JP2014515748A - BCL9の安定化されたαへリックスを使用した、癌における調節解除されたWntシグナル伝達の標的化 - Google Patents
BCL9の安定化されたαへリックスを使用した、癌における調節解除されたWntシグナル伝達の標的化 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2014515748A JP2014515748A JP2014505404A JP2014505404A JP2014515748A JP 2014515748 A JP2014515748 A JP 2014515748A JP 2014505404 A JP2014505404 A JP 2014505404A JP 2014505404 A JP2014505404 A JP 2014505404A JP 2014515748 A JP2014515748 A JP 2014515748A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- bcl9
- peptide
- sah
- catenin
- cancer
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 0 C*C(C(C)(*CNC(*)*=C)NC)=O Chemical compound C*C(C(C)(*CNC(*)*=C)NC)=O 0.000 description 4
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/82—Translation products from oncogenes
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- A61K38/17—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- A61K38/1703—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- A61K38/1709—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K45/00—Medicinal preparations containing active ingredients not provided for in groups A61K31/00 - A61K41/00
- A61K45/06—Mixtures of active ingredients without chemical characterisation, e.g. antiphlogistics and cardiaca
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P17/00—Drugs for dermatological disorders
- A61P17/02—Drugs for dermatological disorders for treating wounds, ulcers, burns, scars, keloids, or the like
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P3/00—Drugs for disorders of the metabolism
- A61P3/08—Drugs for disorders of the metabolism for glucose homeostasis
- A61P3/10—Drugs for disorders of the metabolism for glucose homeostasis for hyperglycaemia, e.g. antidiabetics
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
- A61P35/02—Antineoplastic agents specific for leukemia
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
- A61P35/04—Antineoplastic agents specific for metastasis
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P9/00—Drugs for disorders of the cardiovascular system
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Oncology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Diabetes (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Marine Sciences & Fisheries (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Dermatology (AREA)
Abstract
本発明は、治療薬として使用するための、BCL9 HD2へリックスの炭化水素ステープリングによって構造的に拘束されたペプチドを提供する。本発明はさらに、本発明の構造的に拘束されたペプチドの使用のための方法およびキットを提供する。本発明は、少なくとも一部には、炭化水素ステープルされたヘリックスペプチドが、タンパク質分解、酸および熱に対する優れた安定性を示し、ペプチドの天然へリックス構造を回復し、対応する非修飾ペプチドと比較して卓越した薬物動態特性を有し、ならびにインビトロ、インセルロおよびインビボでβ−カテニンに結合して、BCL9/β−カテニン相互作用を阻害し、それにより調節解除されたWnt/β−カテニンシグナル伝達を妨げ、ヒトの癌を含む様々なヒト疾患における治療効果のために極めて有効であることを明らかにする、本明細書で提供される結果に基づく。
Description
本願は、その内容全体が参照により本明細書に組み込まれる、2011年4月15日に出願された米国特許仮出願第61/475,932号の優先権を主張する。
連邦により支援された研究開発の下でなされた発明の権利への宣言
本発明の一部分は、許諾番号1 R01 CA151391−01(R.D.C)の下に国立衛生研究所によって支援された。合衆国政府は本発明に一定の権利を有する。
本発明の一部分は、許諾番号1 R01 CA151391−01(R.D.C)の下に国立衛生研究所によって支援された。合衆国政府は本発明に一定の権利を有する。
古典的Wnt経路は、胚発生および成体組織のホメオスタシスの両方に必要とされる厳密に調節された受容体媒介性シグナル伝達ネットワークの鍵となる成分である、β−カテニンの構成的レベルおよび細胞内局在を調節する。刺激されていない正常細胞では、β−カテニンをリン酸化する分解複合体を形成してリン酸化β−カテニンをプロテオソーム分解の標的にする、大腸腺腫性ポリポーシス遺伝子(APC)、グリコーゲンシンターゼキナーゼ3β(GSK3β)およびアキシンに、β−カテニンが結合する。フリズルド(frizzled)受容体および低密度リポタンパク質受容体(LRP5およびLRP6)へのWntリガンドの結合は、GSK3β/APC/アキシン複合体の活性を阻害し、非リン酸化β−カテニンが核内移行を経てその転写作用を及ぼすことを可能にする。核内β−カテニンは、転写因子のリンパ系エンハンサー因子/T細胞因子(LEF/TCF)ファミリーと結合して、c−MycおよびサイクリンD1などの細胞増殖、移動および生存遺伝子の発現を誘導する。通常、この転写経路は、Wntリガンドがそれらの受容体から離れたときに停止する。しかし、APCおよびアキシンにおける様々な機能喪失突然変異ならびにβ−カテニン自体の活性化突然変異は、β−カテニンが分解複合体を免れ、核内で存続して、発癌性転写を駆動することを可能にする。
キイロショウジョウバエ(ドロソフィラ・メラノガスター、Drosophila melanogaster)では、β−カテニンの転写活性はさらに2つの補因子、BCL9およびピゴパスに依存する。TCF、β−カテニン、BCL9およびピゴパスからなる四成分複合体の形成は、β−カテニン依存性Wnt転写活性を増強する。ヒトBCL9遺伝子は、前駆体B細胞急性リンパ芽球性白血病(ALL)を有する患者からt(1;14)(q21;q32)転座をクローニングすることによって最初に同定された。BCL9遺伝子が存在する染色体1q21遺伝子座の増幅は広範囲のヒト癌型において認められ、腫瘍の進行、生存率低下および臨床転帰不良に結び付いてきた。ごく最近、PiggyBacトランスポゾンによる挿入突然変異誘発がBCL9においてヒットを同定した。結腸直腸癌(CRC)では、APCおよびβ−カテニンにおける確立された突然変異が癌表現型を促進するが、多発性骨髄腫(MM)においてはそのような突然変異は報告されておらず、Wnt活性化はその代わりにBCL9によって駆動され、このβ−カテニン補因子を真正な癌遺伝子として示唆する。BCL9の過剰発現は、それ以来、ヒト腫瘍の大きなサブグループにおいて同定されているが、腫瘍が由来する正常細胞対応物では発現されない。BCL9が媒介するβ−カテニン転写活性の増強は、上皮表現型の喪失と間葉様機能の獲得を促進することにより、腫瘍細胞の細胞増殖、移動、浸潤および転移能を増大させる。インビボでshRNAが誘導するBCL9の下方調節は、Wnt標的であるc−Myc、サイクリンD1、CD44およびVEGFの発現を抑制し、それに対応して腫瘍細胞量、転移および宿主の血管新生応答を低減することによりCRCおよびMMを有する異種移植マウスの生存率を上昇させる。これらの癌の著しいBCL9依存性および上皮腫瘍の約30%におけるBCL9の発現は、BCL9/β−カテニンタンパク質の相互作用を標的とするための説得力のある論理的根拠を提供する。重要な点として、Bcl9ヌルマウスは明らかな疾患表現型を有さず、BCL9/β−カテニン複合体の薬理学的遮断が比較的非毒性であり得ることを示唆する。
Wnt経路は、脊椎動物および無脊椎動物における胚発生および成体組織のホメオスタシスの両方に必要とされる厳密に調節された受容体媒介性シグナル伝達系からなり、古典的および非古典的Wnt経路を含む。古典的Wntシグナル伝達カスケードのいくつかの成分は、結腸直腸癌、肝細胞癌、乳癌、子宮内膜癌およびMMを含む広範囲の一般的なヒト癌において腫瘍抑制遺伝子(TSG)または癌遺伝子のいずれかとして機能することが示されている。さらに、古典的Wnt経路は、病理過程(例えば糖尿病)だけでなく正常過程(例えば創傷治癒)の調節にも関係づけられてきた。これらの所見は、この経路の発癌との関連性ならびに癌治療、創傷治癒、血管新生および糖尿病のための潜在的標的としてのWntシグナル伝達成分のさらなる検討の必要性を強調する。
Wntシグナル伝達をブロックするためにBCL9のHD2ドメインの炭化水素ステープルペプチド(BCL9のステープルされたαへリックスまたはSAH−BCL9)を設計し、作製することが本発明の1つの目的である。β−カテニンへの安定化されたαへリックスペプチドの直接結合がβ−カテニン/BCL9相互作用、Wnt転写活性および下流標的の発現を妨げることを明らかにすることも本発明の目的である。そのような機構は、SAH−BCL9を用いた癌細胞の治療の方法をもたらし、Wnt/β−カテニン駆動性癌における腫瘍細胞の増殖、移動、腫瘍誘導性血管新生、腫瘍細胞量、脱分化(上皮間葉転換[EMT])および転移の阻害を生じさせる。
本発明は、構造的に拘束された、プロテアーゼ抵抗性および細胞透過性BCL9 αへリックスペプチド、ならびに治療薬および予防薬としてのこれらのペプチドの使用の方法を提供する。そのような構造的に拘束されたペプチドは、タンパク質分解、酸および熱に対する優れた安定性を示し、対応する非修飾ペプチドと比較して卓越した薬物動態特性を有する。本発明のペプチドは、少なくとも1つの炭化水素ステープルで安定化されるが、2、3またはそれ以上の炭化水素ステープルを含むことができる。複数の炭化水素ステープルを含むことは、20またはそれ以上のアミノ酸長であるαへリックスペプチドに特に適する。炭化水素ステープルは、相互作用面上のアミノ酸残基がBCL9 HD2ドメインのらせん構造の安定化により適切に方向づけられることを可能にする。
1つの態様では、本発明は、少なくとも1つの炭化水素ステープルまたはステッチを含む、BCL9のHD2ドメイン(BCL9−HD2)の構造的に拘束されたペプチドを提供する。
1つの実施形態では、該ペプチドは、β−カテニンと相互作用するアミノ酸からなる相互作用面を含む。
別の実施形態では、相互作用面は約3から約20個のアミノ酸を含む。
ある実施形態では、相互作用面は4から15個のアミノ酸を含む。
様々な実施形態では、相互作用面は、β−カテニンに結合するBCL9−HD2のへリックス面に40%またはそれ以上の同一性を含み、ここで相互作用面は、BCL9残基Gln−355、His−358、Arg−359、Ser−362、Leu−363、Leu−366、Ile−369、Gln−370、Leu−373およびPhe−374、またはその保存的置換体を含む。
さらに他の実施形態では、相互作用面は、β−カテニンに結合するBCL9−HD2のへリックス面に50%から90%の同一性を含み、ここで相互作用面は、BCL9残基Gln−355、His−358、Arg−359、Ser−362、Leu−363、Leu−366、Ile−369、Gln−370、Leu−373およびPhe−374、またはその保存的置換体を含む。
別の実施形態では、相互作用面はαへリックスの1つの面である。
様々な実施形態では、へリックスの1つの面は、アミノ酸の1、2、3または4の隣接する積層柱を含み、ここでアミノ酸の積層柱は、1回転当たり3.6個のアミノ酸を有するαへリックスにおいて位置a、dおよびg;位置bおよびe;または位置cおよびfによって規定され、ここでアミノ酸は、連続的および順次に位置a〜gが割り当てられ;並びに、1回転当たり3個のアミノ酸を有する310へリックスにおいて位置aおよびd;位置bおよびe;または位置cおよびfによって規定され、ここでアミノ酸は、連続的および順次に位置a〜fが割り当てられ;またはそのホモログによって規定される。
他の実施形態では、本発明は、BCL9−HD2のアミノ酸351から374、配列番号1
(LSQEQLEHRERSLQTLRDIQRMLF)
に約20%から100%の配列相同性を有する構造的に拘束されたペプチドを提供し、ここでペプチドは、1から5の炭化水素ステープルを含む。
(LSQEQLEHRERSLQTLRDIQRMLF)
に約20%から100%の配列相同性を有する構造的に拘束されたペプチドを提供し、ここでペプチドは、1から5の炭化水素ステープルを含む。
他の実施形態では、本発明は、BCL9−HD2のアミノ酸351から374、配列番号1
(LSQEQLEHRERSLQTLRDIQRMLF)
に約50%から100%の配列相同性を有する構造的に拘束されたペプチドを提供し、ここでペプチドは、1から5の炭化水素ステープルを含む。
(LSQEQLEHRERSLQTLRDIQRMLF)
に約50%から100%の配列相同性を有する構造的に拘束されたペプチドを提供し、ここでペプチドは、1から5の炭化水素ステープルを含む。
様々な実施形態では、炭化水素ステープルまたはステッチは、1またはそれ以上の天然または非天然アミノ酸の間に位置する。
ある実施形態では、炭化水素ステープルまたはステッチはオレフィンメタセシス反応によって形成される。
別の実施形態では、非天然アミノ酸は、以下:
から選択される。
様々な実施形態では、構造的に拘束されたペプチドは、BCL9 HD2ペプチド内に1から5のステープルまたはステッチを含む。
他の実施形態では、1つのステープルまたはステッチは、BCL9 HD2ペプチド内の以下の位置:a)i,i+4;b)i,i+7;およびc)i,i+3に存在する。
ある実施形態では、別のステープルまたはステッチは、BCL9 HD2ペプチド内の以下の位置:a)i,i+4;b)i,i+7;およびc)i,i+3に存在する。
様々な実施形態では、任意の他のステープルまたはステッチは、BCL9 HD2ペプチド内の以下の位置:a)i,i+4;b)i,i+7;およびc)i,i+3に存在する。
別の実施形態では、本発明は構造的に拘束されたペプチドを提供し、ここで1つの炭化水素ステープルは、ステープルスキャニングによりBCL9 HD2ペプチド内の以下の例示的な位置に存在し、反復される:
ある実施形態では、本発明は構造的に拘束されたペプチドを提供し、ここで2つの炭化水素ステープルは、ステープルスキャニングによりBCL9 HD2ペプチド内の以下の例示的な位置に存在し、反復される:
別の実施形態では、本発明は構造的に拘束されたペプチドを提供し、ここで1またはそれ以上の炭化水素ステープルまたはステッチは、ステープルスキャニングによりBCL9 HD9ドメイン内の以下の例示的な位置のいずれかに存在し、反復される:
様々な実施形態では、本発明は、1から4個の付加的な炭化水素ステープルをさらに含む、構造的に拘束されたペプチドを提供する。
他の実施形態では、本発明は構造的に拘束されたペプチドを提供し、ここで付加的な炭化水素ステープルは、ステープルスキャニングによりBCL9 HD2ドメイン内の以下の例示的な位置のいずれかに存在し、反復される:
請求項2の一部において、位置351から374のアミノ酸配列は以下から選択される:
別の態様では、本発明は、上述したペプチドおよび医薬的に許容される担体を含む組成物を提供する。本発明はさらに、単位剤形としての医薬担体中の本発明のペプチドを提供する。
別の態様では、本発明は、本発明のペプチドを投与することを含む、被験者において古典的Wnt/β−カテニンシグナル伝達を阻害する方法を提供する。
別の態様では、本発明は、本発明のペプチドを投与することを含む、被験者においてBCL9のβ−カテニンへの結合を阻害する方法を提供する。
1つの実施形態では、BCL9のβ−カテニンへの結合の阻害は、本発明の構造的に拘束されたペプチドによってもたらされる。
別の態様では、本発明は、本発明のペプチドを被験者に投与することを含む、被験者においてBCL9/β−カテニン結合によって媒介される疾患または障害を治療する方法を提供する。
1つの実施形態では、被験者は、BCL9/β−カテニン相互作用またはWntシグナル伝達の阻害剤を必要とすると同定された。
別の実施形態では、疾患は、癌、腫瘍細胞増殖、腫瘍細胞の脱分化および転移、腫瘍の移動、腫瘍誘導性血管新生、癌幹細胞の化学療法抵抗性ならびに増殖性疾患であるか、または創傷治癒、血管新生もしくは糖尿病に関係する。
本発明は、例えば被験者において、本発明の構造的に拘束されたペプチドを治療有効量で被験者に投与することによる、癌の改善または治療のための方法を提供する。該方法は、被験者を、癌の改善もしくは治療を必要とすると同定すること、または癌の予防、改善もしくは治療のために被験者を観測することの1またはそれ以上をさらに含み得る。ある実施形態では、本発明は癌の改善または治療の方法を提供し、ここで、被験者はBCL9/β−カテニンの調節を必要とすると同定される。
さらなる実施形態では、疾患は、結腸直腸癌、多発性骨髄腫、肺癌、結腸癌、乳癌、前立腺癌、肝癌、膵癌、脳の癌、腎癌、卵巣癌、胃癌、皮膚癌、骨の癌、胃癌、乳癌、膵癌、神経膠腫、膠芽腫、肝細胞癌、乳頭状腎癌、頭頸部扁平上皮癌、白血病、リンパ腫、骨髄腫および固形腫瘍である。
別の態様では、本発明は、本発明のペプチドを被験者に投与することを含む、被験者において癌を治療する方法を提供する。
1つの実施形態では、被験者は、癌を治療するために古典的Wnt/β−カテニンシグナル伝達の阻害剤を必要とすると以前に同定されたことがある。
別の実施形態では、疾患は、創傷治癒、血管新生または糖尿病に関係する。
他の実施形態では、被験者は、付加的な治療薬、放射線または化学療法を投与される。
さらなる実施形態では、付加的な治療化合物は抗癌化合物である。
別のさらなる実施形態では、本発明の化合物と付加的な治療薬を同時にまたは連続的に投与する。
他の実施形態では、本発明の化合物と付加的な治療薬を結合する(すなわち二官能性化合物)。
ある実施形態では、被験者はヒトである。
別の態様では、本発明は、本発明の構造的に拘束されたペプチドおよび癌を治療するのに使用するための指示書を含むキットを提供する。
別の態様では、本発明は、BCL9のβ−カテニンへの結合を阻害する化合物を同定する方法であって、本発明のペプチドをβ−カテニンと接触させる段階および次に本発明のペプチドとβ−カテニンとの間の相互作用を分断する低分子または化合物をスクリーニングする段階を含む方法を提供する。
本発明の他の実施形態は、以下で提供される開示に基づいて理解される。
最近の試験は、高いWntシグナル伝達活性が、従来の化学療法に抵抗性であり、腫瘍再発の原因であると考えられている、結腸癌幹細胞(CRC)集団に機能的に帰せられることを明らかにした(Vermeulen L,et al.Nat Cell Biol.12:468,2010)。したがって、Wntシグナル伝達経路をブロックすることはこれらの細胞に対して最も効果的であり得る。さらに古典的Wnt経路は生理的および病的血管新生に関与しており(Dejana E.Circulation Research.107:943 2010)、標的薬剤発見および治療開発のためのこの経路の重要性を強調する(Barker,N.,& Clevers,H.Nat Rev Drug Discov 5:997,2006)。
β−カテニン/BCL9/TCF−4複合体の結晶構造は、β−カテニン上のBCL9結合部位が、BCL9のαへリックスHD2ドメイン(残基352から374)がβ−カテニンのアルマジロリピート1のαへリックス2および3によって形成される表面溝に結合する(図1a)という点で他の結合パートナーとは異なることを明らかにした(Sampietro,J.et al.Mol Cell 24,293−300(2006))。重要な点として、H358AまたはR359AなどのBCL9結合界面における鍵となる残基のアラニン突然変異誘発は、β−カテニンに結合するBCL9の能力をブロックし、トランス活性化を排除した。β−カテニンを標的とするのにこの天然結合モチーフを利用するため、炭化水素ステープリングを適用して(Schafmeister,C,Po,J.& Verdine,G.J Am Chem Soc 122,5891−5892(2000);Walensky,L.D.et al.Science 305,1466−70(2004))、BCL9 HD2ドメインに基づく構造的に強化されたαへリックスペプチドを作製した。オレフィン側鎖を有する非天然アミノ酸を(i,i+4)位置で置換し、次いでルテニウム触媒オレフィンメタセシスに供して、SAH−BCL9ペプチドA〜Cを生成した(図1b)。円二色性(CD)分析は、炭化水素ステープリングが、対応する非修飾ペプチド(BCL9 HD2)と比較してペプチドのαへリックス性を一貫して増強することを確認した(図1c)。ペプチドの蛍光誘導体で処理し、次いで洗浄して、トリプシン処理し、抽出した細胞は、溶解物中にFITC−SAH−BCL9 A〜Cを含んだが、対応する非修飾FITC−ペプチドは含まず、SAHペプチドの細胞取込みを明らかにした(図1d)。FITCおよびβ−カテニンの免疫沈降はいずれも、SAH−BCL9Bをインサイチュで最も有効なβ−カテニン相互作用物質と同定した(図1d)。免疫蛍光共焦点顕微鏡検査は、β−カテニンの顕著な核局在および核内のSAH−BCL9Bを明らかにし(図1e)、SAH−BCL9Bの核内濃縮が細胞分画法によって確認された(図1f)。生物学的試験用の陰性対照SAH−BCL9Bペプチドを開発するため、SAH−BCL9B(H358D)およびSAH−BCL9B(R359E)を作製し、これらは鍵となる結合界面残基の単一逆極性点突然変異体を含む(図1a)。SAH−BCL9Bと比較して、両変異体は類似のαへリックス増強(図1g)および細胞取込み(図1h)を示したが、共免疫沈降分析によりβ−カテニン相互作用の低下(図1h)、およびR359E突然変異誘発が最も有害な作用を生じさせることを明らかにした。そこで、SAH−BCL9Bおよびその対応するR359E突然変異体を、これら2つのペプチドの用量当量取込みを示す、β−カテニン/BCL9依存性細胞株Colo320およびMM1Sにおける機能試験のために選択した(Mani,M.et al.Cancer Res 69,7577−86(2009);Ilyas,M.,et al.Proc Natl Acad Sci USA 94,10330−4(1997))(図1i)。
SAH−BCL9Bによるβ−カテニン標的化が、β−カテニンと、BCL9および同じHD2ドメインを含む(Sampietro,J.et al.Mol Cell 24,293−300(2006))その近縁ホモログB9L(Brembeck,F.H.et al.Genes Dev 18,2225−30(2004))との内因性相互作用を分断するかどうかを判定するために、一連の共免疫沈降分析を実施した。顕著に、抗BCL9およびB9L共免疫沈降試験においてSAH−BCL9Bはβ−カテニン−BCL9/B9L複合体の用量応答性破壊を生じさせたが、そのR359E誘導体は破壊を生じさせなかった(図2a)。それに対応して、FITC−SAH−BCL9Bはβ−カテニンと用量応答的に共免疫沈降したが、SAH−BCL9B(R359E)は共免疫沈降せず(図2a)、SAH−BCL9Bによるβ−カテニン標的化をβ−カテニン−BCL9/B9L複合体の離脱と関連付けた。β−カテニンを標的とし、広くそのタンパク質相互作用を分断する薬剤に関連する実証された毒性を考慮して、FITC−SAH−BCL9Bは、BCL9/β−カテニン結合部位の異なる、重複しない位置と一致して、β−カテニンのE−カドヘリンとの恒常的相互作用に影響を及ぼさないことが確認された。FITC−SAH−BCL9Bの標的ベースの選択性は、抗FITCプルダウンによってさらに実証され、抗FITCプルダウンはβ−カテニンを共沈させるが、IκBαおよびアクチンなどの他の無関係な細胞タンパク質は共沈させない。
SAH−BCL9B媒介性複合体破壊の機能的影響を調べるため、Wnt特異的TCFレポーター遺伝子転写アッセイにおけるSAH−BCL9BおよびSAH−BCL9B(R359E)の作用を評価した(Mani,M.et al..Cancer Res 69,7577−86(2009);Sustmann,C.,et al.Mol Cell Biol 28,3526−37(2008))。SAH−BCL9B(R359E)処理はレポーター活性を50%近く低下させたが、ビヒクルおよびSAH−BCL9B(R359E)は影響を及ぼさなかった(図2b)。重要な点として、SAH−BCL9の作用の特異性は、SAH−BCL9の阻害作用が漸増量のpcDNA−BCL9でのトランスフェクションによって選択的に排除されること、およびSAH−BCL9BがNFκBレポーター遺伝子転写アッセイに影響を及ぼさないことを示すことにより実証された(図2b)。TCF調節配列の転写制御下にあるdGFPを観測する2番目のWnt特異的レポーターアッセイにおいて、SAH−BCL9BはdGFP発現を用量応答的にブロックしたが、ビヒクルまたはSAH−BCL9B(R359E)はブロックしなかった。VEGFを含む、β−カテニン/BCL9標的遺伝子の発現へのビヒクル、SAH−BCL9BおよびSAH−BCL9B(R359E)の作用を測定するために定量的PCR(qPCR)分析を使用した。SAH−BCL9Bは、VEGF、c−Mycおよびアキシン2のmRNAレベルを有意に低下させたが、非Wnt経路標的遺伝子であるGAPDHのmRNAレベルは低下させず、一方ビヒクルまたはSAH−BCL9B(R359E)はVEGF、c−Mycおよびアキシン2のmRNAレベルを有意に低下させなかった(図2c)。
β−カテニン/BCL9複合体の薬理学的破壊の表現型への影響を調べるため、細胞増殖、血管新生および移動アッセイを実施した。SAH−BCL9BはColo320、MM1Sならびに一次CRCおよびMM細胞の増殖を低下させるが、ビヒクルまたはSAH−BCL9B(R359E)は低下させないという一貫したパターンが現れた(図3a〜d)。言うまでもなく、生存能アッセイならびにカスパーゼ3およびPARP活性化についてのウェスタン分析によって評価したように、SAH−BCL9B処理は細胞死を誘導しなかった(図3e〜f)。腫瘍細胞誘導性血管新生へのSAH−BCL9Bの作用を測定するため、Colo320およびMM1S細胞をビヒクルおよびSAH−BCL9Bペプチドで処理し、その後VEGFレベルを培地中で定量した。qPCR分析と一致して、SAH−BCL9Bだけが分泌VEGFのレベルを低下させた(図3g)。インビトロ血管新生アッセイにおいて、ヒト臍静脈内皮細胞(HUVEC)を、処理したColo320またはMM1S細胞からの上清で培養し、次に顕微鏡検査によって毛細管様形成物の形成に関して採点した。SAH−BCL9B処理細胞からの上清に曝露したHUVEC細胞は、ビヒクルおよびSAH−BCL9B(R359E)処理対照と比較して低い毛細管形成を示した(図3h)。SAH−BCL9Bはまた、マトリゲル被覆浸潤チャンバーを用いて評価した場合、細胞外マトリックスを通過するSAH−BCL9B処理細胞の能力の有意の低下に反映されたように、Colo320細胞の接着および浸潤能も低下させた(図3i)。合わせて考慮すると、これらのデータは、SAH−BCL9BがBCL9/β−カテニン転写複合体によって調節される一連の生理的過程を特異的に分断することを明らかにする。
BCL9/β−カテニン相互作用を標的化することの治療可能性を調べるため、腫瘍増殖を抑制するSAH−BCL9Bの能力をインビボで検討した。GFPを発現するColo320細胞(1×106)を、致死量以下で照射したNOD/SCIDマウスの腹腔内に注入した。細胞注入の2日後、マウスコホート(n=6)を、ビヒクル(D5W中2.5%DMSO)、SAH−BCL9BまたはSAH−BCL9B(R359E)ペプチド(20mg/kg)で、1日おきに腹腔内投与した合計6回にわたって処置した。実験の40日目に、マウスを犠死させ、全身イメージングおよび採取したGFP陽性組織の組織学的検査によって腫瘍量および転移に関して評価した。全体的な組織蛍光は、ビヒクルおよびSAH−BCL9B(R359E)処置動物と比較してSAH−BCL9Bで処置したマウスでは著明に減少した(図4a)。これらのデータは、SAH−BCL9B処置マウスの肝臓で認められた転移性腫瘍結節の全体的な減少と一致した(図4b〜c)。興味深いことに、SAH−BCL9B処置マウスからの腫瘍組織はまた、腫瘍細胞CD44の免疫反応性の低下(図4b)、腫瘍内血管数の減少(図4d)、およびより低い強度の毛細管CD34免疫反応性(図4e)を示し、腫瘍増殖および転移のSAH−BCL9B媒介性抑制が、少なくとも一部には細胞移動および血管新生の低減に由来し得ることを示唆した。重要な点として、剖検後の処置群全体にわたって正常マウス組織の組織学的変化は認められなかった。
2番目のインビボモデルでは、SCID−huマウスの側腹部に移植したヒト骨移植片内のINA−6 MM細胞の増殖へのSAH−BCL9B処置の影響を検討した(Tassone,P.et al.Blood 106,713−6(2005))。BCL9およびβ−カテニンの両方を発現し、インビトロでSAH−BCL9Bによって抑制される、GFP標識INA−6細胞(5×106)を、移植の4週間後に骨移植片に注入した。2日後、マウスのコホート(n=5)を、局所注射によりビヒクル(D5W中2.5%DMSO)、SAH−BCL9BまたはSAH−BCL9B(R359E)ペプチド(5mg/kg)で、1日おきに投与して合計10回にわたって処置した。腫瘍量を観測するため、INA−6腫瘍移植の3〜4週間後に最初に検出可能となる、可溶性ヒトインターロイキン6受容体(shuIL−6R)の血清レベルを測定した。ビヒクルおよびSAH−BCL9B(R359E)で処置したマウスは、腫瘍増殖を反映するshuIL−6Rレベルの漸進的上昇を示したが、SAH−BCL9B処置マウスは評価期間全体を通じて低レベルから検出不能レベルを維持した(図4f)。INA−6細胞注入の33日後にマウスを犠死させ、蛍光イメージング、組織学的分析および抗CD34染色によってMM腫瘍量を評価した。測定されたshuIL−6Rのレベルと一致して、骨片内の腫瘍量はSAH−BCL9B処置マウスにおいて有意に低減した(図4g〜h)。興味深いことに、SAH−BCL9B処置マウス中に存在する腫瘍細胞は骨片の境界内に位置したが、ビヒクルおよびSAH−BCL9B(R359E)処置マウスは周囲の軟組織への浸潤を示した(図4h、黒色の矢印)。CRCモデルと同様に、抗CD34染色および血管定量によって観測されたように、SAH−BCL9Bで処置したSCID−huマウスでは局所血管新生が抑制された(図4i)。したがって、Wnt駆動性癌の2つの異なるマウスモデルにおいて、SAH−BCL9は配列特異的に腫瘍の増殖、浸潤および血管新生を有効に抑制した。
β−カテニン転写複合体は、広範囲の癌におけるその病理学的役割のゆえに最優先の薬理学的標的である。β−カテニンは様々な恒常性機能に関与し、同じ結合表面を使用してその相互作用パートナーの大部分と係合するので(Barker,N.& Clevers,H.Nat Rev Drug Discov 5,997−1014(2006))、抗癌活性および選択性を達成することは依然として緊急の課題である。例えば、β−カテニン/TCF相互作用の阻害剤に関するハイスループットスクリーニングによって同定された低分子、PKF115−584は、Wnt特異的転写活性をブロックし、結腸癌細胞の増殖を低減したが(Lepourcelet,M.et al.Cancer Cell 5,91−102(2004))、処置マウスの重篤な骨髄低形成、貧血および全身性消耗を誘導した(Sukhdeo,K.et al.Proc Natl Acad Sci USA 104,7516−21(2007))。BCL9は、(1)病的β−カテニン転写活性を促進し、(2)独自の結合部位でβ−カテニンに係合し(Sampietro,J.et al.Mol Cell 24,293−300(2006))、および(3)起源細胞ではなく主として腫瘍組織において認められる(Mani,M.et al.Cancer Res 69,7577−86(2009))ので、選択的な方法としてβ−カテニン−BCL9界面の標的化は魅力的である。重要な点として、マウスモデルにおけるBcl9の遺伝子欠失を介したBCL9/β−カテニン相互作用の排除は、明らかな表現型への影響を及ぼさなかった(Deka,J.et al.Cancer Res 70,6619−28)。そこで、炭化水素ステープリングを適用して、β−カテニンと直接係合するBCL9のαへリックスHD2ドメインを構造的に安定化した。これを行う際に、SAH−BCL9Bがインサイチュでβ−カテニンを標的とし、β−カテニン−BCL9/B9L複合体を選択的に破壊することが測定された。これらの相互作用の薬理学的遮断は、β−カテニン依存性転写活性および標的遺伝子発現の阻害、ならびに正常組織への明らかな損傷を伴わない、腫瘍細胞の増殖、血管新生および転移の抑制と一致した。したがって、これらの原理証明実験は、癌におけるβ−カテニン−BCL9界面の選択的標的化が発癌性Wntシグナル伝達を探索し、それに対抗するための有望な方策であることを明らかにする。
本発明は、少なくとも一部には、本明細書で提供する結果、ならびに安定化されたαへリックスペプチドが優れた構造安定性、タンパク質分解、酸および熱に対する安定性を有することを明らかにする国際出願第PCT/US2009/000438号(国際公開第2009/108261号;2009年1月23日出願)に基づく。安定化されたαへリックスペプチドはWnt/β−カテニンシグナル伝達を妨げるうえで極めて有効であることも解明され、このペプチドが癌の治療のために使用できることを指示した。さらに、安定化されたαへリックスペプチドは、その非修飾対応物と比較してインビボで卓越した薬理学的特性を有しており、天然ペプチド配列と比較して投与する必要がある安定化αへリックスペプチドの頻度および量を低減し、接触が維持されることを確実にする。
この点から、「安定化架橋」という用語またはその派生語は、ジスルフィド、アミド、エステル、1,2,3−トリアゾール、または他のバイオコンジュゲートもしくは生体適合性架橋などの、しかしこれらに限定されない、その同名の架橋または他の共有結合もしくはイオン性架橋を指す。この点から、「炭化水素ステープル」または「炭化水素架橋」という用語またはその派生語は、その同名の架橋または他の炭化水素共有結合もしくはイオン性、バイオコンジュゲートもしくは生体適合性架橋を指す。
本明細書で提供するペプチドにおいて、αへリックスHD2ドメインは少なくとも1つの分子テザー、例えば炭化水素ステープルで安定化されるが、2、3またはそれ以上の炭化水素ステープルを含み得る。複数の炭化水素ステープルを含むことは、16またはそれ以上のアミノ酸長であるαへリックスペプチドに特に適する。2以上(例えば、ペプチドの長さに依存して、2、3、4、5)の炭化水素ステープルを含むことは、修飾されたペプチドの非常に優れたタンパク質分解に対する安定性、構造安定性、酸および熱に対する安定性を提供し、インビボで著しく増強された薬理学的特性を有する生物活性ペプチドを生じる(Bird et al.,PNAS,2010参照)。
本明細書で提供する化合物において、HD2ドメインは天然配列の1またはそれ以上の修飾によって構造的に拘束される。HD2ドメインのαへリックスは、炭化水素ステープルなどの分子テザーを用いて安定化することができる。あるいはまたは加えて、ペプチドの所望構造を促進するため、2つのへリックス間の所望角度を促進するもしくは維持するためまたは相互に対してヘリックスを方向づけるため、または薬理学的特性を改善するための、天然または非天然アミノ酸を含むように、該領域内でまたは該領域に隣接してアミノ酸置換を行うことができる。1つの実施形態では、HD2ドメインのヘリックスの少なくとも一方は、ドメインのヘリックス性を促進するまたは維持するための炭化水素ステープルなどの分子テザーを含む。別の実施形態では、HD2ドメインのヘリックスの両方が、ドメインのヘリックス性を促進するまたは維持するための炭化水素ステープルなどの分子テザーを含む。
ポリペプチドの炭化水素ステープリング
好ましくは、αへリックスまたはHD2ドメインは少なくとも1つの炭化水素ステープルで安定化される。修飾ペプチドのいずれかに関する使用に適する炭化水素ステープルは、本明細書で、ならびにその全体が参照により本明細書に組み込まれる、米国特許出願公開第2005/0250680号、同第2010/0234563号、同第2007/0197772号、同第2006/0008848号、同第2006/0014675号;米国特許第7,723,469号、同第7,192,713号および同第7,084,244号;国際公開第2009/108261号および同第2010/148335号;ならびにKawamoto,S.A.et al,J.Med.Chem.55,1137−1146(2012);Mahon,A.B.and Arora,P.S.,Chem.Commun.48,1416−1418(2012);およびChapman,R.N.et al.,J.Am.Chem.Soc.126,12252−3(2004)において記述されている。炭化水素ステープリングは、ヘリックス二次構造を有する傾向があるポリペプチドがその天然ヘリックス立体配座を維持し、安定性と効果を高めることを可能にする。1つの実施形態では、修飾ペプチドは、円二色性によって測定した場合、水溶液中で少なくとも10%、20%、30%、35%、40%、45%、50%、60%、70%、80%または90%またはそれ以上のヘリックス性を有する。円二色性を測定するためのアッセイは当分野で公知であり、本明細書で説明する。
好ましくは、αへリックスまたはHD2ドメインは少なくとも1つの炭化水素ステープルで安定化される。修飾ペプチドのいずれかに関する使用に適する炭化水素ステープルは、本明細書で、ならびにその全体が参照により本明細書に組み込まれる、米国特許出願公開第2005/0250680号、同第2010/0234563号、同第2007/0197772号、同第2006/0008848号、同第2006/0014675号;米国特許第7,723,469号、同第7,192,713号および同第7,084,244号;国際公開第2009/108261号および同第2010/148335号;ならびにKawamoto,S.A.et al,J.Med.Chem.55,1137−1146(2012);Mahon,A.B.and Arora,P.S.,Chem.Commun.48,1416−1418(2012);およびChapman,R.N.et al.,J.Am.Chem.Soc.126,12252−3(2004)において記述されている。炭化水素ステープリングは、ヘリックス二次構造を有する傾向があるポリペプチドがその天然ヘリックス立体配座を維持し、安定性と効果を高めることを可能にする。1つの実施形態では、修飾ペプチドは、円二色性によって測定した場合、水溶液中で少なくとも10%、20%、30%、35%、40%、45%、50%、60%、70%、80%または90%またはそれ以上のヘリックス性を有する。円二色性を測定するためのアッセイは当分野で公知であり、本明細書で説明する。
炭化水素ステープルポリペプチドは、2個のアミノ酸の間にテザー(連結部)を含み、テザーはポリペプチドのヘリックス二次構造を有意に増強する。一般に、テザーは1または2個のヘリックスターンの長さ(すなわち3、4または7アミノ酸)にわたって伸びる。したがって、iとi+3;iとi+4;またはiとi+7に位置するアミノ酸は化学修飾および架橋のための理想的な候補である。したがって、本発明の修飾ポリペプチドのアミノ酸残基のいずれかを上記に従ってテザーし得る(例えば架橋し得る)。適切なテザーは、本明細書で、ならびに米国特許出願公開第2005/0250680号、同第2010/0234563号、同第2007/0197772号、同第2006/0008848号、同第2006/0014675号;米国特許第7,723,469号、同第7,192,713号および同第7,084,244号;国際公開第2009/108261号および同第2010/148335号;ならびにKawamoto,S.A.et al,J.Med.Chem.55,1137−1146(2012);Mahon,A.B.and Arora,P.S.,Chem.Commun.48,1416−1418(2012);およびChapman,R.N.et al.,J.Am.Chem.Soc.126,12252−3(2004)において記述されている。炭化水素ステープルなどのテザーは、ヘリックス変異体(例えば異なるピッチ、角度または残基およびターン当たりのその割合を有する)またはヘリックス以外の構造を促進するために他の間隔で位置し得ることが理解される。
さらなる実施形態では、炭化水素ステープルは、1番目のアミノ酸(i)と、1番目のアミノ酸の3アミノ酸下流にある2番目のアミノ酸(i+3)を連結するように位置する。別の実施形態では、炭化水素ステープルは、1番目のアミノ酸(i)と、1番目のアミノ酸の4アミノ酸下流にある2番目のアミノ酸(i+4)を連結する。さらに別の実施形態では、炭化水素ステープルは、1番目のアミノ酸(i)と、1番目のアミノ酸の7アミノ酸下流にある2番目のアミノ酸(i+7)を連結する。
本発明の修飾ポリペプチドは、一般に以下で提供する式(I)、(II)または(III)の構造を含む。
本明細書で述べる修飾ポリペプチドのいずれかは、組成物(例えば医薬組成物)またはキット中に存在し得る。本発明の一部の実施形態では、組成物またはキットは2またはそれ以上の修飾ポリペプチドを含む。
SAH−BCL9ペプチド
本発明の修飾ポリペプチドは以下のHD2ペプチド(アミノ酸352から374)を含む:
本発明の修飾ポリペプチドは以下のHD2ペプチド(アミノ酸352から374)を含む:
上述した、完全長およびトランケートされたHD2ドメインまたはBCL9ペプチドの類似体に対応するペプチドは、本発明によって企図され得る。本明細書で使用される、「HD2ドメイン類似体」という用語は、リピート類似体ドメインまたはBCL9ドメインを有すると認識されるまたは同定されるペプチドを指す。リピート類似体ポリペプチドについての方法は当分野で公知であり、例えばペアワイズ残基相関に基づくバイオインフォマティクスプログラム(例えばワールドワイドウェブ:ch.embnet.org/software/COILS_form.html上の)は、タンパク質配列からコイルを認識し、それらの構造をモデリングする能力を有する(参照により本明細書に組み込まれる、Lupas,A.,et al.Science 1991.252:1162−1164参照)。さらに、そのような修飾ペプチドは抗癌活性を示す。BCL9 HD2および他のBCL9ホモログを同定するための方法は当分野で公知であり、本明細書で示す基準を用いて実施できる。
HD2ドメインおよびBCL9ペプチドの突然変異、トランケーションおよび伸長
アミノ酸置換は、保存的または非保存的であり得る。保存的アミノ酸置換は、HD2ペプチド配列の1またはそれ以上のアミノ酸を類似の電荷、大きさおよび/または疎水性特徴のアミノ酸で置換することからなる。非保存的置換は、HD2ドメイン配列の1またはそれ以上のアミノ酸を異なる電荷、大きさおよび/または疎水性特徴を有するアミノ酸で置換することからなる。置換は、保存的または非保存的非天然アミノ酸の使用を含み得る。
アミノ酸置換は、保存的または非保存的であり得る。保存的アミノ酸置換は、HD2ペプチド配列の1またはそれ以上のアミノ酸を類似の電荷、大きさおよび/または疎水性特徴のアミノ酸で置換することからなる。非保存的置換は、HD2ドメイン配列の1またはそれ以上のアミノ酸を異なる電荷、大きさおよび/または疎水性特徴を有するアミノ酸で置換することからなる。置換は、保存的または非保存的非天然アミノ酸の使用を含み得る。
アミノ酸挿入は1個のアミノ酸残基または一続きの残基で構成され得る。挿入は、完全長もしくはトランケートされたHD2ドメインまたはBCL9ペプチドのカルボキシ末端またはアミノ末端で、ならびにペプチドの内部の位置で行われ得る。そのような挿入は一般に2から15アミノ酸の長さにわたる。対象とするペプチドのカルボキシ末端またはアミノ末端のいずれかで行われる挿入はより広いサイズ範囲であってもよいことが企図され、約2から約50アミノ酸が好ましい。1またはそれ以上のそのような挿入は、そのような挿入がまだ抗癌活性を示し得る修飾ペプチドを生じさせる限り、完全長もしくはトランケートされたHD2ドメインまたはBCL9ペプチドに導入され得る。
完全長もしくはトランケートされたHD2ドメインまたはBCL9ペプチドの欠失も本発明の範囲内である。そのような欠失は、HD2ドメインもしくはBCL9ペプチドからの、またはHD2ドメインもしくはBCL9ペプチド様ペプチド配列からの1またはそれ以上のアミノ酸の除去からなり、生じるペプチド配列の下限の長さは4、5または6アミノ酸である。そのような欠失は、ペプチド配列の1つの隣接する部分または2以上の別個の部分を含み得る。1またはそれ以上のそのような欠失は、そのような欠失がまだ抗癌活性を示し得る修飾ペプチドを生じさせる限り、完全長もしくはトランケートされたHD2ドメインまたはBCL9ペプチドに導入され得る。
加えて、当業者は、炭化水素ステープルペプチドとその標的タンパク質との間の相互作用が、ペプチド上で相互作用面と非相互作用面が規定され得る複合体を形成することを認識する。非相互作用面に沿った突然変異は容易に作製できるが、相互作用面上の突然変異は、相互作用面上の残基は複合体の主成分であり、設計される炭化水素ステープルペプチド内でそれ自体が保存され、維持されるべきであるので、容認されない。そこで、β−カテニン/BCL9複合体中のBCL9 HD2ドメインの相互作用面上の残基の10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%または90%は、不変であるかまたは構造的もしくは化学的に類似のアミノ酸残基に変更されるべきである。
HD2ドメインおよびBCL9ペプチドの安定化
本発明の修飾ポリペプチドは、構造的に拘束(例えば安定化、ステープル)されたヘリックスであり、ならびに/または生理的環境から取り出された場合生物活性形状を失う天然配列に比べてペプチドの構造的柔軟性を制限する天然および/もしくは非天然アミノ酸を組み込むための、ネイティブ(すなわち野生型または天然に生じる)配列と比較して1もしくはそれ以上のアミノ酸配列修飾を含む。好ましくは、ポリペプチドは、炭化水素ステープルなどの少なくとも1つの分子テザーを含む。炭化水素ステープリングは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる、米国特許出願公開第2005/0250680号、同第2010/0234563号、同第2007/0197772号、同第2006/0008848号、同第2006/0014675号;米国特許第7,723,469号、同第7,192,713号および同第7,084,244号;国際公開第2009/108261号および同第2010/148335号;ならびにKawamoto,S.A.et al,J.Med.Chem.55,1137−1146(2012);Mahon,A.B.and Arora,P.S.,Chem.Commun.48,1416−1418(2012);およびChapman,R.N.et al.,J.Am.Chem.Soc.126,12252−3(2004)に記載されている。
本発明の修飾ポリペプチドは、構造的に拘束(例えば安定化、ステープル)されたヘリックスであり、ならびに/または生理的環境から取り出された場合生物活性形状を失う天然配列に比べてペプチドの構造的柔軟性を制限する天然および/もしくは非天然アミノ酸を組み込むための、ネイティブ(すなわち野生型または天然に生じる)配列と比較して1もしくはそれ以上のアミノ酸配列修飾を含む。好ましくは、ポリペプチドは、炭化水素ステープルなどの少なくとも1つの分子テザーを含む。炭化水素ステープリングは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる、米国特許出願公開第2005/0250680号、同第2010/0234563号、同第2007/0197772号、同第2006/0008848号、同第2006/0014675号;米国特許第7,723,469号、同第7,192,713号および同第7,084,244号;国際公開第2009/108261号および同第2010/148335号;ならびにKawamoto,S.A.et al,J.Med.Chem.55,1137−1146(2012);Mahon,A.B.and Arora,P.S.,Chem.Commun.48,1416−1418(2012);およびChapman,R.N.et al.,J.Am.Chem.Soc.126,12252−3(2004)に記載されている。
ペプチドαへリックスは、比較的大きな接触表面積にわたって規則正しい正確な配置で特定のアミノ酸残基を提示することにより、決定的に重要なタンパク質相互作用に関与する(Chittenden,T.,et al.,Embo Journal,1995.14(22):p.5589−5596;Kussie,P.H.,et al.,Science,1996.274(5289):p.948−953;Ellenberger,T.E.,et al.,Cell,1992.71(7):p.1223−1237)。αへリックスドメインおよび他のタンパク質構造特徴は、タンパク質の残りの部分における足場配列によってしばしば安定化され、足場配列はヘリックス構造、例えばαへリックス構造の形成および/または維持を促進する。環境から取り出された場合、αへリックスペプチドモチーフはほどけて、生物学的活性の喪失をもたらし得る。αへリックスペプチドを開発するうえでの重要な課題には、それらの天然のαへリックス構造を促進および/または維持すること、ならびにタンパク質分解、酸および熱分解に耐えることができ、それによりインビボで無傷のままであり得るペプチドを作製することが含まれる。
炭化水素ステープリングは、少なくとも2個の置換アミノ酸(または2個の天然アミノ酸からの非天然結合、例えば炭素−炭素)によってポリペプチドを安定に架橋するための工程であって、そのポリペプチドの天然二次構造を立体配座的に与えるのを助ける工程を指す。炭化水素ステープリングは、αへリックス構造が熱力学的に好ましいペプチドにおいてαへリックス二次構造を促進し、維持する。この二次構造は、タンパク質分解切断および熱に対するポリペプチドの抵抗性を増大させ、疎水性も高め得る。したがって、本明細書で述べる炭化水素ステープル(構造的に拘束された、例えば架橋された)ポリペプチドは、対応する非炭化水素ステープル(構造的に拘束されていない)ポリペプチドと比較して改善された生物学的活性を有する。本明細書で述べる架橋ポリペプチドは治療的に、例えば癌を治療するために使用できる。
炭化水素ステープルペプチドは2個のアミノ酸の間にテザー(連結部)を含み、該テザーはポリペプチドのヘリックス二次構造を有意に増強する。一般に、テザーは1または2個のヘリックスターンの長さ(すなわち約3〜3.6または約7アミノ酸)にわたって伸びる。したがって、iとi+3;iとi+4;またはiとi+7に位置するアミノ酸は化学修飾および架橋のための理想的な候補である。したがって、例えば、ペプチドが配列・・・X1、X2、X3、X4、X5、X6、X7、X8、X9・・・を有する場合、X1とX4の間、またはX1とX5の間、またはX1とX8の間の架橋は、X2とX5の間、またはX2とX6の間、またはX2とX9の間等の架橋と同様に有用である。個々のステープル付加体の有用性を組み合わせる(例えば改善されたヘリックス性と活性;改善されたヘリックス性と熱安定性;改善されたヘリックス性と酸安定性;改善されたヘリックス性と薬理学的特性)、複数の架橋(例えば2、3、4またはそれ以上)の使用も達成されている。「ステッチ」架橋の使用も達成されており、それにより二重の結合が共通の起源(例えばX1、X5およびX9、ここでX5は2つのステープルのアンカーポイントである)から作製される。したがって、本発明は、配列をさらに安定化するためまたはより長い一続きのポリペプチドの構造安定化、タンパク質分解抵抗性、熱安定性、酸安定性、薬理学的特性および生物学的活性増強を促進するための、ポリペプチド配列内の1またはそれ以上の架橋の組込みを包含する。
本発明の一部の実施形態では、テザー、例えば炭化水素ステープルを、ヘリックス以外の構造を安定化するために使用する。そのような場合、テザーの末端はi、i+3、i+4およびi+7以外の間隔で位置づけることができる。
1つの実施形態では、本発明の修飾ポリペプチドは、式(I):
[式中、
各々のR1およびR2は、独立してHまたはC1〜C10アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキルまたはヘテロシクリルアルキルであり;
R3は、アルキル、アルケニル、アルキニル;[R4−K−R4]nであり、その各々は0〜6個のR5で置換されており;
R4は、アルキル、アルケニルまたはアルキニルであり;
R5は、ハロ、アルキル、OR6、N(R6)2、SR6、SOR6、SO2R6、CO2R6、R6、蛍光部分または放射性同位体であり;
Kは、O、S、SO、SO2、CO、CO2、CONR6または
各々のR1およびR2は、独立してHまたはC1〜C10アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキルまたはヘテロシクリルアルキルであり;
R3は、アルキル、アルケニル、アルキニル;[R4−K−R4]nであり、その各々は0〜6個のR5で置換されており;
R4は、アルキル、アルケニルまたはアルキニルであり;
R5は、ハロ、アルキル、OR6、N(R6)2、SR6、SOR6、SO2R6、CO2R6、R6、蛍光部分または放射性同位体であり;
Kは、O、S、SO、SO2、CO、CO2、CONR6または
であり、
R6は、H、アルキルまたは治療薬であり;
nは1〜4の整数であり;
xは2〜10の整数であり;
各々のyは、独立して0〜100の整数であり;
zは1〜10の整数(例えば1、2、3、4、5、6、7、8、9、10)であり;ならびに
各々のXaaは、独立してアミノ酸である]
を有する。
R6は、H、アルキルまたは治療薬であり;
nは1〜4の整数であり;
xは2〜10の整数であり;
各々のyは、独立して0〜100の整数であり;
zは1〜10の整数(例えば1、2、3、4、5、6、7、8、9、10)であり;ならびに
各々のXaaは、独立してアミノ酸である]
を有する。
修飾ポリペプチドは、αへリックスを形成し、および配列番号1から7のアミノ酸配列に30%またはそれ以上同一であるアミノ酸配列を含んでよく、ここで、Xは任意のアミノ酸であり、炭化水素ステープルによって連結されたアミノ酸残基をさらに特定し、およびBはノルロイシンである。
テザーは、アルキル、アルケニルまたはアルキニル部分(例えばC5、C8もしくはC11アルキル、またはC5、C8もしくはC11アルケニル、またはC5、C8もしくはC11アルキニル)を含み得る。テザーされたアミノ酸はα二置換され得る(例えばC1〜C3またはメチル)。
一部の場合には、xは2、3または6である。
一部の場合には、各々のyは、独立して3から15の間の整数である。
一部の場合には、各々のyは、独立して1から15の間の整数である。
一部の場合には、R1およびR2は、各々独立してHまたはC1〜C6アルキルである。
一部の場合には、R1およびR2は、各々独立してC1〜C3アルキルである。
一部の場合には、R1およびR2の少なくとも一方はメチルである。例えばR1およびR2はどちらもメチルである。
一部の場合には、R3はアルキル(例えばC8アルキル)であり、およびxは3である。
一部の場合には、R3はC11アルキルであり、およびxは6である。
一部の場合には、R3はアルケニル(例えばC8アルケニル)であり、およびxは3である。
一部の場合には、xは6であり、およびR3はC11アルケニルである。
一部の場合には、R3は直鎖アルキル、アルケニルまたはアルキニルである。
一部の場合には、R3は−CH2−CH2−CH2−CH=CH−CH2−CH2−CH2−である。
ある実施形態では、2つのα,α二置換された立体中心は、どちらもR立体配置もしくはS立体配置であるか(例えばi、i+4架橋)、または一方の立体中心はRであり、および他方はSである(例えばi、i+7架橋)。したがって、式Iが、
と表される場合、例えばxが3であるとき、C’およびC’’二置換された立体中心は、どちらもR立体配置であり得るかまたはこれらはどちらもS立体配置であり得る。xが6である場合、C’二置換された立体中心はR立体配置であり、およびC’’二置換された立体中心はS立体配置である。R3二重結合は、EまたはZ立体化学的立体配置であってもよい。
一部の場合には、R3は[R4−K−R4]nであり;およびR4は直鎖アルキル、アルケニルまたはアルキニルである。
一部の実施形態では、修飾ポリペプチドは、リピートまたはリピート様ドメイン、例えばBCL9 HD2ドメインの少なくとも3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、45、50個またはそれ以上のアミノ酸を含む。各々の[Xaa]yは、リピートまたはリピート様ドメイン、例えばHD2ドメインの少なくとも5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25個またはそれ以上のアミノ酸を独立して含み得るペプチドである。[Xaa]xは、リピートまたはリピート様ドメインの3または6個のアミノ酸を含み得るペプチドである。
修飾ポリペプチドは、リピートまたはリピート様ドメイン、例えばHD2ドメイン、例えば配列番号1から7のアミノ酸配列を有するポリペプチドの3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、35、40、45、50個またはそれ以上のアミノ酸を含むことができ、ここで、2、3または6個のアミノ酸によって隔てられた2個のアミノ酸は、R3を介して連結されたアミノ酸置換基によって置き換えられている。したがって、少なくとも2個のアミノ酸は、テザーアミノ酸またはテザーアミノ酸置換基によって置き換えることができる。したがって、式(I)が、
と表される場合、[Xaa]y’および[Xaa]y’’は、同じかまたは異なる7アミノ酸リピートまたは7アミノ酸リピート様ドメインからのポリペプチド配列を各々含み得る。
本発明は、リピートまたはリピート様ドメイン、例えばHD2ドメイン、例えば配列番号1から7のアミノ酸配列を有するポリペプチドの10個(11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、30、35、40、45、50個またはそれ以上)のアミノ酸を含む架橋ポリペプチドに関し、ここで、2、3または6個のアミノ酸によって隔てられた2個のアミノ酸のα炭素はR3を介して連結されており、2個のα炭素の一方はR1で置換され、他方はR2で置換され、および各々はペプチド結合を介してさらなるアミノ酸に連結されている。
別の実施形態では、本発明の修飾ポリペプチドは、式(II):
[式中、
各々のR1およびR2は、独立してH、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキルまたはヘテロシクリルアルキルであり;
各々のnは、独立して1〜15の整数であり;
xは2、3または6であり;
各々のyは、独立して0〜100の整数であり;
zは1〜10の整数(例えば1、2、3、4、5、6、7、8、9、10)であり;
各々のXaaは、独立してアミノ酸である]
を有する。
各々のR1およびR2は、独立してH、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキルまたはヘテロシクリルアルキルであり;
各々のnは、独立して1〜15の整数であり;
xは2、3または6であり;
各々のyは、独立して0〜100の整数であり;
zは1〜10の整数(例えば1、2、3、4、5、6、7、8、9、10)であり;
各々のXaaは、独立してアミノ酸である]
を有する。
さらに別の実施形態では、本発明の修飾ポリペプチドは、式(III):
[式中、
各々のR1およびR2は、独立してH、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキルまたはヘテロシクリルアルキルであり;
R3は、アルキル、アルケニル、アルキニル;[R4−K−R4]nまたは天然のアミノ酸側鎖であり、その各々は0〜6個のR5で置換されており;
R4は、アルキル、アルケニルまたはアルキニルであり;
R5は、ハロ、アルキル、OR6、N(R6)2、SR6、SOR6、SO2R6、CO2R6、R6、蛍光部分または放射性同位体であり;
Kは、O、S、SO、SO2、CO、CO2、CONR6または
各々のR1およびR2は、独立してH、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキルまたはヘテロシクリルアルキルであり;
R3は、アルキル、アルケニル、アルキニル;[R4−K−R4]nまたは天然のアミノ酸側鎖であり、その各々は0〜6個のR5で置換されており;
R4は、アルキル、アルケニルまたはアルキニルであり;
R5は、ハロ、アルキル、OR6、N(R6)2、SR6、SOR6、SO2R6、CO2R6、R6、蛍光部分または放射性同位体であり;
Kは、O、S、SO、SO2、CO、CO2、CONR6または
であり、
R6は、H、アルキルまたは治療薬であり;
R7は、アルキル、アルケニル、アルキニル;[R4−K−R4]nまたは天然のアミノ酸側鎖であり、その各々は0〜6個のR5で置換されており;
nは1〜4の整数であり;
xは2〜10の整数であり;
各々のyは、独立して0〜100の整数であり;
zは1〜10の整数(例えば1、2、3、4、5、6、7、8、9、10)であり;ならびに
各々のXaaは、独立してアミノ酸である]
を有する。
R6は、H、アルキルまたは治療薬であり;
R7は、アルキル、アルケニル、アルキニル;[R4−K−R4]nまたは天然のアミノ酸側鎖であり、その各々は0〜6個のR5で置換されており;
nは1〜4の整数であり;
xは2〜10の整数であり;
各々のyは、独立して0〜100の整数であり;
zは1〜10の整数(例えば1、2、3、4、5、6、7、8、9、10)であり;ならびに
各々のXaaは、独立してアミノ酸である]
を有する。
その内容が参照により本明細書に組み込まれる、国際出願第PCT/US2008/058575号(国際公開第2008/121767号)に少なくとも開示されているステッチペプチドも本発明によって企図される。
修飾ポリペプチドは、αへリックスを形成し、および配列番号1から7の配列を有するペプチドに20%またはそれ以上同一であるアミノ酸配列を含み得るか、またはアミノ酸配列からの少なくとも7個のアミノ酸、または配列番号1から7の配列を有するペプチドによって形成されるヘリックスの1つの面からの少なくとも2個のアミノ酸を含み、ここで、Xは任意のアミノ酸であり、炭化水素ステープルによって連結されたアミノ酸残基をさらに特定し、およびBはノルロイシンである。ある実施形態では、修飾ポリペプチドは、αへリックスを形成し、および配列番号1から7の配列を有するペプチドに30%またはそれ以上同一であるアミノ酸配列を含み得る。ある実施形態では、αへリックス内のアミノ酸配列は、配列番号1から7の配列を有するペプチドに40%、50%、60%、70%、80%、90%または95%またはそれ以上同一である。
炭化水素テザーが説明されてきたが、他のテザーも想定される。例えば、テザーは、エーテル、チオエーテル、エステル、アミンまたはアミド部分の1またはそれ以上を含み得る。一部の場合には、天然のアミノ酸側鎖をテザーに組み込むことができる。例えば、テザーを、セリン中のヒドロキシル、システイン中のチオール、リシン中の第一級アミン、アスパラギン酸もしくはグルタミン酸中の酸、またはアスパラギンもしくはグルタミン中のアミドなどの官能基とカップリングすることができる。したがって、2個の非天然アミノ酸をカップリングすることによって作製されたテザーを使用するのではなく、天然アミノ酸を用いてテザーを作製することが可能である。天然アミノ酸と共に1個の非天然アミノ酸を使用することも可能である。
テザーの長さを変化させ得ることがさらに想定される。例えば、二次構造に比較的高度の拘束を与えることが望ましい場合は、より短い長さのテザーを使用することができ、一方、一部の場合には、二次構造により少ない拘束を与えることが望ましく、したがってより長いテザーが望ましいと考えられる。アミノ酸配列がヘリックスを形成する傾向を有さない場合、ある部位におけるまたはアミノ酸配列内のテザーの挿入はヘリックス形成をもたらさないことがさらに理解される。
加えて、アミノ酸iからi+3、iからi+4;およびiからi+7にまたがるテザーの例は、主としてαヘリックスの単一面上にあるテザーを提供するために記述されているが、テザーは、多数のアミノ酸の任意の組合せにまたがるようにおよび/またはαへリックス以外の構造を維持するように合成することができる。
当業者に認識されるように、本明細書で述べる化合物を合成する方法は当業者に明らかである。加えて、所望化合物を与えるために様々な合成段階を選択的な順序または順番で実施し得る。本明細書で述べる化合物を合成するのに有用な合成化学変換および保護基の方法論(保護および脱保護)は当分野で公知であり、例えば、R.Larock,Comprehensive Organic Transformations,VCH Publishers(1989);T.W.Greene and P.G.M.Wuts,Protective Groups in Organic Synthesis,2d.Ed.,John Wiley and Sons(1991);L.Fieser and M.Fieser,Fieser and Fieser’s Reagents for Organic Synthesis,John Wiley and Sons(1994);およびL.Paquette,ed.,Encyclopedia of Reagents for Organic Synthesis,John Wiley and Sons(1995)ならびにこれらのその後の版に記載されているものを包含する。ペプチドの合成の特定の方法は本発明の限定ではない。
ペプチドの合成
本発明のペプチドは、当業者に周知であり、本明細書で述べる化学合成方法によって作製することができる。例えば、Fields et al,Chapter 3 in Synthetic Peptides:A User’s Guide,ed.Grant,W.H.Freeman & Co.,New York,N.Y.,1992,p.77;およびBird,G.H.,et al.,Methods Enzymol 446,369−86(2008)参照。したがって、ペプチドは、例えばApplied Biosystems Peptide Synthesizer Model 430Aもしくは431またはAAPPTECマルチチャネル合成装置APEX 396上で側鎖保護されたアミノ酸を使用する、t−BocまたはFmoc化学のいずれかによって保護されたα−NH2による固相合成の自動Merrifield法を用いて合成することができる。
本発明のペプチドは、当業者に周知であり、本明細書で述べる化学合成方法によって作製することができる。例えば、Fields et al,Chapter 3 in Synthetic Peptides:A User’s Guide,ed.Grant,W.H.Freeman & Co.,New York,N.Y.,1992,p.77;およびBird,G.H.,et al.,Methods Enzymol 446,369−86(2008)参照。したがって、ペプチドは、例えばApplied Biosystems Peptide Synthesizer Model 430Aもしくは431またはAAPPTECマルチチャネル合成装置APEX 396上で側鎖保護されたアミノ酸を使用する、t−BocまたはFmoc化学のいずれかによって保護されたα−NH2による固相合成の自動Merrifield法を用いて合成することができる。
本明細書で述べるペプチドを作製する1つの方法は、固相ペプチド合成(SPPS)を用いることである。C末端アミノ酸を、リンカー分子との酸に不安定な結合を介して架橋ポリスチレン樹脂に付着させる。この樹脂は合成に使用される溶媒に不溶性であり、このことが、過剰な試薬および副産物を洗浄除去することを比較的簡単かつ迅速にしている。N末端は、酸に安定であるが、塩基によって除去し得るFmoc基で保護する。任意の側鎖官能基を、塩基に安定で、酸に不安定な基で保護する。
より長いペプチドも、ネイティブケミカルライゲーション法を用いて個々の合成ペプチドを結合させることによって作製できる。あるいは、より長い合成ペプチドは、周知の組換えDNA技術によって合成することができる。そのような技術は、詳細なプロトコールと共に周知の標準的なマニュアルにおいて提供される。本発明のペプチドをコードするコード配列を構築するために、そのアミノ酸配列を逆翻訳し、好ましくは遺伝子が発現される生物に最適なコドンと共に、アミノ酸配列をコードする核酸配列を得る。次に、典型的にはこのペプチドおよび必要に応じて任意の調節エレメントをコードするオリゴヌクレオチドを合成することにより、コード配列を作製する。コード配列を適切なクローニングベクターに挿入し、宿主細胞にトランスフェクトする。さらに、炭化水素ステープルのための非天然アミノ酸を組み込むことができるように宿主細胞を遺伝子操作する。ペプチドを、次に、選択した発現系および宿主に適した適切な条件下で発現させる。Liu et al.Proc.Nat.Acad.Sci(USA),94:10092−10097(1997)参照。ペプチドを標準的な方法によって精製し、特性付ける。
ペプチドは、例えば、Advanced Chemtech/APPTTEC、ThuramedまたはCEMから入手可能なもののようなハイスループットマルチチャネルコンビナトリアル合成装置を使用して、ハイスループット、コンビナトリアル方式で作製することができる。
定義
「作用物質」は、本明細書では治療活性化合物または潜在的に治療活性な化合物を包含すると理解される。作用物質は、これまでに既知または未知の化合物であり得る。本明細書で使用される場合、作用物質は、典型的には非細胞ベースの化合物であるが、生物学的治療薬、例えばペプチドまたは核酸治療薬、サイトカイン等を包含し得る。
「作用物質」は、本明細書では治療活性化合物または潜在的に治療活性な化合物を包含すると理解される。作用物質は、これまでに既知または未知の化合物であり得る。本明細書で使用される場合、作用物質は、典型的には非細胞ベースの化合物であるが、生物学的治療薬、例えばペプチドまたは核酸治療薬、サイトカイン等を包含し得る。
本明細書で使用される場合、「改善」または「治療」は、特定の疾患または状態の少なくとも1つの徴候、症状、徴候または作用を軽減するまたは低下させるという意味と理解される。改善および治療は、単独でまたは他の治療薬および治療介入と組み合わせて、作用物質の2回分以上の用量の投与を必要とし得る。改善または治療は疾患または状態が治癒されることを必要としない。
「アミノ酸」という用語は、アミノ基とカルボキシル基の両方を含む分子を指す。適切なアミノ酸は、限定されることなく、適当なアミノ酸は、ペプチドにおいて認められる20種類の一般的な天然に生じるアミノ酸(例えばA、R、N、C、D、Q、E、G、H、I、L、K、M、F、P、S、T、W、Y、V(一文字略号として公知))のD異性体およびL異性体の両方、ならびに有機合成または他の代謝経路により調製され、化学的多様性、機能性、結合能力、構造模倣性および安定性の増大などの特定の用途のために適用できる、β−アミノ酸およびα,α二置換アミノ酸を含む天然および非天然のアミノ酸を包含する。
「アミノ酸側鎖」または「アミノ酸R基」という用語は、アミノ酸のα−炭素に結合した部分を指す。例えば、アラニンについてのアミノ酸側鎖またはR基はメチルであり、フェニルアラニンのアミノ酸側鎖はフェニルメチルであり、システインのアミノ酸側鎖はチオメチルであり、アスパラギン酸のアミノ酸側鎖はカルボキシメチルであり、チロシンのアミノ酸側鎖は4−ヒドロキシフェニルメチルである、等である。他の非天然アミノ酸側鎖も、例えば天然に生じるもの(例えばアミノ酸代謝産物)または合成により生成されたもの(例えばα,α二置換アミノ酸、β−アミノ酸)も包含される。
本明細書で使用される場合、「対照と比較して変化した」試料または被験者は、正常、未処置または対照試料からの試料とは統計的に異なるレベルで検出される分析物または診断もしくは治療指標のレベルを有すると理解される。対照試料には、例えば、培養下の細胞、1もしくはそれ以上の実験室試験動物、または1もしくはそれ以上のヒト被験者が含まれる。対照試料を選択し、試験する方法は当業者の能力の範囲内である。分析物は、細胞もしくは生物によって特徴的に発現もしくは産生される天然の物質、またはレポーター構築物によって生成される物質(例えばβ−ガラクトシダーゼもしくはルシフェラーゼ)であり得る。検出のために使用される方法に依存して、変化の量および測定は異なり得る。統計的有意性の決定は当業者の能力の範囲内である。
本明細書で使用される「共投与」は、1またはそれ以上の作用物質を、作用物質が被験者において同時に存在し、活性であるように被験者に投与することと理解される。共投与は、作用物質の混合剤の調製または作用物質の同時投与を必要としない。
「保存的アミノ酸置換」とは、アミノ酸残基が、類似の側鎖を有するアミノ酸残基で置き換えられる置換である。例えば、類似の側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーが当分野において定義されている。これらのファミリーには、塩基性側鎖(例えばリシン、アルギニン、ヒスチジン)、酸性側鎖(例えばアスパラギン酸、グルタミン酸)、非荷電極性側鎖(例えばグリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、トレオニン、チロシン、システイン)、非極性側鎖(例えばアラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン)、β分枝側鎖(例えばトレオニン、バリン、イソロイシン)および芳香族側鎖(例えばチロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン)を有するアミノ酸が含まれる。例えばペプチドの電荷を改変するためにアスパラギン酸をアスパラギンに置換する場合のような、他の保存的アミノ酸置換も、アミノ酸側鎖ファミリーを越えて起こり得る。したがって、HD2ドメインペプチド内の予測されるアミノ酸残基を、例えば、好ましくは同じ側鎖ファミリーからの別アミノ酸残基またはファミリーを越える同族体(例えばアスパラギン酸の代わりにアスパラギン、グルタミン酸の代わりにグルタミン)で置換する。保存的変化は、化学的に同族の非天然アミノ酸の置換(すなわちロイシンの代わりに合成非天然疎水性アミノ酸、トリプトファンの代わりに合成非天然芳香族アミノ酸)をさらに包含し得る。
「細胞に接触させること」は、本明細書では、作用物質または単離された細胞が、試験細胞または処理されるべき細胞と相互作用して、潜在的に試験細胞または処理されるべき細胞によって取り込まれ、試験細胞または処理されるべき細胞に作用を及ぼすように、作用物質を培養下または動物中の試験細胞、例えば処理されるべき細胞に提供することと理解される。作用物質または単離された細胞は、直接(例えば培地への作用物質の添加もしくは対象とする細胞もしくは組織への注入によって)、または循環、リンパ管もしくは他の手段による細胞への送達のための経腸的または非経口的投与経路による生物への送達によって、対象とする細胞に送達され得る。
本明細書で使用される場合、「検出すること」、「検出」等は、試料中の特定の分析物、試料中のレポーター構築物からの生成物または試料中の作用物質の活性の同定のためにアッセイを実施することと理解される。
本明細書で使用される「診断すること」とは、疾患、障害または状態の少なくとも1つの徴候または症状の存在に基づいて疾患、障害または状態を有する被験者を同定するための、観察、試験または状況に基づく被験者の状態の臨床的または他の評価を指す。典型的には、本発明の方法を使用した診断には、疾患、障害または状態の他の徴候または症状に関して被験者を観察することが含まれる。
「有効量」または「有効用量」という用語は、意図する薬理学的、治療的または予防的結果を生じさせる作用物質の量を指す。薬理学的有効量は、本明細書で提供する障害の1もしくはそれ以上の徴候もしくは症状の改善をもたらすか、または障害の拡大を予防する。例えば、治療有効量は、好ましくは癌拡大の速度を未処置の対照被験者と比較して少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%またはそれ以上低下させる治療薬の量を指す。有効用量を提供するには作用物質の2回以上の投与が必要であり得る。
本明細書で使用される場合、「有効」および「有効性」という用語は、薬理学的有効性と生理的安全性の両方を包含する。薬理学的有効性は、患者において所望の生物学的作用を生じさせる治療の能力を指す。生理的安全性は、治療の投与から生じる細胞、器官および/または生物レベルでの毒性または他の有害な生理的作用(しばしば副作用と称される)のレベルを指す。他方で、「無効」という用語は、治療が、有害作用が存在しない場合でも、少なくとも非層別集団において治療的に有用である十分な薬理学的作用を提供しないことを指示する。(そのような治療は、発現プロフィールによって同定され得るサブグループにおいて無効であり得る。)「より有効でない」は、治療が、治療的に有意により低いレベルの薬理学的有効性および/または治療的により高いレベルの有害な生理的作用を生じさせることを意味する。
したがって、薬剤の投与に関連して、疾患または状態「に対して有効」な薬剤は、臨床的に適切な方法での投与が、少なくとも統計的に有意の割合の患者に対して有益な作用、例えば症状の改善、治癒、疾患徴候または症状の軽減、寿命の延長、生活の質の改善、または特定の種類の疾患または状態を治療することに精通した医師によって一般的に有益と認識される他の作用を生じさせることを指示する。
本明細書で使用される場合、ヘリックス、例えばαへリックスまたは310ヘリックスの「面」は、ヘリックスが垂直に位置する場合、1つの面のアミノ酸が他方の面の上にあるものとして表されるように、タンパク質のヘリックス内に「積層」されているアミノ酸と理解される。例えば、αへリックスは1回転当たり約3.6個のアミノ酸を有する。それゆえ、配列abcdefga’b’c’d’e’f’g’を有するペプチドがαへリックスを形成する場合、4番目と5番目のアミノ酸(i+3とi+4)、すなわちアミノ酸dとeは最初のアミノ酸(位置1+〜3.6アミノ酸)上に「積層」し、8番目のアミノ酸であるアミノ酸a’(i+7)はアミノ酸a上に積層してヘリックスの面を形成し、アミノ酸a’から新しい回転が始まる。αへリックスにおいて、2番目のアミノ酸であるアミノ酸bは、+3および+4位置で5番目と6番目のアミノ酸、すなわちアミノ酸eおよびfと積層し、+7位置のアミノ酸b’と共にヘリックスの面を形成する。アミノ酸c、d、e、fおよびgから始まるヘリックス上の面は、上記開示に基づいて容易に決定することができる。さらに、ヘリックスの面は、「積層」残基の2つの隣接する柱、3つの隣接する柱または4つの隣接する柱を含み得る。
ヘリックスの「面」の一例には、ヘリックスの「相互作用面」が含まれる。「相互作用面」のアミノ酸残基は、ヘリックスバンドル中の1またはそれ以上のヘリックスと接触して、ポリペプチドの機能活性を無効化または実質的な無効化を生じさせる残基である。実質的な無効化とは、適切なアッセイにおいてBCL9ペプチドの機能活性を野生型ペプチドの約50%未満、約40%未満、約30%未満に低下させることと理解される。BCL9ペプチドの相互作用面アミノ酸残基は当分野で周知の方法によって容易に決定することができ、本明細書で説明する。1つの実施形態では、必須アミノ酸残基はBCL9 HD2ドメインの「a」または「d」位置にあるが、可欠アミノ酸は「b」、「c」、「e」、「f」または「g」位置に生じ得る。本明細書で使用される「相互作用面」アミノ酸残基という用語は、配列の機能を妨げない相互作用面アミノ酸の保存的置換を包含する。一般に、「相互作用面」アミノ酸残基はαへリックスの相互作用面において認められる。
BCL9、BCL9様およびHD2ドメインならびにHD2ドメイン類似体は、配列に基づく相同性、構造的相同性および/または機能的相同性により、当業者によって容易に同定可能である。そのような方法は当分野で周知であり、ペアワイズ残基相関に基づくバイオインフォマティクスプログラム(例えばch.embnet.org/software/COILS_form.html)を含み、このプログラムは、タンパク質配列からコイルを認識し、それらの構造をモデリングする能力を有する(Lupas,A.,et al.Science 1991.252:1162−1164参照)。
1つの実施形態では、本発明の修飾ポリペプチドは、相互作用面において配列番号1から7のアミノ酸配列と20%またはそれ以上類似する。別の実施形態では、本発明の修飾ポリペプチドは、相互作用面において配列番号1から7のアミノ酸配列と30%またはそれ以上類似する。別の実施形態では、本発明の修飾ポリペプチドは、相互作用面において配列番号1から7のアミノ酸配列と40%またはそれ以上類似する。別の実施形態では、本発明の修飾ポリペプチドは、相互作用面において配列番号1から7のアミノ酸配列と50%またはそれ以上類似する。別の実施形態では、本発明の修飾ポリペプチドは、相互作用面において配列番号1から7のアミノ酸配列と60%またはそれ以上類似する。別の実施形態では、本発明の修飾ポリペプチドは、相互作用面において配列番号1から7のアミノ酸配列と70%またはそれ以上類似する。別の実施形態では、本発明の修飾ポリペプチドは、相互作用面において配列番号1から7のアミノ酸配列と80%またはそれ以上類似する。別の実施形態では、本発明の修飾ポリペプチドは、相互作用面において配列番号1から7のアミノ酸配列と90%またはそれ以上類似する。BCL9ペプチドの相互作用面はβ−カテニン相互作用面であり得る。αへリックスの「相互作用面」は、他のタンパク質上および/または他のヘリックス内の他のアミノ酸残基と相互作用するアミノ酸残基を含む。リピートおよび相互作用面残基を同定する方法は当分野で周知であり、本明細書で説明する。
本明細書で使用される場合、「炭化水素ステープリング」という用語は、少なくとも2個のアミノ酸を有するポリペプチドを安定に架橋するための工程であって、そのポリペプチドの天然二次構造を立体配座的に与えるのを助ける工程を指す。炭化水素ステープリングは、ヘリックス二次構造、例えばαへリックス二次構造を有する傾向があるペプチドにおいて、その天然αへリックス立体配座を達成するまたは維持するために、ヘリックス二次構造を促進するまたは維持する。この二次構造は、タンパク質分解切断および熱に対するポリペプチドの抵抗性を増大させ、疎水性も高め得る。
炭化水素ステープルペプチドは2個の非天然アミノ酸(または2個の天然アミノ酸からの非天然結合、例えば炭素−炭素)の間に1またはそれ以上のテザー(連結部)を含み、該テザーはポリペプチドのヘリックス二次構造を有意に増強する。一般に、ヘリックス構造を促進するために、テザーは1または2個のヘリックスターンの長さ(すなわち約3、4または約7アミノ酸)にわたって伸びる。したがって、iとi+3;iとi+4;またはiとi+7に位置するアミノ酸は化学修飾および架橋のための理想的な候補である。したがって、例えば、ペプチドが配列・・・X1、X2、X3、X4、X5、X6、X7、X8、X9・・・を有し、およびアミノ酸Xが各々の位置について独立して選択される場合、X1とX4の間、またはX1とX5の間、またはX1とX8の間の架橋は、X2とX5の間、またはX2とX6の間、またはX2とX9の間等の架橋と同様に有用である。複数の架橋(例えば2、3、4またはそれ以上)の使用も企図される。複数の架橋の使用は、特にペプチドの長さが増大すると共に、ペプチドを安定化し、最適化するのに有効である。「ステッチ」架橋の使用も達成されており、それにより二重の結合が共通の起源(例えばX1、X5およびX9、ここでX5は2つのステープルのアンカーポイントである)から作製される。したがって、本発明は、ポリペプチド配列内の1またはそれ以上の架橋の組込みを包含する。複数の架橋の使用は、特にペプチドの長さが増大すると共に、ペプチドを安定化し、最適化するのに有効である。したがって、本発明は、2つのステープルが共通の起源から生じるステッチ架橋を含む、ポリペプチド配列内の1またはそれ以上の架橋の組込みを包含する。
本明細書で使用される場合、「ステープルスキャン」は、ステープルペプチドのライブラリの合成を指し、それによりiとi+3;iとi+4;およびiとi+7の単一および複数のステープルまたはステッチの場所がペプチド配列の長さに沿って下流へと連続的に位置づけ、すべての可能な場所をサンプリングして、ステープルまたはステッチ構築物についての所望のまたは最適の特性および活性を同定する。
本明細書で使用される場合、「同一性」または「パーセント同一性」という用語は、2つのポリマー分子、例えば2つのポリヌクレオチドまたは2つのポリペプチドの間のサブユニット配列類似性を指す。2つの分子の両方におけるサブユニット位置が同じ単量体サブユニットによって占められている場合、例えば2つのペプチドの各々におけるある位置がセリンで占められている場合、それらはその位置において同一である。2つの配列間の同一性は、マッチするまたは同一の位置の数の直接の関数であり、例えば2つのペプチドまたは化合物配列における位置の半数(例えばポリマーの10サブユニット長における5つの位置)が同一である場合、これら2つの配列は50%同一である;位置の90%、例えば10のうち9がマッチする場合、2つの配列は90%の配列同一性を共有する。2つの配列間の同一性は、マッチするまたは同一の位置の数の直接の関数である。したがって、参照配列の一部分が特定のペプチドにおいて欠失している場合、その欠失区域は、配列同一性を計算する目的に関しては計数しない。同一性はしばしば配列解析ソフトウェア、例えばBLASTNまたはBLASTP(www.ncbi.nih.gov/BLASTにおいて入手可能)を用いて測定される。BLASTN(ヌクレオチド配列用)により2つの配列を比較する(例えば2つの配列を互いに対して「Blast」する)ためのデフォルトパラメータは、マッチリワード=1、ミスマッチペナルティ=0、オープンギャップ=5、エクステンションギャップ=2である。タンパク質配列用のBLASTPを使用する場合は、デフォルトパラメータは、マッチリワード=0、ミスマッチペナルティ=0、オープンギャップ=11およびエクステンションギャップ=1である。同一性を決定するためのさらなるコンピュータプログラムは当分野で公知である。
本明細書で使用される場合、ポリペプチドに関して使用される場合の「単離された」または「精製された」とは、天然ポリペプチドまたはタンパク質がその通常の生理的環境から取り出されていること(例えば血漿もしくは組織から単離されたタンパク質)、または非天然環境で合成されること(例えばインビトロ翻訳系においてもしくは化学合成を用いて人工的に合成される)を意味する。したがって、「単離された」または「精製された」ポリペプチドは、無細胞溶液中に存在し得るかまたは異なる細胞環境に位置し得る(例えば異種細胞型において発現される)。「精製された」という用語は、そのポリペプチドが、存在する唯一のポリペプチドであることを意味するのではなく、該ポリペプチドが天然に結合している細胞または生物物質を基本的に含まず(約90〜95%、99〜100%まで純粋)、したがって天然のポリペプチドとは区別されることを意味する。同様に、単離された核酸は、その通常の生理的環境から取り出されている。細胞に関して使用される場合の「単離された」は、細胞が、初代細胞または細胞株の、細胞培養または器官培養のいずれかの、培養下にある(すなわち動物中ではない)ことを意味する。細胞は、正常な動物、トランスジェニック動物、自然に生じる遺伝子変化を有する動物、ならびに/または遺伝的および/もしくは誘発された疾患もしくは状態を有する動物から単離することができる。
本明細書で使用される場合、「キット」は、本発明の方法における使用のための少なくとも1つの非標準的な実験用試薬を含むと理解される。例えば、キットは、すべて適切な包装中の、少なくとも1つのペプチドおよび使用のための指示書の少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つを含み得る。キットは、乾燥粉末、濃縮溶液または即時使用溶液として、本発明の方法を実施するために必要な任意の他の成分をさらに含み得る。一部の実施形態では、キットは、本発明の方法における使用のための試薬が入った1またはそれ以上の容器を含み、そのような容器は、箱、アンプル、ビン、バイアル、チューブ、バッグ、パウチ、ブリスターパック、または当分野で公知の他の適切な容器形態であり得る。そのような容器は、プラスチック、ガラス、ラミネート紙、金属箔、または試薬を保持するのに適した他の材料で作製され得る。
「可欠」アミノ酸残基は、ポリペプチドの活性/二次構造(αへリックス構造)を無効にせずまたは実質的に無効にせずに、ポリペプチドの野生型配列から変化させ得る残基である。
「得ること」は、本明細書では製造する、購入するまたは入手することと理解される。
本明細書で使用される場合、「作動可能に連結された」は、作動可能に連結された2またはそれ以上の成分がそれらのもとの活性を保持するか、または作動可能に連結された部分の活性が実施例で提供する方法の少なくとも1つを用いて検定することができ、検出可能な活性を有するように、連結されたとき活性を獲得する方法で、好ましくは共有結合によって連結されていること、例えば1つのペプチドのアミノ末端が別のペプチドのカルボキシ末端に連結されていることと理解される。
「医薬的に許容される担体」という語句は、当分野で承認されており、本発明の化合物を哺乳動物に投与するのに適した、医薬的に許容される材料、組成物またはビヒクルを包含する。担体には、対象作用物質を1つの器官または身体の一部分から別の器官または身体の別の部分に運ぶまたは輸送することに関与する、液体もしくは固体充填剤、希釈剤、賦形剤、溶媒または封入材料が含まれる。各々の担体は、製剤のその他の成分と適合性であり、患者に有害でないという意味で「許容され」ねばならない。例えば、細胞の投与のための医薬的に許容される担体は、典型的な注射による送達用に許容される担体であり、界面活性剤または送達すべき細胞を損傷し得る他の化合物などの作用物質を含まない。医薬的に許容される担体としての機能を果たし得る材料の一部の例には、糖類、例えばラクトース、グルコースおよびスクロース;デンプン、例えばトウモロコシデンプンおよびジャガイモデンプン;セルロースおよびその誘導体、例えばカルボキシメチルセルロースナトリウム、エチルセルロースおよび酢酸セルロース;粉末トラガカント;麦芽;ゼラチン;滑石;賦形剤、例えばココアバターおよび坐剤ワックス;油脂類、例えば落花生油、綿実油、ベニバナ油、ゴマ油、オリーブ油、トウモロコシ油およびダイズ油;グリコール類、例えばプロピレングリコール;ポリオール類、例えばグリセリン、ソルビトール、マンニトールおよびポリエチレングリコール;エステル類、例えばオレイン酸エチルおよびラウリン酸エチル;寒天;緩衝剤、例えば水酸化マグネシウムおよび水酸化アルミニウム;アルギン酸;発熱物質不含水;等張食塩水;リンガー液;エチルアルコール;リン酸緩衝液;ならびに医薬製剤において使用される他の非毒性適合性物質が含まれる。
湿潤剤、乳化剤および潤滑剤、例えばラウリル硫酸ナトリウムおよびステアリン酸マグネシウム、ならびに着色剤、放出剤、被覆剤、甘味料、着香剤および香料、防腐剤および抗酸化剤も組成物中に存在し得る。
医薬的に許容される抗酸化剤の例には、水溶性抗酸化剤、例えばアスコルビン酸、塩酸システイン、重硫酸ナトリウム、メタ重亜硫酸ナトリウム、亜硫酸ナトリウム等;油溶性抗酸化剤、例えばパルミチン酸アスコルビル、ブチル化ヒドロキシアニソール(BHA)、ブチル化ヒドロキシトルエン(BHT)、レシチン、没食子酸プロピル、α−トコフェロール等;ならびに金属キレート剤、例えばクエン酸、エチレンジアミン四酢酸(EDTA)、ソルビトール、酒石酸、リン酸等が含まれる。
本発明の製剤は、経口、鼻、局所、経皮、口腔、舌下、筋肉内、腹腔内、直腸、膣および/または非経口投与に適するものを包含する。製剤は、単位剤形で好都合に提供され得、薬学の分野で周知の任意の方法によって調製され得る。単一剤形を生成するために担体材料と組み合わせることができる有効成分の量は、一般に治療効果を生じさせる化合物の量である。
本明細書で使用される場合、「複数」は2以上を意味すると理解される。例えば、複数は、少なくとも2、3、4、5またはそれ以上を指す。
本明細書で使用される「ポリペプチド」または「ペプチド」は、共有結合(例えばペプチド結合)によって連結された2またはそれ以上の、独立して選択される天然または非天然アミノ酸と理解される。ペプチドは、ペプチド結合によって連結された2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20またはそれ以上の天然または非天然アミノ酸を含み得る。本明細書で述べるポリペプチドは、完全長タンパク質(例えば完全にプロセシングされたタンパク質)ならびにより短いアミノ酸配列(例えば天然タンパク質のフラグメントまたは合成ポリペプチドフラグメント)を包含する。
本明細書で使用される「試料」は、その環境(例えば動物由来の血液もしくは組織、細胞、または組織培養由来の順化培地)から単離されており、ウイルス、抗体またはレポーター構築物からの生成物などの分析物を含むことが疑われるまたは含むことが既知である生物学的物質を指す。試料はまた、組織または体液の部分精製された画分であり得る。参照試料は、疾患もしくは状態の液体を有さないドナーから、または疾患もしくは状態を有する被験者における正常組織(例えば非感染組織対感染組織)からの、「正常」試料であり得る。参照試料はまた、活性物質で処置されていない(例えば治療なしまたはビヒクルだけの投与)未処置ドナーまたは細胞培養物に由来し得る。参照試料はまた、細胞または被験者を試験する作用物質と接触させる前の「ゼロ時点」で採取することもできる。
2またはそれ以上のポリペプチド配列に関連して「類似性」または「パーセント類似性」は、以下の配列比較アルゴリズムの1つを用いてもしくは目視検査によって測定した場合、同じであるか、または対応を最大にするように比較して整列したとき同じである特定の割合のアミノ酸残基もしくはその保存的置換物を有する、2またはそれ以上の配列を指す。
ポリペプチドに関して本明細書で使用される、「安定な」または「安定化された」という用語は、ヘリックス構造を促進および/もしくは維持するため、ならびに/またはプロテアーゼ抵抗性を改善するため、ならびに/または酸安定性を改善するため、ならびに/または熱安定性を改善するため、ならびに/または薬理学的特性を改善するために炭化水素ステープルされたポリペプチドを指す。安定化されたポリペプチドは、一種の構造的に拘束されたポリペプチドである。
本明細書で使用される場合、「構造的に拘束されたペプチド」等は、構造的に拘束されたペプチドが非修飾ペプチドよりも限られた数の構造をとるように、何らかの(すなわち少なくとも1つの)化学修飾、例えば天然または非天然アミノ酸による、もとのまたは天然の配列の突然変異、分子テザーを組み込むための化学修飾、ジスルフィド架橋の形成を促進するための化学修飾等を有する修飾ペプチドを包含すると理解される。構造的に拘束されたペプチドは、天然の野生型配列と比較して1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12またはそれ以上の突然変異を含み得る。例えば、分子テザーは、安定なヘリックス構造、特にαへリックスおよび310構造の形成を促進する炭化水素ステープル、またはテザーの末端の位置およびテザーの長さに依存するねじれを包含し得る。ねじれ(例えば2つの隣接する構造体間の可変角度によって規定される構造体中の屈曲)または他の好ましい立体配座を促進するために天然または非天然アミノ酸が使用できる。例えば、天然アミノ酸プロリンは、アミノ酸R基の構造および水素結合供与体の欠如によりペプチド内にねじれを誘導することができる。非天然アミノ酸、特に大型および/もしくは荷電R基を有するもの、またはNメチル化アミド、N置換グリシン、環状α,α二置換、環状N,N二置換ならびにβ−アミノ酸は、特定の所望立体配座を促進することができる。溶液中の「構造的に拘束された」ペプチドの集団は、必ずしも常にすべてが所望立体配座を有するとは限らないことが理解される。その代わりに、溶液中の構造的に拘束されたペプチドの集団において、所望立体配座は、化学修飾前の溶液中の天然またはもとのペプチド配列よりも少なくとも約30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%またはそれ以上の確率で存在する。溶液中のペプチドの集団の構造は、円二色性およびNMR分光法を含むがこれらに限定されない、当業者に公知の様々な方法によって決定され得る。結晶の形態でパックされている場合の拘束されたペプチドの構造を決定するにはX線結晶学が適用できる。
本明細書で使用される「低分子」は、約1500Da、1000Da、750Daまたは500Da以下の分子量を有する化合物、典型的には有機化合物と理解される。1つの実施形態では、低分子は、天然アミノ酸および/またはヌクレオチドだけを含むポリペプチドまたは核酸を包含しない。
作用物質、ポリペプチド、核酸または他の化合物は、非特異的化合物または非特異的化合物のプールと比較して、標的分子が少なくとも100倍、好ましくは少なくとも500倍、好ましくは少なくとも1000倍、好ましくは少なくとも5000倍、好ましくは少なくとも10,000倍の選択性で結合される場合、標的分子、例えば抗原、ポリペプチド、核酸または他の化合物に「特異的に結合する」。特異的結合は、物理的に関連する構造を有する2またはそれ以上の関連化合物の1つに結合することに関して使用できる。絶対的または相対的な、結合選択性および親和性は、例えば各々の対に関して別々に親和性を測定することによってまたは競合アッセイもしくは当業者に周知の他の方法の使用によって決定することができる。
本明細書で使用される「被験者」は生存生物を指す。ある実施形態では、生存生物は動物である。ある好ましい実施形態では、被験者は哺乳動物である。ある実施形態では、被験者は家畜哺乳動物である。被験者の例には、ヒト、サル、イヌ、ネコ、マウス、ラット、ウシ、ウマ、ヤギおよびヒツジが含まれる。ヒト被験者は患者とも称され得る。
特定の疾患、状態または症候群に「罹患しているかまたは罹患している疑いがある」被験者は、適格な個人が、被験者が疾患、状態または症候群に罹患していると診断するかまたはその疑いを抱くのに十分な数の危険因子を有するかまたは十分な数もしくは組合せの疾患、状態もしくは症候群の徴候もしくは症状を呈する。
本明細書で使用される「治療有効量」は、細胞または被験者への単回用量または反復用量の投与後に、そのような治療を行わない場合に予想される以上に、そのような障害を有する患者の生存能を延長させる、障害の1またはそれ以上の徴候または症状を軽減する、感染を予防するまたは遅延させる、疾患または障害の進行を予防するかまたは遅延させるうえで有効な作用物質の量を指す。
作用物質は、単独でまたは1もしくはそれ以上の治療薬と組み合わせて、従来の賦形剤、例えば医薬的に許容される担体との混合物中の医薬組成物としてまたは治療処置として、被験者に投与することができる。
薬剤は、単位剤形で好都合に投与することができ、および、例えばRemington’s Pharmaceutical Sciences(Mack Pub.Co.,Easton,PA,1985)に記載されているように、製薬分野において周知の方法のいずれかによって調製し得る。非経口投与用の製剤は、無菌水または食塩水のような一般的な賦形剤として、ポリエチレングリコールなどのポリアルキレングリコール、植物起源の油、水素化ナフタレン等を含み得る。特に、生体適合性、生分解性ラクチドポリマー、ラクチド/グリコリドコポリマーまたはポリオキシエチレン−ポリオキシプロピレンコポリマーは、ある種の作用物質の放出を制御するために有用な賦形剤であり得る。
所与の療法において使用される活性化合物の実際の好ましい量は、例えば使用される特定の化合物、製剤化される特定の組成物、投与の方法ならびに被験者の特徴、例えば被験者の動物種、性別、体重、一般的な健康状態および年齢に応じて異なる。所与の投与プロトコールについての最適の投与率は、前記指針に関して実施される従来の用量決定試験を用いて当業者によって容易に確認され得る。
本明細書で使用される場合、特定の疾患または状態等に「感受性がある」、「罹患しやすい」または「素因がある」は、遺伝、環境、健康および/または他の危険因子に基づき、一般的な集団よりも疾患または状態を発症する可能性が高い個体を指す。疾患を発症する可能性の上昇は、約10%、20%、50%、100%、150%、200%またはそれ以上の上昇であり得る。
「アルキル」という用語は、指示数の炭素原子を含む、直鎖または分枝鎖であってよい炭化水素鎖を指す。例えば、C1〜C10は、基がその中に1から10個(両端を含む)の炭素原子を有してよいことを示す。数の指定がない場合、「アルキル」は、その中に1から20個(両端を含む、すなわち1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19または20個)の炭素原子を有する鎖(直鎖または分枝鎖)である。「アルキレン」という用語は、二価アルキル(すなわち−R−)を指す。
「アルケニル」という用語は、1またはそれ以上の炭素−炭素二重結合を有する直鎖または分枝鎖であってよい炭化水素鎖を指す。アルケニル部分は指示数の炭素原子を含む。例えば、C2〜C10は、基がその中に2から10個(両端を含む)の炭素原子を有してよいことを示す。「低級アルケニル」という用語は、C2〜C8アルケニル鎖を指す。数の指定がない場合、「アルケニル」は、その中に2から20個(両端を含む)の炭素原子を有する鎖(直鎖または分枝鎖)である。
「アルキニル」という用語は、1またはそれ以上の炭素−炭素三重結合を有する直鎖または分枝鎖であってよい炭化水素鎖を指す。アルキニル部分は指示数の炭素原子を含む。例えば、C2〜C10は、基がその中に2から10個(両端を含む)の炭素原子を有してよいことを示す。「低級アルキニル」という用語は、C2〜C8アルキニル鎖を指す。数の指定がない場合、「アルキニル」は、その中に2から20個(両端を含む)の炭素原子を有する鎖(直鎖または分枝鎖)である。
「アリール」という用語は、各々の環の0、1、2、3または4個の原子が置換基によって置換されていてもよい、6個の炭素の単環式または10個の炭素の二環式芳香族環系を指す。アリール基の例には、フェニル、ナフチル等が含まれる。「アリールアルキル」という用語または「アラルキル」という用語は、アリールで置換されたアルキルを指す。「アリールアルコキシ」という用語は、アリールで置換されたアルコキシを指す。
本明細書で使用される「シクロアルキル」という用語は、3から12個の炭素、好ましくは3から8個の炭素、より好ましくは3から6個の炭素を有する飽和および部分不飽和の環式炭化水素基を包含し、ここで、シクロアルキル基は場合によりさらに置換されていてもよい。好ましいシクロアルキル基には、限定されることなく、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロペンテニル、シクロヘキシル、シクロヘキセニル、シクロヘプチルおよびシクロオクチルが含まれる。
「ハロ」という用語は、フッ素、塩素、臭素またはヨウ素のいずれかの基を指す。
「ヘテロアリール」という用語は、単環式である場合は1〜3個のヘテロ原子、二環式である場合は1〜6個のヘテロ原子または三環式である場合は1〜9個のヘテロ原子を有する、芳香族の5〜8員単環式、8〜12員二環式または11〜14員三環式環系を指し、前記ヘテロ原子はO、NまたはSから選択され(例えば、炭素原子および、単環式、二環式または三環式である場合、それぞれ1〜3、1〜6または1〜9個のN、OまたはSのヘテロ原子)、ここで、各々の環の0、1、2、3または4個の原子は置換基によって置換されていてもよい。ヘテロアリール基の例には、ピリジル、フリルまたはフラニル、イミダゾリル、ベンゾイミダゾリル、ピリミジニル、チオフェニルまたはチエニル、キノリニル、インドリル、チアゾリル等が含まれる。「ヘテロアリールアルキル」という用語または「ヘテロアラルキル」という用語は、ヘテロアリールで置換されたアルキルを指す。「ヘテロアリールアルコキシ」という用語は、ヘテロアリールで置換されたアルコキシを指す。
「ヘテロシクリル」という用語は、単環式である場合は1〜3個のヘテロ原子、二環式である場合は1〜6個のヘテロ原子または三環式である場合は1〜9個のヘテロ原子を有する、非芳香族の5〜8員単環式、8〜12員二環式または11〜14員三環式環系を指し、前記ヘテロ原子はO、N、またはSから選択され(例えば、炭素原子および、単環式、二環式または三環式である場合、それぞれ1〜3、1〜6または1〜9個のN、OまたはSのヘテロ原子)、ここで、各々の環の0、1、2または3個の原子は置換基によって置換されていてもよい。ヘテロシクリル基の例には、ピペラジニル、ピロリジニル、ジオキサニル、モルホリニル、テトラヒドロフラニル等が含まれる。
「置換基」という用語は、アルキル、シクロアルキル、アリール、ヘテロシクリルまたはヘテロアリール基上のその基の任意の原子において「置換された」基を指す。適切な置換基には、限定されることなく、ハロ、ヒドロキシ、メルカプト、オキソ、ニトロ、ハロアルキル、アルキル、アルカリル、アリール、アラルキル、アルコキシ、チオアルコキシ、アリールオキシ、アミノ、アルコキシカルボニル、アミド、カルボキシ、アルカンスルホニル、アルキルカルボニルおよびシアノ基が含まれる。
本明細書で提供する範囲は、範囲内のすべての値の簡潔表記であると理解される。これは、配列番号の範囲が与えられる場合、すべての個別配列を包含する。例えば、1から50の範囲は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49または50からなる群の任意の数、数の組合せまたは部分的範囲を包含すると理解される。
特に記述されない限りまたは文脈から明らかでない限り、本明細書で使用される場合、「または」は包括的であると理解される。
特に記述されない限りまたは文脈から明らかでない限り、本明細書で使用される場合、「1つの」および「その」という用語は単数または複数であると理解される。
特に記述されない限りまたは文脈から明らかでない限り、本明細書で使用される場合、「約」という用語は、当分野における一般な許容値の範囲内、例えば平均の2標準偏差の範囲内と理解される。約は、記述される値の10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%、0.5%、0.1%、0.05%または0.01%内と理解され得る。文脈から明らかでない限り、本明細書で提供するすべての数値は約の語で修飾され得る。
本明細書での変数の何らかの定義における化学基の列挙の記述は、単一の基としてまたは列挙される基の組合せとしてのその変数の定義を包含する。本明細書での変数または態様についての実施形態の記述は、単一の実施形態としてまたは任意の他の実施形態もしくはその部分との組合せとしてのその実施形態を包含する。
記号
は、分子構造の一部として用いられる場合、単結合またはトランスもしくはシス二重結合を指す。
本明細書で提供する任意の組成物または方法は、本明細書で提供するその他の組成物および方法のいずれかの1またはそれ以上と組み合わせることができる。
医薬組成物および投与経路
本発明の1またはそれ以上の構造的に拘束されたペプチドは、本明細書で提供する障害の治療のための医薬組成物において使用することができる。本明細書で提供する治療方法は、被験者において障害を治療するために選択し、組み合わせることができる、構造的に拘束されたペプチドの組合せを用いて実施できる。例えば、本発明の医薬組成物は、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15またはそれ以上の構造的に拘束されたペプチドを含み得る。構造的に拘束されたペプチドはまた、他の作用物質、例えば抗癌剤または血管新生阻害剤と組み合わせることもできる。
本発明の1またはそれ以上の構造的に拘束されたペプチドは、本明細書で提供する障害の治療のための医薬組成物において使用することができる。本明細書で提供する治療方法は、被験者において障害を治療するために選択し、組み合わせることができる、構造的に拘束されたペプチドの組合せを用いて実施できる。例えば、本発明の医薬組成物は、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15またはそれ以上の構造的に拘束されたペプチドを含み得る。構造的に拘束されたペプチドはまた、他の作用物質、例えば抗癌剤または血管新生阻害剤と組み合わせることもできる。
本明細書で使用される場合、本発明の化合物は、医薬的に許容されるその誘導体を包含すると定義される。「医薬的に許容される誘導体」は、受容者に投与したとき、本発明の化合物を提供することができる(直接または間接的に)、本発明の化合物の任意の医薬的に許容される塩、エステル、エステルの塩または他の誘導体を意味する。特に好ましい誘導体は、そのような化合物を哺乳動物に投与した場合、本発明の化合物のバイオアベイラビリティを高める(例えば経口的に投与された化合物が、血液中により容易に吸収される、血清安定性を高めるもしくは化合物のクリアランス率を低下させることを可能にすることによって)、または親種に比べて親化合物の生物学的区画(例えば脳またはリンパ系)への送達を増強するものである。誘導体は、水溶解度または消化管膜を介した能動輸送を高める基が本明細書に記載する式の構造に付加されている誘導体を包含する。
本発明の化合物は、選択的な生物学的特性を高める適切な官能基を付加することによって修飾し得る。そのような修飾は当分野で公知であり、所与の生物学的区画(例えば血液、リンパ系、中枢神経系)への生物学的浸透を高める、経口バイオアベイラビリティを高める、注射による投与を可能にするために溶解度を高める、代謝を変化させるおよび排泄の速度を変化させるものを包含する。本発明の化合物の医薬的に許容される塩には、医薬的に許容される無機および有機酸および塩基から誘導されるものが含まれる。適切な酸性塩の例には、酢酸塩、アジピン酸塩、安息香酸塩、本発明の化合物の医薬的に許容される塩は、医薬的に許容される無機および有機の酸および塩基に由来するものを含む。適当な酸塩の例は、酢酸塩、アジピン酸塩、安息香酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、酪酸塩、クエン酸塩、ジグルコン酸塩、ドデシル硫酸塩、ギ酸塩、フマル酸塩、グリコール酸塩、ヘミ硫酸塩、ヘプタン酸塩、ヘキサン酸塩、塩酸塩、臭化水素酸塩、ヨウ化水素酸塩、乳酸塩、マレイン酸塩、マロン酸塩、メタンスルホン酸塩、2−ナフタレンスルホン酸塩、ニコチン酸塩、硝酸塩、パモ酸塩、リン酸塩、ピクリン酸塩、ピバリン酸塩、プロピオン酸塩、サリチル酸塩、コハク酸塩、硫酸塩、酒石酸塩、トシル酸塩およびウンデカン酸塩が含まれる。適切な塩基から誘導される塩には、アルカリ金属(例えばナトリウム)、アルカリ土類金属(例えばマグネシウム)、アンモニウムおよびN−(アルキル)4+塩が含まれる。本発明はまた、本明細書で開示する化合物の任意の塩基性窒素含有基の四級化も想定する。水溶性もしくは油溶性または分散性生成物は、そのような四級化によって得ることができる。
本発明の化合物は、例えば、注射によって、静脈内、動脈内、真皮下、腹腔内、筋肉内もしくは皮下的に;または経口的、口腔内、鼻内、経粘膜、膣内、頸部、局所的に、眼用調製物中でもしくは吸入によって、約0.001から約100mg/kg体重の範囲の用量で、または特定の薬剤の必要条件に従って、より好ましくは0.5〜10mg/kg体重の用量で投与することができる。本明細書における方法は、所望のまたは記述される作用を達成するための有効量の化合物または化合物組成物の投与を企図する。
単一剤形を製造するために担体物質と組み合わせ得る有効成分の量は、処置される宿主および投与の特定の方法に応じて異なる。典型的な製剤は、約1%から約95%の活性化合物(w/w)を含有する。あるいは、そのような製剤は約20%から約80%の活性化合物を含有する。
上記で言及したものより低いまたは高い用量が必要なこともある。任意の特定の患者についての具体的な用量および治療レジメンは、使用される特定の化合物の活性、年齢、体重、全身の健康状態、性別、食事、投与時間、排泄率、併用薬、疾患、状態または症状の重症度および経過、患者の疾患、状態または症状に対する素因、ならびに治療する医師の判断を含む、様々な因子に依存する。
患者の状態が改善したときは、必要に応じて、本発明の化合物、組成物または組合せの維持用量を投与し得る。その後、用量または投与の頻度またはその両方を、症状に応じて、改善された状態が保持されるレベルに低減し得る。患者は、しかし、疾患症状が再発したときには長期的なベースでの間欠的治療を必要とし得る。
本発明の医薬組成物は、本発明の化合物または医薬的に許容されるその塩、例えば本明細書で提供する障害の予防および/または治療のため、特に癌の予防および/または治療のための1またはそれ以上の治療薬を含む付加的な作用物質、ならびに任意の医薬的に許容される担体、補助剤またはビヒクルを含有する。本発明の選択的な組成物は、本発明の化合物または医薬的に許容されるその塩、および医薬的に許容される担体、補助剤またはビヒクルを含有する。本明細書で説明する組成物は、本明細書で説明する本発明の化合物ならびに、存在する場合は、付加的な治療薬を、癌またはその症状を含む疾患または疾患症状の調節を達成するために有効な量で含有する。
「医薬的に許容される担体または補助剤」という用語は、本発明の化合物と共に患者に投与することができ、ならびに治療量の化合物を送達するのに十分な用量で投与した場合、その薬理学的活性を破壊せずかつ非毒性である担体または補助剤を指す。
本発明の医薬組成物中で使用し得る医薬的に許容される担体、補助剤およびビヒクルには、イオン交換体、アルミナ、ステアリン酸アルミニウム、レシチン、自己乳化型ドラッグデリバリーシステム(SEDDS)、例えばd−α−トコフェロールポリエチレングリコール1000スクシネート、医薬剤形中で使用される界面活性剤、例えばTween(登録商標)または他の同様の高分子送達マトリックス、血清タンパク質、例えばヒト血清アルブミン、緩衝物質、例えばリン酸塩、グリシン、ソルビン酸、ソルビン酸カリウム、飽和植物性脂肪酸の部分的グリセリド混合物、水、塩または電解質、例えば硫酸プロタミン、リン酸水素二ナトリウム、リン酸水素カリウム、塩化ナトリウム、亜鉛塩、コロイド状シリカ、三ケイ酸マグネシウム、ポリビニルピロリドン、セルロースベースの物質、ポリエチレングリコール、カルボキシメチルセルロースナトリウム、ポリアクリレート、ワックス、ポリエチレン−ポリオキシプロピレンブロックポリマー、ポリエチレングリコールおよび羊毛脂が含まれるが、これらに限定されない。α−シクロデキストリン、β−シクロデキストリンおよびγ−シクロデキストリンなどのシクロデキストリン類も、本明細書に記載する式の化合物の送達を増強するために好都合に使用し得る。
本発明の医薬組成物は、例えば経口投与によって経腸的に、吸入スプレーによって、局所的、直腸、鼻内、口腔内、膣または埋め込み式リザーバーによって非経口的に、好ましくは経口もしくは膣投与または注射による投与によって、投与し得る。本発明の医薬組成物は、任意の従来の非毒性の医薬的に許容される担体、補助剤またはビヒクルを含有し得る。一部の場合、製剤のpHは、医薬的に許容される酸、塩基または緩衝剤を用いて、製剤化された化合物またはその送達形態の安定性を高めるように調整し得る。本明細書で使用される非経口的という用語は、皮下、皮内、静脈内、筋肉内、関節内、動脈内、滑液包内、胸骨内、髄腔内、病巣内および頭蓋内注射または注入技術を包含する。
剤形の例には、錠剤、カプレット、軟弾性ゼラチンカプセルなどのカプセル、カシェ剤、トローチ、ロゼンジ、分散液、坐剤、軟膏、パップ剤(湿布)、ペースト、散剤、包帯、クリーム、硬膏剤、溶液、パッチ、エアロゾル(例えば鼻スプレーまたは吸入器)、ゲル、懸濁液(例えば水性もしくは非水性懸濁液、水中油型乳剤または油中水型乳濁液)、溶液およびエリキシルを含む、患者に経口または粘膜投与するのに適した液体剤形、患者に非経口投与するのに適した液体剤形、ならびに患者に非経口投与するのに適した液体剤形を提供するように再構成できる滅菌固体(例えば結晶性または非晶質固体)が含まれるが、これらに限定されない。
医薬組成物は、滅菌の注射可能な製剤の形態、例えば滅菌の注射可能な水性または油性懸濁液であり得る。この懸濁液は、適切な分散剤または湿潤剤(例えばTween(登録商標)80など)および懸濁化剤を使用して、当分野で公知の技術に従って製剤化し得る。滅菌注射可能製剤はまた、例えば、1,3−ブタンジオール中の溶液のような、非毒性の非経口的に許容される希釈剤または溶媒中の滅菌の注射可能な溶液または懸濁液であり得る。使用し得る許容されるビヒクルおよび溶媒には、マンニトール、水、リンガー液および等張塩化ナトリウム溶液がある。加えて、滅菌の不揮発性油が溶媒または懸濁媒として慣例的に使用される。このために、合成モノグリセリドまたはジグリセリドを含む、任意の無刺激性の不揮発性油を使用し得る。オレイン酸およびそのグリセリド誘導体などの脂肪酸は、オリーブ油またはヒマシ油、特にそれらのポリオキシエチル化型などの天然の医薬的に許容される油と同様に、注射可能製剤の調製において有用である。これらの油性溶液または懸濁液は、長鎖アルコール希釈剤もしくは分散剤、またはカルボキシメチルセルロースまたは乳剤および/もしくは懸濁液などの医薬的に許容される剤形の製剤化において一般的に使用される同様の分散剤も含有し得る。TweenまたはSpanなどの他の一般的に使用される界面活性剤および/または医薬的に許容される固体、液体もしくは他の剤形の製造において一般的に使用される他の同様の乳化剤もしくはバイオアベイラビリティ増強剤も製剤化のために使用し得る。
本発明の医薬組成物は、カプセル、錠剤、乳剤および水性懸濁液、分散液および溶液を含むがこれらに限定されない、任意の経口的に許容される剤形で経口投与し得る。経口使用のための錠剤の場合、一般的に使用される担体にはラクトースおよびトウモロコシデンプンが含まれる。ステアリン酸マグネシウムなどの滑沢剤も、典型的には添加される。カプセル形態での経口投与に関しては、有用な希釈剤にはラクトースおよび乾燥トウモロコシデンプンが含まれる。水性懸濁液および/または乳剤を経口的に投与する場合は、有効成分を油相に懸濁または溶解することができ、乳化剤および/または懸濁化剤と組み合わせる。所望する場合は、特定の甘味料および/または着香剤および/または着色剤を添加し得る。
本発明の医薬組成物はまた、直腸投与のための坐剤の形態でも投与し得る。これらの組成物は、本発明の化合物を、室温では固体であるが直腸温度では液体であり、そのため直腸内で溶けて活性成分を放出する適切な非刺激性の賦形剤と混合することによって調製できる。そのような物質には、ココアバター、蜜ろうおよびポリエチレングリコールが含まれるが、これらに限定されない。
本発明の医薬組成物は局所的または膣内に投与し得る。医薬組成物は、担体中に懸濁または溶解した活性成分を含む適切な軟膏で製剤化される。本発明の化合物の局所投与のための担体には、鉱油、流動ワセリン、白色ワセリン、プロピレングリコール、ポリオキシエチレンポリオキシプロピレン化合物、乳化ワックスおよび水が含まれるが、これらに限定されない。あるいは、医薬組成物は、担体中に懸濁または溶解した活性成分を含む適切なローションまたはクリームで製剤化することができる。さらに別の実施形態では、医薬組成物は膣リングとして製剤化される。適切な担体には、鉱油、モノステアリン酸ソルビタン、ポリソルベート60、セチルエステルワックス、セテアリルアルコール、2−オクチルドデカノール、ベンジルアルコールおよび水が含まれるが、これらに限定されない。本発明の医薬組成物はまた、肛門坐剤製剤によってまたは適切な浣腸製剤中で下部腸管に局所的に適用し得る。局所経皮的なパッチおよびイオン泳動投与も本発明に包含される。
本発明の医薬組成物は、鼻エアロゾルまたは吸入によって投与し得る。そのような組成物は、医薬製剤化の分野で周知の技術に従って調製され、ベンジルアルコールまたは他の適切な防腐剤、バイオアベイラビリティを増強するための吸収促進剤、フルオロカーボンおよび/または当分野で公知の他の可溶化剤もしくは分散剤を使用して、生理食塩水中の溶液として調製され得る。
本発明の組成物が、本明細書に記載する式の化合物と1またはそれ以上の付加的な治療薬または予防薬との組合せを含有する場合、化合物および付加的な作用物質の両方が、単剤療法レジメンで通常投与される用量の約1から100%、より好ましくは約5から95%の用量レベルで存在すべきである。付加的な作用物質は、反復投与レジメンの一部として、本発明の化合物とは別途に投与され得る。あるいは、これらの作用物質は、単一組成物中で本発明の化合物と共に混合された、単一剤形の一部であり得る。
投与すべき本発明のペプチドの有効用量は、生物学的半減期、バイオアベイラビリティおよび毒性などのパラメータに対処する当業者に周知の手順を通して決定され得る。
治療有効用量は、患者において症状の改善または生存の延長をもたらすのに十分な化合物の量を指す。そのような化合物の毒性および治療効果は、例えばLD50(集団の50%に対して致死的な用量)およびED50(集団の50%において治療的に有効な用量)を決定するための、細胞培養物または実験動物における標準的な製薬手順によって判定することができる。毒性と治療効果の用量比が治療指数であり、LD50/ED50比として表すことができる。大きな治療指数を示す化合物が好ましい。これらの細胞培養アッセイおよび動物試験から得られたデータを、ヒトにおける使用のための用量範囲を策定する際に使用することができる。そのような化合物の用量は、好ましくは、ほとんどまたは全く毒性を伴わない、ED50を含む循環濃度の範囲内にある。用量は、使用される剤形および用いられる投与経路に依存してこの範囲内で変化し得る。本発明の方法において使用されるいずれの化合物についても、最初は細胞培養アッセイから治療有効用量を推定することができる。用量は、細胞培養物において決定されたIC50(例えば、試験化合物が存在しない場合の量と比較してアッセイによって測定されたBCL9/β−カテニンタンパク質相互作用の最大半量阻害またはその機能的代替値を達成する試験化合物の濃度)を含む循環血漿濃度範囲を達成するように動物モデルにおいて策定し得る。そのような情報を使用して、ヒトにおいて有用な用量をより正確に決定することができる。血漿中のレベルは、例えば高性能液体クロマトグラフィ(HPLC)または質量分析法(MS)によって測定し得る。
キット
本発明はまた、最終包装され、ラベル貼付された医薬品または実験用試薬を包含する。この製品は、ガラスバイアルまたは密閉される他の容器などの適切な入れ物または容器中に、使用のための適切な指示書を含む。医薬品は、例えば、1番目の容器に単位剤形中の本発明の化合物、および2番目の容器には注射用の滅菌水または補助剤を含み得る。あるいは、単位剤形は、経口、経皮、鼻内、膣内、子宮頸リングまたは局所送達に適した固体であり得る。
本発明はまた、最終包装され、ラベル貼付された医薬品または実験用試薬を包含する。この製品は、ガラスバイアルまたは密閉される他の容器などの適切な入れ物または容器中に、使用のための適切な指示書を含む。医薬品は、例えば、1番目の容器に単位剤形中の本発明の化合物、および2番目の容器には注射用の滅菌水または補助剤を含み得る。あるいは、単位剤形は、経口、経皮、鼻内、膣内、子宮頸リングまたは局所送達に適した固体であり得る。
特定の実施形態では、単位剤形は、静脈内、筋肉内、腹腔内、鼻内、経口、膣内、頸部、局所または皮下送達に適する。したがって、本発明は、各々の送達経路に適した、好ましくは滅菌の、溶液、固体、泡、ゲルを包含する。
任意の医薬品に関して、包装材料および容器は、貯蔵および発送の間、製品の安定性を保護するように設計される。さらに、本発明の製品は、使用のための指示書または問題の疾患もしくは障害をいかにして適切に予防または治療するかに関して医師、技術者もしくは患者にアドバイスする他の情報資料を含む。言い換えると、製品は、実際の用量、観測手順(例えば感染の検出および定量化)および他の観測情報を含むがこれらに限定されない投与レジメンを指示するまたは示唆する指示書を含む。
具体的には、本発明は、箱、ビン、チューブ、バイアル、容器、噴霧器、注入器、静脈内(i.v.)バッグ、薬袋等のような包装材料および前記包装材料内に含まれる少なくとも1つの単位剤形の薬剤を含む製品を提供し、ここで、前記薬剤は本発明の化合物を含有し、および前記包装材料は、前記化合物が、特定の用量を投与し、本明細書で述べる特定の投与レジメンを使用することにより、本明細書で提供する疾患に関連する1またはそれ以上の症状を管理する、治療するおよび/または改善するために使用できることを示す指示手段を含む。
以下の実施例は、単に本発明の様々な態様の説明として提供するものであり、いかなる意味においても本発明を限定すると解釈されるべきではない。
本発明によって治療される障害
ある実施形態では、本発明の安定化されたペプチドによって治療される疾患または障害は、血管新生に関連する。ある実施形態では、疾患は、腫瘍または癌増殖(新生物)、皮膚障害、新生血管形成、炎症性疾患および関節炎疾患、網膜芽細胞腫、類嚢胞黄斑水腫 (CME)、滲出型加齢黄斑変性(AMD)、糖尿病性網膜症、糖尿病性黄斑浮腫または眼炎症性疾患から選択される。
ある実施形態では、本発明の安定化されたペプチドによって治療される疾患または障害は、血管新生に関連する。ある実施形態では、疾患は、腫瘍または癌増殖(新生物)、皮膚障害、新生血管形成、炎症性疾患および関節炎疾患、網膜芽細胞腫、類嚢胞黄斑水腫 (CME)、滲出型加齢黄斑変性(AMD)、糖尿病性網膜症、糖尿病性黄斑浮腫または眼炎症性疾患から選択される。
様々な実施形態において、本発明の構造的に拘束されたペプチドは、癌幹細胞の化学療法抵抗性および放射線抵抗性(治療抵抗性)を克服するために使用できる。
ある実施形態では、疾患または障害は、腫瘍または癌増殖(新生物)である。さらなる実施形態では、疾患または障害は、眼の癌、直腸癌、結腸癌、結腸直腸癌、子宮頸癌、前立腺癌、乳癌、膀胱癌、口腔癌、良性および悪性腫瘍、胃癌、肝癌、膵癌、肺癌、子宮体癌、卵巣癌、前立腺癌、精巣癌、腎癌、脳/CNS癌、咽喉癌、多発性骨髄腫、皮膚黒色腫、急性リンパ性白血病、急性骨髄性白血病、ユーイング肉腫、カポジ肉腫、基底細胞癌および扁平上皮癌、小細胞肺癌、絨毛癌、横紋筋肉腫、血管肉腫、血管内皮腫、ウィルムス腫瘍、神経芽細胞腫、口腔/咽頭癌、食道癌、喉頭癌、リンパ腫、神経芽細胞腫、結節硬化症、血管腫およびリンパ管新生である。
他の実施形態では、疾患または障害は皮膚障害である。さらなる実施形態では、疾患または障害は、乾癬、ざ瘡、酒さ、いぼ、湿疹、血管腫、リンパ管新生、スタージ・ウェーバー症候群、皮膚の静脈性潰瘍、神経線維腫症および結節硬化症である。
ある実施形態では、疾患または障害は新生血管形成である。さらなる実施形態では、疾患または障害は、糖尿病性網膜症、未熟児網膜症、角膜移植片拒絶反応、血管新生緑内障、水晶体後線維増殖症、流行性角結膜炎、ビタミンA欠乏症、コンタクトレンズ過剰装用、アトピー性角膜炎、上輪部角膜炎、乾性翼状片角膜炎、シェーグレン症候群、酒さ性ざ瘡、フリクテン症、梅毒、ミコバクテリア感染、脂質変性、化学熱傷、細菌性潰瘍、真菌性潰瘍、単純ヘルペス感染、帯状疱疹感染、原生動物感染、カポジ肉腫、モーレン潰瘍、テリエン辺縁変性、辺縁性角膜溶解、外傷、関節リウマチ、全身性狼瘡、多発性動脈炎、ウェゲナーサルコイドーシス、強膜炎、スティーブンス・ジョンソン病、類天疱瘡、放射状角膜切開、角膜移植片拒絶反応、黄斑水腫、黄斑変性、鎌状赤血球貧血、サルコイド、梅毒、弾力線維性仮性黄色腫、パジェット病、静脈閉塞、動脈閉塞、頸動脈閉塞性疾患、慢性ブドウ膜炎/硝子体炎、ミコバクテリア感染、ライム病、全身性エリテマトーデス、未熟児網膜症、イールズ病、ベーチェット病、網膜炎または脈絡膜炎を引き起こす感染、推定眼ヒストプラスマ症、ベスト病、近視、眼陥凹、シュタルガルト病、扁平部炎、慢性網膜剥離、過粘稠度症候群、トキソプラスマ症、外傷およびレーザー治療後合併症、ルベオーシス(隅角の新生血管形成)に関連する疾患である。
ある実施形態では、疾患または障害は、炎症性疾患および関節炎疾患である。さらなる実施形態では、疾患または障害は、関節リウマチ、変形性関節症、狼瘡、強皮症、クローン病、潰瘍性大腸炎、乾癬、サルコイドーシス、サルコイドーシス、皮膚病変、血管腫、オスラー・ウェーバー・ランデュ病、遺伝性出血性末梢血管拡張症および変形性関節症である。
他の実施形態では、疾患または障害は、真皮、表皮、子宮内膜、網膜、外科創傷、胃腸管、臍帯、肝臓、腎臓、生殖系、リンパ系、中枢神経系、乳房組織、尿路、循環系、骨、筋肉または気道を侵す。
実施例1.ペプチド合成および円二色性
β−カテニンと直接相互作用する、BCL9 HD2ドメインの安定化されたαへリックス(図16)を作製するため、炭化水素ステープルペプチド(図14、15)の合成を以前に記述されているように実施した(Walensky,L.D.et al.Science 305,1466−70(2004);Bird,G.H.et al.,Methods Enzymol 446,369−86(2008);Bird et al.,PNAS 107,14093−8(2010))。ペプチドを、50mmol規模で、RinkアミドAM LL樹脂(EMD Biosciences、0.2mmol/g樹脂)を使用してApex 396(Aapptec)自動ペプチド合成装置で生成した。標準的なFmocプロトコールを用いて20%ピペリジン/NMP中で10分間ずつ2回脱保護し、次にメタノールとジメチルホルムアミド(DMF)の対で連続的に洗浄した。組み込まれた非天然アミノ酸を20%ピペリジン/NMP中で10分間ずつ4回インキュベートして処理し、完全な脱保護を達成した。Fmoc保護アミノ酸の0.4M保存溶液、0.67M 2−(6−クロロ−1H−ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルアミニウムヘキサフルオロホスフェート(HCTU)および2M N,N−ジイソプロピルエチルアミン(DIEA)を使用してアミノ酸カップリングを実施し、0.2M活性エステル1mL(4当量)を生成した。カップリングの頻度およびインキュベーション時間は、標準的な残基については30分間ずつ2回、オレフィン非天然アミノ酸については45分間ずつ2回、および非天然アミノ酸に続く残基については45分間ずつ3回であった。自動合成の完了後、アミノ末端をアセチル化するかまたはFITC誘導体化のためにFmoc−β−Alaでキャップした。オレフィンメタセシスによって炭化水素ステープルを作製するため、樹脂に1,2−ジクロロエタン中のビス(トリシクロヘキシルホスフィン)−ベンジリデンルテニウム(IV)ジクロリド(グラブス第一世代触媒)の10mM溶液を充填し、2時間ずつ2回撹拌した。FITC誘導体化のために、Fmoc−β−AlaをNMP中のピペリジンで脱保護し、次にジメチルホルムアミド中のフルオレセインイソチオシアネート(FITC)およびトリエチルアミンと一晩反応させた。ペプチドを樹脂から切断し、TFA/トリイソプロピルシラン(TIS)/水(95%、2.5%、2.5%)中で脱保護して、ジエチルエーテル/ヘキサンで沈殿させた。ステープルペプチドを、C18カラム(Zorbax)を用いた逆相HPLC(Agilent)によって精製し、LC/MS(エレクトロスプレーを正イオンモードで使用して得られた質量スペクトル)によって特徴づけて、Beckman 6300高速アミノ酸分析装置でのアミノ酸分析(AAA)によって定量化した。凍結乾燥粉末を1から10mMで100%DMSOに溶解することによって作業用保存溶液を作製した。SAH−gp41粉末とDMSO溶液を−20℃で保存した。αへリックス性の測定を以前に記述されているように実施した(Walensky,L.D.et al.Science 305,1466−70(2004);Bird,G.H.,et al.,Methods Enzymol 446,369−86(2008))。図1a〜1c、1gの実験結果参照。
β−カテニンと直接相互作用する、BCL9 HD2ドメインの安定化されたαへリックス(図16)を作製するため、炭化水素ステープルペプチド(図14、15)の合成を以前に記述されているように実施した(Walensky,L.D.et al.Science 305,1466−70(2004);Bird,G.H.et al.,Methods Enzymol 446,369−86(2008);Bird et al.,PNAS 107,14093−8(2010))。ペプチドを、50mmol規模で、RinkアミドAM LL樹脂(EMD Biosciences、0.2mmol/g樹脂)を使用してApex 396(Aapptec)自動ペプチド合成装置で生成した。標準的なFmocプロトコールを用いて20%ピペリジン/NMP中で10分間ずつ2回脱保護し、次にメタノールとジメチルホルムアミド(DMF)の対で連続的に洗浄した。組み込まれた非天然アミノ酸を20%ピペリジン/NMP中で10分間ずつ4回インキュベートして処理し、完全な脱保護を達成した。Fmoc保護アミノ酸の0.4M保存溶液、0.67M 2−(6−クロロ−1H−ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルアミニウムヘキサフルオロホスフェート(HCTU)および2M N,N−ジイソプロピルエチルアミン(DIEA)を使用してアミノ酸カップリングを実施し、0.2M活性エステル1mL(4当量)を生成した。カップリングの頻度およびインキュベーション時間は、標準的な残基については30分間ずつ2回、オレフィン非天然アミノ酸については45分間ずつ2回、および非天然アミノ酸に続く残基については45分間ずつ3回であった。自動合成の完了後、アミノ末端をアセチル化するかまたはFITC誘導体化のためにFmoc−β−Alaでキャップした。オレフィンメタセシスによって炭化水素ステープルを作製するため、樹脂に1,2−ジクロロエタン中のビス(トリシクロヘキシルホスフィン)−ベンジリデンルテニウム(IV)ジクロリド(グラブス第一世代触媒)の10mM溶液を充填し、2時間ずつ2回撹拌した。FITC誘導体化のために、Fmoc−β−AlaをNMP中のピペリジンで脱保護し、次にジメチルホルムアミド中のフルオレセインイソチオシアネート(FITC)およびトリエチルアミンと一晩反応させた。ペプチドを樹脂から切断し、TFA/トリイソプロピルシラン(TIS)/水(95%、2.5%、2.5%)中で脱保護して、ジエチルエーテル/ヘキサンで沈殿させた。ステープルペプチドを、C18カラム(Zorbax)を用いた逆相HPLC(Agilent)によって精製し、LC/MS(エレクトロスプレーを正イオンモードで使用して得られた質量スペクトル)によって特徴づけて、Beckman 6300高速アミノ酸分析装置でのアミノ酸分析(AAA)によって定量化した。凍結乾燥粉末を1から10mMで100%DMSOに溶解することによって作業用保存溶液を作製した。SAH−gp41粉末とDMSO溶液を−20℃で保存した。αへリックス性の測定を以前に記述されているように実施した(Walensky,L.D.et al.Science 305,1466−70(2004);Bird,G.H.,et al.,Methods Enzymol 446,369−86(2008))。図1a〜1c、1gの実験結果参照。
実施例2.タンパク質の生成および精製
組換えヒトBCL9(214〜493)を、カルボキシ末端にヘキサヒスチジンタグを含むpET−23a(+)ベクター(Novagen)にクローニングした。大腸菌(E.coli)BL21(DE3)コンピテント細胞(Stratagene)を形質転換し、A600=0.6に達するまで37℃でインキュベートして、その後1mMイソプロピル−β−D−チオガラクトシド(IPTG)で3時間誘導した。細胞を遠心分離によって採取し、50mM Na2HPO4、pH8.0、0.3M NaCl緩衝液中で超音波処理によって溶解させた。次に溶解物を遠心分離し、HIS−Select Nickel Affinity Gel(Sigma)に負荷して、洗浄緩衝液(50mM NaH2PO4、pH8.0、0.3M NaClおよび10mMイミダゾール)で洗浄した。タンパク質を50mM Na2HPO4、pH8.0、0.3M NaClおよび250mMイミダゾール中で溶出させ、滅菌1×PBS中で一晩透析した。ヒトβ−カテニン構築物(例えば残基1〜781、138〜683、273〜684)をpGEX4T1/pGEX4T2、pET−28aおよびpET−23aにそれぞれクローニングした。Hisタグ融合タンパク質をBCL9について上述したように生成した。GSTタグ構築物については、形質転換した大腸菌BL21(DE3)を37℃でA600=0.6まで培養し、1mM IPTGで4時間誘導した。細胞をペレット化し、再懸濁して、緩衝液A(50mMトリス、pH8.0、150MM NaCl、20%スクロース、5mMジチオトレイトール(DTT)、1mM EDTA、1mM PMSF、2mg/mlアプロチニンおよび0.7mg/mlペプスタチン)中で超音波処理した。可溶化したタンパク質をグルタチオン−セファロース4Bビーズ(GE)に吸着させ、次にこれを20mMグルタチオンを含む緩衝液A中で溶出させて、プロテアーゼ阻害剤カクテル錠剤(Roche)を添加したPBS緩衝液に対して透析した。
組換えヒトBCL9(214〜493)を、カルボキシ末端にヘキサヒスチジンタグを含むpET−23a(+)ベクター(Novagen)にクローニングした。大腸菌(E.coli)BL21(DE3)コンピテント細胞(Stratagene)を形質転換し、A600=0.6に達するまで37℃でインキュベートして、その後1mMイソプロピル−β−D−チオガラクトシド(IPTG)で3時間誘導した。細胞を遠心分離によって採取し、50mM Na2HPO4、pH8.0、0.3M NaCl緩衝液中で超音波処理によって溶解させた。次に溶解物を遠心分離し、HIS−Select Nickel Affinity Gel(Sigma)に負荷して、洗浄緩衝液(50mM NaH2PO4、pH8.0、0.3M NaClおよび10mMイミダゾール)で洗浄した。タンパク質を50mM Na2HPO4、pH8.0、0.3M NaClおよび250mMイミダゾール中で溶出させ、滅菌1×PBS中で一晩透析した。ヒトβ−カテニン構築物(例えば残基1〜781、138〜683、273〜684)をpGEX4T1/pGEX4T2、pET−28aおよびpET−23aにそれぞれクローニングした。Hisタグ融合タンパク質をBCL9について上述したように生成した。GSTタグ構築物については、形質転換した大腸菌BL21(DE3)を37℃でA600=0.6まで培養し、1mM IPTGで4時間誘導した。細胞をペレット化し、再懸濁して、緩衝液A(50mMトリス、pH8.0、150MM NaCl、20%スクロース、5mMジチオトレイトール(DTT)、1mM EDTA、1mM PMSF、2mg/mlアプロチニンおよび0.7mg/mlペプスタチン)中で超音波処理した。可溶化したタンパク質をグルタチオン−セファロース4Bビーズ(GE)に吸着させ、次にこれを20mMグルタチオンを含む緩衝液A中で溶出させて、プロテアーゼ阻害剤カクテル錠剤(Roche)を添加したPBS緩衝液に対して透析した。
実施例3.GSTプルダウンアッセイ
グルタチオン−セファロース4Bビーズ(GE)に結合した等量(0.5μM)のHisタグBCL9およびGSTタグβ−カテニンを、漸増量のHD2またはSAH−BCL9ペプチドと共にまたはペプチドなしで、最終容量1000μlのPBS中、4℃で1時間インキュベートした。タンパク質複合体を2000rpmで2分間遠心分離してペレット化し、ビーズをPBS緩衝液で4回洗浄した。次にビーズをSDS−PAGE負荷緩衝液中に取り、煮沸して、クマシー染色によって結合タンパク質を視覚化するためにSDS−PAGEを実施した。
グルタチオン−セファロース4Bビーズ(GE)に結合した等量(0.5μM)のHisタグBCL9およびGSTタグβ−カテニンを、漸増量のHD2またはSAH−BCL9ペプチドと共にまたはペプチドなしで、最終容量1000μlのPBS中、4℃で1時間インキュベートした。タンパク質複合体を2000rpmで2分間遠心分離してペレット化し、ビーズをPBS緩衝液で4回洗浄した。次にビーズをSDS−PAGE負荷緩衝液中に取り、煮沸して、クマシー染色によって結合タンパク質を視覚化するためにSDS−PAGEを実施した。
実施例4.患者試料および細胞株
Dana−Farber Cancer Institute治験審査委員会の承認に基づきMMを有する患者から骨髄標本を入手し、ヘルシンキ宣言に従ってインフォームドコンセントを得た。初代CD138+形質細胞を、記述されているように(Sukhdeo,K.et al.Proc Natl Acad Sci USA 104,7516−21(2007))磁気ビーズを使用して精製した。CRC原発腫瘍試料をBrigham and Women’s Hospitalから、この施設の治験審査委員会の方針に従って得た。実験のために十分なCRC原発腫瘍細胞を生成するため、原発腫瘍を最初にNOD/SCIDマウス(Jackson Laboratory)において皮下的に拡大させた。腫瘍が直径2cmに達した後、マウスを施設のガイドラインに従って犠死させ、皮下腫瘍異種移植片を外科用メスで細分化して、コラゲナーゼIV(Worthington Biomedical Corporation)および0.01%DNアーゼI(Sigma−Aldrich)と共に37℃で30分間インキュベートして消化し、次いでStomacher装置(Seward Laboratory Systems Inc.)を用いてさらに機械的に解離させた。試料を70μmセルストレーナーでろ過し、PBSで洗浄した。ACK溶解緩衝液(BioWhittaker,Lonza)を用いて赤血球を溶解し、生腫瘍細胞をFicoll−Paque勾配遠心分離(GE Healthcare)によって濃縮した。生腫瘍細胞だけを精製するため、試料をAPC結合抗マウスH−2Kd抗体(クローンSF1−1.1.1、eBioscience)、FITC結合抗ヒトEpCAM抗体(クローンBer−EP4,Dako)およびHoechst 33258(Sigma−Aldrich)で処理し、次にFACSAriaフローソーティング(BD Biosciences)を用いてEpCAM陽性、H−2Kd陰性およびHoechst陰性原発腫瘍細胞を単離した。培養した細胞株を以前に記述されているように(Mani,M.et al.Cancer Res 69,7577−86(2009))維持した。図3b、3dの結果参照。
Dana−Farber Cancer Institute治験審査委員会の承認に基づきMMを有する患者から骨髄標本を入手し、ヘルシンキ宣言に従ってインフォームドコンセントを得た。初代CD138+形質細胞を、記述されているように(Sukhdeo,K.et al.Proc Natl Acad Sci USA 104,7516−21(2007))磁気ビーズを使用して精製した。CRC原発腫瘍試料をBrigham and Women’s Hospitalから、この施設の治験審査委員会の方針に従って得た。実験のために十分なCRC原発腫瘍細胞を生成するため、原発腫瘍を最初にNOD/SCIDマウス(Jackson Laboratory)において皮下的に拡大させた。腫瘍が直径2cmに達した後、マウスを施設のガイドラインに従って犠死させ、皮下腫瘍異種移植片を外科用メスで細分化して、コラゲナーゼIV(Worthington Biomedical Corporation)および0.01%DNアーゼI(Sigma−Aldrich)と共に37℃で30分間インキュベートして消化し、次いでStomacher装置(Seward Laboratory Systems Inc.)を用いてさらに機械的に解離させた。試料を70μmセルストレーナーでろ過し、PBSで洗浄した。ACK溶解緩衝液(BioWhittaker,Lonza)を用いて赤血球を溶解し、生腫瘍細胞をFicoll−Paque勾配遠心分離(GE Healthcare)によって濃縮した。生腫瘍細胞だけを精製するため、試料をAPC結合抗マウスH−2Kd抗体(クローンSF1−1.1.1、eBioscience)、FITC結合抗ヒトEpCAM抗体(クローンBer−EP4,Dako)およびHoechst 33258(Sigma−Aldrich)で処理し、次にFACSAriaフローソーティング(BD Biosciences)を用いてEpCAM陽性、H−2Kd陰性およびHoechst陰性原発腫瘍細胞を単離した。培養した細胞株を以前に記述されているように(Mani,M.et al.Cancer Res 69,7577−86(2009))維持した。図3b、3dの結果参照。
実施例5.免疫ブロット法および共免疫沈降法
記述されているように(Sukhdeo,K.et al.Proc Natl Acad Sci USA 104,7516−21(2007))実施したウェスタンブロット法は、以下の一次抗体を使用した:BCL9(6109)(Mani,M.et al.Cancer Res 69,7577−86(2009))、BCL9(ab37305、Abcam)、B9L(AF4967、R&D Systems)、β−カテニン(CAT5−H10、Zymed)、FITC(ab19224、Abcam)、アクチン−HRP(C−11、Santa Cruz)、カスパーゼ3(No.9662、Cell Signaling)、ΙκΒα(No.9242、Cell signaling)、PARP(No.9542、Cell Signaling)、E−カドヘリン(No.3195、Cell Signaling)およびラミンB(sc−6217、Santa Cruz)。ホースラディッシュペルオキシダーゼ結合二次抗体をSanta CruzおよびSouthernBiotechより購入した。共免疫沈降法を記述されているように(Walensky,L.D.et al.Science 305,1466−70(2004))実施した。簡単に述べると、細胞を、プロテアーゼおよびホスファターゼ阻害剤を含む50mMトリス、150mM NaClおよび1% CHAPS緩衝液中で溶解させた。溶解物をプロテインA/G PLUS−アガロースビーズ(Santa Cruz Biotechnologies)で3時間前除去し、次いでそれぞれの抗体と共に4℃で一晩インキュベートした。次にアガロースA/Gビーズを4時間添加し、ペレット化して、記述されているように(Walensky,L.D.et al.Science 305,1466−70(2004))洗浄した。図1d、1h、2a、8の結果参照。
記述されているように(Sukhdeo,K.et al.Proc Natl Acad Sci USA 104,7516−21(2007))実施したウェスタンブロット法は、以下の一次抗体を使用した:BCL9(6109)(Mani,M.et al.Cancer Res 69,7577−86(2009))、BCL9(ab37305、Abcam)、B9L(AF4967、R&D Systems)、β−カテニン(CAT5−H10、Zymed)、FITC(ab19224、Abcam)、アクチン−HRP(C−11、Santa Cruz)、カスパーゼ3(No.9662、Cell Signaling)、ΙκΒα(No.9242、Cell signaling)、PARP(No.9542、Cell Signaling)、E−カドヘリン(No.3195、Cell Signaling)およびラミンB(sc−6217、Santa Cruz)。ホースラディッシュペルオキシダーゼ結合二次抗体をSanta CruzおよびSouthernBiotechより購入した。共免疫沈降法を記述されているように(Walensky,L.D.et al.Science 305,1466−70(2004))実施した。簡単に述べると、細胞を、プロテアーゼおよびホスファターゼ阻害剤を含む50mMトリス、150mM NaClおよび1% CHAPS緩衝液中で溶解させた。溶解物をプロテインA/G PLUS−アガロースビーズ(Santa Cruz Biotechnologies)で3時間前除去し、次いでそれぞれの抗体と共に4℃で一晩インキュベートした。次にアガロースA/Gビーズを4時間添加し、ペレット化して、記述されているように(Walensky,L.D.et al.Science 305,1466−70(2004))洗浄した。図1d、1h、2a、8の結果参照。
実施例6.SAH−BCL9細胞取込みおよび局在化分析
蛍光顕微鏡検査による評価のために、集細胞遠心装置(Thermo Shandon)を用いて細胞を調製し、以前に記述されているように(Sukhdeo,K.et al.Proc Natl Acad Sci USA 104,7516−21(2007);Mani,M.et al.Cancer Res 69,7577−86(2009))固定した。抗β−カテニンおよびローダミン結合二次抗体(5μg/ml;Southern Biotechnology)を使用した。BioRad Radiance 2000レーザー走査共焦点顕微鏡を用いて画像を得た。SAH−BCL9BおよびSAH−BCL9B(R359E)の細胞透過性を、上述したステープルペプチドの FITC誘導体で処理した細胞の蛍光顕微鏡検査によって、およびまた以前に記述されているように(Pitter,K.et al.Methods Enzymol,446,(2008),387−408;Walensky,L.D.et al.Science 305,1466−70(2004))実施したブロット法/蛍光走査によって測定した。図1e、7の結果参照。
蛍光顕微鏡検査による評価のために、集細胞遠心装置(Thermo Shandon)を用いて細胞を調製し、以前に記述されているように(Sukhdeo,K.et al.Proc Natl Acad Sci USA 104,7516−21(2007);Mani,M.et al.Cancer Res 69,7577−86(2009))固定した。抗β−カテニンおよびローダミン結合二次抗体(5μg/ml;Southern Biotechnology)を使用した。BioRad Radiance 2000レーザー走査共焦点顕微鏡を用いて画像を得た。SAH−BCL9BおよびSAH−BCL9B(R359E)の細胞透過性を、上述したステープルペプチドの FITC誘導体で処理した細胞の蛍光顕微鏡検査によって、およびまた以前に記述されているように(Pitter,K.et al.Methods Enzymol,446,(2008),387−408;Walensky,L.D.et al.Science 305,1466−70(2004))実施したブロット法/蛍光走査によって測定した。図1e、7の結果参照。
実施例7.組織病理学的分析および免疫組織化学
組織切片を記述されているように(Sukhdeo,K.et al.Proc Natl Acad Sci USA 104,7516−21(2007))処理した。切片を一次抗体(5μg/ml)または免疫前血清の対応するIgG画分と共にブロッキング溶液(3%BSA/PBS)中4℃で一晩インキュベートした。BCL9抗体(ab37305、Abcam)、マウスCD34抗体(RAM34、eBiosciences)、ヒトCD34抗体(M7165、Dako)およびヒトCD44H抗体(2C5、R&D Systems)を使用した。CRCおよびMMモデルにおける血管形成を、それぞれ抗マウスCD34抗体および抗ヒトCD34抗体ならびにストレプトアビジンペルオキシダーゼに結合した対応するビオチン化抗体(Vector)を使用して評価した。CD34染色(褐色)によって強調した50x倍率での5つの無作為に選択した視野において独立した血管の平均数を数えることによって血管の数を決定した。図4b、4e、4iおよび6の結果参照。
組織切片を記述されているように(Sukhdeo,K.et al.Proc Natl Acad Sci USA 104,7516−21(2007))処理した。切片を一次抗体(5μg/ml)または免疫前血清の対応するIgG画分と共にブロッキング溶液(3%BSA/PBS)中4℃で一晩インキュベートした。BCL9抗体(ab37305、Abcam)、マウスCD34抗体(RAM34、eBiosciences)、ヒトCD34抗体(M7165、Dako)およびヒトCD44H抗体(2C5、R&D Systems)を使用した。CRCおよびMMモデルにおける血管形成を、それぞれ抗マウスCD34抗体および抗ヒトCD34抗体ならびにストレプトアビジンペルオキシダーゼに結合した対応するビオチン化抗体(Vector)を使用して評価した。CD34染色(褐色)によって強調した50x倍率での5つの無作為に選択した視野において独立した血管の平均数を数えることによって血管の数を決定した。図4b、4e、4iおよび6の結果参照。
実施例8.定量的逆転写PCR
製造者のプロトコールに従ってTRIzol試薬(Invitrogen)でRNAを抽出した。全RNA(2μg)を逆転写し(Superscript VILO cDNA合成キット、Invitrogen)、Applied Biosynthesis 7500リアルタイムPCRシステムを用いてqPCRを実施した。標的遺伝子の分析を、POWER SYBR Green Master Mix(Applied Biosystems)を先に述べたプライマーセットと共に使用して四重に実施した。転写産物レベルをβ−アクチン発現に規準化した。これらの実験を3回反復した。図2b、2cの結果参照。
製造者のプロトコールに従ってTRIzol試薬(Invitrogen)でRNAを抽出した。全RNA(2μg)を逆転写し(Superscript VILO cDNA合成キット、Invitrogen)、Applied Biosynthesis 7500リアルタイムPCRシステムを用いてqPCRを実施した。標的遺伝子の分析を、POWER SYBR Green Master Mix(Applied Biosystems)を先に述べたプライマーセットと共に使用して四重に実施した。転写産物レベルをβ−アクチン発現に規準化した。これらの実験を3回反復した。図2b、2cの結果参照。
実施例9.遺伝子発現プロファイリング
SAH−BCL9Bおよびビヒクル(0.1%DMSO)で処理した細胞からのRNAを、記述されているように(Mollering et al.,Nature 462,182−8(2009))Affymetrix U133A 2.0アレイチップ上で移動させた。統計解析をR(http://www.r−project.org)において実施した。アレイデータを、Affyパッケージ(http://www.bioconductor.Org/packages/2.6/bioc/html/affy.html)で実行されるようにrma法(Bolstad,B.M.,et al..Bioinformatics 19,185−93(2003))で基準化し、LIMMA(http://www.bioconductor.Org/packages/2.6/bioc/html/limma.html)により一般値へと向かう標準誤差の経験的ベイズ収縮を用いて区別的発現を算定した(McCarthy,D.J.&Smyth,G.K.Bioinformatics 25,765−71(2009);Smyth,G.K.Stat Appl Genet Mol Biol 3,Article3(2004))。遺伝子セットの濃縮分析を、GSEAソフトウェア(バージョン2.06)およびmSigDB(バージョン2.5)を用いて実施した(Subramanian,A.et al.Proc Natl Acad Sci USA 102,15545−50(2005))。
SAH−BCL9Bおよびビヒクル(0.1%DMSO)で処理した細胞からのRNAを、記述されているように(Mollering et al.,Nature 462,182−8(2009))Affymetrix U133A 2.0アレイチップ上で移動させた。統計解析をR(http://www.r−project.org)において実施した。アレイデータを、Affyパッケージ(http://www.bioconductor.Org/packages/2.6/bioc/html/affy.html)で実行されるようにrma法(Bolstad,B.M.,et al..Bioinformatics 19,185−93(2003))で基準化し、LIMMA(http://www.bioconductor.Org/packages/2.6/bioc/html/limma.html)により一般値へと向かう標準誤差の経験的ベイズ収縮を用いて区別的発現を算定した(McCarthy,D.J.&Smyth,G.K.Bioinformatics 25,765−71(2009);Smyth,G.K.Stat Appl Genet Mol Biol 3,Article3(2004))。遺伝子セットの濃縮分析を、GSEAソフトウェア(バージョン2.06)およびmSigDB(バージョン2.5)を用いて実施した(Subramanian,A.et al.Proc Natl Acad Sci USA 102,15545−50(2005))。
実施例10.細胞増殖、生存能アッセイおよびアポトーシスの検出
細胞増殖アッセイを記述されているように(Sukhdeo,K.et al.Proc Natl Acad Sci USA 104,7516−21(2007))実施した。CellTiter−Gloアッセイ(Promega)を製造者の指示に従って使用して細胞生存能を測定した。アポトーシスは、活性化カスパーゼ3およびPARPウェスタンブロット法によって評価した。図3a〜f、13および20の結果参照。
細胞増殖アッセイを記述されているように(Sukhdeo,K.et al.Proc Natl Acad Sci USA 104,7516−21(2007))実施した。CellTiter−Gloアッセイ(Promega)を製造者の指示に従って使用して細胞生存能を測定した。アポトーシスは、活性化カスパーゼ3およびPARPウェスタンブロット法によって評価した。図3a〜f、13および20の結果参照。
実施例11.血管新生および浸潤アッセイ
血管新生を、インビトロ血管新生アッセイキット(Millipore)を使用して以前に記述されているように(Mani,M.et al.Cancer Res 69,7577−86(2009))評価した。毛細管形成分析のために、HUVECを重合マトリックスゲル上で培養し、ビヒクル(0.5%DMSO)、SAH−BCL9Bペプチド(5μΜ)で24時間処理したColo320またはMM1S細胞から収集した上清培地に曝露した。37℃で5時間の処理後に形成された毛細管の数を、製造者の指示に従って40x倍率で5つの無作為に選択した視野を数えることによって測定した。VEGF培地およびVEGF不含培地で培養したHUVECをそれぞれ陽性対照および陰性対照として使用した。細胞浸潤アッセイは、記述されているように(Mani,M.et al.Cancer Res 69,7577−86(2009))Matrigelボイデンチャンバー(BD Biosciences)を使用して実施した。報告するデータは、三重に実施した3つの独立した実験の平均である。図3h〜3iの結果参照。
血管新生を、インビトロ血管新生アッセイキット(Millipore)を使用して以前に記述されているように(Mani,M.et al.Cancer Res 69,7577−86(2009))評価した。毛細管形成分析のために、HUVECを重合マトリックスゲル上で培養し、ビヒクル(0.5%DMSO)、SAH−BCL9Bペプチド(5μΜ)で24時間処理したColo320またはMM1S細胞から収集した上清培地に曝露した。37℃で5時間の処理後に形成された毛細管の数を、製造者の指示に従って40x倍率で5つの無作為に選択した視野を数えることによって測定した。VEGF培地およびVEGF不含培地で培養したHUVECをそれぞれ陽性対照および陰性対照として使用した。細胞浸潤アッセイは、記述されているように(Mani,M.et al.Cancer Res 69,7577−86(2009))Matrigelボイデンチャンバー(BD Biosciences)を使用して実施した。報告するデータは、三重に実施した3つの独立した実験の平均である。図3h〜3iの結果参照。
実施例12.SAH−BCL9Bのインビボ抗腫瘍作用(異種移植モデル)
GFP陽性Colo320細胞を、以前に報告されているように(Mani,M.et al.Cancer Res 69,7577−86(2009))作製した。細胞をペレット化し、滅菌1×PBSに再懸濁して、5週齢の致死量以下に照射したNOD.CB17−PrkdcSCID/Jマウス(Jackson Laboratory)(コホートにつきn=6)に腹腔内注射した(1×106細胞/マウス)。細胞接種の2日後、マウスを1日おきに合計6回投与にわたってビヒクル(D5W中2.5%DMSO)またはSAH−BCL9ペプチド(20mg/kg)の腹腔内注射により処置した。腫瘍細胞注射の40日後、マウスを安楽死させ、ImageQuant LAS−4000(GE Healthcare)を用いてGFP陽性腫瘍を視覚化した。各々の実験動物について完全な剖検を実施し、腫瘍転移の定量化のために肝臓全体を5mm間隔で切片化した。組織をH&E染色および抗CD34および抗CD44抗体を使用した免疫組織化学分析に供した。
GFP陽性Colo320細胞を、以前に報告されているように(Mani,M.et al.Cancer Res 69,7577−86(2009))作製した。細胞をペレット化し、滅菌1×PBSに再懸濁して、5週齢の致死量以下に照射したNOD.CB17−PrkdcSCID/Jマウス(Jackson Laboratory)(コホートにつきn=6)に腹腔内注射した(1×106細胞/マウス)。細胞接種の2日後、マウスを1日おきに合計6回投与にわたってビヒクル(D5W中2.5%DMSO)またはSAH−BCL9ペプチド(20mg/kg)の腹腔内注射により処置した。腫瘍細胞注射の40日後、マウスを安楽死させ、ImageQuant LAS−4000(GE Healthcare)を用いてGFP陽性腫瘍を視覚化した。各々の実験動物について完全な剖検を実施し、腫瘍転移の定量化のために肝臓全体を5mm間隔で切片化した。組織をH&E染色および抗CD34および抗CD44抗体を使用した免疫組織化学分析に供した。
ヒトMMのSCID−huマウスモデルのために、1.5×0.5cmと測定されるヒト胎児骨移植片を、以前に記述されているように(Tassone,P.et al.Blood 106,713−6(2005))8週齢の雄性CB−17 SCIDマウス(Taconic)に皮下移植した。骨移植の4週間後、5×106GFP陽性IΝΑ−6 MM細胞を各骨移植片に直接注入した。2日後、マウスを1日おきに合計10回投与にわたって、骨片に隣接して注入したビヒクル(D5W中2.5%DMSO)またはSAH−BCL9ペプチド(5mg/kg)1000μlの注射により処置した。マウス血清をELISA(R&DSystems)によってshuIL−6Rレベルに関して連続的に観測した。腫瘍細胞注入の33日後、マウスを犠死させ、骨移植片の蛍光イメージングおよび組織学的分析によって腫瘍量を分析した。図4a〜iの結果参照。加えて、マウスから得た試料に関してTUNEL染色を実施した。結果は、ビヒクルまたはSAH−BCL9MUT処置マウスと比較してSAH−BCL9Bで処置した動物ではアポトーシス腫瘍細胞の増加が存在することを明らかにした。図22および23の結果参照。すべての動物実験は、Dana−Farber Cancer Institute動物実験委員会の承認済みプロトコールに従って実施した。
実施例13.Wntレポーター活性へのSAH−BCL9Bのインビボ作用
HCT116細胞にpOT−Lucプラスミドまたは対照UbC−Lucプラスミドをトランスフェクトした。HCT116−pOT−Luc細胞をマウス(n=2)の左側腹部に移植し、および構成的UbC−Luc対照細胞を右側腹部に移植した。動物に基線イメージングを行い、次いでSAH−BCL9BまたはSAH−BCL9B(R359E)を注射して、指示されている時点で連続的に画像撮影した。pOT−Lucレポーター活性をUbC−Luc活性に基準化した。図9の結果参照。
HCT116細胞にpOT−Lucプラスミドまたは対照UbC−Lucプラスミドをトランスフェクトした。HCT116−pOT−Luc細胞をマウス(n=2)の左側腹部に移植し、および構成的UbC−Luc対照細胞を右側腹部に移植した。動物に基線イメージングを行い、次いでSAH−BCL9BまたはSAH−BCL9B(R359E)を注射して、指示されている時点で連続的に画像撮影した。pOT−Lucレポーター活性をUbC−Luc活性に基準化した。図9の結果参照。
実施例14.VEGF ELISA
以前に記述されているように(Mani,M.et al.Cancer Res 69,7577−86(2009))VEGF ELISAを実施した。簡単に述べると、細胞(1×106)をビヒクルおよびSAH−BCL9ペプチド(5μΜ)で24時間処理した。次に上清中のVEGFレベルを製造者のELISAプロトコール(DuoSet,R&D Systems)に従って測定した。
以前に記述されているように(Mani,M.et al.Cancer Res 69,7577−86(2009))VEGF ELISAを実施した。簡単に述べると、細胞(1×106)をビヒクルおよびSAH−BCL9ペプチド(5μΜ)で24時間処理した。次に上清中のVEGFレベルを製造者のELISAプロトコール(DuoSet,R&D Systems)に従って測定した。
実施例15.クロマチン免疫沈降(ChIP)およびポリメラーゼ連鎖反応(PCR)
抗体(3μg)をプロテインAおよびプロテインG Dynal磁気ビーズ(Dynal Biotech,Norway)に8時間、前結合させ、5%BSAを含む氷冷PBSで5回洗浄して、次に以下の抗体を使用した一晩免疫沈降のために希釈したクロマチンに添加した:TCF−4(Upstate No.05−511)、マウスIgG2aアイソタイプ対照(Sigma、M5409)およびウサギIgG(sc−2027、Santa Cruz)。磁気ビーズ−クロマチン複合体を収集し、RIPA緩衝液(50mM HEPES[pH7.6]、1mM EDTA、0.7%デオキシコール酸ナトリウム、1%NP−40、0.5M LiCl)中で6回洗浄した。DNAを以前に記述されているように(Clevers,H.Cell 127,469−80(2006))ビーズから溶出させた。94℃で5分の初期変性後、以下の温度および時間プロフィールを使用した30サイクルのPCRにより、PTC−200プログラマブルサーマルコントローラ(MJ Research)で増幅を実施した:94℃、0.5分の変性、59℃、0.5分のプライマーアニーリング、72℃、0.5分のプライマー伸長および72℃、10分間の最終伸長。PCR産物を2%ゲル電気泳動によって視覚化した。以下のプロモータープライマーセットを使用した:(1)VEGF:F(順方向):5’−gcgtgtctctggacagagttt−3’およびR(逆方向):5’−agcctcagcccttccaca−3’;(2)VEGF上流:F:5’−gaggctatgccagctgtagg−3’およびR:5’−cccttttcctccaactctcc−3’;(3)c−Myc:F:5’−actcccccggctcggtccacaagc−3’およびR:5’−cccaatttctcagccaggtttcag−3’(Klaus,A.& Birchmeier,W.Nat Rev Cancer 8,387−98(2008))。図11aの結果参照。
抗体(3μg)をプロテインAおよびプロテインG Dynal磁気ビーズ(Dynal Biotech,Norway)に8時間、前結合させ、5%BSAを含む氷冷PBSで5回洗浄して、次に以下の抗体を使用した一晩免疫沈降のために希釈したクロマチンに添加した:TCF−4(Upstate No.05−511)、マウスIgG2aアイソタイプ対照(Sigma、M5409)およびウサギIgG(sc−2027、Santa Cruz)。磁気ビーズ−クロマチン複合体を収集し、RIPA緩衝液(50mM HEPES[pH7.6]、1mM EDTA、0.7%デオキシコール酸ナトリウム、1%NP−40、0.5M LiCl)中で6回洗浄した。DNAを以前に記述されているように(Clevers,H.Cell 127,469−80(2006))ビーズから溶出させた。94℃で5分の初期変性後、以下の温度および時間プロフィールを使用した30サイクルのPCRにより、PTC−200プログラマブルサーマルコントローラ(MJ Research)で増幅を実施した:94℃、0.5分の変性、59℃、0.5分のプライマーアニーリング、72℃、0.5分のプライマー伸長および72℃、10分間の最終伸長。PCR産物を2%ゲル電気泳動によって視覚化した。以下のプロモータープライマーセットを使用した:(1)VEGF:F(順方向):5’−gcgtgtctctggacagagttt−3’およびR(逆方向):5’−agcctcagcccttccaca−3’;(2)VEGF上流:F:5’−gaggctatgccagctgtagg−3’およびR:5’−cccttttcctccaactctcc−3’;(3)c−Myc:F:5’−actcccccggctcggtccacaagc−3’およびR:5’−cccaatttctcagccaggtttcag−3’(Klaus,A.& Birchmeier,W.Nat Rev Cancer 8,387−98(2008))。図11aの結果参照。
実施例16.VEGFプロモータールシフェラーゼアッセイ
VEGFプロモーター駆動性ルシフェラーゼ構築物(2.6kb)は、Soumitro Pal(Transplantation Research Center,Children’s Hospital BostonおよびBrigham and Women’s Hospital)の好意により提供された(Basu,A.et al.Cancer Res 68,5689−98(2008))。FuGENEトランスフェクション試薬(Roche)を使用して細胞にVEGFルシフェラーゼ構築物をトランスフェクトし、以前に記述されているように(Sukhdeo,K.et al.Proc Natl Acad Sci USA 104,7516−21(2007))、Dual Luciferase Reporter Assay System(Promega)を使用してルシフェラーゼ活性を測定した。図11bの結果参照。
VEGFプロモーター駆動性ルシフェラーゼ構築物(2.6kb)は、Soumitro Pal(Transplantation Research Center,Children’s Hospital BostonおよびBrigham and Women’s Hospital)の好意により提供された(Basu,A.et al.Cancer Res 68,5689−98(2008))。FuGENEトランスフェクション試薬(Roche)を使用して細胞にVEGFルシフェラーゼ構築物をトランスフェクトし、以前に記述されているように(Sukhdeo,K.et al.Proc Natl Acad Sci USA 104,7516−21(2007))、Dual Luciferase Reporter Assay System(Promega)を使用してルシフェラーゼ活性を測定した。図11bの結果参照。
実施例17.レンチウイルスベクター
7つのTCF/LEF−1結合モチーフおよび脱安定化されたGFP発現を駆動する最小プロモーターを含むレンチウイルスレポーターベクター(7xTdG)を、3つのTCF/LEF−1結合モチーフを含むレンチウイルスベクターTOP−dGFPから誘導した(Sukhdeo,K.et al.Proc Natl Acad Sci USA 104,7516−21(2007))。Xba1制限部位にアニーリングするための適合性突出末端を作製するために、4つのTCF/LEF−1結合モチーフ(GATCAAAGG)を含む2つの合成相補的オリゴヌクレオチド(IDT−DNA)を設計した。オリゴヌクレオチドを95℃に加熱し、室温まで緩やかに冷却することによってアニーリングして、次にXba1で直線化したTOP−dGFPベクターに連結し、7xTdGを生成した。7つのFOP部位を担持する対照ベクター(7xFdG)を構築するため、Xma1およびAge1で制限消化することによって7xTOPカセットを7xTdGベクターから除去した。7つのFOP部位を担持するが、さもなければ除去された7xTOPカセットと同一である合成カセット(GGCCAAAGG)を挿入し、7xFdGを生成した。BCL9 shRNAおよび対照shRNAレンチウイルスベクターを、報告されているように(Sampietro,J.et al.Mol Cell 24,293−300(2006))作製した。図10、11bの結果参照。
7つのTCF/LEF−1結合モチーフおよび脱安定化されたGFP発現を駆動する最小プロモーターを含むレンチウイルスレポーターベクター(7xTdG)を、3つのTCF/LEF−1結合モチーフを含むレンチウイルスベクターTOP−dGFPから誘導した(Sukhdeo,K.et al.Proc Natl Acad Sci USA 104,7516−21(2007))。Xba1制限部位にアニーリングするための適合性突出末端を作製するために、4つのTCF/LEF−1結合モチーフ(GATCAAAGG)を含む2つの合成相補的オリゴヌクレオチド(IDT−DNA)を設計した。オリゴヌクレオチドを95℃に加熱し、室温まで緩やかに冷却することによってアニーリングして、次にXba1で直線化したTOP−dGFPベクターに連結し、7xTdGを生成した。7つのFOP部位を担持する対照ベクター(7xFdG)を構築するため、Xma1およびAge1で制限消化することによって7xTOPカセットを7xTdGベクターから除去した。7つのFOP部位を担持するが、さもなければ除去された7xTOPカセットと同一である合成カセット(GGCCAAAGG)を挿入し、7xFdGを生成した。BCL9 shRNAおよび対照shRNAレンチウイルスベクターを、報告されているように(Sampietro,J.et al.Mol Cell 24,293−300(2006))作製した。図10、11bの結果参照。
実施例18.レンチウイルスの生成および感染
HEK293T細胞を10cmの組織培養皿に塗布し、製造者のプロトコールに従ってLipoD293(Signagen)60μLを使用してレンチウイルスベクター10μg(7xTdGまたは7xFdGのいずれか)、pCMV−dR8.91 10μgおよびpMD2.G 2μg(Naldini et al,PNAS,1996)を同時トランスフェクトした。培地を12時間後にDMEM(Gibco)を含む30%FCSと交換し、36時間順化させた。次に順化培地を0.45μmシリンジフィルター(Millipore)でろ過し、新鮮DMEMと1:1混合して、その後、培養したColo320(ATCC)細胞の感染のために直接使用した。感染の効率を高めるためにポリブレン(Sigma)を8μg/mLの最終濃度まで添加した。ノックダウンBCL9発現物へのレンチウイルスshRNA感染を以前に記述されているように(Logan,C.Y.& Nusse,R.Annu Rev Cell Dev Biol 20,781−810(2004))実施した。簡単に述べると、組換えBCL9 shRNAおよび対照レンチウイルスを293T細胞の一過性トランスフェクションによって生成した。Colo320にポリブレンを含むウイルス上清で形質導入し、GFP発現細胞をFACSによって選別した。図10、11bの結果参照。
HEK293T細胞を10cmの組織培養皿に塗布し、製造者のプロトコールに従ってLipoD293(Signagen)60μLを使用してレンチウイルスベクター10μg(7xTdGまたは7xFdGのいずれか)、pCMV−dR8.91 10μgおよびpMD2.G 2μg(Naldini et al,PNAS,1996)を同時トランスフェクトした。培地を12時間後にDMEM(Gibco)を含む30%FCSと交換し、36時間順化させた。次に順化培地を0.45μmシリンジフィルター(Millipore)でろ過し、新鮮DMEMと1:1混合して、その後、培養したColo320(ATCC)細胞の感染のために直接使用した。感染の効率を高めるためにポリブレン(Sigma)を8μg/mLの最終濃度まで添加した。ノックダウンBCL9発現物へのレンチウイルスshRNA感染を以前に記述されているように(Logan,C.Y.& Nusse,R.Annu Rev Cell Dev Biol 20,781−810(2004))実施した。簡単に述べると、組換えBCL9 shRNAおよび対照レンチウイルスを293T細胞の一過性トランスフェクションによって生成した。Colo320にポリブレンを含むウイルス上清で形質導入し、GFP発現細胞をFACSによって選別した。図10、11bの結果参照。
実施例19.単細胞培養物の樹立
Colo320細胞を7xTdGまたは7xFdGレンチウイルスによる72時間の感染に供し、形質導入した細胞と対照非形質導入細胞をトリプシン処理して、洗浄し、次にFACSariaフローソーターで分析した。Hoechst 33258染色を使用して死細胞を除外した。単一GFP陽性Colo320−7xTdG細胞を、二重項を排除するために前方/側方散乱の高さおよび幅に関する厳密なゲーティングを使用して96穴プレートに選別した。選別後、ウェル当たりの単細胞の存在を顕微鏡で確認し、次に単細胞培養物をその後の使用のために増殖させた。図11bの結果参照。
Colo320細胞を7xTdGまたは7xFdGレンチウイルスによる72時間の感染に供し、形質導入した細胞と対照非形質導入細胞をトリプシン処理して、洗浄し、次にFACSariaフローソーターで分析した。Hoechst 33258染色を使用して死細胞を除外した。単一GFP陽性Colo320−7xTdG細胞を、二重項を排除するために前方/側方散乱の高さおよび幅に関する厳密なゲーティングを使用して96穴プレートに選別した。選別後、ウェル当たりの単細胞の存在を顕微鏡で確認し、次に単細胞培養物をその後の使用のために増殖させた。図11bの結果参照。
実施例20.クロマチン免疫沈降
抗体(3μg)をプロテインAおよびプロテインG Dynal磁気ビーズ(Dynal Biotech,Norway)に8時間、前結合させ、5%BSAを含む氷冷PBSで5回洗浄して、次に以下の抗体を使用した一晩免疫沈降のために希釈したクロマチンに添加した:TCF−4(Upstate No.05−511)、マウスIgG2aアイソタイプ対照(Sigma、M5409)およびウサギIgG(sc−2027、Santa Cruz)。磁気ビーズ−クロマチン複合体を収集し、RIPA緩衝液(50mM HEPES[pH7.6]、1mM EDTA、0.7%デオキシコール酸ナトリウム、1%NP−40、0.5M LiCl)中で6回洗浄した。DNAを以前に記述されているように(Clevers,H.Cell 127,469−80(2006))ビーズから溶出させた。94℃で5分の初期変性後、以下の温度および時間プロフィールを使用した30サイクルのPCRにより、PTC−200プログラマブルサーマルコントローラ(MJ Research)で増幅を実施した:94℃、0.5分の変性、59℃、0.5分のプライマーアニーリング、72℃、0.5分のプライマー伸長および72℃、10分間の最終伸長。PCR産物を2%ゲル電気泳動によって視覚化した。以下のプロモータープライマーセットを使用した:(1)VEGFB:F(順方向):5’−gcgtgtctctggacagagttt−3’およびR(逆方向):5’−agcctcagcccttccaca−3’;(2)VEGF上流:F:5’−gaggctatgccagctgtagg−3’およびR:5’−cccttttcctccaactctcc−3’;(3)c−Myc:F:5’−actcccccggctcggtccacaagc−3’およびR:5’−cccaatttctcagccaggtttcag−3’。図11aの結果参照。
抗体(3μg)をプロテインAおよびプロテインG Dynal磁気ビーズ(Dynal Biotech,Norway)に8時間、前結合させ、5%BSAを含む氷冷PBSで5回洗浄して、次に以下の抗体を使用した一晩免疫沈降のために希釈したクロマチンに添加した:TCF−4(Upstate No.05−511)、マウスIgG2aアイソタイプ対照(Sigma、M5409)およびウサギIgG(sc−2027、Santa Cruz)。磁気ビーズ−クロマチン複合体を収集し、RIPA緩衝液(50mM HEPES[pH7.6]、1mM EDTA、0.7%デオキシコール酸ナトリウム、1%NP−40、0.5M LiCl)中で6回洗浄した。DNAを以前に記述されているように(Clevers,H.Cell 127,469−80(2006))ビーズから溶出させた。94℃で5分の初期変性後、以下の温度および時間プロフィールを使用した30サイクルのPCRにより、PTC−200プログラマブルサーマルコントローラ(MJ Research)で増幅を実施した:94℃、0.5分の変性、59℃、0.5分のプライマーアニーリング、72℃、0.5分のプライマー伸長および72℃、10分間の最終伸長。PCR産物を2%ゲル電気泳動によって視覚化した。以下のプロモータープライマーセットを使用した:(1)VEGFB:F(順方向):5’−gcgtgtctctggacagagttt−3’およびR(逆方向):5’−agcctcagcccttccaca−3’;(2)VEGF上流:F:5’−gaggctatgccagctgtagg−3’およびR:5’−cccttttcctccaactctcc−3’;(3)c−Myc:F:5’−actcccccggctcggtccacaagc−3’およびR:5’−cccaatttctcagccaggtttcag−3’。図11aの結果参照。
実施例21.レポーターアッセイ
以前に記述されているように(Sukhdeo,K.et al.Proc Natl Acad Sci USA 104,7516−21(2007))Dual Luciferase Reporter Assay System(Promega)を使用してルシフェラーゼ活性を測定した。WntまたはNFκBレポーター活性を測定するため、Colo320細胞にTOP−FLASH、FOP−FLASHプラスミド(Millipore Corporation)またはNFκBルシフェラーゼレポーター(Stratagene)を、内部ウミシイタケ対照プラスミド(hRL−null)と共にトランスフェクトした。FuGENE(Roche)を製造者のプロトコールに従って使用してトランスフェクションを実施した。結果を対照ウミシイタケ活性に規準化した。報告するデータは、三重に実施した3つの独立したトランスフェクション実験の平均である。図9、10の結果参照。
以前に記述されているように(Sukhdeo,K.et al.Proc Natl Acad Sci USA 104,7516−21(2007))Dual Luciferase Reporter Assay System(Promega)を使用してルシフェラーゼ活性を測定した。WntまたはNFκBレポーター活性を測定するため、Colo320細胞にTOP−FLASH、FOP−FLASHプラスミド(Millipore Corporation)またはNFκBルシフェラーゼレポーター(Stratagene)を、内部ウミシイタケ対照プラスミド(hRL−null)と共にトランスフェクトした。FuGENE(Roche)を製造者のプロトコールに従って使用してトランスフェクションを実施した。結果を対照ウミシイタケ活性に規準化した。報告するデータは、三重に実施した3つの独立したトランスフェクション実験の平均である。図9、10の結果参照。
実施例22.SAH−BCL9BによるBCL9/β−カテニン複合体の選択的解離
ELISAによって結合を評価するため、グルタチオンマイクロタイタープレート(Pierce)を、ウェルにつきELISA緩衝液(PBS、1%BSA、0.05%Tween−20)100μL中の組換えGST−β−カテニン50ngと共に37℃で1時間インキュベートして回転させ(200rpm)、次いでPBS、0.05%Tween−20による4サイクルの自動プレート洗浄に供した。ELISA緩衝液中のFITC結合ペプチドの2倍段階希釈物を別の96穴プレートにおいて調製し、β−カテニン結合プレートに移した(100μL)。実験プレートを37℃で2時間インキュベートし(200rpm)、自動プレート洗浄に供して、次にELISA緩衝液中の抗FITC結合HRPの1:7500希釈物100μLを各ウェルに移して、37℃でさらに1時間インキュベートし(200rpm)、次いで自動プレート洗浄を行った。テトラメチルベンジジン(TMB)溶液50μLを添加することによってウェルを発色させ、室温で20分間インキュベートして、その後2M H2SO4 50μLで反応を停止させた。マイクロプレートリーダー(Molecular Devices)で450nmの吸光度を読み取り、結合等温線をプロットして、Prismソフトウェア(GraphPad)を用いた非線形回帰分析によってEC50値を決定した。結合アッセイを三重に実施し、新鮮調製した組換えタンパク質を用いて少なくとも2回反復した。天然β−カテニンを免疫沈降させるFITC−SAH−BCL9MUT(SAH−BCL9B(R359E))の能力低下と一致して(図1H参照)、R359E点突然変異誘発は組換えβ−カテニンタンパク質への直接結合活性の5倍低下を生じさせた。図17Aの結果参照。
ELISAによって結合を評価するため、グルタチオンマイクロタイタープレート(Pierce)を、ウェルにつきELISA緩衝液(PBS、1%BSA、0.05%Tween−20)100μL中の組換えGST−β−カテニン50ngと共に37℃で1時間インキュベートして回転させ(200rpm)、次いでPBS、0.05%Tween−20による4サイクルの自動プレート洗浄に供した。ELISA緩衝液中のFITC結合ペプチドの2倍段階希釈物を別の96穴プレートにおいて調製し、β−カテニン結合プレートに移した(100μL)。実験プレートを37℃で2時間インキュベートし(200rpm)、自動プレート洗浄に供して、次にELISA緩衝液中の抗FITC結合HRPの1:7500希釈物100μLを各ウェルに移して、37℃でさらに1時間インキュベートし(200rpm)、次いで自動プレート洗浄を行った。テトラメチルベンジジン(TMB)溶液50μLを添加することによってウェルを発色させ、室温で20分間インキュベートして、その後2M H2SO4 50μLで反応を停止させた。マイクロプレートリーダー(Molecular Devices)で450nmの吸光度を読み取り、結合等温線をプロットして、Prismソフトウェア(GraphPad)を用いた非線形回帰分析によってEC50値を決定した。結合アッセイを三重に実施し、新鮮調製した組換えタンパク質を用いて少なくとも2回反復した。天然β−カテニンを免疫沈降させるFITC−SAH−BCL9MUT(SAH−BCL9B(R359E))の能力低下と一致して(図1H参照)、R359E点突然変異誘発は組換えβ−カテニンタンパク質への直接結合活性の5倍低下を生じさせた。図17Aの結果参照。
Wntシグナル伝達の遮断のために必要な生物学的活性である、あらかじめ形成したBCL9/β−カテニン複合体を破壊するSAH−BCL9の能力を評価するため、カルボキシ末端にヘキサヒスチジンタグを含むpET−23a(+)ベクターにクローニングした組換えヒトBCL9(残基243〜469)(His−BCL9)およびアミノ末端グルタチオン−S−トランスフェラーゼ(GST)タグを有するpGEX−4T−1ベクターにクローニングした完全長ヒトβ−カテニン(組換えGST−β−カテニン)を発現させ、以前に報告されているように(J.Sampietro et al.,Mol Cell 24,293(2006))精製した。グルタチオン−セファロース4Bビーズ(GE)に結合したGSTタグβ−カテニン及び等量(1nM)のHisタグBCL9を、アッセイ緩衝液(100mM Na2PO4[pH7.4]、100μg/mLウシ血清アルブミン、0.01%Triton X−100および4%DMSO)中4℃で一晩インキュベートした。ビーズに固定化したGSTタグβ−カテニンに結合したHisタグBCL9の複合体を遠心分離によって単離し、アッセイ緩衝液1mLに再懸濁して、スラリー50μLをアッセイ緩衝液500μl中のSAH−BCL9BまたはSAH−BCL9MUT(SAH−BCL9B(R359E))の存在下または不在下に室温で2時間インキュベートした。グルタチオンビーズ結合タンパク質を遠心分離によって2回洗浄し、溶出させて、ゲル電気泳動によって分離した。GST−β−カテニンをクマシーブルー染色によって検出し、保持されるHis−BCL9の存在を免疫ブロット分析(抗His 23655、Cell Signaling)によって検出して、ImageJソフトウェア(msbweb.nih.gov/ij)を用いて定量化した。実験を3回反復し、同様の結果を得た。結果は、SAH−BCL9Bが135nMのIC50で複合体を用量応答的に解離することができ、一方単一点突然変異誘発は活性を6倍低下させることを明らかにした。図17Bの結果参照。
実施例23.SAH−BCL9BはWntの転写活性を阻害する
Colo320(図18)およびMM1S(図19)細胞株において、VEGFを含むWnt/β−カテニン標的遺伝子の発現へのビヒクル、SAH−BCL9BおよびSAH−BCL9MUTの作用を測定するため、定量的PCR(qRT−PCR)分析を実施した。TRIzol試薬(Invitrogen)を製造者のプロトコールに従って使用してRNAを抽出した。全RNA(2μg)を逆転写し(Superscript VILO cDNA合成キット、Invitrogen)、Applied Biosynthesis 7500リアルタイムPCRシステムを用いてqPCRを実施した。PCRプライマーを以下のように設計した:
Colo320(図18)およびMM1S(図19)細胞株において、VEGFを含むWnt/β−カテニン標的遺伝子の発現へのビヒクル、SAH−BCL9BおよびSAH−BCL9MUTの作用を測定するため、定量的PCR(qRT−PCR)分析を実施した。TRIzol試薬(Invitrogen)を製造者のプロトコールに従って使用してRNAを抽出した。全RNA(2μg)を逆転写し(Superscript VILO cDNA合成キット、Invitrogen)、Applied Biosynthesis 7500リアルタイムPCRシステムを用いてqPCRを実施した。PCRプライマーを以下のように設計した:
標的遺伝子の分析を、以前に報告されているように(M.Mani et al.,Cancer Res 69,7577(2009))POWER SYBR Green Master Mix(Applied Biosystems)を使用して四重に実施した。転写産物レベルをβ−アクチン発現に規準化した。これらの実験を3回反復した。SAH−BCL9Bでの処理は、VEGF、c−MYC、LGR5、LEF1およびアキシン2のmRNAレベルを用量応答的に低下させたが、ビヒクルまたはSAH−BCL9MUTによる処理はmRNAレベルを低下させなかった(図18Aおよび19A)。非Wnt経路標的遺伝子であるアクチンをColo320細胞における対照標準として使用し、アクチンはSAH−BCL9B処理に応答した変化を示さなかった(図18A)。Wnt標的遺伝子転写の細胞特異性と一致して、LGR5はColo320細胞において低下したが、MM1S細胞では低下しなかった。
Wnt転写活性をブロックするうえでのSAH−BCL9Bの特異性をさらに検討するため、Wnt転写経路シグネチャーが記述されている(L.G.Van der Flier et al.,Gastroenterology 132,628(2007))、DLD1結腸癌細胞株におけるWnt標的遺伝子の比較全ゲノム発現分析を実施した。3組のSAH−BCL9B処理およびビヒクル処理したDLD1試料(各々10μΜで12時間)からのRNAを遺伝子発現プロファイリング分析のために単離した。Affymetrix Human U133 Plus 2.0アレイを、affy Bioconductorパッケージ(URL http://www.R−project.org.)の機能を利用して処理した。遺伝子セットをVan der Flier et al.から収集し、遺伝子セットの濃縮および統計解析を、GSEAソフトウェア(http://www.broad.mit.edu/GSEA)および両側t検定をそれぞれ使用して実施した。マイクロアレイデータをGene Expression Omnibus(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo)に寄託し、MIAME注釈基準に従った。
Affimetrixオリゴヌクレオチドマイクロアレイを使用して作製したSAH−BCL9B処理およびビヒクル処理DLD1からの3組のデータセットを、誘導的ドミナントネガティブ形態のTCF1およびTCF4を担持するDLD1細胞からの公開されている遺伝子発現データ(L.G.Van der Flier et al.,Gastroenterology 132,628(2007))と比較した。遺伝子セット濃縮分析(GSEA)は、腺腫(図18B、ファミリーワイズエラー率(FWER)p値<0.001;偽発見率(FDR)q値<0.001)および癌腫(図18C、FWERおよびFDR<0.01)の両方においてSAH−BCL9Bによって下方調節される遺伝子とドミナントネガティブ形態のTCF1およびTCF4との間で強い、統計的に有意の相関を明らかにし、Wnt転写経路をブロックするうえでのSAH−BCL9Bの特異性を強調した。堅固で特異的なWnt標的遺伝子(3)であるアキシン2は、細胞転移(CD44、CLDN2)、細胞増殖(サイクリンA2、CDK4)およびEMT(FOXQ1)に関与する他のWnt標的に加えて、SAH−BCL9B処理によって最も下方調節される遺伝子の1つであった(図18Dおよび18E)。次にこれらの所見をqRT−PCRによって確認した(図18F)。VEGF−Aは、SAH−BCL9Bで処理した細胞において下方調節される遺伝子の1つであり(図18Fおよび19)、β−カテニン/BCL9複合体を腫瘍誘導性血管新生に関連付けた。
実施例24.併用療法
SAH−BCL9Bの抗増殖作用がMMまたはCRCを治療するために一般的に使用される他の作用物質と相乗的に作用し得るかどうかを調べるため、併用治療試験を実施した。実際に、CRC細胞への5−フルオロウラシルの細胞傷害作用およびMM細胞へのドキソルビシンの細胞傷害作用がSAH−BCL9Bによって増強されたが、ビヒクルまたは突然変異体ペプチドによっては増強されなかった。図21の結果参照。
SAH−BCL9Bの抗増殖作用がMMまたはCRCを治療するために一般的に使用される他の作用物質と相乗的に作用し得るかどうかを調べるため、併用治療試験を実施した。実際に、CRC細胞への5−フルオロウラシルの細胞傷害作用およびMM細胞へのドキソルビシンの細胞傷害作用がSAH−BCL9Bによって増強されたが、ビヒクルまたは突然変異体ペプチドによっては増強されなかった。図21の結果参照。
参考文献の組込み
本出願全体にわたって引用されるすべての参考文献(文献、発行済み特許、公開特許出願、同時係属特許出願およびGenBank番号を含む)の内容は、それらの全体が参照により本明細書に明白に組み込まれる。特に定義されない限り、本明細書で使用されるすべての技術および学術用語は、当業者に一般的に知られる意味を与えられる。
本出願全体にわたって引用されるすべての参考文献(文献、発行済み特許、公開特許出願、同時係属特許出願およびGenBank番号を含む)の内容は、それらの全体が参照により本明細書に明白に組み込まれる。特に定義されない限り、本明細書で使用されるすべての技術および学術用語は、当業者に一般的に知られる意味を与えられる。
等価物
当業者は、本明細書で述べる本発明の特定の実施形態の多くの等価物を、日常的な実験だ系を使用して認識するまたは確認することができる。そのような等価物は以下の特許請求の範囲に包含されることが意図されている。
当業者は、本明細書で述べる本発明の特定の実施形態の多くの等価物を、日常的な実験だ系を使用して認識するまたは確認することができる。そのような等価物は以下の特許請求の範囲に包含されることが意図されている。
実施例2.タンパク質の生成および精製
組換えヒトBCL9(214〜493)を、カルボキシ末端にヘキサヒスチジンタグ(配列番号141)を含むpET−23a(+)ベクター(Novagen)にクローニングした。大腸菌(E.coli)BL21(DE3)コンピテント細胞(Stratagene)を形質転換し、A600=0.6に達するまで37℃でインキュベートして、その後1mMイソプロピル−β−D−チオガラクトシド(IPTG)で3時間誘導した。細胞を遠心分離によって採取し、50mM Na2HPO4、pH8.0、0.3M NaCl緩衝液中で超音波処理によって溶解させた。次に溶解物を遠心分離し、HIS−Select Nickel Affinity Gel(Sigma)に負荷して、洗浄緩衝液(50mM NaH2PO4、pH8.0、0.3M NaClおよび10mMイミダゾール)で洗浄した。タンパク質を50mM Na2HPO4、pH8.0、0.3M NaClおよび250mMイミダゾール中で溶出させ、滅菌1×PBS中で一晩透析した。ヒトβ−カテニン構築物(例えば残基1〜781、138〜683、273〜684)をpGEX4T1/pGEX4T2、pET−28aおよびpET−23aにそれぞれクローニングした。Hisタグ融合タンパク質をBCL9について上述したように生成した。GSTタグ構築物については、形質転換した大腸菌BL21(DE3)を37℃でA600=0.6まで培養し、1mM IPTGで4時間誘導した。細胞をペレット化し、再懸濁して、緩衝液A(50mMトリス、pH8.0、150MM NaCl、20%スクロース、5mMジチオトレイトール(DTT)、1mM EDTA、1mM PMSF、2mg/mlアプロチニンおよび0.7mg/mlペプスタチン)中で超音波処理した。可溶化したタンパク質をグルタチオン−セファロース4Bビーズ(GE)に吸着させ、次にこれを20mMグルタチオンを含む緩衝液A中で溶出させて、プロテアーゼ阻害剤カクテル錠剤(Roche)を添加したPBS緩衝液に対して透析した。
組換えヒトBCL9(214〜493)を、カルボキシ末端にヘキサヒスチジンタグ(配列番号141)を含むpET−23a(+)ベクター(Novagen)にクローニングした。大腸菌(E.coli)BL21(DE3)コンピテント細胞(Stratagene)を形質転換し、A600=0.6に達するまで37℃でインキュベートして、その後1mMイソプロピル−β−D−チオガラクトシド(IPTG)で3時間誘導した。細胞を遠心分離によって採取し、50mM Na2HPO4、pH8.0、0.3M NaCl緩衝液中で超音波処理によって溶解させた。次に溶解物を遠心分離し、HIS−Select Nickel Affinity Gel(Sigma)に負荷して、洗浄緩衝液(50mM NaH2PO4、pH8.0、0.3M NaClおよび10mMイミダゾール)で洗浄した。タンパク質を50mM Na2HPO4、pH8.0、0.3M NaClおよび250mMイミダゾール中で溶出させ、滅菌1×PBS中で一晩透析した。ヒトβ−カテニン構築物(例えば残基1〜781、138〜683、273〜684)をpGEX4T1/pGEX4T2、pET−28aおよびpET−23aにそれぞれクローニングした。Hisタグ融合タンパク質をBCL9について上述したように生成した。GSTタグ構築物については、形質転換した大腸菌BL21(DE3)を37℃でA600=0.6まで培養し、1mM IPTGで4時間誘導した。細胞をペレット化し、再懸濁して、緩衝液A(50mMトリス、pH8.0、150MM NaCl、20%スクロース、5mMジチオトレイトール(DTT)、1mM EDTA、1mM PMSF、2mg/mlアプロチニンおよび0.7mg/mlペプスタチン)中で超音波処理した。可溶化したタンパク質をグルタチオン−セファロース4Bビーズ(GE)に吸着させ、次にこれを20mMグルタチオンを含む緩衝液A中で溶出させて、プロテアーゼ阻害剤カクテル錠剤(Roche)を添加したPBS緩衝液に対して透析した。
実施例15.クロマチン免疫沈降(ChIP)およびポリメラーゼ連鎖反応(PCR) 抗体(3μg)をプロテインAおよびプロテインG Dynal磁気ビーズ(Dynal Biotech,Norway)に8時間、前結合させ、5%BSAを含む氷冷PBSで5回洗浄して、次に以下の抗体を使用した一晩免疫沈降のために希釈したクロマチンに添加した:TCF−4(Upstate No.05−511)、マウスIgG2aアイソタイプ対照(Sigma、M5409)およびウサギIgG(sc−2027、Santa Cruz)。磁気ビーズ−クロマチン複合体を収集し、RIPA緩衝液(50mM HEPES[pH7.6]、1mM EDTA、0.7%デオキシコール酸ナトリウム、1%NP−40、0.5M LiCl)中で6回洗浄した。DNAを以前に記述されているように(Clevers,H.Cell 127,469−80(2006))ビーズから溶出させた。94℃で5分の初期変性後、以下の温度および時間プロフィールを使用した30サイクルのPCRにより、PTC−200プログラマブルサーマルコントローラ(MJ Research)で増幅を実施した:94℃、0.5分の変性、59℃、0.5分のプライマーアニーリング、72℃、0.5分のプライマー伸長および72℃、10分間の最終伸長。PCR産物を2%ゲル電気泳動によって視覚化した。以下のプロモータープライマーセットを使用した:(1)VEGF:F(順方向):5’−gcgtgtctctggacagagttt−3’(配列番号116)およびR(逆方向):5’−agcctcagcccttccaca−3’(配列番号117);(2)VEGF上流:F:5’−gaggctatgccagctgtagg−3’(配列番号118)およびR:5’−cccttttcctccaactctcc−3’(配列番号119);(3)c−Myc:F:5’−actcccccggctcggtccacaagc−3’(配列番号120)およびR:5’−cccaatttctcagccaggtttcag−3’(配列番号121)(Klaus,A.& Birchmeier,W.Nat Rev Cancer 8,387−98(2008))。図11aの結果参照。
実施例20.クロマチン免疫沈降
抗体(3μg)をプロテインAおよびプロテインG Dynal磁気ビーズ(Dynal Biotech,Norway)に8時間、前結合させ、5%BSAを含む氷冷PBSで5回洗浄して、次に以下の抗体を使用した一晩免疫沈降のために希釈したクロマチンに添加した:TCF−4(Upstate No.05−511)、マウスIgG2aアイソタイプ対照(Sigma、M5409)およびウサギIgG(sc−2027、Santa Cruz)。磁気ビーズ−クロマチン複合体を収集し、RIPA緩衝液(50mM HEPES[pH7.6]、1mM EDTA、0.7%デオキシコール酸ナトリウム、1%NP−40、0.5M LiCl)中で6回洗浄した。DNAを以前に記述されているように(Clevers,H.Cell 127,469−80(2006))ビーズから溶出させた。94℃で5分の初期変性後、以下の温度および時間プロフィールを使用した30サイクルのPCRにより、PTC−200プログラマブルサーマルコントローラ(MJ Research)で増幅を実施した:94℃、0.5分の変性、59℃、0.5分のプライマーアニーリング、72℃、0.5分のプライマー伸長および72℃、10分間の最終伸長。PCR産物を2%ゲル電気泳動によって視覚化した。以下のプロモータープライマーセットを使用した:(1)VEGFB:F(順方向):5’−gcgtgtctctggacagagttt−3’(配列番号116)およびR(逆方向):5’−agcctcagcccttccaca−3’ (配列番号117);(2)VEGF上流:F:5’−gaggctatgccagctgtagg−3’ (配列番号118)およびR:5’−cccttttcctccaactctcc−3’ (配列番号119);(3)c−Myc:F:5’−actcccccggctcggtccacaagc−3’(配列番号120)およびR:5’−cccaatttctcagccaggtttcag−3’(配列番号121)。図11aの結果参照。
抗体(3μg)をプロテインAおよびプロテインG Dynal磁気ビーズ(Dynal Biotech,Norway)に8時間、前結合させ、5%BSAを含む氷冷PBSで5回洗浄して、次に以下の抗体を使用した一晩免疫沈降のために希釈したクロマチンに添加した:TCF−4(Upstate No.05−511)、マウスIgG2aアイソタイプ対照(Sigma、M5409)およびウサギIgG(sc−2027、Santa Cruz)。磁気ビーズ−クロマチン複合体を収集し、RIPA緩衝液(50mM HEPES[pH7.6]、1mM EDTA、0.7%デオキシコール酸ナトリウム、1%NP−40、0.5M LiCl)中で6回洗浄した。DNAを以前に記述されているように(Clevers,H.Cell 127,469−80(2006))ビーズから溶出させた。94℃で5分の初期変性後、以下の温度および時間プロフィールを使用した30サイクルのPCRにより、PTC−200プログラマブルサーマルコントローラ(MJ Research)で増幅を実施した:94℃、0.5分の変性、59℃、0.5分のプライマーアニーリング、72℃、0.5分のプライマー伸長および72℃、10分間の最終伸長。PCR産物を2%ゲル電気泳動によって視覚化した。以下のプロモータープライマーセットを使用した:(1)VEGFB:F(順方向):5’−gcgtgtctctggacagagttt−3’(配列番号116)およびR(逆方向):5’−agcctcagcccttccaca−3’ (配列番号117);(2)VEGF上流:F:5’−gaggctatgccagctgtagg−3’ (配列番号118)およびR:5’−cccttttcctccaactctcc−3’ (配列番号119);(3)c−Myc:F:5’−actcccccggctcggtccacaagc−3’(配列番号120)およびR:5’−cccaatttctcagccaggtttcag−3’(配列番号121)。図11aの結果参照。
Wntシグナル伝達の遮断のために必要な生物学的活性である、あらかじめ形成したBCL9/β−カテニン複合体を破壊するSAH−BCL9の能力を評価するため、カルボキシ末端にヘキサヒスチジンタグ(配列番号141)を含むpET−23a(+)ベクターにクローニングした組換えヒトBCL9(残基243〜469)(His−BCL9)およびアミノ末端グルタチオン−S−トランスフェラーゼ(GST)タグを有するpGEX−4T−1ベクターにクローニングした完全長ヒトβ−カテニン(組換えGST−β−カテニン)を発現させ、以前に報告されているように(J.Sampietro et al.,Mol Cell 24,293(2006))精製した。グルタチオン−セファロース4Bビーズ(GE)に結合したGSTタグβ−カテニン及び等量(1nM)のHisタグBCL9を、アッセイ緩衝液(100mM Na2PO4[pH7.4]、100μg/mLウシ血清アルブミン、0.01%Triton X−100および4%DMSO)中4℃で一晩インキュベートした。ビーズに固定化したGSTタグβ−カテニンに結合したHisタグBCL9の複合体を遠心分離によって単離し、アッセイ緩衝液1mLに再懸濁して、スラリー50μLをアッセイ緩衝液500μl中のSAH−BCL9BまたはSAH−BCL9MUT(SAH−BCL9B(R359E))の存在下または不在下に室温で2時間インキュベートした。グルタチオンビーズ結合タンパク質を遠心分離によって2回洗浄し、溶出させて、ゲル電気泳動によって分離した。GST−β−カテニンをクマシーブルー染色によって検出し、保持されるHis−BCL9の存在を免疫ブロット分析(抗His 23655、Cell Signaling)によって検出して、ImageJソフトウェア(msbweb.nih.gov/ij)を用いて定量化した。実験を3回反復し、同様の結果を得た。結果は、SAH−BCL9Bが135nMのIC50で複合体を用量応答的に解離することができ、一方単一点突然変異誘発は活性を6倍低下させることを明らかにした。図17Bの結果参照。
Claims (41)
- 少なくとも1つの炭化水素ステープルまたはステッチを含む、BCL9のHD2ドメイン(BCL9−HD2)の構造的に拘束されたペプチド。
- ペプチドが、β−カテニンと相互作用するアミノ酸からなる相互作用面を含む、請求項1に記載の構造的に拘束されたペプチド。
- 相互作用面が約3から約20個のアミノ酸を含む、請求項2に記載の構造的に拘束されたペプチド。
- 相互作用面が4から15個のアミノ酸を含む、請求項3に記載の構造的に拘束されたペプチド。
- 相互作用面が、β−カテニンに結合するBCL9−HD2のへリックス面に40%またはそれ以上の同一性を含み、ここで相互作用面が、BCL9残基Gln−355、His−358、Arg−359、Ser−362、Leu−363、Leu−366、Ile−369、Gln−370、Leu−373およびPhe−374またはその保存的置換物を含む、請求項4に記載の構造的に拘束されたペプチド。
- 相互作用面が、β−カテニンに結合するBCL9−HD2のへリックス面に50%から90%の同一性を含み、ここで相互作用面が、BCL9残基Gln−355、His−358、Arg−359、Ser−362、Leu−363、Leu−366、Ile−369、Gln−370、Leu−373およびPhe−374またはその保存的置換物を含む、請求項5に記載の構造的に拘束されたペプチド。
- 相互作用面がαへリックスの1つの面である、請求項2に記載の構造的に拘束されたペプチド。
- へリックスの1つの面が、アミノ酸の1、2、3または4の隣接する積層柱を含み、ここでアミノ酸の積層柱は、1回転当たり3.6個のアミノ酸を有するαへリックスにおいて位置a、dおよびg;位置bおよびe;または位置cおよびfによって規定され、ここでアミノ酸は、連続的および順次に位置a〜gが割り当てられ;並びに、1回転当たり3個のアミノ酸を有する310へリックスにおいて位置aおよびd;位置bおよびe;または位置cおよびfによって規定され、ここでアミノ酸は、連続的および順次に位置a〜fが割り当てられ;またはそのホモログである、請求項7に記載の構造的に拘束されたペプチド。
- BCL9−HD2のアミノ酸351から374である配列番号1(LSQEQLEHRERSLQTLRDIQRMLF)に約20%から100%の配列相同性を有し、1から5個の炭化水素ステープルを含む、請求項2に記載の構造的に拘束されたペプチド。
- BCL9−HD2のアミノ酸351から374である配列番号1(LSQEQLEHRERSLQTLRDIQRMLF)に約50%から100%の配列相同性を有し、1から5個の炭化水素ステープルを含む、請求項2に記載の構造的に拘束されたペプチド。
- 炭化水素ステープルまたはステッチが1またはそれ以上の天然アミノ酸または非天然アミノ酸の間に存在する、請求項2に記載の構造的に拘束されたペプチド。
- 炭化水素ステープルまたはステッチがオレフィンメタセシス反応によって形成される、請求項11に記載のペプチド。
- BCL9 HD2ペプチド内に1から5個のステープルまたはステッチを含む、請求項2に記載の構造的に拘束されたペプチド。
- 1つのステープルまたはステッチがBCL9 HD2ペプチド内の以下の位置:a)i,i+4;b)i,i+7;およびc)i,i+3に存在する、請求項14に記載の構造的に拘束されたペプチド。
- 別のステープルまたはステッチがBCL9 HD2ペプチド内の以下の位置:a)i,i+4;b)i,i+7;およびc)i,i+3に存在する、請求項14に記載の構造的に拘束されたペプチド。
- 任意の他のステープルまたはステッチがBCL9 HD2ペプチド内の以下の位置:a)i,i+4;b)i,i+7;およびc)i,i+3に存在する、請求項14に記載の構造的に拘束されたペプチド。
- 1から4個の付加的な炭化水素ステープルをさらに含む、請求項18に記載の構造的に拘束されたペプチド。
- 請求項1から23のいずれか一項に記載のペプチドおよび医薬的に許容される担体を含有する組成物。
- 請求項1から23のいずれか一項に記載のペプチドを投与することを含む、被験者において古典的Wnt/β−カテニンシグナル伝達を阻害する方法。
- 請求項1から23のいずれか一項に記載のペプチドを投与することを含む、被験者においてBCL9のβ−カテニンへの結合を阻害する方法。
- BCL9のβ−カテニンへの結合の阻害が、請求項1から23のいずれか一項に記載の構造的に拘束されたペプチドによって引き起こされる、請求項25または26に記載の方法。
- 請求項1から23のいずれか一項に記載の化合物を被験者に投与することを含む、被験者においてBCL9/β−カテニン結合によって媒介される疾患または障害を治療する方法。
- 被験者が、BCL9/β−カテニン相互作用またはWntシグナル伝達の阻害剤を必要とすると特定された、請求項28に記載の方法。
- 疾患が、癌、腫瘍細胞増殖、腫瘍細胞の脱分化および転移、腫瘍の移動、腫瘍誘導性血管新生、癌幹細胞の化学療法抵抗性ならびに増殖性疾患であるか、または創傷治癒、血管新生もしくは糖尿病に関係する、請求項28に記載の方法。
- 疾患が、結腸直腸癌、多発性骨髄腫、肺癌、結腸癌、乳癌、前立腺癌、肝癌、膵癌、脳の癌、腎癌、卵巣癌、胃癌、皮膚癌、骨の癌、胃癌、乳癌、膵癌、神経膠腫、膠芽腫、肝細胞癌、乳頭状腎癌、頭頸部扁平上皮癌、白血病、リンパ腫、骨髄腫および固形腫瘍である、請求項30に記載の方法。
- 請求項1から23のいずれか一項に記載の化合物を被験者に投与することを含む、被験者において癌を治療する方法。
- 被験者が、癌を治療するために古典的Wnt/β−カテニンシグナル伝達の阻害剤を必要とすると以前に特定されたことがある、請求項32に記載の方法。
- 疾患が創傷治癒、血管新生または糖尿病に関係する、請求項30に記載の方法。
- 被験者に付加的な治療薬、放射線または化学療法を投与する、請求項28から34のいずれか一項に記載の方法。
- 付加的な治療化合物が抗癌化合物である、請求項35に記載の方法。
- 該化合物と付加的な治療薬を同時にまたは連続的に投与する、請求項35に記載の方法。
- 該化合物と付加的な治療薬を結合する(すなわち二官能性化合物である)、請求項35に記載の方法。
- 被験者がヒトである、請求項25から38のいずれか一項に記載の方法。
- 請求項1から23のいずれか一項に記載の構造的に拘束されたペプチドおよび癌を治療するのに使用するための指示書を含むキット。
- BCL9のβ−カテニンへの結合を阻害する化合物を同定する方法であって、請求項1から23のいずれか一項に記載のペプチドをβ−カテニンと接触させる段階および次に請求項1から23のいずれか一項に記載のペプチドとβ−カテニンとの間の相互作用を阻害する低分子または化合物をスクリーニングする工程を含む方法。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201161475932P | 2011-04-15 | 2011-04-15 | |
US61/475,932 | 2011-04-15 | ||
PCT/US2012/033822 WO2012142604A2 (en) | 2011-04-15 | 2012-04-16 | Targeting deregulated wnt signaling in cancer using stabilized alpha-helices of bcl-9 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2014515748A true JP2014515748A (ja) | 2014-07-03 |
Family
ID=47010037
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2014505404A Pending JP2014515748A (ja) | 2011-04-15 | 2012-04-16 | BCL9の安定化されたαへリックスを使用した、癌における調節解除されたWntシグナル伝達の標的化 |
Country Status (9)
Country | Link |
---|---|
US (3) | US10703785B2 (ja) |
EP (3) | EP3360892B1 (ja) |
JP (1) | JP2014515748A (ja) |
CN (2) | CN103649113B (ja) |
AU (1) | AU2012242502B2 (ja) |
CA (1) | CA2833171C (ja) |
ES (1) | ES2815498T3 (ja) |
HK (1) | HK1255701A1 (ja) |
WO (1) | WO2012142604A2 (ja) |
Cited By (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2017018595A1 (ko) * | 2015-07-28 | 2017-02-02 | 동국대학교 산학협력단 | 이중 스테이플화된 펩타이드 및 이의 용도 |
JP2018537120A (ja) * | 2015-10-05 | 2018-12-20 | ウィントルクス ファーマシューティカルズ インコーポレーテッド | 異常wntシグナル伝達の処置のための安定化bcl9ペプチド |
JP2022510606A (ja) * | 2018-11-21 | 2022-01-27 | エンドメット バイオサイエンシーズ,インク. | 子宮内膜症を処置するための組成物および方法 |
Families Citing this family (20)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN102573699A (zh) | 2009-08-04 | 2012-07-11 | 抛罗根有限公司 | 美容皮肤再生 |
KR20120116934A (ko) | 2009-11-16 | 2012-10-23 | 폴로젠 리미티드 | 비침습적인 지방 제거 방법 |
US11590346B2 (en) | 2009-11-16 | 2023-02-28 | Pollogen Ltd. | Apparatus and method for cosmetic treatment of human mucosal tissue |
EP3360892B1 (en) | 2011-04-15 | 2020-06-10 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | Targeting deregulated wnt signaling in cancer using stabilized alpha-helices of bcl-9 |
FI125828B (en) | 2013-11-18 | 2016-02-29 | Teconer Oy | rain sensor |
WO2015148620A2 (en) * | 2014-03-25 | 2015-10-01 | University Of Utah Research Foundation | Peptide inhibitors of bcr-abl oligomerization |
AU2016287754B2 (en) * | 2015-07-02 | 2021-02-25 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | Stabilized anti-microbial peptides |
CA3014442A1 (en) | 2016-02-29 | 2017-09-08 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | Stapled intracellular-targeting antimicrobial peptides to treat infection |
EP3214093A1 (en) * | 2016-03-03 | 2017-09-06 | Fondation The Ark | Fusion respiratory syncytial virus inhibitors and use thereof |
AU2018304230A1 (en) | 2017-07-19 | 2020-02-06 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | Stabilized anti-microbial peptides for the treatment of antibiotic-resistant bacterial infections |
US11198713B2 (en) | 2017-09-07 | 2021-12-14 | Fog Pharmaceuticals, Inc. | Agents modulating beta-catenin functions and methods thereof |
WO2019135816A2 (en) * | 2017-10-23 | 2019-07-11 | The Broad Institute, Inc. | Novel nucleic acid modifiers |
EP3706771A4 (en) * | 2017-11-09 | 2022-05-18 | WNTRX Pharmaceuticals Inc. | BCL9 PEPTIDES AND VARIANTS THEREOF |
WO2020037119A1 (en) * | 2018-08-16 | 2020-02-20 | H. Lee Moffitt Cancer Center And Research Institute, Inc. | Stapled peptides as pyrin-domain targeted nlrp3 inflammasome inhibitors |
CN110003312A (zh) * | 2019-03-05 | 2019-07-12 | 复旦大学 | 一种抗肿瘤的多肽及其应用 |
CN109750055B (zh) * | 2019-03-13 | 2022-12-23 | 南开大学 | 基于α螺旋把手提高蛋白核酸生物耦合效率的方法 |
AU2020311873B2 (en) * | 2019-07-05 | 2024-03-21 | Sapience Therapeutics, Inc. | Modified BCL9 mimetic peptides |
CN111909242B (zh) * | 2020-07-28 | 2021-12-17 | 西安交通大学医学院第一附属医院 | 高亲和力特异性结合β-catenin蛋白的多肽及其应用和合成方法 |
CN111718406B (zh) * | 2020-07-31 | 2022-12-06 | 西安交通大学医学院第一附属医院 | 一种纳米多肽载体及其制备方法和应用 |
WO2023159052A2 (en) * | 2022-02-15 | 2023-08-24 | Transira Therapeutics, Llc | Stapled peptides, methods of making same, and uses thereof |
Family Cites Families (12)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6407059B1 (en) | 1994-06-08 | 2002-06-18 | Peptor Limited | Conformationally constrained backbone cyclized peptide analogs |
US7192713B1 (en) | 1999-05-18 | 2007-03-20 | President And Fellows Of Harvard College | Stabilized compounds having secondary structure motifs |
US7049290B2 (en) * | 2000-07-28 | 2006-05-23 | Universität Zürich | Essential downstream component of the wingless signaling pathway and therapeutic and diagnostic applications based thereon |
CN1852974A (zh) * | 2003-06-09 | 2006-10-25 | 密歇根大学董事会 | 用于治疗和诊断癌症的组合物和方法 |
CA2528669A1 (en) | 2003-06-09 | 2005-01-20 | The Regents Of The University Of Michigan | Compositions and methods for treating and diagnosing cancer |
ES2437567T3 (es) * | 2003-11-05 | 2014-01-13 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | Péptidos alfa helicoidales estabilizados y utilizaciones de los mismos |
US7202332B2 (en) | 2004-05-27 | 2007-04-10 | New York University | Methods for preparing internally constrained peptides and peptidomimetics |
JP5631201B2 (ja) | 2007-03-28 | 2014-11-26 | プレジデント アンド フェローズ オブ ハーバード カレッジ | ステッチングされたポリペプチド |
JP5788178B2 (ja) | 2008-01-23 | 2015-09-30 | ダナ ファーバー キャンサー インスティテュート インコーポレイテッド | ウィルス感染症の治療のための組成物及び方法 |
CA3037721A1 (en) | 2009-06-18 | 2010-12-23 | Dana Farber Cancer Institute, Inc. | Structured viral peptide compositions and methods of use |
WO2011008260A2 (en) * | 2009-07-13 | 2011-01-20 | President And Fellows Of Harvard College | Bifunctional stapled polypeptides and uses thereof |
EP3360892B1 (en) | 2011-04-15 | 2020-06-10 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | Targeting deregulated wnt signaling in cancer using stabilized alpha-helices of bcl-9 |
-
2012
- 2012-04-16 EP EP18164082.2A patent/EP3360892B1/en active Active
- 2012-04-16 AU AU2012242502A patent/AU2012242502B2/en active Active
- 2012-04-16 CN CN201280029656.5A patent/CN103649113B/zh active Active
- 2012-04-16 EP EP20172306.1A patent/EP3715366A1/en active Pending
- 2012-04-16 CN CN201711420142.3A patent/CN108276490B/zh active Active
- 2012-04-16 CA CA2833171A patent/CA2833171C/en active Active
- 2012-04-16 WO PCT/US2012/033822 patent/WO2012142604A2/en active Application Filing
- 2012-04-16 JP JP2014505404A patent/JP2014515748A/ja active Pending
- 2012-04-16 ES ES18164082T patent/ES2815498T3/es active Active
- 2012-04-16 US US14/111,299 patent/US10703785B2/en active Active
- 2012-04-16 EP EP12771731.2A patent/EP2697254B1/en active Active
-
2018
- 2018-11-21 HK HK18114851.9A patent/HK1255701A1/zh unknown
-
2020
- 2020-05-18 US US16/876,779 patent/US11220532B2/en active Active
-
2021
- 2021-11-19 US US17/455,831 patent/US20220204572A1/en active Pending
Cited By (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2017018595A1 (ko) * | 2015-07-28 | 2017-02-02 | 동국대학교 산학협력단 | 이중 스테이플화된 펩타이드 및 이의 용도 |
JP2018537120A (ja) * | 2015-10-05 | 2018-12-20 | ウィントルクス ファーマシューティカルズ インコーポレーテッド | 異常wntシグナル伝達の処置のための安定化bcl9ペプチド |
JP7101118B2 (ja) | 2015-10-05 | 2022-07-14 | ウィントルクス ファーマシューティカルズ インコーポレーテッド | 異常wntシグナル伝達の処置のための安定化bcl9ペプチド |
JP2022510606A (ja) * | 2018-11-21 | 2022-01-27 | エンドメット バイオサイエンシーズ,インク. | 子宮内膜症を処置するための組成物および方法 |
US11884749B2 (en) | 2018-11-21 | 2024-01-30 | Endomet Biosciences, Inc. | Compositions and methods for treating endometriosis |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
US20140113857A1 (en) | 2014-04-24 |
EP3715366A1 (en) | 2020-09-30 |
ES2815498T3 (es) | 2021-03-30 |
CN108276490A (zh) | 2018-07-13 |
AU2012242502B2 (en) | 2016-07-28 |
CA2833171C (en) | 2021-08-31 |
US11220532B2 (en) | 2022-01-11 |
HK1255701A1 (zh) | 2019-08-23 |
US20220204572A1 (en) | 2022-06-30 |
CN103649113A (zh) | 2014-03-19 |
US10703785B2 (en) | 2020-07-07 |
WO2012142604A2 (en) | 2012-10-18 |
CA2833171A1 (en) | 2012-10-18 |
EP3360892B1 (en) | 2020-06-10 |
EP2697254A2 (en) | 2014-02-19 |
EP2697254B1 (en) | 2018-06-06 |
US20210002336A1 (en) | 2021-01-07 |
WO2012142604A3 (en) | 2012-12-27 |
EP3360892A1 (en) | 2018-08-15 |
AU2012242502A1 (en) | 2013-10-24 |
CN108276490B (zh) | 2022-07-05 |
CN103649113B (zh) | 2018-01-12 |
EP2697254A4 (en) | 2014-12-17 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US11220532B2 (en) | Targeting deregulated Wnt signaling in cancer using stabilized alpha-helices of BCL-9 | |
AU2014235039B2 (en) | Stabilized EZH2 peptides | |
JP2014502152A (ja) | 癌の治療及び診断 | |
US20210292385A1 (en) | Stabilized BCL9 Peptides for Treatment of Aberrant WNT Signaling | |
EP3515934A1 (en) | Compositions comprising sasp modulators and senescence attenuators and uses thereof for modulating cellular senescence | |
US20240075099A1 (en) | COMPOSITIONS, ASSAYS, AND METHODS FOR TARGETING HDM2 AND HDMX TO REVERSE THE INHIBITION OF p53 IN PEDIATRIC CANCERS | |
WO2016136372A1 (ja) | Ckap4を標的分子とした抗腫瘍剤 | |
US9783586B2 (en) | Inhibitors of the linear ubiquitin chain assembly complex (LUBAC) and related methods | |
WO2018112226A1 (en) | Sharpin-based polypeptides and their uses | |
KR20230006581A (ko) | 고형암의 치료에 사용하기 위한 pcna 상호작용 모티프를 함유하는 펩티드 | |
JP2021534826A (ja) | がんの処置のためのペプチド治療薬およびその使用 | |
JP2023531683A (ja) | CEBP-βアンタゴニストの投与及び使用方法 | |
AU2021223703A1 (en) | Molecules targeting proteins |