JP2004501605A5 - - Google Patents
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Description
【特許請求の範囲】
【請求項１】 配列番号１のアミノ酸配列または長さが50〜79残基である配列番号１の断片を含む単離ポリペプチドであって、
ここで、配列番号１の2番目のアミノ酸残基XaaがThr又はSerであり、5番目のアミノ酸残基XaaがLeu又はProであり、6番目のアミノ酸残基XaaがPro又はLeuであり、16番目のアミノ酸残基XaaがLeu又はGlnであり、18番目のアミノ酸残基XaaがMet又はLeuであり、21番目のアミノ酸残基がGly、Asp、Ala又はValであり、36番目のアミノ酸残基XaaがLeu又はIleであり、54番目のアミノ酸残基がPro又はArgであり、64番目のアミノ酸残基XaaがPro又はLeuであり、73番目のアミノ酸残基XaaがAsp又はAsnであり；かつ
配列番号１の17番目のアミノ酸残基がArgからCysに変異した残基又は配列番号1の31番目のアミノ酸残基がArgからIleに変異した残基から選択される変異残基を含む、前記ポリペプチド。
【請求項２】 配列番号１の2番目のアミノ酸残基XaaがThrであり、5番目のアミノ酸残基XaaがLeuであり、6番目のアミノ酸残基XaaがProであり、16番目のアミノ酸残基XaaがLeuであり、18番目のアミノ酸残基XaaがMetであり、21番目のアミノ酸残基がGlyであり、36番目のアミノ酸残基XaaがLeuであり、54番目のアミノ酸残基がProであり、64番目のアミノ酸残基XaaがProであり、かつ73番目のアミノ酸残基XaaがAspである、請求項１に記載の単離ポリペプチド。
【請求項３】 配列番号１の断片の長さが69〜79残基である、請求項１に記載の単離ポリペプチド。
【請求項４】 配列番号１の断片の長さが79残基である、請求項１に記載の単離ポリペプチド。
【請求項５】 HER-2の細胞外ドメインECD上において、4D5ヒト化モノクローナル抗体(ハーセプチン（登録商標）)の結合部位とは異なる部位に結合する、請求項１〜４のいずれか１項に記載の単離ポリペプチド。
【請求項６】 配列番号２のアミノ酸配列又は長さが80〜419残基である配列番号２の断片を含む請求項４に記載の単離ポリペプチドであって、
ここで、配列番号２の342番目のアミノ酸残基XaaがThr又はSerであり、345番目のアミノ酸残基XaaがLeu又はProであり、346番目のアミノ酸残基XaaがPro又はLeuであり、356番目のアミノ酸残基XaaがLeu又はGlnであり、358番目のアミノ酸残基XaaがMet又はLeuであり、361番目のアミノ酸残基がGly、Asp、Ala又はValであり、376番目のアミノ酸残基XaaがLeu又はIleであり、394番目のアミノ酸残基がPro又はArgであり、404番目のアミノ酸残基XaaがPro又はLeuであり、413番目のアミノ酸残基XaaがAsp又はAsnであり；
配列番号２の357番目のアミノ酸残基がArgからCysに変異した残基又は371番目のアミノ酸残基がArgからIleに変異した残基から選択される変異残基を含み；かつ
少なくとも３つのN結合型グリコシル化部位が存在している、前記ポリペプチド。
【請求項７】 配列番号2の342番目のアミノ酸残基XaaがThrであり、345番目のアミノ酸残基XaaがLeuであり、346番目のアミノ酸残基XaaがProであり、356番目のアミノ酸残基XaaがLeuであり、358番目のアミノ酸残基XaaがMetであり、361番目のアミノ酸残基がGlyであり、376番目のアミノ酸残基XaaがLeuであり394番目のアミノ酸残基がProであり、404番目のアミノ酸残基XaaがProであり、かつ413番目のアミノ酸残基XaaがAspである、請求項６に記載の単離ポリペプチド。
【請求項８】 配列番号２の断片の長さが350〜419残基であり、且つ４つのN結合型グリコシル化部位が存在している、請求項６又は７に記載の単離ポリペプチド。
【請求項９】 配列番号２の断片の長さが419残基である、請求項６に記載の単離ポリペプチド。
【請求項１０】 HER-2の細胞外ドメインECD上において、4D5ヒト化モノクローナル抗体(ハーセプチン（登録商標）)の結合部位とは異なる部位に結合する、請求項６〜９のいずれか１項に記載の単離ポリペプチド。
【請求項１１】 発現したときに、配列が請求項１〜１０のいずれか１項に記載のポリペプチドをコードしている単離DNA。
【請求項１２】 発現したときに、請求項１〜１０のいずれか１項に記載のポリペプチドをコードしているDNA配列を有する発現ベクターを含む、トランスフェクションされた細胞。
【請求項１３】 HER-2の過剰発現を特徴とする固形ガンの治療用薬剤を製造するための、請求項１〜１０のいずれか１項に記載のポリペプチドの使用。
【請求項１４】 請求項１〜１０のいずれか１項に記載のポリペプチドと医薬上許容される担体とを含む、医薬組成物。
【請求項１５】 HER-2の過剰発現を特徴とする固形ガン組織を標的とする治療薬を調製する方法であって、
治療薬を請求項１〜１０のいずれか１項に記載の単離ポリペプチドに付着させることを含む、前記方法。
【請求項１６】 (a)抗p68HER-2抗体に基づくアッセイを用いて、変異１３又は変異１４から選択されるp68HER-2のECD IIIa変異体が体液サンプル中に存在しているかどうかを決定すること、ここで前記アッセイはELISA、免疫沈降法、免疫組織化学法、ウエスタンブロット解析法からなる群より選択され；ならびに
(b) 歴史データベースを用いて、このp68HER-2のECD IIIa変異体の存在またはその量を、ガンの治療および診断と関連づけること；
を含む、診断的アッセイ。
【請求項１７】 体液サンプルが血液、血清、尿、リンパ液、唾液、腫瘍組織、胎盤組織、臍帯組織、羊水、絨毛膜絨毛組織、及びこれらの組み合わせからなる群より選択される、請求項１６記載の診断的アッセイ。
【請求項１８】 体液中のp185HER-2のECDの量を測定することをさらに含む、請求項１６記載の診断的アッセイ。
【請求項１９】 p68HER-2の量とp185HER-2のECDの量との比を決定することをさらに含む、請求項１８記載の診断的アッセイ。
【請求項２０】 （a）配列同定アッセイを用いて、体液サンプル中にECD IIIa変異体のタンパク質またはDNA配列、すなわちHER-2のイントロン8変異体DNA配列が存在しているかどうかを決定すること；ならびに
（b）歴史データベースを用いて、ECD IIIa変異体のタンパク質またはDNA配列、すなわちHER-2のイントロン8変異体DNA配列の存在を、ガンの治療および診断と関連づけること；
を含む、診断的アッセイ。
【請求項２１】 体液サンプルが血液、血清、尿、リンパ液、唾液、腫瘍組織、胎盤組織、臍帯組織、羊水、絨毛膜絨毛組織、及びこれらの組み合わせからなる群より選択される、請求項２０記載の診断的アッセイ。
【請求項２２】 配列同定アッセイを、DNAシークエンシング、PCRアッセイ、ELISA免疫アッセイ、イムノアッセイ、ハイブリダイゼーション・アッセイ、及びこれらの組み合わせからなる群より選択する、請求項２０記載の診断的アッセイ。
【請求項２３】 体液中のp185HER-2のECDの量を測定することをさらに含む、請求項２０記載の診断的アッセイ。
【請求項２４】 （a）配列同定アッセイを用いて、HER-2のイントロン8変異体DNA配列が存在しているかどうかを決定すること；ならびに
（b）歴史データベースを用いて、HER-2のイントロン8変異体DNA配列の存在を、ガンの治療および診断と関連づけること；
を含む、診断的アッセイ。
【請求項２５】 体液サンプルが血液、血清、尿、リンパ液、唾液、腫瘍組織、胎盤組織、臍帯組織、羊水、絨毛膜絨毛組織、及びこれらの組み合わせからなる群より選択される、請求項２４記載の診断的アッセイ。
【請求項２６】 配列同定アッセイを、DNAシークエンシング、PCRアッセイ、ハイブリダイゼーション・アッセイ、及びこれらの組み合わせからなる群より選択する、請求項２４記載の診断的アッセイ。
【請求項２７】 体液中のp185HER-2のECDの量を測定することをさらに含む、請求項２４記載の診断的アッセイ。
【請求項２８】 配列番号1、配列番号2、配列番号12又は配列番号13のいずれかで配列が表わされるp68HER-2のECD IIIa変異体又はHER-2のイントロン8変異体に対して特異的な抗体。
【請求項２９】 p68HER-2のECD IIIa変異体3に対して特異的な抗体。
【請求項３０】 (a) 配列番号1、配列番号2、配列番号12又は配列番号13のいずれかで配列が表わされるp68HER-2のECD IIIa変異体又はHER-2のイントロン8変異体に対して特異的に結合するモノクローナル抗体又はその抗原結合断片；および
(b) (a)の抗体又は断片の結合を検出できる検出可能な標識；
を含む、診断キット。
【請求項３１】 標識を、酵素、放射性標識、発色団、化学発光タグ、及び蛍光発光体からなる群より選択する、請求項３０に記載の診断キット。
【請求項１】 配列番号１のアミノ酸配列または長さが50〜79残基である配列番号１の断片を含む単離ポリペプチドであって、
ここで、配列番号１の2番目のアミノ酸残基XaaがThr又はSerであり、5番目のアミノ酸残基XaaがLeu又はProであり、6番目のアミノ酸残基XaaがPro又はLeuであり、16番目のアミノ酸残基XaaがLeu又はGlnであり、18番目のアミノ酸残基XaaがMet又はLeuであり、21番目のアミノ酸残基がGly、Asp、Ala又はValであり、36番目のアミノ酸残基XaaがLeu又はIleであり、54番目のアミノ酸残基がPro又はArgであり、64番目のアミノ酸残基XaaがPro又はLeuであり、73番目のアミノ酸残基XaaがAsp又はAsnであり；かつ
配列番号１の17番目のアミノ酸残基がArgからCysに変異した残基又は配列番号1の31番目のアミノ酸残基がArgからIleに変異した残基から選択される変異残基を含む、前記ポリペプチド。
【請求項２】 配列番号１の2番目のアミノ酸残基XaaがThrであり、5番目のアミノ酸残基XaaがLeuであり、6番目のアミノ酸残基XaaがProであり、16番目のアミノ酸残基XaaがLeuであり、18番目のアミノ酸残基XaaがMetであり、21番目のアミノ酸残基がGlyであり、36番目のアミノ酸残基XaaがLeuであり、54番目のアミノ酸残基がProであり、64番目のアミノ酸残基XaaがProであり、かつ73番目のアミノ酸残基XaaがAspである、請求項１に記載の単離ポリペプチド。
【請求項３】 配列番号１の断片の長さが69〜79残基である、請求項１に記載の単離ポリペプチド。
【請求項４】 配列番号１の断片の長さが79残基である、請求項１に記載の単離ポリペプチド。
【請求項５】 HER-2の細胞外ドメインECD上において、4D5ヒト化モノクローナル抗体(ハーセプチン（登録商標）)の結合部位とは異なる部位に結合する、請求項１〜４のいずれか１項に記載の単離ポリペプチド。
【請求項６】 配列番号２のアミノ酸配列又は長さが80〜419残基である配列番号２の断片を含む請求項４に記載の単離ポリペプチドであって、
ここで、配列番号２の342番目のアミノ酸残基XaaがThr又はSerであり、345番目のアミノ酸残基XaaがLeu又はProであり、346番目のアミノ酸残基XaaがPro又はLeuであり、356番目のアミノ酸残基XaaがLeu又はGlnであり、358番目のアミノ酸残基XaaがMet又はLeuであり、361番目のアミノ酸残基がGly、Asp、Ala又はValであり、376番目のアミノ酸残基XaaがLeu又はIleであり、394番目のアミノ酸残基がPro又はArgであり、404番目のアミノ酸残基XaaがPro又はLeuであり、413番目のアミノ酸残基XaaがAsp又はAsnであり；
配列番号２の357番目のアミノ酸残基がArgからCysに変異した残基又は371番目のアミノ酸残基がArgからIleに変異した残基から選択される変異残基を含み；かつ
少なくとも３つのN結合型グリコシル化部位が存在している、前記ポリペプチド。
【請求項７】 配列番号2の342番目のアミノ酸残基XaaがThrであり、345番目のアミノ酸残基XaaがLeuであり、346番目のアミノ酸残基XaaがProであり、356番目のアミノ酸残基XaaがLeuであり、358番目のアミノ酸残基XaaがMetであり、361番目のアミノ酸残基がGlyであり、376番目のアミノ酸残基XaaがLeuであり394番目のアミノ酸残基がProであり、404番目のアミノ酸残基XaaがProであり、かつ413番目のアミノ酸残基XaaがAspである、請求項６に記載の単離ポリペプチド。
【請求項８】 配列番号２の断片の長さが350〜419残基であり、且つ４つのN結合型グリコシル化部位が存在している、請求項６又は７に記載の単離ポリペプチド。
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【請求項１０】 HER-2の細胞外ドメインECD上において、4D5ヒト化モノクローナル抗体(ハーセプチン（登録商標）)の結合部位とは異なる部位に結合する、請求項６〜９のいずれか１項に記載の単離ポリペプチド。
【請求項１１】 発現したときに、配列が請求項１〜１０のいずれか１項に記載のポリペプチドをコードしている単離DNA。
【請求項１２】 発現したときに、請求項１〜１０のいずれか１項に記載のポリペプチドをコードしているDNA配列を有する発現ベクターを含む、トランスフェクションされた細胞。
【請求項１３】 HER-2の過剰発現を特徴とする固形ガンの治療用薬剤を製造するための、請求項１〜１０のいずれか１項に記載のポリペプチドの使用。
【請求項１４】 請求項１〜１０のいずれか１項に記載のポリペプチドと医薬上許容される担体とを含む、医薬組成物。
【請求項１５】 HER-2の過剰発現を特徴とする固形ガン組織を標的とする治療薬を調製する方法であって、
治療薬を請求項１〜１０のいずれか１項に記載の単離ポリペプチドに付着させることを含む、前記方法。
【請求項１６】 (a)抗p68HER-2抗体に基づくアッセイを用いて、変異１３又は変異１４から選択されるp68HER-2のECD IIIa変異体が体液サンプル中に存在しているかどうかを決定すること、ここで前記アッセイはELISA、免疫沈降法、免疫組織化学法、ウエスタンブロット解析法からなる群より選択され；ならびに
(b) 歴史データベースを用いて、このp68HER-2のECD IIIa変異体の存在またはその量を、ガンの治療および診断と関連づけること；
を含む、診断的アッセイ。
【請求項１７】 体液サンプルが血液、血清、尿、リンパ液、唾液、腫瘍組織、胎盤組織、臍帯組織、羊水、絨毛膜絨毛組織、及びこれらの組み合わせからなる群より選択される、請求項１６記載の診断的アッセイ。
【請求項１８】 体液中のp185HER-2のECDの量を測定することをさらに含む、請求項１６記載の診断的アッセイ。
【請求項１９】 p68HER-2の量とp185HER-2のECDの量との比を決定することをさらに含む、請求項１８記載の診断的アッセイ。
【請求項２０】 （a）配列同定アッセイを用いて、体液サンプル中にECD IIIa変異体のタンパク質またはDNA配列、すなわちHER-2のイントロン8変異体DNA配列が存在しているかどうかを決定すること；ならびに
（b）歴史データベースを用いて、ECD IIIa変異体のタンパク質またはDNA配列、すなわちHER-2のイントロン8変異体DNA配列の存在を、ガンの治療および診断と関連づけること；
を含む、診断的アッセイ。
【請求項２１】 体液サンプルが血液、血清、尿、リンパ液、唾液、腫瘍組織、胎盤組織、臍帯組織、羊水、絨毛膜絨毛組織、及びこれらの組み合わせからなる群より選択される、請求項２０記載の診断的アッセイ。
【請求項２２】 配列同定アッセイを、DNAシークエンシング、PCRアッセイ、ELISA免疫アッセイ、イムノアッセイ、ハイブリダイゼーション・アッセイ、及びこれらの組み合わせからなる群より選択する、請求項２０記載の診断的アッセイ。
【請求項２３】 体液中のp185HER-2のECDの量を測定することをさらに含む、請求項２０記載の診断的アッセイ。
【請求項２４】 （a）配列同定アッセイを用いて、HER-2のイントロン8変異体DNA配列が存在しているかどうかを決定すること；ならびに
（b）歴史データベースを用いて、HER-2のイントロン8変異体DNA配列の存在を、ガンの治療および診断と関連づけること；
を含む、診断的アッセイ。
【請求項２５】 体液サンプルが血液、血清、尿、リンパ液、唾液、腫瘍組織、胎盤組織、臍帯組織、羊水、絨毛膜絨毛組織、及びこれらの組み合わせからなる群より選択される、請求項２４記載の診断的アッセイ。
【請求項２６】 配列同定アッセイを、DNAシークエンシング、PCRアッセイ、ハイブリダイゼーション・アッセイ、及びこれらの組み合わせからなる群より選択する、請求項２４記載の診断的アッセイ。
【請求項２７】 体液中のp185HER-2のECDの量を測定することをさらに含む、請求項２４記載の診断的アッセイ。
【請求項２８】 配列番号1、配列番号2、配列番号12又は配列番号13のいずれかで配列が表わされるp68HER-2のECD IIIa変異体又はHER-2のイントロン8変異体に対して特異的な抗体。
【請求項２９】 p68HER-2のECD IIIa変異体3に対して特異的な抗体。
【請求項３０】 (a) 配列番号1、配列番号2、配列番号12又は配列番号13のいずれかで配列が表わされるp68HER-2のECD IIIa変異体又はHER-2のイントロン8変異体に対して特異的に結合するモノクローナル抗体又はその抗原結合断片；および
(b) (a)の抗体又は断片の結合を検出できる検出可能な標識；
を含む、診断キット。
【請求項３１】 標識を、酵素、放射性標識、発色団、化学発光タグ、及び蛍光発光体からなる群より選択する、請求項３０に記載の診断キット。
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