor;Piscataway、NJ)を使用して表面プラズモン共鳴(SPR)によりリガンド(バイオセンサーマトリックス上の標的抗原)およびアナライト(溶液中の結合性タンパク質)の間のリアルタイム結合相互作用を測定する。表面プラズモン分析はまた、アナライト(バイオセンサーマトリックス上の結合性タンパク質)を固定化することおよびリガンド(標的抗原)を提示することにより行うことができる。「K」という用語は、本明細書において使用される場合、特定の結合性タンパク質および標的抗原の間の相互作用の解離定数を指す。
「特異的に結合する」という用語は、本明細書において使用される場合、約1×10-6M、1×10-7M、1×10-8M、1×10-9M、1×10-10M、1×10-11M、1×10-12M、もしくはそれ以下のKdでエピトープを含有する抗原に結合する、かつ/または非特異的な抗原に対するその親和性よりも少なくとも2倍高い親和性でエピトープに結合する結合性タンパク質またはその抗原結合性断片の能力を指す。
「リンカー」という用語は、本明細書において使用される場合、免疫グロブリンドメインの間に挿入されて、クロスオーバー二重可変領域免疫グロブリンにフォールディングさせるために十分なモビリティを軽鎖および重鎖のドメインに提供する、1つまたはそれ以上のアミノ酸残基を指す。リンカーは、配列レベルでの、可変ドメインの間または可変ドメインおよび定常ドメインの間の転移で挿入される。免疫グロブリンドメインのおおよそのサイズはよく理解されているので、ドメインの間の転移を同定することができる。ドメイン転移の精密な位置は、実験データにより実証されるようなまたはモデリングもしくは二次構造予測の技術により推定できるような二次構造要素、例えばベータシートまたはアルファ-ヘリックスを形成しないペプチドストレッチを位置決めすることにより決定することができる。本明細書に記載のリンカーは、VL2ドメインのC末端およびVL1ドメインのN末端の間で軽鎖上に位置するL;ならびにVL1ドメインのC末端およびCドメインのN末端の間で軽鎖上に位置するLと称される。重鎖リンカーは、VH1ドメインのC末端およびVH2ドメインのN末端の間に位置するL;ならびにVH2ドメインのC末端およびCH1ドメインのN末端の間に位置するLとして知られる。
「ベクター」という用語は、本明細書において使用される場合、コーディング情報を宿主細胞に伝達するために使用される任意の分子(例えば、核酸、プラスミド、またはウイルス)を指す。「ベクター」という用語は、それが連結された別の核酸を輸送することができる核酸分子を含む。ベクターの1つの種類は「プラスミド」であり、これは、追加のDNAセグメントをその中に挿入することができる環状二本鎖DNA分子を指す。ベクターの別の種類はウイルスベクターであり、ウイルスベクターでは、追加のDNAセグメントをウイルスゲノムに挿入することができる。ある特定のベクターは、それらが導入される宿主細胞中で自律複製することができる(例えば、細菌複製起点を有する細菌ベクターおよびエピソーム哺乳動物ベクター)。他のベクター(例えば、非エピソーム哺乳動物ベクター)は、宿主細胞への導入で宿主細胞のゲノムに組み込むことができ、それにより宿主ゲノムと共に複製される。追加的に、ある特定のベクターは、それらが作動可能に連結された遺伝子の発現を指令することができる。そのようなベクターは本明細書において「組換え発現ベクター」(または単純に、「発現ベクター」)と称される。一般に、組換えDNA技術において有用な発現ベクターは多くの場合にプラスミドの形態である。プラスミドは最も一般的に使用されるベクターの形態であるので、「プラスミド」および「ベクター」という用語は本明細書において交換可能に使用されることがある。しかしながら、本開示は、同等の機能に役立つ発現ベクターの他の形態、例えばウイルスベクター(例えば、複製欠陥性レトロウイルス、アデノウイルス、およびアデノ随伴ウイルス)を含むことが意図される。
「組換え宿主細胞」(または「宿主細胞」)という語句は、本明細書において使用される場合、組換え発現ベクターが導入された細胞を指す。組換え宿主細胞または宿主細胞は、特定の対象細胞だけではなく、そのような細胞の子孫も指すことが意図される。突然変異または環境上の影響のいずれかに起因してある特定の改変が連続する世代において起こり得るので、そのような子孫は実際には親細胞と同一でないことがあるが、そのような細胞は依然として、本明細書において使用される場合の「宿主細胞」という用語の範囲内に含まれる。多様な宿主細胞発現系を使用して結合性タンパク質を発現させることができ、該発現系としては、細菌、酵母、バキュロウイルス、および哺乳動物発現系(ならびにファージディスプレイ発現系)が挙げられる。好適な細菌発現ベクターの例はpUC19である。結合性タンパク質を組換えにより発現させるために、結合性タンパク質のポリペプチド鎖をコードするDNA断片を有する1つまたはそれ以上の組換え発現ベクターを用いて宿主細胞は形質転換またはトランスフェクトされ、その結果、ポリペプチド鎖は宿主細胞中で発現され、好ましくは、宿主細胞が培養される培地中に分泌され、該培地から結合性タンパク質を回収することができる。
「形質転換」という用語は、本明細書において使用される場合、細胞の遺伝学的特徴における変化を指し、細胞は、新たなDNAを含有するように改変されている場合に、形質転換されている。例えば、細胞は形質転換され、そのネイティブな状態から遺伝学的に改変される。形質転換後に、形質転換性DNAは、細胞の染色体に物理的に組み込まれることにより細胞のDNAと組換えを起こすことができ、または複製されることなくエピソームエレメントとして一過的に維持することができ、またはプラスミドとして独立して複製することができる。DNAが細胞の分裂と共に複製される場合に、細胞は安定的に形質転換されたと考えられる。「トランスフェクション」という用語は、本明細書において使用される場合、細胞による外来性または外因性DNAの取込みを指し、外因性DNAが細胞膜の内側に導入された場合に、細胞は「トランスフェクト」されている。多数のトランスフェクション技術が当技術分野において周知である。そのような技術を使用して、1つまたはそれ以上の外因性DNA分子を好適な宿主細胞に導入することができる。
「天然に存在するという用語」は、本明細書において使用され、物体に適用される場合、物体は天然において見出すことができ、人間により操作されていないという事実を指す。例えば、天然における供給源から単離することができ、人間により意図的に改変されていない生物(ウイルスを含む)中に存在するポリヌクレオチドまたはポリペプチドは天然に存在する。同様に、「天然に存在しない」は、本明細書において使用される場合、天然において見出されないか、または人間により構造的に改変もしくは合成されている物体を指す。
本明細書において使用される場合、20個の従来型アミノ酸およびそれらの略語は従来の用法に従う。20個の従来型アミノ酸の立体異性体(例えば、D-アミノ酸);非天然アミノ酸およびアナログ、例えばα-、α-二置換アミノ酸、N-アルキルアミノ酸、乳酸、および他の非従来型アミノ酸もまた、結合性タンパク質のポリペプチド鎖のための好適な成分であり得る。非従来型アミノ酸の例としては、4-ヒドロキシプロリン、γ-カルボキシグルタメート、ε-N,N,N-トリメチルリジン、ε-N-アセチルリジン、O-ホスホセリン、N-アセチルセリン、N-ホルミルメチオニン、3-メチルヒスチジン、5-ヒドロキシリジン、σ-N-メチルアルギニン、ならびに他の類似したアミノ酸およびイミノ酸(例えば、4-ヒドロキシプロリン)が挙げられる。本明細書において使用されるポリペプチド表記において、標準的な用法および慣習に従って、左手方向はアミノ末端方向であり、右手方向はカルボキシル末端方向である。
天然に存在する残基は、共通の側鎖特性に基づいてクラスに分けることができる:
(1)疎水性:Met、Ala、Val、Leu、Ile、Phe、Trp、Tyr、Pro;
(2)極性親水性:Arg、Asn、Asp、Gln、Glu、His、Lys、Ser、Thr;
(3)脂肪族:Ala、Gly、Ile、Leu、Val、Pro;
(4)脂肪族疎水性:Ala、Ile、Leu、Val、Pro;
(5)中性親水性:Cys、Ser、Thr、Asn、Gln;
(6)酸性:Asp、Glu;
(7)塩基性:His、Lys、Arg;
(8)鎖配向に影響を及ぼす残基:Gly、Pro;
(9)芳香族:His、Trp、Tyr、Phe;および
(10)芳香族疎水性:Phe、Trp、Tyr。
保存的アミノ酸置換は、これらの1つのクラスのメンバーの、同じクラスの別のメンバーでの交換を伴ってもよい。非保存的置換は、これらの1つのクラスのメンバーの、別のクラスのメンバーでの交換を伴ってもよい。
当業者は、周知の技術を使用して結合性タンパク質のポリペプチド鎖の好適なバリアントを決定することができる。例えば、当業者は、活性のために重要であるとは思われない領域を標的化することにより活性を破壊することなく変化させることができるポリペプチド鎖の好適な区画を同定してもよい。代替的に、当業者は、類似したポリペプチドの間で保存された残基および分子の部分を同定することができる。追加的に、生物学的活性または構造のために重要であり得る区画であっても、生物学的活性を破壊することなくまたはポリペプチド構造に不利に影響することなく保存的アミノ酸置換に供することができる。
「患者」という用語は、本明細書において使用される場合、ヒトおよび動物対象を含む。
「処置」または「処置する」という用語は、本明細書において使用される場合、治療的処置および予防的(prophylactic)または予防的(preventative)手段の両方を指す。処置を必要とする者としては、障害を有する者の他に、障害を有する素因がある者または障害が予防されるべき者が挙げられる。特定の実施形態において、結合性タンパク質は、HIVに感染したヒト、もしくはHIV感染症に罹りやすいヒトを処置し、またはHIVに感染したヒト対象においてHIV感染症を寛解させるために使用することができる。結合性タンパク質はまた、ヒト患者においてHIVを予防するために使用することができる。
HIVに感染したヒトは、例えば、急性一次感染症候群(無症候性であるか、または発熱、倦怠感、下痢および神経学的症状、例えば頭痛を伴うインフルエンザ様の疾病を伴うものであり得る)、無症候性感染症(循環性CD4T細胞の数における段階的な低下を伴う長い潜伏期間)、ならびにAIDS(より重篤なAIDSを定義する疾病および/または有効な免疫機能と適合性のレベルより低くまでの循環性CD4細胞数における低下により定義される)を含む、HIV感染症の進行のいくつかのステージのいずれか1つにある対象を含むことが理解されるべきである。追加的に、HIV感染症の処置または予防はまた、HIVへの疑わしい過去の曝露、例えば、HIV汚染血液との接触、輸血、体液の交換、感染者との「安全でない」性交、偶発的な穿刺、汚染された道具を用いたタトゥーもしくは鍼を受けること、または妊娠、出産の間もしくはその直後の母から嬰児へのウイルスの伝染の後のHIVによる疑わしい感染症を処置することを包含する。
「医薬組成物」または「治療用組成物」という用語は、本明細書において使用される場合、患者に適切に投与された場合に所望の治療効果を誘導することができる化合物または組成物を指す。
「薬学的に許容される担体」または「生理学的に許容される担体」という用語は、本明細書において使用される場合、結合性タンパク質の送達を達成または増強するために好適な1つまたはそれ以上の製剤材料を指す。
「有効量」および「治療有効量」という用語は、1つまたはそれ以上の結合性タンパク質を含む医薬組成物に関して使用される場合、所望の治療結果を生成するために十分な量または投薬量を指す。より特には、治療有効量は、処置されている状態に伴う臨床的に定義される病理学的プロセスの1つまたはそれ以上を何らかの時間的期間にわたり阻害するために十分な結合性タンパク質の量である。有効量は、使用されている特異的結合性タンパク質に依存して、ならびに処置されている患者に関する様々な要因および条件ならびに障害の重症度にも依存して、変動し得る。例えば、結合性タンパク質がin vivoで投与される場合、患者の年齢、体重、および健康の他に、前臨床動物実験において得られた用量応答曲線および毒性データなどの要因は、考慮される要因に含まれる。所与の医薬組成物の有効量または治療有効量の決定は十分に当業者の能力の範囲内である。
本開示の1つの実施形態は、薬学的に許容される担体および治療有効量の結合性タンパク質を含む医薬組成物を提供する。
三重特異性および/または三価結合性タンパク質
本開示のある特定の態様は、三重特異性および/または三価結合性タンパク質に関する。本明細書に記載の任意の抗原結合性タンパク質の任意のCDRまたは可変ドメインは、本開示の三重特異性結合性タンパク質において用途を有し得る。様々なフォーマットの三重特異性結合性タンパク質が企図される。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、三重特異性および/または三価結合性タンパク質であって、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、式:
L2-L-VL1-L-C [I]
により表される構造を含み、
第2のポリペプチド鎖は、式:
H1-L-VH2-L-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [II]
により表される構造を含み、
第3のポリペプチド鎖は、式:
H3-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [III]
により表される構造を含み、
第4のポリペプチド鎖は、式:
L3-C [IV]
により表される構造を含み、
ここで、
L1は第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L2は第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
L3は第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
H1は第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H2は第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
H3は第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
は免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
H1は免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
H2は免疫グロブリンCH2重鎖定常ドメインであり;
H3は免疫グロブリンCH3重鎖定常ドメインであり;
ヒンジは、CH1およびCH2ドメインを接続する免疫グロブリンヒンジ領域であり;
、L、LおよびLはアミノ酸リンカーであり;
式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドはクロスオーバー軽鎖-重鎖ペアを形成する、前記結合性タンパク質である。
一部の実施形態において、第1のポリペプチド鎖および第2のポリペプチド鎖は、2つの別個の抗原結合性部位を形成するクロスオーバー配向性を有する。一部の実施形態において、VH1およびVL1は、結合性ペアを形成し、第1の抗原結合性部位を形成する。一部の実施形態において、VH2およびVL2は、結合性ペアを形成し、第2の抗原結合性部位を形成する。一部の実施形態において、第3のポリペプチドおよび第4のポリペプチドは第3の抗原結合性部位を形成する。一部の実施形態において、VH3およびVL3は、結合性ペアを形成し、第3の抗原結合性部位を形成する。
一部の実施形態において、抗原結合性部位の1つまたはそれ以上はHIV標的タンパク質に結合する。一部の実施形態において、VH3およびVL3は、HIV標的タンパク質に結合する第3の抗原結合性部位を形成する。一部の実施形態において、VH1およびVL1は、T細胞標的タンパク質に結合する第1の抗原結合性部位を形成し、VH2およびVL2は、T細胞標的タンパク質に結合する第2の抗原結合性部位を形成し、VH3およびVL3は、HIV標的タンパク質に結合する第3の抗原結合性部位を形成する。一部の実施形態において、VH1およびVL1は、T細胞標的タンパク質に結合する第1の抗原結合性部位を形成し、VH2およびVL2は、CD3ポリペプチドに結合する第2の抗原結合性部位を形成し、VH3およびVL3は、HIV標的タンパク質に結合する第3の抗原結合性部位を形成する。一部の実施形態において、VH1およびVL1は、CD28ポリペプチドに結合する第1の抗原結合性部位を形成し、VH2およびVL2は、CD3ポリペプチドに結合する第2の抗原結合性部位を形成し、VH3およびVL3は、HIV標的タンパク質に結合する第3の抗原結合性部位を形成する。
一部の実施形態において、結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質(例えば、下記されるもの)、およびT細胞受容体複合体を含めて、T細胞上の1つまたはそれ以上の標的タンパク質に特異的に結合する。これらのT細胞エンゲージャー結合性タンパク質は、T細胞を一過的に標的細胞に動員し、同時に、T細胞の細胞溶解活性を活性化させることができる。T細胞エンゲージャー三重特異性抗体は、HIV-1リザーバーを活性化させ、T細胞を再方向付け/活性化させて、潜伏感染したHIV-1T細胞を溶解するために使用することができる。T細胞上の標的タンパク質の例としては、数ある中でもCD3およびCD28が挙げられるがこれらに限定されない。一部の実施形態において、三重特異性結合性タンパク質は、2つまたはそれより多くの単一特異性抗体(親抗体)の抗原結合性ドメインを組み合わせて1つの抗体にすることにより生成することができる。国際公開WO2011/038290A2、WO2013/086533A1、WO2013/070776A1、WO2012/154312A1、およびWO2013/163427A1を参照。本開示の結合性タンパク質は、例えば、ヒト、マウス、またはヒト化抗体を含めて、任意のヒトまたは非ヒト抗体から得られるまたはそれに由来するドメインまたは配列を使用して製造することができる。
本開示の一部の実施形態において、三価結合性タンパク質は、3つの異なる抗原標的に結合することができる。1つの実施形態において、結合性タンパク質は三重特異性であり、1つの軽鎖-重鎖ペアは2つの異なる抗原標的またはエピトープに結合することができ、1つの軽鎖-重鎖ペアは1つの抗原標的またはエピトープに結合することができる。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質および1つまたはそれ以上のT細胞標的タンパク質に結合する。一部の実施形態において、結合性タンパク質は、1つのHIV標的タンパク質および単一のT細胞標的タンパク質上の2つの異なるエピトープに特異的に結合することができる。一部の実施形態において、結合性タンパク質は、1つのHIV標的タンパク質ならびに2つの異なるT細胞標的タンパク質(例えば、CD28およびCD3)に特異的に結合することができる。一部の実施形態において、結合性タンパク質の第1および第2のポリペプチド鎖は、2つのT細胞標的タンパク質を特異的に標的化する2つの抗原結合性部位を形成し、結合性タンパク質の第3および第4のポリペプチド鎖は、HIV標的タンパク質に特異的に結合する抗原結合性部位を形成する。一部の実施形態において、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質は、糖タンパク質120、糖タンパク質41、および糖タンパク質160のうちの1つまたはそれ以上である。一部の実施形態において、1つまたはそれ以上のT細胞標的タンパク質はCD3およびCD28のうちの1つまたはそれ以上である。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、配列番号61のアミノ酸配列または配列番号61のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号62のアミノ酸配列または配列番号62のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号63のアミノ酸配列または配列番号63のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号64のアミノ酸配列または配列番号64のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、配列番号65のアミノ酸配列または配列番号65のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号66のアミノ酸配列または配列番号66のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号67のアミノ酸配列または配列番号67のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号68のアミノ酸配列または配列番号68のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、配列番号69のアミノ酸配列または配列番号69のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号70のアミノ酸配列または配列番号70のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号71のアミノ酸配列または配列番号71のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号72のアミノ酸配列または配列番号72のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、配列番号73のアミノ酸配列または配列番号73のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号74のアミノ酸配列または配列番号74のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号75のアミノ酸配列または配列番号75のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号76のアミノ酸配列または配列番号76のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、配列番号77のアミノ酸配列または配列番号77のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号78のアミノ酸配列または配列番号78のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号79のアミノ酸配列または配列番号79のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号80のアミノ酸配列または配列番号80のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、配列番号81のアミノ酸配列または配列番号81のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号82のアミノ酸配列または配列番号82のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号83のアミノ酸配列または配列番号83のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号84のアミノ酸配列または配列番号84のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、配列番号85のアミノ酸配列または配列番号85のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号86のアミノ酸配列または配列番号86のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号87のアミノ酸配列または配列番号87のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号88のアミノ酸配列または配列番号88のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、配列番号89のアミノ酸配列または配列番号89のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号90のアミノ酸配列または配列番号90のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号91のアミノ酸配列または配列番号91のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号92のアミノ酸配列または配列番号92のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、配列番号93のアミノ酸配列または配列番号93のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号94のアミノ酸配列または配列番号94のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号95のアミノ酸配列または配列番号95のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号96のアミノ酸配列または配列番号96のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、配列番号97のアミノ酸配列または配列番号97のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号98のアミノ酸配列または配列番号98のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号99のアミノ酸配列または配列番号99のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号100のアミノ酸配列または配列番号100のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、配列番号101のアミノ酸配列または配列番号101のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号102のアミノ酸配列または配列番号102のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号103のアミノ酸配列または配列番号103のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号104のアミノ酸配列または配列番号104のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、配列番号105のアミノ酸配列または配列番号105のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号106のアミノ酸配列または配列番号106のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号107のアミノ酸配列または配列番号107のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号108のアミノ酸配列または配列番号108のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、配列番号109のアミノ酸配列または配列番号109のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号110のアミノ酸配列または配列番号110のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号111のアミノ酸配列または配列番号111のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号112のアミノ酸配列または配列番号112のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、配列番号113のアミノ酸配列または配列番号113のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号114のアミノ酸配列または配列番号114のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号115のアミノ酸配列または配列番号115のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号116のアミノ酸配列または配列番号116のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、配列番号117のアミノ酸配列または配列番号117のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号118のアミノ酸配列または配列番号118のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号119のアミノ酸配列または配列番号119のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号120のアミノ酸配列または配列番号120のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、配列番号121のアミノ酸配列または配列番号121のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号122のアミノ酸配列または配列番号122のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号123のアミノ酸配列または配列番号123のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号124のアミノ酸配列または配列番号124のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、配列番号129のアミノ酸配列または配列番号129のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号130のアミノ酸配列または配列番号130のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号131のアミノ酸配列または配列番号131のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号132のアミノ酸配列または配列番号132のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、配列番号133のアミノ酸配列または配列番号133のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号134のアミノ酸配列または配列番号134のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号135のアミノ酸配列または配列番号135のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号136のアミノ酸配列または配列番号136のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、配列番号137のアミノ酸配列または配列番号137のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号138のアミノ酸配列または配列番号138のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号139のアミノ酸配列または配列番号139のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号140のアミノ酸配列または配列番号140のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、配列番号141のアミノ酸配列または配列番号141のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号142のアミノ酸配列または配列番号142のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号143のアミノ酸配列または配列番号143のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号144のアミノ酸配列または配列番号144のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、配列番号145のアミノ酸配列または配列番号145のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号146のアミノ酸配列または配列番号146のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号147のアミノ酸配列または配列番号147のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号148のアミノ酸配列または配列番号148のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、配列番号149のアミノ酸配列または配列番号149のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号150のアミノ酸配列または配列番号150のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号151のアミノ酸配列または配列番号151のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号152のアミノ酸配列または配列番号152のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、配列番号153のアミノ酸配列または配列番号153のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号154のアミノ酸配列または配列番号154のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号155のアミノ酸配列または配列番号155のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号156のアミノ酸配列または配列番号156のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、配列番号157のアミノ酸配列または配列番号157のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号158のアミノ酸配列または配列番号158のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号159のアミノ酸配列または配列番号159のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号160のアミノ酸配列または配列番号160のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、配列番号161のアミノ酸配列または配列番号161のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号162のアミノ酸配列または配列番号162のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号163のアミノ酸配列または配列番号163のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号164のアミノ酸配列または配列番号164のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、配列番号165のアミノ酸配列または配列番号165のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号166のアミノ酸配列または配列番号166のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号167のアミノ酸配列または配列番号167のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号168のアミノ酸配列または配列番号168のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、配列番号169のアミノ酸配列または配列番号169のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号170のアミノ酸配列または配列番号170のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号171のアミノ酸配列または配列番号171のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号172のアミノ酸配列または配列番号172のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含み、第1のポリペプチド鎖は、配列番号173のアミノ酸配列または配列番号173のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号174のアミノ酸配列または配列番号174のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号175のアミノ酸配列または配列番号175のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号176のアミノ酸配列または配列番号176のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む。本明細書に記載の任意の三重特異性結合性タンパク質において用途を有し得る例示的かつ非限定的なポリペプチドは表4に提供される。
抗HIV結合性部位
本開示のある特定の態様は、HIV標的タンパク質またはポリペプチドに結合する抗原結合性部位を含む結合性タンパク質に関する。
一部の実施形態において、HIV標的タンパク質は、糖タンパク質120、糖タンパク質41、または糖タンパク質160である。一部の実施形態において、結合性タンパク質は、糖タンパク質120、糖タンパク質41、および糖タンパク質160のうちの1つまたはそれ以上に結合する。例示的なHIV標的タンパク質としては、HIV-1 gp41タンパク質のMPER、HIV-1 gp120タンパク質のCD4結合性部位、HIV-1 gp120タンパク質のV3ループ中のグリカン、またはHIV-1 gp120タンパク質もしくはgp160の三量体apexが挙げられるがこれらに限定されない。例えば、一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、HIV-1 gp120タンパク質のCD4結合性部位に結合する抗原結合性部位を含む。本明細書において使用のために企図されるHIV標的タンパク質に結合する例示的な抗原結合性部位としては、国際公開WO2017/074878に記載のもの、例えば抗体CD4BS 「a」、CD4BS 「b」、MPER、MPER_100W、V1/V2 「a」、V1/V2 「b」、またはV3からのものが挙げられるがこれらに限定されない。
一部の実施形態において、HIV標的タンパク質に結合する抗原結合性部位を含む結合性タンパク質は、単一特異性および/もしくは一価、二重特異性および/もしくは二価、三重特異性および/もしくは三価、または多重特異性および/もしくは多価である。一部の実施形態において、HIV標的タンパク質に結合する抗原結合性部位を含む結合性タンパク質は、3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチドを含む三重特異性結合性タンパク質である。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、NCPIN(配列番号1)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、WMKPRHGAVSYARQLQG(配列番号2)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列、およびGKYCTARDYYNWDFEH(配列番号3)のアミノ酸配列を含むCDR-H3配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン;ならびに/またはRTSQYGSLA(配列番号4)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、SGSTRAA(配列番号5)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびQQYEF(配列番号6)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、NCPIN(配列番号1)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、WMKPRHGAVSYARQLQG(配列番号2)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列、およびGKYCTARDYYNWDFEH(配列番号3)のアミノ酸配列を含むCDR-H3配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン;ならびにRTSQYGSLA(配列番号4)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、SGSTRAA(配列番号5)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびQQYEF(配列番号6)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、GYTFTAHI(配列番号7)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、IKPQYGAV(配列番号8)またはIKPQYGAT(配列番号9)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン;ならびに/またはQGVGSD(配列番号11)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、HTS(配列番号12)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびCQVLQF(配列番号13)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、GYTFTAHI(配列番号7)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、IKPQYGAV(配列番号8)またはIKPQYGAT(配列番号9)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン;ならびにQGVGSD(配列番号11)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、HTS(配列番号12)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびCQVLQF(配列番号13)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、GYTFTAHI(配列番号7)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、IKPQYGAV(配列番号8)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン;ならびに/またはQGVGSD(配列番号11)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、HTS(配列番号12)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびCQVLQF(配列番号13)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、GYTFTAHI(配列番号7)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、IKPQYGAV(配列番号8)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン;ならびにQGVGSD(配列番号11)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、HTS(配列番号12)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびCQVLQF(配列番号13)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、GYTFTAHI(配列番号7)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、IKPQYGAT(配列番号9)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン;ならびに/またはQGVGSD(配列番号11)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、HTS(配列番号12)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびCQVLQF(配列番号13)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、GYTFTAHI(配列番号7)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、IKPQYGAT(配列番号9)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン;ならびにQGVGSD(配列番号11)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、HTS(配列番号12)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびCQVLQF(配列番号13)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、DCTLN(配列番号14)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、WLKPRWGAVNYARPLQG(配列番号15)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列、およびGKNCDYNWDFEH(配列番号16)のアミノ酸配列を含むCDR-H3配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン;ならびに/またはRTSQYGSLA(配列番号17)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、SGSTRAA(配列番号18)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびQQYEF(配列番号19)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、DCTLN(配列番号14)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、WLKPRWGAVNYARPLQG(配列番号15)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列、およびGKNCDYNWDFEH(配列番号16)のアミノ酸配列を含むCDR-H3配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン;ならびにRTSQYGSLA(配列番号17)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、SGSTRAA(配列番号18)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびQQYEF(配列番号19)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、例えば、Liu, Q. et al. (2019) Nat. Commun. 10:721に記載されるような、抗体VRC03の伸長された重鎖FR3ループを含むVHドメインを有する抗原結合性部位を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、
QVRLSQSGGQMKKPGDSMRISCRASGYEFINCPINWIRLAPGKRPEWMGWMKPRHGAVSYARQLQGRVTMTRDMYSETAFLELRSLTSDDTAVYFCTRGKYCTARDYYNWDFEHWGQGTPVTVSS(配列番号43)のアミノ酸配列に対して少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%同一のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および/またはSLTQSPGTLSLSPGETAIISCRTSQYGSLAWYQQRPGQAPRLVIYSGSTRAAGIPDRFSGSRWGPDYNLTISNLESGDFGVYYCQQYEFFGQGTKVQVDIK(配列番号45)のアミノ酸配列に対して少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%同一のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、配列番号43のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および/または配列番号45のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、配列番号43のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および配列番号45のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、
QVRLSQSGGQMKKPGDSMRISCRASGYEFINCPINWIRLAPGKRPEWMGWMKPRHGAVSYARQLQGRVTMTRQLSQDPDDPDWGTAFLELRSLTSDDTAVYFCTRGKYCTARDYYNWDFEHWGQGTPVTVSS(配列番号44)のアミノ酸配列に対して少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%同一のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および/またはSLTQSPGTLSLSPGETAIISCRTSQYGSLAWYQQRPGQAPRLVIYSGSTRAAGIPDRFSGSRWGPDYNLTISNLESGDFGVYYCQQYEFFGQGTKVQVDIK(配列番号45)のアミノ酸配列に対して少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%同一のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、配列番号44のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および/または配列番号45のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、配列番号44のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および配列番号45のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、
RAHLVQSGTAMKKPGASVRVSCQTSGYTFTAHILFWFRQAPGRGLEWVGWIKPQYGAVNFGGGFRDRVTLTRDVYREIAYMDIRGLKPDDTAVYYCARDRSYGDSSWALDAWGQGTTVVVSA(配列番号46)のアミノ酸配列に対して少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%同一のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および/またはYIHVTQSPSSLSVSIGDRVTINCQTSQGVGSDLHWYQHKPGRAPKLLIHHTSSVEDGVPSRFSGSGFHTSFNLTISDLQADDIATYYCQVLQFFGRGSRLHIK(配列番号49)のアミノ酸配列に対して少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%同一のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、配列番号46のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および/または配列番号49のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、配列番号46のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および配列番号49のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、
RAHLVQSGTAMKKPGASVRVSCQTSGYTFTAHILFWFRQAPGRGLEWVGWIKPQYGATNFGGGFRDRVTLTRDVYREIAYMDIRGLKPDDTAVYYCARDRSYGDSSWALDAWGQGTTVVVSA(配列番号47)のアミノ酸配列に対して少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%同一のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および/またはYIHVTQSPSSLSVSIGDRVTINCQTSQGVGSDLHWYQHKPGRAPKLLIHHTSSVEDGVPSRFSGSGFHTSFNLTISDLQADDIATYYCQVLQFFGRGSRLHIK(配列番号49)のアミノ酸配列に対して少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%同一のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、配列番号47のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および/または配列番号49のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、配列番号47のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および配列番号49のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、
RAHLVQSGTAMKKPGASVRVSCQTSGYTFTAHILFWFRQAPGRGLEWVGWIKPQYGAVNFGGGFRDRVTLTRQLSQDPDDPDWGIAYMDIRGLKPDDTAVYYCARDRSYGDSSWALDAWGQGTTVVVSA(配列番号48)のアミノ酸配列に対して少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%同一のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および/またはYIHVTQSPSSLSVSIGDRVTINCQTSQGVGSDLHWYQHKPGRAPKLLIHHTSSVEDGVPSRFSGSGFHTSFNLTISDLQADDIATYYCQVLQFFGRGSRLHIK(配列番号49)のアミノ酸配列に対して少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%同一のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、配列番号48のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および/または配列番号49のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、配列番号48のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および配列番号49のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、
QVQLVQSGGQMKKPGESMRISCRASGYEFIDCTLNWIRLAPGKRPEWMGWLKPRWGAVNYARPLQGRVTMTRQLSQDPDDPDWGTAFLELRSLTVDDTAVYFCTRGKNCDYNWDFEHWGRGTPVIVSS(配列番号50)のアミノ酸配列に対して少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%同一のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および/またはLTQSPGTLSLSPGETAIISCRTSQYGSLAWYQQRPGQAPRLVIYSGSTRAAGIPDRFSGSRWGPDYNLTISNLESGDFGVYYCQQYEFFGQGTKVQVDIK(配列番号51)のアミノ酸配列に対して少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%同一のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、配列番号50のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および/または配列番号51のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、配列番号50のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および配列番号51のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。
上記実施形態のいずれかの一部の実施形態において、結合性タンパク質は、三重特異性結合性タンパク質である。一部の実施形態において、三重特異性結合性タンパク質は、HIV標的タンパク質に結合する抗原結合性部位、CD28ポリペプチドに結合する抗原結合性部位、およびCD3ポリペプチドに結合する抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、結合性タンパク質は、3つの抗原結合性部位を含む4つのポリペプチドを含む三重特異性結合性タンパク質であり、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、クロスオーバー軽鎖-重鎖ペア(例えば、本明細書に記載される通り)を形成する。一部の実施形態において、上述される抗CD38抗原結合性部位のいずれかのVHおよびVLドメインは、VH3およびVL3を表し、HIV標的タンパク質に結合する第3の抗原結合性部位を形成する。一部の実施形態において、VH1およびVL1は、CD28ポリペプチドに結合する第1の抗原結合性部位を形成し、VH2およびVL2は、CD3ポリペプチドに結合する第2の抗原結合性部位を形成し、上述されるおよび/または表2における抗HIV抗原結合性部位のいずれかのVHおよびVLドメインは、VH3およびVL3を表し、HIV標的タンパク質に結合する第3の抗原結合性部位を形成する。
例示的な抗HIV抗原結合性部位の配列は、表1に提供される。一部の実施形態において、本開示の抗HIV抗原結合性部位を含む結合性タンパク質は、表1に記載される抗HIV抗体の、1、2、3、4、5、または6つ全てのCDR配列を含む。一部の実施形態において、本開示の抗HIV抗原結合性部位を含む結合性タンパク質は、表1に記載される抗HIV抗体のVHドメイン配列および/またはVLドメイン配列を含む。
Figure 2022526826000002
Figure 2022526826000003
抗CD28結合性部位
本開示の特定の態様は、CD28ポリペプチドに結合する抗原結合性部位を含む結合性タンパク質に関する。一部の実施形態において、CD28ポリペプチドは、Tp44としても公知のヒトCD28ポリペプチドである。ヒトCD28ポリペプチドは、当技術分野において公知であり、これらに限定されないが、NCBI受託番号XP_011510499.1、XP_011510497.1、XP_011510496.1、NP_001230007.1、NP_001230006.1、もしくはNP_006130.1によって表されるポリペプチド、またはNCBI遺伝子識別番号940から産生されたポリペプチドが挙げられる。一部の実施形態において、CD28ポリペプチドに結合する抗原結合性部位を含む結合性タンパク質は、単一特異性および/もしくは1価、二重特異性および/もしくは2価、三重特異性および/もしくは3価、または多重特異性および/もしくは多価である。一部の実施形態において、CD28ポリペプチドに結合する抗原結合性部位を含む結合性タンパク質は、3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチドを含む三重特異性結合性タンパク質である。一部の実施形態において、CD28ポリペプチドに結合する抗原結合性部位を含む結合性タンパク質は、3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチドを含む三重特異性結合性タンパク質であり、3つの抗原結合性部位のうちの1つは、CD28ポリペプチドに結合し、そのうちの1つは、CD3ポリペプチドに結合する。一部の実施形態において、CD28ポリペプチドに結合する抗原結合性部位を含む結合性タンパク質は、3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチドを含む三重特異性結合性タンパク質であり、抗原結合性部位のうちの1つはCD28ポリペプチドに結合し、抗原結合性部位のうちの1つはCD3ポリペプチドに結合し、抗原結合性部位のうちの1つはHIV標的タンパク質に結合する。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、GYTFTSYY(配列番号31)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、IYPGNVNT(配列番号32)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列、およびTRSHYGLDWNFDV(配列番号33)のアミノ酸配列を含むCDR-H3配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン;ならびに/またはQNIYVW(配列番号34)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、KAS(配列番号35)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびQQGQTYPY(配列番号36)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、GYTFTSYY(配列番号31)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、IYPGNVNT(配列番号32)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列、およびTRSHYGLDWNFDV(配列番号33)のアミノ酸配列を含むCDR-H3配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン;ならびにQNIYVW(配列番号34)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、KAS(配列番号35)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびQQGQTYPY(配列番号36)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、
QVQLVQSGAEVVKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGSIYPGNVNTNYAQKFQGRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYYCTRSHYGLDWNFDVWGKGTTVTVSS(配列番号59)のアミノ酸配列に対して少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%同一のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および/または
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCQASQNIYVWLNWYQQKPGKAPKLLIYKASNLHTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDIATYYCQQGQTYPYTFGQGTKLEIK(配列番号60)のアミノ酸配列に対して少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%同一のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、配列番号59のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および/または配列番号60のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、配列番号59のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および配列番号60のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。
上記実施形態のいずれかの一部の実施形態において、結合性タンパク質は、三重特異性結合性タンパク質である。一部の実施形態において、三重特異性結合性タンパク質は、HIV標的タンパク質に結合する抗原結合性部位、CD28ポリペプチドに結合する抗原結合性部位、およびCD3ポリペプチドに結合する抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、結合性タンパク質は、3つの抗原結合性部位を含む4つのポリペプチドを含む三重特異性結合性タンパク質であり、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、クロスオーバー軽鎖-重鎖ペア(例えば、本明細書に記載される通り)を形成する。一部の実施形態において、上記の任意の抗CD28抗原結合性部位のVHおよびVLドメインはVH1およびVL1を表し、CD28ポリペプチドに結合する第1の抗原結合性部位を形成する。一部の実施形態において、上述される抗CD28抗原結合性部位のいずれかのVHおよびVLドメインは、VH1およびVL1を表し、CD28ポリペプチドに結合する第1の抗原結合性部位を形成し、VH2およびVL2は、CD3ポリペプチドに結合する第2の抗原結合性部位を形成し、VH3およびVL3は、HIV標的タンパク質に結合する第3の抗原結合性部位を形成する。
例示的な抗CD28抗原結合性部位の配列が表2に提供される。一部の実施形態において、本開示の抗CD28抗原結合性部位を含む結合性タンパク質は、表2に記載の抗CD28抗体の1、2、3、4、5、または6つ全てのCDR配列を含む。一部の実施形態において、本開示の抗CD28抗原結合性部位を含む結合性タンパク質は、表2に記載の抗CD28抗体のVHドメイン配列および/またはVLドメイン配列を含む。
Figure 2022526826000004
抗CD3結合性部位
本開示の特定の態様は、CD3ポリペプチドに結合する抗原結合性部位を含む結合性タンパク質に関する。一部の実施形態において、CD3ポリペプチドは、ヒトCD3ポリペプチド、例えば、CD3-デルタ(T3D、IMD19、およびCD3-デルタとしても公知)、CD3-イプシロン(T3E、IMD18、およびTCREとしても公知)、およびCD3-ガンマ(T3G、IMD17、およびCD3-ガンマとしても公知)などである。ヒトCD3ポリペプチドは、当技術分野において公知であり、これらに限定されないが、NCBI受託番号XP_006510029.1もしくはNP_031674.1によって表されるポリペプチド、またはNCBI遺伝子識別番号915、916、もしくは917から産生されたポリペプチドが挙げられる。一部の実施形態において、CD3ポリペプチドに結合する抗原結合性部位を含む結合性タンパク質は、単一特異性および/もしくは1価、二重特異性および/もしくは2価、三重特異性および/もしくは3価、または多重特異性および/もしくは多価である。一部の実施形態において、CD3ポリペプチドに結合する抗原結合性部位を含む結合性タンパク質は、3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチドを含む三重特異性結合性タンパク質である。一部の実施形態において、CD3ポリペプチドに結合する抗原結合性部位を含む結合性タンパク質は、3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチドを含む三重特異性結合性タンパク質であり、3つの抗原結合性部位のうちの1つは、CD28ポリペプチドに結合し、そのうちの1つは、CD3ポリペプチドに結合する。一部の実施形態において、CD3ポリペプチドに結合する抗原結合性部位を含む結合性タンパク質は、3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチドを含む三重特異性結合性タンパク質であり、3つの抗原結合性部位のうちの1つは、CD28ポリペプチドに結合し、そのうちの1つは、CD3ポリペプチドに結合し、そのうちの1つは、HIV標的タンパク質に結合する。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、GFTFTKAW(配列番号20)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、IKDKSNSYAT(配列番号21)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列、およびRGVYYALSPFDY(配列番号22)のアミノ酸配列を含むCDR-H3配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン;ならびに/またはQSLVHXNXTYであって、ここでXはEまたはQであり、XはAまたはLであり、XはQ、R、またはFである、QSLVHXNXTY(配列番号293)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、KVS(配列番号29)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびGQGTQYPFT(配列番号30)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、VL2ドメインのCDR-L1配列は、QSLVHQNAQTY(配列番号24)、QSLVHENLQTY(配列番号25)、QSLVHENLFTY(配列番号26)、およびQSLVHENLRTY(配列番号27)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、GFTFTKAW(配列番号20)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、IKDKSNSYAT(配列番号21)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列、およびRGVYYALSPFDY(配列番号22)のアミノ酸配列を含むCDR-H3配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン;ならびに/またはQSLVHQNAQTY(配列番号24)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、KVS(配列番号29)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびGQGTQYPFT(配列番号30)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、GFTFTKAW(配列番号20)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、IKDKSNSYAT(配列番号21)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列、およびRGVYYALSPFDY(配列番号22)のアミノ酸配列を含むCDR-H3配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン;ならびにQSLVHQNAQTY(配列番号24)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、KVS(配列番号29)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびGQGTQYPFT(配列番号30)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、GFTFTKAW(配列番号20)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、IKDKSNSYAT(配列番号21)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列、およびRGVYYALSPFDY(配列番号22)のアミノ酸配列を含むCDR-H3配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン;ならびに/またはQSLVHENLQTY(配列番号25)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、KVS(配列番号29)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびGQGTQYPFT(配列番号30)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、GFTFTKAW(配列番号20)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、IKDKSNSYAT(配列番号21)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列、およびRGVYYALSPFDY(配列番号22)のアミノ酸配列を含むCDR-H3配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン;ならびにQSLVHENLQTY(配列番号25)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、KVS(配列番号29)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびGQGTQYPFT(配列番号30)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、GFTFTKAW(配列番号20)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、IKDKSNSYAT(配列番号21)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列、およびRGVYYALSPFDY(配列番号22)のアミノ酸配列を含むCDR-H3配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン;ならびに/またはQSLVHENLFTY(配列番号26)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、KVS(配列番号29)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびGQGTQYPFT(配列番号30)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、GFTFTKAW(配列番号20)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、IKDKSNSYAT(配列番号21)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列、およびRGVYYALSPFDY(配列番号22)のアミノ酸配列を含むCDR-H3配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン;ならびにQSLVHENLFTY(配列番号26)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、KVS(配列番号29)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびGQGTQYPFT(配列番号30)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、GFTFTKAW(配列番号20)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、IKDKSNSYAT(配列番号21)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列、およびRGVYYALSPFDY(配列番号22)のアミノ酸配列を含むCDR-H3配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン;ならびに/またはQSLVHENLRTY(配列番号27)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、KVS(配列番号29)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびGQGTQYPFT(配列番号30)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、GFTFTKAW(配列番号20)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、IKDKSNSYAT(配列番号21)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列、およびRGVYYALSPFDY(配列番号22)のアミノ酸配列を含むCDR-H3配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン;ならびにQSLVHENLRTY(配列番号27)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、KVS(配列番号29)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびGQGTQYPFT(配列番号30)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、
QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFTKAWMHWVRQAPGKQLEWVAQIKDKSNSYATYYADSVKGRFTISRDDSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCRGVYYALSPFDYWGQGTLVTVSS(配列番号52)のアミノ酸配列に対して少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%同一のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、ならびに/または
DIVMTQTPLSLSVTPGQPASISCKSSQSLVHQNAQTYLSWYLQKPGQSPQSLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCGQGTQYPFTFGSGTKVEIK(配列番号54)、DIVMTQTPLSLSVTPGQPASISCKSSQSLVHENLQTYLSWYLQKPGQSPQSLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCGQGTQYPFTFGSGTKVEIK(配列番号55)、DIVMTQTPLSLSVTPGQPASISCKSSQSLVHENLFTYLSWYLQKPGQSPQSLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCGQGTQYPFTFGSGTKVEIK(配列番号56)、およびDIVMTQTPLSLSVTPGQPASISCKSSQSLVHENLRTYLSWYLQKPGQSPQSLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCGQGTQYPFTFGSGTKVEIK(配列番号57)からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%同一のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、配列番号52のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、ならびに/または配列番号54、配列番号55、配列番号56、および配列番号57からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、配列番号52のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、ならびに配列番号54、配列番号55、配列番号56、および配列番号57からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、
QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFTKAWMHWVRQAPGKQLEWVAQIKDKSNSYATYYADSVKGRFTISRDDSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCRGVYYALSPFDYWGQGTLVTVSS(配列番号52)のアミノ酸配列に対して少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%同一のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および/または
DIVMTQTPLSLSVTPGQPASISCKSSQSLVHQNAQTYLSWYLQKPGQSPQSLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCGQGTQYPFTFGSGTKVEIK(配列番号54)のアミノ酸配列に対して少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%同一のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、配列番号52のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および/または配列番号54のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、配列番号52のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および配列番号54のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、
QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFTKAWMHWVRQAPGKQLEWVAQIKDKSNSYATYYADSVKGRFTISRDDSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCRGVYYALSPFDYWGQGTLVTVSS(配列番号52)のアミノ酸配列に対して少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%同一のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および/または
DIVMTQTPLSLSVTPGQPASISCKSSQSLVHENLQTYLSWYLQKPGQSPQSLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCGQGTQYPFTFGSGTKVEIK(配列番号55)のアミノ酸配列に対して少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%同一のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、配列番号52のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および/または配列番号55のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、配列番号52のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および配列番号55のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、
QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFTKAWMHWVRQAPGKQLEWVAQIKDKSNSYATYYADSVKGRFTISRDDSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCRGVYYALSPFDYWGQGTLVTVSS(配列番号52)のアミノ酸配列に対して少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%同一のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および/または
DIVMTQTPLSLSVTPGQPASISCKSSQSLVHENLFTYLSWYLQKPGQSPQSLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCGQGTQYPFTFGSGTKVEIK(配列番号56)のアミノ酸配列に対して少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%同一のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、配列番号52のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および/または配列番号56のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、配列番号52のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および配列番号56のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、
QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFTKAWMHWVRQAPGKQLEWVAQIKDKSNSYATYYADSVKGRFTISRDDSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCRGVYYALSPFDYWGQGTLVTVSS(配列番号52)のアミノ酸配列に対して少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%同一のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および/または
DIVMTQTPLSLSVTPGQPASISCKSSQSLVHENLRTYLSWYLQKPGQSPQSLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCGQGTQYPFTFGSGTKVEIK(配列番号57)のアミノ酸配列に対して少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%同一のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、配列番号52のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および/または配列番号57のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、配列番号52のアミノ酸配列を含む抗体重鎖可変(VH)ドメイン、および配列番号57のアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変(VL)ドメインを含む抗原結合性部位を含む。
有利には、抗CD3結合性部位は、ヒトCD3ポリペプチドに対する高親和性結合および除去された潜在的な製造的不都合(例えば、脱アミド部位)と共に本明細書に記載される。
上記実施形態のいずれかの一部の実施形態において、結合性タンパク質は、三重特異性結合性タンパク質である。一部の実施形態において、三重特異性結合性タンパク質は、HIV標的タンパク質に結合する抗原結合性部位、CD28ポリペプチドに結合する抗原結合性部位、およびCD3ポリペプチドに結合する抗原結合性部位を含む。一部の実施形態において、結合性タンパク質は、3つの抗原結合性部位を含む4つのポリペプチドを含む三重特異性結合性タンパク質であり、式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドは、クロスオーバー軽鎖-重鎖ペア(例えば、本明細書に記載される通り)を形成する。一部の実施形態において、上述される抗CD3抗原結合性部位のいずれかのVHおよびVLドメインは、VH2およびVL2を表し、CD3ポリペプチドに結合する第2の抗原結合性部位を形成する。一部の実施形態において、VH1およびVL1は、CD28ポリペプチドに結合する第1の抗原結合性部位を形成する、上述されるおよび/または表3における抗CD3抗原結合性部位のいずれかのVHおよびVLドメインは、VH2およびVL2を表し、CD3ポリペプチドに結合する第2の抗原結合性部位を形成し、VH3およびVL3は、HIV標的タンパク質に結合する第3の抗原結合性部位を形成する。
例示的な抗CD3抗原結合性部位の配列が表3に提供される。一部の実施形態において、本開示の抗CD3抗原結合性部位を含む結合性タンパク質は、表3に記載の抗CD3抗体の1、2、3、4、5、または6つ全てのCDR配列を含む。一部の実施形態において、本開示の抗CD3抗原結合性部位を含む結合性タンパク質は、表3に記載の抗CD3抗体のVHドメイン配列および/またはVLドメイン配列を含む。
Figure 2022526826000005
Figure 2022526826000006
リンカー
一部の実施形態において、リンカーL、L、L、およびLは、アミノ酸なし(長さ=0)から約100アミノ酸の長さの範囲であるか、または100未満、50未満、40未満、30未満、20未満、もしくは15未満のアミノ酸であるか、またはそれより少ない。リンカーは、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1アミノ酸の長さであってもよい。1つの結合性タンパク質におけるL、L、L、およびLは、全て同じアミノ酸配列を有していてもよいし、または全て異なるアミノ酸配列を有していてもよい。
好適なリンカーの例としては、例えば、GGGGSGGGGS(配列番号40)、GGGGSGGGGSGGGGS(配列番号41)、S、RT、TKGPS配列番号39)、GQPKAAP(配列番号38)、GGSGSSGSGG(配列番号42)、ならびにDKTHT(配列番号37)、加えて、国際公報WO2017/074878号およびWO2017/180913号で開示されたものが挙げられる。上記で列挙された例は、開示の範囲をいかなるようにも限定することを意図しておらず、バリン、ロイシン、イソロイシン、セリン、スレオニン、リシン、アルギニン、ヒスチジン、アスパラギン酸、グルタミン酸、アスパラギン、グルタミン、グリシン、およびプロリンからなる群から選択されるランダムに選択されたアミノ酸を含むリンカーは、結合性タンパク質において好適であることが示されている。
リンカーにおけるアミノ酸残基の同一性および配列は、リンカーにおいて達成する必要がある二次的な構造エレメントのタイプに応じて変更することができる。例えば、グリシン、セリン、およびアラニンは、最大のフレキシビリティーを有するリンカーにとって最良である。より硬く長いリンカーが必要な場合、グリシン、プロリン、スレオニン、およびセリンの一部の組合せが有用である。所望の特性に応じて必要なより大きいペプチドリンカーを構築するために、あらゆるアミノ酸残基を他のアミノ酸残基と組み合わせてリンカーとして考慮することができる。
一部の実施形態において、Lの長さは、Lの長さの少なくとも2倍である。一部の実施形態において、Lの長さは、Lの長さの少なくとも2倍である。一部の実施形態において、Lの長さは、Lの長さの少なくとも2倍であり、Lの長さは、Lの長さの少なくとも2倍である。一部の実施形態において、Lは、3~12アミノ酸残基の長さであり、Lは、3~14アミノ酸残基の長さであり、Lは、1~8アミノ酸残基の長さであり、Lは、1~3アミノ酸残基の長さである。一部の実施形態において、Lは、5~10アミノ酸残基の長さであり、Lは、5~8アミノ酸残基の長さであり、Lは、1~5アミノ酸残基の長さであり、Lは、1~2アミノ酸残基の長さである。一部の実施形態において、Lは、7アミノ酸残基の長さであり、Lは、5アミノ酸残基の長さであり、Lは、1アミノ酸残基の長さであり、Lは、2アミノ酸残基の長さである。
一部の実施形態において、L、L、LおよびLは、それぞれ独立して、ゼロアミノ酸の長さであり、またはGGGGSGGGGS(配列番号40)、GGGGSGGGGSGGGGS(配列番号41)、S、RT、TKGPS(配列番号39)、GQPKAAP(配列番号38)、およびGGSGSSGSGG(配列番号42)からなる群から選択される配列を含む。一部の実施形態において、L、L、LおよびLは、それぞれ独立して、GGGGSGGGGS(配列番号40)、GGGGSGGGGSGGGGS(配列番号41)、S、RT、TKGPS配列番号39)、GQPKAAP(配列番号38)、およびGGSGSSGSGG(配列番号42)からなる群から選択される配列を含む。一部の実施形態において、Lは、配列GQPKAAP(配列番号38)を含み、Lは、配列TKGPS配列番号39)を含み、Lは、配列Sを含み、Lは、配列RTを含む。
一部の実施形態において、L、L、LまたはLの少なくとも1つは、配列DKTHT(配列番号37)を含む。一部の実施形態において、L、L、LおよびLは、配列DKTHT(配列番号37)を含む。
Fc領域および定常ドメイン
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、CH1に連結されたFc領域をさらに含む第2のポリペプチド鎖を含み、Fc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、CH1に連結されたFc領域をさらに含む第3のポリペプチド鎖を含み、Fc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、CH1に連結されたFc領域をさらに含む第2のポリペプチド鎖であって、Fc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域およびCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含む、第2のポリペプチド鎖、ならびにCH1に連結されたFc領域をさらに含む第3のポリペプチド鎖であって、Fc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域およびCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含む、第3のポリペプチド鎖を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、全長抗体重鎖またはFc領域を含むポリペプチド鎖を含む。一部の実施形態において、Fc領域は、ヒトFc領域、例えば、ヒトIgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4のFc領域である。一部の実施形態において、Fc領域は、抗体ヒンジ、CH1、CH2、CH3、および任意選択でCH4ドメインを含む。一部の実施形態において、Fc領域は、ヒトIgG1のFc領域である。一部の実施形態において、Fc領域は、ヒトIgG4のFc領域である。一部の実施形態において、Fc領域は、以下に記載される突然変異の1つまたはそれ以上を含む。一部の実施形態において、Fc領域は、表4に示される結合性タンパク質の重鎖ポリペプチド(例えば、ポリペプチド2または3)の1つのFc領域である。一部の実施形態において、重鎖定常領域は、表4に示される結合性タンパク質の重鎖ポリペプチド(例えば、ポリペプチド2または3)の1つの定常領域である。一部の実施形態において、軽鎖定常領域は、表4に示される結合性タンパク質の軽鎖ポリペプチド(例えば、ポリペプチド1または4)の1つの定常領域である。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、1または2つのFcバリアントを含む。用語「Fcバリアント」は、本明細書で使用される場合、天然Fcから改変されているが、それでもなおサルベージ受容体、FcRn(新生児Fc受容体)のための結合性部位を含む分子または配列を指す。例示的なFcバリアント、およびそのサルベージ受容体との相互作用は、当技術分野において公知である。したがって、用語「Fcバリアント」は、非ヒト天然Fcからヒト化された分子または配列を含む場合がある。さらに、天然Fcは、本発明の抗体様の結合性タンパク質に必要ではない構造的特色または生物学的活性を提供するため除去することができる領域を含む。したがって、用語「Fcバリアント」は、(1)ジスルフィド結合形成、(2)選択された宿主細胞との不適合、(3)選択された宿主細胞における発現でのN末端の不均一性、(4)グリコシル化、(5)補体との相互作用、(6)サルベージ受容体以外のFc受容体への結合、または(7)抗体依存性細胞傷害(ADCC)に影響を与えるかまたはそれに関与する、1つまたはそれ以上の天然Fc部位または残基を欠如した、または1つまたはそれ以上のFc部位または残基が改変された分子または配列を含む。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質(例えば、三重特異性結合性タンパク質)は、第2のポリペプチド鎖における「ノブ」突然変異および第3のポリペプチド鎖における「ホール」突然変異を含む。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、第3のポリペプチド鎖における「ノブ」突然変異および第2のポリペプチド鎖における「ホール」突然変異を含む。一部の実施形態において、「ノブ」突然変異は、EUインデックスに従ってヒトIgG1またはIgG4の354位および/または366位に対応する位置における置換を含む。一部の実施形態において、アミノ酸置換は、S354C、T366W、T366Y、S354CおよびT366W、またはS354CおよびT366Yである。一部の実施形態において、「ノブ」突然変異は、EUインデックスに従ってヒトIgG1またはIgG4の354位および366位に対応する位置における置換を含む。一部の実施形態において、アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wである。一部の実施形態において、「ホール」突然変異は、EUインデックスに従ってヒトIgG1またはIgG4の407位、および任意選択で349、366、および/または368位に対応する位置における置換を含む。一部の実施形態において、アミノ酸置換は、Y407VまたはY407Tおよび任意選択でY349C、T366S、および/またはL368Aである。一部の実施形態において、「ホール」突然変異は、EUインデックスに従ってヒトIgG1またはIgG4の349、366、368、および407位に対応する位置における置換を含む。一部の実施形態において、アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vである。
一部の実施形態において、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、第1のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、第1のFc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG1またはIgG4の366位および任意選択で354位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、T366WまたはT366Yおよび任意選択でS354Cであり;第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、第2のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、第2のFc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG1またはIgG4の407位ならびに任意選択で349、366、および/または368位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、Y407VまたはY407Tならびに任意選択でY349C、T366S、および/またはL368Aである。
一部の実施形態において、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、第1のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、第1のFc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG1またはIgG4の407位ならびに任意選択で349、366、および/または368位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、Y407VまたはY407Tならびに任意選択でY349C、T366S、および/またはL368Aであり;第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、第2のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、第2のFc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG1またはIgG4の366位および任意選択で354位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、T366WまたはT366Yおよび任意選択でS354Cである。
一部の実施形態において、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、第1のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、第1のFc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG1またはIgG4の366位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、T366Wであり;第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、第2のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、第2のFc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG1またはIgG4の366、368、および/または407位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、T366S、L368A、および/またはY407Vである。
一部の実施形態において、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、第1のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、第1のFc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG1またはIgG4の366、368、および/または407位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、T366S、L368A、および/またはY407Vであり;第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、第2のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、第2のFc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG1またはIgG4の366位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、T366Wである。
一部の実施形態において、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、第1のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、第1のFc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG1またはIgG4の354位および366位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wであり;第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、第2のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、第2のFc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG1またはIgG4の349、366、368、および407位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vである。一部の実施形態において、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、第1のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、第1のFc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG1またはIgG4の349、366、368、および407位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vであり;第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、第2のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み、第2のFc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG1またはIgG4の354位および366位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、S354CおよびT366Wである。一部の実施形態において、第1および/または第2のFc領域は、ヒトIgG1のFc領域である。一部の実施形態において、第1および/または第2のFc領域は、ヒトIgG4のFc領域である。
一部の実施形態において、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、第1のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含むヒトIgG4のFc領域であり、第1のFc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG4の228、354、366、および409位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、S228P、S354C、T366W、およびR409Kであり;第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、第2のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含むヒトIgG4のFc領域であり、第2のFc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG4の228、349、366、368、407、および409位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、S228P、Y349C、T366S、L368A、Y407V、およびR409Kである。一部の実施形態において、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、第1のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含むヒトIgG4のFc領域であり、第1のFc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG4の228、349、366、368、407、および409位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、S228P、Y349C、T366S、L368A、Y407V、およびR409Kであり;第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、第2のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含むヒトIgG4のFc領域であり、第2のFc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG4の228、354、366、および409位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、S228P、S354C、T366W、およびR409Kである。
一部の実施形態において、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、第1のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含むヒトIgG4のFc領域であり、第1のFc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG4の234、235、354、および366位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、F234A、L235A、S354C、およびT366Wであり;第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、第2のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含むヒトIgG4のFc領域であり、第2のFc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG4の234、235、349、366、368、および407位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、F234A、L235A、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vである。一部の実施形態において、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、第1のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含むヒトIgG4のFc領域であり、第1のFc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG4の234、235、349、366、368、および407位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、F234A、L235A、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vであり;第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、第2のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含むヒトIgG4のFc領域であり、第2のFc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG4の234、235、354、および366位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、F234A、L235A、S354C、およびT366Wである。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、エフェクター機能、例えば、Fc受容体によって媒介される抗体依存性細胞貪食(ADCP)、補体依存性細胞傷害(CDC)、および/または抗体依存性細胞傷害(ADCC)を低減することができる1つまたはそれ以上の突然変異を含む。一部の実施形態において、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、第1のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み;第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、第2のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み;第1および第2のFc領域は、ヒトIgG1のFc領域であり;第1および第2のFc領域はそれぞれ、EUインデックスに従ってヒトIgG1の234位および235位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、L234AおよびL235Aである。一部の実施形態において、第2および第3のポリペプチド鎖のFc領域は、ヒトIgG1のFc領域であり、Fc領域はそれぞれ、EUインデックスに従ってヒトIgG1の234位および235位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、L234AおよびL235Aである。一部の実施形態において、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、第1のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み;第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、第2のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含み;第1および第2のFc領域は、ヒトIgG1のFc領域であり;第1および第2のFc領域はそれぞれ、EUインデックスに従ってヒトIgG1の234、235、および329位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、L234A、L235A、およびP329Aである。一部の実施形態において、第2および第3のポリペプチド鎖のFc領域は、ヒトIgG1のFc領域であり、Fc領域はそれぞれ、EUインデックスに従ってヒトIgG1の234、235、および329位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、L234A、L235A、およびP329Aである。一部の実施形態において、第2および第3のポリペプチド鎖のFc領域は、ヒトIgG4のFc領域であり、Fc領域はそれぞれ、EUインデックスに従ってヒトIgG4の234位および235位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、F234AおよびL235Aである。一部の実施形態において、結合性タンパク質は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含む第2のポリペプチド鎖であって、第1のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域およびCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含む、第2のポリペプチド鎖、ならびにCH1に連結された第2のFc領域をさらに含む第3のポリペプチド鎖であって、第2のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域およびCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含む、第3のポリペプチド鎖を含み;第1および第2のFc領域はそれぞれ、EUインデックスに従ってヒトIgG4の234位および235位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、F234AおよびL235Aである。
一部の実施形態において、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、第1のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含むヒトIgG4のFc領域であり、第1のFc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG4の228、234、235、354、366、および409位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、S228P、F234A、L235A、S354C、T366W、およびR409Kであり;第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、第2のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含むヒトIgG4のFc領域であり、第2のFc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG4の228、234、235、349、366、368、407、および409位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、S228P、F234A、L235A、Y349C、T366S、L368A、Y407V、およびR409Kである。一部の実施形態において、第2のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含み、第1のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含むヒトIgG4のFc領域であり、第1のFc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG4の228、234、235、349、366、368、407、および409位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、S228P、F234A、L235A、Y349C、T366S、L368A、Y407V、およびR409Kであり;第3のポリペプチド鎖は、CH1に連結された第2のFc領域をさらに含み、第2のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域ならびにCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含むヒトIgG4のFc領域であり、第2のFc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG4の228、234、235、354、366、および409位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、S228P、F234A、L235A、S354C、T366W、およびR409Kである。
一部の実施形態において、Fc領域は、FcγIおよび/またはFcγIIの結合を低減または消去する1つまたはそれ以上の突然変異を含むヒトIgG4のFc領域である。一部の実施形態において、Fc領域は、FcγIおよび/またはFcγIIの結合を低減または消去するがFcRnの結合に影響を与えない1つまたはそれ以上の突然変異を含むヒトIgG4のFc領域である。一部の実施形態において、Fc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG4の228位および/または409位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含むヒトIgG4のFc領域である。一部の実施形態において、アミノ酸置換は、S228Pおよび/またはR409Kである。一部の実施形態において、Fc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG4の234位および/または235位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含むヒトIgG4のFc領域である。一部の実施形態において、アミノ酸置換は、F234Aおよび/またはL235Aである。一部の実施形態において、Fc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG4の228、234、235、および/または409位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含むヒトIgG4のFc領域である。一部の実施形態において、アミノ酸置換は、S228P、F234A、L235A、および/またはR409Kである。一部の実施形態において、Fc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG4の233~236位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含むヒトIgG4のFc領域である。一部の実施形態において、アミノ酸置換は、E233P、F234V、L235A、および236における欠失である。一部の実施形態において、Fc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG4の228、233~236、および/または409位に対応する位置におけるアミノ酸突然変異を含むヒトIgG4のFc領域である。一部の実施形態において、アミノ酸突然変異は、S228P;E233P、F234V、L235A、および236における欠失;ならびに/またはR409Kである。
一部の実施形態において、Fc領域は、Fc領域のFc受容体結合および/またはエフェクター機能(例えば、Fc受容体によって媒介される抗体依存性細胞貪食(ADCP)、補体依存性細胞傷害(CDC)、および/または抗体依存性細胞傷害(ADCC))を低減または消去する1つまたはそれ以上の突然変異を含む。
一部の実施形態において、Fc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG1の234、235、および/または329位に対応する位置における1つまたはそれ以上のアミノ酸置換を含むヒトIgG1のFc領域である。一部の実施形態において、アミノ酸置換は、L234A、L235A、および/またはP329Aである。一部の実施形態において、Fc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG1の298、299、および/または300位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含むヒトIgG1のFc領域である。一部の実施形態において、アミノ酸置換は、S298N、T299A、および/またはY300Sである。
一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、安定性、例えば、IgG4のヒンジ領域および/または二量体境界の安定性を改善するための1つまたはそれ以上の突然変異を含む(例えば、Spiess,C.ら(2013)J.Biol.Chem.288:26583~26593を参照)。一部の実施形態において、突然変異は、EUインデックスに従ってヒトIgG4の228位および409位に対応する位置における置換を含み、アミノ酸置換は、S228PおよびR409Kである。一部の実施形態において、結合性タンパク質は、CH1に連結された第1のFc領域をさらに含む第2のポリペプチド鎖であって、第1のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域およびCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含む、第2のポリペプチド鎖、ならびにCH1に連結された第2のFc領域をさらに含む第3のポリペプチド鎖であって、第2のFc領域は、免疫グロブリンのヒンジ領域およびCH2およびCH3免疫グロブリン重鎖定常ドメインを含む、第3のポリペプチド鎖を含み;第1および第2のFc領域は、ヒトIgG4のFc領域であり;第1および第2のFc領域はそれぞれ、EUインデックスに従ってヒトIgG4の228位および409位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、S228PおよびR409Kである。一部の実施形態において、本開示の結合性タンパク質は、ノブおよびホールの突然変異ならびに安定性を改善するための1つまたはそれ以上の突然変異を含む。一部の実施形態において、第1および/または第2のFc領域は、ヒトIgG4のFc領域である。
一部の実施形態において、Fc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG1の234、235、および/または329位に対応する位置における1つまたはそれ以上のアミノ酸置換を含むヒトIgG1のFc領域である。一部の実施形態において、アミノ酸置換は、L234A、L235A、および/またはP329Aである。一部の実施形態において、Fc領域は、EUインデックスに従ってヒトIgG1の298、299、および/または300位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含むヒトIgG1のFc領域である。一部の実施形態において、アミノ酸置換は、S298N、T299A、および/またはY300Sである。
核酸
本開示の他の態様は、単離された核酸分子であって、本明細書に記載の任意の結合性タンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む、前記単離された核酸分子に関する。例示的および非限定的な核酸配列は表5に提供される。
本開示の他の態様は、例えば、本明細書に記載されるような結合性タンパク質の1つまたはそれ以上のポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチドのキットに関する。一部の実施形態において、本開示のポリヌクレオチドのキットは、(a)配列番号177のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号178のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号179のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号180のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(b)配列番号181のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号182のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号183のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号184のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(c)配列番号185のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号186のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号187のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号188のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(d)配列番号189のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号190のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号191のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号192のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(e)配列番号193のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号194のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号195のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号196のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(f)配列番号197のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号198のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号199のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号200のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(g)配列番号201のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号202のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号203のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号204のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(h)配列番号205のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号206のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号207のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号208のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(i)配列番号209のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号210のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号211のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号212のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(j)配列番号213のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号214のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号215のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号216のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(k)配列番号217のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号218のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号219のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号220のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(l)配列番号221のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号222のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号223のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号224のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(m)配列番号225のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号226のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号227のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号228のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(n)配列番号229のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号230のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号231のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号232のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(o)配列番号233のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号234のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号235のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号236のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(p)配列番号237のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号238のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号239のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号240のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(q)配列番号241のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号242のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号243のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号244のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(r)配列番号245のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号246のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号247のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号248のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(s)配列番号249のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号250のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号251のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号252のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(t)配列番号253のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号254のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号255のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号256のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(u)配列番号257のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号258のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号259のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号260のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(v)配列番号261のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号262のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号263のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号264のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(w)配列番号265のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号266のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号267のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号268のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(x)配列番号269のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号270のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号271のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号272のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(y)配列番号273のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号274のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号275のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号276のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(z)配列番号277のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号278のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号279のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号280のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(aa)配列番号281のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号282のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号283のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号284のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;(bb)配列番号285のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号286のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号287のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号288のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;または(cc)配列番号289のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号290のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号291のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号292のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチドを含む、ポリヌクレオチドのキットの1、2、3、または4つのポリヌクレオチドを含む。
本開示の他の態様は、本明細書に記載の任意の結合性タンパク質の第1、第2、第3、および第4のポリペプチド鎖をコードする1つまたはそれ以上のベクターを含む、ベクターシステムに関する。一部の実施形態において、例えば、表5のポリヌクレオチドに示されるように、ベクターシステムは、結合性タンパク質の第1のポリペプチド鎖をコードする第1のベクター、結合性タンパク質の第2のポリペプチド鎖をコードする第2のベクター、結合性タンパク質の第3のポリペプチド鎖をコードする第3のベクター、および結合性タンパク質の第4のポリペプチド鎖をコードする第4のベクターを含む。一部の実施形態において、ベクターシステムは、結合性タンパク質の第1および第2のポリペプチド鎖をコードする第1のベクター、ならびに結合性タンパク質の第3および第4のポリペプチド鎖をコードする第2のベクターを含む。一部の実施形態において、ベクターシステムは、結合性タンパク質の第1および第3のポリペプチド鎖をコードする第1のベクター、ならびに結合性タンパク質の第2および第4のポリペプチド鎖をコードする第2のベクターを含む。一部の実施形態において、ベクターシステムは、結合性タンパク質の第1および第4のポリペプチド鎖をコードする第1のベクター、ならびに結合性タンパク質の第2および第3のポリペプチド鎖をコードする第2のベクターを含む。一部の実施形態において、ベクターシステムは、結合性タンパク質の第1、第2、第3、および第4のポリペプチド鎖をコードする第1のベクターを含む。ベクターシステムの1つまたはそれ以上のベクターは、本明細書に記載の任意のベクターであってもよい。一部の実施形態において、1つまたはそれ以上のベクターは発現ベクターである。一部の実施形態において、第1、第2、第3、および第4のポリヌクレオチドは、1つまたはそれ以上の発現ベクター、例えば、1、2、3、または4つの発現ベクター上に存在する。
結合性タンパク質を形成するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを構築し、これらのポリヌクレオチドを組換え発現ベクターに組み込み、そのようなベクターを宿主細胞に導入するために標準的な組換えDNA方法論が使用される。例えば、Sambrook et al.、2001、MOLECULAR CLONING: A LABORATORY MANUAL(Cold Spring Harbor Laboratory Press、3rd ed.)を参照。酵素反応および精製技術は、当技術分野において一般的に達成されるように、または本明細書に記載されるように、製造者の仕様書に従って行うことができる。特有の定義が提供されなければ、本明細書に記載の分析化学、合成有機化学、ならびに医薬品および薬化学との繋がりにおいて利用される学術用語、ならびにその実験室手順および技術は、当技術分野において周知かつ一般的に使用されるものである。同様に、化学合成、化学分析、医薬製造、製剤、送達、および患者の処置のために従来技術を使用することができる。
一部の実施形態において、単離された核酸は、結合性タンパク質コーディング核酸配列の転写を指令するために異種プロモーターに作動可能に連結している。プロモーターは、核酸の転写を指令する核酸制御配列を指すことができる。第1の核酸配列が第2の核酸配列と機能的な関係性に置かれている場合に、第1の核酸配列は第2の核酸配列に作動可能に連結している。例えば、プロモーターがコーディング配列の転写または発現に影響する場合に、プロモーターは結合性タンパク質のコーディング配列に作動可能に連結している。プロモーターの例としては、ウイルス(例えばポリオーマウイルス、鶏痘ウイルス、アデノウイルス(例えばアデノウイルス2)、ウシパピローマウイルス、トリ肉腫ウイルス、サイトメガロウイルス、レトロウイルス、B型肝炎ウイルス、およびシミアンウイルス40(SV40)など)のゲノム、異種真核性プロモーター(例えばアクチンプロモーター、免疫グロブリンプロモーター、および熱ショックプロモーターなど)、CAG-プロモーター(Niwa et al.、Gene 108(2):193~9頁、1991)、ホスホグリセリン酸キナーゼ(PGK)-プロモーター、テトラサイクリン誘導性プロモーター(Masui et al.、Nucleic Acid Res.33:e43、2005)、lacシステム、trpシステム、tacシステム、trcシステム、ファージラムダの主要なオペレーターおよびプロモーター領域、3-ホスホグリセリン酸キナーゼのプロモーター、酵母酸ホスファターゼのプロモーター、ならびに酵母アルファ接合因子のプロモーターから得られるプロモーターを挙げることができるがこれらに限定されない。本開示の結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチドは、構成的プロモーター、誘導性プロモーター、または本明細書に記載の任意の他の好適なプロモーターまたは当業者により容易に認識される他の好適なプロモーターの制御下にあってもよい。
一部の実施形態において、単離された核酸はベクターに組み込まれる。一部の実施形態において、ベクターは発現ベクターである。発現ベクターは、発現されるべきポリヌクレオチドに作動可能に連結した1つまたはそれ以上の調節配列を含んでもよい。「調節配列」という用語は、プロモーター、エンハンサーおよび他の発現制御エレメント(例えば、ポリアデニル化シグナル)を含む。好適なエンハンサーの例としては、哺乳動物遺伝子(例えばグロビン、エラスターゼ、アルブミン、α-フェトプロテイン、インスリンなど)からのエンハンサー配列、ならびに真核細胞ウイルスからのエンハンサー配列(例えば複製起点の後期側(bp 100~270)のSV40エンハンサー、サイトメガロウイルス初期プロモーターエンハンサー、複製起点の後期側のポリオーマエンハンサー、アデノウイルスエンハンサーなど)を挙げることができるがこれらに限定されない。好適なベクターの例としては、例えば、プラスミド、コスミド、エピソーム、トランスポゾン、およびウイルスベクター(例えば、アデノウイルス、ワクシニアウイルス、シンドビスウイルス、麻疹、ヘルペスウイルス、レンチウイルス、レトロウイルス、アデノ随伴ウイルスベクターなど)を挙げることができる。発現ベクターを使用して、宿主細胞、例えば、細菌細胞、酵母細胞、昆虫細胞、および哺乳動物細胞などへのトランスフェクトを行うことができる。宿主における発現および複製が可能な生物学的に機能的なウイルスおよびプラスミドDNAベクターは当技術分野において公知であり、関心対象の任意の細胞へのトランスフェクトを行うために使用することができる。
宿主細胞
本開示の他の態様は、宿主細胞(例えば、単離された宿主細胞)であって、本明細書に記載の1つまたはそれ以上の単離されたポリヌクレオチド、ベクター、および/またはベクターシステムを含む、前記宿主細胞(例えば、単離された宿主細胞)に関する。一部の実施形態において、本開示の単離された宿主細胞はin vitroで培養される。一部の実施形態において、宿主細胞は細菌細胞(例えば、E. coli細胞)である。一部の実施形態において、宿主細胞は酵母細胞(例えば、S. cerevisiae細胞)である。一部の実施形態において、宿主細胞は昆虫細胞である。昆虫宿主細胞の例としては、例えば、Drosophila細胞(例えば、S2細胞)、Trichoplusia ni細胞(例えば、High Five(商標)細胞)、およびSpodoptera frugiperda細胞(例えば、Sf21またはSf9細胞)を挙げることができる。一部の実施形態において、宿主細胞は哺乳動物細胞である。哺乳動物宿主細胞の例としては、例えば、ヒト胎児腎臓細胞(例えば、293細胞または懸濁培養での増殖のためにサブクローニングされた293細胞)、Expi293(商標)細胞、CHO細胞、ベビーハムスター腎臓細胞(例えば、BHK、ATCC CCL 10)、マウスセルトリ細胞(例えば、TM4細胞)、サル腎臓細胞(例えば、CV1 ATCC CCL 70)、アフリカミドリザル腎臓細胞(例えば、VERO-76、ATCC CRL-1587)、ヒト子宮頸癌細胞(例えば、HELA、ATCC CCL 2)、イヌ腎臓細胞(例えば、MDCK、ATCC CCL 34)、バッファローラット肝細胞(例えば、BRL 3A、ATCC CRL 1442)、ヒト肺細胞(例えば、W138、ATCC CCL 75)、ヒト肝細胞(例えば、Hep G2、HB 8065)、マウス乳腺腫瘍細胞(例えば、MMT 060562、ATCC CCL51)、TRI細胞、MRC 5細胞、FS4細胞、ヒトヘパトーマ系(例えば、Hep G2)、ならびに骨髄腫細胞(例えば、NS0およびSp2/0細胞)を挙げることができる。
本開示の他の態様は、本明細書に記載の任意の結合性タンパク質を産生する方法に関する。一部の実施形態において、方法は、a)単離された核酸、ベクター、および/またはベクターシステム(例えば、本明細書に記載の任意の単離された核酸、ベクター、および/またはベクターシステム)を含む宿主細胞(例えば、本明細書に記載の任意の宿主細胞)を、宿主細胞が結合性タンパク質を発現するような条件下で培養すること;ならびにb)宿主細胞から結合性タンパク質を単離することを含む。タンパク質を発現させるための条件下で宿主細胞を培養する方法は当業者に周知である。培養された宿主細胞からタンパク質を単離する方法は当業者に周知であり、例えば、アフィニティークロマトグラフィー(例えば、プロテインAアフィニティークロマトグラフィー、続いてサイズ排除クロマトグラフィーを含む2工程アフィニティークロマトグラフィー)が挙げられる。
医薬組成物
結合性タンパク質を含む治療用または医薬組成物は本開示の範囲内である。そのような治療用または医薬組成物は、投与のモードとの好適性のために選択される薬学的または生理学的に許容される製剤化剤(formulation agent)との組合せで、治療有効量の結合性タンパク質、または結合性タンパク質-薬物コンジュゲートを含むことができる。
許容される製剤材料は、用いられる投薬量および濃度においてレシピエントに対して非毒性である。
医薬組成物は、例えば、組成物のpH、容量オスモル濃度、粘性、透明性、色、等張性、匂い、無菌状態、安定性、溶解もしくは放出の速度、吸着、または透過を改変、維持、または保存するための製剤材料を含有することができる。好適な製剤材料は、アミノ酸(例えばグリシン、グルタミン、アスパラギン、アルギニン、もしくはリジン)、抗微生物剤、抗酸化剤(例えばアスコルビン酸、亜硫酸ナトリウム、もしくは亜硫酸水素ナトリウム)、緩衝剤(例えばホウ酸、重炭酸、Tris-HCl、クエン酸、リン酸、もしくは他の有機酸)、増量剤(例えばマンニトールもしくはグリシン)、キレート剤(例えばエチレンジアミン四酢酸(EDTA))、錯化剤(例えばカフェイン、ポリビニルピロリドン、ベータ-シクロデキストリン、もしくはヒドロキシプロピル-ベータ-シクロデキストリン)、充填剤、単糖、二糖、および他の炭水化物(例えばグルコース、マンノース、もしくはデキストリン)、タンパク質(例えば血清アルブミン、ゼラチン、もしくは免疫グロブリン)、着色剤、香味剤および希釈剤、乳化剤、親水性ポリマー(例えばポリビニルピロリドン)、低分子量ポリペプチド、塩形成対イオン(例えばナトリウム)、防腐剤(例えば塩化ベンザルコニウム、安息香酸、サリチル酸、チメロサール、フェネチルアルコール、メチルパラベン、プロピルパラベン、クロルヘキシジン、ソルビン酸、もしくは過酸化水素)、溶媒(例えばグリセリン、プロピレングリコール、もしくはポリエチレングリコール)、糖アルコール(例えばマンニトールもしくはソルビトール)、懸濁化剤、界面活性剤もしくは湿潤剤(例えばpluronics;PEG;ソルビタンエステル;ポリソルベート、例えばポリソルベート20もしくはポリソルベート80;triton;トロメタミン;レシチン;コレステロールもしくはtyloxapol)、安定性増強剤(例えばスクロースもしくはソルビトール)、張度増強剤(例えばハロゲン化アルカリ金属、例えば塩化ナトリウムもしくはカリウム、もしくはマンニトール、ソルビトール)、送達媒体、希釈剤、賦形剤ならびに/または薬学的アジュバントを含むがこれらに限定されない(例えば、参照によって任意の目的のために本明細書に組み入れる、REMINGTON’S PHARMACEUTICAL SCIENCES(18th Ed.、A.R. Gennaro編、Mack Publishing Company 1990)、およびそれのその後の版を参照)。
最適な医薬組成物は、例えば、意図される投与の経路、送達フォーマット、および所望の投薬量に依存して、当業者により決定される。そのような組成物は、結合性タンパク質の物理的状態、安定性、in vivo放出の速度、およびin vivoクリアランスの速度に影響を及ぼすことができる。
医薬組成物中の主要な媒体または担体は、水性または非水性のいずれかの性質であることができる。例えば、注射用の好適な媒体または担体は、水、生理食塩水溶液、または人工脳脊髄液であることができ、これらは場合により、非経口投与用の組成物において一般的な他の材料を補足されている。中性緩衝化食塩水または血清アルブミンと混合された食塩水はさらなる例示的な媒体である。他の例示的な医薬組成物は、約pH 7.0~8.5のTris緩衝液、または約pH 4.0~5.5の酢酸緩衝液を含み、これらはソルビトールまたは好適な代用物をさらに含むことができる。本開示の1つの実施形態において、結合性タンパク質組成物は、所望の純度を有する選択された組成物を、凍結乾燥ケーキまたは水性溶液の形態の任意選択的な製剤化剤と混合することにより貯蔵のために製造することができる。さらに、結合性タンパク質は、適切な賦形剤、例えばスクロースを使用して凍結乾燥物として製剤化することができる。
本開示の医薬組成物は、非経口送達または皮下のために選択することができる。代替的に、組成物は、吸入のためまたは消化管を通じた、例えば経口的な送達のために選択することができる。そのような薬学的に許容される組成物の製造は当該技術分野の技術的範囲内である。
製剤成分は、投与の部位にとって許容される濃度で存在する。例えば、生理的pHまたはわずかにより低いpH、典型的には約5~約8のpH範囲内に組成物を維持するために緩衝剤が使用される。
非経口投与が企図される場合、使用のための治療用組成物は、薬学的に許容される媒体中に所望の結合性タンパク質を含む、発熱物質非含有の、非経口的に許容される、水性溶液の形態であり得る。非経口注射のための特に好適な媒体は無菌蒸留水であり、無菌蒸留水中で、結合性タンパク質は、適切に保存された無菌の等張溶液として製剤化される。さらに別の生成物は、デポー注射を介して送達することができる製造物の制御されたまたは持続した放出を提供する剤、例えば注射可能なマイクロスフェア、生体内分解性粒子、ポリマー化合物(例えばポリ乳酸もしくはポリグリコール酸)、ビーズ、またはリポソームを用いる所望の分子の製剤化を伴うことができる。ヒアルロン酸を使用することもでき、これは循環中の持続された持続期間を促進する効果を有することができる。所望の分子の導入のための他の好適な手段としては、埋め込み可能な薬物送達デバイスが挙げられる。
1つの実施形態において、医薬組成物は、吸入のために製剤化することができる。例えば、結合性タンパク質は、吸入用の乾燥粉末として製剤化することができる。結合性タンパク質吸入溶液はまた、エアロゾル送達用の噴射剤を用いて製剤化することができる。さらに別の実施形態において、溶液は噴霧することができる。
ある特定の製剤を経口的に投与できることも企図される。本開示の1つの実施形態において、この様式で投与される結合性タンパク質は、固体投薬形態、例えば錠剤およびカプセルの調合において慣習的に使用される担体を用いてまたは用いずに製剤化することができる。例えば、カプセルは、バイオアベイラビリティが最大化され、前全身性分解が最小化される胃腸管中の位置において製剤の活性部分を放出するように設計することができる。結合性タンパク質の吸収を促すために追加の剤を含めることができる。希釈剤、香味剤、低融点ワックス、植物油、滑沢剤、懸濁化剤、錠剤崩壊剤、および結合剤もまた用いることができる。
別の医薬組成物は、錠剤の製造のために好適な非毒性賦形剤との混合物中に有効量の結合性タンパク質を伴うことができる。無菌水、または別の適切な媒体中に錠剤を溶解させることにより、溶液を単位用量形態に製造することができる。好適な賦形剤としては、不活性希釈剤、例えば炭酸カルシウム、炭酸もしくは重炭酸ナトリウム、ラクトース、もしくはリン酸カルシウム;または結合剤、例えばデンプン、ゼラチン、もしくはアカシア;または潤滑剤、例えばステアリン酸マグネシウム、ステアリン酸、もしくはタルクが挙げられるがこれらに限定されない。
本開示の追加の医薬組成物は当業者に明らかであり、持続または制御送達製剤中に結合性タンパク質を伴う製剤が挙げられる。様々な他の持続または制御送達手段、例えばリポソーム担体、生体内分解性マイクロ粒子または多孔性ビーズおよびデポー注射を製剤化するための技術もまた当業者に公知である。持続放出製造物の追加の例としては、成形品、例えば、フィルム、またはマイクロカプセルの形態の半透性ポリマーマトリックスが挙げられる。持続放出マトリックスは、ポリエステル、ハイドロゲル、ポリラクチド、L-グルタミン酸およびガンマエチル-L-グルタメートのコポリマー、ポリ(2-ヒドロキシエチル-メタクリレート)、エチレン酢酸ビニル、またはポリ-D(-)-3-ヒドロキシ酪酸を含むことができる。持続放出組成物はまた、当技術分野において公知のいくつかの方法のいずれかにより製造することができるリポソームを含むことができる。
in vivo投与のために使用される医薬組成物は典型的には無菌でなければならない。これは、無菌濾過膜を通じた濾過により達成することができる。組成物が凍結乾燥される場合、この方法を使用する滅菌は、凍結乾燥および再構成の前、または後のいずれかに実行することができる。非経口投与用の組成物は、凍結乾燥形態で、または溶液中に貯蔵することができる。追加的に、非経口組成物は、一般に、無菌アクセスポートを有する容器、例えば、静脈内溶液バッグまたは皮下注射針により貫通可能なストッパーを有するバイアル中に入れられる。
医薬組成物が製剤化されると、それを無菌バイアル中に溶液、懸濁液、ゲル、エマルション、固体として、または脱水もしくは凍結乾燥粉末として貯蔵することができる。そのような製剤は、使用準備済み形態または投与の前に再構成を要求する形態(例えば、凍結乾燥された形態)のいずれかで貯蔵することができる。
本開示はまた、単回用量投与単位を生成するためのキットを包含する。キットはそれぞれ、乾燥タンパク質を有する第1の容器および水性製剤を有する第2の容器の両方を含有することができる。単一および複数チャンバー事前充填シリンジ(例えば、液体シリンジおよびリオシリンジ)を含有するキットもまた本開示の範囲内に含まれる。
治療的に用いられる結合性タンパク質医薬組成物の有効量は、例えば、治療的な文脈および目的に依存する。処置のための適切な投薬量レベルはそのため、送達される分子、結合性タンパク質が使用されている適応症、投与の経路、ならびに患者のサイズ(体重、身体表面、または臓器サイズ)および状態(年齢および全般的健康状態)に部分的に依存して変動することを当業者は理解する。よって、臨床医は、投薬量を滴定し、投与の経路を改変して最適な治療効果を得ることができる。
投薬頻度は、使用されている製剤中の結合性タンパク質の薬物動態パラメーターに依存する。典型的には、臨床医は、所望の効果を達成する投薬量に達するまで組成物を投与する。組成物はしたがって、単一の用量として、経時的に2つもしくはそれより多くの用量(同じ量の所望の分子を含有してもよいし、そうでなくてもよい)として、または埋め込みデバイスもしくはカテーテルを介して連続注入として、投与することができる。適切な投薬量のさらなる精密化は、当業者により日常的に為され、当業者により日常的に行われるタスクの範囲内である。適切な投薬量は、適切な用量応答データの使用を通じて確認することができる。
医薬組成物の投与の経路は公知の方法に従い、例えば、経口的に;注射を通じて静脈内、腹腔内、脳内(実質内)、脳室内、筋肉内、眼内、動脈内、門脈内、もしくは病巣内経路により;持続放出システムにより;または埋め込みデバイスにより為される。所望の場合、組成物は、ボーラス注射によりまたは注入により連続的に、または埋め込みデバイスにより投与することができる。
組成物はまた、所望の分子が吸収または被包された膜、スポンジ、または他の適切な材料の埋め込みを介して局所的に投与することができる。埋め込みデバイスが使用される場合、デバイスを任意の好適な組織または臓器に埋め込むことができ、所望の分子の送達を拡散、時限放出ボーラス、または連続的な投与を介して行うことができる。
医薬組成物を使用して、HIV感染症を予防および/または処置することができる。医薬組成物は、スタンドアロンの療法としてまたは標準的な抗レトロウイルス療法と組み合わせて使用することができる。
本開示はまた、キットであって、結合性タンパク質および生物学的試料中の標的抗原レベルを検出するために有用な他の試薬を含む、前記キットに関する。そのような試薬は、検出可能な標識、ブロッキング血清、陽性および陰性対照試料、ならびに検出試薬を含むことができる。一部の実施形態において、キットは、本明細書に記載の任意の結合性タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、ベクターシステム、および/または宿主細胞を含む組成物を含む。一部の実施形態において、キットは、容器および容器上のまたは容器に付随した標識またはパッケージ挿入物を含む。好適な容器としては、例えば、ボトル、バイアル、シリンジ、IV溶液バッグなどが挙げられる。容器は、様々な材料、例えばガラスまたはプラスチックから形成することができる。容器は、単独の、または状態(例えば、HIV感染症)を処置、予防および/もしくは診断するために有効な別の組成物と組み合わせた組成物を保持し、無菌アクセスポートを有してもよい(例えば、容器は、静脈内溶液バッグまたは皮下注射針により貫通可能なストッパーを有するバイアルであってもよい)。一部の実施形態において、標識またはパッケージ挿入物は、組成物は、選択された状態を予防、診断、および/または処置するために使用されることを指し示す。代替的に、または追加的に、製品またはキットは、薬学的に許容される緩衝液、例えば注射用静菌水(BWFI)、リン酸緩衝化食塩水、リンゲル溶液およびデキストロース溶液を含む第2(または第3の)容器をさらに含んでもよい。それは、他の緩衝剤、希釈剤、フィルター、針、およびシリンジを含めて、商業的およびユーザーの観点から望ましい他の材料をさらに含んでもよい。
方法および結合性タンパク質の使用
本開示のある特定の態様は、本明細書に開示される任意の結合性タンパク質または医薬組成物を使用して、患者においてHIV感染症を予防し、患者においてHIV感染症を処置し、患者においてAIDSを予防し、および患者においてAIDSを処置する方法に関する。本明細書に開示される任意の結合性タンパク質または医薬組成物は、本開示の方法、例えば、患者においてHIV感染症を予防し、患者においてHIV感染症を処置し、患者においてAIDSを予防し、および患者においてAIDSを処置する方法において用途を有し得る。
図1は、本明細書に記載の方法および使用において用いることができる三重特異性結合性タンパク質についての例示的かつ非限定的なフォーマットを図示する。図2に示されるように、図1に示される結合性タンパク質が患者においてHIVリザーバー細胞の排除を結果としてもたらし得る提案される機序は、(1)三重特異性結合性タンパク質の抗CD28および抗CD3アームを介する潜伏感染したCD4+ T細胞の活性化;(2)抗Envおよび抗CD3アームを介する活性化された潜伏感染したCD4+ T細胞へのCD8+ T細胞の動員;(3)抗CD28および抗CD3アームを介する係合したCD8+ T細胞の活性化;ならびに(4)パーフォリン/グランザイム機構を通じた潜伏感染したCD4+ T細胞の殺滅を伴う。有利には、この機序は、HIV-1リザーバー細胞を活性化させ、その後に殺滅して、患者においてHIV-1リザーバーを攻撃するための新規の戦略を提供すると考えられる。
一部の実施形態において、本開示の方法は、患者に治療有効量の本明細書に記載の結合性タンパク質または医薬組成物のうちの少なくとも1つを投与することを含む。
一部の実施形態において、少なくとも1つの結合性タンパク質は、抗レトロウイルス療法(例えば、抗HIV療法)と組み合わせて投与される。一部の実施形態において、少なくとも1つの結合性タンパク質は、抗レトロウイルス療法の前に投与される。一部の実施形態において、少なくとも1つの結合性タンパク質は、抗レトロウイルス療法と並行して投与される。一部の実施形態において、少なくとも1つの結合性タンパク質は、抗レトロウイルス療法の後に投与される。一部の実施形態において、少なくとも1つの結合性タンパク質は、当該技術分野において公知の任意の標準的な抗レトロウイルス療法と併用投与される。
一部の実施形態において、少なくとも1つの結合性タンパク質の投与または医薬組成物は、患者において1つまたはそれ以上の潜伏および/または慢性的HIV感染細胞の排除を結果としてもたらす。一部の実施形態において、少なくとも1つの結合性タンパク質の投与は、1つまたはそれ以上のHIVビリオンの中和を結果としてもたらし、患者において1つまたはそれ以上の潜伏および/または慢性的HIV感染細胞の排除を結果としてもたらす。一部の実施形態において、患者はヒトである。
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Claims (39)

  1. 1つまたはそれ以上のHIV標的タンパク質に特異的に結合する3つの抗原結合性部位を形成する4つのポリペプチド鎖を含む結合性タンパク質であって、第1のポリペプチド鎖は、式:
    L2-L-VL1-L-C [I]
    により表される構造を含み、
    第2のポリペプチド鎖は、式:
    H1-L-VH2-L-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [II]
    により表される構造を含み、
    第3のポリペプチド鎖は、式:
    H3-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [III]
    により表される構造を含み、
    第4のポリペプチド鎖は、式:
    L3-C [IV]
    により表される構造を含み、
    ここで、
    L1は第1の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
    L2は第2の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
    L3は第3の免疫グロブリン軽鎖可変ドメインであり;
    H1は第1の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
    H2は第2の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
    H3は第3の免疫グロブリン重鎖可変ドメインであり;
    は免疫グロブリン軽鎖定常ドメインであり;
    H1は免疫グロブリンCH1重鎖定常ドメインであり;
    H2は免疫グロブリンCH2重鎖定常ドメインであり;
    H3は免疫グロブリンCH3重鎖定常ドメインであり;
    ヒンジは、CH1およびCH2ドメインを接続する免疫グロブリンヒンジ領域であり;
    、L、LおよびLはアミノ酸リンカーであり;
    式Iのポリペプチドおよび式IIのポリペプチドはクロスオーバー軽鎖-重鎖ペアを形成し;
    H1およびVL1は第1の抗原結合性部位を形成し;
    H2およびVL2は、CD3ポリペプチドに結合する第2の抗原結合性部位を形成し、VH2ドメインは、GFTFTKAW(配列番号20)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、IKDKSNSYAT(配列番号21)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列、およびRGVYYALSPFDY(配列番号22)のアミノ酸配列を含むCDR-H3配列を含み、VL2ドメインは、QSLVHXNXTYであって、ここでXはEまたはQであり、XはAまたはLであり、XはQ、R、またはFである、QSLVHXNXTY(配列番号293)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、KVS(配列番号29)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびGQGTQYPFT(配列番号30)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含み;
    H3およびVL3は、HIV標的タンパク質に結合する第3の抗原結合性部位を形成する、
    前記結合性タンパク質。
  2. 第1の結合性部位はCD28ポリペプチドに結合する、請求項1に記載の結合性タンパク質。
  3. H1ドメインは、GYTFTSYY(配列番号31)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、IYPGNVNT(配列番号32)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列、およびTRSHYGLDWNFDV(配列番号33)のアミノ酸配列を含むCDR-H3配列を含み、VL1ドメインは、QNIYVW(配列番号34)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、KAS(配列番号35)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびQQGQTYPY(配列番号36)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む、請求項2に記載の結合性タンパク質。
  4. H1ドメインは
    QVQLVQSGAEVVKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGSIYPGNVNTNYAQKFQGRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYYCTRSHYGLDWNFDVWGKGTTVTVSS(配列番号59)のアミノ酸配列を含み、かつ/またはVL1ドメインは
    DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCQASQNIYVWLNWYQQKPGKAPKLLIYKASNLHTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDIATYYCQQGQTYPYTFGQGTKLEIK(配列番号60)のアミノ酸配列を含む、
    請求項3に記載の結合性タンパク質。
  5. L2ドメインのCDR-L1配列は、QSLVHQNAQTY(配列番号24)、QSLVHENLQTY(配列番号25)、QSLVHENLFTY(配列番号26)、およびQSLVHENLRTY(配列番号27)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項1~4のいずれか1項に記載の結合性タンパク質。
  6. H2ドメインは
    QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFTKAWMHWVRQAPGKQLEWVAQIKDKSNSYATYYADSVKGRFTISRDDSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCRGVYYALSPFDYWGQGTLVTVSS(配列番号52)のアミノ酸配列を含み、かつ/またはVL2ドメインは、
    DIVMTQTPLSLSVTPGQPASISCKSSQSLVHQNAQTYLSWYLQKPGQSPQSLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCGQGTQYPFTFGSGTKVEIK(配列番号54)、DIVMTQTPLSLSVTPGQPASISCKSSQSLVHENLQTYLSWYLQKPGQSPQSLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCGQGTQYPFTFGSGTKVEIK(配列番号55)、DIVMTQTPLSLSVTPGQPASISCKSSQSLVHENLFTYLSWYLQKPGQSPQSLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCGQGTQYPFTFGSGTKVEIK(配列番号56)、およびDIVMTQTPLSLSVTPGQPASISCKSSQSLVHENLRTYLSWYLQKPGQSPQSLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCGQGTQYPFTFGSGTKVEIK(配列番号57)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、
    請求項5に記載の結合性タンパク質。
  7. 第3の抗原結合性部位は、糖タンパク質120、糖タンパク質41および糖タンパク質160からなる群から選択されるHIV標的タンパク質に結合する、請求項1~6のいずれか1項に記載の結合性タンパク質。
  8. (a)VH3ドメインは、NCPIN(配列番号1)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、WMKPRHGAVSYARQLQG(配列番号2)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列、およびGKYCTARDYYNWDFEH(配列番号3)のアミノ酸配列を含むCDR-H3配列を含み、VL3ドメインは、RTSQYGSLA(配列番号4)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、SGSTRAA(配列番号5)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびQQYEF(配列番号6)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含み;
    (b)VH3ドメインは、GYTFTAHI(配列番号7)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、IKPQYGAV(配列番号8)もしくはIKPQYGAT(配列番号9)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列、およびDRSYGDSSWALDA(配列番号10)のアミノ酸配列を含むCDR-H3配列を含み、VL3ドメインは、QGVGSD(配列番号11)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、HTS(配列番号12)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびCQVLQF(配列番号13)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含み;または
    (c)VH3ドメインは、DCTLN(配列番号14)のアミノ酸配列を含むCDR-H1配列、WLKPRWGAVNYARPLQG(配列番号15)のアミノ酸配列を含むCDR-H2配列、およびGKNCDYNWDFEH(配列番号16)のアミノ酸配列を含むCDR-H3配列を含み、VL3ドメインは、RTSQYGSLA(配列番号17)のアミノ酸配列を含むCDR-L1配列、SGSTRAA(配列番号18)のアミノ酸配列を含むCDR-L2配列、およびQQYEF(配列番号19)のアミノ酸配列を含むCDR-L3配列を含む、
    請求項7に記載の結合性タンパク質。
  9. (a)VH3ドメインは
    QVRLSQSGGQMKKPGDSMRISCRASGYEFINCPINWIRLAPGKRPEWMGWMKPRHGAVSYARQLQGRVTMTRDMYSETAFLELRSLTSDDTAVYFCTRGKYCTARDYYNWDFEHWGQGTPVTVSS(配列番号43)のアミノ酸配列を含み、かつ/もしくはVL3ドメインはSLTQSPGTLSLSPGETAIISCRTSQYGSLAWYQQRPGQAPRLVIYSGSTRAAGIPDRFSGSRWGPDYNLTISNLESGDFGVYYCQQYEFFGQGTKVQVDIK(配列番号45)のアミノ酸配列を含み;
    (b)VH3ドメインは
    QVRLSQSGGQMKKPGDSMRISCRASGYEFINCPINWIRLAPGKRPEWMGWMKPRHGAVSYARQLQGRVTMTRQLSQDPDDPDWGTAFLELRSLTSDDTAVYFCTRGKYCTARDYYNWDFEHWGQGTPVTVSS(配列番号44)のアミノ酸配列を含み、かつ/もしくはVL3ドメインは、SLTQSPGTLSLSPGETAIISCRTSQYGSLAWYQQRPGQAPRLVIYSGSTRAAGIPDRFSGSRWGPDYNLTISNLESGDFGVYYCQQYEFFGQGTKVQVDIK(配列番号45)のアミノ酸配列を含み;
    (c)VH3ドメインは
    RAHLVQSGTAMKKPGASVRVSCQTSGYTFTAHILFWFRQAPGRGLEWVGWIKPQYGAVNFGGGFRDRVTLTRDVYREIAYMDIRGLKPDDTAVYYCARDRSYGDSSWALDAWGQGTTVVVSA(配列番号46)のアミノ酸配列を含み、かつ/もしくはVL3ドメインはYIHVTQSPSSLSVSIGDRVTINCQTSQGVGSDLHWYQHKPGRAPKLLIHHTSSVEDGVPSRFSGSGFHTSFNLTISDLQADDIATYYCQVLQFFGRGSRLHIK(配列番号49)のアミノ酸配列を含み;
    (d)VH3ドメインは
    RAHLVQSGTAMKKPGASVRVSCQTSGYTFTAHILFWFRQAPGRGLEWVGWIKPQYGATNFGGGFRDRVTLTRDVYREIAYMDIRGLKPDDTAVYYCARDRSYGDSSWALDAWGQGTTVVVSA(配列番号47)のアミノ酸配列を含み、かつ/もしくはVL3ドメインはYIHVTQSPSSLSVSIGDRVTINCQTSQGVGSDLHWYQHKPGRAPKLLIHHTSSVEDGVPSRFSGSGFHTSFNLTISDLQADDIATYYCQVLQFFGRGSRLHIK(配列番号49)のアミノ酸配列を含み;
    (e)VH3ドメインは
    RAHLVQSGTAMKKPGASVRVSCQTSGYTFTAHILFWFRQAPGRGLEWVGWIKPQYGAVNFGGGFRDRVTLTRQLSQDPDDPDWGIAYMDIRGLKPDDTAVYYCARDRSYGDSSWALDAWGQGTTVVVSA(配列番号48)のアミノ酸配列を含み、かつ/もしくはVL3ドメインはYIHVTQSPSSLSVSIGDRVTINCQTSQGVGSDLHWYQHKPGRAPKLLIHHTSSVEDGVPSRFSGSGFHTSFNLTISDLQADDIATYYCQVLQFFGRGSRLHIK(配列番号49)のアミノ酸配列を含み;または
    (f)VH3ドメインは
    QVQLVQSGGQMKKPGESMRISCRASGYEFIDCTLNWIRLAPGKRPEWMGWLKPRWGAVNYARPLQGRVTMTRQLSQDPDDPDWGTAFLELRSLTVDDTAVYFCTRGKNCDYNWDFEHWGRGTPVIVSS(配列番号50)のアミノ酸配列を含み、かつ/もしくはVL3ドメインはLTQSPGTLSLSPGETAIISCRTSQYGSLAWYQQRPGQAPRLVIYSGSTRAAGIPDRFSGSRWGPDYNLTISNLESGDFGVYYCQQYEFFGQGTKVQVDIK(配列番号51)のアミノ酸配列を含む、
    請求項8に記載の結合性タンパク質。
  10. 、L、LまたはLの少なくとも1つは独立して0アミノ酸の長さである、請求項1~9のいずれか1項に記載の結合性タンパク質。
  11. (a)L、L、LおよびLはそれぞれ独立して、0アミノ酸の長さであり、もしくはGGGGSGGGGS(配列番号40)、GGGGSGGGGSGGGGS(配列番号41)、S、RT、TKGPS配列番号39)、GQPKAAP(配列番号38)、およびGGSGSSGSGG(配列番号42)からなる群から選択される配列を含み;または(b)L、L、LおよびLはそれぞれ独立して、GGGGSGGGGS(配列番号40)、GGGGSGGGGSGGGGS(配列番号41)、S、RT、TKGPS(配列番号39)、GQPKAAP(配列番号38)、およびGGSGSSGSGG(配列番号42)からなる群から選択される配列を含む、請求項1~9のいずれか1項に記載の結合性タンパク質。
  12. は配列GQPKAAP(配列番号38)を含み、Lは配列TKGPS配列番号39)を含み、Lは配列Sを含み、Lは配列RTを含む、請求項1~9のいずれか1項に記載の結合性タンパク質。
  13. 、L、LまたはLの少なくとも1つは配列DKTHT(配列番号37)を含む、請求項1~9のいずれか1項に記載の結合性タンパク質。
  14. 、L、LおよびLは配列DKTHT(配列番号37)を含む、請求項13に記載の結合性タンパク質。
  15. 第2および第3のポリペプチド鎖のヒンジ-CH2-CH3ドメインはヒトIgG4ヒンジ-CH2-CH3ドメインであり、ヒンジ-CH2-CH3ドメインはそれぞれ、EUインデックスに従ってヒトIgG4の234および235位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換はF234AおよびL235Aである、請求項1~14のいずれか1項に記載の結合性タンパク質。
  16. 第2および第3のポリペプチド鎖のヒンジ-CH2-CH3ドメインはヒトIgG4ヒンジ-CH2-CH3ドメインであり、ヒンジ-CH2-CH3ドメインはそれぞれ、EUインデックスに従ってヒトIgG4の233~236位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、E233P、F234V、L235A、および236における欠失である、請求項1~14のいずれか1項に記載の結合性タンパク質。
  17. 第2および第3のポリペプチド鎖のヒンジ-CH2-CH3ドメインはヒトIgG4ヒンジ-CH2-CH3ドメインであり、ヒンジ-CH2-CH3ドメインはそれぞれ、EUインデックスに従ってヒトIgG4の228および409位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換はS228PおよびR409Kである、請求項1~16のいずれか1項に記載の結合性タンパク質。
  18. 第2および第3のポリペプチド鎖のヒンジ-CH2-CH3ドメインはヒトIgG1ヒンジ-CH2-CH3ドメインであり、ヒンジ-CH2-CH3ドメインはそれぞれ、EUインデックスに従ってヒトIgG1の234、235、および329位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、L234A、L235A、およびP329Aである、請求項1~14のいずれか1項に記載の結合性タンパク質。
  19. 第2および第3のポリペプチド鎖のヒンジ-CH2-CH3ドメインはヒトIgG1ヒンジ-CH2-CH3ドメインであり、ヒンジ-CH2-CH3ドメインはそれぞれ、EUインデックスに従ってヒトIgG1の298、299、および300位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、S298N、T299A、およびY300Sである、請求項1~14のいずれか1項に記載の結合性タンパク質。
  20. 第2のポリペプチド鎖のヒンジ-CH2-CH3ドメインは、EUインデックスに従ってヒトIgG1またはIgG4の349、366、368、および407位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vであり;第3のポリペプチド鎖のヒンジ-CH2-CH3ドメインは、EUインデックスに従ってヒトIgG1またはIgG4の354および366位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換はS354CおよびT366Wである、請求項1~19のいずれか1項に記載の結合性タンパク質。
  21. 第2のポリペプチド鎖のヒンジ-CH2-CH3ドメインは、EUインデックスに従ってヒトIgG1またはIgG4の354および366位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換はS354CおよびT366Wであり;第3のポリペプチド鎖のヒンジ-CH2-CH3ドメインは、EUインデックスに従ってヒトIgG1またはIgG4の349、366、368、および407位に対応する位置におけるアミノ酸置換を含み、アミノ酸置換は、Y349C、T366S、L368A、およびY407Vである、請求項1~19のいずれか1項に記載の結合性タンパク質。
  22. (a)第1のポリペプチド鎖は、配列番号61のアミノ酸配列もしくは配列番号61のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号62のアミノ酸配列もしくは配列番号62のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号63のアミノ酸配列もしくは配列番号63のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号64のアミノ酸配列もしくは配列番号64のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;
    (b)第1のポリペプチド鎖は、配列番号65のアミノ酸配列もしくは配列番号65のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号66のアミノ酸配列もしくは配列番号66のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号67のアミノ酸配列もしくは配列番号67のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号68のアミノ酸配列もしくは配列番号68のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;
    (c)第1のポリペプチド鎖は、配列番号69のアミノ酸配列もしくは配列番号69のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号70のアミノ酸配列もしくは配列番号70のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号71のアミノ酸配列もしくは配列番号71のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号72のアミノ酸配列もしくは配列番号72のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;
    (d)第1のポリペプチド鎖は、配列番号73のアミノ酸配列もしくは配列番号73のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号74のアミノ酸配列もしくは配列番号74のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号75のアミノ酸配列もしくは配列番号75のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号76のアミノ酸配列もしくは配列番号76のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;
    (e)第1のポリペプチド鎖は、配列番号77のアミノ酸配列もしくは配列番号77のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号78のアミノ酸配列もしくは配列番号78のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号79のアミノ酸配列もしくは配列番号79のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号80のアミノ酸配列もしくは配列番号80のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;
    (f)第1のポリペプチド鎖は、配列番号81のアミノ酸配列もしくは配列番号81のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号82のアミノ酸配列もしくは配列番号82のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号83のアミノ酸配列もしくは配列番号83のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号84のアミノ酸配列もしくは配列番号84のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;
    (g)第1のポリペプチド鎖は、配列番号85のアミノ酸配列もしくは配列番号85のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号86のアミノ酸配列もしくは配列番号86のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号87のアミノ酸配列もしくは配列番号87のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号88のアミノ酸配列もしくは配列番号88のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;
    (h)第1のポリペプチド鎖は、配列番号89のアミノ酸配列もしくは配列番号89のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号90のアミノ酸配列もしくは配列番号90のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号91のアミノ酸配列もしくは配列番号91のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号92のアミノ酸配列もしくは配列番号92のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;
    (i)第1のポリペプチド鎖は、配列番号93のアミノ酸配列もしくは配列番号93のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号94のアミノ酸配列もしくは配列番号94のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号95のアミノ酸配列もしくは配列番号95のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号96のアミノ酸配列もしくは配列番号96のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;
    (j)第1のポリペプチド鎖は、配列番号97のアミノ酸配列もしくは配列番号97のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号98のアミノ酸配列もしくは配列番号98のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号99のアミノ酸配列もしくは配列番号99のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号100のアミノ酸配列もしくは配列番号100のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;
    (k)第1のポリペプチド鎖は、配列番号101のアミノ酸配列もしくは配列番号101のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号102のアミノ酸配列もしくは配列番号102のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号103のアミノ酸配列もしくは配列番号103のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号104のアミノ酸配列もしくは配列番号104のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;
    (l)第1のポリペプチド鎖は、配列番号105のアミノ酸配列もしくは配列番号105のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号106のアミノ酸配列もしくは配列番号106のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号107のアミノ酸配列もしくは配列番号107のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号108のアミノ酸配列もしくは配列番号108のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;
    (m)第1のポリペプチド鎖は、配列番号109のアミノ酸配列もしくは配列番号109のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号110のアミノ酸配列もしくは配列番号110のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号111のアミノ酸配列もしくは配列番号111のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号112のアミノ酸配列もしくは配列番号112のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;
    (n)第1のポリペプチド鎖は、配列番号113のアミノ酸配列もしくは配列番号113のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号114のアミノ酸配列もしくは配列番号114のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号115のアミノ酸配列もしくは配列番号115のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号116のアミノ酸配列もしくは配列番号116のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;
    (o)第1のポリペプチド鎖は、配列番号117のアミノ酸配列もしくは配列番号117のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号118のアミノ酸配列もしくは配列番号118のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号119のアミノ酸配列もしくは配列番号119のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号120のアミノ酸配列もしくは配列番号120のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;
    (p)第1のポリペプチド鎖は、配列番号121のアミノ酸配列もしくは配列番号121のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号122のアミノ酸配列もしくは配列番号122のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号123のアミノ酸配列もしくは配列番号123のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号124のアミノ酸配列もしくは配列番号124のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;
    (q)第1のポリペプチド鎖は、配列番号129のアミノ酸配列もしくは配列番号129のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号130のアミノ酸配列もしくは配列番号130のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号131のアミノ酸配列もしくは配列番号131のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号132のアミノ酸配列もしくは配列番号132のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;
    (r)第1のポリペプチド鎖は、配列番号133のアミノ酸配列もしくは配列番号133のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号134のアミノ酸配列もしくは配列番号134のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号135のアミノ酸配列もしくは配列番号135のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号136のアミノ酸配列もしくは配列番号136のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;
    (s)第1のポリペプチド鎖は、配列番号137のアミノ酸配列もしくは配列番号137のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号138のアミノ酸配列もしくは配列番号138のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号139のアミノ酸配列もしくは配列番号139のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号140のアミノ酸配列もしくは配列番号140のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;
    (t)第1のポリペプチド鎖は、配列番号141のアミノ酸配列もしくは配列番号141のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号142のアミノ酸配列もしくは配列番号142のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号143のアミノ酸配列もしくは配列番号143のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号144のアミノ酸配列もしくは配列番号144のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;
    (u)第1のポリペプチド鎖は、配列番号145のアミノ酸配列もしくは配列番号145のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号146のアミノ酸配列もしくは配列番号146のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号147のアミノ酸配列もしくは配列番号147のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号148のアミノ酸配列もしくは配列番号148のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;
    (v)第1のポリペプチド鎖は、配列番号149のアミノ酸配列もしくは配列番号149のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号150のアミノ酸配列もしくは配列番号150のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号151のアミノ酸配列もしくは配列番号151のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号152のアミノ酸配列もしくは配列番号152のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;
    (x)第1のポリペプチド鎖は、配列番号153のアミノ酸配列もしくは配列番号153のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号154のアミノ酸配列もしくは配列番号154のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号155のアミノ酸配列もしくは配列番号155のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号156のアミノ酸配列もしくは配列番号156のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;
    (y)第1のポリペプチド鎖は、配列番号157のアミノ酸配列もしくは配列番号157のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号158のアミノ酸配列もしくは配列番号158のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号159のアミノ酸配列もしくは配列番号159のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号160のアミノ酸配列もしくは配列番号160のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;
    (z)第1のポリペプチド鎖は、配列番号161のアミノ酸配列もしくは配列番号161のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号162のアミノ酸配列もしくは配列番号162のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号163のアミノ酸配列もしくは配列番号163のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号164のアミノ酸配列もしくは配列番号164のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;
    (aa)第1のポリペプチド鎖は、配列番号165のアミノ酸配列もしくは配列番号165のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号166のアミノ酸配列もしくは配列番号166のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号167のアミノ酸配列もしくは配列番号167のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号168のアミノ酸配列もしくは配列番号168のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;
    (bb)第1のポリペプチド鎖は、配列番号169のアミノ酸配列もしくは配列番号169のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号170のアミノ酸配列もしくは配列番号170のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号171のアミノ酸配列もしくは配列番号171のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号172のアミノ酸配列もしくは配列番号172のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;または
    (cc)第1のポリペプチド鎖は、配列番号173のアミノ酸配列もしくは配列番号173のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第2のポリペプチド鎖は、配列番号174のアミノ酸配列もしくは配列番号174のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第3のポリペプチド鎖は、配列番号175のアミノ酸配列もしくは配列番号175のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含み;第4のポリペプチド鎖は、配列番号176のアミノ酸配列もしくは配列番号176のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む、
    請求項1に記載の結合性タンパク質。
  23. 請求項1~22のいずれか1項に記載の結合性タンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子。
  24. 請求項23に記載の核酸分子を含む、発現ベクター。
  25. 請求項23に記載の核酸分子または請求項24に記載の発現ベクターを含む、単離された宿主細胞。
  26. 哺乳動物または昆虫細胞である、請求項25に記載の単離された宿主細胞。
  27. 請求項1~22のいずれか1項に記載の結合性タンパク質および薬学的に許容される担体を含む、医薬組成物。
  28. 患者においてHIV感染を予防および/または処置する方法であって、患者に治療有効量の少なくとも1つの請求項1~22のいずれか1項に記載の結合性タンパク質または請求項27に記載の医薬組成物を投与することを含む、前記方法。
  29. 結合性タンパク質は標準的な抗レトロウイルス療法と併用投与される、請求項28に記載の方法。
  30. 少なくとも1つの結合性タンパク質の投与は、患者において1つまたはそれ以上の潜伏および/または慢性的HIV感染細胞の排除を結果としてもたらす、請求項28または請求項29に記載の方法。
  31. 患者はヒトである、請求項28~30のいずれか1項に記載の方法。
  32. 患者におけるHIV感染症の予防および/または処置のための、請求項1~22のいずれか1項に記載の結合性タンパク質または請求項27に記載の医薬組成物。
  33. 結合性タンパク質は標準的な抗レトロウイルス療法と併用投与される、請求項32に記載の使用のための結合性タンパク質。
  34. 結合性タンパク質は、患者において1つまたはそれ以上の潜伏および/または慢性的HIV感染細胞の排除を引き起こす、請求項32または請求項33に記載の使用のための結合性タンパク質。
  35. 患者はヒトである、請求項32~34のいずれか1項に記載の使用のための結合性タンパク質。
  36. 請求項1~22のいずれか1項に記載の結合性タンパク質の第1、第2、第3、および第4のポリペプチド鎖をコードする1つまたはそれ以上のベクターを含む、ベクターシステム。
  37. 結合性タンパク質の第1のポリペプチド鎖をコードする第1のベクター、該結合性タンパク質の第2のポリペプチド鎖をコードする第2のベクター、該結合性タンパク質の第3のポリペプチド鎖をコードする第3のベクター、および該結合性タンパク質の第4のポリペプチド鎖をコードする第4のベクターを含む、請求項36に記載のベクターシステム。
  38. ポリヌクレオチドのキットであって、
    (a)配列番号177のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号178のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号179のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号180のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;
    (b)配列番号181のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号182のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号183のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号184のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;
    (c)配列番号185のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号186のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号187のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号188のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;
    (d)配列番号189のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号190のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号191のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号192のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;
    (e)配列番号193のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号194のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号195のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号196のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;
    (f)配列番号197のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号198のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号199のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号200のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;
    (g)配列番号201のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号202のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号203のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号204のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;
    (h)配列番号205のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号206のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号207のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号208のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;
    (i)配列番号209のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号210のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号211のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号212のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;
    (j)配列番号213のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号214のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号215のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号216のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;
    (k)配列番号217のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号218のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号219のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号220のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;
    (l)配列番号221のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号222のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号223のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号224のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;
    (m)配列番号225のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号226のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号227のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号228のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;
    (n)配列番号229のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号230のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号231のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号232のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;
    (o)配列番号233のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号234のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号235のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号236のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;
    (p)配列番号237のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号238のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号239のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号240のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;
    (q)配列番号241のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号242のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号243のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号244のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;
    (r)配列番号245のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号246のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号247のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号248のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;
    (s)配列番号249のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号250のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号251のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号252のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;
    (t)配列番号253のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号254のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号255のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号256のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;
    (u)配列番号257のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号258のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号259のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号260のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;
    (v)配列番号261のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号262のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号263のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号264のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;
    (w)配列番号265のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号266のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号267のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号268のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;
    (x)配列番号269のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号270のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号271のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号272のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;
    (y)配列番号273のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号274のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号275のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号276のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;
    (z)配列番号277のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号278のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号279のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号280のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;
    (aa)配列番号281のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号282のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号283のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号284のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;
    (bb)配列番号285のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号286のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号287のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号288のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド;または
    (cc)配列番号289のポリヌクレオチド配列を含む第1のポリヌクレオチド、配列番号290のポリヌクレオチド配列を含む第2のポリヌクレオチド、配列番号291のポリヌクレオチド配列を含む第3のポリヌクレオチド、および配列番号292のポリヌクレオチド配列を含む第4のポリヌクレオチド
    を含む、前記キット。
  39. 第1、第2、第3、および第4のポリヌクレオチドは1つまたはそれ以上の発現ベクター上に存在する、請求項38に記載のキット。
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