JPWO2020022038A1 - 情報処理装置、情報処理方法、情報処理システム、およびプログラム - Google Patents
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Abstract
Description
1.概要
2.構成例
3.処理の流れの例
4.実施例
5.蛍光飽和に関する補正
6.ハードウェア構成例
7.備考
8.まとめ
まず、本開示の概要について説明する。
上記では本開示の概要について説明した。続いて、図1を参照して、本開示の一実施形態に係る情報処理システムの構成例について説明する。
蛍光染色試薬10は、標本20の染色に使用される薬品である。蛍光染色試薬10は、例えば、蛍光抗体、蛍光プローブ、または核染色試薬などであるが、蛍光染色試薬10の種類はこれらに特に限定されない。また、蛍光染色試薬10は、蛍光染色試薬10(および蛍光染色試薬10の製造ロット)を識別可能な識別情報(以降「試薬識別情報11」と呼称する)を付されて管理される。試薬識別情報11は、例えばバーコード情報など(一次元バーコード情報や二次元バーコード情報など)であるが、これに限定されない。蛍光染色試薬10は、同一(同種類)の製品であっても、製造方法や抗体が取得された細胞などに応じて製造ロット毎にその性質が異なる。例えば、蛍光染色試薬10において、褪色係数や蛍光標識率(「F/P値:Fluorescein/Protein」とも呼称される。抗体を標識する蛍光分子数を指す)などが異なる。そこで、本実施形態に係る情報処理システムにおいて、蛍光染色試薬10は、試薬識別情報11を付されることによって製造ロット毎に管理される(換言すると、各蛍光染色試薬10の試薬情報は製造ロット毎に管理される)。これによって、情報処理装置100は、製造ロット毎に現れる僅かな性質の違いも考慮した上で各種処理を行うことができる。なお、蛍光染色試薬10が製造ロット単位で管理されることはあくまで一例であり、蛍光染色試薬10は製造ロットよりも細かい単位で管理されてもよい。
標本20は、人体から採取された検体または組織サンプルから病理診断などを目的に作製されたものである。標本20について、使用される組織(例えば臓器など)の種類、対象となる疾病の種類、対象者の属性(例えば、年齢、性別、血液型、または人種など)、または対象者の生活習慣(例えば、食生活、運動習慣、または喫煙習慣など)は特に限定されない。標本20は、使用される組織の種類、対象となる疾病の種類、対象者の属性、または対象者の生活習慣などに応じてその性質が異なるため、標本20は、各標本20を識別可能な識別情報を付されて管理されてもよい。
蛍光染色標本30は、標本20が蛍光染色試薬10によって染色されることで作成されたものである。本実施形態において、蛍光染色標本30は、標本20が少なくとも一つの蛍光染色試薬10によって染色されることを想定しているところ、染色に用いられる蛍光染色試薬10の数は特に限定されない。また、染色方法は、標本20および蛍光染色試薬10それぞれの組み合わせなどによって決まり、特に限定されるものではない。蛍光染色標本30は、情報処理装置100に対して入力され、撮像される。
情報処理装置100は、図1に示すように、取得部110と、保存部120と、処理部130と、表示部140と、制御部150と、操作部160と、を備える。
取得部110は、情報処理装置100の各種処理に使用される情報を取得する構成である。図1に示すように、取得部110は、情報取得部111と、画像取得部112と、を備える。
情報取得部111は、試薬情報などの各種情報を取得する構成である。より具体的には、情報取得部111は、蛍光染色標本30の生成に使用された蛍光染色試薬10に付された試薬識別情報11を取得する。例えば、情報取得部111は、バーコードリーダーなどを用いて試薬識別情報11を取得する。そして、情報取得部111は、試薬識別情報11に基づいて試薬情報をデータベース200から取得する。また、情報取得部111は、別途実測された励起パワー密度も取得する(励起パワー密度を実測する主体は特に限定されない)。なお、情報取得部111が取得する情報はこれらに限定されない。情報取得部111は、取得したこれらの情報を後述する情報保存部121に保存する。
画像取得部112は、蛍光染色標本30(蛍光染色試薬10で染色された標本20)の撮像画像情報を取得する構成である。より具体的には、画像取得部112は、任意の撮像素子(例えば、CCDやCMOSなど)を備えており、当該撮像素子を用いて蛍光染色標本30を撮像することで撮像画像情報を取得する。「撮像画像情報」とは、蛍光染色標本30の撮像画像自体、および像として視覚化されていない測定値など(例えば、輝度の測定値など)を含む概念である。画像取得部112は、撮像画像情報を後述する画像情報保存部122に保存する。
保存部120は、情報処理装置100の各種処理に使用される情報、または各種処理によって出力された情報を保存(記憶)する構成である。図1に示すように、保存部120は、情報保存部121と、画像情報保存部122と、を備える。
情報保存部121は、情報取得部111によって取得された試薬情報など(上記のとおり、褪色係数、吸収断面積(またはモル吸光係数)、量子収率、および蛍光標識率など)の各種情報を保存する構成である。なお、後述する補正部131による褪色補正処理、算出部132による蛍光分子数(または蛍光分子に結合している抗体数)の算出処理、および画像生成部133による画像生成処理などが終了した後には、情報保存部121は、処理に用いられたこれらの情報を削除することで空き容量を増やしてもよい。
画像情報保存部122は、画像取得部112によって取得された蛍光染色標本30の撮像画像情報を保存(記憶)する構成である。なお、情報保存部121と同様に、補正部131による褪色補正処理、算出部132による蛍光分子数(または蛍光分子に結合している抗体数)の算出処理、および画像生成部133による画像生成処理などが終了した後には、画像情報保存部122は、処理に用いられた撮像画像情報を削除することで空き容量を増やしてもよい。
処理部130は、撮像画像情報、試薬情報(上記のとおり、褪色係数、吸収断面積(またはモル吸光係数)、量子収率、および蛍光標識率など)、および励起パワー密度などの情報を用いて各種処理を行う機能構成である。図1に示すように、処理部130は、補正部131と、算出部132と、画像生成部133と、を備える。
補正部131は、撮像画像情報の褪色補正処理を行う構成である。より具体的には、補正部131は、褪色係数、吸収断面積、および励起パワー密度などを用いて、撮像画像情報における輝度を褪色前の輝度に補正する。補正部131によって行われる褪色補正処理については後段にて詳述する。
算出部132は、補正部131によって補正された撮像画像情報の輝度を用いて、撮像画像情報における蛍光分子に対応する情報(例えば、蛍光分子数または抗体数など)を算出する構成である。より具体的には、算出部132は、吸収断面積、量子収率、蛍光標識率、および励起パワー密度などを用いて、補正後の画素毎の輝度を蛍光分子数や抗体数へ変換する。算出部132によって行われる蛍光分子数や抗体数の算出処理については後段にて詳述する。
画像生成部133は、算出部132によって算出された蛍光分子に対応する情報(例えば、蛍光分子数または抗体数など)に基づいて画像情報を生成する構成である。「画像情報」とは、上記で説明した撮像画像情報と同様に、画像自体、および像として視覚化されていない数値など(例えば、蛍光分子数または抗体数など)を含む概念である。画像生成部133によって行われる画像情報の生成処理については後段にて詳述する。
表示部140は、画像生成部133によって生成された画像情報(蛍光分子に対応する情報に基づいて生成された画像情報)をディスプレイに表示することでユーザへ提示する構成である。なお、表示部140として用いられるディスプレイの種類は特に限定されない。また、本実施形態では詳細に説明しないが、画像生成部133によって生成された画像情報がプロジェクターによって投影されたり、プリンターによってプリントされたりすることでユーザへ提示されてもよい(換言すると、画像情報の出力方法は特に限定されない)。
制御部150は、情報処理装置100が行う処理全般を統括的に制御する構成である。例えば、制御部150は、操作部160を介して行われるユーザによる操作入力に基づいて、上記で説明したような各種処理(例えば、蛍光染色標本30の撮像処理、褪色補正処理、蛍光分子数(または蛍光分子に結合している抗体数)の算出処理、画像情報の生成処理、および画像情報の表示処理など)の開始や終了などを制御する。なお、制御部150の制御内容はこれらの処理に限定されない。例えば、制御部150は、汎用コンピュータ、PC、タブレットPCなどにおいて一般的に行われる処理(例えば、OS(Operating System)に関する処理)を制御してもよい。
操作部160は、ユーザからの操作入力を受ける構成である。より具体的には、操作部160は、キーボード、マウス、ボタン、タッチパネル、またはマイクロホンなどの各種入力手段を備えており、ユーザはこれらの入力手段を操作することで情報処理装置100に対して様々な入力を行うことができる。操作部160を介して行われた操作入力に関する情報は制御部150へ提供される。
データベース200は、蛍光染色試薬10に関する褪色係数、吸収断面積(またはモル吸光係数)、量子収率、および蛍光標識率などの情報を管理する装置である。より具体的に説明すると、データベース200は、試薬識別情報11と、褪色係数、吸収断面積(またはモル吸光係数)、量子収率、および蛍光標識率などの情報を紐づけて管理する。これによって、情報取得部111は、蛍光染色試薬10の試薬識別情報11に基づいてこれらの情報をデータベース200から取得することができる。なお、データベース200は、標本20を識別可能な識別情報を用いて標本20に関する各種情報を管理してもよい。また、データベース200は、実測された励起パワー密度などを含む他の情報も併せて管理してもよい。
上記では、本実施形態に係る情報処理システムの構成例について説明した。続いて、本実施形態に係る情報処理システムにおける処理の流れの例について説明する。
まず、図2を参照して、蛍光分子数(または蛍光分子に結合している抗体数)の算出処理全体の流れの例について説明する。
続いて、図2のステップS1016にて行われる褪色補正処理について詳細に説明する。
続いて、図2のステップS1020にて行われる、画素毎の輝度のフォトン数への変換処理について詳細に説明する。
続いて、図2のステップS1024にて行われる、画素毎のフォトン数の蛍光分子数または抗体数への変換処理について詳細に説明する。まず、フォトン数の蛍光分子数への変換処理について説明する。
続いて、図2のステップS1028にて行われる、蛍光分子数または蛍光分子に結合している抗体数が反映された画像情報の生成処理について説明する。
上記のとおり、本実施形態においては、褪色係数の測定が蛍光分子数などの測定とは別に行われ、蛍光分子数などの測定時には図2のステップS1012にて、蛍光物質の褪色係数がデータベース200から取得されることを想定している。そこで続いて、図5を参照して、褪色係数の測定処理を詳細に説明する。図5には一例として、蛍光顕微鏡の外部ポートに撮像素子(CMOSなど)が装着されることで蛍光物質PEの撮像画像情報が取得され、当該撮像画像情報が用いられる場合の褪色係数の測定処理を示すフローチャートが示されている。なお、褪色係数の測定を行う機能構成は特に限定されないが、以降では、情報処理装置100の算出部132が褪色係数の測定を行うことを想定して説明を行う。
本実施形態においては、褪色係数と同様に量子収率の測定が蛍光分子数などの測定とは別に行われ、蛍光分子数などの測定時には図2のステップS1012にて、蛍光物質の量子収率がデータベース200から取得されることを想定している(なお、これに限定されず、量子収率の測定と蛍光分子数などの測定とが一度に行われてもよい)。
上記では、本実施形態に係る情報処理システムにおける処理の流れの例について説明した。続いて、上記で説明してきた方法を用いて蛍光分子数および抗体数を算出する実施例を説明する。より具体的には、乳癌組織のER(エストロゲン)を、蛍光物質AF647(AlexaFluor 647)を用いて染色した場合の例を説明する。
上記では、蛍光分子数および抗体数を算出する実施例について説明した。続いて、蛍光飽和に関する補正が行われる場合について説明する。
上記では、本開示の一実施例について説明した。続いて、情報処理装置100のハードウェア構成例について説明する。上記で説明してきた各種処理は、ソフトウェアと、以下に説明するハードウェアとの協働により実現される。
上記では、情報処理装置100のハードウェア構成例について説明した。続いて、蛍光の放出点42からの全方位に対する、対物レンズを通して検出可能な範囲の割合(上記の式14)の導出方法について説明する。
以上で説明してきたように、本開示に係る情報処理装置100は、蛍光染色試薬10で染色された標本20の撮像画像情報および試薬情報などを取得し、試薬情報に含まれる褪色係数を用いて撮像画像情報における輝度を補正する。そして、情報処理装置100は、補正後の輝度を用いて、撮像画像情報における蛍光分子に対応する情報(例えば、蛍光分子数、または蛍光分子に結合している抗体数など)を算出し、当該情報を反映した画像情報などを出力することができる。
(1)
蛍光染色試薬で染色された標本の撮像画像情報を取得する画像取得部と、
前記蛍光染色試薬に関する情報を取得する情報取得部と、
前記蛍光染色試薬に関する情報に含まれる、前記蛍光染色試薬の蛍光強度の低減し易さを示す褪色係数を用いて前記撮像画像情報における輝度を補正する補正部と、
補正後の前記輝度を用いて、前記撮像画像情報における蛍光分子に対応する情報を算出する算出部と、を備える、
情報処理装置。
(2)
前記蛍光分子に対応する情報は、前記蛍光分子の数、または前記蛍光分子と結合している抗体の数のうちの少なくともいずれか一方を含む、
前記(1)に記載の情報処理装置。
(3)
前記蛍光強度または前記輝度は連続値であり、前記蛍光分子の数または前記抗体の数は離散値である、
前記(2)に記載の情報処理装置。
(4)
前記蛍光染色試薬に関する情報は、前記蛍光染色試薬に関する量子収率、および吸収断面積もしくはモル吸光係数を少なくとも含む、
前記(2)または(3)に記載の情報処理装置。
(5)
前記情報取得部は、前記蛍光染色試薬を識別可能な試薬識別情報に基づいて前記蛍光染色試薬に関する情報を取得する、
前記(4)に記載の情報処理装置。
(6)
前記試薬識別情報は、前記蛍光染色試薬の製造ロットも識別可能である、
前記(5)に記載の情報処理装置。
(7)
前記蛍光分子に対応する情報に基づいて生成された画像情報を表示する表示部をさらに備える、
前記(1)から(6)のいずれか1項に記載の情報処理装置。
(8)
前記褪色係数は、前記蛍光染色試薬の蛍光物質が吸収するフォトンの数または励起パワー密度あたりに前記蛍光物質が褪色する確率で定義される、
前記(1)から(7)のいずれか1項に記載の情報処理装置。
(9)
前記褪色係数は、前記蛍光分子に対応する情報の算出とは別のサンプルが用いられて別途算出される、
前記(1)から(8)のいずれか1項に記載の情報処理装置。
(10)
前記補正部は、前記撮像画像情報における輝度に対して、更に蛍光飽和に関する補正も行い、
前記算出部は、補正後の前記輝度を用いて、前記撮像画像情報における蛍光分子に対応する情報を算出する、
前記(1)から(9)のいずれか1項に記載の情報処理装置。
(11)
蛍光染色試薬で染色された標本の撮像画像情報を取得することと、
前記蛍光染色試薬に関する情報を取得することと、
前記蛍光染色試薬に関する情報に含まれる、前記蛍光染色試薬の蛍光強度の低減し易さを示す褪色係数を用いて前記撮像画像情報における輝度を補正することと、
補正後の前記輝度を用いて、前記撮像画像情報における蛍光分子に対応する情報を算出することと、を有する、
コンピュータにより実行される情報処理方法。
(12)
蛍光染色試薬で染色された標本の撮像画像情報を取得することと、
前記蛍光染色試薬に関する情報を取得することと、
前記蛍光染色試薬に関する情報に含まれる、前記蛍光染色試薬の蛍光強度の低減し易さを示す褪色係数を用いて前記撮像画像情報における輝度を補正することと、
補正後の前記輝度を用いて、前記撮像画像情報における蛍光分子に対応する情報を算出することと、
をコンピュータに実現させるためのプログラム。
(13)
蛍光染色試薬で染色された標本の撮像画像情報を取得する画像取得部と、
前記蛍光染色試薬に関する情報を取得する情報取得部と、
前記蛍光染色試薬に関する情報に含まれる、前記蛍光染色試薬の蛍光強度の低減し易さを示す褪色係数を用いて前記撮像画像情報における輝度を補正する補正部と、
補正後の前記輝度を用いて、前記撮像画像情報における蛍光分子に対応する情報を算出する算出部と、
前記蛍光分子に対応する情報に基づいて生成された画像情報を表示する表示部と、を備える、
情報処理システム。
11 試薬識別情報
20 標本
30 蛍光染色標本
100 情報処理装置
110 取得部
111 情報取得部
112 画像取得部
120 保存部
121 情報保存部
122 画像情報保存部
130 処理部
131 補正部
132 算出部
133 画像生成部
140 表示部
150 制御部
160 操作部
200 データベース
Claims (13)
- 蛍光染色試薬で染色された標本の撮像画像情報を取得する画像取得部と、
前記蛍光染色試薬に関する情報を取得する情報取得部と、
前記蛍光染色試薬に関する情報に含まれる、前記蛍光染色試薬の蛍光強度の低減し易さを示す褪色係数を用いて前記撮像画像情報における輝度を補正する補正部と、
補正後の前記輝度を用いて、前記撮像画像情報における蛍光分子に対応する情報を算出する算出部と、を備える、
情報処理装置。 - 前記蛍光分子に対応する情報は、前記蛍光分子の数、または前記蛍光分子と結合している抗体の数のうちの少なくともいずれか一方を含む、
請求項1に記載の情報処理装置。 - 前記蛍光強度または前記輝度は連続値であり、前記蛍光分子の数または前記抗体の数は離散値である、
請求項2に記載の情報処理装置。 - 前記蛍光染色試薬に関する情報は、前記蛍光染色試薬に関する量子収率、および吸収断面積もしくはモル吸光係数を少なくとも含む、
請求項2に記載の情報処理装置。 - 前記情報取得部は、前記蛍光染色試薬を識別可能な試薬識別情報に基づいて前記蛍光染色試薬に関する情報を取得する、
請求項4に記載の情報処理装置。 - 前記試薬識別情報は、前記蛍光染色試薬の製造ロットも識別可能である、
請求項5に記載の情報処理装置。 - 前記蛍光分子に対応する情報に基づいて生成された画像情報を表示する表示部をさらに備える、
請求項1に記載の情報処理装置。 - 前記褪色係数は、前記蛍光染色試薬の蛍光物質が吸収するフォトンの数または励起パワー密度あたりに前記蛍光物質が褪色する確率で定義される、
請求項1に記載の情報処理装置。 - 前記褪色係数は、前記蛍光分子に対応する情報の算出とは別のサンプルが用いられて別途算出される、
請求項1に記載の情報処理装置。 - 前記補正部は、前記撮像画像情報における輝度に対して、更に蛍光飽和に関する補正も行い、
前記算出部は、補正後の前記輝度を用いて、前記撮像画像情報における蛍光分子に対応する情報を算出する、
請求項1に記載の情報処理装置。 - 蛍光染色試薬で染色された標本の撮像画像情報を取得することと、
前記蛍光染色試薬に関する情報を取得することと、
前記蛍光染色試薬に関する情報に含まれる、前記蛍光染色試薬の蛍光強度の低減し易さを示す褪色係数を用いて前記撮像画像情報における輝度を補正することと、
補正後の前記輝度を用いて、前記撮像画像情報における蛍光分子に対応する情報を算出することと、を有する、
コンピュータにより実行される情報処理方法。 - 蛍光染色試薬で染色された標本の撮像画像情報を取得することと、
前記蛍光染色試薬に関する情報を取得することと、
前記蛍光染色試薬に関する情報に含まれる、前記蛍光染色試薬の蛍光強度の低減し易さを示す褪色係数を用いて前記撮像画像情報における輝度を補正することと、
補正後の前記輝度を用いて、前記撮像画像情報における蛍光分子に対応する情報を算出することと、
をコンピュータに実現させるためのプログラム。 - 蛍光染色試薬で染色された標本の撮像画像情報を取得する画像取得部と、
前記蛍光染色試薬に関する情報を取得する情報取得部と、
前記蛍光染色試薬に関する情報に含まれる、前記蛍光染色試薬の蛍光強度の低減し易さを示す褪色係数を用いて前記撮像画像情報における輝度を補正する補正部と、
補正後の前記輝度を用いて、前記撮像画像情報における蛍光分子に対応する情報を算出する算出部と、
前記蛍光分子に対応する情報に基づいて生成された画像情報を表示する表示部と、を備える、
情報処理システム。
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CN117616268A (zh) * | 2021-05-06 | 2024-02-27 | 株式会社岛津制作所 | 光反应评价装置 |
WO2022264539A1 (ja) * | 2021-06-17 | 2022-12-22 | ソニーグループ株式会社 | 情報処理システム、情報処理方法及び蛍光体構造体 |
Citations (12)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPH0943147A (ja) * | 1995-07-28 | 1997-02-14 | Bunshi Bio Photonics Kenkyusho:Kk | 暗視野落射蛍光顕微鏡装置 |
JP2001201691A (ja) * | 1999-12-31 | 2001-07-27 | Leica Microsystems Heidelberg Gmbh | 走査型顕微鏡法における使用者手引きのための方法およびシステム |
JP2005214728A (ja) * | 2004-01-28 | 2005-08-11 | Olympus Corp | 蛍光検出装置、濃淡情報補正方法、濃淡情報補正プログラムおよび走査型共焦点レーザ顕微鏡 |
JP2008520247A (ja) * | 2004-11-19 | 2008-06-19 | トリリウム ダイアグノスティクス,エルエルシー | 白血球FcγRI受容体(CD64)の定量化のための、ソフトウェアを統合したフローサイトメトリーアッセイ |
JP2009008603A (ja) * | 2007-06-29 | 2009-01-15 | Canon Inc | 蛍光検出装置および生化学反応分析装置と蛍光検出方法 |
JP2011247656A (ja) * | 2010-05-25 | 2011-12-08 | Yokogawa Electric Corp | 蛍光検出装置および蛍光顕微鏡 |
JP2012194013A (ja) * | 2011-03-16 | 2012-10-11 | Konica Minolta Medical & Graphic Inc | 免疫組織化学染色方法及び反応試薬 |
JP2014145632A (ja) * | 2013-01-28 | 2014-08-14 | Ushio Inc | 蛍光光度計点検方法、点検用試薬容器及び蛍光光度計 |
JP2014161321A (ja) * | 2013-02-27 | 2014-09-08 | Olympus Corp | 発光量を補正する方法 |
JP2016186446A (ja) * | 2015-03-27 | 2016-10-27 | 富士フイルム株式会社 | 細胞分化情報取得装置および方法並びにプログラム |
WO2017163427A1 (ja) * | 2016-03-25 | 2017-09-28 | オリンパス株式会社 | 顕微鏡観察システム、顕微鏡観察方法、及び顕微鏡観察プログラム |
WO2018008309A1 (ja) * | 2016-07-05 | 2018-01-11 | コニカミノルタ株式会社 | 生体物質定量方法、画像処理装置、病理診断支援システム及びプログラム |
Family Cites Families (10)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5324633A (en) * | 1991-11-22 | 1994-06-28 | Affymax Technologies N.V. | Method and apparatus for measuring binding affinity |
US6259524B1 (en) * | 1997-04-25 | 2001-07-10 | The University Of Amsterdam | Photobleachable luminescent layers for calibration and standardization in optical microscopy |
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JP2015082088A (ja) * | 2013-10-24 | 2015-04-27 | ソニー株式会社 | レーザ走査型顕微鏡システムおよびレーザ光強度設定方法 |
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WO2016006096A1 (ja) * | 2014-07-11 | 2016-01-14 | コニカミノルタ株式会社 | 生体物質定量方法、画像処理装置、病理診断支援システム及びプログラム |
JP6467813B2 (ja) | 2014-08-15 | 2019-02-13 | ソニー株式会社 | 画像処理装置、画像処理プログラム及び画像処理方法 |
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Patent Citations (12)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPH0943147A (ja) * | 1995-07-28 | 1997-02-14 | Bunshi Bio Photonics Kenkyusho:Kk | 暗視野落射蛍光顕微鏡装置 |
JP2001201691A (ja) * | 1999-12-31 | 2001-07-27 | Leica Microsystems Heidelberg Gmbh | 走査型顕微鏡法における使用者手引きのための方法およびシステム |
JP2005214728A (ja) * | 2004-01-28 | 2005-08-11 | Olympus Corp | 蛍光検出装置、濃淡情報補正方法、濃淡情報補正プログラムおよび走査型共焦点レーザ顕微鏡 |
JP2008520247A (ja) * | 2004-11-19 | 2008-06-19 | トリリウム ダイアグノスティクス,エルエルシー | 白血球FcγRI受容体(CD64)の定量化のための、ソフトウェアを統合したフローサイトメトリーアッセイ |
JP2009008603A (ja) * | 2007-06-29 | 2009-01-15 | Canon Inc | 蛍光検出装置および生化学反応分析装置と蛍光検出方法 |
JP2011247656A (ja) * | 2010-05-25 | 2011-12-08 | Yokogawa Electric Corp | 蛍光検出装置および蛍光顕微鏡 |
JP2012194013A (ja) * | 2011-03-16 | 2012-10-11 | Konica Minolta Medical & Graphic Inc | 免疫組織化学染色方法及び反応試薬 |
JP2014145632A (ja) * | 2013-01-28 | 2014-08-14 | Ushio Inc | 蛍光光度計点検方法、点検用試薬容器及び蛍光光度計 |
JP2014161321A (ja) * | 2013-02-27 | 2014-09-08 | Olympus Corp | 発光量を補正する方法 |
JP2016186446A (ja) * | 2015-03-27 | 2016-10-27 | 富士フイルム株式会社 | 細胞分化情報取得装置および方法並びにプログラム |
WO2017163427A1 (ja) * | 2016-03-25 | 2017-09-28 | オリンパス株式会社 | 顕微鏡観察システム、顕微鏡観察方法、及び顕微鏡観察プログラム |
WO2018008309A1 (ja) * | 2016-07-05 | 2018-01-11 | コニカミノルタ株式会社 | 生体物質定量方法、画像処理装置、病理診断支援システム及びプログラム |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
"蛍光色素を標識したい", [ONLINE], JPN6023039407, 17 July 2018 (2018-07-17), pages 127 - 133, ISSN: 0005158310 * |
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