JP2018529986A - 光酸化増幅を用いた高感度バイオマーカー定量方法 - Google Patents
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Abstract
Description
そして、バイオマーカーに特異的な抗体、アプタマー、核酸などを用いて検出されたバイオマーカーの濃度を定量する方法には、酵素免疫検定法(ELISA;enzyme−linked immunosorbent assay、EIA;enzyme−linked immunoassay)などを用いることができる。
酵素免疫検定法は、抗原−抗体または抗原−アプタマーの特異的な結合を用いた免疫検定法の一つであって、タンパク質、ペプチド、ホルモン、低分子化合物などの抗原の定量測定法であるといえる。通常は、抗原に特異的な抗体またはアプタマーに酵素を標識し、基質との反応を用いて定量するので、抗体またはアプタマーに標識されている酵素と基質との反応による生成物の発色量、発光量、蛍光量などを光学的に測定してバイオマーカーを定量する。一般に、プレートリーダー(plate reader)、スペクトロメータ(spectrometer)などを用いて測定試料の酵素−基質反応の程度を光学的に測定し、これを基準試料の酵素−基質反応度測定値と比較してバイオマーカーの量を定量化することができる。
本明細書全体において、ある部分がある構成要素を「含む」とするとき、これは、特に反対の記載がない限り、他の構成要素を排除するのではなく、他の構成要素をさらに含むことができることを意味する。
以下、添付図面を参照して、本発明の実施例を詳細に説明する。
図2を参照すると、バイオマーカーに特異的に結合する抗体、アプタマー、核酸などに標識された酵素は、基質との反応で色または蛍光を呈する生成物に変わるが、一定時間の間、酵素−基質反応の後、生成物の発色量、発光量、蛍光量などを光学的に測定して酵素−基質反応の程度を分析することができる。このような酵素−基質反応の程度を分析すると、バイオマーカーに特異的に結合する抗体、アプタマー、核酸などに標識された酵素の量を分析することができ、結果として、検出しようとするバイオマーカーの量を定量することができる。
図3を参照すると、無色及び無蛍光である基質が、酵素(HRP)の作用で、色及び蛍光を呈する生成物(Resorufin)に変わるが、プレートリーダーなどで生成物の蛍光量を測定すると、酵素−基質反応の程度を分析することができる。これにより、バイオマーカーに特異的に結合する抗体、アプタマー、核酸などに標識された酵素の量またはバイオマーカーの量を定量することができる。例えば、抗原に特異的に結合する抗体にペルオキシダーゼなどの酵素を標識し、酵素−基質反応の程度を測定すると、検出しようとする抗原の量を定量化することができる。
本発明は、光酸化増幅で検出しようとするバイオマーカーを高感度で定量するために、まず、バイオマーカーに特異的に結合する抗体、アプタマー及び核酸の中から選ばれたいずれか一つに標識された酵素を含む測定試料に酵素−基質反応を行い、前記酵素−基質反応の後、生成物に持続的に露光して光酸化増幅過程を行うと同時に、光酸化増幅過程中に生成物の発色量、発光量及び蛍光量の中から選ばれたいずれか一つまたは複数の光特性を光学的に測定する。
本発明において、前記酵素−基質反応生成物の発色量、発光量及び蛍光量の中から選ばれる光特性は、前記抗体、アプタマー、核酸などに標識される酵素またはこれに反応する基質に応じていずれか一つまたは複数を選択することができる。
前記光特性を光学的に測定するために、光酸化増幅に用いられる光は、広い波長の白色光、狭い波長を有する単色光、単一波長のレーザーの中から少なくとも一つが選択できる。酵素−基質反応生成物に持続的を露光しながら光酸化増幅過程中の生成物の光特性を時間に従って連続的に測定することができる。光特性を連続的又は持続的に測定する方法は、継続的な露光を用いた動画像測定、あるいは短い時間間隔による光特性連続測定又は一定時間間隔の間欠的光露出を用いた時間別の光特性測定によって行うことができる。
本発明において、「指標化」とは、時間による光特性測定値に対して、様々な回帰分析(regression analysis)によって測定値を正確に表現することができる。すなわち、測定値の時間による変化様相を正確に表すことができる指標を抽出することをいう。
したがって、本発明の前記指標化は、測定された生成物の時間による光特性の変化様相に対する回帰分析によって、様々な形態の指標を抽出することができる。
測定試料に含まれているバイオマーカーの濃度定量は、前記指標化工程で抽出された指標を基準試料の指標と比較して得ることができる。また、前記基準試料の指標は、一定の濃度間隔で希釈されたバイオマーカーを含む試料の光酸化増幅様相から得ることができる。
図4を参照すると、光酸化増幅過程は、一種の自己触媒反応で起こる。すなわち、酵素−基質反応が行われた試料に持続的に露光すると、自己触媒反応によって酵素−基質反応の後に生成物の発色量、発光量、蛍光量などが増幅される。そこで、生成物の発色量、発光量、蛍光量などを光酸化増幅時間に従って測定すると、光酸化増幅様相を示すことができる。
光酸化増幅過程は、自己触媒反応の一種なので、光酸化増幅様相を時間に従って示すと、S字カーブ型のグラフで表示することができる。
また、酵素−基質反応の際に酵素の濃度によってそれぞれ異なる量の初期生成物が生成され、このように生成された初期生成物の量によって光酸化増幅速度が異なる。
その結果、抗体、アプタマー、核酸などに標識された酵素の濃度が高いほど初期生成物の生成量が多いため、自己触媒反応の速度も速く、光酸化増幅が急速に進み、生成物の蛍光量が急速に増幅される。これに対し、抗体、アプタマー、核酸などに標識された酵素の濃度が低いほど初期生成物の生成量が少ないため、自己触媒反応の速度が遅く、光酸化増幅が遅く行われて生成物の蛍光量が相対的に遅く増幅される。
したがって、生成物の発色量、発光量、蛍光量などの光特性が増幅される相対的な時間比較によって、抗体、アプタマー、核酸などに標識された酵素の濃度を確認することができ、時間による光酸化増幅様相を指標化すると、低濃度または微量の酵素の濃度をより正確に高感度で定量することができる。
[数式1]
数式1において、ARはAmplex Red(基質)を、RSFはレゾルフィン(resorufin)(生成物)を、[AR]はARの濃度を、[RSF]はRSFの濃度を、kは自己触媒反応の反応速度定数(reaction rate constant)或いは増幅率を、tは自己触媒反応の経過時間をそれぞれ意味する。数式1の自己触媒反応の反応速度式を解くと、下記数式2に示されているように、自己触媒反応の経過時間に伴うRSF濃度の変化様相を表示することが可能な数式を導くことができる。
数式2において、[AR]0は初期基質の濃度を、[RSF]0は初期レゾルフィンの濃度をそれぞれ意味する。光酸化増幅による生成物の発色量、発光量、蛍光量などの変化様相を時間に従って示すと、S字カーブ型で表示されることを理解することができる。
光酸化増幅様相指標としては、生成物の発色量、発光量、蛍光量などの光特性の初期値の回帰分析推定値、生成物の光特性最大値の回帰分析推定値、生成物の光特性最大値の1/2に達するまでにかかる時間の回帰分析推定値、生成物の光特性の時間による増幅率の回帰分析推定値などを含み、これらの中から1つ以上を選択して、これを個別又は複合的に組み合わせて計算する指標を含むことができる。
[数式3]
別の例として、生成物の発色量、発光量、蛍光量などの光特性の初期値の回帰分析推定値、生成物の光特性最大値の回帰分析推定値、生成物の光特性最大値の1/2に達するまでにかかる時間の回帰分析推定値、生成物の光特性の時間による増幅率の回帰分析推定値などを複合的に計算する指標をCTL(characteristic time length)指標としたとき、CTL指標は、下記数式4に示されているように導くことができる。
[数式4]
光酸化増幅様相指標は、光酸化増幅による生成物の発色量、発光量、蛍光量などの変化様相を、前記数式2に基づいて回帰分析して抽出することができる。回帰分析に用いられる数式は、前記数式2のようにS字カーブ型を示すことが可能な他の形態の数式を含むこともでき、回帰分析に使用される数式に基づいて様々な形態の光酸化増幅様相指標を導くことができる。
本発明の第1実施例として、酵素の濃度による光酸化増幅様相を比較する。
まず、様々な濃度の酵素を含む試料を準備し、酵素−基質反応を行う。様々な濃度の酵素には、抗体に標識された酵素、アプタマーに標識された酵素、核酸に標識された酵素などを含むことができる。
本発明の第1実施例では、一例として、HRP酵素が含まれていない試料(ブランク試料)と、抗体に標識されたHRP酵素を含む試料、すなわち抗体に標識されたHRPと、1×PBSバッファとを混合して試料を濃度に応じて様々に準備し、Amplex Red基質を混合して一定時間の間、酵素−基質反応が起こるようにする。
次に、前記各試料の酵素−基質反応の後、生成物(レゾルフィン)を持続的に露光して光酸化増幅過程を行うとともに、光酸化増幅過程での生成物の蛍光量を光学的に検出し、その時間による変化様相を指標化して、抗体に標識された酵素の濃度による光酸化増幅様相指標を比較する。
光酸化増幅に用いられる光としては、白色光などの広い波長の光、単色光などの狭い波長の光、レーザーなどの単一波長の光などを含むことができ、本発明の第1実施例では、510〜550nm波長帯の緑色光を用いる。
図5を参照すると、抗体に標識された酵素の濃度によって光酸化増幅様相が異なることがわかる。すなわち、酵素−基質反応の際に酵素の濃度によってそれぞれ異なる量の初期生成物が生成され、このように生成された初期生成物の量によって光酸化増幅速度が異なることを確認することができる。
結果として、抗体が結合された酵素の濃度が高いほど初期レゾルフィンの生成量が多いため、自己触媒反応の速度も速く、光酸化増幅が急速に行われて蛍光明るさ値が速く変化する。これに対し、抗体が結合された酵素の濃度が低いほど初期レゾルフィンの生成量が少ないため、自己触媒反応の速度が遅く、光酸化増幅が遅く、蛍光の明るさの値が遅く変化する。
図6に示すように、酵素の濃度が低いほど生成物の発色量、発光量、蛍光量などの最大値の1/2に達するまでにかかる時間を示すT50指標が大きくなることを確認することができ、これにより低濃度または微量の酵素の濃度をより正確に高感度で定量することができる。
本発明の第2実施例として、バイオマーカーの濃度による光酸化増幅様相を指標化してバイオマーカーの濃度を高感度で定量する。
まず、様々な濃度のバイオマーカーを含む試料を準備し、バイオマーカーに特異的な抗体、アプタマー、核酸などを用いてバイオマーカーを選択的に検出する過程を行う。バイオマーカーとしては、タンパク質、ペプチド、遺伝子、ホルモン、低分子化合物などの中から少なくとも一つが選択でき、検出されたバイオマーカーの量を定量するために、バイオマーカーに特異的な抗体、アプタマー、核酸などに酵素を標識する従来の酵素免疫検定法などを用いることができる。
本発明の第2実施例では、一例として、タンパク質バイオマーカーの一種であるPSA(prostate specific antigen)を含む試料を様々な濃度で準備し、HRP酵素が標識されたPSAに特異的な抗体を用いる従来の酵素免疫検定法を行う。
図8は本発明の第2実施例に係るタンパク質バイオマーカーの濃度に対する光酸化増幅様相を時間に従って示すグラフであり、図9はタンパク質バイオマーカーの濃度に対する光酸化増幅様相のT50指標抽出値を示すグラフ、図10は光酸化増幅様相のCTL指標抽出値を示すグラフである。
次に、様々な濃度のAβ42−抗体−HRP複合体が含まれている試料に基質を混合して一定時間の間、酵素−基質反応を行った後、上記の第1実施例と同様の過程で光酸化増幅過程を行う。したがって、第2実施例の他の例における光酸化増幅過程の測定及び光酸化増幅様相の指標化方法は、第1実施例の説明に代える。
図11及び図12に示すように、様々な濃度のAβ42を含む試料を用いた酵素免疫検定法で、酵素−基質反応の後に生成物に持続的を露光して光酸化増幅を行うと、Aβ42の濃度が低いほど生成物の発色量、発光量、蛍光量などの最大値の1/2に達するまでにかかる時間を示すT50指標及びCTL指標が大きくなることを確認することができ、これにより低濃度または微量のAβ42の濃度をより正確に高感度で定量することができる。すなわち、濃度を知らないAβ42を含む試料のT50指標またはCTL指標を、一定の濃度間隔で希釈されたAβ42を含む基準試料の濃度によるT50指標またはCTL指標と比較すると、測定試料に含まれているAβ42の濃度をより正確に高感度で定量することができる。
すなわち、検出しようとするバイオマーカーの種類に応じて抗体、アプタマー、核酸などの種類を変更して第2実施例と同様の方式で光酸化増幅様相を指標化し、これを基準試料の光酸化増幅面様相指標と比較して、測定試料に含まれている低濃度または微量のバイオマーカーの濃度をより正確に高感度で定量することができる。
上述した本発明の光酸化増幅を用いた高感度バイオマーカー定量方法では、検出しようとするバイオマーカーに特異的な抗体、アプタマー、核酸などに標識された酵素と基質との反応後、生成物に持続的に露光して光酸化増幅過程を行う。そして、光酸化増幅時間による生成物の発色量、発光量、蛍光量などの変化様相を指標化し、これを基準試料の指標と比較すると、低濃度または微量のバイオマーカーをより正確に高感度で定量することができる。
Claims (8)
- バイオマーカーに特異的に結合する抗体、アプタマー及び核酸の中から選ばれたいずれか一つに標識された酵素を含む測定試料に酵素−基質反応を行う工程と、
前記酵素−基質反応の後、生成物に持続的に露光して光酸化増幅過程を行うとともに、光酸化増幅過程中に生成物の発色量、発光量及び蛍光量の中から少なくとも一つ選ばれた光特性を光学的に測定する工程と、
測定された前記光特性に対して時間による変化様相を指標化する工程と、
前記指標化工程で抽出された指標を基準試料の指標と比較して、測定試料に含まれているバイオマーカーの濃度を定量する工程とを含む光酸化増幅を用いた高感度バイオマーカー定量方法。 - 前記測定試料に酵素−基質反応を行う工程は、ペルオキシダーゼ(peroxidase)、ガラクトシダーゼ(galactosidase)、及びホスファターゼ(phosphatase)の中から選ばれる少なくとも一つの酵素が、抗体、アプタマー及び核酸の中から選ばれたいずれか一つに標識され、前記酵素が標識された測定試料にADHP(10−Acetyl−3,7−dihydroxyphenoxazine;Amplex Red)、RGP(resorufin−β−D−galactopyranoside)及びMUP(4−methylumbelliferyl phosphate)の中から選ばれた少なくとも一つの基質を混合して一定時間の間、酵素−基質反応を行う工程を含む請求項1に記載の光酸化増幅を用いた高感度バイオマーカー定量方法。
- 前記バイオマーカーは、
タンパク質、ペプチド、遺伝子、ホルモン及び低分子化合物のうちの少なくとも一つを選択する請求項1に記載の光酸化増幅を用いた高感度バイオマーカー定量方法。 - 前記光特性を光学的に測定する工程で、光酸化増幅に用いられる光は白色光、単色光及びレーザーの中から少なくとも一つ選ばれる請求項1に記載の光酸化増幅を用いた高感度バイオマーカー定量方法。
- 前記光特性を光学的に測定する工程は、酵素−基質反応生成物に持続的に光を露出させながら生成物の光特性を時間に従って連続的に測定する工程を含む請求項1に記載の光酸化増幅を用いた高感度バイオマーカー定量方法。
- 前記指標化する工程は、測定された生成物の時間による光特性変化様相に対する回帰分析によって指標を抽出する請求項1に記載の光酸化増幅を用いた高感度バイオマーカー定量方法。
- 前記指標化する工程は、測定された生成物の時間による光特性変化様相に対する回帰分析によって、前記光特性の初期値の回帰分析推定値、前記光特性の最大値の回帰分析推定値、前記光特性の最大値の1/2に達するまでにかかる時間の回帰分析推定値及び前記光特性の時間による増幅率の回帰分析推定値を含む群から選ばれる1つ以上の指標を抽出する請求項1に記載の光酸化増幅を用いた高感度バイオマーカー定量方法。
- 前記測定試料に含まれているバイオマーカーの濃度を定量する工程は、
一定の濃度間隔で希釈されたバイオマーカーを含む基準試料の光酸化増幅様相指標を基準指標とし、検出しようとするバイオマーカーを含む測定試料の光酸化増幅様相指標を基準指標と比較して、測定試料に含まれているバイオマーカーの濃度を定量する工程を含む、請求項1に記載の光酸化増幅を用いた高感度バイオマーカー定量方法。
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