JP2014508511A - 抗il−18抗体およびそれらの使用 - Google Patents
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Abstract
Description
HCDR1は、Kabat残基31〜35bからなる7アミノ酸長であり得;
HCDR2は、Kabat残基50〜65からなる16アミノ酸長であり得;
HCDR3は、Kabat残基95〜102からなる15アミノ酸長であり得;
LCDR1は、Kabat残基24〜34からなる11アミノ酸長であり得;
LCDR2は、Kabat残基50〜56からなる7アミノ酸長であり得;および/または
LCDR3は、Kabat残基89〜97からなる9アミノ酸長であり得る。
(a)配列番号153と同一の、またはそれに対して1、2、もしくは3つのアミノ酸残基置換を含むアミノ酸配列を有するHCDR1;
(b)配列番号154と同一の、またはそれに対して1、2、3もしくは4つのアミノ酸残基置換を含むアミノ酸配列を有するHCDR2;
(c)配列番号155と同一の、またはそれに対して1、2、3、4もしくは5つのアミノ酸残基置換を含むアミノ酸配列を有するHCDR3;
(d)配列番号158と同一の、またはそれに対して1、2、3もしくは4つのアミノ酸残基置換を含むアミノ酸配列を有するLCDR1;
(e)配列番号159と同一の、またはそれに対して1、2、3もしくは4つのアミノ酸残基置換を含むアミノ酸配列を有するLCDR2;および
(f)配列番号160と同一の、またはそれに対して1、2、3、4、5、6、7、8、または9つのアミノ酸残基置換を含むアミノ酸配列を有するLCDR3
を含み得る。
(i)
HCDR1が、アミノ酸配列の配列番号3であり;
HCDR2が、アミノ酸配列の配列番号4であり;
HCDR3が、アミノ酸配列の配列番号5であり;
LCDR1が、アミノ酸配列の配列番号8であり;
LCDR2が、アミノ酸配列の配列番号9であり;
LCDR3が、アミノ酸配列の配列番号10である、
抗体1CDRのセット:
(ii)
HCDR1が、アミノ酸配列の配列番号143であり;
HCDR2が、アミノ酸配列の配列番号144であり;
HCDR3が、アミノ酸配列の配列番号145であり;
LCDR1が、アミノ酸配列の配列番号148であり;
LCDR2が、アミノ酸配列の配列番号149であり;
LCDR3が、アミノ酸配列の配列番号150である、
抗体11GL CDRのセット:または
(iii)
HCDR1が、アミノ酸配列の配列番号153であり;
HCDR2が、アミノ酸配列の配列番号154であり;
HCDR3が、アミノ酸配列の配列番号155であり;
LCDR1が、アミノ酸配列の配列番号158であり;
LCDR2が、アミノ酸配列の配列番号159であり;
LCDR3が、アミノ酸配列の配列番号160である、
抗体12GL CDRのセット。
HCDR3のKabat残基99、100a、100bおよび100d;
LCDR3のKabat残基89、90、91、92、93、94、95、および97。
Kabat残基95が、Thrであり;
Kabat残基96が、Proであり
Kabat残基97が、Alaであり;
Kabat残基98が、Tyrであり;
Kabat残基99が、AspもしくはPheであり;
Kabat残基100が、Glyであり;
Kabat残基100Aが、AspもしくはGlnであり;
Kabat残基100Bが、AlaもしくはAspであり;
Kabat残基100Cが、Argであり
Kabat残基100Dが、AlaもしくはThrであり;
Kabat残基100Eが、Aspであり;
Kabat残基100Fが、Pheであり;
Kabat残基100Gが、Pheであり;
Kabat残基101が、Aspであり;および/または
Kabat残基102が、Valである
HCDR3を含み得る。
Kabat残基92が、Tyr、Ser、Leu、His、またはAlaであり;
Kabat残基93が、Ser、Phe、Tyr、His、またはIleであり;および/または
Kabat残基94が、ThrまたはProである、
LCDR3を含み得る。
Kabat残基89が、GlnもしくはAlaであり;
Kabat残基90が、Gln、Asp、もしくはAsnであり;
Kabat残基91が、SerもしくはIleであり;
Kabat残基92が、Tyr、Ser、Leu、His、もしくはAlaであり;
Kabat残基93が、Ser、Phe、Tyr、His、もしくはIleであり;
Kabat残基94が、ThrまたはProであり;
Kabat残基95が、Pro、Asn、もしくはGlnであり、
Kabat残基96が、Trpであり、および/または
Kabat残基97が、ThrもしくはAspである
LCDR3を含み得る。
Kabat残基6が、GlnもしくはGluであり得;
Kabat残基10が、ArgもしくはGlyであり得;
Kabat残基13が、LysもしくはGluであり得;および/または
Kabat残基16が、GlnもしくはGluであり得る、
重鎖FW1を含み得る。
FW1配列番号161;
FW2配列番号162;
FW3配列番号163;
FW4配列番号164;
を含み得、
または1、2、3、4、5、6もしくは7つのアミノ酸変化、例えば置換を有する重鎖フレームワーク領域の前記セットを含み得る。
FW1配列番号165;
FW2配列番号166;
FW3配列番号167;
FW4配列番号168;
含み得、
または1、2、3、4、5、もしくは6つのアミノ酸変化、例えば置換を有する軽鎖フレームワーク領域の前記セットを含み得る。
重鎖FW1が、配列番号161であり;
重鎖FW2が、配列番号162であり;
重鎖FW3が、配列番号163であり;
重鎖FW4が、配列番号164であり;
軽鎖FW1が、配列番号165であり;
軽鎖FW2が、配列番号166であり;
軽鎖FW3が、配列番号167であり;
軽鎖FW4が、配列番号168であり;
一組の重鎖および軽鎖フレームワーク領域のセットを含み得、
または11個以下、例えば1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10個のアミノ酸変化、例えば置換を有する重鎖および軽鎖フレームワーク領域の前記セットを含み得る。例えば、重鎖および軽鎖フレームワーク領域の前記セット中に1または2つのアミノ酸置換が存在し得る。
(i)VHドメインアミノ酸配列が配列番号142に示され、VLドメインアミノ酸配列が配列番号147に示され、
(ii)VHドメインアミノ酸配列が配列番号142と比較して1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14または15個のアミノ酸置換を有し、VLドメインアミノ酸配列が配列番号147と比較して8、9、10、11、12または13個のアミノ酸置換を有し;または
(iii)VHドメインアミノ酸配列が配列番号142と少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%または少なくとも95%の配列同一性を有し、VLドメインアミノ酸配列が配列番号147と少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%または少なくとも95%の配列同一性を有する、
VHドメインおよびVLドメインを含み得る。
(i)VHドメインアミノ酸配列が配列番号152に示され、VLドメインアミノ酸配列が配列番号157に示され、
(ii)VHドメインアミノ酸配列が配列番号152と比較して1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14または15個のアミノ酸置換を有し、VLドメインアミノ酸配列が配列番号157と比較して1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12または13個のアミノ酸置換を有し;または
(iii)VHドメインアミノ酸配列が配列番号152と少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%または少なくとも95%の配列同一性を有し、VLドメインアミノ酸配列が配列番号157と少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%または少なくとも95%の配列同一性を有する、
VHドメインおよびVLドメインを含み得る。
(i)VHドメインアミノ酸配列が配列番号102に示され、VLドメインアミノ酸配列が配列番号107に示され、
(ii)VHドメインアミノ酸配列が配列番号102と比較して1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14または15個のアミノ酸置換を有し、VLドメインアミノ酸配列が配列番号107と比較して1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12または13個のアミノ酸置換を有し;または
(iii)VHドメインアミノ酸配列が配列番号102と少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%または少なくとも95%の配列同一性を有し、VLドメインアミノ酸配列が配列番号107と少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%または少なくとも95%の配列同一性を有する、
VHドメインおよびVLドメインを含み得る。
(i)IL−18に結合し、
(ii)抗体分子、VHおよび/またはVLドメイン、CDR、例えばHCDR3、および/または表10および11に列記されるCDRのセットを含む、
任意の抗体分子と、IL−18への結合について競合する抗体抗原結合部位または本明細書に記載の抗体分子を含む結合メンバーを提供する。
(i)配列番号152の配列を有するVHドメインおよび配列番号157の配列を有するVLドメイン;
(ii)配列番号152と比較して15個以下、例えば、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1個のアミノ酸置換を有する配列を有するVHドメイン;および配列番号157と比較して13個以下、例えば12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1個のアミノ酸置換を有する配列を有するVLドメイン;または
(iii)配列番号152および配列番号157とそれぞれ少なくとも90%の配列同一性を有する配列を有するVHドメインおよびVLドメイン
を含む抗体分子と競合し得る。
結合メンバーという用語は、互いに結合する分子のペアの一方のメンバーを説明する。結合ペアのメンバーは、天然に由来し得、または全体的もしくは部分的に合成により産生することができる。分子のペアの一方のメンバーは、分子のペアの他のメンバーに結合し、したがってそのメンバーの特定の空間的および極性組織化に相補的であるその表面上の領域、または空洞を有する。結合ペアのタイプの例は、抗原−抗体、ビオチン−アビジン、ホルモン−ホルモン受容体、受容体−リガンド、酵素−基質である。本発明は、抗原−抗体タイプの反応に関する。
抗体は、天然であるかまたは部分的もしくは完全に合成により産生されるかにかかわらず、免疫グロブリンを説明する。この用語はまた、抗体抗原結合部位を含む任意のポリペプチドまたはタンパク質を包含する。ここで、本発明は天然形態の抗体に関するものではなく、すなわちそれらはその天然環境中に存在しないが、それらは天然源から単離することができたか、または精製により得ることができたか、またはそうでなければ遺伝子組換え、もしくは化学合成により得ることができたものであり、その場合、下記のとおりそれらは非天然アミノ酸を含有し得ることが理解されなければならない。抗体抗原結合部位を含む抗体断片には、限定されるものではないが、Fab、Fab’、Fab’−SH、scFv、Fv、dAbおよびFdなどの分子が含まれる。1つ以上の抗体抗原結合部位を含む種々の他の抗体分子が遺伝子操作されており、それには、例えばFab2、Fab3、ダイアボディ(diabodies)、トリアボディ(triabodies)、テトラボディ(tetrabodies)およびミニボディ(minibodies)が含まれる。抗体分子およびそれらの構築および使用のための方法はHolliger & Hudson,Nature Biotechnology 23(9):1126−1136 2005に記載されている。
抗原結合部位は、標的抗原の全体または部分と結合し、それと相補的な分子の部分を説明する。抗体分子において、それは抗体抗原結合部位と称され、標的抗原の全体または部分と結合し、それと相補的な抗体の部分を含む。抗原が大きい場合、抗体は抗原の特定部分にのみ結合し得、その部分はエピトープと称される。抗体抗原結合部位は1つ以上の抗体可変ドメインにより提供することができる。抗体抗原結合部位は、抗体軽鎖可変領域(VL)および抗体重鎖可変領域(VH)を含み得る。
「単離された」は、本発明の結合メンバー、またはそのような結合メンバーをコードする核酸が、一般に本発明による状態を指す。したがって、本発明による結合メンバー、VHおよび/またはVLドメイン、ならびにコード核酸分子およびベクターは、実質的に純粋または均質な形態で、例えばそれらの天然環境から単離および/または精製されている状態、または核酸の場合、要求される機能を有するポリペプチドをコードする配列以外の起源の核酸または遺伝子を含まないかまたは実質的に含まない状態で提供することができる。単離されたメンバーおよび単離された核酸は、それらが天然に付随する材料、例えばその天然環境、またはそれらが調製される環境(例えば細胞培養物)中で(そのような調製がインビトロもしくはインビボで実施される組換えDNA技術によるものである場合)、それらが見出される他のポリペプチドまたは核酸を含まないかまたは実質的に含まない。メンバーおよび核酸は希釈剤またはアジュバントとともに製剤化することができ、実際的な目的のために依然として単離されており、例えば、メンバーは、イムノアッセイで使用するためのマイクロタイタープレートをコーティングするために使用する場合、通常ゼラチンまたは他の担体と混合し、または診断もしくは治療において使用する場合、薬学的に許容可能な担体または希釈剤と混合する。結合メンバーは、天然にまたは異種真核細胞(例えばCHOまたはNS0(ECACC85110503)細胞)の系によってグリコシル化されているか、または(例えば原核細胞中の発現により産生される場合)非グリコシル化状態であり得る。
・抗原に特異的な既知の抗体に対して増加した、抗原についての結合親和性
・抗原活性が既知である場合、抗原に特異的な既知の抗体に対して増加した、抗原活性の中和性
・指定モル比における、抗原に対する既知の抗体またはリガンドとの、指定の競合能力
・複合体を免疫沈降させる能力
・指定エピトープに結合する能力
・線形エピトープ、例えば、本明細書に記載のペプチド結合スキャン(例えば線形および/または拘束コンフォメーションでスクリーニングされたペプチドを使用する)を使用して同定されたペプチド配列
・不連続残基により形成されたコンフォメーショナルエピトープ
・IL−18、または下流の分子の新規生物学的活性をモジュレートする能力。
(a)置き換えるべきCDR3を含むかまたはCDR3コード領域を欠くVHドメインをコードする核酸の出発レパートリーを提供すること;
(b)前記レパートリーを、VHCDR3、例えば表11に示されるVHCDR3について本明細書に実質的に記載されるアミノ酸配列をコードするドナー核酸と組み合わせて前記ドナー核酸がレパートリー中のCDR3領域中に挿入されるようにしてVHドメインをコードする核酸の産物レパートリーを提供すること;
(c)前記産物レパートリーの核酸を発現させること;
(d)IL−18についての結合メンバーを選択すること;および
(e)前記結合メンバーまたはそれをコードする核酸を回収すること
を含む方法を提供する。
− 酵素、例えばアルカリホスファターゼ、グルコース−6−リン酸デヒドロゲナーゼ(「G6PDH」)、アルファ−D−ガラクトシダーゼ、グルコースオキシダーゼ、グルコースアミラーゼ、カルボニックアンヒドラーゼ、アセチルコリンエステラーゼ、リゾチーム、マレートデヒドロゲナーゼおよびペルオキシダーゼ、例えばセイヨウワサビペルオキシダーゼ;
− 色素;
− 蛍光標識または蛍光剤、例えばフルオレセインおよびその誘導体、蛍光色素、ローダミン化合物および誘導体、GFP(GFPは「緑色蛍光タンパク質」を表す)、ダンシル、ウンベリフェロン、フィコエリトリン、フィコシアニン、アロフィコシアニン、o−フタルデヒド(o−phthaldehyde)、およびフルオレサミン;フルオロフォア、例えばランタニドクリプテートおよびキレート、例えばユーロピウムなど(Perkin ElmerおよびCis Biointernational)、
− 化学発光標識または化学発光剤、例えばイソルミノール、ルミノールおよびジオキセタン;
− 生物発光標識、例えばルシフェラーゼおよびルシフェリン;
− 増感剤;
− 補酵素;
− 酵素基質;
− 放射性標識、例として限定されるものではないが、臭素77、炭素14、コバルト57、フッ素8、ガリウム67、ガリウム68、水素3(トリチウム)、インジウム111、インジウム113m、ヨウ素123m、ヨウ素125、ヨウ素126、ヨウ素131、ヨウ素133、水銀107、水銀203、リン32、レニウム99m、レニウム101、レニウム105、ルテニウム95、ルテニウム97、ルテニウム103、ルテニウム105、スカンジウム47、セレン75、硫黄35、テクネチウム99、テクネチウム99m、テルル121m、テルル122m、テルル125m、ツリウム165、ツリウム167、ツリウム168、イットリウム199および本明細書に記載の他の放射性標識;
− 粒子、例えばラテックスまたは炭素粒子:金属ゾル;微結晶;リポソーム;細胞など(色素、触媒または他の検出可能な基によりさらに標識することができる);
− ビオチン、ジゴキシゲニンまたは5−ブロモデオキシウリジンなどの分子;
− 毒素部分、例えばシュードモナス外毒素(PEまたはその細胞傷害性断片もしくは突然変異体)、ジフテリア毒素またはその細胞傷害性断片もしくは突然変異体、ボツリヌス毒素A、B、C、D、EもしくはF、リシンまたはその細胞傷害性断片、例えばリシンA、アブリンまたはその細胞傷害性断片、サポリンまたはその細胞傷害性断片、ヨウシュヤマゴボウ抗ウイルス毒素またはその細胞傷害性断片およびブリオジン1(bryodin 1)またはその細胞傷害性断片の群から選択される毒素部分など。
試料を本発明の結合メンバーと接触させることおよび
試料への結合メンバーの結合を測定すること
を含み得る。
試料をIL−18に結合する第1の結合メンバーと接触させること、および;
試料中のIL−18への前記第1の結合メンバーの結合を、IL−18に結合する第2の結合メンバーを使用して測定すること
を含み得、
前記第1または第2の結合メンバーの一方が本発明の結合メンバーであり、前記第1または第2の結合メンバーの他方が、IL−18への結合について本発明の結合メンバーと競合しない抗IL−18結合メンバーである。
上記のとおり、本発明の結合メンバーを使用する前記治療前および後に個体から得られた試料中の遊離IL−18の量を計測すること
を含み得、
遊離IL−18のレベルの減少は、個体が治療に対して応答性であることを示す。
(a)個体を治療のレジメンに供すること;および
(b)上記の方法を使用して個体から得られた試料中で遊離IL−18のレベルまたは量を前記治療の間モニタリングすること
を含み得、
治療の間に得られた試料中の遊離IL−18のレベルまたは量の低減が、レジメンが個体における疾患状態の治療に有効であることを示す。
(c)治療のレジメンを変え、変えたレジメンに個体を供すること;
(d)本明細書に記載の方法を使用して個体から得られた試料中の遊離IL−18のレベルをモニタリングすること、ならびに
(e)工程c)およびd)を、遊離IL−18のレベルの持続変化が観察されるまで繰り返すこと
を含み得、
治療の間に持続される遊離IL−18のレベルまたは量の変化、例えば低減が、変えたレジメンが個体における疾患状態の治療に有効であることを示す。
(c)治療のレジメンを変え、変えたレジメンに個体を供すること;
(d)本明細書に記載の方法を使用して個体から得られた試料中の遊離IL−18のレベルをモニタリングすること、ならびに
(e)工程c)およびd)を、遊離IL−18のレベルの最大変化が観察されるまで繰り返すこと
を含み得、
治療の間に持続される遊離IL−18のレベルまたは量の最大変化が、変えたレジメンが個体における疾患状態の治療に有効であることを示す。
(a)疾患状態を有する患者の集団を同定すること
(b)上記のとおり本発明の結合メンバーを使用して集団の患者から得られた試料中の遊離IL−18の量を計測すること;
(c)閾値超または未満である遊離IL−18の量を含有する試料を同定すること、および;
(d)同定された試料から患者のコホートを同定すること
含み得る。
1.骨および関節:例えば、先天的股異形成に対して原発性および続発性の骨関節炎/変形性関節症に関連するか、もしくはそれを含む関節炎;頸部および腰部脊椎症、ならびに腰部および頸部疼痛;関節リウマチ;スティル病;血清反応陰性脊椎関節症、例として強直性脊椎関節炎、乾癬性関節炎、反応性関節炎および未分化脊椎関節症;敗血症性関節炎および他の感染関連関節症ならびに骨障害、例えば結核、例としてポッツ病およびポンセ症候群;急性および慢性の結晶誘導性滑膜炎、例として尿酸性痛風、ピロリン酸カルシウム蓄積症、ならびにカルシウムアパタイトに関連する腱、滑液胞および滑液炎症;ベーチェット病;原発性および続発性シェーグレン症候群;全身性硬化症および限局性強皮症;全身性エリテマトーデス、混合結合組織疾患、および未分化結合組織疾患;炎症性筋疾患、例として皮膚筋炎および多発性筋炎;リウマチ性多発性筋痛;川崎病;若年性関節炎、例として全身性若年性特発性関節炎(sJIA)および全ての関節分布の特発性炎症性関節炎および関連症候群;マクロファージ活性化症候群;リウマチ熱およびその全身性合併症;血球貪食症候群;血球貪食リンパ組織球増加症;CAP症候群;血管炎、例として巨細胞動脈炎、高安動脈炎、チャーグ・ストラウス症候群、結節性多発性動脈炎、顕微鏡的多発性動脈炎、ならびにウイルス感染、過敏性反応、クリオグロブリン、およびパラプロテインと関連する血管炎;腰部疼痛;家族性地中海熱、マックル・ウェルズ症候群;ならびに家族性ヒベルニアン熱、菊池病;薬剤誘導性関節痛、腱炎、および筋疾患;
2.傷害に起因する筋骨格障害の疼痛および結合組織再形成[例えば、スポーツによる傷害]または疾患:関節炎(例えば、関節リウマチ、骨関節炎、痛風または結晶性関節炎)、他の関節疾患(例えば、椎間板変性または側頭下顎骨関節変性)、骨再形成疾患(例えば、骨粗鬆症、パジェット病または骨壊死)、多発性軟骨炎、強皮症、混合結合組織障害、脊椎関節症または歯周疾患(例えば、歯周炎);
3.心血管:腎虚血;卒中;アテローム性動脈硬化症;動脈硬化症;腹部大動脈瘤;末梢動脈疾患;狭心症;急性冠症候群;心筋梗塞;鬱血性心不全;血管再開通術後の再狭窄;脳血管疾患、例として多発性脳梗塞性認知症;末梢血管疾患、例として勃起機能不全;冠状循環および末梢循環に影響する障害;心筋炎、炎症および自己免疫心筋症、例として心筋サルコイド;虚血性再かん流傷害;心内膜炎、弁膜炎、および大動脈炎、例として感染性(例えば、梅毒);血管炎;近位静脈および末梢静脈の障害、例として静脈炎および血栓症、例として深静脈血栓症および静脈瘤の合併症;
4.内分泌疾患:真性糖尿病、例として2型糖尿病および糖尿病性合併症、例えば糖尿病性ネフロパシー、ニューロパシーおよびレチノパシー。
5.気道:気道の閉塞性疾患、例として喘息、例として断続的および持続的の両方ならびに全ての重症度の気管支性、アレルギー性、内在性、外来性、運動誘導性、薬剤誘導性(例としてアスピリンおよびNSAID誘導性)および粉塵誘導性喘息、ならびに他の原因の気道過敏性;慢性閉塞性肺疾患(COPD);気管支炎、例として感染性および好酸球性気管支炎;肺気腫;気管支拡張症;嚢胞性線維症;サルコイドーシス;農夫肺および関連疾患;過敏性肺炎;肺線維症、例として特発性繊維化性肺胞炎、特発性間質性肺炎、抗新生物治療および慢性感染に併発する線維症、例として結核およびアスペルギルス症ならびに他の真菌感染;肺移植の合併症;肺血管の血管性および血栓性障害、ならびに肺高血圧;鎮咳活性、例として気道の炎症および分泌病態に関連する慢性の咳、ならびに医原性の咳の治療;急性および慢性鼻炎、例として薬物性鼻炎、および血管運動神経性鼻炎;通年性および季節性アレルギー性鼻炎、例として神経性鼻炎(花粉症);鼻ポリープ;急性ウイルス感染、例として風邪、ならびに呼吸器合胞体ウイルス、インフルエンザ、コロナウイルス(例としてSARS)およびアデノウイルスに起因する感染;
6.皮膚:乾癬、アトピー性皮膚炎、接触性皮膚炎もしくは他の湿疹様皮膚炎、および遅延型過敏反応;植物性皮膚炎および光線皮膚炎;脂漏性皮膚炎、疱疹状皮膚炎、扁平苔癬、硬化性萎縮性苔癬、壊疽性膿皮症、皮膚サルコイド、円板状エリテマトーデス、天疱瘡、類天疱瘡、表皮水疱症、蕁麻疹、血管性浮腫、血管炎、毒性紅斑、皮膚好酸球増加症、円形脱毛症、男性型禿頭症、スイート症候群、ウェーバー・クリスチャン症候群、多形性紅斑;感染性および非感染性の蜂巣炎;脂肪織炎;皮膚リンパ腫、非メラノーマ皮膚癌および他の異形成病変;薬剤誘導性障害、例として固定薬疹;
7.眼:眼瞼炎;結膜炎、例として通年性および春季アレルギー性結膜炎;虹彩炎;前部および後部ブドウ膜炎;脈絡膜炎;自己免疫;網膜に影響する変性障害もしくは炎症疾患;眼炎、例として交感性眼炎;サルコイドーシス;感染、例としてウイルス、真菌、および細菌感染;
8.胃腸管:舌炎、歯肉炎、歯周炎;食道炎、例として逆流性食道炎;好酸球性胃腸炎、肥満細胞症、クローン病、大腸炎、例として潰瘍性大腸炎、直腸炎、肛門掻痒症;セリアック症、過敏性腸症候群、および腸から遠くでの効果を有し得る食品関連アレルギー(例えば、偏頭痛、鼻炎または湿疹);
9.腹部:肝炎、例として自己免疫性、アルコール性およびウイルス性肝炎;肝臓の線維症および肝硬変;胆嚢炎;急性および慢性の膵炎;
10.尿生殖器:腎炎、例として間質性腎炎および糸球体腎炎;ネフローゼ症候群;膀胱炎、例として急性および慢性(間質性)膀胱炎ならびにハンナー潰瘍;急性および慢性尿道炎、前立腺炎、精巣上体炎、卵巣炎ならびに卵管炎;外陰膣炎;ペイロニー病;勃起機能不全(男性および女性の両方);
11.同種移植片拒絶反応:例えば、腎臓、心臓、肝臓、肺、骨髄、皮膚もしくは角膜の移植後もしくは輸血後の急性および慢性拒絶反応;または慢性移植片対宿主病;
12.CNS:アルツハイマー病ならびに他の認知障害、例としてCJDおよびnvCJD;アミロイドーシス;多発性硬化症および他の脱髄症候群;脳のアテローム性動脈硬化症および血管炎;側頭動脈炎;重症筋無力症;急性および慢性疼痛(中枢もしくは末梢起源の急性、断続的もしくは持続的なもの)、例として内臓痛、頭痛、片頭痛、三叉神経痛、非定型顔面痛、関節および骨の疼痛、癌および腫瘍侵襲から生じる疼痛、ニューロパシー性疼痛症候群、例として糖尿病性、ヘルペス後およびHIV関連性ニューロパシー;ニューロサルコイドーシス;悪性の感染または自己免疫プロセスの中枢および末梢神経系合併症;
13.他の自己免疫およびアレルギー障害、例として橋本甲状腺炎、グレーブス病、アジソン病、糖尿病、特発性血小板減少性紫斑病、好酸球性筋膜炎、超IgE症候群、抗リン脂質症候群;
14.炎症または免疫学的構成要素による他の障害、例として後天性免疫不全症候群(AIDS)、ハンセン病、セザリー症候群、および腫瘍随伴症候群;
15.癌、例として任意のタイプの転移性または非転移性固形腫瘍または悪性リンパ腫、例えば白血病、肉腫、皮膚癌、膀胱癌、乳癌、子宮癌、卵巣癌、前立腺癌、肺癌、結腸直腸癌、子宮頸癌、肝臓癌、頭頸部癌、食道癌、膵臓癌、腎臓癌、胃癌および脳癌。
− サイトカインまたはサイトカイン機能のアゴニストもしくはアンタゴニスト(例えばサイトカインシグナリング経路に作用する薬剤、例えばSOCS系のモジュレーター)、例えばアルファ−、ベータ−および/またはガンマ−インターフェロン;インシュリン様成長因子I型(IGF−1)、その受容体および関連結合タンパク質;インターロイキン(IL)、例えばIL−1からIL−37の1つ以上、および/またはインターロイキンアンタゴニストまたはインヒビター、例えばアナキンラ;インターロイキンファミリーメンバーの受容体のインヒビターまたはそのような受容体の特定サブユニットのインヒビター(例えば、トシリズマブ(Actemra(商標);Roche)、ヒトIL−6受容体に対するヒト化IgG1モノクローナル抗体)、腫瘍壊死因子アルファ(TNF−α)インヒビター、例えば抗TNFモノクローナル抗体(例えばインフリキシマブ、アダリムマブおよび/またはCDP−870)および/またはTNF受容体アンタゴニスト、例えば免疫グロブリン分子(例えばエタネルセプト)および/または低分子量薬剤、例えばペントキシフィリン;
− B細胞のモジュレーター、例えばBリンパ球を標的化するモノクローナル抗体(例えばCD20(リツキシマブ)またはMRA−aILl6R)またはTリンパ球を標的化するにするもの(例えばCTLA4−Ig、HuMax Il−15またはアバタセプト);
− 破骨細胞活性を阻害するモジュレーター、例えばRANKLに対する抗体;
− ケモカインまたはケモカイン受容体機能のモジュレーター、例えばCCR1、CCR2、CCR2A、CCR2B、CCR3、CCR4、CCR5、CCR6、CCR7、CCR8、CCR9、CCR10およびCCR11(C−Cファミリーについて);CXCR1、CXCR2、CXCR3、CXCR4およびCXCR5およびCXCR6(C−X−Cファミリーについて)ならびにCX3CR1(C−X3−Cファミリーについて)のアンタゴニスト;
− マトリックスメタロプロテアーゼ(MMP)、すなわちストロメライシン、コラゲナーゼおよびゼラチナーゼならびにアグリカナーゼ、特にコラゲナーゼ−1(MMP−1)、コラゲナーゼ−2(MMP−8)、コラゲナーゼ−3(MMP−13)、ストロメライシン−1(MMP−3)、ストロメライシン−2(MMP−10)および/またはストロメライシン−3(MMP−11)および/またはMMP−9および/またはMMP−12の1つ以上のインヒビター、例えばドキシサイクリンなどの薬剤;
− ロイコトリエン生合成インヒビター、5−リポキシゲナーゼ(5−LO)インヒビターまたは5−リポキシゲナーゼ活性化タンパク質(FLAP)アンタゴニスト、例えばジレウトン;ABT−761;フェンレウトン;テポキサリン;Abbott−79175;Abbott−85761;N−(5−置換)−チオフェン−2−アルキルスルホンアミド;2,6−ジ−tert−ブチルフェノールヒドラゾン;メトキシテトラヒドロピラン、例えばZeneca ZD−2138;化合物SB−210661;ピリジニル置換2−シアノナフタレン化合物、例えばL−739,010;2−シアノキノリン化合物、例えばL−746,530;インドールおよび/またはキノリン化合物、例えばMK−591、MK−886および/またはBAYx1005;
− フェノチアジン−3−1、例えばL−651,392;アミジノ化合物、例えばCGS−25019c;ベンゾキサラミン(benzoxalamines)、例えばオンタゾラスト;ベンゼンカルボキシミドアミド、例えばBIIL284/260;および化合物、例えばザフィルルカスト、アブルカスト、モンテルカスト、プランルカスト、ベルルカスト(MK−679)、RG−12525、Ro−245913、イラルカスト(CGP45715A)およびBAYx7195からなる群から選択されるロイコトリエン(LT)B4、LTC4、LTD4、およびLTE4の受容体アンタゴニスト;
− ホスホジエステラーゼ(PDE)インヒビター、例えばメチルキサンタニン(methylxanthanine)、例えばテオフィリンおよび/またはアミノフィリン;および/または選択的PDEアイソザイムインヒビター、例えばPDE4インヒビターおよび/またはアイソフォームPDE4Dのインヒビターおよび/またはPDE5のインヒビター;
− ヒスタミン1型受容体アンタゴニスト、例えばセチリジン、ロラタジン、デスロラタジン、フェキソフェナジン、アクリバスチン、テルフェナジン、アステミゾール、アゼラスチン、レボカバスチン、クロルフェニラミン、プロメタジン、シクリジン、および/またはミゾラスチン(一般に、経口、局所または非経口で適用される);
− プロトンポンプインヒビター(例えばオメプラゾール)または胃保護性ヒスタミン2型受容体アンタゴニスト;
− ヒスタミン4型受容体のアンタゴニスト;
− アルファ−1/アルファ−2アドレナリン受容体アゴニスト血管収縮性交感神経様作用剤、例えばプロピルヘキセドリン、フェニレフリン、フェニルプロパノールアミン、エフェドリン、シュードエフェドリン、塩酸ナファゾリン、塩酸オキシメタゾリン、塩酸テトラヒドロゾリン、塩酸キシロメタゾリン、塩酸トラマゾリンおよび塩酸エチルノルエピネフリン;
− 抗コリン作動剤、例えばムスカリン受容体(M1、M2、およびM3)アンタゴニスト、例えばアトロピン、ヒヨスチン、グリコピロレート、臭化イプラトロピウム、臭化チオトロピウム、臭化オキシトロピウム、ピレンゼピンおよびテレンゼピン;
− ベータ−アドレナリン受容体アゴニスト(例としてベータ受容体サブタイプ1〜4)、例えばイソプレナリン、サルブタモール、ホルモテロール、サルメテロール、テルブタリン、オルシプレナリン、メシル酸ビトルテロールおよび/またはピルブテロール、例えばそのキラルエナンチオマー;
− クロモン、例えばクロモグリク酸ナトリウムおよび/またはネドクロミルナトリウム;
− PDE−4インヒビター、例えばロフルミラスト
− グルココルチコイド、例えばフルニソリド、トリアムシノロンアセトニド、ジプロピオン酸ベクロメタゾン、ブデソニド、プロピオン酸フルチカゾン、シクレソニド、および/またはフランカルボン酸モメタゾン;
− 核ホルモン受容体、例えばPPARをモジュレートする薬剤;
− 免疫グロブリン(Ig)もしくはIg調製物またはIg機能をモジュレートするアンタゴニストもしくは抗体、例えば抗IgE(例えばオマリズマブ);
− 他の全身または局所適用の抗炎症剤、例えばサリドマイドもしくはその誘導体、レチノイド、ジトラノールおよび/またはカルシポトリオール;
− アミノサリチル酸およびスルファピリジンの組合せ、例えばスルファサラジン、メサラジン、バルサラジド、およびオルサラジン;ならびに免疫調節剤、例えばチオプリン;およびコルチコステロイド、例えばブデソニド;
− 抗菌剤、例えばペニシリン誘導体、テトラサイクリン、マクロライド、ベータ−ラクタム、フルオロキノロン、メトロニダゾールおよび/もしくは吸入アミノグリコシド;ならびに/または抗ウイルス剤、例えばアシクロビル、ファムシクロビル、バラシクロビル、ガンシクロビル、シドフォビル;アマンタジン、リマンタジン;リバビリン;ザナマビル(zanamavir)および/またはオセルタマビル(oseltamavir);プロテアーゼインヒビター、例えばインジナビル、ネルフィナビル、リトナビルおよび/またはサキナビル;ヌクレオシド逆転写酵素インヒビター、例えばジダノシン、ラミブジン、スタブジン、ザルシタビン、ジドブジン;非ヌクレオシド逆転写酵素インヒビター、例えばネビラピン、エファビレンツ;または抗体、例えばパリビズマブ(Synagis(商標));
− 心血管作動剤、例えばチアジドまたはループ利尿薬;血管拡張剤、例えばニトログリセリン、カルシウムチャネルブロッカー、アルファ−アドレナリン受容体ブロッカー、ベータ−アドレナリン受容体ブロッカーまたはアルファおよびベータ−アドレナリン受容体ブロッカーの組合せ、アンギオテンシン変換酵素(ACE)インヒビター、アンギオテンシン−2受容体アンタゴニスト;アルドステロンアンタゴニストまたはカリウム保持性利尿薬;脂質低下剤、例えばスタチン、コレステロール吸収インヒビターおよび/またはフィブレート;血液細胞形態のモジュレーター、例えばペントキシフィリン;血栓溶解剤および/または抗凝血剤、例えば血小板凝集インヒビター;
− CNS作動剤、例えば抗うつ剤(例えばセルトラリン)、抗パーキンソン薬(例えばデプレニル、L−ドーパ、ロピニロール、プラミペキソール;MAOBインヒビター、例えばセレギンおよびラサギリン;comPインヒビター、例えばtasmar;A−2インヒビター、ドーパミン再取り込みインヒビター、NMDAアンタゴニスト、ニコチンアゴニスト、ドーパミンアゴニストおよび/またはニューロン一酸化窒素シンターゼのインヒビター)および抗アルツハイマー薬、例えばドネペジル、リバスチグミン、タクリン、COX−2インヒビター、プロペントフィリンまたはメトリホネート;
− 急性および慢性疼痛を治療するための薬剤、例えば中枢または末梢作用鎮痛薬、例えばオピオイド類似体または誘導体、カルバマゼピン、フェニトイン、バルプロ酸ナトリウム、アミトリプチリンまたは他の抗うつ剤、パラセタモール、または非ステロイド性抗炎症剤;
− 非経口または局所適用(吸入を含む)局所麻酔剤、例えばリグノカインまたはその類似体;
− 抗骨粗鬆症剤、例えばホルモン剤、例えばラロキシフェン、またはビホスホネート、例えばアレンドロネート;
− (i)トリプターゼインヒビター;(ii)血小板活性化因子(PAF)アンタゴニスト;(iii)インターロイキン変換酵素(ICE)インヒビター;(iv)IMPDHインヒビター;(v)接着分子インヒビター、例としてVLA−4アンタゴニスト;(vi)カテプシン;(vii)キナーゼインヒビター、例えばチロシンキナーゼのインヒビター(例えばBtk、Itk、Jak3MAP インヒビターの例にはゲフィチニブ、メシル酸イマチニブが含まれる)、セリン/スレオニンキナーゼ(例えばMAPキナーゼ、例えばp38、JNK、プロテインキナーゼA、BおよびCならびにIKKのインヒビター)、または細胞周期調節に関与するキナーゼ(例えばサイクリン依存性キナーゼ);(viii)グルコース−6リン酸デヒドロゲナーゼインヒビター;(ix)キニン−B1.−および/またはB2.−受容体アンタゴニスト;(x)抗痛風剤、例えばコルヒチン;(xi)キサンチンオキシダーゼインヒビター、例えばアロプリノール;(xii)尿酸排泄剤、例えばプロベネシド、スルフィンピラゾン、および/またはベンズブロマロン;(xiii)成長ホルモン分泌促進剤;(xiv)トランスフォーミング成長因子(TGFβ);(xv)血小板由来成長因子(PDGF);(xvi)線維芽細胞成長因子、例えば塩基性線維芽細胞成長因子(bFGF);(xvii)顆粒球マクロファージコロニー刺激因子(GM−CSF);(xviii)カプサイシンクリーム;(xix)タキキニンNK.sub1.および/またはNK.sub3.受容体アンタゴニスト、例えばNKP−608C、SB−233412(タルネタント)および/またはD−4418;(xx)エラスターゼインヒビター、例えばUT−77および/またはZD−0892;(xxi)TNF−アルファ変換酵素インヒビター(TACE);(xxii)誘導性一酸化窒素シンターゼ(iNOS)インヒビターまたは(xxiii)TH2細胞上で発現される化学誘引物質受容体相同分子(例えばCRTH2アンタゴニスト);(xxiv)P38のインヒビター(xxv)Toll様受容体(TLR)の機能をモジュレートする薬剤および(xxvi)プリン受容体の活性をモジュレートする薬剤、例えばP2X7;(xxvii)転写因子活性化、例えばNFkB、API、および/またはSTATSのインヒビターまたは(xxviii)カスパーゼインヒビター、例えばBoc−Asp−FMK、z−VAD−FMK、YVAD−FMK、Ac−WEHD−CHO、Ac−DEVD−CHO、Ac−YVADCHO、t−ブトキシカルボニル−IETD−CHO、およびt−ブトキシカルボニル−AEVD−CHO。
(i)内科的腫瘍学において使用される抗増殖性/抗悪性腫瘍薬およびその組合せ、例えばGleevec(メシル酸イマチニブ)、アルキル化剤(例えばシスプラチン、カルボプラチン、シクロホスファミド、ナイトロジェンマスタード、メルファラン、クロランブシル、ブスルファンおよびニトロソウレア);代謝拮抗剤(例えば葉酸拮抗剤、例えばフルオロピリミジン、例えば5−フルオロウラシルおよびテガフール、ラルチトレキセド、メトトレキセート、シトシンアラビノシド、ヒドロキシウレア、ゲムシタビンおよびパクリタキセル);抗腫瘍性抗生物質(例えばアントラサイクリン、例えばアドリアマイシン、ブレオマイシン、ドキソルビシン、ダウノマイシン、エピルビシン、イダルビシン、マイトマイシン−C、ダクチノマイシンおよびミトラマイシン);有糸分裂阻害剤(例えばビンカアルカロイド、例えばビンクリスチン、ビンブラスチン、ビンデシンおよびビノレルビンおよびタキソイド、例えばタキソールおよびタキソテール);およびトポイソメラーゼインヒビター(例えばエピポドフィロトキシン、例えばエトポシドおよびテニポシド、アムサクリン、トポテカンおよびカンプトセシン);
(ii)細胞増殖抑制剤、例えば抗エストロゲン剤(例えばタモキシフェン、トレミフェン、ラロキシフェン、ドロロキシフェンおよびヨードキシフェン(iodoxyfene))、エストロゲン受容体下方調節因子(例えばフルベストラント)、抗アンドロゲン剤(例えばビカルタミド、フルタミド、ニルタミドおよび酢酸シプロテロン)、LHRHアンタゴニストまたはLHRHアゴニスト(例えばゴセレリン、ロイプロレリンおよびブセレリン)、プロゲストゲン(例えば酢酸メゲストロール)、アロマターゼインヒビター(例えばアナストロゾール、レトロゾール、ボラゾール(vorazole)およびエキセメスタンとして)および5α−レダクターゼのインヒビター、例えばフィナステリド;
(iii)癌細胞侵襲を阻害する薬剤(例えばメタロプロテイナーゼインヒビター、例えばマリマスタットおよびウロキナーゼプラスミノーゲンアクチベーター受容体機能のインヒビター);
(iv)成長因子機能のインヒビター、例えば、そのようなインヒビターには、成長因子抗体、成長因子受容体抗体(例えば抗erbb2抗体トラスツズマブおよび抗erbb1抗体セツキシマブ[C225])、ファルネシルトランスフェラーゼインヒビター、チロシンキナーゼインヒビターおよびセリン/スレオニンキナーゼインヒビター、例えば上皮細胞成長因子ファミリーのインヒビター(例えばEGFRファミリーチロシンキナーゼインヒビター、例えばN−(3−クロロ−4−フルオロフェニル)−7−メトキシ−6−(3−モルホリノプロポキシ)キナゾリン−4−アミン(ゲフィチニブ、AZD1839)、N−(3−エチニルフェニル)−6,7−ビス(2−メトキシエトキシ)キナゾリン−4−アミン(エルロチニブ、OSI−774)および6−アクリルアミド−N−(3−クロロ−4−フルオロフェニル)−7−(3−モルホリノプロポキシ)キナゾリン−4−アミン(CI 1033))、例えば血小板由来成長因子ファミリーのインヒビターおよび例えば肝細胞成長因子ファミリーのインヒビターが含まれ;
(v)血管新生阻害剤、例えば血管内皮成長因子の効果を阻害するもの(例えば抗血管内皮細胞成長因子抗体ベバシズマブ、国際公開第97/22596号パンフレット、国際公開第97/30035号パンフレット、国際公開第97/32856号パンフレットおよび国際公開第98/13354号パンフレットに開示されている化合物等の化合物および他の機構により作用する化合物(例えばリノマイド、インテグリンαvβ3機能のインヒビターおよびアンギオスタチン);
(vi)血管損傷剤、例えばコンブレタスタチンA4および国際公開第99/02166号パンフレット、国際公開第00/40529号パンフレット、国際公開第00/41669号パンフレット、国際公開第01/92224号パンフレット、国際公開第02/04434号パンフレットおよび国際公開第02/08213号パンフレット(そのそれぞれは、全体として本明細書に組み込まれる)に開示されている化合物;
(vii)アンチセンス治療薬、例えば上記列挙される標的に指向されるもの、例えばISIS2503、抗rasアンチセンス;
(viii)遺伝子治療アプローチ、例として例えば異常遺伝子、例えば異常p53または異常BRCA1もしくはBRCA2を置き換えるアプローチ、GDEPT(遺伝子指向性酵素プロドラッグ治療)アプローチ、例えばシトシンデアミナーゼ、チミジンキナーゼまたは細菌性ニトロレダクターゼ酵素を使用するアプローチおよび化学療法または放射線療法に対する患者の耐容性を増加させるアプローチ、例えば多剤耐性遺伝子治療;ならびに
(ix)免疫療法アプローチ、例として例えば患者腫瘍細胞の免疫原性を高めるエクスビボおよびインビボアプローチ、例えばサイトカイン、例えばインターロイキン2、インターロイキン4または顆粒球マクロファージコロニー刺激因子による形質移入、T細胞不応答を減少させるアプローチ、形質移入された免疫細胞、例えばサイトカインにより形質移入された樹状細胞を使用するアプローチ、サイトカインにより形質移入された腫瘍細胞系を使用するアプローチおよび抗イディオタイプ抗体を使用するアプローチ。
抗−18抗体生成およびリード選択
1.1 組換えヒトIL−18抗原の発現および精製
細菌発現のためのヒトIL−18(Uniprot登録番号Q14116−1;配列番号169)を、pET21aベクター(Novagen)中にクローニングし、大腸菌(E.coli)BL21DE3*中で発現させた。構築物は、N末端GSTタグ、ヒスチジンタグ(8×His)をXa因子開裂部位と一緒に含むようにインハウスで生成した。可溶性発現後、タンパク質を標準的親和性クロマトグラフィーを使用する精製に付し、次いでXa因子開裂し、サイズ排除精製して生物学的に活性なヒトIL−18を生成した。
繊維状ファージM13に基づくファージミドベクター中にクローニングされたナイーブヒト一本鎖Fv(scFv)ファージディスプレイライブラリーを選択に使用した(Vaughan他(1996)Nature Biotechnology 14(3):309−14;Lloyd他(2009)Protein Eng Des Sel.(3):159−68;Hutchings他(2001)Generation of Naive Human Antibody Libraries,in Antibody Engineering,Ed.by R.Kontermann & S.Dubel,Springer Laboratory Manuals,Berlin,p93;Groves他(2006)J Immunol Methods.313(1−2):129−39)。Vaughan他((1996)Nature Biotechnology 14(3):309−14)およびHawkins他((1992)Journal of Molecular Biology 226,889−896)により本質的に既に記載されているとおり、組換えヒトIL−18(Medical and Biological Laboratories Co.,日本,名古屋)に基づく一連の選択サイクルを使用してファージディスプレイライブラリーから抗IL−18特異的scFv抗体を単離した。簡潔に述べると、パニング選択の第1ラウンドについて、ダルベッコリン酸緩衝生理食塩水(DPBS、pH7.4)中のヒトIL−18を、Nunc(商標)maxisorpマイクロタイタープレート(Thermo Fisher Scientific,Rochester NY;カタログ番号439454)のウェル上に4℃において一晩、事前に吸着させたラット抗IL−18モノクローナル抗体、クローン159−12B(Medical and Biological Laboratories,Japan;カタログ番号D045−3)により特異的に捕捉させた。ウェルをPBSにより洗浄し、次いでPBS−Marvel(3%w/v)により1時間ブロッキングした。4倍過剰の捕捉抗体、ラット抗IL−18モノクローナル抗体を含有するPBS−Marvel(3%w/v)中の精製ファージを除外プレート(maxisorpマイクロタイタープレートのウェル上に吸着させたラット抗IL−18モノクローナル抗体)のウェルに1時間添加してからコーティングされた抗原(組換えヒトIL−18)と1時間結合させた。未結合ファージをPBS−Tween(0.1%v/v)およびPBSを使用する一連の洗浄サイクルにより除去した。結合したファージ粒子を溶出させ、大腸菌(E.coli)TG1細菌中に感染させ、次の選択ラウンドのためにレスキューした(Vaughan他(1996)Nature Biotechnology 14(3):309−314)。第2ラウンドの選択を、ファージ粒子を100nMのビオチン化IL−18とインキュベートすることにより溶液中で実施し、次いで上記のラット抗IL−18モノクローナル抗体捕捉選択の第3ラウンドを実施した。
ペリプラズム調製物からの未精製scFvを、EnVisionプレートリーダー(PerkinElmer,Boston MA)を使用するホモジニアス時間分解蛍光(HTRF(登録商標)、CIS Bio international)受容体リガンド結合アッセイにおいてスクリーニングした。ヒトIL−18Rアルファ鎖([IL−18Rα];R&D Systems,Minneapolis,MN;カタログ番号816−LR)のユウロピウムクリプテート標識を、トリスビピリジン−Eu3+−クリプテート−NHS(CIS bio International,フランス,バニョル・シュル・セズ(Bagnols−sur−Ceze);カタログ番号65EUSABA)をpH8のPBS中で製造業者の指示書に従って使用して達成した。ヒトIL−18Rベータ鎖([IL−18Rβ];R&D Systems,Minneapolis,MN;カタログ番号118−AP)は、EZlinkスルホ−NHS−LC−ビオチン(Thermo Fisher Scientific,Rochester NY;カタログ番号21335)をpH8のPBS中で使用して遊離アミンを介してビオチン化した。HTRF(商標)アッセイにおいて、未精製scFv試料は、ヒト組換えIL−18のその受容体、ユウロピウムクリプテート標識ヒトIL−18Rαおよびビオチン化ヒトIL−18Rβへの結合相互作用について競合した。選択産物は、50mMのMOPS緩衝液pH7.4、0.5mMのEDTAおよび0.5Mのソルビトール中で調製されたscFvを含有する未精製細菌ペリプラズム抽出物としてスクリーニングした。5マイクロリットルの未精製scFv試料をCostar(登録商標)384ウェルアッセイプレート(Corning;Lowell,MA;カタログ番号77776−818)に添加した。この後に、5μlの6nM組換えヒトIL−18(インハウス、大腸菌(E.coli)由来)を添加し、次いで10nMのビオチン化IL−18Rβ、2.5nMのユウロピウムクリプテート標識IL−18Rαおよび30nMのストレプトアビジンXlent!(Cis Bio International,フランス,バニョル・シュル・セズ(Bagnols−sur−Ceze);カタログ番号611SAXLB)を含有する10μlの混合物を添加した。非特異的結合は、対照マウスモノクローナル抗ヒトIL−18抗体(Medical & Biological Laboratories Co.,日本,名古屋;クローン125−2H)を5nM最終濃度においてペリプラズム抽出物に代えて使用して測定した。全ての希釈は、0.4MのKFおよび0.1%のBSAを含有するPBS(アッセイ緩衝液)中で実施した。アッセイプレートを、室温において4時間インキュベートしてから、EnVisionプレートリーダー(Perkin Elmer,Waltham,Ma)を使用してユウロピウム分子を320nmにおいて励起させ、ユウロピウム分子についての620nmにおける発光およびXL665分子についての665nm発光波長を計測することにより時間分解蛍光を読み取った。
未精製ペリプラズム抽出物としてIL−18受容体アルファおよび受容体ベータ結合相互作用に対して顕著な阻害効果を示したscFv抽出物を、DNAシーケンシングに供した(Vaughan他(1996)Nature Biotechnology 14:309−314;Osbourn他(1996)Immunotechnology.2,181−196)。特有の配列を有するscFvを大腸菌(E.coli)中で発現させ、親和性クロマトグラフィーにより精製した(Bannister他(2006)Biotechnology and bioengineering,94.931−937により記載のとおり)。未精製scFvペリプラズム抽出物を精製scFvに置換して、セクション1.3に記載のHTRF(商標)アッセイにおける希釈系列の精製scFvを試験することにより平均scFv(av scFv)の効力を測定した。
Y=Bottom+(Top−Bottom)/(1+10exp((LogEC50−X)*HillSlope))
Xは、濃度の対数である。
Yは、特異的結合である
完全ヒト抗体重鎖および軽鎖をそれぞれ発現するベクター中に可変重鎖(VH)および可変軽鎖(VL)ドメインをサブクローニングすることにより、抗体1scFvをIgG2に再フォーマット化した。哺乳動物細胞中で完全IgG2重鎖を発現させるためのヒト重鎖定常ドメインおよび調節エレメントを含有する哺乳動物発現ベクター(pEU9.2)中に可変重鎖をクローニングした。同様に、哺乳動物細胞中で完全IgG軽鎖を発現させるためのヒトカッパ軽鎖定常ドメインおよび調節エレメントの発現のための哺乳動物発現ベクター(pEU3.4)中に可変軽鎖ドメインをクローニングした。重鎖および軽鎖の発現のためのベクターは、Persic他,(1997)Gene 187:9−18に最初に記載された。抗体1をIgG2として得るため、重鎖および軽鎖IgG発現ベクターをHEK293−EBNA哺乳動物細胞中に一過的に形質移入し、抗体を発現させ、培地中に分泌させた。回収した培地を精製前に遠心分離により澄明化した。IgGは、プロテインA(GE Healthcare)を使用して精製した。培養上清を、50mMのTris、0.15MのNaCl pH8緩衝液中で事前に平衡化した1mlカラム上にロードした。0.1MのシトレートpH3を使用してカラムから1MのTris pH10中にIgGを直接溶出させた。溶出物は、NAP−10緩衝液交換カラム(GE Healthcare)を使用して1×DPBSへの緩衝液交換に付した。精製IgGは、0.2マイクロメートル滅菌濾過し、内毒素について分析し、SDS PAGEにより特性決定し、280nmにおける吸光度により濃度測定した。
上記のとおり、IL−18、IL−18RαおよびIL−18Rβ複合体の形成を提示した精製抗体1scFvを、組換えIgG2に変換した。精製抗体1IgG2を系列希釈し、セクション1.3に記載のHTRF(商標)IL−18リガンド受容体アッセイにおいて試験した。抗体1のIgG2調製物は、ヒトIL−18/ヒトIL−18受容体複合体の形成を2.9nM(幾何平均、n=2;図2A)のIC50値で阻害した。
組換えヒトIL−18の生物学的活性を中和する抗体1IgG2の効力を、KG−1細胞アッセイを使用して確認した。KG−1細胞(ヒト骨髄性白血病細胞系)は、外因性組換えヒトIL−18に応答してIL−18RαおよびIL−18Rβ鎖を発現し、インターフェロン−ガンマ(IFNγ)を産生することが示されている(Konishi他(1997)J.Immunol.Methods 209(2):187−191)。KG−1細胞(ECACC,United Kingdom;カタログ番号86111306)を、Costar(登録商標)96ウェル平底組織培養処理プレート(Corning,Lowell,MA;カタログ番号3596)中に、培養培地(5%v/vの加熱不活化FBS、100U/mlのペニシリンおよび100μg/mlのストレプトマイシン[Invitrogen Corp.,Paisley,UK;カタログ番号15140−122]を含有するIMDM[Invitrogen Corp.,Paisley,UK;カタログ番号21980−032])中で105個の細胞/100μl/ウェルにおいてプレーティングした。IL−18と相乗作用してIFNγ産生を誘導することが示された組換え腫瘍壊死因子アルファ(TNFα)(R&D Systems Minneapolis,MN;カタログ番号210−TA)を、1.1nMの最終濃度において添加した。抗体1IgG2の効力を測定するため、U底96ウェルポリプロピレンプレート(Greiner Bio−One,Kremsmunster,Austria;カタログ番号650201)中で培養培地中で抗体の系列希釈物(700nMから0.1nMの細胞アッセイにおける最終濃度)を作製することにより試験溶液を調製した。組換えヒトIL−18(インハウス、大腸菌(E.coli)由来)をそれぞれのウェルに添加して3ng/mlから8ng/mlの細胞アッセイにおける最終濃度を得た。濃度は、最終濃度および1.1nMのTNFαの存在下で最大IFNγ分泌の約50%増加を与える用量に基づき選択した。抗体1/IL−18混合物を室温において30〜45分間インキュベートしてから100μlの試料を上記のとおり調製したKG−1細胞に移した。細胞を加湿雰囲気中で37℃/5%CO2中で22〜24時間インキュベートした後、150μlの上清をそれぞれのウェルから回収し、IFNγの濃度を下記のとおり測定した。
BIAcore2000(GE Healthcare)バイオセンサ装置を使用して抗体1と組換え発現ヒトIL−18との相互作用のキネティックパラメータを評価した。これらの実験は、本質的にはKarlsson他(1991)J.Immunol.Methods 145(1−2):229−240により記載のとおり実施した。
BIAcore2000バイオセンサ装置(GE Healthcare)を使用して、抗体1IgG2と一連の組換え発現IL−18タンパク質およびIL−18生物学に関連するタンパク質との相互作用の特異性を評価した。
抗体1がヒトIL−18へのヒトIL−18結合タンパク質(IL−18BP)の結合を阻害し得るか否かを決定するため、エピトープ競合アッセイを開発した。精製scFvまたはIgG2としての希釈系列の抗体1を、scFvについて4893nMから41.4pM、IgG2について987nMから16.8pMの範囲で調製した。10マイクロリットルのそれぞれの希釈物を、Costar(登録商標)384ウェルアッセイプレート(Corning,Lowell,MA;カタログ番号3676)中に移した。別個に、1.73nMのクリプテート標識抗FLAG抗体(Cis Bio International,Bagols−sur−Ceze,フランス;カタログ番号61FG2KLB)を、FLAGおよびHisタグを含有する3.2nMのバキュロウイルス産生IL−18(インハウス)と合わせた。5マイクロリットルのこの混合物を、抗体1scFvまたはIgG2を有するアッセイプレートに添加した。ヒトIL−18BPa−Fc(R&D Systems,Minneapolis,MN;カタログ番号119BP)を、EZ linkスルホ−NHS−LC−ビオチン(Thermo Fisher Scientific,Rochester NY;カタログ番号21335)をpH8のPBS中で使用して遊離アミンを介してビオチン化した。0.8nMのビオチン化IL−18BPa−Fcを、20nMのストレプトアビジンXlent!(Cis Bio International.カタログ番号611SAXLB)と合わせ、5μlのこの溶液をアッセイプレートに添加した。
抗体最適化
2.1 標的化突然変異導入による抗体1の最適化
標的化突然変異導入アプローチおよび親和性ベースファージディスプレイ選択を使用して、ヒトおよびアカゲザルIL−18の両方に対する親和性の改善のために抗体1を最適化した。抗体1に由来するラージscFv−ファージライブラリーを、Clackson and Lowman(2004)A Practical Approach,2004.Oxford University Pressにより記載される標準的分子生物学的技術を使用して可変重鎖(VH)および軽鎖(VL)相補性決定領域3(CDR3)のオリゴヌクレオチド指向突然変異導入により作出した。
組換えヒトおよびアカゲザルIL−18への結合を改善し得るscFv可変ドメイン内の重要な残基を同定するためのランダム突然変異導入アプローチを使用して、抗体6および抗体7をさらに最適化した。抗体6および7の可変領域全体にわたるランダム突然変異の導入によりラージscFv−リボソームディスプレイライブラリーを生成した。この生成は、A Diversify(商標)PCRランダム突然変異導入キット(BD biosciences,Franklin Lakes NJ;カタログ番号630703)を製造業者の指示書に従って使用する2ラウンドの突然変異導入により達成して、突然変異導入1ラウンド当たり核酸配列の1キロベース当たり平均8.1個の突然変異を取り込んだ。選択は、本質的には、既に記載されているとおり実施した(Hanes他(2000)Methods in Enzymology 328:404−430)。簡潔に述べると、標的化CDR3ランダム化戦略から同定した2つのリードクローン(抗体6および抗体7)のランダム突然変異導入ライブラリーを、mRNAに転写し、続いてプールして1つのライブラリーを作出した。翻訳停止のプロセスを使用して、mRNA−リボソーム−scFv複合体を形成した(Hanes J and Plueckthun A.(1997)Proc Natl Acad Sci USA.1997年5月 13;94(10):4937−42)。次いで、これらの複合体を、減少濃度のビオチン化ヒトIL−18またはビオチン化アカゲザルIL−18(3ラウンドにわたり1nMから30pM)の存在下でインキュベートする3ラウンドの選択に供して、IL−18のヒトおよびアカゲザル形態の両方についてより高い親和性を有する変異体について選択した。次いで、抗原と結合したそれらの複合体をストレプトアビジンコート常磁性ビーズ(Dynabeads(商標))上で捕捉した。非特異的リボソーム複合体を洗い流し、結合したリボソーム複合体からmRNAを単離し、cDNAに逆転写し、次いでPCRにより増幅した。このDNAを次のラウンドの選択に使用し、および/またはスクリーニングのためにクローンアウトした。リボソームディスプレイ構築物をNco1/Not1制限エンドヌクレアーゼにより消化し(New England Biolabs,Ipswich MA)、次いでNco1/Not1消化pCANTAB6中にT4DNAリガーゼ(New England Biolabs,Ipswich MA)(McCafferty他(1994)Appl.Biochem.Biotech.47:157−171,)を使用してライゲートすることにより、リボソームディスプレイにより単離されたscFvをファージミドベクターpCANTAB6中にクローニングした。
セクション2.1に記載の標的化突然変異導入アプローチからの選択ラウンド2および3からランダムに選択された880個のscFvを細菌中で発現させ、未精製scFvをエピトープ競合HTRF(商標)アッセイフォーマット中でスクリーニングした。このアッセイにおいて、未精製scFvは、ユウロピウムクリプテート標識ヒトIL−18(インハウス)への結合について抗体1IgG2と競合した。組換えヒトIL−18のユウロピウムクリプテート標識は、トリスビピリジン−Eu3+−クリプテート−4−カルボキシ−4’−(マレイミドプロピオンアミド−2−アミノエチル−アミノカルボニル)(Cis bio International,フランス,バニョル・シュル・セズ(Bagnols−sur−Ceze);カタログ番号65EUMABA)を中性pHのPBS中で使用して達成した。選択産物は、50mMのMOPS緩衝液pH7.4、0.5mMのEDTAおよび0.5Mのスクロース中で調製された未精製scFvを含有する未希釈または希釈ペリプラズム抽出物としてスクリーニングし、0.4MのKFおよび0.1%のBSAを含有するリン酸緩衝生理食塩水(PBS)(アッセイ緩衝液)中で希釈した。24ナノモル濃度の抗体1IgG2および30nMの抗ヒトFcXL665(Cis Bio International,フランス,バニョル・シュル・セズ(Bagnols−sur−Ceze);カタログ番号61HFCXLA)を、アッセイ緩衝液中で一緒に希釈した。10マイクロリットルのこの溶液をCostar(登録商標)384ウェルアッセイプレート(Corning,Lowell,MA;カタログ番号3676)に移した。5マイクロリットルの未精製scFvをアッセイプレートに添加し、次いで1.2nMに希釈したユウロピウムクリプテート標識組換えヒトIL−18を添加した。非特異的結合は、モノクローナルマウス抗ヒトIL−18クローン125−2H(R&D Systems,Minneapolis,MN)を20nMの最終濃度において使用して測定した。アッセイプレートを室温において3時間インキュベートしてから、セクション1.3に記載のとおりEnVisionプレートリーダー(Perkin Elmer,Boston MA)を使用して620nmおよび665nmの発光波長における時間分解蛍光を読み取った。データは、セクション1.3に記載の式を使用して特異的結合%として算出した。顕著な阻害特性を示し、抗体1IgG2がIL−18に結合するのを妨げるscFvを、DNAシーケンシングに供し、特有の配列を有するscFvを精製調製物として調製した。
標的化突然変異導入およびランダム突然変異導入により生成した精製最適化scFv抗体の効力も、ヒトおよびアカゲザルIL−18をアゴニストとして使用するIFNγ放出KG−1細胞アッセイにおいて測定した。アッセイは、セクション1.7に記載のとおり設定した。一部の実験において、ヒトIL−18を組換えアカゲザルIL−18(R&D systems,Minneapolis MN;カタログ番号2548−RM/CF)により置き換え、4ng/mlの最終濃度において使用した。scFvを、100nMから0.03nMの最終濃度範囲において試験した。精製scFv抗体についての効力の例を表1に提供する。抗体7、抗体9および抗体10scFvについての代表的データを図5に示す。
完全ヒト抗体重鎖および軽鎖をそれぞれ発現するベクター中に可変重鎖(VH)および可変軽鎖(VL)ドメインをサブクローニングすることにより、scFvをIgG2に再フォーマット化した。哺乳動物細胞中で完全IgG2重鎖を発現させるためのヒト重鎖定常ドメインおよび調節エレメントを含有する哺乳動物発現ベクター(pEU9.2)中に可変重鎖をクローニングした。同様に、哺乳動物細胞中で完全IgG軽鎖を発現させるためのヒトカッパ軽鎖定常ドメインおよび調節エレメントの発現のための哺乳動物発現ベクター(pEU3.4)中に可変軽鎖ドメインをクローニングした。抗体をIgG2として得るため、重鎖および軽鎖IgG発現ベクターをHEK293−EBNA哺乳動物細胞中に一過的に形質移入し、抗体を発現させ、培地中に分泌させた。回収した培地を精製前に遠心分離により澄明化した。IgGは、プロテインA(GE Healthcare)を使用して精製した。培養上清を、50mMのTris、0.15MのNaCl pH8緩衝液中で事前に平衡化した1mlカラム上にロードした。0.1MのシトレートpH3を使用してカラムから1MのTris pH10中にIgGを直接溶出させた。溶出物は、NAP−10緩衝液交換カラム(GE Healthcare)を使用して1xDPBSへの緩衝液交換に付した。精製IgGは、0.2マイクロメートル滅菌濾過し、内毒素について分析し、SDS PAGEにより特性決定し、280nmにおける吸光度により濃度測定した。
KG−1細胞アッセイにおける最も強力なscFvクローンを、上記のとおり(セクション2.5)IgGに変換し、この細胞アッセイにおいて20nMから0.002nMの最終濃度範囲において再試験した。精製IgG抗体についての効力の例を表2に提供する。
抗体1および親和性最適化抗IL−18抗体のVHおよびVLドメインのアミノ酸配列を、VBASEデータベース(Tomlinson(1997)Journal of Molecular biology 224:487−499)中の既知のヒト生殖細胞系列配列にアラインし、最も近縁な生殖細胞系列を配列類似性により同定した。最適化抗体系列のVHドメインについて、これはVh4_DP−66_(4−61)であった。VLドメインについて、これはVκ1_L12であった。不変のままであったバーニア残基(Foote & Winter(1992)J Mol Biol.224(2):487−99)を除き、生殖細胞系列化プロセスは、VHおよびVLドメインのフレームワーク残基を最も近縁な生殖細胞系列配列に復帰させて同等にヒト抗体に適合させることであった。産生した全ての抗体のVHおよびVLドメイン配列を表12および13に示す。これらのアミノ酸残基の生殖細胞系列化は、適切な突然変異導入プライマーを用いる標準的な部位特異的突然変異導入技術を使用して実施した。次いで、ランダム突然変異導入戦略からCDR中に導入された変化を完全に生殖細胞系列化された骨格中に導入した。次いで、IgG2またはIgG1TMフォーマットの生殖細胞系列化抗体を、KG−1細胞アッセイにおいて再評価して効力の顕著な低減が存在しなかったことを確認した。生殖細胞系列化(GL)抗体の効力の例を表3に提供する。抗体8GL、抗体11GLおよび抗体12GLIgGの代表的データを図6に示す。
生殖細胞系列化IgGを、組換えヒトおよびアカゲザルIL−18を阻害するそれらの効力の他、内因的に産生されるIL−18を中和するそれらの能力について試験した。末梢血単核細胞(PBMC)を、ヒト軟膜血液またはカニクイザル血液から精製し、LPS(Sigma−Aldrich,St Louis MO;カタログ番号L−6143)および組換えヒトIL−12(R&D Systems,Minneapolis MN;カタログ番号219−IL)により刺激して、IL−18依存性機構を介してIFNγ放出を誘発した。内因性IL−18にアンタゴナイズし、結果的にIFNγ産生を遮断する最適化生殖細胞系列化IgGの能力を、このアッセイにおいて評価した。簡潔に述べると、PBMCを培養培地(10%v/vの熱不活化FBS[SAFC Biosciences;カタログ番号12076C]、100U/mlのペニシリンおよび100μg/mlのストレプトマイシン[Invitrogen Corp.,Paisley,UK;カタログ番号15140−122]を含有するRPMI−1640[Invitrogen Corp.,Paisley,UK;カタログ番号61870−010])中で、300gにおける遠心分離により10分間洗浄した。PBMCを培養培地中で再懸濁し、Costar(登録商標)96ウェル平底組織培養処理プレート(Corning,Lowell,MA;カタログ番号3596)中に、4×105個の細胞/100μl/ウェル(抗体8GLIgG2、抗体11LIgG2および抗体12GLIgG2の評価について)または2×105個の細胞/100μl/ウェル(抗体12GLIgG1TMについて)においてプレーティングした。最適化生殖細胞系列化IgGの効力を測定するため、U底96ウェルポリプロピレンプレート(Greiner Bio−One;Kremsmunster,Austria;カタログ番号650201)中の培養培地中でIgGの系列希釈物(2.5pMから16.7nMの細胞アッセイにおける最終濃度)を作製することにより試験溶液を調製した。50マイクロリットルのこれらの溶液を、PBMCを含有するプレートのウェルに移した。内因性IL−18の産生を誘発するため、次いでLPS(Sigma−Aldrich,St Louis MO;カタログ番号L−6143)および組換えヒトIL−12(R&D Systems,Minneapolis MN;カタログ番号219−IL)(両方1ng/ml最終)の50μlの混合物を添加することにより細胞を刺激した。細胞を加湿雰囲気中で37℃/5%CO2において24時間インキュベートした後、150μlの上清をそれぞれのウェルから回収し、IFNγの濃度をセクション1.7に記載のとおり測定した。
CD11bは、活性化の間に好中球上で上方調節されることが示されている。これらの細胞は、多数の炎症性障害において重要な役割を担い、インビトロIL−18誘導性CD11b上方調節を阻害する抗体12GLIgG1TMの能力をフローサイトメトリーにより測定した。
適切な同時刺激物質、例えばホルミル化ペプチドの存在下、IL−18は好中球による多数の炎症性促進メディエーター、例として活性酸素種(ROS)の産生を促進することが示された(Elbin他(2005)Clin Diagn Lab Immunol.12(3):436−46)。好中球によるホルミルペプチド誘導性ROS産生のIL−18誘導性増強をインビトロで阻害する抗体12GLIgG1TMの能力を、フローサイトメトリーにより評価した。
上記セクション(セクション1.8)に詳述したとおりBIAcore2000またはT−100(GE Healthcare)バイオセンサ装置を使用して抗IL−18抗体、抗体8GLおよび抗体12GLと、組換え発現ヒトIL−18(インハウス、大腸菌(E.coli)由来)またはアカゲザルIL−18(R&D systems,Minneapolis MN;カタログ番号2548−RM)との相互作用のキネティックパラメータを評価した。
競合アンタゴニストの親和性を定量するための主要な薬理学的ツールは、Schild分析である。このアプローチを使用して、機能アッセイにおけるアンタゴニスト親和性を推定する系非依存性手段を決定することができる。この方法は、アンタゴニスト濃度およびその親和性がアゴニスト応答のアンタゴニズムを決定するという概念に基づく。アンタゴニズムは定量することができ、アンタゴニストの濃度が既知であるため、アンタゴニストの親和性を測定することができる。このアンタゴニズムは、用量比(DR)と称される、アンタゴニストの存在下および不存在下で計測されるアゴニストの等活性(equiactive)濃度の比を計測することにより定量する。
Log(DR−1)=log[B]−logKB
(式中、[B]は結合メンバーの分子濃度である)
であるSchild式に従ってlog(DR−1)とlog[結合メンバー]の間に線形関係が存在する。
pA2=log(DR−1)−log[B]
から用量比についての単一値をもたらす単一濃度のアンタゴニストからpA2を算出することにより定量することができる。
[B]は、元の最大以下の応答を引き出すアゴニスト濃度を倍加するために必要であるアンタゴニストのモル濃度である。
DR=用量比であり、アンタゴニストの存在下および不存在下で計測されたアゴニストの等量活性の濃度の比を計測することにより定量される。
pA2は、用量応答アッセイデータから算出することができる。
BIAcore2000またはT−100(GE Healthcare)バイオセンサ装置を使用して抗IL−18抗体、抗体8GLおよび抗体12GLと、一連の組換え発現IL−18および関連タンパク質との相互作用の特異性を評価した。
精製抗体12GLIgG2の希釈系列物を調製して、抗体がIL−18とIL−18BPとの結合相互作用を阻害し得るか否かを決定し、したがって抗体12GLが組換えヒトIL−18上のIL−18BPと同一のコンフォメーショナルエピトープに結合したことを示し得るか否かを判定した。このアッセイはセクション1.10に記載のとおり設定した。
ヒトIL−18への結合についての抗体12GLIgG1TMとIL−18BPとの競合の評価を、Biacore2000またはT100と類似の様式で作動するProteOn XPR装置(Bio−Rad,Hercules CA)を使用してさらに評価した。この実験において、12GLIgG1TMまたはIL−18BPa−Fc(R&D Systems,Minneapolis MN;カタログ番号119−BP)の3つの異なる密度(230〜6340RUの範囲)のアミン連結表面は、100nM溶液(10RUから330RUの最終密度)からヒトIL−18(インハウス、大腸菌(E.coli)由来)を捕捉させ、次いで安定化させた。その後、さらなる抗体12GLIgG1TMおよびIL−18BPを100nMにおいて、捕捉されたIL−18上で通過させ、得られたセンサグラムを調査してそれらがIL−18への結合であるか否かを決定した。さらなる結合は、抗体12GLIgG1TMまたはIL−18BPa−Fcの組合せのいずれにおいても観察されなかった。このことは、抗体12GLIgG1TMおよびIL−18BPaがIL−18上の重複するエピトープを有する指標を提供する。
結晶学的試験
3.1 ヒトIL−18および抗体12GLFab断片の精製
ヒトIL−18構築物、セクション1.1に挙げたHis−GST−IL−18を、大腸菌(E.coli)中で可溶性発現に付した。タンパク質は、標準的な親和性クロマトグラフィーにより精製し、次いでXa因子開裂した。次いで、開裂したタンパク質をアニオン交換クロマトグラフィーおよび標準的な親和性クロマトグラフィーにより精製していかなる汚染開裂タグも除去し、次いで結晶解析のために遠心分離濃縮デバイスを使用してタンパク質を濃縮した。
抗体12GLFabおよびヒトIL−18(インハウス、大腸菌(E.coli)由来)を、1:1のモル比(IL−18がわずかに過剰)で混合し、+4℃において一晩穏やかに撹拌した。形成された複合体を過剰のIL−18から、20mMのHEPES、pH 7.5、150mMのNaCl中で2.5mL/分において平衡化したHiLoad Superdex75pg26/60カラム(GE Healthcare)上でのサイズ排除クロマトグラフィーにより分離した。複合体を単一ピークとして溶出させ、回収し、10kDaのMWCOを有するAmicon遠心分離デバイスを使用して10mg/mLに濃縮した。
広範な蒸気拡散結晶化試験を、タンパク質緩衝液(20mMのHEPES pH7.5、150mMのNaCl)中15mg/mLの濃度のIL−18:抗体12GLFab複合体について設定して結晶化条件を同定した。タンパク質を遠心分離してから100nLタンパク質溶液および100nLウェル溶液を有するIntelli−plate Flat ledge(Art Robbins)中でシッティングドロップを設定した。第1の結晶は、エタノール、3−メチル−1,5−ペンタジオール(MPD)またはその両方を含有するドロップ中で数週間以内に現れた。結晶は、針または針の束として現れ、回折実験に有用でなかった。結晶はUV顕微鏡観察によりタンパク質であることを確認した。
ヒトIL−18:抗体12GL複合体の結晶を、空間群P3121で得た。電子密度マップの全体の質は良好であり、残基の97%の明確なモデリングを可能とした。特に、エピトープおよびパラトープ領域を十分に規定した。IL−18の最終モデルは、残基1〜156を含有する。2つのループ領域を電子密度で無秩序化し(残基33〜41および131〜132)、それらの一部をモデルから除外した。同一のループを、エクトウイルス(ectovirus)(PDBアクセッションコード3F62;Krumm他 2008(前掲))からのIL−18BPとの複合体中のIL−18の公開結晶構造のモデルから除外し、未結合IL−18の溶液構造で高度にフレキシブルであると報告する(PDBコード1J0S;Kato他(2003)Nat Struct Biol 10(11):966−971)。抗体12GLFabの最終モデルは、軽鎖(LC)残基1〜213(非対称単位の第2の分子について1〜212)および重鎖(HC)1〜226からなる。最終モデルは、IL−18−抗体12GLFab複合体の2つのコピーおよび79個の水分子を含有する。
遊離IL−18アッセイ
遊離IL−18の濃度を、エレクトロルミネセント(ECL)イムノアッセイにより測定した。
Claims (95)
- ヒトIL−18上のIL−18BP結合部位と完全にまたは部分的に重複するヒトIL−18のエピトープに特異的に結合するヒトIl−18についての単離された抗体分子。
- 残基Tyr1、Gly3、Leu5、Glu6、Lys8、Met51、Lys53、Asp54、Ser55、Gln56、Pro57、Arg58、Gly59、Met60、Arg104、Ser105およびPro107の1つ以上を含むヒトIL−18のエピトープに特異的に結合する、請求項1に記載の抗体分子。
- 前記エピトープが、残基Tyr1、Gly3、Leu5、Glu6、Lys8、Met51、Lys53、Asp54、Ser55、Gln56、Pro57、Arg58、Gly59、Met60、Arg104、Ser105およびPro107を含む、請求項2に記載の抗体分子。
- IL−18受容体(IL−18R)および/またはIL−18結合タンパク質(IL−18BP)へのIL−18結合を阻害する、請求項1〜3のいずれか一項に記載の抗体分子。
- IL−18への結合についてIL−18BPと競合する、請求項1〜4のいずれか一項に記載の抗体分子。
- IL−18へのIL−18BP結合の少なくとも90%の阻害を示す、請求項5に記載の抗体分子。
- ヒトIL−18に1nM未満のIC50値において結合する、請求項1〜6のいずれか一項に記載の抗体分子。
- 9 10−5s−1未満のヒトIL−18についての解離定数(kd)を示す、請求項1〜7のいずれか一項に記載の抗体分子。
- 10nM未満、好ましくは100pM未満のヒトIL−18についての親和性(kD)を示す、請求項1〜8のいずれか一項に記載の抗体分子。
- 規定される親CDR:HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2およびLCDR3のセットを含み、
HCDR1が、アミノ酸配列の配列番号153を有し;
HCDR2が、アミノ酸配列の配列番号154を有し;
HCDR3が、アミノ酸配列の配列番号155を有し;
LCDR1が、アミノ酸配列の配列番号158を有し;
LCDR2が、アミノ酸配列の配列番号159を有し;
LCDR3が、アミノ酸配列の配列番号160を有し;
または1つ以上のアミノ酸置換、欠失もしくは挿入を有する親のCDRのセットを含む、
請求項1〜9のいずれか一項に記載の抗体分子。 - (a)配列番号153と同一の、またはそれに対して3つ以下のアミノ酸残基置換を含むアミノ酸配列を有するHCDR1;
(b)配列番号154と同一の、またはそれに対して4つ以下のアミノ酸残基置換を含むアミノ酸配列を有するHCDR2;
(c)配列番号155と同一の、またはそれに対して5つ以下のアミノ酸残基置換を含むアミノ酸配列を有するHCDR3;
(d)配列番号158と同一の、またはそれに対して4つ以下のアミノ酸残基置換を含むアミノ酸配列を有するLCDR1;
(e)配列番号159と同一の、またはそれに対して4つ以下のアミノ酸残基置換を含むアミノ酸配列を有するLCDR2;および
(f)配列番号160と同一の、またはそれに対して9つ以下のアミノ酸残基置換を含むアミノ酸配列を有するLCDR3
含む、請求項9に記載の抗体分子。 - HCDR3において、
Kabat残基97が、Alaであり;
Kabat残基98が、Tyrであり;
Kabat残基99が、AspまたはPheであり;
Kabat残基100が、Glyであり;
Kabat残基100Dが、AlaまたはThrであり;
Kabat残基100Eが、Aspである、
請求項10または11に記載の抗体分子。 - HCDR3において、
Kabat残基95が、Thrであり;
Kabat残基96が、Proであり
Kabat残基97が、Alaであり;
Kabat残基98が、Tyrであり;
Kabat残基99が、AspもしくはPheであり;
Kabat残基100が、Glyであり;
Kabat残基100Aが、AspもしくはGlnであり;
Kabat残基100Bが、AlaもしくはAspであり;
Kabat残基100Cが、Argであり
Kabat残基100Dが、AlaもしくはThrであり;
Kabat残基100Eが、Aspであり;
Kabat残基100Fが、Pheであり;
Kabat残基100Gが、Pheであり;
Kabat残基101が、Aspであり;および/または
Kabat残基102が、Valである、
請求項10〜12のいずれか一項に記載の抗体分子。 - HCDR3において、
HCDR3のKabat残基99が、Pheであり;
HCDR3のKabat残基100aが、Glnであり;
HCDR3のKabat残基100bが、Aspであり;および/または
HCDR3のKabat残基100dが、Thrである、
請求項10〜13のいずれか一項に記載の抗体分子。 - HCDR3が、配列番号5、15、25、35、45、55、65、75、85、95、105、115、125、135、145、または155のいずれか1つである、請求項10〜14のいずれか一項に記載の抗体分子。
- HCDR3が、アミノ酸配列の配列番号155である、請求項15に記載の抗体分子。
- HCDR2において、
Kabat残基52が、Tyrであり;
Kabat残基53が、Tyrであり;
Kabat残基58が、Tyrである、
請求項10〜16のいずれか一項に記載の抗体分子。 - HCDR1において、
Kabat残基35が、Tyrである、
請求項10〜17のいずれか一項に記載の抗体分子。 - LCDR3のKabat残基92が、Tyr、Ser、Leu、His、もしくはAlaであり;
LCDR3のKabat残基93が、Ser、Phe、Tyr、His、もしくはIleであり;および/または
LCDR3のKabat残基94が、ThrもしくはProである、
請求項10〜18のいずれか一項に記載の抗体分子。 - LCDR3のKabat残基91が、SerもしくはIleであり;
LCDR3のKabat残基92が、Hisであり;
LCDR3のKabat残基93が、Hisであり;および/または
LCDR3のKabat残基94が、Proである、
請求項10〜19のいずれか一項に記載の抗体分子。 - LCDR3のKabat残基89が、GlnもしくはAlaであり;
LCDR3のKabat残基90が、Gln、Asp、もしくはAsnであり;
LCDR3のKabat残基91が、SerもしくはIleであり;
LCDR3のKabat残基95が、Pro、Asn、もしくはGlnであり
LCDR3のKabat残基96が、Trpであり、および/または
LCDR3のKabat残基97が、ThrもしくはAspである、
請求項10〜20のいずれか一項に記載の抗体分子。 - LCDR3が、配列番号10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、または160である、請求項10〜21のいずれか一項に記載の抗体分子。
- LCDR3が、アミノ酸配列の配列番号160である、請求項21に記載の抗体分子。
- HCDR1が、配列番号3、103、113または153であり;HCDR2が、配列番号4、124、134、144、または154である、請求項9〜21のいずれか一項に記載の抗体分子。
- HCDR1が、アミノ酸配列の配列番号153であり;および/またはHCDR2が、アミノ酸配列の配列番号154である、請求項22に記載の抗体分子。
- LCDR1において、
Kabat残基30が、Serであり;
Kabat残基32が、Trpである、
請求項10〜25のいずれか一項に記載の抗体分子。 - LCDR1が、アミノ酸配列の配列番号158であり;および/または
LCDR2が、アミノ酸配列の配列番号159である、
請求項10〜26のいずれか一項に記載の抗体分子。 - 抗体1、抗体1GL、抗体2、抗体3、抗体4、抗体5、抗体6、抗体6GL、抗体7、抗体7GL、抗体8GL、抗体9、抗体10、抗体11、抗体11_GL、および抗体12GLの抗体のいずれかについての表11に示すCDRのセットを含む、請求項1〜27のいずれか一項に記載の抗体分子。
- 抗体VHドメインおよび抗体VLドメインを含み、
前記VHドメインが、それぞれ配列番号153、154および155のアミノ酸配列を有するHCDR1、HCDR2、HCDR3を含み;
前記VLドメインが、それぞれ配列番号158、159および160のアミノ酸配列を有するLCDR1、LCDR2、LCDR3を含む、
請求項1〜28のいずれか一項に記載の抗体分子。 - 前記重鎖および/または軽鎖フレームワーク領域が、ヒト生殖細胞系列遺伝子セグメント配列に生殖細胞系列化されている、請求項1〜29のいずれか一項に記載の抗体分子。
- VL FW1 kabat残基1が、Aspである、請求項1〜30のいずれか一項に記載の抗体分子。
- 配列番号2、12、22、32、42、52、62、72、82、92、102、112、122、132、142、および152から選択される配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有するVHドメインを含む、請求項1〜31のいずれか一項に記載の抗体分子。
- 前記VHドメインが、配列番号2、12、22、32、42、52、62、72、82、92、102、112、122、132、142、および152から選択される、請求項32に記載の抗体分子。
- 配列番号7、17、27、37、47、57、67、77、87、97、107、117、127、137、147、および157から選択される配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有するVLドメインを含む、請求項1〜33のいずれか一項に記載の抗体分子。
- 前記VLドメインが、配列番号7、17、27、37、47、57、67、77、87、97、107、117、127、137、147、および157から選択される、請求項34に記載の抗体分子。
- 抗体VHドメインおよび抗体ドメインVLを含み、前記抗体VHドメインおよび前記抗体VLドメインのアミノ酸配列が、それぞれ配列番号2および7、それぞれ配列番号12および17;それぞれ配列番号22および27;それぞれ配列番号32および37;それぞれ配列番号42および47;それぞれ配列番号52および57;それぞれ配列番号62および67;それぞれ配列番号72および77;それぞれ配列番号82および87;それぞれ配列番号92および97;それぞれ配列番号102および107;それぞれ配列番号112および117;それぞれ配列番号122および127;それぞれ配列番号132および137;それぞれ配列番号142および147;またはそれぞれ配列番号152および157と少なくとも90%同一である、請求項1〜31のいずれか一項に記載の抗体分子。
- 抗体VHドメインおよび抗体VLドメインを含み、前記抗体VHドメインおよび前記抗体VLドメインのアミノ酸配列が、それぞれ配列番号2および7、それぞれ配列番号12および17;それぞれ配列番号22および27;それぞれ配列番号32および37;それぞれ配列番号42および47;それぞれ配列番号52および57;それぞれ配列番号62および67;それぞれ配列番号72および77;それぞれ配列番号82および87;それぞれ配列番号92および97;それぞれ配列番号102および107;それぞれ配列番号112および117;それぞれ配列番号122および127;それぞれ配列番号132および137;それぞれ配列番号142および147;またはそれぞれ配列番号152および157である、請求項36に記載の抗体分子。
- 前記抗体VHドメインのアミノ酸配列が、配列番号152と少なくとも90%同一であり、前記抗体VLドメインのアミノ酸配列が、配列番号157と少なくとも90%同一である、請求項1〜29のいずれか一項に記載の抗体分子。
- 前記抗体VHドメインのアミノ酸配列が、配列番号152であり、前記抗体VLドメインのアミノ酸配列が、配列番号157である、請求項38に記載の抗体分子。
- 配列番号152のアミノ酸配列を有する抗体VHドメインおよび抗体VLドメイン配列の配列番号157を含む抗体分子と、IL−18への結合について競合する抗体分子。
- 寄託アクセッション番号NCIMB41786の核酸配列によりコードされるVHおよびVLドメインを含む抗体分子。
- scFvである、請求項1〜41のいずれか一項に記載の抗体分子。
- 抗体定常領域を含む、請求項1〜41のいずれか一項に記載の抗体分子。
- モノクローナル抗体である、請求項43に記載の抗体分子。
- キメラ抗体、ヒト化抗体、または完全ヒト抗体である、請求項44に記載の抗体分子。
- IgGである、請求項43〜45のいずれか一項に記載の抗体分子。
- IgG1またはIgG4である、請求項46に記載の抗体分子。
- YTEおよびTM突然変異をFc領域中に有するIgG1である、請求項47に記載の抗体分子。
- 請求項1〜48のいずれか一項に記載の抗体分子の単離されたVHドメイン。
- 請求項1〜48のいずれか一項に記載の抗体分子の単離されたVLドメイン。
- 請求項1〜48のいずれか一項に記載の単離された抗体分子および薬学的に許容可能な賦形剤を含む組成物。
- ヒトまたは動物体の治療方法において使用される、請求項1〜48のいずれか一項に記載の抗体分子を含む組成物。
- 個体におけるIL−18活性の減少において使用される、請求項52に記載の組成物。
- 個体におけるIL−18発現または活性の増加に関連する疾患の治療において使用される、請求項52または53に記載の組成物。
- 前記疾患が、炎症、心血管または自己免疫疾患である、請求項54に記載の組成物。
- 前記疾患が、急性冠症候群(AVS);アテローム性動脈硬化症;および慢性閉塞性肺疾患(COPD)から選択される、請求項55に記載の組成物。
- 個体におけるIL−18の活性を減少させるための医薬品の製造のための、請求項1〜48のいずれか一項に記載の抗体分子の使用。
- 個体におけるIL−18発現または活性の増加に関連する疾患の治療のための医薬品の製造のための、請求項1〜46のいずれか一項に記載の抗体分子の使用。
- 前記疾患が、炎症、心血管または自己免疫疾患である、請求項58に記載の使用。
- 前記疾患が、急性冠症候群(AVS);アテローム性動脈硬化症;および慢性閉塞性肺疾患(COPD)から選択される、請求項59に記載の使用。
- 個体を治療する方法であって、請求項1〜48のいずれか一項に記載の抗体分子を前記個体に投与することを含む方法。
- 前記抗体分子が、前記個体におけるIL−18の活性を減少させる、請求項61に記載の方法。
- 個体におけるIL−18発現または活性の増加に関連する疾患の治療のための、請求項61または62に記載の方法。
- 前記疾患が、炎症、心血管または自己免疫疾患である、請求項63に記載の方法。
- 前記疾患が、急性冠症候群(ACS);アテローム性動脈硬化症;および慢性閉塞性肺疾患(COPD)から選択される、請求項64に記載の方法。
- 請求項1〜48のいずれか一項に記載の抗体分子、請求項49に記載のVHドメインまたは請求項50に記載のVLドメインをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子。
- 請求項66に記載の核酸によりインビトロで形質転換された宿主細胞。
- 抗体VHまたはVLドメインを産生する方法であって、前記抗体分子VHまたはVLドメインの産生のための条件下で請求項67に記載の宿主細胞を培養することを含む方法。
- 前記抗体分子VHドメインまたはVLドメインを単離および/または精製することをさらに含む、請求項68に記載の方法。
- 前記抗体分子VHドメインまたはVLドメインを、少なくとも1つの追加の構成要素を含む組成物に製剤化することをさらに含む、請求項69に記載の方法。
- ヒトIL−18についての抗体抗原結合ドメインを産生する方法であって、
HCDR1、HCDR2およびHCDR3を含む親VHドメイン(前記親VHドメインHCDR1、HCDR2およびHCDR3は、表11に示されるHCDRのセットである)のアミノ酸配列中の1つ以上のアミノ酸の付加、欠失、置換または挿入を用いて、前記親VHドメインのアミノ酸配列変異体であるVHドメインを提供し、場合によりこうして提供した前記VHドメインを1つ以上のVLドメインと組み合わせて1つ以上のVH/VL組合せを提供すること;ならびに
前記親VHドメインのアミノ酸配列変異体である前記VHドメインまたはVH/VL組合せを試験してIL−18についての抗体抗原結合ドメインを同定すること
を含む方法。 - 前記親VHドメインが、配列番号152に記載のVHドメインである、請求項71に記載の方法。
- 前記1つ以上のVLドメインを、LCDR1、LCDR2およびLCDR3を含む親VLドメインのアミノ酸配列中の1つ以上のアミノ酸の付加、欠失、置換または挿入の手法により提供し、前記親VLドメインLCDR1、LCDR2およびLCDR3は、表11に示されるCDRのVLセットであり、それぞれが前記親VLドメインのアミノ酸配列変異体である1つ以上のVLドメインを産生する、請求項71または72に記載の方法。
- 前記親VLドメインが、配列番号157に記載のVLドメインである、請求項73に記載の方法。
- 前記親VHドメインのアミノ酸配列変異体である前記VHドメインを、CDR突然変異導入により提供する、請求項71〜74のいずれか一項に記載の方法。
- IgG、scFvまたはFab抗体分子の構成要素としての前記抗体抗原結合ドメインを産生することをさらに含む、請求項71〜75のいずれか一項に記載の方法。
- ヒトIL−18に結合する結合メンバーを産生する方法であって、
VHドメインをコードする出発核酸またはVHドメインをそれぞれコードする核酸の出発レパートリーを提供すること(前記VHドメインが、置き換えるべきHCDR1、HCDR2および/またはHCDR3を含み、またはHCDR1、HCDR2および/またはHCDR3コード領域を欠く);
前記出発核酸または出発レパートリーを、表11に示されるHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3のアミノ酸配列をコードするドナー核酸またはその突然変異により産生されたドナー核酸と組み合わせて前記ドナー核酸が前記出発核酸または出発レパートリー中のCDR1、CDR2および/またはCDR3領域中に挿入されるようにしてVHドメインをコードする核酸の産物レパートリーを提供すること;
前記産物レパートリーの核酸を発現させて産物VHドメインを産生すること;
場合により、前記産物VHドメインを1つ以上のVLドメインと組み合わせること;
産物VHドメインおよび場合によりVLドメインを含む、IL−18についての結合メンバーを選択すること;ならびに
前記結合メンバーまたはそれをコードする核酸を回収すること
を含む方法。 - 前記ドナー核酸を、前記HCDR1および/またはHCDR2の突然変異により産生する、請求項77に記載の方法。
- 前記ドナー核酸をHCDR3の突然変異により産生する、請求項77に記載の方法。
- 前記ドナー核酸を、核酸のランダム突然変異により提供することを含む、請求項77に記載の方法。
- 回収した結合メンバー内に含まれる産物VHドメインを抗体定常領域に付着させることをさらに含む、請求項77〜80のいずれか一項に記載の方法。
- 前記産物VHドメインおよびVLドメインを含むIgG、scFvまたはFab抗体分子を提供することを含む、請求項77〜80のいずれか一項に記載の方法。
- IL−18に結合する前記抗体抗原結合ドメインまたは結合メンバーを、IL−18RへのヒトIL−18の結合阻害能について試験することをさらに含む、請求項77〜82のいずれか一項に記載の方法。
- ヒトIL−18に結合し、IL−18RへのヒトIL−18結合を阻害する抗体分子を含む結合メンバーを得る、請求項77〜83のいずれか一項に記載の方法。
- 前記抗体分子が、scFvである、請求項77〜84のいずれか一項に記載の方法。
- 前記抗体分子が、IgGである、請求項77〜84のいずれか一項に記載の方法。
- 抗体分子組成物を産生する方法であって、請求項84〜86のいずれか一項に記載の方法を使用して抗体分子を得ることと、前記抗体分子を、少なくとも1つの追加の構成要素を含む組成物に製剤化することとを含む方法。
- 試料中のIL−18を計測する方法における、請求項1〜48のいずれか一項に記載の抗体分子の使用。
- IL−18が、遊離IL−18である、請求項88に記載の使用。
- IL−18を検出および/または計測する方法であって;
(i)請求項1〜48のいずれか一項に記載の抗体分子をIL−18に曝露することならびに
(ii)IL−18への前記結合メンバーの結合を検出および/または計測すること
を含む方法。 - 試料中のIL−18を計測する方法であって;
(i)試料を請求項1〜48のいずれか一項に記載の抗体分子と接触させること;および
(ii)前記試料への前記抗体分子の結合を測定すること
を含み、
前記試料への前記抗体分子の結合が前記試料中のIL−18の量を示す、方法。 - 試料中のIL−18を計測する方法であって;
前記試料を、IL−18に結合する第1の抗体分子と接触させること、および;
IL−18に結合する第2の抗体分子を使用して、前記試料中でのIL−18への前記第1の抗体分子の結合を測定すること
を含み、
前記第1または第2の抗体分子の一方が、請求項1〜48のいずれか一項に記載の抗体分子であり、前記第1または第2の結合メンバーの他方が、IL−18への結合について請求項1〜48のいずれか一項に記載の抗体分子と競合しない抗IL−18抗体分子である方法。 - 前記試料が、脳脊髄液(CSF)、胆汁、尿、皮脂、唾液または血清試料である、請求項91または92に記載の方法。
- 前記IL−18が、遊離IL−18である、請求項90〜93のいずれか一項に記載の方法。
- 前記IL−18が、遊離IL−18である、請求項91〜94のいずれか一項に記載の方法。
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