JP2012519485A5 - - Google Patents

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Claims (25)

  1. 照する細菌と比較してyqhD遺伝子、dkgA遺伝子及びyqhC遺伝子の少なくとも一つの発現が減少しており、参照する細菌と比較してフルフラールに対する耐性を増大している、単離された細菌。
  2. 単離された細菌がエタノール生産性である、請求項1に記載の単離された細菌。
  3. 単離された細菌が、参照する細菌と比較してエタノール生産を増大している、請求項1に記載の単離された細菌。
  4. 参照する細菌における発現と比較して、yqhD遺伝子及びdkgA遺伝子の発現が減少している、請求項1に記載の単離された細菌。
  5. yghD遺伝子、dkgA遺伝子及びyqhC遺伝子の少なくとも一つが発現されない、請求項1に記載の単離された細菌。
  6. yghD遺伝子及びdkgA遺伝子が発現されない、請求項に記載の単離された細菌。
  7. 参照する細菌と比較して、yqhC遺伝子の発現が減少している、請求項4に記載の単離された細菌。
  8. yqhC遺伝子が欠失している、請求項4に記載の単離された細菌。
  9. 参照する細菌と比較して、YqhDタンパク質の活性が減少している、請求項1に記載の単離された細菌。
  10. 参照する細菌と比較して、YqhDタンパク質の活性及びDkgAタンパク質の活性が減少している、請求項1に記載の単離された細菌。
  11. 参照する細菌と比較して、YqhCタンパク質の活性が減少している、請求項1に記載の単離された細菌。
  12. 参照する細菌と比較して、yqhD遺伝子の発現の調節が修正されている、請求項1に記載の単離された細菌。
  13. 参照する細菌の発現と比較して、yqhD遺伝子の発現の調節及びdkgA遺伝子の調節が修正されている、請求項1に記載の単離された細菌。
  14. 参照する細菌の発現と比較して、yqhC遺伝子の発現の調節が修正されている、請求項1に記載の単離された細菌。
  15. 参照する細菌と比較して、yqhC遺伝子の発現が減少している、請求項に記載の単離された細菌。
  16. yqhC遺伝子が欠失している、請求項に記載の単離された細菌。
  17. yqhD遺伝子のプロモーター又は調節タンパク質の活性に変化がある、請求項12又は13に記載の単離された細菌。
  18. dkgA遺伝子のプロモーター又は調節タンパク質の活性に変化がある、請求項13に記載の単離された細菌。
  19. アンチセンスRNAの付加によってYqhD、DkgA、及び/又はYqhCタンパク質のレベルが減少している、請求項1に記載の単離された細菌。
  20. siRNAの付加によってYqhD、DkgA、及び/又はYqhCタンパク質のレベルが減少している、請求項1に記載の単離された細菌。
  21. 当該細菌がエタノールを生産できて、そして当該細菌が工程:
    a)(1)フルフラール又は
    (2)増大する濃度のフルフラール
    の存在下で細菌の候補突然変異株を生育すること;及び
    b)フルフラールの存在下でエタノールを生産する突然変異体を選択すること:
    を含有してなる処理工程によって調製される、NADPH依存性フルフラール還元酵素活性の発現が減少している、請求項1に記載の単離された細菌。
  22. バイオマス、ヘミセルロース系バイオマス、リグノセルロース系バイオマス、セルロース系バイオマス又はオリゴ糖を、請求項1に記載の単離された細菌と接触させて、それによってバイオマス、ヘミセルロース系バイオマス、リグノセルロース系バイオマス、セルロース系バイオマス又はオリゴ糖源からエタノールを生産することを含有してなる、バイオマス、ヘミセルロース系バイオマス、リグノセルロース系バイオマス、セルロース系バイオマス又はオリゴ糖源からエタノールを生産する方法。
  23. イオマス、ヘミセルロース系バイオマス、リグノセルロース系バイオマス、セルロース系バイオマス又はオリゴ糖源がフルフラールの存在下にある、請求項22に記載の方法。
  24. 請求項1に記載の単離された細菌を含有してなる、キット。
  25. Agricultural Research Culture Collection に寄託された、寄託番号NRRL B−50239で表される大腸菌LY180株、寄託番号NRRL B−50240で表される大腸菌EMFR9株、寄託番号NRRL B−50241で表される大腸菌EMFR17株、寄託番号NRRL B−50242で表される大腸菌EMFR26株、及び、寄託番号NRRL B−50243で表される大腸菌EMFR35株からなる群より選択される大腸菌株
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