JP2022508724A - 進行性家族性肝内胆汁鬱滞タイプ3(pfic3)の治療のためのコドン最適化導入遺伝子 - Google Patents

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Abstract

本開示は、進行性家族性肝内胆汁鬱滞タイプ3の治療に使用する遺伝子治療ベクターに関する。より具体的には、本発明は、PFIC3の治療のためのMDR3アイソフォームAをコードするコドン最適化配列を含むアデノ随伴ウイルスベクターに関する。

Description

本開示は、進行性家族性肝内胆汁鬱滞タイプ3の治療に使用する遺伝子治療ベクターに関する。より具体的には、本発明は、PFIC3の治療のためのMDR3アイソフォームAをコードするコドン最適化配列を含むアデノ随伴ウイルスベクターに関する。
進行性家族性肝内胆汁鬱滞タイプ3(PFIC3)は、多剤耐性タンパク質3(MDR3)をコードするアデノシン三リン酸結合カセット、サブファミリーB、4(ABCB4)遺伝子の変異と関連する遺伝病である(Jacquemin EClin Res Hepatol Gastroenterol.2012;36 Suppl 1:S26-35)。肝細胞の小管膜に主に発現するこのタンパク質は、肝細胞膜から胆汁へのホスファチジルコリンの移行に関与するフロッパーゼ(floppase)である。ホスファチジルコリンは、混合ミセルの生成を通して胆汁酸塩の毒性を中和するために必要である。ABCB4遺伝子の変異により、適切なミセル形成が妨げられ、その結果、毛細胆管および胆管上皮が損傷され、胆汁鬱滞が引き起こされる(Jacquemin E.ら.Gastroenterology.2001;120:1448-1458)。
現在、PFIC3の治療法は存在せず、したがって、満たされていない医療ニーズは非常に高い。ウルソデオキシコール酸(UDCA)療法は一部の患者の症状を改善する可能性があるが、肝移植以外では現在のところPFIC3に対する治癒的治療法はない。胆道変更術という形での外科的介入は、患者の転帰を改善する。しかし、感染症などの術後合併症やストーマ袋の問題は患者のQOL(quality of life)に影響を及ぼす一方で、肝硬変や肝癌のリスクは依然として残っている。肝臓移植は有効な治療であるが、そのような複雑な処理に伴う危険性、ならびに状態の再発の可能性を伴う(van der Woerdら World J gastroenterol.2017;23(5):763-775)。
疾患発生の原因となる欠陥遺伝子を修正する遺伝子治療は、多くの疾患に対する有望な治療法である。しかしながら、この技術は依然として研究中である。PFIC3を治療または予防するための肝細胞におけるABCB4の安定な組み込みおよび発現は、WO2015/139093に開示されている。しかしながら、これらの組み込みベクター系は、挿入突然変異誘発を引き起こす潜在的な危険性である主な欠点を示す。進行性家族性肝内胆汁鬱滞3(PFIC3)のような肝臓状態を、ABCB4を含む種々の潜在的治療遺伝子を用いて治療するRNA療法は、WO2017/100551においてのみ示唆された。したがって、挿入突然変異誘発を回避し、一方で安定かつ長期の導入遺伝子発現を可能にする遺伝子治療法を開発する必要性が依然として存在する。ここでは、罹患患者の胆汁中の毒性の原因を復帰させるために、胆汁鬱滞性肝臓での高発現の成功を可能にするMDR3アイソフォームAをコードするコドン最適化配列によるPFIC3遺伝子療法について述べる。
驚くべきことに、本発明者らは、野生型MDR3アイソフォームAとは対照的に、MDR3アイソフォームAのコドン最適化配列が、インビボで投与された場合、肝細胞の小管膜において特異的に効率的な発現を示したことを見出した。PFIC3症状の大部分を再現するAbcb4-/-ノックアウトマウスにおいて、MDR3アイソフォームAのコドン最適化バージョンをコードするAAVの投与は、PFIC3血清バイオマーカーレベルの有意な回復、肝臓および脾臓の大きさの低下、胆汁ホスファチジルコリンの増加および肝臓形態異常の補正のような長期治療効果を達成する。
したがって、本開示の第1の態様はMDR3アイソフォームAをコードする導入遺伝子を含む核酸構築物に関し、該導入遺伝子は、配列番号1によって表されるか、または配列番号1と少なくとも90%の同一性を有する配列である。
特定の実施形態では、前記核酸構築物はさらに、宿主細胞への導入時に導入遺伝子発現を開始するプロモーター、好ましくは肝臓特異的プロモーター、より好ましくはα-1-アンチトリプシンプロモーターまたは胆汁酸塩誘導性プロモーターを含む。特定の実施形態では、前記ベクターはさらに、ポリアデニリル化シグナル配列、例えば配列番号3の配列を有する合成ポリアデニリル化シグナル配列を含む。
特定の実施形態では、前記核酸構築物はさらに、5’ITRおよび3’ITR配列、好ましくはアデノ随伴ウイルス(AAV)の5’ITRおよび3’ITR配列、特にAAV2血清型由来の5’ITRおよび3’ITR配列を含む。
より特定の実施形態では、前記核酸構築物は、配列番号4の核酸配列または配列番号4と少なくとも90%の同一性を有する核酸配列を含むか、またはそれからなる。
別の態様では、前記核酸構築物が、発現ベクター、好ましくはウイルスベクター、より好ましくはAAVベクターに含まれる。
本開示の別の態様は、本発明の核酸構築物または発現ベクターを含み、好ましくは、AAVタイプ33A、AAVタイプ33B、NP40、NP59、NP84、LK03、AAV3-ST、Anc80およびAAV8血清タイプからなる群より選択されるカプシドタンパク質などのアデノ随伴ウイルスのカプシドタンパク質を含む、ウイルス粒子に関する。
本開示の別の態様は、本発明の核酸構築物または発現ベクターを含む宿主細胞、または、本発明のウイルス粒子で形質導入された宿主細胞に関する。
本開示の別の態様は、本発明の核酸構築物、発現ベクター、宿主細胞、またはウイルス粒子を、1つ以上の薬学的に受容可能な賦形剤、希釈剤、または担体と組み合わせて含み、また、任意に他の活性成分を含む、薬学的組成物に関する。
本発明はまた、それを必要とする対象者における進行性家族性肝内胆汁鬱滞タイプ3の予防および/または治療などの薬剤として使用するための、本発明の生成物に関する。特定の実施形態では、対象者が、新生児、乳児、小児または成人、好ましくは新生児、乳児または小児、より好ましくは新生児または小児である。
また、本明細書には、
a)上記のような宿主細胞を培養培地中で培養する工程、および、
b)細胞培養上清および/または細胞内からウイルス粒子を採取する工程
を含む、上記のようなウイルス粒子を製造するためのプロセスが開示される。
本開示はまた、上述したような、核酸構築物、発現ベクター、宿主細胞、ウイルス粒子、または薬学的組成物を、1つ以上の容器中に含み、随意的に、さらに、取扱説明書またはパッケージング材料を含むキットに関する。
示されたヒトMDR3アイソフォームを発現するプラスミドでトランスフェクションされたHuh7細胞の免疫蛍光顕微鏡画像である。Wt:野生型配列、co:コドン最適化配列。核をDAPIで染色した。 示されたヒトMDR3アイソフォームを発現するプラスミドでトランスフェクションされたHuh7細胞の共焦点顕微鏡像である。アイソフォームBwt、Bco、Cwt、およびCcoに対し、MDR3の細胞質局在化を実証する直交投影が示される。Wt:野生型配列、co:コドン最適化配列。核をDAPIで染色した。 HDI(裸のDNA転写)を介してpAAV-MDR3プラスミドを注射されたマウス由来の肝臓切片におけるMDR3発現である。MDR3アイソフォームAcoを注射した1匹のマウスからの3つの画像を示し(左パネル)、MDR3アイソフォームAwtを注射した両方のマウスを示す(右パネル)。 AAVAnc80-MDR3-Acoベクターで処理した3週齢のAbcb4-/-マウスにおける胆汁PC濃度である。AAV用量をx軸の下に示す。雄(M)は塗りつぶされたシンボルであり、雌(F)は白抜きのシンボルである。 AAVAnc80-MDR3-Aco処理Abcb4-/-マウスにおける血清アラニントランスアミナーゼ(ALT)および胆汁酸塩(BS)レベルである。雄は塗りつぶされたシンボルで示され、雌は白抜きのシンボルで示されている。サンプルを、処理後5日、1週、2週および3週で収集した。d、日;WT、Abcb4+/+マウス;KO、Abcb4-/-マウス。 2週齢でAAVAnc80-MDR3-Acoで処理し、3週間後に屠殺したAbcb4-/-マウス(KO)の脾臓および肝臓の重量(体重の割合として)を、未処理のABCB4-/-(方形)または野生型(wt)マウス(三角)と比較したものである。雄(M)は塗りつぶされたシンボルで示され、雌(F)は白抜きのシンボルで示される。*,p<0.05;ns、有意ではない。 生理食塩水(A&D)またはAAVAnc80-MDR3-Acoを1.5×1013(B&E)または5×1013(C&F)で2週齢で処理し、3週間後に屠殺した雄Abcb4-/-マウス(KO)における肝臓のシリウスレッド(A-C)およびマッソントリクローム(D-F)染色である。(G)シリウスレッド染色について陽性の面積パーセントの定量を、ImageJソフトウェアを介して行った。*:p<0.05;ns:有意ではない。 未処理のAbcb4-/-(方形)またはwtマウス(三角)と比較して、2週齢でAAVAnc80-MDR3-Acoで処理し、3週間後に屠殺したAbcb4-/-マウス(KO)の胆汁PC濃度である。雄(M)は塗りつぶされたシンボルで示され、雌(F)は白抜きのシンボルで示される。****,p<0.0001;ns、有意ではない。 AAV8-MDR3-Acoで処理したAbcb4-/-マウスにおける血清バイオマーカーである。雄(M)は塗りつぶされたシンボルで示され、雌(F)は白抜きのシンボルで示される。処理からの週をx軸のすぐ下に示し、そして各群についてのAAV用量を下に示す。 AAV8-MDR3-Acoで処理し、12週間後に屠殺したAbcb4-/-マウス(KO)の脾臓および肝臓重量(体重の割合として)を、未処理のABCB4-/-(KO)または野生型(wt)マウスと比較したものである。雄(M)は塗りつぶされたシンボルで示され、雌(F)は白抜きのシンボルで示される。***,p<0.001 **、p<0.01;ns、有意ではない。 生理食塩水(上)またはAAV8-MDR3-Acoで5×1013 VG/kg(中央)で処理し、1週間後に採取したAbcb4-/-マウスからの肝臓切片の抗MDR3抗体でのIHC染色である。野生型マウス(WT)肝臓切片の染色は、対照および陽性対照として含める(下)。 Abcb4-/-マウスにおけるAAV8-MDR3-Acoの用量範囲設定研究のための血清バイオマーカーレベルである。指示された血清マーカーをベクター投与1~10週後に分析した。雄(M)は塗りつぶされたシンボルで示され、雌(F)は白抜きのシンボルで示される。AAV用量をx軸の下に示す。 5週齢で処理したAbcb4-/-マウスからの血清アルカリホスファターゼ(ALP)およびアラニントランスアミナーゼ(ALT)レベルである。野生型(WT)動物を灰色の白丸で示し、生理食塩水処理Abcb4-/-マウスを黒四角で示し、AAV-MDR3-Aco処理Abcb4-/-マウスを黒丸で示す。雄は左側のグラフに示され、雌は右側のグラフに示される。 5週齢で処理したAbcb4-/-マウスからのアスパラギン酸トランスアミナーゼ(AST)および胆汁酸塩(BS)レベルである。野生型(WT)動物を灰色の白丸で示し、生理食塩水処理Abcb4-/-マウスを黒四角で示し、AAV-MDR3-Aco処理Abcb4-/-マウスを黒丸で示す。雄は左側のグラフに示され、雌は右側のグラフに示される。 5週齢で処理したAbcb4-/-マウスにおける肝臓(a)および脾臓(b)の重量(体重の割合として)である。野生型(WT)動物を灰色の菱形で示し、生理食塩水処理Abcb4-/-マウスを白丸で示し、AAV-MDR3-Aco処理Abcb4-/-マウスを黒い三角で示す。 5週齢で処理したAbcb4-/-マウスにおける胆汁PC(c)、線維症(d)、およびMDR3タンパク質発現(e)である。野生型(WT)動物を灰色の菱形で示し、生理食塩水処理Abcb4-/-マウスを白丸で示し、AAV-MDR3-Aco処理Abcb4-/-マウスを黒い三角で示す。
本発明はMDR3アイソフォームA(NCBI参照配列:NP_000434.1)をコードするコドン最適化配列を含む導入遺伝子に関するものである。MDR3遺伝子と名付けられたABCB4遺伝子によってコードされる膜関連タンパク質は、ATP結合カセット(ABC)トランスポーターのスーパーファミリーのメンバーである。この遺伝子はホスファチジルコリンを基質とする膜タンパク質の完全なトランスポーターとp‐糖タンパク質ファミリーのメンバーをコードし、肝細胞から胆汁へのリン脂質の輸送に関与している可能性がある。この遺伝子の選択的スプライシングにより、A、BおよびCと名づけられた3つの潜在的なアイソフォームが生じる。
本明細書中で使用される場合、用語「導入遺伝子」は、遺伝子産物をコードする外因性DNAまたはcDNAをいう。遺伝子産物は、RNA、ペプチドまたはタンパク質であり得る。遺伝子産物のコード領域に加えて、導入遺伝子は、プロモーター、エンハンサー、応答エレメント、レポーターエレメント、インシュレーターエレメント、ポリアデニル化シグナルおよび/または他の機能的エレメントのような、発現を促進または増強するための1つ以上のエレメントを含み得るか、またはそれと関連し得る。本発明の実施形態は、任意の公知の適切なプロモーター、エンハンサー、応答エレメント、レポーターエレメント、インシュレーターエレメント、ポリアデニル化シグナルおよび/または他の機能エレメントを利用し得る。適切なエレメントおよび配列は、当業者に周知である。
〔核酸構築物〕
より詳細には、本発明は、MDR3アイソフォームAをコードする導入遺伝子を含む核酸構築物に関し、該導入遺伝子は配列番号1もしくは2によって表されるか、または配列番号1もしくは2と少なくとも90%の同一性を有する。
用語「核酸配列」および「ヌクレオチド配列」は、モノマーヌクレオチドから構成されるか、またはモノマーヌクレオチドを含む任意の分子を指すために、互換的に使用され得る。核酸は、オリゴヌクレオチドまたはポリヌクレオチドであり得る。ヌクレオチド配列は、DNAまたはRNAであり得る。ヌクレオチド配列は、化学的に修飾されていても、人工的であってもよい。ヌクレオチド配列には、ペプチド核酸(PNA)、モルホリノおよびロックド核酸(LNA)、ならびにグリコール核酸(GNA)およびトレオース核酸(TNA)が含まれる。これらの配列の各々は、分子の骨格への変更によって、天然に存在するDNAまたはRNAと区別される。また、ホスホロチオエート型ヌクレオチドが使用されてもよい。他のデオキシヌクレオチドアナログには、メチルホスホネート、ホスホラミデート、ホスホロジチオエート、N3’P5’-ホスホラミデートおよびオリゴリボヌクレオチドホスホロチオエートならびにそれらの2’-0-アリルアナログおよび2’-0-メチルリボヌクレオチドメチルホスホネートが含まれ、これらは本発明のヌクレオチドに使用することができる。
「核酸構築物」という用語は、本明細書中で使用される場合、組み換えDNA技術の使用から生じる人工核酸分子をいう。核酸構築物は核酸配列のセグメントを含むように修飾された、一本鎖または二本鎖のいずれかの核酸分子であり、これらはさもなければ天然には存在しない様式で組み合わされ、そして並置される。核酸構築物は通常、「ベクター」、すなわち、外因的に作製されたDNAを宿主細胞に送達するために使用される核酸分子である。
本明細書中で使用される場合、用語「配列同一性」または「同一性」は、2つのポリヌクレオチド配列のアラインメントからの位置における一致(同一の核酸残基)の数をいう。配列同一性は配列ギャップを最小限にしながら、重複および同一性を最大限にするようにアラインメントされた場合の配列を比較することによって決定される。特に、配列同一性は、2つの配列の長さに依存して、多数の数学的グローバルまたはローカルアラインメントアルゴリズムのいずれかを使用して決定され得る。同様の長さの配列は、好ましくは、配列を全長にわたって最適にアラインメントさせるグローバルアラインメントアルゴリズム(例えば、NeedlemanおよびWunschアルゴリズム;NeedlemanおよびWunsch,1970,J Mol Biol;48(3):443-53)を使用してアラインメントされ、一方、実質的に異なる長さの配列は、好ましくは、ローカルアラインメントアルゴリズム(例えば、SmithおよびWatermanアルゴリズム(SmithおよびWaterman,1981,J Theor Biol.;91(2):379-80)またはAltschulアルゴリズム(Altschul SFら、1997、Nucleic Acids Res.;25(17):3389-402;Altschul SFら、2005,Bioinformatics.;21(8):1451-6))を使用してアラインメントされる。核酸配列同一性パーセントを決定する目的のためのアラインメントは、当業者の範囲内である様々な方法で、例えば、http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/またはhttp://www.ebi.ac.uk/Tools/emboss/のようなインターネットウェブサイト上で利用可能な公的に利用可能なコンピュータソフトウェアを使用して、達成され得る。当業者は、比較される配列の全長にわたって最大のアラインメントを行うために必要な任意のアルゴリズムを含む、アラインメントを測定するための適切なパラメーターを決定することができる。本明細書中の目的のために、%核酸配列同一性値は、Needleman-Wunschアルゴリズムを使用して2つの配列の最適なグローバルアラインメントを作製するペアワイズ配列アラインメントプログラムEMBOSS Needleを使用して生成される値をいい、ここで、全ての検索パラメーターはデフォルト値、すなわち、スコアリングマトリックス=BLOSUM62、ギャップオープン=10、ギャップ伸長=0.5、エンドギャップペナルティ=偽、エンドギャップオープン=10およびエンドギャップ伸長=0.5に設定される。
本明細書中で使用される場合、前記核酸構築物は、本発明によるMDR3アイソフォームAをコードする導入遺伝子、および前記コード配列の発現に必要な1つ以上の制御配列を含む。一般に、核酸構築物は、コード配列および選択された遺伝子産物の発現に必要なコード配列の前(5’非コード配列)および後(3’非コード配列)の調節配列を含む。したがって、核酸構築物は、典型的にはプロモーター配列、コード配列、および通常ポリアデニル化部位および/または転写ターミネーターを含む3’非翻訳領域を含む。核酸構築物はまた、さらなる調節エレメント(例えば、エンハンサー配列、ベクター内のDNAフラグメントの挿入を容易にするポリリンカー配列および/またはスプライシングシグナル配列)を含み得る。
一実施形態では、核酸構築物はプロモーターを含む。前記プロモーターは、宿主細胞への導入時に導入遺伝子発現を開始する。本明細書で使用する「プロモーター」という用語はそれが作動可能に連結されている核酸の転写を指示する調節エレメントを指す。プロモーターは、作動可能に連結された核酸の転写の速度および効率の両方を調節することができる。プロモーターはまた、核酸のプロモーター依存性転写を増強する(「エンハンサー」)または抑制する(「リプレッサー」)他の調節エレメントに作動可能に連結されていてもよい。これらの調節エレメントは、転写因子結合部位、リプレッサーおよびアクチベータータンパク質結合部位、ならびにプロモーターからの転写の量を調節するために直接的または間接的に作用することが当業者に公知のヌクレオチドの任意の他の配列(例えば、アテニュエーター、エンハンサー、およびサイレンサーを含む)を含むが、これらに限定されない。プロモーターは、作動可能に連結されている遺伝子またはコード配列の転写開始部位の近く、DNA配列の同じ鎖および上流(センス鎖の5’領域に向かって)に位置する。プロモーターは、約100~1000塩基対の長さであり得る。プロモーター中の位置は、特定の遺伝子についての転写開始部位に対して指定される(すなわち、上流の位置は-1から数えて負の数であり、例えば、-100は100塩基対上流の位置である)。
本明細書中で使用される場合、用語「作動可能に連結された」は、機能的関係にあるポリヌクレオチド(またはポリペプチド)素子の連結をいう。核酸がそれが別の核酸配列と機能的関係に置かれる場合、「作動可能に連結される」。例えば、プロモーターまたは転写調節配列は、それがコード配列の転写に影響を及ぼす場合、コード配列に作動可能に連結される。作動可能に連結された手段は連結されているDNA配列が典型的には連続していることである;2つのタンパク質コード領域を連結しなければならない場合、それらは連続しており、リーディングフレームにある。
特定の実施形態において、本発明の核酸構築物はさらに、本発明の導入遺伝子に作動可能に連結された肝臓特異的プロモーターを含む。本発明との関連において、「肝臓特異的プロモーター」は、身体の任意の他の組織よりも肝臓においてより活性であるプロモーターである。典型的には、肝臓特異的プロモーターの活性は、他の組織よりも肝臓においてかなり大きい。例えば、このようなプロモーターは少なくとも2、少なくとも3、少なくとも4、少なくとも5または少なくとも10倍活性であり得る(例えば、他の細胞または組織における発現を駆動する能力と比較して、所定の組織における発現を駆動する能力によって決定される)。したがって、肝臓特異的プロモーターはそれに連結された遺伝子の肝臓における活性発現を可能にし、他の細胞または組織におけるその発現を妨げる。
1つの実施形態において、肝臓特異的プロモーターは、α1-アンチトリプシン遺伝子プロモーター(AATまたはA1AT)(配列番号6)、胆汁酸塩誘導性プロモーター(配列番号7または8)、またはアルブミン遺伝子エンハンサー要素(Ealb)と結合したα1-アンチトリプシン遺伝子プロモーター配列(AATまたはPa1AT)を含むキメラプロモーター配列EalbPa1ATである。これらのプロモーター配列はすべて肝臓特異的プロモーターの性質をもっている。
これらの核酸構築物の実施形態の各々はまた、ポリアデニリル化シグナル配列を、他の任意のヌクレオチド素子と共に、または他の任意のヌクレオチド素子と共に含まなくてもよい。本明細書中で使用される、用語「ポリアデニル化シグナル」または「ポリ(A)シグナル」は遺伝子の3’非翻訳領域(3’UTR)内の特異的認識配列を意味し、これは前駆体mRNA分子に転写され、遺伝子転写の終結を誘導する。ポリ(A)シグナルは、新たに形成された前駆体mRNAの3’末端でのエンドヌクレアーゼによる切断、およびアデニン塩基のみからなるRNA伸長部分のこの3’末端への付加のシグナルとして作用する(ポリアデニル化プロセス;ポリ(A)尾部)。ポリ(A)テールは、mRNAの核輸送、翻訳、および安定性に重要である。本発明との関連において、ポリアデニル化シグナルは、哺乳動物細胞における哺乳動物遺伝子および/またはウイルス遺伝子のポリアデニル化を指示し得る認識配列である。
ポリ(A)シグナルは、典型的には、a)プレメッセンジャーRNA(プレmRNA)の3’末端切断およびポリアデニル化の両方に必要であること、ならびに下流転写終結を促進することが示されているコンセンサス配列AAUAAA、および、b)ポリ(A)シグナルとしてのAAUAAAの利用効率を制御するAAUAAの上流および下流のさらなる素子からなる。哺乳類の遺伝子では、これらのモチーフにかなりのばらつきがある。
1つの実施形態において、必要に応じて、上記または下記の様々な実施形態の1つ以上の特徴と組み合わせて、本発明の核酸構築物のポリアデニリル化シグナル配列は、哺乳動物遺伝子またはウイルス遺伝子のポリアデニリル化シグナル配列である。適当なポリアデニル化シグナルには、とりわけ、SV40初期ポリアデニル化シグナル、SV40後期ポリアデニル化シグナル、HSVチミジンキナーゼポリアデニル化シグナル、プロタミン遺伝子ポリアデニル化シグナル、アデノウイルス5 EIbポリアデニル化シグナル、成長ホルモンポリアデニル化シグナル、PBGDポリアデニル化シグナル、インシリコ設計ポリアデニル化シグナル(合成)などが含まれる。
特定の実施形態において、核酸構築物のポリアデニリル化シグナル配列は、ウサギβグロビン遺伝子に基づく合成ポリ(A)シグナル配列、より詳細には配列番号3の配列を有する合成ポリ(A)である。
〔発現ベクター〕
本発明の核酸構築物は、発現ベクターに含まれ得る。本明細書中で使用される場合、用語「発現ベクター」は遺伝物質を転写するための、そして特に、インビトロまたはインビボのいずれかで、宿主細胞中に核酸を送達するためのビヒクルとして使用される核酸分子をいう。発現ベクターはまた、このような配列に適合する宿主細胞または宿主生物において遺伝子(導入遺伝子)の発現を達成することができる核酸分子をいう。発現ベクターは、典型的には少なくとも適切な転写調節配列および場合により3’転写終結シグナルを含む。正確な誘導シグナル(内因性またはキメラ転写因子)に応答することができる発現エンハンサーエレメント、または特定の細胞、器官または組織に特異的な発現エンハンサーエレメントのような、発現を達成するのに必要または役立つさらなる因子も存在し得る。ベクターにはプラスミド、ファスミド、コスミド、転移因子、ウイルス、および人工染色体(例えば、YAC)が含まれるが、これらに限定されない。好ましくは、本発明のベクターは、遺伝子または細胞治療における使用に適したベクターであり、特に肝細胞を標的とするのに適している。
いくつかの実施形態において、発現ベクターは、モロニーマウス白血病ウイルスベクター(MoMLV)、MSCV、SFV、MPSVまたはSNV、レンチウイルスベクター(例えば、ヒト免疫不全ウイルス(HIV)、サル免疫不全ウイルス(SIV)、ネコ免疫不全ウイルス(FIV)、ウシ免疫不全ウイルス(BIV)またはウマ感染性貧血ウイルス(EIAV)に由来する)、アデノウイルス(Ad)ベクター、アデノ随伴ウイルス(AAV)ベクター、サルウイルス40(SV-40)ベクター、ウシ乳頭腫ウイルスベクター、エプスタイン-バーウイルスベクター、ヘルペスウイルスベクター、ワクシニアウイルスベクター、ハルビーマウス肉腫ウイルスベクター、マウス乳房腫瘍ウイルスベクター、ラウス肉腫ウイルスベクターなどのウイルスベクターである。
当技術分野で知られているように、使用すると考えられる特定のウイルスベクターに応じて、機能的ウイルスベクター、例えば、AAVベクター用のAAV ITR、またはレンチウイルスベクター用のLTRを得るために、本発明のベクターに適切な配列を導入すべきである。特定の実施形態では、前記ベクターはAAVベクターである。
AAVは、ヒト遺伝子治療のための潜在的ベクターとしてかなりの関心が生じている。このウイルスの好ましい特性の中には、あらゆるヒト疾患との関連性がないこと、分裂細胞と非分裂細胞の両方に感染する能力があること、感染可能な異なる組織に由来する広範囲の細胞株があることが挙げられる。AAVゲノムは、4681個の塩基を含む線状の一本鎖DNA分子から構成される(BernsおよびBohenzky、1987、Advances in Virus Research(Academic Press、Inc.)32:243-307)。ゲノムは両端に逆方向末端反復配列(ITR)を含み、これはDNA複製の起点としてシスで機能し、ウイルスのパッケージングシグナルとして機能する。ITRの長さは約145bpである。ゲノムの内部非反復部分には2つの大きなオープンリーディングフレームがあり、それぞれAAV repおよびcap遺伝子として知られている。これらの遺伝子は、ビリオンの複製とパッケージングに関与するウイルスタンパク質をコードしている。特に、少なくとも4つのウイルスタンパク質が、AAV rep遺伝子、Rep 78、Rep 68、Rep 52およびRep 40から合成され、それらの見かけの分子量に従って命名される。AAVcap遺伝子は、VP1、VP2およびVP3の少なくとも3つのタンパク質をコードする。AAVゲノムの詳細な説明については、例えば、Muzyczka、N.1992 Current Topics in MicrobiolおよびImmunol.158:97-129を参照のこと。
したがって、一実施形態では、本発明の導入遺伝子を含む核酸構築物はさらに、5’ITRおよび3’ITR配列、好ましくはアデノ随伴ウイルスの5’ITRおよび3’ITR配列を含む。
本明細書中で使用される場合、用語「逆方向末端反復(ITR)」は、ウイルスの5’末端(5’ITR)に位置するヌクレオチド配列、およびウイルスの3’末端(3’ITR)に位置するヌクレオチド配列をいい、これは、パリンドローム配列を含み、そしてDNA複製の開始の間にプライマーとして機能するT型ヘアピン構造を形成するように折り畳まれ得る。これらは、ウイルスゲノムの宿主ゲノムへの組み込み、宿主ゲノムからのレスキュー、ウイルス核酸の成熟ビリオンへのカプシド封入にも必要である。ITRはベクターゲノムの複製とウイルス粒子へのパッケージングにシスで必要である。
本発明のベクターにおける使用のためのAAV ITRは、野生型ヌクレオチド配列を有し得るか、または挿入、欠失もしくは置換によって改変され得る。AAVベクターの逆方向末端反復(ITR)の血清型は、任意の公知のヒトまたは非ヒトAAV血清型から選択され得る。特定の実施形態では、発現ウイルスベクターは、AAV1、AAV2、AAV3(タイプ3Aおよび3Bを含む)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、トリAAV、ウシAAV、イヌAAV、ウマAAV、ヒツジAAV、および現在知られているまたは後に発見された任意の他のAAV血清型を含む任意のAAV血清型のITRを用いることによって実施され得る。
一実施形態では、核酸構築物はさらに、血清型AAV2のAAVの5’ITRおよび3’ITRを含む。
特定の実施形態において、本発明の核酸構築物は、配列番号4もしくは5を含むか、またはそれらからなるか、または配列番号4もしくは5と少なくとも90%の同一性を有する配列を含むか、またはそれらからなる。
一実施形態では、本発明による核酸構築物またはAAVベクターゲノムは、組み換えバキュロウイルスゲノムに含まれる。本明細書中で使用される「組み換えバキュロウイルスゲノム」という用語は、バキュロウイルス感染および複製を許容する宿主細胞(典型的には昆虫細胞)中での組み換えバキュロウイルスゲノムの自律的複製のためのバキュロウイルス遺伝要素を含む核酸を意味する。明らかに、「組み換えバキュロウイルスゲノム」という用語は、バキュロウイルスに異種性である核酸を含むゲノムを含む。同様に、「組み換えバキュロウイルスゲノム」という用語は、ゲノムが感染サイクルの完了のために必要ではないウイルス配列を欠いていてもよいので、必ずしも完全なバキュロウイルスゲノムを意味しない。特に、組み換えバキュロウイルスゲノムは、rAAV生成に有用な異種AAV遺伝子および/または遺伝子治療に使用するためにrAAVにカプシド封入されるコドン最適化したMDR3アイソフォームAなどの導入遺伝子を含み得る。本開示において使用するバキュロウイルス遺伝子エレメントは、AcMNPVバキュロウイルス(Autographa californica multinucleocapsid nucleopolyhedrovirus)から得られることが好ましい。
特定の実施形態では、前記第1および第2のバキュロウイルスゲノム中のバキュロウイルスカテプシンおよびキチナーゼをコードする遺伝子が破壊または欠失される。特に、AcMNPVバキュロウイルスの遺伝子v-cath(Ac127)およびchiA(Ac126)は、対応するカテプシンまたはキチナーゼが発現されないか、または不活性型として発現される(すなわち、酵素カテプシンまたはキチナーゼ活性を有さない)ように破壊または欠失され得る。特定の実施形態において、前記組み換えバキュロウイルスゲノムは、少なくともp24遺伝子(Ac129)、好ましくは3つのバキュロウイルス遺伝子p10(Ac137)、p24およびp26(Ac136)についてさらに破壊または欠失される。特定の実施形態では、前記組み換えバキュロウイルスゲノムは、機能的p74バキュロウイルス遺伝子(Ac138)を含む(すなわち、前記遺伝子は欠失または破壊されていない)。
一方、本発明の核酸構築物または発現ベクターは、合成的5’ITRおよび/または3’ITRを使用することによって;ならびに異なる血清型のウイルスに由来する5’ITRおよび3’ITRを使用することによっても実施され得る。ウイルスベクター複製に必要な他の全てのウイルス遺伝子は、以下に記載されるように、ウイルス生成細胞(パッケージング細胞)内にトランスで提供され得る。したがって、ウイルスベクターへのそれらの包含は任意である。
一実施形態では、本発明の核酸構築物またはウイルスベクターは、ウイルスの5’ITR、ψパッケージングシグナル、および3’ITRを含む。「ψパッケージングシグナル」はウイルスゲノムのシス作用性ヌクレオチド配列であり、いくつかのウイルス(例えば、アデノウイルス、レンチウイルス…)では、複製中にウイルスゲノムをウイルスカプシドにパッケージングするプロセスに不可欠である。
組み換えAAVウイルス粒子の構築は当該分野で一般に公知であり、そして例えば、US 5,173,414およびUS 5,139,941;WO 92/01070、WO 93/03769、Lebkowskiら(1988)Molec.Cell.Biol.8:3988-3996;Vincentら(1990)Vaccines 90(Cold Spring Harbor Laboratory Press);Carter、BJ(1992)Current Opinion in Biotechnology 3:533-539;Muzyczka、N(1992) Current Topics in Microbiol. and Immunol. 158:97-129;およびKotin、RM(1994)Human Gene Therapy 5:793-801に記載されている。
〔ウイルス粒子〕
本発明の核酸構築物または発現ベクターは、「ウイルスベクター粒子」とも呼ばれる「ウイルス粒子」を生成するためにウイルスカプシドにパッケージングされてもよい。特定の実施形態では、核酸構築物または発現ベクターは、「アデノ随伴ウイルス粒子」または「AAV粒子」を生成するためにAAV由来カプシドにパッケージングされる。本発明は、本発明の核酸構築物または発現ベクターを含み、好ましくはアデノ随伴ウイルスのカプシドタンパク質を含むウイルス粒子に関する。
AAVベクター粒子という用語は、遺伝子操作された任意の組み換えAAVベクター粒子または突然変異体AAVベクター粒子を包含する。組み換えAAV粒子は、同じまたは異なる血清型のAAVに対応する天然または突然変異体Capタンパク質によって形成されるウイルス粒子上に、特定のAAV血清型に由来するITRを含む核酸構築物またはウイルス発現ベクターをカプシド封入することによって調製され得る。
アデノ随伴ウイルスのウイルスカプシドのタンパク質には、カプシドタンパク質VP1、VP2、VP3がある。様々なAAV血清型のカプシドタンパク質配列の相違は、細胞侵入のための異なる細胞表面受容体の使用をもたらす。これは、別の細胞内プロセシング経路と組み合わせて、各AAV血清型に対して異なる組織親和性を生じる。天然に存在するAAVウイルス粒子の構造的および機能的特性を改変および改善するために、いくつかの技術が開発されている(Bunning Hら J Gene Med、2008;10:717-733;Paulkら Mol Ther. 2018.26(1):289-303;Wang Lら Mol Ther. 2015.23(12)1877-87;Vercauterenら Mol Ther. 2016.24(6):1042-1049;Zinn Eら、Cell Rep 2015;12(6):1056-68)。
したがって、本開示によるAAVウイルス粒子において、所定のAAV血清型のITRを含む核酸構築物またはウイルス発現ベクターは、例えば、以下のようにパッケージングされ得る:
a)同一または異なるAAV血清型(例えば、AAV2 ITRおよびAAV5カプシドタンパク質;AAV2 ITRおよびAAV8カプシドタンパク質;AAV2 ITRおよびAnc80カプシドタンパク質;AAV2 ITRおよびAAV9カプシドタンパク質)に由来するカプシドタンパク質で構成されるウイルス粒子;
b)異なるAAV血清型または突然変異体由来のカプシドタンパク質の混合物で構成されるモザイクウイルス粒子(例えば、AAV1およびAAV5カプシドタンパク質を有するAAV2 ITR);
c)異なるAAV血清型または変異体(例えば、AAV3ドメインを有するAAV5カプシドタンパク質を有するAAV2 ITR)間のドメインスワッピングにより切断されたカプシドタンパク質で構成されるキメラウイルス粒子。
当業者は、本開示によるAAVウイルス粒子が、AAV1、AAV2、AAV3(タイプ3Aおよび3Bを含む)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、トリAAV、ウシAAV、イヌAAV、ウマAAV、ヒツジAAV、NP40、NP59、NP84(Paulkら Mol Ther.2018.26(1):289-303)、LK03(Wang Lら Mol Ther.2015(12):1877-87)、AAV3-ST(Vercauterenら Mol Ther.2016.24(6):1042-1049)、Anc80(Zinn Eら、Cell Rep 2015;12(6):1056-68)および現在知られているまたは後に発見された他のAAV血清型を含む任意のAAV血清型由来のカプシドタンパク質を含み得ることを認識するであろう。
特定の実施形態において、AAVウイルス粒子は、肝細胞への送達に、より適したAAV1、AAV3B、AAV5、AAV7、AAV8、およびAAV9からなる群より選択される血清型由来のカプシドタンパク質を含む(Nathwaniら、Blood 2007;109:1414-1421;Kitajimaら、Atherosclerosis 2006;186:65-73)。
特定の実施形態では、AAVウイルス粒子は、肝臓、筋肉および網膜を標的とするための非常に強力な遺伝子治療ベクターとして挙動する、ウイルスAAV血清型1、2、8および9の予測される祖先であるAnc80由来のカプシドタンパク質を含む(Zinn Eら、Cell Report.2015;12(6):1056-68)。より特定の実施形態では、ウイルス粒子は、Anc80L65 VP3カプシドタンパク質(Genbank受託番号:KT235804)を含む。
したがって、さらなる態様において、本発明は、本発明の核酸構築物または発現ベクターを含み、そして好ましくはAnc80およびAAV8血清型、より好ましくはAAV8血清型由来のカプシドタンパク質のようなアデノ随伴ウイルスのカプシドタンパク質を含む、ウイルス粒子に関する。
特定の実施形態では、ウイルス粒子は、組み換えバキュロウイルスに含まれるAAVベクターゲノムを含む。したがって、AAV repおよびcapを含む第2の組み換えバキュロウイルスゲノムが、AAVウイルス粒子を生成するために使用される。特定の実施形態において、repおよびcapタンパク質は、異なるバキュロウイルス後期プロモーターから、好ましくは逆方向で発現される。先の実施形態と組み合わせることができる特定の実施形態では、第2のバキュロウイルスゲノムは、repタンパク質、例えば、バキュロウイルス多面体(PPh)プロモーターの転写制御下にあるAAV2由来のrepタンパク質をコードする異種核酸を含む。他の実施形態では、第2のバキュロウイルスゲノムは、p10バキュロウイルスプロモーターの転写制御下でcapタンパク質をコードする異種核酸を含む。昆虫細胞における適切な発現のための、および/またはVPおよびビリオンの収率を増加させるための、またはビリオンの親和性を変化させるかまたは抗原性を減少させるための、野生型AAV配列の他の改変もまた、当該分野で公知である。AAV血清型のrep ORF(オープンリーディングフレーム)および異なる血清型AAVのcap ORFをコードするヘルパーバキュロウイルス構築物を用いることにより、所定のAAV血清型のITRに隣接するベクターを、異なる血清型の構造カプシドタンパク質から集合したビリオンにパッケージングすることが可能である。モザイクベクター、キメラベクターまたは標的ベクターをパッケージングすることも、この同じ手順によって可能である。
ウイルス-グリカン相互作用は宿主細胞侵入の重要な決定因子である。特定の実施形態において、AAVウイルス粒子は1つ以上のアミノ酸置換を含むカプシドタンパク質を含み、ここで、この置換は、AAVカプシドタンパク質に新しいグリカン結合部位を導入する。より特定の実施形態では、アミノ酸置換は、AAV2中のアミノ酸266、アミノ酸463~475およびアミノ酸499~502、またはAAV1、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10またはAnc80およびAnc80L65を含む任意の他のAAV血清型中の対応するアミノ酸位置にある。
導入された新しいグリカン結合部位は、ヘキソース結合部位[例えば、ガラクトース(Gal)、マンノース(Man)、グルコース(Glu)またはフコース(fuc)結合部位];シアル酸(Sia)結合部位[例えば、N-アセチルノイラミン酸(NeuSAc)またはN-グリコリルノイラミン酸(NeuSGc)などのSia残基];または二糖類結合部位であってよく、二糖類は例えば、Sia(α2,3)GalまたはSia(α2,6)Galの形態でガラクトースに結合したシアル酸である。AAV血清型からの新しい結合部位を別の血清型のAAVのカプシドタンパク質に導入するための詳細なガイダンスは、国際特許公開WO2014144229およびShenら(J. Biol. Chem. 2013;288(40):28814-28823)に記載されている。特定の実施形態において、AAV9由来のGal結合部位は、AAV2 VP3骨格に導入され、細胞侵入のためにHSおよびGal受容体の両方を使用することができる二重グリカン結合AAV歪を生じる。好ましくは、前記二重グリカン結合AAV歪はAAV2G9である。Shenらは、AAV9 VP3カプシドタンパク質サブユニット上のGal認識部位に直接関連するまたは直接隣接するアミノ酸残基を、AAV9 VP3サブユニットコード領域上の対応する残基に置き換えることによって、AAV2G9を生成した(AAV2 VP3番号Q464V、A467P、D469N、I470M、R471A、D472V、S474G、Y500FおよびS501A)。
別の実施形態では、本開示による使用のためのウイルス粒子は、Ad5ウイルス粒子などのアデノウイルス粒子であってもよい。AAVウイルス粒子の場合のように、Adウイルス粒子のカプシドタンパク質はまた、それらの親和性および細胞標的化特性を改変するように操作され得、代替のアデノウイルス血清型もまた使用され得る。
〔ウイルス粒子の製造プロセス〕
上記に開示される発現ウイルスベクターを保有するウイルス粒子の生成は、従来の方法およびプロトコールによって実施され得、これらは生成されるべきベクターの発現ベクターおよびウイルス粒子の実際の実施形態のために選択される構造的特徴を考慮して選択される。
簡潔には、ウイルス粒子は、宿主細胞、より詳細には、ヘルパーベクターまたはウイルスまたは他のDNA構築物の存在下で、パッケージングされる核酸構築物または発現ベクターでトランスフェクションされる特異的ウイルス生成細胞(パッケージング細胞)において生成され得る。
本明細書中で使用される用語「パッケージング細胞」は、本発明の核酸構築物または発現ベクターでトランスフェクションされ得る細胞または細胞株をいい、そしてウイルスベクターの完全な複製およびパッケージングに必要とされる全ての欠失した機能をトランスで提供する。典型的には、パッケージング細胞は、構成的または誘導可能な様式で、1つ以上の前記欠失ウイルス機能を発現する。前記パッケージング細胞は、接着細胞または懸濁細胞であり得る。
典型的には、ウイルス粒子の製造プロセスは、以下の工程を含む:
a)上記の核酸構築物または発現ベクターを含むパッケージング細胞を培養培地中で培養する工程;および、
b)細胞培養上清および/または細胞内からウイルス粒子を採取する工程。
従来の方法を使用して、本発明の導入遺伝子を保有する核酸構築物または発現ベクター(例えば、プラスミド);repおよびcap遺伝子をコードするが、ITR配列を保有しない核酸構築物(例えば、AAVヘルパープラスミド);ならびにAAV複製に必要なアデノウイルス機能を提供する第3の核酸構築物(例えば、プラスミド)との一過性細胞同時トランスフェクションにて存在するAAVウイルス粒子を生成し得る。AAV複製に必要なウイルス遺伝子はここではウイルスヘルパー遺伝子と称する。典型的には、AAV複製に必要な前記遺伝子は、E1A、E1B、E2a、E4、またはVA RNAなどのアデノウイルスヘルパー遺伝子である。好ましくは、アデノウイルスヘルパー遺伝子は、Ad5またはAd2血清型のものである。
本開示によるAAV粒子の大規模製造はまた、例えば、組み換えバキュロウイルスの組み合わせを用いた昆虫細胞の感染によって実施され得る(Urabeら、Hum. Gene Ther. 2002;13:1935-1943)。SF9細胞を、AAVrep、AAVcapおよびパッケージングされるべきAAVベクターをそれぞれ発現する2つまたは3つのバキュロウイルスベクターに同時感染させる。組み換えバキュロウイルスベクターは、ウイルス複製および/またはパッケージングに必要なウイルスヘルパー遺伝子機能を提供する。Smithら 2009(Molecular Therapy、vol.17、no.11、pp 1888-1896)はさらに、昆虫細胞におけるAAV粒子の大規模製造のための二重バキュロウイルス発現系を記載している。
適切な培養培地は、当業者に公知である。このような培地を構成する成分は、培養される細胞のタイプに依存して異なり得る。栄養組成物に加えて、浸透圧およびpHは、培養培地の重要なパラメーターと考えられる。細胞増殖培地は、アミノ酸、ビタミン、有機塩および無機塩、炭水化物の供給源、脂質、微量元素(CuS04、FeS04、Fe(N03)3、ZnS04…)を含む、当業者に周知の多くの成分を含み、各成分は、インビトロでの細胞の培養(すなわち、細胞の生存および増殖)を支持する量で存在する。成分はまた、緩衝物質(重炭酸ナトリウム、Hepes、Trisなど)、酸化安定剤、機械的ストレスを打ち消すための安定剤、プロテアーゼインヒビター、動物成長因子、植物加水分解物、凝集防止剤、消泡剤などの種々の補助物質を含んでもよい。細胞増殖培地の特性および組成は、特定の細胞要件に応じて異なる。市販の細胞増殖培地の例は、MEM(最小必須培地)、BME(基礎培地Eagle)、DMEM(Dulbeccoにより改変したEagle培地)、Iscoves DMEM(Dulbeccoの培地のIscoveによる改変)、GMEM、RPMI 1640、Leibovitz L-15、McCoy’s、Medium 199、Ham(Hamの培地)F10および誘導体、Ham F12、DMEM/F12などである。
本開示による使用のためのウイルスベクターの構築および製造についてのさらなるガイダンスは、遺伝子治療のためのウイルスベクター、方法およびプロトコールに見出すことができる。シリーズ:Methods in Molecular Biology、Vol.737.MertenおよびAl-Rubeai(編);2011 Humana Press(Springer);Gene Therapy. M. Giacca.2010 Springer-Verlag;Heilbronn RおよびWeger S.Viral Vectors for Gene Transfer:Current Status of Gene Therapeutics.In:Drug Delivery、Handbook of Experimental Pharmacology 197;M.Schafer-Korting(編).2010 Springer-Verlag;pp.143-170;Adeno-Associated Virus:Methods and Protocols. R.O.SnyderおよびP.Moulllier(編)。2011 Humana Press (Springer);Bunning Hら Recent developments in adeno-associated virus technology. J. Gene Med.2008;10:717-733;;アデノウイルス:Methods and Protocols. M. ChillonおよびABosch(編);Third Edition. 2014 Humana Press (Springer)。
〔宿主細胞〕
別の態様において、本発明は、本発明の核酸構築物または発現ベクターを含む宿主細胞に関する。より詳細には、本発明による宿主細胞は、ヘルパーベクターまたはウイルスまたは他のDNA構築物の存在下で、本発明による核酸構築物または発現ベクターでトランスフェクションされ、ウイルス粒子の完全な複製およびパッケージングに必要とされる全ての欠失した機能をトランスで提供する、パッケージング細胞とも呼ばれる特異的ウイルス生成細胞である。前記パッケージング細胞は、接着細胞または懸濁細胞であり得る。
例えば、前記パッケージング細胞は真核細胞、例えば、哺乳動物細胞(サル、ヒト、イヌおよびげっ歯類細胞を含む)であり得る。ヒト細胞の例は、PER.C6細胞(WO01/38362)、MRC-5(ATCC CCL-171)、WI-38(ATCC CCL-75)、HEK-293細胞(ATCC CRL-1573)、HeLa細胞(ATCC CC LC2)および胎児アカゲザル肺細胞(ATCC CL160)である。非ヒト霊長類細胞の例は、Vero細胞(ATCC CCL81)、COS-1細胞(ATCC CRL-1650)またはCOS-7細胞(ATCC CRL-1651)である。イヌ細胞の例は、MDCK細胞(ATCC CCL-34)である。齧歯類細胞の例は、ハムスター細胞、例えばBHK21-F、HKCC細胞、またはCHO細胞である。
哺乳動物供給源の代替として、ウイルス粒子を生成するためのパッケージング細胞は、ニワトリ、アヒル、ガチョウ、ウズラまたはキジなどのトリ供給源に由来し得る。鳥類細胞株の例には、鳥類胚幹細胞(WO01/85938およびWO03/076601)、不死化アヒル網膜細胞(WO2005/042728)、およびニワトリ細胞(WO2006/108846)を含む鳥類胚幹細胞由来細胞、またはEB66細胞株(WO2008/129058およびWO2008/142124)などのアヒル細胞が含まれる。
別の実施形態において、細胞は、バキュロウイルス感染および複製パッケージング細胞を許容する任意の細胞であり得る。特定の実施態様において、前記細胞は昆虫細胞、例えば、SF9細胞(ATCC CRL-1711)、Sf21細胞(IPLB-Sf21)、MG1細胞(BTI-TN-MG1)または高い Five(商標)細胞(BTI-TN-5B1-4)である。
したがって、特定の実施形態では、任意選択で、上記または下記の様々な実施形態の1つまたは複数の特徴と組み合わせて、宿主細胞は以下のものを含む:
・本発明によるMDR3アイソフォームAをコードする導入遺伝子を含む核酸構築物または発現ベクター(例えば、本発明によるAAVベクター)、
・核酸構築物、例えば、ITR配列を保有しないAAV repおよび/またはcap遺伝子をコードするプラスミド、および/または、
・ウイルスヘルパー遺伝子を含む核酸構築物、例えばプラスミドまたはウイルス。
別の態様において、本発明は本発明のウイルス粒子で形質導入された宿主細胞に関し、そして本明細書中で使用される用語「宿主細胞」は、目的のウイルスによる感染に感受性であり、そしてインビトロでの培養に従順である任意の細胞株をいう。
本発明の宿主細胞は、生体外遺伝子治療目的のために使用され得る。このような実施形態において、細胞は、本発明のウイルス粒子で形質導入され、その後、患者または対象者に移植される。移植された細胞は、自家性、同種性または異種性の起源を有し得る。臨床使用のために、細胞単離は一般的にGMP(Good Manufacturing Practices)条件下で実施される。移植の前に、細胞の質および微生物または他の汚染物質の不在を典型的にチェックし、放射線および/または免疫抑制処理などによる肝臓のプレコンディショニングを行うことができる。さらに、宿主細胞は、肝細胞成長因子(HGF)などの、細胞増殖および/または分化を刺激するための成長因子とともに移植されてもよい。
特定の実施形態において、宿主細胞は、肝臓への生体外遺伝子治療のために使用される。好ましくは、前記細胞は、ヒト、類人猿、チンパンジー、サル、およびオランウータンなどの非ヒト霊長類、イヌおよびネコを含む飼育動物、ならびにウマ、ウシ、ブタ、ヒツジ、およびヤギなどの家畜、または限定されないがマウス、ラット、モルモット、ウサギ、ハムスターなどを含む他の哺乳動物種などの真核細胞であるが、これらに限定されない。当業者は、移植される患者または対象者に従って、より適切な細胞を選択する。
前記宿主細胞は、幹細胞または誘導多能性幹細胞などの自己再生および多能性特性を有する細胞であってもよい。幹細胞は、好ましくは間葉幹細胞である。間葉系幹細胞(MSC)は、骨芽細胞、軟骨細胞、脂肪細胞、または筋細胞の少なくとも1つに分化することができ、任意のタイプの組織から単離することができる。一般に、MSCは、骨髄、脂肪組織、臍帯、または末梢血から単離される。それらを得るための方法は、当業者に周知である。人工多能性幹細胞(iPS細胞またはiPSCとしても知られる)は、成体細胞から直接生成できる多能性幹細胞の一種である。Yamanakaらは、Oct3/4、Sox2、Klf4およびc-Myc遺伝子をマウスおよびヒト線維芽細胞に移入し、そして細胞に遺伝子を強制的に発現させることによって、iPS細胞を誘導した(WO 2007/069666)。Thomsonらは、続いて、Klf4およびc-Mycの代わりにNanogおよびLin28を使用してヒトiPS細胞を生成した(WO 2008/118820)。
前記宿主細胞はまた、肝細胞であってもよい。細胞単離およびその後のヒトまたはマウスレシピエントへの移植を含む肝細胞移植手順は例えば、FilippiおよびDhawan、Ann NY Acad Sci.2014,1315 1315 50-55;Yoshidaら、Gastroenterology 1996,111:1654-1660;Iraniら、Molecular Therapy 2001、3:3、302-309;およびVogelら J Inherit Metab Dis 2014、37:165-176に記載されている。ウイルスベクターの肝細胞への生体外形質導入のための方法は例えば、Merleら、Scandinavian Journal of Gastroenterology 2006、41:8、974-982に記載されている。
〔薬学的組成物〕
本開示の別の態様は、本発明の核酸構築物、発現ベクター、ウイルス粒子、または宿主細胞を、1つ以上の薬学的に受容可能な賦形剤、希釈剤、または担体と組み合わせて含む薬学的組成物に関する。
本明細書中で使用される場合、用語「薬学的に受容可能である」は、動物および/またはヒトにおける使用のために、規制当局によって承認されたか、または欧州薬局方のような認知されたことを意味する。用語「賦形剤」は、それと治療剤とが一緒に投与されるような、希釈剤、補助剤、担体、またはビヒクルをいう。
任意の適切な薬学的に許容可能な担体、希釈剤または賦形剤が、薬学的組成物の調製において使用され得る(例えば、Remington: The Science and Practice of Pharmacy、Alfonso RGennaro(Editor)Mack Publishing Company、April 1997を参照のこと)。薬学的組成物は典型的には無菌であり、製造および貯蔵の条件下で安定である。薬学的組成物は、溶液(例えば、生理食塩水、デキストロース溶液、または緩衝溶液、または他の薬学的に受容可能な滅菌流体)、マイクロエマルジョン、リポソーム、または高い生成物濃度を収容するのに適した他の秩序だった構造(例えば、微粒子またはナノ粒子)として処方され得る。担体は例えば、水、エタノール、ポリオール(例えば、グリセロール、プロピレングリコール、および液体ポリエチレングリコールなど)、およびそれらの適切な混合物を含有する溶媒または分散媒体であり得る。適切な流動性は例えば、レシチンのようなコーティングの使用、分散液の場合には必要な粒径の維持、および界面活性剤の使用によって維持される。多くの場合に、等張剤、例えば糖質、ポリアルコール例えばマンニトール、ソルビトール、または塩化ナトリウムを組成物中に含むのが好ましい。
注射可能な組成物の延長された吸収は組成物中に、吸収を遅延させる薬剤、例えばモノステアリン酸塩およびゼラチンを含めることによってもたらされ得る。本発明の生成物は、制御放出製剤で、例えば、注入およびマイクロカプセル化送達システムを含む、生成物を急速放出から保護する徐放性ポリマーまたは他の担体を含む組成物で投与され得る。例えば、エチレン酢酸ビニル、ポリ無水物、ポリグリコール酸、コラーゲン、ポリオルトエステル、ポリ乳酸およびポリ乳酸/ポリグリコールコポリマー(PLG)などの生分解性および生体適合性ポリマーを使用することができる。好ましくは、前記薬学的組成物は、溶液として、より好ましくは、任意に緩衝化された生理食塩水溶液として製剤化される。補足的な活性化合物もまた、本発明の薬学的組成物に組み込むことができる。追加の治療薬の同時投与に関するガイダンスは例えば、カナダ薬学者協会の医薬品専門部会(CPS)に見出すことができる。
一実施形態では、薬学的組成物は、静脈内、動脈内、皮下、腹腔内または筋肉内投与に適した組成物を含む非経口薬学的組成物である。これらの薬学的組成物は、例示的なものにすぎず、他の非経口および非経口投与経路に適した薬学的組成物を限定するものではない。本明細書中に記載される薬学的組成物は、単一の単位用量形態または複数の用量形態でパッケージングされ得る。
〔治療的用途〕
さらなる態様において、本発明は、それを必要な対象者における薬剤として使用するための、本発明の核酸構築物、発現ベクター、ウイルス粒子、宿主細胞または薬学的組成物に関する。
本明細書で使用される「対象者」または「患者」という用語は哺乳動物を指す。開示された治療方法から恩恵を受けることができる哺乳動物種には、ヒト、類人猿、チンパンジー、サル、およびオランウータンなどの非ヒト霊長類、イヌおよびネコを含む飼育動物、ならびにウマ、ウシ、ブタ、ヒツジ、およびヤギなどの家畜、または限定されないがマウス、ラット、モルモット、ウサギ、ハムスターなどを含む他の哺乳動物種が含まれるが、これらに限定されない。特定の実施形態では、前記対象者は、新生児、乳児、または小児、より具体的には新生児または乳児である。本明細書で使用される「新生児」は28日未満の乳児を指し、本明細書で使用される「乳児」は、29日から2年の間の子供を指す。
さらなる態様において、本発明は、肝疾患、特にそれを必要とする対象者における家族性胆汁鬱滞タイプ3(PFIC3)の処理における使用のための、本発明の核酸構築物、発現ベクター、ウイルス粒子、宿主細胞または薬学的組成物に関する。
本明細書中で使用される場合、用語「処理」は、疾患の治療、予防、予防法および遅延のような、患者の健康状態を改善することが意図される任意の行為をいう。特定の実施形態では、このような用語は、疾患または疾患に関連する症状の改善または根絶を指す。他の実施形態では、この用語は、このような疾患を有する対象者への1つ以上の治療薬の投与から生じる疾患の広がりまたは悪化を最小限にすることを指す。
特定の実施形態では、肝疾患は、妊娠タイプ3(ICP3)の肝内胆汁鬱滞、コレステロール胆石疾患、薬物誘発性胆汁鬱滞、一過性新生児胆汁鬱滞、成人特発性肝硬変、胆管癌、および家族性胆汁鬱滞タイプ3(PFIC3)からなる群より選択される。より特定の実施形態では、前記肝疾患は、家族性胆汁鬱滞タイプ3(PFIC3)である。
関連する態様において、本発明は、肝疾患の処理において使用するための、好ましくは家族性タイプ3胆汁鬱滞(PFIC3)の処理において使用するための薬剤の調製における、本発明の核酸構築物、発現ベクター、ウイルス粒子、宿主細胞または薬学的組成物の使用に関する。
さらなる態様において、本発明は、治療有効量の本発明の核酸構築物、発現ベクター、ウイルス粒子、宿主細胞、または薬学的組成物を対象者に投与することを含む、それを必要とする対象者における肝疾患、好ましくは家族性胆汁鬱滞タイプ3(PFIC3)を治療および/または予防する方法に関する。
本発明との関連において、「有効量」は、治療有効量を意味する。本明細書において使用される場合、「治療有効量」は、所望の治療結果を達成するために必要な用量および期間において有効な量をいい、例えば、血清中のバイオマーカーレベル、例えば、γ-グルタミルトランスフェラーゼ(GGT)、アラニントランスアミナーゼ(ALT)、アルカリホスファターゼ(ALP)、アスパラギン酸トランスアミナーゼ(AST)、胆汁酸塩(BS)およびビリルビンの減少、胆汁ホスファチジルコリンまたは他のリン脂質濃度の回復をいう。本発明の生成物、またはそれを含む薬学的組成物の治療有効量は、個々の疾患状態、年齢、性別、および重量、ならびに個々において所望の応答を誘発する生成物または薬学的組成物の能力などの因子に従って異なり得る。用量・用法は、最適の治療応答を提供するために調節してよい。治療有効量はまた、典型的には、生成物または薬学的組成物の任意の毒性または有害な効果を治療上有益な作用が上回る量である。
本発明の生成物による治療は、家族性タイプ3胆汁鬱滞(PFIC3)の1つまたは複数の症状の重篤度を緩和、改善、または軽減低減することができる。例えば、治療により、γ-グルタミルトランスフェラーゼ(GGT)、アラニントランスアミナーゼ(ALT)、アルカリホスファターゼ(ALP)、アスパラギン酸トランスアミナーゼ(AST)、胆汁酸塩(BS)およびビリルビンなどの血清中のバイオマーカーレベルが低下するか;または胆汁ホスファチジルコリンまたは他のリン脂質濃度が回復する可能性があり;その結果、胆管炎、細胆管増殖、胆管線維症、門脈圧亢進症、肝硬変、消化管出血、黄疸、胆汁鬱滞、そう痒症、および肝不全の重篤度を緩和、改善、または軽減低減しうる。
本発明の生成物は、典型的には、薬学的組成物または薬剤中に含まれ、場合により薬学的担体、希釈剤および/またはアジュバントと組み合わせて含まれる。このような組成物または薬剤は、所望の治療効果を提供するのに十分な有効量の本発明の生成物、および薬学的に受容可能な担体または賦形剤を含む。
1つの実施形態において、核酸構築物、発現ベクター、ウイルス粒子、宿主細胞、またはその治療用途のための薬学的組成物は、非経口経路によって、特に静脈内、動脈内、皮下、腹腔内または筋肉内経路によって、対象者または患者に投与される。
1つの実施形態において、核酸構築物、発現ベクター、ウイルス粒子、宿主細胞、またはその治療用途のための薬学的組成物は間質経路によって、すなわち、組織の間隙への、またはその中への注入によって投与される。組織標的は、特異的であってもよく、例えば肝臓組織であってもよく、またはいくつかの組織、例えば筋肉組織および肝臓組織の組み合わせであってもよい。例示的な組織標的は、肝臓、骨格筋、心筋、脂肪沈着物、腎臓、肺、血管内皮、上皮および/または造血細胞を含み得る。好ましい実施形態において、それは、肝内注入、すなわち、肝組織の間質空間への注入によって投与される。
対象者または患者に投与される本発明の生成物の量は、個体の年齢、性別、および体重;疾患の性質および段階、疾患の攻撃性;投与経路;および/または対象者または患者に処方された併用薬を含む、個々の対象者または患者の特定の状況に依存して異なり得る。用量・用法は、最適の治療応答を提供するために調節してよい。
任意の特定の対象者について、特定の用量・用法は、個々の必要性、および組成物を投与するまたは投与を監督する人の専門的判断に従って、経時的に調節され得る。本明細書に記載される用量範囲は単に例示的なものであり、医師によって選択され得る用量範囲を限定するものではない。
一実施形態において、本発明によるAAVウイルス粒子は、PFIC3病の治療のために、5×1011~1×1016 vg/kg(vg:ウイルスゲノム;kg:対象者または患者の体重)の範囲内に含まれる量または用量で対象者または患者に投与することができる。より特定の実施形態では、AAVウイルス粒子は、1×1013~1×1015 vg/kgの範囲内に含まれる量で投与される。より特定の実施形態では、AAVウイルス粒子は、少なくとも2×1013 vg/kg、好ましくは4.5×1013 vg/kg、より好ましくは5×1013 vg/kg、より好ましくは8×1013 vg/kgの用量で投与される。
〔キット〕
別の態様において、本発明はさらに、1つ以上の容器中に本発明の核酸構築物、発現ベクター、宿主細胞、ウイルス粒子または薬学的組成物を含むキットに関する。キットは、キット内に含まれる核酸構築物、発現ベクター、ウイルス粒子、宿主細胞または薬学的組成物を患者に投与する方法を記載する取扱説明書またはパッケージング材料を含み得る。キットの容器は任意の適切な材料、例えば、ガラス、プラスチック、金属など、および任意の適切なサイズ、形状、または構成であり得る。特定の実施形態では、キットは、適切な液体または溶液形態の本発明の生成物を含有する1つ以上のアンプルまたはシリンジを含み得る。
以下の実施例は例示のために提供され、そしてそれらは本発明を限定することを意図しない。さらに、本発明は、本明細書に記載される特定の好ましい実施形態の全ての可能な組み合わせを包含する。
〔実施例〕
〔トランスフェクションによりインビトロで分析した6つのMDR3導入遺伝子変異体〕
ABCB4遺伝子は、肝細胞の小管膜に局在し、胆汁中のホスファチジルコリン(PC)濃度の調節を担うホスファチジルコリン(PC)トランスポータータンパク質である多剤耐性タンパク質(MDR3)をコードする。PCは、胆汁酸と混合ミセルを形成し、PCは、遊離胆汁酸によって引き起こされる組織損傷および毒性を減少させるのに役立つ。ABCB4の突然変異は毒性を引き起こす胆汁中のPCの欠乏につながり、それが胆汁鬱滞につながる可能性がある。その結果生じる障害は、進行性家族性肝内胆汁鬱滞タイプ3である(Jacquemin、E.2012、Clin Res Hepatol Gastroenterol;36 Suppl 1:S26-35)。MDR3に対して3種類のアイソフォームが存在する可能性があり、A、B、Cと名付けた。肝臓特異的α1‐抗トリプシン(A1AT)プロモーターの転写制御下で、ヒトMDR3‐A、‐Bまたは‐C cDNAの野生型(wt)またはコドン最適化(co)バージョンのいずれかを含むプラスミドを作成した。これらのプラスミドをヒト肝細胞株Huh7に一過性にトランスフェクションし、6つの変異体の発現を分析し、比較した。トランスフェクションの48時間後、細胞を採取し、固定し、抗ウサギMDR3一次抗体および抗ウサギ-Alexa488二次抗体で染色し、免疫蛍光および共焦点顕微鏡によって可視化した。MDR3発現陽性に染色された細胞の画像から、アイソフォームAのみが細胞膜に局在すると思われることが示された。このことは、MDR3陽性細胞の連続面が明らかな膜局在性発現を示したことから、共焦点顕微鏡法の方が明らかであった(図1および図2)。注目すべきことに、潜在的アイソフォームBおよびC(発現配列タグ(EST)データに基づく交互スプライシング変異体の遺伝子予測を介してCの場合に同定される)の配列は、ヌクレオチド結合ドメイン2付近の7アミノ酸付加の存在および膜貫通ドメインをそれぞれ11含む47アミノ酸の欠失により、Aアイソフォームとは異なる。アイソフォームC(UniProtエントリーP21439)の自然な存在の実験的確認はない。
〔コドン最適化MDR3-Aアイソフォームのみが、効率的なAAVベクター生成と適合性である。〕
一過性にトランスフェクションされたプラスミドから発現された場合、Huh7細胞の膜に局在化されたアイソフォームAのみを示すデータを用いて、MDR3アイソフォームAの野生型(MDR3-Awt)またはコドン最適化(MDR3-Aco)導入遺伝子変異体のいずれかをコードする人工Anc80変異体(Zinn Eら、Cell Rep.;2015,12(6):1056-68)に基づくAAVベクターを作製した。最も慣用的なAAVベクター製造プロセスは、ベクターゲノム増幅、カプシド製造およびウイルス粒子集合体に必要な全ての機能を提供する2または3のプラスミドのセットを用いたHEK293細胞の一過性トランスフェクションに基づく。これらのプラスミドの1つは、2つのAAV逆方向末端反復(ITR)に隣接する導入遺伝子を含み、ベクターの生成を可能にするのに十分な量で生成されなければならない。A1ATプロモーター下流のMDR3‐AwtおよびMDR3‐Aco配列を含むAAVプラスミドを作製した。予想外にも、本発明者らは、MDR3-Awt AAVプラスミドを有する細菌を増殖させる際に、単離されたプラスミドDNAの異常な制限酵素消化分析によって見られるように、細菌増殖速度の低下および組み換えのより高い例などの問題に遭遇した。これらの問題は増殖温度を30℃に低下させることによってプラスミド製造において部分的に改善されたが、組み換え/不純プラスミドDNA汚染物質は未解決のままである。対照的に、MDR3-Aco配列を含むAAVプラスミドははるかに安定であり、上記の技術的問題のいずれもなしに生成され得た。
AAVベクターは、HEK293細胞の一過性トランスフェクションによりMDR3プラスミドで製造した。簡潔には、AAVAnc80ウイルス粒子を生成するために、融合性の(confluent)HEK293T細胞単層を含む30個の150cmフラスコを、ヘルパープラスミドpδF6、pAAP2、pKAnc80L65(Zinn Eら、Cell Report;2015,12(6):1056-68)およびポリエチレンイミン(PEI)を使用してパッケージングされるべきベクター配列を含む選択されたAAVプラスミド(AAV-MDR3-AcoまたはAAV-MDR3-Awt)で同時トランスフェクションした。72時間のインキュベーション後、Vanrell L.ら、Mol Ther.2011;19(7):1245-53に記載されているように、イオジキサノール勾配(gradient)を使用する超遠心分離によって、上清および細胞からAAV粒子を精製した。最後に、精製ウイルスを、Amicon Ultra Centrifugal Filters-Ultracel 100K(Millipore)を使用して濃縮し、A1ATプロモーターに特異的なオリゴヌクレオチド(フォワードプライマー:5’-TTGCTCCTCCGATAACTGGG-3’(配列番号9);リバースプライマー:5’-CCCTGTCCTCGTCCGTATTT-3’(配列番号10))を使用する定量PCRによって滴定した。AAV8ウイルス粒子を、pDP8(PlasmidFactory、ドイツ)を単一のヘルパープラスミドとして使用することを除いて、同じ方法で生成した。AAVAnc80-MDR3-Acoウイルス粒子は、4.6×1012ウイルスゲノム(VG)/mLの平均力価で、インビボ試験(表1)に適合する量と濃度でルーチン通りに製造された。驚くべきことに、MDR3-Awtアイソフォームを用いてAAVAnc80ベクターを生成する5つの試行のうち4つは、いかなる有意な収率も達成することができなかった(5つのうち4つは5×1011 VG/mL未満の力価を有し、これはインビボ適用には低すぎた)。これは、以前に観察されたように、プラスミドとして運ばれる場合だけでなく、AAV粒子との関連においても、MDR3-Awtアイソフォームコード配列の予想外の固有の特徴を示した。MDR3-Awtバージョンを有するAAVベクターの生成は、コドン最適化MDR3-Acoの生成よりも、実質的なトラブルシューティングおよび/またはより多量の時間、資源、および材料を必要とすると推定された。したがって、アイソフォームMDR3-Acoを、さらなる開発のために選択した。
Figure 2022508724000001
〔流体力学的注入(プラスミドDNAトランスフェクション)を介したMDR3 WTおよび共変異体の肝臓発現のインビボ試験〕
トランスジェニックマウスモデルFVB.129P2-ABCB4tm1Bor/J(ABCB4 -/-)はAbcb4遺伝子のホモ接合性ノックアウトである(Smit J.J.ら、Cell.1993;75(3):451-62)。流体力学的注射(HDI)を介したMDR3導入遺伝子変異体を含有するプラスミドの送達後、これらのマウスにおいてインビボでMDR3発現を分析した。7週齢の雄Abcb4-/-マウスに、総容量2.4ml中25μgのプラスミドpAAV-MDR3を5秒以内に尾静脈に注射した。MDR3アイソフォームAco、Awt、Cco、およびCwtを有するプラスミドを試験した。24時間後に動物を屠殺し、肝臓を採取し、免疫組織化学(IHC)によってMDR3発現について染色した。pAAV‐MDR3‐Acoを接種した両マウスはMDR3発現を示した。特に、1匹のマウスは、肝臓組織全体にわたって個別のポケットでMDR3発現を示し(図3)、MDR3は明らかに肝細胞の小管膜上に位置していた。対照的に、pAAV-MDR3-Awtを有するHDIは、全サンプル中の1つの細胞のみの周りで検出され得るMDR3発現を示す1つの動物のみをもたらした(図3)。これらの結果は、MDR3-Aco配列が、MDR3-Awtと比較して、インビボではるかに効率的に発現され得ることを示唆する。最後に、pAAV-MDR3-CcoもpAAV-MDR3-Cwtも、MDR3に対していかなる陽性染色も示さなかった(データは示さず)。
〔PFIC3のマウスモデルにおけるMDR3導入遺伝子を有するAAVベクターの試験〕
Abcb4-/-ノックアウトマウスモデルは、血清肝トランスアミナーゼ、アルカリホスファターゼ、胆汁酸塩およびビリルビンレベルの上昇;肝臓および脾臓の大きさの増加;胆汁中のホスファチジルコリン濃度の低下;ならびに線維症、コラーゲン沈着および細胞浸潤のような肝臓における重篤な形態学的異常のようないくつかのPFIC3関連マーカーを確実に複製することが示されている。これらのマウスにおける症状の発症は4週齢以前に現れる。本発明者らは最初に、緑色蛍光タンパク質(GFP)レポーターの導入遺伝子を有するAnc80変異体に基づくAAVベクターを用いて、これらのマウスがAAV感染に感受性であるかどうかを試験した。
5×1012 VG/kg体重を接種したマウス(3または4週齢)を1週間後に屠殺し、肝臓サンプルを、それぞれqPCRおよびRT-qPCRによってAAVベクターゲノムコピーおよびGFP mRNAコピーの定量のためにプロセシングした。3週齢および4週齢のAbcb4-/-マウスのいずれも、同じ年齢で接種したWTマウスと比較した場合、有意なレベルでAnc80ベクターで形質導入されないことが見出された(データは示さず)。
次に、2週齢または3週齢のAbcb4-/-マウスに、MDR3‐Aco導入遺伝子を有するAAVAnc80ベクターを3種類の用量(5×1012、1.5×1013および5×1013 VG/kg)で注射した。3週齢で処理され、2週間後に屠殺されたマウスは、5×1013用量の雄のみにおいてPFIC3症状(血清バイオマーカーレベルおよび脾臓および肝臓の大きさ)の非常に最小限の向上しか示さなかったが(データは示さず)、一方、最も高いAAV用量を与えられた雄および雌の両方において、胆汁PC濃度のわずかな増加が観察された(p=0.057対生理食塩水処理Abcb4-/-マウス)(図4)。
しかしながら、5×1013 VG/kgのAAVAnc80-MDR3-Acoにて2週齢で処理したマウスは、処理後3週間まで血清バイオマーカーの顕著な改善を示した(図5)。これらのマウスを処理後3週間で屠殺すると、肝臓および脾臓の重量および肝臓の組織学的所見において、野生型の特性に戻って復帰が見られた(図6および図7)。しかしながら、3倍低用量(1.5×1013 VG/kg)で処理したマウスは、陰性対照の生理食塩水処理ABCB4-/-マウスよりもほとんどまたは全く改良を示さなかった。胆汁PC濃度もまた、最高用量で処理したマウスにおいて有意に増加した(図8)。
〔AAV血清型8ベクターは、PFIC3マウスにおいて持続的な治療反応を達成する。〕
MDR3-Aco導入遺伝子を有する血清型8のAAVベクターを作製し、Abcb4-/-マウスで試験した。AAV8‐MDR3‐Acoベクターを1.5×1013または5×1013VG/kg用量のいずれかで2週齢でマウスに投与した。処理後1~2週という早い時期に、最高用量で処理されたマウスの血清アラニントランスアミナーゼ(ALT)、アルカリホスファターゼ(ALP)、アスパラギン酸トランスアミナーゼ(AST)、胆汁酸塩(BS)およびビリルビンのバイオマーカーレベルは、病気の動物で示されたレベルから野生型動物レベルに明らかに復帰した(図9)。肝臓と脾臓の重量および肝臓の組織学的所見において、野生型の特性に戻って復帰が認められた(図10)。この肝疾患の復帰は、試験の全期間(処理後12週間まで)にわたって維持された。一方、低用量処理マウスのバイオマーカーレベルは、生理食塩水処理Abcb4-/-マウスのバイオマーカーレベルと異ならなかった。
〔AAV8‐MDR3‐Acoで処理したPFIC3マウスではMDR3発現が高レベルで達成された。〕
5×1013 VG/kgのAAV8‐MDR3‐Acoで処理したAbcb4-/-マウスの肝臓におけるMDR3発現を、抗ヒトMDR3抗体を用いた免疫組織化学(IHC)により分析した。実質的なMDR3発現は肝細胞の小管膜上に明らかなタンパク質局在を有する肝臓において検出され(図11)、これは野生型マウスにおいて観察された発現のパターンおよび強度に匹敵した(抗hMDR3を生成するための合成ペプチドがMDR3のマウスバージョンの配列と100%の配列同一性を有したので、同じ条件下で染色されたこれらのマウスは比較体を提供した)。生理食塩水で処理した対照動物は、予想通りMDR3の発現を示さなかった。
〔PFIC3マウスにおけるAAV8-MDR3処理は用量反応を示す。〕
Abcb4-/-マウスを5種類のAAV8-MDR3用量(5x1012、1x1013、2x1013、4x1013および8x1013 VG/kg)で処理した。処理3週間後には、血清バイオマーカーレベルについて、明らかな用量依存性の反応が認められる(図12)。
〔AAV血清型8ベクターは、5週齢のPFIC3マウスにおいて持続的な治療反応を達成する。〕
AAV8-MDR3-Acoベクターを、1×1014 VG/kgで5週齢のAbcb4-/-マウスに投与した。12週間の追跡期間を通して、バイオマーカーレベルは、2週齢で処理した場合に見られたように、疾患状態から野生型動物で見られるレベルまで復帰した(図13)。その効果は、雌よりも雄の方が一貫性が高かった。17週齢で、マウスを屠殺し、AAV8-MDR3-Aco処理マウスは、肝臓および脾臓サイズの減少(図14a-b)、胆汁PCの増加(図14c)および肝線維症の減少(図14d)を含む、PFIC3病の明らかに減少した証拠を示した。MDR3タンパク質の発現を、MDR3に特異的な抗体を使用する免疫組織化学による染色によって測定した。発現量は、雄で野生型レベルの66%、雌で31%であった(図14e)。胆汁PCは、雄と雌でそれぞれ54%と25%の野生型レベルに回復した。
結論として、本発明者らは、MDR3のアイソフォームAのコドン最適化バージョンがPFIC3患者を潜在的に治療する遺伝子治療ベクターを開発するための最良の候補であることを見出した。インビトロのヒト肝細胞株でDNAトランスフェクションにより発現を試験したところ、アイソフォームAのみが細胞膜に局在することがわかった。驚くべきことに、裸のDNAとして投与した場合、コドン最適化MDR3-Aのみが効率的なインビボ発現を示した。
MDR3-A導入遺伝子を有するAAVベクター(Anc80およびAAV8)の製造を開始する場合、コドン最適化したバージョンのみが、期待される標準収率でベクター製造のために実行可能であった。
Abcb4-/-KOマウスモデルにおいてMDR3-Aco導入遺伝子を有するこれらのAAVベクターの試験から、2週齢で処理したマウスは、肝細胞の小管膜への局在およびバイオマーカーレベルの有意な回復を伴うMDR3の高発現レベルを示し、治療効果を達成した。祖先血清型Anc80を利用する研究において、5×1013 VG/kgでのベクター処理は、PFIC3血清バイオマーカーレベルの復帰(処理後3週間まで)、肝臓および脾臓サイズの減少、胆汁PCの増加、ならびに胆汁鬱滞性マウスにおいて観察される肝臓形態異常の矯正を達成した。5×1013 VG/kgのAAV8-MDR3-Acoでは、PFIC3病を示す血清バイオマーカーレベルは、処理後3ヶ月まで、野生型動物で観察された正常レベルに復帰した。さらに、肝臓と脾臓のサイズ、胆汁PC、および肝臓の形態において、これらのAAV8‐MDR3‐Aco処理マウスは、処理3か月後にPFIC3特性の顕著な改善も示した。
〔本発明を実施する際に使用するための配列〕
本発明を実施する際に使用するための配列を以下に記載する:
〔MDR3アイソフォームA(co-MDR3(A))をコードするコドン最適化配列:(配列番号1)〕
ATGGATCTGGAGGCCGCCAAGAAcGGCACCGCcTGGAGACCCACAAGCGCCGAGGGCGACTTCGAGCTGGGCATCAGCTCCAAGCAGAAGAGAAAGAAGACCAAGACAGTGAAGATGATCGGCGTGCTGACACTGTTCAGGTACTCCGACTGGCAGGATAAGCTGTTTATGTCTCTGGGCACCATCATGGCAATCGCCCACGGCAGCGGCCTGCCTCTGATGATGATCGTGTTCGGCGAGATGACCGACAAGTTTGTGGATACAGCCGGCAATTTCTCCTTTCCCGTGAACTTCTCTCTGAGCCTGCTGAACCCTGGCAAGATCCTGGAGGAGGAGATGACAAGATATGCCTACTATTACTCTGGCCTGGGAGCAGGCGTGCTGGTGGCAGCATACATCCAGGTGAGCTTCTGGACCCTGGCAGCAGGCCGGCAGATCAGAAAGATCAGGCAGAAGTTCTTTCACGCCATCCTGCGCCAGGAGATCGGCTGGTTTGACATCAATGATACCACAGAGCTGAACACCCGGCTGACAGACGACATCTCTAAGATCAGCGAGGGCATCGGCGATAAAGTGGGCATGTTCTTTCAGGCCGTGGCCACATTCTTTGCCGGCTTCATCGTGGGCTTTATCAGGGGCTGGAAGCTGACCCTGGTCATCATGGCCATCTCTCCAATCCTGGGCCTGAGCGCCGCCGTGTGGGCAAAGATCCTGTCCGCCTTCTCTGACAAGGAGCTGGCCGCCTACGCCAAGGCAGGAGCAGTGGCAGAGGAGGCCCTGGGCGCCATCCGCACCGTGATCGCCTTTGGCGGCCAGAATAAGGAGCTGGAGCGGTATCAGAAGCACCTGGAGAACGCCAAGGAGATCGGCATCAAGAAGGCCATCTCCGCCAATATCTCTATGGGCATCGCCTTCCTGCTGATCTATGCCAGCTACGCCCTGGCCTTTTGGTATGGCAGCACCCTGGTCATCAGCAAGGAGTACACCATCGGCAATGCCATGACAGTGTTCTTTAGCATCCTGATCGGAGCCTTCTCCGTGGGACAGGCAGCACCATGCATCGACGCCTTCGCCAACGCCAGAGGCGCAGCCTACGTGATCTTTGACATCATCGATAACAATCCAAAGATCGACTCCTTTTCTGAGCGGGGCCACAAGCCCGATTCCATCAAGGGCAATCTGGAGTTCAACGACGTGCACTTTAGCTATCCCTCCCGCGCCAATGTGAAGATCCTGAAGGGCCTGAACCTGAAGGTGCAGTCCGGACAGACAGTGGCCCTGGTGGGCTCTAGCGGATGCGGCAAGTCTACCACAGTGCAGCTGATCCAGCGGCTGTATGACCCAGATGAGGGCACCATCAACATCGACGGCCAGGACATCCGCAACTTCAATGTGAACTACCTGCGGGAGATCATCGGCGTGGTGTCTCAGGAGCCCGTGCTGTTTAGCACCACAATCGCCGAGAATATCTGTTATGGCCGCGGCAACGTGACAATGGATGAGATCAAGAAGGCCGTGAAGGAGGCCAATGCCTACGAGTTCATCATGAAGCTGCCCCAGAAGTTTGACACCCTGGTGGGAGAGAGAGGCGCCCAGCTGAGCGGAGGCCAGAAGCAGAGGATCGCCATCGCCAGAGCCCTGGTGAGGAACCCTAAGATCCTGCTGCTGGACGAGGCCACCTCCGCCCTGGATACAGAGTCTGAGGCAGAGGTGCAGGCCGCCCTGGATAAGGCCCGCGAGGGACGGACCACAATCGTGATCGCCCACAGACTGAGCACAGTGAGGAATGCCGACGTGATCGCCGGCTTCGAGGATGGCGTGATCGTGGAGCAGGGCAGCCACTCCGAGCTGATGAAGAAGGAGGGCGTGTACTTCAAGCTGGTGAACATGCAGACCTCTGGCAGCCAGATCCAGTCCGAGGAGTTTGAGCTGAATGACGAGAAGGCAGCAACAAGGATGGCACCTAACGGATGGAAGAGCAGACTGTTCAGGCACTCCACCCAGAAGAATCTGAAGAACTCTCAGATGTGCCAGAAGAGCCTGGACGTGGAAACCGATGGACTGGAGGCAAATGTGCCACCCGTGAGCTTCCTGAAGGTGCTGAAGCTGAACAAGACAGAGTGGCCATATTTTGTGGTGGGCACCGTGTGCGCAATCGCAAATGGCGGCCTGCAGCCAGCCTTCAGCGTGATCTTTTCCGAGATCATCGCCATCTTCGGCCCTGGCGACGATGCCGTGAAGCAGCAGAAGTGTAACATCTTTTCCCTGATCTTCCTGTTTCTGGGCATCATCTCTTTCTTTACCTTCTTTCTGCAGGGCTTCACATTTGGCAAGGCCGGCGAGATCCTGACACGGAGACTGAGAAGCATGGCCTTCAAGGCCATGCTGAGGCAGGATATGTCCTGGTTTGACGATCACAAGAACAGCACCGGCGCCCTGTCCACCAGACTGGCAACAGACGCAGCACAGGTGCAGGGAGCAACCGGCACAAGGCTGGCCCTGATCGCCCAGAATATCGCCAACCTGGGCACAGGCATCATCATCTCTTTCATCTACGGCTGGCAGCTGACCCTGCTGCTGCTGGCAGTGGTGCCAATCATCGCCGTGAGCGGCATCGTGGAGATGAAGCTGCTGGCCGGCAATGCCAAGAGAGACAAGAAGGAGCTGGAGGCAGCAGGCAAGATCGCAACCGAGGCCATCGAGAACATCCGCACCGTGGTGAGCCTGACACAGGAGCGGAAGTTCGAGTCCATGTATGTGGAGAAGCTGTATGGCCCTTACCGCAATTCCGTGCAGAAGGCCCACATCTACGGCATCACCTTTTCCATCTCTCAGGCTTTCATGTATTTTTCTTACGCCGGCTGCTTCCGGTTTGGCGCCTATCTGATCGTGAACGGCCACATGAGGTTCCGCGATGTGATCCTGGTGTTCTCTGCCATCGTGTTTGGAGCAGTGGCCCTGGGACACGCCTCCTCTTTTGCCCCTGACTATGCAAAGGCAAAGCTGTCCGCCGCACACCTGTTCATGCTGTTTGAGAGACAGCCTCTGATCGATAGCTACTCCGAGGAGGGCCTGAAGCCAGACAAGTTCGAGGGCAATATCACATTCAACGAGGTGGTGTTTAATTATCCAACCAGGGCCAACGTGCCCGTGCTGCAGGGCCTGAGCCTGGAGGTGAAGAAGGGACAGACACTGGCCCTGGTGGGCAGCTCCGGATGCGGCAAGTCCACCGTGGTGCAGCTGCTGGAGAGATTCTACGACCCTCTGGCAGGCACCGTGCTGCTGGATGGACAGGAGGCCAAGAAGCTGAATGTGCAGTGGCTGAGAGCCCAGCTGGGCATCGTGTCTCAGGAGCCAATCCTGTTCGATTGTAGCATCGCCGAGAATATCGCCTACGGCGACAACTCTAGGGTGGTGAGCCAGGATGAGATCGTGAGCGCCGCAAAGGCAGCAAACATCCACCCTTTTATCGAGACCCTGCCACACAAGTATGAGACACGCGTGGGCGACAAGGGCACCCAGCTGTCCGGAGGACAGAAGCAGAGGATCGCAATCGCCCGCGCCCTGATCAGGCAGCCCCAGATCCTGCTGCTGGATGAAGCCACCTCCGCCCTGGACACAGAGTCTGAGAAGGTGGTGCAGGAGGCCCTGGACAAAGCCCGCGAGGGACGGACATGTATTGTCATTGCTCACAGACTGAGCACCATCCAGAATGCCGACCTGATCGTGGTGTTCCAGAACGGCAGGGTGAAGGAGCACGGCACACACCAGCAGCTGCTGGCCCAGAAGGGCATCTACTTTTCTATGGTGAGCGTGCAGGCCGGCACCCAGAACCTGTAG
〔MDR3アイソフォームA(co-MDR3(A)-2)をコードするコドン最適化配列(配列番号2)〕
ATGGATCTGGAAGCTGCCAAAAATGGCACAGCTTGGAGGCCCACCTCTGCTGAAGGGGATTTTGAGCTGGGCATCAGCAGCAAGCAGAAGAGAAAAAAGACCAAGACAGTGAAGATGATTGGGGTGCTGACCCTGTTCAGATACTCTGACTGGCAGGACAAGCTGTTCATGAGCCTGGGCACCATCATGGCCATTGCTCATGGTTCTGGCCTGCCTCTGATGATGATTGTGTTTGGGGAGATGACAGACAAGTTTGTGGACACAGCTGGCAACTTCAGCTTCCCTGTGAACTTCAGCCTGAGCCTGCTGAACCCTGGCAAGATCCTGGAAGAGGAAATGACCAGATACGCCTACTACTACTCTGGCCTTGGAGCTGGTGTCCTGGTGGCTGCCTATATCCAGGTGTCCTTTTGGACCCTGGCTGCTGGCAGACAGATCAGAAAGATCAGGCAGAAATTCTTCCATGCCATCCTGAGGCAAGAGATTGGATGGTTTGACATCAATGACACCACAGAGCTGAACACCAGGCTGACAGATGACATCAGCAAGATCTCTGAAGGCATTGGGGACAAAGTGGGGATGTTCTTCCAGGCTGTGGCCACCTTCTTTGCTGGCTTCATTGTGGGCTTTATCAGAGGCTGGAAACTGACCCTGGTCATCATGGCTATCAGCCCCATCCTGGGACTGTCTGCTGCTGTGTGGGCCAAAATCCTGTCTGCCTTCTCTGACAAAGAACTGGCAGCCTATGCCAAGGCTGGTGCTGTGGCTGAAGAAGCCCTGGGAGCCATCAGAACAGTGATTGCCTTTGGAGGGCAGAACAAAGAGCTGGAAAGATACCAGAAACACCTGGAAAATGCCAAAGAGATAGGCATCAAGAAGGCCATCTCTGCCAACATCAGCATGGGCATTGCCTTTCTGCTCATCTATGCCAGCTATGCCCTGGCCTTTTGGTATGGCAGCACCCTGGTTATCAGCAAAGAGTACACCATTGGCAACGCCATGACAGTGTTCTTCAGCATCCTGATTGGAGCCTTTTCTGTTGGCCAGGCTGCCCCTTGCATTGATGCCTTTGCTAATGCCAGAGGGGCTGCTTATGTGATCTTTGACATTATTGACAACAACCCCAAGATTGACAGCTTCTCTGAGAGAGGCCACAAGCCTGACAGCATCAAGGGCAACCTTGAGTTCAATGATGTGCACTTCAGCTACCCCAGCAGGGCCAATGTGAAAATCCTGAAGGGCCTGAACCTGAAGGTGCAGTCTGGACAGACAGTGGCCCTTGTGGGATCTTCTGGCTGTGGCAAGAGCACCACAGTGCAGCTGATCCAGAGACTGTATGACCCTGATGAGGGCACAATCAACATTGATGGCCAGGACATCAGAAACTTCAATGTGAACTACCTGAGGGAAATCATAGGGGTTGTGTCCCAAGAGCCTGTGCTGTTCAGCACCACCATTGCTGAGAACATCTGCTATGGCAGGGGCAATGTCACAATGGATGAGATCAAGAAAGCTGTGAAAGAGGCCAATGCCTATGAGTTCATCATGAAGCTGCCCCAGAAGTTTGACACCCTTGTTGGAGAAAGAGGGGCCCAGCTGTCTGGTGGCCAGAAGCAGAGAATTGCCATTGCCAGGGCTCTTGTCAGAAACCCTAAGATCCTGCTGCTGGATGAGGCCACATCTGCCCTGGATACAGAGTCTGAGGCAGAGGTGCAGGCTGCACTGGATAAGGCTAGAGAGGGAAGAACAACCATTGTGATTGCCCACAGACTGAGCACAGTCAGAAATGCAGATGTGATTGCAGGCTTTGAGGATGGGGTCATAGTGGAACAGGGCAGCCACTCTGAGCTGATGAAGAAAGAAGGGGTGTACTTCAAGCTGGTCAACATGCAGACCAGTGGCAGCCAGATCCAGTCTGAGGAATTTGAGCTGAATGATGAGAAGGCTGCCACCAGAATGGCCCCTAATGGCTGGAAGTCTAGGCTGTTTAGACACAGCACCCAGAAGAACCTCAAGAACAGCCAGATGTGCCAGAAAAGCCTGGATGTTGAGACAGATGGCCTGGAAGCCAATGTGCCTCCTGTGTCCTTCCTGAAAGTGCTGAAGCTGAACAAGACAGAGTGGCCCTACTTTGTTGTGGGCACAGTGTGTGCCATTGCAAATGGTGGCCTGCAGCCAGCTTTCTCTGTGATCTTCTCTGAAATCATTGCCATCTTTGGCCCTGGGGATGATGCTGTGAAGCAGCAGAAGTGCAATATCTTTTCCCTGATCTTCCTGTTCCTGGGGATCATCAGTTTCTTCACATTCTTTCTGCAAGGCTTCACCTTTGGCAAGGCTGGGGAGATCCTGACTAGAAGGCTGAGATCTATGGCCTTCAAAGCCATGCTGAGACAGGACATGTCTTGGTTTGATGACCACAAGAACTCCACAGGGGCCCTGAGCACAAGACTGGCTACAGATGCTGCTCAGGTGCAGGGTGCTACAGGCACTAGACTGGCCCTGATTGCACAGAACATTGCCAACCTTGGCACAGGCATCATCATTAGCTTCATCTATGGCTGGCAGCTGACACTGCTCCTGCTGGCTGTTGTGCCCATCATTGCAGTGTCTGGCATTGTGGAAATGAAGTTGCTGGCTGGCAATGCCAAGAGGGACAAGAAAGAGCTTGAGGCAGCAGGCAAGATTGCCACAGAGGCCATTGAGAATATCAGGACAGTGGTGTCTCTGACCCAAGAAAGAAAGTTTGAGTCTATGTATGTGGAAAAGCTGTATGGGCCCTATAGGAACTCTGTGCAAAAGGCCCACATCTATGGGATCACCTTCTCCATCAGCCAGGCTTTCATGTACTTTAGCTATGCTGGCTGCTTCAGATTTGGGGCCTACCTGATTGTGAATGGCCACATGAGATTCAGGGATGTGATCCTGGTGTTTTCTGCCATTGTCTTTGGAGCTGTGGCTCTGGGCCATGCCTCTAGCTTTGCCCCTGACTATGCCAAAGCCAAACTGTCTGCAGCCCACCTGTTCATGCTGTTTGAGAGACAGCCCCTGATTGACTCCTACTCTGAGGAAGGACTGAAGCCTGATAAGTTTGAGGGCAACATCACCTTCAATGAGGTGGTGTTCAACTACCCTACCAGAGCTAATGTGCCAGTGCTGCAGGGACTCTCCCTGGAAGTGAAGAAAGGGCAGACTCTGGCTCTTGTGGGCAGCTCAGGATGTGGCAAGTCTACAGTGGTGCAGCTGCTGGAAAGGTTCTATGATCCCCTGGCAGGCACAGTGCTGTTGGATGGCCAAGAGGCTAAAAAGCTGAATGTGCAGTGGCTGAGAGCACAGCTGGGAATTGTGTCTCAAGAACCCATCCTGTTTGACTGCAGCATAGCAGAGAACATAGCCTATGGGGACAACTCCAGAGTGGTTTCTCAGGATGAGATTGTCTCTGCTGCCAAGGCAGCCAACATTCACCCCTTCATTGAGACACTGCCCCACAAATATGAGACAAGAGTGGGAGACAAGGGAACCCAGCTCAGTGGTGGACAGAAACAAAGGATTGCTATAGCTAGGGCCCTGATCAGACAGCCTCAGATTCTGCTCCTTGATGAAGCAACCTCTGCTCTGGACACTGAATCTGAGAAGGTGGTGCAAGAGGCCCTGGACAAAGCCAGAGAGGGTAGAACCTGCATTGTCATTGCTCACAGGCTGTCTACCATCCAGAATGCTGATCTGATTGTGGTGTTCCAGAATGGGAGAGTGAAAGAGCATGGCACCCACCAGCAACTGCTGGCCCAGAAGGGCATCTACTTCAGCATGGTGTCTGTGCAGGCAGGGACCCAGAACCTGTAA
〔合成ポリA配列(配列番号3)〕
AATAAAGACCTCTTATTTTCATTCATCAGGTGTGGTTGGTTTTTTTGTGTGGGGGC
〔rAAV-MDR3-Aco 1(配列番号4)〕
CCTGCAGGCAGCTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGCCCGGGCAAAGCCCGGGCGTCGGGCGACCTTTGGTCGCCCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGGCCAACTCCATCACTAGGGGTTCCTGCGGCCGCGAATTCCATGGTACCAGGCATCAAGAcacgtgCGCCACCCCCTCCACCTTGGACACAGGACGCTGTGGTTTCTGAGCCAGGTACAATGACTCCTTTCGGTAAGTGCAGTGGAAGCTGTACACTGCCCAGGCAAAGCGTCCGGGCAGCGTAGGCGGGCGACTCAGATCCCAGCCAGTGGACTTAGCCCCTGTTTGCTCCTCCGATAACTGGGGTGACCTTGGTTAATATTCACCAGCAGCCTCCCCCGTTGCCCCTCTGGATCCACTGCTTAAATACGGACGAGGACAGGGCCCTGTCTCCTCAGCTTCAGGCACCACCACTGACCTGGGACAGTGAAGGCCTGTCGACGGATCCGCCGCCACCATGGATCTGGAGGCCGCCAAGAAcGGCACCGCcTGGAGACCCACAAGCGCCGAGGGCGACTTCGAGCTGGGCATCAGCTCCAAGCAGAAGAGAAAGAAGACCAAGACAGTGAAGATGATCGGCGTGCTGACACTGTTCAGGTACTCCGACTGGCAGGATAAGCTGTTTATGTCTCTGGGCACCATCATGGCAATCGCCCACGGCAGCGGCCTGCCTCTGATGATGATCGTGTTCGGCGAGATGACCGACAAGTTTGTGGATACAGCCGGCAATTTCTCCTTTCCCGTGAACTTCTCTCTGAGCCTGCTGAACCCTGGCAAGATCCTGGAGGAGGAGATGACAAGATATGCCTACTATTACTCTGGCCTGGGAGCAGGCGTGCTGGTGGCAGCATACATCCAGGTGAGCTTCTGGACCCTGGCAGCAGGCCGGCAGATCAGAAAGATCAGGCAGAAGTTCTTTCACGCCATCCTGCGCCAGGAGATCGGCTGGTTTGACATCAATGATACCACAGAGCTGAACACCCGGCTGACAGACGACATCTCTAAGATCAGCGAGGGCATCGGCGATAAAGTGGGCATGTTCTTTCAGGCCGTGGCCACATTCTTTGCCGGCTTCATCGTGGGCTTTATCAGGGGCTGGAAGCTGACCCTGGTCATCATGGCCATCTCTCCAATCCTGGGCCTGAGCGCCGCCGTGTGGGCAAAGATCCTGTCCGCCTTCTCTGACAAGGAGCTGGCCGCCTACGCCAAGGCAGGAGCAGTGGCAGAGGAGGCCCTGGGCGCCATCCGCACCGTGATCGCCTTTGGCGGCCAGAATAAGGAGCTGGAGCGGTATCAGAAGCACCTGGAGAACGCCAAGGAGATCGGCATCAAGAAGGCCATCTCCGCCAATATCTCTATGGGCATCGCCTTCCTGCTGATCTATGCCAGCTACGCCCTGGCCTTTTGGTATGGCAGCACCCTGGTCATCAGCAAGGAGTACACCATCGGCAATGCCATGACAGTGTTCTTTAGCATCCTGATCGGAGCCTTCTCCGTGGGACAGGCAGCACCATGCATCGACGCCTTCGCCAACGCCAGAGGCGCAGCCTACGTGATCTTTGACATCATCGATAACAATCCAAAGATCGACTCCTTTTCTGAGCGGGGCCACAAGCCCGATTCCATCAAGGGCAATCTGGAGTTCAACGACGTGCACTTTAGCTATCCCTCCCGCGCCAATGTGAAGATCCTGAAGGGCCTGAACCTGAAGGTGCAGTCCGGACAGACAGTGGCCCTGGTGGGCTCTAGCGGATGCGGCAAGTCTACCACAGTGCAGCTGATCCAGCGGCTGTATGACCCAGATGAGGGCACCATCAACATCGACGGCCAGGACATCCGCAACTTCAATGTGAACTACCTGCGGGAGATCATCGGCGTGGTGTCTCAGGAGCCCGTGCTGTTTAGCACCACAATCGCCGAGAATATCTGTTATGGCCGCGGCAACGTGACAATGGATGAGATCAAGAAGGCCGTGAAGGAGGCCAATGCCTACGAGTTCATCATGAAGCTGCCCCAGAAGTTTGACACCCTGGTGGGAGAGAGAGGCGCCCAGCTGAGCGGAGGCCAGAAGCAGAGGATCGCCATCGCCAGAGCCCTGGTGAGGAACCCTAAGATCCTGCTGCTGGACGAGGCCACCTCCGCCCTGGATACAGAGTCTGAGGCAGAGGTGCAGGCCGCCCTGGATAAGGCCCGCGAGGGACGGACCACAATCGTGATCGCCCACAGACTGAGCACAGTGAGGAATGCCGACGTGATCGCCGGCTTCGAGGATGGCGTGATCGTGGAGCAGGGCAGCCACTCCGAGCTGATGAAGAAGGAGGGCGTGTACTTCAAGCTGGTGAACATGCAGACCTCTGGCAGCCAGATCCAGTCCGAGGAGTTTGAGCTGAATGACGAGAAGGCAGCAACAAGGATGGCACCTAACGGATGGAAGAGCAGACTGTTCAGGCACTCCACCCAGAAGAATCTGAAGAACTCTCAGATGTGCCAGAAGAGCCTGGACGTGGAAACCGATGGACTGGAGGCAAATGTGCCACCCGTGAGCTTCCTGAAGGTGCTGAAGCTGAACAAGACAGAGTGGCCATATTTTGTGGTGGGCACCGTGTGCGCAATCGCAAATGGCGGCCTGCAGCCAGCCTTCAGCGTGATCTTTTCCGAGATCATCGCCATCTTCGGCCCTGGCGACGATGCCGTGAAGCAGCAGAAGTGTAACATCTTTTCCCTGATCTTCCTGTTTCTGGGCATCATCTCTTTCTTTACCTTCTTTCTGCAGGGCTTCACATTTGGCAAGGCCGGCGAGATCCTGACACGGAGACTGAGAAGCATGGCCTTCAAGGCCATGCTGAGGCAGGATATGTCCTGGTTTGACGATCACAAGAACAGCACCGGCGCCCTGTCCACCAGACTGGCAACAGACGCAGCACAGGTGCAGGGAGCAACCGGCACAAGGCTGGCCCTGATCGCCCAGAATATCGCCAACCTGGGCACAGGCATCATCATCTCTTTCATCTACGGCTGGCAGCTGACCCTGCTGCTGCTGGCAGTGGTGCCAATCATCGCCGTGAGCGGCATCGTGGAGATGAAGCTGCTGGCCGGCAATGCCAAGAGAGACAAGAAGGAGCTGGAGGCAGCAGGCAAGATCGCAACCGAGGCCATCGAGAACATCCGCACCGTGGTGAGCCTGACACAGGAGCGGAAGTTCGAGTCCATGTATGTGGAGAAGCTGTATGGCCCTTACCGCAATTCCGTGCAGAAGGCCCACATCTACGGCATCACCTTTTCCATCTCTCAGGCTTTCATGTATTTTTCTTACGCCGGCTGCTTCCGGTTTGGCGCCTATCTGATCGTGAACGGCCACATGAGGTTCCGCGATGTGATCCTGGTGTTCTCTGCCATCGTGTTTGGAGCAGTGGCCCTGGGACACGCCTCCTCTTTTGCCCCTGACTATGCAAAGGCAAAGCTGTCCGCCGCACACCTGTTCATGCTGTTTGAGAGACAGCCTCTGATCGATAGCTACTCCGAGGAGGGCCTGAAGCCAGACAAGTTCGAGGGCAATATCACATTCAACGAGGTGGTGTTTAATTATCCAACCAGGGCCAACGTGCCCGTGCTGCAGGGCCTGAGCCTGGAGGTGAAGAAGGGACAGACACTGGCCCTGGTGGGCAGCTCCGGATGCGGCAAGTCCACCGTGGTGCAGCTGCTGGAGAGATTCTACGACCCTCTGGCAGGCACCGTGCTGCTGGATGGACAGGAGGCCAAGAAGCTGAATGTGCAGTGGCTGAGAGCCCAGCTGGGCATCGTGTCTCAGGAGCCAATCCTGTTCGATTGTAGCATCGCCGAGAATATCGCCTACGGCGACAACTCTAGGGTGGTGAGCCAGGATGAGATCGTGAGCGCCGCAAAGGCAGCAAACATCCACCCTTTTATCGAGACCCTGCCACACAAGTATGAGACACGCGTGGGCGACAAGGGCACCCAGCTGTCCGGAGGACAGAAGCAGAGGATCGCAATCGCCCGCGCCCTGATCAGGCAGCCCCAGATCCTGCTGCTGGATGAAGCCACCTCCGCCCTGGACACAGAGTCTGAGAAGGTGGTGCAGGAGGCCCTGGACAAAGCCCGCGAGGGACGGACATGTATTGTCATTGCTCACAGACTGAGCACCATCCAGAATGCCGACCTGATCGTGGTGTTCCAGAACGGCAGGGTGAAGGAGCACGGCACACACCAGCAGCTGCTGGCCCAGAAGGGCATCTACTTTTCTATGGTGAGCGTGCAGGCCGGCACCCAGAACCTGTAGCATATGATATCAATAAAGACCTCTTATTTTCATTCATCAGGTGTGGTTGGTTTTTTTGTGTGGGGGCTCGAGATCTGAGGAACCCCTAGTGATGGAGGCGGCCGCAGGAACCCCTAGTGATGGAGTTGGCCACTCCCTCTCTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGGGCGACCAAAGGTCGCCCGACGCCCGGGCTTTGCCCGGGCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGCTGCCTGCAGG
〔rAAV-MDR3-Aco 2(配列番号5)〕
CCTGCAGGCAGCTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGCCCGGGCAAAGCCCGGGCGTCGGGCGACCTTTGGTCGCCCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGGCCAACTCCATCACTAGGGGTTCCTGCGGCCGCGAATTCCATGGTACCAGGCATCAAGACACGTGCGCCACCCCCTCCACCTTGGACACAGGACGCTGTGGTTTCTGAGCCAGGTACAATGACTCCTTTCGGTAAGTGCAGTGGAAGCTGTACACTGCCCAGGCAAAGCGTCCGGGCAGCGTAGGCGGGCGACTCAGATCCCAGCCAGTGGACTTAGCCCCTGTTTGCTCCTCCGATAACTGGGGTGACCTTGGTTAATATTCACCAGCAGCCTCCCCCGTTGCCCCTCTGGATCCACTGCTTAAATACGGACGAGGACAGGGCCCTGTCTCCTCAGCTTCAGGCACCACCACTGACCTGGGACAGTGAAGGCCTGTCGACGGATCCGCCGCCACCATGGATCTGGAAGCTGCCAAAAATGGCACAGCTTGGAGGCCCACCTCTGCTGAAGGGGATTTTGAGCTGGGCATCAGCAGCAAGCAGAAGAGAAAAAAGACCAAGACAGTGAAGATGATTGGGGTGCTGACCCTGTTCAGATACTCTGACTGGCAGGACAAGCTGTTCATGAGCCTGGGCACCATCATGGCCATTGCTCATGGTTCTGGCCTGCCTCTGATGATGATTGTGTTTGGGGAGATGACAGACAAGTTTGTGGACACAGCTGGCAACTTCAGCTTCCCTGTGAACTTCAGCCTGAGCCTGCTGAACCCTGGCAAGATCCTGGAAGAGGAAATGACCAGATACGCCTACTACTACTCTGGCCTTGGAGCTGGTGTCCTGGTGGCTGCCTATATCCAGGTGTCCTTTTGGACCCTGGCTGCTGGCAGACAGATCAGAAAGATCAGGCAGAAATTCTTCCATGCCATCCTGAGGCAAGAGATTGGATGGTTTGACATCAATGACACCACAGAGCTGAACACCAGGCTGACAGATGACATCAGCAAGATCTCTGAAGGCATTGGGGACAAAGTGGGGATGTTCTTCCAGGCTGTGGCCACCTTCTTTGCTGGCTTCATTGTGGGCTTTATCAGAGGCTGGAAACTGACCCTGGTCATCATGGCTATCAGCCCCATCCTGGGACTGTCTGCTGCTGTGTGGGCCAAAATCCTGTCTGCCTTCTCTGACAAAGAACTGGCAGCCTATGCCAAGGCTGGTGCTGTGGCTGAAGAAGCCCTGGGAGCCATCAGAACAGTGATTGCCTTTGGAGGGCAGAACAAAGAGCTGGAAAGATACCAGAAACACCTGGAAAATGCCAAAGAGATAGGCATCAAGAAGGCCATCTCTGCCAACATCAGCATGGGCATTGCCTTTCTGCTCATCTATGCCAGCTATGCCCTGGCCTTTTGGTATGGCAGCACCCTGGTTATCAGCAAAGAGTACACCATTGGCAACGCCATGACAGTGTTCTTCAGCATCCTGATTGGAGCCTTTTCTGTTGGCCAGGCTGCCCCTTGCATTGATGCCTTTGCTAATGCCAGAGGGGCTGCTTATGTGATCTTTGACATTATTGACAACAACCCCAAGATTGACAGCTTCTCTGAGAGAGGCCACAAGCCTGACAGCATCAAGGGCAACCTTGAGTTCAATGATGTGCACTTCAGCTACCCCAGCAGGGCCAATGTGAAAATCCTGAAGGGCCTGAACCTGAAGGTGCAGTCTGGACAGACAGTGGCCCTTGTGGGATCTTCTGGCTGTGGCAAGAGCACCACAGTGCAGCTGATCCAGAGACTGTATGACCCTGATGAGGGCACAATCAACATTGATGGCCAGGACATCAGAAACTTCAATGTGAACTACCTGAGGGAAATCATAGGGGTTGTGTCCCAAGAGCCTGTGCTGTTCAGCACCACCATTGCTGAGAACATCTGCTATGGCAGGGGCAATGTCACAATGGATGAGATCAAGAAAGCTGTGAAAGAGGCCAATGCCTATGAGTTCATCATGAAGCTGCCCCAGAAGTTTGACACCCTTGTTGGAGAAAGAGGGGCCCAGCTGTCTGGTGGCCAGAAGCAGAGAATTGCCATTGCCAGGGCTCTTGTCAGAAACCCTAAGATCCTGCTGCTGGATGAGGCCACATCTGCCCTGGATACAGAGTCTGAGGCAGAGGTGCAGGCTGCACTGGATAAGGCTAGAGAGGGAAGAACAACCATTGTGATTGCCCACAGACTGAGCACAGTCAGAAATGCAGATGTGATTGCAGGCTTTGAGGATGGGGTCATAGTGGAACAGGGCAGCCACTCTGAGCTGATGAAGAAAGAAGGGGTGTACTTCAAGCTGGTCAACATGCAGACCAGTGGCAGCCAGATCCAGTCTGAGGAATTTGAGCTGAATGATGAGAAGGCTGCCACCAGAATGGCCCCTAATGGCTGGAAGTCTAGGCTGTTTAGACACAGCACCCAGAAGAACCTCAAGAACAGCCAGATGTGCCAGAAAAGCCTGGATGTTGAGACAGATGGCCTGGAAGCCAATGTGCCTCCTGTGTCCTTCCTGAAAGTGCTGAAGCTGAACAAGACAGAGTGGCCCTACTTTGTTGTGGGCACAGTGTGTGCCATTGCAAATGGTGGCCTGCAGCCAGCTTTCTCTGTGATCTTCTCTGAAATCATTGCCATCTTTGGCCCTGGGGATGATGCTGTGAAGCAGCAGAAGTGCAATATCTTTTCCCTGATCTTCCTGTTCCTGGGGATCATCAGTTTCTTCACATTCTTTCTGCAAGGCTTCACCTTTGGCAAGGCTGGGGAGATCCTGACTAGAAGGCTGAGATCTATGGCCTTCAAAGCCATGCTGAGACAGGACATGTCTTGGTTTGATGACCACAAGAACTCCACAGGGGCCCTGAGCACAAGACTGGCTACAGATGCTGCTCAGGTGCAGGGTGCTACAGGCACTAGACTGGCCCTGATTGCACAGAACATTGCCAACCTTGGCACAGGCATCATCATTAGCTTCATCTATGGCTGGCAGCTGACACTGCTCCTGCTGGCTGTTGTGCCCATCATTGCAGTGTCTGGCATTGTGGAAATGAAGTTGCTGGCTGGCAATGCCAAGAGGGACAAGAAAGAGCTTGAGGCAGCAGGCAAGATTGCCACAGAGGCCATTGAGAATATCAGGACAGTGGTGTCTCTGACCCAAGAAAGAAAGTTTGAGTCTATGTATGTGGAAAAGCTGTATGGGCCCTATAGGAACTCTGTGCAAAAGGCCCACATCTATGGGATCACCTTCTCCATCAGCCAGGCTTTCATGTACTTTAGCTATGCTGGCTGCTTCAGATTTGGGGCCTACCTGATTGTGAATGGCCACATGAGATTCAGGGATGTGATCCTGGTGTTTTCTGCCATTGTCTTTGGAGCTGTGGCTCTGGGCCATGCCTCTAGCTTTGCCCCTGACTATGCCAAAGCCAAACTGTCTGCAGCCCACCTGTTCATGCTGTTTGAGAGACAGCCCCTGATTGACTCCTACTCTGAGGAAGGACTGAAGCCTGATAAGTTTGAGGGCAACATCACCTTCAATGAGGTGGTGTTCAACTACCCTACCAGAGCTAATGTGCCAGTGCTGCAGGGACTCTCCCTGGAAGTGAAGAAAGGGCAGACTCTGGCTCTTGTGGGCAGCTCAGGATGTGGCAAGTCTACAGTGGTGCAGCTGCTGGAAAGGTTCTATGATCCCCTGGCAGGCACAGTGCTGTTGGATGGCCAAGAGGCTAAAAAGCTGAATGTGCAGTGGCTGAGAGCACAGCTGGGAATTGTGTCTCAAGAACCCATCCTGTTTGACTGCAGCATAGCAGAGAACATAGCCTATGGGGACAACTCCAGAGTGGTTTCTCAGGATGAGATTGTCTCTGCTGCCAAGGCAGCCAACATTCACCCCTTCATTGAGACACTGCCCCACAAATATGAGACAAGAGTGGGAGACAAGGGAACCCAGCTCAGTGGTGGACAGAAACAAAGGATTGCTATAGCTAGGGCCCTGATCAGACAGCCTCAGATTCTGCTCCTTGATGAAGCAACCTCTGCTCTGGACACTGAATCTGAGAAGGTGGTGCAAGAGGCCCTGGACAAAGCCAGAGAGGGTAGAACCTGCATTGTCATTGCTCACAGGCTGTCTACCATCCAGAATGCTGATCTGATTGTGGTGTTCCAGAATGGGAGAGTGAAAGAGCATGGCACCCACCAGCAACTGCTGGCCCAGAAGGGCATCTACTTCAGCATGGTGTCTGTGCAGGCAGGGACCCAGAACCTGTAACATATGATATCAATAAAGACCTCTTATTTTCATTCATCAGGTGTGGTTGGTTTTTTTGTGTGGGGGCTCGAGATCTGAGGAACCCCTAGTGATGGAGGCGGCCGCAGGAACCCCTAGTGATGGAGTTGGCCACTCCCTCTCTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGGGCGACCAAAGGTCGCCCGACGCCCGGGCTTTGCCCGGGCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGCTGCCTGCAGG
〔α1アンチトリプシンプロモーター(配列番号6)〕
CGCCACCCCCTCCACCTTGGACACAGGACGCTGTGGTTTCTGAGCCAGGTACAATGACTCCTTTCGGTAAGTGCAGTGGAAGCTGTACACTGCCCAGGCAAAGCGTCCGGGCAGCGTAGGCGGGCGACTCAGATCCCAGCCAGTGGACTTAGCCCCTGTTTGCTCCTCCGATAACTGGGGTGACCTTGGTTAATATTCACCAGCAGCCTCCCCCGTTGCCCCTCTGGATCCACTGCTTAAATACGGACGAGGACA
〔ヒト最小胆汁酸塩排出ポンプ(ABCB11)遺伝子プロモーター(配列番号:7)〕
TTCCCAAGCACACTCTGTGTTTGGGGTTATTGCTCTGAGTATGTTTCTCGTATGTCACTGAACTGTGCTTGGGCTGCCCTTAGGGACATTGATCCTTAGGCAAATAGATAATGTTCTTGAAAAAGTTTGAATTCTGTTCAGTGCT
〔マウス最小胆汁酸塩排出ポンプ(ABCB11)遺伝子プロモーター(配列番号8)〕
GGTTCCTGCTTTGAGTATGTTCGACCTTTCCTCTCATGTCACTGAACTGTGCTAGATCTGGACTTTAGGCCATTGACCTATAAGCAAATAGATAGTGTTCTTAAAAAAGCCTGATTTCTGTTCAATGCTTTATTACCATGAAAAC

Claims (16)

  1. MDR3アイソフォームAをコードする導入遺伝子を含む核酸構築物であって、前記導入遺伝子が配列番号1の配列または配列番号1と少なくとも90%の同一性を有する配列である、核酸構築物。
  2. さらに、肝臓特異的プロモーター、好ましくはα-1-アンチトリプシンプロモーターまたは胆汁酸塩誘導性プロモーターを含む、請求項1に記載の核酸構築物。
  3. さらに、ポリアデニリル化シグナル配列、特に配列番号3の配列を有する合成ポリアデニリル化シグナル配列を含む、請求項1または2に記載の核酸構築物。
  4. さらに、5’ITRおよび3’ITR配列、好ましくはアデノ随伴ウイルスの5’ITRおよび3’ITR配列、より好ましくはAAV2血清型由来の5’ITRおよび3’ITR配列を含む、請求項1~3のいずれか1項に記載の核酸構築物。
  5. 配列番号4の核酸配列または配列番号4と少なくとも90%の同一性を有する核酸配列を含む、請求項1~4のいずれか1項に記載の核酸構築物。
  6. 請求項1~5のいずれか1項に記載の核酸構築物を含む発現ベクター。
  7. 前記発現ベクターがウイルスベクター、好ましくはアデノ随伴ウイルス(AAV)ベクターである、請求項6に記載の発現ベクター。
  8. ウイルス粒子であって、
    請求項1~5のいずれか1項に記載の核酸構築物または請求項6もしくは7に記載の発現ベクターを含む、ウイルス粒子。
  9. AAV粒子であって、
    請求項1~5のいずれか1項に記載の核酸構築物または請求項6または7に記載の発現ベクターを含み、好ましくは、AAVタイプ33A、AAVタイプ33B、NP40、NP59、NP84、LK03、AAV3-ST、Anc80およびAAV8血清タイプからなる群より選択されるカプシドタンパク質などのアデノ随伴ウイルスのカプシドタンパク質を含む、AAV粒子。
  10. 宿主細胞であって、
    請求項1~5のいずれか1項に記載の核酸構築物または請求項6もしくは7に記載の発現ベクターを含む、宿主細胞、または、
    請求項8もしくは9に記載のウイルス粒子で形質導入された、宿主細胞。
  11. 薬学的組成物であって、
    請求項1~5のいずれか1項に記載の核酸構築物、請求項6または7に記載の発現ベクター、請求項8または9に記載のウイルス粒子、または請求項10に記載の宿主細胞、および、
    薬学的に受容可能な賦形剤を含む、薬学的組成物。
  12. それを必要とする対象者における薬剤としてのその使用のための、
    請求項1~5のいずれか1項に記載の核酸構築物、請求項6または7に記載の発現ベクター、請求項8または9に記載のウイルス粒子、請求項10に記載の宿主細胞、または請求項11に記載の薬学的組成物。
  13. それを必要とする対象者における進行性家族性肝内胆汁鬱滞タイプ3(PFIC3)の予防および/または治療のためのその使用のための、
    請求項1~5のいずれか1項に記載の核酸構築物、請求項6または7に記載の発現ベクター、請求項8または9に記載のウイルス粒子、請求項10に記載の宿主細胞、または請求項11に記載の薬学的組成物。
  14. 対象者が、新生児、乳児、小児または成人、好ましくは新生児、乳児または小児、より好ましくは新生児または乳児であって、それを必要とする対象者における進行性家族性肝内胆汁鬱滞タイプ3(PFIC3)の予防および/または治療のためのその使用のための、
    請求項1~5のいずれか1項に記載の核酸構築物、請求項6または7に記載の発現ベクター、請求項8または9に記載のウイルス粒子、請求項10に記載の宿主細胞、または請求項11に記載の薬学的組成物。
  15. 請求項8または9に記載のウイルス粒子の製造方法であって、
    a)請求項10に記載の核酸構築物または発現ベクターを含む宿主細胞を培養培地中で培養する工程と、
    b)細胞培養上清および/または細胞内からウイルス粒子を採取する工程と、
    を含む、方法。
  16. キットであって、
    請求項1~5のいずれか1項に記載の核酸構築物、請求項6もしくは7に記載の発現ベクター、請求項8もしくは9に記載のウイルス粒子、請求項10に記載の宿主細胞、または請求項11に記載の薬学的組成物を、1つ以上の容器中に含むキットであって、随意的に、さらに、取扱説明書またはパッケージング材料を含む、キット。

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