JP2006162624A - ポンプ及び弁を利用したハイブリダイぜーションチャンバの撹拌装置 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】ハイブリダイぜーションチャンバと、ハイブリダイぜーションチャンバの両端に連結された第1エアチャンネル及び第2エアチャンネルと、第1エアチャンネル上に設置された第1弁と、第2エアチャンネル上に設置された第2弁と、第1エアチャンネル及び第2エアチャンネルを連結する統合エアチャンネルと、統合エアチャンネル上に設置されたポンプとを備えるハイブリダイぜーションチャンバ内で溶液を撹拌するのに使われる撹拌装置及び該装置を利用した撹拌方法である。これにより、DNAチップを利用したハイブリダイぜーション時に、サンプルをさらに効率的に拡散させ、プローブと標的物質とのハイブリダイぜーションの効果を向上させられる。
【選択図】図7
Description
アクリル材質の構造物を利用し、カートリッジを挿入できる構造物を作製した。チャンバを密封パッドにより覆い包んだ後、前記密封パッドをねじで固定し、150μmの高さのチャンバを形成した。前記密封パッドに孔を形成し、そこに2個の弁(Bio−Chemvlave社製のseries 075P)と1個のポンプ(Uniflow社製のステッピングモータ方式ポンプ)とを連結し、図7のような本発明の撹拌装置を作製した。完成した構造物の流入ホールに、脱イオン水45μlを入れて1μlのインクを入れた後に撹拌ポンプを連結した。実験進行にあたり、速度を異なるようポンプの上昇及び下降(空気を送る及び空気を抜く)を反復し、インクの拡散を観測した。
実施例1で使用した撹拌装置を使用し、上昇時間/ブレーク時間によるハイブリダイぜーションチップ強度の係数変化(CV)を測定した。このときに使われたチップは、アミンをシリコンウェーハにコーティングした後、作製された構造物に合うように切り、この後にスポッタを利用し、同一プローブ(配列:TGT TCT CTT GTC TTG)を固定した。このように作製されたチップをアクリル構造物に固定するために、チップの安定性を高めるべくプラスチック構造物に接着剤を利用してカートリッジ形態に作製した(韓国特許出願第2004−0039981号公報参照)。これをアクリル構造物に装着した後、標的溶液(Cy3が標識されたプローブ(CAA GAC AAG AGA ACA)をハイブリダイぜーションバッファに混合した溶液)をチャンバに注入した後に、ポンプを利用して撹拌した。ハイブリダイぜーション過程の終了後、カートリッジを3X SSPETバッファと1X SSPETバッファとでそれぞれ5分間洗浄した後、レーザスキャナを利用してチップのイメージを分析した。分析後、各スポットの強度を定量し、これをもとにスポット間の強度CVを測定した。ブレーク周期は、ポンプを利用して空気を押し込んだ後、再びポンプが空気を押し込む周期までにかかる時間である。
本発明の撹拌装置をMODY3チップに適用し、既存のカバースライドパッチ方式と比較した。実験に使われたプローブは、次の表2の通りである。
2,2’ チャンネル
3,3’ 膜
4,4’,105 ポンプ
102,102’ エアチャンネル
103,103’ 弁
104 統合エアチャンネル
Claims (8)
- ハイブリダイぜーションチャンバと、
前記ハイブリダイゼーションチャンバの両端に連結された第1エアチャンネル及び第2エアチャンネルと、
前記第1エアチャンネル上に設置された第1弁と、
前記第2エアチャンネル上に設置された第2弁と、
前記第1エアチャンネル及び第2エアチャンネルを連結する統合エアチャンネルと、
前記統合エアチャンネル上に設置されたポンプと、
を備えるハイブリダイゼーションチャンバ内で溶液を撹拌するのに使用される撹拌装置。 - DNA、RNA、PNA、LNA、ペプチド及び蛋白質からなる群から選択されたすくなくとも一つの生体分子がハイブリダイぜーションされることを特徴とする、請求項1に記載の撹拌装置。
- 前記ハイブリダイぜーションチャンバは、分離可能なカートリッジ形態で装着されることを特徴とする、請求項1に記載の撹拌装置。
- 前記弁は、ソレノイド弁であることを特徴とする、請求項1に記載の撹拌装置。
- 前記ポンプは、ステッピングモータ方式のマイクロポンプであることを特徴とする、請求項1に記載の撹拌装置。
- (請求項6につきましては別途テクニカルクエスチョン)(請求項6は英語の明細書の説明と図8と一致しません)
第1弁を開放させて第2弁を閉鎖させた状態で空気を送るステップと、
第1弁を閉鎖させて第2弁を開放させた状態で空気を抜くステップと、
第1弁を閉鎖させて第2弁を開放させた状態で空気を送るステップと、
第1弁を開放させて第2弁を閉鎖させた状態で空気を抜くステップとを含む
ハイブリダイぜーションチャンバと、
前記ハイブリダイぜーションチャンバの両端に連結された第1エアチャンネル及び第2エアチャンネルと、
前記第1エアチャンネル上に設置された第1弁と、
前記第2エアチャンネル上に設置された第2弁と、
前記第1エアチャンネル及び第2エアチャンネルを連結する統合エアチャンネルと、
前記統合エアチャンネル上に設置されたポンプとを備える撹拌装置を利用してハイブリダイぜーションチャンバ内で溶液を撹拌する方法。 - ハイブリダイぜーションチャンバ内の溶液がチャンネルを介した循環なしに閉鎖システムで撹拌されることを特徴とする、請求項6に記載の撹拌方法。
- ポンプを上昇させた後、さらにポンプを上昇させるまでのブレーク周期が1分ないし3分であることを特徴とする、請求項6に記載の撹拌方法。
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