JP2006223234A5 - - Google Patents
Download PDFInfo
- Publication number
- JP2006223234A5 JP2006223234A5 JP2005043272A JP2005043272A JP2006223234A5 JP 2006223234 A5 JP2006223234 A5 JP 2006223234A5 JP 2005043272 A JP2005043272 A JP 2005043272A JP 2005043272 A JP2005043272 A JP 2005043272A JP 2006223234 A5 JP2006223234 A5 JP 2006223234A5
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- measurement result
- nucleic acid
- biological sample
- test method
- genetic test
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
Description
この発明の第1の局面による遺伝子検査方法は、生体試料中に存在する標的核酸を特異的に増幅して測定し、測定結果に基づいて診断支援情報を生成する遺伝子検査方法であって、前記生体試料中には存在しない核酸であり、既知量の内部標準核酸を、前記生体試料成分の非存在下で特異的に増幅し、その増幅に基づいて第1測定結果を取得する工程と、前記第1測定結果取得工程と同量の前記内部標準核酸を、前記生体試料成分の存在下で特異的に増幅し、その増幅に基づいて第2測定結果を取得する工程と、前記生体試料成分の存在下で前記標的核酸を特異的に増幅し、その増幅に基づいて第3測定結果を取得する工程と、第3測定結果と所定の基準値に基づいて診断支援情報を求める工程と、第1測定結果および第2測定結果に基づいて、生体試料成分中の阻害物質の診断支援情報に対する影響を判定する工程と、を備える。
この発明の第2の局面による遺伝子検査方法は、生体試料中に存在する標的核酸を特異的に増幅して測定し、測定結果に基づいて診断支援情報を生成する遺伝子検査方法であって、前記生体試料中には存在しない核酸であり、既知量の内部標準核酸を、前記生体試料成分の非存在下で特異的に増幅し、その増幅に基づいて第1測定結果を取得する工程と、前記第1測定結果取得工程と同量の前記内部標準核酸を、前記生体試料成分の存在下で特異的に増幅し、その増幅に基づいて第2測定結果を取得する工程と、前記生体試料成分の存在下で前記標的核酸を特異的に増幅し、その増幅に基づいて第3測定結果を取得する工程と、第1測定結果および第2測定結果に基づいて、前記第3測定結果および基準標的核酸量に対応する基準値の何れか一方を補正する工程と、前記第3測定結果および前記基準値のうちの補正された一方と、他方とに基づいて診断支援情報を求める工程とを備える。
この発明の第3の局面による遺伝子検査方法は、生体試料中に存在する標的核酸を特異的に増幅して測定し、測定結果に基づいて診断支援情報を生成する遺伝子検査方法であって、前記生体試料中には存在しない核酸であり、既知量の内部標準核酸を、前記生体試料成分の存在下で特異的に増幅し、その増幅に基づいて第1測定結果を取得する工程と、前記生体試料成分の存在下で前記標的核酸を特異的に増幅し、その増幅に基づいて第2測定結果を取得する工程と、第1測定結果および第2測定結果を比較して診断支援情報を求める工程とを備える。
Claims (17)
- 生体試料中に存在する標的核酸を特異的に増幅して測定し、測定結果に基づいて診断支援
情報を生成する遺伝子検査方法であって、
前記生体試料中には存在しない核酸であり、既知量の内部標準核酸を、前記生体試料成分の非存在下で特異的に増幅し、その増幅に基づいて第1測定結果を取得する工程と、
前記第1測定結果取得工程と同量の前記内部標準核酸を、前記生体試料成分の存在下で特異的に増幅し、その増幅に基づいて第2測定結果を取得する工程と、
前記生体試料成分の存在下で前記標的核酸を特異的に増幅し、その増幅に基づいて第3測定結果を取得する工程と、
第3測定結果と所定の基準値に基づいて診断支援情報を求める工程と、
第1測定結果および第2測定結果に基づいて、生体試料成分中の阻害物質の診断支援情報に対する影響を判定する工程と、を備えたことを特徴とする遺伝子検査方法。 - 第1測定結果と第2測定結果との差を、閾値と比較し、差が閾値より大きいとき、阻害物質の影響が大きいと判定する請求項1記載の遺伝子検査方法。
- 阻害物質の影響が大きいと判定されたとき、前記診断支援情報の信頼性について警告する請求項2記載の遺伝子検査方法。
- 阻害物質の影響が大きいと判定されたとき、前記第3測定結果取得工程における標的核酸の増幅を、所定の希釈倍率で希釈した条件下で再度測定する請求項2記載の遺伝子検査方法。
- 阻害物質の影響が大きいと判定されたとき、前記第1測定結果と第2測定結果との差に基づいて、前記第3測定結果または基準値を補正する請求項2記載の遺伝子検査方法。
- 前記診断支援情報が、前記生体試料に含まれる標的核酸量が、基準標的核酸量より多いか否かを判定した判定結果である請求項1記載の遺伝子検査方法。
- 前記診断支援情報が、陽性か否か、または正常か異常かを判定した判定結果である請求項1記載の遺伝子検査方法。
- 前記第3測定結果と、第1の基準値および第2の基準値に基づいて診断支援情報を求める請求項1〜5の何れか1項に記載の遺伝子検査方法。
- 前記診断支援情報が、陽性、弱陽性および陰性の何れであるかを判定した判定結果である請求項8記載の遺伝子検査方法。
- 前記第1〜第3測定結果取得工程が、所定の希釈倍率で希釈された条件下で行われる請求項1〜9の何れか1項に記載の遺伝子検査方法。
- 生体試料中に存在する標的核酸を特異的に増幅して測定し、測定結果に基づいて診断支援情報を生成する遺伝子検査方法であって、
前記生体試料中には存在しない核酸であり、既知量の内部標準核酸を、前記生体試料成分の非存在下で特異的に増幅し、その増幅に基づいて第1測定結果を取得する工程と、
前記第1測定結果取得工程と同量の前記内部標準核酸を、前記生体試料成分の存在下で特異的に増幅し、その増幅に基づいて第2測定結果を取得する工程と、
前記生体試料成分の存在下で前記標的核酸を特異的に増幅し、その増幅に基づいて第3測定結果を取得する工程と、
第1測定結果および第2測定結果に基づいて、前記第3測定結果および基準標的核酸量に対応する基準値の何れか一方を補正する工程と、
前記第3測定結果および前記基準値のうちの補正された一方と、他方とに基づいて診断支援情報を求める工程と、を備えたことを特徴とする遺伝子検査方法。 - 前記第1測定結果が、内部標準核酸の増幅を測定した第1測定値が所定値になった時間であり、前記第2測定結果が、内部標準核酸の増幅を測定した第2測定値が所定値になった時間であり、前記第3測定結果が、標的核酸の増幅を測定した第3測定値が所定値になった時間である請求項1〜11の何れか1項に記載の遺伝子検査方法。
- 生体試料中に存在する標的核酸を特異的に増幅して測定し、測定結果に基づいて診断支援情報を生成する遺伝子検査方法であって、
前記生体試料中には存在しない核酸であり、既知量の内部標準核酸を、前記生体試料成分の存在下で特異的に増幅し、その増幅に基づいて第1測定結果を取得する工程と、
前記生体試料成分の存在下で前記標的核酸を特異的に増幅し、その増幅に基づいて第2測定結果を取得する工程と、
第1測定結果および第2測定結果を比較して診断支援情報を求める工程と、を備えた遺伝子検査方法。 - 前記内部標準核酸が前記標的核酸と阻害物質により略同等の増幅阻害を受ける核酸である請求項1〜13の何れか1項に記載の遺伝子検査方法。
- 前記内部標準核酸がリブロース2リン酸カルボキシラーゼスモールチェーン1A遺伝子及び/又は前記遺伝子のmRNAである請求項1〜14の何れか1項に記載の遺伝子検査方法。
- 前記遺伝子がアラビドプシス属植物由来である請求項15記載の遺伝子検査方法。
- 前記生体試料がリンパ節であり、前記診断支援情報が、リンパ節への癌の転移の有無を判定した判定結果である請求項1〜16の何れか1項に記載の遺伝子検査方法。
Priority Applications (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2005043272A JP4829509B2 (ja) | 2005-02-18 | 2005-02-18 | 遺伝子検査方法 |
US11/354,945 US20060188911A1 (en) | 2005-02-18 | 2006-02-16 | Genetic testing method |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2005043272A JP4829509B2 (ja) | 2005-02-18 | 2005-02-18 | 遺伝子検査方法 |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2006223234A JP2006223234A (ja) | 2006-08-31 |
JP2006223234A5 true JP2006223234A5 (ja) | 2008-03-27 |
JP4829509B2 JP4829509B2 (ja) | 2011-12-07 |
Family
ID=36913184
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2005043272A Expired - Fee Related JP4829509B2 (ja) | 2005-02-18 | 2005-02-18 | 遺伝子検査方法 |
Country Status (2)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20060188911A1 (ja) |
JP (1) | JP4829509B2 (ja) |
Families Citing this family (9)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP5102450B2 (ja) * | 2006-01-27 | 2012-12-19 | シスメックス株式会社 | 核酸増幅分析装置 |
JP2008194028A (ja) * | 2007-01-15 | 2008-08-28 | Sysmex Corp | 胃がんのリンパ節転移判定方法 |
GB0812862D0 (en) * | 2008-07-14 | 2008-08-20 | Lumora Ltd | Nucleic acid amplification |
US9464319B2 (en) | 2009-03-24 | 2016-10-11 | California Institute Of Technology | Multivolume devices, kits and related methods for quantification of nucleic acids and other analytes |
US10196700B2 (en) | 2009-03-24 | 2019-02-05 | University Of Chicago | Multivolume devices, kits and related methods for quantification and detection of nucleic acids and other analytes |
JP5766178B2 (ja) | 2009-03-24 | 2015-08-19 | ザ・ユニバーシティ・オブ・シカゴThe University Of Chicago | SlipChip装置および方法 |
US9447461B2 (en) | 2009-03-24 | 2016-09-20 | California Institute Of Technology | Analysis devices, kits, and related methods for digital quantification of nucleic acids and other analytes |
WO2011116028A1 (en) * | 2010-03-15 | 2011-09-22 | Anderson Forschung Group, Inc. | Improved mass spectrometric assays for peptides |
JP6924600B2 (ja) * | 2017-04-10 | 2021-08-25 | シスメックス株式会社 | 測定方法、測定装置、プログラム、演算式の取得方法および定性判定結果の表示方法 |
Family Cites Families (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5372929A (en) * | 1992-01-27 | 1994-12-13 | Cimino; George D. | Methods for measuring the inactivation of pathogens |
US20020142328A1 (en) * | 2000-12-01 | 2002-10-03 | Danenberg Kathleen D. | Method of determining a chemotherapeutic regimen by assaying gene expression in primary tumors |
ATE485372T1 (de) * | 2002-01-09 | 2010-11-15 | Sysmex Corp | Nukleinsäurenachweisverfahren und system dafür |
EP2107482B1 (en) * | 2003-12-06 | 2014-06-25 | Abbott Laboratories | Method and system for analyzing reactions using an information system |
JP4719455B2 (ja) * | 2004-12-07 | 2011-07-06 | シスメックス株式会社 | 直接核酸増幅方法用生体試料処理液および直接核酸増幅方法 |
-
2005
- 2005-02-18 JP JP2005043272A patent/JP4829509B2/ja not_active Expired - Fee Related
-
2006
- 2006-02-16 US US11/354,945 patent/US20060188911A1/en not_active Abandoned
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP2006223234A5 (ja) | ||
WO2010013138A3 (en) | Methods and compositions for detection of a pathogen, disease, medical condition, or biomarker thereof | |
TR201903235T4 (tr) | Böbrek hasari ve böbrek yetmezli̇ği̇ni̇n tanilanmasi ve prognozuna yöneli̇k metotlar ve bi̇leşi̇mler. | |
AU2017219171B2 (en) | Extrapolation of interpolated sensor data to increase sample throughput | |
GB2503698A (en) | Sensor multi-point calibration method and apparatus | |
JPWO2008013225A1 (ja) | バイオセンサ測定システム、およびバイオセンサにおける異常波形検出方法 | |
CN113707219B (zh) | 用于分析核酸扩增反应的分析方法和系统 | |
Fauth et al. | Validation of extracellular miRNA quantification in blood samples using RT‐qPCR | |
JP2016154558A5 (ja) | ||
US8293473B2 (en) | Assessment of reaction kinetics compatibility between polymerase chain reactions | |
JPWO2020027098A5 (ja) | ||
JP2015027302A5 (ja) | ||
KR20180048702A (ko) | 가스 분석 시스템 및 가스 분석 방법 | |
US11525781B2 (en) | Method for measuring oxygen and apparatus for measuring oxygen | |
JP2021503925A5 (ja) | ||
US20150040691A1 (en) | Method and system of monitoring a potentiometric measuring probe | |
O'Riordan et al. | In vitro physiological performance factors of a catalase-based biosensor for real-time electrochemical detection of brain hydrogen peroxide in freely-moving animals | |
KR20140002241A (ko) | Pcr 데이터 및 다른 데이터에서 크로스토크의 영향을 보상하여 핵산을 분석하는 방법 및 장치 | |
CN107132165B (zh) | 一种粉尘质量浓度值的测量方法及装置 | |
JP6397134B2 (ja) | 内因性変性因子を補正するアンペロメトリッククレアチニンセンサ用較正コンセプト | |
CN104359957B (zh) | 一种电化学传感器及其制备与应用 | |
WO2005007890A3 (en) | Means and methods for detecting a risk of infarction related to atherosclerosis | |
EP2215265B1 (en) | Method for adjusting results of a polymerase chain reaction (pcr) instrument | |
JP6557740B2 (ja) | カルシウム阻害に関するcreaセンサの補正方法 | |
US20230029306A1 (en) | Method and Device for Determining the Number of Copies of a DNA Sequence That is Present in a Fluid |