JP2008201734A - 蛋白質内包球状遷移金属錯体及びその製造方法 - Google Patents
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Abstract
遷移金属原子と二座有機配位子とから形成される中空の殻を有し、前記二座有機配位子の一つが、連結基を介して蛋白質が結合してなるものであり、前記蛋白質が中空の殻内部に配向するように形成されている蛋白質内包球状遷移金属錯体、前記二座有機配位子、及びその製造方法を提供する。
【解決手段】
中空の殻を有する球状遷移金属錯体であって、前記中空の殻が、n個(nは、6〜60の整数を表す。)の遷移金属原子と、2n個の二座有機配位子とから形成されてなり、前記二座有機配位子の一つが、連結基を介して蛋白質が結合してなるものであり、かつ、前記蛋白質が中空の殻内部に配向するように形成されていることを特徴とする蛋白質内包球状遷移金属錯体。
【選択図】 図5
Description
(1)中空の殻を有する球状遷移金属錯体であって、前記中空の殻が、n個(nは、6〜60の整数を表す。)の遷移金属原子と、2n個の二座有機配位子とから形成されてなり、前記二座有機配位子の一つが、連結基を介して蛋白質が結合してなるものであり、かつ、前記蛋白質が中空の殻内部に配向するように形成されていることを特徴とする蛋白質内包球状遷移金属錯体。
(2)前記nが、6、12、24、30または60であることを特徴とする(1)に記載の蛋白質内包球状遷移金属錯体。
(4)前記遷移金属錯体を構成する遷移金属原子が、Ti、Fe、Co、Ni、Cu、Zn、Ru、Rh、Pd、Cd、Os、Ir及びPtからなる群から選ばれる一種であることを特徴とする(1)〜(3)のいずれかに記載の蛋白質内包球状遷移金属錯体。
(5)前記二座有機配位子(L1)が、式(I)
tは2〜6の整数を表し、複数のX同士は同一であっても相異なっていてもよい。
R1、R2はそれぞれ独立して、ハロゲン原子、置換されていても良いアルキル基、置換されていても良いアルコキシル基、シアノ基またはニトロ基を表す。
m1、m2はそれぞれ独立して、0〜4の整数を表す。m1、m2が2以上のとき、複数のR1同士、R2同士はそれぞれ同一であっても、相異なっていても良い。
A1は、下記式(a−1)〜(a−4)
R4は、ハロゲン原子、置換されていても良いアルキル基、置換されていても良いアルコキシル基、シアノ基、ニトロ基、ヒドロキシル基、ヒドロキシアルキル基、カルボキシル基、置換基を有していてもよいアミノ基、置換基を有していてもよいアミノアルキル基、または4級化アミノアルキル基を表す。
m3は0〜3の整数を表し、m4は0〜2の整数を表す。m3が2以上のとき、またはm4が2のとき、複数個のR4同士は同一であっても、相異なっていても良い。
Qは、−Nr1−(r1は、水素原子、アルキル基、アリール基若しくはアシル基を表す。)、−O−、−C(=O)−、−S−、または−SO2−を表す。〕で表される基の一種を示す。}で示される化合物であり、前記二座有機配位子(L2)が、式(II)
R5、R6はそれぞれ独立して、ハロゲン原子、置換されていても良いアルキル基、置換されていても良いアルコキシル基、シアノ基またはニトロ基を表す。
m5、m6はそれぞれ独立して、0〜4の整数を表す。m5、m6が2以上のとき、複数のR5同士、R6同士はそれぞれ同一であっても、相異なっていても良い。
A2は、下記式(a−5)〜(a−8)
R7は、ハロゲン原子、置換されていても良いアルキル基、置換されていても良いアルコキシル基、シアノ基、ニトロ基、ヒドロキシル基、ヒドロキシアルキル基、カルボキシル基、カルボキシアルキル基、置換基を有していてもよいアミノ基、置換基を有していてもよいアミノアルキル基、または4級化アミノアルキル基を表す。
R8は、水素原子、ハロゲン原子、アルキル基、またはハロアルキル基を表す。
m7は0〜3の整数を表し、m8は0〜2の整数を表す。m7が2以上のとき、またはm8が2のとき、複数個のR7同士は同一であっても、相異なっていても良い。)で表される基の一種を示す。}で示される化合物であることを特徴とする、(1)〜(4)のいずれかに記載の蛋白質内包球状遷移金属錯体。
(6)前記Yが、下記式
(7)遷移金属化合物(M)と、前記式(I)で表される二座有機配位子(L1)および式(II)で表される二座有機配位子(L2)とを、遷移金属化合物(M)nモル(nは6〜60の整数を表す)に対し、二座有機配位子(L1)を1モル、二座有機配位子(L2)を(2n−1)モルの割合で反応させることを特徴とする(1)〜(6)のいずれかに記載の蛋白質内包球状遷移金属錯体の製造方法。
(8)式(I)
n1は1〜6の整数を表し、n1が2以上のとき、複数のX同士は同一であっても相異なっていてもよい。
R1、R2はそれぞれ独立して、ハロゲン原子、置換されていても良いアルキル基、置換されていても良いアルコキシル基、シアノ基またはニトロ基を表す。
m1、m2はそれぞれ独立して、0〜4の整数を表す。m1、m2が2以上のとき、複数のR1同士、R2同士はそれぞれ同一であっても、相異なっていても良い。
A1は、下記式(a−1)〜(a−4)
R4は、ハロゲン原子、置換されていても良いアルキル基、置換されていても良いアルコキシル基、シアノ基、ニトロ基、ヒドロキシル基、ヒドロキシアルキル基、カルボキシル基、置換基を有していてもよいアミノ基、置換基を有していてもよいアミノアルキル基、または4級化アミノアルキル基を表す。
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(10)式(II)
n1は1〜6の整数を表し、n1が2以上のとき、複数のX同士は同一であっても相異なっていてもよい。
R5、R6はそれぞれ独立して、ハロゲン原子、置換されていても良いアルキル基、置換されていても良いアルコキシル基、シアノ基またはニトロ基を表す。
m5、m6はそれぞれ独立して、0〜4の整数を表す。m5、m6が2以上のとき、複数のR5同士、R6同士はそれぞれ同一であっても、相異なっていても良い。
A2は、下記式(a−5)〜(a−8)
R7は、ハロゲン原子、置換されていても良いアルキル基、置換されていても良いアルコキシル基、シアノ基、ニトロ基、ヒドロキシル基、ヒドロキシアルキル基、カルボキシル基、カルボキシアルキル基、置換基を有していてもよいアミノ基、置換基を有していてもよいアミノアルキル基、または4級化アミノアルキル基を表す。
R8は、水素原子、ハロゲン原子、アルキル基、またはハロアルキル基を表す。
m10は1〜3の整数を表し、m11は1〜2の整数を表す。m10が2以上のとき、またはm11が2のとき、複数個のR7同士は同一であっても、相異なっていても良い。)で表される基の一種を示す。}で示される化合物。
本発明によれば、精密に制御された大きさの中空内に蛋白質を内包することができるため、蛋白質の安定化だけでなく、蛋白構造の新たな情報取得手法の開発への利用が期待できる。
本発明の第3、第4によれば、新規な二座有機配位子が提供される。これらの一部は、本発明の球状遷移金属錯体の製造原料として用いることができる。
本発明の蛋白質内包球状遷移金属錯体(以下、単に「球状遷移金属錯体」ということがある。)は、中空の殻を有する球状遷移金属錯体であって、前記中空の殻がn個の遷移金属原子と、2n個の二座有機配位子とから形成されてなり、前記二座有機配位子の一つが、連結基を介して蛋白質が結合してなるものであり、かつ、前記蛋白質が中空の殻内部に配向するように形成されていることを特徴とする。
本発明の球状遷移金属錯体においては、自己組織化が容易に進行することから、前記nが、6、12、24、30または60であるのが好ましく、6または12であるのがより好ましく、12であるのが特に好ましい。
本発明の球状遷移金属錯体を構成する遷移金属原子としては、特に制限されないが、Ti、Fe、Co、Ni、Cu、Zn、Ru、Rh、Pd、Cd、Os、Ir及びPtからなる群から選ばれる一種であることが好ましく、平面4配位の錯体を容易に形成し得ることから、Ru、Rh、Pd、Os、Ir、Pt等の白金族原子が好ましく、Ru、Pd、Ptがより好ましく、Pdが特に好ましい。
遷移金属原子の価数は、通常0〜4価、好ましくは2価であり、配位数は、通常4〜6、好ましくは4である。
本発明の球状遷移金属錯体を構成する二座有機配位子は、二座有機配位子(L1)と二座有機配位子(L2)である。
すなわち、遷移金属原子と自己組織的に二座有機配位子を反応させて球状遷移金属錯体を形成させる際、蛋白質を内包させるため、用いる二座有機配位子のうちの一つに蛋白質を連結基を介して結合させた二座有機配位子(二座有機配位子(L1))を用いる。
二座有機配位子(L1)は、連結基を介して蛋白質が結合してなる二座有機配位子であり、形成される球状遷移金属錯体において、前記蛋白質が中空の殻内部に配向することができるものであれば特に制限されないが、下記式(I)で表される化合物が好ましい。
式(I)中、Xは、エチニレン基またはp−フェニレン基を表す。
tは2〜6の整数を表し、複数のX同士は同一であっても相異なっていてもよい。
式:−(X)t−で表される基の具体例を下記に示す。
置換されていても良いアルキル基のアルキル基としては、メチル基、エチル基、プロピル基、イソプロピル基、n−ブチル基、t−ブチル基、n−ペンチル基、n−ヘキシル基、n−オクチル基、n−ノニル基、n−デシル基等の炭素数1〜10のアルキル基が挙げられる。置換されていても良いアルキル基の置換基としては、ハロゲン原子、アルコキシル基、置換基を有していても良いフェニル基などが挙げられる。
式中、Yは単結合又は2価の連結基を表す。2価の連結基としては、前記Dと結合できるものであれば特に制約はない。例えば、−O−(CH2)a−(aは1〜8の整数を表す。以下にて同じ)、−O−(CH2)a−C(=O)−、−C(=O)−、−O−(CH2)a−NH−、−NH−、及び式(y)
これらの中でも、蛋白質の結合、脱離が容易で、蛋白質と結合する際、蛋白質の変性、分解が起こりにくい、式(y)で表される基が好ましい。
例えば、Pro−SHは、C末端がメチオニンである蛋白質や、C末端がグリシンである蛋白質を、該グリシンをシステインへと変異させることによって得られる蛋白質である。なお、Pro−SHは、S−S結合を形成して2量体となっている場合がある。その場合は還元して単量体としてから用いる。
ユビキチンは、アミノ酸76残基からなり、外径3nm強の小さな蛋白質であり、有機溶媒や酵素、熱などに対して安定であることが知られており、扱いも比較的容易であると考えられる。ユビキチンは生体内で他の蛋白質の修飾に用いられており、蛋白質分解・細胞周期・シグナル伝達・DNA修復・転写調節・代謝制御など数多くの生命現象を制御する重要な蛋白質である。2004年に「ユビキチンを介した蛋白質分解の発見」に対してノーベル化学賞が授与され、その構造に注目が集められている。
ヒドロキシアルキル基、カルボキシルアルキル基、置換基を有していてもよいアミノアルキル基、4級化アミノアルキル基のアルキル基としては、メチル基、エチル基、プロピル基等の炭素数1〜6のアルキル基が挙げられる。
カルボキシアルキル基としては、カルボキシルメチル基、2−カルボキシルエチル基、3−カルボキシ−n−プロピル基等が挙げられる。
式:−Nr1−で表される基において、r1は、水素原子、アルキル基、アリール基又はアシル基を表す。
前記r1のアルキル基としては、メチル基、エチル基、プロピル基、イソプロピル基等が挙げられる。アリール基としては、フェニル基、p−メチルフェニル基等が挙げられる。アシル基としては、アセチル基、プロピオニル基、ベンゾイル基等が挙げられる。
二座有機配位子(L1)は、公知の合成法を適用することにより製造することができる。例えば、前記式(I)で表される化合物のうち、下記式(I−3)で表される化合物は、下記式に示すように、式(III)で表される化合物に、式:Pro−DHで表される蛋白質を反応させて製造することができる。
A1’は、A1’−R3=A1を成立させる基である。
Y’は、Pro−DHと反応してPro−D−Yとなる、連結基Yの前駆体を表す。
具体的には、−OH、−O−(CH2)a−OH(aは1〜8の整数を表す。以下にて同じ)、−O−(CH2)a−COOH、−COOH、−O−(CH2)a−NH2、−NH2、及び式(y’)
式(III)で表される化合物にPro−DHを反応させて、前記式(I−3)で表される化合物を得る反応としては、公知のエステル化反応、脱水反応、マイケル付加反応等が挙げられる。
(a)用いる蛋白質がPro−OHで表されるものである場合には、末端部にCOOH基を有するY’と反応させて、Pro−O−C(=O)−を形成させることで、式(I−3)で表される化合物を得ることができる。
(b)用いる蛋白質がPro−NH2で表されるものである場合には、末端部にCOOH基を有するY’と反応させて、Pro−NH−C(=O)−を形成させることで、式(I−3)で表される化合物を得ることができる。
(c)用いる蛋白質がPro−COOHで表されるものである場合には、末端部にOH基を有するY’と反応させて、Pro−C(=O)−O−を形成させることで、式(I−3)で表される化合物を得ることができる。
(d)また、用いる蛋白質がPro−SHで表されるものである場合には、末端部に−CH=CH−を有するY’と反応させて(マイケル付加反応)、式
これらの中でも、本発明においては、上記(d)の、蛋白質としてPro−SHで表されるものを用い、マイケル付加反応させる方法が、簡便性等の観点から好ましい。
二座有機配位子(L2)は、前記遷移金属原子と自己組織的に球状遷移金属錯体を形成できるものであり、蛋白質が結合していないものであれば特に制限されないが、前記式(I)で表される化合物と配位子の大きさがほぼ同じである下記式(II)で表される化合物が好ましい。
R5、R6はそれぞれ独立して、前記R1、R2と同様の、ハロゲン原子、置換されていても良いアルキル基、置換されていても良いアルコキシル基、シアノ基またはニトロ基を表す。
m5、m6はそれぞれ独立して、0〜4の整数を表す。m5、m6が2以上のとき、複数のR5同士、R6同士はそれぞれ同一であっても、相異なっていても良い。
R7は、前記R4と同様の、ハロゲン原子、置換されていても良いアルキル基、置換されていても良いアルコキシル基、シアノ基、ニトロ基、ヒドロキシル基、ヒドロキシアルキル基、カルボキシル基、カルボキシルアルキル基、置換基を有していてもよいアミノ基、置換基を有していてもよいアミノアルキル基、または4級化アミノアルキル基を表す。
なお、4級化アミノアルキル基の対イオンとしては、後述するように、球状遷移金属錯体の製造原料となる遷移金属族化合物のアニオンと同じものであるのが好ましい。
R8のハロゲン原子としては、フッ素原子、塩素原子、臭素原子などが挙げられる。
アルキル基としては、メチル基、エチル基、プロピル基、イソプロピル基、n−ブチル基、t−ブチル基、n−ペンチル基、n−ヘキシル基、n−オクチル基、n−ノニル基、n−デシル基等の炭素数1〜20のアルキル基等が挙げられる。
ハロアルキル基としては、クロロメチル基、ジクロロメチル基、ブロモメチル基、トリフルオロメチル基等が挙げられる。
すなわち、式(VII)で表される化合物を、トリフェニルホスフィンと四臭化炭素を用いてベンジルブロマイド誘導体とした後、単離することなくトリアルキルアミン水溶液(Nr3aq.)を加えて、トリアルキルアンモニウムカチオン基を有する式(II−3)で表される化合物を合成することができる。
本発明の球状遷移金属錯体の製造方法は、遷移金属化合物(M)と、前記式(I)で表される二座有機配位子(L1)および式(II)で表される二座有機配位子(L2)とを、遷移金属化合物(M)nモル(nは6〜60の整数を表す)に対し、二座有機配位子(L1)を1モル、二座有機配位子(L2)を(2n−1)モルの割合で反応させることを特徴とする。
反応時間は、数分から数日間である。
以上のようにして、極めて簡便な操作により、本発明の球状遷移金属錯体を効率よく製造することができる。そのため、グラムスケールでの大量合成も可能である。
本発明の二座有機配位子は、前記式(I’)で表される化合物(以下、「化合物(I’)」という。)及び前記(II’)で表される化合物(以下、「化合物(II’)」という。)である。
化合物(I’)は、前記式(I)で表される化合物において、tがn1(n1は1〜6の整数を表す。)の化合物である。化合物(II’)は、前記式(II)で表される化合物において、tがn1(n1は1〜6の整数を表す。)の化合物である。
本発明の二座有機配位子は新規化合物であり、二座有機配位子(L1)、(L2)と同様に製造することができる。
(1)1H−NMRスペクトルの測定
1H−NMRスペクトルは、Bruker DRX 500(500MHz)NMR spectrometerにより測定した。なお、テトラメチルシラン(TMS)を内部標準とした)。
13C−NMRスペクトルは、Bruker DRX 500(125MHz)NMR spectrometerを用いて測定した。
CSI−MSスペクトル(コールドスプレーイオン化質量分析)は、JEOL、JMS−700C(4−セクター(BE/BE)−タンデム質量分析計)を用いて測定した。
MALDI−TOF MSは、質量分析装置(Applied Biosystem Voyager DE−STR)を用いて測定した。
融点は、融点測定器:Yanaco MP−500Vを用いて測定した。
(4)元素分析
炭素、水素、及び窒素の元素分析は、Yanaco MT−6を用いて行った。
IRスペクトルは、DIGILAB Scimitar FTS−2000(KBr)を用いて測定した。
溶媒及び試薬は、特に記載のないものは、東京化成工業株式会社、和光純薬工業株式会社、又は、Sigma−Aldrich Co.の市販品を使用した。
(1)N−(2−ヒドロキシエチル)マレイミドの合成
(i)N−メトキシカルボニルマレイミドの合成
Helvetica Chimica Acta,第58巻,536頁,1975年
N−メトキシカルボニルマレイミド(3.10g,20.0mmol)及び2−アミノエタノール(1.25g,20.5mmol)を炭酸水素ナトリウム(2.52g,30.0mmol)の水溶液(150mL)に加え、全容を室温で30分撹拌した。反応液をクロロホルム(200mL×6)で抽出した。有機層を濃縮して得られた残渣をクロロホルムとn−ヘキサンの混合溶媒から再結晶することにより、標記化合物を白色固体(1.45g,10.3mmol)として得た。収率52%。
トリt−ブチルホスフィン(0.462mL,0.184mmol;10重量%n−ヘキサン溶液)と、ジイソプロピルアミン(2.0mL,14mmol)を、1−アセトキシ−2,6−ジブロモベンゼン(441mg,1.50mmol)、4−(4−ピリジル)フェニルアセチレン(716mg,4.00mmol)、Pd(PhCN)2Cl2(34.5mg,0.090mmol)、及びヨウ化銅(I)(11.5mg,0.0060mmol)の1,4−ジオキサン(25mL)溶液に加え、全容を、アルゴン雰囲気下、45℃で12時間攪拌した。反応混合物に酢酸エチル(40mL)を加え、不溶物をろ別した。ろ液に水(100mL)及びエチレンジアミン(2mL)を加え、酢酸エチル層を分取した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥した後、溶媒を減圧留去した。
得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(CHCl3:メタノール=50:1(体積比))で精製することにより、標記化合物を白色固体(650mg,1.33mmol)として得た。収率88%。
ジイソプロピルアゾジカルボキシレート(0.089mL,0.45mmol)を、2,6−ビス[4−(4−ピリジル)フェニルエチニル]フェノール(168mg,0.375mmol)、及びトリフェニルホスフィン(110mg,0.42mmol)のTHF(20mL)溶液に加え、混合物をアルゴン雰囲気下、室温で30分間攪拌した。次いで、この溶液に、N−(2−ヒドロキシエチル)マレイミド(59.2mg,0.42mmol)を加え、全容を室温で17時間攪拌した。反応混合物を減圧濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(CHCl3:MeOH=50:1(体積比))により精製して、標記化合物を白色固体(42.9mg,0.0750mmol)として得た。収率20%。
MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGC
3,5−ジブロモ−4−メチル安息香酸(2.35g,8.00mmol)のTHF(20mL)様液を、1.0M(BH3−THF)THF溶液(18.0mmol,18.0mL)に30分かけて滴下した。反応液を飽和炭酸水素ナトリウム水溶液にゆっくりと注いだ。反応混合物を酢酸エチル(200mL×3)で抽出した。有機層を集め溶媒を減圧留去した。得られた残渣をクロロホルムとn−ヘキサンの混合溶媒から再結晶して、標記化合物を白色固体(1.95g,6.97mmol)として得た。収率87%。
トリt−ブチルホスフィン(0.462mL,0.186mmol;10重量%n−ヘキサン溶液)、及びジイソプロピルアミン(1.5mL,10.7mmol)を、(3,5−ジブロモ−4メチルフェニル)メタノール(420mg,1.50mmol),4−(4−エチニルフェニル)ピリジン(716mg,4.00mmol),Pd(PhCN)2Cl2(34.5mg,0.090mmol)、及びヨウ化銅(I)(11.5mg,0.060mmol)の1,4−ジオキサン(25mL)溶液に添加し、全容を、アルゴン雰囲気下、45℃で16時間攪拌した。反応液に酢酸エチル(30mL)を加え、不溶物をろ別した。ろ液に水(80mL)及びエチレンジアミン(1mL)を加え、酢酸エチル層を分取した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥し、溶媒を減圧留去した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(CHCl3:MeOH=40:1(体積比))で精製し、標記化合物を白色固体(634mg,1.33mmol)として得た。収率89%。
トリフェニルホスフィン(367mg,1.40mmol)、及び四臭化炭素(663mg,3.00mmol)を、アルゴン雰囲気下、室温で、{4−メチル−3,5−ビス[4−(4−ピリジル)フェニルエチニル]フェニル}メタノール(238mg,0.500mmol)の乾燥THF(150mL)溶液に順次添加した。全容を3時間攪拌することにより、4−メチル−3,5−ビス[4−(4−ピリジル)フェニルエチニル]ベンジルブロマイドが定量的に生成していることを、MALDI−TOF MSにより確認した(単離せず)。
トリメチル{4−メチル−3,5−ビス[4−(4−ピリジル)フェニルエチニル]ベンジル}アンモニウムブロマイド(77.5mg,0.130mmol)、及び、亜硝酸銀(22.8mg,0.133mmol)の、アセトニトリル(10mL)及び水(40mL)溶液に加え、全容を、アルゴン雰囲気下、40℃で3時間攪拌した。
反応液をろ過し、ろ液を減圧下に濃縮して、標記化合物を白色固体(47mg,0.081mmol)として得た。収率62%。
トリt−ブチルホスフィン(0.062mL,0.025mmol;10%n−ヘキサン溶液)、及びジイソプロピルアミン(0.20mL,1.4mmol)を、1−アセトキシ−2,6−ジブロモベンゼン(58.8mg,0.200mmol),1−エチニル−4−(ピリジルエチニル)ベンゼン(101.6mg,0.500mmol),Pd(PhCN)2Cl2(4.60mg,0.012mmol)、及びヨウ化銅(I)(1.52mg,0.0080mmol)の1,4−ジオキサン(1.5mL)溶液に加え、全容を、アルゴン雰囲気下、45℃で12時間攪拌した。
ジイソプロピルアゾジカルボキシレート(0.032mL,0.16mmol)を、2,6−ビス[4−(4−ピリジルエチニル)フェニルエチニル]フェノール(69mg,0.14mmol)、トリフェニルホスフィン(36.7mg,0.14mmol)のTHF(10mL)溶液に添加し、全容を、アルゴン雰囲気下、室温で30分間攪拌した。
反応混合物を減圧濃縮し、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(CHCl3:MeOH=50:1(体積比))で精製することにより、標記化合物を白色固体(46.5mg,0.075mmol)として得た。収率54%。
(3)配位子2bの合成
反応混合物を逆相(reversedphase)HPLC〔on an Inertsil Peptide C18 semi−preparative column(20mm×250mm)、溶離液:0.1重量%トリフルオロ酢酸(TFA)水溶液とアセトニトリル〕で精製後、凍結乾燥し、標記化合物を白色粉末(14mg,1.5μmol)として得た。収率57%。
トリt−ブチルホスフィン(0.462mL,0.0186mmol;10重量%n−ヘキサン溶液)、及びジイソプロピルアミン(1.5mL,11mmol)を、(3,5−ジブロモ−4−メチルフェニル)メタノール(420mg,1.50mmol),4−(4−エチニルフェニルエチニル)ピリジン(762mg,3.75mmol),Pd(PhCN)2Cl2(35mg,0.090mmol)、及びヨウ化銅(I)(11mg,0.060mmol)の1,4−ジオキサン(15ml)溶液に添加し、全容を、アルゴン雰囲気下、50℃で14時間攪拌した。反応混合物に酢酸エチル(30mL)を加え、不溶物をろ別した。ろ液に水(50mL)を加え、エチレンジアミン(1mL)で洗浄し、酢酸エチルで抽出した。有機層を集め、無水硫酸ナトリウムで乾燥し、溶媒を減圧留去した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(CHCl3:MeOH=40:1(体積比))により、精製して、標記化合物を白色固体(703mg,1.34mmol)として得た。収率89%。
Found:C,82.54;H,4.57;N,4.80
トリフェニルホスフィン(367mg,1.40mmol)及び四臭化炭素(597mg,1.80mmol)を、アルゴン雰囲気下、室温で、{4−メチル−3,5−ビス[4−(4−ピリジルエチニル)フェニルエチニル]フェニル}メタノール(314mg,0.600mmol)の乾燥THF(150mL)溶液に順次添加した。
Found:C,71.94;H,5.57;N,5.66
トリメチル{4−メチル−3,5−ビス[4−(4−ピリジルエチニル)フェニルエチニル]ベンジル}アンモニウムブロマイド(120mg,0.186mmol)、及び硝酸銀(32.6mg,0.192mmol)のアセトニトリル(10mL)及び水(60mL)の混合溶液に加え、全容を、アルゴン雰囲気下、40℃で12時間攪拌した。反応液をろ過し、真空乾燥することにより、標記化合物を白色固体(111mg,0.176mmol)として得た。収率95%。
Found:C,74.67;H,5.29;N,8.16
(1)1−(2−{2,6−ビス[(4−ピリジル)エチニル]フェノキシ}エチニル)ピロール−2,5−ジオン(4c)の合成
Found:C,74.20;H,4.09;N,9.81
トリt−ブチルホスフィン(1.84mL,0.745mmol;10重量%n−ヘキサン溶液、及びジイソプロピルアミン(9.0mL,64mmol)を、(3,5−ジブロモ−4−メチルフェニル)メタノール(1.34g,4.79mmol),4−エチニルピリジン塩酸塩(2.18g,15.6mmol),Pd(PhCN)2Cl2(138mg,0.360mmol)、及びヨウ化銅(I)(45.7mg,0.2400mmol)の1,4−ジオキサン(30mL)溶液に加え、全容を、アルゴン雰囲気下、40℃で24時間攪拌した。反応液に酢酸エチル(40mL)を加え、不溶物をろ別し、ろ液に水(100mL)を加え、エチレンジアミン(3mL)で洗浄し、酢酸エチルで抽出した。有機層を集め、無水硫酸ナトリウムで乾燥し、溶媒を減圧留去した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(CHCl3:メタノール=50:1(体積比))で精製することにより、標記化合物を白色固体(1.15g,3.54mmol)として得た。収率74%。
トリフェニルホスフィン(1.73g,6.60mmol)、及び四臭化炭素(2.98g,9.00mmol)を、{4−メチル−3,5−ビス[(4−ピリジル)エチニル]フェニル}メタノール(930mg,3.00mmol)の乾燥THF(200mL)様液に、アルゴン雰囲気下、室温で順次添加した。全容を3時間攪拌することにより、4−メチル−3,5−ビス[(4−ピリジル)エチニル]ベンジルブロマイドが定量的に生成していることをMALDI−TOF MSにより確認した(単離せず。)。
(参考1)
得られた二座有機配位子2a、2b、2cにつき、SDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動(SDS−PAGE)による分析を行った。SDS−PAGEは、アクリルアミドとN,N’−メチレンビスアクリルアミドの混合溶液を重合させた分子ふるいを用いて、その目の大きさによって蛋白質を分子量別によりわける手法である。サンプルを煮て蛋白質の高次構造をほどき、SDS(sodium dodecyl sulfate)を付加させることにより、分子量(=アミノ酸鎖の長さ)と対応する負電荷を蛋白質に与えた。ここに電圧をかけることにより蛋白質は陽極方向に移動し、ほぼ分子量によって分画することが可能である。最後に、Coomasie Brilliant Blueにより蛋白質を青色に着色を行った。
続いて、錯体形成反応に用いる溶媒を決定するために、溶媒によるユビキチンのフォールディング構造への影響を調べた。蛋白質のフォールディング構造の情報は、1H−NMRの測定により、シグナルが存在する化学シフト値の幅から読み取ることができる。フォールディング構造を維持している場合には、それぞれのプロトンの存在する環境が異なるため、アミドプロトンの化学シフト値が幅広い領域に観測される。一方、蛋白質が変性した場合には、ランダムコイル状になることによりアミドプロトンの観測される化学シフトの幅は狭くなることが知られている。
錯体形成後のスペクトルより、配位子骨格の拡散係数はlogD=−10.12に観測され、(1a)のみから形成する球状錯体の拡散係数(logD=−10.10)とほぼ等しいことより、直径6.3nmの球状錯体の形成が確認された。
まず、配位子(1a)から直径7.3nmの球状錯体を形成した。この錯体に対し、配位子を連結していないユビキチンを添加し室温で攪拌後、DOSY NMRの測定を行った。その結果、添加したユビキチンの拡散係数は球状錯体と比較して大きな領域に観測され、ユビキチンは球状錯体よりもサイズが小さく、拡散運動が早いことが分かった。すなわち、溶液中にユビキチンと球状錯体が共存する場合において、これらの拡散係数は区別して観測されることが示された。これは、先の実験において球状錯体とユビキチンが同一の拡散係数で観測されたことは、ユビキチンが球状錯体内に内包されたと解釈できることを支持している。
(参考例3)
Claims (10)
- 中空の殻を有する球状遷移金属錯体であって、前記中空の殻が、n個(nは、6〜60の整数を表す。)の遷移金属原子と、2n個の二座有機配位子とから形成されてなり、前記二座有機配位子の一つが、連結基を介して蛋白質が結合してなるものであり、かつ、前記蛋白質が中空の殻内部に配向するように形成されていることを特徴とする蛋白質内包球状遷移金属錯体。
- 前記nが、6、12、24、30または60であることを特徴とする請求項1に記載の蛋白質内包球状遷移金属錯体。
- 遷移金属化合物(M)、連結基を介して蛋白質が結合してなる二座有機配位子(L1)、および二座有機配位子(L2)とから、前記蛋白質が中空の殻内部に配向するように自己組織的に形成された、式:MnL2(2n-1)L1(nは前記と同じ意味を表し、複数のM同士、L2同士は、それぞれ同一であっても、相異なっていても良い。)で表される化合物であることを特徴とする請求項1または2に記載の蛋白質内包球状遷移金属錯体。
- 前記遷移金属錯体を構成する遷移金属原子が、Ti、Fe、Co、Ni、Cu、Zn、Ru、Rh、Pd、Cd、Os、Ir及びPtからなる群から選ばれる一種であることを特徴とする請求項1〜3のいずれかに記載の蛋白質内包球状遷移金属錯体。
- 前記二座有機配位子(L1)が、式(I)
tは2〜6の整数を表し、複数のX同士は同一であっても相異なっていてもよい。
R1、R2はそれぞれ独立して、ハロゲン原子、置換されていても良いアルキル基、置換されていても良いアルコキシル基、シアノ基またはニトロ基を表す。
m1、m2はそれぞれ独立して、0〜4の整数を表す。m1、m2が2以上のとき、複数のR1同士、R2同士はそれぞれ同一であっても、相異なっていても良い。
A1は、下記式(a−1)〜(a−4)
R4は、ハロゲン原子、置換されていても良いアルキル基、置換されていても良いアルコキシル基、シアノ基、ニトロ基、ヒドロキシル基、ヒドロキシアルキル基、カルボキシル基、置換基を有していてもよいアミノ基、置換基を有していてもよいアミノアルキル基、または4級化アミノアルキル基を表す。
m3は0〜3の整数を表し、m4は0〜2の整数を表す。m3が2以上のとき、またはm4が2のとき、複数個のR4同士は同一であっても、相異なっていても良い。
Qは、−Nr1−(r1は、水素原子、アルキル基、アリール基若しくはアシル基を表す。)、−O−、−C(=O)−、−S−、または−SO2−を表す。〕で表される基の一種を示す。}で示される化合物であり、前記二座有機配位子(L2)が、式(II)
R5、R6はそれぞれ独立して、ハロゲン原子、置換されていても良いアルキル基、置換されていても良いアルコキシル基、シアノ基またはニトロ基を表す。
m5、m6はそれぞれ独立して、0〜4の整数を表す。m5、m6が2以上のとき、複数のR5同士、R6同士はそれぞれ同一であっても、相異なっていても良い。
A2は、下記式(a−5)〜(a−8)
R7は、ハロゲン原子、置換されていても良いアルキル基、置換されていても良いアルコキシル基、シアノ基、ニトロ基、ヒドロキシル基、ヒドロキシアルキル基、カルボキシル基、カルボキシアルキル基、置換基を有していてもよいアミノ基、置換基を有していてもよいアミノアルキル基、または4級化アミノアルキル基を表す。
R8は、水素原子、ハロゲン原子、アルキル基、またはハロアルキル基を表す。
m7は0〜3の整数を表し、m8は0〜2の整数を表す。m7が2以上のとき、またはm8が2のとき、複数個のR7同士は同一であっても、相異なっていても良い。)で表される基の一種を示す。}で示される化合物であることを特徴とする請求項1〜4のいずれかに記載の蛋白質内包球状遷移金属錯体。 - 遷移金属化合物(M)と、前記式(I)で表される二座有機配位子(L1)および式(II)で表される二座有機配位子(L2)とを、遷移金属化合物(M)nモル(nは6〜60の整数を表す)に対し、二座有機配位子(L1)を1モル、二座有機配位子(L2)を(2n−1)モルの割合で反応させることを特徴とする請求項1〜6のいずれかに記載の蛋白質内包球状遷移金属錯体の製造方法。
- 式(I)
n1は1〜6の整数を表し、n1が2以上のとき、複数のX同士は同一であっても相異なっていてもよい。
R1、R2はそれぞれ独立して、ハロゲン原子、置換されていても良いアルキル基、置換されていても良いアルコキシル基、シアノ基またはニトロ基を表す。
m1、m2はそれぞれ独立して、0〜4の整数を表す。m1、m2が2以上のとき、複数のR1同士、R2同士はそれぞれ同一であっても、相異なっていても良い。
A1は、下記式(a−1)〜(a−4)
R4は、ハロゲン原子、置換されていても良いアルキル基、置換されていても良いアルコキシル基、シアノ基、ニトロ基、ヒドロキシル基、ヒドロキシアルキル基、カルボキシル基、置換基を有していてもよいアミノ基、置換基を有していてもよいアミノアルキル基、または4級化アミノアルキル基を表す。
m3は0〜3の整数を表し、m4は0〜2の整数を表す。m3が2以上のとき、またはm4が2のとき、複数個のR4同士は同一であっても、相異なっていても良い。
Qは、−Nr1−(r1は、水素原子、アルキル基、アリール基若しくはアシル基を表す。)、−O−、−C(=O)−、−S−、または−SO2−を表す。〕で表される基の一種を示す。}で示される化合物。 - 式(II)
n1は1〜6の整数を表し、n1が2以上のとき、複数のX同士は同一であっても相異なっていてもよい。
R5、R6はそれぞれ独立して、ハロゲン原子、置換されていても良いアルキル基、置換されていても良いアルコキシル基、シアノ基またはニトロ基を表す。
m5、m6はそれぞれ独立して、0〜4の整数を表す。m5、m6が2以上のとき、複数のR5同士、R6同士はそれぞれ同一であっても、相異なっていても良い。
A2は、下記式(a−5)〜(a−8)
R7は、ハロゲン原子、置換されていても良いアルキル基、置換されていても良いアルコキシル基、シアノ基、ニトロ基、ヒドロキシル基、ヒドロキシアルキル基、カルボキシル基、カルボキシアルキル基、置換基を有していてもよいアミノ基、置換基を有していてもよいアミノアルキル基、または4級化アミノアルキル基を表す。
R8は、水素原子、ハロゲン原子、アルキル基、またはハロアルキル基を表す。
m10は1〜3の整数を表し、m11は1〜2の整数を表す。m10が2以上のとき、またはm11が2のとき、複数個のR7同士は同一であっても、相異なっていても良い。)で表される基の一種を示す。}で示される化合物。
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