JP2018100274A - Mcm複合体の形成を阻害する方法および抗ガン化合物についてスクリーニングする方法 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は米国仮特許出願第61/644,442号(2012年5月9日出願;その内容がその全体において参照によって本明細書中に組み込まれる)からの利益を主張する。
本発明は、MCM複合体(6個のサブユニットから形成されるヘテロヘキサマー環状体)の機能性をDNA複製の過程において阻害することができる作用因を使用することによってガンを処置するための方法に関連し、また、さらには、候補化合物で処理される細胞におけるMCMサブユニット(例えば、hMcm2およびhMcm6など)の所在および機能を検出することによってそのような作用因についてスクリーニングする方法に関連する。
式中、R1はHであるか、あるいは、1つまたは複数の糖ユニットによって置換される;R2はベータ型立体配置での5員環基または6員環基である;R3およびR4はそれぞれがHまたはOHであるか、あるいは、R3およびR4は、R3およびR4がそれぞれ、それぞれ結合する2個のC原子との3員環を形成するただ1つのO原子である;R5はOHであり、かつ、R6はHであるか、あるいは、R5およびR6は、R5およびR6がそれぞれ、それぞれ結合する2個のC原子との3員環を形成するただ1つのO原子である。
ヒトMcm6およびヒトMcm2のcDNAフラグメントをそれぞれ、局在化検出のためにpEGFP−C3ベクター(Invitrogen)にクローン化した。HeLa細胞(子宮頸部腺ガン)、HepG2細胞(肝細胞ガン)、Hep3B細胞(肝細胞ガン)、HKl(鼻咽頭ガン)およびC666−1(鼻咽頭ガン)を、10%のFBSを含有するDMEMにおいて培養した。L−02細胞(正常なヒト肝臓細胞)を、10%のFBSを伴うRPMI1640において培養した。NP460細胞を補充物S0125(Cascade Biologics)とともに1:1のケラチノサイト−SFM(Invitrogen)およびMEPI500CAにおいて培養した。すべての細胞株を、5%のCO2を含有する加湿雰囲気において37℃で培養した。
化合物の抗増殖活性をヒト細胞株において試験し、IC50を計算するために、HepG2、HeLaおよびHep3Bを含むガン細胞(4×105細胞/ウエル)ならびに正常なL−02細胞(5×105細胞/ウエル)を100μlの培養培地において96ウエルプレートにそれぞれ播種し、37℃で約12時間インキュベーションした。細胞を48時間にわたって薬物の2倍連続希釈物で処理した。培地を除き、1μMのWST−1(水溶性テトラゾリウム−1)を含有する100μlの培養培地をそれぞれのウエルに加えた。細胞を2時間インキュベーションし、その後、405nmにおける吸光度(630nmにおける参照)を測定した。細胞数とOD405における吸光度との関係の標準曲線を構築するために、既知の細胞数を有する細胞の連続希釈物を播種し、6時間インキュベーションし、その後で、WST−1アッセイによる測定を行った。細胞生存性を、候補化合物で処理される生細胞の数の、DMSO処理細胞の数に対する比率として表した。
化学サンプルを抗ガン薬物選別アッセイのための天然供給源から調製するための一般的プロトコルは下記の通りであった。10〜100グラムの薬草材料(植物全体、根、茎、葉または実)を、室温で3回、メタノールで抽出した。それぞれの総抽出物を水に懸濁し、その後、Et2O、EtOAc、n−BuOHにより順次、分配して、4つの画分、すなわち、Et2O画分、EtOAc画分、n−BuOH画分およびH2O画分を得た。それぞれの総抽出物または画分をスクリーニングアッセイのための10mg/mlのストック液としてDMSOに溶解した。精製された単一の化合物をそれぞれ1mg/mlのストック液として調製した。
17ベータ−デアセチルタンギニンの構造を分光学的証拠に基づいて特徴づけた。NMRスペクトルを、Varian−400分光計を使用して記録した。結合定数がHz単位で与えられ、化学シフトを内部標準としてのMe4Siに対して(ppm)で表した。HR−ESI−MSをQ−TOF質量分析計(Bruker Daltonics、MA、米国)で行った。
hMcm2とhMcm6との間の相互作用に対する抗ガン化合物の影響を細胞において研究するために、免疫染色を、タンパク質の細胞内局在化を検出するために行った。薬物処理を伴う、または伴わない、(ポリ−D−リシンで被覆される)カバースリップにおいて成長させられるHeLa細胞を、室温で20分間、PBSにおける4%のPFAにより固定処理した。PBSにおける0.1%のTriton X−100および1%のBSAによる透過処理を20分間行った後、細胞を1%のBSAによりブロッキング処理し、その後、ウサギ抗hMcm6一次抗体(Santa Cruz;1:500)およびマウス抗hMcm2一次抗体(Becton Dickinson、1:500)と室温で1時間インキュベーションした。その後、細胞を、Alexa Fluor488コンジュゲート化ロバ抗ヤギ抗体およびAlexa Fluor594コンジュゲート化ロバ抗マウス抗体(Invitrogen、1:500)と室温で1時間インキュベーションした。PBSによる3回の洗浄を抗体インキュベーションのそれぞれの操作の後で行った。その後、細胞を核染色のためにHochest33852(Sigma Chemical Company;1μg/ml)と室温で15分間インキュベーションし、再度、PBSにより3回洗浄した。最後に、細胞をスライドガラスに載せ、蛍光顕微鏡(Nikon TE2000E)のもとで観察した。
細胞をM期において停止させるために、HeLa細胞を2μMのチミジンで18時間にわたって事前に同期化し、新鮮な培地の中に6時間にわたって解放し、その後、0.1μg/mlのノコドゾールで6時間にわたって初期M期において停止させた。HeLa細胞を0.5mMのミモシンによる20時間の処理によってG1/S期境界で停止させた。その後、G1/S期細胞のアリコートをヒドロキシ尿素含有培地の中に4時間にわたって解放して、初期S期細胞を得た。
ポリ−D−リシンで被覆されるカバースリップにおいて成長させられるHeLa細胞を、24時間の17ベータ−デアセチルタンギニン処理の後、50μMのBrdU(Sigma)と37℃で1時間インキュベーションした。その後、細胞をPBSにおける4%のPFAにより室温で20分間にわたって固定処理し、PBSにおける0.1%のTriton X−100および1%のBSAにより20分間にわたって透過処理し、その後、抗BrdU(Sigma Chemical Company;1:500)および抗マウスIgG−FITCコンジュゲート(Sigma Chemical Company;1:500)と順次、それぞれ37℃で1時間インキュベーションし、PBSにおける3回の洗浄をそれぞれの抗体インキュベーションの後で行った。BrdUシグナルを蛍光顕微鏡(Nikon TE2000E)のもとで観察した。
細胞をトリプシン処理によって集め、冷PBSにより2回洗浄した。抽出緩衝液(EB;約20μl/106細胞)(100mM KCl、50mM HEPES−KOH pH7.5、2.5mM MgCl2、50mM NaF、5mM Na4P2O7、0.1mM NaVO3、0.5% Triton X−100、1mM PMSF、2μg/mlのペプスタチンA、20μg/mlのロイペプチン、20μg/mlのアプロチニン、0.2mMのPefabloc、2mMのベンズアミジンHClおよび0.2mg/mlのバシトラシン)を加えて再懸濁し、細胞をピペッティングによって溶解した。細胞を氷上に10分間置き、インキュベーション期間中において2分毎〜3分毎に軽くたたいて混合した。プロテアーゼ阻害剤を含有するEBに等しい体積の30%氷冷スクロースをチューブの底に加えた。チューブを微量遠心分離器において最高速度で10分間遠心分離して、クロマチンおよび遊離タンパク質を分離した。上清を新しいチューブに移し、氷上で保った。ペレットを、チューブを軽くたたいてペレットをチューブの壁から取り除くことによって等体積のEBにより洗浄し、軽いボルテックス処理によって再懸濁した。懸濁物を再び、最高速度で5分間遠心分離した。2つの上清を一緒にした。ペレットを上清の体積の半量に等しいEBに再懸濁した。上清画分およびペレット画分を最終的には免疫ブロッティングのために処理した。
浮遊細胞および付着細胞の両方を回収し、PBSにより1回洗浄した。細胞を、−20℃で1時間〜一晩、70%エタノールにおいて固定処理し、PBSにより徹底的に洗浄し、その後、50μg/mlのRNase A、0.1%のTriton X−100、0.1mMのEDTA(pH7.4)および50μg/mlのヨウ化プロピジウムにおいて4℃で30分間染色した。サンプルをFACSort装置(Becton Dickinson)により分析した。
植物由来の化合物、分画物または粗抽出物、および、合成化合物である数百個のサンプルのスクリーニングの後、ヒトMCMタンパク質およびDNA複製を阻害することができるいくつかの候補物を特定した。これらの候補物のうち、17ベータ−デアセチルタンギニンと呼ばれる小さい化合物(図1)を、植物抽出物、分画物および化合物の数回の活性誘導分画化、精製および試験の後で単離し、特定した。17ベータ−デアセチルタンギニンに構造的に関連するいくつかの他の化合物および17ベータ−デアセチルタンギニンの化学的誘導体(7ベータ−デアセチルタンギニンジオール)もまた、17ベータ−デアセチルタンギニンと類似する活性を有することが見出された(図1の(3)〜(8))。一方で、それらの17アルファ異性体(図1の(1)および(2))は不活性であることが見出された。
17ベータ−デアセチルタンギニンがヒト細胞においてhMcm2タンパク質およびhMcm6タンパク質を標的とするかを試験するために、これら2つのタンパク質の起こり得る共免疫沈澱(co−IP)を、17ベータ−デアセチルタンギニンで処理される細胞から得られるヒト細胞抽出物において試験した。図3において、非同期のHeLa細胞をDMSOまたは17ベータ−デアセチルタンギニン(DAT)で処理し(図3A)、あるいは、DMSO、17ベータ−ネリイホリン(NRF)または17ベータ−デアセチルタンギニンジオール(Diol)で処理した(図3B)。また、全細胞抽出物を調製し、化合物とさらにインキュベーションし、その後で、化合物の存在下でのco−IPのために使用した。その後、免疫沈殿物を、抗hMcm6抗体、抗hMcm2体、抗hMcm4抗体および抗hMcm7抗体により免疫ブロットした。結果は、17ベータ−デアセチルタンギニンがhMcm2とhMcm6との相互作用および他のMCMサブユニットの間における相互作用を中断させたことを示した(図3A)。同様に、17ベータ−ネリイホリンもまた、hMcm2−hMcm6の相互作用を中断させることができ、一方、17ベータ−デアセチルタンギニンジオールはより弱い活性を示した(図3B)。
。このことを試験するために、本発明者らは、内因性MCMタンパク質に対する抗体を使用する間接的な蛍光顕微鏡法(免疫染色)と、hMcm2−GFPおよびhMcm6−GFPを細胞において発現するためのプラスミドによるトランスフェクションの後における直接的な蛍光顕微鏡法との両方を用いた。
プレPCの成分として、MCM複合体がDNA複製のライセンス化において中心的な役割を果たしている。17ベータ−デアセチルタンギニンはhMcm2およびhMcm6の相互作用を中断させることができ、かつ、それらの核局在化を妨げることができるので、17ベータ−デアセチルタンギニンはMCMタンパク質のクロマチン会合を阻害するにちがいなく、このことはプレRC組み立て(複製ライセンス化)の不首尾を示している。このことを試験するために、本発明者らは、クロマチン会合タンパク質を検出するためにクロマチン結合アッセイを行った。図5Aおよび図5Bにおいて、非同期のHela細胞を17ベータ−デアセチルタンギニンで24時間処理し、クロマチン結合アッセイによって分析した(図5A)。非処理の細胞(Untreat)、溶媒のDMSOで処理される細胞、および、0.2、0.4または0.8g/mlの17ベータ−デアセチルタンギニンで処理される細胞を、免疫ブロッティングによって、クロマチン画分および上清画分におけるプレRC成分について分析した(図5A)。ベータ−アクチンを負荷コントロールとして使用した。それぞれの細胞サンプルはまた、フローサイトメトリーによって細胞周期分布について分析した(図5B)。図5Cおよび図5Dに示される実験は、細胞が、ノコダゾール(Noc.)を使用してM期において同期化され、その後、示されるようにDMSOまたは17ベータ−デアセチルタンギニン(DAT)を含有する新鮮な培地の中に解放されたことを除いて、図5Aおよび図5Bにおける実験と類似していた。
17ベータ−デアセチルタンギニンはhMcm2とhMcm6との間における相互作用を中断させ、かつ、クロマチンとのMCMタンパク質の会合を阻害するので、17ベータ−デアセチルタンギニンはDNA複製を阻止するにちがいない。このことを確認するために、本発明者らはHeLa細胞を17ベータ−デアセチルタンギニンで24時間処理し、その後、細胞をBrdUにより1時間標識した。細胞のDNAにおける取り込まれたBrdUを、抗brdU抗体、続いて、蛍光顕微鏡のもとで可視化されたFITC−抗マウス二次抗体によって検出した(図6A)。DAPIを使用して、核を染色し(図6A)、BrdU陽性細胞の割合を定量化した(図6B)。BrdUシグナルが、17ベータ−デアセチルタンギニンが0.2g/mlを超えたときにはほとんど全く認められず、一方、DMSO処理細胞および非処理細胞では、約30%が、予想されるようにBrdU陽性であったように(図6A、図6B)、DNA複製の有意な阻害が17ベータ−デアセチルタンギニン処理のHeLa細胞において認められた。
図2および図8Aにおけるデータは、本発明の抗増殖化合物が、正常な細胞に対する細胞毒性をほとんど伴うことなく、ガン細胞を特異的に殺傷し得ることを示している。正常な細胞および/またはガン細胞が、17ベータ−デアセチルタンギニンを除いた後で細胞成長を再開し得るかを試験するために、L−02(正常な肝臓)細胞およびHepG2(肝臓ガン)細胞を17ベータ−デアセチルタンギニンまたはDMSOと1日間インキュベーションし、その後、17ベータ−デアセチルタンギニンまたはDMSOを除き、細胞をさらに、新鮮な成長培地と3日間インキュベーションした。生細胞数をWST−1アッセイによって毎日モニターした。図9において、L+DATは、17ベータ−デアセチルタンギニンで処理されるL−02細胞を示す;L+Dは、DMSOで処理されるL−02細胞を示す;H+DATは、17ベータ−デアセチルタンギニンで処理されるHepG2細胞を示す;H+Dは、DMSOで処理され、その後で、新鮮な培地の中に解放されるHepG2細胞を示す。結果は、ガン細胞ではなく、正常な細胞が、17ベータ−デアセチルタンギニンを除いた後で成長を再開したことを示した(図9)。このことは、正常な細胞の大部分が、17ベータ−デアセチルタンギニンで処理されたときにはG1期に留まり、これに対して、ガン細胞は、同じ処理のもとでは頓挫性S期に入り、死んだという本発明者らの発見と一致している(図8A)。
インビボ抗ガン活性試験を、ヌードマウスにHeLa細胞を左側腹および右側腹の両方に接種することによってヌードマウス異種移植モデルにおいて行った。無作為グループ化の後、ヌードマウスを17ベータ−デアセチルタンギニンまたは溶媒(PBSにおける30%のプロピレングリコール)により腹腔内処理した。小さい腫瘍が形成し始めた腫瘍接種後3日での最初の試験において、2群のヌードマウスを1日目〜3日目および6日目〜10日目に3.5mg−薬物/kg−体重および7.0mg−薬物/kg−体重の17ベータ−デアセチルタンギニンでそれぞれ処置し、別の一群のコントロールマウスを同じ体積の溶媒で処置した(図10A)。図10Aにおいて、細い線でつながれる小さいサイズのデータ点記号によって表される腫瘍体積データは、腫瘍サイズの両方の測定および薬物注入が行われた日に得られ、太い線でつながれる大きいサイズのデータ点記号によって表される腫瘍体積データは、薬物注入のない日に得られた。それぞれの腫瘍サイズがそれぞれの群において5匹のマウスにおける10個の腫瘍の平均であった。結果は、17ベータ−デアセチルタンギニンが腫瘍成長を著しく抑制し、高用量(7.0mg/kg)では90%抑制し、低用量(3.5mg/kg)では70%抑制したことを示した。実際、高用量において、17ベータ−デアセチルタンギニンの最後の5回の連続注入については、腫瘍サイズが低下さえした。このことは、17ベータ−デアセチルタンギニンがマウスにおいて腫瘍細胞の死を誘導していたことを示唆する。
次に、さらなる一組の動物実験をより長い期間により行い、この期間において、5.0mg/kgでの15回の薬物注入を、腫瘍サイズが0.05〜0.1cm3に達した腫瘍接種後1週において行った。図10Bにおいて、薬物注入および腫瘍サイズ測定をデータ点によって表される日に行い、図10Cにおける写真を20日目に撮影した。結果は、腫瘍成長が再び、著しく抑制されたことを示した;17ベータ−デアセチルタンギニンで処置されるマウスにおける腫瘍は、溶媒処置されたコントロールマウスにおける腫瘍よりも80%を超えて小さかった(図10B、図10C)。比較のために、注入あたり10mg/kgでのパクリタキセル(タキソール)は、最初の10日において17ベータ−デアセチルタンギニンよりもはるかに小さい抗腫瘍活性を示し、これらのマウスはタキソールの毒性のために10日目に死亡した(図10B)。
(付記1)
ガンを患者において処置する方法であって、抗ガン剤をガン性細胞におけるヒトMCM複合体に対するその阻害効果のために選択する工程(a)、および、(b)前記選択された抗ガン剤を含む医薬組成物の治療効果的な量を前記患者に投与する工程(b)を含む方法。
(付記2)
前記抗ガン剤が、ガン性細胞を頓挫性S期に入らせ、かつ、正常な細胞をG1期において実質的に停止させるその能力のためにさらに選択される、付記1に記載の方法。
(付記3)
前記阻害効果が、MCMサブユニットからの機能的なMCM複合体の形成を中断させることによって達成される、付記2に記載の方法。
(付記4)
前記機能的なMCM複合体が、核の中に移動することができるヘテロヘキサマー環状構造体であり、かつ、DNA複製のために必要である、付記3に記載の方法。
(付記5)
選択された抗ガン剤が、hMcm2とhMcm6との間における相互作用を妨害することによって前記機能的なMCM複合体の前記形成を中断させる、付記3に記載の方法。
(付記6)
前記抗ガン剤が、式(I)
(式中、R1はHであるか、あるいは、1つまたは複数の糖ユニットによって置換される;R2はベータ型立体配置での5員環基または6員環基である;R3およびR4はそれぞれがHまたはOHであるか、あるいは、R3およびR4は、R3およびR4がそれぞれ、それぞれ結合する2個のC原子との3員環を形成するただ1つのO原子である;R5はOHであり、かつ、R6はHであるか、あるいは、R5およびR6は、R5およびR6がそれぞれ、それぞれ結合する2個のC原子との3員環を形成するただ1つのO原子である)である、付記1に記載の方法。
(付記7)
前記抗ガン剤が、17ベータ−デアセチルタンギニン、17ベータ−ネリイホリン、ブファリン、17ベータ−デアセチルタンギニンジオール、レシブホゲニンおよびシノブファギンからなる群から選択される、付記6に記載の方法。
(付記8)
前記抗ガン剤が17ベータ−デアセチルタンギニンである、付記7に記載の方法。
(付記9)
前記抗ガン剤が17ベータ−デアセチルタンギニンジオールである、付記7に記載の方法。
(付記10)
前記抗ガン剤が、ブファリン、シノブファギンまたはレシブホゲニンである、付記7に記載の方法。
(付記11)
抗ガン化合物についてスクリーニングする方法であって、(a)候補化合物を一定の期間にわたって細胞の集団と接触させる工程、および、(b)そのサブユニットから形成される機能的なMCM複合体の量を前記細胞において決定する工程を含む方法。
(付記12)
工程(b)が、核に位置するMCMサブユニットの一部を、細胞質に位置する一部と比較して検出することによって行われる、付記11に記載の方法。
(付記13)
間接的な蛍光プロセス(免疫染色)が、1つまたは複数の内因性MCMサブユニットに対する1つまたは複数の一次抗体と、前記一次抗体を認識する蛍光標識された二次抗体とが、前記細胞が特定の継続期間にわたって前記候補化合物で処理された後における前記MCMタンパク質の所在を可視化するために使用される工程(b)において行われる、付記12に記載の方法。
(付記14)
直接的な蛍光プロセスが、前記細胞が、蛍光タンパク質と融合される1つまたは複数のMCMサブユニットを発現することができる1つまたは複数のプラスミドでトランスフェクションされており、その後、前記蛍光標識されたMCMサブユニットの所在が、前記細胞が特定の継続期間にわたって前記候補化合物で処理された後で検出される工程(b)において行われる、付記12に記載の方法。
(付記15)
前記MCMサブユニットが、hMcm2、hMcm3、hMcm4、hMcm5、hMcm6およびhMcm7からなる群から選択される1つまたは複数のものを含む、付記12に記載の方法。
(付記16)
工程(b)が、前記MCMサブユニットの物理的相互作用を検出することによって、または、クロマチンに結合するMCMタンパク質の量を測定することによって行われる、付記11に記載の方法。
(付記17)
工程(b)が、MCMタンパク質の酵素機能(例えば、ATPase活性および/またはヘリカーゼ活性など)を測定することによって行われる、付記11に記載の方法。
(付記18)
前記細胞に対する前記候補化合物の抗増殖効果およびアポトーシス誘導効果を調べる確認工程をさらに含む、付記11に記載の方法。
(付記19)
前記確認工程が、BrdU取り込みアッセイおよび/またはフローサイトメトリーを使用することによって行われる、付記17に記載の方法。
(付記20)
ガンを患者において処置するための方法であって、効果的な量の式(I)の化合物またはその医薬的に許容される塩またはその配合物 (式中、R1はHであるか、あるいは、1つまたは複数の糖ユニットによって置換される;R2はベータ型立体配置での5員環基または6員環基である;R3およびR4はそれぞれがHまたはOHであるか、あるいは、R3およびR4は、R3およびR4がそれぞれ、それぞれ結合する2個のC原子との3員環を形成するただ1つのO原子であり、但し、R1が1つまたは複数の糖ユニットによって置換されるとき、R3およびR4はただ1つのO原子でなければならず、これにより、3員環を形成する;R5はOHであり、かつ、R6はHであるか、あるいは、R5およびR6は、R5およびR6がそれぞれ、それぞれ結合する2個のC原子との3員環を形成するただ1つのO原子である)を患者に投与することを含む方法。
(付記21)
前記化合物が17ベータ−デアセチルタンギニンである、付記19に記載の方法。
Claims (9)
- 正常およびガン性細胞におけるMCMサブユニットから機能的なMCM複合体の形成を阻害する方法であって、
17ベータ−デアセチルタンギニン、17ベータ−ネリイホリンおよび17ベータ−デアセチルタンギニンジオールからなる群から選択される化合物の使用を含む方法。 - 前記機能性なMCM複合体の前記形成に対する前記化合物の効果が、ガン性細胞を頓挫性S期に入らせるが、正常細胞をG1期において停止させる、請求項1に記載の方法。
- 前記機能的なMCM複合体が、核の中に移動することができ、かつ、DNA複製のために必要であるヘテロヘキサマー環状構造体である、請求項1に記載の方法。
- 前記選択される化合物が、hMcm2とhMcm6との間における相互作用を妨害することによって前記機能的なMCM複合体の前記形成を阻害する、請求項1に記載の方法。
- 前記選択される化合物が、17ベータ−デアセチルタンギニンである、請求項1に記載の方法。
- 前記選択される化合物が、17ベータ−ネリイホリンである、請求項1に記載の方法。
- 前記選択される化合物が、17ベータ−デアセチルタンギニンジオールである、請求項1に記載の方法。
- 抗ガン化合物についてスクリーニングする方法であって、(a)候補化合物を一定の期間にわたって細胞の集団と接触させる工程、および、(b)そのサブユニットから形成される機能的なMCM複合体の量を前記細胞において決定する工程を含む方法。
- 前記細胞に対する前記候補化合物の抗増殖効果およびアポトーシス誘導効果を調べる確認工程をさらに含む、請求項8に記載の方法。
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