JP2021531796A - Gタンパク質αに結合する単一ドメイン抗体 - Google Patents
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Abstract
Description
・不活性な休止状態では、Gタンパク質のαサブユニットはGDPヌクレオチドに結合している(GDPに結合した完全なGタンパク質)。
・GPCRの活性化後、GPCRはGタンパク質のαサブユニットに結合し、以下の2つの工程(1)及び(2)からなるGタンパク質活性化プロセスを引き起こす。(1)Gタンパク質のGDPが放出されて空のGタンパク質となり、不活性なGPCR/空のGタンパク質複合体が形成される。(2)GTPが結合してGTP形態の活性Gタンパク質が形成される(GTPに結合した完全なGタンパク質)。第一の工程では、受容体に結合したGタンパク質はいわゆる「空の形態」である。文献では、この状態は一過性とされている。というのは、GTPヌクレオチドがGタンパク質のαサブユニットにすぐに結合するといわれているからである。また、活性化Gタンパク質のβ/γサブユニットがαサブユニットから解離する。
・次いで、GTPに結合した完全なGタンパク質のαサブユニットは、エフェクターに結合してエフェクターを活性化させる。すると、エフェクターはシグナル伝達経路を活性化させて、細胞応答が起こる。
・次いで、GTPはGタンパク質のαサブユニットにより加水分解されてGDPとなり、αサブユニットがβ/γサブユニットと再結合して、GDPに結合した完全なGタンパク質を再形成する(不活性状態)。
FR1−CDR1−FR2−CDR2−FR3−CDR3−FR4 (I)
上記抗体は、FRETで測定した完全なGタンパク質αに対する解離定数(Kd)が100nM未満である。
FR1−CDR1−FR2−CDR2−FR3−CDR3−FR4 (I)
・CDR1は、配列番号1、配列番号9、配列番号17、配列番号25、配列番号33、配列番号41、配列番号49、配列番号57、及び配列番号65から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有し、
・CDR2は、配列番号2、配列番号10、配列番号18、配列番号26、配列番号34、配列番号42、配列番号50、配列番号58、及び配列番号66から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有し、且つ
・CDR3は、配列番号3、配列番号11、配列番号19、配列番号27、配列番号35、配列番号43、配列番号51、配列番号59、及び配列番号67から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有する。
「抗Gタンパク質α抗体」、「Gタンパク質αに結合する抗体」、及び「Gタンパク質αに特異的に結合する抗体」という用語は交換可能であり、Gタンパク質αを標的にすることで抗体が検出薬(例えばFRETアッセイ用)、診断薬、及び/又は治療薬として有用となるのに充分な親和性でGタンパク質αに結合する抗体を意味する。
本発明の第1の主題は、Gタンパク質αに結合する単一ドメイン抗体(sdAb)に関し、上記抗体は、下記式(I)で表される、3つの相補性決定領域「CDR」(CDR1〜CDR3)及び4つのヒンジ領域「FR」(FR1〜FR4)からなるアミノ酸配列を有し、
FR1−CDR1−FR2−CDR2−FR3−CDR3−FR4 (I)
FRETで測定した完全なGタンパク質αに対する解離定数(Kd)が100nM未満である。
・CDR1は、配列番号1、配列番号9、配列番号17、配列番号25、配列番号33、配列番号41、配列番号49、配列番号57、及び配列番号65から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、
・CDR2は、配列番号2、配列番号10、配列番号18、配列番号26、配列番号34、配列番号42、配列番号50、配列番号58、及び配列番号66から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、且つ
・CDR3は、配列番号3、配列番号11、配列番号19、配列番号27、配列番号35、配列番号43、配列番号51、配列番号59、及び配列番号67から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有する。
FR1−CDR1−FR2−CDR2−FR3−CDR3−FR4 (I)
・CDR1は、配列番号1、配列番号9、配列番号17、配列番号25、配列番号33、配列番号41、配列番号49、配列番号57、及び配列番号65から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、
・CDR2は、配列番号2、配列番号10、配列番号18、配列番号26、配列番号34、配列番号42、配列番号50、配列番号58、及び配列番号66から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、且つ
・CDR3は、配列番号3、配列番号11、配列番号19、配列番号27、配列番号35、配列番号43、配列番号51、配列番号59、及び配列番号67から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有する。
・CDR1は、配列番号1と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、CDR2は、配列番号2と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、且つCDR3は、配列番号3と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有するか;
・CDR1は、配列番号9と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、CDR2は、配列番号10と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、且つCDR3は、配列番号11と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有するか;
・CDR1は、配列番号17と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、CDR2は、配列番号18と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、且つCDR3は、配列番号19と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有するか;
・CDR1は、配列番号25と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、CDR2は、配列番号26と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、且つCDR3は、配列番号27と少なくとも80%の相同性を有するか;
・CDR1は、配列番号33と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、CDR2は、配列番号34と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、且つCDR3は、配列番号35と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有するか;
・CDR1は、配列番号41と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、CDR2は、配列番号42と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、且つCDR3は、配列番号43と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有するか;
・CDR1は、配列番号49と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、CDR2は、配列番号50と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、且つCDR3は、配列番号51と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有するか;
・CDR1は、配列番号57と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、CDR2は、配列番号58と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、且つCDR3は、配列番号59と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有するか;あるいは
・CDR1は、配列番号65と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、CDR2は、配列番号66と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、且つCDR3は、配列番号67と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有する。
・FR1は、配列番号5、配列番号12、配列番号20、配列番号28、配列番号36、配列番号44、配列番号52、配列番号60、及び配列番号68から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、
・FR2は、配列番号6、配列番号13、配列番号21、配列番号29、配列番号37、配列番号45、配列番号53、配列番号61、及び配列番号69から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、且つ
・FR3は、配列番号7、配列番号14、配列番号22、配列番号30、配列番号38、配列番号46、配列番号54、配列番号62、及び配列番号70から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、且つ
・FR4は、配列番号8、配列番号15、配列番号23、配列番号31、配列番号39、配列番号47、配列番号55、配列番号63、及び配列番号71から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有する。
・FR1は、配列番号5と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、FR2は、配列番号6と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、FR3は、配列番号7と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、且つFR4は、配列番号8と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有するか;
・FR1は、配列番号12と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、FR2は、配列番号13と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、FR3、好ましくは少なくとも90%の相同性、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性は、配列番号14と少なくとも80%の相同性を有し、且つFR4は、配列番号15と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有するか;
・FR1は、配列番号20と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、FR2は、配列番号21と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、FR3は、配列番号22と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、且つFR4は、配列番号23と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有するか;
・FR1は、配列番号28と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、FR2は、配列番号29と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、FR3は、配列番号30と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、且つFR4は、配列番号31と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有するか;
・FR1は、配列番号36と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、FR2は、配列番号37と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、FR3は、配列番号38と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、且つFR4は、配列番号39と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有するか;
・FR1は、配列番号44と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、FR2は、配列番号45と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、FR3は、配列番号46と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、且つFR4は、配列番号47と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有するか;
・FR1は、配列番号52と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、FR2は、配列番号53と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、FR3は、配列番号54と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、且つFR4は、配列番号55と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有するか;
・FR1は、配列番号60と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、FR2は、配列番号61と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、FR3は、配列番号62と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、且つFR4は、配列番号63と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有するか;あるいは
・FR1は、配列番号68と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、FR2は、配列番号69と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、FR3は、配列番号70と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、且つFR4は、配列番号71と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有する。
・CDR1は、配列番号1、配列番号9、配列番号17、配列番号25、配列番号33から選択されるアミノ酸配列のうちの1つと少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、
・CDR2は、配列番号2、配列番号10、配列番号18、配列番号26、配列番号34のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、且つ
・CDR3は、配列番号3、配列番号11、配列番号19、配列番号27、配列番号35のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有する。
・CDR1は、配列番号41、配列番号49、配列番号57、配列番号65から選択されるアミノ酸配列のうちの1つと少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、
・CDR2は、配列番号42、配列番号50、配列番号58、配列番号66のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有し、且つ
・CDR3は、配列番号43、配列番号51、配列番号59、配列番号67のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、好ましくは少なくとも90%の相同性を有し、例えば、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、若しくは100%の相同性を有する。
FRETパートナー対は、エネルギー供与体蛍光化合物及びエネルギー受容体蛍光化合物からなることが好ましい。
・1つ以上のピリジン単位を含むランタニドクリプテート。そのような希土類クリプテートは、例えば、欧州特許第0180492号、欧州特許第0321353号、欧州特許第0601113号、及び国際公開第01/96877号に記載されている。テルビウム(Tb3+)又はユウロピウム(Eu3+)のクリプテートは本発明の目的に特に好適である。ランタニドクリプテートはCisbio Bioassays社から販売されている。例としては、下記式のユウロピウムクリプテート(反応性基(ここではNH2基等)を介して標識対象の化合物と結合させることができる)が挙げられるが、これらに限定されない。
本発明に係る抗体は、フルオロフォアで直接的(共有結合的)又は間接的に標識してもよい。FRETパートナーの少なくとも一方を第1又は第2の抗体と共有結合させることが好ましく、FRETパートナーの両方をそれぞれ第1及び第2の抗体と共有結合させることが更に好ましい。
・スクシンイミジルオキシ(−OC4H4NO2)基及びスルホスクシンイミジルオキシ(−OC4H3NO2−SO3H)基から選択される脱離基。
・ニトロ基、フルオロ基、クロロ基、シアノ基、及びトリフルオロメチル基等の少なくとも1つの求電子性置換基で置換されているか又は置換されていないアリールオキシ基。そのため活性化アリールエステルを形成する。
・カルボジイミド基で活性化されたカルボン酸。無水物−OCORa又は−OCNRaNHRbを形成する。式中、Ra及びRbは同一又は異なって、炭素数1〜6のアルキル基、炭素数1〜6のパーフルオロアルキル基、炭素数1〜6のアルコキシ基、及びシクロヘキシル基から選択される。
・3−ジメチルアミノプロピル又はN−モルホリノエチル。
TR−FRETシグナル測定は、パルス線源を用いて測定培地を供与体化合物の励起帯で励起した後に、好ましくは1〜500マイクロ秒(μ秒)の遅延時間後、10〜2000μ秒間行う。遅延時間は50μ秒(時間分解)であることが更に好ましい。
本発明の第3の主題は、本発明に係る抗体をコードする核酸配列に関する。
GDP又はGTPgSに結合した組換えヒトタンパク質TST−Gαi1(TEVリンカーを介してN末端がTwinStreptag(TST)タグ(IBA)で標識されたUniProt配列P63096−1のGαi1タンパク質)で、2頭のラマ(Lama glama)を皮下免疫した。これまでに(Alvarez−Rueda,Behar et al.,2007,Behar Chames et al.2009)で述べられている通り、大腸菌株TG1においてVH/VHHライブラリーの構築を行った。得られたライブラリーの多様性は108クローンを超えていた。
50mLの2YTA(アンピシリン100μg/mLを含有する2YT)に50μLの細菌ライブラリーを播種し、振とう(250rpm)させながら37℃でインキュベートしてOD600を0.4と0.6との間とした。この細菌を、振とうさせずに、感染多重度を20とし、30分間37℃でファージKM13に感染させた。培養液を3000gで10分間遠心分離し、50μg/mLのカナマイシンを含有する2YTA250mLに細菌ペレットを再懸濁させて、振とうさせながら30℃で一晩かけてVH−ファージを作製した。培養液を10本のチューブに分け、3000g、4℃で20分間遠心分離した。各チューブについて、新しい清潔なチューブ内の上清に5mLの20%PEG8000、2.5mMのNaClを加え、氷上で1時間インキュベートしてファージ粒子を沈殿させた。この溶液を3000g、4℃で15分間遠心分離し、ファージ含有ペレットを1mLのPBSに再懸濁させた。別の遠心分離工程(2分、16000g)を行って細菌混入物を除去し、新しいチューブ内の上清に200μLのPEG8000NaClを加えた。氷上に30分間置き、最終遠心分離(5分、16000g)を行った後、ファージ含有ペレットを1mLのPBSに再懸濁させて、すぐに選択に使用できる状態のファージ−VHを得た。
固定化されたStrep−Tactinを含むプレート(IBA#2−4101−001)上でファージライブラリーを枯渇させることで、抗Strep−Tactin VHが選択されないようにする工程を行った後、予め10μMのGDPを37℃で2時間ロードし、2%BSAのPBS溶液で室温にて1時間飽和させたTwin−Strep−tagと融合した組換えヒトGαi1を含むStrep−Tactinプレート上で第1の選択サイクルを実施した。室温で2時間インキュベートした後、プレートを0.1%のTween PBS及びPBSで洗浄した。結合したファージを、振とうさせながら、1mg/mLのトリプシン溶液(Sigma)を用いて室温で30分間溶出した。ファージを回収し、TG1細菌株に感染させて増幅した。予め10μMのGTPをロードしたGαi1に対して同様の方法で第2の選択サイクルを実施した。第2のストラテジーでは、ヌクレオチドの非存在下、Gαi1に対する選択を2ラウンド行った。第3のストラテジーは、Gαiの活性立体構造(GTP)に特異的なVHの選択を促進することを目的としており、予め10μMのGTPgSをロードしたGαi1 Twin−Strep−tagに対して2回の選択サイクルを行い、次いで、予め10μMのGDPをロードしたGαi1 Twin−Strep−tagで被覆したプレート上で枯渇工程を行った。96ウェル深型ウェルプレートにおいて、2%グルコースを含有する2YTA400μL中で個々のTG1コロニーを培養した。一晩増殖させた後、培養液を20%グリセリン中、−80℃で凍結させ、残りの培養液は、2YTA中、イソプロピル−β−D−チオガラクトピラノシド(IPTG)で誘導した可溶性VHの作製に用いた。VHを含む上清はスクリーニングアッセイに用いた。
VHを大規模に作製するために、陽性ファージミドを大腸菌株BL21 DE3に形質転換した。形質転換細菌を400mLの2YTA中で培養してOD600値を0.7とし、100μMのIPTGで誘導して、振とうさせながら30℃で一晩増殖させた。細菌を遠心分離で回収し、Bugbuster(商標)試薬(Novagen)で溶解させた。3000gで20分間遠心分離した後、TALON(登録商標)Superflow(商標)(GE Healthcare)アフィニティークロマトグラフィーを用い、製造元の指示に従って上清からVHを精製した。
遺伝子合成(Genecust)によって、ヒトIgG1のCH2及びCH3領域をコードする遺伝子、次いで6ヒスチジンタグと融合させることで、VH遺伝子をpHLsecベクターにクローニングした(Aricescu AR,Lu W,Jones EY.Acta Crystallogr D Biol Crystallogr.2006 Oct;62(Pt10):1243−50)。対応するプラスミドを用いて浮遊適応HEK293株をトランスフェクトし、この細胞を製造元の指示に従って撹拌しながらインキュベートした(FreeStyle 293 Expression System、Thermofisher)。5日後、回収した上清をそのまま用いて、製造元の指示に従ってTALON(登録商標)Superflow(商標)アフィニティークロマトグラフィーによってHcAbを精製した。
材料
組換えTST−Gαi1タンパク質(TEVリンカーを介してN末端がTwinStreptag(TST)タグ(IBA)で標識されたUniProt配列P63096−1のGαi1タンパク質)をSf9昆虫細胞(バキュロウイルスを介した感染)で産生させてから、TwinStreptag(TST)タグを介したアフィニティーカラム(Strep−Tactin Superflow高容量樹脂(IBA、カタログ:2−1208−002))で精製した。
1)試薬の調製
すべての試薬は、緩衝液(50mMのトリス−HCl(pH7.4)、10mMのMgCl2、10mMのNaCl、0.1%のBSA)で希釈した。組換えTST−Gαi1タンパク質は、4倍調製してウェル中の最終濃度1nMで使用した(別段の指示が無い限り)。GDP又はGTPγSヌクレオチドは、4倍調製してウェル中の最終濃度10μMで使用した。抗TST抗体−Lumi4−Tbは、4倍調製してウェル中の最終濃度0.25nMで使用した。各種の抗Gαi−d2抗体は、4倍調製して、グラフに記載したウェル中の最終濃度を目指し、最大で200nMであった。
・TST−Gαi1タンパク質:5μL
・ヌクレオチド(GDP又はGTPgS):5μL
・抗TST抗体−Lumi4−Tb(供与体):5μL
・抗Gαi抗体−d2(受容体):5μL
プレートを21℃で20時間インキュベートし、次いでHTRFシグナルを以下の構成でPHERAstarリーダー(BMG Labtech)によって測定した。
・モジュール:HTRF(励起:337nm、発光:665nm及び620nm)
・励起:レーザー、40フラッシュ
・読取りウィンドウ:遅延:60μ秒−積算:400μ秒
665nm及び620nmの生シグナルから下記式によってHTRF比を算出した。
HTRF比=(665nmのシグナル/620nmのシグナル)×10,000
TR−FRET(HTRF)試験によって、各種抗体のGαi1タンパク質に対する親和性(Kd)を測定することができた。この試験の原理を図2に示す。精製してTSTで標識した組換えGαi1タンパク質(TST−Gαi1タンパク質)を一定濃度(1nM)とし、過剰のヌクレオチド(GDP又はGTPgS)(10μM)、一定濃度(0.5nM)の供与体Lumi4−Tbで標識した抗TST抗体(抗TST抗体−Lumi4−Tb)、及び濃度を漸増させた受容体d2で標識したVH型単一ドメイン抗体(抗GαiVH抗体−d2)の存在下に置いた。その後、全HTRFシグナルを得た。
各種VH−HcAbのGαi1タンパク質に対する親和性(Kd)を測定するために実施したTR−FRET(HTRF)アッセイの原理を図12に示す。精製してTSTで標識した組換えGαi1タンパク質(TST−Gαi1タンパク質)を一定濃度(1nM)とし、過剰のヌクレオチド(GDP又はGTPgS)(10μM)、一定濃度(0.5nM)の供与体Lumi4−Tbで標識した抗TST抗体(抗Tag Ab−供与体)、一定濃度(50nM)の受容体d2で標識した抗6HIS抗体(抗6HIS受容体抗体、Cisbio Bioassays #61HISDLF)、及び濃度を漸増させた6HISで標識したVH−HcAb抗体(6HIS−Fc−sdAb)の存在下に置いた。その後、全HTRFシグナルを得た。
図3〜11に上記VHについて得られた飽和曲線を示す。
Claims (14)
- Gタンパク質αに結合する単一ドメイン抗体(sdAb)であって、下記式(I)で表される、3つのCDR領域(CDR1〜CDR3)及び4つのヒンジ領域(FR1〜FR4)からなるアミノ酸配列を有し、
FR1−CDR1−FR2−CDR2−FR3−CDR3−FR4 (I)
上記抗体は、FRETで測定した完全なGタンパク質αに対する解離定数(Kd)が100nM未満である、単一ドメイン抗体。 - CDR1は、配列番号1、配列番号9、配列番号17、配列番号25、配列番号33、配列番号41、配列番号49、配列番号57、及び配列番号65から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有し、
CDR2は、配列番号2、配列番号10、配列番号18、配列番号26、配列番号34、配列番号42、配列番号50、配列番号58、及び配列番号66から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有し、且つ
CDR3は、配列番号3、配列番号11、配列番号19、配列番号27、配列番号35、配列番号43、配列番号51、配列番号59、及び配列番号67から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有する、請求項1に記載の抗体。 - Gタンパク質αに結合する単一ドメイン抗体(sdAb)であって、下記式(I)で表される、3つのCDR領域(CDR1〜CDR3)及び4つのヒンジ領域(FR1〜FR4)からなるアミノ酸配列を有し、
FR1−CDR1−FR2−CDR2−FR3−CDR3−FR4 (I)
CDR1は、配列番号1、配列番号9、配列番号17、配列番号25、配列番号33、配列番号41、配列番号49、配列番号57、及び配列番号65から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有し、
CDR2は、配列番号2、配列番号10、配列番号18、配列番号26、配列番号34、配列番号42、配列番号50、配列番号58、及び配列番号66から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有し、且つ
CDR3は、配列番号3、配列番号11、配列番号19、配列番号27、配列番号35、配列番号43、配列番号51、配列番号59、及び配列番号67から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有する、単一ドメイン抗体。 - CDR1は配列番号1と少なくとも80%の相同性を有し、CDR2は配列番号2と少なくとも80%の相同性を有し、且つCDR3は配列番号3と少なくとも80%の相同性を有するか;
CDR1は配列番号9と少なくとも80%の相同性を有し、CDR2は配列番号10と少なくとも80%の相同性を有し、且つCDR3は配列番号11と少なくとも80%の相同性を有するか;
CDR1は配列番号17と少なくとも80%の相同性を有し、CDR2は配列番号18と少なくとも80%の相同性を有し、且つCDR3は配列番号19と少なくとも80%の相同性を有するか;
CDR1は配列番号25と少なくとも80%の相同性を有し、CDR2は配列番号26と少なくとも80%の相同性を有し、且つCDR3は配列番号27と少なくとも80%の相同性を有するか;
CDR1は配列番号33と少なくとも80%の相同性を有し、CDR2は配列番号34と少なくとも80%の相同性を有し、且つCDR3は配列番号35と少なくとも80%の相同性を有するか;
CDR1は配列番号41と少なくとも80%の相同性を有し、CDR2は配列番号42と少なくとも80%の相同性を有し、且つCDR3は配列番号43と少なくとも80%の相同性を有するか;
CDR1は配列番号49と少なくとも80%の相同性を有し、CDR2は配列番号50と少なくとも80%の相同性を有し、且つCDR3は配列番号51と少なくとも80%の相同性を有するか;
CDR1は配列番号57と少なくとも80%の相同性を有し、CDR2は配列番号58と少なくとも80%の相同性を有し、且つCDR3は配列番号59と少なくとも80%の相同性を有するか;あるいは
CDR1は配列番号65と少なくとも80%の相同性を有し、CDR2は配列番号66と少なくとも80%の相同性を有し、且つCDR3は配列番号67と少なくとも80%の相同性を有する、請求項1〜3のいずれか1項に記載の抗体。 - FR1は、配列番号5、配列番号12、配列番号20、配列番号28、配列番号36、配列番号44、配列番号52、配列番号60、及び配列番号68から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有し、
FR2は、配列番号6、配列番号13、配列番号21、配列番号29、配列番号37、配列番号45、配列番号53、配列番号61、及び配列番号69から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有し、
FR3は、配列番号7、配列番号14、配列番号22、配列番号30、配列番号38、配列番号46、配列番号54、配列番号62、及び配列番号70から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有し、且つ
FR4は、配列番号8、配列番号15、配列番号23、配列番号31、配列番号39、配列番号47、配列番号55、配列番号63、及び配列番号71から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有する、請求項1〜4のいずれか1項に記載の抗体。 - FR1は配列番号5と少なくとも80%の相同性を有し、FR2は配列番号6と少なくとも80%の相同性を有し、且つFR3は配列番号7と少なくとも80%の相同性を有するか;
FR1は配列番号12と少なくとも80%の相同性を有し、FR2は配列番号13と少なくとも80%の相同性を有し、且つFR3は配列番号14と少なくとも80%の相同性を有するか;
FR1は配列番号20と少なくとも80%の相同性を有し、FR2は配列番号21と少なくとも80%の相同性を有し、且つFR3は配列番号22と少なくとも80%の相同性を有するか;
FR1は配列番号28と少なくとも80%の相同性を有し、FR2は配列番号29と少なくとも80%の相同性を有し、且つFR3は配列番号30と少なくとも80%の相同性を有するか;
FR1は配列番号36と少なくとも80%の相同性を有し、FR2は配列番号37と少なくとも80%の相同性を有し、且つFR3は配列番号38と少なくとも80%の相同性を有するか;
FR1は配列番号44と少なくとも80%の相同性を有し、FR2は配列番号45と少なくとも80%の相同性を有し、且つFR3は配列番号46と少なくとも80%の相同性を有するか;
FR1は配列番号52と少なくとも80%の相同性を有し、FR2は配列番号53と少なくとも80%の相同性を有し、且つFR3は配列番号54と少なくとも80%の相同性を有するか;
FR1は配列番号60と少なくとも80%の相同性を有し、FR2は配列番号61と少なくとも80%の相同性を有し、且つFR3は配列番号62と少なくとも80%の相同性を有するか;あるいは
FR1は配列番号68と少なくとも80%の相同性を有し、FR2は配列番号69と少なくとも80%の相同性を有し、且つFR3は配列番号70と少なくとも80%の相同性を有する、請求項1〜5のいずれか1項に記載の抗体。 - 上記式(I)のアミノ酸配列が、配列番号4、配列番号16、配列番号24、配列番号32、配列番号40、配列番号48、配列番号56、配列番号64、及び配列番号72から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有する、請求項1〜6のいずれか1項に記載の抗体。
- 上記式(I)のアミノ酸配列が、配列番号4、配列番号16、配列番号24、配列番号32、配列番号40、配列番号48、配列番号56、配列番号64、及び配列番号72から選択されるアミノ酸配列と100%の相同性を有する、請求項1〜6のいずれか1項に記載の抗体。
- 上記抗体は、重鎖可変領域(VH)、VHH型重鎖可変領域(VHH)、VH型重鎖抗体(VH HcAb)、VHH型重鎖抗体(VHH HcAb)、軟骨魚類由来抗免疫グロブリン新規抗原受容体IgG重鎖抗体(Ig NAR)、又はIg NAR可変領域(V−NAR)から選択される、請求項1〜8のいずれか1項に記載の抗体。
- 上記抗体の検出を可能にする分子と結合している請求項1〜9のいずれか1項に記載の抗体。
- 上記分子は、ペプチドタグ、酵素、放射性核種、蛍光化合物、発光化合物、染料、有利にはFRETパートナー対のメンバーから選択される、請求項10に記載の抗体。
- 請求項1〜11のいずれか1項に記載の単一ドメイン抗体(sdAb)をコードする核酸配列。
- 請求項12に記載の核酸配列を有する組換えベクター。
- 請求項13に記載のベクター又は請求項12に記載の核酸配列を有する細胞。
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