JP2015535609A - バイオポリマーの自動染色法及び染色装置 - Google Patents
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Abstract
Description
染料と染色しようとするバイオポリマーを含む媒体とを、電場を印加した容器で接触させ、染料と染色しようとするバイオポリマーを結合して染色する染料と染色しようとするバイオポリマーの結合ステップaと、
電場で媒体での余剰な染料を除去するステップbと、
を含み、ステップaとステップbでの媒体は同一の媒体である。
電場で余剰な染料を除去するステップa、又は
容器に脱色剤を添加し、電場を印加し、バイオポリマーと結合されない染料を媒体から全部又は部分に移し出すが、バイオポリマーを媒体に残留するステップb、
を更に含む。
該技術は出願した授権特許(バイオポリマー高速染色法、201010220009.5)のうえに、改良したものである。バイオポリマー高速染色法(201010220009.5)にはキャリア、例えば使い捨て増厚濾紙を消耗する必要があり、本発明の自動染色方法はサンドイッチ構造を形成する必要がなくて、キャリアを消耗する必要がないので、コストを節約する。原理は、同様に、電場で帯電バイオポリマー染料とバイオポリマーとの高速結合を加速するとともに、結合されない染料と染料を結合したバイオポリマーとを迅速に分離させることができ、染色時間全体を短縮し、コストを節約することであり、該方法は、操作が簡単で、染色、脱色は機器で自動に完成されることができ、手動操作及び実験者と染料及び脱色液との接触を避けて、実験の安全性を強化する。
4−20%のポリアクリルアミドゲル(GenScript、MG420W12)において、10μlの細胞溶解液(1レーン)、5μ1のNEBタンパク質標準サンプル(2レーン)、500ngのマウス抗体(3レーン)、50ngのマウス抗体(4レーン)、5000ngのGタンパク質(5レーン)、500ngのGタンパク質(6レーン)、50ngのGタンパク質(7レーン)、5000ngのBSA(8レーン)、500ngのBSA(9レーン)、50ngのBSA(10レーン)、5μ1のNEBタンパク質標準サンプル(11レーン)、10μlの細胞溶解液(12レーン)というサンプルをそれぞれ12個のサンプル穴にローディングする。130ボルトで1時間電気泳動した後、ゲルを取り出し、以下の方法で染色する。
電気泳動により分離されたタンパク質サンプルを含むポリアクリルアミドゲルを染色容器に置いて、コントローラの制御プロセスは以下のとおりである。ポンプにより20mlの染料を自動にポンプ注入し、機器には自動に36vの直流電流を流れてアクリルアミドゲルでのタンパク質を染色し始め、5分間後、染色を終了する。ポンプにより染料を自動にポンプアウトする。そして、ポンプにより20mlの脱色液を自動にポンプ注入し、機器は自動に通電されてアクリルアミドゲルを脱色し始め、5分間後、脱色を終了する。ポンプにより脱色液を自動にポンプアウトする。染色容器からタンパク質サンプルに対して染色したポリアクリルアミドゲルを取り出し、染色過程全体を終了する。染色されたポリアクリルアミドゲルを撮影し、図1に結果を示す。使用した染料はクマシーブリリアントブルーであり、具体的に0.05%のクマシーブリリアントブルーR250溶液であり、溶剤は59%の脱イオン水、28.5%のエタノール及び12.5wt%乳酸である。使用した脱色液は25mMのEDTA二ナトリウムと25mMのNaH2P04の混合物水溶液である。
4−20%のポリアクリルアミドゲル(GenScript、MG420W10)において、5μlのNEΒタンパク質標準サンプル(1)、1000ngのBSA(2)、500ngのBSA(3)、250ngのBSA(4)、125ngのBSA(5)、62.5ngのBSA(6)、31ngのBSA(7)、15ngのBSA(8)、8ngのBSA(9) というサンプルを9つのサンプル穴にそれぞれローディングする。130ボルトで1時間電気泳動した後、以上に記載の方法により染色する。
電気泳動により分離されたタンパク質サンプルを含むポリアクリルアミドゲルを染色容器に置いて、コントローラの制御プロセスは以下のとおりである。ポンプにより20mlの染料を自動にポンプ注入し、機器には自動に36ボルトの直流電流を流れてアクリルアミドゲルでのタンパク質を染色し始め、5分間後、染色を終了する。ポンプにより染料を自動にポンプアウトする。そして、ポンプにより20mlの脱色液を自動にポンプ注入し、機器には自動に36ボルトの直流電流を流れてアクリルアミドゲルを脱色し始め、5分間後、脱色を終了する。ポンプにより脱色液を自動にポンプアウトする。染色容器からタンパク質サンプルに対して染色したポリアクリルアミドゲルを取り出し、染色過程全体を終了する。染色されたポリアクリルアミドゲルを撮影し、結果を図2に示す。使用された染料がクマシーブリリアントブルーであり、具体的には0.05%のクマシーブリリアントブルーR250溶液であり、溶剤は59%の脱イオン水、28.5%のエタノール及び12.5wt%の乳酸である。使用した脱色液は25mMのEDTA二ナトリウムと25mMのNaH2P04の混合物水溶液である。
染色キットであって、染色装置、染料溶液及び脱色液を含む。
図3に示す染色装置に電極4が挿し込まれた容器3が設けられ、バイオポリマーを含む媒体11を容器3に置いて染色し、容器3の上壁にそれぞれ染料注入口9と脱色剤注入口10が設けられ、染料注入口9は染料ポンプ5により染料貯蔵装置6と連通され、脱色剤注入口10は脱色剤ポンプ2により脱色剤貯蔵装置1と連通され、容器3の底部に廃液排出口12が設けられ、廃液ポンプ7により廃液溜め8と連通される。各貯蔵装置とポンプの間、ポンプと容器3の間は管路により接続される。
染料溶液は0.05%のクマシーブリリアントブルーR250であり、溶剤が59%の脱イオン水、28.5%のエタノール及び12.5wt%の乳酸である。
脱色液は25mMのEDTA二ナトリウムと25mMのNaH2P04の混合物水溶液である。
電気泳動サンプルは、タンパク質marker(Genscipt、M00516):5μL(1)、2.5μL(2)、1.25μL(3)、0.625μL(4)、BSA:50ng(5)、25ng(6)、12.5ng(7)、6.25ng(8)、3.125ng(9)である。実施例1又は2の操作により電気泳動及び染色を行い、脱色液はそれぞれ以下のとおりである。
25mMのEDTA二ナトリウムと15uMのNaH2P04の混合物水溶液、結果を図4に示す。
25mMのEDTA二ナトリウムと150uMのNaH2P04の混合物水溶液、結果を図5に示す。
25mMのEDTA二ナトリウムと1.5mMのNaH2P04の混合物水溶液、結果を図6に示す。
25mMのEDTA二ナトリウムと15mMのNaH2P04の混合物水溶液、結果を図7に示す。
25mMのEDTA二ナトリウムと150mMのNaH2P04の混合物水溶液、結果を図8に示す。
サンプルは、新たなタンパク質marker(Genscript、M00516):5μL(1)、2.5μL(2)、1.25μL(3)、0.625μL(4)、BSA:50ng(5)、25ng(6)、12.5ng(7)、6.25ng(8)、3.125ng(9)である。実施例1又は2の操作に応じて電気泳動及び染色を行い、脱色液はそれぞれ以下のとおりである。
0.1mMの酢酸水溶液、結果を図9に示す。
1mMの酢酸水溶液、結果を図10に示す。
10mMの酢酸水溶液、結果を図11に示す。
0.5Mの酢酸水溶液、結果図12に示す。
2.5Mの酢酸水溶液、結果を図13に示す。
1Mの酢酸水溶液、結果を図14に示す。
5Mの酢酸水溶液、結果を図15に示す。
8Mの酢酸水溶液、結果を図16に示す。
12Mの酢酸水溶液、結果を図17に示す。
1、細胞溶解液の取得
タンパク質サンプル1:大腸菌菌液を遠心させて菌体を収集し、超音波細胞粉砕機で菌体を粉砕し、遠心した後上澄みを収集し、タンパク質の濃度を測定した後0.5mMのTirsを用いて0.4mg/mlに希釈し、そして、5X Protein Loading Bufferと4:1の割合で混合する。10minの沸騰水浴又は10minの100°Cの金属浴を行う。
5X Protein Loading Buffer
250mM Tris−HCl (pH6.8)
10%(W/V) SDS
0.5% (W/V)BPB
50%(V/V) グリセリン
5%(W/V) β−メルカプトエタノール
配合量:5mL
タンパク質サンプル2:電気泳動サンプルはタンパク質marker(Genscipt、M00516):5μL(l)、2.5μL(2)、1.25μL(3)、0.625μL(4)、BSA:50ng(5)、25ng(6)、12.5ng(7)、6.25ng(8)、3.125ng(9)である。
2、電気泳動
140V 電気泳動 45min
3染色
染色液(0.05%のクマシーブリリアントブルーR250、溶剤が59%の脱イオン水、28.5%のエタノール及び12.5wt%の乳酸である)を反応容器に添加し、24Vでl0min後、結果をそれぞれ図18と19に示す。
荷電染料、例えばクマシーブリリアントブルーに対して、染色時間を10分間に延長し、結合されない染料は正極に移動した後電極の酸化により消耗されるので、このように、余剰な染料を除去する目的を実現することが見られる。
Claims (28)
- 高速のバイオポリマーの自動染色法であって、
染料と、染色しようとするバイオポリマーを含む媒体とを電場を印加した容器において接触させ、染料と染色しようとするバイオポリマーを結合して染色する染料と染色しようとするバイオポリマーの結合ステップaと、
電場で余剰な染料を除去するステップbと、
を含むことを特徴とする高速のバイオポリマーの自動染色法。 - 前記容器に脱色剤を添加し、電場を印加し、バイオポリマーと結合されない染料を媒体から全部又は部分に移し出し、バイオポリマーを媒体に残留するステップを更に含むことを特徴とする請求項1に記載のバイオポリマーの自動染色法。
- 染料を結合したバイオポリマーを現像し、現像技術は可視光での現像又は非可視光イメージング技術の現像を採用するステップを更に含むことを特徴とする請求項1に記載のバイオポリマーの自動染色法。
- 前記の結合されない染料を染料を結合したバイオポリマーから分離して除去することを特徴とする請求項1又は2に記載のバイオポリマーの自動染色法。
- 前記の容器の少なくとも1つの端部は管路によってポンプと接続され、ポンプは着色剤と脱色剤の貯蔵容器に接続され、染料の添加及び除去と脱色剤の添加及び除去はポンプにより完成されることを特徴とする請求項1又は2に記載のバイオポリマーの自動染色法。
- 染料、脱色剤及びバイオポリマーは媒体での移動方向と同じ又は異なることを特徴とする請求項2に記載のバイオポリマーの自動染色法。
- 前記バイオポリマーと結合されない染料が媒体から一部的に移り出す程度は媒体に残留された、結合されない染料による背景色と染料と結合したバイオポリマーの着色を区分することができることを特徴とする請求項2に記載のバイオポリマーの自動染色法。
- 非可視光イメージング技術は蛍光現像、赤外現像、紫外現像、放射現像、デジタルイメージング技術であることを特徴とする請求項3に記載のバイオポリマーの自動染色法。
- 前記の染料は有機染料、無機染料、蛍光染料、複合型染料の中の1種又は多種であり、前記の脱色剤は電解質であり、バイオポリマーはポリペプチド、タンパク質、RNA、DNA、オリゴ糖の中の1種又は多種であり、媒体は濾紙、酢酸セルロース膜、寒天、ゲルの中の1種であることを特徴とする請求項1に記載のバイオポリマーの自動染色法。
- 前記の有機染料はクマシーブリリアントブルー、アミドブラック、ポンソー、ファストグリーンFCF、亜鉛試薬、エリオクロムブラックの中の1種又は多種であり、前記の無機染料は銅イオン、第一鉄イオン及び他の重金属イオンの中の1種又は多種であり、前記の蛍光染料はエチジウムブロマイド、アクリジン系染料、シアニン染料の中の1種又は多種であり、前記の複合型染料は無機染料と有機染料の複合体、蛍光染料と有機染料の複合体、蛍光染料と無機染料の複合体等の中の1種又は多種であり、ゲルはアガロースゲル、ポリアクリルアミドゲル、又はアガロースとアクリルアミドの混合ゲルの中の1種であることを特徴とする請求項9に記載のバイオポリマーの自動染色法。
- ステップaとステップbを行うための容器と、着色剤、脱色剤を搬送するための装置と、を含み、前記の容器の端部に少なくとも着色剤と脱色剤を注入と排出するための開口が設けられ、開口は、管路により、ポンプ、着色剤と脱色剤を収納する貯蔵容器及び廃液溜めに接続されることを特徴とする請求項1又は2に記載のバイオポリマーの自動染色法に用いる染色装置。
- 前記の染色装置は電源、コントローラを更に含むことを特徴とする請求項10に記載のバイオポリマーの自動染色法の染色装置。
- 請求項11に記載の染色装置、着色剤及び脱色剤を含み、前記の着色剤は有機染料、無機染料、蛍光染料、複合型染料の中の1種又は多種であり、前記の有機染料はクマシーブリリアントブルー、アミドブラック、ポンソー、ファストグリーンFCF、亜鉛試薬、エリオクロムブラックの中の1種又は多種であり、前記の無機染料は銅イオン、第一鉄イオン及び他の重金属イオンの中の1種又は多種であり、前記の蛍光染料はエチジウムブロマイド、アクリジン系染料、シアニン染料の中の1種又は多種であり、前記の複合型染料は無機染料と有機染料の複合体、蛍光染料と有機染料の複合体、蛍光染料と無機染料の複合体等の中の1種又は多種であり、前記の脱色剤は電解質であることを特徴とする染色キット。
- 前記脱色剤はリン酸又は可溶性リン酸塩を含むことを特徴とする請求項13に記載の染色キット。
- 前記リン酸又はリン酸塩のリン酸基の含有量は15uM−150mM(モル比)であることを特徴とする請求項14に記載の染色キット。
- 前記脱色剤にはEDTAを更に含む請求項14に記載の染色キット。
- 前記脱色剤は25mMのEDTAと25mMのNaH2P04を含む水溶液であることを特徴とする請求項16に記載の染色キット。
- 前記脱色剤は水溶性有機酸基を含むことを特徴とする請求項13に記載の染色キット。
- 前記水溶性有機酸基は蟻酸、乳酸、酢酸、クエン酸又は上記酸の可溶性塩の中の1種又は多種から選ばれることを特徴とする請求項18に記載の染色キット。
- 前記水溶性有機酸基は乳酸基である場合、その含有量が0.1mM−12M(モル比)であることを特徴とする請求項19に記載の染色キット。
- 前記水溶性有機酸基は酢酸基である場合、その含有量は0.1mM−12M(モル比)であることを特徴とする請求項19に記載の染色キット。
- 染料が荷電染料である場合、染色過程は、
染料と、染色しようとするバイオポリマーを含む媒体とを電場を印加した容器に接触させ、染料と染色しようとするバイオポリマーを結合して染色し、結合されない染料は消耗されるか又は色をなくすまで継続的に移動するステップを含むことを特徴とするバイオポリマーの自動染色法。 - 電場で余剰な染料を除去するステップa、又は
容器に脱色剤を添加し、電場を印加し、バイオポリマーと結合されない染料を媒体から全部又は部分に移し出すが、バイオポリマーを媒体に残留するステップb、を更に含むことを特徴とする請求項22に記載の自動染色法。 - 前記染料はクマシーブリリアントブルー、エチジウムブロマイド、シアニン染料の中の1種又は多種であることを特徴とする請求項22又は23に記載の自動染色法。
- 染料と、染色しようとするバイオポリマーを含む媒体とを接触させるための容器と、着色剤、脱色剤を搬送するための装置と、を含み、前記の容器の端部に少なくとも着色剤と脱色剤を注入と排出するための開口が設けられ、開口は、管路により、ポンプ、着色剤と脱色剤を収納する貯蔵容器、及び廃液溜めに接続されることを特徴とする請求項22又は23に記載のバイオポリマーの自動染色法に用いる染色装置。
- 前記の染色装置は電源、コントローラを更に含むことを特徴とする請求項25に記載のバイオポリマーの自動染色法に用いる染色装置。
- 該染色キットは請求項25に記載の染色装置と着色剤を含み、前記の着色剤は荷電染料であることを特徴とする染色キット。
- 前記着色剤はクマシーブリリアントブルー、臭化エチジウム、シアニン染料の中の1種又は多種であることを特徴とする請求項27に記載の染色キット。
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