JP2017507949A - マトリックスメタロプロテイナーゼ９に対する抗体およびその使用の方法 - Google Patents

Abstract

本開示は、マトリックスメタロプロテイナーゼ−９（ＭＭＰ９）タンパク質（ＭＭＰ９は、ゼラチナーゼ−Ｂとしても公知である）に結合する結合タンパク質、例えば、抗体およびその抗原結合断片を含む組成物および使用方法であって、例えば結合タンパク質が免疫グロブリン（Ｉｇ）重鎖（またはその機能性断片）およびＩｇ軽鎖（またはその機能性断片）を含む組成物および使用方法を提供する。本開示は、マトリックスメタロプロテイナーゼ−９（ＭＭＰ９）タンパク質（ゼラチナーゼ−Ｂとしても公知である）に結合する結合タンパク質、例えば、抗体およびその抗原結合断片を含む組成物および使用方法を提供する。

Description

関連出願への相互参照
該当せず。

分野
本開示は、細胞外酵素、細胞外マトリックス酵素、プロテアーゼおよび免疫学の分野に入る。

背景
マトリックスメタロプロテイナーゼ（ＭＭＰ）は、細胞外マトリックスの形成およびリモデリングに関与する細胞外酵素のファミリーに属する。これらの酵素は、亜鉛原子が３つのヒスチジン残基によって配位されている保存された触媒ドメインを含有する。このファミリーのメンバーは２０超が公知であり、コラゲナーゼ、ゼラチナーゼ、ストロメライシン、マトリライシン、エナメリシンおよび膜ＭＭＰを含めたいくつもの群で構成されている。

ＭＭＰ２およびＭＭＰ９は、マトリックスメタロプロテイナーゼのゼラチナーゼ群に属する。大多数のＭＭＰに共通するシグナルペプチド、プロペプチド、触媒ドメイン、亜鉛結合ドメインおよびヘモペキシン（ｈｅａｍｏｐｅｘｉｎ）様ドメインを含有することに加えて、ゼラチナーゼは、複数のフィブロネクチン様ドメインおよびＯ−グリコシル化ドメインも含有する。ＭＭＰは、いくつもの疾患に関与する。ＭＭＰの阻害剤については、一部において特異性および有効性に関して、完全に十分であるとはいえない。したがって、特異的かつ有効なＭＭＰ阻害剤が必要とされている。

何十年にもわたって活発な薬物開発が行われており、２０１１年にＣＯＰＤに対する新しい治療クラス（ホスホジエステラーゼ−４阻害剤ロフルミラスト）がＦＤＡにより承認されたにもかかわらず、症状、増悪、入院、および死亡率によって評価される通り、ＣＯＰＤにおけるまだ満たされていない必要性が残っている。疾患の進行または死亡率を変更する薬理学的療法は示されていない。ＣＯＰＤに対する非気管支拡張性機構を用いた多数の活発な開発プログラムが存在するが、許容される安全性を伴って炎症および疾患の進行の両方を変更する潜在力を有するものは殆どない。したがって、特に、利用可能な治療薬の効果がなかった被験体に対する、そのような疾患に有効な処置が必要とされている。

本明細書では、被験体における慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）を処置または防止するための方法であって、被験体に、免疫グロブリン重鎖ポリペプチドまたはその機能性断片、および免疫グロブリン軽鎖ポリペプチドまたはその機能性断片を含み、有効量の、マトリックスメタロプロテイナーゼ９（ＭＭＰ９）に特異的に結合するＭＭＰ９結合タンパク質を投与するステップを含む方法が提供される。一部の実施形態では、ＭＭＰ９結合タンパク質は、マトリックスメタロプロテイナーゼ−９（ＭＭＰ９）タンパク質（ゼラチナーゼ−Ｂとしても公知である）に結合する抗体またはその抗原結合断片である。ＭＭＰ９またはその断片（例えば、抗原結合断片）に結合する抗体は、一般には、免疫グロブリン（Ｉｇ）重鎖（またはその機能性断片）およびＩｇ軽鎖（またはその機能性断片）を含有する。重鎖は、一般には、ＩｇＧ１もしくはＩｇＧ４などのＩｇＧまたはその改変型である。軽鎖は、一般には、カッパ鎖である。

いくつかの実施形態では、ＭＭＰ９結合タンパク質、例えば、抗体としては、ＭＭＰ９に特異的に結合し、他の、関連するマトリックスメタロプロテイナーゼには結合しないものが挙げられる。そのようなＭＭＰ９結合タンパク質は、ＭＭＰ９の特異的な調節（例えば、阻害）を、例えば、他のマトリックスメタロプロテイナーゼの活性には直接影響を及ぼすことなく得ることが必要である、またはそれが望ましい適用において使用される。したがって、本開示のある特定の実施形態では、抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片は、ＭＭＰ９の活性の特異的な阻害剤である。一部の態様では、本明細書に開示されているＭＭＰ９結合タンパク質は、ＭＭＰ９を阻害する一方で、他の、関連するマトリックスメタロプロテイナーゼの正常な機能を可能にするために有用になる。

ある特定の実施形態では、ＭＭＰ９に結合する抗体またはその抗原結合性断片は、ＭＭＰ９のエピトープに特異的に結合し、該エピトープはＭＭＰ９の領域内のアミノ酸残基を含み、該領域は配列番号２７の残基１０４〜１１９、残基１５９〜１６６または残基１９１〜２０２を含む。ある特定の実施形態では、領域は、配列番号２７の残基１０４〜１１９、残基１５９〜１６６または残基１９１〜２０２からなる。一態様では、エピトープは、配列番号２７のＥ１１１、Ｄ１１３、Ｒ１６２またはＩ１９８を含む。例えば、エピトープは、配列番号２７の残基Ｒ１６２を含んでよい。ある特定の実施形態では、抗体は、ヒト化抗体、キメラ抗体またはヒト抗体である。

抗体および断片は、それらのアミノ酸配列またはその一部、ならびに／または種々の機能、例えば、ＭＭＰ９もしくはその特定のエピトープに対する結合特異性、または特定の抗体と結合について競合する能力、ならびに／または活性、例えば、ＭＭＰ９を、例えば、非競合的に阻害する能力に関して記載することができる。

ある特定の実施形態では、ＭＭＰ９に結合する抗体またはその抗原結合断片は、配列番号１３、１４、および１５からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するＣＤＲを含むＶＨ領域；ならびに配列番号１６、１７、および１８からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するＣＤＲを有するＶＬ領域を含む。ある特定の実施形態では、ＭＭＰ９に結合する抗体またはその抗原結合断片は、配列番号１３、１４、および１５のアミノ酸配列を含む３つのＣＤＲを含むＶＨ領域；ならびに配列番号１６、１７、および１８のアミノ酸配列を含む３つのＣＤＲを含むＶＬ領域を含む。ある特定の実施形態では、ＶＨ領域は、配列番号３、５、６、７、および８からなる群から選択されるアミノ酸配列を有し、ＶＬ領域は配列番号４、９、１０、１１、および１２からなる群から選択されるアミノ酸配列を有する。

ある特定の実施形態では、ＭＭＰ９に結合する抗体またはその抗原結合断片は、配列番号７に記載のアミノ酸配列を含むＶＨ領域および配列番号１２に記載のアミノ酸配列を含むＶＬ領域を含む。

ある特定の実施形態では、ＭＭＰ９に結合する抗体は、シグナルペプチドを伴わない配列番号４９に記載のアミノ酸配列を含む重鎖、およびシグナル配列を伴わない配列番号５０に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、ＭＭＰ９に結合する抗体は、配列番号５６に記載のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号５７に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。

ある特定の実施形態では、ＭＭＰ９に結合する抗体またはその抗原結合断片は、配列番号４７に記載のアミノ酸配列を含むＶＨ領域および配列番号４８に記載のアミノ酸配列を含むＶＬ領域を含む。

ある特定の実施形態では、ＭＭＰ９に結合する抗体は、シグナルペプチドを伴わない配列番号４５に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖およびシグナルペプチドを伴わない配列番号４６に記載のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。一部の実施形態では、ＭＭＰ９に結合する抗体は、配列番号５８に記載のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号５９に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。

ある特定の実施形態では、ＭＭＰ９に結合する抗体またはその抗原結合断片は、本明細書に記載の任意の抗体またはその抗原結合断片である。一実施形態では、被験体におけるＣＯＰＤを処置または防止するための方法は、被験体に、有効量の、抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片を投与するステップを含む。一部の実施形態では、抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片は、ＭＭＰ９のエピトープに結合し得、該エピトープは、配列番号２７のアミノ酸残基１０４〜１１９、残基１５９〜１６６もしくは残基１９１〜２０２；または配列番号２７のアミノ酸残基Ｅ１１１、Ｄ１１３、Ｒ１６２もしくはＩ１９８を含む。ある特定の実施形態では、抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片は、タンパク質または抗体と、ＭＭＰ９との結合について競合し得、該タンパク質または該抗体は、配列番号２７のアミノ酸残基１０４〜１１９、残基１５９〜１６６もしくは残基１９１〜２０２；または配列番号２７のアミノ酸残基Ｅ１１１、Ｄ１１３、Ｒ１６２もしくはＩ１９８に結合し得る。ある特定の他の実施形態では、抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片は、タンパク質または抗体と、ＭＭＰ９との結合について競合し得、該タンパク質または該抗体は、配列番号７、１２、１３、１４、１５、１６、１７、および１８からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して約９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれ超の同一性（identify）を有する。さらなる実施形態では、抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片は、配列番号１３、１４、および１５からなる群から選択されるアミノ酸配列を有する相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む重鎖可変（ＶＨ）領域；配列番号１６、１７、および１８からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するＣＤＲを有する軽鎖可変（ＶＬ）領域；配列番号１３、１４、および１５に記載のアミノ酸配列を含む３つのＣＤＲ（すなわち、ＣＤＲ１〜３）を含むＶＨ領域；または配列番号１６、１７、および１８に記載のアミノ酸配列を含む３つのＣＤＲ（すなわち、ＣＤＲ１〜３）を含むＶＬ領域を含んでよい。一部のさらなる実施形態では、抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片は、配列番号３、５、６、７、および８からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むＶＨ領域；配列番号４、９、１０、１１、および１２からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むＶＬ領域；配列番号５６もしくは５８に記載のアミノ酸配列を含む重鎖；または配列番号５７もしくは５９に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖を含んでよい。ある特定の別の実施形態では、抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片は、配列番号７に記載のアミノ酸配列を含むＶＨ領域および配列番号１２に記載のアミノ酸配列を含むＶＬ領域を含む。

一部の実施形態では、ＭＭＰ９結合タンパク質、例えば、ＭＭＰ９に結合する抗体またはその抗原結合断片は、医薬組成物の状態である。

ある特定の実施形態では、ＭＭＰ９結合タンパク質により、ＭＭＰ９の酵素活性が阻害される。ある特定の実施形態では、酵素活性の阻害は非競合的である。

ある特定の実施形態では、ＭＭＰ９に結合する抗体またはその抗原結合断片またはその医薬組成物を、被験体に、約２５ｍｇから約８００ｇまでの用量で投与する。いくつかの例では、ＭＭＰ９に結合する抗体またはその抗原結合断片またはその医薬組成物を、被験体に、約２００ｍｇ、約３００ｍｇまたは約４００ｍｇの投与量で、１週間、２週間または３週間の間隔で、または１週間毎に１回、２週間毎に１回または３週間毎に１回投与する。ある特定の実施形態では、ＭＭＰ９に結合する抗体またはその抗原結合断片を、被験体に、約４００ｍｇの投与量で２週間ごとに投与する。ある特定の実施形態では、ＭＭＰ９に結合する抗体またはその抗原結合断片を、被験体に、約２００ｍｇの投与量で２週間ごとに投与する。一部の実施形態では、ＭＭＰ９に結合する抗体またはその抗原結合断片を、被験体に、二段階手順：第１に、負荷投与量相（loading dose phase）（疾患に関連するＭＭＰ９の「標的シンク（ｔａｒｇｅｔ ｓｉｎｋ）」または高ベースライン濃度をカバーするためにより頻繁に投薬を行い、ここで、毎週約２００ｍｇ、約３００ｍｇもしくは約４００ｍｇの投与量で、１週間、２週間もしくは３週間の間隔にわたる投薬範囲で被験体に投与する、または疾患に関連するＭＭＰ９の「標的シンク」もしくは高ベースライン濃度をカバーするためにより頻繁に投薬を行う）、および第２に、負荷投与量相後に予測可能なｐＫが確立されたら、より低い毎週の用量、例えば、１５０ｍｇ／週、１２５ｍｇ／週、１００ｍｇ／週または５０ｍｇ／週などで投与する。一部の実施形態では、より低い毎週の用量は、週ベースでより低い、例えば、１５０ｍｇ／週、１２５ｍｇ／週、１００ｍｇ／週または５０ｍｇ／週であってよい。一部の実施形態では、抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片を約１００ｍｇ、１５０ｍｇ、２００ｍｇ、３００ｍｇまたは４００ｍｇの用量で投与する。

ある特定の実施形態では、ＭＭＰ９に結合する抗体またはその抗原結合断片またはその医薬組成物を、１週間、２週間または３週間の間隔、または１週間毎に１回、２週間毎に１回または３週間毎に１回投与する。ある特定の実施形態では、ＭＭＰ９に結合する抗体またはその抗原結合断片またはその医薬組成物を、静脈内、皮内または皮下に投与する。一実施形態では、抗ＭＭＰ９抗体もしくはその抗原結合断片またはその組成物もしくは医薬製剤を皮下に投与する。他の実施形態では、抗ＭＭＰ９抗体もしくはその抗原結合断片またはその組成物もしくは医薬製剤を静脈内に投与する。

ある特定の実施形態では、ＭＭＰ９に結合する抗体またはその抗原結合断片またはその医薬組成物を単独で、単独療法として投与する。ある特定の実施形態では、ＭＭＰ９に結合する抗体またはその抗原結合断片またはその医薬組成物を、併用療法の一部として、ＣＯＰＤを処置するための１種または複数種の他の治療剤と一緒に投与する。ＣＯＰＤを処置するための治療剤としては、これだけに限定されないが、１）短時間作用性β２刺激薬（例えば、サルブタモール（アルブテロール）、レバルブテロール（ｌｅｖａｌｂｕｔｅｒｏｌ）、フェノテロール、テルブタリンなど）、２）短時間作用性抗コリン作用薬（例えば、イプラトロピウム臭化物、オキシトロピウム臭化物など）、３）長時間作用性β２刺激薬（例えば、ホルモテロール、アルホルモテロール（arfomoterol）、インダカテロール、サルメテロール、ツロブテロールなど）、４）長時間作用性抗コリン作用薬（例えば、アクリジニウム臭化物、グリコピロニウム臭化物、チオトロピウムなど）、５）短時間作用性β２刺激薬と抗コリン作用薬の組合せ（例えば、フェノテロール／イプラトロピウム、サルブタモール／イプラトロピウムなど）、６）吸入コルチコステロイド（例えば、ベクロメタゾン、ブデソニド、フルチカゾンなど）、７）長時間作用性β２刺激薬とコルチコステロイドの組合せ（例えば、ホルモテロール／ブデソニド、ホルモテロール／モメタゾン、サルメテロール／フルチカゾンなど）、８）メチルキサンチン（例えば、アミノフィリン、テオフィリンなど）、９）ホスホジエステラーゼ−４（phosphosdiesterase-4）阻害剤（例えば、ロフルミラストなど）、１０）全身性コルチコステロイド（例えば、プレドニゾン、メチルプレドニゾロンなど）が挙げられる。１種または複数種の他の治療剤は、ＭＭＰ９に結合する抗体またはその抗原結合断片と同時にまたは逐次的に投与することができる。一実施形態では、ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片は、短時間作用性β２刺激薬、短時間作用性抗コリン作用薬、長時間作用性β２刺激薬、長時間作用性抗コリン作用薬、およびこれらの組合せからなる群から選択される治療剤と組み合わせることができる。抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片と１種または複数種の治療剤の組合せはいずれもβ２刺激薬、抗コリン作用薬、吸入コルチコステロイド、全身性コルチコステロイド、メチルキサンチン、ホスホジエステラーゼ−４阻害剤またはこれらの組合せとさらに組み合わせることができる。

ある特定の実施形態では、被験体は、慢性気管支炎、気腫またはその両方を有する。ある特定の実施形態では、被験体はＣＯＰＤと診断されている。ある特定の実施形態では、被験体は、少なくとも６カ月間にＧｌｏｂａｌ Ｉｎｉｔｉａｔｉｖｅ ｆｏｒ Ｃｈｒｏｎｉｃ Ｏｂｓｔｒｕｃｔｉｖｅ Ｌｕｎｇ Ｄｉｓｅａｓｅ（ＧＯＬＤ）ガイドラインに従ってＣＯＰＤと診断されている。一部の実施形態では、被験体は、気管支拡張薬投与後の（ｐｏｓｔ−ｂｒｏｎｃｈｏｄｉｌａｔｏｒ）１秒間の努力呼気量（ＦＥＶ_１）が予測値の≧４０％である。一部の実施形態では、被験体は、気管支拡張薬投与後の１秒間の努力呼気量（ＦＥＶ_１）が予測値の≧４０％かつ≦８０％である。一部の実施形態では、被験体は、３０日以内にＣＯＰＤの薬物療法が変化していない。他の実施形態では、被験体は、１年で１回、２回またはそれ超の増悪を有する慢性気管支炎、気腫またはＣＯＰＤと診断される。一実施形態では、被験体は、本出願の処置前に、１年で２回またはそれ超の増悪、および肺機能の低下を有するＣＯＰＤと診断される。

ある特定の実施形態では、被験体は、臨床的に有意な活動性感染を有さない。ある特定の実施形態では、被験体は、ＱｕａｎｔｉＦＥＲＯＮ−ＴＢ ＧＯＬＤ検査陽性を有さない。ある特定の実施形態では、被験体は、６カ月以内に心筋梗塞、不安定なまたは生命にかかわる不整脈、心不全での入院などのあらゆる重篤な心臓事象、またはあらゆる有意なまたは新しい心電図（ＥＣＧ）所見を有さない。ある特定の実施形態では、被験体は、ここ６カ月以内に、これだけに限定されないが、ＣＯＰＤ、肺炎、細気管支炎などの呼吸器事象で入院していない。ある特定の実施形態では、被験体は、ＣＯＰＤ以外の慢性肺疾患（例えば、喘息、嚢胞性線維症または線維性疾患、α１アンチトリプシン欠損症、間質性肺疾患、肺血栓塞栓性疾患または気管支拡張症など）を有さない。ある特定の実施形態では、被験体は、全身性コルチコステロイドの慢性使用および／または９０日以内の、入院の必要がないＣＯＰＤの急性増悪（ＡＥＣＯＰＤ）事象または他の医学的状態に対する全身性コルチコステロイドを用いた処置を示さない。ある特定の実施形態では、被験体は、無作為化の９０日以内に、入院の必要がないＡＥＣＯＰＤ事象または他の医学的状態に対して、または、１４日以内に、入院の必要がないあらゆる軽微な医学的事象に対して、抗生物質を用いた処置を受けていない。ある特定の実施形態では、被験体は、あらゆる販売されているまたは治験中の生物製剤による処置を、分子の５半減期以内に、または、未知の場合には９０日以内に受けていない。ある特定の実施形態では、被験体は、これまでのところ、９０日以内に、非生物学的免疫修飾薬物療法（アザチオプリン、シクロスポリン、ヒドロキシクロロキン、レフルノミド、メトトレキサート、ミコフェノール酸モフェチル、スルファサラジン、トファシチニブなど）を受けていない。

本明細書に記載の種々の実施形態の性質の１つ、いくつかまたは全てを組み合わせて本発明の他の実施形態を形成できることが理解されるべきである。本発明のこれらおよび他の態様は、当業者には明らかである。本発明のこれらおよび他の実施形態を以下の発明の詳細な説明にさらに記載する。

図１は、マウスモノクローナル抗ＭＭＰ９抗体（ＡＢ００４１）の重鎖可変領域のアミノ酸配列を、重鎖（ＶＨ１〜ＶＨ４）のヒト化変異体のアミノ酸配列と一緒に示し、ヒト化によって生じるフレームワークのアミノ酸配列の差異を示すためにアラインメントした図である。ＣＤＲがイタリック体で示されており、ヒト化変異体において親マウスモノクローナルと比較して異なるアミノ酸に下線が引かれている。

図２は、マウスモノクローナル抗ＭＭＰ９抗体（ＡＢ００４１）の軽鎖可変領域のアミノ酸配列を、この軽鎖（ＶＨ１〜ＶＨ４）のヒト化変異体のアミノ酸配列と一緒に示し、ヒト化によって生じるフレームワークのアミノ酸配列の差異を示すためにアラインメントした図である。ＣＤＲがイタリック体で示されており、ヒト化変異体において親マウスモノクローナルと比較して異なるアミノ酸に下線が引かれている。

図３は、ＭＭＰ９タンパク質の概略図である。

図４は、ＡＢ００４１、Ｍ４、およびＭ１２と称される抗体の重鎖および軽鎖のアミノ酸配列の間の比較を示す図である。

詳細な説明
本開示の実施には、別段の指定のない限り、細胞生物学、毒性学、分子生物学、生化学、細胞培養、免疫学、腫瘍学、組換えＤＮＡの分野および当技術分野の技術の範囲内の関連する分野における標準の方法および従来の技法が使用される。そのような技法は、文献に記載されており、それにより、当業者が利用可能である。例えば、Ａｌｂｅｒｔｓ， Ｂ．ら、「Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ ｏｆ ｔｈｅ Ｃｅｌｌ」、第５版、Ｇａｒｌａｎｄ Ｓｃｉｅｎｃｅ、Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ、ＮＹ、２００８年；Ｖｏｅｔ， Ｄ．ら、「Ｆｕｎｄａｍｅｎｔａｌｓ ｏｆ Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ： Ｌｉｆｅ ａｔ ｔｈｅ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｌｅｖｅｌ」、第３版、Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ、Ｈｏｂｏｋｅｎ、ＮＪ、２００８年；Ｓａｍｂｒｏｏｋ， Ｊ．ら、「Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ： Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ」、第３版、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ、２００１年； Ａｕｓｕｂｅｌ， Ｆ．ら、「Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ」、Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ、Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ、１９８７年および定期的更新版； Ｆｒｅｓｈｎｅｙ， Ｒ．Ｉ．、「Ｃｕｌｔｕｒｅ ｏｆ Ａｎｉｍａｌ Ｃｅｌｌｓ： Ａ Ｍａｎｕａｌ ｏｆ Ｂａｓｉｃ Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅ」、第４版、Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ、Ｓｏｍｅｒｓｅｔ、ＮＪ、２０００年；および「Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ」シリーズ、Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ、Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ、ＣＡを参照されたい。例えば、「Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ」、（Ｒ． Ｃｏｉｃｏ、シリーズ編集者）、Ｗｉｌｅｙ、２０１０年８月に最新更新されたものも参照されたい。

特定のＭＭＰの異常な活性が腫瘍の成長、転移、炎症、自己免疫、および血管疾患において役割を果たす。例えば、Ｈｕら（２００７年）Ｎａｔｕｒｅ Ｒｅｖｉｅｗｓ：Ｄｒｕｇ Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ ６巻：４８０〜４９８頁を参照されたい。特定の治療的状況において１種または複数種のＭＭＰの活性を阻害することが望ましい場合がある。しかし、特定の他のＭＭＰ、例えばＭＭＰ２の活性は、多くの場合、正常な機能のために必要であり、かつ／または疾患を防止する。大多数のＭＭＰ阻害剤は保存された触媒ドメインを標的とし、結果として、いくつもの異なるＭＭＰを阻害するので、利用可能なＭＭＰ阻害剤を使用することにより、必須な、病原として関連しないＭＭＰが阻害されることに起因する副作用が引き起こされている。これらの副作用は、より広範に亜鉛要求性酵素の阻害を含めた、これらの阻害剤の多くによって引き起こされる一般的な亜鉛キレート化にも起因する可能性がある。

特定のＭＭＰに特異的なまたはＭＭＰを選択する阻害剤の開発に伴う難題は、基質競合機構による酵素活性の阻害には、一般に、阻害剤を触媒ドメインにターゲティングすることが必要であるという事実に関連する。ＭＭＰ触媒ドメインの相同性により、阻害剤が１つ超のＭＭＰとの反応を引き起こし得る。提供される実施形態としては、単一のＭＭＰの触媒活性を特異的に阻害するまたはＭＭＰ９などの複数のＭＭＰを選択し、また、ある特定の他のＭＭＰまたはあらゆる他のＭＭＰとは反応しないまたはそれを阻害しない抗体およびその抗原結合断片などの治療用試薬を含めた作用剤がある。提供される実施形態としては、慢性閉塞性肺障害（ＣＯＰＤ）を処置するための方法およびその使用もある。ある特定の実施形態では、本開示のＭＭＰ９結合タンパク質（複数可）は、一般的な大きな触媒ドメインに結合するが、基質ポケットには結合せず、他のアロステリックな機構によって作用するようである（例えば、本開示のＭＭＰ９結合タンパク質は、基質と結合について競合せず、基質の存在または基質濃度に依存せずに阻害する）。

本明細書では、被験体における慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）を処置または防止するための方法であって、被験体に、免疫グロブリン重鎖ポリペプチドまたはその機能性断片、および免疫グロブリン軽鎖ポリペプチドまたはその機能性断片を含み、有効量の、ＭＭＰ９に特異的に結合するマトリックスメタロプロテイナーゼ９（ＭＭＰ９）結合タンパク質を投与するステップを含む方法が提供される。ＣＯＰＤの処置または防止において使用するための組成物であって、免疫グロブリン重鎖ポリペプチドまたはその機能性断片、および免疫グロブリン軽鎖ポリペプチドまたはその機能性断片を含み、ＭＭＰ９に特異的に結合するマトリックスメタロプロテイナーゼ９（ＭＭＰ９）結合タンパク質を含む組成物も提供される。ＣＯＰＤを処置または防止するための医薬の製造における、マトリックスメタロプロテイナーゼ９（ＭＭＰ９）結合タンパク質の使用であって、該ＭＭＰ９タンパク質が、免疫グロブリン重鎖ポリペプチドまたはその機能性断片、および免疫グロブリン軽鎖ポリペプチドまたはその機能性断片を含み、該ＭＭＰ９結合タンパク質がＭＭＰ９に特異的に結合する使用も提供される。本明細書に記載の任意のＭＭＰ９結合タンパク質（例えば、ＭＭＰ９に結合する抗体またはその抗原結合断片）を本明細書に記載の方法において使用することができる。

本明細書で使用される場合、単数形「ａ（１つの）」、「ａｎ（１つの）」および「ｔｈｅ（その）」は、別段の指定のない限り、複数への言及を包含する。

「約」値またはパラメータへの言及は、本明細書では、本技術分野の当業者には容易に分かる、それぞれの値についての通常の誤差範囲を指す。「約」値またはパラメータへの言及は、本明細書では、その値またはパラメータそれ自体を対象とする態様を包含する（および記載する）。例えば、「約Ｘ」に関する記載は、「Ｘ」についての記載を包含する。ある特定の実施形態では、「約」という用語は、示されている量±１％〜１０％を包含する。他の実施形態では、「約」という用語は、示されている量±５％を包含する。ある特定の他の実施形態では、「約」という用語は、示されている量±１％を包含する。ある特定の他の実施形態では、「約」という用語は、示されている量±１０％を包含する。

本明細書に記載の本発明の態様および実施形態は、「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」、「からなる（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ）」、および「から本質的になる（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ ｅｓｓｅｎｔｉａｌｌｙ ｏｆ）」態様および実施形態を包含することが理解される。

特許出願および刊行物を含めた、本明細書において引用された全ての参考文献は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。

ＭＭＰ９結合タンパク質
ＭＭＰ９により、基底膜コラーゲンおよび他の細胞外マトリックス（ＥＣＭ）構成成分が分解される。Ｋｅｓｓｅｎｂｒｏｃｋ Ｋら、「Ｍａｔｒｉｘ ｍｅｔａｌｌｏｐｒｏｔｅｉｎａｓｅｓ： ｒｅｇｕｌａｔｏｒｓ ｏｆ ｔｈｅ ｔｕｍｏｒ ｍｉｃｒｏｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔ」、Ｃｅｌｌ（２０１０年）；１４１巻（１号）：５２〜６７頁。マトリックス分解は、関節炎、がん、および潰瘍性大腸炎を含めた複数の疾患における病理に寄与する。Ｒｏｙ Ｒら、「Ｍａｔｒｉｘ ｍｅｔａｌｌｏｐｒｏｔｅｉｎａｓｅｓ ａｓ ｎｏｖｅｌ ｂｉｏｍａｒｋｅｒｓ ａｎｄ ｐｏｔｅｎｔｉａｌ ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ ｔａｒｇｅｔｓ ｉｎ ｈｕｍａｎ ｃａｎｃｅｒ」、Ｊ Ｃｌｉｎ Ｏｎｃｏｌ （２００９年）；２７巻（３１号）：５２８７〜９７頁。炎症およびがんの動物モデルでは、マリマスタットなどの広範囲にわたるマトリックスメタロプロテイナーゼ阻害剤が効果的である（Ｗａｔｓｏｎ ＳＡら、「Ｉｎｈｉｂｉｔｉｏｎ ｏｆ ｔｕｍｏｕｒ ｇｒｏｗｔｈ ｂｙ ｍａｒｉｍａｓｔａｔ ｉｎ ａ ｈｕｍａｎ ｘｅｎｏｇｒａｆｔ ｍｏｄｅｌ ｏｆ ｇａｓｔｒｉｃ ｃａｎｃｅｒ： ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ ｗｉｔｈ ｌｅｖｅｌｓ ｏｆ ｃｉｒｃｕｌａｔｉｎｇ ＣＥＡ」、Ｂｒ Ｊ Ｃａｎｃｅｒ （１９９９年）；８１巻（１号）：１９〜２３頁；Ｓｙｋｅｓ ＡＰら、「Ｔｈｅ ｅｆｆｅｃｔ ｏｆ ａｎ ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ ｏｆ ｍａｔｒｉｘ ｍｅｔａｌｌｏｐｒｏｔｅｉｎａｓｅｓ ｏｎ ｃｏｌｏｎｉｃ ｉｎｆｌａｍｍａｔｉｏｎ ｉｎ ａ ｔｒｉｎｉｔｒｏｂｅｎｚｅｎｅｓｕｌｐｈｏｎｉｃ ａｃｉｄ ｒａｔ ｍｏｄｅｌ ｏｆ ｉｎｆｌａｍｍａｔｏｒｙ ｂｏｗｅｌ ｄｉｓｅａｓｅ」、Ａｌｉｍｅｎｔ Ｐｈａｒｍａｃｏｌ Ｔｈｅｒ （１９９９年）；１３巻（１１号）：１５３５〜４２頁）。しかし、そのような汎阻害剤により、一般には、ヒトでは、マリマスタットの効果的な用量レベルまたはその付近で、集合的に筋骨格症候群（ＭＳＳ）と称される手、腕、および肩の関節の凝り、炎症、および疼痛を含めた筋骨格の副作用が引き起こされる恐れがある。Ｐｅｔｅｒｓｏｎ ＪＴ． 「Ｔｈｅ ｉｍｐｏｒｔａｎｃｅ ｏｆ ｅｓｔｉｍａｔｉｎｇ ｔｈｅ ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ ｉｎｄｅｘ ｉｎ ｔｈｅ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ｏｆ ｍａｔｒｉｘ ｍｅｔａｌｌｏｐｒｏｔｅｉｎａｓｅ ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｓ」、Ｃａｒｄｉｏｖａｓｃ Ｒｅｓ （２００６年）；６９巻（３号）：６７７〜８７頁；Ｔｉｅｒｎｅｙ ＧＭら 「Ａ ｐｉｌｏｔ ｓｔｕｄｙ ｏｆ ｔｈｅ ｓａｆｅｔｙ ａｎｄ ｅｆｆｅｃｔｓ ｏｆ ｔｈｅ ｍａｔｒｉｘ ｍｅｔａｌｌｏｐｒｏｔｅｉｎａｓｅ ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ ｍａｒｉｍａｓｔａｔ ｉｎ ｇａｓｔｒｉｃ ｃａｎｃｅｒ」、Ｅｕｒ Ｊ Ｃａｎｃｅｒ （１９９９年）；３５巻（４号）：５６３〜８頁；Ｗｏｊｔｏｗｉｃｚ−Ｐｒａｇａ Ｓら、「Ｐｈａｓｅ Ｉ ｔｒｉａｌ ｏｆ Ｍａｒｉｍａｓｔａｔ、ａ ｎｏｖｅｌ ｍａｔｒｉｘ ｍｅｔａｌｌｏｐｒｏｔｅｉｎａｓｅ ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ， ａｄｍｉｎｉｓｔｅｒｅｄ ｏｒａｌｌｙ ｔｏ ｐａｔｉｅｎｔｓ ｗｉｔｈ ａｄｖａｎｃｅｄ ｌｕｎｇ ｃａｎｃｅｒ」、Ｊ Ｃｌｉｎ Ｏｎｃｏｌ （１９９８年）；１６巻（６号）：２１５０〜６頁。症状は用量依存性かつ時間依存性であり、汎ＭＭＰ阻害剤を用いた処置を休止したすぐ後には可逆的である。Ｗｏｊｔｏｗｉｃｚ−Ｐｒａｇａ Ｓ、１９９８年；Ｎｅｍｕｎａｉｔｉｓ Ｊら、「Ｃｏｍｂｉｎｅｄ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｓｔｕｄｉｅｓ ｏｆ ｔｈｅ ｅｆｆｅｃｔｓ ｏｆ ｔｈｅ ｍａｔｒｉｘ ｍｅｔａｌｌｏｐｒｏｔｅｉｎａｓｅ ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ ｍａｒｉｍａｓｔａｔ ｏｎ ｓｅｒｕｍ ｔｕｍｏｒ ｍａｒｋｅｒｓ ｉｎ ａｄｖａｎｃｅｄ ｃａｎｃｅｒ： ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ ｏｆ ａ ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌｌｙ ａｃｔｉｖｅ ａｎｄ ｔｏｌｅｒａｂｌｅ ｄｏｓｅ ｆｏｒ ｌｏｎｇｅｒ−ｔｅｒｍ ｓｔｕｄｉｅｓ」、Ｃｌｉｎ Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ （１９９８年）；４巻（５号）：１１０１〜９頁；Ｈｕｔｃｈｉｎｓｏｎ ＪＷら、「Ｄｕｐｕｙｔｒｅｎ’ｓ ｄｉｓｅａｓｅ ａｎｄ ｆｒｏｚｅｎ ｓｈｏｕｌｄｅｒ ｉｎｄｕｃｅｄ ｂｙ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｗｉｔｈ ａ ｍａｔｒｉｘ ｍｅｔａｌｌｏｐｒｏｔｅｉｎａｓｅ ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ」、Ｔｈｅ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ ｂｏｎｅ ａｎｄ ｊｏｉｎｔ ｓｕｒｇｅｒｙ． Ｂｒｉｔｉｓｈ ｖｏｌｕｍｅ （１９９８年）；８０巻（５号）：９０７〜８頁。マリマスタットおよび他の同じクラスの汎ＭＭＰ阻害剤は亜鉛キレート化剤である。Ｐｅｔｅｒｓｏｎ ＪＴ、２００６年。ホモ接合性ＭＭＰ９ノックアウトマウスは、ＭＳＳ様症状もＭＳＳ様組織変化も示さない。Ｖｕ ＴＨら、「ＭＭＰ−９／ｇｅｌａｔｉｎａｓｅ Ｂ ｉｓ ａ ｋｅｙ ｒｅｇｕｌａｔｏｒ ｏｆ ｇｒｏｗｔｈ ｐｌａｔｅ ａｎｇｉｏｇｅｎｅｓｉｓ ａｎｄ ａｐｏｐｔｏｓｉｓ ｏｆ ｈｙｐｅｒｔｒｏｐｈｉｃ ｃｈｏｎｄｒｏｃｙｔｅｓ」、Ｃｅｌｌ （１９９８年）；９３巻（３号）：４１１〜２２頁。

本開示は、マトリックスメタロプロテイナーゼ−９（ＭＭＰ９）タンパク質（ＭＭＰ９は、ゼラチナーゼ−Ｂとしても公知である）に結合する結合タンパク質、例えば、抗体およびその断片（例えば、抗原結合断片）、例えば、配列番号２７または配列番号２８に記載のアミノ酸配列を有するヒトＭＭＰ９などのヒトＭＭＰ９を提供する。本開示の結合タンパク質は、一般には、免疫グロブリン（Ｉｇ）重鎖（またはその機能性断片）およびＩｇ軽鎖（またはその機能性断片）を含む。

本開示は、さらに、ＭＭＰ９に特異的に結合し、ＭＭＰ１、ＭＭＰ２、ＭＭＰ３、ＭＭＰ７、ＭＭＰ９、ＭＭＰ１０、ＭＭＰ１２、およびＭＭＰ１３などの他のマトリックスメタロプロテイナーゼには結合しないＭＭＰ９結合タンパク質を提供する。したがって、そのような特異的なＭＭＰ９結合タンパク質は、一般に、非ＭＭＰ９マトリックスメタロプロテイナーゼとは有意にまたは検出可能に交差反応しない。ＭＭＰ９に特異的に結合するＭＭＰ９結合タンパク質は、例えば、他のマトリックスメタロプロテイナーゼの活性には直接影響を及ぼすことなく、ＭＭＰ９の特異的な調節（例えば、阻害）を得ることが必要である、またはそれが望ましい適用において使用される。

本開示のある特定の実施形態では、抗ＭＭＰ９抗体は、ＭＭＰ９の活性の阻害剤であり、ＭＭＰ９の特異的な阻害剤であってよい。具体的には、本明細書に開示されているＭＭＰ９結合タンパク質は、ＭＭＰ９の阻害に有用である一方で、他の、関連するマトリックスメタロプロテイナーゼの正常な機能を可能にする。「ＭＭＰの阻害剤」または「ＭＭＰ９活性の阻害剤」とは、これだけに限定されないが、酵素的プロセシング（ｅｎｚｙｍａｔｉｃ ｐｒｏｃｅｓｓｉｎｇ）、ＭＭＰ９のその基質に対する作用の阻害（例えば、基質の結合、基質の切断などを阻害することによる）などを含め、直接的に、または間接的にＭＭＰ９の活性を阻害する抗体またはその抗原結合断片であってよい。

いくつかの実施形態では、本明細書の実施例において実証されている通り、汎ＭＭＰ阻害剤、例えばマリマスタットなどの小分子汎阻害剤などを使用して処置することにより、歩行、姿勢および動く意欲に対する実質的な影響、ならびに関節への甚大な組織学的損傷を含めた、筋骨格症候群（ＭＳＳ）などの筋骨格疾患の症状が生じるが、ＭＭＰ９の特異的な阻害、例えば、本出願における抗体またはその抗原結合断片などでは、そのような症状は引き起こされず、ＭＳＳは誘導されない。

本開示は、ヒトＭＭＰ９、カニクイザルＭＭＰ９、およびラットＭＭＰ９などの非マウスＭＭＰ９に特異的に結合するＭＭＰ９結合タンパク質も提供する。

本開示は、非競合的な阻害剤としての機能を果たすＭＭＰ９結合タンパク質（例えば、抗ＭＭＰ９抗体およびその機能性断片）も提供する。「非競合的な阻害剤」とは、酵素の基質結合部位から離れた部位に結合する、したがって、酵素がその基質と結合するか否かにかかわらず酵素に結合し、阻害活性に影響を及ぼすことができる阻害剤を指す。そのような非競合的な阻害剤により、例えば、基質濃度に実質的に非依存性であり得る阻害のレベルをもたらすことができる。

本開示のＭＭＰ９結合タンパク質（例えば、抗体およびその機能性断片）は、ＭＭＰ９、特にヒトＭＭＰ９に結合し、本明細書に開示されている重鎖ポリペプチドに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％またはそれ超のアミノ酸配列同一性を有する重鎖ポリペプチド（またはその機能性断片）を有するものを包含する。一部の例では、本開示のＭＭＰ９結合タンパク質（例えば、抗体およびその機能性断片）は、ＭＭＰ９、特にヒトＭＭＰ９に結合し、本明細書に開示されている重鎖ポリペプチドに対して少なくとも約９０％、９５％、９７％、９８％、９９％またはそれ超のアミノ酸配列同一性を有する重鎖ポリペプチド（またはその機能性断片）を有するものを包含する。

本開示のＭＭＰ９結合タンパク質（例えば、抗体およびその機能性断片）は、ＭＭＰ９、特にヒトＭＭＰ９に結合し、本明細書に開示されている重鎖ポリペプチドに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％またはそれ超のアミノ酸配列同一性を有する軽鎖ポリペプチド（ｌｉｇｈｔ ｐｏｌｙｐｅｐｔｉｄｅ）（またはその機能性断片）を有するものを包含する。本開示のＭＭＰ９結合タンパク質は、ＭＭＰ９、特に、ヒトＭＭＰ９に結合し、本明細書に開示されている軽鎖ポリペプチドに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％またはそれ超のアミノ酸配列同一性を有する軽鎖ポリペプチド（またはその機能性断片）を有するものを包含する。一部の例では、本開示のＭＭＰ９結合タンパク質は、ＭＭＰ９、特に、ヒトＭＭＰ９に結合し、本明細書に開示されている軽鎖ポリペプチドに対して少なくとも約９０％、９５％、９７％、９８％、９９％またはそれ超のアミノ酸配列同一性を有する軽鎖ポリペプチド（またはその機能性断片）を有するものを包含する。

本開示のＭＭＰ９結合タンパク質（例えば、抗体およびその機能性断片）は、ＭＭＰ９、特にヒトＭＭＰ９に結合し、本明細書に開示されている重鎖ポリペプチドの相補性決定領域（「ＣＤＲ」）を有する重鎖ポリペプチド（またはその機能性断片）および軽鎖ポリペプチド（またはその機能性断片）のＣＤＲを有するものを包含する。

「相同性」または「同一性」または「類似性」とは、本明細書において核酸およびポリペプチドに関して使用される場合、それぞれ、アミノ酸配列または核酸配列のアラインメントに基づいた２つのポリペプチド間または２つの核酸分子間の関係を指す。相同性および同一性は、それぞれ比較するためにアラインメントすることができる各配列内の位置を比較することによって決定することができる。比較する配列内の同等の位置が同じ塩基またはアミノ酸によって占有されていれば、それらの分子はその位置において同一であり、同等の部位が同じまたは類似したアミノ酸残基（例えば、立体的本質および／または電子的本質が類似している）によって占有されていれば、その分子は、その位置において相同である（類似した）と称することができる。相同性／類似性または同一性の百分率としての表示とは、比較される配列によって共有される位置における同一のまたは類似したアミノ酸の数の関数を指す。２つの配列の比較において、残基（アミノ酸または核酸）が存在しないことまたは余分の残基が存在することによっても、同一性および相同性／類似性が低下する。

本明細書で使用される場合、「同一性」とは、配列をアラインメントして配列マッチングを最大にした場合、すなわち、ギャップおよび挿入を考慮に入れた場合に、２つ以上の配列内の対応する位置にある同一のヌクレオチドまたはアミノ酸残基の百分率を意味する。配列は、一般に、指定の領域、例えば、少なくとも約２０、約２５、約３０、約３５、約４０、約４５、約５０、約５５、約６０、約６５またはそれ超のアミノ酸長またはヌクレオチド長の領域にわたって、および参照アミノ酸またはヌクレオチドの全長に至ってよい領域にわたって一致が最大になるようにアラインメントされる。配列比較のために、一般には、１つの配列が、試験配列が比較される参照配列として作用する。配列比較アルゴリズムを使用する場合、試験配列および参照配列をコンピュータプログラムにインプットし、必要であれば部分配列座標を指定し、配列アルゴリズムプログラムパラメータを指定する。次いで、配列比較アルゴリズムにより、試験配列（複数可）について、指定されたプログラムパラメータに基づいて参照配列と比較してパーセント配列同一性を算出する。

パーセント配列同一性を決定するために適したアルゴリズムの例はＢＬＡＳＴアルゴリズムおよびＢＬＡＳＴ２．０アルゴリズムであり、これらは、それぞれＡｌｔｓｃｈｕｌら（１９９０年）Ｊ． Ｍｏｌ． Ｂｉｏｌ． ２１５巻：４０３〜４１０頁およびＡｌｔｓｃｈｕｌら（１９７７年）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ． ２５巻：３３８９〜３４０２頁に記載されている。ＢＬＡＳＴ分析を実施するためのソフトウェアは、Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ（ｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ）を通じて公的に入手可能である。別の例示的なアルゴリズムとしては、ｗｗｗ．ｅｂｉ．ａｃ．ｕｋ／Ｔｏｏｌｓ／ｃｌｕｓｔａｌｗ／ｉｎｄｅｘ．ｈｔｍｌにおいて入手可能なＣｌｕｓｔａｌＷ（Ｈｉｇｇｉｎｓ Ｄ．ら（１９９４年）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ ２２巻：４６７３〜４６８０頁）が挙げられる。

同一でない残基の位置は保存的アミノ酸置換によって異なり得る。保存的アミノ酸置換とは、類似した側鎖を有する残基の互換性を指す。例えば、脂肪族側鎖を有するアミノ酸の群は、グリシン、アラニン、バリン、ロイシン、およびイソロイシンであり、脂肪族ヒドロキシル側鎖を有するアミノ酸の群はセリンおよびトレオニンであり、アミドを含有する側鎖を有するアミノ酸の群はアスパラギンおよびグルタミンであり、芳香族側鎖を有するアミノ酸の群はフェニルアラニン、チロシンおよびトリプトファンであり、塩基性側鎖を有するアミノ酸の群はリシン、アルギニン、およびヒスチジンであり、硫黄を含有する側鎖を有するアミノ酸の群は、システインおよびメチオニンである。

２つの核酸の間の配列同一性を、２つの分子の、ストリンジェントな条件下での互いとのハイブリダイゼーションに関して記載することもできる。ハイブリダイゼーション条件は当技術分野における標準の方法に従って選択される（例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋら、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ： Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ、第２版（１９８９年）Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ、Ｎ．Ｙ．を参照されたい）。ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件の例は、５０℃以上、０．１×ＳＳＣ（１５ｍＭの塩化ナトリウム／１．５ｍＭのクエン酸ナトリウム）でのハイブリダイゼーションである。ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件の別の例は、溶液：５０％ホルムアミド、５×ＳＳＣ（１５０ｍＭのＮａＣｌ、１５ｍＭのクエン酸三ナトリウム）、５０ｍＭのリン酸ナトリウム（ｐＨ７．６）、５×デンハート液、１０％デキストラン硫酸、および２０ｍｇ／ｍｌの変性せん断サケ精子ＤＮＡ中、４２℃で一晩インキュベートし、その後、フィルターを０．１×ＳＳＣ中、約６５℃で洗浄することである。ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件は、少なくとも上記の代表的な条件と同様にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件であり、条件は、上記の特定のストリンジェントな条件と少なくとも約８０％同様にストリンジェント、一般には、少なくとも９０％同様にストリンジェントであれば、少なくとも同様にストリンジェントであるとみなされる。

したがって、本開示は、例えば、本明細書に記載の重鎖可変領域のアミノ酸配列（例えば、配列番号１または配列番号５〜８）に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれ超のアミノ酸配列同一性を有する重鎖可変領域ポリペプチド、および本明細書に記載の軽鎖ポリペプチド（例えば、配列番号２または配列番号９〜１２）のアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれ超のアミノ酸配列同一性を有する可変軽鎖ポリペプチドを含む抗体またはその抗原結合断片を提供する。一実施形態では、本開示は、配列番号７に記載の重鎖可変領域アミノ酸配列に対して少なくとも約９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれ超のアミノ酸配列同一性を有する重鎖可変領域ポリペプチド、および配列番号１２に記載の軽鎖ポリペプチドのアミノ酸配列に対して少なくとも約９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれ超のアミノ酸配列同一性を有する可変軽鎖ポリペプチドを含む抗体またはその抗原結合断片を提供する。さらなる例では、本開示は、配列番号３２、４０または４７に記載の重鎖可変領域アミノ酸配列に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれ超のアミノ酸配列同一性を有する重鎖可変領域ポリペプチド、および配列番号３３、４１または４８に記載の軽鎖ポリペプチドのアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれ超のアミノ酸配列同一性を有する可変軽鎖ポリペプチドを含む抗体またはその抗原結合断片を提供する。一部の実施形態では、本開示は、配列番号３２、４０または４７に記載の重鎖可変領域のアミノ酸配列に対して少なくとも約９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれ超のアミノ酸配列同一性を有する重鎖可変領域ポリペプチド、および配列番号３３、４１または４８に記載の軽鎖ポリペプチドのアミノ酸配列に対して少なくとも約９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれ超のアミノ酸配列同一性を有する可変軽鎖ポリペプチドを含む抗体またはその抗原結合断片を提供する。さらなる実施形態では、本出願は、配列番号７、１２、１３、１４、１５、１６、１７または１８に記載のアミノ酸配列に対して少なくとも約９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれ超の同一性を有するアミノ酸配列を含むタンパク質または抗体との結合について競合し得る抗体またはその抗原結合断片を提供する。

本開示の抗ＭＭＰ９抗体の例を、以下により詳細に記載する。

抗体
ＭＭＰ９結合タンパク質は、ＭＭＰ９に特異的に結合するものなどの抗体およびその機能性断片を含む。本明細書で使用される場合、「抗体」という用語は、抗原エピトープに特異的に結合するペプチド配列（例えば、可変領域の配列）を含む、単離された、または組換え型のポリペプチド結合作用剤を意味する。この用語は、その最も広範な意味で使用され、特にモノクローナル抗体（全長のモノクローナル抗体を含む）、ポリクローナル抗体、ヒト抗体、ヒト化抗体、キメラ抗体、ナノボディ、ダイアボディ（ｄｉａｂｏｄｙ）、多重特異性抗体（例えば、二重特異性抗体）、ならびに、所望の生物活性を示す限りは、これだけに限定されないが、Ｆｖ、ｓｃＦｖ、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）_２およびＦａｂ_２を含めた抗体断片を包含する。「ヒト抗体」という用語は、可能な非ヒトＣＤＲ領域以外はヒト起源の配列を含有する抗体を指し、また、免疫グロブリン分子の完全な構造が存在することを意味するものではなく、抗体が、ヒトにおいて最小の免疫原性作用を有する（すなわち、それ自体に対する抗体の産生を誘導しない）ことのみを意味する。

「抗体断片」とは、全長の抗体の一部、例えば、全長の抗体の抗原結合領域または可変領域を含む。そのような抗体断片は、本明細書では、「機能性断片」または「抗原結合断片」とも称することができる。抗体断片の例としては、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）_２、およびＦｖ断片；ダイアボディ；直鎖抗体（Ｚａｐａｔａら（１９９５年）Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇ． ８巻（１０号）：１０５７〜１０６２頁）；単鎖抗体分子；ならびに抗体断片から形成される多重特異性抗体が挙げられる。抗体のパパイン消化により、「Ｆａｂ」断片と称される、それぞれが単一の抗原結合部位を有する２つの同一の抗原結合断片、および残りの、容易に結晶化することができることが名称に反映された「Ｆｃ」断片が生じる。ペプシン処理により、２つの抗原結合部位を有し、なお抗原と架橋することができるＦ（ａｂ’）_２断片がもたらされる。

「Ｆｖ」とは、完全な抗原認識部位および抗原結合部位を含有する最小の抗体断片である。この領域は、１つの重鎖可変ドメインと１つの軽鎖可変ドメインが密接に非共有結合で会合した二量体からなる。この立体配置では、各可変ドメインの３つの相補性決定領域（ＣＤＲ）が相互作用してＶ_Ｈ−Ｖ_Ｌ二量体の表面上に抗原結合部位が確定される。集合的に、６つのＣＤＲにより抗原との結合の特異性が抗体に付与される。しかし、単一の可変ドメイン（または抗原に特異的な６つのＣＤＲのうちの３つしか含まない単離されたＶ_Ｈ領域またはＶ_Ｌ領域）でさえ、抗原を認識し、それに結合することができるが、一般に親和性はＦｖ断片全体よりも低い。

「Ｆ_ａｂ」断片は、重鎖可変領域および軽鎖可変領域に加えて、軽鎖の定常ドメインおよび重鎖の第１の定常ドメイン（ＣＨ_１）も含有する。Ｆａｂ断片は、抗体のパパイン消化後に最初に観察された。Ｆａｂ’断片は、Ｆ（ａｂ’）断片が重鎖ＣＨ_１ドメインのカルボキシ末端に抗体ヒンジ領域由来の１つまたは複数のシステインを含めたいくつかの追加の残基を含有するという点でＦａｂ断片とは異なる。Ｆ（ａｂ’）_２断片は、ヒンジ領域の近くでジスルフィド結合によってつながった２つのＦａｂ断片を含有し、また、抗体のペプシン消化後に最初に観察された。Ｆａｂ’−ＳＨとは、本明細書では、定常ドメインのシステイン残基（複数可）が遊離型のチオール基を担持するＦａｂ’断片に対する名称である。抗体断片の他の化学的カップリングも公知である。

任意の脊椎動物種由来の抗体（免疫グロブリン）の「軽鎖」は、それらの定常ドメインのアミノ酸配列に基づいて、カッパおよびラムダと称される２つの明白に異なる種類の一方に割り当てることができる。それらの重鎖の定常ドメインのアミノ酸配列に応じて、免疫グロブリンを５つの主要なクラス：ＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧ、およびＩｇＭに割り当てることができ、これらのうちのいくつかは、サブクラス（アイソタイプ）、例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１、およびＩｇＡ２にさらに分けることができる。

「単鎖Ｆｖ」または「ｓＦｖ」または「ｓｃＦｖ」抗体断片は、抗体のＶ_ＨドメインおよびＶ_Ｌドメインを含み、これらのドメインは、単一のポリペプチド鎖に存在する。いくつかの実施形態では、Ｆｖポリペプチドは、Ｖ_ＨドメインとＶ_Ｌドメインの間にポリペプチドリンカーをさらに含み、これにより、ｓＦｖが抗原と結合するための所望の構造を形成することが可能になる。ｓＦｖの概説については、Ｐｌｕｃｋｔｈｕｎ、Ｔｈｅ Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ ｏｆ Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ、１１３巻（ＲｏｓｅｎｂｕｒｇおよびＭｏｏｒｅ編）Ｓｐｒｉｎｇｅｒ−Ｖｅｒｌａｇ、Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ、２６９〜３１５頁（１９９４年）を参照されたい。

「ダイアボディ」という用語は、２つの抗原結合部位を有する小さな抗体断片を指し、この断片は、同じポリペプチド鎖内で接続した重鎖可変ドメイン（Ｖ_Ｈ）と軽鎖可変ドメイン（Ｖ_Ｌ）（Ｖ_Ｈ−Ｖ_Ｌ）を含む。同じ鎖上の２つのドメイン間の対合が可能になるには短すぎるリンカーを使用することによって、ドメインを別の鎖の相補的なドメインと対合させ、それにより、２つの抗原結合部位を作製する。ダイアボディは、さらに、例えば、ＥＰ４０４，０９７；ＷＯ９３／１１１６１、およびＨｏｌｌｉｎｇｅｒら（１９９３年）Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ＵＳＡ ９０巻：６４４４〜６４４８頁に記載されている。

「単離された」抗体とは、その天然の環境の構成成分から同定され、分離および／または回収された抗体である。その天然の環境の構成成分は、酵素、ホルモン、および他のタンパク質性溶質または非タンパク質性溶質を含み得る。いくつかの実施形態では、単離された抗体は、（１）Ｌｏｗｒｙ法によって決定したところ、抗体の９５重量％超、例えば、９９重量％超まで、（２）例えば、スピニングカップシークエネーターを使用することによって少なくとも１５残基のＮ末端または内部のアミノ酸配列を得るために十分な程度まで、または（３）クーマシーブルー（Ｃｏｏｍａｓｓｉｅ ｂｌｕｅ）または銀染色による検出を用いた、還元条件下または非還元条件下でのゲル電気泳動（例えば、ＳＤＳ−ＰＡＧＥ）によって均一になるまで、精製される。組換え細胞内のｉｎ ｓｉｔｕ抗体は、抗体の天然の環境の少なくとも１つの構成成分が存在しないので、「単離された抗体」という用語に包含される。ある特定の実施形態では、単離された抗体は、少なくとも１つの精製ステップによって調製される。

本明細書で使用される場合、「免疫反応性の」とは、他のペプチド／タンパク質に対して交差反応性であっても、アミノ酸残基の配列（「結合部位」または「エピトープ」）に特異的であって、ヒトへの使用のために投与するために製剤化されるレベルにおいて毒性でない抗体またはその断片を指す。「エピトープ」とは、抗体またはその抗原結合断片との結合相互作用を形成することができる抗原の部分を指す。エピトープは、直鎖ペプチド配列（すなわち、「連続的」）であってもよく、連続していないアミノ酸配列で構成されてもよい（すなわち、「立体構造」または「不連続」）。「優先的に結合する」という用語は、結合作用剤が、結合部位に、無関係のアミノ酸配列に結合するよりも大きな親和性で結合することを意味する。

抗ＭＭＰ９抗体は、重鎖および軽鎖のＣＤＲに関して記載することができる。本明細書で使用される場合、「ＣＤＲ」または「相補性決定領域」という用語は、重鎖ポリペプチドおよび軽鎖ポリペプチドの両方の可変領域において見出される連続していない抗原結合部位を意味するものとする。これらの特定の領域は、Ｋａｂａｔら、Ｊ． Ｂｉｏｌ． Ｃｈｅｍ． ２５２巻：６６０９〜６６１６頁（１９７７年）；Ｋａｂａｔら、Ｕ．Ｓ． Ｄｅｐｔ． ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ ａｎｄ Ｈｕｍａｎ Ｓｅｒｖｉｃｅｓ、「Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｏｆ ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ ｉｎｔｅｒｅｓｔ」（１９９１年）；Ｃｈｏｔｈｉａら、Ｊ． Ｍｏｌ． Ｂｉｏｌ． １９６巻：９０１〜９１７頁（１９８７年）；およびＭａｃＣａｌｌｕｍら、Ｊ． Ｍｏｌ． Ｂｉｏｌ．２６２巻：７３２〜７４５頁（１９９６年）によって記載されており、定義は、互いに比較した場合にアミノ酸残基のオーバーラップまたはサブセットを含む。それにもかかわらず、いずれの定義を適用して抗体または移植抗体またはその変異体のＣＤＲについて言及することも、本明細書において定義され、使用されるこの用語の範囲内であるものとする。上で引用された参考文献のそれぞれによって定義されるＣＤＲを包含するアミノ酸残基は以下の表１Ａに比較として記載されている。

本明細書で使用される場合、「フレームワーク」という用語は、抗体可変領域に関して使用される場合、抗体の可変領域内のＣＤＲ領域の外側の全てのアミノ酸残基を意味するものとする。可変領域フレームワークは、一般に、長さが約１００アミノ酸から約１２０アミノ酸の間の不連続なアミノ酸配列であるが、ＣＤＲの外側のアミノ酸のみを指すものとする。本明細書で使用される場合、「フレームワーク領域」という用語は、ＣＤＲによって分離されているフレームワークの各ドメインを意味するものとする。

いくつかの実施形態では、抗体は、ヒト化抗体またはヒト抗体である。ヒト化抗体は、レシピエントの相補性決定領域（ＣＤＲ）由来の残基が、所望の特異性、親和性および能力を有するマウス、ラットまたはウサギなどの非ヒト種（ドナー抗体）のＣＤＲ由来の残基で置き換えられているヒト免疫グロブリン（レシピエント抗体）を包含する。したがって、非ヒト（例えば、マウス）抗体のヒト化形態は、非ヒト免疫グロブリンに由来する最小の配列を含有するキメラ免疫グロブリンである。非ヒト配列は、主に可変領域、特に相補性決定領域（ＣＤＲ）に位置する。いくつかの実施形態では、ヒト免疫グロブリンのＦｖフレームワーク残基が対応する非ヒト残基で置き換えられている。ヒト化抗体は、レシピエント抗体にも移入されたＣＤＲやフレームワーク配列にも見出されない残基も含んでよい。ある特定の実施形態では、ヒト化抗体は、少なくとも１つ、一般には２つの可変ドメインの実質的に全てを含み、ＣＤＲの全てまたは実質的に全てが、非ヒト免疫グロブリンのＣＤＲに対応し、フレームワーク領域の全てまたは実質的に全てがヒト免疫グロブリンコンセンサス配列のフレームワーク領域に対応する。本開示の目的に関して、ヒト化抗体は、免疫グロブリン断片、例えば、Ｆｖ、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）_２、または他の抗体の抗原結合部分配列も含んでよい。

ヒト化抗体は、免疫グロブリン定常領域（Ｆｃ）の少なくとも一部分、一般には、ヒト免疫グロブリンの定常領域（Ｆｃ）も含んでよい。例えば、Ｊｏｎｅｓら（１９８６年）Ｎａｔｕｒｅ ３２１巻：５２２〜５２５頁；Ｒｉｅｃｈｍａｎｎら（１９８８年）Ｎａｔｕｒｅ ３３２巻：３２３〜３２９頁；およびＰｒｅｓｔａ（１９９２年）Ｃｕｒｒ． Ｏｐ． Ｓｔｒｕｃｔ． Ｂｉｏｌ． ２巻：５９３〜５９６頁を参照されたい。

非ヒト抗体をヒト化するための方法は当技術分野で公知である。一般に、ヒト化抗体には、非ヒトである供給源から１つまたは複数のアミノ酸残基が導入されている。これらの非ヒトアミノ酸残基は、多くの場合、「移入」または「ドナー」残基と称され、一般には、「移入」または「ドナー」可変ドメインから得られる。例えば、ヒト化は、基本的にＷｉｎｔｅｒおよび共同研究者の方法に従って、げっ歯類ＣＤＲまたはＣＤＲ配列で対応するヒト抗体の配列を置換することによって実施することができる。例えば、Ｊｏｎｅｓら、上記；Ｒｉｅｃｈｍａｎｎら、上記およびＶｅｒｈｏｅｙｅｎら（１９８８年）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２３９巻：１５３４〜１５３６頁を参照されたい。したがって、そのような「ヒト化」抗体は、実質的にインタクトなヒト可変ドメイン未満が非ヒト種由来の対応する配列で置換されているキメラ抗体（米国特許第４，８１６，５６７号）を包含する。ある特定の実施形態では、ヒト化抗体は、いくつかのＣＤＲ残基、および必要に応じていくつかのフレームワーク領域残基がげっ歯類抗体（例えば、マウスモノクローナル抗体）の類似の部位由来の残基で置換されているヒト抗体である。

ヒト抗体は、例えば、ファージディスプレイライブラリーを使用することによっても産生することができる。Ｈｏｏｇｅｎｂｏｏｍら（１９９１年）Ｊ． Ｍｏｌ． Ｂｉｏｌ、２２７巻：３８１頁；Ｍａｒｋｓら（１９９１年）Ｊ． Ｍｏｌ． Ｂｉｏｌ． ２２２巻：５８１頁。ヒトモノクローナル抗体を調製するための他の方法は、Ｃｏｌｅら（１９８５年）「Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ ａｎｄ Ｃａｎｃｅｒ Ｔｈｅｒａｐｙ」、Ａｌａｎ Ｒ． Ｌｉｓｓ、７７頁およびＢｏｅｒｎｅｒら（１９９１年）Ｊ． Ｉｍｍｕｎｏｌ． １４７巻：８６〜９５頁に記載されている。

ヒト抗体は、ヒト免疫グロブリン遺伝子座を、内在性免疫グロブリン遺伝子が部分的に、または完全に不活性化されたトランスジェニック動物（例えば、マウス）に導入することによって作製することができる。免疫学的に攻撃するとヒト抗体産生が観察され、これはヒトにおいて見られるものと、遺伝子再構成、集合、および抗体レパートリーを含めたあらゆる点でよく似ている。この手法は、例えば、米国特許第５，５４５，８０７号；同第５，５４５，８０６号；同第５，５６９，８２５号；同第５，６２５，１２６号；同第５，６３３，４２５号；同第５，６６１，０１６号、および以下の科学的刊行物に記載されている：Ｍａｒｋｓら（１９９２年）Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ １０巻：７７９〜７８３頁（１９９２年）；Ｌｏｎｂｅｒｇら（１９９４年）Ｎａｔｕｒｅ ３６８巻：８５６〜８５９頁；Ｍｏｒｒｉｓｏｎ（１９９４年）Ｎａｔｕｒｅ ３６８巻：８１２〜８１３頁；Ｆｉｓｈｗａｌｄら（１９９６年）Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ １４巻：８４５〜８５１頁；Ｎｅｕｂｅｒｇｅｒ（１９９６年）Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ １４巻：８２６頁；およびＬｏｎｂｅｒｇら（１９９５年）Ｉｎｔｅｒｎ． Ｒｅｖ． Ｉｍｍｕｎｏｌ． １３巻：６５〜９３頁。

抗体は、上記の公知の選択方法および／または変異誘発方法を使用して親和性成熟させることができる。いくつかの実施形態では、親和性成熟した抗体は、成熟抗体を調製する出発抗体（一般にマウス、ウサギ、ニワトリ、ヒト化またはヒト）の親和性よりも５倍以上、１０倍以上、２０倍以上、または３０倍以上の親和性を有する。

抗体は二重特異性抗体であってもよい。二重特異性抗体はモノクローナルであり、少なくとも２種の異なる抗原に対して結合特異性を有するヒト抗体またはヒト化抗体であってよい。この場合、２つの異なる結合特異性は、２つの異なるＭＭＰ、または単一のＭＭＰ（例えば、ＭＭＰ９）上の２つの異なるエピトープに対するものであってよい。

本明細書に開示されている抗体は、免疫コンジュゲートであってもよい。そのような免疫コンジュゲートは、第２の分子、例えば、レポーターにコンジュゲートした抗体（例えば、ＭＭＰ９に対する）を含む。免疫コンジュゲートは、細胞傷害性薬剤、例えば、化学療法剤、毒素（例えば、細菌起源、真菌起源、植物起源、もしくは動物起源の酵素的に活性な毒素、またはその断片）、または放射性同位元素（すなわち、放射性コンジュゲート（ｒａｄｉｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ））とコンジュゲートした抗体も含んでよい。

特定のポリペプチドまたはエピトープに「特異的に結合する」または「特異的な」抗体とは、抗体と標的抗原またはエピトープの選択的結合を指し、これらの用語および特異的な結合を決定するための方法は当技術分野においてよく理解されている。抗体は、標的抗原またはエピトープと、他の物質よりも大きな親和性、アビディティで、より容易に、かつ／またはより長い持続時間で結合する場合に、特定の標的抗原またはエピトープに対する「特異的な結合」を示す。いくつかの実施形態では、ポリペプチドまたはエピトープに特異的に結合する抗体とは、他のポリペプチドまたはポリペプチドエピトープのいずれにも実質的に結合することなく特定のポリペプチドまたはエピトープに結合する抗体である。いくつかの実施形態では、提供される抗体は、ヒトＭＭＰ９に、約４℃、２５℃、３７℃または４２℃の温度で測定して、モノクローナル抗体、ｓｃＦｖ、Ｆａｂの形態、または抗体の他の形態で、１００ｎＭ以下、必要に応じて１０ｎＭ未満、必要に応じて１ｎＭ未満、必要に応じて０．５ｎＭ未満、必要に応じて０．１ｎＭ未満、必要に応じて０．０１ｎＭ未満、または必要に応じて０．００５ｎＭ未満、特定の例では、０．１ｎＭから０．２ｎＭまでの間、または０．１ｐＭから１０ｐＭの間、例えば、０．４ｐＭから９ｐＭの間、例えば、０．４ｐＭから８．８ｐＭの間の解離定数（Ｋ_ｄ）で特異的に結合する。

ある特定の実施形態では、本開示の抗体は、ＭＭＰ９の１つまたは複数のプロセシング部位（例えば、タンパク質分解的切断の部位）に結合し、それにより、プロ酵素またはプレプロ酵素がプロセシングされて触媒として活性な酵素になることを有効に遮断し、したがって、ＭＭＰ９のタンパク質分解活性を低下させる。

ある特定の実施形態では、本開示による抗体は、ＭＭＰ９に、別のＭＭＰに対するその結合親和性よりも少なくとも２倍、少なくとも５倍、少なくとも１０倍、少なくとも２５倍、少なくとも５０倍、少なくとも１００倍、少なくとも５００倍、または少なくとも１０００倍大きな親和性で結合する。結合親和性は、当技術分野で公知の任意の方法によって測定することができ、例えば、会合速度（ｏｎ−ｒａｔｅ）、解離速度（ｏｆｆ−ｒａｔｅ）、解離定数（Ｋ_ｄ）、平衡定数（Ｋ_ｅｑ）または当技術分野における任意の用語として表すことができる。

ある特定の実施形態では、本開示による抗体は、ＭＭＰ９の酵素（すなわち、触媒）活性を阻害する抗体、例えば、ＭＭＰ９の触媒活性の非競合的な阻害剤である。ある特定の実施形態では、本開示による抗体は、ＭＭＰ９の触媒ドメイン内に結合する。さらなる実施形態では、本開示による抗体は、ＭＭＰ９の触媒ドメインの外側に結合する。

本明細書に記載の抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片の任意の１つまたは複数と、ＭＭＰ９との結合について競合する抗体またはその抗原結合断片も提供される。したがって、本開示は、例えば、配列番号１または配列番号５〜８のいずれかの重鎖ポリペプチド、配列番号２または配列番号９〜１２の軽鎖ポリペプチド、またはそれらの組合せを有する抗体との結合について競合する抗ＭＭＰ９抗体およびその機能性断片を意図している。一実施形態では、抗ＭＭＰ９抗体またはその機能性断片は、本明細書においてＡＢ００４１と記載されている抗体と、ヒトＭＭＰ９との結合について競合する。一部の実施形態では、抗ＭＭＰ９抗体またはその機能性断片は、ＡＢ００４５として本明細書に記載されている抗体と、ヒトＭＭＰ９との結合について競合する。ある特定の実施形態では、抗ＭＭＰ９抗体またはその機能性断片は、ＡＢ００４６として本明細書に記載されている抗体と、ヒトＭＭＰ９との結合について競合する。さらなる実施形態では、抗ＭＭＰ９抗体またはその機能性断片は、Ｍ４として本明細書に記載されている抗体と、ヒトＭＭＰ９との結合について競合する。他の実施形態では、抗ＭＭＰ９抗体またはその機能性断片は、Ｍ１２として本明細書に記載されている抗体と、ヒトＭＭＰ９との結合について競合する。

本明細書に記載の抗体の任意の１つまたは複数と同じエピトープ、例えば、ＭＭＰ９エピトープに結合する抗体およびその断片も提供される。ＭＭＰ９のエピトープに特異的に結合する抗体および断片も提供され、エピトープは、ＭＭＰ９の特定の領域またはＭＭＰ９の複数の領域内のアミノ酸残基を含む。さらに、本明細書に記載のエピトープまたは領域に結合するタンパク質または抗体との結合について競合する抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片が提供される。そのような領域は、例えば、ＭＭＰ９の構造ループおよび／または他の構造ドメイン、例えば、本明細書に記載の例示的な抗体と結合するために重要であることが示されているものを含んでよい。一般には、領域は、全長のＭＭＰ９配列、例えば、配列番号２７におけるアミノ酸残基の位置に従って定義される。一部の例では、エピトープは、配列番号２７のアミノ酸残基１０４〜２０２を含有する。一例では、エピトープは、配列番号２７の残基１０４〜１１９、残基１５９〜１６６、または残基１９１〜２０２である領域内のアミノ酸残基（すなわち、１つまたは複数のアミノ酸残基）を含有する。一部の態様では、エピトープは、配列番号２７の残基１０４〜１１９であるＭＭＰ９の領域内のアミノ酸残基（すなわち、１つまたは複数のアミノ酸残基）、配列番号２７の残基１５９〜１６６であるＭＭＰ９の領域内のアミノ酸残基、および配列番号２７の残基１９１〜２０２であるＭＭＰ９の領域内のアミノ酸残基を含む。一部の場合には、エピトープは、配列番号２７のＥ１１１、Ｄ１１３、Ｒ１６２、またはＩ１９８を含む。一部の場合には、エピトープは配列番号２７のＲ１６２を含む。一部の場合には、エピトープは、配列番号２７のＥ１１１、Ｄ１１３、Ｒ１６２、およびＩ１９８を含む。

ＭＭＰ９配列
ヒトＭＭＰ９タンパク質のアミノ酸配列は以下の通りである：

タンパク質ドメインは、図３に概略的に示されており、また、以下に示されている：
アミノ酸番号 特徴
１〜１９ シグナルペプチド
３８〜９８ ペプチドグリカン結合ドメイン
Ｒ９８／Ｃ９９ システインスイッチ活性ポケット
１１２〜４４５ Ｚｎ依存性メタロプロテイナーゼドメイン
２２３〜２７１ フィブロネクチンＩＩ型ドメイン（ゼラチン結合ドメイン）
２８１〜３２９ フィブロネクチンＩＩ型ドメイン（ゼラチン結合ドメイン）
３４０〜３８８ フィブロネクチンＩＩ型ドメイン（ゼラチン結合ドメイン）
４００〜４１１ Ｚｎ結合領域
５２１〜５６５ ヘモペキシン様ドメイン
５６７〜６０８ ヘモペキシン様ドメイン
６１３〜６５９ ヘモペキシン様ドメイン
６６１〜７０４ ヘモペキシン様ドメイン

成熟全長ヒトＭＭＰ９のアミノ酸配列（シグナルペプチドを伴わない配列番号２７のプロポリペプチドのアミノ酸配列である）は：

である。

シグナルペプチドのアミノ酸配列はＭＳＬＷＱＰＬＶＬＶＬＬＶＬＧＣＣＦＡ（配列番号２９）である。

ミュータントＭＭＰ９ポリペプチドを含めた、ＭＭＰ９ポリペプチドも提供される。そのようなペプチドは、例えば、本明細書において提供される抗体および断片を生成および選択することにおいて有用である。例示的なポリペプチドとしては、配列番号２７の残基１１１〜１９８を含有するアミノ酸配列を有するポリペプチド、および配列番号２７の残基１１１〜１９８を含有するアミノ酸配列を有し、配列番号２７の残基１１１、１１３、１６２、もしくは１９８にアミノ酸置換を有する、またはそのような残基全てにアミノ酸置換を有するポリペプチドが挙げられる。そのようなポリペプチドは、例えば、本明細書に記載のものなどの、そのような残基を含有するエピトープおよび／またはＭＭＰ９のそのような残基が結合のために重要であるエピトープに結合する抗体を選択することにおいて使用が見出される。

本開示は、ＭＭＰ９、例えば、ヒトＭＭＰ９の任意の部分に結合するＭＭＰ９結合タンパク質を意図しており、他のＭＭＰと比較してＭＭＰ９に優先的に結合するＭＭＰ９結合タンパク質が特に興味深い。

抗ＭＭＰ９抗体およびその機能性断片は、当技術分野で周知の方法に従って生成することができる。例示的な抗ＭＭＰ９抗体が以下に提供される。

マウスモノクローナル抗ＭＭＰ９抗体
ヒトＭＭＰ９に対するマウスモノクローナル抗体を同様に得た。この抗体は、マウスＩｇＧ２ｂ重鎖およびマウスカッパ軽鎖を含有し、ＡＢ００４１と称される。

ＡＢ００４１重鎖のアミノ酸配列は以下の通りである：

シグナル配列に下線が引かれており、ＩｇＧ２ｂ定常領域の配列がイタリック体で示されている。シグナルペプチドを伴わないＡＢ００４１抗体の重鎖は配列番号５８に記載されている配列を有する。

ＡＢ００４１軽鎖のアミノ酸配列は以下の通りである：

シグナル配列に下線が引かれており、カッパ定常領域の配列がイタリック体で示されている。シグナルペプチドを伴わないＡＢ００４１抗体の軽鎖は配列番号５９に記載されている配列を有する。

以下のアミノ酸配列は、ＡＢ００４１のＩｇＧ２ｂ重鎖の可変領域のフレームワーク領域および相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む（ＣＤＲに下線が引かれている）：

以下のアミノ酸配列は、ＡＢ００４１のカッパ軽鎖の可変領域のフレームワーク領域および相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む（ＣＤＲに下線が引かれている）：

他の例示的なマウス抗ヒトＭＭＰ９抗体（例えば、Ｍ４およびＭ１２）が本明細書に記載されている。例示的な抗マウスＭＭＰ９抗体（ＡＢ００４６）が本明細書に記載されている。いくつかの実施形態では、そのような抗マウス抗体の、本明細書において提供されるＭＭＰ９−阻害方法、例えば、処置方法を試験し、評価するための代理抗体としての使用が提供される。

重鎖変異体
ＡＢ００４１重鎖および軽鎖の可変領域のアミノ酸配列を、重鎖可変領域および軽鎖可変領域のフレームワーク領域の配列を変更することによって、別々に改変した。これらの配列変更の効果は、ヒトＴ細胞エピトープの抗体を枯渇させ、それにより、ヒトにおけるその免疫原性を低下させるまたは無効にすることであった（Ａｎｔｉｔｏｐｅ、Ｂａｂｒａｈａｍ、ＵＫ）。

ヒンジドメインを安定化するＳ２４１Ｐアミノ酸変化（Ａｎｇａｌら（１９９３年）Ｍｏｌｅｃ． Ｉｍｍｕｎｏｌ． ３０巻：１０５〜１０８頁）を含有するヒトＩｇＧ４重鎖バックグラウンドで、４種の重鎖変異体を構築し、ＶＨ１、ＶＨ２、ＶＨ３およびＶＨ４と名付けた。それらのフレームワーク領域およびＣＤＲのアミノ酸配列は、以下の通りである：

図１に、ヒト化重鎖の可変領域のアミノ酸配列のアラインメントが示され、４種の変異体の間のフレームワーク領域内のアミノ酸配列の差異が示されている。

軽鎖変異体
ヒトカッパ鎖バックグラウンドで、４種の軽鎖変異体を構築し、Ｖｋ１、Ｖｋ２、Ｖｋ３およびＶｋ４と名付けた。それらのフレームワーク領域およびＣＤＲのアミノ酸配列は以下の通りである：

図２に、ヒト化軽鎖の可変領域のアミノ酸配列のアラインメントが示され、４種の変異体の間のフレームワーク領域内のアミノ酸配列の差異が示されている。

ヒト化重鎖および軽鎖を、可能性のある対組合せの全てに組み合わせて、いくつもの機能的なヒト化抗ＭＭＰ９抗体を生成する。例えば、配列番号３、５、６、７、および８のいずれかに記載のアミノ酸配列を有する重鎖可変（ＶＨ）領域を有する抗体；配列番号４、９、１０、１１、および１２のいずれかに記載のアミノ酸配列を有する軽鎖可変（ＶＬ）領域を有する抗体；および配列番号３、５、６、７、および８のいずれかに記載のアミノ酸配列を有する重鎖可変（ＶＨ）領域および配列番号４、９、１０、１１、および１２のいずれかに記載のアミノ酸配列を有する軽鎖可変（ＶＬ）領域を有する抗体、ならびにそのような抗体とＭＭＰ９との結合について競合する抗体、およびそのような抗体に対して少なくとも約７５％、約８０％、約８５％、約９０％、約９１％、約９２％、約９３％、約９４％、約９５％、約９６％、約９７％、約９８％、約９９％またはそれ超の配列同一性を有する抗体が提供される。一例では、抗体は、配列番号７に対して少なくとも約７５％、約８０％、約８５％、約９０％、約９１％、約９２％、約９３％、約９４％、約９５％、約９６％、約９７％、約９８％、約９９％またはそれ超の配列同一性を有するアミノ酸配列を有するＶＨ領域および配列番号１２と少なくとも約７５％、約８０％、約８５％、約９０％、約９１％、約９２％、約９３％、約９４％、約９５％、約９６％、約９７％、約９８％、約９９％またはそれ超の配列同一性を有するアミノ酸配列を有するＶＬ領域、または配列番号７のＶＨ領域および配列番号１２のＶＬ領域を有する。さらなる例では、抗体は、配列番号７に対して少なくともまたは約９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれ超の配列同一性を有するアミノ酸配列を有するＶＨ領域を有する。別の例では、抗体は、配列番号１２に対して少なくともまたは約９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれ超の配列同一性を有するアミノ酸配列を有するＶＬ領域を有する。一部の例では、抗体は、配列番号７のＶＨ領域および配列番号１２のＶＬ領域を有する。

本明細書に開示されている重鎖可変領域の配列に対して７５％以上、８０％以上、９０％以上、９５％以上、または９９％以上の相同性を有する追加の重鎖可変領域アミノ酸配列も提供される。さらに、本明細書に開示されている軽鎖可変領域の配列に対して７５％以上、８０％以上、９０％以上、９５％以上、または９９％以上の相同性を有する追加の軽鎖可変領域アミノ酸配列も提供される。

本明細書に開示されている重鎖可変領域の配列に対して７５％以上、８０％以上、９０％以上、９５％以上、または９９％以上の配列同一性を有する追加の重鎖可変領域アミノ酸配列も提供される。さらに、本明細書に開示されている軽鎖可変領域の配列に対して７５％以上、８０％以上、９０％以上、９５％以上、または９９％以上の配列同一性を有する追加の軽鎖可変領域アミノ酸配列も提供される。

相補性決定領域（ＣＤＲ）

いくつかの実施形態では、本明細書に開示されている例示的な提供される抗ＭＭＰ９抗体の重鎖のＣＤＲは以下のアミノ酸配列を有する：
ＣＤＲ１：ＧＦＳＬＬＳＹＧＶＨ（配列番号１３）
ＣＤＲ２：ＶＩＷＴＧＧＴＴＮＹＮＳＡＬＭＳ（配列番号１４）
ＣＤＲ３：ＹＹＹＧＭＤＹ（配列番号１５）

したがって、提供される抗ＭＭＰ９抗体としては、配列番号１３に記載のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ１領域を有する抗体、配列番号１４に記載のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ２領域を有する抗体、および配列番号１５に記載のアミノ酸配列を有する重鎖ＣＤＲ３領域を有する抗体、およびＭＭＰ９上のそのような抗体と同じエピトープとの結合について競合する、またはそれに結合する抗体が挙げられる。一部の場合には、抗体は、配列番号１５に記載の配列を有するＶＨ ＣＤＲを含有する。一部の場合には、抗体は、配列番号１３および１４に記載の配列を有するＶＨ ＣＤＲを含有する。一部の場合には、抗体は、配列番号１３および１５に記載の配列を有するＶＨ ＣＤＲを含有する。一部の場合には、抗体は、配列番号１４および１５に記載の配列を有するＶＨ ＣＤＲを含有する。一部の場合には、抗体は、配列番号１３、１４および１５に記載の配列を有するＶＨ ＣＤＲを含有する。

いくつかの実施形態では、本明細書に開示されている例示的な抗ＭＭＰ９抗体の軽鎖のＣＤＲは以下のアミノ酸配列を有する：
ＣＤＲ１：ＫＡＳＱＤＶＲＮＴＶＡ（配列番号１６）
ＣＤＲ２：ＳＳＳＹＲＮＴ（配列番号１７）
ＣＤＲ３：ＱＱＨＹＩＴＰＹＴ（配列番号１８）

したがって、提供される抗ＭＭＰ９抗体としては、配列番号１６に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ１領域を有する抗体、配列番号１７に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ２領域を有する抗体、および配列番号１８に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖ＣＤＲ３領域を有する抗体、およびＭＭＰ９上のそのような抗体と同じエピトープとの結合について競合する、またはそれに結合する抗体が挙げられる。一部の場合には、抗体は、配列番号１８に記載の配列を有するＶＬ ＣＤＲを含有する。一部の場合には、抗体は、配列番号１６および１７に記載の配列を有するＶＬ ＣＤＲを含有する。一部の場合には、抗体は、配列番号１６および１８に記載の配列を有するＶＬ ＣＤＲを含有する。一部の場合には、抗体は、配列番号１７および１８に記載の配列を有するＶＬ ＣＤＲを含有する。一部の場合には、抗体は、配列番号１６、１７および１８に記載の配列を有するＶＬ ＣＤＲを含有する。

例示的なヒト化変異体抗ＭＭＰ９抗体ＡＢ００４５（ヒト化、改変ＩｇＧ４（Ｓ２４１Ｐ））は、ヒト化ＡＢ００４１重鎖変異体ＶＨ３（配列番号７

に記載の配列を有する）およびヒト化ＡＢ００４１軽鎖変異体ＶＨ４（Ｖｋ４（配列番号１２

に記載の配列を有する）に記載の軽鎖配列を有する）を含有する。

ＡＢ００４５抗体は、２つの重鎖および２つの軽鎖で構成される１３１２アミノ酸長を含有し、理論的ｐＩは約７．９０であり、吸光係数は１ｇ／Ｌについて２８０ｎｍにおいて約１．５０ＡＵ／ｃｍであり、分子量は約１４４ｋＤａであり、密度は製剤緩衝液中約１ｇ／ｍＬ（製品濃度５０〜１００ｍｇ／ｍＬ）である。

ＡＢ００４５抗体の重鎖は、配列番号４９（

（シグナル配列に下線が引かれており、定常領域の配列がイタリック体で示されている））に記載の配列を有し、ＡＢ００４５抗体の軽鎖は配列番号５０（

（シグナル配列に下線が引かれており、定常領域の配列がイタリック体で示されている））に記載の配列を有する。シグナルペプチドを伴わないＡＢ００４５抗体の重鎖は配列番号５６に記載されている配列を有し、

ＡＢ００４５抗体の軽鎖は配列番号５７に記載されている配列を有する

（定常領域がイタリック体で示されている）。

抗体は、Ｍ４と称される、ハイブリドーマによって産生された抗体、すなわち、重鎖（ＩｇＧ２ｂ）配列：

（配列番号３０）（シグナルペプチドが、下線が引かれたテキストで記載されており、可変領域がプレーンテキストで記載されており、定常領域がイタリック体で記載されている）、および軽鎖（カッパ）配列：

（シグナルペプチドが、下線が引かれたテキストで記載されており、可変領域がプレーンテキストで記載されており、定常領域がイタリック体で記載されている）（配列番号３１）を含有する抗体をさらに含む。Ｍ４抗体は、アミノ酸配列：

（ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３（それぞれ配列番号３４、３５、および３６）下線が引かれている）（配列番号３２）を有する可変重鎖およびアミノ酸配列

（ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３（それぞれ配列番号３７、３８、および３９）、下線が引かれている）（配列番号３３）を有する可変軽鎖を有する。抗体は、Ｍ１２と称される、ハイブリドーマによって産生された抗体、すなわち、配列：

（シグナルペプチドが、下線が引かれたテキストで記載されており、可変領域がプレーンテキストで記載されており、定常領域がイタリック体で記載されている）（配列番号４０）を有するカッパ鎖のみを有する抗体をさらに含む。Ｍ１２抗体は、アミノ酸配列

（ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３（それぞれ配列番号４２、４３、および４４）、下線が引かれている）（配列番号４１）を有する可変軽鎖を有する。Ｍ４、ＡＢ００４１、およびＭ１２と称される抗体の重鎖の部分（それぞれ配列番号５１、５２、および５３）とＭ４およびＡＢ００４１と称される抗体の軽鎖の部分（それぞれ配列番号５４および５５）の配列比較が図４に示されている。Ｍ４の部分的な軽鎖（すなわち、定常領域が短縮された軽鎖）のアミノ酸配列は、

であり、ＡＢ００４１の部分的な軽鎖（すなわち、定常領域が短縮された軽鎖）は、

であり、Ｍ１２の部分的な軽鎖（すなわち、定常領域が短縮された軽鎖）は、

であり、Ｍ４の部分的な重鎖（すなわち、定常領域が短縮された重鎖）は、

であり、ＡＢ００４１の部分的な重鎖（すなわち、定常領域が短縮された重鎖）は、

である。

抗体は、アミノ酸配列

（配列番号４５）（シグナルペプチドが、下線が引かれたテキストで記載されており、可変領域がプレーンテキストで記載されており、定常領域がイタリック体で記載されている）を有するカッパ軽鎖およびアミノ酸配列

（配列番号４６）（シグナルペプチドが、下線が引かれたテキストで記載されており、可変領域がプレーンテキストで記載されており、定常領域がイタリック体で記載されている）を有するＩｇＧ１重鎖を有するＡＢ００４６と称されるマウス抗体をさらに含む。

以下のアミノ酸配列は、ＡＢ００４６のＩｇＧ１重鎖の可変領域のフレームワーク領域および相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む（ＣＤＲに下線が引かれている）：

以下のアミノ酸配列は、ＡＢ００４６のカッパ軽鎖の可変領域のフレームワーク領域および相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む（ＣＤＲに下線が引かれている）：

現在提供される方法、組成物、および組合せと共に使用するための抗体は、種々の例示されている重鎖および軽鎖、重鎖可変領域および軽鎖可変領域、およびＣＤＲの任意の組合せを含有するものを含めた抗体および抗体断片を含めた本明細書に記載の抗体のいずれを含んでもよい。例として、現在提供される方法、組成物、および組合せは、配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９または５０のいずれかのアミノ酸配列を含む抗体またはその抗原結合断片を含む。一部の実施形態では、配列番号７および１２のアミノ酸配列を含む抗体またはその抗原結合断片を含む方法、組成物、および組合せが提供される。ある特定の実施形態では、配列番号１３、１４、１５、１６、１７、および１８のアミノ酸配列を含む抗体またはその抗原結合断片を含む方法、組成物、および組合せが提供される。

抗ＭＭＰ９抗体をコードする核酸
本開示は、抗ＭＭＰ９抗体およびその機能性断片をコードする核酸を提供する。したがって、本開示は、本明細書に記載の抗体または抗原結合断片をコードする単離されたポリヌクレオチド（核酸）、そのようなポリヌクレオチドを含有するベクター、ならびにそのようなポリヌクレオチドをポリペプチドへと転写し、翻訳するための宿主細胞および発現系を提供する。

本開示は、上記の少なくとも１つのポリヌクレオチドを含むプラスミド、ベクター、転写カセットもしくは発現カセットの形態の構築物も意図している。

本開示は、上記の１つまたは複数の構築物を含む組換え宿主細胞、ならびに本明細書に記載の抗体またはその抗原結合断片を産生する方法も提供し、該方法は、組換え宿主細胞において重鎖ポリペプチドおよび軽鎖ポリペプチドをコードする核酸を発現させること（同じ宿主細胞において、または異なる宿主細胞において、同じ構築物から、または異なる構築物から）を含む。発現は、核酸を含有する組換え宿主細胞を適切な条件下で培養することによって達成することができる。発現によって産生した後、抗体または抗原結合断片を、任意の適切な技法を使用して単離し、かつ／または精製し、次いで適切に使用することができる。

種々の異なる宿主細胞においてポリペプチドをクローニングし、発現させるための系が周知である。適切な宿主細胞としては、細菌、哺乳動物の細胞、酵母およびバキュロウイルス系が挙げられる。異種ポリペプチドを発現させるために当技術分野において利用可能な哺乳動物の細胞系としては、チャイニーズハムスター卵巣細胞、ＨｅＬａ細胞、ベビーハムスター腎臓細胞、ＮＳＯマウスメラノーマ細胞およびその他の多くの細胞が挙げられる。一般的な細菌宿主はＥ．ｃｏｌｉである。

作動可能に連結したプロモーター配列、ターミネーター配列、ポリアデニル化配列、エンハンサー配列、マーカー遺伝子および／または適宜他の配列を含めた適切な調節配列を含有する適切なベクターを選択または構築することができる。ベクターは、適宜、プラスミド、ウイルス性の例えばファージまたはファージミドであってよい。さらなる詳細については、例えば、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ： ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ：第２版、Ｓａｍｂｒｏｏｋら、１９８９年、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓを参照されたい。例えば核酸構築物の調製、変異誘発、配列決定、ＤＮＡの細胞への導入および遺伝子発現、ならびにタンパク質の分析において核酸を操作するための多くの公知の技法およびプロトコールは、Ｓｈｏｒｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ、第２版、Ａｕｓｕｂｅｌら編、Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ、１９９２年に詳しく記載されている。ＳａｍｂｒｏｏｋらおよびＡｕｓｕｂｅｌらの開示は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。

対象のポリペプチドをコードする核酸は、宿主細胞のゲノムに組み込むか、あるいは安定なまたは一過性のエピソームエレメントとして維持することができる。

多種多様な発現制御配列−作動可能に連結したＤＮＡ配列の発現を制御する配列−のいずれも、ＤＮＡ配列を発現させるためにこれらのベクターに使用することができる。例えば、対象のポリペプチドをコードする核酸は、プロモーターに作動可能に連結させ得、組換えＭＭＰ９タンパク質またはその一部を産生する方法において使用するための発現構築物中に提供することができる。

本明細書に開示されている抗体鎖をコードする核酸を分子生物学における標準の知識および手順を使用して合成することができることは、当業者には知られている。

本明細書に開示されている重鎖および軽鎖のアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列の例は、以下の通りである：

可変領域内のＣＤＲおよびフレームワーク領域の近位（ｊｕｘｔａｐｏｓｉｔｉｏｎ）、フレームワーク領域の構造および重鎖定常領域および軽鎖定常領域の構造を含めた抗体の構造は当技術分野で周知であるので、抗ＭＭＰ−９抗体をコードする関連する核酸を得ることは、十分に当技術分野の技術の範囲内である。したがって、本明細書に開示されているヌクレオチド配列のいずれかに対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％および少なくとも９９％の相同性を有する核酸配列を含むポリヌクレオチドも提供される。したがって、本明細書に開示されているヌクレオチド配列のいずれかに対して少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％および少なくとも９９％同一性を有する核酸配列を含むポリヌクレオチドも提供される。一例では、ポリヌクレオチドは、配列番号２１に対して少なくとも約７５％、約８０％、約８５％、約９０％、約９１％、約９２％、約９３％、約９４％、約９５％、約９６％、約９７％、約９８％、約９９％またはそれ超の配列同一性を有するか、または配列番号２１を含むもしくは配列番号２１であり、かつ／または配列番号２６に対して少なくとも約７５％、約８０％、約８５％、約９０％、約９１％、約９２％、約９３％、約９４％、約９５％、約９６％、約９７％、約９８％、約９９％またはそれ超の配列同一性を有する、または配列番号２６を含むもしくは配列番号２６である。

医薬組成物
ＭＭＰ９結合タンパク質、ならびにＭＭＰ９結合タンパク質をコードする核酸（例えば、ＤＮＡまたはＲＮＡ）は、例えば、薬学的に許容されるキャリアまたは賦形剤と組み合わせた医薬組成物として提供することができる。そのような医薬組成物は、例えば、被験体にｉｎ ｖｉｖｏまたはｅｘ ｖｉｖｏで投与するため、および、被験体を、例えば本明細書において提供される処置方法または診断方法のいずれにおいてもＭＭＰ９結合タンパク質を使用して診断し、かつ／または処置するために有用である。

薬学的に許容されるキャリアまたは賦形剤は、投与される患者に生理的に許容され、一緒に投与される抗体またはペプチドの治療的性質を保持する。薬学的に許容されるキャリアまたは賦形剤およびそれらの製剤は、一般に、例えば、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ（第１８版、Ａ． Ｇｅｎｎａｒｏ編、Ｍａｃｋ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏ．、Ｅａｓｔｏｎ、ＰＡ １９９０年）に記載されている。１つの例示的な医薬キャリアは生理食塩水である。キャリアまたは賦形剤のそれぞれは、製剤の他の成分と適合し、患者に対して実質的に傷害性ではないという意味で「薬学的に許容される」。

医薬組成物は、全身的または局所的な特定の投与経路と適合するように製剤化することができる。したがって、医薬組成物は、種々の経路によって投与するために適したキャリア、希釈剤、または賦形剤を含む。

医薬組成物は、薬学的に許容される添加剤を含んでよい。添加剤の例としては、これだけに限定されないが、マンニトール、ソルビトール、グルコース、キシリトール、トレハロース、ソルボース、スクロース、ガラクトース、デキストラン、ブドウ糖、フルクトース、ラクトースならびにそれらの混合物などの糖が挙げられる。薬学的に許容される添加剤は、ブドウ糖などの薬学的に許容されるキャリアおよび／または賦形剤と組み合わせることができる。添加剤は、ポリソルベート２０またはポリソルベート８０などの界面活性物質も包含する。

製剤および送達方法は、一般に、処置される部位および疾患に応じて適合させる。例示的な製剤としては、これだけに限定されないが、非経口投与、例えば、静脈内投与、動脈内投与、筋肉内投与、もしくは皮下投与、または経口投与に適した製剤が挙げられる。一実施形態では、抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片、その組成物または製剤を静脈内投与（静脈内注入と称することができる）によって送達する。一部の実施形態では、抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片、その組成物または製剤を皮下投与（皮下注射と称することができる）によって送達する。

非経口的送達用の医薬組成物としては、例えば、水、食塩水、リン酸緩衝食塩水、ハンクス液、リンゲル液、ブドウ糖／食塩水、およびグルコース溶液が挙げられる。製剤は、生理的条件に近づけるための補助的な物質、例えば、緩衝剤、張度調整剤、湿潤剤、界面活性剤などを含有してよい。添加剤は、殺菌剤または安定剤などの追加の活性成分も含んでよい。例えば、液剤は、酢酸ナトリウム、乳酸ナトリウム、塩化ナトリウム、塩化カリウム、塩化カルシウム、ソルビタンモノラウレートまたはオレイン酸トリエタノールアミンを含有してよい。追加の非経口的な製剤および方法は、Ｂａｉ（１９９７年）Ｊ． Ｎｅｕｒｏｉｍｍｕｎｏｌ．８０巻：６５〜７５頁；Ｗａｒｒｅｎ（１９９７年）Ｊ． Ｎｅｕｒｏｌ． Ｓｃｉ． １５２巻：３１〜３８頁；およびＴｏｎｅｇａｗａ（１９９７年）Ｊ． Ｅｘｐ． Ｍｅｄ． １８６巻：５０７〜５１５頁に記載されている。非経口的調製物は、ガラス製またはプラスチック製のアンプル、使い捨てシリンジまたは複数回投薬バイアルに封入することができる。

静脈内投与、皮内投与または皮下投与用の医薬組成物は滅菌した希釈剤、例えば、水、食塩水溶液、不揮発性油、ポリエチレングリコール、グリセリン、プロピレングリコールまたは他の合成溶媒；抗菌剤、例えば、ベンジルアルコールまたはメチルパラベン；抗酸化剤、例えば、アスコルビン酸、グルタチオンまたは亜硫酸水素ナトリウム；キレート化剤、例えば、エチレンジアミン四酢酸；緩衝剤、例えば、酢酸塩、クエン酸塩またはリン酸塩、および張度を調整するための作用剤、例えば、塩化ナトリウムまたはブドウ糖を含んでよい。

注射用の医薬組成物としては、滅菌注射用溶液または分散液を即時調製するための水性液剤（水溶性の場合）または分散製剤および滅菌粉剤を含む。静脈内投与に関して、適切なキャリアとしては、生理食塩水、静菌水、Ｃｒｅｍｏｐｈｏｒ ＥＬＴＭ（ＢＡＳＦ、Ｐａｒｓｉｐｐａｎｙ、Ｎ．Ｊ．）またはリン酸緩衝食塩水（ＰＢＳ）が挙げられる。キャリアは、例えば、水、エタノール、ポリオール（例えば、グリセロール、プロピレングリコール、および液体ポリエチレングリコール（ｐｏｌｙｅｔｈｅｙｌｅｎｅ ｇｌｙｃｏｌ）など）、およびそれらの適切な混合物を含有する溶媒または分散媒であってよい。流動性は、例えば、レシチンなどのコーティングを使用することによって、分散製剤の場合では必要な粒度を維持することによって、および界面活性物質を使用することによって維持することができる。抗細菌剤および抗真菌剤としては、例えば、パラベン、クロロブタノール、フェノール、アスコルビン酸およびチメロサールが挙げられる。等張化剤、例えば、糖、マンニトール、ソルビトールなどの多価アルコール、および塩化ナトリウムを組成物に含めることができる。生じた溶液は、そのまま使用するために包装することもでき、凍結乾燥させることもできる。凍結乾燥した調製物は、後で投与する前に滅菌溶液と組み合わせることができる。

薬学的に許容されるキャリアは、吸収またはクリアランスを安定化する、増加させるまたは遅延させる化合物を含有してよい。そのような化合物としては、例えば、炭水化物、例えば、グルコース、スクロース、またはデキストラン；低分子量のタンパク質；ペプチドのクリアランスまたは加水分解を減少させる組成物；または賦形剤または他の安定剤および／もしくは緩衝剤が挙げられる。吸収を遅延させる作用剤としては、例えば、モノステアリン酸アルミニウムおよびゼラチンが挙げられる。医薬組成物の吸収を安定化するため、または増加もしくは減少させるために、リポソームキャリアを含めた界面活性剤も用いることができる。化合物を消化から保護するために、組成物と複合体化させて（ｃｏｍｐｌｅｘｅｄ）、酸性および酵素による加水分解に対して抵抗性にすることもできるか、または化合物をリポソームなどの適切に抵抗性のキャリアに複合体化させることもできる。化合物を消化から保護する手段は当技術分野で公知である（例えば、Ｆｉｘ（１９９６年）Ｐｈａｒｍ Ｒｅｓ． １３巻：１７６０〜１７６４頁；Ｓａｍａｎｅｎ（１９９６年）Ｊ． Ｐｈａｒｍ． Ｐｈａｒｍａｃｏｌ． ４８巻：１１９〜１３５頁；および治療剤を経口送達するための脂質組成物が記載されている米国特許第５，３９１，３７７号を参照されたい）。

本発明の組成物は、本明細書において提供される他の治療用部分またはイメージング／診断用部分と組み合わせることができる。治療用部分および／またはイメージング用部分は、別々の組成物として、またはＭＭＰ９結合タンパク質上に存在するコンジュゲートした部分として提供することができる。

ｉｎ ｖｉｖｏ投与用の製剤は、一般に、無菌である。一実施形態では、医薬組成物は、発熱物質を含まず、したがってヒト患者への投与が許容されるように製剤化される。

種々の他の医薬組成物およびそれらを調製および使用するための技法は、本開示を考慮すると当業者に公知である。適切な薬理学的組成物および関連する管理技法の詳細な一覧については、本明細書における詳細な教示を参照することができ、これは、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ： Ｔｈｅ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ Ｐｒａｃｔｉｃｅ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｙ 第２０版（Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ、Ｗｉｌｌｉａｍｓ ＆ Ｗｉｌｋｉｎｓ ２００３年）などのテキストによってさらに補充することができる。

医薬組成物は、処置を必要としている患者／被験体の身体特性、投与経路などに基づいて製剤化することができる。そのような医薬組成物は、病院および診療所に配布するために適切なラベルを伴う適切な医薬用パッケージに包装することができ、ラベルは、被験体における本明細書に記載の障害の処置を表示するためのものである。医薬品は、単一単位として包装することもでき、複数の単位として包装することもできる。本発明の医薬組成物の投与量および投与についての指示を医薬用パッケージおよび下記のキットに含めることができる。

使用方法
本開示の抗ＭＭＰ９抗体およびその断片を含めたＭＭＰ９結合タンパク質は、例えば、治療方法および診断方法、例えば、試料中のＭＭＰ９を検出する方法、処置の方法（例えば、血管新生を阻害する方法など）、ならびに診断および予後判定の方法において使用することができる。したがって、診断方法および治療方法ならびに抗ＭＭＰ９抗体の使用が提供される。使用方法の例は下に記載されている。

処置の方法
本明細書では、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）の処置および／または防止の方法が提供される。

本明細書で使用される場合、「処置」という用語は、ＣＯＰＤの臨床病理の過程中に処置される個体または細胞の自然経過が変更されるように設計された臨床的介入（例えば、本明細書に記載のＭＭＰ９結合タンパク質の投与など）を指す。処置の望ましい効果としては、疾患の進行の速度または死亡率を低下させること、病態を軽減するまたは和らげること、および寛解または予後の改善が挙げられる。一部の実施形態では、処置により、ＣＯＰＤ症状が改善される、ＣＯＰＤ増悪の頻度または重症度が低下する、肺機能、患者から報告されるＣＯＰＤ症状（運動耐容能および生活の質など）が改善される。応答は、患者が、特に、これだけに限定することなく、生存の延長および生活の質の改善を含めた、疾病の徴候または症状の部分的もしくは完全な緩和、または減少を経験したときに実現される。被験体は、例えば、ＣＯＰＤに関連する１つまたは複数の症状が沈静したまたは排除された場合、首尾よく「処置された」。

本明細書で使用される場合、「と併せて」とは、ある１つの処置モダリティを別の処置モダリティに加えて投与することを指す。そのように、「と併せて」とは、ある１つの処置モダリティ（例えば、本明細書に記載のＭＭＰ９結合タンパク質）を他の処置モダリティを個体に投与する前、その間またはその後に投与することを指す。

本明細書で使用される場合、「防止」という用語は、個体におけるＣＯＰＤの出現または再発に対する予防法をもたらすことを包含する。個体は、ＣＯＰＤの素因がある、ＣＯＰＤにかかりやすい、またはＣＯＰＤが発生するリスクがある可能性があるが、まだその障害の診断がついていない。一部の実施形態では、ＣＯＰＤの発生を遅延させるために、本明細書に記載のＭＭＰ９結合タンパク質を使用する。一部の実施形態では、本明細書に記載のＭＭＰ９結合タンパク質により、ＣＯＰＤ増悪を防止し、かつ／または肺機能または肺組織の破壊を減少させる。

本明細書で使用される場合、ＣＯＰＤが発生する「リスクがある」個体は、本明細書に記載の処置方法の前に、検出可能な疾患または疾患の症状を有していても有していなくてもよく、また、検出可能な疾患または疾患の症状が示されていても示されていなくてもよい。「リスクがある」とは、個体が、当技術分野で公知の通りＣＯＰＤの発生と相関する測定可能なパラメータである１つまたは複数の危険因子を有することを示す。これらの危険因子のうちの１つまたは複数を有する個体では、これらの危険因子のうちの１つまたは複数を有さない個体よりもＣＯＰＤが発生する確率が高い。

「有効量」とは、治療的または予防的結果を含めた所望のまたは指示された効果を実現するために必要な投与量で、および必要な期間にわたって、少なくとも有効な量を指す。有効量は、１回または複数回の投与でもたらすことができる。

「治療有効量」とは、特定の障害の測定可能な改善を実現するために必要な少なくとも最小の濃度である。本明細書では、治療有効量は、患者の病態、年齢、性別、および体重、ならびに個体における所望の応答を引き出す抗体の能力などの因子に応じて変動し得る。治療有効量はまた、抗体のいかなる毒性の影響または有害な影響よりも治療的に有益な影響が上回る量でもある。

したがって、有効量の作用剤は、被験体に投与されると（指定され得る通り単独でまたは別の治療剤と組み合わせてのいずれかで）疾患の状態もしくは疾患の進行を防止もしくは軽減する、または症状の軽減、例えば、関連する医学的状態の処置、治癒、防止もしくは軽減をもたらすもしくはそのような状態の処置、治癒、防止もしくは軽減の速度を上昇させるために有効である。単独で、投与される個々の活性成分に適用される場合、治療有効用量とは、その成分単独について指す。組合せに適用される場合、治療有効用量とは、組み合わせて、段階的にまたは同時に投与されるかにかかわらず、治療効果をもたらす、活性成分を全部合わせた量を指す。

「予防有効量」とは、所望の予防的結果を実現するために必要な投与量で、および必要な期間にわたって有効な量を指す。必ずではないが、一般には、予防用量は、被験体において疾患の前またはより早い段階で使用されるので、予防有効量は治療有効量よりも少なくてよい。

一般に、ＭＭＰ９結合タンパク質は、治療有効量で、例えば、ＭＭＰ９活性の阻害を実現するためまたはＣＯＰＤを処置するための量で投与する。

ある特定の実施形態では、本明細書に記載のＭＭＰ９結合タンパク質（例えば、ＭＭＰ９に結合する抗体またはその機能性断片）を、１週間、２週間または３週間の間隔、または１週間ごとに１回、２週間ごとに１回または３週間ごとに１回投与する。ある特定の実施形態では、本明細書に記載のＭＭＰ９結合タンパク質（例えば、ＭＭＰ９に結合する抗体またはその機能性断片）は、毎日または毎日よりも少ない頻度で、例えば、週に６回、週に５回、週に４回、週に３回、週に２回、１週間に１回、２週間ごとに１回、３週間ごとに１回、１カ月に１回、２カ月ごとに１回、３カ月ごとに１回または６カ月ごとに１回、投与することができる。一部の実施形態では、処置は、少なくとも１回、少なくとも２回、少なくとも３回、少なくとも４回、少なくとも５回、少なくとも６回、少なくとも７回、少なくとも８回、少なくとも９回または少なくとも１０回の投与を含む。組成物は、ある期間にわたって使用するために組成物が徐々に放出される埋め込み物などの、および、組成物を、１カ月に１回、２〜６カ月ごとに１回、１年ごとに１回または、さらには単回投与などのより低頻度で投与することが可能になる持続放出製剤として投与することもできる。また、処置は継続的なものである。一実施形態では、抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片、その組成物または製剤を週に１回投与する。ある特定の実施形態では、抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片、その組成物または製剤を２週間ごとに１回投与する。

ＭＭＰ９結合タンパク質は、個体に、これだけに限定されないが、静脈内（例えば、注入ポンプによって）、腹腔内、動脈内、肺内、経口、吸入、小胞内、筋肉内、気管内、皮下、髄腔内、経皮、経胸膜、局所的、吸入（例えば、噴霧剤のミストとして）、粘膜（例えば、鼻粘膜を介してなど）、皮下、経皮、胃腸管、関節内、大槽内または脳室内を含めた任意の経路によって投与することができる。一部の実施形態では、組成物を全身的に投与する（例えば静脈内注射によって）。一部の実施形態では、ＭＭＰ９結合タンパク質を局所的に投与する（例えば動脈内にまたは注射によって）。一部の実施形態では、ＭＭＰ９結合タンパク質を皮下に投与する。一部の実施形態では、ＭＭＰ９結合タンパク質を皮内に投与する。一部の実施形態では、ＭＭＰ９結合タンパク質を吸入によって投与する。一部の実施形態では、ＭＭＰ９結合タンパク質を粘膜を通じて投与する。一実施形態では、抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片、その組成物または製剤を、２週間ごとに２回、静脈内投与（すなわち、静脈内注入）によって送達する。ある特定の実施形態では、抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片、その組成物または製剤を、毎週１回、皮下投与によって送達する。

一部の実施形態では、ＭＭＰ９に結合する抗体またはその抗原結合断片を被験体当たり約２５ｍｇ〜被験体当たり約８００ｍｇで投与する。一部の実施形態では、ＭＭＰ９に結合する抗体またはその抗原結合断片を、被験体当たり約５０ｍｇ、約１００ｍｇ、約２００ｍｇ、約３００ｍｇ、約４００ｍｇ、約５００ｍｇ、約６００ｍｇ、約７００ｍｇまたは約８００ｍｇ（これらの値の間の任意の範囲を含む）で投与する。ある特定の実施形態では、ＭＭＰ９に結合する抗体（すなわち、抗ＭＭＰ９抗体）またはその抗原結合断片を、被験体当たり約１５０ｍｇ、約２５０ｍｇ、約３５０ｍｇ、約４５０ｍｇ、約５５０ｍｇ、約６５０ｍｇまたは約７５０ｍｇ（これらの値の間の任意の範囲を含む）で投与する。一部の実施形態では、上記の投与量の抗体またはその抗原結合断片を１週間に１回、２週間ごとに１回、３週間ごとに１回、１カ月に１回、２カ月ごとに１回、３カ月ごとに１回または６カ月ごとに１回、投与する。一部の実施形態では、ＭＭＰ９に結合する抗体またはその抗原結合断片を、２週間ごとに約４００ｍｇ投与する。ある特定の実施形態では、ＭＭＰ９に結合する抗体またはその抗原結合断片を、２週間ごとに約２００ｍｇの投与量で被験体に投与する。ある特定の実施形態では、ＭＭＰ９に結合する抗体またはその抗原結合断片を、週に１回、約１５０ｍｇで投与する。ある特定の実施形態では、ＭＭＰ９に結合する抗体またはその抗原結合断片を、週に１回、約３００ｍｇで投与する。ある特定の実施形態では、ＭＭＰ９に結合する抗体またはその抗原結合断片を、被験体に、二段階手順：第１に、負荷投与量相（疾患に関連するＭＭＰ９の「標的シンク」／「組織および血清シンク（ｔｉｓｓｕｅ ａｎｄ ｓｅｒｕｍ ｓｉｎｋ）」または高ベースライン濃度をカバーするためにより頻繁に投薬を行い、ここで、毎週約２００ｍｇ、約３００ｍｇもしくは約４００ｍｇの投与量で、１週間、２週間もしくは３週間の間隔にわたる投薬範囲で被験体に投与する、または疾患に関連するＭＭＰ９の「標的シンク」もしくは高ベースライン濃度をカバーするためにより頻繁に投薬を行う）、および第２に、負荷投与量相後に予測可能なｐＫが確立されたら、より低い毎週の用量、例えば、１５０ｍｇ／週、１２５ｍｇ／週、１００ｍｇ／週または５０ｍｇ／週などで投与する。一部の実施形態では、より低い毎週の用量は、週ベースでより低い用量、例えば、１５０ｍｇ／週、１２５ｍｇ／週、１００ｍｇ／週または５０ｍｇ／週であってよい。一実施形態では、抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片、その組成物または製剤を、２週間ごとに、約４００ｍｇで静脈内に投与する（すなわち、静脈内注入）。一実施形態では、抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片、その組成物または製剤を、２週間ごとに、約２００ｍｇで静脈内に投与する。一実施形態では、抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片、その組成物または製剤を、週に１回、約１５０ｍｇで皮下に投与する（すなわち、皮下注射）。一実施形態では、抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片、その組成物または製剤を、２週間ごとに、約３００ｍｇで皮下に投与する。

選択された投与レジメンは、ＭＭＰ９結合タンパク質の活性、投与経路、投与の時間、使用されている特定の化合物の排出速度、処置の持続時間、使用する特定の組成物と組み合わせて使用する他の薬物、化合物および／または材料、処置される患者の年齢、性別、体重、状態、全体的な健康ならびに以前の病歴、ならびに同様に医学の分野で周知の因子を含めた種々の因子に依存する。

いくつかの実施形態では、標的媒介性体内動態（ｔａｒｇｅｔ−ｍｅｄｉａｔｅｄ ｄｉｓｐｏｓｉｔｉｏｎ）を示す抗体についての薬物動態モデルに基づいて投与量を決定する。可溶性受容体標的を対象とする抗体について観察される比較的線形の薬物動態とは対照的に、組織に基づく標的受容体を対象とする抗体では、非線形薬物動態が頻繁に実証される。Ｍａｇｅｒ， Ｄ． Ｅ．（２００６年）、Ａｄｖ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖ Ｒｅｖ ５８巻（１２〜１３号）：１３２６〜１３５６頁。非線形体内動態についての基礎は、抗体と標的の高親和性結合および結合の程度（用量と比較して）に関し、したがって、相互作用が抗体の薬物動態特性に反映される。Ｍａｇｅｒ， Ｄ． Ｅ．およびＷ． Ｊ． Ｊｕｓｋｏ（２００１年）、Ｊ Ｐｈａｒｍａｃｏｋｉｎｅｔ Ｐｈａｒｍａｃｏｄｙｎ ２８巻（６号）：５０７〜５３２頁。抗体−受容体複合体の受容体媒介性エンドサイトーシス（内部移行）が標的媒介性薬物体内動態に含まれる。Ｗａｎｇ， Ｗ．、Ｅ．
Ｑ． Ｗａｎｇら（２００８年）、Ｃｌｉｎ Ｐｈａｒｍａｃｏｌ Ｔｈｅｒ ８４巻（５号）：５４８〜５５８頁。

薬物（抗体）の不在下で標的媒介性体内動態を有する抗体についての薬物動態モデルでは、標的受容体は一定の速度で合成され、一次プロセスによって排除される。結果として、標的受容体は、薬物（抗体）の不在下では定常状態の濃度で存在する。薬物を体に加える場合、薬物を標的受容体と２分子反応で相互作用させること、あまりよく灌流されない組織に分布させること、または一次プロセスによって排除することができる。低薬物濃度で、薬物は、高親和性結合に起因して受容体上を優勢に移動する。体に進入する薬物の量が利用可能な受容体の塊に結合するために十分になるに従い、薬物は、組織内外に分布し、排除される。薬物濃度が低下し、薬物が組織と平衡化するに従い、新しく合成された受容体に結合する追加のレザバーがもたらされる。

当技術分野における通常の技術を有する臨床医は、必要な医薬組成物の有効量（ＥＤ５０）を容易に決定し、処方することができる。例えば、医師または獣医師は、医薬組成物に使用する本発明の化合物の用量を、所望の治療効果を達成するために必要なレベルよりも低いレベルで開始し、投与量を所望の効果が達成されるまで徐々に上昇させることができる。

一部の場合には、処置の方法は、作用剤、例えば、抗ＭＭＰ９抗体またはそれを含有する組成物を非経口投与、例えば、静脈内投与、動脈内投与、皮内投与、筋肉内投与、もしくは皮下投与すること、または経口投与することを含む。

本明細書で使用される場合、「被験体」という用語は、哺乳動物の被験体を意味する。例示的な被験体としては、これだけに限定されないが、ヒト、サル、イヌ、ネコ、マウス、ラット、ウシ、ウマ、ヤギおよびヒツジが挙げられる。一部の実施形態では、被験体はＣＯＰＤを有し、下記の通り本発明の作用剤を用いて処置することができる。ある特定の実施形態では、被験体は、ＣＯＰＤと診断された患者またはＣＯＰＤを有する疑いがある患者である。必要であれば、処置のために、方法は、以下に列挙されているものなどの追加的な療法をさらに含んでよい。他の抗ＣＯＰＤ作用剤の投与または処置は、本明細書に開示されている組成物の投与と同時であっても逐次的であってもよい。また、ＣＯＰＤを有する被験体は、任意の先のＣＯＰＤの処置を受けたことがあっても受けたことがなくてもよい。

一部の実施形態では、ＭＭＰ９に結合する抗体またはその抗原結合断片を単独で、単独療法として投与する。他の実施形態では、抗体を、ＣＯＰＤを処置するための１種または複数種の他の治療剤との併用療法の一部として投与する。治療剤としては、これだけに限定されないが、１）短時間作用性β２刺激薬（例えば、サルブタモール（アルブテロール）、レバルブテロール、フェノテロール、テルブタリンなど）、２）短時間作用性抗コリン作用薬（例えば、イプラトロピウム臭化物、オキシトロピウム臭化物など）、３）長時間作用性β２刺激薬（例えば、ホルモテロール、アルホルモテロール、インダカテロール、サルメテロール、ツロブテロールなど）、４）長時間作用性抗コリン作用薬（例えば、アクリジニウム臭化物、グリコピロニウム臭化物、チオトロピウムなど）、５）短時間作用性β２刺激薬と抗コリン作用薬の組合せ（例えば、フェノテロール／イプラトロピウム、サルブタモール／イプラトロピウムなど）、６）吸入コルチコステロイド（例えば、ベクロメタゾン、ブデソニド、フルチカゾンなど）、７）長時間作用性β２刺激薬とコルチコステロイドの組合せ（例えば、ホルモテロール／ブデソニド、ホルモテロール／モメタゾン、サルメテロール／フルチカゾンなど）、８）メチルキサンチン（例えば、アミノフィリン、テオフィリンなど）、９）ホスホジエステラーゼ−４阻害剤（例えば、ロフルミラストなど）、１０）全身性コルチコステロイド（例えば、プレドニゾン、メチルプレドニゾロンなど）が挙げられる。併用療法では、本出願の抗体を、それを必要とする患者の処置において一次的なまたは第一線の作用剤として使用することもでき、二次的または追加的な作用剤として使用することもできる。一部の実施形態では、本出願の抗体を、それを必要とする患者の処置において、二次的または追加的な作用剤として使用することができる。一実施形態では、ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片を、短時間作用性β２刺激薬、短時間作用性抗コリン作用薬、長時間作用性β２刺激薬、および長時間作用性抗コリン作用薬からなる群から選択される治療剤と組み合わせることができ、また、抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片と１種または複数種の治療剤の組合せはいずれも、β２刺激薬、抗コリン作用薬、吸入コルチコステロイド、全身性コルチコステロイド、メチルキサンチンまたはホスホジエステラーゼ−４阻害剤とさらに組み合わせることができる。例として、ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片をβ２刺激薬（長時間作用性または短時間作用性のいずれか）およびメチルキサンチンと組み合わせることができる。

一部の態様では、ＭＭＰ９に結合する抗体またはその抗原結合断片の投与量を調整し、体重１ｋｇ当たり約１３３ｍｇ、約２６７ｍｇ、約４００ｍｇ、約６００ｍｇまたは約１２００ｍｇ（これらの値の間の任意の範囲を含む）投与することができる。各治療サイクル後に、患者をＭＭＰ９抗体、ＭＭＰ９または他の適切なバイオマーカーのレベルについてモニタリングする。

併用療法における作用剤は、上記の適切な経路によって、同時に（同じ組成物中で、もしくは別々に）、または逐次的に、任意の順序で投与することができる。

一部の実施形態では、処置方法は、薬力学的活性などの有効性または活性をモニタリングすることを含めた、処置をモニタリングするステップを含む。いくつかの例では、そのような方法は、上記方法および組成物を使用して処置される被験体から得た試験生体試料中の、処置の有効性を示し、さらに、ＭＭＰ９活性により切断によって直接または細胞外マトリックス内の貯蔵物から血清中に放出されるＭＭＰ９の基質として作用し得る、サイトカインおよび他の炎症マーカーなどのマーカーの存在、非存在、レベル、および／または発現を検出または測定することを含む。試料は、一般には、血液試料または血清試料であるが、本明細書に記載の他の生体試料も含めることができる。一実施形態では、試験生体試料は、本出願の方法を使用してＣＯＰＤと診断されたまたはＣＯＰＤを有する疑いがある被験体から得た痰である。そのような方法において使用するためのマーカーとしては、組織メタロプロテイナーゼ阻害物質１（ＴＩＭＰ−１）、腫瘍壊死因子アルファ（ＴＮＦ−アルファ）、マクロファージ炎症性タンパク質−２（ＭＩＰ−２）、インターロイキン−１７Ａ（ＩＬ−１７Ａ）、ＣＸＣＬ１０、リンホタクチン、マクロファージ炎症性タンパク質−１ベータ（ＭＩＰ−１ベータ）、オンコスタチン−Ｍ（ＯＳＭ）、インターロイキン−６（ＩＬ−６）、インターロイキン−８（ＩＬ−８）、単球走化性タンパク質３（ＭＣＰ−３）、血管内皮増殖因子Ａ（ＶＥＧＦ−Ａ）、単球走化性タンパク質−５（ＭＣＰ−５）、インターロイキン−１アルファ（ＩＬ−１アルファ）、マクロファージコロニー刺激因子−１（Ｍ−ＣＳＦ−１）、ミエロペルオキシダーゼ（ＭＰＯ）、成長調節アルファタンパク質（Ｇｒｏｗｔｈ−Ｒｅｇｕｌａｔｅｄ Ａｌｐｈａ Ｐｒｏｔｅｉｎ）（ＫＣ／ＧＲＯ）、インターロイキン−７（ＩＬ−７）、白血病抑制因子（ＬＩＦ）、アポリポタンパク質Ａ−Ｉ（Ａｐｏ Ａ−Ｉ）、Ｃ反応性タンパク質（ＣＲＰ）、顆粒球走化性タンパク質−２（ＧＣＰ−２）、インターロイキン−１１（ＩＬ−１１）、単球走化性タンパク質１（ＭＣＰ−１）、フォン・ヴィルブランド因子（ｖＷＦ）、ＲＡＮＫリガンド、ＣＣＬ−５、および幹細胞因子（ＳＣＦ）遺伝子産物がある。そのような方法において使用する他のマーカーとしては、ＭＭＰ９活性によって生成するデスモシン、エラスチンおよびコラーゲン断片が挙げられる。これらのマーカーは、疾患プロセスによって引き起こされる局所的な組織破壊を反映する。そのような局所的な組織破壊の産物は、最後には血清中に入る可能性があり、血清中で検出可能になり得る。

いくつかの実施形態では、各処置サイクルの後に、患者をＭＭＰ９抗体、ＭＭＰ９、または他の適切なバイオマーカーのレベルについてモニタリングする。

提供される方法としては、利用可能な処置および治療レジメンと比較して改善された安全性プロファイルおよび／またはそのような疾患および状態の処置における持続的な長期有効性をもたらす方法が挙げられる。
慢性閉塞性肺障害（ＣＯＰＤ）

ＭＭＰ９に結合する抗体およびその断片などの本明細書に記載のＭＭＰ９結合タンパク質を、例えば、慢性閉塞性肺障害（ＣＯＰＤ）を有する被験体におけるＭＭＰ９を阻害することによる、ＣＯＰＤの処置または防止において使用する。

ＣＯＰＤは、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＬＤ）または慢性閉塞性気道疾患（ＣＯＡＤ）としても公知であり、不十分な気流（気流制限）および十分に息を吐き出せないこと（エアトラッピング）を特徴とする進行性の閉塞性肺疾患（例えば、気腫および慢性気管支炎）の群を指す。不十分な気流は、肺の結合組織が破壊され、次いでそれが、不十分な気流および不十分な呼吸ガスの吸収および放出に寄与した結果である。ＣＯＰＤの徴候および症状としては、これだけに限定されないが、例えば、特に身体活動中の息切れ、喘鳴、胸部絞扼感、肺内の粘液過剰、透明、白色、黄色または緑がかった痰が生じる慢性咳、チアノーゼ（すなわち、唇および爪床が青いこと）、頻繁な呼吸器感染症、疲労、および、後期には、意図していない体重減少が挙げられる。ＣＯＰＤを有する被験体では、症状が悪化し、数日間またはそれ超持続する、増悪と称されるエピソードが生じる可能性がある。頻繁な増悪が生じる被験体では、肺機能がより速く劣化する。

ＣＯＰＤは、吸入された刺激物に対する著しい慢性炎症性応答として生じる。ＣＯＰＤの公知の原因としては、タバコ喫煙、大気汚染（例えば、多くの場合、木炭または木材もしくは動物の糞などのバイオマス燃料を燃料とする換気不十分の調理の火、都市大気汚染、排気ガスへの曝露）、および職業性曝露（例えば、作業場における粉塵、化学物質、およびヒュームへの持続的曝露など）が挙げられる。遺伝的特質がＣＯＰＤの発生に役割を果たす場合がある。現在、遺伝性危険因子はアルファ−１抗トリプシン（ＡＡＴ）欠損症のみである。増悪（すなわち、症状の突発的悪化）は、一般には、感染、環境汚染物質または薬物の不適切な使用によって誘発される。

ＣＯＰＤは、一般には、肺活量測定（すなわち、肺機能、特に、吸い込み、吐き出すことができる空気の量およびまたはスピードを測定する肺機能検査）を使用して診断される。診断を行うために測定される肺活量測定要素は、ａ）呼吸の最初の１秒で吐き出すことができる空気の最大体積である１秒間の努力呼気量（ＦＥＶ_１）；ｂ）１回の深呼吸で吐き出すことができる最大体積である努力肺活量（ＦＶＣ）である。ＣＯＰＤの症状を有する人においてＦＥＶ_１／ＦＶＣ比が７０％未満であることにより、人がＣＯＰＤの疾患を有すると定義される。高齢者では、診断基準にはＦＥＶ_１が予測値の８０％未満であることがさらに必要である。

被験体におけるＣＯＰＤの重症度を評価するために、追加的な検査が使用される。例えば、改変Ｂｒｉｔｉｓｈ Ｍｅｄｉｃａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｃｏｕｎｃｉｌ ｑｕｅｓｔｉｏｎｎａｉｒｅ（ｍＭＲＣ）またはＣＯＰＤ評価検査（ＣＡＴ）は、症状の重症度を決定するために使用することができる単純な質問票である。ＣＡＴのスコアは０〜４０にわたり、スコアが高いほど疾患の重症度が高い。気流制限の重症度を決定するためには肺活量測定が役立ち得る。これは、一般には、その人の年齢、性別、身長および体重に関して予測される「正常値」に対する百分率として表されるＦＥＶ_１に基づく。体重減少および筋肉の衰弱ならびに他の疾患の存在も考慮に入れるべきである。被験体におけるＣＯＰＤの重症度を評価するための追加的な基準は、Vestbo（２０１３年）「Diagnosis and Assessment」、Global Strategy for the Diagnosis、Management、and Prevention of Chronic Obstructive Pulmonary Disease. Global Initiative for Chronic Obstructive Lung Disease. ９〜１７頁に記載されている。

診断時に他の状態を排除するために、胸部Ｘ線および／または胸部ＣＴスキャンおよび動脈血ガス検査が一般に実施される。Ｘ線での特徴的な徴候は、肺の過膨張、横隔膜の平低化、胸骨後方の気腔の拡大、および胞（bullae）（体液が充満した肺内の嚢）である。動脈血ガス分析は、酸素の必要性を決定するために使用され、一般には、ＦＥＶ_１が予測値の３５％未満である被験体、末梢酸素飽和が９２％未満である被験体、およびうっ血性心不全の症状を有する被験体において実施される。世界の複数の地域でアルファ−１アンチトリプシン欠損症が一般的であり、ＣＯＰＤを有する人（特に、４５歳未満であり、肺の下部に影響を及ぼす気腫を伴う人）に検査が考えられる。

一部の実施形態では、本明細書に記載のＭＭＰ９結合タンパク質を用いて処置される被験体は、以下の症状の任意の１つまたは複数を有する：特に身体活動中の息切れ、喘鳴、胸部絞扼感、肺内の粘液過剰、透明、白色、黄色または緑がかった痰が生じる慢性咳、チアノーゼ（すなわち、唇および爪床が青いこと）、頻繁な呼吸器感染症、疲労、および意図していない体重減少。一部の実施形態では、処置される被験体はＣＯＰＤ増悪を有する。一部の実施形態では、被験体は、ＦＥＶ_１が予測値の４０％以上８０％未満である。一部の実施形態では、被験体は、ＦＥＶ_１／ＦＶＣ比が７０％未満である。一部の実施形態では、被験体は、改変Ｂｒｉｔｉｓｈ Ｍｅｄｉｃａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｃｏｕｎｃｉｌ ｑｕｅｓｔｉｏｎｎａｉｒｅ（ｍＭＲＣ）の結果に基づいてＣＯＰＤと診断されている。一部の実施形態では、被験体は、ＣＯＰＤ評価検査（ＣＡＴ）に基づいてＣＯＰＤと診断されている。一部の実施形態では、被験体は、Ｇｌｏｂａｌ Ｉｎｉｔｉａｔｉｖｅ ｆｏｒ Ｃｈｒｏｎｉｃ Ｏｂｓｔｒｕｃｔｉｖｅ Ｌｕｎｇ Ｄｉｓｅａｓｅ（ＧＯＬＤ）ガイドラインに基づいてＣＯＰＤと診断されている。一部の実施形態では、被験体は、以下の１つまたは複数に基づいてＣＯＰＤと診断されている：胸部Ｘ線、胸部ＣＴスキャン、および動脈血ガス分析。一実施形態では、被験体は、本出願の処置前１年間に２回またはそれ超の増悪を有するＣＯＰＤと診断される。一部の実施形態では、被験体は、処置前１年間に２回またはそれ超の増悪、および肺機能の低下を有するＣＯＰＤと診断される。肺機能の低下は、本明細書に記載の臨床的指標によって決定することができる。一部の実施形態では、肺機能の低下は、ＦＥＶ_１が８０％未満であることによって決定することができる。１年間に２回またはそれ超の増悪を有するＣＯＰＤと診断された被験体が罹患率、死亡率ならびに増悪関連入院に伴う費用の大部分を占める。いかなる仮説にも縛られることなく、そのような患者では、気道内のＭＭＰ９のレベルまたは活性が、健康な被験体または増悪が１回またはそれ未満のＣＯＰＤ被験体と比較して上昇している場合がある。気道内のＭＭＰ９のレベルまたは活性は、当業者が、一般に使用される方法を使用して決定することができる。一部の実施形態では、気道内のＭＭＰ９のレベルまたは活性は、イムノアッセイおよび試験生体試料を使用して決定することができる。ある特定の実施形態では、気道内のＭＭＰ９のレベルまたは活性は、被験体由来の痰試料においてＥＬＩＳＡを使用して決定することができる。一実施形態では、被験体は、１年間に２回またはそれ超の増悪、肺機能の低下、および気道内のＭＭＰのレベルまたは活性の上昇を有するＣＯＰＤと診断される。

一部の実施形態では、被験体は、長期タバコ喫煙者であるまたは長期タバコ喫煙者であった。一部の実施形態では、被験体は、副流煙に曝露されてきた。一部の実施形態では、被験体は、仕事場の化学的ヒューム、塵、および／または蒸気に曝露されているまたは曝露されてきた。一部の実施形態では、被験体は、大気汚染に曝露されているまたは曝露されてきた。一部の実施形態では、被験体はＣＯＰＤの家族歴を有する。
ＭＭＰ９を検出する方法

本開示は、例えば、ＣＯＰＤに関連する組織または体液または他の生体試料を検出するために、被験体におけるＭＭＰ９を検出する方法も意図している。したがって、ＣＯＰＤを有する患者由来の試料中のＭＭＰ９活性を診断、モニタリング、病期分類または検出する方法が提供される。

被験体（例えば、ＣＯＰＤを有する疑いがあるまたはＣＯＰＤを有することが分かっている個体）由来の試料（例えば、試験生体試料）を、ＭＭＰ９の存在、非存在、発現、および／またはレベルについて分析することができる。また、ＣＯＰＤを有する疑いがある被験体由来の試料を、ＭＭＰ９の存在、非存在、発現、および／またはレベルについて分析することができる。例えば、そのような試料を収集し、本明細書に記載の抗体または断片などのＭＭＰ９結合タンパク質と本試料中の物質（例えば、タンパク質）の結合が存在するかしないかを検出することによって分析することができる。いくつかの例では、該方法は、検出された結合の量を対照試料との結合の量と比較すること、またはＭＭＰ９の検出レベルをＭＭＰ９の対照レベルと比較することをさらに含む。一部の場合には、該方法により、本明細書に記載の疾患または状態の存在、非存在、または重症度が示される。

この分析は、本明細書に記載のＭＭＰ９結合タンパク質を使用した処置を開始する前に実施することができ、ＣＯＰＤ処置の進行のモニタリングの一部として行うこともできる。いくつかの実施形態では、検出アッセイを実施し、例えば、診断アッセイの結果に基づいて被験体の処置を開始、変更、または中止することによって行われる処置の方法が提供される。そのような診断分析は、これだけに限定されないが、組織、そのような組織から単離された細胞などを含めた任意の試料を使用して実施することができる。一部の場合には、該方法を、血液、血漿、血清、全血、唾液、尿、または精液などの液体試料に対して実施する。組織試料としては、例えば、ホルマリン固定したまたは凍結させた組織切片が挙げられる。

ＭＭＰ９を検出および分析するための任意の適切な方法を使用することができる。当技術分野で公知の種々の診断アッセイ技法、例えば、競合結合アッセイ、直接または間接サンドイッチアッセイおよび不均一相または均一相のいずれかで行われる免疫沈降アッセイが、そのような目的に適し得る。

検出方法において使用するためのＭＭＰ９結合タンパク質は、検出可能部分を用いて標識することができる。検出可能部分により、直接的に、または間接的に、検出可能なシグナルが生じる。例えば、検出可能部分は、例えば、放射性同位元素、例えば、３Ｈ、１４Ｃ、３２Ｐ、３５Ｓ、もしくは１２５Ｉ、蛍光化合物もしくは化学発光化合物、例えば、フルオレセインイソチオシアネート（ＦＩＴＣ）、Ｔｅｘａｓ Ｒｅｄ、シアニン、フォトシアン、ローダミン、もしくはルシフェリン、または酵素、例えば、アルカリホスファターゼ、β−ガラクトシダーゼまたは西洋ワサビペルオキシダーゼなどの本明細書に記載のもののいずれであってもよい。

検出は、ＭＭＰ９結合タンパク質とＭＭＰ９との結合に適した条件下で試料を接触させ、ＭＭＰ９結合タンパク質−ＭＭＰ９複合体が存在すること（例えば、レベル）または存在しないことを評価することによって達成することができる。参照試料のレベルと比較した試料中のＭＭＰ９のレベルにより、ＭＭＰ９活性を有するＣＯＰＤに関連する組織が存在することが示され得る。参照試料は、被験体から以前に取得した試料であっても別の個体由来の試料であってもよい。

一部の態様では、ＭＭＰ９ ｍＲＮＡを、例えば、ハイブリダイゼーションによって、例えば、発色ｉｎ ｓｉｔｕハイブリダイゼーション（ＣＩＳＨ）によって検出する。一部の態様では、高レベルの炎症細胞由来のＭＭＰ９が、他の検出方法による所望の細胞型におけるシグナル、例えばＩＨＣによるシグナルを不明瞭にする場合に、そのような検出方法を使用する。

本発明の種々の態様が、以下のいくつかの実施例を介してさらに記載され、例示されており、これはいずれも本発明の範囲を限定するものではない。

（実施例１）
第Ｉ相試験におけるＡＢ００４５の評価
この試験は、第Ｉ相二重盲検式無作為化プラセボ対照多施設試験である。この試験の主要な目的は、ベースラインから２９日目プラス３０日までの有害事象（ＡＥ）および検査異常によって評価される、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）を有する被験体におけるＡＢ００４５（すなわち、ＭＭＰ９に結合する抗体）の安全性、忍容性および薬物動態（ＰＫ）を評価することである。主要評価項目は、有害事象の発生率、検査所見およびバイタルサインのスクリーニングからの変化、ならびに投薬後の免疫原性の発生である。この複合エンドポイントにより、ＡＢ００４５の安全性および忍容性プロファイルが測定される。副次的評価項目は、ベースラインから２９日目までの、血漿中濃度を経時的に比較することによる体に吸収される薬物の総量であるＡＵＣ、および、薬物の最大濃度であるＣｍａｘによって測定されるＡＢ００４５のＰＫパラメータである。以下のＡＢ００４５のＰＫパラメータを測定する：ベースラインから２９日目までのＴｍａｘ（すなわち、Ｃｍａｘの時間）、Ｃｌａｓｔ（すなわち、薬物の最後の観察可能な濃度）、Ｔｌａｓｔ（すなわち、Ｃｌａｓｔの時間）、Ｃｔａｕ（すなわち、投薬間隔の最後に観察された薬物濃度）、λｚ（すなわち、終末相の消失速度定数）、ＣＬ（すなわち、静脈内投与後の全身クリアランス）、およびＶｚ（すなわち、静脈内投与後の見かけの分布体積）。

試験は、各参加者がＡＢ００４５ ４００ｍｇを２週間ごとに、１日目、１５日目、および２９日目に合計３回の注入で受ける実験群（experimental arm）を有する。試験には、参加者がＡＢ００４５に対応するプラセボを２週間ごとに、１日目、１５日目、および２９日目に合計３回の注入で受けるプラセボ群を含める。ＡＢ００４５ ４００ｍｇは静脈内に投与する。ＡＢ００４５に対応するプラセボも静脈内に投与する。

参加者は４０歳から７５歳の間である。男性、または妊娠しておらず授乳中でない女性が本試験に適格である。男性被験体および異性との性交を行う出産可能性がある女性被験体はプロトコールにより指定された避妊方法（複数可）の使用に同意しなければならない。男性被験体は、試験薬の最後の注入後９０日間にわたって精子提供を控えなければならない。組み入れ基準には、以下が含まれる：ａ）スクリーニング時の体重が≧４５ｋｇ〜＜１２０ｋｇであること；ｂ）スクリーニング前少なくとも６カ月間にＧｌｏｂａｌ Ｉｎｉｔｉａｔｉｖｅ ｆｏｒ Ｃｈｒｏｎｉｃ Ｏｂｓｔｒｕｃｔｉｖｅ Ｌｕｎｇ Ｄｉｓｅａｓｅ（ＧＯＬＤ）ガイドラインに従ってＣＯＰＤと診断され（Global Initiative for Chronic Obstructive Lung Disease (GOLD). Global Strategy for the Diagnosis, Management, and Prevention of Chronic Obstructive Pulmonary Disease.２０１３年更新、ワールドワイドウェブ−goldcopd.org/guidelines-global-strategy-for-diagnosis-management.htmlで入手可能）、試験期間中、安定療法のままであることが予測されること；ｃ）気管支拡張薬投与後の１秒間の努力呼気量（ＦＥＶ１）が予測値の≧４０％（かつ、一部の実施形態では、予測値の≦８０％）であること；ｄ）無作為化の前３０日以内にＣＯＰＤの薬物療法に変化がないこと；ｅ）肝臓パネル［アスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ（ＡＳＴ）、アラニンアミノトランスフェラーゼ（ＡＬＴ）、総ビリルビン、直接ビルビリン、アルカリホスファターゼ、乳酸デヒドロゲナーゼ（ＬＤＨ）］が正常範囲の上限（ＵＬＮ）の２倍以下であること；ｆ）血清クレアチニンが≦２．０であること；ｇ）ヘモグロビンが≧８．５ｇ／ｄＬであること（男性および女性どちらも）；ｈ）絶対好中球数（ＡＮＣ）が≧１．５×１０^９／Ｌ（１，５００ｍｍ^３）であること；ならびにｉ）血小板が≧１００×１０^９／Ｌであること。

除外基準には以下が含まれる：ａ）スクリーニングの間に治験責任医師によって判断される臨床的に有意な活動性感染；ｂ）スクリーニングの間に分かっているＨＩＶ、Ｂ型肝炎またはＣ型肝炎の病歴（Ｂ型肝炎表面抗原陽性であるが、上首尾の一連のＢ型肝炎ワクチン接種を受け、疾患を有したことがない被験体は適格の被験体のままである）；ｃ）スクリーニングの間にＱｕａｎｔｉＦＥＲＯＮ−ＴＢ ＧＯＬＤ検査陽性；ｄ）ここ５年以内の悪性腫瘍の病歴、非黒色腫皮膚がんまたはある特定の上皮内癌に対する局所的な処置を受けた患者以外；ｅ）無作為化の前６カ月以内の心筋梗塞、不安定なもしくは生命にかかわる不整脈、心不全での入院などのあらゆる重篤な心臓事象、または、来診１の時点に治験責任医師によって判断されるあらゆる有意なまたは新しい心電図（ＥＣＧ）所見；ｆ）無作為化の前の先の６カ月以内の、これだけに限定されないが、ＣＯＰＤ、肺炎、細気管支炎などの呼吸器事象での入院；ｇ）喘息、嚢胞性線維症または線維性疾患、α１アンチトリプシン欠損症、間質性肺疾患、肺血栓塞栓性疾患または気管支拡張症などの、ＣＯＰＤ以外の慢性肺疾患；ｇ）全身性コルチコステロイドの慢性使用および／または無作為化の９０日以内の、入院の必要がないＣＯＰＤの急性増悪（ＡＥＣＯＰＤ）事象または他の医学的状態に対する全身性コルチコステロイドを用いた処置；ｈ）無作為化の９０日以内に、入院の必要がないＡＥＣＯＰＤ事象もしくは他の医学的状態、または、無作為化の１４日以内の、入院の必要がないあらゆる軽微な医学的事象に対する抗生物質を用いた処置；ｉ）あらゆる販売されているまたは治験中の生物製剤を用いた、分子の５半減期以内、または、未知の場合にはスクリーニングの９０日以内の処置；ならびにｊ）これまでのところ、無作為化の９０日以内に、アザチオプリン、シクロスポリン、ヒドロキシクロロキン、レフルノミド、メトトレキサート、ミコフェノール酸モフェチル、スルファサラジン、トファシチニブなどの非生物学的免疫修飾薬物療法を受けている被験体。

本明細書に記載の種々の実施形態の性質の１つ、いくつかまたは全てを組み合わせて本発明の他の実施形態を形成できることが理解されるべきである。本発明のこれらおよび他の態様は、当業者には明らかである。本発明のこれらおよび他の実施形態を以下の発明の詳細な説明にさらに記載する。
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
（項目１）
被験体における慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）を処置または防止するための方法であって、該被験体に、有効量の、抗マトリックスメタロプロテイナーゼ９（ＭＭＰ９）抗体またはその抗原結合断片を投与するステップを含む方法。
（項目２）
前記抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片がＭＭＰ９のエピトープに結合し、該エピトープが配列番号２７のアミノ酸残基１０４〜１１９、残基１５９〜１６６または残基１９１〜２０２を含む、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記エピトープが配列番号２７のＥ１１１、Ｄ１１３、Ｒ１６２またはＩ１９８を含む、項目２に記載の方法。
（項目４）
抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片が、配列番号２７のアミノ酸残基１０４〜１１９、残基１５９〜１６６または残基１９１〜２０２に結合するタンパク質と、ＭＭＰ９との結合について競合する、項目１から３までのいずれかに記載の方法。
（項目５）
前記タンパク質が、配列番号７、１２、１３、１４、１５、１６、１７、および１８からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも約９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれ超の同一性を有する抗体である、項目４に記載の方法。
（項目６）
前記抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片が、配列番号１３、１４、および１５からなる群から選択されるアミノ酸配列を有する相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む重鎖可変（ＶＨ）領域を含む、項目１から５までのいずれかに記載の方法。
（項目７）
前記抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片が、配列番号１６、１７、および１８からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するＣＤＲを含む軽鎖可変（ＶＬ）領域を含む、項目１から６までのいずれかに記載の方法。
（項目８）
前記抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片が、配列番号３、５、６、７、および８からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むＶＨ領域を含む、項目１から７までのいずれかに記載の方法。
（項目９）
前記抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片が、配列番号４、９、１０、１１、および１２からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むＶＬ領域を含む、項目１から８までのいずれかに記載の方法。
（項目１０）
前記抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片が、配列番号７に記載のアミノ酸配列を含むＶＨ領域および配列番号１２に記載のアミノ酸配列を含むＶＬ領域を含む、項目１から９までのいずれかに記載の方法。
（項目１１）
前記抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片が、配列番号５６に記載のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号５７に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、項目１から１０までのいずれかに記載の方法。
（項目１２）
前記抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片が、ヒト化、キメラまたはヒト抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片である、項目１から１１までのいずれかに記載の方法。
（項目１３）
前記抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片が、ＭＭＰ９の酵素活性を阻害する、項目１から１２までのいずれかに記載の方法。
（項目１４）
前記阻害が非競合的である、項目１３に記載の方法。
（項目１５）
前記抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片が、約１００ｍｇ、１５０ｍｇ、２００ｍｇ、３００ｍｇまたは４００ｍｇの用量で投与される、項目１から１４までのいずれかに記載の方法。
（項目１６）
前記抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片が、毎週１回、２週間ごとに１回または３週間ごとに１回投与される、項目１から１５までのいずれかに記載の方法。
（項目１７）
前記抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片が、静脈内、皮内または皮下に投与される、項目１から１６までのいずれかに記載の方法。
（項目１８）
前記抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片が、ＣＯＰＤを処置するための１種または複数種の治療剤と同時にまたは逐次的に投与される、項目１から１７までのいずれかに記載の方法。
（項目１９）
ＣＯＰＤを処置するための前記１種または複数種の治療剤が、短時間作用性β２刺激薬、短時間作用性抗コリン作用薬、長時間作用性β２刺激薬、長時間作用性抗コリン作用薬、およびこれらの組合せからなる群から選択される、項目１８に記載の方法。
（項目２０）
β２刺激薬、抗コリン作用薬、吸入コルチコステロイド、全身性コルチコステロイド、メチルキサンチン、ホスホジエステラーゼ−４阻害剤またはこれらの組合せをさらに含む、項目１９に記載の方法。

Claims (20)

1. 被験体における慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）を処置または防止するための方法であって、該被験体に、有効量の、抗マトリックスメタロプロテイナーゼ９（ＭＭＰ９）抗体またはその抗原結合断片を投与するステップを含む方法。
2. 前記抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片がＭＭＰ９のエピトープに結合し、該エピトープが配列番号２７のアミノ酸残基１０４〜１１９、残基１５９〜１６６または残基１９１〜２０２を含む、請求項１に記載の方法。
3. 前記エピトープが配列番号２７のＥ１１１、Ｄ１１３、Ｒ１６２またはＩ１９８を含む、請求項２に記載の方法。
4. 抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片が、配列番号２７のアミノ酸残基１０４〜１１９、残基１５９〜１６６または残基１９１〜２０２に結合するタンパク質と、ＭＭＰ９との結合について競合する、請求項１から３までのいずれかに記載の方法。
5. 前記タンパク質が、配列番号７、１２、１３、１４、１５、１６、１７、および１８からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも約９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれ超の同一性を有する抗体である、請求項４に記載の方法。
6. 前記抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片が、配列番号１３、１４、および１５からなる群から選択されるアミノ酸配列を有する相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む重鎖可変（ＶＨ）領域を含む、請求項１から５までのいずれかに記載の方法。
7. 前記抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片が、配列番号１６、１７、および１８からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するＣＤＲを含む軽鎖可変（ＶＬ）領域を含む、請求項１から６までのいずれかに記載の方法。
8. 前記抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片が、配列番号３、５、６、７、および８からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むＶＨ領域を含む、請求項１から７までのいずれかに記載の方法。
9. 前記抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片が、配列番号４、９、１０、１１、および１２からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むＶＬ領域を含む、請求項１から８までのいずれかに記載の方法。
10. 前記抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片が、配列番号７に記載のアミノ酸配列を含むＶＨ領域および配列番号１２に記載のアミノ酸配列を含むＶＬ領域を含む、請求項１から９までのいずれかに記載の方法。
11. 前記抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片が、配列番号５６に記載のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号５７に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、請求項１から１０までのいずれかに記載の方法。
12. 前記抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片が、ヒト化、キメラまたはヒト抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片である、請求項１から１１までのいずれかに記載の方法。
13. 前記抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片が、ＭＭＰ９の酵素活性を阻害する、請求項１から１２までのいずれかに記載の方法。
14. 前記阻害が非競合的である、請求項１３に記載の方法。
15. 前記抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片が、約１００ｍｇ、１５０ｍｇ、２００ｍｇ、３００ｍｇまたは４００ｍｇの用量で投与される、請求項１から１４までのいずれかに記載の方法。
16. 前記抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片が、毎週１回、２週間ごとに１回または３週間ごとに１回投与される、請求項１から１５までのいずれかに記載の方法。
17. 前記抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片が、静脈内、皮内または皮下に投与される、請求項１から１６までのいずれかに記載の方法。
18. 前記抗ＭＭＰ９抗体またはその抗原結合断片が、ＣＯＰＤを処置するための１種または複数種の治療剤と同時にまたは逐次的に投与される、請求項１から１７までのいずれかに記載の方法。
19. ＣＯＰＤを処置するための前記１種または複数種の治療剤が、短時間作用性β２刺激薬、短時間作用性抗コリン作用薬、長時間作用性β２刺激薬、長時間作用性抗コリン作用薬、およびこれらの組合せからなる群から選択される、請求項１８に記載の方法。
20. β２刺激薬、抗コリン作用薬、吸入コルチコステロイド、全身性コルチコステロイド、メチルキサンチン、ホスホジエステラーゼ−４阻害剤またはこれらの組合せをさらに含む、請求項１９に記載の方法。