JP2010500571A - 組織マイクロアレイの多チャネル画像の共位置合わせシステム及び方法 - Google Patents
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Abstract
【選択図】 図4
Description
EGF−R/erbB:上皮増殖因子受容体
ER:乳癌腫瘍の増殖に所要するエストロゲン受容体、感染者におけるエストロゲンを制限する治療を決めるため、エストロゲン受容体は核に配置され、且つICHにより検出される。
AR: アンドロゲン依存腫瘍増殖に関与するアンドロゲン受容体
P53: 50%のヒト癌で不活性化されたDNAの損傷を検出する腫瘍抑制遺伝子
β−カテニン: 細胞粘着及び潜在遺伝子調節タンパク質に機能する、膜から核に転位した癌の癌遺伝子
りん酸化型β−カテニン:サイトゾルで分解し、核に転位しないβ−カテニンのリン酸化体
GSK3β:グリコーゲン合成酵素キナーゼ−3βタンパク質、ウィント経路リン酸化β−カテニンにおいて、前体で急速分解するようにりん酸化型−β−カテニンをマーキングする
PKCβ:メディエイターであるG−タンパク質共役型受容体
NFΚβ:核に転位する時、核因子カッパBのような炎症マーカー
Bcl−2: アポトーシス阻害剤とするB細胞リンパ腫癌遺伝子2
CyclinD:細胞周期調節
VEGF: 血管形成に関連する血管内皮細胞増殖因子
E−カドヘリン:上皮細胞で現われた細胞と細胞との間の相互分子、その機能は上皮癌で失われる。
Pan−カドヘリン: 膜のマーカー
平滑筋アクチン: 筋肉のマーカー
DAPI: 核のマーカー
ヘマトキシリン:DNAのマーカー(青色染色剤)
エオシン:pHに依存する細胞質のマーカー(赤色染色剤)。
Claims (25)
- 組織マイクロアレイの多チャネル画像を位置合わせする方法であって、
基質に生物学的材料を提供するステップと、
前記生物学的材料に蛍光分子マーカーを提供する1以上の分子プローブを提供するステップと、
前記生物学的材料と前記蛍光分子マーカーの第一デジタル画像を獲得するステップと、
前記生物学的材料に形態学的染色剤を提供するステップと、
前記生物学的材料の第二デジタル画像を獲得するステップと、
1以上の位置合わせメトリックに基づいて、前記第一画像に前記第二画像を共位置合わせするステップと、
を有する、組織マイクロアレイの多チャネル画像を位置合わせする方法。 - 1以上の前記位置合わせメトリックは、相互情報量を含む、請求項1記載の組織マイクロアレイの多チャネル画像を位置合わせする方法。
- 1以上の前記位置合わせメトリックは、少なくとも部分的に特徴ベース情報を使用し、核、上皮組織、及び間質からなる群から選択される1以上の特徴を含む、請求項2記載の組織マイクロアレイの多チャネル画像を位置合わせする方法。
- 前記1以上の前記位置合わせメトリックは、少なくとも部分的に強度ベース情報を使用する、請求項1記載の組織マイクロアレイの多チャネル画像を位置合わせする方法。
- 更に、少なくとも一つの前記画像を核、上皮組織、及び間質にセグメント化するステップを含む、請求項1記載の組織マイクロアレイの多チャネル画像を位置合わせする方法。
- 更に、前記間質のマスクを生成するステップを含む、請求項1記載の組織マイクロアレイの多チャネル画像を位置合わせする方法。
- 更に、前記分子マーカーに基づいて1以上の分子経路を識別するステップを含む、請求項1記載の組織マイクロアレイの多チャネル画像を位置合わせする方法。
- 前記分子経路は、病気を示す、請求項7記載の組織マイクロアレイの多チャネル画像を位置合わせする方法。
- 前記病気は、癌である、請求項8記載の組織マイクロアレイの多チャネル画像を位置合わせする方法。
- 前記癌は、上皮組織癌である、請求項9記載の組織マイクロアレイの多チャネル画像を位置合わせする方法。
- さらに、前記少なくとも一つの前記画像を核、上皮組織、及び間質にセグメントする、
前記分子マーカーに基づいて、1以上の分子経路を識別するステップを含む、請求項1記載の組織マイクロアレイの多チャネル画像を位置合わせする方法。 - 更に前記間質のマスクを生成するステップを含む、請求項11記載の組織マイクロアレイの多チャネル画像を位置合わせする方法。
- 更に、前記核、上皮組織、及び間質からなる群から選択される1以上の形態学的構造の関数として、前記識別された分子経路を定量するステップを含む、請求項11記載の組織マイクロアレイの多チャネル画像を位置合わせする方法。
- インタラクティブ・ビューアを使用して、前記第一画像を前記第二画像に重ねる、請求項1記載の組織マイクロアレイの多チャネル画像を位置合わせする方法。
- バーチャル顕微鏡で1以上の前記画像を観察して、通信ネットワークで通信するステップを含む、請求項1記載の組織マイクロアレイの多チャネル画像を位置合わせする方法。
- 1以上の前記位置合わせメトリックは、平均平方誤差、結合エントロピー、相互情報量、標準型相互情報量、相互相関、差の二乗和、及び絶対差の和からなる群から選ばれる、請求項1記載の組織マイクロアレイの多チャネル画像を位置合わせする方法。
- 請求項1記載の方法を実行するシステムであって、
デジタル画像を記憶する記憶手段と、
1以上の位置合わせメトリックに基づいて、前記第二画像を前記第一画像と位置合わせる処理装置とを含む、システム。 - 組織マイクロアレイの多チャネル画像を位置合わせする方法であって、
1以上の蛍光分子マーカーにより染色された生物学的材料のデジタル画像を提供する、
1以上の形態学的染色剤により染色された前記生物学的材料のデジタル 画像を提供する、
第一画像と第二画像との共通情報に基づいて、前記第一画像と前記第二画像とを位置合わせるステップが含まれる、、組織マイクロアレイの多チャネル画像を位置合わせする方法。 - 請求項18記載の方法を実行するシステムであって、
デジタル画像を記憶する記憶手段と、
第一画像と第二画像との共通情報に基づいて、前記第一画像と前記第二画像とを位置合わせる処理装置とを含む、システム。 - 前記第一画像と前記第二画像との共通情報は、核、上皮組織、及び間質からなる群から選択される1以上のタイプの特徴ベース情報を含む、請求項18記載の組織マイクロアレイの多チャネル画像を位置合わせする方法。
- 更に、前記デジタル画像を複数の形態学的特徴にセグメント化する、
1以上の前記形態学的特徴のマスクを生成するステップを含む、請求項18記載の組織マイクロアレイの多チャネル画像を位置合わせする方法。 - 1以上の前記形態学的特徴は、核、上皮組織、間質、及び細胞外のマトリクスからなる群から選ばれる、請求項21記載の組織マイクロアレイの多チャネル画像を位置合わせする方法。
- 前記第一画像と前記第二画像との前記共通情報は、強度ベース情報を含む、請求項18記載の組織マイクロアレイの多チャネル画像を位置合わせする方法。
- 更に、前記デジタル画像を複数の形態学的特徴にセグメントする、
1以上の前記形態学的特徴のマスクを生成するステップを含む、請求項23記載の組織マイクロアレイの多チャネル画像を位置合わせする方法。 - 組織マイクロアレイの多チャネル画像を位置合わせする方法であって、
基質に生物学的材料を提供する、
前記生物学的材料に蛍光分子マーカーを提供する1以上の分子プローブを提供する、
前記生物学的材料と前記蛍光分子マーカーの第一デジタル画像を獲得する、
前記分子マーカーと対応する1以上の分子経路を識別する、
前記生物学的材料に形態学的染色剤を提供する、
前記生物学的材料の第二デジタル画像を獲得する、
前記第二画像をセグメント化して、1以上の形態学的特徴を識別する、
少なくとも部分的に前記ステップのセグメント化された第二画像に基づいて、前記第一画像に前記第二画像を重ねる、組織マイクロアレイの多チャネル画像を位置合わせする方法。
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