JP2019526272A - 治療用組換えクロトータンパク質ならびにそれを含む組成物および方法 - Google Patents

治療用組換えクロトータンパク質ならびにそれを含む組成物および方法 Download PDF

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Abstract

組換えクロトータンパク質および多様体、それをコードする核酸、それを発現する細胞株および懸濁培養物、ならびにその製造および投与方法が開示される。タンパク質は、グリコシル化および融合タンパク質タグのような溶解度または半減期延長の特色を含む。タンパク質は、ヒトアルファクロトーアイソフォーム１の一部分と少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有する。治療手順は、被験体における血清可溶性クロトーレベルを測定することと、被験体における血清可溶性クロトーレベルを所定のレベルまで上昇させるのに十分なタンパク質の投薬量を計算することと、ボーラス投与または段階的注入などによって被験体にタンパク質の投薬量を投与することと、第１投薬量の投与に続いて被験体の血清におけるクロトータンパク質の低下速度を測定することと、クロトータンパク質の次の投薬時間および投薬量を計算することと、およびクロトータンパク質の次の投薬量を被験体に投与することと、を含む。

Description

本開示は、治療薬としての組換えヒトクロトー（Ｋｌｏｔｈｏ）タンパク質組成物の産生および投与に関する。具体的には、本開示は、ＣＧＭＰグレードのヒト組換え可溶性アルファ−クロトータンパク質またはその多様体を含む組成物、ならびにその製造方法およびヒトまたは非ヒト被験体への投与方法に関する。
クロトー（またはアルファ−クロトー、α−クロトーなど）は、ヒト染色体１３に位置するＫＬ（またはクロトー）遺伝子によってコードされる近年特徴付けられたタンパク質である。選択的ＲＮＡスプライシングを通して、単一のクロトー遺伝子から生じる２つの転写物が同定されている。図１および２を参照されたい。第１の転写産物は、短い細胞質尾部（ヒト残基１００３〜１０１２）と、貫膜（ＴＭ）ドメイン（ヒト残基９８２〜１００２）と、各々β−グルコシダーゼと２０％〜４０％のアミノ酸配列相同性を有するが、グルコシダーゼ触媒活性を欠く）２つの相同な（内部反復）ドメイン（ＫＬ１（４５０残基長であるヒト残基５６〜５０６）、およびＫＬ２（４３８残基長であるヒト残基５１５〜９５３と称されるもの）、およびシグナル配列（ＳＳ）ドメイン（ヒト残基１〜３３）を含む細胞外領域またはドメイン（ヒト残基１〜９８１）と、を含む全長１，０１２個のアミノ酸の１回膜貫通膜タンパク質であるクロトーアイソフォーム１をコードすると予測される。ＳＳ、ＫＬ１およびＫＬ２ドメイン含有細胞外領域（ヒト残基１〜９８１）は、α／β−セクレターゼによって酵素的に切断され、可溶性クロトー（またはｓクロトー、ｓ−クロトー、アルファ可溶性クロトーなど）と称される１３０ｋＤａの循環タンパク質として循環流に放出され得る。細胞外領域はまた、別個の６８ｋＤａタンパク質（ＫＬ１＋ＳＳ）および６４ｋＤａタンパク質（ＫＬ２）に切断され得る。
アルファ−クロトーｍＲＮＡのスプライシング多様体である第２の転写物は、主にＫＬ１ドメインに対応するクロトータンパク質の第２のアイソフォームをコードする。内部スプライスドナー部位は、クロトー遺伝子のエクソン３に位置すると考えられている。得られる選択的にスプライシングされた転写物は、エクソン３の後に、その終わりにインフレーム翻訳終止コドンを有する、５０ｂｐの挿入を含有する（図１；灰色）。発現されたタンパク質生成物は、循環中に分泌され、分泌型クロトー（またはクロトーアイソフォーム２）と称される。したがって、遺伝子発現、ＲＮＡスプライシング、および酵素的切断に依存して、任意の所与の時間で、循環中に多くの異なるクロトータンパク質が存在し得る。アルファ−クロトータンパク質の様々な形態の存在にもかかわらず、全長の膜結合アイソフォーム１のみが線維芽細胞増殖因子（ＦＧＦ）受容体と複合体を形成し、尿中へのリン酸排泄を誘導し、ＰｉおよびビタミンＤ代謝に調節的役割を有する、骨由来ホルモンである、ＦＧＦ２３の必須共受容体として機能することが知られている。
クロトーは、腎臓、脳で高く発現し、他の器官では程度が低く、哺乳動物の脳脊髄液や尿中にも見出され得る。哺乳動物における可溶性クロトータンパク質の循環レベルは、年齢と共に減少すると考えられている。加えて、クロトー欠損マウスは、加速した加齢表現型を示すことに対し、マウスにおけるクロトーの過剰発現は寿命を延長することを呈する。加えて、クロトーは、加齢に関係する多くの細胞プロセスに関与している。前述の見地から、可溶性クロトーは、人体において抗加齢化合物として機能し得るという仮説が立てられている。
加齢は不可避であり、進行性の生物学的プロセスであり、ほとんど全ての組織および器官の機能障害および破滅をもたらし、最終的には死に至る。例えば、人体の加齢は、種々の疾患の発症につながり得る細胞機能の低下と関連している。加齢は、遺伝的因子と後天的因子との間の厳密に制御された複雑な相互作用によって引き起こされると考えられ、老化の増大、幹細胞の量的および質的減少、ならびに組織レベルでの異常な構造が典型的な特徴である。
いわゆる「ベビーブーマー」の世代が年齢を重ねるにつれて、高齢者（例えば６０〜６５歳）の人口は急速に世界的に増加している。この高齢人口に対する医療需要の増加は、あらゆる医療制度の顕著な経済的負担となっている。組換えクロトータンパク質は、年齢に関係する健康状態に対抗する有望な治療薬を提供し得る。可溶性クロトーの産生および（例えば、実質的に均質なものへの）精製に基づく方策および保険介入方法の構築、ならびに増加する高齢人口内の被験体へのこのタンパク質の投与は、この状況およびそれに関連する問題を改善するのに役立ち得る。
現在、組換え可溶性ヒトアルファ−クロトータンパク質またはタンパク質多様体などの、ヒトクロトータンパク質の外因性形態、特に米国食品医薬品局（ＦＤＡ）によって決定および施行されるように、医薬品適正製造基準（Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｇｏｏｄ Ｍａｎｕｆａｃｔｕｒｉｎｇ Ｐｒａｃｔｉｃｅ）（ＣＧＭＰ）規則に準拠するタンパク質を提供するための生成物または方法は、単独でも、または１つ以上の追加の活性成分と組み合わせても、存在しない。特に増加する高齢人口内の被験体に組換えＳ−クロトーを投与することに基づく方策および保険介入方法を構築することは、この状況を改善するのに役立ち得る。
本開示の実施形態は、組換えヒトクロトータンパク質、タンパク質断片、および／またはタンパク質多様体、発現核酸構築物および／またはベクター、細胞株および／または細胞懸濁培養物、ならびにその製造、精製方法、および（ヒトまたは非ヒト動物）被験体への投与方法を用いて、当該技術分野における前述のまたは他の問題のうちの１つ以上を解決する。
例えば、本開示のいくつかの実施形態は、
組換えヒトアルファ可溶性クロトータンパク質、タンパク質断片、および／もしくはタンパク質多様体と、
組換えヒトアルファ可溶性クロトータンパク質の医薬品（または治療用組成物−例えば製剤）と、
組換えヒトアルファ可溶性クロトータンパク質および少なくとも１つの追加の（活性）成分の組成物と、
組換えヒトアルファ可溶性クロトータンパク質をコードする核酸構築物もしくはベクターと、
（ｉ）組換えヒトアルファ可溶性クロトータンパク質をコードする核酸構築物もしくはベクター、を含有し、および／もしくは（ｉｉ）組換えヒトアルファ可溶性クロトータンパク質を発現する、細胞株と、
（ｉ）組換えヒトアルファ可溶性クロトータンパク質をコードする核酸構築物もしくはベクター、を含有し、および／もしくは（ｉｉ）組換えヒトアルファ可溶性クロトータンパク質を発現する、細胞の細胞懸濁培養物と、
組換えヒトアルファ可溶性クロトータンパク質の製造する方法、および任意選択的に精製する方法と、
組換えヒトアルファ可溶性クロトータンパク質の医薬品（または治療用組成物、すなわち製剤）を製造する方法と、
組換えヒトアルファ可溶性クロトータンパク質を（ヒトまたは非ヒト動物）被験体に投与する方法と、
被験体におけるクロトータンパク質欠損を測定するための診断方法と、
被験体におけるクロトータンパク質欠損を診断する方法と、
投与により組換えヒトアルファ可溶性クロトータンパク質を投与される必要があると被験体を診断する方法と、
それを必要とする被験体へのタンパク質の有効性を評価する方法、および／もしくは有効投薬量を測定する方法と、
特定の病状または他の病態の治療に使用するための組換えヒトアルファ可溶性クロトータンパク質と、ならびに／または
特定の病状または他の病態の治療のための医薬品の製造への組換えヒトアルファ可溶性クロトータンパク質の使用と、を含み得る。
いくつかの実施形態は、組換えクロトータンパク質を製造する方法であって、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞中、好ましくはジヒドロ葉酸還元酵素（ＤＨＦＲ）欠損ＣＨＯ細胞中、より好ましくはＣＨＯ−Ｓ細胞中、または好ましくはグルタミン合成酵素（ＧＳ）欠損ＣＨＯ細胞中、より好ましくはＧＳ−／−ＣＨＯ細胞中で、組換えクロトータンパク質を産生することを含み、タンパク質が、好ましくは配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有する、方法を含み得る。
いくつかの実施形態は、好ましくはジヒドロ葉酸還元酵素（ＤＨＦＲ）欠損ＣＨＯ細胞中、より好ましくはＣＨＯ−Ｓ細胞中、または好ましくはグルタミン合成酵素（ＧＳ）欠損細胞中、より好ましくはＧＳ−／−ＣＨＯ細胞中で複数のチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞を含む細胞株であって、ＣＨＯ細胞が、プロモーター、好ましくは強力なプロモーターを含み、かつポリペプチドであって、ポリペプチドの少なくとも一部分が、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有する、ポリペプチドと、任意選択的に、機能性ジヒドロ葉酸還元酵素（ＤＨＦＲ）酵素、または機能性グルタミン合成（ＧＳ）酵素とをコードする、外因性核酸を含有する、細胞株を含み得る。
いくつかの実施形態は、液体培地、好ましくは無血清および／または動物タンパク質成分を含まない液体培地であって、好ましくは炭素源、窒素源、および１つ以上のビタミン、ミネラル、塩、アミノ酸、補充剤、または添加剤を含み、より好ましくは、液体培地が、ヒポキサンチン、チミジン、および／またはグルタミンを欠く、液体培地と、ＣＨＯ細胞が核酸によってコードされたポリペプチドを発現するような液体培地中で増殖する請求項１４〜１７のいずれか１項に記載の細胞株と、を含み、ポリペプチドが、組換えクロトータンパク質を含む。
いくつかの実施形態は、組換えクロトータンパク質を含み得、タンパク質の少なくとも一部分が、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと、少なくとも８０％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの実施形態は、加齢に関係するまたは他の病態、疾患、または障害を治療する方法であって、それを必要とする被験体に、薬学的有効量の本明細書に記載の組換えクロトータンパク質を投与することを含む方法を含み得る。
いくつかの実施形態は、加齢に関係するもしくは他の病態、疾患、または障害を治療する方法であって、それを必要とする被験体に、薬学的有効量の、ヒトアルファクロトーアイソフォーム１のアミノ酸残基１〜９８１の少なくともサブセットと少なくとも８０％のアミノ酸配列同一性を有する、可溶性組換えクロトータンパク質を投与することを含む、方法を含み得る。
いくつかの実施形態は、加齢に関係するもしくは他の病態、疾患、または障害を治療する方法であって、それを必要とする被験体に、薬学的有効量の、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと、少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、９８％、または９９％のアミノ酸配列同一性を有する可溶性組換えクロトータンパク質を投与することを含む、方法を含み得る。
いくつかの実施形態は、薬学的有効量の本明細書に記載の組換えクロトータンパク質および薬学的に許容可能な担体を含む医薬組成物を含み得る。
いくつかの実施形態は、医薬組成物であって、薬学的有効量の組換え可溶性クロトータンパク質であって、タンパク質の少なくとも一部分が、ヒトアルファクロトーアイソフォーム１の１〜９８１、２９〜９８１、３４〜９８１、３６〜９８１、１３１〜９８１、１〜５４９、２９〜５４９、３４〜５４９、３６〜５４９、もしくは１３１〜５４９のアミノ酸残基の少なくともサブセット、または配列番号２〜配列番号７０のうちの１つの少なくとも一部分と、少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有する、組換え可溶性クロトータンパク質と、薬学的に許容可能な担体とを含む、医薬組成物を含み得る。
いくつかの実施形態は、急性腎臓傷害（ＡＫＩ）または他の病態を治療または防止する方法であって、それを必要とする被験体に、薬学的有効量の組換え可溶性クロトータンパク質を投与することを含み、タンパク質の少なくとも一部分が、ヒトアルファクロトーアイソフォーム１の１〜９８１、２９〜９８１、３４〜９８１、３６〜９８１、１３１〜９８１、１〜５４９、２９〜５４９、３４〜５４９、３６〜５４９、もしくは１３１〜５４９のアミノ酸残基の少なくともサブセット、または配列番号２〜配列番号７０のうちの１つの少なくとも一部分と、少なくとも８５％、８６％、８８％、９０％、９２％、９５％、９８％、９９％、もしくは好ましくは１００％のアミノ酸配列同一性を有する方法を含み得る。
いくつかの実施形態は、治療用クロトータンパク質、例えばＣＧＭＰグレードのヒト組換え可溶性アルファ−クロトータンパク質、および薬剤、抗体、ホルモン、ヒト細胞、組織、細胞または組織系の生成物（ＨＣＴ／Ｐｓ）などの少なくとも１つの他の活性成分を含む組成物、ならびに／またはそれらをヒトもしくは非ヒト被験体に投与する方法を含む。コンビナトリアル組成物および方法は、年齢に関係する障害または病態、代謝障害、慢性疾患、急性傷害などに罹患している被験体を治療するために有用であり得る。明白な病態または障害のない被験体への併用療法の予防的投与はまた、本明細書に記載のある特定の病態または障害を遅延または防止するのに有用であり得る。
いくつかの実施形態は、核酸または核酸構築物を含み得る。例えば、実施形態は、発現ベクターまたは核酸を含み得る。核酸は、組換えヒトアルファ可溶性クロトータンパク質、タンパク質断片、またはタンパク質多様体をコードし得る。核酸は、天然または非天然のシグナリング配列をコードし得る。例えば、核酸は、コードされたクロトータンパク質配列の上流（またはＮ末端）に非天然シグナリング配列をコードし得る。
いくつかの実施形態は、組換えヒトアルファ可溶性クロトータンパク質を製造する方法を含み得る。製造方法は、液体培地中でチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞を増殖させることと、ＣＨＯ細胞中で組換え可溶性クロトータンパク質を産生することと、および／またはＣＨＯ細胞、液体培地もしくは両方からの組換え可溶性クロトータンパク質含有抽出物を精製することと、を含み得る。抽出物は、少なくとも約９８％の乾燥重量の組換え可溶性クロトータンパク質および／または約１〜１００ｐｐｍ未満のＣＨＯ宿主細胞タンパク質（ＨＣＰ）を含み得る。ＣＨＯ細胞は、ＣＨＯ−Ｓ細胞などのジヒドロ葉酸還元酵素（ＤＨＦＲ）欠損ＣＨＯ細胞、またはＧＳ−／−ＣＨＯ細胞などのグルタミン合成酵素（ＧＳ）欠損ＣＨＯ細胞であり得る。産生された（発現された）タンパク質は、ＣＨＯ細胞から液体培地に放出（例えば、分泌）され得、かつ／またはそれに結合した１つ以上のグリカンを有し得る。
ＣＨＯ細胞は、タンパク質、および任意選択的にジヒドロ葉酸還元酵素、グルタミン合成（ＧＳ）酵素などの機能性酵素をコードする１つ以上の外因性核酸を含有し得る。外因性核酸は、ＣＨＯ細胞における外因性タンパク質の発現に慣習的または典型的に使用されるためのプロモーターなどの、プロモーター（例えば、強力なプロモーター、弱いプロモーターなど）を含み得る。外因性核酸は、好ましくは、配列番号７６〜配列番号９６のうちの１つ、または本明細書に記載のクロトータンパク質をコードする任意の他の好適な核酸酸性配列（例えば、Ｓ−クロトー多様体）と少なくとも８５％の核酸配列同一性を有する導入遺伝子またはｃＤＮＡ（例えば、プロモーターの制御下にある）を含み得る。
方法は、トランスフェクションなどによって外因性核酸をＣＨＯ細胞に導入することを含み得る。方法は、（ヒト、ウシ（胎児）、または他の）血清を含まず、かつ／または動物（または動物由来）タンパク質（成分）を含まない培地などの液体培地中でＣＨＯ細胞を増殖させることを含み得る。培地は、好ましくは、炭素源、窒素源、および／または１つ以上のビタミン、ミネラル、塩、アミノ酸、補充剤、もしくは添加剤を、好ましくはバイオリアクター内に含む。特定のＣＨＯ細胞株に応じて、方法は、有効量のメトトレキサート（ＭＴＸ）、メチオニンスルホキシミン（ＭＳＸ）、または他の薬剤を液体培地に導入することと、および／または（例えば、ＣＨＯ細胞サブクローニング、限界希釈法、蛍光活性化細胞選別（ＦＡＣＳ）などによって）、液体培地中で増殖する生存ＣＨＯ細胞の懸濁培養物を選択することと、を含み得る。
いくつかの実施形態では、選択および／または遺伝子増幅は、トランスフェトされた細胞を、ヒポキサンチンおよび／またはチミジン（例えば、−ＨＴ培地）、グルタミンなどを欠く培地などの選択培地中で培養することによって実施され得る。少なくとも１つの実施形態では、低濃度のＭＴＸを添加または使用して、トランスフェクトされた核酸（またはその遺伝子）を増幅し、それによって（例えば、ＤＨＦＲ導入遺伝子を用いてトランスフェクトされたＤＨＦＲ欠損ＣＨＯ細胞中で）タンパク質発現を増加するために選択する。あるいは（または加えて）、選択および／または遺伝子増幅は、少なくとも１つの（外因性）グルタミン合成酵素（ＧＳ）導入遺伝子を有するＣＨＯ細胞の懸濁培養物にＭＳＸ（（内因性）グルタミン合成酵素（ＧＳ）の阻害剤）を添加することによって実施され得る。
方法は、生存細胞または培養物（例えば、ＭＴＸ耐性および／またはＭＳＸ耐性細胞または培養物）を継代培養することを含み得る。選択された懸濁培養物および／または選択されたＣＨＯ細胞は、タンパク質の産生増加（例えば、ＣＨＯ細胞による）、タンパク質の濃度の増加（例えば、液体培地中への）、および／または、外因性核酸の（例えば、細胞当たりの）コピー数の増加（例えば、選択されなかった懸濁培養物またはＣＨＯ細胞と比較して）を有し得るか、または呈し得る。
ある特定の実施形態は、複数のＣＨＯ細胞を含む細胞株を含み得る。例えば、ＣＨＯ細胞は、ＣＨＯ−Ｓ細胞などのＤＨＦＲ欠損ＣＨＯ細胞であり得る。ＣＨＯ細胞は、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有するポリペプチドをコードする（導入遺伝子またはｃＤＮＡを含む）（コピーの）外因性核酸を１つ以上含有し得る。ポリペプチドは、ヒト組換えアルファ可溶性クロトータンパク質を含み得る。外因性核酸は、好ましくは配列番号７６〜配列番号９６のうちの１つと少なくとも８５％の核酸配列同一性を有する導入遺伝子またはｃＤＮＡを含み得る。いくつかの実施形態では、核酸は（また）、プロモーター（導入遺伝子に関連する）、および／または（機能性）ジヒドロ葉酸還元（ＤＨＦＲ）酵素、グルタミン合成（ＧＳ）酵素などの任意選択的な（外因性）酵素を含み得るか、またはコードし得る。
少なくとも１つの実施形態は、好ましくは炭素源、窒素源、および／または１つ以上のビタミン、ミネラル、塩、アミノ酸、補充剤もしくは添加剤を含み、ＣＨＯ細胞が核酸によってコードされたポリペプチドを発現するような液体培地中で増殖する細胞株を含む、懸濁細胞培養物を含む。液体培地は、（ヒト、ウシ（胎児）、または他の）無血清および／または動物（または動物由来）タンパク質（成分）を含まないものであり得る。例えば、液体培地は、ウシ血清アルブミン、ヒト血清アルブミンなどを含まないものであり得る。
いくつかの実施形態では、液体培地はまた、有効量のＭＴＸおよび／またはＭＳＸを含み得る。懸濁培養物（またはそのＣＨＯ細胞）は、（例えばＣＨＯ細胞による）タンパク質の産生増加を呈し、（例えば、液体培地中で）タンパク質の濃度の増加を呈し、タンパク質を（例えば液体培地中へ）分泌し、および／または好ましくは選択されなかった懸濁培養物と比較して、外因性核酸のコピー数の増加（例えば、細胞当たり）を有し得る（ように選択される）。タンパク質は、それに結合した１つ以上のグリカンを有し得る。
いくつかの実施形態は、ＣＨＯ細胞、液体培地、または両方の懸濁細胞培養物の抽出物、またはそれらからの抽出物を含み、この抽出物は、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有する組換えタンパク質を含有する。ある特定の実施形態は、ＣＨＯ細胞、液体培地、または両方（例えば、懸濁細胞培養物）の、またはそれらからの、ヒト組換えアルファ可溶性クロトータンパク質含有抽出物を含む。少なくとも１つの実施形態は、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有する単離組換えタンパク質を含む。
いくつかの実施形態は、組換えヒトアルファ可溶性クロトータンパク質を、それを必要とするヒトまたは非ヒト動物被験体に投与する方法を含み得る。クロトータンパク質が投与される被験体は、種々の病態（例えば、障害、疾患、傷害、病気など）に苦しんでいるか、またはそのリスクがあり得る。例えば、いくつかの実施形態は、（ヒト）加齢に関連する身体的、知能的、神経学的、または他の病態など、１つ以上の慢性疾患および／または加齢に関係する病態を治療する方法を含む。いくつかの実施形態は、１つ以上の機構または作用を通して治癒、回復、長寿化および／または他の有益な結果を促進し得る。実施形態は、例えば、薬学的有効量の組換え可溶性クロトータンパク質またはタンパク質多様体を、それを必要とする被験体（例えば、病態に罹患しているか、または病態が進行するリスクのある被験体）に投与することを含み得る。かかるタンパク質またはタンパク質多様体の投与は、ヒト被験体における慢性および／または年齢に関係する疾患ならびに長寿化を含む、病態の経過および結果にポジティブな治療効果、ならびにその特徴を有し得る。
薬学的有効量は、被験体の血清可溶性クロトータンパク質濃度を、血清１ミリリットル当たり、約５０〜３０００ピコグラム以上、またはその間の可溶性クロトータンパク質などの所定レベルまで上昇させるのに十分であり得る。その量はまた、またはあるいは、所定の期間の間、所定の閾値以上で被験体の血清可溶性クロトータンパク質濃度を維持するのに十分であり得る。実施形態はまた、被験体の血清可溶性クロトータンパク質濃度を所定の閾値以上に所定の期間の間維持するように、タンパク質をそれを必要とする被験体に投与することも含み得る。
実施形態はまた、被験体の血清可溶性クロトータンパク質濃度を測定することと、薬学的有効量を計算することと、被験体の血清中の可溶性クロトータンパク質の低下速度を測定することと、被験体の血清可溶性クロトータンパク質濃度が、測定された速度に基づいて第２の所定のレベル以下になるであろう次の投薬時間を計算することと、被験体の血清可溶性クロトータンパク質濃度を第２の所定のレベルから第１の所定のレベルまで上昇させるのに十分なタンパク質の次の投与量を計算することと、および／または、タンパク質の次の投薬量を被験体に投与することと、を含み得る。
タンパク質は、ＩＧＦ−１および／もしくはＷｎｔシグナリング経路を調節し得る（調節するために有効であり得）、β−グルクロニダーゼおよび／もしくはシアリダーゼ活性を呈し得る、ｐ５３／ｐ２１シグナリング経路を抑制し得る、ならびに／または好ましくは、ｐ５３／ｐ２１シグナリング経路の抑制を介して、Ｈ２Ｏ２によって誘発される細胞老化およびアポトーシスを低減し得る。タンパク質は、好ましくは多面発現活性を呈し、ならびに／または好ましくは酸化ストレス、増殖因子シグナリング、イオン恒常性の調節、および／もしくは１つ以上のイオンチャネルタンパク質および／もしくはインスリン／インスリン様増殖因子−１受容体などの増殖因子受容体などの細胞表面上での糖タンパク質の活性の調節において、体液性因子として機能し得るか、または機能的であり得る。
タンパク質はまた、虚弱、骨密度喪失または骨ミネラル密度低下、体重低下、筋肉萎縮または退化、筋量低下、筋力、握力、脚力または体力の低下、動作、動作自由、生活の質評価、駆出率、運動能力の低下、学習力、学習能力、記憶力、または知能指数の低下、認知力劣化または健忘症、認知能力または機能の低下、シナプス可塑性またはシナプス機能の低下、および細胞老化などの、１つ以上の加齢に関係する病態（または（ヒトの）加齢に関連する病態）を治療するために有効であり得る。
タンパク質はまた、アルツハイマー病、パーキンソン病、認知症または血管性認知症、筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）、または運動ニューロン疾患（ＭＮＤ）、心房細動、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）、線維筋痛症、成人発症糖尿病、関節炎または関節リウマチ、変形性関節症、骨粗鬆症、緑内障、白内障、黄斑変性および他の眼疾患／障害、多発性硬化症（ＭＳ）、狼瘡、および／または潰瘍性大腸炎などの、１つ以上の加齢に関係する病態（または（ヒトの）加齢に関連する病態）を治療するために有効であり得る。
したがって、実施形態はまた、１つ以上の加齢に関係する病態の治療に使用するための組成物も含み得る。組成物は、組換え可溶性クロトータンパク質（例えば、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと、少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有する）、および薬学的に許容可能な担体を含み得る。
いくつかの実施形態は、治療用クロトータンパク質、例えばＣＧＭＰグレードのヒト組換え可溶性アルファ−クロトータンパク質、および薬剤、抗体、ホルモン、ホルモン、ヒト細胞、組織、細胞または組織系の生成物（ＨＣＴ／Ｐｓ）などの少なくとも１つの他の活性成分を含む組成物、ならびにそれらをヒトもしくは非ヒト被験体に投与する方法を含む。コンビナトリアル組成物および方法は、年齢に関係する障害または病態、代謝障害、慢性疾患、急性傷害などに罹患している被験体を治療するために有用であり得る。明白な病態または障害のない被験体への併用療法の予防的投与はまた、本明細書に記載のある特定の病態または障害を遅延または防止するのに有用であり得る。
本開示の様々な実施形態では、生成物またはプロセスにかかわらず、組換えクロトータンパク質は、配列番号１〜配列番号３８のうちの１つと、８０％〜１００％の配列同一性を有する配列を有し、好ましくは、配列番号７４または配列番号７５の配列のうちの１つと、８０％〜１００％の配列同一性を有するＣ末端タグを有し、任意選択的に、その間に配置される配列番号７３と８０％〜１００％の配列同一性を有するリンカー配列を有する、クロトータンパク質のうちの１つを含み得る。タンパク質は、任意選択的に、配列番号７１または配列番号７２と、８０％〜１００％の配列同一性を有するシグナリング配列を含み得るか、またはそれを用いて発現され得る。好ましくは、（製造、産生、発現または投与される）タンパク質は、配列番号３９〜配列番号７０のうちの１つと、８０％〜１００％の配列同一性を有する。
組換えクロトータンパク質を製造する例示的な方法は、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞中、好ましくはジヒドロ葉酸還元酵素（ＤＨＦＲ）欠損ＣＨＯ細胞中、より好ましくはＣＨＯ−Ｓ細胞中、または好ましくはグルタミン合成酵素（ＧＳ）欠損ＣＨＯ細胞中、より好ましくはＧＳ−／−ＣＨＯ細胞中で、組換えクロトータンパク質を産生することを含み、タンパク質が、好ましくは配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有する。
例示的な細胞株は、好ましくはジヒドロ葉酸還元酵素（ＤＨＦＲ）欠損ＣＨＯ細胞中、より好ましくはＣＨＯ−Ｓ細胞中、または好ましくはグルタミン合成酵素（ＧＳ）欠損（ＣＨＯ）細胞中、より好ましくはＧＳ−／−ＣＨＯ細胞中で複数のチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞を含む細胞株を含み、外因性核酸を含有するＣＨＯ細胞が、プロモーター、好ましくは強力なプロモーターを含み、かつポリペプチドであって、ポリペプチドの少なくとも一部分が、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有するポリペプチドと、をコードし、任意選択的に、機能性ジヒドロ葉酸還元酵素（ＤＨＦＲ）酵素、または機能性グルタミン合成（ＧＳ）酵素と、をコードする。
例示的な懸濁細胞培養物は、液体培地、好ましくは無血清および／または動物タンパク質成分を含まない液体培地であって、好ましくは炭素源、窒素源、および１つ以上のビタミン、ミネラル、塩、アミノ酸、補充剤、または添加剤を含み、より好ましくは、液体培地が、ヒポキサンチン、チミジン、および／またはグルタミンを欠く、液体培地と、ＣＨＯ細胞が核酸によってコードされたポリペプチドを発現するような液体培地中で増殖する、請求項１４〜１７のいずれか１項に記載の細胞株と、を含み、ポリペプチドが、組換えクロトータンパク質を含む。
例示的な組換えクロトータンパク質は、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと少なくとも８０％のアミノ酸配列同一性を含む。
加齢に関係するまたは他の病態、疾患、または障害を治療する例示的な方法であって、それを必要とする被験体に、薬学的有効量の、ヒトアルファクロトーアイソフォーム１のアミノ酸残基１〜９８１の少なくともサブセットと少なくとも８０％のアミノ酸配列同一性を有する、可溶性組換えクロトータンパク質を投与することを含む、方法。
加齢に関係するもしくは他の病態、疾患、または障害を治療する例示的な方法であって、それを必要とする被験体に、薬学的有効量の、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと少なくとも８０％のアミノ酸配列同一性を有する可溶性組換えクロトータンパク質を投与することを含む、方法。
例示的な医薬組成物は、薬学的有効量の組換え可溶性クロトータンパク質であって、タンパク質の少なくとも一部分が、ヒトアルファクロトーアイソフォーム１の１〜９８１、２９〜９８１、３４〜９８１、３６〜９８１、１３１〜９８１、１〜５４９、２９〜５４９、３４〜５４９、３６〜５４９、もしくは１３１〜５４９のアミノ酸残基の少なくともサブセット、または配列番号２〜配列番号７０のうちの１つの少なくとも一部分と、少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有するタンパク質と、薬学的に許容可能な担体とを含む。
急性腎臓傷害（ＡＫＩ）または他の病態を治療または防止する例示的な方法は、それを必要とする被験体に、薬学的有効量の組換え可溶性クロトータンパク質を投与することを含み、タンパク質の少なくとも一部分が、ヒトアルファクロトーアイソフォーム１の１〜９８１、２９〜９８１、３４〜９８１、３６〜９８１、１３１〜９８１、１〜５４９、２９〜５４９、３４〜５４９、３６〜５４９、もしくは１３１〜５４９のアミノ酸残基の少なくともサブセット、または配列番号２〜配列番号７０のうちの１つの少なくとも一部分と、少なくとも８５％、８６％、８８％、９０％、９２％、９５％、９８％、９９％、もしくは好ましくは１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
高齢な個体を治療する例示的な方法であって、高齢な個体が、クロトータンパク質をコードする遺伝子においてホモ接合またはヘテロ接合変異を有する、方法。方法は、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと、少なくとも８５％、好ましくは少なくとも９０％、より好ましくは少なくとも９５％、さらにより好ましくは少なくとも９８％、なおより好ましくは少なくとも９９％、最も好ましくは１００％のアミノ酸配列同一性を有する、治療濃度のポリペプチドを投与することを含む。
いくつかの実施形態は、本開示の他の態様または実施形態を含む、本開示の他の場所に記載された特色、選択肢、および／または可能性のいずれかを含み得る。本明細書に記載の前述の、以下の、および／または他の特色の各々はまた、本開示の別個の実施形態を表すことにも留意されたい。さらに、かかる特色のうちの任意の２つ以上の組み合わせは、本開示の別個の実施形態を表す。かかる特色または実施形態はまた、本開示の範囲から逸脱することなく、任意の好適な組み合わせおよび／または順序で組み合わせられ得る。したがって、本明細書に記載の特色の各々は、任意の好適な組み合わせおよび／または順序で、本明細書に記載の任意の１つ以上の他の特色と組み合わせられ得る。したがって、本開示は、本明細書に詳細に記載される例示的な実施形態の特定の組み合わせに限定されない。
本開示の例示的な実施形態の追加の特色および利点は、以下の説明に記載され、その一部は説明から明らかになるか、またはかかる例示的な実施形態の実施によって習得され得る。かかる実施形態の特色および利点は、添付の特許請求の範囲で特に指摘される機器および組み合わせによって実現および取得され得る。これらの特色および他の特色は、以下の説明および添付の特許請求の範囲からより完全に明らかになるか、または以下に記載のようなかかる例示的な実施形態の実施によって習得され得る。
本開示の上に列挙され、かつ他の利点および特色が得られ得る方式を説明するために、上で簡潔に説明された実施形態のより具体的な説明は、添付図面に示されているその特定の実施形態を参照することによって提供されるであろう。より良好な理解のために、同様の要素は、図面全体を通して同様の参照番号によって表記されている。これらの図面は、本開示の典型的な実施形態のみを示しており、したがって、その範囲を限定するものではないとみなされることを理解することによって、本開示は、添付の図面の使用を通して追加の特異性および詳細と共に記載および説明されるであろう。
本開示の一実施形態にしたがった、様々なクロトータンパク質の細胞産生を示す模式図である。 ヒトα−クロトーのアイソフォーム１およびアイソフォーム２の概略構造、およびＣ〜Ｄ（残基８００〜９００）の生成に使用される抗体結合のためのエピトープの位置を示す。 それぞれ赤色および緑色で示されたＫＬ１およびＫＬ２、ならびに強調表示された（黒色）ＴＭを含む、１０１２アミノ酸の全長α−クロトータンパク質配列を示す。 ヒト細胞溶解物のウエスタンブロット分析を示す。 ヒト組織のウエスタンブロット分析を示す。 ２０１０年に、ある特定のアミノグリコシドを投与された成人患者の数を示す。 図３Ａに示されたアミノグリコシドを投与された成人患者の年齢分布を示す。 図３Ａに示されたアミノグリコシドを投与された成人患者について収集した治療データを示す。
本開示の様々な実施形態を詳細に説明する前に、本開示は、それぞれの実施形態で変動し得る特定のパラメータ、言い回し、ならびに特定の例示されたシステム、方法、および／または生成物の説明のみに限定されないことが理解されるものである。したがって、特定の特色（例えば、構成、パラメータ、特性、ステップ、構成要素、成分、部材、要素、部品、および／または部分など）を参照して、本開示のある特定の実施形態は、詳細に説明されるが、説明は例示的なものであり、本開示および／または特許請求される発明の範囲を限定するものとして解釈されるものではない。加えて、本明細書で使用される用語は、実施形態を説明する目的のためであり、必ずしも本開示および／または特許請求される発明の範囲を限定することを意図するものではない。
特に定義されない限り、本明細書で使用される全ての技術用語および科学用語は、本開示が関係する当業者によって一般的に理解されるものと同じ意味を有する。
システム、方法、および／または生成物を含む本開示の様々な態様は、本質的に例示的な１つ以上の実施形態を参照して例示され得る。本明細書で使用される場合、用語「実施形態」は、「例、事例、または例示としての役割を果たす」ことを意味し、本明細書に開示の他の態様よりも好ましいまたは有利であると必ずしも解釈されるべきではない。加えて、本開示または本発明の「実施形態」への言及は、添付の特許請求の範囲によって示される本発明の範囲を限定することなく、例示的な例を提供することを意図している。
本明細書および添付の特許請求の範囲で使用されるように、単数形「１つ」および「前記」、「その」は、別段の明確な指示がない限り、単数および複数の指示対象の両方であると各々考慮され、含み、かつ具体的に開示する。例えば、「タンパク質」への言及は、１つ、ならびに複数の（例えば、２つ以上、３つ以上など）タンパク質を考慮し、かつ具体的に開示する。同様に、複数の指示対象の使用は、必ずしもかかる指示対象の複数を必要としないが、別段の明確な指示がない限り、かかる指示対象の単数ならびに複数の支持を考慮し、含み、具体的に開示し、かつ／または提供する。
本開示全体を通して使用されるように、「し得る」および「してもよい」という言葉は、強制的な意味（すなわち、しなければならない、の意味）ではなく、許容的な意味（すなわち、可能性を有することを意味する）で使用される。さらに、「含む」、「有する」、「含有する」、「特徴とする」という用語、その変形（例えば、「含み」、「有し」、「含有し」など）、ならびに特許請求の範囲を含む本明細書で使用される同様の用語は、包括的でありかつ／または変更可能であるものとし、例示的に、言葉「含む」およびその変形（例えば、「含み」、が同じ意味を有するものとし、かつ追加の列挙されていない要素または方法ステップを除外しない。
簡潔にするために、本開示は、数値のリストまたは範囲のみを列挙してもよい。しかしながら、数値のかかるリストまたは数値の範囲（例えば、より大きい、より小さい、最大で、少なくとも、および／または約ある特定の値、および／または２つの列挙された値の間）が開示または列挙されている場合、開示の値またはリスト、または値の範囲内にある任意の特定の値または値の範囲は、同様に、本明細書に具体的に開および考慮されることが理解されるであろう。したがって、約１０単位以下または０〜１０単位である例示的な測定値（例えば、長さ、幅、厚さなど）の開示は、例示的に、（ｉ）９単位、５単位、１単位、または０単位および／もしくは１０単位を含む０〜１０単位の任意の他の値の測定値；ならびに／または（ｉｉ）９単位〜１単位、８単位〜２単位、６単位〜４単位、および／もしくは０単位〜１０単位の任意の他の値の範囲の測定値の特定の開示を含む。
理解を容易にするために、可能な場合は、本開示の異なる実施形態に共通の同様の要素を表記するために、同様の参照（すなわち、構成要素および／または要素の同様の名称）が使用されている。同様に、同様の構成要素、または同様の機能を有する構成要素には、可能な場合は、同様の参照表記で提供されるであろう。本明細書では、例示的な実施形態を説明するために特定の言語が使用されるであろう。それでもなお、それによって本開示の範囲を限定することを意図しないことが理解されるであろう。むしろ、例示的な実施形態を説明するために使用される言語は、（かかる言語が不可欠であると明らかに本明細書に記載されない限り）例示に過ぎず、開示の範囲を限定するものと解釈されるものではないことが理解されるものである。
詳細な説明は段落に分かれているが、各段落内の段落見出しおよび内容は、構成的な目的のみのためであり、独立した説明および実施形態であること、または説明もしくは特許請求の範囲を限定することを意図しない。むしろ、詳細な説明の中の各段落の内容は、１つの段落の要素が他の段落に関係し、かつ／または他の段落の特徴をなし得る集合的な全体として読み取られ、理解されることを意図する。したがって、１つの段落内に具体的に開示される実施形態はまた、同じおよび／または同様の生成物、方法、および／または用語を有する別の段落において、追加のおよび／または代替的な実施形態に関係し得、かつ／または機能し得る。
本開示の実施形態は、（医薬品適正製造基準（Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｇｏｏｄ Ｍａｎｕｆａｃｔｕｒｉｎｇ Ｐｒａｃｔｉｃｅ）（ＣＧＭＰ）グレードの）ヒト組換え可溶性アルファ−クロトータンパク質、タンパク質断片、および／またはタンパク質多様体などの組換えヒトクロトータンパク質を、製造および／または使用する生成物、組成物および／または方法を含む。
遺伝子治療は、動物実験において有効であり得る。しかしながら、遺伝子治療の安全性、特にヒト治療の安全性は依然として疑わしい。動物（細胞）へのクロトー遺伝子のウイルス送達と比較して、ヒトにおける外因性および／または組換えクロトータンパク質の投与は、（内分泌で）クロトーレベルを回復するための、より安全、より簡単、かつより直接的な様式であり得る。したがって、ＣＫＤ患者の貧血を治すためのエリスロポエチンまたは赤血球生成刺激剤の投与、および／またはＩ型糖尿病の正常なグルコース代謝を維持するためのインスリンの投与と同様に、近い将来、外因性（ヒト組換えアルファ可溶性）クロトータンパク質の投与は、高齢者および／または加齢に関係する障害を治療するための現実的かつ有効な選択肢となり得る。例えば、ヒトへの外因性（ヒト組換えアルファ可溶性）クロトータンパク質の投与は、幹細胞の枯渇を逆転もしくは遅延させ、かつ／または年齢に関連する虚弱もしくは他の病理学的プロセスを軽減する、有効な方策であり得る。
前臨床データは、年齢に関係する疾患およびクロトー欠損に関連する疾患に対する、可溶性クロトータンパク質の治療の潜在性を立証している。疫学的データは、可溶性クロトーが若年成人よりも高齢者で低く、可溶性クロトーのレベルが年齢と逆相関することを示しており、加齢は可溶性クロトーの低下と関連していることを示している。
定義された用語の概略リスト
前述の範囲および内容ならびに以下記載の説明および特許請求の範囲の理解を助けるために、選択されたいくつかの用語を以下に定義する。
用語「病態」とは、当業者によって理解されるように、患者に現れるかまたは予期される任意の障害、疾患、傷害または病気を指す。かかる病態の現れは、病態前の症状、予兆、または現れを含む、当該技術分野で既知の早期、中期または後期段階の現れであり得る。かかる病態の予測は、科学的もしくは医学的根拠、リスク評価、または単なる不安もしくは恐怖のいずれに見出されるかにかかわらず、病態の予測、想定、期待、想像、想定、および／または憶測される発生であり得るか、またはそれらを含み得る。
用語「患者」とは、医師または他の関連する医療専門家にかかっているヒトを特に参照して、その用語が本明細書で定義されるように、医者にかかっている任意の動物を総称する。
本明細書で使用される場合、用語「医者」とは、一般に医師を指す。この用語は、文脈上適切なとき、腫瘍医、外科医、または医者の助手、看護師、採血技師（ｐｈｌｅｂｏｔｏｍｉｓｔ）、獣医師などの任意の認可された医療専門家を含む任意の医療専門家を含む。
用語「癌」とは、異常な、典型的には制御されていない細胞増殖を指す。本明細書で使用される場合、「癌細胞」は、異常な、典型的には制御されない増殖を有する悪性細胞を含む。このように、癌という用語は、典型的には制御されない方式で増殖する悪性細胞を特徴とする、複数の異なる別個の疾患を包含する包括的な用語である。
用語「共投与」および同様の用語は、２つ以上の成分の並行、連続および／または併用投与を意味する。例えば、２つの成分は、各成分を別々の投薬量で並行、同時、または連続投与（例えば、ある期間によって隔てられた別個の投与）することによって、共投与され得る。期間は、非常に短いか（例えば、実質的に第１の投与の直後に）、またはそれより長く（例えば、１〜６０秒、１〜６０分、１〜２４時間、１〜７日、１〜４週間、１〜１２ヶ月など、またはそれらの間の任意の値もしくは値の範囲）てもよい。並行または同時投与には、２つ以上の成分の投与時間枠の重複、または２つ以上の成分の混合物を含む組合せ生成物の投与が含まれ得る。
本明細書で使用される場合、「核酸」および同様の用語は、ＤＮＡまたはＲＮＡまたはＤＮＡ−ＲＮＡハイブリッド、一本鎖または二本鎖、センスまたはアンチセンスのいずれかの、天然型または合成のオリゴヌクレオチドまたはポリヌクレオチドを指す。特に、核酸としては、ＤＮＡ、ＲＮＡ、ｃＤＮＡ、ｇＤＮＡ、ｓｓＤＮＡ、ｄｓＤＮＡまたはそれらの任意の組み合わせが挙げられ得るが、これらに限定されない。本開示の核酸としてはまた、当該技術分野で既知のヌクレオチドまたは核酸類似体（例えば、ＢｒｄＵ）、および非ホスホジエステル（ヌクレオシド間）結合または主鎖（例えば、ペプチド核酸（ＰＮＡ）またはチオジエステル結合）が挙げられ得る。
本明細書で使用される場合、用語「標準アミノ酸」としては、アラニン−ａｌａ−Ａ；アルギニン−Ａｒｇ−Ｒ；アスパラギン−ａｓｎ−Ｎ；アスパラギン酸−ａｓｐ−Ｄ；システイン−ｃｙｓ−Ｃ；グルタミン−ｇｌｎ−Ｑ；グルタミン酸−ｇｌｕ−Ｅ；グリシン−ｇｌｙ−Ｇ；ヒスチジン−ｈｉｓ−Ｈ；イソロイシン−ｉｌｅ−Ｉ；ロイシン−ｌｅｕ−Ｌ；リジン−ｌｙｓ−Ｋ；メチオニン−ｍｅｔ−Ｍ；フェニルアラニン−ｐｈｅ−Ｆ；プロリン−ｐｒｏ−Ｐ；セリン−ｓｅｒ−Ｓ；スレオニン−ｔｈｒ−Ｔ；トリプトファン−ｔｒｐ−Ｗ；チロシン−ｔｙｒ−Ｙ；およびバリン−ｖａｌ−Ｖが挙げられる。
本明細書で使用される場合、「コドン最適化（ｃｏｄｏｎ ｏｐｔｉｍｉｚｅｄ）」または「コドン最適化（ｃｏｄｏｎ ｏｐｔｉｍｉｚａｔｉｏｎ）」は、ヌクレオチド配列中のコドンを、その分子の発現のために使用される生物におけるコドン使用パターンに好ましくまたはより近似するコドンに修飾するかまたは変化させるプロセスを指す。したがって、核酸の発現の有効性を向上するために、例えば、より速い翻訳速度および高精度を達成するために、生物における既知のコドン使用に基づいて発現が望まれる特定の生物への使用のために、コドンを最適化し得る。特定の生物におけるコドン使用は、既知である。
コード核酸分子は、修飾野生型、またはコドンが特定の宿主細胞中、例えばＣＨＯ細胞もしくは２９３細胞などの哺乳動物細胞、または酵母中、もしくは植物細胞、真核細胞などの中で発現するために最適化された、コドン最適化配列であり得る。
特定の例では、核酸配列は、例えば、コードされた配列の発現レベルを増加させるために、コドン最適化され得る。特定のコドン使用は、修飾ポリペプチドが発現される宿主生物に依存する。当業者は、哺乳動物またはヒト細胞、例えば大腸菌もしくはサッカロマイセスセレヴィシエを含む細菌または酵母中での発現のために最適なコドンに精通している。例えば、コドン使用情報は、ｋａｚｕｓａ．ｏｒ．ｊｐ．ｃｏｄｏｎで入手可能なＣｏｄｏｎ Ｕｓａｇｅ Ｄａｔａｂａｓｅから入手可能である（データベースの説明については、例えば、Ｒｉｃｈｍｏｎｄ（２０００）Ｇｅｎｏｍｅ Ｂｉｏｌｏｇｙ，１：２４１を参照されたい。また、Ｆｏｒｓｂｕｒｇ（２００４）Ｙｅａｓｔ，１０：１０４５−１０４７、Ｂｒｏｗｎら（１９９１）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ，１９：４２９８、Ｓｈａｒｐら（１９８８）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．，１２：８２０７−８２１１、Ｓｈａｒｐら（１９９１）Ｙｅａｓｔ，６５７−７８も参照されたい）。
治療用タンパク質
本開示の実施形態は、１つ以上の治療用および／または組換えヒトアルファ可溶性クロトータンパク質、タンパク質断片、および／またはタンパク質変異体を含み得る。
タンパク質は、ヒトアルファクロトーアイソフォーム１のアミノ酸残基１〜１０１２、１〜９８１、２９〜９８１、３４〜９８１、３６〜９８１、１３１〜９８１、１〜５４９、２９〜５４９、３４〜５４９、３６〜５４９または１３１〜５４９の全てまたはサブセットを含み得る。タンパク質は、ヒトアルファクロトーアイソフォーム１のアミノ酸残基１〜１０１２、１〜９８１、２９〜９８１、３４〜９８１、３６〜９８１、１３１〜９８１、１〜５４９、２９〜５４９、３４〜５４９、３６〜５４９、または１３１〜５４９の全てまたはサブセットと、少なくともまたは約８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。例えば、タンパク質の少なくとも一部分は、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つ、またはそれらの２つ以上の組み合わせと、少なくとも８５％などのアミノ酸配列同一性を有し得る。本出願に記載のタンパク質配列の他の部分または断片もまた、本明細書で考慮される。例えば、いくつかの実施形態は、配列番号１〜７５のうちの１つの任意の好適な一部分、またはそれらの２つ以上の組み合わせと、少なくとも８５％などのアミノ酸配列同一性を有する少なくとも一部分を有するタンパク質を含み得る。
いくつかの実施形態は、ヒトアルファクロトーアイソフォーム１と比較して１つ以上のアミノ酸変異体を有するタンパク質を含み得る。例示的には、タンパク質は、ヒトＣ３７０多様体を含み得る。例えば、タンパク質は、Ｃ３７０Ｓ変質を含むことができ、それによってＳ３７０を含む。いくつかの実施形態では、タンパク質は、ヒトＦ３５２、またはＦ３５２Ｖ以外のものを含み得る。少なくとも１つの実施形態では、タンパク質はＣ３７０Ｓ変化を含み得、それによってＦ３５２Ｖ多様体を含まず好ましくはＦ３５２を含む、Ｓ３７０を含む。タンパク質は、Ｈ１９３、またはＨ１９３Ｒ多様体以外のものを含み得る。ヒトアルファクロトーアイソフォーム１のアミノ酸残基（または位置）１９３、３５２、および／または３７０において、全ての他の標準アミノ酸置換が考慮され、本明細書に明示的に開示される。
いくつかの実施形態は、ヒトアルファクロトーアイソフォーム１のアミノ酸残基４５における変異を含み得る。４５位では、残基はバリン（Ｖａｌ；Ｖ）、フェニルアラニン（Ｐｈｅ；Ｆ）、または別のアミノ酸であり得る。
タンパク質はまた、１つ以上の（それに結合した）グリカンを含み得る。例えば、天然ヒトアルファクロトーアイソフォーム１は、アミノ酸１０６、１５９、２８３、３４４、６０４、６１２および／または６９４で（グリコシル化を介して）結合したグリカンを有し得る。したがって、本開示のタンパク質またはそのクロトータンパク質配列は、（例えば、同じアミノ酸位置（複数可）で）（グリコシル化を介して）そこへ結合した同じ（または同様の）グリカンのうちの１つ以上を有し得る。好ましい実施形態では、タンパク質は、同じアミノ酸位置（複数可）でそこへ結合した同じまたは同様の（天然型）グリカンのうちの全てを含む。
いくつかの実施形態では、タンパク質は、シグナルペプチドまたはシグナリング配列を含み得る。例えば、タンパク質は、天然クロトーシグナリング配列を含み得る。タンパク質は、非天然または合成シグナリング配列を含み得る。いくつかの実施形態では、シグナリング配列は、Ｎ末端シグナリング配列および／またはクロトータンパク質配列の上流（またはＮ末端）であり得る。他の実施形態では、シグナリング配列はＣ末端であり得るか、または別の方法で配置され得る。好ましくは、シグナリング配列は、天然ヒトアルファクロトーアイソフォーム１シグナリング配列、天然ヒトアルファクロトーアイソフォーム２シグナリング配列、配列番号７１または配列番号７２と、少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９８％、または９９％のアミノ酸配列同一性であり得るか、それを含み得るか、または有し得る。
いくつかの実施形態では、タンパク質はアミノ酸タグを含み得る。タグは、Ｃ末端タグおよび／またはクロトータンパク質配列の下流（またはＣ末端）であり得る。他の実施形態では、タグはＮ末端であり得るか、または別の方法で配置され得る。タグは、Ｆｃ融合タンパク質であり得るか、またはそれを含み得る。例えば、タグは、ＩｇＧ１−Ｆｃタンパク質配列であり得るか、またはそれを含み得る。好ましくは、タグは、配列番号７４と、少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９８％、または９９％のアミノ酸配列同一性であり得るか、それを含み得るか、または有し得る。
タグはまた、またはあるいは、（例えば、当該技術分野で既知のように）ＴＥＶ−ｔｗｉｎｓｔｒｅｐタンパク質配列であり得るか、またはそれを含み得る。好ましくは、シグナリング配列は、配列番号７５と、少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９８％、または９９％のアミノ酸配列同一性であり得るか、それを含み得るか、または有し得る。
少なくとも１つの実施形態では、タグはタンパク質から切断され得る。他の実施形態では、タグはタンパク質の一部として保持され得る。いくつかの実施形態では、タグは、タンパク質の溶解度および／または（血清）半減期を向上することができる。いくつかの実施形態では、タグは、タンパク質精製の間に（例えば、精製機構の一部として）利用され得る。
いくつかの実施形態では、タンパク質は、クロトータンパク質配列とアミノ酸タグとの間に配置されたリンカー（例えば、アミノ酸リンカー）を含み得る。例示的に、リンカーは、１〜４０個のアミノ酸、好ましくは５〜２０個のアミノ酸、より好ましくは８〜１２個のアミノ酸、最も好ましくは約１０個のアミノ酸を含み得る。いくつかの実施形態では、リンカーは、ＧＳリンカーであり得るか、またはそれを含み得る。好ましくは、リンカーは、配列番号７３と、少なくとも７０％、８０％、９０％、または１００％のアミノ酸配列同一性であり得るか、それを含み得るか、または有し得る。
少なくとも１つの実施形態では、タンパク質は、米国食品医薬品局（ＦＤＡ）によって決定および施行されるＣＧＭＰ規則に準拠し得る。例えば、クロトータンパク質は、乾燥重量で少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％純粋であり得る。いくつかの実施形態では、クロトータンパク質サンプルは、１０００万分率（ｐｐｍ）約１〜１００未満、１０００万分率（ｐｐｍ）約１００〜１０００未満、または約１〜１００ｐｐｍ未満、またはそれらの間に置かれる任意の値または値の範囲のＣＨＯ宿主細胞タンパク質（ＨＣＰ）、核酸、および／または他の細胞成分を含み得る。
核酸および発現ベクター
いくつかの実施形態は、核酸または核酸構築物を含み得る。例えば、実施形態は、発現ベクターまたは核酸構築物を含み得る。核酸は、本明細書に記載のように、組換えヒトアルファ可溶性クロトータンパク質、タンパク質断片、またはタンパク質多様体をコードし得る。少なくとも１つの実施形態では、核酸は、本明細書に記載のように、クロトータンパク質配列、任意選択的な（天然または非天然の）シグナリング配列（例えば、クロトータンパク質配列の複数のＮ末端または単数のＮ末端の）、任意選択的なリンカー配列（例えば、ＧＳリンカー）、および／またはアミノ酸タグ（例えば、ＩｇＧ１−ＦｃまたはＴＥＶ−ｔｗｉｎｓｔｒｅｐ）をコードし得る。
いくつかの実施形態では、核酸は、ヒトアルファクロトーアイソフォーム１のアミノ酸残基１〜１０１２、１〜９８１、２９〜９８１、３４〜９８１、３６〜９８１、１３１〜９８１、１〜５４９、２９〜５４９、３４〜５４９、３６〜５４９または１３１〜５４９の全てまたはサブセットを含むタンパク質を発現し得る。タンパク質の少なくとも一部分は、ヒトアルファクロトーアイソフォーム１のアミノ酸残基１〜１０１２、１〜９８１、２９〜９８１、３４〜９８１、３６〜９８１、１３１〜９８１、１〜５４９、２９〜５４９、３４〜５４９、３６〜５４９、または１３１〜５４９の全てまたはサブセットと、少なくともまたは約８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。例えば、タンパク質の少なくとも一部分は、配列番号１〜配列番号７５のうちの１つの全てもしくは一部分、またはその２つ以上の組み合わせと、少なくともおよび／または約８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。好ましい実施形態では、タンパク質は、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つの全てまたは一部分と、少なくともおよび／または約８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。
いくつかの実施形態では、核酸の少なくとも一部分は、配列番号７６〜配列番号１０１のうちの１つ、またはその２つ以上の組み合わせと、少なくともおよび／または約８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％、または１００％のヌクレオチド配列同一性を有し得る核酸の少なくとも一部分を有し得る。好ましい実施形態では、核酸は、配列番号７６〜配列番号９６のうちの１つと、少なくともおよび／または約８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％、または１００％のヌクレオチド配列同一性を有し得る。
本開示の核酸配列はまた、当該技術分野で既知の停止コドン（例えば、ＴＧＡ、ＴＡＧ、ＴＡＡ）を含み得る。
細胞株および製造方法
本開示の一実施形態は、細胞株を含み得る。細胞系は、ＣＨＯ細胞、ＨＥＫ細胞、ＨＬ−６０細胞、または当該技術分野で既知の他の細胞株などの任意の好適な細胞型を含み得る。例示的に、細胞株は、ＣＨＯ細胞（例えば、複数のＣＨＯ細胞）を含み得る。いくつかの実施形態では、ＣＨＯ細胞は、（１コピー以上の）外因性核酸を（各々）含有し得る。核酸は、配列番号１〜配列番号７５のうちの１つ、またはその２つ以上の組み合わせ、好ましくは配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと、少なくともおよび／または約８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するポリペプチドをコードし得る。
核酸は、少なくとも１つの導入遺伝子またはｃＤＮＡを含み得る。いくつかの実施形態では、核酸の少なくとも一部分は、配列番号７６〜配列番号１０１のうちの１つ、またはその２つ以上の組み合わせ、好ましくは配列番号７６〜配列番号９６のうちの１つと、少なくともおよび／または約８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％または１００％の核酸配列同一性を有し得る。核酸は、プラスミドまたは他の（構造的な）形態の核酸であり得るか、またはそれを含み得る。
いくつかの実施形態では、外因性核酸は、ジヒドロ葉酸還元酵素（ＤＨＦＲ）および／またはグルタミン合成酵素（ＧＳ）などの機能性酵素をコードし得る。少なくとも１つの実施形態では、ＣＨＯ細胞は、ＣＨＯ−Ｓ細胞などのジヒドロ葉酸還元酵素（ＤＨＦＲ）欠損ＣＨＯ細胞であり得るか、またはそれを含み得る。核酸は、プロモーター（例えば、当業者によって理解されるように、弱いプロモーターから強いプロモーター）を含み得る。例えば、いくつかの実施形態では、核酸は、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと、少なくとも８５％などの核酸配列同一性を有する導入遺伝子に関連する（強力な）プロモーターを含み得る。したがって、導入遺伝子は、プロモーターの制御下にあり得る。
便宜上、本開示全体を通して、ＣＨＯ細胞および／または細胞株について言及されている。しかしながら、他の細胞、細胞株および／または宿主細胞（ＣＨＯ細胞に加えて）もまた、本開示の範囲内で考慮されることに留意されたい。したがって、ＣＨＯ細胞および／または細胞株への言及はまた、他の既知の細胞、細胞株および／または宿主細胞への言及および／または使用も考慮する。
トランスフェクション
ＣＨＯ細胞株を製造する方法は、好ましくはトランスフェクションまたは当該技術分野で既知の他の技術を介して、外因性核酸をＣＨＯ細胞に導入することを含み得る。少なくとも１つの実施形態では、ＣＨＯ細胞株の無血清増殖最適化細胞懸濁液を、プロモーター、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有するポリペプチドをコードするヒトアルファＳ−クロトー導入遺伝子、および選択可能な（酵素）マーカーを含有する核酸（プラスミド）の挿入のための宿主細胞株として使用した。導入遺伝子はそれぞれ、ヒトアルファ可溶性クロトーのアミノ酸１〜９８１、２９〜９８１、または３４〜９８１をコードする。特定の実施形態では、導入遺伝子は、配列番号７６〜配列番号９６のうちの１つに対応する配列を有した（または配列番号７６〜配列番号９６のうちの１つと少なくとも８５％の核酸配列同一性を有した）。ＤＨＦＲ欠損ＣＨＯ細胞株（ＣＨＯ−Ｓ細胞株など）では、選択可能な（酵素）マーカーは外因性ＤＨＦＲであった。他のＣＨＯ細胞株では、選択可能な（酵素）マーカーは外因性ＧＳであった。
増殖、選択および／または遺伝子増幅
いくつかの実施形態は、固体培地で、および／または液体培地中（例えば、懸濁細胞培養物中）、好ましくは無血清および／または動物（または動物由来の）タンパク質（成分）を含まない培地中で、細胞（例えば、トランスフェクトされた細胞および／またはＣＨＯ細胞）を増殖させることを含み得る。例えば、細胞は、ある期間の間、固体増殖培地上にプレートされ得る。細胞はまた、またはあるいは、懸濁培養物中で、および／または液体培地中で増殖され得る。液体培地は、好ましくは、炭素源、窒素源、および１つ以上のビタミン、ミネラル、塩、アミノ酸、補充剤、もしくは添加剤を含む。いくつかの実施形態では、培地はまた、ヒポキサンチンおよびチミジン（ＨＴ）、グルタミンなどを欠き得る。
少なくとも１つの実施形態では、ある特定の期間後（例えば、トランスフェクション後４８時間）に、細胞を集め（例えば、切り離し）、任意選択的に遠心分離し（例えば、５分間１００×ｇ）、および／または９６ウェル付着培養プレート（例えば、血清補充された−ＨＴおよび／または−グルタミン培地を含有する）などに（例えば、およそ２０００細胞／ウェルで）播種し得る。ある特定の実施形態では、培地はまた、ＭＴＸおよび／またはＭＳＸを含み得る。非トランスフェクト細胞は、選択後（例えば、−ＨＴおよび／または−グルタミン培地中のＭＴＸおよび／またはＭＳＸへの曝露後、７〜１４日以内に死滅し得る。
ある特定の実施形態では、ＣＨＯ細胞は、（例えば、細胞当たり）少なくとも約２〜１０コピー、少なくとも約１０〜２０コピー、少なくとも約２０〜３０コピー、または少なくとも約３０〜５０コピーの外因性核酸を含有し得る（含有するように選択され得る）。したがって、方法は、（例えば、細胞当たり）少なくとも約２〜１０コピー、少なくとも約１０〜２０コピー、少なくとも約２０〜３０コピー、または少なくとも約３０〜５０コピーの外因性核酸を含有するＣＨＯ細胞を選択することを含み得る。例えば、（連続的にレベルを増加しながら）ＭＴＸおよび／またはＭＳＸを、細胞に（例えば、約１ｎＭ〜１μＭ、約１０〜１００ｎＭなどの濃度で）投与し得る。
外因性ＤＨＦＲでトランスフェクトされたＤＨＦＲ欠損ＣＨＯ細胞（ＣＨＯ−Ｓ細胞株など）におけるジヒドロ葉酸還元酵素（ＤＨＦＲ）遺伝子増幅は、増殖培地中のメトトレキサート（ＭＴＸ）のレベルを連続的に増加させることによって達成された。プラスミドはＤＨＦＲを含有するため、ＭＴＸ（１０〜１００ｎＭ）への曝露時に宿主細胞内のＳ−クロトー遺伝子（断片）の増幅が可能になる。ＧＳ遺伝子発現系もまた使用して、外因性ＧＳでトランスフェクトされたＣＨＯ細胞を増幅した（例えば、ＭＳＸへの曝露時）。あるいは、ＧＳ−／−宿主細胞株もまた使用して、ＭＳＸの必要性が排除された。これらのステップは、Ｓ−クロトー遺伝子の多数のコピー（例えば、細胞当たり１０〜３０コピーの遺伝子）の産生、およびトランスジェニック細胞株において得られるＳ−クロトータンパク質の高レベルの発現を生じた。
いくつかの実施形態では、懸濁培養物中で、タンパク質は、ＣＨＯ細胞から液体培地に分泌され得る。例えば、本開示のある特定のＣＨＯ細胞および／または細胞株は、（タンパク質を濃縮することなく）１リットルの液体培地当たり２００〜５００ｍｇのタンパク質、１リットルの液体培地当たり５００〜２０００ｍｇのタンパク質、１リットルの液体培地当たり２０００〜５０００ｍｇのタンパク質、またはそれらの間の任意の値または値の範囲の濃度で分泌し得る（または分泌するように選択され得る）。少なくとも１つの実施形態では、（選択された懸濁培養物または選択された細胞株の懸濁培養物の）培地中のヒト組換えアルファ可溶性クロトータンパク質の濃度が、タンパク質を濃縮することなく、少なくとも２００ｍｇ／Ｌ、好ましくは少なくとも５００ｍｇ／Ｌ、より好ましくは少なくとも１０００ｍｇ／Ｌ、さらにより好ましくは少なくとも２０００ｍｇ／Ｌ、なおより好ましくは少なくとも５０００ｍｇ／Ｌであるように、高産生細胞株（または懸濁培養物）が選択され得る。
制限された細胞希釈によって得られた高Ｓ−クロトー産生導入遺伝子含有コロニーのサブクローニングを行って、細胞条件培地へＳ−クロトーを５００〜２０００ｍｇ／Ｌの範囲で分泌するＳ−クロトー分泌ＣＨＯ細胞株をさらに産生した。全ての細胞構築物を制限消化し、配列を確認した。
いくつかの実施形態では、ＣＨＯ細胞は、少なくとも１０リットル、好ましくは少なくとも２５リットル、より好ましくは少なくとも５０リットル、さらにより好ましくは少なくとも１００リットル、なおより好ましくは少なくとも２５０リットル、なおより好ましくは少なくとも５００リットル、なおより好ましくは少なくとも１，０００リットル、なおより好ましくは少なくとも２，０００リットル、なおより好ましくは少なくとも２，５００リットル、なおより好ましくは少なくとも５，０００リットル、なおより好ましくは少なくとも１０，０００リットルの容積または作業容積を有するバイオリアクター内で、増殖され得る。
細胞株の維持
任意選択的な細胞サブクローニング前に増幅された高産生Ｓ−クロトー細胞株（例えば、ＤＨＦＲ／ＭＴＸまたはＧＳ／ＭＳＸ系によって産生された）については、スケールアップ中および最終的なバイオリアクターの運転まで、細胞株産生に投与される濃縮培地原料を慎重に使用して、無血清および動物性タンパク質成分を含まない基礎培地中で行った。
高産出性細胞株のスケールアップは、振盪フラスコ内またはウェーブバッグシステム（Ｗａｖｅ Ｂａｇ ｓｙｓｔｅｍｓ）内の細胞懸濁液中で細胞接種材料の増殖、続いて１００Ｌおよび次いで５００Ｌ容積のバイオリアクターで産生された細胞の連続接種によって行った。細胞生存率は、振盪フラスコ、ウェーブバッグ、またはバイオリアクター内での増殖サイクル全体を通して、８５％を超える生存細胞で、次いでＣＨＯ細胞増殖のプラトー期の間にバイオリアクター中の生存細胞数を８０％以上で維持され、産生されるＳ−クロトーが最大１〜３ｇ／Ｌで付随して産生される（「高産生性」と表記する）。
タンパク質産生
ある特定の実施形態は、哺乳動物（例えば、ＣＨＯ）細胞におけるクロトータンパク質の治療量の産生のために、強力なプロモーター配列および／または高コピー数のプラスミドを利用する組換えＤＮＡ方策を採用し得る。少なくとも１つの実施形態では、例えば、ＤＨＦＲ欠損ＣＨＯ細胞におけるジヒドロ葉酸還元酵素（ＤＨＦＲ）遺伝子増幅は、メトトレキサート（ＭＴＸ）を提供すること、および／または（連続的にレベルを増加しながらの）ＭＴＸの使用を含み得る。同様に、外因性グルタミン合成酵素（ＧＳ）遺伝子含有ＣＨＯ細胞は、メチオニンスルホキシミン（ＭＳＸ）で処理され得る。
クロトータンパク質はまた、（それに結合した）１つ以上のグリカンを含み得る。例えば、天然ヒトアルファクロトーアイソフォーム１（配列番号１）は、アミノ酸１０６、１５９、２８３、３４４、６０４、６１２および／または６９４で（グリコシル化を介して）結合したグリカンを有し得る。本開示のクロトータンパク質は、（例えば、同じアミノ酸（複数可）に）（グリコシル化を介して）そこへ結合した同じ（または同様の）グリカンのうちの１つ以上を有し得る。
少なくとも１つの実施形態では、タンパク質は、米国食品医薬品局（ＦＤＡ）によって決定および施行されるＣＧＭＰ規則に準拠し得る。例えば、クロトータンパク質は、乾燥重量で少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％純粋であり得る。いくつかの実施形態では、クロトータンパク質サンプルは、１０００万分率（ｐｐｍ）約１〜１００未満、１０００万分率（ｐｐｍ）約１００〜１０００未満、または約１〜１００ｐｐｍ未満、またはそれらの間に置かれる任意の値または値の範囲のＣＨＯ宿主細胞タンパク質（ＨＣＰ）、核酸、および／または他の細胞成分を含み得る。
産生されたＳ−クロトータンパク質の存在するグリカン構造は、ヒトの体液（すなわち、血液、血清、尿、脳脊髄液）から単離された天然Ｓ−クロトー構造体の構造と比較して、同様または同一であり得る。少なくとも１つの実施形態では、天然様グリカンの確認は、正しい天然の翻訳後修飾（ＰＴＭ）が生成され、Ｓ ＣＨＯ細胞産生Ｓ−クロトータンパク質において安定に維持されることを確実にし得る。
クロトータンパク質の溶解度および／または半減期延長
ヒトＳ−クロトータンパク質の半減期を延長し、溶解度を増加させるための方法および組成物が開示される。また、これらの結果を達成するためにそのように産生されたタンパク質構築物の精製および特徴評価も、本開示の主題である。クロトー遺伝子または核酸構築物の配列（配列番号７６〜９６参照）においてなされた核酸変化、および／またはクロトータンパク質のアミノ酸配列（配列番号１〜７０参照）における変化または化学的変質、および／またはクロトータンパク質のアミノ酸配列に対する化学基、ペプチド、またはタンパク質の付加または除去に関する関連情報は、天然クロトー分子のものよりも増加した生物学的半減期または生物学的マトリックス（血液、脳脊髄液、尿、または様々なヒト組織など）への増大した溶解度を有する、得られるヒトクロトー多様体タンパク質（新規組成物）を得るために本開示に教示されている。これらの新規組成物は、Ｓ−クロトータンパク質の修飾のために本明細書に記載の方法を通して作製され得る。
融合タンパク質構築物は、Ｓ−クロトータンパク質を抗体（ＩｇＧ）のＦｃドメインと組み合わせることによって産生され得る。
融合タンパク質構築物は、Ｓ−クロトータンパク質をヒト血清アルブミン（ＨＳＡ）と組み合わせることによって産生した。
融合タンパク質構築物は、Ｓ−クロトータンパク質をヒトトランスフェリン（ＴＦ）と組み合わせることによって産生した。
融合タンパク質は、Ｓ−クロトータンパク質をＸＴＥＮ（登録商標）などの独自の組換えポリペプチドと組み合わせることによって産生した。
新規のＳ−クロトータンパク質は、ＰＥＧ化を通して産生した。
前述および他の半減期延長法を利用して、Ｓ−クロトータンパク質の性能を以下のようないくつかの方法：
Ｓ−クロトーの投薬間隔を長くすることで、患者に優れた利便性および有望な服用コンプライアンスを提供すること、
投薬頻度を低減することにより、薬剤の総使用量を少なくし、商品費用が削減されること、
親タンパク質と同じ投薬間隔で薬剤量を少なくすること、
投薬処方を簡素化し、皮下処方を可能にすること、
親タンパク質と同じ投薬および投薬間隔を使用する、より高い薬剤レベルにより、より長い薬剤曝露および潜在的により良好な有効性を生じること、
Ｓ−クロトーの免疫原性を減少させること、で改善した。
Ｓ−クロトーのＦｃドメイン融合タンパク質構築物の産生
抗体Ｆｃドメインおよびヒト血清アルブミン（ＨＳＡ）における半減期を延長し、ヒトＳ−クロトータンパク質の溶解度を増加させる有効性について試験した。Ｆｃ融合物は、ペプチド、タンパク質または受容体エキソドメインの抗体のＦｃ部分への融合を含む。Ｆｃ融合体とアルブミンの両方は、ペプチド薬剤のサイズの増大によって半減期の延長を達成するのみならず、両者はまた、新生児Ｆｃ受容体であるＦｃＲｎへの伸長タンパク質の結合を通して、身体の自然循環機構も利用する。ＦｃＲｎ受容体への伸長タンパク質の結合後、細胞のエンドソームにおける融合タンパク質の分解が防止される。Ｆｃまたはアルブミンの添加に基づく融合は、典型的なＰＥＧ化または脂質化ペプチドについて報告されているものよりもはるかに長く、３〜１６日の範囲の生物学的半減期を生じ得る。Ｆｃ融合タンパク質、ヒト血清アルブミンへの融合、カルボキシ末端ペプチドへの融合、およびより望ましい薬物動態学的プロファイルを有するバイオベター薬剤を作製するための他のポリペプチド融合アプローチなどのタンパク質融合技術の使用について記載している論評については、その全体が特定の参照により本明細書に援用される、Ｓｔｒｏｈｌ ＷＲＦｕｓｉｏｎ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｆｏｒ Ｈａｌｆ−Ｌｉｆｅ Ｅｘｔｅｎｓｉｏｎ ｏｆ Ｂｉｏｌｏｇｉｃｓ ａｓ ａ Ｓｔｒａｔｅｇｙ ｔｏ Ｍａｋｅ Ｂｉｏｂｅｔｔｅｒｓ．Ｂｉｏｄｒｕｇｓ．２０１５；２９（４）：２１５−２３９を参照されたい。
Ｆｃドメインは、したがって、本発明者らの親タンパク質（Ｓ−クロトー）に添加されて、Ｆｃ受容体（ＦｃＲｎ）に対する結合親和性を増加した。ＦｃＲｎは、血管を覆う内皮細胞のリソソーム内に存在し、ほとんどのタンパク質を循環中に短命にする分解から抗体を救済するように機能する。ＦｃＲｎとの相互作用の結果として、タンパク質は、数日から数週間の範囲の半減期を有し、伸長された形態のタンパク質薬剤が、この新たに産生された組成物を有さない生物製剤よりも少ない投薬頻度を可能にする。
Ｆｃとアルブミンとの間の主な相違点は、Ｆｃの二量体性対ＨＳＡの単量体構造であり、ＨＳＡとは対照的に、Ｆｃ融合ペプチドが二量体または単量体として存在することにつながる。ペプチドＦｃ融合物の二量体性は、Ｓ−クロトーの標的受容体が十分に近接して離間しているか、またはそれら自体が特にヒト標的器官で二量体である場合、結合活性効果を生じ得る。これは、標的に応じて、望ましい場合もあれば、そうでない場合もある。
抗体Ｆｃに対するＳ−クロトータンパク質の融合もまた、Ｓ−クロトーの溶解度および安定性を改善するために本開示で教示される。Ｓ−クロトーへのＦｃドメインの付加はまた、ヒト被験体への投与の際に融合タンパク質の免疫原性の低下を可能にする。
Ｓ−クロトータンパク質のヒト血清アルブミン（ＨＳＡ）との接合
ヒトＩｇＧと同様の６６．５ｋＤａのタンパク質ＨＳＡは、１９日の範囲で長い平均半減期を有する。約５０ｍｇ／ｍＬ（約６００μＭ）の濃度で、ＨＳＡはヒト血漿中で最も豊富に存在するタンパク質であり、血漿ｐＨ、代謝産物および脂肪酸輸送の維持、ならびに血圧維持の役割を含むいくつかの機能を有する。タンパク質の腎臓による糸球体濾過のためのサイズの上限であるＨＳＡもまた、強いアニオン性であり、腎臓を介した濾過をさらに遅らせるのに役立つ。ＩｇＧと同様に、ＨＳＡもまた、ＩｇＧ結合とは異なる部位で、かつＩｇＧ結合のものとは別個の機構を介したとしても、ｐＨ依存的方式でＦｃＲｎに結合し、ＩｇＧと同様にリサイクルされ、その半減期の延長が生じる。ＨＳＡはまた、腫瘍および炎症を起こした組織にも蓄積する傾向があり、アルブミンへの融合または結合は、タンパク質またはペプチドをそれらの部位に標的化するのに役立値ウル可能性があることを示唆している。
これらの分子の血清半減期の延長のため、本質的に短い半減期特性を有するペプチドまたはタンパク質のＨＳＡへの融合は、１９９０年代初期から広く研究されている。それ以来、革新的および潜在的なバイオベター分子の両方として、数十の異なるペプチドおよび小さなタンパク質がＨＳＡに融合されている。市販承認された最初のＨＳＡ−ペプチドまたはタンパク質融合生成物は、Ｈｕｍａｎ Ｇｅｎｏｍｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ社で発見され、ＧｌａｘｏＳｍｉｔｈＫｌｉｎｅによって開発および市販されている、Ｔａｎｚｅｕｍ（登録商標）（欧州連合においてＥｐｅｒｚａｎ（登録商標）として市販されている）ＤＰＰ−４耐性ＧＬＰ−１−ＨＳＡ融合タンパク質であった。Ｔａｎｚｅｕｍ（登録商標）（アルビグルチド）は、２０１４年３月および４月にそれぞれ欧州医薬品局（ＥＭＡ）およびＦＤＡによって承認された。したがって、ＨＳＡは、薬理的に活性なＧＬＰ−１の半減期を、天然ＧＬＰ−１については１〜２分から４〜７日に改善し、これにより毎週１回の投薬が可能になる。７つの他の既知のＨＳＡ融合タンパク質生成物候補が現在開発中であるか、または近年開発中である。また、Ｎｏｖｏｚｙｍｅ社はさらに、より長い半減期特性を有し得る「次世代」ＨＳＡタンパク質融合体の構築のために改良されたＦｃＲｎ結合を有する組換えＨＳＡの修飾型を開発している。これは、マウスおよびカニクイザルの両方における野生型分子よりもより長い半減期をＨＳＡに与える、１２倍高いＦｃＲｎへの親和性を有することが見出された、ＨＳＡのＫ５７３Ｐ変異体の使用に基づいていた。これらのより長い半減期のＨＳＡの変異体は、融合タンパク質の半減期を改善するための融合タンパク質としてさらに使用され得ることが期待されている。
したがって、本発明者らは、患者に優れた利便性および有望な服薬コンプライアンスなどの方策的な治療上の利点をもたらすために、本発明者らのクロトータンパク質を野生型ＨＳＡまたはＨＳＡの変異体形態に融合させて、ヒト血液、脳脊髄液、および他のヒト生物学的マトリックスに、顕著に延長された半減期を有するクロトー融合分子を産生し得ることを本明細書に開示し、低減された投薬頻度により、より少ない薬剤総使用量および／または商品費用の低減が生じる。また、親タンパク質と同じ投薬間隔で薬剤量を少なくすることにより、投薬処方を簡素化し、皮下処方を可能にし得るか、またはＳ−クロトーの免疫原性の減少を可能にし得る。
Ｓ−クロトータンパク質のヒトトランスフェリン（ＴＦ）との接合
トランスフェリンは、非常に豊富な血清糖タンパク質であり、血清中に３〜４ｍｇ／ｍＬで見出され、これは強く可逆的に鉄を結合し、鉄を組織に運ぶように機能する。トランスフェリンは、６７９個のアミノ酸残基を有し、約８０ｋＤａの大きさであり、２つの高親和性Ｆｅ３＋結合部位を有し、一方はＮ末端ドメインに、他方はＣ末端ドメインにある。ヒトトランスフェリンは、７〜１０日、または１０〜１２日であると報告されている半減期を有する。総トランスフェリンプールの約２〜８％を占めるヒトトランスフェリンのアグリコシル化形態は、１４〜１７日間とわずかにより長い半減期を有する。ヒト血清中のトランスフェリンの長期持続性は、（受容体結合トランスフェリンを循環中に戻して再利用する）クラスリン依存性トランスフェリン受容体が介在する機構によるものである。
ペプチドおよびタンパク質の融合物は、ヒトトランスフェリンのＮ末端およびＣ末端に、ならびにトランスフェリンの２つの主な突起部を共に連結する、中央に位置するヒンジ領域に作製されている。トランスフェリンのＮ末端は空いており、直接融合され得る。Ｃ末端は、より埋もれており、近くのジスルフィド結合によって拘束されているので、タンパク質がＣ末端に融合されているとき、典型的には可撓性リンカーが使用される。この能力は、特定の標的に対するペプチドのライブラリーを作製し、次いでそれらのライブラリーからのバインダーをアグリコ−トランスフェリン（Ｎ末端、Ｃ末端、ループまたはリンカー領域）へと融合することによって拡大されて、延長された半減期を有する治療用融合タンパク質へと構築された。
バイオテクノロジー企業ＢｉｏＲｅｘｉｓ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｉｎｃ．，は２００２年に創設されて、トランスフェリン融合タンパク質プラットフォームを開発し、これを治療用プラットフォームとして、「Ｔｒａｎｓ Ｂｏｄｙ」プラットフォームと称した。それらのリード分子、ＢＲＸ−０５８５は、２型真性糖尿病（Ｔ２ＤＭ）の治療のためのトランスフェリン−ＧＬＰ−１融合タンパク質であった。トランスフェリンへのＧＬＰ−１の融合は、ＧＬＰ−１の半減期を顕著に向上することが実証された。ＢｉｏＲｅｘｉｓ社は、２００７年３月にファイザー社によって買収された。確認され得る限りでは、ＢｉｏＲｅｘｉｓ由来の融合タンパク質は現在のところ病院にはない。クロトータンパク質は、半減期、またはインビボでのヒト生物学的マトリックス中での安定性を顕著に延長するために、ヒトトランスフェリンに融合されてクロトー融合分子を産生することができ、かつ病院で投与されることができる。
Ｓ−クロトータンパク質のＡｍｕｎｉｘ社のＸＴＥＮとの接合
ＸＴＥＮ（登録商標）は、治療用ペイロードのインビボ半減期を延長する、独占所有権下にある組換えポリペプチドである。ＸＴＥＮは、天然の親水性アミノ酸からなり、生分解性である。タンパク質、ペプチド、および合成化合物などの医薬品は、化学的接合または遺伝子融合を介してＸＴＥＮ化され得る。ＸＴＥＮタンパク質は、二次および三次構造を欠き、その溶液挙動は、非常に大きな流体力学的半径を有する化学的に調製されたポリマーに似ている。サイズ排除クロマトグラフィーによって、ＸＴＥＮタンパク質ポリマーは、同様の分子量の典型的な球状タンパク質よりもはるかに大きく見える。ＸＴＥＮのバルキング効果は、結合した分子の腎クリアランスを大幅に低減し、したがってインビボ半減期を大幅に増大する。本発明では、クロトータンパク質に結合されるＸＴＥＮポリマーの長さは、薬剤動態、ならびに結合されるクロトータンパク質ペイロードの体内分布を最適化するように仕様されるであろう。
したがって、ＸＴＥＮは、分子のインビボ半減期を増加するために、発明者らのＳ−クロトータンパク質に組換え融合され得る。１つの利点は、遺伝子的Ｓ−クロトー−ＸＴＥＮ融合構築物により、治療部分とバルキング部分の両方を含む単一分子の発現、精製および特徴づけの利便性を有する分子が産生されることである。ＸＴＥＮ化成長ホルモン（Ｓｏｍａｖａｒａｔａｎ、Ｖｅｒｓａｒｔｉｓ社）およびＦＶＩＩＩ−ＸＴＥＮ（Ｂｉｏｇｅｎ社）によって例示されるような、クラス最高の薬剤動態を生じる治療薬剤製造業者による組換え融合は、精密に限定された位置にタンパク質ごとに複数のＸＴＥＮ鎖を付着させることを可能にし、うまく使用されている。例えば、異なる投薬量のＸＴＥＮ化成長ホルモン（Ｓｏｍａｖａｒａｔａｎ、Ｖｅｒｓａｒｔｉｓ社）を投与された小児において行われた薬剤動態は、腎臓クリアランスに加えて受容体介在性排出を低減する、Ｓｏｍａｖａｒａｔａｎ分子の最適化を示しており、クラス最高の半減期を生じる。
ＸＴＥＮタンパク質ポリマーは、ペプチド、ペプチド模倣体、および他の合成分子への化学接合のための遊離中間体として産生され得る。反応基（チオール、アミン）は、ＸＴＥＮをコードする遺伝子にシステインまたはリシン残基を導入することを介して、精密に限定された位置に挿入される。Ａｍｕｎｉｘ社は、様々な間隔で１〜９個のチオール基を含有するＸＴＥＮを開発し、これは提携先に提供され得る。したがって、本発明では、ＸＴＥＮ中のアミノ基およびチオール基への直交接合は、本発明者らのクロトー−ＸＴＥＮ分子の産生を容易にするであろう。
タンパク質の精製
クロトータンパク質は、ＣＨＯ細胞の（例えば、ＣＨＯ細胞株の）細胞懸濁培養物から抽出され得る。ＣＨＯ細胞は、クロトータンパク質を産生し、任意選択的に（例えば、液体培地中に）分泌し得る。細胞消費培地への、最高２００〜５００ｍｇ／ＬのＳ−クロトーの分泌もまた、観察された。
本開示の組換えタンパク質の精製は、当該分野で既知の、または本明細書に記載の任意の好適な方法、例えば抽出、沈殿、クロマトグラフィーおよび／または電気泳動を含む任意の従来の手順によって実行され得る。タンパク質を精製するために使用され得るさらなる精製手順は、標的タンパク質を結合するモノクローナル抗体を使用する親和クロマトグラフィーを含む。いくつかの実施形態は、親和クロマトグラフィーによって精製され得るＩｇＧタグ付きタンパク質を含み得る。一般に、組換えタンパク質を含有する粗調製物は、好適なモノクローナル抗体が固定化されたカラムに通される。タンパク質は通常、不純物が通過する間に特異的な抗体を介してカラムに結合する。カラムを洗浄後、ｐＨまたはイオン強度を変えることによって、タンパク質はゲルから溶出される。例えば、ＣＨＯ−Ｓ高産出性細胞株からの消費培地を、接線流濾過を介して濃縮し、親和クロマトグラフィー、続いてイオン交換カートリッジまたはカラムクロマトグラフィーによってＳ−クロトータンパク質を精製した。サイズ排除クロマトグラフィーはまた、タンパク質の精製に使用され得る。
代替的プロトコルでは、１つ以上の親和性精製の前または後のステップが実施された。かかるステップとしては、例えば、（超）遠心分離、透析、膜および／もしくは接線流濾過、イオン交換などのクロマトグラフィー分離、（水性）二相抽出法などの液−液抽出法、または他の既知の精製ステップが挙げられ得る。ある特定の実施形態では、１つ以上の精製後処理ステップが実施された。かかる精製後処理ステップとしては、例えば、タンデムアニオン／カチオンフロースルークロマトグラフィー（結合および溶出クロマトグラフィーと対照的に）、膜濾過（例えば、０．２ミクロン、０．１ミクロンなど）による、または当業者に既知の他の手段によるウイルスおよび／または細菌の除去が挙げられ得る。
クロトータンパク質の分析
タンパク質純度は、ＳＤＳ−ＰＡＧＥまたは他のアッセイまたは当該技術分野で既知の手段によって実証され得る。例えば、少なくとも１つの実施形態では、クロトータンパク質サンプル（５０μｇ）をプレキャストＳＤＳ−ＰＡＧＥゲル（４〜１５％、１０ウェル；カタログ番号４５６−１０８３；ＢｉｏＲａｄ社）で分画し、クマシーブルー色素で染色した。サンプル間の混入を避けるために、全てのサンプルを、空のレーンを間に置くか、または別々のゲル上に置いた。クマシーブルー色素およびデンシトメトリーの透写によって、または銀染色の視覚化によって、またはＨＰＬＣもしくはＲＰ−ＨＰＬＣによって測定されたように、９８％を超えるＳ−クロトーがＣＨＯ Ｓ条件培地から単離されたことが示された。配列情報を得るために、タンパク質化学の既知の方法に従って、タンパク質（還元およびＳ−カルボキシメチル化後）を臭化シアン、トリプシン、および／またはプロテイナーゼＫで切断し、ＨＰＬＣによってペプチドを分離し得る。次いで、このように調整されたサンプルを、コンセントに接続した、オンライン自動ＨＰＬＣ ＰＴＨアミノ酸分析器（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ社モデル１２０、ＡＢＩ下記参照）を含む自動気相ミクロ配列決定装置（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ社モデル４７０Ａ、ＡＢＩ、米国カリフォルニア州フォスターシティ）で、配列決定した。
タンパク質はまた、質量分析法を通して分析された。質量分析のためのサンプル調製に関しては、分析を正しいＳ−クロトータンパク質に限定するために、分析のために７５〜１５０ｋＤａのゲルバンドのみを切り抜いた。ゲル画分を、滅菌ブレードで軟化し、ゲル内消化に供した。ゲル画分を、８０μＬの５０％アセトニトリル（ＡＣＮ）／５０ｍｍ炭酸水素アンモニウムで３回洗浄することによって脱色し、１００％ＡＣＮで洗浄した。アルキル化ステップは、標的α−クロトーペプチド由来のシステイン残基が存在しないと考慮して省略した。６０μＬのトリプシン（配列決定グレード改変、カタログ番号Ｖ５１１Ａ；Ｐｒｏｍｅｇａ社）を用いて、５０ｍｍ炭酸水素アンモニウム（０．００５μｇ／μＬ）中で、トリプシン消化を３７℃で一晩実行した。このプロセスで２５μＬが得られ、そのうち５μＬ（Ｓ−クロトーでは１μＬ）を、ｎａｎｏＬＣ （Ｄｉｏｎｅｘ Ｕｌｔｉｍａｔｅ ３０００ ＵＨＰＬＣ）に取り付けられた、Ｏｒｂｉｔｒａｐ ｎａｎｏ−ＥＳＩＱ−Ｅｘａｃｔｉｖｅ質量分析計（Ｔｈｅｒｍｏ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ社）で、液体クロマトグラフィー−エレクトロスプレーイオン化タンデム質量分析（ＭＳ／ＭＳ）およびＰＲＭ分析に供した。ＭＳ／ＭＳ分析では、本開示の実施形態によって産生されたヒト組換えアルファ−Ｓ−クロトーが、ヒト血液、血清、尿または脳脊髄液に見出されるものと実質的に同様である（例えば、対応するアミノ酸配列において同一である）ことが確認された。
上記の精製方法を使用して、混入されたＣＨＯ宿主細胞タンパク質（ＨＣＰ）のレベルは、精製されたＳ−クロトータンパク質において許容可能であると判定された。最終的なＳ−クロトー生成物では、ＨＣＰを＜１〜１００ｐｐｍまで除去した。９８＋％純度のＳ−クロトータンパク質生成物を、使用されたＣＨＯ Ｓ産出細胞株（細胞および／または液体培地）から単離した。具体的には、ヒト被験体での臨床投与に好適な分析プロファイルを有するＣＧＭＰグレードのヒトアルファ−Ｓ−クロトーを産生し、精製した。例えば、ヒト組換えアルファＳ−クロトーの分析プロファイルは、ｈｔｔｐ：／／ｐｒｏｔｅｏｍｅｃｅｎｔｒａｌ．ｐｒｏｔｅｏｍｅｘｃｈａｎｇｅ．ｏｒｇ／ｃｇｉ／ＧｅｔＤａｔａｓｅｔ？ＩＤ＝ＰＸＤ００２７７５で見出され得る、ＰｒｏｔｅｏｍｅＸｃｈａｎｇｅＤａｔａｂａｓｅの参照番号ＰＸＤ００２７７５に表記されている。ＮＩＨの完全Ｓ−クロトータンパク質データセットは、ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／ｐｒｏｔｅｉｎ／Ｑ９ＵＥＦ７にある。
臨床投与に好適なＳ−クロトーの分析プロファイル、および本開示の一実施形態で得られた分析プロファイルは、Ｓ−クロトー１μｇ当たり０．１ｎｇ（１ＥＵ／μｇ）未満のエンドトキシンレベルを含んでいた。加えて、精製されたヒト組換えＳ−クロトーはまた、ＳＤＳ ＰＡＧＥによって＞または＝９８％の純度を有することも示された。
ＣＨＯ Ｓ細胞で産生されたＳ−クロトーに存在するグリカン構造は、ヒトの体液（すなわち、血液、血清、尿、および脳脊髄液）から単離された天然Ｓ−クロトーの構造と比較して同一であった。これにより、Ｓ ＣＨＯ細胞中で産生されたＳ−クロトータンパク質において、同じ天然の翻訳後修飾（ＰＴＭ）が生成され、安定に維持されたことが確実になった。したがって、本明細書に記載の製造および精製方法を使用して、本発明者らは、ヒト被験体への臨床投与に好適な分析プロファイルを有するｃＧＭＰグレードのヒトＳ−クロトーの産生に成功している。
治療用組成物
本開示のいくつかの実施形態は、治療用組成物などの医薬組成物を含み得る。本開示の医薬組成物は、一般に、治療有効量の組換え可溶性アルファクロトータンパク質と、１つ以上の追加の成分で構成されるビヒクルまたは担体との混和物を含み得る。成分は、１つ以上の凝集阻害剤、緩衝液、等張化剤、および追加の賦形剤を含み得る。担体中の主溶媒は、本質的に水性または非水性のいずれであってもよい。組成物は、本開示の精製クロトータンパク質を薬学的に許容可能な担体と組み合わせることによって調製され得る。
当業者であれば、組成物中に含まれる様々な成分の組み合わせが、任意の適切な順序で行われ得ること、すなわち緩衝液が最初、中間または最後に添加され得、等張化剤もまた、最初、中間または最後に添加され得ることが理解されるであろう。これらの化学物質のいくつかは、ある種の組み合わせでは不適合であり得、したがって、同様の特性を有するが関連する混合物に適合する異なる化学物質で容易に置換されることもまた、当業者には理解されるものである。
凝集阻害剤は、不適切なまたは望ましくない三成分または四成分の複合体に会合するポリペプチドの傾向を低減する。アミノ酸Ｌ−アルギニン、および／またはＬ−システインは、製剤中のＦｃドメイン含有ポリペプチドの凝集を長期間、例えば、２年以上、低減するように作用し得る。製剤中の凝集阻害剤の濃度は、好ましくは約１ｍＭ〜１Ｍ、より好ましくは約１０ｍＭ〜約２００ｍＭ、より好ましくは約１０ｍＭ〜約１００ｍＭ、さらにより好ましくは約１５ｍＭ〜約７５ｍＭであり、またより好ましくは約２５ｍＭである。これらの化合物は、商業的供給元から入手可能である。
本開示の組成物は、緩衝液を含み得る。緩衝液は、ｐＨを所望の範囲に維持する。本開示の医薬組成物への使用に好適な様々な緩衝液としては、ヒスチジン、リン酸カリウム、アルカリ塩、リン酸ナトリウムもしくはリン酸カリウムまたはそれらの水素塩もしくは二水素塩、クエン酸ナトリウムまたはクエン酸カリウム／クエン酸、酢酸ナトリウム／酢酸、マレイン酸、酢酸アンモニウム、トリス−（ヒドロキシメチル）−アミノメタン（トリス）、様々な形態の酢酸塩およびジエタノールアミン、ならびに当該技術分野で既知の、所望の範囲内に溶液のｐＨを維持するための任意の他の薬学的に許容可能なｐＨ緩衝液が挙げられる。これらの緩衝液の混合物もまた、使用され得る。
組成物に有用な緩衝液の量は、使用される特定の緩衝液および溶液のｐＨに大きく依存する。例えば、酢酸塩はｐＨ６よりもｐＨ５でより効率的な緩衝液であるため、ｐＨ６よりもｐＨ５では、より少ない酢酸塩が溶液に使用され得る。好ましい製剤の好ましいｐＨは４．０〜５．０の範囲であり、所望のｐＨを得るために、塩酸、クエン酸、水酸化ナトリウムまたはその塩などのｐＨ調整剤もまた、含まれ得る。
１つの好ましい緩衝液は、その緩衝能がｐＨ６．２付近のリン酸ナトリウムである。しかしながら、任意の所望のｐＨ緩衝を達成するために、他の緩衝液が選択され得ることが理解されるであろう。製剤中の緩衝液の濃度は、好ましくは約１ｍＭ〜約１Ｍ、より好ましくは約１０ｍＭ〜約２００ｍＭである。緩衝液は当該技術分野で公知であり、既知の方法によって製造され、商業的供給者から入手可能である。
医薬組成物のｐＨを生理学的レベル付近に設定すると、投与時の患者の快適性が最大化される。特に、ｐＨは、ｐＨ約５．８〜８．４の範囲内であることが好ましく、約６．２〜７．４が好ましいが、しかしながら、ｐＨは必要に応じて調整されて、特定の製剤などの中のポリペプチドの安定性および溶解度を最大化し得、生理学的範囲外のｐＨであっても患者にとって許容できるものが、本開示の範囲内であることが理解されるものである。
本開示の製剤は、（例えば、注射のために溶液を患者の血液と等張にするために）１つ以上の等張化剤をさらに含み得る。等張化剤は、溶液の重量オスモル濃度に寄与する分子であると理解される。医薬組成物の重量オスモル濃度は、好ましくは、活性成分の安定性を最大化し、投与時の患者の不快感もまた、最小限にするために調節される。それは、血清がキログラム当たりおよそ３００＋／−５０ミリモルであるときである。医薬組成物が血清と等張性であること、すなわち等張化剤を添加することによって達成される同じまたは同様の重量オスモル濃度を有することが一般的には好ましく、したがって、重量オスモル濃度が約１８０〜約４２０ミリオスモルであり得ると考慮されるが、重量オスモル濃度は、特定の条件で必要なように、より高いかまたはより低いかのいずれでもよいことが理解されるものである。
典型的な等張化剤は、当該技術分野で公知であり、これらに限定されないが、様々な塩、アミノ酸、または多糖類が挙げられる。好適なアミノ酸の非限定的な例としては、グリシンが挙げられる。好適な多糖類の非限定的な例としては、スクロース、マンニトール、およびソルビトールが挙げられる。一度に２つ以上の等張化剤が使用され得、例えば、ソルビトールとグリシンとを組み合わせて使用して、製剤の張度を変更し得ることが理解される。
重量オスモル濃度の変更のために好適な等張化剤の追加の例としては、これらに限定されないが、アミノ酸（例えば、アルギニン、システイン、ヒスチジン、およびグリシン）、塩（例えば、塩化ナトリウム、塩化カリウム、およびクエン酸ナトリウム）、および／または糖類（例えば、スクロース、グルコース、およびマンニトール）が挙げられる。製剤中の等張化剤の濃度は、好ましくは約１ｍＭ〜１Ｍ、より好ましくは約１０ｍＭ〜約２００ｍＭである。等張化剤は当該技術分野で公知であり、既知の方法によって製造され、商業的供給者から入手可能である。
溶液中（乾燥または凍結形態でも）でポリペプチドを安定化させる化学的添加剤、共溶質または共溶媒とも称される、賦形剤もまた、医薬組成物に添加され得る。賦形剤は、所望の効果、例えば安定化、等張性を提供するために医薬組成物に添加される非治療薬として本明細書では定義される。望ましい賦形剤の共通の属性は、水溶性、非毒性、非反応性、体からの迅速なクリアランス、および免疫原性の欠如である。加えて、賦形剤は、加工、保存および患者への投与中の薬剤の有効性および安全性を維持するために、タンパク質の天然のコンフォメーションを安定化することが可能であるべきである。例としては、これらに限定されないが、スクロース、ラクトース、グリセロール、キシリトール、ソルビトール、マンニトール、マルトース、イノシトール、トレハロース、グルコースなどの糖／ポリオール；血清アルブミン（ウシ血清アルブミン（ＢＳＡ）、ヒトＳＡまたは組換えＨＡ）、デキストラン、ＰＶＡ、ヒドロキシプロピルメチルセルロース（ＨＰＭＣ）、ポリエチレンイミン、ゼラチン、ポリビニルピロリドン（ＰＶＰ）、ヒドロキシエチルセルロース（ＨＥＣ）などのポリマー；多価アルコール（例えば、ＰＥＧ、エチレングリコール、およびグリセロール）ジメチスルホキシド（ｄｉｍｅｔｈｙｓｕｌｆｏｘｉｄｅ）（ＤＭＳＯ）、およびジメチルホルムアミド（ＤＭＦ）などの非水性溶媒；プロリン、Ｌ−セリン、グルタミン酸ナトリウム、アラニン、グリシン、リジン塩酸塩、サルコシン、およびガンマ−アミノ酪酸などのアミノ酸；Ｔｗｅｅｎ（登録商標）−８０（ポリソルベート８０）、Ｔｗｅｅｎ（登録商標）−２０（ポリソルベート２０）、ＳＤＳ、ポリソルベート、ポリオキシエチレンコポリマーなどの界面活性剤；ならびにリン酸カリウム、酢酸ナトリウム、硫酸アンモニウム、硫酸マグネシウム、硫酸ナトリウム、トリメチルアミンＮ−オキシド、ベタイン、金属イオン（例えば、亜鉛、銅、カルシウム、マンガン、およびマグネシウム）、ＣＨＡＰＳ、モノラウレート、２−Ｏ−ベータ−マンノグリセラート（ｍａｎｎｏｇｌｙｃｅｒａｔｅ）などの諸々の賦形剤、または上記の任意の組み合わせが挙げられる。
本開示の製剤中の１つ以上の賦形剤の濃度は、好ましくは約０．００１〜５重量パーセント、より好ましくは約０．１〜２重量パーセントである。賦形剤は当該技術分野で公知であり、既知の方法によって製造され、商業的供給者から入手可能である。
１つの例示的な実施形態では、本開示の製剤は、ＨＥＰＥＳ、ＭＥＳ、またはＴｒｉｓ−ＨＣｌ、および任意選択的に、本明細書に記載の１つ以上の追加の成分でｐＨ約７．３〜７．４に緩衝された約１５０ｍＭのＮａＣｌを含み得る。
１つの例示的な実施形態では、本開示の製剤は、ｐＨ約６．０〜ｐＨ約７．０で、約２５〜約５０ｍｇのＴＮＦＲ：Ｆｃ（エタネルセプト）、約１０ｍＭ〜約１００ｍＭのＬ−アルギニン、約１０ｍＭ〜約５０ｍＭのリン酸ナトリウム、約０．７５％〜約１．２５％のスクロース、約５０ｍＭ〜約１５０ｍＭのＮａＣｌを含み得る。別の実施形態では、Ｌ−アルギニンは、製剤中でＬ−システイン（約１〜約５００マイクロモル）で置き換えられ得る。さらに別の実施形態では、ｐＨは、ｐＨ約７．０であり得る。別の特定の実施形態では、本開示の製剤は、ｐＨ約６．２で、約２５ｍｇ／ｍｌのＴＮＦＲ：Ｆｃ、約２５ｍＭのＬ−アルギニン、約２５ｍＭのリン酸ナトリウム、約９８ｍＭの塩化ナトリウム、および約１％のスクロースを含み得る。
別の実施形態では、本開示の製剤は、ｐＨ約６〜ｐＨ約７で、約１０ｍＭ〜約１００ｍＭのＬ−アルギニン、約１０ｍＭ〜約５０ｍＭのリン酸ナトリウム、約０．７５％〜１．２５％のスクロース、約５０ｍＭ〜約１５０ｍＭのＮａＣｌ中に、約１０〜約１００ｍｇ／ｍＬのＲＡＮＫ：Ｆｃを含み得る。特定の実施形態では、本開示の製剤は、ｐＨ約６．２で、約２５ｍＭのＬ−アルギニン、約２５ｍＭのリン酸ナトリウム、約９８ｍＭの塩化ナトリウム、および約１％のスクロース中に、５０ｍｇ／ｍｌのＲＡＮＫ：Ｆｃを含む。
さらに別の実施形態では、本開示の製剤は、ｐＨ約６〜７で、有効量のＦｃドメイン含有ポリペプチド、約１０ｍＭ〜約１００ｍＭのＬ−アルギニン、約１０ｍＭ〜約５０ｍＭのリン酸ナトリウム、約０〜５％のマンニトール、および０〜０．２％のＴｗｅｅｎ（登録商標）−２０（ポリソルベート２０）を含み得る。別の実施形態では、本開示の製剤は、Ｅｍａｂ（抗−ＣＤ２２特異的抗体）などの有効量の抗体、約２５ｍＭのＬ−アルギニン、約２５ｍＭのリン酸ナトリウム、約４％のマンニトール、約０．０２％のＴｗｅｅｎ（登録商標）−２０（ポリソルベート２０）を含み得、かつｐＨ約６．０である。
さらに別の実施形態では、本開示は、治療有効量の本明細書に記載の医薬組成物を投与することを含む、哺乳動物を治療する方法であって、哺乳動物が、組成物中のＦｃドメイン含有ポリペプチドで有益に治療され得る疾患または障害を有する、方法を提供する。さらに別の実施形態では、Ｆｃドメイン含有ポリペプチドは、組成物で治療されるであろう哺乳動物と同じ種に由来する。特定の実施形態では、哺乳動物は、治療を必要とするヒトの患者である。組成物のＦｃドメイン含有ポリペプチドがＴＮＦＲ：Ｆｃであるとき、治療され得る疾患または障害の例としては、これらに限定されないが、関節リウマチ、乾癬性関節炎、強直性脊椎炎、ウェゲナー病（肉芽腫症）、クローン病（または炎症性腸疾患）、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）、Ｃ型肝炎、子宮内膜症、喘息、悪液質、乾癬、およびアトピー性皮膚炎、または１つ以上のクロトー遺伝子に変異を有する遺伝性疾患を有する人が挙げられる。ＴＮＦＲ：Ｆｃで治療され得る追加の疾患または障害としては、ＷＯ００／６２７９０、ＷＯ０１／６２２７２、および米国特許出願第２００１／００２１３８０号に記載のものが挙げられ、その関連部分が参照により本明細書に援用される。
さらに別の実施形態では、本開示は、本開示の医薬組成物中のＦｃドメイン含有ポリペプチド安定性の加速安定性を試験するための方法であって、保存前に本開示に従って配合されたポリペプチドの活性を試験するためのステップ、すなわち開始時、組成物を３７℃で１ヶ月間保存し、ポリペプチドの安定性を測定するステップと、開始時から１ヶ月時点の安定性形態を比較するステップとを含む、方法を提供する。この情報は、最初は良好な安定性を有するように見えるが、長期間良好に保存されないバッチまたはロットを早期に除去するのに役立つ。
さらに、医薬組成物は、活性成分、例えばＦｃドメイン含有ポリペプチドが、液体かまたは凍結状態のいずれかの保存段階にわたって安定であるように、長期保存を提供する。本明細書で使用される場合、語句「長期間」の保存とは、医薬組成物が、３ヶ月以上、６ヶ月以上、１年以上、および好ましくは２年以上保存され得ることを意味すると理解される。長期保存はまた、医薬組成物が、２〜８℃で液体として保存されるか、または例えば−２０℃またはそれ以下（例えば−２０℃または−８０℃）で凍結されるかのいずれかを意味すると理解される。組成物はまた、２回以上凍結および解凍され得ることも考慮される。長期保存に関する用語「安定」は、医薬組成物の活性ポリペプチドが、保存開始時の組成物の活性と比較して、２０％、より好ましくは１５％、さらにより好ましくは１０％、および最も好ましくは５％を超えてその活性を失わないことを意味すると理解される。
１つ以上の抗酸化剤は、本開示の製剤に含められ得る。製剤の調製への使用を考慮される抗酸化剤としては、グリシンおよびリシンなどのアミノ酸、ＥＤＴＡおよびＤＴＰＡなどのキレート剤、ならびにソルビトールおよびマンニトールなどのフリーラジカルスカベンジャーが挙げられる。
例えば非経口の徐放性製剤、ミスト吸入、経口活性製剤、または坐剤などの、他の有効な投与形態もまた想定される。このように、配合物はまた、バルク浸食性ポリマー（ｂｕｌｋ ｅｒｏｓｉｏｎ ｐｏｌｙｍｅｒｓ）（例えば、ポリ（乳酸−グリコール酸共重合体）（ＰＬＧＡ）コポリマー、ＰＬＧＡポリマーブレンド、ＰＥＧのブロックコポリマー、および乳酸およびグリコール酸、ポリ（シアノアクリレート）などのポリマー化合物の微粒子調製物）；表面侵食性ポリマー（例えば、ポリ（無水物）、およびポリ（オルトエステル））；ヒドロゲルエステル（例えば、プルロニックポリオール、ポリ（ビニルアルコール）、ポリ（ビニルピロリドン）、無水マレイン酸−アルキルビニルエーテルコポリマー、セルロース、ヒアルロン酸誘導体、アルギネート、コラーゲン、ゼラチン、アルブミン、ならびにデンプンおよびデキストラン）、およびそれらの組成物系の微粒子調製物、またはリポソームもしくは微小球の調製物を含み得る。かかる製剤は、本タンパク質および誘導体の物理的状態、安定性、インビボ放出速度、およびインビボクリアランスの速度に影響し得る。所望のタンパク質のための最適な医薬製剤は、投与経路および所望の投薬量に依存して、当業者によって決定され得る。例示的な医薬製剤は、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ´ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，１８ｔｈ Ｅｄ．（１９９０），Ｍａｃｋ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏ．，Ｅａｓｔｏｎ，Ｐａ．１８０４２、ｐａｇｅｓ１４３５−１７１２に開示されおり、この開示は参照により本明細書に援用される。
生物活性
（事前に）ヒト組換えアルファ可溶性クロトーの有効性を評価および／または有効投薬量（年齢に関係する障害または代謝障害を呈する患者、被験体、または個体に対する）を測定するための方法としては、（例えば、哺乳類（例えば、マウス、ラット、霊長類、または他の何らかの非ヒト）、または他の動物（例えば、アフリカツメガエル、ゼブラフィッシュ、またはハエ（例えばキイロショウジョウバエ）または線虫（例えば、カエノラブディティスエレガンス）などの）生物に基づいたアッセイを実施することが挙げられる。クロトータンパク質は、生物に１回、またはレジメン（規則的または不規則的）通りに投与され得る。例えば、タンパク質は、所与の期間（例えば、毎月、半月毎、毎週、半週毎、毎日など）に好適な回数（例えば、１回、２回など）投与され得る。次いで、生物パラメータ（例えば、年齢に関連するパラメータ）が評価され得る。対象のクロトータンパク質は、参照（例えば、対照生物のパラメータ）と比較して、パラメータの変更を実施するか、または生じる。他のパラメータ（例えば、毒性、クリアランス、および薬剤動態に関係する）もまた、評価され得る。
本開示のクロトータンパク質は、年齢に関係するまたは年齢に関連する障害または病態、代謝障害または病態など、特定の障害または病態を有するかまたはそれを呈する動物（モデル）を使用して評価され得るかかる障害および病態はまた、タンパク質の生理学上の効果が観察され得る感作系を提供し得る。例示的な障害としては、例えば、除神経、廃用性萎縮、代謝障害（例えば、ｄｂ／ｄｂマウス、ｏｂ／ｏｂマウスなどの肥満および／または糖尿病動物の障害）、脳障害、肝虚血または他の肝障害、シスプラチン／タキソール／ビンクリスチンモデル、様々な組織（異種移植）移植、遺伝子導入骨モデル、疼痛症候群（例えば、炎症性および神経障害）、パラコート中毒、遺伝毒性、酸化ストレスモデル、および腫瘍（Ｉ）モデルが挙げられる。
本開示のＳ−クロトータンパク質を評価するために、タンパク質を好適な動物に（好適な治療期間の間）投与してもよく、動物のパラメータを（例えば、１０〜６０分、１〜２４時間、１〜３０日、１〜１２ヶ月、１〜５年、またはそれらの間の任意の値もしくは値の範囲などの好適な期間の後で）評価する。動物には、随意にまたは通常通り栄養を与えてもよい（例えば、カロリー制限下ではないが、いくつかのパラメータは、かかる条件下で評価され得る）。典型的には、かかる動物のコホートが、アッセイに使用される。一般に、試験ポリペプチドが、カロリー制限を供される同様の動物の表現型の方向にパラメータを影響する場合、試験ポリペプチドは、動物の寿命調節を好都合に変化させて示され得る。かかる試験ポリペプチドは、生物にカロリー摂取させないのではなく、カロリー制限（例えば、かかる影響のサブセット）による寿命調節効果を少なくともいくらか引き起こし得る。
試験されるパラメータは、年齢に関連するまたは疾患に関連するパラメータ（例えば、動物モデルに関連する障害の症状）であり得る。好都合に示される試験タンパク質は、ポリペプチドで処理されていない同様の参照動物と比較して、症状の改善を引き起こし得る。障害または加齢に関連する他のパラメータとしては、抗酸化レベル（例えば、抗酸化酵素レベルまたは活性）、ストレス耐性（例えば、パラコート耐性）、深部体温、グルコースレベル、インスリンレベル、甲状腺刺激ホルモンレベル、プロラクチンレベル、および黄体形成ホルモンレベルが挙げられ得る。
年齢に関係する障害を治療するための本開示のＳ−クロトータンパク質の有効性を測定するために、クロトー発現の低下した動物（例えば、変異体またはクロトー遺伝子欠損を有するマウス）が使用され得る。例えば、試験タンパク質は、変異マウスに投与されて、年齢に関係するパラメータをモニターしてもよい。好都合に示される試験タンパク質は、タンパク質で治療されていない同様の参照動物と比較して症状の改善を引き起こし得る。
代謝障害または加齢に関連するパラメータは、体重の測定、生殖能力獲得の検査、血糖レベルの測定、寿命の観察、皮膚の観察、歩行などの運動機能の観察などによって評価され得る。評価はまた、胸腺重量の測定、胸腔の内面に形成された石灰化結節の大きさの観察などによっても行われ得る。さらに、クロトー遺伝子またはクロトータンパク質のｍＲＮＡの定量測定もまた、評価に有用であり得る。
さらに他の（インビボ）モデルおよびバイオアッセイとしては、代謝パラメータ、例えばインスリン障害、ＩＩ型糖尿病に関連するパラメータで動物を評価することが挙げられる。例示的な代謝パラメータとしては、グルコース濃度、インスリン濃度、およびインスリン感受性が挙げられる。
試験タンパク質が寿命調節を変化可能か評価する際に、多くの年齢に関連するパラメータまたはバイオマーカーが監視または評価され得る。例示的な年齢に関連するパラメータとしては、（ｉ）細胞または生物の寿命、（ｉｉ）生物学的な年齢に依存する発現パターンを有する細胞または生物における遺伝子転写または遺伝子産物の存在または存在量、（ｉｉｉ）ストレスに対する細胞または生物の耐性、（ｉｖ）細胞または生物の１つ以上の代謝パラメータ（例示的なパラメータとしては、循環インスリンレベル、血中グルコースレベル、脂肪含有量、深部体温などが挙げられる）、（ｖ）生物に存在する細胞または細胞の組の増殖能力、（ｖｉ）細胞または生物の物理的外観または挙動、が挙げられる。
用語「平均寿命」とは、生物コホートの平均死亡年齢を指す。場合によっては、「平均寿命」は、制御された環境条件下で遺伝的に同一の生物のコホートを使用して評価される。事故による死亡は、数に入れない。制御された環境条件下で平均寿命が測定できない場合（例えば、ヒトの場合）、十分に大きな母集団に対する信頼できる統計情報（例えば、数理表から）が、平均寿命として使用され得る。
２つのかかる生物、例えば１つの参照生物とＳ−クロトータンパク質で治療された１つの生物との間の分子差の特徴付けにより、生物の生理学的状態の差異を明らかにすることができる。参照生物および治療された生物は、典型的には、同じ（または実質的に同じ）実年齢および／または性別である。本明細書で使用される場合、用語「実年齢」とは、受胎、定義された胎生期もしくは胎児期、またはより好ましくは出生などの、予め選択された事象から経過した時間を指す。生物が比較分析のために「同じ」実年齢のものであるかを決定するために、種々の基準が使用され得る。
典型的には、必要とされる精度の程度は、野生型生物の平均寿命と相関している。例えば、実験室野生型株Ｎ２がいくつかの制御条件下で平均約１６日間生存する線虫カエノラブディティスエレガンスの場合、同じ年齢の生物は同日数の間生存し得る。マウスの場合、同年齢の生物は同じ週数または月数の間、霊長類またはヒトの場合、同じ年数（すなわち２年、３年または５年以内）など、生存し得る。一般的に、同じ実年齢の生物は、その種の野生型生物の平均寿命の１５、１０、５、３、２または１％以内の時間量の間生存し得る。好ましくは、生物は、（例えば、平均的な野生型生物が、生殖能力のある年齢まで成熟する、すくなくともある時間量の間生物が生存した）成体である。
生物が加齢の明白な物理的特色を呈する前に、生物学的スクリーニングアッセイが実施され得る。例えば、生物は、同じ種の野生型生物の平均寿命の１０、３０、４０、５０、６０、または７０％のみ生存した成体であってもよい。代謝、免疫能力、および染色体構造の、年齢に関連した変化が報告されている。これらの変化のいずれかは、試験被験体（例えば、生物に基づくアッセイ）において、または（例えば、（ヒトまたは哺乳類）患者の）本明細書に記載の治療剤での治療前、治療中または治療後のいずれかで評価され得る。
カロリー制限に関連するマーカーはまた、スクリーニングアッセイの被験体生物（または治療された被験体）において評価され得る。これらのマーカーは年齢に関連しない場合があるが、クロトーまたはクロトーに関係する経路が調節されると変化する生理学的状態を示し得る。マーカーは、カロリー制限された動物において大きく変化するｍＲＮＡまたはタンパク質であり得る。本明細書に記載の動物の細胞に由来する細胞モデル、または本明細書に記載の動物モデルの類似体は、細胞に基づくアッセイに使用され得る。
筋肉萎縮に対する試験タンパク質の効果を評価するためのモデルとしては、１）例えば、大腿中央部で右坐骨神経を切断することによる、除神経から生じるラットの内側腓腹筋量低下、２）（例えば、９０度の屈曲で右足首関節を固定することによる）固定化から生じるラットの内側腓腹筋量低下、３）後肢懸垂から生じるラットの内側腓腹筋量低下、４）悪液質サイトカインであるインターロイキン−１（ＩＬ−１）を用いた治療から生じる骨格筋萎縮、および５）グルココルチコイド、デキサメタゾンを用いた治療から生じる骨格筋萎縮、が挙げられる。
外因性Ｓ−クロトーの投与
本開示は、（例えば、正常および／または（例えば、慢性的病態のない）若年（例えば、１８〜３０歳）の範囲内のＳ−クロトーの血清濃度を増加および／または維持するためのＳ−クロトー製剤、臨床投薬量および投与に関する。
本開示の態様または実施形態は、例えば、それを必要とする（ヒト）被験体に（ｃＧＭＰおよび／または臨床グレードの）ヒト組換えアルファ可溶性クロトータンパク質または（アイソフォーム１の）タンパク質断片を投与することを含む。実施形態はまた、（（ヒトの）被験体の）血清Ｓ−クロトーのレベルまたは濃度を（例えば、質量分析器（ＭＳ）またはＥＬＩＳＡによって）測定することを含み得る。かかる測定は、Ｓ−クロトー投与の前後、および／またはその間に行うことができ、必要に応じて、血清Ｓ−クロトーレベル、および／または血清Ｓ−クロトーレベルの代謝、分解または低減の速度を測定するために反復され得る。ＭＳは、当該技術分野で公知の技術である。ＭＳは、被験体の血清中の１つ以上の（天然および／または組換え）クロトータンパク質のレベルを同定し、さらに定量化するために使用され得る。
１つ以上の追加のタンパク質もまた、被験体の血清中で測定され得る。１つ以上のクロトーに関係するおよび／または加齢に関係するタンパク質（例えば、ＦＧＦ２１、ＧＤＦ−１１、ＴＩＭＰ２、ＮＡＤ＋、ＣＣＬ１１、ホルモンテストステロン、エストロゲンなど）、および／または腎臓機能タンパク質（例えば、ＫＩＭ−１、シスタチン−Ｃ、クレアチニン、ＢＵＮ、クレアチニン、ＮＧＡＬなど）は、血清中のクロトーの測定とは別に、またはそれと組み合わせて測定され得る。
少なくとも１つの実施形態では、血液サンプルなどの血清サンプルが得られる。サンプルは、当該技術分野で既知のように、採血によって得られ得る。好ましい実施形態では、血液サンプルを得るための指先に針を刺す（ｆｉｎｇｅｒ ｐｒｉｃｋ）手段か、または他のより低侵襲性の手段が使用され得る。したがって、血液サンプルは、より頻繁に（例えば、１日中、および／または０．５、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１または１２時間毎に）採取され得る。合計クロトータンパク質血清濃度、ならびに天然クロトー種（例えば、可溶性クロトー、切断されたクロトー、分泌されたクロトーなど）などの様々なアルファクロトータンパク質種の血清濃度、および／または本開示の１つ以上のクロトータンパク質を測定するために、ＭＳが使用され得る。いくつかの実施形態では、クロトーレベルは、治療的組換えクロトータンパク質投与の前に、かつ投与後再度１日中、および／または０．５、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１もしくは１２時間毎に測定され得る。
実施形態はまた、かかる速度を測定すること、および／またはかかる被験体の血清内のＳ−クロトータンパク質濃度を、正常な若年の人のＳ−クロトーの血清濃度の範囲内に維持するための、治療プロトコル（例えば、Ｓ−クロトーの投与頻度、投与量、および／または（次の）投与継続時間を含む）を計算することを含み得る。少なくとも１つの実施形態では、Ｓ−クロトーの濃度は、血清１ミリリットル当たりおよそ１０００ピコグラム（ｐｇ／ｍＬ）の（Ｓ−クロトー）タンパク質で維持され得る。
少なくとも１つの実施形態では、（ヒトにおける）Ｓ−クロトー投与方策は、Ｓ−クロトーの１つ以上の薬剤動態学的パラメータの測定を含み得る。例えば、Ｓ−クロトー投与に応答した血清、尿および脳脊髄液中のＳ−クロトーレベルに得られたインビボ変化が測定され得る。いくつかの実施形態は、１つ以上の臨床指標に対するＳ−クロトー投与の有効性を測定することを含み得る。様々な病態、疾患、および障害の臨床指標は、当該技術分野で既知であり、本明細書でさらに説明される。
実施形態はまた、（例えば、開始時（いずれかの外因性Ｓ−クロトーの投与前）、ならびに／または治療プロトコルの前および／もしくは治療プロトコル全体を通して異なる時間に、（ヒト）被験体における任意の概日リズム効果を説明するために、（例えば、Ｓ−クロトーの投与前後に））、（基準値）Ｓ−クロトーレベル測定を行うことを含み得る。
実施形態はまた、Ｓ−クロトー投与の好適な頻度、量、および／または継続時間を測定することを含み得る。例えば、（例えば、ＭＳまたはＥＬＩＳＡイムノアッセイ定量によって測定される）低Ｓ−クロトー血清レベルを有する被験体は、被験体の血清Ｓ−クロトー濃度（に得られた変化）を（ＭＳまたはＥＬＩＳＡによって）測定し、（第１の投与に続いて）血清Ｓ−クロトーレベルのおよび／もしくは代謝、分解もしくは低減速度を測定し、投与されたＳ−クロトーの半減期を計算し、ならびに／または（例えば、血清Ｓ−クロトーレベルを第２の所定のレベルより上に維持するために）Ｓ−クロトーの第２の次の投与を受けるべき頻度および／もしくは時間枠を決定して、（例えば、静脈内、皮内、腹腔内、筋肉内、皮内、および／または皮下注射もしくは他の投与を介して）被験体の血清Ｓ−クロトーレベルを第１の所定レベル（例えば、約１０００ｐｇ／ｍＬ）にするように構成および／または適合されたクロトーの第１の投与を受け得る。少なくとも１つの実施形態では、第２の所定レベルは、第１の所定のレベルの約９５％、９０％、８５％、８０％、７５％、７０％、６５％、６０％、５５％、５０％、４５％、４０％、３５％、３０％、２５％、２０％、１５％、１０％、および／もしくは、５％、ならびに／またはその間であり得る。
さらなる投与は、正常な同性の若年の人の血清維持レベル（例えば、およそ１０００ｐｇ／ｍｌ）と同等のＳ−クロトー血清レベルを、被験体中に（長期的に）産生するのに好適な時間枠にわたって与えられ得る。（（ヒト）被験体への）Ｓ−クロトー投与の合計期間は、１日〜５年以上の範囲であり得る。臨床虚弱スコア（ｃｌｉｎｉｃａｌ ｆｒａｌｉｔｙ ｓｃｏｒｅ）の使用および他の測定値に基づく被験体の虚弱性の測定および／または決定もまた、時間枠にわたって行われ得る。
本開示の実施形態は、Ｓ−クロトー投薬量を、５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、１００％以上、正常範囲（１０００ｐｇ／ｍｌ）を上回って増加したＳ−クロトーレベルまで増加して維持することをさらに含む。
ある特定の実施形態は、単一回のボーラス注射または長期（ＩＶ）注射（例えば、長期間にわたる点滴）でＳ−クロトータンパク質を投与することを含む。少なくとも１つの実施形態では、被験体当たり、１、２、２．５、２．７５、３、３．５、４、４．５、５マイクログラム以上のＳ−クロトーが、治療毎に投与され得る。好適な投与量は、当該分野で既知の１つ以上の方法を通して計算され得る。１つのかかる方法は、相対成長（ａｌｌｏｍｅｔｒｉｃ ｓｃａｌｉｎｇ）方法である。例えば、ラット実験では、１回の投与当たり０．０１ｍｇのＳ−クロトー／体重ｋｇまたは１０μｇ／ｋｇが使用される。例示的には、ヒト相対成長率と等価である０．１６を使用すると、ヒト等価用量（ＨＥＤ）＝１０μｇ／ｋｇｘ０．１６＝１．６μｇ／ｋｇである。したがって、例示的には、７０ｋｇのヒト個体は、７０ｋｇｘ１．６ｕｇ／ｋｇ＝１１２ｕｇが必要であり、および６０ｋｇのヒトは、６０ｋｇｘ１．６＝９６ｕｇが必要であろう。
ＨＥＤは、参照により本明細書に援用されるＲｅａｇａｎ−Ｓｈａｗ（２００８）によって記載されているプロセスである、体表面積の標準化を使用して確立された。このプロセスは、相対成長率と称され、異なる種間の代謝速度の基礎的な差異を補正し、単純な投薬量外挿よりも好ましい場合がある。例示的には、ＨＥＤが０．４ｍｇ／ｋｇの場合、相対成長率を使用すると、ヒト等価用量は、体重７０ｋｇの個体には０．４ｍｇ／ｋｇ、すなわち２８ｍｇ、体重６０ｋｇの個体には２４ｍｇとなるであろう。
（組換えタンパク質投与の前および／または後の）ヒトにおけるＳ−クロトーの量および／もしくは生物学的利用能、投与されるＳ−クロトーの合計量および／もしくは濃度、ならびに／または組換えタンパク質投与後の血清レベル応答（経時的）の決定、測定、および／または推定には、複数の要因が考慮され得るか、または配慮され得る。例えばかかる要因としては、希釈剤の組成、投与経路、投与部位、被験体の組織および器官への分配、被験体の代謝または他の速度、薬剤動態（ＰＫ）、薬力学（ＰＤ）、毒物学（Ｔｏｘ）などが挙げられ得る。
少なくとも１つの実施形態では、（例えば健康な、若年（１８〜３０歳の）ヒト成人における）Ｓ−クロトーの（正常な）濃度は、血清中でおよそ１０００ｐｇ／ｍｌであり得る。典型的な成人は、およそ５リットルの血液量を有し得、女性は一般に男性より少ない血液量を有する。ヒトの血液のおよそ５５％は、血清で構成され得る。したがって、（５リットルの血液／成人）ｘ（０．５５血清／血液リットル）＝２．７５リットル（２７５０ｍｌ）の血清／成人となる。内因性血清Ｓ−クロトーがないと仮定する場合、合計血清中に１０００ｐｇ／ｍｌの最終濃度を達成するためには、成人被験体当たり２７５０ｍｌＸ１０００ｐｇ／ｍｌ＝２，７５０，０００ｐｇ（または２７５０ｎｇまたは２．７５μｇ）の外因性Ｓ−クロトーを投与した。
可溶性クロトーを典型的な健康なレベル（例えば、１５００ｐｇ／血清ｍｌ）よりも５０％増加させるためには、４．１２５マイクログラム／被験体の投薬量が投与され得る。可溶性クロトーを典型的な健康なレベル（例えば、２０００ｐｇ／血清ｍｌ）よりも１００％増加させるためには、５．５マイクログラム／被験体の投薬量が投与され得る、などである。
任意の好適なレベルまで被験体の血清可溶性クロトータンパク質濃度を上昇させるために、精製された組換えＳ−クロトータンパク質の薬学的に有効なおよび／または十分な量は、血清１ミリリットル当たり、約５０、１００、２５０、５００、７５０、１０００、１２５０、１５００、１７５０、２０００、２２５０、２５００、２７５０、３０００、３５００、４０００、４５００、５０００、５５００、６０００、６５００、７０００、７５００、８０００、８５００、９０００、９５００、１０，０００、１１，０００、１２，０００、１３，０００、１４，０００、１５，０００ ２０，０００、２５，０００、３０，０００ ４０，０００、５０，０００、７５，０００、１００，０００ピコグラム以上、もしくはその間などの可溶性クロトータンパク質、または、血清中の可溶性クロトータンパク質の典型的な健康レベルを、約５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、１００％、１５０％、２００％、２５０％、３００％、４００％、５００％、６００％、７００％、８００％、９００％、１０００％、１２００％、１５００％、２０００％、２５００％、３０００％、４０００％、５０００％超える、もしくはその間で投与され得る。
いくつかの実施形態では、被験体は、組換えヒトＳ−クロトータンパク質を、１つ以上の（ボーラス）静脈内、皮内（ｉｎｔｒａｄｅｒｍａｌ）、腹腔内、筋肉内、皮内（ｉｎｔｒａｃｕｔａｎｅｏｕｓ）、皮下および／または他の注射を、好適な量のクロトー緩衝液（例えば、１５０ｍＭのＮａＣｌおよび１０ｍＭのＨＥＰＥＳ ｐＨ７．４）または他の薬学的に許容可能な担体中に、約０．０１ｍｇ／体重ｋｇ以上、またはその間の投薬量で投与され得る。したがって、１６０ポンド（すなわち７２．５７ｋｇの体重）の被験体は、１回の投与当たり約０．７３ｍｇのＳ−クロトー（０．０１ｍｇのＳ−クロトー／ｋｇＸ体重７２．５７ｋｇの計算に基づいて）の（ボーラス）注射を投与され得る。同様に、１７０ポンドの人は、１回の投与当たり０．７７ｍｇのＳ−クロトーを受け得る。投与の合計数および頻度は、例えば１０００ｐｇ／ｍｌのＳ−クロトー（０．０００００１ｍｇ／血清ｍｌと等しい）の濃度を血清中で達成および維持することに基づいて決定され得る。後者は、ＭＳによって、またはヒトＳ−クロトーＥＬＩＳＡアッセイによって測定されて確認され得る。
他の実施形態では、投薬量は、約０．０００１〜１０ｍｇ／体重ｋｇ、０．０００１〜１０μｇ／体重ｋｇ、０．０００１〜１０ｎｇ／体重ｋｇ、０．０００１〜１０ｐｇ／体重ｋｇ以上、もしくはその間、またはその間の任意の値もしくは値の範囲であり得る。尿、および／または血液は、（例えば、血清Ｓ−クロトーレベル、ならびに投与応答および／または経時的応答における変化を測定、試験、および／または決定するために）組換えクロトータンパク質の医学的手順または第１の投与（投薬）後、約５分、１０分、１５分、２０分、２５分、３０分、４０分、４５分、６０分、９０分、２時間、３時間、４時間、５時間、６時間、９時間、１２時間、１８時間、２４時間、３６時間、４８時間、２．５日、３日、５日、７日、１０日、１４日、２１日、４週間、１ヶ月、２ヶ月、３ヶ月以上、それ以下、その間なの１つ以上の時点で収集され得る。
１つ以上の実施形態は、Ｓ−クロトー活性薬剤生成物の独特な製剤および／または薬学的に許容可能な担体との組み合わせの、製造および／または（次の）投与を含む。担体は、ＩＶおよび／またはボーラス注射に好適であり得る。実施形態はまた、（不活性Ｓ−クロトーが、動物またはヒト被験体において生物学的に有効なＳ−クロトーを放出するようにインビボで活性化され得るように、Ｓ−クロトーおよび／または薬学的に許容可能な担体と組み合わせの独特な不活性プロドラッグ製剤の製造および／または（次の）投与を含み得る。かかるプロドラッグ製剤は、コーティングまたは徐放性製剤を含み得る。
ヒトの年齢に関係する虚弱を治療するための外因性Ｓ−クロトーの投与
本開示の例示的な実施形態は、（例えば、ヒトまたは非ヒト動物の）年齢に関係する虚弱を治療するための外因性クロトータンパク質の投与に関する。Ｓ−クロトーは、ヒト疾患の動物モデルにおいて、筋原性幹細胞を救済し、筋肉修復を改善し、および／または線維症を抑制し得る。したがって、Ｓ−クロトーは、虚弱の徴候を示している高齢なヒト被験体における、筋肉退化に対抗する有望な治療薬であり得る。
例えば、本開示は、Ｓ−クロトー製剤、臨床投薬量、ならびに脆弱および／または高齢者（例えば、６０〜９５歳）へ投与して、前者の被験体のＳ−クロトー血清濃度の維持を、正常および／または（例えば、慢性的な病態のない）若年（例えば、１８〜３０歳）の人の範囲内に維持することに関する。
長期間にわたるクロトー治療は、高齢者、虚弱者、またはその他の生理学的加齢における１つ以上の加齢に関係する指標または病態を回復および／または改善し得る。
ヒトにおける筋肉萎縮の治療（減少）のための外因性Ｓ−クロトーの投与
本開示の例示的な実施形態は、骨格筋組織質量および上記のタンパク質と分子指標との併用によって測定される、ヒトにおける筋肉萎縮を治療する（例えば、（速度を）低下させる）ための外因性クロトータンパク質の投与に関し、筋肉萎縮に対抗するクロトーの投与の効果についてのガイダンスを提供する。
筋肉萎縮としては、多数の神経筋、代謝、免疫および神経障害および疾患、ならびに飢餓、栄養欠損、代謝ストレス、糖尿病、加齢、筋ジストロフィー、またはミオパチーが挙げられ得る。筋肉萎縮は、加齢プロセスの間に起こり得る。筋肉萎縮はまた、筋肉の使用の低減または廃用からも生じ得る。症状としては、骨格筋組織質量の低下が挙げられる。ヒトの男性では、５０〜８０歳の間で筋量が３分の１に低下する。筋肉萎縮のいくつかの分子の特色としては、ユビキチンリガーゼのアップレギュレーション、および筋原線維性タンパク質の低下が挙げられ得る。これらのタンパク質の分解は、例えば、ある特定の筋肉のミオシンで（例えば、アクチンの特異的構成成分である３−メチル−ヒスチジン産生を測定することによって）、監視され得る。クレアチンキナーゼ（細胞損傷マーカー）の放出もまた、指標となり得る。
老年および／またはヒトの寿命全体を通して知能的および／または認知力低下を治療するための外因性Ｓ−クロトーの投与
本開示の例示的な実施形態は、（加齢に関係する）認知機能低下の改善および／または抑制するための外因性クロトータンパク質の投与に関する。本開示の時点で、外因性クロトータンパク質の投与が、ヒトの認知力低下を抑制し得るかは不明であった。しかしながら、クロトーの全身の過剰発現を有する遺伝子導入マウスは、学習力および記憶力の複数の試験において対照よりも良好な成績であった。マウスのクロトー上昇はまた、シナプス可塑性の形態で、長期的な増強を向上し、学習力と記憶力に重要な機能を有するＮ−メチル−Ｄ−アスパラギン酸受容体（ＮＭＤＡＲ）サブユニットであるシナプスＧｌｕＮ２Ｂを高めた。ＧｌｕＮ２Ｂの遮断により、クロトーが介在する効果が失われた。
クロトーを調節した経路は、アルツハイマー病および他の形態の認知症の進行を遅らせることに関連し得る。５３歳以上の４００人以上の健康な男女の脳スキャンでは、特定のクロトー遺伝子多様体の単一コピーを保有していた人々が、計画および意思決定を扱う脳領域を、より大きく有していたことが見出された。グループへのさらなる試験では、右背外側前頭前皮質（ｒＤＬＰＦＣ）が拡大している人々は、一連の知能的課題に対してより良好であったことが見出された。
約５人に１人が、心臓および腎臓機能を改善するＫＬ−ＶＳとして知られる遺伝子多様体または対立遺伝子の単一コピーを継承し、平均して約３年ヒトの寿命を延ばす。しかしながら、脳機能に関しては、より大きなｒＤＬＰＦＣを有することで、人々の知能的試験スコアはわずか１２％の改善を占めるが、一方、編集者が指摘するには、ＫＬ−ＶＳ対立遺伝子の１コピーを保持することで、ｒＤＬＰＦＣの構造および機能の期待される低下に対して、１０年分の回復力が得られるようである。したがって、ＫＬ−ＶＳヘテロ接合性は、右背外側前頭前皮質（ｒＤＬＰＦＣ）のより大きな体積と関連しているようである。
ｒＤＬＰＦＣは実行機能に重要であるため、研究者らはまた、個体の作業メモリおよび処理速度も分析した。ＫＬ−ＶＳヘテロ接合性は、試験された寿命にわたって向上された実行機能と関連し得る。要するに、クロトー遺伝子の多様性が、より大きな脳容積およびより良好な機能と関連し得ることを結果は示唆している。
本開示の例示的な実施形態は、（例えば、認知力を向上し、ヒトの寿命全体を通して認知力欠損を抑制するための）インビボクロトーレベルおよび／または（細胞、分子、および／または下流）効果を補完するための外因性クロトータンパク質の投与に関する。臨床グレードのＳ−クロトーの外因性投与は、（例えば、ヒトにおける）認知機能を保持および／または改善する。
ヒトの長寿および／または寿命を治療する（延長する）ための外因性Ｓ−クロトーの投与
本開示の例示的な実施形態は、実年齢（例えば、出生からの年齢が一致）および性別が一致するヒト被験体に外因性クロトータンパク質を投与して、平均寿命を改善することに関する。クロトー投与（ヒト被験体の実験グループ）で得られた平均寿命の結果は、クロトー外因性投与を受けていない個体（対照グループ）および／または十分に大きな人口に対する統計情報（例えば、数理表から）と確実に比較され得る。
他の臨床指標を治療するための外因性Ｓ−クロトーの投与
本開示の例示的な実施形態は、任意の年齢に関連するか、または年齢に関連しない病態を治療するための外因性Ｓ−クロトーの投与に関し、病態としては、これらに限定されないが、ヒトの虚弱（の増加）、長寿（の減少）、細胞老化（の減少）、筋力（の低下）、骨量の喪失または密度（の減少）、認知力（の減少）、筋量（の低下）、体力（の低下）、握力（の低下）、脚力（の低下）などが挙げられる。本開示はまた、（例えば、男性ではなく女性の）骨ミネラル密度（ＢＭＤ）の増加、閉経後に低減される（例えば、高齢女性の）ＢＭＤの増加、（退化した）骨格筋を再生するかまたはその退化の低減、歩行の改善、空間学習力および記憶、動作、動作自由、生活の質評価、駆出率の改善（または低下の低減）、運動の変化、運動の改善などのための、Ｓ−クロトーの投与に関する。本開示はさらに、認知力劣化または健忘症の減少、認知能力の増大、認知機能およびシナプス可塑性の改善、学習力、学習能力またはＩＱの低下の減少、学習力、学習能力、またはＩＱなどの改善のためのＳ−クロトーの投与に関する。
遺伝的欠陥を治療するための外因性Ｓ−クロトーの投与
本開示の例示的な実施形態は、既知のヒトの遺伝的欠陥を治療（例えば、補正）するための外因性Ｓ−クロトーの投与に関する。例えば、家族性腫瘍性石灰化症およびクロトー変異体を有する１３歳の少女が報告されている。家族性腫瘍性石灰化症は、ＦＧＦ２３またはＧＡＬＮＴ３の不活性化変異による、異所性石灰化および高リン酸血症を特徴とする常染色体劣性代謝疾患である。ＦＧＦ２３は、リン酸の腎排泄に必要なホルモンであり、一方、ＧＡＬＮＴは、ＦＧＦ２３の成熟および分泌に寄与する酵素である。クロトー（ＫＬＯＴＨＯ）遺伝子のホモ接合性変異が、１３歳の少女に同定されている。クロトーは、ＦＧＦ２３がその受容体に向かって放出するシグナルの伝達に必要な分泌タンパク質をコードする。外因性ヒト組換えＳ−クロトーの投与は、家族性腫瘍性石灰化症に関連する機能不全および症状に対処するために高度に標的化された、有効な治療法を構成する。
急性腎臓傷害（ＡＫＩ）を治療するための外因性Ｓ−クロトーの投与
以前は急性腎不全（ＡＲＦ）と呼ばれていた急性腎臓傷害（ＡＫＩ）は、多くの場合、軽度の機能低下から機能不全までの範囲にわたる腎機能障害の突然の発症として定義される。ＡＫＩは、毎年入院患者のおよそ４％〜７％に発生する一般的な臨床的合併症であり、予後は良好ではない場合がある。ＡＫＩに関連する死亡率は、２０％〜３５％の範囲である。腎クロトーの発現は、ＡＫＩに続いて抑制されることが示されている。クロトーのアデノウイルス遺伝子導入は、ＡＫＩでは細胞保護的であり得る。
急性腎臓傷害（ＡＫＩ）は、毎年およそ４．９％〜７％の入院患者において報告されている。ＡＫＩの割合は、（入院した）高齢者では６０％、高齢者または重病患者では２０〜３０％と高くなり得る。ＡＫＩはまた、死亡率の増加、滞在期間（ＬＯＳ）、および病院費用にも関連している。
ＡＫＩは、腎臓移植もしくは他の外科手術、急性尿細管壊死（ＡＴＮ）、急性アレルギー性間質性腎炎（ＡＡＩＮ）、腎炎（例えば糸球体腎炎）、腎毒性（例えば、薬剤性腎毒性）、低血圧、または他の寄与因子から少なくとも部分的に生じ得る。腎臓移植および他の外科手術は、腎臓に急性の損傷または傷害を引き起こし、腎疾患および／または腎不全を引き起こし得る。腎毒性は、ＡＫＩ、ＡＴＮ、ＡＡＩＮ、腎炎などに寄与し得る。薬剤（例えば、臨床的に投与された処方薬、違法薬剤、または他の薬剤）は、ＡＫＩの全症例の１５％〜２５％に関連していることが報告されている。造影剤単独では、院内感染した急性腎不全（例えば、造影剤によって誘発される急性腎臓傷害ＣＩＡＫＩ）の全原因の１０％を占め、腎灌流の減少後の入院中の腎機能の劣化および術後腎不全（ｒｅｎａｌ ｉｎｓｕｆｆｉｃｉｅｎｃｙ）の第３の主要原因である。
場合によっては、薬剤性ＡＫＩは、抗菌剤によって誘発される（抗菌処理から生じる）腎毒性であり得るか、またはそれを含み得る。例えば、ある特定の（グラム陰性）細菌感染症は、パロモマイシン、トブラマイシン、ゲンタマイシン、アミカシン、カナマイシン、ネオマイシンなどの１つ以上のアミノグリコシドで治療され得る。アミノグリコシドは、腎毒性であることが示されている。例えば、図４に示されるように、一般的なアミノグリコシドであるアミカシンで治療された患者の２３％近くが急性腎臓疾患を発症し、アミカシンで治療された患者の１７％超が退院前に死亡している。ゲンタマイシンおよびトブラマイシンを含む他のアミノグリコシドはまた、腎臓疾患を誘発した（またはそれに関連していたか、または寄与していた）。図３Ａおよび３Ｂに示されるように、様々な年齢層の１２０万人を超える成人患者が、２０１０年にアミノグリコシドで治療された。他の抗菌剤としては、例えば、ペニシリン、アンピシリン、セファロスポリン、スルホンアミド、シプロフロキサシン、バンコマイシン、マクロライド、テトラサイクリン、リファンピンなどが挙げられる。
薬剤性腎毒性はまた、アスピリン（アセチルサリチル酸）、セレコキシブ、ジクロフェナク、ジフルニサル、エトドラク、イブプロフェン、インドメタシン、ケトプロフェン、ケトロラク、ナブメトン、ナプロキセン、オキサプロジン、ピロキシカム、サルサレート、スリンダク、トルメチンなどの１つ以上の非ステロイド抗炎症薬剤（ＮＳＡＩＤ）を用いた治療から生じ得る。
薬剤性腎毒性はまた、１つ以上のシクロオキシゲナーゼ−２（ＣＯＸ−２）阻害剤（例えば、バルデコキシブ、ロフェコキシブ、セレコキシブなど）、プロトンポンプ阻害剤（例えば、オメプラゾール、ランソプラゾールなど）、抗痙攣薬（例えば、フェニトイン、バルプロ酸など）、ヒスタミンＨ２受容体拮抗剤（例えば、ニザチジン、ラニチジン、ファモチジン、シメチジンなど）、利尿薬（例えば、炭酸脱水酵素阻害薬、ループ利尿薬（例えば、ブメタニド、エタクリン酸、トラセミド、フロセミドなど）、カリウム保持性利尿薬（例えば、トリアムテレン、スピロノラクトン、アミロライドなど）、チアジド利尿薬（例えば、インダパミド、クロルタリドン、メトラゾン、メチクロチアジド、ヒドロクロロチアジド、クロロチアジド、ベンドロフルメチアジド、ポリチアジド、ヒドロフルメチアジドなど）、またはパマブロム、マンニトールなど他の利尿剤などを用いた治療から生じ得る。
薬剤性腎毒性はまた、体内の神経細胞および筋肉細胞を通ってナトリウムの流れに影響し得るリチウムを用いた治療からも生じ、多くの場合、多動、切迫談話、判断力（ｊｕｄｇｍｅｎｔ）低下、睡眠欲求の低減、攻撃性、および怒りを特徴とする、双極性障害の躁病エピソードを治療するために使用され得る。リチウムはまた、躁病エピソードの防止または強度の軽減にも役立ち得る。薬剤性腎毒性はまた、金、水銀、銅、または他の元素物質を用いた治療またはそれらへの曝露から生じ得る。
薬剤性腎毒性はまた、強皮症、ウィルソン病（尿を通して除去するための銅が蓄積されて結合することによる）、システイン尿症（システインと結合してシステインよりも可溶性の混合ジスルフィドを生じることによる）、の治療に使用され得る、キレート化剤部類の医薬品である（Ｄ−）ペニシラミン、平滑筋に直接作用する弛緩剤（例えば、ヒドララジン）、鎮痙剤（例えば、カリソプロドール、シクロベンザプリン、メタキサロン、メトカルバモール、ジアゼパム、クロニジンおよび他のイミダゾリン化合物などのベンゾジアゼピン、チザニジン、バクロフェン、ヒダントイン誘導体、ダントロレンなどを用いた治療から生じ得る。
薬剤性腎毒性の他の形態としては、例えば、造影剤によって誘発される腎毒性（例えば、（ヨウ素化）造影剤への曝露に続いて、放射線造影剤によって誘発される腎症（ＣＩＮ）としても知られている）；麻薬（オピオイド）によって誘発される腎毒性（例えば、コカイン、ヘロインなどのある特定の麻薬（例えば、オピオイド）の使用または乱用後）；化学療法によって誘発される腎毒性（例えば、シスプラチン；カルボプラチン；オキサリプラチン；ベンダムスチン、シクロホスファミド、イホスファミド、ニトロソウレア、テモゾロミド、メルファランなどのアルキル化剤；マイトマイシンＣ、ブレオマイシン、アントラサイクリン、および関係する薬剤などの抗腫瘍抗生物質；カペシタビン、ヒドロキシウレア、メトトレキサート、ペメトレキセド、プララトレキサート、ペントスタチン、フルダラビン、クラドリビン、ゲムシタビン、シタラビンなどの代謝拮抗剤；ビンカアルカロイド；トポテカン；エトポシド；タキサン；イリノテカン；レナリドマイド；エリブリン；三酸化ヒ素；イキサゾミブ；などの癌治療薬を用いた治療後）などが挙げられ得る。事実、多種多様な腎毒性薬剤が腎毒性を誘発し、ＡＫＩにつながり得る。薬剤性腎毒性（および他の形態のＡＫＩ）は、治療しなければ生命を脅かし得、（患者、病院、および保険会社に）莫大な治療費用が発生し得る。
本開示の実施形態は、（予防的に）急性腎臓傷害（ＡＫＩ）または他の病態を治療または防止する方法を含み得る。方法は、組換え（可溶性）クロトータンパク質を、それを必要とする被験体に投与することを含み得る。例えば、方法は、（例えば、所定の期間の間、所定の閾値以上で被験体の血清可溶性クロトータンパク質濃度を上昇および／または維持するように）それを必要とする被験体に、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有する組換え可溶性クロトータンパク質の薬学的有効量を投与することを含み得る。この病態は、（ｉ）急性尿細管壊死（ＡＴＮ）、急性アレルギー性間質性腎炎（ＡＡＩＮ）、腎炎、糸球体腎炎、および／もしくは腎毒性、または（ｉｉ）腎臓移植もしくは他の外科手術、急性尿細管壊死（ＡＴＮ）、急性アレルギー性間質性腎炎（ＡＡＩＮ）、腎炎、糸球体腎炎、腎毒性、もしくは低血圧から少なくとも部分的に生じるＡＫＩを含み得る。この病態は、薬剤性（例えば、アミノグリコシドによって誘発される）腎毒性を含み得る。タンパク質は、例えば、ＡＫＩを引き起こすかまたはＡＫＩに寄与することが知られているかまたは予期される、腎臓移植、腎毒素投与、または他の活動、治療、または事象の前に、予防的に投与され得る。あるいは、または加えて、タンパク質は、ＡＫＩを引き起こすか、またはＡＫＩに寄与すると知られているかまたは予期される、腎臓移植もしくは他の外科手術、アミノグリコシドもしくは他の腎毒素投与、または他の活動、治療、もしくは事象の後など、ＡＫＩに応答して投与され得る。
いくつかの実施形態では、腎毒素または他の薬剤は、例えば：
１つ以上のアミノグリコシド（例えば、パロモマイシン、トブラマイシン、ゲンタマイシン、アミカシン、カナマイシン、ネオマイシンなど）；
１つ以上の抗真菌剤（例えば、アンホテリシンＢ、フルシトシンなど）；
１つ以上の造影剤（例えば、（ヨウ素化）放射造影剤、約１．５：１のヨウ素対分子比を有する高浸透圧造影剤（ＨＯＣＭ）、約３：１のヨウ素対分子比を有する低浸透圧の非イオン性造影剤（ＬＯＣＭ）、約６：１のヨウ素対分子比を有する等張性（等浸透圧性）造影剤（ＩＯＣＭ））など）；
１つ以上の抗レトロウイルス剤（例えば、アデホビル、シドホビル、テノホビル、ホスカネットなど）；
１つ以上の癌（または化学）治療薬（例えば、シトプラチン、カルボプラチン、オキサリプラチン、アルキル化剤（ベンダムスチン、シクロホスファミド、イホスファミド、ニトロソウレア、テモゾロミド、メルファランなど）、抗腫瘍抗生物質（マイトマイシンＣ、ブレオマイシン、アントラサイクリンおよび関係する薬剤など）、代謝拮抗剤（カペシタビン、ヒドロキシウレア、メトトレキサート、ペメトレキセド、プララトレキサート、ペントスタチン、フルダラビン、クラドリビン、ゲムシタビン、シタラビンなど）、ビンカアルカロイド、トポテカン、エトポシド、タキサン、イリノテカン、レナリドマイド、エリブリン、三酸化ヒ素、イキサゾミブなど）；
１つ以上のビスホスホネートまたはその誘導体（例えば、ゾレドロネート／ゾレドロン酸、イバンドロネート、アレンドロネート、アレンドロネート／コレカルシフェロール、エチドロネート、リセドロネート（任意選択的に、炭酸カルシウムを含む）、パミドロネート、チルドロン酸など）；および／または
コカイン、ヘロインなどの１つ以上の麻薬（例えば、オピオイド））であり得るか、またはそれらを含み得る；
本開示の実施形態は、治療用組換え（アルファ可溶性）クロトータンパク質（例えば、ヒトアルファクロトーアイソフォーム１のアミノ酸残基１〜９８１またはそのサブセットと少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有する）を投与する方法を含み得る。方法は、ＡＫＩまたはＡＫＩに関連する１つ以上の病態を（予防的に）治療または防止するために、ヒトまたは非ヒト被験体に治療用クロトータンパク質を投与することを含み得る。方法は、被験体における血清可溶性クロトーレベルのレベルを測定することと、被験体における血清可溶性クロトーレベルを所定のレベルもしくは正常レベルのパーセントまで上昇させるのに十分な第１の投薬量のタンパク質を計算することと、ボーラスまたは段階的投与などによって、被験体にタンパク質の第１の投薬量を投与することと、第１の投薬量の投与に続いてなど血清中の可溶性クロトー低下速度を測定することと、次の投薬時間および量を計算することと、および／または次のタンパク質の投与量を被験体に投与することと、を含み得る。
慢性腎臓疾患（ＣＫＤ）を治療するための外因性Ｓ−クロトーの投与
その全体が参照により本明細書に援用される、ＮｅｙｒａおよびＨｕ、Ｐｏｔｅｎｔｉａｌ ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ ｋｌｏｔｈｏ ｉｎ ｈｕｍａｎ ｃｈｒｏｎｉｃ ｋｉｄｎｅｙ ｄｉｓｅａｓｅ， Ｂｏｎｅ （２０１７）に記載のように、循環中の可溶性クロトーは、慢性腎臓疾患（ＣＫＤ）ステージ２では早期に低下し始め、尿クロトーはおそらくＣＫＤステージ１のさらに早期に低下し始める。したがって、可溶性クロトーは、腎臓機能低下の早期的および高感度のマーカーとして機能し得る。さらに、前臨床動物データは、クロトー欠損が、単にバイオマーカーであるだけではなく、ＣＫＤ進行、および心血管疾患、および鉱質代謝妨害を含む腎外ＣＫＤ合併症の病因であることを裏付けている。クロトー低下の防止、内因性クロトー生成の再活性化または外因性クロトーの補充は全て、動物モデルにおける、腎線維症の減弱、ＣＫＤ進行の遅延、鉱質代謝の改善、心筋症の改善、およびＣＫＤによる血管石灰化の緩和に関連する。
ＣＫＤは、ＥＳＲＤのリスクが高い腎機能の進行性の劣化を特徴とする。ＣＫＤリスクは年齢と共に増加し、Ｎ７０歳の被験体ではＣＫＤステージ≧３の症例の約半数に発生する。ＣＫＤは、加齢の加速した状態とみなされ得る。２５〜３４歳の透析患者の心血管系死亡率の相対リスクは、Ｎ７５歳の非ＣＫＤ患者と同様である。心血管疾患は、ＣＫＤおよびＥＳＲＤ患者の主な死因である。ＣＫＤおよびＥＳＲＤ患者は、腎クロトーの発現が低く、循環クロトーのレベルが低い。ＣＫＤ早期ステージの腎クロトー欠損は、主に生存可能な腎尿細管の低下ではなく、むしろクロトー発現の抑制に起因し得る。さらに、透析患者の中には、未だ検出可能なクロトーの循環を有し、腎クロトー発現が完全に抑制されておらず、クロトーの起源は今日まで明らかではないが、腎外の源に由来し得ることが示唆されている。クロトーの腎外の源を確立し、腎産生が失敗したときにクロトーがどのようにアップレギュレーションされ得るのかを特徴付けることは、最も重要である。
本開示の外因性クロトータンパク質の投与は、ＣＫＤでの併存疾患の負担を防止し、遅延させ、減少させるのに役立ち得る。
他の成分と組み合わせたＳ−クロトーを含む組成物および治療
クロトーはまた、ヒトの健康と福利の１つ以上の側面に影響する、他の化合物および／または成分との相加的または相乗的な物質中で作用し得る。例えば、治療用ヒト組換え可溶性アルファクロトー（Ｓ−クロトー）タンパク質を１つ以上の追加の活性成分と組み合わせておよび／または並行して用いることを含む治療は、ヒト患者に有益であり得る。かかる治療は、クロトータンパク質および／または他の成分が治療効果を有し得る任意のヒトの病態に予防的または応答性であり得る。かかる病態としては、例えば、年齢に関係する病態、代謝的病態、慢性または急性の病態などが挙げられ得る。特定の条件の特定の非限定的な例が、本明細書に開示されている。
Ｓ−クロトーは、増殖／分化因子１１（ＧＤＦ−１１）などの他の血液によって運ばれる抗加齢化合物と共に人体に存在し得る。したがって、ある特定の実施形態では、治療用Ｓ−クロトーは、治療用ＧＤＦ−１１と（例えば、並行して、連続的に、および／または組み合わせて）共投与され得る。いくつかの実施形態では、かかる投与は、相加的または相乗的な抗加齢または他の効果を有し得る。同様に、ＣＣＬ１１に対する（中和）抗体、またはその抑制因子を用いる、ヒト被験体へのＳ−クロトー共投与は、加齢または他の病態に対抗するために同調して作用し得る（ＣＣＬ１１（エオタキシン−１としても知られる）は、幹細胞の若返りの負の調節因子であると理解されているため）。Ｓ−クロトーはまた、またはあるいは、エオタキシン−２（ＣＣＬ２４）および／またはエオタキシン−３（ＣＣＬ２６）などの他のエオタキシンと共投与され得る。
いくつかの実施形態では、Ｓ−クロトーは、トランスフォーミング増殖因子β−１（ＴＧＦ−β１）の抑制因子または抗体と共投与され得る。Ｓ−クロトー投与は、腎線維化および他の組織の線維化につながる内因性抗細胞上皮−間葉移行（抗ＥＭＴ）に関与するＴＧＦ−β１シグナル経路の作用に対抗し得る。抗ＥＭＴはまた、癌細胞にも関連しており、ＥＭＴの阻害が癌細胞に転移能を付与し得、この後者のプロセスはクロトーによって対抗されると理解されている。したがって、Ｓ−クロトーとトランスフォーミング増殖因子β−１（ＴＧＦ−β１）の抑制因子または抗体との共投与は、相乗的または相加的な効果を有し得る。
いくつかの実施形態では、Ｓ−クロトーは、インスリン増殖因子−１（ＩＧＦ−１）の抗体または抑制因子と共投与され得る。クロトーは、細胞内インスリン／ＩＧＦ−１シグナリングカスケードを阻害するホルモンであり、この阻害は、哺乳類の細胞および生物レベルでの酸化ストレスに対する耐性を増加させ、寿命を延長するために進化的に保存されていると考えられるメカニズムである、と理解されている。したがって、Ｓ−クロトーとインスリン増殖因子−１（ＩＧＦ−１）の抑制因子または抗体との共投与は、相乗的または相加的な効果を有し得る。
多数の研究により、クロトーアルファ−Ｋ１、ＦＧＦ２３、および１，２５（ＯＨ）２Ｄの相互に調節された正／負のフィードバック作用、ならびに／または胆汁酸／コレステロール代謝を調節するクロトーβ−Ｋ１、ＦＧＦ１５／ヒトＦＧＦ１９、および胆汁酸で構成される類似の調節ネットワークを含む鉱物ホメオスタシスの総合的な調節スキームが明らかになったため、いくつかの実施形態では、Ｓ−クロトーは、ビタミンＤ（例えば、ビタミンＤ３）、または１，２５−ジヒドロキシビタミンＤ３［１，２５（ＯＨ）２Ｄ３］、ＦＧＦ−１５、ＦＧＦ−１９、ＦＧＦ−１５、ＦＧＦ−１９、および／またはクロトーβと組み合わせて投与され得る。かかる共投与は、体内の多数の病態および／またはプロセスに対して相乗的または相加的な効果を有し得る。いくつかの実施形態では、Ｓ−クロトーは、ＦＧＦ−２１と組み合わせて投与され得る、
いくつかの実施形態では、Ｓ−クロトーは、アセタゾラミド、メタゾラミド、ジクロルフェナミド、ドルゾラミド、ブリンゾラミドおよび／またはトピラマートなどの炭酸脱水酵素阻害剤と共投与され得る。かかるコンビナトリアル投与は、強直性脊椎炎（ＡＳ）、関節リウマチ（ＲＡ）、および種々の他の病態の治療に有用であり得る。様々な調査により、骨吸収の増加はＡＳおよびＲＡの特徴であり、炭酸脱水酵素阻害剤は骨吸収を阻害することによって抗関節炎の役割を果たすことが示されている。骨レベルでは、近年同定された破骨細胞機能調節因子であるＴＲＰＶ５への作用による異なるメカニズムを通じ、Ｓ−クロトーは、骨吸収およびリン酸放出を刺激する。Ｓ−クロトー投与によって引き起こされる１，２５（ＯＨ）+Ｄ３のレベルの上昇はまた、破骨細胞分化および骨吸収を刺激し、それによりリン酸を放出する。したがって、Ｓ−クロトーと炭酸脱水酵素阻害剤との共投与は、特にＡＳおよびＲＡにおける、特に骨の健康促進において、相加的または相乗的効果を有し得る。
重度の活動性関節リウマチの治療のために、Ｓ−クロトーは、１つ以上の疾患修飾性抗リウマチ薬（ＤＭＡＲＤ）と組み合わせて投与され得る。
シクロスポリンはクロトーｍＲＮＡおよびタンパク質を減少させ、シクロスポリンによって誘発される腎傷害（ＣｓＡ）につながる酸化ストレスを増加させるため、Ｓ−クロトーはシクロスポリンと組み合わせて投与され得る。関連するクロトーｍＲＮＡおよびタンパク質の減少および酸化ストレスの増加は、Ｓ−クロトーの外因性共投与によって対抗され得る。
いくつかの実施形態では、Ｓ−クロトーは、ロサルタン、および／またはシクロスポリンと共投与され得る。アンジオテンシンＩＩ１型（ＡＴ１）受容体ブロッカーであるロサルタンを用いた治療は、シクロスポリンを用いて見られるクロトー発現の減少を逆転させた。ロサルタンはまた、腎組織（シクロスポリンによって引き起こされる尿細管間質線維症を減少させるロサルタンを用いて）の並行した改善をもたらした。
いくつかの実施形態では、Ｓ−クロトーは、アミカシン、ゲンタマイシン、トブラマイシンなどの１つ以上のアミノグリコシドと共投与され得る。感染症の治療へのアミノグリコシドの使用を大幅に拡大し得る（グラム陰性）病原体感染症を治療するためにアミノグリコシドが使用されるとき、かかる治療は、腎毒性および／または急性腎臓傷害（ＡＫＩ）を防止するために有用であり得る。ＡＫＩをブロックするために使用されてきたベラパミルおよび／またはジルチアゼムと共にＳ−クロトーを投与することは、ＡＫＩからの腎機能障害の治療および／または防止に治療的であり得る。
いくつかの実施形態では、Ｓ−クロトーは、テストステロンまたはアンドロゲン受容体（ＡＲ）アップレギュレーション化合物と共投与され得る。近年の報告は、人格、心理的福利、または気分に関する男性へのテストステロン治療には有益な効果が観察されないことを示している。加えて、心血管の健康、性機能、身体機能、気分、または認知機能としての低Ｔに対するテストステロン補充の処方は、無作為化臨床試験による裏付けはないと考慮されていた。しかしながら、テストステロン補充は、筋力を増加することが一貫して見出されたが、身体機能に有益な効果は見出されなかった。テストステロンおよび／またはアンドロゲン受容体（ＡＲ）アップレギュレーション化合物と組み合わせたＳ−クロトー投与は、テストステロンまたはＳ−クロトーが単独でこれらの治療グループに対して有し得るいかなる効果をも超えて、高齢者、虚弱または低Ｔ男性の筋力および／または身体機能を顕著に増加し得る。
いくつかの実施形態では、Ｓ−クロトーは、エストロゲンまたはエストロゲンホルモン（例えば、エストラジオール、エストリオール、エストロンなど）と共投与され得る。かかる共投与は、女性の健康指標（例えば、月経、閉経、または閉経に移行している女性）を改善し得、ならびに／または不妊症、多嚢胞性卵巣疾患もしくは障害、肥満、ホルモン不均衡および関係する病態、ならびに／または他の女性健康状態を治療し得る。
いくつかの実施形態では、Ｓ−クロトーは、スマートドラッグまたは認知力向上剤とも呼ばれる、１つ以上のヌートロピックと共投与され得る。ヌートロピック薬剤、補充剤、および／または他の物質は、認知機能、特に実行能力、記憶力、創造性、動機づけ、作業サリエンシー（ｔａｓｋ ｓａｌｉｅｎｃｙ）（作業を実施する動機づけ）、パフォーマンス（特に高度な努力が必要な面倒な作業の）を改善し得、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンチントン病およびＡＤＨＤなどの障害の原因となる認知機能障害または運動機能障害の治療に有用であり得る。認知力のいくつかの側面を改善することが知られている最も一般的に使用される薬剤の部類は、刺激物質、特に前頭前皮質のドーパミン受容体Ｄ１、アドレナリン受容体Ａ２、またはそれらの両方の受容体の直接作用物質または間接作用物質として作用することによって、ヒトへの認知力向上効果を示す刺激物質の部類である。刺激物質としては、例えば、特にＡＤＨＤを有する個体における認知機能（例えば、抑制制御、エピソード記憶、作業記憶、および注意力の面）の範囲に有益であり得るアンフェタミン（例えば、アンフェタミン、デキストロアンフェタミン、リスデキサンフェタミンなど）；身体能力、警戒性、反応時間などを改善し得る１，３−ジメチルアミルアミンなどのジメチルアミルアミン（ＤＭＡＡ）が挙げられる。
メチルフェニデート−認知機能の範囲（例えば、作業記憶、エピソード記憶、および抑制制御、注意力の面、および計画にかかる速度（ｐｌａｎｎｉｎｇ ｌａｔｅｎｃｙ））を改善し得る置換フェネチルアミン；特に睡眠不足の個体の警戒度を高め、論理的思考および問題解決を容易にし、ナルコレプシー、交代制の仕事による睡眠障害、および睡眠時無呼吸症の治療後にも残る日中の眠気などを治療し得る覚醒促進剤として機能し得るユーゲロイクス（ｅｕｇｅｒｏｉｃｓ）（例えば、アルモダフィニル、モダフィニルなど）；警戒性、パフォーマンス、および／または記憶力を高め得るキサンチン（例えば、カフェインなど）；ニコチン、などが挙げられる。
いくつかの実施形態では、Ｓ−クロトーは、当該技術分野で既知のように、１つ以上の骨粗鬆症および／または骨減少症医薬品と共投与され得る。クロトーは骨ミネラル密度を調節する役割を果たし得、クロトーの欠如により動物の骨ミネラル密度低減につながり得る。例えば、クロトーノックアウトマウスは、経時的な骨ミネラル密度の低減を示す。クロトーノックアウトマウスが経時的に骨ミネラル密度の低減を示すなど、クロトー発現はクロトーノックアウト動物における骨の欠陥から救済し得る。疫学研究は、様々なクロトー遺伝子多様体と、骨ミネラル密度の変化および手の変形性関節症の広がりとの間の関連を示している。
Ｓ−クロトーは、化学療法などの１つ以上の抗癌治療および／または防止と組み合わせて投与され得る。非小細胞肺癌（ＮＳＣＬＣ）などの肺癌では、例えば、Ｓ−クロトー投与は、肺癌細胞のシスプラチンおよび／または他の化学療法に対する耐性に影響し得る。加えて、Ｓ−クロトーは、肺癌、胃癌、膵臓癌（腺癌）、および他の形態の癌において潜在的な腫瘍抑制因子として機能し得る。Ｓ−クロトーは、肝細胞癌（ＨＣＣ）の治療のためにソラフェニブ化学療法と組み合わせて投与され得る。クロトーの過剰発現ならびに可溶性クロトータンパク質を用いた治療は、インビトロおよびインビボでの肝癌細胞増殖を低減し得る。Ｓ−クロトー共投与で治療され得る他の癌のタイプとしては、肝細胞癌（ＨＣＣ）、中枢神経系（ＣＮＳ）癌（例えば脳（例えば、神経膠腫、頭蓋咽頭腫、髄芽腫、および髄膜腫）、脊髄および他の腫瘍、リンパ腫など）、（転移性の）結腸癌などが挙げられる。
Ｓ−クロトーはまた、癌患者の化学療法によって誘発される虚弱を治療するために、化学療法と組み合わせて投与され得る。Ｓ−クロトーはまた、他の既知の治療に続いて、癌患者における癌によって誘発される虚弱を治療するために投与され得る。
Ｓ−クロトーは、腎臓透析または他の処置と組み合わせて投与され得る。虚弱は透析患者の予後不良と関連しているため、Ｓ−クロトーは、透析患者の虚弱を治療するために投与され得る。
適切な量のＢＤＮＦが脳内の正常なニューロン回路を発達させ維持するのに役立ち得るため、Ｓ−クロトーは、１つ以上のアルツハイマー病治療もしくは防止と組み合わせて、または脳由来神経栄養因子（ＢＤＮＦ）と組み合わせて投与され得る。
ＣＮＳに関係する病態を治療または防止するためにクロトーが中枢神経系（ＣＮＳ）に入る能力を高めるために、Ｓ−クロトーは、クロトーが血液脳関門を通過する能力を高める１つ以上の分子と組み合わせて投与され得る。例えば、Ｓ−クロトーもＢＤＮＦも、血液脳関門を通過しないことが知られている。本開示の実施形態は、アルツハイマー病を治療するために、および／またはアルツハイマー病に罹患していない個体の認知力を改善するために、Ｓ−クロトーおよび／またはＢＤＮＦを含むＳ−クロトーをＣＮＳに投与するための血液脳関門送達技術を利用することを含む。
Ｓ−クロトーは、５’アデノシンモノリン酸活性化プロテインキナーゼ（ＡＭＰＫ）、またはＡＭＰＫ活性化薬剤、または脂肪酸酸化およびオートファジーを含む細胞のＡＴＰ供給を補給するシグナリング経路を正に調節するか、または糖新生、脂質およびタンパク質合成を含むＡＴＰ消費生合成プロセスを負に調節する成分と組み合わせて投与され得る。
Ｓ−クロトーは、インスリン、フロリジン、または抗酸化剤タイロンなどの１つ以上の抗糖尿病薬剤と組み合わせて投与され得、これらの組み合わせ治療は、糖尿病性障害で生じる酸化的ストレスによる腎損傷の防止にメリットを有し得る。Ｓ−クロトーと１型糖尿病用の他の抗糖尿病薬剤との共投与は、インテグリンβ１−ＦＡＫ／Ａｋｔ経路の活性化を通してβ細胞のアポトーシスを阻害し、カスパーゼ３切断の阻害につながることによって、β−細胞を保護し得る。
Ｓ−クロトーは、過体重および肥満糖尿病被験体の血糖制御および血管機能を改善するために、メトホルミンなどの１つ以上の２型抗糖尿病薬剤と組み合わせて投与され得る。
Ｓ−クロトーは、１つ以上の血圧医薬品、カルシウム調節剤、または慢性腎臓疾患（ＣＫＤ）の治療もしくは防止と組み合わせて投与され得る。例えば、軟組織石灰化はＣＫＤの顕著な特色であり、クロトーは、リン酸塩尿の向上、糸球体濾過量の維持、および血管平滑筋によるリン酸取り込みの直接阻害によって、血管石灰化を改善し得る。
ＰＡＩ−１阻害または欠損が老化の進行を遅延し、臓器の構造および機能を保護しながらクロトー欠損（ｋｌ／ｋｌ）マウスの寿命を延ばすと考えられているため、Ｓ−クロトーは、ＴＭ５４４１または他のＰＡＩ−１阻害剤（プラスミノーゲン活性化因子１）と組み合わせて投与され得る。
Ｓ−クロトーは、サーチュイン１（ＳＩＲＴ１）またはレスベラトロールなどのＳＩＲＴ１活性化化合物（ＳＴＡＣ）と組み合わせて投与され得る。ＩＩＩ型タンパク質デアセチラーゼであるＳＩＲＴ１は、細胞老化／加齢および炎症の調節に関与する新規な抗加齢タンパク質であると考えられている。ＳＩＲＴ１レベルおよび活性は、酸化的ストレスによって引き起こされる肺の炎症中に減少する。炎症に対するＳＩＲＴ１介在性の防御機構は、炎症、早期老化、テロメア短縮、老化に関連する分泌表現型、およびＤＮＡ損傷応答の調節に関連する。２型糖尿病、癌、心血管疾患、および炎症に関連する慢性閉塞性肺疾患の進行に介入するために、種々の食物ポリフェノールおよび薬理的活性化剤がＳＩＲＴ１を調節することが示されている。したがって、ＳＩＲＴ−１の健康上の利点の一部または全部は、Ｓ−クロトーと共に投与されるＳＩＲＴ１および／またはＳＩＲＴＩ活性化化合物の共投与によって補完され得る。
Ｓ−クロトーは、ＦＤＡによって承認済みの、１つ以上のヒト細胞、組織、細胞および組織系生成物（ＨＣＴ／Ｐｓ）と組み合わせて投与され得る。かかる生成物としては、例えば、保存された臍帯静脈、心膜、羊膜（眼の修復のために単独で使用されるとき（細胞を添加されていない））、硬膜、心臓弁同種移植片、末梢血もしくは臍帯血、精液、卵母細胞または胚由来の造血幹細胞を除く、（脱灰骨、靭帯、腱、筋膜、軟骨、眼球組織（角膜および強膜）、皮膚、血管移植片（静脈および動脈）を含む）の１つ以上の骨が挙げられ得る。少なくとも１つの実施形態では、ＨＣＴ／Ｐは、１つ以上の幹細胞であり得るか、またはそれを含み得る。損傷した身体組織および器官の幹細胞治療は、一般的になってきている。幹細胞と組み合わせた治療用組換えクロトータンパク質の投与は、それを必要とする被験体にとって驚くべき、予想外の、さらには相乗的な結果を提供した。
本開示の実施形態は、ヒト幹細胞と組み合わせた治療用組換えクロトータンパク質を含む組み合せ生成物をさらに含む。組成物はまた、本明細書に記載の薬学的に許容可能な担体を含み得る。かかる組成物は、ＦＤＡによって承認済みの、重篤なまたは生命を脅かす疾患または病態を治療、改変、逆転、または治癒するための再生薬として含まれ得るか、または再生薬として分類され得る。暫定的な臨床的根拠は、組成物（薬剤）が、かかる疾患または病態に対して適合していない医学的必要性に対処する潜在性を有することを示す。
例示的には、幹細胞は、ヒト臍帯または胎盤からなどの間葉系幹細胞（ＭＳＣ）であり得るか、またはそれを含み得る。少なくとも１つの実施形態では、本開示のｈｕＭＳＣおよび治療用組換えクロトータンパク質を含む組成物は、ＡＫＩで生じる炎症性および酸化ストレス応答を減弱し、ならびに／または老化に関係するタンパク質およびマイクロＲＮＡの発現を低下させた。
Ｓ−クロトーは、１つ以上の老化阻害剤と組み合わせて投与され得る。例えば、クロトータンパク質は、Ｐｉｎ１−ＦＯＸＭ１および／または他の老化阻害剤と組み合わせて、かかる治療を受けている患者における結果を向上し得る。
Ｓ−クロトーは、以下の：クロトー刺激剤（Ｖｉｔ．Ｄ、ロサルタン、テストステロン）、ＧＤＦ−１１、トリコスタチンＡ抗真菌剤（ＧＤＦ−１１刺激剤）、ＴＩＭＰ−２、ＣＣＬ−１１阻害剤／抗体、ダサチニブ、ニコチンアミドリボシド（ＮＡＤ＋）、ニコチンアミドモノヌクレオチド（ＮＭＮ）（ＮＤＡ＋）、ＡＭＰＫ刺激剤（レスベラトロール、アスピリン、サリチレート、ファイトケミカル、ＤＲ）、Ｃ６０フラーレン、ラパマイシン、ＦＧＦ阻害剤、ＦＯＸＯ４−ｐ５３干渉ペプチド（例えば、ＦＯＸＯ４−ＤＲＩ）などのセノリティック薬剤／化合物、抗アポトーシスタンパク質ＢＣＬ−２およびＢＣＬ−ｘＬの阻害剤のうちの１つ以上と組み合わせて投与され得る。
前述のまたは他の治療または共投与のいずれも、いずれかの治療単独のものよりも相加的または相乗的効果を有し得る。例えば、クロトータンパク質と前述のもののうちの１つ以上との共投与は、同様の濃度で単独成分を投与する個々の結果の合計よりも、大きな治療結果を生じ得る。加えて、相乗効果は、より低い濃度で、単独成分を投与する個々の結果のものと同様の治療結果を含み得る。相乗効果はまた、成分のうちの１つ以上の最大有効投薬量の増加、成分のうちの１つ以上の毒性の低減、または個々の治療結果の単なる相加的な効果以上の任意の他の有益な結果を含み得る。加えて、個々の治療結果の相加的効果は、個々の成分の性質および理解を考慮すると、かかる相加的効果が予測または期待されない相乗効果を含み得る。
本明細書で使用される場合、併用治療または共投与は、クロトータンパク質および１つ以上の追加の活性成分を含む組み合わせ生成物、組成物、または製剤の治療または投与を含み得る。１つ以上の追加の活性成分は、本明細書に記載の成分、薬剤、物質、治療組成物など、または当該技術分野で既知の他のものの中から選択され得る。例えば、クロトータンパク質および１つ以上の追加の活性成分は、注射可能な（例えば、筋肉内、静脈内など）、摂取可能な、経皮的な、吸入可能な、局所的な、または他の製剤に共配合され得る。
あるいは、併用治療または共投与は、クロトータンパク質および１つ以上の追加の活性成分が、組み合わせ生成物、組成物、製剤に組み合わせられていない、または配合されていない、クロトータンパク質および１つ以上の追加の活性成分の治療または投与を含み得る。例えば、クロトータンパク質および１つ以上の追加の活性成分は、別々に注射可能な（例えば、筋肉内、静脈内など）、摂取可能な、経皮的な、吸入可能な、局所的な、または他の製剤を各々含むか、またはそのような製剤であり得る。
また、共投与は、２つ以上の成分の同時投与、または２つ以上の成分の別個の投与を含み得、別個の投与は、好ましくはある期間によって隔てられていることが理解されるであろう。いくつかの実施形態では、期間は非常に短くてもよい。例えば、クロトータンパク質および１つ以上の追加の活性成分の第１の成分の投与直後に、クロトータンパク質および１つ以上の追加の活性成分の第２の成分が、実質的に投与（例えば、注射）され得る。あるいは、第１および第２の投与は、１〜６０秒、１〜６０分、１〜２４時間、１〜７日、１〜４週間、１〜１２ヶ月など、または任意の値もしくはその間の値の範囲などの期間によって隔てられ得る。同様に、同時投与は、２つ以上の成分の投与時間枠の重複を含み得る。
クロトータンパク質多様体
様々な長さの治療用Ｓ−クロトータンパク質（例えば、Ｓ−クロトー１〜９８１、２９〜９８１、３４〜９８１、３６〜９８１、１３１〜９８１、１〜５４９、２９〜５４９、３４〜５４９、３６〜５４９、１３１〜５４９など）は、様々な方法で修飾されて、種々の有益な効果および／または天然クロトータンパク質が呈さない結果を達成し得る。例示的には、ＱｕｉｃｋＣｈａｎｇｅＸＬ部位特異的突然変異誘発キット（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ）を使用して、様々なＳ−クロトー構築物の核酸配列を変化させ得る。当該技術分野で既知の他の突然変異誘発方法およびキットもまた、使用され得る。例えば、様々なサブクローニング方法およびキットが当該技術分野で既知であり、市販されている。
本開示の少なくとも１つの実施形態では、タンパク質は、１つ以上のＣ末端タグおよび／またはＮ末端タグで修飾される。かかるタグは、血清および／またはタンパク質の可溶性半減期を（１つ以上の治療または他の環境において）延長するように機能し得る。タグはまた、タンパク質の存在または診断的な局在化、タンパク質の単離または除去、タンパク質の送達または輸送、タンパク質の１つ以上の標的（例えば、タンパク質、核酸、オルガネラ、細胞構造構成要素など）への結合、酵素的な処理または切断などのためのマーカーとして有用であり得る。少なくとも１つの実施形態では、当該技術分野で既知であり、本明細書にさらに記載されるように、タンパク質のＣ末端は、ＴＥＶ−ＴｗｉｎＳｔｒｅｐおよび／またはＦｃ融合体でタグ付けされ得る。追加の説明は、各々の全体が特定の参照によって本明細書に援用される、文献“Ｆｕｓｉｏｎ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｆｏｒ Ｈａｌｆ−Ｌｉｆｅ Ｅｘｔｅｎｓｉｏｎ ｏｆ Ｂｉｏｌｏｇｉｃｓ ａｓ ａ Ｓｔｒａｔｅｇｙ ｔｏ Ｍａｋｅ Ｂｉｏｂｅｔｔｅｒｓ”、“Ｗｈａｔ ｉｓ ｔｈｅ ｆｕｔｕｒｅ ｏｆ ＰＥＧｙｌａｔｅｄ ｔｈｅｒａｐｉｅｓ？”、および“Ｓｔｒａｔｅｇｉｅｓ ｆｏｒ ｅｘｔｅｎｄｅｄ ｓｅｒｕｍ ｈａｌｆ−ｌｉｆｅ ｏｆ ｐｒｏｔｅｉｎ ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ”に見出され得る。ある特定の実施形態では、リンカーまたはリンカーペプチドは、（天然または多様体）クロトータンパク質配列とタグとの間に挿入および／または配置され得る。
いくつかの実施形態では、修飾クロトータンパク質は、代替（例えば、天然、非天然および／または合成）シグナルペプチドを含み得る。例えば、いくつかの実施形態では、天然シグナルペプチド配列は、代替シグナルペプチドまたはシグナリング配列（ＳＳ）で置換および／または補充され得る。いくつかの実施形態では、クロトータンパク質の天然メチオニン残基は除去され得、ＳＳのＮ末端にメチオニン残基が含まれ得る。追加の説明は、その全体が特定の参照によって援用される、論文“Ｇｅｎｅｒａｔｉｏｎ ｏｆ ｈｉｇｈ ｅｘｐｒｅｓｓｉｎｇ ＣＨＯ ｃｅｌｌ ｌｉｎｅｓ ｆｏｒ ｔｈｅ ｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ ｏｆ ｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔ ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ ｕｓｉｎｇ ｏｐｔｉｍｉｚｅｄ ｓｉｇｎａｌ ｐｅｐｔｉｄｅｓ ａｎｄ ａ ｎｏｖｅｌ ＥＲ ｓｔｒｅｓｓ ｂａｓｅｄ ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ ｓｙｓｔｅｍ”に見出され得る。ある特定の実施形態では、リンカーまたはリンカーペプチドは、（天然または多様体）クロトータンパク質配列と代替ＳＳとの間に挿入および／または配置され得る。
いくつかの実施形態は、１つ以上のアミノ酸多様体を含み得る。本開示は、開示されたクロトータンパク質のいずれかの天然アミノ酸のうちの任意の１つ以上を、天然、合成、または他の構成にかかわらず任意の他のアミノ酸へ多様化させることを考慮することが理解されるであろう。
Ｓ−クロトーＣ３７０Ｓタンパク質多様体
ヒトでは、クロトー遺伝子は染色体１３ｑ１２上に位置する。ＫＬ−ＶＳとして知られる多様体は、白人のおよそ１５％に存在する。この多様体は、６つの一塩基多型（ＳＮＰ）で構成され、そのうちの２つはアミノ酸置換を引き起こす（すなわち、Ｆ３５２ＶおよびＣ３７０Ｓ−フェニルアラニン３５２はバリンに変化し、システイン３７０はセリンに変化した）。インビトロトランスフェクションアッセイは、クロトーの分泌レベルがＶ３５２多様体では６倍低減され、一方でＳ３７０形態ではほぼ３倍増加されたことを示した。しかしながら、ヒトクロトー遺伝子におけるこれらの２つの多様体は、共に分離し、クロトー分泌を１．６倍の範囲で増加させるＫＬ−ＶＳハプロタイプを形成する。例えば、地理的および／または民族的に別個のコホートから採取された３００人を超える個体のスクリーニングでは、Ｖ３５２多様体またはＳ３７０多様体のうちの１つのみを保有する個体は１人も見出されていないことが報告されている。
本開示の一実施形態は、Ｃ３７０Ｓホモ多様体を有する（すなわち、Ｆ３５２Ｖ多様体が存在しない（またはその欠失を伴う））組換えＳ−クロトータンパク質を含む。Ｃ３７０Ｓ多様体は、本明細書に記載の任意のタンパク質構築物との関係において、産生および／または発現され得る。例えば、Ｃ３７０Ｓ多様体は、Ｆｃ融合体および／またはＴＥＶ−ＴｗｉｎＳｔｒｅｐの有無にかかわらず、Ｓ−クロトー１〜９８１、２９〜９８１、３４〜９８１、３６〜９８１、１３１〜９８１、１〜５４９、２９〜５４９、３４〜５４９、３６〜５４９、１３１〜５４９などとの関係において産生または発現され得る。したがって、タンパク質が発現される核酸構築物またはｃＤＮＡは、対応する長さであり得る。
実施形態は、Ｓ３７０ヘテロ接合性またはホモ接合性多様体構築物を産生することと、Ｓ−クロトーＣ３７０Ｓタンパク質をコードする得られた構築物を（例えば、トランスフェクションを介して）適切な発現系（例えば、ＣＨＯ細胞）に導入することと、および／またはＳ−クロトーＳ３７０タンパク質を一過性に発現することと、を含み得る。Ｓ３７０クロトータンパク質は、Ｆ３５２Ｖ／Ｃ３７０Ｓタンパク質および／または野生型Ｆ３５２／Ｃ３７０タンパク質よりもより高いレベルで発現され得る。実施形態は、治療的投与のために発現されたタンパク質を精製すること（および任意選択的に品質管理試験をすること）を含み得る。実施形態は、治療用、または治療有効量のＳ−クロトーＣ３７０Ｓタンパク質を、それを必要とする被験体に投与することを含み得る。被験体は、例えば、ＫＬ−ＶＳ多様体を保有または発現し得る。あるいは、被験体は、他の変異体または多様体の野生型のものであり得る。組換えＳ−クロトーＣ３７０Ｓタンパク質の投与は、血中Ｓ−クロトーレベルの有益な増加につながり得る。したがって、治療用組換えＳ−クロトーＣ３７０Ｓタンパク質を投与された被験体におけるＳ−クロトーの循環濃度は、Ｆ３５２Ｖ多様体が存在するときに観察される希釈効果を受けない可能性がある。
高リン酸血症性家族性腫瘍性石灰化症（ＨＦＴＣ）の治療的処置
罹患しているヒト個体では、ＨＦＴＣは、Ｓ−クロトー−ｒｓ１２１９０８４２３のアミノ酸（ＡＡ）１９３位でのヒスチジン（Ｈ）からアルギニン（Ｒ）への変異によって引き起こされる。いかなる理論にも拘束されるものではないが、ＨＦＴＣ個体におけるＨ１９３Ｒ変異は、ＫＬ依存性ＦＧＦ２３シグナリングを損なわせるＦＧＦ２３およびＦＧＦＲ１ｃとの三成分複合体を形成するＳ−クロトーの能力を損なわせる、と考えられている。結果として、罹患している被験体は、皮膚および皮下組織に高リン酸血症および大量のカルシウム沈着が現れる重度の代謝障害を示す。一部の患者では、骨膜反応および皮質性骨増殖症および皮膚への浸潤の欠如の放射線学的所見に関連する、再発する一過性の長骨の痛みのある腫脹が現れる。
本開示の一実施形態は、Ｈ１９３を有するＳ−クロトータンパク質を含む。Ｈ１９３タンパク質は、本明細書に記載の任意のタンパク質構築物との関係において、産生または発現され得る。例えば、Ｈ１９３多様体は、Ｆｃ融合体および／またはＴＥＶ−ＴｗｉｎＳｔｒｅｐの有無にかかわらず、Ｓ−クロトー１〜９８１、２９〜９８１、３４〜９８１、３６〜９８１、１３１〜９８１、１〜５４９、２９〜５４９、３４〜５４９、３６〜５４９、１３１〜５４９などとの関係において産生または発現され得る。したがって、タンパク質が発現される核酸構築物またはｃＤＮＡは、対応する立体配置であり得る。
実施形態は、Ｈ１９３ヘテロ接合性またはホモ接合性多様体構築物を産生することと、Ｓ−クロトーＨ１９３タンパク質をコードする得られた構築物を（例えば、トランスフェクションを介して）適切な発現系（例えば、ＣＨＯ細胞）に導入することと、および／またはＳ−クロトーＨ１９３タンパク質を一過性に発現することと、を含み得る。Ｈ１９３クロトータンパク質はまた、Ｒ１９３（またはＨ１９３Ｒ）タンパク質よりもより高いレベルで発現され得る。実施形態は、治療的投与のために発現されたタンパク質を精製すること（および任意選択的に品質管理試験をすること）を含み得る。実施形態は、それを必要とする被験体（例えば、ＨＦＴＣ個体、ＨＦＴＣと診断された個体、またはＨ１９３Ｒ（ｒｓ１２１９０８４２３）もしくは他の変異体を保有する患者）に、治療用または治療有効量のＳ−クロトーＨ１９３タンパク質を投与することを含み得る。あるいは、被験体は、他の変異体または多様体の野生型のものであり得る。組換えＳ−クロトーＨ１９３タンパク質の投与は、血中Ｓ−クロトーレベルの有益な増加につながり得る。投与は、ＨＦＴＣに罹患している個体のヒトクロトー遺伝子に見出されるＨ−〜−Ｒ１９３点突然変異の結果として、ＨＦＴＣ個体において転写および循環されるＲ１９３変異体の悪影響を逆転または抑制し得る。したがって、Ｓ−クロトーＨ１９３の循環濃度は、Ｈ１９３ＲまたはＨＦＴＣ個体において観察される影響に対抗するのに役立ち得る。
末期腎疾患（ＥＳＲＤ）を有するＣＣ遺伝子型患者における治療的処置
末期腎疾患（ＥＳＲＤ）を有するおよそ３５万人の患者が、常習的な血液透析のその最初の年に非常に高い死亡率に苦しんでいる。ビタミンＤおよび線維芽細胞増殖因子（ＦＧＦ）−２３レベルの両方は、これらの患者の生存と相関する。いかなる理論にも拘束されるものではないが、クロトーは、ビタミンＤ／ＦＧＦ−２３シグナリング経路中のタンパク質であり、動物モデルにおける加速した加齢および若年死亡と関連している。クロトー遺伝子の遺伝的変異は、ＥＳＲＤを有する被験体の生存と関連し得るとの仮説が立てられている。研究者らは、血液透析の最初の１年間に、クロトー遺伝子の１２の一塩基多型（ＳＮＰ）とＥＳＲＤ患者コホート（ｎ＝１３０７人、白人およびアジア人）の死亡率との間の関連性を試験した。１つのタグＳＮＰ、ｒｓ５７７９１２のＣＣ遺伝子型（イントロン１に位置するクロトー遺伝子配列内のマイナー対立遺伝子頻度［ＭＡＦ］＞０．０５を有する一般的なＨａｐＭａｐの変異体）と、１年死亡率のリスク増加（ＲＲ、１．７６；９５％ＣＩ、１．１９〜２．５９；ｐ＝０．００３）との間の顕著な関連性が発見された。活性型ビタミンＤ補充剤（ＨＲ、２．５１；９５％ＣＩ、１．１８〜５．３４；ｐ＝０．００５）を用いて治療されなかった患者のうち、ＣＣ遺伝子型を有する個体におけるこの効果はさらにより顕著であった。ＨａｐＭａｐ被験体由来のリンパ芽球様細胞株では、ＣＣ遺伝子型は、ＡＡまたはＡＣ遺伝子型と比較して、１６〜２１％低いクロトー発現と関連していた。しかしながら、上述のｒｓ５７７９１２ ＳＮＰヌクレオチド変化のいずれも、クロトータンパク質のアミノ酸変化を生じない。したがって、この機能性ＳＮＰ（ｒｓ５７７９１２）は、ｍＲＮＡレベルでのクロトー遺伝子発現に定量的に影響し得る。
本開示の一実施形態は、ＡＡまたはＡＣ遺伝子型から発現されるＳ−クロトータンパク質を含む。タンパク質は、本明細書に記載の任意のタンパク質構築物との関係において、産生または発現され得る。例えば、タンパク質は、Ｆｃ融合体および／またはＴＥＶ−ＴｗｉｎＳｔｒｅｐの有無にかかわらず、Ｓ−クロトー１〜９８１、２９〜９８１、３４〜９８１、３６〜９８１、１３１〜９８１、１〜５４９、２９〜５４９、３４〜５４９、３６〜５４９、１３１〜５４９などとの関係において産生または発現され得る。したがって、タンパク質が発現される核酸構築物またはｃＤＮＡは、対応する長さであり得る。
実施形態は、ＡＡまたはＡＣヘテロ接合性またはホモ接合性構築物を産生することと、Ｓ−クロトータンパク質をコードする得られた構築物を（例えば、トランスフェクションを介して）適切な発現系（例えば、ＣＨＯ細胞）に導入することと、および／またはＳ−クロトータンパク質を一過性に発現することと、を含み得る。ＡＡまたはＡＣヘテロ接合性またはホモ接合性細胞中で発現されるクロトータンパク質は、ＣＣ細胞におけるよりもより高いレベルで発現され得る。実施形態は、治療的投与のために発現されたタンパク質を精製すること（および任意選択的に品質管理試験をすることと）を含み得る。実施形態は、治療用または治療有効量のＳ−クロトータンパク質を、それを必要とする被験体（例えば、内在性Ｓ−クロトータンパク質発現が低い、１つのタグＳＮＰ、ｒｓ５７７９１２でＣＣ変異を保有する、および／または末期腎疾患（ＥＳＲＤ）を有する、個体または患者）に投与することを含み得る。あるいは、被験体は、他の変異体または多様体の野生型のものであり得る。組換えＳ−クロトータンパク質の投与は、血中Ｓ−クロトーレベルの有益な増加につながり得る。投与は、罹患している個体のヒトクロトー遺伝子に見出される点突然変異の結果として、個体において転写および循環されるＣＣ変異体の悪影響を逆転または抑制し得る。したがって、Ｓ−クロトーの循環濃度は、ＣＣ個体、特に末期腎疾患（ＥＳＲＤ）を有する患者に観察される効果、すなわち常習的に血液透析を受けているＥＳＲＤ患者の最初の年の死亡率に対抗するのに役立ち得る。
レントゲン写真による手の変形性関節症（ＯＡ）および骨棘の治療的処置
変形性関節症（ＯＡ）は、強い遺伝性の要素を有する一般的な複雑な疾患である。研究者らは、白人女性の大きな集団では、クロトー遺伝子の４つの推定上の機能性遺伝子多様体と、手の変形性関節症ＯＡとの間の関連性を研究した。研究者らは、ＳＮＰ Ｇ−３９５Ａと、レントゲン写真による手のＯＡおよび骨棘形成の有無との間に顕著な関連性を見出した。対立遺伝子Ｇは、それぞれ、１．４４（Ｐ＝０．００８、９５％信頼区間（ＣＩ）１．０９〜１．９１）および１．３６（Ｐ＝０．００６、９５％ＣＩ １．０９〜１．７０）のオッズ比（ＯＲ）を有するレントゲン写真による手のＯＡおよび骨棘のリスクを顕著に増加させた。ロジスティック回帰モデリングから、遺伝子型ＧＧは、遺伝子型ＡＡと比較したとき、レントゲン写真による手のＯＡ（ＯＲ＝３．１０、９５％ＣＩ １．１０〜８．７６）および骨棘（ＯＲ＝３．１０、９５％ＣＩ １．１０〜８．７５）の両方のリスクが３倍を超えて増加したことを示した。年齢調整後、遺伝子型ＧＧのＯＲは、レントゲン写真による手のＯＡでは４．３９（Ｐ＝０．００６、９５％ＣＩ １．５１〜１２．７４）、骨棘では４．４７（Ｐ＝０．００５、９５％ＣＩ １．５６〜１２．７７）にさらに増加した。研究者らはまた、クロトー遺伝子の１つの多様体（ＳＮＰ Ｇ−３９５Ａ）が手のＯＡの感受性と関連し、軟骨損傷よりもむしろ骨棘形成を通して作用するようであることを示唆した。
本開示の一実施形態は、ＳＮＰ Ｇ３９５Ａを有する構築物から発現されるＳ−クロトータンパク質を含む。得られたタンパク質は、本明細書に記載の任意のタンパク質構築物との関係において、産生または発現され得る。例えば、Ａ３９５多様体は、Ｆｃ融合体および／またはＴＥＶ−ＴｗｉｎＳｔｒｅｐの有無にかかわらず、Ｓ−クロトー１〜９８１、２９〜９８１、３４〜９８１、３６〜９８１、１３１〜９８１、１〜５４９、２９〜５４９、３４〜５４９、３６〜５４９、１３１〜５４９などとの関係において産生または発現され得る。したがって、タンパク質が発現される核酸構築物またはｃＤＮＡは、対応する長さであり得る。
実施形態は、Ｇ３９５Ａヘテロ接合性またはホモ接合性構築物を産生することと、Ｓ−クロトータンパク質をコードする得られた構築物を（例えば、トランスフェクションを介して）適切な発現系（例えば、ＣＨＯ細胞）に導入することと、および／またはＳ−クロトータンパク質を一過性に発現することと、を含み得る。Ａ３９５ヘテロ接合性またはホモ接合性細胞中で発現されるクロトータンパク質は、Ｇ３９６細胞におけるよりもより高いレベルで発現され得る。実施形態は、治療的投与のために発現されたタンパク質を精製すること（および任意選択的に品質管理試験をすること）を含み得る。実施形態は、それを必要とする被験体（例えば、Ｇ３９５ ＳＮＰ、ならびに／またはレントゲン写真による手の変形性関節症（ＯＡ）および／もしくは骨棘を保有する（これらを発症するリスクがある）個体または患者）に、治療用または治療的有効量のＳ−クロトータンパク質を投与することを含み得る。あるいは、被験体は、他の変異体または多様体の野生型のものであり得る。組換えＳ−クロトータンパク質の投与は、血中Ｓ−クロトーレベルの有益な増加につながり得る。投与は、罹患している個体で転写および循環されるＧ３９５ ＳＮＰの悪影響を逆転または抑制し得る。したがって、Ｓ−クロトーの循環濃度は、Ｇ３９５個体、特にレントゲン写真による手の変形性関節症（ＯＡ）および／または骨棘を発症するリスクがある個体において観察される影響に対抗するのに役立ち得る。したがって、Ｇ−３９５Ａ Ｓ−クロトータンパク質の投与は、患者（例えば、Ｇ３９５ ＳＮＰを保有する患者におけるレントゲン写真による手の変形性関節症（ＯＡ）および骨棘形成のリスクを減少し得る。
メタボリック症候群の治療的処置
腹部肥満、高血糖、脂質異常、および高血圧を含む心血管代謝性危険因子の集団であるメタボリック症候群（ＭｅｔＳ）のリスクおよび／または発生率は年齢と共に増加する。高齢の成人では、ＭｅｔＳは心血管疾患および２型糖尿病のリスクを高めるだけでなく、認知力低下および身体障害にも関連している。現在の根拠によると、ＭｅｔＳは、部分的に遺伝性であり、遺伝因子はＭｅｔＳの発生率に対する環境因子よりもより大きな役割を果たすことが示唆されている。研究者は、中国の９０歳代および１００歳代の人口間で、Ｇ−３９５Ａ多型とメタボリック症候群（ＭｅｔＳ）との間の関連性を発見した。被験体は、都江堰市（ＰＬＡＤ）の長寿および加齢のプロジェクトからであった。クロトー遺伝子のプロモーター領域におけるＧ−３９５Ａ（ｒｓ１２０７５６８）の遺伝子型決定を、ＴａｑＭａｎ対立遺伝子識別アッセイを使用して実施した。ＭｅｔＳは、国際糖尿病連合の基準に従って診断された。９３．５±３．２歳の６９５人の被験体が含まれた。ＧおよびＡの対立遺伝子頻度は、それぞれ０．８５２および０．１４８であった。人口全体では、ＭｅｔＳの頻度は、ＧＧおよびＧＡ＋ＡＡ遺伝子型群でそれぞれ、１０．８％および５．９％であった（ｐ＝０．００４）。−３９５Ａ対立遺伝子キャリアは、人口全体では（オッズ比［ＯＲ］０．５０、９５％信頼区間［ＣＩ］０．２５〜０．９８）、および女性では（ＯＲ０．５１、９５％ＣＩ ０．２４〜０．９７）の顕著に低いＭｅｔＳのリスクを有したが、男性では（ＯＲ０．４２、９５％ＣＩ ０．０５〜３．８５）であった。人口全体および女性では、クロトーＧ−３９５Ａ ＳＮＰとＭｅｔＳとの間の関係は、高血圧（それぞれＯＲ０．４８、９５％ＣＩ ０．３４〜０．６７；ＯＲ０．４７、９５％ＣＩ０．３１〜０．７１）、および高トリグリセリド血症（それぞれＯＲ０．６６、９５％ＣＩ ０．３９〜０．９５；ＯＲ０．５４、９５％ＣＩ０．３１〜０．９８）へのその影響による可能性があった。男性では、この関係は、高血圧（ＯＲ０．４７、９５％ＣＩ ０．２５〜０．９０）および低ＨＤＬ−Ｃ（ＯＲ０．６９、９５％ＣＩ ０．２７〜０．９３）へのその影響による可能性があった。研究者らは、クロトー遺伝子の−３９５Ａ対立遺伝子キャリアが、中国の特に女性の９０歳代および１００歳代の間のＭｅｔＳの低いリスクと相関していると結論付けた。
本開示の一実施形態は、−３９５Ａ対立遺伝子を有する構築物から発現されるＳ−クロトータンパク質を含む。得られたタンパク質は、本明細書に記載の任意のタンパク質構築物との関係において、産生または発現され得る。例えば、Ａ３９５対立遺伝子は、Ｆｃ融合体および／またはＴＥＶ−ＴｗｉｎＳｔｒｅｐの有無にかかわらず、Ｓ−クロトー１〜９８１、２９〜９８１、３４〜９８１、３６〜９８１、１３１〜９８１、１〜５４９、２９〜５４９、３４〜５４９、３６〜５４９、１３１〜５４９などとの関係において産生または発現され得る。したがって、タンパク質が発現される核酸構築物またはｃＤＮＡは、対応する長さであり得る。
実施形態は、−３９５Ａヘテロ接合性またはホモ接合性構築物を産生することと、Ｓ−クロトータンパク質をコードする得られた構築物を（例えば、トランスフェクションを介して）適切な発現系（例えば、ＣＨＯ細胞）に導入することと、および／またはＳ−クロトータンパク質を一過性に発現することと、を含み得る。Ａ３９５ヘテロ接合性またはホモ接合性細胞中で発現されるクロトータンパク質は、Ｇ３９６細胞におけるよりもより高いレベルで発現され得る。実施形態は、治療的投与のために発現されたタンパク質を精製すること（および任意選択的に品質管理試験をすること）を含み得る。実施形態は、それを必要とする被験体（例えば、Ｇ３９５ ＳＮＰ、および／またはメタボリック症候群（ＭｅｔＳ）を保有する（これらを発症するリスクがある）個体もしくは患者に、治療用または治療的有効量のＳ−クロトータンパク質を投与することを含み得る。あるいは、被験体は、他の変異体または多様体の野生型のものであり得る。組換えＳ−クロトータンパク質の投与は、血中Ｓ−クロトーレベルの有益な増加につながり得る。投与は、罹患している個体で転写および循環されるＧ３９５ ＳＮＰの悪影響を逆転または抑制し得る。したがって、Ｓ−クロトーの循環濃度は、Ｇ３９５個体、特にメタボリック症候群（ＭｅｔＳ）を発症するリスクのある個体において観察される影響に対抗するのに役立ち得る。したがって、Ｇ−３９５Ａ Ｓ−クロトータンパク質の投与は、患者（例えば、Ｇ３９５ ＳＮＰを保有する高齢のヒトおよび／または女性の患者）におけるメタボリック症候群（ＭｅｔＳ）のリスクを減少し得る。
癌の治療的処置
Ｓ−クロトーは、基礎Ｗｎｔシグナリング活性を阻害し、それによって結腸直腸癌（ＣＲＣ）の腫瘍抑制因子として機能すると考えられている。加えて、寿命差に関連するクロトー遺伝子多様体は、酪酸塩が介在するＷｎｔの過剰活性化を抑制し、したがってＣＲＣのリスクを増加させ得る。このような方式で、存在するクロトー多様体のタイプおよびその相対的発現は、食事に由来する酪酸塩のレベルと相互作用し、ＣＲＣリスクを改変し得るという仮説が立てられている。さらに、ｍＴＯＲシグナリングはまた、ヒトの加齢に関連しており、かつＷｎｔとｍＴＯＲシグナリング間のクロストークは、結腸腫瘍化に影響し得る。
ＫＬ−ＶＳ多様体または他の構築物は、（例えば、ＫＬ−ＶＳ内の）どのＳＮＰが、Ｓ−クロトーに影響して基礎Ｗｎｔシグナリングの減少および／または酪酸塩が介在するＷｎｔの過剰活性化の抑制を生じる要因であるかを調べるためのビヒクルとして機能し得、後者は、Ｓ−クロトー腫瘍抑制に関連しているＷｎｔに関係する活性である。実施形態は、ＫＬ−ＶＳ多様体の腫瘍抑制作用に影響することが示されている適切なアミノ酸（例えば、Ｓ−クロトーのＫＬ−ＶＳストレッチ）を修飾することを含む。本開示の一実施形態は、６つのＳＮＰのＫＬ−ＶＳストレッチにおいて１つ以上のアミノ酸変化を有する組換えＳ−クロトータンパク質を含む。タンパク質は、本明細書に記載の任意のタンパク質構築物との関係において、産生およびまたは発現され得る。例えば、タンパク質は、Ｆｃ融合体および／またはＴＥＶ−ＴｗｉｎＳｔｒｅｐの有無にかかわらず、Ｓ−クロトー１〜９８１、２９〜９８１、３４〜９８１、３６〜９８１、１３１〜９８１、１〜５４９、２９〜５４９、３４〜５４９、３６〜５４９、１３１〜５４９などとの関係において産生または発現され得る。したがって、タンパク質が発現される核酸構築物またはｃＤＮＡは、対応する長さであり得る。
実施形態は、ヘテロ接合性またはホモ接合性多様体構築物を産生することと、Ｓ−クロトータンパク質をコードする得られた構築物を（例えば、トランスフェクションを介して）適切な発現系（例えば、ＣＨＯ細胞）に導入することと、および／またはＳ−クロトータンパク質を一過性に発現することと、を含み得る。クロトータンパク質は、野生型を含む他のクロトータンパク質より、より高いレベルで発現され得る。実施形態は、治療的投与のために発現されたタンパク質を精製すること（および任意選択的に品質管理試験をすること）を含み得る。実施形態は、それを必要とする被験体（例えば、結腸直腸癌（ＣＲＣ）または別の腫瘍を有するかまたは発症するリスクがある患者）に、治療用または治療有効量のＳ−クロトータンパク質を投与することを含み得る。被験体は、例えば、減少したＷｎｔ阻害活性を有するクロトー多様体を保有または発現し得る。あるいは、被験体は、他の変異体または多様体の野生型のものであり得る。組換えＳ−クロトータンパク質の投与は、血中Ｓ−クロトーレベルの有益な増加につながり得る。
加齢に関係する病態の治療的処置
研究者らは、クロトーと、入院した高齢患者の臨床病態の指標として一般に受け入れられている生物学的パラメータとの間の関連性を発見した。研究者らは、入院した高齢患者（６５〜９９歳）５９４人のＫＬ遺伝子座で一塩基多型（ＳＮＰｓ）ｒｓ９５３６３１４、ｒｓ１２０７５６８、およびｒｓ５６４４８１を遺伝子型決定し、連続して老人病棟に通い、共分散的かつ遺伝的リスクスコアモデルの分析を使用して、これらの生物学的量的形質を有するＫＬ多様体との関連性を試験した。ｒｓ９５３６３１４と血清レベルのヘモグロビン、アルブミン、および高密度リポタンパク質コレステロール（ＨＤＬ−Ｃ）との顕著な関連性、ならびにｒｓ５６４４８１と血清レベルのヘモグロビン、空腹時インスリンおよび空腹時グルコースとの顕著な関連性が観察された。性別分析により、これらの関連性が確認され、ＫＬ遺伝子型とＨＤＬ−Ｃ、空腹時グルコース、および空腹時インスリンレベルとの関連性が、女性の性別によって支配され得る一方で、血清レベルのヘモグロビンとの関連性は、男性の性別によって支配され得ることを示唆している。ＫＬ遺伝子型とクレアチンレベルとの関連性は女性に見出された一方で、インスリン様増殖因子−１（ＩＧＦ−１）とリンパ球数（ＬＣ）との関連性は男性に見出された。遺伝的リスクスコア（ＧＲＳ）モデルにより、ＫＬ ＳＮＰとヘモグロビン、総コレステロール、およびＨＤＬ−Ｃとの間の顕著な関連性をさらに確認した。ＧＲＳタグ付きアプローチを用いた性別分析では、女性ではＨＤＬ−Ｃ、空腹時グルコースレベル、および空腹時インスリンレベルとの、男性ではヘモグロビンおよびＬＣとの関連性を確認した。この知見は、ＫＬ遺伝子座が、入院した高齢患者の血清レベルの脂質、空腹時グルコース、アルブミン、およびヘモグロビンなどの定量的形質に影響し得、クレアチン、ＩＧＦ−１レベル、およびＬＣではいくらかの性差が示唆され、したがって遺伝的要因のうちの１つが年齢に関係する疾患および寿命に寄与する可能性があることを示唆している。
本開示の一実施形態は、本明細書に記載のＳ−クロトータンパク質を含む。実施形態は、好適なクロトー構築物を産生することと、Ｓ−クロトータンパク質をコードする構築物を（例えば、トランスフェクションを介して）適切な発現系（例えば、ＣＨＯ細胞）に導入することと、および／またはＳ−クロトータンパク質を一過性に発現することと、を含み得る。実施形態は、治療的投与のために発現されたタンパク質を精製すること（および任意選択的に品質管理試験をすること）を含み得る。実施形態は、治療用または治療有効量のＳ−クロトータンパク質を、それを必要とする被験体（例えば、個体もしくは患者、任意選択的に老人、ならびに／または加齢に関係する病態、低内在性Ｓ−クロトータンパク質発現、および／もしくは年齢に関係する病態、もしくは減少した寿命の症状に苦しむ個体または患者）に投与することを含み得る。組換えＳ−クロトータンパク質の投与は、血中Ｓ−クロトーレベルの有益な増加につながり得る。（例えば、入院患者および／または高齢患者の）血清レベルの総コレステロール、ＨＤＬ−Ｃ、空腹時グルコース、空腹時インスリン、アルブミン、クレアチン、ＩＧＦ−１、ヘモグロビン、およびリンパ球数などの定量的形質である積極的な治療方式で、投与は、加齢に関係する病態および／または悪影響を逆転または抑制し得る。
本明細書に記載の１つ以上の治療方法では、治療される個体は、クロトー遺伝子に変異（例えば、ゲノム的にコードされたヘテロ接合性変異またはホモ接合性変異）を有し得、治療レジメンは、例えば、個体によって発現される変異と同様の多様体を含む、野生型クロトーおよび／または本明細書に開示のクロトーのうちの任意の１つ以上の変異体を含むペプチドの治療的投薬量を投与することを含み得る。あるいは、治療される個体は、野生型クロトーをコード／発現し得、治療レジメンは、野生型クロトーおよび／または本明細書に開示のクロトーのうちの任意の１つ以上の多様体を含む治療的投薬量のペプチドを投与することを含み得る。いくつかの実施形態では、個体によって発現されるクロトーの天然野生型または変異形態にかかわらず、治療方法は、循環および／または細胞に結合したクロトーのレベルの低さ（例えば、対照グループと比較して）を測定することと、循環および／または細胞に結合したクロトータンパク質の濃度を少なくとも恒常性レベルまで作用可能に回復させる治療投薬量を投与することと、を含み得る。いくつかの実施形態では、これは、治療用濃縮物の投与前に、クロトーのレベル（例えば、遺伝子発現レベル、タンパク質発現レベル、循環レベルなど）を測定することを含み得る。加えて、治療的投薬量は、個体で測定されたクロトーのレベルに依存し得る。いくつかの実施形態では、治療的投薬量は、例えば、恒常性レベルのスカラー倍（例えば、１．５倍多く、２倍多く、３倍多く、４倍多く、５倍多く、６倍多く、７倍多く、８倍多く、９倍多く、１０倍多く、１５倍多く、２０倍多く ２５倍多く、３０倍多く、４０倍多く、５０倍多く、７５倍多く、１００倍多く、５００倍多く、１、０００倍多く、１０、０００倍多くなど）など、恒常性レベルを超える。
より具体的には、年齢に関係する病態の治療的処置は、治療濃度の１つ以上のクロトー多様体を投与することを含み得ることが理解されるべきである。いくつかの実施形態では、これは、例えば、配列番号２〜配列番号７０のうちのいずれか１つ以上から選択されるペプチドなどの、治療濃度の本明細書に開示のクロトー多様体（またはクロトー多様体の組み合わせ）を用いて患者を治療することを含み得る。年齢に関係する病態は、年齢に関係する病態を有する個体によって発現および／またはコードされたクロトー多様体と同じかまたは異なるクロトー多様体で治療され得ることが理解されるべきである。例えば、年齢に関係する病態に苦しんでいる個体は、クロトーの１つ以上の野生型または変異体を遺伝的にコードしている場合があり、かつこの個体は、野生型および／または変異体クロトータンパク質を、（対照グループと比較して）恒常性レベルで、恒常性レベル未満で発現するか、または全く発現しない場合がある。個体の年齢に関係する病態を治療することを目的とする治療レジメンは、本明細書に開示の１つ以上のクロトー多様体を投与することを含み得る。
予防的Ｓ−クロトー投与
前述に加えて、本開示の実施形態は、治療用または治療有効量のＳ−クロトータンパク質を、予防目的および／またはある特定の健康属性の維持のためにそれを必要とする個体または被験体に投与することを含み得る。例えば、ある特定のＳ−クロトータンパク質の投与は、診断された加齢に関係する病態に未だ苦しんでいない任意選択的な加齢患者の若さの維持に役立ち得る。したがって、本開示のある特定の実施形態は、患者の病態の治療に関係し得る、および／または治療を含み得るが、他の実施形態は、１つ以上の病態の防止、発症の阻害、および／または予防的対処に関係し得る、および／またはこれらを含み得る。例えば、Ｓ−クロトーは、１つ以上のクロトー遺伝子に変異を有する遺伝性障害を有する人に投与され得る。
実施例１
表１は、ＨＥＫおよび／またはＣＨＯ細胞株における列挙されたクロトー多様体の発現および精製の結果を示す。以下の表１に提供された結果では、以下の簡略化されたプロトコルに従った。
Ｆｃ融合タンパク質については、標準的なＡＴＵＭ法を使用して、タンパク質発現ベクターをＨＥＫ２９３．ｓｕｓまたはＣＨＯにトランスフェクトした。要約すると、細胞を７日間増殖させ、採取した。細胞数は、注釈の欄に記載されている。上清ｐＨを、１Ｍ Ｈｅｐｅｓ ｐＨ７．４で調整し、アジ化ナトリウムを添加した。ＫａｎＣａｐ Ａ樹脂を使用してタンパク質を捕捉した。樹脂をＰＢＳで洗浄した。樹脂をＰＢＳプラス１ＭのＮａＣｌで洗浄した。樹脂をＰＢＳで洗浄した。タンパク質を、５０ｍＭのクエン酸塩ｐＨ３．５、１００ｍＭのＮａＣｌで溶出した。タンパク質を、１ＭのトリスｐＨ８、０．５Ｍのアルギニンで直ちに中和した。ＳＤＳ ＰＡＧＥゲルサンプルをこの段階で除去した。タンパク質をＰＢＳに緩衝液交換した。ＯＤ２８０によってタンパク質を定量化し、計算された吸光係数を使用して、量および濃度を測定した。還元および非還元ＳＤＳ−ＰＡＧＥ（Ｂｉｏｒａｄ基準トリス／グリシン／ＳＤＳ、４〜２０％）を使用して、純度および分子量を決定した。Ｓｅｐａｘ Ｚｅｎｉｘ−Ｃ ＳＥＣ−３００、３ｕｍ、３００Å、４．６×１５０ｍｍサイズ排除カラムおよびＰＢＳランニングバッファを使用して２８０ｎｍでの検出で、ＨＰＬＣによって凝集状態を測定した。フィルター滅菌、液体窒素で急速凍結後、タンパク質をアリコートとして出荷した。以前の精製ラウンドにおけるように、Ｆｃタグ付きタンパク質については、精製の前後でＳＤＳ−ＰＡＧＥを実行したサンプルから測定されたように、ＰＢＳへの脱塩中にタンパク質の損失が観察されたことに留意すべきである。これらのタンパク質はＨＰＬＣから発現されたが、脱塩中またはＰＢＳ中のシリカＨＰＬＣカラムでのアッセイ中に問題が生じた。したがって、バッファ選択を最適化し得る。
Ｓｔｒｅｐタグ付けタンパク質については、標準的なＡＴＵＭ法を使用して、タンパク質発現ベクターをＨＥＫ２９３．ｓｕｓまたはＣＨＯにトランスフェクトした。要約すると、細胞を７日間増殖させ、採取した。上清ｐＨを、１Ｍ Ｈｅｐｅｓ ｐＨ７．４で調整し、アジ化ナトリウムを添加した。ＢｉｏＬｏｃｋビオチン隔離試薬を添加した。ＳｔｒｅｐＴａｃｔｉｎ ｓｕｐｅｒｆｌｏｗ樹脂を使用してタンパク質を捕捉した。樹脂を１００ｍＭのトリスｐＨ８、１５０ｍＭのＮａＣｌ、１ｍＭのＥＤＴＡで洗浄した。タンパク質を１００ｍＭのトリスｐＨ８、１５０ｍＭのＮａＣｌ、１ｍＭのＥＤＴＡプラス２．５ｍＭのデスチオビンで溶出した。ＯＤ２８０によってタンパク質を定量化し、計算された吸光係数を使用して、量および濃度を測定した。還元および非還元ＳＤＳ−ＰＡＧＥ（Ｂｉｏｒａｄ基準トリス／グリシン／ＳＤＳ、４〜２０％）を使用して、純度および分子量を決定した。Ｓｅｐａｘ Ｚｅｎｉｘ−Ｃ ＳＥＣ−３００、３ｕｍ、３００Å、４．６×１５０ｍｍサイズ排除カラムおよびＰＢＳランニングバッファを使用して２８０ｎｍでの検出で、ＨＰＬＣによって凝集状態を測定した。フィルター滅菌、液体窒素で急速凍結後、タンパク質をアリコートとして出荷した。Ｓｔｒｅｐタグ付きタンパク質については、サンプルを溶出緩衝液中でアッセイしたことに留意すべきである。この溶出緩衝液は、非常に「中性」であり、タンパク質に有害ではない。また、ＳＥＣカラムのランニングバッファはＰＢＳであったため、タンパク質はアッセイ中に緩衝液交換を受けた。７分を超える時間での吸光度は小分子である。
本明細書に開示されているが表１に示されていない１つ以上の他のクロトー多様体に加えて、表１に開示のクロトー多様体の発現および／または精製は、いくつかの実施形態では、天然クロトーの発現および／または精製に優る利点を生じることが理解されるべきである。例えば、クロトー多様体を発現および／または精製すると、代替生成物の数および／またはタイプが減少され得る。加えて、またはあるいは、天然クロトーの発現レベルと比較して、所望のクロトー多様体の発現レベルが増加し得る。加えて、またはあるいは、所望のクロトー多様体は、同等な条件および方法（例えば、所望のクロトー多様体の濃度が、発現および／または精製された副生成物の付随的な減少と共に増加する）下で、より純粋な形態で発現および／または精製される。
実施例２
以下の例は、開示の本発明の範囲を定義する例示的な一連の特許請求の範囲を含む。しかしながら、本明細書で提供されるように、本発明の範囲は、以下の実施例または前述の説明によってではなく、添付の特許請求の範囲によって示される。
１．組換えクロトータンパク質を製造する例示的な方法であって、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞中、好ましくはジヒドロ葉酸還元酵素（ＤＨＦＲ）欠損ＣＨＯ細胞中、より好ましくはＣＨＯ−Ｓ細胞中、または好ましくはグルタミン合成酵素（ＧＳ）欠損ＣＨＯ細胞中、より好ましくはＧＳ−／−ＣＨＯ細胞中で、組換えクロトータンパク質を産生することを含み、当該タンパク質が、好ましくは配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有する、方法。
２．当該タンパク質が、それに結合した１つ以上のグリカンを含む、請求項１に記載の方法。
３．当該ＣＨＯ細胞が、プロモーター、好ましくは強力なプロモーターをコードする外因性核酸と、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有するポリペプチドと、任意選択的に、機能性ジヒドロ葉酸還元（ＤＨＦＲ）酵素、または機能性グルタミン合成（ＧＳ）酵素と、を含有し、当該組換えクロトータンパク質を産生することが、当該核酸によってコードされた当該ポリペプチドを発現することを含む、請求項１または２に記載の方法。
４．好ましくはトランスフェクションを介して当該外因性核酸を当該ＣＨＯ細胞に導入するステップ、ならびに液体培地、好ましくは無血清および／または動物タンパク質成分を含まない培地中で当該ＣＨＯ細胞を増殖させるステップであって、当該液体培地が、好ましくは炭素源、窒素源、および１つ以上のビタミン、ミネラル、塩、アミノ酸、補充剤、または添加剤を含み、より好ましくは、当該液体培地が、ヒポキサンチン、チミジン、および／またはグルタミンを欠く、増殖させるステップ、から選択される１つ以上のステップをさらに含む、請求項３に記載の方法。
５．当該タンパク質が、当該タンパク質を濃縮することなく、液体培地１リットル当たり、好ましくは２００〜５００ｍｇのタンパク質の濃度まで、より好ましくは５００〜２０００ｍｇのタンパク質の濃度まで、なおより好ましくは２０００〜５０００ｍｇのタンパク質の濃度まで、当該ＣＨＯ細胞から当該液体培地に分泌される、請求項４に記載の方法。
６．有効量のメトトレキサート（ＭＴＸ）および／またはメチオニンスルホキシミン（ＭＳＸ）を、好ましくは約１ｎＭ〜１μＭの濃度まで、より好ましくは約１０〜１００ｎＭの濃度まで当該液体培地に導入することをさらに含む、請求項４に記載の方法。
７．当該液体培地中で増殖する生存ＣＨＯ細胞の懸濁培養物を選択することをさらに含み、当該選択された懸濁培養物の当該培地中の当該タンパク質濃度が、当該タンパク質を濃縮することなく、少なくとも２００ｍｇ／Ｌ、好ましくは少なくとも５００ｍｇ／Ｌ、より好ましくは少なくとも１０００ｍｇ／Ｌ、さらにより好ましくは少なくとも２０００ｍｇ／Ｌ、なおより好ましくは少なくとも５０００ｍｇ／Ｌである、請求項４に記載の方法。
８．当該選択された懸濁培養物の当該生存ＣＨＯ細胞が、細胞当たり、少なくとも約２〜１０コピー、好ましくは少なくとも約１０〜２０コピー、より好ましくは少なくとも約２０〜３０コピー、さらにより好ましくは少なくとも約３０〜５０コピーの当該外因性核酸を含有する、請求項７に記載の方法。
９．当該ＣＨＯ細胞、液体培地、またはそれらの両方からの組換えクロトータンパク質含有抽出物を精製することをさらに含み、当該抽出物が、好ましくは、乾燥重量で少なくとも約９８％のタンパク質、および／または約１〜１００ｐｐｍ未満のＣＨＯ宿主細胞タンパク質（ＨＣＰ）を含む、請求項４に記載の方法。
１０．当該抽出物を精製することが、当該タンパク質のグリコシル化を維持する、請求項９に記載の方法。
１１．当該ＣＨＯ細胞を増殖させることが、少なくとも１０リットル、好ましくは少なくとも２５リットル、より好ましくは少なくとも５０リットル、さらにより好ましくは少なくとも１００リットル、なおより好ましくは少なくとも２５０リットル、なおより好ましくは少なくとも５００リットル、なおより好ましくは少なくとも１，０００リットル、なおより好ましくは少なくとも２，０００リットル、なおより好ましくは少なくとも２，５００リットル、なおより好ましくは少なくとも５，０００リットル、なおより好ましくは少なくとも１０，０００リットルの容積または作業容積を有するバイオリアクター内で、当該ＣＨＯ細胞を培養することを含む、請求項４に記載の方法。
１２．当該核酸が、配列番号７６〜配列番号９６のうちの１つと、好ましくは少なくとも８５％、より好ましくは少なくとも９０％、さらにより好ましくは少なくとも９５％、なおより好ましくは少なくとも９８％、なおより好ましくは少なくとも９９％、最も好ましくは１００％の核酸配列同一性を有する導入遺伝子またはｃＤＮＡを含む、請求項１〜１１のいずれか１項に記載の方法。
１３．当該タンパク質が、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと、少なくとも９０％、好ましくは少なくとも９５％、より好ましくは少なくとも９８％、さらにより好ましくは少なくとも９９％、最も好ましくは１００％のアミノ酸配列同一性を有する、請求項１〜１２のいずれか１項に記載の方法。
１４．好ましくはジヒドロ葉酸還元酵素（ＤＨＦＲ）欠損ＣＨＯ細胞中、より好ましくはＣＨＯ−Ｓ細胞中、または好ましくはグルタミン合成酵素（ＧＳ）欠損細胞中、より好ましくはＧＳ−／−ＣＨＯ細胞中で複数のチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞を含む細胞株であって、当該ＣＨＯ細胞が、プロモーター、好ましくは強力なプロモーターを含み、かつポリペプチドであって、ポリペプチドの少なくとも一部分が、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有するポリペプチドと、任意選択的に、機能性ジヒドロ葉酸還元酵素（ＤＨＦＲ）酵素、または機能性グルタミン合成（ＧＳ）酵素とをコードする、外因性核酸を含有する、細胞株。
１５．当該ＣＨＯ細胞が、細胞当たり、少なくとも約２〜１０コピー、好ましくは少なくとも約１０〜２０コピー、より好ましくは少なくとも約２０〜３０コピー、さらにより好ましくは少なくとも約３０〜５０コピーの当該外因性核酸を含有するか、または含有するように選択される、請求項１４に記載の細胞株。
１６．当該核酸が、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと、少なくとも９０％、好ましくは少なくとも９５％、より好ましくは少なくとも９８％、さらにより好ましくは少なくとも９９％、最も好ましくは１００％のアミノ酸配列同一性を有するポリペプチドをコードする、請求項１４に記載の細胞株。
１７．当該核酸が、配列番号７６〜配列番号９６のうちの１つと、好ましくは少なくとも８５％、より好ましくは少なくとも９０％、さらにより好ましくは少なくとも９５％、なおより好ましくは少なくとも９８％、なおより好ましくは少なくとも９９％、最も好ましくは１００％の核酸配列同一性を有する導入遺伝子またはｃＤＮＡを含む、請求項１４に記載の細胞株。
１８．液体培地、好ましくは無血清および／または動物タンパク質成分を含まない液体培地であって、好ましくは炭素源、窒素源、および１つ以上のビタミン、ミネラル、塩、アミノ酸、補充剤、または添加剤を含み、より好ましくは、当該液体培地が、ヒポキサンチン、チミジン、および／またはグルタミンを欠く、液体培地と、当該ＣＨＯ細胞が当該核酸によってコードされた当該ポリペプチドを発現するような当該液体培地中で増殖する請求項１４〜１７のいずれか１項に記載の細胞株と、を含み、当該ポリペプチドが、組換えクロトータンパク質を含む、懸濁細胞培養物。
１９．当該ＣＨＯ細胞が、当該タンパク質を濃縮することなく、液体培地１リットル当たり、好ましくは２００〜５００ｍｇのタンパク質の濃度まで、より好ましくは５００〜２０００ｍｇのタンパク質の濃度まで、なおより好ましくは２０００〜５０００ｍｇのタンパク質の濃度まで当該タンパク質を当該液体培地中に分泌し、および／または当該タンパク質が、当該タンパク質を濃縮せずに、液体培地１リットル当たり、２００〜５００ｍｇのタンパク質の濃度で、より好ましくは５００〜２０００ｍｇのタンパク質の濃度まで、なおより好ましくは２０００〜５０００ｍｇのタンパク質の濃度まで、当該液体培地中に存在する、請求項１８に記載の懸濁細胞培養物。
２０．当該タンパク質が、それに結合した１つ以上のグリカンを含む、請求項１８または１９に記載の懸濁細胞培養物。
２１．当該液体培地が、有効量のメトトレキサート（ＭＴＸ）および／またはメチオニンスルホキシミン（ＭＳＸ）を、好ましくは約１ｎＭ〜１μＭの濃度で、より好ましくは約１０ｎＭ〜１００ｎＭの濃度でさらに含む、請求項１８〜２０のいずれか１項に記載の懸濁細胞培養物。
２２．当該タンパク質が、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと、少なくとも８５％、好ましくは少なくとも９０％、より好ましくは少なくとも９５％、さらにより好ましくは少なくとも９８％、なおより好ましくは少なくとも９９％、最も好ましくは１００％のアミノ酸配列同一性を有する、請求項１８〜２１のいずれか１項に記載の懸濁細胞培養物。
２３．当該タンパク質の少なくとも一部分が、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと、少なくとも８０％のアミノ酸配列同一性を有する、組換えクロトータンパク質。
２４．当該タンパク質が、ＩＧＦ−１および／もしくはＷｎｔシグナリング経路を調節する、β−グルクロニダーゼおよび／もしくはシアリダーゼ活性を呈する、ｐ５３／ｐ２１シグナリング経路を抑制する、ならびに／または好ましくは、当該ｐ５３／ｐ２１シグナリング経路の抑制を通して、Ｈ２Ｏ２によって誘発される細胞老化およびアポトーシスを低減する、請求項２３に記載の組み換えタンパク質。
２５．当該タンパク質が、好ましくは酸化ストレス、増殖因子シグナリング、イオン恒常性の調節、ならびに／または当該細胞表面、好ましくは１つ以上のイオンチャネルタンパク質および／もしくは増殖因子受容体、好ましくはインスリン／インスリン様増殖因子−１受容体上で１つ以上の糖タンパク質の活性の調節において、好ましくは多面発現活性を呈する体液性因子として機能する、請求項２３または２４に記載の組換えクロトータンパク質。
２６．当該タンパク質の少なくとも一部分が、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと、少なくとも８５％、好ましくは少なくとも９０％、より好ましくは少なくとも９５％、さらにより好ましくは少なくとも９８％、なおより好ましくは少なくとも９９％、最も好ましくは１００％のアミノ酸配列同一性を有する、請求項２３〜２５のいずれか１項に記載の組換えクロトータンパク質。
２７．加齢に関係するもしくは他の病態、疾患、または障害を治療する方法であって、それを必要とする被験体に、薬学的有効量の請求項２３〜２６のいずれか１項に記載の組換えクロトータンパク質を投与することを含む、方法。
２８．加齢に関係するもしくは他の病態、疾患、または障害を治療する方法であって、それを必要とする被験体に、薬学的有効量の、ヒトアルファクロトーアイソフォーム１のアミノ酸残基１〜９８１の少なくともサブセットと少なくとも８０％のアミノ酸配列同一性を有する、可溶性組換えクロトータンパク質を投与することを含む、方法。
２９．加齢に関係するもしくは他の病態、疾患、または障害を治療する方法であって、それを必要とする被験体に、薬学的有効量の、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと少なくとも８０％のアミノ酸配列同一性を有する可溶性組換えクロトータンパク質を投与することを含む、方法。
３０．当該タンパク質が、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと、少なくとも８５％、好ましくは少なくとも９０％、より好ましくは少なくとも９５％、さらにより好ましくは少なくとも９８％、なおより好ましくは少なくとも９９％、最も好ましくは１００％のアミノ酸配列同一性を有する、請求項２７〜２９のいずれか１項に記載の方法。
３１．当該薬学的有効量が、当該被験体の当該血清可溶性クロトータンパク質濃度を所定のレベルまで上昇させることと、好ましくは、所定の期間の間、所定の閾値以上で当該被験体の当該血清可溶性クロトータンパク質濃度を維持することと、に十分である、請求項３０に記載の方法。
３２．当該所定のレベルが、血清１ミリリットル当たり、約１０００ピコグラム以上の可溶性クロトータンパク質である、請求項３１に記載の方法。
３３．当該所定のレベルが、血清１ミリリットル当たり、約５０、１００、２５０、５００、７５０、１０００、１２５０、１５００、１７５０、２０００、２２５０、２５００、２７５０、３０００、３５００、４０００、４５００、５０００、５５００、６０００、６５００、７０００、７５００、８０００、８５００、９０００、９５００、１０，０００、１１，０００、１２，０００、１３，０００、１４，０００、１５，０００ ２０，０００、２５，０００、３０，０００ ４０，０００、５０，０００、７５，０００、もしくは１００，０００ピコグラム以上、もしくはその間の可溶性クロトータンパク質であり、および／または、血清中の可溶性クロトータンパク質の典型的な健康レベルより約５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、１００％、１５０％、２００％、２５０％、３００％、４００％、５００％、６００％、７００％、８００％、９００％、１０００％、１２００％、１５００％、２０００％、２５００％、３０００％、４０００％、もしくは５０００％以上、もしくはその間高い、請求項３１に記載の方法。
３４．当該被験体の血清可溶性クロトータンパク質濃度を測定することと、当該被験体の当該血清可溶性クロトータンパク質濃度を第１の所定レベルまで上昇させるのに十分なタンパク質の薬学的有効量を計算することであって、当該第１の所定のレベルが、好ましくは血清１ミリリットル当たり約１０００ピコグラム以上の可溶性クロトータンパク質である、計算することと、当該被験体の当該血清中の可溶性クロトータンパク質の低下速度および／または代謝速度を測定することと、当該被験体の当該血清可溶性クロトータンパク質濃度が当該測定された速度に基づいて第２の所定のレベル以下になる次の投薬時間を計算することと、当該被験体の当該血清可溶性クロトータンパク質濃度を当該第２の所定のレベルから当該第１の所定のレベルまで上昇させるのに十分な当該タンパク質の次の投薬量を計算することと、のうちの１つ以上をさらに含む、請求項３１に記載の方法。
３５．当該タンパク質の当該次の投薬量を当該被験体に投与することをさらに含む、請求項３４に記載の方法。
３６．好ましくはトランスフェクションを介して外因性核酸をチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞に導入することであって、当該核酸が好ましくは導入遺伝子またはｃＤＮＡを含む、導入することであって、当該核酸が、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと少なくとも８５％、好ましくは少なくとも９０％、より好ましくは少なくとも９５％、さらにより好ましくは少なくとも９８％、なおより好ましくは少なくとも９９％、最も好ましくは１００％のアミノ酸配列同一性を有するポリペプチドをコードし、当該核酸が、好ましくは少なくとも８５％、より好ましくは少なくとも９０％、さらにより好ましくは少なくとも９５％、なおより好ましくは少なくとも９８％、なおより好ましくは少なくとも９９％、最も好ましくは１００％の配列番号７６〜配列番号９６のうちの１つと核酸配列同一性を有する、導入することと、当該ＣＨＯ細胞を、液体培地中、好ましくは無血清および／または動物性タンパク質成分を含まない液体培地中で増殖させることであって、当該液体培地が、好ましくは炭素源、窒素源、および１つ以上のビタミン、ミネラル、塩、アミノ酸、補充剤、または添加剤を含み、より好ましくは、当該液体培地が、ヒポキサンチン、チミジン、および／またはグルタミンを欠き、当該ＣＨＯ細胞が、好ましくは、ジヒドロ葉酸還元酵素（ＤＨＦＲ）欠損ＣＨＯ細胞、より好ましくはＣＨＯ−Ｓ細胞中、またはグルタミン合成酵素（ＧＳ）欠損ＣＨＯ細胞、より好ましくはＧＳ−／−ＣＨＯ細胞中である、増殖させることと、有効量のメトトレキサート（ＭＴＸ）および／またはメチオニンスルホキシミン（ＭＳＸ）を、好ましくは約１ｎＭ〜１μＭの濃度まで、より好ましくは約１０〜１００ｎＭの濃度まで当該液体培地に導入することと、当該液体培地中で増殖する生存ＣＨＯ細胞の懸濁培養物を細胞選択プロセスを通して選択することであって、当該選択された懸濁培養物の当該培地中の当該タンパク質の濃度が、当該タンパク質を濃縮することなく、少なくとも２００ｍｇ／Ｌ、好ましくは少なくとも５００ｍｇ／Ｌ、より好ましくは少なくとも１０００ｍｇ／Ｌ、さらにより好ましくは少なくとも２０００ｍｇ／Ｌ、なおより好ましくは少なくとも５０００ｍｇ／Ｌである、選択することと、当該ＣＨＯ細胞中で当該組換え可溶性クロトータンパク質を産生することであって、当該タンパク質が、好ましくは当該ＣＨＯ細胞から当該液体培地中に、液体培地１リットル当たり、好ましくは２００〜５００ｍｇのタンパク質濃度まで、より好ましくは５００〜２０００ｍｇのタンパク質濃度、なおより好ましくは２０００〜５０００ｍｇのタンパク質濃度まで分泌される、産生することと、当該ＣＨＯ細胞、液体培地、またはそれらの両方から組換え可溶性クロトータンパク質含有抽出物を精製することであって、当該抽出物が、好ましくは、乾燥重量で少なくとも約９８％の当該組換え型可溶性クロトータンパク質、および／または約１〜１００ｐｐｍ未満のＣＨＯ宿主細胞タンパク質（ＨＣＰ）を含み、当該抽出物を精製することが、好ましくは当該タンパク質のグリコシル化を維持し、当該タンパク質がそれに結合した１つ以上のグリカンを有する、精製することと、のうちの１つ以上をさらに含む、請求項３１に記載の方法。
３７．当該所定の期間が、少なくとも約６時間、好ましくは少なくとも約１２時間、より好ましくは少なくとも約１８時間、さらにより好ましくは少なくとも約２４時間、なおより好ましくは少なくとも約３０時間、なおより好ましくは少なくとも約３６時間、なおより好ましくは少なくとも約４２時間、なおより好ましくは少なくとも約４８時間、なおより好ましくは少なくとも約５４時間、なおより好ましくは少なくとも約６０時間、なおより好ましくは少なくとも約６６時間、なおより好ましくは少なくとも約７２時間である、請求項３１に記載の方法。
３８．当該所定の期間が、約１〜１２０日以上である、請求項３１に記載の方法。
３９．当該所定の期間が、約６ヶ月、９ヶ月、または１年以上である、請求項３１に記載の方法。
４０．当該被験体が、ヒト、非ヒト動物、または非ヒト哺乳動物である、請求項３０〜３９のいずれか１項に記載の方法。
４１．当該タンパク質が、薬学的に許容可能な担体中にまたは薬学的に許容可能な担体と共に投与される、請求項３０〜４０のいずれか１項に記載の方法。
４２．当該加齢に関係する、または他の病態、疾患、または障害が、虚弱、骨密度低下、骨ミネラル密度低下、体重低下、筋肉萎縮、筋肉退化、筋量低下、筋力低下、握力低下、脚力低下、体力低下、動作低下、動作自由の低下、生活の質評価の低下、駆出率低下、運動能力低下、学習力低下、学習能力低下、記憶力低下、知能指数低下、認知力劣化、健忘症、認知能力低下、認知機能低下、シナプス可塑性低下、シナプス機能低下、および細胞老化のうちの１つ以上を含む、請求項３０〜４１のいずれか１項に記載の方法。
４３．当該加齢に関係するまたは他の病態、疾患、または障害が、慢性腎臓病（ＣＫＤ）、多嚢胞腎臓疾患（ＰＫＤ）、常染色体優性多嚢胞腎臓（ＡＤＰＫＤ）、急性腎臓傷害（ＡＫＩ）、急性尿細管壊死（ＡＴＮ）、急性アレルギー性間質性腎炎（ＡＡＩＮ）、糸球体腎炎、腎臓疾患、腎不全、非乏尿性腎不全、アルコール依存症、高リン酸血症、筋ジストロフィー（ＭＳ）、１型糖尿病、２型糖尿病、心血管疾患（ＣＶＤ）、心血管石灰化、脳血管不全、血管石灰化、虚血性心疾患、血圧異常、食塩感受性高血圧、組織石灰化、石灰化アテローム硬化性プラーク負荷、石灰化症、家族性腫瘍性石灰化症、癌、１つ以上の腫瘍、ミエリンに関係する疾患、脱髄疾患、神経変性疾患、神経血管疾患、進行性核上麻痺ＰＳＰ）、ポンペ病、ニーマンピック病、微小膠症、ファーバー病（ＦＤ）、骨量疾患、骨粗鬆症、骨減少症、骨減少症（特に皮質骨のＢＭＤの低下）、肺気腫、肺線維症、皮膚萎縮、胸腺萎縮、腎間質マトリックスの蓄積、糸球体硬化、貧血、アルブミン尿症、タンパク尿症、不妊症、アルツハイマー病、パーキンソン病、認知症、血管性認知症、筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）、運動ニューロン疾患（ＭＮＤ）、心房細動、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）、線維筋痛症、成人発症糖尿病、関節炎、関節リウマチ、変形性関節症、緑内障、白内障、黄斑変性、多発性硬化症（ＭＳ）、狼瘡、潰瘍性大腸炎、悪液質、肥満、ビタミンＤに関係する病態、骨疾患、骨再形成を通じた骨疾患、幹細胞枯渇、船酔い、宇宙不適応症候群（ＳＡＳ）、吐き気、およびめまい、のうちの１つ以上を含む、請求項３０〜４１のいずれか１項に記載の方法。
４４．１つ以上の追加の活性成分を投与または共投与することをさらに含む、請求項３０〜４３のいずれか１項に記載の方法。
４５．当該１つ以上の追加の活性成分が、薬剤、抗体、ホルモン、造影剤、医薬品、天然化合物、合成化合物、または医薬組成物からなる群から選択される、請求項４４に記載の方法。
４６．請求項２３〜２５のいずれか１項に記載の組換えクロトータンパク質の薬学的有効量と、薬学的に許容可能な担体と、を含む、医薬組成物。
４７．薬学的有効量の組換え可溶性クロトータンパク質であって、当該タンパク質の少なくとも一部分が、ヒトアルファクロトーアイソフォーム１の１〜９８１、２９〜９８１、３４〜９８１、３６〜９８１、１３１〜９８１、１〜５４９、２９〜５４９、３４〜５４９、３６〜５４９、もしくは１３１〜５４９のアミノ酸残基の少なくともサブセット、または配列番号２〜配列番号７０のうちの１つの少なくとも一部分と、少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有する、当該タンパク質と、薬学的に許容可能な担体とを含む、医薬組成物。
４８．当該タンパク質の少なくとも一部分が、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つの少なくとも一部分と、少なくとも８５％、好ましくは少なくとも８８％、より好ましくは少なくとも９０％、さらにより好ましくは少なくとも９２％、なおより好ましくは少なくとも９５％、なおより好ましくは少なくとも９８％、なおより好ましくは少なくとも９９％、最も好ましくは１００％のアミノ酸配列同一性を有する、請求項４６または４７に記載の医薬組成物。
４９．１つ以上の追加の活性成分をさらに含む、請求項４６〜４８のいずれか１項に記載の医薬組成物。
５０．虚弱、骨密度低下、骨ミネラル密度低下、体重低下、筋肉萎縮、筋肉退化、筋量低下、筋力低下、握力低下、脚力低下、体力の低下、動作低下、動作自由の低下、生活の質評価低下、駆出率低下、運動能力の低下、学習力低下、学習能力低下、記憶力低下、知能指数低下、認知力劣化、健忘症、認知能力低下、認知機能低下、シナプス可塑性低下、シナプス機能低下、細胞老化、慢性腎臓病（ＣＫＤ）、多嚢胞腎臓疾患（ＰＫＤ）、常染色体優性多嚢胞腎臓（ＡＤＰＫＤ）、急性腎臓傷害（ＡＫＩ）、急性尿細管壊死（ＡＴＮ）、急性アレルギー性間質性腎炎（ＡＡＩＮ）、糸球体腎炎、腎臓疾患、腎不全、非乏尿性腎不全、アルコール依存症、高リン酸血症、筋ジストロフィー（ＭＳ）、１型糖尿病、２型糖尿病、心血管疾患（ＣＶＤ）、心血管石灰化、脳血管不全、血管石灰化、虚血性心疾患、血圧異常、食塩感受性高血圧、組織石灰化、石灰化アテローム硬化性プラーク負荷、石灰化症、家族性腫瘍性石灰化症、癌、１つ以上の腫瘍、ミエリンに関係する疾患、脱髄疾患、神経変性疾患、神経血管疾患、進行性核上麻痺（ＰＳＰ）、ポンペ病、ニーマンピック病、微小膠症、ファーバー病（ＦＤ）、骨量疾患、骨粗鬆症、骨減少症、骨減少症（特に皮質骨のＢＭＤの喪失）、肺気腫、肺線維症、皮膚萎縮、胸腺萎縮、腎間質マトリックスの蓄積、糸球体硬化、貧血、アルブミン尿症、タンパク尿症、不妊症、アルツハイマー病、パーキンソン病、認知症、血管性認知症、筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）、運動ニューロン疾患（ＭＮＤ）、心房細動、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）、線維筋痛症、成人発症糖尿病、関節炎、関節リウマチ、変形性関節症、緑内障、白内障、黄斑変性、多発性硬化症（ＭＳ）、狼瘡、潰瘍性大腸炎、悪液質、肥満、ビタミンＤに関係する病態、骨疾患、骨再形成を通じた骨疾患、幹細胞枯渇、船酔い、宇宙不適応症候群（ＳＡＳ）、吐き気、およびめまい、のうちの１つ以上を含む、加齢に関係するもしくは他の病態、疾患、または障害の治療に使用されるための、請求項４６〜４９のいずれか１項に記載の医薬組成物。
５１．急性腎臓傷害（ＡＫＩ）の治療または防止に使用するための、請求項４６〜４９のいずれか１項に記載の医薬組成物。
５２．急性腎臓傷害（ＡＫＩ）または他の病態を治療または防止する方法であって、それを必要とする被験体に、薬学的有効量の組換え可溶性クロトータンパク質を投与することを含み、当該タンパク質の少なくとも一部分が、ヒトアルファクロトーアイソフォーム１の１〜９８１、２９〜９８１、３４〜９８１、３６〜９８１、１３１〜９８１、１〜５４９、２９〜５４９、３４〜５４９、３６〜５４９、もしくは１３１〜５４９のアミノ酸残基の少なくともサブセット、または配列番号２〜配列番号７０のうちの１つの少なくとも一部分と、少なくとも８５％、８６％、８８％、９０％、９２％、９５％、９８％、９９％、もしくは好ましくは１００％のアミノ酸配列同一性を有する、方法。
５３．当該薬学的有効量の組換え可溶性クロトータンパク質と共に、１つ以上の追加の活性成分を共投与することをさらに含む、請求項５２に記載の方法。
５４．当該タンパク質および１つ以上の追加の活性成分が、組み合わせ生成物または組成物に配合される、請求項５３に記載の方法。
５５．当該タンパク質および１つ以上の追加の活性成分が、別個の組成物である、請求項５３に記載の方法。
５６．当該タンパク質および１つ以上の追加の活性成分が、混合される、請求項５３に記載の方法。
５７．当該タンパク質および１つ以上の追加の活性成分が、共投与のために構成され、共投与が、同時投与、または好ましくはある期間によって隔てられた別個の投与を含む、請求項５３に記載の方法。
５８．当該１つ以上の追加の活性成分が、薬剤、抗体、ホルモン、造影剤、医薬品、または組成物からなる群から選択される、請求項５３に記載の方法。
５９．当該症状が、急性尿細管壊死（ＡＴＮ）、腎炎、急性アレルギー性間質性腎炎（ＡＡＩＮ）、糸球体腎炎および／もしくは腎毒性、または腎臓移植もしくは他の外科手術、急性尿細管壊死（ＡＴＮ）、腎炎、急性アレルギー性間質性腎炎（ＡＡＩＮ）、糸球体腎炎、腎毒性、もしくは低血圧から少なくとも部分的に生じるＡＫＩを含む、請求項５２または５３に記載の方法。
６０．当該腎毒性が、薬剤性腎毒性を含む、請求項５２または５３に記載の方法。
６１．当該薬剤性腎毒性が、抗菌剤によって誘発される腎毒性を含む、請求項６０に記載の方法。
６２．当該薬剤性腎毒性が、アミノグリコシドによって誘発される腎毒性を含む、請求項６０に記載の方法。
６３．当該投与するステップが、当該被験体における血清可溶性クロトーレベルを測定するステップと、当該被験体における当該血清可溶性クロトーレベルを所定のレベルまたは正常レベルのパーセントまで上昇させるのに十分な第１の投薬量のタンパク質を計算するステップと、好ましくはボーラスまたは段階的投与によって、より好ましくは注射によって、当該被験体に当該タンパク質の第１の投与量を投与するステップと、好ましくは当該第１の投薬量の投与に続いて当該被験体の当該血清中の可溶性クロトー低下速度を測定するステップと、当該タンパク質の次の投薬量時間および／または量を計算するステップと、ならびに計算された時間および／または量に従って当該被験体に当該タンパク質の次の投薬量を投与するステップと、からなる群から選択される１つ以上のステップを含む、請求項５２または５３に記載の方法。
６４．当該投与するステップが、所定のレベルまたは閾値以上に、任意選択的に所定の期間の間、当該被験体の血清可溶性クロトータンパク質濃度を上昇および／または維持するのに十分である、請求項５２または５３に記載の方法。
６５．当該所定のレベルまたは閾値が、血清１ミリリットル当たり約５０、１００、２５０、５００、７５０、１０００、１２５０、１５００、１７５０、２０００、２２５０、２５００、２７５０、３０００、３５００、４０００、４５００、５０００、５５００、６０００、６５００、７０００、７５００、８０００、８５００、９０００、９５００、１０，０００、１１，０００、１２，０００、１３，０００、１４，０００、１５，０００ ２０，０００、２５，０００、３０，０００ ４０，０００、５０，０００、７５，０００、もしくは１００，０００ピコグラム以上、および／もしくはその間の可溶性クロトータンパク質、または、約５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、１００％、１５０％、２００％、２５０％、３００％、４００％、５００％、６００％、７００％、８００％、９００％、１０００％、１２００％、１５００％、２０００％、２５００％、３０００％、４０００％、もしくは５０００％、可溶性クロトータンパク質の典型的な健康レベルを超える、請求項６４に記載の方法。
６６．当該所定の期間が、約６時間、１２時間、１８時間、１日、２日、３日、４日、５日、６日、７日、８日、９日、１０日、１２日、１４日、２１日、３０日、４５日、６０日、９０日、１２０日、６ヶ月、９ヶ月、１年、２年、３年、４年、または５年以上である、請求項６４に記載の方法。
６７．当該タンパク質が、腎臓移植または腎毒素の投与前に予防的に、および／または腎臓移植または腎毒素の投与に続いて投与される、請求項５２または５３に記載の方法。
６８．当該腎毒素が、好ましくは、パロモマイシン、トブラマイシン、ゲンタマイシン、アミカシン、カナマイシンおよびネオマイシンからなる群から選択される１つ以上のアミノグリコシド；好ましくはアンホテリシンＢおよびフルシトシンからなる群から選択される１つ以上の抗真菌剤；好ましくは、約１．５：１のヨウ素対分子比を有する高浸透圧調節媒体（ＨＯＣＭ）、約３：１のヨウ素対分子比を有する低浸透圧の非イオン性造影剤（ＬＯＣＭ）、および約６：１のヨウ素対分子比を有する等張性（等浸透圧性）造影剤（ＩＯＣＭ））からなる群から選択される、１つ以上の造影剤；好ましくは、アデホビル、シドホビル、テノホビル、およびホスカネットからなる群から選択される１つ以上の抗レトロウイルス剤；好ましくは、シスプラチン、カルボプラチン、オキサリプラチン、アルキル化剤、ベンダムスチン、シクロホスファミド、イホスファミド、ニトロソウレア、テモゾロミド、メルファラン、抗腫瘍抗生物質、マイトマイシンＣ、ブレオマイシン、アントラサイクリン、代謝拮抗剤、カペシタビン、ヒドロキシウレア、メトトレキサート、ペメトレキセド、プララトレキサート、ペントスタチン、フルダラビン、クラドリビン、ゲムシタビン、シタラビン、ビンカアルカロイド、トポテカン、エトポシド、タキサン、イリノテカン、レナリドミド、エリブリン、三酸化ヒ素、もしくはイキサゾミブからなる群から選択される１つ以上の癌（または化学）治療薬；好ましくは、ゾレドロネート／ゾレドロン酸、イバンドロネート、アレンドロネート、アレンドロネート／コレカルシフェロール、エチドロネート、リセドロネート、炭酸カルシウムリセドロネート、パミドロネート、およびチルドロネートからなる群から選択される１つ以上のビスホスホネートもしくはその誘導体；および／または好ましくはコカインおよびヘロインからなる群から選択される１つ以上の麻酔薬またはオピオイド）を含む、請求項６７に記載の方法。
６９．当該タンパク質が、好ましくはＦ３５２Ｖを含まず、より好ましくはＦ３５２を含むＣ３７０Ｓ、および／またはＨ１９３またはＨ１９３Ｒ以外の多様体を含む、請求項５２または５３に記載の方法。
７０．高齢な個体を治療する方法であって、当該高齢な個体が、クロトータンパク質をコードする遺伝子においてホモ接合またはヘテロ接合変異を有し、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと、少なくとも８５％、好ましくは少なくとも９０％、より好ましくは少なくとも９５％、さらにより好ましくは少なくとも９８％、なおより好ましくは少なくとも９９％、最も好ましくは１００％のアミノ酸配列同一性を有する、治療濃度のポリペプチドを投与することを含む、方法。
７１．当該遺伝子の発現レベルを測定することをさらに含む、請求項７０に記載の方法。
７２．当該治療薬濃縮物を投与する当該ステップが、当該遺伝子の当該発現レベルに依存する、請求項７１に記載の方法。
結論
前述の詳細な説明は、特定の例示的な実施形態を参照しているが、本開示は、その趣旨または本質的な特徴から逸脱することなく、他の特定の形態で具体化され得る。したがって、記載の実施形態は、全ての点において、例示的なものであって限定的なものではないとみなされるべきである。例えば、関連する当業者および本開示の所有者に考えられ得る、本明細書に記載および／または例示された本発明の特色の様々な置換、変化および／または改変、ならびに本明細書に記載および／または例示された原理の追加の適用は、添付の特許請求によって規定される本開示の趣旨および範囲から逸脱することなく、記載されたおよび／または例示された実施形態になされ得る。かかる置換、変化および／または改変は、本開示の範囲内であるとみなされるものである。
したがって、本発明の範囲は、前述の説明によってではなく、添付の特許請求の範囲によって示される。特許請求の範囲に列挙される制限は、特許請求の範囲で採用される言語に基づいて広く解釈されるものであり、前述の詳細な説明に記載の特定の例に限定されず、非排他的かつ非限定的であると解釈されるものである。特許請求に相当する範囲および意味に入る全ての変更は、その範囲内に含まれるものである。
ある特定の実施形態の様々な特色はまた、本開示の他の実施形態と互換性があり、組み合わせられ、含まれ、および／または組み込まれ得ることも理解されるであろう。例えば、本開示のある特定の実施形態に従ったシステム、方法、および／または生成物は、本明細書に開示および／または記載の他の実施形態に記載された特色を含み得るか、組み込み得るか、または含み得る。したがって、本開示の特定の実施形態に関連するある特定の特色の開示は、かかる特色の特定の実施形態への適用または包含を制限するものとして解釈されるべきではない。
加えて、特色が特定の実施形態で必要とされていると記載されていない限り、様々な実施形態に記載の特色は任意選択的であり、本開示の他の実施形態に含まれ得ない。さらに、特色がそれと組み合わせて別の特色を必要とするものとして記載されていない限り、本明細書の任意の特色は、本明細書に開示の同じかまたは異なる実施形態の任意の他の特色と組み合わせられ得る。ある特定の実施形態では、特色は任意選択的であり得るが、かかる実施形態に特色が含まれるとき、それらは本開示で記載のような特定の構成を有することが要求され得ることが理解されるであろう。
同様に、本明細書に記載の、および／または特許請求の範囲に列挙される任意の方法またはプロセスに列挙されるステップは、任意の好適な順序で実行され得、特に（明示的または黙示的に）記載されない限り、記載および／または列挙される順序に必ずしも限定されない。しかしながら、かかるステップはまた、本開示のある特定の実施形態では、特定の順序または任意の好適な順序で実施されることも要求され得る。
さらに、例示的なシステム、方法、生成物などの様々な周知の態様は、例示的な実施形態の態様を不明瞭にすることを避けるために、本明細書では詳細には記載しない。しかしながら、かかる態様もまた、本明細書において考慮される。

Claims (72)

  1. 組換えクロトータンパク質を製造する方法であって、
    組換えクロトータンパク質を、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞中、
    好ましくはジヒドロ葉酸還元酵素（ＤＨＦＲ）欠損ＣＨＯ細胞中、より好ましくはＣＨＯ−Ｓ細胞中、または
    好ましくはグルタミン合成酵素（ＧＳ）欠損ＣＨＯ細胞中、より好ましくはＧＳ−／−ＣＨＯ細胞中で産生することを含み、
    前記タンパク質が、好ましくは、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有する、方法。
  2. 前記タンパク質が、それに結合した１つ以上のグリカンを含む、請求項１に記載の方法。
  3. 前記ＣＨＯ細胞が、
    プロモーター、好ましくは強力なプロモーターと、
    配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有するポリペプチドと、
    任意選択的に、機能性ジヒドロ葉酸還元（ＤＨＦＲ）酵素、または機能性グルタミン合成（ＧＳ）酵素と、をコードする外因性核酸を含有し、
    前記組換えクロトータンパク質を産生することが、前記核酸によってコードされた前記ポリペプチドを発現させることを含む、請求項１または２に記載の方法。
  4. 好ましくはトランスフェクションを介して前記外因性核酸を前記ＣＨＯ細胞に導入するステップ、ならびに
    液体培地、好ましくは無血清および／または動物タンパク質成分を含まない培地中で前記ＣＨＯ細胞を増殖させるステップであって、前記液体培地が、好ましくは炭素源、窒素源、および１つ以上のビタミン、ミネラル、塩、アミノ酸、補充剤、または添加剤を含み、より好ましくは、前記液体培地が、ヒポキサンチン、チミジン、および／またはグルタミンを欠く、増殖させるステップ、から選択される１つ以上のステップをさらに含む、請求項３に記載の方法。
  5. 前記タンパク質が、前記タンパク質を濃縮することなく、液体培地１リットル当たり、好ましくは２００〜５００ｍｇのタンパク質の濃度まで、より好ましくは５００〜２０００ｍｇのタンパク質の濃度まで、なおより好ましくは２０００〜５０００ｍｇのタンパク質の濃度まで、前記ＣＨＯ細胞から前記液体培地に分泌される、請求項４に記載の方法。
  6. 有効量のメトトレキサート（ＭＴＸ）および／またはメチオニンスルホキシミン（ＭＳＸ）を、好ましくは約１ｎＭ〜１μＭの濃度まで、より好ましくは約１０〜１００ｎＭの濃度まで前記液体培地に導入することをさらに含む、請求項４に記載の方法。
  7. 前記液体培地中で増殖する生存ＣＨＯ細胞の懸濁培養物を選択することをさらに含み、前記選択された懸濁培養物の前記培地中の前記タンパク質濃度が、前記タンパク質を濃縮することなく、少なくとも２００ｍｇ／Ｌ、好ましくは少なくとも５００ｍｇ／Ｌ、より好ましくは少なくとも１０００ｍｇ／Ｌ、さらにより好ましくは少なくとも２０００ｍｇ／Ｌ、なおより好ましくは少なくとも５０００ｍｇ／Ｌである、請求項４に記載の方法。
  8. 前記選択された懸濁培養物の前記生存ＣＨＯ細胞が、細胞当たり、少なくとも約２〜１０コピー、好ましくは少なくとも約１０〜２０コピー、より好ましくは少なくとも約２０〜３０コピー、さらにより好ましくは少なくとも約３０〜５０コピーの前記外因性核酸を含有する、請求項７に記載の方法。
  9. 前記ＣＨＯ細胞、液体培地、またはそれらの両方からの組換えクロトータンパク質含有抽出物を精製することをさらに含み、前記抽出物が、好ましくは、
    乾燥重量で少なくとも約９８％の前記タンパク質、および／または
    約１〜１００ｐｐｍ未満のＣＨＯ宿主細胞タンパク質（ＨＣＰ）を含む、請求項４に記載の方法。
  10. 前記抽出物を精製することが、前記タンパク質のグリコシル化を維持する、請求項９に記載の方法。
  11. 前記ＣＨＯ細胞を増殖させることが、少なくとも１０リットル、好ましくは少なくとも２５リットル、より好ましくは少なくとも５０リットル、さらにより好ましくは少なくとも１００リットル、なおより好ましくは少なくとも２５０リットル、なおより好ましくは少なくとも５００リットル、なおより好ましくは少なくとも１，０００リットル、なおより好ましくは少なくとも２，０００リットル、なおより好ましくは少なくとも２，５００リットル、なおより好ましくは少なくとも５，０００リットル、なおより好ましくは少なくとも１０，０００リットルの容積または作業容積を有するバイオリアクター内で、前記ＣＨＯ細胞を培養することを含む、請求項４に記載の方法。
  12. 前記核酸が、配列番号７６〜配列番号９６のうちの１つと、好ましくは少なくとも８５％、より好ましくは少なくとも９０％、さらにより好ましくは少なくとも９５％、なおより好ましくは少なくとも９８％、なおより好ましくは少なくとも９９％、最も好ましくは１００％の核酸配列同一性を有する導入遺伝子またはｃＤＮＡを含む、請求項１〜１１のいずれか１項に記載の方法。
  13. 前記タンパク質が、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと、少なくとも９０％、好ましくは少なくとも９５％、より好ましくは少なくとも９８％、さらにより好ましくは少なくとも９９％、最も好ましくは１００％のアミノ酸配列同一性を有する、請求項１〜１２のいずれか１項に記載の方法。
  14. 好ましくはジヒドロ葉酸還元酵素（ＤＨＦＲ）欠損ＣＨＯ細胞中、より好ましくはＣＨＯ−Ｓ細胞中、または
    好ましくはグルタミン合成酵素（ＧＳ）欠損ＣＨＯ細胞中、より好ましくはＧＳ−／−ＣＨＯ細胞中の、複数のチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞を含む、細胞株であって、
    外因性核酸を含有する前記ＣＨＯ細胞が、プロモーター、好ましくは強力なプロモーターを含み、かつ
    ポリペプチドであって、前記ポリペプチドの少なくとも一部分が、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有する、ポリペプチドと、
    任意選択的に、機能性ジヒドロ葉酸還元（ＤＨＦＲ）酵素、または機能性グルタミン合成（ＧＳ）酵素と、をコードする、細胞株。
  15. 前記ＣＨＯ細胞が、細胞当たり、少なくとも約２〜１０コピー、好ましくは少なくとも約１０〜２０コピー、より好ましくは少なくとも約２０〜３０コピー、さらにより好ましくは少なくとも約３０〜５０コピーの前記外因性核酸を含有するか、または含有するように選択される、請求項１４に記載の細胞株。
  16. 前記核酸が、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと、少なくとも９０％、好ましくは少なくとも９５％、より好ましくは少なくとも９８％、さらにより好ましくは少なくとも９９％、最も好ましくは１００％のアミノ酸配列同一性を有するポリペプチドをコードする、請求項１４に記載の細胞株。
  17. 前記核酸が、配列番号７６〜配列番号９６のうちの１つと、好ましくは少なくとも８５％、より好ましくは少なくとも９０％、さらにより好ましくは少なくとも９５％、なおより好ましくは少なくとも９８％、なおより好ましくは少なくとも９９％、最も好ましくは１００％の核酸配列同一性を有する導入遺伝子またはｃＤＮＡを含む、請求項１４に記載の細胞株。
  18. 液体培地、好ましくは無血清および／または動物タンパク質成分を含まない液体培地であって、前記液体培地が、好ましくは炭素源、窒素源、および１つ以上のビタミン、ミネラル、塩、アミノ酸、補充剤、または添加剤を含み、より好ましくは、前記液体培地が、ヒポキサンチン、チミジン、および／またはグルタミンを欠く、液体培地と、
    前記ＣＨＯ細胞が前記核酸によってコードされた前記ポリペプチドを発現するよう前記液体培地中で増殖する請求項１４〜１７のいずれか１項に記載の細胞株と、を含み、前記ポリペプチドが、組換えクロトータンパク質を含む、懸濁細胞培養物。
  19. 前記ＣＨＯ細胞が、前記タンパク質を濃縮することなく、液体培地１リットル当たり、好ましくは２００〜５００ｍｇのタンパク質の濃度まで、より好ましくは５００〜２０００ｍｇのタンパク質の濃度まで、なおより好ましくは２０００〜５０００ｍｇのタンパク質の濃度まで前記タンパク質を前記液体培地中に分泌し、および／または前記タンパク質が、前記タンパク質を濃縮せずに、液体培地１リットル当たり、２００〜５００ｍｇのタンパク質の濃度で、より好ましくは５００〜２０００ｍｇのタンパク質の濃度まで、なおより好ましくは２０００〜５０００ｍｇのタンパク質の濃度まで、前記液体培地中に存在する、請求項１８に記載の懸濁細胞培養物。
  20. 前記タンパク質が、それに結合した１つ以上のグリカンを含む、請求項１８または１９に記載の懸濁細胞培養物。
  21. 前記液体培地が、有効量のメトトレキサート（ＭＴＸ）および／またはメチオニンスルホキシミン（ＭＳＸ）を、好ましくは約１ｎＭ〜１μＭの濃度で、より好ましくは約１０ｎＭ〜１００ｎＭの濃度でさらに含む、請求項１８〜２０のいずれか１項に記載の懸濁細胞培養物。
  22. 前記タンパク質が、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと、少なくとも８５％、好ましくは少なくとも９０％、より好ましくは少なくとも９５％、さらにより好ましくは少なくとも９８％、なおより好ましくは少なくとも９９％、最も好ましくは１００％のアミノ酸配列同一性を有する、請求項１８〜２１のいずれか１項に記載の懸濁細胞培養物。
  23. 前記タンパク質の少なくとも一部分が、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと、少なくとも８０％のアミノ酸配列同一性を有する、組換えクロトータンパク質。
  24. 前記タンパク質が、
    ＩＧＦ−１および／もしくはＷｎｔシグナリング経路を調節する、
    β−グルクロニダーゼ活性および／もしくはシアリダーゼ活性を呈する、
    ｐ５３／ｐ２１シグナリング経路を抑制する、ならびに／または
    好ましくは前記ｐ５３／ｐ２１シグナリング経路の抑制を通して、Ｈ２Ｏ２によって誘発される細胞老化およびアポトーシスを低減する、請求項２３に記載の組換えクロトータンパク質。
  25. 前記タンパク質が、好ましくは酸化ストレス、増殖因子シグナリング、イオン恒常性の調節、ならびに／または前記細胞表面、好ましくは１つ以上のイオンチャネルタンパク質および／もしくは増殖因子受容体、好ましくはインスリン／インスリン様増殖因子−１受容体上で１つ以上の糖タンパク質の活性の調節において、好ましくは多面発現活性を呈する体液性因子として機能する、請求項２３または２４に記載の組換えクロトータンパク質。
  26. 前記タンパク質の少なくとも一部分が、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと、少なくとも８５％、好ましくは少なくとも９０％、より好ましくは少なくとも９５％、さらにより好ましくは少なくとも９８％、なおより好ましくは少なくとも９９％、最も好ましくは１００％のアミノ酸配列同一性を有する、請求項２３〜２５のいずれか１項に記載の組換えクロトータンパク質。
  27. 加齢に関係するもしくは他の病態、疾患、または障害を治療する方法であって、それを必要とする被験体に、薬学的有効量の請求項２３〜２６のいずれか１項に記載の組換えクロトータンパク質を投与することを含む、方法。
  28. 加齢に関係するもしくは他の病態、疾患、または障害を治療する方法であって、それを必要とする被験体に、薬学的有効量の、ヒトアルファクロトーアイソフォーム１のアミノ酸残基１〜９８１の少なくともサブセットと少なくとも８０％のアミノ酸配列同一性を有する、可溶性組換えクロトータンパク質を投与することを含む、方法。
  29. 加齢に関係するもしくは他の病態、疾患、または障害を治療する方法であって、それを必要とする被験体に、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと少なくとも８０％のアミノ酸配列同一性を有する可溶性組換えクロトータンパク質の薬学的有効量を投与することを含む、方法。
  30. 前記タンパク質が、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと、少なくとも８５％、好ましくは少なくとも９０％、より好ましくは少なくとも９５％、さらにより好ましくは少なくとも９８％、なおより好ましくは少なくとも９９％、最も好ましくは１００％のアミノ酸配列同一性を有する、請求項２７〜２９のいずれか１項に記載の方法。
  31. 前記薬学的有効量が、
    前記被験体の前記血清可溶性クロトータンパク質濃度を所定のレベルまで上昇させることと、
    好ましくは、所定の期間の間、所定の閾値以上で前記被験体の前記血清可溶性クロトータンパク質濃度を維持することと、に十分である、請求項３０に記載の方法。
  32. 前記所定のレベルが、血清１ミリリットル当たり、約１０００ピコグラム以上の可溶性クロトータンパク質である、請求項３１に記載の方法。
  33. 前記所定のレベルが、
    血清１ミリリットル当たりの可溶性クロトータンパク質が、約５０、１００、２５０、５００、７５０、１０００、１２５０、１５００、１７５０、２０００、２２５０、２５００、２７５０、３０００、３５００、４０００、４５００、５０００、５５００、６０００、６５００、７０００、７５００、８０００、８５００、９０００、９５００、１０，０００、１１，０００、１２，０００、１３，０００、１４，０００、１５，０００ ２０，０００、２５，０００、３０，０００ ４０，０００、５０，０００、７５，０００、もしくは１００，０００ピコグラム以上、もしくはその間、および／または
    血清中の可溶性クロトータンパク質の典型的な健康的レベルを約５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、１００％、１５０％、２００％、２５０％、３００％、４００％、５００％、６００％、７００％、８００％、９００％、１０００％、１２００％、１５００％、２０００％、２５００％、３０００％、４０００％、もしくは５０００％超える、請求項３１に記載の方法。
  34. 前記被験体の血清可溶性クロトータンパク質濃度を測定することと、
    前記被験体の前記血清可溶性クロトータンパク質濃度を第１の所定レベルまで上昇させるのに十分な前記タンパク質の薬学的有効量を計算することであって、前記第１の所定レベルが、好ましくは、血清１ミリリットル当たり約１０００ピコグラム以上の可溶性クロトータンパク質である、計算することと、
    前記被験体の前記血清中の可溶性クロトータンパク質の低下速度および／または代謝速度を測定することと、
    前記被験体の前記血清可溶性クロトータンパク質濃度が、前記測定された速度に基づいて第２の所定のレベル以下になる次の投薬時間を計算することと、
    前記被験体の前記血清可溶性クロトータンパク質濃度を、前記第２の所定のレベルから前記第１の所定のレベルまで上昇させるのに十分な前記タンパク質の次の投薬量を計算することと、のうちの１つ以上をさらに含む、請求項３１に記載の方法。
  35. 前記タンパク質の前記次の投薬量を前記被験体に投与することをさらに含む、請求項３４に記載の方法。
  36. 好ましくはトランスフェクションを介して、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞に外因性核酸を導入することであって、前記核酸が、好ましくは導入遺伝子またはｃＤＮＡを含み、前記核酸が、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと、少なくとも８５％、好ましくは少なくとも９０％、より好ましくは少なくとも９５％、さらにより好ましくは少なくとも９８％、なおより好ましくは少なくとも９９％、最も好ましくは１００％のアミノ酸配列同一性を有するポリペプチドをコードし、前記核酸が、配列番号７６〜配列番号９６のうちの１つと、少なくとも８５％、より好ましくは少なくとも９０％、さらにより好ましくは少なくとも９５％、なおより好ましくは少なくとも９８％、なおより好ましくは少なくとも９９％、最も好ましくは１００％の核酸配列同一性を好ましくは有する、導入することと、
    液体培地、好ましくは無血清および／または動物タンパク質成分を含まない液体培地中で前記ＣＨＯ細胞を増殖させることであって、前記液体培地が、好ましくは炭素源、窒素源、および１つ以上のビタミン、ミネラル、塩、アミノ酸、補充剤、または添加剤を含み、より好ましくは、前記液体培地が、ヒポキサンチン、チミジン、および／またはグルタミンを欠き、
    前記ＣＨＯ細胞が、好ましくは、
    ジヒドロ葉酸還元酵素（ＤＨＦＲ）欠損ＣＨＯ細胞、より好ましくはＣＨＯ−Ｓ細胞中、または
    グルタミン合成酵素（ＧＳ）欠損ＣＨＯ細胞、より好ましくはＧＳ−／−ＣＨＯ細胞中にある、増殖させることと、
    有効量のメトトレキサート（ＭＴＸ）および／またはメチオニンスルホキシミン（ＭＳＸ）を、好ましくは約１ｎＭ〜１μＭの濃度まで、より好ましくは約１０〜１００ｎＭの濃度まで前記液体培地に導入することと、
    前記液体培地中で増殖する生存ＣＨＯ細胞の懸濁培養物を、細胞選択プロセスを通して選択することであって、前記選択された懸濁培養物の前記培地中の前記タンパク質濃度が、前記タンパク質を濃縮することなく、少なくとも２００ｍｇ／Ｌ、好ましくは少なくとも５００ｍｇ／Ｌ、より好ましくは少なくとも１０００ｍｇ／Ｌ、さらにより好ましくは少なくとも２０００ｍｇ／Ｌ、なおより好ましくは少なくとも５０００ｍｇ／Ｌである、選択することと、
    前記ＣＨＯ細胞中に前記組換え可溶性クロトータンパク質を産生することであって、前記タンパク質が、前記タンパク質を濃縮することなく、液体培地１リットル当たり、好ましくはタンパク質２００〜５００ｍｇの濃度まで、より好ましくはタンパク質５００〜２０００ｍｇの濃度まで、さらにより好ましくはタンパク質２０００〜５０００ｍｇの濃度まで、好ましくは前記ＣＨＯ細胞から前記液体培地に分泌される、産生することと、
    前記ＣＨＯ細胞、液体培地、またはそれらの両方から組換え可溶性クロトータンパク質含有抽出物を精製することであって、前記抽出物が好ましくは、
    乾燥重量で少なくとも約９８％の前記組換え可溶性クロトータンパク質、および／または
    約１〜１００ｐｐｍ未満のＣＨＯ宿主細胞タンパク質（ＨＣＰ）を含み、
    前記抽出物を精製することが、好ましくは前記タンパク質のグリコシル化を維持し、前記タンパク質が、それに結合した１つ以上のグリカンを有する、精製することと、のうちの１つ以上をさらに含む、請求項３１に記載の方法。
  37. 前記所定の期間が、少なくとも約６時間、好ましくは少なくとも約１２時間、より好ましくは少なくとも約１８時間、さらにより好ましくは少なくとも約２４時間、なおより好ましくは少なくとも約３０時間、なおより好ましくは少なくとも約３６時間、なおより好ましくは少なくとも約４２時間、なおより好ましくは少なくとも約４８時間、なおより好ましくは少なくとも約５４時間、なおより好ましくは少なくとも約６０時間、なおより好ましくは少なくとも約６６時間、なおより好ましくは少なくとも約７２時間である、請求項３１に記載の方法。
  38. 前記所定の期間が、約１〜１２０日以上である、請求項３１に記載の方法。
  39. 前記所定の期間が、約６ヶ月、９ヶ月、または１年以上である、請求項３１に記載の方法。
  40. 前記被験体が、ヒト、非ヒト動物、または非ヒト哺乳動物である、請求項３０〜３９のいずれか１項に記載の方法。
  41. 前記タンパク質が、薬学的に許容可能な担体中にまたは薬学的に許容可能な担体と共に投与される、請求項３０〜４０のいずれか１項に記載の方法。
  42. 前記加齢に関係するもしくは他の病態、疾患、または障害が、
    虚弱、
    骨密度低下、
    骨ミネラル密度低下、
    体重低下、
    筋肉萎縮、
    筋肉退化、
    筋量低下、
    筋力低下、
    握力低下、
    脚力低下、
    体力低下、
    動作低下、
    動作の自由の低下、
    生活の質評価低下、
    駆出率低下、
    運動能力低下、
    学習力低下、
    学習能力低下、
    記憶力低下、
    知能指数低下、
    認知機能劣化、
    健忘症、
    認知能力低下、
    認知機能低下、
    シナプス可塑性低下、
    シナプス機能低下、および
    細胞老化からなる群から選択される、請求項３０〜４１のいずれか１項に記載の方法。
  43. 前記加齢に関係するもしくは他の病態、疾患、または障害が、
    慢性腎臓疾患（ＣＫＤ）、
    多嚢胞腎臓疾患（ＰＫＤ）、
    常染色体優性多発性嚢胞腎臓（ＡＤＰＫＤ）、
    急性腎臓傷害（ＡＫＩ）、
    急性尿細管壊死（ＡＴＮ）、
    急性アレルギー性間質性腎炎（ＡＡＩＮ）、
    糸球体腎炎、
    腎臓疾患、
    腎不全、
    非乏尿性腎不全、
    アルコール依存症、
    高リン酸血症、
    筋ジストロフィー（ＭＳ）、
    １型糖尿病、
    ２型糖尿病、
    心血管疾患（ＣＶＤ）、
    心血管石灰化、
    脳血管不全、
    血管石灰化、
    虚血性心疾患、
    血圧異常、
    食塩感受性高血圧、
    組織石灰化、
    石灰化アテローム硬化性プラーク負荷、
    石灰化症、
    家族性腫瘍性石灰化症、
    癌、
    １つ以上の腫瘍、
    ミエリンに関係する疾患、
    脱髄疾患、
    神経変性疾患、
    神経血管疾患、
    進行性核上性麻痺（ＰＳＰ）、
    ポンペ病、
    ニーマン−ピック病、
    微小膠症、
    ファーバー病（ＦＤ）、
    骨量疾患、
    骨粗鬆症、
    骨減少症、
    骨減少症（特に皮質骨のＢＭＤの低下）、
    肺気腫、
    肺線維症、
    皮膚萎縮、
    胸腺萎縮、
    腎間質マトリックスの蓄積、
    糸球体硬化、
    貧血、
    アルブミン尿症、
    タンパク尿症、
    不妊症、
    アルツハイマー病、
    パーキンソン病、
    認知症、
    血管性認知症、
    筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）、
    運動ニューロン疾患（ＭＮＤ）、
    心房細動、
    慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）、
    線維筋痛症、
    成人発症糖尿病、
    関節炎、
    関節リウマチ、
    変形性関節症、
    緑内障、
    白内障、
    黄斑変性、
    多発性硬化症（ＭＳ）、
    狼瘡、
    潰瘍性大腸炎、
    悪液質、
    肥満、
    ビタミンＤに関係する病態、
    骨疾患、
    骨再形成を通じた骨疾患、
    幹細胞枯渇、
    船酔い、
    宇宙不適応症候群（ＳＡＳ）、
    吐き気、および
    めまい、からなる群から選択される、請求項３０〜４１のいずれか１項に記載の方法。
  44. １つ以上の追加の活性成分を投与または共投与することをさらに含む、請求項３０〜４３のいずれか１項に記載の方法。
  45. 前記１つ以上の追加の活性成分が、薬剤、抗体、ホルモン、造影剤、医薬品、天然化合物、合成化合物、または医薬組成物からなる群から選択される、請求項４４に記載の方法。
  46. 請求項２３〜２５のいずれか１項に記載の組換えクロトータンパク質の薬学的有効量と、
    薬学的に許容可能な担体と、を含む、医薬組成物。
  47. 薬学的有効量の組換え可溶性クロトータンパク質であって、前記タンパク質の少なくとも一部分が、
    ヒトアルファクロトーアイソフォーム１のアミノ酸残基１〜９８１、２９〜９８１、３４〜９８１、３６〜９８１、１３１〜９８１、１〜５４９、２９〜５４９、３４〜５４９、３６〜５４９、もしくは１３１〜５４９の少なくともサブセット、または
    配列番号２〜配列番号７０のうちの１つの少なくとも一部分と、少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有する、組換え可溶性クロトータンパク質と、
    薬学的に許容可能な担体と、を含む、医薬組成物。
  48. 前記タンパク質の少なくとも一部分が、配列番号２〜配列番号７０のうちの１つの少なくとも一部分と、少なくとも８５％、好ましくは少なくとも８８％、より好ましくは少なくとも９０％、さらにより好ましくは少なくとも９２％、なおより好ましくは少なくとも９５％、なおより好ましくは少なくとも９８％、なおより好ましくは少なくとも９９％、最も好ましくは１００％のアミノ酸配列同一性を有する、請求項４６または４７に記載の医薬組成物。
  49. １つ以上の追加の活性成分をさらに含む、請求項４６〜４８のいずれか１項に記載の医薬組成物。
  50. 虚弱、
    骨密度低下、
    骨ミネラル密度低下、
    体重低下、
    筋肉萎縮、
    筋肉退化、
    筋量低下、
    筋力低下、
    握力低下、
    脚力低下、
    体力低下、
    動作低下、
    動作の自由の低下、
    生活の質評価低下、
    駆出率低下、
    運動能力低下、
    学習力低下、
    学習能力低下、
    記憶力低下、
    知能指数低下、
    認知機能劣化、
    健忘症、
    認知能力低下、
    認知機能低下、
    シナプス可塑性低下、
    シナプス機能の低下、
    細胞老化、
    慢性腎臓疾患（ＣＫＤ）、
    多嚢胞腎臓疾患（ＰＫＤ）、
    常染色体優性多発性嚢胞腎臓（ＡＤＰＫＤ）、
    急性腎臓傷害（ＡＫＩ）、
    急性尿細管壊死（ＡＴＮ）、
    急性アレルギー性間質性腎炎（ＡＡＩＮ）、
    糸球体腎炎、
    腎臓疾患、
    腎不全、
    非乏尿性腎不全、
    アルコール依存症、
    高リン酸血症、
    筋ジストロフィー（ＭＳ）、
    １型糖尿病、
    ２型糖尿病、
    心血管疾患（ＣＶＤ）、
    心血管石灰化、
    脳血管不全、
    血管石灰化、
    虚血性心疾患、
    血圧異常、
    食塩感受性高血圧、
    組織石灰化、
    石灰化アテローム硬化性プラーク負荷、
    石灰化症、
    家族性腫瘍性石灰化症、
    癌、
    １つ以上の腫瘍、
    ミエリンに関係する疾患、
    脱髄疾患、
    神経変性疾患、
    神経血管疾患、
    進行性核上性麻痺（ＰＳＰ）、
    ポンペ病、
    ニーマン−ピック病、
    微小膠症、
    ファーバー病（ＦＤ）、
    骨量疾患、
    骨粗鬆症、
    骨減少症、
    骨減少症（特に皮質骨のＢＭＤの低下）、
    肺気腫、
    肺線維症、
    皮膚萎縮、
    胸腺萎縮、
    腎間質マトリックスの蓄積、
    糸球体硬化、
    貧血、
    アルブミン尿症、
    タンパク尿症、
    不妊症、
    アルツハイマー病、
    パーキンソン病、
    認知症、
    血管性認知症、
    筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）、
    運動ニューロン疾患（ＭＮＤ）、
    心房細動、
    慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）、
    線維筋痛症、
    成人発症糖尿病、
    関節炎、
    関節リウマチ、
    変形性関節症、
    緑内障、
    白内障、
    黄斑変性、
    多発性硬化症（ＭＳ）、
    狼瘡、
    潰瘍性大腸炎、
    悪液質、
    肥満、
    ビタミンＤに関係する病態、
    骨疾患、
    骨再形成を通じた骨疾患、
    幹細胞枯渇、
    船酔い、
    宇宙不適応症候群（ＳＡＳ）、
    吐き気、および
    めまい、からなる群から選択される、加齢に関係するもしくは他の病態、疾患、または障害の治療に使用するための、請求項４６〜４９のいずれか１項に記載の医薬組成物。
  51. 急性腎臓傷害（ＡＫＩ）の治療または防止に使用するための、請求項４６〜４９のいずれか１項に記載の医薬組成物。
  52. 急性腎臓傷害（ＡＫＩ）または他の病態を治療または防止する方法であって、
    薬学的有効量の組換えクロトータンパク質を、それを必要とする被験体に投与することであって、前記タンパク質の少なくとも一部分が、
    ヒトアルファクロトーアイソフォーム１のアミノ酸残基１〜９８１、２９〜９８１、３４〜９８１、３６〜９８１、１３１〜９８１、１〜５４９、２９〜５４９、３４〜５４９、３６〜５４９もしくは１３１〜５４９の少なくともサブセット、または
    配列番号２〜配列番号７０のうちの１つの少なくとも一部分と、少なくとも８５％、８６％、８８％、９０％、９２％、９５％、９８％、９９％、もしくは好ましくは１００％のアミノ酸配列同一性を有する、投与することを含む、方法。
  53. 前記薬学的有効量の組換え可溶性クロトータンパク質と共に、１つ以上の追加の活性成分を共投与することをさらに含む、請求項５２に記載の方法。
  54. 前記タンパク質および１つ以上の追加の活性成分が、組み合わせ生成物または組成物に配合される、請求項５３に記載の方法。
  55. 前記タンパク質および１つ以上の追加の活性成分が、別個の組成物である、請求項５３に記載の方法。
  56. 前記タンパク質および１つ以上の追加の活性成分が、混合される、請求項５３に記載の方法。
  57. 前記タンパク質および１つ以上の追加の活性成分が、共投与のために構成され、共投与が、
    同時投与、または
    好ましくはある期間によって隔てられた別個の投与を含む、請求項５３に記載の方法。
  58. 前記１つ以上の追加の活性成分が、薬剤、抗体、ホルモン、造影剤、医薬品、または組成物からなる群から選択される、請求項５３に記載の方法。
  59. 前記病態が、
    急性尿細管壊死（ＡＴＮ）、腎炎、急性アレルギー性間質性腎炎（ＡＡＩＮ）、糸球体腎炎、および／もしくは腎毒性、または
    腎臓移植もしくは他の外科手術、急性尿細管壊死（ＡＴＮ）、腎炎、急性アレルギー性間質性腎炎（ＡＡＩＮ）、糸球体腎炎、腎毒性、もしくは低血圧から少なくとも部分的に生じるＡＫＩを含む、請求項５２または５３に記載の方法。
  60. 前記腎毒性が、薬剤性腎毒性を含む、請求項５２または５３に記載の方法。
  61. 前記薬剤性腎毒性が、抗菌剤によって誘発される腎毒性を含む、請求項６０に記載の方法。
  62. 前記薬剤性腎毒性が、アミノグリコシドによって誘発される腎毒性を含む、請求項６０に記載の方法。
  63. 前記投与するステップが、
    前記被験体における血清可溶性クロトーレベルを測定することと、
    前記被験体における前記血清可溶性クロトーレベルを所定のレベルまたは正常レベルのパーセントまで上昇させるのに十分な前記タンパク質の第１の投薬量を計算するステップと、
    好ましくはボーラス投与または段階的投与によって、より好ましくは注射によって、前記被験体にタンパク質の前記第１の投薬量を投与するステップと、
    好ましくは前記第１の投薬量の投与に続いて、前記被験体の前記血清中の可溶性クロトー低下の速度を測定するステップと、
    前記タンパク質の次の投薬の時間および／または量を計算するステップと、
    前記計算された時間および／または量に従って、前記タンパク質の次の投薬量を前記被験体に投与するステップと、からなる群から選択される１つ以上のステップを含む、請求項５２または５３に記載の方法。
  64. 前記投与するステップが、所定のレベルまたは閾値以上に、任意選択的に所定の期間の間、前記被験体の血清可溶性クロトータンパク質濃度を上昇および／または維持するのに十分である、請求項５２または５３に記載の方法。
  65. 前記所定のレベルまたは閾値が、
    血清１ミリリットル当たり、約５０、１００、２５０、５００、７５０、１０００、１２５０、１５００、１７５０、２０００、２２５０、２５００、２７５０、３０００、３５００、４０００、４５００、５０００、５５００、６０００、６５００、７０００、７５００、８０００、８５００、９０００、９５００、１０，０００、１１，０００、１２，０００、１３，０００、１４，０００、１５，０００、 ２０，０００、２５，０００、３０，０００ ４０，０００、５０，０００、７５，０００、もしくは１００，０００ピコグラム以上、および／もしくはその間の可溶性クロトータンパク質、または
    血清の可溶性クロトータンパク質の典型的な健康的レベルを約５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、１００％、１５０％、２００％、２５０％、３００％、４００％、５００％、６００％、７００％、８００％、９００％、１０００％、１２００％、１５００％、２０００％、２５００％、３０００％、４０００％、もしくは５０００％超える、請求項６４に記載の方法。
  66. 前記所定の期間が、約６時間、１２時間、１８時間、１日、２日、３日、４日、５日、６日、７日、８日、９日、１０日、１２日、１４日、２１日、３０日、４５日、６０日、９０日、１２０日、６ヶ月、９ヶ月、１年、２年、３年、４年、または５年以上である、請求項６４に記載の方法。
  67. 腎臓移植または腎毒素の投与の前に予防的に、および／または
    腎臓移植または腎毒素の投与に続いて、前記タンパク質が投与される、請求項５２または５３に記載の方法。
  68. 前記腎毒素が、
    好ましくは、パロモマイシン、トブラマイシン、ゲンタマイシン、アミカシン、カナマイシンおよびネオマイシンからなる群から選択される１つ以上のアミノグリコシドと、
    好ましくは、アンホテリシンＢおよびフルシトシンからなる群から選択される１つ以上の抗真菌剤と、
    好ましくは、ヨウ素化放射造影剤、約１．５：１のヨウ素対分子比を有する高浸透圧造影剤（ＨＯＣＭ）、約３：１のヨウ素対分子比を有する低浸透圧の非イオン性造影剤（ＬＯＣＭ）、および約６：１のヨウ素対分子比を有する等張性（等浸透圧性）造影剤（ＩＯＣＭ））からなる群から選択される、１つ以上の造影剤と、
    好ましくは、アデホビル、シドホビル、テノホビル、およびホスカネットからなる群から選択される１つ以上の抗レトロウイルス剤と、
    好ましくは、シスプラチン、カルボプラチン、オキサリプラチン、アルキル化剤、ベンダムスチン、シクロホスファミド、イホスファミド、ニトロソウレア、テモゾロミド、メルファラン、抗腫瘍抗生物質、マイトマイシンＣ、ブレオマイシン、アントラサイクリン、代謝拮抗剤、カペシタビン、ヒドロキシウレア、メトトレキサート、ペメトレキセド、プララトレキサート、ペントスタチン、フルダラビン、クラドリビン、ゲムシタビン、シタラビン、ビンカアルカロイド、トポテカン、エトポシド、タキサン、イリノテカン、レナリドミド、エリブリン、三酸化ヒ素、もしくはイキサゾミブからなる群から選択される１つ以上の癌（または化学）治療薬と、
    好ましくは、ゾレドロネート／ゾレドロン酸、イバンドロネート、アレンドロネート、アレンドロネート／コレカルシフェロール、エチドロネート、リセドロネート、炭酸カルシウムリセドロネート、パミドロネート、およびチルドロネートからなる群から選択される１つ以上のビスホスホネートもしくはその誘導体と、ならびに／または
    好ましくはコカインおよびヘロインからなる群から選択される１つ以上の麻酔薬またはオピオイド）を含む、請求項６７に記載の方法。
  69. 前記タンパク質が、
    好ましくはＦ３５２Ｖを含まない、より好ましくはＦ３５２を含むＣ３７０Ｓ、および／または
    Ｈ１９３もしくはＨ１９３Ｒ多様体以外を含む、請求項５２または５３に記載の方法。
  70. 高齢な個体を治療する方法であって、前記高齢な個体が、クロトータンパク質をコードする遺伝子においてホモ接合またはヘテロ接合変異を有し、
    配列番号２〜配列番号７０のうちの１つと、少なくとも８５％、好ましくは少なくとも９０％、より好ましくは少なくとも９５％、さらにより好ましくは少なくとも９８％、なおより好ましくは少なくとも９９％、最も好ましくは１００％のアミノ酸配列同一性を有する、治療濃度のポリペプチドを投与することを含む、方法。
  71. 前記遺伝子の発現レベルを測定することをさらに含む、請求項７０に記載の方法。
  72. 前記治療薬濃縮物を投与する前記ステップが、前記遺伝子の前記発現レベルに依存する、請求項７１に記載の方法。
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