JP2007504219A - 関節リウマチのインビボ遺伝子治療のためのaavベクター - Google Patents

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Abstract

本発明は、関節リウマチ(RA)の、アデノ随伴ウイルス(AAV)に基づく遺伝子治療、詳細にはインビボ遺伝子治療の分野に関する。本発明は、関節炎の関節への治療タンパク質をコードする遺伝子の送達において非常に効果的である組換えAAVビリオン、およびインビボ遺伝子治療においてこのようなビリオンを使用するための方法を提供する。

Description

本発明は、関節リウマチ(RA)の、アデノ随伴ウイルス(AAV)ベースの遺伝子治療、詳細にはインビボ(in vivo)遺伝子治療の分野に関する。本発明は、抗炎症性タンパク質またはNF−κB活性を阻害するタンパク質のような治療用タンパク質をコードする遺伝子の関節への送達において非常に効果的である組換えAAVビリオン、およびインビボまたはエクスビボ(ex vivo)遺伝子治療でこのようなビリオンを使用するための方法を提供する。
関節リウマチ(RA)は、主に関節を標的とする進行性の破壊的な異常であり、および滑膜組織の過剰増殖および血液由来の細胞の浸潤によって特徴付けられ、軟骨および骨の進行性の侵食を生じる。RAの罹患率は、100,000人の集団あたり約30人であることが報告され、およびこれは、子供から老人までの任意の年齢群に影響を与え得る。疾患の有病率は、世界中で約1%である。したがって、オランダにおいてのみで約15,000人のRA患者が存在する。発病のピークは、30歳と55歳との間であり、女性における一貫したより高い割合のために、65歳を超える女性におけるRAの罹患率は5%までのぼる。
RAは、高い程度の経済的損失、病的状態、および早死を伴う。例えば、あるセンターにおいて、ほぼ80%の患者が20年間の追跡調査後に重篤な身体障害者であり;さらに3分の1が死亡した。入院治療を要求するRAを伴う患者は、健常者に比較される場合、少なくとも2倍増加される死亡率であり、そしてより重篤なRAは、より高い死亡率と関連される。重篤なRAにおける過剰な死亡率は、三枝冠動脈疾患または第4期ホジキン病の死亡率と比較されてきた。
RAの発病メカニズムの理解、および従来の治療での不十分な回復は、進行的な炎症を抑制するための、および関節傷害を防ぐための、新しく診断されるかまたは初期の疾患の積極的な処置についての近年の概念に導いた。薬物治療は、臨床的寛解期における患者以外の全ての患者についての処置の中軸である。このような治療は十分にこのような患者を処置して寛解を誘導し、そして日常的な活動における関節の組織または機能のさらなる喪失を防止する目的を伴って、開始されるべきである。疾患を緩和する抗リウマチ薬物での従来の治療に加えて、TNF−α阻害を目的とする新規なアプローチが首尾よく臨床に取り入れられた。現在、このアプローチを使用することにより、約70%のRA患者において20%の改善を達することが可能である。しかしながら、これらの米国リウマチ学会の大多数の20%の応答者は、いくらか活発な炎症性の関節をなお有した。患者の約30%は、関節炎活性に関して、TNFα阻害に応答しなかった。
関節内コルチコステロイドは、RA患者における兆候性滑膜炎の処置における重要な中軸である、特に、ほとんどの患者において生じ得るように、全身性の抗リウマチ治療の下で分離された関節炎活性がある場合、局所治療についての指標がある。しかし、全ての患者がコルチコステロイドの使用に応答するわけではなく、その使用は副作用によって制限される。
RAの病変は、滑膜関節を通して広がる。正常な滑膜液の無細胞性の性質とは対照的に、RA滑膜液は好中球で優先的に富化されるが、マクロファージ、T−リンパ球、および樹状細胞もまた存在する(非特許文献1)。細胞充実度における増加は、滑膜において最も明白であり、これは血液から補充される細胞によって浸潤されるようになる。関節の内層は、1〜2細胞から6〜8細胞厚に増加し、主に活性化血管内膜マクロファージおよび線維芽細胞様滑膜細胞からなる。滑膜細胞の正常な生態の変化は、RAと関連する病理学的プロセスの発生および維持において重要であり、関節軟骨および骨の侵襲および破壊を含む。エラスターゼおよびコラゲナーゼのような可溶性の媒介物の生成に加えて、滑膜液は細胞表面のタンパク質の発現によりこの病理生理学的なプロセスを媒介し、これはリウマチ様滑膜内のリンパ球およびマクロファージの補充および活性化に関与する。滑膜細胞は、関節空間内を介して容易に到達し、比較的長期間生存し、このことにより遺伝子治療戦略のための理想的な標的を示す(非特許文献2)。
さらに、関節の限局性であるという性質は、インビボ遺伝子治療を非常に魅力的なものとする。リウマチ様滑膜における多くの細胞性および分子性の相互作用は、サイトカインによって維持および調節される。RAにおける一貫した知見は、リウマチ様滑膜におけるIL−1、TNFα、およびIL−18のような線維芽細胞およびマクロファージ由来の炎症反応を促進するサイトカインの豊富さである。天然に存在するIL−1およびTNFαインヒビターの、IL−1受容体アンタゴニスト(IL−1RA)、ならびに可溶性TNFα受容体p55およびp75は、それらの対応物とともに平衡して産生される。IL−18およびIL−18結合タンパク質は精製される。過剰の組換えサイトカインインヒビターを提供する治療は、RAにおける均衡を抗炎症性状態に移行させる。抗TNF−αおよび抗IL−1指向性のアプローチは、あるサイトカインを遺伝子治療のための適切な標的とする。別のアプローチは、炎症性カスケードを阻害するための滑膜細胞による生物学的に活性な抗炎症性タンパク質(例えば、IL−4、IL−10、IL−13、およびIFN−β)の指向性の過剰発現であり得た(非特許文献3)。
NF−κBは、明らかに、炎症反応を促進する遺伝子発現の最も重要な調節因子の一つである(非特許文献4)。TNF−α、IL−1β、IL−6、およびIL−8のようなサイトカインの合成は、Cox−2の発現のように、NF−κBによって媒介される。Aupperleら(非特許文献5)は近年、RAおよび変質性関節炎を伴う患者から単離された初代線維芽細胞様滑膜細胞におけるIKKの役割を研究した。両方の患者群において、免疫反応性のIKKタンパク質は、これらの細胞において豊富であり、そしてIKK−αおよびIKK−βはmRNAレベルで構成的に発現される。これらの細胞におけるIKK機能は、TNF−αおよびIL−1によって非常に増強され得、内因性IκB−αの分解、およびNFκBの核への転移を誘導する。この経路の活性化およびIL−6、IL−8、ICAM−1、およびコラゲナーゼ−1の発現の結果として生じる誘導は、IKK−βに明確に依存する(非特許文献6)。したがって、IKK−βドミナントネガティブ変異体をコードするアデノウイルス構築物のトランスフェクションは、滑膜細胞におけるTNF−α媒介性のNFκB核転移および炎症反応を促進する遺伝子発現を防ぐが、IKK−αドミナントネガティブ変異体は何の効果も有しない(非特許文献7)。炎症性関節炎の動物モデルは、NF−κB活性化はインビボで病原性役割を有するという知見を支持した。例えば、滑膜性NF−κB結合の増加は、マウスコラーゲン誘導性関節炎における臨床的な関節症状の発達を進行させ、疾患が発症している間徐々に増加する(非特許文献8)。この結合活性の多くは、p50に起因するようであり、これはコラゲナーゼ−3転写に関与され、そして局所的に活性化されるAP−1とともに、細胞外マトリックス吸収に寄与し得た。滑膜性NF−κB活性化はまた、ラットアジュバント関節炎における免疫後数日以内に生じる(非特許文献9)。機能的なIKK−β遺伝子の関節内移送によるNF−κBの選択的な活性化は、滑膜性炎症および関節炎の臨床的兆候に導く(非特許文献10)。反対に、NF−κB核転移の減少および臨床的な滑膜炎がラットにおけるアジュバント関節炎において、ドミナントネガティブなアデノウイルスIKK−β構築物の関節内注入後に観察された(非特許文献11)。炎症におけるNF−κBの中心的な役割はまた、連鎖球菌の細胞壁誘導性の関節炎を伴うラットにおいて(非特許文献12)、およびコラーゲン誘導性の関節炎(CIA)を伴うマウスにおいて(非特許文献13)、観察された。
したがって、インビボ遺伝子治療によって、滑膜区分において抗炎症性タンパク質の局所的産生を増加させることを目的とする、またはNF−κB活性の阻害を目的とする種々の戦略は、RAの処置のために非常に有望である。
関節において、特にリウマチ様滑膜において、治療用タンパク質の有効量の持続性の局所的産生を可能にするために、効果的な遺伝子デリバリーシステムの開発が必要とされている。アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクター、レトロウイルスベクター、ヘルペスウイルスベクター、リポソーム、DNA予防接種などといった、一連の様々なウイルスおよび非ウイルスベクターが存在する(非特許文献14を参照のこと)。今日までに、主にアデノウイルスベクターが、遺伝子送達のためのベクターとして試験されている。しかし、それらのエピソーム性の性質は遺伝子発現の持続性を制限し、それによってそれらを長期間の遺伝子発現が要求される関節炎の治療にそれほど適切でないものとする。アデノウイルスベクターの別の欠点は、ウイルスタンパク質の存在であり、これは宿主における免疫応答を誘発し得る。
他方、アデノ随伴ウイルスベクター(AAV)は、標的細胞のゲノムに取り込まれることが(いくつかの組織において)示され(非特許文献15)、形質導入細胞における長期間の導入遺伝子発現を可能にする。アデノ随伴ウイルスは、ヘルパー依存性DNAパルボウイルスであり、これはヒトおよび哺乳動物における疾患と関連していない(概説に関して、非特許文献16を参照のこと)。組換えAAVベクターは、造血幹細胞、呼吸上皮細胞、およびニューロンのような異なる一連の細胞型にトランスフェクトし得ることが示された。しかし、多くの細胞型(例えば、滑膜細胞であるが、また多くの他の細胞など)について、AAVベクターによってそれらの全てがまたは効果的にトランスフェクトされ得るか否かは不明のままである。Panら(非特許文献17)は、rAAVベクターを使用して、リポ多糖誘導性の関節炎の症状を示すラット滑膜細胞をトランスフェクトし得たが、炎症性が消退した場合、導入遺伝子の発現が減少することを見出した。さらに、文献は、AAVベースのベクターでの関節へのインビボ遺伝子送達を試みる実験から、非常に不一致な結果を報告している(非特許文献18)。
複雑な要素は、AAV血清型が向細胞性において異なることである。特許文献1は、例えば、AAV5ベースのベクターがある細胞型(培養気道上皮細胞、培養横紋筋細胞、および培養ヒト臍帯静脈内皮細胞)をAAV2よりも高い効率にて形質導入したことを示す。他方、AAV5は培養されたcos細胞、293、HeLa、IB3細胞、およびMCF7細胞株において非常に非効率的であり、AAV2およびAAV5はともに、NIH3T3、skbr3、およびt−47D細胞株について不十分な形質導入効率を示した。
国際公開第99/61601号パンフレット Tak、P.P.滑膜および滑膜液の実験。Firestein GS、Panayi GS、Wollheim FA、編集者。関節リウマチ。発病および処置における最先端。New York:Oxford University Press、Inc.、2000:55〜68 Chernajovsky、Yら、1998、Drug Aging 12:29〜41;Robbins、P.D.ら、1998、Springer Semin、Immunopathol.20:197〜209 Boyle、D.L.ら、1999、Gene Ther.6:1911〜1918 Tak、P.P.およびFirestein、G.S.、2001、J.Clin.Invest.107(1):7〜11 1999、J.Immunol.163:427〜433 Aupperle、K.R.ら、1999、J.Immunol.163:427〜433 Aupperle、K.R.ら、1999、J.Immunol.163:427〜433 Han,Z.N.ら、1998、Autoimmunity 28:197〜208 Tsao、P.W.ら 1997、Clin.Immunol.Immunopathol.83、173〜178 Tak,P.P.ら、2001、Arthritis Rheum.44(8):1897〜907 Tak,P.P.ら、2001、Arthritis Rheum.44(8):1897〜907 Miagkov、A.V.ら、1998、Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.95:13859〜13864 GErlag、D.M.ら、2000、J.Immunol.165:1652〜1658;Han、Z.N.ら1998Autoimmunity 28:197〜208 Vervoordeldonk M.J.B.M.およびTak P.P.2001、Best Practice & Research Clinical Rheumatology 第15巻(5):771〜788 Hirataら、2000、J.of Virology 74:4612〜4620 BernsおよびBohensky、1987、Advances in Virus Research、Academic Press Inc.32:243〜307 J.of Virology 1999、第73巻、4:3410〜3417 Ghivizanniら、2000、DrugDiscov.Today 6:259〜267
上述のウイルスおよび非ウイルス遺伝子デリバリーシステムの利用可能性にもかかわらず、今日、関節リウマチを被る被験体のリウマチ様滑膜への遺伝子(治療用タンパク質をコードする)の効率的な送達に適したベクターは何ら存在しない。それゆえ、効果的な処置を可能にするために、滑膜への適切なインビボおよびエクスビボ遺伝子デリバリーシステムを作製する必要性が依然としてある。本発明はこのような遺伝子デリバリーシステムを提供する。
本発明は、1つの実施態様において、リウマチ様滑膜細胞にインビボで核酸分子を送達するための方法を提供し、該方法は、(a)AAV血清型5またはAAV血清型2のカプシドタンパク質を含む組換えAAVビリオン(rAAV)を提供する工程であって、ここでrAAVビリオンがrAAVXベクターを含み、rAAVXベクターが核酸配列に作動可能に連結される発現エレメントを含む、工程;および、(b)rAAVビリオンを滑膜細胞と接触させる工程であって、それによってrAAVXベクターの形質導入が、形質導入された滑膜細胞における核酸配列の発現を生じる、工程を包含する。
本発明の別の実施態様において、本発明は、本発明のrAAVビリオンを使用してリウマチ様関節を処置するための方法を提供する。該方法は好ましくは、(a)関節の関節リウマチの診断を確立する工程;(b)薬学的に許容される腑形剤、およびAAV血清型5またはAAV血清型2のカプシドタンパク質を含有するrAAVビリオンを含む薬学的組成物の治療的に有効な量を使用して、関節のリウマチ様滑膜細胞を形質導入する工程であって、ここでrAAVビリオンは少なくとも1つの治療用タンパク質(またはペプチド)をコードするヌクレオチド配列を含むrAAVXベクターを含む、工程、ならびに(c)必要に応じて一定期間後に工程(b)を反復する工程、を包含する。
処置の代替の実施態様において、前記方法は、本発明のrAAVビリオンを使用してエクスビボでリウマチ様滑膜細胞を形質導入する工程、必要に応じて形質導入細胞を選択する工程、被験体のリウマチ様関節に形質導入細胞を投与する工程、および必要に応じて一定期間後に投与を反復する工程を包含する。
本発明の別の実施態様において、組換えAAVビリオンが提供され、それによってビリオンはAAV血清型5またはAAV血清型2のカプシドタンパク質を含み、それによってrAAVビリオンはrAAVXベクターを含み、ここでrAAVXベクターは関節リウマチに対して有効な治療用タンパク質をコードする核酸配列に作動可能に連結される発現エレメントを含む。
一般的な定義
「遺伝子」または「コード配列」は、DNAまたはRNA領域(転写される領域)をいい、これは特定のタンパク質を「コードする」。コード配列は転写され(DNA)、そしてプロモーターのような適切な調節領域の制御下に置かれる場合、ポリペプチドに翻訳される(RNA)。遺伝子は、プロモーター、5’リーダー配列、コード配列、およびポリアデニル化部位を含む3’非翻訳配列のような、いくつかの作動可能に連結されるフラグメントを含み得る。キメラまたは組換え遺伝子は、通常天然において見出されない遺伝子であり、例えばプロモーターが天然と関連していないものであり、転写されるDNA領域の部分または全てをともなう遺伝子である。「遺伝子の発現」は、遺伝子がRNAに転写され、および/または活性なタンパク質に翻訳されるプロセスをいう。
本明細書中で使用されるように、用語「プロモーター」は、1つまたは複数の遺伝子の転写を制御するために機能し、遺伝子の転写開始部位の転写される方向に関して上流に位置され、そしてDNA依存性RNAポリメラーゼの結合部位、転写開始部位、および転写因子結合部位、リプレッサーまたはアクチベータータンパク質結合部位、およびプロモーターからの転写の量を直接的または間接的に調節することが当業者に公知の任意の他のヌクレオチドの配列を含むがこれらに制限されない、任意の他のDNA配列の存在によって構造的に同定される。「構成的」プロモーターは、ほとんどの生理学的および発生的条件下、ほとんどの組織において活性であるプロモーターである。「誘導性」プロモーターは、生理学的にまたは発生的に調節されるプロモーターである。「組織特異的」プロモーターは、特異的タイプの組織または細胞においてのみ活性である。
本明細書中で使用されるように、「作動可能に連結される」とは、互いに機能的な関係にあるように物理的に連結される、2つ以上の核酸またはアミノ酸の配列エレメントをいう。例えば、プロモーターはプロモーターがコード配列の転写および/または発現を開始し得る、またはそうでなければ制御/調節し得る場合、コード配列に作動可能に連結され、この場合、コード配列は、プロモーターの「制御下」にあると理解されるべきである。一般に、2つの核酸配列が作動可能に連結される場合、これらは同じ方向にあり、そしてまた、通常同じリーディングフレーム内にある。それらはまた、これは必要とされないかもしれないが、通常本質的に連続的である。
用語「シグナル配列」、「シグナルペプチド」、および「分泌リーダー」は交換可能に使用され、そして分泌性のおよび膜結合性のポリペプチドに通常存在する短い(通常約15〜60アミノ酸)、連続的なアミノ酸のストレッチをいい、これは細胞質の外側の様々な位置へのそれらの送達を指向する。したがって、特異的な分類化または標的化シグナルは、シグナル配列を含み、核、ER、ミトコンドリア、ペルオキソームなどへのポリペプチドの送達を指向し得る。シグナル配列は通常、約4〜15アミノ酸の疎水性コアを含み、これはしばしば、塩基性アミノ酸によって直接に先行される。シグナルペプチドのカルボキシル末端にて、シグナルペプチド切断部位を規定するシグナルを介入するアミノ酸によって分離される小さな、非荷電のアミノ酸の対が存在する。von Heijne、G.(1990)J.Membrane Biol.115:195〜201。それらの重複する構造的および機能的な類似性にもかかわらず、ネイティブのシグナルペプチドはコンセンサス配列を有しない。
「遺伝子送達」または「遺伝子移送」は、宿主への組換えまたは外来DNAの信頼性のある導入のための方法をいう。移送されたDNAは、宿主細胞のゲノムへ取り込まれないままであり得るか、好ましくは宿主細胞のゲノムに取り込まれ得る。遺伝子送達は、ウイルスベクターを使用する形質導入によって、またはエレクトロポレーション、細胞照射などのような公知の方法を使用する、細胞の形質転換によって行われ得る。
「ベクター」は一般に、ヌクレオチド配列のクローニングおよび発現に適切な核酸構築物をいう。ベクターはまた時折、ウイルスまたはビリオンのようなベクターを含む輸送媒体をいい、これは、宿主細胞中に、および宿主細胞間で、ベクターを移入し得る。
本明細書中で使用されるように「rAAVベクター」は、AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5などのようなアデノ随伴ウイルス血清型に由来する組換えベクターをいう。rAAVベクターは、1つの、好ましくは全ての野生型AAV遺伝子が欠失されるが、機能的なITR核酸配列をなお含む。機能的なITR配列は、AAVビリオンの複製、レスキュー、およびパッケージングのために必要である。ITR配列は、野生型配列であり得るか、または実質的に同一な配列(以下の定義のように)であり得るか、または例えば、それらが機能的なままである限り、ヌクレオチドの挿入、変異、欠失、または置換によって変化され得る。
本明細書中で使用されるように「rAAVベクター」は、任意のAAV血清型のITR核酸配列、またはそれが機能的なままである限り、特定のAAV血清型野生型ITR配列に実質的に同一である核酸配列を含む組換えAAVベクターをいう。選択のヌクレオチド配列は、AAV ITR配列間に挿入され、例えば発現コンストラクトは、コード配列および3’末端配列に作動可能に連結される発現調節エレメントを含む。本明細書中で使用されるように用語「rAAVXベクター」は、AAVX血清型のITR核酸配列、またはそれらが機能的なままである限り、AAVX血清型の野生型ITR配列に実質的に同一である核酸配列を含む組換えAAVベクターをいう。したがって、用語「rAAV5ベクター」または「rAAV2ベクター」は、AAV血清型5もしくは2のITR核酸配列、またはそれらに実質的に同一な核酸配列をそれぞれ含む、rAAV5もしくはrAAV2ベクターを示すために使用される。
「AAVビリオン」は、例えば野生型AAVビリオン粒子のような完全なウイルス粒子をいい、これはAAVカプシドタンパク質にパックされる1本鎖ゲノムDNAを含む。1本鎖核酸分子は、センス鎖またはアンチセンス鎖のいずれかであり、両方の鎖は等しく感染性である。「rAAVビリオン」は組換えAAVウイルス粒子、すなわち、感染性であるが複製欠陥である粒子をいう。これはAAVタンパク質の殻から構成され、そしてrAAVベクターを含む。本発明において、タンパク質の殻はrAAVベクターとは異なる血清型のものであり得る。したがって本発明のAAVビリオンはタンパク質の殻、すなわち、20面体のカプシドから構成され得、これは1つのAAV血清型、例えばAAV血清型5のカプシドタンパク質(VP1、VP2、および/またはVP3)を含み、一方そのAAV5ビリオンを含むrAAVベクターは、上記の任意のrAAVXベクターであり得、rAAV5ベクターを含む。したがって「rAAV5ビリオン」はAAV血清型5のカプシドタンパク質を含み、一方例えばrAAV2ビリオンはAAV血清型2のカプシドタンパク質を含み、それによりいずれも本発明の任意のrAAVXベクターを含み得る。
「AAVヘルパー機能」は一般に、rAAV複製、またはrAAVビリオンもしくはrAAVベクターにトランス(in trans)で供給されるパッケージングのために必要とされる対応するAAV機能をいう。AAVヘルパー機能は、rAAVベクターにおいて欠損するAAV機能を相補するが、それらはAAV ITRを欠損する(これはrAAVベクターによって提供される)。AAVヘルパー機能はAAVの2つの主要なORF、すなわちrepコード領域およびcapコード領域、または機能的に実質的に同一なそれらの配列を含む。RepおよびCap領域は当該分野において周知であり、例えば、本明細書中で参考として援用される、Chioriniら(1999、J.of Virology、第73巻(2):1309〜1319)または米国特許第5,139,941号を参照のこと。AAVヘルパー機能は、AAVヘルパー構築物において供給され得る。宿主細胞へのヘルパー構築物の導入は、例えば、rAAVベクターの導入の前のまたはそれと同時の形質転換または形質導入によって生じ得る。したがって本発明のAAVヘルパー構築物は、それらが、一方でrAAVビリオンのカプシドタンパク質についての、他方でrAAVXベクターの複製およびパッケージングについての、血清型の所望される組合せを生成するように、選択され得る。
「AAVヘルパーウイルス」は、AAV複製およびパッケージングに必要とされるさらなる機能を提供する。適切なAAVヘルパーウイルスは、アデノウイルス、単純ヘルペスウイルス(例えば、HSV 1型および2型)、ならびにワクシニアウイルスを包含する。ヘルパーウイルスによって提供されるさらなる機能はまた、本明細書中で参考として援用される、米国特許第6,531,456号において記載されるように、ベクターを介して宿主細胞に導入され得る。
本明細書において「導入遺伝子」は、細胞に新規に導入された遺伝子、すなわち、細胞において通常存在しない遺伝子として規定される。導入遺伝子は、細胞に対してネイティブである配列、細胞において天然には存在しない配列を含み得、そしてこれは両方の組合せを含み得る。導入遺伝子は、細胞におけるコード配列の発現に適切な調節配列に作動可能に連結され得る1つまたは複数のタンパク質をコードする配列を含み得る。好ましくは、導入遺伝子は宿主細胞のゲノムに取り込まれる。
「形質導入」は、AAVビリオンによる受容宿主細胞へのDNA分子の送達をいう。例えば、本発明のrAAVビリオンによる標的細胞の形質導入は、そのビリオン中に含まれるrAAVXベクターを形質導入細胞への移送に導く。「宿主細胞」または「標的細胞」は、DNA送達が行われる細胞、例えば、被験体の滑膜細胞をいう。AAVビリオンは、分裂または非分裂細胞の両方を形質導入し得る。
「被験体」は、任意のメンバーのクラスの哺乳動物を意味し、ヒト、非ヒト霊長類、畜産動物、家畜動物、および実験室動物を含むが、これらに制限されない。
用語「関節内」は、例えば、膝、肘、肩、足首、手首などの関節の内部をいう。したがって、関節内注入は、関節の骨の間における空間への注入である。膝において、「関節内」は、膝蓋骨の背後および周囲の大腿と脛骨との間の空間をいう。
用語「実質的な同一性」は、2つのペプチドまたは2つのヌクレオチド配列が、例えばデフォルトパラメーターを使用するプログラムGAPまたはBESTFITにより、必要に応じてアラインされる場合、少なくとも80%の配列同一性、好ましくは少なくとも90%の配列同一性、より好ましくは少なくとも95%の配列同一性、またはそれ以上(例えば、99%の配列同一性)を共有することを意味する。GAPは、2つの配列をそれらの全体の長さにわたってアラインするためにNeedlemanおよびWunschのグローバルアラインメントアルゴリズムを使用し、適合の数を最大にし、およびギャップの数を最小にする。一般に、GAPデフォルトパラメーターが、ギャップ作製ペナルティー=50(ヌクレオチド)/8(タンパク質)およびギャップ伸張ペナルティー=3(ヌクレオチド)/2(タンパク質)を伴って使用される。ヌクレオチドについて、使用されるデフォルトスコアマトリクスは、nwsgapdnaであり、およびタンパク質について、デフォルトスコアマトリクスはBlosum62である(Henikoff & Henikoff、1992)。
用語「含む」は、記載される部分、工程、または成分の存在を特定するように解釈されるが、1つまたは複数のさらなる部分、工程、または成分の存在を排除しない。したがって、領域Xを含む核酸配列はさらなる領域を含み得、すなわち領域Xはより大きな核酸領域内に組込まれ得る。
B.発明の実施態様
AAVはエンベロープを持たないDNAウイルスであり、これは複製のためにヘルパーウイルスを必要とする。組換えAAVベクターは、それらがヒトにおいて非病原性であり、免疫学的に不活性であり、そして長期間の遺伝子発現をインビボで可能にするので、他のベクターよりも多くの重要な利点を有する。治療に関連する遺伝子の発現を媒介するこれらの能力は、いくつかの関節炎の実験的モデルにおいて、現在十分に確立される。増大する数のAAV血清型が同定されているが、これまでのところ全ての研究は血清型2(AAV2)を用いて行われた。異なる血清型は異なるビリオン殻タンパク質を有し、その結果それらの指向性が異なる。
本発明者らは、驚くべきことに、異なる血清型のAAVビリオンを、関節炎の関節、特に滑膜への遺伝子のインビボ送達のためにAAVベクターとして使用する場合、それらの形質導入効率がかなり異なることを見出した。レポーター遺伝子のマウス分泌性アルカリホスファターゼ(mSEAP)またはE,coli βガラクトシダーゼ(β−Gal)をコードする5つの異なるAAV血清型(AAV1〜AAV5)に基づくrAAVベクターを含む組換えビリオンの形質導入効率が、関節炎の2つの異なる動物モデル(マウスおよびラット)において比較される場合、驚くべきことに、インビボ遺伝子移送は、血清型AAV1〜AAV4に基づくビリオンを用いるよりも、AAV5を用いることにより、より効率的であることが見出された。かくして、本発明者らは滑膜細胞への効率的な遺伝子デリバリーシステムを提供し得た。それゆえ本発明は、リウマチ様滑膜のインビボ遺伝子治療に基づき、関節リウマチ、特にリウマチ様関節の処置のための治療方法を開示する。
本発明の1つの実施態様は、関節炎の関節、特にリウマチ様滑膜に、核酸分子を局所的に送達するための方法を提供することである。特に、提供される方法は、治療的に有効な量において、および治療的に有効な期間、リウマチ様滑膜細胞および組織への、治療用タンパク質をコードする核酸分子の効率的な形質導入を可能にする。本発明の方法は、標的細胞における治療用タンパク質の、改善された持続性の(長期間)高レベルな発現を提供する。本発明の範囲は制限されないが、本発明のrAAVベクターと組み合わせて、rAAV5の形質導入効率は特に高く、そしてAAV2ビリオンの形質導入効率はより少ない程度であり、これは効率的なビボ遺伝子送達を可能にする。AAV血清型5および2の両方のカプシドタンパク質を含むrAAVビリオンは本発明において有利に使用され得るが、AAV血清型5のカプシドタンパク質を含むrAAVビリオン(rAAV5ビリオン)は、このように本発明の方法および組成物における使用に最も好ましい。
本発明の方法は、以下の工程:(a)AAV血清型5またはAAV血清型2のカプシドタンパク質を含む組換えAAVビリオン(rAAV)を提供する工程であって、ここでrAAVビリオンがrAAVXベクターを含み、rAAVXベクターが核酸配列に作動可能に連結される発現エレメントを含む、工程;および、(b)rAAVビリオンを滑膜細胞と接触させる工程であって、それによってrAAVXベクターの形質導入が、形質導入された滑膜細胞における核酸配列の発現を生じる、工程を包含する。好ましくは該方法において、被験体のリウマチ様関節への、rAAVビリオンの局所的な投与によって、核酸配列がインビボで滑膜細胞に送達される。好ましくは、rAAVビリオンの投与は、関節への注入によって、より好ましくは滑膜区分への注入によってである。あるいは、方法において、rAAVビリオンを、滑膜細胞またはエキソビボで滑膜細胞を含有する細胞培養物と接触させ、それによって必要に応じて形質導入細胞を選択する。代替の方法はさらに、被験体のリウマチ様関節に形質導入細胞を投与する工程を包含し、このことにより好ましくは形質導入細胞の投与は関節への注入、好ましくは滑膜区分への注入によってである。好ましくはこれらの方法において、インビボまたはエクスビボで形質導入された滑膜細胞における核酸配列の発現は、関節の関節炎の症状の軽減を生じる。
組換えAAVビリオンは、rAAVXベクターの1つを含み、本明細書中で参考として援用される、Panら(J.of Virology 1999、第73巻(4):3410〜3417)、およびClarkら(Human Gene Therapy、1999、10:1031〜1039)において記載されるように、当該分野において公知の方法を使用して生成される。簡潔には、方法は概して、(a)宿主細胞へのrAAVベクターの導入、(b)宿主細胞へのAAVヘルパー構築物の導入であって、ここでヘルパー構築物はrAAVベクターから欠損するウイルス機能を含み、そして(c)宿主細胞にヘルパーウイルスを導入することを包含する。rAAVビリオンへのrAAVベクターの複製およびパッケージングを達成するために、rAAVビリオン複製およびパッケージングについての全ての機能が存在することが必要とされる。宿主細胞への導入は、標準的なウイルス学的技術を使用して行われ得、そして同時または連続的であり得る。最後に宿主細胞は、rAAVビリオンを生成するために培養され、そしてCsCl勾配のような標準的な技術を使用して精製される(Xiaoら、1996、J.Virol.70:8098〜8108)。残余のヘルパーウイルス活性は、例えば熱不活性化のような、公知の方法を使用して不活性化され得る。次いで、精製されたrAAVビリオンは前記方法における使用のために備えられる。 1ml当たり1012を超える高い力価、および高純度(検出可能なヘルパーおよび野生型ウイルスが存在しない)が達成され得る(Clarkら、前出、およびFlotteら、1995、Gene Ther.2:29〜37)。
rAAVXベクターはAAV血清型の1つが逆位である末端反復領域のヌクレオチド配列、またはそれに実質的に同一なヌクレオチド配列、および2つのITR間に挿入された(適切な調節エレメントの制御下で)治療用タンパク質をコードする少なくとも1つのヌクレオチド配列を少なくとも含む。
AAV5および他のAAV血清型の完全なゲノムが配列決定され(Chioriniら、1999、J.of Virology 第73巻、2号、1309〜1319頁)、そしてヌクレオチド配列は、GenBankにおいて利用可能である(アクセス番号AF085716)。したがって、AAV5のITRヌクレオチド配列は当業者に容易に利用可能である。これらは、当該分野において公知であるように、クローン化され得るか、または例えば、Applied Biosystems Inc.(Fosters、CA、USA)によって、または標準的な分子生物学技術によって提供されるような、例えばオリゴヌクレオチド合成器を使用して化学的合成により作製され得るかのいずれかであり得る。ITRは、AAVウイルスゲノムからクローン化され得るか、またはAAV ITRを含むベクターから切り出され得る。ITRヌクレオチド配列は、標準的な分子生物学技術を使用して1つまたは複数の治療用タンパク質をコードするヌクレオチド配列のいずれかの末端にて連結され得るか、またはITR間の野生型AAV配列が所望されるヌクレオチド配列で置換され得るかのいずれかである。
好ましくは、rAAVベクターは、AAVのrep(複製)またはcap(カプシド)遺伝子のような、ウイルスタンパク質をコードする任意のヌクレオチド配列を含まない。rAAVベクターはさらに、抗生物質耐性遺伝子、蛍光タンパク質(例えば、gfp)をコードする遺伝子のようなマーカーもしくはレポーター遺伝子を、または化学的に、酵素学的に、もしくはそうでなければ、当該分野において公知の検出可能なおよび/若しくは選択可能な産物(例えば、LacZ、aphなど)をコードする遺伝子を含み得る。
rAAVベクターはさらに、治療用タンパク質をコードするヌクレオチド配列に作動可能に連結されるプロモーター配列を含む。適切なプロモーター配列は、リウマチ様滑膜、例えば血管内膜マクロファージにおいて、ならびに/または線維芽細胞様滑膜細胞および/もしくはこれに制限されないがT細胞のようなその他の滑膜細胞において、発現を付与するプロモーターである。適切なプロモーター配列は、例えば、当業者によって容易に決定されるように、CMVプロモーター(サイトメガロウイルス)、IL−6遺伝子のプロモーター、またはSV40プロモーターなどのような、滑膜細胞において発現することが知られる遺伝子のプロモーターである。
適切な3’非翻訳配列はまた、治療用タンパク質をコードするヌクレオチド配列に作動可能に連結され得る。適切な3’非翻訳領域は、ヌクレオチド配列と天然に結合される領域であり得るか、または例えばウシ成長ホルモン3’非翻訳領域(BGHポリA)配列のような、異なる遺伝子に由来し得る。
ITR領域間でrAAVベクターに導入されるDNA分子の全体の大きさは一般に5キロ塩基(kb)よりも小さい大きさである。rAAVベクターは、2つの治療用タンパク質(例えば相乗的効果を有する治療用タンパク質)をコードするヌクレオチド配列を含むことがまた想定される。これらは、適切なプロモーターおよび適切な3’非翻訳領域をそれぞれ有し得るか、またはこれらはIRES(内部リボソーム介入部位)エレメントによって連結され得、単一プロモーターの制御下に2シストロン性の転写物を提供するかのいずれかである。適切なIRESエレメントは、Hsiehら(1995、Biochemical Biophys.Res.Commun.214:910〜917)において記載される。
必要に応じて、シグナルペプチド(例えば、細胞外空間へのペプチドの輸送を標的化するために)、核局在化シグナル、発現エンハンサーなどのような、さらなる核酸配列が、治療用タンパク質をコードするヌクレオチド配列に作動可能に連結され得る。
本明細書中で使用されるように「治療用タンパク質」は、有効量(または投薬量)においてリウマチ様関節に(特に滑膜に)局所的に投与される場合、関節リウマチに対して治療効果を有するタンパク質をいう。適切な治療用タンパク質は、例えば、インターロイキン−1(IL−1、Marchら、1985、Nature 315:641〜647)またはTNFαインヒビターのようなサイトカインインヒビター、例えば、インターロイキン−1受容体アンタゴニストIL−Ra(Cominelliら、1994、J.Biol.Chem.269(9):6962〜6971)のようなサイトカイン受容体アンタゴニスト、IL−18結合タンパク質(Imら、2002、J.Interferon Cytokine Res.22(3):321〜328)のようなサイトカイン結合タンパク質、またはsTNFα受容体p55またはp75(Croxfordら、2000、J.of Immunology 164:2776〜2718)のような可溶性のサイトカイン受容体、または可溶性IL−1受容体である。また適切なのは、例えば、米国特許第6,277,969号において、当該分野において公知であるように、TNFα抗体をコードする配列、および例えば米国特許第6,046,319号においてそれ自体が当該分野において公知であるTNFαのアンチセンスまたはRNA干渉配列をコードする配列である。また適切なのは、IL−4、IL−10、IL−13、IFN−β、またはVIP(血管活性腸管ペプチド;Delgado、2003、Trends Immunol.24:221〜4)のような抗炎症活性を伴うタンパク質である。さらに、dn−IKK−β(優勢ネガティブIκB−キナーゼ)は、NF−κBを阻害する、使用に適切なタンパク質である。適切なタンパク質の列挙が、VervoordeldonkおよびTak、2001(前出)において提供される:
IL−RA=インターロイキン−I受容体アンタゴニスト;IL−IsR=可溶性IL-I受容体;TNFsR=可溶性腫瘍壊死因子受容体;vIL−10=ウイルスIL-10;IFN−β=インターフェロンβ;TGF−β=トランスフォーミング増殖因子β;dn−IKK−β=ドミナントネガティブIκB−キナーゼβ;NF−κB=核因子κB;FADD=Fas関連性死ドメインタンパク質
これらのタンパク質をコードするヌクレオチド配列は、当業者に容易に利用可能である。配列(ヌクレオチドおよびタンパク質の両方)は、例えば、GenBank、SwissProtなどのようなデータベースにおいて見出され得、そして配列を含むクローンは、ほとんどがアメリカンタイプカルチャーコレクション(ATCC)のような寄託機関から得ることができる。好ましい実施態様において、ヌクレオチド配列はヒト起源であるが、これらはまた他の種に由来し得る。これらはcDNAまたはゲノムDNA配列であり得る。治療用タンパク質をコードするヌクレオチド配列は、天然に存在する配列、またはデノボ合成配列、ならびに治療に活性なフラグメント、突然変異型、または修飾されたポリペプチド(「変異体(Variant)」という)をコードするヌクレオチド配列を包含する。変異体は、これらに制限されないが、アミノ酸置換または欠失、ペプチドのデノボ化学合成、または突然変異誘発もしくは遺伝子シャッフリング技術、ハイブリダイゼーション技術のような当該分野において公知の方法を使用して容易に作製され得、そして機能性の保持について試験され得る。治療的ペプチドの変異体は、天然に存在するタンパク質に対して少なくとも、80、90、95または99%の「実質的な配列同一性」を伴うアミノ酸配列を有し、その治療的有効性、すなわち被験体における関節リウマチの症状を軽減、または根絶する能力を保持するペプチドを包含する。
必要であると見なされる場合、本発明のrAAVベクターは、治療用タンパク質をコードするヌクレオチド配列に加えて、rAAVベクターからまたはそれで形質導入細胞から被験体を治療する事を可能にするフェイル−セーフ機構を提供するタンパク質をコードする、第2のまたはさらなるヌクレオチド配列を含む。このようなヌクレオチドは、しばしば自殺遺伝子といわれ、タンパク質が発現されるトランスジェニック細胞を殺傷し得る毒性物質にプロドラックを変換し得るタンパク質をコードする。このような自殺遺伝子の適切な例として、E.coliシトシンジアミナーゼ遺伝子または単純ヘルペスウイルス、サイトメガロウイルス、および水疱瘡ウイルスからのチミジンキナーゼ遺伝子の1つが挙げられ、この場合において、ガンシクロビルは被験体においてIL−10トランスジェニック細胞を殺傷するためのプロドラッグとして使用され得る(例えば、Clairら、1987、Antimicrob.Agents Chemother.31:844〜849を参照のこと)。
投与は好ましくは、本明細書中の他の場所に記載されるように、rAAVベクターによって生じる。関節リウマチ、特にリウマチ様滑膜に対する「治療効果」は、滑膜組織の炎症の減少といった典型的な症状の減少、ならびに/または関節の軟骨および/もしくは骨の破壊の減少をいう。減少はまた、症状の発症における進行の減速、または症状の完全な消滅を意味し得る。症状、したがってまた症状における減少は、多様な方法、臨床的な実験および日常的な実験室の試験といった、関節リウマチの診断において使用されるのと大体同じ方法を使用して評価され得る。このような方法は、巨視的、および微視的方法の両方、ならびに分子法、X線、生化学、免疫組織化学などを含む。該方法は、全関節の分析(例えば、X線)、または抽出された滑膜液もしくは滑膜組織の生検と言ったその部分の分析を包含し得る。リウマチ様滑膜液は、滑膜および関節軟骨と直接的に接触され、高い診断価値を有し、および吸引に容易に利用可能である(Tak P.P.、Rheumatoid Arthritis 2000:55〜68、前出)。
治療効果を達成するために必要とされる治療上の有効量は、処置される被験体(例えば非ヒト哺乳動物またはヒト)、コードされる治療用タンパク質(プロモーター、取り込み部位などの強度および特異性を含む)に、ならびに関節の関節リウマチの発達段階および重篤度に依存して変化し得る。個体間、関節間、さらに関節内で滑膜炎症の大きな多様性がある(Takら、1997、Arthritis Rheum.40:217〜225)。同様に、治療的に有効な期間(治療効果が検出可能になるまでにかかる時間)は、個体間で、および関節間で変化し得、そして導入遺伝子により異なる。また、処置は有効性のために、後期に反復されなくてはならないかもしれない。当業者は容易に、日常的な試行錯誤によって、および例えば用量−応答曲線を描くことによって、治療的な有効量を容易に決定し得る。少なくとも10〜10rAAVビリオンの、好ましくは少なくとも10〜10ビリオンの、より好ましくは10〜1011またはそれ以上のビリオンの投与が、適切な用量である。
好ましくは、rAAVベクターは、形質導入細胞のゲノムに安定に取り込まれ、そして長期間(少なくとも4〜8週間、好ましくは少なくとも8〜12週間、より好ましくは少なくとも6ヶ月間、または生涯)の治療用タンパク質の発現を提供する。
関節炎の関節への局所(全身と対照的に)投与は特に、リウマチ様滑膜、とりわけ滑膜細胞へのrAAVビリオンの局所的なインビボまたはエクスビボ投与をいう。本明細書中で使用されるインビボ投与は、例えば関節内注入による、被験体の関節へのrAAVビリオンの直接的投与を言う。エクスビボ投与は、rAAVビリオンの単離、培養された細胞への投与がその後に続く、被験体からのリウマチ様細胞の単離をいう。次いで治療用タンパク質を発現する形質導入細胞は、例えば、注入、被験体の関節に戻した細胞の再培養または再輸液によって被験体に投与される。局所的投与は、必要であれば、多くの週または月の後に反復され得る。
さらなる実施態様において、本発明は、リウマチ様滑膜細胞にエクスビボで核酸分子を送達するための方法を提供し、該方法は、(a)AAV血清型2、またはより好ましくはAAV血清型5のカプシドタンパク質を含む組換えAAVビリオン(rAAV)を提供する工程であって、ここでrAAVビリオンがrAAVXベクターを含み、rAAVXベクターが核酸配列に作動可能に連結される発現エレメントを含む、工程;(b)rAAVビリオンを滑膜細胞、または滑膜細胞を含む細胞培養物に投与する工程であって、それによって形質導入が形質導入細胞において核酸分子の発現を生じ;(c)必要に応じて、形質導入細胞が選択され;そして(d)形質導入細胞または形質導入細胞を含む細胞を、被験体のリウマチ様関節に投与する工程を包含する。
細胞が由来する関節への再投与前における形質導入細胞の選択または富化は、公知の方法を使用して行われ得る。工程(b)において細胞または細胞培養物が得られる被験体は、形質導入細胞が工程(d)において再投与されるのと同じ被験体である必要はなく、すなわち細胞は自己(同じ被験体から)または非自己(異なる被験体から)であり得る。
rAAVビリオンを関節に直接的に投与する代わりに、例えば、注入またはマイクロインジェクションによって、薬学的組成物がインビボで局所的に投与されるように、本発明のrAAV5ビリオンはまた、薬学的組成物中に処方され得る。薬学的組成物は、十分なrAAVビリオン、およびこれらに限定されないが、水、生理食塩水、グリセロール、またはエタノールのようなさらなる薬学的に許容される腑形剤を含む。乳化剤、湿潤剤、緩衝液などのような、さらなる物質が存在し得る。
本発明の1つの実施態様において、本発明のrAAVビリオンを使用してリウマチ様関節を処置するための方法が提供される。方法は好ましくは、(a)関節の関節リウマチの診断を確立する工程;(b)薬学的に許容される腑形剤およびrAAVビリオンを含む薬学的組成物の治療的に有効な量を使用して、関節のリウマチ様滑膜細胞を形質導入する工程であって、ここでrAAVビリオンは少なくとも1つの治療用タンパク質(またはペプチド)をコードするヌクレオチド配列を含むrAAVXベクターを含む工程、ならびに(c)必要に応じて一定期間後に工程(b)を反復する工程、を包含する。
処置の方法において、滑膜細胞の形質導入は、インビボまたはエクスビボのいずれかであり得る。エクスビボ形質導入の場合において、形質導入されたおよび(再)投与された細胞は、自己または非自己のいずれかであり得る。
代替の処置において、前記方法は、上記のrAAVビリオンを使用してエクスビボでリウマチ様滑膜細胞を形質導入する工程、必要に応じて形質導入細胞を選択する工程、被験体のリウマチ様関節に形質導入細胞を投与する工程、および必要に応じて一定期間後に投与を反復する工程を包含する。
さらなる局面において、本発明は、リウマチ様関節の処置のための医薬を製造するための、上述で規定されるようなビリオンの使用に関する。好ましくは、該処置は、薬学的に許容される腑形剤および上述で規定されるようなrAAVビリオンを含む治療的に有効な量の薬学的組成物を使用して、インビボで関節のリウマチ様滑膜細胞を形質導入する工程、ならびに必要に応じて一定期間後に形質導入を反復する工程を包含する。あるいは、処置は、rAAVビリオンを使用してエクスビボでリウマチ様細胞を形質導入する工程、必要に応じて形質導入細胞を選択する工程、被験体のリウマチ様関節に形質導入細胞を投与する工程、および必要に応じて一定期間後に投与を反復する工程を包含する。
本明細書中で使用されるように「滑膜」または「滑膜組織」または「滑膜細胞」は、Tak(2000、滑膜および滑膜液の実験。In:Firestein GS、Panyani GS、Wollheim FA編、Rheumatoid Arthritis.New York:Oxford Univ.Press、Inc.55〜68)においてさらに記載され、そして本明細書中で参考として援用されるように、滑膜関節の非軟骨性表面を覆う細胞内層をいう。滑膜は血管内層(または滑膜内層)およびサブ滑膜内層(サブ滑膜(subsynovium))からなり、これは関節包と結合される。血管内層は血管内膜マクロファージ(またはマクロファージ様滑膜細胞またはA型滑膜細胞)および線維芽細胞様滑膜細胞(またはB型滑膜細胞)を含む。用語「リウマチ様滑膜」、または「リウマチ様滑膜細胞」、または「リウマチ様滑膜組織」は、関節リウマチを患う被験体の関節の炎症性の滑膜をいう。リウマチ様滑膜は、血管内層過形成によって、ならびにサブ滑膜内層における、T細胞、血漿細胞、マクロファージ、B細胞、ナチュラルキラー細胞、および樹状細胞の集積によって特徴づけられる。これらの集積される細胞は、リウマチ様滑膜細胞の規定において含まれる。
本発明の別の実施態様において、本発明はAAV血清型5またはAAV血清型2のカプシドタンパク質を含むrAAVビリオンに関し、それによってrAAVビリオンはrAAVXベクターを含み、ここでrAAVXベクターは関節リウマチに対して有効な治療用タンパク質をコードする核酸配列に作動可能に連結される発現エレメントを含む。より好ましくは、rAAVビリオンはrAAV5ビリオンであり、AAV5カプシドタンパク質を含み、ここでrAAVXベクターはrAAV5またはrAAV2ベクターであり、そのうち、rAAV2ベクターが最も好ましい。関節リウマチに対して有効な治療用タンパク質をコードする核酸配列は好ましくは上記されるようであり、ベクターはさらに、上記のような自殺遺伝子を含み得る。
本発明の別の実施態様において、rAAVXベクターを含有するrAAV5ビリオンが提供され、ここでrAAVXベクターは関節リウマチに対して有効な治療用タンパク質をコードする核酸配列に作動可能に連結される発現調節エレメントを含み、ここでrAAV5ビリオンはrAAV2ビリオンよりも滑膜細胞への高い形質導入効力を有する。該形質導入効力は好ましくは、少なくとも約2倍の高さであり、より好ましくは少なくとも約2.5倍の高さであり、またはさらに約3倍の高さである。形質導入効力は、インビボまたはインビトロ(培養された滑膜細胞)で、細胞を形質導入し、そして標準的な方法を使用して形質導入を評価することによって試験され得る。形質導入効力は、例えば実施例において示されるように評価され得る。好ましくは形質導入効力を評価する場合に、検出可能なレポーターまたはマーカー遺伝子がrAAVベクターに存在する。
また想定されるのは、例えば、1つまたは複数のrAAVXベクター、rAAVビリオン、プロトコール、試薬などを含むキットのような、本発明の方法を行うために必要とされる1つまたは複数の成分を含むキットである。
そうでないと記載されない限り、本発明の実施は、分子生物学、ウイルス学、微生物学、または生化学の標準的な従来の方法を用いる。このような技術は、SambrookおよびRussell(2001)Molecular Cloning:A Laboratory Manual、第3版、Cold Spring Harbor Laboratory Press、NYにおいて、Ausubelら(1994)Current Protocols in Molecular Biology、Current Protocols、USAの第1巻および第2巻において、ならびにBrown(1998)のMolecular Biology LabFax、第2版、Academic Press(UK)の第I巻および第II巻において、Oligonucleotide Synthesis(N.Gait editor)、Nucleic Acid Hybridization(HamesおよびHiggins編)、CRC Handbook of Parvoviruses 第I巻および第II巻(P.Tijessen編)、Fundamental Virology第2版、第I巻および第II巻(FieldsおよびKnipe編)において記載され、これら全ては本明細書中で参考として援用される。
以下の制限されない実施例は、本発明の方法およびベクターの同定を記載する。
実施例1−組換えAAVビリオンの産生
rAAV1〜rAAV5ビリオンは、基本的に本明細書の表2および図2においてまとめられるような方法に特に参照して、Grimmら(2002;Methods 28:146〜157)によって記載されるように生成した(本発明者らは、Grimmra、2002、前出における参考文献21は現在Grimmら、2003、Mol.Therapy 7:839〜850として刊行されていることを注記する)。rAAVビリオンの生成のために、これらのGrimmらの論文において記載されるいわゆる2プラスミド法を使用した。ヘルパーおよび発現プラスミドは、基本的にGrimmら(2002、2003、前出)によりこれらの2つの論文において記載されるようであり、それによってヘルパープラスミドは、ビリオンの血清型を決定するカプシドタンパク質を含むウイルス骨格を含む。本発明において使用される特定の発現プラスミドはpVD11であり、この中でlacZ発現カセットはAAV2 ITRによって隣接される。
pVD11は、pTRUF−2から開始して構築し、これはZolotukhinら(1996、J.Virol.70:4646〜4654)に記載され、その中にウッドチャック肝炎ウイルスの転写後調節エレメント(WPRE)を、レポーター遺伝子の発現を増強するために挿入し(Xuら、2003、Biochim Biophys Acta.11;1621:266〜71)、その中でGFPレポーター遺伝子を、レポーター遺伝子としてE.coli lacZ遺伝子によって置換した。例として、pVD11を含むAAV5ビリオンの生成は以下のようであった:ローラーボトル中で増殖させた293細胞を、リン酸カルシウム法(リン酸カルシウムトランスフェクションについて、例えば、SambrookおよびRussell、2001、前出を参照のこと)を使用して、pDP5 AAVヘルパープラスミドおよびプラスミドpVD11でトランスフェクトした。細胞は3日後に回収した。細胞を溶解し、ビリオンを、Zolotukhinら(1999、Gene Ther.6:973〜85)によって記載されるように、イオジキサノール勾配を使用して細胞溶解物から精製した。イオジキサノールをその後除去し、そしてビリオンをさらにダイアフィルトレーションを使用して濃縮した。Grimmら(2002、前出)において記載されるように、適切な血清決定ヘルパープラスミドを用いて、同じ手順をAAV−1、−2、−3、および−4ビリオンの生成のために使用した。
実施例2−ラットおよびマウスへのインビボ遺伝子送達
A.ラット
β−ガラクトシダーゼをコードする遺伝子を含むpVD11ベクター(または他のrAAV1〜rAAV5ベクター、示されず)を含む、rAAV1〜rAAV5ビリオンを、アジュバント免疫化の12日後に、アジュバント関節炎(AA)を伴うラットの右足関節に注入した。関節を2週間後に採集し、凍結切片の直接的なインサイチュー(in situ)染色(図2)、デジタル画像解析による定量(図1)、そしてRT−PCRにより、β−ガラクトシダーゼ発現について分析した。
AAV−β−Galベクターを注入した2週間後に、滑膜組織においてβ−ガラクトシダーゼを発現する細胞数を評価した。rAAV5ビリオンを注入された関節炎の関節において、非常に多くの細胞がβ−ガラクトシダーゼを発現し(111,441 IOD/mm)、一方rAAV2ビリオンが注入された関節炎の関節においては、わずか38,212 IOD/mm細胞が計数された(図1)。バックグラウンド染色を上回る発現は、血清型AAV1、AAV3、およびAAV4に由来するベクターについて何も観察されなかった。導入遺伝子の発現は、半定量PCRにより関節を分析することによって確認した(データは示していない)。
B.マウス
マウスコラーゲン誘導性関節炎(CIA)において、mSEAP遺伝子を含むrAAV1、rAAV2、およびrAAV5ベクターを含むrAAVビリオンを、関節炎誘導の32日後に、左膝関節に局所的に注入した。導入遺伝子の発現を、生体分布について種々の器官において、RT−PCRによって分析し、そして血清、および異なる時点にて関節組織により馴化される培養培地において、Elisaにより分析した。
CIAマウスにおいて、rAAV5ビリオンはまた、非常に高い形質導入効率を提供した。形質導入発現は、関節注入の1週間後、血清および膝蓋おいて検出可能であり、経時的に増加され、そして少なくとも1ヶ月間横ばい状態であった(それぞれ、5.31±1.59および1.94±1.97ng/ml)。血清型AAV1およびAAV2に基づくベクターについて、検出可能な発現は何も見出されなかった。
結論
驚くべきことに、関節リウマチの実験モデルにおいて、異なるAAV血清型ビリオンに基づくベクターの形質導入効果は顕著に変化し、完全に無効な状態から非常に高い形質導入効率を有する(AAV5ビリオン中に含まれたベクターについて)状態にまでに及んだ。実施例は明らかに、AAV5ビリオンでのインビボ遺伝子移送は、他の血清型を用いるよりも非常に効率的であること、およびrAAV5ビリオンが関節リウマチのインビボ遺伝子治療について特に適切であることを、実証した。
実施例3−マウスにおけるコラーゲン誘導性の関節炎
材料および方法
組換えAAV−2/2およびAAV−2/5ベクター
偽型rAAV(AAV1、AAV2、またはAAV5カプシド中にパッケージングされる2型ITRベースの組換えAAVゲノム)の生成は、以下の改変を伴い、Allen、J.Mら(Mol Ther、2000、1、88)によって記載されるように一過性のトランスフェクションによって達成した。ヒト胎児腎臓293細胞にアデノウイルスヘルパープラスミドpXX6、IE CMVプロモーターの転写制御下でマウスアルカリホスファターゼの分泌された形態をコードするpAAV2ベクタープラスミドpGG2−CMV−muSEAP、ならびにrepおよびcap遺伝子を発現する適切なAAVパッケージングプラスミドをトランスフェクトした。パッケージングプラスミドはrAAV2についてpACG2.1、およびrAAV−1/2についてpLT−RC02であり、ここでAAV2 rep遺伝子はAAV1 cap遺伝子(R.Mulliganからの提供)と融合される。パッケージングプラスミドは、rAAV−2/5の生成のために、2つに分割され(AAV2 Repタンパク質をコードするpMTRep2、D.Millerからの提供、およびAAV5 RepおよびCapタンパク質を発現するpAAV5svori、J.Chioriniからの提供)、4部分からなるトランスフェクション工程を必要とした。組換えベクターは、二重CsCl超遠心分離勾配、続く滅菌PBSに対する徹底的な透析によって精製された。物理的粒子が、標準的なプラスミド範囲に対するドットブロットハイブリダイゼーションによって定量された。力価は、1ml当たりのウイルスゲノム(vg/ml)として表される。rAAV−2/1−mSEAP、rAAV−2/2−mSEAP、およびrAAV−2/5−mSEAP力価は、それぞれ、1,6×1012、2,9×1012、および2,7×1011vg/mlであった。CMVプロモーターの下でβ−Gal導入遺伝子を発現するrAAV−2/2および−2/5プラスミドは、AAV−2 ITRにより隣接され、そしてそれぞれ、AAV−2、AAV−5殻中にカプシドで包まれた。ウイルス粒子は、Grimm、D.(Hum Gene Ther、1998、9、2745)によって以前に記載されるように、293細胞に対する二重トランスフェクションによって生成し、それぞれヨードキシノールヘパリンカラムまたは二重CsClカラムを使用して精製し、そしてVector Core of the University Hospital of NantesによってPBSに対して透析した。rAAV力価は、ドットブロットによって決定し、1ml当たりのベクターゲノムとして発現させた(vg/ml)。それらは、rAAV−2/2および−2/5について、それぞれ、1,8×1011および3×1012vg/mlであった。
動物研究
雄性DBA/1マウス(Harlan France)を、本発明者らの施設において飼育し、そして8〜10週齢にて使用した。を用いて、0日目に尾部の付け根において1μg/μlのコラーゲン溶液100μlを皮内注入することにより、コラーゲン誘導性関節炎(CIA)を誘導した。ウシII型コラーゲン(bCII)を、使用前に、酢酸50mMで2mg/mlに希釈し(Sigma−Aldrich、St.Quentin Fallavier、France)、そして等容量のフロイント完全アジュバント(Pierce、Bezons、France)で乳化した。21日目に、動物を、等容量のフロイント不完全アジュバント(Pierce,Bezons、France)で使用前に乳化された、100μl bCII溶液の皮内注入で追加免疫した。関節炎誘導後、肢の厚さを経時的にマイクロメーターMitutoyo(Sigma)で測定した。28日目に、マウスを40μg LPS(Sigma)の腹膜内注入で同期化した。関節炎についての臨床的兆候が出現した場合、マウスをケタミン(30mg/Kg)およびキシラジン(10mg/Kg)溶液の腹膜内注入によって麻酔した。膝上部の皮膚を剃り、そして示された用量のAAV血清型を5μlの0.9%NaCl中で、30ゲージ針を備えるHamiltonシリンジ(NH−BIO、Massy、France)を使用することにより、左側膝関節において関節内に注入した。屠殺の日に、全膝関節を回収し、凍結切片におけるβ−gal染色のインサイチュー定量のために液体窒素中に凍結した。mSEAPレポーター遺伝子を使用する実験において、ベクター注入の前および後の種々の時間にて血液サンプルを採取し、試験されるまで−20℃にて保存した。屠殺の日に、左側および右側の膝蓋を回収し、RPMI(200μl)中で24時間インキュベートした。上清を−20℃にて保存し、試験するまで膝蓋を液体窒素中に保存した。
β−ガラクトシダーゼ導入遺伝子発現についてのインサイチュー染色
膝蓋を至適な切断温度(OCT)化合物中に静置し、ドライアイス上で即座に凍結した。サンプルを低温保持装置上で切断し、組織切片を1,25%グルタルアルデヒド中で10分間固定され、PBS中で3回リンスし、X−Gal溶液中に37℃にて一晩静置した。次いで、スライドはPBS中で3回洗浄し、HEで対比染色した。
血清muSeAP定量化
ベクター投与後、血液サンプルを示した時点で回収した。化学発光検出は、酵素活性の定量化を可能にした。簡潔には、サンプルを5分間2500gにて遠心分離して血清を回収し、内因性アルカリホスファターゼを5分間65℃にて熱不活性化し、そして製造業者(Tropix)の指示に従い、熱耐性muSeAPを反応緩衝液およびCPSD化学発光基質の添加により測定した。化学発光は、ルミノメーター(Mediators Diagnostika)において定量化した。発現レベルは、精製されたヒト胎盤アルカリホスファターゼの標準曲線に従い、血清1ml当たりのmuSeApをngで表す。
結果
マウス関節におけるrAAV血清型の関節内送達
関節におけるAAV血清型の形質導入効率を比較するために、本発明者らは、関節炎の発症後、β−galまたはmSEAPを発現する5×10粒子のAAV−2/1、AAV−2/2、およびAAV−2/5を、DBA/1マウスの関節への直接的な注入により、送達した。X−gal染色および免疫組織化学、または関節組織により馴化した培養培地中のmSEAPの化学発光検出のために、4週間にて膝蓋を採集した。
ベクター注入の4週間後、AAV−2/2およびAAV−2/5−LacZの両方を注入したマウスの関節において有意なLacZ発現が検出され、AAV−2/5で有意に高い形質導入効率が観察された。AAV−1/5を注入した膝からの膝蓋凍結切片においても、および対側の未注入の膝においても染色は観察され得なかった。発現のパターンは、以前に報告されたパターンに類似していたが、軽度の染色が滑膜内層組織において観察され、強力な染色が膝蓋上嚢において示された。染色をデジタル画像解析によって定量化したところ、AAV−2/5−LacZの形質導入効率は、AAV−2/2−LacZよりも3倍高かった。mSEAPのような分泌性のレポーター遺伝子を使用した場合、局所的な導入遺伝子発現は、非関節炎マウスと比較すると、AAV−2/1またはAAV−2/2でよりも、AAV−2/5で2倍高く、関節炎の関節において増加した。したがって、血清型5からのAAVカプシドは、血清型1または2よりも、関節内組織の形質導入のためにより効率的である。
AAV−2/5の用量応答
本発明者らは次に、AAV−2/5で観察されるより良好な効率が、関節炎の関節へのより高い用量を使用しても当てはまるか否かを決定するために、β−galまたはmSEAPを発現する漸増用量のAAV−2/2またはAAV−2/5(5×10、1,5×10、および5×10粒子)を送達した。X−gal染色および免疫組織化学、または関節組織により馴化された培養培地中での、または血清中でのmSEAPの化学発光検出のために、遺伝子送達の4週間後に膝蓋を採集した。漸増用量のAAV−2/5は、マウスの関節においてLacZ発現レベルの増加を生じた。mSEAPをレポーター遺伝子として使用した場合、局所的な導入遺伝子分泌は、注入した3倍多くの粒子で、2,6倍高かったが、試験された他のカプシドでは改変しなかった。驚くべきことではないが、分泌された導入遺伝子はまた血清中で検出され得、発現レベルにおける同じ範囲の増加が、漸増用量のウイルスを使用して観察された。試験されたAAV−2/5−mSEAPベクターの最も高い用量は、ウイルス調製物の力価、およびマウス関節において注入され得る最大の用量(5μl)によって制限された。AAV−2/5の用量が高いほど(>5×10粒子)、関節炎の関節においてさらにより多くのレベルの導入遺伝子発現を生じるようである。
AAV−2/5についての発現の動態
次いで、本発明者らは、AAV−2/2と比較してAAV−2/5の最も高い効率がより遅延した導入遺伝子の発現に起因したのか否かを調査した。したがって、本発明者らは、分泌性のレポーター遺伝子mSEAPを発現するAAV−2/1、AAV−2/2、およびAAV−2/5の1,5×10粒子を、関節炎DBA/1マウスの関節に注入し、そして示した時点にて血液サンプルを回収した。AAV−2/5−mSEAP注入された動物において、導入遺伝子発現は、投与後7日間から叙々に増加し、3週間で最大のレベルに達した。対照的に、AAV−2/1−、およびAAV−2/2−mSEAPは、それぞれ、3および4週間にて弱く検出された。第2の実験において、本発明者らは導入遺伝子の発現は、AAV−2/5−mSEAPを使用して少なくとも19週間安定なままであったが、AAV−2/1−mSEAPは6週間にわたって導入遺伝子の一過性の発現を与え、そしてAAV−2/2−mSEAPは検出可能な全身性の導入遺伝子発現を示さなかった。
実施例4−ラットにおけるアジュバント誘導性の関節炎
材料および方法
組換えAAVの構築
全てのrAAV構築物は、AAV2に由来し、そしてサイトメガロウイルス(CMV)プロモーターによって駆動される。組換えAAVは、リン酸カルシウム法により、パッケージングプラスミド(AAV2についてpDG、ならびにAAV1、AAV3、AAV4、およびAAV5についてそれぞれ、pDP1、pDP3、pDP4、およびpDP5)ならびにベクタープラスミド(pVD11)での、293 HEK細胞の同時トランスフェクションによって生成した。パッケージングプラスミドには、全てのトランス作用性エレメント:Cap遺伝子、Rep遺伝子、およびアデノウイルスヘルパー遺伝子を含有させた。ベクタープラスミドには、全てのシス作用性エレメント:ITR、導入遺伝子、およびCMVプロモーターを含有させた。
細胞は、850cmローターボトルにおけるトランスフェクションの4日前に、3×10細胞/cmの密度にて播種し、37℃にて、50mlダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)中、グルタマックス−1(Invitrogen)、10%(v/v)胎児ウシ血清(FBS)(JRH)、60U/mlペニシリン/ストレプトマイシン(PS)インビトロゲンと共に増殖させた。トランスフェクションの前に、培地をイスコブ改変ダルベッコ培地(IMDM:Invitrogen)で置換し、トランスフェクションの16時間後に、培地を50mlの新鮮なDMEM/FBS/PSで置換した。トランスフェクションの72時間後、細胞を、10ml 50mM Tris−HCl pH8.5、150mM NaCl、1mM、MgCl、0.1%(v/v)TritonX−100中に採取した。最後に、ベンゾナーゼ(Merck)を75U/mlの最終濃度で、溶解物中に添加した。粗細胞溶解物をさらに、イオジキサノール勾配で精製した。イオジキサノールの段階勾配は、Beckman Quick−Seal tubes(25×89mm、Beckman)において行った。段階勾配は、チューブにパスツールピペットを置くことによって、負荷した。上部から底部まで:15mlの粗細胞溶解物、9ml 15%イオジキサノール、PBS−MK(PBS+1mM MgCl+2.5mM KCl)中の1M NaCl、6ml PBS−MK中の25%イオジキサノール、5ml PBS−MK中の40%イオジキサノール、5ml 60%純粋なイオジキサノール。その後、チューブを密閉し、69.000rpm16℃にて1時間遠心分離した。遠心分離後、勾配からの40%イオジキサノール段階を抽出した。ウイルス溶液を含有する40%のイオジキサノールを、PBS−MKで10倍希釈し、centricon装置(YM−100、Millipore)を用いて約2mlに濃縮した。1011〜1012ゲノムコピー(GC)/mlに及ぶストックの力価を達成した。
局所的遺伝子移送
病原体非含有Lewisラット(150〜200g)を、Harlan Sprague Dawley Inc.(Horst、The Netherlands)から得て、本発明者らの中央動物施設において維持した。全てのラットを0日目に0.1ml精油中の1mgのMycobacterium tuberculosis H37RA(Difco、Detriot、MI)で、尾部の付け根にて免疫化した。通常、肢の膨れが10〜12日目に観察され、水置換プレチスモメトリーにて毎日測定された。イソフルランで麻酔された動物において、免疫化の12日後に右側足首関節を注入した。皮膚を、エタノールで調整し、LacZについての遺伝子を含むrAAV1〜5(rAAV1〜5としてさらに言及される)を、ガラスシリンジにおいて31ゲージ針を使用し、50μl生理食塩水の総容量中、右足首関節へ前外側に注入した。動物には6.1×1010GCで注入した(n=6/群)。LacZ(6.1×1010GC/動物に調節された)を含有するアデノウイルスは、ポジティブコントロールとして作用され、一方生理食塩水はネガティブコントロールとして使用された。AAVおよび生理食塩水を注入したラットは、CO吸入により関節内注入の2週間後に屠殺し、アデノウイルスを注入したラットは、注入の2日後に屠殺した。血清サンプルは大静脈を出血することによって採取した。
異なる時点での導入遺伝子の発現を調査するために、rAAVの異なるバッチを使用して第2の実験を行った。動物に1.14×1010GC rAAV2またはrAAV5の関節内注入し、注入の1、2、3、および4週間後に記載されるように屠殺した(n=3)。血清サンプルはAAV注入の前に尾部を出血させることによって、および屠殺の間の大静脈パンクション(punction)によって全ての群から得た。
導入遺伝子産物の検出
βgalのインサイチュー染色
関節をEDTAおよび液体窒素中のスナップ凍結を使用して石灰除去した。10μm切片を切断し、ガラススライド上にマウントした。β−ガラクトシダーゼ(β−gal)の検出が、X−gal染色によって行われた。簡潔には、組織を0.25%グルタルアルデヒド/4%パラホルムアルデヒド中、10分間、4℃にて固定化した。その後、サンプルをPBSで2回洗浄し、PBS中1mg/ml X−gal(5−ブロモ−4−クロロ−3−インドイル−β−D−ガラクトシダーゼ)、2mM MgCl、5mM KFe(CN)、5mM KFe(CN)、および0.1%トリトン x−100を含有する染色領域中で、一晩、37℃にて染色した。PBSでの洗浄後、核レッドで切片を対比染色した。β−galポジティブ細胞について、デジタル画像解析によって切片を分析した。
デジタル画像解析
各切片内の5つのランダムに選択された領域を、ポジティブシグナルの量をデジタル化するために選択した。これらの画像は、Olympus顕微鏡(Olympus、Tokyo、Japan)において捕捉し、Charged Coupled Device ビデオカメラ(Sony、Tokyo、Japan)を使用して捕捉し、そしてPV100マルチメディア、16ビットカラービデオデジタイザーカードでデジタル化した。得られたカラー画像において、ポジティブな染色の面積および平均光学密度(MOD)をマクロプログラムによって測定した。MODはタンパク質の細胞濃度に比例する。取り込まれた光学密度(IOD)は、ポジティブ染色の面積により乗じられたMODに等しい。
LacZのリアルタイムPCR検出
足首関節(皮膚は除去される)および器官を、液体窒素中でスナップ凍結し、モルタルを使用して粉砕し、そして組織ホモジナイザーを使用して、1mlのTRIzol試薬(GibcoBRL Life Technologies)中にホモジナイズした。製造業者の指示に従って、全RNAを水相から単離し、ゲノムDNA(gDNA)をフェノール−クロロホルム相から抽出した。gDNAはQ−PCR解析のために保存した。RNAはDEPC−水中に溶解し、そして分光光度計によって定量化した。cDNAは、1μg RNAおよび0.5μgオリゴ(dT)(Gibco BRL)、5×第1ストランド緩衝液、0.1M DTT、dNTP Mix(各10mM)、および1μlのSuperscript II RT(Invitrogen)を使用して合成した。RT−PCRについて、10μlのcDNA溶液を、50μlの総容量中25μlのAccuPrime SuperMixI(Invitrogen Life technologies)、215mMのLacZ1プライマー(フォワード、5’−GCA−TCG−AGC−TGG−GTA−ATA−AGC−GTT−GGC−AAT−3’)および215mMのLacZ2プライマー(リバース、5’−GAC−ACC−AGA−CCA−ACT−GGT−AAT−GGT−AGC−GAC−3’)を使用して、増幅した。次いで、増幅をサーモサイクラー(MJ Research、Inc.)において、以下のように行った:95℃にて3分間、続いて94℃ 1分間、58℃ 90秒間、および72℃ 1分間をそれぞれ35サイクル、続いて72℃にて10分間の最終的な伸張相。PCR産物は、622bp産物をUVで補助して可視化するためにエチジウムブロミドを含有する0.9%アガロースゲル中において、標準的なアガロースゲル電気泳動により分析した。
定量的PCRによるウイルスゲノムコピーの検出
ゲノムコピー(完全なウイルス粒子)に関してウイルス力価を決定するために、まずAAVサンプルをPBS中で10倍に希釈した。続いて、5μlのこれらの希釈物を二連で、45μlの0.25mg/ml DNASeI、PBSに添加した。その後、混合物を、20分間37℃にてインキュベートし、75μlの2.75mg/mlプロテイナーゼK、8.6mM Tris・HCl pH8.0、86mM NaCl、8.6mM EDTA、0.43%(w/v)SDSを添加した。60分間、37℃でのインキュベーション後、ウェル当たり115μlの14μg/mlポリA、SV RNA溶解緩衝液(Promega)を添加した。サンプルを10μlのMagneSil Blue懸濁液(Promega)とともにインキュベートし、ウイルスDNAを、供給者の指示に従ってMagnaBot96Magnetic Separation Device(Promega)を使用して単離した。精製されたウイルスDNAまたは関節および器官から単離されたgDNAの希釈物は、PCRミックス(0.5μM CMVフォワードプロモーター(5’AATGGGCGGTAGGCGTGTA3’)(Invitrogen)、0.5μM CMVリバースプロモーター(5’AGGCGATCTGACGGTTCACTAA3’)(Invitrogen)、およびSYBRグリーンPCRマスターミックス緩衝液(Applied Biosystems)に添加した。使用されたDNAスタンダードは、pVD23の10E+1〜10E+8コピーの10倍連続希釈物であった。PCR反応は、AbiプリズムSDS7000配列検出系(AppliedBiosystems)を使用して行った。
血清におけるrAAVに対する中和化抗体の検出
中和化抗体力価は、COS細胞へのAAVの形質導入を阻害する血清抗体の能力を評価することによって分析した。血清の種々の希釈物(1:200〜1:5200)は、rAAVとともに、37℃にて1時間、予めインキュベートし、次いで80%コンフルエント細胞に添加した。その後、細胞培養物を、血清の存在下、20時間、AAVとともにインキュベートし、LacZ発現を、X−gal染色によって測定した。抗体力価は、AAV単独でインキュベートした細胞と比較して、β−gal発現の阻害を何ら与えない最も高い希釈によって示した。
ヒトFLSの細胞培養物
小口径の関節鏡検査(2.7mm関節鏡、Storz、Tuttlingen、Germany)を、確立されたRAを伴う患者において局所麻酔の下で行った。
得られた生検を、酵素学的に分散させた。簡潔には、滑膜を細分化し、血清非含有DMEM(Gibco)中、3時間37℃にて、1mg/mlコラゲナーゼVIII型(Sigma)と共にインキュベートした。その後細胞を徹底的に洗浄し、そして加湿した5% CO大気中、DMEM/10%胎児ウシ血清(FCS)中で培養した。細胞を、一晩接着させ、非接着細胞を除去した。接着FLSを、DMEM/10%FCS中で増殖し、80〜90%コンフルエンスにて1:3に分割した。ヒトFLSは、3〜10継代から使用した。
FLSにおけるインビトロ遺伝子形質導入
FLSを、8×10/ウェルにて、96ウェルディッシュ(Falcon)上にプレートした。10時間のインキュベーション後、LacZまたは緑色蛍光タンパク質(GFP)についての遺伝子を含む、8×10GCのrAAV2およびrAAV5を、10%を含有する培地中、各ウェルに添加した。細胞を48時間培養し、そしてマーカー遺伝子発現を酵素的染色または蛍光顕微鏡によって評価した。3つの独立したFLS細胞株をこれらの実験について使用した。
結果
5つのAAV血清型の比較効率
関節におけるAAV血清型の形質導入効率を比較するために、rAAV1〜rAAV5を、アジュバント免疫化12日後にラットの右足首関節において注入した。関節は、注入の2週間後に回収し、β−gal発現についてインサイチューで染色した。導入遺伝子発現は、デジタル画像解析によって定量化した。最も豊富なβ−Gal発現は、rAAV5を注入した関節炎の関節において観察された。AAV形質導入は、アデノウイルスに比較して滑膜組織へのより優れた浸透を顕著に生じ、まさに内層におけるβ−gal発現を示した。対側の未注入のおよびコントロールの関節において、染色は何ら観察され得なかった。デジタル画像解析を使用して、滑膜組織においてβ−Galを発現する最も高い数の細胞がAAV5を注入した関節炎の関節において検出され、AAV2を使用して非常に低い発現が続いた(それぞれ、111441および38212 IOD/mm)。バックグラウンド染色を上回る発現は、血清型1、3、および4について何ら観察されなかった。
導入遺伝子発現の持続時間
経時的な導入遺伝子発現を研究するために、rAAV2およびrAAV5をラットの関節炎の関節において注入し、ベクターを注入した1、2、3、および4週間後に屠殺した。両方の血清型は、4週間までの有意な発現を実証し、これは注入の1週間後に既に存在した。しかし、rAAV5は、デジタル画像解析によって定量化されるように、初期および全ての時点で、より高いβ−gal発現を示した(図4)。注入された関節を、スナップ凍結し、低温切開片をβ−gal活性についてインサイチューで染色した。切片当たりの青色染色の量をデジタル画像解析によって解析し、累積IOD/mmとして表した(IOD:取り込まれた光学密度)。これは、Q−PCR解析によって確認された。rAAV2を注入した関節と比較して、rAAV5注入後の全ての時点において、より高量のゲノムコピーが検出された。
AAV2またはAAV5の関節内注入後の注入された関節におけるウイルスゲノムコピーの検出。ゲノムDNAは、AAV注入の1、2、3、および4週間後、粉砕された足首関節から単離した。qPCRはCMVプロモーターに特異的なプライマーを用いて行った。値は、GC/μg gDNA±標準偏差として表す。
関節におけるLacZ転写を検出するために、特異的なプライマーを使用してRT−PCR解析を行った。本発明者らは、全ての時点で、rAAV5を注入した関節における導入遺伝子の転写を見出し、強度において最小の差異を示したが、LacZ mRNAは、rAAV2を注入した関節における本発明者らのアッセイの検出限界を下回った。
rAAV抗体の形成
rAAVカプシドタンパク質に対する潜在的な体液性免疫応答を検出するために、局所的な関節内注入後、本発明者らは方法の節において記載したように特定のアッセイを行った。rAAV注入の前および後の中和化抗体の存在をrAAV2および5を注入したラットの血清において測定した。結果を図5において示す。関節炎ラットは1.14×1010GC rAAV2(A)またはrAAV5(B)を、右側足首関節に注入した。血清サンプルを、注入の1、2、3、および4週間後に得た。力価は、rAAVLacZ単独とともにインキュベートしたウェルと比較して、X−galポジティブ細胞の阻害を何ら示さない最も高い希釈として算定した。
注入の前において、抗体は任意のサンプルで何ら見出されなかった。注入の1週間後、中和化抗体が検出され、2週間後にピークとなり、そして3週間後ゆっくりと減少した。この傾向は両方の血清型について見られたが、バックグラウンドを僅かに上回るレベルのみを示したrAAV5よりも、rAAV2注入は明らかに高い中和化抗体力価を血清中に誘導する。重要なことに、2つの血清型について、交差反応性は何ら観察されなかった。
実施例5−rAAV2およびrAAV5でのヒトFLSの形質導入
rAAV2および5はラット滑膜をトランスフェクトし得ることが示されたので、本発明者らは、RAを伴う患者から得られた一次ヒトFLSを形質導入する、両方の血清型の可能性を調べたいと考えた。この目的のために、本発明者らは、LacZまたはGFPのいずれかを発現するrAAVベクターを使用した。導入遺伝子の発現は、酵素的β−gal染色または蛍光顕微鏡によって48時間後に可視化された。両方の血清型がヒトFLSを形質導入し得、rAAV5は全ての実験においてより高い発現を示した。図6において代表的な実験が示される。
LacZ遺伝子を発現するrAAV1、rAAV2、rAAV3、rAAV4、rAAV5、コントロールベクター、およびアデノウイルスで形質導入され処置されたラット関節の凍結切片の直接的なインサイチュー染色のX−Gal(5−ブロモ−4−クロロ−3−インドイル−β−D−ガラクトピラノシド)染色(定量的なデジタル画像解析の結果)。 rAAV1〜rAAV5を注入されたラット関節の凍結切片のX−gal(青色)の直接的なインサイチュー染色。 CMVプロモーターによって駆動されるE.coli lacZコード配列を含む発現カセットがAAV2 ITR配列に隣接しているrAAV2ベクターを含有する、プラスミドpVD11の物理的地図。 デジタル画像解析によって定量化される、rAAV2および5の関節内注射の1、2、3、および4週間後のラット滑膜組織におけるβ−gal発現。 rAAV2またはrAAV5の関節内注入後の血清における中和化抗体の発達。 rAAV5はインビトロでヒト線維芽細胞様滑膜細胞(FLS)への遺伝子移送を媒介する。RA患者からの滑膜生検から単離されたヒトFLSがAAV5.GFPで形質導入された。トランスフェクションの48時間後、細胞は蛍光顕微鏡に固定化された。A:蛍光細胞、B:位相差顕微鏡写真。

Claims (17)

  1. 治療用タンパク質をコードする核酸配列を滑膜細胞に送達するための方法であって、以下の工程:
    a)AAV血清型5のカプシドタンパク質を含む組換えAAVビリオン(rAAV)を提供する工程であって、該rAAVビリオンがrAAVXベクターを含み、rAAVXベクターが核酸配列に作動可能に連結される発現エレメントを含む工程;および、
    b)rAAVビリオンを滑膜細胞と接触させる工程であって、それによってrAAVXベクターの形質導入が、形質導入された滑膜細胞における核酸配列の発現を生じる工程、
    を含む、方法。
  2. 被験体のリウマチ様関節へのrAAVビリオンの局所的な投与によって、核酸配列がインビボで滑膜細胞に送達される、請求項1に記載の方法。
  3. rAAVビリオンの投与が、関節への注入によって、好ましくは滑膜区分への注入によってである、請求項2に記載の方法。
  4. rAAVビリオンを、滑膜細胞またはエキソビボで滑膜細胞を含有する細胞培養物と接触させ、それによって必要に応じて形質導入細胞を選択する、請求項1に記載の方法。
  5. 被験体のリウマチ様関節に形質導入細胞を投与する工程をさらに含む、請求項4に記載の方法。
  6. 形質導入細胞の投与が、関節への注入によって、好ましくは滑膜区分への注入によってである、請求項5に記載の方法。
  7. 形質導入された滑膜細胞における核酸配列の発現が、関節における関節炎の症状の軽減を生じる、請求項2〜3および5〜6のいずれか1項に記載の方法。
  8. 核酸配列が以下:IL−1インヒビター、TNFαインヒビター、IL−1受容体アンタゴニスト、IL−18結合タンパク質、sTNFα受容体p55またはsTNFαp75、dn−IKK−β、IL−4、IL−10、IL−13、IFN−β、およびVIPの1つまたは複数から選択される治療用タンパク質をコードする、請求項1〜7のいずれか1項に記載の方法。
  9. rAAVXベクターがrAAV5またはrAAV2ベクターである、請求項1〜8のいずれか1項に記載の方法。
  10. AAV血清型5またはAAV血清型2のカプシドタンパク質を含むrAAVビリオンであって、それによってrAAVビリオンはrAAVXベクターを含み、該rAAVXベクターは関節リウマチに対して効果的な治療用タンパク質をコードする核酸配列に作動可能に連結される発現エレメントを含む、ビリオン。
  11. rAAVビリオンがrAAV5ビリオンであり、rAAVXベクターがrAAV5またはrAAV2ベクターである、請求項10に記載ビリオン。
  12. 核酸配列が以下:IL−1インヒビター、TNFαインヒビター、IL−1受容体アンタゴニスト、IL−18結合タンパク質、sTNFα受容体p55またはsTNFαp75、dn−IKK−β、IL−4、IL−10、IL−13、IFN−β、およびVIPの1つまたは複数から選択される治療用タンパク質をコードする、請求項10または11に記載のビリオン。
  13. 薬学的に許容される腑形剤および請求項10〜12のいずれか1項において規定されるrAAVビリオンを含む薬学的組成物の治療的に有効な量を使用して、インビボで関節のリウマチ様滑膜細胞を形質導入する工程、ならびに必要に応じて一定期間後に形質導入を反復する工程、を含む、リウマチ様関節を処置するための方法。
  14. 請求項10〜12のいずれか1項において規定されるrAAVビリオンを使用してエキソビボでリウマチ様滑膜細胞を形質導入する工程、必要に応じて形質導入細胞を選択する工程、被験体のリウマチ様関節に形質導入細胞を投与する工程、および必要に応じて一定期間後に投与を反復する工程を包含する、リウマチ様関節を処置するための方法。
  15. リウマチ様関節の処置のための薬剤の製造のための、請求項10〜12のいずれか1項において規定されるビリオンの使用。
  16. 処置は、薬学的に許容される腑形剤および請求項10〜12のいずれか1項において規定されるrAAVビリオンを含む薬学的組成物の治療的に有効な量を使用して、インビボで関節のリウマチ様滑膜細胞を形質導入する工程、および必要に応じて一定期間後に形質導入を反復する工程を含む、請求項15に記載の使用。
  17. 処置は、請求項10〜12のいずれか1項において規定されるrAAVビリオンを使用してエキソビボでリウマチ様滑膜細胞を形質導入する工程、必要に応じて形質導入細胞を選択する工程、被験体のリウマチ様関節に形質導入細胞を投与する工程、および必要に応じて一定期間後に投与を反復する工程を包含する、請求項14に記載の使用。
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