JP2018508532A5 - - Google Patents

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本発明の他の目的、特色および利点は、次の詳細な説明から明らかである。しかし、本発明の精神および範囲内の様々な変更および修正が、この詳細な説明から当業者に明らかであり得るため、詳細な説明および具体例は、本発明の好ましい実施形態を示しているが、単なる例示として提示されていることを理解されたい。
特定の実施形態において、例えば、以下が提供される:
(項目1)
がんを有する患者の処置における使用のための組成物であって、該がんの細胞が、(i)TP53遺伝子のヘミ接合性喪失;(ii)POLR2A遺伝子のヘミ接合性喪失;または(iii)参照発現レベルと比べたPOLR2A遺伝子産物の発現のレベル減少を示し、該組成物が治療有効量のPOLR2A阻害剤を含む、組成物。
(項目2)
前記POLR2A阻害剤が、POLR2Aタンパク質の発現を阻害する核酸を含む、項目1に記載の組成物。
(項目3)
前記POLR2A阻害剤が、アマトキシンを含む、項目1に記載の組成物。
(項目4)
前記アマトキシンが、アルファ−アマニチンである、項目3に記載の組成物。
(項目5)
前記アマトキシンが、抗体にコンジュゲートされている、項目3に記載の組成物。
(項目6)
前記抗体が、抗EpCAM抗体である、項目5に記載の組成物。
(項目7)
前記抗体が、腫瘍関連抗原に特異的に結合する、項目5に記載の組成物。
(項目8)
前記POLR2A遺伝子産物が、mRNAである、項目1に記載の組成物。
(項目9)
前記mRNAの発現のレベルが、ノーザンブロッティング、逆転写定量的リアルタイムPCR(RT−qPCR)、ヌクレアーゼプロテクション、トランスクリプトーム解析、ハイブリダイゼーションアッセイ、チップに基づく発現プラットフォームまたはインベーダーRNAアッセイプラットフォームによって決定される、項目8に記載の組成物。
(項目10)
前記POLR2A遺伝子産物が、タンパク質である、項目1に記載の組成物。
(項目11)
前記タンパク質の発現のレベルが、質量分析、ウエスタンブロット、ELISA、免疫沈降、免疫組織化学的検査またはラジオイムノアッセイによって決定される、項目10に記載の組成物。
(項目12)
前記参照発現レベルが、非がん性細胞における発現レベルである、項目1に記載の組成物。
(項目13)
前記TP53遺伝子の前記ヘミ接合性喪失または前記POLR2A遺伝子の前記ヘミ接合性喪失が、ゲノムハイブリダイゼーション技法、PCR解析または制限断片解析によって決定される、項目1に記載の組成物。
(項目14)
前記がん細胞が、前記TP53遺伝子のヘミ接合性喪失を示す、項目1に記載の組成物。
(項目15)
前記がん細胞が、前記POLR2A遺伝子のヘミ接合性喪失を示す、項目1に記載の組成物。
(項目16)
前記患者が、参照発現レベルと比べたPOLR2A遺伝子産物の発現のレベル減少を示すがん細胞を有する、項目1に記載の組成物。
(項目17)
前記がん細胞が、肺がん細胞、脳がん細胞、乳がん細胞、肝臓がん細胞、卵巣がん細胞
、結腸直腸がん細胞、前立腺がん細胞または膵臓がん細胞である、項目1に記載の組成物。
(項目18)
前記がん細胞が、転移性、再発性または多剤耐性である、項目1に記載の組成物。
(項目19)
少なくとも第2の抗がん療法薬をさらに含む、項目1に記載の組成物。
(項目20)
前記第2の抗がん療法薬が、化学療法剤である、項目19に記載の組成物。
(項目21)
前記化学療法剤が、5−フルオロウラシル、オキサリプラチンまたはSN−38である、項目20に記載の組成物。
(項目22)
前記患者が、ヒトである、項目1に記載の組成物。
(項目23)
前記患者が、非ヒト哺乳動物である、項目1に記載の組成物。
(項目24)
前記患者が、少なくとも1ラウンドの抗がん療法を以前に受けたことがある、項目1に記載の組成物。
(項目25)
(i)TP53遺伝子のヘミ接合性喪失;(ii)POLR2A遺伝子のヘミ接合性喪失;または(iii)参照発現レベルと比べたPOLR2A遺伝子産物の発現のレベル減少を示すがん細胞を有する患者を処置する方法であって、治療有効量のPOLR2A阻害剤をかかる患者に投与するステップを含む方法。
(項目26)
前記患者が、少なくとも再度処置される、項目25に記載の方法。
(項目27)
前記患者が、1週間〜6ヶ月間の期間にわたって処置される、項目26に記載の方法。
(項目28)
少なくとも第2の抗がん療法を前記被験体に投与するステップをさらに含む、項目25に記載の方法。
(項目29)
前記第2の抗がん療法が、外科的療法、化学療法、放射線療法、寒冷療法、ホルモン療法、毒素療法、免疫療法またはサイトカイン療法である、項目28に記載の方法。
(項目30)
前記化学療法が、5−フルオロウラシル、オキサリプラチンまたはSN−38である、項目29に記載の方法。
(項目31)
がんを有する患者を処置する方法であって、
(a)(i)TP53遺伝子のヘミ接合性喪失;(ii)POLR2A遺伝子のヘミ接合性喪失;または(iii)参照レベルと比べたPOLR2A遺伝子産物の発現のレベル減少を含むがん細胞を有すると決定された患者を選択するステップと、
(b)治療有効量のPOLR2A阻害剤を該患者に投与するステップと
を含む方法。
(項目32)
POLR2A阻害剤による処置のための患者を選択するin vitro方法であって、該患者由来のがん細胞が、(i)TP53遺伝子のヘミ接合性喪失;(ii)POLR2A遺伝子のヘミ接合性喪失;または(iii)参照レベルと比べたPOLR2A遺伝子産物の発現のレベル減少を含むかどうかを決定するステップを含むin vitro方法。
(項目33)
患者を選択するステップが、前記がんの試料を得るステップと、該がんの細胞が、(i)前記TP53遺伝子のヘミ接合性喪失;(ii)前記POLR2A遺伝子のヘミ接合性喪失;または(iii)参照レベルと比べたPOLR2A遺伝子産物の発現のレベル減少を含むかどうかを決定するステップとを含む、項目32に記載の方法。
(項目34)
前記決定するステップに関する報告を提供するステップをさらに含む、項目33に記載の方法。
(項目35)
前記報告が、書面または電子の報告である、項目34に記載の方法。
(項目36)
前記報告が、前記患者、医療費支払者、医師、保険代理人または電子システムに提供される、項目34に記載の方法。
(項目37)
患者を選択するステップが、前記がんの細胞が、(i)前記TP53遺伝子のヘミ接合性喪失;(ii)前記POLR2A遺伝子のヘミ接合性喪失;または(iii)参照レベルと比べたPOLR2A遺伝子産物の発現のレベル減少を含むかどうかを決定する検査の結果を得るステップを含む、項目32に記載の方法。
(項目38)
前記がん細胞が、前記TP53遺伝子のヘミ接合性喪失を含むかどうかを決定するステップを含む、項目32に記載の方法。
(項目39)
前記がん細胞が、前記POLR2A遺伝子のヘミ接合性喪失を含むかどうかを決定するステップを含む、項目32に記載の方法。
(項目40)
前記がん細胞が、参照レベルと比べたPOLR2A遺伝子産物の発現のレベル減少を含むかどうかを決定するステップを含む、項目32に記載の方法。
(項目41)
がん患者のための薬物療法を選択するin vitro方法であって、
(a)該がんの試料を得るステップと、
(b)該がんの細胞における(i)TP53遺伝子のヘミ接合性喪失;(ii)POLR2A遺伝子のヘミ接合性喪失;または(iii)参照レベルと比べたPOLR2A遺伝子産物の発現のレベル減少の存在を検出するステップと、
(c)該がんの細胞において(i)該TP53遺伝子のヘミ接合性喪失が検出される;(ii)該POLR2A遺伝子のヘミ接合性喪失が検出される;または(iii)参照レベルと比べたPOLR2A遺伝子産物の発現のレベル減少が検出される場合、POLR2A阻害剤を選択するステップと
を含むin vitro方法。
(項目42)
治療有効量のPOLR2A阻害剤を前記患者に投与するステップをさらに含む、項目41に記載の方法。
(項目43)
前記がんの細胞が、前記TP53遺伝子のヘミ接合性喪失を含む、項目41に記載の方法。
(項目44)
前記がんの細胞が、前記POLR2A遺伝子のヘミ接合性喪失を含む、項目41に記載の方法。
(項目45)
前記がんの細胞が、参照レベルと比べたPOLR2A遺伝子産物の発現のレベル減少を含む、項目41に記載の方法。
(項目46)
被験体におけるがんの処置における使用のためのPOLR2A阻害剤を含む組成物であって、該がんの細胞が、(i)TP53遺伝子のヘミ接合性喪失;(ii)POLR2A遺伝子のヘミ接合性喪失;または(iii)参照レベルと比べたPOLR2A遺伝子産物の発現のレベル減少を含むことが決定されている、組成物。
(項目47)
がんの処置のための医薬の製造におけるPOLR2A阻害剤の使用であって、該がんの細胞が、(i)TP53遺伝子のヘミ接合性喪失;(ii)POLR2A遺伝子のヘミ接合性喪失;または(iii)参照レベルと比べたPOLR2A遺伝子産物の発現のレベル減少を含むことが決定されている、使用。

Claims (21)

  1. がんを有する患者の処置における使用のための組成物であって、該がんの細胞が、(i)TP53遺伝子のヘミ接合性喪失;(ii)POLR2A遺伝子のヘミ接合性喪失;または(iii)参照発現レベルと比べたPOLR2A遺伝子産物の発現のレベル減少を示し、該組成物が治療有効量のPOLR2A阻害剤を含み、該POLR2A阻害剤が、アマトキシンを含み、該アマトキシンが、腫瘍関連抗原に特異的に結合する抗体にコンジュゲートされている、組成物。
  2. 前記POLR2A阻害剤が、POLR2Aタンパク質の発現を阻害する核酸を含む、請求項1に記載の組成物。
  3. 前記抗体が、抗EpCAM抗体である、請求項1または2のいずれかに記載の組成物。
  4. 前記POLR2A遺伝子産物が、mRNAであり、該mRNAの発現のレベルが、ノーザンブロッティング、逆転写定量的リアルタイムPCR(RT−qPCR)、ヌクレアーゼプロテクション、トランスクリプトーム解析、ハイブリダイゼーションアッセイ、チップに基づく発現プラットフォームまたはインベーダーRNAアッセイプラットフォームによって決定され得るか、または、
    前記POLR2A遺伝子産物が、タンパク質であり、該タンパク質の発現のレベルが、質量分析、ウエスタンブロット、ELISA、免疫沈降、免疫組織化学的検査またはラジオイムノアッセイによって決定され得る、請求項1〜3のいずれかに記載の組成物。
  5. 前記参照発現レベルが、非がん性細胞における発現レベルである、請求項1〜4のいずれかに記載の組成物。
  6. 前記TP53遺伝子の前記ヘミ接合性喪失または前記POLR2A遺伝子の前記ヘミ接合性喪失が、ゲノムハイブリダイゼーション技法、PCR解析または制限断片解析によって決定される、請求項1〜5のいずれかに記載の組成物。
  7. 前記がん細胞が、肺がん細胞、脳がん細胞、乳がん細胞、肝臓がん細胞、卵巣がん細胞、結腸直腸がん細胞、前立腺がん細胞または膵臓がん細胞である、ならびに/あるいは
    前記がん細胞が、転移性、再発性または多剤耐性である、請求項1〜6のいずれかに記載の組成物。
  8. 少なくとも第2の抗がん療法薬、好ましくは、化学療法剤、最も好ましくは、5−フルオロウラシル、オキサリプラチンまたはSN−38をさらに含む、請求項1〜7のいずれかに記載の組成物。
  9. 前記患者が、ヒトまたは非ヒト哺乳動物である、請求項1〜8のいずれかに記載の組成物。
  10. 前記患者が、少なくとも1ラウンドの抗がん療法を以前に受けたことがある、請求項1〜9のいずれかに記載の組成物。
  11. がんを有する患者を処置するための組成物であって、該組成物は、POLR2A阻害剤を含み、該患者は、(i)TP53遺伝子のヘミ接合性喪失;(ii)POLR2A遺伝子のヘミ接合性喪失;または(iii)参照レベルと比べたPOLR2A遺伝子産物の発現のレベル減少を含むがん細胞を有すると決定されており
    該組成物は、POLR2A阻害剤の治療有効量で、該患者に投与されることを特徴とし、該POLR2A阻害剤が、アマトキシンを含み、該アマトキシンが、腫瘍関連抗原に特異的に結合する抗体にコンジュゲートされている、組成物
  12. (i)TP53遺伝子のヘミ接合性喪失;(ii)POLR2A遺伝子のヘミ接合性喪失;または(iii)参照レベルと比べたPOLR2A遺伝子産物の発現のレベル減少を、POLR2A阻害剤による処置のための患者選択の指標とするin vitro方法であって、該患者由来のがん細胞が、(i)TP53遺伝子のヘミ接合性喪失;(ii)POLR2A遺伝子のヘミ接合性喪失;または(iii)参照レベルと比べたPOLR2A遺伝子産物の発現のレベル減少を含むかどうかを決定するステップを含み、該POLR2A阻害剤が、アマトキシンを含み、該アマトキシンが、腫瘍関連抗原に特異的に結合する抗体にコンジュゲートされている、in vitro方法。
  13. 前記決定するステップに関する報告、好ましくは、書面または電子の報告を提供するステップをさらに含み、好ましくは、前記報告が、前記患者、医療費支払者、医師、保険代理人または電子システムに提供される、請求項12に記載の方法。
  14. 前記方法が、前記がんの細胞が、(i)前記TP53遺伝子のヘミ接合性喪失;(ii)前記POLR2A遺伝子のヘミ接合性喪失;または(iii)参照レベルと比べたPOLR2A遺伝子産物の発現のレベル減少を含むかどうかを決定する検査の結果を得るステップを含む、請求項12〜13のいずれかに記載の方法。
  15. (i)TP53遺伝子のヘミ接合性喪失;(ii)POLR2A遺伝子のヘミ接合性喪失;または(iii)参照レベルと比べたPOLR2A遺伝子産物の発現のレベル減少の存在を、がん患者のための薬物療法選択の指標とするin vitro方法であって、
    がんの細胞における(i)TP53遺伝子のヘミ接合性喪失;(ii)POLR2A遺伝子のヘミ接合性喪失;または(iii)参照レベルと比べたPOLR2A遺伝子産物の発現のレベル減少の存在を検出するステップを含み
    がんの細胞において(i)該TP53遺伝子のヘミ接合性喪失が検出される;(ii)該POLR2A遺伝子のヘミ接合性喪失が検出される;または(iii)参照レベルと比べたPOLR2A遺伝子産物の発現のレベル減少が検出される場合、そのことは、薬物療法としてPOLR2A阻害剤選択されることを示すことを特徴とし、
    該POLR2A阻害剤が、アマトキシンを含み、該アマトキシンが、腫瘍関連抗原に特異的に結合する抗体にコンジュゲートされている、in vitro方法。
  16. 前記方法は、治療有効量の前記POLR2A阻害剤前記患者に投与されることを示すことを特徴とする、請求項15に記載の方法。
  17. 被験体におけるがんの処置における使用のためのPOLR2A阻害剤を含む組成物であって、該がんの細胞が、(i)TP53遺伝子のヘミ接合性喪失;(ii)POLR2A遺伝子のヘミ接合性喪失;または(iii)参照レベルと比べたPOLR2A遺伝子産物の発現のレベル減少を含むことが決定されており、該POLR2A阻害剤が、アマトキシンを含み、該アマトキシンが、腫瘍関連抗原に特異的に結合する抗体にコンジュゲートされている、組成物。
  18. がんの処置のための医薬の製造におけるPOLR2A阻害剤の使用であって、該がんの細胞が、(i)TP53遺伝子のヘミ接合性喪失;(ii)POLR2A遺伝子のヘミ接合性喪失;または(iii)参照レベルと比べたPOLR2A遺伝子産物の発現のレベル減少を含むことが決定されており、該POLR2A阻害剤が、アマトキシンを含み、該アマトキシンが、腫瘍関連抗原に特異的に結合する抗体にコンジュゲートされている、使用。
  19. 請求項15〜16のいずれかに記載の方法を実施するためのキットであって、POLR2A mRNAまたはタンパク質遺伝子産物の発現のレベルを決定するためのキットである、キット。
  20. 前記キットが、ノーザンブロッティング、逆転写定量的リアルタイムPCR(RT−qPCR)、ヌクレアーゼプロテクション、トランスクリプトーム解析、ハイブリダイゼーションアッセイ、チップに基づく発現プラットフォームまたはインベーダーRNAアッセイ、質量分析、ウエスタンブロット、ELISA、免疫沈降、免疫組織化学的検査またはラジオイムノアッセイからなる方法の群のうちの少なくとも1つを実施するために役立つ、請求項19に記載のキット。
  21. POLR2Aについての少なくとも1つの核酸プローブまたは少なくとも1つの抗体を含む、請求項20に記載のキット。
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