JP2015536951A - 黄色ブドウ球菌(S.aureus)関連性疾患を治療する方法 - Google Patents
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Abstract
Description
(a)配列番号7、10、13又は69のアミノ酸配列を含むVH CDR1;
(b)配列番号8、11、14、17、70又は75のアミノ酸配列を含むVH CDR2;
(c)配列番号9、12、15、18、16、65、66、67、71、72、76又は78のアミノ酸配列を含むVH CDR3;
(d)配列番号1又は4のアミノ酸配列を含むVL CDR1;
(e)配列番号2、5、73又は77のアミノ酸配列を含むVL CDR2;及び
(f)配列番号3、6、64、68又は74のアミノ酸配列を含むVL CDR3
を含む。
抗黄色ブドウ球菌(S.aureus)α毒素(抗黄色ブドウ球菌(S.aureus)AT又は抗ATとも呼ばれる)抗体又はその抗原結合断片は、本明細書で用いられる場合、α毒素タンパク質、ペプチド、サブユニット、断片、部分、オリゴマー又はそれらの任意の組み合わせに特異的な1つ又は複数のエピトープに免疫特異的に結合し、概して他のポリペプチドには特異的に結合しない。用語「オリゴマー」又は「α毒素オリゴマー」は、機能的な膜孔(例えば、7個のα毒素モノマー)を形成するα毒素モノマーの会合体(例えば、2個のモノマー、3個のモノマー、4個のモノマー、5個のモノマー、6個のモノマー又は7個のモノマー)を指す。エピトープは、α毒素タンパク質の少なくとも一部分を含む少なくとも1つの抗体結合領域を含み得る。用語「エピトープ」は、本明細書で使用されるとき、抗体との結合能を有するタンパク質決定基を指す。エピトープは、概してアミノ酸及び/又は糖側鎖などの分子の化学的に活性な表面基を含み、概して特定の三次元構造特徴、並びに特定の化学的特徴(例えば、電荷、極性、塩基性、酸性、疎水性など)を有する。立体構造エピトープと非立体構造エピトープとは、変性溶媒の存在下で前者との結合が失われるのに対し、後者との結合は失われない点で区別される。一部の実施形態では、認識されたエピトープが活性なヘプタマーの形成を妨げる(例えば、α毒素モノマーのオリゴマー形成による活性なヘプタマーへの複合体化を阻害する)。
特定の実施形態では、抗α毒素抗体又は抗原結合断片は親抗体から調製される。一部の実施形態では、抗α毒素抗体又は抗原結合断片は親抗体の範囲内に包含される。本明細書で使用されるとき、用語「親抗体」は、本明細書において定義される変異体又は誘導体の調製に用いられるアミノ酸配列によりコードされる抗体を指す。親ポリペプチドは、自然抗体配列(すなわち、天然に存在する対立遺伝子変異体を含め、天然に存在するもの)又は天然に存在する配列の既存のアミノ酸配列修飾(他の挿入、欠失及び/又は置換など)を有する抗体配列を含み得る。親抗体はヒト化抗体又はヒト抗体であってもよい。具体的な実施形態において、抗α毒素抗体及び抗原結合断片は親抗体の変異体である。本明細書で使用されるとき、用語「変異体」は、親抗体配列における1つ以上のアミノ酸残基の付加、欠失及び/又は置換によって「親」抗α毒素抗体又は抗原結合断片アミノ酸配列とアミノ酸配列が異なる抗α毒素抗体又は抗原結合断片を指す。
可変ドメイン(VH及びVL)は抗原結合領域を含むが、その変異性は抗体の可変ドメインにわたり均等に分布するわけではない。変異性は、軽鎖(VL又はVK)及び重鎖(VH)のいずれの可変ドメインにもある相補性決定領域(CDR)と呼ばれるセグメントに集中している。可変ドメインのなかでより高度に保存されている部分は、フレームワーク領域(FR)と呼ばれる。天然の重鎖及び軽鎖の可変ドメインは、各々4つのFRを含み、FRは概してβシート構造をとり、3つのCDRにより接続される。CDRはループを形成し、これらのループがβシート構造を接続し、及びある場合にはβシート構造の一部を形成する。各鎖のCDRはFRによって近接して一体に保持され、他方の鎖のCDRと共に抗体の抗原結合部位の形成に寄与する(Kabat et al.,前掲を参照のこと)。重鎖の3つのCDRはVH−CDR1、VH CDR2、及びVH−CDR−3と命名され、軽鎖の3つのCDRはVL−CDR1、VL−CDR2、及びVl−CDR3と命名される。本明細書ではカバット付番方式を使用している。従って、VH−CDR1はおよそアミノ酸31から始まり(すなわち、最初のシステイン残基後の約9残基)、約5〜7アミノ酸を含み、及び次のセリン残基で終わる。VH−CDR2はCDR−H1の終わりから15番目の残基から始まり、約16〜19アミノ酸を含み、及び次のグリシン残基で終わる。VH−CDR3はVH−CDR2の終わりから約30番目のアミノ酸残基から始まり;約13〜15アミノ酸を含み;及び配列M−D−Vで終わる。VL−CDR1はおよそ残基24から始まり(すなわち、システイン残基に続く);約10〜15残基を含み;及び配列Y−V−Sで終わる。VL−CDR2はVL−CDR1の終わりから約16番目の残基から始まり、及び約7残基を含む。VL−CDR3はVH−CDR2の終わりから約33番目の残基から始まり;約7〜11残基を含み、及び配列T−I−Lで終わる。CDRは抗体毎に著しく異なる(及び定義上、カバットのコンセンサス配列との相同性は示さない)ことに留意されたい。
本発明はまた、修飾IgG定常ドメインを有する本発明の結合メンバー、特に本発明の抗体も含む。長い血清中半減期及び様々なエフェクター機能を媒介する能力などの機能的特性を有するヒトIgGクラスの抗体が、本発明の特定の実施形態で使用される(Monoclonal Antibodies:Principles and Applications,Wiley−Liss,Inc.,Chapter 1(1995))。ヒトIgGクラス抗体は、さらに以下の4つのサブクラスに分類される:IgG1、IgG2、IgG3及びIgG4。IgGクラス抗体のエフェクター機能としてのADCC及びCDCについて、これまで数多くの研究が行われており、ヒトIgGクラスの抗体のなかでもIgG1サブクラスは、ヒトにおいて最大のADCC活性及びCDC活性を有することが報告されている(Chemical Immunology,65,88(1997))。
また、本明細書に記載する抗α毒素抗体又はその抗原結合断片と担体を含む医薬製剤も提供される。かかる製剤は、全体を通して記載する様々な方法で、容易に投与することができる。一部の実施形態では、製剤は、薬学的に許容可能な担体を含む。
本発明はまた、黄色ブドウ球菌(S.aureus)α毒素(抗AT)抗体及びその抗原結合断片を用いて、菌血症及び敗血症などの黄色ブドウ球菌(S.aureus)関連性疾患及び病態を予防及び/又は治療する方法も提供する。また、黄色ブドウ球菌(S.aureus)α毒素(抗AT)抗体及びその抗原結合断片を用いて、免疫無防備患者における肺炎などの黄色ブドウ球菌(S.aureus)関連性疾患及び病態を予防及び/又は治療する方法も提供する。
(a)配列番号7、10、13又は69のアミノ酸配列を含むVH CDR1;
(b)配列番号8、11、14、17、70又は75のアミノ酸配列を含むVH CDR2;
(c)配列番号9、12、15、18、16、65、66、67、71、72、76又は78のアミノ酸配列を含むVH CDR3;
(d)配列番号1又は4のアミノ酸配列を含むVL CDR1;
(e)配列番号2、5、73、又は77のアミノ酸配列を含むVL CDR2;及び
(f)配列番号3、6、64、68又は74のアミノ酸配列を含むVL CDR3
を含む。さらに、こうした抗体又はその抗原結合断片の突然変異体及び誘導体、並びに前述したアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を示す抗体又はその抗原結合断片も使用することができる。
細菌攻撃用量の調製
黄色ブドウ球菌(S.aureus)SF8300(USA300)は、Binh Diep(カリフォルニア大学サンフランシスコ校(University California San Francisco)により提供された。50mLのトリプチックソイブロス(TSB)において細菌を250rpmで振盪しながら、37℃で一晩培養した。一晩の培養物から10mLを1Lの新鮮なTSBに添加し、600nmでの光学密度(OD600)0.8まで、細菌を37℃で振盪しながら増殖させた。4℃で15分間の8000rpmの遠心分離により細菌を回収し、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で洗浄した。遠心分離により細菌を回収し、最終細菌株約2x1010cfu/mLまで、10%グリセロールを含むPBS中に再懸濁させた。
8〜9週齢の雌BALB/cマウス10匹のマウス群に、指定濃度のLC10又は500μLPBS中のR347(45mg/kg)mAbを腹腔内注射した。それから24時間後に、200μLの細菌懸濁液(凍結株から、pH7.2のPBSで希釈した5x107cfu)で、マウスを尾静脈において静脈内(IV)攻撃した。攻撃後14日にわたり生存についてマウスをモニターした。ログランク検定:R347(対照)対LC10(抗AT抗体)免疫マウスを用いて、統計的分析を評価した。
感染したマウスを、感染から14時間後にCO2で安楽死させた。心臓を摘出し、溶解マトリックスA(lysing matrix A)チューブにおいて、1mLの低温PBS中で均質化し、細菌計数のためにTSAプレートに塗布した。独立両側スチューデントt検定を用いて、心臓組織中の細胞負荷をR347とLC10mAbとの対比較で分析した。p<0.05であれば、データは有意であるとみなした。
感染から8、24、48、72、及び144時間後にCO2でマウスを安楽死させた。心臓穿孔により血液を回収し、その直後に100μLをcfu計数のためにTSBプレートに塗布した。独立スチューデントt検定を用いて、データを分析した。p<0.05であれば、LC10とR347との間で、値が統計的に相違するとみなした。
抗AT抗体媒介によるATの阻害が敗血症の進行に作用するかどうかを決定するために、マウス10匹のマウス群を、LC10(45及び15mg/kg)又はアイソタイプ対照(R347、45mg/kg)で受動免疫し、24時間後に黄色ブドウ球菌(S.aureus)SF8300(USA300)によるIV攻撃を実施し、14日にわたり生存をモニターした。LC10予防は、生存を有意に増加させたが、これは、ATが、全身性黄色ブドウ球菌(S.aureus)疾患に重要な役割を果たしており、LC10によるその阻害が、マウスを死亡から防御することを示している(図1)。
免疫無防備状態の個体、特に好中球減少症に罹患している個体は、黄色ブドウ球菌(S.aureus)感染の危険性が増大する(Andrews及びSullivan,2003;Bouma et.al.,2010)。免疫無防備状態の個体における黄色ブドウ球菌(S.aureus)肺炎の予防に使用する抗AT抗体の有効性を調べるために、免疫無防備状態のマウス肺炎モデルを作製し、使用した。免疫無防備状態の個体の集団において感染を模倣するために、マウスの白血球(好中球、リンパ球及び血小板を含む)を枯渇させることがわかっているアルキル化剤であるシクロホスファミドの投与により、マウスを好中球減少症にした(Zuluaga,et.al.,2006)。
細菌攻撃用量の調製
黄色ブドウ球菌(S.aureus)SF8300を、50mLのトリプチックソイブロス(TSB)中で、250rpmにて振盪しながら、37℃で一晩培養した。10mLの一晩の培養物を1Lの新鮮なTSBに添加し、37℃で振盪しながら、600nmでの光学密度(OD600)0.8まで細菌を増殖させた。4℃で15分間8000rpmの遠心分離により細菌を回収し、リン酸緩衝食塩水(PBS)中で洗浄した。遠心分離により細菌を再度回収し、最終細菌株約2×1010cfu/mLまで、10%グリセロールを含むPBS中に再懸濁させた。
初めに、免疫無防備状態のマウスにおける最小致死黄色ブドウ球菌(S.aureus)用量を攻撃用量滴定実験で特定した。2回目のCPM投与から24時間後に、免疫無防備状態のマウスをイソフルオランで麻酔した後、左右の鼻孔に50μLの黄色ブドウ球菌(S.aureus)(1×107〜2×108CFU)を接種した。回復のためにマウスを仰臥位で檻に配置し、7日間にわたり致死性について観察した。
免疫無防備状態の肺炎モデルにおける抗ATmAbの効能
この実験で用いるマウスは30匹で、これらをランダムに3つの群に分けた。感染の4日及び1日前に、マウスにCPMを投与した。各群にLC10(45若しくは15mg/kg)又はR347(45mg/kg)のいずれかを投与し(第−1日)、24時間後に黄色ブドウ球菌(S.aureus)SF8300(5×107)による鼻腔内(IN)攻撃を実施し、生存を最大7日間観察した。ログランク検定を用いて、統計的有意性を決定した。
好中球などの全WBC数を90%減少する最適CPM用量レジメンを決定するために実験を実施した。20匹のマウス群を、6つの異なるCPM用量レジメンで第0及び3日に処置した。第0、1、4、及び6日に、用量群毎に5匹からの血液試料を採取し、Sysmex自動化血液分析器を用いて、全WBC数及び百分率を実施した。第4及び6日に、群6のマウス(1回目CPM用量150mg/kg;2回目CPM用量100mg/kg[CPM150/100]は、非処置のマウスと比較して、全WBCの90%減少を示した。この群では、第4及び6日に、好中球及びリンパ球の90%減少が見られた(図4)。第7日に白血球が回復し始めた。これらの結果は、以前報告されたもの(Zuluaga et.al.,2006)と一致する。従って、免疫無防備状態のマウスにおけるLC10予防を評価するために、CPM150/100用量を選択した。
免疫無防備状態のマウスにおける最小致死攻撃用量を決定するために、黄色ブドウ球菌(S.aureus)SF8300を、5匹のマウス群に対するIN攻撃により滴定した(1×107〜2×108CFU)。7日間にわたり致死性を観察した。最も低い致死用量は、5×107CFUであったため、これを、LC10予防を評価するための用量として選択した。
免疫無防備状態のマウスにおけるLC10予防の効果を理解するために、CPMを注射したマウスに、LC10(45又は15mg/kg)又は45mg/kgのR347を投与し、24時間後に50μLの細菌懸濁液(5×107CFUのSF8300)によるIN攻撃を実施し、前述のように致死性を観察した。
好中球及びリンパ球を含む循環白血球の>90%減少を引き起こすシクロホスファミドを用いて、黄色ブドウ球菌(S.aureus)による免疫無防備状態マウス肺炎モデルを作製した。マウスは、重度の好中球減少(≦10好中球/μL血液)を示した。LC10による予防は、黄色ブドウ球菌(S.aureus)好中球減少マウス肺炎モデルにおける生存率を有意に改善した。これらの結果は、シクロホスファミドの投与により好中球減少症にしたマウスの黄色ブドウ球菌(S.aureus)の24時間前に、LC10による受動免疫が、生存を有意に改善することを示している。従って、以上のことから、抗AT抗体は、免疫無防備状態の患者において疾患を予防することができることが明らかである。
Claims (16)
- 哺乳動物対象における黄色ブドウ球菌(S.aureus)関連性敗血症を予防する、又はその重症度を軽減する方法であって、有効量の単離抗黄色ブドウ球菌(S.aureus)α毒素(抗AT)抗体又はその抗原結合断片を前記対象に投与することを含む方法。
- 哺乳動物対象の血流又は心臓における黄色ブドウ球菌(S.aureus)の細菌負荷を低減する方法であって、有効量の単離抗黄色ブドウ球菌(S.aureus)α毒素(抗AT)抗体又はその抗原結合断片を前記対象に投与することを含む方法。
- 哺乳動物対象における黄色ブドウ球菌(S.aureus)凝集及び/又は血栓塞栓性病変形成を低減する方法であって、有効量の単離抗黄色ブドウ球菌(S.aureus)α毒素(抗AT)抗体又はその抗原結合断片を前記対象に投与することを含む方法。
- 前記対象の血流又は心臓における黄色ブドウ球菌(S.aureus)の細菌負荷が低減される、請求項1に記載の方法。
- 前記対象における黄色ブドウ球菌(S.aureus)の細菌凝集及び/又は血栓塞栓性病変形成が低減される、請求項1に記載の方法。
- 免疫無防備状態の哺乳動物対象における黄色ブドウ球菌(S.aureus)関連性肺炎を予防する、又はその重症度を軽減する方法であって、有効量の単離抗黄色ブドウ球菌(S.aureus)α毒素(抗AT)抗体又はその抗原結合断片を前記対象に投与することを含む方法。
- 前記哺乳動物対象が、ヒトである、請求項1〜6のいずれか一項に記載の方法。
- 前記単離抗AT抗体又はその抗原結合断片が、Fv、Fab、Fab’、及びF(ab’)2からなる群から選択される、請求項1〜7のいずれか一項に記載の方法。
- 前記抗体が、全長抗体である、請求項1〜7のいずれか一項に記載の方法。
- 前記抗体が、Fc変異領域を含む、請求項9に記載の方法。
- 前記単離抗体又はその抗原結合断片が、黄色ブドウ球菌(Staphylococcus aureus)α毒素ポリペプチドに免疫特異的に結合し、且つ
(a)配列番号7、10、13又は69のアミノ酸配列を含むVH CDR1;
(b)配列番号8、11、14、17、70又は75のアミノ酸配列を含むVH CDR2;
(c)配列番号9、12、15、18、16、65、66、67、71、72、76又は78のアミノ酸配列を含むVH CDR3;
(d)配列番号1又は4のアミノ酸配列を含むVL CDR1;
(e)配列番号2、5、73又は77のアミノ酸配列を含むVL CDR2;及び
(f)配列番号3、6、64、68又は74のアミノ酸配列を含むVL CDR3
を含む、請求項1〜10のいずれか一項に記載の方法。 - 前記VH CDR1、VH CDR2、VH CDR3、VL CDR1、VL CDR2及びVL CDR3が、配列番号7、8、9、1、2及び3;配列番号10、11、12、1、2及び3;配列番号13、14、15、4、5及び6;配列番号7、17、18、1、2及び3;配列番号7、8、16、1、2及び64;配列番号7、8、65、1、2及び64;配列番号7、8、66、1、2及び64;配列番号7、8、67、1、2及び68;配列番号7、8、67、1、2及び64;配列番号7、8、78、1、2及び64;配列番号7、8、65、1、2及び68;配列番号69、70、71、1、2及び68;配列番号7、8、72、1、73及び74;配列番号69、75、71、1、2及び68;配列番号69、75、76、1、2及び68;配列番号69、75、76、1、77及び74;配列番号69、70、71、1、77及び74のアミノ酸配列に対応する、請求項11に記載の方法。
- 前記単離抗体又はその抗原結合断片が、(i)配列番号20、22、24、26、28、41、43、45、47、49、51、53、55、57、79、59、61、又は62のアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有する重鎖可変ドメインを含み、及び(ii)配列番号19、21、23、25、27、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60又は63のアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有する軽鎖可変ドメインを含む、請求項11又は12に記載の方法。
- 前記単離抗体又はその抗原結合断片が、配列番号20、22、24、26、28、41、43、45、47、49、51、53、55、57、79、59、61、又は62の重鎖可変ドメインと、配列番号19、21、23、25、27、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60又は63の軽鎖可変ドメインとを含む、請求項11〜13のいずれか一項に記載の方法。
- 前記VH及びVLが、配列番号20及び19;配列番号22及び21;配列番号24及び23;配列番号26及び25;配列番号28及び27;配列番号41及び42;配列番号43及び44;配列番号45及び46;配列番号47及び48;配列番号47及び48;配列番号49及び50;配列番号51及び52;配列番号51及び52;配列番号53及び54;配列番号55及び56;配列番号57及び58;配列番号59及び60;配列番号61及び58;配列番号62及び58;配列番号62及び63;配列番号79及び63のアミノ酸配列に対応する、請求項11〜14のいずれか一項に記載の方法。
- 前記単離抗体がさらにFc変異ドメインを含み、ここで、前記抗体は、配列番号80に対応するVH−IgG1−YTE及び/又は配列番号81に対応するVL−κを含む、請求項11〜15のいずれか一項に記載の方法。
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