JP2006170725A - 蛋白質の染色法、脱色法および保存法、また、染色液、脱色液および脱色後の保存液 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】電気泳動にて分離されたサンプルを含んだ支持体、サンプルを塗布したマイクロプレートあるいはブロット膜、組織切片、組織アレイのいずれかにおける蛋白質の染色、あるいは脱色、または染色や脱色後の保存操作において用いられる溶液の組成中に安息香酸または安息香酸塩を含有する。
【選択図】図1
Description
(1)電気泳動によって分離されたサンプルを含んだ支持体、サンプルを塗布したマイクロプレートかブロット膜、組織切片か組織アレイの蛋白質の検出に用いられる色素染色法において、色素は特に限定されないが、利用されやすい色素としてAcid Violet 17、Alcian Blue、Amide black 10B、Brilliant Blue FCF、Calconcarboxylic acid、Carmine、Coomassie Brilliant Blue G-250、Coomassie Brilliant Blue R-250、Curcumin、Fast Green FCF、Orange II、Procion Blue MX-2G-125、Sulforhodamine B、Sulforhodamine 101、Methylene Blue、Nigrosineから成る群より選ばれた1種類、あるいは時に2種類以上の色素か蛍光剤を含むことが望ましい。これらの溶液中の濃度は特に限定されないが、0.001 %(重量%)から5 %、好ましくは色素の溶解性や、蛋白質の量と結合色素のリニアリティーから0.01 %から0.5 %程度である。
染色液、脱色液または保存用途の溶液中の安息香酸または安息香酸塩の濃度は特に限定されないが、染色液中では0.05 %(重量%)から5 %、溶解性の点から好ましくは0.1 %から0.5 %程度である。また、使用時に純水(イオン交換水、蒸留水または高純度の濾過水)で2倍から20倍ほど希釈する濃縮脱色液中の安息香酸の濃度は、0.05 %(重量%)から10 %、好ましくは0.1 %から2 %程度である。
染色液、脱色液または保存用途の溶液中のpHは安息香酸で調製しても、共存させる酸にて調製してもよく、pH 0からpH 6.5、好ましくはpH 1.5からpH 4である。
安息香酸塩としては、例えば亜鉛塩、カリウム塩、カルシウム塩、コバルト塩、ナトリウム塩、マグネシウム塩、マンガン塩、リチウム塩等が示される。好ましくは、安全性と試薬の安価性から安息香酸か安息香酸ナトリウムが選ばれる。
水溶性有機溶媒としてMethanol、Ethanol、Isopropanol、n-Propanolの他、Acetonitrile、Acetone、Acetylacetone、Dimethylformamide、Ethylene glycol、N-Ethylformamide、Dimethylsulfoxide、1,4-Dioxane、Ethylene glycol、N-Methylamide、Pyridine、Tetrahydrofuranから成る群より選ばれた1種類、あるいは時に2種類以上の溶媒を含むことを特徴とする染色法。これらの溶液中の濃度は特に限定されないが、使用時の濃度として5 %(重量%)から95 %、好ましくは安息香酸と色素の溶解性を室温で保持するために10 %から70 %程度である。
本発明の脱色液による脱色時間は、1分から1週間までで、脱色操作は振盪浸漬することが好ましい。脱色時間も、脱色すべき対象(支持体)の厚さ又は嵩高さが増すことによって長くなる。脱色温度は10度Cから80度Cにて行われることが望ましい。しかしながら、その使用時において共存させる有機溶媒の濃度(重量%)が50 %を越える場合には、より低温でも用いることができる。いずれの場合でも、数回、好ましくは、希望のS/N比(SignalとNoiseの比率)が得られる蛋白質染色像が得られるまで、新鮮な脱色液に交換し脱色する。脱色液を保存液として用いる場合には、脱色液にグリセロールなどの保湿成分を、0.5 %(重量%)から20 %、好ましくは2 %から10 %程度含有させる状態が望ましい。
さらに、保存液での処理のあと、乾燥保存する場合は、たとえば、電気泳動のゲル支持体の場合、セロファン膜でゲル支持体を被い(平板のゲルの場合は、両面を被う)数日、室温にて風乾するのが簡単で望ましいが、もちろん専用のゲル乾燥機の適用も可能である。
実施例1 Polyacrylamide gelの染色
二種類の染色液の作成をおこなった。本発明染色溶液の一つが(1)で、対照の染色液が(2)である。
(1)Polyacrylamide gelまたはAgarose gel、ないしは弾性化ゲルを支持体とした場合に用いるCBB-R染色液の作成法
(約1リットル作成の場合)
1) Coomassie Brilliant Blue R-250 0.5 g
2) 安息香酸 3 g
3) 硫酸アンモニウム 10 g
4) 80% エタノール 250 ml
5) イオン交換水 750 g
作成手順:2)を4)に完全溶解させた後、1)をこれに溶解させ、1時間室温で攪拌し(A)とする。同時に、3)を5)に完全溶解させ(B)とする。最後に(A)に(B)を徐々に混入、1時間室温で攪拌させ、最後にこの混合液を濾紙(Advantec 330mm, No.1)で濾す。これを瓶に充填し作成終了。当発明染色液のpHは、2.7から2.9であった。
(2)対照の染色液
最終濃度表示として0.25% Coomassie Brilliant Blue R-250、7% (v/v) 酢酸、40% (v/v) Ethanolになるように、イオン交換水にて調製した。当対照の染色液の最終pHは、2.5から2.7であった。
Laemmliの方法(Nature、227巻、680頁、1970年)に従って、SDS化させた蛋白質の電気泳動をおこなった。用いた分離ゲルはPolyacrylamideからなるもので、架橋剤はBisacrylamideを用い、12.5% T, 3.3% C という組成の分離ゲルを用いた。ゲルの厚さは1 mmで、分離ゲルの分離長は7.5 cm、濃縮ゲルの分離長は5 mmであった。
大腸菌の抽出物(E. coli extract 、Promega社)をLaemmliのサンプル処理法によって分離用サンプルとして調製し、電気泳動ゲルのサンプル用ウェル一箇所あたり10ないし20マイクログラムをアプライした。通常の電気泳動用電源にて100Vの一定電圧で、室温下1時間の電気泳動を行った。泳動を終了後、ゲルをゲル体積の20倍容量の(1)ないしは(2)の染色液にいれ、37度Cにて30分、または室温にて3日間まで振盪浸漬しながら染色した。この状態にて、(1)の方法では3日までの染色でも脱色操作なしでも含量が高い蛋白質のバンドが観察された。しかし(2)の方法では、蛋白質バンドとバックグラウンドの色調の差が小さいために、蛋白質バンドの観察が困難であった。
(1)ブロット(ウエスタンまたはドット法)用PVDF膜のAmide black 10B染色液
(約1リットル作成の場合)
1) Amide black 10B 0.8 g
2) 安息香酸 5 g
3) 80% (v/v) Ethanol 250ml
4) イオン交換水 750 g
作成手順:2)を3)に完全溶解させた後、1)をこれに溶解させ、1時間室温で攪拌し、さらに4)をこれらに混入、1時間室温で攪拌させ、最後にこの混合液を濾紙(Advantec 330mm, No.1)で濾して瓶に充填し作成終了。
1) 安息香酸 7.0 g
2) 80% (v/v) Ethanol 625 ml
3) イオン交換水 375 g
作成手順:1)を2)に完全溶解させた後、3)をこれに溶解させ、1時間室温で攪拌し、これを瓶に充填し作成終了。
Analytica Chimica Acta、365巻、109頁、1998年に示されているPVDF膜への蛋白質のドット法を行った。ドットする蛋白質はRabbit serumで、1ドットあたり10マイクログラムをPVDF膜にブロットした。蛋白質の懸濁に用いた緩衝液は、25mM Tris, 192mM glycine, 0.1% SDS, 20% (v/v) methanolであった。Rabbit serumのブロット操作に続き、論文の手続きに従い、PVDF膜を洗浄処理した。次にPVDF膜上の蛋白質の染色は、(1)のAmide black 10B染色液にPVDF膜を浸漬3分間の処理をした。さらにイオン交換水で一回洗浄し、(2)の脱色液にて3分間の振盪洗浄を、脱色液を交換し2回行った後、これを乾燥し保存した。その結果、蛋白質をアプライした領域にはAmide black 10Bが明瞭に残存したが、非アプライ領域に残存するAmide black 10Bはデンシトメーターでの検出感度の誤差以下であった。
(1)CBB-R染色における脱色液と保存液の両者を兼ねる濃縮溶液の作成法
(脱色液として10倍の濃縮液、保存液として5倍の濃縮液を約1リットル作成の場合)
1) 安息香酸 10 g
2) 80% (v/v) Ethanol 700 ml
3) Glycerol 380 g
作成手順:1)を2)に完全溶解させる。次に、3)をこれに溶解させ、1時間室温で攪拌する。これを瓶に充填し作成終了。
最終濃度表示として10 % (v/v) 酢酸、10 % (v/v) Ethanolとなるように、イオン交換水にて調製した。
脱色液として(1)を使用するにあたり、1容量の(1)に対して、9容量のイオン交換水を加え、脱色液として使用した。染色過程を検査するために、実施例1で染色したPolyacrylamide gelを当適応例の(1)の10倍希釈液か、(2)の溶液にて脱色した。脱色は、室温で2時間か一晩(16時間)で行い、その間、ゲル体積の20倍容量の(1)ないしは(2)の脱色液を4回(2時間の場合)、または6回(16時間の場合)交換した。その結果、本発明染色溶液の場合、(2)(3)何れの脱色液、何れの脱色時間でも得られた染色像のS/N比は対照の染色液にくらべ高かった。これは主に、Polyacrylamide gelのバックグラウンドの染色性が低かったことに由来していた。
特に重要なことに、室温にて3日間も振盪浸漬にて染色し脱色した結果ですら本発明染色溶液によるPolyacrylamide gelのバックグラウンドの染色性は低かったが、対照の染色液による染色結果は、その脱色処理を24時間まで延長した場合ですら、バックグラウンドには染色剤による微小な染色斑が点在し、詳細な解析実験には耐えない状態であった。
(1)本発明での保存液
実施例3の濃縮溶液1容量に対し4容量のイオン交換水を加え、保存液とした。
(2)対照の保存液
最終濃度5% (w/v) Glycerol、10 % (v/v) 酢酸となるようにイオン交換水で調製した。
(3)実施例3にて本発明の染色溶液と脱色液により処理したPolyacrylamide gelに(1)あるいは(2)の保存液で3時間の振盪浸漬をすることで、平衡化させた。その後、平板状のゲルの両面をセロファンを密着させて被い、3日間室温で風乾させた。その結果を保管中、図1にあるように、本発明での保存液による乾燥ゲルには亀裂が入らないにもかかわらず、対照の保存液による乾燥では亀裂がはいって保存に耐えない状態となった。さらに、この本発明での保存液による乾燥ゲルを実験ノートの間に室温保管しても、少なくとも1年間は亀裂が入らず染色像の鮮明さも失われることはなかった。さらに安息香酸を染色と脱色操作に用いている本発明の副次的な効能により、カビ(黴)や害虫の発生もみられなかった。
実施例1と実施例2にある、本発明に関する何れの染色液も、それらを1リットルのガラス瓶、ないしはプラスチックボトルに封入し、1年間、室温で遮光せずに保存したが、染色性の低下は見られず、色素の凝集もおこらなかった。これに対し、実施例1における対照の染色液では、色素が一部沈殿し、また一部が肉眼で観察できる粒子状に凝集した。このため蛋白質を一様に染められずPolyacrylamide gelのバックグラウンドの染色性も一様ではなく、その脱色に、本発明染色液の倍の時間を要する結果となった。
実施例3にある、本発明に関する濃縮脱色液も、それらを1リットルのガラス瓶、ないしはプラスチックボトルに封入し、1年間、室温で遮光せずに保存したが、その脱色性の低下や変色は見られず透明のままであった。また何らかの沈殿が凝集析出することもなかった。
廃棄に当たっては、安息香酸を主な酸成分とする溶液においては、重炭酸塩溶液などの弱アルカリ性溶液を用いることで中和でき、また廃棄溶液量の縮小ができた。廃棄にあたって、色素を活性炭に吸着させる処理にても、容易に染色成分の活性炭への吸着操作ができることを確認した。
Claims (8)
- 電気泳動にて分離されたサンプルを含んだ支持体、サンプルを塗布したマイクロプレートあるいはブロット膜、組織切片、組織アレイのいずれかにおける蛋白質の染色、あるいは脱色、または染色や脱色後の保存操作において用いられる溶液の組成中に安息香酸または安息香酸塩を含有することを特徴とする、染色液、脱色液または保存用途の処理液。
- 保存操作において用いられる溶液は、アイソトープ標識された蛋白質サンプルを含んだ支持体、同標識されたサンプルを塗布したマイクロプレートあるいはブロット膜、同標識された組織切片、同標識された組織アレイにも適用できる請求項1に記載の染色液、脱色液または保存用途の処理液。
- 前記安息香酸もしくは色素を安定して溶解させるために、水溶性有機溶媒を含有させることを特徴とする、請求項1に記載の染色液、脱色液または保存用途の処理液。
- 保存操作において用いられる、水溶性有機溶媒を含有する溶液は、アイソトープ標識された蛋白質サンプルを含んだ支持体、同標識されたサンプルを塗布したマイクロプレートあるいはブロット膜、同標識された組織切片、同標識された組織アレイにも適用できる請求項3に記載の染色液、脱色液または保存用途の処理液。
- 請求項1乃至4に記載の染色液、脱色液あるいは保存溶液を構成試薬として含んで成る電気泳動用、マイクロプレート計測法用、ウエスタンブロットやドットブロットといったブロット法用、あるいは組織染色か組織アレイ法用の試薬キット。
- 測定用基材上の蛋白質の染色又は脱色をするための溶液に安息香酸または安息香酸塩を含む染色用乃至脱色用溶液。
- 測定用基材上の蛋白質の染色又は脱色後の保存液に安息香酸または安息香酸塩を含む保存用溶液。
- 前記測定用基材が、電気泳動にて分離されたサンプルを含んだ支持体、サンプルを塗布したマイクロプレートあるいはブロット膜、組織切片、組織アレイのいずれかである請求項6乃至7に記載の染色用乃至脱色用溶液及び保存用溶液。
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