JP2005214728A - 蛍光検出装置、濃淡情報補正方法、濃淡情報補正プログラムおよび走査型共焦点レーザ顕微鏡 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】 試料に対してレーザビームを2次元走査して任意の波長域の濃淡情報を取得する濃淡情報取得手段と、上記濃淡情報取得手段を用い第1の2次元走査によって取得した第1の濃淡情報と、上記濃淡情報取得手段を用い上記第1の2次元走査と同一波長域での第2の2次元走査によって取得した第2の濃淡情報と、波長域毎に予め定められた色素に固有の色素固有濃淡情報とに基づいて、褪色量を算出する褪色量算出手段と、上記褪色量算出手段によって算出した褪色量に基づいて、上記濃淡情報取得手段によって取得した濃淡情報を補正する濃淡情報補正手段とを備えたことを特徴とする。
【選択図】 図1
Description
まず、観察対象である試料を蛍光指示薬で染色する。次に、励起光(レーザビーム)を蛍光染色した試料に照射し、試料からの蛍光を走査型共焦点レーザ顕微鏡等の蛍光検出装置により検出する。そして、検出した蛍光の二次元の輝度情報を画像化し、ディスプレイ装置などに輝度の二次元分布として表示することにより試料の蛍光像を観察する。
このような褪色は、レーザビームが試料に照射されていることにより起こるので、試料に照射するレーザビームの照射時間を短くすることにより、褪色を引き起こしにくくしている走査型共焦点レーザ顕微鏡の技術が開示されている(例えば、特許文献1参照。)。
本発明は、上記従来技術の欠点に鑑みてなされたもので、試料を染色している蛍光色素の褪色による濃淡情報(輝度情報)の劣化を補正することが可能な蛍光検出装置、濃淡情報補正方法、濃淡情報補正プログラムおよび走査型共焦点レーザ顕微鏡を提供することを目的とする。
すなわち、本発明の一態様によれば、本発明の蛍光検出装置は、試料をレーザビームで2次元走査して得られる濃淡情報から試料画像を形成する蛍光検出装置であって、上記試料に対してレーザビームを2次元走査して任意の波長域の濃淡情報を取得する濃淡情報取得手段と、上記濃淡情報取得手段を用い第1の2次元走査によって取得した第1の濃淡情報と、上記濃淡情報取得手段を用い上記第1の2次元走査と同一波長域での第2の2次元走査によって取得した第2の濃淡情報と、波長域毎に予め定められた色素に固有の色素固有濃淡情報とに基づいて、褪色量を算出する褪色量算出手段と、上記褪色量算出手段によって算出した褪色量に基づいて、上記濃淡情報取得手段によって取得した濃淡情報を補正する濃淡情報補正手段とを備えたことを特徴とする。
また、本発明の蛍光検出装置は、上記褪色量算出手段が、上記第1の濃淡情報と上記第2の濃淡情報との差に、上記任意の波長域における色素固有濃淡情報に対する上記濃淡情報補正手段によって補正する対象である濃淡情報の比を乗じることにより、波長域毎の上記褪色量を算出し、上記濃淡情報補正手段が、上記濃淡情報補正手段によって補正する対象である濃淡情報に上記波長域毎の褪色量を加算することにより補正することが望ましい。
また、本発明の蛍光検出装置は、上記褪色量算出手段が、上記第1の濃淡情報と上記第2の濃淡情報との差に、上記任意の波長域における色素固有濃淡情報に対する上記濃淡情報補正手段によって補正する対象である濃淡情報の比を乗じることにより、波長域毎の上記褪色量を算出し、上記濃淡情報補正手段が、上記濃淡情報補正手段によって補正する対象である濃淡情報に上記波長域毎の褪色量を加算することにより補正することが望ましい。
図1は、本発明を適用した蛍光検出装置の機能ブロック図である。
図1において、蛍光検出装置100は、蛍光染色した試料をレーザビームで2次元走査することにより輝度情報等の濃淡情報を得て、その濃淡情報から試料画像を形成する走査型共焦点レーザ顕微鏡等であり、濃淡情報取得手段101、褪色量算出手段104および濃淡情報補正手段105を備える。
褪色量算出手段104は、上記濃淡情報取得手段101を用い第1の2次元走査によって取得し濃淡情報格納手段102に格納した第1の濃淡情報と、上記濃淡情報取得手段101を用い上記第1の2次元走査と同一波長域での第2の2次元走査によって取得し濃淡情報格納手段102に格納した第2の濃淡情報と、色素固有濃淡情報格納手段103に格納され波長域毎に予め定められた色素に固有の色素固有濃淡情報とに基づいて、褪色量を算出する。
上記第1の2次元走査を行う試料と上記第2の2次元走査を行う試料とは同一である。
まず、ステップS100において、蛍光染色した試料をレーザビームで2次元走査することにより輝度情報等の濃淡情報を取得する。そして、ステップS101において、濃淡情報の取得が終了したか否かを判断する。例えば、予め定めた所定回数の2次元走査が終了したか否か、波長域を少しずつずらしながら2次元走査する場合に、予め定めた波長域の濃淡情報の取得が終了したか否か、予め定めた所定時間が終了したか否か等により、濃淡情報の取得が終了したか否かを判断する。
そして、ステップS103において、ステップS102で算出した褪色量に基づいて、濃淡情報を補正する。この補正対象である濃淡情報は、ステップS100で取得し褪色量の算出のもととなった濃淡情報でもよいが、別に2次元走査することにより取得した濃淡情報であってもよい。
レーザ光源1から照射されるレーザ光は、共焦点用スキャナ2によってX−Y平面方向に振られ、対物レンズ3を通り、ステージ4上の試料面を走査する。なお、共焦点用スキャナはPC8が有するCPU81により制御される。
以上のように構成した走査型共焦点レーザ顕微鏡で、画像を取得するための条件を入力すると、スキャン画像を取得することができる。
図4は、試料とスキャン領域との関係を説明するための図である。
まず、試料に外接する長方形領域であるスキャン領域をレーザビームでスキャンし、得られる蛍光から波長域[λs,λs+λst)の蛍光を分光光学系5により取り出し画像化する。次に、スキャン領域をレーザビームでスキャンし、波長域[λs+λst,λs+2λst)の蛍光を分光光学系5により取り出し画像化する。このようにスキャン領域をレーザビームで繰り返しスキャンし、得られる蛍光から画像化する波長域をλstずつずらして画像化していく。すなわちi回目のスキャンが終了したときには、波長域[λs+(i−1)λst,λs+iλst)の常光を画像化する。なお、すべてのスキャンが終了するのはλs+iλst>λeとなるスキャン時である。ここで波長域[λs,λs+λst)は、λs以上λs+λst未満の波長域をあらわす。
この条件で試料をスキャンすると、図5に示したように合計4枚の画像が取得できる。
次に、本発明の第1の実施の形態を適用した濃淡情報補正処理について詳細に説明する。
ステップS1において、入力装置12を用いて画像取得条件を入力する。画像取得条件として、たとえばλs=400nm、λe=600nm、λst=50nmと入力する。
ステップS3でスキャンが終了したらステップS6において、スキャン領域をスキャンし検出した蛍光から波長域[λs,λs+λst)の蛍光を画像化する。このステップS6で画像化した画像は、ステップS4のスキャン回数i=1の時に画像化した画像と同じ波長域の蛍光を含んだ画像である。
α[λs,λs+λst)(i)={(Istart−Iend)/(Nend−Nstart)}・(i−1)・・・式(1)
ただし、式(1)は褪色量がスキャン回数に対して線形であるとしている。
α[λs+(i−1)λst,λs+iλst)(i)=α[λs,λs+λs)(i)・(S[λs+(i−1)λst,λs+iλst)/S[λs,λs+λst))・・・式(2)
この式(2)は、蛍光スペクトルデータを用いて式(1)を波長域[λs,λs+λst)以外の波長域のスキャン回数と褪色量の関係に変換している式である。
ステップS9において、ステップS8で記憶した値を用いてステップS4で画像化した画像の輝度値を式(3)で補正する。
ConpensationI[λs+(i−1)λst,λs+iλst)(p,q)=I[λs+(i−1)λst,λs+Iλst)(p,q)+α[λs+(i−1)λst,λs+iλst)(i)・・・式(3)
ここで式(3)で用いる記号は次のように定義する。
i:スキャン回数(ステップS4で画像化した画像の枚数)。
p:画像の横幅のインデックス。1≦p≦画像の縦幅のピクセル数。
q:画像の縦幅のインデックス。1≦q≦画像の横幅のピクセル数。
I[λs+(i−l)λst,λs−iλst)(p,q):波長域[λs+(i−1)λst,λs+iλst)の蛍光からなる画像の縦p,横qピクセルの輝度値(図9参照)。
ConpensationI[λs+(i−1)λst,λs+iλst)(p,q):I[λs+(i−1)λst,λs+iλst)(p,q)に対して褪色量を補正した輝度値。
図10は、本発明の第2の実施の形態を適用した走査型共焦点レーザ顕微鏡の構成例を示す図である。
PC8内の記録媒体82は、褪色量補正プログラム92を記憶している。またPC8は、褪色量補正プログラム92で使用する輝度値記憶領域88、褪色量記憶領域87を有する。これ以外は全て図3を用いて説明した第1の実施の形態と同様である。
ステップS11において、スキャン対象の試料(試料A)と同じ試料(試料B:標準サンプル)を用意する(図12参照)。
ステップS13において、T> Tlかどうかを判断する。ここでTlとは、試料Aをスキャン開始波長λsからスキャン終了波長λeまでスキャンするのに要する時間である(図13参照)。そして、もしT>TlならばステップS15に進む。T≦T1ならばS14に進む。
ステップS13でスキャンが終了したら、ステップS16において、 PC8内の蛍光スペクトル記録領域83に保存されている蛍光スペクトルデータと、ステップS14で取得したデータの組から波長域[λs+(i−1)λst,λs+iλst)における褪色量を算出し、褪色量記憶領域87に保存する。
β[λs,λs+λst)(i)=F(T1)−F(Ti)・・・式(4)
次に式(4)および、PC8内の蛍光スペクトル記憶領域83に記憶されている蛍光スペクトルデータを用いて、波長域[λs+(i−1)λst,λs+iλst)における褪色量を式(5)で求め、スキャン回数に対するβの値を褪色量記憶領域87に記録する。
β[λs+(i−1)λst,λs+iλst)(i)=β[λs,λs+iλst)(Ti)・{S[λs+(i−1)λst,λs+iλst)/S[λs,λs+iλst)}・・・式(5)
ステップS17において、試料Aに対する画像取得条件を入力する。
ステップS22において、ステップS20でスキャンした画像の輝度値を式(6)で補正する。
ConpensationI[λS+(i−1)λst,λs+iλst)(p,q)=I[λs+(i−1)λst,λs+Iλst)(p,q)+β[λs+(i−1)λst,λs+iλst)(i)・・・式(6)
ステップS20で画像化したすべての画像について上記補間を行うと、褪色を補正した画像が得られる。
また、ステップS14で、Δtは試料Aを1回スキャンするのに要する時間としているが、Δtを1回のスキャン時間とは無関係に任意に設定しデータを取り込んでもよい。ただし取り込むデータは二つ以上になるようにΔt設定する。取り込むデータの数が少ない場合、ステップS16の式(4)で用いるF(Ti)は、取り込んだデータを補間(線形補間、スプライン補間等)した値を用いてもよい。
すなわち、本発明が適用される蛍光検出装置は、その機能が実行されるのであれば、上述の実施の形態に限定されることはなく、本発明の要旨を逸脱しない範囲内で種々の構成または形状を取ることができる。
2 共焦点用スキャナ
3 対物レンズ
4 ステージ
5 分光光学系
6 光検出器
7 A/D変換器
8 PC
10 フレームメモリ
11 出力装置
12 入力装置
81 CPU
82 記録媒体
83 蛍光スペクトル記憶領域
84 代表輝度値記憶領域
85、87 褪色量記憶領域
86 輝度値記憶領域
91、92 褪色量補正プログラム
100 蛍光検出装置
101 濃淡情報取得手段
102 濃淡情報格納手段
103 色素固有濃淡情報格納手段
104 褪色量算出手段
105 濃淡情報補正手段
Claims (10)
- 試料をレーザビームで2次元走査して得られる濃淡情報から試料画像を形成する蛍光検出装置において、
前記試料に対してレーザビームを2次元走査して任意の波長域の濃淡情報を取得する濃淡情報取得手段と、
前記濃淡情報取得手段を用い第1の2次元走査によって取得した第1の濃淡情報と、前記濃淡情報取得手段を用い前記第1の2次元走査と同一波長域での第2の2次元走査によって取得した第2の濃淡情報と、波長域毎に予め定められた色素に固有の色素固有濃淡情報とに基づいて、褪色量を算出する褪色量算出手段と、
前記褪色量算出手段によって算出した褪色量に基づいて、前記濃淡情報取得手段によって取得した濃淡情報を補正する濃淡情報補正手段と、
を備えたことを特徴とする蛍光検出装置。 - 前記濃淡情報補正手段によって補正する対象である濃淡情報が取得された試料は、前記第1の2次元走査および前記第2の2次元走査を行う試料と同一であることを特徴とする請求項1に記載の蛍光検出装置。
- 前記褪色量算出手段は、前記第1の濃淡情報と前記第2の濃淡情報との差に、前記任意の波長域における色素固有濃淡情報に対する前記濃淡情報補正手段によって補正する対象である濃淡情報の比を乗じることにより、波長域毎の前記褪色量を算出し、
前記濃淡情報補正手段は、前記濃淡情報補正手段によって補正する対象である濃淡情報に前記波長域毎の褪色量を加算することにより補正することを特徴とする請求項2に記載の蛍光検出装置。 - 前記第1の2次元走査を行う試料と前記第2の2次元走査を行う試料とは同一であり、前記濃淡情報補正手段によって補正する対象である濃淡情報が取得された試料は、前記第1の2次元走査および前記第2の2次元走査を行う試料と異なることを特徴とする請求項1に記載の蛍光検出装置。
- 前記第1の2次元走査と前記第2の2次元走査とは、所定の時間間隔で行うことを特徴とする請求項4に記載の蛍光検出装置。
- 前記褪色量算出手段は、前記第1の濃淡情報と前記第2の濃淡情報との差に、前記任意の波長域における色素固有濃淡情報に対する前記濃淡情報補正手段によって補正する対象である濃淡情報の比を乗じることにより、波長域毎の前記褪色量を算出し、
前記濃淡情報補正手段は、前記濃淡情報補正手段によって補正する対象である濃淡情報に前記波長域毎の褪色量を加算することにより補正することを特徴とする請求項5に記載の蛍光検出装置。 - 蛍光染色した試料をレーザビームで2次元走査して得られる輝度情報から試料画像を形成する走査型共焦点レーザ顕微鏡において、
前記試料に対してレーザビームを2次元走査して任意の波長域の輝度情報を取得する輝度情報取得手段と、
前記輝度情報取得手段を用い第1の2次元走査によって取得した第1の輝度情報と、前記輝度情報取得手段を用い前記第1の2次元走査と同一の試料に対して同一波長域での第2の2次元走査によって取得した第2の輝度情報との差に、前記任意の波長域における波長域毎に予め定められた色素に固有の色素固有輝度情報に対する前記輝度情報補正手段によって補正する対象である輝度情報の比を乗じることにより、波長域毎の褪色量を算出する褪色量算出手段と、
前記輝度情報補正手段によって補正する対象である輝度情報に前記波長域毎の褪色量を加算することにより、前記輝度情報取得手段によって取得した輝度情報を補正する輝度情報補正手段と、
を備えたことを特徴とする走査型共焦点レーザ顕微鏡。 - 蛍光染色した試料をレーザビームで2次元走査して得られる輝度情報から試料画像を形成する走査型共焦点レーザ顕微鏡において、
前記試料に対してレーザビームを2次元走査して任意の波長域の輝度情報を取得する輝度情報取得手段と、
前記輝度情報取得手段を用い第1の2次元走査によって取得した第1の輝度情報と、前記輝度情報取得手段を用い前記第1の2次元走査と同一の試料に対して同一波長域で前記第1の2次元走査と所定の時間間隔で行われた第2の2次元走査によって取得した第2の輝度情報との差に、前記任意の波長域における波長域毎に予め定められた色素に固有の色素固有輝度情報に対する前記輝度情報補正手段によって補正する対象である輝度情報の比を乗じることにより、波長域毎の褪色量を算出する褪色量算出手段と、
前記輝度情報補正手段によって補正する対象である輝度情報に前記波長域毎の褪色量を加算することにより、前記輝度情報取得手段によって取得した前記第1の2次元走査および前記第2の2次元走査を行う試料とは異なる試料の輝度情報を補正する輝度情報補正手段と、
を備えたことを特徴とする走査型共焦点レーザ顕微鏡。 - 試料をレーザビームで2次元走査して得られる濃淡情報から試料画像を形成するコンピュータが実行する濃淡情報補正方法であって、
前記試料に対してレーザビームを2次元走査して任意の波長域の濃淡情報を取得し、
第1の2次元走査によって取得した第1の濃淡情報と、前記第1の2次元走査と同一波長域での第2の2次元走査によって取得した第2の濃淡情報と、波長域毎に予め定められた色素に固有の色素固有濃淡情報とに基づいて、褪色量を算出し、
前記算出した褪色量に基づいて、前記取得した濃淡情報を補正することを特徴とする濃淡情報補正方法。 - 試料をレーザビームで2次元走査して得られる濃淡情報から試料画像を形成するコンピュータに対して、
前記試料に対してレーザビームを2次元走査して任意の波長域の濃淡情報を取得する手順と、
前記濃淡情報を取得する手順での第1の2次元走査によって取得した第1の濃淡情報と、前記濃淡情報を取得する手順での第1の2次元走査と同一波長域での第2の2次元走査によって取得した第2の濃淡情報と、波長域毎に予め定められた色素に固有の色素固有濃淡情報とに基づいて、褪色量を算出する手順と、
前記褪色量を算出する手順によって算出した褪色量に基づいて、前記濃淡情報を取得する手順によって取得した濃淡情報を補正する手順と、
を実行させるための濃淡情報補正プログラム。
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