JP2010057517A - リコンビナーゼ発現細胞 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】酵母由来FLPをコードする塩基配列において、FLP蛋白質のアミノ酸をコードするコドンを置換することにより、酵母において好適に用いられるコドンの比率がヒトにおいて好適に用いられるコドンの比率に変更されることによる、ヒトを含む動物細胞でのFLPタンパク質の翻訳効率が増強された改変塩基配列を有するDNAが得られる。
【選択図】なし
Description
Cre蛋白質に限らず、細胞毒性を有する蛋白質を恒常的に発現する細胞株を樹立しようとする場合、一般に高発現プロモーター下流に当該蛋白質遺伝子を組み込んだプラスミド等で細胞を形質転換しても、当該蛋白質を高レベルで安定に発現する細胞株は得にくく、当該蛋白質の毒性が細胞にとって許容レベル以下の量の蛋白質を発現する細胞株しか得られないことが多い。
一方、薬剤等により蛋白質の発現を誘導するプロモーターも知られている。しかし、一般にこのような誘導型のプロモーターは、恒常的に発現する強力なプロモーターに較べれば、そのプロモーター活性は弱いことが知られている。
(1)リコンビナーゼFLPの存在下でFLP依存的にリコンビナーゼCreを発現する細胞、
(2)前記(1)記載の細胞に、リコンビナーゼFLPを導入することによりリコンビナーゼCreを発現させる方法、
(3)リコンビナーゼFLPの存在下でFLP依存的にリコンビナーゼCreを発現する細胞を用いることを特徴とする、組換えウイルスベクターの製造方法、
(4)前記(2)および前記(3)記載の方法を用いた組換えアデノウイルスベクターの製造方法、
ならびに
(5)酵母由来FLPをコードする塩基配列において、FLP蛋白質のアミノ酸をコードするコドンを置換することにより、酵母において好適に用いられるコドンの比率がヒトにおいて好適に用いられるコドンの比率に変更されることによる、ヒトを含む動物細胞でのFLPタンパク質の翻訳効率が増強された改変塩基配列を有するDNA、
に関する。
本発明において「リコンビナーゼCre」とは、大腸菌のバクテリオファージP1がコードし、バクテリオファージP1内のloxP配列(Abremskiら、J. Biol. Chem. 1509 −1514 (1984) ;および Hoessら、Proc. Natl. Acad. Sci. Vol. 81、1026−1029 (1984))を基質とする、特異的なDNA組換え酵素であり、loxP配列を認識し、この配列間でDNAの切断、鎖の交換と結合の全工程を行なう。即ち、loxP配列がリコンビナーゼCreの認識配列となる。
前記プロモーターとしては、哺乳動物細胞で機能する限り特に限定されないが、その例として、SRαプロモーター(Molecular and Cellular Biology, Vol.8, 466-472 (1991)) 、EF−1αプロモーター(Gene, Vol.91, 217-223 (1990))、CMVプロモーター等が挙げられる。
前記スタッファー配列とは、2つの同一方向のリコンビナーゼFLPの認識配列に挟まれた塩基配列をいい、FLPの存在下では環状に切り出される配列である。
本発明の細胞を調製するために用いる細胞としては、目的のウイルスベクターの増殖に適した細胞であれば特に限定されない。
AAVベクターの作製には、AAVのベクタープラスミドと共に、ヘルパーウイルスとしてアデノウイルスを293細胞等の細胞に感染させる必要がある(Berns et. al., Adv. Virus. Res., Vol. 32, 243-306 (1987))。ヘルパーウイルスとして用いたアデノウイルスは、AAVベクター生成後に、熱失活等の操作によりAAVベクターから除く必要があるため、ヘルパーウイルス自体は増殖しない方が望ましい。
本発明において、「酵母において好適に用いられるコドンの比率がヒトにおいて好適に用いられるコドンの比率に変更される」とは、ある蛋白質のアミノ酸配列を変化させずに、その使用コドンを置換することにより、各コドンの使用頻度を表1の「ヒト遺伝子標準値」に近づけることである。「ヒト遺伝子標準値」に近づける割合に特に制限はなく、ヒト型コドンへの置換によりヒトを含む動物細胞でのFLP蛋白質の翻訳効率が増強するという特徴を満たせば良い。
ただし、機械的に「ヒト遺伝子標準値」に近づけるようにコドンを置換するのではなく、例えば、同一アミノ酸が連続する場合には同一コドンを用いずに、2番目以降のアミノ酸のコドンを変え同一コドンが連続しないようにするなどの工夫も本発明に含まれる。
ヒトもしくは動物細胞に遺伝子導入したFLP蛋白質の発現量の増加を確認する方法は、特に制限はなく、FLP蛋白質そのものの量を測定する方法、FLP蛋白質の機能を測定する方法などが挙げられる。FLP蛋白質そのものの量を測定する方法としては、抗FLP抗体を用いたウエスタンブロット法などが挙げられる。FLP蛋白質の機能を測定する方法としては、FLP蛋白質を含む細胞破砕液を酵素溶液として用いてFRT配列を含む基質DNAの組換え効率を測定する方法や、細胞にFLP遺伝子とともに基質DNAを同時に導入し、基質DNAが組換えを起こすことにより細胞に何らかの性質が現れるような測定方法を用いてもよい。後者の例として、プロモーター/FRT配列/ネオマイシン耐性遺伝子/ポリA配列/FRT配列/lacZ遺伝子/ポリA配列の構造を有する基質DNAを用い、lacZ遺伝子産物であるβ−ガラクトシダーゼの活性を測定する方法が挙げられる。
FLP蛋白質依存的にリコンビナーゼCreを発現する細胞株(293FNCre細胞)の作製
動物細胞の染色体上に、CAGプロモーター/FRT配列/ネオマイシン耐性遺伝子/SV40ポリA配列/FRT配列/核移行シグナル付きCre遺伝子/β−グロビンポリA配列の構造を有するDNAが挿入された細胞株を得るために、以下の操作を行なった。
プラスミドpCALNLZ(Y. Kanegae et. al., Gene, Vol.181, 207-212 (1996) 、図1A)) をMluIおよびXhoIで消化後平滑化したネオマイシン耐性遺伝子とSV40のポリA配列を含む断片を、pUFwFのSwaI部位に挿入したプラスミドpUFNF(図1B)を得た。
リコンビナーゼFLP発現プラスミドおよび組換えアデノウイルスの作製
リコンビナーゼFLPの翻訳開始コドンの前後の塩基配列をKozak配列に合わせたプラスミドを得るため、以下の操作を行った。
5'-AG CTT CTG CAG CAG ACC GTG CAT CAT G-3' (配列番号:3)
3'-A GAC GTC GTC TGG CAC GTA-5' (配列番号:4)
(a)および(b)の両DNAをpUC19のHind III−XbaI部位間に挿入し、プラスミドpUKFLP(4.1kb)を得た。
pUKFLPをPstIおよびFspIで消化後平滑化したFLPコード領域を含む1.4kbの断片を、コスミドベクターpAxCAwtのプロモーターとポリA配列との間のSwaI部位に挿入し、コスミドベクターpAxCAFLPを得た。
293FNCre細胞のFLP蛋白質に依存したCre蛋白質の発現
(1) Cre蛋白質に依存してlacZ遺伝子を発現するプラスミドの作製
コスミドベクターpAxCALNLZ(Kanegae et. al., Nucleic Acid Res., Vol.23, 3816-3821 (1995))は、コスミドベクターpAxcwのE1遺伝子欠失部位に、CAGプロモーター/loxP配列/ネオマイシン耐性遺伝子/SV40ポリA配列/loxP配列/大腸菌lacZ遺伝子/β−グロビンのポリA配列が挿入されたコスミドである。pAxCALNLZをSalI消化後自己ライゲーションさせ、アデノウイルスDNAの大部分を除いた(左端約0.4kbを含む)プラスミドpxCALNLZ(図3C)を作製した。pxCALNLZは、Cre蛋白質に依存してlacZ遺伝子を発現するベクターである。
293FNCre細胞がFLP蛋白質依存的にCre蛋白質を発現することの確認は、実施例2で作製したプラスミドpxCAFLPとプラスミドpxCALNLZとのコ・トランスフェクション法により行なった。その原理は、pxCAFLPにより発現したFLP蛋白質が293FNCre細胞の染色体に作用し、2個のFRT配列間のスタッファー配列(ネオマイシン耐性遺伝子およびSV40ポリA配列)を切り出し、CAGプロモーターからCre蛋白質が発現する。発現したCre蛋白質が、プラスミドpxCALNLZの2個のloxP配列間のスタッファー配列(ネオマイシン耐性遺伝子およびSV40ポリA配列)を切り出すことにより、lacZ遺伝子が発現する。したがって、これらの2つのプラスミドをコ・トランスフェクションした細胞がlacZ遺伝子を発現すれば、293FNCre細胞がFLP蛋白質依存的にCre蛋白質を発現することの証明となる。以下に、実験方法の詳細および結果を示す。
配列番号:2の塩基配列は、ポリリンカーである。
配列番号:3の塩基配列は、アダプターのセンス鎖である。
配列番号:4の塩基配列は、アダプターのアンチセンス鎖である。
配列番号:5の塩基配列は、ヒト型FLP全配列である。
Claims (5)
- 酵母由来FLPをコードする塩基配列において、FLP蛋白質のアミノ酸をコードするコドンを置換することにより、酵母において好適に用いられるコドンの比率がヒトにおいて好適に用いられるコドンの比率に変更されることによる、ヒトを含む動物細胞でのFLPタンパク質の翻訳効率が増強された改変塩基配列を有するDNA。
- FLPをコードする塩基配列の5’末端領域がKozak配列に一致する請求項2記載のDNA。
- 37℃におけるFLP蛋白質の翻訳効率が増強されている請求項1または2記載のDNA。
- FLPのアミノ酸配列中、2番目がセリン、33番目がセリン、108番目がアスパラギン、および294番目がプロリンである、請求項1から3のいずれか記載のDNA。
- 配列番号:5の塩基配列である請求項4記載のDNA。
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