JP2014196340A - ヒト抗ip−10抗体およびその使用 - Google Patents
ヒト抗ip−10抗体およびその使用 Download PDFInfo
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Abstract
Description
したがって、本発明は、以下の項目を提供する:
(項目1)
単離された完全ヒトモノクローナル抗IP−10抗体またはそのフラグメントであって、この抗体は、
(a)配列番号5、34、44、64、86、95または127のアミノ酸配列を含むVHのCDR1領域;
(b)配列番号6,15、35、45、65、87、96または128のアミノ酸配列を含むVHのCDR2領域;および
(c)配列番号7、21、36、46、52、57、66、78、88、97、105、129、132または140のアミノ酸配列を含むVHのCDR3領域
を含み、
この抗体はIP−10に結合する抗体またはそのフラグメント。
(項目2)
上記抗体は、
(d)配列番号8、16、37、47、71、79、98、106、112、119、133または141のアミノ酸配列を含むVLのCDR1領域;
(e)配列番号9、38、48、58、72、80、89、99、113、120または142のアミノ酸配列を含むVLのCDR2領域;および
(f)配列番号10、24、29、39、49、59、73、81、90、100、107、114、121、126または143のアミノ酸配列を含むVLのCDR3領域
をさらに含む、項目1に記載の抗体。
(項目3)
上記抗体はIgGアイソタイプである、項目1に記載の抗体。
(項目4)
上記抗体はIgG1アイソタイプである、項目1に記載の抗体。
(項目5)
上記抗体は、配列番号5のアミノ酸配列を含むVHのCDR1領域;配列番号6のアミノ酸配列を含むVHのCDR2領域、配列番号7のアミノ酸配列を含むVHのCDR3領域;配列番号8のアミノ酸配列を含むVLのCDR1領域;配列番号9のアミノ酸配列を含むVLのCDR2領域;および配列番号10のアミノ酸配列を含むVLのCDR3領域を含む、項目2に記載の抗体。
(項目6)
上記抗体は、配列番号2のアミノ酸配列を含む重鎖可変配列および配列番号4のアミノ酸配列を含む軽鎖可変配列を含む、項目5に記載の抗体。
(項目7)
配列番号134のアミノ酸配列を含む重鎖配列および配列番号135のアミノ酸配列を含む軽鎖配列を含む、単離された完全ヒトモノクローナル抗体。
(項目8)
上記抗体はIgG1アイソタイプである、項目7に記載の抗体。
(項目9)
単離された完全ヒトモノクローナル抗体であって、この抗体は、配列番号2、12、18、26、31、41、51、54、61、68、75、83、92、102、109、116、123および137からなる群から選択される重鎖可変アミノ酸配列を含み、この抗体はIP−10に結合する、抗体。
(項目10)
上記抗体は、配列番号4、14、23、28、33、43、56、63、70、77、85、94、104、111、118、125、139および145からなる群から選択される軽鎖可変アミノ酸配列をさらに含み、この抗体はIP−10に結合する、項目9に記載の抗体。
(項目11)
上記抗体はIgGアイソタイプである、項目10に記載の抗体。
(項目12)
上記抗体はIgG1アイソタイプである、項目11に記載の抗体。
(項目13)
配列番号5のアミノ酸配列を含むVHのCDR1領域;配列番号6のアミノ酸配列を含むVHのCDR2領域、配列番号7のアミノ酸配列を含むVHのCDR3領域;配列番号8のアミノ酸配列を含むVLのCDR1領域;配列番号9のアミノ酸配列を含むVLのCDR2領域;および配列番号10のアミノ酸配列を含むVLのCDR3領域を含む、単離された完全ヒトモノクローナル抗体。
(項目14)
上記抗体はIgGアイソタイプである、項目13に記載の抗体。
(項目15)
上記抗体はIgG1アイソタイプである、項目14に記載の抗体。
(項目16)
項目1、7、9または13のいずれか1項に記載の抗体およびキャリアを含む、医薬組成物。
(項目17)
自己免疫疾患または炎症性障害の症状を緩和する方法であって、この方法は、被験体のこの自己免疫疾患または炎症性障害の症状を緩和する十分な量で項目1〜16のいずれか1項に記載の抗体を緩和を必要とするこの被験体に投与することを含む、方法。
(項目18)
上記被験体はヒトである、項目17に記載の方法。
(項目19)
上記抗体は、配列番号5のアミノ酸配列を含むVHのCDR1領域;配列番号6のアミノ酸配列を含むVHのCDR2領域、配列番号7のアミノ酸配列を含むVHのCDR3領域;配列番号8のアミノ酸配列を含むVLのCDR1領域;配列番号9のアミノ酸配列を含むVLのCDR2領域;および配列番号10のアミノ酸配列を含むVLのCDR3領域を含む、項目17に記載の方法。
(項目20)
上記抗体は、配列番号2のアミノ酸配列を含む重鎖可変配列および配列番号4のアミノ酸配列を含む軽鎖可変配列を含む、項目19に記載の方法。
(項目21)
上記抗体は、配列番号134のアミノ酸配列を含む重鎖配列および配列番号135のアミノ酸配列を含む軽鎖配列を含む、項目19に記載の方法。
相補性決定領域(CDR)を包含するアミノ酸は、ChothiaらおよびE.A.Kabatらにより定義されたとおりである(Chothia,Cら、Nature 342:877−883(1989);Kabat,EAら、Sequences of Protein of immunological interest,Fifth Edition,US Department of Health and Human
Services,US Government Printing Office(1991)を参照されたい)。NI−0801抗体の重鎖CDRは、以下の配列:
of Protein of immunological interest,Fifth Edition,US Department of Health and Human Services,US Government Printing Office(1991)を参照されたい)。C7抗体の重鎖CDRは、以下の配列:
Services,US Government Printing Office(1991)を参照されたい)。G11抗体の重鎖CDRは、以下の配列:
Services,US Government Printing Office(1991)を参照されたい)。B5抗体の重鎖CDRは、以下の配列:
相補性決定領域(CDR)を包含するアミノ酸は、ChothiaらおよびE.A.Kabatらにより定義されたとおりである(Chothia,Cら、Nature 342:877−883(1989);Kabat,EAら、Sequences of Protein of immunological interest,Fifth Edition,US Department of Health and Human
Services,US Government Printing Office(1991)を参照されたい)。F3抗体の重鎖CDRは、以下の配列:
Services,US Government Printing Office(1991)を参照されたい)。D3抗体の重鎖CDRは、以下の配列:
Services,US Government Printing Office(1991)を参照されたい)。C3抗体の重鎖CDRは、以下の配列:
Services,US Government Printing Office(1991)を参照されたい)。CB_F1抗体の重鎖CDRは、以下の配列:
相補性決定領域(CDR)を包含するアミノ酸は、ChothiaらおよびE.A.Kabatらにより定義されたとおりである(Chothia,Cら、Nature 342:877−883(1989);Kabat,EAら、Sequences of Protein of immunological interest,Fifth Edition,US Department of Health and Human
Services,US Government Printing Office(1991)を参照されたい)。E5抗体の重鎖CDRは、以下の配列:
Services,US Government Printing Office(1991)を参照されたい)。G7抗体の重鎖CDRは、以下の配列:
Services,US Government Printing Office(1991)を参照されたい)。A2抗体の重鎖CDRは、以下の配列:
Services,US Government Printing Office(1991)を参照されたい)。C1a抗体の重鎖CDRは、以下の配列:
相補性決定領域(CDR)を包含するアミノ酸は、ChothiaらおよびE.A.Kabatらにより定義されたとおりである(Chothia,Cら、Nature 342:877−883(1989);Kabat,EA,etal.,Sequences
of Protein of immunological interest,Fifth Edition,US Department of Health and Human Services,US Government Printing Office(1991)を参照されたい)。C1抗体の重鎖CDRは、以下の配列:
Services,US Government Printing Office(1991)を参照されたい)。E7抗体の重鎖CDRは、以下の配列:
Services,US Government Printing Office(1991)を参照されたい)。H6抗体の重鎖CDRは、以下の配列:
Services,US Government Printing Office(1991)を参照されたい)。F4抗体の重鎖CDRは、以下の配列:
相補性決定領域(CDR)を包含するアミノ酸は、ChothiaらおよびE.A.Kabatらにより定義されたとおりである(Chothia,Cら、Nature 342:877−883(1989);Kabat,EAら、Sequences of Protein of immunological interest,Fifth Edition,US Department of Health and Human
Services,US Government Printing Office(1991)を参照されたい)。C5抗体の重鎖CDRは、以下の配列:
Human Services,US Government Printing Office(1991)を参照されたい)。J9抗体の重鎖CDRは、以下の配列:
Services,US Government Printing Office(1991)を参照されたい)。B9抗体の重鎖CDRは、以下の配列:
Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,N.Y.(1989))を参照されたい。本明細書に記載の分析化学、有機合成化学ならびに医薬および製薬化学に関連して用いられる命名法と、それらの実験の手順および技法とは当該技術分野において周知であり、一般に使用されているものである。化学合成、化学分析、医薬品の調製、製剤化、送達、および患者の処置には、標準的な技法を用いる。
al.,Science 229:81(1985)を参照されたい。
たとえば、下記の実施例に記載する手順を用いて、huIP−10抗体を作製する。たとえば、scFvクローンをIgG型に転換してIgG huIP−10抗体を作製する(たとえば、実施例9を参照されたい)。たとえば、huIP−10抗体をIgG1アイソタイプに再変換する。
et al.(1991)Sequences of Proteins of immunological Interest,N.I.H.publication no.91−3242で確認できる。ヒトC領域遺伝子については、既知のクローンから容易に入手することができる。補体結合または抗体依存性細胞傷害の活性など、所望のエフェクター機能(effecter function)を基にアイソタイプの選択を行う。好ましいアイソタイプはIgG1、IgG3およびIgG4である。ヒト軽鎖定常領域に関してはκ鎖またはλ鎖のどちらを用いてもよい。次いで、従来の方法によりヒト化キメラ抗体を発現させる。
et al.Cell 41:885(1985))のようなレトロウイルスLTRなど、任意の強力なプロモーターに結合してもよい。また、理解されているように、ネイティブなIgプロモーターおよび同種のものを用いてもよい。
本発明によれば、IP−10に対して本明細書で作製され特徴付けが行われる抗体の活性に基づき、抗体部分の範囲を超えた他の治療方式が設計しやすくなる。こうした方式として、以下に限定されるものではないが、先進的な抗体治療剤(二重特異性抗体、免疫毒素および放射能標識治療剤など)、ペプチド治療剤の生成、遺伝子療法剤(特にイントラボディ、アンチセンス治療剤)および小分子がある。
Longo,eds.,Lippincott Raven(1996))を参照されたい。さらに、米国特許第4,681,581号、同第4,735,210号、同第5,101,827号、同第5,102,990号(米国再発行特許第35,500号)、同第5、648,471号および同第5,697,902号も参照されたい。免疫毒素および放射能標識分子はそれぞれ、IP−10を発現する細胞および特に本発明の抗体が効果を発揮するそうした細胞を死滅させる可能性があると考えられる。
当然のことながら、本発明による治療物質は、好適なキャリア、賦形剤ならびに移行性、送達性、忍容性および同種のものを向上させるため製剤に加えられる他の薬と共に投与される。すべての薬剤師に知られている処方集:Remington’s Pharmaceutical Sciences(15th ed,Mack Publishing Company,Easton,PA(1975))、特にその中のChapter
87 by Blaug,Seymourで、数多くの適切な製剤を確認することができる。こうした製剤として、たとえば、粉末、ペースト、軟膏、ゼリー、ワックス、油、脂質、脂質(陽イオン性または陰イオン性)を含む小胞(Lipofectin(商標)など)、DNAコンジュゲート、無水吸収ペースト、水中油型および油中水型乳剤、エマルジョンカルボワックス(種々の分子量のポリエチレングリコール)、半固体ゲルおよびカルボワックスを含む半固体混合物が挙げられる。本発明による処置および療法には、前述の混合物のいずれも適当であり得る。ただし、製剤により製剤中の活性成分が不活化されず、かつ製剤が生理的に適合し、投与経路に対して問題がないことが条件となる。さらに、Baldrick P. 「Pharmaceutical excipient development:the need for preclinical guidance.」 Regul.Toxicol Pharmacol.32(2):210−8(2000),Wang W.「Lyophilization and development of solid protein pharmaceuticals.」 Int.J.Pharm.203(1−2):1−60(2000),Charman WN「Lipids,lipophilic drugs,and oral drug delivery−some emerging concepts.」 J
Pharm Sci.89(8):967−78(2000)、Powell et al.「Compendium of excipients for parenteral formulations」 PDA J Pharm Sci Technol.52:238−311(1998)およびそこでの引用(薬剤師によく知られている製剤、賦形剤およびキャリアに関する追加情報)を参照されたい。
診断用製剤および予防用製剤中で本発明の完全ヒト抗IP−10MAbを用いる。一実施形態では、本発明のhuIP−10MAbを、前述の自己免疫疾患の1つを発症するリスクがある患者に投与する。遺伝子型マーカー、血清学的マーカーまたは生化学的マーカーを用いて、前述の自己免疫疾患のうちの1つまたは複数の患者の素因を決定することができる。
ヒトIP−10のクローニング、発現および精製
クローニング
成熟タンパク質ヒトIP−10(hIP10)(NM001565)をコードする遺伝子をPCR(polymerase chain reaction)増幅により発現プラスミドpET43(Novagen Madison,WI)にクローニングした。Factor Xプロテアーゼ切断部位の配列をNusAのC末端に導入した。AviTag(Avidity,Denver CO)ビオチン化部位の配列をケモカインコード配列のC末端に導入した。このpET系プラスミドを用いて、ビオチンリガーゼ遺伝子をコードするpACYC184−BirAプラスミドを菌株Origami Bに同時形質転換した。
発現コンストラクトを持つ細菌の一晩培養液を、50μg/mLのアンピシリン、10μg/mLのカナマイシン(Kanamicin)、5μg/mLのテトラサイクリン、20μg/mLのクロラムフェニコールおよび50μMのビオチンを含むTerrificブロス(InvitroGen)で1:30に希釈した。この培養液を振盪させながらOD(optical density)600=0.7に達するまで37℃でインキュベートした。次いでIPTG(isopropyl thiogalactoside)を最終濃度1mMまで加え、37℃で15分間および25℃で一晩インキュベートした。
細菌ペレットをベンゾナーゼヌクレアーゼおよびプロテアーゼ阻害剤Complete EDTA−free(Roche)を含むBugbuster(Novagen)に再懸濁し、4℃で1時間インキュベートした。可溶性および不可溶性画分を10,000g、4℃で15分間遠心分離して分離した。可溶性および不可溶性タンパク質画分をSDS−PAGE(sodium dodecyl sulfate−polyacrylamide gel electrophoresis)(Novex gels,InvitroGen)で解析した。可溶性画分を緩衝液A(トリス−HCl 100mM pH8.0、NaCl 600mM、CaCl2 10mM、イミダゾール40mM)で1/2に希釈し、予めBufffer B(トリス−HCl 50mM pH8.0、NaCl 300mM、CaCl2 5mM、イミダゾール20mM)で平衡処理しておいた50%(v/v)Ni−NTAアガロース(Qiagen)と混合した。緩やかに振盪させながらこの混合物を室温で30分間インキュベートした。遠心分離後に得られたビーズをPoly−Prepクロマトグラフィーカラム(Biorad)に充填し、5容量の緩衝液Bで3回洗浄し、緩衝液C(トリス−HCl 50mM pH8.0、NaCl 200mM、CaCl2 5mM、イミダゾール400mM)で溶出した。タンパク質を含む溶出画分をプールし、PD−10カラム(Amersham)を用いて脱塩した。切断緩衝液(トリス−HCl 50mM pH8.0、NaCl 200mM、CaCl2 5mM)中で1mgのタンパク質を25UのFactor Xと30℃で最大24時間インキュベートして、NusA−ケモカイン融合タンパク質をFactor X(Novagen,Madison,WI)により切断した。融合タンパク質の一部では、最適切断のパラメーターがやや異なったが、インキュベーションの時間(4〜24時間)および/または温度(25〜37℃)を変えたことで容易に決定できた。切断したタンパク質をSDS−PAGEにより解析し、活性を走化性により検査した。
hIP−10の受容体hCXCR3のクローニング、発現
ケモカイン受容体を安定発現するマウスのプレBリンパ腫L1.2細胞株をトランスフェクションにより作製した。リンパ節cDNA(Clontech,Palo Alto,CA)を鋳型としてhCXCR3をコードするcDNAをPCRによりクローニングした。このPCR産物をXba IおよびNot Iで消化し、哺乳動物の発現ベクターpCDNA 3.1−C(Invitrogen)にライゲートした 受容体のコード領域の配列をシーケンシングにより確認した。L1.2細胞(5×106)に20μgの直線化したCXCR3発現プラスミドをエレクトロポレーションによりトランスフェクトした。1mg/mLのジェネテシンの存在下で限界希釈法により受容体発現L1.2細胞の安定なクローンを樹立した。
ネイティブなヒトIP−10の作製。
細胞表面にヒトIP−10を発現する細胞
チャイニーズハムスターの卵巣(CHO:chinese hamster ovary)細胞(アメリカンタイプカルチャーコレクション(ATCC:American Type Culture Collection)から入手可能)に、ネオマイシン耐性遺伝子を含むpCDNA3.1プラスミド(Invitrogen,Carlsbad CA)にサブクローニングしたc−mycタグ付きヒトIP−10cDNAを安定にトランスフェクトした。この抗生物質を用いてトランスフェクタントを選択し、抗6xHis(Sigma)抗体を用いてフローサイトメトリーにより連続的な細胞選別を行った。抗IP−10mAb266(R&D Systems,Minneapolis MN)を用いてフローサイトメトリーによりヒトIP−10の表面発現を確認した。
ヒトscFvライブラリーのスクリーニング
ヒトscFvライブラリーの構築および取り扱いに関する一般的な手順は、参照によってその全体を本明細書に援用するVaughan et al.,(Nat.Biotech.1996,14:309−314)に記載されている。以下の手順に従ってヒトscFvのライブラリーをhIP−10に対してスクリーニングした。
単一クローンを、1ウェル当たり150μlの2xTYAG培地(2%グルコース)を含むマイクロタイタープレートに蒔き、30℃(120rpm)で一晩増殖させた。翌日、5μlの培養液を、45μlのdH2Oを含む別のプレートに移し、混合した。次いでプレートを−20℃で凍結させた。解凍後、この懸濁液1μlを用いて、標準的なPCRプロトコルによりPCR増幅を行った。その際、pCANTAB6に対して特異的プライマー:
1mlの2xTYAGのスターター培養液に、2xTYAG寒天プレートで新たに画線培養した単一コロニーを播種し、振盪させながら(240rpm)37℃で5時間インキュベートした。この培養液0.9mlを用いて同じ培地の培養液400mlに播種し、激しく振盪させながら(300rpm)一晩30℃で増殖させた。
hIP−10誘導性のカルシウム流のscFv抽出物による阻害
様々なhIP−10のscFvのペリプラズム抽出物を上記のように作製した。hCXCR3を発現するL1.2細胞を、10%FCSを補充したRPMI培地中で培養した。scFvを含む抽出物を2〜10nMのhIP−10(Peprotech,Rocky
Hill NJ)と室温で30分間インキュベートした。細胞をPBSで洗浄し、これに2μMのFura2/AMをロードした。ロード済みの細胞100μlを96ウェル黒(透明平底)プレートの各ウェルに加え、カルシウム流の動態を、Flex station II機器(Molecular Devices)を用いて340または380nmで励起し514nmの蛍光を測定して記録した。各scFv抽出物の阻害活性を、無関係のscFvを含む抽出物と比較して評価した。scFvの陽性候補を上記の実施例5のように大量に発現させ、カルシウム流アッセイを用いて用量反応実験で確認した(表4)。
hIP−10誘導性の細胞走化性のscFvによる阻害
野生型L1.2細胞およびhCXCR3を発現するL1.2細胞を、10%FCSを補充したRPMI培地中で培養した。実験の前日に細胞を0.6mg/mlの酪酸とインキュベートした。様々な濃度の精製scFvを0.2〜10nMのrhIP−10とインキュベートし、走化性96ウェルプレート(Neuroprobe)のボトムチャンバーに入れた。フィルタープレートを走化性プレートの上に置き、各ウェルの表面に106細胞/mlの懸濁液20μlを加えた。このプレートを37℃で2時間インキュベートした。フィルターを通過する細胞をDRAQ5(Alexis Corporation)で染色し、FMAT8200リーダー(Applied Biosystems,Foster City CA)でカウントした。候補抗体ごとのIC50(hIP−10誘導性の細胞遊走の50%を阻害する濃度、すなわち、50%阻害濃度)を決定した(表4)。
IgG型へのscFvの再変換
選択したscFvのVHおよびVL配列を、5’末端にリーダー配列およびHindIII制限部位を導入した特異的オリゴヌクレオチドを用いて増幅させた。ApaIまたはAvrII部位を重鎖および軽鎖配列それぞれの3’末端に導入した。増幅VH配列をHindIII/ApaIで消化し、pCon_gamma1発現ベクター(LONZA,Basel,Switzerland)にクローニングした。増幅VL配列をHindIII/AvrIIで消化し、pCon_lambda2発現ベクター(LONZA)にクローニングした。構築物をシーケンシングにより確認してから哺乳動物細胞にトランスフェクトした。
(実施例9)
IgG1型に再変換したscFvによるhIP−10誘導性のカルシウム流または細胞走化性の阻害
上記の実施例8のようにscFvをIgG型に再変換した。実施例6および8に記載した細胞ベースのアッセイを用いて、hIP−10誘導性のカルシウム流または細胞走化性に対するIgGの中和ポテンシャルを評価した。図1、図2および図3に示すように、これらのIgGクローンは、組換えhIP−10とネイティブなhIP−10の活性を共に用量依存的に阻害する。こうしたアッセイにおける各抗体のIC50値を表5および表6にまとめてある。
グリコサミノグリカンに固定化されたhIP−10に対する抗体結合
hIP−10は多くのケモカインと同様にオリゴマー化し、内皮細胞などの細胞の表面に発現するグリコサミノグリカン(GAG)に結合することができる。この状況で本抗体がhIP−10に結合できることを確認するため、以下のアッセイで抗体を検査した。検査対象のヒトIgGの捕捉試薬としての抗ヒトFc(Jackson,West Grove,PA)でMaxisorb96ウェルプレートをコートした。原型GAGとしてFITC(fluorescein isothiocyanate)標識ヘパリン(Sigma,St.Louis,MO)を用い、hIP−10とインキュベートしてから捕捉対象の抗hIP10抗体を加えた。HRP(horseradish peroxidase)結合抗FITC Fab(Roche,Basel,Switzerland)を用いて結合を確認した。図4に示すように、hIP−10がGAGに結合したときhIP−10に結合できる抗体があった一方、結合できない抗体もあった。おそらくオリゴマー構造内のhIP−10のエピトープがすでに認識できないものになっているためであろう。抗体がGAGの状況でhIP−10に結合する能力を表7にまとめてある。
抗体CC_F1の親和性成熟
hIP−10中和アッセイにおけるhIP−10に対する親和性および効力を高めるため、選択した有力な候補(CC21R3P1_F1)を親和性成熟させた。重鎖または軽鎖のCDR3における5つの残基配列をランダムに組み合わせて6つのライブラリー(ライブラリーサイズの範囲は5×107〜2×108)を作成した。実施例5に記載されているようにハイストリンジェントな選択ラウンドを3回行った。エピトープ競合アッセイにおいてscFvペリプラズム抽出物を用いて改良変異体のスクリーニングを行った。簡単に説明すると、親抗体(CC21R3P1_F1)をプレート上にコートし、希釈したペリプラズムscFv抽出物を各ウェルに加えた。次いでビオチン化hIP−10を加え、室温で2時間インキュベートした。洗浄後、コートした親抗体に結合したままのhIP−10をストレプトアビジン結合HRP(Jackson,West Grove PA)を用いて確認した。改良変異体を同定する参照として、CC21R3P1_F1のscFvを用いて、コートしたIgG型のCC21R3P1_F1と競合させた。競合アッセイならびに(as well)走化性およびカルシウム流アッセイにおいても、クローンCF1A11R3P3_F3をより強力な抗体として同定した。
並行して第2の候補CC21R3P1_E7についても、軽鎖のCDR3を標的にする同様の親和性成熟プロセスを行った。このプロセスでは、クローンCE7C1R3H8_J9が単離され、走化性アッセイでは親抗体と比較してより強力であった。
生殖系列配列へのhIP−10抗体クローンC7の復帰突然変異
本明細書に記載の研究では、CF1N1R3P4_C7クローンの核酸およびアミノ酸配列におけるヌクレオチドおよびアミノ酸残基を変異させて、生殖系列配列に見られるヌクレオチドまたはアミノ酸残基に一致させた。本明細書ではこのプロセスを「復帰突然変異」という。
hIP−10抗体の親和性および結合動態
Biacore2000機器(Biacore AB,Uppsala,Sweden)を用いてNI−0801およびCC21R3P1_F1の親和性および結合動態の特徴付けを行った。200RU(反応単位)のヤギ抗ヒトポリクローナルIgG(ahIgG;Biacore AB,Uppsala,Sweden)をC1Biacoreチップ上にEDC/NHS化学で固定化した。この表面を用いてNI−0801または特徴付けを行った他のヒトIgG1を捕捉した。この表面を各サイクル後に再生させた。その際、10mMのグリシン(pH=1.5)を30μL/分で30秒間注入し、続いてHBS−EP緩衝液による安定化のための時間を1分設けた。hIP−10(Peprotech,Rocky Hill NJ)あるいはNusA−hIP−10融合タンパク質を以下の濃度:34.7nM、11.6nM、3.85nM、1.28nM、0.428nM、0.142nMおよび0nMで通過させて結合を測定した。HBS−EP緩衝液(Biacore AB,Uppsala,Sweden)で溶液をすべて希釈した。注入を50μl/分で3分間行い、続いて解離時間を12分設けて、温度を25℃に設定した。データを、1:1Langmuirモデルにフィッティングさせ、Kon値、Koff値およびKD値を決定した。rhIP−10またはNusA−hIP−10融合体を用いた場合、非常に類似した値が得られたが、融合タンパク質の場合、サイズがより大きくBiacoreでの応答が高まるため、より良好な応答シグナルが得られた。hIP−10に対する抗体およびCC21R3P1_F1およびNI−0801の親和性は、それぞれ90.2nMおよび109pMである(図6)。したがって、親和性成熟プロセスにおいてCC21R3P1_F1の親和性は90倍高まったと考えられる。2つの抗体の親和性および速度定数を表8にまとめてある。
hIP−10抗体の交差反応性
結合アッセイ:捕捉ELISAフォーマットアッセイを用いて、異なる種由来のIP−10に結合するNI−0801の能力を検査した。簡単に説明すると、マウス、ラット、ウサギおよびカニクイザルから単離されたcDNAからクローニングしたIP−10、さらに一連のヒトケモカインを発現させ、実施例1に記載されているように精製した。NI−0801をコートし、一定の濃度範囲の組換えNusA融合タンパク質とインキュベートした。抗NusA抗体を用いて結合のレベルを確認した。図7に示すように、NI−0801はカニクイザルIP−10とのみ交差反応したが、他の種由来のIP−10とも、検査対象の他のヒトケモカインのいずれとも交差反応しなかった。
hIP−10抗体のエピトープマッピング
ELISAアッセイでは、NI−0801は同等の見かけの親和性でヒトIP−10とカニクイザルIP−10とに結合する(図7)。NI−0801に対する結合に際してhIP−10に潜在的に必要な残基を同定するため、図10に示すように複数の種のIP−10タンパク質配列を整列させた。このアライメントでは、ヒト配列とカニクイザル配列との間で保存されている残基であって、NI−0801が結合できない種のIP−10において異なっている残基を調べた。ウサギIP−10の配列はヒトIP−10配列に近いが、NI−0801はこのタンパク質を中和することができない。本発明らは、ヒトIP−10とカニクイザルIP−10とを比較してウサギIP−10と異なる複数の残基(N13、K17、D48、L48、K63、F68、R74、G75およびS77)を同定した。ヒト残基をそれらの位置に回復させるため、ウサギIP−10の以下の4つのミュータント:[N13S/K17Q];[D48K];[L48S/K63N/F68V]および[L48S/K63N/F68V/R74K/G75R/S77P]を部位特異的変異誘発により作製した。これらのウサギIP−10のミュータント形態を実施例1に記載されているようにNusA融合タンパク質として発現させた。次いでこれら残基を導入したことでウサギIP−10に対するNI−0801の結合が回復できたかどうかをELISAアッセイで検査した。NusA−hIP−10および各NusA−ウサギIP−10ミュータントをMaxisorbプレート(Nunc)に5μg/mlで4℃にて一晩コートした。3%PBS−BSAでブロッキングし、用量範囲のNI−0801とインキュベートした後、プレートを洗浄し、西洋わさびペルオキシダーゼと結合したヤギ抗ヒトIgG Fcγ特異的抗体(Jackson)とインキュベートした。洗浄後、シグナルをTMB(Roche)により確認し、H2SO4で止めた。プレートを450nmで読み取った。図11に示すように、[N13S/K17Q]ミュータントでは、ウサギIP−10に対するNI−0801の結合が回復しており、ヒトIP−10に対するNI−0801のエピトープの完全性にはS13およびQ17が極めて重要であることが示される。
本発明をその詳細な説明と共に記載してきたが、上記の記載は本発明を説明するためのものであり、添付の特許請求の範囲の範囲により規定される本発明の範囲を限定することを意図するものではない。他の態様、利点および改変も以下の特許請求の範囲の範囲内にある。
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