JP2021119133A - 幹細胞分化剤のスクリーニング方法 - Google Patents
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Abstract
Description
(ii) 分化を引き起こすか、幹細胞の多分化能あるいは幹細胞の増殖を阻害する物質を同定し、ここでこのような物質は抗がん剤であると決定される。
該幹細胞はナイーブ状態幹細胞でありえる。あるいは、ステップ(i)で、幹細胞は、ナイーブ状態若しくはプライムド状態幹細胞でありえる。そこでは、ナイーブ状態幹細胞に対する当該物質の影響が、プライムド状態幹細胞での効果と比較され、当該物質が、プライムド状態幹細胞と比べて、ナイーブ状態幹細胞により大きな効果があれば、そこでは、当該物質が抗ガン剤たりうると決定される。当該物質は、多クローン性抗体、単クローン抗体、抗体様分子、抗体フラグメント融合蛋白質、抗体ミミック、ペプチド、ペプチドミミック、低分子あるいは天然物でありうる。幹細胞は、ヒトでありうる。幹細胞は、NME7ABあるいはNME7-X1を含む培地中で培養することにより、ナイーブ状態で維持されうる。癌は、乳、卵巣、黒色腫、前立腺、肺、あるいは膵臓でありうる。癌は、MUC1陽性あるいはMUC1*陽性癌でありうる。癌は、NME7ABあるいはNME7-X1陽性癌でありうる。当該物質は、一般に、細胞毒性が存在しないものでありうる。当該物質は、繊維芽細胞あるいは繊維芽細胞始原細胞に細胞毒性が存在しないものでありうる。
(i)プライムド状態幹細胞と比較して、ナイーブ状態幹細胞においてダウンレギュレートされる遺伝子あるいは遺伝子産物を同定すること;
(ii) 候補作用薬とナイーブ幹細胞を接触させること; 及び
(iii)ナイーブ状態幹細胞でダウンレギュレートされた遺伝子若しくは遺伝子産物の発現あるいは活性を増加させる作用薬を同定すること。
ダウンレギュレートされた遺伝子は、幹細胞が分化を始める場合アップレギュレートされる遺伝子でありうる。ダウンレギュレートされた遺伝子は、フィブロネクチン、ビメンチンあるいはNF1でありうる。
(i)プライムド状態幹細胞と比較して、ナイーブ状態幹細胞においてアップレギュレートされる遺伝子あるいは遺伝子産物を同定すること;
(ii) 候補作用薬とナイーブ幹細胞を接触させること;及び
(iii)ナイーブ状態幹細胞中のアップレギュレートされた遺伝子若しくは遺伝子産物の発現あるいは活性を阻害する作用薬を同定すること。
アップレギュレートされた遺伝子は、e-カドヘリンあるいはCXCR4でありうる。
(i)繊維芽細胞と比較して、ナイーブ状態幹細胞においてアップレギュレートされる遺伝子あるいは遺伝子産物を同定すること;
(ii) 候補作用薬とナイーブ幹細胞を接触させること; 及び
(iii)ナイーブ状態幹細胞中のアップレギュレートされた遺伝子若しくは遺伝子産物の発現あるいは活性を阻害する作用薬を同定すること。
アップレギュレートされた遺伝子は、e-カドヘリンあるいはCXCR4でありうる。
(i)繊維芽細胞と比較して、ナイーブ状態幹細胞においてダウンレギュレートされる遺伝子あるいは遺伝子産物を同定すること;
(ii) 作用薬とナイーブ幹細胞と接触させること;及び
(iii)ナイーブ状態幹細胞中のダウンレギュレートされた遺伝子若しくは遺伝子産物の発現あるいは活性を増加させる作用薬を同定すること。
ダウンレギュレートされた遺伝子は、幹細胞が分化を始めるとき、アップレギュレートされる遺伝子でありうる。ダウンレギュレートされた遺伝子は、フィブロネクチン、ビメンチンあるいはNF1でありうる。
(i)プライムド幹細胞あるいは繊維芽細胞と比較して、ナイーブ状態幹細胞においてアップレギュレートされるmicroRNAを同定すること;
(ii) 作用薬とナイーブ幹細胞と接触させること; 及び
(iii)ナイーブ状態幹細胞中のアップレギュレートされたMicroRNAの発現若しくは活性を阻害する作用薬を同定すること。
(i)患者からの癌サンプルを分析し、それがMUC1*陽性、NME7AB陽性若しくはNME7-X1陽性であることを決定する患者に処理する; そして、
分析ステップは、PCRによって行なわれうる。1つの態様で、癌サンプルが、EEF1A1遺伝子のmRNA発現レベルの少なくとも0.5%であるMUC1遺伝子、NME7遺伝子あるいはNME7-X1遺伝子のmRNAのレベルを発現しうる場合、それはMUC1*陽性、NME7AB陽性あるいはNME7-X1陽性であると決定される。分析ステップは、免疫組織化学によって行なわれうる。1つの態様で、癌サンプルが、PSMGFRペプチドあるいはN-10ペプチドに結合する抗体と接触され、病理標準スコア1〜4("+〜++++")で、組織を染色する場合、それはMUC1*陽性であると決定される。癌サンプルが、NME7のB3ペプチドに結合する抗体と接触され、病理標準スコア1〜4("+〜++++")で、組織を染色する場合、それはNME7AB陽性あるいはNME7-X1陽性であると決定される。
(i)幹細胞に候補作用薬をさらし、そして
(ii)幹細胞多分化能あるいは増殖を阻害する、又は幹細胞分化を引き起こす作用薬を同定することであって、そこでは、該作用薬またはそのアナログは、炎症性疾患若しくは状態を治療するための作用薬である。
炎症性疾患若しくは状態は、慢性関節リウマチ、炎症性の腸症候群、クローン病、変形性関節症、喘息、皮膚炎、乾癬(嚢胞性繊維症)、移植後遅延性及び慢性の実質臓器拒絶反応、多発性硬化症、全身性紅斑性狼瘡、シェーグレン症候群、橋本甲状腺炎、多発性筋炎、強皮症、アジソン病、白斑、悪性貧血、糸球体腎炎、肺線維症、自己免疫性糖尿病、糖尿病性網膜症、鼻炎、乏血再潅流傷害、血管形成術後再狭窄、慢性閉塞性肺疾患(COPD)、グレーブス病、消化管アレルギー、結膜炎、アテローム性動脈硬化、冠動脈疾患、狭心症、癌転移、小動脈疾病あるいはミトコンドリア疾患でありうる。
炎症性疾患若しくは状態は、慢性関節リウマチ、炎症性の腸症候群、クローン病、変形性関節症、喘息、皮膚炎、乾癬(嚢胞性繊維症)、移植後遅延性及び慢性の実質臓器拒絶反応、多発性硬化症、全身性紅斑性狼瘡、シェーグレン症候群、橋本甲状腺炎、多発性筋炎、強皮症、アジソン病、白斑、悪性貧血、糸球体腎炎、肺線維症、自己免疫性糖尿病、糖尿病性網膜症、鼻炎、乏血再潅流傷害、血管形成術後再狭窄、慢性閉塞性肺疾患(COPD)、グレーブス病、消化管アレルギー、結膜炎、アテローム性動脈硬化、冠動脈疾患、狭心症、癌転移、小動脈疾病あるいはミトコンドリア疾患でありうる。該作用薬は、図18〜27に表示される又は式1〜10の化合物でありうる。
時間=0時間で得られた写真。
本願明細書において、「a」「an」は、単一及び複数の主題の両方を参照するために使用される。
アミノ酸置換の何らかの整数値、及びそのN末端及び/又はC末端での20までのアミノ酸の付加若しくは欠失の何らかの整数値をもつ全ての機能的変異体及び断片である。上記の明細書中の「機能的な変異体あるいは断片」は、配列番号3のペプチドに、特異的に結合する、そうでなければ特異的に相互作用する、リガンドに、特異的に結合する、そうでなければ特異的に相互作用する能力をもつ変異体若しくは断片を意図する。配列番号3のPSMGFRペプチドの機能的な変異体であるPSMGFRの1つの例(天然のためにはnat-PSMGFRと記載)は、配列番号11(var-PSMGFRと記載)であり、それは天然-SRY-の代わりに-SPY-配列を含むことで、nat-PSMGFRと異なる(配列表の太字参照)。「var-PSMGFR」は、天然型に比べ、立体的安定性が促進され、抗体生産のような特定の適応において重要である。PSMGFRは、未修飾ペプチド、および酵素修飾、例えばリン酸化、グリコシレーション化など、を受けたペプチドの両方を包含する。
GTINVHDVETQFNQYKTEAASRYNLTISDVSVSDVPFPFSAQSGA(配列番号: 3)
として記述されるMUCl成長因子リセプタの一次配列の頭字語である。この点で、「N-10 PSMGFR」、「N-15 PSMGFR」あるいは「N-20 PSMGFR」での「N-数」は、PSMGFRのN末端で欠失されたアミノ酸残基の数を指す。同様に「C-10 PSMGFR」、「C-15 PSMGFR」あるいは「C-20 PSMGFR」での「C-数」は、PSMGFRのC末端で欠失されたアミノ酸残基の数を指す。
胆道癌;膀胱癌;膠芽腫と髄芽腫を含む脳腫瘍;乳癌;子宮頸癌;絨毛癌;結腸癌;子宮内膜癌;食道癌;胃癌;急性リンパ球・骨髄性白血病を含む血液の新生物;多発性骨髄腫; AIDSに関連する白血病および成人T細胞白血病リンパ腫;ボーエン病とパジェット病を含む上皮内の新生物;肝臓癌;肺癌;ホジキン病とリンパ球性リンパ腫を含むリンパ腫;神経芽細胞腫;扁平上皮癌を含む口腔癌;上皮細胞、間質細胞、生殖細胞および間充織細胞から発生するものを含む卵巣癌;膵臓癌;前立腺癌;直腸癌;平滑筋肉腫、横紋筋肉腫、脂肪肉腫、繊維肉腫および骨肉腫を含む肉腫;黒色腫、カポジ肉腫、基底細胞癌および扁平上皮癌のような皮膚癌;精上皮腫、非精上皮腫(奇形腫、絨毛癌)、間質腫瘍および生殖細胞腫瘍を含む精巣癌;甲状の腺癌および髄様癌を含む甲状腺癌;及び腺癌とウィルムス腫瘍を含む腎臓癌。好ましい癌は以下である;胸、前立腺、肺、卵巣、結腸直腸、及び脳の腫瘍。良性若しくは悪性形態の新生物も癌性の状態の範囲内に包含される。
全長MUClリセプタを記述する(ムチン1前駆物質、Genbank受付番号: P15941)。
そのN末端でnat-PSMGFRを持っており、全長MUClリセプタの膜貫通及び細胞質の配列を含む欠失MUClリセプたアイソフォームを記述する。
MUCl成長因子リセプタ(nat-PSMGFR -「PSMGFR」の例)の天然一次配列の細胞外領域について記述する。
N末端10アミノ酸が削除されたPSMGFRのN-10ペプチドについて記述する。
NME7アミノ酸配列を記述する(NME7:GENBANK ACCESSION AB209049)。
SRPFFNELIQFITTGPIIAMEILRDDAICEWKRLLGPANSGVARTDASESIRALFGTDGI
RNAAHGPDSFASAAREMELFFPSSGGCGPANTAKFTNCTCCIVKPHAVSEGLLGKIL
MAIRDAGFEISAMQMFNMDRVNVEEFYEVYKGVVTEYHDMVTEMYSGPCVAMEIQ
QNNATKTFREFCGPADPEIARHLRPGTLRAIFGKTKIQNAVHCTDLPEDGLLEVQYFF
KILDN(配列番号: 6)
ヒトNME7-ABを記述する。
LGPANSGVARTDASESIRALFGTDGIRNAAHGPDSFASAAREMELFFPSSGGCGPANT
AKFTNCTCCIVKPHAVSEGLLGKILMAIRDAGFEISAMQMFNMDRVNVEEFYEVYK
GVVTEYHDMVTEMYSGPCVAMEIQQNNATKTFREFCGPADPEIARHLRPGTLRAIFG
KTKIQNAVHCTDLPEDGLLEVQYFFKILDN*(配列番号: 7)
ヒトNME7-X1について記述する。
SRPFFNELIQFITTGPIIAMEILRDDAICEWKRLLGPANSGVARTDASESIRALFGTDGI
RNAAHGPDSFASAAREMELFF - (配列番号:8)
ヒトNME7-A1について記述する。
QMFNMDRVNVEEFYEVYKGVVTEYHDMVTEMYSGPCVAMEIQQNNATKTFREFC
GPADPEIARHLRPGTLRAIFGKTKIQNAVHCTDLPEDGLLEVQYFFKILDN(配列番号: 9)
ヒトNME7-B3について記述する。
NME7Bペプチド3(B領域)である、B3について記述する。
増強された:安定性を持っている、MUC1成長因子リセプタの天然一次配列の「SPY」機能的変異体の細胞外領域について記述する(バール-PSMGFR「PSMGFR」の-例)。
NME7のDM10領域について記述する。
1) 多能性の状態において幹細胞を育てる;
2) 薬候補と多能性幹細胞の個体群を接触させる;
3) 多能性幹細胞の分化を引き起こす、又は多分化能または増殖を阻害する、薬候補を同定する;そして、
4) 多能性幹細胞の分化を引き起こす、又は多分化能または増殖を阻害する、薬候補が抗ガン剤であると結論をする。
1) ナイーブ状態幹細胞を育てる;
2) 薬候補と幹細胞を接触させる;
3) ナイーブ幹細胞の分化を引き起こす、又は多分化能または増殖を阻害する、薬候補を同定する;そして、
4) ナイーブ幹細胞の分化を引き起こす、又は多分化能または増殖を阻害する、薬候補が攻撃的な癌若しくは癌転移の治療若しくは予防のための抗ガン剤であると結論する。
1) ナイーブ状態幹細胞を育て、任意に、合わせて、プライムド状態幹細胞を育てる;
2) 薬候補と幹細胞の個体群を接触させる;
3) ナイーブ幹細胞の分化を引き起こす、又は多分化能または増殖を阻害する、しかし、任意に、プライムド幹細胞ではおこらない、あるいはプライムド幹細胞ではるかにより劣った効果がある、薬候補を同定する;そして
4) ナイーブ幹細胞の分化を引き起こす、又は多分化能または増殖を阻害する、しかし、任意に、プライムド幹細胞ではおこらない、あるいはプライムド幹細胞ではるかにより劣った効果がある、薬候補が癌転移の処置若しくは予防のための抗ガン剤であると結論する。
さらに本発明の別の態様では、新規抗癌若しくは抗転移薬の標的は、プライムド幹細胞でではなく、ナイーブ幹細胞でアップレギュレートされるmicroRNAsを同定することにより特定される。
今の時点で、BRD4のこれらのいわゆる機能のどれが正確かは完全には明らかではない。プライムド状態幹細胞は、JQ1(+)、不活性立体異性体JQl(-)、BRD4特異siRNAあるいはJMJD6特異siRNAで、3日目間処置された。これらの作用薬のいずれも、プライムド状態幹細胞の分化を引き起こさなかったが、JQ1(+)は、プライムド幹細胞コロニーのそのサイズで適度の効果があるように見え(図11)、さらにある異常な形態学を引き起こすように見えた(図12)。しかしながら、JQ1(+)は、劇的に、ナイーブ状態幹細胞の分化を誘導し、また、それらの増殖を阻害した(図14 E-F、15 E-Fおよび16 E-F)。ナイーブ幹細胞が、NME7AB(図13-14)若しくはNME1二量体(図15-16)において培養され、JQ1(+)は、ナイーブ幹細胞多分化能および増殖を阻害し、および分化を誘導した。JQ1(+)は、炎症、癌細胞移動および癌細胞増殖の既知の抑制剤であるので、これらの結果は、炎症の有効な治療法あるいは癌の予防若しくは治療の有効な治療法である作用薬が、ナイーブ幹細胞多分化能あるいは増殖を阻害する若しくは幹細胞分化を引き起こすことを示す。したがって、ナイーブ幹細胞多分化能あるいは増殖を阻害する、幹細胞分化を引き起こす作用薬は、又、炎症あるいは癌の予防若しくは治療の有効な治療法である。
癌細胞移動における低分子による阻害の検討は、DU145(MUC1 *+/NME7AB+++/NME7-X1+++)前立腺癌細胞およびSK-OV-3(MUC1*+)卵巣癌細胞(図84A1-87H6); A549(MUCl*LO)肺癌細胞およびPC-3(MUC1 *+/ NME7AB +++/NME7-X1+++)前立腺癌細胞(図88A1-95H6); CHL-1(MUC1*+/NME7+)メラノーマ細胞およびOV-90(MUC1*=)卵巣癌細胞(図96A1-101H6); CAPAN-2(MUC1 *+)膵癌細胞およびZR-75-1(MUC1 *++)乳癌細胞(図102A1-106H6)、で行われた。
該文言は、限定されないが、以下に例示される基を含む、直鎖アルキル基の分枝鎖異性体を含んでいる:
-CH(CH3)2、-H(CH3)(CH2CH3)、-CH(CH2CH3)2、-C(CH3)3、-C(CH2CH3)3、-CH2CH(CH3)2、-CH2CH(CH3)(CH2CH3)、-CH2CH(CH2CH3)2、-CH2C(CH3)3、-CH2C(CH2CH3)3、-CH(CH3)、-CH(CH3)(CH2CH3)、-CH2CH2CH(CH3)2、-CH2CH2CH(CH3)(CH2CH3)、-CH2CH2CH(CH2CH3)2、-CH2CH2C(CH3)3、-CH2CH2C(CH2CH3)3、-CH(CH3)CH2-CH(CH3)2、-CH(CH3)CH(CH3)CH(CH3)2、-CH(CH2CH3)CH(CH3)CH(CH3)(CH2CH3)等.
適切な「アルケニル」基は、限定されないが、C1-C9アルケニル、C1-C6アルケニル、C1-C4アルケニルおよびC1-C3アルケニルを含む。アルケニル基/部分の例は、エテニル、プロペニル、1−ブテニル、2−ブテニル、1−ペンテニル、1−ヘキセニル、1,3−ブタジエニル、1,3−ペンタジエニル、1,4−ペンタジエニル、1,4−ヘキサジエニルおよびシクロアルケニル基/部分を含み、以下に例示される。
それの例は、シクロペント-l-エン-l-イル、シクロヘクス-l-エン-l-イルおよびシクロヘクス-l,3-ジエン-l-イルを含む。他に記述がなければ、シクロアルケニル置換基若しくは部分は、モノサイクリック、バイサイクリック(例えば縮合若しくはスピロ)及びポリサイクリックヒドロカルビル環を含みうる。
-(CH2)nNH(CO)-、-(CH2)nNH (CO)O-、-(CH2)mNH(CO)NH-;
-C3-C7シクロアルキル-NH(CO)-、-C3-C7シクロアルキル-CH2NH(CO)O-、-C3-C7シクロアルキル-NH(CO)NH-、-N(CH2CH2C6H5)-である;
上述されたパスウェイは、炭素原子及び/又は異種原子から成る。
水素原子は、パスウェイの一部としては数えられない。
1,1,1,3,3,3-ヘキサフルオロイソプロパノール(ルイス酸)若しくはトリフルオロ酢酸(Bronsted酸)を使用して、RlとR2で置換をもつ、テトラヒドロ-ベータカルボリンを提供するために、ピクテ・スパングラー・タイプ複素環式化反応で、非置換トリプタミンおよび置換トリプタミンが、脂肪族および芳香族アルデヒドと反応された。
テトラヒドロ-ベータカルボリンの基礎的な第2の窒素が、次いで、カルボン酸(カップリング剤の存在下で)、塩基が存在する状態での酸塩化物、あるいは尿素を生成するためにイソシアネートで、アシル化された。
該反応は、ウォーターバスから除かれ、室温に暖められ、20時間撹拌された。溶剤は、蒸発され、黒油を産出した。該油はCH2Cl2(250 mL)に溶かされ、そして、1N NaOHが加えられ、振とうされた。沈殿が、集められ、真空乾燥機で乾燥し、17.9gのオリーブ色粉体(TFA塩)をえた。TFA塩は、アセトニトリル還流から再結晶した。集められた固体は、冷ACN(〜20 mL)で洗われ、そして乾燥し結晶性固体を得た(9.3g、54%収率;TLC Rf= 0.30(10%MeOH/l%NH4OH/CH2Cl2);HPLC Rt= 3.099min)。この中間物は次の化合物の合成において使用された:MN1132、MN1133、MN1137、MN1138、MN1157、MN1186、MN1189、MN1190、MN1194、MN1195、MN1197、MN1203、MN1206、MN1207、MN1208、MN1209、MN1212、MN1213、MN1214、MN1220、MN1221、MN1222、MN1223、MN1224、MN1225、MN1226、MN1231、MN1232、MN1246。
該反応は、真空下で蒸発し乾燥された。残渣は、EtOAc(100 mL)に溶かされ、1Mクエン酸(3x25mL)、飽和NaHCO3(3x25mL)、そして飽和NaCl(25 mL)で洗浄された。有機物層は、乾燥され(無水Na2SO4)、ろ過され、、そして真空下で蒸発され、オフホワイト固体(339mg)を得た。当該物質は、1時間40%EtOAc/60%ヘキサン(3 mL)でかき混ぜ粉砕によってさらに精製され、その後、粉砕産物を集めた。該粉砕は、1時間40%EtOAc/60%ヘキサン(3 mL)でかき混ぜることにより繰り返された。得られた固体は、濾過され、真空乾燥機で乾燥させ、白色固体(138mg、36.7%収率; TLC Rf = 0.46(ヘキサン中の40%EtOAc); HPLCRt = 4.598min);MS m/z375.2412(100%rel.int.)を得た。この方法は、次の化合物の合成で使用された:MN733、MN1130、MN1131、MN1158、MN1160、MN1169、MN1171、MN1172、MN1184。
MN0477、MN0642、MN0908、MN1132、MN1133、MN1135、MN1137、MN1138、MN1152、MN1156、MN1157、MN1188、MN1193、MN1197、MN1203、MN1206、MN1207、MN1208、MN1209、MN1210、MN1211、MN1212、MN1213、MN1214、MN1216、MN1217、MN1218、MN1219。
この方法は次の化合物の合成で使用された: MN0580、MN1169、MN1172、MN1186、MN1189、MN1190、MN1194、MN1195、MN1220、MN1221、MN1222、MN1223、MN1224、MN1225、MN1226、MN1227、MN1228、MN1229、MN1230、MN1231、MN1232、MN1233、MN1234、MN1235、MN1236、MN1237、MN1238、MN1239、MN1240、MN1241、MN1242、MN1243、MN1244、MN1245、MN1246、MN1247、MN1248、MN1249、MN1250、MN1251、MN1253、MN1254、MN1255、MN1256、MN1257、MN1258、MN1259、MN1260、MN1261、MN1262、MN1263。
該溶液は夜通し攪拌された。該溶液は、EtOAc(100 mL)で希釈され、1Mクエン酸(3×25 mL)、飽和NaHCO3 (3×25 mL)及び飽和NaCl(25 mL)で洗浄された。有機物層は、乾燥され(無水Na2SO4)、濾過され、真空下で蒸発させた。この物質は、シリカゲル・クロマトグラフィーによってさらに精製された:CH2Cl2中の0%、1%MeOH、1%MeOH/0.1% NH4OH、2%MeOH/0.1% NH4OHおよび3%MeOH/0.1% NH4OHから成る5つの画分(200 mL、各々)。
生成物を含んでいる画分は合わされ、そして、溶剤は真空下で蒸発させ、固体(412mg、80.3%収率; TLC Rf = 0.14(CH2Cl2中の10%EtOAc); HPLC Rt = 4.652min); 1H NMR(CDC13、0.003%v/v TMS、400MHz):δH 0.97(3H、d)、1.05(3H、d)、1.45(9H、s)、1.5-1.85(7H、m)、2.30-2.60(2H、m)、2.65-2.90(2H、m)、3.05-3.20(2H、m)、3.40-3.55(1H、m)、4.05(1H、dd)、4.65(1H、br s)、5.85-5.90(1H、m)および7.07(1H、dd)、7.15(1H、dd)、7.30(1H、d)、7.45(1H、d)、7.80(1H、br s)を得た。この方法は次の化合物の合成で使用された: MN0580、MN1169、MN1172、MN1186、MN1189、MN1190、MN1194、MN1195、MN1220、MN1221、MN1222、MN1223、MN1224、MN1225、MN1226、MN1227、MN1228、MN1229、MN1230、MN1231、MN1232、MN1233、MN1234、MN1235、MN1236、MN1237、MN1238、MN1239、MN1240、MN1241、MN1242、MN1243、MN1244、MN1245、MN1246、MN1247、MN1248、MN1249、MN1250、MN1251、MN1253、MN1254、MN1255、MN1256、MN1257、MN1258、MN1259、MN1260、MN1261、MN1262、MN1263。
m)、7.30-7.37(1H、m)、7.87(1H、br s)を得た。この方法は次の化合物の合成で使用された: MN0580、MN1169、MN1172、MN1186、MN1189、MN1190、MN1194、MN1195、MN1220、MN1221、MN1222、MN1223、MN1224、MN1225、MN1226、MN1227、MN1228、MN1229、MN1230、MN1231、MN1232、MN1233、MN1234、MN1235、MN1236、MN1237、MN1238、MN1239、MN1240、MN1241、MN1242、MN1243、MN1244、MN1245、MN1246、MN1247、MN1248、MN1249、MN1250、MN1251、MN1252、MN1253、MN1254、MN1255、MN1256、MN1257、MN1258、MN1259、MN1260、MN1261、MN1262、MN1263。
アセチルグリシン(5.86g、50 mmol)の懸濁に、無水酢酸(47.3 mL(500 mmol)中の酢酸ナトリウム(4.10g、50 mmol)が、ベンズアルデヒド(5.11 mL(50 mmol)を添加された。反応混合物は、溶かすために、10min、l00℃の油浴で加熱された。その後、還流コンデンサーが加えられ、そして、浴は正確に1時間で140℃に加熱した。その後、反応フラスコは、攪拌をしながら、氷水浴におかれ、l時間かき混ぜられた。1時間後、氷冷水(47 mL)が、暗赤溶液の黄色固体の懸濁に加えられた。生成物は、フリット化したがラス漏斗に集められ、漏斗でかき混ぜながら、氷冷水(3×50 mL)で洗浄された。粗生成物は、固体KOH上のデシケータで夜通し乾燥され、黄色のパウダーとして4.6gの生成物を得た。この材料は、熱い2-プロパノールの85 mLから再結晶され、室温にゆっくりと冷やし、氷浴中で冷却し、そして次に、ろ過によって集められ2.98g、32%収率で精製4-ベンジリデン-2-メチルオキサゾール-5(4H)-オン: mp 148-151℃を得た。
トリプタミン塩酸塩(2.4g、10.2 mmol)が、1N HCl中で懸濁された。アゼラクトン(4-ベンジリデン-2-メチルオキサゾール-5(4H)-オン(2.3g、12.2 mmol)が、加えられ、そして、混合物は、窒素下の還流コンデンサーをもつ油浴において105℃で還流加熱された。15分後、溶液は、澄明となり、1時間後、沈殿が、穏やかな沸騰と共に形成し始めた。反応液は、夜通し還流され、次に、氷浴で冷却された。生成物は、フリット化したグラスに集められ、水(100 mL)で洗浄された。泥状の緻密な固体が、3日間、固体KOH上の真空デシケータで乾燥され、オフホワイト固体として3.2gの生成物を得た。この物質は、氷冷2-プロパノール(2 x10 mL)で、そして次に、氷冷ジエチルエーテル(10 mL)で洗浄され、次に、真空下で夜通し乾燥され、オフホワイト・パウダーとして1-ベンジル-2,3,4,9-テトラヒドロ-lH-ピリド[3,4-b]インドール塩酸塩を3.0g 98%収率で、得た。この中間物は次の化合物の合成で使用された:
MN1131、及びMN1233。
MN733、MN1130、MN1131、MN1158、MN1160、MN1169、MN1171、MN1172、MN1184。
ジオキサン(4 mL,16 mmol)の4N HC1が加えられた。該溶液は、還流して加熱され、そのポイントで、環化された生成物のHCl塩が沈殿し始めた。その後、反応液は-20℃まで冷やされ、そして、固体はフリット化したグラスに集められた。生成物、1,(4-クロロフェニル)-2,3,4,9-テトラヒドロ-lH-ピリド[3,4-b]インドール塩酸塩が、真空下乾燥され、オフホワイト・パウダー;Mp:163-165℃(フリー塩基)の2.16g 、85%収率(全体として68%)を得た。
無水EtOH(15 mL)中にあるトリプタミン(1.5g、9.4 mmol)の溶液に、4-t-ブチルベンズアルデヒド(2.0 mL,12 mmol)を加えられた。その反応は、0℃に冷却前に1時間攪拌され、そして次にNaBH4(750mg、19 mmol)が加えられた。該溶液は、真空内で濃縮され、次に、高真空下で乾燥された。その後、その反応は1N HCl (~20mL)で停止され、次に、EtOAc(100mL)が添加され沈殿を形成した。該混合物は、固体K2CO3で、塩基性 (pH 10)にした。層は分離され、Na2O4の上に乾燥され、蒸発させ、300mgの油を得た。この材料は、最初に1N HCl(10 mL)を加えることにより精製され、次に、EtOAc(50 mL)が添加され、個体として、N-(4-tert-ブチルベンジル)-2-(lH-インドール-3-イル)エタンアミンを沈殿させた: 260mg(9%収率); HPLC Rt (2.757min)。
本明細書に記述の分析法のいずれかによって、又は当業者に既知の他のMUC1*陽性活性測定法によって、或は、癌兆候の阻害若しくは緩和を検出することによって、MUC1*陽性活性を検知可能に阻害できるのに十分ないかなる量をも含む。
プライムド状態幹細胞の増殖
転移性癌の阻害剤についての薬剤スクリーニング
癌若しくは転移性癌についての薬剤のスクリーニング
移動分析
その後、集められたデータは、各実験のDMSOコントロールに対し標準化された。
増殖分析
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Claims (59)
- 次の工程を含む、癌若しくは転移癌の治療若しくは予防のための作用薬を同定する方法;
(i) 潜在的な作用薬と幹細胞を接触させる、
(ii) 分化を引き起こすか、又は幹細胞多分化能若しくは幹細胞成長を阻害する、作用薬を同定し、そのような作用薬は抗ガン剤であると決定される。 - 幹細胞は、ナイーブ状態幹細胞である請求項1に記載の方法。
- 請求項1に記載の方法であって、ステップ(i)で、幹細胞はナイーブ状態若しくはプライムド状態幹細胞であり、ナイーブ状態幹細胞に対する作用薬の効果がプライムド状態幹細胞に対する効果が比較され、作用薬が、プライムド状態幹細胞と比較して、ナイーブ状態幹細胞により大きな効果があれば、当該作用薬が、制癌剤でありうると決定される、方法。
- 請求項1に記載の方法であって、該作用薬は、多クローン性抗体、単クローン抗体、抗体様分子、抗体断片融合蛋白質、抗体ミミック、ペプチド、ペプチドミミック、低分子あるいは天然物である、方法。
- 請求項1に記載の方法であって、幹細胞がヒトである、方法。
- 請求項1に記載の方法であって、幹細胞が、NME7ABを含む培地中で培養することにより、ナイーブ状態に維持される、方法。
- 請求項1に記載の方法であって、幹細胞が、NME7-X1を含む培地中で培養することにより、ナイーブ状態に維持される、方法。
- 請求項1に記載の方法であって、癌は、乳癌、卵巣癌、黒色腫、前立腺癌、肺癌、あるいは膵臓癌である、方法。
- 請求項1に記載の方法であって、癌は、MUC1陽性若しくはMUC1*陽性癌である、方法。
- 請求項1に記載の方法であって、癌は、NME7AB陽性癌である、方法。
- 請求項1に記載の方法であって、癌は、NME7-X1陽性癌である、方法。
- 請求項1に記載の方法であって、作用薬が一般的に細胞毒性をもたないものである、方法。
- 請求項1に記載の方法であって、作用薬が、繊維芽細胞若しくは繊維芽細胞始原細胞に細胞毒性をもたないものである、方法。
- 請求項1に記載の方法によって得られた作用薬を、対象に、投与することを含む癌を予防若しくは治療する方法。
- 請求項14に記載の方法であって、癌は、乳癌、卵巣癌、黒色腫、前立腺癌、肺癌、あるいは膵臓癌である、方法。
- 請求項14に記載の方法であって、癌は、MUC1陽性若しくはMUC1*陽性癌である、方法。
- 請求項14に記載の方法であって、癌は、NME7AB陽性癌である、方法。
- 請求項14に記載の方法であって、癌は、NME7-X1陽性癌である、方法。
- 請求項1に記載の方法によって得られた作用薬を対象に投与することを含む癌の転移を防ぐ方法。
- 請求項1に記載の方法によって得られた作用薬を対象に投与することを含む癌増殖を阻害する方法。
- 請求項1に記載の方法によって得られた作用薬を処理することを含む転移性癌細胞の成長を阻害する方法。
- プライムド状態幹細胞と比較して、ナイーブ状態幹細胞でアップレギュレートされる遺伝子若しくは遺伝子産物を同定することを含む、創薬のための抗癌若しくは抗転移の標的を同定する方法。
- プライムド状態幹細胞と比較して、ナイーブ状態幹細胞でダウンレギュレートされる遺伝子若しくは遺伝子産物を同定することを含む、創薬のための抗癌若しくは抗転移の標的を同定する方法。
- 以下を含む、抗癌若しくは抗転移作用薬の同定方法;
(i)プライムド状態幹細胞と比較して、ナイーブ状態幹細胞でダウンレギュレートされる遺伝子あるいは遺伝子産物を同定すること;
(ii)作用薬とナイーブ幹細胞と接触させること;及び
(iii)ナイーブ状態幹細胞で、ダウンレギュレートされた遺伝子若しくは遺伝子産物の発現あるいは活性を増加させる作用薬を同定すること。 - 以下を含む、抗癌若しくは抗転移作用薬の同定方法;
(i)プライムド状態幹細胞と比較して、ナイーブ状態幹細胞でアップレギュレートされる遺伝子あるいは遺伝子産物を同定すること;
(ii)作用薬とナイーブ幹細胞と接触させること;及び
(iii)ナイーブ状態幹細胞で、アップレギュレートされた遺伝子若しくは遺伝子産物の発現あるいは活性を阻害する作用薬を同定すること。 - 以下を含む、抗癌若しくは抗転移作用薬の同定方法;
(i)繊維芽細胞と比較して、ナイーブ状態幹細胞でアップレギュレートされる遺伝子あるいは遺伝子産物を同定すること;
(ii)作用薬とナイーブ幹細胞と接触させること;及び
(iii)ナイーブ状態幹細胞で、アップレギュレートされた遺伝子若しくは遺伝子産物の発現あるいは活性を阻害する作用薬を同定すること。 - 以下を含む、抗癌若しくは抗転移作用薬の同定方法;
(i)繊維芽細胞と比較して、ナイーブ状態幹細胞でダウンレギュレートされる遺伝子あるいは遺伝子産物を同定すること;
(ii)作用薬とナイーブ幹細胞と接触させること;及び
(iii)ナイーブ状態幹細胞で、ダウンレギュレートされた遺伝子若しくは遺伝子産物の発現あるいは活性を増加させる作用薬を同定すること。 - アップレギュレートされた遺伝子がe-カドヘリンである、請求項25または26に記載の方法。
- アップレギュレートされた遺伝子がCXCR4である、請求項25または26に記載の方法。
- ダウンレギュレートされた遺伝子が、幹細胞が分化を始める場合に、アップレギュレートされる遺伝子である、請求項24または27に記載の方法。
- ダウンレギュレートされた遺伝子はフィブロネクチンである請求項24または27に記載の方法。
- ダウンレギュレートされた遺伝子はビメンチンである請求項24または27に記載の方法。
- ダウンレギュレートされた遺伝子はNFLである請求項24または27に記載の方法。
- 以下を含む、抗癌若しくは抗転移作用薬の同定方法;
(i)プライムド幹細胞若しくは繊維芽細胞と比較して、ナイーブ状態幹細胞でアップレギュレートされるmicroRNAを同定すること;
(ii)作用薬とナイーブ幹細胞と接触させること;及び
(iii)ナイーブ状態幹細胞で、アップレギュレートされたmicroRNAの発現若しくは活性を阻害する作用薬を同定すること。 - 以下の化学式1の化合物
ここで、
JとKは、両方とも水素でありうる、あるいは、JとKは、六員環に帰着する結合を共に形成する、あるいは、ともにJとKは、7員環となる−CH2である;
Rlは、H、任意に置換されたC1-C6アルキル;任意に置換されたC2-C6アルケニル;任意に置換されたC1-C6アルコキシ;任意に置換されたC6-C12アリール; N、SおよびOから独立して選ばれた1〜4環原子で任意に置換されたC1-C9ヘテロアリール;制限されないが、ベンジルまたはアルファメチルベンジルのような、任意に置換されたC7-C15アリールアルキル; N、SおよびOから独立して選ばれた1〜4環原子で任意に置換されたC2-C15ヘテロアリールアルキル;任意に置換されたC7-C15 アリールアルケニル;任意に置換されたC3-C8シクロアルキル;あるいは任意に置換されたC4-C8シクロアルキルアルキル、である;
R2は、H、C1-C6アルコキシ、制限されないが、例えばメトキシ、エトキシ、トリフルオロメチル、ハロゲン、メチルカルボキシ、エチルカルボキシ、任意に置換されたC1-C6アルキル、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2、あるいは-SO3Hである;
Z1は、結合、-NH、-O-、-S-、-CH(CH3)-、-(CH2)n -、-C3-C7シクロアルキル-CH2、-CH=CH-、-CO-、-SO-、-SO2-、-C(=NH)-、-CH2NH(CO)-、-CH2NH(CO)O-、-CH2NH(CO)NH-; -(CH2)nNH(CO)-、-(CH2)nNH(CO)O-、-(CH2)mNH(CO)NH- ; -C3-C7シクロアルキル-CH2NH(CO)-、-C3-C7シクロアルキル-CH2NH(CO)O-、-C3-C7シクロアルキル-(CH2)NH(CO)NH-、-(CH2)nN(CH2CH2C6H5)-;あるいは、任意に、置換されたC6-C12アリール、である;
R3は、H、任意に置換されたC1-C9アルキル;任意に置換されたC2-C6アルケニル;任意に置換されたC6-C12アリール; N、SおよびOから、独立して、選ばれた1〜4環原子で任意に置換されたC1-C9ヘテロアリール;任意に置換されたC7-C15 アリールアルキル、限定されないが、例えばベンジルまたはアルファ-メチルベンジル;任意に置換されたC3-C7シクロアルキル; -(CH2)p-NH(CO)O-(Cl-C6アルキル); - CH2O(CH2)p-NH(CO)O-(C1-C6)アルキル; -(CH2)p-NHCO-(CH2)p-NH(CO)O-Cl-C6アルキル; -NH(CO)O-tert-ブチル; - O-tert-ブチル;あるいは-tert-ブチル; -CONHアリール;
m = 1-5; n=1-8; p=1-9;
ここで、「置換された」とは、ハロゲン、トリフルオロメチル、メチルカルボキシ、エチルカルボキシ、メトキシ、エトキシ、C1-C6アルコキシ、C1-C6アルキル、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2あるいは-SO3Hから選ばれた、1以上で、独立して置換されたことを意味する。 - 請求項35に記載の化合物であって、化合物は以下の化学式2である化合物:
Rlは、H、任意に置換されたC1-C6アルキル;任意に置換されたC2-C6アルケニル;任意に置換されたC1-C6アルコキシ;任意に置換されたC6-C12アリール; N、SおよびOから、独立して、選ばれた1〜4環原子で任意に置換されたC1-C9ヘテロアリール;任意に置換されたC7-C15アリールアルキル、限定されないが、例えば、ベンジルまたはアルファ-メチルベンジル; N、SおよびOから、独立して、選ばれた1〜4環原子で任意に置換されたC2-C15ヘテロアリールアルキル;任意に置換されたC7-C15 アリールアルケニル;任意に置換された非置換 C3-C8シクロアルキル;あるいは、任意に、置換されたC4-C8シクロアルキルアルキル;
R2は、H、C1-C6アルコキシ、制限されないが、例えばメトキシ若しくはエトキシを含む;トリフルオロメチル、ハロゲン、メチルカルボキシ、エチルカルボキシ、任意に置換されたC1-C6アルキル、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2あるいは-SO3Hである;
Zlは、結合、-NH-、-O-、-S-、-CH(CH3)-、-(CH2)n-、-CH=CH-、-CO-、-SO-、- SO2-、-C (=NH)-、-CH2NH(CO)-、-CH2NH(CO)O-、-CH2NH(CO)NH-; -(CH2)nNH(CO)-、-(CH2)nNH(CO)O-、-(CH2)mNH(CO)NH-;-C3-C7 シクロアルキル-CH2NH(CO)-、-C3-C7シクロアルキル-CH2NH(CO)O-、-C3-C7シクロアルキル-CH2NH(CO)NH-、-(CH2)nN(CH2CH2C6H5)-、任意に置換されたC6-C12アリール;でありうる。
R3は、H、任意に置換されたC1-C9アルキル; C2-C6 アルケニル;任意に置換されたC6-C12アリール、限定されないがフェニル若しくはナフチル; N、SおよびOから、独立して、選ばれた1〜4環原子で任意に置換されたC1-C9ヘテロアリール;任意に置換されたC7-C15アリールアルキル、例えば、限定されないが、ベンジルまたはアルファ-メチルベンジル;任意に置換されたC3-C7シクロアルキル; -(CH2)P-NH(CO)O-(C1-C6アルキル); -CH2O(CH2)p-NH(CO)O-(Cl-C6)アルキル; -(CH2)p-NHCO(CH2)p-NH(CO)O-Cl-C6アルキル; -NH(CO)O-tert-ブチル; - O-tert-ブチル; - tert-ブチル; - CONHアリール;
m = 1-5; n=1-8; p=1-9;
ここで、「置換された」は、ハロゲン、トリフルオロメチル、メチルカルボキシ、エチルカルボキシ、メトキシ、エトキシ、C1-C6アルコキシ、Cl-C6アルキル、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2あるいは-SO3Hから選ばれる独立した1以上で置換されることを意味する。
- 請求項35に記載の化合物であって、化合物は以下の化学式3である;
Rlは、H、任意に置換されたC1-C6アルキル;任意に置換されたC2-C6アルケニル;任意に置換されたC1-C6アルコキシ;任意に置換されたC6-C12アリール;N、SおよびOから、独立して、選ばれた1〜4環原子で任意に置換されたC1-C9ヘテロアリール;任意に置換されたC7-C15 アリールアルキル、例えば制限されないが、ベンジル若しくはアルファ-メチルベンジル; N、SおよびOから、独立して、選ばれた1〜4環原子で任意に置換されたC2-C15 ヘテロアリールアルキル;任意に置換されたC7-C15 アリールアルケニル;任意に置換されたC3-C8シクロアルキル;あるいは、任意に置換されたC4-C8シクロアルキルアルキルである;
R2は、H、C1-C6アルコキシ、例えば、制限されないが、メトキシ若しくはエトキシ、トリフルオロメチル、ハロゲン、メチルカルボキシ、エチルカルボキシ、任意に置換されたC1-C6アルキル、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2あるいは-SO3Hである;。
Z1は、結合、-NH-、-O-、-S-、-CH(CH3)-、-(CH2)n-、-C3-C7シクロアルキル-CH2、-CH=CH-、-CO-、-SO-、-SO2 -あるいは-C(=NH)-、-CH2NH(CO)-、-CH2NH(CO)O-、-CH2NH(CO)NH-;-(CH2)nNH(CO)-、-(CH2)n NH (CO)O-、-(CH2)mNH(CO)NH-; -C3-C7 シクロアルキル-CH2NH(CO)-、- C3-C7シクロアルキル-CH2NH(CO)O-、-C3-C7シクロアルキル-CH2NH(CO)NH-、-(CH2)nN(CH2CH2C6H5)-、あるいは任意に置換されたC6-C12アリールである;
R3は、H、任意に置換されたC1-C9アルキル、C2-C6アルケニル;任意に置換されたC6-C12アリール、N、SおよびOから、独立して、選ばれた1〜4環原子で任意に置換されたC1-C9ヘテロアリール;任意に置換されたC7-C15 アリールアルキル、例えば、制限されないが、ベンジルまたはアルファ-メチルベンジル;あるいは任意に置換されたC3-C7シクロアルキル; -(CH2)n-NH(CO)O-(Cl-C6アルキル); - CH2O(CH2)p-NH(CO)O-(C1-C6)アルキル; -(CH2)P-NHCO(CH2)m-NH(CO)O-Cl-C6アルキル; - NH(CO)O-tert-ブチル; - O-tert-ブチル;あるいは-tert-ブチル; CONHアリールである;
m = 1-5; n=1-8; p=1-9;
ここで、「置換された」は、ハロゲン、トリフルオロメチル、メチルカルボキシ、エチルカルボキシ、メトキシ、エトキシ、C1-C6アルコキシ、Cl-C6アルキル、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2あるいは-SO3Hから選ばれる独立した1以上で置換されることを意味する。 - 請求項35に記載の化合物であって、化合物は以下の化学式4である:
Rlは、任意に置換されたC1-C6アルキル;任意に置換されたC2-C6アルケニル;任意に置換されたC1-C6アルコキシ;任意に置換されたC6-C12アリール; N、SおよびOから、独立して、選ばれた1〜4環原子で任意に置換されたC1-C9ヘテロアリールアルキル;任意に置換されたC7-C15 アリールアルケニル;任意に置換されたC3-C8シクロアルキル;あるいは任意に置換されたC4-C8シクロアルキルアルキルである;
R2は、H、C1-C6アルコキシ、例えば、制限されないが、メトキシ若しくはエトキシ、トリフルオロメチル、ハロゲン、メチルカルボキシ、エチルカルボキシ、任意に置換されたC1-C6アルキル、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2あるいは-SO3Hである;
Glは、結合、-NH-、-O-、-S-、-CH(CH3)-、-(CH2)n-、-CH=CH-、-CO-、-SO-、-SO2-あるいは-C(=NH)-、-CH2NH(CO)-、-CH2NH(CO)O-、-CH2NH(CO)NH-; -(CH2)nNH(CO)-、-(CH2)nNH(CO)O-、-(CH2)mNH(CO)NH-;-C3-C7シクロアルキル-NH(CO)、-C3-C7シクロアルキル-CH2NH(CO)O-、-C3-C7シクロアルキル-NH(CO)NH-、-N(CH2CH2C6H5)-である;
R4は、H、任意にハロゲン、エチルカルボキシ、メチルカルボキシ、メトキシ、エトキシ、C1-C6アルコキシ、C1-C6アルキル、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2あるいは-SO3Hで置換されうる;
m = l-5; n=l-8;
ここで、「置換された」は、ハロゲン、トリフルオロメチル、メチルカルボキシ、エチルカルボキシ、メトキシ、エトキシ、C1-C6アルコキシ、Cl-C6アルキル、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2あるいは-SO3Hから選ばれる独立した1以上で置換されることを意味する。 - 請求項35に記載の化合物であって、化合物は化学式5である:
Rlは、H、任意に置換されたC1-C6アルキル;任意に置換されたC2-C6アルケニル;任意に置換されたC1-C6アルコキシ;任意に置換されたC6-C12アリール; N、SおよびOから、独立して、選ばれた1〜4環原子で任意に置換されたC1-C9ヘテロアリール;任意に置換されたC7-C15 アリールアルキル、例えば制限されないが、ベンジルまたはアルファ-メチルベンジル; N、SおよびOから、独立して、選ばれた1〜4環原子で任意に置換されたC2-C15 ヘテロアリールアルキル;任意に置換されたC7-C15 アリールアルケニル;任意に置換された非置換C3-C8シクロアルキル;あるいは、任意に、C4-C8シクロアルキルアルキルである;
R2は、水素、C1-C6アルコキシ、例えば制限されないが、メトキシ若しくはエトキシ、トリフルオロメチル、ハロゲン、メチルカルボキシ、エチルカルボキシ、任意に置換されたC1-C6アルキル、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2あるいは-SO3Hである;
Glは、結合、-NH-、-O-、-S-、-CH(CH3)-、-(CH2)n-、-CH=CH-、-CO-、-SO-、-SO2-あるいは-C(=NH)-、-CH2NH(CO)-、-CH2NH(CO)O-、-CH2NH(CO)NH-; -(CH2)nNH(CO)-、-(CH2)nNH (CO)O-、-(CH2)mNH(CO)NH-;-C3-C7 シクロアルキル-NH(CO)-、-C3-C7シクロアルキル-CH2NH(CO)O-、-C3-C7シクロアルキル-NH(CO)NH-、-N(CH2CH2C6H5)-、-C3-C7シクロアルキル-CH2-、例えば制限されないが、-シクロヘキシル-CH2-である;
Z2は、結合、-NH-、-O-、-S-、-CH(CH3)-、-(CH2)n-、-CH=CH-、-CO-、-SO-、-SO2-あるいは-C(=NH)-、-CH2NH(CO)-、-CH2NH(CO)O-、-CH2NH(CO)NH-; -(CH2)pNH(CO)-、-(CH2)pNH(CO)O-、-(CH2)pNH(CO)NH-;- C3-C7シクロアルキル-NH(CO)、-C3-C7シクロアルキル-CH2NH(CO)O-、-C3-C7シクロアルキル-NH(CO)NH-、-N(CH2CH2C6H5)-;あるいは、任意に置換されたC6-C12アリールである;
R5は、H、メチル、C1-C6アルキル、C1-C3アリールアルキルあるいは2-フェニルエチルである;
R4は、H、任意に置換されたC1-C9アルキル、例えば、制限されないが、tert-ブチル;任意に置換されたC2-C6アルケニル;任意に置換されたC6-C12アリール、例えば、制限されないが、フェニル若しくはナフチル; N、SおよびOから、独立して、選ばれた1〜4環原子で任意に置換されたC1-C9ヘテロアリール;任意に置換されたC7-C15アリールアルキル、例えば、制限されないが、ベンジルまたはアルファ-メチルベンジル;任意に置換されたC3-C7シクロアルキル; -(CH2)p-NH(CO)O-(C1-C6アルキル); -CH2O(CH2)p-NH(CO)O-(C1-C6)アルキル;-(CH2)p-NHCO(CH2)n-NH(CO)O-Cl-C6アルキル; -NH(CO)O-tert-ブチル;あるいは-O-tert-ブチル; -tert-ブチルである;
m = 1-5; n=1-8; p=1-9;
ここで、「置換された」は、ハロゲン、トリフルオロメチル、メチルカルボキシ、エチルカルボキシ、メトキシ、エトキシ、C1-C6アルコキシ、Cl-C6アルキル、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2あるいは-SO3Hから選ばれる独立した1以上で置換されることを意味する。 - 請求項35に記載の化合物であって、化合物は以下の化学式6である:
Rlは、H、任意に置換されたC1-C6アルキル;任意に置換されたC2-C6アルケニル;任意に置換されたC1-C6アルコキシ;任意に置換されたC6-C12アリール;N、SおよびOから、独立して、選ばれた1〜4環原子で任意に置換されたC1-C9ヘテロアリール;任意に置換されたC7-C15アリールアルキル、例えば、制限されないが、ベンジルまたはアルファ-メチルベンジル;N、SおよびOから、独立して、選ばれた1〜4環原子で任意に置換されたC2-C15 ヘテロアリールアルキル;任意に置換されたC7-C15アリールアルケニル;任意に置換されたC3-C8シクロアルキル;あるいは任意に置換されたC4-C8シクロアルキルアルキルである;
R2は、水素、C1-C6アルコキシ、例えば制限されないが、メトキシ若しくはエトキシ、トリフルオロメチル、ハロゲン、メチルカルボキシ、エチルカルボキシ、任意に置換されたC1-C6アルキル、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2あるいは-SO3Hである;
Glは、結合、-NH-、-O-、-S-、-CH(CH3)-、-(CH2)n-、-CH=CH-、-CO-、-SO-、-SO2-あるいは-C(=NH)-、-CH2NH(CO)-、-CH2NH(CO)O-、-CH2NH(CO)NH-;-(CH2)nNH(CO)-、-(CH2)nNH (CO)O-、-(CH2)mNH(CO)NH-;-C3-C7シクロアルキル-NH(CO)-、-C3-C7シクロアルキル-CH2NH(CO)O-、-C3-C7シクロアルキル-NH(CO)NH-、-N(CH2CH2C6H5)-、-C3-C7シクロアルキル-CH2-例えば、制限されないが、-シクロヘキシル-CH2-である;
Z2は、結合、-NH-、-O-、-S-、-CH(CH3)-、(CH2)n-;-CH=CH-、-CO-、-SO-、-SO2-あるいは-C(=NH)-、-CH2NH(CO)-、-CH2NH(CO)O-、-CH2NH(CO)NH-;-(CH2)pNH(CO)- 、-(CH2)pNH (CO)O-、-(CH2)pNH(CO)NH-;-C3-C7シクロアルキル-NH(CO)-、-C3-C7シクロアルキル-CH2NH(CO)O-、-C3-C7シクロアルキル-NH(CO)NH-、あるいは-N(CH2CH2C6H5)-;
R5は、H、メチル、C1-C6アルキル、C1-C3 アリールアルキルあるいは2-フェニルエチルである;
Xは、H、C1-C3アルキルあるいはC1-C3アリールアルキルである;
m = 1-5; n=1-8; p=1-9;
ここで、「置換された」は、ハロゲン、トリフルオロメチル、メチルカルボキシ、エチルカルボキシ、メトキシ、エトキシ、Cl-C6アルコキシ、Cl-C6アルキル、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2あるいは-SO3Hから選ばれる独立した1以上で置換されることを意味する。 - 請求項35に記載の化合物であって、化合物は下記化学式7である:
Rlは、H、任意に置換されたC1-C6アルキル;任意に置換されたC2-C6アルケニル;任意に置換されたC1-C6アルコキシ;任意に置換されたC6-C12アリール; N、SおよびOから、独立して、選ばれた1〜4環原子で任意に置換されたC1-C9ヘテロアリール;任意に置換されたC7-C15アリールアルキル、例えば、制限されないが、ベンジルまたはアルファ-メチルベンジル; N、SおよびOから、独立して、選ばれた1〜4環原子で任意に置換されたC2-C15 ヘテロアリールアルキル;任意に置換されたC7-C15アリールアルケニル;任意に置換されたC3-C8シクロアルキル;あるいは任意に置換されたC4-C8シクロアルキルアルキルである;
R2は、水素、C1-C6アルコキシ、例えば制限されないが、メトキシ若しくはエトキシ、トリフルオロメチル、ハロゲン、メチルカルボキシ、エチルカルボキシ、任意に置換されたC1-C6アルキル、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2あるいは-SO3H;である;
G2は、結合、-NH-、-O-、-S-、-CH(CH3)-、-(CH2)n-、-CH=CH-、-CO-、-SO-、-SO2-あるいは-C(=NH)-、-CH2NH(CO)-、-CH2NH(CO)O-、-CH2NH(CO)NH-; -(CH2)nNH(CO)-、-(CH2)nNH (CO)O-、-(CH2)mNH(CO)NH-;-C3-C7シクロアルキル-例えば、制限されないが、-シクロヘキシル-、若しくは -N(CH2CH2C6H5)-である;
Z2は、結合、-NH-、-O-、-S-、-CH(CH3)-、(CH2)n-、- CH=CH-、-CO-、-SO-、-SO2-あるいは-C(=NH)-、-CH2NH(CO)-、-CH2NH(CO)O-、-CH2NH(CO)NH-;-(CH2)pNH(CO)-、-(CH2)pNH (CO)O-、-(CH2)pNH(CO)NH-;-C3-C7シクロアルキル-NH(CO)-、-C3-C7シクロアルキル-CH2NH(CO)O-、-C3-C7シクロアルキル-NH(CO)NH-、あるいは-N(CH2CH2C6H5)-である;
R5は、H、メチル、C1-C6アルキル、C1-C3 アリールアルキルあるいは2-フェニルエチルである;
Xは、H、C1-C3アルキルあるいはC1-C3アリールアルキルである;
m = 1-5; n=1-8; p=1-9;
ここで、「置換された」は、ハロゲン、トリフルオロメチル、メチルカルボキシ、エチルカルボキシ、メトキシ、エトキシ、C1-C6アルコキシ、Cl-C6アルキル、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2あるいは-SO3Hから選ばれる独立した1以上で置換されることを意味する。 - 請求項35に記載の化合物であって、化合物は下記の化学式8である:
Rlは、H、任意に置換されたC1-C6アルキル;任意に置換されたC2-C6アルケニル;任意に置換されたC1-C6アルコキシ;任意に置換されたC6-C12アリール; N、SおよびOから、独立して、選ばれた1〜4環原子で任意に置換されたC1-C9ヘテロアリール;任意に置換されたC7-C15アリールアルキル、例えば、制限されないが、ベンジルまたはアルファ-メチルベンジル; N、SおよびOから、独立して、選ばれた1〜4環原子で任意に置換されたC2-C15 ヘテロアリールアルキル;任意に置換されたC7-C15アリールアルケニル;任意に置換されたC3-C8シクロアルキル;あるいは任意に置換されたC4-C8シクロアルキルアルキルである;
R2は、水素、C1-C6アルコキシ、例えば制限されないが、メトキシ若しくはエトキシ、トリフルオロメチル、ハロゲン、メチルカルボキシ、エチルカルボキシ、任意に置換されたC1-C6アルキル、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2あるいは-SO3Hである;
Z2は、結合、-NH-、-O-、-S-、-CH(CH3)-、-(CH2)n-、-CH=CH-、-CO-、-SO-、-SO2-あるいは-C(=NH)-、-CH2NH(CO)-、-CH2NH(CO)O-、-CH2NH(CO)NH-; -(CH2)nNH(CO)-、-(CH2)nNH (CO)O-、-(CH2)mNH(CO)NH-;-C3-C7シクロアルキル-NH(CO)-、-C3-C7シクロアルキル-CH2NH(CO)O-、-C3-C7シクロアルキル-NH(CO)NH-、-N(CH2CH2C6H5)-である;
R5は、H、メチル、C1-C6アルキル、C1-C3 アリールアルキルあるいは2-フェニルエチルである;
Xは、H、C1-C3アルキルあるいはC1-C3アリールアルキルである;
m = 1-5; n=1-8;
ここで、「置換された」は、ハロゲン、トリフルオロメチル、メチルカルボキシ、エチルカルボキシ、メトキシ、エトキシ、C1-C6アルコキシ、Cl-C6アルキル、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2あるいは-SO3Hから選ばれる独立した1以上で置換されることを意味する。 - 請求項35に記載の化合物であって、化合物は下記化学式9である:
Rlは、H、任意に置換されたC1-C6アルキル;任意に置換されたC2-C6アルケニル;任意に置換されたC1-C6アルコキシ;任意に置換されたC6-C12アリール; N、SおよびOから、独立して、選ばれた1〜4環原子で任意に置換されたC1-C9ヘテロアリール;任意に置換されたC7-C15アリールアルキル、例えば、制限されないが、ベンジルまたはアルファ-メチルベンジル; N、SおよびOから、独立して、選ばれた1〜4環原子で任意に置換されたC2-C15 ヘテロアリールアルキル;任意に置換されたC7-C15アリールアルケニル;任意に置換されたC3-C8シクロアルキル;あるいは任意に置換されたC4-C8シクロアルキルアルキルである;
R2は、水素、C1-C6アルコキシ、例えば制限されないが、メトキシ若しくはエトキシ、トリフルオロメチル、ハロゲン、メチルカルボキシ、エチルカルボキシ、任意に置換されたC1-C6アルキル、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2あるいは-SO3Hである;
R5は、H、メチル、C1-C6アルキル、C1-C3 アリールアルキルあるいは2-フェニルエチルである;
XはH、C1-C3アルキルあるいはC1-C3 アリールアルキルである;
Z2は、結合、-NH-、-O-、-S-、-CH(CH3)-、-(CH2)n-;-CH=CH-、-CO-、-SO-、-SO2-、-C(=NH)-、-CH2NH(CO)-、-CH2NH(CO)O-、-CH2NH(CO)NH-; -(CH2)nNH(CO)-、-(CH2)nNH (CO)O-、-(CH2)mNH(CO)NH-;-C3-C7シクロアルキル-NH(CO)-、-C3-C7シクロアルキル-CH2NH(CO)O-、-C3-C7シクロアルキル-NH(CO)NH-、若しくは-N(CH2CH2C6H5)-である;
m = l-5; n=l-8;
ここで、「置換された」は、ハロゲン、トリフルオロメチル、メチルカルボキシ、エチルカルボキシ、メトキシ、エトキシ、C1-C6アルコキシ、Cl-C6アルキル、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2あるいは-SO3Hから選ばれる独立した1以上で置換されることを意味する。 - 請求項35に記載の化合物であって、化合物は下記化学式10である:
Rlは、H、任意に置換されたC1-C6アルキル;任意に置換されたC2-C6アルケニル;任意に置換されたC1-C6アルコキシ;任意に置換されたC6-C12アリール; N、SおよびOから、独立して、選ばれた1〜4環原子で任意に置換されたC1-C9ヘテロアリール;任意に置換されたC7-C15アリールアルキル、例えば、制限されないが、ベンジルまたはアルファ-メチルベンジル; N、SおよびOから、独立して、選ばれた1〜4環原子で任意に置換されたC2-C15 ヘテロアリールアルキル;任意に置換されたC7-C15アリールアルケニル;任意に置換されたC3-C8シクロアルキル;あるいは任意に置換されたC4-C8シクロアルキルアルキルである;
R2は、水素、C1-C6アルコキシ、例えば制限されないが、メトキシ若しくはエトキシ、トリフルオロメチル、ハロゲン、メチルカルボキシ、エチルカルボキシ、任意に置換されたC1-C6アルキル、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2あるいは-SO3Hである;
Z3は、結合、-NH-、-O-、-S-、-CH(CH3)-、-(CH2)n-;-CH=CH-、-CO-、-SO-、-SO2-あるいは-C(=NH)-、-CH2NH(CO)-、-CH2NH(CO)O-、-CH2NH(CO)NH-; -(CH2)nNH(CO)-、-(CH2)nNH (CO)O-、-(CH2)mNH(CO)NH-;-C3-C7シクロアルキル-NH(CO)-、-C3-C7シクロアルキル-CH2NH(CO)O-、-C3-C7シクロアルキル-NH(CO)NH-、-N(CH2CH2C6H5)-である;
R7は、H、メチル、C1-C6アルキル、C1-C3 アリールアルキルあるいは2-フェニルエチルである;
m = l-5; n=l-8;
ここで、「置換された」は、ハロゲン、トリフルオロメチル、メチルカルボキシ、エチルカルボキシ、メトキシ、エトキシ、C1-C6アルコキシ、Cl-C6アルキル、-OH、-SH、-NH2、-N3、-CN、-NO2、-CHO、-COOH、-CONH2、-C(=NH)NH2あるいは-SO3Hから選ばれる独立した1以上で置換されることを意味する。 - 図18-27に記述する化合物若しくは化学式1〜10の化合物を、対象患者に投与することを含む、対象患者の癌を治療する方法。
- 請求項45に記載の方法であって、化合物が、図18-27に記述する化合物のいずれかである、方法。
- 請求項45に記載の方法であって、癌はMUC1陽性若しくはMUC1*陽性癌である、方法。
- 請求項45に記載の方法であって、癌はNME7AB若しくはNME7-X1陽性癌である、方法。
- 次のステップを含む癌を予防若しくは治療する方法:
(i)患者からの癌のサンプルを分析し、そして、それがMUC1*陽性、NME7AB陽性、あるいはNME7-X1陽性であることを決定する;そして、
(ii)患者に化学式1〜10の化合物の有効量を投与すること。 - 請求項49に記載の方法であって、分析するステップはPCRによって行なわれる、方法。
- 請求項49に記載の方法であって、そこでは癌サンプルが、EEF1A1遺伝子のmRNA発現レベルの少なくとも0.5%である、MUC1遺伝子、NME7遺伝子あるいはNME7-X1遺伝子のmRNAのレベルを発現する場合、それはMUC1*陽性、NME7AB陽性、あるいはNME7-X1陽性であると決定される、方法。
- 請求項49に記載の方法であって、分析するステップは免疫組織化学によって行なわれる、方法。
- 請求項52に記載の方法であって、癌サンプルが、PSMGFRペプチドあるいはN-10ペプチドに結合する抗体と接触され、病理学的標準スコア1-4("+〜++++")で組織を染色される場合、それはMUC1*陽性と決定される、方法。
- 請求項52に記載の方法であって、癌サンプルが、NME7のB3ペプチド結合する抗体と接触され、病理学的標準スコア1-4("+〜++++")で組織を染色される場合、それはNME7AB陽性あるいはNME7-X1陽性と決定される、方法。
- 以下のステップを含む、炎症性疾患若しくは状態の予防若しくは治療のための作用薬を同定する方法であって、
(i) 作用薬に幹細胞を暴露し、そして
(ii) 幹細胞多分化能あるいは増殖を阻害する、又は幹細胞分化を誘導する作用薬が同定され、該作用薬若しくはそのアナログは炎症性疾患若しくは状態を治療するための作用薬であると決定される。 - 請求項55に記載の方法であって、炎症性疾患若しくは状態は、慢性関節リウマチ、炎症性の腸症候群、クローン病、変形性関節症、喘息、皮膚炎、乾癬、嚢胞性繊維症、移植後遅及び慢性の実質臓器拒絶反応、多発性硬化症、全身性紅斑性狼瘡、シェーグレン症候群、橋本甲状腺炎、多発性筋炎、強皮症、アジソン病、白斑、悪性貧血、糸球体腎炎、肺線維症、自己免疫性糖尿病、糖尿病性網膜症、鼻炎、乏血再潅流傷害、ポスト血管形成術再狭窄、慢性閉塞性肺疾患(COPD)、グレーブス病、消化管アレルギー、結膜炎、アテローム性動脈硬化、冠動脈疾患、狭心症、癌転移、小動脈疾病あるいはミトコンドリア疾患である、方法。
- 炎症性疾患若しくは状態を治療する方法であって、その必要とする人に、幹細胞と接触した時に、幹多分化能若しくは成長を阻害する、又は幹細胞分化を誘導する、作用薬を投与することを含む、方法。
- 請求項57に記載の方法であって、炎症性疾患若しくは状態は、慢性関節リウマチ、炎症性の腸症候群、クローン病、変形性関節症、喘息、皮膚炎、乾癬、嚢胞性繊維症、移植後遅及び慢性の実質臓器拒絶反応、多発性硬化症、全身性紅斑性狼瘡、シェーグレン症候群、橋本甲状腺炎、多発性筋炎、強皮症、アジソン病、白斑、悪性貧血、糸球体腎炎、肺線維症、自己免疫性糖尿病、糖尿病性網膜症、鼻炎、乏血再潅流傷害、ポスト血管形成術再狭窄、慢性閉塞性肺疾患(COPD)、グレーブス病、消化管アレルギー、結膜炎、アテローム性動脈硬化、冠動脈疾患、狭心症、癌転移、小動脈疾病あるいはミトコンドリア疾患である、方法。
- 請求項57に記載の方法であって、作用薬は、図18-27に記述する化合物若しくは化学式1〜10の化合物である、方法。
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