JP2011528442A5 - - Google Patents
Download PDFInfo
- Publication number
- JP2011528442A5 JP2011528442A5 JP2011518921A JP2011518921A JP2011528442A5 JP 2011528442 A5 JP2011528442 A5 JP 2011528442A5 JP 2011518921 A JP2011518921 A JP 2011518921A JP 2011518921 A JP2011518921 A JP 2011518921A JP 2011528442 A5 JP2011528442 A5 JP 2011528442A5
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- pcdeterminant
- subject
- sample
- level
- cancer
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Withdrawn
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 105
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 claims description 57
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 claims description 29
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 24
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 23
- 238000011282 treatment Methods 0.000 claims description 19
- 206010060862 Prostate cancer Diseases 0.000 claims description 18
- 208000037819 metastatic cancer Diseases 0.000 claims description 16
- 208000011575 metastatic malignant neoplasm Diseases 0.000 claims description 16
- 208000000236 Prostatic Neoplasms Diseases 0.000 claims description 15
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims description 15
- 238000011830 transgenic mouse model Methods 0.000 claims description 15
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims description 12
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims description 12
- 102100040557 Osteopontin Human genes 0.000 claims description 11
- 101710168942 Sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 Proteins 0.000 claims description 11
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 claims description 10
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims description 10
- 101710143112 Mothers against decapentaplegic homolog 4 Proteins 0.000 claims description 9
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 claims description 8
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 8
- 108010011536 PTEN Phosphohydrolase Proteins 0.000 claims description 7
- 102000014160 PTEN Phosphohydrolase Human genes 0.000 claims description 7
- 102000049937 Smad4 Human genes 0.000 claims description 7
- 238000009098 adjuvant therapy Methods 0.000 claims description 7
- 208000010658 metastatic prostate carcinoma Diseases 0.000 claims description 7
- 102100032912 CD44 antigen Human genes 0.000 claims description 6
- 208000005443 Circulating Neoplastic Cells Diseases 0.000 claims description 6
- 101000868273 Homo sapiens CD44 antigen Proteins 0.000 claims description 6
- 206010027476 Metastases Diseases 0.000 claims description 6
- 101150019443 SMAD4 gene Proteins 0.000 claims description 6
- 239000008280 blood Substances 0.000 claims description 6
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 claims description 6
- 238000011161 development Methods 0.000 claims description 6
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 6
- 230000009401 metastasis Effects 0.000 claims description 6
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 6
- 238000012360 testing method Methods 0.000 claims description 6
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 claims description 6
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 claims description 6
- 238000011269 treatment regimen Methods 0.000 claims description 6
- 102000006311 Cyclin D1 Human genes 0.000 claims description 4
- 108010058546 Cyclin D1 Proteins 0.000 claims description 4
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 claims description 4
- 206010061309 Neoplasm progression Diseases 0.000 claims description 4
- 230000008238 biochemical pathway Effects 0.000 claims description 4
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 claims description 4
- 210000002919 epithelial cell Anatomy 0.000 claims description 4
- 230000000984 immunochemical effect Effects 0.000 claims description 4
- 230000000474 nursing effect Effects 0.000 claims description 4
- 230000000306 recurrent effect Effects 0.000 claims description 4
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 claims description 4
- 230000005751 tumor progression Effects 0.000 claims description 4
- 102000016736 Cyclin Human genes 0.000 claims description 3
- 108050006400 Cyclin Proteins 0.000 claims description 3
- 108020004459 Small interfering RNA Proteins 0.000 claims description 3
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 claims description 3
- 108091023037 Aptamer Proteins 0.000 claims description 2
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 claims description 2
- 102000010834 Extracellular Matrix Proteins Human genes 0.000 claims description 2
- 108010037362 Extracellular Matrix Proteins Proteins 0.000 claims description 2
- 206010015866 Extravasation Diseases 0.000 claims description 2
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 claims description 2
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 claims description 2
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 claims description 2
- 206010038111 Recurrent cancer Diseases 0.000 claims description 2
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 239000003098 androgen Substances 0.000 claims description 2
- 230000033115 angiogenesis Effects 0.000 claims description 2
- 230000025164 anoikis Effects 0.000 claims description 2
- 238000003556 assay Methods 0.000 claims description 2
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 claims description 2
- 239000013060 biological fluid Substances 0.000 claims description 2
- 210000000481 breast Anatomy 0.000 claims description 2
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 claims description 2
- 230000012292 cell migration Effects 0.000 claims description 2
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims description 2
- 210000001072 colon Anatomy 0.000 claims description 2
- 230000005757 colony formation Effects 0.000 claims description 2
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 claims description 2
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 claims description 2
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 claims description 2
- 210000002744 extracellular matrix Anatomy 0.000 claims description 2
- 230000036251 extravasation Effects 0.000 claims description 2
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims description 2
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 claims description 2
- 238000010166 immunofluorescence Methods 0.000 claims description 2
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 claims description 2
- 210000005265 lung cell Anatomy 0.000 claims description 2
- 239000003550 marker Substances 0.000 claims description 2
- 230000001394 metastastic effect Effects 0.000 claims description 2
- 206010061289 metastatic neoplasm Diseases 0.000 claims description 2
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 claims description 2
- 230000000750 progressive effect Effects 0.000 claims description 2
- 210000002307 prostate Anatomy 0.000 claims description 2
- 210000005267 prostate cell Anatomy 0.000 claims description 2
- 208000023958 prostate neoplasm Diseases 0.000 claims description 2
- 238000011002 quantification Methods 0.000 claims description 2
- 238000003127 radioimmunoassay Methods 0.000 claims description 2
- 238000012216 screening Methods 0.000 claims description 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 claims description 2
- 238000001356 surgical procedure Methods 0.000 claims description 2
- 230000005740 tumor formation Effects 0.000 claims description 2
- 229940126062 Compound A Drugs 0.000 claims 1
- NLDMNSXOCDLTTB-UHFFFAOYSA-N Heterophylliin A Natural products O1C2COC(=O)C3=CC(O)=C(O)C(O)=C3C3=C(O)C(O)=C(O)C=C3C(=O)OC2C(OC(=O)C=2C=C(O)C(O)=C(O)C=2)C(O)C1OC(=O)C1=CC(O)=C(O)C(O)=C1 NLDMNSXOCDLTTB-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 238000002679 ablation Methods 0.000 claims 1
- 230000005855 radiation Effects 0.000 claims 1
- 101150063780 spp1 gene Proteins 0.000 claims 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
Description
したがって、本発明の1つの態様では、所定レベルの予測可能性を用いて、対象で転移性癌を発症するリスクを評価するための方法を提供する。転移性前立腺癌を発症するリスクは、対象由来のサンプル中のPCDETERMINANTのレベルを測定することによって決定する。対象が転移性癌を発症するリスクが高いことは、サンプル中のPCDETERMINANTのレベルの臨床的に有意な変化を測定することによって決定される。あるいは、対象が転移性癌を発症するリスクが高いことは、有効量のPCDETERMINANTのレベルを基準値と比較することによって決定される。いくつかの態様では、この基準値が指標である。
本発明は、例えば以下の項目を提供する。
(項目1)
所定レベルの予測可能性を用いて、対象における癌再発のリスクまたは転移性癌を発症するリスクを評価するための方法であって、
a.前記対象由来のサンプル中の、PCDETERMINANT1〜372からなる群から選択された2個以上のPCDETERMINANTのレベルを測定するステップと、
b.前記サンプル中の前記2個以上のPCDETERMINANTのレベルの臨床的に有意な変化を測定するステップであって、前記変化が、前記対象において癌再発のリスクまたは転移性癌を発症するリスクが高いことを示しているステップと
を含む方法。
(項目2)
前記2個以上のPCDETERMINANTが、
a)表2、
b)表3、
c)表4、
d)表5、
e)表6、
f)表7、および
g)表2〜7から選択された2つ以上の表
から選択される、項目1に記載の方法。
(項目3)
前記PCDETERMINANTが、PTEN、SMAD4、サイクリンD1およびSPP1を含む、項目1に記載の方法。
(項目4)
前記癌に関連する少なくとも1つの標準的なパラメータを測定するステップをさらに含む、項目1に記載の方法。
(項目5)
前記癌が前立腺癌であり、前記標準パラメータがグリーソンスコアである、項目4に記載の方法。
(項目6)
PCDETERMINANTの前記レベルが、電気泳動、免疫化学的手法または非浸潤性イメージングによって測定される、項目1に記載の方法。
(項目7)
前記免疫化学的検出が、ラジオイムノアッセイ、免疫蛍光アッセイ、または酵素結合免疫吸着アッセイによって行われる、項目6に記載の方法。
(項目8)
前記対象が、原発性腫瘍、再発性腫瘍、または転移性前立腺癌を有する、項目1に記載の方法。
(項目9)
前記サンプルが、腫瘍生検標本、血液または生物学的液体中の循環腫瘍細胞である、項目1に記載の方法。
(項目10)
前記生検標本が、コア生検標本、切除組織生検標本、または切開組織生検標本である、項目1に記載の方法。
(項目11)
4個以上のPCDETERMINANTの発現レベルを測定する、項目1に記載の方法。
(項目12)
所定レベルの予測可能性を用いて、対象における癌再発のリスクまたは転移性癌を発症するリスクを評価するための方法であって、
a.前記対象由来のサンプル中の、PCDETERMINANT1〜372からなる群から選択された2個以上のPCDETERMINANTのレベルを測定するステップと、
b.前記2個以上のPCDETERMINANTのレベルを基準値と比較するステップと
を含む方法。
(項目13)
前記基準値が指標値である、項目12に記載の方法。
(項目14)
所定レベルの予測可能性を用いて、対象における腫瘍の進行を評価するための方法であって、
a.第1の期間で、前記対象由来の第1のサンプル中の、PCDETERMINANT1〜372からなる群から選択された2個以上のPCDETERMINANTのレベルを検出するステップと、
b.第2の期間で、前記対象由来の第2のサンプル中の2個以上のPCDETERMINANTのレベルを検出するステップと、
c.ステップ(a)で検出された前記2個以上のPCDETERMINANTのレベルを、ステップ(b)で検出されたレベルまたは基準値と比較するステップと
を含む方法。
(項目15)
前記第1のサンプルが、前記腫瘍の治療前に前記対象から採取される、項目14に記載の方法。
(項目16)
前記第2のサンプルが、前記腫瘍の治療後に前記対象から採取される、項目14に記載の方法。
(項目17)
所定レベルの予測可能性を用いて、再発性癌または転移性癌の治療の有効性をモニタするための方法であって、
a.第1の期間で、前記対象由来の第1のサンプル中の、PCDETERMINANT1〜372からなる群から選択された2個以上のPCDETERMINANTのレベルを検出するステップと、
b.第2の期間で、前記対象由来の第2のサンプル中の、2個以上のPCDETERMINANTの有効量のレベルを検出するステップと、
c.ステップ(a)で検出された前記2個以上のPCDETERMINANTのレベルを、ステップ(b)で検出されたレベルまたは基準値と比較するステップであって、治療の有効性が、前記対象由来の2個以上のPCDETERMINANTのレベルの変化によってモニタされるステップと
を含む方法。
(項目18)
前記対象が、前記癌の治療を事前に受けている、項目17に記載の方法。
(項目19)
前記第1のサンプルが、前記癌の治療前に前記対象から採取される、項目17に記載の方法。
(項目20)
前記第2のサンプルが、前記癌の治療後に前記対象から採取される、項目17に記載の方法。
(項目21)
前記第2のサンプルを、前記癌の再発後に前記対象から採取する、項目17に記載の方法。
(項目22)
前記第2のサンプルを、前記癌の再発前に前記対象から採取する、項目17に記載の方法。
(項目23)
所定レベルの予測可能性を用いて、腫瘍を有すると診断された対象に関する治療レジメンを選択するための方法であって、
a.第1の期間で、前記対象由来の第1のサンプル中の、PCDETERMINANT1〜372からなる群から選択された2個以上のPCDETERMINANTのレベルを検出するステップと、
b.任意選択で第2の期間で、前記対象由来の第2のサンプル中の2個以上のPCDETERMINANTのレベルを検出するステップと、
c.ステップ(a)で検出された前記2個以上のPCDETERMINANTのレベルを、基準値または任意選択でステップ(b)で検出された量と比較するステップと
を含む方法。
(項目24)
前記対象が、腫瘍の治療を事前に受けている、項目23に記載の方法。
(項目25)
前記第1のサンプルを、前記腫瘍を治療する前に前記対象から採取する、項目23に記載の方法。
(項目26)
前記第2のサンプルを、前記腫瘍を治療した後に前記対象から採取する、項目23に記載の方法。
(項目27)
PCDETERMINANT1〜372からなる群から選択された2個以上のマーカーの、マーカーレベルのパターンを含む、転移性前立腺癌基準発現プロファイル。
(項目28)
項目27に記載のプロファイルを作成するのに十分な、PCDETERMINANT1〜372からなる群から選択された対応するPCDETERMINANTを検出する複数のPCDETERMINANT検出試薬を含むキット。
(項目29)
前記検出試薬が、1つもしくは複数の抗体またはその断片を含む、項目28に記載のキット。
(項目30)
前記検出試薬が1種または複数のオリゴヌクレオチドを含む、項目28に記載のキット。
(項目31)
前記検出試薬が1種または複数のアプタマーを含む、項目28に記載のキット。
(項目32)
項目27に記載の1つまたは複数の転移性前立腺癌基準発現プロファイルと、任意選択で追加の試験結果および対象情報とを含有する機械可読媒体。
(項目33)
生理学的または生化学的な経路に関連した転移を示す1個または複数のPCDETERMINANTを含む、PCDETERMINANTパネル。
(項目34)
前記生理学的または生化学的な経路が、細胞移動、血管新生、細胞外マトリックス分解、溢出、コロニー形成またはアノイキスを含む、項目33に記載のパネル。
(項目35)
腫瘍の進行を示す1個または複数のPCDETERMINANTを含む、PCDETERMINANTパネル。
(項目36)
PCDETERMINANTの活性または発現を調節する化合物を同定する方法であって、
(a)前記PCDETERMINANTを発現する細胞を提供するステップと、
(b)前記細胞を、候補化合物を含む組成物と接触させるステップと、
(c)物質が前記PCDETERMINANTの発現または活性を変化させるか否かを決定するステップと
を含み、それにより、前記化合物の存在下で観察された前記変化が、細胞を、前記化合物を含まない組成物と接触させたときに観察されない場合、前記同定された化合物は、PCDETERMINANTの活性または発現を調節する方法。
(項目37)
前記細胞を、インビボ、エキソビボ、またはインビトロで接触させる、項目36に記載の方法。
(項目38)
対象の癌を治療する方法であって、PCDETERMINANTの活性または発現を調節する化合物を前記対象に投与するステップを含む方法。
(項目39)
対象の前立腺癌を治療しまたは予防する方法であって、PCDETERMINANTの活性または発現を調節する薬剤を前記対象に投与するステップを含む方法。
(項目40)
ゲノムが内在性のPten遺伝子およびSmad4遺伝子の両方のホモ接合型破壊を含有するダブルノックアウトのトランスジェニックマウスであって、野生型マウスと比較して、前立腺腫瘍の形成に対する感受性の増加を示すトランスジェニックマウス。
(項目41)
項目40に記載のトランスジェニックマウス由来の細胞。
(項目42)
上皮細胞である、項目41に記載の細胞。
(項目43)
前記上皮細胞が、前立腺細胞、乳房細胞、結腸細胞または肺細胞である、項目41に記載の細胞。
(項目44)
前立腺癌の進行を阻害する治療剤についてスクリーニングする方法であって、候補治療剤を項目40に記載のトランスジェニックマウスに投与するステップと、前記マウスにおいて前記治療剤の前立腺癌(prostate caner)の進行に対する効果を評価するステップとを含む方法。
(項目45)
生物マーカーを同定する方法であって、試験化合物の非存在下において項目40に記載のトランスジェニックマウスから得た第1のサンプル中の遺伝子発現プロファイル、ゲノムプロファイルまたはプロテオミクスプロファイルを、試験化合物の存在下において項目40に記載のトランスジェニックマウスから得たサンプル中の前記プロファイルと比較するステップを含む方法。
(項目46)
前記サンプルが、細胞サンプル、血液サンプルまたは循環腫瘍細胞である、項目45に記載の方法。
(項目47)
生物マーカーを同定する方法であって、第1の期間において項目40に記載のトランスジェニックマウスから得た第1のサンプル中の遺伝子発現プロファイル、ゲノムプロファイルまたはプロテオミクスプロファイルを、第2の期間において項目40に記載のトランスジェニックマウスから得たサンプル中のプロファイルと比較するステップを含む方法。
(項目48)
前記サンプルが、細胞サンプル、血液サンプルまたは循環腫瘍細胞である、項目47に記載の方法。
(項目49)
キットであって、PTEN、SMAD4、サイクリンD1およびSPP1の検出または定量化のための試薬ならびに前記キットを使用するための指示を含むキット。
(項目50)
ゲノムが内在性のPten遺伝子およびSmad4遺伝子の両方のホモ接合型破壊を含有する細胞を前立腺組織が含むトランスジェニック非ヒト哺乳動物であって、前記Pten遺伝子または前記Smad4遺伝子のいずれかにそのような破壊がない対照哺乳動物と比較して、前立腺癌の発症に対する感受性の増加を示し、Smad4遺伝子ではなく、Pten遺伝子のみにおけるホモ接合型破壊を有する対照哺乳動物と比較して、転移性であって、緩徐進行型ではない前立腺癌の発症に対する感受性の増加を示す、トランスジェニック非ヒト哺乳動物。
(項目51)
癌を治療するための方法であって、
a)癌細胞がPCDETERMINANT1〜372のうちの2個以上のレベルにおいて臨床的に有意な変化を示す対象を提供するステップであって、前記変化が、前記対象において癌が再発するかまたは転移性癌を発症するリスクの増加を示すステップと、
b)前記対象を、看護療法の標準に加えて、アジュバント療法も用いて治療するステップと
を含む方法。
(項目52)
前記看護療法の標準が、手術、放射線照射またはアンドロゲン除去である、項目51に記載の方法。
(項目53)
前立腺癌を、前立腺癌の治療を必要とする対象において治療するための方法であって、a)対象の前立腺癌組織由来のサンプル中のPTEN、SMAD4、CYCLIN D1およびSPP1の発現レベルに関する情報を得るステップと、
b)SPP1阻害剤またはCD44阻害剤を、前記発現レベルに基づいて前立腺癌が再発するかまたは転移性癌を発症するリスクがあると同定される対象に投与するステップと
を含む方法。
(項目54)
前記阻害剤が、抗SPP1抗体、SPP!siRNA、CD44抗体またはCD44siRNAである、項目53に記載の方法。
(項目55)
対象の癌に治療レジメンが有益であるかどうかを決定する方法であって、
a)2個以上のPCDETERMINANT1〜372のレベルを検出するステップと、b)ステップ(a)で検出された2個以上のPCDETERMINANTのレベルを基準値と比較するステップと
を含む方法。
(項目56)
アジュバント治療を必要とする腫瘍患者を選択する方法であって、
DETERMINANT1〜372の2個以上を測定することにより、前記患者における転移のリスクを評価するステップであって、前記患者由来の腫瘍サンプル中の前記2個以上のDETERMINANTの臨床的に有意な変化は、前記患者がアジュバント治療を必要としていることを示すステップ
を含む方法。
(項目57)
腫瘍患者に治療決定を知らせる方法であって、
前記患者から得た腫瘍サンプル中の、DETERMINANT1〜372の2個以上に関する情報を得るステップと、
前記2個以上のDETERMINANTが臨床的に有意に変化した場合に、前記患者における腫瘍転移を予防または低減する治療レジメンを選択するステップと
を含む方法。
本発明は、例えば以下の項目を提供する。
(項目1)
所定レベルの予測可能性を用いて、対象における癌再発のリスクまたは転移性癌を発症するリスクを評価するための方法であって、
a.前記対象由来のサンプル中の、PCDETERMINANT1〜372からなる群から選択された2個以上のPCDETERMINANTのレベルを測定するステップと、
b.前記サンプル中の前記2個以上のPCDETERMINANTのレベルの臨床的に有意な変化を測定するステップであって、前記変化が、前記対象において癌再発のリスクまたは転移性癌を発症するリスクが高いことを示しているステップと
を含む方法。
(項目2)
前記2個以上のPCDETERMINANTが、
a)表2、
b)表3、
c)表4、
d)表5、
e)表6、
f)表7、および
g)表2〜7から選択された2つ以上の表
から選択される、項目1に記載の方法。
(項目3)
前記PCDETERMINANTが、PTEN、SMAD4、サイクリンD1およびSPP1を含む、項目1に記載の方法。
(項目4)
前記癌に関連する少なくとも1つの標準的なパラメータを測定するステップをさらに含む、項目1に記載の方法。
(項目5)
前記癌が前立腺癌であり、前記標準パラメータがグリーソンスコアである、項目4に記載の方法。
(項目6)
PCDETERMINANTの前記レベルが、電気泳動、免疫化学的手法または非浸潤性イメージングによって測定される、項目1に記載の方法。
(項目7)
前記免疫化学的検出が、ラジオイムノアッセイ、免疫蛍光アッセイ、または酵素結合免疫吸着アッセイによって行われる、項目6に記載の方法。
(項目8)
前記対象が、原発性腫瘍、再発性腫瘍、または転移性前立腺癌を有する、項目1に記載の方法。
(項目9)
前記サンプルが、腫瘍生検標本、血液または生物学的液体中の循環腫瘍細胞である、項目1に記載の方法。
(項目10)
前記生検標本が、コア生検標本、切除組織生検標本、または切開組織生検標本である、項目1に記載の方法。
(項目11)
4個以上のPCDETERMINANTの発現レベルを測定する、項目1に記載の方法。
(項目12)
所定レベルの予測可能性を用いて、対象における癌再発のリスクまたは転移性癌を発症するリスクを評価するための方法であって、
a.前記対象由来のサンプル中の、PCDETERMINANT1〜372からなる群から選択された2個以上のPCDETERMINANTのレベルを測定するステップと、
b.前記2個以上のPCDETERMINANTのレベルを基準値と比較するステップと
を含む方法。
(項目13)
前記基準値が指標値である、項目12に記載の方法。
(項目14)
所定レベルの予測可能性を用いて、対象における腫瘍の進行を評価するための方法であって、
a.第1の期間で、前記対象由来の第1のサンプル中の、PCDETERMINANT1〜372からなる群から選択された2個以上のPCDETERMINANTのレベルを検出するステップと、
b.第2の期間で、前記対象由来の第2のサンプル中の2個以上のPCDETERMINANTのレベルを検出するステップと、
c.ステップ(a)で検出された前記2個以上のPCDETERMINANTのレベルを、ステップ(b)で検出されたレベルまたは基準値と比較するステップと
を含む方法。
(項目15)
前記第1のサンプルが、前記腫瘍の治療前に前記対象から採取される、項目14に記載の方法。
(項目16)
前記第2のサンプルが、前記腫瘍の治療後に前記対象から採取される、項目14に記載の方法。
(項目17)
所定レベルの予測可能性を用いて、再発性癌または転移性癌の治療の有効性をモニタするための方法であって、
a.第1の期間で、前記対象由来の第1のサンプル中の、PCDETERMINANT1〜372からなる群から選択された2個以上のPCDETERMINANTのレベルを検出するステップと、
b.第2の期間で、前記対象由来の第2のサンプル中の、2個以上のPCDETERMINANTの有効量のレベルを検出するステップと、
c.ステップ(a)で検出された前記2個以上のPCDETERMINANTのレベルを、ステップ(b)で検出されたレベルまたは基準値と比較するステップであって、治療の有効性が、前記対象由来の2個以上のPCDETERMINANTのレベルの変化によってモニタされるステップと
を含む方法。
(項目18)
前記対象が、前記癌の治療を事前に受けている、項目17に記載の方法。
(項目19)
前記第1のサンプルが、前記癌の治療前に前記対象から採取される、項目17に記載の方法。
(項目20)
前記第2のサンプルが、前記癌の治療後に前記対象から採取される、項目17に記載の方法。
(項目21)
前記第2のサンプルを、前記癌の再発後に前記対象から採取する、項目17に記載の方法。
(項目22)
前記第2のサンプルを、前記癌の再発前に前記対象から採取する、項目17に記載の方法。
(項目23)
所定レベルの予測可能性を用いて、腫瘍を有すると診断された対象に関する治療レジメンを選択するための方法であって、
a.第1の期間で、前記対象由来の第1のサンプル中の、PCDETERMINANT1〜372からなる群から選択された2個以上のPCDETERMINANTのレベルを検出するステップと、
b.任意選択で第2の期間で、前記対象由来の第2のサンプル中の2個以上のPCDETERMINANTのレベルを検出するステップと、
c.ステップ(a)で検出された前記2個以上のPCDETERMINANTのレベルを、基準値または任意選択でステップ(b)で検出された量と比較するステップと
を含む方法。
(項目24)
前記対象が、腫瘍の治療を事前に受けている、項目23に記載の方法。
(項目25)
前記第1のサンプルを、前記腫瘍を治療する前に前記対象から採取する、項目23に記載の方法。
(項目26)
前記第2のサンプルを、前記腫瘍を治療した後に前記対象から採取する、項目23に記載の方法。
(項目27)
PCDETERMINANT1〜372からなる群から選択された2個以上のマーカーの、マーカーレベルのパターンを含む、転移性前立腺癌基準発現プロファイル。
(項目28)
項目27に記載のプロファイルを作成するのに十分な、PCDETERMINANT1〜372からなる群から選択された対応するPCDETERMINANTを検出する複数のPCDETERMINANT検出試薬を含むキット。
(項目29)
前記検出試薬が、1つもしくは複数の抗体またはその断片を含む、項目28に記載のキット。
(項目30)
前記検出試薬が1種または複数のオリゴヌクレオチドを含む、項目28に記載のキット。
(項目31)
前記検出試薬が1種または複数のアプタマーを含む、項目28に記載のキット。
(項目32)
項目27に記載の1つまたは複数の転移性前立腺癌基準発現プロファイルと、任意選択で追加の試験結果および対象情報とを含有する機械可読媒体。
(項目33)
生理学的または生化学的な経路に関連した転移を示す1個または複数のPCDETERMINANTを含む、PCDETERMINANTパネル。
(項目34)
前記生理学的または生化学的な経路が、細胞移動、血管新生、細胞外マトリックス分解、溢出、コロニー形成またはアノイキスを含む、項目33に記載のパネル。
(項目35)
腫瘍の進行を示す1個または複数のPCDETERMINANTを含む、PCDETERMINANTパネル。
(項目36)
PCDETERMINANTの活性または発現を調節する化合物を同定する方法であって、
(a)前記PCDETERMINANTを発現する細胞を提供するステップと、
(b)前記細胞を、候補化合物を含む組成物と接触させるステップと、
(c)物質が前記PCDETERMINANTの発現または活性を変化させるか否かを決定するステップと
を含み、それにより、前記化合物の存在下で観察された前記変化が、細胞を、前記化合物を含まない組成物と接触させたときに観察されない場合、前記同定された化合物は、PCDETERMINANTの活性または発現を調節する方法。
(項目37)
前記細胞を、インビボ、エキソビボ、またはインビトロで接触させる、項目36に記載の方法。
(項目38)
対象の癌を治療する方法であって、PCDETERMINANTの活性または発現を調節する化合物を前記対象に投与するステップを含む方法。
(項目39)
対象の前立腺癌を治療しまたは予防する方法であって、PCDETERMINANTの活性または発現を調節する薬剤を前記対象に投与するステップを含む方法。
(項目40)
ゲノムが内在性のPten遺伝子およびSmad4遺伝子の両方のホモ接合型破壊を含有するダブルノックアウトのトランスジェニックマウスであって、野生型マウスと比較して、前立腺腫瘍の形成に対する感受性の増加を示すトランスジェニックマウス。
(項目41)
項目40に記載のトランスジェニックマウス由来の細胞。
(項目42)
上皮細胞である、項目41に記載の細胞。
(項目43)
前記上皮細胞が、前立腺細胞、乳房細胞、結腸細胞または肺細胞である、項目41に記載の細胞。
(項目44)
前立腺癌の進行を阻害する治療剤についてスクリーニングする方法であって、候補治療剤を項目40に記載のトランスジェニックマウスに投与するステップと、前記マウスにおいて前記治療剤の前立腺癌(prostate caner)の進行に対する効果を評価するステップとを含む方法。
(項目45)
生物マーカーを同定する方法であって、試験化合物の非存在下において項目40に記載のトランスジェニックマウスから得た第1のサンプル中の遺伝子発現プロファイル、ゲノムプロファイルまたはプロテオミクスプロファイルを、試験化合物の存在下において項目40に記載のトランスジェニックマウスから得たサンプル中の前記プロファイルと比較するステップを含む方法。
(項目46)
前記サンプルが、細胞サンプル、血液サンプルまたは循環腫瘍細胞である、項目45に記載の方法。
(項目47)
生物マーカーを同定する方法であって、第1の期間において項目40に記載のトランスジェニックマウスから得た第1のサンプル中の遺伝子発現プロファイル、ゲノムプロファイルまたはプロテオミクスプロファイルを、第2の期間において項目40に記載のトランスジェニックマウスから得たサンプル中のプロファイルと比較するステップを含む方法。
(項目48)
前記サンプルが、細胞サンプル、血液サンプルまたは循環腫瘍細胞である、項目47に記載の方法。
(項目49)
キットであって、PTEN、SMAD4、サイクリンD1およびSPP1の検出または定量化のための試薬ならびに前記キットを使用するための指示を含むキット。
(項目50)
ゲノムが内在性のPten遺伝子およびSmad4遺伝子の両方のホモ接合型破壊を含有する細胞を前立腺組織が含むトランスジェニック非ヒト哺乳動物であって、前記Pten遺伝子または前記Smad4遺伝子のいずれかにそのような破壊がない対照哺乳動物と比較して、前立腺癌の発症に対する感受性の増加を示し、Smad4遺伝子ではなく、Pten遺伝子のみにおけるホモ接合型破壊を有する対照哺乳動物と比較して、転移性であって、緩徐進行型ではない前立腺癌の発症に対する感受性の増加を示す、トランスジェニック非ヒト哺乳動物。
(項目51)
癌を治療するための方法であって、
a)癌細胞がPCDETERMINANT1〜372のうちの2個以上のレベルにおいて臨床的に有意な変化を示す対象を提供するステップであって、前記変化が、前記対象において癌が再発するかまたは転移性癌を発症するリスクの増加を示すステップと、
b)前記対象を、看護療法の標準に加えて、アジュバント療法も用いて治療するステップと
を含む方法。
(項目52)
前記看護療法の標準が、手術、放射線照射またはアンドロゲン除去である、項目51に記載の方法。
(項目53)
前立腺癌を、前立腺癌の治療を必要とする対象において治療するための方法であって、a)対象の前立腺癌組織由来のサンプル中のPTEN、SMAD4、CYCLIN D1およびSPP1の発現レベルに関する情報を得るステップと、
b)SPP1阻害剤またはCD44阻害剤を、前記発現レベルに基づいて前立腺癌が再発するかまたは転移性癌を発症するリスクがあると同定される対象に投与するステップと
を含む方法。
(項目54)
前記阻害剤が、抗SPP1抗体、SPP!siRNA、CD44抗体またはCD44siRNAである、項目53に記載の方法。
(項目55)
対象の癌に治療レジメンが有益であるかどうかを決定する方法であって、
a)2個以上のPCDETERMINANT1〜372のレベルを検出するステップと、b)ステップ(a)で検出された2個以上のPCDETERMINANTのレベルを基準値と比較するステップと
を含む方法。
(項目56)
アジュバント治療を必要とする腫瘍患者を選択する方法であって、
DETERMINANT1〜372の2個以上を測定することにより、前記患者における転移のリスクを評価するステップであって、前記患者由来の腫瘍サンプル中の前記2個以上のDETERMINANTの臨床的に有意な変化は、前記患者がアジュバント治療を必要としていることを示すステップ
を含む方法。
(項目57)
腫瘍患者に治療決定を知らせる方法であって、
前記患者から得た腫瘍サンプル中の、DETERMINANT1〜372の2個以上に関する情報を得るステップと、
前記2個以上のDETERMINANTが臨床的に有意に変化した場合に、前記患者における腫瘍転移を予防または低減する治療レジメンを選択するステップと
を含む方法。
Claims (56)
- 2個以上のPCDETERMINANTのレベルを、対象における癌再発のリスクまたは転移性癌を発症するリスクを評価することの指標とするための方法であって、
a.前記対象由来のサンプル中の、PCDETERMINANT1〜372からなる群から選択された2個以上のPCDETERMINANTのレベルを測定するステップと、
b.前記サンプル中の前記2個以上のPCDETERMINANTのレベルの臨床的に有意な変化を測定するステップであって、前記変化が、前記対象において癌再発のリスクまたは転移性癌を発症するリスクの増加を示しているステップと
を含む方法。 - 前記2個以上のPCDETERMINANTが、
a)表2、
b)表3、
c)表4、
d)表5、
e)表6、
f)表7、および
g)表2〜7から選択された2つ以上の表
から選択される、請求項1に記載の方法。 - 前記PCDETERMINANTが、PTEN、SMAD4、cyclin D1およびSPP1を含む、請求項1に記載の方法。
- 前記癌に関連する少なくとも1つの標準的なパラメータを測定するステップをさらに含む、請求項1に記載の方法。
- 前記癌が前立腺癌であり、前記標準パラメータがグリーソンスコアである、請求項4に記載の方法。
- PCDETERMINANTの前記レベルが、電気泳動、免疫化学的手法または非浸潤性イメージングによって測定される、請求項1に記載の方法。
- 前記免疫化学的検出が、ラジオイムノアッセイ、免疫蛍光アッセイ、または酵素結合免疫吸着アッセイによって行われる、請求項6に記載の方法。
- 前記対象が、原発性腫瘍、再発性腫瘍、または転移性前立腺癌を有する、請求項1に記載の方法。
- 前記サンプルが、腫瘍生検標本、血液または生物学的液体中の循環腫瘍細胞である、請求項1に記載の方法。
- 前記生検標本が、コア生検標本、切除組織生検標本、または切開組織生検標本である、請求項9に記載の方法。
- 4個以上のPCDETERMINANTの発現レベルが測定される、請求項1に記載の方法。
- 2個以上のPCDETERMINANTのレベルを、対象における癌再発のリスクまたは転移性癌を発症するリスクを評価することの指標とするための方法であって、
a.前記対象由来のサンプル中の、PCDETERMINANT1〜372からなる群から選択された2個以上のPCDETERMINANTのレベルを測定するステップと、
b.前記2個以上のPCDETERMINANTのレベルを基準値と比較するステップと
を含む方法。 - 前記基準値が指標値である、請求項12に記載の方法。
- 2個以上のPCDETERMINANTのレベルを、対象における腫瘍の進行を評価することの指標とするための方法であって、
a.第1の期間で、前記対象由来の第1のサンプル中の、PCDETERMINANT1〜372からなる群から選択された2個以上のPCDETERMINANTのレベルを検出するステップと、
b.第2の期間で、前記対象由来の第2のサンプル中の2個以上のPCDETERMINANTのレベルを検出するステップと、
c.ステップ(a)で検出された前記2個以上のPCDETERMINANTのレベルを、ステップ(b)で検出されたレベルまたは基準値と比較するステップと
を含む方法。 - 前記第1のサンプルは、前記腫瘍の治療前に前記対象から採取されたサンプルである、請求項14に記載の方法。
- 前記第2のサンプルは、前記腫瘍の治療後に前記対象から採取されたサンプルである、請求項14に記載の方法。
- 2個以上のPCDETERMINANTのレベルを、再発性癌または転移性癌の治療の有効性をモニタすることの指標とするための方法であって、
a.第1の期間で、前記対象由来の第1のサンプル中の、PCDETERMINANT1〜372からなる群から選択された2個以上のPCDETERMINANTのレベルを検出するステップと、
b.第2の期間で、前記対象由来の第2のサンプル中の、2個以上のPCDETERMINANTの有効量のレベルを検出するステップと、
c.ステップ(a)で検出された前記2個以上のPCDETERMINANTのレベルを、ステップ(b)で検出されたレベルまたは基準値と比較するステップであって、治療の有効性が、前記対象由来の2個以上のPCDETERMINANTのレベルの変化によってモニタされるステップと
を含む方法。 - 前記対象が、前記癌の治療を事前に受けている、請求項17に記載の方法。
- 前記第1のサンプルは、前記癌の治療前に前記対象から採取されたサンプルである、請求項17に記載の方法。
- 前記第2のサンプルは、前記癌の治療後に前記対象から採取されたサンプルである、請求項17に記載の方法。
- 前記第2のサンプルは、前記癌の再発後に前記対象から採取されたサンプルである、請求項17に記載の方法。
- 前記第2のサンプルは、前記癌の再発前に前記対象から採取されたサンプルである、請求項17に記載の方法。
- 2個以上のPCDETERMINANTのレベルを、腫瘍を有すると診断された対象に対する治療レジメンを選択することの指標とするための方法であって、
a.第1の期間で、前記対象由来の第1のサンプル中の、PCDETERMINANT1〜372からなる群から選択された2個以上のPCDETERMINANTのレベルを検出するステップと、
b.任意選択で、第2の期間で、前記対象由来の第2のサンプル中の2個以上のPCDETERMINANTのレベルを検出するステップと、
c.ステップ(a)で検出された前記2個以上のPCDETERMINANTのレベルを、基準値または任意選択でステップ(b)で検出された量と比較するステップと
を含む方法。 - 前記対象が、腫瘍の治療を事前に受けている、請求項23に記載の方法。
- 前記第1のサンプルは、前記腫瘍を治療する前に前記対象から採取されたサンプルである、請求項23に記載の方法。
- 前記第2のサンプルは、前記腫瘍を治療した後に前記対象から採取されたサンプルである、請求項23に記載の方法。
- PCDETERMINANT1〜372からなる群から選択された2個以上のマーカーの、マーカーレベルのパターンを含む、転移性前立腺癌基準発現プロファイル。
- 請求項27に記載のプロファイルを作成するのに十分な、PCDETERMINANT1〜372からなる群から選択された対応するPCDETERMINANTを検出する複数のPCDETERMINANT検出試薬を含むキット。
- 前記検出試薬が、1つもしくは複数の抗体またはその断片を含む、請求項28に記載のキット。
- 前記検出試薬が1種または複数のオリゴヌクレオチドを含む、請求項28に記載のキット。
- 前記検出試薬が1種または複数のアプタマーを含む、請求項28に記載のキット。
- 請求項27に記載の1つまたは複数の転移性前立腺癌基準発現プロファイルと、任意選択で追加の試験結果および対象情報とを含有する機械可読媒体。
- 生理学的または生化学的な経路に関連した転移を示す1個または複数のPCDETERMINANTを含む、PCDETERMINANTパネル。
- 前記生理学的または生化学的な経路が、細胞移動、血管新生、細胞外マトリックス分解、溢出、コロニー形成またはアノイキスを含む、請求項33に記載のパネル。
- 腫瘍の進行を示す1個または複数のPCDETERMINANTを含む、PCDETERMINANTパネル。
- PCDETERMINANTの活性または発現を調節する化合物を同定する方法であって、
(a)前記PCDETERMINANTを発現する前記細胞を、候補化合物を含む組成物とエキソビボ、またはインビトロで接触させるステップと、
(b)物質が前記PCDETERMINANTの発現または活性を変化させるか否かを決定するステップと
を含み、それにより、前記化合物の存在下で観察された前記変化が、前記細胞を、前記化合物を含まない組成物と接触させたときに観察されない場合、前記同定された化合物は、PCDETERMINANTの活性または発現を調節する方法。 - 対象の癌を治療するための組成物であって、PCDETERMINANTの活性または発現を調節する化合物を含む組成物。
- 対象の前立腺癌を治療しまたは予防するための組成物であって、PCDETERMINANTの活性または発現を調節する薬剤を含む組成物。
- ゲノムが内在性のPten遺伝子およびSmad4遺伝子の両方のホモ接合型破壊を含有するダブルノックアウトのトランスジェニックマウスであって、野生型マウスと比較して、前立腺腫瘍の形成に対する感受性の増加を示すトランスジェニックマウス。
- 請求項39に記載のトランスジェニックマウス由来の細胞。
- 上皮細胞である、請求項40に記載の細胞。
- 前記上皮細胞が、前立腺細胞、乳房細胞、結腸細胞または肺細胞である、請求項40に記載の細胞。
- 前立腺癌の進行を阻害する治療剤についてスクリーニングする方法であって、候補治療剤を請求項39に記載のトランスジェニックマウスに投与するステップと、前記マウスにおいて前記治療剤の前立腺癌の進行に対する効果を評価するステップとを含む方法。
- 生物マーカーを同定する方法であって、試験化合物の非存在下において請求項39に記載のトランスジェニックマウスから得た第1のサンプル中の遺伝子発現プロファイル、ゲノムプロファイルまたはプロテオミクスプロファイルを、試験化合物の存在下において請求項39に記載のトランスジェニックマウスから得たサンプル中の前記プロファイルと比較するステップを含む方法。
- 前記サンプルが、細胞サンプル、血液サンプルまたは循環腫瘍細胞である、請求項44に記載の方法。
- 生物マーカーを同定する方法であって、第1の期間において請求項39に記載のトランスジェニックマウスから得た第1のサンプル中の遺伝子発現プロファイル、ゲノムプロファイルまたはプロテオミクスプロファイルを、第2の期間において請求項39に記載のトランスジェニックマウスから得たサンプル中のプロファイルと比較するステップを含む方法。
- 前記サンプルが、細胞サンプル、血液サンプルまたは循環腫瘍細胞である、請求項46に記載の方法。
- キットであって、PTEN、SMAD4、cyclin D1およびSPP1の検出または定量化のための試薬ならびに前記キットを使用するための指示を含むキット。
- ゲノムが内在性のPten遺伝子およびSmad4遺伝子の両方のホモ接合型破壊を含有する細胞を前立腺組織が含むトランスジェニック非ヒト哺乳動物であって、前記Pten遺伝子または前記Smad4遺伝子のいずれかにそのような破壊がない対照哺乳動物と比較して、前立腺癌の発症に対する感受性の増加を示し、Smad4遺伝子ではなく、Pten遺伝子のみにおけるホモ接合型破壊を有する対照哺乳動物と比較して、転移性であって、緩徐進行型ではない前立腺癌の発症に対する感受性の増加を示す、トランスジェニック非ヒト哺乳動物。
- 2個以上のPCDETERMINANT1〜372のレベルを、看護療法の標準に加えて、アジュバント療法も必要とする対象を選択することの指標とするための方法であって、
PCDETERMINANT1〜372のうちの2個以上を測定するステップを含み、
前記対象において、癌の再発または転移性癌の発症のリスクが評価され、
PCDETERMINANT1〜372のうちの2個以上のレベルにおける臨床的に有意な変化が、前記対象における癌の再発または転移性癌の発症のリスクの増加を示し、そして、前記対象が、看護療法の標準に加えて、アジュバント療法も必要とすることを示す、方法。 - 前記看護療法の標準が、手術、放射線照射またはアンドロゲン除去である、請求項50に記載の方法。
- PTEN、SMAD4、CYCLIN D1およびSPP1の発現レベルを、SPP1阻害剤またはCD44阻害剤での治療を必要とする対象を決定することの指標とするための方法であって、
対象の前立腺癌組織由来のサンプル中のPTEN、SMAD4、CYCLIN D1およびSPP1の発現レベルに関する情報を得るステップを含み、
対象において、前立腺癌を再発または転移性癌を発症するリスクがあることが、前記対象が、SPP1阻害剤またはCD44阻害剤での治療を必要とすることを示す、方法。 - 前記阻害剤が、抗SPP1抗体、SPP1siRNA、CD44抗体またはCD44siRNAである、請求項52に記載の方法。
- 2個以上のPCDETERMINANT1〜372のレベルを、対象の癌に治療レジメンが有益であるかどうかを決定することの指標とするための方法であって、
a)2個以上のPCDETERMINANT1〜372のレベルを検出するステップと、b)ステップ(a)で検出された2個以上のPCDETERMINANTのレベルを基準値と比較するステップと
を含む方法。 - 2個以上のPCDETERMINANT1〜372を、アジュバント治療を必要とする腫瘍患者を選択することの指標とするための方法であって、
DETERMINANT1〜372の2個以上を測定するステップを含み、
前記患者における転移のリスクが評価され、前記患者由来の腫瘍サンプル中の前記2個以上のDETERMINANTの臨床的に有意な変化は、前記患者がアジュバント治療を必要としていることを示す、方法。 - 2個以上のPCDETERMINANT1〜372を、腫瘍患者に治療決定を知らせることの指標とするための方法であって、
前記患者から得た腫瘍サンプル中の、DETERMINANT1〜372の2個以上に関する情報を得るステップを含み、
前記2個以上のDETERMINANTが臨床的に有意に変化した場合に、前記患者における腫瘍転移を予防または低減する治療レジメンが選択される、方法。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US8128608P | 2008-07-16 | 2008-07-16 | |
US61/081,286 | 2008-07-16 | ||
PCT/US2009/050885 WO2010009337A2 (en) | 2008-07-16 | 2009-07-16 | Signatures and pcdeterminants associated with prostate cancer and methods of use thereof |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2011528442A JP2011528442A (ja) | 2011-11-17 |
JP2011528442A5 true JP2011528442A5 (ja) | 2013-06-06 |
Family
ID=41551019
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2011518921A Withdrawn JP2011528442A (ja) | 2008-07-16 | 2009-07-16 | 前立腺癌に関連した兆候およびpcdeterminant、ならびにそれらの使用方法 |
Country Status (14)
Country | Link |
---|---|
US (3) | US20110265197A1 (ja) |
EP (1) | EP2318543A2 (ja) |
JP (1) | JP2011528442A (ja) |
KR (1) | KR20110052627A (ja) |
CN (1) | CN102159727A (ja) |
AU (1) | AU2009270851A1 (ja) |
BR (1) | BRPI0916229A2 (ja) |
CA (1) | CA2730614A1 (ja) |
IL (1) | IL210681A0 (ja) |
MX (1) | MX2011000451A (ja) |
NZ (1) | NZ590851A (ja) |
RU (1) | RU2011105627A (ja) |
WO (1) | WO2010009337A2 (ja) |
ZA (1) | ZA201101132B (ja) |
Families Citing this family (39)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP2598659B1 (en) | 2010-07-27 | 2015-03-11 | Genomic Health, Inc. | Method for using gene expression to determine prognosis of prostate cancer |
WO2012061510A2 (en) * | 2010-11-03 | 2012-05-10 | Merck Sharp & Dohme Corp. | Methods of predicting cancer cell response to therapeutic agents |
SG195208A1 (en) * | 2011-06-02 | 2013-12-30 | Almac Diagnostics Ltd | Molecular diagnostic test for cancer |
AU2012203810B2 (en) * | 2011-06-22 | 2013-12-05 | Oncocyte Corporation | Methods and compositions for the treatment and diagnosis of bladder cancer |
CA2840066A1 (en) | 2011-06-27 | 2013-01-03 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | Signatures and determinants associated with prostate cancer progression and methods of use thereof |
WO2013031757A1 (ja) * | 2011-08-29 | 2013-03-07 | 東レ株式会社 | 膵癌、乳癌、肺癌又は前立腺癌の検出用マーカー及び検査方法 |
SG10201605210PA (en) | 2012-01-31 | 2016-08-30 | Genomic Health Inc | Gene expression profile algorithm and test for determining prognosis of prostate cancer |
WO2013163134A2 (en) * | 2012-04-23 | 2013-10-31 | The Trustees Of Columbia University In The City Of New York | Biomolecular events in cancer revealed by attractor metagenes |
NZ703411A (en) | 2012-06-27 | 2017-09-29 | Berg Llc | Use of markers in the diagnosis and treatment of prostate cancer |
US20140011685A1 (en) * | 2012-07-03 | 2014-01-09 | Yixin Wang | Genomic diagnostics using circulating endothelial cells |
AU2013342273A1 (en) * | 2012-11-09 | 2015-05-21 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | Metabolic profiling in tissue and serum is indicative of tumor differentiation in prostate cancer |
WO2014087156A1 (en) | 2012-12-03 | 2014-06-12 | Almac Diagnostics Limited | Molecular diagnostic test for cancer |
KR101456683B1 (ko) * | 2013-01-04 | 2014-11-06 | 서울대학교산학협력단 | 폐암 진단용 마커 |
WO2014152443A2 (en) * | 2013-03-14 | 2014-09-25 | The Board Of Regents Of The University Of Texas System | Single-cell analysis as a sensitive and specific method for early prostate cancer detection |
JP6554087B2 (ja) | 2013-03-14 | 2019-07-31 | オートレイシーズ・インコーポレイテッドOTraces Inc. | 測定分析物を使用する、疾患診断を改善するための方法 |
CN103602720A (zh) * | 2013-06-24 | 2014-02-26 | 复旦大学附属肿瘤医院 | 前列腺癌基因标记物在标记前列腺癌复发和转移中的用途及方法 |
GB201322034D0 (en) | 2013-12-12 | 2014-01-29 | Almac Diagnostics Ltd | Prostate cancer classification |
ES2613521T3 (es) * | 2014-01-03 | 2017-05-24 | Koninklijke Philips N.V. | Evaluación de la actividad de la ruta de señalización celular PI3K utilizando una modelación matemática de expresión de genes diana |
CN115684591A (zh) | 2014-01-28 | 2023-02-03 | 奎斯特诊断投资股份有限公司 | 用于在癌症中检测腺瘤-腺癌过渡的方法和组合物 |
GB201409479D0 (en) | 2014-05-28 | 2014-07-09 | Almac Diagnostics Ltd | Molecular diagnostic test for cancer |
US9994912B2 (en) | 2014-07-03 | 2018-06-12 | Abbott Molecular Inc. | Materials and methods for assessing progression of prostate cancer |
CN107428821B (zh) | 2014-12-08 | 2022-06-24 | 博格有限责任公司 | 包括细丝蛋白a的标志物在诊断和治疗前列腺癌中的用途 |
US11174518B2 (en) | 2015-10-05 | 2021-11-16 | Cedars-Sinai Medical Center | Method of classifying and diagnosing cancer |
WO2017079571A1 (en) | 2015-11-05 | 2017-05-11 | Arphion Diagnostics | Process for the indentication of patients at risk for oscc |
US11079745B2 (en) * | 2015-11-25 | 2021-08-03 | Lawrence Livermore National Security, Llc | Rapid closed-loop control based on machine learning |
RU2018127709A (ru) | 2016-01-22 | 2020-02-25 | Отрэйсис, Инк. | Системы и способы улучшения диагностики заболеваний |
KR101881874B1 (ko) * | 2016-04-29 | 2018-07-26 | 한국수력원자력 주식회사 | 저선량 방사선 조사에 의한 암화 예방 방법 |
WO2017213897A1 (en) | 2016-06-09 | 2017-12-14 | Cedars-Sinai Medical Center | Compositions and methods for treating cancer |
EP3507360A4 (en) * | 2016-08-30 | 2020-07-29 | Beth Israel Deaconess Medical Center Inc. | COMPOSITIONS AND METHODS FOR TREATING TUMOR SUPPRESSOR-DEFICIENT CANCER |
US10487365B2 (en) | 2016-09-20 | 2019-11-26 | The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | Methods for detecting expression of lnc-FANCI-2 in cervical cells |
CA2984267A1 (en) * | 2016-11-01 | 2018-05-01 | Medarchon, Inc. | Patient handoff device, system and predictive method |
WO2018085802A1 (en) * | 2016-11-07 | 2018-05-11 | The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | Methods for selecting therapy for a cancer patient |
US10767164B2 (en) | 2017-03-30 | 2020-09-08 | The Research Foundation For The State University Of New York | Microenvironments for self-assembly of islet organoids from stem cells differentiation |
US11754567B2 (en) | 2018-04-30 | 2023-09-12 | City Of Hope | Cancer detection and ablation system and method |
SG11201911777QA (en) * | 2018-10-15 | 2020-05-28 | Illumina Inc | Deep learning-based techniques for pre-training deep convolutional neural networks |
CA3126432A1 (en) * | 2019-02-01 | 2020-08-06 | Health Research, Inc. | Methods and compositions for treating resistant and recurrent forms of cancer |
WO2021062261A1 (en) * | 2019-09-25 | 2021-04-01 | The Trustees Of Columbia University In The City Of New York | Prognostic markers of metastatic cancer |
KR102380529B1 (ko) * | 2020-04-29 | 2022-03-31 | 인제대학교 산학협력단 | 전이성 전립선 암의 진단 및 예후 예측을 위한 혈중종양세포 기반 바이오 마커 조성물 |
US20220261668A1 (en) * | 2021-02-12 | 2022-08-18 | Tempus Labs, Inc. | Artificial intelligence engine for directed hypothesis generation and ranking |
Family Cites Families (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
ES2905579T3 (es) * | 2003-07-10 | 2022-04-11 | Genomic Health Inc | Algoritmo del perfil de expresión y prueba para el pronóstico de la recaída del cáncer de mama |
WO2006086345A2 (en) * | 2005-02-07 | 2006-08-17 | The Trustees Of Columbia University In The City Of New York | Methods to treat or prevent hormone-resistant prostate cancer using sirna specific for protocadherin-pc, or other inhibitors of protocadherin-pc expression or activity |
AU2007231487B2 (en) * | 2006-03-24 | 2014-01-09 | Phenomenome Discoveries Inc. | Biomarkers useful for diagnosing prostate cancer, and methods thereof |
-
2009
- 2009-07-16 WO PCT/US2009/050885 patent/WO2010009337A2/en active Application Filing
- 2009-07-16 CN CN2009801363207A patent/CN102159727A/zh active Pending
- 2009-07-16 EP EP09744246A patent/EP2318543A2/en not_active Withdrawn
- 2009-07-16 US US13/054,468 patent/US20110265197A1/en not_active Abandoned
- 2009-07-16 KR KR1020117003408A patent/KR20110052627A/ko not_active Application Discontinuation
- 2009-07-16 JP JP2011518921A patent/JP2011528442A/ja not_active Withdrawn
- 2009-07-16 NZ NZ590851A patent/NZ590851A/xx not_active IP Right Cessation
- 2009-07-16 RU RU2011105627/15A patent/RU2011105627A/ru unknown
- 2009-07-16 AU AU2009270851A patent/AU2009270851A1/en not_active Abandoned
- 2009-07-16 BR BRPI0916229A patent/BRPI0916229A2/pt not_active IP Right Cessation
- 2009-07-16 MX MX2011000451A patent/MX2011000451A/es not_active Application Discontinuation
- 2009-07-16 CA CA2730614A patent/CA2730614A1/en not_active Abandoned
-
2011
- 2011-01-16 IL IL210681A patent/IL210681A0/en unknown
- 2011-02-11 ZA ZA2011/01132A patent/ZA201101132B/en unknown
-
2014
- 2014-02-06 US US14/174,072 patent/US20140235479A1/en not_active Abandoned
-
2016
- 2016-10-28 US US15/337,966 patent/US20170299594A1/en not_active Abandoned
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP2011528442A5 (ja) | ||
RU2011105627A (ru) | Отличительные признаки (рс)-детерминанты, связанные с раком предстательной железы, и способы их применения | |
Bedossa et al. | Biopsy and noninvasive methods to assess progression of nonalcoholic fatty liver disease | |
Cornu et al. | Urine TMPRSS2: ERG fusion transcript integrated with PCA3 score, genotyping, and biological features are correlated to the results of prostatic biopsies in men at risk of prostate cancer | |
Van Treijen et al. | Blood transcript profiling for the detection of neuroendocrine tumors: results of a large independent validation study | |
JP2011526693A5 (ja) | ||
JP2013505429A5 (ja) | ||
RU2011102743A (ru) | Характерные признаки и детерминанты, связанные с метастазированием, и способы их применения | |
CN106662543B (zh) | 肺癌患者中的非侵入性基因突变检测 | |
CN104487591A (zh) | 预测前列腺癌预后之分子标记、方法及套组 | |
CN108369234B (zh) | 基于标志物分子将个体鉴定为待通过化疗治疗的方法和相关用途 | |
JP2014512515A (ja) | 癌診断および処置 | |
Sato et al. | Multiple primary malignancies in Japanese patients with renal cell carcinoma | |
Xie et al. | Prognostic value of pretreatment serum alkaline phosphatase in nasopharyngeal carcinoma | |
JP2008292424A (ja) | 腫瘍の検出方法 | |
CN102534009B (zh) | 一种与原发性肺癌辅助诊断相关的snp标志物及其应用 | |
ES2882875T3 (es) | Método de pronóstico y predicción de la recurrencia del cáncer de mama, marcadores empleados en el mismo y kit del mismo | |
Li et al. | AGR2 diagnostic value in nasopharyngeal carcinoma prognosis | |
Chen et al. | Fructose 1, 6‐Bisphosphatase 1 Expression Reduces 18F‐FDG Uptake in Clear Cell Renal Cell Carcinoma | |
Racz et al. | The accuracy of three predictive models in the evaluation of recurrence rates for gastrointestinal stromal tumors | |
KR102507439B1 (ko) | 고형 종양의 개시의 유전적 상태 전구증증을 조사하고 확인하는 방법 | |
Hui et al. | Immunohistochemical detection of cdc2 is useful in predicting survival in patients with mantle cell lymphoma | |
Gonzalez et al. | Prognostic value of combined p53 and survivin in pT1G3 urothelial carcinoma of the bladder | |
Shin et al. | What is the appropriate cut-off value of CRP to predict endoscopic remission in patients with ulcerative colitis in clinical remission? | |
US11448650B2 (en) | Methods for diagnosing high-risk cancer using polysialic acid and one or more tissue-specific biomarkers |