JP2018528781A5 - - Google Patents

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プロドラッグとしては、体内で内因性ヌクレアーゼにより開裂されて活性化合物を形成する化合物の一方または両方の末端における追加のヌクレオシドの取り込みを挙げることができる。特定の実施形態において、化合物または組成物は、薬学的に許容可能な担体または希釈剤をさらに含む。
本発明の実施形態を、以下、さらに記載する。
[項1]
8〜80個の結合ヌクレオシドからなり、かつ配列番号13〜2190の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも8、9、10、11、または12個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物。
[項2]
8〜80個の結合ヌクレオシドからなり、かつ配列番号13〜2190のいずれか1つの核酸塩基配列を含む核酸塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物。
[項3]
配列番号13〜2190のいずれか1つの核酸塩基配列からなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物。
[項4]
配列番号1の核酸塩基463〜478、877〜892、1129〜1144、1313〜1328、1447〜1462、1686〜1701、1690〜1705、1778〜1793、1915〜1930、1919〜1934、1920〜1935、2114〜2129、2115〜2130、2461〜2476、2462〜2477、2463〜2478、4035〜4050内の相補的な8〜80個の結合ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号1と少なくとも85%、90%、95%、または100%相補的である、化合物。
[項5]
配列番号272、804、239、569、607、615、621、640、655、678、715、790、854、1028、2130、2136、2142、2154、および2158のいずれか1つの核酸塩基配列のいずれかの少なくとも8、9、10、11、または12個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する8〜80個の結合ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物。
[項6]
配列番号272、804、239、569、607、615、621、640、655、678、715、790、854、1028、2130、2136、2142、2154、および2158のいずれか1つの核酸塩基配列を含む核酸塩基配列を有する16〜80個の結合ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物。
[項7]
配列番号272、804、239、569、607、615、621、640、655、678、715、790、854、1028、2130、2136、2142、2154、および2158のいずれか1つからなる核酸塩基配列を有する16個の結合ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物。
[項8]
前記修飾オリゴヌクレオチドは、
結合デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント;
結合ヌクレオシドからなる5’ウイングセグメント;および
結合ヌクレオシドからなる3’ウイングセグメント
を含み、
前記ギャップセグメントは、前記5’ウイングセグメントと前記3’ウイングセグメントとの間に位置し、それぞれのウイングセグメントのそれぞれのヌクレオシドは、修飾糖を含む、上記項1〜7のいずれか一項に記載の化合物。
[項9]
配列番号272、239、569、607、615、621、640、655、678、715、790、および854のいずれか1つの核酸塩基配列を含む核酸塩基配列を有する16〜80個の結合ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドは、
10個の結合デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント;
3つの結合ヌクレオシドからなる5’ウイングセグメント;および
3つの結合ヌクレオシドからなる3’ウイングセグメント
を含み、
前記ギャップセグメントは、前記5’ウイングセグメントと前記3’ウイングセグメントとの間に位置し、それぞれのウイングセグメントのそれぞれのヌクレオシドは、拘束エチル(cEt)ヌクレオシドを含み;それぞれのヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合であり、それぞれのシトシンは、5−メチルシトシンである、化合物。
[項10]
配列番号2130の核酸塩基配列を含む核酸塩基配列を有する16〜80個の結合ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドは、
9つの結合デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント;
1つの結合ヌクレオシドからなる5’ウイングセグメント;および
6つの結合ヌクレオシドからなる3’ウイングセグメント
を含み、
前記ギャップセグメントは、前記5’ウイングセグメントと前記3’ウイングセグメントとの間に位置し;前記5’ウイングセグメントは、cEtヌクレオシドを含み;前記3’ウイングセグメントは、cEtヌクレオシド、2’−O−メトキシエチルヌクレオシド、cEtヌクレオシド、2’−O−メトキシエチルヌクレオシド、cEtヌクレオシド、および2’−O−メトキシエチルヌクレオシドを5’から3’方向に含み;それぞれのヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合であり;それぞれのシトシンは、5−メチルシトシンである、化合物。
[項11]
配列番号804、1028、および2136のいずれか1つの核酸塩基配列を含む核酸塩基配列を有する16〜80個の結合ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドは、
10個の結合デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント;
2つの結合ヌクレオシドからなる5’ウイングセグメント;および
4つの結合ヌクレオシドからなる3’ウイングセグメント
を含み、
前記ギャップセグメントは、前記5’ウイングセグメントと前記3’ウイングセグメントとの間に位置し;前記5’ウイングセグメントは、cEtヌクレオシドおよびcEtヌクレオシドを5’から3’方向に含み;前記3’ウイングセグメントは、cEtヌクレオシド、2’−O−メトキシエチルヌクレオシド、cEtヌクレオシド、および2’−O−メトキシエチルヌクレオシドを5’から3’方向に含み;それぞれのヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合であり;それぞれのシトシンは、5−メチルシトシンである、化合物。
[項12]
配列番号2142の核酸塩基配列を含む核酸塩基配列を有する16〜80個の結合ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドは、
8つの結合デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント;
2つの結合ヌクレオシドからなる5’ウイングセグメント;および
6つの結合ヌクレオシドからなる3’ウイングセグメント
を含み、
前記ギャップセグメントは、前記5’ウイングセグメントと前記3’ウイングセグメントとの間に位置し;前記5’ウイングセグメントは、cEtヌクレオシドおよびcEtヌクレオシドを5’から3’方向に含み;前記3’ウイングセグメントは、cEtヌクレオシド、2’−O−メトキシエチルヌクレオシド、cEtヌクレオシド、2’−O−メトキシエチルヌクレオシド、cEtヌクレオシド、およびcEtヌクレオシドを5’から3’方向に含み;それぞれのヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合であり;それぞれのシトシンは、5−メチルシトシンである、化合物。
[項13]
配列番号2154の核酸塩基配列を含む核酸塩基配列を有する16〜80個の結合ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドは、
9つの結合デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント;
2つの結合ヌクレオシドからなる5’ウイングセグメント;および
5つの結合ヌクレオシドからなる3’ウイングセグメント
を含み、
前記ギャップセグメントは、前記5’ウイングセグメントと前記3’ウイングセグメントとの間に位置し;前記5’ウイングセグメントは、cEtヌクレオシドおよびcEtヌクレオシドを5’から3’方向に含み;前記3’ウイングセグメントは、cEtヌクレオシド、2’−O−メトキシエチルヌクレオシド、cEtヌクレオシド、2’−O−メトキシエチルヌクレオシド、およびcEtヌクレオシドを5’から3’方向に含み;それぞれのヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合であり;それぞれのシトシンは、5−メチルシトシンである、化合物。
[項14]
配列番号2158の核酸塩基配列を含む核酸塩基配列を有する16〜80個の結合ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドは、
8つの結合デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント;
3つの結合ヌクレオシドからなる5’ウイングセグメント;および
5つの結合ヌクレオシドからなる3’ウイングセグメント
を含み、
前記ギャップセグメントは、前記5’ウイングセグメントと前記3’ウイングセグメントとの間に位置し;前記5’ウイングセグメントは、cEtヌクレオシド、cEtヌクレオシド、およびcEtヌクレオシドを5’から3’方向に含み;前記3’ウイングセグメントは、cEtヌクレオシド、デオキシヌクレオシド、cEtヌクレオシド、デオキシヌクレオシド、およびcEtヌクレオシドを5’から3’方向に含み;それぞれのヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合であり;それぞれのシトシンは、5−メチルシトシンである、化合物。
[項15]
前記オリゴヌクレオチドは、配列番号1または2に少なくとも80%、85%、90%、95%または100%相補的である、上記項1〜14のいずれか一項に記載の化合物。
[項16]
前記修飾オリゴヌクレオチドは、少なくとも1つの修飾ヌクレオシド間結合、少なくとも1つの修飾糖、または少なくとも1つの修飾核酸塩基を含む、上記項1〜15のいずれか一項に記載の化合物。
[項17]
前記修飾ヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、上記項16に記載の化合物。
[項18]
前記修飾糖は、二環式糖である、上記項16または17に記載の化合物。
[項19]
前記二環式糖は、4’−(CH )−O−2’(LNA);4’−(CH −O−2’(ENA);および4’−CH(CH )−O−2’(cEt)からなる群から選択される、上記項18に記載の化合物。
[項20]
前記修飾糖は、2’−O−メトキシエチルである、上記項16〜19のいずれか一項に記載の化合物。
[項21]
前記修飾核酸塩基は、5−メチルシトシンである、上記項16〜20のいずれか一項に記載の化合物。
[項22]
前記修飾オリゴヌクレオチドは、
結合デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント;
結合ヌクレオシドからなる5’ウイングセグメント;および
結合ヌクレオシドからなる3’ウイングセグメント
を含み、
前記ギャップセグメントは、前記5’ウイングセグメントおよび前記3’ウイングセグメントに直接隣接してかつそれらの間に位置し、それぞれのウイングセグメントのそれぞれのヌクレオシドは、修飾糖を含む、上記項1〜21のいずれか一項に記載の化合物。
[項23]
一本鎖である、上記項1〜22のいずれか一項に記載の化合物。
[項24]
二本鎖である、上記項1〜23のいずれか一項に記載の化合物。
[項25]
リボヌクレオチドを含む、上記項1〜24のいずれか一項に記載の化合物。
[項26]
二本鎖RNAオリゴヌクレオチドを含み、前記二本鎖RNAオリゴヌクレオチドの一方の鎖は、前記修飾オリゴヌクレオチドである、上記項25に記載の化合物。
[項27]
デオキシリボヌクレオチドを含む、上記項1〜24のいずれか一項に記載の化合物。
[項28]
前記修飾オリゴヌクレオチドは、10〜30、12〜30、15〜30、16〜30、または16個の結合ヌクレオシドからなる、上記項1〜27のいずれか一項に記載の化合物。
[項29]
コンジュゲートおよび前記修飾オリゴヌクレオチドを含む、上記項1〜28のいずれか一項に記載の化合物。
[項30]
コンジュゲートおよび前記修飾オリゴヌクレオチドからなる、上記項1〜28のいずれか一項に記載の化合物。
[項31]
前記修飾オリゴヌクレオチドからなる、上記項1〜28のいずれか一項に記載の化合物。
[項32]
上記項1〜31のいずれか一項に記載の化合物のいずれかの薬学的に許容可能な塩からなる化合物。
[項33]
前記薬学的に許容可能な塩は、ナトリウム塩である、上記項32に記載の化合物。
[項34]
前記薬学的に許容可能な塩は、カリウム塩である、上記項32に記載の化合物。
[項35]
式:
Figure 2018528781
を有するISIS651987またはその薬学的に許容可能な塩を含む化合物。
[項36]
式:
Figure 2018528781
を有するISIS651987またはその薬学的に許容可能な塩からなる化合物。
[項37]
前記薬学的に許容可能な塩は、ナトリウム塩である、上記項35または36に記載の化合物。
[項38]
上記項1〜37のいずれか一項に記載の化合物および薬学的に許容可能な担体を含む組成物。
[項39]
個体における癌を治療、予防、または改善する方法であって、前記個体に上記項1〜37のいずれか一項に記載の化合物または上記項38に記載の組成物を投与し、それにより前記個体における癌を治療、予防、または改善することを含む方法。
[項40]
前記癌は、肺癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、小細胞肺癌(SCLC))、消化管癌、大腸癌、小腸癌、結腸癌、結腸直腸癌、膀胱癌、肝臓癌、胃癌、食道癌、膵臓癌、胆道癌、乳癌、卵巣癌、子宮内膜癌、子宮頸癌、前立腺癌、血液癌、脳癌、膠芽細胞腫、悪性末梢神経鞘腫瘍(MPNST)、神経線維腫症1型(NF1)突然変異MPNST、神経線維腫、白血病、骨髄性白血病、またはリンパ腫である、上記項39に記載の方法。
[項41]
前記化合物を投与することは、前記個体における癌細胞の数を低減させるか、前記個体における腫瘍のサイズを低減させるか、前記個体における腫瘍の成長もしくは増殖を低減もしくは阻害するか、前記個体における転移を予防するかもしくは転移の程度を低減させるか、または前記個体の生存率を延長させる、上記項39または40に記載の方法。
[項42]
細胞中でKRASの発現を阻害する方法であって、前記細胞を上記項1〜37のいずれか一項に記載の化合物または上記項38に記載の組成物と接触させ、それにより前記細胞中でKRASの発現を阻害することを含む方法。
[項43]
個体における癌を治療、予防、または改善するための、上記項1〜37のいずれか一項に記載の化合物または上記項38に記載の組成物の使用。
[項44]
癌を治療するための医薬品の製造のための、上記項1〜37のいずれか一項に記載の化合物または上記項38に記載の組成物の使用。
[項45]
前記癌は、肺癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、小細胞肺癌(SCLC))、消化管癌、大腸癌、小腸癌、結腸癌、結腸直腸癌、膀胱癌、肝臓癌、胃癌、食道癌、膵臓癌、胆道癌、乳癌、卵巣癌、子宮内膜癌、子宮頸癌、前立腺癌、血液癌、脳癌、膠芽細胞腫、悪性末梢神経鞘腫瘍(MPNST)、神経線維腫症1型(NF1)突然変異MPNST、神経線維腫、白血病、骨髄性白血病、またはリンパ腫である、上記項43または44に記載の使用。

Claims (21)

  1. 16〜80個の結合ヌクレオシドからなり、かつ配列番号804、678、272、621、854、715、2158、615、640、790、239、569、607、および655のいずれか1つの核酸塩基配列を含む核酸塩基配列を有する一本鎖修飾オリゴヌクレオチド。
  2. 前記修飾オリゴヌクレオチドは、少なくとも1つの修飾ヌクレオシド間結合、少なくとも1つの修飾糖、または少なくとも1つの修飾核酸塩基を含む、請求項1に記載の一本鎖修飾オリゴヌクレオチド。
  3. (i)前記修飾ヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合であり、
    (ii)前記修飾糖は、二環式糖であり、
    (iii)前記修飾糖は、2’−O−メトキシエチルであり、および/または
    (iv)前記修飾核酸塩基は、5−メチルシトシンである、
    請求項2に記載の一本鎖修飾オリゴヌクレオチド。
  4. 前記二環式糖は、4’−(CH)−O−2’(LNA);4’−(CH−O−2’(ENA);および4’−CH(CH)−O−2’(cEt)からなる群から選択される、請求項3に記載の一本鎖修飾オリゴヌクレオチド。
  5. 前記修飾オリゴヌクレオチドは、
    結合デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント;
    結合ヌクレオシドからなる5’ウイングセグメント;および
    結合ヌクレオシドからなる3’ウイングセグメント
    を含み、
    前記ギャップセグメントは、前記5’ウイングセグメントと前記3’ウイングセグメントとの間に位置し、それぞれのウイングセグメントのそれぞれのヌクレオシドは、修飾糖を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の一本鎖修飾オリゴヌクレオチド。
  6. 前記オリゴヌクレオチドは、配列番号1または2に少なくとも80%、85%、90%、95%または100%相補的である、請求項1〜5のいずれか一項に記載の一本鎖修飾オリゴヌクレオチド。
  7. 前記修飾オリゴヌクレオチドは、16〜30、または16個の結合ヌクレオシドからなる、請求項1〜6のいずれか一項に記載の一本鎖修飾オリゴヌクレオチド。
  8. 前記修飾オリゴヌクレオチドは、16個の結合ヌクレオシドからなり、かつ配列番号804、678、272、621、854、715、2158、615、640、790、239、569、607、および655のいずれか1つからなる核酸塩基配列を有する、請求項1〜7のいずれか一項に記載の一本鎖修飾オリゴヌクレオチド。
  9. (i)前記修飾オリゴヌクレオチドは、16〜80個の結合ヌクレオシドからなり、かつ配列番号804の核酸塩基配列を含む核酸塩基配列を有し、前記修飾オリゴヌクレオチドは、
    10個の結合デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント;
    2つの結合ヌクレオシドからなる5’ウイングセグメント;および
    4つの結合ヌクレオシドからなる3’ウイングセグメント
    を含み、
    前記ギャップセグメントは、前記5’ウイングセグメントと前記3’ウイングセグメントとの間に位置し;前記5’ウイングセグメントは、cEtヌクレオシドおよびcEtヌクレオシドを5’から3’方向に含み;前記3’ウイングセグメントは、cEtヌクレオシド、2’−O−メトキシエチルヌクレオシド、cEtヌクレオシド、および2’−O−メトキシエチルヌクレオシドを5’から3’方向に含み;それぞれのヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合であり;それぞれのシトシンは、5−メチルシトシンであるか、
    (ii)前記修飾オリゴヌクレオチドは、16〜80個の結合ヌクレオシドからなり、かつ配列番号678、272、239、569、607、615、621、640、655、715、790、および854のいずれか1つの核酸塩基配列を含む核酸塩基配列を有し、前記修飾オリゴヌクレオチドは、
    10個の結合デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント;
    3つの結合ヌクレオシドからなる5’ウイングセグメント;および
    3つの結合ヌクレオシドからなる3’ウイングセグメント
    を含み、
    前記ギャップセグメントは、前記5’ウイングセグメントと前記3’ウイングセグメントとの間に位置し、それぞれのウイングセグメントのそれぞれのヌクレオシドは、拘束エチル(cEt)ヌクレオシドを含み;それぞれのヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合であり、それぞれのシトシンは、5−メチルシトシンであるか、または
    (iii)前記修飾オリゴヌクレオチドは、16〜80個の結合ヌクレオシドからなり、かつ配列番号2158の核酸塩基配列を含む核酸塩基配列を有し、前記修飾オリゴヌクレオチドは、
    8つの結合デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント;
    3つの結合ヌクレオシドからなる5’ウイングセグメント;および
    5つの結合ヌクレオシドからなる3’ウイングセグメント
    を含み、
    前記ギャップセグメントは、前記5’ウイングセグメントと前記3’ウイングセグメントとの間に位置し;前記5’ウイングセグメントは、cEtヌクレオシド、cEtヌクレオシド、およびcEtヌクレオシドを5’から3’方向に含み;前記3’ウイングセグメントは、cEtヌクレオシド、デオキシヌクレオシド、cEtヌクレオシド、デオキシヌクレオシド、およびcEtヌクレオシドを5’から3’方向に含み;それぞれのヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合であり;それぞれのシトシンは、5−メチルシトシンである、
    請求項1〜8のいずれか一項に記載の一本鎖修飾オリゴヌクレオチド。
  10. (i)前記修飾オリゴヌクレオチドは、16個の結合ヌクレオシドからなり、かつ配列番号804の核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有するか、または
    (ii)前記修飾オリゴヌクレオチドは、16個の結合ヌクレオシドからなり、かつ配列番号678、272、239、569、607、615、621、640、655、715、790、および854のいずれか1つの核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有するか、または
    (iii)前記修飾オリゴヌクレオチドは、16個の結合ヌクレオシドからなり、かつ配列番号2158の核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有する、
    請求項9に記載の一本鎖修飾オリゴヌクレオチド。
  11. 請求項1〜10のいずれか一項に記載の一本鎖修飾オリゴヌクレオチドおよびコンジュゲート基を含む化合物。
  12. 前記一本鎖修飾オリゴヌクレオチドは、薬学的に許容可能な塩である、請求項1〜10のいずれか一項に記載の一本鎖修飾オリゴヌクレオチドまたは請求項11に記載の化合物
  13. 前記薬学的に許容可能な塩は、ナトリウム塩またはカリウム塩である、請求項12に記載の一本鎖修飾オリゴヌクレオチドまたは化合物
  14. 一本鎖修飾オリゴヌクレオチドまたはその薬学的に許容可能な塩を含む化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドのアニオン形態は、化学構造:
    Figure 2018528781
    を有する、化合物
  15. 前記薬学的に許容可能な塩は、ナトリウム塩である、請求項14に記載の化合物
  16. コンジュゲート基をさらに含む、請求項14または15に記載の化合物。
  17. 請求項1〜10、12および13のいずれか一項に記載の一本鎖修飾オリゴヌクレオチドまたは請求項11〜16のいずれか一項に記載の化合物、および薬学的に許容可能な希釈剤または担体を含む医薬組成物。
  18. 前記医薬組成物は、癌を治療、予防、または改善するためのものである、請求項17に記載の医薬組成物。
  19. 前記癌は、肺癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、小細胞肺癌(SCLC))、消化管癌、大腸癌、小腸癌、結腸癌、結腸直腸癌、膀胱癌、肝臓癌、胃癌、食道癌、膵臓癌、胆道癌、乳癌、卵巣癌、子宮内膜癌、子宮頸癌、前立腺癌、血液癌、脳癌、膠芽細胞腫、悪性末梢神経鞘腫瘍(MPNST)、神経線維腫症1型(NF1)突然変異MPNST、神経線維腫、白血病、骨髄性白血病、またはリンパ腫である、請求項18に記載の医薬組成物。
  20. 癌を治療、予防、または改善するための医薬品の製造のための、請求項1〜10、12および13のいずれか一項に記載の一本鎖修飾オリゴヌクレオチドまたは請求項11〜16のいずれか一項に記載の化合物または請求項17〜19のいずれか一項に記載の医薬組成物の使用。
  21. 前記癌は、肺癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、小細胞肺癌(SCLC))、消化管癌、大腸癌、小腸癌、結腸癌、結腸直腸癌、膀胱癌、肝臓癌、胃癌、食道癌、膵臓癌、胆道癌、乳癌、卵巣癌、子宮内膜癌、子宮頸癌、前立腺癌、血液癌、脳癌、膠芽細胞腫、悪性末梢神経鞘腫瘍(MPNST)、神経線維腫症1型(NF1)突然変異MPNST、神経線維腫、白血病、骨髄性白血病、またはリンパ腫である、請求項20に記載の使用。
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