JP2022509508A - 植物有害生物を制御するおよび植物の健康状態を改善するための細菌組成物および方法 - Google Patents

Abstract

植物において植物有害生物を制御するおよび／または少なくとも１つの目的の農学上の形質を改善するための組成物および方法が、提供される。このような組成物および方法は、植物用の接種物として使用され得る細菌株を含む。従って、植物有害生物および／または植物有害生物によって引き起こされる植物の病気に感受性である植物を生長させるための方法、ならびに植物有害生物および／または植物の病気に感受性である植物に対して上記植物有害生物および／または植物の病気を制御する方法がまた、提供される。

Description

発明の分野
本発明は、植物において植物有害生物を制御するおよび／または目的の農学上の形質を改善するための細菌株および集団に関する。

背景
植物有害生物によって引き起こされる損傷および病気は、顕著な農業損失の原因である。影響は、軽度の症状から破滅的な植物の損傷までの範囲に及び得、そして大きな経済的かつ社会的結果をもたらし得る。植物有害生物を有効に制御する方法が必要とされる。

要旨
植物において植物有害生物を制御するおよび／または 少なくとも１つの目的の農学上の形質を改善するための組成物および方法が、提供される。このような組成物および方法は、１種もしくはこれより多くの植物有害生物を制御するおよび／または少なくとも１つの目的の農学上の形質を改善する細菌株を含む。上記細菌株は、植物用の接種物として使用され得る。植物有害生物または植物有害生物によって引き起こされる植物の病気に感受性である植物を生長させるための方法、ならびに植物有害生物によって引き起こされる植物の病気または損傷を処理または防止するための方法および組成物がまた、提供される。目的の殺生物剤に対して抵抗性を有する改変された細菌株を作製するための方法および組成物が、さらに提供される。

詳細な説明
Ｉ．全体像
１種もしくはこれより多くの植物有害生物を制御するおよび／または少なくとも１つの目的の農学上の形質を改善するための組成物および方法が、提供される。生物学的因子、生物防除因子、細菌株、改変された細菌株、改変された生物学的因子、または改変された生物防除因子もしくはその活性改変体は、植物有害生物を制御するおよび／または少なくとも１つの目的の農学上の形質を改善するために使用される微生物を記載するために、本明細書で使用される。

ＩＩ．細菌株
種々の生物防除因子または細菌株が提供され、これらは、１種もしくはこれより多くの植物有害生物を制御するおよび／または少なくとも１つの目的の農学上の形質を改善するために使用され得る。このような細菌株は、以下を包含する：ＡＩＰ０４５８８５（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｃｈｌｏｒｏｒａｐｈｉｓ株）、ＡＩＰ０７５６５５（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｃｈｌｏｒｏｒａｐｈｓ株）、ＡＩＰ００９４７４（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ株）、ＡＩＰ００２４５２５（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｔｈｕｒｉｎｉｇｉｅｎｓｉｓ株）、ＡＩＰ０３３２８７（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ株）、ＡＩＰ００９３７９８（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ株）、ＡＩＰ０６１６３９（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｃｈｌｏｒｏｒａｐｈｉｓ株）、ＡＩＰ０８２８６２（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｃｈｌｏｒｏｒａｐｈｉｓ株）、ＡＩＰ０５８１８７（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｃｈｌｏｒｏｒａｐｈｉｓ株）、ＡＩＰ０５９２８６（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｃｈｌｏｒｏｒａｐｈｉｓ株）、およびＡＩＰ０３６７０６（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｃｈｌｏｒｏｒａｐｈｉｓ株）。ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、およびＡＩＰ０３６７０６のうちの１種もしくはこれより多くを含む細胞集団、ならびにこれらの株の各々に由来する胞子の集団、またはこれらの任意の調製物が、提供される。

従って、本明細書で提供される種々の細菌株および／または農薬組成物は、活性成分として、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、およびＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの１種もしくはこれより多くを含む細胞集団を含む。

ＡＩＰ０４５８８５を、Ｐａｔｅｎｔ Ｄｅｐｏｓｉｔｏｒｙ ｏｆ ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｔｉｌｉｚａｔｉｏｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ， Ｕ．Ｓ． Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅ（１８１５ Ｎｏｒｔｈ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｓｔｒｅｅｔ， Ｐｅｏｒｉａ， Ｉｌｌｉｎｏｉｓ ６１６０４ Ｕ．Ｓ．Ａ．）に２０１８年８月３日に寄託し、ＮＲＲＬ Ｎｏ． Ｂ－６７６５０が割り当てられた。

ＡＩＰ０７５６５５を、Ｐａｔｅｎｔ Ｄｅｐｏｓｉｔｏｒｙ ｏｆ ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｔｉｌｉｚａｔｉｏｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ， Ｕ．Ｓ． Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅ（１８１５ Ｎｏｒｔｈ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｓｔｒｅｅｔ， Ｐｅｏｒｉａ， Ｉｌｌｉｎｏｉｓ ６１６０４ Ｕ．Ｓ．Ａ．）に２０１８年８月３日に寄託し、ＮＲＲＬ Ｎｏ． Ｂ－６７６５１が割り当てられた。

ＡＩＰ００９４７４を、Ｐａｔｅｎｔ Ｄｅｐｏｓｉｔｏｒｙ ｏｆ ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｔｉｌｉｚａｔｉｏｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ， Ｕ．Ｓ． Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅ（１８１５ Ｎｏｒｔｈ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｓｔｒｅｅｔ， Ｐｅｏｒｉａ， Ｉｌｌｉｎｏｉｓ ６１６０４ Ｕ．Ｓ．Ａ．）に２０１８年８月３日に寄託し、ＮＲＲＬ Ｎｏ． Ｂ－６７６５７が割り当てられた。

ＡＩＰ０２４５２５を、Ｐａｔｅｎｔ Ｄｅｐｏｓｉｔｏｒｙ ｏｆ ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｔｉｌｉｚａｔｉｏｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ， Ｕ．Ｓ． Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅ（１８１５ Ｎｏｒｔｈ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｓｔｒｅｅｔ， Ｐｅｏｒｉａ， Ｉｌｌｉｎｏｉｓ ６１６０４ Ｕ．Ｓ．Ａ．）に２０１８年８月３日に寄託し、ＮＲＲＬ Ｎｏ． Ｂ－６７６６１が割り当てられた。

ＡＩＰ０３３２８７を、Ｐａｔｅｎｔ Ｄｅｐｏｓｉｔｏｒｙ ｏｆ ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｔｉｌｉｚａｔｉｏｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ， Ｕ．Ｓ． Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅ（１８１５ Ｎｏｒｔｈ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｓｔｒｅｅｔ， Ｐｅｏｒｉａ， Ｉｌｌｉｎｏｉｓ ６１６０４ Ｕ．Ｓ．Ａ．）に２０１８年８月３日に寄託し、ＮＲＲＬ Ｎｏ． Ｂ－６７６５９が割り当てられた。

ＡＩＰ０９３７９８を、Ｐａｔｅｎｔ Ｄｅｐｏｓｉｔｏｒｙ ｏｆ ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｔｉｌｉｚａｔｉｏｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ， Ｕ．Ｓ． Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅ（１８１５ Ｎｏｒｔｈ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｓｔｒｅｅｔ， Ｐｅｏｒｉａ， Ｉｌｌｉｎｏｉｓ ６１６０４ Ｕ．Ｓ．Ａ．）に２０１８年８月３日に寄託し、ＮＲＲＬ Ｎｏ． Ｂ－６７６６０が割り当てられた。

ＡＩＰ０６１６３９を、Ｐａｔｅｎｔ Ｄｅｐｏｓｉｔｏｒｙ ｏｆ ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｔｉｌｉｚａｔｉｏｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ， Ｕ．Ｓ． Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅ（１８１５ Ｎｏｒｔｈ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｓｔｒｅｅｔ， Ｐｅｏｒｉａ， Ｉｌｌｉｎｏｉｓ ６１６０４ Ｕ．Ｓ．Ａ．）に２０１８年８月３日に寄託し、ＮＲＲＬ Ｎｏ． Ｂ－６７６５４が割り当てられた。

ＡＩＰ０８２８６２を、Ｐａｔｅｎｔ Ｄｅｐｏｓｉｔｏｒｙ ｏｆ ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｔｉｌｉｚａｔｉｏｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ， Ｕ．Ｓ． Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅ（１８１５ Ｎｏｒｔｈ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｓｔｒｅｅｔ， Ｐｅｏｒｉａ， Ｉｌｌｉｎｏｉｓ ６１６０４ Ｕ．Ｓ．Ａ．）に２０１８年８月３日に寄託し、ＮＲＲＬ Ｎｏ． Ｂ－６７６５６が割り当てられた。

ＡＩＰ０５８１８７を、Ｐａｔｅｎｔ Ｄｅｐｏｓｉｔｏｒｙ ｏｆ ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｔｉｌｉｚａｔｉｏｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ， Ｕ．Ｓ． Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅ（１８１５ Ｎｏｒｔｈ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｓｔｒｅｅｔ， Ｐｅｏｒｉａ， Ｉｌｌｉｎｏｉｓ ６１６０４ Ｕ．Ｓ．Ａ．）に２０１８年８月３日に寄託し、ＮＲＲＬ Ｎｏ． Ｂ－６７６５５が割り当てられた。

ＡＩＰ０５９２８６を、Ｐａｔｅｎｔ Ｄｅｐｏｓｉｔｏｒｙ ｏｆ ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｔｉｌｉｚａｔｉｏｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ， Ｕ．Ｓ． Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅ（１８１５ Ｎｏｒｔｈ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｓｔｒｅｅｔ， Ｐｅｏｒｉａ， Ｉｌｌｉｎｏｉｓ ６１６０４ Ｕ．Ｓ．Ａ．）に２０１８年８月３日に寄託し、ＮＲＲＬ Ｎｏ． Ｂ－６７６５３が割り当てられた。

ＡＩＰ０３６７０６を、Ｐａｔｅｎｔ Ｄｅｐｏｓｉｔｏｒｙ ｏｆ ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｔｉｌｉｚａｔｉｏｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ， Ｕ．Ｓ． Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅ（１８１５ Ｎｏｒｔｈ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｓｔｒｅｅｔ， Ｐｅｏｒｉａ， Ｉｌｌｉｎｏｉｓ ６１６０４ Ｕ．Ｓ．Ａ．）に２０１８年８月３日に寄託し、ＮＲＲＬ Ｎｏ． Ｂ－６７６５２が割り当てられた。

上記で同定される寄託物の各々は、特許手続上の微生物の寄託の国際的承認に関するブダペスト条約の条項の下で維持される。各寄託物は、当業者の便宜として行われたに過ぎず、寄託が米国特許法第１１２条の下で要求されるという承認ではない。

用語「単離される（ｉｓｏｌａｔｅｄ）」とは、（１）最初に生産される（天然であろうと、実験的状況であろうと）場合に関連付けられていた成分のうちの少なくともいくつかから分離されている、ならびに／または（２）ひとの手によって生産、調製、精製、および／もしくは製造されている、細菌、胞子、または他の実体もしくは物質を包含する。単離された細菌は、これらが最初に関連付けられていた他の成分のうちの少なくとも約１０％、約２０％、約３０％、約４０％、約５０％、約６０％、約７０％、約８０％、約９０％、もしくはこれより多くから分離されていてもよい。

本明細書で使用される場合、物質は、これが他の成分を実質的に含まない場合に「純粋（ｐｕｒｅ）」である。用語「精製する（ｐｕｒｉｆｙ）」、「精製する（ｐｕｒｉｆｙｉｎｇ）」および「精製された（ｐｕｒｉｆｉｅｄ）」とは、最初に生産されたかまたは起こった（例えば、天然であろうと、実験的状況であろうと）とき、またはその最初の生産後の任意の時間の間のいずれかで関連付けられていた成分のうちの少なくともいくつかから分離されている細菌、胞子、または他の物質に言及する。細菌または胞子または細菌集団または胞子集団は、これらが生産時もしくは生産後に（例えば、細菌または細菌集団または胞子を含む物質または環境から）単離されている場合に精製されていると見做され得、そして精製された細菌または細菌集団または胞子は、約１０％、約２０％、約３０％、約４０％、約５０％、約６０％、約７０％、約８０％、約９０％、または約９０％を超えるまで他の物質を含み得、そしてなお精製されていると見做され得る。いくつかの実施形態において、精製された細菌または胞子または細菌集団または胞子集団は、約８０％より高く、約８５％、約９０％、約９１％、約９２％、約９３％、約９４％、約９５％、約９６％、約９７％、約９８％、約９９％、または約９９％より高く純粋である。具体的実施形態において、細菌の培養物は、通常の細菌学的手順によって検出されるべき量において他の細菌種を含まない。

いくつかの実施形態において、本発明の組成物は、細菌株ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、またはＡＩＰ０３６７０６の実質的に純粋な培養物を含む。本発明の組成物はまた、細菌株ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、またはＡＩＰ０３６７０６の実質的に純粋な培養物の子孫であって、ここで上記培養物は、それぞれ、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、またはＡＩＰ０３６７０６の生理学的および形態的特徴の全てを有する。「集団（ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ）」とは、所定の細菌株の２もしくはこれより多くの個体（すなわち、１０、１００、１，０００、１０，０００、１×１０^６、１×１０^７、もしくは１×１０^８またはこれより多く）を含む、意図された群またはコレクションである。少なくとも１種の細菌株の集団または１種より多くの細菌株の個体の混合集団を含む種々の組成物が、本明細書で提供される。具体的実施形態において、細菌株（すなわち、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、およびＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体の細胞、またはＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、およびＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１種もしくはこれより多くから形成される、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせ）のうちの少なくとも１種の集団は、少なくとも約１０^５ ＣＦＵ／ｍｌ～約１０^１１ ＣＦＵ／ｍｌ、約１０^５ ＣＦＵ／ｍｌ～約１０^１０ ＣＦＵ／ｍｌ、約１０^５ ＣＦＵ／ｍｌ～約１０^１２ ＣＦＵ／ｍｌ、約１０^５ ＣＦＵ／ｍｌ～約１０^６ ＣＦＵ／ｍｌ、約１０^６ ＣＦＵ／ｍｌ～約１０^７ ＣＦＵ／ｍｌ、約１０^７ ＣＦＵ／ｍｌ～約１０^８ ＣＦＵ／ｍｌ、約１０^８ ＣＦＵ／ｍｌ～約１０^９ ＣＦＵ／ｍｌ、約１０^９ ＣＦＵ／ｍｌ～約１０^１０ ＣＦＵ／ｍｌ、約１０^１０ ＣＦＵ／ｍｌ～約１０^１１ ＣＦＵ／ｍｌ、約１０^１１ ＣＦＵ／ｍｌ～約１０^１２ ＣＦＵ／ｍｌの濃度を含む。他の実施形態において、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体の濃度は、少なくとも約１０^５ ＣＦＵ／ｍｌ、少なくとも約１０^６ ＣＦＵ／ｍｌ、少なくとも約１０^７ ＣＦＵ／ｍｌ、少なくとも約１０^８ ＣＦＵ／ｍｌ、少なくとも約１０^９ ＣＦＵ／ｍｌ、少なくとも約１０^１０ ＣＦＵ／ｍｌ、少なくとも約１０^１１ ＣＦＵ／ｍｌ、または少なくとも約１０^１２ ＣＦＵ／ｍｌを含む。

「胞子（ｓｐｏｒｅ）」とは、細菌種の少なくとも１種の休眠している（適用時には）が、生存可能な生殖単位に言及する。胞子が、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、およびＡＩＰ０３６７０６（またはこれらのうちのいずれかの改変体）の各々から形成される非限定的な方法は、本明細書で他の箇所に開示される。本明細書で開示される集団が、栄養細胞および前胞子（ｆｏｒｅｓｐｏｒｅ）（胞子形成の中間段階にある細胞）の組み合わせ；前胞子および胞子の組み合わせ；または前胞子、栄養細胞および／または胞子の組み合わせを含み得ることは、さらに認識される。

本明細書で使用される場合、「に由来する（ｄｅｒｉｖｅｄ ｆｒｏｍ）」とは、特定の供給源から直接単離もしくは得られるか、または代わりに特定の供給源から単離もしくは得られる物質もしくは生物の同定特徴を有することを意味する。「供給源（ｓｏｕｒｃｅ）」が生物である事象では、「由来する」は、それは、生物自体もしくは培養ブロス、懸濁物、または上記生物を培養または成長させるために使用される培地から単離または得られ得ることを意味する。「に由来する」または「から得られる（ｏｂｔａｉｎｅｄ ｆｒｏｍ）」化合物または組成物は、上記化合物または組成物が、細胞培養物もしくは全細胞ブロス、または懸濁物、濾液、上清、画分、または細胞培養物もしくは全細胞ブロスに由来する抽出物から単離され得るか、またはそれらによって生産され得ることを意味する。

本明細書で使用される場合、「全ブロス培養物（ｗｈｏｌｅ ｂｒｏｔｈ ｃｕｌｔｕｒｅ）」または「全細胞ブロス（ｗｈｏｌｅ ｃｅｌｌ ｂｒｏｔｈ）」とは、細胞および培地の両方を含む液体培養物に言及する。細菌がプレート上で成長される場合、上記細胞は、水または他の液体、全培養物中で採取され得る。用語「全ブロス培養物」および「全細胞ブロス」は、交換可能に使用される。

本明細書で使用される場合、「上清」とは、細胞がブロス中で成長するか、またはアガープレートから別の液体中で採取され、遠心分離、濾過、沈降、もしくは当該分野で周知の他の手段によって除去される場合に残っている液体に言及する。いくつかの実施形態において、上記上清は、別の組成物（例えば、水、緩衝液、新鮮な培地、および／または製剤）で希釈され得る。上記希釈された上清は、本発明の上清となおも考えられる。

本明細書で使用される場合、「濾液」とは、膜を通過した全ブロス培養物からの液体に言及する。上記濾液は、上記全ブロス培養物または上清中の有効な化合物または代謝産物の濃度と比較して、濃縮された量の上記有効な化合物または代謝産物を含み得る。本明細書で使用される場合、「抽出物」とは、溶媒（例えば、水、界面活性剤、緩衝液、および／または有機溶媒）によって細胞から除去され、遠心分離、濾過、または当該分野で公知野他の方法によって細胞から分離された液体物質に言及する。上記抽出物は、抽出する前の細胞中の有効な化合物または代謝産物の濃度と比較して、濃縮された量の有効な化合物または代謝産物を含み得る。あるいは、上記濾液または抽出物は、次いで、別の組成物（例えば、水、緩衝液、新鮮な培地、および／または製剤）で希釈され得る。このような希釈された濾液または抽出物は、本発明の濾液および抽出物となおも考えられる。

本明細書で使用される場合、「代謝産物」とは、細菌株（すなわち、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つ）の発酵の化合物、物質、または副生産物に言及する。有効な化合物または代謝産物は、有効量において目的の植物に適用される場合、植物の目的の任意の農学上の形質を改善し得るか、または植物有害生物または植物の病気を引き起こす植物病原体を制御する、上清、全細胞ブロス、または細菌株に存在する化合物である。

いくつかの実施形態において、本発明の組成物は、細菌株の発酵に由来する濾液または抽出物を含み、ここで上記組成物は、上記細菌株の全細胞ブロスまたは上清における量と比較して、濃縮された量の有効な化合物または代謝産物を含み、ここで上記細菌は、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つである。他の実施形態において、本発明の組成物は、細菌株の発酵に由来する希釈された濾液、希釈された抽出物、または希釈された上清を含み、ここで上記組成物は、上記細菌株の全細胞ブロスまたは希釈されていない上清の量と比較して、希釈された量の有効な化合物または代謝産物を含み、ここで上記細菌は、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つである。上記希釈された濾液、希釈された抽出物、または希釈された上清は、上記有効な化合物または代謝産物の有効量をなおも含み得る。

本明細書で記載される組成物および方法は、細菌株（すなわち、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つ、あるいはＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１種に由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせ）を含むかまたは由来する。方法は、これらの細菌株のうちの少なくとも１つを培養する工程を包含する。いくつかの実施形態において、これらの細菌株のうちの少なくとも１つは、培養され、化合物および／または組成物は、これらの化合物および／または組成物を、これらの細菌株のうちの少なくとも１つの培養物から単離することによって得られる。

いくつかの実施形態において、少なくとも１種の細菌株は、当該分野で公知の方法を使用して、栄養培地中で培養される。上記細菌株は、適切な培地中で、および細菌細胞成長を可能にする条件下で、振盪フラスコ培養によって、または実験用もしくは産業用の発酵器の中で行われる小スケールもしくは大スケールの発酵（連続発酵、バッチ発酵、流加発酵、または固体状態の発酵が挙げられるが、これらに限定されない）によって培養され得る。培養は、当該分野で公知の手順を使用して、炭素源および窒素源ならびに無機塩を含む適切な栄養培地中で起こり得る。適切な培地は、市販の供給源から入手可能であるか、または当該分野で周知の刊行物に従って調製される。

培養後に、化合物、代謝産物、および／または組成物が、培養ブロスから抽出され得る。上記抽出物は、クロマトグラフィーによって分画され得る。上記抽出物は、当該分野で周知の方法を使用してさらに精製され得る。上記抽出物はまた、当該分野で周知の方法を使用して希釈され得る。

細菌株（すなわち、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、およびＡＩＰ０３６７０６またはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つ、あるいはＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、およびＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１種に由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせ、ならびに／または組成物）の細胞を含む組成物は、農業的に受容可能なキャリアをさらに含み得る。用語「農業的に受容可能なキャリア（ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌｌｙ ａｃｃｅｐｔａｂｌｅ ｃａｒｒｉｅｒ）」とは、意図された被験体（すなわち、植物有害生物によって引き起こされる損傷もしくは病気に感受性である植物もしくは植物部分、または目的の農学上の形質を改善するための植物もしくは植物部分）への組成物の適用を容易にする任意の物質を含むことが意図される。植物および植物部分への適用のために組成物中で使用されるキャリアは、好ましくは、非植物毒性またはごく軽度に植物毒性である。適切なキャリアは、望ましい製剤化に依存して、固体、液体もしくは気体であり得る。一実施形態において、キャリアとしては、極性もしくは非極性の液体キャリア（例えば、水、鉱油および植物性油）が挙げられる。さらなるキャリアが、本明細書中の他の箇所で開示される。

Ａ．細菌株の活性改変体
ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、およびＡＩＰ０３６７０６の活性改変体が、さらに提供される。このような改変体は、植物において、１種もしくはこれより多くの植物有害生物を制御するか、または目的の１もしくはこれより多くの農学上の形質を改善する能力を保持する。従って、いくつかの実施形態において、本明細書で提供される細菌株の活性改変体は、植物有害生物に対して農薬活性を保持する。本明細書で使用される場合、「農薬活性（ｐｅｓｔｉｃｉｄａｌ ａｃｔｉｖｉｔｙ）」とは、有害生物が死滅させられるかまたは制御されるように、１種またはこれより多くの有害生物（昆虫、真菌、細菌、線虫、ウイルスまたはウイロイド、原生動物病原体などが挙げられる）に対する活性に言及する。いくつかの実施形態において、改変体は、１種またはこれより多くの昆虫有害生物または線虫有害生物を制御する能力を保持する。特定の実施形態において、改変体は、甲虫類の昆虫有害生物（コーンルートワーム（例えば、ウェスタンコーンルートワーム）、コロラドハムシ、ゾウムシ（例えば、アリモドキゾウムシ）、または半翅類の昆虫有害生物が挙げられる）を制御する能力を保持する。

本明細書で提供される種々の細菌株の活性改変体としては、例えば、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、およびＡＩＰ０３６７０６の任意の単離体（ｉｓｏｌａｔｅ）または変異体（ｍｕｔａｎｔ）が挙げられる。

用語「変異体」とは、親株の改変体ならびに農薬活性が上記親株によって発現されるものより大きい変異体または改変体を得るための方法に言及する。「親株」は、変異誘発する前の元の株である。このような変異体を得るために、上記親株は、Ｎ－メチル－Ｎ’－ニトロ－Ｎ－ニトロソグアニジン、エチルメタンスルホン（ＥＭＳ）のような化学物質で、またはγ線、ｘ線、もしくはＵＶ照射を使用する照射によって、または当該分野で周知の他の手段によって、処理され得る。

いくつかの実施形態において、上記活性改変体は、寄託された株に対して、少なくとも１つの遺伝子において変異を少なくとも含む。上記遺伝子は、例えば、バイオフィルム形成、運動性、化学走性、細胞外分泌、輸送（例えば、ＡＢＣトランスポータータンパク質）、ストレス応答、揮発性、転写（例えば、代替のシグマ因子および全体の転写調節因子）、根定着、植物における誘導性全身応答（ｉｎｄｕｃｅｄ ｓｙｓｔｅｍｉｃ ｒｅｓｉｓｔａｎｃｅ）を刺激する能力、および／または二次代謝（リポペプチド、ポリケチド、高分子ヒドロラーゼ（例えば、プロテアーゼおよび／またはカルボヒドラーゼ）、および／または抗微生物化合物（抗生物質が挙げられる）の合成が挙げられる）において役割を有し得る。二次代謝とは、抗微生物化合物（環式リポペプチド、ポリケチド、イツリン、バクテリオシン（例えば、プランタゾリシンおよびアミロサイクリシン（ａｍｙｌｏｃｙｃｌｉｃｉｎ））およびジペプチド（例えば、バシリシン）が挙げられる）の非リボソームおよびリボソーム合成の両方に言及する。

活性改変体の例は、細菌株ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、またはＡＩＰ０３６７０６の細胞であり、ここで上記細胞は、機能喪失を生じるｓｗｒＡ遺伝子における変異をさらに含む。上記ｓｗｒＡ変異（これは、バイオフィルム形成に影響を与える（Ｋｅａｒｎｓらら， Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ （２０１１） ５２（２）： ３５７－３６９））は、植物有害生物を制御するか、または植物の目的の農学上の形質を改善する増強された能力を有する本発明の株の活性改変体を生じ得る。バイオフィルム形成に関与する他の遺伝子（例えば、ｓｆｐ、ｅｐｓＣ、ｄｅｇＱ、およびｒａｐＰといわれるプラスミド遺伝子（例えば、ＭｃＬｏｏｎら， Ｊ ｏｆ Ｂａｃｔｅｒｉｏｌｏｇｙ， （２０１１） １９３（８）： ２０２７－２０３４を参照のこと））はまた、本発明の細菌株の活性改変体において変異され得る。

具体的実施形態において、上記細菌株は、殺生物剤と適合性である。殺生物剤は、化学的または生物学的手段によって生物に対して制御効果を発揮し得る化学物質である。殺生物剤としては、農薬（例えば、殺真菌剤または殺虫剤；除草剤；他の農作物保護化学物質など）が挙げられる。このような化合物は、本明細書中の他の箇所で詳細に考察される。細菌株は、この細菌株が目的の殺生物剤の有効量の存在下で生存および／または生殖する能力がある場合に、殺生物剤と適合性である。その細菌株が目的の殺生物剤に関して適合性でない場合には、望ましい場合、その細菌株を改変して、目的の適合性を付与するための方法が企図され得る。改変された細菌株を生産するためのこのような方法は、選択技術および／または形質転換技術の両方を含む。

「改変された細菌株（ｍｏｄｉｆｉｅｄ ｂａｃｔｅｒｉａｌ ｓｔｒａｉｎ）」とは、この株が改変されて（選択および／または形質転換によって）、目的の１種もしくはこれより多くのさらなる形質を有する集団を意図する。場合によっては、その改変された細菌株は、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、およびＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１種を含む。具体的実施形態において、その改変された細菌株は、目的の殺生物剤と適合性である（除草剤、殺真菌剤、農薬、もしくは他の農作物保護化学物質への抵抗性が挙げられるが、これらに限定されない）。その改変された殺生物剤抵抗性株は、これらが特定の除草剤、殺真菌剤、農薬、もしくは他の農作物保護化学物質に対して有意により抵抗性であることを除いて、元の感受性株と同じ同定特徴を有する。それらの同定は、公知の感受性株の特徴と比較することによって、容易に可能である。従って、改変された細菌株の単離された集団が提供される。

殺生物剤への抵抗性（例えば、除草剤、殺虫剤、殺真菌剤、農薬、または他の農作物保護化学物質への抵抗性）の増大は、生物（すなわち、細菌細胞もしくは胞子）が、その改変されていない生物に通常は致死的であるかまたは改変されていない生物の成長を実質的に低減する殺生物剤（例えば、除草剤、殺虫剤、殺真菌剤、農薬、もしくは他の農作物保護化学物質）の用量への曝露後に、生存および生殖する能力に言及する。具体的実施形態において、殺生物剤への抵抗性の増大は、その殺生物剤の農業上有効な量の存在下で示される。

このような場合に、１種もしくはこれより多くの殺生物剤への抵抗性を有するその改変された細菌株は、特に、除草剤、殺虫剤、殺真菌剤、農薬、または他の農作物保護化学物質に対して抵抗性のない他の微生物因子を超える細菌株の競争力を増強するために有用である。従って、本明細書で提供される組成物は、選択もしくは操作された細菌株および細菌株の改変された集団を含む。これらの細菌株または改変された細菌株は、植物用の接種物として使用され得る。それらはまた、植物の地上部に直接スプレー適用として適用され得るか、または種子コーティングとして適用され得、それらが改変されて耐性になった除草剤もしくは他の化学物質と混合され得る。

従って、本明細書で開示される細菌株の活性改変体は、その活性改変体が植物有害生物を制御しかつさらに、少なくとも１種の殺生物剤の存在下で成長し得るように、例えば、改変された株を含む。除草剤、殺虫剤、殺真菌剤、農薬、または他の農作物保護化学物質への抵抗性を有する組換え細菌株は、遺伝子工学技術を通じて作製され得、このように操作されたまたは組換えの細菌株は、細菌株の改変された集団を生産するために成長させられる。組換え細菌株は、ポリヌクレオチドを、形質転換によって細菌宿主細胞の中に導入することによって、生産される。微生物を形質転換するための方法は公知であり、当該分野で利用可能である。一般には、Ｈａｎａｈａｎ， Ｄ． （１９８３） Ｓｔｕｄｉｅｓ ｏｎ ｔｒａｎｓｆｏｒｍａｔｉｏｎ ｏｆ Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ ｗｉｔｈ ｐｌａｓｍｉｄｓ Ｊ． Ｍｏｌ． Ｂｉｏｌ． １６６， ５５７－７７； Ｓｅｉｄｍａｎ， Ｃ．Ｅ． （１９９４） Ｉｎ： Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ， Ａｕｓｕｂｅｌ， Ｆ．Ｍ． ｅｔ ａｌ． ｅｄｓ．， Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ａｎｄ Ｓｏｎｓ， ＮＹ； Ｃｈｏｉ ｅｔ ａｌ． （２００６） Ｊ． Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ． Ｍｅｔｈｏｄｓ ６４：３９１－３９７； Ｗａｎｇ ｅｔ ａｌ． ２０１０． Ｊ． Ｃｈｅｍ． Ｔｅｃｈｎｏｌ． Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ． ８５：７７５－７７８を参照のこと。形質転換は、実験室において、コンピテント細胞によるそれらの環境からの裸のＤＮＡの天然の取り込みによって起こり得る。あるいは、細胞は、冷たい条件下での二価カチオンへの曝露によって、エレクトロポレーションによって、ポリエチレングリコールへの曝露によって、線維性ナノ粒子での処理、または当該分野で周知の他の方法によって、コンピテントにされ得る。

組換え細菌株を形質転換するにあたって使用するための除草剤抵抗性遺伝子としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：フモニシン解毒遺伝子（米国特許第５，７９２，９３１号）；除草剤抵抗性（特に、スルホニルウレアタイプの除草剤）をもたらすアセトラクテートシンターゼ（ＡＬＳ）変異体（例えば、Ｓ４および／もしくはＨｒａ変異）；グルタミンシンターゼのインヒビター（例えば、ホスフィノスリシンもしくはバスタ（例えば、ｂａｒ遺伝子））；ならびにグリホサート抵抗性（ＥＰＳＰＳ遺伝子））；グルホシネート（ｇｌｕｐｈｏｓｉｎａｔｅ）およびＨＰＰＤ抵抗性（ＷＯ９６／３８５７６、米国特許第６，７５８，０４４号；同第７，２５０，５６１号；同第７，９３５，８６９号；および同第８，１２４，８４６号）、または当該分野で公知の他のこのような遺伝子。ＷＯ９６／３８５７６、米国特許第５，７９２，９３１号、米国特許第６，７５８，０４４号、米国特許第７，２５０，５６１号、米国特許第７，９３５，８６９号および米国特許第８，１２４，８４６号の開示は、本明細書で参考として援用される。ｂａｒ遺伝子は、除草剤バスタに対する抵抗性をコードし、ｎｐｔＩＩ遺伝子は、抗生物質カナマイシンおよびジェネティシンに対する抵抗性をコードし、ＡＬＳ遺伝子変異体は、スルホニルウレア除草剤（クロルスルフロン、メトスルフロン、スルホメツロン、ニコスルフロン、リムスルフロン、フラザスルフロン、スルホスルフロン、およびトリアスルフロンが挙げられる）ならびにイミダゾリノン（ｉｍａｄｉｚｏｌｉｎｏｎｅ）除草剤（イマゼタピル、イマザキン、イマザピル、およびイマザメタベンズが挙げられる）に対する抵抗性をコードする。

選択を通じて細菌株の改変された集団を同定および生産するために、上記細菌株は、選択圧としての除草剤、殺虫剤、殺真菌剤、農薬、または他の農作物保護化学物質の存在下で成長させられる。感受性の因子は死滅する一方で、抵抗性の因子は競合なしに生存して生殖する。上記細菌株は、除草剤、殺虫剤、殺真菌剤、農薬、もしくは他の農作物保護化学物質の存在下で成長させられるので、抵抗性の細菌株は、成功裡に生殖し、集団の中で優勢になり、細菌株の改変された集団になる。抵抗性株を選択するための方法は公知であり、米国特許第４，３０６，０２７号および同第４，０９４，０９７号（本明細書に参考として援用される）を含む。細菌株の改変された集団を含む細菌株の活性改変体は、これらが特定の除草剤、殺虫剤、殺真菌剤、農薬、もしくは他の農作物保護化学物質に対して顕著により耐性であることを除いて、その元の感受性株と同じ同定特徴を有する。従って、それらの同定は、公知の感受性株の特徴との比較によって容易に可能である。

本明細書で提供される種々の細菌のさらなる活性改変体は、例えば、１６ＳリボソームＲＮＡ間の配列同一性の関連性を決定する方法、導出されかつ機能的に同一もしくはほぼ同一の株の群を同定する方法を使用して同定され得、多座配列タイピング法（Ｍｕｌｔｉ－ｌｏｃｕｓ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｔｙｐｉｎｇ）（ＭＬＳＴ）、連接された連鎖状遺伝子ツリー（ｃｏｎｃａｔｅｎａｔｅｄ ｓｈａｒｅｄ ｇｅｎｅｓ ｔｒｅｅ）、全ゲノムアラインメント法（Ｗｈｏｌｅ Ｇｅｎｏｍｅ Ａｌｉｇｎｍｅｎｔ）（ＷＧＡ）、平均ヌクレオチド同一性法（Ａｖｅｒａｇｅ Ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ Ｉｄｅｎｔｉｔｙ）、およびＭｉｎＨａｓｈ（Ｍａｓｈ）距離測定法が挙げられる。

一局面において、細菌株ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、およびＡＩＰ０３６７０６の活性改変体は、Ｂｉｓｈｏｐら （２００９） ＢＭＣ Ｂｉｏｌｏｇｙ ７（１）１７４１－７００７－７－３において定義されるとおりの生物分類のＢｉｓｈｏｐ ＭＬＳＴ法を使用することによって、開示される株のうちのいずれかに密接に関連する株を含む。従って、具体的実施形態において、本明細書で開示される細菌株の活性改変体は、Ｂｉｓｈｏｐら （２００９） ＢＭＣ Ｂｉｏｌｏｇｙ ７（１）１７４１－７００７－７－３（これは、その全体において本明細書に参考として援用される）に示されるとおりの生物分類のＢｉｓｈｏｐ法を使用して、少なくとも８０％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％． ９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９８．５％、９８．８％、９９％、９９．１％、９９．２％、９９．３％、９９．４％、９９．５％、９９．６％、９９．７％、９９．８％、または９９．９％の配列カットオフ内に入る細菌株を含む。このような方法によって同定される細菌の活性改変体は、有効量において、植物、植物部分、または栽培地に適用される場合に、少なくとも１種の植物有害生物を制御するおよび／または少なくとも１種の農学上の形質を改善する能力を保持する（例えば、植物有害生物を低減する、植物有害生物の外寄生を低減するおよび／または有害生物への抵抗性（昆虫有害生物への抵抗性（例えば、ウェスタンコーンルートワーム、コロラドハムシ、および／またはアリモドキゾウムシのような甲虫類の昆虫）を含む）を増大させることが挙げられる）。

別の局面において、本明細書で開示される細菌株の活性改変体は、生物分類の平均ヌクレオチド同一性（ＡＮＩ）法に基づいて、開示される株のうちのいずれかに密接に関連する株を含む。ＡＮＩ（例えば、Ｋｏｎｓｔａｎｔｉｎｉｄｉｓ， Ｋ．Ｔ．，ら， （２００５） ＰＮＡＳ ＵＳＡ １０２（７）：２５６７－７２；およびＲｉｃｈｔｅｒ， Ｍ．，ら， （２００９） ＰＮＡＳ １０６（４５）：１９１２６－３１）を参照のこと）および変法（例えば、Ｖａｒｇｈｅｓｅ， Ｎ．Ｊ．，ら， Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ （Ｊｕｌｙ ６， ２０１５）： ｇｋｖ６５７を参照のこと）は、ＷＧＡにおいて整列させる株のゲノムの間で共有される平均ヌクレオチドを合計することに基づく。従って、具体的実施形態において、本明細書で開示される細菌株ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、およびＡＩＰ０３６７０６の活性改変体は、Ｋｏｎｓｔａｎｔｉｎｉｄｉｓ， Ｋ．Ｔ．，ら， （２００５） ＰＮＡＳ ＵＳＡ １０２（７）：２５６７－７２（これは、その全体において本明細書に参考として援用される）に示されるとおりの生物分類のＡＮＩ法を使用して、少なくとも９０％、９５％、９６％、９７％、９７．５％、９８％、９８．５％、９８．８％、９９％、９９．５％、または９９．８％の配列カットオフ内に入る細菌株を含む。このような方法によって同定される細菌の活性改変体は、有効量において、植物、植物部分、または栽培地に適用される場合、少なくとも１種の植物有害生物を制御するおよび／または少なくとも１種の農学上の形質を改善する能力を保持する（例えば、植物有害生物を低減する、植物有害生物の外寄生を低減するおよび／または有害生物への抵抗性（昆虫有害生物への抵抗性（例えば、ウェスタンコーンルートワーム、コロラドハムシ、および／またはアリモドキゾウムシのような甲虫類の昆虫）を含む）を増大させることが挙げられる）。

別の局面において、本明細書で開示される単離された細菌株の活性改変体は、１６Ｓ ｒＤＮＡ配列同一性に基づいて、上記の株のうちのいずれかに密接に関連する（例えば、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、またはＡＩＰ０３６７０６に密接に関連する）株を含む。細菌における関連性を決定するための１６Ｓ ｒＤＮＡ配列同一性の使用に関しては、Ｓｔａｃｋｅｂｒａｎｄｔ Ｅ，ら， 「Ｒｅｐｏｒｔ ｏｆ ｔｈｅ ａｄ ｈｏｃ ｃｏｍｍｉｔｔｅｅ ｆｏｒ ｔｈｅ ｒｅ－ｅｖａｌｕａｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ｓｐｅｃｉｅｓ ｄｅｆｉｎｉｔｉｏｎ ｉｎ ｂａｃｔｅｒｉｏｌｏｇｙ」，Ｉｎｔ Ｊ Ｓｙｓｔ Ｅｖｏｌ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．５２（３）：１０４３－７ （２００２）を参照のこと。ある実施形態では、上記活性改変体は、１６Ｓ ｒＤＮＡの配列同一性に基づいて上記の株のいずれかに少なくとも９５％同一、１６Ｓ ｒＤＮＡの配列同一性に基づいて上記の株のいずれかに少なくとも９６％同一、１６Ｓ ｒＤＮＡの配列同一性に基づいて上記の株のいずれかに少なくとも９７％同一、１６Ｓ ｒＤＮＡの配列同一性に基づいて上記の株のいずれかに少なくとも９８％、１６Ｓ ｒＤＮＡの配列同一性に基づいて上記の株のいずれかに少なくとも９８．５％同一、１６Ｓ ｒＤＮＡの配列同一性に基づいて上記の株のいずれかに少なくとも９９％同一、１６Ｓ ｒＤＮＡの配列同一性に基づいて上記の株のいずれかに少なくとも９９．５％または１６Ｓ ｒＤＮＡの配列同一性に基づいて上記の株のいずれかに少なくとも１００％である。このような方法によって同定される細菌の活性改変体は、有効量において、植物、植物部分、または栽培地に適用される場合、少なくとも１種の植物有害生物を制御するおよび／または少なくとも１種の農学上の形質を改善する能力を保持する（例えば、植物有害生物を低減する、植物有害生物の外寄生を低減するおよび／または有害生物への抵抗性（昆虫有害生物への抵抗性（例えば、ウェスタンコーンルートワーム、コロラドハムシ、および／またはアリモドキゾウムシのような甲虫類の昆虫）を含む）を増大させることが挙げられる）。

ＭｉｎＨａｓｈ（Ｍａｓｈ）距離測定法は、高分解能で微生物の階層的分類のための閾値を規定しかついくつかのパラメーターおよび工程を要する比較法である（Ｏｎｄｏｖら （２０１６） Ｇｅｎｏｍｅ Ｂｉｏｌｏｇｙ １７：１３２）。Ｍａｓｈ距離は、それらのＭｉｎＨａｓｈスケッチから直接、２つの配列間の変異率を推測する（Ｏｎｄｏｖら （２０１６） Ｇｅｎｏｍｅ Ｂｉｏｌｏｇｙ １７：１３２）。Ｍａｓｈ距離は、階層的分類に関して平均ヌクレオチド同一性法（ＡＮＩ）と強く対応する（Ｋｏｎｓｔａｎｔｉｎｉｄｉｓ， Ｋ．Ｔ．ら （２００５） ＰＮＡＳ ＵＳＡ １０２（７）：２５６７－７２（その全体において本明細書に参考として援用される）を参照のこと）。すなわち、ＡＮＩ ９７％は、Ｍａｓｈ距離 ０．０３におよそ等しく、その結果、ＡＮＩ文献中での有用な分類閾値として示される値は、Ｍａｓｈ距離で直接適用され得る。

本明細書で開示される細菌株の活性改変体は、完全ゲノムＤＮＡ配列間のＭｉｎｈａｓｈ（Ｍａｓｈ）距離に基づいて、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、またはＡＩＰ０３６７０６に密接に関連する株を含む。従って、具体的実施形態において、本明細書で開示される細菌株の活性改変体は、その開示される株に対してＭａｓｈ距離 約０．０１５未満以内のゲノムを有する細菌株を含む。他の実施形態において、本明細書で開示される細菌株の活性改変体は、約０．００１、０．００２５、０．００５、０．０１０、０．０１５、０．０２０、０．０２５、または０．０３０未満の距離測定値（ｄｉｓｔａｎｃｅ ｍｅｔｒｉｃ）を含む。ゲノムは、これがＭａｓｈ距離に関連する場合、細菌染色体ＤＮＡおよび細菌プラスミドＤＮＡの両方を含む。他の実施形態において、細菌株の活性改変体は、技術的な分散によって引き起こされる相違点より大きい、開示される株に対するＭａｓｈ距離閾値を上回っているゲノムを有する。さらなる場合には、細菌株の活性改変体は、技術的な分散によって引き起こされる相違点より大きい、開示される株に対するＭａｓｈ距離閾値を上回っており、かつＭａｓｈ距離 約０．０１５未満を有するゲノムを有する。他の場合には、細菌株の活性改変体は、技術的な分散によって引き起こされる相違点より大きい、開示される株に対するＭａｓｈ距離閾値を上回っており、かつＭａｓｈ距離 約０．００１、０．００２５、０．００５、０．０１０、０．０１５、０．０２０、０．０２５、または０．０３０未満を有するゲノムを有する。

本明細書で使用される場合、「技術的な変動を上回る（ａｂｏｖｅ ｔｅｃｈｎｉｃａｌ ｖａｒｉａｔｉｏｎ）」とは、比較されているゲノムがＩｌｌｕｍｉｎａ ＨｉＳｅｑ ２５００ ＤＮＡ配列決定技術での少なくとも２０×カバレッジ（ｃｏｖｅｒａｇｅ）で配列決定した各ＤＮＡでありかつそのゲノムが汚染に関して２％未満という証拠を伴って少なくとも９９％完全であるとすれば、ゲノムアセンブリにおける誤差によって引き起こされる２つの株間のＭａｓｈ距離を上回ることを意味する。２０×カバレッジは当該分野で認識されている用語であるが、明瞭性のために、２０×カバレッジの例は、以下のとおりである：ゲノムサイズ５メガベース（ＭＢ）に関しては、所定のゲノムから１００ＭＢのＤＮＡ配列決定が、そのゲノムに沿った各位置で、平均して２０×配列決定カバレッジを有するために必要とされる。Ｃａｍｐｂｅｌｌら（２０１３） ＰＮＡＳ ＵＳＡ １１０（１４）：５５４０－４５， Ｄｕｐｏｎｔら（２０１２） ＩＳＭＥＪ ６：１６２５－１６２８、およびＣｈｅｃｋＭ ｆｒａｍｅｗｏｒｋ （Ｐａｒｋｓら （２０１５） Ｇｅｎｏｍｅ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ２５：１０４３－１０５５）（これらの参考文献の各々は、それらの全体において本明細書に参考として援用される）に見出されるセットを含め、ゲノム完全性計算のために使用するマーカー遺伝子の多くの適切なコレクションが存在する。汚染は、所定のゲノム配列中の複数のコピー中に見出される代表的には単一コピーのマーカー遺伝子のパーセンテージとして定義される（例えば、Ｐａｒｋｓら （２０１５） Ｇｅｎｏｍｅ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ２５：１０４３－１０５５）（これらの参考文献の各々は、それらの全体において本明細書に参考として援用される）。完全性および汚染は、マーカー遺伝子の同じコレクションを使用して計算される。別段述べられなければ、完全性および汚染アッセイにおいて使用されるコレクションマーカーのセットは、Ｃａｍｐｂｅｌｌら （２０１３） ＰＮＡＳ ＵＳＡ １１０（１４）：５５４０－４５（本明細書に参考として援用される）に示されるものである。

問題のゲノム間で距離概算値を得るための例示的工程は、以下のとおりである：（１）比較のために十分な品質のゲノムが、生産されなければならない。十分な品質のゲノムは、Ｉｌｌｕｍｉｎａ ＨｉＳｅｑ ２５００技術を使用して、少なくとも２０×ゲノムカバレッジに達するために十分なＤＮＡ配列で作製されるゲノムアセンブリとして定義される。そのゲノムは、特許請求される微生物のゲノムと比較されるために、２％未満の汚染を伴って少なくとも９９％完全でなければならない。（２）ゲノムは、Ｏｎｄｏｖら（２０１６） Ｇｅｎｏｍｅ Ｂｉｏｌｏｇｙ １７：１３２（その全体において本明細書に参考として援用される）に示されるように、Ｍｉｎｈａｓｈワークフローを使用して比較されるべきである。別段述べられなければ、使用されるパラメーターは、以下のとおりである：「スケッチ（ｓｋｅｔｃｈ）」サイズ １０００、および「ｋ－ｍｅｒー長」 ２１。（３）２つのゲノム間のＭａｓｈ距離が、０．００１、０．００２５、０．００５、０．０１０、０．０１５、０．０２０、０．０２５、もしくは０．０３０未満であることを確認する。上記で述べられたパラメーターおよび方法を使用すると、２つのゲノム間のＭａｓｈ距離 ０．０１５は、予測される変異率が、相同な位置あたり０．０１５変異であることを意味する。このような方法によって同定される細菌の活性改変体は、有効量において、植物、植物部分、または栽培地に適用される場合、少なくとも１種の植物有害生物を制御するおよび／または少なくとも１種の農学上の形質を改善する能力を保持する（例えば、植物有害生物を低減する、植物有害生物の外寄生を低減するおよび／または有害生物への抵抗性（昆虫有害生物への抵抗性（例えば、ウェスタンコーンルートワーム、コロラドハムシ、および／またはアリモドキゾウムシのような甲虫類の昆虫）を含む）を増大させることが挙げられる）。

ＩＩＩ．製剤化
本明細書で提供される細菌株（すなわち、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体の細胞、またはＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１種に由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせ、ならびに／または組成物）は、細胞ペースト、水和剤、細胞ペレット、粉剤（ｄｕｓｔ）、粒剤（ｇｒａｎｕｌｅ）、スラリー、乾燥粉末、水性もしくは油ベースの液体生産物などとして製剤化され得る。このような製剤は、キャリアおよび他の因子に加えて、本明細書で提供される細菌もしくはその活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物を含む。その製剤は、本明細書の他の箇所で開示されるように、種々の方法で使用され得る。

本明細書で開示される細菌株およびその活性改変体は、増量剤、溶媒、自発性増進因子（ｓｐｏｎｔａｎｅｉｔｙ ｐｒｏｍｏｔｅｒ）、キャリア、乳化剤、分散剤、防霜剤（ｆｒｏｓｔ ｐｒｏｔｅｃｔａｎｔ）、濃化剤、および／またはアジュバントのうちの少なくとも１種もしくはこれより多くを含むように製剤化され得る。いくつかの実施形態において、上記増量剤、溶媒、自発性増進因子、キャリア、乳化剤、分散剤、防霜剤、濃化剤、および／またはアジュバントは、非天然のまたは合成の増量剤、溶媒、自発性増進因子、キャリア、乳化剤、分散剤、防霜剤、濃化剤、および／またはアジュバントである。特定の実施形態において、本明細書で開示される細菌株およびその活性改変体は、少なくとも１種またはこれより多くの天然の増量剤、溶媒、自発性増進因子、キャリア、乳化剤、分散剤、防霜剤、濃化剤、および／またはアジュバントを含むように製剤化され得る。

代表的な製剤の例としては、水溶性液剤（ｗａｔｅｒ－ｓｏｌｕｂｌｅ ｌｉｑｕｉｄ）（ＳＬ）、乳剤（ｅｍｕｌｓｉｆｉａｂｌｅ ｃｏｎｃｅｎｔｒａｔｅ）（ＥＣ）、ＥＷ剤（ｅｍｕｌｓｉｏｎ ｉｎ ｗａｔｅｒ）（ＥＷ）、ＳＣ剤（ｓｕｓｐｅｎｓｉｏｎ ｃｏｎｃｅｎｔｒａｔｅ）（ＳＣ）、ＳＥ剤（ｓｕｓｐｏ－ｅｍｕｌｓｉｏｎ）（ＳＥ）、種子処理用フロアブル剤（ｆｌｏｗａｂｌｅ ｃｏｎｃｅｎｔｒａｔｅ ｆｏｒ ｓｅｅｄ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ）（ＦＳ）、ＯＤ剤（ｏｉｌ ｄｉｓｐｅｒｓｉｏｎ）（ＯＤ）、水和性粒剤（ｗａｔｅｒ－ｄｉｓｐｅｒｓｉｂｌｅ ｇｒａｎｕｌｅ）（ＷＧ）、粒剤（ＧＲ）、カプセル剤（ｃａｐｓｕｌｅ ｃｏｎｃｅｎｔｒａｔｅ）（ＣＳ）、水和性粒剤（ＷＧ）、粒剤（ＧＲ）、ブロックベイト剤（ｂｌｏｃｋ ｂａｉｔ）（ＢＢ）、水溶剤（ｗａｔｅｒ－ｓｏｌｕｂｌｅ ｇｒａｎｕｌｅ）（ＳＧ）、ならびにＣＳとＳＣとの混合製剤（ＺＣ）が挙げられる。これらおよび他の考えられる製剤タイプは、例えば、Ｃｒｏｐ Ｌｉｆｅ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌによって、およびＰｅｓｔｉｃｉｄｅ Ｓｐｅｃｉｆｉｃａｔｉｏｎｓ， Ｍａｎｕａｌ ｏｎ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ａｎｄ ｕｓｅ ｏｆ ＦＡＯ ａｎｄ ＷＨＯ ｓｐｅｃｉｆｉｃａｔｉｏｎｓ ｆｏｒ ｐｅｓｔｉｃｉｄｅｓ， ＦＡＯ Ｐｌａｎｔ Ｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ ａｎｄ Ｐｒｏｔｅｃｔｉｏｎ Ｐａｐｅｒｓ － １７３（ＦＡＯ／ＷＨＯ Ｊｏｉｎｔ Ｍｅｅｔｉｎｇ ｏｎ Ｐｅｓｔｉｃｉｄｅ Ｓｐｅｃｉｆｉｃａｔｉｏｎｓ， ２００４作成、ＩＳＢＮ： ９２５１０４８５７６）に記載される。その製剤は、１種もしくはこれより多くの本発明の活性化合物以外の活性農薬化合物（ａｇｒｏｃｈｅｍｉｃａｌ ｃｏｍｐｏｕｎｄ）を含み得る。

種々の細菌株またはその活性改変体の製剤形態または適用形態は、補助物質、例えば、増量剤、溶媒、自発性増進因子、キャリア、乳化剤、分散剤、防霜剤、殺生物剤、固体キャリア、界面活性剤、濃化剤、および／または他の補助物質（例えば、アジュバント）を含み得るが、これらに限定されない。この状況でのアジュバントは、その成分自体が生物学的効果を有することなく、製剤の生物学的効果を増強する成分である。アジュバントの例は、葉表面に留まる、拡がる、付着する、または浸透することを増進する因子である。

非限定的な増量剤は、例えば、水、極性および非極性の有機化学的液体（例えば、芳香族炭化水素および非芳香族炭化水素のクラスに由来するもの（例えば、パラフィン、アルキルベンゼン、アルキルナフタレン、クロロベンゼン））、アルコールおよびポリオール（これはまた、適切であれば、置換、エーテル化および／またはエステル化されていてもよい）、ケトン（例えば、アセトン、シクロヘキサノン）、エステル（脂肪および油を含む）ならびに（ポリ）エーテル、置換されていないおよび置換されているアミン、アミド、ラクタム（例えば、Ｎ－アルキルピロリドン）ならびにラクトン、スルホンおよびスルホキシド（例えば、ジメチルスルホキシド）である。使用される増量剤が水である場合、例えば、補助的溶媒として有機溶媒を使用することも可能である。本質的には、非限定的な液体溶媒は、以下である：芳香族（例えば、キシレン、トルエンもしくはアルキルナフタレン）、塩素化芳香族および塩素化脂肪族炭化水素（例えば、クロロベンゼン、クロロエチレンもしくは塩化メチレン）、脂肪族炭化水素（例えば、シクロヘキサンもしくはパラフィン）、例えば、石油画分、鉱油および植物性油、アルコール（例えば、ブタノールもしくはグリコール）、ならびにまた、それらのエーテルおよびエステル、ケトン（例えば、アセトン、メチルエチルケトン、メチルイソブチルケトンもしくはシクロヘキサノン）、高極性溶媒（例えば、ジメチルホルムアミドおよびジメチルスルホキシド）、ならびにまた、水。原則として、任意の適切な溶媒を使用することも可能である。非限定的な溶媒は、以下である：例えば、芳香族炭化水素（例えば、キシレン、トルエンもしくはアルキルナフタレン）、例えば、塩素化芳香族もしくは塩素化脂肪族炭化水素（例えば、クロロベンゼン、クロロエチレンもしくは塩化メチレン）、例えば、脂肪族炭化水素（例えば、シクロヘキサン）、例えば、パラフィン、石油画分、鉱油および植物性油、アルコール（例えば、メタノール、エタノール、イソプロパノール、ブタノールもしくはグリコール）、例えば、ならびにまた、それらのエーテルおよびエステル、ケトン（例えば、アセトン、メチルエチルケトン、メチルイソブチルケトンもしくはシクロヘキサノン）、例えば、高極性溶媒（例えば、ジメチルホルムアミド）、ならびに水。

適切なキャリアの非限定的な例としては、例えば、アンモニウム塩および土壌の天然ミネラル（例えば、カオリン、クレイ、タルク、白亜、石英、アタパルジャイト、モンモリロナイトもしくは珪藻土）、および土壌の合成ミネラル（例えば、微粉化シリカ、アルミナおよび天然もしくは合成のシリケート、樹脂、ワックスならびに／または固形肥料が挙げられる。このようなキャリアの混合物は、同様に使用され得る。粒剤に適したキャリアとしては、以下が挙げられる：例えば、粉砕されかつ分画された天然のミネラル（例えば、方解石、大理石、軽石、海泡石、苦灰石）、そしてまた、無機物および有機物のあらびき粉（ｍｅａｌ）の合成粒、そしてまた、有機物質（例えば、おがくず、紙、ヤシ殻、軸付トウモロコシ、およびタバコの茎）の粒。

液化ガスの増量剤または溶媒がまた、使用され得る。非限定的な例は、標準的な温度でおよび標準的な圧力下でガスである増量剤またはキャリアであり、例は、エアロゾル噴霧体（例えば、ハロゲン化炭化水素）、そしてまた、ブタン、プロパン、窒素および二酸化炭素である。イオン性もしくは非イオン性の特性を有する乳化剤および／または泡沫形成剤（ｆｏａｍ－ｆｏｒｍｅｒ）、分散剤もしくは湿潤剤、またはこれら表面活性物質の混合物の例は、ポリアクリル酸の塩、リグノスルホン酸の塩、フェノールスルホン酸もしくはナフタレンスルホン酸の塩、エチレンオキシドと脂肪アルコールまたは脂肪酸もしくは脂肪アミンとの、置換されたフェノール（好ましくは、アルキルフェノールもしくはアリールフェノール）との多重縮合物（ｐｏｌｙｃｏｎｄｅｎｓａｔｅｓ）、スルホコハク酸エステルの塩、タウリン誘導体（好ましくは、アルキルタウレート（ａｌｋｙｌｔａｕｒａｔｅ））、ポリエトキシル化アルコールもしくはフェノールのリン酸エステル、ポリオールの脂肪酸エステル、ならびにスルフェート、スルホネートおよびホスフェートを含む化合物の誘導体であり、例は、アルキルアリールポリグリコールエーテル、アルキルスルホネート、アルキルスルフェート、アリールスルホネート、タンパク質加水分解物、リグニン－スルファイト廃棄物リカーおよびメチルセルロースである。表面活性物質の存在は、活性化合物のうちの１種および／または不活性キャリアのうちの１種が、水に可溶性でない場合に、および適用が水の中で行われる場合に、有利である。

製剤中におよびそれらから導出される適用形態に存在し得るさらなる補助物質としては、着色剤（例えば、無機顔料（例は、酸化鉄、二酸化チタン、プルシアンブルーである）および有機染料（例えば、アリザリン染料、アゾ染料および金属フタロシアニン染料）、ならびに栄養素および微量栄養素（例えば、鉄、マンガン、ホウ素、銅、コバルト、モリブデン、および亜鉛の塩）が挙げられる。

安定化剤（例えば、低温安定化剤、保存剤、抗酸化剤、光安定化剤、または化学的および／もしくは物理的安定性を改善する他の因子）がまた、存在し得る。泡沫形成剤または消泡剤がさらに存在し得る。

さらに、製剤およびこれらから導出される適用形態はまた、さらなる補助物質として、増粘剤（ｓｔｉｃｋｅｒ）（例えば、カルボキシメチルセルロース）、粉末、顆粒もしくはラテックス形態にある天然および合成のポリマー（例えば、アラビアガム、ポリビニルアルコール、ポリビニルアセテート）、そしてまた天然のリン脂質（例えば、セファリンおよびレシチン）、ならびに合成リン脂質を含み得る。さらなる可能な補助物質としては、鉱油および植物性油が挙げられる。

さらなる補助物質が、製剤およびこれらから導出される適用形態におそらく存在し得る。このような添加剤の例としては、芳香物質（ｆｒａｇｒａｎｃｅ）、保護コロイド、結合剤、接着剤、濃化剤、チキソトロピック物質（ｔｈｉｘｏｔｒｏｐｉｃ ｓｕｂｓｔａｎｃｅ）、浸透剤、保持増進因子（ｒｅｔｅｎｔｉｏｎ ｐｒｏｍｏｔｅｒ）、安定化剤、金属イオン封鎖剤、錯化剤、湿潤剤（ｈｕｍｅｃｔａｎｔ）および展着剤（ｓｐｒｅａｄｅｒ）が挙げられる。概して、活性化合物は、製剤化目的で一般に使用される任意の固体もしくは液体の添加剤と合わせられ得る。

適切な保持増進因子としては、例えば、動的表面張力を低下させる物質（例えば、ジオクチルスルホスクシネート）、または粘弾性を増大させる物質（例えば、ヒドロキシプロピルグアールポリマー（ｈｙｄｒｏｘｙｐｒｏｐｙｌｇｕａｒ ｐｏｌｙｍｅｒ））が全て挙げられ得る。

本発明の状況において適切な浸透剤としては、植物への活性農薬化合物の浸透を増強するために代表的には使用される物質の全てが挙げられる。この状況での浸透剤は、（一般には、水性の）適用リカーから、および／またはスプレーコーティングから、それらが植物のクチクラに浸透し得、それによって、活性化合物のクチクラ中での移動性を増大させ得るという点で定義される。この特性は、文献中で記載される方法（Ｂａｕｒら， １９９７， Ｐｅｓｔｉｃｉｄｅ Ｓｃｉｅｎｃｅ ５１： １３１－１５２）を使用して決定され得る。例としては、例えば、アルコールアルコキシレート（例えば、ヤシ脂肪エトキシレート（ｃｏｃｏｎｕｔ ｆａｔｔｙ ｅｔｈｏｘｙｌａｔｅ）（１０）またはイソトリデシルエトキシレート（１２））、脂肪酸エステル（例えば、菜種油もしくはダイズ油のメチルエステル）、脂肪アミンアルコキシレート（例えば、獣脂アミンエトキシレート（１５））、あるいはアンモニウム塩および／またはホスホニウム塩（例えば、硫酸アンモニウムまたはリン酸水素二アンモニウム）が挙げられる。

本明細書で開示される種々の組成物および製剤は、細菌株（例えば、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体、または胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせ）の細胞のある量を含み得る、ならびに／またはＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１つに由来する組成物のある量を含み得る。このような量は、少なくとも約１０^４～約１０^１１、少なくとも約１０^５ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１１ ＣＦＵ／ｇ、約１０^５ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１０ ＣＦＵ／ｇ、約１０^５ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１２ ＣＦＵ／ｇ、約１０^５ ＣＦＵ／ｇ～約１０^６ ＣＦＵ／ｇ、約１０^６ ＣＦＵ／ｇ～約１０^７ ＣＦＵ／ｇ、約１０^７ ＣＦＵ／ｇ～約１０^８ ＣＦＵ／ｇ、約１０^８ ＣＦＵ／ｇ～約１０^９ ＣＦＵ／ｇ、約１０^９ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１０ ＣＦＵ／ｇ、約１０^１０ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１１ ＣＦＵ／ｇ、または約１０^１１ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１２ ＣＦＵ／ｇの細菌株の濃度を含み得る。他の実施形態において、上記細菌株の濃度は、少なくとも約１０^４ ＣＦＵ／ｇ、少なくとも約１０^５ ＣＦＵ／ｇ、少なくとも約１０^６ ＣＦＵ／ｇ、少なくとも約１０^７ ＣＦＵ／ｇ、少なくとも約１０^８ ＣＦＵ／ｇ、少なくとも約１０^９ ＣＦＵ／ｇ、少なくとも約１０^１０ ＣＦＵ／ｇ、少なくとも約１０^１１ ＣＦＵ／ｇ、少なくとも約１０^１２ ＣＦＵ／ｇを含む。上記細菌株のこのような濃度は、任意の目的の製剤タイプにおいて（例えば、液体製剤、水和剤（ｗｅｔｔａｂｌｅ ｐｏｗｅｒ）、噴霧乾燥製剤において、細胞ペースト、顆粒水和剤（ｗｅｔｔａｂｌｅ ｇｒａｎｕｌｅ）、または凍結乾燥製剤において、が挙げられる）起こり得る。

いくつかの実施形態において、上記細菌株は、液体製剤中に存在し得る。液体製剤は、細菌株（例えば、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体、またはＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１つに由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせ）の細胞、ならびに／またはこれらに由来する組成物のある量を含み得る。液体製剤において、本明細書で開示される、細菌株もしくはその活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物の量は、少なくとも約１０^４～約１０^１１ ＣＦＵ／ｍｌ、少なくとも約１０^５ ＣＦＵ／ｍｌ～約１０^１１ ＣＦＵ／ｍＬ，約１０^５ ＣＦＵ／ｍＬ～約１０^１０ ＣＦＵ／ｍＬ、約１０^５ ＣＦＵ／ｍＬ～約１０^１２ ＣＦＵ／ｍＬ、約１０^５ ＣＦＵ／ｍＬ～約１０^６ ＣＦＵ／ｍＬ、約１０^６ ＣＦＵ／ｍＬ～約１０^７ ＣＦＵ／ｍＬ、約１０^７ ＣＦＵ／ｍＬ～約１０^８ ＣＦＵ／ｍＬ、約１０^８ ＣＦＵ／ｍＬ～約１０^９ ＣＦＵ／ｍＬ、約１０^９ ＣＦＵ／ｍＬ～約１０^１０ ＣＦＵ／ｍＬ、約１０^１０ ＣＦＵ／ｍＬ～約１０^１１ ＣＦＵ／ｍＬ、または約１０^１１ ＣＦＵ／ｍＬ～約１０^１２ ＣＦＵ／ｍＬまたは少なくとも約１０^４ ＣＦＵ／ｍＬ、少なくとも約１０^５ ＣＦＵ／ｍＬ、少なくとも約１０^６ ＣＦＵ／ｍＬ、少なくとも約１０^７ ＣＦＵ／ｍＬ、少なくとも約１０^８ ＣＦＵ／ｍＬ、少なくとも約１０^９ ＣＦＵ／ｍＬ、少なくとも約１０^１０ ＣＦＵ／ｍＬ、少なくとも約１０^１１ ＣＦＵ／ｍＬ、少なくとも約１０^１２ ＣＦＵ／ｍＬの濃度を含み得る。

乾燥製剤（例えば、細胞ペースト、水和剤、および噴霧乾燥製剤）は、細菌株（例えば、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体、またはこれらのうちのいずれかの、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせ）の細胞を含み得る、ならびに／またはＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１つに由来する組成物を含み得る。上記乾燥製剤（例えば、細胞ペースト、水和剤、および／または噴霧乾燥製剤）における上記細菌株の量は、少なくとも約１０^５ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１１ ＣＦＵ／ｇ、約１０^７ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１０ ＣＦＵ／ｇ、約１０^７ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１１ ＣＦＵ／ｇ、約１０^６ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１０ ＣＦＵ／ｇ、約１０^６ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１１ ＣＦＵ／ｇ、約１０^１１ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１２ ＣＦＵ／ｇ、約１０^５ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１０ ＣＦＵ／ｇ、約１０^５ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１２ ＣＦＵ／ｇ、約１０^５ ＣＦＵ／ｇ～約１０^６ ＣＦＵ／ｇ、約１０^６ ＣＦＵ／ｇ～約１０^７ ＣＦＵ／ｇ、約１０^７ ＣＦＵ／ｇ～約１０^８ ＣＦＵ／ｇ、約１０^８ ＣＦＵ／ｇ～約１０^９ ＣＦＵ／ｇ、約１０^９ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１０ ＣＦＵ／ｇ、約１０^１０ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１１ ＣＦＵ／ｇ、または約１０^１１ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１２ ＣＦＵ／ｇの上記細菌株の濃度を含み得る。いくつかの実施形態において、上記細菌株の濃度は、少なくとも約１０^５ ＣＦＵ／ｇ、少なくとも約１０^６ ＣＦＵ／ｇ、少なくとも約１０^７ ＣＦＵ／ｇ、少なくとも約１０^８ ＣＦＵ／ｇ、少なくとも約１０^９ ＣＦＵ／ｇ、少なくとも約１０^１０ ＣＦＵ／ｇ、少なくとも約１０^１１ ＣＦＵ／ｇ、少なくとも約１０^１２ ＣＦＵ／ｇ、または少なくとも約１０^１３ ＣＦＵ／ｇを含む。

本明細書で使用される場合、「細胞ペースト（ｃｅｌｌ ｐａｓｔｅ）」は、遠心分離および／もしくは濾過されているか、または別の方法で濃縮されている細胞の集団を含む。種子および種子上のコーティングを含むコーティングされた種子がさらに提供され、ここで、コーティングは、少なくとも１種の細菌株、例えば、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体の細胞、またはこれらのうちのいずれかの、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせを含む、ならびに／またはＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１つに由来する組成物を含み得、ここで上記細菌株もしくはその活性改変体は、種子上に、約１０^５ ＣＦＵ／種子～約１０^７ ＣＦＵ／種子で、約１０^４ ＣＦＵ／種子～約１０^８ ＣＦＵ／種子で、約１０^４ ＣＦＵ／種子～約１０^５ ＣＦＵ／種子で、約１０^５ ＣＦＵ／種子～約１０^６ ＣＦＵ／種子で、約１０^６ ＣＦＵ／種子～約１０^７ ＣＦＵ／種子で、または約１０^７ ＣＦＵ／種子～約１０^８ ＣＦＵ／種子で存在する。種々の目的の植物が、本明細書中の他の箇所で開示される。

特定の実施形態において、種子上に異種コーティングを含む種子が提供され、ここで上記異種コーティングは、少なくとも１種の細菌株、例えば、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体の細胞、または胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせを含む、ならびに／またはＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１種に由来する組成物を含み得、ここで上記細菌株もしくはその活性改変体は、種子上に、約１０^５ ＣＦＵ／種子～約１０^７ ＣＦＵ／種子で、約１０^４ ＣＦＵ／種子～約１０^８ ＣＦＵ／種子で、約１０^４ ＣＦＵ／種子～約１０^５ ＣＦＵ／種子で、約１０^５ ＣＦＵ／種子～約１０^６ ＣＦＵ／種子で、約１０^６ ＣＦＵ／種子～約１０^７ ＣＦＵ／種子で、または約１０^７ ＣＦＵ／種子～約１０^８ ＣＦＵ／種子で存在する。本明細書で使用される場合、コーティングに関連して「異種（ｈｅｔｅｒｏｌｏｇｏｕｓ）」とは、種子上では天然に見出されない、または種子状で天然に見出される場合には、計画的なヒトの介入によって、組成物および／または濃縮物においてその天然の形態から実質的に改変される細菌株を含む種子コーティングに言及する。特定の実施形態において、コーティングに関連して「異種」とは、上記細菌株が天然には見出されない溶液中に懸濁された細菌株を含む種子コーティングに言及し得る。異種コーティング用の懸濁溶液は、天然または非天然であり得、上記株が通常は有しない特性を伴う細菌株を提供し得る。例えば、異種コーティングの懸濁溶液は、上記細菌が、種子の貯蔵および発芽の間に活性を保持するような様式で、上記細菌株が上記種子に接着することを可能にし得る。

種子コーティングは、少なくとも１種の栄養素、少なくとも１種の殺生物剤（例えば、除草剤もしくは農薬）をさらに含み得る。例えば、米国特許公開２００４０３３６０４９、同第２０１４０１７３９７９、および同第２０１５００３３８１１を参照のこと。

細菌株ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つに由来する、全細胞ブロス、上清、濾液、または抽出物を含む組成物が、さらに提供され、ここで有効量の組成物は、植物の目的の農学上の形質を改善するか、または病気を引き起こす植物有害生物もしくは植物病原体を制御する。上記組成物は、植物の目的の農学上の形質を改善するか、または病気を引き起こす植物有害生物もしくは植物病原体を制御する、有効な化合物、代謝産物、および／またはタンパク質を含む。上清とは、細胞がブロス中で成長させられるか、またはアガープレートから別の液体において採取され、遠心分離、濾過、沈降、または当該分野で周知の他の手段によって除去される場合に残っている液体に言及する。上記上清は、濾液を生産するためにさらに濃縮され得る。上記濾液は、上記上清または全細胞ブロスにおける有効な化合物または代謝産物の濃度と比較して、濃縮された量の有効な化合物または代謝産物を含み得る。いくつかの実施形態において、上記上清、濾液、または抽出物は、水和剤および／または噴霧乾燥製剤へと処理され得る。他の実施形態において、上記上清、濾液、または抽出物は、濃縮され得る（例えば、水が除去される）が、液体製剤の中に残る。上記で記載される組成物は、植物有害生物を制御するか、または植物の目的の農学上の形質を改善するために有効量において、単独でまたは別の物質と組み合わせて適用され得る。

本明細書で開示される種々の製剤は、少なくとも３０日間、４０日間、５０日間、６０日間、７０日間、８０日間、９０日間、１００日間、１２５日間、１５０日間、２００日間、２２５日間、２５０日間、２７５日間、３００日間、３２５日間、３５０日間、１．５年間、２年間またはこれより長く安定であり得る。安定は、その製剤が、生きている細菌を保持する、および／または生物学的に活性な細菌集団の有効量を保持することを意図する。生物学的活性とは、本明細書で使用される場合、その製剤が目的の農学上の形質を改善するか、または植物有害生物を制御する能力に言及する。一実施形態において、その安定な製剤は、製剤の調製直後にもたらされるＣＦＵ／ｇと比較した場合に、所定の貯蔵の時点で、製剤中のＣＦＵ／ｇのうちの少なくとも約１％、約１０％、約２０％、約３０％ 約４０％、約５０％、約６０％、約７０％、約８０％、または約９０％を保持する。別の実施形態において、その安定な製剤は、生産直後に製剤中で見出される生物学的活性と比較した場合に、所定の貯蔵の時点で、製剤中の生物学的活性のうちの少なくとも約３０％～８０％、約５０％～約８０％、約６０％～約７０％、約７０％～約８０％、約４０％～約５０％、約５０％～約６０％、約６０％～約７０％を保持する。別の実施形態において、所定の貯蔵の時点での安定な製剤は、生産直後に製剤中で見出される生物学的活性と比較した場合に、生物学的活性のうちの少なくとも約３０％、４５％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％を保持する。さらに別の実施形態において、その安定な製剤は、上記で示した生存度および生物学的活性の任意の組み合わせを保持する。

その製剤は、好ましくは、その製剤の重量に基づいて、０．０００００００１重量％～９８重量％の間の活性化合物、または特に好ましくは、０．０１重量％～９５重量％の間の活性化合物、より好ましくは、０．５重量％～９０重量％の間の活性化合物を含む。

その製剤から調製される適用形態の活性化合物含有量は、広い範囲内で変動し得る。その適用形態の活性化合物濃度は、その適用形態の重量に基づいて、代表的には、０．０００００００１重量％～９５重量％の間の活性化合物、好ましくは０．００００１重量％～１重量％の間にあり得る。適用は、その適用形態に適合した慣習的な様式で起こる。

さらに、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物は、その活性または上記化学物質（これに上記細菌株もしくはその活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物が添加されている）の活性を増強するために、殺生物剤（例えば、殺真菌剤、殺虫剤、または除草剤）と混合され得る。ある場合には、その細菌株（またはこれに由来する組成物）および化学物質の組み合わせは、その２種の混合物がそれらの単純な相加効果から予測されるものを超える相乗効果的な活性を示し得る。他の実施形態において、本明細書で記載される生物防除因子は、他の生物防除因子と混合され得る。

具体的実施形態において、上記細菌株、その活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物は、殺生物剤の性能を改善するために使用される農業的化学物質と適合性である。このような農業的化学物質としては、毒性緩和剤（ｓａｆｅｎｅｒ）、界面活性剤、増粘剤、展着剤、ＵＶ保護剤、ならびに懸濁および分散補助物質（ｓｕｓｐｅｎｓｉｏｎ ａｎｄ ｄｉｓｐｅｒｓａｌ ａｉｄ）が挙げられる。毒性緩和剤は、除草剤の性能を改善または改変する化学物質である。界面活性剤、展着剤、および増粘剤は、スプレーの機械的特性を変化させる（例えば、表面張力を変化させることによって、または葉のクチクラへの浸透を改善することによって）農業的スプレー調製物中に含まれる化学物質である。ＵＶ保護剤は、紫外線による分解を低減することによって、農業的殺生物剤の性能を改善する。懸濁および分散補助物質は、スプレータンク中での殺生物剤の挙動を変化させることによって、それら殺生物剤の性能を改善する。細菌株または活性改変体が目的の農業的化学物質と適合性でない場合、望ましいのであれば、その細菌株を改変して、目的の適合性を付与する方法が企図され得る。改変された細菌株を生産するためのこのような方法は、選択技術および／または形質転換技術の両方を含む。

本明細書で提供される細菌株、その活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物は、少なくとも１つの目的の農学上の形質を有意に改善する（例えば、植物有害生物（例えば、昆虫および線虫有害生物）に対する感受性を低減する）ために使用され得る。本明細書で提供される細菌株、その活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物は、有効な統合された有害生物管理プログラムのために他の農薬とともに使用され得る。一実施形態において、上記生物防除集団は、ＷＯ ９４／１０８４５（本明細書中に参考として援用される）に記載される様式で公知の農薬と混合され得る。

製剤に添加され得る化合物および組成物の非限定的な例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：アセチルトリブチルシトレート［クエン酸、２－（アセチルオキシ）－、トリブチルエステル］；アガー；アーモンド外皮（Ａｌｍｏｎｄ ｈｕｌｌ）；アーモンドの殻（Ａｌｍｏｎｄ ｓｈｅｌｌ）；α－シクロデキストリン；酸化アルミニウム／二酸化ケイ素（Ａｌｕｍｉｎａｔｅｓｉｌｉｃａｔｅ）；ケイ酸アルミニウムマグネシウム［ケイ酸、アルミニウムマグネシウム塩］；ケイ酸アルミニウムカリウムナトリウム［ケイ酸、アルミニウムカリウムナトリウム塩］；ケイ酸アルミニウム；ケイ酸アルミニウムナトリウム［ケイ酸、アルミニウムナトリウム塩］；ケイ酸アルミニウムナトリウム（１：１：１）［ケイ酸（Ｈ_４ＳｉＯ_４）、アルミニウムナトリウム塩（１：１：１）］；安息香酸アンモニウム［安息香酸、アンモニウム塩］；ステアリン酸アンモニウム［オクタデカン酸、アンモニウム塩］；アミロペクチン、酸加水分解、１－オクテニルブタンジオエート；アミロペクチン、水素 １－オクタデセニルブタンジオエート；動物性膠（Ａｎｉｍａｌ ｇｌｕｅ）；パルミチン酸アスコルビル；アタパルジャイトタイプクレイ；蜜蝋；ベントナイト；ベントナイト、ｓｏｄｉａｎ；β－シクロデキストリン；骨粉；ふすま；パンくず（Ｂｒｅａｄ ｃｒｕｍｂ）；（＋）－ブチルラクテート；［乳酸、ｎ－ブチルエステル、（Ｓ）］；ブチルラクテート［乳酸、ｎ－ブチルエステル］；ステアリン酸ブチル［オクタデカン酸、ブチルエステル］；石灰質頁岩；方解石（Ｃａ（Ｃｏ_３））；酢酸カルシウム；酢酸カルシウム一水和物［酢酸、カルシウム塩、一水和物］；安息香酸カルシウム［安息香酸、カルシウム塩］；炭酸カルシウム；クエン酸カルシウム［クエン酸、カルシウム塩］；オクタン酸カルシウム；ケイ酸酸化カルシウム（Ｃａｌｃｉｕｍ ｏｘｉｄｅ ｓｉｌｉｃａｔｅ）（Ｃａ_３Ｏ（ＳｉＯ_４））；ケイ酸カルシウム［ケイ酸、カルシウム塩］；ステアリン酸カルシウム［オクタデカン酸、カルシウム塩］；硫酸カルシウム；硫酸カルシウム二水和物（Ｃａｌｃｉｕｍ ｓｕｌｆａｔｅ ｄｅｈｙｄｒａｔｅ）；硫酸カルシウム０．５水和物；カナリーシード（Ｃａｎａｒｙ ｓｅｅｄ）；炭素；二酸化炭素；カルボキシメチルセルロース［セルロース、カルボキシメチルエーテル］；厚紙；カルナウバ蝋；カロブガム（Ｃａｒｏｂ ｇｕｍ）［ローカストビーンガム］；カラギーナン；カゼイン；ヒマシ油；ヒマシ油、水素化；キャットフード；セルロース；酢酸セルロース；セルロース、セルロースカルボキシメチルエーテルとの混合物、ナトリウム塩；セルロース、パルプ；セルロース、再生；チーズ；クロロフィルａ；クロロフィルｂ；シトラスあらびき粉（Ｃｉｔｒｕｓ ｍｅａｌ）；クエン酸；クエン酸、一水和物；シトラスペクチン；シトラスパルプ；二枚貝の殻（Ｃｌａｍ ｓｈｅｌｌ）；カカオ（Ｃｏｃｏａ）；カカオ殻粉（Ｃｏｃｏａ ｓｈｅｌｌ ｆｌｏｕｒ）；カカオ殻；タラ肝油；コーヒーの出し殻（Ｃｏｆｆｅｅ ｇｒｏｕｎｄｓ）；クッキー；コルク；軸付トウモロコシ；ワタ；綿実あらびき粉；挽き割りコムギ（Ｃｒａｃｋｅｄ ｗｈｅａｔ）；デカン酸、１，２，３－プロパントリオールとのモノエステル；デキストリン；モノオレイン酸ジグリセリル［９－オクタデセン酸、１，２，３－プロパントリオールとのエステル］；モノステアリン酸ジグリセリル［９－オクタデカン酸、オキシビス（プロパンジオール）とのモノエステル（ｍｏｎｏｅｓｔｅｒ ｗｉｔｈ ｘｙｂｉｓ（ｐｒｏｐａｎｅｄｉｏｌ））］；ジラウリン［ドデカン酸、１，２，３－プロパントリオールとのジエステル］；ジパルミチン［ヘキサデカン酸、１，２，３－プロパントリオールとのジエステル］；クエン酸二カリウム［クエン酸、二カリウム塩］；クエン酸二ナトリウム［クエン酸、二ナトリウム塩］；硫酸ナトリウム十水和物；珪藻土（１％未満の結晶性シリカ）；ドデカン酸、１，２，３－プロパントリオールとのモノエステル；苦灰石；ダグラスファー樹皮；卵殻；卵；（＋）－エチルラクテート［乳酸、エチルエステル、（Ｓ）］；エチルラクテート［乳酸、エチルエステル］；長石；魚粉；魚油（４０ ＣＦＲ １８０．９５０に従わない）；フーラー土；フマル酸；γ－シクロデキストリン；ゼラチン；ゲランガム；膠（脱重合動物性コラーゲンとして（ａｓ ｄｅｐｏｌｙｍｄ． ａｎｉｍａｌ ｃｏｌｌａｇｅｎ））；グリセリン［１，２，３－プロパントリオール］；モノオレイン酸グリセロール［９－オクタデセン酸（Ｚ）－， ２，３－ジヒドロキシプロピルエステル］；ジカプリル酸グリセリル［オクタン酸、１，２，３－プロパントリオールとのジエステル］；ジミリスチン酸グリセリル［テトラデカン酸、１，２，３－プロパントリオールとのジエステル］；ジオレイン酸グリセリル［９－オクタデセン酸（９Ｚ）－、１，２，３－プロパントリオールとのジエステル］；ジステアリン酸グリセリル；モノミリスチン酸グリセリル［テトラデカン酸、１，２，３－プロパントリオールとのモノエステル］；モノオクタン酸グリセリル［オクタン酸、１，２，３－プロパントリオールとのモノエステル］；モノオレイン酸グリセリル［９－オクタデセン酸（９Ｚ）－、１，２，３－プロパントリオールとのモノエステル］；モノステアリン酸グリセリル［オクタデカン酸、１，２，３－プロパントリオールとのモノエステル］；ステアリン酸グリセリル［オクタデカン酸、１，２，３－プロパントリオールとのエステル］；花崗岩；グラファイト；グアールガム；アラビアガム；トラガカントガム；石膏；赤鉄鉱（Ｆｅ_２Ｏ_３）；フミン酸；水素化綿実油；水素化菜種油；水素化ダイズ油；ヒドロキシエチルセルロース［セルロース、２－ヒドロキシエチルエーテル］；ヒドロキシプロピルセルロース［セルロース、２－ヒドロキシプロピルエーテル］；ヒドロキシプロピルメチルセルロース［セルロース、２－ヒドロキシプロピルメチルエーテル］；酸化鉄マグネシウム（Ｉｒｏｎ ｍａｇｎｅｓｉｕｍ ｏｘｉｄｅ）（Ｆｅ_２ＭｇＯ_４）；酸化鉄（Ｆｅ_２Ｏ_３）；酸化鉄（Ｆｅ_２Ｏ_３）；酸化鉄（Ｆｅ_３Ｏ_４）；酸化鉄（ＦｅＯ）；イソプロピルアルコール［２－プロパノール］；ミリスチン酸イソプロピル；カオリン；ラクトース；ラクトース一水和物；ラノリン；ラテックスゴム；ラウリン酸；レシチン；甘草抽出物；ドロマイト石灰（化学的苦灰石）（Ｌｉｍｅ （ｃｈｅｍｉｃａｌ） ｄｏｌｏｍｉｔｉｃ）；石灰石；亜麻仁油；炭酸マグネシウム［炭酸、マグネシウム塩（１：１）］；安息香酸マグネシウム；酸化マグネシウム；ケイ酸酸化マグネシウム（Ｍａｇｎｅｓｉｕｍ ｏｘｉｄｅ ｓｉｌｉｃａｔｅ）（Ｍｇ_３Ｏ（Ｓｉ_２Ｏ_５）_２）、一水和物；ケイ酸マグネシウム；ケイ酸マグネシウム水和物；酸化マグネシウムケイ素（Ｍａｇｎｅｓｉｕｍ ｓｉｌｉｃｏｎ ｏｘｉｄｅ）（Ｍｇ_２Ｓｉ_３Ｏ_８）；ステアリン酸マグネシウム［オクタデカン酸、マグネシウム塩］；硫酸マグネシウム；硫酸マグネシウム七水和物；リンゴ酸；麦芽抽出物；麦芽フレーバー；マルトデキストリン；メチルセルロース［セルロース、メチルエーテル］；マイカ；マイカ群のミネラル；ミルク；Ｎ／Ａ キビの種；鉱油（米国薬局方）；１－モノラウリン［ドデカン酸、２，３－ジヒドロキシプロピルエステル］；１－モノミリスチン［テトラデカン酸、２，３－ジヒドロキシプロピルエステル］；モノミリスチン［デカン酸、１，２，３－プロパントリオールとのジエステル］；モノパルミチン［ヘキサデカン酸、１，２，３－プロパントリオールとのモノエステル］；クエン酸一カリウム［クエン酸、一カリウム塩］；クエン酸一ナトリウム［クエン酸、一ナトリウム塩］；モンモリロナイト；ミリスチン酸；霞石閃長岩；窒素；ヌートリアミート（Ｎｕｔｒｉａ ｍｅａｔ）；ナイロン；オクタン酸、カリウム塩；オクタン酸、ナトリウム塩；油、アーモンド；油、コムギ；オレイン酸；蛎殻；パーム油；パーム油、水素化；パルミチン酸［ヘキサデカン酸］；パラフィンワックス；ピーナッツバター（Ｐｅａｎｕｔ ｂｕｔｔｅｒ）；ラッカセイ殻；ラッカセイ；ピートモス；ペクチン；パーライト；パーライト、膨張；焼石膏；ポリエチレン；オレイン酸ポリグリセリル；ステアリン酸ポリグリセリル；酢酸カリウム［酢酸、カリウム塩］；ケイ酸カリウムアルミニウム（Ｐｏｔａｓｓｉｕｍ ａｌｕｍｉｎｕｍ ｓｉｌｉｃａｔｅ）、無水物；安息香酸カリウム［安息香酸、カリウム塩］；炭酸水素カリウム［炭酸、一カリウム塩］；塩化カリウム；クエン酸カリウム［クエン酸、カリウム塩］；フミン酸カリウム［フミン酸、カリウム塩］；ミリスチン酸カリウム［テトラデカン酸、カリウム塩］；オレイン酸カリウム［９－オクタデセン酸（９Ｚ）－、カリウム塩］；リシノール酸カリウム［９－オクタデセン酸、１２－ヒドロキシ、一カリウム塩、（９Ｚ，１２Ｒ）－］；ソルビン酸カリウム［ソルビン酸、カリウム塩］；ステアリン酸カリウム［オクタデカン酸、カリウム塩］；硫酸カリウム；硫酸カリウム［硫酸、一カリウム塩］；１，２－プロピレンカーボネート［１，３－ジオキソラン－２－オン、４－メチル－］；軽石；紫キャベツ色素（Ｒｅｄ ｃａｂｂａｇｅ ｃｏｌｏｒ）（酸性化した水のみを使用する加圧プロセスを介して食用紫キャベツ頭花（ｒｅｄ ｃａｂｂａｇｅ ｈｅａｄ）から絞り出される）；レッドシダーチップ；質の悪い小麦粉（Ｒｅｄ ｄｏｇ ｆｌｏｕｒ）；ゴム；おがくず；頁岩；シリカ、無定形、フュームド（結晶性遊離）；シリカ、無定形、沈殿およびゲル；シリカ（結晶性遊離）；シリカゲル；シリカゲル、沈殿、結晶性－遊離；シリカ、水和物；シリカ、ガラス質；ケイ酸（Ｈ_２ＳｉＯ_３）、マグネシウム塩（１：１）；石鹸（脂肪および油の鹸化、または脂肪酸の中和のいずれかによって生産される脂肪酸の水溶性ナトリウムもしくはカリウム塩）；セッケンボク［Ｑｕｉｌｌａｊａ ｓａｐｏｎｉｎ］；ソープストーン；酢酸ナトリウム［酢酸、ナトリウム塩］；アルギン酸ナトリウム；安息香酸ナトリウム［安息香酸、ナトリウム塩］；炭酸水素ナトリウム；カルボキシメチルセルロースナトリウム［セルロース、カルボキシメチルエーテル、ナトリウム塩］；塩化ナトリウム；クエン酸ナトリウム；フミン酸ナトリウム［フミン酸、ナトリウム塩］；オレイン酸ナトリウム；リシノール酸ナトリウム［９－オクタデセン酸、１２－ヒドロキシ－、一ナトリウム塩、（９Ｚ，１２Ｒ）－］；ステアリン酸ナトリウム［オクタデカン酸、ナトリウム塩］；硫酸ナトリウム；ソルビトール；［Ｄ－グルシトール］；ダイズタンパク質；ダイズレシチン［レシチン、ダイズ］；ダイズ外皮；ダイズあらびき粉；ダイズ、粉；ステアリン酸［オクタデカン酸］；硫黄；シロップ、加水分解デンプン、水素化；モノオレイン酸テトラグリセリル［９－オクタデセン酸 （９Ｚ）－、テトラグリセロールとのモノエステル］；クエン酸三カルシウム［クエン酸、カルシウム塩（２：３）］；クエン酸トリエチル［クエン酸、トリエチルエステル］；クエン酸三カリウム［クエン酸、三カリウム塩］；クエン酸三カリウム一水和物［クエン酸、三カリウム塩、一水和物］；クエン酸三ナトリウム［クエン酸、三ナトリウム塩］；クエン酸三ナトリウム二水和物（Ｔｒｉｓｏｄｉｕｍ ｃｉｔｒａｔｅ ｄｅｈｙｄｒａｔｅ）［クエン酸、三ナトリウム塩、二水和物］；クエン酸三ナトリウム五水和物［クエン酸、三ナトリウム塩、五水和物］；ウルトラマリンブルー［Ｃ．Ｉ． Ｐｉｇｍｅｎｔ Ｂｌｕｅ ２９］；尿素；バニラ；バーミキュライト；酢（溶液中最大８％ 酢酸）；ビタミンＣ［Ｌ－アスコルビン酸］；ビタミン；胡桃粉（Ｗａｌｎｕｔ ｆｌｏｕｒ）；胡桃殻；コムギ；小麦粉；コムギ胚芽
油；ホエー；流動パラフィン（Ｗｈｉｔｅ ｍｉｎｅｒａｌ ｏｉｌ）（石油）；ウインターグリーン油；珪灰石（Ｃａ（ＳｉＯ_３））；ウール；キサンタンガム；酵母；ゼオライト（エリオナイトを除く（ＣＡＳ登録番号６６７３３－２１－９））；ゼオライト、ＮａＡ；酸化亜鉛鉄（Ｚｉｎｃ ｉｒｏｎ ｏｘｉｄｅ）；酸化亜鉛（ＺｎＯ）；およびステアリン酸亜鉛［オクタデカン酸、亜鉛塩］。

ＩＶ．使用法
本明細書で提供される細菌株もしくは改変された細菌株、その活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物は、植物有害生物を制御するか、または目的の農学上の形質を改善するために、任意の植物種とともに使用され得る。目的の農学上の形質としては、植物の健康状態または商業的価値を改善する任意の形質が挙げられる。目的の農学上の形質の非限定的な例としては、以下が挙げられる：バイオマスの増大、旱魃耐性の増大、熱耐性、除草剤耐性、旱魃抵抗性、有害生物抵抗性（例えば、線虫抵抗性、昆虫抵抗性、真菌抵抗性、ウイルス抵抗性、細菌抵抗性）、雄性不稔性、低温耐性、塩耐性、増大した収量、増強された栄養素利用効率、増大した窒素利用効率、窒素ストレスへの増大した耐性、増大した発酵性炭水化物含有量、低減したリグニン含有量、増大した抗酸化物質含有量、増強された水利用効率、増大した生長力、増大した発芽効率、より速いもしくは増大した開花、増大したバイオマス、変化した根 対 苗条バイオマス比（ｒｏｏｔ－ｔｏ－ｓｈｏｏｔ ｂｉｏｍａｓｓ ｒａｔｉｏ）、増強された土壌水分保持、またはこれらの組み合わせ。他の場合には、上記目的の農学上の形質としては、変化した油含有量、変化したタンパク質含有量、変化した種子炭水化物組成、変化した種子油組成、および変化した種子タンパク質組成、化学物質耐性、低温耐性、遅延した老化、病気抵抗性、旱魃耐性、穂重、生長改善、健康状態の増強、熱耐性、除草剤耐性、改善された窒素固定、改善された窒素利用、改善された根の構造、改善された水利用効率、増大したバイオマス、増大した根の長さ、増大した種子重量、増大した苗条の長さ、増大した収量、水を制限した条件下での増大した収量、穀粒の重量（ｋｅｒｎｅｌ ｍａｓｓ）、穀粒の水分含有量、金属耐性、穂の数、穂１本あたりの穀粒の数、莢の数、栄養増強、光合成能力改善、塩分耐性、青々したままでいる（ｓｔａｙ－ｇｒｅｅｎ）、生長力改善、成熟種子の増大した乾燥重量、成熟種子の増大した新鮮重量（ｉｎｃｒｅａｓｅｄ ｆｒｅｓｈ ｗｅｉｇｈｔ ｏｆ ｍａｔｕｒｅ ｓｅｅｄｓ）、１植物体あたりの成熟種子の増大した数、増大したクロロフィル含有量、１植物体あたりの増大した莢の数、１植物体あたりの増大した莢の長さ、１植物体あたりのしおれた葉の低減した数、１植物体あたりのひどくしおれた葉の低減した数、および１植物体あたりのしおれていない葉の増大した数、代謝産物のレベルでの検出可能な調節、転写物のレベルでの検出可能な調節、または参照植物に対するプロテオームでの検出可能な調節。

１つの非限定的な実施形態において、本明細書で提供される細菌株、その活性改変体および／もしくはこれらに由来する組成物は、植物有害生物に感受性であるか、または植物有害生物によって引き起こされる植物の病気もしくは損傷を発生させるリスクにある任意の植物種とともに使用され得る。「有害生物抵抗性（ｐｅｓｔ ｒｅｓｉｓｔａｎｃｅ）」とは、本明細書で提供される細菌株、その活性改変体および／もしくはこれらに由来する組成物が、有害生物（例えば、昆虫有害生物）を阻害し得る（成長、摂食、生産力、または生存度を阻害し得る）、抑制し得る（成長、摂食、生産力、または生存度を抑制し得る）、低減し得る（特定の植物に対して、有害生物外寄生を低減し得る、有害生物摂食活動を低減し得る）、または死滅させ得る（疾病率、死滅率、または低減した生産力を引き起こし得る）ことが意図される。「有害生物に感受性である植物（ａ ｐｌａｎｔ ｓｕｓｃｅｐｔｉｂｌｅ ｔｏ ａ ｐｅｓｔ）」とは、有害生物が上記植物に感染し得るまたは損傷を与え得ることを意味する。例えば、有害生物に感受性である植物は、本明細書中の他の箇所で開示されるとおりの真菌、昆虫、または線虫有害生物によって引き起こされる損傷に感受性であり得る。

改変された生物防除因子は、任意の植物種（単子葉植物および双子葉植物が挙げられるが、これらに限定されない）とともに使用され得る。目的の植物種の例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：トウモロコシ（Ｚｅａ ｍａｙｓ）、Ｂｒａｓｓｉｃａ ｓｐ．（例えば、Ｂ．ｎａｐｕｓ、Ｂ．ｒａｐａ、Ｂ．ｊｕｎｃｅａ）、特に、種子油の供給源として有用なそれらＢｒａｓｓｉｃａ種、アルファルファ（Ｍｅｄｉｃａｇｏ ｓａｔｉｖａ）、コメ（Ｏｒｙｚａ ｓａｔｉｖａ）、ライ（Ｓｅｃａｌｅ ｃｅｒｅａｌｅ）、ソルガム（Ｓｏｒｇｈｕｍ ｂｉｃｏｌｏｒ、Ｓｏｒｇｈｕｍ ｖｕｌｇａｒｅ）、雑穀（例えば、トウジンビエ（Ｐｅｎｎｉｓｅｔｕｍ ｇｌａｕｃｕｍ）、キビ（Ｐａｎｉｃｕｍ ｍｉｌｉａｃｅｕｍ）、アワ（Ｓｅｔａｒｉａ ｉｔａｌｉｃａ）、シコクビエ（Ｅｌｅｕｓｉｎｅ ｃｏｒａｃａｎａ））、ヒマワリ（Ｈｅｌｉａｎｔｈｕｓ ａｎｎｕｕｓ）、ベニバナ（Ｃａｒｔｈａｍｕｓ ｔｉｎｃｔｏｒｉｕｓ）、コムギ（Ｔｒｉｔｉｃｕｍ ａｅｓｔｉｖｕｍ）、ダイズ（Ｇｌｙｃｉｎｅ ｍａｘ）、タバコ（Ｎｉｃｏｔｉａｎａ ｔａｂａｃｕｍ）、ジャガイモ（Ｓｏｌａｎｕｍ ｔｕｂｅｒｏｓｕｍ）、ラッカセイ（Ａｒａｃｈｉｓ ｈｙｐｏｇａｅａ）、ワタ（Ｇｏｓｓｙｐｉｕｍ ｂａｒｂａｄｅｎｓｅ、Ｇｏｓｓｙｐｉｕｍ ｈｉｒｓｕｔｕｍ）、サツマイモ（Ｉｐｏｍｏｅａ ｂａｔａｔｕｓ）、キャッサバ（Ｍａｎｉｈｏｔ ｅｓｃｕｌｅｎｔａ）、コーヒー（Ｃｏｆｆｅａ ｓｐｐ．）、ココヤシ（Ｃｏｃｏｓ ｎｕｃｉｆｅｒａ）、パイナップル（Ａｎａｎａｓ ｃｏｍｏｓｕｓ）、柑橘類の木（Ｃｉｔｒｕｓ ｓｐｐ．）、カカオ（Ｔｈｅｏｂｒｏｍａ ｃａｃａｏ）、チャ（Ｃａｍｅｌｌｉａ ｓｉｎｅｎｓｉｓ）、バナナ（Ｍｕｓａ ｓｐｐ．）、アボカド（Ｐｅｒｓｅａ ａｍｅｒｉｃａｎａ）、イチジク（Ｆｉｃｕｓ ｃａｓｉｃａ）、グアバ（Ｐｓｉｄｉｕｍ ｇｕａｊａｖａ）、マンゴー（Ｍａｎｇｉｆｅｒａ ｉｎｄｉｃａ）、オリーブ（Ｏｌｅａ ｅｕｒｏｐａｅａ）、パパイヤ（Ｃａｒｉｃａ ｐａｐａｙａ）、ブドウ（Ｖｉｔｕｓ ｓｐｐ．）、イチゴ（Ｆｒａｇａｒｉａ ｘ ａｎａｎａｓｓａ）、サクランボ（Ｐｒｕｎｕｓ ｓｐｐ．）、リンゴ（Ｍａｌｕｓ ｄｏｍｅｓｔｉｃａ）、オレンジ（Ｃｉｔｒｕｓ × ｓｉｎｅｎｓｉｓ）、カシュー（Ａｎａｃａｒｄｉｕｍ ｏｃｃｉｄｅｎｔａｌｅ）、マカダミア（Ｍａｃａｄａｍｉａ ｉｎｔｅｇｒｉｆｏｌｉａ）、アーモンド（Ｐｒｕｎｕｓ ａｍｙｇｄａｌｕｓ）、テンサイ（Ｂｅｔａ ｖｕｌｇａｒｉｓ）、サトウキビ（Ｓａｃｃｈａｒｕｍ ｓｐｐ．）、エンバク、オオムギ、野菜、観賞植物、および球果植物。

野菜としては、トマト（Ｌｙｃｏｐｅｒｓｉｃｏｎ ｅｓｃｕｌｅｎｔｕｍ）、レタス（例えば、Ｌａｃｔｕｃａ ｓａｔｉｖａ）、サヤインゲン（Ｐｈａｓｅｏｌｕｓ ｖｕｌｇａｒｉｓ）、ライマメ（Ｐｈａｓｅｏｌｕｓ ｌｉｍｅｎｓｉｓ）、エンドウ（Ｌａｔｈｙｒｕｓ ｓｐｐ．）、およびＣｕｃｕｍｉｓ属のメンバー、例えば、キュウリ（Ｃ．ｓａｔｉｖｕｓ）、カンタロープ（Ｃ．ｃａｎｔａｌｕｐｅｎｓｉｓ）、およびマスクメロン（Ｃ．ｍｅｌｏ）が挙げられる。観賞植物としては、アザレア（Ｒｈｏｄｏｄｅｎｄｒｏｎ ｓｐｐ．）、アジサイ（Ｍａｃｒｏｐｈｙｌｌａ ｈｙｄｒａｎｇｅａ）、ハイビスカス（ｈｉｂｉｓｃｕｓ）（Ｈｉｂｉｓｃｕｓ ｒｏｓａｓａｎｅｎｓｉｓ）、バラ（Ｒｏｓａ ｓｐｐ．）、チューリップ（Ｔｕｌｉｐａ ｓｐｐ．）、スイセン（Ｎａｒｃｉｓｓｕｓ ｓｐｐ．）、ペチュニア（Ｐｅｔｕｎｉａ ｈｙｂｒｉｄａ）、カーネーション（Ｄｉａｎｔｈｕｓ ｃａｒｙｏｐｈｙｌｌｕｓ）、ポインセチア（Ｅｕｐｈｏｒｂｉａ ｐｕｌｃｈｅｒｒｉｍａ）、およびキクが挙げられる。

本発明を実施するにあたって使用され得る球果植物としては、以下が挙げられる：例えば、マツ（例えば、テーダマツ（Ｐｉｎｕｓ ｔａｅｄａ）、スラッシュパイン（Ｐｉｎｕｓ ｅｌｌｉｏｔｉｉ）、ポンデローサマツ（Ｐｉｎｕｓ ｐｏｎｄｅｒｏｓａ）、ロッジポールパイン（Ｐｉｎｕｓ ｃｏｎｔｏｒｔａ）、およびラジアータパイン（Ｐｉｎｕｓ ｒａｄｉａｔａ））；ベイマツ（Ｐｓｅｕｄｏｔｓｕｇａ ｍｅｎｚｉｅｓｉｉ）；アメリカツガ（Ｔｓｕｇａ ｃａｎａｄｅｎｓｉｓ）；シトカスプルース（Ｐｉｃｅａ ｇｌａｕｃａ）；セコイア（Ｓｅｑｕｏｉａ ｓｅｍｐｅｒｖｉｒｅｎｓ）；モミ（ｔｒｕｅ ｆｉｒｓ）（例えば、ヨーロッパモミ（Ａｂｉｅｓ ａｍａｂｉｌｉｓ）およびバルサムモミ（Ａｂｉｅｓ ｂａｌｓａｍｅａ））；ならびにシダー（例えば、ベイスギ（Ｔｈｕｊａ ｐｌｉｃａｔａ）およびアラスカイエローシダー（Ａｌａｓｋａ ｙｅｌｌｏｗ－ｃｅｄａｒ）（Ｃｈａｍａｅｃｙｐａｒｉｓ ｎｏｏｔｋａｔｅｎｓｉｓ）。具体的実施形態において、本発明の植物は、農作物植物（例えば、トウモロコシ、アルファルファ、ヒマワリ、Ｂｒａｓｓｉｃａ、ダイズ、ワタ、ベニバナ、ラッカセイ、ソルガム、コムギ、雑穀、タバコなど）である。他の実施形態において、トウモロコシおよびダイズ植物が最適であり、なお別の実施形態では、トウモロコシ植物が最適である。

他の目的の植物としては、目的の種子を提供する穀物植物、脂肪種子植物、およびマメ科植物が挙げられる。目的の種子としては、穀物種子（例えば、トウモロコシ、コムギ、オオムギ、イネ、ソルガム、ライなど）が挙げられる。脂肪種子植物としては、ワタ、ダイズ、ベニバナ、ヒマワリ、アブラナ属、トウモロコシ、アルファルファ、ヤシ、ココナツなどが挙げられる。マメ科植物としては、豆類（ｂｅａｎｓ）、エンドウ、および乾燥豆類（ｄｒｙ ｐｕｌｓｅｓ）が挙げられる。豆類としては、グアール、イナゴマメ、コロハ、ダイズ、ガーデンビーンズ（ｇａｒｄｅｎ ｂｅａｎｓ）、ササゲ、緑豆、リママメ、ソラマメ、レンズマメ、ヒヨコマメなどが挙げられる。

Ａ．非限定的な植物有害生物
具体的実施形態において、本明細書で提供される細菌株は、１種もしくはこれより多くの植物有害生物を標的とするものである。用語「有害生物」としては、昆虫、真菌、細菌、線虫、ウイルスもしくはウイロイド、原生動物病原体などが挙げられるが、これらに限定されない。

具体的実施形態において、本明細書で提供される細菌株は、１種もしくはこれより多くの昆虫もしくは昆虫有害生物を標的とするものである。用語「昆虫」または「昆虫有害生物」とは、本明細書で使用される場合、昆虫および他の類似の有害生物に言及する。用語「昆虫」は、昆虫の卵、幼虫、幼若形態および成熟形態を包含する。昆虫は、任意の発生ステージにおいて標的とされ得る。例えば、昆虫は、一齢後に、二齢、三齢、四齢、五齢、または任意の他の発生ステージもしくは成体成長ステージの間に、標的とされ得る。本明細書で使用される場合、用語「齢（ｉｎｓｔａｒ）」は、昆虫の幼虫形態または若虫形態の発生ステージを示すために使用される。昆虫有害生物としては、鞘翅目、鱗翅目、半翅目、双翅目、膜翅目、鱗翅目、食毛目、同翅目、半翅目、直翅目、総翅目、ケダニ亜目、革翅目、等翅目、シラミ目、ノミ目、毛翅目などから選択される昆虫が挙げられる。

鞘翅目の昆虫有害生物としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：Ａｇｒｉｏｔｅｓ ｓｐｐ．、Ａｎｔｈｏｎｏｍｕｓ ｓｐｐ．、Ａｔｏｍａｒｉａ ｌｉｎｅａｒｉｓ、Ｃｈａｅｔｏｃｎｅｍａ ｔｉｂｉａｌｉｓ、Ｃｏｓｍｏｐｏｌｉｔｅｓ ｓｐｐ．、Ｃｕｒｃｕｌｉｏ ｓｐｐ．、Ｄｅｒｍｅｓｔｅｓ ｓｐｐ．、Ｅｐｉｌａｃｈｎａ ｓｐｐ．、Ｅｒｅｍｎｕｓ ｓｐｐ．、Ｌｅｐｔｉｎｏｔａｒｓａ ｄｅｃｅｍｌｉｎｅａｔａ、Ｌｉｓｓｏｒｈｏｐｔｒｕｓ ｓｐｐ．、Ｍｅｌｏｌｏｎｔｈａ ｓｐｐ．、Ｏｒｙｃａｅｐｈｉｌｕｓ ｓｐｐ．、Ｏｔｉｏｒｈｙｎｃｈｕｓ ｓｐｐ．、Ｐｈｌｙｃｔｉｎｕｓ ｓｐｐ．、Ｐｏｐｉｌｌｉａ ｓｐｐ．、Ｐｓｙｌｌｉｏｄｅｓ ｓｐｐ．、Ｒｈｉｚｏｐｅｒｔｈａ ｓｐｐ．、Ｓｃａｒａｂｅｉｄａｅ、Ｓｉｔｏｐｈｉｌｕｓ ｓｐｐ．、Ｓｉｔｏｔｒｏｇａ ｓｐｐ．、Ｔｅｎｅｂｒｉｏ ｓｐｐ．、Ｔｒｉｂｏｌｉｕｍ ｓｐｐ．、およびＴｒｏｇｏｄｅｒｍａ ｓｐｐ．。具体的実施形態において、甲虫類の昆虫としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：ヒゲナガゾウムシ科、マメゾウムシ科、およびゾウムシ科（例えば、アリモドキゾウムシ（Ｃｙｌａｓ ｆｏｒｍｉｃａｒｉｕｓ （Ｆａｂｒｉｃｉｕｓ））、ワタノミゾウムシ（ｂｏｌｌ ｗｅｅｖｉｌ）（Ａｎｔｈｏｎｏｍｕｓ ｇｒａｎｄｉｓ Ｂｏｈｅｍａｎ）、イネミズゾウムシ（Ｌｉｓｓｏｒｈｏｐｔｒｕｓ ｏｒｙｚｏｐｈｉｌｕｓ Ｋｕｓｃｈｅｌ）、コクゾウムシ（Ｓｉｔｏｐｈｉｌｕｓ ｏｒｙｚａｅ Ｌ．））のゾウムシ；ハムシ科におけるノミハムシ（ｆｌｅａ ｂｅｅｔｌｅ）、キューカンバービートル（ｃｕｃｕｍｂｅｒ ｂｅｅｔｌｅ）、ルートワーム、ハムシ（ｌｅａｆ ｂｅｅｔｌｅ）、ジャガイモノミハムシ（ｐｏｔａｔｏ ｂｅｅｔｌｅ）、およびリーフマイナー（ｌｅａｆｍｉｎｅｒ）（例えば、コロラドハムシ（Ｌｅｐｔｉｎｏｔａｒｓａ ｄｅｃｅｍｌｉｎｅａｔａ Ｓａｙ）、Ｄｉａｂｒｏｔｉｃａ ｓｐｐ（ウェスタンコーンルートワーム（Ｄｉａｂｒｏｔｉｃａ ｖｉｒｇｉｆｅｒａ ｖｉｒｇｉｆｅｒａ ＬｅＣｏｎｔｅ）が挙げられる））；コガネムシ科のコガネムシ類および他の甲虫（例えば、マメコガネ（Ｐｏｐｉｌｌｉａ ｊａｐｏｎｉｃａ Ｎｅｗｍａｎ）およびヨーロッパコガネムシ（Ｅｕｒｏｐｅａｎ ｃｈａｆｅｒ）（Ｒｈｉｚｏｔｒｏｇｕｓ ｍａｊａｌｉｓ Ｒａｚｏｕｍｏｗｓｋｙ））；コメツキムシ科のコメツキムシの幼虫およびキクイムシ科のキクイムシ。

本明細書で開示されるように、昆虫有害生物としては、コーンルートワーム複合体（ｃｏｒｎ ｒｏｏｔｗｏｒｍ ｃｏｍｐｌｅｘ）の鞘翅目有害生物： ウェスタンコーンルートワーム、Ｄｉａｂｒｏｔｉｃａ ｖｉｒｇｉｆｅｒａ ｖｉｒｇｉｆｅｒａ；ノーザンコーンルートワーム、Ｄ． ｂａｒｂｅｒｉ；サザンコーンルートワームまたはジュウイチホシウリハムシ、Ｄｉａｂｒｏｔｉｃａ ｕｎｄｅｃｉｍｐｕｎｃｔａｔａ ｈｏｗａｒｄｉ；およびメキシココーンルートワーム、Ｄ．ｖｉｒｇｉｆｅｒａ ｚｅａｅが挙げられる。具体的実施形態において、上記昆虫有害生物は、ウェスタンコーンルートワーム、Ｄｉａｂｒｏｔｉｃａ ｖｉｒｇｉｆｅｒａ ｖｉｒｇｉｆｅｒａである。

本明細書で開示される組成物および方法で制御され得る昆虫有害生物としては、鱗翅目の昆虫、例えば、以下がさらに挙げられる：Ａｃｈｏｒｏｉａ ｇｒｉｓｅｌｌａ、Ａｃｌｅｒｉｓ ｇｌｏｖｅｒａｎａ、Ａｃｌｅｒｉｓ ｖａｒｉａｎａ、Ａｄｏｘｏｐｈｙｅｓ ｏｒａｎａ、Ａｇｒｏｔｉｓ ｉｐｓｉｌｏｎ、Ａｌａｂａｍａ ａｒｇｉｌｌａｃｅａ、Ａｌｓｏｐｈｉｌａ ｐｏｍｅｔａｒｉａ、Ａｍｙｅｌｏｉｓ ｔｒａｎｓｉｔｅｌｌａ、Ａｎａｇａｓｔａ ｋｕｅｈｎｉｅｌｌａ、Ａｎａｒｓｉａ ｌｉｎｅａｔｅｌｌａ、Ａｎｉｓｏｔａ ｓｅｎａｔｏｒｉａ、Ａｎｔｈｅｒａｅａ ｐｅｒｎｙｉ、Ａｎｔｉｃａｒｓｉａ ｇｅｍｍａｔａｌｉｓ、Ａｒｃｈｉｐｓ ｓｐｐ．、Ａｒｇｙｒｏｔａｅｎｉａ ｓｐｐ．、Ａｔｈｅｔｉｓ ｍｉｎｄａｒａ、Ｂｏｍｂｙｘ ｍｏｒｉ、Ｂｕｃｃｕｌａｔｒｉｘ ｔｈｕｒｂｅｒｉｅｌｌａ、Ｃａｄｒａ ｃａｕｔｅｌｌａ、Ｃｈｏｒｉｓｔｏｎｅｕｒａ ｓｐ．、Ｃｏｃｈｙｌｌｓ ｈｏｓｐｅｓ、Ｃｏｌｉａｓ ｅｕｒｙｔｈｅｍｅ、Ｃｏｒｃｙｒａ ｃｅｐｈａｌｏｎｉｃａ、Ｃｙｄｉａ ｌａｔｉｆｅｒｒｅａｎｕｓ、Ｃｙｄｉａ ｐｏｍｏｎｅｌｌａ、Ｄａｔａｎａ ｉｎｔｅｇｅｒｒｉｍａ、Ｄｅｎｄｒｏｌｉｍｕｓ ｓｉｂｅｒｉｃｕｓ、Ｄｅｓｍｉａｆｅｎｅｒａｌｉｓ ｓｐｐ．、Ｄｉａｐｈａｎｉａ ｈｙａｌｉｎａｔａ、Ｄｉａｐｈａｎｉａ ｎｉｔｉｄａｌｉｓ、Ｄｉａｔｒａｅａ ｇｒａｎｄｉｏｓｅｌｌａ、Ｄｉａｔｒａｅａ ｓａｃｃｈａｒａｌｉｓ、Ｅｎｎｏｍｏｓ ｓｕｂｓｉｇｎａｒｉａ、Ｅｏｒｅｕｍａ ｌｏｆｔｉｎｉ、Ｅｓｐｈｅｓｔｉａ ｅｌｕｔｅｌｌａ、Ｅｒａｎｎｉｓ ｔｉｌａｒｉａ、Ｅｓｔｉｇｍｅｎｅ ａｃｒｅａ、Ｅｕｌｉａ ｓａｌｕｂｒｉｃｏｌａ、Ｅｕｐｏｃｏｅｌｌｉａ ａｍｂｉｇｕｅｌｌａ、Ｅｕｐｏｅｃｉｌｉａ ａｍｂｉｇｕｅｌｌａ、Ｅｕｐｒｏｃｔｉｓ ｃｈｒｙｓｏｒｒｈｏｅａ、Ｅｕｘｏａ ｍｅｓｓｏｒｉａ、Ｇａｌｌｅｒｉａ ｍｅｌｌｏｎｅｌｌａ、Ｇｒａｐｈｏｌｉｔａ ｍｏｌｅｓｔａ、Ｈａｒｒｉｓｉｎａ ａｍｅｒｉｃａｎａ、Ｈｅｌｉｃｏｖｅｒｐａ ｓｕｂｆｌｅｘａ、Ｈｅｌｉｃｏｖｅｒｐａ ｚｅａ、Ｈｅｌｉｏｔｈｉｓ ｖｉｒｅｓｃｅｎｓ、Ｈｅｍｉｌｅｕｃａ ｏｌｉｖｉａｅ、Ｈｏｍｏｅｏｓｏｍａ ｅｌｅｃｔｅｌｌｕｍ、Ｈｙｐｈａｎｔｉａ ｃｕｎｅａ、Ｋｅｉｆｅｒｉａ ｌｙｃｏｐｅｒｓｉｃｅｌｌａ、Ｌａｍｂｄｉｎａ ｆｉｓｃｅｌｌａｒｉａ ｆｉｓｃｅｌｌａｒｉａ、Ｌａｍｂｄｉｎａ ｆｉｓｃｅｌｌａｒｉａ ｌｕｇｕｂｒｏｓａ、Ｌｅｕｃｏｍａ ｓａｌｉｃｉｓ、Ｌｏｂｅｓｉａ ｂｏｔｒａｎａ、Ｌｏｘｏｓｔｅｇｅ ｓｔｉｃｔｉｃａｌｉｓ、Ｌｙｍａｎｔｒｉａ ｄｉｓｐａｒ、Ｍａｃａｌｌａ ｔｈｙｒｉｓａｌｉｓ、Ｍａｌａｃｏｓｏｍａ ｓｐｐ．、Ｍａｍｅｓｔｒａ ｂｒａｓｓｉｃａｅ、Ｍａｍｅｓｔｒａ ｃｏｎｆｉｇｕｒａｔａ、Ｍａｎｄｕｃａ ｑｕｉｎｑｕｅｍａｃｕｌａｔａ、Ｍａｎｄｕｃａ ｓｅｘｔａ、Ｍａｒｕｃａ ｔｅｓｔｕｌａｌｉｓ、Ｍｅｌａｎｃｈｒａ ｐｉｃｔａ、Ｏｐｅｒｏｐｈｔｅｒａ ｂｒｕｍａｔａ、Ｏｒｇｙｉａ ｓｐｐ．、Ｏｓｔｒｉｎｉａ ｎｕｂｉｌａｌｉｓ、Ｐａｌｅａｃｒｉｔａ ｖｅｒｎａｔａ、Ｐａｐｉｌｉｏ ｃｒｅｓｐｈｏｎｔｅｓ、Ｐｅｃｔｉｎｏｐｈｏｒａ ｇｏｓｓｙｐｉｅｌｌａ、Ｐｈｒｙｇａｎｉｄｉａ ｃａｌｉｆｏｒｎｉｃａ、Ｐｈｙｌｌｏｎｏｒｙｃｔｅｒ ｂｌａｎｃａｒｄｅｌｌａ、Ｐｉｅｒｉｓ ｎａｐｉ、Ｐｉｅｒｉｓ ｒａｐａｅ、Ｐｌａｔｈｙｐｅｎａ ｓｃａｂｒａ、Ｐｌａｔｙｎｏｔａ ｆｌｏｕｅｎｄａｎａ、Ｐｌａｔｙｎｏｔａ ｓｔｕｌｔａｎａ、Ｐｌａｔｙｐｔｉｌｉａ ｃａｒｄｕｉｄａｃｔｙｌａ、Ｐｌｏｄｉａ ｉｎｔｅｒｐｕｎｃｔｅｌｌａ、Ｐｌｕｔｅｌｌａ ｘｙｌｏｓｔｅｌｌａ、Ｐｏｎｔｉａ ｐｒｏｔｏｄｉｃｅ、Ｐｓｅｕｄａｌｅｔｉａ ｕｎｉｐｕｎｃｔａ、Ｐｓｅｕｄｏｐｌａｓｉａ ｉｎｃｌｕｄｅｎｓ、Ｓａｂｕｌｏｄｅｓ ａｅｇｒｏｔａｔａ、Ｓｃｈｉｚｕｒａ ｃｏｎｃｉｎｎａ、Ｓｉｔｏｔｒｏｇａ ｃｅｒｅａｌｅｌｌａ、Ｓｐｉｌｏｎｔａ ｏｃｅｌｌａｎａ、Ｓｐｏｄｏｐｔｅｒａ ｓｐｐ．、Ｔｈａｕｒｎｓｔｏｐｏｅａ ｐｉｔｙｏｃａｍｐａ、Ｔｉｎｓｏｌａ ｂｉｓｓｅｌｌｉｅｌｌａ、Ｔｒｉｃｈｏｐｌｕｓｉａ ｈｉ、Ｔｕｔａ ａｂｓｏｌｕｔａ、Ｕｄｅａ ｒｕｂｉｇａｌｉｓ、Ｘｙｌｏｍｙｇｅｓ ｃｕｒｉａｉｌｓ、およびＹｐｏｎｏｍｅｕｔａ ｐａｄｅｌｌａ。

本明細書で提供される方法および組成物はまた、Ｌｙｇｕｓ ｓｐｐ．（Ｌｙｇｕｓ ｈｅｓｐｅｒｕｓ、Ｌｙｇｕｓ ｌｉｎｅｏｌａｒｉｓ、Ｌｙｇｕｓ ｐｒａｔｅｎｓｉｓ、Ｌｙｇｕｓ ｒｕｇｕｌｉｐｅｎｎｉｓ、およびＬｙｇｕｓ ｐａｂｕｌｉｎｕｓが挙げられる）、Ｃａｌｏｃｏｒｉｓ ｎｏｒｖｅｇｉｃｕｓ、Ｏｒｔｈｏｐｓ ｃｏｍｐｅｓｔｒｉｓ、Ｐｌｅｓｉｏｃｏｒｉｓ ｒｕｇｉｃｏｌｌｉｓ、Ｃｙｒｔｏｐｅｌｔｉｓ ｍｏｄｅｓｔｕｓ、Ｃｙｒｔｏｐｅｌｔｉｓ ｎｏｔａｔｕｓ、Ｓｐａｎａｇｏｎｉｃｕｓ ａｌｂｏｆａｓｃｉａｔｕｓ、Ｄｉａｐｈｎｏｃｏｒｉｓ ｃｈｌｏｒｉｎｏｎｉｓ、Ｌａｂｏｐｉｄｉｃｏｌａ ａｌｌｉｉ、Ｐｓｅｕｄａｔｏｍｏｓｃｅｌｉｓ ｓｅｒｉａｔｕｓ、Ａｄｅｌｐｈｏｃｏｒｉｓ ｒａｐｉｄｕｓ、Ｐｏｅｃｉｌｏｃａｐｓｕｓ ｌｉｎｅａｔｕｓ、Ｂｌｉｓｓｕｓ ｌｅｕｃｏｐｔｅｒｕｓ、Ｎｙｓｉｕｓ ｓｐｐ．（Ｎｙｓｉｕｓ ｅｒｉｃａｅおよびＮｙｓｉｕｓ ｒａｐｈａｎｕｓが挙げられる）、Ｎｅｚａｒａ ｖｉｒｉｄｕｌａ、Ａｃｒｏｓｔｅｒｎｕｍ ｈｉｌａｒｅ、Ｅｕｓｃｈｉｓｔｕｓ ｓｐｐ．（Ｅｕｓｃｈｉｓｔｕｓ ｓｅｒｖｕｓおよびＥｕｓｃｈｉｓｔｕｓ ｈｅｒｏｓが挙げられる）、Ｄｉｃｈｅｌｏｐｓ ｓｐｐ．（Ｄｉｃｈｅｌｏｐｓ ｍｅｌａｃａｎｔｕｓおよびＤｉｃｈｅｌｏｐｓ ｆｕｒｃａｔｕｓが挙げられる）、Ｈａｌｙｏｍｏｒｐｈａ ｈａｌｙｓ、Ｌｉｐａｐｈｉｓ ｅｒｙｓｉｍｉ、Ａｐｈｉｓ ｇｏｓｓｙｐｉｉ、Ｍａｃｒｏｓｉｐｈｕｍ ａｖｅｎａｅ、Ｍｙｚｕｓ ｐｅｒｓｉｃａｅ、Ａｃｙｒｔｈｏｓｉｐｈｏｎ ｐｉｓｕｍ、Ａｐｈｉｄｏｉｄｅａ ｓｐｐ、Ｅｕｒｙｇａｓｔｅｒ ｓｐｐ．、Ｃｏｒｅｉｄａｅ ｓｐｐ．、Ｐｙｒｒｈｏｃｏｒｉｄａｅ ｓｐｐ．、Ｂｌｏｓｔｏｍａｔｉｄａｅ ｓｐｐ．、Ｒｅｄｕｖｉｉｄａｅ ｓｐｐ．、Ｃｉｍｉｃｉｄａｅ ｓｐｐ． Ａｌｅｕｒｏｃａｎｔｈｕｓ ｗｏｇｌｕｍｉ、Ａｌｅｙｒｏｄｅｓ ｐｒｏｌｅｔｅｌｌａ、Ｂｅｍｉｓｉａ ｓｐｐ．（Ｂｅｍｉｓｉａ ａｒｇｅｎｔｉｆｏｌｉｉおよびＢｅｍｉｓｉａ ｔａｂａｃｉが挙げられる）、およびＴｒｉａｌｅｕｒｏｄｅｓ ｖａｐｏｒａｒｉｏｒｕｍが挙げられるが、これらに限定されない半翅目の昆虫有害生物に対して使用され得る。

本明細書で提供される方法および組成物はまた、アザミウマの種（Ｆｒａｎｋｌｉｎｉｅｌｌａ ｓｐｐ．、例えば、ミカンキイロアザミウマ（Ｆｒａｎｋｌｉｎｉｅｌｌａ ｏｃｃｉｄｅｎｔａｌｉｓ （Ｐｅｒｇａｎｄｅ））；Ｔｈｒｉｐｓ ｓｐｐ．、例えば、Ｔｈｒｉｐｓ ｔａｂａｃｉ；Ｓｃｉｒｔｏｔｈｒｉｐｓ ｓｐｐ．、例えば、Ｓｃｉｒｔｏｔｈｒｉｐｓ ｄｏｒｓａｌｉｓ； Ｋｌａｍｂｏｔｈｒｉｐｓ ｓｐｐ．、例えば、Ｋｌａｍｂｏｔｈｒｉｐｓ ｍｙｏｐｏｒｉ；Ｅｃｈｉｎｏｔｈｒｉｐｓ ｓｐｐ．、例えば、Ｅｃｈｉｎｏｔｈｒｉｐｓ ａｍｅｒｉｃａｎｕｓ；およびＭｅｇａｌｕｒｏｔｈｒｉｐｓ ｓｐｐ．、例えば、Ｍｅｇａｌｕｒｏｔｈｒｉｐｓ ｕｓｉｔａｔｕｓが挙げられる）が挙げられるが、これらに限定されないＴｈｙｓｅｎｏｐｔｅｒａ目の昆虫有害生物に対して使用され得る。

本明細書で提供される方法および組成物はまた、植物摂食ダニ（ｐｌａｎｔ ｆｅｅｄｉｎｇ ｍｉｔｅ）（ナミハダニ（ｓｉｘ－ｓｐｏｏｔｅｄ ｓｐｉｄｅｒ ｍｉｔｅ）（Ｅｕｔｅｔｒａｎｙｃｈｕｓ ｓｅｘｍａｃｕｌａｔｕｓ）、テキサスミカンダニ（Ｔｅｘａｓ ｃｉｔｒｕｓ ｍｉｔｅ）（Ｅｕｔｅｔｒａｎｙｃｈｕｓ ｂａｎｋｓｉ）、ミカンハダニ（Ｃｉｔｒｕｓ ｒｅｄ ｍｉｔｅ）（Ｐａｎｏｎｙｃｈｕｓ ｃｉｔｒｉ）、リンゴハダニ（Ｐａｎｏｎｙｃｈｕｓ ｕｌｍｉ）、マクダニエルダニ（ＭｃＤａｎｉｅｌ ｍｉｔｅ）（Ｔｅｔｒａｎｙｃｈｕｓ ｍｃｄａｎｉｅｌｉ）、パシフィックハダニ（Ｐａｃｉｆｉｃ ｓｐｉｄｅｒ ｍｉｔｅ）（Ｔｅｔｒａｎｙｃｈｕｓ ｐａｃｉｆｉｃｕｓ）、イチゴハダニ（Ｓｔｒａｗｂｅｒｒｙ ｓｐｉｄｅｒ ｍｉｔｅ）（Ｔｅｔｒａｎｙｃｈｕｓ ｕｒｔｉｃａｅ）、トドマツノハダニ（Ｏｌｉｇｏｎｙｃｈｕｓ ｕｎｕｎｇｕｉｓ）、スギノハダニ（Ｏｌｉｇｏｎｙｃｈｕｓ ｎｏｎｄｏｎｅｎｓｉｓｉ）、およびＴｅｔｒａｎｙｃｈｕｓ ｅｖａｎｓｉが挙げられる）が挙げられるが、これらに限定されないケダニ亜目の昆虫有害生物に対して使用され得る。

目的の昆虫有害生物としてはまた、以下が挙げられる：Ａｒａｅｃｅｒｕｓ ｆａｓｃｉｃｕｌａｔｕｓ、ワタミヒゲナガゾウムシ；Ａｃａｎｔｈｏｓｃｅｌｉｄｅｓ ｏｂｔｅｃｔｕｓ、マメゾウムシ；Ｂｒｕｃｈｕｓ ｒｕｆｍａｎｕｓ、ソラマメゾウムシ；Ｂｒｕｃｈｕｓ ｐｉｓｏｒｕｍ、エンドウゾウムシ；Ｚａｂｒｏｔｅｓ ｓｕｂｆａｓｃｉａｔｕｓ、メキシコマメゾウムシ；Ｄｉａｂｒｏｔｉｃａ ｂａｌｔｅａｔａ、バンデッドキューカンバービートル（ｂａｎｄｅｄ ｃｕｃｕｍｂｅｒ ｂｅｅｔｌｅ）；Ｃｅｒｏｔｏｍａ ｔｒｉｆｕｒｃａｔａ、ヒメキバネサルハムシ；Ｄｉａｂｒｏｔｉｃａ ｖｉｒｇｉｆｅｒａ、メキシココーンルートワーム；Ｅｐｉｔｒｉｘ ｃｕｃｕｍｅｒｉｓ、ジャガイモノミハムシ（ｐｏｔａｔｏ ｆｌｅａ ｂｅｅｔｌｅ）；Ｃｈａｅｔｏｃｎｅｍａ ｃｏｎｆｉｎｉｓ、サツマイモノミハムシ（ｓｗｅｅｔ ｐｏｔａｔｏ ｆｌｅａ ｂｅｅｔｌｅ）；Ｈｙｐｅｒａ ｐｏｓｔｉｃａ、アルファルファゾウムシ；Ａｎｔｈｏｎｏｍｕｓ ｑｕａｄｒｉｇｉｂｂｕｓリンゴシギゾウムシ（ａｐｐｌｅ ｃｕｒｃｕｌｉｏ）；Ｓｔｅｒｎｅｃｈｕｓ ｐａｌｕｄａｔｕｓ、マメクキゾウムシ（ｂｅａｎ ｓｔａｌｋ ｗｅｅｖｉｌ）；Ｈｙｐｅｒａ ｂｒｕｎｎｉｐｅｎｎｉｓ、エジプトアルファルファゾウムシ（Ｅｇｙｐｔｉａｎ ａｌｆａｌｆａ ｗｅｅｖｉｌ）；Ｓｉｔｏｐｈｉｌｕｓ ｇｒａｎａｒｉｅｓ、グラナリアコクゾウムシ（ｇｒａｎａｒｙ ｗｅｅｖｉｌ）；Ｃｒａｐｏｎｉｕｓ ｉｎａｅｑｕａｌｉｓ、ブドウシギゾウムシ（ｇｒａｐｅ ｃｕｒｃｕｌｉｏ）；Ｓｉｔｏｐｈｉｌｕｓ ｚｅａｍａｉｓ、コクゾウムシ；Ｃｏｎｏｔｒａｃｈｅｌｕｓ ｎｅｎｕｐｈａｒ、プラムシギゾウムシ（ｐｌｕｍ ｃｕｒｃｕｌｉｏ）；Ｅｕｓｃｅｐｅｓ ｐｏｓｔｆａｃｉａｔｕｓ、イモゾウムシ；Ｍａｌａｄｅｒａ ｃａｓｔａｎｅａ、アカビロウドコガネ；Ｒｈｉｚｏｔｒｏｇｕｓ ｍａｊａｌｉｓ、ヨーロッパコガネムシ；Ｍａｃｒｏｄａｃｔｙｌｕｓ ｓｕｂｓｐｉｎｏｓｕｓ、コフキコガネムシ（ｒｏｓｅ ｃｈａｆｅｒ）；Ｔｒｉｂｏｌｉｕｍ ｃｏｎｆｕｓｕｍ、ヒラタコクヌストモドキ；Ｔｅｎｅｂｒｉｏ ｏｂｓｃｕｒｕｓ、コメノゴミムシダマシ；Ｔｒｉｂｏｌｉｕｍ ｃａｓｔａｎｅｕｍ、コクヌストモドキ；Ｔｅｎｅｂｒｉｏ ｍｏｌｉｔｏｒ、チャイロコメノゴミムシダマシならびにショウジョウバエ科（Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ ｓｕｚｕｋｉｉ、オウトウショウジョウバエを含む）。

昆虫有害生物はまた、双翅目、膜翅目、食毛目、同翅目、半翅目、直翅目、総翅目、革翅目、等翅目、シラミ目、ノミ目、および毛翅目から選択される昆虫を含む。本発明の昆虫有害生物は、ダニ目のもの（ダニ類（ｍｉｔｅ）およびマダニ類（ｔｉｃｋ）が挙げられるが、これらに限定されない）をさらに含み得る。具体的実施形態において、甲虫有害生物としては、ウェスタンコーンルートワーム、コロラドハムシ、および／またはアリモドキゾウムシが挙げられる。

主要作物に関する本発明の組成物および方法で制御され得る昆虫有害生物としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：トウモロコシ：Ｏｓｔｒｉｎｉａ ｎｕｂｉｌａｌｉｓ、ヨーロッパアワノメイガ；Ａｇｒｏｔｉｓ ｉｐｓｉｌｏｎ、タマナヤガ；Ｈｅｌｉｃｏｖｅｒｐａ ｚｅａｅ、アメリカタバコガ；Ｓｐｏｄｏｐｔｅｒａ ｆｒｕｇｉｐｅｒｄａ、ツマジロクサヨトウ；Ｄｉａｔｒａｅａ ｇｒａｎｄｉｏｓｅｌｌａ、南西部アワノメイガ（ｓｏｕｔｈｗｅｓｔｅｒｎ ｃｏｒｎ ｂｏｒｅｒ）；Ｅｌａｓｍｏｐａｌｐｕｓ ｌｉｇｎｏｓｅｌｌｕｓ、モロコシマダラメイガ（ｌｅｓｓｅｒ ｃｏｒｎｓｔａｌｋ ｂｏｒｅｒ）；Ｄｉａｔｒａｅａ ｓａｃｃｈａｒａｌｉｓ、サトウキビメイガ（ｓｕｒｇａｒｃａｎｅ ｂｏｒｅｒ）；ウェスタンコーンルートワーム、例えば、Ｄｉａｂｒｏｔｉｃａ ｖｉｒｇｉｆｅｒａ ｖｉｒｇｉｆｅｒａ；ノーザンコーンルートワーム、例えば、Ｄｉａｂｒｏｔｉｃａ ｌｏｎｇｉｃｏｒｎｉｓ ｂａｒｂｅｒｉ；サザンコーンルートワーム、例えば、Ｄｉａｂｒｏｔｉｃａ ｕｎｄｅｃｉｍｐｕｎｃｔａｔａ ｈｏｗａｒｄｉ；Ｍｅｌａｎｏｔｕｓ ｓｐｐ．、コメツキムシの幼虫；Ｃｙｃｌｏｃｅｐｈａｌａ ｂｏｒｅａｌｉｓ、ノーザンコガネカブト（ｎｏｒｔｈｅｒｎ ｍａｓｋｅｄ ｃｈａｆｅｒ）（コガネムシ類の幼虫）；Ｃｙｃｌｏｃｅｐｈａｌａ ｉｍｍａｃｕｌａｔａ、サザンコガネカブト（コガネムシ類の幼虫）；Ｐｏｐｉｌｌｉａ ｊａｐｏｎｉｃａ、マメコガネ；Ｃｈａｅｔｏｃｎｅｍａ ｐｕｌｉｃａｒｉａ、ノミハムシ；Ｓｐｈｅｎｏｐｈｏｒｕｓ ｍａｉｄｉｓ、トウモロコシゾウムシ（ｍａｉｚｅ ｂｉｌｌｂｕｇ）；Ｒｈｏｐａｌｏｓｉｐｈｕｍ ｍａｉｄｉｓ、トウモロコシアブラムシ；Ａｎｕｒａｐｈｉｓ ｍａｉｄｉｒａｄｉｃｉｓ、コーンルートアブラムシ（ｃｏｒｎ ｒｏｏｔ ａｐｈｉｄ）；Ｍｙｚｕｓ ｐｅｒｓｉｃａｅ、モモアカアブラムシ；Ｎｅｚａｒａ ｖｉｒｉｄｕｌａ、ミナミアオカメムシ；Ｂｌｉｓｓｕｓ ｌｅｕｃｏｐｔｅｒｕｓ ｌｅｕｃｏｐｔｅｒｕｓ、アメリカコバネナガカメムシ；Ｍｅｌａｎｏｐｌｕｓ ｆｅｍｕｒｒｕｂｒｕｍ、レッドレッグドグラスホッパー（ｒｅｄｌｅｇｇｅｄ ｇｒａｓｓｈｏｐｐｅｒ）；Ｍｅｌａｎｏｐｌｕｓ ｓａｎｇｕｉｎｉｐｅｓ、渡りグラスホッパー（ｍｉｇｒａｔｏｒｙ ｇｒａｓｓｈｏｐｐｅｒ）；Ｈｙｌｅｍｙａ ｐｌａｔｕｒａ、タネバエ；Ａｇｒｏｍｙｚａ ｐａｒｖｉｃｏｒｎｉｓ、コーンブロッチリーフマイナー（ｃｏｒｎ ｂｌｏｔｃｈ ｌｅａｆｍｉｎｅｒ）；Ａｎａｐｈｏｔｈｒｉｐｓ ｏｂｓｃｒｕｒｕｓ、グラススリップス（ｇｒａｓｓ ｔｈｒｉｐｓ）；Ｓｏｌｅｎｏｐｓｉｓ ｍｉｌｅｓｔａ、盗賊アリ（ｔｈｉｅｆ ａｎｔ）；Ｔｅｔｒａｎｙｃｈｕｓ ｕｒｔｉｃａｅ、ナミハダニ・黄緑型（ｔｗｏ ｓｐｏｔｔｅｄ ｓｐｉｄｅｒ ｍｉｔｅ）；ソルガム：Ｃｈｉｌｏ ｐａｒｔｅｌｌｕｓ、ソルガムメイガ（ｓｏｒｇｈｕｍ ｂｏｒｅｒ）；Ｓｐｏｄｏｐｔｅｒａ ｆｒｕｇｉｐｅｒｄａ、ツマジロクサヨトウ；Ｈｅｌｉｃｏｖｅｒｐａ ｚｅａ、アメリカタバコガ；Ｅｌａｓｍｏｐａｌｐｕｓ ｌｉｇｎｏｓｅｌｌｕｓ、モロコシマダラメイガ；Ｆｅｌｔｉａ ｓｕｂｔｅｒｒａｎｅａ、グラニュレートカットワーム（ｇｒａｎｕｌａｔｅ ｃｕｔｗｏｒｍ）；Ｐｈｙｌｌｏｐｈａｇａ ｃｒｉｎｉｔａ、コガネムシ類の幼虫；Ｅｌｅｏｄｅｓ、Ｃｏｎｏｄｅｒｕｓ、およびＡｅｏｌｕｓ ｓｐｐ．、コメツキムシの幼虫；Ｏｕｌｅｍａ ｍｅｌａｎｏｐｕｓ、シリアルリーフビートル（ｃｅｒｅａｌ ｌｅａｆ ｂｅｅｔｌｅ）；Ｃｈａｅｔｏｃｎｅｍａ ｐｕｌｉｃａｒｉａ、ノミハムシ；Ｓｐｈｅｎｏｐｈｏｒｕｓ ｍａｉｄｉｓ、トウモロコシゾウムシ；Ｒｈｏｐａｌｏｓｉｐｈｕｍ ｍａｉｄｉｓ；トウモロコシアブラムシ；Ｓｉｐｈａ ｆｌａｖａ、黄色サトウキビアブラムシ（ｙｅｌｌｏｗ ｓｕｇａｒｃａｎｅ ａｐｈｉｄ）；アメリカコバネナガカメムシ、例えば、Ｂｌｉｓｓｕｓ ｌｅｕｃｏｐｔｅｒｕｓ ｌｅｕｃｏｐｔｅｒｕｓ；Ｃｏｎｔａｒｉｎｉａ ｓｏｒｇｈｉｃｏｌａ、ソルガムミッジ（ｓｏｒｇｈｕｍ ｍｉｄｇｅ）；Ｔｅｔｒａｎｙｃｈｕｓ ｃｉｎｎａｂａｒｉｎｕｓ、ナミハダニ・赤色型（ｃａｒｍｉｎｅ ｓｐｉｄｅｒ ｍｉｔｅ）；Ｔｅｔｒａｎｙｃｈｕｓ ｕｒｔｉｃａｅ、ナミハダニ・黄緑型；コムギ：Ｐｓｅｕｄａｌｅｔｉａ ｕｎｉｐｕｎｃｔａｔａ、アーミーワーム（ａｒｍｙ ｗｏｒｍ）；Ｓｐｏｄｏｐｔｅｒａ ｆｒｕｇｉｐｅｒｄａ、ツマジロクサヨトウ；Ｅｌａｓｍｏｐａｌｐｕｓ ｌｉｇｎｏｓｅｌｌｕｓ、モロコシマダラメイガ；Ａｇｒｏｔｉｓ ｏｒｔｈｏｇｏｎｉａ、ペールウェスタンカットワーム（ｐａｌｅ ｗｅｓｔｅｒｎ ｃｕｔｗｏｒｍ）；Ｅｌａｓｍｏｐａｌｐｕｓ ｌｉｇｎｏｓｅｌｌｕｓ、モロコシマダラメイガ；Ｏｕｌｅｍａ ｍｅｌａｎｏｐｕｓ、シリアルリーフビートル；Ｈｙｐｅｒａ ｐｕｎｃｔａｔａ、オオタコクゾウムシ（ｃｌｏｖｅｒ ｌｅａｆ ｗｅｅｖｉｌ）；サザンコーンルートワーム、例えば、Ｄｉａｂｒｏｔｉｃａ ｕｎｄｅｃｉｍｐｕｎｃｔａｔａ ｈｏｗａｒｄｉ；ロシアコムギアブラムシ（Ｒｕｓｓｉａｎ ｗｈｅａｔ ａｐｈｉｄ）；Ｓｃｈｉｚａｐｈｉｓ ｇｒａｍｉｎｕｍ、グリーンバグ（ｇｒｅｅｎｂｕｇ）；Ｍａｃｒｏｓｉｐｈｕｍ ａｖｅｎａｅ、コムギアブラムシ（Ｅｎｇｌｉｓｈ ｇｒａｉｎ ａｐｈｉｄ）；Ｍｅｌａｎｏｐｌｕｓ ｆｅｍｕｒｒｕｂｒｕｍ、レッドレッグドグラスホッパー；Ｍｅｌａｎｏｐｌｕｓ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｉｓ、ディファレンシャルグラスホッパー（ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌ ｇｒａｓｓｈｏｐｐｅｒ）；Ｍｅｌａｎｏｐｌｕｓ ｓａｎｇｕｉｎｉｐｅｓ、渡りグラスホッパー；Ｍａｙｅｔｉｏｌａ ｄｅｓｔｒｕｃｔｏｒ、ヘシアンバエ；Ｓｉｔｏｄｉｐｌｏｓｉｓ ｍｏｓｅｌｌａｎａ、ムギアカタマバエ；Ｍｅｒｏｍｙｚａ ａｍｅｒｉｃａｎａ、ムギキモグリバエ；Ｈｙｌｅｍｙａ ｃｏａｒｃｔａｔａ、コムギハナアブ（ｗｈｅａｔ ｂｕｌｂ ｆｌｙ）；Ｆｒａｎｋｌｉｎｉｅｌｌａ ｆｕｓｃａ、ウスグロアザミウマ；Ｃｅｐｈｕｓ ｃｉｎｃｔｕｓ、コムギクキバチ（ｗｈｅａｔ ｓｔｅｍ ｓａｗｆｌｙ）；Ａｃｅｒｉａ ｔｕｌｉｐａｅ、チューリップサビダニ；ヒマワリ：Ｃｙｌｉｎｄｒｏｃｕｐｔｕｒｕｓ ａｄｓｐｅｒｓｕｓ、ヒマワリクキゾウムシ（ｓｕｎｆｌｏｗｅｒ ｓｔｅｍ ｗｅｅｖｉｌ）；Ｓｍｉｃｒｏｎｙｘ ｆｕｌｕｓ、赤ヒマワリクキゾウムシ（ｒｅｄ ｓｕｎｆｌｏｗｅｒ ｓｅｅｄ ｗｅｅｖｉｌ）；Ｓｍｉｃｒｏｎｙｘ ｓｏｒｄｉｄｕｓ、灰色ヒマワリ種子ゾウムシ（ｇｒａｙ ｓｕｎｆｌｏｗｅｒ ｓｅｅｄ ｗｅｅｖｉｌ）；Ｓｕｌｅｉｍａ ｈｅｌｉａｎｔｈａｎａ、ヒマワリハマキガ（ｓｕｎｆｌｏｗｅｒ ｂｕｄ ｍｏｔｈ）；Ｈｏｍｏｅｏｓｏｍａ ｅｌｅｃｔｅｌｌｕｍ、ヒマワリガ（ｓｕｎｆｌｏｗｅｒ ｍｏｔｈ）；Ｚｙｇｏｇｒａｍｍａ ｅｘｃｌａｍａｔｉｏｎｉｓ、ヒマワリ甲虫（ｓｕｎｆｌｏｗｅｒ ｂｅｅｔｌｅ）；Ｂｏｔｈｙｒｕｓ ｇｉｂｂｏｓｕｓ、キャロットビートル（ｃａｒｒｏｔ ｂｅｅｔｌｅ）；Ｎｅｏｌａｓｉｏｐｔｅｒａ ｍｕｒｔｆｅｌｄｔｉａｎａ、サンフラワーシードミッジ（ｓｕｎｆｌｏｗｅｒ ｓｅｅｄ ｍｉｄｇｅ）；ワタ：Ｈｅｌｉｏｔｈｉｓ ｖｉｒｅｓｃｅｎｓ、ニセアメリカタバコガ（ｔｏｂａｃｃｏ ｂｕｄｗｏｒｍ）；Ｈｅｌｉｃｏｖｅｒｐａ ｚｅａ、アメリカタバコガ（ｃｏｔｔｏｎ ｂｏｌｌｗｏｒｍ）；Ｓｐｏｄｏｐｔｅｒａ ｅｘｉｇｕａ、シロイチモジヨトウ；Ｐｅｃｔｉｎｏｐｈｏｒａ ｇｏｓｓｙｐｉｅｌｌａ、ピンクボールワーム（ｐｉｎｋ ｂｏｌｌｗｏｒｍ）；ワタノミゾウムシ、例えば、Ａｎｔｈｏｎｏｍｕｓ ｇｒａｎｄｉｓ；Ａｐｈｉｓ ｇｏｓｓｙｐｉｉ、ワタアブラムシ；Ｐｓｅｕｄａｔｏｍｏｓｃｅｌｉｓ ｓｅｒｉａｔｕｓ、ワタノミハムシ（ｃｏｔｔｏｎ ｆｌｅａｈｏｐｐｅｒ）；Ｔｒｉａｌｅｕｒｏｄｅｓ ａｂｕｔｉｌｏｎｅａ、バンデッドウイングドホワイトフライ（ｂａｎｄｅｄ ｗｉｎｇｅｄ ｗｈｉｔｅｆｌｙ）；Ｌｙｇｕｓ ｌｉｎｅｏｌａｒｉｓ、サビイロカスミカメ；Ｍｅｌａｎｏｐｌｕｓ ｆｅｍｕｒｒｕｂｒｕｍ、レッドレッグドグラスホッパー；Ｍｅｌａｎｏｐｌｕｓ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｉｓ、ディファレンシャルグラスホッパー；Ｔｈｒｉｐｓ ｔａｂａｃｉ、ネギアザミウマ；Ｆｒａｎｋｌｉｎｉｅｌｌａ ｆｕｓｃａ、ウスグロアザミウマ；Ｔｅｔｒａｎｙｃｈｕｓ ｃｉｎｎａｂａｒｉｎｕｓ、ナミハダニ・赤色型；Ｔｅｔｒａｎｙｃｈｕｓ ｕｒｔｉｃａｅ、ナミハダニ・黄緑型；イネ：Ｄｉａｔｒａｅａ ｓａｃｃｈａｒａｌｉｓ、サトウキビメイガ；Ｓｐｏｄｏｐｔｅｒａ ｆｒｕｇｉｐｅｒｄａ、ツマジロクサヨトウ；Ｈｅｌｉｃｏｖｅｒｐａ ｚｅａ、アメリカタバコガ；Ｃｏｌａｓｐｉｓ ｂｒｕｎｎｅａ、ブドウハムシ（ｇｒａｐｅ ｃｏｌａｓｐｉｓ）；Ｌｉｓｓｏｒｈｏｐｔｒｕｓ ｏｒｙｚｏｐｈｉｌｕｓ、イネミズゾウムシ；Ｓｉｔｏｐｈｉｌｕｓ ｏｒｙｚａｅ、コクゾウムシ；Ｎｅｐｈｏｔｅｔｔｉｘ ｎｉｇｒｏｐｉｃｔｕｓ、ツマグロヨコバイ（ｒｉｃｅ ｌｅａｆｈｏｐｐｅｒ）；アメリカコバネナガカメムシ、例えば、Ｂｌｉｓｓｕｓ ｌｅｕｃｏｐｔｅｒｕｓ ｌｅｕｃｏｐｔｅｒｕｓ；Ａｃｒｏｓｔｅｒｎｕｍ ｈｉｌａｒｅ、ミドリカメムシ（ｇｒｅｅｎ ｓｔｉｎｋ ｂｕｇ）；ダイズ：Ｐｓｅｕｄｏｐｌｕｓｉａ ｉｎｃｌｕｄｅｎｓ、ダイズシャクトリムシ（ｓｏｙｂｅａｎ ｌｏｏｐｅｒ）；Ａｎｔｉｃａｒｓｉａ ｇｅｍｍａｔａｌｉｓ、ハッショウマメキャタピラー（ｖｅｌｖｅｔｂｅａｎ ｃａｔｅｒｐｉｌｌａｒ）；Ｐｌａｔｈｙｐｅｎａ ｓｃａｂｒａ、グリーンクローバーアオムシ（ｇｒｅｅｎ ｃｌｏｖｅｒｗｏｒｍ）；Ｏｓｔｒｉｎｉａ ｎｕｂｉｌａｌｉｓ、ヨーロッパアワノメイガ；Ａｇｒｏｔｉｓ ｉｐｓｉｌｏｎ、タマナヤガ；Ｓｐｏｄｏｐｔｅｒａ ｅｘｉｇｕａ、シロイチモジヨトウ；Ｈｅｌｉｏｔｈｉｓ ｖｉｒｅｓｃｅｎｓ、ニセアメリカタバコガ；Ｈｅｌｉｃｏｖｅｒｐａ ｚｅａ、アメリカタバコガ；Ｅｐｉｌａｃｈｎａ ｖａｒｉｖｅｓｔｉｓ、インゲンテントウ；Ｍｙｚｕｓ ｐｅｒｓｉｃａｅ、モモアカアブラムシ；Ｅｍｐｏａｓｃａ ｆａｂａｅ、ジャガイモヒメヨコバイ；Ａｃｒｏｓｔｅｒｎｕｍ ｈｉｌａｒｅ、ミドリカメムシ；Ｍｅｌａｎｏｐｌｕｓ ｆｅｍｕｒｒｕｂｒｕｍ、レッドレッグドグラスホッパー；Ｍｅｌａｎｏｐｌｕｓ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｉｓ、ディファレンシャルグラスホッパー；Ｈｙｌｅｍｙａ ｐｌａｔｕｒａ、タネバエ；Ｓｅｒｉｃｏｔｈｒｉｐｓ ｖａｒｉａｂｉｌｉｓ、ダイズアザミウマ；Ｔｈｒｉｐｓ ｔａｂａｃｉ、ネギアザミウマ；Ｔｅｔｒａｎｙｃｈｕｓ ｔｕｒｋｅｓｔａｎｉ、イチゴハダニ；Ｔｅｔｒａｎｙｃｈｕｓ ｕｒｔｉｃａｅ、ナミハダニ・黄緑型；オオムギ：Ｏｓｔｒｉｎｉａ ｎｕｂｉｌａｌｉｓ、ヨーロッパアワノメイガ；Ａｇｒｏｔｉｓ ｉｐｓｉｌｏｎ、タマナヤガ；Ｓｃｈｉｚａｐｈｉｓ ｇｒａｍｉｎｕｍ、グリーンバグ；アメリカコバネナガカメムシ、例えば、Ｂｌｉｓｓｕｓ ｌｅｕｃｏｐｔｅｒｕｓ ｌｅｕｃｏｐｔｅｒｕｓ；Ａｃｒｏｓｔｅｒｎｕｍ ｈｉｌａｒｅ、ミドリカメムシ；Ｅｕｓｃｈｉｓｔｕｓ ｓｅｒｖｕｓ、クサギカメムシ；Ｊｙｌｅｍｙａ ｐｌａｔｕｒａ、タネバエ；Ｍａｙｅｔｉｏｌａ ｄｅｓｔｒｕｃｔｏｒ、ヘシアンバエ；Ｐｅｔｒｏｂｉａ ｌａｔｅｎｓ、ホモノハダニ；アブラナ：Ｖｒｅｖｉｃｏｒｙｎｅ ｂｒａｓｓｉｃａｅ、ダイコンアブラムシ；Ｐｈｙｌｌｏｔｒｅｔａ ｃｒｕｃｉｆｅｒａｅ、アブラナノミハムシ（ｃｒｕｃｉｆｅｒ ｆｌｅａ ｂｅｅｔｌｅ）；Ｐｈｙｌｌｏｔｒｅｔａ ｓｔｒｉｏｌａｔａ、キスジノミハムシ；Ｐｈｙｌｌｏｔｒｅｔａ ｎｅｍｏｒｕｍ、カブスジノミハムシ（ｓｔｒｉｐｅｄ ｔｕｒｎｉｐ ｆｌｅａ ｂｅｅｔｌｅ）；Ｍｅｌｉｇｅｔｈｅｓ ａｅｎｅｕｓ、菜種
甲虫（ｒａｐｅｓｅｅｄ ｂｅｅｔｌｅ）；およびチビケシキスイ（ｐｏｌｌｅｎ ｂｅｅｔｌｅｓ）、Ｍｅｌｉｇｅｔｈｅｓ ｒｕｆｉｍａｎｕｓ、Ｍｅｌｉｇｅｔｈｅｓ ｎｉｇｒｅｓｃｅｎｓ、Ｍｅｌｉｇｅｔｈｅｓ ｃａｎａｄｉａｎｕｓ、およびＭｅｌｉｇｅｔｈｅｓ ｖｉｒｉｄｅｓｃｅｎｓ；ジャガイモ：Ｌｅｐｔｉｎｏｔａｒｓａ ｄｅｃｅｍｌｉｎｅａｔａ、コロラドハムシ；サツマイモ：Ｓｐａｒｔｏｃｅｒａ ｂａｔａｔａｓ、ジャイアントスイートポテトバグ（ｇｉａｎｔ ｓｗｅｅｔ ｐｏｔａｔｏ ｂｕｇ）；Ｃｈａｒｉｄｏｔｅｌｌａ（＝Ｍｅｔｒｉｏｎａ） ｂｉｃｏｌｏｒ、ゴールデントータスビートル（ｇｏｌｄｅｎ ｔｏｒｔｏｉｓｅ ｂｅｅｔｌｅ）；Ｃｙｌａｓ ｆｏｒｍｉｃａｒｉｕｓ、アリモドキゾウムシ；Ｃｙｌａｓ ｐｕｎｃｔｉｃｏｌｌｉｓ、アリモドキゾウムシ；Ｃｙｌａｓ ｂｒｕｎｎｅｕｓ、アリモドキゾウムシ、Ｎａｕｐａｃｔｕｓ（＝Ｇｒａｐｈｏｇｎａｔｈｕｓ） ｓｐｐ．、シロヘリクチブトゾウムシ（ｗｈｉｔｅｆｒｉｎｇｅｄ ｂｅｅｔｌｅ）；Ｃｏｎｏｄｅｒｕｓ ｒｕｄｉｓ、コメツキムシの幼虫；Ｃｏｎｏｄｅｒｕｓ ｓｃｉｓｓｕｓ、ラッカセイコメツキムシ（ｐｅａｎｕｔ ｗｉｒｅｗｏｒｍ）；Ｂｌｏｓｙｒｕｓ ｓｐｐ．、イモゾウムシ（ｒｏｕｇｈ ｓｗｅｅｔ ｐｏｔａｔｏ ｗｅｅｖｉｌ）；Ａｃｒａｅａ ａｃｅｒａｔａ、スイートポテトバタフライ（ｓｗｅｅｔ ｐｏｔａｔｏ ｂｕｔｔｅｒｆｌｙ）；Ａｇｒｉｕｓ ｃｏｎｖｏｌｖｕｌｉ、エビガラスズメ；Ｓｐｏｄｏｐｔｅｒａ ｅｘｉｇｕａ、アーミーワーム；Ｓｐｏｄｏｐｔｅｒａ ｅｒｉｄａｎｉａ、アーミーワーム；Ｓｙｎａｎｔｈｅｄｏｎ ｓｐｐ．、スカシバ（ｃｌｅａｒｗｉｎｇ ｍｏｔｈ）；ケダニ（Ｈａｉｒｉｎｅｓｓ ｍｉｔｅ）およびフシダニ（ｅｒｉｏｐｈｙｉｄ ｍｉｔｅ）；Ｅｕｓｃｅｐｅｓ ｐｏｓｔｆａｓｃｉａｔｕｓ，イモゾウムシ；Ｐｅｌｏｒｏｐｕｓ ｂａｔａｔａｅ、Ｐｅｌｏｒｏｐｕｓゾウムシ（Ｐｅｌｏｒｏｐｕｓ ｗｅｅｖｉｌ）；Ｏｍｐｈｉｓｉａ ａｎａｓｔｏｍａｓａｌｉｓ、サツマイモノメイガ、およびコガネムシ類の幼虫－オサムシ科昆虫（ｓｃａｒａｂｉｄ ｂｅｅｔｌｅ）の種々の種の幼虫。

いくつかの実施形態において、本明細書で提供される組成物および方法は、線虫植物有害生物を制御する。線虫としては、以下を含む、寄生性線虫（例えば、ネコブセンチュウ、シストセンチュウ、およびネグサレセンチュウ（ｌｅｓｉｏｎ ｎｅｍａｔｏｄｅｓ）：サツマイモネコブセンチュウ（Ｍｅｌｏｉｄｏｇｙｎｅ ｉｎｃｏｇｎｉｔａ）、ジャワネコブセンチュウ（Ｍｅｌｏｉｄｏｇｙｎｅ ｊａｖａｎｉｃａ）、キタネコブセンチュウ（Ｍｅｌｏｉｄｏｇｙｎｅ ｈａｐｌａ）およびアレナリアネコブセンチュウ（Ｍｅｌｏｉｄｏｇｙｎｅ ａｒｅｎａｒｉａ）のようなＭｅｌｏｉｄｏｇｙｎｅ種の線虫；Ｄｉｔｙｌｅｎｃｈｕｓ ｄｅｓｔｒｕｃｔｏｒおよびＤｉｔｙｌｅｎｃｈｕｓ ｄｉｐｓａｃｉのようなＤｉｔｙｌｅｎｃｈｕｓ種の線虫；キタネグサレセンチュウ（Ｐｒａｔｙｌｅｎｃｈｕｓ ｐｅｎｅｔｒａｎｓ）、キクネグサレセンチュウ（Ｐｒａｔｙｌｅｎｃｈｕｓ ｆａｌｌａｘ）、Ｐｒａｔｙｌｅｎｃｈｕｓ ｃｏｆｆｅａｅ、Ｐｒａｔｙｌｅｎｃｈｕｓ ｌｏｏｓｉおよびクルミネグサレセンチュウ（Ｐｒａｔｙｌｅｎｃｈｕｓ ｖｕｌｎｕｓ）のようなＰｒａｔｙｌｅｎｃｈｕｓ種の線虫；Ｇｌｏｂｏｄｅｒａ ｒｏｓｔｏｃｈｉｅｎｓｉｓおよびＧｌｏｂｏｄｅｒａ ｐａｌｌｉｄａのようなＧｌｏｂｏｄｅｒａ種の線虫；Ｈｅｔｅｒｏｄｅｒａ ｇｌｙｃｉｎｅｓ（ダイズシストセンチュウ）；Ｈｅｔｅｒｏｄｅｒａ ｓｃｈａｃｈｔｉｉ（テンサイシストセンチュウ）；Ｈｅｔｅｒｏｄｅｒａ ａｖｅｎａｅ（ムギシストセンチュウ）のようなＨｅｔｅｒｏｄｅｒａ種の線虫；イネシンガレセンチュウ（Ａｐｈｅｌｅｎｃｈｏｉｄｅｓ ｂｅｓｓｅｙｉ）、Ａｐｈｅｌｅｎｃｈｏｉｄｅｓ ｒｉｔｚｅｍａｂｏｓｉおよびＡｐｈｅｌｅｎｃｈｏｉｄｅｓ ｆｒａｇａｒｉａｅのようなＡｐｈｅｌｅｎｃｈｏｉｄｅｓ種の線虫；Ａｐｈｅｌｅｎｃｈｕｓ ａｖｅｎａｅのようなＡｐｈｅｌｅｎｃｈｕｓ種の線虫；バナナネモグリセンチュウ（Ｒａｄｏｐｈｏｌｕｓ ｓｉｍｉｌｉｓ）のようなＲａｄｏｐｈｏｌｕｓ種の線虫；Ｔｙｌｅｎｃｈｕｌｕｓ ｓｅｍｉｐｅｎｅｔｒａｎｓのようなＴｙｌｅｎｃｈｕｌｕｓ種の線虫；Ｒｏｔｙｌｅｎｃｈｕｌｕｓ ｒｅｎｉｆｏｒｍｉｓのようなＲｏｔｙｌｅｎｃｈｕｌｕｓ種の線虫；Ｂｕｒｓａｐｈｅｌｅｎｃｈｕｓ ｘｙｌｏｐｈｉｌｕｓおよびレッドリングセンチュウ（Ｒｅｄ Ｒｉｎｇ Ｎｅｍａｔｏｄｅ）（Ｂｕｒｓａｐｈｅｌｅｎｃｈｕｓ ｃｏｃｏｐｈｉｌｕｓ）などのような木の中で生活するセンチュウ、ならびにＧｌｏｂｏｄｅｒａ ｓｐｐ．；特に、シストセンチュウのメンバー（Ｇｌｏｂｏｄｅｒａ ｒｏｓｔｏｃｈｉｅｎｓｉｓおよびＧｌｏｂｏｄｅｒａ ｐａｉｌｉｄａ（ジャガイモシストセンチュウ）が挙げられるが、これらに限定されない）；ラセンセンチュウ（Ｓｐｉｒａｌ）（Ｈｅｌｉｃｏｔｙｌｅｎｃｈｕｓ ｓｐｐ．）；バナナネモグリセンチュウ（Ｂｕｒｒｏｗｉｎｇ）（Ｒａｄｏｐｈｏｌｕｓ ｓｉｍｉｌｉｓ）；ナミクキセンチュウ（Ｄｉｔｙｌｅｎｃｈｕｓ ｄｉｐｓａｃｉ）；ニセフクロセンチュウ（Ｒｏｔｙｌｅｎｃｈｕｌｕｓ ｒｅｎｉｆｏｒｍｉｓ）；オオハリセンチュウ（Ｄａｇｇｅｒ）（Ｘｉｐｈｉｎｅｍａ ｓｐｐ．）；花芽および葉センチュウ（Ｂｕｄ ａｎｄ ｌｅａｆ）（Ａｐｈｅｌｅｎｃｈｏｉｄｅｓ ｓｐｐ．）；ならびにマツノザイセンチュウ（Ｂｕｒｓａｐｈｅｌｅｎｃｈｕｓ ｘｙｌｏｐｈｉｌｕｓ）が挙げられる。ネグサレセンチュウとしては、Ｐｒａｔｙｌｅｎｃｈｕｓ ｓｐｐ．が挙げられる。用語「線虫」とは、卵、幼虫、幼若形態および成熟形態の線虫を包含する。

細菌株もしくはその活性改変体および／またはこれらに由来する組成物は、有害生物に対して、任意の発生ステージ（発生初期段階を含む）に、例えば、幼虫もしくは他の未成熟形態として、農薬活性に関して試験され得る。例えば、昆虫有害生物の幼虫は、約２０℃～約３０℃および約３０％～約７０％の相対湿度において、完全に遮光して飼育され得る。バイオアッセイは、Ｃｚａｐｌａ ａｎｄ Ｌａｎｇ （１９９０） Ｊ． Ｅｃｏｎ． Ｅｎｔｏｍｏｌ． ８３ （６）： ２４８０－２４８５に記載されるとおりに行われ得る。昆虫の幼虫を飼育し、バイオアッセイを行うための方法は、当業者に周知である。

具体的実施形態において、本明細書で提供される細菌株は、１種もしくはこれより多くの昆虫または昆虫有害生物を標的とするものである。例えば、本明細書で提供される種々の細菌株は、植物に損傷を引き起こす１種もしくはこれより多くの昆虫有害生物を標的とする。例えば、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体のうちのいずれかは、１種、２種、３種、４種、５種、またはこれより多くの本明細書で記載される昆虫有害生物に対して殺昆虫活性を有し得る。

具体的実施形態において、細菌株ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体の細胞、または胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせは、昆虫または線虫有害生物を制御する。従って、いくつかの実施形態において、本明細書で開示される植物有害生物は、鞘翅目の昆虫有害生物である。例えば、細菌株ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体の細胞、または胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせは、コーンルートワーム、コロラドハムシ、およびゾウムシを制御し得る。具体的実施形態において、細菌株ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体の細胞は、ウェスタンコーンルートワーム、コロラドハムシ、および／またはアリモドキゾウムシに対して活性を有し得る。特定の実施形態において、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体は、ネコブセンチュウおよびミナミアオカメムシに対して活性を有し得る。

本明細書で開示される方法および組成物は、１種もしくはこれより多くの細菌病原体を制御するために使用され得る。細菌病原体は、Ｅｒｗｉｎｉａ ｓｐｐ．（例えば、Ｅｒｗｉｎｉａ ａｍｙｌｏｖｏｒａ）、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｓｐｐ．（例えば、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｓｙｒｉｎｇａｅ ｐｖ． ｐｈａｓｅｏｌｉｃｏｌａ）、Ｒａｌｓｔｏｎｉａ ｓｐｐ．（例えば、Ｒａｌｓｔｏｎｉａ ｓｏｌａｎａｃｅａｒｕｍ）、Ｘａｎｔｈｏｍｏｎａｓ ｓｐｐ．（例えば、Ｘａｎｔｈｏｍｏｎａｓ ｖｅｓｉｃａｔｏｒｉａ）、およびＳｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ ｓｐｐ．（例えば、Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ ｓｃａｂｉｅｓ）からなる群より選択される細菌種であり得るが、これらに限定されない。本明細書で開示される方法および組成物はまた、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ ｓｐｐ．（例えば、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ ｅｎｔｅｒｉｃａ）および／またはＥｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｓｐｐ．（例えば、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ）を制御するために使用され得る。

本明細書で開示される方法および組成物は、１種もしくはこれより多くの真菌有害生物を制御するために使用され得る。真菌有害生物、以下からなる群より選択される真菌であり得るが、これらに限定されない：Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｓｐｐ．、Ｂｏｔｒｙｔｉｓ ｓｐｐ．、Ｂｏｔｒｙｔｉｓ ｃｉｎｅｒｅａ、Ｃｅｒｓｏｓｐｏｒａ ｓｐｐ．、Ｃｅｒｃｏｓｐｏｒａ ｓｏｊｉｎａ、Ｃｅｒｃｏｓｐｏｒａ ｂｅｔｉｃｏｌａ、Ａｌｔｅｒｎａｒｉａ ｓｐｐ．、Ａｌｔｅｒｎａｒｉａ ｓｏｌａｎｉ、Ｒｈｉｚｏｃｔｏｎｉａ ｓｐｐ．、Ｒｈｉｚｏｃｔｏｎｉａ ｓｏｌａｎｉ、Ｂｌｕｍｅｒｉａ ｇｒａｍｉｎｉｓ ｆ． ｓｐ． Ｔｒｉｔｉｃｉ、Ｅｒｙｓｉｐｈｅ ｎｅｃａｔｏｒ、Ｐｏｄｏｓｐｈａｅｒａ ｘａｎｔｈｉｉ、Ｇｏｌｏｖｉｎｏｍｙｃｅｓ ｃｉｃｈｏｒａｃｅａｒｕｍ、Ｅｒｙｓｉｐｈｅ ｌａｇｅｒｓｔｒｏｅｍｉａｅ、Ｓｐｈａｅｒｏｔｈｅｃａ ｐａｎｎｏｓａ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｃｅｒｅａｌｅ、Ａｐｉｏｇｎｏｍｏｎｉａ ｅｒｒａｂｕｎｄａ、Ａｐｉｏｇｎｏｍｏｎｉａ ｖｅｎｅｔａ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｓｐｐ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｇｌｏｅｏｓｐｏｒｉｏｄｅｓ、Ｄｉｓｃｕｌａ ｆｒａｘｉｎｅａ、Ｍｙｃｏｓｐｈａｅｒｅｌｌａ ｓｐｐ．、Ｐｈｏｍｏｐｓｉｓ ｓｐｐ．、Ｐｌａｓｍｏｐａｒａ ｖｉｔｉｃｏｌａ、Ｐｓｅｕｄｏｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｃｕｂｅｎｓｉｓ、Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｂｅｌｂａｈｒｉｉ、Ｂｒｅｍｉａ ｌａｃｔｕｃａｅ、Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｌａｍｉｉ、Ｐｌａｓｍｏｐａｒａ ｏｂｄｕｓｃｅｎｓ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｓｐｐ．、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｃｒｙｐｔｏｉｒｒｅｇｕｌａｒｅ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ａｐｈａｎｉｄｅｒｍａｔｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｉｒｒｅｇｕｌａｒｅ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｓｙｌｖａｔｉｃｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｍｙｒｉｏｔｙｌｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｕｌｔｉｍｕｍ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｓｐｐ．、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｃａｐｓｉｃｉ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｎｉｃｏｔｉａｎａｅ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｉｎｆｅｓｔａｎｓ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｓｏｊａｅ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｓｐｐ．、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｇｒａｍｉｎｅａｒｕｍ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｓｏｌａｎｉ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｏｘｙｓｐｏｒｕｍ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｇｒａｍｉｎｉｃｏｌａ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｖｉｒｇｕｌｉｆｏｒｍｅ、Ｇｉｂｂｅｒｅｌｌａ ｚｅａｅ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｇｒａｍｉｎｉｃｏｌａ、Ｐｅｎｉｃｉｌｌｉｕｍ ｓｐｐ．、Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｓｐｐ．、Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｍｅｉｂｏｍｉａｅ、Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｐａｃｈｙｒｉｚｉ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｔｒｉｔｉｃｉｎａ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｒｅｃｏｎｄｉｔａ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｓｔｒｉｉｆｏｒｍｉｓ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｇｒａｍｉｎｉｓ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｓｐｐ．、Ｓｃｌｅｒｏｔｉｕｍ ｓｐｐ．、Ｓｃｌｅｒｏｔｉｎｉａ ｓｐｐ．、Ｖｅｎｔｕｒｉａ ｉｎａｅｑｕａｌｉｓ、Ｖｅｒｔｉｃｉｌｌｉｕｍ ｓｐｐ．、Ｅｒｗｉｎｉａ ａｍｙｌｏｖｏｒａ、Ｍｏｎｉｌｉｎｉａ ｓｐｐ．、Ｍｏｎｉｌｉｎｉａ ｆｒｕｃｔｉｃｏｌａ、Ｍｏｎｉｌｉｎｉａ ｌａｘ、およびＭｏｎｉｌｉｎｉａ ｆｒｕｃｔｉｇｅｎａ。

いくつかの実施形態において、上記真菌有害生物は、Ｂｏｔｒｙｔｉｓ ｃｉｎｅｒｅａ、Ｃｅｒｃｏｓｐｏｒａ ｓｏｊｉｎａ、Ａｌｔｅｒｎａｒｉａ ｓｏｌａｎｉ、Ｒｈｉｚｏｃｔｏｎｉａ ｓｏｌａｎｉ、Ｅｒｙｓｉｐｈｅ ｎｅｃａｔｏｒ、Ｐｏｄｏｓｐｈａｅｒａ ｘａｎｔｈｉｉ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｃｅｒｅａｌｅ、Ｐｌａｓｍｏｐａｒａ ｖｉｔｉｃｏｌａ、Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｂｅｌｂａｈｒｉｉ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ａｐｈａｎｉｄｅｒｍａｔｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｓｙｌｖａｔｉｃｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｍｙｒｉｏｔｙｌｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｕｌｔｉｍｕｍ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｎｉｃｏｔｉａｎａｅ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｉｎｆｅｓｔａｎｓ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｓｏｊａｅ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｇｒａｍｉｎｅａｒｕｍ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｓｏｌａｎｉ、Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｐａｃｈｙｒｉｚｉ、およびＶｅｎｔｕｒｉａ ｉｎａｅｑｕａｌｉｓからなる群より選択される。

さらなる実施形態において、上記真菌病原体は、Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｓｐ．（Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｐａｃｈｙｒｈｉｚｉおよび／またはＰｈａｋｏｐｓｏｒａ ｍｅｉｂｏｍｉａｅを含む）である。

真菌有害生物によって引き起こされる真菌の植物状態および病気の例としては、アジア型ダイズさび病（ＡＳＲ）、灰色カビ病、斑点病、ダイズ斑点病、夏疫病、立ち枯れ病（Ｄａｍｐｉｎｇ ｏｆｆ ｃｏｍｐｌｅｘ）、ブラウンパッチ、黒あざ病、根腐れ、ベリーロット（ｂｅｌｌｙ ｒｏｔ）、紋枯れ病、うどんこ病、炭疽病（Ａｎｔｈｒａｃｎｏｓｅ ｌｅａｆ ｓｐｏｔ）、ベト病、ピシウム病、疫病（Ｌａｔｅ Ｂｌｉｇｈｔ）、赤カビ病（Ｆｕｓａｒｉｕｍ Ｈｅａｄ Ｂｌｉｇｈｔ）、急性枯死症（ＳＤＳ）、萎凋病（Ｆｕｓａｒｉｕｍ Ｗｉｌｔ）、腰折れ病（Ｃｏｒｎ Ｓｔａｌｋ Ｒｏｔ）、赤さび病、黒さび病、黄さび病、コムギさび病（Ｗｈｅａｔ Ｒｕｓｔ）、さび病、リンゴ黒星病、バーティシリウム萎凋病、火傷病、および灰星病が挙げられるが、これらに限定されない。

Ｂ．植物有害生物を制御する方法、および植物の病気を処理または防止する方法
植物有害生物を制御するための方法が、本明細書で提供され、上記方法は、有効量の、少なくとも１種の本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物を植物に適用する工程であって、ここで上記細菌株および／またはこれらに由来する組成物は、上記植物有害生物（例えば、昆虫または線虫有害生物）を制御する工程を包含する。植物有害生物に対する感受性を低減する、および／または植物有害生物への抵抗性を増大させる方法がまた、本明細書で提供され、上記方法は、植物有害生物、植物有害生物によって引き起こされる植物の病気もしくは損傷を有するか、または植物有害生物によって引き起こされる植物の病気もしくは損傷を発生させるリスクにある植物に、有効量の、少なくとも１種の本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物を適用する工程であって、ここで上記細菌株および／またはこれらに由来する組成物は、上記植物有害生物を制御する工程を包含する。植物の病気または損傷を処理または防止する方法が、本明細書で提供され、上記方法は、植物の病気もしくは損傷を有するか、または植物の病気もしくは損傷を発生させるリスクにある植物に、有効量の、少なくとも１種の本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物を適用する工程であって、ここで上記細菌株および／またはこれらに由来する組成物は、上記植物の病気もしくは損傷を引き起こす植物有害生物を制御する工程を包含する。特定の実施形態において、上記植物の損傷は、昆虫有害生物（例えば、甲虫類有害生物）によって引き起こされる。ある特定の実施形態において、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体は、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つの細胞；あるいはＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１つに由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせを含み得る。いくつかの実施形態において、上記細菌株もしくはその活性改変体の有効量は、少なくとも約１０^１２～１０^１６ ＣＦＵ／ヘクタールまたは少なくとも約１０^４～１０^１６ ＣＦＵ／ヘクタール、または少なくとも約１０^５～１０^１１ ＣＦＵ／ヘクタールを含む。いくつかの実施形態において、上記組成物は、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つの細胞；あるいはＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１つに由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせを含み得る、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体に由来する。

本明細書で提供される細菌株、その活性改変体、またはこれらに由来する組成物のうちのいずれかは、本明細書で記載される１種、２種、３種、４種、５種、もしくはこれより多くの植物有害生物を制御し得る。いくつかの方法において、上記細菌株は、１種、２種、３種、４種、５種、もしくはこれより多くの昆虫有害生物（例えば、甲虫類有害生物）を制御する。いくつかの実施形態において、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体のうちのいずれかは、昆虫有害生物および他の植物有害生物（真菌、ウイルスもしくはウイロイド、細菌、昆虫、線虫、および原生動物有害生物を含む）の組み合わせに対して活性を有し得る。本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体は、目的の植物有害生物に対して感受性である任意の植物種とともに使用され得る。

例示的な植物有害生物によって引き起こされる病気の例は、表１に提供される。上記有害生物によって引き起こされる植物の病気に感受性である非限定的な例示的作物種もまた、提供される。例えば、表１は、Ｂｏｒｔｒｙｔｉｓ ｃｉｎｅｒｅａが、全ての開花作物に対して灰色カビ病を引き起こすことを示す。従って、Ｂｏｒｔｒｙｔｉｓ ｃｉｎｅｒｅａを制御する、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体は、植物における灰色カビ病を処理または防止するために、灰色カビ病を有するかまたは灰色カビ病を発生させるリスクのある植物に適用され得る。同様に、表１は、Ｒｈｉｚｏｃｔｏｎｉａ ｓｏｌａｎｉが、トウモロコシにおいて立ち枯れ病を、ダイズにおいて立ち枯れ病を、芝においてブラウンパッチを、および観賞植物において立ち枯れ病を引き起こすことを示す。従って、Ｒｈｉｚｏｃｔｏｎｉａ ｓｏｌａｎｉを制御する本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体は、植物において立ち枯れ病および／もしくはブラウンパッチを処理または防止するために、立ち枯れ病および／もしくはブラウンパッチを有するか、または立ち枯れ病および／もしくはブラウンパッチを発生させるリスクのある植物に適用され得る。さらに別の例において、表１は、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｃｅｒｅａｌｅ、Ａｐｉｏｇｎｏｍｏｎｉａ ｅｒｒａｂｕｎｄａ、Ａｐｉｏｇｎｏｍｏｎｉａ ｖｅｎｅｔａ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｇｌｏｅｏｓｐｏｒｉｏｄｅｓ、Ｄｉｓｃｕｌａ ｆｒａｘｉｎｅａが炭疽病を引き起こすことを示す。従って、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｃｅｒｅａｌｅ、Ａｐｉｏｇｎｏｍｏｎｉａ ｅｒｒａｂｕｎｄａ、Ａｐｉｏｇｎｏｍｏｎｉａ ｖｅｎｅｔａ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｇｌｏｅｏｓｐｏｒｉｏｄｅｓ、Ｄｉｓｃｕｌａ ｆｒａｘｉｎｅａのうちの１種もしくはこれより多くを制御する本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体は、植物において、炭疽病を処理または防止するために、炭疽病を有するかまたは炭疽病を有するリスクのある植物に適用され得る。
表１

具体的実施形態において、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体は、１種もしくはこれより多くの線虫有害生物を制御する。例えば、上記細菌株もしくはその活性改変体は、ネコブセンチュウ（Ｍｅｌｏｉｄｏｇｙｎｅ ｓｐｐ．）を制御または処理し得る。植物寄生性線虫は、植物の根、茎、葉および花を攻撃し得る。全ての植物寄生性線虫は、口針といわれる穿刺用口器を有する。口針の存在は、植物寄生性線虫を全ての他のタイプの線虫から区別する重要な診断上のしるしである。線虫の攻撃を示す代表的な根の症状は、根瘤または虫こぶ、根腐れ、過剰な根の分枝、傷害された根端および発育が妨げられた根系である。根の感染を示す地上の植物部分に関する症状は、植物全体の緩慢な衰弱、十分な土壌水分があるにもかかわらずしおれる、葉の黄変および葉が少なく小さくなる、である。これらは、実際に、適切に機能している根系が奪われた植物において出現する症状である。クキセンチュウは、茎の腫脹および節間の短縮化を生じる。花芽および葉センチュウ（Ｂｕｄ ａｎｄ ｌｅａｆ ｎｅｍａｔｏｄｅｓ）は、花芽および葉組織をゆがめ、死滅させる。ＳＣＮに伴うようないくつかの場合には、目に見える症状なしに、収量喪失が起こり得る。

用語「処理する（ｔｒｅａｔ）」または「処理すること（ｔｒｅａｔｉｎｇ）」またはその派生語は、ある状態の進行を実質的に阻害するか、遅らせるかまたは逆転させる（ｒｅｖｅｒｓｅ）こと、ある状態の症状を実質的に改善すること、あるいは植物の病気を引きおこす、昆虫有害生物、または病原体もしくは有害生物によってもたらされる症状もしくは状態の出現を実質的に防止することを包含する。

用語植物有害生物を「制御すること（ｃｏｎｔｒｏｌｌｉｎｇ）」とは、植物有害生物の成長、摂食、生産力、生殖、および／もしくは増殖を阻害するかもしくは低減する；または植物有害生物を死滅させる（例えば、疾病率もしくは死滅率、または生産力の低減の原因となる）、のうちの１もしくはこれより多くをいう。よって、本明細書で提供される細菌株および／またはこれらに由来する組成物で処理した植物は、統計的に有意な量が低減した有害生物の外寄生、または有害生物によって引き起こされる低減した損傷を示し得る。特定の実施形態において、有害生物から植物を「制御する」および「防御する（ｐｒｏｔｅｃｔｉｎｇ）」とは、有害生物の成長、発芽、生殖、および／もしくは増殖を阻害するかまたは低減する；ならびに／または有害生物を死滅させる、除去する、破壊する、もしくは別の方法で有害生物の存在および／もしくは活性を減少させる、のうちの１もしくはこれより多くをいう。よって、本明細書で提供される細菌株および／またはこれらに由来する組成物で処理した植物は、統計的に有意な量で、植物有害生物の存在下で低減した病気もしくは損傷の重篤度または低減した病気もしくは損傷の発生を示し得る。

用語「防止する」およびそのバリエーションは、細菌、真菌、ウイルス、昆虫もしくは他の有害生物の成長、増殖、外寄生、胞子発芽、および菌糸成長に先だって阻止することを意味する。この場合に、上記組成物は、その植物有害生物に曝露される前に適用される。

用語「改善する（ａｍｅｌｉｏｒａｔｅ）」および「改善（ａｍｅｌｉｏｒａｔｉｏｎ）」とは、本明細書で提供される組成物および方法によってもたらされる処理された植物の状態における改善（ｉｍｐｒｏｖｅｍｅｎｔ）に関する。上記改善は、有害生物の成長の減少および／または損傷したもしくは罹患した植物の高さ、重量、葉の数、根系、もしくは収量の改善という形態において現れ得る。一般に、上記用語は、損傷したもしくは罹患した植物の生理学的状態の改善をいう。

用語「阻害する（ｉｎｈｉｂｉｔ）」およびこの用語の全てのバリエーションは、細菌、真菌、ウイルス、線虫、昆虫、または任意の他の有害生物の成長、ならびに胞子発芽の制限もしくは禁止を包含することが意図される。

用語「排除する」とは、本発明の組成物と接触させることによって、必要に応じて、以下で記載される本の方法に従って、細菌、真菌、ウイルス、線虫、昆虫、または任意の他の有害生物の実質的な根絶または除去に関連する。

用語「遅らせる（ｄｅｌａｙ）」、「遅延させる（ｒｅｔａｒｄ）」、およびこれらの全てのバリエーションは、細菌、真菌、ウイルス、線虫、昆虫、または任意の他の有害生物の成長、ならびに胞子発芽の進行を遅くすることを包含することが意図される。表現「開始を遅らせる（ｄｅｌａｙｉｎｇ ｔｈｅ ｏｎｓｅｔ）」とは、細菌、真菌、ウイルス、線虫、昆虫、または任意の他の有害生物の成長、外寄生、感染、胞子発芽、および菌糸成長が、本発明に従う処理の非存在下で、発生に沿ってほぼ進行していないか、またはより遅く現れるように、上記細菌、真菌、ウイルス、線虫、昆虫、または任意の他の有害生物の成長、外寄生、感染、胞子発芽、および菌糸成長の進行をある期間にわたって防止するかまたは遅くすると解釈される。

本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体で処理される植物、植物部分、または栽培地は、統計的に有意な量で、植物有害生物の存在下で低減した病気もしくは損傷の重篤度または低減した病気もしくは損傷の発生を示し得る。低減した病気もしくは損傷の重篤度または低減した病気もしくは損傷の発生は、非処理コントロール植物と比較した場合に、約１０％～約２０％、約２０％～約３０％、約３０％～約４０％、約４０％～約５０％、約５０％～約６０％、約６０％～約７０％、約７０％～約８０％、約８０％～約９０％、または約９０％～約１００％の低減であり得る。他の場合では、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体で処理される植物は、植物有害生物の存在下で、非処理コントロール植物と比較した場合に、少なくとも約１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４４％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または約１００％多く、低減した病気もしくは損傷の重篤度または低減した病気もしくは損傷の発生を示し得る。植物の損傷もしくは病気の重篤度を評価するための方法は公知であり、損傷もしくは罹患した葉の面積のパーセンテージを測定すること（Ｇｏｄｏｙら （２００６） Ｆｉｔｏｐａｔｏｌ． Ｂｒａｓ． ３１（１） ６３－６８）または夏胞子層の数を測定することを含む。

本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体で処理される植物、植物部分、または栽培地は、昆虫および／または線虫有害生物を含む植物有害生物の低減を示し得る。植物有害生物の低減は、非処理コントロール植物と比較した場合に、約１０％～約２０％、約２０％～約３０％、約３０％～約４０％、約４０％～約５０％、約５０％～約６０％、約６０％～約７０％、約７０％～約８０％、約８０％～約９０％、または約９０％～約１００％の低減であり得る。他の場合では、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体で処理される植物は、非処理コントロール植物と比較した場合に、少なくとも約１０％、１１％、１２％、１３％、１４％、１５％、１６％、１７％、１８％、１９％、２０％、２１％、２２％、２３％、２４％、２５％、２６％、２７％、２８％、２９％、３０％、３１％、３２％、３３％、３４％、３５％、３６％、３７％、３８％、３９％、４０％、４１％、４２％、４３％、４４％、４５％、４６％、４７％、４８％、４９％、５０％、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または約１００％多い、植物有害生物の低減を示し得る。植物有害生物の数を測定するための方法は公知であり、有害生物の数を計数すること、または植物と１種もしくはこれより多くの有害生物とを接触させること、ならびに上記植物が生存するおよび／または上記有害生物の死滅を引き起こす能力を決定することを含む。例えば、Ｃｚａｐｌａ ａｎｄ Ｌａｎｇ， （１９９０） Ｊ． Ｅｃｏｎ． Ｅｎｔｏｍｏｌ． ８３：２４８０－２４８５； Ａｎｄｒｅｗｓ，ら， （１９８８） Ｂｉｏｃｈｅｍ． Ｊ． ２５２：１９９－２０６； Ｍａｒｒｏｎｅ，ら， （１９８５） Ｊ． ｏｆ Ｅｃｏｎｏｍｉｃ Ｅｎｔｏｍｏｌｏｇｙ ７８：２９０－２９３および米国特許第５，７４３，４７７号（これらは全て、それらの全体において本明細書に参考として援用される）を参照のこと。

いくつかの実施形態において、本明細書で提供される細菌株およびその活性改変体、ならびに／またはこれらに由来する組成物は、昆虫有害生物に対して農薬活性（すなわち、殺昆虫活性）を有する。これらの実施形態のうちのいくつかにおいて、上記殺昆虫活性は、甲虫類の種に対する活性である。１つの実施形態において、上記殺昆虫活性は、鱗翅類昆虫に対するものである。１つの実施形態において、上記殺昆虫活性は、半翅類の種に対するものである。いくつかの実施形態において、上記殺昆虫活性は、１種もしくはこれより多くの昆虫有害生物（例えば、ウェスタンコーンルートワーム、サザンコーンルートワーム、ノーザンコーンルートワーム、メキシココーンルートワーム、コロラドハムシ、アリモドキゾウムシ、またはミナミアオカメムシ）に対するものである。

具体的実施形態において、本明細書で提供される細菌株、その活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物は、植物有害生物から生じる損傷または病気の症状を、統計的に有意な量（例えば、少なくとも約１０％～少なくとも約２０％、少なくとも約２０％～約５０％、少なくとも約１０％～約６０％、少なくとも約３０％～約７０％、少なくとも約４０％～約８０％、もしくは少なくとも約５０％～約９０％またはこれより多くを含む）低減する。よって、本発明の方法は、植物有害生物によって引き起こされる病気または損傷から植物を防御するために利用され得る。

有害生物の外寄生後の損傷または病気の抵抗性を定量するアッセイは、当該分野で一般に公知である。例えば、米国特許第５，６１４，３９５号（本明細書に参考として援用される）を参照のこと。このような技術は、経時的に、平均病変部直径、有害生物バイオマス、および衰えた植物組織の全体的なパーセンテージを測定することを含む。例えば、農薬性ポリペプチドを発現するかまたは農薬組成物がその表面に適用されているかのいずれかである植物は、上記農薬組成物に曝されなかったコントロール植物と比較した場合に、有害生物チャレンジ後の組織壊死（すなわち、病変部直径）の減少または植物の死滅の減少を示す。あるいは、農薬活性は、有害生物バイオマスの減少によって測定され得る。例えば、農薬性ポリペプチドを発現するかまたは農薬組成物に曝された植物は、目的の有害生物でチャレンジされる。経時的に、その有害生物が外寄生した組織に由来する組織サンプルが得られ、ＲＮＡが抽出される。植物特異的転写物のレベルに対する特異的有害生物ＲＮＡ転写物のパーセンテージは、有害生物バイオマスのレベルを決定することを可能にする。例えば、Ｔｈｏｍｍａら （１９９８） Ｐｌａｎｔ Ｂｉｏｌｏｇｙ ９５：１５１０７－１５１１１（本明細書に参考として援用される）を参照のこと。

さらに、インビトロ農薬アッセイは、例えば、種々の濃度の農薬組成物を紙のディスクに添加すること、およびそのディスクを目的の有害生物の懸濁物を含むアガー上に配置することを含む。インキュベーションの後、透明な阻害ゾーンが、上記農薬組成物の有効濃度を含むディスクのまわりに発生する（Ｌｉｕら （１９９４） Ｐｌａｎｔ Ｂｉｏｌｏｇｙ ９１：１８８８－１８９２（本明細書に参考として援用される））。さらに、顕微分光測光法による分析が、組成物のインビトロ農薬特性を測定するために使用され得る（Ｈｕら （１９９７） Ｐｌａｎｔ Ｍｏｌ． Ｂｉｏｌ． ３４：９４９－９５９およびＣａｍｍｕｅら （１９９２） Ｊ． Ｂｉｏｌ． Ｃｈｅｍ． ２６７： ２２２８－２２３３（その両方が、本明細書に参考として援用される））。

Ｃ．植物において有害生物および／もしくは病気の抵抗性を誘導ならびに／または目的の農学上の形質を改善するための方法
植物において有害生物および／または病気の抵抗性を誘導するための組成物および方法であって、ここで上記病気は、植物有害生物によって引き起こされるものがまた、提供される。よって、上記組成物および方法はまた、真菌有害生物、ウイルス、線虫、および昆虫を含む、任意のタイプの植物有害生物に対して植物を防御するにあたって有用である。植物有害生物による感染もしくは外寄生、または植物有害生物によって引きおこされる植物の病気に感受性である植物に、少なくとも１種の本明細書で提供される細菌株、その活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物の有効量を適用する工程を包含する、植物有害生物に対する抵抗性を誘導するための方法が、本明細書で提供される。ある特定の実施形態において、本明細書で提供される細菌株、その活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物は、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つの細胞；あるいはＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１つに由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせを含み得る。ある特定の実施形態において、本明細書で提供される細菌株、その活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物は、植物の病気または損傷を引き起こす有害生物への防御応答を増進する。いくつかの実施形態において、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体の有効量は、少なくとも約１０^５～１０^１２ ＣＦＵ／ヘクタールを含む。いくつかの実施形態において、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体の有効量は、少なくとも約１０^１２～１０^１６ ＣＦＵ／ヘクタールを含む。

植物における防御応答は、本明細書で提供される細菌株、その活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物を上記植物に適用した後であるが、有害生物チャレンジ前および／または本明細書で提供される細菌株、その活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物で処理した植物の有害生物チャレンジ後に、誘発され得る。

いくつかの方法では、本明細書で提供される細菌株、その活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物は、１種、２種、３種、４種、５種もしくはこれより多くの本明細書で記載される植物有害生物への抵抗性を誘導する。他の方法では、本明細書で提供される細菌株、その活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物は、１種、２種、３種、４種、５種もしくはこれより多くの本明細書で記載される昆虫有害生物、真菌植物有害生物、または線虫有害生物への抵抗性を誘導する。

「病気の抵抗性（ｄｉｓｅａｓｅ ｒｅｓｉｓｔａｎｃｅ）」とは、植物が、植物－有害生物相互作用から生じる病気の症状を回避することを意図される。すなわち、有害生物は、植物の病気およびその関連する病気の症状を引きおこすことを防止されるか、または代わりに、上記有害生物によって引きおこされる病気の症状が、コントロ－ルと比較して、最小限にされるかまたは低減される。「有害生物抵抗性（ｐｅｓｔ ｒｅｓｉｓｔａｎｃｅ）」とは、植物が、有害生物による植物の感染または外寄生から生じる症状を回避することを意図され得る。すなわち、有害生物は、植物の病気およびその関連する病気の症状を引きおこすことを防止されるか、または代わりに、上記有害生物によって引きおこされる病気の症状が、コントロ－ルと比較して、最小限にされるかまたは低減される。さらに提供されるのは、少なくとも１種の本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体またはその活性誘導体の有効量を植物に適用する工程を包含する、植物の健康状態を改善するおよび／または目的の農学上の形質を改善するための方法である。ある特定の実施形態において、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体は、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つの細胞；あるいはＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１つに由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせを含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体の有効量は、少なくとも約１０^５～１０^１２ ＣＦＵ／ヘクタールを含む。いくつかの実施形態において、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体の有効量は、少なくとも約１０^１２～１０^１６ ＣＦＵ／ヘクタールを含む。いくつかの実施形態において、上記組成物は、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つの細胞；あるいはＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１つに由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせを含み得る、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体に由来する。

特定の実施形態において、本明細書で記載される細菌株もしくはその活性改変体によって改善される目的の農学上の形質は、改善された植物の健康状態である。「改善された植物の健康状態（ｉｍｐｒｏｖｅｄ ｐｌａｎｔ ｈｅａｌｔｈ）」とは、いくつか挙げると、植物の増大した生長および／もしくは収量、増大したストレス耐性および／もしくは低下した除草剤抵抗性を意味する。増大したストレス耐性とは、植物が１種もしくはこれより多くのストレスと関連する症状を低減または防止する能力の増大をいう。上記ストレスは、有害生物（例えば、細菌、ウイルス、真菌、寄生生物）、昆虫、線虫、雑草、栽培されたもしくは自生の植物のような他の生きている生物によって植物に与えられる損傷の結果として起こる生物的ストレスであり得る。上記ストレスはまた、極端な温度（高いまたは低い）、強風、旱魃、塩分、化学毒性、酸化的ストレス、洪水、トルネード、野火、放射線および重金属への曝露のような非生物的ストレスであり得る。改善された農学上の形質の非限定的な例は、本明細書中の他の箇所で開示される。具体的実施形態において、上記細菌株、その活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物の有効量は、植物の健康状態を改善するかまたは統計的に有意な量で、例えば、少なくとも約１０％～少なくとも約２０％、少なくとも約２０％～約５０％、少なくとも約１０％～約６０％、少なくとも約３０％～約７０％、少なくとも約４０％～約８０％、もしくは少なくとも約５０％～約９０％もしくはこれより高くを含め、目的の農学上の形質を改善する。

Ｄ．植物もしくは植物部分への適用方法
本明細書で提供される細菌株、その活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物は、有効量で適用される。本明細書で提供される細菌株、その活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物の有効量は、有害生物（例えば、昆虫有害生物）を制御、処理、防止、阻害する、および／あるいは目的の農学上の形質を改善するために十分な量である。具体的実施形態において、本明細書で提供される細菌株、その活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物の有効量は、植物の病気もしくは損傷を引き起こす有害生物を制御、処理、防止、阻害する、および／あるいは植物の病気の重篤度を低減するかまたは植物の病気の発生を低減するために十分な量である。他の実施形態において、本明細書で提供される細菌株、その活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物の有効量は、目的の農学上の形質を改善するならびに／または植物の健康状態、病気、植物有害生物による感染もしくは植物有害生物（例えば、昆虫有害生物）による外寄生に感受性である植物の生長もしくは収量を増進もしくは増大させるために十分な量である。本明細書で提供される細菌株、その活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物の適用の割合は、標的とされている病原体、防御すべき作物、本明細書で提供される細菌株、その活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物の有効性、上記病気の重篤度、気候条件、改善すべき目的の農学上の形質などに従って変動し得る。本明細書で提供される方法は、少なくとも１種の本明細書で提供される細菌株、もしくはその活性改変体および／またはこれらに由来する組成物の、植物、植物部分、または栽培地への１回の適用、あるいは少なくとも１種の本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体の、植物、植物部分、または栽培地への多数回の適用を含み得る。

一般に、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体の割合は、１０^７～１０^１６コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタールである。他の実施形態において、圃場接種に関しては、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体の適用の割合は、３×１０^７～１×１０^１１ コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタールである（これは、約１Ｋｇ～１０ｋｇの製剤化物質／ヘクタールに相当する）。別の実施形態では圃場接種に関しては、本明細書で提供される細菌株またはその活性改変体の適用の割合は、３ｘ１０^７～１ｘ１０^１６コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタール；約１ｘ１０^１２～約１ｘ１０^１３コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタール、約１ｘ１０^１３～約１ｘ１０^１４コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタール、約１ｘ１０^１４～約１ｘ１０^１５コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタール、約１ｘ１０^１５～約１ｘ１０^１６コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタール、約１ｘ１０^１６～約１ｘ１０^１７コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタール；約１ｘ１０^４～約１ｘ１０^１４コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタール；約１ｘ１０^５～約１ｘ１０^１３コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタール；約１ｘ１０^６～約１ｘ１０^１２コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタール；約１ｘ１０^９～約１ｘ１０^１１コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタール；または約１ｘ１０^９～約１ｘ１０^１１コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタールである。別の実施形態では、圃場接種に関しては、本明細書で提供される細菌株またはその活性改変体の適用の割合は、少なくとも約１ｘ１０^４、約１ｘ１０^５、約１ｘ１０^６、約１ｘ１０^７、約１ｘ１０^８、約１ｘ１０^９、約１ｘ１０^１０、約１ｘ１０^１１、約１ｘ１０^１２１ｘ１０^１３、約１ｘ１０^１４、１ｘ１０^１５、約１ｘ１０^１６、または約１ｘ１０^１７コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタールである。他の実施形態において、圃場接種に関しては、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体の適用の割合は、少なくとも１×１０^７～少なくとも約１×１０^１２ ＣＦＵ／ヘクタールである。具体的実施形態において、適用される、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体は、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６として寄託された株、またはこれらのうちのいずれかの活性誘導体、あるいはＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、またはこれらのうちのいずれかの活性誘導体のうちのいずれか１つに由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせを含む。

いくつかの実施形態において、適用される組成物は、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６として寄託された株、またはこれらのうちのいずれかの活性誘導体を含む細菌株もしくはその活性改変体、あるいはＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、またはこれらのうちのいずれかの活性誘導体のうちのいずれか１つに由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせに由来する。いくつかの実施形態において、適用される組成物は、本発明の細菌株もしくはその活性改変体に由来する、実質的に純粋な培養物、全細胞ブロス、上清、濾液、抽出物、または化合物であり得る。適用される組成物は、植物有害生物を制御するか、または植物において目的の農学上の形質を改善するために有効な量において、単独で、または別の物質との組み合わせにおいて適用され得る。

適用される組成物の有効量は、微生物細胞、上清、全細胞ブロス、濾液、細胞画分もしくは抽出物、代謝産物、および／または化合物単独、または植物有害生物外寄生または植物において目的の農学上の形質の性能を調節するために十分な別の農薬物質との組み合わせにおける量である。有効な範囲内にある量は、当業者によって実験的な試験または圃場試験によって決定され得る。

いくつかの実施形態において、上記組成物が種子に直接適用される場合、有効量は、種子１００ｇあたり、約０．０５～２５％、または約０．１～２０％、または約０．５～１５％、または約１～１０％、または約２～５％の活性成分の濃度である。いくつかの実施形態において、上記有効量は、種子１００ｇあたり、約０．５～１％の活性成分の量である。

いくつかの実施形態において、上記組成物が土壌に、例えば、畝において適用される場合、有効量は、１０００フィードの列あたり、約０．１～５０オンスの活性成分である。別の実施形態において、土壌適用のための有効量は、１０００フィートの列あたり約１～２５オンスの活性成分である。別の実施形態において、上記有効量は、１０００フィートの列あたり、約２～２０オンス、または約３～１５オンス、または約４～１０オンス、または約５～８オンスの活性成分である。なお別の実施形態において、上記有効量は、１０００フィードの列あたり、約１４または２８オンスの活性成分である。

殺生物剤に関する任意の適切な農業的適用割合は、本明細書で提供される細菌株もしくは本明細書で開示されるその活性改変体と組み合わせて適用され得る。本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体の有効量に関してアッセイするための方法は、例えば、上記細菌株、その活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物によって標的化される有害生物の制御の任意の統計的に有意な増大を含む。このような制御に関してアッセイするための方法は公知である。さらに、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体の有効量の適用に際して起こり得る植物の健康状態、収量および／または生長は、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体が適用されない場合に起こる植物の健康状態、収量および／または生長と比較すると、統計的に有意に増大する。

本明細書で提供される細菌株もしくは本明細書で提供されるその活性改変体（すなわち、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つの細胞、あるいはＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１つに由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせ）を含む組成物ならびに／または上記で記載される細菌株もしくは活性改変体に由来する組成物を適用することによって、植物有害生物（例えば、植物の病気を引き起こすもの）の成長を制御または阻害するための方法が、さらに提供される。「適用すること（ａｐｐｌｙｉｎｇ）」とは、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体の有効量を、植物、栽培地、および／もしくは種子に、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体のうちの１種もしくはこれより多くと所望の効果が達成されるように接触させることを意図する。さらに、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体の適用は、作物を植える前に（例えば、土壌、種子、もしくは植物に）起こり得る。具体的実施形態において、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体および／またはこれらに由来する組成物の適用は、葉面適用である。従って、本発明のさらなる実施形態は、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体の集団および／またはこれらに由来する組成物を、植物有害生物が成長し得る環境に適用することによって、植物有害生物の成長を制御または阻害するための方法を提供する。上記適用は、植物に、植物の一部に、上記防御されるべき植物の種子に、または上記防御されるべき植物が生長しつつあるかまたは生長する土壌に対して行われ得る。上記植物または植物部分への適用は、収穫前または収穫後に行われ得る。種子への適用は、種子を蒔く前に行われる。

いくつかの実施形態において、少なくとも１種の本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体および／または本明細書で提供されるこれらに由来する組成物の有効量は、サツマイモネコブセンチュウ（Ｍｅｌｏｉｄｏｇｙｎｅ ｉｎｃｏｇｎｉｔａ）、ジャワネコブセンチュウ（Ｍｅｌｏｉｄｏｇｙｎｅ ｊａｖａｎｉｃａ）、キタネコブセンチュウ（Ｍｅｌｏｉｄｏｇｙｎｅ ｈａｐｌａ）およびアレナリアネコブセンチュウからなる群より選択される１種もしくはこれより多くの線虫病原体の成長を制御または阻害するために、葉面適用として使用される。

いくつかの実施形態において、少なくとも１種の本明細書で提供される細菌株もしくは本明細書で提供されるその活性改変体および／またはこれらに由来する組成物の有効量は、１種もしくはこれより多くの昆虫有害生物の成長を制御または阻害するために葉面適用または土壌適用または種子適用として使用される。例えば、少なくとも１種の本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体の有効量は、コーンルートワーム、ウェスタンコーンルートワーム、コロラドハムシ、ゾウムシ、およびアリモドキゾウムシを含む甲虫類の昆虫の成長を制御または阻害するために葉面適用として使用され得る。他の実施形態において、少なくとも１種の本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体および／または本明細書で提供されるこれらに由来する組成物の有効量は、１種もしくはこれより多くの線虫または線虫有害生物の成長を制御または阻害するために、上記防御されるべき植物が生長しつつあるかまたは生長する土壌に対して適用される。具体的実施形態において、少なくとも１種の本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体および／または本明細書で提供されるこれらに由来する組成物の有効量は、植物有害生物（例えば、昆虫有害生物、例えば、甲虫類の昆虫有害生物）を阻害する（成長、摂食、生産力、または生存度を阻害する）、抑制する（成長、摂食、生産力、または生存度を抑制する）、低減する（有害生物外寄生を低減する、特定の作物に対して有害生物摂食活動を制限する）または死滅させる（疾病率、死滅率、低減した生産力の原因となる）ために、植物種子に適用される。

他の実施形態において、少なくとも１種の本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体および／または本明細書で提供されるこれらに由来する組成物の有効量は、１種もしくはこれより多くの植物有害生物の成長を制御または阻害するために、防御されるべき植物が生長しつつあるかまたは生長する植物栄養分体（すなわち、種子、接ぎ穂、挿し枝（ｓｔｅｍ ｃｕｔｔｉｎｇ）、穀粒（ｃｏｒｎ）など）に適用される。例えば、少なくとも１種の本明細書で提供される細菌株、もしくはその活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物の有効量は、昆虫有害生物（例えば、コーンルートワーム、ウェスタンコーンルートワーム、コロラドハムシ、ゾウムシ、およびアリモドキゾウムシを含む甲虫類）の成長を制御または阻害するために、植物栄養分体に適用され得る。具体的実施形態において、少なくとも１種の本明細書で提供される細菌株、もしくはその活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物の有効量は、植物有害生物（例えば、昆虫有害生物、例えば、コーンルートワーム、ウェスタンコーンルートワーム、コロラドハムシ、ゾウムシ、およびアリモドキゾウムシを含む甲虫類の昆虫）の成長を制御または阻害するために、収穫前または収穫後に植物組織（果実を含む）に適用され得る。いくつかの実施形態において、本明細書で提供される細菌株、もしくはその活性改変体、および／または本明細書で提供されるこれらに由来する組成物の有効量は、１種もしくはこれより多くの線虫有害生物の成長を制御または阻害するために、収穫後に植物組織（果実を含む）に適用され得る。

他の実施形態において、少なくとも１種の本明細書で提供される細菌株、もしくはその活性改変体、および／または本明細書で提供されるこれらに由来する組成物の有効量は、サツマイモネコブセンチュウ（Ｍｅｌｏｉｄｏｇｙｎｅ ｉｎｃｏｇｎｉｔａ）、ジャワネコブセンチュウ（Ｍｅｌｏｉｄｏｇｙｎｅ ｊａｖａｎｉｃａ）、キタネコブセンチュウ（Ｍｅｌｏｉｄｏｇｙｎｅ ｈａｐｌａ）およびアレナリアネコブセンチュウからなる群より選択される１種もしくはこれより多くの有害生物の成長を制御または阻害するために、防御されるべき植物が生長しつつあるかまたは生長する土壌に適用される。

いくつかの実施形態において、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体および／または本明細書で提供されるこれらに由来する組成物の有効量は、サツマイモネコブセンチュウ（Ｍｅｌｏｉｄｏｇｙｎｅ ｉｎｃｏｇｎｉｔａ）、ジャワネコブセンチュウ（Ｍｅｌｏｉｄｏｇｙｎｅ ｊａｖａｎｉｃａ）、キタネコブセンチュウ（Ｍｅｌｏｉｄｏｇｙｎｅ ｈａｐｌａ）およびアレナリアネコブセンチュウからなる群より選択される１種もしくはこれより多くの有害生物の成長を制御または阻害するために、収穫後に植物に適用される。

本明細書で使用される場合、用語、植物は、植物細胞、植物プロトプラスト、植物細胞組織培養物（これらから植物が再生され得る）、植物カルス、植物凝集塊（ｐｌａｎｔ ｃｌｕｍｐ）、および植物または植物の部分（例えば、胚、花粉、胚珠、種子、葉、花、枝、果実、穀粒、穂、穂軸、殻、茎、根、根端、葯など）の中で無傷である植物細胞を含む。子実（ｇｒａｉｎ）は、種（ｓｐｅｃｉｅｓ）を生長または生殖する以外の目的で、商業栽培者によって生産される成熟種子を意味することが意図される。

具体的実施形態において、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体（すなわち、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つの細胞、あるいはＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１つに由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせ）、および／またはこれらに由来する組成物の適用は、植物の種子（例えば、トウモロコシ（ｃｏｒｎ）（トウモロコシ（ｍａｉｚｅ））植物の種子）に適用される。トウモロコシ種子への上記細菌株もしくはその活性改変体の適用は、約１０^５ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１１ ＣＦＵ／ｇ、約１０^７ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１０ ＣＦＵ／ｇ、約１０^７ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１１ ＣＦＵ／ｇ、約１０^６ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１０ ＣＦＵ／ｇ、約１０^６ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１１ ＣＦＵ／ｇ、約１０^１１ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１２ ＣＦＵ／ｇ、約１０^５ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１０ ＣＦＵ／ｇ、約１０^５ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１２ ＣＦＵ／ｇ、約１０^５ ＣＦＵ／ｇ～約１０^６ ＣＦＵ／ｇ、約１０^６ ＣＦＵ／ｇ～約１０^７ ＣＦＵ／ｇ、約１０^７ ＣＦＵ／ｇ～約１０^８ ＣＦＵ／ｇ、約１０^８ ＣＦＵ／ｇ～約１０^９ ＣＦＵ／ｇ、約１０^９ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１０ ＣＦＵ／ｇ、約１０^１０ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１１ ＣＦＵ／ｇ、または約１０^１１ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１２ ＣＦＵ／ｇの濃度を含み得る。いくつかの実施形態において、上記細菌株の濃度は、少なくとも約１０^５ ＣＦＵ／ｇ、少なくとも約１０^６ ＣＦＵ／ｇ、少なくとも約１０^７ ＣＦＵ／ｇ、少なくとも約１０^８ ＣＦＵ／ｇ、少なくとも約１０^９ ＣＦＵ／ｇ、少なくとも約１０^１０ ＣＦＵ／ｇ、少なくとも約１０^１１ ＣＦＵ／ｇ、少なくとも約１０^１２ ＣＦＵ／ｇ、または少なくとも約１０^１３ ＣＦＵ／ｇを含む。具体的実施形態において、上記トウモロコシ種子に適用される上記細菌株、もしくはその活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物は、本明細書中の他の箇所に記載されるとおりの異種種子コーティングの形態において適用される。適用の濃度およびタイミングは、その状態および地理上の位置に依存して変動し得る。

具体的実施形態において、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体（すなわち、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つの細胞、あるいはＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１つに由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせ）および／またはこれらに由来する組成物の適用は、ダイズ植物の葉に適用される。適用のタイミングは、その状態および地理上の位置に依存して変動し得る。

種々の方法が、植物有害生物または植物有害生物によって引き起こされる植物の病気に感受性である植物を含む栽培地において、植物有害生物（例えば、植物の病気を引き起こすもの）を制御するために提供される。上記方法は、上記栽培地に、上記植物の病気または有害生物に感受性である種子または植物を植える工程；ならびに上記病気または有害生物に感受性である植物、上記植物の病気または有害生物に感受性である植物の種子または栽培地に、少なくとも１種の本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体（すなわち、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、またはこれらのうちのいずれかの活性誘導体のうちの少なくとも１つの細胞、あるいはＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１つに由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせ）、および／またはこれらに由来する組成物の有効量を適用する工程を包含し、ここで、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体の上記有効量は、上記作物に有意に罹患することなく、植物有害生物を御する。具体的実施形態において、上記有効量は、少なくとも約１０^１２～１０^１６ コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタールを含む。植物有害生物または植物有害生物によって引き起こされる植物の病気に感受性である植物を生長させるための方法がさらに提供される。上記方法は、上記病気または有害生物に感受性である植物、上記病気または有害生物に感受性である植物の種子もしくは栽培地に、少なくとも１種の本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体を含む組成物の有効量を適用する工程を包含する。ある特定の実施形態において、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体は、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つの細胞；あるいはＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１つに由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせを含み得る。少なくとも１種の本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体の種々の有効量は、本明細書の他の箇所で開示され、１つの非限定的例において、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体の有効量は、少なくとも約１０^１２～１０^１６ コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタールを含む。いくつかの実施形態において、上記組成物は、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体に由来し、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つの細胞；あるいはＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１つに由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせを含み得る。

植物収量を増大させるための方法が、提供される。植物の「収量（ｙｉｅｌｄ）」とは、上記植物によって生産されるバイオマスの質および／または量に言及する。「バイオマス（ｂｉｏｍａｓｓ）」とは、任意の測定される植物生産物が意図される。バイオマス生産の増大は、測定される植物生産物の収量の任意の改善である。収量の増大は、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体に曝されていない植物と比較して、少なくとも１％増大、少なくとも３％増大、少なくとも５％増大、少なくとも１０％増大、少なくとも２０％増大、少なくとも３０％、少なくとも５０％、少なくとも７０％、少なくとも１００％もしくはこれより大きな収量の増大が挙げられるが、これらに限定されない任意の統計的に有意な増大を含み得る。植物において収量を増大させるための方法がまた、提供され、上記方法は、作物または栽培地に、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体を含む少なくとも１種の細菌株、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１つに由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせを含む組成物の有効量を適用する工程を包含し、ここで上記有効量は、少なくとも約１０^１２～１０^１６ コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタールを含み、そしてここで上記組成物は、植物有害生物を制御し、それによって、収量を増大させる。植物において収量を増大させるための方法がまた、提供され、上記方法は、作物または栽培地に、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体を含む少なくとも１種の細菌株、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１つに由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせに由来する組成物の有効量を適用する工程を包含し、ここで上記組成物は、植物有害生物を制御し、それによって、収量を増大させる。

本明細書で使用される場合、「栽培地（ａｒｅａ ｏｆ ｃｕｌｔｉｖａｔｉｏｎ）」とは、植物を生長させることが望まれる任意の領域を含む。このような栽培地としては、植物が栽培される圃場（例えば、農地（ｃｒｏｐ ｆｉｅｌｄ）、芝生地、植林地（ｔｒｅｅ ｆｉｅｌｄ）、保安林（ｍａｎａｇｅｄ ｆｏｒｅｓｔ）、果実および野菜栽培の圃場など）、温室、生育チャンバなどが挙げられるが、これらに限定されない。

他の実施形態において、目的の植物（すなわち、植物有害生物または植物有害生物によって引き起こされる植物の病気に感受性である植物）および／または上記植物を含む栽培地は、本明細書で提供される細菌株、その活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物の有効量、ならびに殺生物剤または他の生物防除因子の有効量の組み合わせで処理され得る。本明細書で提供される細菌株、その活性改変体、これらに由来する組成物、および殺生物剤もしくは他の生物防除因子「の組み合わせで処理される」または植物、栽培地もしくは圃場に本明細書で提供される細菌株、その活性改変体、これらに由来する組成物、および殺生物剤もしくは他の殺生物剤「の組み合わせを適用する」は、特定の圃場、植物、および／もしくは雑草のうちの１種もしくはこれより多くが、所望の効果が達成されるように、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体のうちの１種もしくはこれより多くおよび１種もしくはこれより多くの殺生物剤もしくは他の生物防除因子の有効量で処理されることが意図される。さらに、本明細書で提供される細菌株、その活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物、ならびに上記殺生物剤もしくは他の生物防除因子のうちの一方の適用は、作物を（例えば、土壌に）植える前に（または植物に）起こり得る。さらに、本明細書で提供される細菌株、その活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物、ならびに上記殺生物剤もしくは他の生物防除因子の適用は、同時であってもよいし、上記適用は、所望の効果が達成される限りにおいて、異なる時間（逐次的）であってもよい。

１つの非限定的実施形態において、上記活性改変体は、１種もしくはこれより多くの殺生物剤に抵抗性である本明細書で提供される細菌株を含む。具体的実施形態において、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体（すなわち、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つの細胞、あるいはＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１つに由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせ）は、グリホサートに対して抵抗性である。このような方法において、植物、作物、または栽培地は、グリホサートに対して抵抗性である本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体の有効量およびグリホサートの有効量の組み合わせで処理され、ここでグリホサートの上記有効量は、例えば、選択的に雑草を制御すると同時に、上記作物が有意に損傷されないようなものである。

別の非限定的実施形態において、上記活性改変体は、グルホシネートに対して抵抗性である本明細書で提供される細菌株を含む。このような方法において、植物、作物、または栽培地は、グルホシネートに対して抵抗性である本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体の有効量およびグルホシネートの有効量の組み合わせで処理され、ここでグルホシネートの上記有効量は、選択的に雑草を制御すると同時に、上記作物が有意に損傷されないようなものである。このような実施形態において、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体の有効量は、グルホシネートに対して抵抗性であるように改変されなかった本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体の同じ濃度が、グルホシネートもしくはその活性誘導体の上記有効量と組み合わせて適用される場合に起こる植物の健康状態、収量、および／または生長と比較して、植物の健康状態、収量、および／または生長の統計的に有意な増大を生じるために十分である。さらなる実施形態において、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体は、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つの細胞、あるいはＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１つに由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせの有効量を含む。

Ｖ．本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体と組み合わせて使用するための殺生物剤
本明細書中の他の箇所で考察されるように、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物は、殺生物剤（すなわち、除草剤、殺虫剤、殺真菌剤、農薬、もしくは他の農作物保護化学物質）と組み合わせて使用され得る。このような場合には、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体は、目的の殺生物剤と適合性である。

「除草剤、殺虫剤、殺真菌剤、農薬、殺虫剤もしくは他の農作物保護化学物質への耐性または除草剤、殺真菌剤、農薬、殺虫剤もしくは他の農作物保護化学物質への抵抗性」とは、生物（すなわち、上記植物および／または本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体など）が野生型生物には通常致死的である除草剤、殺虫剤、殺真菌剤、農薬、殺虫剤、もしくは他の農作物保護化学物質の用量への曝露後に、生存および生殖する能力が意図される。

本明細書に開示の種々の方法および組成物において使用され得る除草剤としては、グリホサート、ＡＣＣａｓｅインヒビター（アリールオキシフェノキシ（Ａｒｌｏｘｙｐｈｅｎｏｘｙ）プロピオネート（ＦＯＰＳ））；ＡＬＳインヒビター（スルホニルウレア（ＳＵ））、イミダゾリノン（Ｉｍｉｄａｚｏｎｌｉｎｏｎｅ）（ＩＭＩ）、ピリミジン（ＰＭ））；微小管タンパク質インヒビター（ジニトロアニリン（ＤＮＡ））；合成オーキシン（フェノキシ（Ｐ））、安息香酸（ＢＡ）、カルボン酸（ＣＡ））；光合成系ＩＩインヒビター（トリアジン（ＴＺ））、トリアジノン（ＴＮ）、ニトリル（ＮＴ）、ベンゾチアジアジノン（ＢＺ）、ウレア（ＵＳ））；ＥＰＳＰシンターゼインヒビター（グリシン（ＧＣ））；グルタミン合成インヒビター（ホスフィン酸（ＰＡ））；ＤＯＸＰシンターゼインヒビター（イソオキサゾリジノン（ＩＡ））；ＨＰＰＤインヒビター（ピラゾール（ＰＡ））、トリケトン（ＴＥ））；ＰＰＯインヒビター（ジフェニルエーテル（ＤＥ）、Ｎ－フェニルフタルイミド（ＮＰ）（アリールトリアジノン（Ａｒｙ ｔｒｉａｚｉｎｏｎｅ）（ＡＴ））；ＶＬＦＡインヒビター（クロロアセトアミド（ＣＡ））、オキシアセトアミド（ＯＡ））；光合成系Ｉインヒビター（ビピリジリウム（Ｂｉｐｙｒｉｄｙｌｉｕｍｓ）（ＢＰ））；などが挙げられる。

本明細書に開示の種々の方法および組成物において使用され得る農薬としては、イミダクロプリドクロチアニジン、アリールピラゾール化合物（ＷＯ２００７１０３０７６）；有機リン、フェニルピラゾール、ピレスロイド（ｐｙｒｅｔｈｏｉｄｓ）カラモイルオキシム（ｃａｒａｍｏｙｌｏｘｉｍｅｓ）、ピラゾール、アミジン、ハロゲン化炭化水素、カルバメートおよびその誘導体、テルブホス、クロルピリホス（ｃｈｌｏｒｏｐｙｒｉｆｏｓ）、フィプロニル、クロルエトキシホス、テフルトリン（ｔｅｌｆｕｔｈｒｉｎ）、カルボフラン、イミダクロプリド、テブピリムホス（米国特許第５，８４９，３２０号）が挙げられる。

本明細書に開示の種々の方法および組成物において使用され得る殺虫剤としては、以下が挙げられる：イミダクロプリド、β－シフルトリン、シアントラニリプロール、ダイアジノン、ラムダシハロトリン、メチオカルブ、ピメトロジン、ピリフルキナゾン、スピネトラム、スピロテトラマト、チオジカルブ、およびＴｉ－４３５、カルバメート、ナトリウムチャネル調節因子／電位依存性ナトリウムチャネルブロッカー、ピレスロイド（例えば、ＤＤＴ）、オキサジアジン（例えば、インドキサカルブ）、アセチルコリンレセプターアゴニスト／アンタゴニスト、アセチルコリンレセプター調節因子、ニコチン、ベンスルタップ、カルタップ、クロロニコチニル（ｃｈｌｏｒｏｎｉｃｏｔｙｉｎｙｌ）（例えば、アセタミプリド、ビフェントリン、クロチアニジン、ジノテフラン（ｄｉｎｏｔｅｆｕｒａｎ）、イミダクロプリド、ニテンピラム、ニチアジン、チアクロプリド、およびチアメトキサム）、スピノシン（例えば、スピノサド）、シクロジエン有機塩素化合物（例えば、カンフェクロル、クロルデン、エンドスルファン、γ－ＨＣＨ、ＨＣＨ、ヘプタクロル、リンデン、メトキシクロル、フィプロール（ｆｉｐｒｏｌｅ）（例えば、アセトプロール、エチプロール、フィプロニル、バニリプロール、塩化物チャネル、６．１メクチン（６．１ ｍｅｃｔｉｎ）（例えば、アベルメクチン、エマメクチン、エマメクチン安息香酸塩、イベルメクチン、およびミルベマイシン）、幼若ホルモン模倣物（例えば、ジオフェノラン、エポフェノナン、フェノキシカルブ、ヒドロプレン、キノプレン、メトプレン、ピリプロキシフェン、およびトリプレン）、エクジソンアゴニスト／破壊因子（ｄｉｓｒｕｐｔｏｒ）、ジアシルヒドラジン、クロマフェノジド、ハロフェノジド、メトキシフェノジド、テブフェノジド、キチン生合成インヒビター、ベンゾイルウレア（例えば、ビストリフルロン、クロルフルアズロン、ジフルベンズロン、フルアズロン、フルシクロクスロン（ｆｌｕｃｙｃｌｏｘｕｒｏｎ）、フルフェノクスロン、ヘキサフルムロン、ルフェヌロン、ノバルロン、ノビフルムロン、ペンフルロン（ｐｅｎｆｌｕｒｏｎ）、テフルベンズロン、トリフルムロン、ブプロフェジン、シロマジン、酸化的リン酸化インヒビター、ＡＴＰ破壊因子、ジアフェンチウロン、有機スズ化合物（例えば、アゾシクロチン、シヘキサチン、酸化フェンブタスズ）、ピロール（例えば、クロルフェナピル）、ジニトロフェノール（例えば、ビナパクリル）、ジノブトン（ｄｉｎｏｂｕｔｏｎ）、ジノカップ、ＤＮＯＣ、サイトＩ電子伝達系インヒビター（ｓｉｔｅ－Ｉ ｅｌｅｃｔｒｏｎ ｔｒａｎｓｐｏｒｔ ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ）、ＭＥＴＩ（例えば、フェナザキン、フェンピロキシメート、ピリミジフェン、ピリダベン、テブフェンピラド、トルフェンピラド、ヒドラメチルノン（ｈｙｄｒａｍｅｔｈｙｉｎｏｎ）、ジコホル、ロテノン、アセキノシル、フルアクリピリム、スピロジクロフェン、スピロメシフェン、テトラミン酸）、カルボキサミド（例えば、フロニカミド）、オクトパミン作動性アゴニスト（例えば、アミトラズ）、マグネシウム刺激性ＡＴＰａｓｅインヒビター（例えば、プロパルギット）、ＢＤＣＡ（例えば、Ｎ２－［１，１－ジメチル－２－（メチルスルホニル）エチル］－３－ヨード－Ｎ１－［２－メチル－４－［１，２，２，２－－テトラフルオロ－１－（トリフルオロメチル）エチル］フェニル］－１，２－ベンゼン、ネライストキシンアナログ（ｎｅｒｅｉｓｔｏｘｉｎ ａｎａｌｏｇｕｅ）（例えば、チオシクラムシュウ酸塩（ｔｈｉｏｃｙｃｌａｍ ｈｙｄｒｏｇｅｎ ｏｘａｌａｔｅ）、ならびにチオスルタップナトリウム。好ましくは、上記殺虫剤は、クロルピリホスおよびテフルトリンのうちの１つまたはこれより多くである。

本明細書で開示される種々の方法および組成物において使用され得る殺線虫剤としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：アシベンゾラルＳメチル、アベルメクチン（例えば、アバメクチン）、カルバメート殺線虫剤（例えば、アルジカルブ、チオジカルブ（ｔｈｉａｄｉｃａｒｂ）、カルボフラン、カルボスルファン、オキサミル、アルドキシカルブ、エトプロップ（ｅｔｈｏｐｒｏｐ）、メソミル、ベノミル、アラニカルブ）、有機リン系殺線虫剤（例えば、フェナミホス（ｐｈｅｎａｍｉｐｈｏｓ）（フェナミホス（ｆｅｎａｍｉｐｈｏｓ））、フェンスルホチオン、テルブホス、ホスチアゼート、ジメトエート、ホスホカルブ（ｐｈｏｓｐｈｏｃａｒｂ）、ジクロフェンチオン、イサミドホス（ｉｓａｍｉｄｏｆｏｓ）、フォスチエタン（ｆｏｓｔｈｉｅｔａｎ）、イサゾホス エトプロホス、カズサホス、テルブホス、クロルピリホス、ジクロフェンチオン、ヘテロホス（ｈｅｔｅｒｏｐｈｏｓ）、イサミドホス、メカルホン（ｍｅｃａｒｐｈｏｎ）、ホレート（ｐｈｏｒａｔｅ）、チオナジン（ｔｈｉｏｎａｚｉｎ）、トリアゾホス、ジアミダホス（ｄｉａｍｉｄａｆｏｓ）、フォスチエタン（ｆｏｓｔｈｉｅｔａｎ）、ホスファミドン）、ならびにある種の殺真菌剤（例えば、キャプタン、チオファネートメチルおよびチアベンダゾール）。

本明細書に開示の種々の方法および組成物において使用され得る殺真菌剤としては、以下が挙げられる：脂肪族窒素殺真菌剤（ブチルアミン、シモキサニル、ドジシン、ドジン、グアザチン、イミノクタジン）；アミド殺真菌剤（ベンゾビンジフルピル、カルプロパミド、クロラニホルメタン、シフルフェナミド、ジクロシメット、ジクロシメット、ジモキシストロビン、フェナミンストロビン、フェノキサニル、フルメトベル、フラメトピル、イソフェタミド、イソピラザム、マンデストロビン、マンジプロパミド、メトミノストロビン、オリサストロビン、ペンチオピラド、プロクロラズ、キナザミド、シルチオファム、トリホリン）；アシルアミノ酸殺真菌剤（ベナラキシル、ベナラキシルＭ、フララキシル、メタラキシル、メタラキシルＭ、ペフラゾエート、バリフェナレート）；アニリド殺真菌剤（ベナラキシル、ベナラキシルＭ、ビキサフェン、ボスカリド、カルボキシン、フェンヘキサミド、フルキサピロキサド、イソチアニル、メタラキシル、メタラキシルＭ、メトスルホバックス、オフレース、オキサジキシル、オキシカルボキシン、ペンフルフェン、ピラカルボリド、セダキサン、チフルザミド、チアジニル、バンガード（ｖａｎｇｕａｒｄ））；ベンズアニリド殺真菌剤（ベノダニル、フルトラニル、メベニル、メプロニル、サリチルアニリド、テクロフタラム）；フルアニリド（ｆｕｒａｎｉｌｉｄｅ）殺真菌剤（フェンフラム、フララキシル、フルカルバニル、メトフロキサム）；スルホンアニリド殺真菌剤（フルスルファミド）；ベンズアミド殺真菌剤（ベンゾヒドロキサム酸、フルオピコリド、フルオピラム、チオキシミド、トリクラミド、ザリラミド、ゾキサミド）；フラミド殺真菌剤（シクラフラミド、フルメシクロックス）；フェニルスルファミド殺真菌剤（ジクロフルアニド、トリルフルアニド）；スルホンアミド殺真菌剤（アミスルブロム、シアゾファミド）；バリンアミド殺真菌剤（ベンチアバリカルブ、イプロバリカルブ）；抗生物質殺真菌剤（オーレオファンギン（ａｕｒｅｏｆｕｎｇｉｎ）、ブラストサイジンＳ、シクロヘキシミド、グリセオフルビン、カスガマイシン、モロキシジン、ナタマイシン、ポリオキシン、ポリオキソリム（ｐｏｌｙｏｘｏｒｉｍ）、ストレプトマイシン、バリダマイシン）；ストロビルリン殺真菌剤（フルオキサストロビン、マンデストロビン）；メトキシアクリレートストロビルリン殺真菌剤（アゾキシストロビン、ビフジュンチ（ｂｉｆｕｊｕｎｚｈｉ）、クモキシストロビン、エノキサストロビン、フルフェノキシストロビン、ジアシアンジュンチ（ｊｉａｘｉａｎｇｊｕｎｚｈｉ）、ピコキシストロビン、ピラオキシストロビン）；メトキシカルバニレート（ｍｅｔｈｏｘｙｃａｒｂａｎｉｌａｔｅ）ストロビルリン殺真菌剤（ピラクロストロビン、ピラメトストロビン、トリクロピリカルブ）；メトキシイミノアセトアミドストロビルリン殺真菌剤（ジモキシストロビン、フェナミンストロビン、メトミノストロビン、オリサストロビン）；メトキシイミノアセテートストロビルリン殺真菌剤（クレソキシムメチル、トリフロキシストロビン）；芳香族殺真菌剤（ビフェニル、クロロジニトロナフタレン、クロロネブ、クロロタロニル、クレゾール、ジクロラン、フェンジュントン（ｆｅｎｊｕｎｔｏｎｇ）、ヘキサクロロベンゼン、ペンタクロロフェノール、キントゼン、ナトリウムペンタクロロフェノキシド、テクナゼン、トリクロロトリニトロベンゼン）；ヒ素を含む殺真菌剤（アソメート、ウルバシド（ｕｒｂａｃｉｄｅ））；アリールフェニルケトン殺真菌剤（メトラフェノン、ピリオフェノン）；ベンゾイミダゾール殺真菌剤（アルベンダゾール、ベノミル、カルベンダジム、クロルフェナゾール、シペンダゾール、デバカルブ、フベリダゾール、メカルビンジド、ラベンザゾール、チアベンダゾール）；ベンゾイミダゾール前駆体殺真菌剤（フロファネート、チオファネート、チオファネートメチル）；ベンゾチアゾール殺真菌剤（ベンタルロン、ベンチアバリカルブ、ベンチアゾール（ｂｅｎｔｈｉａｚｏｌｅ）、クロベンチアゾン、プロベナゾール）；植物性殺真菌剤（アリシン、ベルベリン、カルバクロール、カルボン、オストール、サンギナリン、サントニン）；架橋ジフェニル殺真菌剤（ビチオノール、ジクロロフェン、ジフェニルアミン、ヘキサクロロフェン、パリノール）；カルバメート殺真菌剤（ベンチアバリカルブ、フロファネート、ヨードカルブ（ｉｏｄｏｃａｒｂ）、イプロバリカルブ、ピカルブトラゾクス、プロパモカルブ、ピリベンカルブ、チオファネート、チオファネートメチル、トルプロカルブ）；ベンゾイミダゾリルカルバメート殺真菌剤（アルベンダゾール、ベノミル、カルベンダジム、シペンダゾール、デバカルブ、メカルビンジド）；カルバニレート殺真菌剤（ジエトフェンカルブ、ピラクロストロビン、ピラメトストロビン、トリクロピリカルブ）；コナゾール殺真菌剤、コナゾール殺真菌剤（イミダゾール）（クリンバゾール、クロトリマゾール、イマザリル、オキスポコナゾール、プロクロラズ、トリフルミゾール）；コナゾール殺真菌剤（トリアゾール）（アザコナゾール、ブロムコナゾール、シプロコナゾール、ジクロブトラゾール、ジフェノコナゾール、ジニコナゾール、ジニコナゾールＭ、エポキシコナゾール、エタコナゾール、フェンブコナゾール、フルキンコナゾール、フルシラゾール、フルトリアホール、フルコナゾール、フルコナゾール・シス、ヘキサコナゾール、イミベンコナゾール、イプコナゾール、メトコナゾール、ミクロブタニル、ペンコナゾール、プロピコナゾール、プロチオコナゾール、キンコナゾール、シメコナゾール、テブコナゾール、テトラコナゾール、トリアジメホン、トリアジメノール、トリチコナゾール、ウニコナゾール、ウニコナゾールＰ）；銅殺真菌剤（アシペタックス－銅、ボルドー液（Ｂｏｒｄｅａｕｘ ｍｉｘｔｕｒｅ）、バーガンディー液（Ｂｕｒｇｕｎｄｙ ｍｉｘｔｕｒｅ）、チェスハント液（Ｃｈｅｓｈｕｎｔ ｍｉｘｔｕｒｅ）、酢酸銅、炭酸銅、塩基性、水酸化銅、ナフテン酸銅、オレイン酸銅、オキシ塩化銅（ｃｏｐｐｅｒ ｏｘｙｃｈｌｏｒｉｄｅ）、ケイ酸銅、硫酸銅、硫酸銅、塩基性、クロム酸銅亜鉛（ｃｏｐｐｅｒ ｚｉｎｃ ｃｈｒｏｍａｔｅ）、クフラネブ、クプロバム、酸化銅（Ｉ）、マンカッパー、オキシン銅、サイセントン（ｓａｉｓｅｎｔｏｎｇ）、チオジアゾール銅（ｔｈｉｏｄｉａｚｏｌｅ－ｃｏｐｐｅｒ））；シアノアクリレート殺真菌剤（ベンザマクリル、フェナマクリル（ｐｈｅｎａｍａｃｒｉｌ））；ジカルボキシイミド殺真菌剤（ファモキサドン、フルオロイミド）；ジクロロフェニルジカルボキシイミド殺真菌剤（クロゾリネート、ジクロゾリン、イプロジオン、イソバレジオン、ミクロゾリン、プロシミドン、ビンクロゾリン）；フタルイミド殺真菌剤（カプタホール、キャプタン、ジタリムホス、ホルペット、チオクロルフェンヒム）；ジニトロフェノール殺真菌剤（ビナパクリル、ジノブトン、ジノカップ、ジノカップ－４、ジノカップ－６、メプチルジノカップ、ジノクトン、ジノペントン、ジノスルホン、ジノテルボン、ＤＮＯＣ）；ジチオカルバメート殺真菌剤（アモバム、アソメート、アジチラム、カルバモルフ、クフラネブ、クプロバム、ジスルフィラム、フェルバム、メタム、ナバム、テコラム、チウラム、ウルバシド（ｕｒｂａｃｉｄｅ）、ジラム）；環式ジチオカルバメート殺真菌剤（ダゾメット、エテム、ミルネブ）；ポリマージチオカルバメート殺真菌剤（マンカッパー、マンコゼブ、マネブ、メチラム、ポリカルバメート、プロピネブ、ジネブ）；ジチオラン殺真菌剤（イソプロチオラン、サイジュンマオ（ｓａｉｊｕｎｍａｏ））；燻蒸用殺真菌剤（二硫化炭素、シアン、ジチオエーテル、臭化メチル、ヨウ化メチル、テトラチオ炭酸ナトリウム）；ヒドラジド殺真菌剤（ベンキノックス、サイジュンマオ（ｓａｉｊｕｎｍａｏ））；イミダゾール殺真菌剤（シアゾファミド、フェナミドン、フェナパニル、グリオジン、イプロジオン、イソバレジオン、ペフラゾエート、トリアゾキシド）；コナゾール殺真菌剤（イミダゾール）（クリンバゾール、クロトリマゾール、イマザリル、オキスポコナゾール、プロクロラズ、トリフルミゾール）；無機性殺真菌剤（アジ化カリウム、チオシアン酸カリウム、アジ化ナトリウム、硫黄、銅殺真菌剤もまた参照のこと、無機水銀殺真菌剤もまた参照のこと）；水銀殺真菌剤；無機水銀殺真菌剤（塩化水銀（ＩＩ）、酸化水銀（ＩＩ）、塩化水銀（Ｉ））；有機水銀殺真菌剤（臭化（３－エトキシプロピル）水銀（ＩＩ）、酢酸エチル水銀（ＩＩ）、臭化エチル水銀（ＩＩ）、塩化エチル水銀（ＩＩ）、エチル水銀２，３－ジヒドロキシプロピルメルカプチド（ｅｔｈｙｌｍｅｒｃｕｒｙ ２，３－ｄｉｈｙｄｒｏｘｙｐｒｏｐｙｌ ｍｅｒｃａｐｔｉｄｅ）、エチル水銀ホスフェート、Ｎ－（エチル水銀）－ｐ－トルエンスルホンアニリド、ヒドラルガフェン、塩化２－メトキシエチル水銀、安息香酸メチル水銀、メチル水銀ジシアンジアミド、メチル水銀ペンタクロロフェノキシド、８－フェニル水銀オキシキノリン（８－ｐｈｅｎｙｌｍｅｒｃｕｒｉｏｘｙｑｕｉｎｏｌｉｎｅ）、フェニル水銀ウレア（ｐｈｅｎｙｌｍｅｒｃｕｒｉｕｒｅａ）、酢酸フェニル水銀、塩化フェニル水銀、ピロカテコールのフェニル水銀誘導体、硝酸フェニル水銀、サリチル酸フェニル水銀、チメロサール（ｔｈｉｏｍｅｒｓａｌ）、トリル水銀アセテート）；モルホリン殺真菌剤（アルジモルフ、ベンザモルフ、カルバモルフ、ジメトモルフ、ドデモルフ、フェンプロピモルフ、フルモルフ、トリデモルフ）；有機リン殺真菌剤（アンプロピルホス、ジタリムホス、ＥＢＰ、エジフェンホス、ホセチル、ヘキシルチオホス、イネジン、イプロベンホス、イゾパムホス（ｉｚｏｐａｍｆｏｓ）、ケジュンリン（ｋｅｊｕｎｌｉｎ）、ホスダイフェン、ピラゾホス、トルクロホスメチル、トリアミホス）；有機スズ殺真菌剤（デカフェンチン、フェンチン、酸化トリブチルスズ）；オキサチイン（ｏｘａｔｈｉｉｎ）殺真菌剤（カルボキシン、オキシカルボキシン）；オキサゾール殺真菌剤（クロゾリネート、ジクロゾリン、ドラゾキソロン、ファモキサドン、ヒメキサゾール、メタゾキソロン、ミクロゾリン、オキサジキシル、オキサチアピプロリン、ピリソキサゾール、ビンクロゾリン）；ポリスルフィド殺真菌剤（多硫化バリウム（ｂａｒｉｕｍ ｐｏｌｙｓｕｌｆｉｄｅ）、多硫化カルシウム（ｃａｌｃｉｕｍ ｐｏｌｙｓｕｌｆｉｄｅ）、多硫化カリウム（ｐｏｔａｓｓｉｕｍ ｐｏｌｙｓｕｌｆｉｄｅ）、多硫化ナトリウム（ｓｏｄｉｕｍ ｐｏｌｙｓｕｌｆｉｄｅ））；ピラゾール殺真菌剤（ベンゾビンジフルピル、ビキサフェン、フェンピラザミン、フルキサピロキサド、フラメトピル、イソピラザム、オキサチアピプロリン、ペンフルフェン、ペンチオピラド、ピラクロストロビン、ピラメトストロビン、ピラオキシストロビン、ラベンザゾール、セダキサン）；ピリジン殺真菌剤（ボスカリド、ブチオベート、ジピリチオン、フルアジナム、フルオピコリド、フルオピラム、パリノール、ピカルブトラゾクス、ピリベンカルブ、ピリジニトリル、ピリフェノックス、ピリソキサゾール、ピロキシクロル、ピロキシフル、トリクロピリカルブ）；ピリミジン殺真菌剤（ブピリメート、ジフルメトリム、ジメチリモール、エチリモール、フェナリモール、フェリムゾン、ヌアリモール、トリアリモール）；アニリノピリミジン殺真菌剤（シプロジニル、メパニピリム、ピリメタニル）；ピロール殺真菌剤（ジメタクロン（ｄｉｍｅｔａｃｈｌｏｎｅ）、フェンピクロニル、フルジオキソニル、フルオロイミド）；四級アンモニウム殺真菌剤（ベルベリン、サンギナリン）；キノリン殺真菌剤（エトキシキン、ハラクリネート、８－ヒドロキシキノリンスルフェート、キナセトール、キノキシフェン、テブフロキン）；キノン殺真菌剤（クロラニル、ジクロン、ジチアノン）；キノキサリン殺真菌剤（キノメチオネート、クロルキノックス、チオキノックス）；チアジアゾール殺真菌剤（エトリジアゾール、サイセントン（ｓａｉｓｅ
ｎｔｏｎｇ）、チアジアゾール銅（ｔｈｉｏｄｉａｚｏｌｅ－ｃｏｐｐｅｒ）、亜鉛チアゾール（ｚｉｎｃ ｔｈｉａｚｏｌｅ））；チアゾール殺真菌剤（エタボキサム、イソチアニル、メトスルホバックス、オクチリノン、オキサチアピプロリン、チアベンダゾール、チフルザミド）；チアゾリジン殺真菌剤（フルチアニル、チアジフルオール）；チオカルバメート殺真菌剤（メタスルホカルブ、プロチオカルブ）；チオフェン殺真菌剤（エタボキサム、イソフェタミド、シルチオファム）；トリアジン殺真菌剤（アニラジン）；トリアゾール殺真菌剤（アミスルブロム、ビテルタノール、フルオトリマゾール、トリアズブチル）；コナゾール殺真菌剤（トリアゾール）（アザコナゾール、ブロムコナゾール、シプロコナゾール、ジクロブトラゾール、ジフェノコナゾール、ジニコナゾール、ジニコナゾールＭ、エポキシコナゾール、エタコナゾール、フェンブコナゾール、フルキンコナゾール、フルシラゾール、フルトリアホール、フルコナゾール、フルコナゾール・シス、ヘキサコナゾール、フアンジュンズオ（ｈｕａｎｊｕｎｚｕｏ）、イミベンコナゾール、イプコナゾール、メトコナゾール、ミクロブタニル、ペンコナゾール、プロピコナゾール、プロチオコナゾール、キンコナゾール、シメコナゾール、テブコナゾール、テトラコナゾール、トリアジメホン、トリアジメノール、トリチコナゾール、ウニコナゾール、ウニコナゾールＰ）；トリアゾロピリミジン殺真菌剤（アメトクトラジン）；ウレア殺真菌剤（ベンタルロン、ペンシクロン、キナザミド）；亜鉛殺真菌剤（アシペタックス亜鉛、クロム酸銅亜鉛、クフラネブ、マンコゼブ、メチラム、ポリカルバメート、ポリオキソリム－亜鉛、プロピネブ、ナフテン酸亜鉛、亜鉛チアゾール（ｚｉｎｃ ｔｈｉａｚｏｌｅ）、亜鉛トリクロロフェノキシド（ｚｉｎｃ ｔｒｉｃｈｌｏｒｏｐｈｅｎｏｘｉｄｅ）、ジネブ、ジラム）；未分類殺真菌剤（アシベンゾラル、アシペタックス、アリルアルコール、塩化ベンザルコニウム、ベトキサジン、ブロモタロニル（ｂｒｏｍｏｔｈａｌｏｎｉｌ）、キトサン、クロロピクリン、ＤＢＣＰ、デヒドロ酢酸、ジクロメジン、ジエチルピロカーボネート、エチリシン（ｅｔｈｙｌｉｃｉｎ）、フェナミノスルフ、フェニトロパン、フェンプロピジン、ホルムアルデヒド、フルフラール、ヘキサクロロブタジエン、メチルイソチオシアネート、ニトロスチレン、ニトロタル－イソプロピル、ＯＣＨ、ペンタクロロフェニルラウレート、２－フェニルフェノール、フタリド、ピペラリン、プロパミジン、プロキナジド、ピロキロン、ナトリウムオルトフェニルフェノキシド、スピロキサミン、スルトロペン、チシオフェン、トリシクラゾール）またはメフェノキサム。

本発明のいくつかの実施形態において、本明細書で提供される細菌株もしくはその活性改変体、および／またはこれらに由来する組成物、ならびに少なくとも１種の殺生物剤を、空間的に別個にした配置において含むパーツのキットが、提供される。いくつかの実施形態において、上記殺生物剤は、除草剤、殺真菌剤、殺虫剤、農薬、または他の農作物保護化学物質である。

本発明の非限定的実施形態は、以下を包含する：

１． 以下：
（ａ）細菌株ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体の少なくとも１つであって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、そしてここで前記細菌株もしくはその活性改変体は、約１０^５ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１２ ＣＦＵ／ｇまたは約１０^５ ＣＦＵ／ｍｌ～約１０^１２ ＣＦＵ／ｍｌで存在する、細菌株またはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つ；
（ｂ）ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１つに由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせのうちの少なくとも１つであって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、そしてここで前記胞子、前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせ、またはこれらのうちのいずれかの活性改変体は、約１０^５ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１２ ＣＦＵ／ｇまたは約１０^５ ＣＦＵ／ｍｌ～約１０^１２ ＣＦＵ／ｍｌで存在する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせのうちの少なくとも１つ；ならびに／あるいは
（ｃ）細菌株ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つの全細胞培養物に由来する上清、濾液、または抽出物であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含む、上清、濾液、または抽出物、
を含む組成物。

２． 前記植物有害生物は、真菌有害生物を含む、実施形態１に記載の組成物。

３． 前記真菌有害生物は、Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｓｐｐ．、Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｌａｖｕｓ、Ｂｏｔｒｙｔｉｓ ｃｉｎｅｒｅａ、Ｃｅｒｓｏｓｐｏｒａ ｓｐｐ、Ｃｅｒｃｏｓｐｏｒａ ｓｏｊｉｎａ、Ｃｅｒｃｏｓｐｏｒａ ｂｅｔｉｃｏｌａ、Ａｌｔｅｒｎａｒｉａ ｓｏｌａｎｉ、Ｒｈｉｚｏｃｔｏｎｉａ ｓｏｌａｎｉ、Ｂｌｕｍｅｒｉａ ｇｒａｍｉｎｉｓ、Ｂｒｅｍｉａ ｌａｃｔｕｃａｅ、Ｅｒｙｓｉｐｈｅ ｎｅｃａｔｏｒ、Ｐｏｄｏｓｐｈａｅｒａ ｓｐｐ．、Ｐｏｄｏｓｐｈａｅｒａ ｘａｎｔｈｉｉ、Ｇｏｌｏｖｉｎｏｍｙｃｅｓ ｃｉｃｈｏｒａｃｅａｒｕｍ、Ｅｒｙｓｉｐｈｅ ｌａｇｅｒｓｔｒｏｅｍｉａｅ、Ｓｐｈａｅｒｏｔｈｅｃａ ｐａｎｎｏｓａ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｍ ｓｐｐ．、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｓｕｂｌｉｎｅｏｌｕｍ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｃｅｒｅａｌｅ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｇｌｏｅｏｓｐｏｒｉｏｄｅｓ、Ａｐｉｏｇｎｏｍｏｎｉａ ｅｒｒａｂｕｎｄａ、Ａｐｉｏｇｎｏｍｏｎｉａ ｖｅｎｅｔａ、Ｄｉｓｃｕｌａ ｆｒａｘｉｎｅａ、Ｐｌａｓｍｏｐａｒａ ｖｉｔｉｃｏｌａ、Ｐｓｅｕｄｏｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｃｕｂｅｎｓｉｓ、Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｓｐｐ．、Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｂｅｌｂａｈｒｉｉ、Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｌａｍｉｉ、Ｐｌａｓｍｏｐａｒａ ｏｂｄｕｓｃｅｎｓ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｃｒｙｐｔｏｉｒｒｅｇｕｌａｒｅ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ａｐｈａｎｉｄｅｒｍａｔｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｉｒｒｅｇｕｌａｒｅ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｓｙｌｖａｔｉｃｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｍｙｒｉｏｔｙｌｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｕｌｔｉｍｕｍ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｓｐｐ．、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｃａｐｓｉｃｉ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｎｉｃｏｔｉａｎａｅ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｉｎｆｅｓｔａｎｓ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｓｏｊａｅ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｓｐｐ．、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｖｉｒｇｕｌｉｆｏｒｍｅ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｇｒａｍｉｎｅａｒｕｍ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｓｏｌａｎｉ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｏｘｙｓｐｏｒｕｍ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｇｒａｍｉｎｉｃｏｌａ、Ｇｉｂｂｅｒｅｌｌａ ｚｅａｅ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｇｒａｍｉｎｉｃｏｌａ、Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｓｐｐ．、Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｍｅｉｂｏｍｉａｅ、Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｐａｃｈｙｒｉｚｉ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｔｒｉｔｉｃｉｎａ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｒｅｃｏｎｄｉｔａ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｓｔｒｉｉｆｏｒｍｉｓ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｇｒａｍｉｎｉｓ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｓｐｐ．、Ｖｅｎｔｕｒｉａ ｉｎａｅｑｕａｌｉｓ、Ｖｅｒｔｉｃｉｌｌｉｕｍ ｓｐｐ、Ｍｙｃｏｓｐｈａｅｒｅｌｌａ ｓｐｐ．、Ｍｙｃｏｓｐｈａｅｒｅｌｌａ ｆｉｊｉｅｎｓｉｓ、Ｍｏｎｉｌｉｎｉａ ｆｒｕｃｔｉｃｏｌａ、Ｍｏｎｉｌｉｎｉａ ｌａｘ、およびＭｏｎｉｌｉｎｉａ ｆｒｕｃｔｉｇｅｎａからなる群より選択される１種もしくはこれより多くの真菌病原体を含む、実施形態２に記載の組成物。

４． 前記有害生物は、昆虫有害生物である、実施形態１に記載の組成物。

５． 前記昆虫有害生物は、甲虫類、鱗翅類、または半翅類の昆虫である、実施形態４に記載の組成物。

６． 前記細胞、胞子、前胞子、または細胞、胞子、および／もしくは前胞子の組み合わせ、またはこれらのうちのいずれかの活性誘導体は、約１０^５ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１０ ＣＦＵ／ｇでまたは約１０^５ ＣＦＵ／ｍｌ～約１０^１０ ＣＦＵ／ｍｌで存在する、実施形態１～５のいずれかに記載の組成物。

７． 前記組成物は、細胞ペーストを含む、実施形態１～６のいずれかに記載の組成物。

８． 前記組成物は、水和剤を含む、実施形態１～７のいずれか１つに記載の組成物。

９． 細菌株ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つの細胞、胞子、前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせを含む細胞ペーストを含む組成物であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する、細胞、胞子、前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせを含み；
ここで有効量の前記組成物は、植物有害生物を制御するか、または植物の目的の農学上の形質を改善する、
組成物。

１０． 前記植物有害生物は、真菌有害生物を含む、実施形態９に記載の組成物。

１１． 前記真菌有害生物は、Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｓｐｐ．、Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｌａｖｕｓ、Ｂｏｔｒｙｔｉｓ ｃｉｎｅｒｅａ、Ｃｅｒｓｏｓｐｏｒａ ｓｐｐ、Ｃｅｒｃｏｓｐｏｒａ ｓｏｊｉｎａ、Ｃｅｒｃｏｓｐｏｒａ ｂｅｔｉｃｏｌａ、Ａｌｔｅｒｎａｒｉａ ｓｏｌａｎｉ、Ｒｈｉｚｏｃｔｏｎｉａ ｓｏｌａｎｉ、Ｂｌｕｍｅｒｉａ ｇｒａｍｉｎｉｓ、Ｂｒｅｍｉａ ｌａｃｔｕｃａｅ、Ｅｒｙｓｉｐｈｅ ｎｅｃａｔｏｒ、Ｐｏｄｏｓｐｈａｅｒａ ｓｐｐ．、Ｐｏｄｏｓｐｈａｅｒａ ｘａｎｔｈｉｉ、Ｇｏｌｏｖｉｎｏｍｙｃｅｓ ｃｉｃｈｏｒａｃｅａｒｕｍ、Ｅｒｙｓｉｐｈｅ ｌａｇｅｒｓｔｒｏｅｍｉａｅ、Ｓｐｈａｅｒｏｔｈｅｃａ ｐａｎｎｏｓａ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｍ ｓｐｐ．、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｓｕｂｌｉｎｅｏｌｕｍ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｃｅｒｅａｌｅ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｇｌｏｅｏｓｐｏｒｉｏｄｅｓ、Ａｐｉｏｇｎｏｍｏｎｉａ ｅｒｒａｂｕｎｄａ、Ａｐｉｏｇｎｏｍｏｎｉａ ｖｅｎｅｔａ、Ｄｉｓｃｕｌａ ｆｒａｘｉｎｅａ、Ｐｌａｓｍｏｐａｒａ ｖｉｔｉｃｏｌａ、Ｐｓｅｕｄｏｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｃｕｂｅｎｓｉｓ、Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｓｐｐ．、Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｂｅｌｂａｈｒｉｉ、Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｌａｍｉｉ、Ｐｌａｓｍｏｐａｒａ ｏｂｄｕｓｃｅｎｓ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｃｒｙｐｔｏｉｒｒｅｇｕｌａｒｅ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ａｐｈａｎｉｄｅｒｍａｔｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｉｒｒｅｇｕｌａｒｅ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｓｙｌｖａｔｉｃｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｍｙｒｉｏｔｙｌｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｕｌｔｉｍｕｍ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｓｐｐ．、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｃａｐｓｉｃｉ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｎｉｃｏｔｉａｎａｅ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｉｎｆｅｓｔａｎｓ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｓｏｊａｅ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｓｐｐ．、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｖｉｒｇｕｌｉｆｏｒｍｅ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｇｒａｍｉｎｅａｒｕｍ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｓｏｌａｎｉ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｏｘｙｓｐｏｒｕｍ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｇｒａｍｉｎｉｃｏｌａ、Ｇｉｂｂｅｒｅｌｌａ ｚｅａｅ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｇｒａｍｉｎｉｃｏｌａ、Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｓｐｐ．、Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｍｅｉｂｏｍｉａｅ、Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｐａｃｈｙｒｉｚｉ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｔｒｉｔｉｃｉｎａ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｒｅｃｏｎｄｉｔａ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｓｔｒｉｉｆｏｒｍｉｓ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｇｒａｍｉｎｉｓ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｓｐｐ．、Ｖｅｎｔｕｒｉａ ｉｎａｅｑｕａｌｉｓ、Ｖｅｒｔｉｃｉｌｌｉｕｍ ｓｐｐ、Ｍｙｃｏｓｐｈａｅｒｅｌｌａ ｓｐｐ．、Ｍｙｃｏｓｐｈａｅｒｅｌｌａ ｆｉｊｉｅｎｓｉｓ、Ｍｏｎｉｌｉｎｉａ ｆｒｕｃｔｉｃｏｌａ、Ｍｏｎｉｌｉｎｉａ ｌａｘ、およびＭｏｎｉｌｉｎｉａ ｆｒｕｃｔｉｇｅｎａからなる群より選択される１種もしくはこれより多くの真菌病原体を含む、実施形態１０に記載の組成物。

１２． 前記植物有害生物は、昆虫有害生物である、実施形態９に記載の組成物。

１３． 前記昆虫有害生物は、甲虫類、鱗翅類、または半翅類の昆虫である、実施形態１２に記載の組成物。

１４． 以下：
（ａ）細菌株ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つであって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、そしてここで前記細菌株もしくはその活性改変体は、約１０^５ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１２ ＣＦＵ／ｇまたは約１０^５ ＣＦＵ／ｍｌ～約１０^１２ ＣＦＵ／ｍｌで存在する、細菌株またはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つ；
（ｂ）ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれかに由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせのうちの少なくとも１つであって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、そしてここで前記胞子、前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせ、またはこれらのうちのいずれかの活性改変体は、約１０^５ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１２ ＣＦＵ／ｇまたは約１０^５ ＣＦＵ／ｍｌ～約１０^１２ ＣＦＵ／ｍｌで存在する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせのうちの少なくとも１つ；ならびに／または
（ｃ）細菌株ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つの全細胞培養物に由来する上清、濾液、または抽出物であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含む、上清、濾液、または抽出物；
を含む水和剤を含む組成物であって、
ここで有効量の前記組成物は、植物有害生物を制御するか、または植物の目的の農学上の形質を改善する、
組成物。

１５． 前記植物有害生物は、少なくとも１種の真菌有害生物を含む、実施形態１４に記載の組成物。

１６． 前記真菌有害生物は、Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｓｐｐ．、Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｌａｖｕｓ、Ｂｏｔｒｙｔｉｓ ｃｉｎｅｒｅａ、Ｃｅｒｓｏｓｐｏｒａ ｓｐｐ、Ｃｅｒｃｏｓｐｏｒａ ｓｏｊｉｎａ、Ｃｅｒｃｏｓｐｏｒａ ｂｅｔｉｃｏｌａ、Ａｌｔｅｒｎａｒｉａ ｓｏｌａｎｉ、Ｒｈｉｚｏｃｔｏｎｉａ ｓｏｌａｎｉ、Ｂｌｕｍｅｒｉａ ｇｒａｍｉｎｉｓ、Ｂｒｅｍｉａ ｌａｃｔｕｃａｅ、Ｅｒｙｓｉｐｈｅ ｎｅｃａｔｏｒ、Ｐｏｄｏｓｐｈａｅｒａ ｓｐｐ．、Ｐｏｄｏｓｐｈａｅｒａ ｘａｎｔｈｉｉ、Ｇｏｌｏｖｉｎｏｍｙｃｅｓ ｃｉｃｈｏｒａｃｅａｒｕｍ、Ｅｒｙｓｉｐｈｅ ｌａｇｅｒｓｔｒｏｅｍｉａｅ、Ｓｐｈａｅｒｏｔｈｅｃａ ｐａｎｎｏｓａ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｍ ｓｐｐ．、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｓｕｂｌｉｎｅｏｌｕｍ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｃｅｒｅａｌｅ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｇｌｏｅｏｓｐｏｒｉｏｄｅｓ、Ａｐｉｏｇｎｏｍｏｎｉａ ｅｒｒａｂｕｎｄａ、Ａｐｉｏｇｎｏｍｏｎｉａ ｖｅｎｅｔａ、Ｄｉｓｃｕｌａ ｆｒａｘｉｎｅａ、Ｐｌａｓｍｏｐａｒａ ｖｉｔｉｃｏｌａ、Ｐｓｅｕｄｏｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｃｕｂｅｎｓｉｓ、Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｓｐｐ．、Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｂｅｌｂａｈｒｉｉ、Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｌａｍｉｉ、Ｐｌａｓｍｏｐａｒａ ｏｂｄｕｓｃｅｎｓ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｃｒｙｐｔｏｉｒｒｅｇｕｌａｒｅ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ａｐｈａｎｉｄｅｒｍａｔｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｉｒｒｅｇｕｌａｒｅ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｓｙｌｖａｔｉｃｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｍｙｒｉｏｔｙｌｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｕｌｔｉｍｕｍ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｓｐｐ．、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｃａｐｓｉｃｉ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｎｉｃｏｔｉａｎａｅ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｉｎｆｅｓｔａｎｓ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｓｏｊａｅ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｓｐｐ．、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｖｉｒｇｕｌｉｆｏｒｍｅ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｇｒａｍｉｎｅａｒｕｍ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｓｏｌａｎｉ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｏｘｙｓｐｏｒｕｍ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｇｒａｍｉｎｉｃｏｌａ、Ｇｉｂｂｅｒｅｌｌａ ｚｅａｅ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｇｒａｍｉｎｉｃｏｌａ、Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｓｐｐ．、Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｍｅｉｂｏｍｉａｅ、Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｐａｃｈｙｒｉｚｉ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｔｒｉｔｉｃｉｎａ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｒｅｃｏｎｄｉｔａ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｓｔｒｉｉｆｏｒｍｉｓ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｇｒａｍｉｎｉｓ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｓｐｐ．、Ｖｅｎｔｕｒｉａ ｉｎａｅｑｕａｌｉｓ、Ｖｅｒｔｉｃｉｌｌｉｕｍ ｓｐｐ、Ｍｙｃｏｓｐｈａｅｒｅｌｌａ ｓｐｐ．、Ｍｙｃｏｓｐｈａｅｒｅｌｌａ ｆｉｊｉｅｎｓｉｓ、Ｍｏｎｉｌｉｎｉａ ｆｒｕｃｔｉｃｏｌａ、Ｍｏｎｉｌｉｎｉａ ｌａｘ、およびＭｏｎｉｌｉｎｉａ ｆｒｕｃｔｉｇｅｎａからなる群より選択される１種もしくはこれより多くの真菌病原体を含む、
実施形態１５に記載の組成物。

１７． 前記植物有害生物（ｐｌａｎｔ ｐｌｅｓｔ）は、少なくとも１種の昆虫有害生物を含む、実施形態１４に記載の組成物。

１８． 前記昆虫有害生物は、甲虫類、鱗翅類、および／または半翅類の昆虫である、実施形態１６に記載の組成物。

１９． 前記活性改変体は、少なくとも１つの除草剤、殺線虫剤、殺真菌剤、農薬、殺虫剤、または他の農作物保護化学物質に対して抵抗性である、実施形態１４～１８のいずれか１つに記載の組成物。

２０． 前記活性改変体は、除草剤、殺真菌剤、農薬、殺虫剤、または他の農作物保護化学物質の圧の下で選択され、前記除草剤、殺真菌剤、農薬、殺虫剤、または他の農作物保護化学物質に対して抵抗性である、実施形態１９に記載の組成物。

２１． 前記活性改変体は、前記細胞、胞子、前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせを除草剤抵抗性にする、除草剤抵抗性遺伝子で形質転換されている、実施形態１４～２０のいずれか１つに記載の組成物。

２２． 前記除草剤は、グリホサート、グルホシネート（グルタミンシンターゼインヒビター）、スルホニルウレアおよびイミダゾリノン除草剤（分枝鎖アミノ酸合成インヒビター）からなる群より選択される、実施形態２１に記載の組成物。

２３． ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体の細胞、胞子、前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせを含む細菌株の単離された生物学的に純粋な培養物であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細胞、胞子、前胞子、または細胞、胞子、および／もしくは前胞子の組み合わせを含み；
ここで有効量の前記細胞、胞子、前胞子、または細胞、胞子、および／もしくは前胞子の組み合わせは、植物有害生物を制御するか、または植物の目的の農学上の形質を改善する、
単離された生物学的に純粋な培養物。

２４． 前記細菌株は、除草剤、殺真菌剤、農薬、殺虫剤、または農作物保護化学物質から選択される殺生物剤に対して抵抗性であり、ここで前記培養物は、前記殺生物剤の存在下で成長させることによって生産される、実施形態２３に記載の単離された生物学的に純粋な培養物。

２５． 前記生物学的に純粋な培養物は、グリホサートの存在下で成長できる、実施形態２４に記載の単離された生物学的に純粋な培養物。

２６． 前記植物有害生物は、真菌有害生物を含む、実施形態２３～２５のいずれか１つに記載の単離された生物学的に純粋な培養物。

２７． 前記真菌有害生物は、Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｓｐｐ．、Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｌａｖｕｓ、Ｂｏｔｒｙｔｉｓ ｃｉｎｅｒｅａ、Ｃｅｒｓｏｓｐｏｒａ ｓｐｐ、Ｃｅｒｃｏｓｐｏｒａ ｓｏｊｉｎａ、Ｃｅｒｃｏｓｐｏｒａ ｂｅｔｉｃｏｌａ、Ａｌｔｅｒｎａｒｉａ ｓｏｌａｎｉ、Ｒｈｉｚｏｃｔｏｎｉａ ｓｏｌａｎｉ、Ｂｌｕｍｅｒｉａ ｇｒａｍｉｎｉｓ、Ｂｒｅｍｉａ ｌａｃｔｕｃａｅ、Ｅｒｙｓｉｐｈｅ ｎｅｃａｔｏｒ、Ｐｏｄｏｓｐｈａｅｒａ ｓｐｐ．、Ｐｏｄｏｓｐｈａｅｒａ ｘａｎｔｈｉｉ、Ｇｏｌｏｖｉｎｏｍｙｃｅｓ ｃｉｃｈｏｒａｃｅａｒｕｍ、Ｅｒｙｓｉｐｈｅ ｌａｇｅｒｓｔｒｏｅｍｉａｅ、Ｓｐｈａｅｒｏｔｈｅｃａ ｐａｎｎｏｓａ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｍ ｓｐｐ．、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｓｕｂｌｉｎｅｏｌｕｍ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｃｅｒｅａｌｅ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｇｌｏｅｏｓｐｏｒｉｏｄｅｓ、Ａｐｉｏｇｎｏｍｏｎｉａ ｅｒｒａｂｕｎｄａ、Ａｐｉｏｇｎｏｍｏｎｉａ ｖｅｎｅｔａ、Ｄｉｓｃｕｌａ ｆｒａｘｉｎｅａ、Ｐｌａｓｍｏｐａｒａ ｖｉｔｉｃｏｌａ、Ｐｓｅｕｄｏｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｃｕｂｅｎｓｉｓ、Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｓｐｐ．、Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｂｅｌｂａｈｒｉｉ、Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｌａｍｉｉ、Ｐｌａｓｍｏｐａｒａ ｏｂｄｕｓｃｅｎｓ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｃｒｙｐｔｏｉｒｒｅｇｕｌａｒｅ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ａｐｈａｎｉｄｅｒｍａｔｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｉｒｒｅｇｕｌａｒｅ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｓｙｌｖａｔｉｃｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｍｙｒｉｏｔｙｌｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｕｌｔｉｍｕｍ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｓｐｐ．、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｃａｐｓｉｃｉ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｎｉｃｏｔｉａｎａｅ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｉｎｆｅｓｔａｎｓ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｓｏｊａｅ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｓｐｐ．、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｖｉｒｇｕｌｉｆｏｒｍｅ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｇｒａｍｉｎｅａｒｕｍ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｓｏｌａｎｉ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｏｘｙｓｐｏｒｕｍ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｇｒａｍｉｎｉｃｏｌａ、Ｇｉｂｂｅｒｅｌｌａ ｚｅａｅ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｇｒａｍｉｎｉｃｏｌａ、Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｓｐｐ．、Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｍｅｉｂｏｍｉａｅ、Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｐａｃｈｙｒｉｚｉ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｔｒｉｔｉｃｉｎａ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｒｅｃｏｎｄｉｔａ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｓｔｒｉｉｆｏｒｍｉｓ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｇｒａｍｉｎｉｓ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｓｐｐ．、Ｖｅｎｔｕｒｉａ ｉｎａｅｑｕａｌｉｓ、Ｖｅｒｔｉｃｉｌｌｉｕｍ ｓｐｐ、Ｍｙｃｏｓｐｈａｅｒｅｌｌａ ｓｐｐ．、Ｍｙｃｏｓｐｈａｅｒｅｌｌａ ｆｉｊｉｅｎｓｉｓ、Ｍｏｎｉｌｉｎｉａ ｆｒｕｃｔｉｃｏｌａ、Ｍｏｎｉｌｉｎｉａ ｌａｘ、およびＭｏｎｉｌｉｎｉａ ｆｒｕｃｔｉｇｅｎａからなる群より選択される１種もしくはこれより多くの真菌病原体を含む、実施形態２６に記載の単離された生物学的に純粋な培養物。

２８． 前記植物有害生物は、少なくとも１種の昆虫有害生物を含む、実施形態２３～２５のいずれか１つに記載の単離された生物学的に純粋な培養物。

２９． 前記昆虫有害生物は、甲虫類、鱗翅類、および／または半翅類の昆虫である、実施形態２８に記載の単離された生物学的に純粋な培養物。

３０． ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体の細胞、胞子、前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせから成長される、細菌培養物であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細胞、胞子、前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせを含み；
ここで前記細菌培養物は、グルホシネートの存在下で成長でき；そして
ここで有効量の前記細菌培養物は、植物有害生物を制御するか、または植物の目的の農学上の形質を改善する、細菌培養物。

３１． 前記植物有害生物は、真菌有害生物を含む、実施形態３０に記載の細菌培養物。

３２． 前記真菌有害生物は、Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｓｐｐ．、Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｌａｖｕｓ、Ｂｏｔｒｙｔｉｓ ｃｉｎｅｒｅａ、Ｃｅｒｓｏｓｐｏｒａ ｓｐｐ、Ｃｅｒｃｏｓｐｏｒａ ｓｏｊｉｎａ、Ｃｅｒｃｏｓｐｏｒａ ｂｅｔｉｃｏｌａ、Ａｌｔｅｒｎａｒｉａ ｓｏｌａｎｉ、Ｒｈｉｚｏｃｔｏｎｉａ ｓｏｌａｎｉ、Ｂｌｕｍｅｒｉａ ｇｒａｍｉｎｉｓ、Ｂｒｅｍｉａ ｌａｃｔｕｃａｅ、Ｅｒｙｓｉｐｈｅ ｎｅｃａｔｏｒ、Ｐｏｄｏｓｐｈａｅｒａ ｓｐｐ．、Ｐｏｄｏｓｐｈａｅｒａ ｘａｎｔｈｉｉ、Ｇｏｌｏｖｉｎｏｍｙｃｅｓ ｃｉｃｈｏｒａｃｅａｒｕｍ、Ｅｒｙｓｉｐｈｅ ｌａｇｅｒｓｔｒｏｅｍｉａｅ、Ｓｐｈａｅｒｏｔｈｅｃａ ｐａｎｎｏｓａ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｍ ｓｐｐ．、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｓｕｂｌｉｎｅｏｌｕｍ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｃｅｒｅａｌｅ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｇｌｏｅｏｓｐｏｒｉｏｄｅｓ、Ａｐｉｏｇｎｏｍｏｎｉａ ｅｒｒａｂｕｎｄａ、Ａｐｉｏｇｎｏｍｏｎｉａ ｖｅｎｅｔａ、Ｄｉｓｃｕｌａ ｆｒａｘｉｎｅａ、Ｐｌａｓｍｏｐａｒａ ｖｉｔｉｃｏｌａ、Ｐｓｅｕｄｏｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｃｕｂｅｎｓｉｓ、Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｓｐｐ．、Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｂｅｌｂａｈｒｉｉ、Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｌａｍｉｉ、Ｐｌａｓｍｏｐａｒａ ｏｂｄｕｓｃｅｎｓ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｃｒｙｐｔｏｉｒｒｅｇｕｌａｒｅ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ａｐｈａｎｉｄｅｒｍａｔｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｉｒｒｅｇｕｌａｒｅ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｓｙｌｖａｔｉｃｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｍｙｒｉｏｔｙｌｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｕｌｔｉｍｕｍ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｓｐｐ．、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｃａｐｓｉｃｉ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｎｉｃｏｔｉａｎａｅ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｉｎｆｅｓｔａｎｓ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｓｏｊａｅ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｓｐｐ．、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｖｉｒｇｕｌｉｆｏｒｍｅ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｇｒａｍｉｎｅａｒｕｍ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｓｏｌａｎｉ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｏｘｙｓｐｏｒｕｍ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｇｒａｍｉｎｉｃｏｌａ、Ｇｉｂｂｅｒｅｌｌａ ｚｅａｅ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｇｒａｍｉｎｉｃｏｌａ、Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｓｐｐ．、Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｍｅｉｂｏｍｉａｅ、Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｐａｃｈｙｒｉｚｉ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｔｒｉｔｉｃｉｎａ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｒｅｃｏｎｄｉｔａ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｓｔｒｉｉｆｏｒｍｉｓ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｇｒａｍｉｎｉｓ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｓｐｐ．、Ｖｅｎｔｕｒｉａ ｉｎａｅｑｕａｌｉｓ、Ｖｅｒｔｉｃｉｌｌｉｕｍ ｓｐｐ、Ｍｙｃｏｓｐｈａｅｒｅｌｌａ ｓｐｐ．、Ｍｙｃｏｓｐｈａｅｒｅｌｌａ ｆｉｊｉｅｎｓｉｓ、Ｍｏｎｉｌｉｎｉａ ｆｒｕｃｔｉｃｏｌａ、Ｍｏｎｉｌｉｎｉａ ｌａｘ、およびＭｏｎｉｌｉｎｉａ ｆｒｕｃｔｉｇｅｎａからなる群より選択される１種もしくはこれより多くの真菌病原体を含む、実施形態３１に記載の細菌培養物。

３３． 前記植物有害生物は、昆虫有害生物である、実施形態３０に記載の細菌培養物。

３４． 前記昆虫有害生物は、甲虫類、鱗翅類、および／または半翅類の昆虫である、実施形態３３に記載の細菌培養物。

３５． 植物有害生物集団を制御するための方法であって、前記方法は、前記集団と、有効量の、実施形態１～２２のいずれか１つに記載の組成物、実施形態２３～２９のいずれか１つに記載の単離された生物学的に純粋な培養物、または実施形態３０～３４のいずれか１つに記載の細菌培養物とを接触させる工程を包含し、ここで前記細菌株は、前記植物有害生物を制御する、方法。

３６． 植物有害生物もしくは植物有害生物によって引き起こされる植物の病気に感受性である植物を成長させるか、または植物において目的の農学上の形質を改善するための方法であって、前記方法は、前記植物に、
（ａ）有効量の、細菌株ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１種であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、前記有効量は、少なくとも約１０^１２～１０^１６ コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタールを含む、少なくとも１種；
（ｂ）有効量の、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６またはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１つに由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせのうちの少なくとも１種であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、前記有効量は、少なくとも約１０^１２～１０^１６ コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタールを含む、少なくとも１種；ならびに／あるいは
（ｃ）有効量の、細菌株ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つの全細胞培養物に由来する上清、濾液、または抽出物であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含む、上清、濾液、または抽出物；
を適用する工程を包含し、
ここで前記有効量は、前記植物有害生物を制御するか、または前記目的の農学上の形質を改善する、方法。

３７． 前記方法は、前記植物有害生物に対して感受性である植物の収量を増大させる、実施形態３６に記載の方法。

３８． 前記植物は、ダイズである、実施形態３６または３７に記載の方法。

３９． 前記植物有害生物は、真菌有害生物を含む、実施形態３６～３８のいずれか１つに記載の方法。

４０． 前記真菌有害生物は、Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｓｐｐ．、Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｌａｖｕｓ、Ｂｏｔｒｙｔｉｓ ｃｉｎｅｒｅａ、Ｃｅｒｓｏｓｐｏｒａ ｓｐｐ、Ｃｅｒｃｏｓｐｏｒａ ｓｏｊｉｎａ、Ｃｅｒｃｏｓｐｏｒａ ｂｅｔｉｃｏｌａ、Ａｌｔｅｒｎａｒｉａ ｓｏｌａｎｉ、Ｒｈｉｚｏｃｔｏｎｉａ ｓｏｌａｎｉ、Ｂｌｕｍｅｒｉａ ｇｒａｍｉｎｉｓ、Ｂｒｅｍｉａ ｌａｃｔｕｃａｅ、Ｅｒｙｓｉｐｈｅ ｎｅｃａｔｏｒ、Ｐｏｄｏｓｐｈａｅｒａ ｓｐｐ．、Ｐｏｄｏｓｐｈａｅｒａ ｘａｎｔｈｉｉ、Ｇｏｌｏｖｉｎｏｍｙｃｅｓ ｃｉｃｈｏｒａｃｅａｒｕｍ、Ｅｒｙｓｉｐｈｅ ｌａｇｅｒｓｔｒｏｅｍｉａｅ、Ｓｐｈａｅｒｏｔｈｅｃａ ｐａｎｎｏｓａ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｍ ｓｐｐ．、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｓｕｂｌｉｎｅｏｌｕｍ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｃｅｒｅａｌｅ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｇｌｏｅｏｓｐｏｒｉｏｄｅｓ、Ａｐｉｏｇｎｏｍｏｎｉａ ｅｒｒａｂｕｎｄａ、Ａｐｉｏｇｎｏｍｏｎｉａ ｖｅｎｅｔａ、Ｄｉｓｃｕｌａ ｆｒａｘｉｎｅａ、Ｐｌａｓｍｏｐａｒａ ｖｉｔｉｃｏｌａ、Ｐｓｅｕｄｏｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｃｕｂｅｎｓｉｓ、Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｓｐｐ．、Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｂｅｌｂａｈｒｉｉ、Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｌａｍｉｉ、Ｐｌａｓｍｏｐａｒａ ｏｂｄｕｓｃｅｎｓ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｃｒｙｐｔｏｉｒｒｅｇｕｌａｒｅ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ａｐｈａｎｉｄｅｒｍａｔｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｉｒｒｅｇｕｌａｒｅ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｓｙｌｖａｔｉｃｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｍｙｒｉｏｔｙｌｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｕｌｔｉｍｕｍ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｓｐｐ．、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｃａｐｓｉｃｉ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｎｉｃｏｔｉａｎａｅ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｉｎｆｅｓｔａｎｓ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｓｏｊａｅ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｓｐｐ．、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｖｉｒｇｕｌｉｆｏｒｍｅ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｇｒａｍｉｎｅａｒｕｍ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｓｏｌａｎｉ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｏｘｙｓｐｏｒｕｍ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｇｒａｍｉｎｉｃｏｌａ、Ｇｉｂｂｅｒｅｌｌａ ｚｅａｅ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｇｒａｍｉｎｉｃｏｌａ、Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｓｐｐ．、Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｍｅｉｂｏｍｉａｅ、Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｐａｃｈｙｒｉｚｉ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｔｒｉｔｉｃｉｎａ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｒｅｃｏｎｄｉｔａ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｓｔｒｉｉｆｏｒｍｉｓ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｇｒａｍｉｎｉｓ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｓｐｐ．、Ｖｅｎｔｕｒｉａ ｉｎａｅｑｕａｌｉｓ、Ｖｅｒｔｉｃｉｌｌｉｕｍ ｓｐｐ、Ｍｙｃｏｓｐｈａｅｒｅｌｌａ ｓｐｐ．、Ｍｙｃｏｓｐｈａｅｒｅｌｌａ ｆｉｊｉｅｎｓｉｓ、Ｍｏｎｉｌｉｎｉａ ｆｒｕｃｔｉｃｏｌａ、Ｍｏｎｉｌｉｎｉａ ｌａｘ、ａｎｄ Ｍｏｎｉｌｉｎｉａ ｆｒｕｃｔｉｇｅｎａからなる群より選択される１種もしくはこれより多くの真菌病原体を含む、実施形態３９に記載の方法。

４１． 前記植物有害生物は、昆虫有害生物である、実施形態３６～３８のいずれか１つに記載の方法。

４２． 前記昆虫有害生物は、甲虫類、鱗翅類、および／または半翅類の昆虫である、実施形態４１に記載の方法。

４３． 栽培地において植物有害生物を制御する方法であって、前記方法は、
（ａ）前記栽培地に、前記植物有害生物に感受性である種子または植物を植える工程；および
（ｂ）前記植物有害生物に感受性である種子または植物に、以下：
（ｉ）有効量の、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体を含む少なくとも１種の細菌株であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、そしてここで前記有効量は、少なくとも約１０^１２～１０^１６ コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタールを含む、少なくとも１種の細菌株；
（ｉｉ）有効量の、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１つに由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせを含む少なくとも１種の細菌株であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、そしてここで前記有効量は、少なくとも約１０^１２～１０^１６ コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタールを含む、少なくとも１種の細菌株；あるいは
（ｉｉｉ）有効量の、細菌株ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１種の全細胞培養物に由来する上清、濾液、または抽出物であって、ここで活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含む、上清、濾液、または抽出物；
を適用する工程を包含し、
ここで前記有効量は、栽培地において植物有害生物を制御する、方法。

４４． 前記種子または植物は、ダイズである、実施形態４３に記載の方法。

４５． 前記植物有害生物は、真菌有害生物を含む、実施形態４３または４４に記載の方法。

４６． 前記真菌有害生物は、Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｓｐｐ．、Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｌａｖｕｓ、Ｂｏｔｒｙｔｉｓ ｃｉｎｅｒｅａ、Ｃｅｒｓｏｓｐｏｒａ ｓｐｐ、Ｃｅｒｃｏｓｐｏｒａ ｓｏｊｉｎａ、Ｃｅｒｃｏｓｐｏｒａ ｂｅｔｉｃｏｌａ、Ａｌｔｅｒｎａｒｉａ ｓｏｌａｎｉ、Ｒｈｉｚｏｃｔｏｎｉａ ｓｏｌａｎｉ、Ｂｌｕｍｅｒｉａ ｇｒａｍｉｎｉｓ、Ｂｒｅｍｉａ ｌａｃｔｕｃａｅ、Ｅｒｙｓｉｐｈｅ ｎｅｃａｔｏｒ、Ｐｏｄｏｓｐｈａｅｒａ ｓｐｐ．、Ｐｏｄｏｓｐｈａｅｒａ ｘａｎｔｈｉｉ、Ｇｏｌｏｖｉｎｏｍｙｃｅｓ ｃｉｃｈｏｒａｃｅａｒｕｍ、Ｅｒｙｓｉｐｈｅ ｌａｇｅｒｓｔｒｏｅｍｉａｅ、Ｓｐｈａｅｒｏｔｈｅｃａ ｐａｎｎｏｓａ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｍ ｓｐｐ．、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｓｕｂｌｉｎｅｏｌｕｍ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｃｅｒｅａｌｅ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｇｌｏｅｏｓｐｏｒｉｏｄｅｓ、Ａｐｉｏｇｎｏｍｏｎｉａ ｅｒｒａｂｕｎｄａ、Ａｐｉｏｇｎｏｍｏｎｉａ ｖｅｎｅｔａ、Ｄｉｓｃｕｌａ ｆｒａｘｉｎｅａ、Ｐｌａｓｍｏｐａｒａ ｖｉｔｉｃｏｌａ、Ｐｓｅｕｄｏｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｃｕｂｅｎｓｉｓ、Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｓｐｐ．、Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｂｅｌｂａｈｒｉｉ、Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｌａｍｉｉ、Ｐｌａｓｍｏｐａｒａ ｏｂｄｕｓｃｅｎｓ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｃｒｙｐｔｏｉｒｒｅｇｕｌａｒｅ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ａｐｈａｎｉｄｅｒｍａｔｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｉｒｒｅｇｕｌａｒｅ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｓｙｌｖａｔｉｃｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｍｙｒｉｏｔｙｌｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｕｌｔｉｍｕｍ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｓｐｐ．、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｃａｐｓｉｃｉ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｎｉｃｏｔｉａｎａｅ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｉｎｆｅｓｔａｎｓ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｓｏｊａｅ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｓｐｐ．、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｖｉｒｇｕｌｉｆｏｒｍｅ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｇｒａｍｉｎｅａｒｕｍ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｓｏｌａｎｉ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｏｘｙｓｐｏｒｕｍ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｇｒａｍｉｎｉｃｏｌａ、Ｇｉｂｂｅｒｅｌｌａ ｚｅａｅ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｇｒａｍｉｎｉｃｏｌａ、Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｓｐｐ．、Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｍｅｉｂｏｍｉａｅ、Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｐａｃｈｙｒｉｚｉ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｔｒｉｔｉｃｉｎａ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｒｅｃｏｎｄｉｔａ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｓｔｒｉｉｆｏｒｍｉｓ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｇｒａｍｉｎｉｓ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｓｐｐ．、Ｖｅｎｔｕｒｉａ ｉｎａｅｑｕａｌｉｓ、Ｖｅｒｔｉｃｉｌｌｉｕｍ ｓｐｐ、Ｍｙｃｏｓｐｈａｅｒｅｌｌａ ｓｐｐ．、Ｍｙｃｏｓｐｈａｅｒｅｌｌａ ｆｉｊｉｅｎｓｉｓ、Ｍｏｎｉｌｉｎｉａ ｆｒｕｃｔｉｃｏｌａ、Ｍｏｎｉｌｉｎｉａ ｌａｘ、およびＭｏｎｉｌｉｎｉａ ｆｒｕｃｔｉｇｅｎａからなる群より選択される１種もしくはこれより多くの真菌病原体を含む、実施形態４５に記載の方法。

４７． 前記植物有害生物は、昆虫有害生物である、実施形態４３または４４に記載の方法。

４８． 前記昆虫有害生物は、甲虫類、鱗翅類、および／または半翅類の昆虫である、実施形態４６に記載の方法。

４９． 前記方法は、有効量の殺生物剤を適用する工程をさらに包含し、ここで前記有効量の殺生物剤は、目的の生物を選択的に制御すると同時に、前記種子または植物に有意に損傷を与えない、実施形態４３～４８のいずれか１つに記載の方法。

５０． 前記細胞、胞子、前胞子、または細胞、胞子、および／もしくは前胞子の組み合わせ、またはこれらのうちのいずれかの活性改変体ならびに前記殺生物剤は、同時に適用される、実施形態４９に記載の方法。

５１． 前記細胞、胞子、前胞子、または細胞、胞子、および／もしくは前胞子の組み合わせ、またはこれらのうちのいずれかの活性改変体ならびに前記殺生物剤は、逐次的に適用される、実施形態４９に記載の方法。

５２． 前記殺生物剤は、殺線虫剤である、実施形態４９～５１のいずれか１つに記載の方法。

５３． 改変された細菌株を作製する方法であって、前記方法は、
（ａ）ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体を含む少なくとも１種の細菌株の細胞、胞子、前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせの集団を提供する工程であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細胞、胞子、前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせを含み、ここで前記集団は、目的の殺生物剤に感受性である、工程；
（ｂ）前記集団を、前記目的の殺生物剤の存在下で培養する工程；ならびに
（ｃ）前記目的の殺生物剤に対して増大した抵抗性を有する改変された細菌株を選択する工程、
を包含する、方法。

５４． 前記培養する工程は、前記殺生物剤の濃度を経時的に増大させる工程を包含する、実施形態５３に記載の方法。

５５． 前記殺生物剤は、グリホサートまたはグルホシネートである、実施形態５３または５４に記載の方法。

５６． 植物有害生物によって引き起こされる植物の病気または損傷を処理または防止する方法であって、前記方法は、前記植物有害生物、前記植物の病気、前記損傷を有し、前記植物有害生物に感受性であるか、または前記植物の病気もしくは損傷を発生させるリスクにある植物に、以下：
（ａ）細菌株ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つであって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、前記有効量は、少なくとも約１０^１２～１０^１６ ＣＦＵ／ヘクタールを含む、少なくとも１つ；
（ｂ）ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１種に由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせのうちの少なくとも１つであって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、ここで前記有効量は、少なくとも約１０^１２～１０^１６ ＣＦＵ／ヘクタールを含む、少なくとも１つ；ならびに／あるいは
（ｃ）有効量の、細菌株ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つの全細胞培養物に由来する上清、濾液、または抽出物であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含む、上清、濾液、または抽出物；
を適用する工程を包含し、ここで前記有効量は、前記植物の病気を引き起こす前記植物有害生物を制御する、方法。

５７． 前記植物は、ダイズである、実施形態５６に記載の方法。

５８． 前記細菌株もしくはその活性改変体は、１種もしくはこれより多くの植物の病気を処理または防止する、実施形態５６または５７に記載の方法。

５９． 前記１種もしくはこれより多くの植物の病気は、真菌有害生物によって引き起こされる、実施形態５８に記載の方法。

６０． 前記真菌有害生物は、Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｓｐｐ．、Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｆｌａｖｕｓ、Ｂｏｔｒｙｔｉｓ ｃｉｎｅｒｅａ、Ｃｅｒｓｏｓｐｏｒａ ｓｐｐ、Ｃｅｒｃｏｓｐｏｒａ ｓｏｊｉｎａ、Ｃｅｒｃｏｓｐｏｒａ ｂｅｔｉｃｏｌａ、Ａｌｔｅｒｎａｒｉａ ｓｏｌａｎｉ、Ｒｈｉｚｏｃｔｏｎｉａ ｓｏｌａｎｉ、Ｂｌｕｍｅｒｉａ ｇｒａｍｉｎｉｓ、Ｂｒｅｍｉａ ｌａｃｔｕｃａｅ、Ｅｒｙｓｉｐｈｅ ｎｅｃａｔｏｒ、Ｐｏｄｏｓｐｈａｅｒａ ｓｐｐ．、Ｐｏｄｏｓｐｈａｅｒａ ｘａｎｔｈｉｉ、Ｇｏｌｏｖｉｎｏｍｙｃｅｓ ｃｉｃｈｏｒａｃｅａｒｕｍ、Ｅｒｙｓｉｐｈｅ ｌａｇｅｒｓｔｒｏｅｍｉａｅ、Ｓｐｈａｅｒｏｔｈｅｃａ ｐａｎｎｏｓａ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｍ ｓｐｐ．、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｓｕｂｌｉｎｅｏｌｕｍ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｃｅｒｅａｌｅ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｇｌｏｅｏｓｐｏｒｉｏｄｅｓ、Ａｐｉｏｇｎｏｍｏｎｉａ ｅｒｒａｂｕｎｄａ、Ａｐｉｏｇｎｏｍｏｎｉａ ｖｅｎｅｔａ、Ｄｉｓｃｕｌａ ｆｒａｘｉｎｅａ、Ｐｌａｓｍｏｐａｒａ ｖｉｔｉｃｏｌａ、Ｐｓｅｕｄｏｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｃｕｂｅｎｓｉｓ、Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｓｐｐ．、Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｂｅｌｂａｈｒｉｉ、Ｐｅｒｏｎｏｓｐｏｒａ ｌａｍｉｉ、Ｐｌａｓｍｏｐａｒａ ｏｂｄｕｓｃｅｎｓ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｃｒｙｐｔｏｉｒｒｅｇｕｌａｒｅ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ａｐｈａｎｉｄｅｒｍａｔｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｉｒｒｅｇｕｌａｒｅ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｓｙｌｖａｔｉｃｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｍｙｒｉｏｔｙｌｕｍ、Ｐｙｔｈｉｕｍ ｕｌｔｉｍｕｍ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｓｐｐ．、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｃａｐｓｉｃｉ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｎｉｃｏｔｉａｎａｅ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｉｎｆｅｓｔａｎｓ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ、Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｓｏｊａｅ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｓｐｐ．、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｖｉｒｇｕｌｉｆｏｒｍｅ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｇｒａｍｉｎｅａｒｕｍ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｓｏｌａｎｉ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｏｘｙｓｐｏｒｕｍ、Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｇｒａｍｉｎｉｃｏｌａ、Ｇｉｂｂｅｒｅｌｌａ ｚｅａｅ、Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｇｒａｍｉｎｉｃｏｌａ、Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｓｐｐ．、Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｍｅｉｂｏｍｉａｅ、Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｐａｃｈｙｒｉｚｉ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｔｒｉｔｉｃｉｎａ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｒｅｃｏｎｄｉｔａ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｓｔｒｉｉｆｏｒｍｉｓ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｇｒａｍｉｎｉｓ、Ｐｕｃｃｉｎｉａ ｓｐｐ．、Ｖｅｎｔｕｒｉａ ｉｎａｅｑｕａｌｉｓ、Ｖｅｒｔｉｃｉｌｌｉｕｍ ｓｐｐ、Ｍｙｃｏｓｐｈａｅｒｅｌｌａ ｓｐｐ．、Ｍｙｃｏｓｐｈａｅｒｅｌｌａ ｆｉｊｉｅｎｓｉｓ、Ｍｏｎｉｌｉｎｉａ ｆｒｕｃｔｉｃｏｌａ、Ｍｏｎｉｌｉｎｉａ ｌａｘ、およびＭｏｎｉｌｉｎｉａ ｆｒｕｃｔｉｇｅｎａからなる群より選択される１種もしくはこれより多くの真菌病原体を含む、実施形態５９に記載の方法。

６１． 前記１種もしくはこれより多くの植物の病気は、昆虫有害生物によって引き起こされる、実施形態５８に記載の方法。

６２． 前記昆虫有害生物は、甲虫類、鱗翅類、および／または半翅類の昆虫である、実施形態６１に記載の方法。

６３． 殺生物剤ならびに以下：
（ａ）細菌株ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つであって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含む、少なくとも１つ、
（ｂ）ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１つに由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせのうちの少なくとも１つであって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含む、少なくとも１つ；ならびに／あるいは
（ｃ）細菌株ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つの全細胞培養物に由来する上清、濾液、または抽出物であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含む、上清、濾液、または抽出物、
のうちの少なくとも１つを含むパーツのキット。

６４． 前記殺生物剤は、除草剤、殺真菌剤、殺虫剤、殺線虫剤、または農薬である、実施形態６３に記載のキット。
以下の実施例は、例証のために提供されるのであって、限定のために提供されるのではない。

実施例１．微生物株および培養方法
表２： 有害生物活性の阻害を評価するために選択された細菌株

表２に示される細菌株を、培地中で培養した。表３Ａは、インキュベーション時間および達成される細菌濃度（ＣＦＵ／ｍｌ）をまとめる。表３Ｂは、培地配合表を提供する。
表３Ａ： 培養条件

表３Ｂ： 培地配合表

実施例２：アジア型ダイズさび病に対する細菌株の評価

植物材料： 感受性ダイズ品種Ｗｉｌｌｉａｍｓ ８２を、切断葉（ｄｅｔａｃｈｅｄ－ｌｅａｆ）技術（Ｔｗｉｚｅｙｉｍａｎａ ａｎｄ Ｈａｒｔｍａｎ， ２０１０）を使用して、および生育チャンバ中の全植物体を使用して、株評価において使用した。簡潔には、ダイズ種子を、１８セルプラスチック挿入物中に蒔き、これにソイルレスミックス（Ｓｕｎｓｈｉｎｅ Ｍｉｘ， ＬＣ１； Ｓｕｎ Ｇｒｏ Ｈｏｒｔｉｃｕｌｔｕｒｅ Ｉｎｃ．， Ｂｅｌｌｅｖｕｅ， ＷＡ）を満たし、平箱の中に置いた。セルに、蒔いたときに、遅延放出ペレット（Ｏｓｍｏｃｏｔｅ １９－６－１２； ２ペレット／ｃｍ^２）を施肥した。平箱を、７０％ 相対湿度（ＲＨ）で、１４時間明および１０時間暗の毎日のサイクルで、それぞれ２４℃および２０℃において維持した生育チャンバ（Ｐｅｒｃｉｖａｌ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ， Ｉｎｃ．， Ｂｏｏｎｅ， ＩＡ）の中で維持した。

細菌株：表２に示される細菌株を、Ｌｕｒｉａ Ｂｅｒｔａｎｉ培地上に、または液体培養（１Ｌあたり、ＮａＣｌ（５ｇ）、トリプトン（１０ｇ）、栄養ブロス（８ｇ）、ＣａＣｌ_２（０．１４ｍＭ）、ＭｇＣｌ_２・６Ｈ_２Ｏ（０．２ｍＭ）、およびＭｎＣｌ_２・４Ｈ_２Ｏ（０．０１ｍＭ）からなるＣＨＡ培地）において、プレートし、精製して、単一のコロニーを得た。単一のコロニーを形態学的にまたは分子技術を使用して特徴付けた。

Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｐａｃｈｙｒｈｉｚｉ単離体：単離体ＦＬ０７－１を、全ての接種において使用した。その単離体は、２００７年にＧａｄｓｅｄｅｎ Ｃｏｕｎｔｙ（Ｆｌｏｒｉｄａ）から集めたダイズ感染葉から得た単一の胞子単離体であった。

株評価：
切断葉に対する評価： 簡潔には、葉のディスク（各３ｃｍ直径）に、１２０μｌのＰ． ｐａｃｈｙｒｈｉｚｉの細菌株（１×１０^８ 胞子／ｍｌ 水）を噴霧した。葉のディスクに、細菌株の適用の１日後に、１２０μｌ Ｐ． ｐａｃｈｙｒｈｉｚｉの胞子懸濁物（１×１０^４ 胞子／ｍｌ 滅菌蒸留水）を接種した。上記細菌株およびＰ．ｐａｃｈｙｒｈｉｚｉ接種物の適用の両方を、空気コンプレッサーに取り付けた噴霧器を使用して行った（Ｔｗｉｚｅｙｉｍａｎａ ａｎｄ Ｈａｒｔｍａｎ， ２０１０）。葉のディスクを、プラスチック容器（Ｂｌｉｓｔｅｒ Ｂｏｘ ２０×２０ｃｍ， Ｐｌａｃｏｎ， Ｍａｄｉｓｏｎ， ＷＩ）中で、飽和２０×２０ｃｍ 濾紙（Ｗｈａｔｍａｎ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｌｔｄ．， Ｋｅｎｔ， Ｅｎｇｌａｎｄ）上に向軸面を下にして置いた；２枚の濾紙を１箱あたり使用した。葉のディスクの入った箱を、遮光して１２時間インキュベートし、続いて、２３℃および９５％ ＲＨで維持した組織チャンバ（Ｐｅｒｃｉｖａｌ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ， Ｉｎｃ．）の中で１３時間明（３８０ｕｍｏｌ ｍ－２ｓ－１）および１１時間暗のサイクルでインキュベートした。インキュベーションの前に、箱をジップバッグ（Ｗｅｂｓｔｅｒ Ｉｎｄｕｓｔｒｉｅｓ， Ｐｅａｂｏｄｙ， ＭＡ）の中に入れた。その実験設計は、２つの複製を伴う完全乱塊法（ｒａｎｄｏｍｉｚｅｄ ｃｏｍｐｌｅｔｅ ｂｌｏｃｋ ｄｅｓｉｇｎ）であり、１回反復した。

全植物体に対する評価： 細菌株を、それらの夏胞子層の計数に基づいて初期スクリーニング（葉のディスクを使用して行った）から選択し、生育チャンバ中での全植物体に対して評価した。この評価では、植物がＶ２ステージ（Ｆｅｈｒら １９７１）にあるときに、第１の完全に拡がった三つ葉に、上記細菌株を噴霧し、Ｐ．ｐａｃｈｙｒｈｉｚｉでの接種を、切断葉評価において記載されるように１日後に行った。噴霧した植物を、それぞれ、２２℃および２４℃において、７５％ ＲＨでの生育チャンバ中、１４時間および１０時間の明暗の１日サイクルで維持した。その実験設計は、３つの複製を伴う完全乱塊法であり、１回反復した。

データ収集および結果：両方の評価において、記録したデータは、接種後１４日間記録した１ｃｍ直径の円の中の夏胞子層の数（夏胞子層の計数）であった。１ｃｍ直径の円の中で＜１０ 夏胞子層を有する９個の細菌株を、生育チャンバ中の全植物体に対する評価後に、圃場で試験するために選択した。
表４：Ｐｈａｋｏｐｓｏｒａ ｐａｃｈｙｒｈｉｚｉに対する細菌株の活性

実施例３：トマトに対する疫病に対する細菌株の評価

トマト品種Ｍｏｎｅｙ Ｍａｋｅｒを、剥離葉アッセイにおいて使用して、目的の細菌株を評価した。４～５週齢のトマト植物の完全に拡がった葉を切除し、３．５ｃｍ直径コルクボーラーを使用して、等しいサイズのディスクにした。接種物を調製するために、Ｐ．ｉｎｆｅｓｔａｎｓ（遺伝子型ＵＳ－２３）を、ノースカロライナのトマトから単離した（Ｎｏｒｔｈ Ｃａｒｏｌｉｎａ Ｓｔａｔｅ ＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙのＲｉｓｔａｉｎｏ博士の研究室から得た）。２週齢の活発に成長している培養物を、滅菌蒸留水で水浸しにし、菌糸体をそぎ落とした。次いで、菌糸体懸濁物を一貫性のために破断した。

目的の細菌株の各々を、Ｌｕｒｉａ Ｂｅｒｔａｎｉ（ＬＢ）アガーペトリプレートに画線培養した。１個のコロニーを拾い上げ、５０ｍｌのＬＢ液体培地中に、または２５０ｍｌ フラスコ中の液体培養（ＣＨＡ培地；１Ｌあたり、ＮａＣｌ（５ｇ）、トリプトン（１０ｇ）、栄養ブロス（８ｇ）、ＣａＣｌ_２（０．１４ｍＭ）、ＭｇＣｌ_２・６Ｈ_２Ｏ（０．２ｍＭ）、およびＭｎＣｌ_２・４Ｈ_２Ｏ（０．０１ｍＭ））に配置した。細胞をペレット化し、滅菌脱イオン水中で元の容積に再懸濁することによって、４８時間後に培養物を採取した。各培養物を滴定して、標準的な希釈プレート計数法を使用してＣＦＵ／ｍＬを決定し、プレートを夾雑の徴候に関して検査した。滅菌蒸留水を添加して、株の評価に必要とされる最終濃度を達成した。

葉のディスク（各３．５ｃｍ直径）に、１５ｍＬコニカル遠心分離チューブ（Ｆｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ， Ｃａｔ Ｎｏ．１４－５９－５３Ａ）に取り付けたリブ付きスカート微細ミストフィンガーチップ噴霧器（ｒｉｂｂｅｄ ｓｋｉｒｔ ｆｉｎｅ ｍｉｓｔ ｆｉｎｇｅｒｔｉｐ ｓｐｒａｙｅｒ）（ＩＤ－Ｓ００９， Ｃｏｎｔａｉｎｅｒ ＆ Ｐａｃｋａｇｉｎｇ Ｓｕｐｐｌｙ， Ｅａｇｌｅ， ＩＤ）を使用して、１２０μＬの細菌株（１×１０^８ ＣＦＵ／ｍＬ、塩化マグネシウム緩衝液中に懸濁）を噴霧した。葉のディスクに、細菌株の適用の２４時間後に、３０μＬ液滴のＰ．ｉｎｆｅｓｔａｎｓ菌糸懸濁物を接種した。その葉のディスクを、プラスチック容器（ＢｌｉｓｔｅｒＢｏｘ Ｐ５８８７， ２０×２０ｃｍ， Ｐｌａｃｏｎ， Ｍａｄｉｓｏｎ， ＷＩ）の中で、背軸面をＷｈａｔｍａｎ^ＴＭ ３ＭＭ クロマトグラフィー紙、２０×２０ｃｍ（Ｆｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｃａｔ Ｎｏ． ３０３０－８６１）の飽和させた二重層と接触させて置いた。葉のディスクの入った箱を、二重ジッパー付きガロンサイズ保存バッグ（ＺＩＰ ＩＧＳ２５０－４４８６３２， ＡＥＰ Ｉｎｄｕｓｔｒｉａｌ Ｉｎｃ． Ｍｏｎｔｖａｌｅ ＮＪ）の内側に入れ、１３時間明および１１時間暗のサイクルに設定し、１８℃および９５％ ＲＨに維持した生育チャンバ（Ｐｅｒｃｉｖａｌ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ， Ｉｎｃ）においてインキュベートした。実験設計は、２つの複製を伴う完全乱塊法であり、実験を１回反復した。

疫病重篤度を、７日後に評価した。病気の制御のパーセントは、病原体による感染をどの程度十分に防止したかを示す。結果を表５に示す。
表５： Ｐｈｙｔｏｐｈｔｈｏｒａ ｉｎｆｅｓｔａｎｓに対する細菌株の活性

実施例４：Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｓｕｂｌｉｎｅｏｌｕｍ（ソルガム炭疽病）に対する細菌株の評価）

ソルガム品種１２－ＧＳ９０１６－ＫＳ５８５を、細菌株評価用の葉組織を安定して供給するために、温室の中で生長させた。４～６週齢の植物の完全に拡がったソルガムの葉を切除し、２．５ｃｍ幅の等しい小片に切断した。Ｃｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍ ｓｕｂｌｉｎｅｏｌｕｍ（Ｔｅｘａｓ Ａ＆Ｍ ＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙのＩｓａｋｅｉｔ博士の研究室から得た）を、２０％ オートミールアガー上で１４日間成長させた。活発に成長している培養物を、滅菌蒸留水で水浸しにして、胞子を追い出した。次いで、懸濁物の濃度を、１×１０^６ 胞子／ｍＬに調節した。次いで、Ｔｗｅｅｎ（登録商標） ２０を０．０５％になるようにその懸濁物に添加した。

目的の細菌株の各々を、Ｌｕｒｉａ Ｂｅｒｔａｎｉ（ＬＢ）アガーペトリプレートに画線培養した。１個のコロニーを拾い上げ、５０ｍｌのＬＢ液体培地中に、または２５０ｍｌ フラスコ中の液体培養（ＣＨＡ培地；１Ｌあたり、ＮａＣｌ（５ｇ）、トリプトン（１０ｇ）、栄養ブロス（８ｇ）、ＣａＣｌ_２（０．１４ｍＭ）、ＭｇＣｌ_２・６Ｈ_２Ｏ（０．２ｍＭ）、およびＭｎＣｌ_２・４Ｈ_２Ｏ（０．０１ｍＭ））に配置した。細胞をペレット化し、滅菌脱イオン水中で元の容積に再懸濁することによって、４８時間後に培養物を採取した。各培養物を滴定して、標準的な希釈プレート計数法を使用してＣＦＵ／ｍＬを決定し、プレートを夾雑の徴候に関して検査した。滅菌蒸留水を添加して、株の評価に必要とされる最終濃度を達成した。

葉片に、１５ｍＬコニカル遠心分離チューブ（Ｆｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ， Ｃａｔ Ｎｏ．１４－５９－５３Ａ）に取り付けたリブ付きスカート微細ミストフィンガーチップ噴霧器（ＩＤ－Ｓ００９， Ｃｏｎｔａｉｎｅｒ ＆ Ｐａｃｋａｇｉｎｇ Ｓｕｐｐｌｙ， Ｅａｇｌｅ， ＩＤ）を使用して、１２０μＬの各細菌株（１×１０^８ ＣＦＵ／ｍＬ、塩化マグネシウム緩衝液中に懸濁）を噴霧した。次いで、その処理した葉片を、６－ベンジルアミノプリン（ＢＡＰ）改変１％素寒天（ｗａｔｅｒ ａｇａｒ）上にプレートし、室温において暗所でインキュベートした。処理の２４時間後、その葉片に、中間リブの各側に適用した、３０μＬ液滴のＣ．ｓｕｂｌｉｎｅｏｌｕｍ胞子懸濁物を接種した。次いで、そのプレートを、１２時間明期に設定し、２５℃および９５％相対湿度において維持した生育チャンバ（Ｐｅｒｃｉｖａｌ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ， Ｉｎｃ）の中でインキュベートした。実験設計は、２つの複製を伴う完全乱塊法であり、実験を２回反復した。

炭疽病重篤度を、Ｐｒｏｍら，２０１６（Ｐｌａｎｔ Ｐａｔｈ Ｊ． １５（１）： １１－１６）に従ってわずかに改変して、７日後に０～４のスケールで評価した。０＝症状または斑紋（ｃｈｌｏｒｏｔｉｃ ｆｌｅｃｋｓ）なし；１＝分生子層を伴わない過敏反応；２＝微小のおよび数個の分生子層を伴う病変；３＝葉組織のうちの≦２５％に微小のおよび数個の分生子層を伴う病変；ならびに４＝葉表面のうちの≧２５％を覆う分生子層を伴う病変。結果（表６）を、ＪＭＰ（登録商標）（バージョン１３．２．１； ＳＡＳ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ Ｉｎｃ．， Ｃａｒｙ， ＮＣ）の中の分散分析（ＡＮＯＶＡ）を使用して分析し、有意差（Ｐ＜０．０５）を、細菌株間で観察した。
表６：ソルガムの剥離葉アッセイでの細菌株による炭疽病制御（％）

実施例５： Ｐｏｄｏｓｐｈａｅｒａ ｘａｎｔｈｉｉ（ウリ科植物に対するうどんこ病）に対する細菌株の評価

健康な押しつぶした葉のディスクを切除し、大型コルクボーラーを使用して、直径３５ｍｍの均一な葉のディスクへと切断した。実験ユニットは、１枚の葉ディスク（各々、選択した細菌の懸濁物で処理）からなった。処理は、ＡｇＢｉｏｍｅ株ＡＩＰ０６１３８２、ＡＩＰ０７５６５５、およびＡＩＰ０２９１０５、ならびにコントロール処理を含んだ。コントロールは、非接種のおよび接種した葉のディスク、ならびに陽性コントロールとして１０ｐｐｍの合成殺真菌剤テブコナゾールであった。細菌株を、実施例２に記載されるように調製した。各葉のディスクに、２００μＬの処理（細菌懸濁物または合成殺真菌剤）を向軸面に、病原体Ｐｏｄｏｓｐｈａｅｒａ ｘａｎｔｈｉｉ（ＭｃＧｒａｔｈ博士の研究室（Ｃｏｒｎｅｌｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ）から得た株）を接種する２４時間前に噴霧した。上記殺真菌剤での処理後、葉のディスクを、２３℃において２４時間暗所でインキュベートした。

葉のディスクに、上記処理した葉の表面にＰ．ｘａｎｔｈｉｉ分生子の１×１０^６ 懸濁物を噴霧することによって接種した。処理したものを、密封した透明なブラスチック箱の中に入れ、２５℃において、相対湿度８０％および１２時間明期で６日間インキュベートした。各処理を、０～４の病気の重篤度スケールで評価した。０は症状なしであり、４は、葉ディスクのうちの５０％超がコロニーで覆われている。うどんこ病コロニーの数をまた、各処理に対して記録した。この実験を、各処理を２～３回複製して１回行った。データをＳＡＳ ＪＭＰバージョン１４．０において分析した。結果を表７に示す。

表７： 剥離し、押しつぶした葉のディスクでの細菌株によるうどんこ病の制御

実施例６： Ｍｙｃｏｓｐｈａｅｒｅｌｌａ ｆｉｊｉｅｎｓｉｓ（シガトカ病）に対する細菌株の評価

感受性バナナ品種Ｇｒａｎｄ Ｎａｉｎを使用した。植物を、病気のない葉を絶えず供給するために、温室の中で維持した。この評価において使用した接種物は、Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ ｏｆ Ｔｒｏｐｉｃａｌ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅ（ＩＩＴＡ）（Ｉｂａｄａｎ， Ｎｉｇｅｒｉａ）から得たＭ．ｆｉｊｉｅｎｓｉｓ培養物であり、Ｖ８ジュースアガー上で維持した。

小さな葉片（４ｃｍ長×３ｃｍ幅）を、切除した葉から切断した。２枚の葉片を、プラスチックペトリ皿の中に、向軸側を５ｍｇ／リットル ジベレリン酸改変アガー上に接するようにして入れた。葉片に、フィンガーチップ噴霧器を使用して、１２０μＬの細菌株（１×１０^８ ＣＦＵ／ｍＬ 滅菌蒸留水）を噴霧した。葉片の入ったペトリ皿を、室温において暗所で２４時間インキュベートした。次いで、葉片に、Ｍ．ｆｉｊｉｅｎｓｉｓの菌糸体懸濁物を接種した。成長している培養物からそぎ落とした菌糸体断片を、ホモジナイザー（Ｏｍｎｉ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ， Ｋｅｎｎｅｓａｗ， ＧＡ）を使用して、滅菌蒸留水（５０ｍｌ コニカルチューブ中）の中でより小さな菌糸体先端部に切断した。その懸濁物を、２層のチーズクロスを通して濾過し、次いで、撹拌した。Ｔｗｅｅｎ（登録商標） ２０（０．０５％）および０．０５％ Ｓｉｌｗｅｔ Ｌ－７７（Ｌｏｖｅｌａｎｄ Ｉｎｄｕｓｔｒｉｅｓ Ｉｎｃ．， Ｇｒｅｅｌｅｙ， ＣＯ）を添加し、血球計算板を使用して、その懸濁物を、滅菌蒸留水で１×１０^６ 菌糸体断片／ｍｌの濃度へと調節した。接種の１日後、プレートを、１４時間明期に設定し、２５℃および９０％相対湿度に維持した生育チャンバ（Ｐｅｒｃｉｖａｌ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ， Ｉｎｃ）の中でインキュベートした。

記録したデータは、データ収集の日付での接種した葉上で最も進行したステージであった（シガトカ病症状発生には６つの認識されたステージが存在する）。データを、ＳＡＳ（バージョン９．４； ＳＡＳ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ Ｉｎｃ．， Ｃａｒｙ， ＮＣ）のＰＲＯＣ ＧＬＭの中の分散分析（ＡＮＯＶＡ）を使用して分析し、有意差（Ｐ＜０．０５）を処理間で観察した。結果を表８に示す。
表８： Ｇｒａｎｄ Ｎａｉｎ葉片上での細菌株によるシガトカ病の制御

実施例７： 昆虫種に対する細菌株の評価

実施例７．１： 微生物成長：
出発培養物を、９６ウェルブロックに１ｍｌ（１ウェルあたり）ＬＢ培地を満たすことによって調製する。冷凍庫ストックのスクリーンメイト（ｓｃｒｅｅｎｍａｔｅ）から、ピペットチップまたは白金耳を使用して、ブロックの各ウェルに細菌株を接種する。この出発培養物を、３０℃において、２２５ｒｐｍで２４時間振盪しながら成長させる。アッセイ培養物を、２つの４８ウェルブロックに約１．７ｍｌ（１ウェルあたり）の培地を満たすことによって調製する。その出発培養物の各ウェルから２５μｌをアッセイ培養ブロックに添加する。アッセイブロックを、３０℃で、２４時間、４８時間または７２時間のいずれかにわたって、２２５ｒｐｍにおいて成長させる。

成長させた後、そのアッセイブロックをインキュベーター／振盪機から外し、２０分間、４０００ｒｐｍにおいて遠心分離して、微生物内容物をペレット化する。次いで、そのペレットのみが残るように、その上清を外に注ぐ。次いで、ペレットを０．５ｍｌ緩衝液中で再懸濁し、それらをアッセイにおいて使用するまで氷上に置く。全ての微生物調製物を、調製の１２時間以内に適用する。

実施例７．２：コロラドハムシの葉ディスクアッセイ：
出発培養物を、９６ウェルブロックに１ｍｌ（１ウェルあたり）ＬＢ培地を満たすことによって調製した。そのブロックの各ウェルに、細菌株を接種した。その出発培養物を、３０℃において、２２５ｒｐｍで２４時間振盪しながら成長させた。アッセイ培養物を、２つの４８ウェルブロックに約１．７ｍｌ（１ウェルあたり）の培地を満たすことによって調製した。その出発培養物の各ウェルから２５μｌをアッセイ培養ブロックに添加した。アッセイブロックを、３０℃で、２４時間、４８時間または７２時間のいずれかにわたって、２２５ｒｐｍにおいて成長させた。全ての微生物調製物を、調製の１２時間以内に適用した。

１枚のプレフィルターを、２４ウェルプレートの各ウェルの中に配置した。５０μｌ ｄｄＨ_２Ｏを各フィルターに適用して、実験の間中、相対湿度を維持した。ジャガイモ植物の損傷されておらずまた丸まっていないジャガイモの葉を、使用するのに選択した。＃８ コルクボーラーを使用して、葉のディスクを作製した。１枚の葉のディスクを、葉の上側が、２４ウェルプレートの各ウェルに上を向くように配置した。１００μｌの界面活性剤の１％ストック溶液（Ｓｉｌｗｅｔ ＥＣＯ ｓｐｒｅａｄｅｒ）を、微生物調製物を含む各ウェルに添加した。上記培養物を徹底的に混合し、４０μｌを、ジャガイモの葉のディスク上にピペットで移した。処理を、葉全体に拡げさせた。このプロセスを、あらゆる細菌処理が２枚の葉のディスクに適用されるように反復した。

処理したものが乾燥した後、５～６匹の２齢コロラドハムシ（ＣＰＢ）幼虫を、各ウェルに添加した。ＣＰＢ卵を、ＡｇＢｉｏｍｅ研究室において飼育し、Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｍａｉｎｅから購入した昆虫に由来する。５～６匹の幼虫を各ウェルに添加した後、上記プレートを、感圧式接着カバーで密封し、４個の小さな穴を各ウェルに上に追加した。次いで、プレートを、Ｐｅｒｃｉｖａｌインキュベーターの中に入れ、２６℃および５５％ ＲＨにおいて１２／１２ 明：暗期で２４時間、維持した。２４時間後、プレートを、ＣＰＢ幼虫が消費した各葉のディスクのパーセントについて評価した。次いで、プレートを、インキュベーターに戻した。処理の４８時間後、そのプレートをインキュベーターから取り出し、ＣＰＢ死滅率を、＜２０％推定葉消費が２４時間読み取りで起こった任意のウェルに関して記録した。微生物を、葉のディスクのうちの２０％未満が消費されたおよび／または３回またはこれより多くの独立した反復において８０％超の死滅率が存在した場合に、ＣＰＢに対して活性であるとみなした。結果を表９に示す。「ｎｔ」は、細菌株がＣＰＢ葉ディスクアッセイにおいて試験されなかったことを示す。

実施例７．３： ウェスタンコーンルートワームアッセイ：
ウェスタンコーンルートワーム（ＷＣＲ）の卵を、Ｃｒｏｐ Ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ（Ｆａｒｍｉｎｇｔｏｎ， ＭＮ）から購入した。６０μｌ容積の全培養微生物懸濁物を、２４ウェルプレート（Ｃｅｌｌｓｔａｒ， ２４－ｗｅｌｌ， Ｇｒｅｉｎｅｒ Ｂｉｏ Ｏｎｅ）のウェルの中の食餌の一番上の表面に接種し、乾燥させた。各ウェルは、５００μｌ 食餌（Ｍａｒｒｏｎｅら， １９８５から改変）を含む。１５～２０匹の孵化幼虫を、先端が細い絵筆を使用して各ウェル中に導入し、上記プレートを、膜（Ｖｉｅｗｓｅａｌ， Ｇｒｅｉｎｅｒ Ｂｉｏ Ｏｎｅ）で覆った。バイオアッセイを周囲温度において保存し、４日目に、死滅率、成長阻害、および／または摂食阻害に関してスコア付けした。微生物を、３回またはこれより多くの独立した反復において７０％超の死滅率が存在した場合に、ＷＣＲに対して活性とみなした。結果を表９に示す。
表９： 細菌株による昆虫の制御

実施例８． Ｒｈｉｚｏｃｔｏｎｉａ立ち枯れ病アッセイ－－ ダイズモック種子処理／畝間（Ｉｎ－Ｆｕｒｒｏｗ）

１１～１４日齢のＲｈｉｚｏｃｔｏｎｉａ ｓｏｌａｎｉ感染子実をすり潰す。そのすり潰した接種物を、＃１０スクリーンを通してふるいにかけて、十分にすり潰されていないいかなる子実をも除去する。そのすり潰してふるいにかけた感染子実を、容積で１リットルの土壌ミックスに対してすり潰した接種物を１．５グラムで、Ｆａｆａｒｄスーパーファイン発芽培地に添加する。発芽ミックス、接種物、および７５リットルの発芽培地あたり１リットルの水を、セメントミキサーに添加し、全てが十分に一体化するまで混合する。その十分に一体化した培地－接種物材料を、第２のふた付き保持容器の中に入れ、アッセイにおいて使用する前に２０℃において１８時間保持する。

６０６セルの植え付けトレイに、接種された発芽培地を堅く詰め込みすぎないように確認して、その培地を満たす。１粒のダイズ種子を、６０６セルごとに蒔いて、１．５～２ｃｍの深さに埋め、処理を液体製剤として適用する場合には、植え穴を開いたままにする。個々の植え付けセルを、セル／種子あたり３ｍｌにおいて、表２に示される再懸濁した株で処理する。種子処理は、その種子の上部に対して直接行う。一旦処理を適用した後に、その振盪平箱を軽く振盪して、植え穴を閉じる。その植え付けトレイに軽く水を遣り、平箱上の育苗ドーム（ｈｕｍｉｄｉｔｙ ｄｏｍｅ）内に置く。３～４日後に、平箱を水分に関してチェックし、必要に応じて軽く水を遣って、セルが一様に湿っていることを確実にする。その育苗ドームを、水遣りの後に交換する。

データ収集および結果： １０～１２日後、そのアッセイを評価して、発芽した種子の数を決定する。データを、１処理あたり合計６粒の種子の中で発芽した種子のパーセントとして報告する。

実施例９． 種々の細菌株もしくはその活性改変体についての圃場試験

表２に記載される種々の細菌株を、圃場のダイズに適用する。処理を、ＡＳＲ処理に関する一般処理ガイドラインに従って均一な植物カバレッジを達成するために処理を適用するようにして、１６．８ガロン／エーカーで適用する。第１の処理を、Ｒ１で適用し、追跡処理を、第１の処理の１４日後および２８日後に適用する。その具体的処理を以下に概説する。
処理：
１． 非処理チェック
２． 接種チェック
３． ６．２オンス／エーカーでＱｕａｄｒｉｓ
４． ２．１オンス／エーカーでＱｕａｄｒｉｓ
５． ７．５ｇ／ＬでＡＩＰ０４５８８５
６． ７．５ｇ／ＬでＡＩＰ０７５６５５
７． ７．５ｇ／ＬでＡＩＰ００９４７４
８． ７．５ｇ／ＬでＡＩＰ０２４５２５
９． ７．５ｇ／ＬでＡＩＰ０３３２８７
１０． ７．５ｇ／ＬでＡＩＰ０９３７９８
１１． ７．５ｇ／ＬでＡＩＰ０６１６３９
１２。 ７．５ｇ／ＬでＡＩＰ０８２８６２
１３． ７．５ｇ／ＬでＡＩＰ０５８１８７
１４． ７．５ｇ／ＬでＡＩＰ０５９２８６
１５． ７．５ｇ／ＬでＡＩＰ０３６７０６

実施例１０． 種々の細菌株に関する種々の真菌有害生物に対する圃場試験

表２に記載される種々の細菌株を、表６に列挙される現在の農耕法の下で圃場において表６に列挙される作物に適用して、均一な植物カバレッジを達成し、適切な農耕法に従う。病気につき適切なタイミングで、処理を防止的におよび／または治癒的に適用する。
表６

その具体的処理を以下に概説する：
葉面有害生物処理リスト：夏疫病
６～１０処理
処理容積：１００ガロン／エーカー
処理リスト：
１． 非接種、非処理チェック
２． 接種チェック
３． ラベル説明書に適用された協力者が選択した化学物質制御
４． ラベル説明書に適用された生物学的制御Ｓｅｒｅｎａｄｅ
５． ５ｇ／Ｌでの実験的生物学的葉面処理＋３オンス／１００ガロンでのＣａｐｓｉｌ

実施例１１． 種子処理を使用する、種々の細菌株もしくはその活性改変体に関する種々の真菌有害生物に対する圃場試験

表２に記載される種々の細菌株を、圃場に植える前に種子処理として表７に列挙される作物に適用する。細菌株処理を、病気の防止的制御のためにそして表８中の適用割合で適用する。その具体的処理を以下に概説する。
表７

種子処理試験処理リスト：
１． 非接種チェック
２． 接種チェック
３． 協力者が選択しかつ適用した病気の適切な種子処理化学チェック
５． 生物学的実験の種子処理
表８

実施例１２． 畝間処理を使用する、種々の細菌株もしくはその活性改変体に関する種々の真菌有害生物に対する圃場試験

表２に記載される種々の細菌株もしくはその活性改変体を、病気の防止的制御としておよび表９に列挙される処理割合で、植えるときに畝間処理として表８に列挙される作物に適用する。その具体的処理を以下に概説する：
畝間試験処理リスト：
１． 非接種チェック
２． 接種チェック
３． 畝間生物学的処理 ５ｇ／Ｌ＋１５ガロン／エーカーにおいて６オンス／１００ガロンでのＣａｐｓｉｌ
４． 協力者が選択しかつ適用したとおりの病気の適切な畝間化学チェック
表９

実施例１３． 生物学的制御株種子処理プロトコル

種子処理製剤を、１０ｇ製剤化株＋３０ｍｌ水＋１５ｍｌ Ｕｎｉｃｏａｔ Ｐｏｌｙｍｅｒを混合することによって作製する。秤量した種子を滅菌したメイソンジャーの中に入れる。種子重量に基づく種子処理溶液の適切な量（．０５ｍｌ／２５ｇ 種子）を、混合物を６０秒間振盪するかまたは種子が視覚的に十分にコーティングされるまで振盪する。その種子を、ホイルローストパン（ｆｏｉｌ ｒｏａｓｔｉｎｇ ｐａｎ）の中に単層にして入れ、１時間、または種子が乾燥するまで、層流フードの下に置く。種子が一旦乾燥した後、それらを気密容器の中に入れて、室温で貯蔵する。

実施例１４． 水和剤製剤
表２中で以下に示した株の各々の１００ｇの細胞ペーストを、５ｇのグリセロールおよび２０ｇの合成ケイ酸カルシウムと、フードプロセッサーを使用して混合する。この材料を、水分活性が０．３０未満になるように４０℃で乾燥させる。その乾燥粉末製剤を、真空封入したマイラーパウチの中に２２℃で貯蔵する。その乾燥粉末製剤は、農薬活性を保持する。

実施例１５． Ｐｙｔｈｉｕｍ圃場試験

表２に記載される細菌株を、種子処理としてダイズ変種Ｗ３１０３に適用する。その細菌株を、実施例１４に記載されるように、水和剤として製剤化し、次いで、１０ｇの製剤化細菌株と３０ｍｌ水および１５ｍｌ Ｓｅｅｄ Ｃｏａｔｉｎｇ Ｐｏｌｙｍｅｒ（Ｕｎｉｃｏａｔ）とを合わせ、次いで、均一な溶液が作製されるまで振盪することによって、種子処理に使用する。その完成した溶液を、１ｋｇのダイズ種子に適用し、層流フードの下で１２時間乾燥させた。

Ｐｙｔｈｉｕｍ接種物を、雑穀の子実上で成長させ、畝間適用を介して１．２５ｇ／ｆｔで適用し、１日目に１３０，０００種子／エーカーで蒔いた処理済みダイズを植えたときに、適用した。全列の立っている数を１７日後に数えた。その具体的処理を以下に概説する。
処理：
１． 非接種チェック
２． 接種チェック
３． ０．４液量オンス／エーカーでＱｕａｄｒｉｓ
４． ＡＩＰ０４５８８５ 種子処理
５． ＡＩＰ０７５６５５ 種子処理
６． ＡＩＰ００９４７４ 種子処理
７． ＡＩＰ０２４５２５ 種子処理
８． ＡＩＰ０３３２８７ 種子処理
９． ＡＩＰ０９３７９８ 種子処理
１０． ＡＩＰ０６１６３９ 種子処理
１１． ＡＩＰ０８２８６２ 種子処理
１２． ＡＩＰ０５８１８７ 種子処理
１３． ＡＩＰ０５９２８６ 種子処理
１４． ＡＩＰ０３６７０６ 種子処理

実施例１６． Ｒｈｉｚｏｃｔｏｎｉａ ｓｏｌａｎｉ圃場試験

表２に記載される細菌株を、種子処理としてダイズ変種Ｗ３１０３に適用する。その細菌株を、実施例１０に注記されるように、水和剤として各々製剤化し、次いで、１０ｇの製剤化細菌株と３０ｍｌ 水および１５ｍｌ Ｓｅｅｄ Ｃｏａｔｉｎｇ Ｐｏｌｙｍｅｒ（Ｕｎｉｃｏａｔ）とを合わせ、次いで、均一な溶液が作製されるまで振盪することによって、種子処理に使用する。その完成した溶液を、１ｋｇのダイズ種子に適用し、層流フードの下で１２時間乾燥させる。

Ｒｈｉｚｏｃｔｏｎｉａ ｓｏｌａｎｉ接種物を、ソルガム子実で成長させ、畝間適用を介して１．２５ｇ／ｆｔで適用し、１日目に１３０，０００種子／エーカーで蒔いた処理済みダイズを植えたときに、適用する。全列の立っている数を、１７日後に数えた。その具体的処理を以下に概説する：
処理：
１． 非接種チェック
２． 接種チェック
３． ０．４液量オンス／エーカーでＱｕａｄｒｉｓ
４． ＡＩＰ０４５８８５ 種子処理
５． ＡＩＰ０７５６５５ 種子処理
６． ＡＩＰ００９４７４ 種子処理
７． ＡＩＰ０２４５２５ 種子処理
８． ＡＩＰ０３３２８７ 種子処理
９． ＡＩＰ０９３７９８ 種子処理
１０． ＡＩＰ０６１６３９ 種子処理
１１． ＡＩＰ０８２８６２ 種子処理
１２． ＡＩＰ０５８１８７ 種子処理
１３． ＡＩＰ０５９２８６ 種子処理
１４． ＡＩＰ０３６７０６ 種子処理

Ｒｈｉｚｏｃｔｏｎｉａ ｓｏｌａｎｉ接種物を、ソルガム子実で成長させ、畝間適用を介して１．２５ｇ／ｆｔで適用し、１日目に１３０，０００種子／エーカーで蒔いた処理済みダイズを植えたときに、適用する。全列の立っている数を、１７日後に数えた。その具体的処理を以下に概説する：
処理：
１． 非接種チェック
２． 接種チェック
３． ０．４液量オンス／エーカーでＱｕａｄｒｉｓ
４． ＡＩＰ０４５８８５ 種子処理
５． ＡＩＰ０７５６５５ 種子処理
６． ＡＩＰ００９４７４ 種子処理
７． ＡＩＰ０２４５２５ 種子処理
８． ＡＩＰ０３３２８７ 種子処理
９． ＡＩＰ０９３７９８ 種子処理
１０． ＡＩＰ０６１６３９ 種子処理
１１． ＡＩＰ０８２８６２ 種子処理
１２． ＡＩＰ０５８１８７ 種子処理
１３． ＡＩＰ０５９２８６ 種子処理
１４． ＡＩＰ０３６７０６ 種子処理
本発明は、例えば以下の項目を提供する。
（項目１）
以下：
（ａ）細菌株ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つであって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、そしてここで前記細菌株もしくはその活性改変体は、約１０ ^５ ＣＦＵ／ｇ～約１０ ^１２ ＣＦＵ／ｇまたは約１０ ^５ ＣＦＵ／ｍｌ～約１０ ^１２ ＣＦＵ／ｍｌで存在する、細菌株またはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つ；
（ｂ）ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１種に由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせのうちの少なくとも１つであって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、そしてここで前記胞子、前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせ、またはこれらのうちのいずれかの活性改変体は、約１０ ^５ ＣＦＵ／ｇ～約１０ ^１２ ＣＦＵ／ｇまたは約１０ ^５ ＣＦＵ／ｍｌ～約１０ ^１２ ＣＦＵ／ｍｌで存在する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせのうちの少なくとも１つ；ならびに／あるいは
（ｃ）細菌株ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つの全細胞培養物に由来する上清、発酵産物、濾液または抽出物であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含む、上清、発酵産物、濾液または抽出物；を含む組成物であって、
ここで有効量の前記組成物は、植物の目的の農学上の形質を改善するか、または植物有害生物もしくは植物の病気を引き起こす植物病原体を制御する、組成物。
（項目２）
前記組成物は、細胞ペースト、水和剤、噴霧乾燥製剤、安定な製剤、または種子処理剤（ｓｅｅｄ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ）を含む、項目１に記載の組成物。
（項目３）
以下：
（ａ）ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含む、細菌株またはこれらのうちのいずれかの活性改変体；あるいは
（ｂ）ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１種に由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせであって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含む、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせ；
を含む細菌株の単離された生物学的に純粋な培養物であって、ここで有効量の前記培養物は、植物有害生物を制御するか、または植物の目的の農学上の形質を改善する、単離された生物学的に純粋な培養物。
（項目４）
前記細菌株は、除草剤、殺真菌剤、農薬、殺虫剤、または農作物保護化学物質から選択される殺生物剤に対して抵抗性であり、前記組成物または培養物は、前記殺生物剤の存在下で成長させることによって生産され、前記細菌株は、植物有害生物または植物の病気を引き起こす植物病原体を制御する、項目１もしくは２に記載の組成物、または項目３に記載の単離された生物学的に純粋な培養物。
（項目５）
前記殺生物剤は、グリホサートまたはグルホシネートを含む、項目４に記載の組成物または単離された生物学的に純粋な培養物。
（項目６）
前記植物有害生物は、昆虫有害生物である、項目１，２、４、および５のいずれか１項に記載の組成物または項目３～５のいずれか１項に記載の単離された生物学的に純粋な培養物。
（項目７）
前記昆虫有害生物は、甲虫類の昆虫有害生物、半翅類の昆虫有害生物、または鱗翅類の昆虫有害生物を含む、項目６に記載の組成物または単離された生物学的に純粋な培養物。
（項目８）
前記植物病原体は、少なくとも１種の真菌病原体を含む、項目１，２、４、および５のいずれか１項に記載の組成物または項目３～５のいずれか１項に記載の単離された生物学的に純粋な培養物。
（項目９）
植物有害生物集団を制御するための方法であって、前記方法は、前記集団と、有効量の、項目１、２、もしくは４～８のいずれか１項に記載の組成物または項目３～８のいずれか１項に記載の単離された生物学的に純粋な培養物とを接触させる工程を包含し、ここで細菌株は、前記植物有害生物を制御する、方法。
（項目１０）
植物有害生物もしくは植物の病気に感受性である植物を生長させるか、または植物において目的の農学上の形質を改善するための方法であって、前記方法は、前記植物に、
（ａ）有効量の、細菌株ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つであって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、前記有効量は、少なくとも約１０ ^１２ ～１０ ^１６ コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタールを含む、細菌株もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つ；
（ｂ）有効量の、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１種に由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせのうちの少なくとも１つであって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、前記有効量は、少なくとも約１０ ^１２ ～１０ ^１６ コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタールを含む、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせのうちの少なくとも１つ；ならびに／あるいは
（ｃ）有効量の、細菌株ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つの全細胞培養物に由来する上清、発酵産物、濾液または抽出物であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含む、上清、発酵産物、濾液または抽出物、
を適用する工程を包含し；
ここで前記有効量は、植物有害生物もしくは前記植物の病気を引き起こす植物病原体を制御するか、または前記目的の農学上の形質を改善する、
方法。
（項目１１）
前記方法は、前記植物の病気に感受性である前記植物の収量を増大させる、項目１０に記載の方法。
（項目１２）
栽培地において植物有害生物または植物の病気を引き起こす植物病原体を制御する方法であって、前記方法は、
（ａ）前記栽培地に、前記植物有害生物または植物の病気に感受性である種子または植物を植える工程；および
（ｂ）前記植物有害生物または植物の病気に感受性である前記植物に、以下：
（ｉ）有効量の、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体を含む少なくとも１種の細菌株であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、そしてここで前記有効量は、少なくとも約１０ ^１２ ～１０ ^１６ コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタールを含む、少なくとも１種の細菌株；
（ｉｉ）有効量の、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１種に由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせを含む少なくとも１種の細菌株であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、そしてここで前記有効量は、少なくとも約１０ ^１２ ～１０ ^１６ コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタールを含む、少なくとも１種の細菌株；あるいは
（ｉｉｉ）有効量の、細菌株ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つの全細胞培養物に由来する上清、発酵産物、濾液または抽出物であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含む、上清、発酵産物、濾液または抽出物；
を含む、有効量の組成物を適用する工程を包含し、
ここで前記有効量は、栽培地において植物有害生物または植物の病気を引き起こす植物病原体を制御する、
方法。
（項目１３）
植物の病気を処理または防止する方法であって、前記方法は、植物有害生物もしくは植物の病気を有するか、または植物有害生物もしくは植物の病気を発生させるリスクにある植物に、有効量の、以下：
（ａ）細菌株ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つであって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、前記有効量は、少なくとも約１０ ^１２ ～１０ ^１６ ＣＦＵ／ヘクタールを含む、細菌株もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つ；ならびに／あるいは
（ｂ）ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１種に由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせのうちの少なくとも１つであって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み；ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、前記有効量は、少なくとも約１０ ^１２ ～１０ ^１６ ＣＦＵ／ヘクタールを含む、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせのうちの少なくとも１つ；ならびに／あるいは
（ｃ）有効量の、細菌株ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つの全細胞培養物に由来する上清、発酵産物、濾液または抽出物であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含む、上清、発酵産物、濾液または抽出物、
を適用する工程を包含し、ここで前記有効量は、前記植物有害生物または前記植物の病気を引き起こす植物病原体を制御する、
方法。
（項目１４）
前記植物有害生物は、昆虫有害生物である、項目９～１３のいずれか１項に記載の方法。
（項目１５）
前記昆虫有害生物は、甲虫類の昆虫有害生物、半翅類の昆虫有害生物、または鱗翅類の昆虫有害生物を含む、項目１４に記載の方法。
（項目１６）
前記植物有害生物または植物病原体は、１種またはこれより多くの真菌病原体である、項目９～１３のいずれか１項に記載の方法。
（項目１７）
前記方法は、有効量の殺生物剤を適用する工程をさらに包含し、ここで前記有効量の殺生物剤は、目的の生物を選択的に制御すると同時に、作物に有意に損傷を与えない、項目９～１６のいずれか１項に記載の方法。
（項目１８）
改変された細菌株を作製する方法であって、前記方法は、
（ａ）ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体を含む少なくとも１種の細菌株の集団を提供する工程であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、前記細菌株は、目的の殺生物剤に感受性である、工程；
（ｂ）前記細菌株を、前記目的の殺生物剤の存在下で培養する工程；ならびに
（ｃ）前記目的の殺生物剤に対して増大した抵抗性を有する改変された細菌株を選択する工程、
を包含する、方法。
（項目１９）
殺生物剤、ならびに：
（ａ）細菌株ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つであって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、ここで有効量は、少なくとも約１０ ^１２ ～１０ ^１６ コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタールを含む、細菌株もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つ；
（ｂ）ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１種に由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせのうちの少なくとも１つであって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、ここで有効量は、少なくとも約１０ ^１２ ～１０ ^１６ コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタールを含む、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせのうちの少なくとも１つ；ならびに／あるいは
（ｃ）細菌株ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つの全細胞培養物に由来する上清、発酵産物、濾液または抽出物であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含む、上清、発酵産物、濾液または抽出物、を含むパーツのキット。
（項目２０）
前記殺生物剤は、除草剤、殺真菌剤、殺虫剤、殺線虫剤、および／または農薬である、項目１９に記載のキット。

Claims (20)

1. 以下：
   （ａ）細菌株ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つであって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、そしてここで前記細菌株もしくはその活性改変体は、約１０^５ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１２ ＣＦＵ／ｇまたは約１０^５ ＣＦＵ／ｍｌ～約１０^１２ ＣＦＵ／ｍｌで存在する、細菌株またはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つ；
   （ｂ）ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１種に由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせのうちの少なくとも１つであって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、そしてここで前記胞子、前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせ、またはこれらのうちのいずれかの活性改変体は、約１０^５ ＣＦＵ／ｇ～約１０^１２ ＣＦＵ／ｇまたは約１０^５ ＣＦＵ／ｍｌ～約１０^１２ ＣＦＵ／ｍｌで存在する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせのうちの少なくとも１つ；ならびに／あるいは
   （ｃ）細菌株ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つの全細胞培養物に由来する上清、発酵産物、濾液または抽出物であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含む、上清、発酵産物、濾液または抽出物；
   を含む組成物であって、
   ここで有効量の前記組成物は、植物の目的の農学上の形質を改善するか、または植物有害生物もしくは植物の病気を引き起こす植物病原体を制御する、組成物。
2. 前記組成物は、細胞ペースト、水和剤、噴霧乾燥製剤、安定な製剤、または種子処理剤（ｓｅｅｄ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ）を含む、請求項１に記載の組成物。
3. 以下：
   （ａ）ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含む、細菌株またはこれらのうちのいずれかの活性改変体；あるいは
   （ｂ）ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１種に由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせであって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含む、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせ；
   を含む細菌株の単離された生物学的に純粋な培養物であって、ここで有効量の前記培養物は、植物有害生物を制御するか、または植物の目的の農学上の形質を改善する、単離された生物学的に純粋な培養物。
4. 前記細菌株は、除草剤、殺真菌剤、農薬、殺虫剤、または農作物保護化学物質から選択される殺生物剤に対して抵抗性であり、前記組成物または培養物は、前記殺生物剤の存在下で成長させることによって生産され、前記細菌株は、植物有害生物または植物の病気を引き起こす植物病原体を制御する、請求項１もしくは２に記載の組成物、または請求項３に記載の単離された生物学的に純粋な培養物。
5. 前記殺生物剤は、グリホサートまたはグルホシネートを含む、請求項４に記載の組成物または単離された生物学的に純粋な培養物。
6. 前記植物有害生物は、昆虫有害生物である、請求項１，２、４、および５のいずれか１項に記載の組成物または請求項３～５のいずれか１項に記載の単離された生物学的に純粋な培養物。
7. 前記昆虫有害生物は、甲虫類の昆虫有害生物、半翅類の昆虫有害生物、または鱗翅類の昆虫有害生物を含む、請求項６に記載の組成物または単離された生物学的に純粋な培養物。
8. 前記植物病原体は、少なくとも１種の真菌病原体を含む、請求項１，２、４、および５のいずれか１項に記載の組成物または請求項３～５のいずれか１項に記載の単離された生物学的に純粋な培養物。
9. 植物有害生物集団を制御するための方法であって、前記方法は、前記集団と、有効量の、請求項１、２、もしくは４～８のいずれか１項に記載の組成物または請求項３～８のいずれか１項に記載の単離された生物学的に純粋な培養物とを接触させる工程を包含し、ここで細菌株は、前記植物有害生物を制御する、方法。
10. 植物有害生物もしくは植物の病気に感受性である植物を生長させるか、または植物において目的の農学上の形質を改善するための方法であって、前記方法は、前記植物に、
    （ａ）有効量の、細菌株ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つであって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、前記有効量は、少なくとも約１０^１２～１０^１６ コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタールを含む、細菌株もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つ；
    （ｂ）有効量の、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１種に由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせのうちの少なくとも１つであって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、前記有効量は、少なくとも約１０^１２～１０^１６ コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタールを含む、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせのうちの少なくとも１つ；ならびに／あるいは
    （ｃ）有効量の、細菌株ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つの全細胞培養物に由来する上清、発酵産物、濾液または抽出物であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含む、上清、発酵産物、濾液または抽出物、
    を適用する工程を包含し；
    ここで前記有効量は、植物有害生物もしくは前記植物の病気を引き起こす植物病原体を制御するか、または前記目的の農学上の形質を改善する、
    方法。
11. 前記方法は、前記植物の病気に感受性である前記植物の収量を増大させる、請求項１０に記載の方法。
12. 栽培地において植物有害生物または植物の病気を引き起こす植物病原体を制御する方法であって、前記方法は、
    （ａ）前記栽培地に、前記植物有害生物または植物の病気に感受性である種子または植物を植える工程；および
    （ｂ）前記植物有害生物または植物の病気に感受性である前記植物に、以下：
    （ｉ）有効量の、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体を含む少なくとも１種の細菌株であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、そしてここで前記有効量は、少なくとも約１０^１２～１０^１６ コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタールを含む、少なくとも１種の細菌株；
    （ｉｉ）有効量の、ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１種に由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせを含む少なくとも１種の細菌株であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、そしてここで前記有効量は、少なくとも約１０^１２～１０^１６ コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタールを含む、少なくとも１種の細菌株；あるいは
    （ｉｉｉ）有効量の、細菌株ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つの全細胞培養物に由来する上清、発酵産物、濾液または抽出物であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含む、上清、発酵産物、濾液または抽出物；
    を含む、有効量の組成物を適用する工程を包含し、
    ここで前記有効量は、栽培地において植物有害生物または植物の病気を引き起こす植物病原体を制御する、
    方法。
13. 植物の病気を処理または防止する方法であって、前記方法は、植物有害生物もしくは植物の病気を有するか、または植物有害生物もしくは植物の病気を発生させるリスクにある植物に、有効量の、以下：
    （ａ）細菌株ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つであって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、前記有効量は、少なくとも約１０^１２～１０^１６ ＣＦＵ／ヘクタールを含む、細菌株もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つ；ならびに／あるいは
    （ｂ）ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１種に由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせのうちの少なくとも１つであって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み；ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、前記有効量は、少なくとも約１０^１２～１０^１６ ＣＦＵ／ヘクタールを含む、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせのうちの少なくとも１つ；ならびに／あるいは
    （ｃ）有効量の、細菌株ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つの全細胞培養物に由来する上清、発酵産物、濾液または抽出物であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含む、上清、発酵産物、濾液または抽出物、
    を適用する工程を包含し、ここで前記有効量は、前記植物有害生物または前記植物の病気を引き起こす植物病原体を制御する、
    方法。
14. 前記植物有害生物は、昆虫有害生物である、請求項９～１３のいずれか１項に記載の方法。
15. 前記昆虫有害生物は、甲虫類の昆虫有害生物、半翅類の昆虫有害生物、または鱗翅類の昆虫有害生物を含む、請求項１４に記載の方法。
16. 前記植物有害生物または植物病原体は、１種またはこれより多くの真菌病原体である、請求項９～１３のいずれか１項に記載の方法。
17. 前記方法は、有効量の殺生物剤を適用する工程をさらに包含し、ここで前記有効量の殺生物剤は、目的の生物を選択的に制御すると同時に、作物に有意に損傷を与えない、請求項９～１６のいずれか１項に記載の方法。
18. 改変された細菌株を作製する方法であって、前記方法は、
    （ａ）ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体を含む少なくとも１種の細菌株の集団を提供する工程であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、前記細菌株は、目的の殺生物剤に感受性である、工程；
    （ｂ）前記細菌株を、前記目的の殺生物剤の存在下で培養する工程；ならびに
    （ｃ）前記目的の殺生物剤に対して増大した抵抗性を有する改変された細菌株を選択する工程、
    を包含する、方法。
19. 殺生物剤、ならびに：
    （ａ）細菌株ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つであって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、ここで有効量は、少なくとも約１０^１２～１０^１６ コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタールを含む、細菌株もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つ；
    （ｂ）ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちのいずれか１種に由来する、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせのうちの少なくとも１つであって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含み、ここで有効量は、少なくとも約１０^１２～１０^１６ コロニー形成単位（ＣＦＵ）／ヘクタールを含む、胞子、もしくは前胞子、または細胞、前胞子および／もしくは胞子の組み合わせのうちの少なくとも１つ；ならびに／あるいは
    （ｃ）細菌株ＡＩＰ０７５６５５、ＡＩＰ０５９２８６、ＡＩＰ０４５８８５、ＡＩＰ０９４７４、ＡＩＰ０２４５２５、ＡＩＰ０３３２８７、ＡＩＰ０９３７９８、ＡＩＰ０６１６３９、ＡＩＰ０８２８６２、ＡＩＰ０５８１８７、ＡＩＰ０３６７０６、もしくはこれらのうちのいずれかの活性改変体のうちの少なくとも１つの全細胞培養物に由来する上清、発酵産物、濾液または抽出物であって、ここで前記活性改変体は、Ｍａｓｈ距離 約０．０１５以内のゲノムを有する細菌株を含む、上清、発酵産物、濾液または抽出物、
    を含むパーツのキット。
20. 前記殺生物剤は、除草剤、殺真菌剤、殺虫剤、殺線虫剤、および／または農薬である、請求項１９に記載のキット。