JP2021071932A - 装置、方法およびプログラム - Google Patents
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Abstract
Description
非特許文献1 亀倉晃一ほか、「バイオ医薬品製造プラント」、IHI技報、第49巻、第2号、2009年、p.67〜p.73
非特許文献2 塩屋捨明、「培養操作の最適化とその実現」、計測と制御、第34巻、第1号、1995年、p.11〜p.17
非特許文献3 大政健史、「バイオ医薬品生産におけるプロダクションサイエンス」、生物工学、 第91巻、 第9号、2013年、p.507〜p.510
非特許文献4 松崎淳一、「バイオ医薬品産業の現状と課題」、生物工学、第91巻、第9号、2013年、p.495〜p.498
図1は、本実施形態に係るシステム1を示す。システム1は、バイオリアクタ2と装置3とを備える。
バイオリアクタ2は、製造対象物を製造する製造システムの一例である。バイオリアクタ2は、特定の機能(一例として特定のタンパク質を生成する機能)を有する細胞を培養し、製造対象物として製造してよい。バイオリアクタ2は、外部から入力される動作内容に応じて動作して、当該バイオリアクタ2の状態、ひいては細胞の状態を変化させる。
装置3は、バイオリアクタ2における細胞培養を支援する。装置3は、第1記憶部300と、設定部302と、パラメータ取得部304と、算出部306と、環境情報取得部308と、パラメータ入力部310と、1または複数の制御モデル312と、学習処理部314と、動作内容取得部316と、制御部318と、出力部320と、第2記憶部322と、予測部324と、第3記憶部326と、検出部328とを有する。
第1記憶部300は、動作内容の変動パターンを複数記憶する。記憶される変動パターンは、一例として既知の変動パターンであってよい。
設定部302は、バイオリアクタ2に対して動作内容を設定する。設定部302は、基準時間ごとに動作内容を設定してよい。設定部302は、動作内容取得部316から供給される動作内容をバイオリアクタ2に設定してよい。一の基準時間について複数の動作内容が動作内容取得部316から供給される場合には、詳細は後述するものの、設定部302は第1記憶部300内の変動パターンに基づいて一の動作内容を選択してバイオリアクタ2に設定してよい。設定部302は、設定した動作内容を学習処理部314、第2記憶部322および第3記憶部326に供給してよい。
パラメータ取得部304は、第1取得部および第2取得部の一例であり、バイオリアクタ2および細胞の少なくとも一方の状態を示す状態パラメータセットを取得する。状態パラメータセットは、取得された時点(一例として現時点)での状態を示してよい。状態パラメータセットは、設定部302による動作内容の設定後の時点で取得されている場合には事後状態パラメータセットと称されてもよいし、設定部302による動作内容の設定前の時点で取得されている場合には事前状態パラメータセットと称されてもよい。状態パラメータセットには、バイオリアクタ2および細胞の少なくとも一方の状態を示す状態パラメータが少なくとも1つ含まれてよい。
算出部306は、パラメータセット(一例として事後状態パラメータセット)に含まれる少なくとも1つの状態パラメータ(一例として事後状態パラメータ)から報酬値を算出する。算出部306は、算出した報酬値を学習処理部314に供給してよい。
環境情報取得部308は、バイオリアクタ2の外部環境を示す環境情報を取得する。外部環境は、バイオリアクタ2の設置環境の気温および湿度の少なくとも1つであってよい。これに代えて、またはこれに加えて、外部環境はバイオリアクタ2に供給される原材料の特性を含んでよい。環境情報取得部308は、バイオリアクタ2の設置位置に設けられたセンサ(図示せず)から環境情報を取得してもよいし、オペレータから環境情報を取得してもよいし、これらを組み合わせて環境情報を取得してもよい。環境情報取得部308は、取得した環境情報をパラメータ入力部310および学習処理部314に供給してよい。
パラメータ入力部310は、制御モデル312および予測部324に対し、パラメータ取得部304により取得された状態パラメータセット(一例として事後状態パラメータセット)を入力する。パラメータ入力部310は、環境情報取得部308から取得した環境情報を併せて制御モデル312および予測部324に入力してよい。
制御モデル312は、バイオリアクタ2を制御するためのモデルであり、状態パラメータセットの入力に応じ、報酬値を高める動作内容を出力する。パラメータ入力部310から状態パラメータセットに加えて環境情報も入力される場合には、制御モデル312は、入力された状態パラメータセットおよび環境情報に応じた動作内容を出力してよい。出力する動作内容は、状態パラメータセットで示される状態において設定されるべき動作内容であってよい。制御モデル312は、動作内容を動作内容取得部316に供給してよい。
学習処理部314は、入力される学習データを用いて制御モデル312の学習処理を実行する。学習データは、設定部302から供給される動作内容のデータと、パラメータ取得部304から供給される事後状態パラメータセットのデータとを含んでよい。学習データは、パラメータ取得部304から供給される事前状態パラメータセットのデータをさらに含んでもよいし、事前状態パラメータセットと事後状態パラメータセットとの差分データをさらに含んでもよい。
動作内容取得部316は、第3取得部の一例であり、状態パラメータセットを制御モデル312に入力したことに応じて制御モデル312が出力する一または複数の動作内容を取得する。動作内容取得部316は、取得した一または複数の動作内容を設定部302に供給してよい。
制御部318は、少なくとも設定部302、パラメータ取得部304、パラメータ入力部310、および、動作内容取得部316を制御する。例えば、制御部318は、パラメータ取得部304による状態パラメータセットの取得と、動作内容取得部316による動作内容の取得と、設定部302による動作内容の設定とを順に繰り返し実行させて、バイオリアクタ2に細胞を培養させてよい。なお、図示の簡略化のため、図中では制御部318から出力される制御信号の経路を省略している。制御部318は、装置3内の他の構成をさらに制御してもよい。
出力部320は、一の状態パラメータセットと、当該一の状態パラメータセットに対して一意に定まった好適な動作内容とを対応付けて出力する。学習処理部314から一の環境情報と、一の状態パラメータセットと、一の動作内容とが対応付けて供給された場合には、出力部320は、これらを対応付けて出力してよい。出力部320は、動作内容を装置3の外部に出力してよい。
第2記憶部322は、報酬値が目標条件を満たす場合の学習履歴を記憶する。第2記憶部322は、一の状態パラメータセットが制御モデル312に入力されたことに応じて出力された一の動作内容がバイオリアクタ2に設定されて一の事後状態パラメータセットが取得され、当該一の事後状態パラメータセットに基づいて算出される報酬値が目標条件を満たす場合に、当該一の動作内容と、当該一の状態パラメータセットと、当該一の事後状態パラメータセットとを対応付けて蓄積記憶してよい。第2記憶部322は、パラメータ取得部304や環境情報取得部308からの入力に応じて、培養する細胞の種類や外部環境ごとに学習履歴を記憶してもよいし、細胞の種類や外部環境とは無関係に学習履歴を記憶してもよい。
予測部324は、パラメータ取得部304により取得された状態パラメータセットで示される状態から、報酬値が目標条件を満たす動作内容を逐次設定する場合での、少なくとも1つの事後状態パラメータに応じた値の推移を予測する。
第3記憶部326は、学習データを蓄積記憶する。第3記憶部326は、バイオリアクタ2に設定された動作内容と、当該動作内容の設定後の状態を示す事後状態パラメータセットと、を対応付けた組を蓄積記憶してよい。第3記憶部326は、パラメータ入力部310や環境情報取得部308からの入力に応じて、培養する細胞の種類ごとや、外部環境ごとに学習データを記憶してもよいし、細胞の種類や外部環境とは無関係に学習データを記憶してもよい。
検出部328は、第3記憶部326内の複数の事後状態パラメータセットのうち、特定の2以上の事後状態パラメータセットに対応する動作内容の間での共通内容を検出する。検出部328は、基準条件を満たさない2以上の事後状態パラメータセットに対応する動作内容の間での共通内容を検出してよい。これに代えて、または、これに加えて、検出部328は、基準条件を満たす2以上の事後状態パラメータセットに対応する動作内容の間での共通内容を検出してよい。細胞の種類や外部環境ごとに学習データが第3記憶部326に記憶される場合には、検出部328は、パラメータ入力部310または環境情報取得部308から入力される細胞の種類や環境情報に応じて、第3記憶部326の記憶内容のうち、該当する細胞の種類および外部環境に対応する記憶内容から検出を行ってよい。検出部328は、細胞の種類とは無関係に検出を行ってもよい。この場合には、別々の細胞の培養で学習に用いられた動作内容の間での共通内容が検出され得る。検出部328は、検出結果を装置3の外部に出力してよい。
以上の装置3によれば、バイオリアクタ2の動作内容と、動作内容の設定後での事後状態パラメータセットとを含む学習データを用いて、状態パラメータセットの入力に応じ報酬値を高める動作内容を出力する制御モデル312の学習処理が実行されるので、状態パラメータセットを入力することで、報酬値が高まる動作内容を得ることができる。従って、熟練したオペレータによる試行錯誤を必要とせずに、好適な動作内容を確実に得ることができる。
図2は、学習の初期段階での制御モデル312の入出力を示す。
図4は、第2記憶部322の記憶内容を示す。第2記憶部322は、事前状態パラメータセットと、当該事前状態パラメータセットで示される状態で設定されることで報酬値が目標条件を満たす動作内容と、当該動作内容の設定後の事後状態パラメータセットとを対応付けた組を複数記憶してよい。これにより、予測部324において事後状態パラメータセットの推移(本図では一例として、事後状態パラメータセット(IA2,IB2)→(IA4,IB4)→(IAN,IBN))、ひいては何れかの事後状態パラメータに応じた値の推移の予測が可能となる。
図5は、制御部318による制御内容を示す。制御部318は、パラメータ取得部304による状態パラメータセットの取得と、動作内容取得部316による動作内容の取得と、設定部302による動作内容の設定とを順に繰り返し実行させて、バイオリアクタ2に細胞を培養させてよい。制御部318は、一の状態パラメータセットの入力に対して制御モデル312から複数の動作内容が出力される場合に、当該一の状態パラメータセットで示される状態のバイオリアクタ2に対し、これら複数の動作内容をそれぞれ設定部302によって設定させて、好適な動作内容の探索を行ってよい。制御部318は、外部環境ごとに好適な動作内容の探索を行ってよい。
[5.1.学習時の動作]
図6は、装置3の動作を示す。装置3は、ステップS11〜S23の処理を行うことにより、バイオリアクタ2で細胞を培養しつつ制御モデル312を学習させる。なお、この動作は、培養する細胞ごとに行われてよい。
図7は、装置3の他の動作を示す。装置3は、ステップS31〜S37の処理を行うことにより、学習の完了した制御モデル312を用いてバイオリアクタ2で細胞を培養する。
なお、上記の実施形態においては、装置3は第1記憶部300と、設定部302と、パラメータ取得部304と、算出部306と、環境情報取得部308と、パラメータ入力部310と、1または複数の制御モデル312と、学習処理部314と、動作内容取得部316と、制御部318と、出力部320と、第2記憶部322と、予測部324と、第3記憶部326と、検出部328とを有することとして説明した。しかしながら、装置3は、設定部302、パラメータ取得部304および学習処理部314以外の少なくとも1つの構成を有しないこととしてもよいし、パラメータ取得部304、パラメータ入力部310および動作内容取得部316以外の構成を有しないこととしてもよい。また、装置3は、制御モデル312を有することとして説明したが、制御モデル312は装置3の外部装置に具備されてもよい。
Claims (20)
- 製造対象物を製造する製造システムに対して動作内容を設定する設定部と、
前記動作内容の設定後での前記製造システムおよび前記製造対象物の少なくとも一方の状態を示す事後状態パラメータセットを取得する第1取得部と、
前記動作内容と、前記事後状態パラメータセットとを含む学習データを用いて、前記製造システムおよび前記製造対象物の少なくとも一方の状態を示す状態パラメータセットの入力に応じ、予め設定された報酬関数により定まる報酬値を高める前記動作内容を出力する前記製造システムの制御モデルの学習処理を実行する学習処理部と、
を備える装置。 - 前記学習処理部は、
一の前記状態パラメータセットが前記制御モデルに入力されたことに応じて出力される一の前記動作内容の設定結果に応じた前記報酬値の増加幅が基準幅未満であった場合に、当該一の状態パラメータセットの入力に応じて当該一の動作内容を出力しないよう前記制御モデルの学習処理を実行する、請求項1に記載の装置。 - 前記動作内容は、前記製造システムに対して能動的に設定可能な複数種類の能動変数を有し、
前記学習処理部は、
一の前記状態パラメータセットが前記制御モデルに入力されたことに応じて、前記複数種類の能動変数のうち一の能動変数の値のみが相違する第1の動作内容および第2の動作内容が出力され、前記一の状態パラメータセットで示される状態で前記第1の動作内容および前記第2の動作内容それぞれを別々に設定した結果に応じた報酬値同士の差分が基準幅未満である場合に、前記一の状態パラメータセットの入力に応じて前記複数種類の能動変数のうち前記一の能動変数を含まない前記動作内容を出力するよう前記制御モデルの学習処理を実行する、請求項1または2に記載の装置。 - 前記動作内容の変動パターンを複数記憶する第1記憶部をさらに備え、
前記設定部は、
一の前記状態パラメータセットが前記制御モデルに入力されたことに応じて複数の動作内容が取得された場合に、前記第1記憶部内の各変動パターンと、当該設定部によって設定される前記動作内容の変動パターンとが一致しないように、前記複数の動作内容のいずれか1つを設定する、請求項1から3のいずれか一項に記載の装置。 - 前記動作内容の変動パターンを複数記憶する第1記憶部をさらに備え、
前記報酬値は、前記設定部によって設定される場合に前記第1記憶部内の何れかの前記変動パターンと一致する変動パターンをなす前記動作内容に対して、より低く算出される、請求項1から3のいずれか一項に記載の装置。 - 前記製造システムの外部環境を示す環境情報を取得する環境情報取得部をさらに備え、
前記学習処理部は、外部環境ごとに前記制御モデルの学習処理を実行する、請求項1から5のいずれか一項に記載の装置。 - 前記学習処理部は、一の外部環境に対して学習処理が実行された前記制御モデルを用いて転移学習を行い、他の外部環境に対する学習処理を実行する、請求項6に記載の装置。
- 前記状態パラメータセットを取得する第2取得部と、
前記制御モデルに対し、前記第2取得部により取得された前記状態パラメータセットを入力するパラメータ入力部と、
前記状態パラメータセットを前記制御モデルに入力したことに応じて前記制御モデルが出力する前記動作内容を取得する第3取得部と、
をさらに備え、
前記設定部は、前記第3取得部により取得された前記動作内容を前記製造システムに対して設定する、請求項1から7のいずれか一項に記載の装置。 - 前記事後状態パラメータセットに含まれる少なくとも1つの事後状態パラメータから前記報酬値を算出する算出部をさらに備え、
前記学習処理部は、前記算出部によって算出された前記報酬値をさらに用いて学習処理を実行する、請求項8に記載の装置。 - 前記学習処理部は、一の前記状態パラメータセットを前記制御モデルに入力したことに応じて出力された一の前記動作内容が前記製造システムに設定された結果、前記算出部により算出される前記報酬値が目標条件を満たす場合に、当該一の状態パラメータセットの入力に応じて当該一の動作内容が出力されるよう前記制御モデルの学習処理を実行し、
当該装置は、これら一の動作内容および一の状態パラメータセットを対応付けて出力する出力部をさらに備える、請求項9に記載の装置。 - 前記第2取得部による前記状態パラメータセットの取得と、前記第3取得部による前記動作内容の取得と、前記設定部による前記動作内容の設定とを順に繰り返し実行させて前記製造対象物を製造させる制御部をさらに備える、請求項8〜10のいずれか一項に記載の装置。
- 一の前記状態パラメータセットが前記制御モデルに入力されたことに応じて出力された一の前記動作内容が前記製造システムに設定されて一の前記事後状態パラメータセットが取得され、当該一の事後状態パラメータセットに基づいて算出される前記報酬値が目標条件を満たす場合に、当該一の動作内容と、前記一の状態パラメータセットと、前記一の事後状態パラメータセットとを対応付けて蓄積記憶する第2記憶部と、
前記第2取得部により取得された前記状態パラメータセットで示される状態から、前記報酬値が前記目標条件を満たす前記動作内容を逐次設定する場合での、各事後状態パラメータセットに含まれる少なくとも1つの事後状態パラメータに応じた値の推移を、前記第2記憶部の記憶内容に基づいて予測する予測部と、
をさらに備える、請求項9から11のいずれか一項に記載の装置。 - 前記事後状態パラメータセットには、前記製造システムおよび前記製造対象物中の少なくとも一方に存在する異物の量が含まれ、
前記予測部は、前記異物の量が上限値を超えると予測される場合に、その旨を報知する、請求項12に記載の装置。 - 前記学習データを蓄積記憶する第3記憶部と、
前記第3記憶部内の複数の前記事後状態パラメータセットのうち、基準条件を満たさない2以上の前記事後状態パラメータセットに対応する前記動作内容の間での共通内容、および、基準条件を満たす2以上の前記事後状態パラメータセットに対応する前記動作内容の間での共通内容の少なくとも一方を検出する検出部と、
をさらに備える、請求項1から13のいずれか一項に記載の装置。 - 製造システムおよび前記製造システムによる製造対象物の少なくとも一方の状態を示す状態パラメータセットを取得する第2取得部と、
前記状態パラメータセットの入力に応じ、予め設定された報酬関数により定まる報酬値を高める動作内容を出力する前記製造システムの制御モデルに対し、前記第2取得部により取得された前記状態パラメータセットを入力するパラメータ入力部と、
前記状態パラメータセットを前記制御モデルに入力したことに応じて前記制御モデルが出力する前記動作内容を取得する第3取得部と、
を備える装置。 - 前記製造システムは、細胞を培養するシステムである、請求項1から15のいずれか一項に記載の装置。
- 製造対象物を製造する製造システムに対して動作内容を設定する設定段階と、
前記動作内容の設定後での前記製造システムおよび前記製造対象物の少なくとも一方の状態を示す事後状態パラメータセットを取得する第1取得段階と、
前記動作内容と、前記事後状態パラメータセットとを含む学習データを用いて、前記製造システムおよび前記製造対象物の少なくとも一方の状態を示す状態パラメータセットの入力に応じ、予め設定された報酬関数により定まる報酬値を高める前記動作内容を出力する前記製造システムの制御モデルの学習処理を実行する学習処理段階と、
を備える方法。 - 製造システムおよび前記製造システムによる製造対象物の少なくとも一方の状態を示す状態パラメータセットを取得する第2取得段階と、
前記状態パラメータセットの入力に応じ、予め設定された報酬関数により定まる報酬値を高める動作内容を出力する前記製造システムの制御モデルに対し、前記第2取得段階により取得された前記状態パラメータセットを入力するパラメータ入力段階と、
前記状態パラメータセットを前記制御モデルに入力したことに応じて前記制御モデルが出力する前記動作内容を取得する第3取得段階と、
を備える方法。 - コンピュータを、
製造対象物を製造する製造システムに対して動作内容を設定する設定部と、
前記動作内容の設定後での前記製造システムおよび前記製造対象物の少なくとも一方の状態を示す事後状態パラメータセットを取得する第1取得部と、
前記動作内容と、前記事後状態パラメータセットとを含む学習データを用いて、前記製造システムおよび前記製造対象物の少なくとも一方の状態を示す状態パラメータセットの入力に応じ、予め設定された報酬関数により定まる報酬値を高める前記動作内容を出力する前記製造システムの制御モデルの学習処理を実行する学習処理部
として機能させるプログラム。 - コンピュータを、
製造システムおよび前記製造システムによる製造対象物の少なくとも一方の状態を示す状態パラメータセットを取得する第2取得部と、
前記状態パラメータセットの入力に応じ、予め設定された報酬関数により定まる報酬値を高める動作内容を出力する前記製造システムの制御モデルに対し、前記第2取得部により取得された前記状態パラメータセットを入力するパラメータ入力部と、
前記状態パラメータセットを前記制御モデルに入力したことに応じて前記制御モデルが出力する前記動作内容を取得する第3取得部
として機能させるプログラム。
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