JP2015179088A - 電気泳動ゲルカセット及びコーム - Google Patents
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Abstract
Description
本明細書に記載するすべての刊行物、特許、及び特許出願は、個々の刊行物、特許、又は特許出願が各々明示的かつ個別に、参照により組み込まれることが示されているのと同程度に、参照により本明細書に組み込むものとする。
図1は、組立てゲルカセット100の実施形態を示す。組立てゲルカセット100は、2つのプラスチックプレート、すなわち保持板104と仕切り板102とを含む。これらの板は、射出成型などの方法によって形成することができる。任意の好適なプラスチックを用いて上記板102、104を形成することができる。電気泳動ゲル型を形成するのに適したプラスチックとしては、ポリマー、例えばポリエチレンテレフタレート、ポリ塩化ビニル、ポリメタクリル酸メチル、ポリスチレン、ポリエチレン、ポリメチルポリプロピレン、及び酢酸セルロース、又は各種コポリマーがある。いくつかの実施形態では、上記プラスチックは、組立てカセット100内部のゲルが見えるように、透明なプラスチックであってもよい。いくつかの実施形態では、上記カセット100は、ガラスプレートから構成されていてもよいし、あるいは1枚のガラスプレートと1枚のプラスチックプレートから構成されていてもよい。
図4に示すように、ゲル材料を組立てカセット400の開口部に流し込んだ後、コーム420を組立てカセットの開口部に挿入して、コームの歯がゲル材料の上部と接触するようにする。コーム420の挿入の深さは、コーム420のエッジ432、434と、カセット400に位置する開口部の肩部436、438によって限定することができる。いくつかの実施形態では、コーム420の挿入深さは、へり416の前縁458に位置するコーム420によってさらに限定することができる。ゲルを成形した後、上記コームを取り出すことができ、各歯の位置に空隙が残る。コームの歯によって形成される空隙が、ゲルにおけるサンプルウエルである。
2009年8月24日に提出された米国特許仮出願第61/236,293号(該文献はその全文を参照により本明細書に組み込むものとする)に記載されているように、標準NOVEX(登録商標)1.5mmミニカセット及びコームを用いて、また図1〜4及び図10A〜10Cにおける本明細書に記載の試験1.0mmくさびウエルカセット及びコームを用いて、4〜12%ゲルを成形した。NOVEX(登録商標)カセットにおけるゲルは、標準(平板)1.5nm、10ウエルコームを用いて作製した。試験カセットにおけるゲルは、10ウエルくさび形コームを用いて作製した。NOVEX(登録商標)カセットゲル及び試験カセットゲル各々の5レーンに、NuPAGE(登録商標)サンプルバッファーで希釈した5μLのMARK 12(商標)非染色標準液を最終量37.5μLまでローディングした。各ゲルの5レーンの各々に、37.5μLの希釈標準液をローディングして、ゲルにローディングした標準液の量を比較することにより、ゲルの性能を評価できるようにした。各ゲルを150mAで個別に泳動させた。くさび形ウエルのゲルは15分かけて泳動させ、1.5mmゲルは21分にわたって泳動させた。泳動の終了後、SIMPLY BLUE SAFESTAINを用いてゲルを染色して、フラットベッドスキャナーで画像化した後、NonLinear Dynamics Total Lab Software Version TL100を用いて分析した。このソフトウエアは、バンドの鮮明度を分析する目的で用いた。バンドの鮮明度は、ピーク発生の自動機能を用いて測定したが、ここで、上記ソフトウエアはピークの起点と終点を決定する。ピークの終点と起点との差は、バンドの鮮明度と相関しており、これをミリメートルで記録する。結果は、1.0mmくさび形ウエルゲルのバンド(図6A)が1.5mm標準ミニゲルのバンド(図6B)と同じくらい鮮明であることを示している。いくつかの実施形態では、サンプルは任意の好適な染料及び染色方法によって染色することができ、例えば、2008年5月16日に提出された米国特許出願第12/122,607号、2009年8月25日に提出された米国特許仮出願第61/236,795号に記載されているものがある。尚、両文献はその全文を参照により本明細書に組み込むものとする。
[1] ゲルカセットと、
少なくとも1つのくさび形歯を有するコームと
を備えたゲル電気泳動用装置。
[2] ゲルカセットが保持板及び仕切り板を含む、1に記載の装置。
[3] ゲルカセットが、仕切り板又は保持板の少なくとも1つの外側面から延びるへりを含む、2に記載の装置。
[4] くさび形歯が少なくとも40μLの容量を有する、1に記載の装置。
[5] カセットが少なくとも1つの内側面を有する、1に記載の装置。
[6] 少なくとも1つの内側面がコーティングで被覆されている、5に記載の装置。
[7] コーティングが酸素干渉コーティングである、6に記載の装置。
[8] 酸素干渉コーティングが、SiO又はSiO 2 の少なくとも1つから選択される、7に記載の装置。
[9] 1mmゲル内にサンプルウエルを形成するように設計されたくさび形歯を有するコームを備えたゲル電気泳動用装置であって、該サンプルウエルの大きさが、標準コームによって形成されるサンプルウエルを有するゲルより少なくとも10%大きいものである、上記装置。
[10] サンプルウエルの大きさが、標準コームによって形成されるサンプルウエルを有するゲルより少なくとも100%大きいものである、9に記載の装置。
[11] 標準ミニゲル10歯コームによって形成されるサンプルウエルが、37.5μLの容量を有する、10に記載の装置。
[12] 1mmゲル内にサンプルウエルを形成するように設計されたくさび形歯を有する10歯ミニゲルコームを備えたゲル電気泳動用装置であって、該サンプルウエルが少なくとも70μLの容量を有する、上記装置。
[13] 標準ゲルサンプルウエルより少なくとも10%多いサンプルを受容するように設計されたサンプルウエルを形成するように設計されたくさび形歯を有するコームを備えたゲル電気泳動用装置。
[14] 鮮明なバンドを有するゲルを形成するように設計されている、13に記載の装置。
[15] 高分解能を有するゲルを形成するように設計されている、13に記載の装置。
[16] コーム上に陥凹部を含む、1に記載の装置。
[17] 陥凹部が、ゲル形成中に皮膜の形成を防止するように設計されている、16に記載の装置。
[18] ゲルカセットの少なくとも1つの外側面からある角度を成して延びるへりを有するゲルカセットと、
少なくとも1つのくさび形歯を有するコームと
を備えたゲル電気泳動用装置。
[19] キャビティーを有するゲルカセットと、
コームと
を備えたゲル電気泳動用装置であって、該コームが、コーム上に設けられる少なくとも1つの歯を含み、少なくとも1つの歯の少なくとも片側が傾斜しており、少なくとも1つの歯は、上記キャビティーの縁から少なくとも0.335インチの地点に位置する、上記装置。
Claims (19)
- ゲルカセットと、
少なくとも1つのくさび形歯を有するコームと
を備えたゲル電気泳動用装置。 - ゲルカセットが保持板及び仕切り板を含む、請求項1に記載の装置。
- ゲルカセットが、仕切り板又は保持板の少なくとも1つの外側面から延びるへりを含む、請求項2に記載の装置。
- くさび形歯が少なくとも40μLの容量を有する、請求項1に記載の装置。
- カセットが少なくとも1つの内側面を有する、請求項1に記載の装置。
- 少なくとも1つの内側面がコーティングで被覆されている、請求項5に記載の装置。
- コーティングが酸素干渉コーティングである、請求項6に記載の装置。
- 酸素干渉コーティングが、SiO又はSiO2の少なくとも1つから選択される、請求項7に記載の装置。
- 1mmゲル内にサンプルウエルを形成するように設計されたくさび形歯を有するコームを備えたゲル電気泳動用装置であって、該サンプルウエルの大きさが、標準コームによって形成されるサンプルウエルを有するゲルより少なくとも10%大きいものである、上記装置。
- サンプルウエルの大きさが、標準コームによって形成されるサンプルウエルを有するゲルより少なくとも100%大きいものである、請求項9に記載の装置。
- 標準ミニゲル10歯コームによって形成されるサンプルウエルが、37.5μLの容量を有する、請求項10に記載の装置。
- 1mmゲル内にサンプルウエルを形成するように設計されたくさび形歯を有する10歯ミニゲルコームを備えたゲル電気泳動用装置であって、該サンプルウエルが少なくとも70μLの容量を有する、上記装置。
- 標準ゲルサンプルウエルより少なくとも10%多いサンプルを受容するように設計されたサンプルウエルを形成するように設計されたくさび形歯を有するコームを備えたゲル電気泳動用装置。
- 鮮明なバンドを有するゲルを形成するように設計されている、請求項13に記載の装置。
- 高分解能を有するゲルを形成するように設計されている、請求項13に記載の装置。
- コーム上に陥凹部を含む、請求項1に記載の装置。
- 陥凹部が、ゲル形成中に皮膜の形成を防止するように設計されている、請求項16に記載の装置。
- ゲルカセットの少なくとも1つの外側面からある角度を成して延びるへりを有するゲルカセットと、
少なくとも1つのくさび形歯を有するコームと
を備えたゲル電気泳動用装置。 - キャビティーを有するゲルカセットと、
コームと
を備えたゲル電気泳動用装置であって、該コームが、コーム上に設けられる少なくとも1つの歯を含み、少なくとも1つの歯の少なくとも片側が傾斜しており、少なくとも1つの歯は、上記キャビティーの縁から少なくとも0.335インチの地点に位置する、上記装置。
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