JP2011512163A5

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Publication number: JP2011512163A5
Application number: JP2010547822A
Authority: JP
Filing date: 2009-02-20
Publication date: 2012-04-05
Anticipated expiration: 2029-02-20

Claims

自閉症または自閉症スペクトラム障害を発現する傾向を検出する方法であって、前記方法は、標的ポリヌクレオチドにおいて少なくとも１つの欠失を含むＣＮＶの存在を検出する工程を含み、前記ＣＮＶが存在する場合、前記患者は自閉症および／または自閉症スペクトラム障害を発現するリスクが高いものであり、前記欠失含有ＣＮＶは、ｃｈｒ８：４３７６５５７０〜４３７７６５９５、ｃｈｒ２：５１１２０６４４〜５１１４７６００、ｃｈｒ３：１９１５１９０〜１９１５９２２、ｃｈｒ３：４１９９７３１〜４２３６３０４、ｃｈｒ１０：８７９４１６６６〜８７９４９０２９、ｃｈｒ６：１６２５８４５７６〜１６２５８７００１、ｃｈｒ２：７８２６８１９９〜７８３１１２４９およびｃｈｒ１６：４５８３４３２１〜４５８８７７４５から成るＣＮＶの群から選択されるものである、方法。
請求項１記載の方法において、この方法は、さらに、染色体８上のｒｓ８１８５７７１、染色体２上のｒｓ４９７１７２４、染色体３上のｒｓ１０５１０２２１、染色体３上のｒｓ１４４４０５６、染色体１０上のｒｓ１２４１１９７１、染色体６上のｒｓ１２２１４７８８、染色体２上のｒｓ２１６４８５０、および染色体１６上のｒｓ１７４６４２から成る群から選択される少なくとも１つの単一ヌクレオチド多型を検出する工程を含むものである。
自閉症または自閉症スペクトラム障害を発現する傾向を検出する方法であって、標的ポリヌクレオチドにおいて少なくとも１つの重複を含むＣＮＶの存在を検出する工程を含み、前記ＣＮＶが存在する場合、前記患者は自閉症および／または自閉症スペクトラム障害を発現するリスクが高いものであり、前記重複含有ＣＮＶは、ｃｈｒ２：１３１１９６６７〜１３１６５８９８、ｃｈｒ１５：２２３９３８３３〜２２５３２３０９、ｃｈｒ１２：３１３００８４６〜３１３０２０８８、ｃｈｒ６：６９２９１８２１〜６９２９４０２８、ｃｈｒ３：２５４８１４８〜２５４８５３１、ｃｈｒ３：１７４７５４３７８〜１７４７７１９７５、ｃｈｒ４：１４４８４７４０２〜１４４８５４５７９、ｃｈｒ１：１４５６５８４６５〜１４５８０７３５８、ｃｈｒ２：２３７４８６３２８〜２３７４９７１０５、ｃｈｒ６：１６８０９１８６０〜１６８３３９１００、ｃｈｒ１９：２２４３１１８９〜２２４３１３９７、ｃｈｒ１５：２２３９３８３３〜２２５３２３０９、ｃｈｒ２２：１９３５１２６４〜１９３５８９４６、ｃｈｒ７：３２６６７０８７〜３２７７０７１３、ｃｈｒ２０：５５４２６９６１〜５５４３０８７４、ｃｈｒ１：１７４５００５５５〜１７４５４３６７５、ｃｈｒ８：５５０２１０４７〜５５０７０１３４、およびｃｈｒ３：１２２８２６１９０〜１２２８７０４７４から成る群から選択されるものである、方法。
請求項３記載の方法において、この方法は、さらに、染色体２上のｒｓ４３４６３５２、染色体１５上のｒｓ７４９７２３９、染色体１２上のｒｓ６１７３７２、染色体６上のｒｓ９３４２７１７、染色体３上のｒｓ１７０１５８１６、染色体３上のｒｓ９８６０９９２、染色体４上のｒｓ７６８１９１４、染色体１上のｒｓ１２４０８１７８、染色体２上のｒｓ１１０７１９４、染色体６上のｒｓ９３４６６４９、染色体１９上のｒｓ１２３０３００、染色体１５上のｒｓ７４９７２３９、染色体２２上のｒｓ６７４４７８、染色体７上のｒｓ１３２２５１３２、染色体２０上のｒｓ６０２５５５３、染色体１上のｒｓ１０７９８４５０、染色体８上のｒｓ１０４３５６３４および染色体３上のｒｓ２０７０１８０から成る群から選択される少なくとも１つの単一ヌクレオチド多型を検出する工程を含むものである。
自閉症または自閉症スペクトラム障害を発現する傾向を検出する方法であって、標的ポリヌクレオチドにおいて核酸を含む少なくとも１つのＳＮＰの存在を検出する工程を含み、前記ＳＮＰが存在する場合、前記患者は自閉症および／または自閉症スペクトラム障害を発現するリスクが高いものであり、核酸を含有する前記ＳＮＰが、染色体５上のｒｓ４３０７０５９、ｒｓ７７０４９０９、ｒｓ１２５１８１９４、ｒｓ４３２７５７２、ｒｓ１８９６７３１、およびｒｓ１００３８１１３から成るＳＮＰの群から選択されるものである、方法。
請求項１〜５記載の方法において、前記標的核酸は検出前に増幅されるものである。
請求項１〜５記載の方法において、前記ＣＮＶまたはＳＮＰの存在を検出する工程は、特異的ハイブリダイゼーションの検出、対立遺伝子サイズの測定、制限断片長多型解析、対立遺伝子特異的ハイブリダイゼーション分析、単一塩基プライマー伸長反応、および増幅ポリヌクレオチドのシークエンシングから成る群から選択される工程を行うことにより、ポリヌクレオチド試料を分析し、前記ＣＮＶまたはＳＮＰの存在を決定する工程をさらに含むものである。
請求項１〜５記載の方法において、前記標的核酸はＤＮＡである。
請求項１〜５記載の方法において、前記標的配列はリボ核酸（ＲＮＡ）である。
請求項１〜５記載の方法において、前記ＣＮＶまたはＳＮＰを含む核酸は、ヒト対象の単離された細胞から得られるものである。
神経シグナリングおよび／または形態を変化させる薬剤を同定する方法であって、
ａ）請求項１または３記載の少なくとも１つのＣＮＶを発現する細胞を提供する工程と、
ｂ）工程ａ）のＣＮＶに対応する同種野生型配列を発現する細胞を提供する工程と、
ｃ）工程ａ）およびｂ）の細胞を試験薬と接触させる工程と、
ｄ）前記薬剤が、工程ｂ）の細胞に対する工程ａ）の細胞の神経シグナリングおよび／または形態を変わるか否かを分析し、それによって神経シグナリングおよび形態を変化させる薬剤を同定する工程と
を有する方法。
神経シグナリングおよび／または形態を変化させる治療薬を同定する方法であって、
ａ）少なくとも１つの請求項５記載のＳＮＰを発現する細胞を提供する工程と、
ｂ）工程ａ）のＳＮＰに対応する同種野生型配列を発現する細胞を提供する工程と、
ｃ）工程ａ）およびｂ）の細胞を試験薬と接触させる工程と、
ｄ）前記薬剤が、工程ｂ）の細胞に対して工程ａ）の細胞の神経シグナリングおよび／または形態が変わるか否かを分析し、それによって神経シグナリングおよび形態を変化させる薬剤を同定する工程と
を有する方法。
請求項１１または１２記載の方法において、前記治療薬は、自閉症／ＡＳＤまたは他の関連する神経発生障害の治療に対して有効性を有するものである。
治療薬であって、請求項１１または１２記載の方法によって同定されることを特徴とする治療薬。
自閉症を治療するための方法であって、請求項１１または１２記載の方法によって同定される有効量の前記薬剤を、これを必要とする患者に投与する工程を含むものである、方法。
請求項１２記載の方法において、前記薬剤はカドヘリンを介した細胞接着活性を調整するものである。
単離された自閉症関連ＳＮＰ含有核酸であって、前記ＳＮＰが、染色体２上のｒｓ４３４６３５２、染色体１５上のｒｓ７４９７２３９、染色体１２上のｒｓ６１７３７２、染色体６上のｒｓ９３４２７１７、染色体３上のｒｓ１７０１５８１６、染色体３上のｒｓ９８６０９９２、染色体４上のｒｓ７６８１９１４、染色体１上のｒｓ１２４０８１７８、染色体２上のｒｓ１１０７１９４、染色体６上のｒｓ９３４６６４９、染色体１９上のｒｓ１２３０３００、染色体１５上のｒｓ７４９７２３９、染色体２２上のｒｓ６７４４７８、染色体７上のｒｓ１３２２５１３２、染色体２０上のｒｓ６０２５５５３、染色体１上のｒｓ１０７９８４５０、染色体８上のｒｓ１０４３５６３４および染色体３上のｒｓ２０７０１８０から成る群から選択される、単離された自閉症関連ＳＮＰ含有核酸。
単離された自閉症関連ＳＮＰ含有核酸であって、前記ＳＮＰが、ｒｓ４３０７０５９、ｒｓ７７０４９０９、ｒｓ１２５１８１９４、ｒｓ４３２７５７２、ｒｓ１８９６７３１およびｒｓ１００３８１１３から成る群から選択されることを特徴とする単離された自閉症関連ＳＮＰ含有核酸。
ベクターであって、請求項１７または１８記載のＳＮＰ含有核酸のうちの少なくとも１つを含むものである、ベクター。
ベクターであって、請求項１または３記載の前記ＣＮＶ含有核酸のうちの少なくとも１つを含むものである、ベクター。
宿主細胞であって、請求項１９または２０記載の前記ベクターを含むものである、宿主細胞。
固体担体であって、請求項１７または１８記載の自閉症関連ＳＮＰ含有核酸を含むものである、固体担体。
単離された自閉症関連ＣＮＶ含有核酸であって、前記ＣＮＶが、ｃｈｒ８：４３７６５５７０〜４３７７６５９５、ｃｈｒ２：５１１２０６４４〜５１１４７６００、ｃｈｒ３：１９１５１９０〜１９１５９２２、ｃｈｒ３：４１９９７３１〜４２３６３０４、ｃｈｒ１０：８７９４１６６６〜８７９４９０２９、ｃｈｒ６：１６２５８４５７６〜１６２５８７００１、ｃｈｒ２：７８２６８１９９〜７８３１１２４９およびｃｈｒ１６：４５８３４３２１〜４５８８７７４５から成る群から選択される欠失を含むことを特徴とする単離された自閉症関連ＣＮＶ含有核酸。
単離された自閉症関連ＣＮＶ含有核酸であって、前記ＣＮＶが、ｃｈｒ２：１３１１９６６７〜１３１６５８９８、ｃｈｒ１５：２２３９３８３３〜２２５３２３０９、ｃｈｒ１２：３１３００８４６〜３１３０２０８８、ｃｈｒ６：６９２９１８２１〜６９２９４０２８、ｃｈｒ３：２５４８１４８〜２５４８５３１、ｃｈｒ３：１７４７５４３７８〜１７４７７１９７５、ｃｈｒ４：１４４８４７４０２〜１４４８５４５７９、ｃｈｒ１：１４５６５８４６５〜１４５８０７３５８、ｃｈｒ２：２３７４８６３２８〜２３７４９７１０５、ｃｈｒ６：１６８０９１８６０〜１６８３３９１００、ｃｈｒ１９：２２４３１１８９〜２２４３１３９７、ｃｈｒ１５：２２３９３８３３〜２２５３２３０９、ｃｈｒ２２：１９３５１２６４〜１９３５８９４６、ｃｈｒ７：３２６６７０８７〜３２７７０７１３、ｃｈｒ２０：５５４２６９６１〜５５４３０８７４、ｃｈｒ１：１７４５００５５５〜１７４５４３６７５、ｃｈｒ８：５５０２１０４７〜５５０７０１３４、およびｃｈｒ３：１２２８２６１９０〜１２２８７０４７４から成る群から選択される重複を含むものである、単離された自閉症関連ＣＮＶ含有核酸。
固体担体であって、請求項２３または２４記載の前記自閉症関連ＣＶＮを含むものである、固体担体。
単離された自閉症関連ＣＮＶ含有核酸の使用であって、前記ＣＮＶは、自閉症または自閉症スペクトラム障害を発現する傾向を検出する方法において、ｃｈｒ８：４３７６５５７０〜４３７７６５９５、ｃｈｒ２：５１１２０６４４〜５１１４７６００、ｃｈｒ３：１９１５１９０〜１９１５９２２、ｃｈｒ３：４１９９７３１〜４２３６３０４、ｃｈｒ１０：８７９４１６６６〜８７９４９０２９、ｃｈｒ６：１６２５８４５７６〜１６２５８７００１、ｃｈｒ２：７８２６８１９９〜７８３１１２４９およびｃｈｒ１６：４５８３４３２１〜４５８８７７４５から成る群から選択される欠失を有するものであり、前記方法は、標的ポリヌクレオチドにおいて少なくとも１つの欠失を含むＣＮＶの存在を検出する工程を含み、前記ＣＮＶが存在する場合、前記患者は自閉症および／または自閉症スペクトラム障害を発現するリスクが高いものである、使用。
単離された自閉症関連ＣＮＶ含有核酸の使用であって、前記ＣＮＶは、自閉症または自閉症スペクトラム障害を発現する傾向を検出する方法において、ｃｈｒ２：１３１１９６６７〜１３１６５８９８、ｃｈｒ１５：２２３９３８３３〜２２５３２３０９、ｃｈｒ１２：３１３００８４６〜３１３０２０８８、ｃｈｒ６：６９２９１８２１〜６９２９４０２８、ｃｈｒ３：２５４８１４８〜２５４８５３１、ｃｈｒ３：１７４７５４３７８〜１７４７７１９７５、ｃｈｒ４：１４４８４７４０２〜１４４８５４５７９、ｃｈｒ１：１４５６５８４６５〜１４５８０７３５８、ｃｈｒ２：２３７４８６３２８〜２３７４９７１０５、ｃｈｒ６：１６８０９１８６０〜１６８３３９１００、ｃｈｒ１９：２２４３１１８９〜２２４３１３９７、ｃｈｒ１５：２２３９３８３３〜２２５３２３０９、ｃｈｒ２２：１９３５１２６４〜１９３５８９４６、ｃｈｒ７：３２６６７０８７〜３２７７０７１３、ｃｈｒ２０：５５４２６９６１〜５５４３０８７４、ｃｈｒ１：１７４５００５５５〜１７４５４３６７５、ｃｈｒ８：５５０２１０４７〜５５０７０１３４、およびｃｈｒ３：１２２８２６１９０〜１２２８７０４７４から成る群から選択される重複を有するものであり、前記方法は、標的ポリヌクレオチドにおいて少なくとも１つの重複を含むＣＮＶの存在を検出する工程を含み、前記ＣＮＶが存在する場合、前記患者は自閉症および／または自閉症スペクトラム障害を発現するリスクが高いものである、使用。
単離された自閉症関連ＳＮＰ含有核酸の使用であって、前記ＳＮＰは、自閉症または自閉症スペクトラム障害を発現する傾向を検出する方法において、染色体２上のｒｓ４３４６３５２、染色体１５上のｒｓ７４９７２３９、染色体１２上のｒｓ６１７３７２、染色体６上のｒｓ９３４２７１７、染色体３上のｒｓ１７０１５８１６、染色体３上のｒｓ９８６０９９２、染色体４上のｒｓ７６８１９１４、染色体１上のｒｓ１２４０８１７８、染色体２上のｒｓ１１０７１９４、染色体６上のｒｓ９３４６６４９、染色体１９上のｒｓ１２３０３００、染色体１５上のｒｓ７４９７２３９、染色体２２上のｒｓ６７４４７８、染色体７上のｒｓ１３２２５１３２、染色体２０上のｒｓ６０２５５５３、染色体１上のｒｓ１０７９８４５０、染色体８上のｒｓ１０４３５６３４および染色体３上のｒｓ２０７０１８０から成る群から選択されるものであり、前記方法は、標的ポリヌクレオチドにおいて少なくとも１つのＳＮＰの存在を検出する工程を含み、前記ＳＮＰが存在する場合、前記患者は自閉症および／または自閉症スペクトラム障害を発現するリスクが高いものである、使用。