JP2018517402A - ホスファターゼ選択的および非選択的なホスファターゼ阻害剤を選択するための方法 - Google Patents
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Abstract
Description
したがって、ホスファターゼを選択的に阻害する一般的な戦略およびアッセイを開発し、特異的な阻害剤、したがって、治療適用を有する薬物の同定を可能とする必要性がある。
i)捕捉/固定化されている第1のホロホスファターゼを提供するステップと;
ii)試験化合物を第1のホロホスファターゼに結合するその能力に関して試験するステップと;
iii)捕捉/固定化されている第2のホロホスファターゼを提供するステップと;
iv)同じ試験化合物を第2のホロホスファターゼに結合するその能力に関して試験するステップと;
v)試験化合物の前記第1のホロホスファターゼとの結合と前記第2のホスファターゼとの結合を比較するステップと
を含み、
ホロホスファターゼに結合する試験化合物が、前記第1のホロホスファターゼに選択的に結合するが、前記第2のホスファターゼに結合せず;または、前記第2のホロホスファターゼに結合するが、前記第1に結合せず;またはホロホスファターゼに結合する化合物が、前記第1のホロホスファターゼおよび前記第2のホロホスファターゼの両方に非選択的に結合する、方法が提供される。
本発明の任意の態様または実施形態の一実施形態において、調節サブユニットは、完全長サブユニットの切断型バージョンとして提供され得る。適宜、切断型バージョンは、触媒サブユニットに結合し、必要な触媒機能を保持する能力を保持する。例えば、本明細書において記載される通り、R15Aおよび/またはR15Bの適切な切断型バージョンは、触媒サブユニットPP1cに結合する能力を保持し、eIF2αに結合し、脱リン酸化する、その触媒活性を保持するものである。一実施形態において、調節サブユニットがR15Aである場合、アミノ酸325−636を含む切断型断片として提供される。一実施形態において、調節サブユニットがR15Bである場合、アミノ酸340−698を含む切断型断片として提供される。R15AおよびR15Bのアミノ酸配列は、本明細書において図16に与えられる。有利なことに、より短い断片を使用することにより、完全長タンパク質を使用して観察される、低いタンパク質収率および低い安定性における問題を克服することができる。しかし、R15AおよびR15Bについて例示されているように、本明細書において記載される断片は、100アミノ酸よりも小さい調節サブユニットの断片のみを含有する、以前に再構成されたPP1cホスファターゼのものよりも大きい(Chenら、2015;Choyら、2015)。別の実施形態において、触媒サブユニットは、天然タンパク質の切断形態であり得る。適宜、そのような切断形態は、その調節サブユニットに結合する能力ならびにその触媒活性を保持するであろう。
vi)捕捉/固定化されている前記第1および第2のホロホスファターゼの触媒サブユニットを提供するステップ;
vii)前記候補ホスファターゼ阻害剤分子を、触媒サブユニットに結合するその能力に関して試験するステップ
をさらに含む。
この例において、方法は、以下のステップ(図33)からなる:
1.この例において、ホロホスファターゼ(Aと呼ばれる)を単離および精製するステップ。
これは、内因性タンパク質の使用、または任意の適切な系(細菌、昆虫または哺乳動物細胞など)でサブユニットを発現させることのいずれかによってそれらを精製すること、およびホロホスファターゼを再構成することによる、任意の利用可能な方法によって実行することができる。この例において、ホスファターゼPP1cの触媒サブユニットは、ストレプトアビジンSPRチップにおける高親和性捕捉のためインビボでビオチン化される。
2.チップにホロホスファターゼを固定化するステップ
本明細書における例において、触媒サブユニットPP1cは、チップに最初に固定化され、次にそれは調節サブユニット(本明細書における例において、AまたはB)に結合される。
3.ホロホスファターゼA(チップA)に結合する分子/試験化合物をスクリーニングするステップ
4.この例においてB(チップB)と呼ばれる異なるホスファターゼでステップ1〜3を反復するステップ
5.触媒サブユニットを使用してステップ1〜2を反復して、チップCを生成するステップ
6.試験化合物の選択性を、それらのチップA、BおよびCへの結合を試験することによってプロファイリングするステップ。
本発明の別の態様によると、PPP1R15B(「R15B」)を阻害できる候補ポリペプチド、ポリヌクレオチド、抗体、ペプチドまたは小分子化合物を同定するステップ、スクリーニングするステップ、評価するステップ、特徴づけするステップにおいて使用するための一連のアッセイ方法が提供される。
PPP1R15A阻害剤は以前に記載されたが、異なるセリン/トレオニンホスファターゼの選択的な阻害剤は報告されていない。したがって、別のホスファターゼが選択的に阻害することができるかどうかは未知であった。出願人は、PPP1R15Bを選択的に阻害することは可能であるかどうかおよびこのような選択的な阻害が有益となり得るかどうかを調査した。正常であるように見えるPPP1R15Aノックアウトマウスと反対に、PPP1R15Bが欠如するマウスは、出生後生活期間の初日を生存しない(Hardingら、Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.、106、1832〜1837、2009)。したがって、PPP1R15A阻害は安全であると予想されたが、PPP1R15Bの阻害は有害であると予想された。しかし、本発明者らは、驚くべきことにPPP1R15Bを選択的に阻害することができることおよびこのような阻害が治療の利益をもたらすことを見出した。
PPP1R15A阻害の代わりにPPP1R15Bの阻害は有利であり得る、その理由は、PPP1R15A阻害剤で処置できる治療適応の数は、PPP1R15Aが発現され、PPP1R15Aが疾患作用機序に存在する疾患に限定されると予想されるからである。対照的に、PPP1R15Bは、構成的に発現され、したがって、疾患標的により広く適用可能である。本明細書において記載される通り、PPP1R15B阻害は、ハンチントン病の処置において使用することができる。本発明において有用なPPP1R15B選択的な阻害剤は、タンパク質もしくはポリペプチド、ポリヌクレオチド、抗体、ペプチドまたは小分子化合物であり得る。あるいは、PPP1R15Bは、遺伝子編集によって不活化され得る。
本発明の別の態様によると、対象に、治療有効量のPPP1R15B選択的な阻害剤を投与するステップを含む、PPP1R15Bの阻害によって軽減される病状を有する対象を処置する方法が提供される。
本発明の別の態様によると、PPP1R15Bの阻害によって軽減される病状を処置または予防のための医薬の製造における、PPP1R15B選択的な阻害剤の使用が提供される。
さらなる実施形態において、疾患は、ハンチントン病、パーキンソン病、タウオパシー、タンパク質輸送疾患またはミエリン障害である。
さらなる実施形態において、疾患は、シャペロンHSJ1において変異を有する遠位遺伝性運動性ニューロパシー(Distal hereditary motor neuropathy)である。
本明細書において使用する場合、用語「PPP1R15A阻害剤」は、ポリペプチド、ポリヌクレオチド、抗体、ペプチドまたは小分子化合物からなる群から選択される選択的な阻害剤を指す。用語「PPP1R15A」は用語「R15A」と交換可能に使用される。適宜、「PPP1R15A阻害剤」は、R15Bおよび/またはPPIcと対比してR15Aに選択的な阻害剤である。選択的な阻害のためのアッセイは、本明細書において記載される。
本発明の実施形態の任意の態様に従うアッセイにおける使用のための試験化合物は、タンパク質もしくはポリペプチド、ポリヌクレオチド、抗体、ペプチドまたは小分子化合物であり得る。一実施形態において、アッセイは、例えば、タンパク質、ポリペプチド、ポリヌクレオチド、抗体、ペプチドまたは小分子化合物のライブラリーの試験化合物のライブラリーをスクリーニングすることを包含し得る。適切なハイスループットスクリーニング方法は、当業者に知られる。例えば、ハイスループットSPRは、アレイを使用して行われ得る。
アッセイ
一実施形態において、本発明は、R15Bに対して特異的な阻害剤に関するアッセイを参照して記載される。しかし、本明細書において記載される方法が、より一般に本発明の任意の態様または実施形態に従ってホロホスファターゼの特異的なまたは非特異的な阻害剤を同定するためのアッセイに等しく適用可能であることが理解されよう。
結合アッセイを使用してPPP1R15Bに結合する候補に関するスクリーニングに使用することができるが、候補の特性は必ずしも結合アッセイによって予想されない。したがって、候補がPPP1R15B機能を阻害するかどうかを評価するため他のアッセイが必要とされる。
i)哺乳動物細胞を候補で処置するステップ;
ii)eIF2αリン酸化を長期にわたりモニターするステップ;
を含み、
eIF2αリン酸化の一過性の誘導は、PPP1R15BまたはPPP1R15Aの選択的な阻害を示すアッセイが提供される。
別の実施形態において、PPP1R15B阻害剤は、少なくとも20%、より好ましくは少なくとも30%、なおより好ましくは少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、およびよりなお好ましくは、少なくとも90%によるストレスから細胞を保護できる。
一実施形態において、本発明は、選択的なホスファターゼ阻害剤を同定する方法を記載する。
本発明の他の態様または実施形態において、本発明に従う、使用のため配置されるおよび/またはスクリーニング方法のために使用される場合の、キットおよび/または装置が提供される。適切なキットおよび/または装置は、SPRチップまたはチップまたは固体表面(例えば、ビーズまたはマイクロタイタープレート)に対して付着する表面を通して第1および/または第2のホロホスファターゼを「提示する」ため生成される他の固体表面を含み得る。適宜、チップまたはビーズは、本明細書において記載される通りスクリーニング方法が行われることを可能にするような様式で配置され得る。
したがって、別の態様において、本発明の実施形態の任意の態様に従うスクリーニングの方法における使用のためのキットが提供される。適宜、前記キットは、第1の表面に捕捉される第1のホロホスファターゼおよび第2の表面に捕捉される第2のホロホスファターゼを含み得る。そのような第1および/または第2の表面は、SPRによる結合反応の分析に適したチップまたはビーズであり得る。一実施形態において、本発明の本態様に従うキットまたは装置は、本明細書において記載される通り、スクリーニング方法のために使用される場合のものである。
PPP1R15Aおよび/またはPPP1R15Bの阻害剤を含む、本発明の任意の態様または実施形態に従うアッセイを使用して同定される阻害剤は、種々の疾患および障害を処置することおよび予防することにおいて、潜在的な治療適用を有する。eIF2α脱リン酸の阻害は翻訳を低下させ、結果として、フォールディングを支持するシャペロンの有効性を増加させる。
・PPP1R15B阻害剤(実施例1に記される化合物によって例示される)は、良好な組織分布を有する;
・PPP1R15B阻害は、哺乳動物において安全である(図5、6、7);
・PPP1R15Bの阻害は、哺乳動物において疾患を予防する(図9);および
・PPP1R15Bの阻害は、哺乳動物において代謝性障害を低減させる(図11)。
本発明の別の態様は、対象に、治療有効量のPPP1R15B阻害剤を投与するステップを含む、PPP1R15Bの阻害によって軽減される病状を有する対象を処置する方法に関する。
本発明のさらに別の態様は、PPP1R15Bの阻害によって軽減される病状を処置または予防のための医薬の製造における、PPP1R15B阻害剤の使用に関する。
一実施形態において、PPP1R15B阻害剤は、実施例1の化合物の構造を有する。
さらなる実施形態において、PPP1R15B阻害剤は、実施例3の化合物の構造を有する。
本明細書において使用する場合、用語「方法」は、化学、薬理学、生物学、生化学および医学技術分野の実務家に公知であるか、または該実務家によって公知の様式、手段、技術および手順から容易に開発されるかのいずれかである様式、手段、技術および手順を含むがこれらに限定されない、所与の作業を達成するための様式、手段、技術および手順を指す。
本明細書において、用語「処置すること」は、疾患もしくは障害の進行を、抑止し、実質的に阻害し、遅らせ、もしくは逆行させること、疾患もしくは障害の臨床症状を実質的に改善させること、または疾患もしくは障害の臨床症状の出現を実質的に予防することを含む。
疾患原因タンパク質(Disease−causing proteins)は、生涯を通じて発現されるが、変性疾患は主として遅発性である。このことは、異なる疾患原因タンパク質が、時間を経て次第に有害になることを示唆する。ミスフォールドしたタンパク質が別個の変性疾患の原因であることは現在十分に確立されているが、それらがなぜ蓄積するかは大部分が不確かなままである。細胞は、通常、タンパク質が、正確にフォールドし、実際全ての細胞が、数十年間も潜在的に有害なタンパク質を非常に効率的に取り扱う強力で洗練されたタンパク質品質管理システムを有することを保証するようにしている。しかし、タンパク質品質管理機構は年齢とともに次第に機能しないようであり、ミスフォールドしたタンパク質の蓄積につながるとともに、細胞および生物にとって結果的に破局的な結末をもたらす。これらのミスフォールドした/凝集性のタンパク質またはペプチドは、細胞の内側または外側に存在することができ、あらゆる位置に見出され得る。原理的には、ミスフォールドしたタンパク質に対する自然の細胞防御をブーストすることは、ミスフォールドした/凝集傾向タンパク質がその病理に存在する多様なタンパク質ミスフォールディング疾患における病状を低減させるために、一般的なアプローチを提示するはずである。本発明は、そのようなアプローチを記載し、哺乳動物においてその安全性および有効性の両方を実証する。
別の実施形態において、例えば、任意の実施例1〜4の化合物であるが、限定されない、PPP1R15Bの阻害剤は、ミスフォールドしたタンパク質の蓄積が作用機序に関与する疾患を処置することにおける使用のためのものである。
別の特定の実施形態において、任意の実施例1〜4のいずれかの化合物は、パーキンソン病の処置における使用のためのものである。
出願人は、実施例1の化合物が、PPP1R15B−PP1を選択的に阻害し、マウスにおけるタンパク質ミスフォールディング疾患を癒すことを実証した。PPP1R15B阻害剤は、同じ機構であるミスフォールドしたタンパク質の蓄積によって引き起こされる疾患の進行を、予防または停止するのにも有用であり得る。
ミエリンは、中枢および末梢神経系の両方に豊富なタンパク質である。ミエリンは、末梢神経系中の中枢神経系中のオリゴデンドロサイトおよびシュワン細胞の2つの細胞型によって産生される。ミエリンは、軸索の周囲に鞘を形成して軸索に沿う電気的インパルスの伝導の速度を保証し、軸索からの散逸からの電流を防止する。ミエリン機能は、神経系にとって必須である。
別の実施形態において、例えば、任意の実施例1〜4の化合物であるが、限定されない、PPP1R15Bの阻害剤は、シャルコ−マリートゥース病を処置することにおける使用のためのものである。
出願人は、実施例1の化合物が、小胞体(ER)において合成される1つのミスフォールドしたタンパク質PMP22によって引き起こされる欠陥をレスキューすることができることを実証した。作用機序(フォールディングを増加させる翻訳の減少)に起因して、PPP1R15Bの阻害剤が、本発明に従って、膜貫通または分泌タンパク質を含む、ERにおいて作られる任意のタンパク質のミスフォールディングまたは輸送欠陥に起因する疾患の処置に関しても有用である。
代謝疾患、例えば、糖尿病、肥満、インスリン抵抗性、高脂血症、肝脂肪疾患、およびアテローム性動脈硬化症が、病理学的なERストレスに関連することが公知であり、UPRの薬理学的なモジュレーターが、治療の利益を有し得ることが考えられる(CaoおよびKaufman、2012、Curr Biol、vol.22(16))。しかし、PPP1R15B阻害剤が以前に利用可能ではなく、PPP1R15B阻害が有害であると予想されたので、さらにホスファターゼを阻害することが挑戦であったので、PPP1R15Bが代謝疾患における治療標的であり得るかについては不確かであった。
好ましい実施形態において、代謝性障害は、糖尿病、肥満、肝脂肪疾患、およびアテローム性動脈硬化症から選択される。
本発明の一実施形態において、実施例1〜4の化合物およびPPP1R15B選択的な阻害剤としてのその使用が提供される:
本明細書の化合物は、塩またはエステル、特に薬学的に許容される塩またはエステルとして存在し得る。
鏡像異性体/互変異性体
先に論じた本発明の全ての態様において、本発明は、適切な場合、本発明の化合物の全ての鏡像異性体、ジアステレオ異性体および互変異性体を含む。当業者であれば、光学的性質(1つまたは複数のキラル炭素原子)または互変異性特性を保有する化合物を認識する。対応する鏡像異性体および/または互変異性体は、当技術分野において公知の方法によって単離/調製できる。鏡像異性体は、そのキラル中心の絶対配置によって特徴づけられ、Cahn、IngoldおよびPrelogのRおよびSの順序付けルールにより表される。このような従来法は、当技術分野において周知である(例えば、「Advanced Organic Chemistry」、第3版、March,J.、John Wiley and Sons、New York、1985を参照されたい)。
本発明の化合物のいくつかは、立体異性体および/または幾何異性体として存在し得、例えば、それらは、1つまたは複数の不斉および/または幾何中心を保有し得るため、2以上の立体異性および/または幾何形態で存在し得る。本発明は、それらの阻害剤の個々の立体異性体および幾何異性体全て、ならびにそれらの混合物の使用を企図する。特許請求の範囲において使用される用語は、これらの形態が(必ずしも同程度までとは限らないが)適切な機能的活性を保持する限り、前記形態を包含する。
本発明は、プロドラッグ形態の本発明の化合物、すなわち、任意の例示的な化合物による活性親薬物をインビボで放出する共有結合化合物をさらに含む。そのようなプロドラッグは、概して、ヒトまたは哺乳類対象への投与時に修飾を逆転できるように1つまたは複数の適切な基が修飾された本発明の化合物である。逆転は通常、そのような対象において自然に存在する酵素によって実施されるが、逆転をインビボで実施するために、そのようなプロドラッグと一緒に第2の薬剤を投与することが可能である。そのような修飾の例は、エステル(例えば、上述したもののいずれか)を含み、ここで、逆転はエステラーゼ等によって行われ得る。他のそのようなシステムは、当業者には周知である。
本発明は、本発明の化合物の溶媒和物形態も含む。特許請求の範囲において使用される用語は、これらの形態を包含する。
本発明は、その種々の結晶形態、多形体形態および(無水)水和形態である本発明の化合物にさらに関する。そのような化合物の合成的調製において使用される精製および/または溶媒からの単離の方法をわずかに変更することにより、化学化合物がそのような形態のいずれかで単離され得ることは、製薬業界内で十分に確立されている。
「抗体」の参照は、モノクローナル、ヒト、ヒト化またはキメラ抗体を含むが、これらに限定されない。抗体は、VHまたはVLドメインを含む、抗体断片または単鎖抗体分子(scFv)であり得る。一実施形態において、抗体は、ヒトである。
本発明のさらなる態様によると、PPP1R15B阻害剤を含む医薬組成物が提供される。一実施形態において、医薬組成物は、任意の薬学的に許容される担体、アジュバントまたはビヒクルと組み合わせた療法における使用のためのものである。
医薬製剤は、経口、局所(真皮、頬側、経眼および舌下を含む)、直腸または非経口(皮下、皮内、筋肉内および静脈内を含む)、例えば吸入による経鼻、眼内および経肺投与に適するものを含む。製剤は、適切な場合には、好都合なことに個別の投薬単位で提示されてよく、薬学技術分野において周知である任意の方法によって調製できる。
概して、製剤は、活性剤を液体担体もしくは微粉化した固体担体または両方と均一で密接に会合させ、次いで、必要ならば、生成物を成形することによって調製される。本発明は、本明細書において開示される化合物を薬学的に許容される担体またはビヒクルと併用するかまたはそれらと連携させるステップを含む、医薬組成物を調製するための方法にまで及ぶ。いずれの方法も、活性化合物を液体担体もしくは微粉化した固体担体または両方と会合させるステップと、次いで、必要ならば、生成物を所望の製剤に成形するステップとを含む。
特に好ましい実施形態において、1つまたは複数の本発明のPPP1R15B阻害剤は、1つまたは複数の他の活性剤、例えば、市場で入手可能な既存の薬物と組み合わせて投与される。そのような事例では、本発明の阻害剤は、1つまたは複数の他の活性剤と連続的に、同時にまたは順次に投与され得る。
1.PPP1R15Aと対比してPPP1R15Bを選択的に結合する、ポリペプチド、ポリヌクレオチド、抗体、ペプチドまたは小分子化合物を同定するおよび/または決定するためのアッセイ方法。
2.PPP1R15B選択的な阻害剤をPPP1R15Bおよび候補ポリペプチド、ポリヌクレオチド、抗体、ペプチド、または小分子化合物と接触させるステップならびにPPP1R15B選択的な阻害剤とPPP1R15Bとの間の相互作用における任意の変化を検出するステップを含む、競合的な結合アッセイである、条項1に記載のアッセイ。
3.スクリーニングまたはハイスループットスクリーニングとして使用される、条項2に記載のアッセイ。
4.ポリペプチド、ポリヌクレオチド、抗体、ペプチドまたは小分子化合物から選択される候補のPPP1R15Bの選択的な阻害を決定するためのアッセイであって:
i)哺乳動物細胞を候補で処置するステップ;
ii)eIF2αリン酸化を長期にわたりモニターするステップ;
を含み、
eIF2αリン酸化の一過性の誘導は、PPP1R15Bの選択的な阻害を示すアッセイ。
5.ハイスループットスクリーニングとして使用される、条項4に記載のアッセイ。
6.PPP1R15B阻害剤の選択性を決定するための細胞生存度アッセイであって:
i)細胞をPPP1R151B阻害剤で処置するステップ;
ii)生存度を野生型、PPP1R151AおよびPPP1R15Bノックアウト細胞の生存度と比較するステップ;
を含み、
処置された細胞における生存度における低減は、PPP1R15B選択的な阻害剤の存在を示すアッセイ。
7.ポリペプチド、ポリヌクレオチド、抗体、ペプチドまたは小分子化合物から選択される候補のPPP1R15Bの選択的な阻害を決定するためのアッセイであって:
i)哺乳動物細胞または生物を候補で処置するステップ;
ii)PPP1R15Aを長期にわたりモニターするステップ;
を含み、
一過性の誘導PPP1R15Aは、PPP1R15Bの選択的な阻害を示すアッセイ。
8.療法における使用のための、選択的なPPP1R15B阻害剤。
9.PPP1R15Bの選択的な阻害によって軽減される疾患または障害の予防または処置における使用のための、選択的なPPP1R15B阻害剤。
10.疾患または障害がプロテオスタシス疾患である、条項9に記載の使用のための、選択的なPPP1R15B阻害剤。
11.プロテオスタシス疾患がハンチントン病、パーキンソン病、アルツハイマー病、タウオパシー、運動失調症、網膜変性、緑内障、筋萎縮性側索硬化症(ALS)またはプリオン病である、条項10に記載の使用のための、選択的なPPP1R15B阻害剤。
12.疾患がハンチントン病である、条項11に記載の使用のための、選択的なPPP1R15B阻害剤。
13.疾患がパーキンソン病である、条項11に記載の使用のための、選択的なPPP1R15B阻害剤。
14.疾患がタウオパシーである、条項11に記載の使用のための、選択的なPPP1R15B阻害剤。
15.疾患がタンパク質輸送疾患である、条項9に記載の使用のための、選択的なPPP1R15B阻害剤。
16.疾患または障害がミエリン障害である、条項9に記載の使用のための、選択的なPPP1R15B阻害剤。
17.ミエリン障害が、多発性硬化症、ペリツェウスメルツバッハー病、白質消失病、急性散在性脳脊髄炎、脳室周囲白質軟化症、脳室周囲白質傷害、脊髄癆、デビック病、視神経炎、進行性多巣性白質脳症、横断性脊髄炎、慢性炎症性脱髄性多発性ニューロパシー(chronic inflammatory demyelinating polyneuropathyl)、抗MAG末梢性ニューロパシー、副腎脳白質ジストロフィー、副腎脊髄神経症、びまん性白質傷害(diffuse white matter injury)、ギランバレー症候群、橋中央ミエリン溶解、白質ジストロフィーまたはシャルコ−マリートゥース病である、条項16に記載の使用のための、選択的なPPP1R15B阻害剤。
18.疾患または障害が、嚢胞性線維症、先天性甲状腺機能低下性甲状腺腫、家族性神経下垂体性糖尿病(familial neurohypophyseal diabetes)、骨形成不全を含むプロコラーゲン生合成障害、高コレステロール血症、アルファ−1アンチトリプシン欠損症、リソソーム障害、網膜色素変性症(retinis pigmentosa)または炎症性腸疾患である、条項9に記載の使用のための、選択的なPPP1R15B阻害剤。
19.疾患または障害が代謝疾患である、条項9に記載の使用のための、選択的なPPP1R15B阻害剤。
20.代謝疾患が、糖尿病、ウォルコットラリソン症候群、肥満症、インスリン抵抗性、高脂血症、脂肪性肝疾患またはアテローム性動脈硬化症である、条項19に記載の使用のための、選択的なPPP1R15B阻害剤。
21.疾患または障害が、関節リウマチ、1型糖尿病または白斑である、条項9に記載の使用のための、選択的なPPP1R15B阻害剤。
22.疾患または障害が、微小管結合タンパク質タウの凝集に関連する、条項9に記載の使用のための、選択的なPPP1R15B阻害剤。
23.対象に、治療有効量のPPP1R15B阻害剤を投与するステップを含む、PPP1R15Bの阻害によって軽減される病状を有する対象を処置する方法。
24.条項1から4のいずれか一項に記載のアッセイ、条項8から22のいずれか一項に記載の使用のための阻害剤または条項23に記載の処置の方法、ここで、PPP1R15B選択的な阻害剤は、以下から選択される化合物である:
(E)−2−(2,3−ジクロロベンジリデン)ヒドラジン−1−カルボキシイミドアミド;
(E)−2−(2−クロロ−4−フルオロベンジリデン)ヒドラジン−1−カルボキシイミドアミド;
(E)−2−(3,4,5−トリクロロベンジリデン)ヒドラジン−1−カルボキシイミドアミド;および
(E)−2−(2,4,5−トリクロロベンジリデン)ヒドラジン−1−カルボキシイミドアミド。
25.ハンチントン病の処置における使用のための、選択的なPPP1R15B阻害剤、ここで、阻害剤は、以下から選択される化合物である:
(E)−2−(2,3−ジクロロベンジリデン)ヒドラジン−1−カルボキシイミドアミド;
(E)−2−(2−クロロ−4−フルオロベンジリデン)ヒドラジン−1−カルボキシイミドアミド;
(E)−2−(3,4,5−トリクロロベンジリデン)ヒドラジン−1−カルボキシイミドアミド;および
(E)−2−(2,4,5−トリクロロベンジリデン)ヒドラジン−1−カルボキシイミドアミド。
26.パーキンソン病の処置における使用のための、選択的なPPP1R15B阻害剤、ここで、阻害剤は、以下から選択される化合物である:
(E)−2−(2,3−ジクロロベンジリデン)ヒドラジン−1−カルボキシイミドアミド;
(E)−2−(2−クロロ−4−フルオロベンジリデン)ヒドラジン−1−カルボキシイミドアミド;
(E)−2−(3,4,5−トリクロロベンジリデン)ヒドラジン−1−カルボキシイミドアミド;および
(E)−2−(2,4,5−トリクロロベンジリデン)ヒドラジン−1−カルボキシイミドアミド。
27.PPP1R15B選択的な阻害剤としての
(E)−2−(2,3−ジクロロベンジリデン)ヒドラジン−1−カルボキシイミドアミド;
(E)−2−(2−クロロ−4−フルオロベンジリデン)ヒドラジン−1−カルボキシイミドアミド;
(E)−2−(3,4,5−トリクロロベンジリデン)ヒドラジン−1−カルボキシイミドアミド;および
(E)−2−(2,4,5−トリクロロベンジリデン)ヒドラジン−1−カルボキシイミドアミド
から選択される化合物の使用。
本発明による化合物の調製
本発明による化合物は、以下の手順により調製することができる:
一般的手順A:
エタノール(300ml)中のベンズアルデヒドの溶液(1当量)に、順次に塩酸アミノグアニジン(1当量)および酢酸ナトリウム(1当量)を25℃で添加した。得られた反応混合物を、80℃で次の約6時間加熱した。反応完了を、ジクロロメタン/メタノール(8/2)を移動相として使用したTLCでモニターした。反応の完了後、反応混合物を、25℃に冷却させ、NaHCO3の飽和溶液(700ml)に入れた。得られた沈殿物を、真空下で濾別し、水(100ml)で洗浄した。得られた固形物を、ジエチルエーテル(2×25ml)で粉砕して、真空下で乾燥して、所望の置換されたアミノグアニジン誘導体を得た。
以下の化合物を、一般的手順Aにより調製した:
実施例1:(E)−2−(2,3−ジクロロベンジリデン)ヒドラジン−1−カルボキシイミドアミド
一般的手順Aに従って2,3−ジクロロベンズアルデヒドから85%収率で調製した(モノアセタート塩と考慮)LC−MS:m/z=231.23(M+H)。1H-NMR (DMSO-d6): δ(ppm) 11.85 (brs, 1H); 8.35 (s, 1H); 8.19-8.21 (dd, 1H); 7.56-7.59 (dd, 1H); 7.32-7.36 (t, 1H); 7.04 (brs, 4H); 1.84 (s, 3H); MS (ESI+): m/z = 231.23 [M+H]+
実施例2:(E)−2−(2−クロロ−4−フルオロベンジリデン)ヒドラジン−1−カルボキシイミドアミド
一般的手順Aに従って2−クロロ−4−フルオロベンズアルデヒドから67%収率で調製した。1H-NMR (DMSO-d6): δ(ppm) 5.80 (brs, 2H); 5.84 (brs, 2H); 7.19-7.34 (m, 4H); 8.16 (s, 1H); MS (ESI+): m/z = 215.1 [M+H]+
実施例3:(E)−2−(3,4,5−トリクロロベンジリデン)ヒドラジン−1−カルボキシイミドアミド
一般的手順Aに従って3,4,5−トリクロロベンズアルデヒドから70.88%収率で調製した。
1H-NMR (DMSO-d6): δ (ppm) 7.96 (s, 2H); 7.89 (s, 1H); 6.20 (brs, 2H); 5.69 (brs, 2H); MS (ESI+): m/z = 265.1 [M+H]+
実施例4:(E)−2−(2,4,5−トリクロロベンジリデン)ヒドラジン−1−カルボキシイミドアミド
一般的手順Aに従って2,4,5−トリクロロベンズアルデヒドから78.76%収率で調製した。
1H-NMR (DMSO-d6): δ (ppm) 8.43 (s, 1H); 8.12 (s, 1H); 7.77 (s, 1H); 6.33 (brs, 2H); 5.83 (brs, 2H); MS (ESI+): m/z =265.17 [M+H]+
タンパク質発現、精製および表面プラズモン共鳴による分析
タンパク質発現および精製
PPP1R15A325−636およびPPP1R15B340−698を発現させ、次の通り精製した:PPP1R15Aの325−636およびPPP1R15Bの340−698のアミノ酸をコードするcDNAをHis−タグ化し、pMAL−c5xにクローニングした。R15AおよびR15Bのアミノ酸配列は、図16に記される。組換えPPP1R15A/BをBL21−Gold細胞において発現させ、HisTrap HPカラム(GE Healthcare)、続いてMBPTrap HPカラム(GE Healthcare)におけるアフィニティークロマトグラフィーによって精製した。ヒトPP1γ(PP1c)をコードするcDNAを、バキュロウイルストランスファーベクターpDW464にクローニングしてビオチンアクセプターペプチド(BAP)を付加した。ベクターは、大腸菌ビオチンホロ酵素合成酵素(BirA)もコードするため、BAP−タグ化タンパク質をSpodoptere frugiperda(Sf9)昆虫細胞中でインビボでビオチン化することができる(Duffyら、Anal.Biochem.、262、122〜128、1998)。Bac−to−Bacバキュロウイルス発現システム(Life Technologies)を使用して組換えバクミドDNAを生成し、Sf9昆虫細胞を使用してウイルスストックを増幅した。培養物を1,200gで15分間遠心分離することによって採取し、細胞ペレットを溶解緩衝剤(50mM Tris pH7.4、150mM NaCl、0.2%Triton、5%グリセロール、1PiC錠剤(Roche)/50mlおよび0.2mM PMSF)に再懸濁し、続いて穏やかに超音波処理した。タンパク質を最初に5ml HiTrap Q HPカラム(GE Healthcare)、続いてHiLoad 16/600 Superdex 200カラム(GE Healthcare)において精製した。SDS−PAGEおよびウエスタンブロットによって確認された陽性画分を、プールし、約1μMに濃縮し、−80℃で貯蔵した。
Biacore T200(GE Healthcare)システムを全ての実験に使用し、ビオチン化PP1をセンサーチップSA(GE Healthcare、カタログ番号BR−1005−31)を使用して捕捉した。ストレプトアビジンでコーティングした表面を、50mM NaOHおよび1M NaClの溶液の1分間注入によって活性化した。ビオチン−PP1を、ランニング緩衝剤(50mM Tris pH7.5、100mM NaCl、0.1mM EGTA、1mM MnCl2、0.05%Tween20)で希釈し、およそ300nM濃度で、直接的にストレプトアビジンでコーティングした表面に100秒または約7000RUに対応するビオチン−PP1の固定化レベルに達するまで注入した。ブランク固定化を、参照として使用するため、SAセンサーチップ表面の1つについて実施した。
軽微な偏りはあるが、同じ手順および条件を全ての結合実験に使用した。小分子を、100%DMSO中に50mM貯蔵溶液として貯蔵した。結合定数の決定の前、化合物の12または8つの濃度のいずれかの連続希釈を、96ウェルプレートのランニング緩衝剤で調製した。各々の化合物希釈系列より前に、調節サブユニットR15AまたはR15Bを、ランニング緩衝剤で15μMに希釈し、ビオチン−PP1表面に捕捉させ、センサーチップ表面にホロホスファターゼ複合体を形成させた。次いで、表面を再生することなく、化合物希釈系列をチップの表面上に注入した。センサーグラムをBiacore T200査定ソフトウェアを使用して分析し、結合定数を定常状態モデルに基づいて決定した。速度実験は異なる濃度の化合物を使用して行い、それらそれぞれの平衡結合レベルを決定した。これらの平衡応答レベル(Req)は、濃度に対してプロットされ、グローバルフィットを使用してフィッティングされ、これにより定常状態親和性定数を決定できる(すなわち、50%飽和での濃度がKDである)(Frostell−Karlssonら、J.Med.Chem.、43、1986〜1992、2000)。
HeLa細胞を、それぞれ、ペニシリン、ストレプトマイシンを補充し、5%および10%ウシ胎児血清(FBS)を含有する、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)中で培養した。MEF細胞を、ペニシリン、ストレプトマイシン、グルタミン、55μM β−メルカプトエタノール、1×非必須アミノ酸(Sigma−Adrich)および10%FBSを補充したDMEM中で培養した。示される場合、細胞を、2.5μg/mlツニカマイシン、1mM DTT(Sigma−Adrich)および/または示した化合物を示した濃度で処理した。
免疫ブロットに関して、HeLa細胞(細胞80,000個/ml)を、各実験の24時間前に12ウェルプレートにプレーティングした。示した処理の直後、細胞を、75μl Laemmli緩衝剤に溶解し、95℃で5分間ボイルし、超音波処理した。タンパク質を、分離し、ホスホ−eIf2α[pS52]およびPPP1R15A/GADD34(10449−1−AP;ProteinTech Group、1/1000希釈)の抗体で記載(Tsaytlerら、Science、332、91〜94、2011)の通り分析した。
細胞を、処理の24時間前に15,000(HeLa)または細胞12,000個/ml(MEFs)の密度で24ウェルプレートにプレーティングした。ERストレスを、2.5μg/mlツニカマイシン(Sigma−Aldrich)を含有する新鮮な培地を添加することによって誘発した。実施例1の化合物を、DMSOに溶解し、示される通り添加した。DMSOを、模擬処理として使用した。細胞生存度を、ツニカマイシン処理の48時間後、供給者の推奨に従ってCell viability Counting Kit−8(Dojindo)を使用してWST−8[2−(2−メトキシ−4−ニトロフェニル)−3−(4−ニトロフェニル)−5−(2,4−ジスルホフェニル)−2H−テトラゾリウム]のホルマザンへの還元を測定することによって評価した。
全ての動物ケアおよび手順を、地域の倫理的な承認を受けた研究における動物の使用における規則(1986の英国動物科学的処置法)に準拠して実施した。
疾患表現型の改善における実施例1の化合物の有効性を評価するため、28日齢のトランスジェニックマウスまたは同腹仔対照に実施例1の化合物(2mg/kg)またはビヒクルを経口的に4週の期間毎日投与した。疾患進行を、処置の間にマウスを秤量することおよび処置の4週後のそれらの運動能力を評価することによって査定した。
脳からのRNAを、トリゾール(Life Technologies)中に抽出した。RNA濃度をNANODROP1000分光光度計(Thermo Fisher Scientific)を使用して測定し、SuperScript逆転写酵素(Life Technologies)を使用して1μgをcDNAに逆転写した。プライマーGAPDH(f):ACCACAGTCCATGCCATCAC、GAPDH(r):TCCACCACCCTGTTGCTGTA、PPP1R15A(f):CCTCCTGAAACTTGGGGACT;およびPPP1R15A(r):GCTGTGATGTGGGATAAGCGでの定量的PCRを、SYBR(登録商標)Select Master Mix(Ref4472908、applied biosystems)をCorbett Rotor−Geneバージョン6000に使用して実施した。各遺伝子の発現を、ハウスキーピング遺伝子GAPDHに対して標準化し、Paffl式を使用して計算される倍率変化として表した。
13.5での胚または発生(E13.5)の野生型のまたはPmp22Tr−J(PMP22変異体)(Henryら、Neuropathol.Exp.Neurol.、42、688〜706、1983)から解剖した後根神経節(DRG)を、4g/lグルコース、2mM L−グルタミン、2%B27サプリメントおよび50ng/mlニューロン成長因子(NGF)を補充した神経基礎(neurobasal)培地中でコラーゲンでコーティングしたカバーガラスにおいて7日間培養した。シュワン細胞を分化させ、ミエリン形成を誘導させるため、培養したDRGを、次にC−培地(4g/lグルコース、2mM L−グルタミン、10%FCS、50ng/ml NGFを補充したMEM培地)において維持した。C−培地を、新たに添加した50μg/mlアスコルビン酸±5nMの実施例Iの化合物で1日おきに置き換え、シュワン細胞によるミエリン形成のために14日間培養した。培養したDRGを、次に4%パラホルムアルデヒド中で固定し、MBP(ラットミエリン塩基性タンパク質、1/250希釈、ab73498)で免疫染色した。
生化学的アッセイ
アッセイ1:選択的なPPP1R15B阻害剤は、PPP1R15B−PP1に選択的に結合する(図1)。
実施例1の化合物の選択性は、組換えタンパク質でのインビトロ結合アッセイを使用して明らかにされた。しかし、結合アッセイを使用してPPP1R15Bに結合する選択的な化合物に関するスクリーニングに使用することができるが、化合物の特性は必ずしも結合アッセイによって予想されない。したがって、化合物がPPP1R15B機能を阻害するかどうかを評価するため他のアッセイが必要とされる。
通常、細胞および生物は、欠損を補償する機構を有する。したがって、本発明者らは、細胞が、PPP1R15Aを誘導することによってPPP1R15B阻害に関して補償し得るかどうかを考えた。PPP1R15Aレベルが、PPP1R15Bノックアウトマウスの肝臓中で増加することが以前に報告されていた(Hardingら、Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.、106、1832〜1837、2009)。この代償性応答が、肝臓に特異的であるかまたは細胞または他の組織において起こり得るかは未知である。さらに、この研究よりも前に、PPP1R15A誘導が、PPP1R15Bの薬理学的な阻害に際して観察することができるかどうかは未知であった、その理由は、この研究よりも前に、それらはPPP1R15Bの選択的な阻害剤とされてはいなかったからである。
図3は、選択的なPPP1R15B阻害剤がストレスから細胞を保護することを示す。ここで、細胞は、0.2〜5μMの実施例1の化合物の存在下で、ツニカマイシン(2.5ug/ml)でストレスを受けた。細胞生存度を、処置の3日後に測定した。
本発明者らは、PPP1R15B阻害剤が、ストレスに続いてeIF2αリン酸化を延長することに理由を付けた。この活性を明らかにするため、PPP1R15Aが発現されず、交絡する効果を回避する、条件を探索することが重要であった。本発明者らは、DTTによるストレス誘導の速い速度および可逆性(Bertolottiら、Nat.Cell.Biol.、2、326〜332、2000;Jousseら、2003)を利用し、1mM DTTで30分間処理し、洗い流した後に細胞中のeIF2αリン酸化をモニターした。DTTを洗い流した後に通常発生するeIF2αリン酸化における減退が遅延し、これがPPP1R15Aの何らかの実質的な誘導の前に発生することを本発明者らは見出した。したがって、本明細書において記載されるものなどのストレス−回復パラダイムの初期相におけるeIF2α脱リン酸化の動態の慎重なモニタリングを使用して他のPPP1R15B阻害剤を同定することができる。
実施例1の化合物の経口での強制飼養後の異なる時間でのマウス組織(血漿、脳、脊髄、膵臓、肝臓)の分析は、PPP1R15B阻害剤が広範な組織分布を有し、したがって、異なる臓器に影響を及ぼす種々の疾患および障害の処置において適用を示すことを明らかにした。
実施例1でマウスを処置し、任意の臨床的症状を検出するために厳重にモニターした。1日に1回の実施例1の化合物10mg/mgまで2週間処置されたマウスが、プラセボで処置されたマウスと区別がつかないことおよびマウスが通常どおり体重を増すことが見出された(図6)。これにより、PPP1R15B阻害が毒性ではないことが確立される。これは驚くべきかつ予期しないことであった、その理由は、この研究の前には、PPP1R15B阻害剤は、治療可能性も有することはないほどに有害であると予想されたであろうからである。
ヒトにおいて、グアナベンズのアドレナリン作動性アゴニスト活性は、高用量で傾眠および昏睡を含む副作用を有する(A.H.Hall、Ann Intern Med 102;787〜788;1985)。これらの副作用に起因して、グアナベンズは、もはやヒトでは使用されない。グアナベンズ誘導体が、アルファ−2アドレナリン作動性活性に関連する、グアナベンズの副作用を有することが見込まれる。グアナベンズとアルファ−2アドレナリン作動性レセプターとの構造−活性相関は入手不可能であるが、本発明者らは驚くべきことに本発明において実施例1が、構造的に非常に類似するが、グアナベンズの副作用を欠いていることを見出した。
PPP1R15A誘導を、示される用量の実施例1の化合物で処置されたマウスの脳から抽出されたトータルmRNAにおけるqPCRによって評価した。
PPP1R15Bの阻害によりフォールディングを増加させることは、非常に広範囲のヒトの病理に利益がある可能性がある。このことを試験するため、本発明者らは、ミスフォールドしたタンパク質、変異体ハンチントンの蓄積によって引き起こされるプロテオスタシス疾患であるハンチントン病(HD)に注目した。変異体ハンチントンがUPRを誘導することを示すいくつかの報告がある(DuennwaldおよびLindquist、Gene&Development、22、3308〜3319、2008;Nishitohら、Genes&Development、16、1345〜1355、2002)。しかし、本発明者らはハンチントン病のモデルにおいてPPP1R15Aを検出することに失敗し、このことからPPP1R15AがHDに関する治療標的ではないことが示唆された。HDは現在まで救済法はないので、本発明者らは、HDがPPP1R15B阻害によって予防できるかどうかを試験した。本発明者らは、2mg/kgの実施例1の化合物でのHDマウスの処置が、運動能力機能障害を予防することを見出した(図9)。これは、PPP1R15Bが有効な治療標的であること、したがって、PPP1R15B阻害が疾患の処置および予防において有用であることを示す。
CMTは、いくつかの遺伝子中の変異によって引き起こされるミエリンニューロパシーのグループである。末梢性ミエリンタンパク質PMP22中の変異は、CMTの最も共通する原因である。PMP22(Trembler−J)中の変異は、PMP22のミスフォールディングを引き起こし、末梢神経系中のミエリンにおける欠陥に起因して、マウスにおいてヒトにおけるCMTに似た疾患を引き起こす。PMP22変異体マウスからの外植片は、ヒト疾患において観察される重篤なミエリン形成不全を繰り返す。本発明者らは、PMP22変異体マウスからの後根神経節培養物(DRG)の処置が、ミエリン形成を改善することを見出した。変異体マウスからのDRG培養物が、化合物の治療有効性を予想するための有用なモデルであることが以前に見出された。したがって、本明細書において提示されるデータは、実施例1の化合物が、CMT疾患などのPMP22の変異または過剰産生によって引き起こされる疾患を処置するために有用であることを実証する。実施例1の化合物はまた、他のミエリン障害の処置において有用である。
代謝疾患、例えば、糖尿病、肥満、肝脂肪疾患、およびアテローム性動脈硬化症が、病理学的なERストレスに関連することが公知であり、UPRの薬理学的なモジュレーターが、治療の利益を有し得ることが考えられる。本研究の前には利用可能なPPP1R15B阻害剤は存在しなかったので、PPP1R15Bが代謝疾患における治療標的であり得るかについては不確かであった。本発明者らはこの可能性を試験して、実施例1の化合物での肥満マウスの処置が、これらの哺乳動物において病理学的な高い血液グルコースを低減させることを見出した(図11)。これにより、実施例1の化合物での処置が、代謝性障害を改善できることが示される。
可逆的なリン酸化により、大部分のタンパク質の活性が制御される。セリン/トレオニンホスファターゼの阻害剤はわずかが予期せず発見されただけであるので、この大きいファミリーの酵素は依然として薬として開発することが困難であると考えられる。本明細書において本発明者らは、表面プラズモン共鳴を使用して、タンパク質ホスファターゼ1の調節サブユニットである、PPP1R15Bの選択的な阻害剤である、TST3(実施例1に記される化合物)の合理的な発見を可能にする方法を設計した。PPP1R15Bの選択的な阻害により、そのリン酸化基質である、翻訳開始因子2(eIF2α)のαサブユニットの急速かつ一過性の蓄積が引き起こされた。これにより、本発明者らが、典型的なタンパク質ミスフォールディング疾患である、ハンチントン病のマウスモデルにおける行動性および分子の欠陥を安全に予防するために治療的に活用した特性である、タンパク質合成の急速かつ一過性の減弱がもたらされた。これにより、セリン/トレオニンホスファターゼの内因的に無秩序である調節サブユニットが、有効で取り扱いやすい薬物標的であり、それらの選択的な阻害剤を同定する一般化可能な方法を提供することが確立される。
細胞において、ホスファターゼの調節サブユニットは、PP1cとの結合に際してフォールドし(9)、ホロホスファターゼが、関連性のあるアッセイを設計するため必要とされ得ることを示唆する。本発明者らは、GBZ(7)およびSephin1(8)に結合することが公知である、インビボビオチン化(biotynilated)PP1cおよび大きいR15A断片(アミノ酸325〜636)を使用して組換えR15A−PP1cを再構成した。R15A−PP1c複合体を、ニュートラアビジン樹脂における親和性捕捉によって精製した(図15)。同様に、パラロガスなホロホスファターゼR15B−PP1cを、精製した(図15)。R15AおよびR15Bは機能上関連するが、非常に異なる配列を有する(図16)ことが留意される。R15−PP1cホロホスファターゼを、SPRストレプトアビジンセンサーチップに2つのステップで次に固定化した(図17)。GBZおよびSephin1がR15A−PP1cに強く結合するが、R15B−PP1c(図18〜22)には結合しないかまたは弱く結合し、PP1c単独(図18〜22)には結合しないことをSPR実験は示し、それらのR15Aに対する選択性が確認された。R15A−PP1cに対するGBZおよびSephin1の測定された定常状態の親和性(それぞれ0.122μMおよび0.786μM)は、細胞に基づくアッセイ(7)およびインビボ(8)において阻害剤のマイクロモル未満の作用強度と矛盾しなかった。したがって、組換えホロホスファターゼで実施されたSPR実験により、関連性のある公知の阻害剤とR15Aとの結合親和性を測定する定量的な方法が提供される。
タンパク質発現および精製
MBP−R15A325−636−HisおよびMBP−R15B340−698−Hisを、発現させ、前の記載(Dasら(2015)Science 348、239−242)の通り精製した。ヒトPP1γをコードするcDNAを、バキュロウイルストランスファーベクターpDW464にクローニングしてN末端ビオチンアクセプターペプチド(BAP)を付加した。ベクターは、大腸菌ビオチンホロ酵素合成酵素(BirA)もコードするため、BAP−タグ化タンパク質をSpodoptere frugiperda(Sf9)昆虫細胞中でインビボでビオチン化(bio−PP1c)することができる(Duffyら(1998)Anal.Biochem.262、122〜128)。Bac−to−Bacバキュロウイルス発現システム(Thermo Fisher Scientific)を使用して組換えバクミドDNAを生成し、Sf9昆虫細胞を使用してウイルスストックを増幅した。タンパク質を、Insect−Xpress培地(Lonza)中でSf9昆虫細胞を使用して産生した。bio−PP1を、HiTrap Q HPカラム(GE Healthcare)において陰イオン交換クロマトグラフィー(chromotography)、続いてゲル濾過(HiLoad 16/600 Superdex 200カラム、GE Healthcare)によって精製した。タンパク質を、BOLT SDS−PAGE 4〜12%Bis−Trisゲル(Thermo Fisher Scientific)で分析し、InstantBlue(Expedeon)で染色し、ビオチン化PP1の存在をPierce High Sensitivity Streptavidin−HRP抗体(Thermo Fisher Scientific)を使用したウエスタンブロットによって確認した。これは部分的に純粋なタンパク質をもたらし、完全な精製は、ビオチンとストレプトアビジンの高親和性および特異性に起因して後の段階で達した(SPRチップにおいて)。
部分的に精製したbio−PP1c(100μl)を、ニュートラアビジンアガロースビーズ(Thermo Fisher Scientific)に、2時間、4℃で振盪してIP緩衝剤(50mM Tris pH7.5、100mM NaCl、0.1mM EGTA、0.05%Tween20、0.1%NP40)中でインキュベートした。ビーズを、次に3回IP緩衝剤で洗浄し、10μM R15(AまたはB)の存在下または非存在下で一晩4℃で振盪してIP緩衝剤中でインキュベートした。ビーズを、次に3回IP緩衝剤で洗浄し、結合したタンパク質を60μlのLaemmli緩衝剤中でボイルすることによって溶出した。結合したタンパク質を、次にBOLT SDS−PAGE 4〜12%Bis−Trisゲル(Thermo Fisher Scientific)で分析し、InstantBlue(Expedeon)で染色し、ビオチン化PP1cの存在をPierce High Sensitivity Streptavidin−HRP抗体(Thermo Fisher Scientific)を使用したウエスタンブロットによって確認した。
SAセンサーチップにおけるbio−GBZまたはbio−PP1cの捕捉
Biacore T200(GE Healthcare)システムを全ての実験に使用し、ビオチン化GBZ(bio−GBZ)(Tsaylter 2011)またはbio−PP1をセンサーチップSA(GE Healthcare)に捕捉した。ストレプトアビジンでコーティングした表面を、50mM NaOHおよび1M NaClの溶液での3回、流速10μl/分での1分間注入によって活性化した。bio−GBZまたはbio−PP1cを、ランニング緩衝剤(50mM Tris pH7.5、100mM NaCl、0.1mM EGTA、0.05%Tween20、0.1%DMSO)で希釈し、およそ300nM濃度で流速10μl/分で直接的にストレプトアビジンでコーティングした表面に注入して、それぞれ約200および6000RUに相当するbio−GBZまたはbio−PP1cの固定化レベルに達した。ブランク固定化を、参照として使用するため、SAセンサーチップ表面の1つについて実施した。
軽微な偏りはあるが、同じ手順および条件を全ての結合実験に使用した。小分子を、100%DMSO中に50mM貯蔵溶液として貯蔵した。結合定数の決定の前、化合物の12または8つの濃度のいずれかの連続希釈を、96ウェルプレートのランニング緩衝剤中に調製した。各々の化合物希釈系列より前に、調節サブユニットMBP−R15A325−636−HisまたはMBP−R15B340−698−Hisを、ランニング緩衝剤で10μMに希釈し、流速30μl/分で1分間bio−PP1c表面に捕捉し、ホロホスファターゼ複合体をセンサーチップ表面に形成させた。これを、続いて1分間の安定化期間をおき、任意の非特異的な結合物を洗い流した。次いで、表面を再生することなく、化合物希釈系列を、チップの表面に流速30μl/分で1分間注入し、続いて2分間の解離時間をおいた。各々の希釈系列の後に、表面を3M NaClを使用して90秒間再生した。再生後、SPR応答は一般的には基礎レベルに戻り、bio−PP1c表面は次の化合物希釈系列のために整えられた。サンプル間のDMSO濃度における小さな変動を補正可能にするために、0.06〜8%DMSOの範囲の8つの溶媒サンプルを50サイクルごとに注入した。フローセル温度は、10℃であった。
センサーグラムをBiacore T200査定ソフトウェアを使用して分析し、結合定数を定常状態モデルに基づいて決定した。速度実験は異なる濃度の化合物を使用して行い、それらそれぞれの平衡結合レベルを決定した。これらの平衡応答レベル(Req)は、濃度に対してプロットされ、グローバルフィットを使用してフィッティングされ、これにより定常状態親和性定数を決定できる(すなわち、50%飽和での濃度がKDである)。KD値(上記のFrostell−Karlsson(2000))を表1に示す。
精製されたPP1c(30nM)を、示される濃度のカリクリンA、GBZ、Sal003、Sephin1およびTST3を含む50mM Tris pH7、1.5mM EGTA、3mM MnCl2、0.01%Brij−35、0.15%β−メルカプトエタノールで30分間4℃でインキュベートした。PP1cの残効性を、次に供給者の指示に従ってEnzChekホスファターゼアッセイキット(Thermo Fisher Scientific)を使用して測定した。
HeLa細胞を、ペニシリン、ストレプトマイシン、グルタミンおよび10%ウシ胎児血清(FBS)を補充したダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)中で維持した。Ppp1r15a−/−およびPpp1r15b−/−MEF細胞を、ペニシリン、ストレプトマイシン、グルタミン、55μM β−メルカプトエタノール、1X非必須アミノ酸(Sigma)および10%FBSを補充したDMEM中で維持した。
細胞(細胞90,000個/ml)を、24ウェルプレートにプレーティングし、示される通り処置した。処置の終了時、細胞を、150μl Laemmli緩衝剤中で溶解した。溶解物を、95℃で5分間ボイルし、超音波処理し、4〜12%Bolt Bis−Tris Plus Gels(Thermo Fisher Scientific)で分離した。タンパク質を、iBlot2系(Thermo Fisher Scientific)を使用してニトロセルロース膜に移し、以下の抗体を使用して分析した:e−IF2α−P(44−728G、Thermo Fisher Scientific、1:1000)、e−IF2α(ab5369、Abcam、1:1000)、チューブリン(T5168、Sigma−Aldrich、1:4000)、BiP(610978、BD Biosciences Pharmingen、1:1000)、ATF4(sc−200、Santa Cruzバイオテクノロジー、1:500)、Ppp1r15a(10449−1−AP、Proteintech、1:1000)およびPpp1r15b(14634−1−AP、Proteintech、1:1000)。タンパク質を、ECL Prime(GE Healthcare)を使用して視覚化した。
細胞(細胞90,000個/ml)を、12ウェルプレートにプレーティングし、示される通り処置し、100μCi/ml 35S−メチオニン(Hartmann Analytic)で10分間37℃で標識し、氷冷PBSで洗浄し、120μl Laemmli緩衝剤中で溶解した。溶解物を、95℃で5分間ボイルし、超音波処理し、4〜12%Bolt Bis−Tris Plus Gels(Thermo Fisher Scientific)で分離した。次いで、ゲルを、InstantBlue(Expedeon)で染色し、蛍光イメージングによって分析した。
全ての動物ケアおよび手順を、地域の倫理的な承認を受けた研究における動物の使用における規則(1986の英国動物科学的処置法およびEU指令2010/63/EU)に準拠して実施した。
C57BL/6J雄性マウスを、The Jackson LaboratoryまたはCharles Riverから得た。HD−N171−82Q(HD)トランスジェニックマウスを、The Jackson Laboratoryから得て、混合したバックグラウンド(C3H/B6)で維持した。
全てのマウスを、食物および水を自由に摂取させ、換気ケージ中で個別に、群(1ケージ当たり2〜3)で収容し、12時間の明/暗サイクル(7am〜7pm)で維持した。
TST3またはGBZの酢酸塩を、水に溶解し、10分間超音波処理した。溶液を、等分し、使用時まで−20℃で維持した。解凍したら、チューブを、4℃で保持し、24時間内に使用した。
TST3またはGBZを、(別段の定めがない限り)経口での強制飼養で2mg/kgで投与した。マウスは、一日当たり一回、単一用量を受けたかまたは長期にわたり処置された。
実験群を作るため、HD−N171−82Qトランスジェニック雄を、C3H/B6 F1野生型雌と交配した。4週齢のトランスジェニック雄およびそれらの野生型同腹仔雄対照を、異なる群に無作為化し、TST3で4週間処置した。
薬物動態試験を、XenoGesisによって実施した。TST3を、C57BL/6J雄に経口的に投与した。血漿サンプルを、内部標準を含有するメタノールでのタンパク質沈殿によって調製した。組織を、秤量し、均質化(リン酸緩衝生理食塩水中1:3)によって調製し、内部標準を含有するメタノールでタンパク質沈殿させた。メタノールの添加後、血漿および組織サンプルを、−20℃で>1時間(または一晩)置いてタンパク質を沈殿させた。サンプルを、次に2,500×g(3,400rpm)で20分間4℃で遠心分離した。上清を、LC−MS/MSによって分析した。
HD−N171−82Qトランスジェニック雄およびこれらの野生型同腹仔雄対照のTST3処置を、4週齢から開始し、試験前4週間続けた。慣れさせる段階の間、マウスを、静止したロッドに1分間配置し、次に1分間固定速度4rpmで訓練した。慣れさせる段階を、反復した。ロータロッド試験を、3回の試行で実施した。各々の試行でマウスを4〜40rpmで加速させたロッド上で300秒間まで走らせ、落下するまでの反応時間を計数した。提示されるものは、3回の試行の平均である。
処置のGBZ様副作用(アドレナリン作動性活性に起因)を評価するために、マウスの運動能力を、TST3の単回投与後にモニターした。この終了時に、マウスを、TST3で処置し、ケージ中に60分間静置させた。マウスの行動を、15分間ごとにモニターした。同様に、GBZで処置したマウスを、対照として使用した。
比較を、スチューデントt検定または二元配置分散分析(ANOVA)を使用して行った。有意な差は、対応する図中に示される。
合成手順:
メタノール(220ml)中の2,3−ジクロロベンズアルデヒド(22.00g、0.12570mol)および重炭酸アミノグアニジン(17.1g、0.12570mol)の懸濁液に、25℃で酢酸(22ml)を添加した。得られた反応混合物を、70℃で次の約30分間加熱した。加熱に際して、懸濁液は透明になった。反応完了を、ジクロロメタン/メタノール(8/2)を移動相として使用したTLCでモニターした。反応の完了後、反応混合物を、25℃に冷却させ、真空下で濃縮した。得られた残留物をジエチルエーテル(100ml)に懸濁し、得られた産物を濾過によって収集した。このプロセスを、3回反復した。上記プロセスの終了時に、本発明者らは、所望の(E)−2−(2,3−ジクロロベンジリデン)ヒドラジン−1−カルボキシイミドアミド(「TST3)を得ることができた。LC−MS:m/z=231.23(M+H)。得られた産物を、1H−NMR、13C−NMR、電位差滴定、HPLCおよびCHN分析によっても分析した。
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Claims (27)
- 試験化合物をスクリーニングして、化合物が、ホロホスファターゼに選択的にまたは非選択的に結合するかどうかを決定するための方法であって:
i)捕捉/固定化されている第1のホロホスファターゼを提供するステップと;
ii)試験化合物を第1のホロホスファターゼに結合するその能力に関して試験するステップと;
iii)捕捉/固定化されている第2のホロホスファターゼを提供するステップと;
iv)同じ試験化合物を第2のホロホスファターゼに結合するその能力に関して試験するステップと;
v)試験化合物の前記第1のホロホスファターゼとの結合と前記第2のホスファターゼとの結合を比較するステップと
を含み、
ホロホスファターゼに結合する化合物が、前記第1のホロホスファターゼに選択的に結合するが、前記第2のホスファターゼに結合せず;または、前記第2のホロホスファターゼに結合するが、前記第1に結合せず;またはホロホスファターゼに結合する化合物が、前記第1のホロホスファターゼおよび前記第2のホロホスファターゼの両方に非選択的に結合する、方法。 - 前記第1および/または前記第2のホロホスファターゼが、触媒および1つまたは複数の調節サブユニットから構成されるオリゴマー酵素である、請求項1に記載の方法。
- ホロホスファターゼが、単離され、精製される、請求項1または2に記載の方法。
- 前記第1および/または第2のホロホスファターゼの調節および/または触媒サブユニットが、2つのタグとともに発現され、2つのステップの手順において精製を促進する、請求項3に記載の方法。
- ホロホスファターゼの調節サブユニットが、切断形態である、請求項1から4のいずれか一項に記載の方法。
- ホロホスファターゼが、再構成される、請求項1から5のいずれか一項に記載の方法。
- 試験化合物を結合するその能力に関して試験する前記ステップが、表面プラズモン共鳴(SPR)アプローチを使用して結合親和性を決定することによる、請求項1から6のいずれか一項に記載の方法。
- ホロホスファターゼが、表面に固定化されている、請求項1から7のいずれか一項に記載の方法。
- 前記ホロホスファターゼが、前記第1または第2の調節サブユニットを添加するステップ前に、最初に表面に触媒サブユニットを捕捉するステップによって再構成される、請求項8に記載の方法。
- 表面が、SPR分析に適するチップである、請求項8または9に記載の方法。
- ホロホスファターゼが、親和性捕捉方法を使用して固定化されている、請求項8から10のいずれか一項に記載の方法。
- 親和性捕捉方法が、ビオチン:ストレプトアビジンを使用することである、請求項11に記載の方法。
- 前記第1または第2のホロホスファターゼの調節サブユニットが、R15Aである、請求項1から12のいずれか一項に記載の方法。
- 前記第1または第2のホロホスファターゼの調節サブユニットが、R15Bである、請求項1から12のいずれか一項に記載の方法。
- 前記1つまたは複数の触媒サブユニットが、PP1cである、請求項1から14のいずれか一項に記載の方法。
- 触媒サブユニットPP1cが、チップに最初に固定化され、次にそれは調節サブユニットに結合される、請求項15に記載の方法。
- vi)触媒サブユニットが捕捉/固定化されている前記第1および第2のホロホスファターゼの触媒サブユニットを提供するステップと;
vii)前記候補ホスファターゼ阻害剤分子を、触媒サブユニットに結合するその能力に関して試験するステップと
をさらに含む、請求項1から16のいずれか一項に記載の方法。 - 検証アッセイにおいて候補ホスファターゼ阻害剤として試験化合物の活性を確認するステップをさらに含む、請求項1から17のいずれか一項に記載の方法。
- 請求項1から18のいずれか一項に記載のスクリーニングの方法における使用のためのキット。
- 第1の表面に捕捉される第1のホロホスファターゼおよび第2の表面に捕捉される第2のホロホスファターゼを含む、請求項20に記載のキット。
- 前記第1および/または第2の表面が、SPRに適するチップである、請求項21に記載のキット。
- PPP1R115B選択的な阻害剤である、(E)−2−(2,3−ジクロロベンジリデン)ヒドラジン−1−カルボキシイミドアミドを含む組成物。
- PPP1R115B選択的な阻害剤である、(E)−2−(2,3−ジクロロベンジリデン)ヒドラジン−1−カルボキシイミドアミドを含む医薬組成物。
- ミスフォールドしたタンパク質の蓄積またはプロテオスタシス障害に関連する障害における使用のための、請求項24または25に記載の組成物。
- 障害がハンチントン病である、請求項26に記載の組成物。
- 対象に、治療有効量のPPP1R115B選択的な阻害剤である、(E)−2−(2,3−ジクロロベンジリデン)ヒドラジン−1−カルボキシイミドアミドを投与するステップを含む、ミスフォールドしたタンパク質の蓄積またはプロテオスタシス障害に関連する障害を有する対象を処置する方法。
- ミスフォールドしたタンパク質の蓄積またはプロテオスタシス障害に関連する障害の処置における使用のための医薬の製造における、PPP1R115B選択的な阻害剤である、(E)−2−(2,3−ジクロロベンジリデン)ヒドラジン−1−カルボキシイミドアミドの使用。
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