JP2022008967A - 生化学分析方法 - Google Patents
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Abstract
Description
本願は、2016年4月27日に日本に出願された特願2016-089362号に基づき優先権を主張し、その内容をここに援用する。
例えば、DNA内に記録されている一塩基多型(Single Nucleotide Polymorphism:SNP)解析による体質診断、体細胞変異解析による抗がん剤の投与判断、ウイルスのタンパク質の解析による感染症対策等が知られている。
上記第二態様において、前記酵素反応は、等温反応であってもよい。
上記第二態様において、前記酵素反応は、インベーダー反応であってもよい。
なお、粒子としては、ポリマービーズ、磁性ビーズ、蛍光ビーズ、蛍光標識磁性ビーズ、シリカビーズ、金属コロイドが挙げられる。
本発明の上記態様に係る生化学分析方法によれば、上記の反応容器を用いて明視野観察及び蛍光観察をすることができる。
図1は、本実施形態の反応容器1の概観図である。図2は、本実施形態の反応容器1の断面図である。
基材2は、光透過性樹脂から形成される。本実施形態の基材2は、実質的に透明である。
基材2は、複数の凹部3を有する。基材2の凹部3は、基材2の表面(第一表面2a)に開口している。凹部3の形状、寸法、および配置は特に限定されない。本実施形態では、反応容器1を用いて行われる生化学分析において使用される一定量の試料を収容可能な同形同大の複数の凹部3が基材2に形成されている。また、反応容器1を用いて行われる生化学分析においてマイクロビーズが使用される場合には、マイクロビーズを1つ収容可能な形状及び寸法を有し、マイクロビーズを含んだ一定量の試料を収容可能な同形同大の凹部3が基材2に形成されている。
基材2の第一表面2aのうち、複数の凹部3を含んだ領域は、生化学分析において分析対象となる1種類の試料が充填される領域となっている。この領域の内側では、基材2とカバー部材4との間に隙間(流路)Sが開けられている。
カバー部材4は、全体に亘って略均一な光透過性を有している。たとえば、カバー部材4は、シクロオレフィンポリマー(COP)やアクリル樹脂を含む熱可塑性樹脂から形成される。なお、カバー部材4における光透過性が、カバー部材4の厚さ方向に勾配を有していてもよい。たとえば、カバー部材4は、基材2側における光透過性が低く、基材2と反対側における光透過性が高くてもよい。この場合、カバー部材4において基材2の第一表面2a側は最も赤外線吸収率が高い。
本実施形態の反応容器1の製造には、基材2の材料となる樹脂製の第一板状部材2Aと、カバー部材4の材料となる樹脂製の第二板状部材4Aとを用意する(図1参照)。
第一板状部材2Aに対しては、板厚方向の一方の面に複数の凹部3が形成される。一例として、図1に示すように、第一板状部材2Aの材料となる樹脂板2bにおける板厚方向の一方の面に、10mm四方の領域内に例えば5μmの直径の微小な孔が格子状に整列して開口するCYTOP(登録商標)(旭硝子)の層2cを形成する。即ち、第一板状部材2Aは樹脂板2bとCYTOPの層2cとを有する。CYTOP(登録商標)に形成された微小な孔が凹部3となる。第一板状部材2Aは、例えば実質的に透明な熱可塑性樹脂にCYTOP(登録商標)が形成されたものであり、少なくとも可視光及び赤外光の領域において実用上は透明と見做せる程度の光透過性を有している。また、第一板状部材は樹脂で一体成型されていてもよい。
樹脂からなる第一板状部材の材質の例としては、シクロオレフィンポリマーや、シクロオレフィンコポリマー、シリコン、ポリプロピレン、ポリカーボネート、ポリスチレン、ポリエチレン、ポリ酢酸ビニル、フッ素樹脂、アモルファスフッ素樹脂などが挙げられる。なお、第一板状部材の例として示されたこれらの材質はあくまでも例であり、第一板状部材の材質はこれらには限られない。
特に本実施形態では、基材2が実質的に透明であり、カバー部材4の全光線透過率が25%以上であるので、明視野観察における十分な明るさを得ることができる。
このように、本実施形態の反応容器1によれば、光透過性を有する樹脂が高い精度で溶着されているとともに、明視野観察における十分な明るさを得ることができる。カバー部材4の全光線透過率(光学濃度)は、公知の測定方法を用いて測定することができる。なお、可視光透過率から近赤外線以上の長波長の光の透過率を推測することも可能である。例えば、COPでカバー部材を形成する場合、可視光の透過率が92%であると、近赤外線以上の長波長の光の透過率が90%になる。
本実施形態の反応容器1は、試料に対してシグナル増幅反応を行ってシグナルを観察し、試料中の分析対象物の濃度を測定するために利用可能である。
送液工程において基材2とカバー部材4との間の隙間に送液された試料は、複数の凹部3の内部に収容される。
封止工程において、封止液は、上記の送液工程において基材2とカバー部材4との隙間に送液された試料のうち、凹部3に収容されていない試料を置換する。これにより、封止液が複数の凹部3を個別に封止し、凹部3は独立した反応空間となる。
まず、特異的標識物質が収容された凹部3を特定するために、凹部3内におけるマイクロビーズの有無を観察する(第一観察工程)。
第一観察工程では、反応容器1における第一表面2aに対して垂直な方向に照射する白色光を用いた明視野観察を行う。凹部3内にマイクロビーズが存在していればマイクロビーズの影が観察されるので、これによって、基材2上に形成された凹部3のうちマイクロビーズが収容されたビーズを特定することができる。
第二観察工程では、たとえば上記のインベーダー反応が行われた場合には、蛍光物質に対応する励起光を、基材2側からカバー部材4側へ、基材2を通じて凹部3内へ照射し、試料に含まれる蛍光物質が発する蛍光を基材2側から観察する。基材2は実質的に透明であるので、蛍光観察に使用される公知の反応容器1と同等の感度で蛍光観察をすることができる。
カバー部材4の光透過性の程度が明視野観察及び蛍光観察に及ぼす影響について明らかにした実験例を以下に示す。以下に示す実験例において、本実施形態の反応容器1に相当する構成要素には、対応する符号が付されている。
本実験例では、実験用の反応容器10を製造するために、2枚の透明な樹脂製の板状部材を使用した。2枚の板状部材のうちの一方の板状部材から基材2を形成した。他方の板状部材に対して両面テープによってスペーサ部5を形成し、基材2に接着して上記のカバー部材4の代用とした。
2枚の板状部材の間に、蛍光標識マイクロビーズが分散された液体を注入し、さらに封止液によって複数の凹部3を個別に封止した。凹部3内に蛍光標識マイクロビーズが収容された状態を、蛍光顕微鏡(Olympus社製BX-51)を用いて観察(明視野観察及び蛍光観察)した。
図3及び図4に示すように、どちらのフィルムも貼り付けていない実験用の反応容器10の場合には、明視野観察により画像を得ることができ、蛍光観察によっても画像を得ることができた。
図5及び図6に示すように、光透過性を有する着色フィルムを貼り付けた実験用の反応容器10の場合でも、明視野観察により画像を得ることができ、蛍光観察によっても画像を得ることができた。
図7及び図8に示すように、光不透過の黒色のフィルムを貼り付けた実験用の反応容器10の場合では、明視野観察により画像を得ることはできなかった。一方、この場合では、蛍光観察によって画像を得ることができた。
例えば、上記実施形態の反応容器は、凹部内に収容される液体に接触可能となるように凹部内に配された検出電極(不図示)をさらに備えていてもよい。この検出電極は、不図示の配線を通じて測定器に接続可能であり、pH測定その他の電気化学的な測定に使用可能である。
本発明の実施例1を以下に示す。
レーザー透過溶着法では、特定の波長を持つレーザー光を透過する透過材と、このレーザー光を吸収する吸収材をあわせて双方から加圧した後、上記のレーザー光を、透過材側から、透過材と吸収材との境界面にあてることによって、吸収材を溶解させる。これにより、吸収材が溶解するとともに、吸収材から透過材へも熱が伝わり、透過材の溶融温度を超えて透過材が加熱されることによって、透過材も溶解する。その結果、レーザー透過溶着法では、照射するレーザー光の波長に対する吸収率の低い透過材を溶着することができる。
本実施例では、レーザー透過溶着法を用いて反応容器を製造する際に吸収材として機能するカバー部材について、レーザー透過溶着法により基材に確実に溶着できるとともに、反応容器を用いた生化学反応においてカバー部材を透過する蛍光による蛍光観察ができるようにするための具体例を示す。
本実施例におけるカバー部材の材料として、ポリスチレン(黒色)、PMMA(YL-500P-Y1 YAG(半透明)、シグマ光機製)を用いてカバー部材を作製した。
また、レーザー透過溶着法に適していないカバー部材の材料を示す比較例として、ポリスチレン(透明)、PMMA製(YL-500P-LD(半透明))、PMMA(YL-500P-Y2 アルゴン(半透明))についても示す。これらの材料は、YAGレーザーの吸収率が低い材料である。
本実施例及び比較例におけるレーザー溶着機として、YAGレーザー溶着機であるML-2030B(株アマダミヤチ製)を使用した。
結果として、溶着できたのは、カバー部材の材料として、ポリスチレン(黒色)を使用した場合、及び、PMMA(YL-500P-Y1 YAG(半透明))を使用した場合であった。
結果として、ポリスチレン(黒色)以外のすべての材料で光を視認することができた。
なお、基材の材質は、COP以外の光透過性樹脂であってもよい。
本発明の実施例2を以下に示す。
本実施例では、レーザー透過溶着法を用いて反応容器を製造する際に吸収材として機能するカバー部材について、レーザー透過溶着法により基材に確実に溶着できるとともに、反応容器を用いた生化学反応においてカバー部材を透過する蛍光による蛍光観察ができるようにするための具体例を示す。
全光線透過率(光学濃度)の測定は、光学ベンチ上に、レーザー光源(2波長 532nm、632nm、出力 2mmW程度)、ピンホール、ミラー、サンプルホルダー、PD光検出器(アンリツ製OPTICAL POWER METER ML910B)をセットアップして透過率の測定を行った。なお、全光線透過率は、空気の透過率を100%とする相対値である。
また、透過率0.01%~47%の材料を使用した場合では、カバー部材の基材と反対側から照射した光を基材側から視認することができた。一方で、透過率0%の材料を使用した場合では、カバー部材の反対側から光を視認することができなかった。
2 基材
2A 第一板状部材
3 凹部
4 カバー部材
4A 第二板状部材
5 スペーサ部
10 実験用の反応容器
本願は、2016年4月27日に日本に出願された特願2016-089362号に基づき優先権を主張し、その内容をここに援用する。
この生化学分析方法は、凹部に一つの検出対象物質が入るように希釈された試料を基材とカバー部材との間の隙間に送液する送液工程と、隙間に油性の封止液を送液して複数の凹部を個別に封止する封止工程と、封止工程の後、凹部内の試料に対して垂直な方向に照射する白色光を用いて基材側から明視野観察を行う第一観察工程と、封止工程の後、凹部内の試料に基材に対して溶着された赤外線吸収性のカバー部材を通じて励起光を照射するとともに励起光に対応して試料が発する蛍光を基材側から観察する第二観察工程とを含む。
Claims (13)
- 第一表面に開口する複数の凹部を有する透明な基材と、
前記第一表面のうち前記複数の凹部を含んだ領域の内側において前記第一表面との間に隙間が空いた状態となるように前記領域の外側において前記基材に対して溶着された赤外線吸収性のカバー部材と、
を備え、
前記カバー部材において、波長532nmの光および波長632nmの光の透過率が0.01%以上47%以下である、
反応容器。 - 前記カバー部材は、可視光の波長域のうち480nm以上570nm以下の範囲の光の透過率が25%以上である、
請求項1に記載の反応容器。 - 前記第一表面に対して垂直な方向において、前記カバー部材における前記第一表面側の赤外線吸収率が最も高い、
請求項1に記載の反応容器。 - 前記凹部内に収容される液体に接触可能となるように前記凹部内に配された検出電極をさらに備える、
請求項1に記載の反応容器。 - 前記領域を前記第一表面に複数有し、
複数の前記領域が互いに独立した複数の反応区画となるように複数の前記領域のそれぞれの外周が前記カバー部材に溶着されている、
請求項1に記載の反応容器。 - 請求項1から請求項5までのいずれか一項に記載の反応容器を用いた生化学分析方法であって、
前記凹部に一つの検出対象物質が入るように希釈された試料を前記基材と前記カバー部材との間の前記隙間に送液する送液工程と、
前記隙間に油性の封止液を送液して複数の凹部を個別に封止する封止工程と、
前記封止工程の後、前記凹部内の試料に対して前記一部の範囲の光を用いて明視野観察を行う第一観察工程と、
前記封止工程の後、前記凹部内の試料に前記基材を通じて励起光を照射するとともに前記励起光に対応して前記試料が発する蛍光を観察する第二観察工程と、
を含む、
生化学分析方法。 - 前記封止工程の後、前記第二観察工程の前に、前記凹部内でシグナル増幅反応を行う反応工程をさらに含む、
請求項6に記載の生化学分析方法。 - 前記シグナル増幅反応が酵素反応である、
請求項7に記載の生化学分析方法。 - 前記酵素反応が等温反応である、
請求項8に記載の生化学分析方法。 - 前記酵素反応がインベーダー反応である、
請求項8に記載の生化学分析方法。 - 前記試料は、分析対象物となるDNA,RNA,miRNA,mRNA,又はタンパク質と、前記分析対象物に対する特異的標識物質と、を含む、
請求項6から請求項10のいずれか一項に記載の生化学分析方法。 - 前記分析対象物は核酸を含み、
前記特異的標識物質は、前記分析対象物とは異なる核酸,酵素,粒子,抗体,及びリポソームの少なくとも一つを含む、
請求項11に記載の生化学分析方法。 - 前記封止液は、フッ素系オイルとシリコン系オイルとの少なくともいずれかを含む、
請求項6に記載の生化学分析方法。
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