JP2022516389A - 血液悪性腫瘍を治療するためのゲノム編集インバリアントナチュラルキラーT(iNKT)細胞 - Google Patents

血液悪性腫瘍を治療するためのゲノム編集インバリアントナチュラルキラーT(iNKT)細胞 Download PDF

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Abstract

本明細書では、ゲノム編集インバリアントナチュラルキラーT(iNKT)細胞、及びそれらを使用して免疫療法を行うための方法を開示する。とりわけ、本開示は、遺伝子改変キメラ抗原受容体(CAR)保有iNKT細胞(CAR-iNKT)、及びがんの治療におけるその使用方法に関する。【選択図】図1

Description

本出願は、2018年5月31日に出願された米国仮出願第62/678,883号の優先権の利益を主張するものであり、その開示は、その全体が本明細書に記載されるかのように、参照により本明細書に組み込まれる。
本明細書では、ゲノム編集インバリアントナチュラルキラーT(iNKT)細胞、及びそれらを使用して免疫療法を行うための方法を開示する。とりわけ、本開示は、遺伝子改変キメラ抗原受容体(CAR)保有iNKT細胞(CAR-iNKT)、及びがんの治療におけるその使用方法に関する。
キメラ抗原受容体T細胞(CAR-T)免疫療法は、ますます広く知られるようになっている。T細胞は、抗原認識部分及びT細胞活性化ドメインで構成される融合タンパク質であるキメラ抗原受容体(CAR)を発現するように、遺伝的に修飾されている。CARは、がん細胞上に過剰発現した抗原を認識するように設計されている。CAR-Tは、B細胞悪性腫瘍に対する優れた臨床効果を示しており、2種の治療薬、キムリア(商標)(チサゲンレクロイセル、Novartis)及びイエスカルタ(商標)(アキシカブタゲンシロロイセル、Kite/Gilead)は、最近FDAにより承認された。しかしながら、CAR-T療法の広い応用範囲は、2つの点で限定されている。第1に、T細胞悪性腫瘍に対するCAR-T細胞治療薬の開発には、CAR-T細胞上における標的抗原の発現が、CAR-T細胞の同胞殺し及び有効性の低下を誘導し得ることから、悪性T細胞とエフェクターT細胞の間における標的抗原の共通発現を一因とする未解決問題があることが判明している。第2に、CAR-T療法において、個々の患者自身のT細胞(同種異系)以外のT細胞を使用すると、移植片対宿主病を含む同種異系反応が引き起こされる場合がある。
インバリアントナチュラルキラーT細胞(iNKT細胞またはI型NKT細胞とも呼ばれる)とは、インバリアントT細胞受容体α鎖及び特定TCRβ鎖(Vβ11と結合したVα24-Jα18)の発現を特徴とする、独特なリンパ球集団のことを意味する。iNKT TCR介在性応答は、非多型CD1抗原を提示するタンパク質ファミリーのメンバーであり、内在性脂質抗原及び病原体由来脂質抗原のTCRへの提示を促進するCD1dによって制限されている。インバリアント受容体のプロトタイプリガンドは、α-ガラクトシルセラミド(αGalCer)である。インバリアントTCRがCD1d-αGalCerに結合すると、iNKTが増殖する。CD1d遺伝子は、単型であり、ほんのわずかの細胞型のみが発現しているため、自家または同種異系環境におけるNKT細胞の潜在的な毒性は限定的なものである。
1種または複数種の標的、例えば、CD7を標的とするゲノム編集CAR-iNKT細胞を作製するための方法を示す。 2種の標的、ここでは、CD7及びCD2を標的とするゲノム編集タンデムCAR-iNKT細胞を作製するための方法を示す。 CD7を標的とするゲノム編集CAR-iNKT細胞を作製するための方法を示す。 「A」と呼ばれる別の標的を標的とするゲノム編集CAR-iNKT細胞を作製するための方法を示す。 CD7及びCD2を標的とするゲノム編集タンデムCAR-iNKT細胞を作製するための方法を示す。 「A」及び「B」と呼ばれる2種のその他の標的を標的とするゲノム編集デュアルCAR-iNKT細胞を作製するための方法を示す。 遺伝子編集iNKT細胞を調製して注入することによりがん(例えば、T細胞悪性腫瘍)を治療するための方法のフローチャートを示す。 in vitro及びin vivoにおいて腫瘍細胞を効果的に殺傷するCAR-iNKT。Aは、CAR19及びCAR-BCMAを有するiNKTの形質導入効率を示す。Bは、CAR19及びCAR-BCMAが、4時間のCr放出アッセイにおいて、抗原陽性標的細胞(Ramos)を特異的に殺傷することを示す。Cは、iNKT-BCMAが、in vivoにおいてMM1.s細胞を効果的に殺傷することを示す。Dは、iNKT-BCMAが、多発性骨髄腫の異種MM1.sマウスモデルにおいて、マウスの生存を延長することを示す。 CAR2-iNKT細胞が、CD2T-ALL細胞株及びCD2CTCL細胞株をin vitroで効果的に殺傷することを示す。
以下の開示は、遺伝子改変iNKT細胞、例えば、ゲノム編集iNKT細胞、CAR-iNKT細胞、デュアルCAR iNKT細胞、及びタンデムCAR-iNKT細胞の実施形態、選択肢、及び使用、ならびに、例えば、疾患を治療するための、免疫療法及び養子細胞移入におけるこのような細胞の使用を詳述する。それゆえ、本明細書では以下の実施形態を提供する。
実施形態1.ゲノム編集iNKT細胞。
実施形態2.前記ゲノム編集iNKT細胞は、凍結させることなく少なくとも3週間にわたり維持または増殖させることが可能な、複数のドナーに由来する、実施形態1に記載のゲノム編集iNKT細胞の集団。
実施形態3.1種または複数種の抗原を標的とする少なくとも1つのキメラ抗原受容体(CAR)を含み、前記CARが特異的に結合する抗原を欠損している、実施形態1に記載のiNKT細胞。
実施形態4.前記キメラ抗原受容体は、悪性T細胞上に発現した少なくとも1種の抗原に特異的に結合する、実施形態1から実施形態3のいずれか1つに記載のiNKT細胞。
実施形態5.前記抗原は、CD2、CD3ε、CD4、CD5、CD7、TRAC、及びTCRβ、から選択される、実施形態1から実施形態4のいずれか1つに記載のiNKT細胞。
実施形態6.前記キメラ抗原受容体は、悪性形質細胞上に発現した少なくとも1種の抗原に特異的に結合する、実施形態1から実施形態5のいずれか1つに記載のiNKT細胞。
実施形態7.前記抗原は、BCMA、CS1、CD38、及びCD19、から選択される、実施形態1から実施形態6のいずれか1つに記載のiNKT細胞。
実施形態8.前記キメラ抗原受容体は、BCMAとTACIの両方を効果的に共標的とする、BCMA及びTACIに対するリガンドである、APRILタンパク質の細胞外部分を発現する、実施形態1から実施形態7のいずれか1つに記載のiNKT細胞。
実施形態9.前記CAR-T細胞は自殺遺伝子を更に含む、実施形態1から実施形態8のいずれか1つに記載のiNKT細胞。
実施形態10.内在性T細胞受容体介在性シグナル伝達は、前記iNKT細胞内においてごくわずかである、実施形態1から実施形態9のいずれか1つに記載のiNKT細胞。
実施形態11.アロ反応性または移植片対宿主病を誘導しない、実施形態1から実施形態10のいずれか1つに記載のiNKT細胞。
実施形態12.同胞殺しを誘導しない、実施形態1から実施形態11のいずれか1つに記載のiNKT細胞。
実施形態13.前記キメラ抗原受容体(複数可)は、悪性B細胞上に発現した少なくとも1種の抗原に特異的に結合する、実施形態1から実施形態12のいずれか1つに記載のiNKT細胞。
実施形態14.悪性B細胞上に発現した前記抗原は、CD19、CD20、CD21、CD22、CD23、CD24、CD25、CD27、CD38、及びCD45、から選択される、実施形態13に記載のiNKT細胞。
実施形態15.悪性B細胞上に発現した前記抗原は、CD19及びCD20から選択される、実施形態14に記載のiNKT細胞。
実施形態16.デュアルiNKT-CAR細胞である、実施形態1から実施形態15のいずれか1つに記載のiNKT細胞。
実施形態17.それぞれが異なるT細胞抗原を標的とする2つまたはそれ以上のCARを含む、実施形態16に記載のデュアルiNKT-CAR細胞。
実施形態18.前記異なるT細胞抗原は、CD2xCD3ε、CD2xCD4、CD2xCD5、CD2xCD7、CD3εxCD4、CD3εxCD5、CD3εxCD7、CD4xCD5、CD4xCD7、CD5xCD7、TRACxCD2、TRACxCD3ε、TRACxCD4、TRACxCD5、TRACxCD7、TCRβxCD2、TCRβxCD3ε、TCRβxCD4、TCRβxCD5、TCRβxCD7、BCMAxCS1、BCMAxCD19、BCMAxCD38、CS1xCD19、CS1xCD38、CD19xCD38、APRILxCS1、APRILxBCMA、APRILxCD19、及びAPRILxCD38、から選択される、実施形態16及び実施形態17に記載のデュアルiNKT-CAR細胞。
実施形態19.それぞれのV鎖及びV鎖は、CD5、CD7、CD2、CD4、及びCD3、から選択される異なる抗原を認識するscFvに由来する、実施形態16から実施形態18に記載のデュアルiNKT-CAR細胞。
実施形態20.それぞれのV鎖及びV鎖は、異なり、配列番号:12~配列番号:31から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を示す、実施形態16から実施形態19に記載のデュアルiNKT-CAR細胞。
実施形態21.それぞれのV鎖及びV鎖は、異なり、配列番号:12~配列番号:31から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも98%の配列同一性を示す、実施形態16及び実施形態20に記載のデュアルiNKT-CAR細胞。
実施形態22.それぞれのV鎖及びV鎖は、異なり、配列番号:12~配列番号:31から選択される配列である、実施形態16及び実施形態21に記載のデュアルiNKT-CAR細胞。
実施形態23.CD28及び4-1BBから選択される少なくとも1種の共刺激ドメインを含む、実施形態16及び実施形態22に記載のデュアルiNKT-CAR細胞。
実施形態24.前記共刺激ドメインはCD28である、実施形態16及び実施形態23に記載のデュアルiNKT-CAR細胞。
実施形態25.CD3ζシグナル伝達ドメインを含む、実施形態16及び実施形態24に記載のデュアルiNKT-CAR細胞。
実施形態26.前記それぞれのV鎖及びV鎖は、CD2を認識するscFvまたはCD3を認識するscFvに由来する、実施形態16及び実施形態25に記載のデュアルiNKT-CAR細胞。
実施形態27.2種またはそれ以上のT細胞抗原を標的とする1つのCARを含む、実施形態1から実施形態15に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
実施形態28.前記抗原対は、CD2xCD3ε、CD2xCD4、CD2xCD5、CD2xCD7、CD3εxCD4、CD3εxCD5、CD3εxCD7、CD4xCD5、CD4xCD7、CD5xCD7、TRACxCD2、TRACxCD3ε、TRACxCD4、TRACxCD5、TRACxCD7、TCRβxCD2、TCRβxCD3ε、TCRβxCD4、TCRβxCD5、TCRβxCD7、BCMAxCS1、BCMAxCD19、BCMAxCD38、CS1xCD19、CS1xCD38、CD19xCD38、APRILxCS1、APRILxBCMA、APRILxCD19、及びAPRILxCD38、から選択される、実施形態27に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
実施形態29.前記直鎖状tCAR構築物は、V1及びV1と呼ばれる第1の重(V)鎖可変フラグメント及び第1の軽(V)鎖可変フラグメント、ならびに、V2及びV2と呼ばれる第2の軽(V)鎖可変フラグメント及び第1の重(V)鎖可変フラグメント、を含み、前記第1の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第1の軽(V)鎖可変フラグメントは、(GGGGS)2~6リンカーにより、前記第2の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第1の重(V)鎖可変フラグメントと連結している、実施形態27及び実施形態28に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
実施形態30.前記直鎖状tCAR構築物は、V2及びV2と呼ばれる第1の重(V)鎖可変フラグメント及び第1の軽(V)鎖可変フラグメント、ならびに、V1及びV1と呼ばれる第2の軽(V)鎖可変フラグメント及び第1の重(V)鎖可変フラグメント、を含み、前記第1の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第1の軽(V)鎖可変フラグメントは、(GGGGS)2~6リンカーにより、前記第2の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第1の重(V)鎖可変フラグメントと連結している、実施形態27から実施形態29に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
実施形態31.前記直鎖状tCAR構築物は、V1及びV1と呼ばれる第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び第1の重(V)鎖可変フラグメント、ならびに、V2及びV2と呼ばれる第2の重(V)鎖可変フラグメント及び第1の軽(V)鎖可変フラグメント、を含み、前記第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第1の重(V)鎖可変フラグメントは、(GGGGS)2~6リンカーにより、前記第2の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第1の軽(V)鎖可変フラグメントと連結している、実施形態27及び実施形態30に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
実施形態32.前記直鎖状tCAR構築物は、V2及びV2と呼ばれる第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び第1の重(V)鎖可変フラグメント、ならびに、V1及びV1と呼ばれる第2の重(V)鎖可変フラグメント及び第1の軽(V)鎖可変フラグメント、を含み、前記第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第1の重(V)鎖可変フラグメントは、(GGGGS)2~6リンカーにより、前記第2の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第1の軽(V)鎖可変フラグメントと連結している、実施形態27及び実施形態31に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
実施形態33.前記直鎖状tCAR構築物は、6-I~6-XXXIIから選択される構造物を含む、実施形態27及び実施形態32に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
実施形態34.前記CAR構築物はヘアピンtCAR構築物である、実施形態27及び実施形態33に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
実施形態35.前記ヘアピンtCAR構築物は、V1及びV2と呼ばれる、第1のscFvに由来する第1の重(V)鎖可変フラグメント及び第2のscFvに由来する第2の重(V)鎖可変フラグメント、ならびに、V2及びV2と呼ばれる、前記第2のscFvに由来する第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第1のscFvに由来する第2の軽(V)鎖可変フラグメントを含み、前記第1のscFvに由来する前記第1の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する前記第2の重(V)鎖可変フラグメントは、(GGGGS)2~6リンカーにより、前記第2のscFvに由来する前記第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第1のscFvに由来する前記第2の軽(V)鎖可変フラグメントと連結している、実施形態27及び実施形態34に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
実施形態36.前記ヘアピンtCAR構築物は、V2及びV1と呼ばれる、第2のscFvに由来する第2の重(V)鎖可変フラグメント及び第1のscFvに由来する第1の重(V)鎖可変フラグメント、ならびに、V1及びV2と呼ばれる、前記第1のscFvに由来する第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する第2の軽(V)鎖可変フラグメントを含み、前記第2のscFvに由来する前記第2の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第1のscFvに由来する前記第1の重(V)鎖可変フラグメントは、(GGGGS)2~6リンカーにより、前記第1のscFvに由来する前記第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する前記第2の軽(V)鎖可変フラグメントと連結している、実施形態27及び実施形態35に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
実施形態37.前記ヘアピンtCAR構築物は、V1及びV2と呼ばれる、第1のscFvに由来する第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び第2のscFvに由来する第2の軽(V)鎖可変フラグメント、ならびに、V2及びV1と呼ばれる、前記第1のscFvに由来する第1の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する第2の重(V)鎖可変フラグメントを含み、前記第1のscFvに由来する前記第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する前記第2の軽(V)鎖可変フラグメントは、(GGGGS)2~6リンカーにより、前記第1のscFvに由来する前記第1の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する前記第2の重(V)鎖可変フラグメントと連結している、実施形態27及び実施形態36に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
実施形態38.前記ヘアピンtCAR構築物は、V2及びV1と呼ばれる、第2のscFvに由来する第2の軽(V)鎖可変フラグメント及び第1のscFvに由来する第1の軽(V)鎖可変フラグメント、ならびに、V1及びV2と呼ばれる、前記第1のscFvに由来する第1の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する第2の軽重(V)鎖可変フラグメントを含み、前記第2のscFvに由来する前記第2の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第1のscFvに由来する前記第1の軽(V)鎖可変フラグメントは、(GGGGS)2~6リンカーにより、前記第1のscFvに由来する前記第1の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する前記第2の軽重(V)鎖可変フラグメントと連結している、実施形態27及び実施形態37に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
実施形態39.前記ヘアピンtCAR構築物は、8-I~8-XXXIIから選択される構造物を含む、実施形態27及び実施形態38に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
実施形態40.前記CAR構築物は、前記リンカー内に(Cys=Cys)二本鎖結合(DSB)を有するヘアピンDSBtCAR構築物である、実施形態27及び実施形態39に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
実施形態41.前記ヘアピンDSBtCAR構築物は、V1及びV2と呼ばれる、第1のscFvに由来する第1の重(V)鎖可変フラグメント及び第2のscFvに由来する第2の重(V)鎖可変フラグメント、ならびに、V2及びV2と呼ばれる、前記第2のscFvに由来する第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第1のscFvに由来する第2の軽(V)鎖可変フラグメントを含み、前記第1のscFvに由来する前記第1の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する前記第2の重(V)鎖可変フラグメントは、(GGGGS)0~1-(GGGGC)-(GGGGS)1~2-(GGGGP)-(GGGGS)2~3-(GGGGC)-(GGGGS)0~1リンカーにより、前記第2のscFvに由来する前記第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第1のscFvに由来する前記第2の軽(V)鎖可変フラグメントと連結している、実施形態27及び実施形態40に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
実施形態42.前記ヘアピンDSBtCAR構築物は、V2及びV1と呼ばれる、第2のscFvに由来する第2の重(V)鎖可変フラグメント及び第1のscFvに由来する第1の重(V)鎖可変フラグメント、ならびに、V1及びV2と呼ばれる、前記第1のscFvに由来する第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する第2の軽(V)鎖可変フラグメントを含み、前記第2のscFvに由来する前記第2の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第1のscFvに由来する前記第1の重(V)鎖可変フラグメントは、(GGGGS)0~1-(GGGGC)-(GGGGS)1~2-(GGGGP)-(GGGGS)2~3-(GGGGC)-(GGGGS)0~1リンカーにより、前記第1のscFvに由来する前記第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する前記第2の軽(V)鎖可変フラグメントと連結している、実施形態27及び実施形態41に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
実施形態43.前記ヘアピンDSBtCAR構築物は、V1及びV2と呼ばれる、第1のscFvに由来する第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び第2のscFvに由来する第2の軽(V)鎖可変フラグメント、ならびに、V2及びV1と呼ばれる、前記第1のscFvに由来する第1の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する第2の重(V)鎖可変フラグメントを含み、前記第1のscFvに由来する前記第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する前記第2の軽(V)鎖可変フラグメントは、(GGGGS)0~1-(GGGGC)-(GGGGS)1~2-(GGGGP)-(GGGGS)2~3-(GGGGC)-(GGGGS)0~1リンカーにより、前記第1のscFvに由来する前記第1の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する前記第2の重(V)鎖可変フラグメントと連結している、実施形態27及び実施形態42に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
実施形態44.前記ヘアピンDSBtCAR構築物は、V2及びV1と呼ばれる、第2のscFvに由来する第2の軽(V)鎖可変フラグメント及び第1のscFvに由来する第1の軽(V)鎖可変フラグメント、ならびに、V1及びV2と呼ばれる、前記第1のscFvに由来する第1の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する第2の軽重(V)鎖可変フラグメントを含み、前記第2のscFvに由来する前記第2の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第1のscFvに由来する前記第1の軽(V)鎖可変フラグメントは、(GGGGS)0~1-(GGGGC)-(GGGGS)1~2-(GGGGP)-(GGGGS)2~3-(GGGGC)-(GGGGS)0~1リンカーにより、前記第1のscFvに由来する前記第1の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する前記第2の軽重(V)鎖可変フラグメントと連結している、実施形態27及び実施形態43に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
実施形態45.前記ヘアピンDSBtCAR構築物は、10-I~10-XXXIIから選択される構造物を含む、実施形態27及び実施形態44に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
実施形態46.それぞれのV鎖及びV鎖は、CD5、CD7、CD2、CD4、及びCD3、から選択される異なる抗原を認識するscFvに由来する、実施形態27及び実施形態45に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
実施形態47.それぞれのV鎖及びV鎖は、異なり、配列番号:12~配列番号:31から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を示す、実施形態27及び実施形態46に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
実施形態48.それぞれのV鎖及びV鎖は、異なり、配列番号:12~配列番号:31から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも98%の配列同一性を示す、実施形態27及び実施形態47に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
実施形態49.それぞれのV鎖及びV鎖は、異なり、配列番号:12~配列番号:31から選択される配列である、実施形態27及び実施形態48に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
実施形態50.CD28及び4-1BBから選択される少なくとも1種の共刺激ドメインを含む、実施形態27及び実施形態49に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
実施形態51.前記共刺激ドメインはCD28である、実施形態27及び実施形態50に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
実施形態52.CD3ζシグナル伝達ドメインを含む、実施形態27及び実施形態51に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
実施形態53.前記それぞれのV鎖及びV鎖は、CD2を認識するscFvまたはCD3を認識するscFvに由来する、実施形態27及び実施形態52に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
実施形態54.前記tCAR構築物は、クローン5、クローン6、クローン7、クローン8、クローン13、クローン14、クローン15、及びクローン16、から選択される、実施形態27及び実施形態53に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
実施形態55.前記tCAR構築物は、配列番号:41~配列番号:46から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を示す、実施形態27及び実施形態54に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
実施形態55.実施形態1から実施形態54のいずれか1つに記載のiNKT細胞、ならびに、少なくとも1種の治療的に許容される担体及び/またはアジュバント、を含む、治療用組成物。
実施形態56.IL-7、IL-15、Il-2、または上記のいずれかのアナログ、から選択される少なくとも1種のアジュバントを含む、実施形態1から実施形態55のいずれか1つに記載のiNKT細胞を含む治療用組成物。
実施形態57.IL-2を含む、実施形態1から実施形態56のいずれか1つに記載のiNKT細胞を含む治療用組成物。
実施形態58.IL-7、IL-15、Il-2、または上記のいずれかのアナログの、任意の2種またはそれ以上の組み合わせを含む、実施形態1から実施形態57のいずれか1つに記載のiNKT細胞を含む治療用組成物。
実施形態59.IL-7、IL-15、Il-2を含む、実施形態1から実施形態58のいずれか1つに記載のiNKT細胞を含む治療用組成物。
実施形態60.患者における血液悪性腫瘍を治療するための方法であって、ゲノム編集iNKT細胞、実施形態1から実施形態59のいずれか1つに記載のゲノム編集iNKT細胞、デュアルiNKT-CAR細胞、もしくはタンデムiNKT-CAR細胞の集団、または、請求項55から請求項59のいずれか1項に記載の治療用組成物を、血液悪性腫瘍の治療を必要とする前記患者に投与することを含む、前記方法。
実施形態61.前記血液悪性腫瘍はT細胞悪性腫瘍である、実施形態60に記載の方法。
実施形態62.前記T細胞悪性腫瘍はT細胞急性リンパ芽球性白血病(T-ALL)である、実施形態61に記載の方法。
実施形態63.前記T細胞悪性腫瘍は非ホジキンリンパ腫である、実施形態61に記載の方法。
実施形態64.前記血液悪性腫瘍は多発性骨髄腫である、実施形態60に記載の方法。
実施形態65.
a)単離及び精製したiNKT細胞を活性化させること、
b)前記iNKT細胞における細胞表面タンパク質の発現を欠失または抑制すること、ならびに、
c)任意選択的に、前記iNKT細胞に、1種または複数種の抗原標的または細胞表面タンパク質標的を認識するキメラ抗原受容体を形質導入すること、
の工程を含む、遺伝子編集iNKT細胞を作製するための方法。
実施形態66.前記iNKT細胞に、1種または複数種の抗原標的または細胞表面タンパク質標的を認識するキメラ抗原受容体を形質導入する工程を含む、実施形態65に記載の方法。
実施形態67.前記CARの標的である前記抗原は、前記細胞から欠失されている、実施形態66に記載の方法。
実施形態68.複数のドナーに由来するゲノム編集iNKT細胞の集団を作製するための方法であって、
a)それぞれのドナーから単離及び精製したiNKT細胞を活性化させること、
b)前記iNKT細胞における細胞表面タンパク質の発現を欠失または抑制すること、
c)任意選択的に、前記iNKT細胞に、1種または複数種の抗原標的または細胞表面タンパク質標的を認識するキメラ抗原受容体を形質導入すること、
d)ゲノム編集iNKT細胞の前記集団を増殖させること、
e)前記ゲノム編集iNKT細胞をプールすること、
の工程を含む、前記方法。
実施形態69.Cas9-CRISPR、及び本明細書で開示するgRNAから選択されるgRNAを使用して、上記の任意の実施形態または本明細書に記載のCAR-T細胞を作製するための方法。
実施形態70.Cas9-CRISPR、ならびに、表12及び表14~表26で開示するgRNAから選択されるgRNAを使用して、上記の任意の実施形態または本明細書に記載のCAR-T細胞を作製するための方法。
実施形態71.Cas9-CRISPR、ならびに、表12で開示するgRNA及び表14~表26において太字体で示すgRNAから選択されるgRNAを使用して、上記の任意の実施形態または本明細書に記載のCAR-T細胞を作製するための方法。
実施形態72.Cas9-CRISPR、及び表12で開示するgRNAから選択されるgRNAを使用して、上記の任意の実施形態または本明細書に記載のCAR-T細胞を作製するための方法。
本明細書では、ゲノム編集インバリアントナチュラルキラーT(iNKT)細胞を開示する。
凍結させることなく少なくとも3週間にわたり維持または増殖させることが可能な、複数のドナーに由来するゲノム編集iNKT細胞の集団もまた提供する。
1種または複数種の抗原を標的とする少なくとも1つのキメラ抗原受容体(CAR)を含み、CARが特異的に結合する抗原を欠損している、iNKT細胞もまた提供する。
特定の実施形態では、キメラ抗原受容体は、悪性T細胞上に発現した少なくとも1種の抗原に特異的に結合する。
特定の実施形態では、抗原は、BCMA、CS1、CD38、CD138、CD19、CD33、CD123、CD371、CD117、CD135、Tim-3、CD5、CD7、CD2、CD4、CD3、CD79A、CD79B、APRIL、CD56、及びCD1a、から選択される。
特定の実施形態では、キメラ抗原受容体は、悪性形質細胞上に発現した少なくとも1種の抗原に特異的に結合する。
特定の実施形態では、抗原は、BCMA、CS1、CD38、及びCD19、から選択される。
特定の実施形態では、キメラ抗原受容体(複数可)は、悪性B細胞上に発現した少なくとも1種の抗原に特異的に結合する。
特定の実施形態では、悪性B細胞上に発現した抗原は、CD19、CD20、CD21、CD22、CD23、CD24、CD25、CD27、CD38、及びCD45、から選択される。
特定の実施形態では、悪性B細胞上に発現した抗原は、CD19及びCD20から選択される。
特定の実施形態では、キメラ抗原受容体は、BCMAとTACIの両方を効果的に共標的とする、BCMA及びTACIに対するリガンドである、APRILタンパク質の細胞外部分を発現する。
特定の実施形態では、iNKT細胞は自殺遺伝子を更に含む。
特定の実施形態では、内在性T細胞受容体介在性シグナル伝達は、iNKT細胞において阻害される。
特定の実施形態では、iNKT細胞は、アロ反応性または移植片対宿主病を誘導しない。
特定の実施形態では、iNKT細胞は同胞殺しを誘導しない。
デュアルiNKT-CARまたはタンデムiNKT-CARもまた提供する。
本明細書で開示するiNKT細胞の集団、ならびに、少なくとも1種の治療的に許容される担体及び/またはアジュバントを含む、治療用組成物もまた提供する。
特定の実施形態では、組成物は、IL-7、IL-15、IL-2、または上記のいずれかのアナログ、から選択される少なくとも1種のアジュバントを含む。
特定の実施形態では、組成物はIL-2を含む。
特定の実施形態では、組成物は、IL-7、IL-15、IL-2、または上記のいずれかのアナログの、任意の2種またはそれ以上の組み合わせを含む。
特定の実施形態では、組成物は、IL-7、IL-15、及びIL-2を含む。
ゲノム編集iNKT細胞、本明細書で開示するゲノム編集iNKT細胞、デュアルiNKT-CAR細胞、もしくはタンデムiNKT-CAR細胞の集団、または、本明細書で開示する治療用組成物を、血液悪性腫瘍の治療を必要とする患者に投与することを含む、患者における血液悪性腫瘍を治療するための方法についてもまた提供する。
特定の実施形態では、血液悪性腫瘍はT細胞悪性腫瘍である。
特定の実施形態では、T細胞悪性腫瘍はT細胞急性リンパ芽球性白血病(T-ALL)である。
特定の実施形態では、T細胞悪性腫瘍は非ホジキンリンパ腫である。
特定の実施形態では、血液悪性腫瘍は多発性骨髄腫である。
d)単離及び精製したiNKT細胞を活性化させること、
e)iNKT細胞における細胞表面タンパク質の発現を欠失または抑制すること、ならびに、
f)任意選択的に、iNKT細胞に、1種または複数種の抗原標的または細胞表面タンパク質標的を認識するキメラ抗原受容体を形質導入すること、
の工程を含む、遺伝子編集iNKT細胞を作製するための方法もまた提供する。
特定の実施形態では、方法は、iNKT細胞に、1種または複数種の抗原標的または細胞表面タンパク質標的を認識するキメラ抗原受容体を形質導入する工程を含む。
特定の実施形態では、CARの標的である抗原は、細胞から欠失されている。
f)それぞれのドナーから単離及び精製したiNKT細胞を活性化させること、
g)iNKT細胞における細胞表面タンパク質の発現を欠失または抑制すること、
h)任意選択的に、iNKT細胞に、1種または複数種の抗原標的または細胞表面タンパク質標的を認識するキメラ抗原受容体を形質導入すること、
i)ゲノム編集iNKT細胞の集団を増殖させること、ならびに、
j)ゲノム編集iNKT細胞をプールすること、
の工程を含む、複数のドナーに由来するゲノム編集iNKT細胞の集団を作製するための方法もまた提供する。
その他の実施形態については以下で開示する。
ゲノム編集iNKT細胞及びゲノム編集iNKT-CAR
同胞殺し抵抗性。本明細書で開示するiNKT細胞は、キメラ抗原受容体が特異的に結合する抗原を欠損していることにより、同胞殺し抵抗性であってもよい。一部の実施形態では、iNKT細胞の抗原は、キメラ抗原受容体が修飾抗原にもはや特異的に結合しないように、修飾されている。例えば、キメラ抗原受容体が認識する抗原のエピトープは、1つもしくは複数のアミノ酸変異(例えば、置換または欠失)によって修飾されていてもよく、または、エピトープは、抗原から欠失されていてもよい。その他の実施形態では、抗原の発現は、iNKT細胞において、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、またはそれ以上低下する。タンパク質の発現を低下させるための方法は当技術分野において周知であり、タンパク質をコードする核酸配列に機能的に連結するプロモーターを修飾または置換することが挙げられるがこれらに限定されない。更にその他の実施形態では、iNKT細胞は、例えば、抗原をコードする遺伝子を欠失または破壊することにより、抗原が発現しないように修飾される。上記の実施形態のそれぞれでは、iNKT細胞は、キメラ抗原受容体が特異的に結合する1種または好ましくは全ての抗原を欠損していてもよい。抗原を欠損させるiNKT細胞を遺伝的に修飾するための方法は、当該技術分野において十分周知されており、非限定的な例については上に記載している。例示的な実施形態では、CRISPR/Cas9遺伝子編集を用いて、抗原、例えば、以下に記載する抗原を欠損させるiNKT細胞を修飾してもよい。代替的に、TALENを用いて遺伝子を編集してもよい。
上記方法の変化形態では、編集工程もしくは編集工程の一部、または、CAR形質導入の一部のいずれかとして、1種または複数種のタンパク質発現ブロッカー(PEBL)をコードする構築物を、細胞に形質導入してもよい。例えば、CD3εに特異的な抗体由来単鎖可変フラグメントをコードする構築物を、例えば、レンチウイルスベクターにより、形質導入してもよい。一旦発現すると、PEBLはCD3εと細胞内で共局在化し、表面CD3及びTCRαβの発現を阻害する。それゆえ、PEBLによる表面CD3/TCRαβ発現の阻害は、同種異系CAR-T細胞を調製するための代替法である。更に、PEBL及びCARの発現を、単一の構築物内で組み合わせてもよい。本明細書で開示する方法を用いてこれらの方法のいずれかを実施してもよく、本明細書で開示する遺伝子抑制標的のいずれかを阻害するためのPEBLを作製してもよい。
上記の方法を適応させて、抗原、細胞表面タンパク質、または分泌可能なタンパク質、例えば、サイトカインなど、をコードする遺伝子用の遺伝子座に、CARを挿入してもよい。この方法では、ゲノムの編集は、CARのトランスフェクションによりもたらされる。その後、本明細書に記載するとおりに細胞を活性化させて、特定の実施形態における独立したゲノム編集工程を取り除いてもよい。理論上、このような工程は、細胞が活発に分裂している間に実施する必要がある。このような方法はまた、遺伝子改変細胞の強力な増殖をもたらすと予想されている。
特定の状況では、キメラ抗原受容体が特異的に結合する抗原の欠損で、iNKT細胞を選択してもよい。ある特定のiNKT細胞は、より少ない任意の表面タンパク質を産生及び提示するが、その代わりに、iNKT-CARの標的となる抗原を欠失または非機能化する場合には、iNKT細胞を、抗原の欠損で選択して、抗原欠損細胞の集団をCARの形質導入用に増殖させてもよい。このような細胞はまた、同胞殺し抵抗性であり得る。
CAR抗原。本明細書で開示するiNKT細胞を用いてゲノム編集される好適な抗原、及び本明細書で開示するiNKT-CARにおけるCARが認識する好適な抗原としては、血液悪性腫瘍に特異的な抗原が挙げられる。これら好適な抗原としては、T細胞特異的抗原、及び/またはT細胞に特異的ではない抗原を挙げることができる。抗原は、iNKT-CAR細胞のキメラ抗原受容体が特異的に結合する抗原であってもよく、iNKT-CAR細胞が欠損している抗原は、悪性T細胞上に発現した抗原、好ましくは、非悪性T細胞と比較して悪性T細胞上に過剰発現した抗原(すなわち、T細胞悪性腫瘍に由来するT細胞)である。このような抗原の例としては、BCMA、CS1、CD38、CD138、CD19、CD33、CD123、CD371、CD117、CD135、Tim-3、CD5、CD7、CD2、CD4、CD3ε、CD79A、CD79B、APRIL、CD56、及びCD1a、TRAC、ならびにTCRβ、が挙げられる。
T細胞悪性腫瘍は、T細胞前駆細胞、成熟T細胞、またはナチュラルキラー細胞、に由来する悪性腫瘍を含む。T細胞悪性腫瘍の例としては、T細胞急性リンパ芽球性白血病/リンパ腫(T-ALL)、T細胞大顆粒リンパ球(LGL)性白血病、ヒトT細胞白血病ウイルス1型陽性(HTLV-1+)成人T細胞性白血病/リンパ腫(ATL)、T細胞前リンパ球性白血病(T-PLL)、ならびに、血管免疫芽球性T細胞リンパ腫(AITL)、ALK陽性未分化大細胞リンパ腫、及びALK陰性未分化大細胞リンパ腫を含むがこれらに限定されない、様々な末梢性T細胞リンパ腫(PTCL)、が挙げられる。
好適なCAR抗原としてはまた、多発性骨髄腫細胞、すなわち、悪性形質細胞の表面上に認められる抗原、例えば、BCMA、CS1、CD38、及びCD19などを挙げることができる。代替的に、多発性骨髄腫を治療するための、BCMAとTACIの両方を効果的に共標的とする、BCMA及びTACIに対するリガンドである、APRILタンパク質の細胞外部分を発現するように、CARを設計してもよい。
本明細書で開示するiNKT細胞を用いてゲノム編集される好適な抗原、及び本明細書で開示するiNKT-CARにおけるCARが認識する好適な抗原の別の例については、以下の表4、5、11に記載する。これらの抗原としては、BCMA、CS1、CD38、CD138、CD19、CD33、CD123、CD371、CD117、CD135、Tim-3、CD5、CD7、CD2、CD4、CD3ε、CD79A、CD79B、APRIL、CD56、及びCD1a、CD2、CD3ε、CD4、CD5、CD7、TRAC、ならびにTCRβ、が挙げられる。
自殺遺伝子。代替的にまたは加えて、ゲノム編集iNKT細胞は、1種または複数種の自殺遺伝子を更に含んでいてもよい。本明細書で使用する場合、「自殺遺伝子」とは、活性化した場合にiNKT細胞の死をもたらす、当該技術分野において周知の標準的な方法を用いてiNKT細胞に導入された核酸配列のことを意味する。自殺遺伝子により、必要に応じ、in vivoにおけるiNKT細胞の効果的な追跡及び除去を促進してもよい。自殺遺伝子を活性化させることにより促進された殺傷は、当該技術分野において周知の方法を用いて生じさせてもよい。当該技術分野において周知の好適な自殺遺伝子療法システムとしては、様々な単純ヘルペスウイルスチミジンキナーゼ(HSVtk)/ガンシクロビル(GCV)自殺遺伝子療法システム、または誘導性カスパーゼ9タンパク質、が挙げられるがこれらに限定されない。例示的な実施形態では、自殺遺伝子は、CD34/チミジンキナーゼキメラ自殺遺伝子である。
CAR及びiNKT-CARを構築するための方法
「キメラ抗原受容体(CAR)」とは、本明細書で使用する場合、及び当該技術分野において一般的に使用する場合、抗原が細胞外ドメインに結合すると、細胞に特殊機能を実行させる細胞内ドメイン(シグナル伝達ドメイン)に結合した、抗原特異的細胞外ドメイン(抗原認識ドメイン)を有する組換え融合タンパク質のことを意味する。キメラ抗原受容体は、MHC非依存性抗原に結合するその能力と、その細胞内ドメインを介して活性化シグナルを変換するその能力の両方により、その他の抗原結合因子とは区別される。
臨床グレードのiNKT細胞集団のCAR設計、送達及び発現、ならびに製造を行うための方法は、当該技術分野において周知である。例えば、Lee et al.,Clin.Cancer Res.,2012,18(10):2780-90を参照されたい。CARをコードする遺伝子改変キメラ抗原受容体ポリヌクレオチドは、シグナルペプチド、細胞外リガンド結合ドメイン、すなわち、抗原認識ドメイン、膜貫通ドメイン、及びシグナル伝達ドメイン、を含む。
キメラ抗原受容体の細胞外リガンド結合ドメインは、抗原(一般的には、悪性腫瘍の表面に発現した抗原)を認識してそれに特異的に結合する。「抗原特異的細胞外ドメイン」(すなわち、「抗原結合ドメイン」)は抗原に特異的に結合するが、その際、例えば、約0.1pM~約10μM、好ましくは約0.1pM~約1μM、より好ましくは約0.1pM~約100nMの親和性定数または相互作用(KD)の親和性で抗原に結合する。相互作用の親和性を測定するための方法は、当該技術分野において周知である。本開示のCARに用いるのに好適な細胞外リガンド結合ドメインは、任意の抗原結合ポリペプチドであってもよく、多種多様なそれらは、当技術分野において周知である。一部の例においては、抗原結合ドメインは一本鎖Fv(scFv)である。その他の抗体ベース認識ドメイン、cAb VHH(ラクダ科抗体可変ドメイン)及びそれらのヒト化型、IgNAR V(サメ抗体可変ドメイン)及びそれらのヒト化型、sdAb V(単一ドメイン抗体可変ドメイン)、ならびに、「ラクダ化」抗体可変ドメイン、が使用に好適である。一部の例においては、T細胞受容体(TCR)ベース認識ドメイン、例えば、一本鎖TCR(scTv、VαVβを含む一本鎖2ドメインTCR)などもまた、使用に好適である。
本開示のキメラ抗原受容体はまた、抗原特異的細胞外ドメインに抗原が結合すると、iNKT細胞に細胞内シグナルをもたらす、「細胞内ドメイン」を含む。本開示のキメラ抗原受容体の細胞内シグナル伝達ドメインは、キメラ受容体を発現するiNKT細胞における少なくとも1種のエフェクター機能の活性化に影響を及ぼす。用語「エフェクター機能」とは、iNKT細胞などの分化細胞における特殊機能のことを意味する。例えば、iNKT細胞のエフェクター機能は、NKのトランス活性化、T細胞の活性化及び分化、B細胞の活性化、樹状細胞の活性化及びクロスプレゼンテーション活性、ならびにマクロファージの活性化、であってもよい。それゆえ、用語「細胞内ドメイン」とは、抗原が細胞外ドメインに結合すると、エフェクター機能シグナルを伝達してiNKT細胞に特殊機能を実行させる、CARの部分のことを意味する。好適な細胞内ドメインの非限定例としては、T細胞受容体のζ鎖またはそのホモログ(例えば、η、δ、γ、またはε)のいずれか、及びCD3ζとCD28などのシグナル伝達分子の組み合わせ、CD27、4-1 BB、DAP-10、OX40及びこれらの組み合わせ、ならびにその他の類似した分子及びフラグメント、が挙げられる。活性化タンパク質ファミリーのその他のメンバーの細胞内シグナル伝達部位、例えば、FcγRIII及びFcεRIなどを使用してもよい。通常は、完全な細胞内ドメインを採用するが、多くのケースでは、完全な細胞内ポリペプチドの使用は必須ではない。細胞内シグナル伝達ドメインのトランケート部分が有用となり得る範囲において、エフェクター機能シグナルをなおも伝達する限りにおいて、このようなトランケート部分をインタクト鎖の代わりに使用してもよい。それゆえ、用語「細胞内ドメイン」とは、エフェクター機能シグナルを伝達するのに十分な、細胞内ドメインの任意のトランケート部分を含むことを意味する。
通常、抗原特異的細胞外ドメインは、「膜貫通ドメイン」により、キメラ抗原受容体の細胞内ドメインに連結している。膜貫通ドメインは細胞膜を貫通し、CARをT細胞表面に固定し、細胞外ドメインを細胞内シグナル伝達ドメインに連結させることにより、T細胞表面上におけるCARの発現に影響を及ぼす。キメラ抗原受容体はまた、1種もしくは複数種の共刺激ドメイン及び/または1種もしくは複数種のスペーサーを更に含んでいてもよい。「共刺激ドメイン」は、in vivoにおけるサイトカインの産生、増殖、細胞傷害性、及び/または持続性を向上させる共刺激タンパク質の細胞内シグナル伝達ドメインから誘導される。「ペプチドヒンジ」は抗原特異的細胞外ドメインを膜貫通ドメインに連結させる。膜貫通ドメインは共刺激ドメインに融合し、任意選択的に、共刺激ドメインは第2の共刺激ドメインに融合し、共刺激ドメインは、CD3ζに限定されないシグナル伝達ドメインに融合する。例えば、抗原特異的細胞外ドメインと膜貫通ドメインの間、及び複数のscFv(タンデムCARの場合)間にスペーサードメインを設けて、抗原結合ドメイン(複数可)の柔軟性に影響を及ぼすことにより、CAR機能に影響を及ぼしてもよい。好適な膜貫通ドメイン、共刺激ドメイン、及びスペーサーは、当該技術分野において周知である。
Figure 2022516389000002

Figure 2022516389000003

Figure 2022516389000004

Figure 2022516389000005
モノiNKT-CAR細胞(miNKT)
特定の実施形態では、本開示は、CD7に特異的に結合する単一のCARを含む遺伝子改変iNKT細胞を提供し、iNKT細胞は、CD7を欠損している(例えば、CD7-iNKT-CARΔCD7細胞)。非限定的な例では、CD7の欠損は、(a)キメラ抗原受容体が、修飾されたCD7にもはや特異的に結合しないように、iNKT細胞が発現するCD7を修飾すること、(b)CD7の発現が、iNKT細胞において、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、もしくはそれ以上低下するように、iNKT細胞を修飾すること、または(c)CD7が発現しないように、iNKT細胞を修飾すること(例えば、CD7をコードする遺伝子の欠失または破壊により)、によるものである。更なる実施形態では、iNKT細胞は自殺遺伝子を含む。非限定的な例では、修飾ヒト単純ヘルペスウイルス1型-チミジンキナーゼ(TK)遺伝子をコードする、CD7-iNKT-CARΔCD7細胞内で発現している自殺遺伝子は、ヒトCD34 cDNAの細胞外ドメイン及び膜貫通ドメインにインフレームで融合している。
商業的に合成された抗CD7一本鎖可変フラグメント(scFv)を、CD28及び4-1BB内部シグナル伝達ドメインを有する第3世代のCAR骨格にクローニングすることにより、CD7特異的iNKT-CAR細胞用のCARを作製してもよい。P2Aペプチドの後に細胞外hCD34ドメインを加えて、ウイルス形質導入及び抗hCD34磁性ビーズを用いた精製の後における、CARによる両方の検出を可能としてもよい。その他の悪性T細胞抗原に特異的なCARを作製するために、同様の方法を続けてもよい。
iNKT細胞に由来する、ゲノム編集されたiNKT細胞の表面上に発現させることのできるCARアミノ酸配列の実施形態について開示する。
Figure 2022516389000006

Figure 2022516389000007

Figure 2022516389000008

Figure 2022516389000009

Figure 2022516389000010
類似の方法を用いて、その他のモノiNKT細胞を構築してもよく、それらについては以下の表4に記載する。
Figure 2022516389000011
タンデムiNKT-CAR細胞
特定の実施形態では、本開示は、タンデム(andem)CAR(tCAR)、すなわち、CD7及びCD2に特異的に結合する単一の細胞内ドメインを共有する2つのscFv、を含む遺伝子改変iNKT細胞を提供し、iNKT細胞は、CD7及びCD2を欠損している(例えば、CD7xCD2-iNKT-tCARΔCD7ΔCD2細胞)。非限定的な例では、CD7及びCD2の欠損は、(a)キメラ抗原受容体が、修飾されたCD7もしくはCD2にもはや特異的に結合しないように、iNKT細胞が発現するCD7及びCD2を修飾すること、(b)CD7及びCD2の発現が、iNKT細胞において、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、もしくはそれ以上低下するように、iNKT細胞を修飾すること、または(c)CD7及びCD2が発現しないように、iNKT細胞を修飾すること(例えば、CD7及び/またはCD2をコードする遺伝子の欠失または破壊により)、によるものである。更なる実施形態では、iNKT細胞は自殺遺伝子を含む。非限定的な例では、修飾ヒト単純ヘルペスウイルス1型-チミジンキナーゼ(TK)遺伝子をコードする、CD7*CD2-iNKT-tCARΔCD7ΔCD2細胞内で発現している自殺遺伝子は、ヒトCD34 cDNAの細胞外ドメイン及び膜貫通ドメインにインフレームで融合している。
商業的に合成された抗CD7一本鎖可変フラグメント(scFv)及び抗CD2一本鎖可変フラグメント(scFv)を、CD28及び4-1BB内部シグナル伝達ドメインを有する第3世代のCAR骨格にクローニングすることにより、ゲノム編集タンデムiNKT-CAR細胞用のtCAR、すなわち、CD7*CD2-iNKT-tCARΔCD7ΔCD2を作製してもよい。P2Aペプチドの後に細胞外hCD34ドメインを加えて、ウイルス形質導入及び抗hCD34磁性ビーズを用いた精製の後における、CARによる両方の検出を可能としてもよい。その他の悪性T細胞抗原に特異的なtCARを作製するために、同様の方法を続けてもよい。
直鎖状タンデムCAR構築物
直鎖状タンデムCAR構築物の一実施形態では、第1の細胞外リガンド結合ドメインは、リンカー(例えば、GGGGS)2~6により連結されたV1及びV1と呼ばれる重(V)鎖可変フラグメント及び軽(V)鎖可変フラグメント、を含む、一本鎖抗体フラグメント(scFv)を含む。第2の細胞外リガンド結合抗原認識ドメインは、リンカー(例えば、GGGGS)2~6により連結されたV2及びV2と呼ばれる軽(V)鎖可変フラグメント及び重(V)鎖可変フラグメント、を含む、一本鎖抗体フラグメント(scFv)を含む。
直鎖状タンデムCAR構築物の第2の実施形態では、第1の細胞外リガンド結合ドメインは、リンカー(例えば、GGGGS)2~6により連結されたV2及びV2と呼ばれる重(V)鎖可変フラグメント及び軽(V)鎖可変フラグメント、を含む、一本鎖抗体フラグメント(scFv)を含む。第2の細胞外リガンド結合抗原認識ドメインは、リンカー(例えば、GGGGS)2~6により連結されたV1及びV1と呼ばれる軽(V)鎖可変フラグメント及び重(V)鎖可変フラグメント、を含む、一本鎖抗体フラグメント(scFv)を含む。
直鎖状タンデムCAR構築物の第3の実施形態では、第1の細胞外リガンド結合ドメインは、リンカー(例えば、GGGGS)2~6により連結されたV1及びV1と呼ばれる重(VL)鎖可変フラグメント及び軽(VH)鎖可変フラグメント、を含む、一本鎖抗体フラグメント(scFv)を含む。第2の細胞外リガンド結合抗原認識ドメインは、リンカー(例えば、GGGGS)2~6により連結されたV2及びV2と呼ばれる軽(V)鎖可変フラグメント及び重(V)鎖可変フラグメント、を含む、一本鎖抗体フラグメント(scFv)を含む。
直鎖状タンデムCAR構築物の第4の実施形態では、第1の細胞外リガンド結合ドメインは、リンカー(例えば、GGGGS)2~6により連結されたV2及びV2と呼ばれる重(V)鎖可変フラグメント及び軽(V)鎖可変フラグメント、を含む、一本鎖抗体フラグメント(scFv)を含む。第2の細胞外リガンド結合抗原認識ドメインは、リンカー(例えば、GGGGS)2~6により連結されたV1及びV1と呼ばれる軽(V)鎖可変フラグメント及び重(V)鎖可変フラグメント、を含む、一本鎖抗体フラグメント(scFv)を含む。
直鎖状タンデムCAR構築物の実施形態のそれぞれにおいて、第1及び第2の細胞外リガンド結合ドメインは、表面分子、すなわち、限定するわけではないが、BCMA、CS1、CD38、CD138、CD19、CD33、CD123、CD371、CD117、CD135、Tim-3、CD5、CD7、CD2、CD4、CD3ε、CD79A、CD79B、APRIL、CD56、及びCD1a、TRAC、ならびにTCRβ、から選択される、悪性T細胞上に発現した抗原を標的とする。
直鎖状タンデムCARの更なる例については、以下の表5に記載する。
Figure 2022516389000012

Figure 2022516389000013

Figure 2022516389000014

Figure 2022516389000015

Figure 2022516389000016
例えば、本明細書では、上の表5の例に記載の抗原対のいずれかを標的とする、scFvのVドメイン及びVドメインを組み込まれていてもよい直鎖状タンデムCAR構築物を提供する。
Figure 2022516389000017

Figure 2022516389000018
ヘアピンタンデムCAR構築物
ヘアピンタンデムCAR構築物の一実施形態では、第1の細胞外リガンド結合ドメインは、リンカー(例えば、GGGGS)2~6により連結されたV1及びV2と呼ばれる2つの重鎖可変フラグメント、を含む、一本鎖抗体フラグメント(scFv)を含む。第2の細胞外リガンド結合抗原認識ドメインは、リンカー(例えば、GGGGS)2~6により連結されたV2及びV1と呼ばれる2つの軽鎖可変フラグメント、を含む、一本鎖抗体フラグメント(scFv)を含む。
ヘアピンタンデムCAR構築物の第2の実施形態では、第1の細胞外リガンド結合ドメインは、リンカー(例えば、GGGGS)2~6により連結されたV2及びV1と呼ばれる2つの重鎖可変フラグメント、を含む、一本鎖抗体フラグメント(scFv)を含む。第2の細胞外リガンド結合抗原認識ドメインは、リンカー(例えば、GGGGS)2~6により連結されたV1及びV2と呼ばれる2つの軽鎖可変フラグメント、を含む、一本鎖抗体フラグメント(scFv)を含む。
ヘアピンタンデムCAR構築物の第3の実施形態では、第1の細胞外リガンド結合ドメインは、リンカー(例えば、GGGGS)2~6により連結されたV1及びV2と呼ばれる2つの軽鎖可変フラグメント、を含む、一本鎖抗体フラグメント(scFv)を含む。第2の細胞外リガンド結合抗原認識ドメインは、リンカー(例えば、GGGGS)2~6により連結されたV2及びV1と呼ばれる2つの重鎖可変フラグメント、を含む、一本鎖抗体フラグメント(scFv)を含む。
ヘアピンタンデムCAR構築物の第4の実施形態では、第1の細胞外リガンド結合ドメインは、リンカー(例えば、GGGGS)2~6により連結されたV2及びV1と呼ばれる2つの軽鎖可変フラグメント、を含む、一本鎖抗体フラグメント(scFv)を含む。第2の細胞外リガンド結合抗原認識ドメインは、リンカー(例えば、GGGGS)2~6により連結されたV1及びV2と呼ばれる2つの重鎖可変フラグメント、を含む、一本鎖抗体フラグメント(scFv)を含む。
ヘアピンタンデムCAR構築物の実施形態のそれぞれにおいて、第1及び第2の細胞外リガンド結合ドメインは、表面分子、すなわち、限定するわけではないが、BCMA、CS1、CD38、CD138、CD19、CD33、CD123、CD371、CD117、CD135、Tim-3、CD5、CD7、CD2、CD4、CD3ε、CD79A、CD79B、APRIL、CD56、及びCD1a、TRAC、ならびにTCRβ、から選択される、悪性T細胞上に発現した抗原を標的とする。
ヘアピンタンデムCARの別の例については、上の表5に記載する。
更に、本明細書では、(1)CD2及びCD3、ならびに(2)CD2及びCD7を標的とする、scFvのVドメイン及びVドメインを組み込まれていてもよいCAR構築物及びiNKT細胞を提供し、以下の表7に記載する。
Figure 2022516389000019

Figure 2022516389000020

Figure 2022516389000021

Figure 2022516389000022

Figure 2022516389000023
加えて、本明細書では、表5に記載の抗原対のいずれかを標的とする、scFvのVドメイン及びVドメインを組み込まれていてもよいヘアピンタンデムCAR構築物を提供する。
Figure 2022516389000024

Figure 2022516389000025
例えば、本明細書の表9では、CD2 scFv及びCD3 scFvのVドメイン及びVドメインを組み込んだヘアピンタンデムCAR構築物を提供する。
Figure 2022516389000026
本明細書の表10ではまた、表5に記載の抗原対のいずれかを標的とする、scFvのVドメイン及びVドメインを組み込まれていてもよい(Cys=Cys)二本鎖結合(DSB)を有するヘアピンタンデムCAR構築物を提供する。
Figure 2022516389000027

Figure 2022516389000028

Figure 2022516389000029

Figure 2022516389000030

Figure 2022516389000031
デュアルiNKT-CAR細胞
特定の実施形態では、本開示は、デュアル(ual)CAR(dCAR)、すなわち、CD7及びCD2に特異的に結合する単一のレンチウイルス構築物から発現する2つのCAR、を含む遺伝子改変iNKT細胞を提供し、iNKT細胞は、CD7及びCD2を欠損している(例えば、CD7xCD2-iNKT-dCARΔCD7ΔCD2細胞)。非限定的な例では、CD7及びCD2の欠損は、(a)キメラ抗原受容体が、修飾されたCD7もしくはCD2にもはや特異的に結合しないように、iNKT細胞が発現するCD7及びCD2を修飾すること、(b)CD7及びCD2の発現が、iNKT細胞において、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、もしくはそれ以上低下するように、iNKT細胞を修飾すること、または(c)CD7及びCD2が発現しないように、iNKT細胞を修飾すること(例えば、CD7及び/またはCD2をコードする遺伝子の欠失または破壊により)、によるものである。更なる実施形態では、iNKT細胞は自殺遺伝子を含む。非限定的な例では、修飾ヒト単純ヘルペスウイルス1型-チミジンキナーゼ(TK)遺伝子をコードする、CD7*CD2-iNKT-dCARΔCD7ΔCD2細胞内で発現している自殺遺伝子は、ヒトCD34 cDNAの細胞外ドメイン及び膜貫通ドメインにインフレームで融合している。
類似の方法を用いて、その他のiNKT-CARを構築してもよく、それらについては以下の表11に記載する。
Figure 2022516389000032

Figure 2022516389000033

Figure 2022516389000034

Figure 2022516389000035

Figure 2022516389000036
更なる態様では、特定の状況において対照として使用するiNKT-CAR細胞を作製してもよい。例えば、T細胞抗原に結合するiNKT-CARを設計する場合、対照iNKT-CARは、悪性T細胞上に発現していない抗原に結合する細胞外ドメインを含んでいてもよい。対照iNKT-CAR細胞が結合する抗原は、例えば、CD19であってもよい。CD19はT細胞上ではなくB細胞上に発現する抗原であることから、CD19に結合するように適合させた細胞外ドメインを有するiNKT-CARは、T細胞に結合しない。これらのiNKT-CARをiNKT-CAR19細胞と呼んでもよい。これらの対照iNKT-CAR細胞を対照として用いて、目的のがんを標的とする及び/または目的の抗原を認識するiNKT-CAR細胞の、結合効率及び非特異的結合を解析してもよい。
当業者に周知の変化形態を任意選択的に採用して、WO2018027036A1に開示されるように、CARを更に設計してもよい。WO2018027036A1に開示されるように、加えて、当該技術分野において周知の方法を用いて、また市販の供給元から、レンチウイルスベクター及び細胞株を得てもよく、ガイドRNAを設計、検証及び合成してもよい。
レトロウイルスを用いて遺伝子改変CARをiNKT細胞内に導入してもよく、それにより、キメラ抗原受容体をコードする核酸配列を標的細胞ゲノム内に効率的かつ安定的に組み込むことが可能となる。当該技術分野において周知のその他の方法としては、レンチウイルス形質導入、トランスポゾンベースのシステム、直接的なRNAトランスフェクション、及びCRISPR/Casシステム(例えば、Cas3、Cas4、Cas5、Cas5e(すなわちCasD)、Cas6、Cas6e、Cas6f、Cas7、Cas8a1、Cas8a2、Cas8b、Cas8c、Cas9、Cas10、Cas10d、CasF、CasG、CasH、Csy1、Csy2、Csy3、Cse1(すなわちCasA)、Cse2(すなわちCasB)、Cse3(すなわちCasE)、Cse4(すなわちCasC)、Csc1、Csc2、Csa5、Csn2、Csm2、Csm3、Csm4、Csm5、Csm6、Cmr1、Cmr3、Cmr4、Cmr5、Cmr6、Csb1、Csb2、Csb3、Csx17、Csx14、Csx10、Csx16、CsaX、Csx3、Csz1、Csx15、Csf1、Csf2、Csf3、Csf4、及びCu1966などの好適なCasタンパク質を用いたI型、II型、またはIII型のシステム)、が挙げられるがこれらに限定されない。ジンクフィンガーヌクレアーゼ(ZFN)及び転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ(TALEN)もまた使用してもよい。例えば、Shearer RF and Saunders DN,“Experimental design for stable genetic manipulation in mammalian cell lines: lentivirus and alternatives,”Genes Cells 2015 Jan;20(1):1-10を参照されたい。
サイトカイン遺伝子の欠失または抑制
TCRならびに細胞表面タンパク質及び抗原を遺伝子編集することに加えて、分泌可能なタンパク質、例えば、サイトカイン及びケモカインなどの遺伝子を編集してもよい。このような編集を行って、例えば、サイトカイン放出症候群(CRS)の発症または維持を抑制または予防してもよい。CRSは、免疫治療薬(またはその他の免疫学的刺激物)に応答した免疫細胞からの、大規模で急速なサイトカインの放出によって引き起こされる。当該技術分野において周知の方法、例えば、遺伝子の配列情報を変化または欠失させることにより遺伝子発現をなくす、遺伝子の除去(遺伝子サイレンシング)などを用いて、1つまたは複数のサイトカインまたはケモカインの遺伝子の修飾、破壊、または欠失を達成してもよい。これは、当該技術分野において周知の遺伝子操作ツール、例えば、転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ(TALEN)、ジンクフィンガーヌクレアーゼ(ZFN)、CRISPRなどを用いることにより、低分子ヘアピンRNA(shRNA)の形質導入により、サイトカインの遺伝子配列にCARを標的形質導入することなどにより、達成することができる。
例えば、Cas9-CRISPRを用いることにより、または、サイトカインの遺伝子配列にCARを標的形質導入することにより、本明細書で開示する免疫エフェクター細胞から欠失させることができるサイトカインまたはケモカインとしては、以下、XCL1、XCL2、CCL1、CCL2、CCL3、CCL4、CCL5、CCL7、CCL8、CCL11、CCL13、CCL14、CCL15、CCL16、CCL17、CCL18、CCL19、CCL20、CCL21、CCL22、CCL23、CCL24、CCL25、CCL26、CCL27、CXCL1、CXCL2、CXCL3、CXCL4、CXCL5、CXCL6、CXCL7、CXCL8、CXCL9、CXCL10、CXCL11、CXCL12、CXCL13、CXCL14、CX3CL1、IL-1α、IL-1β、IL-1RA、IL-18、IL-2、IL-4、IL-7、IL-9、IL-13、IL-15、IL-3、IL-5、GM-CSF、IL-6、IL-11、G-CSF、IL-12、LIF、OSM、IL-10、IL-20、IL-14、IL-16、IL-17、IFN-α、IFN-β、IFN-γ、CD154、LT-β、TNF-α、TNF-β、4-1BBL、APRIL、CD70、CD153、CD178、GITRL、LIGHT、OX40L、TALL-1、TRAIL、TWEAK、TRANCE、TGF-β1、TGF-β2、TGF-β3、Epo、Tpo、Flt-3L、SCF、M-CSF、MSP、A2M、ACKR1、ACKR2、ACKR3、ACVR1、ACVR2B、ACVRL1、ADIPOQ、AGER、AGRN、AIMP1、AREG、BMP1、BMP10、BMP15、BMP2、BMP3、BMP4、BMP5、BMP6、BMP7、BMP8A、BMP8B、BMPR2、C10orf99、C1QTNF4、C5、CCL28、CCR1、CCR2、CCR3、CCR5、CCR6、CCR7、CD109、CD36、CD4、CD40LG、CD74、CER1、CHRD、CKLF、CLCF1、CMTM1、CMTM2、CMTM3、CMTM4、CMTM5、CMTM6、CMTM7、CMTM8、CNTF、CNTFR、COPS5、CRLF1、CSF1、CSF1R、CSF2、CSF3、CSF3R、CTF1、CX3CR1、CXCL16、CXCL17、CXCR1、CXCR2、CXCR3、CXCR4、CXCR6、EBI3、EDN1、ELANE、ENG、FAM3B、FAM3C、FAM3D、FAS、FASLG、FGF2、FLT3LG、FZD4、GBP1、GDF1、GDF10、GDF11、GDF15、GDF2、GDF3、GDF5、GDF6、GDF7、GDF9、GPI、GREM1、GREM2、GRN、HAX1、HFE2、HMGB1、HYAL2、IFNA10、IFNA14、IFNA16、IFNA2、IFNA5、IFNA6、IFNA8、IFNAR1、IFNAR2、IFNB1、IFNE、IFNG、IFNGR1、IFNK、IFNL1、IFNL3、IFNW1、IL10RA、IL11RA、IL12A、IL12B、IL12RB1、IL17A、IL17B、IL17C、IL17D、IL17F、IL18BP、IL-19、IL1F10、IL1R1、IL1R2、IL1RAPL1、IL1RL1、IL1RN、IL20RA、IL20RB、IL21、IL22、IL22RA1、IL22RA2、IL23A、IL23R、IL24、IL25、IL26、IL27、IL2RA、IL2RB、IL2RG、IL31、IL31RA、IL32、IL33、IL34、IL36A、IL36B、IL36G、IL36RN、IL37、IL6R、IL6ST、INHA、INHBA、INHBB、INHBC、INHBE、ITGA4、ITGAV、ITGB1、ITGB3、KIT、KITLG、KLHL20、LEFTY1、LEFTY2、LIFR、LTA、LTB、LTBP1、LTBP3、LTBP4、MIF、MINOS1-、MSTN、NAMPT、NBL1、NDP、NLRP7、NODAL、NOG、NRG1、NRP1、NRP2、OSMR、PARK7、PDPN、PF4、PF4V1、PGLYRP1、PLP2、PPBP、PXDN、SCG2、SCGB3A1、SECTM1、SLURP1、SOSTDC1、SP100、SPP1、TCAP、TGFBR1、TGFBR2、TGFBR3、THBS1、THNSL2、THPO、TIMP1、TNF、TNFRSF11、TNFRSF1A、TNFRSF9、TNFRSF10、TNFSF11、TNFSF12、TNFSF12-、TNFSF13、TNFSF13B、TNFSF14、TNFSF15、TNFSF18、TNFSF4、TNFSF8、TNFSF9、TRIM16、TSLP、TWSG1、TXLNA、VASN、VEGFA、VSTM1、WFIKKN1、WFIKKN2、WNT1、WNT2、WNT5A、WNT7A、及びZFP36、が挙げられるがこれらに限定されない。
これらの遺伝子の配列は当該技術分野において周知かつ入手可能である。
適応症、及び実際の(iNKT)療法における標準治療
一部の実施形態では、本明細書で開示する及び/または本明細書で開示する方法を用いて作製されるゲノム編集免疫エフェクター細胞は、1種または複数種のキメラ抗原受容体(CAR)を発現し、医薬品として、すなわち、疾患の治療用に使用され得る。多くの実施形態では、細胞はiNKT細胞である。
本明細書で開示する及び/または本明細書で開示する方法を用いて作製される細胞は、がん、自己免疫疾患、感染症、及びその他の症状を治療するために、または、がん、自己免疫疾患、感染症、及びその他の症状を治療するための医薬品を製造するために、免疫療法及び養子細胞移入に使用され得る。
がんは、血液悪性腫瘍または固形腫瘍であってもよい。血液悪性腫瘍としては、白血病、リンパ腫、多発性骨髄腫、及びそれらの亜型、が挙げられる。リンパ腫は、様々な方法、多くの場合、悪性細胞の基本的なタイプに基づいて分類することができ、ホジキンリンパ腫(リードスタンバーグ細胞のがんであることが多いが、時としてB細胞から発生することもあり、全てのその他のリンパ腫は非ホジキンリンパ腫である)、B細胞リンパ腫、T細胞リンパ腫、マントル細胞リンパ腫、バーキットリンパ腫、濾胞性リンパ腫、ならびに、本明細書で定義する及び当該技術分野において周知のその他のリンパ腫、が挙げられる。
B細胞リンパ腫としては、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、慢性リンパ性白血病(CLL)/小リンパ球性リンパ腫(SLL)、ならびに、本明細書で定義する及び当該技術分野において周知のその他のB細胞リンパ腫、が挙げられるがこれらに限定されない。
T細胞リンパ腫としては、T細胞急性リンパ芽球性白血病/リンパ腫(T-ALL)、末梢T細胞リンパ腫(PTCL)、T細胞慢性リンパ性白血病(T-CLL)、セザリー症候群、ならびに、本明細書で定義する及び当該技術分野において周知のその他のT細胞リンパ腫、が挙げられる。
白血病としては、急性骨髄性(myeloid)(または骨髄性(myelogenous))白血病(AML)、慢性骨髄性(または骨髄性)白血病(CML)、急性リンパ性(またはリンパ芽球性)白血病(ALL)、慢性リンパ性白血病(CLL)、毛様細胞性白血病(時として、リンパ腫に分類される)、ならびに、本明細書で定義する及び当該技術分野において周知のその他の白血病、が挙げられる。
形質細胞性悪性腫瘍としては、リンパ形質細胞性リンパ腫、形質細胞腫、及び多発性骨髄腫、が挙げられる。
一部の実施形態では、患者におけるがんを治療するために、とりわけ、固形腫瘍、例えば、黒色腫、神経芽細胞腫、神経膠腫など、または、がん、例えば、脳、頭頸部、乳房、肺(例えば、非小細胞肺癌、NSCLC)、生殖系(例えば、卵巣)、上部消化管、膵臓、肝臓、腎臓(renal)系(例えば、腎臓(kidney))、膀胱、前立腺、及び結腸直腸の腫瘍など、を治療するために、医薬品を使用してもよい。
別の実施形態では、患者におけるがんを治療するために、とりわけ、多発性骨髄腫及び急性骨髄性白血病(AML)から選択される血液悪性腫瘍、ならびに、T細胞急性リンパ芽球性白血病(T-ALL)、非ホジキンリンパ腫、及びT細胞慢性リンパ性白血病(T-CLL)から選択されるT細胞悪性腫瘍、を治療するために、医薬品を使用してもよい。
一部の実施形態では、自己免疫疾患、例えば、狼瘡、自己免疫(関節)リウマチ、多発性硬化症、移植拒絶反応、クローン病、潰瘍性大腸炎、皮膚炎などの治療に、細胞を使用してもよい。一部の実施形態では、細胞は、抗体フラグメントの代わりに抗原またはそのフラグメントを提示するキメラ自己抗体受容体T細胞、すなわちiNKTであり、このタイプの養子細胞移入では、自己免疫疾患を引き起こすB細胞は、遺伝子改変T細胞を攻撃しようとし、遺伝子改変T細胞を殺傷することで反応する。
一部の実施形態では、HIV及び結核などの感染症の治療に、細胞を使用してもよい。
別の実施形態では、本開示のiNKT細胞は、強力なin vivoT細胞増殖を受けてもよく、長時間にわたり持続し得る。
一部の実施形態では、本開示のiNKT細胞を用いた患者の治療は、緩和、治癒的または予防的となり得る。その治療は、自家免疫療法治療の一部、または同種異系免疫療法治療の一部のいずれかであってもよい。自家とは、患者の治療に用いる細胞、細胞株、または細胞集団が、上記患者またはヒト白血球抗原(HLA)適合ドナーに由来するということを意味する。同種異系とは、患者の治療に用いる細胞または細胞集団が、その患者ではなくドナーに由来するということを意味する。
本開示のiNKT細胞を用いたがんの治療は、抗体療法、化学療法、サイトカイン療法、樹状細胞療法、遺伝子療法、ホルモン療法、放射線療法、レーザー光線療法、及び放射線療法、から選択される1種または複数種の治療法と組み合わされてもよい。
本開示のiNKT細胞またはiNKT細胞の集団の投与は、エアロゾル吸入、注射、摂取、輸注、埋め込み、または移植、により実施される。本明細書に記載のiNKT細胞組成物、すなわち、モノCAR、デュアルCAR、タンデムCARは、皮下、皮膚内、腫瘍内、節内、髄内、筋肉内、静脈内もしくはリンパ管内注射、または腹腔内で、患者に投与され得る。一実施形態では、本開示の細胞組成物は、静脈注射で投与されることが好ましい。
iNKT細胞またはiNKT細胞の集団の投与は、体重1kgあたり10~10の細胞、好ましくは、10~10の細胞/kg(体重)(これらの範囲内の細胞数の全ての整数値を含む)、の投与で構成され得る。iNKT細胞またはiNKT細胞の集団は、1回または複数回の投与で投与されてもよい。別の実施形態では、有効量のiNKT細胞またはiNKT細胞の集団は、単回投与で投与される。別の実施形態では、有効量の細胞は、ある期間にわたり2回以上の投与で投与される。投与のタイミングは健康管理提供者の良識の範囲内であり、患者の臨床症状によって決まる。iNKT細胞またはiNKT細胞の集団は、任意の供給源、例えば、血液銀行またはドナーなどから得てもよい。患者の要望は様々ではあるが、個々の疾患または症状のための、任意のiNKT細胞集団(複数可)の有効量の至適範囲の算出は当業者の知るところである。有効量とは、治療効果または予防効果をもたらす量のことを意味する。投与量は、患者レシピエントの年齢、健康及び体重、併用治療の種類(ある場合、治療の頻度)、ならびに、望まれる効果の性質によって決まる。
別の実施形態では、有効量の、iNKT細胞もしくはiNKT細胞の集団、またはそれらiNKT細胞を含む組成物は、非経口で投与される。投与は、静脈内投与であってもよい。iNKT細胞もしくはiNKT細胞の集団、またはそれらiNKT細胞を含む組成物の投与は、腫瘍内への注射によって直接実施されてもよい。
本開示の一実施形態では、iNKT細胞またはiNKT細胞の集団は、iNKT細胞の増殖及び持続性を向上させる、サイトカイン、もしくはiNKT細胞内のサイトカインの発現を用いた治療、ならびに、IL-2、IL-7、及びIL-15、またはそのアナログを用いることを含むがこれらに限定されない治療、を含むがこれらに限定されない多くの関連治療モダリティと共に、例えば、その前に、それと同時に、またはその後に、患者に投与される。
一部の実施形態では、本開示のiNKT細胞またはiNKT細胞の集団は、TGFβ、インターロイキン10(IL-10)、アデノシン、VEGF、インドールアミン-2,3-ジオキシゲナーゼ1(IDO1)、インドールアミン-2,3-ジオキシゲナーゼ2(IDO2)、トリプトファン-2,3-ジオキシゲナーゼ(TDO)、乳酸、低酸素症、アルギナーゼ、及びプロスタグランジンE2の阻害剤、を含むがこれらに限定されない、免疫抑制経路を阻害する薬剤と組み合わせて使用してもよい。
別の実施形態では、本開示のiNKT細胞またはiNKT細胞の集団は、抗CTLA4(イピリムマブ)、抗PD1(ペンブロリズマブ、ニボルマブ、セミプリマブ)、抗PDL1(アテゾリズマブ、アベルマブ、デュルバルマブ)、抗PDL2、抗BTLA、抗LAG3、抗TIM3、抗VISTA、抗TIGIT、及び抗KIR、を含むがこれらに限定されないT細胞チェックポイント阻害薬、と組み合わせて使用してもよい。
別の実施形態では、本開示のiNKT細胞またはiNKT細胞の集団は、CD28、ICOS、OX-40、CD27、4-1BB、CD137、GITR、及びHVEMを刺激する抗体を含むがこれらに限定されないT細胞アゴニストと組み合わせて使用してもよい。
別の実施形態では、本開示のiNKT細胞またはiNKT細胞の集団は、レトロウイルス、ピコルナウイルス、ラブドウイルス、パラミクソウイルス、レオウイルス、パルボウイルス、アデノウイルス、ヘルペスウイルス、及びポックスウイルス、を含むがこれらに限定されない治療用腫瘍崩壊ウイルス、と組み合わせて使用してもよい。
別の実施形態では、α-GalCerとIL-12の両方がiNKT活性化のために相乗的に作用することから、iNKT細胞を、これらの化合物と同時投与してもよい。
別の実施形態では、本開示のiNKT細胞またはiNKT細胞の集団は、TLR3、TLR4、TLR7、及びTLR9アゴニスト、を含むがこれらに限定されない、Toll様受容体アゴニストなどの免疫活性化治療薬、と組み合わせて使用してもよい。
別の実施形態では、本開示のiNKT細胞またはiNKT細胞の集団は、環状GMP-AMPシンターゼ(cGAS)などのインターフェロン遺伝子刺激因子(STING)アゴニストと組み合わせて使用してもよい。
免疫エフェクター細胞無形成症、とりわけ、T細胞無形成症はまた、養子細胞移入療法後の懸念事である。治療する悪性腫瘍がT細胞悪性腫瘍でありiNKT細胞がT細胞抗原を標的とする場合、抗原を発現する正常なT細胞及びその前駆細胞が枯渇し、免疫機構が損なわれる。それゆえ、これらの副作用を管理するための方法は、治療の案内係である。このような方法としては、後ほど、iNKT細胞が枯渇または不活性化した後に、増殖させて患者に再注入するために、自家または同種異系(任意選択的に、拒絶反応を引き起こさないまたは拒絶されないように遺伝子改変された)のいずれかの、非悪性のT細胞または前駆細胞を選択及び保持することが挙げられる。代替的に、TCR保有細胞の亜型、例えば、正常及び悪性のTRBC1(しかし、TRBC2細胞ではない)、または代替的に、TRBC2(しかし、TRBC1細胞ではない)などを認識して殺傷するiNKT細胞を使用して、十分な正常T細胞を保持して正常な免疫機構の機能を維持しつつ、T細胞悪性腫瘍を根絶してもよい。
定義
本明細書において特に定義しない限り、使用する全ての技術用語及び科学用語は、遺伝子療法、生化学、遺伝学、及び分子生物学の分野の当業者が一般に理解する意味と同一の意味を有する。本明細書に記載の組成物及び方法と同様または同等の全ての開示される組成物及び方法を、本開示の実施または試験に使用することができる。
数値の範囲を開示する場合、また表記「n…~n」または「n…~nの間」を使用する場合、n及びnは数字であり、そのため、特に明記しない限り、この表記は、数字自体及びそれらの間の範囲を含むことを意図している。この範囲は、数字間における整数または連続であってもよく、末端の数値を含む。例えば、「2~6個の炭素」の範囲は、炭素が整数単位で存在することから、2、3、4、5、及び6個の炭素を含むことを意図している。対照的に、例えば、「1~3μM(マイクロモル)」の範囲は、1μM、3μM、及び、数字間における任意数の有効数字(例えば、1.255μM、2.1μM、2.9999μMなど)の全てを含むことを意図している。
用語「約」は、本明細書で使用する場合、その用語が修飾する数値を、このような数値が誤差の範囲内で変動することを表すように、限定することを意図している。誤差の範囲が特にない場合、例えば、データのグラフまたは表に記載された平均値に対する標準偏差が列挙されている場合などにおいて、用語「約」は、列挙された数値を包含し得る範囲、及び、同様に、有効数字を考慮して、その数値にまで切り上げるまたは切り下げることにより含まれ得る範囲を意味するものと理解すべきである。
細胞に関する用語「活性化」(及びその別の活用型)は通常、「刺激すること」と同義であると理解すべきであり、本明細書で使用する場合、細胞集団の増殖をもたらす細胞の処理のことを意味する。T細胞において、活性化は、CD2及びCD28(及び同様に、CD2の場合もある)アゴニスト、一般的には、任意選択的に、磁性ビーズ上にコーティングしたまたはコロイド状のポリマーマトリックスにコンジュゲートした、抗体、に曝露することによって達成されることが多い。
用語「抗原」は、本明細書で使用する場合、T細胞受容体またはキメラ抗原受容体が認識する(すなわち、T細胞受容体またはキメラ抗原受容体の標的である)細胞表面タンパク質である。古典的な意味において、抗原は、抗体が認識する物質、典型的にはタンパク質であるが、CARが、1種または複数種の抗原(複数可)を認識する軽(V)鎖及び重(V)鎖などの抗体由来ドメインを含む限りにおいて、定義は重複するものである。
用語「がん」とは、体内における悪性腫瘍、または細胞の異常増殖のことを意味する。多くの異なるがんが、特定の細胞表面タンパク質または分子によって特性決定または同定され得る。それゆえ、一般的な用語において、本開示によるがんは、本明細書に記載のiNKT細胞などの免疫エフェクター細胞を用いて治療可能なあらゆる悪性腫瘍のことを意味し得、免疫エフェクター細胞は、がん細胞上の細胞表面タンパク質を認識してそれに結合する。本明細書で使用する場合、がんとは、血液悪性腫瘍、例えば、多発性骨髄腫、T細胞悪性腫瘍、またはB細胞悪性腫瘍などのことを意味し得る。T細胞悪性腫瘍としては、T細胞急性リンパ芽球性白血病(T-ALL)または非ホジキンリンパ腫を挙げることができるがこれらに限定されない。がんはまた、子宮頸癌、膵臓癌、卵巣癌、中皮腫、及び肺癌、を含むがこれらに限定されない固形腫瘍のことを意味し得る。
「細胞表面タンパク質」は、本明細書で使用する場合、細胞の表面上で少なくとも部分的に、細胞が発現するタンパク質(またはタンパク質複合体)である。細胞表面タンパク質の例としては、TCR(及びそのサブユニット)及びCD7が挙げられる。
「キメラ抗原受容体」すなわち「CAR」とは、本明細書で使用する場合、及び当該技術分野において一般的に使用する場合、細胞外リガンド結合ドメイン、膜貫通ドメイン、及び、細胞外リガンド結合ドメインが標的細胞上に存在する構成要素に結合すると、細胞に特殊機能を実行させるシグナル伝達ドメイン、を有する、組換え融合タンパク質のことを意味する。例えば、CARは、特定の抗標的細胞免疫活性を示すキメラタンパク質を産生するための、T細胞受容体を活性化させる細胞内ドメインを有し、所望の抗原(例えば、腫瘍抗原)に対する、抗体に基づいた特異性を有していてもよい。第1世代のCARは、細胞外リガンド結合ドメイン、及びシグナル伝達ドメイン(一般的には、CD3ζまたはFcεRIγ)を含む。第2世代のCARは、細胞内共刺激ドメイン(一般的には、4-1BBまたはCD28)を含ませることにより、第1世代のCAR構築物を土台に構築されている。これらの共刺激ドメインは、第1世代のCARと比較して、iNKT細胞の傷害性及び増殖を向上させるのに役立つ。第3世代のCARは、主として、iNKT細胞の増殖及び持続性を向上させるための、複数の共刺激ドメインを含む。キメラ抗原受容体は、MHC非依存性抗原に結合するその能力と、その細胞内ドメインを介して活性化シグナルを変換するその能力の両方により、その他の抗原結合因子とは区別される。
「CAR保有免疫エフェクター細胞」は、少なくとも1種のCARを形質導入された免疫エフェクター細胞である。「CAR-iNKT細胞」は、少なくとも1種のCARを形質導入されたiNKT細胞であり、CAR-iNKT細胞は、モノ、デュアル、またはタンデムCAR-iNKT細胞であってもよい。CAR-iNKT細胞は、自家(対象自身の細胞から遺伝子改変されたことを意味する)であってもよく、または、同種異系(細胞が健康なドナーを供給源としていることを意味する)であってもよく、多くの場合、宿主対移植片反応、または移植片対宿主反応を引き起こさないように遺伝子改変されている。ドナー細胞はまた、臍帯血に由来していてもよく、または、人工多能性幹細胞から作製してもよい。
用語「CAR-iNKT細胞」(すなわち、iNKT-CAR)とは、キメラ抗原受容体を発現するiNKT細胞のことを意味する。
デュアルiNKT-CAR細胞(すなわち、iNKT-dCAR)は、同一エフェクター細胞内に発現した異なる標的抗原に対する親和性を有する、2つの異なるキメラ抗原受容体ポリペプチドを発現するiNKT-CAR細胞であり、それぞれのCAR機能は独立している。CARは、単一または複数のポリヌクレオチド配列から発現してもよい。
タンデムiNKT-CAR細胞(すなわち、iNKT-tCAR)は、異なる標的に対する親和性を有する、2つの異なる抗原認識ドメインを含有する単一キメラ抗原ポリペプチドを有するiNKT-CAR細胞であり、抗原認識ドメインは、ペプチドリンカーによって連結し、共通の共刺激ドメイン(複数可)を共有しており、いずれかの抗原認識ドメインの結合により、共通の共刺激ドメイン(複数可)、及びシグナル伝達ドメインにわたり、シグナルが伝達される。
用語「組み合わせ治療」とは、本開示に記載の治療症状または障害を治療するための、2種またはそれ以上の治療薬の投与のことを意味する。このような投与は、固定比率の活性成分を有する単一のカプセル剤、または、それぞれの活性成分用の複数の別々のカプセル剤などによる、これらの治療薬のほぼ同時の共投与を包含する。加えて、このような投与はまた、それぞれの種類の治療薬の連続的な使用を包含する。いずれの場合も、治療レジメンは、本明細書に記載の症状または障害の治療において、薬剤組み合わせの有益な効果をもたらす。
用語「組成物」とは、本明細書で使用する場合、1種または複数種の治療的に許容される担体と組み合わせた、免疫療法用の細胞集団のことを意味する。
用語「疾患」は、本明細書で使用する場合、全てが、正常な機能を損なっているヒトもしくは動物の体またはその部位の1つにおける、異常な状態を反映し、典型的には、徴候及び症状が際立つことにより顕在化し、またヒトまたは動物の寿命または生活の質を低下させるという点で、一般的に、用語「障害」、「症候群」及び「症状」(医学的症状と同様)と同義であり、それらと同じ意味で用いられることを意図している。
用語「同胞殺し」とは、本明細書で使用する場合、標的とされる細胞が、両方の細胞上のキメラ抗原受容体が特異的に認識する抗原を発現していることから、iNKT-CAR細胞が、そのiNKT-CAR細胞の標的と同一のキメラ抗原受容体を含む別のiNKT-CAR細胞の標的となる際、または別のiNKT-CAR細胞によって殺傷される際に生じるプロセスのことを意味する。キメラ抗原受容体が特異的に結合する抗原を欠損したキメラ抗原受容体を含むiNKT-CARは、「同胞殺し抵抗性」である。
用語「ゲノム編集」とは、本明細書で使用する場合、遺伝子が、非機能的となるように付加、欠失、または修飾されているということを意味する。それゆえ、特定の実施形態では、「遺伝子編集iNKT細胞」は、少なくとも1種の抗原を認識するCARなどの遺伝子を付加された、及び/または、CARが認識する抗原(複数可)の遺伝子(複数可)などの遺伝子を欠失された、iNKT細胞である。
本明細書で使用する場合、「自殺遺伝子」とは、活性化した場合にiNKT細胞の死をもたらす、当該技術分野において周知の標準的な方法を用いてiNKT細胞に導入された核酸配列のことを意味する。必要に応じ、自殺遺伝子は、in vivoにおけるiNKT細胞の追跡及び除去、すなわち、殺傷を促進し得る。自殺遺伝子を活性化することによりiNKT細胞の殺傷を促進することは、当該技術分野において周知の標準的な方法を用いて実施することができる。当該技術分野において周知の自殺遺伝子システムとしては、(a)非毒性プロドラッグのガンシクロビル(GCV)をGCV-三リン酸に変換して、DNA複製を停止させることにより細胞死をもたらす、単純ヘルペスウイルス(HSV)-tk、(b)iCasp9が低分子AP1903に結合することにより二量体化が可能となり、内因性アポトーシス経路が活性化されること、及び、(c)関連モノクローナル抗体の投与後、補体/抗体依存性細胞傷害(CDC/ADCC)により、修飾細胞の効率的な除去を可能とする、形質導入iNKT細胞において発現する、標的となり得る表面抗原(例えば、CD20及びトランケートEGFR)、が挙げられるがこれらに限定されない。
例えば、「がん細胞」は、悪性T細胞、悪性B細胞、または悪性形質細胞である。
「悪性B細胞」は、B細胞悪性腫瘍に由来するB細胞である。B細胞悪性腫瘍としては、(DLBCL)、慢性リンパ性白血病(CLL)/小リンパ球性リンパ腫(SLL)、及びB細胞前駆細胞急性リンパ芽球性白血病(ALL)、が挙げられるがこれらに限定されない。
「悪性T細胞」は、T細胞悪性腫瘍に由来するT細胞である。
用語「T細胞悪性腫瘍」とは、T細胞前駆細胞、成熟T細胞、またはナチュラルキラー細胞に由来する、広く、極めて不均一なグループの悪性腫瘍のことを意味する。T細胞悪性腫瘍の非限定例としては、T細胞急性リンパ芽球性白血病/リンパ腫(T-ALL)、ヒトT細胞白血病ウイルス1型陽性(HTLV-1+)成人T細胞性白血病/リンパ腫(ATL)、T細胞前リンパ球性白血病(T-PLL)、成人T細胞リンパ腫/白血病(HTLV-1関連)、アグレッシブNK細胞性白血病、未分化大細胞リンパ腫(ALCL)、ALK陽性未分化大細胞リンパ腫(ALCL)、ALK陰性血管免疫芽球性T細胞リンパ腫(AITL)、乳房インプラント関連未分化大細胞リンパ腫、NK細胞の慢性リンパ増殖性障害、節外性鼻型NK/T細胞リンパ腫、腸疾患型T細胞リンパ腫、濾胞性T細胞リンパ腫、肝脾T細胞リンパ腫、GI管の無痛性T細胞リンパ増殖性障害、単形性上皮向性腸管T細胞リンパ腫、菌状息肉腫、TFH表現型を伴う節性末梢T細胞リンパ腫、末梢T細胞リンパ腫(PTCL)、NOS、原発性皮膚γδT細胞リンパ腫、原発性皮膚CD8+アグレッシブ表皮向性細胞傷害性T細胞リンパ腫、原発性皮膚先端型CD8+T細胞リンパ腫、原発性皮膚CD4+小型/中型T細胞リンパ増殖性障害[原発性皮膚未分化大細胞リンパ腫(C-ALCL)、リンパ球様丘疹症]、セザリー症候群、皮下脂肪組織炎様T細胞リンパ腫、小児期の全身性EBV+T細胞リンパ腫、及びT細胞大顆粒リンパ球性白血病(LGL)、が挙げられる。
「健康なドナー」は、本明細書で使用する場合、血液悪性腫瘍(例えば、T細胞悪性腫瘍)を有していない健康なドナーである。
用語「治療的に許容される」とは、過度の毒性、炎症、及びアレルギー反応を伴わず、妥当な利益/リスク比に見合い、及び/または、その使用目的において有効である、患者の組織との接触に用いるのに適切な物質のことを意味する。
用語「治療的に有効」は、疾患もしくは障害の治療に使用する、または、臨床エンドポイントの効果に使用する、活性成分の量を適格とすることを意図している。
本明細書で使用する場合、「分泌可能なタンパク質」は、別の細胞に影響を及ぼす、細胞が分泌するタンパク質である。例えば、分泌可能なタンパク質としては、サイトカイン、ケモカイン、及び転写因子、が挙げられる。
用語「ドナー鋳型」とは、相同組換え修復(HDR)DNA修復経路により二本鎖切断を修復するための鋳型として細胞が使用する基準ゲノム物質のことを意味する。ドナー鋳型は、ゲノム内へと挿入される、二本鎖切断部位の側面を狙う2本のホモロジーアームを有するDNAの断片(発現させる遺伝子、すなわち、CARまたはマーカーの遺伝子を含有している)を含有している。一部の実施形態では、ドナー鋳型は、アデノ随伴ウイルス、一本鎖DNA、または二本鎖DNA、であってもよい。
用語「に曝露する」は、本明細書で使用する場合、目的の組成物(例えば、抗体など)を別の目的の組成物(例えば、細胞など)と密着させる状況において、「と培養する」と同義であることを意図しており、短い期間の接触は、用語「と培養する」の代わりに用語「に曝露する」を使用することを意図している。
用語「患者」は一般的に、用語「対象」と同義であり、ヒトを含む全ての哺乳動物を含む。
以下の実施例により本発明を更に説明する。
実施例1-ゲノム編集iNKT細胞を作製するための方法
以下の工程を採用して、本明細書で開示する遺伝子編集iNKT細胞を得てもよい。当業者は理解するように、おそらく異なる効率をもたらすであろうが、ある特定の工程を、以下に記載する順で連続的に実施してもよく、または、順不同に実施してもよい。
工程1.1名または複数名の健康なドナーから末梢血単核球(PBMC)を採取する。
工程2.次に、例えば、Valpha24に結合する、標識抗体をコーティングした磁性ビーズ(例えば、Miltenyi Biotec)を使用した磁気選択を用いて、ドナーのPBMCからiNKT細胞を単離/精製する。その他の精製技術は当該技術分野において周知であり、それらを使用してもよい。
工程3.その後、iNKT細胞を活性化させる。iNKTを活性化させるための方法はいくつかある。精製後に残った非iNKT画分に照射(例えば、40Gy)を行ってから、α-GalCerを添加してもよい(インバリアント受容体用のリガンドであるCD1d-α-GalCerを有する細胞を作製するために、例えば、200ng/mlを1時間、例えば、37℃で)。次に、iNKT細胞を、照射α-GalCerパルス陰性細胞と培養する(1:10)。代替的に、抗iNKT受容体抗体を使用してiNKTを活性化させてもよい。更に別の代替例では、α-GalCerと複合体を形成した精製CD-1dを使用して、iNKTを活性化させてもよい。更に別の代替例では、α-GalCerをパルスしたCD1d発現細胞株を使用して、iNKTを刺激してもよい。
工程4.1種または複数種の抗原を標的とするCARを細胞に形質導入する場合、CARの標的である抗原を細胞表面から欠失させてもよく、または、その抗原の発現を抑制してそれに続く同胞殺しを防止してもよい。Cas9 mRNA、及び標的(複数可)に対するgRNAをエレクトロポレーションすることにより、標的の欠失を実施してもよい。しかしながら、その他の技術を使用して標的の発現を抑制してもよい。これらの技術としては、その他のゲノム編集技術、例えば、TALEN、ZFN、RNA干渉、及び、抗原の内部結合を生じさせて細胞表面発現を防止することなどが挙げられる。標的の欠失は、全ての状況において必須ということでなくてもよい。例えば、CD7は、iNKTの50%において発現しているに過ぎず、それに対し、CD2は、ほぼ全てのiNKTにおいて発現している。使用可能なgRNAの例としては、表2に示すgRNA、及び、当該技術分野において周知のその他のgRNAが挙げられる。
Figure 2022516389000037
工程5.次に、1種または複数種の抗原標的またはタンパク質標的を標的とする、すなわち、認識する、CAR、例えば、CAR構築物を含有するレンチウイルスを、iNKTに形質導入してもよい。形質導入/トランスフェクションの任意のその他の好適な方法を用いてもよく、例えば、転移因子を含有する、DNAを組み込んだウイルスもしくは非ウイルスベクター、または、一過性発現の、非DNAを組み込んだポリヌクレオチド、例えば、mRNAなど、を使用したトランスフェクションを用いてもよく、あるいは、相同または非相同組換えを使用した、ヌクレアーゼ活性部位へのCARポリヌクレオチドの挿入を用いてもよい。
工程6.次に、iNKTを培養してCAR-iNKT集団を増殖させる。この増殖を数週間にわたり継続してもよい。定期的にα-GalCer添加細胞を加えることにより、iNKTが刺激される状態を維持してもよいが、初回刺激の場合と同様に、その他の選択肢が利用可能である。培地は通常、高用量のIL-2(本発明者らの手順においては目下、200ユニット/ml)を含有している。IL-7、IL-15、または、IL-2、IL-7、及びIL-15の組み合わせもまた使用して、iNKTをin vitroで増殖させてもよい。力価または安定性が向上するように遺伝子改変されたこれらサイトカインのアナログもまた使用して、培養を増強してもよい。
工程7.任意選択的に、複数のドナーに由来する細胞をプールしてもよい。これはプロセスの最後の工程である必要はなく、照射α-GalCerパルス陰性細胞に代わる選択肢、例えば、抗体を使用してiNKT細胞を刺激する場合、実際に、最初の工程のうちの1つ(例えば、工程3の前)であってもよい。これは、α-GalCerを添加した細胞集団が、複数のドナーに由来する試料をプールした場合に、細胞傷害性となり得るT細胞及びNK細胞を含有するからである。
これらの工程を図1及び図7のフローチャートで示す。当業者は、図1に明記した期間にある程度の自由度が可能であることを理解するであろう。これらの方法を用いて作製した、CD7標的化CAR(iNKT-CAR7)を有するCAR-iNKT細胞を図3に、別の抗原を標的とするCARを有するCAR-iNKT細胞を図4に示す。iNKT-CARの別の例については、以下の実施例IVに記載する。
実施例2-ゲノム編集タンデムCAR-iNKT細胞を作製するための方法
実施例1における手順の変化形態では、2種の抗原を認識するタンデムCAR-iNKTを作製してもよい。工程4では、細胞表面から2種の抗原を欠失させる、または、上記のとおり抑制してもよいが、2種の標的それぞれ用のgRNA、及びCas9 mRNAをエレクトロポレーションする。次に、工程5では、2種の標的を認識するCARをiNKTに形質導入する。この変化形態を図2のフローチャートで示す。これらの方法を用いて作製した、タンデムCD2及びCD7標的化CAR(T-CAR7×2)を有するCAR-iNKT細胞を図5に、A及びBと表記した2種のその他の抗原を標的とするCAR(iNKT-CAR(A×B))を有するCAR-iNKT細胞を図6に示す。タンデムiNKT-CARの別の例については、以下の実施例IVに記載する。
実施例3-ゲノム編集デュアルCAR-iNKT細胞を作製するための方法
実施例1における手順の変化形態では、2種の抗原を標的とするデュアルCAR-iNKT細胞を作製してもよい。この変化形態では、それぞれが異なる抗原を認識する2種の独立したCARを含有していてもよい。デュアルiNKT-CARの別の例については、以下の実施例IVに記載する。
実施例4-ゲノム編集iNKT-CAR細胞
上記の方法を使用して、いくつかのタイプのゲノム編集iNKT細胞を作製してもよい。図3及び図5は、2つの具体的な例を示している。CARの抗原標的である表面タンパク質を欠失または抑制した別の例について、本明細書に記載する。通常、抗原を欠失または抑制した例は、同胞殺し抵抗性の利点を有する。特定の実施形態では、iNKT-CARは、CARの抗原標的である表面タンパク質を欠失または抑制している。
CARの抗原標的である1種または複数種の表面タンパク質を欠失または抑制した、及び、欠失または抑制していない、タンデムiNKT-CAR及びデュアルiNKT-CARの別の例については、以下に記載する。通常、より多くの抗原を欠失または抑制した例は、より高い同胞殺し抵抗性の利点を有する可能性がより高い。タンデムCARにおいて抗原(scFv)が配向する順番が以下の表3に記載されているが、限定することを意図するものではなく、どちらの配向のタンデムiNKT-CARも含むということを、更に留意すべきである。例えば、CD2×CD3ε iNKT-tCARは、CD2-CD3εの配向を有するtCAR、またはCD3ε-CD2の配向を有するtCARを包含する。
実施例5-ゲノム編集iNKT細胞
Figure 2022516389000038

Figure 2022516389000039
実施例6-ゲノム編集iNKT細胞を用いた患者(複数可)の治療
図7に示す、上記の方法により作製した細胞を用いて、患者を治療してもよい。例えば、iNKT-CARの増殖させた集団を患者に注入してもよい。
工程7.図7の工程7に示すとおり、治療前に数名のドナーに由来するiNKTを混合することが可能である。
工程8.ゲノム編集細胞であるiNKTを患者に注入する。
工程9.iNKTは、アロ反応性を誘導せずに、がん細胞を標的とする。例えば、iNKT-CAR7細胞は、表面タンパク質としてCD7を保有するがん細胞(及びその他の非がん細胞)を標的とし得る。iNKT-CAR7×2細胞は、1種の表面タンパク質または複数種の表面タンパク質としてCD7及び/またはCD2を保有するがん細胞を標的とし得る。
工程10.任意選択的に、IL-7、IL-15、IL-2、αGalCer、または上記のいずれかのアナログを、単独でまたは組み合わせて、同時注入すると、in vivoにおける機能が増強されると予想される。同時注入は、その同時注入が注入細胞の増殖を刺激するのになおも有効である限りにおいて、わずかな時間差があってもよい。
本明細書で開示するiNKT-CARで治療した患者は、有意に長期間にわたる生存、全身腫瘍組織量の低下、健康状態の改善、及び寛解を示すと予想される。
実施例7-バイオアッセイ
以下のアッセイまたはその変形形態を使用して、本明細書で開示するiNKT-CARの有効性を評価してもよい。
T-ALL用のiNKT-CAR7。T-ALLの異種モデルを用いたiNKT-CAR7の有効性試験:1×10のClick Beetle Redルシフェラーゼ(CBR)標識CCRF-CEM T-ALL(FACSにより99% CD7+)細胞をNSGレシピエントにI.V.注射してから、2×10~1×10のiNKT-CAR7または非標的iNKT-CAR19対照細胞を+4日目にI.V.注入する。iNKT-CART19を投与されたマウスまたは腫瘍のみを注入されたマウスとは対照的に、iNKT-CAR7を投与されたマウスは、生物発光イメージングを用いて測定する際に、有意に長期間にわたる生存及び全身腫瘍組織量の低下を示す。
MM用のiNKT-CAR(CS1)。多発性骨髄腫の異種モデルを用いたiNKT-CAR-CS1の有効性試験:5×10のClick Beetle Redルシフェラーゼ(CBR)標識MM.1S(FACSにより99% CS1+)細胞をNSGレシピエントにI.V.注射してから、2×10~1×10のiNKT-CAR-CS1または非標的iNKT-CAR19対照細胞を+4日目、または+14日目もしくは+28日目にI.V.注入する。iNKT-CAR19を投与されたマウスまたは腫瘍のみを注入されたマウスとは対照的に、iNKT-CAR-CS1を投与されたマウスは、生物発光イメージングを用いて測定する際に、有意に長期間にわたる生存及び全身腫瘍組織量の低下を示す。
実施例8-gRNA選択のためのオフターゲット解析
Washington University Genome Engineering & iPSCにおいて、ガイドRNAを設計して活性を確認した。Washington University Genome Engineering & iPSCにおいて、ガイドRNAを設計して活性を確認した。任意のgRNAに対して相補的な配列は、標的遺伝子座を含むがこれらに限定されないゲノム中にわたり存在し得る。短い配列はオフターゲットにハイブリダイズする可能性がより高い。同様に、gRNA内のある程度長い配列は、ゲノム中にわたり、完全マッチ(長_0)またはニアマッチ(それぞれ、単一のヌクレオチド差または2つのヌクレオチド差を表す、長_1、長_2)を有し得る。これらもまたオフターゲットにハイブリダイズする、要するに、関係ない遺伝子の編集をもたらして編集効率を低下させる場合がある。
hCD2の2つのエキソン(CF58及びCF59)について、選択したgRNAのオフターゲット解析を実施して、完全マッチであるまたは最大1もしくは2つのミスマッチを含有し、標的部位を含み得る、ヒトゲノムにおける部位の数を決定した。エキソンCF58の結果を表14に列挙し、エキソンCF59の結果を表15に列挙する。
Figure 2022516389000040

Figure 2022516389000041

Figure 2022516389000042

Figure 2022516389000043
次世代シークエンシング(NGS)により、表14及び表15のgRNA配列をgRNA活性に正規化した(NHEJに対する正規化率)。GFPを対照として使用した。シークエンシング解析後、オフターゲットプロファイルに基づき、以下のgRNA、CF58.CD2.g1(41.2%)、CF58.CD2.g23(13.2%)、CF59.CD2.g20(26.6%)、CF59.CD2.g13(66.2%)、CF59.CD2.g17(17.5%)、を推奨した。15%以上の正規化NHEJ頻度を有するガイドRNA(gRNA)は、細胞株及び動物モデルの作製プロジェクト用の良好な候補である。
hCD3Eについて、選択したgRNAのオフターゲット解析を実施して、完全マッチであるまたは最大1もしくは2つのミスマッチを含有し、標的部位を含み得る、ヒトゲノムにおける部位の数を決定した。hCD3Eの結果を表16に列挙する。
Figure 2022516389000044
次世代シークエンシング(NGS)により、表16のgRNA配列をgRNA活性に正規化した(NHEJに対する正規化率)。GFPを対照として使用した。シークエンシング解析後、オフターゲットプロファイルに基づき、以下のgRNA、MS1044.CD3E.sp28(>15%)、及びMS1044.CD3E.sp12(>15%)、を推奨した。15%以上の正規化NHEJ頻度を有するガイドRNA(gRNA)は、細胞株及び動物モデルの作製プロジェクト用の良好な候補である。
hCD5の3つのエキソン(エキソン3、エキソン4、及びエキソン5)について、選択したgRNAのオフターゲット解析を実施して、完全マッチであるまたは最大1もしくは2つのミスマッチを含有し、標的部位を含み得る、ヒトゲノムにおける部位の数を決定した。エキソン3の結果を表17に列挙し、エキソン4の結果を表18に列挙し、エキソン5の結果を表19に列挙する。
Figure 2022516389000045

Figure 2022516389000046

Figure 2022516389000047

Figure 2022516389000048

Figure 2022516389000049

Figure 2022516389000050

Figure 2022516389000051
次世代シークエンシング(NGS)により、表17、表18、及び表19のgRNA配列をgRNA活性に正規化した(NHEJに対する正規化率)。GFPを対照として使用した。シークエンシング解析後、オフターゲットプロファイルに基づき、以下のgRNA、エキソン3:SP597.hCD5.g2(76.5%)、SP597.hCD5.g22(36.3%)、SP597.hCD5.g39(16.0%)、SP597.hCD5.g46、エキソン4:SP598.hCD5.g7、SP598.hCD5.g10(58.5%)、エキソン5:SP599.hCD5.g5(51.0%)、SP599.hCD5.g30、SP599.hCD5.g42、SP599.hCD5.g58(41.0%)、を推奨した。
hCSF2について、選択したgRNAのオフターゲット解析を実施して、完全マッチであるまたは最大1もしくは2つのミスマッチを含有し、標的部位を含み得る、ヒトゲノムにおける部位の数を決定した。hCSF2の結果を表20に列挙する。
Figure 2022516389000052
次世代シークエンシング(NGS)により、表20のgRNA配列をgRNA活性に正規化した(NHEJに対する正規化率)。GFPを対照として使用した。シークエンシング解析後、オフターゲットプロファイルに基づき、以下のgRNA、MS1086.CSF2.sp8(>15%)、及びMS1086.CSF2.sp10(>15%)、を推奨した。
hCTLA4の2つのエキソン(エキソン1及びエキソン2)について、選択したgRNAのオフターゲット解析を実施して、完全マッチであるまたは最大1もしくは2つのミスマッチを含有し、標的部位を含み得る、ヒトゲノムにおける部位の数を決定した。hCTLA4のエキソン1の結果を表21に列挙し、hCTLA4のエキソン2の結果を表22に列挙する。
Figure 2022516389000053

Figure 2022516389000054

Figure 2022516389000055
次世代シークエンシング(NGS)により、表21及び表22のgRNA配列をgRNA活性に正規化した(NHEJに対する正規化率)。GFPを対照として使用した。シークエンシング解析後、オフターゲットプロファイルに基づき、以下のgRNA、エキソン1:SP621.hCTLA4.g2(>15%)、及びSP621.hCTLA4.g12(>15%)、エキソン2:SP622.hCTLA4.g2(>15%)、SP622.hCTLA4.g9(>15%)、及びSP622.hCTLA4.g33(>15%)、を推奨した。
hPDCD1の2つのエキソン(CF60及びCF61)について、選択したgRNAのオフターゲット解析を実施して、完全マッチであるまたは最大1もしくは2つのミスマッチを含有し、標的部位を含み得る、ヒトゲノムにおける部位の数を決定した。エキソンCF60の結果を表23に列挙し、エキソンCF61の結果を表24に列挙する。
Figure 2022516389000056
Figure 2022516389000057

Figure 2022516389000058

Figure 2022516389000059
次世代シークエンシング(NGS)により、表23及び表24のgRNA配列をgRNA活性に正規化した(NHEJに対する正規化率)。GFPを対照として使用した。シークエンシング解析後、オフターゲットプロファイルに基づき、以下のgRNA、CF60.PDCD1.g12(65.6%)、CF60.PDCD1.g3(69.2%)、CF61.PDCD1.g6、CF61.PDCD1.g2(72.7%)、及びCF61.PDCD1.g35(24.0%)、を推奨した。
hTIM3の2つのエキソン(エキソン2及びエキソン3)について、選択したgRNAのオフターゲット解析を実施して、完全マッチであるまたは最大1もしくは2つのミスマッチを含有し、標的部位を含み得る、ヒトゲノムにおける部位の数を決定した。エキソン2の結果を表25に列挙し、エキソン3の結果を表26に列挙する。
Figure 2022516389000060

Figure 2022516389000061

Figure 2022516389000062

Figure 2022516389000063
次世代シークエンシング(NGS)により、表25及び表26のgRNA配列をgRNA活性に正規化した(NHEJに対する正規化率)。GFPを対照として使用した。シークエンシング解析後、オフターゲットプロファイルに基づき、以下のgRNA、エキソン2:SP619.hTIM3.g12(45.0%)、SP619.hTIM3.g20(60.9%)、及びSP619.hTIM3.g49(45.4%)、エキソン3:SP620.hTIM3.g5(58.0%)、及びSP620.hTIM3.g7(2.9%)、を推奨した。
実施例9-BCMA-CAR-iNKTを作製及び試験するための方法
実施例1における手順の変化形態では、工程1及び工程2におけるように、単一の抗原を認識するCAR-iNKTを作製してもよい。本実施例では工程3及び工程4を省略する。工程5では、BCMAを認識するCARをiNKTに形質導入する。これらの方法を用いて作製したCAR-iNKT細胞を図8Aに示す。
BCMA+標的細胞(MM1.s)に対する4時間のCr放出アッセイで、BCMA-CAR iNKTの有効性を試験した。図8B。5×10のMM.1S-CGをNSGマウスにI.V.で移植してから、28日目に、1×10eのBCMA-CAR-Tまたは非標的CARでマウスを治療することにより、in vivo有効性を試験した。BLIイメージング(図8C)を用いて全身腫瘍組織量を測定することにより、また生存率(図8D)をモニタリングすることにより、有効性を評価した。
実施例10-CD2+T-ALL細胞株及びCD2+CTCL細胞株をin vitroで効果的に殺傷するCAR2-iNKT細胞。
工程1.1名または複数名の健康なドナーから末梢血単核球(PBMC)を採取した。
工程2.例えば、Valpha24に結合する、標識抗体をコーティングした磁性ビーズ(例えば、Miltenyi Biotec)を使用した磁気選択を用いて、ドナーのPBMCからiNKT細胞を単離/精製した。その他の精製技術は当該技術分野において周知であり、それらを使用してもよい。
工程3.その後、iNKT細胞を活性化させる。iNKTを活性化させるための方法はいくつかある。精製後に残った非iNKT画分に照射(例えば、40Gy)を行ってから、α-GalCerを添加してもよい(インバリアント受容体用のリガンドであるCD1d-α-GalCerを有する細胞を作製するために、例えば、200ng/mlを1時間、例えば、37℃で)。次に、iNKT細胞を、照射α-GalCerパルス陰性細胞と培養する(1:10)。代替的に、抗iNKT受容体抗体を使用してiNKTを活性化させてもよい。更に別の代替例では、α-GalCerと複合体を形成した精製CD-1dを使用して、iNKTを活性化させてもよい。更に別の代替例では、α-GalCerをパルスしたCD1d発現細胞株を使用して、iNKTを刺激してもよい。
工程4.iNKTをカウントしてから、20ugのCD2gRNA及び15ugのCas9を含有する100ulのエレクトロポレーション緩衝液中に5×10で再懸濁した。次に、iNKTをキュベットに移し、当該技術分野において周知のエレクトロポレーターを用いてエレクトロポレーションを行った。予め調整した培地に細胞を戻した。
工程5.CD2を標的とするCARをiNKTに形質導入した。
工程6.iNKTを培養してCAR-iNKT集団を増殖させた。この増殖を数週間にわたり継続してもよい。定期的にα-GalCer添加細胞を加えることにより、iNKTが刺激される状態を維持してもよいが、初回刺激の場合と同様に、その他の選択肢が利用可能である。培地は通常、高用量のIL-2(本発明者らの手順においては目下、200ユニット/ml)を含有している。IL-7、IL-15、または、IL-2、IL-7、及びIL-15の組み合わせもまた使用して、iNKTをin vitroで増殖させてもよい。力価または安定性が向上するように遺伝子改変されたこれらサイトカインのアナログもまた使用して、培養を増強してもよい。フローサイトメトリーを用いて、CAR形質導入の効率(CD34を用いて試験した)及び標的欠失の効率(CD2)を評価した。
工程7.CAR形質導入iNKTの濃縮について、Miltenyi prodigyを使用したtrCD34(CAR発現のマーカー)磁気選択を用いて、試験を行った。
工程8.CAR-T殺傷の有効性について、図9に示すように、CD2+標的に対するin vitroの4時間のCr放出アッセイを用いて評価を行ったところ、CD2+T-ALL細胞株及びCD2+CTCL細胞株のin vitroにおける効果的な殺傷が認められた。非標的cCAR-iNKを対照として使用した。
当業者は、上で開示した方法を適宜変更して、本明細書で開示するその他のモノ、デュアル、及びタンデムiNKT細胞を作製し、それらの活性を確認することができる。
上記実施例において、その特定の実施形態の特定の詳細を参照しながら、本発明を説明してきたが、変更及び変化形態が本発明の趣旨及び範囲に包含されるということを理解されたい。

Claims (68)

  1. ゲノム編集iNKT細胞。
  2. 凍結させることなく少なくとも3週間にわたり維持または増殖させることが可能な、複数のドナーに由来するゲノム編集iNKT細胞の集団。
  3. 1種または複数種の抗原を標的とする少なくとも1つのキメラ抗原受容体(CAR)を含むiNKT細胞であって、前記CARが特異的に結合する抗原を欠損している、前記iNKT細胞。
  4. 前記キメラ抗原受容体は、悪性T細胞上に発現した少なくとも1種の抗原に特異的に結合する、請求項3に記載のiNKT細胞。
  5. 前記抗原は、CD2、CD3ε、CD4、CD5、CD7、TRAC、及びTCRβ、から選択される、請求項4に記載のiNKT細胞。
  6. 前記キメラ抗原受容体は、悪性形質細胞上に発現した少なくとも1種の抗原に特異的に結合する、請求項3に記載のiNKT細胞。
  7. 前記抗原は、BCMA、CS1、CD38、及びCD19、から選択される、請求項6に記載のiNKT細胞。
  8. 前記キメラ抗原受容体は、BCMAとTACIの両方を効果的に共標的とする、BCMA及びTACIに対するリガンドである、APRILタンパク質の細胞外部分を発現する、請求項3に記載のiNKT細胞。
  9. 前記CAR-T細胞は自殺遺伝子を更に含む、請求項1から請求項8のいずれか1項に記載のiNKT細胞。
  10. 内在性T細胞受容体介在性シグナル伝達は、前記iNKT細胞内においてごくわずかである、請求項1から請求項8のいずれか1項に記載のiNKT細胞。
  11. アロ反応性または移植片対宿主病を誘導しない、請求項10に記載のiNKT細胞。
  12. 同胞殺しを誘導しない、請求項1から請求項8のいずれか1項に記載のiNKT細胞。
  13. タンデムiNKT-CAR細胞またはデュアルiNKT-CAR細胞。
  14. それぞれが異なる抗原を標的とする2つまたはそれ以上のCARを含む、請求項13に記載のデュアルiNKT-CAR細胞。
  15. 一対(すなわち、2種)のT細胞抗原を標的とする、請求項14に記載のデュアルiNKT-CAR細胞。
  16. 前記抗原対は、CD2xCD3ε、CD2xCD4、CD2xCD5、CD2xCD7、CD3εxCD4、CD3εxCD5、CD3εxCD7、CD4xCD5、CD4xCD7、CD5xCD7、TRACxCD2、TRACxCD3ε、TRACxCD4、TRACxCD5、TRACxCD7、TCRβxCD2、TCRβxCD3ε、TCRβxCD4、TCRβxCD5、TCRβxCD7、BCMAxCS1、BCMAxCD19、BCMAxCD38、CS1xCD19、CS1xCD38、CD19xCD38、APRILxCS1、APRILxBCMA、APRILxCD19、及びAPRILxCD38、から選択される、請求項14に記載のデュアルiNKT-CAR細胞。
  17. それぞれのV鎖及びV鎖は、CD5、CD7、CD2、CD4、及びCD3、から選択される異なる抗原を認識するscFvに由来する、請求項14から請求項15のいずれか1項に記載のデュアルiNKT-CAR細胞。
  18. それぞれのV鎖及びV鎖は、異なり、配列番号:12~配列番号:31から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を示す、請求項14に記載のデュアルiNKT-CAR細胞。
  19. それぞれのV鎖及びV鎖は、異なり、配列番号:12~配列番号:31から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも98%の配列同一性を示す、請求項14に記載のデュアルiNKT-CAR細胞。
  20. それぞれのV鎖及びV鎖は、異なり、配列番号:12~配列番号:31から選択される配列である、請求項14に記載のデュアルiNKT-CAR細胞。
  21. CD28及び4-1BBから選択される少なくとも1種の共刺激ドメインを含む、請求項14に記載のデュアルiNKT-CAR細胞。
  22. 前記共刺激ドメインはCD28である、請求項14に記載のデュアルiNKT-CAR細胞。
  23. CD3ζシグナル伝達ドメインを含む、請求項14に記載のデュアルiNKT-CAR細胞。
  24. 前記それぞれのV鎖及びV鎖は、CD2を認識するscFvまたはCD3を認識するscFvに由来する、請求項14に記載のデュアルiNKT-CAR細胞。
  25. 2種またはそれ以上のT細胞抗原を標的とする1つのCARを含む、請求項13に記載のタンデムiNKT-CAR細胞。
  26. 一対(すなわち、2種)の抗原を標的とする、請求項25に記載のiNKT-CAR細胞。
  27. 前記抗原対は、CD2xCD3ε、CD2xCD4、CD2xCD5、CD2xCD7、CD3εxCD4、CD3εxCD5、CD3εxCD7、CD4xCD5、CD4xCD7、CD5xCD7、TRACxCD2、TRACxCD3ε、TRACxCD4、TRACxCD5、TRACxCD7、TCRβxCD2、TCRβxCD3ε、TCRβxCD4、TCRβxCD5、TCRβxCD7、BCMAxCS1、BCMAxCD19、BCMAxCD38、CS1xCD19、CS1xCD38、CD19xCD38、APRILxCS1、APRILxBCMA、APRILxCD19、及びAPRILxCD38、から選択される、請求項13に記載のiNKT-CAR細胞。
  28. 前記直鎖状tCAR構築物は、V1及びV1と呼ばれる第1の重(V)鎖可変フラグメント及び第1の軽(V)鎖可変フラグメント、ならびに、V2及びV2と呼ばれる第2の軽(V)鎖可変フラグメント及び第1の重(V)鎖可変フラグメント、を含み、前記第1の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第1の軽(V)鎖可変フラグメントは、(GGGGS)2~6リンカーにより、前記第2の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第1の重(V)鎖可変フラグメントと連結している、請求項25に記載のiNKT-CAR細胞。
  29. 前記直鎖状tCAR構築物は、V2及びV2と呼ばれる第1の重(V)鎖可変フラグメント及び第1の軽(V)鎖可変フラグメント、ならびに、V1及びV1と呼ばれる第2の軽(V)鎖可変フラグメント及び第1の重(V)鎖可変フラグメント、を含み、前記第1の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第1の軽(V)鎖可変フラグメントは、(GGGGS)2~6リンカーにより、前記第2の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第1の重(V)鎖可変フラグメントと連結している、請求項25に記載のiNKT-CAR細胞。
  30. 前記直鎖状tCAR構築物は、V1及びV1と呼ばれる第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び第1の重(V)鎖可変フラグメント、ならびに、V2及びV2と呼ばれる第2の重(V)鎖可変フラグメント及び第1の軽(V)鎖可変フラグメント、を含み、前記第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第1の重(V)鎖可変フラグメントは、(GGGGS)2~6リンカーにより、前記第2の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第1の軽(V)鎖可変フラグメントと連結している、請求項25に記載のiNKT-CAR細胞。
  31. 前記直鎖状tCAR構築物は、V2及びV2と呼ばれる第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び第1の重(V)鎖可変フラグメント、ならびに、V1及びV1と呼ばれる第2の重(V)鎖可変フラグメント及び第1の軽(V)鎖可変フラグメント、を含み、前記第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第1の重(V)鎖可変フラグメントは、(GGGGS)2~6リンカーにより、前記第2の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第1の軽(V)鎖可変フラグメントと連結している、請求項25に記載のiNKT-CAR細胞。
  32. 前記直鎖状tCAR構築物は、6-I~6-XXXIIから選択される構造物を含む、請求項25に記載のiNKT-CAR細胞。
  33. 前記CAR構築物はヘアピンtCAR構築物である、請求項25に記載のiNKT-CAR細胞。
  34. 前記ヘアピンtCAR構築物は、V1及びV2と呼ばれる、第1のscFvに由来する第1の重(V)鎖可変フラグメント及び第2のscFvに由来する第2の重(V)鎖可変フラグメント、ならびに、V2及びV2と呼ばれる、前記第2のscFvに由来する第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第1のscFvに由来する第2の軽(V)鎖可変フラグメントを含み、前記第1のscFvに由来する前記第1の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する前記第2の重(V)鎖可変フラグメントは、(GGGGS)2~6リンカーにより、前記第2のscFvに由来する前記第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第1のscFvに由来する前記第2の軽(V)鎖可変フラグメントと連結している、請求項33に記載のiNKT-CAR細胞。
  35. 前記ヘアピンtCAR構築物は、V2及びV1と呼ばれる、第2のscFvに由来する第2の重(V)鎖可変フラグメント及び第1のscFvに由来する第1の重(V)鎖可変フラグメント、ならびに、V1及びV2と呼ばれる、前記第1のscFvに由来する第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する第2の軽(V)鎖可変フラグメントを含み、前記第2のscFvに由来する前記第2の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第1のscFvに由来する前記第1の重(V)鎖可変フラグメントは、(GGGGS)2~6リンカーにより、前記第1のscFvに由来する前記第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する前記第2の軽(V)鎖可変フラグメントと連結している、請求項33に記載のiNKT-CAR細胞。
  36. 前記ヘアピンtCAR構築物は、V1及びV2と呼ばれる、第1のscFvに由来する第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び第2のscFvに由来する第2の軽(V)鎖可変フラグメント、ならびに、V2及びV1と呼ばれる、前記第1のscFvに由来する第1の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する第2の重(V)鎖可変フラグメントを含み、前記第1のscFvに由来する前記第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する前記第2の軽(V)鎖可変フラグメントは、(GGGGS)2~6リンカーにより、前記第1のscFvに由来する前記第1の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する前記第2の重(V)鎖可変フラグメントと連結している、請求項33に記載のiNKT-CAR細胞。
  37. 前記ヘアピンtCAR構築物は、V2及びV1と呼ばれる、第2のscFvに由来する第2の軽(V)鎖可変フラグメント及び第1のscFvに由来する第1の軽(V)鎖可変フラグメント、ならびに、V1及びV2と呼ばれる、前記第1のscFvに由来する第1の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する第2の軽重(V)鎖可変フラグメントを含み、前記第2のscFvに由来する前記第2の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第1のscFvに由来する前記第1の軽(V)鎖可変フラグメントは、(GGGGS)2~6リンカーにより、前記第1のscFvに由来する前記第1の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する前記第2の軽重(V)鎖可変フラグメントと連結している、請求項33に記載のiNKT-CAR細胞。
  38. 前記ヘアピンtCAR構築物は、8-I~8-XXXIIから選択される構造物を含む、請求項33に記載のiNKT-CAR細胞。
  39. 前記CAR構築物は、前記リンカー内に(Cys=Cys)二本鎖結合(DSB)を有するヘアピンDSBtCAR構築物である、請求項25に記載のiNKT-CAR細胞。
  40. 前記ヘアピンDSBtCAR構築物は、V1及びV2と呼ばれる、第1のscFvに由来する第1の重(V)鎖可変フラグメント及び第2のscFvに由来する第2の重(V)鎖可変フラグメント、ならびに、V2及びV2と呼ばれる、前記第2のscFvに由来する第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第1のscFvに由来する第2の軽(V)鎖可変フラグメントを含み、前記第1のscFvに由来する前記第1の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する前記第2の重(V)鎖可変フラグメントは、(GGGGS)0~1-(GGGGC)-(GGGGS)1~2-(GGGGP)-(GGGGS)2~3-(GGGGC)-(GGGGS)0~1リンカーにより、前記第2のscFvに由来する前記第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第1のscFvに由来する前記第2の軽(V)鎖可変フラグメントと連結している、請求項39に記載のiNKT-CAR細胞。
  41. 前記ヘアピンDSBtCAR構築物は、V2及びV1と呼ばれる、第2のscFvに由来する第2の重(V)鎖可変フラグメント及び第1のscFvに由来する第1の重(V)鎖可変フラグメント、ならびに、V1及びV2と呼ばれる、前記第1のscFvに由来する第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する第2の軽(V)鎖可変フラグメントを含み、前記第2のscFvに由来する前記第2の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第1のscFvに由来する前記第1の重(V)鎖可変フラグメントは、(GGGGS)0~1-(GGGGC)-(GGGGS)1~2-(GGGGP)-(GGGGS)2~3-(GGGGC)-(GGGGS)0~1リンカーにより、前記第1のscFvに由来する前記第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する前記第2の軽(V)鎖可変フラグメントと連結している、請求項39に記載のiNKT-CAR細胞。
  42. 前記ヘアピンDSBtCAR構築物は、V1及びV2と呼ばれる、第1のscFvに由来する第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び第2のscFvに由来する第2の軽(V)鎖可変フラグメント、ならびに、V2及びV1と呼ばれる、前記第1のscFvに由来する第1の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する第2の重(V)鎖可変フラグメントを含み、前記第1のscFvに由来する前記第1の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する前記第2の軽(V)鎖可変フラグメントは、(GGGGS)0~1-(GGGGC)-(GGGGS)1~2-(GGGGP)-(GGGGS)2~3-(GGGGC)-(GGGGS)0~1リンカーにより、前記第1のscFvに由来する前記第1の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する前記第2の重(V)鎖可変フラグメントと連結している、請求項39に記載のiNKT-CAR細胞。
  43. 前記ヘアピンDSBtCAR構築物は、V2及びV1と呼ばれる、第2のscFvに由来する第2の軽(V)鎖可変フラグメント及び第1のscFvに由来する第1の軽(V)鎖可変フラグメント、ならびに、V1及びV2と呼ばれる、前記第1のscFvに由来する第1の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する第2の軽重(V)鎖可変フラグメントを含み、前記第2のscFvに由来する前記第2の軽(V)鎖可変フラグメント及び前記第1のscFvに由来する前記第1の軽(V)鎖可変フラグメントは、(GGGGS)0~1-(GGGGC)-(GGGGS)1~2-(GGGGP)-(GGGGS)2~3-(GGGGC)-(GGGGS)0~1リンカーにより、前記第1のscFvに由来する前記第1の重(V)鎖可変フラグメント及び前記第2のscFvに由来する前記第2の軽重(V)鎖可変フラグメントと連結している、請求項39に記載のiNKT-CAR細胞。
  44. 前記ヘアピンDSBtCAR構築物は、10-I~10-XXXIIから選択される構造物を含む、請求項39に記載のiNKT-CAR細胞。
  45. それぞれのV鎖及びV鎖は、CD5、CD7、CD2、CD4、及びCD3、から選択される異なる抗原を認識するscFvに由来する、請求項25から請求項44のいずれか1項に記載のiNKT-CAR細胞。
  46. それぞれのV鎖及びV鎖は、異なり、配列番号:12~配列番号:31から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を示す、請求項25に記載のiNKT-CAR細胞。
  47. それぞれのV鎖及びV鎖は、異なり、配列番号:12~配列番号:31から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも98%の配列同一性を示す、請求項25に記載のiNKT-CAR細胞。
  48. それぞれのV鎖及びV鎖は、異なり、配列番号:12~配列番号:31から選択される配列である、請求項25に記載のiNKT-CAR細胞。
  49. CD28及び4-1BBから選択される少なくとも1種の共刺激ドメインを含む、請求項25に記載のiNKT-CAR細胞。
  50. 前記共刺激ドメインはCD28である、請求項25に記載のiNKT-CAR細胞。
  51. CD3ζシグナル伝達ドメインを含む、請求項25に記載のiNKT-CAR細胞。
  52. 前記それぞれのV鎖及びV鎖は、CD2を認識するscFvまたはCD3を認識するscFvに由来する、請求項25に記載のiNKT-CAR細胞。
  53. 前記tCAR構築物は、クローン5、クローン6、クローン7、クローン8、クローン13、クローン14、クローン15、及びクローン16、から選択される、請求項25に記載のiNKT-CAR細胞。
  54. 前記tCAR構築物は、配列番号:41~配列番号:46から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも95%の配列同一性を示す、請求項25に記載のiNKT-CAR細胞。
  55. 請求項1、及び/または請求項3から請求項13のいずれか1項に記載のiNKT細胞、あるいは、請求項2に記載のiNKT細胞の集団、ならびに、少なくとも1種の治療的に許容される担体及び/またはアジュバント、を含む、治療用組成物。
  56. IL-7、IL-15、Il-2、または上記のいずれかのアナログ、から選択される少なくとも1種のアジュバントを含む、請求項55に記載の治療用組成物。
  57. IL-2を含む、請求項55に記載の治療用組成物。
  58. IL-7、IL-15、Il-2、または上記のいずれかのアナログの、任意の2種またはそれ以上の組み合わせを含む、請求項55に記載の治療用組成物。
  59. IL-7、IL-15、Il-2を含む、請求項55に記載の治療用組成物。
  60. 患者における血液悪性腫瘍を治療するための方法であって、ゲノム編集iNKT細胞、請求項1から請求項14のいずれか1項に記載のゲノム編集iNKT細胞、デュアルiNKT-CAR細胞、もしくはタンデムiNKT-CAR細胞の集団、または、請求項55から請求項59のいずれか1項に記載の治療用組成物を、血液悪性腫瘍の治療を必要とする前記患者に投与することを含む、前記方法。
  61. 前記血液悪性腫瘍はT細胞悪性腫瘍である、請求項60に記載の方法。
  62. 前記T細胞悪性腫瘍はT細胞急性リンパ芽球性白血病(T-ALL)である、請求項61に記載の方法。
  63. 前記T細胞悪性腫瘍は非ホジキンリンパ腫である、請求項61に記載の方法。
  64. 前記血液悪性腫瘍は多発性骨髄腫である、請求項60に記載の方法。
  65. g)単離及び精製したiNKT細胞を活性化させること、
    h)前記iNKT細胞における細胞表面タンパク質の発現を欠失または抑制すること、ならびに、
    i)任意選択的に、前記iNKT細胞に、1種または複数種の抗原標的または細胞表面タンパク質標的を認識するキメラ抗原受容体を形質導入すること、
    の工程を含む、遺伝子編集iNKT細胞を作製するための方法。
  66. 前記iNKT細胞に、1種または複数種の抗原標的または細胞表面タンパク質標的を認識するキメラ抗原受容体を形質導入する工程を含む、請求項65に記載の方法。
  67. 前記CARの標的である前記抗原は、前記細胞から欠失されている、請求項66に記載の方法。
  68. 複数のドナーに由来するゲノム編集iNKT細胞の集団を作製するための方法であって、
    a)それぞれのドナーから単離及び精製したiNKT細胞を活性化させること、
    b)前記iNKT細胞における細胞表面タンパク質の発現を欠失または抑制すること、
    c)任意選択的に、前記iNKT細胞に、1種または複数種の抗原標的または細胞表面タンパク質標的を認識するキメラ抗原受容体を形質導入すること、
    d)ゲノム編集iNKT細胞の前記集団を増殖させること、
    e)前記ゲノム編集iNKT細胞をプールすること、
    の工程を含む、前記方法。
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