JP2005110502A - Cyp2c19*3アレルの検出法およびそのための核酸プローブ - Google Patents
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Abstract
【解決手段】 G636A変異を含む領域をPCRで増幅し、末端が蛍光色素で標識され、ハイブリダイゼーションしたときに蛍光色素の蛍光が減少する核酸プローブであって、特定の塩基配列において塩基番号306で終わる10〜30塩基長の塩基配列を有し、3’末端が蛍光色素で標識されている、または、別の特定の塩基配列において塩基番号296から始まる10〜30塩基長の塩基配列を有し、5’末端が蛍光色素で標識されている前記核酸プローブを用いて、蛍光色素の蛍光を測定することにより融解曲線分析を行い、融解曲線分析の結果に基づいて変異を検出する。
【選択図】 図3
Description
ペアを形成するように設計するという教示があるのみである。本発明者らは、G636A変異に関し、上記条件を満たす消光プローブを設計し、検出を試みたが、容易に検出を可能とする消光プローブは得られなかった。
本発明は、以下のものを提供する。
例としては、FAM(商標)、TAMRA(商標)、BODIPY(商標) FL等が挙げられる。蛍光色素のオリゴヌクレオチドへの結合方法は、通常の方法、例えば特許文献1に記載の方法に従って行うことができる。
(2) アニーリング、50〜70℃、10〜60秒
(3) 伸長、60〜75℃、10〜180秒
Claims (3)
- 末端が蛍光色素で標識され、ハイブリダイゼーションしたときに蛍光色素の蛍光が減少する核酸プローブであって、配列番号1に示す塩基配列において塩基番号306で終わる10〜30塩基長の塩基配列を有し、3’末端が蛍光色素で標識されている、または、配列番号2に示す塩基配列において塩基番号296から始まる10〜30塩基長の塩基配列を有し、5’末端が蛍光色素で標識されている前記核酸プローブ。
- 核酸プローブが、配列番号8または9に示す塩基配列を有する請求項1記載の核酸プローブ。
- 一塩基多型の部位を有する核酸について、蛍光色素で標識された核酸プローブを用いて、蛍光色素の蛍光を測定することにより融解曲線分析を行い、融解曲線分析の結果に基づいて変異を検出する方法であって、一塩基多型は、CYP2C19遺伝子のcDNAにおける636位の変異であり、核酸プローブは、請求項1または2に記載の核酸プローブである前記方法。
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