JP2005296012A - ホスホエノールピルビン酸シンターゼ活性を有する新規耐熱性タンパク質 - Google Patents
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Abstract
【課題】 ホスホエノールピルビン酸シンターゼ活性を有する新規耐熱性タンパク質を提供する。
【解決手段】 超好熱性古細菌であって、好気性thermoacidophilic crenarchaeonの1種であるスルホロブス・トコダイイ(Sulfolobus tokodaii)種7(JCM10545)の遺伝子配列から、ホスホエノールピルビン酸シンターゼ活性を有するタンパク質をコードすると推定される遺伝子をクローニングし、これを、大腸菌を用いて発現させることにより得たものである。
【選択図】 図1
【解決手段】 超好熱性古細菌であって、好気性thermoacidophilic crenarchaeonの1種であるスルホロブス・トコダイイ(Sulfolobus tokodaii)種7(JCM10545)の遺伝子配列から、ホスホエノールピルビン酸シンターゼ活性を有するタンパク質をコードすると推定される遺伝子をクローニングし、これを、大腸菌を用いて発現させることにより得たものである。
【選択図】 図1
Description
本発明は、ホスホエノールピルビン酸シンターゼ活性を有する新規耐熱性タンパク質に関する。なお、本出願は、国の委託の成果に係る出願である。
ホスホエノールピルビン酸シンターゼは、水およびATPの存在下、ピルビン酸をホスホエノールピルビン酸に変えると共に、前記ATPをAMPに変える触媒機能を有する酵素である。この酵素は、糖新生に関与している。ホスホエノールピルビン酸シンターゼとしては、様々の生物由来のものが知られているが、その中で、耐熱性菌由来のものも知られている。前記耐熱性菌としては、超好熱性古細菌(hyperthermophilic archaeum)に属する菌である、パイロコッカス・フリオサス(Pyrococcus furiosus)と、スタフィロサーマス・マリナス(Staphylothermus marinus)とがあり、これらの菌由来のホスホエノールピルビン酸シンターゼが知られている(例えば、非特許文献1、非特許文献2および非特許文献3参照)。このような耐熱性菌由来のホスホエノールピルビン酸シンターゼは、その工業的用途を広げるものと期待されているが、前2種類の菌由来のものだけでは、未だ不十分である。
他方、前記の菌以外の超好熱性古細菌(例えば、非特許文献4参照)についての研究があり、スルホロブス属細菌の1種であるスルホロブス・トコダイイ(Sulfolobus tokodaii)(JCM10545)(例えば、非特許文献5参照)は、その遺伝子が既に解析されている(例えば、非特許文献6参照)。したがって、この超好熱古細菌が、ホスホエノールピルビン酸シンターゼを産生するとすれば、それは優れた耐熱性を有すると予想され、これによって工業的用途さらに広がる可能性がある。
J Bacteriol., 183(2), 709-715, 2001 FEBS Letter, 356(2-3), 345-350, 1994 Journal Molecular Biology, 290(1), 347-361, 1999 Advances in Protein Chemistry, Volume 48, Enzymes and Proteins from Hyperthermophilic Microorganisms (M.Adams ed.), Academic Press (1996) Suzuki, T. et al., Extremophiles, 2002 Feb;6(1):39-44 Kawarabayashi,Y. et al., "Complete genome sequence of an aerobic thermoacidophilic crenarchaeon, Sulfolobus tokodaii strain7", DNA Res. 8 (4), 123-140 (2001)
J Bacteriol., 183(2), 709-715, 2001 FEBS Letter, 356(2-3), 345-350, 1994 Journal Molecular Biology, 290(1), 347-361, 1999 Advances in Protein Chemistry, Volume 48, Enzymes and Proteins from Hyperthermophilic Microorganisms (M.Adams ed.), Academic Press (1996) Suzuki, T. et al., Extremophiles, 2002 Feb;6(1):39-44 Kawarabayashi,Y. et al., "Complete genome sequence of an aerobic thermoacidophilic crenarchaeon, Sulfolobus tokodaii strain7", DNA Res. 8 (4), 123-140 (2001)
本発明は、このような事情に鑑みなされたものであり、ホスホエノールピルビン酸シンターゼ活性を持つ新規耐熱性タンパク質の提供を、その目的とする。
前記目的を達成するために、超好熱性古細菌であるスルホロブス・トコダイイ(Sulfolobus tokodaii)(JCM10545)のゲノム情報について調べたところ、この細菌が、ホスホエノールピルビン酸シンターゼを産生する可能性があることを突き止めた。この知見に基づき、さらに研究を重ねたところ、この細菌の遺伝子から、ホスホエノールピルビン酸シンターゼ活性を持つ新規耐熱性タンパク質を発現させることに成功し、本発明に到達した。
すなわち、本発明のタンパク質は、下記の(a)または(b)のタンパク質である。
(a) 配列番号1のアミノ酸配列からなる耐熱性タンパク質。
(b) 配列番号1のアミノ酸配列において、1つ以上のアミノ酸残基が、欠失、置換、付加若しくは挿入されたアミノ酸配列からなり、ホスホエノールピルビン酸シンターゼ活性を有する耐熱性タンパク質。
(a) 配列番号1のアミノ酸配列からなる耐熱性タンパク質。
(b) 配列番号1のアミノ酸配列において、1つ以上のアミノ酸残基が、欠失、置換、付加若しくは挿入されたアミノ酸配列からなり、ホスホエノールピルビン酸シンターゼ活性を有する耐熱性タンパク質。
なお、スルホロブス・トコダイイ(Sulfolobus tokodaii)(JCM10545)は、理化学研究所生物基盤研究部微生物系統保存施設に保存されており、第三者の要求により分譲可能である。
スルホロブス・トコダイイ(Sulfolobus tokodaii)(JCM10545)の生育温度は80℃であり、生育限界温度が87℃であるから、本発明のタンパク質は、80〜87℃の高温であっても活性がある。
本発明のタンパク質の酵素反応の温度条件は、70〜85℃の範囲であることが好ましい。
前記ホスホエノールピルビン酸シンターゼ活性は、水およびATPの存在下にピルビン酸に作用して、ホスホエノールピルビン酸およびAMPを生成する機能である。
前述のように、本発明の新規耐熱性タンパク質は、超好熱性古細菌由来であり、具体的には、スルホロブス・トコダイイ(Sulfolobus tokodaii)(JCM10545)由来である。但し、本発明のタンパク質は、この菌が産生するものに限定されず、遺伝子工学的手法により、他の生物が産生するものであってもよい。
つぎに、本発明の発現ベクターは、前記本発明のタンパク質をコードするDNAまたは配列番号2に記載のDNAを含むベクターである。
つぎに、本発明の形質転換体は、前記本発明のベクターにより形質転換された形質転換体である。なお、宿主は特に制限されず、例えば、大腸菌等がある。
つぎに、本発明のタンパク質の製造方法は、前記本発明の形質転換体を培養する工程と、前記培養工程において発現した前記タンパク質を回収する工程とを含む製造方法である。
つぎに、本発明の製造方法は、酵素反応により、ピルビン酸およびATPからホスホエノールピルビン酸およびAMPを製造する方法であって、前記酵素として前記本発明のタンパク質を用い、温度70〜85℃の条件で前記酵素反応を行う製造方法である。このように、前記本発明のタンパク質を用いれば、温度70〜85℃の高温領域で酵素反応を実施でき、この結果、工業的な用途が広がる。なお、この製造方法において、前記酵素反応のpHは、pH8.5〜9.5の範囲が好ましい。
以下、本発明について、さらに詳細に説明する。
本発明者らは、海洋底から採取された超好熱性古細菌であって、好気性thermoacidophilic crenarchaeonの1種であるスルホロブス・トコダイイ(Sulfolobus tokodaii)種7(JCM10545)の遺伝子配列からホスホエノールピルビン酸シンターゼ活性を示すと推定される遺伝子(配列番号2)をクローニングし、これを、大腸菌を用いて発現させることにより、本発明の新規耐熱性タンパク質を得るに至った。遺伝子のクローニング方法は、後記した実施例1に記載した通り実施した。クローニングされた遺伝子の塩基配列は配列番号2に示す通りであり、また、その推定アミノ酸配列は配列番号1に示す通りである。なお、本発明の耐熱性タンパク質は、ホスホエノールピルビン酸シンターゼ活性を有していれば、配列番号1のアミノ酸配列において、一つ以上若しくは数個のアミノ酸残基が、欠質、置換、付加若しくは挿入されていてもよい。このアミノ酸配列における「アミノ酸の欠失、置換、付加若しくは挿入」は、当業者に公知の方法(例えば、突然変異誘発法)に従って実施することができる。
本発明のタンパク質は、前述の本発明のタンパク質の製造方法により製造可能であるが、これに限定されず、他の製造方法で製造されてもよい。例えば配列番号1に示すように、そのアミノ酸配列が決定されているタンパク質については、その配列を元に当業者に公
知の手法、例えば、個々のアミノ酸を化学的に重合してタンパク質を合成する方法に従って調製することができる。
知の手法、例えば、個々のアミノ酸を化学的に重合してタンパク質を合成する方法に従って調製することができる。
本発明のタンパク質をコードする遺伝子の一例としては、配列番号2に示す遺伝子がある。前記遺伝子は、例えば、後記する実施例2に示すように超好熱性古細菌スルホロブス・トコダイイ(Sulfolobus tokodaii)(JCM10545)のゲノムから、例えば配列番号2で示される塩基配列の一部をプライマーとして用いるPCR法あるいは該DNA断片をプローブとして用いるハイブリダイゼーション法により調製することができる。また、その塩基配列をもとに、当業者に公知である核酸化学合成法等に従って前記遺伝子を得ることもできるが、これらに限定されない。
本発明の発現ベクターは、前記遺伝子もしくは配列番号2のDNAを適当なベクターに挿入することによって得ることができる。本発明の遺伝子を挿入するためのベクターは、宿主中で複製可能なものであれば、特に制限されるものではなく、例えば、プラスミドDNA、ファージDNA、AcMNPVなどのバキュロウイルスなどが挙げられる。プラスミドDNAは、大腸菌やアグロバクテリウムからアルカリ抽出法またはその変法などにより調製することができる。また、市販プラスミドとして、例えばpET-11a(Novagen社製)あるいはバチルス属の宿主を用いた分泌型のプラスミドなどを用いてもよい。これらのプラスミドは、アンピシリン耐性遺伝子、カナマイシン耐性遺伝子、クロラムフェニコール耐性遺伝子などが含まれていてもよい。
ベクターへの遺伝子等の挿入は、例えば、精製された遺伝子の塩基配列を適当な制限酵素で切断し、適当なベクターDNAの制限酵素部位またはマルチクローニングサイトに挿入してベクターに連結する方法などを用いることができるが、これらに限定されない。また、本発明の遺伝子の機能が発揮されるように、本発明の発現ベクターには本発明の遺伝子のほか、プロモーター、ターミネーター、リボソーム結合配列などを組み込んでいてもよい。さらに、本発明の遺伝子も他のタンパク質のコードする配列を融合したものを挿入してもよい。
前記発現ベクターで宿主生物を形質転換すれば、本発明の形質転換体が得られる。宿主生物としては、本発明の遺伝子を発現できるものであれば、特に制限されるものではなく、例えば、大腸菌などの原核細胞が挙げられるが、これらに限定されない。形質転換法としては、既に公知である塩化カルシウム法などを使用することができるが、これらの方法に限定されない。
本発明のタンパク質の製造方法は、前記形質転換体を培養する工程と、前記培養工程において発現した前記タンパク質を回収する工程とを含む製造方法である。前記培養する方法は、宿主細胞の培養に用いられる通常の方法に従って行われる。大腸菌等の微生物を宿主とした形質転換体を培養する培地としては、微生物が資化し得る炭素源、窒素源、無機塩類などを含有し、形質転換体の培養を効率的に行えるものであれば、天然培地、合成培地などのいずれを用いてもよい。本発明のタンパク質の回収は、特に制限されない。前記タンパク質が菌体内または細胞内に生産される場合には、菌体または細胞を破砕することによって前記タンパク質を回収する。また、本発明の前記タンパク質が菌体外または細胞外に生産される場合には、培養液をそのまま使用するか、遠心分離などにより菌体または細胞を除去した後、タンパク質の単離精製に用いられる一般的な生化学的方法、例えば、硫酸アンモニウム沈殿、ゲルクロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィーなどを単独でまたは適宜組み合わせて用いることにより、培養物中から本発明のタンパク質を単離精製することができる。なお、培養液をそのまま使用する場合、熱処理をすることにより、他のタンパク質が失活するので、実質上、本発明のタンパク質のみの酵素液として使用できる。
以下に実施例により本発明をさらに詳細に説明するが、本発明はこれらにより限定されない。
染色体DNAの調製
スルホロブス・トコダイイ(Sulfolobus tokodaii(JCM10545))をL培地中で37℃にて一晩培養して集菌したものに、SSC溶液(0.15M NaCl、0.015M クエン酸ナトリウム)10mL、0.5M EDTA0.2mL、100mg/mL ニワトリ卵白リゾチーム0.1mLおよび10%非イオン性界面活性剤Brij-58を0.5mL加え、0℃で30分間放置した後、プロテイナーゼK(Merck社製)5mgを10%SDS0.2mLに溶かした溶液を加え、37℃で2、3日間放置した。この溶液に水飽和フェノール、クロロホルム、イソアミルアルコールの混合溶液を加えて、37℃で1時間放置した後、水層を分取し、そこへエタノールを加えてDNAを沈殿濃縮した。このDNAの沈殿をTE溶液(10mM Tris−HCl(pH7.5)、1mM EDTA(pH8.0))10mLに溶解し、リボヌクレアーゼ0.25mL(最終濃度0.25mg/mL)を加えて、37℃で一晩放置した後、エタノールで沈殿させた。次いで、DNAをTE溶液5mLに溶解した後、260nmの吸光度より、DNA濃度を決定した(Clarke,L. & Carbon,J.(1979) Methods Enzymol. 68, 396-408)。
スルホロブス・トコダイイ(Sulfolobus tokodaii(JCM10545))をL培地中で37℃にて一晩培養して集菌したものに、SSC溶液(0.15M NaCl、0.015M クエン酸ナトリウム)10mL、0.5M EDTA0.2mL、100mg/mL ニワトリ卵白リゾチーム0.1mLおよび10%非イオン性界面活性剤Brij-58を0.5mL加え、0℃で30分間放置した後、プロテイナーゼK(Merck社製)5mgを10%SDS0.2mLに溶かした溶液を加え、37℃で2、3日間放置した。この溶液に水飽和フェノール、クロロホルム、イソアミルアルコールの混合溶液を加えて、37℃で1時間放置した後、水層を分取し、そこへエタノールを加えてDNAを沈殿濃縮した。このDNAの沈殿をTE溶液(10mM Tris−HCl(pH7.5)、1mM EDTA(pH8.0))10mLに溶解し、リボヌクレアーゼ0.25mL(最終濃度0.25mg/mL)を加えて、37℃で一晩放置した後、エタノールで沈殿させた。次いで、DNAをTE溶液5mLに溶解した後、260nmの吸光度より、DNA濃度を決定した(Clarke,L. & Carbon,J.(1979) Methods Enzymol. 68, 396-408)。
発現プラスミドの構築と遺伝子発現
1.発現プラスミドの構築
耐熱性ホスホエノールピルビン酸シンターゼ遺伝子の翻訳領域の前後に制限酵素NdeIおよびBamHI、NotIサイトを含むDNAを構築する目的で下記のDNAプライマーを合成し、このプライマーを用いたPCRで耐熱性ホスホエノールピルビン酸シンターゼ遺伝子の翻訳領域の前後に制限酵素サイトを導入した。用いたDNAポリメラーゼはKOD Dash(東洋紡社製)であった。
Forward primer(配列番号3):5'-ATATCATATGAATTATACCTATCGTCTTGACGAAATTAAC-3'
Reverse primer(配列番号4):5'-ATATGGATCCGCGGCCGCTTATTAAACTTCTGGGTAAATTTT-3'
1.発現プラスミドの構築
耐熱性ホスホエノールピルビン酸シンターゼ遺伝子の翻訳領域の前後に制限酵素NdeIおよびBamHI、NotIサイトを含むDNAを構築する目的で下記のDNAプライマーを合成し、このプライマーを用いたPCRで耐熱性ホスホエノールピルビン酸シンターゼ遺伝子の翻訳領域の前後に制限酵素サイトを導入した。用いたDNAポリメラーゼはKOD Dash(東洋紡社製)であった。
Forward primer(配列番号3):5'-ATATCATATGAATTATACCTATCGTCTTGACGAAATTAAC-3'
Reverse primer(配列番号4):5'-ATATGGATCCGCGGCCGCTTATTAAACTTCTGGGTAAATTTT-3'
PCR反応後、Ex Taq(宝酒造社製)を用いて増幅断片の3’末端側にデオキシアデノシンを付加した後、pGEM-T Easy Vector(Promega社製)と、T4リガーゼで15℃、30分間反応させ連結した。連結したDNAを大腸菌DH5αのコンピテントセルに導入し、形質転換体のコロニーを得た。得られた形質転換体を、アンピシリンを含むLB培地(18mL)で24時間培養し、その培養液からプラスミドを改変アルカリSDS法で精製した。プラスミド中に期待される大きさのインサートが存在することを、アガロース電気泳動で確認した。精製プラスミドのインサートの塩基配列は、BigDye Terminator kit(登録商標:Applied Biosystems社製)とABI PRISM 3700 DNA Analyzer(登録商標:Applied Biosystems社製)を用いて決定し、インサートの塩基配列が、耐熱性ホスホエノールピルビン酸シンターゼ遺伝子の正しい配列であることを確認した。正しい配列を有するプラスミドの一部を制限酵素NdeIとBamHIで完全分解(37℃で2時間)した後、アガロース電気泳動により、耐熱性ホスホエノールピルビン酸シンターゼ遺伝子を精製した。pET-11a(Novagen社製)を制限酵素NdeIとBamHIで切断・精製した後、上記の構造遺伝子とT4リガーゼで反応させ連結した。連結したDNAの一部を大腸菌DH5αのコンピテントセルに導入し、アンピシリンを含むLB寒天プレートに適量まき、37℃で一晩培養し、形質転換体のコロニーを得た。得られた形質転換体を、アンピシリンを含むLB培地(18mL)で24時間培養し、その培養液から発現プラスミドを改変アルカリSDS法で精製した。
2.組換え遺伝子の発現
大腸菌Rosetta-gami(DE3)(Novagen社製)のコンピテントセルを融解して、ファルコンチューブに0.1mL移した。その中に上記1.の精製発現プラスミドの溶液0.002mLを加え氷中に20分間放置した後、42℃でヒートショックを90秒間行い、氷中に1分間放置した後、クロラムフェニコールとアンピシリンを含むLB寒天プレートに適量まき、37℃で一晩培養し、形質転換体を得た。得られた形質転換体を、アンピシリンを含むLB培地(5mL)で18時間培養し、耐熱性ホスホエノールピルビン酸シンターゼ遺伝子を発現した。培養後、遠心分離(13,000G、10分)で集菌した。集菌した菌体に、破砕液(20mM Tris−HCl、100mM KCl、pH7.5)を0.2mL加え、超音波発生器で細胞を破砕し、その懸濁液を0.1mLずつ2本のサンプルチューブに分けた。一方のサンプルチューブは遠心分離(13,000G、10分)して上清と沈殿に分け、沈殿は破砕液0.1mLで懸濁した。もう一方のサンプルチューブは、熱処理(70℃、10分)を施した後、遠心分離(13,000G、10分)して上清と沈殿に分け、沈殿は破砕液0.1mLで懸濁した。これらの試料の一部をSDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動(PAGE)で分析し、発現を確認できた。この結果を、図1のSDS−PAGE写真に示す。
耐熱性ホスホエノールピルビン酸シンターゼの発現が見られた試料についてSDSポリアクリルアミドゲル電気泳動を行った後、エレクトロブロッティングによりPVDF膜に転写し、染色によって可視化された目的組換えタンパク質である耐熱性ホスホエノールピルビン酸シンターゼのバンドを切り出し、プロテインシーケンサーModel492Procise(Applied Biosystems社製)を用いて、アミノ末端配列を解析した結果、配列番号5に示すように7残基のアミノ末端配列が決定できた。この配列により、発現タンパク質が耐熱性ホスホエノールピルビン酸シンターゼであることを確認できた。このタンパク質は、309アミノ酸残基より構成されており、その推定分子量は34.9kDであり、図1の結果とほぼ一致した。
大腸菌Rosetta-gami(DE3)(Novagen社製)のコンピテントセルを融解して、ファルコンチューブに0.1mL移した。その中に上記1.の精製発現プラスミドの溶液0.002mLを加え氷中に20分間放置した後、42℃でヒートショックを90秒間行い、氷中に1分間放置した後、クロラムフェニコールとアンピシリンを含むLB寒天プレートに適量まき、37℃で一晩培養し、形質転換体を得た。得られた形質転換体を、アンピシリンを含むLB培地(5mL)で18時間培養し、耐熱性ホスホエノールピルビン酸シンターゼ遺伝子を発現した。培養後、遠心分離(13,000G、10分)で集菌した。集菌した菌体に、破砕液(20mM Tris−HCl、100mM KCl、pH7.5)を0.2mL加え、超音波発生器で細胞を破砕し、その懸濁液を0.1mLずつ2本のサンプルチューブに分けた。一方のサンプルチューブは遠心分離(13,000G、10分)して上清と沈殿に分け、沈殿は破砕液0.1mLで懸濁した。もう一方のサンプルチューブは、熱処理(70℃、10分)を施した後、遠心分離(13,000G、10分)して上清と沈殿に分け、沈殿は破砕液0.1mLで懸濁した。これらの試料の一部をSDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動(PAGE)で分析し、発現を確認できた。この結果を、図1のSDS−PAGE写真に示す。
耐熱性ホスホエノールピルビン酸シンターゼの発現が見られた試料についてSDSポリアクリルアミドゲル電気泳動を行った後、エレクトロブロッティングによりPVDF膜に転写し、染色によって可視化された目的組換えタンパク質である耐熱性ホスホエノールピルビン酸シンターゼのバンドを切り出し、プロテインシーケンサーModel492Procise(Applied Biosystems社製)を用いて、アミノ末端配列を解析した結果、配列番号5に示すように7残基のアミノ末端配列が決定できた。この配列により、発現タンパク質が耐熱性ホスホエノールピルビン酸シンターゼであることを確認できた。このタンパク質は、309アミノ酸残基より構成されており、その推定分子量は34.9kDであり、図1の結果とほぼ一致した。
組換え大腸菌の大量培養
実施例2と同様にして調製したプラスミドDNA(pET−11aベクター)を用いて、大腸菌DH5α株を常法に従い形質転換した。形質転換された大腸菌DH5αからアルカリSDS法を用いてプラスミドDNAを抽出した。このプラスミドDNAを用いて、大腸菌ロゼッタ・ガミ(Rosetta−Gami)(DE3)株を形質転換した。プレート上に生えてきたコロニーを3白金耳量とり、5mLのLBL培地(1%ペプトン、0.5%酵母抽出液、0.5%NaCl、0.1%ラクトース、50μg/mLアンピシリン、40μg/mLクロラムフェニコール)に植菌して、培養開始直前まで約6時間、37℃で前培養した。この前培養液を全量、3Lの4×LBL培地(4%ペプトン、2%酵母抽出液、 2%NaCl、50μg/mLアンピシリン)に加え、高密度培養槽(ABLE社製)にて37℃、pH7.2、圧力0.02Paでコンピュータプログラム制御し、培養した。pHは、オートクレーブ済みの2M HCl(和光純薬社製)および2M NaOH(和光純薬社製)で調整した。集菌約25時間前にオートクレーブ済みの300mL発現誘導液(10%ラクトース、20%グリセロール)を加えた。集菌約19時間前に培養温度を30℃とし、以降は30℃とした。大腸菌の生育度が定常期に入ったところ(培養開始41時間後)で大型遠心分離機(Beckman社製、商品名AvantiHP−30I)を用い集菌した。回収した菌体は、−30℃で保存した。この時、菌体を少量、別に取り、150mM NaCl、20mM Tris−HCl(pH8)、5mM β−メルカプトエタノール(和光純薬社製)に溶解・懸濁し、超音波破砕装置(TOMY社製、商品名UD−201)で破砕した。この溶液を2等分し、一方を9100G、4℃で10分間、遠心分離し、上清と沈殿に分け、他方を75℃に設定した恒温槽(TAITEC社製、商品名DryThermoUnit DTU−1C)で10分間、加熱した後、9100G、4℃で10分間、遠心分離し、上清と沈殿に分けた。これら4種の上清および沈殿(沈殿は、菌体破砕液にて再懸濁)に変性剤(62.5mM Tris−HCl(pH6.8)、10%グリセロール、2%SDS、2.4%β−メルカプトエタノール、0.005%ブロムフェノールブルー(和光純薬社製))を加え、95℃で5分間加熱し、変性させた。これらの変性させたタンパク質溶液を12.5%または15%(発現させるタンパク質の分子量により異なる)ポリアクリルアミドゲルに加え、SDS−PAGEにて電気泳動を行った。染色液(和光純薬社製、商品名Quick−CBB)を用い、電気泳動後のゲルを染色・脱色し、目的タンパク質の発現を確認した。
実施例2と同様にして調製したプラスミドDNA(pET−11aベクター)を用いて、大腸菌DH5α株を常法に従い形質転換した。形質転換された大腸菌DH5αからアルカリSDS法を用いてプラスミドDNAを抽出した。このプラスミドDNAを用いて、大腸菌ロゼッタ・ガミ(Rosetta−Gami)(DE3)株を形質転換した。プレート上に生えてきたコロニーを3白金耳量とり、5mLのLBL培地(1%ペプトン、0.5%酵母抽出液、0.5%NaCl、0.1%ラクトース、50μg/mLアンピシリン、40μg/mLクロラムフェニコール)に植菌して、培養開始直前まで約6時間、37℃で前培養した。この前培養液を全量、3Lの4×LBL培地(4%ペプトン、2%酵母抽出液、 2%NaCl、50μg/mLアンピシリン)に加え、高密度培養槽(ABLE社製)にて37℃、pH7.2、圧力0.02Paでコンピュータプログラム制御し、培養した。pHは、オートクレーブ済みの2M HCl(和光純薬社製)および2M NaOH(和光純薬社製)で調整した。集菌約25時間前にオートクレーブ済みの300mL発現誘導液(10%ラクトース、20%グリセロール)を加えた。集菌約19時間前に培養温度を30℃とし、以降は30℃とした。大腸菌の生育度が定常期に入ったところ(培養開始41時間後)で大型遠心分離機(Beckman社製、商品名AvantiHP−30I)を用い集菌した。回収した菌体は、−30℃で保存した。この時、菌体を少量、別に取り、150mM NaCl、20mM Tris−HCl(pH8)、5mM β−メルカプトエタノール(和光純薬社製)に溶解・懸濁し、超音波破砕装置(TOMY社製、商品名UD−201)で破砕した。この溶液を2等分し、一方を9100G、4℃で10分間、遠心分離し、上清と沈殿に分け、他方を75℃に設定した恒温槽(TAITEC社製、商品名DryThermoUnit DTU−1C)で10分間、加熱した後、9100G、4℃で10分間、遠心分離し、上清と沈殿に分けた。これら4種の上清および沈殿(沈殿は、菌体破砕液にて再懸濁)に変性剤(62.5mM Tris−HCl(pH6.8)、10%グリセロール、2%SDS、2.4%β−メルカプトエタノール、0.005%ブロムフェノールブルー(和光純薬社製))を加え、95℃で5分間加熱し、変性させた。これらの変性させたタンパク質溶液を12.5%または15%(発現させるタンパク質の分子量により異なる)ポリアクリルアミドゲルに加え、SDS−PAGEにて電気泳動を行った。染色液(和光純薬社製、商品名Quick−CBB)を用い、電気泳動後のゲルを染色・脱色し、目的タンパク質の発現を確認した。
組換えタンパク質の精製
実施例3において、−30℃で保存してあった菌体を、150mM NaCl、20mM Tris−HCl(pH8)、5mM β−メルカプトエタノールに溶解・懸濁し、超音波破砕装置(TOMY社製、商品名UD−201)で破砕し、75℃に設定した恒温槽(TAITEC社製、商品名DryThermoUnit DTU−1C)で、10分間、加熱した後、すばやく冷却した。次に、この破砕菌体液を大型遠心分離機(Beckman社製、商品名Avanti HP−30I)を用いて、100,000Gで1時間、遠心分離し、上清を回収した。
つぎに、この上清をタンパク質精製装置(Amersham Biosciences社製、AKTATM explorer)を用いて、1.20M 硫安、20mM Tris−HCl(pH8.0)、5mM β−メルカプトエタノールの緩衝溶液に置換した後、疎水交換カラム(Amersham Biosciences社製、RESOURCETMPhe 6mL)に通した。1.2M→0の硫安濃度勾配で溶出させ、各画分をSDS−PAGEにて確認し、目的タンパク質の画分を回収した。
つぎに、回収した画分を、遠心濃縮チューブ(ミリポア社製、VIVASPINTM10000)を用いて遠心分離して濃縮し、タンパク質精製装置(GILSON社製)を用いて、10mM リン酸緩衝溶液(pH7.0)、5mM β−メルカプトエタノール、150mM NaClで平衡化したゲルろ過カラム(東ソー社製、TSKgelTM G2000SW)に通した。溶出してきた各画分をSDS−PAGE電気泳動にて確認し、目的タンパク質の画分を回収した。
つぎに、回収した画分を、20mM Tris−HCl(pH8.0)、5mM β−メルカプトエタノールに置換した後、遠心濃縮チューブ(ミリポア社製、VIVASPINTM 10000)を用いて遠心分離して濃縮し、活性測定に供した。
実施例3において、−30℃で保存してあった菌体を、150mM NaCl、20mM Tris−HCl(pH8)、5mM β−メルカプトエタノールに溶解・懸濁し、超音波破砕装置(TOMY社製、商品名UD−201)で破砕し、75℃に設定した恒温槽(TAITEC社製、商品名DryThermoUnit DTU−1C)で、10分間、加熱した後、すばやく冷却した。次に、この破砕菌体液を大型遠心分離機(Beckman社製、商品名Avanti HP−30I)を用いて、100,000Gで1時間、遠心分離し、上清を回収した。
つぎに、この上清をタンパク質精製装置(Amersham Biosciences社製、AKTATM explorer)を用いて、1.20M 硫安、20mM Tris−HCl(pH8.0)、5mM β−メルカプトエタノールの緩衝溶液に置換した後、疎水交換カラム(Amersham Biosciences社製、RESOURCETMPhe 6mL)に通した。1.2M→0の硫安濃度勾配で溶出させ、各画分をSDS−PAGEにて確認し、目的タンパク質の画分を回収した。
つぎに、回収した画分を、遠心濃縮チューブ(ミリポア社製、VIVASPINTM10000)を用いて遠心分離して濃縮し、タンパク質精製装置(GILSON社製)を用いて、10mM リン酸緩衝溶液(pH7.0)、5mM β−メルカプトエタノール、150mM NaClで平衡化したゲルろ過カラム(東ソー社製、TSKgelTM G2000SW)に通した。溶出してきた各画分をSDS−PAGE電気泳動にて確認し、目的タンパク質の画分を回収した。
つぎに、回収した画分を、20mM Tris−HCl(pH8.0)、5mM β−メルカプトエタノールに置換した後、遠心濃縮チューブ(ミリポア社製、VIVASPINTM 10000)を用いて遠心分離して濃縮し、活性測定に供した。
活性測定
1.測定方法
実施例4において精製したタンパク質は、ホスホエノールピルビン酸シンターゼであり、ホスホエノールピルビン酸シンターゼは、生体内で、ピルビン酸およびATPをホスホエノールピルビン酸、リン酸およびAMPに変換する反応を触媒する酵素である。前記反応を下記に示す。
1.測定方法
実施例4において精製したタンパク質は、ホスホエノールピルビン酸シンターゼであり、ホスホエノールピルビン酸シンターゼは、生体内で、ピルビン酸およびATPをホスホエノールピルビン酸、リン酸およびAMPに変換する反応を触媒する酵素である。前記反応を下記に示す。
前記実施例4において精製したタンパク質について、下記の種々条件下で、その活性を測定した。この活性測定は、つぎの通りである。すなわち、まず、10mMのMgCl2、200μMのKCl、10mMのピルビン酸(SIGMA社製)、102μMの前記実施例4において精製したタンパク質を含む緩衝溶液(278μL、後述のとおり、各測定によって種類が異なる)を10分間、後述の各反応温度で保温した。ついで、終濃度が4mMになるようにATP(Sigma社製)を添加し、反応を開始した(最終体積290μL)。つぎに、0.5mMのEDTAを10μL添加することにより反応を停止させ、リン酸の定量を行うための呈色試薬Ames mixture(10%L−アスコルビン酸(和光純薬社製)水溶液と0.42%(NH4)6Mo7O24・4H2O(ナカライテスク社製)の1N硫酸水溶液とを1:6で混合した試薬)を700μL加えた。この溶液を45℃で20分間熱処理後、イオン交換水で4倍に希釈し、820nmの吸収の変化を分光光度計(HITACHI社製、商品名U−3300)で追跡することで、反応の進行度(前記実施例4において精製したタンパク質の活性に対応する)を観測した。進行度の指標として見かけの速度定数kappを用いた。各測定値は、前記実施例4において精製したタンパク質を加えずに前記測定を行ったコントロール実験結果を差し引いた値である。
2.至適pH
pH6.0、6.3、6.8、7.4、8.0、8.5、9.5、10.0の各条件で、前記測定を行い、kappを求めた。緩衝溶液には、pH6.0〜6.8までは、50mMのTrisを、pH7.4〜8.0までは、CHES(N−Cyclohexyl−2−aminoethanesulfonic acid、(株)同仁化学研究所製)、を、pH8.5〜10.0までは、CAPS(N−Cyclohexyl−3−aminopropanesulfonic acid、(株)同仁化学研究所製)を用いた。反応温度は、85℃とした。測定結果を、下記表1および図2のグラフに示す。図示のとおり、pH9付近で最も高い活性が認められ、至適pHが9程度であることが分かった。
pH6.0、6.3、6.8、7.4、8.0、8.5、9.5、10.0の各条件で、前記測定を行い、kappを求めた。緩衝溶液には、pH6.0〜6.8までは、50mMのTrisを、pH7.4〜8.0までは、CHES(N−Cyclohexyl−2−aminoethanesulfonic acid、(株)同仁化学研究所製)、を、pH8.5〜10.0までは、CAPS(N−Cyclohexyl−3−aminopropanesulfonic acid、(株)同仁化学研究所製)を用いた。反応温度は、85℃とした。測定結果を、下記表1および図2のグラフに示す。図示のとおり、pH9付近で最も高い活性が認められ、至適pHが9程度であることが分かった。
(表1)
pH k app (s -1 )
6.0 0
6.3 0
6.8 0.00940
7.4 0.00588
8.0 0.0484
8.5 0.0812
9.5 0.124
10.0 0.0106
pH k app (s -1 )
6.0 0
6.3 0
6.8 0.00940
7.4 0.00588
8.0 0.0484
8.5 0.0812
9.5 0.124
10.0 0.0106
3.至適温度
25、45、70、85、90℃の各温度において、前記測定を行い、kappを求めた。緩衝溶液には、CAPS(85℃でpH9.5)を用いた。測定結果を、下記表2および図3のグラフに示す。図示のとおり、70〜85℃において特に高い活性を示した。
25、45、70、85、90℃の各温度において、前記測定を行い、kappを求めた。緩衝溶液には、CAPS(85℃でpH9.5)を用いた。測定結果を、下記表2および図3のグラフに示す。図示のとおり、70〜85℃において特に高い活性を示した。
(表2)
温度(℃) k app (s -1 )
25 0
45 0.00310
70 0.136
85 0.124
95 0.0310
温度(℃) k app (s -1 )
25 0
45 0.00310
70 0.136
85 0.124
95 0.0310
本発明により、ホスホエノールピルビン酸シンターゼ活性を有する新規耐熱性タンパク質が提供できる。本発明のタンパク質は、高温下で使用することが可能であり、工業的用途が広がると共に、基質濃度の増加、反応効率の向上、混入微生物の除去、保存期間および耐用期間の延長などの多くの利点がもたらされる。
配列番号1:耐熱性ホスホエノールピルビン酸シンターゼのアミノ酸配列
配列番号2:耐熱性ホスホエノールピルビン酸シンターゼのアミノ酸配列をコードする塩基配列
配列番号3:耐熱性ホスホエノールピルビン酸シンターゼの構造遺伝子の末端に制限酵素部位NdeIおよびBamHI、NotIを導入するための順方向プライマー
配列番号4:耐熱性ホスホエノールピルビン酸シンターゼの構造遺伝子の末端に制限酵素部位NdeIおよびBamHI、NotIを導入するための逆方向プライマー
配列番号5:N末端アミノ酸配列
配列番号2:耐熱性ホスホエノールピルビン酸シンターゼのアミノ酸配列をコードする塩基配列
配列番号3:耐熱性ホスホエノールピルビン酸シンターゼの構造遺伝子の末端に制限酵素部位NdeIおよびBamHI、NotIを導入するための順方向プライマー
配列番号4:耐熱性ホスホエノールピルビン酸シンターゼの構造遺伝子の末端に制限酵素部位NdeIおよびBamHI、NotIを導入するための逆方向プライマー
配列番号5:N末端アミノ酸配列
Claims (9)
- 下記の(a)または(b)の耐熱性タンパク質
(a) 配列番号1のアミノ酸配列からなる耐熱性タンパク質。
(b) 配列番号1のアミノ酸配列において、1つ若しくは数個のアミノ酸残基が、欠失、置換、付加若しくは挿入されたアミノ酸配列からなり、ホスホエノールピルビン酸シンターゼ活性を有する耐熱性タンパク質。 - 前記ホスホエノールピルビン酸シンターゼ活性が、水およびATPの存在下にピルビン酸に作用して、ホスホエノールピルビン酸およびAMPを生成する機能である請求項1記載のタンパク質。
- 超好熱性古細菌由来である請求項1または2記載のタンパク質。
- 超好熱性古細菌が、スルホロブス・トコダイイ(Sulfolobus tokodaii)(JCM10545)である請求項3記載のタンパク質。
- 請求項1から4のいずれかに記載のタンパク質をコードするDNAまたは配列番号2に記載のDNAを含むベクター。
- 請求項5記載のベクターにより形質転換された形質転換体。
- 請求項1から4のいずれかに記載のタンパク質の製造方法であって、請求項6記載の形質転換体を培養する工程と、前記培養工程において発現した前記タンパク質を回収する工程とを含む製造方法。
- 酵素反応により、ピルビン酸およびATPからホスホエノールピルビン酸およびAMPを製造する方法であって、前記酵素として請求項1から4のいずれかに記載のタンパク質を用い、温度70〜85℃の条件で前記酵素反応を行う製造方法。
- 前記酵素反応のpHが、pH8.5〜9.5の範囲である請求項8記載の製造方法。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2005080336A JP2005296012A (ja) | 2004-03-19 | 2005-03-18 | ホスホエノールピルビン酸シンターゼ活性を有する新規耐熱性タンパク質 |
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2004080859 | 2004-03-19 | ||
JP2005080336A JP2005296012A (ja) | 2004-03-19 | 2005-03-18 | ホスホエノールピルビン酸シンターゼ活性を有する新規耐熱性タンパク質 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2005296012A true JP2005296012A (ja) | 2005-10-27 |
Family
ID=35328303
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
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JP2005080336A Withdrawn JP2005296012A (ja) | 2004-03-19 | 2005-03-18 | ホスホエノールピルビン酸シンターゼ活性を有する新規耐熱性タンパク質 |
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-
2005
- 2005-03-18 JP JP2005080336A patent/JP2005296012A/ja not_active Withdrawn
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Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A300 | Withdrawal of application because of no request for examination |
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